annotate COSMIC_v2_SBS_GRCh37.txt @ 18:8d9f31389f33 draft

"planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit 1cb9c8fd0c74943a8e6de4c63ac5e4a84ef27430"

Type	SBS1	SBS2	SBS3	SBS4	SBS5	SBS6	SBS7	SBS8	SBS9	SBS10	SBS11	SBS12	SBS13	SBS14	SBS15	SBS16	SBS17	SBS18	SBS19	SBS20	SBS21	SBS22	SBS23	SBS24	SBS25	SBS26	SBS27	SBS28	SBS29	SBS30
A[C>A]A	0.011098326166	0.000682708227003414	0.0221723067751109	0.0365	0.014941547714	0.0017	4e-04	0.0367180037768898	0.012	7e-04	2e-04	0.0077	0.000334757187	1e-04	0.0013	0.0161	0.001832019172	0.0505364186250505	0.0107	0.001179961596	1e-04	0.0015040703750015	0.000453360682999093	0.0286459925360286	0.0098967680010099	0.00203977290999388	0.00520562690902082	0.00139743884199441	0.06998198728	0
A[C>A]C	0.009149340734	0.000619107232003095	0.0178716753530894	0.0309	0.008960917997	0.0028	5e-04	0.0332457222459003	0.0067	0.001	0.001	0.0047	0.000648736139	0.0042	0.004	0.0097	0.000342235622	0.0109398247890109	0.0074	0.002211505148	7e-04	0.00245101101500245	0.000366800483999266	0.0202146384330202	0.006998928770007	0.00148716228399554	0.00473822741501895	0.000917187664996331	0.055152357207	0
A[C>A]G	0.001490070468	9.92789560004964e-05	0.00213833961701069	0.0183	0.002207846012	5e-04	0	0.00252531125599242	5e-04	3e-04	0	0.0017	3.8144594e-05	5e-04	0	0.0022	1.576225e-06	0.00228807269700229	5e-04	1.61691e-07	0	0	0	0.0204789964850205	0.00144844299800145	0.000283945613999148	0.000782697937003131	0	0.017846984044	0.0019673
A[C>A]T	0.006233885236	0.000323891363001619	0.0162651455900813	0.0243	0.009206905292	0.0019	4e-04	0.0335985495158992	0.0068	0.0092	2e-04	0.0046	0.00084665846	0.0296	0.0057	0.0088	0.003179664772	0.0194240913640194	0.0074	0.003008009987	6e-04	0.000922452518000922	0	0.0246001454250246	0.00496656500400497	0.000597865637998206	0.00271824245501087	0.000513409970997946	0.026804715973	0
A[C>G]A	0.001801068369	0.000263481044001317	0.02400261520212	0.0097	0.011671021651	0.0013	0	0.00835684480597493	0.0048	5e-04	7e-04	0.0031	0.003775165298	1e-04	0.0011	0.0048	0.001661704195	0.00151688758000152	0.0058	0.00069704107	5e-04	0.000527644040000528	0	0.011993038821012	0.00803256764600803	0.00127288129699618	0.0013241632460053	0.000255194995998979	0.009301971097	0
A[C>G]C	0.00258090852	0.000269866049001349	0.0121603036680608	0.0054	0.007292088583	0.0012	0	0.00430638030398708	0.0023	3e-04	3e-04	0.0015	0.000920824828	0	1e-04	0.0024	0.001626898399	0.0024987845270025	0.0019	0.002059310006	8e-04	0	0	0.00842511979200843	0.00163597041300164	0.00152819486199542	0.00177108412900708	0.000268898963998924	0.003479048871	0
A[C>G]G	0.000592548022	0.000219233911001096	0.00527541945802638	0.0031	0.002303839151	0	0	0.000584415302998247	0	0	0	0	1.9890489e-05	0	6e-04	0	2.5801897e-05	0.00261450898300261	0	1.2734958e-05	0	0	0	0	0	0.000307246307999078	0	0	0.000154433523	0.00482
A[C>G]T	0.002963986287	0.000610973492003055	0.0232776563421164	0.0054	0.011696245747	0.0018	1e-04	0.00863490691197409	0.0038	2e-04	9e-04	0.0025	0.003860632488	1e-04	0.001	0.0073	0.001328507581	0.00398301117000398	0.0072	0.000848587116	0.0018	0.000299454735000299	0	0.00388138318500388	0.00342844970100343	0.00249825182599251	0.00132271981900529	0.000307698015998769	0.003976789927	0
A[C>T]A	0.029514532745	0.00744155681703721	0.0178721707320894	0.012	0.021839187574	0.0312	0	0.0180666871559458	0.0093	0	0.0225	0.0121	0.001480180764	0.0293	0.0117	0.0135	0.009350488403	0.00382562391200383	0.0221	0.032858047272	0.0051	0.00311338969500311	0.0197671543719605	0.00631551813600632	0.020987618053021	0.00590723203898228	0.0137232857870549	0.00543379247097827	0.005197221326	0.065119
A[C>T]C	0.014322747041	0.00272631242801363	0.00889603432304448	0.0075	0.012756105638	0.0163	0.0197	0.00565001502898305	0.0056	0.0032	0.1099	0.0054	4.0508707e-05	0.0321	0.0169	0.0076	0.004224289013	0.00246521426100247	0.0203	0.022196046913	0.0062	0.00152486029000152	0.0818805799248362	0.00384432691700384	0.0131412836970131	0.0106264578159681	0.0054243060010217	0.00181541548799274	0.00897646999	0.054397
A[C>T]G	0.171646931305	0.00332208328101661	0.00357270835001786	0.0028	0.016760177116	0.0908	1e-04	0.0192651054649422	0.0125	0.0126	0.0072	0.0019	0.000316594671	0.0496	0.0309	0.0035	0.009229213313	0.00846395688600846	0.0368	0.034572014703	0.0256	0.00362564120100363	0.0092487150849815	0.00311066442500311	0.0196598942850197	0.0199303232389402	0.00670642945402683	0.00543203933097827	0.03163899636	0.0204604
