Mercurial > repos > artbio > mutational_patterns

comparison test-data/user_defined_signature.tsv @ 23:83f8c93c34b4 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
"planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit 3c4d96db0a3c54ed68bf782f08b89b6959255d58"
author artbio
date Wed, 27 Oct 2021 00:46:47 +0000
parents 8d9f31389f33
children
comparison
equal deleted inserted replaced
22:00be8f0b2c89 23:83f8c93c34b4
1 Type SBS1 SBS2 SBS3 SBS4 SBS5 SBS6 SBS7a SBS8 SBS9 SBS10a SBS11 SBS12 SBS13 SBS14 SBS15 SBS16 SBS17a SBS18 SBS19 SBS20 SBS21 SBS22 SBS23 SBS24 SBS25 SBS26 SBS28 SBS29 SBS30 1 Type SBSa SBSb SBSc SBSd SBSe SBSf SBS7a SBSg SBSh SBS10a SBSi SBSj SBSk SBSl SBSm SBSn SBS17a SBSo SBSp SBSq SBSr SBSs SBSt SBSu SBSv SBSw SBSx SBSy SBSz
2 A[C>A]A 0.000876022860356065 5.79005909129116e-07 0.0209197492105927 0.0424507363741909 0.0120520481367051 0.000425145613703031 6.71694562134893e-05 0.0443106405724723 0.000560638966969298 0.00218526226624343 0.000147337461127982 0.00454236809131541 0.00181687918087284 0.00112609260941517 0.000946030090875022 0.0160943727268514 0.00207279918632882 0.0516883199119327 0.00127961346873583 0.000624247512114177 0.000157722171783313 0.00604617162363952 0.000844506730061431 0.0366237270205082 0.00993578471500029 0.000876874614431855 0.000785670933284911 0.0634975968681214 0.00181050219506439 2 A[C>A]A 0.000876022860356065 5.79005909129116e-07 0.0209197492105927 0.0424507363741909 0.0120520481367051 0.000425145613703031 6.71694562134893e-05 0.0443106405724723 0.000560638966969298 0.00218526226624343 0.000147337461127982 0.00454236809131541 0.00181687918087284 0.00112609260941517 0.000946030090875022 0.0160943727268514 0.00207279918632882 0.0516883199119327 0.00127961346873583 0.000624247512114177 0.000157722171783313 0.00604617162363952 0.000844506730061431 0.0366237270205082 0.00993578471500029 0.000876874614431855 0.000785670933284911 0.0634975968681214 0.00181050219506439
3 A[C>A]C 0.0022201195808427 0.000145504532003707 0.0163431921068143 0.0329895820389566 0.00933708706453245 0.000516225985778605 0.000176729831442553 0.0472995640705189 0.00404699056207519 0.00173937218490227 0.000548604298962786 0.00111836131396873 0.000708842466041201 0.0129714099117801 0.000490511447644093 0.00287284286844122 0.000905293428455269 0.015617160603031 0.000636052426566461 0.00138051386891227 0.00233488180943175 9.45179243898909e-05 0.000397419651060091 0.0262583136241544 0.00691870511579565 0.000522296335554948 0.00249692183598218 0.0506605586475702 0.000501229784403264 3 A[C>A]C 0.0022201195808427 0.000145504532003707 0.0163431921068143 0.0329895820389566 0.00933708706453245 0.000516225985778605 0.000176729831442553 0.0472995640705189 0.00404699056207519 0.00173937218490227 0.000548604298962786 0.00111836131396873 0.000708842466041201 0.0129714099117801 0.000490511447644093 0.00287284286844122 0.000905293428455269 0.015617160603031 0.000636052426566461 0.00138051386891227 0.00233488180943175 9.45179243898909e-05 0.000397419651060091 0.0262583136241544 0.00691870511579565 0.000522296335554948 0.00249692183598218 0.0506605586475702 0.000501229784403264
