comparison COSMIC_v2_SBS_GRCh37.txt @ 17:8c6ee1c2248f draft

"planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/mutational_patterns commit e5d498dfc5a6a9aaea3d09037dea5d15c2d85dd2"
author artbio
date Tue, 05 Oct 2021 22:28:34 +0000
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
16:31e7a33ecd71 17:8c6ee1c2248f
1 Type SBS1 SBS2 SBS3 SBS4 SBS5 SBS6 SBS7 SBS8 SBS9 SBS10 SBS11 SBS12 SBS13 SBS14 SBS15 SBS16 SBS17 SBS18 SBS19 SBS20 SBS21 SBS22 SBS23 SBS24 SBS25 SBS26 SBS27 SBS28 SBS29 SBS30
2 A[C>A]A 0.011098326166 0.000682708227003414 0.0221723067751109 0.0365 0.014941547714 0.0017 4e-04 0.0367180037768898 0.012 7e-04 2e-04 0.0077 0.000334757187 1e-04 0.0013 0.0161 0.001832019172 0.0505364186250505 0.0107 0.001179961596 1e-04 0.0015040703750015 0.000453360682999093 0.0286459925360286 0.0098967680010099 0.00203977290999388 0.00520562690902082 0.00139743884199441 0.06998198728 0
3 A[C>A]C 0.009149340734 0.000619107232003095 0.0178716753530894 0.0309 0.008960917997 0.0028 5e-04 0.0332457222459003 0.0067 0.001 0.001 0.0047 0.000648736139 0.0042 0.004 0.0097 0.000342235622 0.0109398247890109 0.0074 0.002211505148 7e-04 0.00245101101500245 0.000366800483999266 0.0202146384330202 0.006998928770007 0.00148716228399554 0.00473822741501895 0.000917187664996331 0.055152357207 0
4 A[C>A]G 0.001490070468 9.92789560004964e-05 0.00213833961701069 0.0183 0.002207846012 5e-04 0 0.00252531125599242 5e-04 3e-04 0 0.0017 3.8144594e-05 5e-04 0 0.0022 1.576225e-06 0.00228807269700229 5e-04 1.61691e-07 0 0 0 0.0204789964850205 0.00144844299800145 0.000283945613999148 0.000782697937003131 0 0.017846984044 0.0019673
5 A[C>A]T 0.006233885236 0.000323891363001619 0.0162651455900813 0.0243 0.009206905292 0.0019 4e-04 0.0335985495158992 0.0068 0.0092 2e-04 0.0046 0.00084665846 0.0296 0.0057 0.0088 0.003179664772 0.0194240913640194 0.0074 0.003008009987 6e-04 0.000922452518000922 0 0.0246001454250246 0.00496656500400497 0.000597865637998206 0.00271824245501087 0.000513409970997946 0.026804715973 0
6 A[C>G]A 0.001801068369 0.000263481044001317 0.02400261520212 0.0097 0.011671021651 0.0013 0 0.00835684480597493 0.0048 5e-04 7e-04 0.0031 0.003775165298 1e-04 0.0011 0.0048 0.001661704195 0.00151688758000152 0.0058 0.00069704107 5e-04 0.000527644040000528 0 0.011993038821012 0.00803256764600803 0.00127288129699618 0.0013241632460053 0.000255194995998979 0.009301971097 0
7 A[C>G]C 0.00258090852 0.000269866049001349 0.0121603036680608 0.0054 0.007292088583 0.0012 0 0.00430638030398708 0.0023 3e-04 3e-04 0.0015 0.000920824828 0 1e-04 0.0024 0.001626898399 0.0024987845270025 0.0019 0.002059310006 8e-04 0 0 0.00842511979200843 0.00163597041300164 0.00152819486199542 0.00177108412900708 0.000268898963998924 0.003479048871 0
8 A[C>G]G 0.000592548022 0.000219233911001096 0.00527541945802638 0.0031 0.002303839151 0 0 0.000584415302998247 0 0 0 0 1.9890489e-05 0 6e-04 0 2.5801897e-05 0.00261450898300261 0 1.2734958e-05 0 0 0 0 0 0.000307246307999078 0 0 0.000154433523 0.00482
9 A[C>G]T 0.002963986287 0.000610973492003055 0.0232776563421164 0.0054 0.011696245747 0.0018 1e-04 0.00863490691197409 0.0038 2e-04 9e-04 0.0025 0.003860632488 1e-04 0.001 0.0073 0.001328507581 0.00398301117000398 0.0072 0.000848587116 0.0018 0.000299454735000299 0 0.00388138318500388 0.00342844970100343 0.00249825182599251 0.00132271981900529 0.000307698015998769 0.003976789927 0
10 A[C>T]A 0.029514532745 0.00744155681703721 0.0178721707320894 0.012 0.021839187574 0.0312 0 0.0180666871559458 0.0093 0 0.0225 0.0121 0.001480180764 0.0293 0.0117 0.0135 0.009350488403 0.00382562391200383 0.0221 0.032858047272 0.0051 0.00311338969500311 0.0197671543719605 0.00631551813600632 0.020987618053021 0.00590723203898228 0.0137232857870549 0.00543379247097827 0.005197221326 0.065119
11 A[C>T]C 0.014322747041 0.00272631242801363 0.00889603432304448 0.0075 0.012756105638 0.0163 0.0197 0.00565001502898305 0.0056 0.0032 0.1099 0.0054 4.0508707e-05 0.0321 0.0169 0.0076 0.004224289013 0.00246521426100247 0.0203 0.022196046913 0.0062 0.00152486029000152 0.0818805799248362 0.00384432691700384 0.0131412836970131 0.0106264578159681 0.0054243060010217 0.00181541548799274 0.00897646999 0.054397
12 A[C>T]G 0.171646931305 0.00332208328101661 0.00357270835001786 0.0028 0.016760177116 0.0908 1e-04 0.0192651054649422 0.0125 0.0126 0.0072 0.0019 0.000316594671 0.0496 0.0309 0.0035 0.009229213313 0.00846395688600846 0.0368 0.034572014703 0.0256 0.00362564120100363 0.0092487150849815 0.00311066442500311 0.0196598942850197 0.0199303232389402 0.00670642945402683 0.00543203933097827 0.03163899636 0.0204604