A[C>T]T	0.012623763151	0.00332652841701663	0.014797612209074	0.0059	0.016477954692	0.0149	0.0043	0.0208059674969376	0.0076	0.0047	0.0639	0.0067	0	0.0277	0.0066	0.0101	0.005735961173	0.00560573992700561	0.0266	0.018819559611	0.003	0	0.0332096522089336	0.00342041867300342	0.00572851931200573	0.011334530551966	0.0044756140340179	0.00162921318899348	0.004769666594	0.0219359
A[T>A]A	0.004021520333	1.32377000000662e-07	0.00842856356604214	0.0048	0.008902904323	6e-04	0.001	0.0133650828109599	0.0121	0	2e-04	0.0058	0.001243618346	0	0.0021	0.0081	0.00061300245	0.00303721080400304	0.0011	0.000574401358	0.0083	0.0496192297120496	0	0.00116674712600117	0.0204305271250204	0.00445933987898662	0.143076389009572	0.000964030890996144	0	0.0075743
A[T>A]C	0.002371144163	0.000113069562000565	0.00737309667003687	0.0039	0.007399202496	0.0033	8e-04	0.0124312020769627	0.0042	2e-04	1e-04	0.0065	0.001060001878	8e-04	0.009	0.0073	0.001878587472	0.000811167214000811	0.0053	0.001971462059	0.0292	0.0116667404640117	0	1.51730570000152e-05	0.00889256066100889	0.0128222429159615	0.00146408538700586	0.00336566780898654	0.003049595749	0.003738
A[T>A]G	0.002810909959	0.000532929416002665	0.00735730002003679	0.01	0.011508051457	0	9e-04	0.0140366570669579	0.0068	0	7e-04	0.0046	0.00010255436	0	9e-04	0.008	0.001087349685	0.0045032071380045	0.0045	0.000190586616	0.0027	0.0679154542130679	0.000237418520999525	0.00633245557300633	0.00624194848000624	0.00117234427199648	0.00122628089700491	0.00178575364999286	0.003909981984	0.0065906
A[T>A]T	0.008360909345	0.000149110959000746	0.00875393899104377	0.003	0.011193623195	0.0053	0.0035	0.0241099165959277	0.0185	0.0012	3e-04	0.006	0.000971812099	9e-04	0.0079	0.0084	0.002045493651	0.00273652318500274	0.0033	0.007421103528	0.0043	0.0145999175800146	0	4.96721600000497e-06	0.0148508776220149	0.00399313754898802	0.00253519795101014	0.00565308909997739	0.005105527437	0.0093447
A[T>C]A	0.01391577303	0.00130350955800652	0.0130357094320652	0.0084	0.035366735114	0.0075	5e-04	0.0162065101009514	0.0252	0.0031	6e-04	0.0466	0.000549454166	0.0026	0.0115	0.0717	0.002697314025	0.00293305364400293	0.0145	0.016395062964	0.0265	0.0168399309490168	0.00106844881999786	0.00472600914200473	0.0206632827730207	0.0550286521328349	0.00504730108102019	0.00409274688798363	0.010119181163	0
A[T>C]C	0.0062749606	0.000425576677002128	0.00918628969004593	0.002	0.013771102129	0.0056	1e-04	0.00778780281997664	0.0105	0.0052	0.0015	0.0317	0.000145506661	0.0046	0.0073	0.0171	0.008078150072	0.00151328476300151	0.0048	0.019251793639	0.0165	0.00110826238200111	0.000221573158999557	0.000627949341000628	0.0095024784240095	0.0275946042079172	0.00184569122800738	0.00788072921096848	0.006349682655	0.0087547
A[T>C]G	0.010137636154	0.000575473007002877	0.0117169200770586	0.0081	0.028449051657	0.0217	7e-04	0.00985258355297044	0.0176	0.0026	8e-04	0.0487	0.000279178024	0.0035	0.0073	0.0348	0.004432870698	0.00332966895500333	0.0135	0.054784918009	0.0224	0.00491361640500491	0.000498801513999002	0.00272375862700272	0.0199114924560199	0.0517910440498446	0.00568881387902276	0.00552083360397792	0.014659610308	0.0090498
A[T>C]T	0.009256316389	0.00148816409300744	0.0169788707980849	0.0036	0.027302974158	0.0023	0.0011	0.0218294638259345	0.0247	0.004	3e-04	0.025	0.000267461432	0.0025	0.0063	0.0497	0.003140370209	0.00549131777100549	0.016	0.007341269916	0.0189	0.00263052393300263	0.000313240540999374	0.00712236847000712	0.0144883902550145	0.0390722444188828	0.00259275457701037	0.00323248399998707	0.007892413403	0
A[T>G]A	0.001587636423	3.37184110001686e-05	0.00235136807601176	0	0.003462151975	0	0	0.00421971928398734	0.0335	0	0	0.0012	0.00038619979	0	0	0.0052	5.3139249e-05	0.000386138197000386	0.0014	1.765291e-06	0	0.00165199861500165	0	0	0.00528167968200528	8.0653425999758e-05	0.00113633739200455	0.00636467555497454	0	0.0053118
A[T>G]C	0.001784091288	2.48448260001242e-05	0.00146423112900732	2e-04	0.002246592659	0.0017	0	0.000793671328997619	0.0051	0.004	0	0.001	0.000112383214	0.002	6e-04	0.0042	0.006468661271	0.00125498208000125	0	0.000381387913	0.0031	0	0	0.00146395068800146	0	0.00016317120999951	0.000958976380003836	0.0166109056469336	0	0.0024592
A[T>G]G	0.001385830552	0.000273454078001367	0.00905377764204527	0.0015	0.005490216837	7e-04	9e-04	0.0068658003739794	0.0052	0.0015	1e-04	0.0018	3.6000696e-05	7e-04	0.0012	0.0061	0.003481549012	0.00236921607300237	0.001	0.000658758087	0.0016	0.00108687275800109	0	0.000847612530000848	0.00713642164400714	0.00125507950699623	6.76606100002706e-05	0.00659284224497363	0.002925171448	0.0062955
A[T>G]T	0.003158539312	0.000217694872001088	0.00703097641903516	2e-04	0.003821226712	0.0029	0	0.00293992225899118	0.0193	0.0137	0	0.003	0.000192493754	0.0056	0.0029	0.0076	0.030926375169	0.000338602881000339	0.0017	0.000532125222	0.0018	0	0	0.00107545529400108	0	0.00185038349199445	0.000256027748001024	0.0863928974346544	0	0.0095416
