annotate COSMIC_v3.2_SBS_GRCh38.txt @ 17:8c6ee1c2248f draft

"planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
author artbio
date Tue, 05 Oct 2021 22:28:34 +0000
parents
children
Ignore whitespace changes - Everywhere: Within whitespace: At end of lines:
rev   line source
17
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
1 Type SBS1 SBS2 SBS3 SBS4 SBS5 SBS6 SBS7a SBS7b SBS7c SBS7d SBS8 SBS9 SBS10a SBS10b SBS10c SBS10d SBS11 SBS12 SBS13 SBS14 SBS15 SBS16 SBS17a SBS17b SBS18 SBS19 SBS20 SBS21 SBS22 SBS23 SBS24 SBS25 SBS26 SBS27 SBS28 SBS29 SBS30 SBS31 SBS32 SBS33 SBS34 SBS35 SBS36 SBS37 SBS38 SBS39 SBS40 SBS41 SBS42 SBS43 SBS44 SBS45 SBS46 SBS47 SBS48 SBS49 SBS50 SBS51 SBS52 SBS53 SBS54 SBS55 SBS56 SBS57 SBS58 SBS59 SBS60 SBS84 SBS85 SBS86 SBS87 SBS88 SBS89 SBS90 SBS91 SBS92 SBS93 SBS94
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
2 A[C>A]A 0.000876022860356065 5.79005909129116e-07 0.0209197492105927 0.0424507363741909 0.0120520481367051 0.000425145613703031 6.71694562134893e-05 0.0023442806064472 0.0048409876668343 4.04303518755573e-05 0.0443106405724723 0.000560638966969298 0.00218526226624343 0.000180914642923439 0.00434263942606707 0.01012472850983 0.000147337461127982 0.00454236809131541 0.00181687918087284 0.00112609260941517 0.000946030090875022 0.0160943727268514 0.00207279918632882 0.000607768765141304 0.0516883199119327 0.00127961346873583 0.000624247512114177 0.000157722171783313 0.00604617162363952 0.000844506730061431 0.0366237270205082 0.00993578471500029 0.000876874614431855 0.00524479055319963 0.000785670933284911 0.0634975968681214 0.00181050219506439 0.00960912183117111 0.0223789211417006 0.00311541332789912 0.00491451849966565 0.00889879970109325 0.0252566874551386 0.00396339013292478 0.0129023666540016 0.0117479311902508 0.0283232393641942 0.00211992485836903 0.00117067429085544 0.0295843611171861 7.72517333163933e-18 0.00917774752467885 0.00441211963335343 0.0681598353125126 0.000846457012082653 0.0252196471738968 0.119346279650656 0.141438096214809 0.015188293523162 0.0054145126690836 0.00217000566121913 0.00589903294896179 0.0126059908089869 0.0123291256649843 0.0589648993205378 0.00361671808815035 0.00616315261337056 0.00350023963380068 0.00610786743467984 0.0029681671253879 0.00894607632626567 0 0.0322967820585411 0.00222200179738472 0.00293439734382328 0.011395595580872 0.0116277043206954 0.0156768224427753
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
3 A[C>A]C 0.0022201195808427 0.000145504532003707 0.0163431921068143 0.0329895820389566 0.00933708706453245 0.000516225985778605 0.000176729831442553 0.000456787700688116 0.00113512709023552 0.000753958416703351 0.0472995640705189 0.00404699056207519 0.00173937218490227 0.00640235692941599 0.0146429162836609 0.0181854964747198 0.000548604298962786 0.00111836131396873 0.000708842466041201 0.0129714099117801 0.000490511447644093 0.00287284286844122 0.000905293428455269 0.000126994323924781 0.015617160603031 0.000636052426566461 0.00138051386891227 0.00233488180943175 9.45179243898909e-05 0.000397419651060091 0.0262583136241544 0.00691870511579565 0.000522296335554948 0.00469925022200316 0.00249692183598218 0.0506605586475702 0.000501229784403264 0.0183513008890373 0.0185802663233841 0.00219998616712925 0.00691705223307522 0.0458535015969002 0.0082121897974964 0.00143283945896517 0.0100262974818025 0.00707035755018954 0.0132543494116393 0.0012071400122214 0.0204741138844213 0.00582709358762871 0.000148592905316116 0.00282762877086536 0.00464143490262438 0.0294045874420047 0.000819963632460125 0.00695633378556714 0.125436939014046 0.00166952834394008 0.00643580600312405 0.00194264288809634 0.000787553355151439 0.0020254296323646 0.0154691302427 0.00141163691801075 0.00665490472038005 0.0023514099858487 0.00076882069739839 0.00497144778101741 0.000870520591015149 0.00373467649610322 0.00448990659687645 0 0.0174945514426125 0.000703923956014938 0.0520129793720394 0.00965299387896681 0.00801102801757618 0.0245227064135183
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
4 A[C>A]G 0.000179727205679816 5.36186073164881e-05 0.00180754877738393 0.0161159612218968 0.00190813974719045 5.34208697464283e-05 7.3305382042244e-05 0.000192187641025743 0.000388049415693723 0.000256936026118117 0.00476727552433761 0.000439559345708089 0.000153712628486902 5.46153789728894e-05 0.000676583182257768 0.000746924768476702 9.75233896485778e-05 0.000557309553139576 0.000270655854422162 0.000426446913390031 4.74452478520416e-05 0.00105369054278497 4.89499976093771e-05 5.97470711001324e-05 0.0025046687585242 0.000254547611912212 2.25777938295459e-05 0.000303318754994713 0.000790362401227405 1.02308497833945e-07 0.0152926133494441 0.00149449277081636 0.000117594481949321 0.00080948913978732 0.000363293951337536 0.0198107208240535 9.43096572057688e-05 0.00171712634413146 0.00459650757075094 0.000425906691851179 5.38907459139644e-05 0.0014386142783664 0.00230559332278304 0.00109228113177588 0.00196685275665963 0.00275324989862116 0.00301186501563961 6.33527135443591e-05 3.46165192499398e-05 0.000644723277294773 9.46240046928534e-07 0.00171745218767174 0.000308940394015026 0.00142474375857976 0.000262311503347356 0.00733658111996591 0.00594287472302467 0.00494478445066236 0.00424839190745919 0.0393786580759121 0.00169203679094557 4.62603245157679e-05 0.000211656933411383 0.00342791653883655 0.000848185909133496 0.000146915423770117 2.29504659611542e-16 0.000468632467934575 0.000315691975215588 0.00039774589930654 0.00635721369998859 0 0.00997117734563621 0.000143618553719305 0.000208984785583635 0.00485145553771008 0.00181662009666457 0.00162681470685805
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
5 A[C>A]T 0.00126505263784183 9.75912243380865e-05 0.0122650656971785 0.0296627698719921 0.00663587169503364 0.000179985776931981 0.000248522446240606 0.000714050506828172 0.00196363075751922 0.00405133437082305 0.0472045874219964 0.00306313282723616 0.0169560731896464 1.61959655767103e-05 0.013156119205243 0.0142057644899811 0.000268323600008673 0.00122552063885904 0.000347256843861562 0.0830143252239989 0.00111191821370535 0.0106580277520086 6.18574864123409e-05 0.000455634446095697 0.0214692003868359 0.000575079781725448 0.00124998489684999 0.000623593537179773 0.00172962261411101 5.67148006587459e-18 0.022125889785216 0.00498586225712035 0.000621485230278024 0.00273700908935119 0.00397678433704963 0.0357525578677183 0.000559008293866678 0.00632283542744842 0.0146454947657922 0.00190250494695433 0.0012407207163642 0.0217591230618291 0.0179327043906159 0.00185548892250343 0.00891701689834946 0.00742718362689331 0.0148584134555463 0.00133569273070186 0.00803994952747432 0.00207504459089877 0.00581154707766758 0.009707595518449 0.00340792814729816 0.0119581145471586 3.84950867736259e-05 0.0080046162395617 0.0834069344919052 0.0212569063678941 0.00922899209747968 1.72024426332739e-05 0.000415742445266941 0.00117329242521166 0.0230012366528922 0.0086568086798959 0.00558379383363819 0.0146017571483921 0.00044476201135469 0.00936762036273204 0.00272846764316958 0.00363947595496165 0.00494076188562373 0.00173775710787734 0.0208175344957078 0.00177063911789106 0.000130303604125752 0.00780006070488747 0.00845689051563497 0.0111405163855675
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
6 A[C>G]A 0.00183905476327572 2.22617789199643e-16 0.0198134163196479 0.00693093776346386 0.0101438071817268 0.000471161374245006 6.50641448993352e-05 8.61246437390044e-06 0.00112254786477317 0.00118088651517717 0.00435068194283005 0.00486288996439319 2.22517573229354e-16 0.000303181132371697 0.000348531720172589 0.000129033857802022 0.00017155731775176 0.00122603740517805 0.00386336397251532 2.23207642223365e-16 0.000113243008759404 0.0017502630340451 0.00101136578656624 0.000145944473208273 0.00173632608636201 0.0032141472167459 0.00884434681945288 1.69777369626624e-05 0.001669990831155 5.80535165335642e-18 0.00336052879803564 0.00805902537994468 0.000428895143599544 0.00132881449716382 0.000154328219038108 0.00315478566718198 0.0010762429715105 0.00838028235171318 0.001997042738654 0.00141245427406359 0.00076896572828444 0.00360789387654743 0.00184413908402599 0.0344162738124861 0.00271151299213002 0.0474937731024669 0.0122533163206797 0.00535507085076158 0.000409736001799406 0.000362032351298448 0.00319870458263191 0.00313312785968729 0.00120330535455094 0.00103546652465911 0.00019602162385072 0.000289372844067022 0.00386120316516826 0.00397230397879889 0.00172866761809672 0.00707509740960181 0.00155717998837484 0.00285922515383353 0.000418198742710833 0.0154364662797364 0.0206226982343477 0.00296188055129861 0.000377806265892797 0.00681305386778403 0.00726778078880316 0.0527625037257121 0.00784324604023013 0 0.0148760934994768 0.00051276995609508 0.000242480468410939 0.0030737311009965 0.00889848841394802 0.00704754750461015
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
7 A[C>G]C 0.0011879587230825 0.000130757451057385 0.0115888089484683 0.00281352591563474 0.00563785977413505 0.00028471242345423 2.13260578723975e-05 0.000187273048655214 0.000314874384160983 0.0025131947223445 0.00291911535581654 0.00193938912021207 2.38795164367939e-05 0.000131179790296902 0.000321024992196369 0.000287969460379068 0.000288216026628999 0.000635387578378694 0.0009349641958463 5.72326330458696e-06 0.000265488087356663 0.00199117729847134 0.000561124140295259 4.27252221576393e-05 0.00256002822543356 0.00177618384329792 0.00149969492234355 0.000711347466517554 0.000193197015262356 4.06384004091522e-05 0.00363652871700555 0.0016209537699864 0.000373916694772293 0.00175478331074802 0.000221071340418976 0.00260229041490448 0.000462597449241747 0.0031346005842896 0.00200627343811009 0.00128250314675696 0.00112302715853089 0.00451587515727047 0.00164836021175709 0.0110674496140758 0.00156847029913346 0.0222493769061908 0.00858565320097235 0.00312669052345872 0.000502907845898892 3.09132253038608e-05 0.000230814312924366 0.0019148503606211 0.00148130901147587 0.000610862978172287 0.000111148459096854 0.000133585357190834 0.00108646167649961 0.00448500513697514 0.00149578365821843 0.00541164804541123 0.000490736764013962 0.000165986428408416 0.000163558956706255 0.00308980668068086 0.00171548655014242 0.00242086091370077 0.000580316521271185 0.010734524199746 0.00252405236112297 0.0774946609753081 0.00386285538908104 0.00399492612043862 0.00581698614128222 0.00027544820201909 0.000122260393063771 0.00167395179099994 0.00536100728107385 0.00395405176943823
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
8 A[C>G]G 0.000116771913294796 1.55832281302221e-05 0.000261319908958935 0.00132233527974538 0.00177405425144193 2.28066020840521e-16 5.23021546031742e-05 0.000521799778053765 2.28506552477471e-16 0.000931136158652059 0.000295117056268519 0.00140328805202582 2.28519441017194e-16 2.26628301532364e-16 4.36906724327611e-05 2.76824445624589e-05 6.17682680452204e-05 7.75073100755226e-05 0.000270655854422162 4.03730612918892e-05 3.15958591986481e-05 0.000874976362489088 0.000156310916735826 2.28927781019408e-16 0.00197899753759936 0.000637403776170416 0.000485733270920046 2.29036610914376e-16 0.000238658450566707 2.9705817645186e-18 0.00095062191091139 0 7.04535361152515e-05 0 2.28473816421906e-16 0.000924500305122498 0.000135318347140807 0.00310324038096047 0.0011645859988674 0.000260276311686832 2.30072030632694e-16 0.000358101108140128 0.000514641366692644 0.00551292835377448 0.000658378080650277 0.0140240444274336 0.00232078639903736 0.0012484818141478 1.83446823570041e-05 0.0045624985917186 3.24366129623974e-05 0.000279344632934562 0 0.000338634748416058 8.16419136387313e-05 0.000210501061669908 0.000851777711601631 0.00202942195162601 0.000839416565290245 0.00259423705434487 0.00175394057598016 0.000525451347506494 0.000439753240291611 0.00285145009386703 0.00173749598355831 0.00085873099809294 0.000284050610102178 4.76250403740493e-05 0.000435553639771432 0.00512316198559435 0.031395948598565 0 0.00623847132764373 4.78859801520757e-05 4.83673719271591e-05 0.000937221335860929 0.00168346035064741 0.0005687102813141
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
9 A[C>G]T 0.00112668750557787 9.10053134931849e-05 0.0174927986172873 0.00356958756086685 0.0101395316368895 0.000253979929670684 9.58013945992012e-05 0.000286625907670463 0.00193357518470005 0.00291095877014693 0.00573485519531064 0.0064376004664209 2.22423783605362e-16 2.20583089449674e-16 0.000517420905678921 0.000106649177234618 0.000539673406032481 0.00144651616389921 0.00399145797542025 0.000205023272950312 0.000325561639147962 0.0115629546366131 1.96182319366e-05 0.000318744272597647 0.00409319334477992 0.00215529025024949 0.0044555913258685 6.21585184403027e-05 6.23468616714434e-05 5.67148006587459e-18 0.00286630844944844 0.00344094719153376 0.000730922855642006 0.00132825441100867 8.34423514549708e-05 0.00250067048007356 0.000734955148950615 0.00380578310760431 0.00175545313973537 0.00130171391107402 0.00204769354001571 0.00954983734380279 0.00191348968637299 0.0188557793205754 0.00245847697536415 0.0435594282982662 0.0146576240845255 0.00830539765631904 0.000434782715977595 0.000354862698153703 0.00330795672759971 0.00144002713603549 0.00220512997766352 0.00172839974967336 0.000678859370866512 0.000176764423859832 0.00197489977102227 0.000902415836372864 0.00170796282323488 0.00305821202369314 0.00520180160986173 0.0012735738290759 0.000123006613404597 0.00507986342674446 0.00203138019395799 0.00385687792264426 0.00025042906044746 0.029822389327123 0.0130733710488696 0.0924752276172127 0.00968758080343255 0.00405476658504711 0.0109394222514338 0.000931915590691366 8.05633637401174e-05 0.00413823544993071 0.0139612449031832 0.00716503586927057
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
10 A[C>T]A 0.0247184780010176 6.09952776686017e-05 0.0142817518649239 0.00875169209610095 0.0327413974380489 0.0641219619726219 0.000122308562060383 0.00141864191205603 0.00133302558941814 0.00333250177588133 0.00684252748976273 0.0081383075850382 0.00103775011730282 0.000545726038269056 0.0048796369429312 0.00136935710687976 0.0260363458705612 0.00553726729715663 0.00716768819706977 0.0124674538899537 0.00506086012597336 0.00177038099995366 0.0012216497619909 0.00057078283699948 0.00923364161533556 0.0282119504918135 0.0497179359405959 0.00217998160999866 0.0017705926884535 0.0228573079034591 0.0118725268912637 0.0210759069712127 0.00267180581258733 0.0137914837963214 0.000778656014237724 0.00511396784903066 0.106618462598236 0.0178282449068899 0.0867057751857814 0.00531924269168628 0.00355217764246881 0.00222721940423738 0.00597340703304069 0.00626115302011409 0.00347759101221136 0.00963932815610322 0.0197860927473272 0.00992647279653367 0.0226061242372086 2.90829312677423e-05 0.0904287867857259 0.00133989069240646 0.0152418678243119 0.0042926621944606 0.000284132353763417 0.000577740921314366 0.00353024289386812 0.0359112329396465 0.00268792826166485 0.00726631625850996 0.00148685573083532 0.0051265405389787 0.00740351841162719 0.0326771948519096 0.0805886994109219 0.00394917406839815 0.00276590263624435 0.0543241290242723 0.00138102387772697 0.00876525080459726 0.00939723870257078 0.0104309402205433 0.0500965408012801 0.000714563494302478 0.0157090562682218 0.0239053590893529 0.00898309311752424 0.00757731998215875
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
11 A[C>T]C 0.00615401568023061 0.00135673144706159 0.0122821564923938 0.00414103462230746 0.017704857887196 0.022560257775439 0.0174755196454368 0.0377518685384321 0.00758067482870327 0.00137979318089503 0.00279047637403479 0.00536300460793338 0.000819568588818356 0.00513950670939357 0.00518313681183191 0.00193568741462708 0.146095710049872 0.00209816458903868 2.18256626159704e-16 0.0100008580235862 0.00681978692800943 0.00369507031009854 0.00168633089614217 6.92069842783881e-05 0.0045961896711452 0.0139911688215087 0.0129112807883881 0.00387827825973409 0.000217965863372914 0.0805795733603041 0.0110978533053031 0.012947862430989 0.00251256191725297 0.00537340426229054 0.00333580861882205 0.00426458999552788 0.0895477717590021 0.00920540931082517 0.121562380732779 0.00210133207891717 0.00368710686561913 0.00396007513791411 0.00323749790093608 0.00302378534098856 0.00213431085008667 0.00399499923115605 0.0119684796925997 0.00332458232874092 0.0395567831359208 0.000126418301562115 0.0167414673322824 0.000596282417996519 0.00878910013475681 0.000930650242272202 0.000427044079687913 0.000299824912806095 0.00177784637972664 0.00558155925636774 0.00206654321201231 0.00194264288809634 0.000523386589039084 0.000230207367971196 0.000967559611358687 0.0127343470226144 0.00666476383848431 0.00283756648081321 0.00132249003146834 0.0418052723552856 0.00146262085083548 0.0020278764018449 0.00349129858195642 0 0.0133696024552419 0.000290751156008062 0.00119237413462796 0.0139648268683165 0.00501776983585197 0.0141610351956751
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
12 A[C>T]G 0.370623898718264 3.35244447275174e-05 0.00265451449021527 0.00080889728440674 0.00637421818250647 0.123278930184066 2.29594103868264e-16 0.000561063919768702 0.000954169252912681 0.00124357036641169 0.00333296535575984 0.00451941299108317 0.00570786227114695 0.000422631156911705 0.0134057010798281 0.000722658130184807 0.00785576294937534 0.000121782457908277 0.000310639105643618 0.0273628164766001 0.0766739905634947 0.00337800791657534 4.06202711254284e-05 0.000294629027590001 0.0125748801868293 0.00160385690432491 0.013774525593255 0.00763455369714586 0.00140508871329317 0.00905715838692384 0.000531108328487451 0.020304487989712 0.0054980577964025 0.00693700144057845 0.00725558741339839 0.0207393483626811 0.014874688540669 0.00785119816382998 0.0377202190783598 0.00736592249674986 0.000122290538804765 0.000600285094570157 0.00727702892503399 0.00652277317371822 0.005362261726051 0.00618707842386777 0.000275399986019101 0.00353908481200573 0.000456026002095015 0.00125648945415275 0.0147720880688625 0.00559723875620732 0.00473708604156373 0.00314889019106395 0.00123022061647403 0.00207405457821821 0.0143164573050334 0.00582042336380048 0.00418682101024963 0.00718324602697084 0.000353883304447762 0.00548117876222461 0.0015617404795403 0.0181175168418989 0.00887253866160251 0.00264861609050353 0.00433280097293539 0.00263042726526646 0.000457815313806605 0.024856926146447 0.124633581091166 0.0130927978575078 0.00629524842960314 9.57719603041513e-05 0.00227973506727857 0.0101084997289112 0.0181987334658972 0.0238703483943847
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
13 A[C>T]T 0.00946812833634737 0.0018560294199268 0.0121645323717918 0.00427344989681243 0.0220861085159969 0.021298316936951 0.00743563125445683 0.0108616133433018 0.0074938561562468 0.032910839703723 0.0125544115484033 0.00651794493402053 0.00298227404923781 0.00787938693394555 0.00616951081579087 0.00250933063761106 0.109952151883253 0.00239076977088896 0.00031732090904591 0.0161807583063727 0.00178307605441038 0.0060328458973634 0.000737685558024193 0.00014688215696506 0.00799577229360196 0.0370629351444772 0.0131046803702014 4.18741553951635e-05 0.000619446238542083 0.0353835654733708 0.00920235870612394 0.00574828787390334 0.00280120160335329 0.00450801497069608 0.00506864703916149 0.00183784216005405 0.0294585305940534 0.0101688913721702 0.152473644137015 0.00307404746692094 0.00390373103441419 0.000906630127576214 0.00431787463260081 0.005666763466024 0.00245847697536415 0.0128470203275992 0.0169667018512658 0.00637717957891486 0.0355089364325089 0.000912217670395111 0.0304653765490186 0.00122855461955475 0.00681585629459633 0.0025021601027248 0.000232553866113164 0.000416802476714945 0.00693721137841327 0.00320858964043685 0.00175790325666279 0.00195162214669891 0.00501100193691314 0.000778183693986533 0.00284015269974843 0.0154299599155551 0.00731497005804573 0.00341379011952063 0.000298511440053373 0.0547648842176043 0.00458237396764145 0.00459463753905769 0.0106658666061412 0 0.0297418433526406 0.00065234040906142 0.0023171948923522 0.016541309041923 0.00653690622118176 0.0166059516342956