13 A[C>T]T 0.012623763151 0.00332652841701663 0.014797612209074 0.0059 0.016477954692 0.0149 0.0043 0.0208059674969376 0.0076 0.0047 0.0639 0.0067 0 0.0277 0.0066 0.0101 0.005735961173 0.00560573992700561 0.0266 0.018819559611 0.003 0 0.0332096522089336 0.00342041867300342 0.00572851931200573 0.011334530551966 0.0044756140340179 0.00162921318899348 0.004769666594 0.0219359
14 A[T>A]A 0.004021520333 1.32377000000662e-07 0.00842856356604214 0.0048 0.008902904323 6e-04 0.001 0.0133650828109599 0.0121 0 2e-04 0.0058 0.001243618346 0 0.0021 0.0081 0.00061300245 0.00303721080400304 0.0011 0.000574401358 0.0083 0.0496192297120496 0 0.00116674712600117 0.0204305271250204 0.00445933987898662 0.143076389009572 0.000964030890996144 0 0.0075743
15 A[T>A]C 0.002371144163 0.000113069562000565 0.00737309667003687 0.0039 0.007399202496 0.0033 8e-04 0.0124312020769627 0.0042 2e-04 1e-04 0.0065 0.001060001878 8e-04 0.009 0.0073 0.001878587472 0.000811167214000811 0.0053 0.001971462059 0.0292 0.0116667404640117 0 1.51730570000152e-05 0.00889256066100889 0.0128222429159615 0.00146408538700586 0.00336566780898654 0.003049595749 0.003738
16 A[T>A]G 0.002810909959 0.000532929416002665 0.00735730002003679 0.01 0.011508051457 0 9e-04 0.0140366570669579 0.0068 0 7e-04 0.0046 0.00010255436 0 9e-04 0.008 0.001087349685 0.0045032071380045 0.0045 0.000190586616 0.0027 0.0679154542130679 0.000237418520999525 0.00633245557300633 0.00624194848000624 0.00117234427199648 0.00122628089700491 0.00178575364999286 0.003909981984 0.0065906
17 A[T>A]T 0.008360909345 0.000149110959000746 0.00875393899104377 0.003 0.011193623195 0.0053 0.0035 0.0241099165959277 0.0185 0.0012 3e-04 0.006 0.000971812099 9e-04 0.0079 0.0084 0.002045493651 0.00273652318500274 0.0033 0.007421103528 0.0043 0.0145999175800146 0 4.96721600000497e-06 0.0148508776220149 0.00399313754898802 0.00253519795101014 0.00565308909997739 0.005105527437 0.0093447
18 A[T>C]A 0.01391577303 0.00130350955800652 0.0130357094320652 0.0084 0.035366735114 0.0075 5e-04 0.0162065101009514 0.0252 0.0031 6e-04 0.0466 0.000549454166 0.0026 0.0115 0.0717 0.002697314025 0.00293305364400293 0.0145 0.016395062964 0.0265 0.0168399309490168 0.00106844881999786 0.00472600914200473 0.0206632827730207 0.0550286521328349 0.00504730108102019 0.00409274688798363 0.010119181163 0
19 A[T>C]C 0.0062749606 0.000425576677002128 0.00918628969004593 0.002 0.013771102129 0.0056 1e-04 0.00778780281997664 0.0105 0.0052 0.0015 0.0317 0.000145506661 0.0046 0.0073 0.0171 0.008078150072 0.00151328476300151 0.0048 0.019251793639 0.0165 0.00110826238200111 0.000221573158999557 0.000627949341000628 0.0095024784240095 0.0275946042079172 0.00184569122800738 0.00788072921096848 0.006349682655 0.0087547
20 A[T>C]G 0.010137636154 0.000575473007002877 0.0117169200770586 0.0081 0.028449051657 0.0217 7e-04 0.00985258355297044 0.0176 0.0026 8e-04 0.0487 0.000279178024 0.0035 0.0073 0.0348 0.004432870698 0.00332966895500333 0.0135 0.054784918009 0.0224 0.00491361640500491 0.000498801513999002 0.00272375862700272 0.0199114924560199 0.0517910440498446 0.00568881387902276 0.00552083360397792 0.014659610308 0.0090498
21 A[T>C]T 0.009256316389 0.00148816409300744 0.0169788707980849 0.0036 0.027302974158 0.0023 0.0011 0.0218294638259345 0.0247 0.004 3e-04 0.025 0.000267461432 0.0025 0.0063 0.0497 0.003140370209 0.00549131777100549 0.016 0.007341269916 0.0189 0.00263052393300263 0.000313240540999374 0.00712236847000712 0.0144883902550145 0.0390722444188828 0.00259275457701037 0.00323248399998707 0.007892413403 0
22 A[T>G]A 0.001587636423 3.37184110001686e-05 0.00235136807601176 0 0.003462151975 0 0 0.00421971928398734 0.0335 0 0 0.0012 0.00038619979 0 0 0.0052 5.3139249e-05 0.000386138197000386 0.0014 1.765291e-06 0 0.00165199861500165 0 0 0.00528167968200528 8.0653425999758e-05 0.00113633739200455 0.00636467555497454 0 0.0053118
23 A[T>G]C 0.001784091288 2.48448260001242e-05 0.00146423112900732 2e-04 0.002246592659 0.0017 0 0.000793671328997619 0.0051 0.004 0 0.001 0.000112383214 0.002 6e-04 0.0042 0.006468661271 0.00125498208000125 0 0.000381387913 0.0031 0 0 0.00146395068800146 0 0.00016317120999951 0.000958976380003836 0.0166109056469336 0 0.0024592
24 A[T>G]G 0.001385830552 0.000273454078001367 0.00905377764204527 0.0015 0.005490216837 7e-04 9e-04 0.0068658003739794 0.0052 0.0015 1e-04 0.0018 3.6000696e-05 7e-04 0.0012 0.0061 0.003481549012 0.00236921607300237 0.001 0.000658758087 0.0016 0.00108687275800109 0 0.000847612530000848 0.00713642164400714 0.00125507950699623 6.76606100002706e-05 0.00659284224497363 0.002925171448 0.0062955
