Mercurial > repos > artbio > snvtocnv
comparison test-data/hg38_chr22.vcf @ 0:b77d7a0a45e8 draft
"planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/snvtocnv commit 10ad3a0ca7cd23ad1e0940844147e1d1b3d069f0"
| author | artbio |
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| date | Sun, 07 Mar 2021 23:19:59 +0000 |
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| 30 ##INFO=<ID=INDEL,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates that the variant is an INDEL"> | |
| 31 ##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total depth of quality bases"> | |
| 32 ##INFO=<ID=SOMATIC,Number=0,Type=Flag,Description="Indicates if record is a somatic mutation"> | |
| 33 ##INFO=<ID=SS,Number=1,Type=String,Description="Somatic status of variant (0=Reference,1=Germline,2=Somatic,3=LOH, or 5=Unknown)"> | |
| 34 ##INFO=<ID=SSC,Number=1,Type=String,Description="Somatic score in Phred scale (0-255) derived from somatic p-value"> | |
| 35 ##INFO=<ID=GPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor+normal versus no variant for Germline calls"> | |
| 36 ##INFO=<ID=SPV,Number=1,Type=Float,Description="Fisher's Exact Test P-value of tumor versus normal for Somatic/LOH calls"> | |
| 37 ##FILTER=<ID=str10,Description="Less than 10% or more than 90% of variant supporting reads on one strand"> | |
| 38 ##FILTER=<ID=indelError,Description="Likely artifact due to indel reads at this position"> | |
| 39 ##FILTER=<ID=VarCount,Description="Fewer than 4 variant-supporting reads"> | |
| 40 ##FILTER=<ID=VarFreq,Description="Variant allele frequency below 0.05"> | |
| 41 ##FILTER=<ID=VarAvgRL,Description="Average clipped length of variant-supporting reads < 90"> | |
| 42 ##FILTER=<ID=VarReadPos,Description="Relative average read position < 0.1"> | |
| 43 ##FILTER=<ID=VarDist3,Description="Average distance to effective 3' end < 0.1"> | |
| 44 ##FILTER=<ID=VarMMQS,Description="Average mismatch quality sum for variant reads > 100"> | |
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| 47 ##FILTER=<ID=Strand,Description="Strand representation of variant reads < 0.01"> | |
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| 54 ##FILTER=<ID=MMQSdiff,Description="Mismatch quality sum difference (var - ref) > 50"> | |
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| 65 ##bcftools_viewVersion=1.10.2+htslib-1.10.2 | |
| 66 ##bcftools_viewCommand=view --regions chr22 --output-type v --threads 1 input.vcf.gz; Date=Thu Feb 18 10:15:47 2021 | |
| 67 #CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT NORMAL TUMOR | |
| 68 chr22 10510983 . A G . PASS DP=35;SS=1;SSC=0;GPV=8.9137e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,3:0,13 1/1:.:19:0,19:0,6:0,13 | |
| 69 chr22 10511046 . G T . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=1.3852e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,5:0,12 1/1:.:16:0,16:0,6:0,10 | |
| 70 chr22 10511116 . G A . PASS DP=33;SS=1;SSC=1;GPV=1.0623e-09;SPV=0.73003 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:5,11:3,5:2,6 0/1:.:17:6,11:3,6:3,5 | |
| 71 chr22 10511193 . T C . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,11:0,6 1/1:.:24:0,24:0,17:0,7 | |
| 72 chr22 10511266 . T C . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,15:0,4 1/1:.:23:0,23:0,17:0,6 | |
| 73 chr22 10511267 . T G . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,14:0,4 1/1:.:26:0,26:0,20:0,6 | |
| 74 chr22 10511419 . C T . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=1.4508e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,15:0,2 1/1:.:21:0,21:0,10:0,11 | |
| 75 chr22 10511422 . G C . PASS DP=35;SS=1;SSC=0;GPV=8.9137e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,15:0,1 1/1:.:19:0,19:0,9:0,10 | |
| 76 chr22 10514084 . C A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,11:0,20 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 | |
| 77 chr22 10515914 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=1.2059e-23;SPV=0.53478 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:9,21:6,6:3,15 0/1:.:46:13,33:8,8:5,25 | |
| 78 chr22 10516018 . G A . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,7:0,13 1/1:.:20:0,20:0,6:0,14 | |
| 79 chr22 10516452 . G T . PASS DP=27;SS=1;SSC=0;GPV=5.1363e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,4:0,6 1/1:.:17:0,17:0,8:0,9 | |
| 80 chr22 10516676 . A G . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,9:0,4 1/1:.:27:0,27:0,17:0,10 | |
| 81 chr22 10516689 . C G . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,10:0,6 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 | |
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| 88 chr22 10524954 . C G . PASS DP=114;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:67:0,67:0,39:0,28 1/1:.:47:0,47:0,20:0,27 | |
| 89 chr22 10524958 . G A . PASS DP=112;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:64:0,64:0,40:0,24 1/1:.:48:0,48:0,23:0,25 | |
| 90 chr22 10525131 . A G . PASS DP=115;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:68:0,68:0,40:0,28 1/1:.:47:0,47:0,29:0,18 | |
| 91 chr22 10525425 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=3;GPV=4.1425e-35;SPV=0.40323 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,13:0,24 1/1:.:25:1,24:1,7:0,17 | |
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| 93 chr22 10526882 . A G . PASS DP=38;SS=1;SSC=2;GPV=3.2089e-19;SPV=0.6 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:1,20:0,11:1,9 1/1:.:15:0,14:0,8:0,6 | |
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| 103 chr22 10532120 . G T . PASS DP=22;SS=1;SSC=0;GPV=4.7526e-13;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,2:0,11 1/1:.:9:0,9:0,0:0,9 | |
| 104 chr22 10532553 . C A . PASS DP=24;SS=1;SSC=0;GPV=3.101e-14;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,9:0,1 1/1:.:14:0,14:0,14:0,0 | |
| 105 chr22 10532586 . T G . PASS DP=22;SS=1;SSC=0;GPV=4.7526e-13;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:0,12:0,11:0,1 1/1:.:10:0,10:0,10:0,0 | |
| 106 chr22 10532730 . T G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,9:0,15 1/1:.:46:0,46:0,26:0,20 | |
| 107 chr22 10536255 . C G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=4.2836e-15;SPV=0.82414 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:15,14:1,7 0/1:.:35:18,17:16,14:2,3 | |
| 108 chr22 10536296 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=5.60491e-41;SPV=0.89378 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:1,39:0,27:1,12 1/1:.:37:2,35:2,27:0,8 | |
| 109 chr22 10536477 . C G . PASS DP=111;SS=1;SSC=9;GPV=1.3943e-17;SPV=0.11633 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:33,18:18,8:15,10 0/1:.:60:31,29:11,10:20,19 | |
| 110 chr22 10547802 . C G . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=9.1365e-19;SPV=0.83248 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:1,11:0,3:1,8 1/1:.:30:4,26:2,9:2,17 | |
| 111 chr22 10548198 . G C . PASS DP=27;SS=1;SSC=0;GPV=1.6161e-11;SPV=0.82564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:1,8:0,7:1,1 1/1:.:18:3,15:0,11:3,4 | |
| 112 chr22 10548370 . A C . PASS DP=26;SS=1;SSC=5;GPV=5.4444e-14;SPV=0.30769 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:1,7:0,5:1,2 1/1:.:18:0,18:0,16:0,2 | |
| 113 chr22 10548478 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,6:0,11 1/1:.:51:0,51:0,27:0,24 | |
| 114 chr22 10548621 . C T . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,4:0,5 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
| 115 chr22 10548651 . G C . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,4:0,7 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
| 116 chr22 10551283 . T A . PASS DP=44;SS=1;SSC=2;GPV=6.1775e-22;SPV=0.62549 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:1,11:0,5:1,6 1/1:.:32:2,30:0,19:2,11 | |
| 117 chr22 10551501 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=5;GPV=2.08793e-43;SPV=0.27632 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:1,20:0,14:1,6 1/1:.:55:0,55:0,22:0,33 | |
| 118 chr22 10551562 . G A . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.83078 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:1,28:0,17:1,11 1/1:.:70:4,66:3,24:1,42 | |
| 119 chr22 10553453 . A C . PASS DP=34;SOMATIC;SS=2;SSC=9;GPV=1;SPV=0.10447 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:14:14,0:14,0:0,0 0/1:.:20:16,4:16,4:0,0 | |
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| 145 chr22 10567527 . C G . PASS DP=62;SS=1;SSC=7;GPV=4.0826e-18;SPV=0.16331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:11,16:5,8:6,8 0/1:.:35:9,26:6,3:3,23 | |
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| 148 chr22 10567859 . C T . PASS DP=29;SS=1;SSC=0;GPV=3.3259e-17;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:0,12:0,5:0,7 1/1:.:17:0,17:0,4:0,13 | |
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| 151 chr22 10568523 . T G . PASS DP=73;SOMATIC;SS=2;SSC=21;GPV=1;SPV=0.0063188 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:36:36,0:15,0:21,0 0/1:.:37:30,7:14,6:16,1 | |
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| 156 chr22 10570728 . C G . PASS DP=23;SS=1;SSC=0;GPV=1.2146e-13;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:0,12:0,2:0,10 1/1:.:11:0,11:0,1:0,10 | |
| 157 chr22 10570812 . G C . PASS DP=19;SS=1;SSC=0;GPV=2.8292e-11;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,2:0,7 1/1:.:10:0,10:0,4:0,6 | |
| 158 chr22 10571013 . T C . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=7.9107e-15;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:0,12:0,10:0,2 1/1:.:13:0,13:0,12:0,1 | |
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| 161 chr22 10571478 . G C . PASS DP=29;SS=1;SSC=0;GPV=3.3259e-17;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,4:0,12 1/1:.:13:0,13:0,8:0,5 | |
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| 164 chr22 10572944 . G C . PASS DP=117;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,57:0,33:0,24 1/1:.:59:0,59:0,32:0,27 | |
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| 166 chr22 10573189 . A T . PASS DP=47;SS=1;SSC=1;GPV=1.1545e-10;SPV=0.63131 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:12,15:1,7:11,8 0/1:.:20:9,11:3,2:6,9 | |
| 167 chr22 10573343 . C G . PASS DP=116;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.60651 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:5,52:4,33:1,19 1/1:.:59:5,54:4,33:1,21 | |
| 168 chr22 10573383 . A G . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,37:0,16 1/1:.:47:0,47:0,30:0,17 | |
| 169 chr22 10574722 . C A . PASS DP=19;SS=1;SSC=0;GPV=2.8292e-11;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,7:0,3 1/1:.:9:0,9:0,6:0,3 | |
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| 176 chr22 10581186 . C A . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,6:0,10 1/1:.:30:0,30:0,6:0,24 | |
| 177 chr22 10581191 . C A . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,5:0,11 1/1:.:30:0,30:0,7:0,23 | |
| 178 chr22 10581289 . A T . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,4:0,7 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 | |
| 179 chr22 10581446 . T A . PASS DP=34;SS=1;SSC=0;GPV=3.5146e-20;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,3:0,7 1/1:.:24:0,24:0,7:0,17 | |
| 180 chr22 10582967 . T A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,4:0,9 1/1:.:47:0,47:0,30:0,17 | |
| 181 chr22 10585286 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,9:0,8 1/1:.:58:0,58:0,25:0,33 | |
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| 185 chr22 10597973 . G C . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:0,8:0,5:0,3 1/1:.:33:0,33:0,10:0,23 | |
| 186 chr22 10598648 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:0,8:0,1:0,7 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 | |
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| 188 chr22 10607681 . A G . PASS DP=22;SS=1;SSC=0;GPV=4.7526e-13;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:0,8:0,3:0,5 1/1:.:14:0,14:0,3:0,11 | |
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| 219 chr22 10620148 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,2:0,16 1/1:.:32:0,32:0,6:0,26 | |
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| 227 chr22 10626163 . C T . PASS DP=39;SS=1;SSC=5;GPV=3.0128e-20;SPV=0.2834 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,6:0,12 1/1:.:21:2,19:2,4:0,15 | |
| 228 chr22 10626164 . A G . PASS DP=37;SS=1;SSC=5;GPV=4.2437e-19;SPV=0.28529 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,6:0,11 1/1:.:20:2,18:2,4:0,14 | |
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| 232 chr22 10628135 . C T . PASS DP=129;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:75:0,75:0,48:0,27 1/1:.:54:0,54:0,34:0,20 | |
| 233 chr22 10628237 . A C . PASS DP=123;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:67:0,67:0,39:0,28 1/1:.:56:0,56:0,35:0,21 | |
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| 237 chr22 10628532 . C T . PASS DP=122;SS=1;SSC=0;GPV=5.6554e-19;SPV=0.90137 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:67:36,31:13,10:23,21 0/1:.:55:35,20:16,6:19,14 | |
| 238 chr22 10628714 . C G . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,9:0,10 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 | |
| 239 chr22 10628738 . C T . PASS DP=27;SS=1;SSC=0;GPV=5.1363e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,6:0,8 1/1:.:13:0,13:0,4:0,9 | |
| 240 chr22 10629007 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=9;GPV=3.2981e-15;SPV=0.10877 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:11,12:14,6 0/1:.:36:15,21:5,8:10,13 | |
| 241 chr22 10629058 . A C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,22:0,30 1/1:.:33:0,33:0,12:0,21 | |
| 242 chr22 10629111 . G C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=1.9451e-10;SPV=0.84761 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:9,7:11,11 0/1:.:24:15,9:6,2:9,7 | |
| 243 chr22 10629324 . A G . PASS DP=34;SS=1;SSC=0;GPV=3.5146e-20;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,1:0,20 1/1:.:13:0,13:0,0:0,13 | |
| 244 chr22 10630979 . G A . PASS DP=125;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:74:0,74:0,43:0,31 1/1:.:51:0,51:0,30:0,21 | |
| 245 chr22 10631103 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,22:0,23 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 246 chr22 10631171 . T G . PASS DP=17;SS=1;SSC=0;GPV=4.2852e-10;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,4:0,5 1/1:.:8:0,8:0,2:0,6 | |
| 247 chr22 10631272 . G T . PASS DP=50;SS=1;SSC=2;GPV=1.2624e-13;SPV=0.61559 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:9,16:2,2:7,14 0/1:.:25:9,16:3,4:6,12 | |
| 248 chr22 10631298 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,6:0,29 1/1:.:31:0,31:0,10:0,21 | |
| 249 chr22 10631348 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,15:0,27 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 | |
| 250 chr22 10631820 . G T . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
| 251 chr22 10631959 . C T . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=5.7269e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,8:0,11 1/1:.:18:0,18:0,12:0,6 | |
| 252 chr22 10631971 . A C . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=1.4508e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,8:0,13 1/1:.:17:0,17:0,10:0,7 | |
| 253 chr22 10632379 . G C . PASS DP=27;SS=1;SSC=0;GPV=5.1363e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,6:0,8 1/1:.:13:0,13:0,4:0,9 | |
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| 255 chr22 10633176 . C G . PASS DP=161;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:97:0,97:0,51:0,46 1/1:.:64:0,64:0,37:0,27 | |
| 256 chr22 10633262 . T C . PASS DP=138;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:87:0,87:0,49:0,38 1/1:.:51:0,51:0,24:0,27 | |
| 257 chr22 10633353 . T C . PASS DP=159;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:92:0,92:0,47:0,45 1/1:.:67:0,67:0,33:0,34 | |
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| 259 chr22 10633591 . T C . PASS DP=157;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.84558 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:95:1,94:1,50:0,44 1/1:.:62:1,61:1,27:0,34 | |
| 260 chr22 10633729 . C T . PASS DP=161;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:96:0,96:0,37:0,59 1/1:.:65:0,65:0,33:0,32 | |
| 261 chr22 10633995 . G A . PASS DP=110;SS=1;SSC=0;GPV=2.8281e-12;SPV=0.91331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:69:45,24:16,6:29,18 0/1:.:41:31,10:11,2:20,8 | |
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| 308 chr22 10650102 . T C . PASS DP=111;SS=1;SSC=4;GPV=7.0787e-12;SPV=0.34559 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:38,14:19,9:19,5 0/1:.:59:40,19:21,14:19,5 | |
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| 316 chr22 10650912 . C T . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=3.6742e-23;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,23:0,11:0,12 1/1:.:16:0,16:0,11:0,5 | |
| 317 chr22 10653047 . C G . PASS DP=62;SS=1;SSC=2;GPV=4.1425e-35;SPV=0.6129 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,16:0,8 1/1:.:38:1,37:1,22:0,15 | |
| 318 chr22 10653105 . A G . PASS DP=40;SS=1;SSC=2;GPV=3.8137e-22;SPV=0.625 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,8:0,7 1/1:.:25:1,24:1,11:0,13 | |
| 319 chr22 10653906 . A T . PASS DP=19;SS=1;SSC=0;GPV=2.8292e-11;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,7:0,4 1/1:.:8:0,8:0,5:0,3 | |
| 320 chr22 10654369 . T C . PASS DP=23;SS=1;SSC=1;GPV=2.9149e-12;SPV=0.65217 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:1,14:0,11:1,3 1/1:.:8:0,8:0,8:0,0 | |
| 321 chr22 10654620 . C T . PASS DP=48;SS=1;SSC=3;GPV=7.6145e-27;SPV=0.47917 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 1/1:.:23:1,22:1,11:0,11 | |
| 322 chr22 10657340 . A T . PASS DP=45;SS=1;SSC=2;GPV=8.2416e-17;SPV=0.56818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,8:0,4:0,4 1/1:.:34:2,23:2,10:0,13 | |
| 323 chr22 10657351 . A T . PASS DP=54;SS=1;SSC=2;GPV=1.7118e-06;SPV=0.61748 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:9,4:4,3:5,1 0/1:.:41:28,13:13,9:15,4 | |
| 324 chr22 10657486 . A T . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=1.9533e-12;SPV=0.56192 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:7,12:7,4:0,8 0/1:.:38:9,17:8,11:1,6 | |
| 325 chr22 10657566 . G T . PASS DP=88;SS=1;SSC=10;GPV=1.3482e-27;SPV=0.092266 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:12,19:9,10:3,9 1/1:.:57:13,44:8,21:5,23 | |
| 326 chr22 10657701 . T C . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=6.4554e-13;SPV=0.87419 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:22,16:15,10:7,6 0/1:.:58:39,19:15,9:24,10 | |
| 327 chr22 10657723 . G C . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=9.8403e-10;SPV=0.7216 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:18,11:10,7:8,4 0/1:.:44:29,15:14,8:15,7 | |
| 328 chr22 10657781 . A C . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=2.2598e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,7:0,8 1/1:.:21:0,21:0,10:0,11 | |
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| 372 chr22 10687187 . A G . PASS DP=156;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:96:0,96:0,49:0,47 1/1:.:60:0,60:0,38:0,22 | |
| 373 chr22 10687312 . T A . PASS DP=221;SS=1;SSC=5;GPV=4.5899e-16;SPV=0.25213 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:120:97,23:43,8:54,15 0/1:.:101:77,24:28,9:49,15 | |
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| 376 chr22 10687852 . A G . PASS DP=113;SS=1;SSC=6;GPV=1.0608e-34;SPV=0.24258 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:20,41:5,21:15,20 1/1:.:52:13,39:7,17:6,22 | |
| 377 chr22 10688064 . C T . PASS DP=163;SS=1;SSC=1;GPV=1.1006e-08;SPV=0.7035 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:80:67,13:39,6:28,7 0/1:.:83:71,12:31,8:40,4 | |
| 378 chr22 10688075 . C T . PASS DP=169;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:81:0,81:0,43:0,38 1/1:.:88:0,88:0,42:0,46 | |
| 379 chr22 10688416 . C A . PASS DP=191;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.97749 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:105:35,70:24,32:11,38 0/1:.:86:40,46:26,23:14,23 | |
| 380 chr22 10688723 . G A . PASS DP=250;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.78702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:118:54,64:29,29:25,35 0/1:.:132:66,66:28,26:38,40 | |
| 381 chr22 10688761 . A G . PASS DP=234;SS=1;SSC=8;GPV=3.2691e-31;SPV=0.13103 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:112:75,37:26,15:49,22 0/1:.:122:72,50:27,20:45,30 | |
| 382 chr22 10689073 . C T . PASS DP=114;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,25:0,34 1/1:.:55:0,55:0,22:0,33 | |
| 383 chr22 10689106 . A G . PASS DP=124;SS=1;SSC=1;GPV=3.8748e-08;SPV=0.63878 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:74:60,14:22,11:38,3 0/1:.:50:41,9:15,8:26,1 | |
| 384 chr22 10689107 . C T . PASS DP=121;SS=1;SSC=8;GPV=1.6813e-08;SPV=0.13571 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:59,11:22,8:37,3 0/1:.:51:38,13:13,8:25,5 | |
| 385 chr22 10689118 . T C . PASS DP=137;SS=1;SSC=0;GPV=2.92871e-43;SPV=0.94414 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:78:18,60:15,23:3,37 0/1:.:59:20,39:12,14:8,25 | |
| 386 chr22 10689122 . G C . PASS DP=141;SS=1;SSC=8;GPV=4.7791e-13;SPV=0.12668 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:78:61,17:23,14:38,3 0/1:.:63:43,20:17,13:26,7 | |
| 387 chr22 10689378 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,8:0,17 1/1:.:41:0,41:0,11:0,30 | |
| 388 chr22 10689419 . C A . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=2.4713e-14;SPV=0.79241 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:2,8:18,9 0/1:.:53:32,21:9,12:23,9 | |
| 389 chr22 10689572 . A C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 1/1:.:49:0,49:0,25:0,24 | |
| 390 chr22 10689638 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=6.7162e-06;SPV=0.49994 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:35,8:17,5:18,3 0/1:.:38:30,8:17,3:13,5 | |
| 391 chr22 10689903 . A G . PASS DP=145;SS=1;SSC=5;GPV=7.7278e-11;SPV=0.30658 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:69:56,13:23,4:33,9 0/1:.:76:58,18:25,8:33,10 | |
| 392 chr22 10690076 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=8;GPV=1.414e-06;SPV=0.13447 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:35,6:18,2:17,4 0/1:.:45:33,12:18,5:15,7 | |
| 393 chr22 10690203 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=1.1819e-13;SPV=0.85632 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:2,1:15,15 0/1:.:51:31,20:15,2:16,18 | |
| 394 chr22 10691230 . C A . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=1.5066e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,17:0,6 1/1:.:20:0,20:0,13:0,7 | |
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| 396 chr22 10691495 . T A . PASS DP=117;SS=1;SSC=0;GPV=9.9441e-14;SPV=0.90642 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:37,22:13,14:24,8 0/1:.:58:42,16:13,9:29,7 | |
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| 451 chr22 10700041 . C T . PASS DP=311;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:176:0,176:0,73:0,103 1/1:.:135:0,135:0,49:0,86 | |
| 452 chr22 10700081 . G A . PASS DP=362;SS=1;SSC=3;GPV=2.6557e-27;SPV=0.47362 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:200:156,44:65,22:91,22 0/1:.:162:125,37:55,19:70,18 | |
| 453 chr22 10700104 . C T . PASS DP=409;SS=1;SSC=1;GPV=1.9679e-28;SPV=0.71493 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:227:178,49:78,24:100,25 0/1:.:182:146,36:63,18:83,18 | |
| 454 chr22 10700547 . A T . PASS DP=433;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:228:0,228:0,111:0,117 1/1:.:205:0,205:0,114:0,91 | |
| 455 chr22 10700725 . A T . PASS DP=356;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:195:0,120:0,63:0,57 1/1:.:161:0,84:0,47:0,37 | |
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| 457 chr22 10700893 . A T . PASS DP=429;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:247:0,247:0,122:0,125 1/1:.:182:0,182:0,87:0,95 | |
| 458 chr22 10700926 . G T . PASS DP=439;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:243:0,243:0,121:0,122 1/1:.:196:0,196:0,100:0,96 | |
| 459 chr22 10701114 . A G . PASS DP=431;SS=1;SSC=4;GPV=4.0065e-23;SPV=0.34943 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:246:208,38:96,16:112,22 0/1:.:185:153,32:78,13:75,19 | |
| 460 chr22 10701141 . G A . PASS DP=336;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:197:0,197:0,89:0,108 1/1:.:139:0,139:0,69:0,70 | |
| 461 chr22 10701157 . C G . PASS DP=422;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:247:0,247:0,97:0,150 1/1:.:175:0,175:0,77:0,98 | |
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| 463 chr22 10701405 . C T . PASS DP=348;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:181:0,181:0,96:0,85 1/1:.:167:0,167:0,80:0,87 | |
| 464 chr22 10701418 . G C . PASS DP=366;SS=1;SSC=4;GPV=0;SPV=0.3693 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:202:71,131:38,72:33,59 0/1:.:164:54,110:25,51:29,59 | |
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| 511 chr22 10706824 . A C . PASS DP=221;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,27:0,22 1/1:.:172:0,172:0,96:0,76 | |
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| 513 chr22 10707078 . C G . PASS DP=211;SS=1;SSC=1;GPV=2.0437e-19;SPV=0.70031 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:38,15:19,10:19,5 0/1:.:158:117,41:57,18:60,23 | |
| 514 chr22 10707079 . T A . PASS DP=204;SS=1;SSC=0;GPV=2.1592e-14;SPV=0.82577 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:41,13:24,8:17,5 0/1:.:150:121,29:66,10:55,19 | |
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| 517 chr22 10707333 . C T . PASS DP=239;SS=1;SSC=0;GPV=2.898e-20;SPV=0.90198 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:39,17:23,8:16,9 0/1:.:183:141,42:64,19:77,23 | |
| 518 chr22 10707578 . T G . PASS DP=250;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:63:0,63:0,27:0,36 1/1:.:187:0,187:0,85:0,102 | |
| 519 chr22 10707616 . A G . PASS DP=232;SS=1;SSC=2;GPV=3.0327e-25;SPV=0.52867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:41,18:24,7:17,11 0/1:.:173:119,54:58,28:61,26 | |
| 520 chr22 10707705 . G A . PASS DP=209;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.57744 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:14,28:11,14:3,14 0/1:.:167:56,111:35,60:21,51 | |
| 521 chr22 10707820 . T G . PASS DP=232;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,30:0,30 1/1:.:172:0,172:0,86:0,86 | |
| 522 chr22 10707869 . T G . PASS DP=247;SS=1;SSC=0;GPV=3.5685e-13;SPV=0.9416 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:43,12:19,7:24,5 0/1:.:192:165,27:68,14:97,13 | |
| 523 chr22 10707891 . G C . PASS DP=252;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.035029 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:45,13:22,4:23,9 0/1:.:194:124,70:47,33:77,37 | |
| 524 chr22 10708094 . T C . PASS DP=247;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,42:0,19 1/1:.:186:0,186:0,86:0,100 | |
| 525 chr22 10708116 . G A . PASS DP=235;SS=1;SSC=31;GPV=1;SPV=0.00078438 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:52,9:32,6:20,3 0/1:.:174:110,64:53,24:57,40 | |
| 526 chr22 10708136 . C G . PASS DP=242;SS=1;SSC=26;GPV=1;SPV=0.0020497 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:10,48:6,23:4,25 0/1:.:184:70,114:29,56:41,58 | |
| 527 chr22 10708151 . A G . PASS DP=234;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,26:0,26 1/1:.:182:0,182:0,85:0,97 | |
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| 529 chr22 10708789 . A C . PASS DP=222;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.75676 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,24:0,30 1/1:.:168:1,167:1,90:0,77 | |
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| 587 chr22 10715925 . G C . PASS DP=160;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 1/1:.:132:0,132:0,56:0,76 | |
| 588 chr22 10716028 . G T . PASS DP=195;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 1/1:.:170:0,170:0,82:0,88 | |
| 589 chr22 10716078 . G A . PASS DP=218;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 1/1:.:181:0,181:0,101:0,80 | |
| 590 chr22 10716192 . T G . PASS DP=209;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.91879 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:9,27:3,14:6,13 0/1:.:173:61,112:38,53:23,59 | |
| 591 chr22 10716330 . T C . PASS DP=213;SS=1;SSC=0;GPV=9.3687e-32;SPV=0.85071 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:15,9:4,8 0/1:.:177:107,70:57,35:50,35 | |
| 592 chr22 10716348 . G A . PASS DP=205;SS=1;SSC=1;GPV=9.8744e-19;SPV=0.69498 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:28,11:17,10:11,1 0/1:.:166:123,43:62,25:61,18 | |
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| 594 chr22 10716520 . G A . PASS DP=221;SS=1;SSC=29;GPV=1;SPV=0.0010391 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:7,37:4,17:3,20 0/1:.:177:73,104:40,42:33,62 | |
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| 654 chr22 10732496 . G A . PASS DP=411;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.98694 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:192:93,99:47,64:46,35 0/1:.:219:129,90:73,57:56,33 | |
| 655 chr22 10732535 . G C . PASS DP=376;SS=1;SSC=2;GPV=8.619e-26;SPV=0.55002 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:171:136,35:76,16:60,19 0/1:.:205:163,42:88,28:75,14 | |
| 656 chr22 10732556 . G T . PASS DP=368;SS=1;SSC=0;GPV=1.509e-26;SPV=0.96852 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:164:122,42:58,24:64,18 0/1:.:204:167,37:98,20:69,17 | |
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| 662 chr22 10733956 . C T . PASS DP=354;SS=1;SSC=1;GPV=1.6935e-32;SPV=0.68078 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:166:120,46:52,23:68,23 0/1:.:188:139,49:63,22:76,27 | |
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| 717 chr22 10738141 . C T . PASS DP=398;SS=1;SSC=3;GPV=1.3708e-23;SPV=0.41811 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:209:173,36:104,18:69,18 0/1:.:189:154,35:85,18:69,17 | |
| 718 chr22 10738259 . G A . PASS DP=393;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.92929 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:210:106,104:43,55:63,49 0/1:.:183:105,78:48,37:57,41 | |
| 719 chr22 10738517 . A G . PASS DP=567;SS=1;SSC=1;GPV=3.8717e-21;SPV=0.65078 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:323:285,38:166,19:119,19 0/1:.:244:217,27:116,14:101,13 | |
| 720 chr22 10738526 . G A . PASS DP=560;SS=1;SSC=12;GPV=1.1289e-34;SPV=0.055309 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:319:267,52:150,34:117,18 0/1:.:241:188,53:109,29:79,24 | |
| 721 chr22 10738532 . C G . PASS DP=583;SS=1;SSC=0;GPV=1.666e-32;SPV=0.8656 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:327:267,60:154,35:113,25 0/1:.:256:217,39:117,24:100,15 | |
| 722 chr22 10738652 . C G . PASS DP=538;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.89269 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:292:208,84:104,47:104,37 0/1:.:246:186,60:97,27:89,33 | |
| 723 chr22 10738775 . G T . PASS DP=443;SS=1;SSC=2;GPV=9.1457e-24;SPV=0.564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:233:195,38:91,18:104,20 0/1:.:210:176,34:83,13:93,21 | |
| 724 chr22 10738779 . T C . PASS DP=405;SS=1;SSC=2;GPV=2.1725e-24;SPV=0.62017 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:216:162,40:70,19:92,21 0/1:.:189:140,33:62,15:78,18 | |
| 725 chr22 10738833 . T C . PASS DP=412;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:228:0,228:0,126:0,102 1/1:.:184:0,184:0,102:0,82 | |
| 726 chr22 10738904 . G C . PASS DP=531;SOMATIC;SS=2;SSC=35;GPV=1;SPV=0.00031295 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:302:294,8:169,4:125,4 0/1:.:229:206,23:100,15:106,8 | |
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| 728 chr22 10739554 . A G . PASS DP=423;SS=1;SSC=2;GPV=1.5098e-24;SPV=0.58024 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:237:193,42:100,21:93,21 0/1:.:186:150,32:81,14:69,18 | |
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| 781 chr22 10746019 . T G . PASS DP=133;SS=1;SSC=6;GPV=9.0125e-36;SPV=0.23307 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:75:29,46:7,18:22,28 0/1:.:58:18,40:5,22:13,18 | |
| 782 chr22 10746060 . A G . PASS DP=120;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:65:0,65:0,31:0,34 1/1:.:55:0,55:0,21:0,34 | |
| 783 chr22 10746154 . T C . PASS DP=137;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:67:0,67:0,32:0,35 1/1:.:70:0,70:0,27:0,43 | |
| 784 chr22 10746298 . A G . PASS DP=168;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:88:0,87:0,44:0,43 1/1:.:80:0,80:0,45:0,35 | |
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| 786 chr22 10746486 . T C . PASS DP=124;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,41:0,19 1/1:.:64:0,64:0,43:0,21 | |
| 787 chr22 10746509 . T C . PASS DP=121;SS=1;SSC=2;GPV=8.6883e-05;SPV=0.56702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:67:60,7:38,6:22,1 0/1:.:54:48,6:33,3:15,3 | |
| 788 chr22 10746620 . G A . PASS DP=243;SS=1;SSC=5;GPV=7.5741e-13;SPV=0.28878 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:122:105,17:56,12:49,5 0/1:.:121:100,21:51,10:49,11 | |
| 789 chr22 10746653 . T G . PASS DP=268;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.59245 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:129:41,88:23,47:18,41 0/1:.:139:45,94:25,47:20,47 | |
| 790 chr22 10746769 . T A . PASS DP=238;SS=1;SSC=3;GPV=0;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:119:37,82:12,40:25,42 0/1:.:119:36,83:16,45:20,38 | |
| 791 chr22 10746809 . T C . PASS DP=224;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:116:0,116:0,51:0,65 1/1:.:108:0,108:0,47:0,61 | |
| 792 chr22 10747005 . C G . PASS DP=294;SS=1;SSC=4;GPV=4.0957e-13;SPV=0.3203 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:162:130,20:70,16:60,4 0/1:.:132:99,19:55,13:44,6 | |
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| 794 chr22 10747038 . G A . PASS DP=326;SS=1;SSC=4;GPV=7.8048e-22;SPV=0.36927 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:179:145,34:87,15:58,19 0/1:.:147:116,31:69,14:47,17 | |
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| 845 chr22 10753358 . C T . PASS DP=263;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:118:0,118:0,76:0,42 1/1:.:145:0,145:0,91:0,54 | |
| 846 chr22 10753466 . A G . PASS DP=302;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:142:0,142:0,76:0,66 1/1:.:160:0,160:0,99:0,61 | |
| 847 chr22 10753601 . A G . PASS DP=285;SS=1;SSC=7;GPV=8.7975e-10;SPV=0.1797 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:136:125,11:71,7:54,4 0/1:.:149:131,18:70,8:61,10 | |
| 848 chr22 10753605 . A G . PASS DP=285;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.96089 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:135:1,134:1,80:0,54 1/1:.:150:4,146:2,81:2,65 | |
| 849 chr22 10753757 . T G . PASS DP=299;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:146:0,146:0,85:0,61 1/1:.:153:0,153:0,66:0,87 | |
| 850 chr22 10753804 . G A . PASS DP=302;SS=1;SSC=4;GPV=3.7414e-19;SPV=0.35141 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:142:117,25:61,13:56,12 0/1:.:160:128,32:57,17:71,15 | |
| 851 chr22 10753877 . T G . PASS DP=279;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:130:0,130:0,68:0,62 1/1:.:149:0,149:0,77:0,72 | |
| 852 chr22 10753965 . G T . PASS DP=340;SS=1;SSC=5;GPV=2.7045e-29;SPV=0.28761 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:169:129,40:72,26:57,14 0/1:.:171:125,46:66,27:59,19 | |
| 853 chr22 10754036 . C T . PASS DP=324;SS=1;SSC=9;GPV=6.5032e-40;SPV=0.1174 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:168:115,53:61,23:54,30 0/1:.:156:96,60:47,28:49,32 | |
| 854 chr22 10754037 . A G . PASS DP=315;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.037429 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:164:30,134:17,59:13,75 1/1:.:151:16,135:8,66:8,69 | |
| 855 chr22 10754183 . A G . PASS DP=358;SS=1;SSC=5;GPV=1.2151e-11;SPV=0.26258 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:187:171,16:88,8:83,8 0/1:.:171:152,19:76,10:76,9 | |
| 856 chr22 10754330 . C T . PASS DP=201;SS=1;SSC=4;GPV=0;SPV=0.38806 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:123:0,123:0,73:0,50 1/1:.:78:1,77:0,38:1,39 | |
| 857 chr22 10754547 . T C . PASS DP=321;SS=1;SSC=19;GPV=1;SPV=0.010703 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:188:116,72:43,30:73,42 0/1:.:133:64,69:27,23:37,46 | |
| 858 chr22 10754578 . A G . PASS DP=296;SS=1;SSC=1;GPV=9.257e-17;SPV=0.63702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:162:134,28:60,9:74,19 0/1:.:134:112,22:51,7:61,15 | |
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| 860 chr22 10754700 . T C . PASS DP=112;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,27:0,31 1/1:.:54:0,54:0,25:0,29 | |
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| 889 chr22 10759067 . A G . PASS DP=167;SS=1;SSC=0;GPV=1.1859e-14;SPV=0.84724 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:86:62,24:20,7:42,17 0/1:.:81:63,18:12,3:51,15 | |
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| 909 chr22 10761126 . C T . PASS DP=162;SS=1;SSC=6;GPV=1.9889e-35;SPV=0.20242 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:92:44,48:33,33:11,15 0/1:.:70:28,42:22,29:6,13 | |
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| 912 chr22 10761668 . T A . PASS DP=386;SS=1;SSC=17;GPV=1;SPV=0.016323 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:213:168,45:97,19:71,26 0/1:.:173:119,54:76,25:43,29 | |
| 913 chr22 10761761 . C T . PASS DP=225;SS=1;SSC=1;GPV=3.6824e-36;SPV=0.71438 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:118:65,53:26,22:39,31 0/1:.:107:62,45:31,20:31,25 | |
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| 915 chr22 10761895 . T G . PASS DP=111;SS=1;SSC=1;GPV=1.9557e-38;SPV=0.68711 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:13,45:5,3:8,42 1/1:.:53:13,40:2,5:11,35 | |
| 916 chr22 10762082 . C A . PASS DP=179;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.72743 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:88:18,70:3,43:15,27 1/1:.:91:21,70:4,39:17,31 | |
| 917 chr22 10762089 . T G . PASS DP=171;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:83:0,83:0,42:0,41 1/1:.:88:0,88:0,40:0,48 | |
| 918 chr22 10762231 . T C . PASS DP=218;SS=1;SSC=12;GPV=0;SPV=0.060765 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:115:40,75:20,30:20,45 1/1:.:103:25,78:9,31:16,47 | |
| 919 chr22 10762263 . T C . PASS DP=180;SS=1;SSC=5;GPV=2.5979e-09;SPV=0.26351 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:100:87,13:31,7:56,6 0/1:.:80:66,14:27,3:39,11 | |
| 920 chr22 10762318 . T A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,9:0,34 1/1:.:40:0,40:0,8:0,32 | |
| 921 chr22 10762645 . C T . PASS DP=30;SS=1;SSC=0;GPV=8.4556e-18;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,12:0,1 1/1:.:17:0,17:0,15:0,2 | |
| 922 chr22 10762721 . A G . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,16:0,5 1/1:.:11:0,11:0,8:0,3 | |
| 923 chr22 10762992 . A T . PASS DP=139;SS=1;SSC=3;GPV=9.0986e-05;SPV=0.48896 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:70:64,6:42,4:22,2 0/1:.:69:62,7:43,5:19,2 | |
| 924 chr22 10763281 . G T . PASS DP=330;SS=1;SSC=0;GPV=4.91e-19;SPV=0.96585 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:152:120,32:59,18:61,14 0/1:.:178:153,25:75,12:78,13 | |
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| 926 chr22 10763309 . A C . PASS DP=299;SS=1;SSC=6;GPV=4.3118e-17;SPV=0.23215 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:140:119,21:56,9:63,12 0/1:.:159:129,30:73,12:56,18 | |
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| 975 chr22 10768377 . G T . PASS DP=247;SS=1;SSC=1;GPV=7.7823e-10;SPV=0.75741 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:134:117,17:71,9:46,8 0/1:.:113:101,12:58,6:43,6 | |
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| 978 chr22 10768556 . G A . PASS DP=224;SS=1;SSC=1;GPV=9.2504e-26;SPV=0.6958 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:128:85,43:45,29:40,14 0/1:.:96:66,30:34,15:32,15 | |
| 979 chr22 10768695 . A T . PASS DP=295;SS=1;SSC=6;GPV=3.8377e-18;SPV=0.22217 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:164:137,27:55,13:82,14 0/1:.:131:104,27:52,12:52,15 | |
| 980 chr22 10768734 . T C . PASS DP=310;SS=1;SSC=1;GPV=3.5994e-36;SPV=0.68756 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:173:114,59:53,30:61,29 0/1:.:137:93,44:42,22:51,22 | |
| 981 chr22 10768772 . T A . PASS DP=311;SS=1;SSC=1;GPV=1.1088e-13;SPV=0.71474 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:173:149,24:76,9:73,15 0/1:.:138:121,17:61,2:60,15 | |
| 982 chr22 10768836 . A T . PASS DP=196;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:116:0,116:0,64:0,52 1/1:.:80:0,80:0,44:0,36 | |
| 983 chr22 10768975 . A C . PASS DP=215;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:118:0,118:0,57:0,61 1/1:.:97:0,97:0,48:0,49 | |
| 984 chr22 10769074 . A G . PASS DP=225;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:125:0,125:0,48:0,77 1/1:.:100:0,100:0,39:0,61 | |
| 985 chr22 10769095 . C T . PASS DP=234;SS=1;SSC=3;GPV=4.7238e-17;SPV=0.43591 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:131:104,27:39,9:65,18 0/1:.:103:80,23:34,6:46,17 | |
| 986 chr22 10769237 . T A . PASS DP=197;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:104:0,104:0,44:0,60 1/1:.:93:0,93:0,35:0,58 | |
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| 988 chr22 10769643 . G A . PASS DP=176;SS=1;SSC=3;GPV=1.1846e-07;SPV=0.476 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:93:82,11:27,7:55,4 0/1:.:83:72,11:35,7:37,4 | |
| 989 chr22 10769672 . G A . PASS DP=176;SS=1;SSC=2;GPV=4.2357e-34;SPV=0.61263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:98:48,50:21,22:27,28 0/1:.:78:39,39:18,19:21,20 | |
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| 1045 chr22 10773969 . G A . PASS DP=206;SS=1;SSC=2;GPV=1.3196e-11;SPV=0.54936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:98:82,16:36,10:46,6 0/1:.:108:90,18:40,12:50,6 | |
| 1046 chr22 10774035 . G A . PASS DP=211;SS=1;SSC=4;GPV=1.4005e-08;SPV=0.38286 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:103:92,11:47,1:45,10 0/1:.:108:94,14:47,6:47,8 | |
| 1047 chr22 10774082 . C A . PASS DP=202;SS=1;SSC=3;GPV=5.0921e-18;SPV=0.49789 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:103:77,26:25,16:52,10 0/1:.:99:73,26:33,9:40,17 | |
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| 1050 chr22 10774433 . T C . PASS DP=128;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:78:0,78:0,28:0,50 1/1:.:50:0,50:0,19:0,31 | |
| 1051 chr22 10774445 . A G . PASS DP=139;SS=1;SSC=4;GPV=1.0267e-35;SPV=0.38559 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:82:32,50:13,18:19,32 0/1:.:57:20,37:9,12:11,25 | |
| 1052 chr22 10774586 . G T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,3:0,43 1/1:.:26:0,26:0,4:0,22 | |
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| 1111 chr22 10861183 . T C . PASS DP=29;SS=1;SSC=2;GPV=2.6068e-06;SPV=0.55002 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:10,10:7,4:3,6 0/1:.:9:4,5:1,1:3,4 | |
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| 1114 chr22 10863830 . C T . PASS DP=26;SS=1;SSC=3;GPV=0.00012791;SPV=0.45236 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:7,4:0,0:7,4 0/1:.:15:8,7:0,0:8,7 | |
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| 1116 chr22 10925525 . G C . PASS DP=138;SS=1;SSC=6;GPV=2.4563e-12;SPV=0.24901 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:50,14:27,5:23,9 0/1:.:74:53,21:26,11:27,10 | |
| 1117 chr22 10925738 . C T . PASS DP=120;SS=1;SSC=2;GPV=8.2691e-08;SPV=0.61352 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:44,10:26,6:18,4 0/1:.:66:54,12:27,7:27,5 | |
| 1118 chr22 10925881 . A G . PASS DP=106;SS=1;SSC=26;GPV=1;SPV=0.0023094 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:37,14:15,8:22,6 0/1:.:55:24,31:13,16:11,15 | |
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| 1120 chr22 10926206 . G A . PASS DP=108;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,29:0,14 1/1:.:65:0,65:0,40:0,25 | |
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| 1167 chr22 10948470 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=8.8178e-26;SPV=0.79242 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:9,29:6,14:3,15 0/1:.:41:12,29:8,15:4,14 | |
| 1168 chr22 10950411 . A T . PASS DP=110;SS=1;SSC=4;GPV=1.5779e-36;SPV=0.33275 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:16,41:11,18:5,23 1/1:.:53:12,41:5,18:7,23 | |
| 1169 chr22 10950517 . G A . PASS DP=128;SS=1;SSC=2;GPV=3.6276e-09;SPV=0.55567 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:48,12:28,2:20,10 0/1:.:68:54,14:33,8:21,6 | |
| 1170 chr22 10950519 . G A . PASS DP=127;SS=1;SSC=2;GPV=5.7768e-11;SPV=0.59996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:46,15:24,7:22,8 0/1:.:66:50,16:30,7:20,9 | |
| 1171 chr22 10950620 . T C . PASS DP=124;SS=1;SSC=2;GPV=4.2378e-06;SPV=0.55754 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:52,8:27,4:25,4 0/1:.:64:55,9:35,4:20,5 | |
| 1172 chr22 10950864 . A G . PASS DP=131;SS=1;SSC=1;GPV=7.0419e-27;SPV=0.64622 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:25,29:16,17:9,12 0/1:.:77:37,40:20,20:17,20 | |
| 1173 chr22 10951555 . C T . PASS DP=121;SS=1;SSC=3;GPV=6.782e-13;SPV=0.44461 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:43,17:26,7:17,10 0/1:.:61:42,19:24,10:18,9 | |
| 1174 chr22 10951772 . T C . PASS DP=130;SS=1;SSC=0;GPV=1.5757e-24;SPV=0.91889 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:28,34:10,21:18,13 0/1:.:68:38,30:15,14:23,16 | |
| 1175 chr22 10952533 . G C . PASS DP=128;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.97023 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:62:8,54:6,26:2,28 1/1:.:66:16,50:11,25:5,25 | |
| 1176 chr22 10953925 . T A . PASS DP=134;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.65298 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:69:15,54:6,35:9,19 1/1:.:65:15,50:10,25:5,25 | |
| 1177 chr22 10954089 . A T . PASS DP=110;SS=1;SSC=0;GPV=2.9733e-14;SPV=0.99188 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:30,25:10,13:20,12 0/1:.:55:41,14:12,5:29,9 | |
| 1178 chr22 10954194 . C T . PASS DP=126;SS=1;SSC=0;GPV=7.2911e-38;SPV=0.83875 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:73:20,53:12,31:8,22 0/1:.:53:18,35:8,25:10,10 | |
| 1179 chr22 10954317 . T C . PASS DP=124;SS=1;SSC=0;GPV=4.2119e-12;SPV=0.8762 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:68:47,21:24,10:23,11 0/1:.:56:43,13:25,6:18,7 | |
| 1180 chr22 10954991 . A G . PASS DP=337;SS=1;SSC=5;GPV=1.7669e-22;SPV=0.28364 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:184:150,34:49,19:101,15 0/1:.:153:120,33:44,17:76,16 | |
| 1181 chr22 10955298 . A T . PASS DP=134;SS=1;SSC=6;GPV=2.8412e-11;SPV=0.21904 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:77:61,16:29,9:32,7 0/1:.:57:41,16:29,13:12,3 | |
| 1182 chr22 10957318 . A T . PASS DP=128;SS=1;SSC=3;GPV=3.8238e-30;SPV=0.43631 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:75:32,43:15,23:17,20 0/1:.:53:21,32:12,23:9,9 | |
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| 1184 chr22 10958095 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=1.8437e-24;SPV=0.55196 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:12,32:7,17:5,15 0/1:.:31:8,23:3,9:5,14 | |
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| 1233 chr22 11025827 . C T . PASS DP=179;SS=1;SSC=1;GPV=2.0268e-19;SPV=0.72728 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:103:70,33:28,18:42,15 0/1:.:76:54,22:35,12:19,10 | |
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| 1235 chr22 11025933 . T C . PASS DP=145;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:77:0,77:0,55:0,22 1/1:.:68:0,68:0,47:0,21 | |
| 1236 chr22 11025950 . G A . PASS DP=141;SS=1;SSC=4;GPV=9.1384e-05;SPV=0.32086 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:79:73,6:57,3:16,3 0/1:.:62:55,7:37,5:18,2 | |
| 1237 chr22 11026303 . A C . PASS DP=410;SS=1;SSC=4;GPV=1.4391e-15;SPV=0.3721 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:212:166,23:97,12:69,11 0/1:.:198:149,24:90,13:59,11 | |
| 1238 chr22 11026440 . C A . PASS DP=520;SS=1;SSC=1;GPV=3.2562e-23;SPV=0.7653 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:298:255,43:170,27:85,16 0/1:.:222:194,28:131,15:63,13 | |
| 1239 chr22 11026491 . G A . PASS DP=396;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.59411 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:220:126,94:77,43:49,51 0/1:.:176:102,74:53,34:49,40 | |
| 1240 chr22 11026499 . C T . PASS DP=395;SS=1;SSC=7;GPV=1.1067e-37;SPV=0.16402 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:222:165,57:96,20:69,37 0/1:.:173:120,53:57,22:63,31 | |
| 1241 chr22 11027019 . A T . PASS DP=408;SS=1;SSC=18;GPV=1;SPV=0.013564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:254:218,36:122,22:96,14 0/1:.:154:118,36:57,20:61,16 | |
| 1242 chr22 11027140 . C T . PASS DP=323;SS=1;SSC=3;GPV=0;SPV=0.47409 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:197:113,84:60,35:53,49 0/1:.:126:71,55:33,33:38,22 | |
| 1243 chr22 11027449 . A C . PASS DP=209;SS=1;SSC=7;GPV=2.5778e-06;SPV=0.18007 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:108:99,7:71,2:28,5 0/1:.:101:87,11:58,8:29,3 | |
| 1244 chr22 11027684 . A G . PASS DP=352;SS=1;SSC=10;GPV=2.6814e-19;SPV=0.083044 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:196:169,27:75,11:94,16 0/1:.:156:125,31:51,20:74,11 | |
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| 1297 chr22 11035954 . T A . PASS DP=349;SS=1;SSC=3;GPV=2.6534e-33;SPV=0.44157 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:209:152,57:70,26:82,31 0/1:.:140:100,40:44,15:56,25 | |
| 1298 chr22 11036036 . A G . PASS DP=357;SS=1;SSC=0;GPV=6.4711e-15;SPV=0.85592 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:208:179,29:79,11:100,18 0/1:.:149:133,16:64,4:69,12 | |
| 1299 chr22 11036117 . A G . PASS DP=240;SS=1;SSC=10;GPV=0;SPV=0.095261 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:143:21,122:6,56:15,66 1/1:.:97:8,89:3,43:5,46 | |
| 1300 chr22 11036308 . C T . PASS DP=163;SS=1;SSC=4;GPV=1.4591e-16;SPV=0.37583 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:95:69,26:37,15:32,11 0/1:.:68:47,21:17,11:30,10 | |
| 1301 chr22 11036325 . T C . PASS DP=231;SS=1;SSC=3;GPV=0;SPV=0.46813 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:131:49,82:36,58:13,24 0/1:.:100:36,64:19,40:17,24 | |
| 1302 chr22 11036339 . G A . PASS DP=176;SS=1;SSC=0;GPV=1.1605e-09;SPV=0.9556 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:97:78,19:49,12:29,7 0/1:.:79:70,9:35,3:35,6 | |
| 1303 chr22 11036359 . T G . PASS DP=212;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.86183 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:120:47,73:27,45:20,28 0/1:.:92:42,50:20,28:22,22 | |
| 1304 chr22 11036446 . G T . PASS DP=286;SS=1;SSC=1;GPV=2.0619e-14;SPV=0.72523 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:171:144,27:65,14:79,13 0/1:.:115:99,16:56,9:43,7 | |
| 1305 chr22 11036519 . G A . PASS DP=309;SS=1;SSC=5;GPV=8.619e-36;SPV=0.28997 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:181:124,57:59,22:65,35 0/1:.:128:83,45:48,26:35,19 | |
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| 1363 chr22 11048144 . T C . PASS DP=331;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.73319 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:179:101,78:63,54:38,24 0/1:.:152:90,62:53,46:37,16 | |
| 1364 chr22 11048371 . C T . PASS DP=419;SS=1;SSC=3;GPV=7.5079e-24;SPV=0.48934 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:213:177,36:90,26:87,10 0/1:.:206:170,36:95,19:75,17 | |
| 1365 chr22 11048378 . C T . PASS DP=408;SS=1;SSC=3;GPV=1.7639e-20;SPV=0.44521 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:204:174,30:88,22:86,8 0/1:.:204:172,32:91,16:81,16 | |
| 1366 chr22 11048522 . A G . PASS DP=226;SS=1;SSC=2;GPV=1.5436e-10;SPV=0.62089 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:129:111,18:56,14:55,4 0/1:.:97:84,13:28,5:56,8 | |
| 1367 chr22 11048550 . T A . PASS DP=263;SS=1;SSC=4;GPV=8.665e-12;SPV=0.3294 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:148:130,18:56,13:74,5 0/1:.:115:98,17:31,6:67,11 | |
| 1368 chr22 11048946 . C T . PASS DP=235;SS=1;SSC=1;GPV=1.054e-36;SPV=0.68672 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:145:82,63:44,33:38,30 0/1:.:90:53,37:29,15:24,22 | |
| 1369 chr22 11049646 . C T . PASS DP=302;SS=1;SSC=4;GPV=3.339e-20;SPV=0.33205 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:181:147,34:74,15:73,19 0/1:.:121:95,26:46,12:49,14 | |
| 1370 chr22 11049671 . T C . PASS DP=292;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.83891 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:175:63,112:31,63:32,49 0/1:.:117:48,69:31,28:17,41 | |
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| 1422 chr22 11058068 . A G . PASS DP=201;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:113:0,113:0,64:0,49 1/1:.:88:0,88:0,46:0,42 | |
| 1423 chr22 11058210 . C T . PASS DP=96;SS=1;SSC=3;GPV=7.7245e-06;SPV=0.42833 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:40,7:19,3:21,4 0/1:.:49:40,9:19,1:21,8 | |
| 1424 chr22 11058211 . C G . PASS DP=96;SS=1;SSC=1;GPV=0.00036057;SPV=0.76196 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:41,6:22,1:19,5 0/1:.:49:44,5:19,1:25,4 | |
| 1425 chr22 11058222 . G C . PASS DP=90;SS=1;SSC=2;GPV=7.6592e-05;SPV=0.60401 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:36,6:20,2:16,4 0/1:.:48:41,7:19,1:22,6 | |
| 1426 chr22 11058327 . T G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 1/1:.:31:0,31:0,20:0,11 | |
| 1427 chr22 11058408 . C A . PASS DP=126;SS=1;SSC=5;GPV=1.0181e-11;SPV=0.31398 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:68:51,16:21,13:30,3 0/1:.:58:41,17:18,4:23,13 | |
| 1428 chr22 11058640 . C T . PASS DP=252;SS=1;SSC=1;GPV=7.735e-14;SPV=0.77844 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:143:118,25:73,15:45,10 0/1:.:109:93,16:52,7:41,9 | |
| 1429 chr22 11058730 . A G . PASS DP=181;SS=1;SSC=9;GPV=4.7148e-12;SPV=0.12558 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:101:85,16:60,13:25,3 0/1:.:80:61,19:36,16:25,3 | |
| 1430 chr22 11058795 . A G . PASS DP=142;SS=1;SSC=1;GPV=7.2786e-17;SPV=0.76416 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:77:50,27:26,16:24,11 0/1:.:65:45,20:22,11:23,9 | |
| 1431 chr22 11058829 . G T . PASS DP=116;SS=1;SSC=0;GPV=2.9212e-13;SPV=0.84031 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:69:37,24:11,10:26,14 0/1:.:47:26,12:8,4:18,8 | |
| 1432 chr22 11058837 . G T . PASS DP=129;SS=1;SSC=7;GPV=2.018e-06;SPV=0.19335 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:73:65,8:20,3:45,5 0/1:.:56:46,10:16,4:30,6 | |
| 1433 chr22 11058987 . A T . PASS DP=194;SS=1;SSC=5;GPV=1.5822e-25;SPV=0.29237 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:102:67,35:29,18:38,17 0/1:.:92:56,36:30,17:26,19 | |
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| 1544 chr22 11282590 . C T . PASS DP=157;SS=1;SSC=3;GPV=1.0689e-06;SPV=0.41991 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:90:80,10:31,5:49,5 0/1:.:67:58,9:21,2:37,7 | |
| 1545 chr22 11284037 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=7.5722e-05;SPV=0.80136 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:40,8:25,6:15,2 0/1:.:40:35,5:17,2:18,3 | |
| 1546 chr22 11284280 . G C . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=0.0032429;SPV=0.32434 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:50:46,4:12,4:34,0 0/1:.:29:25,4:8,3:17,1 | |
| 1547 chr22 11284915 . A G . PASS DP=138;SS=1;SSC=5;GPV=6.9719e-11;SPV=0.30359 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:92:73,19:38,7:35,12 0/1:.:46:34,12:14,5:20,7 | |
| 1548 chr22 11284932 . C G . PASS DP=156;SS=1;SSC=3;GPV=9.8455e-10;SPV=0.44872 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:99:82,17:40,7:42,10 0/1:.:57:46,11:19,5:27,6 | |
| 1549 chr22 11285397 . G A . PASS DP=181;SS=1;SSC=7;GPV=2.3386e-11;SPV=0.16884 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:104:88,16:33,6:55,10 0/1:.:77:60,17:27,9:33,8 | |
| 1550 chr22 11285766 . G A . PASS DP=214;SS=1;SSC=1;GPV=1.4486e-09;SPV=0.65314 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:111:96,15:33,3:63,12 0/1:.:103:90,13:33,5:57,8 | |
| 1551 chr22 11285806 . G A . PASS DP=225;SS=1;SSC=2;GPV=3.2826e-11;SPV=0.59381 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:115:98,17:38,7:60,10 0/1:.:110:94,16:37,4:57,12 | |
| 1552 chr22 11286016 . C T . PASS DP=179;SS=1;SSC=2;GPV=4.0372e-13;SPV=0.55708 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:90:71,19:42,7:29,12 0/1:.:89:70,19:42,9:28,10 | |
| 1553 chr22 11286017 . G C . PASS DP=181;SS=1;SSC=0;GPV=4.7148e-12;SPV=0.89502 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:94:73,21:38,12:35,9 0/1:.:87:73,14:39,7:34,7 | |
| 1554 chr22 11286414 . G A . PASS DP=201;SS=1;SSC=4;GPV=8.9955e-19;SPV=0.35449 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:103:77,26:36,15:41,11 0/1:.:98:70,28:36,11:34,17 | |
| 1555 chr22 11286618 . C T . PASS DP=147;SS=1;SSC=5;GPV=4.4335e-09;SPV=0.26118 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:79:67,12:33,5:34,7 0/1:.:68:54,14:29,8:25,6 | |
| 1556 chr22 11286713 . C A . PASS DP=191;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.042373 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:107:94,13:39,5:55,8 0/1:.:84:65,19:31,7:34,12 | |
| 1557 chr22 11287549 . T C . PASS DP=211;SS=1;SSC=5;GPV=1.2943e-27;SPV=0.27531 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:103:68,35:31,18:37,17 0/1:.:108:66,42:32,25:34,17 | |
| 1558 chr22 11287608 . A G . PASS DP=204;SS=1;SSC=2;GPV=1.208e-12;SPV=0.55192 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:111:91,20:44,7:47,13 0/1:.:93:76,17:40,8:36,9 | |
| 1559 chr22 11288042 . C T . PASS DP=175;SS=1;SSC=8;GPV=4.8934e-11;SPV=0.12993 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:95:81,14:36,9:45,5 0/1:.:80:62,18:35,7:27,11 | |
| 1560 chr22 11288407 . G T . PASS DP=161;SS=1;SSC=2;GPV=7.0148e-13;SPV=0.5743 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:87:67,20:34,14:33,6 0/1:.:74:57,17:25,10:32,7 | |
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| 1562 chr22 11288678 . C A . PASS DP=139;SS=1;SSC=0;GPV=3.0958e-11;SPV=0.88107 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:72:53,19:25,14:28,5 0/1:.:67:54,13:32,8:22,5 | |
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| 1611 chr22 11299402 . T A . PASS DP=175;SS=1;SSC=0;GPV=2.2005e-11;SPV=0.84906 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:100:79,21:30,9:49,12 0/1:.:75:63,12:27,6:36,6 | |
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| 1615 chr22 11300371 . G T . PASS DP=139;SS=1;SSC=2;GPV=3.9904e-16;SPV=0.62302 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:73:49,24:23,12:26,12 0/1:.:66:45,21:25,7:20,14 | |
| 1616 chr22 11300397 . C A . PASS DP=123;SS=1;SSC=2;GPV=1.7201e-08;SPV=0.57234 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:50,12:22,6:28,6 0/1:.:61:49,12:24,7:25,5 | |
| 1617 chr22 11300495 . C T . PASS DP=126;SS=1;SSC=6;GPV=3.5379e-09;SPV=0.23344 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:78:64,14:29,7:35,7 0/1:.:48:36,12:20,6:16,6 | |
| 1618 chr22 11300905 . G T . PASS DP=137;SS=1;SSC=0;GPV=1.9598e-08;SPV=0.98624 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:79:60,18:26,9:34,9 0/1:.:58:52,6:27,4:25,2 | |
| 1619 chr22 11300938 . T G . PASS DP=152;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:82:0,82:0,39:0,43 1/1:.:70:0,70:0,34:0,36 | |
| 1620 chr22 11301239 . C A . PASS DP=91;SS=1;SSC=2;GPV=9.6314e-30;SPV=0.55792 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:11,30:2,11:9,19 0/1:.:50:13,37:4,17:9,20 | |
| 1621 chr22 11301518 . A T . PASS DP=149;SS=1;SSC=0;GPV=1.0354e-13;SPV=0.9735 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:47,23:31,19:16,4 0/1:.:79:63,16:40,13:23,3 | |
| 1622 chr22 11301524 . T A . PASS DP=168;SS=1;SSC=0;GPV=4.9678e-15;SPV=0.98402 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:80:53,26:37,19:16,7 0/1:.:88:70,17:45,13:25,4 | |
| 1623 chr22 11301886 . G C . PASS DP=199;SS=1;SSC=0;GPV=3.2512e-16;SPV=0.98351 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:111:79,32:37,13:42,19 0/1:.:88:73,15:35,7:38,8 | |
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| 1669 chr22 11316286 . T C . PASS DP=180;SS=1;SSC=3;GPV=1.8049e-13;SPV=0.4247 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:97:77,20:40,7:37,13 0/1:.:83:64,19:28,12:36,7 | |
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| 1671 chr22 11316739 . T C . PASS DP=114;SS=3;SSC=23;GPV=1;SPV=0.0044304 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:36,16:21,8:15,8 0/0:.:62:56,6:24,4:32,2 | |
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| 1674 chr22 11317935 . G T . PASS DP=233;SS=1;SSC=1;GPV=3.4353e-10;SPV=0.71246 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:117:101,16:57,9:44,7 0/1:.:116:102,14:50,8:52,6 | |
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| 1676 chr22 11318504 . G T . PASS DP=160;SS=1;SSC=7;GPV=9.3155e-11;SPV=0.17197 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:87:73,14:30,6:43,8 0/1:.:73:56,17:19,5:37,12 | |
| 1677 chr22 11319320 . T C . PASS DP=246;SS=1;SSC=1;GPV=7.3783e-14;SPV=0.63322 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:141:117,24:72,15:45,9 0/1:.:105:88,17:55,11:33,6 | |
| 1678 chr22 11320244 . G A . PASS DP=176;SS=1;SSC=12;GPV=2.6212e-15;SPV=0.05834 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:92:74,18:28,8:46,10 0/1:.:84:58,26:29,8:29,18 | |
| 1679 chr22 11322720 . C T . PASS DP=26;SOMATIC;SS=2;SSC=14;GPV=1;SPV=0.03311 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:14:14,0:14,0:0,0 0/1:.:12:8,4:8,4:0,0 | |
| 1680 chr22 11323063 . C A . PASS DP=185;SS=1;SSC=1;GPV=5.5444e-07;SPV=0.64253 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:90:80,10:37,5:43,5 0/1:.:95:85,10:35,8:50,2 | |
| 1681 chr22 11323800 . G A . PASS DP=148;SS=1;SSC=0;GPV=1.8145e-10;SPV=0.80402 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:76:59,17:26,5:33,12 0/1:.:72:59,13:30,6:29,7 | |
| 1682 chr22 11324584 . T G . PASS DP=123;SS=1;SSC=1;GPV=1.7247e-12;SPV=0.7885 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:45,20:27,11:18,9 0/1:.:58:43,15:19,8:24,7 | |
| 1683 chr22 11324594 . C A . PASS DP=130;SS=1;SSC=1;GPV=3.2103e-10;SPV=0.67903 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:69:53,16:31,9:22,7 0/1:.:61:48,13:23,7:25,6 | |
| 1684 chr22 11324886 . C A . PASS DP=179;SS=1;SSC=2;GPV=2.5814e-09;SPV=0.61647 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:98:83,15:48,7:35,8 0/1:.:81:69,12:39,6:30,6 | |
| 1685 chr22 11325212 . G T . PASS DP=172;SS=1;SSC=5;GPV=6.4289e-11;SPV=0.27281 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:102:61,16:29,2:32,14 0/1:.:70:41,15:21,11:20,4 | |
| 1686 chr22 11325326 . T C . PASS DP=136;SS=1;SSC=0;GPV=1.2753e-11;SPV=0.93642 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:73:52,21:28,11:24,10 0/1:.:63:51,12:26,7:25,5 | |
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| 1736 chr22 11338143 . C T . PASS DP=193;SS=1;SSC=3;GPV=1.2569e-10;SPV=0.46217 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:98:83,15:41,8:42,7 0/1:.:95:79,16:43,9:36,7 | |
| 1737 chr22 11338265 . T C . PASS DP=199;SS=1;SSC=0;GPV=1.2463e-11;SPV=0.97676 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:107:84,23:40,9:44,14 0/1:.:92:81,11:42,5:39,6 | |
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| 1740 chr22 11338332 . C G . PASS DP=278;SS=1;SSC=0;GPV=9.2519e-14;SPV=0.97919 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:146:119,27:51,13:68,14 0/1:.:132:118,14:54,4:64,10 | |
| 1741 chr22 11338428 . A C . PASS DP=307;SS=1;SSC=0;GPV=2.6889e-22;SPV=0.82279 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:145:111,34:54,16:57,18 0/1:.:162:130,32:51,10:79,22 | |
| 1742 chr22 11338522 . G T . PASS DP=247;SS=1;SSC=0;GPV=7.9603e-11;SPV=0.93328 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:120:101,19:53,11:48,8 0/1:.:127:114,13:58,9:56,4 | |
| 1743 chr22 11338789 . T G . PASS DP=162;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:81:0,81:0,44:0,37 1/1:.:81:0,81:0,42:0,39 | |
| 1744 chr22 11338966 . G A . PASS DP=186;SS=1;SSC=5;GPV=5.9078e-16;SPV=0.30265 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:85:66,19:30,11:36,8 0/1:.:101:74,27:33,17:41,10 | |
| 1745 chr22 11339180 . A C . PASS DP=139;SS=1;SSC=4;GPV=2.347e-14;SPV=0.33177 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:40,16:14,9:26,7 0/1:.:80:47,24:19,12:28,12 | |
| 1746 chr22 11339181 . A T . PASS DP=127;SS=1;SSC=2;GPV=1.0703e-34;SPV=0.53622 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:20,37:8,17:12,20 0/1:.:70:24,46:14,21:10,25 | |
| 1747 chr22 11339191 . T A . PASS DP=142;SOMATIC;SS=2;SSC=17;GPV=1;SPV=0.017729 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:62:59,3:25,2:34,1 0/1:.:80:66,14:29,9:37,5 | |
| 1748 chr22 11339584 . A G . PASS DP=115;SS=1;SSC=0;GPV=3.3038e-12;SPV=0.90747 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:36,19:15,8:21,11 0/1:.:60:45,15:24,4:21,11 | |
| 1749 chr22 11339694 . G T . PASS DP=144;SS=1;SSC=1;GPV=4.312e-09;SPV=0.79001 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:56,14:29,6:27,8 0/1:.:74:62,12:34,7:28,5 | |
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| 1751 chr22 11340248 . G C . PASS DP=158;SS=1;SSC=2;GPV=4.8438e-06;SPV=0.57011 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:85:76,9:41,3:35,6 0/1:.:73:65,8:30,3:35,5 | |
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| 1797 chr22 11349622 . C A . PASS DP=194;SS=1;SSC=4;GPV=1.5719e-21;SPV=0.32989 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:111:78,33:40,16:38,17 0/1:.:83:55,28:23,9:32,19 | |
| 1798 chr22 11350016 . C T . PASS DP=133;SS=1;SSC=1;GPV=2.7904e-11;SPV=0.72957 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:79:59,20:33,10:26,10 0/1:.:54:42,12:16,5:26,7 | |
| 1799 chr22 11350505 . T G . PASS DP=201;SS=1;SSC=6;GPV=0;SPV=0.23643 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:120:27,93:16,50:11,43 1/1:.:81:14,67:8,35:6,32 | |
| 1800 chr22 11350816 . G A . PASS DP=141;SS=1;SSC=0;GPV=4.7791e-13;SPV=0.87686 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:82:58,24:32,12:26,12 0/1:.:59:46,13:26,5:20,8 | |
| 1801 chr22 11350847 . G A . PASS DP=137;SS=1;SSC=1;GPV=1.4958e-26;SPV=0.6633 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:74:36,38:21,16:15,22 0/1:.:63:32,31:15,15:17,16 | |
| 1802 chr22 11351969 . C G . PASS DP=186;SS=1;SSC=2;GPV=2.2301e-12;SPV=0.58178 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:103:83,20:38,11:45,9 0/1:.:83:67,16:29,10:38,6 | |
| 1803 chr22 11352481 . G A . PASS DP=114;SS=1;SSC=0;GPV=3.6131e-37;SPV=0.92996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:11,42:5,23:6,19 0/1:.:61:19,42:11,24:8,18 | |
| 1804 chr22 11352503 . C A . PASS DP=122;SS=1;SSC=0;GPV=4.9269e-29;SPV=0.95144 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:21,40:8,17:13,23 0/1:.:61:29,32:20,13:9,19 | |
| 1805 chr22 11352582 . A C . PASS DP=169;SS=1;SSC=3;GPV=5.3426e-08;SPV=0.49431 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:92:80,12:26,8:54,4 0/1:.:77:66,11:31,8:35,3 | |
| 1806 chr22 11355836 . A C . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=4.469e-29;SPV=0.46163 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:15,37:2,12:13,25 0/1:.:39:10,29:4,13:6,16 | |
| 1807 chr22 11356074 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=9.1193e-08;SPV=0.69664 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:26,11:19,8:7,3 0/1:.:37:27,10:19,5:8,5 | |
| 1808 chr22 11356407 . C T . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=4.11e-18;SPV=0.90849 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:23,27:8,9:15,18 0/1:.:48:27,20:12,7:15,13 | |
| 1809 chr22 11356876 . A C . PASS DP=158;SS=1;SSC=10;GPV=2.1363e-17;SPV=0.094812 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:88:65,23:33,14:32,9 0/1:.:70:44,26:20,14:24,12 | |
| 1810 chr22 11356978 . C A . PASS DP=185;SS=1;SSC=3;GPV=9.8371e-13;SPV=0.45592 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:94:76,18:52,12:24,6 0/1:.:91:72,19:39,13:33,6 | |
| 1811 chr22 11357087 . T C . PASS DP=224;SS=1;SSC=3;GPV=3.7824e-21;SPV=0.48898 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:116:85,31:56,21:29,10 0/1:.:108:78,30:46,15:32,15 | |
| 1812 chr22 11357156 . G T . PASS DP=258;SS=1;SSC=2;GPV=1.7858e-10;SPV=0.57016 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:150:132,18:64,9:68,9 0/1:.:108:95,13:46,7:49,6 | |
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| 1814 chr22 11357520 . G A . PASS DP=164;SS=1;SSC=7;GPV=2.018e-15;SPV=0.16459 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:83:64,19:29,5:35,14 0/1:.:81:56,25:31,10:25,15 | |
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| 1844 chr22 11368162 . G A . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:0,8:0,5:0,3 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 | |
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| 1851 chr22 11373623 . G A . PASS DP=109;SS=1;SSC=0;GPV=8.4316e-06;SPV=0.92604 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:13,4:4,0:9,4 0/1:.:92:80,12:37,10:43,2 | |
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| 1862 chr22 11428763 . A G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
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| 1870 chr22 11430117 . C G . PASS DP=23;SS=1;SSC=0;GPV=1.2146e-13;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:0,12:0,7:0,5 1/1:.:11:0,11:0,5:0,6 | |
| 1871 chr22 11430259 . G C . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=1.5066e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,15:0,8 1/1:.:20:0,20:0,11:0,9 | |
| 1872 chr22 11430289 . T C . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,15:0,8 1/1:.:17:0,17:0,12:0,5 | |
| 1873 chr22 11430429 . A C . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,11:0,8 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 | |
| 1874 chr22 11430444 . A T . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=1.5066e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,11:0,8 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 | |
| 1875 chr22 11430568 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
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| 1926 chr22 11439706 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 1/1:.:16:0,16:0,8:0,8 | |
| 1927 chr22 11439711 . T G . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 1/1:.:15:0,15:0,9:0,6 | |
| 1928 chr22 11439712 . T G . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 1/1:.:14:0,14:0,9:0,5 | |
| 1929 chr22 11439775 . T A . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,10:0,9 1/1:.:22:0,22:0,16:0,6 | |
| 1930 chr22 11440065 . T G . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=6.9424e-37;SPV=0.53846 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:1,34:1,21:0,13 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 | |
| 1931 chr22 11440246 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=7;GPV=4.4193e-27;SPV=0.19188 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,10:0,12 1/1:.:31:3,28:2,10:1,18 | |
| 1932 chr22 11440669 . C T . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,10:0,18 1/1:.:17:0,17:0,7:0,10 | |
| 1933 chr22 11440726 . T G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 1/1:.:18:0,18:0,10:0,8 | |
| 1934 chr22 11440773 . C G . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 1/1:.:20:0,20:0,10:0,10 | |
| 1935 chr22 11440823 . A C . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,11:0,11 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 1936 chr22 11440984 . A C . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,7:0,19 1/1:.:24:0,24:0,9:0,15 | |
| 1937 chr22 11440989 . G A . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,8:0,18 1/1:.:22:0,22:0,10:0,12 | |
| 1938 chr22 11441174 . C T . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,22:0,6 1/1:.:21:0,21:0,11:0,10 | |
| 1939 chr22 11441271 . G A . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=1.4508e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,12:0,8 1/1:.:18:0,18:0,14:0,4 | |
| 1940 chr22 11441627 . T C . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,4:0,12 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 | |
| 1941 chr22 11441931 . A T . PASS DP=24;SS=1;SSC=1;GPV=1.0078e-11;SPV=0.71739 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:1,10:1,5:0,5 1/1:.:13:1,12:0,7:1,5 | |
| 1942 chr22 11442007 . C T . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,9:0,5 1/1:.:18:0,18:0,13:0,5 | |
| 1943 chr22 11442244 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,21:0,6 1/1:.:20:0,20:0,9:0,11 | |
| 1944 chr22 11442344 . A T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 1/1:.:29:0,29:0,9:0,20 | |
| 1945 chr22 11442565 . C G . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 1/1:.:23:0,23:0,15:0,8 | |
| 1946 chr22 11442713 . T C . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 | |
| 1947 chr22 11443035 . C T . PASS DP=124;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:67:0,67:0,29:0,38 1/1:.:57:0,57:0,27:0,30 | |
| 1948 chr22 11443184 . A G . PASS DP=132;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:73:0,73:0,36:0,37 1/1:.:59:0,59:0,30:0,29 | |
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| 1950 chr22 11443505 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:34:0,34:0,8:0,26 | |
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| 1978 chr22 11449314 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=1.1598e-38;SPV=0.52941 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 1/1:.:36:1,35:1,20:0,15 | |
| 1979 chr22 11449387 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
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| 1981 chr22 11450364 . T A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,15:0,24 1/1:.:37:0,37:0,13:0,24 | |
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| 1988 chr22 11452673 . C A . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=2.2528e-17;SPV=0.39468 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:10,13:1,2:9,11 0/1:.:46:17,29:5,13:12,16 | |
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| 2001 chr22 11457236 . A C . PASS DP=39;SS=1;SSC=2;GPV=3.0128e-20;SPV=0.58704 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,6:0,3 1/1:.:30:2,28:0,14:2,14 | |
| 2002 chr22 11457243 . A G . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=1.4508e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:0,8:0,6:0,2 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 2003 chr22 11458887 . A G . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:0,8:0,2:0,6 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 2004 chr22 11459828 . A G . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,5:0,5 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
| 2005 chr22 11459924 . G T . PASS DP=34;SS=1;SSC=3;GPV=2.2142e-17;SPV=0.45098 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,7:0,4 1/1:.:23:2,21:2,6:0,15 | |
| 2006 chr22 11460948 . T C . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=1.5066e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,4:0,5 1/1:.:34:0,34:0,22:0,12 | |
| 2007 chr22 11462090 . C T . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,4:0,5 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 | |
| 2008 chr22 11466566 . T G . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,4:0,5 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 2009 chr22 11466807 . A G . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:0,12:0,6:0,6 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
| 2010 chr22 11466936 . A G . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,5:0,4 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 | |
| 2011 chr22 11467164 . C A . PASS DP=36;SS=1;SSC=1;GPV=8.3613e-20;SPV=0.72222 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,2:0,8 1/1:.:26:1,25:1,9:0,16 | |
| 2012 chr22 11467460 . A G . PASS DP=35;SS=1;SSC=0;GPV=8.9137e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:0,8:0,1:0,7 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
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| 2016 chr22 11468928 . T G . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,3:0,6 1/1:.:23:0,23:0,8:0,15 | |
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| 2018 chr22 11472665 . A C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,5:0,10 1/1:.:52:0,52:0,26:0,26 | |
| 2019 chr22 11472808 . T A . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=1.9625e-27;SPV=0.81633 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,9:0,4:0,5 1/1:.:47:1,39:0,19:1,20 | |
| 2020 chr22 11472989 . C G . PASS DP=119;SS=1;SSC=2;GPV=2.8389e-33;SPV=0.53883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:5,9:3,4:2,5 0/1:.:105:35,70:22,39:13,31 | |
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| 2035 chr22 11475749 . C T . PASS DP=124;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 1/1:.:86:0,86:0,48:0,38 | |
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| 2049 chr22 11478941 . T G . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=2.2598e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,8:0,5 1/1:.:23:0,23:0,15:0,8 | |
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| 2057 chr22 11480261 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
| 2058 chr22 11480494 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 1/1:.:40:0,40:0,25:0,15 | |
| 2059 chr22 11480570 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 1/1:.:31:0,31:0,20:0,11 | |
| 2060 chr22 11480787 . C G . PASS DP=78;SS=1;SSC=4;GPV=4.8611e-10;SPV=0.33462 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:21,9:8,5:13,4 0/1:.:48:30,18:15,5:15,13 | |
| 2061 chr22 11480868 . A G . PASS DP=43;SS=1;SSC=5;GPV=1.4915e-22;SPV=0.28018 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,12:0,8 1/1:.:23:2,21:0,8:2,13 | |
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| 2063 chr22 11481014 . G T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 | |
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| 2066 chr22 11481687 . T A . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
| 2067 chr22 11481688 . A C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 1/1:.:23:0,23:0,12:0,11 | |
| 2068 chr22 11481821 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,12:0,23 1/1:.:42:0,42:0,17:0,25 | |
| 2069 chr22 11481985 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 1/1:.:26:0,26:0,9:0,17 | |
| 2070 chr22 11482164 . T C . PASS DP=104;SS=1;SSC=5;GPV=2.8325e-18;SPV=0.28773 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:31,23:15,12:16,11 0/1:.:50:25,25:5,10:20,15 | |
| 2071 chr22 11482195 . C A . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=5.8193e-05;SPV=0.65945 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:7,5:2,4:5,1 0/1:.:33:10,7:2,2:8,5 | |
| 2072 chr22 11482338 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 1/1:.:25:0,25:0,22:0,3 | |
| 2073 chr22 11482352 . T G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 1/1:.:23:0,23:0,19:0,4 | |
| 2074 chr22 11482453 . T C . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 1/1:.:18:0,18:0,11:0,7 | |
| 2075 chr22 11482465 . A C . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 1/1:.:21:0,21:0,12:0,9 | |
| 2076 chr22 11482641 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 1/1:.:45:0,45:0,19:0,26 | |
| 2077 chr22 11482845 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=3.4466e-34;SPV=0.32258 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 1/1:.:36:2,34:1,19:1,15 | |
| 2078 chr22 11483002 . T A . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 1/1:.:23:0,23:0,10:0,13 | |
| 2079 chr22 11483087 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=2;GPV=1.0345e-10;SPV=0.5526 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:8,3:6,10 0/1:.:28:14,14:7,6:7,8 | |
| 2080 chr22 11483251 . C G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 2081 chr22 11483460 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,5:0,15 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 2082 chr22 11483727 . T C . PASS DP=150;SS=1;SSC=1;GPV=6.7831e-37;SPV=0.77967 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:23,40:12,21:11,19 0/1:.:87:36,51:21,25:15,26 | |
| 2083 chr22 11483890 . C G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,24:0,19 1/1:.:50:0,50:0,25:0,25 | |
| 2084 chr22 11484858 . A T . PASS DP=131;SS=1;SSC=1;GPV=4.3825e-06;SPV=0.7257 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:36,6:22,2:14,4 0/1:.:89:78,11:46,5:32,6 | |
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| 2142 chr22 11495837 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
| 2143 chr22 11496725 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 2144 chr22 11496855 . C G . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,16:0,11 1/1:.:18:0,18:0,7:0,11 | |
| 2145 chr22 11496877 . C A . PASS DP=49;SS=1;SSC=8;GPV=5.0044e-26;SPV=0.1301 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,20:0,11 1/1:.:18:2,16:0,7:2,9 | |
| 2146 chr22 11497147 . C A . PASS DP=29;SS=1;SSC=3;GPV=9.9776e-16;SPV=0.41379 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,3:0,14 1/1:.:12:1,11:1,3:0,8 | |
| 2147 chr22 11547776 . T C . PASS DP=108;SS=1;SSC=1;GPV=3.4476e-34;SPV=0.68314 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:13,36:5,19:8,17 0/1:.:59:17,42:9,22:8,20 | |
| 2148 chr22 11547951 . T C . PASS DP=119;SS=1;SSC=2;GPV=2.1238e-20;SPV=0.58115 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:14,10:10,10 0/1:.:75:41,34:23,17:18,17 | |
| 2149 chr22 11548148 . G T . PASS DP=157;SS=1;SSC=0;GPV=6.5548e-13;SPV=0.95384 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:45,19:27,13:18,6 0/1:.:93:75,18:31,8:44,10 | |
| 2150 chr22 11548437 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=7.6592e-05;SPV=0.81357 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:29,6:15,3:14,3 0/1:.:56:48,7:19,4:29,3 | |
| 2151 chr22 11549042 . G A . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=1.4372e-07;SPV=0.84732 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:33,11:17,6:16,5 0/1:.:54:44,10:25,3:19,7 | |
| 2152 chr22 11549886 . T C . PASS DP=123;SS=1;SSC=1;GPV=6.5743e-10;SPV=0.756 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:46,15:24,10:22,5 0/1:.:62:49,13:30,6:19,7 | |
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| 2154 chr22 11551654 . A G . PASS DP=100;SS=1;SSC=7;GPV=2.9522e-11;SPV=0.18511 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:35,12:18,7:17,5 0/1:.:53:34,19:17,13:17,6 | |
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| 2207 chr22 11573548 . C T . PASS DP=115;SS=1;SSC=0;GPV=3.5135e-08;SPV=0.93509 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:72:55,17:29,6:26,11 0/1:.:43:37,6:23,5:14,1 | |
| 2208 chr22 11574163 . C T . PASS DP=182;SS=1;SSC=0;GPV=4.2102e-17;SPV=0.93488 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:108:75,33:43,13:32,20 0/1:.:74:58,16:43,9:15,7 | |
| 2209 chr22 11575378 . C A . PASS DP=135;SS=1;SSC=3;GPV=1.5191e-10;SPV=0.45063 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:80:63,17:35,9:28,8 0/1:.:55:42,13:24,5:18,8 | |
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| 2211 chr22 11576069 . A T . PASS DP=199;SS=1;SSC=0;GPV=3.8565e-15;SPV=0.87949 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:128:96,31:38,13:58,18 0/1:.:71:58,13:26,5:32,8 | |
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| 2213 chr22 11576938 . C T . PASS DP=157;SS=1;SSC=5;GPV=6.5548e-13;SPV=0.30536 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:80:63,17:24,8:39,9 0/1:.:77:57,20:25,13:32,7 | |
| 2214 chr22 11577491 . A G . PASS DP=156;SS=1;SSC=0;GPV=8.8975e-11;SPV=0.90358 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:87:67,20:38,9:29,11 0/1:.:69:58,11:31,5:27,6 | |
| 2215 chr22 11578345 . C A . PASS DP=123;SS=1;SSC=5;GPV=1.3409e-21;SPV=0.26995 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:36,27:17,16:19,11 0/1:.:60:30,30:14,13:16,17 | |
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| 2267 chr22 11593373 . G A . PASS DP=110;SS=1;SSC=0;GPV=2.218e-10;SPV=0.86314 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:37,16:18,8:19,8 0/1:.:57:44,13:23,8:21,5 | |
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| 2270 chr22 11594403 . C T . PASS DP=146;SS=1;SSC=4;GPV=1.2382e-12;SPV=0.38909 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:82:63,19:38,9:25,10 0/1:.:64:47,17:23,11:24,6 | |
| 2271 chr22 11594686 . C T . PASS DP=161;SS=1;SSC=19;GPV=1;SPV=0.01223 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:85:53,32:23,16:30,16 0/1:.:76:33,43:19,29:14,14 | |
| 2272 chr22 11595230 . C T . PASS DP=129;SS=1;SSC=1;GPV=1.0493e-16;SPV=0.78967 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:35,22:22,14:13,8 0/1:.:72:48,24:25,9:23,15 | |
| 2273 chr22 11595551 . T A . PASS DP=105;SS=1;SSC=8;GPV=2.4222e-17;SPV=0.15338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:34,21:19,12:15,9 0/1:.:50:25,25:12,12:13,13 | |
| 2274 chr22 11595799 . G C . PASS DP=128;SS=1;SSC=1;GPV=7.7386e-39;SPV=0.71901 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:18,46:6,19:12,27 0/1:.:64:20,44:11,24:9,20 | |
| 2275 chr22 11596104 . T G . PASS DP=138;SS=1;SSC=0;GPV=3.5986e-10;SPV=0.95323 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:69:51,18:22,12:29,6 0/1:.:69:58,11:24,6:34,5 | |
| 2276 chr22 11596241 . A T . PASS DP=128;SS=1;SSC=0;GPV=9.2083e-23;SPV=0.80035 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:30,30:14,20:16,10 0/1:.:68:38,30:13,14:25,16 | |
| 2277 chr22 11596278 . T C . PASS DP=124;SS=1;SSC=1;GPV=2.3364e-11;SPV=0.69993 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:43,16:24,7:19,9 0/1:.:65:49,16:26,6:23,10 | |
| 2278 chr22 11596738 . T C . PASS DP=122;SS=1;SSC=0;GPV=1.71291e-40;SPV=0.82834 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:66:15,51:9,27:6,24 0/1:.:56:16,40:11,20:5,20 | |
| 2279 chr22 11596892 . G T . PASS DP=136;SS=1;SSC=3;GPV=8.3997e-24;SPV=0.42236 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:80:44,36:28,23:16,13 0/1:.:56:29,27:11,14:18,13 | |
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| 2331 chr22 11612833 . T C . PASS DP=158;SS=1;SSC=8;GPV=1.4298e-18;SPV=0.14305 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:90:64,26:31,12:33,14 0/1:.:68:42,26:25,15:17,11 | |
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| 2333 chr22 11613253 . G A . PASS DP=131;SS=1;SSC=6;GPV=3.2592e-10;SPV=0.19977 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:57,13:31,9:26,4 0/1:.:61:45,16:28,7:17,9 | |
| 2334 chr22 11613458 . A T . PASS DP=143;SS=1;SSC=4;GPV=3.1933e-22;SPV=0.39165 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:77:46,31:20,11:26,20 0/1:.:66:37,29:13,13:24,16 | |
| 2335 chr22 11613890 . T C . PASS DP=129;SS=1;SSC=2;GPV=3.6722e-09;SPV=0.56686 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:56,14:22,4:34,10 0/1:.:59:47,12:23,7:24,5 | |
| 2336 chr22 11614005 . T C . PASS DP=143;SS=1;SSC=4;GPV=3.8369e-10;SPV=0.37934 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:80:65,15:35,8:30,7 0/1:.:63:49,14:24,11:25,3 | |
| 2337 chr22 11614617 . C A . PASS DP=154;SS=1;SSC=11;GPV=0;SPV=0.069179 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:98:21,77:9,45:12,32 1/1:.:56:6,50:3,24:3,26 | |
| 2338 chr22 11614733 . G A . PASS DP=130;SS=1;SSC=0;GPV=6.1027e-11;SPV=0.89682 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:82:60,22:26,8:34,14 0/1:.:48:39,9:21,5:18,4 | |
| 2339 chr22 11615190 . A G . PASS DP=110;SS=1;SSC=0;GPV=3.3688e-24;SPV=0.85754 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:29,41:7,20:22,21 0/1:.:40:20,20:11,11:9,9 | |