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
14 A[T>A]A 0.00078381163610561 9.48666602243016e-05 0.00547148843052349 0.00938995869583773 0.007344732367776 9.73419994045933e-05 0.0019272531382518 0.00248252152490266 0.0123154002949688 8.8159256510135e-05 0.0194152976169594 0.0126442421336871 5.01311206493012e-05 0.0017927251914975 0.0039938571570907 0.00188869978037514 0.000417000315032316 0.00514842552285569 2.19607737098627e-16 0.00061074027733891 0.00202583059382285 0.0230253401146335 0.00100218583421313 6.20082011390074e-05 0.00247642132964036 0.000784761393453593 0.000510654394011762 0.00344436523281768 0.0637010892781995 8.29825885678988e-18 0.00157528175677483 0.0202879024291499 0.0015128882279558 0.142648255784129 0.000170802047458607 0.000616269766054594 0.000361803844684707 0.00784508896539003 0.000709028699651541 0.000861618492767971 0.102998106226864 0.00488336952937667 0.0024232916032434 0.00223713528767991 0.00198770755316677 0.00528335819372953 0.0060710477859899 0.00742705844618275 0.0133005541176504 0.0152044814036216 0.00476447344885323 0.000524103469455352 0.00268286221692426 0.137473163566749 0.000647474590736777 0.000128438432652025 0.00532680398084927 0.112322234549333 0.00175258327103395 0.00587397907743055 0.000951710826735051 0.00423499690102677 5.00654150713513e-06 0.00325792448292634 0.0243043691463942 0.00199659604820731 0.00394237847429266 0.0015607522257325 0.111346738843615 0.00183952297719867 0.00977827511724622 0.0476616463794535 0.0114571084127017 0.0613587754150842 0.000212575391471857 0.0100389763312479 0.0103675837845293 0.0104943351743238
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
15 A[T>A]C 0.00220131415270956 0.000875074368898528 0.00723975465288627 0.00354521785330032 0.00694877566789748 0.000545301711163398 0.000670605757085524 0.000469100611876726 0.00342222371595458 0.00107905941055921 0.0213670461234536 0.0028287439259023 0.000193266520071015 0.000334447286984181 0.0136554276668181 0.00318484725162048 0.000444318463682 0.00271899635623067 6.49826924028379e-05 0.000373417331006569 0.000841442409446559 0.00777303240060496 0.000996729902283197 0.00028842180163688 0.000879782153423284 0.000256513783977942 0.00522551350062126 0.00566678830643069 0.00704075872058155 5.61418702443501e-18 0.00226015965274144 0.0089076713292278 0.00352989154729524 0.00146736693024777 0.000478242276827957 0.00200616039185069 0.000394652216301763 0.00610406937914091 0.000888696250467099 0.00114013317025134 0.0447332475439112 0.00740532268294079 0.00143089356896988 0.00166292729331996 0.00195234509072755 0.0028871108925047 0.00445217502984603 0.0043132230044421 0.00404033996579114 0.00378466482613102 0.00261105371102371 0.000499884376197333 0.00180203222666177 0.00718633247567602 0.000262915308500877 7.80441449865792e-05 0.00394505980211137 0.00135199941274254 0.00117717992164807 0.00260238955839959 0.00319958199245012 0.00061899539205231 0.00428508240705244 0.00643477825821845 0.00145923946784922 0.00251452329516659 0.00022311466375664 0.000400044821558957 0.013089266793533 0.00381154778586595 0.000691354424721244 0.0237208500470542 0.00307488166657553 0.000356805378449904 0.000168378959693381 0.00360328366548472 0.00580668743702756 0.00563444568617566
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
16 A[T>A]G 0.00111728056139953 2.52331144101491e-05 0.00961049698369561 0.0123643171487896 0.00907925311827972 2.20129081319081e-16 0.000583325289017739 0.00155580064096241 0.000209625916663914 0.00367031682073874 0.0227080561753272 0.00274874110524235 2.2056672199249e-16 2.30565255420727e-05 0.00122245593278182 0.000655356033312108 3.93123087970585e-05 0.0031079509606343 0.000583824540399692 0.000352805235694251 0.000536416823365478 0.00878426956449829 0.000198514646019871 6.50992283961348e-05 0.00258662939629398 0.000950796783927343 0.000302889678081424 0.000246956494006603 0.0604302369049086 0.000354891481800625 0.00199465056462219 0.00620765027619678 0.000622270116230185 0.00122735787013044 0.000150988505169337 0.00246983286782249 0.000636096349610561 0.00502202631475941 0.00070825549143058 0.000691098894177534 0.0346101742456373 0.00132861160916794 0.00251346038334493 0.00247653659206447 0.00107909291012626 0.00690733750272658 0.00689926335502061 0.00301756278223067 0.0050117741473742 0.00142151645222587 1.07682825371203e-06 0.00212702701937899 0.000496981567488282 0.00742387729848524 0.000456317809629209 0.000240025841809153 0.000569629168787996 0.0365907054047674 0.00117865859899165 0.00286308781900571 0.00421233746795376 0.00805497484872055 0.000508744210630977 0.00576276401043808 0.00465400433244696 0.00218695576326328 0.000349660153295492 7.07501913305084e-05 0.0210172126134998 0.00198589537163983 0.00379844245758517 0.000574416072913787 0.0106190788913228 0.000354251437420513 0.000158247862066431 0.00699090299730233 0.00529563773597601 0.00401851170540126
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
17 A[T>A]T 0.000179455599598813 2.20792375685429e-16 0.00609478732997757 0.00420028810063082 0.00617583249118727 0.00164695247679033 0.0036888852531921 0.00827241686311701 0.0503986625714675 0.0407936142501651 0.0249134374949811 0.0188336758793869 0.006591099805114 0.0028097740570969 0.0713720311105962 0.0220054397746696 3.40301176189128e-06 0.0028107175465514 0.000600000333259913 0.00184481160044234 0.00948212197839832 0.0109741518257995 0.0014499864598697 0.000627570780038486 0.00780414727584747 0.000653547318318845 0.025605327998176 0.00159417974083247 0.00250440133779996 0.000161497841595752 0.00179621312995545 0.0148312396863771 0.00305834050159412 0.00253599474867876 0.00168965388763028 0.00195308205308782 0.00048881760356036 0.00415578300368906 0.000840041876608072 0.00503717977286065 0.316273862587975 0.00736652085623819 0.00305167606640317 0.00275659969791507 0.00271927118491045 0.00609468355683214 0.0106586401223788 0.0693539911510293 0.00685634827883605 0.00425704415673393 0.0307271256246864 0.000604501399874383 0.00198906422274604 0.0674015278889781 0.00066277599762697 0.00035277090069528 0.0023971939531572 0.0293490137884403 0.0011793333009989 0.00462149296763151 0.000299914745218814 0.00390044151077806 0.0287758821289768 0.0062730786685227 0.00870767210344226 0.00279770840702785 0.000723574732021541 0.0106514273352576 0.0700286229026528 0.00723267350875071 0.00415937826340857 0.0425311246340856 0.00442955628376154 0.0234864575691609 0.000369511045684665 0.00915920890840612 0.0132294744724966 0.0158781987417855
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
18 A[T>C]A 0.0010679433541939 6.10351713851867e-05 0.0164443641354531 0.00792464667005413 0.0459792188877034 0.00219069061796488 0.000486780431826485 0.00101693652827338 0.000286035103625082 0.00432367107293801 0.00972756193424069 0.0202108752215629 0.000736640727489732 0.00920987941785801 0.0181037715982298 0.00517295641667888 0.00114000086123943 0.0732928662441351 0.00188941791828098 0.0125535521932631 0.00386298088724064 0.241217848819971 9.57533990114523e-05 9.63801592783615e-05 0.00200898437183676 0.002585918586571 0.0106927632405595 0.0166245373953917 0.0249221789038338 0.000887953785883555 0.00638088812870817 0.0205862539354608 0.0844032379806922 0.00503757826370525 0.000545176302644044 0.00195135499429242 0.000608986636645607 0.0203612996048291 0.000930786623946482 0.0124081004142853 0.00461991505600105 0.00203723391409579 0.00521404955615897 0.0728808962608613 0.00278678596650015 0.0111438063596555 0.018611244852133 0.0143364130864653 0.0116004832905823 8.82456175582744e-06 0.0192373091135706 0.00136766048219778 0.0183825744492959 0.00281919603546303 0.00107912431789463 0.000610331466788303 0.00261371165478238 0.00257446537595374 0.00371310015049565 0.0112692637648498 0.0290689917789366 0.00432446866654142 0.0123924294731067 0.0264209729408051 0.079857212909581 0.00993306533983139 0.0012810247435359 0 0.0294316925311298 0.00359482035290846 0.00910446322992953 0.110827683450069 0.0157012447094759 0.00571244766469416 0.000296095148646737 0.0888953590269449 0.0342924152310278 0.0135944467781244
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
19 A[T>C]C 0.00300089462970272 2.14283586917066e-05 0.00779202442529785 0.00071808236971947 0.0134363050432649 0.00112855482347004 0.000227205234117036 0.000458051132796118 0.000533346561580056 0.00392657729953493 0.00502577000368558 0.0105325571709128 0.00360631341575812 0.000506136843803953 0.00908824836754239 0.00322615081965093 0.000945058319577588 0.0404337834524339 0.000141526722717837 0.00632400318640156 0.00196103106125477 0.0129550540010083 0.0126965594373085 0.00025149582703285 0.00209424225587091 0.000597526226207442 0.00458113418647914 0.0100297138166915 0.00090294466330996 0.000179734764451337 0.00218984357465615 0.00951888387262813 0.0261733435751152 0.0018593348088756 0.000441223523182278 0.00229705364866905 0.000459925483629027 0.0074415343337138 0.000702340554202297 0.0037504380600373 0.00123923185763538 0.000826055696018259 0.00169105603605531 0.0384677157008956 0.00165043605607896 0.0056539254978217 0.0073601271889797 0.00580780492923715 0.00353655692766257 0.0313386267348945 0.00325377462450647 0.000420425893864155 0.0478539669080181 0.00569085267277695 0.000186808245513781 8.16554421839016e-05 0.00929191750345014 0.0193285841969859 0.00187550699381218 0.00371769936914227 0.00777327913526285 3.3654118402844e-06 0.00615293884089581 0.00966717853411979 0.00492743190171005 0.00262516232015392 0.000277142429868114 0.000325233628770648 0.0204699346981987 0.00207072797945779 0.00310473910515825 0.0457060282861737 0.00346150822609556 0.000186159459317489 0.000148072214934008 0.00465691889663816 0.00330187688427074 0.00517757631994121
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
20 A[T>C]G 0.000103887490796799 1.30618474593714e-05 0.0122623561099021 0.00498561175354419 0.0380293277541979 0.00420426713870676 0.000185829351015873 0.00149596215477155 0.00106303189967009 0.00911627340069973 0.00695185228525369 0.0142416658713643 0.00211664926037636 0.000523205771916264 0.016837866122547 0.0084898857480525 0.000320100224301749 0.070227738052794 0.000423520175069607 0.0123581494988947 0.000238407477051324 0.0637133740262703 0.000373207534517357 2.20960851329346e-16 0.00206930351703518 0.0023070804315884 0.0185932277634142 0.00386367418042589 0.00772828937315251 0.00047118360578049 0.00175529249686752 0.0197968334128711 0.0781571265985111 0.00567777746426194 0.000402304898641981 0.00273872596230317 0.000276173493482955 0.0081071279673651 0.00108426753603838 0.0728831305066537 1.95057340401713e-05 0.000919039609349254 0.00381489639211247 0.0167091625488687 0.00216817742127221 0.00959463019110723 0.0154312528142597 0.00800699827364175 0.00856303127774913 0.000582523525177872 0.027120118982377 0.00206711076531198 0.0327013871407289 0.00208267161796432 0.000279678657514676 0.000199191569966102 0.00112335246200774 0.00392753495513128 0.00259502985660347 0.00823013049017319 0.201156541022851 0.00399765418417983 0.00947077429147337 0.0102338740185366 0.00669819386866032 0.00351510698022225 3.49660153295492e-06 1.1491909608769e-05 0.00504930741022427 0.00350730972360522 0.000961835918346007 0.00631857680205166 0.0146195056832987 0.000107815480880674 0.000603163995897315 0.0399928450066904 0.00626699691211324 0.00282146722183812
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
21 A[T>C]T 0.00562882591091358 0.000153465552606464 0.0172569264825878 0.00155640129144515 0.0381507071633021 0.000498054303222136 0.000611499846553408 0.00214543983784096 0.00263424962158558 0.0506198133031246 0.0148484087470088 0.0288982328308053 0.00332523954131878 0.000147882845110363 0.0127069362710698 0.00564082795654287 0.00119105411666195 0.0635899927198509 0.000949505477881611 0.00595325689440044 0.000923363869804197 0.135680422573521 0.0077365715906746 0.000539334130080469 0.00422061026142771 0.00173879561754556 0.000103021436867661 0.0255068758533195 0.00075331594025457 0.000261807059978206 0.00243486668727293 0.0144330856008368 0.0370587187815313 0.00258591590514881 0.000591378860670595 0.00114594100053623 0.000543684885592646 0.00846141395222267 0.000607139271008203 0.0091503798240723 0.00234202796979703 0.00202904170124336 0.00508944021497858 0.0477677925992503 0.00348906486593289 0.0135437412374048 0.0193250110630046 0.0176374374047876 0.00270250224129304 0.00875280106992024 0.000266368264343872 0.00145879676663901 0.0304326826080144 0.00129618322863419 0.0010898983072088 0.000480326480607697 0.00489385653507611 0.00186042900964011 0.00487589902597866 0.00716680766902684 0.00780176895369874 0.0136316450759335 0.0123041702896315 0.0177952627839233 0.00810200733912073 0.010791160998536 3.60793444675576e-05 0.00938092640637398 0.0590151507242904 0.00445286125159185 0.00551353465014996 0.168975009758159 0.011761820438793 0.00286645740803545 0.000232478801143227 0.0294959918532039 0.0106389568155469 0.022891460534442
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
22 A[T>G]A 0.000168519501762706 0.000235435507126004 0.00393668111121453 0.00104665144698828 0.00384155378585574 2.54754519826685e-05 0.000469892131130464 8.41465127316404e-05 0.0118188115733975 0.00366917040593363 0.00163287631240069 0.0449019937188417 0.00189845663997353 3.41799802994303e-05 0.00250281658238164 0.006876619609547 0.000218000164693154 0.00200161224389554 6.07383561164671e-05 0.000211218497219982 0.000464749371524065 0.0111638012677011 0.000844415985064724 0.00139667034514378 0.0007170681842051 0.0023263283037492 1.0492898507091e-05 0.000390228662215183 0.00232274707383732 8.29825885678988e-18 0.00320041420205519 0.00525098651107407 0.0029063379115993 0.00113719588527208 0.00980125702567707 0.000405204838100516 3.88714874454643e-05 0.00367301875224368 0.000383850039362545 0.000971802424446825 0.00281994815106558 0.00304586443038831 0.00108253600308824 0.0215759269967351 0.00114867521916673 0.00386053291745208 0.00719568450700115 0.00749674934313084 0.00120004999557748 0.00261358079029574 2.39220424210203e-08 0.000116800201764336 9.93652672934913e-05 0.000170347180941406 0.000507188429410475 0.000195146765889898 0.000738398387643845 0.000718663500700598 0.00171297686942866 0.00457751510448323 3.85263692412619e-05 0.000260462250720426 0.000119958717299674 0.00701248379556707 0.0133922034071968 0.00178695346314555 0.0248260609212384 0.000127008873538445 0.0237291142855688 0.00475994117350466 0.00785959082814212 0.00803931417086094 0.00521091830266489 0.00543529430904284 0.00235831462461193 0.0020628679376184 0.0253712806960615 0.00370885093045136
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
23 A[T>G]C 0.000204337233009363 7.43514213209911e-05 0.00261072983321836 0.000159685450049505 0.00260704426212603 0.000203739100874237 0.000247223316418096 0.000936192227556977 0.00105068271981062 0.00265768336304399 0.000670102667158077 0.00695148773280245 0.0012353117777735 5.28962623034327e-05 0.000979805198096043 0.000613296635911616 4.70514110066879e-05 0.000666204273260946 2.21260087629294e-16 0.00298131578787503 0.000415218311439147 0.0044288207863912 0.000699810362686298 0.00447103692502844 0.000859741557673323 0.00190121981066004 2.14457490487924e-05 0.000438298493789418 5.11233407813982e-05 5.48292006163347e-18 0.00140632156170579 0 0.00253710954961845 0.000963838963087402 0.017308768596493 0.000819516520071009 0.000110462452399985 0.00249391961454192 0.00042982039622366 0.000302035278435004 0.000465467575794752 0.000971948602135979 0.000623389296131633 0.0106186923549347 0.00107680889024664 0.00297733310789547 0.00706933197306633 0.00164504319239187 0.000408064260884143 0.00407502270961727 3.2738596530528e-05 0.000587389287121211 0.000800903211849676 0.00172632567851435 4.05245400320899e-05 8.3059835538416e-05 0.000607779517736448 0.00409605748008664 0.000527735744535448 0.00291387247851691 0.00158474593983423 0.000921481813411204 7.98084112642168e-18 0.000789586321265064 0.000787589521003553 0.00156906253618396 0.0105053989661199 0.00127921825343691 0.0034449247359194 7.33240725142242e-05 0.000670340945237471 0.00520701542380416 0.0013032963970209 4.65527121687694e-05 0.00013092076990465 0.000360484020288742 0.00240039011284288 0.000921605345604726
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
24 A[T>G]G 0.000262658938995679 2.0285444917963e-06 0.00628071898312057 0.00141591373800655 0.00790452519288826 0.000106098250906043 0.000274272197221288 0.00146604291167612 0.000600066605047414 0.0105149617026569 0.00475076438404873 0.00530825727932672 0.000316508300617026 0.000515323199081367 0.00103231984921954 0.000932459232310535 0.000179056062968791 0.000804879607754009 8.16364823440247e-05 0.000706607096348091 0.000183772430227062 0.00460650685448151 0.000713660152441437 0.00098094727720203 0.001979766345625 0.00176776292810021 2.68902057438624e-05 0.000186213162819495 0.00294173595494192 5.69430400177274e-18 0.00205449008156085 0.00710298445064824 0.00227999770586739 6.75545754535209e-05 0.00762889289276645 0.000418278146969939 0.000408776651003652 0.0040136273927103 0.00126332089061354 0.000471655136112541 0.000197057928508397 0.00447532331509202 0.000929880995577414 0.0167091625488687 0.00206826141107533 0.00762394888629475 0.00802425146341502 0.00268891733070059 0.000637225575225023 0.034692953973904 7.44806208817485e-06 0.000982626566699025 0.0015903410159625 0.00366709643737258 0.000344446346623339 0.000125490689078644 0.00391682185868186 0.0276418915829492 0.00117865859899165 0.00504781336730622 0.00114519812958553 0.144193994205491 1.25946422514882e-05 0.0012221034022136 0.00268920079763992 0.00169763689385733 0.0259265056846941 0.000952028764553446 0.00446636588834976 0.00171491491397813 0.00265635989943733 0.00229766429165515 0.00508575403585976 0.000231033459150594 0.00120562667228474 0.00123469165880165 0.00511764578066931 0.00207173714912402
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
25 A[T>G]T 0.000109830749481241 3.72277727613099e-06 0.00396011549918346 0.00021550171727702 0.00481117273103783 0.000382966057856065 0.000307241386317078 0.000731445302854617 2.20680534336604e-16 0.0141933986320526 0.000737437749851441 0.0238161298157326 0.00912461564611879 2.18866610763338e-16 0.0129822459330592 0.00482101312308981 0.000285252456511475 0.00127578668779638 0.000316831859147149 0.0110688696026541 0.0036079772307742 0.0079412953212149 0.0124142676358707 0.0685073315966183 0.00183158558514788 0.00161887867840448 5.82121128708532e-05 6.92471824924106e-05 4.17067633147563e-05 7.45297492581637e-18 0.00470009102338341 0 0.00590747855845378 0.000255596321126678 0.11430011592793 0.0008071410525516 0.000792084035156992 0.000782206272088589 6.4197513082015e-18 0.000753093149473051 0.00115099665182333 0.00262875846023154 0.000978126791316196 0.0245805099416976 0.00285923367236908 0.00639344255471607 0.0179304226357775 0.00758310161866857 0.000911844274747394 0.0056097497766307 0.00141664020737191 0.00016586319401512 0.000596719266823812 0.00805627729797252 0.000195396183004099 0.000125562523976286 0.000102452687624561 0.00211909828370772 0.00184332768055291 0.00205621501367622 0.00033877413081195 0.00226862414402398 0.00570556283591781 0.00593506809050404 0.00206521755703077 0.0034371846143485 0.0163003098971886 0.00176474393583315 0.00316684790295766 0.00112450017285147 0.00214979990125297 0.00747168452843603 0.00397721870921375 0.00204967076449517 0.00021145927643877 0.00353270261821364 0.0079348802364147 0.00228503153166586