25 A[T>G]T 0.003158539312 0.000217694872001088 0.00703097641903516 2e-04 0.003821226712 0.0029 0 0.00293992225899118 0.0193 0.0137 0 0.003 0.000192493754 0.0056 0.0029 0.0076 0.030926375169 0.000338602881000339 0.0017 0.000532125222 0.0018 0 0 0.00107545529400108 0 0.00185038349199445 0.000256027748001024 0.0863928974346544 0 0.0095416
26 C[C>A]A 0.006595870109 0.000677444988003387 0.0187817255730939 0.0461 0.00967490433 0.0101 0.0012 0.0317237565899048 0.0098 0.0031 7e-04 0.0135 0.001710089561 0.0056 0.0106 0.0159 0.001032430218 0.0887681088190888 0.0112 0.017377110647 0.002 0.00454969294400455 0.000164739381999671 0.0635592837930636 0.0148329478750148 0.00370585008298888 0.00506507326802026 0.00116851563699533 0.051410211701 0
27 C[C>A]C 0.007342367815 0.000213681013001068 0.0157604578420788 0.0614 0.004952300642 0.0241 6e-04 0.0255054071349235 0.0057 9e-04 0.0017 0.0112 0.001159256581 0.0102 0.0084 0.01 0.000421880127 0.0206413905570206 0.0159 0.036502462984 0.0014 0.00376447385400376 0.000736874801998526 0.0337570047160338 0.00782217530200782 0.00398072337298806 0.00223415334400894 0.000334291810998663 0.025825650831 0
28 C[C>A]G 0.00089284037 6.77046000003385e-06 0.00196338984600982 0.0088 0.002800627307 0.0091 0 0.00115962430299652 0 7e-04 0.001 0.0028 0.000244166533 9e-04 0.0015 0.0022 0.000297462769 0.0171784024800172 0.0018 0.012482587542 0.0027 0.0009001633310009 0.000163953660999672 0.0224289858060224 0.00127697673200128 0.000811741969997565 0.000266312161001065 5.36519979997854e-05 0.014496183324 0.0022624
29 C[C>A]T 0.007186581642 0.000416332906002082 0.0147228611260736 0.0432 0.011013465824 0.0571 0.0013 0.0287911729709136 0.0091 0.016 0.0014 0.0071 0.001256768244 0.1257 0.0228 0.0084 3.1479429e-05 0.0376769589290377 0.0096 0.103401226249 0.0056 0.00443984623100444 0.000722731834998555 0.0200865154380201 0.0125636547190126 0.0190384313449429 0.0031005700090124 0.000186671901999253 0.040355074099 0
30 C[C>G]A 0.001284983446 2.77720770001389e-05 0.0168325719890842 0.0105 0.007537523174 0 1e-04 0.00661907721598014 0.0018 0 0 0.0019 0.005333651375 0 9e-04 0.004 0.001924978751 0.000458463822000458 2e-04 1.331626e-05 1e-04 0.000582017663000582 0.000199049173999602 0.0134768216090135 0.0072007904100072 0.00127910606899616 0.00473064942601892 0.000103366091999587 0.002618863169 0
31 C[C>G]C 0.000702134818 0.000279643862001398 0.0135314415270677 0.0097 0.007633226665 0 4e-04 0.00607770289498177 0.002 0 2e-04 0.0019 0.000912303471 0 3e-04 0.005 0.000709367774 0.00365422833000365 0.0028 0.000548144708 0 0.000825299647000825 0.000283776025999432 0.0161056877370161 0.0045984731170046 0.00121497730299635 0.00126164484200505 0.000144310791999423 0.00111151227 0
32 C[C>G]G 0.000506289594 1.91615760000958e-05 0.00417645752402088 0.0063 0.002613760399 0 6e-04 0.000656033432998032 0 0 8e-04 0 0.000285467331 0 4e-04 0.0028 3.517869e-06 0.00540577424500541 2e-04 0 0 0.000382114636000382 0 0.000797471998000797 0.000823709283000824 0.000207832587999377 0.000360856587001443 0 0.00152004695 0.0032461
33 C[C>G]T 0.001381542722 0.000312781573001564 0.0240463904241202 0.0094 0.009417097876 2e-04 3e-04 0.00780502695697658 0.0039 0 2e-04 0.0019 0.006383097568 0 0.0017 0.008 0.000953776334 0.00551960482000552 8e-04 0.000120730556 3e-04 0.00176064591100176 0.000195775337999608 0.0103886658820104 0.000196360325000196 0.00229702621099311 0.000268026230001072 0.000290999508998836 0.000139750691 0
34 C[C>T]A 0.020896446965 0.0150195069310751 0.014395059491072 0.021 0.022769209355 0.0085 0.0754 0.0048658100209854 0.0098 0.0012 0.031 0.0187 0.003647278451 0.006 0.0051 0.021 0.021265205902 0.00976751147500977 0.0438 0.011145185306 0.0034 0.00773134952200773 0.0605726278048789 0.00603544739400604 0.0143339946910143 0.00659444488498022 0.0174384847780698 0.00439153255398243 0.009126471767 0.0694472
35 C[C>T]C 0.01850170477 0.00351691809801758 0.00854478119204273 0.0144 0.017509476305 0.0099 0.1007 0.00398015043098806 0.0069 0.0024 0.1518 0.0094 0.001004229295 0.0167 0.0088 0.0098 0.003847235312 0.00565482846200565 0.0753 0.018152746866 0.0091 0.00711085052600711 0.186375634075627 0 0.00593664365900594 0.00651063197098047 0.00714487020702858 0.00264766096598941 0.007067603037 0.0638403
36 C[C>T]G 0.095577217268 0.0049792757150249 0.00351846584001759 0.0076 0.012862237589 0.0901 0.0208 0.00833863918197498 0.0076 0.0109 0.0135 0.0046 0.000129202148 0.0293 0.0155 0.0016 0.013176112314 0.0161832229640162 0.0238 0.044384942487 0.0318 0.0055020309650055 0.0151490825929697 0.00292441907400292 0.0115593916270116 0.0119049353239643 0.00750356165503001 0.00228456355099086 0.019875180409 0.0173126