C[C>A]A	0.006595870109	0.000677444988003387	0.0187817255730939	0.0461	0.00967490433	0.0101	0.0012	0.0317237565899048	0.0098	0.0031	7e-04	0.0135	0.001710089561	0.0056	0.0106	0.0159	0.001032430218	0.0887681088190888	0.0112	0.017377110647	0.002	0.00454969294400455	0.000164739381999671	0.0635592837930636	0.0148329478750148	0.00370585008298888	0.00506507326802026	0.00116851563699533	0.051410211701	0
C[C>A]C	0.007342367815	0.000213681013001068	0.0157604578420788	0.0614	0.004952300642	0.0241	6e-04	0.0255054071349235	0.0057	9e-04	0.0017	0.0112	0.001159256581	0.0102	0.0084	0.01	0.000421880127	0.0206413905570206	0.0159	0.036502462984	0.0014	0.00376447385400376	0.000736874801998526	0.0337570047160338	0.00782217530200782	0.00398072337298806	0.00223415334400894	0.000334291810998663	0.025825650831	0
C[C>A]G	0.00089284037	6.77046000003385e-06	0.00196338984600982	0.0088	0.002800627307	0.0091	0	0.00115962430299652	0	7e-04	0.001	0.0028	0.000244166533	9e-04	0.0015	0.0022	0.000297462769	0.0171784024800172	0.0018	0.012482587542	0.0027	0.0009001633310009	0.000163953660999672	0.0224289858060224	0.00127697673200128	0.000811741969997565	0.000266312161001065	5.36519979997854e-05	0.014496183324	0.0022624
C[C>A]T	0.007186581642	0.000416332906002082	0.0147228611260736	0.0432	0.011013465824	0.0571	0.0013	0.0287911729709136	0.0091	0.016	0.0014	0.0071	0.001256768244	0.1257	0.0228	0.0084	3.1479429e-05	0.0376769589290377	0.0096	0.103401226249	0.0056	0.00443984623100444	0.000722731834998555	0.0200865154380201	0.0125636547190126	0.0190384313449429	0.0031005700090124	0.000186671901999253	0.040355074099	0
C[C>G]A	0.001284983446	2.77720770001389e-05	0.0168325719890842	0.0105	0.007537523174	0	1e-04	0.00661907721598014	0.0018	0	0	0.0019	0.005333651375	0	9e-04	0.004	0.001924978751	0.000458463822000458	2e-04	1.331626e-05	1e-04	0.000582017663000582	0.000199049173999602	0.0134768216090135	0.0072007904100072	0.00127910606899616	0.00473064942601892	0.000103366091999587	0.002618863169	0
C[C>G]C	0.000702134818	0.000279643862001398	0.0135314415270677	0.0097	0.007633226665	0	4e-04	0.00607770289498177	0.002	0	2e-04	0.0019	0.000912303471	0	3e-04	0.005	0.000709367774	0.00365422833000365	0.0028	0.000548144708	0	0.000825299647000825	0.000283776025999432	0.0161056877370161	0.0045984731170046	0.00121497730299635	0.00126164484200505	0.000144310791999423	0.00111151227	0
C[C>G]G	0.000506289594	1.91615760000958e-05	0.00417645752402088	0.0063	0.002613760399	0	6e-04	0.000656033432998032	0	0	8e-04	0	0.000285467331	0	4e-04	0.0028	3.517869e-06	0.00540577424500541	2e-04	0	0	0.000382114636000382	0	0.000797471998000797	0.000823709283000824	0.000207832587999377	0.000360856587001443	0	0.00152004695	0.0032461
C[C>G]T	0.001381542722	0.000312781573001564	0.0240463904241202	0.0094	0.009417097876	2e-04	3e-04	0.00780502695697658	0.0039	0	2e-04	0.0019	0.006383097568	0	0.0017	0.008	0.000953776334	0.00551960482000552	8e-04	0.000120730556	3e-04	0.00176064591100176	0.000195775337999608	0.0103886658820104	0.000196360325000196	0.00229702621099311	0.000268026230001072	0.000290999508998836	0.000139750691	0
C[C>T]A	0.020896446965	0.0150195069310751	0.014395059491072	0.021	0.022769209355	0.0085	0.0754	0.0048658100209854	0.0098	0.0012	0.031	0.0187	0.003647278451	0.006	0.0051	0.021	0.021265205902	0.00976751147500977	0.0438	0.011145185306	0.0034	0.00773134952200773	0.0605726278048789	0.00603544739400604	0.0143339946910143	0.00659444488498022	0.0174384847780698	0.00439153255398243	0.009126471767	0.0694472
C[C>T]C	0.01850170477	0.00351691809801758	0.00854478119204273	0.0144	0.017509476305	0.0099	0.1007	0.00398015043098806	0.0069	0.0024	0.1518	0.0094	0.001004229295	0.0167	0.0088	0.0098	0.003847235312	0.00565482846200565	0.0753	0.018152746866	0.0091	0.00711085052600711	0.186375634075627	0	0.00593664365900594	0.00651063197098047	0.00714487020702858	0.00264766096598941	0.007067603037	0.0638403
C[C>T]G	0.095577217268	0.0049792757150249	0.00351846584001759	0.0076	0.012862237589	0.0901	0.0208	0.00833863918197498	0.0076	0.0109	0.0135	0.0046	0.000129202148	0.0293	0.0155	0.0016	0.013176112314	0.0161832229640162	0.0238	0.044384942487	0.0318	0.0055020309650055	0.0151490825929697	0.00292441907400292	0.0115593916270116	0.0119049353239643	0.00750356165503001	0.00228456355099086	0.019875180409	0.0173126
