Mercurial > repos > artbio > rsem
view test-data/de_isoform_abundances.tab @ 4:1823c8e07d96 draft
planemo upload for repository https://github.com/artbio/tools-artbio/tree/master/tools/rsem commit a3df058f7bb29ae3d42b85d6e911b68679150c9f
| author | artbio |
|---|---|
| date | Fri, 01 Jun 2018 03:00:34 -0400 |
| parents | |
| children |
line wrap: on
line source
transcript_id gene_id length effective_length expected_count TPM FPKM IsoPct ENST00000332831 ENSG00000185097 995 783.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000335137 ENSG00000186092 918 706.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000416718 ENSG00000198744 547 335.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000410691 ENSG00000222623 104 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000411249 ENSG00000223181 104 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000452176 ENSG00000223659 802 590.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000450305 ENSG00000223972 632 420.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000456328 ENSG00000223972 1657 1445.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000515242 ENSG00000223972 1653 1441.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000518655 ENSG00000223972 1483 1271.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000445840 ENSG00000224813 180 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000506640 ENSG00000224956 1236 1024.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000457540 ENSG00000225630 1044 832.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000416931 ENSG00000225972 372 160.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000423562 ENSG00000227232 1669 1457.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000438504 ENSG00000227232 1783 1571.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000488147 ENSG00000227232 1351 1139.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000538476 ENSG00000227232 1583 1371.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000541675 ENSG00000227232 1416 1204.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000428504 ENSG00000228327 1317 1105.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000335577 ENSG00000228463 510 298.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000424587 ENSG00000228463 2257 2045.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000442116 ENSG00000228463 1292 1080.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000448958 ENSG00000228463 1925 1713.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000427426 ENSG00000229344 682 470.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000440782 ENSG00000229376 2455 2243.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000422528 ENSG00000229905 456 244.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000414688 ENSG00000230021 750 538.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000419394 ENSG00000230021 480 268.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000440200 ENSG00000230021 413 201.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000441245 ENSG00000230021 629 417.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000447954 ENSG00000230021 336 124.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000448605 ENSG00000230021 370 158.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000447500 ENSG00000230092 523 311.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000590817 ENSG00000230092 523 311.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000417636 ENSG00000231709 842 630.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000432723 ENSG00000233653 2477 2265.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000442987 ENSG00000233750 3812 3600.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000423796 ENSG00000235146 607 395.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000450696 ENSG00000235146 402 190.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000426406 ENSG00000235249 995 783.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000416385 ENSG00000235373 4860 4648.00 1.00 500000.00 107573.15 100.00 ENST00000412666 ENSG00000236601 426 214.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000450983 ENSG00000236601 607 395.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000458203 ENSG00000236679 385 173.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000441866 ENSG00000236743 676 464.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000419160 ENSG00000237094 607 395.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000423728 ENSG00000237094 573 361.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000425496 ENSG00000237094 2661 2449.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000431321 ENSG00000237094 406 194.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000431812 ENSG00000237094 336 124.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000432964 ENSG00000237094 575 363.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000440038 ENSG00000237094 746 534.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000440163 ENSG00000237094 462 250.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000453935 ENSG00000237094 498 286.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000455207 ENSG00000237094 413 201.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000455464 ENSG00000237094 735 523.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000599771 ENSG00000237094 457 245.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000601486 ENSG00000237094 696 484.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000601814 ENSG00000237094 635 423.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000358533 ENSG00000237491 1194 982.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000412115 ENSG00000237491 581 369.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000429505 ENSG00000237491 441 229.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000434264 ENSG00000237491 513 301.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000443772 ENSG00000237491 417 205.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000457084 ENSG00000237491 566 354.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000585745 ENSG00000237491 168 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000585768 ENSG00000237491 394 182.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000585826 ENSG00000237491 390 178.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000586288 ENSG00000237491 1040 828.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000586928 ENSG00000237491 598 386.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000587126 ENSG00000237491 495 283.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000587530 ENSG00000237491 881 669.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000588951 ENSG00000237491 607 395.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000589531 ENSG00000237491 714 502.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000589899 ENSG00000237491 809 597.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000590848 ENSG00000237491 726 514.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000591440 ENSG00000237491 780 568.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000591702 ENSG00000237491 1873 1661.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000592547 ENSG00000237491 608 396.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000593022 ENSG00000237491 693 481.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000417324 ENSG00000237613 1187 975.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000461467 ENSG00000237613 590 378.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000423372 ENSG00000237683 2661 2449.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000414273 ENSG00000237973 1543 1331.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000453576 ENSG00000238009 336 124.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000466430 ENSG00000238009 2748 2536.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000471248 ENSG00000238009 629 417.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000477740 ENSG00000238009 491 279.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000357876 ENSG00000239664 498 286.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000440196 ENSG00000239664 439 227.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000493797 ENSG00000239906 323 111.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000495576 ENSG00000239945 1319 1107.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000492842 ENSG00000240361 940 728.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000467115 ENSG00000240409 207 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000435300 ENSG00000240453 402 190.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000417659 ENSG00000240618 295 83.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000496488 ENSG00000241599 457 245.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000424429 ENSG00000241670 363 151.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000450734 ENSG00000241670 457 245.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000466557 ENSG00000241860 1301 1089.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000484859 ENSG00000241860 4860 4648.00 1.00 500000.00 107573.15 100.00 ENST00000490997 ENSG00000241860 518 306.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000491962 ENSG00000241860 278 66.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000469289 ENSG00000243485 535 323.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000473358 ENSG00000243485 712 500.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000607096 ENSG00000243485 138 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000514057 ENSG00000248527 681 469.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000514436 ENSG00000250575 1239 1027.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000540477 ENSG00000256186 90 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000594647 ENSG00000268020 126 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000606857 ENSG00000268020 840 628.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000438434 ENSG00000268663 424 212.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000494149 ENSG00000268903 755 543.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000437905 ENSG00000269732 363 151.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000599533 ENSG00000269831 129 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ENST00000595919 ENSG00000269981 284 72.00 0.00 0.00 0.00 0.00