37 C[C>T]T 0.017113307642 0.00895655277504478 0.0160755457120804 0.0201 0.020429513385 0.0087 0.0788 0.0188436274339435 0.0097 0.0043 0.0816 0.0205 0.00061176997 0.0186 0.0096 0.0211 0.009648025316 0.00515331861300515 0.1159 0.013847136214 0.004 0.00416977724100417 0.156015396976688 0.00397120157500397 0.0136325968850136 0.00623855632698128 0.00714802770202859 0.0024239842669903 0.001634058687 0.0342318
38 C[T>A]A 0.001182587416 0.000154598981000773 0.00757132026003786 0.0075 0.005043163511 1e-04 0 0.0120242175219639 0.0055 0 4e-04 0.0017 0.000285158991 0 0.0016 0.0054 3.0079241e-05 0.000412346353000412 0.0043 4.5042364e-05 0 0.0868985455160869 0.000594528452998811 0.00276663483800277 0.0262963230890263 0.00356142268098932 0.330601017472322 0.00256657996698973 0.001765447503 0.0053118
39 C[T>A]C 0.001903166857 0.00046401902800232 0.0127254635280636 0.0111 0.006208843676 0.0026 0.0014 0.0178810924229464 0.0049 1e-04 0.0011 0.0086 0.000222287328 0.0034 0.0043 0.0128 0.010223747696 0.00249141131000249 0.0053 0.004389055645 0.0037 0.0537068468090537 0 0.00269446245400269 0.0157998830850158 0.00390161098098829 0.00281359880801125 0.0196108974289216 0.000383359117 0.0067873
40 C[T>A]G 0.00148796063 0.000230409809001152 0.0115085618650575 0.0342 0.01050756897 8e-04 7e-04 0.0163567745329509 0.0051 3e-04 6e-04 0.0031 0.000286951828 2e-04 0.0027 0.013 0.004467036232 0.00552304571300552 0.0021 0.001127835842 0.0025 0.213220866558213 0.000173120399999654 0.00691116472100691 0.0628606063810628 0.00239030417999283 0.00439685708301759 0.00883360003196467 0.003556845215 0.0082628
41 C[T>A]T 0.002179344412 0.000574885587002874 0.0164561776960823 0.0115 0.009784640746 0.0011 0.0018 0.0262478019169213 0.0069 9e-04 4e-04 0.0054 8.00446e-07 0.002 7e-04 0.0096 0.031244883388 0.00331371327300331 0.0022 0.002385541321 0.001 0.0618275074760618 0.000457813098999084 0.00291520016500292 0.0366223511120366 0.00163592266699509 0.00543089163302172 0.0109426098199562 0.002232755492 0
42 C[T>C]A 0.004176674882 0.000546619204002733 0.00789501261103948 0.0052 0.014238629786 0.0062 0.001 0.00517384241698448 0.0154 5e-04 1e-04 0.0312 4.2751466e-05 6e-04 0.0032 0.0146 0.007426999646 0.000192169320000192 0.0066 0.014867696528 0.0219 0.00402734633400403 0 0.00184887653500185 0.00902801489400903 0.0378893776908863 0.0048990792380196 0.020738003351917 0 0
43 C[T>C]C 0.005252593331 0.000392332573001962 0.0144311703620722 0.0026 0.01248950044 0.004 8e-04 0.0109368937679672 0.0118 0.0019 4e-04 0.0385 4.3307542e-05 0.0053 0.005 0.0194 0.039657001207 0.00305019258100305 0.007 0.018356161025 0.01 0.00135244392900135 0 0.00445368985700445 0.0107716324200108 0.0217407349529348 0.0057244484670229 0.0432837972458269 0.002774953681 0
44 C[T>C]G 0.00701322531 0.00036202450800181 0.00842297214404212 0.01 0.018741631229 0.027 0.001 0.00565777360198303 0.0154 0.0015 1e-04 0.0415 5.4272534e-05 0.0016 0.0128 0.019 0.028609696263 0.0025964641930026 0.004 0.074150562563 0.0211 0.00274966613700275 0.000320704885999359 0 0.0133506613100133 0.0472401033428583 0.00566147899202265 0.0370882617278517 0.006902414709 0
45 C[T>C]T 0.006713813119 0.000560900126002804 0.0119324304650597 0.0054 0.019054082944 0.0033 0.0045 0.0111203893219666 0.0275 0.002 9e-04 0.0324 7.63944e-07 0.0027 0.0035 0.0263 0.101869657701 0.00131002874400131 0.0053 0.011001118253 0.0204 0.00236335353700236 0 0.0015973890070016 0.00896102996600896 0.0207406214309378 0.0039005890620156 0.00505271601797979 0.003041424895 0
46 C[T>G]A 0.000302691186 0.000113784603000569 0.00197418114600987 0 0.002041648941 1e-04 0 0.00242405055199273 0.0216 0.0022 0 0.0013 1.5094208e-05 0 0 2e-04 9.1469787e-05 6.1002548000061e-05 0 2.3264084e-05 0 0.00112035651500112 0 0 0 9.53962599997138e-05 0 0.00958984194096164 0.001116854814 0.0046233
47 C[T>G]C 0.00209850244 2.20950870001105e-05 0.00582429554502912 0.0013 0.003478502118 0.004 8e-04 0.00209621061599371 0.0064 0.0018 1e-04 0.0049 0.00014762484 0.002 0.0019 0.0082 0.019814293551 0.00201569691300202 0.0011 0.008476494525 5e-04 0.00106458357100106 0.00019014434199962 0.00218543734800219 0.00288645433700289 0.00391945509998824 0.000381244984001525 0.0339132237218644 0 0.0060004
48 C[T>G]G 0.0015995485 0.000228245948001141 0.0104646545250523 0.0046 0.007147456226 0.005 9e-04 0.00660404629398019 0.0126 0.0037 0.0011 0.0045 4.59873e-05 5e-04 7e-04 0.0067 0.013449837633 0.00531196725400531 0.0013 0.015383776115 4e-04 0.00418856812600419 0 0.000113909674000114 0.0117694924990118 0.00549735731398351 0.000403257236001613 0.0185164816059259 0.002169693346 0.0073775