C[C>T]T	0.017113307642	0.00895655277504478	0.0160755457120804	0.0201	0.020429513385	0.0087	0.0788	0.0188436274339435	0.0097	0.0043	0.0816	0.0205	0.00061176997	0.0186	0.0096	0.0211	0.009648025316	0.00515331861300515	0.1159	0.013847136214	0.004	0.00416977724100417	0.156015396976688	0.00397120157500397	0.0136325968850136	0.00623855632698128	0.00714802770202859	0.0024239842669903	0.001634058687	0.0342318
C[T>A]A	0.001182587416	0.000154598981000773	0.00757132026003786	0.0075	0.005043163511	1e-04	0	0.0120242175219639	0.0055	0	4e-04	0.0017	0.000285158991	0	0.0016	0.0054	3.0079241e-05	0.000412346353000412	0.0043	4.5042364e-05	0	0.0868985455160869	0.000594528452998811	0.00276663483800277	0.0262963230890263	0.00356142268098932	0.330601017472322	0.00256657996698973	0.001765447503	0.0053118
C[T>A]C	0.001903166857	0.00046401902800232	0.0127254635280636	0.0111	0.006208843676	0.0026	0.0014	0.0178810924229464	0.0049	1e-04	0.0011	0.0086	0.000222287328	0.0034	0.0043	0.0128	0.010223747696	0.00249141131000249	0.0053	0.004389055645	0.0037	0.0537068468090537	0	0.00269446245400269	0.0157998830850158	0.00390161098098829	0.00281359880801125	0.0196108974289216	0.000383359117	0.0067873
C[T>A]G	0.00148796063	0.000230409809001152	0.0115085618650575	0.0342	0.01050756897	8e-04	7e-04	0.0163567745329509	0.0051	3e-04	6e-04	0.0031	0.000286951828	2e-04	0.0027	0.013	0.004467036232	0.00552304571300552	0.0021	0.001127835842	0.0025	0.213220866558213	0.000173120399999654	0.00691116472100691	0.0628606063810628	0.00239030417999283	0.00439685708301759	0.00883360003196467	0.003556845215	0.0082628
C[T>A]T	0.002179344412	0.000574885587002874	0.0164561776960823	0.0115	0.009784640746	0.0011	0.0018	0.0262478019169213	0.0069	9e-04	4e-04	0.0054	8.00446e-07	0.002	7e-04	0.0096	0.031244883388	0.00331371327300331	0.0022	0.002385541321	0.001	0.0618275074760618	0.000457813098999084	0.00291520016500292	0.0366223511120366	0.00163592266699509	0.00543089163302172	0.0109426098199562	0.002232755492	0
C[T>C]A	0.004176674882	0.000546619204002733	0.00789501261103948	0.0052	0.014238629786	0.0062	0.001	0.00517384241698448	0.0154	5e-04	1e-04	0.0312	4.2751466e-05	6e-04	0.0032	0.0146	0.007426999646	0.000192169320000192	0.0066	0.014867696528	0.0219	0.00402734633400403	0	0.00184887653500185	0.00902801489400903	0.0378893776908863	0.0048990792380196	0.020738003351917	0	0
C[T>C]C	0.005252593331	0.000392332573001962	0.0144311703620722	0.0026	0.01248950044	0.004	8e-04	0.0109368937679672	0.0118	0.0019	4e-04	0.0385	4.3307542e-05	0.0053	0.005	0.0194	0.039657001207	0.00305019258100305	0.007	0.018356161025	0.01	0.00135244392900135	0	0.00445368985700445	0.0107716324200108	0.0217407349529348	0.0057244484670229	0.0432837972458269	0.002774953681	0
C[T>C]G	0.00701322531	0.00036202450800181	0.00842297214404212	0.01	0.018741631229	0.027	0.001	0.00565777360198303	0.0154	0.0015	1e-04	0.0415	5.4272534e-05	0.0016	0.0128	0.019	0.028609696263	0.0025964641930026	0.004	0.074150562563	0.0211	0.00274966613700275	0.000320704885999359	0	0.0133506613100133	0.0472401033428583	0.00566147899202265	0.0370882617278517	0.006902414709	0
C[T>C]T	0.006713813119	0.000560900126002804	0.0119324304650597	0.0054	0.019054082944	0.0033	0.0045	0.0111203893219666	0.0275	0.002	9e-04	0.0324	7.63944e-07	0.0027	0.0035	0.0263	0.101869657701	0.00131002874400131	0.0053	0.011001118253	0.0204	0.00236335353700236	0	0.0015973890070016	0.00896102996600896	0.0207406214309378	0.0039005890620156	0.00505271601797979	0.003041424895	0
C[T>G]A	0.000302691186	0.000113784603000569	0.00197418114600987	0	0.002041648941	1e-04	0	0.00242405055199273	0.0216	0.0022	0	0.0013	1.5094208e-05	0	0	2e-04	9.1469787e-05	6.1002548000061e-05	0	2.3264084e-05	0	0.00112035651500112	0	0	0	9.53962599997138e-05	0	0.00958984194096164	0.001116854814	0.0046233
C[T>G]C	0.00209850244	2.20950870001105e-05	0.00582429554502912	0.0013	0.003478502118	0.004	8e-04	0.00209621061599371	0.0064	0.0018	1e-04	0.0049	0.00014762484	0.002	0.0019	0.0082	0.019814293551	0.00201569691300202	0.0011	0.008476494525	5e-04	0.00106458357100106	0.00019014434199962	0.00218543734800219	0.00288645433700289	0.00391945509998824	0.000381244984001525	0.0339132237218644	0	0.0060004
C[T>G]G	0.0015995485	0.000228245948001141	0.0104646545250523	0.0046	0.007147456226	0.005	9e-04	0.00660404629398019	0.0126	0.0037	0.0011	0.0045	4.59873e-05	5e-04	7e-04	0.0067	0.013449837633	0.00531196725400531	0.0013	0.015383776115	4e-04	0.00418856812600419	0	0.000113909674000114	0.0117694924990118	0.00549735731398351	0.000403257236001613	0.0185164816059259	0.002169693346	0.0073775