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
26 C[C>A]A 0.00030502624638518 0.000205314317697578 0.0223756961412788 0.0802688813720344 0.00737852110914031 0.00180020125217332 0.000451034045542104 0.00113412108279433 0.000108022504498183 0.01434812187619 0.0398395762397846 0.00476860354309263 0.00313752699107907 0.000512083701506006 0.0172819036294265 0.00990199163417092 0.000616665568136236 0.00538572376899194 0.00138192220412928 0.0162048340802795 0.0414200040189608 0.0103439951982173 0.00029208536613245 0.000267858225331325 0.0734374867262265 0.00131507315259792 0.0374934077426348 2.20519484890833e-16 0.00182036294784901 0.000151006097983349 0.0252694488704786 0.0146868815523791 0.00140037150513469 0.00504660466076144 0.00201150705564858 0.0538443819505899 0.000763815855594349 0.0106566328020618 0.00123042987358243 0.00267436048923122 0.0019457521684884 0.0297949605725662 0.0552981938891716 0.00319467364276483 0.379739071463438 0.0100276185466537 0.0206565623425018 0.00236437232875474 0.0115754259137199 0.00657437702453733 2.8246604645296e-05 0.237080363883106 0.0154674991324114 0.024453151830854 0.00115510562409663 0.227510615866651 0.0223123513909777 0.00692314791846033 0.0567124206698991 0.33237202582103 6.27805466264819e-05 0.00619989610646792 0.00245334723560035 0.00862278026556522 0.00611741072860474 0.00222139592793258 0.00116925897528693 0 0.00423554885380427 0.00607588062560516 0.00843649587467188 0 0.0244917364331311 0.00118304191879661 0.00807132543809265 0.0184495349942586 0.00645583846048336 0.0795217833964244
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
27 C[C>A]C 0.00173825872471949 9.34388688604433e-05 0.024991557884713 0.0787427844376687 0.00605658270412868 0.00401838690605083 0.000236313177974284 0.00153166941832463 0.00304176034794298 0.00316491242260677 0.0382896003886823 0.001894654296248 0.000197965946461223 0.00310462478778305 0.00952237512741357 0.0145992049474909 0.000977275273030938 0.00422442231350393 0.000949095003583006 0.0194536895515796 0.00497054492682487 0.00892116335552276 0.00114083948146752 4.03511845744975e-05 0.0193206141617684 0.000759014573984962 0.0979585012931139 0.00256534697289677 0.0043771294852436 0.000625801872333874 0.0344878603181427 0.0077082075618903 0.00148963500853605 0.00220482923442961 0.000107282970713144 0.0364121435704463 0.000383299228825728 0.0114755361001908 0.00484930002843851 0.00187917973777571 3.63745598249066e-05 0.032663621705034 0.0198841434659525 0.000802183643350484 0.0688056154027775 0.00893477045307675 0.0145007617938357 0.000906845271508928 0.0325110955673593 8.07669533029205e-05 0.029934314028234 0.149408169831582 0.00709098830231037 0.00520342288958417 3.47125627418919e-05 0.028223507649841 0.00284668515161348 0.00312310237701534 0.0186465574624431 0.00350901416143512 0.00253582867398383 0.00369499991609469 0.00656390932194889 0.00387885065765433 0.00179932256158975 0.0058675199143534 0.000249016426587415 0.00516713770905841 0.000302135781186393 0.00310998502028012 0.00591506688901035 0 0.0143121306270885 0.000442574439616685 0.00448226979355107 0.0137866296876586 0.00473231962106865 0.0751033837566999
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
28 C[C>A]G 9.19544820464989e-05 2.2214428150603e-16 0.00251908100337676 0.0245931486072583 0.00346761587777843 0.00164705457389517 2.23088490673349e-16 0.000409627504158682 0.00191027321049198 8.498279071593e-05 0.00341899991854442 0.00137355141503852 4.62011413966183e-05 8.31230791432932e-05 0.00240568835892046 0.00101852104407706 9.26453072669708e-06 0.00117328906708923 4.31338108329658e-06 0.00138455574000147 6.62012543170414e-05 0.00174654022727639 2.21827370404397e-16 2.22441048268914e-16 0.0120182630528982 0.000237280668469444 0.00747704952819194 0.00198487681526093 0.000136527513132735 0.000131200431762527 0.0160641003998816 0.00128189431159794 0.000362833264903189 0.000267206695051481 2.21999946885344e-16 0.014838062597311 0.000408503923719535 0.000330678908515541 1.66233153409346e-05 0.00037085528000566 0.000300084490199296 0.00221242563186149 0.00710083580522425 0.000747938006620971 0.0512985226830781 0.00575125597258988 0.00254567409679789 0.000261669914200943 0.00189326415920859 2.56186014171613e-05 0.00375399670646207 0.0682594486613175 0.00450279722220483 0.000271858803988842 0.135342636383229 0.516354286335259 5.18402343651273e-18 0.00430418587015406 0.0135606208835395 0.0679893735705468 0.00594479771796719 0.000641707031175497 6.70889487254202e-18 0.00107025241854549 0.00145849987034586 0.00081931912186856 0.000379002686727051 6.96145554247606e-05 0.000157635099423908 0.000555536827332714 0.0199054287554481 0 0.00329593291412406 0.000217538731175894 0.00231339887112555 0.00530161948490604 0.00151213869652868 0.0062504649396934
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
29 C[C>A]T 2.18022097545941e-16 0.000415576547930377 0.0153153805568239 0.0686334453739113 0.00644522734929124 0.00949585203217325 0.000368768572780014 0.00148236064040474 0.0133793355814805 0.000115777975363186 0.0327866701698049 0.00304007599691614 0.0170694484315435 0.0081876876343525 0.04449984763278 0.0183619559184573 0.000149680600957248 0.00109307637455717 2.19139954870867e-16 0.258489773751404 0.0284399472029193 0.00247666548725803 0.000135650495389082 0.000179895424856254 0.0360251456145823 3.42726319545804e-05 0.251293146846734 0.0189731917686133 0.000109424007654134 0.000580040830794875 0.0170126198585227 0.0125040717266269 0.00709145576834455 0.00308578776755528 0.000201156742643552 0.0515610201931592 0.000295390778118642 0.0277877550055561 0.00264947287231305 0.00250605003990518 0.000618667974764856 0.0822126428433912 0.059957726506337 0.00175613107352768 0.183396551699037 0.00598696580211062 0.0145990663384395 0.00263267845313609 0.0210559325111637 5.17636169711397e-18 0.0862343001163157 0.193256180612711 0.00822974973324275 0.000677949189925564 0.000827197920931677 0.0486827718769105 0.00114044329786625 0.00502885578849213 0.018575357281454 0.00489616600581465 0.0054934626985965 2.8173173435824e-05 0.0705358499323007 0.00813737364036397 0.00194020791007514 0.00201226656864113 5.36091602327276e-05 0.00562265013742515 0.000855085589325984 0.00329290207012752 0.00481666155882927 0 0.0166122911008274 0.00101406565152565 0.00319233657734877 0.0124753068141394 0.00999642179406317 0.0397036748007002
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
30 C[C>G]A 2.35613222368039e-05 2.20120638685384e-16 0.0191933749122969 0.00778817027438698 0.0069117775127344 4.0652896408969e-05 2.2105624649646e-16 0.000455638119227898 0.000204152623180054 0.00130617385355661 0.00496752820944945 0.000887158950829523 4.5089617450413e-05 2.93882968810548e-05 0.000109247077599155 8.09050923708854e-05 0.00026043642926142 0.0013315258026659 0.00553755968940376 8.50008168014664e-05 8.28400080379215e-05 0.00353088297631456 0.000547536296512695 0.000191750906694749 0.000608340261664552 0.00176339354552903 7.66819961544843e-05 1.95686209565288e-05 0.00104447054384779 0.000174007026815249 0.00259658510047043 0.00714496940386009 0.000361514346006403 0.00470817357897468 1.42688185228274e-05 0.00326841359072769 0.00126308090703753 0.00204169133123615 0.00114112447953209 0.00148575582735068 0.000118740773359036 0.00384643972609049 0.0012288487530927 0.000438523524876415 0.00168440690491656 0.028593605360755 0.00750786592833241 0.00206634220328145 0.00425097537865923 2.07246575886622e-05 5.33104932742207e-05 0.00142447445526405 0.000495753177320878 0.000950293217491721 9.72050749769456e-05 0.000214595166057627 6.50529000554727e-05 0.00282678675753753 0.00116586509391082 0.00270674224620719 0.00112250027987222 0.00291643112848251 0.000201807595186481 0.000880118261588726 0.000785958595228505 0.00207197467717478 4.66712692678088e-05 7.097404857483e-06 0.00121571133904896 0.0210784707761629 0.00667003215182793 0.0045839703020037 0.01531305396056 0.000338011406542304 6.54148109416719e-05 0.00239649467674818 0.00335589024582517 0.00914931055959554
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
31 C[C>G]C 7.45800391388028e-05 0.000344145256768264 0.0139281014298204 0.00678748969995965 0.00894677607922593 3.65486535220271e-05 0.000128987609644297 0.000948646865542995 0.00222471792438548 0.00028110712821911 0.00538817572479911 0.00151967063344892 2.18546564657687e-16 2.16737956882968e-16 0.000204404680258932 0.000122755258799369 0.000175433796477156 0.000879429972273833 0.000635344589175401 7.76172588200078e-05 1.67325274764402e-05 0.00448528035814766 0.000231118343228333 4.57509781306954e-05 0.00222778510232635 0.00179115564395408 4.33830369730878e-06 0.000269361432154162 0.000775631297046552 0.000253300757849425 0.00515835618512049 0.0045342397422884 0.000317657266720932 0.00124577795308578 7.43106815490126e-05 0.00625617859719863 0.000783392496027841 0.00184004285744438 0.00081215919175474 0.00040338413219269 0.000116953625595067 0.00623578232550649 0.00134857804694826 0.000308456364089313 0.00124741115694244 0.0371789013334429 0.00922327365798394 0.00118412875496269 0.00656169062975363 0.000208812123173405 2.45994857855785e-05 0.000791566462683877 0.000295457845929599 0.000234005925015456 0.000118625564552124 0.000252629998544031 0.000284668515161348 0.000118224695659886 0.000819467130586318 0.00596038180097289 0.000871259423785107 0.00281805326934155 0.000221089760095584 0.0028254572049411 0.00125854255674037 0.00171177225157359 0.000139764160377127 0.00340687358330981 0.000207365573347183 0.0583345446723673 0.00326991446854238 0.00113831006133139 0.0104704742327037 7.63269593965305e-05 0.000197767063078655 0.00391426904056853 0.00316598206952061 0.0148980714411638
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
32 C[C>G]G 0.000347295897858022 4.85131233602853e-05 0.00150542689444827 0.00341292674549708 0.00249548079065557 8.41495155026445e-05 7.75307534851325e-05 0.000794155283797839 0.000262037477041307 0.00131818194765015 1.05277123591544e-05 0.000438132823629076 2.0013856510173e-05 2.20206725176744e-16 0.000180303665429856 2.89949348998018e-05 1.12785591455442e-05 0.000173486332142254 0.000486127013544741 1.91630540826291e-05 5.02009511588441e-05 0.00146548777691007 0.000231819594296487 2.22441048268914e-16 0.00358544847744795 4.83610175990688e-05 0.00018919048604308 1.01248766839068e-05 0.000239927026755321 1.87717540829462e-18 0.000948785929868007 0.000825219463091178 4.17959865924393e-05 0.000362637657569867 2.21999946885344e-16 0.00130334333625029 0.000120443417312885 0.000858358017848852 0.000537754237233848 0.000317875954290566 0.00019132903737539 0.000874913772599772 0.000419049324280136 0.000321403079150377 0.000962601690347171 0.012324119941264 0.00168375294591356 0.000412054922362404 0.000473316039802147 0.00254184560935897 7.70874189990073e-18 0.000646403910003346 0.000100062160493441 0.000672123242334038 3.5860859129279e-05 0.000238625864364644 0.00142110294977762 0.00203197612009598 0.000566355342783121 0.00162692444880777 0.00043508300330485 0.000264291195367131 6.64899402546575e-05 0.000763179995654398 5.10474954621051e-05 0.000693656679864179 0.000337002388989488 2.2131795077236e-06 4.02966545008558e-05 0.00316406956446626 0.0855484726114462 0 0.00417751983340345 1.55097058338369e-05 5.31214589111178e-05 0.00160694767192337 0.000777628847421837 0.00185022810953381
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
33 C[C>G]T 2.18022097545941e-16 6.27806851505273e-05 0.0221774666504659 0.00678376952826196 0.00946425526020733 1.42437780482599e-05 9.47695579509928e-05 0.000885436892590748 0.00420210243447981 2.19681286586558e-16 0.00545450967370389 0.00301027133027971 2.96988669242462e-05 2.18207281491748e-16 0.000236210654680981 0.000228466112305321 9.61947328818582e-06 0.00155018104028108 0.0063175482485295 0.000176966075875962 8.37343393256682e-05 0.0095684827258724 3.86158344538264e-05 0.000190768225259654 0.00376130308207347 0.00320807775853922 1.00716697744128e-05 0.00017185142282566 0.000318324385902936 0.000227015980328339 0.0046859321364703 0.000194507782414196 0.000620750680002149 0.000266771329582199 2.19984221019056e-16 0.00664630491507196 0.00101447337939736 0.00340624093616495 0.000491194408911969 0.000655733251548312 7.34418757140216e-05 0.0161435735037932 0.00207126691567346 0.000576447544474342 0.00126583489487922 0.0399131053474041 0.0138045593268237 0.00499712174312246 0.00682571461499333 0.00084586906659736 8.59359115345984e-05 0.0019026768297437 0.00148730416865833 0.000136186274222584 0.000239838450447646 0.000189763457724283 0.000507745190006543 0.002588819252064 0.00118566110307153 0.000505539091657285 0.00132121254776371 0.00328356352368231 0.000760758325356791 0.00284461173542565 0.00123737749367037 0.00344675362747441 0.00014467536772603 0.013266413752677 0.000480841925517052 0.0399696280056237 0.00947508785889972 0.00286506742462223 0.0157187415466307 0.000291927884744434 9.91794383612022e-05 0.00533699774096293 0.00601230938091484 0.00850849635305254
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
34 C[C>T]A 0.00195529645118705 0.00426422044448814 0.016011053683315 0.0126321535740376 0.0192655867452654 0.0134520533129435 0.0495641808288027 0.106448206893853 0.0026856971301842 0.0352271130201629 0.00265266006384601 0.00719264367749804 3.63084884502231e-05 0.000148415813680243 0.00372858843134685 0.000898461425285756 0.00406121175131793 0.00654832465639426 1.90507846712108e-05 0.00271406116804682 0.01070181922021 0.0071313889972325 0.000812888425744885 0.000451701878141755 0.011611062090498 0.118555837241782 0.0105699500551045 0.00134099686757939 0.00120362796005317 0.0622025118845316 0.00535234783162105 0.0141907031215555 0.00167845946360116 0.017319708303205 0.000289339931157332 0.00756006912627286 0.109400708483566 0.0410330160228923 0.0167695684383411 0.00454641283169308 0.00473965271811279 0.00508208357592267 0.00668929764788366 0.00358160616471461 0.00422596761943563 0.0090447133623777 0.0194648375919729 0.00686462722340137 0.018660384878152 7.5560713313687e-06 0.00355071755576432 0.00213173100298255 0.0281587804718259 0.000858842405766578 1.78160358970837e-05 0.00046694318540317 0.00380797463739352 0.00320369165854252 0.0032308295399054 0.0145288370568474 0.00334763357802601 0.00719187948350278 0.000294797369439074 0.014767750109991 0.00800806679521235 0.00285892659783251 0.00150616410375944 0.0179709181788391 0.00162598666305415 0.00351930391986214 0.00826466049857428 0 0.0093754132456672 0.000614567100939891 0.0360785456933908 0.0364084011822998 0.00864431235530197 0.0135884773310382
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
35 C[C>T]C 0.000262195450097354 0.000166680038890613 0.0199537339632887 0.0113618823216209 0.0187418683026783 0.0145408621539247 0.0544504947582412 0.17984763492586 0.00587679911884129 0.00255551934744646 0.00396711839078616 0.00864436022663152 2.18546564657687e-16 8.23994754996508e-05 0.00654211061463815 0.0021657906023675 0.124885075458314 0.000250701698044392 0.00132363456078209 0.00136274576554212 0.0109253561757933 0.00280577009188091 0.00169158957596907 5.7826880083647e-05 0.0066636403945691 0.0910421653280527 0.0128762438504598 0.00509122706928745 0.00315192845551401 0.187740561700162 0.00874548893454336 0.00585508349330285 0.00279183249944173 0.00705940840081945 0.000206691961924406 0.00161831749201984 0.101752114868685 0.162240337968214 0.0279918944731003 0.00150531151769467 0.000509442064032753 0.082351918965419 0.00657554843329516 0.00206951554181328 0.00468274188280773 0.00380664613122254 0.0170655223832216 0.00182553183056749 0.0476763322192069 4.28458837643541e-18 0.00282548310629536 5.01655245725907e-05 0.0130986311695456 0.00455176081992088 0.000292674548608108 0.000486510114383623 0.00418630169354923 0.0046304672466789 0.00178614392534982 0.00454689158946522 0.000222995050708306 0.00394133324383434 0.000521771833825578 0.0119122063344207 0.00975370481473786 0.000404690665256415 0.00185039874302111 0.0402209390849427 0.000364428624762556 0.00477643255724401 0.00787836693632126 0 0.0113978432634263 0.000305223580553022 0.000265033252042424 0.0343406271086929 0.0039386996148748 0.0177354880446316
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
36 C[C>T]G 0.193380670398217 0.00275937067162198 0.00224810416237608 0.0033225845669398 0.0175385196130411 0.121782216978916 0.00671266265658373 0.022188156475262 0.00894127879675302 0.00263636389530029 0.00149393251572762 0.00652687570211735 2.22044278694954e-16 0.00367011208627906 0.00947585734794098 0.000591315726565385 0.000926453072669708 4.10149767897006e-05 0.00198236220687302 0.0116382946260993 0.0248004698952058 0.000693597297154013 0.00189852253949709 0.000541638965067356 0.0168255682740574 0.0157851970125859 0.016604484147398 0.00623532009642577 0.000427652357312832 0.0143311240848299 0.00637543984620301 0.0116171671988564 0.00334768813474214 0.00753402335671468 0.00254999938989923 0.0153393484958688 0.0168620784238039 0.00824184513625361 0.0112157308324378 0.005877706324618 0.00951610212209178 0.00268508019866827 0.00533062744251341 0.00327410613340103 0.00352048685079948 0.00758484454921697 0.00236527199545 0.0101259238828717 0.00193354637536196 9.72706272557843e-05 0.0155580077406851 0.00221164634837848 0.00830515932095558 0.00152481690798169 1.84737759150832e-05 0.00138362896144205 0.00108083886321114 0.02072015058423 0.00237310865461942 0.0137585586102879 0.028370619800754 6.59726885405073e-05 0.00793686223760552 0.00640150979316927 0.00798179038634482 0.00110582948963855 0.00406002878129769 0 2.41579446136971e-05 0.00592992352975445 0.185951148817577 0 0.0023381167768199 0.00020157078403333 0.00126945976117171 0.0108641028619382 0.00726387002485978 0.0189023297930831
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
37 C[C>T]T 0.000191624803224234 0.00143132065201674 0.0228736203121397 0.0159150018258346 0.0229406397178162 0.013650287296249 0.0561083366111526 0.125353987040937 0.0204158750354444 0.00013655863760786 0.0144062641655204 0.0110277266554802 0.000101627351933467 0.000584834831025179 0.00975232807602825 0.00251532033589456 0.0649613808154458 0.00335872558727567 0.00143131952505746 0.00135210035500735 0.0154586472601234 0.0191966441381848 0.00172286030640148 0.000134427350442036 0.00659964788807086 0.257044739659354 0.0116671818178841 0.000322842268314101 0.00159162192951468 0.156010982075863 0.00426807831538378 0.0134964583715973 0.00163878179520568 0.00711722017355493 0.00328985411614084 0.00066860436589588 0.0459496765962332 0.144416647878338 0.0424709509119844 0.002674440754049 3.52241604987087e-05 0.0468362934986593 0.00569846161010641 0.0060125165568236 0.00408655359764158 0.00694011458652624 0.0214516893136254 0.00767947337461961 0.0328312881335206 0.00073778028786452 0.00501292817285157 0.0027195328508902 0.00634583111960886 0.00298218118735586 0.000468908643936418 0.000515639971512582 0.0118011089083552 0.00402705216987733 0.00253929086241152 0.01592249107582 0.00368548763323562 0.000713257454237939 0.000502555564735045 0.0317169252730386 0.0274202852597354 0.00241073519609482 0.00248722721227627 0.0421045196301839 0.00233456520478735 0.00234296151637867 0.00686386102806723 0.00401109439447112 0.012792777092114 0.000368751327460093 0.00120413906366326 0.045078514791759 0.00686073254906646 0.0249224082462878