49 C[T>G]T 0.002758537619 6.71113400003356e-05 0.00872438730204362 0.0012 0.011486811509 0.0086 0.0013 0.0048667138589854 0.0509 0.0182 9e-04 0.0063 0.000463714722 0.0063 0.0045 0.0186 0.261456614079 0.00234162917800234 0.0019 0.002185394659 0.0032 0.00162940957300163 0.000210834979999578 0.00253371833300253 0.00855080748200855 0.00678871869097963 0.00143909606900576 0.118967102953524 0.001143663251 0.0091481
50 G[C>A]A 0.008232603989 0.00035201335300176 0.00969653967604848 0.0376 0.011892168979 0.0024 3e-04 0.023682328868929 0.0118 0.0014 4e-04 0.0062 0.000132109643 0.0018 0.0024 0.0096 0.006535404875 0.128724158080129 0.0032 0.001116123789 1e-04 0.0012983701610013 0.0003499074949993 0.0546764486790547 0.0134652950530135 0.00137531184599587 0.010755871858043 0.00213662907699145 0.078046610108 0.008853
51 G[C>A]C 0.00575802141 0.000133816879000669 0.0108433411160542 0.0399 0.009247857495 0.0058 1e-04 0.0158218964449525 0.0092 0.0022 0.001 0.0056 0.000754244011 0.0114 0.0099 0.0094 0.001293803953 0.0160928786630161 0.0031 0.003271428605 0.0038 0.00180962215200181 0.000568337771998863 0.10994598899711 0.00646829805800647 0.00196163908799411 0.0124423351170498 0.000429208378998283 0.073460914669 0.0093449
52 G[C>A]G 0.000616335232 0.000178441660000892 0.000929140538004646 0.0227 0.002809188466 0.0021 0 0.000850913753997447 0 2e-04 0 0.0015 9.6820775e-05 0.0011 0.0013 0.0036 0.001283663378 0.00927141676200927 0 0.003751612508 3e-04 0.000333838055000334 0.000149417833999701 0.0465248690100465 0.000658103089000658 1.32296639999603e-05 0.00162962834700652 0 0.017383296915 0.0008853
53 G[C>A]T 0.004459080311 0.000122832046000614 0.0122153826390611 0.0258 0.010301267456 0.0087 1e-04 0.0210612358019368 0.0085 0.0088 6e-04 0.0027 0.000551103672 0.0736 0.0309 0.0063 0.003103766672 0.072017070126072 0.0072 0.01293719445 0.0023 0.000519148161000519 0 0.0504287094820504 0.0104730803470105 0.00193499629299419 0.00741235515202965 0.00131850725599473 0.059602472118 0.0081645
54 G[C>G]A 0.000602122711 4.48385140002242e-05 0.0119168445690596 0.007 0.005559423089 0 0 0.00372456794598883 0.0011 0 0 0.0012 0.001349419584 2e-04 0.0022 0.0031 0.001296324191 0.000923879703000924 0.002 0.001339769321 4e-04 0 0 0.00494506070800494 0.00416965552400417 0.00132060747499604 0.00141816638700567 8.15914109996736e-05 0.000265759858 0.0073775
55 G[C>G]C 0.002393352209 1.45201030000726e-05 0.00982365339704912 0.0091 0.005388801221 0.003 4e-04 0.00304659695299086 0.0029 2e-04 2e-04 0.0011 0.000788807743 1e-04 5e-04 0.0032 0.000260760911 0.000648647922000649 0 0.001811151475 0.0042 0 0.000137501073999725 0.00936987577400937 0.00239280494400239 0.00184550107099446 0.00134671678200539 0.000105219030999579 0.000945012884 0.0065906
56 G[C>G]G 2.48534e-07 4.06658890002033e-05 0.00167105425000836 0.0062 0.001100589633 0 0 0.000321212792999036 0 0 0 0 8.1791214e-05 0 6e-04 0 4.377552e-06 0.000542839968000543 0 6.37538e-07 0 0.000214695851000215 0 0.00562572654000563 0.000418193916000418 0.000205060776999385 0 0 0 0.0015739
57 G[C>G]T 0.000890080731 0.000268429459001342 0.0179143343060896 0.006 0.006041247837 0.0017 0 0.00577566359798267 0.0044 4e-04 0 9e-04 0.002680123244 3e-04 0.0018 0.0029 0.001820392786 0.00137672488800138 0 0.001238264182 4e-04 0.000538438803000538 0 0.00305577006400306 0.00199401221700199 0.00122553285599632 0.00456068597401824 0.000159679353999361 0.004796744744 0
58 G[C>T]A 0.024943814154 0.00639080787603195 0.0161272733320806 0.0087 0.020038258645 0.0653 0 0.00226126268599322 0.0062 0 0.0261 0.0124 0.002934137577 0.0557 0.0476 0.0125 0.002068754725 0.0027030687270027 0.0374 0.056793947985 0.0163 0.00191537085400192 0.0532820589648934 0.0236790512950237 0.01003811201301 0.00960651502697118 0.0142153137430569 0.00338424086898646 0.011638793032 0.0485934
59 G[C>T]C 0.027161494035 0.00199581678400998 0.00820863243704104 0.008 0.018022312238 0.0773 0.021 0.00161664918699515 0.0069 0.0134 0.0975 0.0092 0.002515171146 0.0618 0.1345 0.0092 0.000325483399 0.0041993075360042 0.0614 0.05442985727 0.0392 0.00322913354700323 0.162918343742674 0.0159192018400159 0.00695387515500695 0.0195074267199415 0.0201436461820806 0.00168741402899325 0.003781751661 0.0494787
60 G[C>T]G 0.103570762296 0.000303020977001515 0.00121292286600606 0.0023 0.013193817648 0.1339 2e-04 0.0116067115999652 0.0088 0.027 0.009 0.0023 0.00320526455 0.0978 0.1829 9e-04 0.007511101358 0.0118973608250119 0.0278 0.004592688609 0.0019 0.0033005988790033 0.0130464947439739 0.0126480776060126 0.0104683630270105 0.0225027173829325 0.00936846849603747 0.00218930895999124 0.019684388045 0.0157387