C[T>G]T	0.002758537619	6.71113400003356e-05	0.00872438730204362	0.0012	0.011486811509	0.0086	0.0013	0.0048667138589854	0.0509	0.0182	9e-04	0.0063	0.000463714722	0.0063	0.0045	0.0186	0.261456614079	0.00234162917800234	0.0019	0.002185394659	0.0032	0.00162940957300163	0.000210834979999578	0.00253371833300253	0.00855080748200855	0.00678871869097963	0.00143909606900576	0.118967102953524	0.001143663251	0.0091481
G[C>A]A	0.008232603989	0.00035201335300176	0.00969653967604848	0.0376	0.011892168979	0.0024	3e-04	0.023682328868929	0.0118	0.0014	4e-04	0.0062	0.000132109643	0.0018	0.0024	0.0096	0.006535404875	0.128724158080129	0.0032	0.001116123789	1e-04	0.0012983701610013	0.0003499074949993	0.0546764486790547	0.0134652950530135	0.00137531184599587	0.010755871858043	0.00213662907699145	0.078046610108	0.008853
G[C>A]C	0.00575802141	0.000133816879000669	0.0108433411160542	0.0399	0.009247857495	0.0058	1e-04	0.0158218964449525	0.0092	0.0022	0.001	0.0056	0.000754244011	0.0114	0.0099	0.0094	0.001293803953	0.0160928786630161	0.0031	0.003271428605	0.0038	0.00180962215200181	0.000568337771998863	0.10994598899711	0.00646829805800647	0.00196163908799411	0.0124423351170498	0.000429208378998283	0.073460914669	0.0093449
G[C>A]G	0.000616335232	0.000178441660000892	0.000929140538004646	0.0227	0.002809188466	0.0021	0	0.000850913753997447	0	2e-04	0	0.0015	9.6820775e-05	0.0011	0.0013	0.0036	0.001283663378	0.00927141676200927	0	0.003751612508	3e-04	0.000333838055000334	0.000149417833999701	0.0465248690100465	0.000658103089000658	1.32296639999603e-05	0.00162962834700652	0	0.017383296915	0.0008853
G[C>A]T	0.004459080311	0.000122832046000614	0.0122153826390611	0.0258	0.010301267456	0.0087	1e-04	0.0210612358019368	0.0085	0.0088	6e-04	0.0027	0.000551103672	0.0736	0.0309	0.0063	0.003103766672	0.072017070126072	0.0072	0.01293719445	0.0023	0.000519148161000519	0	0.0504287094820504	0.0104730803470105	0.00193499629299419	0.00741235515202965	0.00131850725599473	0.059602472118	0.0081645
G[C>G]A	0.000602122711	4.48385140002242e-05	0.0119168445690596	0.007	0.005559423089	0	0	0.00372456794598883	0.0011	0	0	0.0012	0.001349419584	2e-04	0.0022	0.0031	0.001296324191	0.000923879703000924	0.002	0.001339769321	4e-04	0	0	0.00494506070800494	0.00416965552400417	0.00132060747499604	0.00141816638700567	8.15914109996736e-05	0.000265759858	0.0073775
G[C>G]C	0.002393352209	1.45201030000726e-05	0.00982365339704912	0.0091	0.005388801221	0.003	4e-04	0.00304659695299086	0.0029	2e-04	2e-04	0.0011	0.000788807743	1e-04	5e-04	0.0032	0.000260760911	0.000648647922000649	0	0.001811151475	0.0042	0	0.000137501073999725	0.00936987577400937	0.00239280494400239	0.00184550107099446	0.00134671678200539	0.000105219030999579	0.000945012884	0.0065906
G[C>G]G	2.48534e-07	4.06658890002033e-05	0.00167105425000836	0.0062	0.001100589633	0	0	0.000321212792999036	0	0	0	0	8.1791214e-05	0	6e-04	0	4.377552e-06	0.000542839968000543	0	6.37538e-07	0	0.000214695851000215	0	0.00562572654000563	0.000418193916000418	0.000205060776999385	0	0	0	0.0015739
G[C>G]T	0.000890080731	0.000268429459001342	0.0179143343060896	0.006	0.006041247837	0.0017	0	0.00577566359798267	0.0044	4e-04	0	9e-04	0.002680123244	3e-04	0.0018	0.0029	0.001820392786	0.00137672488800138	0	0.001238264182	4e-04	0.000538438803000538	0	0.00305577006400306	0.00199401221700199	0.00122553285599632	0.00456068597401824	0.000159679353999361	0.004796744744	0
G[C>T]A	0.024943814154	0.00639080787603195	0.0161272733320806	0.0087	0.020038258645	0.0653	0	0.00226126268599322	0.0062	0	0.0261	0.0124	0.002934137577	0.0557	0.0476	0.0125	0.002068754725	0.0027030687270027	0.0374	0.056793947985	0.0163	0.00191537085400192	0.0532820589648934	0.0236790512950237	0.01003811201301	0.00960651502697118	0.0142153137430569	0.00338424086898646	0.011638793032	0.0485934
G[C>T]C	0.027161494035	0.00199581678400998	0.00820863243704104	0.008	0.018022312238	0.0773	0.021	0.00161664918699515	0.0069	0.0134	0.0975	0.0092	0.002515171146	0.0618	0.1345	0.0092	0.000325483399	0.0041993075360042	0.0614	0.05442985727	0.0392	0.00322913354700323	0.162918343742674	0.0159192018400159	0.00695387515500695	0.0195074267199415	0.0201436461820806	0.00168741402899325	0.003781751661	0.0494787
G[C>T]G	0.103570762296	0.000303020977001515	0.00121292286600606	0.0023	0.013193817648	0.1339	2e-04	0.0116067115999652	0.0088	0.027	0.009	0.0023	0.00320526455	0.0978	0.1829	9e-04	0.007511101358	0.0118973608250119	0.0278	0.004592688609	0.0019	0.0033005988790033	0.0130464947439739	0.0126480776060126	0.0104683630270105	0.0225027173829325	0.00936846849603747	0.00218930895999124	0.019684388045	0.0157387