| 2340 chr22 11615454 . A G . PASS DP=124;SS=1;SSC=2;GPV=2.3364e-11;SPV=0.60632 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:73:54,19:36,11:18,8 0/1:.:51:38,13:19,7:19,6 | |
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| 2342 chr22 11615537 . C T . PASS DP=120;SS=1;SSC=1;GPV=5.0199e-11;SPV=0.73663 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:42,16:22,11:20,5 0/1:.:62:47,15:28,10:19,5 | |
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| 2393 chr22 11631069 . C T . PASS DP=123;SS=1;SSC=6;GPV=1.241e-10;SPV=0.21944 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:71:56,15:13,7:43,8 0/1:.:52:37,15:14,2:23,13 | |
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| 2395 chr22 11681842 . G T . PASS DP=111;SS=1;SSC=0;GPV=3.9267e-24;SPV=0.986 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:69:26,43:10,12:16,31 0/1:.:42:24,18:15,5:9,13 | |
| 2396 chr22 11681896 . G T . PASS DP=139;SS=1;SSC=4;GPV=2.1077e-07;SPV=0.35887 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:81:70,11:25,3:45,8 0/1:.:58:48,10:19,3:29,7 | |
| 2397 chr22 11682021 . G A . PASS DP=155;SS=1;SSC=2;GPV=1.0697e-07;SPV=0.57752 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:85:73,12:21,6:52,6 0/1:.:70:60,10:30,2:30,8 | |
| 2398 chr22 11682186 . T C . PASS DP=47;SS=1;SSC=10;GPV=1.9604e-05;SPV=0.093944 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:18,4:13,3:5,1 0/1:.:25:15,10:8,5:7,5 | |
| 2399 chr22 11682376 . G C . PASS DP=73;SS=1;SSC=5;GPV=1.2823e-13;SPV=0.28686 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:12,11:10,6 0/1:.:34:16,18:5,15:11,3 | |
| 2400 chr22 11682515 . C G . PASS DP=115;SS=1;SSC=2;GPV=2.0846e-34;SPV=0.62148 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:18,42:7,26:11,16 0/1:.:55:17,38:13,18:4,20 | |
| 2401 chr22 11682670 . T A . PASS DP=87;SS=1;SSC=12;GPV=6.8092e-10;SPV=0.056843 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:37,11:21,3:16,8 0/1:.:39:23,16:12,6:11,10 | |
| 2402 chr22 11682861 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,9:0,15 1/1:.:22:0,22:0,8:0,14 | |
| 2403 chr22 11682895 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=7;GPV=1.6571e-10;SPV=0.16155 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:20,12:9,2:11,10 0/1:.:28:13,15:6,6:7,9 | |
| 2404 chr22 11683125 . T C . PASS DP=41;SS=1;SSC=2;GPV=2.5278e-17;SPV=0.56605 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:4,21:1,13:3,8 1/1:.:16:2,14:0,6:2,8 | |
| 2405 chr22 11683622 . T C . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=2.4886e-19;SPV=0.9338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:24,30:16,19:8,11 0/1:.:47:27,20:12,12:15,8 | |
| 2406 chr22 11684631 . G T . PASS DP=179;SS=1;SSC=0;GPV=2.4731e-10;SPV=0.86466 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:88:71,17:13,6:58,11 0/1:.:91:78,13:18,3:60,10 | |
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| 2408 chr22 11685175 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=4;GPV=5.5047e-12;SPV=0.39652 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:15,14:8,11:7,3 0/1:.:29:13,16:7,11:6,5 | |
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| 2461 chr22 11710728 . C G . PASS DP=107;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,10:0,43 1/1:.:54:0,54:0,14:0,40 | |
| 2462 chr22 11710794 . G C . PASS DP=151;SS=1;SSC=4;GPV=1.359e-12;SPV=0.35284 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:90:70,20:29,8:41,12 0/1:.:61:45,16:20,5:25,11 | |
| 2463 chr22 11710871 . G T . PASS DP=111;SS=1;SSC=5;GPV=8.9511e-11;SPV=0.28698 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:66:48,16:30,9:18,7 0/1:.:45:30,14:18,9:12,5 | |
| 2464 chr22 11710948 . A G . PASS DP=108;SS=1;SSC=1;GPV=2.2238e-16;SPV=0.79084 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:34,26:22,18:12,8 0/1:.:48:30,18:20,13:10,5 | |
| 2465 chr22 11710962 . G A . PASS DP=110;SS=1;SSC=0;GPV=2.5283e-16;SPV=0.91757 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:36,29:22,19:14,10 0/1:.:45:30,15:20,10:10,5 | |
| 2466 chr22 11711002 . C T . PASS DP=101;SS=1;SSC=4;GPV=1.6625e-06;SPV=0.34392 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:53,10:34,5:19,5 0/1:.:38:30,8:20,5:10,3 | |
| 2467 chr22 11711006 . C T . PASS DP=101;SS=1;SSC=1;GPV=1.4956e-07;SPV=0.7585 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:49,14:32,9:17,5 0/1:.:38:31,7:22,3:9,4 | |
| 2468 chr22 11711294 . G A . PASS DP=103;SS=1;SSC=2;GPV=4.4444e-10;SPV=0.57974 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:43,16:18,5:25,11 0/1:.:44:32,12:10,4:22,8 | |
| 2469 chr22 11714643 . G C . PASS DP=31;SS=1;SSC=7;GPV=3.5853e-07;SPV=0.19683 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:8,6:2,5:6,1 0/1:.:17:6,11:0,8:6,3 | |
| 2470 chr22 11714661 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=0.00069868;SPV=0.73513 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:28,5:12,4:16,1 0/1:.:39:34,5:17,4:17,1 | |
| 2471 chr22 11714806 . C T . PASS DP=106;SS=1;SSC=4;GPV=3.802e-06;SPV=0.39324 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:43,7:15,3:28,4 0/1:.:56:46,10:19,1:27,9 | |
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| 2527 chr22 11790945 . T C . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,6:0,12 1/1:.:28:0,28:0,9:0,19 | |
| 2528 chr22 11791647 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=7;GPV=7.8121e-09;SPV=0.16276 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:27,8:22,1:5,7 0/1:.:45:29,16:21,4:8,12 | |
| 2529 chr22 11792016 . A G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,21:0,9:0,12 1/1:.:29:0,23:0,14:0,9 | |
| 2530 chr22 11792162 . C T . PASS DP=96;SS=1;SSC=4;GPV=1.7439e-13;SPV=0.33165 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:12,10:8,6:4,4 0/1:.:58:20,24:8,17:12,7 | |
| 2531 chr22 11792339 . G A . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=2.5824e-12;SPV=0.98185 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:1,12:0,8:1,4 0/1:.:20:6,14:3,7:3,7 | |
| 2532 chr22 11792372 . T G . PASS DP=47;SS=1;SSC=2;GPV=3.158e-10;SPV=0.54092 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:9,10:5,7:4,3 0/1:.:28:12,15:7,10:5,5 | |
| 2533 chr22 11792543 . C T . PASS DP=55;SOMATIC;SS=2;SSC=19;GPV=1;SPV=0.010211 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:28:28,0:15,0:13,0 0/1:.:27:21,6:13,3:8,3 | |
| 2534 chr22 11793659 . A T . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,8:0,13 1/1:.:19:0,19:0,11:0,8 | |
| 2535 chr22 11793663 . T C . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=3.2269e-18;SPV=0.97931 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:1,20:1,8:0,12 1/1:.:20:4,16:3,8:1,8 | |
| 2536 chr22 11793799 . T C . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=1.1493e-23;SPV=0.9403 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:1,23:1,14:0,9 1/1:.:25:3,22:2,16:1,6 | |
| 2537 chr22 11794120 . G A . PASS DP=180;SS=1;SSC=2;GPV=5.1321e-11;SPV=0.52204 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:92:76,16:46,13:30,3 0/1:.:88:72,16:45,13:27,3 | |
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| 2651 chr22 11838932 . T C . PASS DP=39;SS=1;SSC=0;GPV=3.6837e-05;SPV=0.93264 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:13,9:8,8:5,1 0/1:.:17:13,4:11,2:2,2 | |
| 2652 chr22 11838955 . C T . PASS DP=46;SS=1;SSC=1;GPV=9.8982e-11;SPV=0.64604 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:9,12:4,7:5,5 0/1:.:25:11,14:9,5:2,9 | |
| 2653 chr22 11839109 . C T . PASS DP=119;SS=1;SSC=0;GPV=5.3419e-37;SPV=0.8583 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:15,45:10,22:5,23 0/1:.:59:19,40:12,20:7,20 | |
| 2654 chr22 11839860 . A G . PASS DP=26;SS=1;SSC=1;GPV=0.002076;SPV=0.66362 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:9,4:5,2:4,2 0/1:.:13:9,4:3,1:6,3 | |
| 2655 chr22 11841646 . A G . PASS DP=30;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.030651 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,6:0,8 0/1:.:16:5,11:5,4:0,7 | |
| 2656 chr22 11841789 . C T . PASS DP=154;SS=1;SSC=1;GPV=6.3839e-33;SPV=0.68626 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:77:34,43:11,29:23,14 0/1:.:77:36,41:12,33:24,8 | |
| 2657 chr22 11841971 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,11:0,29 1/1:.:35:0,35:0,11:0,24 | |
| 2658 chr22 11842162 . T C . PASS DP=35;SS=1;SSC=0;GPV=8.9137e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,1:0,9 1/1:.:25:0,25:0,0:0,25 | |
| 2659 chr22 11842462 . C A . PASS DP=21;SS=1;SSC=0;GPV=1.8578e-12;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,7:0,2 1/1:.:12:0,12:0,8:0,4 | |
| 2660 chr22 11842547 . G A . PASS DP=24;SS=1;SSC=0;GPV=1.8413e-08;SPV=0.96281 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:1,8:0,3:1,5 0/1:.:15:5,10:4,6:1,4 | |
| 2661 chr22 11843530 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=1;GPV=0.0006345;SPV=0.76914 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:25,6:17,6:8,0 0/1:.:26:22,4:16,2:6,2 | |
| 2662 chr22 11843867 . A G . PASS DP=145;SS=1;SSC=1;GPV=2.0843e-05;SPV=0.63442 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:76:68,8:30,4:38,4 0/1:.:69:62,7:26,1:36,6 | |
| 2663 chr22 11844292 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=2;GPV=7.4863e-07;SPV=0.60645 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:17,8:6,4:11,4 0/1:.:31:21,10:2,4:19,6 | |
| 2664 chr22 11844293 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=2;GPV=4.3766e-06;SPV=0.61597 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:20,8:6,4:14,4 0/1:.:28:20,8:1,4:19,4 | |
| 2665 chr22 11844297 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=1.3682e-07;SPV=0.57178 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:20,10:6,4:14,6 0/1:.:29:19,10:1,5:18,5 | |
| 2666 chr22 11844494 . T A . PASS DP=36;SS=1;SSC=1;GPV=1.6935e-15;SPV=0.71324 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:3,19:0,10:3,9 1/1:.:14:2,12:0,4:2,8 | |
| 2667 chr22 11844495 . A C . PASS DP=32;SS=1;SSC=6;GPV=1.3219e-10;SPV=0.24154 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:6,12:1,8:5,4 1/1:.:13:2,11:0,4:2,7 | |
| 2668 chr22 11844647 . A G . PASS DP=28;SS=1;SSC=1;GPV=4.7015e-12;SPV=0.75556 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:2,13:1,1:1,12 1/1:.:13:2,11:2,2:0,9 | |
| 2669 chr22 11845685 . G A . PASS DP=46;SOMATIC;SS=2;SSC=14;GPV=1;SPV=0.037638 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:21:19,2:17,0:2,2 0/1:.:25:16,9:9,6:7,3 | |
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| 2671 chr22 11846564 . A T . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=4.9388e-09;SPV=0.99411 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:24,15:8,6:16,9 0/1:.:57:47,10:16,5:31,5 | |
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| 2722 chr22 11859943 . T C . PASS DP=21;SS=1;SSC=1;GPV=4.7003e-10;SPV=0.78571 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:1,10:0,1:1,9 1/1:.:10:1,9:0,0:1,9 | |
| 2723 chr22 11861853 . A C . PASS DP=34;SS=1;SSC=0;GPV=0.000451;SPV=0.9967 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:9,8:7,2:2,6 0/1:.:17:15,2:9,1:6,1 | |
| 2724 chr22 11862021 . T C . PASS DP=29;SS=1;SSC=0;GPV=0.0051909;SPV=0.94917 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:7,4:0,1:7,3 0/1:.:18:15,3:1,0:14,3 | |
| 2725 chr22 11862800 . G T . PASS DP=176;SS=1;SSC=1;GPV=5.5282e-08;SPV=0.67101 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:73:63,10:27,4:36,6 0/1:.:103:90,13:36,7:54,6 | |
| 2726 chr22 11862897 . T G . PASS DP=69;SS=1;SSC=11;GPV=2.9938e-27;SPV=0.079321 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:7,18:3,2:4,16 1/1:.:44:5,39:3,8:2,31 | |
| 2727 chr22 11862930 . G C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=0.001503;SPV=0.85582 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:21,4:9,1:12,3 0/1:.:48:43,5:17,2:26,3 | |
| 2728 chr22 11862979 . T C . PASS DP=106;SOMATIC;SS=2;SSC=14;GPV=1;SPV=0.037346 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:47:45,2:29,1:16,1 0/1:.:59:49,10:33,8:16,2 | |
| 2729 chr22 11863111 . G T . PASS DP=138;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.79407 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:9,44:3,32:6,12 1/1:.:85:18,67:13,48:5,19 | |
| 2730 chr22 11863204 . G A . PASS DP=157;SS=1;SSC=4;GPV=0;SPV=0.32145 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:18,40:3,21:15,19 0/1:.:99:26,73:10,36:16,37 | |
| 2731 chr22 11863933 . A G . PASS DP=145;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.75309 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:10,39:0,12:10,27 1/1:.:96:23,73:5,18:18,55 | |
| 2732 chr22 11864018 . C A . PASS DP=108;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.64001 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:1,42:0,14:1,28 1/1:.:65:1,64:0,20:1,44 | |
| 2733 chr22 11865086 . C A . PASS DP=97;SS=1;SSC=1;GPV=1.1809e-35;SPV=0.75145 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:7,31:5,19:2,12 1/1:.:59:13,46:5,25:8,21 | |
| 2734 chr22 11865154 . G A . PASS DP=107;SS=1;SSC=0;GPV=4.8028e-32;SPV=0.82435 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:9,29:4,13:5,16 0/1:.:66:19,44:13,31:6,13 | |
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| 2791 chr22 11872952 . C G . PASS DP=252;SS=1;SSC=0;GPV=2.9887e-16;SPV=0.94681 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:118:91,27:52,13:39,14 0/1:.:134:113,21:59,12:54,9 | |
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| 2795 chr22 11873651 . T C . PASS DP=120;SS=1;SSC=3;GPV=2.1377e-11;SPV=0.44109 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:39,13:24,9:15,4 0/1:.:68:49,19:27,13:22,6 | |
| 2796 chr22 11873802 . T A . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=8.4848e-13;SPV=0.90028 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:6,15:4,10:2,5 0/1:.:26:11,15:8,12:3,3 | |
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| 2918 chr22 11891442 . T G . PASS DP=132;SS=1;SSC=8;GPV=2.903e-16;SPV=0.15254 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:30,11:14,6:16,5 0/1:.:90:56,34:24,17:32,17 | |
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| 2923 chr22 11892200 . T G . PASS DP=160;SS=1;SSC=6;GPV=2.2496e-09;SPV=0.21125 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:43,6:20,2:23,4 0/1:.:111:90,21:39,15:51,6 | |
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| 2977 chr22 11899514 . G A . PASS DP=154;SS=1;SSC=0;GPV=1.0562e-06;SPV=0.81072 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:47,8:15,5:32,3 0/1:.:99:88,11:24,6:64,5 | |
| 2978 chr22 11899774 . A T . PASS DP=122;SS=1;SSC=4;GPV=7.3777e-17;SPV=0.37389 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:30,16:17,8:13,8 0/1:.:76:46,30:28,13:18,17 | |
| 2979 chr22 11899878 . C T . PASS DP=116;SS=1;SSC=8;GPV=3.5925e-16;SPV=0.15653 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:31,14:18,7:13,7 0/1:.:71:41,30:23,18:18,12 | |
| 2980 chr22 11899955 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,20:0,10 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
| 2981 chr22 11900025 . C G . PASS DP=173;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:68:0,68:0,43:0,25 1/1:.:105:0,105:0,67:0,38 | |
| 2982 chr22 11900134 . T A . PASS DP=306;SS=1;SSC=5;GPV=0;SPV=0.27102 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:113:64,49:41,28:23,21 0/1:.:193:101,92:50,63:51,29 | |
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| 2984 chr22 11900779 . G T . PASS DP=651;SS=1;SSC=3;GPV=0;SPV=0.40809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:232:150,82:77,39:73,43 0/1:.:419:265,153:126,81:139,72 | |
| 2985 chr22 11901013 . G C . PASS DP=406;SS=1;SSC=8;GPV=6.6748e-24;SPV=0.14285 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:155:132,23:76,12:56,11 0/1:.:251:202,49:107,29:95,20 | |
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| 3046 chr22 11907784 . C T . PASS DP=169;SS=1;SSC=3;GPV=1.5218e-13;SPV=0.42842 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:78:61,17:32,4:29,13 0/1:.:91:69,22:41,9:28,13 | |
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| 3048 chr22 11907850 . A G . PASS DP=189;SS=1;SSC=1;GPV=5.3035e-24;SPV=0.72384 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:89:56,33:25,12:31,21 0/1:.:100:66,34:35,14:31,20 | |
| 3049 chr22 11908122 . G C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.5807e-10;SPV=0.8686 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:10,5:6,9 0/1:.:36:23,13:18,6:5,7 | |
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| 3098 chr22 11914143 . T C . PASS DP=206;SS=1;SSC=0;GPV=2.7235e-12;SPV=0.96134 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:113:89,24:33,7:56,17 0/1:.:93:81,12:39,9:42,3 | |
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| 3101 chr22 11914315 . T G . PASS DP=154;SS=1;SSC=0;GPV=1.1525e-13;SPV=0.96119 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:78:54,24:42,14:12,10 0/1:.:76:61,15:37,8:24,7 | |
| 3102 chr22 11914359 . T G . PASS DP=200;SS=1;SSC=0;GPV=5.7004e-12;SPV=0.84981 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:107:86,21:60,13:26,8 0/1:.:93:79,14:45,8:34,6 | |
| 3103 chr22 11914424 . G C . PASS DP=253;SS=1;SSC=2;GPV=6.7319e-16;SPV=0.59472 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:144:117,27:79,22:38,5 0/1:.:109:89,20:50,16:39,4 | |
| 3104 chr22 11914492 . C G . PASS DP=240;SS=1;SSC=4;GPV=7.3184e-28;SPV=0.32773 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:134:92,42:60,25:32,17 0/1:.:106:69,37:47,18:22,19 | |
| 3105 chr22 11914522 . A G . PASS DP=282;SS=1;SSC=11;GPV=9.50501e-42;SPV=0.077435 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:165:104,61:60,46:44,15 0/1:.:117:63,54:30,44:33,10 | |
| 3106 chr22 11914787 . T C . PASS DP=473;SS=1;SSC=9;GPV=2.3727e-17;SPV=0.11058 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:256:232,24:121,13:111,11 0/1:.:217:188,29:99,16:89,13 | |
| 3107 chr22 11914832 . T C . PASS DP=492;SS=1;SSC=3;GPV=1.1092e-34;SPV=0.45908 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:260:206,54:91,28:115,26 0/1:.:232:182,50:86,30:96,20 | |
| 3108 chr22 11914838 . G A . PASS DP=511;SS=1;SSC=4;GPV=2.4196e-29;SPV=0.32602 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:278:232,46:106,20:126,26 0/1:.:233:190,43:94,24:96,19 | |
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| 3164 chr22 11920967 . G A . PASS DP=489;SS=1;SSC=2;GPV=5.5538e-18;SPV=0.5904 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:264:234,30:122,16:112,14 0/1:.:225:200,25:98,15:102,10 | |
| 3165 chr22 11920998 . G C . PASS DP=543;SS=1;SSC=0;GPV=1.5906e-27;SPV=0.81637 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:289:241,48:128,29:113,19 0/1:.:254:218,36:109,20:109,16 | |
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| 3167 chr22 11921228 . T C . PASS DP=532;SS=1;SSC=10;GPV=2.8026e-45;SPV=0.0812 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:312:215,71:96,31:119,40 0/1:.:220:138,62:57,29:81,33 | |
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| 3169 chr22 11921291 . C G . PASS DP=634;SS=1;SSC=11;GPV=1.0814e-33;SPV=0.074895 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:370:317,53:175,26:142,27 0/1:.:264:214,50:130,26:84,24 | |
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| 3225 chr22 11928790 . G A . PASS DP=665;SS=1;SSC=1;GPV=2.8026e-45;SPV=0.71636 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:352:277,75:140,38:137,37 0/1:.:313:251,62:127,29:124,33 | |
| 3226 chr22 11928797 . C T . PASS DP=655;SS=1;SSC=2;GPV=1.141e-35;SPV=0.56245 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:341:284,57:141,27:143,30 0/1:.:314:262,52:138,22:124,30 | |
| 3227 chr22 11928808 . G C . PASS DP=656;SS=1;SSC=10;GPV=0;SPV=0.082188 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:351:249,102:112,49:137,53 0/1:.:305:200,105:107,50:93,55 | |
| 3228 chr22 11928883 . T G . PASS DP=589;SS=1;SSC=3;GPV=3.6105e-33;SPV=0.46936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:314:261,53:129,23:132,30 0/1:.:275:227,48:133,24:94,24 | |
| 3229 chr22 11928947 . C T . PASS DP=650;SS=1;SSC=7;GPV=2.6678e-33;SPV=0.19827 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:315:270,45:133,25:137,20 0/1:.:335:278,57:151,32:127,25 | |
| 3230 chr22 11929058 . G T . PASS DP=652;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.75101 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:309:173,136:89,78:84,58 0/1:.:343:200,143:104,88:96,55 | |
| 3231 chr22 11929106 . C G . PASS DP=717;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.86591 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:336:81,226:33,97:48,129 0/1:.:381:102,238:41,101:61,137 | |
| 3232 chr22 11929113 . G C . PASS DP=703;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.9536 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:335:160,109:79,51:81,58 0/1:.:368:183,94:69,48:114,46 | |
| 3233 chr22 11929296 . A G . PASS DP=504;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:242:0,242:0,124:0,118 1/1:.:262:0,262:0,137:0,125 | |
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| 3285 chr22 11934884 . C T . PASS DP=273;SS=1;SSC=2;GPV=2.9842e-18;SPV=0.5614 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:147:117,29:55,8:62,21 0/1:.:126:101,25:50,9:51,16 | |
| 3286 chr22 11934935 . T G . PASS DP=221;SS=1;SSC=8;GPV=8.3242e-21;SPV=0.1544 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:110:84,26:26,11:58,15 0/1:.:111:77,34:34,16:43,18 | |
| 3287 chr22 11935111 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=4;GPV=4.8802e-11;SPV=0.32586 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:32,14:12,2:20,12 0/1:.:43:27,16:12,2:15,14 | |
| 3288 chr22 11935138 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=5.0119e-12;SPV=0.80706 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:10,7:14,11 0/1:.:39:25,14:3,9:22,5 | |
| 3289 chr22 11935233 . C G . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=1.0795e-10;SPV=0.93686 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:29,19:12,10:17,9 0/1:.:38:28,10:12,2:16,8 | |
| 3290 chr22 11935307 . A G . PASS DP=127;SS=1;SSC=0;GPV=4.5264e-12;SPV=0.99527 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:38,22:17,18:21,4 0/1:.:67:55,12:29,7:26,5 | |
| 3291 chr22 11935349 . C T . PASS DP=170;SS=1;SSC=9;GPV=2.4287e-09;SPV=0.12011 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:90:79,11:49,8:30,3 0/1:.:80:64,16:39,8:25,8 | |
| 3292 chr22 11935356 . G T . PASS DP=181;SS=1;SSC=0;GPV=7.2777e-18;SPV=0.98642 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:99:65,34:39,25:26,9 0/1:.:82:65,17:40,9:25,8 | |
| 3293 chr22 11935397 . G A . PASS DP=220;SOMATIC;SS=2;SSC=20;GPV=1;SPV=0.0082405 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:116:113,3:85,0:28,3 0/1:.:104:92,12:57,4:35,8 | |
| 3294 chr22 11935435 . C G . PASS DP=228;SS=1;SSC=8;GPV=7.0828e-12;SPV=0.15199 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:132:115,17:82,9:33,8 0/1:.:96:78,18:50,9:28,9 | |
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| 3348 chr22 11943445 . G A . PASS DP=278;SS=1;SSC=2;GPV=3.5501e-17;SPV=0.62871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:155:126,29:59,8:67,21 0/1:.:123:101,22:43,7:58,15 | |
| 3349 chr22 11943731 . C A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=2.7526e-17;SPV=0.83126 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:9,15:11,10 0/1:.:40:21,19:7,11:14,8 | |
| 3350 chr22 11944562 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=1.5858e-07;SPV=0.44401 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:26,11:11,4:15,7 0/1:.:26:17,9:11,1:6,8 | |
| 3351 chr22 11944656 . C T . PASS DP=22;SS=1;SSC=0;GPV=4.7526e-13;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,6:0,5 1/1:.:11:0,11:0,4:0,7 | |
| 3352 chr22 11945239 . T G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,14:0,9 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 3353 chr22 11945927 . G A . PASS DP=97;SS=1;SSC=6;GPV=5.3897e-27;SPV=0.22055 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:22,36:10,15:12,21 0/1:.:39:11,28:5,16:6,12 | |
| 3354 chr22 11946197 . T C . PASS DP=146;SS=1;SSC=0;GPV=1.9401e-20;SPV=0.92456 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:87:50,37:30,23:20,14 0/1:.:59:40,19:27,8:13,11 | |
| 3355 chr22 11946199 . C T . PASS DP=136;SS=1;SSC=0;GPV=2.2484e-17;SPV=0.85955 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:78:48,30:27,22:21,8 0/1:.:58:40,18:25,7:15,11 | |
| 3356 chr22 11946432 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=6.2136e-19;SPV=0.75751 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:16,27:9,17:7,10 0/1:.:33:14,19:9,10:5,9 | |
| 3357 chr22 11946448 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,24:0,22 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
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| 3404 chr22 11955232 . A T . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,24:0,15:0,9 0/1:.:46:0,30:0,19:0,11 | |
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| 3406 chr22 11956615 . C T . PASS DP=113;SS=1;SSC=0;GPV=5.5142e-10;SPV=0.87509 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:43,17:17,15:26,2 0/1:.:53:42,11:17,6:25,5 | |
| 3407 chr22 11956702 . G T . PASS DP=166;SS=1;SSC=5;GPV=2.4342e-08;SPV=0.2543 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:83:73,10:35,2:38,8 0/1:.:83:69,14:28,4:41,10 | |
| 3408 chr22 11957505 . G A . PASS DP=157;SS=1;SSC=9;GPV=2.3026e-08;SPV=0.11932 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:86:76,10:50,8:26,2 0/1:.:71:57,14:27,11:30,3 | |
| 3409 chr22 11957531 . A G . PASS DP=169;SS=1;SSC=5;GPV=5.0075e-10;SPV=0.29828 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:92:78,14:48,12:30,2 0/1:.:77:62,15:31,10:31,5 | |
| 3410 chr22 11958035 . T C . PASS DP=110;SS=1;SSC=1;GPV=3.154e-25;SPV=0.77955 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:22,33:8,11:14,22 0/1:.:55:25,30:16,10:9,20 | |
| 3411 chr22 11958526 . T C . PASS DP=117;SS=1;SSC=6;GPV=8.6575e-27;SPV=0.24057 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:67:31,36:21,29:10,7 0/1:.:50:19,31:16,24:3,7 | |
| 3412 chr22 11958596 . T G . PASS DP=136;SS=1;SSC=2;GPV=1.4691e-29;SPV=0.51955 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:75:34,41:25,30:9,11 0/1:.:61:27,34:20,24:7,10 | |
| 3413 chr22 11958722 . G A . PASS DP=214;SS=1;SSC=3;GPV=2.3848e-24;SPV=0.47665 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:120:82,38:59,15:23,23 0/1:.:94:63,31:48,15:15,16 | |
| 3414 chr22 11958769 . T C . PASS DP=198;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:111:0,111:0,60:0,51 1/1:.:87:0,87:0,52:0,35 | |
| 3415 chr22 11958784 . C A . PASS DP=211;SS=1;SSC=4;GPV=8.4642e-27;SPV=0.38376 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:114:75,39:48,12:27,27 0/1:.:97:61,36:41,15:20,21 | |
| 3416 chr22 11958805 . A G . PASS DP=216;SS=1;SSC=2;GPV=4.128e-20;SPV=0.51884 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:113:83,30:38,23:45,7 0/1:.:103:75,28:43,21:32,7 | |
| 3417 chr22 11958955 . G A . PASS DP=196;SS=1;SSC=6;GPV=1.0172e-26;SPV=0.21883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:101:66,35:20,23:46,12 0/1:.:95:56,39:20,18:36,21 | |
| 3418 chr22 11959473 . A G . PASS DP=112;SS=1;SSC=2;GPV=6.5212e-26;SPV=0.52065 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:24,34:13,21:11,13 0/1:.:54:20,30:12,16:8,14 | |
| 3419 chr22 11959774 . T C . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:63:0,63:0,38:0,25 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 | |
| 3420 chr22 11960230 . C T . PASS DP=101;SS=1;SSC=10;GPV=6.8481e-25;SPV=0.097479 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:27,32:11,8:16,24 0/1:.:42:13,29:9,9:4,20 | |
| 3421 chr22 11960711 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=5;GPV=3.1349e-21;SPV=0.29982 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:7,13:12,11 0/1:.:44:16,28:6,14:10,14 | |
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| 3423 chr22 11960824 . T G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.2528e-17;SPV=0.89937 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:12,24:4,10:8,14 0/1:.:33:15,18:8,5:7,13 | |
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| 3451 chr22 11970047 . C T . PASS DP=115;SS=1;SSC=3;GPV=1.8741e-05;SPV=0.41171 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:47,6:12,5:35,1 0/1:.:62:53,9:9,2:44,7 | |
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| 3471 chr22 11975668 . C A . PASS DP=102;SS=1;SSC=2;GPV=1.2862e-08;SPV=0.55858 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:43,13:27,11:16,2 0/1:.:46:35,11:21,5:14,6 | |
| 3472 chr22 11975783 . C T . PASS DP=128;SS=1;SSC=0;GPV=1.4343e-13;SPV=0.91936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:67:44,23:14,14:30,9 0/1:.:61:46,15:16,4:30,11 | |
| 3473 chr22 11975796 . C A . PASS DP=133;SS=1;SSC=0;GPV=1.6281e-16;SPV=0.85644 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:74:40,28:13,15:27,13 0/1:.:59:34,17:11,5:23,12 | |
| 3474 chr22 11975999 . A G . PASS DP=129;SS=1;SSC=2;GPV=1.2182e-23;SPV=0.56415 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:75:39,36:16,14:23,22 0/1:.:54:28,26:12,10:16,16 | |
| 3475 chr22 11976021 . T C . PASS DP=132;SS=1;SSC=1;GPV=9.4982e-07;SPV=0.75988 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:77:65,12:20,6:45,6 0/1:.:55:48,7:16,4:32,3 | |
| 3476 chr22 11976081 . G T . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=0.00015831;SPV=0.46335 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:45,7:12,5:33,2 0/1:.:30:25,5:7,3:18,2 | |
| 3477 chr22 11976101 . G A . PASS DP=49;SS=1;SSC=4;GPV=3.0726e-08;SPV=0.3449 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:3,3:17,10 0/1:.:16:8,8:0,2:8,6 | |
| 3478 chr22 11976103 . T C . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,6:0,27 1/1:.:16:0,16:0,2:0,14 | |
| 3479 chr22 11976156 . T C . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,6:0,16 1/1:.:10:0,10:0,3:0,7 | |
| 3480 chr22 11976616 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=2.3876e-10;SPV=0.62502 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:25,13:18,8:7,5 0/1:.:45:30,15:24,11:6,4 | |
| 3481 chr22 11976702 . G C . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=8.4556e-18;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,16:0,7:0,9 0/1:.:22:0,14:0,9:0,5 | |
| 3482 chr22 11976955 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.7459e-24;SPV=0.8686 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:1,28:1,19:0,9 1/1:.:17:1,16:0,8:1,8 | |
| 3483 chr22 11977035 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=3;GPV=5.6945e-14;SPV=0.45154 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:14,9:6,12 0/1:.:25:11,14:5,6:6,8 | |
| 3484 chr22 11977152 . G A . PASS DP=245;SS=1;SSC=1;GPV=7.7236e-10;SPV=0.72582 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:135:118,17:60,10:58,7 0/1:.:110:98,12:48,6:50,6 | |
| 3485 chr22 11977241 . A C . PASS DP=268;SS=1;SSC=2;GPV=8.7053e-11;SPV=0.51406 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:154:136,18:60,9:76,9 0/1:.:114:100,14:43,6:57,8 | |
| 3486 chr22 11977385 . A G . PASS DP=141;SS=1;SSC=4;GPV=2.0606e-05;SPV=0.37616 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:85:77,8:8,1:69,7 0/1:.:56:49,7:2,1:47,6 | |
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| 3488 chr22 12028973 . G T . PASS DP=221;SS=1;SSC=6;GPV=0;SPV=0.20782 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:15,29:10,18:5,11 0/1:.:177:47,130:30,87:17,43 | |
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| 3596 chr22 12047098 . T G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.9649e-07;SPV=0.92373 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:15,8:9,4:6,4 0/1:.:50:39,11:10,6:29,5 | |
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| 3598 chr22 12047416 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=9.3266e-08;SPV=0.98635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:4,7:2,1:2,6 0/1:.:40:27,13:9,5:18,8 | |
| 3599 chr22 12047468 . A T . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=0.00011358;SPV=0.86801 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:11,5:4,4:7,1 0/1:.:33:26,7:14,3:12,4 | |
| 3600 chr22 12047492 . A G . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=2.2598e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,10:0,5 1/1:.:21:0,21:0,11:0,10 | |
| 3601 chr22 12047959 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=2.3225e-05;SPV=0.65014 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:14,5:9,1:5,4 0/1:.:35:26,9:9,2:17,7 | |
| 3602 chr22 12048098 . C A . PASS DP=24;SS=1;SSC=0;GPV=3.101e-14;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:0,8:0,7:0,1 1/1:.:16:0,16:0,12:0,4 | |
| 3603 chr22 12048546 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=6;GPV=7.3426e-09;SPV=0.24755 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:17,5:9,3:8,2 0/1:.:56:37,19:17,14:20,5 | |
| 3604 chr22 12048633 . T A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=0.0014972;SPV=0.90891 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:18,4:8,2:10,2 0/1:.:50:45,5:25,4:20,1 | |
| 3605 chr22 12048656 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,10:0,6 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 | |
| 3606 chr22 12048852 . C G . PASS DP=142;SS=1;SSC=3;GPV=1.0874e-11;SPV=0.46384 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:23,7:15,3:8,4 0/1:.:110:72,26:51,19:21,7 | |
| 3607 chr22 12048865 . C T . PASS DP=151;SS=1;SSC=16;GPV=1;SPV=0.021668 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:27,7:15,6:12,1 0/1:.:117:69,48:46,37:23,11 | |
| 3608 chr22 12048992 . A C . PASS DP=138;SS=1;SSC=1;GPV=1.9947e-08;SPV=0.67977 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:31,7:19,6:12,1 0/1:.:100:83,17:52,11:31,6 | |
| 3609 chr22 12049052 . A T . PASS DP=192;SS=1;SSC=1;GPV=5.1901e-09;SPV=0.63234 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:37,7:26,6:11,1 0/1:.:140:104,19:71,15:33,4 | |
| 3610 chr22 12049069 . C A . PASS DP=222;SS=1;SSC=0;GPV=6.9876e-11;SPV=0.82497 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:48,10:34,9:14,1 0/1:.:164:142,22:87,19:55,3 | |
| 3611 chr22 12049101 . T C . PASS DP=285;SS=1;SSC=0;GPV=4.4736e-12;SPV=0.86649 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:77:65,12:45,10:20,2 0/1:.:208:184,24:118,14:66,10 | |
| 3612 chr22 12049134 . A C . PASS DP=321;SS=1;SSC=0;GPV=5.3169e-16;SPV=0.87468 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:76:62,14:42,10:20,4 0/1:.:245:211,34:131,24:80,10 | |
| 3613 chr22 12049154 . C T . PASS DP=359;SS=1;SSC=2;GPV=4.4495e-27;SPV=0.60534 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:82:61,19:38,15:23,4 0/1:.:277:202,61:119,41:83,20 | |
| 3614 chr22 12049221 . G A . PASS DP=362;SS=1;SSC=3;GPV=8.2538e-25;SPV=0.46925 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:92:74,18:32,14:42,4 0/1:.:270:214,56:118,26:96,30 | |
| 3615 chr22 12049238 . T C . PASS DP=345;SS=1;SSC=1;GPV=5.00978e-41;SPV=0.74867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:87:53,32:21,17:32,15 0/1:.:258:160,84:82,39:78,45 | |
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| 3617 chr22 12049455 . G A . PASS DP=174;SS=1;SSC=3;GPV=5.4338e-09;SPV=0.45896 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:45,7:10,4:35,3 0/1:.:122:103,19:21,4:82,15 | |
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| 3665 chr22 12057734 . C T . PASS DP=275;SS=1;SSC=3;GPV=1.2766e-31;SPV=0.47552 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:97:66,31:44,19:22,12 0/1:.:178:119,59:69,36:50,23 | |
| 3666 chr22 12057866 . G A . PASS DP=367;SS=1;SSC=4;GPV=0;SPV=0.36807 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:123:75,47:31,16:44,31 0/1:.:244:144,100:57,45:87,55 | |
| 3667 chr22 12057867 . G A . PASS DP=361;SS=1;SSC=4;GPV=4.1297e-24;SPV=0.39039 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:123:100,23:43,9:57,14 0/1:.:238:189,49:80,21:109,28 | |
| 3668 chr22 12058025 . T G . PASS DP=114;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,9:0,42 1/1:.:63:0,63:0,14:0,49 | |
| 3669 chr22 12058518 . A T . PASS DP=35;SS=1;SSC=2;GPV=0.0010857;SPV=0.61899 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:12,4:9,3:3,1 0/1:.:19:14,5:9,2:5,3 | |
| 3670 chr22 12058790 . C T . PASS DP=148;SS=1;SSC=3;GPV=1.8116e-14;SPV=0.47572 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:71:52,19:38,11:14,8 0/1:.:77:55,22:36,13:19,9 | |
| 3671 chr22 12058923 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0.00015455;SPV=0.90155 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:34,8:13,5:21,3 0/1:.:36:32,4:12,1:20,3 | |
| 3672 chr22 12060195 . G A . PASS DP=21;SS=1;SSC=0;GPV=1.8578e-12;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,3:0,6 1/1:.:12:0,12:0,5:0,7 | |
| 3673 chr22 12060300 . A G . PASS DP=30;SS=1;SSC=0;GPV=2.3178e-05;SPV=0.99125 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:7,10:3,6:4,4 0/1:.:13:10,3:4,2:6,1 | |
| 3674 chr22 12060762 . C G . PASS DP=42;SS=1;SSC=9;GPV=1.6656e-05;SPV=0.11348 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:15,4:6,0:9,4 0/1:.:23:13,10:5,2:8,8 | |
| 3675 chr22 12064328 . T A . PASS DP=292;SS=1;SSC=2;GPV=8.9655e-10;SPV=0.53086 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:154:139,15:57,5:82,10 0/1:.:138:124,14:53,6:71,8 | |
| 3676 chr22 12069045 . C T . PASS DP=36;SS=1;SSC=6;GPV=2.3419e-08;SPV=0.22282 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:5,3:1,1:4,2 0/1:.:28:11,17:4,9:7,8 | |
| 3677 chr22 12069697 . T C . PASS DP=161;SS=1;SSC=0;GPV=1.0442e-14;SPV=0.99864 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:18,10:6,8 0/1:.:119:95,24:64,14:31,10 | |
| 3678 chr22 12069792 . C A . PASS DP=160;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,26:0,23 1/1:.:111:0,111:0,59:0,52 | |
| 3679 chr22 12069979 . C T . PASS DP=156;SS=1;SSC=2;GPV=8.8975e-11;SPV=0.60427 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:36,9:16,3:20,6 0/1:.:111:89,22:49,10:40,12 | |
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| 3681 chr22 12070251 . C T . PASS DP=133;SS=1;SSC=10;GPV=3.848e-09;SPV=0.098668 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:37,5:20,1:17,4 0/1:.:91:70,21:41,10:29,11 | |
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| 3731 chr22 12077272 . C T . PASS DP=335;SS=1;SSC=8;GPV=2.7053e-15;SPV=0.14596 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:195:172,23:87,5:85,18 0/1:.:140:117,23:52,5:65,18 | |
| 3732 chr22 12077281 . C T . PASS DP=331;SS=1;SSC=1;GPV=1.1543e-17;SPV=0.6492 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:195:163,32:81,11:82,21 0/1:.:136:115,21:47,8:68,13 | |
| 3733 chr22 12077282 . G A . PASS DP=327;SS=1;SSC=2;GPV=1.5598e-22;SPV=0.58347 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:189:150,39:67,19:83,20 0/1:.:138:110,28:46,13:64,15 | |
| 3734 chr22 12077428 . A C . PASS DP=255;SS=1;SSC=1;GPV=7.321e-35;SPV=0.68869 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:133:81,52:27,15:54,37 0/1:.:122:77,45:35,13:42,32 | |
| 3735 chr22 12077474 . G A . PASS DP=230;SS=1;SSC=0;GPV=3.2838e-22;SPV=0.83287 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:123:86,37:38,19:48,18 0/1:.:107:80,27:38,12:42,15 | |
| 3736 chr22 12077640 . C T . PASS DP=231;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.02725 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:124:47,77:21,44:26,33 0/1:.:107:27,80:17,48:10,32 | |
| 3737 chr22 12077703 . G A . PASS DP=232;SS=1;SSC=10;GPV=0;SPV=0.099711 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:121:49,72:25,34:24,38 0/1:.:111:35,76:18,40:17,36 | |
| 3738 chr22 12077881 . T G . PASS DP=199;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:107:0,107:0,49:0,58 1/1:.:92:0,92:0,45:0,47 | |
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| 3740 chr22 12077940 . T G . PASS DP=206;SS=1;SSC=1;GPV=1.6132e-22;SPV=0.77414 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:103:69,34:27,12:42,22 0/1:.:103:73,30:33,12:40,18 | |
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| 3742 chr22 12078082 . G A . PASS DP=305;SS=1;SSC=8;GPV=4.0818e-09;SPV=0.14115 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:160:149,11:79,5:70,6 0/1:.:145:129,16:79,6:50,10 | |
| 3743 chr22 12078106 . T G . PASS DP=297;SS=1;SSC=1;GPV=2.43658e-41;SPV=0.723 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:155:93,62:55,26:38,36 0/1:.:142:89,53:56,25:33,28 | |
| 3744 chr22 12078216 . T A . PASS DP=213;SS=1;SSC=3;GPV=5.9749e-07;SPV=0.47779 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:113:103,10:55,4:48,6 0/1:.:100:90,10:46,7:44,3 | |
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| 3798 chr22 12084957 . T A . PASS DP=161;SS=1;SSC=9;GPV=1.0695e-24;SPV=0.12352 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:42,23:30,10:12,13 0/1:.:96:52,44:37,29:15,15 | |
| 3799 chr22 12085244 . G A . PASS DP=161;SS=1;SSC=0;GPV=5.0866e-07;SPV=0.88064 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:55,10:32,9:23,1 0/1:.:96:86,10:60,6:26,4 | |
| 3800 chr22 12085269 . T C . PASS DP=176;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:86:0,86:0,48:0,38 1/1:.:90:0,90:0,57:0,33 | |
| 3801 chr22 12085379 . G C . PASS DP=160;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:66:0,66:0,32:0,34 1/1:.:94:0,94:0,43:0,51 | |
| 3802 chr22 12085419 . T C . PASS DP=185;SS=1;SSC=0;GPV=1.7052e-24;SPV=0.89611 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:80:47,33:28,17:19,16 0/1:.:105:70,35:36,14:34,21 | |
| 3803 chr22 12085626 . T C . PASS DP=195;SS=1;SSC=1;GPV=1.3118e-09;SPV=0.63987 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:88:75,13:44,6:31,7 0/1:.:107:92,15:50,8:42,7 | |
| 3804 chr22 12085666 . C T . PASS DP=240;SS=1;SSC=0;GPV=2.42144e-42;SPV=0.82519 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:106:53,53:33,34:20,19 0/1:.:134:74,60:47,32:27,28 | |
| 3805 chr22 12086047 . C G . PASS DP=180;SS=1;SSC=4;GPV=9.2302e-22;SPV=0.38427 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:78:53,25:30,8:23,17 0/1:.:102:66,36:30,15:36,21 | |
| 3806 chr22 12086149 . C T . PASS DP=163;SS=1;SSC=1;GPV=2.3044e-09;SPV=0.65181 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:58,12:30,5:28,7 0/1:.:93:78,15:35,7:43,8 | |
| 3807 chr22 12086419 . A T . PASS DP=140;SS=1;SSC=2;GPV=4.1394e-16;SPV=0.62476 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:39,19:21,9:18,10 0/1:.:82:56,26:23,16:33,10 | |
| 3808 chr22 12086876 . G A . PASS DP=130;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,23:0,20 1/1:.:87:0,87:0,46:0,41 | |
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| 3810 chr22 12087439 . T C . PASS DP=142;SS=1;SSC=3;GPV=7.2786e-17;SPV=0.44748 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:37,17:22,8:15,9 0/1:.:88:58,30:35,18:23,12 | |
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| 3865 chr22 12094921 . C T . PASS DP=172;SS=1;SSC=4;GPV=1.1643e-08;SPV=0.39478 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:97:84,13:44,4:40,9 0/1:.:75:63,12:26,8:37,4 | |
| 3866 chr22 12095172 . T C . PASS DP=194;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:108:0,108:0,51:0,57 1/1:.:86:0,86:0,51:0,35 | |
| 3867 chr22 12095300 . T C . PASS DP=209;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:110:0,110:0,56:0,54 1/1:.:99:0,99:0,45:0,54 | |
| 3868 chr22 12095317 . C T . PASS DP=193;SS=1;SSC=9;GPV=1.2646e-07;SPV=0.10327 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:99:91,8:45,7:46,1 0/1:.:94:80,14:34,8:46,6 | |
| 3869 chr22 12095411 . T C . PASS DP=189;SS=1;SSC=3;GPV=8.9314e-37;SPV=0.46021 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:106:53,53:25,26:28,27 0/1:.:83:40,43:19,21:21,22 | |
| 3870 chr22 12095509 . G A . PASS DP=214;SS=1;SSC=9;GPV=1.2997e-29;SPV=0.11678 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:127:83,44:39,20:44,24 0/1:.:87:49,38:17,25:32,13 | |
| 3871 chr22 12095535 . A G . PASS DP=223;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:130:0,130:0,68:0,62 1/1:.:93:0,93:0,50:0,43 | |
| 3872 chr22 12095618 . G T . PASS DP=223;SS=1;SSC=4;GPV=1.3904e-28;SPV=0.36925 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:119:78,41:37,12:41,29 0/1:.:104:65,39:26,23:39,16 | |
| 3873 chr22 12095880 . A G . PASS DP=203;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:97:0,97:0,55:0,42 1/1:.:106:0,106:0,48:0,58 | |
| 3874 chr22 12095888 . G T . PASS DP=201;SS=1;SSC=6;GPV=1.6619e-39;SPV=0.22141 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:98:51,47:27,27:24,20 0/1:.:103:47,56:15,30:32,26 | |
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| 3926 chr22 12104165 . C G . PASS DP=431;SS=1;SSC=0;GPV=1.9912e-21;SPV=0.83 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:252:211,41:98,22:113,19 0/1:.:179:155,24:84,8:71,16 | |
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| 3930 chr22 12104379 . G A . PASS DP=386;SS=1;SSC=1;GPV=7.5749e-17;SPV=0.6867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:211:182,29:73,18:109,11 0/1:.:175:153,22:66,9:87,13 | |
| 3931 chr22 12104728 . A T . PASS DP=164;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:84:0,84:0,36:0,48 1/1:.:80:0,80:0,33:0,47 | |
| 3932 chr22 12104958 . C T . PASS DP=225;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:129:0,129:0,63:0,66 1/1:.:96:0,96:0,47:0,49 | |
| 3933 chr22 12104974 . A C . PASS DP=229;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:135:0,135:0,67:0,68 1/1:.:94:0,94:0,42:0,52 | |
| 3934 chr22 12104998 . T C . PASS DP=217;SS=1;SSC=9;GPV=0;SPV=0.11348 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:126:50,76:25,41:25,35 0/1:.:91:28,63:9,28:19,35 | |
| 3935 chr22 12105140 . C T . PASS DP=165;SS=1;SSC=8;GPV=1.0776e-42;SPV=0.14053 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:87:36,51:19,26:17,25 0/1:.:78:25,53:11,29:14,24 | |
| 3936 chr22 12105508 . G A . PASS DP=180;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:97:0,97:0,46:0,51 1/1:.:83:0,83:0,55:0,28 | |
| 3937 chr22 12105536 . A G . PASS DP=178;SS=1;SSC=1;GPV=1.1577e-18;SPV=0.63112 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:99:69,30:33,11:36,19 0/1:.:79:56,23:30,17:26,6 | |
| 3938 chr22 12105748 . T A . PASS DP=143;SS=1;SSC=1;GPV=9.4468e-09;SPV=0.66527 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:66:54,12:24,6:30,6 0/1:.:77:64,13:25,3:39,10 | |
| 3939 chr22 12105814 . A T . PASS DP=121;SS=1;SSC=2;GPV=7.8634e-05;SPV=0.54946 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:40,6:15,3:25,3 0/1:.:57:42,7:14,3:28,4 | |
| 3940 chr22 12105931 . T C . PASS DP=158;SS=1;SSC=0;GPV=1.4298e-18;SPV=0.83096 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:78:50,28:23,17:27,11 0/1:.:80:56,24:32,10:24,14 | |
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| 3942 chr22 12106012 . C T . PASS DP=156;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:68:0,68:0,34:0,34 1/1:.:88:0,88:0,51:0,37 | |
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| 3974 chr22 12111209 . C T . PASS DP=252;SS=1;SSC=2;GPV=1.878e-28;SPV=0.52617 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:147:100,47:64,25:36,22 0/1:.:105:71,34:42,24:29,10 | |
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| 3990 chr22 12113020 . G A . PASS DP=123;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:67:0,67:0,45:0,22 1/1:.:56:0,56:0,32:0,24 | |
| 3991 chr22 12113065 . A G . PASS DP=187;SS=1;SSC=6;GPV=2.4747e-11;SPV=0.22429 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:99:84,15:55,14:29,1 0/1:.:88:70,18:36,15:34,3 | |
| 3992 chr22 12113127 . C T . PASS DP=202;SS=1;SSC=5;GPV=5.817e-07;SPV=0.28379 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:118:108,10:74,7:34,3 0/1:.:84:74,10:47,8:27,2 | |
| 3993 chr22 12113174 . T C . PASS DP=222;SS=1;SSC=8;GPV=5.6371e-35;SPV=0.13799 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:130:78,51:59,31:19,20 0/1:.:92:48,44:29,21:19,23 | |
| 3994 chr22 12113271 . C A . PASS DP=252;SS=1;SSC=6;GPV=0;SPV=0.2271 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:136:59,77:38,44:21,33 0/1:.:116:44,72:26,42:18,30 | |
| 3995 chr22 12113348 . T G . PASS DP=240;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:126:0,126:0,66:0,60 1/1:.:114:0,114:0,71:0,43 | |
| 3996 chr22 12113656 . A G . PASS DP=248;SS=1;SSC=5;GPV=2.6079e-29;SPV=0.28493 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:154:105,49:55,23:50,26 0/1:.:94:60,34:22,13:38,21 | |
| 3997 chr22 12113661 . T C . PASS DP=254;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:158:0,158:0,82:0,76 1/1:.:96:0,96:0,37:0,59 | |
| 3998 chr22 12113998 . A G . PASS DP=265;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:149:0,149:0,82:0,67 1/1:.:116:0,116:0,72:0,44 | |
| 3999 chr22 12114028 . C T . PASS DP=235;SS=1;SSC=0;GPV=1.45875e-42;SPV=0.95414 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:127:60,67:32,38:28,29 0/1:.:108:62,46:36,26:26,20 | |
| 4000 chr22 12114258 . T C . PASS DP=265;SS=1;SSC=5;GPV=0;SPV=0.28454 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:152:15,137:8,74:7,63 1/1:.:113:8,105:3,44:5,61 | |
| 4001 chr22 12114282 . T C . PASS DP=286;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.67757 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:160:21,139:10,76:11,63 1/1:.:126:18,108:7,47:11,61 | |
| 4002 chr22 12114391 . G T . PASS DP=316;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.96672 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:178:73,105:35,62:38,43 0/1:.:138:70,68:33,29:37,39 | |
| 4003 chr22 12114538 . C A . PASS DP=212;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.69501 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:129:42,87:14,41:28,46 0/1:.:83:29,54:13,31:16,23 | |
| 4004 chr22 12114801 . C T . PASS DP=205;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.98381 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:114:1,113:1,74:0,39 1/1:.:91:4,87:1,46:3,41 | |
| 4005 chr22 12114905 . C T . PASS DP=214;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:126:0,126:0,71:0,55 1/1:.:88:0,88:0,48:0,40 | |
| 4006 chr22 12115103 . G T . PASS DP=242;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:134:0,134:0,77:0,57 1/1:.:108:0,108:0,55:0,53 | |
| 4007 chr22 12115371 . A G . PASS DP=188;SS=1;SSC=1;GPV=8.1802e-23;SPV=0.74297 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:101:65,36:36,19:29,17 0/1:.:87:59,28:26,12:33,16 | |
| 4008 chr22 12115426 . T A . PASS DP=183;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:94:0,94:0,50:0,44 1/1:.:89:0,88:0,38:0,50 | |
| 4009 chr22 12115902 . C G . PASS DP=232;SS=1;SSC=3;GPV=1.5916e-10;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:116:101,15:43,7:58,8 0/1:.:116:100,16:47,7:53,9 | |
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| 4058 chr22 12122587 . G T . PASS DP=157;SS=1;SSC=5;GPV=1.056e-08;SPV=0.3128 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:73:63,10:37,5:26,5 0/1:.:84:69,15:32,4:37,11 | |
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| 4060 chr22 12122759 . A G . PASS DP=150;SS=1;SSC=0;GPV=7.41105e-41;SPV=0.99651 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:64:15,49:4,26:11,23 0/1:.:86:37,49:24,31:13,18 | |
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| 4064 chr22 12123675 . T C . PASS DP=186;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:90:0,90:0,49:0,41 1/1:.:96:0,96:0,56:0,40 | |
| 4065 chr22 12123745 . A G . PASS DP=157;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:81:0,81:0,38:0,43 1/1:.:76:0,76:0,35:0,41 | |
| 4066 chr22 12123902 . T C . PASS DP=187;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:90:0,90:0,48:0,42 1/1:.:97:0,97:0,41:0,56 | |
| 4067 chr22 12124087 . T C . PASS DP=194;SS=1;SSC=5;GPV=9.3771e-21;SPV=0.27515 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:100:72,28:40,16:32,12 0/1:.:94:63,31:35,18:28,13 | |
| 4068 chr22 12124236 . G T . PASS DP=176;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:81:0,81:0,40:0,41 1/1:.:95:0,95:0,45:0,50 | |
| 4069 chr22 12124326 . G A . PASS DP=196;SS=1;SSC=7;GPV=1.3305e-16;SPV=0.18238 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:103:81,22:44,11:37,11 0/1:.:93:67,26:27,15:40,11 | |
| 4070 chr22 12124464 . T C . PASS DP=219;SS=1;SSC=1;GPV=1.442e-08;SPV=0.71935 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:115:101,14:63,8:38,6 0/1:.:104:93,11:57,4:36,7 | |
| 4071 chr22 12124478 . T C . PASS DP=222;SS=1;SSC=21;GPV=1;SPV=0.0069034 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:112:94,18:53,10:41,8 0/1:.:110:76,34:44,13:32,21 | |
| 4072 chr22 12124584 . C A . PASS DP=161;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.52007 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:79:22,54:14,26:8,28 0/1:.:82:23,59:9,33:14,26 | |
| 4073 chr22 12124586 . T G . PASS DP=166;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.51205 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:85:1,84:0,45:1,39 1/1:.:81:0,81:0,45:0,36 | |
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| 4124 chr22 12137604 . C T . PASS DP=272;SS=1;SSC=14;GPV=8.9067e-14;SPV=0.037754 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:110:99,11:40,5:59,6 0/1:.:162:132,30:58,5:74,25 | |
| 4125 chr22 12138102 . A G . PASS DP=254;SS=1;SSC=5;GPV=3.09547e-42;SPV=0.30884 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:99:57,42:33,22:24,20 0/1:.:155:83,72:44,35:39,37 | |
| 4126 chr22 12138663 . T C . PASS DP=22;SS=1;SSC=0;GPV=9.1981e-05;SPV=0.95975 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:3,6:3,5:0,1 0/1:.:13:8,5:4,4:4,1 | |
| 4127 chr22 12138924 . C A . PASS DP=90;SS=1;SSC=2;GPV=1.6168e-05;SPV=0.61777 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:30,6:19,5:11,1 0/1:.:54:45,9:25,4:20,5 | |
| 4128 chr22 12138986 . G A . PASS DP=159;SS=1;SSC=0;GPV=2.2438e-21;SPV=0.82158 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:38,26:24,17:14,9 0/1:.:95:62,33:36,21:26,12 | |
| 4129 chr22 12139057 . G T . PASS DP=125;SS=1;SSC=17;GPV=1;SPV=0.018124 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:40,15:28,9:12,6 0/1:.:70:37,33:23,16:14,17 | |
| 4130 chr22 12140511 . C A . PASS DP=28;SS=1;SSC=2;GPV=5.4482e-05;SPV=0.56964 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:6,4:5,4:1,0 0/1:.:18:10,8:9,8:1,0 | |
| 4131 chr22 12141046 . C A . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=1.3852e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,7:0,11 1/1:.:15:0,15:0,4:0,11 | |
| 4132 chr22 12141092 . C G . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=5.5539e-18;SPV=0.98461 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:10,3:9,23 0/1:.:55:34,21:10,5:24,16 | |
| 4133 chr22 12141203 . T C . PASS DP=163;SS=1;SSC=1;GPV=6.6576e-32;SPV=0.77598 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:67:31,36:21,10:10,26 0/1:.:96:49,47:21,16:28,31 | |
| 4134 chr22 12141489 . T A . PASS DP=201;SS=1;SSC=2;GPV=1.2988e-07;SPV=0.57936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:83:74,9:49,3:25,6 0/1:.:118:105,13:74,7:31,6 | |
| 4135 chr22 12141493 . C T . PASS DP=227;SS=1;SSC=4;GPV=1.8559e-37;SPV=0.33035 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:92:53,39:37,19:16,20 0/1:.:135:72,62:51,37:21,25 | |
| 4136 chr22 12141513 . G A . PASS DP=296;SS=1;SSC=3;GPV=1.3581e-20;SPV=0.41789 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:123:98,24:61,13:37,11 0/1:.:173:136,37:93,17:43,20 | |
| 4137 chr22 12141567 . T G . PASS DP=419;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.78883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:174:97,77:50,58:47,19 0/1:.:245:145,100:86,66:59,34 | |
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| 4139 chr22 12141758 . A G . PASS DP=155;SS=1;SSC=9;GPV=1.6075e-15;SPV=0.12151 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:66:51,15:11,1:40,14 0/1:.:89:60,29:15,3:45,26 | |
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| 4179 chr22 12153566 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=2;GPV=6.1853e-08;SPV=0.56798 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:22,11:16,8:6,3 0/1:.:29:19,10:12,7:7,3 | |
| 4180 chr22 12153688 . T A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=0.00060611;SPV=0.79775 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:26,7:5,1:21,6 0/1:.:19:16,3:4,1:12,2 | |
| 4181 chr22 12153693 . G T . PASS DP=51;SS=1;SSC=12;GPV=6.2071e-26;SPV=0.054742 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,6:0,25 1/1:.:20:3,17:2,3:1,14 | |
| 4182 chr22 12154148 . G T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=5.9784e-05;SPV=0.83673 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:14,5:7,2:7,3 0/1:.:42:34,8:26,4:8,4 | |
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| 4185 chr22 12154639 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=2.7754e-24;SPV=0.98871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:11,33:5,21:6,12 0/1:.:46:21,25:5,11:16,14 | |
| 4186 chr22 12154710 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=4;GPV=0.00014937;SPV=0.35689 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:32,5:12,1:20,4 0/1:.:36:29,7:1,4:28,3 | |
| 4187 chr22 12155302 . G T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.1853e-08;SPV=0.81647 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:18,11:13,9:5,2 0/1:.:33:23,10:18,7:5,3 | |
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| 4190 chr22 12155657 . G A . PASS DP=178;SS=1;SSC=1;GPV=1.3188e-20;SPV=0.7467 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:69:45,24:14,11:31,13 0/1:.:109:75,34:40,14:35,20 | |
| 4191 chr22 12155739 . C T . PASS DP=192;SS=1;SSC=1;GPV=6.0142e-09;SPV=0.68049 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:77:66,11:31,3:35,8 0/1:.:115:100,15:48,8:52,7 | |
| 4192 chr22 12155798 . A G . PASS DP=171;SS=1;SSC=4;GPV=1.1239e-06;SPV=0.38559 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:73:66,7:31,3:35,4 0/1:.:98:86,12:37,7:49,5 | |
| 4193 chr22 12155804 . A C . PASS DP=153;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:66:0,66:0,34:0,32 1/1:.:87:0,87:0,40:0,47 | |
| 4194 chr22 12155938 . G A . PASS DP=46;SS=1;SSC=5;GPV=2.7459e-24;SPV=0.28986 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,7:0,14 1/1:.:25:2,23:1,3:1,20 | |
| 4195 chr22 12158795 . T C . PASS DP=23;SS=1;SSC=0;GPV=1.2146e-13;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:0,12:0,8:0,4 1/1:.:11:0,11:0,4:0,7 | |
| 4196 chr22 12158957 . C A . PASS DP=80;SS=1;SSC=3;GPV=7.1891e-05;SPV=0.41866 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:31,5:30,1:1,4 0/1:.:44:36,8:32,1:4,7 | |
| 4197 chr22 12158959 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=4.3049e-14;SPV=0.72567 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:12,16:12,16:0,0 0/1:.:43:17,19:13,17:4,2 | |
| 4198 chr22 12158960 . A T . PASS DP=76;SS=1;SSC=3;GPV=6.9736e-05;SPV=0.46837 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:28,5:27,1:1,4 0/1:.:43:35,8:31,1:4,7 | |
| 4199 chr22 12158978 . A C . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=4.4675e-08;SPV=0.56579 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:27,10:19,9:8,1 0/1:.:43:31,12:23,10:8,2 | |
| 4200 chr22 12158992 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=8;GPV=8.9857e-09;SPV=0.15839 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:32,9:19,7:13,2 0/1:.:44:29,15:20,13:9,2 | |
| 4201 chr22 12159005 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=1.9033e-15;SPV=0.80605 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:15,9:5,12 0/1:.:43:24,19:17,12:7,7 | |
| 4202 chr22 12159010 . T G . PASS DP=91;SS=1;SSC=5;GPV=1.8506e-09;SPV=0.26471 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:34,11:19,6:15,5 0/1:.:46:31,15:21,8:10,7 | |
| 4203 chr22 12159111 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=0.00070212;SPV=0.71768 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:29,5:6,1:23,4 0/1:.:39:34,5:9,1:25,4 | |
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| 4205 chr22 12159635 . T G . PASS DP=221;SS=1;SSC=1;GPV=1.5027e-10;SPV=0.78714 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:96:81,15:52,11:29,4 0/1:.:125:109,16:67,11:42,5 | |
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| 4260 chr22 12176519 . C A . PASS DP=6093;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.50143 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:3651:79,3571:34,1474:45,2097 1/1:.:2442:52,2390:26,1006:26,1384 | |
| 4261 chr22 12176691 . G C . PASS DP=4181;SS=1;SSC=8;GPV=0;SPV=0.14977 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:2410:1722,685:946,332:776,353 0/1:.:1771:1240,531:685,268:555,263 | |
| 4262 chr22 12176982 . C G . PASS DP=4752;SS=1;SSC=5;GPV=0;SPV=0.25866 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:2820:77,2735:31,1234:46,1501 1/1:.:1932:46,1880:15,854:31,1026 | |
| 4263 chr22 12176992 . T C . PASS DP=4285;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.90513 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:2553:1861,682:777,305:1084,377 0/1:.:1732:1294,433:530,199:764,234 | |
| 4264 chr22 12177055 . C G . PASS DP=3317;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.91459 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:1912:8,1902:3,352:5,1550 1/1:.:1405:10,1394:3,242:7,1152 | |
| 4265 chr22 12177222 . T C . PASS DP=1728;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:985:0,985:0,64:0,921 1/1:.:743:0,743:0,48:0,695 | |
| 4266 chr22 12177300 . A G . PASS DP=391;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:222:0,222:0,6:0,216 1/1:.:169:0,169:0,6:0,163 | |
| 4267 chr22 12177571 . C T . PASS DP=53;SS=1;SSC=3;GPV=4.4193e-27;SPV=0.45676 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:2,23:0,12:2,11 1/1:.:28:1,27:0,21:1,6 | |
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| 4324 chr22 12194185 . T A . PASS DP=130;SS=1;SSC=2;GPV=7.3018e-10;SPV=0.61993 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:50,14:29,8:21,6 0/1:.:66:52,14:24,7:28,7 | |
| 4325 chr22 12194264 . C G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,13:0,19 1/1:.:46:0,46:0,19:0,27 | |
| 4326 chr22 12194408 . C G . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=4.0499e-10;SPV=0.74509 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:22,14:6,6:16,8 0/1:.:38:25,13:11,6:14,7 | |
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| 4332 chr22 12195058 . C T . PASS DP=185;SS=1;SSC=2;GPV=5.7531e-08;SPV=0.57753 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:89:78,11:53,8:25,3 0/1:.:96:84,12:57,8:27,4 | |
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| 4387 chr22 12200449 . A T . PASS DP=190;SS=1;SSC=1;GPV=2.4451e-14;SPV=0.66491 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:83:53,19:26,4:27,15 0/1:.:107:67,22:24,6:43,16 | |
| 4388 chr22 12200553 . C A . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,11:0,27 1/1:.:51:0,51:0,10:0,41 | |
| 4389 chr22 12200998 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,16:0,6 1/1:.:28:0,28:0,22:0,6 | |
| 4390 chr22 12201158 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=3.6183e-12;SPV=0.79439 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:14,9:5,7 0/1:.:41:25,16:17,8:8,8 | |
| 4391 chr22 12201486 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=7.0184e-11;SPV=0.77787 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:10,10:6,5 0/1:.:31:18,13:7,5:11,8 | |
| 4392 chr22 12201495 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 1/1:.:29:0,29:0,11:0,18 | |
| 4393 chr22 12201583 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=10;GPV=7.6643e-06;SPV=0.089851 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:41:37,4:14,2:23,2 0/1:.:54:42,12:18,6:24,6 | |
| 4394 chr22 12201983 . G A . PASS DP=83;SOMATIC;SS=2;SSC=14;GPV=1;SPV=0.034124 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:31:30,1:15,1:15,0 0/1:.:52:42,10:30,8:12,2 | |
| 4395 chr22 12202214 . G C . PASS DP=114;SS=1;SSC=2;GPV=2.1622e-15;SPV=0.62362 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:25,15:12,9:13,6 0/1:.:74:47,27:26,16:21,11 | |
| 4396 chr22 12202513 . T C . PASS DP=129;SS=1;SSC=4;GPV=2.5717e-21;SPV=0.38213 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:15,20:9,11:6,9 0/1:.:78:19,32:6,17:13,15 | |
| 4397 chr22 12202946 . G A . PASS DP=161;SS=1;SSC=3;GPV=5.118e-08;SPV=0.46696 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:47,7:22,5:25,2 0/1:.:107:91,16:28,8:63,8 | |
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| 4399 chr22 12203124 . A G . PASS DP=123;SS=1;SSC=2;GPV=9.0626e-06;SPV=0.54704 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:36,5:28,1:8,4 0/1:.:82:71,11:46,5:25,6 | |
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| 4425 chr22 12205125 . C T . PASS DP=118;SS=1;SSC=2;GPV=3.1221e-18;SPV=0.53629 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:26,18:15,7:11,11 0/1:.:74:43,31:23,13:20,18 | |
| 4426 chr22 12205201 . T C . PASS DP=113;SS=1;SSC=5;GPV=1.0094e-10;SPV=0.27203 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:32,9:15,5:17,4 0/1:.:72:51,21:22,11:29,10 | |
| 4427 chr22 12205223 . G A . PASS DP=113;SS=1;SSC=2;GPV=4.2743e-11;SPV=0.58743 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:24,9:12,7:12,2 0/1:.:80:58,22:27,9:31,13 | |
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| 4441 chr22 12206427 . G C . PASS DP=106;SS=1;SSC=2;GPV=1.5912e-13;SPV=0.54227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:25,13:14,5:11,8 0/1:.:68:44,24:23,15:21,9 | |
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| 4443 chr22 12206657 . T A . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=1.8267e-08;SPV=0.55227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:18,7:13,3:5,4 0/1:.:54:38,16:16,6:22,10 | |
| 4444 chr22 12206768 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=5;GPV=2.2757e-12;SPV=0.30004 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:18,9:8,2:10,7 0/1:.:57:33,24:13,8:20,16 | |
| 4445 chr22 12207253 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=10;GPV=5.2607e-16;SPV=0.089866 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:9,8:4,3:5,5 0/1:.:58:13,30:12,21:1,9 | |
| 4446 chr22 12207265 . T G . PASS DP=87;SS=1;SSC=6;GPV=4.2138e-29;SPV=0.22493 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:9,19:4,14:5,5 1/1:.:59:13,46:12,34:1,12 | |
| 4447 chr22 12207302 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=6.8574e-07;SPV=0.81037 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:22,7:13,2:9,5 0/1:.:64:52,12:32,8:20,4 | |
| 4448 chr22 12207308 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=1;GPV=1.5361e-06;SPV=0.7726 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:21,6:13,2:8,4 0/1:.:66:54,12:32,8:22,4 | |
| 4449 chr22 12207502 . G A . PASS DP=118;SS=1;SSC=0;GPV=2.5344e-13;SPV=0.9178 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:30,18:16,9:14,9 0/1:.:70:51,19:27,10:24,9 | |
| 4450 chr22 12207531 . A G . PASS DP=119;SS=1;SSC=9;GPV=1.6526e-19;SPV=0.12522 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:30,17:11,12:19,5 0/1:.:72:37,35:19,19:18,16 | |
| 4451 chr22 12207624 . G T . PASS DP=120;SS=1;SSC=1;GPV=3.5751e-18;SPV=0.72328 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:17,11:8,8 0/1:.:76:46,30:20,18:26,12 | |
| 4452 chr22 12207637 . C T . PASS DP=118;SS=1;SSC=2;GPV=5.8901e-17;SPV=0.58806 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:28,18:16,12:12,6 0/1:.:72:44,28:21,16:23,12 | |
| 4453 chr22 12207863 . T A . PASS DP=138;SS=1;SSC=4;GPV=1.5477e-16;SPV=0.37883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:34,15:17,7:17,8 0/1:.:89:58,31:33,14:25,17 | |
| 4454 chr22 12207879 . T A . PASS DP=132;SS=1;SSC=4;GPV=1.8884e-08;SPV=0.39634 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:42,8:22,2:20,6 0/1:.:82:66,16:29,12:37,4 | |
| 4455 chr22 12207906 . C A . PASS DP=137;SS=1;SSC=1;GPV=5.5904e-22;SPV=0.76698 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:32,27:16,13:16,14 0/1:.:78:46,32:19,18:27,14 | |
| 4456 chr22 12207998 . A T . PASS DP=141;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.53428 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:66:12,54:9,29:3,25 1/1:.:75:13,62:6,26:7,36 | |
| 4457 chr22 12208140 . T G . PASS DP=117;SS=1;SSC=4;GPV=6.3633e-15;SPV=0.39 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:35,17:20,9:15,8 0/1:.:65:41,24:25,8:16,16 | |
| 4458 chr22 12208258 . C T . PASS DP=136;SS=1;SSC=3;GPV=8.8332e-18;SPV=0.42119 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:42,22:17,9:25,13 0/1:.:72:45,27:23,12:22,15 | |
| 4459 chr22 12208322 . C T . PASS DP=121;SS=1;SSC=8;GPV=1.0145e-17;SPV=0.15797 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:40,21:22,6:18,15 0/1:.:60:33,27:12,18:21,9 | |
| 4460 chr22 12208355 . C T . PASS DP=114;SS=1;SSC=6;GPV=1.0324e-10;SPV=0.20611 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:40,11:16,5:24,6 0/1:.:63:44,19:16,9:28,10 | |
| 4461 chr22 12208373 . T C . PASS DP=96;SS=1;SSC=2;GPV=1.585e-06;SPV=0.59284 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:35,8:11,4:24,4 0/1:.:53:43,10:21,2:22,8 | |
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| 4463 chr22 12208586 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,10:0,25 1/1:.:39:0,39:0,8:0,31 | |
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| 4506 chr22 12215646 . A G . PASS DP=50;SS=1;SSC=2;GPV=1.7375e-10;SPV=0.51343 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:11,11:3,3:8,8 0/1:.:28:13,15:3,3:10,12 | |
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| 4515 chr22 12217772 . A T . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=1.3852e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,6:0,5 1/1:.:22:0,22:0,11:0,11 | |
| 4516 chr22 12217944 . A C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0.00034115;SPV=0.81582 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:26,5:18,4:8,1 0/1:.:51:45,6:36,5:9,1 | |
| 4517 chr22 12218189 . A T . PASS DP=89;SS=1;SSC=7;GPV=7.2833e-06;SPV=0.17445 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:35,5:18,2:17,3 0/1:.:49:38,11:15,2:23,9 | |
| 4518 chr22 12218216 . T G . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=1.4174e-07;SPV=0.97865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:27,12:13,5:14,7 0/1:.:58:49,9:16,6:33,3 | |
| 4519 chr22 12218323 . A C . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,15:0,6 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 | |
| 4520 chr22 12218385 . G C . PASS DP=91;SOMATIC;SS=2;SSC=28;GPV=1;SPV=0.0012634 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:32:29,3:12,2:17,1 0/1:.:59:35,24:20,15:15,9 | |
| 4521 chr22 12218507 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=5.333e-06;SPV=0.93235 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:11,6:8,3:3,3 0/1:.:48:38,10:33,8:5,2 | |
| 4522 chr22 12218544 . C T . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:0,12:0,8:0,4 1/1:.:34:0,34:0,27:0,7 | |
| 4523 chr22 12218884 . C T . PASS DP=48;SS=1;SSC=6;GPV=3.7531e-12;SPV=0.23183 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:8,8:3,1:5,7 0/1:.:32:11,21:4,6:7,15 | |
| 4524 chr22 12219081 . C A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=5.0699e-07;SPV=0.8076 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:19,8:12,4:7,4 0/1:.:47:36,11:22,7:14,4 | |
| 4525 chr22 12219130 . A C . PASS DP=69;SS=1;SSC=5;GPV=2.4824e-06;SPV=0.29584 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:18,4:13,1:5,3 0/1:.:47:34,13:23,8:11,5 | |
| 4526 chr22 12219262 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=8.5945e-18;SPV=0.86733 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:11,19:4,13:7,6 0/1:.:47:22,25:10,11:12,14 | |
| 4527 chr22 12219299 . C T . PASS DP=104;SS=1;SSC=1;GPV=1.9216e-10;SPV=0.68572 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:24,10:15,4:9,6 0/1:.:70:51,19:30,10:21,9 | |
| 4528 chr22 12219446 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=2.2511e-22;SPV=0.7929 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:5,20:1,13:4,7 0/1:.:39:10,29:4,16:6,13 | |
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| 4530 chr22 12219500 . A G . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=6.654e-13;SPV=0.91211 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:4,12:1,6:3,6 0/1:.:32:12,18:1,10:11,8 | |
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| 4577 chr22 12293422 . T C . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=0.00054148;SPV=0.90966 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:14,6:7,1:7,5 0/1:.:25:19,4:6,1:13,3 | |
| 4578 chr22 12293626 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=5;GPV=7.2338e-25;SPV=0.27752 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,22:0,6:0,16 1/1:.:28:2,23:0,11:2,12 | |
| 4579 chr22 12295012 . G A . PASS DP=173;SS=1;SSC=8;GPV=7.0877e-14;SPV=0.13336 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:89:72,17:47,9:25,8 0/1:.:84:61,23:39,15:22,8 | |
| 4580 chr22 12295719 . T G . PASS DP=136;SS=1;SSC=8;GPV=3.8536e-31;SPV=0.15436 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:20,30:5,9:15,21 0/1:.:73:18,44:5,17:13,27 | |
| 4581 chr22 12297219 . T C . PASS DP=108;SS=1;SSC=0;GPV=7.63848e-42;SPV=0.90821 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:6,47:0,21:6,26 1/1:.:50:9,39:6,15:3,24 | |
| 4582 chr22 12297582 . G A . PASS DP=164;SS=1;SSC=0;GPV=1.0571e-09;SPV=0.90527 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:90:72,18:32,7:40,11 0/1:.:74:64,10:27,5:37,5 | |
| 4583 chr22 12297707 . T G . PASS DP=226;SS=1;SSC=4;GPV=1.5282e-09;SPV=0.34292 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:125:111,14:52,12:59,2 0/1:.:101:87,14:36,12:51,2 | |
| 4584 chr22 12297749 . G T . PASS DP=207;SS=1;SSC=1;GPV=1.2431e-12;SPV=0.76023 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:115:93,22:47,13:46,9 0/1:.:92:77,15:28,11:49,4 | |
| 4585 chr22 12297999 . G C . PASS DP=152;SS=1;SSC=3;GPV=4.8481e-08;SPV=0.40499 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:86:74,12:31,7:43,5 0/1:.:66:55,11:19,3:36,8 | |
| 4586 chr22 12298074 . T C . PASS DP=149;SS=1;SSC=5;GPV=1.8369e-10;SPV=0.31082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:78:64,14:20,4:44,10 0/1:.:71:55,16:20,3:35,13 | |
| 4587 chr22 12298192 . G T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=9.3924e-10;SPV=0.96753 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:2,7:21,11 0/1:.:31:23,8:4,4:19,4 | |
| 4588 chr22 12298352 . C T . PASS DP=28;SS=1;SSC=0;GPV=1.3074e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,10:0,5 1/1:.:13:0,13:0,6:0,7 | |
| 4589 chr22 12298486 . A T . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=3.8262e-11;SPV=0.80046 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:8,16:5,6:3,10 0/1:.:17:7,10:4,3:3,7 | |
| 4590 chr22 12298739 . G A . PASS DP=45;SS=1;SSC=1;GPV=5.1219e-17;SPV=0.77468 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:6,26:5,15:1,11 1/1:.:13:3,10:3,9:0,1 | |
| 4591 chr22 12299128 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=10;GPV=1.3391e-06;SPV=0.094173 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:45,9:24,7:21,2 0/1:.:28:19,9:8,3:11,6 | |
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| 4593 chr22 12299339 . C T . PASS DP=165;SS=1;SSC=3;GPV=3.7088e-12;SPV=0.467 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:84:65,17:31,12:34,5 0/1:.:81:62,18:37,9:25,9 | |
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| 4595 chr22 12299367 . G A . PASS DP=161;SS=1;SSC=9;GPV=1.0302e-09;SPV=0.12535 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:82:71,11:39,5:32,6 0/1:.:79:62,17:36,11:26,6 | |
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| 4642 chr22 12323676 . C T . PASS DP=139;SS=1;SSC=9;GPV=2.327e-15;SPV=0.11164 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:52,18:20,9:32,9 0/1:.:69:43,25:16,11:27,14 | |
| 4643 chr22 12323677 . A G . PASS DP=131;SS=1;SSC=8;GPV=1.7689e-17;SPV=0.13429 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:67:46,21:16,9:30,12 0/1:.:64:37,27:16,14:21,13 | |
| 4644 chr22 12323850 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=4.9906e-05;SPV=0.83717 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:16,7:7,5:9,2 0/1:.:27:21,6:12,2:9,4 | |
| 4645 chr22 12325541 . T C . PASS DP=148;SS=1;SSC=0;GPV=3.78351e-44;SPV=0.91251 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:18,52:12,24:6,28 0/1:.:78:27,51:10,26:17,25 | |
| 4646 chr22 12325964 . G C . PASS DP=145;SS=1;SSC=1;GPV=2.9156e-40;SPV=0.77366 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:20,44:11,22:9,22 0/1:.:81:29,52:15,28:14,24 | |
| 4647 chr22 12326138 . G T . PASS DP=38;SS=1;SSC=3;GPV=1.407e-05;SPV=0.46545 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:12,6:3,2:9,4 0/1:.:20:12,8:8,6:4,2 | |
| 4648 chr22 12327428 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,17:0,1 1/1:.:33:0,33:0,22:0,11 | |
| 4649 chr22 12327846 . G T . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=1.2153e-09;SPV=0.47007 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:18,8:10,2:8,6 0/1:.:53:34,18:20,10:14,8 | |
| 4650 chr22 12328797 . C A . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=9.2415e-08;SPV=0.84336 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:6,8:2,4:4,4 0/1:.:24:13,11:12,5:1,6 | |
| 4651 chr22 12331115 . C A . PASS DP=39;SS=1;SSC=0;GPV=1.0268e-07;SPV=0.88401 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:4,6:3,3:1,3 0/1:.:29:16,13:10,10:6,3 | |
| 4652 chr22 12339467 . C T . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=0.012467;SPV=0.84936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:7,2:5,1:2,1 0/1:.:27:23,4:11,3:12,1 | |
| 4653 chr22 12339727 . A C . PASS DP=46;SS=1;SSC=2;GPV=6.7171e-08;SPV=0.57833 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:7,5:4,4:3,1 0/1:.:34:19,15:10,11:9,4 | |
| 4654 chr22 12347702 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=4.5894e-09;SPV=0.38536 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:6,2:4,2:2,0 0/1:.:58:36,22:23,12:13,10 | |
| 4655 chr22 12347703 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=1.0786e-09;SPV=0.39579 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:6,3:3,3:3,0 0/1:.:60:27,22:15,13:12,9 | |
| 4656 chr22 12351366 . C T . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=8.2728e-11;SPV=0.8183 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:5,7:1,4:4,3 0/1:.:41:21,20:6,10:15,10 | |
| 4657 chr22 12352860 . G T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=0.00014234;SPV=0.98671 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:9,5:4,4:5,1 0/1:.:53:46,7:25,6:21,1 | |
| 4658 chr22 12352879 . T G . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=6.9672e-12;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:7,6:4,4:3,2 0/1:.:47:23,24:12,15:11,9 | |
| 4659 chr22 12353412 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=1.3582e-06;SPV=0.71292 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:13,4:6,3:7,1 0/1:.:66:52,14:23,11:29,3 | |
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| 4661 chr22 12355485 . C G . PASS DP=46;SS=1;SSC=2;GPV=4.5578e-05;SPV=0.59713 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:6,2:4,1:2,1 0/1:.:38:27,11:17,7:10,4 | |
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| 4706 chr22 12379859 . C G . PASS DP=117;SS=1;SSC=5;GPV=2.5058e-15;SPV=0.30547 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:15,6:11,3:4,3 0/1:.:96:60,36:34,20:26,16 | |
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| 4708 chr22 12379978 . G A . PASS DP=111;SS=1;SSC=2;GPV=4.7761e-15;SPV=0.52589 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:8,4:5,4:3,0 0/1:.:99:62,37:33,22:29,15 | |
| 4709 chr22 12380120 . T G . PASS DP=96;SS=1;SSC=10;GPV=1.383e-14;SPV=0.087865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:15,5:7,4:8,1 0/1:.:76:42,34:19,17:23,17 | |
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| 4711 chr22 12380460 . T C . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=7.5757e-07;SPV=0.91924 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:13,5:5,4:8,1 0/1:.:84:70,14:36,4:34,10 | |
| 4712 chr22 12380594 . G A . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=1.0773e-13;SPV=0.9158 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:8,8:4,4:4,4 0/1:.:82:53,29:26,17:27,12 | |
| 4713 chr22 12381066 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=12;GPV=1.0403e-12;SPV=0.058809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:15,6:6,2:9,4 0/1:.:57:25,27:10,11:15,16 | |
| 4714 chr22 12382825 . G A . PASS DP=113;SS=1;SSC=5;GPV=1.0094e-10;SPV=0.28482 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:17,4:6,3:11,1 0/1:.:92:66,26:39,12:27,14 | |
| 4715 chr22 12383041 . G A . PASS DP=96;SS=1;SSC=2;GPV=6.4554e-13;SPV=0.5487 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:13,7:7,4:6,3 0/1:.:76:48,28:22,14:26,14 | |
| 4716 chr22 12383347 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=1.3684e-34;SPV=0.99167 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:1,20:1,8:0,12 1/1:.:68:15,53:7,28:8,25 | |
| 4717 chr22 12384102 . G A . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,14:0,7 1/1:.:82:0,82:0,40:0,42 | |
| 4718 chr22 12384152 . A T . PASS DP=95;SS=1;SSC=1;GPV=2.4302e-24;SPV=0.77971 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:8,16:6,8:2,8 0/1:.:71:28,43:11,20:17,23 | |
| 4719 chr22 12385349 . G A . PASS DP=104;SS=1;SSC=2;GPV=8.5037e-15;SPV=0.53601 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:20,12:10,8:10,4 0/1:.:72:44,28:21,13:23,15 | |
| 4720 chr22 12385710 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,15:0,8 1/1:.:65:0,65:0,41:0,24 | |
| 4721 chr22 12386020 . C A . PASS DP=120;SS=1;SSC=7;GPV=1.8292e-07;SPV=0.17349 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:32,4:17,3:15,1 0/1:.:84:67,17:29,7:38,10 | |
| 4722 chr22 12386135 . A G . PASS DP=102;SS=1;SSC=6;GPV=0;SPV=0.22181 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,18:0,8 1/1:.:76:5,71:2,40:3,31 | |
| 4723 chr22 12386374 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 1/1:.:63:0,63:0,34:0,29 | |
| 4724 chr22 12386603 . C T . PASS DP=101;SS=1;SSC=3;GPV=3.0497e-11;SPV=0.44514 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:23,9:13,5:10,4 0/1:.:69:47,22:27,11:20,11 | |
| 4725 chr22 12386665 . A T . PASS DP=124;SS=1;SSC=2;GPV=1.3599e-15;SPV=0.59447 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:28,15:14,7:14,8 0/1:.:81:53,28:31,13:22,15 | |
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| 4727 chr22 12386896 . G A . PASS DP=141;SS=1;SSC=2;GPV=9.2792e-09;SPV=0.60494 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:46,10:30,6:16,4 0/1:.:85:70,15:35,10:35,5 | |
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| 4774 chr22 12396636 . C T . PASS DP=97;SS=1;SSC=1;GPV=4.3294e-12;SPV=0.70186 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:14,8:6,4:8,4 0/1:.:75:50,25:28,13:22,12 | |
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| 4781 chr22 12399050 . T C . PASS DP=117;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,12:0,4 1/1:.:101:0,101:0,48:0,53 | |
| 4782 chr22 12399099 . C T . PASS DP=135;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.97903 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:1,21:1,14:0,7 1/1:.:113:19,94:10,49:9,45 | |
| 4783 chr22 12399362 . C A . PASS DP=127;SS=1;SSC=2;GPV=3.3554e-13;SPV=0.60767 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:17,7:9,3:8,4 0/1:.:103:73,30:32,11:41,19 | |
| 4784 chr22 12399483 . T G . PASS DP=108;SS=1;SSC=0;GPV=6.881e-14;SPV=0.87838 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:10,8:4,3:6,5 0/1:.:90:60,30:25,16:35,14 | |
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| 4786 chr22 12399815 . G A . PASS DP=107;SS=1;SSC=5;GPV=6.5739e-14;SPV=0.25843 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:14,5:8,1:6,4 0/1:.:88:55,33:26,17:29,16 | |
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| 4789 chr22 12400679 . C A . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=2.1181e-11;SPV=0.79807 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:9,6:3,3:6,3 0/1:.:76:51,25:28,14:23,11 | |
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| 4821 chr22 12407760 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=10;GPV=7.2377e-22;SPV=0.093037 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:6,9:2,5:4,4 1/1:.:48:9,39:7,18:2,21 | |
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| 4835 chr22 12411078 . C T . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=1.4535e-13;SPV=0.81991 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:8,6:4,4:4,2 0/1:.:90:59,31:26,16:33,15 | |
| 4836 chr22 12411261 . C A . PASS DP=101;SOMATIC;SS=2;SSC=7;GPV=1;SPV=0.16287 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:10:10,0:8,0:2,0 0/1:.:91:75,16:41,6:34,10 | |
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| 4840 chr22 12413005 . C G . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=6.2306e-14;SPV=0.68499 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:9,7:3,4:6,3 0/1:.:73:43,30:25,11:18,19 | |
| 4841 chr22 12413134 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=1;GPV=8.0818e-14;SPV=0.74769 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:5,4:3,1:2,3 0/1:.:84:51,33:27,14:24,19 | |
| 4842 chr22 12413211 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=2.01e-30;SPV=0.42542 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:4,9:3,3:1,6 1/1:.:78:19,59:9,28:10,31 | |
| 4843 chr22 12413293 . T G . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,9:0,4 1/1:.:85:0,85:0,43:0,42 | |
| 4844 chr22 12413294 . T G . PASS DP=98;SS=1;SSC=4;GPV=5.898e-15;SPV=0.36588 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:10,5:6,4:4,1 0/1:.:83:48,35:24,21:24,14 | |
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| 4846 chr22 12413387 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=7.7108e-10;SPV=0.85878 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:8,5:3,4:5,1 0/1:.:78:56,22:32,13:24,9 | |
| 4847 chr22 12413977 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:0,12:0,7:0,5 1/1:.:68:0,68:0,34:0,34 | |
| 4848 chr22 12414089 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=1.8891e-12;SPV=0.45665 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:9,5:4,3:5,2 0/1:.:67:39,28:15,16:24,12 | |
| 4849 chr22 12414240 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.8496e-17;SPV=0.88267 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:3,6:0,4:3,2 0/1:.:73:35,38:23,19:12,19 | |
| 4850 chr22 12414658 . G T . PASS DP=121;SS=1;SSC=3;GPV=1.1945e-10;SPV=0.46525 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:15,4:8,2:7,2 0/1:.:102:76,26:41,13:35,13 | |
| 4851 chr22 12414685 . T A . PASS DP=105;SS=1;SSC=3;GPV=9.5926e-13;SPV=0.46996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:10,4:5,2:5,2 0/1:.:91:60,31:31,15:29,16 | |
| 4852 chr22 12414867 . C T . PASS DP=111;SS=1;SSC=0;GPV=8.2223e-07;SPV=0.917 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:11,4:5,2:6,2 0/1:.:96:81,15:36,6:45,9 | |
| 4853 chr22 12415340 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=6.5441e-13;SPV=0.80415 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:5,5:5,3:0,2 0/1:.:70:41,29:22,15:19,14 | |
| 4854 chr22 12415436 . T G . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=6.3227e-06;SPV=0.71642 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:7,2:4,1:3,1 0/1:.:67:53,14:23,9:30,5 | |
| 4855 chr22 12416012 . C T . PASS DP=122;SS=1;SSC=1;GPV=1.2439e-15;SPV=0.78737 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:15,10:4,5:11,5 0/1:.:97:64,33:34,20:30,13 | |
| 4856 chr22 12416115 . C G . PASS DP=96;SS=1;SSC=2;GPV=2.571e-11;SPV=0.58756 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:15,7:6,4:9,3 0/1:.:74:50,24:23,16:27,8 | |
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| 4858 chr22 12416273 . A G . PASS DP=122;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,13:0,8 1/1:.:101:0,101:0,60:0,41 | |
| 4859 chr22 12416446 . G C . PASS DP=99;SS=1;SSC=1;GPV=6.2938e-15;SPV=0.7767 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:7,6:2,4:5,2 0/1:.:86:52,34:19,13:33,21 | |
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| 4887 chr22 12427097 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=1.6365e-19;SPV=0.95912 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:1,8:0,5:1,3 0/1:.:52:16,36:11,19:5,17 | |
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| 4900 chr22 12432095 . C A . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=5.2779e-11;SPV=0.82577 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:9,6:3,3:6,3 0/1:.:76:52,24:23,12:29,12 | |