61 G[C>T]T 0.017689854381 0.00326581818801633 0.0106116492080531 0.0082 0.019502915335 0.0524 0.0161 0.00628492899598115 0.0101 0.0152 0.0522 0.0115 0.001687730545 0.0555 0.08 0.0116 0.000925697167 0.00191338090500191 0.0917 0.049580863753 0.0166 0.00111405957000111 0.107590399753785 0.0181297783780181 0.00982382073500982 0.0173074721839481 0.00758962595003036 0.00104399363099582 0.005761336823 0.0188865
62 G[T>A]A 0.000689289439 0.000114994210000575 0.00443478255902217 0.0069 0.006740387717 0 0 0.00813917860797558 0.003 0 3e-04 0.0015 0.000137960405 0 0 0.003 8.545689e-06 0.00187543408100188 0.0026 0.000163129836 0 0.0537091456930537 0 0.00222512733600223 0.0362178008370362 0.00224288651299327 0.109851871980439 0.000551460782997794 0.002930098053 0.003738
63 G[T>A]C 0.000552409528 0.000293862060001469 0.00561543241102808 0.0052 0.00402159648 0.0028 0 0.00791008031797627 0.0029 1e-04 3e-04 0.0039 0.000252867405 0.0025 0.0038 0.004 0.002573466959 0.00151030975700151 0 0.003799179503 0.0142 0.00948939669400949 0.000183203811999634 0.00485314915700485 0.00584710964700585 0.00520728709498438 2.34556780000938e-05 0.00316398759698734 0 0.0033445
64 G[T>A]G 0.001200228847 8.87213440004436e-05 0.00807013647204035 0.0133 0.006814352288 6e-04 6e-04 0.00905726305597283 0.0028 0 4e-04 0.0019 0.000153517461 0 0.0026 0.0051 0.003538822593 0.00150536877600151 0.0016 0.0008283337 0.0031 0.0502939024280503 0 0.000195758628000196 0.0382411793150382 0.00135812177799593 0.00156593715900626 0.00215284701299139 0.000533632401 0.0050167
65 G[T>A]T 0.002107136837 0.000215755466001079 0.0086791217440434 0.0045 0.005101032909 0.0021 0.001 0.0178122386469466 0.0036 4e-04 1e-04 0.0031 0.000122745552 9e-04 0.0043 0.0033 0.003879009961 0.00361102520200361 0.0052 0.001900746587 0.0041 0.0106014572330106 0 0 0.0201679544190202 0.00251311294199246 0 0.00200773324399197 0 0.0063939
66 G[T>C]A 0.011247835116 4.67385200002337e-06 0.00685005557403425 0.0061 0.016294982792 0.0122 2e-04 0.00572077854898284 0.0091 0.0064 0.001 0.0573 0.001054081222 0.0078 0.0195 0.0161 1.1401335e-05 0.000529126468000529 0.0039 0.002469317074 0.1426 0.00421745411300422 0.000251168627999498 0.00126974984000127 0.0174898238790175 0.0980528247187058 0.00477738035401911 0.00365504812698538 0.007090803763 0
67 G[T>C]C 0.006999724257 0.00018606592700093 0.0062607490140313 0.0016 0.009574560593 0.0059 1e-04 0.00518105150198446 0.0097 0.0101 0.0016 0.0274 0.000529899747 0.0127 0.0499 0.0099 0.009657713318 0.00227913082900228 0.003 0.001565632906 0.0665 0 0.000538218488998924 0.00671033999600671 0.00404561244600404 0.0402263639628793 0.00196495433000786 0.00707117532697172 0.007111327534 0.0065906
68 G[T>C]G 0.004977592617 4.95044000002475e-07 0.00609876299303049 0.0042 0.014103929348 0.0115 3e-04 0.00504070747098488 0.0094 0.0054 0.0019 0.041 0.000630095718 0.0082 0.0154 0.0148 0.004654129131 0.00587105658100587 0.006 0.027341755021 0.0884 0.00147488453400147 0 0.000277684976000278 0.0134022462740134 0.0446207009828661 0.00122916774900492 0.00823223843996707 0.005643063554 0.0078694
69 G[T>C]T 0.010667406133 0.000578598104002893 0.00750934385903755 0.0024 0.015666874692 0.0042 0.0081 0.00848822025797453 0.0126 0.0124 0.0023 0.0405 0.000676187888 0.0086 0.0094 0.0142 0.008149234601 0.00477156573900477 0.0099 0.001498264796 0.1003 0.00156104273800156 0.000995769680998008 0.00423847766900424 0.0141596937360142 0.0555280682798334 0.00374722501301499 0.000407884509998368 0.011237674345 0.0084596
70 G[T>G]A 9.9045003e-05 9.55523920004778e-05 0.00414448801802072 0 0.001627664547 0 0 0.000974578664997076 0.0072 0 0 0 1.8489857e-05 0 0 0 3.9193821e-05 0.00134153246400134 0 3.579149e-06 0 0 0 0 0.00554622692400555 3.73932319998878e-05 0 0 0 0.0032461
71 G[T>G]C 0.000202365646 4.7002381000235e-05 0.00450198531302251 0 0.000327734937 0.0016 0 0.000524821554998426 6e-04 0.002 0 4e-04 9.3373513e-05 0.0019 0.0022 0.0032 0.009078461515 9.2043100000092e-07 0 0.002830575073 6e-04 0 0 0.00107363230200107 0 0.00246070499499262 5.07905650002032e-05 0 0 0.001869
72 G[T>G]G 0.001188353185 0.00010992570300055 0.016391452608082 0.0018 0.005948879802 0.001 0.0017 0.00608775346698174 0.005 9e-04 0.001 0.0011 1.0579194e-05 0.0012 0.0037 8e-04 0.004782775461 0.00969499998100969 0.0043 0.002733219405 4e-04 0.00187758918100188 0.000187132413999626 0.00292469699600292 0.00868524444400869 0.000817201562997548 0.00474291855001897 0.00421780829898313 0.003640593813 0.0033445
73 G[T>G]T 0.000800723342 8.64771800004324e-05 0.00706723664303534 2e-04 0.003307466591 0.0035 9e-04 0.00542743378498372 0.0185 0.003 0 0.0032 5.3741207e-05 0.0038 0.019 0.0044 0.063497756582 0.00289055351900289 0.0025 0.003558558565 8e-04 0 0 0.000825098263000825 0.00276857168300277 0.0078335612709765 0.00229847603000919 0.0316489973208734 0.006181023776 0.0056069