G[C>T]T	0.017689854381	0.00326581818801633	0.0106116492080531	0.0082	0.019502915335	0.0524	0.0161	0.00628492899598115	0.0101	0.0152	0.0522	0.0115	0.001687730545	0.0555	0.08	0.0116	0.000925697167	0.00191338090500191	0.0917	0.049580863753	0.0166	0.00111405957000111	0.107590399753785	0.0181297783780181	0.00982382073500982	0.0173074721839481	0.00758962595003036	0.00104399363099582	0.005761336823	0.0188865
G[T>A]A	0.000689289439	0.000114994210000575	0.00443478255902217	0.0069	0.006740387717	0	0	0.00813917860797558	0.003	0	3e-04	0.0015	0.000137960405	0	0	0.003	8.545689e-06	0.00187543408100188	0.0026	0.000163129836	0	0.0537091456930537	0	0.00222512733600223	0.0362178008370362	0.00224288651299327	0.109851871980439	0.000551460782997794	0.002930098053	0.003738
G[T>A]C	0.000552409528	0.000293862060001469	0.00561543241102808	0.0052	0.00402159648	0.0028	0	0.00791008031797627	0.0029	1e-04	3e-04	0.0039	0.000252867405	0.0025	0.0038	0.004	0.002573466959	0.00151030975700151	0	0.003799179503	0.0142	0.00948939669400949	0.000183203811999634	0.00485314915700485	0.00584710964700585	0.00520728709498438	2.34556780000938e-05	0.00316398759698734	0	0.0033445
G[T>A]G	0.001200228847	8.87213440004436e-05	0.00807013647204035	0.0133	0.006814352288	6e-04	6e-04	0.00905726305597283	0.0028	0	4e-04	0.0019	0.000153517461	0	0.0026	0.0051	0.003538822593	0.00150536877600151	0.0016	0.0008283337	0.0031	0.0502939024280503	0	0.000195758628000196	0.0382411793150382	0.00135812177799593	0.00156593715900626	0.00215284701299139	0.000533632401	0.0050167
G[T>A]T	0.002107136837	0.000215755466001079	0.0086791217440434	0.0045	0.005101032909	0.0021	0.001	0.0178122386469466	0.0036	4e-04	1e-04	0.0031	0.000122745552	9e-04	0.0043	0.0033	0.003879009961	0.00361102520200361	0.0052	0.001900746587	0.0041	0.0106014572330106	0	0	0.0201679544190202	0.00251311294199246	0	0.00200773324399197	0	0.0063939
G[T>C]A	0.011247835116	4.67385200002337e-06	0.00685005557403425	0.0061	0.016294982792	0.0122	2e-04	0.00572077854898284	0.0091	0.0064	0.001	0.0573	0.001054081222	0.0078	0.0195	0.0161	1.1401335e-05	0.000529126468000529	0.0039	0.002469317074	0.1426	0.00421745411300422	0.000251168627999498	0.00126974984000127	0.0174898238790175	0.0980528247187058	0.00477738035401911	0.00365504812698538	0.007090803763	0
G[T>C]C	0.006999724257	0.00018606592700093	0.0062607490140313	0.0016	0.009574560593	0.0059	1e-04	0.00518105150198446	0.0097	0.0101	0.0016	0.0274	0.000529899747	0.0127	0.0499	0.0099	0.009657713318	0.00227913082900228	0.003	0.001565632906	0.0665	0	0.000538218488998924	0.00671033999600671	0.00404561244600404	0.0402263639628793	0.00196495433000786	0.00707117532697172	0.007111327534	0.0065906
G[T>C]G	0.004977592617	4.95044000002475e-07	0.00609876299303049	0.0042	0.014103929348	0.0115	3e-04	0.00504070747098488	0.0094	0.0054	0.0019	0.041	0.000630095718	0.0082	0.0154	0.0148	0.004654129131	0.00587105658100587	0.006	0.027341755021	0.0884	0.00147488453400147	0	0.000277684976000278	0.0134022462740134	0.0446207009828661	0.00122916774900492	0.00823223843996707	0.005643063554	0.0078694
G[T>C]T	0.010667406133	0.000578598104002893	0.00750934385903755	0.0024	0.015666874692	0.0042	0.0081	0.00848822025797453	0.0126	0.0124	0.0023	0.0405	0.000676187888	0.0086	0.0094	0.0142	0.008149234601	0.00477156573900477	0.0099	0.001498264796	0.1003	0.00156104273800156	0.000995769680998008	0.00423847766900424	0.0141596937360142	0.0555280682798334	0.00374722501301499	0.000407884509998368	0.011237674345	0.0084596
G[T>G]A	9.9045003e-05	9.55523920004778e-05	0.00414448801802072	0	0.001627664547	0	0	0.000974578664997076	0.0072	0	0	0	1.8489857e-05	0	0	0	3.9193821e-05	0.00134153246400134	0	3.579149e-06	0	0	0	0	0.00554622692400555	3.73932319998878e-05	0	0	0	0.0032461
G[T>G]C	0.000202365646	4.7002381000235e-05	0.00450198531302251	0	0.000327734937	0.0016	0	0.000524821554998426	6e-04	0.002	0	4e-04	9.3373513e-05	0.0019	0.0022	0.0032	0.009078461515	9.2043100000092e-07	0	0.002830575073	6e-04	0	0	0.00107363230200107	0	0.00246070499499262	5.07905650002032e-05	0	0	0.001869
G[T>G]G	0.001188353185	0.00010992570300055	0.016391452608082	0.0018	0.005948879802	0.001	0.0017	0.00608775346698174	0.005	9e-04	0.001	0.0011	1.0579194e-05	0.0012	0.0037	8e-04	0.004782775461	0.00969499998100969	0.0043	0.002733219405	4e-04	0.00187758918100188	0.000187132413999626	0.00292469699600292	0.00868524444400869	0.000817201562997548	0.00474291855001897	0.00421780829898313	0.003640593813	0.0033445
G[T>G]T	0.000800723342	8.64771800004324e-05	0.00706723664303534	2e-04	0.003307466591	0.0035	9e-04	0.00542743378498372	0.0185	0.003	0	0.0032	5.3741207e-05	0.0038	0.019	0.0044	0.063497756582	0.00289055351900289	0.0025	0.003558558565	8e-04	0	0	0.000825098263000825	0.00276857168300277	0.0078335612709765	0.00229847603000919	0.0316489973208734	0.006181023776	0.0056069