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
38 C[T>A]A 4.22647255611115e-05 0.000241151049401394 0.00793855615880444 0.0144000217946099 0.00353435975793 6.62294093591927e-05 0.000176399835642859 0.00112021033862284 0.00345735679377338 0.00160169534045164 0.0189780208752371 0.00478423467624768 2.21203602212548e-16 7.00610185226327e-05 0.000670929209916808 0.00121022836801431 0.000184589090212015 0.000545461889317742 0.00020740958700283 0.000154922916359623 0.000346689014328885 0.00320986660695816 0.000432020637731996 9.30119022122192e-05 0.000540769705046038 9.61555142479685e-05 0.000144363214349458 6.18175267245055e-06 0.128009985516857 0.000464500830790235 0.00132027064102051 0.0262392010262764 0.000942590651391115 0.33124268799911 0.000139469916011327 0.00194761316927034 0.000213977546760926 0.0206267319803422 0.00032422427214624 0.000742885688849028 0.0237754222720999 0.0526968131833107 0.00125537730884621 0.00156601984317349 0.000898834498405497 0.00493094730473784 0.00108829890547439 0.00361555075726139 0.0126408569576286 0.00135583539572205 1.23992831545754e-05 0.000698036910279119 0.00418669933766923 0.0139911932217328 8.48347800641175e-05 7.40135734777928e-05 0.000192418627759715 0.00609279238704124 0.00121186182352629 0.00369174202037633 7.44031407391564e-18 7.37014130237768e-05 0.00118353548218774 0.00636730870214126 0.00246807201398625 7.04049857201125e-05 6.61490734899671e-05 0.000136847942307234 0.00988255582154105 0.00211537609401218 0.00827833614904223 0 0.0314912764922916 0.102396296649818 0.000314305996825864 0.00704527590809743 0.0106200253784572 0.0119361348780402
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
39 C[T>A]C 0.000387448809235948 0.000242876161926022 0.0178506158388513 0.0122369354851455 0.00519741064896797 0.000549592040065498 0.00026090211488275 0.000961079348560783 0.0133915764922424 8.11253837398107e-05 0.029254477978796 0.00313569259960173 2.21872960040954e-16 0.000105062627814332 0.0027906996455536 0.000613847077810977 0.000213322296117674 0.00561140970729071 0.000340424516303349 0.00295745512795048 0.000243816360966088 0.00571701050702001 0.0404372832153514 0.00223266147358789 0.00306229253692668 0.00040487428153939 0.00651600245916603 0.000689162435091889 0.0552710429959024 4.50779570121621e-18 0.00187604315218444 0.0158111743498565 0.00145221633805444 0.0028205695219113 0.00134895808237884 0.00141253554812439 0.000779269416160331 0.0211913118611497 0.000650410737064657 0.000990847959013516 0.000411543155800176 0.0331607794645742 0.00145904527163079 0.00116056048612233 0.00203025618234504 0.00644765011518154 0.0076311299324052 0.00319572027277717 0.00173079886256018 1.20994495162438e-05 0.0032596459858326 0.00104469888486182 0.00329950359279466 0.000572367557326403 0.00010068830422235 5.14954036175402e-05 0.000535002447171282 0.00149029972145974 0.000230153421732935 0.00451574775662802 0.000733260447072585 1.10036367095927e-06 0.000971640168000137 0.00658646888959027 0.0222598991350353 0.00164741918847043 0.000513607063324727 0 0.00113786976873175 0.000508895934980256 0.00488219863728213 0.00346690724442526 0.0177286753679438 0.000356349381761807 0.000141008121328473 0.00394342730792999 0.00853267260510468 0.00881722788557766
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
40 C[T>A]G 0.000318465389581822 0.000147868880093755 0.0131978316093994 0.0325006203827893 0.00500210553477132 0.000114362101132749 0.000111622196726545 0.000883181351248617 0.000957515352344323 0.00119383117304614 0.0275685569425765 0.00530370200736314 2.21207489901257e-16 2.19376861327031e-16 0.000897199429946486 0.000998973971214944 0.00030598185864358 0.00140863513006559 0.000224284165027034 0.000316847920077617 8.16925253172157e-05 0.00102997529953389 0.0123436637303954 0.000712507542365296 0.00320276985498905 0.00029448143785184 0.000123312412787463 0.000124835648581241 0.168016058848099 0.000132716855561906 0.00503111972749332 0.0627556939696148 0.00113831803817037 0.00440330345143925 0.00080296234269458 0.00197761120502015 0.000586948726511565 0.0187245954913185 0.00140665925636921 0.000477008711719954 0.00117374400636595 0.0583081450472493 0.00213218623549928 0.00159597183818889 0.00178367171249371 0.00678765809212463 0.00345466091051036 0.00311622006065498 0.0149485776927316 0.000295098772444741 0.000581976582664953 0.00341513299613814 0.00428645798909392 5.81644111955013e-05 0.000305095638343104 0.000231733479521463 0.000514454699102134 0.00650175197002504 0.00122181659040647 0.00330161592981012 0.00191753746176675 0.0159572846198442 0.00158139032772358 0.0012854417191092 0.000853888308572908 0.000139210028602582 3.79566866609458e-07 0.000125451329843376 0.000178337754227137 0.00261999626786347 0.00274287520033669 0 0.0368032718530277 0.000370727815659216 0.000243943512241873 0.0102440035279129 0.0074951755051543 0.00773704885283337
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
41 C[T>A]T 0.000257226113285384 2.22751099017644e-16 0.0127807650071292 0.0118772192765515 0.00432123671222928 0.000179168556045325 0.00037216105934257 0.00011275392957989 0.0488400158972952 0.00115155314650069 0.042024805362163 0.00446366960350049 0.000375411253189398 0.00023274383106847 0.00336384118130069 0.00211261235926433 0.000163581931065117 0.00150832572663273 0.000522415843319051 0.0013883378435206 0.00105288816782393 0.00657244928191707 0.0724411225100271 0.00779170040118469 0.00226962243655234 0.000219781718705371 0.000102926293333388 2.23154711469131e-16 0.0606992466203346 0.000379496606827927 0.00483239450668407 0.0367542913423926 0.000645235526824811 0.00546953298667543 0.00103281333887838 0.00199051470923485 0.000615939367466022 0.0312433079018909 0.000665744828074048 0.00112262134932815 0.000270611841717725 0.0669574332910982 0.00196558536787927 0.00206822097647185 0.0023802983886638 0.00830885216536299 0.00932613677696592 0.00905780137743288 0.00764423379329893 0.00020370242863719 1.38894832673308e-05 0.00135077345570938 0.00361207778332117 7.64491077039921e-05 0.000358597578699427 0.00010656906125645 0.000209733691115196 0.0036334220701594 0.0008558529427017 0.00867042208677405 6.69485745913389e-05 0.00525007097572577 6.09654415557567e-06 0.0107317595952083 0.00130221174732319 0.00373984935898159 0.00013236151437065 0 0.0106054147944691 0.00335175578525945 0.0101679569047621 0 0.0200389975015194 0.101511445622012 0.000459009110648137 0.00649027702683019 0.0247189438314592 0.0145393316873089
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
42 C[T>C]A 2.19186832561114e-16 0.000299702127239593 0.00882839431766289 0.00518000784000551 0.0132788092600195 0.0016507630561 0.000449470767654969 0.00153028733758299 0.00754241813511944 0.0101473866289483 0.00238723525746402 0.0136835104518984 0.00012101721735395 0.00130438003455395 0.0119315327329157 0.00258665756753083 0.000329050117334461 0.0453552559982152 4.70393034637998e-05 0.00315842848836393 0.000747174599846735 0.0106995553565272 0.0110493757576617 0.000642934836872925 0.000385123812080757 0.000452732212917518 0.0117295111658935 0.0114846778244235 0.00674052579987197 6.89713354809744e-18 0.00227046542054284 0.00900912491510553 0.0519223663901885 0.00490359266222247 0.00131500206524966 0.00117855566140462 0.00126986674946905 0.00816057600193152 0.000591584595023756 0.0150369623346117 0.000595890330364021 0.001332447937905 0.00149449679624549 0.0498732434131684 0.00195398804001195 0.00732654923416513 0.0108829890547439 0.0102873405524288 0.00355147885952422 0.00271167079144409 0.0145991559723227 0.00111165132053059 0.0222293798166724 0.00190879850382212 0.000142703516349153 0.00012085887167089 0.000836472687515029 0.00416822785234573 0.00237405717887528 0.0101047681316534 0.0113851785829045 0.00416876734018115 0.0033516929201451 0.0119573872340681 0.00390114608662342 0.00220328547061519 0.000875678246953029 0.00227461824844151 0.00717404217212549 0.00128240930345214 0.00507670287533755 0 0.00488007930651512 0.00478848295891305 0.000153184403066571 0.0307617777024853 0.0295226013697448 0.00629667679504534
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
43 C[T>C]C 0.00246468708165361 2.83687320282444e-05 0.0145412320035586 0.00236714489712651 0.0104148498553501 0.00102736806037652 0.000258902864960277 0.000842700055105487 0.00357774954046477 8.87090604485753e-05 0.0070130597894374 0.0153278264453376 4.09917755770732e-05 0.000122903451405445 0.0097801414400112 0.00226164061618597 0.000717447156282554 0.0498012611522051 0.000121437985347978 0.00535349504517138 0.0021483818691684 0.0031794602293427 0.172732098672983 0.00643883621400792 0.00246184301988223 8.17785769660207e-05 0.00485683516632283 0.00282476463220803 0.00134415966632503 4.50779570121621e-18 0.00224723885609259 0.0108076381631931 0.0312476894808956 0.0057415151833924 0.00261797790802411 0.00184330880038928 0.00138403062329635 0.00995288628170588 0.000927585774244517 0.030065043917648 4.06512065875968e-05 0.00202984165207393 0.00187877062374376 0.0218105332736784 0.00233177937774282 0.00791939633712515 0.00988441632976894 0.00525941424203139 0.00314965141849616 0.104995223074843 0.00320949758605057 0.00288296711495519 0.0833874544360833 0.00629504073556884 0.000444213106863308 0.000178330386068525 0.0177000809624891 0.0711143021448238 0.00130519905831231 0.00408424297099467 0.0170292726779152 0.00498164643761557 0.00263360374078066 0.00455755662162847 0.00948291667187601 0.00575592192069243 0.00278786713361088 3.26694716219695e-06 0.00621919257674851 0.00295716433486529 0.00182328133351838 0.00173345362221263 0.00422042313923911 0.000216907969299636 0.000145156293954685 0.00402254879411668 0.00837111985350946 0.0149760411354686
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
44 C[T>C]G 0.000353850432868692 2.21307115845015e-16 0.0100983408526466 0.00550010498785665 0.0207672245754977 0.00529049024370626 0.000103649182674649 0.000730149927985833 0.0021621314407775 0.000930193455665119 0.00125856455607414 0.0153817346352905 0.00104155993002835 2.50010567188012e-05 0.014579222021573 0.00330146548284794 0.00013142171633544 0.0373637970669879 2.20314533787618e-16 0.00446785552917019 0.00138478792915768 0.00960976954225309 0.0869033744889939 0.00389543872534445 0.00161635114177017 0.000498815496769445 0.0261662924695347 0.0143810667165589 0.00203019404441453 0.000391112551618042 0.00422093941352323 0.0133692575388368 0.0785838856175511 0.00566424943980594 0.00248061567408127 0.00390528273314585 0.00126988906758039 0.0044658660904428 0.0018356404480279 0.039833712878493 0.000813595204412631 0.00156289873322524 0.00184324511012788 0.00992494986873717 0.00254523940996293 0.00775589755526594 0.0104837975607973 0.00556325183905392 0.00357160648229022 0.00922183663889816 0.0337986400241845 0.00156234823283739 0.0502412750349613 0.00309810437639268 3.15921612606892e-05 0.00010787593012206 0.00241275265857977 0.00292179958162169 0.00122181659040647 0.00849415734669332 0.192752463604678 0.000946466444014507 0.000478395438764176 0.00827067152605142 0.0059015823657778 0.00164247803531103 0.00057781832712201 0.00363629563047763 0.000838798504553019 0.000557128742824384 0.00082872039713855 0 0.00808188466106195 0.000200811150980828 0.000149061007194782 0.0141217671730762 0.00237524287877608 0.00704634693607655
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
45 C[T>C]T 4.21455093306053e-05 0.000185792396490052 0.015900479300208 0.0025767526566078 0.0149735876772596 0.00127119590043331 0.00182569576281261 0.00576857157582831 0.0432239155066411 0.039753617318328 0.00649474264687974 0.0330753896295419 2.43617940899503e-06 0.000810624881712831 0.0193102575700829 0.00475482249094004 8.53251430555703e-05 0.0461547672349615 0.000111874903349396 0.00207244634612496 0.00175481361303988 0.0156007601638154 0.426831510225056 0.018303994523964 0.00257089975113894 0.00039419565143945 0.00696266101961155 0.021812870445406 0.000539548858847419 4.76647738175876e-05 0.00365449834567983 0.00899777186961305 0.0557797067582196 0.00392839385783318 0.000368002422687735 0.00178945261739294 0.00412639118727237 0.0139083112595514 0.00109451261327407 0.00307718530574769 0.00160549562810143 0.00320669635339898 0.00216615530337716 0.0506011345699909 0.00430672632186205 0.00863035551396228 0.0136676142421052 0.00791175325642584 0.00327177245578448 0.00948269926414505 0.00775999391240004 0.000606840015176901 0.0961214032339358 0.00548220574982576 6.70636908230697e-05 9.79228921356437e-05 0.00138484446765057 0.00666461948780621 0.00233959799757241 0.00545803573871259 0.0270407906382435 0.000686624961261267 0.000206221362241148 0.024372126931174 0.0282479779034724 0.0122981569217185 0.0021057513649876 0.000926609200199657 0.0170001165916836 0.00180209274486551 0.00883630571986447 0 0.00433347554854818 0.0064212326924018 0.000162973801499837 0.0137585302036584 0.0149371985838685 0.0162164984262862
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
46 C[T>G]A 3.48929711027782e-05 0.000151835845919396 0.00436920534181051 0.000870001316757682 0.00258587338221432 4.92245610102108e-05 8.3914498085473e-05 0.000359067421040714 0.00326804907307686 0.00147236590302387 0.00121858870883101 0.0259687059671064 0.000153751382703789 0.000224313839275566 0.0107780519073693 0.00631160107435972 2.22710750147104e-16 0.000892119903224805 4.10849612531922e-05 4.84758802802692e-05 0.000205223956757903 0.0039598354403596 0.000308586169808569 0.00203711965315224 0.000110748039225296 0.000715156637219265 0.000965428995962005 4.34420422054279e-06 0.00491038303818566 6.88707941756085e-18 0.00143029319443888 0 0.00141788000527054 0 0.0145447198126098 0.00078004404369238 0.000197979225507772 0.00197255640782884 5.79613237282972e-05 0.000724960833085914 0.00106337331681121 0.00371682845836659 0.000476246312403563 0.00259340865748476 0.000985010381195767 0.00529028759415193 0.00334477186544881 0.00346573511814835 0.000872821075645783 0.00272164016935382 0.000233986472433118 0.000102151742967675 0 0.000136913819384099 0.000131877732350252 0.0001058763669183 0.000891307011488005 0.00277217067691893 0.000797643478927554 0.00149070341744193 0.00435433145802311 0.00164556605533466 0.00578838361876692 0.000139502851064127 0.000500580735094792 0.00101150832969152 0.00321779378573184 0.000899150610783256 0.00373127816837902 0.00406665573276174 0.00844009286697567 0 0.00688954433282461 0.00897454305256188 0.000751140443360855 0.000928315131746836 0.00930926811860579 0.0022287360286143
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
47 C[T>G]C 0.000209005464524226 0.0001542860864694 0.00706001884862431 0.000442335126963047 0.00461658248395806 0.000781996659548731 0.000171935493332694 0.000794545766242317 0.00557649230050095 4.96930394863785e-05 0.00195363808420042 0.00742347672940856 2.21872960040954e-16 0.00113983039609889 0.00229625645672038 0.000493948841025279 2.23384668576054e-16 0.00114232269041275 2.80700916951883e-06 0.00121305786604071 0.000156881838818343 0.00108322304343537 0.00103838949491272 0.0312971295851159 0.00199149089819741 0.00209972021939783 0.00160888949609038 5.44919134723819e-05 0.000882731721168677 0.000149251401293064 0.000882843836322089 0.00289204391589148 0.00494755083447512 0.000382433091760927 0.0220829434226461 5.70023210555164e-06 0.000215627959426604 0.00143618843419166 0.000450284356429378 0.000947897896274019 2.23380392634814e-16 0.000520523750383316 0.000565629879276046 0.00238114996290617 0.00141715901836956 0.00739877862596143 0.00567828172135663 0.00241432158538965 0.000757727641574315 0.00725966970974625 0.00253750902897123 0.000282269602544394 0.00179972923243345 5.16233436117508e-05 9.16066140375887e-05 2.67495579102787e-05 6.18002826825892e-05 0.00256051495767579 0.000772159748238201 0.00425483788624506 0.0189325443301528 0.000466154064242743 3.92047829593484e-07 0.00084654615318406 0.00103812982513169 0.00263185260597106 0.00415681981212231 0.00216007832285282 0.00248221173167121 0.000164382633459143 0.00107756523304284 0.0023112714962835 0.0032232587442941 4.64932178790164e-05 5.84413236590472e-05 0.000420008822224152 0.00637813399156582 0.00205938125939227
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
48 C[T>G]G 0.000125813487242202 0.000120081439539223 0.0106982422894375 0.00379007234617759 0.00612034070422119 0.000918874621275298 2.22247766696603e-16 0.00129026494123524 0.00118568498365218 2.5667370220492e-05 0.00469464556630831 0.0141831579104627 5.30699583395393e-05 0.000473340164755169 0.00684203723635563 0.00306193240805261 2.22714664324179e-16 0.000592425980233258 2.20314533787618e-16 0.00043479130988569 0.000270980083979057 0.00223994628248147 1.93118609975542e-06 0.0136141608513313 0.00292340052184359 0.00133217793313928 0.00271688324108962 2.00735722918635e-05 0.00803076757470381 6.55540832017901e-05 0.00304067673391247 0.0117729282804683 0.00555179674756778 0.000403302566120459 0.0154415835133573 0.000331599454579136 7.8493143153591e-05 0.00150197290037314 0.00108741743932087 0.00106555181949968 0.000437395202372265 0.00637181791237982 0.000883761304153207 0.00376050864373257 0.00159327978812641 0.00981215868317429 0.00558137412998639 0.00303631698217665 0.005698518207699 0.0463584220225691 0.00346986038118107 0.000649976925071453 0.00159496111222099 0.00366775582624553 0.000102354665766719 0.000111871334941396 0.0036490391447942 0.00591340324881113 0.000790704069889065 0.00298145923358611 0.0220716551588777 0.11269832262765 0.00442590374740246 0.00218226152313887 0.00069565026537583 0.00202305221422457 0.00708325569971982 0.000790405714824765 0.00111876050756739 0.0017667396303079 0.00194170943427152 0.00230433923123766 0.00901264453312456 0.000123575938553072 0.000424864857112881 0.00209036563620549 0.0025493780895237 0.00251432346341306
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
49 C[T>G]T 0.000169175636045387 0.000202773421975702 0.00707470692914318 0.0012078528077849 0.00733605302308692 0.00130122415004985 2.65829328101836e-05 3.70477197191067e-06 0.00340977523718283 0.000156210687699224 0.000577087040140707 0.0568012010355355 0.00129796443921866 0.00520192408755596 0.0301079921669572 0.00593477242374449 0.000134298745874448 0.000345909366641107 5.54380101418879e-05 0.000967812322802043 0.00249684908369673 0.00255651166555426 0.00532036459928414 0.55012005399892 0.00415762694129501 0.0022179806474854 0.0051564054797413 0.000185962259557609 0.0011978789963217 0.000249961765030661 0.00474178710968374 0.00858604346932942 0.00783931013899303 0.00145048388596918 0.1012758710939 0.000771073122213703 0.000266705771860287 0.000956448361254659 0.000678798648232363 0.00019244937417054 6.61383419123544e-07 0.00273275066594693 0.00107304915491368 0.00412640204529093 0.00693917496356227 0.00496320794400159 0.0131651284243807 0.0105557063776964 0.00351412597102778 6.28166109984635e-18 0.0003864899691779 0.000733853041609276 0.00200670987962287 0.000107632296372726 6.50824887308075e-05 9.33987338747567e-05 0.000472653437872044 0.00230852783463166 0.000862851740130335 0.00273908804599598 0.000890637193512407 0.00118452844194195 6.78728561162611e-18 0.0051753158421752 0.000473804735756825 0.021370567765609 1.80492974141795e-05 0 0.00176590478387995 0.00243412203678616 0.00307492903962497 0 0.00419897669944173 0.0097957860628005 0.000121924586274542 0.000548706732580552 0.0384231964121322 0.00281605316366512