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| 4903 chr22 12433404 . T G . PASS DP=89;SS=1;SSC=8;GPV=4.4109e-17;SPV=0.13888 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:10,5:8,2:2,3 0/1:.:74:35,39:22,22:13,17 | |
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| 4909 chr22 12436164 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=2.7049e-06;SPV=0.9008 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:8,4:4,1:4,3 0/1:.:62:49,13:23,7:26,6 | |
| 4910 chr22 12436700 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=7.4354e-05;SPV=0.89988 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:6,2:2,1:4,1 0/1:.:77:66,11:39,7:27,4 | |
| 4911 chr22 12437436 . T A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.0605e-35;SPV=0.85714 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,6:0,3 1/1:.:54:1,53:0,23:1,30 | |
| 4912 chr22 12437684 . G T . PASS DP=85;SS=1;SSC=3;GPV=5.005e-08;SPV=0.47335 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:14,4:6,2:8,2 0/1:.:67:49,18:31,6:18,12 | |
| 4913 chr22 12489169 . T G . PASS DP=112;SS=1;SSC=12;GPV=1.6536e-35;SPV=0.051202 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:7,7:2,5:5,2 1/1:.:98:24,74:17,54:7,20 | |
| 4914 chr22 12489510 . T G . PASS DP=140;SS=1;SSC=4;GPV=1.8919e-21;SPV=0.35373 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:13,7:10,2:3,5 0/1:.:120:69,51:30,31:39,20 | |
| 4915 chr22 12489536 . G T . PASS DP=125;SS=1;SSC=3;GPV=5.5598e-11;SPV=0.46526 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:15,4:8,3:7,1 0/1:.:106:79,27:46,7:33,20 | |
| 4916 chr22 12489919 . A T . PASS DP=151;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.033396 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:12,7:7,2:5,5 0/1:.:132:50,82:32,45:18,37 | |
| 4917 chr22 12490079 . T G . PASS DP=135;SS=1;SSC=0;GPV=1.8473e-19;SPV=0.8986 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:7,4:7,9 0/1:.:108:68,40:31,17:37,23 | |
| 4918 chr22 12490872 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=9;GPV=1.5269e-15;SPV=0.11767 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:5,3:5,1:0,2 0/1:.:51:17,34:11,20:6,14 | |
| 4919 chr22 12491314 . G A . PASS DP=46;SS=1;SSC=3;GPV=1.8161e-07;SPV=0.49233 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:7,4:5,3:2,1 0/1:.:35:20,15:14,8:6,7 | |
| 4920 chr22 12491844 . T C . PASS DP=121;SS=1;SSC=7;GPV=6.782e-13;SPV=0.18058 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:17,4:10,1:7,3 0/1:.:100:68,32:39,21:29,11 | |
| 4921 chr22 12493173 . C A . PASS DP=71;SOMATIC;SS=2;SSC=10;GPV=1;SPV=0.093523 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:14:14,0:8,0:6,0 0/1:.:57:47,10:27,7:20,3 | |
| 4922 chr22 12495678 . T A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=3.3388e-14;SPV=0.82801 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:7,8:4,5:3,3 0/1:.:66:37,29:22,17:15,12 | |
| 4923 chr22 12496120 . C T . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=0.0061097;SPV=0.91098 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:6,2:2,0:4,2 0/1:.:38:33,5:12,2:21,3 | |
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| 4925 chr22 12500035 . C T . PASS DP=48;SS=1;SSC=4;GPV=2.8521e-08;SPV=0.37653 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:6,3:2,2:4,1 0/1:.:39:21,18:16,9:5,9 | |
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| 4976 chr22 12549507 . T G . PASS DP=155;SS=1;SSC=0;GPV=7.6148e-12;SPV=0.94806 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:28,12:13,7:15,5 0/1:.:115:93,22:45,14:48,8 | |
| 4977 chr22 12549543 . C T . PASS DP=121;SS=1;SSC=4;GPV=2.7984e-13;SPV=0.38468 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:22,8:11,3:11,5 0/1:.:91:62,29:35,17:27,12 | |
| 4978 chr22 12549544 . A G . PASS DP=118;SS=1;SSC=3;GPV=3.5998e-12;SPV=0.47983 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:22,8:12,3:10,5 0/1:.:88:62,26:34,15:28,11 | |
| 4979 chr22 12549580 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=1.6521e-09;SPV=0.91673 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:14,9:5,3:9,6 0/1:.:64:47,17:25,13:22,4 | |
| 4980 chr22 12549626 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=7;GPV=2.3121e-20;SPV=0.16351 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:8,9:4,4:4,5 0/1:.:56:17,39:7,16:10,23 | |
| 4981 chr22 12549731 . A T . PASS DP=101;SS=1;SSC=2;GPV=1.4956e-07;SPV=0.62562 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:19,5:8,1:11,4 0/1:.:77:61,16:31,5:30,11 | |
| 4982 chr22 12550213 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=2.0525e-15;SPV=0.71917 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:6,9:1,5:5,4 0/1:.:52:23,29:10,20:13,9 | |
| 4983 chr22 12550859 . A C . PASS DP=21;SS=1;SSC=0;GPV=1.2221e-07;SPV=0.93675 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:1,7:0,2:1,5 0/1:.:13:4,9:1,1:3,8 | |
| 4984 chr22 12550922 . A G . PASS DP=28;SS=1;SSC=0;GPV=1.3074e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,2:0,9 1/1:.:17:0,17:0,2:0,15 | |
| 4985 chr22 12551401 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=1;GPV=2.8411e-14;SPV=0.71646 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:9,6:9,8 0/1:.:60:36,24:15,6:21,18 | |
| 4986 chr22 12551699 . G A . PASS DP=97;SS=1;SSC=4;GPV=0.00036177;SPV=0.37992 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:44:40,4:18,1:22,3 0/1:.:53:46,7:23,5:23,2 | |
| 4987 chr22 12554810 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=3;GPV=1.7551e-23;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:4,23:4,11:0,12 1/1:.:27:3,24:3,15:0,9 | |
| 4988 chr22 12555023 . A C . PASS DP=117;SS=1;SSC=0;GPV=2.9109e-18;SPV=0.88555 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:31,27:16,10:15,17 0/1:.:59:37,22:19,9:18,13 | |
| 4989 chr22 12557623 . T C . PASS DP=269;SS=1;SSC=0;GPV=1.9602e-27;SPV=0.82589 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:126:86,40:41,16:45,24 0/1:.:143:104,39:52,10:52,29 | |
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| 4991 chr22 12558949 . C A . PASS DP=71;SS=1;SSC=6;GPV=1.337e-05;SPV=0.22184 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:31,6:25,2:6,4 0/1:.:34:25,9:19,1:6,8 | |
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| 5037 chr22 12590671 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=8;GPV=1.6142e-19;SPV=0.15848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:9,6:3,3:6,3 0/1:.:74:31,43:20,27:11,16 | |
| 5038 chr22 12591373 . T C . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=9.7369e-18;SPV=0.98019 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:9,16:4,8:5,8 0/1:.:70:40,30:18,12:22,18 | |
| 5039 chr22 12591585 . A G . PASS DP=117;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,26:0,14 1/1:.:77:0,77:0,39:0,38 | |
| 5040 chr22 12592672 . A G . PASS DP=108;SS=1;SSC=3;GPV=2.706e-14;SPV=0.49366 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:21,11:16,6:5,5 0/1:.:76:48,28:20,7:28,21 | |
| 5041 chr22 12592690 . A G . PASS DP=104;SS=1;SSC=2;GPV=6.8901e-08;SPV=0.52593 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:28,7:16,5:12,2 0/1:.:69:54,15:25,7:29,8 | |
| 5042 chr22 12592831 . C A . PASS DP=108;SS=1;SSC=0;GPV=1.1194e-28;SPV=0.99091 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:10,32:6,17:4,15 0/1:.:66:29,37:18,14:11,23 | |
| 5043 chr22 12593419 . C A . PASS DP=113;SS=1;SSC=1;GPV=1.5206e-08;SPV=0.70919 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:34,10:20,4:14,6 0/1:.:69:55,14:34,6:21,8 | |
| 5044 chr22 12593848 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=1.0611e-08;SPV=0.91082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:20,10:12,2:8,8 0/1:.:62:48,14:17,5:31,9 | |
| 5045 chr22 12594263 . G C . PASS DP=201;SS=1;SSC=0;GPV=4.0351e-15;SPV=0.81222 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:82:62,20:48,19:14,1 0/1:.:119:95,24:60,20:35,4 | |
| 5046 chr22 12594276 . G A . PASS DP=207;SS=1;SSC=6;GPV=1.3232e-07;SPV=0.21385 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:87:80,7:66,3:14,4 0/1:.:120:105,15:65,9:40,6 | |
| 5047 chr22 12594289 . T A . PASS DP=205;SS=1;SSC=9;GPV=1.3152e-07;SPV=0.11368 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:85:79,6:65,3:14,3 0/1:.:120:104,16:65,10:39,6 | |
| 5048 chr22 12594318 . A T . PASS DP=227;SS=1;SSC=0;GPV=6.7117e-13;SPV=0.83853 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:100:81,19:58,15:23,4 0/1:.:127:108,19:63,12:45,7 | |
| 5049 chr22 12594505 . G T . PASS DP=175;SS=1;SSC=0;GPV=1.4111e-25;SPV=0.9883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:78:40,38:23,11:17,27 0/1:.:97:65,32:34,14:31,18 | |
| 5050 chr22 12594552 . C T . PASS DP=133;SS=1;SSC=2;GPV=9.5557e-28;SPV=0.61367 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:23,27:12,10:11,17 0/1:.:83:39,44:16,24:23,20 | |
| 5051 chr22 12594562 . C G . PASS DP=140;SS=1;SSC=2;GPV=3.6943e-10;SPV=0.55722 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:43,11:21,3:22,8 0/1:.:86:68,18:28,14:40,4 | |
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| 5053 chr22 12594871 . C A . PASS DP=302;SS=1;SSC=18;GPV=1;SPV=0.013129 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:132:115,17:47,6:68,11 0/1:.:170:130,40:55,22:75,18 | |
| 5054 chr22 12595011 . C T . PASS DP=126;SS=1;SSC=0;GPV=9.1633e-07;SPV=0.93311 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:51,12:35,6:16,6 0/1:.:63:56,7:33,3:23,4 | |
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| 5103 chr22 12604927 . T C . PASS DP=131;SS=1;SSC=4;GPV=7.4045e-10;SPV=0.32933 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:68:55,13:27,6:28,7 0/1:.:63:48,15:21,10:27,5 | |
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| 5106 chr22 12605943 . G A . PASS DP=134;SS=1;SSC=3;GPV=8.6752e-09;SPV=0.40133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:58,12:30,5:28,7 0/1:.:64:51,13:20,7:31,6 | |
| 5107 chr22 12607807 . A T . PASS DP=197;SS=1;SSC=6;GPV=5.0451e-13;SPV=0.24267 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:111:92,19:49,14:43,5 0/1:.:86:67,19:31,11:36,8 | |
| 5108 chr22 12607859 . T C . PASS DP=184;SS=1;SSC=3;GPV=1.2261e-09;SPV=0.45636 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:97:83,14:35,10:48,4 0/1:.:87:73,14:33,8:40,6 | |
| 5109 chr22 12608604 . A G . PASS DP=134;SS=1;SSC=11;GPV=4.4132e-22;SPV=0.076538 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:74:46,28:18,16:28,12 0/1:.:60:29,31:11,13:18,18 | |
| 5110 chr22 12608642 . A G . PASS DP=150;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:78:0,78:0,37:0,41 1/1:.:72:0,72:0,29:0,43 | |
| 5111 chr22 12608724 . C A . PASS DP=174;SS=1;SSC=0;GPV=2.1773e-11;SPV=0.95757 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:90:69,21:37,10:32,11 0/1:.:84:72,12:29,7:43,5 | |
| 5112 chr22 12608827 . T C . PASS DP=230;SS=1;SSC=3;GPV=1.5601e-11;SPV=0.47958 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:126:108,18:48,8:60,10 0/1:.:104:88,16:39,4:49,12 | |
| 5113 chr22 12608839 . G A . PASS DP=228;SS=1;SSC=10;GPV=2.9436e-07;SPV=0.089789 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:124:116,8:52,1:64,7 0/1:.:104:91,13:45,3:46,10 | |
| 5114 chr22 12609711 . G A . PASS DP=147;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:82:0,82:0,38:0,44 1/1:.:65:0,65:0,37:0,28 | |
| 5115 chr22 12609888 . T C . PASS DP=176;SS=1;SSC=5;GPV=5.3838e-07;SPV=0.27346 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:86:78,8:36,1:42,7 0/1:.:90:78,12:33,5:45,7 | |
| 5116 chr22 12609935 . C A . PASS DP=206;SS=1;SSC=4;GPV=1.2314e-12;SPV=0.36962 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:97:81,16:35,3:46,13 0/1:.:109:88,21:42,7:46,14 | |
| 5117 chr22 12609966 . G T . PASS DP=189;SS=1;SSC=2;GPV=7.65e-15;SPV=0.5039 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:90:70,20:26,12:44,8 0/1:.:99:76,23:33,8:43,15 | |
| 5118 chr22 12610405 . G T . PASS DP=156;SS=1;SSC=0;GPV=9.8455e-10;SPV=0.85157 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:78:62,16:23,12:39,4 0/1:.:78:66,12:32,7:34,5 | |
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| 5120 chr22 12610632 . T C . PASS DP=124;SS=1;SSC=1;GPV=3.8748e-08;SPV=0.68905 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:67:54,13:35,6:19,7 0/1:.:57:47,10:31,5:16,5 | |
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| 5168 chr22 12620947 . G A . PASS DP=210;SS=1;SSC=6;GPV=2.5993e-13;SPV=0.24511 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:83:70,13:35,7:35,6 0/1:.:127:101,26:41,11:60,15 | |
| 5169 chr22 12621100 . A G . PASS DP=210;SS=1;SSC=0;GPV=2.0228e-15;SPV=0.98376 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:113:83,30:43,18:40,12 0/1:.:97:82,15:44,8:38,7 | |
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| 5171 chr22 12621761 . G T . PASS DP=208;SS=1;SSC=0;GPV=6.5267e-10;SPV=0.95181 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:103:85,18:46,8:39,10 0/1:.:105:94,11:45,6:49,5 | |
| 5172 chr22 12621814 . C T . PASS DP=229;SOMATIC;SS=2;SSC=27;GPV=1;SPV=0.0017023 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:112:111,1:56,1:55,0 0/1:.:117:105,12:52,9:53,3 | |
| 5173 chr22 12621815 . A G . PASS DP=231;SOMATIC;SS=2;SSC=31;GPV=1;SPV=0.00064829 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:110:109,1:56,1:53,0 0/1:.:121:107,14:53,10:54,4 | |
| 5174 chr22 12621993 . G A . PASS DP=155;SS=1;SSC=18;GPV=1;SPV=0.014139 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:55,7:19,5:36,2 0/1:.:93:68,25:34,5:34,20 | |
| 5175 chr22 12622253 . C G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0.00033788;SPV=0.865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:29,6:16,4:13,2 0/1:.:45:40,5:19,2:21,3 | |
| 5176 chr22 12622300 . C A . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=3.2121e-06;SPV=0.60762 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:37,9:23,7:14,2 0/1:.:41:33,8:17,5:16,3 | |
| 5177 chr22 12622408 . C G . PASS DP=156;SS=1;SSC=0;GPV=2.1752e-09;SPV=0.96881 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:54,16:36,9:18,7 0/1:.:86:75,11:39,7:36,4 | |
| 5178 chr22 12622594 . T A . PASS DP=161;SS=1;SSC=12;GPV=8.2903e-12;SPV=0.054672 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:69:59,10:25,3:34,7 0/1:.:92:68,24:39,8:29,16 | |
| 5179 chr22 12623162 . T G . PASS DP=118;SS=1;SSC=5;GPV=7.192e-09;SPV=0.26987 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:46,10:24,5:22,5 0/1:.:62:47,15:21,8:26,7 | |
| 5180 chr22 12624288 . C A . PASS DP=160;SS=1;SSC=0;GPV=5.5862e-14;SPV=0.92914 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:86:61,25:32,15:29,10 0/1:.:74:59,15:29,9:30,6 | |
| 5181 chr22 12624331 . T A . PASS DP=163;SS=1;SSC=0;GPV=2.548e-14;SPV=0.82804 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:87:63,24:32,16:31,8 0/1:.:76:59,17:33,10:26,7 | |
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| 5232 chr22 12634434 . T G . PASS DP=112;SS=1;SSC=1;GPV=3.9601e-05;SPV=0.63936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:48,7:15,5:33,2 0/1:.:57:50,7:18,4:32,3 | |
| 5233 chr22 12634686 . T C . PASS DP=126;SS=1;SSC=0;GPV=2.4366e-11;SPV=0.90836 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:45,19:22,8:23,11 0/1:.:62:49,13:25,10:24,3 | |
| 5234 chr22 12635701 . T C . PASS DP=181;SS=1;SSC=0;GPV=1.0968e-26;SPV=0.8986 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:90:50,40:21,19:29,21 0/1:.:91:58,33:26,14:32,19 | |
| 5235 chr22 12636082 . C T . PASS DP=176;SS=1;SSC=2;GPV=1.5201e-17;SPV=0.56727 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:95:68,27:39,8:29,19 0/1:.:81:58,23:28,9:30,14 | |
| 5236 chr22 12636561 . T C . PASS DP=151;SS=1;SSC=6;GPV=1.8813e-10;SPV=0.20706 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:83:69,14:34,6:35,8 0/1:.:68:52,16:20,7:32,9 | |
| 5237 chr22 12636810 . C G . PASS DP=222;SS=1;SSC=2;GPV=2.9175e-13;SPV=0.55763 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:120:99,21:56,5:43,16 0/1:.:102:84,18:41,10:43,8 | |
| 5238 chr22 12637191 . A G . PASS DP=145;SS=1;SSC=9;GPV=0;SPV=0.11717 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:75:0,72:0,34:0,38 1/1:.:70:3,67:0,30:3,37 | |
| 5239 chr22 12637709 . C A . PASS DP=55;SS=1;SSC=4;GPV=0.00028065;SPV=0.32012 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:22,4:18,3:4,1 0/1:.:29:22,7:21,7:1,0 | |
| 5240 chr22 12638016 . T A . PASS DP=117;SS=1;SSC=1;GPV=1.1017e-10;SPV=0.67733 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:47,17:26,13:21,4 0/1:.:53:40,13:24,8:16,5 | |
| 5241 chr22 12639145 . T C . PASS DP=106;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,30:0,25 1/1:.:51:0,51:0,22:0,29 | |
| 5242 chr22 12639214 . C G . PASS DP=154;SS=1;SSC=3;GPV=4.9336e-07;SPV=0.4549 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:75:66,9:37,5:29,4 0/1:.:79:68,11:32,6:36,5 | |
| 5243 chr22 12639226 . C G . PASS DP=177;SS=1;SSC=0;GPV=1.1689e-09;SPV=0.80139 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:85:70,15:40,5:30,10 0/1:.:92:79,13:38,9:41,4 | |
| 5244 chr22 12639468 . T C . PASS DP=162;SS=1;SSC=8;GPV=3.926e-22;SPV=0.14518 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:71:48,23:19,13:29,10 0/1:.:91:53,38:25,19:28,19 | |
| 5245 chr22 12639519 . C T . PASS DP=208;SS=1;SSC=0;GPV=1.6499e-16;SPV=0.80284 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:95:71,24:34,11:37,13 0/1:.:113:89,24:31,15:58,9 | |
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| 5300 chr22 12705259 . C G . PASS DP=139;SS=1;SSC=0;GPV=4.5668e-13;SPV=0.99839 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:8,6:12,10 0/1:.:103:82,21:36,11:46,10 | |
| 5301 chr22 12705328 . T A . PASS DP=143;SS=1;SSC=0;GPV=2.7346e-15;SPV=0.83871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:24,13:12,4:12,9 0/1:.:106:76,30:36,13:40,17 | |
| 5302 chr22 12705517 . G A . PASS DP=109;SS=1;SSC=1;GPV=8.3496e-05;SPV=0.76301 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:25,4:19,1:6,3 0/1:.:80:71,9:39,3:32,6 | |
| 5303 chr22 12705518 . A C . PASS DP=111;SS=1;SSC=1;GPV=1.4791e-08;SPV=0.74491 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:22,7:17,3:5,4 0/1:.:82:65,17:36,6:29,11 | |
| 5304 chr22 12705552 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=4.8319e-09;SPV=0.93645 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:16,9:11,7:5,2 0/1:.:70:54,16:23,9:31,7 | |
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| 5306 chr22 12706344 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=8.8662e-16;SPV=0.78922 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:9,10:3,5:6,5 0/1:.:68:37,31:18,17:19,14 | |
| 5307 chr22 12706722 . C G . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=1.0678e-21;SPV=0.83166 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:8,6:5,13 0/1:.:70:34,36:18,15:16,21 | |
| 5308 chr22 12707332 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=3;GPV=1.4169e-08;SPV=0.4203 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:11,4:9,4:2,0 0/1:.:56:37,19:15,11:22,8 | |
| 5309 chr22 12707512 . C A . PASS DP=149;SS=1;SSC=5;GPV=5.6076e-16;SPV=0.26495 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:30,10:19,6:11,4 0/1:.:109:74,35:57,21:17,14 | |
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| 5358 chr22 12721473 . C G . PASS DP=180;SS=1;SSC=4;GPV=2.6992e-39;SPV=0.35058 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:86:40,46:18,30:22,16 0/1:.:94:40,54:23,30:17,24 | |
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| 5360 chr22 12721517 . A C . PASS DP=128;SS=1;SSC=3;GPV=8.2541e-13;SPV=0.44573 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:67:49,18:26,6:23,12 0/1:.:61:43,18:21,10:22,8 | |
| 5361 chr22 12721534 . T G . PASS DP=118;SS=1;SSC=0;GPV=1.497e-12;SPV=0.88684 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:39,20:18,10:21,10 0/1:.:59:44,15:23,9:21,6 | |
| 5362 chr22 12721738 . C A . PASS DP=154;SS=1;SSC=3;GPV=1.0122e-05;SPV=0.49404 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:82:74,8:22,1:52,7 0/1:.:72:64,8:25,1:39,7 | |
| 5363 chr22 12721861 . C T . PASS DP=114;SS=1;SSC=1;GPV=3.5461e-14;SPV=0.66253 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:33,18:13,7:20,11 0/1:.:63:42,21:19,10:23,11 | |
| 5364 chr22 12721990 . C T . PASS DP=99;SS=1;SSC=2;GPV=2.249e-09;SPV=0.50195 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:30,10:17,5:13,5 0/1:.:59:43,16:21,8:22,8 | |
| 5365 chr22 12723067 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=2;GPV=1.5103e-05;SPV=0.62448 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:31,7:15,2:16,5 0/1:.:44:36,8:19,3:17,5 | |
| 5366 chr22 12723173 . A G . PASS DP=50;SS=1;SSC=2;GPV=2.2975e-07;SPV=0.57887 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:20,12:4,1:16,11 0/1:.:18:11,7:5,3:6,4 | |
| 5367 chr22 12723237 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=8.6933e-09;SPV=0.88294 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:10,4:8,10 0/1:.:28:19,9:10,2:9,7 | |
| 5368 chr22 12723439 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=5;GPV=0.0006543;SPV=0.26346 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:29,4:19,2:10,2 0/1:.:28:22,6:12,3:10,3 | |
| 5369 chr22 12723837 . A C . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=0.0032091;SPV=0.56613 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:36,4:16,1:20,3 0/1:.:35:31,4:19,1:12,3 | |
| 5370 chr22 12723860 . A C . PASS DP=87;SS=1;SSC=5;GPV=0.00074273;SPV=0.29773 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:46:42,4:17,3:25,1 0/1:.:41:35,6:18,4:17,2 | |
| 5371 chr22 12724275 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.1519e-11;SPV=0.96412 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:12,16:5,11:7,5 0/1:.:37:23,14:8,12:15,2 | |
| 5372 chr22 12724289 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
| 5373 chr22 12724574 . G A . PASS DP=45;SS=1;SSC=5;GPV=1.8462e-05;SPV=0.26625 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:18,6:8,3:10,3 0/1:.:21:13,8:9,2:4,6 | |
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| 5421 chr22 12794103 . T A . PASS DP=102;SS=1;SSC=11;GPV=1.5147e-07;SPV=0.070552 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:40,6:23,4:17,2 0/1:.:56:41,15:17,10:24,5 | |
| 5422 chr22 12794656 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=5.9381e-08;SPV=0.52113 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:24,12:16,5:8,7 0/1:.:25:16,9:7,3:9,6 | |
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| 5424 chr22 12795714 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=3;GPV=5.0221e-16;SPV=0.42213 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:15,11:4,10 0/1:.:33:14,19:10,8:4,11 | |
| 5425 chr22 12797511 . A C . PASS DP=107;SS=1;SSC=1;GPV=3.8562e-15;SPV=0.63874 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:36,23:18,8:18,15 0/1:.:48:30,18:15,5:15,13 | |
| 5426 chr22 12799246 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=3;GPV=9.7502e-16;SPV=0.46602 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:13,10:16,14 0/1:.:35:18,17:5,9:13,8 | |
| 5427 chr22 12799469 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=6.9639e-12;SPV=0.79492 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:29,19:16,8:13,11 0/1:.:39:26,13:8,3:18,10 | |
| 5428 chr22 12800140 . A G . PASS DP=217;SS=1;SSC=8;GPV=0;SPV=0.13085 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:129:58,71:30,43:28,28 0/1:.:88:32,56:15,39:17,17 | |
| 5429 chr22 12801170 . C T . PASS DP=166;SS=1;SSC=2;GPV=6.6155e-17;SPV=0.60286 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:89:63,26:28,7:35,19 0/1:.:77:55,22:27,9:28,13 | |
| 5430 chr22 12801747 . C A . PASS DP=104;SS=1;SSC=2;GPV=2.2913e-12;SPV=0.58848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:39,19:14,14:25,5 0/1:.:46:31,15:12,7:19,8 | |
| 5431 chr22 12801772 . G C . PASS DP=137;SS=1;SSC=4;GPV=2.4058e-12;SPV=0.32942 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:69:53,16:16,10:37,6 0/1:.:68:49,19:15,8:34,11 | |
| 5432 chr22 12801805 . G T . PASS DP=188;SS=1;SSC=3;GPV=5.783e-10;SPV=0.41482 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:91:78,13:16,8:62,5 0/1:.:97:81,16:14,8:67,8 | |
| 5433 chr22 12802252 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=2;GPV=5.88e-11;SPV=0.52047 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:8,7:10,8 0/1:.:27:14,13:8,9:6,4 | |
| 5434 chr22 12802384 . G A . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,9:0,15 1/1:.:22:0,22:0,11:0,11 | |
| 5435 chr22 12802972 . G A . PASS DP=124;SS=1;SSC=10;GPV=5.9348e-29;SPV=0.086898 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:27,28:16,16:11,12 0/1:.:68:24,44:9,20:15,24 | |
| 5436 chr22 12803153 . T A . PASS DP=145;SS=1;SSC=0;GPV=8.803e-10;SPV=0.92224 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:68:52,16:22,8:30,8 0/1:.:77:65,12:37,6:28,6 | |
| 5437 chr22 12803173 . T A . PASS DP=141;SS=1;SSC=5;GPV=1.647e-24;SPV=0.25735 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:66:38,28:21,13:17,15 0/1:.:75:38,37:21,20:17,17 | |
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| 5485 chr22 12814329 . A C . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,16:0,8 1/1:.:16:0,16:0,6:0,10 | |
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| 5487 chr22 12815620 . C T . PASS DP=119;SS=1;SSC=2;GPV=3.9926e-07;SPV=0.60736 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:71:59,12:30,9:29,3 0/1:.:48:40,8:23,6:17,2 | |
| 5488 chr22 12816162 . A G . PASS DP=152;SS=1;SSC=1;GPV=4.7866e-32;SPV=0.68845 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:89:40,49:25,24:15,25 0/1:.:63:30,33:22,15:8,18 | |
| 5489 chr22 12816215 . C T . PASS DP=135;SS=1;SSC=4;GPV=6.6463e-11;SPV=0.36662 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:84:66,18:31,7:35,11 0/1:.:51:38,13:19,11:19,2 | |
| 5490 chr22 12816532 . T C . PASS DP=184;SS=1;SSC=0;GPV=5.7999e-31;SPV=0.98376 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:96:46,50:25,35:21,15 0/1:.:88:55,33:25,24:30,9 | |
| 5491 chr22 12816695 . C T . PASS DP=207;SS=1;SSC=2;GPV=9.9486e-15;SPV=0.58193 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:115:91,24:39,14:52,10 0/1:.:92:73,19:31,10:42,9 | |
| 5492 chr22 12817168 . G T . PASS DP=99;SS=1;SSC=6;GPV=5.898e-15;SPV=0.20971 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:35,20:16,4:19,16 0/1:.:43:23,20:14,12:9,8 | |
| 5493 chr22 12817657 . G C . PASS DP=148;SS=1;SSC=0;GPV=1.5616e-11;SPV=0.91346 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:72:53,19:32,8:21,11 0/1:.:76:62,14:30,9:32,5 | |
| 5494 chr22 12817746 . C A . PASS DP=98;SS=1;SSC=7;GPV=1.1974e-08;SPV=0.17478 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:41,10:15,4:26,6 0/1:.:47:33,14:15,2:18,12 | |
| 5495 chr22 12868331 . G A . PASS DP=34;SS=1;SSC=0;GPV=0.0055492;SPV=0.88567 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:11,4:11,4:0,0 0/1:.:19:16,3:16,3:0,0 | |
| 5496 chr22 12868733 . C T . PASS DP=247;SS=1;SSC=0;GPV=3.5685e-13;SPV=0.90925 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:112:91,21:84,20:7,1 0/1:.:135:117,18:105,14:12,4 | |
| 5497 chr22 12869208 . A G . PASS DP=429;SS=1;SSC=10;GPV=3.2336e-12;SPV=0.092953 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:189:177,12:86,3:91,9 0/1:.:240:215,25:106,10:109,15 | |
| 5498 chr22 12869535 . A C . PASS DP=151;SS=1;SSC=5;GPV=4.5922e-09;SPV=0.25195 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:60,10:25,2:35,8 0/1:.:81:65,16:25,4:40,12 | |
| 5499 chr22 12869793 . C A . PASS DP=326;SS=1;SSC=8;GPV=5.4317e-13;SPV=0.13984 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:139:126,13:81,7:45,6 0/1:.:187:161,26:124,7:37,19 | |
| 5500 chr22 12869803 . C T . PASS DP=300;SS=1;SSC=4;GPV=4.3432e-10;SPV=0.39553 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:132:120,12:73,11:47,1 0/1:.:168:150,18:104,15:46,3 | |
| 5501 chr22 12869909 . G A . PASS DP=258;SS=1;SSC=5;GPV=1.2709e-17;SPV=0.30115 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:115:94,21:56,13:38,8 0/1:.:143:112,31:66,24:46,7 | |
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| 5552 chr22 12882890 . G A . PASS DP=306;SS=1;SSC=8;GPV=1.0817e-13;SPV=0.12612 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:78:71,7:40,2:31,5 0/1:.:228:194,34:97,16:97,18 | |
| 5553 chr22 12884030 . T G . PASS DP=49;SOMATIC;SS=2;SSC=14;GPV=1;SPV=0.034857 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:13:12,1:6,1:6,0 0/1:.:36:22,14:11,7:11,7 | |
| 5554 chr22 12884043 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.9326e-06;SPV=0.94411 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:8,6:3,5:5,1 0/1:.:44:33,11:20,5:13,6 | |
| 5555 chr22 12885585 . G A . PASS DP=192;SOMATIC;SS=2;SSC=14;GPV=1;SPV=0.033417 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:62:57,5:36,1:21,4 0/1:.:130:105,25:49,12:56,13 | |
| 5556 chr22 12886416 . G C . PASS DP=126;SS=1;SSC=1;GPV=1.7774e-08;SPV=0.76766 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:37,10:37,9:0,1 0/1:.:79:65,14:65,14:0,0 | |
| 5557 chr22 12887083 . G T . PASS DP=358;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.69375 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:140:76,64:37,20:39,44 0/1:.:218:123,95:52,17:71,78 | |
| 5558 chr22 12887509 . T A . PASS DP=106;SS=1;SSC=3;GPV=3.2395e-15;SPV=0.39953 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:29,17:16,16:13,1 0/1:.:60:34,24:17,21:17,3 | |
| 5559 chr22 12887572 . T C . PASS DP=268;SS=1;SSC=1;GPV=3.712e-39;SPV=0.68766 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:118:69,49:49,36:20,13 0/1:.:150:91,59:64,39:27,20 | |
| 5560 chr22 12887673 . G A . PASS DP=370;SS=1;SSC=4;GPV=6.6994e-19;SPV=0.3541 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:161:138,23:78,18:60,5 0/1:.:209:175,34:95,22:80,12 | |
| 5561 chr22 12887794 . T C . PASS DP=187;SS=1;SSC=3;GPV=8.5079e-28;SPV=0.47265 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:83:50,33:24,11:26,22 0/1:.:104:61,43:30,16:31,27 | |
| 5562 chr22 12888273 . T C . PASS DP=36;SS=1;SSC=2;GPV=2.3419e-08;SPV=0.51456 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:8,9:3,6:5,3 0/1:.:19:8,11:5,4:3,7 | |
| 5563 chr22 12889167 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=5;GPV=0.0002925;SPV=0.27324 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:25,4:2,0:23,4 0/1:.:30:23,7:2,0:21,7 | |
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| 5621 chr22 15208718 . A G . PASS DP=33;SS=1;SSC=1;GPV=2.8029e-05;SPV=0.77846 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:5,4:3,1:2,3 0/1:.:24:15,9:8,7:7,2 | |
| 5622 chr22 15209028 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=3.47e-08;SPV=0.70918 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:10,5:6,4:4,1 0/1:.:56:39,17:29,10:10,7 | |
| 5623 chr22 15209282 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,8:0,5 1/1:.:46:0,46:0,24:0,22 | |
| 5624 chr22 15220304 . G T . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=2.1616e-07;SPV=0.63991 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:29,11:13,1:16,10 0/1:.:34:25,9:6,4:19,5 | |
| 5625 chr22 15220500 . C G . PASS DP=26;SS=1;SSC=1;GPV=0.00012791;SPV=0.78585 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:7,6:3,1:4,5 0/1:.:13:8,5:7,4:1,1 | |
| 5626 chr22 15220631 . G A . PASS DP=27;SS=1;SSC=4;GPV=0.0001362;SPV=0.36323 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:11,6:9,4:2,2 0/1:.:10:5,5:5,3:0,2 | |
| 5627 chr22 15220671 . A G . PASS DP=24;SS=1;SSC=0;GPV=3.101e-14;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,12:0,1 1/1:.:11:0,11:0,10:0,1 | |
| 5628 chr22 15220904 . C T . PASS DP=123;SS=1;SSC=2;GPV=6.5743e-10;SPV=0.58001 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:66:51,15:30,7:21,8 0/1:.:57:44,13:21,4:23,9 | |
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| 5679 chr22 15341326 . A G . PASS DP=29;SS=1;SSC=5;GPV=5.4216e-09;SPV=0.26257 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:5,7:3,3:2,4 1/1:.:17:4,13:4,6:0,7 | |
| 5680 chr22 15342394 . G T . PASS DP=35;SS=1;SSC=0;GPV=5.7598e-07;SPV=0.87979 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:7,9:6,4:1,5 0/1:.:19:11,8:7,5:4,3 | |
| 5681 chr22 15343257 . G A . PASS DP=39;SS=1;SSC=3;GPV=8.1342e-07;SPV=0.49121 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:9,6:5,2:4,4 0/1:.:24:13,11:5,2:8,9 | |
| 5682 chr22 15349102 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=6.9672e-12;SPV=0.69952 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:12,13:7,8:5,5 0/1:.:35:18,17:11,10:7,7 | |
| 5683 chr22 15349250 . T C . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,7:0,6 1/1:.:19:0,19:0,10:0,9 | |
| 5684 chr22 15349642 . T C . PASS DP=124;SS=1;SSC=1;GPV=3.37853e-42;SPV=0.7621 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:71:16,55:8,40:8,15 0/1:.:53:14,39:8,22:6,17 | |
| 5685 chr22 15351194 . G T . PASS DP=27;SS=1;SSC=0;GPV=0.0001362;SPV=0.8331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:10,8:1,2:9,6 0/1:.:9:6,3:2,1:4,2 | |
| 5686 chr22 15351489 . A G . PASS DP=32;SS=1;SSC=2;GPV=4.1013e-07;SPV=0.63013 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:8,9:4,5:4,4 0/1:.:15:7,8:3,2:4,6 | |
| 5687 chr22 15353753 . C T . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=1.4682e-08;SPV=0.92112 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:8,12:7,7:1,5 0/1:.:21:12,9:5,4:7,5 | |
| 5688 chr22 15359487 . C A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.768e-06;SPV=0.99219 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:9,9:5,4:4,5 0/1:.:37:29,8:12,5:17,3 | |
| 5689 chr22 15369969 . C G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=5.6911e-08;SPV=0.97756 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:7,8:6,3:1,5 0/1:.:45:32,13:19,6:13,7 | |
| 5690 chr22 15369970 . T G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.1134e-08;SPV=0.92735 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:9,8:8,3:1,5 0/1:.:48:33,15:20,6:13,9 | |
| 5691 chr22 15371634 . G C . PASS DP=45;SS=1;SSC=2;GPV=7.724e-09;SPV=0.53813 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:7,6:3,3:4,3 0/1:.:32:16,16:9,8:7,8 | |
| 5692 chr22 15375371 . T A . PASS DP=46;SS=1;SSC=1;GPV=1.2413e-06;SPV=0.6752 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:5,3:2,2:3,1 0/1:.:38:24,14:12,12:12,2 | |
| 5693 chr22 15418549 . C G . PASS DP=28;SS=1;SSC=0;GPV=0.002188;SPV=0.86858 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:5,3:3,2:2,1 0/1:.:20:15,5:8,1:7,4 | |
| 5694 chr22 15436252 . A C . PASS DP=31;SS=1;SSC=1;GPV=3.2956e-08;SPV=0.78547 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:3,6:0,3:3,3 0/1:.:22:9,13:3,5:6,8 | |
| 5695 chr22 15437261 . G A . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=2.2206e-08;SPV=0.94345 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:7,10:1,3:6,7 0/1:.:28:17,11:7,5:10,6 | |
| 5696 chr22 15440606 . T G . PASS DP=30;SS=1;SSC=0;GPV=8.3837e-06;SPV=0.98691 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:3,7:3,4:0,3 0/1:.:20:13,7:7,4:6,3 | |
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| 5698 chr22 15466244 . A G . PASS DP=43;SS=1;SSC=1;GPV=1.6529e-11;SPV=0.66035 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:4,7:2,4:2,3 0/1:.:32:12,20:7,13:5,7 | |
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| 5736 chr22 15531668 . T G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.0134e-13;SPV=0.8774 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:9,12:8,5 0/1:.:48:29,19:13,16:16,3 | |
| 5737 chr22 15531753 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=2.6432e-07;SPV=0.8764 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:16,7:10,2:6,5 0/1:.:61:48,13:37,6:11,7 | |
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| 5742 chr22 15534986 . T A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=0.00014479;SPV=0.96285 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:16,6:4,1:12,5 0/1:.:47:41,6:20,3:21,3 | |
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| 5747 chr22 15541395 . T C . PASS DP=113;SS=1;SSC=3;GPV=2.054e-15;SPV=0.48404 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:27,15:20,3:7,12 0/1:.:71:44,27:17,10:27,17 | |
| 5748 chr22 15542663 . C T . PASS DP=154;SS=1;SSC=4;GPV=2.1373e-09;SPV=0.31778 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:72:61,11:30,6:31,5 0/1:.:82:66,16:34,5:32,11 | |
| 5749 chr22 15542891 . A G . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=1.2435e-16;SPV=0.83137 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:13,12:12,11 0/1:.:52:31,21:15,6:16,15 | |
| 5750 chr22 15543393 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=9.829e-08;SPV=0.8215 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:22,10:13,3:9,7 0/1:.:45:34,11:19,3:15,8 | |
| 5751 chr22 15543851 . T C . PASS DP=118;SS=1;SSC=6;GPV=2.0394e-11;SPV=0.24263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:43,13:23,3:20,10 0/1:.:62:43,19:22,5:21,14 | |
| 5752 chr22 15544192 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=11;GPV=2.9827e-28;SPV=0.072073 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:15,27:5,9:10,18 1/1:.:46:9,37:6,15:3,22 | |
| 5753 chr22 15544356 . G A . PASS DP=105;SS=1;SSC=5;GPV=1.5709e-07;SPV=0.2965 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:40,8:22,4:18,4 0/1:.:57:44,13:21,7:23,6 | |
| 5754 chr22 15548491 . G A . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=0.00031821;SPV=0.9818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:4,6:3,3:1,3 0/1:.:15:11,4:10,2:1,2 | |
| 5755 chr22 15548844 . C T . PASS DP=63;SOMATIC;SS=2;SSC=13;GPV=1;SPV=0.04583 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:23:21,2:14,2:7,0 0/1:.:40:28,12:11,10:17,2 | |
| 5756 chr22 15549198 . A G . PASS DP=94;SS=1;SSC=1;GPV=3.448e-06;SPV=0.75474 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:32,8:19,1:13,7 0/1:.:54:45,9:18,5:27,4 | |
| 5757 chr22 15549422 . G T . PASS DP=39;SS=1;SSC=1;GPV=1.4735e-05;SPV=0.66287 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:7,4:4,0:3,4 0/1:.:28:18,10:10,3:8,7 | |
| 5758 chr22 15549456 . A G . PASS DP=35;SS=1;SSC=4;GPV=4.6576e-10;SPV=0.38214 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:5,7:0,4:5,3 0/1:.:23:7,16:3,9:4,7 | |
| 5759 chr22 15549664 . G A . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=1.1855e-14;SPV=0.93328 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:2,17:2,10:0,7 1/1:.:17:4,13:2,5:2,8 | |
| 5760 chr22 15550120 . A G . PASS DP=142;SS=1;SSC=8;GPV=6.1582e-12;SPV=0.13195 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:52,12:21,8:31,4 0/1:.:78:56,22:32,6:24,16 | |
| 5761 chr22 15550443 . T C . PASS DP=110;SS=1;SSC=0;GPV=8.4808e-06;SPV=0.96737 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:28,8:15,2:13,6 0/1:.:74:66,8:34,5:32,3 | |
| 5762 chr22 15552330 . A C . PASS DP=117;SS=1;SSC=2;GPV=1.8908e-05;SPV=0.54288 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:50,7:25,4:25,3 0/1:.:60:52,8:21,3:31,5 | |
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| 5812 chr22 15578271 . T A . PASS DP=117;SS=1;SSC=4;GPV=8.0247e-08;SPV=0.32382 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:38,7:12,5:26,2 0/1:.:72:57,15:12,10:45,5 | |
| 5813 chr22 15578507 . C T . PASS DP=113;SS=1;SSC=1;GPV=3.9763e-05;SPV=0.7937 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:49,8:32,1:17,7 0/1:.:56:50,6:31,2:19,4 | |
| 5814 chr22 15578650 . T G . PASS DP=287;SS=1;SSC=0;GPV=3.7766e-19;SPV=0.88856 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:126:78,28:41,11:37,17 0/1:.:161:108,28:60,22:48,6 | |
| 5815 chr22 15578651 . A G . PASS DP=299;SS=1;SSC=4;GPV=9.6961e-11;SPV=0.39332 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:133:120,13:58,9:62,4 0/1:.:166:147,19:88,10:59,9 | |
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| 5817 chr22 15581115 . C T . PASS DP=209;SS=1;SSC=3;GPV=2.8108e-07;SPV=0.43141 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:118:107,11:57,4:50,7 0/1:.:91:81,10:42,4:39,6 | |
| 5818 chr22 15581349 . C A . PASS DP=76;SS=1;SSC=4;GPV=0.00071196;SPV=0.36803 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:34,4:1,0:33,4 0/1:.:38:32,6:0,0:32,6 | |
| 5819 chr22 15582930 . C T . PASS DP=124;SS=1;SSC=0;GPV=1.2643e-10;SPV=0.86117 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:51,19:28,10:23,9 0/1:.:54:43,11:18,6:25,5 | |
| 5820 chr22 15583999 . G C . PASS DP=199;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.032072 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:103:71,32:28,11:43,21 0/1:.:96:53,43:17,14:36,29 | |
| 5821 chr22 15584435 . A T . PASS DP=44;SS=3;SSC=13;GPV=1;SPV=0.044088 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:17,4:9,1:8,3 0/0:.:23:23,0:13,0:10,0 | |
| 5822 chr22 15584652 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=5;GPV=3.7283e-09;SPV=0.30936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:18,9:10,4:8,5 0/1:.:35:20,15:11,5:9,10 | |
| 5823 chr22 15589662 . T C . PASS DP=47;SS=1;SSC=2;GPV=5.072e-07;SPV=0.51843 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:14,8:8,7:6,1 0/1:.:25:15,10:8,8:7,2 | |
| 5824 chr22 15590051 . T C . PASS DP=44;SS=1;SSC=1;GPV=0.00054972;SPV=0.77334 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:18,6:11,3:7,3 0/1:.:20:16,4:8,1:8,3 | |
| 5825 chr22 15590852 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=4;GPV=1.0405e-07;SPV=0.36799 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:21,11:14,4:7,7 0/1:.:21:12,9:10,5:2,4 | |
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| 5881 chr22 15630971 . G A . PASS DP=129;SS=1;SSC=8;GPV=9.2996e-06;SPV=0.13423 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:61:56,5:33,2:23,3 0/1:.:68:57,11:20,5:37,6 | |
| 5882 chr22 15631216 . G A . PASS DP=145;SS=1;SSC=5;GPV=2.2245e-13;SPV=0.27525 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:69:53,16:32,8:21,8 0/1:.:76:54,22:26,11:28,11 | |
| 5883 chr22 15631362 . T A . PASS DP=198;SS=1;SSC=2;GPV=2.8398e-08;SPV=0.58278 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:91:80,11:60,6:20,5 0/1:.:107:94,13:59,11:35,2 | |
| 5884 chr22 15631572 . C T . PASS DP=262;SS=1;SSC=0;GPV=3.50325e-44;SPV=0.94615 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:141:71,70:32,39:39,31 0/1:.:121:72,49:35,28:37,21 | |
| 5885 chr22 15631867 . A G . PASS DP=161;SS=1;SSC=3;GPV=4.9727e-09;SPV=0.48026 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:72:61,11:25,4:36,7 0/1:.:89:74,15:32,9:42,6 | |
| 5886 chr22 15632009 . T G . PASS DP=155;SS=1;SSC=1;GPV=4.9402e-08;SPV=0.70959 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:76:64,12:29,6:35,6 0/1:.:79:68,11:33,4:35,7 | |
| 5887 chr22 15632349 . T G . PASS DP=147;SS=1;SSC=0;GPV=6.6326e-29;SPV=0.92376 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:67:29,38:19,17:10,21 0/1:.:80:43,37:27,21:16,16 | |
| 5888 chr22 15632562 . C A . PASS DP=156;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:84:0,84:0,62:0,22 1/1:.:72:0,72:0,43:0,29 | |
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| 5940 chr22 15672497 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,31:0,6 1/1:.:25:0,25:0,15:0,10 | |
| 5941 chr22 15675677 . C A . PASS DP=93;SS=1;SSC=3;GPV=4.6174e-09;SPV=0.40938 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:39,13:24,4:15,9 0/1:.:41:29,12:15,4:14,8 | |
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| 5944 chr22 15678375 . G A . PASS DP=151;SS=1;SSC=0;GPV=9.3781e-10;SPV=0.82094 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:44,12:24,3:20,9 0/1:.:95:79,16:38,6:41,10 | |
| 5945 chr22 15680325 . T C . PASS DP=22;SS=1;SSC=1;GPV=0.0044505;SPV=0.72446 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:6,3:0,0:6,3 0/1:.:13:9,4:0,0:9,4 | |
| 5946 chr22 15681346 . T G . PASS DP=108;SS=1;SSC=3;GPV=0.00037358;SPV=0.43181 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:47:43,4:36,1:7,3 0/1:.:61:54,7:41,5:13,2 | |
| 5947 chr22 15681383 . T C . PASS DP=131;SS=1;SSC=4;GPV=9.4439e-07;SPV=0.35347 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:50,7:42,4:8,3 0/1:.:74:62,12:48,7:14,5 | |
| 5948 chr22 15682040 . C G . PASS DP=138;SS=1;SSC=0;GPV=1.3742e-14;SPV=0.82593 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:36,18:20,14:16,4 0/1:.:84:61,23:27,15:34,8 | |
| 5949 chr22 15682724 . T G . PASS DP=20;SS=1;SSC=0;GPV=0.023562;SPV=0.94221 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:5,3:4,2:1,1 0/1:.:12:10,2:9,2:1,0 | |
| 5950 chr22 15685968 . A G . PASS DP=170;SS=1;SSC=2;GPV=2.2744e-18;SPV=0.51809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:84:50,26:33,15:17,11 0/1:.:86:46,25:35,14:11,11 | |
| 5951 chr22 15686219 . G A . PASS DP=169;SS=1;SSC=7;GPV=2.2057e-05;SPV=0.19605 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:91:85,6:48,5:37,1 0/1:.:78:69,9:31,7:38,2 | |
| 5952 chr22 15686431 . C A . PASS DP=76;SS=1;SSC=3;GPV=0.0015196;SPV=0.39818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:41:37,4:1,0:36,4 0/1:.:35:30,5:2,0:28,5 | |
| 5953 chr22 15687108 . C T . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=1.6451e-12;SPV=0.84248 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:35,22:25,14:10,8 0/1:.:39:27,12:15,8:12,4 | |
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| 5955 chr22 15687735 . G A . PASS DP=153;SOMATIC;SS=2;SSC=15;GPV=1;SPV=0.031484 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:87:79,8:41,3:38,5 0/1:.:66:52,14:33,6:19,8 | |
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| 6004 chr22 15714311 . A T . PASS DP=216;SS=1;SSC=5;GPV=1.5458e-23;SPV=0.29156 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:114:81,33:51,17:30,16 0/1:.:102:68,34:37,22:31,12 | |
| 6005 chr22 15714327 . G C . PASS DP=218;SS=1;SSC=1;GPV=3.1599e-09;SPV=0.69655 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:115:100,15:57,8:43,7 0/1:.:103:91,12:51,5:40,7 | |
| 6006 chr22 15717285 . C T . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=5.7997e-17;SPV=0.92664 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:1,16:1,10:0,6 1/1:.:20:3,17:3,9:0,8 | |
| 6007 chr22 15717695 . C T . PASS DP=140;SS=1;SSC=3;GPV=2.558e-12;SPV=0.42235 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:72:55,17:33,10:22,7 0/1:.:68:50,18:23,12:27,6 | |
| 6008 chr22 15718338 . G A . PASS DP=26;SS=1;SSC=8;GPV=1.7241e-06;SPV=0.12864 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:7,5:4,4:3,1 0/1:.:14:4,10:3,6:1,4 | |
| 6009 chr22 15718944 . A G . PASS DP=110;SS=1;SSC=0;GPV=5.1933e-10;SPV=0.80821 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:41,16:27,7:14,9 0/1:.:53:41,12:30,5:11,7 | |
| 6010 chr22 15720256 . G A . PASS DP=51;SS=1;SSC=3;GPV=4.7339e-09;SPV=0.44952 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:6,7:9,4 0/1:.:25:13,12:6,4:7,8 | |
| 6011 chr22 15721141 . G A . PASS DP=212;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.70997 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:120:31,89:26,64:5,25 0/1:.:92:26,66:20,46:6,20 | |
| 6012 chr22 15721451 . A G . PASS DP=252;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.03395 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:139:111,28:57,10:54,18 0/1:.:113:78,35:36,10:42,25 | |
| 6013 chr22 15721505 . G A . PASS DP=167;SS=1;SSC=1;GPV=1.0036e-10;SPV=0.69455 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:82:66,16:16,2:50,14 0/1:.:85:70,15:15,5:55,10 | |
| 6014 chr22 15722098 . C A . PASS DP=105;SS=1;SSC=7;GPV=6.9819e-08;SPV=0.19211 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:45,9:27,5:18,4 0/1:.:51:38,13:17,7:21,6 | |
| 6015 chr22 15723605 . G A . PASS DP=29;SS=1;SSC=0;GPV=7.6888e-08;SPV=0.88628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:5,11:1,5:4,6 0/1:.:13:6,7:2,4:4,3 | |
| 6016 chr22 15724353 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=0.0061097;SPV=0.92919 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:14,4:14,4:0,0 0/1:.:28:25,3:25,3:0,0 | |
| 6017 chr22 15725369 . C A . PASS DP=38;SS=1;SSC=7;GPV=9.2415e-08;SPV=0.16499 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:11,7:4,3:7,4 0/1:.:20:8,12:4,5:4,7 | |
| 6018 chr22 15725682 . G A . PASS DP=23;SS=1;SSC=5;GPV=9.5813e-07;SPV=0.2779 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:5,6:3,2:2,4 1/1:.:12:3,9:1,6:2,3 | |
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| 6200 chr22 15807199 . G T . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=3.3581e-05;SPV=0.52335 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:32,6:16,3:16,3 0/1:.:45:37,8:17,3:20,5 | |
| 6201 chr22 15809240 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=5.6671e-10;SPV=0.48929 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:17,11:10,6:7,5 0/1:.:35:20,15:9,7:11,8 | |
| 6202 chr22 15809310 . G A . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=0.0013495;SPV=0.90075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:22,6:8,4:14,2 0/1:.:25:22,3:13,2:9,1 | |
| 6203 chr22 15809421 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=1.5394e-06;SPV=0.93181 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:14,10:5,5:9,5 0/1:.:27:20,7:12,4:8,3 | |
| 6204 chr22 15810784 . C A . PASS DP=91;SS=1;SSC=7;GPV=2.9539e-07;SPV=0.19019 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:35,7:5,1:30,6 0/1:.:49:36,13:11,5:25,8 | |
| 6205 chr22 15810989 . C A . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0.00016419;SPV=0.89015 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:34,7:21,3:13,4 0/1:.:48:43,5:26,3:17,2 | |
| 6206 chr22 15811320 . A G . PASS DP=377;SS=1;SSC=6;GPV=7.022e-19;SPV=0.2256 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:186:161,25:89,14:72,11 0/1:.:191:159,32:85,14:74,18 | |
| 6207 chr22 15813627 . A T . PASS DP=103;SS=1;SSC=11;GPV=1.6922e-06;SPV=0.070796 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:52,7:36,4:16,3 0/1:.:44:33,11:20,9:13,2 | |
| 6208 chr22 15813700 . C T . PASS DP=244;SS=1;SSC=7;GPV=3.604e-10;SPV=0.1899 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:120:108,12:51,7:57,5 0/1:.:124:106,18:47,10:59,8 | |
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| 6267 chr22 15836454 . T G . PASS DP=107;SS=1;SSC=7;GPV=2.0808e-16;SPV=0.17024 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:27,14:13,5:14,9 0/1:.:66:36,30:12,11:24,19 | |
| 6268 chr22 15836799 . C T . PASS DP=22;SS=1;SSC=0;GPV=4.7526e-13;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:0,8:0,4:0,4 1/1:.:14:0,14:0,5:0,9 | |
| 6269 chr22 15836852 . A G . PASS DP=30;SOMATIC;SS=2;SSC=9;GPV=1;SPV=0.12566 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:8:8,0:6,0:2,0 0/1:.:22:16,6:8,2:8,4 | |
| 6270 chr22 15837593 . T C . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=1.3852e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,8:0,1 1/1:.:24:0,24:0,20:0,4 | |
| 6271 chr22 15837787 . A C . PASS DP=112;SS=1;SSC=4;GPV=1.5576e-37;SPV=0.37242 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:16,43:6,39:10,4 1/1:.:53:12,41:7,34:5,7 | |
| 6272 chr22 15838016 . T C . PASS DP=157;SS=1;SSC=3;GPV=5.9858e-13;SPV=0.49413 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:78:40,17:11,4:29,13 0/1:.:79:41,19:10,9:31,10 | |
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| 6275 chr22 15838531 . T C . PASS DP=191;SS=1;SSC=0;GPV=1.2868e-08;SPV=0.8604 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:84:71,13:40,12:31,1 0/1:.:107:95,12:52,6:43,6 | |
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| 6325 chr22 15863111 . T C . PASS DP=182;SS=1;SSC=1;GPV=4.2102e-17;SPV=0.73639 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:73:52,21:17,6:35,15 0/1:.:109:81,28:35,12:46,16 | |
| 6326 chr22 15863252 . A G . PASS DP=174;SS=1;SSC=6;GPV=7.2066e-14;SPV=0.22226 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:81:65,16:38,10:27,6 0/1:.:93:69,24:34,13:35,11 | |
| 6327 chr22 15863445 . T C . PASS DP=210;SS=1;SSC=4;GPV=1.335e-07;SPV=0.3566 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:108:98,10:53,9:45,1 0/1:.:102:90,12:53,4:37,8 | |
| 6328 chr22 15863626 . C T . PASS DP=186;SS=1;SSC=8;GPV=2.4771e-06;SPV=0.12595 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:91:85,6:36,3:49,3 0/1:.:95:83,12:37,5:46,7 | |
| 6329 chr22 15865035 . A T . PASS DP=120;SS=1;SSC=1;GPV=8.6623e-05;SPV=0.65234 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:56,7:25,2:31,5 0/1:.:57:51,6:21,4:30,2 | |
| 6330 chr22 15867063 . C G . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=1.1753e-14;SPV=0.45702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:14,11:9,5:5,6 0/1:.:56:29,27:11,14:18,13 | |
| 6331 chr22 15871396 . C A . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=1.1869e-05;SPV=0.50319 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:15,4:13,4:2,0 0/1:.:44:33,11:32,11:1,0 | |
| 6332 chr22 15871594 . T G . PASS DP=118;SS=1;SSC=1;GPV=1.3887e-09;SPV=0.64221 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:26,8:18,6:8,2 0/1:.:84:65,19:34,15:31,4 | |
| 6333 chr22 15871609 . C G . PASS DP=132;SS=1;SSC=2;GPV=4.1752e-08;SPV=0.61191 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:33,7:21,5:12,2 0/1:.:92:76,16:40,8:36,8 | |
| 6334 chr22 15871630 . C G . PASS DP=157;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.61466 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:14,37:9,20:5,17 0/1:.:106:30,76:17,39:13,37 | |
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| 6337 chr22 15872619 . G A . PASS DP=43;SOMATIC;SS=2;SSC=4;GPV=1;SPV=0.37579 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:9:9,0:7,0:2,0 0/1:.:34:30,4:19,3:11,1 | |
| 6338 chr22 15872768 . G T . PASS DP=185;SS=1;SSC=0;GPV=5.6651e-10;SPV=0.93708 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:50,13:31,6:19,7 0/1:.:122:106,16:55,5:51,11 | |
| 6339 chr22 15872835 . G C . PASS DP=117;SS=1;SSC=1;GPV=5.0184e-20;SPV=0.72172 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:15,14:12,7:3,7 0/1:.:88:49,39:27,8:22,31 | |
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| 6396 chr22 15917213 . C G . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=7.1095e-15;SPV=0.76461 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:11,10:11,10 0/1:.:45:26,19:14,13:12,6 | |
| 6397 chr22 15917318 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=2.8994e-05;SPV=0.59269 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:20,5:13,2:7,3 0/1:.:43:34,9:23,6:11,3 | |
| 6398 chr22 15917491 . G A . PASS DP=44;SS=1;SSC=4;GPV=1.0096e-05;SPV=0.35897 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:2,6:2,4:0,2 0/1:.:26:0,5:0,4:0,1 | |
| 6399 chr22 15917830 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,9:0,33 1/1:.:48:0,48:0,16:0,32 | |
| 6400 chr22 15918255 . A T . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=1.5066e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,3:0,24 1/1:.:16:0,16:0,3:0,13 | |
| 6401 chr22 15918274 . G A . PASS DP=45;SS=1;SSC=4;GPV=0.0027808;SPV=0.34446 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:24,4:4,0:20,4 0/1:.:17:13,4:3,1:10,3 | |
| 6402 chr22 15918589 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=9;GPV=6.5895e-16;SPV=0.10871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:13,14:13,11:0,3 0/1:.:34:10,24:9,21:1,3 | |
| 6403 chr22 15918927 . C T . PASS DP=153;SS=1;SSC=6;GPV=9.4013e-27;SPV=0.24885 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:81:46,35:21,15:25,20 0/1:.:72:36,36:16,17:20,19 | |
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| 6456 chr22 15934599 . T G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,5:0,14 1/1:.:44:0,44:0,24:0,20 | |
| 6457 chr22 15935258 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,8:0,10 1/1:.:44:0,44:0,13:0,31 | |
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| 6462 chr22 15937418 . T G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.0762e-09;SPV=0.84399 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:17,12:5,4:12,8 0/1:.:40:27,13:16,8:11,5 | |
| 6463 chr22 15937496 . G C . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=1.8267e-08;SPV=0.36705 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:26,9:12,7:14,2 0/1:.:44:30,14:16,9:14,5 | |
| 6464 chr22 15937743 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 1/1:.:52:0,52:0,26:0,26 | |
| 6465 chr22 15938046 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,13:0,8 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 | |
| 6466 chr22 15938518 . A C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=2.025e-08;SPV=0.93739 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:12,11:6,8:6,3 0/1:.:35:24,11:11,3:13,8 | |
| 6467 chr22 15938998 . T G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 6468 chr22 15939090 . G T . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=4.6843e-08;SPV=0.78485 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:26,11:13,7:13,4 0/1:.:45:34,11:17,7:17,4 | |
| 6469 chr22 15939402 . C G . PASS DP=73;SS=1;SSC=5;GPV=6.0706e-06;SPV=0.25447 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:29,6:13,3:16,3 0/1:.:38:28,10:13,7:15,3 | |
| 6470 chr22 15939510 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 1/1:.:43:0,43:0,23:0,20 | |
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| 6472 chr22 15939577 . A C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.0525e-07;SPV=0.95489 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:23,12:13,5:10,7 0/1:.:45:36,9:19,5:17,4 | |
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| 6525 chr22 15984077 . A G . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,10:0,8 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
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| 6530 chr22 15984781 . C G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 1/1:.:21:0,21:0,9:0,12 | |
| 6531 chr22 15984883 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,19:0,24 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 6532 chr22 15984990 . T G . PASS DP=62;SS=1;SSC=3;GPV=4.1425e-35;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:1,30:0,20:1,10 1/1:.:31:0,31:0,23:0,8 | |
| 6533 chr22 15985054 . A C . PASS DP=57;SS=1;SSC=7;GPV=1.4722e-11;SPV=0.17095 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:11,8:7,6 0/1:.:25:10,15:6,11:4,4 | |
| 6534 chr22 15985218 . G C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 | |
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| 6592 chr22 16024831 . C G . PASS DP=33;SS=1;SSC=1;GPV=1.5143e-07;SPV=0.64274 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:5,6:4,3:1,3 0/1:.:22:10,12:3,6:7,6 | |
| 6593 chr22 16024910 . T C . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:0,12:0,7:0,5 1/1:.:20:0,20:0,12:0,8 | |
| 6594 chr22 16025025 . C G . PASS DP=41;SS=1;SSC=8;GPV=4.8137e-09;SPV=0.15705 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:9,6:6,1:3,5 0/1:.:26:10,16:7,7:3,9 | |
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| 6596 chr22 16025292 . A G . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=5.3443e-07;SPV=0.95978 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:6,7:3,5:3,2 0/1:.:35:24,11:11,9:13,2 | |
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| 6598 chr22 16025613 . G C . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=1.0581e-06;SPV=0.87163 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:9,8:7,4:2,4 0/1:.:26:17,9:8,6:9,3 | |
| 6599 chr22 16026128 . T C . PASS DP=39;SS=1;SSC=0;GPV=3.6742e-23;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,10:0,9 1/1:.:20:0,20:0,10:0,10 | |
| 6600 chr22 16026417 . C G . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=6.9312e-07;SPV=0.98206 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:5,9:3,5:2,4 0/1:.:23:15,8:11,6:4,2 | |
| 6601 chr22 16026464 . G T . PASS DP=37;SS=1;SSC=2;GPV=4.2437e-19;SPV=0.62012 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:1,13:1,7:0,6 1/1:.:23:1,22:1,14:0,8 | |
| 6602 chr22 16028132 . G T . PASS DP=34;SS=1;SSC=3;GPV=1.4997e-06;SPV=0.41742 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:5,3:1,1:4,2 0/1:.:26:13,13:6,7:7,6 | |
| 6603 chr22 16028582 . A G . PASS DP=36;SS=1;SSC=1;GPV=6.3405e-07;SPV=0.7189 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:5,5:3,2:2,3 0/1:.:26:14,12:4,7:10,5 | |
| 6604 chr22 16029395 . G A . PASS DP=36;SS=1;SSC=1;GPV=2.3419e-08;SPV=0.64744 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:4,5:2,3:2,2 0/1:.:27:12,15:7,5:5,10 | |
| 6605 chr22 16034728 . T G . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:0,8:0,3:0,5 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
| 6606 chr22 16034808 . T C . PASS DP=49;SOMATIC;SS=2;SSC=11;GPV=1;SPV=0.067099 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:8:8,0:5,0:3,0 0/1:.:41:28,13:13,7:15,6 | |
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| 6608 chr22 16037636 . A C . PASS DP=35;SS=1;SSC=4;GPV=4.6576e-10;SPV=0.3614 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:4,5:2,4:2,1 0/1:.:26:8,18:2,9:6,9 | |
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| 6660 chr22 16097540 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=1.7027e-12;SPV=0.59803 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:12,8:11,13 0/1:.:23:12,11:4,7:8,4 | |
| 6661 chr22 16097606 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=3;GPV=5.8427e-13;SPV=0.45999 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:9,9:12,10 0/1:.:27:13,14:10,6:3,8 | |
| 6662 chr22 16097816 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=1.5567e-13;SPV=0.66227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:13,12:9,8 0/1:.:33:18,15:9,9:9,6 | |
| 6663 chr22 16098381 . A T . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=2.8393e-16;SPV=0.52842 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:16,25:8,9:8,16 0/1:.:22:8,14:3,10:5,4 | |
| 6664 chr22 16098497 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 1/1:.:28:0,28:0,18:0,10 | |
| 6665 chr22 16098798 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=4;GPV=7.3575e-14;SPV=0.32289 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:12,4:4,10 0/1:.:38:17,21:5,12:12,9 | |
| 6666 chr22 16099824 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=11;GPV=2.1774e-09;SPV=0.069329 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:22,12:12,9:10,3 0/1:.:20:8,12:3,8:5,4 | |
| 6667 chr22 16099826 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 | |
| 6668 chr22 16100373 . A G . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,7:0,19 1/1:.:19:0,19:0,8:0,11 | |
| 6669 chr22 16100673 . G A . PASS DP=43;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.043255 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:15,9:12,6:3,3 0/1:.:19:6,13:3,9:3,4 | |
| 6670 chr22 16100708 . C T . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=2.7295e-10;SPV=0.88548 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:11,17:8,13:3,4 0/1:.:17:9,8:6,6:3,2 | |
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| 6672 chr22 16101373 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=1.8643e-13;SPV=0.54142 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:13,5:8,12 0/1:.:39:21,18:9,12:12,6 | |
| 6673 chr22 16101499 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=7;GPV=3.195e-13;SPV=0.19596 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:9,11:10,6 0/1:.:26:10,16:2,7:8,9 | |
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| 6721 chr22 16170218 . C G . PASS DP=57;SS=1;SSC=1;GPV=4.8496e-12;SPV=0.63746 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:9,4:6,13 0/1:.:25:12,13:4,5:8,8 | |
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| 6723 chr22 16170969 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=2.3338e-15;SPV=0.67862 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:13,21:9,9:4,12 0/1:.:27:11,16:8,5:3,11 | |
| 6724 chr22 16171230 . A G . PASS DP=48;SS=1;SSC=3;GPV=2.0555e-07;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:15,9:5,7:10,2 0/1:.:24:14,10:8,4:6,6 | |
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| 6726 chr22 16173096 . C T . PASS DP=36;SS=1;SSC=4;GPV=6.3405e-07;SPV=0.34716 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:9,6:3,2:6,4 0/1:.:21:10,11:3,5:7,6 | |
| 6727 chr22 16173097 . A C . PASS DP=39;SS=1;SSC=1;GPV=1.0268e-07;SPV=0.67673 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:8,8:2,4:6,4 0/1:.:23:12,11:5,5:7,6 | |
| 6728 chr22 16173627 . G T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=5.5047e-12;SPV=0.86086 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:11,15:8,10:3,5 0/1:.:32:17,15:10,7:7,8 | |
| 6729 chr22 16174471 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=7;GPV=1.9336e-12;SPV=0.17832 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:12,12:7,6:5,6 0/1:.:27:9,18:6,8:3,10 | |
| 6730 chr22 16174939 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0345e-10;SPV=0.83621 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:7,9:8,8 0/1:.:23:13,10:7,3:6,7 | |
| 6731 chr22 16175116 . C G . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=3.6885e-12;SPV=0.48951 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:11,12:4,5:7,7 0/1:.:32:14,18:8,12:6,6 | |
| 6732 chr22 16176203 . A C . PASS DP=56;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.039548 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:14,10:9,4:5,6 0/1:.:32:10,22:5,10:5,12 | |
| 6733 chr22 16176826 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=1.6571e-10;SPV=0.4092 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:17,7:7,11 0/1:.:18:9,9:5,5:4,4 | |
| 6734 chr22 16176930 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=6.2293e-15;SPV=0.34689 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:14,12:11,11 0/1:.:27:12,15:8,10:4,5 | |
| 6735 chr22 16177136 . T C . PASS DP=74;SS=3;SSC=17;GPV=1;SPV=0.01893 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:9,10:15,12 1/1:.:28:7,21:3,7:4,14 | |
| 6736 chr22 16177619 . T G . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=2.0601e-12;SPV=0.5514 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:12,5:7,11 0/1:.:34:18,16:14,7:4,9 | |
| 6737 chr22 16177809 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=2.6699e-12;SPV=0.4896 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:9,8:11,7 0/1:.:37:20,17:13,13:7,4 | |
| 6738 chr22 16178107 . C G . PASS DP=49;SS=1;SSC=1;GPV=4.6489e-10;SPV=0.66909 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:11,12:3,6:8,6 0/1:.:26:13,13:3,6:10,7 | |
| 6739 chr22 16178521 . G C . PASS DP=43;SS=1;SSC=6;GPV=1.8298e-08;SPV=0.22685 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:14,10:7,6:7,4 0/1:.:19:8,11:5,6:3,5 | |
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| 6741 chr22 16179004 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=4;GPV=1.3458e-12;SPV=0.33821 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:6,10:10,7 0/1:.:23:9,14:6,6:3,8 | |
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| 6789 chr22 16205685 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=3.6826e-13;SPV=0.74635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:12,11:9,9 0/1:.:32:18,14:11,9:7,5 | |
| 6790 chr22 16206835 . T C . PASS DP=44;SS=1;SSC=3;GPV=2.0219e-08;SPV=0.46654 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:9,7:6,3:3,4 0/1:.:28:14,14:3,9:11,5 | |
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| 6792 chr22 16207491 . C G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=2.72e-12;SPV=0.82023 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:11,17:7,6:4,11 0/1:.:25:12,13:6,8:6,5 | |
| 6793 chr22 16208549 . T C . PASS DP=52;SS=1;SSC=2;GPV=1.8384e-09;SPV=0.50841 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:15,12:13,8:2,4 0/1:.:25:13,12:9,7:4,5 | |
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| 6795 chr22 16209503 . C A . PASS DP=67;SS=1;SSC=3;GPV=6.6365e-15;SPV=0.48642 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:8,6:6,10 0/1:.:37:16,21:10,13:6,8 | |
| 6796 chr22 16209674 . T A . PASS DP=55;SS=1;SSC=2;GPV=1.0345e-10;SPV=0.54897 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:13,12:8,6:5,6 0/1:.:30:15,15:8,7:7,8 | |
| 6797 chr22 16211005 . G C . PASS DP=49;SS=1;SSC=3;GPV=1.5284e-10;SPV=0.48728 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:9,9:5,3:4,6 0/1:.:31:14,17:7,10:7,7 | |
| 6798 chr22 16211446 . A C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.0507e-11;SPV=0.81151 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:10,11:6,7:4,4 0/1:.:43:24,19:13,12:11,7 | |
| 6799 chr22 16212032 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=1.16e-09;SPV=0.78923 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:6,9:12,6 0/1:.:26:16,10:7,6:9,4 | |
| 6800 chr22 16212252 . A T . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=1.6529e-10;SPV=0.98621 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:4,13:3,5:1,8 0/1:.:25:13,12:7,7:6,5 | |
| 6801 chr22 16212512 . C G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=5.1348e-09;SPV=0.89587 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:10,11:6,8:4,3 0/1:.:31:19,12:13,9:6,3 | |
| 6802 chr22 16212979 . G C . PASS DP=55;SS=1;SSC=1;GPV=1.1491e-11;SPV=0.68956 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:10,12:2,7:8,5 0/1:.:33:16,17:7,6:9,11 | |
| 6803 chr22 16213221 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=4;GPV=5.349e-11;SPV=0.33014 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:12,4:3,7 0/1:.:33:16,17:8,8:8,9 | |
| 6804 chr22 16213836 . C G . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,13:0,13 1/1:.:23:0,23:0,12:0,11 | |
| 6805 chr22 16214407 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=4;GPV=9.6098e-15;SPV=0.35176 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:10,11:7,6:3,5 0/1:.:41:16,25:7,13:9,12 | |
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| 6856 chr22 16239785 . C T . PASS DP=40;SS=1;SSC=7;GPV=1.2997e-08;SPV=0.18538 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:8,5:3,2:5,3 0/1:.:27:11,16:5,8:6,8 | |
| 6857 chr22 16240475 . G T . PASS DP=38;SS=1;SSC=4;GPV=9.9016e-09;SPV=0.33748 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:6,5:3,1:3,4 0/1:.:27:11,16:7,11:4,5 | |
| 6858 chr22 16241076 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=1.1545e-10;SPV=0.8038 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:5,8:3,2:2,6 0/1:.:34:16,18:7,10:9,8 | |
| 6859 chr22 16241989 . G A . PASS DP=35;SS=1;SSC=6;GPV=6.3952e-08;SPV=0.2478 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:5,3:3,1:2,2 0/1:.:27:11,16:5,4:6,12 | |
| 6860 chr22 16243793 . C T . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=3.8184e-05;SPV=0.99155 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:3,5:1,3:2,2 0/1:.:32:24,8:12,5:12,3 | |
| 6861 chr22 16244215 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=5.6397e-13;SPV=0.79059 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:4,8:3,5:1,3 0/1:.:39:16,23:8,15:8,8 | |
| 6862 chr22 16245115 . A T . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=3.0926e-11;SPV=0.79803 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:5,7:2,2:3,5 0/1:.:42:21,21:9,12:12,9 | |
| 6863 chr22 16245305 . A C . PASS DP=44;SS=1;SSC=2;GPV=1.5811e-07;SPV=0.55588 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:6,4:2,3:4,1 0/1:.:34:19,15:13,7:6,8 | |
| 6864 chr22 16245538 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.7621e-13;SPV=0.95204 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:5,12:5,6:0,6 0/1:.:41:20,21:7,14:13,7 | |
| 6865 chr22 16247046 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=3;GPV=5.9704e-09;SPV=0.4973 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:12,8:6,6:6,2 0/1:.:34:19,15:9,9:10,6 | |
| 6866 chr22 16247170 . T A . PASS DP=49;SS=1;SSC=3;GPV=1.3761e-09;SPV=0.43199 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:11,9:8,6:3,3 0/1:.:29:14,15:6,8:8,7 | |
| 6867 chr22 16247310 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.027789 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:19,7:12,4:7,3 0/1:.:41:19,22:11,10:8,12 | |
| 6868 chr22 16247597 . T C . PASS DP=45;SS=1;SSC=3;GPV=2.7295e-10;SPV=0.43404 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:11,12:4,5:7,7 0/1:.:22:9,13:5,6:4,7 | |
| 6869 chr22 16247859 . C T . PASS DP=40;SS=1;SSC=5;GPV=4.1855e-09;SPV=0.3109 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:8,7:4,2:4,5 0/1:.:25:10,15:4,6:6,9 | |
| 6870 chr22 16248288 . A C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=4.0256e-06;SPV=0.87909 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:16,9:9,5:7,4 0/1:.:28:21,7:13,5:8,2 | |
| 6871 chr22 16249348 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=12;GPV=1.5381e-13;SPV=0.0578 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:16,10:10,6:6,4 0/1:.:39:15,24:10,14:5,10 | |
| 6872 chr22 16249560 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=3;GPV=2.3694e-14;SPV=0.47129 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:11,17:6,11:5,6 0/1:.:26:9,17:6,9:3,8 | |
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| 6874 chr22 16250525 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=1.2505e-10;SPV=0.76772 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:11,11:9,4 0/1:.:35:22,13:10,7:12,6 | |
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| 6926 chr22 16356677 . C T . PASS DP=49;SS=1;SSC=3;GPV=1.5284e-10;SPV=0.40764 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:6,5:2,1:4,4 0/1:.:38:17,21:9,10:8,11 | |
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| 6929 chr22 16357817 . G C . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=2.7004e-08;SPV=0.99674 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:1,7:0,2:1,5 0/1:.:29:16,13:11,10:5,3 | |
| 6930 chr22 16357874 . A G . PASS DP=34;SS=1;SSC=1;GPV=1.4997e-06;SPV=0.72415 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:4,4:1,1:3,3 0/1:.:26:14,12:6,9:8,3 | |
| 6931 chr22 16358792 . G T . PASS DP=28;SS=1;SSC=0;GPV=5.4482e-05;SPV=0.81739 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:4,4:3,1:1,3 0/1:.:20:12,8:7,6:5,2 | |
| 6932 chr22 16360167 . C A . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=7.2254e-08;SPV=0.89705 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:5,6:4,3:1,3 0/1:.:36:22,14:10,10:12,4 | |
| 6933 chr22 16360352 . C T . PASS DP=48;SS=1;SSC=1;GPV=2.0555e-07;SPV=0.69793 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:7,5:5,2:2,3 0/1:.:36:22,14:16,6:6,8 | |
| 6934 chr22 16360615 . A T . PASS DP=32;SS=1;SSC=6;GPV=9.8512e-06;SPV=0.20713 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:6,2:3,1:3,1 0/1:.:24:12,12:7,6:5,6 | |
| 6935 chr22 16360731 . G A . PASS DP=39;SS=1;SSC=2;GPV=2.1927e-06;SPV=0.61985 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:6,4:2,3:4,1 0/1:.:29:17,12:6,4:11,8 | |
| 6936 chr22 16361391 . G A . PASS DP=35;SS=1;SSC=4;GPV=1.2005e-05;SPV=0.35577 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:7,3:6,1:1,2 0/1:.:25:14,11:9,3:5,8 | |
| 6937 chr22 16362410 . G A . PASS DP=41;SS=1;SSC=5;GPV=1.2413e-07;SPV=0.30837 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:6,3:2,1:4,2 0/1:.:32:16,16:6,9:10,7 | |
| 6938 chr22 16364110 . C T . PASS DP=35;SS=1;SSC=1;GPV=3.1103e-05;SPV=0.7309 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:6,4:0,1:6,3 0/1:.:25:16,9:7,2:9,7 | |
| 6939 chr22 16365227 . G A . PASS DP=34;SS=1;SSC=0;GPV=7.5302e-05;SPV=0.92008 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:4,4:2,2:2,2 0/1:.:26:18,8:8,4:10,4 | |
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| 6994 chr22 16409570 . A T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=1.3586e-09;SPV=0.85321 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:33,18:19,7:14,11 0/1:.:30:22,8:10,2:12,6 | |
| 6995 chr22 16410090 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=3.2861e-10;SPV=0.51301 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:25,15:11,5:14,10 0/1:.:30:18,12:12,9:6,3 | |
| 6996 chr22 16412132 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=8;GPV=2.4256e-08;SPV=0.14881 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:12,6:8,4:4,2 0/1:.:32:13,15:6,8:7,7 | |
| 6997 chr22 16412187 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=1.2153e-09;SPV=0.53351 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:23,11:17,9:6,2 0/1:.:44:29,15:15,10:14,5 | |
| 6998 chr22 16413666 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=1.2823e-13;SPV=0.50707 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:14,12:9,6:5,6 0/1:.:47:24,23:11,7:13,16 | |
| 6999 chr22 16414656 . G A . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=1.1173e-08;SPV=0.99065 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:7,12:3,10:4,2 0/1:.:30:20,10:12,4:8,6 | |
| 7000 chr22 16415742 . T C . PASS DP=41;SS=1;SSC=3;GPV=1.3631e-10;SPV=0.49704 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:4,5:0,2:4,3 0/1:.:32:12,20:4,15:8,5 | |
| 7001 chr22 16416036 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=2;GPV=9.7868e-13;SPV=0.57262 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:7,9:5,6:2,3 0/1:.:38:16,22:8,10:8,12 | |
| 7002 chr22 16416895 . A T . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=2.4148e-10;SPV=0.76922 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:12,8:4,5 0/1:.:36:22,14:13,3:9,11 | |
| 7003 chr22 16417036 . C T . PASS DP=100;SS=1;SSC=3;GPV=2.8551e-08;SPV=0.4576 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:30,8:20,3:10,5 0/1:.:62:47,15:28,10:19,5 | |
| 7004 chr22 16418819 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=0.0031718;SPV=0.56184 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:34,4:15,2:19,2 0/1:.:33:29,4:12,2:17,2 | |
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| 7006 chr22 16420298 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=2;GPV=1.5353e-10;SPV=0.60625 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:32,14:22,4:10,10 0/1:.:50:35,15:20,12:15,3 | |
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| 7053 chr22 16442919 . A G . PASS DP=101;SS=1;SSC=2;GPV=5.4688e-09;SPV=0.52238 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:35,11:14,3:21,8 0/1:.:55:41,14:22,4:19,10 | |
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| 7055 chr22 16444061 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.7389e-14;SPV=0.94108 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:14,21:7,11:7,10 0/1:.:34:19,15:7,9:12,6 | |
| 7056 chr22 16444611 . T A . PASS DP=185;SS=1;SSC=1;GPV=7.19e-23;SPV=0.71249 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:109:70,39:45,30:25,9 0/1:.:76:51,25:37,20:14,5 | |
| 7057 chr22 16444620 . T C . PASS DP=188;SS=1;SSC=3;GPV=1.5391e-18;SPV=0.44904 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:106:77,29:50,24:27,5 0/1:.:82:58,24:40,21:18,3 | |
| 7058 chr22 16444863 . G A . PASS DP=165;SS=1;SSC=1;GPV=1.138e-14;SPV=0.68552 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:87:64,23:18,3:46,20 0/1:.:78:59,19:25,5:34,14 | |
| 7059 chr22 16446154 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=9.9184e-09;SPV=0.93114 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:31,15:17,6:14,9 0/1:.:43:34,9:17,5:17,4 | |
| 7060 chr22 16446777 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=9.8334e-16;SPV=0.97944 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:19,28:10,13:9,15 0/1:.:31:19,12:12,7:7,5 | |
| 7061 chr22 16447735 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=1.8221e-14;SPV=0.58586 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:7,8:17,11 0/1:.:43:24,19:10,8:14,11 | |
| 7062 chr22 16449832 . T A . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=5.5047e-12;SPV=0.63583 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:10,11:4,4:6,7 0/1:.:37:18,19:6,13:12,6 | |
| 7063 chr22 16450110 . A G . PASS DP=48;SS=1;SSC=3;GPV=2.8521e-08;SPV=0.41227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:11,7:3,5:8,2 0/1:.:30:16,14:7,5:9,9 | |
| 7064 chr22 16450504 . A G . PASS DP=100;SS=1;SSC=4;GPV=5.3634e-09;SPV=0.36367 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:29,8:20,3:9,5 0/1:.:63:46,17:33,9:13,8 | |
| 7065 chr22 16450533 . C T . PASS DP=129;SS=1;SSC=4;GPV=4.3424e-06;SPV=0.3603 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:42,5:25,2:17,3 0/1:.:82:70,12:44,7:26,5 | |
| 7066 chr22 16451206 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=3.9394e-09;SPV=0.85263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:11,9:7,6:4,3 0/1:.:43:28,15:19,8:9,7 | |
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| 7068 chr22 16451364 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=4;GPV=2.5244e-08;SPV=0.36967 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:23,6:15,1:8,5 0/1:.:64:47,17:28,11:19,6 | |
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| 7124 chr22 16491545 . A C . PASS DP=28;SS=1;SSC=0;GPV=1.3074e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,8:0,7 1/1:.:13:0,13:0,7:0,6 | |
| 7125 chr22 16494363 . A G . PASS DP=24;SS=1;SSC=0;GPV=3.101e-14;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,10:0,5 1/1:.:9:0,9:0,7:0,2 | |
| 7126 chr22 16506044 . T C . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=5.7269e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,15:0,5 1/1:.:17:0,17:0,10:0,7 | |
| 7127 chr22 16510081 . C A . PASS DP=46;SS=1;SSC=6;GPV=2.9994e-11;SPV=0.24074 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:12,13:12,12:0,1 0/1:.:21:7,14:4,9:3,5 | |
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| 7129 chr22 16524776 . T A . PASS DP=143;SS=1;SSC=6;GPV=1.30321e-43;SPV=0.21545 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:83:27,56:12,13:15,43 1/1:.:60:15,45:8,22:7,23 | |
| 7130 chr22 16525283 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=2.3224e-12;SPV=0.93719 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:7,14:8,7 0/1:.:24:14,10:5,6:9,4 | |
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| 7133 chr22 16525943 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=8.9568e-18;SPV=0.66754 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:24,28:15,13:9,15 0/1:.:33:16,17:11,13:5,4 | |
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| 7193 chr22 16550557 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 | |
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| 7196 chr22 16551212 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=9.7868e-13;SPV=0.98848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:11,23:3,14:8,9 0/1:.:20:12,8:4,4:8,4 | |
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| 7199 chr22 16552180 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=6;GPV=3.7425e-15;SPV=0.20293 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:18,10:6,13 0/1:.:24:9,15:4,8:5,7 | |
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| 7201 chr22 16553787 . C G . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=1.1691e-15;SPV=0.87699 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:25,25:13,21:12,4 0/1:.:40:24,16:11,9:13,7 | |
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| 7248 chr22 16578670 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,10:0,5 1/1:.:35:0,35:0,25:0,10 | |
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| 7250 chr22 16582469 . A G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,10:0,7 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 | |
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| 7252 chr22 16583531 . C A . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 1/1:.:21:0,21:0,5:0,16 | |
| 7253 chr22 16584133 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 7254 chr22 16584189 . T A . PASS DP=54;SS=1;SSC=5;GPV=9.7868e-13;SPV=0.29473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:9,14:9,7 0/1:.:15:5,10:4,6:1,4 | |
| 7255 chr22 16584655 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 1/1:.:22:0,22:0,11:0,11 | |
| 7256 chr22 16584658 . A T . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 | |
| 7257 chr22 16584659 . G C . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,14:0,9 1/1:.:21:0,21:0,10:0,11 | |
| 7258 chr22 16585510 . C G . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=2.068e-13;SPV=0.53385 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:14,17:7,10:7,7 0/1:.:28:12,16:8,9:4,7 | |
| 7259 chr22 16585603 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=2.4148e-10;SPV=0.52565 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:13,8:9,7 0/1:.:28:16,12:7,7:9,5 | |
| 7260 chr22 16585657 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 1/1:.:28:0,28:0,8:0,20 | |
| 7261 chr22 16585810 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=1.3693e-11;SPV=0.59447 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:7,12:14,5 0/1:.:29:16,13:8,8:8,5 | |
| 7262 chr22 16586614 . G T . PASS DP=51;SS=1;SSC=2;GPV=1.6778e-09;SPV=0.57202 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:15,13:11,7:4,6 0/1:.:23:12,11:4,5:8,6 | |
| 7263 chr22 16586966 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,12:0,17 1/1:.:35:0,35:0,25:0,10 | |
| 7264 chr22 16587166 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=1.8199e-14;SPV=0.54472 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:13,15:6,13:7,2 0/1:.:38:17,21:12,13:5,8 | |
| 7265 chr22 16587510 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,26:0,19 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
| 7266 chr22 16588174 . T A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,31:0,16 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
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| 7325 chr22 16626376 . G A . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,7:0,8 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 7326 chr22 16628260 . A T . PASS DP=35;SS=1;SSC=7;GPV=6.019e-09;SPV=0.17661 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:7,6:3,4:4,2 0/1:.:22:7,15:4,9:3,6 | |
| 7327 chr22 16628843 . A T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,2:0,15 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
| 7328 chr22 16629512 . C G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,9:0,6 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
| 7329 chr22 16629863 . T G . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,8:0,8 1/1:.:32:0,32:0,13:0,19 | |
| 7330 chr22 16630928 . T C . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=1.5066e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 1/1:.:20:0,20:0,10:0,10 | |
| 7331 chr22 16635508 . G T . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
| 7332 chr22 16637186 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=1.1875e-15;SPV=0.75612 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:9,12:9,12 0/1:.:29:14,15:6,7:8,8 | |
| 7333 chr22 16637615 . A T . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=1.2446e-15;SPV=0.32746 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:6,9:15,9 0/1:.:41:19,22:8,11:11,11 | |
| 7334 chr22 16637728 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=4;GPV=1.973e-16;SPV=0.37249 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:11,12:10,7 0/1:.:43:20,23:10,8:10,15 | |
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| 7336 chr22 16638017 . T G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 1/1:.:42:0,42:0,19:0,23 | |
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| 7389 chr22 16677733 . A G . PASS DP=35;SS=1;SSC=0;GPV=1.637e-06;SPV=0.99329 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:9,13:3,11:6,2 0/1:.:13:10,3:8,2:2,1 | |
| 7390 chr22 16677958 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,22:0,33 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 | |
| 7391 chr22 16678267 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=11;GPV=2.4283e-11;SPV=0.069056 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:30,14:13,8:17,6 0/1:.:31:15,16:6,9:9,7 | |
| 7392 chr22 16678780 . C A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 1/1:.:26:0,26:0,9:0,17 | |
| 7393 chr22 16679917 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=1.7018e-17;SPV=0.5783 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:16,22:9,12:7,10 0/1:.:36:15,21:6,6:9,15 | |
| 7394 chr22 16680299 . A C . PASS DP=42;SS=1;SSC=1;GPV=5.4836e-09;SPV=0.71876 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:11,13:7,7:4,6 0/1:.:18:9,9:4,7:5,2 | |
| 7395 chr22 16680396 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 7396 chr22 16680738 . C A . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=1.1391e-19;SPV=0.62592 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:10,16:7,10 0/1:.:37:15,22:6,12:9,10 | |
| 7397 chr22 16681877 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