T[C>A]A	0.012250063666	0.0151274275190756	0.0116532249090583	0.033	0.014774016248	0.0017	0.001	0.0270323830389189	0.0222	0.0374	9e-04	0.0066	0.048166047937	5e-04	0.0057	0.0122	0.001824558257	0.0670806435290671	0.0051	0.000688299692	1e-04	0.00405163455200405	0.00207128998499586	0.0314512631820315	0.00693814658500694	0.00268006242399196	0.00707928452202832	0.000775902767996897	0.026894406511	0
T[C>A]C	0.011162229329	0.00653249245403266	0.016606775011083	0.0538	0.012043464964	0.0029	0.002	0.0180897732899457	0.0043	0.0103	0.0025	0.0099	0.017329557089	0.0166	0.0062	0.0145	0.001286518338	0.0418690096930419	0.0063	0.00405822906	5e-04	0.00273977093700274	0.000696410200998607	0.0625382936990625	0.0102466074000102	0.00203164386599391	0.00626880062802508	0.000829292466996683	0.031608136996	0
T[C>A]G	0.002275495686	0.00165645539800828	0.00135723943900679	0.0104	0.003902362388	0.0011	2e-04	0.00169487519699492	0	0.0031	1e-04	0.0019	0.002293157306	0	0.0025	0.004	0.002172941968	0.0151623792900152	0.0018	0.001001102231	0	0.000513151070000513	9.93936329998012e-05	0.0128025907280128	0	0.000265071699999205	0.00144640341500579	0	0.012500468152	0.0016722
T[C>A]T	0.015259102491	0.012394610714062	0.0163280759750816	0.037	0.018243395705	0.0058	0.0013	0.0381413308678856	0.0322	0.3083	4e-04	0.0049	0.018634581512	0.0516	0.0145	0.0157	0.005012316394	0.117877846666118	0.0087	0.012229104507	4e-04	0.00360565089900361	0.000207430190999585	0.0302976796130303	0.0246257872260246	0.00301718745699095	0.00980627775003923	0.00199807366699201	0.04120717639	0
T[C>G]A	0.001874853199	0.0372418531491862	0.0160414054380802	0.0032	0.002681056961	0	2e-04	0.00411787883698765	0.0033	0	1e-04	0.0024	0.280234946548	0	9e-04	0.005	0.000392684657	0.0018029690510018	5e-04	2.4298469e-05	2e-04	0.000225490615000225	0.000230608943999539	0.0102208574360102	0.0097987245670098	0.00420189675098739	0.00287043372101148	0.000521370367997915	0.000820444889	0
T[C>G]C	0.002067418791	1.94134110000971e-05	0.0201499204281007	0.0105	0.007924048307	2e-04	0.001	0.0037996495919886	0.0025	0	0.0011	0.0027	0.063885286587	0	0.0026	0.0064	0.000655602418	0.00786300679400786	0.0011	0.00015199855	3e-04	0.000628695020000629	0.000165787008999668	0.00757836525200758	0.00326650715000327	0.00280776153399158	0.00310796756901243	0.000667325889997331	0.000444119287	0
T[C>G]G	0.000304897004	0.00162546545700813	0.00252791093601264	0.0031	0.001319075649	0	3e-04	2.5653017999923e-05	0	0	3e-04	0	0.009528486008	0	0	0	1.3641541e-05	0.00151322333400151	0	0	0	0.000395807994000396	0	0.00159271421700159	0.00205743675300206	6.19699999998141e-09	1.28104090000512e-05	0	0.000143297155	0.0019673
T[C>G]T	0.00315157446	0.0668798996843344	0.0326736407621634	0.005	0.006644595708	1e-04	7e-04	0.00624755373798126	0.0049	1e-04	8e-04	0.0015	0.330225481745	1e-04	0.0015	0.0169	0.002852380395	0.00356710206500357	0.0105	0.000683059976	3e-04	0.000257375147000257	0.000438955808999122	0.0061007271900061	0.0164009168500164	0.00801938298597594	0.00213058750300852	0.00124577953499502	0.001369869047	0
T[C>T]A	0.014492099634	0.4199413995961	0.0088802090610444	0.0035	0.010997560324	0.0074	0.1202	0.00718066853997846	0.005	0.0037	0.0302	0.0138	0.113842093163	0.0092	0.0112	0.0172	0.016100784572	0.0149233917010149	0.0218	0.01071032207	0.0064	0.00201672168800202	0.0145586136959709	0.0265718943460266	0.0110775208000111	0.0113032887679661	0.018757776459075	0.00762225767196951	0.012076583098	0.0849892
T[C>T]C	0.017680775357	0.0819724961444099	0.0135295727980676	0.007	0.020644964803	0.0067	0.2887	0.00406103293798782	0.0084	0.0211	0.1589	0.0095	0.015024839001	0.0283	0.0156	0.0131	0.016779984064	0.00996274431000996	0.033	0.00817550977	0.0086	0.00199083424600199	0.043510446938913	0.0120556910820121	0.00644878754000645	0.0108075269749676	0.00798918440603196	0.00511661924097953	0	0.090301
T[C>T]G	0.076002221712	0.0477201863682386	0.00170540885800853	0.0011	0.007534489574	0.0391	0.0992	0.00553512151998339	0.0047	0.2141	0.008	0.001	0.006102097956	0.0094	0.0104	0.0036	0.016272095596	0.0115497151260116	0.009	0.023163899202	0.0126	0.0014984730910015	0.0027526405439945	0.00536335968000536	0.0140834161810141	0.0103643293279689	0.00460913097101844	0.00191802810999233	0.015830196802	0.0151485
T[C>T]T	0.013761704021	0.228674918307143	0.0103044169280515	0.0077	0.011787461775	0.0047	0.0844	0.0122090704969634	0.0096	0.0392	0.0954	0.009	0.028140661233	0.0229	0.0076	0.0193	0.01982741755	0.0053980139940054	0.0267	0.009540087238	0.0064	0.00118222650200118	0.0243287852339513	0.00553249918000553	0.0124185858850124	0.00724914535997825	0.0118809324820475	0.00619315862597523	0.0134621373	0.045544