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
50 G[C>A]A 0.00155626959896502 8.57251586418347e-05 0.00714379030371472 0.0316669246757628 0.0102053008592886 0.000425522645095338 4.05479677564356e-05 0.000747719196214448 0.00104838831971619 0.000167487140120309 0.0242231620266631 0.00772702665785464 0.00120279288768101 0.000723878599578959 0.00840736851335822 0.00241244003299845 0.000165878576436296 0.00198223485826488 0.000943771595094771 0.00208336541185369 0.0022862013018325 0.00862786324756968 0.00177563180537408 0.000993828319578499 0.108982737880842 0.000817044133069938 0.0108501553378358 0.00214167170363847 0.00223489380127447 0.00033954127061467 0.0623444170648387 0.0134972961152905 0.000496307638601642 0.0108307918890996 0.000155738235960387 0.0971863943910265 0.000944896570124019 0.0131447596613552 0.0045087572532945 0.00440088381490176 0.00282490834862865 0.0099090931241051 0.0675943734976523 0.00203913474582946 0.0120499899569843 0.00688192602218123 0.0142078442607686 0.00309273365822611 0.00775137055679371 0.00929114326614177 7.69580866795757e-18 0.00757723418914115 0.00719238834926264 0.0111164942212059 0.000741656252089294 0.00788746657212328 0.0141871871454141 0.00393721871149004 0.00820235637489211 0.000433118639862038 0.0051942219453194 0.000854507029598712 0.000216277929907312 0.001887274192174 0.0027325924155527 0.103372129632647 0.000516136269471242 0.00271510476637817 0.00144074328793823 0.00484673656118748 0.00705488448557667 0.00865940890727991 0.006783083206448 0.000975202676351818 0.00349915950600553 0.0089574098308125 0.00224419722579264 0.0139261486889945
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
51 G[C>A]C 0.000329319171160487 2.18723508330305e-16 0.0107709803774159 0.0343943906004591 0.00754877784507113 0.000897336117074769 0.000135928872319561 0.000212533665072179 0.000730678533773845 2.18280393661342e-16 0.0258646334571483 0.00659418521599397 0.000432348184052405 0.00249045162120237 0.0073231707729108 0.0246278796077943 0.000401560463896683 0.000411732872756684 0.000442350782909231 0.0221278746071123 0.00245170324081858 0.00420028345986967 0.0012593094186941 2.73033031616265e-06 0.0170595231665851 0.000269264800137913 0.00559822329227382 0.0069782754446415 0.0017099668838652 0.000537587921460353 0.126533849939756 0.00637979695169204 0.000657253762226891 0.0122644396183818 0.00100429290192421 0.0891381382659674 0.000488190245322219 0.0212769504798617 0.00356926218895872 0.000952722100306631 0.00046401654275557 0.0497061404919655 0.0189065669013993 0.000620091776021159 0.00621948824463138 0.0068563966625348 0.0100653662901851 0.000713693772653403 0.0265734831391471 0.00166518496707803 0.00461529527155677 0.00567163075917883 0.00295563945817457 0.00343727025931832 0.000336550692875846 0.00244823196347679 0.00746907340305193 0.00323263544804931 0.00718641134949407 0.00340150519842707 0.00901184038703701 0.000189251932301452 0.00721502929565332 0.000740594711022695 0.00106227661235115 0.127686657311317 0.000852670614286021 0.0101316802906613 0.000497696599522605 0.00358235226618826 0.00457082531757199 0 0.00594384070114234 0.000412199555016576 0.00574771225880907 0.00773299842493295 0.00167836928897786 0.0301038543488522
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
52 G[C>A]G 0.000582768122955382 1.39330364080141e-05 0.00144412619456053 0.0154539740009943 0.00235977957739148 0.000358585693129542 4.278208329961e-05 7.36473579321017e-05 2.23416780476229e-16 1.82883074118887e-05 0.00276436872588365 0.000172512735058905 1.0520217535087e-05 8.50389512115181e-05 0.000898181251184586 8.77819178761215e-05 1.40848133350125e-05 0.000451052798812981 0.000164389652646842 0.00112061139310283 0.000406527838174309 0.00137362741467688 0.000106578282799433 9.27433412219656e-05 0.00761873647016609 0.000207398166174927 0.00158979743821415 0.00170473065168831 0.000520222578057959 0.000120848028584184 0.0665767419655722 0.000663084446466065 0.000130103486010139 0.00164760840970772 3.97463898948079e-05 0.0232029933881708 2.24210266196506e-16 0.000983054417700092 0.000883710154729883 0.00034399914234312 0.00023001377169056 0.000513044051529327 0.00486070147467351 0.000509795754388586 0.00138661516646192 0.00456719656791383 0.0025716387668869 0.000221940552192119 0.00107413761724775 0.000178233532483145 0.000611052262484673 0.00211417038350918 0.000402745376833776 0.00079038114229135 0.000734613998760021 0.00689067803185307 0.000245712765314989 0.00431089085793487 0.00405343047167599 0.0513353798766122 0.00568934393769736 7.77672542444089e-05 9.83479025193292e-06 6.61254295984092e-18 0.00274420709505448 0.0122400037025568 0.000392435586197449 0.000772967341003542 0.000365419392109343 0.00022500516208941 0.00829726122837566 0.000581871222393212 0.00169352824365877 0.000124648956787782 5.90901228784641e-05 0.00450016282854732 0.000298292217363916 0.00178278361388358
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
53 G[C>A]T 2.18542738645068e-16 5.06611173221181e-05 0.00996880129206236 0.0211377344953292 0.00678912471479853 0.00121956144041388 2.21590783544867e-16 0.000146595557326955 0.000360614571060019 7.3401963287356e-05 0.026789926332534 0.0085245732337014 0.0109782276190141 0.00275873613278686 0.011981978649454 0.00981248327828657 2.22056300983659e-16 2.73921665662364e-05 6.0852661370642e-05 0.125567263886908 0.0180781566196098 0.00578271603175148 4.6648162619811e-05 0.000529085494438493 0.0619759273756968 0.000272638716882124 0.00248894510826296 0.00886202361956813 0.000549423711009974 3.09759703041576e-05 0.054251263186867 0.0104449430818803 0.000813383036365003 0.00739364228165656 0.000156939227648042 0.0842481502845766 0.000859376783552309 0.00350422708367719 0.0032526088248402 0.00316734789469729 1.35031652312539e-05 0.0228747317978451 0.0685448357953178 0.00128294854618031 0.00908182425179572 0.00586192999413574 0.0107514581868817 0.00194188015700465 0.0181053309185388 0.00138167143731825 0.0112661429240618 0.00697982775603163 0.00238536940888444 0.0014049722667727 1.95272762027467e-05 0.00581604733571074 0.00202787831842507 0.0034301742694636 0.0041696278027147 0.00113718664392839 0.00670149935864455 0.000733853987033609 0.0155688270379106 0.00193736557953217 0.000347293065196307 0.498276672616533 0.000132108039487806 0.0101713988421528 0.000759647016058676 0.00833566294920252 0.00105495024186417 0.0034462911150432 0.00720185693769895 0.000400434072185542 0.00115272806276731 0.00653622697474611 0.00308768076741545 0.0113142221069969
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
54 G[C>G]A 9.44596547726241e-06 6.5039737531044e-05 0.0127245633740781 0.0053012035295818 0.00468243215896773 1.93328789574931e-05 1.95748809858655e-05 5.12177626361371e-05 0.00018172064208414 0.000195401663473694 0.00258246934003268 0.00136123785682413 1.49106556324092e-05 1.7032437637152e-05 0.000169898393060092 0.000104015074112586 4.6948663755e-05 0.000564636595990604 0.00149173592480733 2.22359192995922e-16 0.000992351132760484 0.00105217844482557 0.000875845351190133 5.96496155738998e-05 0.000634899436278302 0.00131489903479314 0.00067210684453816 0.000388303093930714 0.00140307234160729 4.35257652538687e-18 0.00272631534431449 0.0041691648000564 0.000395244994450905 0.00142404856319644 0.00018269293064584 0.00227201972469238 0.000516035772655217 0.00183625268551756 0.000875758615052324 0.000769406217979425 3.35772024356572e-05 0.00339338751362464 0.000884617650205611 0.00131944012965436 0.00120499899569843 0.0240067186820275 0.00506279520841473 0.00204180474523665 0.00241287799433267 0.0135870482171536 0.000219450794047227 0.000334201190064106 9.98942826286477e-05 0.001682496422669 7.73216092603733e-05 0.000152144025249079 0.0266759082241237 0.00340759284420838 0.00137369560647465 0.00138357343289263 0.00219178151449894 0.000850509335892985 0.000186377755265748 0.00378453396208436 0.00211426858429625 0.00144520258903895 0.000162727682637935 0.0111990418825011 0.00159707716873518 0.00556366323104367 0.00259994166095702 0 0.00652303433977496 0.000433423523426815 3.72931998201332e-05 0.00235356574329682 0.00353525759884103 0.00312151540957153
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
55 G[C>G]C 0.000159316649174985 0.000255994778808114 0.00852784960156868 0.00568298120553562 0.00501278319646553 0.000673247798681508 3.27017287029667e-05 0.000446814960988953 0.000465782946731845 2.18280393661342e-16 0.00235940740315207 0.0027936443355184 8.14696918248409e-05 0.000132824086464126 0.00038254386981725 0.000319801988224521 0.00011303183428203 0.000285349640831371 0.000469813802690735 4.27739718967841e-05 0.00059864882346092 0.00305385315082289 0.000821502628601225 5.45083930025277e-05 0.00132137347070659 0.00127702791241878 0.00283379090546958 0.00140157724630706 0.000919230752598057 0.000126199012986071 0.00572367961836865 0.00235667924490633 0.000571396288782838 0.00133524141006576 2.18581396301151e-16 0.00161889863517372 0.000252989276928114 0.00743208828389588 0.000887385627089183 0.000763752427518539 0.000191357249469712 0.021189470249563 0.00106349438820371 0.000924715557882112 0.00106959351977737 0.0210131293398549 0.00529911931159745 0.00265537517072981 0.00140799798722346 0.0149768115382167 0.0011760602512104 0.00099971152997742 0.000788170522179886 0.00225200465265683 0.000211073700445256 0.00010859093386389 0.0325170741821522 0.0011235379301147 0.00142353776731782 0.0837521774147594 0.00021715278041053 0.00138981887783879 9.66263460167195e-05 0.00253102181825576 0.00146554828926223 0.00170248876415089 0.000132922093451054 0.015608630743165 0.00499441757111974 0.107931552391784 0.00117385768925129 0.00170807824834842 0.00452804889608409 0.000290066280077207 0.000185421459176944 0.0021359303552977 0.00460471353055444 0.00680876051508345
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
56 G[C>G]G 0.000164803251125372 2.23530008560227e-16 0.00244390586771782 0.00333321007864583 0.0015227637443851 2.22986061273833e-16 4.53993401602921e-05 0.000340454864514654 0.000181148740926672 0.000547644370301065 0.000492340123442051 0.000525608976407541 2.23429381935655e-16 2.21580365832829e-16 3.30673562862941e-05 1.92035435658619e-05 3.2830787917583e-06 9.62649597466631e-05 0.000241572599316397 2.24122278620565e-16 1.01631959543577e-05 8.2114638833258e-05 2.38292953051562e-05 2.2382862654219e-16 0.00064396463021642 0.000603983927836252 0.000700726004614135 0.000118019814347652 0.000213139735864523 1.85841926310133e-18 0.00317224536831406 0.000421229937116741 7.44312966476612e-05 0 2.23384773586008e-16 6.94072150046153e-06 0.000118164870022483 0.000462197395976278 6.91248764133067e-05 4.68723977578636e-05 2.24947389054205e-16 0.000598045432847795 0.000173093303031852 0.00058132836024153 0.00103237041590596 0.00994096206614359 0.00120009809121389 0.000157376027918048 0.000225974234571931 0.0128892046089507 7.7568287204666e-18 0.000703037519875062 0 0.000469383436992947 4.28441993864099e-05 3.70260444756967e-05 0.00281965468394249 0.000268927069875844 0.001013357617919 0.00303161692184718 0.0016039107909466 0.00576202971862719 5.64571207516476e-06 0.00187204412561706 0.00171889894964952 0.000363153828860981 0.000203261508748422 0.00171879428798778 2.70320156025273e-05 0.000770529693345999 0.00546166201708555 0.000581871222393212 0.00209674925405372 4.68193642568745e-05 6.39406543144803e-05 0.000902276718601021 0.000919150978736656 0.000711417484082445
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
57 G[C>G]T 2.18542738645068e-16 0.000132589642991481 0.0146541378993316 0.00303107136159437 0.00668957743159035 0.000318275790547037 4.1734587035356e-05 0.000276237886935827 0.00127158857012899 0.000874872048911459 0.00484011308461396 0.00853453184729216 3.50116448390178e-05 0.000111334708216041 0.000153710370563466 0.000367188845766624 0.000186047171094417 0.000502023707250297 0.00267158025529648 8.00242165882437e-05 0.000447980694255164 0.00322037461768229 0.00078110859535726 2.20947687752404e-16 0.00122360177643832 0.000319576517957068 0.00301872057307395 0.000206116729129281 0.000453698345752338 4.04993268701608e-18 0.00337075863183108 0.00197956540313731 0.000303649725937975 0.00454993371178866 2.20509547708008e-16 0.00319664967391833 0.00039778577336122 0.00335447378950296 0.000226787404300785 0.000924388993718866 2.69063070163503e-05 0.00873035615341335 0.00104307358818962 0.00126305787104573 0.000916175229801614 0.0322455911392187 0.00694862760596611 0.00354517608150592 0.00277081583670454 0.0178921481091572 0.00184445702739064 0.000930643700804218 0.000596342352221111 0.00221208399449319 6.40769415095158e-05 0.000207146891408875 0.01421502938896 0.00283362222260037 0.0010102186125342 0.000571585918395586 0.0049190797669694 6.78168589643526e-05 1.73537880995819e-06 0.000433175073167192 0.00107164717260575 0.00225672400824322 6.38687739779391e-05 0.0759995256873075 0.00317232310560578 0.0124020197320823 0.00444630644327428 0.00689258322549023 0.00568864427044189 0.000261822855099634 0.000155965732801706 0.00152285218466879 0.00565013161596774 0.00368205498901424
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
58 G[C>T]A 0.00437331456924348 2.21771582101267e-16 0.0164317196326678 0.00409866208619841 0.0194100820264901 0.0932761582691419 8.47911936581621e-05 0.000856970392444173 0.000156759015424231 0.000363885750856624 0.000276264161956984 0.00698635311811209 4.19486445125112e-05 0.000359463654784079 0.00360942833226664 0.00115131659035649 0.019804896701788 0.00448505664900337 0.00714044262674442 0.0171276675686049 0.0735777449541727 0.00651348561082496 0.00163597537124353 6.08445995252968e-05 0.00967846699712435 0.0612281229941845 0.0423959773385805 0.00932728050369656 0.00238522298073239 0.0541049443086285 0.0299694223511041 0.00999799712243741 0.00275170565756959 0.0142404856319644 0.00324454658250808 0.0104092533642294 0.049799957089251 0.0068232340226882 0.0225937724887929 0.0053389406824772 0.000234236172679884 0.00731887425275849 0.00371419600312063 0.00254891843228683 0.00237987301650441 0.00803224795902838 0.0143078995020416 0.00601531692101581 0.0337802919206573 0.000765270509877914 0.0956965791393161 0.00100360717736969 0.0125866796112096 0.00106157512382687 0.000340254530546285 0.000184174346354148 0.00241781640083818 0.00446684457877169 0.00177186824603252 0.0092037710970683 0.000222180591880715 0.00649625227180308 9.45842191161469e-06 0.00513258695649435 0.00676167028373988 0.00244881549809378 0.00123792838325791 0.0895612830186808 0.000887673944507801 0.00453756631363956 0.00186900604501177 0.000577293860455305 0.00685479299384392 0.00044890318633629 0.0112254337587512 0.0128517990460483 0.00611967605022763 0.00560483851388677
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
59 G[C>T]C 9.01499088014548e-05 1.26526155043091e-07 0.0132413887208598 0.00440801672638068 0.0213141962684361 0.109095628691456 0.0115244043923105 0.0259983041460386 9.3648960326001e-06 0.000177967347985148 0.000241863938816845 0.00644611219467675 0.0122547671216668 0.0147473801882963 0.00889485948567691 0.00547528510011446 0.114023341600293 0.00179701157893804 0.000903337186384482 0.00806086860687663 0.12701595103036 0.00522811753004954 2.18411477304757e-16 0.000154194913538682 0.00805643377289017 0.0393007814907174 0.0527124741856579 0.0193457141039566 0.00184834570683695 0.153028724408308 0.0431994472059948 0.00685310491719624 0.00537842793413898 0.0198802609943125 0.000185104966237011 0.0078575811804773 0.0602826011430271 0.0112817318823453 0.0373687947407556 0.00505887561526455 2.20110411307129e-16 0.0176248864692627 0.00334803788878947 0.002277284582844 0.00293147853568613 0.00443939352250455 0.0114468871535438 0.0085287886524556 0.15071527750561 4.03979784912424e-18 0.0804464743264927 0.000923495898484092 0.00443345918726186 0.00168900348949262 7.18817809350434e-06 0.000116488456326719 0.00155687809720608 0.00304537912636352 0.00119773522491568 0.011766834843396 0.0129304610153543 0.00148838759257912 0.000497384853351578 0.00682489540875968 0.00309830678602417 0.0023260747649736 0.00141783566347791 0.110569020623128 0.00047805395369995 0.0033308344360307 0.00256469733474822 0 0.00841338165986745 0.000320600094619638 0.000128710040335712 0.0133521934728292 0.0050661035959744 0.0165822894013036
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
60 G[C>T]G 0.21642836593573 2.23530008560227e-16 0.000533215825683888 0.000486850684214331 0.0124039695734681 0.178790625706046 5.55663764267877e-06 0.000177804320933469 3.45188989654713e-05 0.00015776177272893 0.00192698695855393 0.00480210888234146 0.0149286896450281 0.012576182925647 0.00928592232552495 0.00205719691173113 0.0018036667436203 7.52763731352313e-05 0.00017842291567767 1.9383548421238e-05 0.27873319597595 0.00118172358468526 0.00161878335195365 0.000858177021047409 0.0149149867405367 0.00324755177278789 0.0207585015817771 4.37782901084454e-05 2.24251286075469e-16 0.0124910147192056 0.0256608383296743 0.0105811347840329 0.00673714175618397 0.00947122134905599 0.000216341109554017 0.0184615121305881 0.00529217024716077 0.0019924045297008 0.0104795731005596 0.00587413740141467 0.0169217180054289 0.00256016065161577 0.00573623155396254 0.00435240644062983 0.00453433280711634 0.00552499717266398 3.96334915837865e-18 0.0172508338294784 0.00461068505516722 9.72732160331745e-06 0.0500961854863468 0.00152746281296596 0.00151029516312666 0.0017362140035008 0.000301201680141118 0.00104923940748568 0.00553860741488705 0.00431089085793487 0.00283940797892154 0.00605312845395488 0.0192671044698616 0.0119874394495915 0.00206942471082552 0.00849465183882151 0.00739830191194175 3.2774885947342e-18 0.00338098351185494 0.00933706579858605 0.000117431917332411 0.00804223974254294 0.0177290024123486 0.00640058344632534 0.00189513874885625 0.000171265639814108 0.00119261831205101 0.00599808943502158 0.00909359701322292 0.0171084219814675
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
61 G[C>T]T 3.76324715873121e-05 4.986953736396e-05 0.0112647454600304 0.00379880983147189 0.0185157946767232 0.0737685944445469 0.0159982583635531 0.0053751704353217 0.000753018856373261 0.0417597655999687 0.00459113607408855 0.0106557165421268 0.0133518984555576 0.0314298866556789 0.0103180530732202 0.00223067009462614 0.0696176511192015 0.0026595303538855 0.00125663219415797 0.0104639386572423 0.0766831698370259 0.00669997443678791 6.55059304873942e-05 2.20947687752404e-16 0.00665519990599377 0.108855751429126 0.0330859771419695 0.00801565057724982 0.00175496502972333 0.107263068690772 0.0202444971083345 0.00976850867276805 0.00495795290220039 0.00757324492817453 0.000101315197595571 0.00509870602195074 0.0176461358107609 0.00569062517862109 0.0529170610035164 0.00390209317434495 0.000517121216633945 0.00602334640790418 0.00360605440488411 0.00230731831561111 0.00319712184881697 0.00856896727495904 0.0126429184234627 0.00837498057456876 0.0865254764891492 0.00184885530461292 0.0664004529860633 0.0019871040392708 0.00397561568147407 0.00402559429628489 0.000107939717703625 0.000306736743047759 0.016203145387416 0.00591580779806041 0.0010102186125342 0.00309234964577019 0.000246949753483484 0.00526028128917046 0.000823065378437312 0.00613995860590194 0.00499109747982121 0.00295570932053094 0.00088800441580525 0.180302771880911 0.00414908097004536 0.00710621589916006 0.00142939581248932 0.0034462911150432 0.00918078686488685 0.00050824413040225 0.000148598077902355 0.0167950911787482 0.00449316083881239 0.00841577197438138
