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changeset 0:9299a59defda draft

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planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/justdiff commit 1ef8ddce2dd398b8328eb864295a3cfbe95087b3
author artbio
date Wed, 27 Sep 2017 11:27:47 -0400
parents
children 294d9452c0d4
files diff.xml test-data/diff.txt test-data/file1.txt test-data/file2.txt
diffstat 4 files changed, 47 insertions(+), 0 deletions(-) [+]
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/diff.xml	Wed Sep 27 11:27:47 2017 -0400
@@ -0,0 +1,32 @@
+<tool id="justdiff" name="Differences between two files" version="0.6.0">
+  <description></description>
+  <stdio>
+      <exit_code range="1:" level="fatal" description="Tool exception" />
+  </stdio>
+  <command detect_errors="exit_code"><![CDATA[
+       diff '${input1}' '${input2}' | cat > '$output'
+  ]]></command>
+  <inputs>
+      <param format="txt" name="input1" type="data" label="first file" help="first file" />
+      <param format="txt" name="input2" type="data" label="second file" help="second file" />
+  </inputs>
+  <outputs>
+    <data name="output" format="txt" label="diff $input1.name | $input2.name" />
+  </outputs>
+  <tests>
+      <test>
+          <param name="input1" value="file1.txt" ftype="txt" />
+          <param name="input2" value="file2.txt" ftype="txt" />
+          <output name="output" file="diff.txt" ftype="txt"/>
+      </test>
+  </tests>
+  <help>
+
+.. class:: infomark
+
+**What it does**
+
+Just returns the Unix-style **diff** between two files !
+  </help>
+</tool>
+
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/diff.txt	Wed Sep 27 11:27:47 2017 -0400
@@ -0,0 +1,6 @@
+1c1
+< Je fais souvent ce reve etrange et penetrant
+---
+> Il fait souvent ce reve etrange et penetrant
+5d4
+<  
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/file1.txt	Wed Sep 27 11:27:47 2017 -0400
@@ -0,0 +1,5 @@
+Je fais souvent ce reve etrange et penetrant
+d'une femme que j'aime et qui m'aime
+et qui n'est jamais ni tout a fait la meme ni tout a fait une autre
+et m'aime et me comprend
+ 
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/file2.txt	Wed Sep 27 11:27:47 2017 -0400
@@ -0,0 +1,4 @@
+Il fait souvent ce reve etrange et penetrant
+d'une femme que j'aime et qui m'aime
+et qui n'est jamais ni tout a fait la meme ni tout a fait une autre
+et m'aime et me comprend