74 T[C>A]A 0.012250063666 0.0151274275190756 0.0116532249090583 0.033 0.014774016248 0.0017 0.001 0.0270323830389189 0.0222 0.0374 9e-04 0.0066 0.048166047937 5e-04 0.0057 0.0122 0.001824558257 0.0670806435290671 0.0051 0.000688299692 1e-04 0.00405163455200405 0.00207128998499586 0.0314512631820315 0.00693814658500694 0.00268006242399196 0.00707928452202832 0.000775902767996897 0.026894406511 0
75 T[C>A]C 0.011162229329 0.00653249245403266 0.016606775011083 0.0538 0.012043464964 0.0029 0.002 0.0180897732899457 0.0043 0.0103 0.0025 0.0099 0.017329557089 0.0166 0.0062 0.0145 0.001286518338 0.0418690096930419 0.0063 0.00405822906 5e-04 0.00273977093700274 0.000696410200998607 0.0625382936990625 0.0102466074000102 0.00203164386599391 0.00626880062802508 0.000829292466996683 0.031608136996 0
76 T[C>A]G 0.002275495686 0.00165645539800828 0.00135723943900679 0.0104 0.003902362388 0.0011 2e-04 0.00169487519699492 0 0.0031 1e-04 0.0019 0.002293157306 0 0.0025 0.004 0.002172941968 0.0151623792900152 0.0018 0.001001102231 0 0.000513151070000513 9.93936329998012e-05 0.0128025907280128 0 0.000265071699999205 0.00144640341500579 0 0.012500468152 0.0016722
77 T[C>A]T 0.015259102491 0.012394610714062 0.0163280759750816 0.037 0.018243395705 0.0058 0.0013 0.0381413308678856 0.0322 0.3083 4e-04 0.0049 0.018634581512 0.0516 0.0145 0.0157 0.005012316394 0.117877846666118 0.0087 0.012229104507 4e-04 0.00360565089900361 0.000207430190999585 0.0302976796130303 0.0246257872260246 0.00301718745699095 0.00980627775003923 0.00199807366699201 0.04120717639 0
78 T[C>G]A 0.001874853199 0.0372418531491862 0.0160414054380802 0.0032 0.002681056961 0 2e-04 0.00411787883698765 0.0033 0 1e-04 0.0024 0.280234946548 0 9e-04 0.005 0.000392684657 0.0018029690510018 5e-04 2.4298469e-05 2e-04 0.000225490615000225 0.000230608943999539 0.0102208574360102 0.0097987245670098 0.00420189675098739 0.00287043372101148 0.000521370367997915 0.000820444889 0
79 T[C>G]C 0.002067418791 1.94134110000971e-05 0.0201499204281007 0.0105 0.007924048307 2e-04 0.001 0.0037996495919886 0.0025 0 0.0011 0.0027 0.063885286587 0 0.0026 0.0064 0.000655602418 0.00786300679400786 0.0011 0.00015199855 3e-04 0.000628695020000629 0.000165787008999668 0.00757836525200758 0.00326650715000327 0.00280776153399158 0.00310796756901243 0.000667325889997331 0.000444119287 0
80 T[C>G]G 0.000304897004 0.00162546545700813 0.00252791093601264 0.0031 0.001319075649 0 3e-04 2.5653017999923e-05 0 0 3e-04 0 0.009528486008 0 0 0 1.3641541e-05 0.00151322333400151 0 0 0 0.000395807994000396 0 0.00159271421700159 0.00205743675300206 6.19699999998141e-09 1.28104090000512e-05 0 0.000143297155 0.0019673
81 T[C>G]T 0.00315157446 0.0668798996843344 0.0326736407621634 0.005 0.006644595708 1e-04 7e-04 0.00624755373798126 0.0049 1e-04 8e-04 0.0015 0.330225481745 1e-04 0.0015 0.0169 0.002852380395 0.00356710206500357 0.0105 0.000683059976 3e-04 0.000257375147000257 0.000438955808999122 0.0061007271900061 0.0164009168500164 0.00801938298597594 0.00213058750300852 0.00124577953499502 0.001369869047 0
82 T[C>T]A 0.014492099634 0.4199413995961 0.0088802090610444 0.0035 0.010997560324 0.0074 0.1202 0.00718066853997846 0.005 0.0037 0.0302 0.0138 0.113842093163 0.0092 0.0112 0.0172 0.016100784572 0.0149233917010149 0.0218 0.01071032207 0.0064 0.00201672168800202 0.0145586136959709 0.0265718943460266 0.0110775208000111 0.0113032887679661 0.018757776459075 0.00762225767196951 0.012076583098 0.0849892
83 T[C>T]C 0.017680775357 0.0819724961444099 0.0135295727980676 0.007 0.020644964803 0.0067 0.2887 0.00406103293798782 0.0084 0.0211 0.1589 0.0095 0.015024839001 0.0283 0.0156 0.0131 0.016779984064 0.00996274431000996 0.033 0.00817550977 0.0086 0.00199083424600199 0.043510446938913 0.0120556910820121 0.00644878754000645 0.0108075269749676 0.00798918440603196 0.00511661924097953 0 0.090301
84 T[C>T]G 0.076002221712 0.0477201863682386 0.00170540885800853 0.0011 0.007534489574 0.0391 0.0992 0.00553512151998339 0.0047 0.2141 0.008 0.001 0.006102097956 0.0094 0.0104 0.0036 0.016272095596 0.0115497151260116 0.009 0.023163899202 0.0126 0.0014984730910015 0.0027526405439945 0.00536335968000536 0.0140834161810141 0.0103643293279689 0.00460913097101844 0.00191802810999233 0.015830196802 0.0151485
85 T[C>T]T 0.013761704021 0.228674918307143 0.0103044169280515 0.0077 0.011787461775 0.0047 0.0844 0.0122090704969634 0.0096 0.0392 0.0954 0.009 0.028140661233 0.0229 0.0076 0.0193 0.01982741755 0.0053980139940054 0.0267 0.009540087238 0.0064 0.00118222650200118 0.0243287852339513 0.00553249918000553 0.0124185858850124 0.00724914535997825 0.0118809324820475 0.00619315862597523 0.0134621373 0.045544