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
62 G[T>A]A 7.9349463735341e-05 2.20022003325224e-16 0.00701785012530352 0.00916663518164201 0.00364293921658587 5.04225955894216e-05 0.000397326609637921 0.000523052963527958 0.00171371736628164 2.34412491669084e-05 0.0127111738260776 0.00263148684988798 3.26432728266e-06 2.18102957639084e-16 0.00188498942618711 0.00152996084125279 1.53598613764735e-06 0.000820408565705625 6.61052135246548e-06 5.73374200868884e-05 0.000506127698697752 0.00093451908476587 6.39330835286649e-05 9.61288810108497e-05 0.00158712604586607 0.000188210190833585 5.54175359798683e-05 0.00116167650831745 0.0533932717325025 6.25744760438378e-18 0.00156123060494486 0.0359072212665768 0.000777304648532239 0.109443345612192 0.000114891754612327 0.00340596813240751 0.000327060952879306 0.00189145134930134 0.00871825177994466 0.000801948635033038 0.0189501155790398 0.00071416100481342 0.000871695432806215 0.00114044361415582 0.000889645769159117 0.00492224762423827 0.00263054622290463 0.00231366343115882 0.0119692127607676 0.00612540633398388 0.00115321757113877 0.000298706885198152 0.00604547858910958 0.0158973622445939 0.000127200375627825 5.00497682169869e-05 0.000725569893931512 0.0202247753334929 0.000517491153298906 0.00442632561322653 0.00231349883908095 0.00240943946000331 0.000415300047323905 0.00329896456270011 0.00204811746602765 0.000253902302467588 0.000107959422636637 0.0010946617621589 0.0171155892235119 0.00125035898815403 0.00926460547917347 0 0.00576553951187731 0.0388693020557021 0.000269606978469301 0.00559088925800456 0.00573804799770415 0.00563839251123463
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
63 G[T>A]C 0.000126346023404813 0.000129543744927479 0.00745220659822295 0.00358728125037528 0.00289509453936029 0.000484560246366744 0.000222451427826069 0.000255143076962202 0.00225373501584483 0.000111028463137781 0.0134367227794364 0.00210996422391121 2.20421759369717e-16 0.000121114904881538 0.00684212247920042 0.00332491492439523 0.000374870912666693 0.00180182502377761 0.00012855476015994 0.0027189979628774 0.000584707144634046 0.000605825851122446 0.00337253100285632 0.000343601002227751 0.00193869704329636 7.76506022348499e-05 0.00255738601617242 0.00324414939740277 0.0101647410678499 0.000140260319791196 0.00234217405872419 0.00581584728253081 0.00114422450292515 2.34341086019598e-05 0.000117137723770792 0.000785248949096863 0.000181337693809127 0.00290347749158454 0.00817139585693423 0.00035921462046048 0.00241912064966911 0.00555054552698755 0.000626462902202943 0.000769309044902832 0.0011183238371042 0.00350113087627519 0.00341254261956086 0.0022791013802419 0.00183944185533221 0.00132124077981296 0.00235152264410076 0.000636690775383797 0.000993309874585856 0.000227051217587839 0.000121604774611625 9.0572598339621e-05 0.00104313705442172 0.00382558775356055 0.000394937560233251 0.00269172700955196 0.00894657809146099 0.000183850736463619 0.00234879404246142 0.00059277741494924 0.000620787193962055 0.00197594817386416 0.000109196983392713 6.5510765769737e-05 0.00100016344527525 0.000354799860174571 0.00335703296680638 0.00516634695534852 0.0025073878779604 0.000169313119512197 0.000314162842656183 0.00191798089480646 0.0043522422547066 0.00148630889460997
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
64 G[T>A]G 0.000242932687993135 6.36128439391058e-05 0.0116525307841752 0.0131617368574235 0.00412278383242369 0.000194828512577401 0.000290378300035954 0.000659214336815492 2.22233205585236e-16 0.00134936380123729 0.0156553639414538 0.000790759520378531 7.27530898697516e-05 2.20406519549762e-16 0.00193290004674917 0.000539499844173451 0.000119943417377965 0.00251933976702705 4.68620895156323e-05 0.000120505387176107 0.000187173212165083 0.00557591553253315 0.000695089646217959 0.000240614043202749 0.00183444800825451 0.00048908065122771 0.00214543274809031 0.000744502451702263 0.0376796098478996 4.72750093431439e-18 0.00250224386182608 0.0382912436554116 0.000609952427170116 0.0015785531514752 7.17650365039881e-05 0.00367274204917463 9.90541319368099e-05 0.00580470654487005 0.0131303018279537 0.000827427450592739 0.0065816430520036 0.00112734769574667 0.00117119940155794 0.0010823372725733 0.00121818686051479 0.00668914325827669 0.00442386163055686 0.00143497118558509 0.00783191997624903 0.00450735561362264 0.00222028342634326 0.00103639207852548 0.00240367073424711 1.31534374853531e-05 0.000141398225953173 0.000110389330898973 0.000199335261987445 0.00429807225740033 0.00128743180775187 0.00398053471042074 0.00264898911311506 0.0125251414650742 0.000435674419437979 0.00246281282034494 0.0203975292617059 0.000508136882243899 0.000360329183678 0.000339710084222061 0.00353183121750494 0.00307251413692719 0.00678217195725702 0.00289394347896804 0.00915753841579621 0.000155194432857324 0.000118471693902758 0.00602389868101019 0.00445386746267036 0.00223710893216686
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
65 G[T>A]T 0.000257267500406029 6.32263555982741e-05 0.0124761834984729 0.00560009453413295 0.00326151204421666 0.000250198070942701 0.000309386927499133 5.67216668856313e-05 0.0205194816993941 0.00884125192329322 0.0284747068870532 0.00259401539779767 0.000428699082788376 0.00010827036234572 0.0129575322556898 0.00694070915374161 0.000166912044798336 0.000927360272458488 0.000360430214687028 0.000869001269360813 0.000848976649800963 0.000979974335224901 0.00484743087611687 0.001592851863081 0.00350223101019034 0.000287570955616168 0.0043733892200774 0.000949327781446514 0.00945595538417047 5.89559960696741e-18 0.00132927841802348 0.0204456937354964 0.00084483677046417 0 0.000327456139280693 0.00108419522957727 0.000193750762896379 0.000801485798661195 0.00623445505545553 0.00177808064963074 0.00761267193144365 0.00290683422205395 0.00113208067072501 0.0017000532050864 0.00187051302239265 0.00414173534058393 0.00584457762192489 0.00457994170659132 0.00330784351484288 0.00132493623654881 0.00322595003027437 0.000518168977922535 0.0012135546889888 3.32549413055113e-06 0.000230639812118748 0.000132745584466976 0.000795001546423051 0.000147701072387435 0.000817277892248883 0.00315661045765079 0.0018744003103419 0.00518032444066462 0.00541831475632849 0.00801648267692582 0.0027966720301386 0.00153419534356103 0.000643799658387428 0.000138027118826882 0.0118111962009421 0.0026752879614532 0.00699400841081462 0.0151952479061407 0.00392344186977503 0.01692449131716 0.00073165142272004 0.00417721129568998 0.00526556510634091 0.00736371677923893
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
66 G[T>C]A 0.0010260706517501 2.20022003325224e-16 0.00992041703265284 0.00288321497036462 0.0139960335024143 0.00254090334636889 0.000100074781978629 0.000264509673571173 2.19910552204928e-16 0.000791265794663574 0.00258195718342201 0.00945349238148439 0.00216964351113353 0.0144419526004258 0.0126233384319343 0.00240585199367947 0.0008068914190628 0.0706187034160653 0.000283167108680238 0.010930877312925 0.0127770006129178 0.00204798863257202 0.000121730174520523 5.87838481001599e-05 0.000702303275295736 0.000950013344207623 0.00275094243353302 0.221413556713498 0.000716881730337696 0.000217911114657455 0.00367933327279999 0.0173584633194777 0.0828926413185722 0.00475581083660253 0.00048630906478149 0.00107243311457729 0.00092948933417067 0.00450961821701845 0.00906539491111425 0.0120787325276581 0.000108713820953439 0.000562762855954787 0.00231791740087108 0.0304448860474641 0.00169361456614838 0.00741314309537497 0.00596588030175729 0.00601751089820704 0.00580506818897233 7.43374555095132e-18 0.0268421331213336 0.000651181009731973 0.0219024716097249 0.000414325003499728 0.000153618915181296 6.54420580456237e-05 0.00136787766888728 0.00116986445556479 0.00238994005912854 0.00558015431240467 0.011319264706233 0.00258791645704059 0.000721831034634406 0.00382402498859532 0.00215695462605812 0.000706943665694068 0.00075373505161909 0 0.0214358534429695 0.00441706788993455 0.00296571435486354 0 0.00501077405736071 0.00327180687270248 0.000168823777342294 0.0290375794350249 0.0113209407452195 0.00412193803803344
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
67 G[T>C]C 0.00186091042224142 2.70954092443735e-05 0.00561904347780447 0.0011758310765119 0.00789933011770473 0.00109992203163003 7.35877267942486e-05 2.2125688705316e-16 0.000419969124097957 0.00229987530785403 0.00260771953200914 0.00973370288200549 0.00620739304413374 0.00524831254486668 0.00602805562719978 0.00271483637369221 0.000859703959715617 0.0302626965319554 0.000179976664223916 0.0065136434715085 0.0115154548009422 0.00118574467571663 0.0147796211595762 0.00148530692605657 0.00224690016299988 0.000370287576209888 0.00225769234240221 0.0659776395852161 0.00123571362001313 0.000418777240519429 0.00363784481461417 0.00402635581098287 0.024675450150038 0.00195450437701452 0.000582710541130975 0.00357293248068154 0.00055298033002234 0.00655527392429912 0.00762464795896418 0.00787890631617738 0.000645765264333159 0.00202654809708359 0.00138993353896057 0.018089695887896 0.00215676740012954 0.0068530658345273 0.00455668956197923 0.0037222005074693 0.00330899594627695 0.0217557692315066 0.00115583316404952 0.000568830316565461 0.0572146487761453 0.00108546415425765 0.000126508192942739 0.000150290795047064 0.00534483557408463 0.00225560628586557 0.00202912781573475 0.00665953200881745 0.00440860299723828 0.00315030721399823 2.7055728843543e-05 0.00227380281446191 0.000773504810368056 0.00317349252166063 0.000630364404130664 0.00086476707415358 0.0115490279839596 0.00682768291933134 0.00384671138544204 0.00344423130356569 0.0016358618036458 9.23782409696137e-05 0.00013371345035507 0.00267602255009735 0.00279759115544269 0.00113497639212104
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
68 G[T>C]G 0.0011554115648454 0.000106686117578124 0.0109493608230612 0.00238116918718272 0.0150466563227142 0.002447845414434 7.25945750089884e-05 0.000531592049047859 0.000232243710341327 0.00256878886605915 0.00281997260740288 0.00633209717460473 2.2224574028705e-16 0.00137009458098501 0.012747214947246 0.00353291357727016 0.00056544753906755 0.0416544224428775 0.000194427818203156 0.0110463271578099 0.00595551129616173 0.00429998531157511 0.00357046048488937 0.00100838250470861 0.00398967381030214 0.000959040865473267 0.0040894164118529 0.117394591440922 0.000583782755243459 4.72750093431439e-18 0.00268312896027134 0.013432006936715 0.071428639497553 0.00123670087663343 0.000731663063938847 0.00300040948826014 0.000503307506088659 0.00516085694543905 0.00964225218205451 0.207106991865413 0.000443479776857824 0.000192253044542512 0.00184188623834753 0.00985127350869956 0.00188265242079559 0.00575647410832207 0.00566775923189257 0.00352220200098159 0.00323558083960867 0.00120196149696603 0.0173804992197911 0.000912628752643312 0.0353539903828846 0.00311264551180112 4.61769031609313e-05 6.55311209791175e-05 0.00371625036167548 0.00456858030157238 0.000912180366112567 0.0025732749643124 0.121412001017773 0.00602208801640764 0.0016487678717263 0.004725396956109 0.0110986556276929 0.000992124684935613 0.000500457199552777 0.000199273236009542 0.00648410422332201 0.00268999269958545 0.00394526309873738 0.000578788695793608 0.00727969098729766 7.76188892353968e-05 0.000144152957016709 0.00930258451109119 0.000207995801906243 0.000952320760205807
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
69 G[T>C]T 7.10975689106584e-05 1.25848637735419e-05 0.0103461033889776 0.000765954958925793 0.0138766195670087 0.000914030049492286 0.000819976464711755 0.00695068726594945 0.00714644017806484 0.320949556119548 0.00637387566973541 0.00999101243058008 0.00532351677922656 0.0115287885831091 0.0106875087025851 0.00218758695152236 0.00024120825986101 0.046925443294894 2.23507004638325e-16 0.0113568427267691 0.00592262281884958 0.00243471884527925 0.00529177870642758 0.00148195711311966 0.0031884473069652 0.00239811821644578 0.000943838417728331 0.134749834506282 0.000846165964634997 0.000814979945669026 0.00404871823504863 0.0143727153982202 0.0559172538724487 0.0038071956665092 0.000860077699160089 0.00157056318303249 0.000451408845491563 0.00476421849901268 0.0130559204895092 0.00980975176586053 2.25937589409157e-16 0.00042789412849116 0.00267858372984042 0.040477457263962 0.00310057865124869 0.00760499569872501 0.0074044822211908 0.00394158699969918 0.00243253723091523 0.000523906084375791 0.0112603916151087 0.00141226446923986 0.0613856413513499 0.00323424581599333 0.000109828481961309 0.000177331887646722 0.00118339924849233 0.00405672123475078 0.00313407428470286 0.00709476112507366 0.00548135442105388 0.0127484546781981 0.00260321267622486 0.00541845487368505 0.0020394503613285 0.00120906785353485 0.000703429454062245 0.00372371661108632 0.054797422337911 0.00866319908405436 0.00657721357416986 0.0134419501876808 0.00411012576860945 0.00134769062842655 0.000153303176211338 0.0128556382310463 0.00595688928960411 0.0109047781857777
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
70 G[T>G]A 2.17917862228831e-16 0.000206208962757721 0.00439361155153563 0.00059453881113036 0.00250141875362299 4.3007508002742e-05 8.97700519531063e-05 0.000321190317907853 0.00245665842102802 7.39833518010441e-05 0.00130090919626263 0.0082420154166303 0.000201185125577837 0.000472556408218014 0.000351826927270116 0.000388904442713036 9.54505671252287e-05 0.000409211052143725 8.65287645688391e-05 7.74104856978961e-05 0.000201064428249792 0.00089674065367959 0.000489889726728934 0.000277617837246134 0.000862999787439676 0.000633342229471749 2.21271456610266e-16 0.000283965368699823 0.00158091810157688 6.25744760438378e-18 0.00106402340591783 0.00550511265274866 0.00136003495337058 0 0.00114891754612327 4.45854137449264e-05 0.000186891973073888 0.000302632215888214 0.00114061314527149 0.000575224885128636 0.000364041694018396 0.00175303119731049 0.00018325415348767 0.011701943171338 0.000502106906669871 0.00330465415095029 0.00247172079057831 0.00178737947471496 0.00113707521227293 0.0605602470884167 7.63509564340155e-18 0.000438103431623957 0 0.0218588730863166 7.47546822920449e-06 6.5640668236961e-05 0.00859384013713964 0.00217118911668381 0.00111596374661787 0.0043566980193106 0.000168796052636808 0.00562202540667438 6.64480075718247e-18 0.00138695206840244 0.0079846898313252 0.00122470522366719 0.0279307864069098 1.88315791673181e-05 0.00764440051129265 0.00138560270971262 0.00347655510498356 0 0.0126625802699482 0.0063425612130774 9.92322865170621e-05 0.000547252937012164 0.00371357991635767 0.0012719040412085
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
71 G[T>G]C 2.18412117978862e-16 0.000131521512025609 0.00233130527270611 0.000252106154540262 0.00170124112106739 0.00021106611958306 0.000120163494495332 0.000319925498847136 0.00164810578251208 2.21065600711831e-05 0.000652925195800761 0.00582230693862292 0.000823369172892262 0.00092756293006837 0.000616052840922972 0.00155980265448338 2.21923580298682e-16 0.000212037972411398 2.19531975042359e-16 0.00209153689452107 0.000575772740047108 0.00089777811161402 0.000202351860171379 0.006188778858569 3.67855336420335e-05 0.000701650043330328 6.64320976857288e-05 0.000530408475096834 0.000235184205099273 8.70615842132499e-05 0.00152490481270129 0 0.00120392317264299 5.06575624246622e-05 0.00191589666845449 9.1264041358913e-05 0.000351715417113308 0.00087004548888719 0.000735624444541524 0.000632098655340679 2.21919332325018e-16 0.00506137874493289 0.000310749426924756 0.0068184238346685 0.000937594717000755 0.00576890883022617 0.00222859926175403 0.000945478738528298 7.04786145657176e-05 0.0751021074841051 1.82342645707813e-05 0.000518932920375509 9.93309874585856e-05 0.0103567222057611 0.000132392294940075 4.34947532685872e-05 0.00952731843038506 0.00526639353087557 0.000555288148598631 0.00173466851726682 0.00152261006450893 0.00318012084693828 9.10777099165419e-07 0.000169790515839732 0.00266759992293599 0.00164662347822014 0.0285897556519104 0.00122776362537931 0.000796131332357464 0.000683962569162334 0.00122340592409034 0.00172211565178284 0.00126320417945036 4.61891204848069e-05 0.00137357220587355 0.000293163244264247 0.00269136304088414 0.0006308831131858
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
72 G[T>G]G 0.000343660875697606 3.69911678705458e-05 0.0109493608230612 0.0024414519514152 0.00531648523402569 0.00027375903818568 0.000325423956936844 0.00242180876787399 0.00603633436792328 0.00379820921829758 0.00398408941330585 0.00398390265977509 2.2224574028705e-16 0.00171758233703193 0.000615079239446457 0.000200028958986233 0.000131030624026348 0.00049784562726909 0.000424750002843816 0.000784289228204497 0.000347321415087079 0.00067815188909187 0.000835107704448914 0.00147762980887995 0.00584417043066872 0.000513232782152536 8.76303516825622e-05 0.000213718358777064 0.000452155318174796 0.000158593514249436 0.00314539087852033 0.00871075673731746 0.00235754638791081 0.00476582289044104 0.00313283911098302 0.000772680704334551 0.00138635600479511 0.00256533824773286 0.00301696248107943 0.00542280142951952 5.69468349828796e-05 0.00406650418822906 0.00153156844819116 0.00985127350869956 0.00217461456091897 0.00774215681467707 0.00446398735963221 0.00120417162426721 0.000413267334654067 0.241393933974013 0.000103479272811473 0.000180110856365108 0.00120183536712356 0.0273109541680614 6.5557359305562e-05 0.000147520287655901 0.0351591341495443 0.0763433813552225 0.00136727254001556 0.00475452757078032 7.47536700481332e-18 0.299601383844574 6.71498187757619e-18 0.00086198448712073 0.0233971659178392 0.00230422467393769 0.662605332207878 0.000214219710441097 0.00195296440864165 0.000456055463911515 0.00322299056465838 0.00289394347896804 0.0486162200229446 0.000232792153304749 7.29925210166147e-05 0.00155148392782397 0.000869002521479564 0.00198430154698029
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
73 G[T>G]T 1.45585484725892e-05 2.24513969719987e-16 0.00591350811350385 0.000255656489601722 0.00238029605711464 0.000793975329967362 0.000844242106084236 0.00185689893382299 0.00682298036802513 0.00690344328257142 0.00130720184641632 0.0196577729364354 0.00222400228394909 0.0051729173120733 0.00755679904096867 0.000956925289639712 0.00015673448109112 0.000167228901590875 2.90961821353495e-06 0.00228150858350272 0.00140485421812302 0.00242457418342393 0.00731154157147627 0.114927286323566 0.00216611975774778 0.000346507759240682 0.0036207594473199 0.00262407572459602 1.988591475641e-05 5.89559960696741e-18 0.00271943981702514 0.00280369166570916 0.00612861206391874 0.00233508000879232 0.0208197421888341 0.00116525655515314 0.000162304303996966 0.00285446780004811 0.000794488184826719 0.000455633166467878 0.000424396282809091 0.00340485826709118 0.000494274507129042 0.0173041129803437 0.00339538776890841 0.00601513641150819 0.00555082935323195 0.0035160171951044 0.000936374164201676 0.0754505673637723 0.00284045914615354 0.00050394473146976 0.000606777344494398 0.0896261222989999 1.14820685686823e-05 0.000103359157371233 0.0369180107435641 0.00211435096773794 0.000870688161409413 0.00206042418939908 1.22595912189929e-05 0.00145696624893693 0.000115025676391331 0.0028608633008449 0.0170627282705207 0.00756937437717197 0.047905971440446 0.00136248770502006 0.00296625374256225 0.00223715800859468 0.00247422285898217 0.0134419501876808 0.00381708689401689 0.00293145720568238 5.42106380413572e-05 0.000202477354595169 0.00622948132939878 0.00215290899981331