4 A[C>A]G 0.000179727205679816 5.36186073164881e-05 0.00180754877738393 0.0161159612218968 0.00190813974719045 5.34208697464283e-05 7.3305382042244e-05 0.00476727552433761 0.000439559345708089 0.000153712628486902 9.75233896485778e-05 0.000557309553139576 0.000270655854422162 0.000426446913390031 4.74452478520416e-05 0.00105369054278497 4.89499976093771e-05 0.0025046687585242 0.000254547611912212 2.25777938295459e-05 0.000303318754994713 0.000790362401227405 1.02308497833945e-07 0.0152926133494441 0.00149449277081636 0.000117594481949321 0.000363293951337536 0.0198107208240535 9.43096572057688e-05 4 A[C>A]G 0.000179727205679816 5.36186073164881e-05 0.00180754877738393 0.0161159612218968 0.00190813974719045 5.34208697464283e-05 7.3305382042244e-05 0.00476727552433761 0.000439559345708089 0.000153712628486902 9.75233896485778e-05 0.000557309553139576 0.000270655854422162 0.000426446913390031 4.74452478520416e-05 0.00105369054278497 4.89499976093771e-05 0.0025046687585242 0.000254547611912212 2.25777938295459e-05 0.000303318754994713 0.000790362401227405 1.02308497833945e-07 0.0152926133494441 0.00149449277081636 0.000117594481949321 0.000363293951337536 0.0198107208240535 9.43096572057688e-05
5 A[C>A]T 0.00126505263784183 9.75912243380865e-05 0.0122650656971785 0.0296627698719921 0.00663587169503364 0.000179985776931981 0.000248522446240606 0.0472045874219964 0.00306313282723616 0.0169560731896464 0.000268323600008673 0.00122552063885904 0.000347256843861562 0.0830143252239989 0.00111191821370535 0.0106580277520086 6.18574864123409e-05 0.0214692003868359 0.000575079781725448 0.00124998489684999 0.000623593537179773 0.00172962261411101 5.67148006587459e-18 0.022125889785216 0.00498586225712035 0.000621485230278024 0.00397678433704963 0.0357525578677183 0.000559008293866678 5 A[C>A]T 0.00126505263784183 9.75912243380865e-05 0.0122650656971785 0.0296627698719921 0.00663587169503364 0.000179985776931981 0.000248522446240606 0.0472045874219964 0.00306313282723616 0.0169560731896464 0.000268323600008673 0.00122552063885904 0.000347256843861562 0.0830143252239989 0.00111191821370535 0.0106580277520086 6.18574864123409e-05 0.0214692003868359 0.000575079781725448 0.00124998489684999 0.000623593537179773 0.00172962261411101 5.67148006587459e-18 0.022125889785216 0.00498586225712035 0.000621485230278024 0.00397678433704963 0.0357525578677183 0.000559008293866678
6 A[C>G]A 0.00183905476327572 2.22617789199643e-16 0.0198134163196479 0.00693093776346386 0.0101438071817268 0.000471161374245006 6.50641448993352e-05 0.00435068194283005 0.00486288996439319 2.22517573229354e-16 0.00017155731775176 0.00122603740517805 0.00386336397251532 2.23207642223365e-16 0.000113243008759404 0.0017502630340451 0.00101136578656624 0.00173632608636201 0.0032141472167459 0.00884434681945288 1.69777369626624e-05 0.001669990831155 5.80535165335642e-18 0.00336052879803564 0.00805902537994468 0.000428895143599544 0.000154328219038108 0.00315478566718198 0.0010762429715105 6 A[C>G]A 0.00183905476327572 2.22617789199643e-16 0.0198134163196479 0.00693093776346386 0.0101438071817268 0.000471161374245006 6.50641448993352e-05 0.00435068194283005 0.00486288996439319 2.22517573229354e-16 0.00017155731775176 0.00122603740517805 0.00386336397251532 2.23207642223365e-16 0.000113243008759404 0.0017502630340451 0.00101136578656624 0.00173632608636201 0.0032141472167459 0.00884434681945288 1.69777369626624e-05 0.001669990831155 5.80535165335642e-18 0.00336052879803564 0.00805902537994468 0.000428895143599544 0.000154328219038108 0.00315478566718198 0.0010762429715105