| 7398 chr22 16681997 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=5;GPV=5.3252e-12;SPV=0.2824 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:18,12:9,7:9,5 0/1:.:38:19,19:11,10:8,9 | |
| 7399 chr22 16682274 . T G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 1/1:.:15:0,15:0,4:0,11 | |
| 7400 chr22 16682473 . A T . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.9694e-09;SPV=0.89052 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:7,5:9,12 0/1:.:16:10,6:4,4:6,2 | |
| 7401 chr22 16682953 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=8.2552e-11;SPV=0.52497 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:11,7:13,11 0/1:.:22:12,10:4,8:8,2 | |
| 7402 chr22 16683482 . C G . PASS DP=65;SS=1;SSC=4;GPV=3.2317e-11;SPV=0.38883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:9,7:12,8 0/1:.:29:15,14:8,7:7,7 | |
| 7403 chr22 16683883 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=1.3682e-07;SPV=0.9004 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:18,12:11,1:7,11 0/1:.:29:21,8:9,4:12,4 | |
| 7404 chr22 16687014 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=8.7556e-14;SPV=0.85242 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:10,16:5,7:5,9 0/1:.:35:17,18:9,10:8,8 | |
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| 7448 chr22 16733118 . C T . PASS DP=40;SS=1;SSC=2;GPV=3.0187e-11;SPV=0.59551 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:4,7:2,3:2,4 0/1:.:29:10,19:7,7:3,12 | |
| 7449 chr22 16733362 . C T . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=3.7193e-07;SPV=0.94975 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:3,5:0,2:3,3 0/1:.:34:21,13:11,8:10,5 | |
| 7450 chr22 16733779 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=5;GPV=3.2974e-08;SPV=0.26772 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:9,4:5,0:4,4 0/1:.:37:20,17:10,7:10,10 | |
| 7451 chr22 16739111 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=7.7752e-12;SPV=0.81286 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:13,15:7,6:6,9 0/1:.:33:18,15:14,5:4,10 | |
| 7452 chr22 16740922 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=4.2444e-12;SPV=0.66892 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:9,11:5,5:4,6 0/1:.:36:17,19:6,9:11,10 | |
| 7453 chr22 16741895 . T A . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=6.451e-11;SPV=0.90519 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:9,14:4,5:5,9 0/1:.:28:15,13:7,8:8,5 | |
| 7454 chr22 16742072 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=1.0643e-11;SPV=0.87913 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:4,9:2,5:2,4 0/1:.:34:15,19:11,8:4,11 | |
| 7455 chr22 16743148 . C T . PASS DP=44;SS=1;SSC=4;GPV=5.7286e-08;SPV=0.33817 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:11,7:4,3:7,4 0/1:.:26:13,13:7,7:6,6 | |
| 7456 chr22 16743534 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=3.1446e-06;SPV=0.89506 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:9,7:6,1:3,6 0/1:.:30:21,9:12,3:9,6 | |
| 7457 chr22 16744429 . A C . PASS DP=47;SS=1;SSC=1;GPV=1.0643e-11;SPV=0.68883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:5,8:5,6:0,2 0/1:.:34:14,20:8,11:6,9 | |
| 7458 chr22 16745013 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.3693e-11;SPV=0.87974 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:10,10:8,8 0/1:.:31:19,12:6,6:13,6 | |
| 7459 chr22 16745175 . G A . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=2.0643e-11;SPV=0.79003 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:9,13:2,5:7,8 0/1:.:29:14,15:9,9:5,6 | |
| 7460 chr22 16745308 . T G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=1.2461e-13;SPV=0.83284 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:9,16:4,12:5,4 0/1:.:31:14,17:8,7:6,10 | |
| 7461 chr22 16748463 . T C . PASS DP=112;SS=1;SSC=3;GPV=1.0892e-20;SPV=0.47662 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:76:40,36:17,18:23,18 0/1:.:36:18,18:10,13:8,5 | |
| 7462 chr22 16749187 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=2;GPV=5.88e-11;SPV=0.61529 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:10,11:7,4 0/1:.:28:15,13:7,9:8,4 | |
| 7463 chr22 16749226 . T A . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=1.7985e-10;SPV=0.73538 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:10,9:6,5 0/1:.:31:18,13:12,9:6,4 | |
| 7464 chr22 16750243 . G C . PASS DP=79;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.043962 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:24,14:7,7:17,7 0/1:.:41:17,24:10,12:7,12 | |
| 7465 chr22 16750347 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=4;GPV=5.349e-11;SPV=0.34064 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:16,12:8,6:8,6 0/1:.:31:15,16:11,13:4,3 | |
| 7466 chr22 16750713 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,8:0,19 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
| 7467 chr22 16750829 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=1.5211e-10;SPV=0.56492 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:12,8:5,6 0/1:.:28:15,13:5,8:10,5 | |
| 7468 chr22 16751192 . G T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=2.0452e-11;SPV=0.90055 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:4,11:9,5 0/1:.:31:18,13:8,7:10,6 | |
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| 7470 chr22 16754043 . A T . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,14:0,10 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
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| 7523 chr22 16782475 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,25:0,12 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 | |
| 7524 chr22 16782964 . C G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 7525 chr22 16783479 . G T . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.2581e-11;SPV=0.74425 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:15,14:8,5:7,9 0/1:.:37:21,16:9,7:12,9 | |
| 7526 chr22 16783675 . G T . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=7.5676e-40;SPV=0.45714 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:32:1,31:0,20:1,11 | |
| 7527 chr22 16784014 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,19:0,10 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 | |
| 7528 chr22 16784234 . A C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 7529 chr22 16784304 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 | |
| 7530 chr22 16785189 . A C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
| 7531 chr22 16785234 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 | |
| 7532 chr22 16785707 . A C . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,13:0,5 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 | |
| 7533 chr22 16785726 . T G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,17:0,8 1/1:.:27:0,27:0,17:0,10 | |
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| 7590 chr22 16815536 . A G . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=7.4746e-10;SPV=0.88465 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:3,6:3,4:0,2 0/1:.:35:17,18:9,10:8,8 | |
| 7591 chr22 16815830 . G A . PASS DP=48;SS=1;SSC=2;GPV=1.0643e-12;SPV=0.59399 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:5,8:4,4:1,4 0/1:.:35:13,22:7,12:6,10 | |
| 7592 chr22 16815946 . T C . PASS DP=55;SS=1;SSC=1;GPV=3.5017e-13;SPV=0.68668 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:8,12:5,8:3,4 0/1:.:35:15,20:9,11:6,9 | |
| 7593 chr22 16816746 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=1.6778e-09;SPV=0.71687 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:7,7:3,6:4,1 0/1:.:37:20,17:14,7:6,10 | |
| 7594 chr22 16819518 . A G . PASS DP=29;SS=1;SSC=0;GPV=3.3259e-17;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:0,8:0,7:0,1 1/1:.:21:0,21:0,6:0,15 | |
| 7595 chr22 16820327 . A G . PASS DP=40;SS=1;SSC=8;GPV=1.1326e-07;SPV=0.15203 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:6,2:3,1:3,1 0/1:.:32:15,17:7,12:8,5 | |
| 7596 chr22 16822150 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=1.3458e-12;SPV=0.71037 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:5,7:3,5:2,2 0/1:.:44:20,24:10,13:10,11 | |
| 7597 chr22 16823031 . A T . PASS DP=29;SS=1;SSC=3;GPV=7.6466e-06;SPV=0.39995 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:6,4:5,2:1,2 0/1:.:19:9,10:3,7:6,3 | |
| 7598 chr22 16823242 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=5.635e-11;SPV=0.95088 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:6,12:2,5:4,7 0/1:.:32:17,15:8,7:9,8 | |
| 7599 chr22 16823356 . C T . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.3341e-10;SPV=0.9182 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:6,11:4,6:2,5 0/1:.:31:16,15:9,9:7,6 | |
| 7600 chr22 16823505 . G A . PASS DP=38;SS=1;SSC=1;GPV=9.2415e-08;SPV=0.63595 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:6,6:1,2:5,4 0/1:.:26:13,13:10,5:3,8 | |
| 7601 chr22 16823567 . C T . PASS DP=35;SS=1;SSC=1;GPV=1.637e-06;SPV=0.7522 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:4,4:1,2:3,2 0/1:.:27:15,12:7,5:8,7 | |
| 7602 chr22 16823997 . G A . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=1.4682e-08;SPV=0.99059 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:3,9:1,5:2,4 0/1:.:29:17,12:5,5:12,7 | |
| 7603 chr22 16824887 . G A . PASS DP=53;SS=1;SSC=10;GPV=8.7266e-12;SPV=0.087725 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:10,6:4,5:6,1 0/1:.:37:14,23:5,12:9,11 | |
| 7604 chr22 16825380 . G A . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=6.4161e-12;SPV=0.72467 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:6,9:6,5:0,4 0/1:.:36:16,20:6,4:10,16 | |
| 7605 chr22 16827196 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=6.4366e-11;SPV=0.86995 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:7,10:7,5 0/1:.:32:19,13:6,7:13,6 | |
| 7606 chr22 16827351 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=4.411e-14;SPV=0.584 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:11,16:3,6:8,10 0/1:.:30:12,18:3,12:9,6 | |
| 7607 chr22 16828472 . G T . PASS DP=53;SS=1;SSC=1;GPV=8.2315e-13;SPV=0.70425 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:12,18:5,11:7,7 0/1:.:23:10,13:8,4:2,9 | |
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| 7615 chr22 16833261 . G A . PASS DP=33;SS=1;SSC=2;GPV=1.4096e-08;SPV=0.62874 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:4,6:2,3:2,3 0/1:.:23:9,14:6,8:3,6 | |
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| 7623 chr22 16837974 . C A . PASS DP=39;SS=1;SSC=7;GPV=8.8326e-11;SPV=0.19359 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:6,6:2,2:4,4 0/1:.:27:8,19:4,6:4,13 | |
| 7624 chr22 16838266 . T C . PASS DP=52;SS=1;SSC=3;GPV=2.38e-11;SPV=0.42245 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:11,11:5,8:6,3 0/1:.:30:13,17:10,13:3,4 | |
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| 7626 chr22 16839591 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=9.9942e-16;SPV=0.58082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:16,24:9,12:7,12 0/1:.:23:9,14:2,8:7,6 | |
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| 7629 chr22 16842702 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=9;GPV=2.8926e-12;SPV=0.11991 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:26,15:10,10:16,5 0/1:.:32:15,17:7,8:8,9 | |
| 7630 chr22 16843614 . T G . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=1.5013e-16;SPV=0.35245 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:7,13:10,10 0/1:.:26:9,17:4,6:5,11 | |
| 7631 chr22 16845291 . C A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=3.2999e-18;SPV=0.9671 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:22,33:7,9:15,24 0/1:.:31:18,13:11,8:7,5 | |
| 7632 chr22 16845778 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=1.1875e-15;SPV=0.61939 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:22,27:11,16:11,11 0/1:.:22:10,12:5,7:5,5 | |
| 7633 chr22 16846024 . G A . PASS DP=102;SS=1;SSC=4;GPV=3.1261e-20;SPV=0.32233 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:33,31:18,13:15,18 0/1:.:38:17,21:12,12:5,9 | |
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| 7635 chr22 16846822 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=2.2536e-12;SPV=0.85853 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:14,11:6,9 0/1:.:30:18,12:5,6:13,6 | |
| 7636 chr22 16847737 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=8;GPV=1.4887e-13;SPV=0.12602 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:7,6:7,7 0/1:.:30:10,20:5,14:5,6 | |
| 7637 chr22 16848117 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=6.6445e-15;SPV=0.86789 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:12,22:5,18:7,4 0/1:.:26:12,14:5,9:7,5 | |
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| 7644 chr22 16852982 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=1;GPV=4.3451e-09;SPV=0.65857 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:9,8:4,4:5,4 0/1:.:33:18,15:6,7:12,8 | |
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| 7646 chr22 16855520 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=6.9672e-12;SPV=0.39827 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:9,7:7,7 0/1:.:30:14,16:7,10:7,6 | |
| 7647 chr22 16856966 . A G . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=3.621e-10;SPV=0.89703 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:11,16:5,7:6,9 0/1:.:20:11,9:9,3:2,6 | |
| 7648 chr22 16857797 . C G . PASS DP=62;SS=1;SSC=2;GPV=2.9394e-12;SPV=0.6014 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:13,13:8,5:5,8 0/1:.:36:18,18:8,8:10,10 | |
| 7649 chr22 16857904 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.4855e-11;SPV=0.92489 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:6,5:10,12 0/1:.:35:22,13:10,6:12,7 | |
| 7650 chr22 16858514 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=2.8393e-15;SPV=0.95267 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:11,23:5,11:6,12 0/1:.:28:14,14:8,9:6,5 | |
| 7651 chr22 16858954 . T A . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=2.3224e-12;SPV=0.6866 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:7,11:9,7 0/1:.:26:13,13:8,8:5,5 | |
| 7652 chr22 16860016 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=3.9115e-10;SPV=0.90681 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:5,9:9,6 0/1:.:29:18,11:10,4:8,7 | |
| 7653 chr22 16860344 . A C . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=1.2122e-15;SPV=0.71832 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:7,13:7,9 0/1:.:28:12,16:2,6:10,10 | |
| 7654 chr22 16860910 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=1;GPV=1.8773e-14;SPV=0.78914 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:7,15:4,6:3,9 0/1:.:31:12,19:11,11:1,8 | |
| 7655 chr22 16861350 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=4.2444e-12;SPV=0.85674 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:7,11:2,5:5,6 0/1:.:38:19,19:10,9:9,10 | |
| 7656 chr22 16861590 . C A . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=1.3059e-08;SPV=0.71798 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:12,10:5,5:7,5 0/1:.:29:17,12:5,6:12,6 | |
| 7657 chr22 16861810 . T C . PASS DP=45;SS=1;SSC=2;GPV=2.7295e-10;SPV=0.56596 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:10,12:6,8:4,4 0/1:.:23:10,13:4,4:6,9 | |
| 7658 chr22 16862147 . T A . PASS DP=45;SS=1;SSC=4;GPV=8.3984e-11;SPV=0.38453 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:9,10:5,4:4,6 0/1:.:26:10,16:6,8:4,8 | |
| 7659 chr22 16862161 . T C . PASS DP=46;SS=1;SSC=1;GPV=6.7171e-08;SPV=0.68546 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:11,9:5,4:6,5 0/1:.:26:15,11:8,6:7,5 | |
| 7660 chr22 16862494 . T C . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=4.7626e-11;SPV=0.96097 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:5,14:3,6:2,8 0/1:.:23:11,12:8,6:3,6 | |
| 7661 chr22 16862910 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 1/1:.:33:0,33:0,23:0,10 | |
| 7662 chr22 16863610 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=3;GPV=8.6344e-12;SPV=0.46209 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:11,9:3,4:8,5 0/1:.:42:21,21:10,12:11,9 | |
| 7663 chr22 16863977 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=7;GPV=9.9959e-10;SPV=0.17215 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:14,7:7,4:7,3 0/1:.:36:18,18:8,11:10,7 | |
| 7664 chr22 16864232 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=4;GPV=1.5236e-09;SPV=0.37016 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:12,9:8,6:4,3 0/1:.:29:14,15:7,5:7,10 | |
| 7665 chr22 16864431 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=19;GPV=1;SPV=0.011882 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:14,7:6,2:8,5 0/1:.:32:10,22:5,12:5,10 | |
| 7666 chr22 16865494 . C G . PASS DP=55;SS=1;SSC=4;GPV=3.5017e-13;SPV=0.36557 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:12,14:8,7:4,7 0/1:.:29:11,18:6,10:5,8 | |
| 7667 chr22 16865712 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=2;GPV=3.0926e-11;SPV=0.60715 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:13,14:6,8:7,6 0/1:.:27:13,14:6,8:7,6 | |
| 7668 chr22 16866025 . T A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=2.0968e-10;SPV=0.94366 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:8,12:10,6 0/1:.:27:18,9:11,6:7,3 | |
| 7669 chr22 16867701 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=1;GPV=2.3048e-12;SPV=0.7561 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:9,14:7,11:2,3 0/1:.:29:13,16:6,8:7,8 | |
| 7670 chr22 16868550 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=6;GPV=1.7018e-17;SPV=0.22824 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:12,13:6,7 0/1:.:36:13,23:8,13:5,10 | |
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| 7672 chr22 16869964 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.044402 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:9,5:6,6 0/1:.:34:11,23:7,12:4,11 | |
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| 7716 chr22 16903504 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=9.1061e-12;SPV=0.96216 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:12,10:10,11 0/1:.:32:22,10:8,7:14,3 | |
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| 7719 chr22 16904736 . C G . PASS DP=68;SS=1;SSC=6;GPV=2.2072e-13;SPV=0.23359 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:11,8:8,7 0/1:.:34:15,19:7,13:8,6 | |
| 7720 chr22 16906293 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.3391e-06;SPV=0.69227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:30,9:18,8:12,1 0/1:.:43:34,9:19,6:15,3 | |
| 7721 chr22 16906294 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=3.0663e-06;SPV=0.79503 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:30,9:18,8:12,1 0/1:.:44:36,8:19,5:17,3 | |
| 7722 chr22 16906514 . G A . PASS DP=114;SS=1;SSC=0;GPV=5.413e-13;SPV=0.87642 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:38,21:16,13:22,8 0/1:.:55:40,15:18,9:22,6 | |
| 7723 chr22 16906639 . T C . PASS DP=95;SS=1;SSC=2;GPV=1.3772e-07;SPV=0.6081 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:42,12:24,1:18,11 0/1:.:41:32,9:22,1:10,8 | |
| 7724 chr22 16906867 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,7:0,15 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 | |
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| 7726 chr22 16907203 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=4.8441e-11;SPV=0.7276 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:12,9:6,9 0/1:.:22:12,10:9,5:3,5 | |
| 7727 chr22 16907688 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.5388e-12;SPV=0.76235 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:9,6:5,9 0/1:.:37:20,17:9,8:11,9 | |
| 7728 chr22 16908266 . A T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.0367e-13;SPV=0.86941 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:13,9:6,12 0/1:.:31:18,13:10,7:8,6 | |
| 7729 chr22 16909194 . A T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,9:0,9 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 7730 chr22 16909268 . T G . PASS DP=47;SS=1;SSC=7;GPV=7.2254e-08;SPV=0.19738 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:14,7:6,4:8,3 0/1:.:26:13,13:6,7:7,6 | |
| 7731 chr22 16910198 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=4;GPV=3.2999e-18;SPV=0.3274 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:11,10:11,12 0/1:.:42:18,24:9,12:9,12 | |
| 7732 chr22 16912130 . G T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 7733 chr22 16915084 . A C . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=2.783e-13;SPV=0.70386 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:10,10:6,10 0/1:.:25:12,13:3,3:9,10 | |
| 7734 chr22 16917618 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=2.4039e-14;SPV=0.50564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:9,11:7,6 0/1:.:35:16,19:5,7:11,12 | |
| 7735 chr22 16918321 . C A . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=1.3095e-14;SPV=0.67288 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:11,9:8,12 0/1:.:32:16,16:11,6:5,10 | |
| 7736 chr22 16918698 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=6;GPV=2.4655e-13;SPV=0.20025 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:13,6:7,9 0/1:.:34:15,19:7,8:8,11 | |
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| 7738 chr22 16920944 . G T . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=1.3284e-10;SPV=0.59823 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:14,4:9,11 0/1:.:33:20,13:12,8:8,5 | |
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| 7787 chr22 16952320 . T G . PASS DP=62;SS=1;SSC=3;GPV=8.6344e-12;SPV=0.40592 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:14,10:4,5 0/1:.:29:14,15:6,4:8,11 | |
| 7788 chr22 16953102 . C T . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4256e-08;SPV=0.99867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:8,15:3,7:5,8 0/1:.:23:17,6:8,1:9,5 | |
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| 7790 chr22 16953363 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=3;GPV=1.1656e-17;SPV=0.45465 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:16,26:10,15:6,11 0/1:.:24:8,16:4,8:4,8 | |
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| 7792 chr22 16954041 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=2;GPV=1.1691e-15;SPV=0.51489 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:11,9:15,12 0/1:.:43:23,20:13,11:10,9 | |
| 7793 chr22 16955956 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,21:0,30 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
| 7794 chr22 16956420 . C T . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=9.9137e-19;SPV=0.81887 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:12,13:10,10 0/1:.:59:33,26:18,12:15,14 | |
| 7795 chr22 16956610 . T C . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,33:0,22 1/1:.:49:0,49:0,25:0,24 | |
| 7796 chr22 16958150 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 1/1:.:28:0,28:0,12:0,16 | |
| 7797 chr22 16958924 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=3;GPV=1.463e-13;SPV=0.46151 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:11,10:12,5 0/1:.:49:28,21:15,12:13,9 | |
| 7798 chr22 16958936 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=4;GPV=7.6501e-21;SPV=0.38752 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:13,12:6,10 0/1:.:51:21,30:13,17:8,13 | |
| 7799 chr22 16959239 . T A . PASS DP=25;SS=1;SSC=1;GPV=5.2969e-05;SPV=0.72794 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:5,8:1,3:4,5 0/1:.:9:2,3:2,1:0,2 | |
| 7800 chr22 16960413 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,23:0,19 1/1:.:45:0,45:0,26:0,19 | |
| 7801 chr22 16960559 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,27:0,14 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 | |
| 7802 chr22 16960634 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=1.2446e-15;SPV=0.58848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:11,13:8,6 0/1:.:42:21,21:9,10:12,11 | |
| 7803 chr22 16961880 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 1/1:.:22:0,22:0,13:0,9 | |
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| 7805 chr22 16962373 . T A . PASS DP=97;SS=1;SSC=1;GPV=1.5531e-19;SPV=0.6778 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:27,30:15,19:12,11 0/1:.:40:20,20:13,13:7,7 | |
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| 7857 chr22 17007540 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=5.2318e-13;SPV=0.6889 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:15,16:11,7:4,9 0/1:.:35:18,17:13,8:5,9 | |
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| 7859 chr22 17007837 . A C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,29:0,19 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 | |
| 7860 chr22 17008234 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=3.2861e-10;SPV=0.96848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:5,4:12,12 0/1:.:37:26,11:13,5:13,6 | |
| 7861 chr22 17008410 . C G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
| 7862 chr22 17008687 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.0669e-14;SPV=0.85536 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:17,15:8,11 0/1:.:29:17,12:6,9:11,3 | |
| 7863 chr22 17010042 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,27:0,17 1/1:.:31:0,31:0,21:0,10 | |
| 7864 chr22 17010952 . A G . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=4.6917e-19;SPV=0.86791 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:26,31:9,14:17,17 0/1:.:40:22,18:8,6:14,12 | |
| 7865 chr22 17011313 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 1/1:.:25:0,25:0,7:0,18 | |
| 7866 chr22 17011643 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,37:0,20 1/1:.:25:0,25:0,18:0,7 | |
| 7867 chr22 17012403 . A G . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 1/1:.:47:0,47:0,22:0,25 | |
| 7868 chr22 17012541 . C G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,25:0,28 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 | |
| 7869 chr22 17012630 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=5.0247e-17;SPV=0.57821 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:13,15:11,12 0/1:.:30:14,16:7,4:7,12 | |
| 7870 chr22 17012818 . G T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,32:0,25 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 | |
| 7871 chr22 17012830 . C G . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,32:0,29 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 | |
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| 7873 chr22 17013110 . T C . PASS DP=105;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:63:0,63:0,30:0,33 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 | |
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| 7923 chr22 17048033 . A C . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,10:0,17 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 | |
| 7924 chr22 17048693 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,8:0,11 1/1:.:39:0,39:0,14:0,25 | |
| 7925 chr22 17048924 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=5.8427e-13;SPV=0.86391 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:9,10:6,8 0/1:.:34:19,15:8,5:11,10 | |
| 7926 chr22 17049480 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 | |
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| 7930 chr22 17051664 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 7931 chr22 17051853 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 1/1:.:26:0,26:0,17:0,9 | |
| 7932 chr22 17051963 . C G . PASS DP=55;SS=1;SSC=2;GPV=8.49e-10;SPV=0.52981 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:14,11:10,6:4,5 0/1:.:30:16,14:7,10:9,4 | |
| 7933 chr22 17051999 . C G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,17:0,10 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
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| 7935 chr22 17052546 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
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| 7938 chr22 17053497 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,20:0,9 1/1:.:31:0,31:0,9:0,22 | |
| 7939 chr22 17053732 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=6;GPV=3.879e-12;SPV=0.24439 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:30,18:7,10:23,8 0/1:.:29:15,14:9,10:6,4 | |
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| 7995 chr22 17073464 . T G . PASS DP=48;SS=1;SSC=2;GPV=1.2355e-09;SPV=0.61338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:12,12:7,6:5,6 0/1:.:24:12,12:6,7:6,5 | |
| 7996 chr22 17074025 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.2505e-10;SPV=0.89149 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:15,6:7,12 0/1:.:30:20,10:6,3:14,7 | |
| 7997 chr22 17074664 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=6;GPV=2.098e-14;SPV=0.20649 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:8,10:14,11 0/1:.:24:9,15:5,8:4,7 | |
| 7998 chr22 17075830 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,16:0,24 1/1:.:21:0,21:0,10:0,11 | |
| 7999 chr22 17076024 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=8;GPV=4.8717e-12;SPV=0.15161 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:12,8:11,7 0/1:.:29:13,16:4,10:9,6 | |
| 8000 chr22 17076254 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=7;GPV=2.2072e-13;SPV=0.16509 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:9,3:12,13 0/1:.:31:13,18:7,9:6,9 | |
| 8001 chr22 17076418 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 | |
| 8002 chr22 17076927 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 | |
| 8003 chr22 17076986 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=5.9795e-14;SPV=0.8067 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:5,13:11,4 0/1:.:43:24,19:13,11:11,8 | |
| 8004 chr22 17077890 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=3.013e-20;SPV=0.77596 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:21,32:9,15:12,17 0/1:.:33:15,18:5,7:10,11 | |
| 8005 chr22 17078739 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,35:0,11 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 8006 chr22 17078824 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=5.9704e-09;SPV=0.76411 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:13,9:4,5 0/1:.:23:14,9:7,8:7,1 | |
| 8007 chr22 17079572 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 1/1:.:35:0,35:0,13:0,22 | |
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| 8009 chr22 17082137 . T A . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=4.1534e-09;SPV=0.60287 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:25,15:10,7:15,8 0/1:.:24:15,9:8,5:7,4 | |
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| 8064 chr22 17114025 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,20:0,28 1/1:.:45:0,45:0,16:0,29 | |
| 8065 chr22 17114180 . T G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 1/1:.:37:0,37:0,24:0,13 | |
| 8066 chr22 17115288 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,29:0,20 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 8067 chr22 17115339 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=21;GPV=1;SPV=0.007697 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:35,20:23,12:12,8 0/1:.:32:11,21:8,13:3,8 | |
| 8068 chr22 17115498 . G C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,21:0,28 1/1:.:35:0,35:0,15:0,20 | |
| 8069 chr22 17116407 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.8389e-15;SPV=0.84412 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:8,11:6,11 0/1:.:29:14,15:10,6:4,9 | |
| 8070 chr22 17117420 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.2905e-14;SPV=0.70087 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:9,15:15,7 0/1:.:36:20,16:16,12:4,4 | |
| 8071 chr22 17117519 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=3.879e-12;SPV=0.9497 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:9,11:9,7 0/1:.:41:27,14:18,5:9,9 | |
| 8072 chr22 17117622 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=4;GPV=4.0806e-19;SPV=0.31796 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:17,24:7,10:10,14 0/1:.:33:11,22:3,11:8,11 | |
| 8073 chr22 17117923 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=5;GPV=1.2823e-13;SPV=0.29243 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:10,4:13,14 0/1:.:32:15,17:10,11:5,6 | |
| 8074 chr22 17118954 . G T . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=1.1883e-17;SPV=0.43606 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:23,27:13,14:10,13 0/1:.:29:12,17:7,7:5,10 | |
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| 8076 chr22 17120087 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,22:0,29 1/1:.:44:0,44:0,15:0,29 | |
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| 8120 chr22 17150801 . G C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 | |
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| 8122 chr22 17151312 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,27:0,20 1/1:.:40:0,40:0,29:0,11 | |
| 8123 chr22 17151662 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,14:0,21 1/1:.:20:0,20:0,11:0,9 | |
| 8124 chr22 17151995 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=6;GPV=9.392e-17;SPV=0.20082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:9,12:11,11 0/1:.:27:9,18:6,14:3,4 | |
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| 8126 chr22 17152895 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 1/1:.:28:0,28:0,21:0,7 | |
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| 8128 chr22 17154081 . C T . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=1.5066e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,7:0,14 1/1:.:22:0,22:0,4:0,18 | |
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| 8131 chr22 17154968 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,26:0,18 1/1:.:22:0,22:0,8:0,14 | |
| 8132 chr22 17155495 . G T . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,26:0,32 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 | |
| 8133 chr22 17156331 . G C . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=1.5391e-12;SPV=0.47815 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:26,18:13,6:13,12 0/1:.:34:19,15:10,11:9,4 | |
| 8134 chr22 17160795 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=6;GPV=1.1086e-15;SPV=0.20304 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:26,22:15,13:11,9 0/1:.:31:13,18:5,14:8,4 | |
| 8135 chr22 17161227 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=3;GPV=1.3424e-14;SPV=0.47503 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:10,9:9,14 0/1:.:22:9,13:6,6:3,7 | |
| 8136 chr22 17162656 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=10;GPV=7.3294e-21;SPV=0.0992 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:12,10:9,13 0/1:.:41:13,28:9,16:4,12 | |
| 8137 chr22 17162799 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=6;GPV=3.104e-14;SPV=0.22692 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:13,5:8,13 0/1:.:31:13,18:8,9:5,9 | |
| 8138 chr22 17164933 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=6.5235e-17;SPV=0.94699 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:21,29:9,11:12,18 0/1:.:33:19,14:11,7:8,7 | |
| 8139 chr22 17165554 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=5;GPV=2.8075e-15;SPV=0.27681 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:9,9:8,8 0/1:.:35:14,21:6,11:8,10 | |
| 8140 chr22 17166125 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=9;GPV=5.88e-11;SPV=0.11217 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:22,14:12,7:10,7 0/1:.:24:10,14:2,5:8,9 | |
| 8141 chr22 17167456 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=4.034e-13;SPV=0.72859 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:16,10:7,11 0/1:.:30:17,13:9,6:8,7 | |
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| 8143 chr22 17168884 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=5.7237e-22;SPV=0.47145 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:21,29:10,16:11,13 0/1:.:41:16,25:7,12:9,13 | |
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| 8199 chr22 17188093 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=19;GPV=1;SPV=0.01103 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:28,12:19,6:9,6 0/1:.:24:9,15:4,7:5,8 | |
| 8200 chr22 17188261 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=7.9176e-20;SPV=0.94134 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:21,32:13,16:8,16 0/1:.:39:21,18:11,9:10,9 | |
| 8201 chr22 17188309 . G A . PASS DP=96;SS=1;SSC=11;GPV=6.9139e-16;SPV=0.07497 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:36,21:21,10:15,11 0/1:.:39:18,21:8,11:10,10 | |
| 8202 chr22 17188416 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=7;GPV=2.781e-14;SPV=0.18019 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:10,12:18,8 0/1:.:31:14,17:7,9:7,8 | |
| 8203 chr22 17188516 . G C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=5.2507e-16;SPV=0.94061 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:10,6:10,20 0/1:.:36:21,15:5,5:16,10 | |
| 8204 chr22 17188579 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=7;GPV=1.4766e-14;SPV=0.18952 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:6,7:19,14 0/1:.:27:11,16:3,2:8,14 | |
| 8205 chr22 17188796 . A G . PASS DP=29;SS=1;SSC=0;GPV=3.3259e-17;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,5:0,11 1/1:.:13:0,13:0,4:0,9 | |
| 8206 chr22 17188980 . A G . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=2.2598e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,11:0,4 1/1:.:21:0,21:0,12:0,9 | |
| 8207 chr22 17189006 . A C . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,11:0,6 1/1:.:24:0,24:0,16:0,8 | |
| 8208 chr22 17189152 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 1/1:.:37:0,37:0,29:0,8 | |
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| 8250 chr22 17221772 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=6;GPV=1.6045e-17;SPV=0.20851 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:26,26:13,10:13,16 0/1:.:29:11,18:6,9:5,9 | |
| 8251 chr22 17221888 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=2.95e-15;SPV=0.41026 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:9,7:13,13 0/1:.:36:17,19:8,8:9,11 | |
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| 8255 chr22 17223385 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=11;GPV=1.8524e-14;SPV=0.066969 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:8,10:16,6 0/1:.:35:14,21:6,6:8,15 | |
| 8256 chr22 17223572 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=1.0148e-14;SPV=0.64798 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:9,16:11,7 0/1:.:27:13,14:7,6:6,8 | |
| 8257 chr22 17224732 . T C . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=4.6489e-10;SPV=0.8408 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:14,17:8,9:6,8 0/1:.:18:10,8:8,6:2,2 | |
| 8258 chr22 17224918 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=1.16e-09;SPV=0.73829 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:9,4:7,9 0/1:.:30:18,12:7,5:11,7 | |
| 8259 chr22 17225380 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.7076e-08;SPV=0.85412 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:13,11:5,4:8,7 0/1:.:31:20,11:8,3:12,8 | |
| 8260 chr22 17225545 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=6.58e-14;SPV=0.88179 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:19,17:4,7 0/1:.:30:18,12:12,9:6,3 | |
| 8261 chr22 17225757 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=1.7206e-15;SPV=0.95912 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:22,27:9,16:13,11 0/1:.:34:21,13:9,11:12,2 | |
| 8262 chr22 17228881 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=3.0774e-18;SPV=0.81965 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:18,28:7,16:11,12 0/1:.:32:15,17:8,8:7,9 | |
| 8263 chr22 17229045 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=9;GPV=1.973e-16;SPV=0.10736 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:17,9:10,12 0/1:.:35:14,21:8,10:6,11 | |
| 8264 chr22 17230983 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=9.653e-15;SPV=0.57489 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:11,9:14,14 0/1:.:31:16,15:6,9:10,6 | |
| 8265 chr22 17231201 . C T . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=4.1632e-19;SPV=0.94913 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:26,34:14,17:12,17 0/1:.:36:21,15:12,7:9,8 | |
| 8266 chr22 17232064 . A T . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=3.4529e-14;SPV=0.99421 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:68:36,32:17,15:19,17 0/1:.:27:21,6:7,3:14,3 | |
| 8267 chr22 17232488 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=7.6659e-08;SPV=0.54396 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:30,13:17,4:13,9 0/1:.:25:17,8:10,6:7,2 | |
| 8268 chr22 17236951 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.0532e-18;SPV=0.95561 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:13,26:8,14:5,12 0/1:.:36:18,18:11,9:7,9 | |
| 8269 chr22 17238320 . A G . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=2.2598e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,11:0,7 1/1:.:18:0,18:0,12:0,6 | |
| 8270 chr22 17238458 . A G . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 1/1:.:25:0,25:0,9:0,16 | |
| 8271 chr22 17238568 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,24:0,8 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 8272 chr22 17239832 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,19:0,29 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
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| 8274 chr22 17240705 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,34:0,21 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 | |
| 8275 chr22 17241134 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,30:0,18 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
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| 8277 chr22 17241552 . A T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,28:0,25 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
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| 8305 chr22 17269300 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.3049e-14;SPV=0.8205 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:9,8:6,13 0/1:.:28:14,14:6,8:8,6 | |
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| 8308 chr22 17271106 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=1.1086e-15;SPV=0.35576 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:12,11:13,12 0/1:.:31:14,17:7,6:7,11 | |
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| 8315 chr22 17277170 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,37:0,16 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
| 8316 chr22 17278297 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=9;GPV=1.4308e-12;SPV=0.1238 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:27,15:13,5:14,10 0/1:.:35:17,18:6,8:11,10 | |
| 8317 chr22 17278450 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=8.9089e-11;SPV=0.7261 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:25,20:11,12:14,8 0/1:.:20:12,8:6,4:6,4 | |
| 8318 chr22 17279293 . C G . PASS DP=59;SS=1;SSC=3;GPV=2.0466e-12;SPV=0.4127 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:10,7:8,11 0/1:.:23:10,13:7,7:3,6 | |
| 8319 chr22 17279730 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.0316e-12;SPV=0.90967 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:9,11:12,12 0/1:.:21:13,8:5,3:8,5 | |
| 8320 chr22 17280535 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.548e-18;SPV=0.64377 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:20,27:11,15:9,12 0/1:.:34:15,19:12,10:3,9 | |
| 8321 chr22 17281609 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=5.0311e-18;SPV=0.43111 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:11,9:9,14 0/1:.:38:16,22:11,10:5,12 | |
| 8322 chr22 17282978 . A C . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=3.9286e-14;SPV=0.68173 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:9,11:10,9 0/1:.:33:17,16:10,5:7,11 | |
| 8323 chr22 17283158 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=11;GPV=1.3846e-17;SPV=0.077532 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:14,14:9,6 0/1:.:37:13,24:6,12:7,12 | |
| 8324 chr22 17284615 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=4;GPV=3.3305e-17;SPV=0.39165 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:8,11:9,11 0/1:.:32:12,20:4,8:8,12 | |
| 8325 chr22 17285225 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=5;GPV=5.8009e-12;SPV=0.27681 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:21,14:7,8:14,6 0/1:.:34:17,17:7,12:10,5 | |
| 8326 chr22 17285551 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=2;GPV=1.768e-06;SPV=0.53611 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:19,8:10,5:9,3 0/1:.:28:19,9:11,7:8,2 | |
| 8327 chr22 17286047 . A T . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=3.7425e-15;SPV=0.73233 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:7,9:8,10 0/1:.:37:18,19:9,10:9,9 | |
| 8328 chr22 17289291 . T G . PASS DP=62;SS=1;SSC=3;GPV=2.9394e-12;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:5,10:12,6 0/1:.:29:14,15:6,7:8,8 | |
| 8329 chr22 17290847 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=3.3502e-13;SPV=0.80865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:10,12:13,11 0/1:.:26:15,11:8,6:7,5 | |
| 8330 chr22 17290974 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=1.973e-16;SPV=0.70479 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:25,27:15,16:10,11 0/1:.:31:16,15:7,9:9,6 | |
| 8331 chr22 17292874 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 | |
| 8332 chr22 17293560 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,10:0,24 1/1:.:34:0,34:0,12:0,22 | |
| 8333 chr22 17293955 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.034536 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:22,14:10,5:12,9 0/1:.:33:12,21:7,10:5,11 | |
| 8334 chr22 17294543 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=3.673e-15;SPV=0.32746 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:14,13:8,5 0/1:.:40:19,21:8,10:11,11 | |
| 8335 chr22 17295000 . T G . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=8.9089e-11;SPV=0.52939 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:10,5:8,8 0/1:.:34:19,15:3,6:16,9 | |
| 8336 chr22 17295986 . C T . PASS DP=48;SS=1;SSC=2;GPV=2.8521e-08;SPV=0.57315 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:12,9:7,6:5,3 0/1:.:27:15,12:9,7:6,5 | |
| 8337 chr22 17296388 . T C . PASS DP=49;SS=1;SSC=9;GPV=1.3761e-09;SPV=0.10033 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:17,11:7,5:10,6 0/1:.:21:8,13:3,8:5,5 | |
| 8338 chr22 17300145 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=9.3121e-14;SPV=0.76401 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:9,9:6,8 0/1:.:38:20,18:10,9:10,9 | |
| 8339 chr22 17300665 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=4;GPV=2.1366e-11;SPV=0.35669 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:26,16:13,8:13,8 0/1:.:31:17,14:4,9:13,5 | |
| 8340 chr22 17301923 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,24:0,20 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 | |
| 8341 chr22 17302461 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=3.2811e-12;SPV=0.56798 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:14,15:7,5 0/1:.:22:11,11:8,7:3,4 | |
| 8342 chr22 17302916 . T C . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
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| 8344 chr22 17303273 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 | |
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| 8395 chr22 17359090 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 1/1:.:24:0,24:0,7:0,17 | |
| 8396 chr22 17359339 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
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| 8399 chr22 17360518 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
| 8400 chr22 17361496 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,18:0,12 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 8401 chr22 17361841 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,16:0,24 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
| 8402 chr22 17362234 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,27:0,21 1/1:.:31:0,31:0,20:0,11 | |
| 8403 chr22 17363108 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,22:0,7 1/1:.:21:0,21:0,17:0,4 | |
| 8404 chr22 17363406 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=11;GPV=3.9115e-10;SPV=0.065283 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:21,11:10,5:11,6 0/1:.:26:11,15:6,8:5,7 | |
| 8405 chr22 17364008 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=6.2293e-15;SPV=0.71584 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:11,13:8,8 0/1:.:35:18,17:10,8:8,9 | |
| 8406 chr22 17364040 . T G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,26:0,15 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 | |
| 8407 chr22 17365156 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 1/1:.:35:0,35:0,12:0,23 | |
| 8408 chr22 17365272 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=2.6615e-19;SPV=0.79716 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:15,26:5,9:10,17 0/1:.:37:16,21:4,9:12,12 | |
| 8409 chr22 17366052 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=5;GPV=1.2823e-13;SPV=0.28686 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:14,11:8,6 0/1:.:34:16,18:12,11:4,7 | |
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| 8411 chr22 17369495 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=3.9286e-14;SPV=0.68173 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:10,11:9,9 0/1:.:33:17,16:6,11:11,5 | |
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| 8458 chr22 17425969 . G T . PASS DP=67;SS=1;SSC=5;GPV=5.8427e-13;SPV=0.27444 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:8,12:13,5 0/1:.:29:13,16:4,4:9,12 | |
| 8459 chr22 17426275 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=7;GPV=3.1039e-10;SPV=0.19042 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:26,13:16,7:10,6 0/1:.:30:16,14:12,7:4,7 | |
| 8460 chr22 17426933 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=5.3252e-12;SPV=0.63808 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:12,10:9,8 0/1:.:29:16,13:7,6:9,7 | |
| 8461 chr22 17427193 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=2.025e-08;SPV=0.82745 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:11,5:7,8 0/1:.:27:18,9:11,2:7,7 | |
| 8462 chr22 17427468 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=7.7551e-09;SPV=0.66823 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:19,13:9,7:10,6 0/1:.:26:16,10:8,3:8,7 | |
| 8463 chr22 17427614 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=4.5813e-10;SPV=0.83397 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:9,7:13,12 0/1:.:19:12,7:9,5:3,2 | |
| 8464 chr22 17428727 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=3;GPV=4.2407e-10;SPV=0.44185 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:17,12:11,8:6,4 0/1:.:30:16,14:5,10:11,4 | |
| 8465 chr22 17429117 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=5;GPV=3.195e-13;SPV=0.25423 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:11,8:9,11 0/1:.:23:9,14:6,8:3,6 | |
| 8466 chr22 17430032 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=3.9005e-19;SPV=0.9899 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:14,31:6,16:8,15 0/1:.:35:19,16:11,8:8,8 | |
| 8467 chr22 17430953 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=9.7868e-13;SPV=0.68091 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:12,17:6,9:6,8 0/1:.:25:11,14:7,6:4,8 | |
| 8468 chr22 17431907 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,12:0,24 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
| 8469 chr22 17432781 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=7;GPV=3.1153e-09;SPV=0.18558 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:17,8:9,4:8,4 0/1:.:34:18,16:8,8:10,8 | |
| 8470 chr22 17433094 . C G . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=2.5259e-14;SPV=0.67475 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:9,10:11,9 0/1:.:39:21,18:11,7:10,11 | |
| 8471 chr22 17433672 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=6.9925e-15;SPV=0.6795 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:13,8:9,15 0/1:.:31:16,15:7,8:9,7 | |
| 8472 chr22 17436386 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.8199e-14;SPV=0.63529 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:11,17:7,5 0/1:.:26:12,14:6,8:6,6 | |
| 8473 chr22 17437370 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=4.8496e-12;SPV=0.80722 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:4,11:11,8 0/1:.:23:12,11:6,5:6,6 | |
| 8474 chr22 17437503 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=2.3048e-12;SPV=0.86001 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:10,17:5,9:5,8 0/1:.:25:12,13:8,9:4,4 | |
| 8475 chr22 17438268 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=5;GPV=3.367e-12;SPV=0.25203 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:26,16:7,9:19,7 0/1:.:33:17,16:7,8:10,8 | |
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| 8477 chr22 17439056 . G C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.3049e-14;SPV=0.85565 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:18,25:11,11:7,14 0/1:.:21:11,10:3,5:8,5 | |
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| 8514 chr22 17461120 . G C . PASS DP=73;SS=1;SSC=6;GPV=1.0403e-12;SPV=0.21996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:18,11:12,5:6,6 0/1:.:44:22,22:7,9:15,13 | |
| 8515 chr22 17461457 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=9;GPV=1.8221e-14;SPV=0.11808 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:30,18:18,11:12,7 0/1:.:38:18,20:8,11:10,9 | |
| 8516 chr22 17461700 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=17;GPV=1;SPV=0.017381 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:23,14:9,7:14,7 0/1:.:30:10,20:5,8:5,12 | |
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| 8519 chr22 17463835 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=2;GPV=8.793e-08;SPV=0.61336 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:15,10:8,6:7,4 0/1:.:25:15,10:8,4:7,6 | |
| 8520 chr22 17464163 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=1.4766e-14;SPV=0.7192 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:11,15:7,5 0/1:.:35:18,17:12,8:6,9 | |
| 8521 chr22 17464790 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=4;GPV=5.8079e-10;SPV=0.34015 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:15,12:5,6:10,6 0/1:.:24:11,13:5,7:6,6 | |
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| 8523 chr22 17465925 . G T . PASS DP=81;SS=1;SSC=6;GPV=1.1753e-14;SPV=0.24231 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:27,20:10,8:17,12 0/1:.:34:16,18:6,9:10,9 | |
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| 8525 chr22 17466386 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=5;GPV=3.6885e-12;SPV=0.28081 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:11,5:6,12 0/1:.:21:8,13:4,8:4,5 | |
| 8526 chr22 17467130 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=1.1758e-13;SPV=0.73284 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:7,10:7,8 0/1:.:31:15,16:8,6:7,10 | |
| 8527 chr22 17467249 . A T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=3.5024e-11;SPV=0.98656 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:3,12:11,6 0/1:.:34:23,11:11,8:12,3 | |
| 8528 chr22 17467580 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,10:0,17 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 8529 chr22 17467797 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.8199e-14;SPV=0.72989 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:12,16:4,11:8,5 0/1:.:38:18,20:10,9:8,11 | |
| 8530 chr22 17468126 . G C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
| 8531 chr22 17469610 . C T . PASS DP=42;SS=1;SSC=2;GPV=2.0568e-13;SPV=0.52 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,12:0,4:0,8 1/1:.:24:1,12:0,6:1,6 | |
| 8532 chr22 17469875 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=4.39e-14;SPV=0.72697 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:8,8:12,13 0/1:.:32:17,15:7,7:10,8 | |
| 8533 chr22 17470721 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,11:0,20 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
| 8534 chr22 17472164 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=12;GPV=2.9394e-12;SPV=0.063038 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:8,7:12,6 0/1:.:29:11,18:5,10:6,8 | |
| 8535 chr22 17472656 . G T . PASS DP=69;SS=1;SSC=6;GPV=4.3774e-11;SPV=0.20241 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:10,3:9,7 0/1:.:40:21,19:12,10:9,9 | |
| 8536 chr22 17473677 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=6;GPV=7.3575e-14;SPV=0.24213 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:8,10:8,3 0/1:.:39:17,22:7,14:10,8 | |
| 8537 chr22 17474528 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.5013e-16;SPV=0.67964 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:11,18:5,11:6,7 0/1:.:37:15,22:7,11:8,11 | |
| 8538 chr22 17474946 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=2.6864e-14;SPV=0.67186 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:12,17:7,9:5,8 0/1:.:32:14,18:7,7:7,11 | |
| 8539 chr22 17475068 . G T . PASS DP=68;SS=1;SSC=11;GPV=5.3252e-12;SPV=0.065609 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:21,11:9,5:12,6 0/1:.:36:16,20:6,7:10,13 | |
| 8540 chr22 17475697 . G C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.0134e-13;SPV=0.89028 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:14,11:9,11 0/1:.:37:23,14:16,8:7,6 | |
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| 8542 chr22 17476920 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=5.9795e-14;SPV=0.53396 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:12,8:12,13 0/1:.:31:16,15:11,8:5,7 | |
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| 8589 chr22 17515556 . T C . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=3.3369e-21;SPV=0.84517 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:21,28:11,10:10,18 0/1:.:53:27,26:11,17:16,9 | |
| 8590 chr22 17516116 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=7;GPV=5.0221e-16;SPV=0.18628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:14,11:10,13 0/1:.:25:9,16:1,8:8,8 | |
| 8591 chr22 17517323 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=1.0404e-13;SPV=0.80696 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:7,7:13,15 0/1:.:29:16,13:8,5:8,8 | |
| 8592 chr22 17518537 . T G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,15:0,31 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 | |
| 8593 chr22 17518587 . G T . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=2.781e-14;SPV=0.42735 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:28,23:13,9:15,14 0/1:.:28:14,14:5,7:9,7 | |
| 8594 chr22 17520129 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,26:0,29 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 | |
| 8595 chr22 17521017 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=3.367e-12;SPV=0.7063 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:14,8:10,11 0/1:.:32:19,13:9,4:10,9 | |
| 8596 chr22 17521026 . C A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 | |
| 8597 chr22 17521251 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=3.5896e-20;SPV=0.76133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:18,27:12,15:6,12 0/1:.:42:19,23:11,11:8,12 | |
| 8598 chr22 17523132 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=11;GPV=2.8926e-12;SPV=0.063312 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:30,17:22,9:8,8 0/1:.:26:11,15:6,8:5,7 | |
| 8599 chr22 17523249 . C G . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=1.0148e-14;SPV=0.46717 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:12,13:8,8 0/1:.:29:13,16:10,7:3,9 | |
| 8600 chr22 17523866 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=9.3121e-14;SPV=0.68606 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:7,8:13,13 0/1:.:29:15,14:7,2:8,12 | |
| 8601 chr22 17524093 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=2.9394e-12;SPV=0.84719 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:11,14:5,5 0/1:.:27:15,12:6,5:9,7 | |
| 8602 chr22 17524786 . C T . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=2.2598e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,12:0,5 1/1:.:19:0,19:0,11:0,8 | |
| 8603 chr22 17525266 . C A . PASS DP=31;SS=1;SSC=0;GPV=2.1486e-18;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,12:0,9 1/1:.:10:0,10:0,7:0,3 | |
| 8604 chr22 17525531 . C G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 1/1:.:20:0,20:0,8:0,12 | |
| 8605 chr22 17525541 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 1/1:.:24:0,24:0,7:0,17 | |
| 8606 chr22 17530213 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
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| 8658 chr22 17616771 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,33:0,16 1/1:.:33:0,33:0,21:0,12 | |
| 8659 chr22 17618052 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,13:0,24 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 8660 chr22 17620308 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 1/1:.:29:0,29:0,9:0,20 | |
| 8661 chr22 17631270 . C A . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,12:0,20 1/1:.:22:0,22:0,15:0,7 | |
| 8662 chr22 17631276 . G A . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,10:0,17 1/1:.:20:0,20:0,12:0,8 | |
| 8663 chr22 17631672 . A G . PASS DP=19;SS=1;SSC=2;GPV=4.357e-08;SPV=0.5418 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:2,8:2,5:0,3 1/1:.:9:1,8:1,4:0,4 | |
| 8664 chr22 17635871 . A G . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,9:0,17 1/1:.:22:0,22:0,7:0,15 | |
| 8665 chr22 17643254 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 | |
| 8666 chr22 17643815 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=9.8334e-16;SPV=0.57693 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:11,5:11,18 0/1:.:33:16,17:8,8:8,9 | |
| 8667 chr22 17646194 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,15:0,20 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 | |
| 8668 chr22 17646499 . G T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,10:0,19 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 | |
| 8669 chr22 17648312 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 | |
| 8670 chr22 17648460 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,24:0,22 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
| 8671 chr22 17648780 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 | |
| 8672 chr22 17649010 . A T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.6893e-16;SPV=0.89627 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:11,19:6,10:5,9 0/1:.:41:20,21:9,11:11,10 | |
| 8673 chr22 17649011 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.7389e-14;SPV=0.87646 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:12,17:8,9:4,8 0/1:.:40:21,19:9,12:12,7 | |
| 8674 chr22 17650046 . G T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
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| 8735 chr22 17709185 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 1/1:.:33:0,33:0,11:0,22 | |
| 8736 chr22 17709370 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,27:0,20 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
| 8737 chr22 17710794 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,26:0,20 1/1:.:25:0,25:0,9:0,16 | |
| 8738 chr22 17714406 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,21:0,26 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
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| 8744 chr22 17719363 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,22:0,23 1/1:.:32:0,32:0,13:0,19 | |
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| 8798 chr22 17759104 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,13:0,29 1/1:.:27:0,27:0,16:0,11 | |
| 8799 chr22 17759416 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 1/1:.:29:0,29:0,20:0,9 | |
| 8800 chr22 17764859 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=2.2072e-13;SPV=0.96268 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:11,14:8,11 0/1:.:24:15,9:6,2:9,7 | |
| 8801 chr22 17767515 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.5731e-10;SPV=0.94264 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:14,8:10,11 0/1:.:31:22,9:10,5:12,4 | |
| 8802 chr22 17774225 . T G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 8803 chr22 17774372 . T G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=2.4857e-11;SPV=0.89057 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:13,15:8,4:5,11 0/1:.:34:20,14:10,9:10,5 | |
| 8804 chr22 17774969 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=7;GPV=4.2756e-16;SPV=0.19268 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:11,15:6,5 0/1:.:28:9,19:7,10:2,9 | |
| 8805 chr22 17775616 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=5;GPV=1.8275e-16;SPV=0.27489 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:6,11:9,7 0/1:.:34:12,22:5,14:7,8 | |
| 8806 chr22 17778262 . A G . PASS DP=102;SS=1;SSC=1;GPV=2.3952e-25;SPV=0.77554 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:21,36:13,18:8,18 0/1:.:45:19,26:10,15:9,11 | |
| 8807 chr22 17778821 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=9;GPV=3.013e-20;SPV=0.12183 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:13,12:9,11 0/1:.:41:14,27:6,15:8,12 | |
| 8808 chr22 17779751 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=3;GPV=2.6279e-15;SPV=0.46068 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:6,9:11,7 0/1:.:44:21,23:11,13:10,10 | |
| 8809 chr22 17782065 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=6;GPV=3.2729e-17;SPV=0.21025 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:12,14:10,8 0/1:.:34:13,21:7,11:6,10 | |
| 8810 chr22 17782406 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=1;GPV=3.55e-15;SPV=0.74058 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:27,23:15,10:12,13 0/1:.:41:24,17:12,9:12,8 | |
| 8811 chr22 17785364 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=1.1653e-16;SPV=0.96042 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:13,11:9,17 0/1:.:38:23,15:15,10:8,5 | |
| 8812 chr22 17785684 . G A . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=4.1632e-19;SPV=0.84176 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:25,30:17,15:8,15 0/1:.:41:22,19:13,7:9,12 | |
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| 8814 chr22 17788013 . C T . PASS DP=103;SS=1;SSC=1;GPV=3.5226e-20;SPV=0.75312 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:26,29:7,11:19,18 0/1:.:48:25,23:10,8:15,15 | |
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| 8868 chr22 17833854 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,27:0,10 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 8869 chr22 17834329 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
| 8870 chr22 17834855 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,30:0,14 1/1:.:38:0,38:0,25:0,13 | |
| 8871 chr22 17835055 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,18:0,29 1/1:.:26:0,26:0,7:0,19 | |
| 8872 chr22 17835218 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=1.0222e-17;SPV=0.72621 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:12,12:10,14 0/1:.:38:19,19:8,14:11,5 | |
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| 8930 chr22 17876797 . A G . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=6.3952e-08;SPV=0.84437 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:5,8:3,5:2,3 0/1:.:23:11,11:2,4:9,7 | |
| 8931 chr22 17877333 . T G . PASS DP=27;SS=1;SSC=2;GPV=5.0681e-05;SPV=0.55212 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:7,5:2,3:5,2 0/1:.:15:8,7:3,5:5,2 | |
| 8932 chr22 17878044 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=3.9427e-17;SPV=0.73951 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:6,10:17,15 0/1:.:40:21,19:13,10:8,9 | |
| 8933 chr22 17878417 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=7.8903e-14;SPV=0.75963 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:9,10:9,7 0/1:.:44:25,19:8,6:17,13 | |
| 8934 chr22 17879105 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=3.6614e-10;SPV=0.59899 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:30,18:10,10:20,8 0/1:.:24:15,9:8,3:7,6 | |
| 8935 chr22 17880174 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=4.4502e-10;SPV=0.76889 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:28,17:13,8:15,9 0/1:.:31:21,10:11,4:10,6 | |
| 8936 chr22 17880621 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.2981e-15;SPV=0.97282 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:17,24:5,17:12,7 0/1:.:38:23,15:11,10:12,5 | |
| 8937 chr22 17881813 . C G . PASS DP=90;SS=1;SSC=7;GPV=5.8861e-19;SPV=0.16975 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:27,25:15,15:12,10 0/1:.:38:15,23:8,12:7,11 | |
| 8938 chr22 17884874 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=8.0845e-10;SPV=0.87379 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:27,19:10,13:17,6 0/1:.:23:16,7:9,2:7,5 | |
| 8939 chr22 17885782 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=3.6641e-16;SPV=0.61264 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:8,12:14,12 0/1:.:33:16,17:7,9:9,8 | |
| 8940 chr22 17886944 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=29;GPV=1;SPV=0.0012562 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:5,24:1,14:4,10 0/1:.:29:17,12:11,8:6,4 | |
| 8941 chr22 17887150 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.5805e-15;SPV=0.91223 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:8,11:5,9 0/1:.:40:21,19:9,11:12,8 | |
| 8942 chr22 17887300 . C A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 1/1:.:27:0,27:0,16:0,11 | |
| 8943 chr22 17888231 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=8.7556e-14;SPV=0.91562 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:12,20:7,8:5,12 0/1:.:29:15,14:8,8:7,6 | |
| 8944 chr22 17888395 . A C . PASS DP=52;SS=1;SSC=6;GPV=2.1991e-10;SPV=0.20286 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:8,3:7,8 0/1:.:26:11,15:6,6:5,9 | |
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| 8998 chr22 17935510 . C T . PASS DP=44;SS=1;SSC=10;GPV=4.2568e-07;SPV=0.099314 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:15,6:9,4:6,2 0/1:.:23:11,12:7,2:4,10 | |
| 8999 chr22 17936128 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=5.349e-11;SPV=0.82465 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:15,16:5,7:10,9 0/1:.:28:16,12:11,4:5,8 | |
| 9000 chr22 17936239 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=8.2973e-14;SPV=0.72319 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:12,10:6,10 0/1:.:31:16,15:9,11:7,4 | |
| 9001 chr22 17941532 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=4.034e-13;SPV=0.74373 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:11,8:13,14 0/1:.:28:16,12:5,4:11,8 | |
| 9002 chr22 17946928 . T G . PASS DP=84;SS=1;SSC=7;GPV=2.0818e-20;SPV=0.17622 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:13,15:9,11 0/1:.:36:12,24:4,15:8,9 | |
| 9003 chr22 17950542 . T G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.5685e-14;SPV=0.86147 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:20,28:9,16:11,12 0/1:.:17:9,8:5,4:4,4 | |
| 9004 chr22 17950837 . A C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=2.2152e-16;SPV=0.91013 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:23,28:10,11:13,17 0/1:.:33:19,14:10,9:9,5 | |
| 9005 chr22 17951518 . A G . PASS DP=69;SS=3;SSC=20;GPV=1;SPV=0.009596 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:9,10:13,8 1/1:.:29:7,22:4,15:3,7 | |
| 9006 chr22 17953028 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=1.8643e-13;SPV=0.6537 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:9,12:13,7 0/1:.:36:20,16:11,12:9,4 | |
| 9007 chr22 17954178 . G A . PASS DP=67;SS=3;SSC=17;GPV=1;SPV=0.016597 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:14,12:7,6 1/1:.:28:7,21:1,13:6,8 | |
| 9008 chr22 17954277 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=4.2836e-15;SPV=0.57338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:14,13:5,8 0/1:.:32:15,17:10,13:5,4 | |
| 9009 chr22 17954616 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=4.2977e-14;SPV=0.80335 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:16,16:10,7 0/1:.:35:21,14:8,9:13,5 | |
| 9010 chr22 17955996 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=4;GPV=5.8427e-13;SPV=0.35903 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:14,7:5,9 0/1:.:32:15,17:8,7:7,10 | |
| 9011 chr22 17956281 . G T . PASS DP=81;SS=1;SSC=4;GPV=5.0119e-12;SPV=0.3433 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:28,16:13,6:15,10 0/1:.:37:21,16:9,9:12,7 | |
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| 9013 chr22 17958844 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=8;GPV=1.8643e-13;SPV=0.13047 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:28,18:19,9:9,9 0/1:.:31:14,17:8,8:6,9 | |
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| 9059 chr22 17986034 . G T . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=1.2446e-15;SPV=0.325 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:9,11:16,11 0/1:.:33:15,18:6,7:9,11 | |
| 9060 chr22 17987264 . T G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.6199e-12;SPV=0.87597 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:13,17:9,10:4,7 0/1:.:31:17,14:9,9:8,5 | |
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| 9062 chr22 17993054 . T G . PASS DP=76;SS=1;SSC=4;GPV=5.9795e-14;SPV=0.37354 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:28,23:17,12:11,11 0/1:.:25:12,13:3,10:9,3 | |
| 9063 chr22 17993833 . C G . PASS DP=85;SS=1;SSC=2;GPV=8.4463e-20;SPV=0.52383 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:11,14:8,11 0/1:.:41:17,24:9,18:8,6 | |
| 9064 chr22 17994143 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=3;GPV=1.2446e-15;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:10,13:14,10 0/1:.:33:16,17:9,13:7,4 | |
| 9065 chr22 17994637 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=9;GPV=2.0525e-15;SPV=0.10868 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:7,4:12,14 0/1:.:30:10,20:6,10:4,10 | |
| 9066 chr22 17996306 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=2.9394e-12;SPV=0.7798 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:9,11:8,8 0/1:.:26:14,12:11,8:3,4 | |
| 9067 chr22 17996681 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=3.7425e-15;SPV=0.72108 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:7,9:9,11 0/1:.:35:17,18:6,11:11,7 | |
| 9068 chr22 17997405 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=1.1614e-17;SPV=0.94293 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:23,31:12,11:11,20 0/1:.:33:19,14:11,6:8,8 | |
| 9069 chr22 17998744 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=1.1758e-13;SPV=0.38859 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:8,7:11,13 0/1:.:24:10,14:8,9:2,5 | |
| 9070 chr22 17999091 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=1.8524e-14;SPV=0.64147 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:10,14:11,7 0/1:.:33:17,16:7,6:10,10 | |
| 9071 chr22 17999834 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=5.2318e-13;SPV=0.77235 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:8,14:10,6 0/1:.:28:15,13:6,7:9,6 | |
| 9072 chr22 18000247 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=2.6212e-16;SPV=0.46667 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:1,13:0,5:1,8 1/1:.:30:0,16:0,6:0,10 | |
| 9073 chr22 18000426 . C G . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=4.4109e-17;SPV=0.70224 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:12,16:10,7 0/1:.:44:23,21:15,17:8,4 | |
| 9074 chr22 18000464 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=1.3142e-17;SPV=0.73445 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:16,15:6,10 0/1:.:41:21,20:13,10:8,10 | |
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| 9116 chr22 18021761 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=8.6835e-16;SPV=0.83366 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:24,29:18,13:6,16 0/1:.:24:13,11:8,3:5,8 | |
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| 9121 chr22 18024007 . T C . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=1.0505e-20;SPV=0.93171 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:22,34:7,15:15,19 0/1:.:38:20,18:10,8:10,10 | |
| 9122 chr22 18024809 . T G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=4.794e-13;SPV=0.9133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:6,10:12,9 0/1:.:39:24,15:14,10:10,5 | |
| 9123 chr22 18025083 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=1.5419e-14;SPV=0.65241 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:27,23:22,14:5,9 0/1:.:34:19,15:10,8:9,7 | |
| 9124 chr22 18027121 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.6893e-16;SPV=0.97231 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:14,26:11,13:3,13 0/1:.:31:17,14:9,8:8,6 | |
| 9125 chr22 18027379 . G T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.0619e-14;SPV=0.87893 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:9,13:10,9 0/1:.:35:20,15:10,7:10,8 | |
| 9126 chr22 18028025 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=1.2446e-15;SPV=0.32331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:6,9:20,14 0/1:.:31:14,17:6,6:8,11 | |
| 9127 chr22 18029992 . T G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=2.068e-13;SPV=0.88423 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:11,18:4,7:7,11 0/1:.:30:15,15:8,10:7,5 | |
| 9128 chr22 18031372 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=1.6574e-14;SPV=0.59346 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:14,13:8,9 0/1:.:30:15,15:6,11:9,4 | |
| 9129 chr22 18031762 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.0507e-11;SPV=0.85397 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:8,10:9,8 0/1:.:29:17,12:7,4:10,8 | |
| 9130 chr22 18032132 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=1.7922e-12;SPV=0.70049 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:9,13:4,3 0/1:.:29:14,15:9,9:5,6 | |
| 9131 chr22 18033918 . C A . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=6.6743e-16;SPV=0.39378 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:15,11:8,13 0/1:.:28:12,16:3,5:9,11 | |
| 9132 chr22 18034231 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=12;GPV=1.7063e-13;SPV=0.062433 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:27,16:16,8:11,8 0/1:.:33:14,19:5,8:9,11 | |
| 9133 chr22 18035152 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=5.5558e-19;SPV=0.69524 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:19,27:8,11:11,16 0/1:.:36:16,20:4,9:12,11 | |
| 9134 chr22 18035868 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=1.282e-20;SPV=0.86742 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:22,35:8,18:14,17 0/1:.:31:15,16:10,10:5,6 | |
| 9135 chr22 18036063 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=7.9203e-12;SPV=0.99812 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:14,20:7,7:7,13 0/1:.:39:28,11:9,3:19,8 | |
| 9136 chr22 18037232 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=6;GPV=2.3308e-15;SPV=0.24754 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:12,7:8,10 0/1:.:39:17,22:6,11:11,11 | |
| 9137 chr22 18037723 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=6;GPV=1.658e-10;SPV=0.24635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:27,13:13,5:14,8 0/1:.:35:20,15:11,11:9,4 | |
| 9138 chr22 18037816 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=8.6835e-16;SPV=0.6984 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:9,12:12,12 0/1:.:32:16,16:7,5:9,11 | |
| 9139 chr22 18037888 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=9.0146e-19;SPV=0.94327 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:17,28:8,16:9,12 0/1:.:40:21,19:7,8:14,11 | |
| 9140 chr22 18038064 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=9.3238e-20;SPV=0.53025 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:18,27:7,12:11,15 0/1:.:34:13,21:7,10:6,11 | |
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| 9142 chr22 18039845 . A G . PASS DP=94;SS=1;SSC=3;GPV=1.6298e-15;SPV=0.49054 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:31,23:18,14:13,9 0/1:.:40:22,18:9,10:13,8 | |
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| 9191 chr22 18063133 . T A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.6516e-12;SPV=0.91199 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:10,12:12,8 0/1:.:37:24,13:15,5:9,8 | |
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| 9194 chr22 18067924 . T G . PASS DP=88;SS=1;SSC=3;GPV=2.7625e-15;SPV=0.41198 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:31,24:16,13:15,11 0/1:.:33:17,16:7,12:10,4 | |
| 9195 chr22 18068246 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=3.0519e-14;SPV=0.8801 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:6,11:15,11 0/1:.:37:22,15:8,4:14,11 | |
| 9196 chr22 18068721 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=5;GPV=6.0487e-10;SPV=0.25672 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:9,3:10,7 0/1:.:35:19,16:6,10:13,6 | |
| 9197 chr22 18069014 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=4;GPV=9.6554e-09;SPV=0.32358 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:24,12:13,10:11,2 0/1:.:26:15,11:7,6:8,5 | |
| 9198 chr22 18070776 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.8183e-16;SPV=0.98316 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:16,27:10,16:6,11 0/1:.:34:20,14:10,9:10,5 | |
| 9199 chr22 18070840 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=1.5502e-15;SPV=0.42438 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:15,13:10,9 0/1:.:35:17,18:11,9:6,9 | |
| 9200 chr22 18071374 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,35:0,15:0,20 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 | |
| 9201 chr22 18072270 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=6;GPV=3.3502e-13;SPV=0.23957 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:12,6:9,9 0/1:.:36:17,19:5,11:12,8 | |
| 9202 chr22 18072368 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:32:0,32:0,12:0,20 | |
| 9203 chr22 18078059 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=5.7384e-17;SPV=0.70515 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:26,30:14,15:12,15 0/1:.:26:13,13:8,3:5,10 | |
| 9204 chr22 18079286 . C G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 | |
| 9205 chr22 18079470 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,17:0,23 1/1:.:45:0,45:0,24:0,21 | |
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| 9208 chr22 18081220 . C G . PASS DP=49;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.029331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:15,7:7,4:8,3 0/1:.:27:10,17:8,14:2,3 | |
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| 9258 chr22 18109227 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=1.8643e-13;SPV=0.7268 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:13,12:8,7 0/1:.:37:21,16:11,6:10,10 | |
| 9259 chr22 18109918 . C A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,32:0,20 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
| 9260 chr22 18112586 . T G . PASS DP=83;SS=1;SSC=5;GPV=1.4126e-14;SPV=0.27563 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:30,22:12,11:18,11 0/1:.:31:15,16:6,8:9,8 | |
| 9261 chr22 18113683 . G T . PASS DP=101;SS=1;SSC=6;GPV=8.912e-23;SPV=0.23113 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:66:31,35:17,22:14,13 0/1:.:35:13,22:10,12:3,10 | |
| 9262 chr22 18117816 . G A . PASS DP=39;SS=1;SSC=1;GPV=1.1402e-08;SPV=0.64862 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:11,13:6,6:5,7 0/1:.:15:7,8:5,5:2,3 | |
| 9263 chr22 18118648 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=1.0137e-17;SPV=0.84848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:7,13:10,13 0/1:.:35:17,18:4,9:13,9 | |
| 9264 chr22 18119886 . C T . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=1.1666e-20;SPV=0.98813 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:25,37:11,23:14,14 0/1:.:41:25,16:12,8:13,8 | |
| 9265 chr22 18140814 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.6624e-13;SPV=0.86643 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:11,8:5,12 0/1:.:29:16,13:12,9:4,4 | |
| 9266 chr22 18142752 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=4;GPV=7.9293e-13;SPV=0.35202 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:9,13:15,6 0/1:.:27:13,14:4,4:9,10 | |
| 9267 chr22 18144963 . C G . PASS DP=88;SS=1;SSC=3;GPV=3.9427e-17;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:13,16:13,9 0/1:.:37:18,19:8,7:10,12 | |
| 9268 chr22 18145948 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=4.4502e-10;SPV=0.60885 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:27,15:13,6:14,9 0/1:.:34:22,12:9,8:13,4 | |
| 9269 chr22 18146553 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.2401e-12;SPV=0.89859 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:9,13:8,8 0/1:.:26:15,11:8,5:7,6 | |
| 9270 chr22 18147462 . G T . PASS DP=27;SS=1;SSC=0;GPV=5.1363e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,8:0,9 1/1:.:10:0,10:0,6:0,4 | |
| 9271 chr22 18151211 . A C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.0507e-11;SPV=0.98674 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:11,17:5,10:6,7 0/1:.:36:23,13:15,11:8,2 | |
| 9272 chr22 18152009 . C G . PASS DP=99;SS=1;SSC=1;GPV=5.0376e-18;SPV=0.63627 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:28,26:15,11:13,15 0/1:.:45:24,21:12,5:12,16 | |
| 9273 chr22 18152358 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=24;GPV=1;SPV=0.0037022 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:17,28:9,14:8,14 0/1:.:39:27,12:15,6:12,6 | |
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| 9275 chr22 18155391 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,33:0,19 1/1:.:41:0,41:0,27:0,14 | |
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| 9307 chr22 18364549 . C T . PASS DP=32;SS=1;SSC=1;GPV=0.0054182;SPV=0.74603 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:13,4:8,2:5,2 0/1:.:15:12,3:8,2:4,1 | |
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| 9311 chr22 18370246 . T C . PASS DP=37;SS=1;SSC=8;GPV=5.6582e-18;SPV=0.14672 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:3,17:3,10:0,7 1/1:.:17:0,17:0,8:0,9 | |
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| 9313 chr22 18370430 . A G . PASS DP=29;SS=1;SSC=0;GPV=3.3259e-17;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,9:0,5 1/1:.:15:0,15:0,6:0,9 | |
| 9314 chr22 18370518 . T C . PASS DP=44;SS=1;SSC=1;GPV=1.7873e-05;SPV=0.72451 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:18,9:9,6:9,3 0/1:.:17:12,5:7,3:5,2 | |
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| 9316 chr22 18373513 . T C . PASS DP=38;SS=1;SSC=7;GPV=1.407e-05;SPV=0.17145 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:12,4:8,4:4,0 0/1:.:22:12,10:9,5:3,5 | |
| 9317 chr22 18374236 . T C . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=3.8647e-06;SPV=0.80442 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:8,8:2,1:6,7 0/1:.:17:10,7:3,5:7,2 | |
| 9318 chr22 18374987 . G A . PASS DP=37;SS=1;SSC=2;GPV=6.9312e-07;SPV=0.62709 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:6,5:1,3:5,2 0/1:.:26:14,12:2,4:12,8 | |