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
74 T[C>A]A 6.506497550281e-05 0.000637963041647135 0.00845919028028641 0.040040132747806 0.0078948124438419 0.000356154495115312 0.000391022093072092 0.00291804060605724 0.00252596335392387 0.0114096065056502 0.0299450720527654 0.0170819584732253 0.0938052110346799 0.000443380766099058 0.0603467544188773 0.259270928087085 0.000181665513453229 0.00349754082855578 0.0788717380408331 0.000348919482513261 0.0172385630822092 0.0108646936994442 0.000190274305032279 1.23964160038532e-05 0.0740766285648105 0.00139057311147815 0.00172465384483994 0.001466849682889 0.000788790589583101 0.00215444743386719 0.0299858992926758 0.00696572152109804 0.000942249143754519 0.00712792864386929 0.0143317861882612 0.0454169855156073 0.000700124780608385 0.00187364767545511 0.00976532681924909 0.0119218020154473 0.00430942718931665 0.00531154667980821 0.141330085356338 0.0020069630798461 0.0178431832378877 0.00600504651434943 0.026116009727491 0.00332587302946943 0.00514740010638031 0.00631859308492106 0.000858095655373576 0.064481831247594 0.0123350062544647 0.0169912450173198 0.122772227895258 0.0330598472252415 0.0190570285389419 0.0358141926038485 0.463684985756471 0.00268737343199207 0.000672160353907887 0.00174579161603381 0.219124135272306 0.0143351705606645 0.00737879447313912 2.38785645055893e-05 0.00202450491290559 0.00210070559161911 0.0019533948315411 0.00860267313249987 0.00399402415779895 0 0.0158040535948872 0.00203572597910949 0.332762881443723 0.0149367805447452 0.00993812103637309 0.0253991296555422
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
75 T[C>A]C 0.00249718027421162 0.000169414891007159 0.016867475091287 0.0470970035386436 0.00919383285851163 0.00049730837414768 0.000636504974589714 0.0035354442567514 0.0142076695255304 0.00775238859864091 0.0251762369482197 0.00246735616605835 0.00993121232576557 0.00377080075067665 0.00855039528612613 0.0143971225176233 0.000944954334462 0.00288924276387019 0.0292987874938127 0.0243898997939911 0.00581241674741198 0.00589440306962073 2.5890134404874e-05 2.22529359255909e-16 0.0436836916732799 0.00113658306834887 0.00339268648640506 0.000236675201748481 0.00174744253930744 0.000670397483955859 0.0521286129615447 0.0102191507752106 0.000631700848231911 0.00630094406183251 0.000452179339655883 0.0412220598749574 0.000243994749606079 0.00943160969666331 0.00930674155289207 0.00511003460894505 0.00122902155730583 0.0232396918282597 0.0772397405745322 0.00159262859644456 0.0115719062603012 0.00787853983675553 0.0210552676268202 0.00172509936756941 0.0544025815230614 5.37603542264624e-06 0.00222919286273907 0.0645654844945392 0.00710723390754229 8.13893068164707e-05 0.0037456367652823 0.00512547172437293 0.000887040201267274 0.00286392064000015 0.046683015710005 0.00365700992591482 4.06171826398593e-05 8.2924238018456e-18 0.0131834182087822 0.000709448802203658 0.000428729350127018 0.0203151126996246 0.000163065868349608 9.11789405397148e-06 0.000169902788738633 0.00396026779643529 0.00415943478964696 0.00231397444176708 0.0168223563911679 0.000791090396643958 0.0450045555380909 0.0128844824907481 0.00404940576548026 0.0203949448849805
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
76 T[C>A]G 2.23914876101514e-16 8.64769572871816e-05 0.00144015295005676 0.0111351389815758 0.00234586931440499 0.000203177276829163 3.5022878628519e-05 0.000306528807259219 2.2596240412213e-16 2.25618910291813e-16 0.00193873926790096 0.000454051859720809 0.00117547611223964 0.000578433344129076 0.00270563403592722 0.00782571014718985 2.27514807541004e-16 0.000515384833945259 0.012266944423306 7.22912459698431e-06 7.82628506836997e-05 0.00152207729457011 2.2575440092516e-16 9.65409751521733e-05 0.0129444998484509 0.000291619330489473 2.2736076008153e-16 6.96803248449787e-05 2.26806418126163e-16 9.36715797567612e-05 0.0100032290512064 0 0.000125465618537268 0.00148236378177522 0.000131283667559097 0.0177535752847651 8.43728976999751e-05 0.000976866155803043 0.002425535340656 0.00139370936563288 2.27510452542272e-16 9.69208186579594e-05 0.0149619965685973 0.00114125874331523 0.00243631104219654 0.00306929332439628 0.00323332561924061 0.000211205257322121 0.000926494592776608 3.12661870226384e-18 3.21776210807406e-07 0.0187225580539805 0.00254583925512581 2.44001842816666e-05 0.712822491385562 0.0413253628041907 4.26748805167897e-05 0.0046248697801856 0.135977345513178 0.00045685774157197 0.000844760929428342 0.000100965620158701 0.00554747623703222 0.000227001327851087 0.00277547474852049 0.000648643147397545 0.000208630612990905 0 4.07039849150918e-09 0.00109937891115893 0.00321206932523599 0.000588501096565764 0.00198809975216506 7.8921377976491e-05 0.322250264977325 0.00244456919415456 0.000178249064939074 0.00266469983613681
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
77 T[C>A]T 5.83920556565815e-06 0.000441166370976711 0.0100712416848926 0.04172703727096 0.012810853164459 0.000750523154758313 0.000617237388477755 0.00142484462134252 0.00375483102952255 0.000191979229431825 0.0321925102694674 0.0275490386880618 0.67147365110273 0.0814680293180893 0.190119224490231 0.343736497805367 4.79420044428837e-05 0.00237195514914897 0.0355940769058342 0.152485221068715 0.00810258428624253 0.00934524143409597 0.000289650373401285 0.00258025507980149 0.122981486612632 0.00139652556062946 0.00091564962639986 2.23996272572608e-16 0.000400125201180533 0.000243793769296718 0.023040437561744 0.0247968666317603 0.00141236195465111 0.0099186862922859 0.000560627684109871 0.041474079305438 0.000671804512708742 0.00454230599029751 0.00971641459533377 0.0128783426198899 3.24337161985214e-05 0.0154866284737517 0.209379377884137 0.00245897591782413 0.0281448492292426 0.00660558907439019 0.0243111541920133 0.00595366980526497 0.0276716757226395 6.56723406891612e-18 0.0167706471460481 0.0627341675820332 0.00302141637663112 0.000193862937089704 0.000185940981795027 0.00883014954820324 0.00186349560716381 0.000372772386734504 0.0612195241442479 0.000880420151763079 0.0072649784943258 0.00409095074215495 0.403949630320906 0.00623178609232128 0.014780540718661 0.00387537474277471 0.00040864723117822 0.00121887781000462 0.00207587186264321 0.00916523166396043 0.00413960090993807 0.0104765472826376 0.0188704972724426 0.00146700246036748 0.0765587901468176 0.0133213663911087 0.00882842153142627 0.00823953378469698
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
78 T[C>G]A 2.20508959530801e-16 2.22638119385464e-16 0.0133777920009285 0.00360159988033029 0.0078445909906368 4.97215685596377e-05 2.23584427577119e-16 0.000255580108254669 0.00194459083595727 0.00374315160799404 0.00147715623884447 0.00270296872311623 5.53849916215398e-05 2.2069625577128e-16 0.000259442285161032 0.00012104566612367 1.57443444992799e-05 0.00097388421346855 0.316485328594229 1.98089735029142e-05 0.000214479796487952 0.00252503529496343 0.00375541391511077 0.000159953754888429 0.0021480214787086 0.00176340793122229 0.000130105465487925 0.000657068282609183 0.00358175318739266 0.000213421788049755 0.00377339336736691 0.00983632145630559 0.00131593430524351 0.00288942870168148 0.000115255623192311 0.000107513660401991 0.000127752653932852 0.000398905634129153 4.72710064940013e-18 0.0130238173277997 6.23706323887046e-07 0.00668226840362969 0.00398931730296613 0.00179623195646226 0.0026815179329255 0.0348453367973119 0.0125557739074476 0.0199954299959038 0.000564195423424823 4.43304467227795e-06 0.000677020370535072 0.00332484442370407 0.00280796890345538 0.000138745077656221 0.000135643509852019 4.82332117571912e-05 0.000934797399910202 0.00205655727837226 0.00197865575818494 0.00376433581859563 0.00471215554533331 0.00708349931563144 0.00113064051533199 0.00228560761386819 0.00213254168626681 2.36770576321245e-06 0.000530179751944088 0 0.000952386810509845 0.0424270732471129 0.000637707704376168 0 0.0225630776534162 0.000652675080974451 4.86202391600237e-05 0.0195666998636049 0.0128721772983278 0.00613122670409679
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
79 T[C>G]C 0.000200366638602751 9.83602926023915e-05 0.0203815324019718 0.00597499298624583 0.00761975242363014 0.000112843064816642 5.09404138468812e-05 0.00162710786816399 0.00461248989526021 0.000587423259793925 0.0013440700203432 0.00200598062281167 2.22132432161055e-16 2.20294149118478e-16 0.000396011860315361 6.53862008428566e-05 0.00022566073658794 0.00155497440416625 0.0632813947570443 0.000150554936999945 6.12254569606907e-05 0.00525174242829923 0.000722724601340692 6.1669571309485e-05 0.00464890663678942 0.00313817625951194 2.83898394411343e-05 0.000632805306369882 0.0015265015285904 0.000268562847488341 0.00560457919702156 0.00327613951322927 0.000747011320528213 0.00312534864948949 0.000136053960604425 0.00685028391596007 0.000990036309101209 0.00293606613158388 0.00110198231519713 0.00251001699969708 0.00014103526067444 0.0056640461035975 0.00241124060601842 0.00111183505789526 0.00219363092586578 0.0367865664133496 0.0141371082637222 0.0142420994299336 0.00188394124903935 0.00103115763227665 9.43892473412037e-06 0.00202144273884772 0.00240244526452133 0.00119424506919359 0.000345903131358524 0.000153463243410774 0.000493578802736756 0.00361494877986033 0.00143640048338477 0.00501331855228433 0.000518495887032278 0.00328492150604513 0.000293630678286511 0.00280177242055042 0.00179886440612735 0.0021019101753572 0.000348140626905911 0.000114671103994666 0.00187464364085007 0.0475270247859188 0.00282789809149197 0 0.0166282009855418 0.000325743460097015 0.000152581616704585 0.00410428811754355 0.00708326795390717 0.00537286686481147
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
80 T[C>G]G 6.96847192889911e-05 4.17684717494946e-05 0.000531120236900364 0.00186947746204437 0.0017441028381011 1.98097844908434e-06 6.46497904915974e-06 0.000371921619474519 8.90617583814701e-06 0.000887231120201587 7.97944267104501e-05 0.000412217868151026 2.25975149163311e-16 2.24105065264668e-16 1.05757456552712e-05 1.98987027343043e-05 2.27514807541004e-16 0.000218400701909476 0.0139903994249275 1.86854491701713e-05 5.94349867350853e-05 0.000448450961286094 0.000386426452034058 1.57348592519315e-05 0.00091630750895727 0.00045124254296792 0.000126994298423918 6.39671503335311e-05 0.000389248852730038 2.62937767738276e-18 0.00137940339316942 0.00209957099953792 9.59862984094057e-05 1.3085694073602e-05 2.5035490092665e-05 0.000915227415542201 0.00010827514716946 0.000425524943260802 0.00101607509858573 8.17914109466306e-05 2.27510452542272e-16 0.000158634919661919 0.000307382514538529 0.000876323677902763 0.00112602611193958 0.00980950225272167 0.0017747591727062 0.00196920843783426 0.000212150863611458 0.00149711058382015 7.84521047301867e-18 0.000182110127519592 0.000101833570205032 0 2.83520370339532e-05 6.45900114939571e-05 0.00010490483754724 0.0022003785738328 0.000589573415993705 0.00191123932156506 0.00125489848212181 0.000233311069791549 8.5244186133151e-05 0.00135386442171276 0.000640494172735497 0.000414354061034709 6.70671092492714e-05 7.38159678708497e-07 0.000173422439188242 0.00473003312690644 0.0264444140110294 0.000588501096565764 0.00371111953737479 6.31371023811929e-05 2.6097945175113e-05 0.000304808871720656 0.000714393794841778 0.00106549286484803
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
81 T[C>G]T 0.00154917698680726 0.00118312799489209 0.023738633861081 0.00341494881297445 0.0126091074453337 0.000128603699878265 0.000282942424408236 0.000721517063573445 0.0123818824834122 8.57373207881395e-05 0.000251283230630012 0.00568135852797758 5.46198716195504e-05 4.33298097108465e-05 0.00034956676821185 0.000169643991285802 0.000187511011034534 0.00307849498081038 0.369977869809939 0.000324157324258659 0.000175136604447975 0.0287934465807281 0.000284621721085291 0.00150598545513706 0.00320558301170631 0.00162927982073437 0.00113443316545115 0.00069317765431253 0.000392041863782947 0.000473366235384462 0.00411292021387271 0.0165312444211735 0.00222951422841352 0.00215359855275932 0.000143931344394454 0.000339058166584603 0.000110115326143237 0.00428939363003595 0.000697485363067528 0.0202230223952958 0.00217914030708815 0.021458596316571 0.00764033402952211 0.00256983138952931 0.00399899836170894 0.0511302848964249 0.023907649558121 0.0450057073414945 0.000386187122722551 0.000252818366763489 0.00261662506676293 0.00332895824749821 0.00493498008183083 0.000932965384744199 0.000147161846554353 0.000548983011911151 0.000424071162495115 0.00335495148061054 0.00242870899064065 0.0037804493313363 0.000313806709963239 0.00212608523791797 0.000412993278760926 0.0129870824864208 0.0181991691842016 0.00153800773081399 0.000765961928390703 0.00501551250117683 0.00629992279922379 0.111847168532856 0.0126487249246281 0.00407421243988069 0.026298275375986 0.00145139680608517 0.000267473453476966 0.0232248281125798 0.0259612339988245 0.0127448289486098
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
82 T[C>T]A 0.00109760065057932 0.535130188298692 0.00579369037032696 0.00376256523811042 0.020389910001271 0.0120052077005162 0.238623738849123 0.00665112014001324 0.0173409388979694 0.000207174433918386 0.00506453567603817 0.00429058604003952 0.000365241566369073 0.00271396746961979 0.00240986169800475 0.00133355688422947 0.00987049289762546 0.00554782338322641 0.00691874866611359 0.0035595820406252 0.0265594140510781 0.00639809740078382 0.000532768054090381 0.000107968784549689 0.0114427312417187 0.0442363475318049 0.00813915586424462 0.00361688962904137 0.00159971560897593 0.0154756083277784 0.00241497175511482 0.0111411396086727 0.00330490371316884 0.0189272681503874 0.00485075840218073 0.0064206756071843 0.098580788074169 0.00753488420021733 0.0248900416359072 0.014726931901435 0.00187717437286393 0.00298333551655262 0.0107250490305873 0.00403399579049066 0.00650217694262011 0.00389625091566485 0.0301338573778742 0.0117561070830188 0.00486479774759865 3.73097877395339e-05 0.0014083633265217 0.00241806867178477 0.0185526516835445 0.00727908958138434 0.000211881102980527 0.000187908554137391 0.0194582291397617 0.00170543774304041 0.00146900200228882 0.00576728455629758 7.48519377670217e-18 5.8393719570786e-11 0.000200113365545486 0.00816002016530134 0.00429511917093173 0.000162213033139235 4.07907673045829e-05 7.13824753579124e-05 0.00384132478010997 0.00863080713015338 8.69501701560525e-06 0 0.00950816766434587 0.0021297551747563 0.0363320171545319 0.0172061912410375 0.00860529004666546 0.00954203733603471
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
83 T[C>T]C 3.68161360585349e-05 0.0969651111470385 0.0133534177806022 0.00701936150821149 0.0230597770715122 0.0104854175272101 0.331262809102509 0.211925777890496 0.0137073994718145 0.00564445819359809 0.000252765406810811 0.00735191898260476 0.00274926238907853 0.0481273253704783 0.00902575198676153 0.00358161739904225 0.159171412414708 0.00264847253354768 0.00446457714191431 0.00013750684245995 0.0095639766101994 0.00369529868759868 9.05654894626094e-05 0.000602725260047394 0.0114218826852154 0.0251456431050637 0.00925186611574555 8.09308846656884e-05 0.0013256460643022 0.0440200757537281 0.012253739463022 0.00646211004903022 0.00253683039051862 0.00802943270399389 0.00413163865659026 3.62072107417509e-18 0.134548545050266 0.0247353516564944 0.0387697414528443 0.00317002146973695 0.000291137073820807 0.0126761955426871 0.00686353135157112 0.00250413301327761 0.00727520715321542 0.00529245424148463 0.0231607943895023 0.00648918192335704 0.0329437854778538 5.06568700904841e-18 0.00225931709061392 0.00203149966789672 0.012612837638737 0.037232346274859 0.00031328940754472 0.00058376214160177 0.104122100374488 0.00177242641007002 0.00152617551359631 0.00579696353640893 0.000662912536418446 0.004116166887148 0.000183768859879993 0.0173109510269722 0.0152903474520824 0.000281595621578955 0.000958387128091559 0.0270812865866371 0.00300652264605532 0.00814589956335608 0.00614638852752019 0 0.0105676978610026 0.000992741205991976 0.00013319471448909 0.0174407393342779 0.00784993154349885 0.0198351019005519
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
84 T[C>T]G 0.110451284175635 0.0448098653234869 0.00101014983518165 0.000287061839800255 0.0162170965647997 0.0528260919755823 0.0754417240224782 0.0586491784555972 4.72281781588597e-05 0.00177852744599402 4.25502249849842e-05 0.0033263125004266 0.00282722271823155 0.441143754597567 0.00874744596137315 0.00540247893452955 3.01303393770519e-07 9.03199164438721e-05 0.00120641850113505 0.00543205407570007 0.0215757143627365 0.00308501572456493 0.0001799933737106 6.33454978916468e-05 0.012027173087537 0.00442033511478779 0.00270374957934791 0.000323406485737309 3.85162250601639e-05 0.00294777888050334 0.00274858898342648 0.0143708500453809 0.00268272013620337 0.00471289450619571 0.00177080295777387 0.0146926140287711 0.0150155156923684 0.00860255955005612 0.0100384550863284 0.0039166285092603 0.000307446557489558 0.000782940087363664 0.00395933106475126 0.00349510490140288 0.00355210055311848 0.00495573606530429 0.00216235025640066 0.00501995104359824 0.000373057557268457 3.12661870226384e-18 7.84521047301867e-18 0.00179040855707464 0.0037678420975862 0.00198060073248674 0.000404167336441461 0.000953034292817631 0.00404341946662661 0.00661132265934022 0.00222231631846164 0.0104249417539913 1.21408877538614e-13 0.0049005512912548 0.000156467278480396 0.00468253860141257 0.00339563577291518 4.64485786937674e-18 0.00176063883158179 7.08469483587074e-06 0.00016114187351386 0.0139689992321828 0.0603026197817845 0.0094160185649247 0.00248848508855666 0.000299818215120846 0.00207214390759922 0.00367696131062085 0.00987675811588531 0.00519676515731741
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
85 T[C>T]T 2.21452864139757e-16 0.300795252938667 0.00825296334659709 0.00729465397327677 0.0211833005081606 0.00702296767303963 0.107739642034453 0.103073866224778 0.00233544450093628 0.0502563427832001 0.00531832379686813 0.00550980773761236 0.022850148127078 0.12779298716563 0.0128904529991591 0.00815736130057871 0.120615190881674 0.00617717681395393 0.00142376307623337 0.000362531088501118 0.00175136604447975 0.022327549804705 0.000349994201193219 0.000898571321565108 0.00378016864588009 0.0636532302634731 5.06443377433551e-05 7.37573311939531e-05 2.24312612783026e-16 0.0267157338854321 0.00475966933841289 0.0124992335867409 0.00214880783100489 0.0120318416797352 0.00200296066674801 0.00431895521720863 0.0530371983717428 0.0197271641004012 0.0675310972912202 0.00909532947529722 0.000818951334012663 0.00813807143326562 0.00838524143160992 0.00588541777052987 0.00666162258735312 0.00426589950911 0.0225962594979708 0.0116046106373809 0.0153055788795552 0.000842056392885563 0.00305104544464249 0.00298493216720965 0.00443141068572565 0.0816849563049845 5.81687028610112e-06 0.000314857903890219 0.082396724684324 0.0427177005338999 0.00165593794816408 0.00779338618839648 0.000238129850647345 0.031639372734893 8.23976857868515e-05 0.0374511215887482 0.17998073392111 0.00211476062986923 0.00393549427070649 0.0170508863104629 0.0389961637844122 0.0131029906477728 0.0109633631917369 0 0.00956156896829502 0.00280915461806003 0.000139907371957077 0.0248346248027133 0.0105472386862582 0.0130645882495569