T[T>A]A	0.005600155423	8.07524860004038e-05	0.00713268135403566	0.0045	0.009205637343	2e-04	0.001	0.0151399962359546	0.0215	0	3e-04	0.0057	0.000403261316	0	8e-04	0.0085	0.000698812311	0.00466327804300466	0.0039	0.000924547968	0.0027	0.0408105028250408	0	0	0.0218303290490218	0.000628145255998116	0.0528138874942113	0.000203237562999187	0.001191207434	0.0076726
T[T>A]C	0.00199907926	4.80289800002401e-06	0.00910279782704551	0.0046	0.006835344247	8e-04	0.0015	0.0120935546059637	0.0027	8e-04	0	0.0132	0.000771813274	0.0016	0.0019	0.0087	0.002579358604	0.00257815554300258	0.0048	0.000708206814	0.0045	0.0255703958010256	0	0.00799412915500799	0.00340568672800341	0.00507375386098478	4.70917850001884e-05	0.0101809648679593	0.001682664015	0.0064922
T[T>A]G	0.001090065693	6.6605043000333e-05	0.00656586304103283	0.0082	0.007144208769	0	0.001	0.00836254658997491	0.014	0	0	0.0037	0.000245194218	0	6e-04	0.0063	2.1133639e-05	0.00201673836100202	0.0052	9.7003127e-05	0	0.0698452180850698	0.000231525617999537	0.0112021435910112	0.0101915204010102	2.01383909999396e-05	0	0.003250427226987	0.002438756	0.0036396
T[T>A]T	0.003981022761	0.000276315891001382	0.0147121354030736	0.0045	0.010240850413	7e-04	0.005	0.027653296253917	0.0139	0.0028	8e-04	0.0094	0.000160345975	0.0012	3e-04	0.008	0.003883130589	0.00281867944700282	0.0085	0.00231348906	8e-04	0.0235790617970236	0	0.000270578768000271	0.0145275393130145	0.00123553846999629	0.00192977081300772	0.016492812255934	0	0
T[T>C]A	0.008073616351	0.00010193235200051	0.00911549507704558	0.0028	0.017059640976	0.0059	0.0023	0.0049010723789853	0.0156	0.003	2e-04	0.05	0.000784056118	0.0018	0.0068	0.0246	0.001708586711	0.000302303565000302	0.0052	0.005734229562	0.0389	0.0048036697400048	0	0.00168229104800168	0.0145150500900145	0.0287896805419136	0.00172101527700688	0.00992955206796028	0.011498665964	0
T[T>C]C	0.004857381178	0.000470343659002352	0.0109537909320548	0.0016	0.014195709147	0.0035	0.0018	0.00608101129898176	0.0137	0.0097	9e-04	0.0342	0.000132974888	0.0056	0.0099	0.0183	0.011074152072	0.00626079111500626	0.002	0.011234254668	0.0313	0.000912157512000912	0.000230608943999539	0.00234452765600234	0.00740608345700741	0.0366394924418901	0.00348921255301396	0.029010563205884	0.003584215038	0.0091481
T[T>C]G	0.008325454207	0.000192354203000962	0.00611303321903056	0.0036	0.012596501722	0.0106	0.0019	0.00171248469899486	0.0098	0.0065	7e-04	0.032	3.7402404e-05	0.0034	0.0039	0.0165	0.005932002763	0.00154126532900154	0.0057	0.023767611345	0.0249	0.00178173568000178	0.000239513774999521	0.000481274164000481	0.00489253121700489	0.0191436942799426	0.00115284658100461	0.0156832185569373	0.00169429667	0.0060004
T[T>C]T	0.006257105605	0.000585330275002927	0.0107743362590539	0.0022	0.017375139145	0.0029	0.0024	0.01000344182997	0.0309	0.0099	5e-04	0.0371	0.000179702846	0.0026	0.0047	0.0174	0.007208218396	0.00135779708900136	0.0038	0.005395186301	0.0274	0	0	0.000358148002000358	0.017014780759017	0.0230716888309308	0.00152795700300611	0.0172915636179308	0.003799705772	0
T[T>G]A	0.001397553749	7.17369500003587e-05	0.00542718424102714	0	0.00520287442	9e-04	0	0.00174322136199477	0.0502	0.005	0	0.0019	0.000546581847	0	0	0.0068	0.000133410642	3.63184040000363e-05	0.0032	2.69147e-07	0	0.00165169876100165	0	0	0.00208147992700208	8.53493499997439e-06	0.00118902245400476	0.00938965870596244	0	0.0086563
T[T>G]C	0.001291736985	1.42814560000714e-05	0.0061602504230308	3e-04	0.005131607914	0.0019	0.001	0.00254983832899235	0.0081	0.0092	0	0.0027	0.000235347085	0.0015	4e-04	0.0069	0.009613345245	0.00323383799000323	0.0018	0.000377234437	0.0018	0	0	0	0.000578978775000579	0.00271850984499184	0.000280295354001121	0.0301170769838795	0	0.0043282
T[T>G]G	0.00203107688	0.000206615168001033	0.0110765262610554	0.003	0.0060552541	0.0011	0.001	0.00603039518498191	0.0088	0.0022	3e-04	0.0011	4.79022e-07	2e-04	9e-04	0.0049	0.004522462318	0.000754601773000755	0.0011	0.000515421599	3e-04	0.00257275195800257	0.000247501932999505	0.00136050485000136	0.00942919588500943	0.00136916117299589	0.00235305558900941	0.0126987508109492	0.000353695951	0.0082628
T[T>G]T	0.00403012816	2.3598204000118e-05	0.013000984209065	0.0011	0.013369935834	0.0072	0.0014	0.00722399889297833	0.0545	0.0633	3e-04	0.0032	0.000670588327	0.0025	0.0033	0.0163	0.05804040776	0.00212644153200213	0.0013	0.000615656691	3e-04	0	0	6.95157780000695e-05	0.00786967157700787	0.0025680767259923	0.000139561285000558	0.233659783275065	0.006104834136	0