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| 9320 chr22 18377092 . T A . PASS DP=22;SS=1;SSC=1;GPV=0.0018042;SPV=0.67028 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:7,4:4,0:3,4 0/1:.:11:7,4:4,3:3,1 | |
| 9321 chr22 18381763 . C G . PASS DP=39;SS=1;SSC=0;GPV=5.7558e-06;SPV=0.866 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:13,10:10,9:3,1 0/1:.:16:11,5:11,5:0,0 | |
| 9322 chr22 18382102 . C T . PASS DP=110;SS=1;SSC=4;GPV=1.3074e-32;SPV=0.34716 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:20,40:9,24:11,16 0/1:.:50:14,36:3,17:11,19 | |
| 9323 chr22 18382185 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=0.0030313;SPV=0.83773 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:26,5:10,2:16,3 0/1:.:28:25,3:8,2:17,1 | |
| 9324 chr22 18393032 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=1.204e-07;SPV=0.89219 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:9,4:6,7 0/1:.:30:21,9:14,5:7,4 | |
| 9325 chr22 18404487 . C G . PASS DP=23;SS=1;SSC=9;GPV=0.00074174;SPV=0.11018 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:11,4:11,4:0,0 0/1:.:8:3,5:3,5:0,0 | |
| 9326 chr22 18417872 . T C . PASS DP=20;SS=1;SSC=5;GPV=0.00061425;SPV=0.31095 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:6,3:6,3:0,0 0/1:.:11:5,6:5,6:0,0 | |
| 9327 chr22 18418143 . A C . PASS DP=53;SS=1;SSC=1;GPV=0.00027419;SPV=0.72707 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:21,6:12,1:9,5 0/1:.:26:21,5:10,1:11,4 | |
| 9328 chr22 18484426 . A G . PASS DP=28;SS=3;SSC=16;GPV=1;SPV=0.022074 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:15,5:6,3:9,2 1/1:.:8:2,6:0,3:2,3 | |
| 9329 chr22 18489505 . T C . PASS DP=27;SS=1;SSC=6;GPV=0.00088132;SPV=0.24363 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:12,4:10,3:2,1 0/1:.:11:6,5:2,2:4,3 | |
| 9330 chr22 18492421 . A C . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=5.7269e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,7:0,11 1/1:.:19:0,19:0,8:0,11 | |
| 9331 chr22 18492481 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=1.8765e-12;SPV=0.50564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:6,8:13,8 0/1:.:33:17,16:5,9:12,7 | |
| 9332 chr22 18493482 . T G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=3.0926e-11;SPV=0.91094 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:12,17:3,8:9,9 0/1:.:25:14,11:7,2:7,9 | |
| 9333 chr22 18495797 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=1.7172e-13;SPV=0.98251 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:5,19:0,16:5,3 0/1:.:22:10,12:1,9:9,3 | |
| 9334 chr22 18496086 . A G . PASS DP=38;SS=1;SSC=5;GPV=1.1316e-19;SPV=0.29872 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,9:0,8 1/1:.:21:2,19:1,7:1,12 | |
| 9335 chr22 18496111 . A G . PASS DP=25;SS=1;SSC=5;GPV=2.7767e-12;SPV=0.30333 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,3:0,8 1/1:.:14:2,12:1,4:1,8 | |
| 9336 chr22 18498424 . A G . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8642e-13;SPV=0.98866 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:6,22:5,20:1,2 0/1:.:16:8,8:4,6:4,2 | |
| 9337 chr22 18498536 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=2.3891e-13;SPV=0.58262 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:31,24:27,13:4,11 0/1:.:25:14,11:11,9:3,2 | |
| 9338 chr22 18504406 . G C . PASS DP=50;SS=1;SSC=7;GPV=5.4249e-12;SPV=0.19164 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:15,16:6,3:9,13 0/1:.:19:6,13:4,3:2,10 | |
| 9339 chr22 18510061 . A G . PASS DP=17;SS=1;SSC=0;GPV=2.5647e-06;SPV=0.97059 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:1,8:0,5:1,3 0/1:.:8:3,5:3,4:0,1 | |
| 9340 chr22 18510438 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=0.00014937;SPV=0.81989 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:35,8:16,5:19,3 0/1:.:30:26,4:10,2:16,2 | |
| 9341 chr22 18510476 . C A . PASS DP=66;SS=1;SSC=5;GPV=4.1996e-07;SPV=0.28448 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:30,10:17,3:13,7 0/1:.:26:17,9:6,4:11,5 | |
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| 9343 chr22 18510989 . G A . PASS DP=29;SS=1;SSC=2;GPV=9.9776e-16;SPV=0.58621 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:1,16:0,6:1,10 1/1:.:12:0,12:0,4:0,8 | |
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| 9395 chr22 18733169 . T A . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,5:0,13 1/1:.:14:0,14:0,6:0,8 | |
| 9396 chr22 18733351 . A C . PASS DP=25;SS=1;SSC=4;GPV=1.4522e-06;SPV=0.34106 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:7,8:2,1:5,7 0/1:.:10:3,7:2,1:1,6 | |
| 9397 chr22 18733590 . G T . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=4.1493e-07;SPV=0.9944 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:1,8:1,6:0,2 0/1:.:16:8,8:6,3:2,5 | |
| 9398 chr22 18735673 . G A . PASS DP=150;SS=1;SSC=6;GPV=4.7855e-08;SPV=0.22266 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:47,6:32,3:15,3 0/1:.:97:80,17:39,8:41,9 | |
| 9399 chr22 18735675 . T G . PASS DP=146;SS=1;SSC=1;GPV=9.8842e-06;SPV=0.77303 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:49,7:31,4:18,3 0/1:.:90:81,9:34,6:47,3 | |
| 9400 chr22 18735703 . G A . PASS DP=168;SS=1;SSC=6;GPV=2.359e-06;SPV=0.24612 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:64:59,5:33,4:26,1 0/1:.:104:91,13:36,6:55,7 | |
| 9401 chr22 18735793 . A T . PASS DP=85;SOMATIC;SS=2;SSC=13;GPV=1;SPV=0.045555 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:41:38,3:18,2:20,1 0/1:.:44:34,10:10,4:24,6 | |
| 9402 chr22 18737967 . T C . PASS DP=113;SS=1;SSC=0;GPV=2.1642e-18;SPV=0.81383 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:31,27:16,16:15,11 0/1:.:55:33,22:18,10:15,12 | |
| 9403 chr22 18737998 . T C . PASS DP=125;SS=1;SSC=0;GPV=4.2592e-06;SPV=0.86701 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:69:58,11:25,9:33,2 0/1:.:56:50,6:19,5:31,1 | |
| 9404 chr22 18738307 . C G . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=3.5726e-06;SPV=0.92332 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:45,12:18,7:27,5 0/1:.:41:36,5:18,3:18,2 | |
| 9405 chr22 18738539 . T G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=3.8591e-22;SPV=0.95 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:16,33:11,12:5,21 0/1:.:42:19,21:3,12:16,9 | |
| 9406 chr22 18738634 . C A . PASS DP=91;SS=1;SSC=4;GPV=3.5546e-05;SPV=0.3354 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:41,6:23,3:18,3 0/1:.:44:36,8:17,2:19,6 | |
| 9407 chr22 18739462 . C T . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=0.00022064;SPV=0.86486 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:12,6:4,5:8,1 0/1:.:22:17,5:9,4:8,1 | |
| 9408 chr22 18741548 . G A . PASS DP=20;SS=1;SSC=0;GPV=7.2544e-12;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,1:0,9 1/1:.:10:0,10:0,3:0,7 | |
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| 9410 chr22 18743463 . C T . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=1.0468e-09;SPV=0.97729 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:30,16:15,7:15,9 0/1:.:57:46,11:21,3:25,8 | |
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| 9457 chr22 18793000 . G A . PASS DP=143;SS=1;SSC=3;GPV=6.6064e-15;SPV=0.42266 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:75:54,21:27,11:27,10 0/1:.:68:47,21:23,12:24,9 | |
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| 9459 chr22 18793084 . A C . PASS DP=126;SS=1;SSC=2;GPV=1.4816e-15;SPV=0.59045 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:46,24:24,8:22,16 0/1:.:56:37,19:25,8:12,11 | |
| 9460 chr22 18794084 . A G . PASS DP=23;SS=1;SSC=1;GPV=0.0018791;SPV=0.7221 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:7,4:0,0:7,4 0/1:.:12:8,4:0,0:8,4 | |
| 9461 chr22 18799478 . A C . PASS DP=145;SS=1;SSC=0;GPV=9.4454e-14;SPV=0.9481 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:75:51,24:32,16:19,8 0/1:.:70:55,15:29,6:26,9 | |
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| 9463 chr22 18799919 . C T . PASS DP=140;SS=1;SSC=2;GPV=1.0176e-15;SPV=0.51104 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:45,20:21,8:24,12 0/1:.:75:51,24:25,14:26,10 | |
| 9464 chr22 18800924 . G T . PASS DP=198;SS=1;SSC=0;GPV=1.0154e-13;SPV=0.83015 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:113:88,25:43,11:45,14 0/1:.:85:70,15:29,8:41,7 | |
| 9465 chr22 18801157 . C T . PASS DP=118;SS=1;SSC=1;GPV=7.192e-09;SPV=0.7532 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:66:51,15:19,3:32,12 0/1:.:52:42,10:12,3:30,7 | |
| 9466 chr22 18801994 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=0.001535;SPV=0.41829 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:42:38,4:13,1:25,3 0/1:.:37:32,5:16,3:16,2 | |
| 9467 chr22 18802112 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=5;GPV=1.414e-06;SPV=0.25447 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:31,6:15,2:16,4 0/1:.:49:37,12:15,8:22,4 | |
| 9468 chr22 18802469 . A C . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=1.0469e-22;SPV=0.97456 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:19,34:9,17:10,17 0/1:.:49:26,23:14,7:12,16 | |
| 9469 chr22 18803800 . G A . PASS DP=175;SS=1;SSC=1;GPV=5.3652e-07;SPV=0.63333 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:103:91,12:48,5:43,7 0/1:.:72:64,8:33,5:31,3 | |
| 9470 chr22 18804467 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=1.9778e-09;SPV=0.62442 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:22,13:11,6:11,7 0/1:.:33:21,12:12,5:9,7 | |
| 9471 chr22 18807109 . C T . PASS DP=143;SS=1;SSC=3;GPV=1.1254e-15;SPV=0.41675 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:75:53,22:25,8:28,14 0/1:.:68:46,22:21,12:25,10 | |
| 9472 chr22 18808376 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=4.8588e-07;SPV=0.51382 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:24,8:11,1:13,7 0/1:.:40:29,11:17,3:12,8 | |
| 9473 chr22 18810188 . G A . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=6.7976e-08;SPV=0.94937 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:38,14:25,5:13,9 0/1:.:51:43,8:17,5:26,3 | |
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| 9475 chr22 18813740 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=5;GPV=1.8643e-13;SPV=0.3149 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:15,9:10,9 0/1:.:34:17,17:15,10:2,7 | |
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| 9524 chr22 18850435 . C T . PASS DP=159;SS=1;SSC=3;GPV=9.0305e-18;SPV=0.48275 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:91:63,28:37,22:26,6 0/1:.:68:46,22:21,17:25,5 | |
| 9525 chr22 18850532 . C T . PASS DP=181;SS=1;SSC=0;GPV=2.0308e-25;SPV=0.99166 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:111:61,50:35,39:26,11 0/1:.:70:50,20:28,13:22,7 | |
| 9526 chr22 18850831 . A G . PASS DP=182;SS=1;SSC=1;GPV=3.5813e-14;SPV=0.66416 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:99:76,23:28,10:48,13 0/1:.:83:65,18:26,7:39,11 | |
| 9527 chr22 18851083 . A G . PASS DP=104;SS=1;SSC=4;GPV=1.2221e-15;SPV=0.38771 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:34,21:19,1:15,20 0/1:.:49:28,21:14,6:14,15 | |
| 9528 chr22 18851652 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=5.5625e-05;SPV=0.73603 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:21,7:20,6:1,1 0/1:.:28:22,6:12,5:10,1 | |
| 9529 chr22 18851787 . T C . PASS DP=113;SS=1;SSC=0;GPV=1.276e-09;SPV=0.93038 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:68:49,19:38,13:11,6 0/1:.:45:37,8:24,4:13,4 | |
| 9530 chr22 18851880 . T G . PASS DP=98;SS=1;SSC=2;GPV=1.7564e-19;SPV=0.55735 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:32,33:11,26:21,7 0/1:.:33:16,17:7,13:9,4 | |
| 9531 chr22 18852110 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=1;GPV=3.6641e-05;SPV=0.63867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:46,8:21,5:25,3 0/1:.:42:36,6:15,3:21,3 | |
| 9532 chr22 18852117 . C G . PASS DP=96;SS=1;SSC=2;GPV=1.3754e-21;SPV=0.59287 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:24,31:10,13:14,18 0/1:.:41:18,23:6,10:12,13 | |
| 9533 chr22 18853350 . C T . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=3.1625e-07;SPV=0.89776 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:48,15:20,7:28,8 0/1:.:33:28,5:10,3:18,2 | |
| 9534 chr22 18853399 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=2.9801e-10;SPV=0.88999 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:37,20:22,9:15,11 0/1:.:32:24,8:13,3:11,5 | |
| 9535 chr22 18853509 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=4.2943e-09;SPV=0.99311 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:33,19:20,14:13,5 0/1:.:38:32,6:18,4:14,2 | |
| 9536 chr22 18853517 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=1.4617e-11;SPV=0.85521 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:27,19:17,11:10,8 0/1:.:37:25,12:15,8:10,4 | |
| 9537 chr22 18853613 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 1/1:.:22:0,22:0,13:0,9 | |
| 9538 chr22 18853804 . A C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,14:0,26 1/1:.:43:0,43:0,24:0,19 | |
| 9539 chr22 18853816 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=1.1744e-10;SPV=0.70678 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:8,9:11,5 0/1:.:36:22,14:11,9:11,5 | |
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| 9587 chr22 18872375 . T A . PASS DP=53;SS=1;SSC=3;GPV=2.4512e-10;SPV=0.45564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:9,11:8,4 0/1:.:21:10,11:4,8:6,3 | |
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| 9597 chr22 18884538 . G T . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=1.4508e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,16:0,4 1/1:.:18:0,18:0,13:0,5 | |
| 9598 chr22 18885796 . G A . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=5.092e-05;SPV=0.7653 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:18,7:14,4:4,3 0/1:.:26:20,6:19,2:1,4 | |
| 9599 chr22 18885977 . T G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=1.5361e-06;SPV=0.89686 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:36,11:19,2:17,9 0/1:.:46:39,7:21,1:18,6 | |
| 9600 chr22 18885984 . T C . PASS DP=96;SOMATIC;SS=2;SSC=17;GPV=1;SPV=0.017027 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:50:46,4:23,1:23,3 0/1:.:46:34,12:18,4:16,8 | |
| 9601 chr22 18886293 . T A . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=1.1021e-09;SPV=0.97448 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:7,13:6,5:1,8 0/1:.:27:16,11:8,2:8,9 | |
| 9602 chr22 18887024 . T G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 1/1:.:26:0,26:0,17:0,9 | |
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| 9604 chr22 18887563 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=5.2318e-13;SPV=0.93082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:9,9:6,11 0/1:.:31:18,13:12,7:6,6 | |
| 9605 chr22 18891882 . G T . PASS DP=23;SS=1;SSC=2;GPV=1.1242e-05;SPV=0.55209 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:6,7:3,3:3,4 0/1:.:10:4,6:3,3:1,3 | |
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| 9650 chr22 18911974 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,31:0,15 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 | |
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| 9655 chr22 18913491 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,17:0,26 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 | |
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| 9657 chr22 18913777 . G A . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,26:0,26 1/1:.:45:0,45:0,28:0,17 | |
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| 9659 chr22 18914365 . C G . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,38:0,23 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
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| 9663 chr22 18915579 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,10:0,34 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 | |
| 9664 chr22 18916341 . T G . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,26:0,28 1/1:.:42:0,42:0,27:0,15 | |
| 9665 chr22 18916631 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,25:0,24 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
| 9666 chr22 18916901 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,27:0,27 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
| 9667 chr22 18917093 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,14:0,33 1/1:.:31:0,31:0,11:0,20 | |
| 9668 chr22 18917130 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,13:0,30 1/1:.:27:0,27:0,7:0,20 | |
| 9669 chr22 18917237 . T G . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,11:0,17 1/1:.:20:0,20:0,9:0,11 | |
| 9670 chr22 18917299 . G A . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,10:0,13 1/1:.:18:0,18:0,9:0,9 | |
| 9671 chr22 18917482 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
| 9672 chr22 18917604 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,23:0,12 1/1:.:32:0,32:0,23:0,9 | |
| 9673 chr22 18917782 . G C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,26:0,14 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 9674 chr22 18918010 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=9.653e-15;SPV=0.77874 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:8,8:10,11 0/1:.:42:23,19:12,8:11,11 | |
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| 9676 chr22 18918465 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=3.86e-20;SPV=0.96647 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:24,36:14,18:10,18 0/1:.:35:20,15:14,11:6,4 | |
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| 9723 chr22 18942400 . T C . PASS DP=43;SS=1;SSC=6;GPV=1.727e-05;SPV=0.24746 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:13,4:8,1:5,3 0/1:.:26:16,10:5,3:11,7 | |
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| 9725 chr22 18945706 . T C . PASS DP=94;SS=1;SSC=1;GPV=1.4411e-10;SPV=0.65021 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:28,13:15,11:13,2 0/1:.:53:37,16:21,14:16,2 | |
| 9726 chr22 18945828 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=7;GPV=1.0957e-13;SPV=0.17243 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:23,13:10,7:13,6 0/1:.:47:24,23:5,11:19,12 | |
| 9727 chr22 18947667 . G A . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,20:0,2 1/1:.:18:0,18:0,13:0,5 | |
| 9728 chr22 18947807 . C T . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,12:0,11 1/1:.:26:0,26:0,17:0,9 | |
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| 9730 chr22 18948253 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:35:0,35:0,14:0,21 | |
| 9731 chr22 18948329 . C A . PASS DP=73;SS=1;SSC=5;GPV=1.0403e-12;SPV=0.29714 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:9,9:14,7 0/1:.:34:17,17:6,11:11,6 | |
| 9732 chr22 18948886 . T A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,30:0,18 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 9733 chr22 18949107 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
| 9734 chr22 18949480 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,30:0,18 1/1:.:37:0,37:0,13:0,24 | |
| 9735 chr22 18950000 . T A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,27:0,19 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 | |
| 9736 chr22 18950334 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,12:0,25 1/1:.:45:0,45:0,27:0,18 | |
| 9737 chr22 18950444 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,25:0,20 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
| 9738 chr22 18950854 . G T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,27:0,9 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
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| 9740 chr22 18951949 . G A . PASS DP=46;SS=1;SSC=4;GPV=0.0034965;SPV=0.35714 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,3:0,1:0,2 0/1:.:20:2,3:0,1:2,2 | |
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| 9791 chr22 18984818 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=9.7292e-12;SPV=0.55541 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:31,21:14,9:17,12 0/1:.:24:14,10:7,7:7,3 | |
| 9792 chr22 18984912 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=7;GPV=2.2057e-13;SPV=0.19399 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:28,18:15,10:13,8 0/1:.:33:16,17:8,8:8,9 | |
| 9793 chr22 18985517 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=5;GPV=6.9672e-12;SPV=0.29795 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:11,10:9,7 0/1:.:23:10,13:3,6:7,7 | |
| 9794 chr22 18985958 . T C . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=6.8883e-21;SPV=0.94802 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:23,34:12,14:11,20 0/1:.:42:23,19:13,9:10,10 | |
| 9795 chr22 18986175 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=8.6008e-14;SPV=0.84596 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:4,13:19,9 0/1:.:35:21,14:6,4:15,10 | |
| 9796 chr22 18987211 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=6.5441e-13;SPV=0.89325 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:8,10:18,13 0/1:.:31:20,11:12,4:8,7 | |
| 9797 chr22 18987473 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=8;GPV=9.7502e-16;SPV=0.15816 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:29,20:14,10:15,10 0/1:.:39:18,21:6,12:12,9 | |
| 9798 chr22 18988309 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=7.191e-13;SPV=0.99769 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:14,23:10,13:4,10 0/1:.:32:22,10:17,5:5,5 | |
| 9799 chr22 18988966 . C G . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=2.1366e-11;SPV=0.58867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:12,7:11,9 0/1:.:34:20,14:8,8:12,6 | |
| 9800 chr22 18989090 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=4;GPV=4.4296e-19;SPV=0.38503 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:16,15:7,10 0/1:.:40:17,23:10,11:7,12 | |
| 9801 chr22 18991168 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=3.1151e-17;SPV=0.7411 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:9,12:11,11 0/1:.:43:22,21:9,14:13,7 | |
| 9802 chr22 18991892 . A C . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=6.7818e-18;SPV=0.75537 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:10,17:10,9 0/1:.:37:18,19:14,9:4,10 | |
| 9803 chr22 18992518 . G T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,28:0,21 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
| 9804 chr22 18992930 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=6;GPV=3.2684e-19;SPV=0.24133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:9,9:13,14 0/1:.:41:16,25:11,10:5,15 | |
| 9805 chr22 18994050 . T C . PASS DP=108;SS=1;SSC=2;GPV=7.7272e-22;SPV=0.5763 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:26,28:17,16:9,12 0/1:.:54:26,28:15,17:11,11 | |
| 9806 chr22 18994584 . G A . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=1.5824e-16;SPV=0.4786 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:27,23:15,12:12,11 0/1:.:41:21,20:13,9:8,11 | |
| 9807 chr22 18995264 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,19:0,26 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
| 9808 chr22 18995310 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=1.7781e-13;SPV=0.84945 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:33,25:21,14:12,11 0/1:.:32:21,11:10,4:11,7 | |
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| 9810 chr22 18996237 . G T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=2.025e-08;SPV=0.89136 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:10,8:10,7 0/1:.:23:16,7:9,3:7,4 | |
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| 9865 chr22 19168149 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=5.4147e-14;SPV=0.58717 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:11,11:14,12 0/1:.:27:14,13:7,4:7,9 | |
| 9866 chr22 19168604 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,26:0,28 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 | |
| 9867 chr22 19169030 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,19:0,28 1/1:.:41:0,41:0,16:0,25 | |
| 9868 chr22 19169195 . G C . PASS DP=89;SS=1;SSC=7;GPV=4.9005e-18;SPV=0.17084 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:9,14:15,6 0/1:.:45:19,26:10,15:9,11 | |
| 9869 chr22 19169487 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=5.8615e-20;SPV=0.7069 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:21,28:11,17:10,11 0/1:.:41:19,22:7,7:12,15 | |
| 9870 chr22 19170129 . A C . PASS DP=81;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.038598 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:10,13:13,7 0/1:.:38:12,26:5,11:7,15 | |
| 9871 chr22 19170306 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 | |
| 9872 chr22 19170603 . G A . PASS DP=97;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.036329 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:11,10:13,15 0/1:.:48:14,34:9,19:5,15 | |
| 9873 chr22 19171080 . C A . PASS DP=103;SS=1;SSC=3;GPV=1.229e-21;SPV=0.47769 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:30,33:17,12:13,21 0/1:.:40:18,22:8,11:10,11 | |
| 9874 chr22 19171209 . A G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=2.7632e-26;SPV=0.9188 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:14,36:7,17:7,19 0/1:.:43:17,26:9,17:8,9 | |
| 9875 chr22 19171243 . G C . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=6.6189e-12;SPV=0.59243 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:32,19:12,9:20,10 0/1:.:35:22,13:14,6:8,7 | |
| 9876 chr22 19171502 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,34:0,24 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 | |
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| 9878 chr22 19173036 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 | |
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| 9922 chr22 19196276 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=5;GPV=1.5461e-16;SPV=0.25738 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:15,11:11,13 0/1:.:31:13,18:7,11:6,7 | |
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| 9927 chr22 19198095 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=1.0364e-16;SPV=0.80467 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:8,10:10,14 0/1:.:36:18,18:9,9:9,9 | |
| 9928 chr22 19198225 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.0601e-12;SPV=0.90113 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:12,10:3,7 0/1:.:37:22,15:11,10:11,5 | |
| 9929 chr22 19199498 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=8;GPV=7.2168e-14;SPV=0.15448 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:28,19:11,12:17,7 0/1:.:31:14,17:6,8:8,9 | |
| 9930 chr22 19200567 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=4;GPV=1.5805e-15;SPV=0.37734 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:11,9:6,8 0/1:.:39:17,22:7,10:10,12 | |
| 9931 chr22 19201517 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.8769e-15;SPV=0.9633 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:13,21:6,11:7,10 0/1:.:39:22,17:11,10:11,7 | |
| 9932 chr22 19202196 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 1/1:.:24:0,24:0,10:0,14 | |
| 9933 chr22 19202633 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=6.0487e-10;SPV=0.91515 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:18,16:10,12:8,4 0/1:.:30:20,10:10,7:10,3 | |
| 9934 chr22 19204215 . T C . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:64:0,64:0,39:0,25 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
| 9935 chr22 19205086 . C G . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=7.191e-13;SPV=0.64293 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:12,6:6,11 0/1:.:34:18,16:7,7:11,9 | |
| 9936 chr22 19205395 . A T . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=2.1236e-16;SPV=0.62184 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:23,28:12,14:11,14 0/1:.:24:11,13:5,6:6,7 | |
| 9937 chr22 19205753 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=7.3585e-12;SPV=0.63198 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:10,8:12,9 0/1:.:33:19,14:13,7:6,7 | |
| 9938 chr22 19207151 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:39:0,39:0,26:0,13 | |
| 9939 chr22 19207358 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=9;GPV=3.0519e-14;SPV=0.1199 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:23,14:13,5:10,9 0/1:.:43:20,23:9,7:11,16 | |
| 9940 chr22 19207786 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=6;GPV=8.8612e-15;SPV=0.23295 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:14,10:7,10 0/1:.:28:11,17:3,9:8,8 | |
| 9941 chr22 19208170 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=1.3095e-14;SPV=0.59061 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:8,10:10,9 0/1:.:35:17,18:5,7:12,11 | |
| 9942 chr22 19208602 . C A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.1519e-11;SPV=0.91932 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:9,8:7,10 0/1:.:31:19,12:11,10:8,2 | |
| 9943 chr22 19209382 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=8;GPV=3.0367e-13;SPV=0.14942 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:14,7:9,9 0/1:.:32:14,18:6,10:8,8 | |
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| 9945 chr22 19210439 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=7.7158e-19;SPV=0.73778 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:22,30:9,20:13,10 0/1:.:32:15,17:9,7:6,10 | |
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| 9992 chr22 19247840 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,10:0,20 1/1:.:21:0,21:0,5:0,16 | |
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| 9994 chr22 19248294 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.9669e-13;SPV=0.86572 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:8,8:6,10 0/1:.:35:19,16:8,8:11,8 | |
| 9995 chr22 19248497 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.043291 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:10,9:13,6 0/1:.:30:11,19:5,8:6,11 | |
| 9996 chr22 19248966 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=6.0487e-10;SPV=0.7434 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:11,12:12,5 0/1:.:24:15,9:8,5:7,4 | |
| 9997 chr22 19251032 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=1.4887e-13;SPV=0.94618 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:11,21:7,14:4,7 0/1:.:25:13,12:7,8:6,4 | |
| 9998 chr22 19251311 . A T . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=4.39e-14;SPV=0.65337 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:9,16:14,7 0/1:.:27:14,13:7,2:7,11 | |
| 9999 chr22 19253338 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=6;GPV=1.3693e-11;SPV=0.23987 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:13,10:11,6 0/1:.:27:13,14:3,8:10,6 | |
| 10000 chr22 19253491 . A C . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=2.7419e-13;SPV=0.42912 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:9,9:15,12 0/1:.:25:12,13:6,6:6,7 | |
| 10001 chr22 19254318 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=3;GPV=3.5003e-14;SPV=0.43818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:16,12:7,10 0/1:.:26:12,14:4,8:8,6 | |
| 10002 chr22 19254838 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 1/1:.:28:0,28:0,11:0,17 | |
| 10003 chr22 19256172 . A T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
| 10004 chr22 19256815 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=1.4766e-14;SPV=0.71668 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:10,13:11,10 0/1:.:29:15,14:9,6:6,8 | |
| 10005 chr22 19258051 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=2;GPV=1.3458e-12;SPV=0.55107 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:6,9:9,9 0/1:.:23:10,13:6,8:4,5 | |
| 10006 chr22 19259630 . A T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=7.7351e-17;SPV=0.94183 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:15,25:11,14:4,11 0/1:.:36:19,17:10,5:9,12 | |
| 10007 chr22 19260755 . G A . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=1.9143e-06;SPV=0.85621 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:12,11:6,5:6,6 0/1:.:14:9,5:6,4:3,1 | |
| 10008 chr22 19261028 . T A . PASS DP=67;SS=1;SSC=7;GPV=2.0525e-15;SPV=0.17154 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:7,11:11,7 0/1:.:31:11,20:6,11:5,9 | |
| 10009 chr22 19261064 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=5.3416e-11;SPV=0.96057 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:12,11:10,9 0/1:.:30:21,9:12,5:9,4 | |
| 10010 chr22 19261878 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=6;GPV=1.7922e-12;SPV=0.2429 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:8,13:11,5 0/1:.:21:8,13:6,5:2,8 | |
| 10011 chr22 19264269 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=1.5685e-14;SPV=0.63091 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:9,12:6,7 0/1:.:31:14,17:6,8:8,9 | |
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| 10056 chr22 19296994 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=5;GPV=1.662e-19;SPV=0.31348 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:8,15:11,8 0/1:.:40:15,25:8,13:7,12 | |
| 10057 chr22 19297998 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=5;GPV=7.1262e-11;SPV=0.28039 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:31,16:17,9:14,7 0/1:.:30:17,13:10,9:7,4 | |
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| 10066 chr22 19303446 . T G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,28:0,23 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 10067 chr22 19304248 . C T . PASS DP=16;SS=1;SSC=0;GPV=1.6637e-09;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:8:0,8:0,4:0,4 1/1:.:8:0,8:0,3:0,5 | |
| 10068 chr22 19304580 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,31:0,10:0,21 1/1:.:30:0,30:0,20:0,10 | |
| 10069 chr22 19304626 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,12:0,20 1/1:.:27:0,27:0,17:0,10 | |
| 10070 chr22 19306502 . G C . PASS DP=59;SS=1;SSC=4;GPV=1.5534e-14;SPV=0.33177 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:3,9:11,9 0/1:.:27:9,17:6,6:3,11 | |
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| 10075 chr22 19310271 . T G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=2.5278e-17;SPV=0.96061 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:1,15:1,6:0,9 1/1:.:44:5,20:3,10:2,10 | |
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| 10077 chr22 19310907 . G C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,19:0,25 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
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| 10105 chr22 19320631 . A T . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,19:0,7 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 10106 chr22 19320658 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=1;GPV=1.8384e-09;SPV=0.7036 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:13,12:7,6:6,6 0/1:.:27:15,12:9,7:6,5 | |
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| 10108 chr22 19321866 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 1/1:.:17:0,17:0,5:0,12 | |
| 10109 chr22 19322171 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=5.9795e-14;SPV=0.97805 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:14,18:7,8 0/1:.:29:19,10:9,3:10,7 | |
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| 10113 chr22 19326007 . A T . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=1.7754e-37;SPV=0.54545 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:1,35:1,17:0,18 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 10114 chr22 19327030 . C T . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 1/1:.:16:0,16:0,9:0,7 | |
| 10115 chr22 19328584 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,23:0,23 1/1:.:24:0,24:0,14:0,10 | |
| 10116 chr22 19330307 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=8;GPV=6.2293e-15;SPV=0.14279 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:15,12:9,7 0/1:.:32:13,19:7,9:6,10 | |
| 10117 chr22 19331099 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,27:0,21 1/1:.:24:0,24:0,12:0,12 | |
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| 10119 chr22 19333321 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=5.7384e-17;SPV=0.74293 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:13,7:6,16 0/1:.:40:20,20:9,10:11,10 | |
| 10120 chr22 19333529 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=1.2661e-10;SPV=0.57221 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:10,8:7,7 0/1:.:25:13,12:8,5:5,7 | |
| 10121 chr22 19334199 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=5;GPV=4.8496e-12;SPV=0.30845 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:6,2:12,15 0/1:.:22:9,13:0,2:9,11 | |
| 10122 chr22 19334226 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=1.3291e-09;SPV=0.72778 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:3,3:17,12 0/1:.:26:16,10:2,2:14,8 | |
| 10123 chr22 19334987 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,29:0,13 1/1:.:16:0,16:0,8:0,8 | |
| 10124 chr22 19335544 . G C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,26:0,22 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 10125 chr22 19335739 . G A . PASS DP=94;SS=1;SSC=1;GPV=1.0497e-19;SPV=0.79205 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:8,12:13,15 0/1:.:46:23,23:14,14:9,9 | |
| 10126 chr22 19337917 . A T . PASS DP=50;SS=1;SSC=2;GPV=1.7754e-11;SPV=0.58617 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:12,15:3,6:9,9 0/1:.:23:10,13:7,7:3,6 | |
| 10127 chr22 19339472 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 1/1:.:21:0,21:0,8:0,13 | |
| 10128 chr22 19340139 . C G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 10129 chr22 19340221 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 10130 chr22 19340899 . A T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 10131 chr22 19341752 . A C . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=6.6242e-17;SPV=0.53542 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:11,18:10,8 0/1:.:28:12,16:8,9:4,7 | |
| 10132 chr22 19341828 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,26:0,19 1/1:.:29:0,29:0,22:0,7 | |
| 10133 chr22 19342448 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,24:0,24 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 | |
| 10134 chr22 19342607 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 | |
| 10135 chr22 19344151 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,16:0,10 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 | |
| 10136 chr22 19347290 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,23:0,21 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 | |
| 10137 chr22 19347926 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=2.1215e-17;SPV=0.81486 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:10,14:12,14 0/1:.:33:17,16:6,10:11,6 | |
| 10138 chr22 19348091 . C A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,25:0,20 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 | |
| 10139 chr22 19349074 . A G . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,15:0,30 1/1:.:49:0,49:0,18:0,31 | |
| 10140 chr22 19350110 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,25:0,21 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 10141 chr22 19350678 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,28:0,18 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 | |
| 10142 chr22 19350889 . T G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.6242e-17;SPV=0.84299 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:20,29:7,17:13,12 0/1:.:26:13,13:7,8:6,5 | |
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| 10144 chr22 19354665 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=9.7369e-18;SPV=0.81974 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:14,16:8,8 0/1:.:49:27,22:13,9:14,13 | |
| 10145 chr22 19355025 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=8.2973e-14;SPV=0.45671 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:8,8:8,7 0/1:.:38:18,20:7,12:11,8 | |
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| 10173 chr22 19401500 . A G . PASS DP=94;SS=1;SSC=1;GPV=2.5559e-17;SPV=0.77715 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:30,30:17,15:13,15 0/1:.:34:19,15:14,11:5,4 | |
| 10174 chr22 19402495 . C A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
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| 10181 chr22 19413783 . G T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 1/1:.:21:0,21:0,12:0,9 | |
| 10182 chr22 19416059 . C G . PASS DP=70;SS=1;SSC=9;GPV=3.2512e-15;SPV=0.11783 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:12,8:11,13 0/1:.:26:9,17:3,7:6,10 | |
| 10183 chr22 19417178 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=4;GPV=6.9925e-15;SPV=0.32328 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:2,7:18,10 0/1:.:39:18,21:8,6:10,15 | |
| 10184 chr22 19418471 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=4;GPV=1.3048e-11;SPV=0.37477 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:7,9:10,7 0/1:.:23:10,13:5,11:5,2 | |
| 10185 chr22 19418592 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 10186 chr22 19418593 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 10187 chr22 19420432 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,23:0,9 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
| 10188 chr22 19422443 . T A . PASS DP=53;SS=1;SSC=11;GPV=7.091e-10;SPV=0.070298 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:19,11:9,2:10,9 0/1:.:23:9,14:3,8:6,6 | |
| 10189 chr22 19423526 . T C . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=1.1019e-10;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,9:0,5:0,4 1/1:.:23:0,9:0,4:0,5 | |
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| 10192 chr22 19431570 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=2.8026e-45;SPV=0.43038 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 1/1:.:34:1,33:0,15:1,18 | |
| 10193 chr22 19432154 . A G . PASS DP=103;SS=1;SSC=2;GPV=2.0956e-14;SPV=0.61337 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:29,18:13,9:16,9 0/1:.:56:35,21:22,13:13,8 | |
| 10194 chr22 19432328 . A C . PASS DP=113;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,37:0,23 1/1:.:53:0,53:0,25:0,28 | |
| 10195 chr22 19432586 . T C . PASS DP=105;SS=1;SSC=6;GPV=5.1907e-22;SPV=0.23649 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:28,27:14,13:14,14 0/1:.:50:21,29:8,10:13,19 | |
| 10196 chr22 19432783 . C G . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=3.1151e-17;SPV=0.66502 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:9,8:12,15 0/1:.:42:21,21:9,7:12,14 | |
| 10197 chr22 19433436 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=1.2216e-16;SPV=0.5938 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:17,27:4,10:13,17 0/1:.:21:8,13:4,3:4,10 | |
| 10198 chr22 19433706 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=24;GPV=1;SPV=0.0036005 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:12,26:9,13:3,13 0/1:.:28:19,9:14,4:5,5 | |
| 10199 chr22 19433719 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=29;GPV=1;SPV=0.001177 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:26,12:14,8:12,4 0/1:.:26:7,19:3,14:4,5 | |
| 10200 chr22 19434466 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=5.8009e-12;SPV=0.70207 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:9,10:13,9 0/1:.:28:16,12:9,6:7,6 | |
| 10201 chr22 19435727 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=4;GPV=5.8102e-14;SPV=0.38348 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:29,19:12,11:17,8 0/1:.:40:22,18:10,10:12,8 | |
| 10202 chr22 19436107 . A T . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=1.8496e-17;SPV=0.56267 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,24:13,12:8,12 0/1:.:37:17,20:10,13:7,7 | |
| 10203 chr22 19436917 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=10;GPV=5.8615e-20;SPV=0.080544 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:13,15:13,9 0/1:.:40:14,26:7,19:7,7 | |
| 10204 chr22 19438509 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=4;GPV=2.3308e-15;SPV=0.32328 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:5,6:15,12 0/1:.:38:17,21:10,9:7,12 | |
| 10205 chr22 19438643 . G T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 | |
| 10206 chr22 19440554 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 | |
| 10207 chr22 19440622 . G T . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=4.9329e-10;SPV=0.64933 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:11,8:10,8 0/1:.:24:14,10:5,2:9,8 | |
| 10208 chr22 19442736 . T A . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=1.2461e-13;SPV=0.68911 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:14,21:5,12:9,9 0/1:.:21:9,12:4,4:5,8 | |
| 10209 chr22 19442949 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=7.191e-13;SPV=0.87646 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:11,11:8,10 0/1:.:29:17,12:9,5:8,7 | |
| 10210 chr22 19443515 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
| 10211 chr22 19443873 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,23:0,27 1/1:.:22:0,22:0,13:0,9 | |
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| 10235 chr22 19463428 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=3.0519e-14;SPV=0.5133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:13,9:10,10 0/1:.:38:20,18:5,11:15,7 | |
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| 10242 chr22 19467853 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=7.2383e-18;SPV=0.66074 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:19,27:16,16:3,11 0/1:.:30:13,17:6,11:7,6 | |
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| 10247 chr22 19472623 . T A . PASS DP=95;SS=1;SSC=1;GPV=1.1672e-21;SPV=0.6728 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:21,29:7,11:14,18 0/1:.:45:20,25:11,11:9,14 | |
| 10248 chr22 19472945 . G A . PASS DP=99;SS=1;SSC=1;GPV=1.7348e-18;SPV=0.70765 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:28,28:15,11:13,17 0/1:.:43:23,20:10,10:13,10 | |
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| 10251 chr22 19474943 . C G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 | |
| 10252 chr22 19479363 . T C . PASS DP=94;SS=1;SSC=2;GPV=7.3611e-17;SPV=0.61311 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:28,25:13,15:15,10 0/1:.:41:22,19:11,6:11,13 | |
| 10253 chr22 19479939 . G T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=1.3095e-14;SPV=0.97283 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:20,28:13,14:7,14 0/1:.:24:15,9:6,4:9,5 | |
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| 10255 chr22 19481132 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=3.125e-12;SPV=0.64138 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:14,11:9,7 0/1:.:33:19,14:13,6:6,8 | |
| 10256 chr22 19484086 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 1/1:.:34:0,34:0,22:0,12 | |
| 10257 chr22 19484757 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=5;GPV=1.7922e-12;SPV=0.28667 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:9,9:7,6 0/1:.:27:11,16:6,5:5,11 | |
| 10258 chr22 19485320 . T G . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,36:0,18 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 | |
| 10259 chr22 19485902 . A C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,18:0,30 1/1:.:42:0,42:0,12:0,30 | |
| 10260 chr22 19486721 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=1.3267e-12;SPV=0.8219 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:13,7:11,14 0/1:.:31:19,12:15,8:4,4 | |
| 10261 chr22 19488036 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=6.4034e-09;SPV=0.86926 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:13,12:4,4:9,8 0/1:.:30:19,11:10,7:9,4 | |
| 10262 chr22 19491093 . C G . PASS DP=87;SS=1;SSC=3;GPV=1.0454e-16;SPV=0.46656 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:28,26:13,12:15,14 0/1:.:33:16,17:8,9:8,8 | |
| 10263 chr22 19491221 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=1.3693e-11;SPV=0.51358 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:8,7:9,6 0/1:.:37:20,17:13,6:7,11 | |
| 10264 chr22 19491581 . A T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 1/1:.:28:0,28:0,12:0,16 | |
| 10265 chr22 19492066 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=5.6397e-13;SPV=0.97974 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:6,17:4,9:2,8 0/1:.:28:14,14:7,9:7,5 | |
| 10266 chr22 19492172 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=1.6045e-12;SPV=0.9848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:6,17:2,6:4,11 0/1:.:27:14,13:10,8:4,5 | |
| 10267 chr22 19493437 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=1.7396e-37;SPV=0.73763 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:2,45:1,30:1,15 1/1:.:24:1,23:0,15:1,8 | |
| 10268 chr22 19496375 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=7.8044e-17;SPV=0.99682 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:10,27:6,11:4,16 0/1:.:32:18,14:7,9:11,5 | |
| 10269 chr22 19496644 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=7.8324e-17;SPV=0.61312 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:12,21:6,13:6,8 0/1:.:30:11,19:6,8:5,11 | |
| 10270 chr22 19497877 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=5;GPV=5.8427e-13;SPV=0.27139 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:8,6:11,9 0/1:.:33:15,18:4,9:11,9 | |
| 10271 chr22 19499844 . G A . PASS DP=109;SS=1;SSC=0;GPV=2.6448e-21;SPV=0.89331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:28,34:15,23:13,11 0/1:.:47:26,21:13,10:13,11 | |
| 10272 chr22 19500682 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=6;GPV=7.6248e-11;SPV=0.2063 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:21,13:8,10:13,3 0/1:.:29:14,15:6,7:8,8 | |
| 10273 chr22 19502048 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=10;GPV=5.5047e-12;SPV=0.090674 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:10,7:8,6 0/1:.:27:10,17:4,9:6,8 | |
| 10274 chr22 19502955 . G T . PASS DP=82;SS=1;SSC=5;GPV=2.8834e-22;SPV=0.2841 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:18,28:9,13:9,15 0/1:.:36:11,25:7,11:4,14 | |
| 10275 chr22 19503116 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=1.7206e-15;SPV=0.77338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:6,10:13,10 0/1:.:44:24,20:12,6:12,14 | |
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| 10277 chr22 19503856 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,20:0,23 1/1:.:40:0,40:0,24:0,16 | |
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| 10302 chr22 19519458 . G C . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=3.7458e-16;SPV=0.89915 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:25,27:11,12:14,15 0/1:.:37:22,15:6,7:16,8 | |
| 10303 chr22 19519629 . C A . PASS DP=98;SS=1;SSC=6;GPV=3.7449e-17;SPV=0.23672 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:32,23:19,11:13,12 0/1:.:43:21,22:15,13:6,9 | |
| 10304 chr22 19521996 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=1.8206e-18;SPV=0.81811 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:7,9:10,13 0/1:.:51:26,25:15,11:11,14 | |
| 10305 chr22 19522206 . G A . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=4.11e-18;SPV=0.87179 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:16,19:8,8 0/1:.:46:26,20:16,12:10,8 | |
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| 10307 chr22 19526353 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.5502e-15;SPV=0.87116 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:11,10:10,14 0/1:.:37:21,16:11,10:10,6 | |
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| 10315 chr22 19528551 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=4;GPV=3.1807e-12;SPV=0.3433 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:11,11:8,5:3,6 0/1:.:32:13,19:7,6:6,13 | |
| 10316 chr22 19529033 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=1.1086e-15;SPV=0.443 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:9,8:16,16 0/1:.:30:14,16:4,7:10,9 | |
| 10317 chr22 19529947 . G T . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 10318 chr22 19529967 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,24:0,11 1/1:.:23:0,23:0,14:0,9 | |
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| 10320 chr22 19530556 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=4;GPV=7.8126e-18;SPV=0.34215 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:6,8:14,12 0/1:.:44:19,25:5,11:14,14 | |
| 10321 chr22 19531920 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=3.5024e-11;SPV=0.73218 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:6,9:14,8 0/1:.:29:17,12:10,3:7,9 | |
| 10322 chr22 19533909 . A T . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=3.1807e-12;SPV=0.72788 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:9,14:6,6 0/1:.:19:9,10:5,5:4,5 | |
| 10323 chr22 19534265 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=8;GPV=2.781e-14;SPV=0.12758 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:29,20:17,11:12,9 0/1:.:30:13,17:5,11:8,6 | |
| 10324 chr22 19534488 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=5;GPV=7.191e-13;SPV=0.27532 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:4,8:16,7 0/1:.:34:16,18:9,8:7,10 | |
| 10325 chr22 19534745 . A C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,28:0,21 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 10326 chr22 19536111 . A T . PASS DP=52;SS=1;SSC=6;GPV=2.38e-11;SPV=0.21371 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:13,11:9,7:4,4 0/1:.:28:11,17:6,8:5,9 | |
| 10327 chr22 19537004 . C A . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=1.7063e-13;SPV=0.71745 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:12,13:11,8 0/1:.:32:18,14:8,9:10,5 | |
| 10328 chr22 19539103 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=7;GPV=2.8926e-12;SPV=0.18091 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:26,16:15,12:11,4 0/1:.:31:15,16:9,11:6,5 | |
| 10329 chr22 19539299 . C A . PASS DP=67;SS=1;SSC=4;GPV=6.6365e-15;SPV=0.3229 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:9,12:9,7 0/1:.:30:12,18:5,5:7,13 | |
| 10330 chr22 19539766 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,25:0,24 1/1:.:29:0,29:0,19:0,10 | |
| 10331 chr22 19540960 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=4.6878e-13;SPV=0.71126 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:31,21:20,14:11,7 0/1:.:38:24,14:17,5:7,9 | |
| 10332 chr22 19541094 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=4.2977e-14;SPV=0.63751 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:8,10:18,11 0/1:.:37:21,16:8,9:13,7 | |
| 10333 chr22 19541607 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=7;GPV=5.3076e-14;SPV=0.18958 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:9,7:8,12 0/1:.:22:7,15:3,6:4,9 | |
| 10334 chr22 19543550 . A T . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=8.9137e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,25:0,12:0,13 1/1:.:16:0,10:0,4:0,6 | |
| 10335 chr22 19543612 . A C . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=6.4906e-14;SPV=0.62571 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:12,9:6,11 0/1:.:29:14,15:3,7:11,8 | |
| 10336 chr22 19543828 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,17:0,32 1/1:.:40:0,40:0,16:0,24 | |
| 10337 chr22 19544855 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 10338 chr22 19544925 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=1.4126e-14;SPV=0.72996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:29,26:16,11:13,15 0/1:.:28:16,12:7,7:9,5 | |
| 10339 chr22 19546375 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=2;GPV=1.9451e-10;SPV=0.51581 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:15,8:8,9 0/1:.:22:12,10:7,2:5,8 | |
| 10340 chr22 19546813 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.045898 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:26,18:10,9:16,9 0/1:.:37:14,23:4,14:10,9 | |
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| 10342 chr22 19548206 . C G . PASS DP=52;SS=1;SSC=4;GPV=1.9712e-13;SPV=0.33886 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:12,16:12,9:0,7 0/1:.:24:8,16:6,8:2,8 | |
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| 10384 chr22 19574189 . G T . PASS DP=73;SS=1;SSC=8;GPV=1.5635e-16;SPV=0.12771 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:13,5:7,14 0/1:.:34:12,22:3,9:9,13 | |
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| 10386 chr22 19575272 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 | |
| 10387 chr22 19575385 . A T . PASS DP=75;SS=1;SSC=10;GPV=6.2293e-15;SPV=0.094881 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:15,14:10,5 0/1:.:31:12,19:7,10:5,9 | |
| 10388 chr22 19575407 . G T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,27:0,13 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 10389 chr22 19576515 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=1.02e-15;SPV=0.73945 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:16,22:9,12:7,10 0/1:.:32:15,17:8,11:7,6 | |
| 10390 chr22 19577544 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,29:0,18 1/1:.:32:0,32:0,24:0,8 | |
| 10391 chr22 19577734 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=8.0845e-10;SPV=0.63376 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:21,13:13,5:8,8 0/1:.:35:22,13:10,3:12,10 | |
| 10392 chr22 19577872 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=4.3182e-16;SPV=0.44764 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:9,9:10,13 0/1:.:31:13,18:6,9:7,9 | |
| 10393 chr22 19578209 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=9.3121e-14;SPV=0.83204 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:9,10:9,11 0/1:.:31:17,14:10,11:7,3 | |
| 10394 chr22 19578327 . T A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.0403e-12;SPV=0.79661 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:15,15:9,7 0/1:.:27:16,11:10,6:6,5 | |
| 10395 chr22 19578549 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 | |
| 10396 chr22 19578680 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.2863e-14;SPV=0.93947 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:13,12:7,12 0/1:.:33:20,13:8,6:12,7 | |
| 10397 chr22 19578842 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 10398 chr22 19579626 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,16:0,25 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 | |
| 10399 chr22 19580381 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 | |
| 10400 chr22 19581825 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=5;GPV=2.5259e-14;SPV=0.27137 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:7,11:19,9 0/1:.:32:15,17:7,8:8,9 | |
| 10401 chr22 19581981 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 | |
| 10402 chr22 19582255 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,25:0,13 1/1:.:27:0,27:0,9:0,18 | |
| 10403 chr22 19582472 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=4;GPV=2.6699e-12;SPV=0.31999 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:27,19:16,9:11,10 0/1:.:26:13,13:9,4:4,9 | |
| 10404 chr22 19582833 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,15:0,23 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 10405 chr22 19583029 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=1;GPV=3.6885e-12;SPV=0.74671 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:12,16:8,8:4,8 0/1:.:27:13,14:7,4:6,10 | |
| 10406 chr22 19583215 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.3907e-10;SPV=0.95854 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:6,10:10,9 0/1:.:23:15,8:11,4:4,4 | |
| 10407 chr22 19584734 . C T . PASS DP=24;SS=1;SSC=0;GPV=3.101e-14;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,9:0,6 1/1:.:9:0,9:0,5:0,4 | |
| 10408 chr22 19585886 . G C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,29:0,17 1/1:.:23:0,23:0,18:0,5 | |
| 10409 chr22 19585902 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=4;GPV=1.5381e-13;SPV=0.39292 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:13,14:9,8 0/1:.:21:9,12:8,5:1,7 | |
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| 10446 chr22 19597149 . A G . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,22:0,35 1/1:.:40:0,40:0,16:0,24 | |
| 10447 chr22 19597165 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.037038 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:30,22:15,9:15,13 0/1:.:43:16,27:7,10:9,17 | |
| 10448 chr22 19597372 . T G . PASS DP=43;SS=1;SSC=1;GPV=1.4915e-22;SPV=0.78959 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:1,22:1,11:0,11 1/1:.:20:1,19:1,10:0,9 | |
| 10449 chr22 19597376 . T G . PASS DP=44;SS=1;SSC=4;GPV=2.0452e-11;SPV=0.38925 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:11,15:2,8:9,7 0/1:.:18:6,12:3,5:3,7 | |
| 10450 chr22 19598313 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 10451 chr22 19599020 . G T . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=2.6432e-07;SPV=0.77308 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:41,14:26,4:15,10 0/1:.:29:23,6:12,2:11,4 | |
| 10452 chr22 19599875 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 10453 chr22 19599954 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=7.3585e-12;SPV=0.49642 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:12,7:13,11 0/1:.:29:16,13:3,9:13,4 | |
| 10454 chr22 19599992 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,14:0,27 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 | |
| 10455 chr22 19600349 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=1.9973e-11;SPV=0.49908 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:25,17:14,10:11,7 0/1:.:30:17,13:6,3:11,10 | |
| 10456 chr22 19600553 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 | |
| 10457 chr22 19601012 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,25:0,15 1/1:.:26:0,26:0,13:0,13 | |
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| 10459 chr22 19602915 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,26:0,16 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 | |
| 10460 chr22 19603509 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 1/1:.:21:0,21:0,6:0,15 | |
| 10461 chr22 19604308 . C A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 | |
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| 10464 chr22 19605778 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,21:0,25 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 | |
| 10465 chr22 19605821 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 10466 chr22 19605911 . G C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 10467 chr22 19606074 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,23:0,25 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 10468 chr22 19606331 . A C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,17:0,24 1/1:.:31:0,31:0,8:0,23 | |
| 10469 chr22 19606731 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=9.3487e-14;SPV=0.50953 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:13,12:13,8 0/1:.:35:19,16:11,13:8,3 | |
| 10470 chr22 19606913 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=9;GPV=4.3182e-16;SPV=0.10723 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:7,11:13,7 0/1:.:34:12,22:6,11:6,11 | |
| 10471 chr22 19607091 . T G . PASS DP=75;SS=1;SSC=5;GPV=6.6743e-16;SPV=0.26284 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:9,11:12,9 0/1:.:34:14,20:8,7:6,13 | |
| 10472 chr22 19608021 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=5.4067e-14;SPV=0.86845 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:32,27:16,14:16,13 0/1:.:28:18,10:11,2:7,8 | |
| 10473 chr22 19608485 . C G . PASS DP=104;SS=1;SSC=1;GPV=1.4089e-21;SPV=0.69662 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:27,32:10,17:17,15 0/1:.:45:22,23:12,11:10,12 | |
| 10474 chr22 19609663 . A C . PASS DP=81;SS=1;SSC=5;GPV=9.3487e-14;SPV=0.30088 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:25,17:11,5:14,12 0/1:.:39:20,19:9,6:11,13 | |
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| 10476 chr22 19610518 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,36:0,21 1/1:.:24:0,24:0,12:0,12 | |
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| 10503 chr22 19629306 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=4;GPV=7.6319e-16;SPV=0.32738 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:13,13:6,5 0/1:.:39:17,22:10,19:7,3 | |
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| 10517 chr22 19633488 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,24:0,25 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
| 10518 chr22 19633731 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 | |
| 10519 chr22 19634138 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=1;GPV=8.49e-10;SPV=0.77883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:8,7:8,8 0/1:.:24:14,10:12,7:2,3 | |
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| 10524 chr22 19635080 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=3;GPV=8.9089e-11;SPV=0.49794 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:13,6:8,9 0/1:.:29:16,13:6,6:10,7 | |
| 10525 chr22 19635167 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,12:0,17 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
| 10526 chr22 19635734 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.7439e-13;SPV=0.66835 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:10,10:11,13 0/1:.:22:11,11:3,7:8,4 | |
| 10527 chr22 19635837 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 | |
| 10528 chr22 19635943 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=1.8424e-11;SPV=0.92949 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:7,10:8,9 0/1:.:25:15,10:8,8:7,2 | |
| 10529 chr22 19637017 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=12;GPV=1.6045e-17;SPV=0.051802 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:26,22:14,11:12,11 0/1:.:33:11,22:7,11:4,11 | |
| 10530 chr22 19637638 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=3.0774e-18;SPV=0.91612 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:17,29:10,17:7,12 0/1:.:32:16,16:7,7:9,9 | |
| 10531 chr22 19637781 . G C . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=3.3945e-16;SPV=0.67596 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:15,14:9,9 0/1:.:41:22,19:10,10:12,9 | |
| 10532 chr22 19638302 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.8851e-14;SPV=0.88829 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:9,7:11,16 0/1:.:31:18,13:6,5:12,8 | |
| 10533 chr22 19638303 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.6279e-15;SPV=0.89426 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:9,8:10,16 0/1:.:34:19,15:8,4:11,11 | |
| 10534 chr22 19639006 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 1/1:.:51:0,51:0,22:0,29 | |
| 10535 chr22 19639179 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.2414e-11;SPV=0.9403 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:14,11:7,7 0/1:.:41:28,13:15,5:13,8 | |
| 10536 chr22 19639758 . A C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=2.5717e-21;SPV=0.8441 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:16,29:8,18:8,11 0/1:.:41:18,23:12,13:6,10 | |
| 10537 chr22 19639935 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=7.9176e-20;SPV=0.93833 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:22,33:8,20:14,13 0/1:.:37:20,17:11,4:9,13 | |
| 10538 chr22 19639978 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,27:0,24 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 | |
| 10539 chr22 19639981 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=9;GPV=2.4776e-16;SPV=0.11584 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:29,22:18,9:11,13 0/1:.:34:14,20:4,10:10,10 | |
| 10540 chr22 19641214 . A C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.39e-14;SPV=0.8233 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:14,10:10,16 0/1:.:23:13,10:3,7:10,3 | |
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| 10542 chr22 19641840 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=9;GPV=2.9394e-12;SPV=0.10082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:20,14:8,13:12,1 0/1:.:28:11,17:7,12:4,5 | |
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| 10591 chr22 19686138 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=3;GPV=1.0222e-17;SPV=0.44144 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:28,29:18,16:10,13 0/1:.:29:13,16:11,8:2,8 | |
| 10592 chr22 19688217 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=7.1262e-11;SPV=0.78616 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:25,17:14,7:11,10 0/1:.:35:23,12:12,5:11,7 | |
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| 10595 chr22 19689041 . A C . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,30:0,23 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 | |
| 10596 chr22 19689075 . C T . PASS DP=100;SS=1;SSC=1;GPV=7.9032e-21;SPV=0.64685 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:24,28:11,17:13,11 0/1:.:48:23,25:8,15:15,10 | |
| 10597 chr22 19689190 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=10;GPV=5.3169e-12;SPV=0.081879 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:31,14:15,8:16,6 0/1:.:37:19,18:13,8:6,10 | |
| 10598 chr22 19689490 . G C . PASS DP=103;SS=1;SSC=1;GPV=2.934e-25;SPV=0.65815 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:25,39:15,24:10,15 0/1:.:39:16,23:8,18:8,5 | |
| 10599 chr22 19689562 . T C . PASS DP=110;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:66:0,66:0,35:0,31 1/1:.:44:0,44:0,27:0,17 | |
| 10600 chr22 19689684 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=2.6276e-20;SPV=0.7717 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:16,29:4,15:12,14 0/1:.:34:14,20:9,13:5,7 | |
| 10601 chr22 19690164 . G A . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=1.6126e-21;SPV=0.83193 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:23,33:10,19:13,14 0/1:.:41:20,21:10,8:10,13 | |
| 10602 chr22 19690316 . G A . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=6.4769e-21;SPV=0.46408 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:9,11:14,18 0/1:.:39:16,23:7,14:9,9 | |
| 10603 chr22 19690620 . C A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 1/1:.:38:0,38:0,14:0,24 | |
| 10604 chr22 19690835 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=3.2999e-18;SPV=0.911 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:16,24:9,12:7,12 0/1:.:46:24,22:14,14:10,8 | |
| 10605 chr22 19691132 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,28:0,15 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
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| 10607 chr22 19692557 . G C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=1.3095e-14;SPV=0.92001 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:16,22:6,7:10,15 0/1:.:34:19,15:8,7:11,8 | |
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| 10645 chr22 19732528 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=4.0755e-15;SPV=0.4574 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:13,9:9,10 0/1:.:40:20,20:13,8:7,12 | |
| 10646 chr22 19732955 . A G . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=5.2692e-19;SPV=0.79762 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:29,32:14,19:15,13 0/1:.:37:20,17:7,11:13,6 | |
| 10647 chr22 19733581 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=2.4776e-16;SPV=0.71398 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:13,15:11,10 0/1:.:36:19,17:10,13:9,4 | |
| 10648 chr22 19733950 . C A . PASS DP=87;SS=1;SSC=4;GPV=3.5113e-17;SPV=0.36035 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:28,26:13,9:15,17 0/1:.:33:15,18:7,11:8,7 | |
| 10649 chr22 19734127 . A T . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=6.107e-18;SPV=0.86527 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:15,19:10,7 0/1:.:50:29,21:18,12:11,9 | |
| 10650 chr22 19734243 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=1.0454e-16;SPV=0.83562 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:12,14:10,11 0/1:.:40:22,18:12,7:10,11 | |
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| 10652 chr22 19735292 . C G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=1.9033e-15;SPV=0.94648 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:10,13:12,13 0/1:.:36:22,14:10,8:12,6 | |
| 10653 chr22 19736532 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=7.2639e-16;SPV=0.97019 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:12,13:8,13 0/1:.:39:24,15:14,8:10,7 | |
| 10654 chr22 19736701 . T C . PASS DP=100;SS=1;SSC=2;GPV=3.0657e-13;SPV=0.62711 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:33,19:18,13:15,6 0/1:.:48:31,17:20,9:11,8 | |
| 10655 chr22 19737090 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,25:0,21 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 10656 chr22 19737930 . G T . PASS DP=101;SS=1;SSC=11;GPV=8.35e-20;SPV=0.063483 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:33,25:15,13:18,12 0/1:.:43:17,26:8,14:9,12 | |
| 10657 chr22 19739466 . C A . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,30:0,22 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
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| 10659 chr22 19740662 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,24:0,22 1/1:.:38:0,38:0,15:0,23 | |
| 10660 chr22 19741031 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,22:0,23 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 | |
| 10661 chr22 19741568 . A C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,32:0,24 1/1:.:30:0,30:0,21:0,9 | |
| 10662 chr22 19741615 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,25:0,23 1/1:.:30:0,30:0,20:0,10 | |
| 10663 chr22 19741838 . A G . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=1.568e-16;SPV=0.81877 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:28,24:12,12:16,12 0/1:.:51:31,20:17,10:14,10 | |
| 10664 chr22 19743069 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,27:0,24 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 | |
| 10665 chr22 19752297 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=6;GPV=2.0579e-15;SPV=0.2107 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:12,10:8,7 0/1:.:38:16,22:9,11:7,11 | |
| 10666 chr22 19755257 . A G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 1/1:.:48:0,48:0,29:0,19 | |
| 10667 chr22 19757166 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,24:0,33 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 10668 chr22 19757169 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,24:0,33 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 10669 chr22 19762002 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,29:0,30 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 10670 chr22 19767493 . T C . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,24:0,28 1/1:.:40:0,40:0,17:0,23 | |
| 10671 chr22 19767504 . G C . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,26:0,29 1/1:.:37:0,37:0,14:0,23 | |
| 10672 chr22 19771592 . T C . PASS DP=98;SS=1;SSC=3;GPV=5.2692e-19;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:14,16:12,9 0/1:.:47:23,24:13,16:10,8 | |
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| 10674 chr22 19797709 . C T . PASS DP=116;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:80:0,80:0,36:0,44 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 | |
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| 10717 chr22 19862430 . T A . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=3.2889e-10;SPV=0.89384 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:12,13:5,5 0/1:.:21:13,8:9,6:4,2 | |
| 10718 chr22 19862647 . G T . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=1.1519e-11;SPV=0.5837 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:10,9:10,8 0/1:.:28:15,13:10,6:5,7 | |
| 10719 chr22 19862874 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=2.5259e-14;SPV=0.89871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:13,12:10,13 0/1:.:30:18,12:7,6:11,6 | |
| 10720 chr22 19863075 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=18;GPV=1;SPV=0.013527 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:29,14:16,4:13,10 0/1:.:33:13,20:7,15:6,5 | |
| 10721 chr22 19863626 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=5;GPV=1.8496e-17;SPV=0.28656 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:12,10:12,14 0/1:.:34:14,20:10,12:4,8 | |
| 10722 chr22 19864915 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=7.5332e-13;SPV=0.44108 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:26,17:11,10:15,7 0/1:.:39:22,17:15,11:7,6 | |
| 10723 chr22 19867210 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=6.6445e-15;SPV=0.71868 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:11,18:6,8:5,10 0/1:.:31:13,18:8,7:5,11 | |
| 10724 chr22 19867644 . T C . PASS DP=34;SS=1;SSC=3;GPV=1.1295e-05;SPV=0.47602 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:10,6:3,2:7,4 0/1:.:18:10,8:4,5:6,3 | |
| 10725 chr22 19868949 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=9;GPV=2.7526e-17;SPV=0.11949 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:31,27:11,16:20,11 0/1:.:27:10,17:8,11:2,6 | |
| 10726 chr22 19869187 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=4;GPV=1.02e-15;SPV=0.37328 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:7,11:11,9 0/1:.:32:13,19:5,11:8,8 | |
| 10727 chr22 19869538 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=8.8908e-21;SPV=0.88391 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:19,33:7,19:12,14 0/1:.:34:16,18:7,8:9,10 | |
| 10728 chr22 19869684 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=6.4956e-13;SPV=0.61051 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:14,9:6,10 0/1:.:29:15,14:8,5:7,9 | |
| 10729 chr22 19870419 . C G . PASS DP=84;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.040836 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:8,10:16,7 0/1:.:43:16,27:10,19:6,8 | |
| 10730 chr22 19870544 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 1/1:.:49:0,49:0,23:0,26 | |
| 10731 chr22 19870591 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=2.781e-14;SPV=0.96913 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:8,12:7,8 0/1:.:44:27,17:12,8:15,9 | |
| 10732 chr22 19871024 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=9;GPV=2.3308e-15;SPV=0.12107 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:8,11:15,7 0/1:.:35:14,21:5,10:9,11 | |
| 10733 chr22 19871211 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=2.4568e-12;SPV=0.67042 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:10,9:11,9 0/1:.:32:18,14:11,5:7,9 | |
| 10734 chr22 19871344 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=5;GPV=7.3575e-14;SPV=0.29612 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:10,10:11,9 0/1:.:28:12,16:6,7:6,9 | |
| 10735 chr22 19871457 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=8.5945e-18;SPV=0.94092 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:16,28:7,18:9,10 0/1:.:33:17,16:7,9:10,7 | |
| 10736 chr22 19871506 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=6;GPV=4.3139e-18;SPV=0.24059 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:20,9:6,15 0/1:.:38:16,22:11,13:5,9 | |
| 10737 chr22 19872394 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=5;GPV=8.3706e-15;SPV=0.28833 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:31,21:19,12:12,9 0/1:.:37:19,18:11,9:8,9 | |
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| 10739 chr22 19872832 . T G . PASS DP=98;SS=1;SSC=6;GPV=1.8717e-20;SPV=0.21268 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:17,12:8,11 0/1:.:50:21,29:14,15:7,14 | |
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| 10785 chr22 19898453 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=5;GPV=6.2985e-12;SPV=0.27736 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:15,8:9,8 0/1:.:30:15,15:7,4:8,11 | |
| 10786 chr22 19899274 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=1;GPV=1.1672e-21;SPV=0.6728 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:21,29:14,15:7,14 0/1:.:45:20,25:13,11:7,14 | |
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| 10788 chr22 19902112 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=6;GPV=1.7063e-13;SPV=0.22944 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:29,21:16,8:13,13 0/1:.:26:12,14:8,8:4,6 | |
| 10789 chr22 19903768 . C G . PASS DP=113;SS=1;SSC=4;GPV=7.8252e-19;SPV=0.3924 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:33,24:13,12:20,12 0/1:.:56:30,26:12,12:18,14 | |
| 10790 chr22 19904808 . G C . PASS DP=105;SS=1;SSC=4;GPV=8.714e-18;SPV=0.36365 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:40,30:24,14:16,16 0/1:.:35:18,17:8,4:10,13 | |
| 10791 chr22 19905394 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=4;GPV=6.5235e-17;SPV=0.33908 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:22,12:4,13 0/1:.:32:14,18:8,15:6,3 | |
| 10792 chr22 19906257 . G C . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=3.7958e-17;SPV=0.32559 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:11,16:11,7 0/1:.:34:14,20:11,13:3,7 | |
| 10793 chr22 19907808 . A G . PASS DP=22;SS=1;SSC=0;GPV=2.7817e-06;SPV=0.86533 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:4,9:1,7:3,2 0/1:.:9:4,5:2,2:2,3 | |
| 10794 chr22 19908205 . A C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=2.95e-15;SPV=0.82029 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:12,13:9,11 0/1:.:33:18,15:12,8:6,7 | |
| 10795 chr22 19908404 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=1.374e-15;SPV=0.45278 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:7,9:13,13 0/1:.:30:13,17:7,10:6,7 | |
| 10796 chr22 19909048 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=6.5425e-16;SPV=0.82419 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:13,15:11,11 0/1:.:34:19,15:9,9:10,6 | |
| 10797 chr22 19911314 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=11;GPV=6.0779e-13;SPV=0.064342 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:30,16:19,5:11,11 0/1:.:33:15,18:6,7:9,11 | |
| 10798 chr22 19913900 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.6516e-12;SPV=0.90914 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:12,10:13,12 0/1:.:32:21,11:6,5:15,6 | |
| 10799 chr22 19918279 . G A . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=1.9793e-19;SPV=0.93451 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:21,28:12,15:9,13 0/1:.:50:28,22:14,15:14,7 | |
| 10800 chr22 19918988 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=5.9795e-14;SPV=0.72027 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:6,9:18,14 0/1:.:29:16,13:4,2:12,11 | |
| 10801 chr22 19920404 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=7;GPV=4.1486e-16;SPV=0.18227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:12,12:11,7 0/1:.:38:16,22:7,7:9,15 | |
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| 10852 chr22 19948817 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=4.794e-13;SPV=0.74027 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:11,9:8,8 0/1:.:40:23,17:10,2:13,15 | |
| 10853 chr22 19950247 . T C . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=2.3178e-05;SPV=0.83316 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:10,9:3,4:7,5 0/1:.:11:7,4:1,1:6,3 | |
| 10854 chr22 19951187 . A T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 10855 chr22 19951314 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 10856 chr22 19951830 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,26:0,29 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 10857 chr22 19951909 . G A . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=4.5213e-16;SPV=0.84115 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:30,29:11,12:19,17 0/1:.:32:19,13:10,3:9,10 | |
| 10858 chr22 19952116 . A G . PASS DP=106;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,27:0,33 1/1:.:46:0,46:0,23:0,23 | |
| 10859 chr22 19952504 . G C . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=8.038e-16;SPV=0.66692 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:9,10:13,11 0/1:.:43:23,20:9,8:14,12 | |
| 10860 chr22 19953138 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.6624e-13;SPV=0.80679 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:10,11:5,7 0/1:.:32:17,15:9,7:8,8 | |
| 10861 chr22 19953481 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,27:0,24 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 10862 chr22 19953984 . A G . PASS DP=104;SS=1;SSC=8;GPV=2.2346e-17;SPV=0.14249 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:68:41,27:21,14:20,13 0/1:.:36:17,19:11,15:6,4 | |
| 10863 chr22 19955157 . C G . PASS DP=77;SS=1;SSC=7;GPV=8.6835e-16;SPV=0.19268 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:15,11:9,10 0/1:.:32:13,19:8,10:5,9 | |
| 10864 chr22 19955474 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=5.6371e-17;SPV=0.82687 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:18,27:6,16:12,11 0/1:.:29:14,15:6,7:8,8 | |
| 10865 chr22 19956139 . T C . PASS DP=35;SS=1;SSC=2;GPV=0.0024931;SPV=0.54753 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:15,4:12,1:3,3 0/1:.:16:12,4:2,1:10,3 | |
| 10866 chr22 19957037 . G A . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=3.158e-10;SPV=0.86382 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:11,16:5,5:6,11 0/1:.:19:10,9:2,4:8,5 | |
| 10867 chr22 19957200 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=4.5213e-16;SPV=0.93758 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:26,28:14,17:12,11 0/1:.:37:23,14:13,8:10,6 | |
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| 10922 chr22 20017414 . C G . PASS DP=120;SS=1;SSC=6;GPV=2.888e-21;SPV=0.2164 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:72:41,31:18,13:23,18 0/1:.:48:23,25:8,17:15,8 | |
| 10923 chr22 20017735 . G T . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=7.7239e-15;SPV=0.6706 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:13,15:16,9 0/1:.:35:20,15:11,8:9,7 | |
| 10924 chr22 20018621 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=2.0579e-15;SPV=0.97489 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:20,29:15,17:5,12 0/1:.:26:16,10:8,3:8,7 | |
| 10925 chr22 20018831 . G C . PASS DP=74;SS=1;SSC=6;GPV=1.6574e-14;SPV=0.24089 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:12,7:11,12 0/1:.:32:14,18:7,12:7,6 | |
| 10926 chr22 20019035 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 1/1:.:37:0,37:0,13:0,24 | |
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| 10929 chr22 20021555 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.2414e-11;SPV=0.64947 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:26,17:15,12:11,5 0/1:.:37:23,14:11,10:12,4 | |
| 10930 chr22 20022405 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=7;GPV=4.2509e-20;SPV=0.18549 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:25,27:16,16:9,11 0/1:.:36:13,23:10,12:3,11 | |
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| 10986 chr22 20110836 . T G . PASS DP=85;SS=1;SSC=9;GPV=2.785e-19;SPV=0.12041 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:27,28:15,12:12,16 0/1:.:30:10,20:6,10:4,10 | |
| 10987 chr22 20111359 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=16;GPV=1;SPV=0.022782 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:11,5:12,11 0/1:.:36:12,24:4,13:8,11 | |
| 10988 chr22 20111808 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=9.653e-15;SPV=0.97572 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:10,11:9,14 0/1:.:35:22,13:8,8:14,5 | |
| 10989 chr22 20113073 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=8;GPV=1.0222e-17;SPV=0.13295 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:12,10:13,11 0/1:.:40:16,24:10,10:6,14 | |
| 10990 chr22 20116778 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=9;GPV=1.3287e-16;SPV=0.10566 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:8,10:14,12 0/1:.:28:9,19:2,2:7,17 | |