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
86 T[T>A]A 0.0065253612191273 0.000413733817388 0.00643024757567479 0.00877282184314081 0.00622389901853831 0.000446023963298285 0.000350510146653627 0.00320149074625301 0.0151586712077381 0.0164133108283281 0.0113480396930534 0.0256552349256455 0.00199913989547118 0.00298728958497681 0.00980954147865275 0.00877529856580903 0.000184343079106361 0.00370108214431743 0.00029020169081303 0.000197487516363174 0.00107278581156196 0.01215102041542 0.000117027361175677 0.00116824875207666 0.0106454128609929 0.000488827463385557 0.0118850492057889 0.000253559441412713 0.0709388281187948 7.71775921775898e-18 0.00407110156831556 0.0214870620857536 0.00111469297487924 0.0522008909862533 0.000185027397259894 0.000753853814099974 0.000278566716929665 0.00662771301086193 0.000504612274966615 0.00403359888328081 0.269571815761301 0.0042559130880413 0.00242138876619669 0.00241428968838813 0.00241547642378506 0.00659713265629059 0.00703293997976377 0.0795292012884156 0.00842462511285799 7.51481483212475e-05 0.00687558759028617 0.000402685234575741 0.00443160132844132 0.154019959127338 2.284863297421e-05 0.000414446181157301 0.00166457050711373 0.0198014463610974 0.00103040571691281 0.00306402538679528 0.00152929891630142 0.00355683946944266 0.00925573497525409 0.00297295049570442 0.0116998096175019 0.00206785490609615 0.001112140910109 0.00650476297210115 0.0593707737932649 0.00387015296922231 0.00810741604307919 0.0210574724521941 0.00699047996016806 0.353858270440413 0.00224474568000669 0.00807869210348304 0.0203893472984475 0.0101890035374383
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
87 T[T>A]C 2.23458694616433e-16 0.000194252630197133 0.0107026941471358 0.00439400679420254 0.00421396214023788 0.000115575106095981 0.000395236739337946 0.00228408556334877 0.0347395051865414 0.00124750399248433 0.0198570498946921 0.00188378565808845 0.000364059718848336 0.000669938063263316 0.00251447399103396 0.000772442682370524 0.000206596220576125 0.00656922717834412 0.000234721743345091 0.0017628398742663 0.000159456888467747 0.00476081855088227 0.00578458778890884 0.000245166338049978 0.00277688893997694 0.000485042024679598 0.000325015421350811 0.000809414353469721 0.024061831345353 5.40179292099938e-18 0.0033344144860323 0.00346842281204361 0.00128263910220536 4.80531664022458e-05 0.00126953685575951 0.00196520652192813 0.000245671212859929 0.00382804707195444 0.00249178773598336 0.000220305680327789 2.27046945793998e-16 0.00541323990076711 0.00103606427229589 0.00114910270888687 0.000948021229146009 0.00375502277366526 0.0104843549534643 0.0145607828913687 0.00231151761637739 0.000953352904756803 2.11022145734663e-05 0.000267503640876975 0.00436992250662583 1.25318338059416e-05 7.66554129642911e-06 5.80431291283242e-05 0.000674901945619895 0.00262287547371257 0.000474951116655708 0.00363109635295613 0.000182251379150763 7.06641236201114e-05 0.000816230836739506 0.0093764738228501 0.000911098391625055 0.00189908249473212 2.26487034808163e-16 0.000883278944515535 0.00793576159560989 0.00174350938562631 0.00376158899907909 0 0.00322009182556761 0.00089762321045132 0.000226415558233373 0.0029023438711528 0.0105599760672084 0.00426668804569213
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
88 T[T>A]G 2.77413168349881e-05 5.01164213447466e-05 0.00676243311328127 0.00961631044803802 0.00482061500777009 2.95704621589026e-05 2.24021250029031e-16 0.00171391752160254 0.012252762053095 0.00561566906398245 0.0129881253907799 0.0168132966507811 0.000692915075108917 7.0322508776711e-05 0.00056842637007611 0.00379370876847167 0.000203256155633775 0.00278940119221799 0.000188061472942725 0.000359676136997044 0.000149625821581235 0.00522120993197726 0.00183622246876959 2.23371100591355e-16 0.00180021983072328 0.000376592127501802 0.000177855034227178 9.91554637678174e-05 0.0737911711696773 0.000187488956244335 0.00200632624642849 0.0102578058167269 0.000279804937026675 0 0.000322342061830407 0.000930249629541836 0.000191499425344798 0.00330042905088544 0.00176984109171656 0.000662501008230918 0.00785706516880736 0.0013935967918684 0.000875749015302043 0.00128696584543064 0.000812087418210129 0.00549358057312038 0.00505225026106534 0.00935278712526447 0.0053900478948288 5.16524137920779e-05 5.0598547874012e-06 0.000660211068692875 0.000502402661085017 0.000455328250780066 8.25371449609785e-06 7.58136811972717e-05 7.57740662619494e-05 0.00405078934560049 0.000778990774004466 0.0016135573454643 0.000331200006915659 0.00953013728186652 0.00637603775760901 0.00441943924295307 0.000831610799649041 0.000457304773950918 4.25775812429228e-05 0.000792026657737622 0.00677781021970922 0.0014018975719019 0.00486183811989271 0.00406477277502022 0.0101232942312586 0.000607239714605753 0.000740724291349451 0.00680483250978877 0.0103863989159489 0.00431830716060245
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
89 T[T>A]T 0.00222100529801663 0.000204312163335997 0.0130533460040592 0.00564409677378196 0.0087735028880773 0.00042544530033313 0.000798702934054665 2.22993398819892e-16 0.279174924610441 0.0272755905175756 0.0380184150597998 0.0170523155725394 0.00526987704693399 0.00150845124601523 0.00483578471589473 0.00696574839893689 0.000679055985310023 0.00526730603298707 6.17919226981037e-05 0.00182689182455662 0.000475238837186997 0.0071903901086876 0.00197941762563075 0.00130734873786408 0.00711424626391767 0.000676979479671814 0.00675575747023961 7.66252339497848e-05 0.0302313717024711 7.39116809280727e-18 0.00219983763776419 0.0145284853310333 0.00131365071990518 0.00193969342719315 0.00572276630184896 0.00120366828009243 0.00070393073433441 0.00892963381103051 0.000712343133593355 0.00272025456203673 0.0463441801276758 0.00544318821790856 0.002701624413367 0.00195339332066482 0.00251585019182256 0.0107261698271933 0.0210570955526898 0.0536632724546234 0.00354655022032023 8.78061896167819e-18 0.0139587706493175 0.00139803449848971 0.0034037595985473 0.00436589668498368 0.000421050076141754 0.000332031003160595 0.00295371983080816 0.00638930068595206 0.00133676649193844 0.00510418221159321 7.47220446660139e-18 0.00210333355056677 0.000743129899623465 0.0289208044713902 0.0145920557801525 0.00300730001692063 0.000530260204027339 0.00710568645938643 0.0629797270112199 0.00237249522360714 0.00523662460793772 0.0746321604361317 0.00636532191775049 0.163909572466399 0.000505797622185026 0.00606953144806548 0.0310814535437801 0.0174021363151163
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
90 T[T>C]A 0.000247614153404384 2.18631851368541e-16 0.0150137885023436 0.00238091223445601 0.017754387057637 0.00145399882308692 0.00211684498681263 0.00592868656713521 0.0297267448359541 0.0798060382790564 0.00205251500535226 0.0138143572676553 0.000715378492006843 0.00864947245846227 0.0167375253645118 0.00555310262293367 0.00011199337601623 0.0849768460335281 2.16670856992161e-05 0.00619123363798551 0.00336598850967147 0.0128425419024765 0.00205535449459803 0.0010406249388246 0.00177423547683216 0.00122701630485444 0.0136678065866573 0.0830727819725698 0.00457446760710334 7.71775921775898e-18 0.00144267191498561 0.0142918532221755 0.041727002510966 0.00170048357000674 0.00128928665111947 0.00255560389858499 0.000537376929112546 0.004540478017889 0.00088405705204112 0.0108218506624607 0.00138750199288905 0.000364226980557953 0.00292338399821308 0.047004742096373 0.00208879313696167 0.00585754379347774 0.0100611483581473 0.0627550521332907 0.00675952273761076 0.00013493179973802 0.0196586484262493 0.00126643022176155 0.0091586427454454 0.00135261117951572 0.000588230763804131 0.000170712355571936 0.00107359872944022 0.00439375376967633 0.00271830841509379 0.00702749048390789 0.00466682830587467 0.00480813756534077 0.000558095272393241 0.00482366140031512 0.00325431679276735 0.00202827873564455 0.000236206918961204 0.000428646185764653 0.0127892520535661 0.00151350677905568 0.00956572669599632 0.00398384576641482 0.00741177913020191 0.0100259902763429 0.000311950939530081 0.0341161315826666 0.0930893658915407 0.00877884198247231
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
91 T[T>C]C 0.00339697298094039 4.40103615290382e-05 0.00916354479835724 0.000512804041179555 0.00988347158978499 0.0011050602249528 0.000605555518368679 0.0017640482252649 0.0212296976139976 0.0145035017012406 0.00268833906266601 0.0138483702432448 0.00522830207346082 8.1601478382449e-05 0.0170293145742123 0.00657331707004089 0.00047762591588639 0.0471558478073384 2.51921181435033e-05 0.00293466984848956 0.0060126419091023 0.00374137132371262 0.0155270514333869 0.00111439244568172 0.00628614419379396 0.00056469103083751 0.0169662138189417 0.0557935931699882 2.26344345706286e-16 0.000194751547436411 0.00305909585874523 0.00753695396986603 0.0319641808009909 0.00356062740432777 0.00208204044344561 0.00152736258180943 0.000291543431028795 0.0105143692909682 0.00124080858689784 0.0126904193737206 0.00638186009799345 0.00083956286762841 0.00231590837336728 0.0458624178502637 0.00223724837481655 0.00655348148032636 0.0076851339707433 0.0272887399642434 0.00309907007859447 0.0364876005125471 0.0107040218850916 0.00112310688917814 0.0551829749092518 0.0178298448458519 0.000405350613057246 8.62500532836676e-05 0.0294761391912303 0.00399531031460868 0.00220766190684317 0.00513045355487903 0.0083387642192444 0.000996414980542578 0.0013384157819828 0.0271237108418307 0.0198858891713264 0.00228706709043008 0.00110704425085605 0.000550157253623808 0.0237459592049925 0.00203136204188779 0.00723387940834559 0.00234920857619671 0.00260158019603709 0.000456685618651615 0.000179689941696108 0.00443457820825569 0.0135319505150837 0.0049531619028683
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
92 T[T>C]G 0.000412156707262679 0.000117038349248211 0.00698415223174951 0.00175391825781825 0.0127811713149645 0.00213508760672754 0.000320460891297134 0.00384119162194451 0.0129557893840103 0.0228637954747856 2.23516576492492e-16 0.00937316118675277 0.000362955515533242 0.000665374445649333 0.0151853486858422 0.004983685382079 0.000156739821508632 0.0402801616204763 9.98326329770421e-05 0.00434230854469821 0.00132554419118947 0.00728751888189104 0.00235799060197187 0.00121201359513695 0.00327861265260217 0.00109040079812854 0.0121264796063986 0.0277836629440787 0.00122985285282796 0.000306063052896157 0.00204665441218585 0.00491771278860734 0.0304967251507491 0.00116004701320009 0.00141589503794665 0.000381563430299087 0.000204602017605231 0.0040473151357953 0.00169944968465966 0.321212610051355 0.00111232582827389 0.000442315503506058 0.00138593307467525 0.0100544206674269 0.00193931323751673 0.00501062843482408 0.0060486103723113 0.0206385507069883 0.00344841713346458 2.79365195217853e-05 0.0192516387329408 0.00125177633819444 0.0238138861354298 0.00159163415095686 0.000294633798718878 6.35304552928001e-05 0.00102506031282744 0.00248274185698094 0.00107136263262825 0.00475999416911969 0.0889911264782501 0.00418200117010177 0.00185466507100262 0.00297307730889571 0.00216680256603369 0.00136282879654247 0.000109456517817891 2.2628409469668e-05 0.00384875317052543 0.00185835743481057 0.00170973091970746 0 0.00874296358777756 0.000140132553011992 0.000150066532568895 0.0130375376388545 0.0110296892435734 0.00211769591848729
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
93 T[T>C]T 0.00427420130684977 3.56798802313596e-05 0.0139570391889557 0.000638726965858598 0.0185496918205062 0.00173773432530434 0.000812715266231062 0.00298329006529316 0.0881552360508237 0.0430614634178574 0.00458427854415 0.0385181716462065 0.00323763712713336 2.4909293601962e-05 0.019939416555606 0.00755050142446645 0.000106795154959736 0.0598967943179672 0.000529217918591825 0.00293105721302489 0.00135067880042621 0.00842561075585042 0.0209938233021443 0.000997976135774104 0.00337676195907078 0.0014786921769949 0.0194316123957711 0.0408199871957622 2.22968920862079e-16 7.39116809280727e-18 0.00368648590438109 0.0170333965950045 0.0575599628416469 0.00153768442673861 0.00206099625556099 0.000824512771863318 0.000446860451895595 0.0121676316569222 0.000685292128520189 0.00912085353153491 0.00713297381095531 0.00106650268225195 0.00280168457682504 0.0615068460968306 0.00307940063479081 0.00950318597773759 0.0102277321255922 0.0462406889749185 0.00237780071589652 0.00184222792354479 0.0372568626683224 0.000548150217033733 0.0365403603961695 0.0115420257189224 0.00052581840494698 0.000208647881140192 0.00511644350353549 0.0213310508794324 0.00199517386856482 0.00220042500854117 0.0125372558164453 0.000888408028263204 0.00028466669542028 0.195140376191041 0.0319825880112931 0.00262510135256283 0.00132064805531338 0.00988437743459446 0.0943261342137136 0.00344976232298314 0.00655752653440012 0.0966168280845929 0.00680553584923923 0.00403044424363779 0.00126728263738267 0.0143468343994853 0.0141231105401887 0.0168427697231051
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
94 T[T>G]A 2.16541004741874e-16 1.63728785554019e-05 0.00716118201592046 0.000372449756178388 0.00514877224671474 0.000103155321908193 0.000126026120145124 0.000943649278602353 0.0189975554746329 0.000207377759567499 2.19066505378943e-16 0.0648288051774966 0.00263612074451836 0.011031494219032 0.00859659068036419 0.0195621623423897 8.43419141502759e-05 0.00160873703872998 0.000180395645640532 9.79538081161343e-05 0.00022735185547781 0.00966154306201693 2.18319951100843e-16 1.19770040128868e-05 0.000686037717708436 0.00164261860165997 2.19873410307095e-16 0.000458774864812886 0.00499931017104599 0.000184749448456007 0.000121540168180294 0.00205014170359484 0.00141062916290027 0.00117649735366745 0.041631164383476 0.000460798077466869 0.00011656337800603 0.00222572451857304 2.22739011996982e-05 0.000460420555457419 2.20018173158121e-16 0.00424601561574354 0.000775631848684142 0.0180332658357154 0.00115824074419202 0.00827353407866637 0.00834483481469867 0.041343344094102 0.00113980222115137 0.000200920344135446 7.58685527203991e-18 0.000281978604064094 0.000689360206646428 0.00237941090703131 0.000243070563555427 0.000148016493270465 0.000322079618832065 0.00251212379207952 0.00140331445255744 0.00128491387188189 3.19672805730103e-05 0.00597076099302563 0.00929503745922545 0.00316983463449279 0.000784575468467777 0.00158304681806403 0.00158455474803141 0.00185709948363716 0.00701086419122068 0.00704063343239573 0.00803378080430973 0.0301634056325708 0.00676939937617531 0.018419132786527 0.00582790190338827 0.00218157236075335 0.0529606566036755 0.00402383671831976
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
95 T[T>G]C 5.52133366518629e-05 7.12259644056158e-05 0.00640123040419171 0.000177391457584975 0.00667719604829963 0.000290965398680233 0.000117859798877126 0.00158050563535294 0.0176744850949071 0.000116636552142844 0.00116087368615123 0.00877742290417431 2.25514770286608e-16 0.00559121240768633 0.000967472446635159 0.000749058448780639 6.88313150731349e-05 0.00115088786225254 2.24604426821595e-16 0.00122277910353731 0.000298600797512851 0.00561715422170478 0.00011772143570411 0.00886448536337729 0.00213606841536688 0.00206270503126902 2.2689755830151e-16 0.000385871748383677 0.000766715981851926 5.40179292099938e-18 0.00269200435569581 0.000588919885094795 0.00175090417126447 0.000285666382009104 0.0362579726004918 0.000101111402915784 9.82684851439715e-05 0.00242953387500041 0.000227820593004193 0.000166498302183214 2.27046945793998e-16 0.00198145007688457 0.000755717469204061 0.0198296485161894 0.000922481864136688 0.00516951644721396 0.0116040433465528 0.0157826667703646 0.000280245941100622 0.00838503354396975 7.8292274359527e-18 0.000137835845490044 0.00101626104805252 2.2924086230381e-05 0.00022274216856116 0.000140525470521206 0.000665754178284685 0.00352766585030334 0.00113421162186437 0.0044470730614856 0.000718823875309714 0.00574463738782201 1.01395134998696e-06 0.00402284250687827 0.00161319202971474 0.00237895817888486 0.0107657514303432 0.000753940163468971 0.00652019303583308 0.00241166967228635 0.00252345570499119 0.0211428792213598 0.00298027112627399 0.000188973253628445 0.000144874062526328 0.000306410169150267 0.0135181712277083 0.00125988308582045
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
96 T[T>G]G 0.000577613846957072 9.54312693870027e-05 0.00811290410758782 0.00233855767709101 0.00698435660833494 0.00032477388947405 2.24021250029031e-16 0.0013610521495079 0.00767304115456111 0.000125349755892465 0.00311110910523333 0.0109739481133841 2.15973529904078e-05 0.00274915190118586 0.00111349547850193 0.00315775722245881 0.000102133690144334 0.00088112853544792 3.67120003031808e-05 0.000114854564755359 0.000148621621436395 0.00528168726709669 0.000923128235665583 0.00478795453285505 0.00145827863382612 0.00208993486307971 0.00281940650848766 0.000131871733538925 0.00561498392643583 0.000184448594791724 0.00306494059755911 0.00948344204428778 0.00285843892502071 0.00237053085306105 0.0140585322916688 0.000181217460300358 0.000819415962133265 0.00539978453279423 0.000822573871036449 0.000962634040747653 0.00153703205361482 0.0048674902440621 0.000905877995186288 0.0303643504156291 0.00191911205795925 0.00732477409749385 0.00871563491251512 0.0195311162788085 0.00296300944312353 0.0229119656509606 0.000924280247021296 0.000714723909227149 0.000904324789953031 0.0015513396154896 0.000347211547311808 0.000112764041090232 0.00876326071358354 0.00277423786448073 0.00148188476288767 0.00620211104662841 0.00774142265404686 0.0799204550536275 0.000101254687660143 0.00542385725271513 0.006761226525494 0.00197862551201721 0.0240000988609871 0 0.00343249069551912 0.00202426962141699 0.00199416988005381 0 0.0050676413188152 0.000295834603098359 0.000627359679752215 0.00175661772288664 0.0127911359675955 0.00307375166944344
8c6ee1c2248f "planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
artbio
parents:
diff changeset
97 T[T>G]T 2.20126302870092e-16 2.22251767921597e-16 0.0105430871571248 0.000570435403471201 0.0135362615987478 0.001008684866987 8.29730241016687e-05 0.00177792034194239 0.0217136052474787 0.000165851576040935 0.000999111910278643 0.0640966450050156 0.0188281051393293 0.0902093541202528 0.0251381696414515 0.0145197508759015 5.5916331134579e-05 0.00221728501579075 1.88365699837768e-05 0.000607290963657555 0.00599301186263181 0.0158670619716849 0.00457865289161051 0.121753088564441 0.00517035362279086 0.00425501218278124 0.00152029713562769 2.22654475613249e-16 0.000597596882490708 7.39116809280727e-18 0.00397778860527223 0.00788546065898152 0.0094763353458809 0.000140703150159089 0.47923165359889 0.000930836803271484 0.00892716723000414 0.00734080256987869 0.000636199563757778 0.0022502105752142 0.000233735864991755 0.00364220727335101 0.00181108895859047 0.0291506387853057 0.00532353900589653 0.0109266589828417 0.0250679708960592 0.0881682551170355 0.00175312425663556 0.00132159829297779 0.00903805293840706 0.000728184875472334 0.00100110576427862 0.0036332289654347 3.16281747336529e-07 0.000365133791995337 0.00160201753535357 0.00291424216240133 0.00252389494373451 0.00708355995900239 0.000500487252192495 0.04126540108731 0.0289660847971512 0.11908566547043 0.0216881924951581 1.30752174648723e-17 0.0318156122416404 0.00664590542112645 0.0127454822235667 0.0049020668231568 0.00622207517854644 0.102402266411758 0.0057030189959015 0.00839340013737568 0.00100355099977588 0.00180187614429687 0.0551214850885336 0.00334864554898619