86 T[T>A]A 0.005600155423 8.07524860004038e-05 0.00713268135403566 0.0045 0.009205637343 2e-04 0.001 0.0151399962359546 0.0215 0 3e-04 0.0057 0.000403261316 0 8e-04 0.0085 0.000698812311 0.00466327804300466 0.0039 0.000924547968 0.0027 0.0408105028250408 0 0 0.0218303290490218 0.000628145255998116 0.0528138874942113 0.000203237562999187 0.001191207434 0.0076726
87 T[T>A]C 0.00199907926 4.80289800002401e-06 0.00910279782704551 0.0046 0.006835344247 8e-04 0.0015 0.0120935546059637 0.0027 8e-04 0 0.0132 0.000771813274 0.0016 0.0019 0.0087 0.002579358604 0.00257815554300258 0.0048 0.000708206814 0.0045 0.0255703958010256 0 0.00799412915500799 0.00340568672800341 0.00507375386098478 4.70917850001884e-05 0.0101809648679593 0.001682664015 0.0064922
88 T[T>A]G 0.001090065693 6.6605043000333e-05 0.00656586304103283 0.0082 0.007144208769 0 0.001 0.00836254658997491 0.014 0 0 0.0037 0.000245194218 0 6e-04 0.0063 2.1133639e-05 0.00201673836100202 0.0052 9.7003127e-05 0 0.0698452180850698 0.000231525617999537 0.0112021435910112 0.0101915204010102 2.01383909999396e-05 0 0.003250427226987 0.002438756 0.0036396
89 T[T>A]T 0.003981022761 0.000276315891001382 0.0147121354030736 0.0045 0.010240850413 7e-04 0.005 0.027653296253917 0.0139 0.0028 8e-04 0.0094 0.000160345975 0.0012 3e-04 0.008 0.003883130589 0.00281867944700282 0.0085 0.00231348906 8e-04 0.0235790617970236 0 0.000270578768000271 0.0145275393130145 0.00123553846999629 0.00192977081300772 0.016492812255934 0 0
90 T[T>C]A 0.008073616351 0.00010193235200051 0.00911549507704558 0.0028 0.017059640976 0.0059 0.0023 0.0049010723789853 0.0156 0.003 2e-04 0.05 0.000784056118 0.0018 0.0068 0.0246 0.001708586711 0.000302303565000302 0.0052 0.005734229562 0.0389 0.0048036697400048 0 0.00168229104800168 0.0145150500900145 0.0287896805419136 0.00172101527700688 0.00992955206796028 0.011498665964 0
91 T[T>C]C 0.004857381178 0.000470343659002352 0.0109537909320548 0.0016 0.014195709147 0.0035 0.0018 0.00608101129898176 0.0137 0.0097 9e-04 0.0342 0.000132974888 0.0056 0.0099 0.0183 0.011074152072 0.00626079111500626 0.002 0.011234254668 0.0313 0.000912157512000912 0.000230608943999539 0.00234452765600234 0.00740608345700741 0.0366394924418901 0.00348921255301396 0.029010563205884 0.003584215038 0.0091481
92 T[T>C]G 0.008325454207 0.000192354203000962 0.00611303321903056 0.0036 0.012596501722 0.0106 0.0019 0.00171248469899486 0.0098 0.0065 7e-04 0.032 3.7402404e-05 0.0034 0.0039 0.0165 0.005932002763 0.00154126532900154 0.0057 0.023767611345 0.0249 0.00178173568000178 0.000239513774999521 0.000481274164000481 0.00489253121700489 0.0191436942799426 0.00115284658100461 0.0156832185569373 0.00169429667 0.0060004
93 T[T>C]T 0.006257105605 0.000585330275002927 0.0107743362590539 0.0022 0.017375139145 0.0029 0.0024 0.01000344182997 0.0309 0.0099 5e-04 0.0371 0.000179702846 0.0026 0.0047 0.0174 0.007208218396 0.00135779708900136 0.0038 0.005395186301 0.0274 0 0 0.000358148002000358 0.017014780759017 0.0230716888309308 0.00152795700300611 0.0172915636179308 0.003799705772 0
94 T[T>G]A 0.001397553749 7.17369500003587e-05 0.00542718424102714 0 0.00520287442 9e-04 0 0.00174322136199477 0.0502 0.005 0 0.0019 0.000546581847 0 0 0.0068 0.000133410642 3.63184040000363e-05 0.0032 2.69147e-07 0 0.00165169876100165 0 0 0.00208147992700208 8.53493499997439e-06 0.00118902245400476 0.00938965870596244 0 0.0086563
95 T[T>G]C 0.001291736985 1.42814560000714e-05 0.0061602504230308 3e-04 0.005131607914 0.0019 0.001 0.00254983832899235 0.0081 0.0092 0 0.0027 0.000235347085 0.0015 4e-04 0.0069 0.009613345245 0.00323383799000323 0.0018 0.000377234437 0.0018 0 0 0 0.000578978775000579 0.00271850984499184 0.000280295354001121 0.0301170769838795 0 0.0043282
96 T[T>G]G 0.00203107688 0.000206615168001033 0.0110765262610554 0.003 0.0060552541 0.0011 0.001 0.00603039518498191 0.0088 0.0022 3e-04 0.0011 4.79022e-07 2e-04 9e-04 0.0049 0.004522462318 0.000754601773000755 0.0011 0.000515421599 3e-04 0.00257275195800257 0.000247501932999505 0.00136050485000136 0.00942919588500943 0.00136916117299589 0.00235305558900941 0.0126987508109492 0.000353695951 0.0082628
97 T[T>G]T 0.00403012816 2.3598204000118e-05 0.013000984209065 0.0011 0.013369935834 0.0072 0.0014 0.00722399889297833 0.0545 0.0633 3e-04 0.0032 0.000670588327 0.0025 0.0033 0.0163 0.05804040776 0.00212644153200213 0.0013 0.000615656691 3e-04 0 0 6.95157780000695e-05 0.00786967157700787 0.0025680767259923 0.000139561285000558 0.233659783275065 0.006104834136 0