| 10991 chr22 20117296 . A C . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=8.038e-16;SPV=0.75141 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:11,5:12,18 0/1:.:40:22,18:8,8:14,10 | |
| 10992 chr22 20126043 . C T . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=3.0906e-19;SPV=0.83339 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:30,32:14,12:16,20 0/1:.:41:23,18:9,10:14,8 | |
| 10993 chr22 20131575 . C G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,17:0,27 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 | |
| 10994 chr22 20131708 . A G . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,5:0,19 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
| 10995 chr22 20131722 . G C . PASS DP=34;SS=1;SSC=0;GPV=3.5146e-20;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,4:0,11 1/1:.:19:0,19:0,11:0,8 | |
| 10996 chr22 20132407 . A G . PASS DP=119;SS=1;SSC=0;GPV=1.1714e-23;SPV=0.91195 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:76:34,42:20,25:14,17 0/1:.:43:24,19:9,12:15,7 | |
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| 10998 chr22 20148740 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=2;GPV=6.5425e-16;SPV=0.60668 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:13,11:13,14 0/1:.:33:17,16:13,10:4,6 | |
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| 11037 chr22 20172176 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,29:0,21 1/1:.:37:0,37:0,23:0,14 | |
| 11038 chr22 20172458 . G C . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,29:0,21 1/1:.:49:0,49:0,27:0,22 | |
| 11039 chr22 20172682 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,22:0,28 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
| 11040 chr22 20173449 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 | |
| 11041 chr22 20173794 . G C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,19:0,27 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
| 11042 chr22 20173901 . T C . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,31:0,26 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 | |
| 11043 chr22 20174215 . G C . PASS DP=106;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,30:0,19 1/1:.:57:0,57:0,28:0,29 | |
| 11044 chr22 20175200 . T C . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,25:0,26 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 | |
| 11045 chr22 20175547 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 | |
| 11046 chr22 20176837 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,26:0,25 1/1:.:36:0,36:0,12:0,24 | |
| 11047 chr22 20177066 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,28:0,23 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 11048 chr22 20177173 . C T . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,31:0,27 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 | |
| 11049 chr22 20177186 . T C . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,29:0,30 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 | |
| 11050 chr22 20177279 . G T . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,23:0,32 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 | |
| 11051 chr22 20177426 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,28:0,23 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 | |
| 11052 chr22 20177916 . C A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,19:0,26 1/1:.:41:0,41:0,14:0,27 | |
| 11053 chr22 20178109 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,28:0,23 1/1:.:43:0,43:0,19:0,24 | |
| 11054 chr22 20178308 . G A . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,33:0,26 1/1:.:39:0,39:0,15:0,24 | |
| 11055 chr22 20178490 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,31:0,23 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 11056 chr22 20178679 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,19:0,33 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
| 11057 chr22 20178699 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,17:0,32 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 | |
| 11058 chr22 20179200 . T G . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,22:0,31 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 | |
| 11059 chr22 20179388 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,30:0,7 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 11060 chr22 20180772 . G T . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,32:0,28 1/1:.:32:0,32:0,21:0,11 | |
| 11061 chr22 20180986 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,27:0,22 1/1:.:29:0,29:0,9:0,20 | |
| 11062 chr22 20181118 . T G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,20:0,29 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 | |
| 11063 chr22 20181514 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,33:0,18 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
| 11064 chr22 20181571 . G T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 | |
| 11065 chr22 20181844 . G T . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,29:0,23 1/1:.:43:0,43:0,23:0,20 | |
| 11066 chr22 20181976 . A G . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,37:0,18 1/1:.:45:0,45:0,17:0,28 | |
| 11067 chr22 20182390 . A G . PASS DP=111;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:62:0,62:0,42:0,20 1/1:.:49:0,49:0,22:0,27 | |
| 11068 chr22 20183473 . C A . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,28:0,23 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 | |
| 11069 chr22 20183623 . C G . PASS DP=106;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,26:0,31 1/1:.:49:0,49:0,26:0,23 | |
| 11070 chr22 20183845 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=1.9451e-10;SPV=0.96242 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:12,6:6,13 0/1:.:25:17,8:11,4:6,4 | |
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| 11099 chr22 20191980 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,28:0,16 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 | |
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| 11108 chr22 20195507 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,19:0,25 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 11109 chr22 20195516 . G C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,21:0,25 1/1:.:35:0,35:0,12:0,23 | |
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| 11116 chr22 20197187 . A G . PASS DP=99;SS=1;SSC=4;GPV=2.1398e-20;SPV=0.38355 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:67:33,34:11,17:22,17 0/1:.:32:14,18:4,7:10,11 | |
| 11117 chr22 20197488 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=9;GPV=1.0051e-11;SPV=0.1177 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:13,10:4,4 0/1:.:23:8,15:5,8:3,7 | |
| 11118 chr22 20198364 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=4.0755e-15;SPV=0.93225 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:27,30:15,16:12,14 0/1:.:24:15,9:6,3:9,6 | |
| 11119 chr22 20199608 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=12;GPV=2.2046e-16;SPV=0.052527 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:12,8:7,10 0/1:.:31:9,22:2,12:7,10 | |
| 11120 chr22 20200020 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=1.7063e-13;SPV=0.94098 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:8,12:8,7 0/1:.:41:25,16:12,10:13,6 | |
| 11121 chr22 20201086 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=3.7283e-09;SPV=0.97498 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:7,8:10,8 0/1:.:29:21,8:10,4:11,4 | |
| 11122 chr22 20201427 . T C . PASS DP=23;SS=1;SSC=0;GPV=0.0018791;SPV=0.88982 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:5,4:1,0:4,4 0/1:.:14:10,4:0,0:10,4 | |
| 11123 chr22 20202651 . G T . PASS DP=96;SS=1;SSC=3;GPV=1.0792e-17;SPV=0.43214 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:28,24:17,18:11,6 0/1:.:44:22,22:15,8:7,14 | |
| 11124 chr22 20204023 . A G . PASS DP=101;SS=1;SSC=22;GPV=1;SPV=0.0062485 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:38,27:18,13:20,14 0/1:.:36:11,25:6,16:5,9 | |
| 11125 chr22 20204808 . C G . PASS DP=94;SS=1;SSC=5;GPV=2.5559e-17;SPV=0.30337 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:34,28:21,15:13,13 0/1:.:32:15,17:7,9:8,8 | |
| 11126 chr22 20205063 . A C . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:63:0,63:0,25:0,38 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 | |
| 11127 chr22 20205064 . G C . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:64:0,64:0,26:0,38 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 | |
| 11128 chr22 20205636 . C A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,23:0,24 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 | |
| 11129 chr22 20206338 . G C . PASS DP=104;SS=1;SSC=1;GPV=1.172e-19;SPV=0.76065 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:71:35,36:22,15:13,21 0/1:.:33:18,15:11,8:7,7 | |
| 11130 chr22 20208946 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,24:0,29 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
| 11131 chr22 20209213 . C G . PASS DP=99;SS=1;SSC=4;GPV=6.8883e-21;SPV=0.38401 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:8,10:16,15 0/1:.:50:22,28:12,12:10,16 | |
| 11132 chr22 20209812 . T A . PASS DP=91;SS=1;SSC=1;GPV=2.0677e-18;SPV=0.75999 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:23,27:16,18:7,9 0/1:.:41:21,20:9,12:12,8 | |
| 11133 chr22 20211009 . G A . PASS DP=96;SS=1;SSC=2;GPV=4.4461e-21;SPV=0.55634 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:23,28:13,14:10,14 0/1:.:45:20,25:13,9:7,16 | |
| 11134 chr22 20214431 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=1;GPV=1.7418e-16;SPV=0.68208 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:16,15:10,9 0/1:.:42:23,19:12,10:11,9 | |
| 11135 chr22 20215206 . G A . PASS DP=99;SS=1;SSC=1;GPV=1.9793e-19;SPV=0.68975 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:26,28:12,9:14,19 0/1:.:45:23,22:8,9:15,13 | |
| 11136 chr22 20215266 . C A . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,19:0,32 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 | |
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| 11138 chr22 20215869 . T G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,31:0,24 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 | |
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| 11170 chr22 20230105 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=1.2112e-18;SPV=0.74143 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:8,15:14,13 0/1:.:37:18,19:7,12:11,7 | |
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| 11173 chr22 20231667 . C G . PASS DP=101;SS=1;SSC=6;GPV=2.4886e-19;SPV=0.24536 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:31,26:13,13:18,13 0/1:.:44:20,24:7,14:13,10 | |
| 11174 chr22 20231969 . G T . PASS DP=78;SS=1;SSC=4;GPV=2.95e-15;SPV=0.32351 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:13,5:11,16 0/1:.:33:15,18:4,6:11,12 | |
| 11175 chr22 20232125 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=1;GPV=9.7369e-18;SPV=0.77121 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:12,9:13,17 0/1:.:44:24,20:14,11:10,9 | |
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| 11177 chr22 20232643 . A C . PASS DP=104;SS=1;SSC=3;GPV=9.9137e-19;SPV=0.49102 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:27,23:18,11:9,12 0/1:.:54:28,26:14,11:14,15 | |
| 11178 chr22 20233241 . T C . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=1.7348e-18;SPV=0.9656 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:27,33:17,12:10,21 0/1:.:39:24,15:5,3:19,12 | |
| 11179 chr22 20233466 . T A . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,24:0,31 1/1:.:40:0,40:0,25:0,15 | |
| 11180 chr22 20234034 . T A . PASS DP=111;SS=1;SSC=5;GPV=3.6968e-22;SPV=0.30013 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:33,31:19,15:14,16 0/1:.:47:21,26:9,8:12,18 | |
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| 11182 chr22 20235502 . G T . PASS DP=99;SS=1;SSC=4;GPV=4.0934e-17;SPV=0.34861 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:32,24:14,14:18,10 0/1:.:43:22,21:9,10:13,11 | |
| 11183 chr22 20238932 . T C . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=1.8771e-12;SPV=0.99697 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:33,26:21,12:12,14 0/1:.:40:32,8:14,1:18,7 | |
| 11184 chr22 20246674 . G A . PASS DP=104;SS=1;SSC=7;GPV=9.9137e-19;SPV=0.19428 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:37,28:21,17:16,11 0/1:.:39:18,21:11,10:7,11 | |
| 11185 chr22 20252023 . C A . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=7.9107e-15;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,5:0,5 1/1:.:15:0,15:0,8:0,7 | |
| 11186 chr22 20258558 . T A . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=4.1077e-24;SPV=0.99381 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:21,42:10,19:11,23 0/1:.:41:23,18:11,9:12,9 | |
| 11187 chr22 20260335 . T C . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,27:0,28 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 | |
| 11188 chr22 20260868 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=5;GPV=1.1715e-11;SPV=0.29522 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:32,18:16,10:16,8 0/1:.:29:16,13:6,8:10,5 | |
| 11189 chr22 20261190 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=3.673e-15;SPV=0.97801 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:16,23:9,11:7,12 0/1:.:41:25,16:14,5:11,11 | |
| 11190 chr22 20261898 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=3.9615e-14;SPV=0.88377 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:16,16:9,8 0/1:.:34:21,13:11,10:10,3 | |
| 11191 chr22 20262028 . A C . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=3.0519e-14;SPV=0.37408 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:13,7:14,14 0/1:.:32:16,16:9,9:7,7 | |
| 11192 chr22 20262284 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=4;GPV=2.3066e-15;SPV=0.35958 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:15,18:12,3 0/1:.:38:19,19:7,14:12,5 | |
| 11193 chr22 20262395 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=3.1151e-17;SPV=0.89917 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:13,13:9,15 0/1:.:36:20,16:11,6:9,10 | |
| 11194 chr22 20263396 . C T . PASS DP=100;SS=1;SSC=5;GPV=7.9032e-21;SPV=0.25337 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:28,27:12,13:16,14 0/1:.:45:19,26:13,16:6,10 | |
| 11195 chr22 20264402 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.1086e-15;SPV=0.84287 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:8,3:12,21 0/1:.:35:19,16:11,5:8,11 | |
| 11196 chr22 20264431 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,13:0,35 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 | |
| 11197 chr22 20264989 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=2.95e-15;SPV=0.75492 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:16,11:6,13 0/1:.:32:17,15:11,9:6,6 | |
| 11198 chr22 20265677 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=5.3169e-12;SPV=0.48037 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:25,15:14,6:11,9 0/1:.:42:25,17:9,10:16,7 | |
| 11199 chr22 20268458 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=4.6893e-11;SPV=0.98511 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:18,17:4,5 0/1:.:26:19,7:15,4:4,3 | |
| 11200 chr22 20269281 . C G . PASS DP=94;SS=1;SSC=1;GPV=9.8683e-19;SPV=0.6443 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:29,31:13,20:16,11 0/1:.:34:17,17:10,6:7,11 | |
| 11201 chr22 20269506 . G A . PASS DP=110;SS=1;SSC=0;GPV=1.0602e-22;SPV=0.89503 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:28,37:15,16:13,21 0/1:.:45:24,21:11,8:13,13 | |
| 11202 chr22 20270888 . T G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,13:0,41 1/1:.:28:0,28:0,10:0,18 | |
| 11203 chr22 20271100 . G A . PASS DP=18;SS=1;SSC=0;GPV=1.1019e-10;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,2:0,8 1/1:.:8:0,8:0,1:0,7 | |
| 11204 chr22 20273291 . G T . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,23:0,30 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
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| 11206 chr22 20274183 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,25:0,29 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
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| 11235 chr22 20287088 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=2.8926e-12;SPV=0.65431 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:10,11:11,6 0/1:.:35:20,15:12,8:8,7 | |
| 11236 chr22 20287744 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,17:0,23 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
| 11237 chr22 20288572 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=2;GPV=2.4078e-13;SPV=0.61214 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:3,9:10,7 0/1:.:31:14,17:6,5:8,12 | |
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| 11239 chr22 20289590 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=3;GPV=1.3267e-12;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:22,16:10,7:12,9 0/1:.:38:21,17:11,10:10,7 | |
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| 11245 chr22 20307096 . G A . PASS DP=102;SS=1;SSC=3;GPV=3.1261e-20;SPV=0.49227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:28,28:17,11:11,17 0/1:.:46:22,24:10,10:12,14 | |
| 11246 chr22 20308823 . G A . PASS DP=130;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.025503 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:74:60,14:38,6:22,8 0/1:.:56:36,20:17,14:19,6 | |
| 11247 chr22 20320756 . G A . PASS DP=102;SS=1;SSC=3;GPV=6.6983e-18;SPV=0.46372 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:32,26:10,11:22,15 0/1:.:44:23,21:9,5:14,16 | |
| 11248 chr22 20323613 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=9.545e-12;SPV=0.60474 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:11,8:11,12 0/1:.:21:11,10:3,5:8,5 | |
| 11249 chr22 20323902 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,19:0,24 1/1:.:43:0,43:0,27:0,16 | |
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| 11251 chr22 20326777 . C A . PASS DP=31;SS=1;SSC=0;GPV=2.1486e-18;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,12:0,2 1/1:.:17:0,17:0,16:0,1 | |
| 11252 chr22 20328070 . G A . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 1/1:.:19:0,19:0,10:0,9 | |
| 11253 chr22 20328406 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 1/1:.:38:0,38:0,25:0,13 | |
| 11254 chr22 20329367 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=3;GPV=1.3771e-06;SPV=0.44027 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:33,8:18,5:15,3 0/1:.:43:33,10:20,5:13,5 | |
| 11255 chr22 20329924 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=6;GPV=1.1336e-25;SPV=0.24122 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:5,25:4,18:1,7 1/1:.:28:2,26:0,15:2,11 | |
| 11256 chr22 20330089 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=5;GPV=0.0032179;SPV=0.29697 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:49:45,4:21,0:24,4 0/1:.:27:23,4:14,3:9,1 | |
| 11257 chr22 20332883 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,11:0,21 1/1:.:26:0,26:0,7:0,19 | |
| 11258 chr22 20332957 . T C . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=2.2598e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,10:0,10 1/1:.:16:0,16:0,2:0,14 | |
| 11259 chr22 20333208 . A G . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,15:0,7 1/1:.:27:0,27:0,18:0,9 | |
| 11260 chr22 20333240 . T G . PASS DP=42;SS=1;SSC=3;GPV=7.3092e-18;SPV=0.42977 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:4,19:0,11:4,8 1/1:.:19:2,17:0,14:2,3 | |
| 11261 chr22 20333306 . C T . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=5.7269e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 1/1:.:15:0,15:0,8:0,7 | |
| 11262 chr22 20333692 . C G . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=1.3852e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,9:0,16 1/1:.:8:0,8:0,4:0,4 | |
| 11263 chr22 20333878 . T C . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=3.404e-05;SPV=0.84549 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:12,8:4,2:8,6 0/1:.:17:12,5:3,3:9,2 | |
| 11264 chr22 20334056 . G A . PASS DP=28;SS=1;SSC=1;GPV=1.9812e-05;SPV=0.65729 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:8,7:1,3:7,4 0/1:.:13:7,6:5,1:2,5 | |
| 11265 chr22 20334366 . A G . PASS DP=35;SS=1;SSC=0;GPV=8.9137e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,20:0,2 1/1:.:13:0,13:0,12:0,1 | |
| 11266 chr22 20334760 . A C . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,8:0,7 1/1:.:25:0,25:0,9:0,16 | |
| 11267 chr22 20334912 . G C . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 1/1:.:18:0,18:0,12:0,6 | |
| 11268 chr22 20335407 . A T . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=2.5665e-10;SPV=0.92522 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:5,13:1,7:4,6 0/1:.:20:9,11:5,7:4,4 | |
| 11269 chr22 20335688 . G A . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=7.9107e-15;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,3:0,8 1/1:.:14:0,14:0,6:0,8 | |
| 11270 chr22 20336152 . A C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 1/1:.:25:0,25:0,17:0,8 | |
| 11271 chr22 20336219 . G T . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 11272 chr22 20336515 . C G . PASS DP=53;SS=1;SSC=4;GPV=1.2559e-15;SPV=0.38791 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:9,16:6,6:3,10 0/1:.:28:8,20:1,7:7,13 | |
| 11273 chr22 20336915 . T C . PASS DP=24;SS=1;SSC=2;GPV=1.0078e-11;SPV=0.61957 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:1,8:0,2:1,6 1/1:.:15:1,14:1,7:0,7 | |
| 11274 chr22 20337209 . T A . PASS DP=20;SS=1;SSC=0;GPV=7.2544e-12;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,4:0,6 1/1:.:10:0,10:0,3:0,7 | |
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| 11300 chr22 20355017 . A G . PASS DP=27;SS=1;SSC=2;GPV=2.0087e-06;SPV=0.55212 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:7,8:4,2:3,6 0/1:.:12:5,7:3,3:2,4 | |
| 11301 chr22 20355018 . A C . PASS DP=33;SS=1;SSC=1;GPV=3.8647e-06;SPV=0.70505 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:9,8:5,3:4,5 0/1:.:16:9,7:4,3:5,4 | |
| 11302 chr22 20355445 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=6;GPV=1.0233e-14;SPV=0.21754 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:10,11:5,9 0/1:.:21:6,15:1,10:5,5 | |
| 11303 chr22 20355550 . G C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:30:0,29:0,14:0,15 | |
| 11304 chr22 20355664 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=4.3451e-09;SPV=0.90531 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:15,16:9,10:6,6 0/1:.:19:12,7:4,2:8,5 | |
| 11305 chr22 20355929 . C T . PASS DP=53;SS=1;SSC=10;GPV=1.0405e-07;SPV=0.082075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:21,8:6,2:15,6 0/1:.:24:12,12:6,6:6,6 | |
| 11306 chr22 20356096 . G T . PASS DP=52;SS=1;SSC=1;GPV=3.905e-06;SPV=0.77875 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:20,10:10,5:10,5 0/1:.:22:16,6:6,3:10,3 | |
| 11307 chr22 20356890 . T C . PASS DP=49;SS=1;SSC=4;GPV=4.5386e-12;SPV=0.35025 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:8,14:7,5 0/1:.:15:5,10:4,7:1,3 | |
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| 11309 chr22 20357188 . A C . PASS DP=43;SS=1;SSC=3;GPV=2.7433e-06;SPV=0.42193 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:14,7:4,4:10,3 0/1:.:22:13,9:6,5:7,4 | |
| 11310 chr22 20357606 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=3;GPV=5.9704e-09;SPV=0.43838 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:18,12:5,8:13,4 0/1:.:24:13,11:9,5:4,6 | |
| 11311 chr22 20357864 . G C . PASS DP=32;SS=1;SSC=1;GPV=9.8512e-06;SPV=0.6388 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:9,7:5,3:4,4 0/1:.:16:9,7:3,4:6,3 | |
| 11312 chr22 20358246 . C T . PASS DP=36;SS=1;SSC=3;GPV=0.00019282;SPV=0.45411 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:13,5:7,2:6,3 0/1:.:18:11,6:6,3:5,3 | |
| 11313 chr22 20358297 . T G . PASS DP=36;SS=1;SSC=4;GPV=1.7753e-06;SPV=0.36899 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:11,7:4,5:7,2 0/1:.:18:9,9:5,7:4,2 | |
| 11314 chr22 20359713 . G C . PASS DP=46;SS=1;SSC=4;GPV=1.9039e-05;SPV=0.33213 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:22,8:10,6:12,2 0/1:.:16:10,6:4,3:6,3 | |
| 11315 chr22 20361361 . C G . PASS DP=49;SS=1;SSC=3;GPV=2.1763e-07;SPV=0.46621 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:19,11:7,5:12,6 0/1:.:19:11,8:6,6:5,2 | |
| 11316 chr22 20361727 . C G . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=1.0949e-07;SPV=0.64311 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:20,12:13,10:7,2 0/1:.:22:14,8:11,7:3,1 | |
| 11317 chr22 20364235 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.037848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:18,11:12,5:6,6 0/1:.:40:15,25:7,12:8,13 | |
| 11318 chr22 20364402 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=4.0755e-11;SPV=0.91961 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:7,8:9,8 0/1:.:36:23,13:12,2:11,11 | |
| 11319 chr22 20364630 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=2.95e-15;SPV=0.82258 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:9,13:13,12 0/1:.:31:17,14:12,9:5,5 | |
| 11320 chr22 20364966 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=1.8424e-11;SPV=0.92354 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:12,16:7,11:5,5 0/1:.:31:18,13:11,8:7,5 | |
| 11321 chr22 20367930 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,20:0,26 1/1:.:26:0,26:0,16:0,10 | |
| 11322 chr22 20369204 . A G . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=4.716e-22;SPV=0.86046 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:18,32:10,21:8,11 0/1:.:40:18,22:9,11:9,11 | |
| 11323 chr22 20378519 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 1/1:.:26:0,26:0,13:0,13 | |
| 11324 chr22 20379377 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=10;GPV=4.9329e-10;SPV=0.07976 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:21,10:15,3:6,7 0/1:.:30:14,16:10,8:4,8 | |
| 11325 chr22 20381704 . A T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.8851e-14;SPV=0.88053 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:6,11:12,10 0/1:.:35:20,15:9,9:11,6 | |
| 11326 chr22 20382025 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 1/1:.:41:0,41:0,17:0,24 | |
| 11327 chr22 20382883 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 1/1:.:23:0,23:0,10:0,13 | |
| 11328 chr22 20384399 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=8.6835e-16;SPV=0.88642 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:13,14:8,13 0/1:.:29:16,13:10,10:6,3 | |
| 11329 chr22 20384769 . G C . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=4.411e-14;SPV=0.92071 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:10,20:7,12:3,8 0/1:.:27:13,14:7,4:6,10 | |
| 11330 chr22 20385352 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.2905e-14;SPV=0.71344 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:13,12:12,11 0/1:.:34:19,15:8,8:11,7 | |
| 11331 chr22 20386488 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=9.8334e-16;SPV=0.91227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:14,9:3,14 0/1:.:38:21,17:13,11:8,6 | |
| 11332 chr22 20386943 . G C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.2293e-15;SPV=0.97612 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:18,26:13,11:5,15 0/1:.:31:19,12:9,6:10,6 | |
| 11333 chr22 20387600 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=1.0364e-16;SPV=0.89556 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:6,14:7,6 0/1:.:45:23,22:13,12:10,10 | |
| 11334 chr22 20388160 . C A . PASS DP=78;SS=1;SSC=5;GPV=2.0308e-13;SPV=0.2694 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:25,17:5,7:20,10 0/1:.:36:18,18:7,13:11,5 | |
| 11335 chr22 20388202 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=1.3142e-17;SPV=0.98342 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:20,30:8,10:12,20 0/1:.:38:23,15:16,5:7,10 | |
| 11336 chr22 20388932 . G C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:28:0,28:0,19:0,9 | |
| 11337 chr22 20389224 . A C . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=1.3846e-12;SPV=0.73291 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:9,10:7,7 0/1:.:32:17,15:7,8:10,7 | |
| 11338 chr22 20389481 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=5;GPV=1.0222e-17;SPV=0.30991 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:12,12:13,12 0/1:.:37:16,21:10,10:6,11 | |
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| 11340 chr22 20390911 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=1.5211e-10;SPV=0.83779 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:9,14:12,6 0/1:.:18:11,7:6,5:5,2 | |
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| 11386 chr22 20420792 . G C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=4.4044e-13;SPV=0.96637 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:11,11:8,11 0/1:.:34:22,12:12,4:10,8 | |
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| 11388 chr22 20421266 . G T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,23:0,21 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
| 11389 chr22 20421492 . G C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=6.7818e-18;SPV=0.86532 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:20,28:7,16:13,12 0/1:.:35:18,17:10,7:8,10 | |
| 11390 chr22 20422116 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,14:0,23 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 | |
| 11391 chr22 20422553 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=1.0691e-15;SPV=0.9096 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:11,14:15,13 0/1:.:36:22,14:9,4:13,10 | |
| 11392 chr22 20423382 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.3809e-19;SPV=0.76698 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:16,26:7,12:9,14 0/1:.:39:17,22:6,8:11,14 | |
| 11393 chr22 20423776 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,31:0,26 1/1:.:39:0,39:0,26:0,13 | |
| 11394 chr22 20424480 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=2;GPV=1.387e-15;SPV=0.55442 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:29,23:12,14:17,9 0/1:.:40:22,18:6,7:16,11 | |
| 11395 chr22 20425273 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=7;GPV=1.1875e-15;SPV=0.17848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:8,12:12,7 0/1:.:32:12,20:6,8:6,12 | |
| 11396 chr22 20425314 . T G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=7.5673e-13;SPV=0.89182 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:14,20:8,10:6,10 0/1:.:26:14,12:7,6:7,6 | |
| 11397 chr22 20427383 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=1;GPV=1.5052e-15;SPV=0.63477 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:31,25:16,10:15,15 0/1:.:37:21,16:8,7:13,9 | |
| 11398 chr22 20427815 . G C . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=3.7814e-18;SPV=0.61931 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:12,12:9,12 0/1:.:42:20,22:13,13:7,9 | |
| 11399 chr22 20429763 . T A . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=2.3066e-15;SPV=0.70684 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:10,15:16,9 0/1:.:36:20,16:12,10:8,6 | |
| 11400 chr22 20429930 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=3;GPV=1.7683e-12;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:10,5:14,11 0/1:.:40:23,17:11,10:12,7 | |
| 11401 chr22 20430263 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=6;GPV=1.5419e-14;SPV=0.2285 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:15,6:8,9 0/1:.:46:23,23:7,14:16,9 | |
| 11402 chr22 20430621 . T G . PASS DP=81;SS=1;SSC=5;GPV=3.3388e-14;SPV=0.29197 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:10,11:14,6 0/1:.:40:20,20:7,7:13,13 | |
| 11403 chr22 20430622 . T A . PASS DP=87;SS=1;SSC=4;GPV=7.1095e-15;SPV=0.38589 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:14,12:12,7 0/1:.:42:22,20:9,8:13,12 | |
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| 11405 chr22 20432313 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=1.2823e-13;SPV=0.72576 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:10,6:9,13 0/1:.:35:19,16:5,8:14,8 | |
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| 11445 chr22 20457643 . C A . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=3.2684e-19;SPV=0.67691 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:6,12:12,12 0/1:.:44:20,24:9,9:11,15 | |
| 11446 chr22 20458441 . C A . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=3.5259e-08;SPV=0.91319 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:3,6:11,7 0/1:.:24:16,8:6,7:10,1 | |
| 11447 chr22 20458960 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=1.7063e-13;SPV=0.77233 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:13,10:8,10 0/1:.:35:20,15:13,8:7,7 | |
| 11448 chr22 20461906 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=6;GPV=1.8275e-16;SPV=0.24358 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:4,9:12,10 0/1:.:32:11,21:4,11:7,10 | |
| 11449 chr22 20462024 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=4;GPV=3.104e-14;SPV=0.39449 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:10,10:10,9 0/1:.:31:14,17:7,11:7,6 | |
| 11450 chr22 20462144 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.2756e-16;SPV=0.91719 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:13,25:7,11:6,14 0/1:.:27:13,14:4,10:9,4 | |
| 11451 chr22 20463817 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=1.7418e-16;SPV=0.81418 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:25,25:20,15:5,10 0/1:.:42:24,18:12,9:12,9 | |
| 11452 chr22 20463980 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=1.3937e-18;SPV=0.83085 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:23,30:15,14:8,16 0/1:.:35:18,17:8,9:10,8 | |
| 11453 chr22 20464134 . G C . PASS DP=86;SS=1;SSC=3;GPV=5.0202e-14;SPV=0.42171 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:30,21:12,9:18,12 0/1:.:35:19,16:10,7:9,9 | |
| 11454 chr22 20465845 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.4655e-13;SPV=0.86628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:10,11:8,10 0/1:.:30:17,13:12,8:5,5 | |
| 11455 chr22 20467587 . A T . PASS DP=72;SS=1;SSC=7;GPV=1.1574e-13;SPV=0.17971 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:10,8:14,10 0/1:.:30:13,17:5,7:8,10 | |
| 11456 chr22 20468079 . G T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=7.9293e-13;SPV=0.91804 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:14,17:9,8:5,9 0/1:.:39:23,16:11,7:12,9 | |
| 11457 chr22 20468593 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
| 11458 chr22 20468658 . G T . PASS DP=73;SS=1;SSC=11;GPV=4.7649e-17;SPV=0.0697 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:12,14:9,6 0/1:.:32:10,22:6,10:4,12 | |
| 11459 chr22 20470183 . T A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,22:0,10 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 11460 chr22 20470615 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=6.0302e-11;SPV=0.95721 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:12,5:13,16 0/1:.:28:20,8:12,7:8,1 | |
| 11461 chr22 20470773 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.1753e-14;SPV=0.70404 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:9,14:11,5 0/1:.:42:23,19:9,12:14,7 | |
| 11462 chr22 20470790 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=1.5519e-05;SPV=0.66104 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:36,8:19,5:17,3 0/1:.:41:34,7:16,3:18,4 | |
| 11463 chr22 20470902 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=4.8717e-12;SPV=0.73888 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:7,10:11,7 0/1:.:32:18,14:10,9:8,5 | |
| 11464 chr22 20472812 . A C . PASS DP=75;SS=1;SSC=3;GPV=2.0241e-17;SPV=0.49919 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:18,23:10,13:8,10 0/1:.:34:14,20:8,9:6,11 | |
| 11465 chr22 20472977 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.0669e-14;SPV=0.65707 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:28,26:12,10:16,16 0/1:.:26:14,12:6,7:8,5 | |
| 11466 chr22 20474351 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=2.4531e-16;SPV=0.63914 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:10,12:10,12 0/1:.:32:15,17:8,5:7,12 | |
| 11467 chr22 20474580 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=1.9669e-13;SPV=0.72542 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:8,9:12,13 0/1:.:25:13,12:6,5:7,7 | |
| 11468 chr22 20477903 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=1.7321e-11;SPV=0.67309 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:10,9:9,6 0/1:.:36:21,15:9,7:12,8 | |
| 11469 chr22 20478049 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=2.4655e-13;SPV=0.55446 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:5,10:15,9 0/1:.:30:15,15:11,8:4,7 | |
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| 11471 chr22 20478762 . C T . PASS DP=41;SS=1;SSC=4;GPV=9.3546e-07;SPV=0.38494 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:15,9:3,3:12,6 0/1:.:17:9,8:2,1:7,7 | |
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| 11515 chr22 20508359 . T G . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=5.6872e-15;SPV=0.56323 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:4,8:12,12 0/1:.:30:13,17:6,12:7,5 | |
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| 11518 chr22 20512006 . G T . PASS DP=39;SS=1;SSC=0;GPV=3.6742e-23;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,7:0,12 1/1:.:20:0,20:0,14:0,6 | |
| 11519 chr22 20512091 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=5.3076e-14;SPV=0.76096 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:12,19:8,7:4,12 0/1:.:28:12,15:5,12:7,3 | |
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| 11521 chr22 20512547 . G A . PASS DP=46;SS=1;SSC=9;GPV=8.5409e-09;SPV=0.12114 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:15,9:9,8:6,1 0/1:.:22:9,13:6,4:3,9 | |
| 11522 chr22 20512786 . A T . PASS DP=58;SS=1;SSC=2;GPV=4.8441e-11;SPV=0.51075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:11,8:6,7 0/1:.:26:13,13:5,7:8,6 | |
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| 11524 chr22 20513936 . C A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.6481e-18;SPV=0.88714 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:19,30:10,11:9,19 0/1:.:30:15,15:10,8:5,7 | |
| 11525 chr22 20514849 . G T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=7.7158e-19;SPV=0.87974 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:19,29:11,21:8,8 0/1:.:36:18,18:10,9:8,9 | |
| 11526 chr22 20517051 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=1.9973e-11;SPV=0.6248 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:22,16:12,9:10,7 0/1:.:34:20,14:10,7:10,7 | |
| 11527 chr22 20517467 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,27:0,24 1/1:.:34:0,34:0,12:0,22 | |
| 11528 chr22 20518568 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,21:0,28 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 | |
| 11529 chr22 20519325 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
| 11530 chr22 20521119 . T C . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=4.6506e-10;SPV=0.99809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:6,18:1,5:5,13 0/1:.:17:11,6:5,2:6,4 | |
| 11531 chr22 20522222 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=7;GPV=4.8769e-15;SPV=0.18501 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:15,8:8,12 0/1:.:30:12,18:5,11:7,7 | |
| 11532 chr22 20526824 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=8.9089e-11;SPV=0.55654 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:7,7:12,7 0/1:.:32:18,14:5,6:13,8 | |
| 11533 chr22 20529162 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 11534 chr22 20529351 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,15:0,20 1/1:.:25:0,25:0,10:0,15 | |
| 11535 chr22 20530623 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=4;GPV=7.6659e-08;SPV=0.34237 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:33,13:18,6:15,7 0/1:.:22:14,8:6,2:8,6 | |
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| 11537 chr22 20533246 . C G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,24:0,31 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
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| 11564 chr22 20549123 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=4.6505e-14;SPV=0.83165 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:9,12:17,11 0/1:.:36:22,14:8,7:14,7 | |
| 11565 chr22 20549152 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=5.7384e-17;SPV=0.49147 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:10,11:11,11 0/1:.:39:18,21:8,7:10,14 | |
| 11566 chr22 20549230 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,23:0,21 1/1:.:36:0,36:0,12:0,24 | |
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| 11568 chr22 20549786 . G C . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=1.8826e-14;SPV=0.60867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:5,11:8,8 0/1:.:27:11,16:4,9:7,7 | |
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| 11572 chr22 20553828 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=8.0818e-14;SPV=0.97457 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:31,27:11,18:20,9 0/1:.:35:25,10:13,7:12,3 | |
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| 11574 chr22 20554415 . A C . PASS DP=76;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.037323 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:29,18:21,7:8,11 0/1:.:29:11,18:7,8:4,10 | |
| 11575 chr22 20554706 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=5;GPV=4.8851e-14;SPV=0.25491 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:13,11:13,10 0/1:.:27:12,15:4,8:8,7 | |
| 11576 chr22 20556396 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=3.9286e-14;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:9,10:9,7 0/1:.:37:18,19:9,8:9,11 | |
| 11577 chr22 20557469 . A C . PASS DP=58;SS=1;SSC=3;GPV=5.3076e-14;SPV=0.45998 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:7,8:9,13 0/1:.:21:8,13:4,4:4,9 | |
| 11578 chr22 20558683 . A G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=1.9118e-16;SPV=0.84832 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:26,26:11,14:15,12 0/1:.:41:24,17:10,7:14,10 | |
| 11579 chr22 20559223 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=1.8278e-16;SPV=0.62595 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:12,12:7,12 0/1:.:31:14,17:5,9:9,8 | |
| 11580 chr22 20559470 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=7.6319e-16;SPV=0.96378 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:14,10:3,16 0/1:.:33:19,14:14,9:5,5 | |
| 11581 chr22 20560412 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=5.8009e-12;SPV=0.515 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:12,8:11,10 0/1:.:28:15,13:7,6:8,7 | |
| 11582 chr22 20561330 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=5.4147e-14;SPV=0.74951 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:17,9:6,14 0/1:.:29:16,13:13,7:3,6 | |
| 11583 chr22 20562046 . A T . PASS DP=74;SS=1;SSC=8;GPV=4.8851e-14;SPV=0.1272 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:15,10:11,9 0/1:.:29:12,17:6,9:6,8 | |
| 11584 chr22 20562380 . A T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=2.4088e-15;SPV=0.86734 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:15,23:6,12:9,11 0/1:.:30:15,15:10,8:5,7 | |
| 11585 chr22 20562780 . A G . PASS DP=101;SS=1;SSC=2;GPV=8.35e-20;SPV=0.61552 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:15,19:11,8 0/1:.:48:24,24:14,17:10,7 | |
| 11586 chr22 20567052 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=2;GPV=4.4109e-17;SPV=0.62607 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:12,12:11,11 0/1:.:43:22,21:12,13:10,8 | |
| 11587 chr22 20567606 . G T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.9669e-13;SPV=0.80422 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:7,9:8,9 0/1:.:34:18,16:9,5:9,11 | |
| 11588 chr22 20568029 . T C . PASS DP=97;SS=1;SSC=5;GPV=5.0692e-20;SPV=0.26353 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:30,29:13,12:17,17 0/1:.:38:16,22:8,12:8,10 | |
| 11589 chr22 20569741 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=2;GPV=7.7239e-15;SPV=0.5582 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:28,22:14,14:14,8 0/1:.:38:21,17:8,7:13,10 | |
| 11590 chr22 20570814 . G A . PASS DP=48;SS=1;SSC=8;GPV=3.6075e-09;SPV=0.13065 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:17,11:5,6:12,5 0/1:.:20:8,12:2,6:6,6 | |
| 11591 chr22 20571473 . G T . PASS DP=105;SS=1;SSC=3;GPV=1.2563e-25;SPV=0.48501 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:66:27,39:16,18:11,21 0/1:.:39:15,24:8,13:7,11 | |
| 11592 chr22 20572008 . G C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,20:0,26 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 | |
| 11593 chr22 20572526 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=8.038e-16;SPV=0.93362 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:10,13:9,10 0/1:.:44:26,18:9,9:17,9 | |
| 11594 chr22 20574522 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=9.545e-12;SPV=0.57189 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:13,9:6,8 0/1:.:27:14,13:7,7:7,6 | |
| 11595 chr22 20574797 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.1391e-19;SPV=0.69331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:17,27:6,17:11,10 0/1:.:36:15,21:7,11:8,10 | |
| 11596 chr22 20574999 . C G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=1.6142e-19;SPV=0.92097 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:22,33:12,20:10,13 0/1:.:34:18,16:9,8:9,8 | |
| 11597 chr22 20575495 . C A . PASS DP=86;SS=1;SSC=8;GPV=3.1151e-17;SPV=0.13787 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:25,20:14,10:11,10 0/1:.:41:17,24:12,11:5,13 | |
| 11598 chr22 20575778 . A C . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=1.4203e-17;SPV=0.52231 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:16,22:9,12:7,10 0/1:.:35:14,21:4,11:10,10 | |
| 11599 chr22 20576704 . T G . PASS DP=94;SS=1;SSC=9;GPV=2.9605e-18;SPV=0.10698 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:29,22:18,12:11,10 0/1:.:43:18,25:12,14:6,11 | |
| 11600 chr22 20577257 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=6.3875e-11;SPV=0.77327 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:7,8:14,7 0/1:.:39:25,14:11,5:14,9 | |
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| 11602 chr22 20578425 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=1.8524e-14;SPV=0.79091 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:11,10:7,10 0/1:.:37:20,17:10,8:10,9 | |
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| 11641 chr22 20608753 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=3.4211e-15;SPV=0.42726 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:8,12:11,13 0/1:.:19:7,12:3,2:4,10 | |
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| 11643 chr22 20609769 . G A . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=1.4745e-14;SPV=0.8769 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:17,9:10,13 0/1:.:48:31,17:16,9:15,8 | |
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| 11646 chr22 20611983 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=3;GPV=1.0222e-17;SPV=0.48405 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:10,16:13,8 0/1:.:39:18,21:11,11:7,10 | |
| 11647 chr22 20612260 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=8.056e-13;SPV=0.56874 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:32,22:16,12:16,10 0/1:.:29:17,12:8,6:9,6 | |
| 11648 chr22 20613469 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=9.653e-15;SPV=0.31692 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:14,10:15,14 0/1:.:26:12,14:2,9:10,5 | |
| 11649 chr22 20614296 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=6;GPV=1.2112e-18;SPV=0.22956 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:13,9:14,18 0/1:.:33:13,20:6,13:7,7 | |
| 11650 chr22 20614437 . A T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=3.1307e-16;SPV=0.88651 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:13,22:8,11:5,11 0/1:.:35:17,18:14,9:3,9 | |
| 11651 chr22 20614723 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=4.4044e-13;SPV=0.66441 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:15,8:7,11 0/1:.:34:19,15:12,5:7,10 | |
| 11652 chr22 20614899 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=7;GPV=5.8079e-10;SPV=0.16534 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:11,9:7,4 0/1:.:20:8,12:4,6:4,6 | |
| 11653 chr22 20615888 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.2905e-14;SPV=0.79067 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:13,10:12,14 0/1:.:33:19,14:14,5:5,9 | |
| 11654 chr22 20616598 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=8;GPV=1.2823e-13;SPV=0.14696 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:6,10:16,5 0/1:.:36:16,20:5,8:11,12 | |
| 11655 chr22 20617547 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.0507e-11;SPV=0.87282 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:6,8:13,12 0/1:.:25:15,10:6,4:9,6 | |
| 11656 chr22 20619099 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.7649e-17;SPV=0.86836 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:16,26:7,15:9,11 0/1:.:31:15,16:6,10:9,6 | |
| 11657 chr22 20619197 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=8.2973e-14;SPV=0.95098 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:12,18:9,9 0/1:.:21:13,8:9,6:4,2 | |
| 11658 chr22 20619401 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=8;GPV=4.2509e-20;SPV=0.15527 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:13,10:11,15 0/1:.:39:14,25:8,12:6,13 | |
| 11659 chr22 20620240 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=2;GPV=7.3839e-17;SPV=0.57321 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:10,13:14,12 0/1:.:35:17,18:4,9:13,9 | |
| 11660 chr22 20621305 . A T . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=1.1758e-13;SPV=0.73284 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:6,13:8,5 0/1:.:31:15,16:7,8:8,8 | |
| 11661 chr22 20621403 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,33:0,14 1/1:.:24:0,24:0,16:0,8 | |
| 11662 chr22 20621751 . T A . PASS DP=112;SS=1;SSC=0;GPV=1.0892e-20;SPV=0.88331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:30,33:14,20:16,13 0/1:.:49:28,21:12,7:16,14 | |
| 11663 chr22 20621809 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=3;GPV=1.1691e-15;SPV=0.41824 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:32,25:20,13:12,12 0/1:.:33:17,16:7,5:10,11 | |
| 11664 chr22 20622071 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,14:0,25 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 | |
| 11665 chr22 20622790 . C A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
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| 11667 chr22 20623359 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.0669e-14;SPV=0.69389 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:15,14:8,8 0/1:.:35:19,16:15,8:4,8 | |
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| 11696 chr22 20639180 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 | |
| 11697 chr22 20639190 . T G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 1/1:.:29:0,29:0,11:0,18 | |
| 11698 chr22 20639479 . C G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,25:0,21 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
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| 11706 chr22 20648599 . A T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,15:0,24 1/1:.:41:0,41:0,16:0,25 | |
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| 11709 chr22 20649707 . A C . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,20:0,26 1/1:.:43:0,43:0,13:0,30 | |
| 11710 chr22 20649788 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,14:0,22 1/1:.:36:0,36:0,11:0,25 | |
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| 11715 chr22 20652211 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=0;SPV=0.43902 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,18:0,28 1/1:.:36:1,35:1,16:0,19 | |
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| 11717 chr22 20655309 . C A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,27:0,17 1/1:.:20:0,20:0,11:0,9 | |
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| 11719 chr22 20655855 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,17:0,25 1/1:.:29:0,29:0,12:0,17 | |
| 11720 chr22 20656031 . G C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,12:0,20 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 11721 chr22 20656151 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,17:0,25 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
| 11722 chr22 20657234 . G C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 | |
| 11723 chr22 20658151 . A C . PASS DP=28;SS=1;SSC=0;GPV=1.3074e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,9:0,5 1/1:.:14:0,14:0,10:0,4 | |
| 11724 chr22 20658281 . G A . PASS DP=27;SS=1;SSC=0;GPV=5.1363e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,5:0,5 1/1:.:17:0,17:0,11:0,6 | |
| 11725 chr22 20659977 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 1/1:.:21:0,21:0,9:0,12 | |
| 11726 chr22 20660042 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 1/1:.:21:0,21:0,7:0,14 | |
| 11727 chr22 20660756 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 11728 chr22 20661450 . A T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 11729 chr22 20662019 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6514e-11;SPV=0.96818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:8,7:5,12 0/1:.:26:16,10:6,5:10,5 | |
| 11730 chr22 20668651 . A G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,27:0,27 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 | |
| 11731 chr22 20669330 . T G . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,30:0,28 1/1:.:45:0,45:0,25:0,20 | |
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| 11733 chr22 20669523 . A T . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,19:0,26 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 | |
| 11734 chr22 20669766 . G C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,23:0,30 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 | |
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| 11736 chr22 20671271 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 1/1:.:26:0,26:0,9:0,17 | |
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| 11779 chr22 20694561 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=9;GPV=1.47893e-41;SPV=0.10401 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:8,44:3,24:5,20 1/1:.:40:2,38:1,19:1,19 | |
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| 11781 chr22 20694806 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=7;GPV=1.4013e-43;SPV=0.17137 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,31:0,15 1/1:.:33:2,31:2,20:0,11 | |
| 11782 chr22 20695468 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 | |
| 11783 chr22 20695805 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=0.00032327;SPV=0.65661 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:38,7:19,2:19,5 0/1:.:27:23,4:9,3:14,1 | |
| 11784 chr22 20695913 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,30:0,6 1/1:.:18:0,18:0,12:0,6 | |
| 11785 chr22 20696031 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=7.747e-38;SPV=0.69086 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:7,50:3,31:4,19 1/1:.:30:4,26:2,13:2,13 | |
| 11786 chr22 20696047 . A G . PASS DP=93;SS=1;SSC=3;GPV=0.0007567;SPV=0.40976 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:63:57,6:35,3:22,3 0/1:.:30:26,4:14,2:12,2 | |
| 11787 chr22 20696129 . C T . PASS DP=96;SS=1;SSC=4;GPV=1.249e-18;SPV=0.33591 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:32,29:16,12:16,17 0/1:.:35:16,19:8,7:8,12 | |
| 11788 chr22 20696130 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=4;GPV=1.3683e-19;SPV=0.36806 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:31,31:16,12:15,19 0/1:.:34:15,19:7,7:8,12 | |
| 11789 chr22 20696393 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=5;GPV=2.4634e-33;SPV=0.28814 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,15:0,27 1/1:.:17:1,16:0,5:1,11 | |
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| 11791 chr22 20709088 . C T . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=2.8631e-15;SPV=0.93131 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:34,28:24,15:10,13 0/1:.:40:27,13:16,7:11,6 | |
| 11792 chr22 20712249 . G C . PASS DP=101;SS=1;SSC=2;GPV=1.7322e-17;SPV=0.61478 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:33,28:17,17:16,11 0/1:.:40:22,18:10,8:12,10 | |
| 11793 chr22 20714371 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,26:0,15 1/1:.:43:0,43:0,26:0,17 | |
| 11794 chr22 20715523 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=8;GPV=2.8964e-11;SPV=0.12778 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:30,14:22,13:8,1 0/1:.:34:18,16:11,11:7,5 | |
| 11795 chr22 20717534 . C T . PASS DP=101;SS=1;SSC=5;GPV=0.00036633;SPV=0.272 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:59:54,5:35,4:19,1 0/1:.:42:36,6:20,5:16,1 | |
| 11796 chr22 20718097 . G T . PASS DP=52;SS=1;SSC=4;GPV=0.0029216;SPV=0.31641 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:29,4:17,2:12,2 0/1:.:19:15,4:9,1:6,3 | |
| 11797 chr22 20718368 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
| 11798 chr22 20719455 . T C . PASS DP=42;SS=1;SSC=5;GPV=6.6622e-06;SPV=0.27298 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:20,9:9,3:11,6 0/1:.:13:7,6:6,4:1,2 | |
| 11799 chr22 20727676 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,15:0,25 1/1:.:54:0,54:0,29:0,25 | |
| 11800 chr22 20731705 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,23:0,19 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 11801 chr22 20735860 . G T . PASS DP=108;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:67:0,67:0,31:0,36 1/1:.:41:0,41:0,14:0,27 | |
| 11802 chr22 20740493 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 1/1:.:20:0,20:0,12:0,8 | |
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| 11861 chr22 20923358 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,26:0,15 1/1:.:27:0,27:0,20:0,7 | |
| 11862 chr22 20925517 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 1/1:.:43:0,43:0,18:0,25 | |
| 11863 chr22 20926175 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 | |
| 11864 chr22 20928468 . C A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,17:0,24 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 11865 chr22 20928786 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,21:0,25 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 11866 chr22 20929313 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 | |
| 11867 chr22 20929330 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 11868 chr22 20930997 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:28:0,28:0,11:0,17 | |
| 11869 chr22 20931558 . T G . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,30:0,20 1/1:.:36:0,36:0,25:0,11 | |
| 11870 chr22 20932274 . C A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 1/1:.:22:0,22:0,11:0,11 | |
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| 11914 chr22 20961970 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=9.6585e-18;SPV=0.59383 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:15,23:6,12:9,11 0/1:.:33:13,20:6,8:7,12 | |
| 11915 chr22 20962763 . A T . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=1.6516e-12;SPV=0.6685 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:11,9:13,9 0/1:.:37:22,15:12,8:10,7 | |
| 11916 chr22 20963144 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=2.6525e-14;SPV=0.94864 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:27,25:18,15:9,10 0/1:.:39:26,13:19,6:7,7 | |
| 11917 chr22 20963373 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=7.1223e-14;SPV=0.88382 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:11,11:14,10 0/1:.:45:29,16:16,10:13,6 | |
| 11918 chr22 20966033 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=3;GPV=2.8888e-20;SPV=0.41357 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:29,33:15,17:14,16 0/1:.:31:13,18:5,12:8,6 | |
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| 11921 chr22 20968297 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=11;GPV=8.9089e-11;SPV=0.064691 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:24,12:13,5:11,7 0/1:.:29:13,16:5,8:8,8 | |
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| 11925 chr22 20969081 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,30:0,13 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 | |
| 11926 chr22 20969503 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 | |
| 11927 chr22 20969894 . T G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,15:0,21 1/1:.:23:0,23:0,12:0,11 | |
| 11928 chr22 20972983 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,25:0,25 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
| 11929 chr22 20973545 . C G . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,29:0,29 1/1:.:41:0,41:0,26:0,15 | |
| 11930 chr22 20974834 . A G . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,19:0,26 1/1:.:45:0,45:0,17:0,28 | |
| 11931 chr22 20975001 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,25:0,19 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 | |
| 11932 chr22 20976319 . C T . PASS DP=98;SS=1;SSC=2;GPV=5.7745e-20;SPV=0.58327 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:11,12:12,13 0/1:.:50:24,26:12,11:12,15 | |
| 11933 chr22 20977220 . A C . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=5.2028e-13;SPV=0.73933 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:11,9:11,10 0/1:.:36:21,15:8,4:13,11 | |
| 11934 chr22 20977267 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,28:0,16 1/1:.:32:0,32:0,11:0,21 | |
| 11935 chr22 20977374 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 11936 chr22 20977629 . C G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.1883e-17;SPV=0.97249 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:20,33:12,13:8,20 0/1:.:26:15,11:6,4:9,7 | |
| 11937 chr22 20977661 . C G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,25:0,25 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 11938 chr22 20977833 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=2.2922e-10;SPV=0.84867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:36,21:17,11:19,10 0/1:.:25:18,7:9,2:9,5 | |
| 11939 chr22 20978120 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 1/1:.:26:0,26:0,17:0,9 | |
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| 11941 chr22 20980584 . G C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,19:0,30 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
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| 11983 chr22 21006261 . A T . PASS DP=59;SS=1;SSC=8;GPV=5.8329e-12;SPV=0.158 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:9,14:6,9:3,5 1/1:.:24:3,13:1,7:2,6 | |
| 11984 chr22 21006384 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 | |
| 11985 chr22 21006647 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
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| 11999 chr22 21011379 . A G . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,14:0,10 1/1:.:24:0,24:0,15:0,9 | |
| 12000 chr22 21011454 . G A . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=1.5066e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,16:0,8 1/1:.:19:0,19:0,11:0,8 | |
| 12001 chr22 21011455 . G T . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,16:0,9 1/1:.:20:0,20:0,12:0,8 | |
| 12002 chr22 21011470 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,19:0,10 1/1:.:21:0,21:0,11:0,10 | |
| 12003 chr22 21011785 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:38:0,38:0,27:0,11 | |
| 12004 chr22 21011821 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 1/1:.:40:0,40:0,24:0,16 | |
| 12005 chr22 21011875 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 | |
| 12006 chr22 21013301 . T C . PASS DP=92;SS=1;SSC=6;GPV=6.0531e-17;SPV=0.22456 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:32,25:14,9:18,16 0/1:.:35:16,19:7,6:9,13 | |
| 12007 chr22 21013418 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=9;GPV=1.2823e-13;SPV=0.10362 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:16,8:8,8 0/1:.:33:14,19:7,10:7,9 | |
| 12008 chr22 21015387 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=5;GPV=5.8427e-13;SPV=0.27139 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:11,10:8,5 0/1:.:33:15,18:7,13:8,5 | |
| 12009 chr22 21015821 . C A . PASS DP=89;SS=1;SSC=4;GPV=4.4109e-17;SPV=0.38157 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:29,26:21,12:8,14 0/1:.:34:16,18:4,9:12,9 | |
| 12010 chr22 21016202 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=4;GPV=3.195e-13;SPV=0.35289 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:7,9:12,10 0/1:.:24:10,14:6,9:4,5 | |
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| 12053 chr22 21062587 . G C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,24:0,25 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
| 12054 chr22 21062931 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=9;GPV=1.3287e-16;SPV=0.10566 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:14,16:8,6 0/1:.:28:9,19:6,12:3,7 | |
| 12055 chr22 21063534 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=8;GPV=4.39e-14;SPV=0.14737 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:17,8:7,10 0/1:.:31:13,18:8,8:5,10 | |
| 12056 chr22 21063901 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=2.8059e-17;SPV=0.56893 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:10,13:10,12 0/1:.:32:14,18:8,13:6,5 | |
| 12057 chr22 21064263 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=8;GPV=2.6374e-16;SPV=0.12978 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:11,10:9,11 0/1:.:28:9,19:4,8:5,11 | |
| 12058 chr22 21065510 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=2.0762e-09;SPV=0.62714 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:26,15:10,5:16,10 0/1:.:28:18,10:9,6:9,4 | |
| 12059 chr22 21066653 . G C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 | |
| 12060 chr22 21066780 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=4;GPV=1.3979e-20;SPV=0.36317 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:20,28:9,12:11,16 0/1:.:34:12,22:3,11:9,11 | |
| 12061 chr22 21067136 . A C . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=1.1052e-12;SPV=0.3448 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:7,8:12,9 0/1:.:27:12,15:9,5:3,10 | |
| 12062 chr22 21069704 . C G . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=1.6045e-17;SPV=0.51023 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:12,10:9,14 0/1:.:36:16,20:5,13:11,7 | |
| 12063 chr22 21071480 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=3.2981e-15;SPV=0.79298 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:12,14:10,10 0/1:.:33:18,15:5,5:13,10 | |
| 12064 chr22 21072313 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=6;GPV=1.3843e-19;SPV=0.22068 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:15,15:9,10 0/1:.:39:15,24:12,13:3,11 | |
| 12065 chr22 21072451 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=7;GPV=1.4154e-13;SPV=0.1759 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:12,7:10,8 0/1:.:37:17,20:6,10:11,10 | |
| 12066 chr22 21073288 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.5807e-10;SPV=0.92141 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:10,9:6,6 0/1:.:35:23,12:18,7:5,5 | |
| 12067 chr22 21074234 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=2;GPV=1.7076e-08;SPV=0.61043 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:21,14:13,8:8,6 0/1:.:20:12,8:7,4:5,4 | |
| 12068 chr22 21075096 . C A . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=3.316e-09;SPV=0.73155 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:15,8:9,9 0/1:.:19:12,7:8,3:4,4 | |
| 12069 chr22 21075417 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=7.7239e-15;SPV=0.65126 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:28,23:17,12:11,11 0/1:.:37:21,16:13,13:8,3 | |
| 12070 chr22 21076216 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=3;GPV=3.3945e-16;SPV=0.49616 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:12,4:11,16 0/1:.:45:23,22:8,9:15,13 | |
| 12071 chr22 21081499 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=1.8081e-15;SPV=0.48002 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:15,12:5,9 0/1:.:33:15,18:7,12:8,6 | |
| 12072 chr22 21083169 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.6045e-17;SPV=0.76292 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:9,7:10,18 0/1:.:37:18,19:7,8:11,11 | |
| 12073 chr22 21084128 . C A . PASS DP=61;SS=1;SSC=5;GPV=8.637e-13;SPV=0.27745 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:14,12:6,3:8,9 0/1:.:35:15,20:5,9:10,11 | |
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| 12075 chr22 21093514 . C G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,25:0,17 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 | |
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| 12102 chr22 21115962 . T C . PASS DP=19;SS=1;SSC=0;GPV=2.8292e-11;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,7:0,2 1/1:.:10:0,10:0,7:0,3 | |
| 12103 chr22 21116057 . G C . PASS DP=48;SS=1;SSC=1;GPV=3.7531e-12;SPV=0.72218 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:9,15:3,6:6,9 0/1:.:24:10,14:8,8:2,6 | |
| 12104 chr22 21116287 . C G . PASS DP=23;SS=1;SSC=0;GPV=0.0018791;SPV=0.81633 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:6,4:0,1:6,3 0/1:.:13:9,4:0,1:9,3 | |
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| 12113 chr22 21123724 . T C . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=8.4519e-21;SPV=0.94077 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:1,24:0,6:1,18 1/1:.:17:2,15:0,3:2,12 | |
| 12114 chr22 21123786 . C A . PASS DP=95;SS=1;SSC=3;GPV=7.6643e-06;SPV=0.47272 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:48,9:18,6:30,3 0/1:.:38:31,7:12,2:19,5 | |
| 12115 chr22 21124324 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=9;GPV=8.0845e-10;SPV=0.11841 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:29,13:9,5:20,8 0/1:.:27:14,13:5,9:9,4 | |
| 12116 chr22 21124594 . G A . PASS DP=111;SS=1;SSC=2;GPV=2.3465e-19;SPV=0.60934 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:67:36,31:17,14:19,17 0/1:.:44:24,20:10,10:14,10 | |
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| 12119 chr22 21125468 . A G . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,7:0,4 1/1:.:21:0,21:0,13:0,8 | |
| 12120 chr22 21126919 . G A . PASS DP=28;SS=1;SSC=0;GPV=6.911e-06;SPV=0.88177 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:8,10:2,8:6,2 0/1:.:10:6,4:5,3:1,1 | |
| 12121 chr22 21126982 . A C . PASS DP=47;SS=1;SSC=5;GPV=0.0028249;SPV=0.30636 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:26,4:12,3:14,1 0/1:.:17:13,4:6,3:7,1 | |
| 12122 chr22 21127431 . G C . PASS DP=113;SS=1;SSC=1;GPV=2.3672e-10;SPV=0.67327 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:72:53,19:26,15:27,4 0/1:.:41:31,10:9,6:22,4 | |
| 12123 chr22 21127442 . G A . PASS DP=110;SS=1;SSC=4;GPV=0.0003755;SPV=0.36299 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:70:64,6:35,4:29,2 0/1:.:40:35,5:13,2:22,3 | |
| 12124 chr22 21128205 . G A . PASS DP=30;SS=1;SSC=0;GPV=2.9161e-06;SPV=0.86823 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:8,10:6,5:2,5 0/1:.:12:7,5:6,3:1,2 | |
| 12125 chr22 21128318 . T C . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=4.7528e-06;SPV=0.81694 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:6,9:5,6:1,3 0/1:.:10:5,5:3,4:2,1 | |
| 12126 chr22 21128540 . A T . PASS DP=30;SS=1;SSC=0;GPV=0.0001594;SPV=0.9631 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:11,9:11,2:0,7 0/1:.:10:8,2:7,1:1,1 | |
| 12127 chr22 21128564 . T G . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=0.00048486;SPV=0.94557 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:16,8:14,1:2,7 0/1:.:13:11,2:11,1:0,1 | |
| 12128 chr22 21128652 . A T . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,18:0,6 1/1:.:18:0,18:0,16:0,2 | |
| 12129 chr22 21128777 . T A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=0.00063967;SPV=0.88943 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:32,8:9,3:23,5 0/1:.:18:16,2:7,1:9,1 | |
| 12130 chr22 21128924 . C T . PASS DP=35;SS=1;SSC=0;GPV=8.9137e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,5:0,18 1/1:.:12:0,12:0,2:0,10 | |
| 12131 chr22 21129046 . G A . PASS DP=117;SS=1;SSC=5;GPV=0.00079914;SPV=0.29791 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:62:58,4:43,0:15,4 0/1:.:55:49,6:35,1:14,5 | |
| 12132 chr22 21129076 . T G . PASS DP=101;SS=1;SSC=2;GPV=8.1311e-13;SPV=0.50772 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:39,20:28,16:11,4 0/1:.:42:27,15:14,13:13,2 | |
| 12133 chr22 21129291 . G C . PASS DP=227;SS=1;SSC=5;GPV=0;SPV=0.29881 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:130:58,72:29,42:29,30 0/1:.:97:39,58:21,35:18,23 | |
| 12134 chr22 21129377 . G A . PASS DP=172;SS=1;SSC=4;GPV=5.0358e-06;SPV=0.34098 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:94:86,8:45,3:41,5 0/1:.:78:69,9:31,4:38,5 | |
| 12135 chr22 21129458 . T G . PASS DP=186;SS=1;SSC=4;GPV=2.6111e-10;SPV=0.37477 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:101:86,15:34,9:52,6 0/1:.:85:70,15:30,5:40,10 | |
| 12136 chr22 21129461 . C G . PASS DP=190;SS=1;SSC=6;GPV=2.6882e-10;SPV=0.22095 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:104:90,14:38,6:52,8 0/1:.:86:70,16:27,6:43,10 | |
| 12137 chr22 21129493 . C T . PASS DP=192;SS=1;SSC=0;GPV=2.25e-17;SPV=0.82517 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:118:85,33:29,17:56,16 0/1:.:74:57,17:15,8:42,9 | |
| 12138 chr22 21129792 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=6;GPV=5.5569e-26;SPV=0.22115 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:19,37:3,10:16,27 1/1:.:30:7,23:0,9:7,14 | |
| 12139 chr22 21129891 . C A . PASS DP=135;SS=1;SSC=8;GPV=2.0532e-07;SPV=0.15031 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:75:66,9:26,7:40,2 0/1:.:60:48,12:24,8:24,4 | |
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| 12141 chr22 21131385 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=0.00068011;SPV=0.76011 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:25,5:15,2:10,3 0/1:.:37:32,5:14,4:18,1 | |
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| 12189 chr22 21177130 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=3;GPV=8.2591e-07;SPV=0.43965 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:23,9:11,2:12,7 0/1:.:27:18,9:9,4:9,5 | |
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| 12191 chr22 21178783 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=3;GPV=6.2051e-05;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:26,6:6,3:20,3 0/1:.:32:25,7:7,1:18,6 | |
| 12192 chr22 21181878 . T G . PASS DP=148;SS=1;SSC=3;GPV=9.9456e-06;SPV=0.44127 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:72:65,7:40,5:25,2 0/1:.:76:67,9:37,3:30,6 | |
| 12193 chr22 21181989 . A T . PASS DP=133;SS=1;SSC=3;GPV=2.8546e-14;SPV=0.47587 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:72:51,21:44,13:7,8 0/1:.:61:42,19:28,11:14,8 | |
| 12194 chr22 21182083 . G T . PASS DP=87;SS=1;SSC=9;GPV=0.00034872;SPV=0.11778 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:50:46,4:10,0:36,4 0/1:.:37:30,7:9,3:21,4 | |
| 12195 chr22 21183040 . C T . PASS DP=57;SS=3;SSC=18;GPV=1;SPV=0.01309 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:23,6:16,5:7,1 0/0:.:28:28,0:25,0:3,0 | |
| 12196 chr22 21183401 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=9;GPV=0.00070876;SPV=0.10869 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:47:43,4:27,2:16,2 0/1:.:28:22,6:10,1:12,5 | |
| 12197 chr22 21183528 . A G . PASS DP=40;SS=1;SSC=2;GPV=1.1326e-07;SPV=0.52525 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:13,11:4,7:9,4 0/1:.:16:8,8:3,3:5,5 | |
| 12198 chr22 21183757 . T C . PASS DP=96;SS=1;SSC=2;GPV=1.6879e-05;SPV=0.59366 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:49,9:21,4:28,5 0/1:.:38:32,6:15,1:17,5 | |
| 12199 chr22 21184093 . G A . PASS DP=25;SS=1;SSC=4;GPV=0.001949;SPV=0.32454 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:11,4:8,0:3,4 0/1:.:10:5,4:3,2:2,2 | |
| 12200 chr22 21184304 . C A . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=0.0027329;SPV=0.83054 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:18,5:10,4:8,1 0/1:.:20:17,3:14,2:3,1 | |
| 12201 chr22 21193971 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=3.1469e-07;SPV=0.92381 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:13,7:7,6 0/1:.:24:18,6:11,3:7,3 | |
| 12202 chr22 21194558 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=1.1494e-07;SPV=0.48927 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:8,5:11,5 0/1:.:26:16,10:9,6:7,4 | |
| 12203 chr22 21194673 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.4191e-07;SPV=0.86947 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:13,10:5,4:8,6 0/1:.:28:19,9:5,4:14,5 | |
| 12204 chr22 21194719 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=10;GPV=2.9084e-08;SPV=0.094336 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:23,7:9,4:14,3 0/1:.:36:21,15:8,8:13,7 | |
| 12205 chr22 21196227 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=8;GPV=1.3078e-18;SPV=0.13938 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:13,14:9,9 0/1:.:35:12,23:9,12:3,11 | |
| 12206 chr22 21196341 . A G . PASS DP=105;SS=1;SSC=2;GPV=4.4301e-20;SPV=0.61779 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:28,28:15,12:13,16 0/1:.:49:25,24:13,13:12,11 | |
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| 12235 chr22 21217829 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,26:0,29 1/1:.:38:0,38:0,15:0,23 | |
| 12236 chr22 21218444 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=5;GPV=7.7108e-10;SPV=0.29922 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:34,12:25,11:9,1 0/1:.:45:30,15:21,8:9,7 | |
| 12237 chr22 21220285 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=3.4899e-11;SPV=0.43466 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:13,9:4,7 0/1:.:22:10,12:5,6:5,6 | |
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| 12241 chr22 21221511 . A T . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=3.9115e-10;SPV=0.74954 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:18,16:9,14:9,2 0/1:.:24:14,10:8,4:6,6 | |
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| 12244 chr22 21221793 . T C . PASS DP=144;SS=1;SSC=1;GPV=9.5298e-09;SPV=0.68996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:77:63,14:30,6:33,8 0/1:.:67:56,11:28,6:28,5 | |
| 12245 chr22 21221799 . G A . PASS DP=139;SS=1;SSC=0;GPV=2.012e-08;SPV=0.97739 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:76:59,17:24,11:35,6 0/1:.:63:56,7:28,1:28,6 | |
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| 12247 chr22 21223068 . G C . PASS DP=120;SS=1;SSC=0;GPV=1.1077e-13;SPV=0.82328 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:46,24:20,6:26,18 0/1:.:50:36,14:17,5:19,9 | |
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| 12250 chr22 21225015 . G A . PASS DP=107;SS=1;SSC=0;GPV=1.6075e-07;SPV=0.80652 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:51,14:23,9:28,5 0/1:.:42:35,7:15,3:20,4 | |
| 12251 chr22 21225253 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.2414e-11;SPV=0.66205 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:29,19:14,12:15,7 0/1:.:32:20,12:7,5:13,7 | |
| 12252 chr22 21227272 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=8.056e-13;SPV=0.79654 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:14,9:13,12 0/1:.:35:22,13:13,4:9,9 | |
| 12253 chr22 21227575 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,5:0,23 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 12254 chr22 21227693 . T A . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 12255 chr22 21229943 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=2.2536e-12;SPV=0.97161 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:9,10:6,9 0/1:.:36:23,13:15,5:8,8 | |
| 12256 chr22 21230067 . C T . PASS DP=110;SS=1;SSC=0;GPV=8.0843e-07;SPV=0.91264 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:35,10:24,6:11,4 0/1:.:64:55,9:26,8:29,1 | |
| 12257 chr22 21230437 . T C . PASS DP=41;SS=1;SSC=4;GPV=0.00022563;SPV=0.35932 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:20,6:1,1:19,5 0/1:.:15:10,5:0,0:10,5 | |
| 12258 chr22 21231442 . A G . PASS DP=28;SOMATIC;SS=2;SSC=16;GPV=1;SPV=0.022074 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:17:16,1:11,1:5,0 0/1:.:11:6,5:3,3:3,2 | |
| 12259 chr22 21231662 . C T . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=1.2704e-05;SPV=0.84737 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:10,8:6,6:4,2 0/1:.:18:12,6:8,5:4,1 | |
| 12260 chr22 21232136 . G A . PASS DP=107;SS=1;SSC=0;GPV=8.7467e-29;SPV=0.86661 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:18,39:9,16:9,23 0/1:.:50:20,30:8,16:12,14 | |
| 12261 chr22 21232354 . G A . PASS DP=49;SS=1;SSC=4;GPV=8.2643e-08;SPV=0.3413 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:16,9:9,4:7,5 0/1:.:24:13,11:8,8:5,3 | |
| 12262 chr22 21233006 . G C . PASS DP=39;SS=1;SSC=0;GPV=0.0058219;SPV=0.91543 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:12,4:3,0:9,4 0/1:.:23:20,3:7,1:13,2 | |
| 12263 chr22 21233535 . C T . PASS DP=142;SS=1;SSC=12;GPV=5.0889e-24;SPV=0.051985 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:41,24:14,5:27,19 0/1:.:77:37,40:12,16:25,24 | |
| 12264 chr22 21234570 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=6;GPV=0;SPV=0.2094 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:2,39:0,31:2,8 1/1:.:48:0,48:0,37:0,11 | |
| 12265 chr22 21234622 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=8;GPV=2.0082e-19;SPV=0.13869 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:5,18:9,4 1/1:.:30:7,23:4,19:3,4 | |
| 12266 chr22 21234948 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.8272e-05;SPV=0.90167 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:22,8:6,2:16,6 0/1:.:36:30,6:12,2:18,4 | |
| 12267 chr22 21236231 . A C . PASS DP=63;SS=1;SSC=7;GPV=1.1758e-13;SPV=0.17427 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:18,16:9,4:9,12 0/1:.:29:11,18:6,7:5,11 | |
| 12268 chr22 21236271 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 12269 chr22 21237675 . A T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,30:0,5 1/1:.:23:0,23:0,18:0,5 | |
| 12270 chr22 21238464 . G T . PASS DP=96;SS=1;SSC=1;GPV=8.8535e-17;SPV=0.74173 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:14,13:12,11 0/1:.:46:26,20:15,10:11,10 | |
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| 12272 chr22 21238982 . T G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=1.0539e-17;SPV=0.83694 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:8,24:3,13:5,11 0/1:.:24:8,16:5,7:3,9 | |
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| 12311 chr22 21262862 . C T . PASS DP=99;SS=1;SSC=3;GPV=2.3502e-15;SPV=0.39986 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:31,20:9,5:22,15 0/1:.:48:27,21:8,5:19,16 | |
| 12312 chr22 21264519 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,23:0,10 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
| 12313 chr22 21264673 . C T . PASS DP=106;SS=1;SSC=2;GPV=6.7812e-29;SPV=0.54863 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:18,33:11,13:7,20 0/1:.:55:19,36:7,15:12,21 | |
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| 12316 chr22 21270164 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=10;GPV=9.3924e-10;SPV=0.079886 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:27,10:12,5:15,5 0/1:.:35:19,16:5,5:14,11 | |
| 12317 chr22 21270579 . C A . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=1.7753e-06;SPV=0.99339 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:8,12:1,8:7,4 0/1:.:16:12,4:5,3:7,1 | |
| 12318 chr22 21270595 . A G . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=4.6376e-07;SPV=0.99891 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:6,14:1,8:5,6 0/1:.:13:10,3:4,2:6,1 | |
| 12319 chr22 21271096 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=2;GPV=5.5625e-05;SPV=0.53046 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:28,8:21,5:7,3 0/1:.:20:15,5:11,1:4,4 | |
| 12320 chr22 21271187 . C T . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,22:0,36 1/1:.:45:0,45:0,16:0,29 | |
| 12321 chr22 21271488 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=5.3813e-05;SPV=0.73721 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:20,7:7,5:13,2 0/1:.:27:21,6:3,5:18,1 | |
| 12322 chr22 21271645 . T G . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,8:0,22 1/1:.:16:0,16:0,7:0,9 | |
| 12323 chr22 21274496 . A G . PASS DP=32;SS=1;SSC=1;GPV=0.0004259;SPV=0.74748 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:12,6:9,1:3,5 0/1:.:14:10,4:5,1:5,3 | |
| 12324 chr22 21274650 . C T . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,10:0,7 1/1:.:15:0,15:0,12:0,3 | |
| 12325 chr22 21275278 . G T . PASS DP=101;SS=1;SSC=5;GPV=8.0858e-05;SPV=0.29061 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:58,7:33,1:25,6 0/1:.:36:30,6:19,3:11,3 | |
| 12326 chr22 21275585 . A G . PASS DP=136;SS=1;SSC=0;GPV=6.7549e-11;SPV=0.86017 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:74:55,19:23,9:32,10 0/1:.:62:50,12:28,7:22,5 | |
| 12327 chr22 21276138 . G C . PASS DP=102;SS=1;SSC=10;GPV=1.5147e-07;SPV=0.085117 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:39,6:17,6:22,0 0/1:.:57:42,15:26,7:16,8 | |
| 12328 chr22 21276373 . C T . PASS DP=112;SS=1;SSC=6;GPV=1.848e-05;SPV=0.20861 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:52:47,5:28,2:19,3 0/1:.:60:50,10:26,2:24,8 | |
| 12329 chr22 21277430 . A G . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=0.025076;SPV=0.95968 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:6,3:6,3:0,0 0/1:.:16:14,2:14,2:0,0 | |
| 12330 chr22 21277807 . A C . PASS DP=157;SS=1;SSC=1;GPV=4.829e-06;SPV=0.72453 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:77:68,9:26,1:42,8 0/1:.:80:72,8:29,3:43,5 | |
| 12331 chr22 21278106 . A C . PASS DP=47;SS=1;SSC=8;GPV=8.0864e-06;SPV=0.12903 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:20,6:2,2:18,4 0/1:.:21:12,9:1,3:11,6 | |
| 12332 chr22 21281035 . G T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.0024e-05;SPV=0.98022 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:26,10:5,2:21,8 0/1:.:35:31,4:11,2:20,2 | |
| 12333 chr22 21281036 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=8;GPV=4.9254e-06;SPV=0.13492 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:26,6:3,4:23,2 0/1:.:29:19,10:4,5:15,5 | |
| 12334 chr22 21281071 . A C . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=5.6497e-05;SPV=0.94008 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:22,9:7,2:15,7 0/1:.:26:22,4:10,2:12,2 | |
| 12335 chr22 21281737 . C A . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=1.9285e-08;SPV=0.52952 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:39,15:23,7:16,8 0/1:.:27:19,8:11,3:8,5 | |
| 12336 chr22 21281754 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=7.4112e-21;SPV=0.52844 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:11,32:6,16:5,16 1/1:.:18:4,14:2,6:2,8 | |
| 12337 chr22 21281827 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=3.195e-25;SPV=0.98698 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:15,41:7,20:8,21 0/1:.:36:17,19:4,12:13,7 | |
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| 12359 chr22 21287533 . T C . PASS DP=33;SS=1;SSC=7;GPV=1.81e-05;SPV=0.16969 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:9,5:0,2:9,3 0/1:.:15:5,8:0,1:5,7 | |
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| 12376 chr22 21294082 . C T . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=0.00056532;SPV=0.84962 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:21,7:1,1:20,6 0/1:.:18:15,3:1,0:14,3 | |
| 12377 chr22 21294546 . T C . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,20:0,1 1/1:.:21:0,21:0,17:0,4 | |
| 12378 chr22 21295167 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=7;GPV=1.2803e-06;SPV=0.17103 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:37,8:5,3:32,5 0/1:.:34:24,10:5,3:19,7 | |
| 12379 chr22 21299537 . T C . PASS DP=34;SS=1;SSC=1;GPV=7.5302e-05;SPV=0.7886 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:15,9:0,2:15,7 0/1:.:10:7,3:0,1:7,2 | |
| 12380 chr22 21302564 . A G . PASS DP=36;SS=1;SSC=2;GPV=0.012467;SPV=0.60903 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:21,4:20,4:1,0 0/1:.:11:9,2:9,2:0,0 | |
| 12381 chr22 21302625 . G A . PASS DP=49;SS=1;SSC=2;GPV=0.00026004;SPV=0.58152 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:25,7:24,6:1,1 0/1:.:17:13,4:12,2:1,2 | |
| 12382 chr22 21307922 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=2.1616e-07;SPV=0.51038 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:34,12:26,10:8,2 0/1:.:28:20,8:16,7:4,1 | |
| 12383 chr22 21309166 . C G . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=9.2415e-08;SPV=0.90816 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:10,13:6,7:4,6 0/1:.:15:9,6:6,2:3,4 | |
| 12384 chr22 21309337 . T G . PASS DP=37;SS=1;SSC=1;GPV=1.9143e-06;SPV=0.65173 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:9,7:6,4:3,3 0/1:.:21:12,9:8,7:4,2 | |
| 12385 chr22 21309403 . G A . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=7.2058e-09;SPV=0.98555 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:4,12:1,1:3,11 0/1:.:20:11,9:9,1:2,8 | |
| 12386 chr22 21311019 . G T . PASS DP=125;SS=1;SSC=5;GPV=1.9534e-05;SPV=0.28379 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:71:64,7:19,4:45,3 0/1:.:54:46,8:16,6:30,2 | |
| 12387 chr22 21311868 . T G . PASS DP=23;SS=1;SSC=7;GPV=5.7694e-08;SPV=0.1968 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:4,6:3,4:1,2 1/1:.:13:2,11:2,6:0,5 | |
| 12388 chr22 21320674 . C G . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=0.00043872;SPV=0.96407 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:10,7:2,1:8,6 0/1:.:16:13,3:4,1:9,2 | |
| 12389 chr22 21321858 . A G . PASS DP=29;SS=1;SSC=3;GPV=0.0051909;SPV=0.45862 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:15,4:6,4:9,0 0/1:.:10:7,3:5,2:2,1 | |
| 12390 chr22 21325211 . A C . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=3.9871e-07;SPV=0.89084 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:9,9:8,7:1,2 0/1:.:25:16,9:9,6:7,3 | |
| 12391 chr22 21326229 . G T . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=0.00034727;SPV=0.74188 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:24,4:14,2:10,2 0/1:.:58:51,7:18,3:33,4 | |
| 12392 chr22 21326687 . G A . PASS DP=28;SS=1;SSC=2;GPV=5.4482e-05;SPV=0.56964 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:6,4:2,2:4,2 0/1:.:18:10,8:6,4:4,4 | |
| 12393 chr22 21326832 . A C . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=1.3852e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,4:0,9 1/1:.:20:0,20:0,4:0,16 | |
| 12394 chr22 21327729 . C G . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,8:0,2 1/1:.:22:0,22:0,16:0,6 | |
| 12395 chr22 21328182 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=5;GPV=2.8822e-31;SPV=0.30006 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 1/1:.:32:2,30:2,9:0,21 | |
| 12396 chr22 21328478 . G T . PASS DP=23;SS=1;SSC=0;GPV=1.2146e-13;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,8:0,3 1/1:.:12:0,12:0,8:0,4 | |
| 12397 chr22 21329189 . T G . PASS DP=97;SS=1;SSC=3;GPV=3.8987e-14;SPV=0.49763 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:37,23:16,17:21,6 0/1:.:37:22,15:12,7:10,8 | |
| 12398 chr22 21331501 . C T . PASS DP=24;SS=1;SSC=0;GPV=3.101e-14;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:0,12:0,3:0,9 1/1:.:12:0,12:0,2:0,10 | |
| 12399 chr22 21332949 . G A . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=2.7295e-10;SPV=0.88146 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:7,12:6,7:1,5 0/1:.:26:13,13:9,10:4,3 | |
| 12400 chr22 21333080 . G A . PASS DP=91;SS=1;SSC=9;GPV=7.4142e-06;SPV=0.10838 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:39,5:17,4:22,1 0/1:.:47:36,11:18,7:18,4 | |
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| 12402 chr22 21333725 . A T . PASS DP=96;SS=1;SSC=2;GPV=3.1107e-17;SPV=0.59595 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:27,24:12,10:15,14 0/1:.:45:24,21:17,11:7,10 | |
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| 12445 chr22 21388309 . G A . PASS DP=25;SS=1;SSC=1;GPV=0.011145;SPV=0.65059 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:13,4:13,4:0,0 0/1:.:8:6,2:6,2:0,0 | |
| 12446 chr22 21388395 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=6;GPV=9.7868e-13;SPV=0.20797 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:12,13:4,4 0/1:.:21:7,14:5,11:2,3 | |
| 12447 chr22 21393426 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.027005 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:24,10:19,8:5,2 0/1:.:22:9,13:6,7:3,6 | |
| 12448 chr22 21395989 . C G . PASS DP=35;SS=1;SSC=2;GPV=2.0063e-08;SPV=0.52057 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:9,11:0,2:9,9 0/1:.:15:6,9:1,2:5,7 | |
| 12449 chr22 21400654 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=3;GPV=6.2401e-06;SPV=0.45275 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:40,10:27,7:13,3 0/1:.:25:19,6:11,4:8,2 | |
| 12450 chr22 21403098 . G T . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=3.2213e-16;SPV=0.58514 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:7,3:12,18 0/1:.:38:18,20:13,2:5,18 | |
| 12451 chr22 21403341 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=2.5307e-23;SPV=0.4858 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:8,28:2,20:6,8 1/1:.:27:5,22:1,15:4,7 | |
| 12452 chr22 21403491 . C T . PASS DP=53;SS=1;SSC=2;GPV=6.2975e-26;SPV=0.51239 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:3,30:1,10:2,20 1/1:.:20:1,19:0,8:1,11 | |
| 12453 chr22 21404226 . C A . PASS DP=82;SS=1;SSC=9;GPV=7.5332e-13;SPV=0.11517 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:26,13:12,9:14,4 0/1:.:43:22,21:12,15:10,6 | |
| 12454 chr22 21404440 . C T . PASS DP=24;SS=1;SSC=7;GPV=1.2938e-05;SPV=0.18461 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:8,6:1,3:7,3 0/1:.:10:3,7:1,2:2,5 | |
| 12455 chr22 21405357 . G A . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=1.0577e-05;SPV=0.92806 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:10,10:7,7:3,3 0/1:.:13:9,4:8,3:1,1 | |
| 12456 chr22 21406039 . G A . PASS DP=104;SS=1;SSC=1;GPV=5.7825e-09;SPV=0.68252 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:42,14:24,9:18,5 0/1:.:48:37,11:16,8:21,3 | |
| 12457 chr22 21406319 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=12;GPV=3.0386e-07;SPV=0.062022 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:49,9:31,3:18,6 0/1:.:35:24,11:13,6:11,5 | |
| 12458 chr22 21406850 . G A . PASS DP=109;SS=1;SSC=1;GPV=2.8665e-22;SPV=0.77879 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:68:31,37:12,18:19,19 0/1:.:41:21,20:10,12:11,8 | |
| 12459 chr22 21406862 . T G . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,25:0,36 1/1:.:40:0,40:0,16:0,24 | |
| 12460 chr22 21407213 . C T . PASS DP=126;SS=1;SSC=2;GPV=2.1445e-31;SPV=0.6193 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:83:32,51:19,22:13,29 0/1:.:43:17,26:7,11:10,15 | |
| 12461 chr22 21408770 . G C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 12462 chr22 21408935 . C T . PASS DP=54;SOMATIC;SS=2;SSC=44;GPV=1;SPV=3.4791e-05 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:33:32,1:14,1:18,0 0/1:.:21:10,11:6,7:4,4 | |
| 12463 chr22 21411522 . A G . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,11:0,9 1/1:.:21:0,21:0,10:0,11 | |
| 12464 chr22 21411978 . A G . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,22:0,38 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 | |
| 12465 chr22 21413631 . A T . PASS DP=80;SS=1;SSC=5;GPV=2.4559e-07;SPV=0.2994 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:36,10:7,2:29,8 0/1:.:34:24,10:8,1:16,9 | |
| 12466 chr22 21417712 . G T . PASS DP=53;SS=1;SSC=5;GPV=5.2873e-05;SPV=0.28481 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:27,7:19,2:8,5 0/1:.:19:13,6:8,2:5,4 | |
| 12467 chr22 21424472 . C T . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=6.9312e-07;SPV=0.9376 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:9,11:2,6:7,5 0/1:.:17:11,6:3,3:8,3 | |
| 12468 chr22 21424579 . A G . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=2.2598e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,7:0,14 1/1:.:15:0,15:0,5:0,10 | |
| 12469 chr22 21438180 . T G . PASS DP=142;SS=1;SSC=6;GPV=8.5098e-10;SPV=0.21244 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:78:65,13:38,8:27,5 0/1:.:64:49,15:28,6:21,9 | |
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| 12513 chr22 21482765 . G C . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=7.9107e-15;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,9:0,8 1/1:.:8:0,8:0,5:0,3 | |
| 12514 chr22 21483273 . C T . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,11:0,8 1/1:.:13:0,13:0,7:0,6 | |
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| 12517 chr22 21485696 . C G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,28:0,15 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 | |
| 12518 chr22 21485916 . C G . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=8.5945e-18;SPV=0.71604 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:19,27:6,13:13,14 0/1:.:31:14,17:7,6:7,11 | |
| 12519 chr22 21486037 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,37:0,24:0,13 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 | |
| 12520 chr22 21486282 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,22:0,20 1/1:.:19:0,19:0,10:0,9 | |
| 12521 chr22 21486301 . C A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:20:0,20:0,10:0,10 | |
| 12522 chr22 21488366 . C T . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=2.2598e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,8:0,13 1/1:.:15:0,15:0,3:0,12 | |
| 12523 chr22 21488524 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 1/1:.:29:0,29:0,25:0,4 | |
| 12524 chr22 21489208 . A G . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,13:0,9 1/1:.:10:0,10:0,8:0,2 | |
| 12525 chr22 21489561 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,10:0,14 1/1:.:26:0,26:0,6:0,20 | |
| 12526 chr22 21489594 . T G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,7:0,17 1/1:.:27:0,27:0,8:0,19 | |
| 12527 chr22 21489748 . A G . PASS DP=34;SS=1;SSC=0;GPV=3.5146e-20;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,6:0,12 1/1:.:16:0,16:0,8:0,8 | |
| 12528 chr22 21491320 . A G . PASS DP=24;SS=1;SSC=0;GPV=3.101e-14;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,3:0,13 1/1:.:8:0,8:0,1:0,7 | |
| 12529 chr22 21509428 . C T . PASS DP=33;SS=1;SSC=8;GPV=4.6376e-07;SPV=0.15359 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:13,10:5,4:8,6 0/1:.:10:3,7:2,4:1,3 | |
| 12530 chr22 21512280 . C T . PASS DP=139;SS=1;SSC=11;GPV=1.9328e-13;SPV=0.063257 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:75:59,16:29,5:30,11 0/1:.:64:42,22:21,10:21,12 | |
| 12531 chr22 21531109 . A G . PASS DP=27;SS=1;SSC=0;GPV=5.1363e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,13:0,3 1/1:.:11:0,11:0,7:0,4 | |
| 12532 chr22 21544764 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=3;GPV=2.7518e-05;SPV=0.46018 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:28,7:20,5:8,2 0/1:.:29:22,7:13,3:9,4 | |
| 12533 chr22 21552216 . G A . PASS DP=131;SS=1;SSC=4;GPV=1.6731e-09;SPV=0.34957 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:53,12:19,5:34,7 0/1:.:66:51,15:31,6:20,9 | |
| 12534 chr22 21554670 . G A . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=1.4508e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,15:0,1 1/1:.:22:0,22:0,20:0,2 | |
| 12535 chr22 21555351 . G A . PASS DP=124;SS=1;SSC=6;GPV=3.4472e-09;SPV=0.23682 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:72:59,13:35,10:24,3 0/1:.:52:39,13:22,9:17,4 | |
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| 12537 chr22 21555897 . A G . PASS DP=143;SS=1;SSC=1;GPV=6.2694e-12;SPV=0.74542 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:92:69,23:37,14:32,9 0/1:.:51:40,11:19,2:21,9 | |
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| 12581 chr22 21573208 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=8;GPV=2.7231e-11;SPV=0.15172 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:13,7:10,8 0/1:.:25:11,14:6,7:5,7 | |
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| 12589 chr22 21577975 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,15:0,23 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 | |
| 12590 chr22 21578024 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=3;GPV=5.2318e-13;SPV=0.40285 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:7,6:10,9 0/1:.:34:16,18:9,7:7,11 | |
| 12591 chr22 21579139 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.5635e-16;SPV=0.9787 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:12,24:9,18:3,6 0/1:.:37:20,17:11,11:9,6 | |
| 12592 chr22 21579491 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
| 12593 chr22 21581863 . C G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 | |
| 12594 chr22 21582362 . T G . PASS DP=53;SS=1;SSC=1;GPV=2.72e-12;SPV=0.70425 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:13,18:5,9:8,9 0/1:.:22:10,12:5,6:5,6 | |
| 12595 chr22 21582546 . C A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
| 12596 chr22 21583935 . A C . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,30:0,20 1/1:.:47:0,47:0,29:0,18 | |
| 12597 chr22 21584120 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=1.1753e-14;SPV=0.59177 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:18,9:8,14 0/1:.:32:17,15:10,8:7,7 | |
| 12598 chr22 21584301 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 1/1:.:37:0,37:0,11:0,26 | |
| 12599 chr22 21584574 . G C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,23:0,26 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 12600 chr22 21585076 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=8;GPV=2.8449e-19;SPV=0.12777 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:17,12:8,9 0/1:.:47:19,28:10,16:9,12 | |
| 12601 chr22 21585386 . G T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 12602 chr22 21585398 . C A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 | |
| 12603 chr22 21585900 . T G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 12604 chr22 21585960 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=3;GPV=4.9668e-14;SPV=0.49279 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:10,13:9,8 0/1:.:25:11,14:5,8:6,6 | |
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| 12633 chr22 21610662 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 1/1:.:35:0,35:0,15:0,20 | |
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| 12635 chr22 21612515 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=2;GPV=1.4593e-31;SPV=0.57143 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:1,31:0,10:1,21 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 | |
| 12636 chr22 21612544 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,9:0,21 1/1:.:20:0,20:0,8:0,12 | |
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| 12644 chr22 21617286 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=6.2104e-12;SPV=0.73829 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:9,8:7,10 0/1:.:25:13,12:9,5:4,7 | |
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| 12646 chr22 21618112 . T G . PASS DP=106;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,28:0,22 1/1:.:56:0,56:0,29:0,27 | |
| 12647 chr22 21619030 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=1.374e-15;SPV=0.58582 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:10,13:7,7 0/1:.:35:16,19:10,8:6,11 | |
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| 12651 chr22 21622645 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 | |
| 12652 chr22 21622758 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 1/1:.:29:0,29:0,19:0,10 | |
| 12653 chr22 21624276 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=7.2168e-14;SPV=0.54898 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:10,6:15,15 0/1:.:32:17,15:9,10:8,5 | |
| 12654 chr22 21624485 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=2.95e-15;SPV=0.40811 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:12,9:13,14 0/1:.:30:14,16:7,10:7,6 | |
| 12655 chr22 21624807 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:45:0,45:0,18:0,27 | |
| 12656 chr22 21625000 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=8.9568e-18;SPV=0.86321 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:23,30:14,18:9,12 0/1:.:32:17,15:8,10:9,5 | |
| 12657 chr22 21625295 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,21:0,27 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 | |
| 12658 chr22 21625649 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,27:0,23 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
| 12659 chr22 21625968 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,25:0,25 1/1:.:23:0,23:0,10:0,13 | |
| 12660 chr22 21626349 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,27:0,25 1/1:.:30:0,30:0,11:0,19 | |
| 12661 chr22 21626605 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,29:0,19 1/1:.:45:0,45:0,34:0,11 | |
| 12662 chr22 21627765 . T G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=6.2104e-12;SPV=0.81743 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:14,17:7,7:7,10 0/1:.:28:15,13:10,6:5,7 | |
| 12663 chr22 21627960 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,28:0,18 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 12664 chr22 21628051 . C G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,30:0,18 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
| 12665 chr22 21628603 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=5.9761e-15;SPV=0.71594 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:8,12:15,9 0/1:.:41:23,18:12,9:11,9 | |
| 12666 chr22 21628971 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,31:0,12 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 | |
| 12667 chr22 21629916 . A G . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:67:0,67:0,40:0,27 1/1:.:34:0,34:0,12:0,22 | |
| 12668 chr22 21630090 . G A . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,27:0,34 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 | |
| 12669 chr22 21630805 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,11:0,22 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 12670 chr22 21634865 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=5;GPV=7.1223e-14;SPV=0.25229 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:37,22:24,10:13,12 0/1:.:32:17,15:11,7:6,8 | |
| 12671 chr22 21635332 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=5.4646e-17;SPV=0.87252 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:8,10:12,13 0/1:.:48:27,21:11,11:16,10 | |
| 12672 chr22 21636037 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=1.4335e-16;SPV=0.67752 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:18,14:7,10 0/1:.:41:22,19:12,9:10,10 | |
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| 12718 chr22 21662654 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 12719 chr22 21663183 . T A . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,20:0,11:0,9 1/1:.:12:0,12:0,2:0,10 | |
| 12720 chr22 21663490 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,24:0,13 1/1:.:28:0,28:0,18:0,10 | |
| 12721 chr22 21663578 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=9.545e-12;SPV=0.75517 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:11,7:7,11 0/1:.:27:15,12:9,9:6,3 | |
| 12722 chr22 21664699 . A C . PASS DP=60;SS=1;SSC=4;GPV=2.0452e-11;SPV=0.31761 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:13,9:7,7 0/1:.:24:11,13:6,8:5,5 | |
| 12723 chr22 21665297 . C G . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.8211e-18;SPV=0.76142 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:20,28:10,11:10,17 0/1:.:34:16,18:4,8:12,10 | |
| 12724 chr22 21665468 . C A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.6571e-10;SPV=0.83819 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:12,8:7,10 0/1:.:23:14,9:5,6:9,3 | |
| 12725 chr22 21666405 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,23:0,29 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 12726 chr22 21666679 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=1.3131e-11;SPV=0.47972 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:29,17:15,9:14,8 0/1:.:35:21,14:12,7:9,7 | |
| 12727 chr22 21666718 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,16:0,26 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 | |
| 12728 chr22 21666827 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=2.3066e-15;SPV=0.9764 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:13,10:7,15 0/1:.:41:26,15:11,2:15,13 | |
| 12729 chr22 21667129 . A C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 1/1:.:20:0,20:0,13:0,7 | |
| 12730 chr22 21668511 . A C . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 1/1:.:18:0,18:0,4:0,14 | |
| 12731 chr22 21668812 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,21:0,7 1/1:.:23:0,23:0,17:0,6 | |
| 12732 chr22 21669041 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
| 12733 chr22 21669653 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=9;GPV=1.3095e-14;SPV=0.10571 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:16,12:8,7 0/1:.:29:11,18:8,7:3,11 | |
| 12734 chr22 21669861 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=4.0755e-15;SPV=0.5426 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:7,5:14,14 0/1:.:41:21,20:8,11:13,9 | |
| 12735 chr22 21670218 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,29:0,16 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 | |
| 12736 chr22 21671173 . A G . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=1.229e-21;SPV=0.96453 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:23,35:11,19:12,16 0/1:.:45:25,20:10,11:15,9 | |
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| 12738 chr22 21671677 . A C . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=1.8765e-12;SPV=0.6184 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:9,8:11,10 0/1:.:30:16,14:6,2:10,12 | |
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| 12776 chr22 21688151 . C T . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=1.9835e-14;SPV=0.91472 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:33,25:19,10:14,15 0/1:.:44:30,14:15,8:15,6 | |
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| 12781 chr22 21690738 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=3;GPV=1.9866e-19;SPV=0.48227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:11,15:9,11 0/1:.:37:15,22:5,13:10,9 | |
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| 12785 chr22 21692029 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=9.8334e-16;SPV=0.81043 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:14,15:7,10 0/1:.:32:17,15:9,9:8,6 | |
| 12786 chr22 21692364 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=4;GPV=4.8717e-12;SPV=0.36683 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:5,3:15,12 0/1:.:32:16,16:6,4:10,12 | |
| 12787 chr22 21692396 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=1;GPV=3.4899e-11;SPV=0.74671 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:2,4:12,12 0/1:.:25:13,12:2,4:11,8 | |
| 12788 chr22 21692434 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=9.392e-17;SPV=0.87947 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:13,23:1,3:12,20 0/1:.:34:16,18:2,5:14,13 | |
| 12789 chr22 21692523 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=4;GPV=9.7345e-13;SPV=0.38056 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:29,17:15,9:14,8 0/1:.:40:23,17:10,4:13,13 | |
| 12790 chr22 21692877 . C G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 1/1:.:22:0,22:0,7:0,15 | |
| 12791 chr22 21692966 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=7.5673e-13;SPV=0.89667 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:7,7:6,12 0/1:.:28:15,13:5,8:10,5 | |
| 12792 chr22 21694573 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.5502e-15;SPV=0.81648 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:8,11:13,12 0/1:.:38:21,17:6,6:15,11 | |
| 12793 chr22 21695494 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=5;GPV=1.5643e-13;SPV=0.28361 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:29,17:23,10:6,7 0/1:.:42:23,19:8,5:15,14 | |
| 12794 chr22 21695776 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,24:0,29 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
| 12795 chr22 21695800 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=8.6835e-16;SPV=0.60499 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:9,11:14,14 0/1:.:29:14,15:6,7:8,8 | |
| 12796 chr22 21696480 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,26:0,25 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 | |
| 12797 chr22 21697294 . G T . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=4.4109e-17;SPV=0.70416 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:13,12:10,12 0/1:.:42:22,20:8,12:14,8 | |
| 12798 chr22 21700318 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,31:0,13 1/1:.:43:0,43:0,20:0,23 | |
| 12799 chr22 21700991 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,23:0,24 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 | |
| 12800 chr22 21701105 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 | |
| 12801 chr22 21701292 . C A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 1/1:.:26:0,26:0,13:0,13 | |
| 12802 chr22 21702626 . C A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,23:0,25 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
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| 12804 chr22 21703711 . C G . PASS DP=88;SS=1;SSC=3;GPV=3.9427e-17;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:13,15:10,7 0/1:.:43:21,22:12,11:9,11 | |
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| 12833 chr22 21728499 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=4;GPV=1.7445e-10;SPV=0.36515 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:29,15:15,7:14,8 0/1:.:32:19,13:10,5:9,8 | |
| 12834 chr22 21728630 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=4;GPV=6.5235e-17;SPV=0.36647 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:14,7:8,14 0/1:.:40:18,22:12,10:6,12 | |
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| 12854 chr22 21795970 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=2.4531e-16;SPV=0.66434 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:7,10:11,12 0/1:.:36:17,19:11,10:6,9 | |
| 12855 chr22 21829843 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=2.7419e-13;SPV=0.41559 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:10,8:11,10 0/1:.:31:15,16:10,8:5,8 | |
| 12856 chr22 21887698 . A C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=3.5019e-16;SPV=0.86814 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:12,23:8,12:4,11 0/1:.:29:13,16:6,7:7,9 | |
| 12857 chr22 21892763 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,28:0,12 1/1:.:21:0,21:0,12:0,9 | |
| 12858 chr22 21893423 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 | |
| 12859 chr22 21896423 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=4.8389e-15;SPV=0.58824 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:7,8:9,13 0/1:.:28:12,16:9,8:3,8 | |
| 12860 chr22 21910163 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=3.6614e-10;SPV=0.49811 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:28,16:14,7:14,9 0/1:.:28:17,11:9,4:8,7 | |
| 12861 chr22 21914545 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=2.0619e-14;SPV=0.60865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:10,10:13,12 0/1:.:31:16,15:8,4:8,11 | |
| 12862 chr22 21919161 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=4;GPV=4.5813e-10;SPV=0.38672 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:13,6:9,9 0/1:.:23:12,11:6,6:6,5 | |
| 12863 chr22 21919731 . G A . PASS DP=105;SS=1;SSC=0;GPV=1.091e-18;SPV=0.81594 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:15,12:12,15 0/1:.:51:29,22:15,15:14,7 | |
| 12864 chr22 21947102 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=1;GPV=7.6501e-21;SPV=0.728 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:23,32:9,19:14,13 0/1:.:37:17,20:9,11:8,9 | |
| 12865 chr22 21955036 . T G . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=3.7543e-09;SPV=0.69411 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:39,17:14,7:25,10 0/1:.:29:21,8:10,5:11,3 | |
| 12866 chr22 21956601 . T C . PASS DP=104;SS=1;SSC=3;GPV=6.8901e-08;SPV=0.50115 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:47,12:29,9:18,3 0/1:.:45:35,10:22,9:13,1 | |
| 12867 chr22 21964166 . C T . PASS DP=101;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.046295 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:28,21:13,9:15,12 0/1:.:52:20,32:11,19:9,13 | |
| 12868 chr22 21975710 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=3;GPV=3.7425e-15;SPV=0.42948 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:9,13:10,7 0/1:.:32:14,18:7,13:7,5 | |
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| 12870 chr22 21980154 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.5567e-13;SPV=0.82224 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:14,14:8,8 0/1:.:31:18,13:7,10:11,3 | |
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| 12914 chr22 22018314 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=2.783e-13;SPV=0.66153 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:7,9:6,7 0/1:.:32:15,17:8,13:7,4 | |
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| 12916 chr22 22021019 . A C . PASS DP=65;SS=1;SSC=4;GPV=4.6624e-13;SPV=0.35575 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:8,6:9,9 0/1:.:33:15,18:9,6:6,12 | |
| 12917 chr22 22021455 . A C . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=5.6397e-13;SPV=0.89148 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:7,15:2,5:5,10 0/1:.:29:13,16:6,10:7,6 | |
| 12918 chr22 22021699 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=8;GPV=2.9719e-11;SPV=0.15762 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:20,12:11,6:9,6 0/1:.:32:15,17:6,11:9,6 | |
| 12919 chr22 22022103 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=8;GPV=5.3252e-12;SPV=0.1378 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:25,16:12,9:13,7 0/1:.:27:12,15:6,5:6,10 | |
| 12920 chr22 22022272 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=9;GPV=2.7419e-13;SPV=0.12053 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:13,11:12,7 0/1:.:27:11,16:6,4:5,12 | |
| 12921 chr22 22022474 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=6;GPV=1.1875e-15;SPV=0.22338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:15,16:6,5 0/1:.:29:11,18:3,11:8,7 | |
| 12922 chr22 22023308 . C G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=4.9005e-18;SPV=0.98651 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:20,31:7,18:13,13 0/1:.:38:23,15:12,9:11,6 | |
| 12923 chr22 22023772 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=1.1519e-11;SPV=0.71163 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:15,14:7,8:8,6 0/1:.:36:20,16:10,7:10,9 | |
| 12924 chr22 22026929 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=6;GPV=4.8769e-15;SPV=0.20885 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:27,25:14,15:13,10 0/1:.:21:8,13:7,6:1,7 | |
| 12925 chr22 22027370 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=1.8891e-12;SPV=0.45554 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:28,18:12,6:16,12 0/1:.:35:20,15:14,7:6,8 | |
| 12926 chr22 22032431 . T G . PASS DP=95;SS=1;SSC=2;GPV=1.2218e-26;SPV=0.56224 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:18,35:10,20:8,15 0/1:.:42:14,28:10,12:4,16 | |
| 12927 chr22 22033934 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=2;GPV=1.1653e-16;SPV=0.60818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:28,27:16,11:12,16 0/1:.:33:17,16:12,8:5,8 | |
| 12928 chr22 22039745 . T C . PASS DP=45;SS=1;SSC=12;GPV=6.2178e-08;SPV=0.062763 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:18,9:11,2:7,7 0/1:.:18:7,11:2,4:5,7 | |
| 12929 chr22 22039828 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=3.4899e-11;SPV=0.93065 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:13,18:4,6:9,12 0/1:.:24:14,10:8,4:6,6 | |
| 12930 chr22 22040281 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.0786e-09;SPV=0.94458 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:7,10:7,5 0/1:.:29:19,10:9,5:10,5 | |
| 12931 chr22 22041815 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=7.3738e-16;SPV=0.82509 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:9,15:8,11 0/1:.:25:12,13:7,9:5,4 | |
| 12932 chr22 22041937 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=2.4857e-11;SPV=0.93311 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:6,9:7,7 0/1:.:33:20,13:17,10:3,3 | |
| 12933 chr22 22042154 . T G . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=1.9866e-19;SPV=0.78668 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:16,25:9,12:7,13 0/1:.:42:19,23:8,15:11,8 | |
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| 12935 chr22 22043310 . T G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 | |
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| 12988 chr22 22064524 . C G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
| 12989 chr22 22064693 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,25:0,10 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 | |
| 12990 chr22 22064696 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=3;GPV=7.2383e-18;SPV=0.43659 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:15,9:1,11 0/1:.:40:16,24:8,15:8,9 | |
| 12991 chr22 22065894 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.047263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:27,11:17,5:10,6 0/1:.:40:20,20:10,10:10,10 | |
| 12992 chr22 22066378 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 | |
| 12993 chr22 22066391 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 | |
| 12994 chr22 22066838 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
| 12995 chr22 22068728 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.2446e-15;SPV=0.86856 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:7,11:10,10 0/1:.:42:23,19:14,12:9,7 | |
| 12996 chr22 22069476 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.5388e-12;SPV=0.78047 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:8,8:10,11 0/1:.:29:16,13:9,6:7,7 | |
| 12997 chr22 22069773 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 1/1:.:47:0,47:0,24:0,23 | |
| 12998 chr22 22070033 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,24:0,14 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
| 12999 chr22 22070446 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 1/1:.:36:0,36:0,12:0,24 | |
| 13000 chr22 22070695 . T G . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=3.6448e-13;SPV=0.33647 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:11,10:7,7 0/1:.:28:12,16:7,7:5,9 | |
| 13001 chr22 22071037 . C A . PASS DP=74;SS=1;SSC=4;GPV=1.4493e-18;SPV=0.38633 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:16,22:8,15:8,7 0/1:.:36:13,23:6,14:7,9 | |
| 13002 chr22 22071795 . C G . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=1.7754e-11;SPV=0.84233 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:8,13:4,5:4,8 0/1:.:29:14,15:7,9:7,6 | |
| 13003 chr22 22072415 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=7.6248e-11;SPV=0.83938 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:5,7:13,10 0/1:.:28:17,11:8,3:9,8 | |
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| 13033 chr22 22085855 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=7;GPV=9.392e-17;SPV=0.1871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:8,7:8,10 0/1:.:37:13,24:7,15:6,9 | |
| 13034 chr22 22086377 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=3;GPV=4.3049e-14;SPV=0.42789 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:9,7:5,8 0/1:.:35:15,20:5,10:10,10 | |
| 13035 chr22 22090164 . A C . PASS DP=68;SS=1;SSC=11;GPV=2.2072e-13;SPV=0.065278 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:16,9:7,4:9,5 0/1:.:43:18,25:8,12:10,13 | |
| 13036 chr22 22101267 . G T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=3.9286e-14;SPV=0.9957 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:15,25:6,14:9,11 0/1:.:32:21,11:13,7:8,4 | |
| 13037 chr22 22108050 . C A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.0316e-12;SPV=0.87207 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:11,9:5,9 0/1:.:31:18,13:9,7:9,6 | |
| 13038 chr22 22109134 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=2.6699e-12;SPV=0.9838 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:17,14:3,9 0/1:.:29:20,9:12,6:8,3 | |
| 13039 chr22 22110263 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=6;GPV=1.5635e-16;SPV=0.24191 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:11,9:5,7 0/1:.:41:16,25:5,9:11,16 | |
| 13040 chr22 22110640 . T A . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=2.2072e-13;SPV=0.59635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:13,10:6,9 0/1:.:30:15,15:9,11:6,4 | |
| 13041 chr22 22111843 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=10;GPV=7.0781e-20;SPV=0.096426 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:12,9:11,15 0/1:.:37:12,25:1,12:11,13 | |
| 13042 chr22 22112189 . A C . PASS DP=62;SS=1;SSC=6;GPV=5.295e-10;SPV=0.20242 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:23,13:9,9:14,4 0/1:.:26:13,13:6,6:7,7 | |
| 13043 chr22 22113188 . A C . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=5.6671e-10;SPV=0.35896 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:20,12:8,3:12,9 0/1:.:31:17,14:9,6:8,8 | |
| 13044 chr22 22113495 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=7;GPV=5.295e-10;SPV=0.19596 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:11,7:8,3 0/1:.:33:17,16:7,11:10,5 | |
| 13045 chr22 22114145 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=4;GPV=1.0372e-11;SPV=0.35547 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:24,14:10,6:14,8 0/1:.:39:22,17:13,7:9,10 | |
| 13046 chr22 22114725 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=7;GPV=2.9605e-18;SPV=0.19681 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:32,27:25,16:7,11 0/1:.:35:15,20:8,12:7,8 | |
| 13047 chr22 22116258 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=7.6761e-12;SPV=0.74112 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:33,20:13,17:20,3 0/1:.:36:24,12:10,10:14,2 | |
| 13048 chr22 22116684 . A C . PASS DP=76;SS=1;SSC=4;GPV=4.794e-13;SPV=0.3656 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:14,4:11,14 0/1:.:33:17,16:6,8:11,8 | |
| 13049 chr22 22117242 . G A . PASS DP=94;SS=1;SSC=5;GPV=2.5559e-17;SPV=0.27626 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:28,22:22,8:6,14 0/1:.:44:21,23:13,8:8,15 | |
| 13050 chr22 22117329 . C A . PASS DP=91;SS=1;SSC=18;GPV=1;SPV=0.013319 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:36,11:21,9:15,2 0/1:.:44:23,21:12,9:11,12 | |
| 13051 chr22 22119038 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.2293e-15;SPV=0.89719 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:18,23:8,10:10,13 0/1:.:34:19,15:11,7:8,8 | |
| 13052 chr22 22119272 . C G . PASS DP=87;SS=1;SSC=3;GPV=2.5278e-15;SPV=0.49473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:13,9:14,13 0/1:.:38:20,18:10,8:10,10 | |
| 13053 chr22 22119536 . C A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=3.642e-14;SPV=0.9735 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:12,11:10,14 0/1:.:35:23,12:10,5:13,7 | |
| 13054 chr22 22119897 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=3.6451e-12;SPV=0.99498 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:5,11:9,11 0/1:.:28:19,9:8,6:11,3 | |
| 13055 chr22 22122209 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=1.4168e-09;SPV=0.76625 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:9,8:8,5 0/1:.:32:20,12:8,10:12,2 | |
| 13056 chr22 22122414 . G C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=1.9732e-14;SPV=0.93818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:14,13:10,11 0/1:.:39:25,14:10,6:15,8 | |
| 13057 chr22 22122602 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=4;GPV=1.2905e-14;SPV=0.3386 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:33,26:19,14:14,12 0/1:.:23:11,12:4,7:7,5 | |
| 13058 chr22 22123507 . T G . PASS DP=48;SS=1;SSC=4;GPV=1.3341e-10;SPV=0.36773 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:13,13:10,8:3,5 0/1:.:22:9,13:4,8:5,5 | |
| 13059 chr22 22123808 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=5;GPV=2.9719e-11;SPV=0.25991 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:12,10:10,5 0/1:.:27:13,14:9,10:4,4 | |
| 13060 chr22 22124561 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=2.4283e-11;SPV=0.59285 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:10,6:14,10 0/1:.:35:21,14:6,7:15,7 | |
| 13061 chr22 22125395 . C A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=3.195e-13;SPV=0.83822 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:14,19:9,12:5,7 0/1:.:29:15,14:6,9:9,5 | |
| 13062 chr22 22125567 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=9;GPV=6.58e-14;SPV=0.11083 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:25,16:15,12:10,4 0/1:.:36:16,20:11,13:5,7 | |
| 13063 chr22 22126814 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=3.2317e-11;SPV=0.67062 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:6,10:13,6 0/1:.:30:17,13:8,5:9,8 | |
| 13064 chr22 22128059 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=3.0264e-07;SPV=0.91036 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:14,10:6,6:8,4 0/1:.:32:23,9:11,5:12,4 | |
| 13065 chr22 22128243 . A C . PASS DP=47;SS=1;SSC=1;GPV=1.9354e-07;SPV=0.64115 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:13,9:9,4:4,5 0/1:.:25:15,10:6,4:9,6 | |
| 13066 chr22 22128380 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=10;GPV=9.9959e-10;SPV=0.086254 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:21,11:12,4:9,7 0/1:.:25:11,14:6,9:5,5 | |
| 13067 chr22 22128520 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=8;GPV=5.9704e-09;SPV=0.14739 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:15,7:3,2:12,5 0/1:.:32:16,16:7,10:9,6 | |
| 13068 chr22 22130154 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=2;GPV=1.7118e-06;SPV=0.57356 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:18,8:10,2:8,6 0/1:.:28:19,9:9,5:10,4 | |
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| 13094 chr22 22140538 . G T . PASS DP=45;SS=1;SSC=1;GPV=6.8121e-15;SPV=0.63246 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:4,11:2,7:2,4 0/1:.:30:8,22:5,15:3,7 | |
| 13095 chr22 22141088 . G A . PASS DP=39;SS=1;SSC=0;GPV=2.9336e-07;SPV=0.91397 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:5,7:2,4:3,3 0/1:.:27:16,11:9,5:7,6 | |
| 13096 chr22 22141753 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=4.2444e-12;SPV=0.8825 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:9,14:6,8:3,6 0/1:.:33:17,16:11,6:6,10 | |
| 13097 chr22 22142491 . C G . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=1.1194e-06;SPV=0.86477 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:11,9:6,3:5,6 0/1:.:24:16,8:7,3:9,5 | |
| 13098 chr22 22142704 . C G . PASS DP=50;SS=1;SSC=1;GPV=1.5236e-09;SPV=0.78821 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:8,9:4,6:4,3 0/1:.:33:18,15:9,9:9,6 | |
| 13099 chr22 22143005 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=10;GPV=1.3284e-10;SPV=0.090532 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:22,9:14,4:8,5 0/1:.:40:21,19:13,10:8,9 | |
| 13100 chr22 22143100 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=4.8717e-12;SPV=0.53083 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:8,6:9,8 0/1:.:36:19,17:14,9:5,8 | |
| 13101 chr22 22143513 . G A . PASS DP=53;SS=1;SSC=1;GPV=3.9927e-08;SPV=0.673 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:13,9:6,4:7,5 0/1:.:31:19,12:7,5:12,7 | |
| 13102 chr22 22143981 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=8;GPV=2.783e-13;SPV=0.13005 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:7,6:9,7 0/1:.:32:12,20:6,12:6,8 | |
| 13103 chr22 22144548 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=2.2072e-13;SPV=0.92824 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:12,11:4,10 0/1:.:31:18,13:11,4:7,9 | |
| 13104 chr22 22144916 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=18;GPV=1;SPV=0.014588 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:25,14:9,5:16,9 0/1:.:29:10,19:5,9:5,10 | |
| 13105 chr22 22145708 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=1.5013e-16;SPV=0.36019 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:8,11:7,9 0/1:.:31:11,20:8,5:3,15 | |
| 13106 chr22 22146272 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=5.295e-10;SPV=0.85806 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:4,9:13,6 0/1:.:30:19,11:7,5:12,6 | |
| 13107 chr22 22147786 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=10;GPV=1.7985e-10;SPV=0.08887 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:17,8:5,2:12,6 0/1:.:36:17,19:7,9:10,10 | |
| 13108 chr22 22149240 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=5.2318e-13;SPV=0.89363 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:12,16:6,7:6,9 0/1:.:38:21,17:11,7:10,10 | |
| 13109 chr22 22149505 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=2.0968e-10;SPV=0.81831 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:6,9:11,6 0/1:.:31:19,12:8,8:11,4 | |
| 13110 chr22 22149888 . G T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=9.2302e-10;SPV=0.99802 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:8,15:4,10:4,5 0/1:.:33:23,10:15,6:8,4 | |
| 13111 chr22 22150100 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=9.9959e-10;SPV=0.56467 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:12,9:6,1:6,8 0/1:.:36:20,16:8,10:12,6 | |
| 13112 chr22 22151195 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=9.798e-13;SPV=0.78225 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:10,6:3,10 0/1:.:33:17,16:10,11:7,5 | |
| 13113 chr22 22152035 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.6571e-10;SPV=0.98406 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:6,10:8,8 0/1:.:28:19,9:6,5:13,4 | |
| 13114 chr22 22152176 . A C . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=2.2536e-12;SPV=0.55776 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:13,10:10,9 0/1:.:28:15,13:5,8:10,5 | |
| 13115 chr22 22152664 . C G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.6199e-12;SPV=0.92048 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:13,18:4,11:9,7 0/1:.:30:17,13:8,7:9,6 | |
| 13116 chr22 22154322 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=5.8079e-10;SPV=0.68087 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:8,10:8,6 0/1:.:19:10,9:8,4:2,5 | |
| 13117 chr22 22154715 . C G . PASS DP=63;SS=1;SSC=8;GPV=9.545e-12;SPV=0.13166 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:14,6:6,7 0/1:.:30:13,17:6,15:7,2 | |
| 13118 chr22 22156654 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=1.5567e-13;SPV=0.55512 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:10,7:11,11 0/1:.:36:19,17:7,9:12,8 | |
| 13119 chr22 22156977 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=9;GPV=1.4722e-11;SPV=0.10441 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:8,11:12,4 0/1:.:22:8,14:3,5:5,9 | |
| 13120 chr22 22157688 . G A . PASS DP=49;SS=1;SSC=1;GPV=4.6489e-10;SPV=0.66119 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:13,14:6,7:7,7 0/1:.:22:11,11:6,5:5,6 | |
| 13121 chr22 22158022 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.3489e-13;SPV=0.93189 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:5,9:8,11 0/1:.:31:17,14:8,10:9,4 | |
| 13122 chr22 22159034 . C A . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,11:0,10 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
| 13123 chr22 22159186 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=3.6448e-13;SPV=0.37155 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:5,2:9,11 0/1:.:36:16,20:10,13:6,7 | |
| 13124 chr22 22159740 . C G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=2.4857e-11;SPV=0.99733 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:10,18:5,12:5,6 0/1:.:34:23,11:14,8:9,3 | |
| 13125 chr22 22161277 . A G . PASS DP=49;SS=1;SSC=1;GPV=1.3761e-09;SPV=0.66909 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:13,13:5,4:8,9 0/1:.:23:12,11:3,4:9,7 | |
| 13126 chr22 22161533 . G A . PASS DP=46;SS=1;SSC=1;GPV=8.7676e-12;SPV=0.70497 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:9,15:5,12:4,3 0/1:.:22:9,13:8,9:1,4 | |
| 13127 chr22 22162633 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=2;GPV=4.3139e-18;SPV=0.61788 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:28,31:16,15:12,16 0/1:.:29:14,15:7,10:7,5 | |
| 13128 chr22 22163086 . C A . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=2.2803e-11;SPV=0.75876 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:9,12:15,6 0/1:.:32:20,12:9,6:11,6 | |
| 13129 chr22 22163945 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.0134e-13;SPV=0.73989 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:26,22:12,9:14,13 0/1:.:34:20,14:14,7:6,7 | |
| 13130 chr22 22164374 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=3.594e-10;SPV=0.90666 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:8,11:8,6 0/1:.:24:15,9:8,4:7,5 | |
| 13131 chr22 22165674 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=8.0845e-10;SPV=0.8168 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:8,10:15,6 0/1:.:30:20,10:13,5:7,5 | |
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| 13133 chr22 22166155 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=3;GPV=6.5669e-19;SPV=0.4502 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:12,13:7,10 0/1:.:41:17,24:4,11:13,13 | |
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| 13162 chr22 22185882 . T C . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.2355e-09;SPV=0.87784 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:9,12:4,5:5,7 0/1:.:27:15,12:7,4:8,8 | |
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| 13171 chr22 22191439 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=1.3291e-09;SPV=0.86723 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:12,11:7,4:5,7 0/1:.:38:24,14:10,6:14,8 | |
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| 13173 chr22 22195500 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=1.0372e-11;SPV=0.79881 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:17,9:8,10 0/1:.:33:21,12:12,6:9,6 | |
| 13174 chr22 22195540 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=2.6276e-20;SPV=0.52233 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:19,30:10,17:9,13 0/1:.:30:11,19:4,10:7,9 | |
| 13175 chr22 22195678 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=8.7026e-15;SPV=0.99416 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:16,25:4,16:12,9 0/1:.:37:24,13:8,4:16,9 | |
| 13176 chr22 22195939 . C G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.0134e-13;SPV=0.99672 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:11,11:7,13 0/1:.:40:28,12:11,7:17,5 | |
| 13177 chr22 22196050 . G C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,19:0,24 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 13178 chr22 22196110 . G T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.0284e-10;SPV=0.84488 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:12,5:8,12 0/1:.:30:19,11:11,6:8,5 | |
| 13179 chr22 22196360 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=7;GPV=3.0367e-13;SPV=0.19853 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:20,14:8,6:12,8 0/1:.:37:17,20:6,9:11,11 | |
| 13180 chr22 22197382 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,18:0,26 1/1:.:48:0,48:0,28:0,20 | |
| 13181 chr22 22197437 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,24:0,21 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 | |
| 13182 chr22 22197586 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=6.7818e-18;SPV=0.51825 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:12,12:9,12 0/1:.:38:17,21:13,9:4,12 | |
| 13183 chr22 22197714 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
| 13184 chr22 22198115 . A C . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,36:0,24 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 | |
| 13185 chr22 22198124 . G A . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,34:0,26 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 | |
| 13186 chr22 22198444 . A T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
| 13187 chr22 22198519 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,32:0,16 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
| 13188 chr22 22199264 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=5;GPV=3.673e-15;SPV=0.25295 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:15,14:8,4 0/1:.:39:18,21:10,8:8,13 | |
| 13189 chr22 22199444 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=1.7063e-13;SPV=0.96493 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:9,14:7,6 0/1:.:40:25,15:17,9:8,6 | |
| 13190 chr22 22199605 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=3.2981e-15;SPV=0.46202 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:11,11:13,11 0/1:.:33:16,17:7,9:9,8 | |
| 13191 chr22 22200764 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=2.2536e-12;SPV=0.55776 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:11,9:12,10 0/1:.:28:15,13:6,8:9,5 | |
| 13192 chr22 22201876 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=9;GPV=9.2302e-10;SPV=0.11131 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:21,12:12,8:9,4 0/1:.:23:10,13:4,5:6,8 | |
| 13193 chr22 22201974 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.4655e-13;SPV=0.87475 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:11,12:9,11 0/1:.:26:15,11:8,4:7,7 | |
| 13194 chr22 22203026 . T G . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,9:0,18 1/1:.:19:0,19:0,7:0,12 | |
| 13195 chr22 22203134 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,29:0,17 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 13196 chr22 22203182 . T A . PASS DP=74;SS=1;SSC=4;GPV=4.8851e-14;SPV=0.33087 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:15,11:8,8 0/1:.:32:15,17:6,9:9,8 | |
| 13197 chr22 22203406 . A C . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,21:0,29 1/1:.:39:0,39:0,26:0,13 | |
| 13198 chr22 22203557 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=4;GPV=1.8496e-17;SPV=0.3607 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:12,14:12,11 0/1:.:33:14,19:11,6:3,13 | |
| 13199 chr22 22203913 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=11;GPV=8.8612e-15;SPV=0.074176 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:12,9:10,9 0/1:.:29:10,19:3,10:7,9 | |
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| 13236 chr22 22217807 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=6;GPV=4.7649e-17;SPV=0.23606 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:4,12:15,9 0/1:.:33:12,21:10,11:2,10 | |
| 13237 chr22 22218550 . G C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.19e-16;SPV=0.87964 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:11,12:8,14 0/1:.:34:18,16:10,5:8,11 | |
| 13238 chr22 22218817 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.6904e-09;SPV=0.85487 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:15,8:10,10 0/1:.:22:15,7:8,4:7,3 | |
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| 13240 chr22 22220066 . G C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=4.5813e-10;SPV=0.85938 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:12,9:4,6 0/1:.:29:18,11:8,6:10,5 | |
| 13241 chr22 22220463 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=2;GPV=5.456e-15;SPV=0.51237 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:13,8:11,12 0/1:.:40:21,19:12,7:9,12 | |
| 13242 chr22 22223476 . A G . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=6.6622e-06;SPV=0.95687 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:12,10:5,3:7,7 0/1:.:20:15,5:7,2:8,3 | |
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| 13245 chr22 22224948 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=3.7283e-09;SPV=0.7083 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:14,10:10,6 0/1:.:22:14,8:8,3:6,5 | |
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| 13250 chr22 22231666 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,13:0,13 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
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| 13253 chr22 22233044 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,26:0,10 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
| 13254 chr22 22233778 . C G . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 1/1:.:13:0,13:0,5:0,8 | |
| 13255 chr22 22234091 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 13256 chr22 22234207 . T G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,28:0,20 1/1:.:24:0,24:0,12:0,12 | |
| 13257 chr22 22234220 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:18:0,18:0,6:0,12 | |
| 13258 chr22 22234458 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,29:0,22 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
| 13259 chr22 22234518 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
| 13260 chr22 22234624 . T G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,19:0,24 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 13261 chr22 22234722 . A C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
| 13262 chr22 22234843 . A C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 13263 chr22 22234999 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,28:0,18 1/1:.:28:0,28:0,11:0,17 | |
| 13264 chr22 22235016 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,30:0,17 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 | |
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| 13304 chr22 22243567 . A C . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.53012 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 1/1:.:44:1,43:0,23:1,20 | |
| 13305 chr22 22243795 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=7.2168e-14;SPV=0.96202 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:13,12:9,13 0/1:.:31:20,11:13,5:7,6 | |
| 13306 chr22 22244312 . T G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,25:0,21 1/1:.:19:0,19:0,14:0,5 | |
| 13307 chr22 22244331 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,18:0,25 1/1:.:24:0,24:0,15:0,9 | |
| 13308 chr22 22244470 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=5;GPV=2.2528e-17;SPV=0.26949 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:7,10:10,12 0/1:.:30:10,20:4,6:6,14 | |
| 13309 chr22 22244645 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=4;GPV=1.7027e-12;SPV=0.37429 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:12,11:9,6 0/1:.:29:14,15:9,7:5,8 | |
| 13310 chr22 22244803 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=7;GPV=1.0507e-11;SPV=0.1749 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:11,5:11,10 0/1:.:27:12,15:4,6:8,9 | |
| 13311 chr22 22244804 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=6;GPV=9.798e-13;SPV=0.21151 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:9,6:10,10 0/1:.:27:11,16:4,7:7,9 | |
| 13312 chr22 22245396 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,18:0,26 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 | |
| 13313 chr22 22246500 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,31:0,28 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
| 13314 chr22 22246881 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 | |
| 13315 chr22 22247403 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 | |
| 13316 chr22 22248357 . C G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,26:0,23 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
| 13317 chr22 22248613 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,12:0,29 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 13318 chr22 22248962 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.6045e-17;SPV=0.75206 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:11,14:9,12 0/1:.:35:17,18:10,11:7,7 | |
| 13319 chr22 22249507 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,24:0,24 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
| 13320 chr22 22250493 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,18:0,28 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
| 13321 chr22 22250552 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,22:0,29 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 13322 chr22 22251113 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,10:0,22 1/1:.:28:0,28:0,6:0,22 | |
| 13323 chr22 22251119 . T A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 1/1:.:26:0,26:0,5:0,21 | |
| 13324 chr22 22251434 . T C . PASS DP=24;SS=1;SSC=5;GPV=5.9538e-05;SPV=0.3 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,7:0,3:0,4 0/1:.:11:1,2:1,2:0,0 | |
| 13325 chr22 22251616 . A T . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,23:0,13 1/1:.:19:0,19:0,10:0,9 | |
| 13326 chr22 22252379 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,30:0,18 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 | |
| 13327 chr22 22252831 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 | |
| 13328 chr22 22253093 . G T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,11:0,19 1/1:.:29:0,29:0,12:0,17 | |
| 13329 chr22 22253573 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,18:0,10 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
| 13330 chr22 22253791 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,24:0,17 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 13331 chr22 22254337 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 | |
| 13332 chr22 22255031 . C A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,23:0,12 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
| 13333 chr22 22255060 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,26:0,14 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
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| 13335 chr22 22255223 . A C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,26:0,23 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
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| 13364 chr22 22296553 . T A . PASS DP=124;SS=1;SSC=1;GPV=4.1396e-05;SPV=0.65995 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:53,7:29,4:24,3 0/1:.:64:57,7:34,6:23,1 | |
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| 13366 chr22 22305873 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.2446e-15;SPV=0.9137 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:9,14:12,12 0/1:.:33:19,14:8,5:11,9 | |
| 13367 chr22 22306690 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=5;GPV=8.9568e-18;SPV=0.26339 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:7,12:18,12 0/1:.:36:15,21:6,11:9,10 | |
| 13368 chr22 22306816 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 | |
| 13369 chr22 22308721 . G T . PASS DP=73;SS=1;SSC=5;GPV=7.9203e-12;SPV=0.25941 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:22,13:16,5:6,8 0/1:.:38:20,18:10,12:10,6 | |
| 13370 chr22 22308722 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=7;GPV=2.1366e-11;SPV=0.18501 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:23,12:18,5:5,7 0/1:.:38:20,18:11,11:9,7 | |
| 13371 chr22 22309303 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 1/1:.:34:0,34:0,22:0,12 | |
| 13372 chr22 22310274 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=7.2383e-18;SPV=0.91289 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:14,25:9,15:5,10 0/1:.:37:18,19:6,12:12,7 | |
| 13373 chr22 22311853 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=3;GPV=9.6072e-33;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 1/1:.:29:1,28:0,12:1,16 | |
| 13374 chr22 22311995 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
| 13375 chr22 22312669 . C A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 | |
| 13376 chr22 22313441 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
| 13377 chr22 22313536 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=2;GPV=1.5052e-15;SPV=0.61485 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:30,24:14,13:16,11 0/1:.:39:22,17:11,7:11,10 | |
| 13378 chr22 22317491 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 | |
| 13379 chr22 22319600 . T A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,14:0,21 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 | |
| 13380 chr22 22319731 . A G . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,20:0,10 1/1:.:19:0,19:0,14:0,5 | |
| 13381 chr22 22320244 . C A . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=1.8424e-11;SPV=0.56225 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:10,9:8,8 0/1:.:24:12,12:5,6:7,6 | |
| 13382 chr22 22322051 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=7;GPV=1.4722e-11;SPV=0.17754 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:16,12:7,8:9,4 0/1:.:29:12,17:7,8:5,9 | |
| 13383 chr22 22323311 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=8.6835e-16;SPV=0.92854 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:17,24:10,11:7,13 0/1:.:36:20,16:10,9:10,7 | |
| 13384 chr22 22323540 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,23:0,28 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 | |
| 13385 chr22 22325761 . G C . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,18:0,9 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
| 13386 chr22 22326954 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,11:0,18 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 13387 chr22 22329940 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 | |
| 13388 chr22 22333120 . A T . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,6:0,5 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 | |
| 13389 chr22 22333609 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,14:0,9 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 | |
| 13390 chr22 22333754 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,11:0,9 1/1:.:33:0,33:0,22:0,11 | |
| 13391 chr22 22333761 . A C . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,9:0,8 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 | |
| 13392 chr22 22333854 . A T . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,4:0,12 1/1:.:33:0,33:0,21:0,12 | |
| 13393 chr22 22334436 . C T . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,10:0,6 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 13394 chr22 22336932 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=1;GPV=1.6045e-12;SPV=0.69953 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:8,13:2,5:6,8 0/1:.:29:12,17:8,7:4,10 | |
| 13395 chr22 22337262 . C G . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,12:0,7 1/1:.:23:0,23:0,12:0,11 | |
| 13396 chr22 22337378 . A G . PASS DP=40;SS=1;SSC=7;GPV=3.8741e-10;SPV=0.15872 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:8,7:3,3:5,4 0/1:.:25:8,17:5,14:3,3 | |
| 13397 chr22 22337740 . G C . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=2.2598e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,6:0,3 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 13398 chr22 22337742 . C G . PASS DP=34;SS=1;SSC=0;GPV=3.5146e-20;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,6:0,4 1/1:.:24:0,24:0,12:0,12 | |
| 13399 chr22 22338127 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,23:0,6 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
| 13400 chr22 22338716 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 | |
| 13401 chr22 22339941 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 | |
| 13402 chr22 22339960 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 | |
| 13403 chr22 22340029 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
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| 13443 chr22 22362390 . A G . PASS DP=49;SS=1;SSC=18;GPV=1;SPV=0.013811 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:15,6:10,4:5,2 0/1:.:28:10,18:8,7:2,11 | |
| 13444 chr22 22363084 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=1.5887e-13;SPV=0.83924 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:7,15:3,8:4,7 0/1:.:29:12,17:7,6:5,11 | |
| 13445 chr22 22363514 . A T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=7.7752e-12;SPV=0.98565 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:10,17:5,9:5,8 0/1:.:34:21,13:14,5:7,8 | |
| 13446 chr22 22363906 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=3.9143e-11;SPV=0.91464 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:9,13:4,5:5,8 0/1:.:34:19,15:8,5:11,10 | |
| 13447 chr22 22365687 . A G . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=1.1545e-10;SPV=0.90028 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:6,11:3,6:3,5 0/1:.:30:15,15:8,5:7,10 | |
| 13448 chr22 22366082 . A C . PASS DP=55;SS=1;SSC=9;GPV=8.49e-10;SPV=0.10409 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:17,9:11,3:6,6 0/1:.:29:13,16:9,7:4,9 | |
| 13449 chr22 22366243 . G C . PASS DP=43;SS=1;SSC=3;GPV=3.9871e-07;SPV=0.45166 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:10,6:6,4:4,2 0/1:.:27:15,12:10,5:5,7 | |
| 13450 chr22 22366347 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=9.2779e-11;SPV=0.79679 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:10,12:5,7:5,5 0/1:.:32:17,15:9,9:8,6 | |
| 13451 chr22 22366931 . C A . PASS DP=51;SS=1;SSC=6;GPV=1.6778e-09;SPV=0.24915 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:16,11:7,6:9,5 0/1:.:24:11,13:4,7:7,6 | |
| 13452 chr22 22367284 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=1.4722e-11;SPV=0.56152 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:12,12:7,6:5,6 0/1:.:33:16,17:9,7:7,10 | |
| 13453 chr22 22368114 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=1.8384e-09;SPV=0.95517 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:12,15:8,7:4,8 0/1:.:25:16,9:12,4:4,5 | |
| 13454 chr22 22368561 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=5.349e-11;SPV=0.97479 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:12,17:7,7:5,10 0/1:.:30:19,11:11,2:8,9 | |
| 13455 chr22 22369103 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=6;GPV=7.3303e-11;SPV=0.21026 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:13,10:5,7:8,3 0/1:.:29:12,17:7,10:5,7 | |
| 13456 chr22 22370026 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=1.3916e-15;SPV=0.92655 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:14,19:6,8:8,11 0/1:.:48:27,21:11,11:16,10 | |
| 13457 chr22 22370746 . T A . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.2446e-15;SPV=0.67375 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:11,11:11,12 0/1:.:35:18,17:11,11:7,6 | |
| 13458 chr22 22371125 . A C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=4.0755e-15;SPV=0.92547 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:8,11:10,11 0/1:.:41:24,17:14,7:10,10 | |
| 13459 chr22 22371876 . A C . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=2.6199e-12;SPV=0.74288 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:13,15:7,9:6,6 0/1:.:33:17,16:6,8:11,8 | |
| 13460 chr22 22372004 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
| 13461 chr22 22372241 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=7.0184e-11;SPV=0.9838 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:10,11:5,8 0/1:.:28:19,9:9,6:10,3 | |
| 13462 chr22 22372353 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=5.6308e-13;SPV=0.97451 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:4,7:12,12 0/1:.:43:28,15:19,9:9,6 | |
| 13463 chr22 22372735 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.4906e-14;SPV=0.95141 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:11,18:6,13:5,5 0/1:.:38:21,17:15,10:6,7 | |
| 13464 chr22 22373203 . G T . PASS DP=67;SS=1;SSC=5;GPV=6.6365e-15;SPV=0.26551 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:8,9:9,8 0/1:.:33:13,20:7,7:6,13 | |
| 13465 chr22 22373357 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,14:0,26 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 13466 chr22 22373536 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=7;GPV=7.3839e-17;SPV=0.18052 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:26,22:13,16:13,6 0/1:.:36:15,21:8,11:7,10 | |
| 13467 chr22 22373958 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=2.0525e-15;SPV=0.87207 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:16,25:5,15:11,10 0/1:.:26:13,13:9,6:4,7 | |
| 13468 chr22 22374294 . A T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 | |
| 13469 chr22 22374488 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=5;GPV=1.6514e-11;SPV=0.29951 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:13,6:4,8 0/1:.:27:12,15:7,8:5,7 | |
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| 13500 chr22 22387757 . G T . PASS DP=76;SS=1;SSC=7;GPV=7.7351e-17;SPV=0.16635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:8,11:16,13 0/1:.:28:10,18:4,5:6,13 | |
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| 13505 chr22 22388701 . G T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.8278e-16;SPV=0.99846 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:13,29:8,13:5,16 0/1:.:32:20,12:10,6:10,6 | |
| 13506 chr22 22388748 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.7425e-15;SPV=0.99849 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:12,26:7,12:5,14 0/1:.:33:21,12:10,8:11,4 | |
| 13507 chr22 22388888 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=1.2446e-15;SPV=0.58848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:8,14:13,7 0/1:.:38:19,19:12,13:7,6 | |
| 13508 chr22 22389098 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,10:0,17 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 13509 chr22 22389369 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 13510 chr22 22389444 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=1.0284e-10;SPV=0.63719 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:6,9:13,5 0/1:.:34:20,14:13,4:7,10 | |
| 13511 chr22 22389494 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=3.1677e-14;SPV=0.69555 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:13,18:7,6:6,12 0/1:.:31:14,17:4,14:10,3 | |
| 13512 chr22 22389591 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 1/1:.:36:0,36:0,28:0,8 | |
| 13513 chr22 22389616 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=4;GPV=7.3575e-14;SPV=0.32661 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:15,13:6,7:9,6 0/1:.:40:18,22:12,15:6,7 | |
| 13514 chr22 22389885 . T A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 1/1:.:50:0,50:0,19:0,31 | |
| 13515 chr22 22390142 . T G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=7.3738e-16;SPV=0.83661 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:13,21:11,11:2,10 0/1:.:34:16,18:3,7:13,11 | |
| 13516 chr22 22390223 . C A . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=7.7752e-12;SPV=0.54542 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:7,5:7,8 0/1:.:34:17,17:8,3:9,14 | |
| 13517 chr22 22390359 . G C . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=8.4623e-14;SPV=0.94023 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:9,20:3,9:6,11 0/1:.:25:12,13:8,6:4,7 | |
| 13518 chr22 22390468 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=3.7062e-14;SPV=0.88476 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:16,24:12,15:4,9 0/1:.:23:12,11:8,6:4,5 | |
| 13519 chr22 22391236 . T G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 13520 chr22 22391419 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=3.9286e-14;SPV=0.98355 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:13,21:8,10:5,11 0/1:.:38:23,15:11,8:12,7 | |
| 13521 chr22 22391604 . C G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.4906e-14;SPV=0.91004 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:14,20:6,13:8,7 0/1:.:33:18,15:6,9:12,6 | |
| 13522 chr22 22391890 . T A . PASS DP=53;SS=1;SSC=12;GPV=7.091e-10;SPV=0.053424 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:15,7:5,3:10,4 0/1:.:31:13,18:5,12:8,6 | |
| 13523 chr22 22391931 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 1/1:.:30:0,30:0,18:0,12 | |
| 13524 chr22 22392247 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.6242e-17;SPV=0.84395 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:12,19:7,13:5,6 0/1:.:44:21,23:13,10:8,13 | |
| 13525 chr22 22392670 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,12:0,20 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 | |
| 13526 chr22 22392775 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 | |
| 13527 chr22 22392961 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=3;GPV=3.594e-10;SPV=0.46082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:13,6:4,7 0/1:.:27:14,13:9,9:5,4 | |
| 13528 chr22 22392982 . A C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 1/1:.:27:0,27:0,17:0,10 | |
| 13529 chr22 22393151 . A T . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=4.2852e-10;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,7:0,4:0,3 1/1:.:25:0,10:0,3:0,7 | |
| 13530 chr22 22393276 . T G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,23:0,12 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
| 13531 chr22 22393339 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=1.6574e-14;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:10,10:8,7 0/1:.:39:19,20:12,12:7,8 | |
| 13532 chr22 22393474 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=8;GPV=4.5064e-15;SPV=0.1367 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:25,17:15,8:10,9 0/1:.:40:18,22:10,13:8,9 | |
| 13533 chr22 22393522 . C G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,23:0,21 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 | |
| 13534 chr22 22393570 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=5.0108e-11;SPV=0.65874 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:8,7:10,6 0/1:.:40:24,16:9,9:15,7 | |
| 13535 chr22 22393734 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
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| 13578 chr22 22428058 . G A . PASS DP=53;SS=1;SSC=5;GPV=1.5031e-08;SPV=0.27871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:15,8:8,4:7,4 0/1:.:30:16,14:7,8:9,6 | |
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| 13580 chr22 22430551 . G C . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=1.3916e-15;SPV=0.54473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:14,10:7,10 0/1:.:40:20,20:13,10:7,10 | |
| 13581 chr22 22430644 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,25:0,23 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 | |
| 13582 chr22 22430758 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=12;GPV=1.0137e-17;SPV=0.054036 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:16,9:8,13 0/1:.:32:10,22:3,14:7,8 | |
| 13583 chr22 22430970 . A C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 1/1:.:40:0,40:0,26:0,14 | |
| 13584 chr22 22432072 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=5;GPV=3.879e-12;SPV=0.31161 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:29,18:11,9:18,9 0/1:.:30:16,14:9,7:7,7 | |
| 13585 chr22 22435724 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=3.1151e-17;SPV=0.79821 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:25,29:11,14:14,15 0/1:.:32:17,15:5,8:12,7 | |
| 13586 chr22 22436273 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=9;GPV=2.2591e-14;SPV=0.10257 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:15,14:8,7:7,7 0/1:.:31:10,21:5,10:5,11 | |
| 13587 chr22 22439182 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=2.7171e-10;SPV=0.85672 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:11,13:4,8:7,5 0/1:.:30:17,13:11,7:6,6 | |
| 13588 chr22 22439773 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,25:0,17 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 | |
| 13589 chr22 22446352 . A T . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=3.0926e-11;SPV=0.95049 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:10,16:5,8:5,8 0/1:.:28:16,12:7,4:9,8 | |
| 13590 chr22 22447791 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=5;GPV=1.7439e-13;SPV=0.30865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:18,16:7,7:11,9 0/1:.:32:14,18:5,6:9,12 | |
| 13591 chr22 22452952 . C T . PASS DP=29;SS=1;SSC=0;GPV=5.8193e-05;SPV=0.80203 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:7,6:3,4:4,2 0/1:.:16:10,6:7,4:3,2 | |
| 13592 chr22 22453458 . C T . PASS DP=49;SS=1;SSC=2;GPV=1.3761e-09;SPV=0.53449 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:7,6:2,3:5,3 0/1:.:36:18,18:11,9:7,9 | |
| 13593 chr22 22458070 . T C . PASS DP=52;SS=1;SSC=5;GPV=7.3303e-11;SPV=0.28966 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:14,12:5,8:9,4 0/1:.:26:11,15:6,6:5,9 | |
| 13594 chr22 22465392 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=4;GPV=4.1337e-13;SPV=0.39198 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:8,11:10,6 0/1:.:29:13,16:8,6:5,10 | |
| 13595 chr22 22465681 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=2.0452e-11;SPV=0.48632 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:14,12:4,4:10,8 0/1:.:34:17,17:6,6:11,11 | |
| 13596 chr22 22470938 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=1.9973e-11;SPV=0.41865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:26,17:10,8:16,9 0/1:.:29:16,13:7,4:9,9 | |
| 13597 chr22 22476281 . G T . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=4.5813e-10;SPV=0.75891 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:5,3:14,13 0/1:.:25:15,10:6,2:9,8 | |
| 13598 chr22 22476744 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=5.0202e-14;SPV=0.62124 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:16,15:10,5 0/1:.:40:23,17:15,11:8,6 | |
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| 13600 chr22 22477951 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=6.4366e-11;SPV=0.8876 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:6,10:10,7 0/1:.:28:17,11:13,7:4,4 | |
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| 13631 chr22 22498420 . T A . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=5.6308e-13;SPV=0.58171 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:11,7:15,13 0/1:.:32:18,14:12,8:6,6 | |
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| 13636 chr22 22501262 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.8765e-12;SPV=0.89369 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:11,14:6,5 0/1:.:32:19,13:11,7:8,6 | |
| 13637 chr22 22501615 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=5;GPV=4.4296e-19;SPV=0.30468 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:28,30:15,18:13,12 0/1:.:30:12,18:9,10:3,8 | |
| 13638 chr22 22502059 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=2.5259e-14;SPV=0.81183 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:5,9:13,10 0/1:.:41:23,18:9,11:14,7 | |
| 13639 chr22 22503437 . C G . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=8.8662e-16;SPV=0.71064 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:15,9:8,13 0/1:.:42:23,19:13,13:10,6 | |
| 13640 chr22 22504088 . A T . PASS DP=71;SS=1;SSC=4;GPV=3.6893e-16;SPV=0.33188 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:9,14:9,6 0/1:.:33:13,20:6,11:7,9 | |
| 13641 chr22 22504803 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=1.973e-16;SPV=0.53735 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:13,16:11,8 0/1:.:35:17,18:6,9:11,9 | |
| 13642 chr22 22504967 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=6.4956e-13;SPV=0.83407 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:8,5:8,13 0/1:.:34:19,15:7,5:12,10 | |
| 13643 chr22 22505080 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=7.0292e-13;SPV=0.99617 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:12,10:7,13 0/1:.:39:28,11:15,6:13,5 | |
| 13644 chr22 22506261 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=5.4147e-14;SPV=0.79476 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:8,7:11,13 0/1:.:36:20,16:12,10:8,6 | |
| 13645 chr22 22507208 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=2.4655e-13;SPV=0.55446 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:10,9:10,10 0/1:.:30:15,15:6,9:9,6 | |
| 13646 chr22 22507315 . C A . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=5.88e-11;SPV=0.41107 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:10,6:8,8 0/1:.:28:14,14:10,5:4,9 | |
| 13647 chr22 22508495 . C G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=4.6708e-19;SPV=0.79451 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:18,28:7,18:11,10 0/1:.:35:16,19:8,13:8,6 | |
| 13648 chr22 22509111 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.049503 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:12,6:10,9 0/1:.:28:10,18:4,11:6,7 | |
| 13649 chr22 22509461 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=2.133e-08;SPV=0.94424 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:9,9:8,5 0/1:.:28:20,8:12,4:8,4 | |
| 13650 chr22 22509657 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=5.4147e-14;SPV=0.99326 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:16,24:6,9:10,15 0/1:.:35:23,12:14,5:9,7 | |
| 13651 chr22 22510340 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-16;SPV=0.80236 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:8,10:7,10 0/1:.:40:20,20:10,12:10,8 | |
| 13652 chr22 22511526 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=3;GPV=5.349e-11;SPV=0.45594 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:10,7:7,7 0/1:.:28:14,14:9,6:5,8 | |
| 13653 chr22 22512450 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 13654 chr22 22512966 . A C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,24:0,17 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 13655 chr22 22512975 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 13656 chr22 22513191 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,30:0,20 1/1:.:34:0,34:0,12:0,22 | |
| 13657 chr22 22513378 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,16:0,25 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
| 13658 chr22 22513632 . C G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 | |
| 13659 chr22 22513693 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 | |
| 13660 chr22 22513766 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,13:0,19 1/1:.:35:0,35:0,14:0,21 | |
| 13661 chr22 22513804 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,7:0,27 1/1:.:29:0,29:0,12:0,17 | |
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| 13663 chr22 22514169 . T G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,26:0,18 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
| 13664 chr22 22514173 . C G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,30:0,19 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
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| 13666 chr22 22514452 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 | |
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| 13693 chr22 22518859 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 1/1:.:28:0,28:0,18:0,10 | |
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| 13704 chr22 22522731 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 | |
| 13705 chr22 22522838 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
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| 13709 chr22 22523307 . G T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 | |
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| 13711 chr22 22524139 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=3.5024e-11;SPV=0.7537 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:7,8:14,10 0/1:.:27:16,11:6,2:10,9 | |
| 13712 chr22 22524402 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=4;GPV=6.2104e-12;SPV=0.34368 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:7,5:10,10 0/1:.:27:12,15:5,9:7,6 | |
| 13713 chr22 22524909 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=3;GPV=3.3305e-17;SPV=0.4261 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:6,10:10,11 0/1:.:34:13,21:7,13:6,8 | |
| 13714 chr22 22526179 . A C . PASS DP=65;SS=1;SSC=6;GPV=4.9668e-14;SPV=0.25112 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:10,11:8,6 0/1:.:30:12,18:7,10:5,8 | |
| 13715 chr22 22526933 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=3;GPV=2.8183e-16;SPV=0.41583 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:11,10:11,13 0/1:.:32:14,18:10,5:4,13 | |
| 13716 chr22 22527322 . T G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=5.0221e-16;SPV=0.79786 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:7,8:8,13 0/1:.:37:18,19:10,7:8,12 | |
| 13717 chr22 22527783 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=9.3121e-14;SPV=0.59753 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:13,8:9,14 0/1:.:26:13,13:8,7:5,6 | |
| 13718 chr22 22527901 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=2.3916e-18;SPV=0.9486 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:11,29:6,14:5,15 0/1:.:25:11,14:8,8:3,6 | |
| 13719 chr22 22529543 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=9;GPV=2.4531e-16;SPV=0.12107 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:11,10:10,8 0/1:.:37:14,23:7,13:7,10 | |
| 13720 chr22 22529851 . G T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.8389e-15;SPV=0.82363 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:12,19:4,12:8,7 0/1:.:34:16,18:13,10:3,8 | |
| 13721 chr22 22530275 . A T . PASS DP=38;SS=1;SSC=10;GPV=2.5665e-10;SPV=0.080163 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:11,12:8,8:3,4 1/1:.:15:3,12:3,9:0,3 | |
| 13722 chr22 22530778 . T A . PASS DP=89;SS=1;SSC=3;GPV=8.1443e-24;SPV=0.48666 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:20,34:10,15:10,19 0/1:.:35:12,23:9,11:3,12 | |
| 13723 chr22 22531058 . G T . PASS DP=84;SS=1;SSC=4;GPV=1.9033e-15;SPV=0.35591 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:8,9:19,13 0/1:.:35:17,18:9,6:8,12 | |
| 13724 chr22 22531494 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=4.0755e-11;SPV=0.8226 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:10,9:11,9 0/1:.:29:18,11:13,6:5,5 | |
| 13725 chr22 22531638 . C A . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=1.0182e-13;SPV=0.63888 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:12,15:8,8:4,7 0/1:.:35:16,19:9,14:7,5 | |
| 13726 chr22 22532218 . T A . PASS DP=53;SS=1;SSC=7;GPV=2.4512e-10;SPV=0.16932 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:12,8:7,6 0/1:.:20:8,12:5,9:3,3 | |
| 13727 chr22 22532908 . A G . PASS DP=52;SS=1;SSC=5;GPV=7.5157e-12;SPV=0.26652 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:6,5:8,9 0/1:.:24:9,15:4,7:5,8 | |
| 13728 chr22 22533067 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=12;GPV=1.3846e-12;SPV=0.051497 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:19,11:11,9:8,2 0/1:.:35:14,21:10,12:4,9 | |
| 13729 chr22 22533303 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=2;GPV=2.5559e-17;SPV=0.51395 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:27,24:15,13:12,11 0/1:.:43:22,21:13,11:9,10 | |
| 13730 chr22 22534431 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=2;GPV=1.0345e-10;SPV=0.5565 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:15,14:6,4:9,10 0/1:.:26:13,13:5,5:8,8 | |
| 13731 chr22 22535121 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=1.1758e-13;SPV=0.5944 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:12,14:9,9:3,5 0/1:.:37:17,20:9,8:8,12 | |
| 13732 chr22 22535659 . T G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=2.0968e-10;SPV=0.96424 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:13,13:4,5 0/1:.:28:19,9:9,5:10,4 | |
| 13733 chr22 22535987 . C A . PASS DP=56;SS=1;SSC=3;GPV=3.9143e-11;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:8,8:8,7 0/1:.:25:12,13:10,4:2,9 | |
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| 13778 chr22 22583673 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=2.098e-14;SPV=0.71504 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:10,15:6,5 0/1:.:31:15,16:9,5:6,11 | |
| 13779 chr22 22583925 . A C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=1.4168e-09;SPV=0.87261 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:8,4:10,11 0/1:.:29:19,10:11,4:8,6 | |
| 13780 chr22 22584393 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=5.5047e-12;SPV=0.90933 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:11,16:6,7:5,9 0/1:.:31:17,14:8,6:9,8 | |
| 13781 chr22 22585481 . T C . PASS DP=48;SS=1;SSC=5;GPV=2.8521e-08;SPV=0.30472 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:16,10:10,6:6,4 0/1:.:22:11,11:8,5:3,6 | |
| 13782 chr22 22586227 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=9;GPV=1.2401e-12;SPV=0.10506 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:18,12:10,5:8,7 0/1:.:34:14,20:9,8:5,12 | |
| 13783 chr22 22586672 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=6.2003e-16;SPV=0.60618 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:10,14:7,5:3,9 0/1:.:43:18,25:9,12:9,13 | |
| 13784 chr22 22586797 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=9;GPV=5.4755e-14;SPV=0.11219 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:11,12:5,7:6,5 0/1:.:29:8,21:4,16:4,5 | |
| 13785 chr22 22586995 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=1.8643e-13;SPV=0.89045 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:13,9:5,10 0/1:.:40:24,16:18,7:6,9 | |
| 13786 chr22 22589245 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=1.6571e-10;SPV=0.6528 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:7,9:12,7 0/1:.:25:14,11:5,8:9,3 | |
| 13787 chr22 22589681 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=1.2401e-12;SPV=0.6017 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:11,13:9,7 0/1:.:24:12,12:9,7:3,5 | |
| 13788 chr22 22589770 . G T . PASS DP=87;SS=1;SSC=3;GPV=3.0665e-16;SPV=0.48468 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:28,25:14,11:14,14 0/1:.:34:17,17:8,9:9,8 | |
| 13789 chr22 22592684 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=1.3287e-16;SPV=0.55569 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:8,14:9,8 0/1:.:33:14,19:7,7:7,12 | |
| 13790 chr22 22596996 . T G . PASS DP=76;SS=1;SSC=5;GPV=7.7351e-17;SPV=0.29635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:9,12:11,9 0/1:.:35:14,21:7,6:7,15 | |
| 13791 chr22 22597138 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=5;GPV=2.1236e-16;SPV=0.26284 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:6,4:14,16 0/1:.:35:14,21:9,13:5,8 | |
| 13792 chr22 22597433 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=4;GPV=4.1537e-13;SPV=0.32429 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:10,12:8,9 0/1:.:17:6,11:3,6:3,5 | |
| 13793 chr22 22598706 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 | |
| 13794 chr22 22599540 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=3.0519e-14;SPV=0.63534 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:14,14:11,8 0/1:.:33:18,15:6,7:12,8 | |
| 13795 chr22 22599689 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.0669e-14;SPV=0.95914 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:23,27:9,15:14,12 0/1:.:30:19,11:13,4:6,7 | |
| 13796 chr22 22600250 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=9;GPV=2.4039e-14;SPV=0.1173 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:9,5:9,9 0/1:.:36:14,22:7,8:7,14 | |
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| 13798 chr22 22601030 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=3.3771e-18;SPV=0.69652 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:15,25:6,14:9,11 0/1:.:32:13,19:8,11:5,8 | |
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| 13835 chr22 22617747 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.8081e-15;SPV=0.87082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:12,13:5,10 0/1:.:34:18,16:11,9:7,7 | |
| 13836 chr22 22617803 . C G . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=8.637e-13;SPV=0.53871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:8,9:8,8 0/1:.:28:13,15:10,9:3,6 | |
| 13837 chr22 22617949 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=11;GPV=1.8221e-14;SPV=0.076966 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:30,17:13,7:17,10 0/1:.:39:18,21:9,13:9,8 | |
| 13838 chr22 22618476 . A C . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=3.6641e-16;SPV=0.55326 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:7,9:11,10 0/1:.:42:20,22:7,13:13,9 | |
| 13839 chr22 22619137 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=10;GPV=5.5248e-15;SPV=0.083436 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:20,14:10,7:10,7 0/1:.:40:16,24:8,12:8,12 | |
| 13840 chr22 22619138 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=10;GPV=1.8081e-15;SPV=0.08458 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:11,7:9,8 0/1:.:39:15,24:8,12:7,12 | |
| 13841 chr22 22619283 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 1/1:.:45:0,45:0,22:0,23 | |
| 13842 chr22 22620135 . G C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=7.6248e-11;SPV=0.98773 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:10,12:5,7 0/1:.:29:20,9:8,4:12,5 | |
| 13843 chr22 22620305 . A T . PASS DP=74;SS=1;SSC=5;GPV=4.034e-13;SPV=0.27615 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:11,9:14,9 0/1:.:31:15,16:5,10:10,6 | |
| 13844 chr22 22620614 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=3;GPV=1.9033e-15;SPV=0.42159 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:13,13:11,7 0/1:.:40:20,20:11,10:9,10 | |
| 13845 chr22 22620799 . T C . PASS DP=52;SS=1;SSC=3;GPV=2.38e-11;SPV=0.47463 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:4,7:10,8 0/1:.:23:10,13:3,2:7,11 | |
| 13846 chr22 22621003 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=3.2811e-12;SPV=0.45071 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:12,7:5,8 0/1:.:31:15,16:7,8:8,8 | |
| 13847 chr22 22621051 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 1/1:.:26:0,26:0,16:0,10 | |
| 13848 chr22 22621120 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=2.3553e-09;SPV=0.43928 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:16,11:11,5:5,6 0/1:.:28:15,13:9,11:6,2 | |
| 13849 chr22 22621411 . T C . PASS DP=42;SS=1;SSC=2;GPV=0.00023046;SPV=0.55682 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:18,6:14,4:4,2 0/1:.:18:13,5:10,2:3,3 | |
| 13850 chr22 22622267 . C G . PASS DP=46;SS=1;SSC=2;GPV=0.0028033;SPV=0.59799 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:20,4:9,2:11,2 0/1:.:22:18,4:9,3:9,1 | |
| 13851 chr22 22622648 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=7.5673e-13;SPV=0.70344 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:9,8:4,8 0/1:.:31:15,16:10,8:5,8 | |
| 13852 chr22 22623118 . G T . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=6.4394e-10;SPV=0.56018 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:11,6:9,7 0/1:.:32:19,13:6,7:13,6 | |
| 13853 chr22 22623392 . C T . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=8.7917e-10;SPV=0.95744 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:1,8:1,6:0,2 0/1:.:27:6,13:5,10:1,3 | |
| 13854 chr22 22623750 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=1.7063e-13;SPV=0.57002 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:11,6:8,10 0/1:.:41:22,19:11,6:11,13 | |
| 13855 chr22 22623960 . T A . PASS DP=40;SS=1;SSC=3;GPV=3.8741e-10;SPV=0.47475 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:9,12:5,8:4,4 0/1:.:19:7,12:3,7:4,5 | |
| 13856 chr22 22624117 . A G . PASS DP=50;SS=1;SSC=3;GPV=1.2104e-08;SPV=0.41383 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:16,11:7,3:9,8 0/1:.:23:12,11:4,5:8,6 | |
| 13857 chr22 22624759 . G T . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=4.2971e-18;SPV=0.66821 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:21,28:10,14:11,14 0/1:.:31:14,17:7,6:7,11 | |
| 13858 chr22 22625316 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.7922e-12;SPV=0.97588 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:8,16:4,14:4,2 0/1:.:34:19,15:11,7:8,8 | |
| 13859 chr22 22626114 . T A . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=3.3933e-17;SPV=0.6349 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:15,26:10,15:5,11 0/1:.:24:9,15:5,6:4,9 | |
| 13860 chr22 22626115 . T A . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.1656e-17;SPV=0.66126 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:15,27:10,15:5,12 0/1:.:24:9,15:5,5:4,10 | |
| 13861 chr22 22626523 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=3;GPV=9.2779e-11;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:7,8:9,7 0/1:.:23:11,12:8,5:3,7 | |
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| 13863 chr22 22626757 . C G . PASS DP=68;SS=1;SSC=8;GPV=2.4039e-14;SPV=0.1542 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:10,10:10,7 0/1:.:31:12,19:7,12:5,7 | |
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| 13911 chr22 22639357 . G C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=4.1158e-11;SPV=0.85426 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:26,17:14,9:12,8 0/1:.:42:29,13:13,8:16,5 | |
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| 13913 chr22 22639572 . C T . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=4.1329e-14;SPV=0.97825 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:30,26:15,10:15,16 0/1:.:42:30,12:12,8:18,4 | |
| 13914 chr22 22640556 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=2;GPV=5.537e-13;SPV=0.55169 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:32,19:12,10:20,9 0/1:.:42:26,16:10,9:16,7 | |
| 13915 chr22 22640901 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 1/1:.:25:0,25:0,9:0,16 | |
| 13916 chr22 22641381 . A C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,23:0,19 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
| 13917 chr22 22641551 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 13918 chr22 22642832 . C G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,25:0,22 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 13919 chr22 22642972 . G C . PASS DP=102;SS=1;SSC=1;GPV=6.6983e-18;SPV=0.68912 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:30,27:13,12:17,15 0/1:.:45:25,20:8,9:17,11 | |
| 13920 chr22 22644135 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=3.1311e-39;SPV=0.92349 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:1,41:1,10:0,31 1/1:.:32:2,30:2,16:0,14 | |
| 13921 chr22 22644263 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=1.7063e-13;SPV=0.91653 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:9,13:9,7 0/1:.:38:23,15:12,7:11,8 | |
| 13922 chr22 22644293 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 | |
| 13923 chr22 22645054 . G T . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=7.9107e-15;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,11:0,4 1/1:.:10:0,10:0,9:0,1 | |
| 13924 chr22 22645128 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,21:0,6 1/1:.:26:0,26:0,23:0,3 | |
| 13925 chr22 22645223 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=1.4429e-23;SPV=0.86896 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:4,23:4,17:0,6 1/1:.:35:8,27:8,22:0,5 | |
| 13926 chr22 22645295 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=2;GPV=2.0985e-15;SPV=0.62526 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:11,7:11,13 0/1:.:43:23,20:17,11:6,9 | |
| 13927 chr22 22645518 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=3;GPV=1.2269e-12;SPV=0.49672 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:9,9:10,5 0/1:.:42:23,19:10,12:13,7 | |
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| 13929 chr22 22646279 . T C . PASS DP=29;SS=1;SSC=0;GPV=3.3259e-17;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,1:0,16 1/1:.:12:0,12:0,0:0,12 | |
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| 13984 chr22 22691195 . G C . PASS DP=69;SS=1;SSC=7;GPV=2.4655e-13;SPV=0.19882 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:25,20:14,10:11,10 0/1:.:24:10,14:5,2:5,12 | |
| 13985 chr22 22691506 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=9;GPV=1.7922e-12;SPV=0.10591 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:11,7:9,10 0/1:.:21:7,14:5,11:2,3 | |
| 13986 chr22 22691840 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=11;GPV=5.8009e-12;SPV=0.069957 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:25,14:10,6:15,8 0/1:.:30:13,17:6,6:7,11 | |
| 13987 chr22 22692174 . G C . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=6.5441e-13;SPV=0.73416 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:25,20:10,10:15,10 0/1:.:35:21,14:9,7:12,7 | |
| 13988 chr22 22692340 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=5.6945e-14;SPV=0.8247 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:10,8:6,13 0/1:.:29:15,14:6,7:9,7 | |
| 13989 chr22 22693254 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=3.2079e-13;SPV=0.94239 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:28,25:14,14:14,11 0/1:.:31:21,10:10,7:11,3 | |
| 13990 chr22 22693873 . A C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,33:0,18 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
| 13991 chr22 22694545 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=10;GPV=1.02e-15;SPV=0.087394 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:8,7:13,12 0/1:.:30:10,20:4,12:6,8 | |
| 13992 chr22 22694791 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=1.0404e-13;SPV=0.55503 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:12,12:9,8 0/1:.:30:15,15:9,10:6,5 | |
| 13993 chr22 22694840 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,24:0,23 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 | |
| 13994 chr22 22694853 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,25:0,24 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 | |
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| 13996 chr22 22695993 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=9;GPV=2.2803e-11;SPV=0.10085 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:24,11:15,8:9,3 0/1:.:39:20,19:11,11:9,8 | |
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| 14025 chr22 22706396 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 | |
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| 14034 chr22 22707740 . T C . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=0.0060363;SPV=0.86204 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:16,4:9,0:7,4 0/1:.:24:21,3:17,1:4,2 | |
| 14035 chr22 22707998 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
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| 14048 chr22 22709664 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
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| 14053 chr22 22710781 . G T . PASS DP=63;SS=1;SSC=9;GPV=3.4211e-15;SPV=0.10223 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:10,8:7,9 0/1:.:29:9,20:6,10:3,10 | |
| 14054 chr22 22711950 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:41:0,41:0,24:0,17 | |
| 14055 chr22 22712129 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=3;GPV=1.4168e-09;SPV=0.45015 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:24,15:11,9:13,6 0/1:.:23:13,10:6,4:7,6 | |
| 14056 chr22 22712431 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=3;GPV=1.8643e-13;SPV=0.43966 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:15,14:12,7 0/1:.:29:15,14:7,4:8,10 | |
| 14057 chr22 22712846 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=3.0926e-11;SPV=0.85478 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:14,18:4,5:10,13 0/1:.:28:12,10:2,5:10,5 | |
| 14058 chr22 22713267 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 1/1:.:36:0,36:0,24:0,12 | |
| 14059 chr22 22713596 . G T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
| 14060 chr22 22713959 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 | |
| 14061 chr22 22713977 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 | |
| 14062 chr22 22714926 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
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| 14064 chr22 22716135 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 1/1:.:42:0,42:0,30:0,12 | |
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| 14117 chr22 22746191 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,21:0,24 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 | |
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| 14120 chr22 22747024 . A T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,31:0,22 1/1:.:28:0,28:0,19:0,9 | |
| 14121 chr22 22747049 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,28:0,20 1/1:.:31:0,31:0,21:0,10 | |
| 14122 chr22 22747253 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 14123 chr22 22747509 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,24:0,22 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
| 14124 chr22 22747519 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:32:0,32:0,13:0,19 | |
| 14125 chr22 22748182 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 14126 chr22 22748204 . G T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 | |
| 14127 chr22 22748430 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:33:0,33:0,21:0,12 | |
| 14128 chr22 22748758 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 14129 chr22 22749193 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 | |
| 14130 chr22 22749196 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 | |
| 14131 chr22 22749673 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,12:0,22 1/1:.:18:0,18:0,11:0,7 | |
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| 14133 chr22 22749868 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
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| 14187 chr22 22765045 . C T . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,7:0,19 1/1:.:18:0,18:0,12:0,6 | |
| 14188 chr22 22765090 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 14189 chr22 22765193 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 1/1:.:25:0,25:0,10:0,15 | |
| 14190 chr22 22765302 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 1/1:.:24:0,24:0,8:0,16 | |
| 14191 chr22 22765422 . G C . PASS DP=30;SS=1;SSC=0;GPV=8.4556e-18;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,4:0,12 1/1:.:14:0,14:0,6:0,8 | |
| 14192 chr22 22765493 . T G . PASS DP=31;SS=1;SSC=0;GPV=2.1486e-18;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,7:0,15 1/1:.:9:0,9:0,5:0,4 | |
| 14193 chr22 22765528 . A C . PASS DP=28;SS=1;SSC=2;GPV=2.3037e-06;SPV=0.60362 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:9,10:8,1:1,9 0/1:.:9:4,5:4,1:0,4 | |
| 14194 chr22 22765529 . G A . PASS DP=31;SS=1;SSC=2;GPV=1.1154e-07;SPV=0.59668 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:9,12:8,1:1,11 0/1:.:10:4,6:4,1:0,5 | |
| 14195 chr22 22765763 . C T . PASS DP=38;SS=1;SSC=6;GPV=1.407e-05;SPV=0.25076 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:16,7:5,4:11,3 0/1:.:15:8,7:2,2:6,5 | |
| 14196 chr22 22766062 . A G . PASS DP=26;SS=1;SSC=0;GPV=2.0165e-15;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,12:0,3 1/1:.:11:0,11:0,8:0,3 | |
| 14197 chr22 22766136 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,24:0,8 1/1:.:19:0,19:0,14:0,5 | |
| 14198 chr22 22766301 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 1/1:.:31:0,31:0,22:0,9 | |
| 14199 chr22 22766356 . A C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 1/1:.:41:0,41:0,29:0,12 | |
| 14200 chr22 22766446 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,24:0,19 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
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| 14202 chr22 22767102 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=1.0222e-17;SPV=0.50795 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:9,13:11,8 0/1:.:45:21,24:7,14:14,10 | |
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| 14229 chr22 22796993 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=5.7384e-17;SPV=0.85209 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:11,18:10,9 0/1:.:34:18,16:11,10:7,6 | |
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| 14252 chr22 22818799 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 1/1:.:20:0,20:0,13:0,7 | |
| 14253 chr22 22818805 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,27:0,16 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 | |
| 14254 chr22 22820272 . T G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,26:0,15 1/1:.:32:0,32:0,21:0,11 | |
| 14255 chr22 22821823 . T A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 | |
| 14256 chr22 22821893 . C A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 14257 chr22 22823643 . T C . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 1/1:.:20:0,20:0,8:0,12 | |
| 14258 chr22 22823764 . A C . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,12:0,7 1/1:.:13:0,13:0,11:0,2 | |
| 14259 chr22 22824726 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 1/1:.:20:0,20:0,10:0,10 | |
| 14260 chr22 22825895 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 | |
| 14261 chr22 22826360 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 | |
| 14262 chr22 22826381 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,21:0,9 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
| 14263 chr22 22827408 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 1/1:.:39:0,39:0,13:0,26 | |
| 14264 chr22 22827549 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,16:0,11 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 | |
| 14265 chr22 22829095 . A C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 1/1:.:32:0,32:0,21:0,11 | |
| 14266 chr22 22829452 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=7.8163e-15;SPV=0.89426 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:11,7:4,12 0/1:.:43:24,19:12,9:12,10 | |
| 14267 chr22 22829558 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
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| 14311 chr22 22880890 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,26:0,10 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 | |
| 14312 chr22 22881847 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=6.0302e-11;SPV=0.47222 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:28,17:11,8:17,9 0/1:.:29:17,12:9,5:8,7 | |
| 14313 chr22 22881878 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,18:0,25 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
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| 14316 chr22 22882584 . A C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,28:0,18 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
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| 14318 chr22 22882655 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=8;GPV=1.2269e-12;SPV=0.12754 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:27,16:13,9:14,7 0/1:.:32:15,17:3,9:12,8 | |
| 14319 chr22 22882759 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,17:0,25 1/1:.:32:0,32:0,13:0,19 | |
| 14320 chr22 22883190 . C G . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=2.4655e-13;SPV=0.36527 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:14,11:8,8 0/1:.:28:13,15:7,9:6,6 | |
| 14321 chr22 22883369 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,26:0,18 1/1:.:38:0,38:0,24:0,14 | |
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| 14323 chr22 22883600 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,20:0,23 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 | |
| 14324 chr22 22883773 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,26:0,26 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 | |
| 14325 chr22 22883815 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,17:0,28 1/1:.:40:0,40:0,14:0,26 | |
| 14326 chr22 22884039 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,18:0,26 1/1:.:29:0,29:0,20:0,9 | |
| 14327 chr22 22884289 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,15:0,20 1/1:.:46:0,46:0,26:0,20 | |
| 14328 chr22 22885013 . C G . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=2.9324e-16;SPV=0.89851 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:16,17:10,8 0/1:.:47:29,18:21,7:8,11 | |
| 14329 chr22 22885393 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,22:0,20 1/1:.:45:0,45:0,27:0,18 | |
| 14330 chr22 22885649 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 1/1:.:40:0,40:0,15:0,25 | |
| 14331 chr22 22886849 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=6;GPV=2.1215e-17;SPV=0.21074 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:5,9:18,12 0/1:.:39:16,23:7,9:9,14 | |
| 14332 chr22 22887738 . A C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:49:0,49:0,24:0,25 | |
| 14333 chr22 22887821 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 | |
| 14334 chr22 22888120 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=3;GPV=5.4526e-21;SPV=0.42519 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:25,32:15,22:10,10 0/1:.:33:13,20:6,9:7,11 | |
| 14335 chr22 22889214 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=8.7026e-15;SPV=0.68129 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:9,10:12,11 0/1:.:36:19,17:10,8:9,9 | |
| 14336 chr22 22889323 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=5;GPV=1.4154e-13;SPV=0.26711 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:15,8:10,11 0/1:.:30:14,16:7,4:7,12 | |
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| 14382 chr22 22903326 . A T . PASS DP=241;SS=1;SSC=0;GPV=1.2248e-28;SPV=0.89023 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:137:87,50:51,31:36,19 0/1:.:104:73,31:41,17:32,14 | |
| 14383 chr22 22903763 . C T . PASS DP=259;SS=1;SSC=0;GPV=1.1821e-25;SPV=0.81398 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:148:103,45:51,27:52,18 0/1:.:111:82,29:47,16:35,13 | |
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| 14385 chr22 22904143 . C T . PASS DP=232;SS=1;SSC=0;GPV=8.9148e-34;SPV=0.957 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:120:66,54:38,23:28,31 0/1:.:112:73,39:41,15:32,24 | |
| 14386 chr22 22904364 . T C . PASS DP=232;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.71286 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:134:51,83:30,51:21,32 0/1:.:98:40,58:20,34:20,24 | |
| 14387 chr22 22904365 . A T . PASS DP=219;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.79568 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:127:48,79:28,49:20,30 0/1:.:92:39,53:21,30:18,23 | |
| 14388 chr22 22904385 . A C . PASS DP=246;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:141:0,141:0,85:0,56 1/1:.:105:0,105:0,59:0,46 | |
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| 14390 chr22 22904583 . A G . PASS DP=248;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=0.85779 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:135:38,97:19,51:19,46 0/1:.:113:38,75:10,31:28,44 | |
| 14391 chr22 22904657 . A G . PASS DP=288;SS=1;SSC=8;GPV=2.1224e-13;SPV=0.14073 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:170:150,20:74,7:76,13 0/1:.:118:98,20:48,6:50,14 | |
| 14392 chr22 22904667 . T A . PASS DP=286;SS=1;SSC=1;GPV=2.2983e-28;SPV=0.66517 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:167:118,49:58,24:60,25 0/1:.:119:86,33:36,21:50,12 | |
| 14393 chr22 22904820 . T C . PASS DP=228;SS=1;SSC=0;GPV=1.136e-15;SPV=0.98904 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:117:87,30:49,18:38,12 0/1:.:111:95,16:58,6:37,10 | |
| 14394 chr22 22904839 . C T . PASS DP=206;SS=1;SSC=0;GPV=5.9541e-12;SPV=0.96159 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:111:87,23:53,14:34,9 0/1:.:95:83,12:53,4:30,8 | |
| 14395 chr22 22904848 . G A . PASS DP=200;SS=1;SSC=1;GPV=0;SPV=0.73473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:108:41,67:26,37:15,30 0/1:.:92:38,54:22,27:16,27 | |
| 14396 chr22 22904902 . T C . PASS DP=244;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:143:0,82:0,47:0,35 0/1:.:101:0,59:0,21:0,38 | |
| 14397 chr22 22904937 . G C . PASS DP=264;SS=1;SSC=6;GPV=1.7657e-14;SPV=0.22283 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:158:135,23:61,11:74,12 0/1:.:106:86,20:38,6:48,14 | |
| 14398 chr22 22905027 . T G . PASS DP=259;SS=1;SSC=7;GPV=3.6466e-09;SPV=0.18897 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:150:137,13:63,6:74,7 0/1:.:109:95,14:37,7:58,7 | |
| 14399 chr22 22905276 . C G . PASS DP=269;SS=1;SSC=8;GPV=8.6748e-14;SPV=0.12762 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:163:141,21:68,8:73,13 0/1:.:106:86,20:40,10:46,10 | |
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| 14401 chr22 22905308 . C G . PASS DP=280;SS=1;SSC=7;GPV=4.3739e-12;SPV=0.18095 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:171:152,19:72,11:80,8 0/1:.:109:92,17:46,6:46,11 | |
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| 14448 chr22 22927902 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=3;GPV=8.6242e-23;SPV=0.41685 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:20,27:8,13:12,14 0/1:.:47:18,29:8,15:10,14 | |
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| 14451 chr22 22931175 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=6;GPV=7.191e-13;SPV=0.21308 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:13,8:10,9 0/1:.:29:13,16:5,9:8,7 | |
| 14452 chr22 22932470 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=2.0241e-17;SPV=0.846 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:18,28:13,14:5,14 0/1:.:29:14,15:6,3:8,12 | |
| 14453 chr22 22933176 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=3.9615e-14;SPV=0.63413 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:10,5:13,14 0/1:.:41:23,18:10,9:13,9 | |
| 14454 chr22 22934197 . C G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,26:0,27 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 | |
| 14455 chr22 22934255 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=3;GPV=2.4219e-17;SPV=0.48763 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:12,12:10,11 0/1:.:39:18,21:8,10:10,11 | |
| 14456 chr22 22934622 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=1.8424e-11;SPV=0.82689 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:4,7:12,11 0/1:.:25:14,11:3,4:11,7 | |
| 14457 chr22 22936302 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,28:0,16 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 14458 chr22 22936336 . C G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=5.8009e-12;SPV=0.80809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:9,13:14,8 0/1:.:25:15,10:5,8:10,2 | |
| 14459 chr22 22936414 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,25:0,20 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 | |
| 14460 chr22 22936479 . G C . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,23:0,28 1/1:.:42:0,42:0,17:0,25 | |
| 14461 chr22 22936629 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 14462 chr22 22937206 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,10:0,20 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
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| 14464 chr22 22938906 . T A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1337e-13;SPV=0.89011 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:8,11:8,10 0/1:.:27:15,12:8,3:7,9 | |
| 14465 chr22 22939160 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,26:0,17 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
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| 14498 chr22 22956589 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=9.392e-17;SPV=0.43422 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:10,12:7,10 0/1:.:31:12,19:8,8:4,11 | |
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| 14509 chr22 22968804 . T C . PASS DP=49;SS=1;SSC=6;GPV=2.1763e-07;SPV=0.22792 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:14,6:4,5:10,1 0/1:.:29:16,13:7,5:9,8 | |
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| 14511 chr22 22971986 . T A . PASS DP=42;SS=1;SSC=4;GPV=1.6451e-08;SPV=0.37211 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:8,6:4,2:4,4 0/1:.:28:13,15:6,6:7,9 | |
| 14512 chr22 22972761 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=5;GPV=9.3895e-09;SPV=0.28964 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:11,7:6,4:5,3 0/1:.:29:14,15:9,8:5,7 | |
| 14513 chr22 22973455 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=4.3658e-11;SPV=0.82057 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:11,13:6,5:5,8 0/1:.:33:18,15:10,5:8,10 | |
| 14514 chr22 22973732 . C A . PASS DP=40;SS=1;SSC=4;GPV=3.1919e-07;SPV=0.32593 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:10,6:7,3:3,3 0/1:.:24:12,12:5,9:7,3 | |
| 14515 chr22 22974442 . A G . PASS DP=39;SS=1;SSC=5;GPV=1.093e-09;SPV=0.26455 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:5,4:3,2:2,2 0/1:.:30:11,19:4,15:7,4 | |
| 14516 chr22 22975217 . C T . PASS DP=39;SS=1;SSC=11;GPV=3.4806e-08;SPV=0.069964 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:9,4:4,1:5,3 0/1:.:26:10,16:4,8:6,8 | |
| 14517 chr22 22975564 . C T . PASS DP=33;SS=1;SSC=10;GPV=4.6376e-07;SPV=0.093375 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:6,2:4,2:2,0 0/1:.:25:10,15:3,8:7,7 | |
| 14518 chr22 22977077 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=2.3224e-12;SPV=0.79644 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:11,14:8,4:3,10 0/1:.:35:18,17:9,7:9,10 | |
| 14519 chr22 22977484 . T C . PASS DP=52;SS=1;SSC=2;GPV=1.4035e-08;SPV=0.57491 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:10,7:8,2:2,5 0/1:.:35:20,15:11,9:9,6 | |
| 14520 chr22 22977688 . A G . PASS DP=47;SS=1;SSC=2;GPV=1.1021e-09;SPV=0.60933 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:5,5:2,1:3,4 0/1:.:37:18,19:12,7:6,12 | |
| 14521 chr22 22978165 . C T . PASS DP=45;SS=1;SSC=7;GPV=4.5278e-07;SPV=0.16681 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:11,4:8,3:3,1 0/1:.:30:16,14:10,7:6,7 | |
| 14522 chr22 22978659 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=4.8441e-11;SPV=0.90114 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:10,13:4,10:6,3 0/1:.:35:20,15:11,6:9,9 | |
| 14523 chr22 22978784 . G T . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=1.5211e-10;SPV=0.57686 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:11,9:8,5:3,4 0/1:.:39:21,18:11,11:10,7 | |
| 14524 chr22 22981322 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=1.5211e-10;SPV=0.50474 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:9,6:11,10 0/1:.:23:12,11:5,2:7,9 | |
| 14525 chr22 22981968 . C T . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=4.6489e-10;SPV=0.83904 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:12,15:8,7:4,8 0/1:.:22:12,10:6,4:6,6 | |
| 14526 chr22 22982664 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=8;GPV=3.195e-13;SPV=0.14613 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:8,8:10,7 0/1:.:29:11,18:5,8:6,10 | |
| 14527 chr22 22983547 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=4;GPV=3.2889e-10;SPV=0.39454 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:16,12:8,2:8,10 0/1:.:28:14,14:5,5:9,9 | |
| 14528 chr22 22984652 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=10;GPV=7.3738e-16;SPV=0.090705 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:8,6:8,8 0/1:.:38:13,25:8,13:5,12 | |
| 14529 chr22 22986571 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 14530 chr22 22987076 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,20:0,34 1/1:.:36:0,36:0,15:0,21 | |
| 14531 chr22 22987111 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=2.0619e-14;SPV=0.69779 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:8,7:15,16 0/1:.:30:16,14:6,5:10,9 | |
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| 14533 chr22 22988700 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=6.2985e-12;SPV=0.95702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:9,5:8,14 0/1:.:34:22,12:11,4:11,8 | |
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| 14579 chr22 23029328 . G C . PASS DP=83;SS=1;SSC=4;GPV=5.8719e-16;SPV=0.37794 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:28,25:13,10:15,15 0/1:.:30:14,16:5,11:9,5 | |
| 14580 chr22 23030238 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=3.3502e-13;SPV=0.97339 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:8,16:14,10 0/1:.:24:16,8:12,2:4,6 | |
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| 14583 chr22 23031136 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.4531e-16;SPV=0.85748 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:18,25:11,18:7,7 0/1:.:33:17,16:6,9:11,7 | |
| 14584 chr22 23031451 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=1.3809e-19;SPV=0.98874 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:13,30:7,17:6,13 0/1:.:38:20,18:9,4:11,14 | |
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| 14586 chr22 23032916 . G T . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=2.3891e-13;SPV=0.73416 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:19,11:6,10 0/1:.:34:20,14:15,7:5,7 | |
| 14587 chr22 23034255 . T G . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=1.374e-15;SPV=0.57077 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:7,17:11,4 0/1:.:33:15,18:8,8:7,10 | |
| 14588 chr22 23035318 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=9;GPV=2.8662e-18;SPV=0.10658 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:14,14:10,7 0/1:.:40:15,25:10,10:5,15 | |
| 14589 chr22 23036329 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,23:0,25 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 | |
| 14590 chr22 23037029 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,38:0,19:0,19 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
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| 14593 chr22 23037448 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,41:0,22:0,19 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 | |
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| 14626 chr22 23075572 . A G . PASS DP=98;SS=1;SSC=10;GPV=5.8301e-22;SPV=0.092039 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:30,30:7,17:23,13 0/1:.:38:13,25:10,11:3,14 | |
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| 14628 chr22 23078872 . C A . PASS DP=73;SS=1;SSC=5;GPV=1.5635e-16;SPV=0.25774 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:12,9:10,15 0/1:.:27:10,17:6,5:4,12 | |
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| 14631 chr22 23079999 . A G . PASS DP=90;SS=1;SSC=4;GPV=1.6633e-17;SPV=0.3343 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:28,25:13,8:15,17 0/1:.:37:17,20:8,10:9,10 | |
| 14632 chr22 23080704 . T C . PASS DP=94;SS=1;SSC=5;GPV=2.5559e-17;SPV=0.26503 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:11,8:15,12 0/1:.:48:23,25:7,12:16,13 | |
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| 14634 chr22 23081061 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=2.3891e-13;SPV=0.38746 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:27,19:16,6:11,13 0/1:.:34:18,16:5,9:13,7 | |
| 14635 chr22 23081777 . G A . PASS DP=51;SS=1;SSC=2;GPV=2.0643e-11;SPV=0.55048 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:12,14:6,7:6,7 0/1:.:25:11,14:8,6:3,8 | |
| 14636 chr22 23083341 . G C . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=2.3066e-15;SPV=0.62124 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:14,13:12,10 0/1:.:37:20,17:12,9:8,8 | |
| 14637 chr22 23084746 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=8.8612e-15;SPV=0.97905 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:13,23:10,14:3,9 0/1:.:33:19,14:11,8:8,6 | |
| 14638 chr22 23086247 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=4;GPV=2.4219e-17;SPV=0.39717 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:13,12:10,11 0/1:.:38:17,21:7,12:10,9 | |
| 14639 chr22 23086623 . A C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.5784e-18;SPV=0.97923 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:14,29:5,13:9,16 0/1:.:34:18,16:10,9:8,7 | |
| 14640 chr22 23099328 . G C . PASS DP=108;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,35:0,24 1/1:.:49:0,49:0,16:0,33 | |
| 14641 chr22 23100835 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 | |
| 14642 chr22 23100902 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=7.7158e-19;SPV=0.90651 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:16,26:8,12:8,14 0/1:.:42:21,21:10,4:11,17 | |
| 14643 chr22 23101722 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=4;GPV=3.9427e-17;SPV=0.33404 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:13,16:13,7 0/1:.:39:18,21:15,12:3,9 | |
| 14644 chr22 23105160 . C G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 1/1:.:26:0,26:0,17:0,9 | |
| 14645 chr22 23112694 . A G . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,34:0,22 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
| 14646 chr22 23113179 . C T . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,26:0,34 1/1:.:39:0,39:0,15:0,24 | |
| 14647 chr22 23127731 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=6.5669e-19;SPV=0.88338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:20,31:11,7:9,24 0/1:.:32:16,16:8,8:8,8 | |
| 14648 chr22 23132569 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=1.1004e-10;SPV=0.56369 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:19,13:11,7:8,6 0/1:.:36:21,15:3,4:18,11 | |
| 14649 chr22 23140296 . G A . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=2.9324e-16;SPV=0.84952 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:34,30:15,18:19,12 0/1:.:34:21,13:10,8:11,5 | |
| 14650 chr22 23148813 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 1/1:.:31:0,31:0,10:0,21 | |
| 14651 chr22 23150791 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=8.7026e-15;SPV=0.41049 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:9,9:12,9 0/1:.:39:19,20:14,7:5,13 | |
| 14652 chr22 23154358 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=3.7425e-15;SPV=0.51778 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:11,13:8,8 0/1:.:31:14,17:10,12:4,5 | |
| 14653 chr22 23155487 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=5;GPV=2.8926e-12;SPV=0.31193 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:11,9:13,7 0/1:.:33:17,16:10,11:7,5 | |
| 14654 chr22 23158366 . A T . PASS DP=93;SS=1;SSC=1;GPV=1.9118e-16;SPV=0.63723 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:11,12:15,11 0/1:.:44:24,20:9,6:15,14 | |
| 14655 chr22 23159099 . T G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=1.8611e-17;SPV=0.91727 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:23,28:14,19:9,9 0/1:.:40:23,17:13,8:10,9 | |
| 14656 chr22 23160521 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=3;GPV=4.1368e-18;SPV=0.45727 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:19,27:11,15:8,12 0/1:.:27:10,17:7,9:3,8 | |
| 14657 chr22 23160648 . T G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=3.6826e-13;SPV=0.91223 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:10,10:9,11 0/1:.:33:20,13:12,8:8,5 | |
| 14658 chr22 23162139 . T C . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=5.0052e-20;SPV=0.67763 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:24,32:14,11:10,21 0/1:.:33:15,18:6,7:9,11 | |
| 14659 chr22 23162471 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=7;GPV=2.3308e-15;SPV=0.16151 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:11,12:14,9 0/1:.:30:12,18:6,9:6,9 | |
| 14660 chr22 23163948 . T G . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=6.2985e-12;SPV=0.47968 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:10,9:14,9 0/1:.:28:15,13:6,8:9,5 | |
| 14661 chr22 23164572 . T A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 14662 chr22 23167127 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=2.0579e-15;SPV=0.70282 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:8,14:12,9 0/1:.:32:16,16:8,8:8,8 | |
| 14663 chr22 23168959 . C A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 | |
| 14664 chr22 23169398 . G A . PASS DP=98;SS=1;SSC=2;GPV=1.5597e-18;SPV=0.58667 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:27,26:13,10:14,16 0/1:.:45:23,22:8,11:15,11 | |
| 14665 chr22 23170432 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=1.0149e-20;SPV=0.76514 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:15,31:9,13:6,18 0/1:.:29:11,18:6,6:5,12 | |
| 14666 chr22 23171336 . A C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
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| 14696 chr22 23232307 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=3.011e-15;SPV=0.63744 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:13,12:12,9 0/1:.:43:24,19:14,8:10,11 | |
| 14697 chr22 23233455 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=10;GPV=9.7502e-16;SPV=0.083844 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:33,22:15,9:18,13 0/1:.:33:14,19:11,10:3,9 | |
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| 14699 chr22 23237323 . C G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=3.7458e-16;SPV=0.80072 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:26,26:13,16:13,10 0/1:.:37:21,16:9,12:12,4 | |
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| 14701 chr22 23237668 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=4;GPV=4.2836e-15;SPV=0.36379 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:11,11:11,11 0/1:.:28:12,16:6,6:6,10 | |
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| 14704 chr22 23241440 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=11;GPV=1.1672e-21;SPV=0.072594 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:31,32:18,15:13,17 0/1:.:32:10,22:8,12:2,10 | |
| 14705 chr22 23241976 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=1.7439e-13;SPV=0.83313 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:8,11:8,9 0/1:.:30:16,14:5,5:11,9 | |
| 14706 chr22 23242092 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.5388e-12;SPV=0.70375 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:10,9:9,10 0/1:.:28:15,13:4,9:11,4 | |
| 14707 chr22 23242945 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=3;GPV=4.9668e-14;SPV=0.4163 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:8,10:10,9 0/1:.:28:12,16:4,9:8,7 | |
| 14708 chr22 23244758 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=1.4126e-14;SPV=0.62309 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:28,24:15,9:13,15 0/1:.:31:17,14:9,8:8,6 | |
| 14709 chr22 23245707 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=2.3827e-23;SPV=0.74674 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:15,29:9,16:6,13 0/1:.:44:17,27:9,9:8,18 | |
| 14710 chr22 23246006 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=1.3693e-11;SPV=0.75154 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:9,5:10,12 0/1:.:31:18,13:8,5:10,8 | |
| 14711 chr22 23246381 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.6574e-14;SPV=0.92373 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:9,13:11,12 0/1:.:29:17,12:9,5:8,7 | |
| 14712 chr22 23246967 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=8.2973e-14;SPV=0.63376 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:12,10:9,12 0/1:.:26:13,13:8,7:5,6 | |
| 14713 chr22 23247571 . T G . PASS DP=82;SS=1;SSC=11;GPV=1.8496e-17;SPV=0.071247 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:26,22:16,11:10,11 0/1:.:34:12,22:6,6:6,16 | |
| 14714 chr22 23247755 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=9;GPV=5.2028e-13;SPV=0.1252 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:27,16:13,9:14,7 0/1:.:34:16,18:4,11:12,7 | |
| 14715 chr22 23248082 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=6.8178e-12;SPV=0.67938 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:11,4:6,10 0/1:.:40:23,17:15,8:8,9 | |
| 14716 chr22 23249536 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=7;GPV=1.8424e-11;SPV=0.17511 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:12,6:11,12 0/1:.:18:7,11:4,5:3,6 | |
| 14717 chr22 23249844 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=3.367e-12;SPV=0.99602 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:12,14:7,9 0/1:.:33:24,9:15,3:9,6 | |
| 14718 chr22 23250255 . T G . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=2.8393e-15;SPV=0.73553 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:13,21:6,13:7,8 0/1:.:28:12,16:5,7:7,9 | |
| 14719 chr22 23250864 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=2;GPV=3.3133e-18;SPV=0.54212 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:12,12:13,12 0/1:.:46:23,23:10,13:13,10 | |
| 14720 chr22 23254843 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=7.3575e-14;SPV=0.95394 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:16,23:7,10:9,13 0/1:.:29:17,12:6,10:11,2 | |
| 14721 chr22 23255805 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.2269e-12;SPV=0.92191 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:11,10:10,11 0/1:.:33:21,12:9,6:12,6 | |
| 14722 chr22 23261770 . T G . PASS DP=88;SS=1;SSC=4;GPV=7.7239e-15;SPV=0.38733 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:29,21:15,9:14,12 0/1:.:38:20,18:8,7:12,11 | |
| 14723 chr22 23262108 . G A . PASS DP=101;SS=1;SSC=2;GPV=0.00077292;SPV=0.61529 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:61:55,6:29,3:26,3 0/1:.:40:36,4:19,2:17,2 | |
| 14724 chr22 23270986 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=4.8717e-12;SPV=0.54511 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:11,7:7,8 0/1:.:34:18,16:10,9:8,7 | |
| 14725 chr22 23272438 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 14726 chr22 23275370 . G A . PASS DP=104;SS=1;SSC=1;GPV=1.172e-19;SPV=0.65535 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:17,13:10,14 0/1:.:50:26,24:11,13:15,11 | |
| 14727 chr22 23276316 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=7;GPV=1.3078e-18;SPV=0.17263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:25,28:15,11:10,17 0/1:.:27:9,18:6,7:3,11 | |
| 14728 chr22 23280019 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=5;GPV=7.9203e-12;SPV=0.28282 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:27,17:17,10:10,7 0/1:.:29:15,14:8,9:7,5 | |
| 14729 chr22 23283500 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.034e-13;SPV=0.83962 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:10,10:10,10 0/1:.:34:20,14:8,7:12,7 | |
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| 14731 chr22 23286167 . C G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,25:0,29 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
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| 14773 chr22 23315548 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=5.0202e-14;SPV=0.66804 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:28,22:13,12:15,10 0/1:.:36:21,15:11,11:10,4 | |
| 14774 chr22 23315687 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=7;GPV=1.315e-08;SPV=0.16689 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:31,12:17,6:14,6 0/1:.:26:15,11:9,6:6,5 | |
| 14775 chr22 23315688 . A C . PASS DP=61;SS=1;SSC=5;GPV=9.1717e-09;SPV=0.28139 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:24,12:11,6:13,6 0/1:.:25:14,11:9,6:5,5 | |
| 14776 chr22 23316340 . A G . PASS DP=48;SS=1;SSC=1;GPV=2.1746e-16;SPV=0.75109 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:4,14:4,5:0,9 0/1:.:30:8,22:6,6:2,16 | |
| 14777 chr22 23316582 . A G . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=5.2839e-11;SPV=0.87864 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:5,14:2,8:3,6 0/1:.:18:7,11:4,4:3,7 | |
| 14778 chr22 23316970 . C G . PASS DP=23;SS=1;SSC=0;GPV=1.2146e-13;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:10:0,10:0,5:0,5 1/1:.:13:0,13:0,11:0,2 | |
| 14779 chr22 23317346 . C T . PASS DP=39;SS=1;SSC=2;GPV=3.1797e-10;SPV=0.50879 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:7,10:2,7:5,3 0/1:.:22:8,14:5,6:3,8 | |
| 14780 chr22 23317394 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=2;GPV=0.000618;SPV=0.57168 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:19,4:10,4:9,0 0/1:.:31:25,6:10,4:15,2 | |
| 14781 chr22 23317823 . A G . PASS DP=30;SS=1;SSC=1;GPV=0.0001594;SPV=0.65871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:12,7:8,5:4,2 0/1:.:11:7,4:3,3:4,1 | |
| 14782 chr22 23317888 . G A . PASS DP=42;SS=1;SSC=4;GPV=0.00053293;SPV=0.36561 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:20,5:13,3:7,2 0/1:.:17:12,5:10,3:2,2 | |
| 14783 chr22 23317908 . T G . PASS DP=36;SS=1;SSC=4;GPV=0.0011061;SPV=0.34771 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:16,4:9,3:7,1 0/1:.:16:11,5:9,3:2,2 | |
| 14784 chr22 23319086 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=3;GPV=1.9033e-15;SPV=0.43724 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:26,22:12,10:14,12 0/1:.:36:18,18:10,12:8,6 | |
| 14785 chr22 23319238 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=2.4696e-16;SPV=0.84943 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:9,22:3,8:6,14 0/1:.:26:10,16:4,7:6,9 | |
| 14786 chr22 23319273 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=8.7266e-12;SPV=0.92795 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:11,18:3,6:8,12 0/1:.:24:13,11:4,5:9,6 | |
| 14787 chr22 23319312 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=1.4773e-07;SPV=0.50348 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:24,11:11,3:13,8 0/1:.:26:17,9:7,4:10,5 | |
| 14788 chr22 23319468 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=4.857e-20;SPV=0.79517 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:15,29:8,15:7,14 0/1:.:32:13,19:7,14:6,5 | |
| 14789 chr22 23319613 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.7703e-18;SPV=0.97377 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:12,27:10,16:2,11 0/1:.:36:18,18:13,7:5,11 | |
| 14790 chr22 23319903 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 1/1:.:43:0,43:0,20:0,23 | |
| 14791 chr22 23319928 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.3596e-16;SPV=0.8242 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:7,10:9,11 0/1:.:43:22,21:9,12:13,9 | |
| 14792 chr22 23320484 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=6.4299e-17;SPV=0.76381 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:17,28:10,12:7,16 0/1:.:23:10,13:3,4:7,9 | |
| 14793 chr22 23320710 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.045748 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:26,13:20,8:6,5 0/1:.:26:11,15:7,8:4,7 | |
| 14794 chr22 23321535 . T A . PASS DP=102;SS=1;SSC=1;GPV=2.3465e-18;SPV=0.64985 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:11,10:15,14 0/1:.:52:28,24:16,15:12,9 | |
| 14795 chr22 23321661 . T G . PASS DP=82;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.049009 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:29,22:17,11:12,11 0/1:.:31:11,20:4,9:7,11 | |
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| 14797 chr22 23321867 . G T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
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| 14837 chr22 23335586 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=9.9771e-17;SPV=0.99534 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:7,29:3,14:4,15 0/1:.:18:9,9:5,5:4,4 | |
| 14838 chr22 23337566 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=5;GPV=1.7985e-10;SPV=0.26462 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:19,12:10,4:9,8 0/1:.:30:15,15:6,8:9,7 | |
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| 14840 chr22 23339424 . T G . PASS DP=77;SS=1;SSC=4;GPV=2.8183e-16;SPV=0.32226 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:13,7:10,16 0/1:.:31:13,18:9,10:4,8 | |
| 14841 chr22 23339573 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 1/1:.:20:0,20:0,9:0,11 | |
| 14842 chr22 23339577 . G T . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 | |
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| 14844 chr22 23341609 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=12;GPV=9.1061e-12;SPV=0.052119 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:28,13:9,6:19,7 0/1:.:34:16,18:10,11:6,7 | |
| 14845 chr22 23343273 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=2;GPV=3.1677e-14;SPV=0.60215 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:11,11:6,11 0/1:.:23:10,13:5,8:5,5 | |
| 14846 chr22 23344038 . C T . PASS DP=39;SS=1;SSC=12;GPV=4.2179e-19;SPV=0.061276 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,12:0,11 1/1:.:16:3,13:0,5:3,8 | |
| 14847 chr22 23344389 . A G . PASS DP=41;SS=1;SSC=4;GPV=1.3631e-10;SPV=0.35028 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:12,16:3,9:9,7 0/1:.:13:4,9:2,7:2,2 | |
| 14848 chr22 23345947 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=1.2435e-09;SPV=0.41354 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:19,12:11,4:8,8 0/1:.:29:16,13:7,7:9,6 | |
| 14849 chr22 23346214 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=4;GPV=3.1153e-09;SPV=0.36087 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:16,9:5,5:11,4 0/1:.:34:19,15:12,7:7,8 | |
| 14850 chr22 23348883 . T G . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,11:0,8 1/1:.:38:0,38:0,15:0,23 | |
| 14851 chr22 23349377 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.7018e-17;SPV=0.95333 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:15,28:9,19:6,9 0/1:.:31:16,15:6,7:10,8 | |
| 14852 chr22 23353217 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=4.9329e-10;SPV=0.95849 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:11,13:7,7:4,6 0/1:.:37:24,13:9,8:15,5 | |
| 14853 chr22 23354277 . A T . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 1/1:.:24:0,24:0,14:0,10 | |
| 14854 chr22 23355771 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=1.0404e-13;SPV=0.96259 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:4,10:9,9 0/1:.:39:23,16:14,9:9,7 | |
| 14855 chr22 23357928 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,12:0,23 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 | |
| 14856 chr22 23358452 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=8.2315e-13;SPV=0.95976 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:9,19:4,11:5,8 0/1:.:25:13,12:8,3:5,9 | |
| 14857 chr22 23358578 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=3;GPV=5.2028e-13;SPV=0.41067 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:12,8:13,10 0/1:.:34:18,16:13,10:5,6 | |
| 14858 chr22 23359394 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=4;GPV=1.204e-07;SPV=0.37352 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:21,10:12,7:9,3 0/1:.:25:15,10:7,4:8,6 | |
| 14859 chr22 23362626 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=2.8075e-15;SPV=0.45671 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:10,11:6,7 0/1:.:35:15,20:6,10:9,10 | |
| 14860 chr22 23364530 . G C . PASS DP=58;SS=1;SSC=5;GPV=4.8441e-11;SPV=0.28149 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:14,10:5,4:9,6 0/1:.:34:16,18:5,7:11,11 | |
| 14861 chr22 23364788 . A G . PASS DP=47;SS=1;SSC=1;GPV=1.0643e-11;SPV=0.6362 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:8,12:4,6:4,6 0/1:.:27:11,16:5,8:6,8 | |
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| 14863 chr22 23366287 . C A . PASS DP=52;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.042496 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:17,5:9,2:8,3 0/1:.:30:15,15:5,7:10,8 | |
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| 14908 chr22 23390698 . C A . PASS DP=84;SS=1;SSC=4;GPV=1.9033e-15;SPV=0.35591 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:14,15:13,7 0/1:.:35:17,18:9,10:8,8 | |
| 14909 chr22 23390805 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=7;GPV=2.5259e-14;SPV=0.18227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:12,3:11,13 0/1:.:39:18,21:9,9:9,12 | |
| 14910 chr22 23390972 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=8;GPV=1.0404e-13;SPV=0.14355 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:14,10:10,8 0/1:.:29:12,17:3,9:9,8 | |
| 14911 chr22 23391370 . T C . PASS DP=55;SS=1;SSC=1;GPV=3.4899e-11;SPV=0.74671 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:8,7:6,9 0/1:.:25:13,12:7,3:6,9 | |
| 14912 chr22 23391612 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,11:0,24 1/1:.:31:0,31:0,9:0,22 | |
| 14913 chr22 23393462 . C A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,22:0,25 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
| 14914 chr22 23393564 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
| 14915 chr22 23393578 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=2.1215e-17;SPV=0.68901 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:13,13:8,12 0/1:.:37:18,19:9,10:9,9 | |
| 14916 chr22 23396462 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=4.9668e-14;SPV=0.65601 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:14,17:10,9:4,8 0/1:.:34:16,18:9,7:7,11 | |
| 14917 chr22 23397911 . C T . PASS DP=111;SS=1;SSC=2;GPV=5.0991e-18;SPV=0.60439 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:35,27:18,12:17,15 0/1:.:49:28,21:13,14:15,7 | |
| 14918 chr22 23398334 . T C . PASS DP=89;SS=1;SSC=7;GPV=3.7458e-16;SPV=0.17413 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:27,19:16,11:11,8 0/1:.:43:20,23:8,12:12,11 | |
| 14919 chr22 23398566 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,24:0,27 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 14920 chr22 23399053 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=4.0755e-15;SPV=0.98252 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:16,23:5,9:11,14 0/1:.:42:26,16:16,9:10,7 | |
| 14921 chr22 23399263 . A C . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=1.6187e-21;SPV=0.6488 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:21,31:11,16:10,15 0/1:.:38:16,22:4,15:12,7 | |
| 14922 chr22 23399605 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=11;GPV=6.2985e-12;SPV=0.068569 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:28,16:20,10:8,6 0/1:.:26:11,15:6,7:5,8 | |
| 14923 chr22 23399623 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,34:0,12 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 14924 chr22 23399705 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=2.3066e-15;SPV=0.89761 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:15,14:11,13 0/1:.:33:20,13:7,8:13,5 | |
| 14925 chr22 23399831 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=4.1861e-22;SPV=0.91611 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:22,36:13,14:9,22 0/1:.:38:19,19:10,9:9,10 | |
| 14926 chr22 23399918 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=4;GPV=3.3133e-18;SPV=0.38474 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:30,27:14,11:16,16 0/1:.:38:18,20:8,12:10,8 | |
| 14927 chr22 23400121 . C A . PASS DP=110;SS=1;SSC=3;GPV=1.0382e-24;SPV=0.4709 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:26,32:14,16:12,16 0/1:.:52:22,30:12,14:10,16 | |
| 14928 chr22 23400351 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=8.9568e-18;SPV=0.90956 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:21,29:10,19:11,10 0/1:.:35:19,16:8,10:11,6 | |
| 14929 chr22 23400821 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=9;GPV=3.0774e-18;SPV=0.10444 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:15,9:6,12 0/1:.:36:12,24:7,17:5,7 | |
| 14930 chr22 23401312 . A C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,26:0,19 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 | |
| 14931 chr22 23402290 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=2;GPV=1.0134e-13;SPV=0.57574 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:16,12:11,9 0/1:.:34:19,15:10,12:9,3 | |
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| 14981 chr22 23420552 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,29:0,18 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 | |
| 14982 chr22 23420656 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,11:0,25 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 14983 chr22 23420867 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=2;GPV=3.3479e-29;SPV=0.57692 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:1,29:0,13:1,16 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
| 14984 chr22 23420927 . A G . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 1/1:.:23:0,23:0,10:0,13 | |
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| 14987 chr22 23421320 . G C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 1/1:.:24:0,24:0,14:0,10 | |
| 14988 chr22 23421860 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,27:0,20 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 14989 chr22 23422085 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,21:0,10 1/1:.:28:0,28:0,11:0,17 | |
| 14990 chr22 23422819 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=1.973e-16;SPV=0.8372 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:12,10:8,14 0/1:.:39:21,18:14,12:7,6 | |
| 14991 chr22 23423078 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=1;GPV=3.6959e-18;SPV=0.73786 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:15,16:11,11 0/1:.:43:23,20:11,11:12,9 | |
| 14992 chr22 23423335 . A C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.783e-13;SPV=0.97279 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:11,20:8,10:3,10 0/1:.:30:17,13:12,5:5,8 | |
| 14993 chr22 23423828 . T A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=1.4308e-12;SPV=0.83154 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:11,12:12,8 0/1:.:34:21,13:11,4:10,9 | |
| 14994 chr22 23426863 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 1/1:.:43:0,43:0,26:0,17 | |
| 14995 chr22 23427184 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=6.58e-14;SPV=0.95628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:13,14:4,7 0/1:.:39:24,15:15,9:9,6 | |
| 14996 chr22 23427599 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 14997 chr22 23428088 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=2.7512e-17;SPV=0.88887 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:12,23:5,14:7,9 0/1:.:35:16,19:6,13:10,6 | |
| 14998 chr22 23428372 . G T . PASS DP=57;SS=1;SSC=4;GPV=1.2661e-10;SPV=0.36254 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:8,11:10,3 0/1:.:25:12,13:5,8:7,5 | |
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| 15025 chr22 23446404 . A C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 1/1:.:30:0,30:0,11:0,19 | |
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| 15036 chr22 23449686 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=4.3182e-16;SPV=0.68001 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:10,16:10,10 0/1:.:26:12,14:8,8:4,6 | |
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| 15039 chr22 23449842 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=1.8891e-12;SPV=0.86023 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:12,9:11,10 0/1:.:39:25,14:15,10:10,4 | |
| 15040 chr22 23449924 . C G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,24:0,24 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 | |
| 15041 chr22 23450016 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,27:0,23 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
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| 15044 chr22 23450594 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,21:0,26 1/1:.:37:0,37:0,8:0,29 | |
| 15045 chr22 23450671 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,25:0,26 1/1:.:38:0,38:0,14:0,24 | |
| 15046 chr22 23451614 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,23:0,20 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 15047 chr22 23451843 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=4;GPV=1.7418e-16;SPV=0.39575 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:32,26:20,17:12,9 0/1:.:34:17,17:15,7:2,10 | |
| 15048 chr22 23452133 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 | |
| 15049 chr22 23452386 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 | |
| 15050 chr22 23452588 . C T . PASS DP=97;SS=1;SSC=9;GPV=4.6917e-19;SPV=0.12575 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:31,25:20,15:11,10 0/1:.:41:17,24:9,15:8,9 | |
| 15051 chr22 23452657 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,32:0,16 1/1:.:43:0,43:0,23:0,20 | |
| 15052 chr22 23452733 . G C . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=7.3611e-17;SPV=0.98157 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:12,16:9,11 0/1:.:46:29,17:17,9:12,8 | |
| 15053 chr22 23452863 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,24:0,28 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 | |
| 15054 chr22 23452927 . G A . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,32:0,26 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 | |
| 15055 chr22 23453003 . T C . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,28:0,27 1/1:.:42:0,42:0,17:0,25 | |
| 15056 chr22 23453746 . G T . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
| 15057 chr22 23455534 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,31:0,17 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 | |
| 15058 chr22 23456538 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,24:0,30 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 | |
| 15059 chr22 23457883 . T A . PASS DP=74;SS=1;SSC=10;GPV=1.5731e-10;SPV=0.083565 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:27,11:12,5:15,6 0/1:.:36:19,17:7,7:12,10 | |
| 15060 chr22 23458091 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=4;GPV=3.642e-14;SPV=0.34211 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:31,23:19,14:12,9 0/1:.:28:14,14:6,9:8,5 | |
| 15061 chr22 23458389 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=9.8334e-16;SPV=0.562 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:7,10:19,17 0/1:.:25:12,13:5,5:7,8 | |
| 15062 chr22 23458746 . G A . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=3.9565e-20;SPV=0.92105 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:29,35:16,17:13,18 0/1:.:40:23,17:14,8:9,9 | |
| 15063 chr22 23459243 . G C . PASS DP=89;SS=1;SSC=4;GPV=4.4109e-17;SPV=0.38211 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:32,29:18,17:14,12 0/1:.:28:13,15:7,9:6,6 | |
| 15064 chr22 23459984 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=6;GPV=6.2293e-15;SPV=0.20683 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:11,9:11,9 0/1:.:35:15,20:7,11:8,9 | |
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| 15066 chr22 23461117 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,14:0,31 1/1:.:28:0,28:0,9:0,19 | |
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| 15102 chr22 23483069 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=7;GPV=7.0924e-18;SPV=0.17149 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:15,22:7,11:8,11 0/1:.:27:7,20:4,10:3,10 | |
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| 15106 chr22 23484662 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=5.295e-10;SPV=0.66452 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:5,8:15,7 0/1:.:27:16,11:10,4:6,7 | |
| 15107 chr22 23484679 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=2.8075e-15;SPV=0.77784 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:16,22:9,10:7,12 0/1:.:31:15,16:7,8:8,8 | |
| 15108 chr22 23485043 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=7.3575e-14;SPV=0.82853 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:11,8:6,13 0/1:.:30:16,14:6,6:10,8 | |
| 15109 chr22 23485397 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=3.6448e-13;SPV=0.42811 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:12,6:6,12 0/1:.:27:12,15:4,8:8,7 | |
| 15110 chr22 23485983 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=1.1004e-10;SPV=0.59718 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:20,14:12,5:8,9 0/1:.:34:20,14:9,4:11,10 | |
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| 15112 chr22 23487055 . C A . PASS DP=58;SS=1;SSC=4;GPV=7.7551e-09;SPV=0.33277 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:23,13:13,8:10,5 0/1:.:22:12,10:4,3:8,7 | |
| 15113 chr22 23487515 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=5;GPV=7.6618e-10;SPV=0.31187 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:28,15:10,5:18,10 0/1:.:25:14,11:5,8:9,3 | |
| 15114 chr22 23487968 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=7;GPV=1.374e-15;SPV=0.16185 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:10,10:10,8 0/1:.:34:13,21:3,8:10,13 | |
| 15115 chr22 23488062 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,25:0,19 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
| 15116 chr22 23488166 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 | |
| 15117 chr22 23488306 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0345e-10;SPV=0.95246 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:7,7:10,14 0/1:.:17:11,6:6,2:5,4 | |
| 15118 chr22 23488578 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 | |
| 15119 chr22 23488823 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,7:0,21 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 | |
| 15120 chr22 23489978 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=4;GPV=1.5685e-14;SPV=0.36909 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:15,16:5,5:10,11 0/1:.:34:14,20:4,4:10,16 | |
| 15121 chr22 23490412 . T G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 15122 chr22 23491152 . A T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 | |
| 15123 chr22 23491402 . T C . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,28:0,24 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 | |
| 15124 chr22 23491414 . G C . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,31:0,24 1/1:.:36:0,36:0,23:0,13 | |
| 15125 chr22 23491525 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,32:0,20 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 | |
| 15126 chr22 23491691 . A G . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,21:0,35 1/1:.:41:0,41:0,16:0,25 | |
| 15127 chr22 23492186 . G C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:24:0,24:0,19:0,5 | |
| 15128 chr22 23492253 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 1/1:.:32:0,32:0,21:0,11 | |
| 15129 chr22 23492373 . G T . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=8.18358e-43;SPV=0.54667 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:1,40:1,20:0,20 1/1:.:34:0,34:0,8:0,26 | |
| 15130 chr22 23492427 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:39:0,39:0,12:0,27 | |
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| 15132 chr22 23492852 . A C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,18:0,26 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
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| 15175 chr22 23511262 . T A . PASS DP=64;SS=1;SSC=7;GPV=1.0507e-11;SPV=0.16192 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:14,8:6,5 0/1:.:31:14,17:9,12:5,5 | |
| 15176 chr22 23511384 . C A . PASS DP=89;SS=1;SSC=5;GPV=4.4109e-17;SPV=0.30179 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:28,24:18,16:10,8 0/1:.:37:17,20:12,17:5,3 | |
| 15177 chr22 23512346 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=3.7458e-16;SPV=0.97442 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:24,29:13,12:11,17 0/1:.:36:23,13:12,5:11,8 | |
| 15178 chr22 23512967 . T C . PASS DP=95;SS=1;SSC=2;GPV=1.0426e-22;SPV=0.50465 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:21,29:9,20:12,9 0/1:.:45:18,27:11,15:7,12 | |
| 15179 chr22 23513335 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,26:0,27 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
| 15180 chr22 23513873 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=4;GPV=3.6893e-16;SPV=0.33716 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:12,12:9,12 0/1:.:26:10,16:5,9:5,7 | |
| 15181 chr22 23514724 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=5.7384e-17;SPV=0.63502 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:17,16:7,11 0/1:.:31:15,16:9,11:6,5 | |
| 15182 chr22 23515355 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=3;GPV=4.8769e-15;SPV=0.44773 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:5,9:14,10 0/1:.:35:16,19:8,9:8,10 | |
| 15183 chr22 23515414 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
| 15184 chr22 23515557 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=3;GPV=1.1391e-19;SPV=0.47992 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:13,18:10,11:3,7 0/1:.:49:19,30:6,18:13,12 | |
| 15185 chr22 23516071 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=1.6045e-17;SPV=0.60579 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:6,13:14,11 0/1:.:37:17,20:11,12:6,8 | |
| 15186 chr22 23516317 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,17:0,23 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 | |
| 15187 chr22 23516664 . G T . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=3.6481e-18;SPV=0.57953 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:7,11:12,14 0/1:.:35:15,20:6,6:9,14 | |
| 15188 chr22 23516958 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=11;GPV=3.7062e-14;SPV=0.074816 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:9,8:9,7 0/1:.:30:10,20:5,9:5,11 | |
| 15189 chr22 23518319 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=2.0579e-15;SPV=0.59707 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:13,14:11,12 0/1:.:25:12,13:7,6:5,7 | |
| 15190 chr22 23518470 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,26:0,18 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 | |
| 15191 chr22 23518687 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,26:0,31 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 15192 chr22 23518779 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=6.3812e-16;SPV=0.8754 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:29,27:15,14:14,13 0/1:.:39:24,15:8,7:16,8 | |
| 15193 chr22 23519110 . G T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,29:0,26 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 15194 chr22 23519170 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,25:0,15 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 | |
| 15195 chr22 23519693 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=2;GPV=2.7815e-13;SPV=0.52584 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:13,12:12,6 0/1:.:39:22,17:11,11:11,6 | |
| 15196 chr22 23519694 . G C . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=2.9905e-13;SPV=0.56468 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:13,12:12,6 0/1:.:40:23,17:11,11:12,6 | |
| 15197 chr22 23519794 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=4.5064e-15;SPV=0.88483 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:10,13:13,12 0/1:.:34:20,14:11,8:9,6 | |
| 15198 chr22 23519966 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=1.2948e-14;SPV=0.90954 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:14,14:11,8 0/1:.:48:31,17:18,6:13,11 | |
| 15199 chr22 23520601 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,25:0,23 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 15200 chr22 23521197 . T A . PASS DP=66;SS=1;SSC=3;GPV=6.8388e-10;SPV=0.4062 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:27,16:12,8:15,8 0/1:.:23:13,10:7,2:6,8 | |
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| 15229 chr22 23531821 . G C . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=5.1181e-19;SPV=0.73499 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:23,29:13,15:10,14 0/1:.:37:18,19:11,7:7,12 | |
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| 15235 chr22 23533671 . C A . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=3.0665e-16;SPV=0.56221 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:16,10:10,14 0/1:.:37:19,18:13,10:6,8 | |
| 15236 chr22 23534045 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=4;GPV=1.4228e-07;SPV=0.32396 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:22,9:14,8:8,1 0/1:.:29:18,11:14,7:4,4 | |
| 15237 chr22 23534221 . G C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=2.7227e-11;SPV=0.81504 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:9,12:5,6 0/1:.:21:11,10:8,8:3,2 | |
| 15238 chr22 23534383 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=4;GPV=5.6308e-13;SPV=0.36203 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:30,21:18,7:12,14 0/1:.:27:14,13:5,8:9,5 | |
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| 15240 chr22 23538626 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=2.6615e-19;SPV=0.82258 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:14,25:7,15:7,10 0/1:.:39:17,22:7,15:10,7 | |
| 15241 chr22 23538812 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=2;GPV=2.6362e-18;SPV=0.61878 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:12,11:13,15 0/1:.:42:21,21:10,7:11,14 | |
| 15242 chr22 23539230 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=7;GPV=2.0241e-17;SPV=0.18482 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:12,11:10,13 0/1:.:29:10,19:3,11:7,8 | |
| 15243 chr22 23539421 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=7;GPV=5.8925e-20;SPV=0.17889 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:23,27:12,16:11,11 0/1:.:33:11,22:6,12:5,10 | |
| 15244 chr22 23540020 . T G . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=9.9942e-16;SPV=0.62066 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:10,10:3,10 0/1:.:30:12,18:7,7:5,11 | |
| 15245 chr22 23540897 . A C . PASS DP=52;SS=1;SSC=2;GPV=0.0062977;SPV=0.55338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:28,4:14,2:14,2 0/1:.:20:17,3:6,2:11,1 | |
| 15246 chr22 23541047 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=3.3862e-07;SPV=0.74098 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:10,5:9,5 0/1:.:30:21,9:10,6:11,3 | |
| 15247 chr22 23542740 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=3;GPV=1.4203e-17;SPV=0.43291 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:6,12:8,6 0/1:.:41:16,25:4,13:12,12 | |
| 15248 chr22 23544599 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=18;GPV=1;SPV=0.013277 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:21,6:13,3:8,3 0/1:.:36:17,19:7,8:10,11 | |
| 15249 chr22 23546266 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=9.9959e-10;SPV=0.88207 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:8,6:6,8 0/1:.:29:18,11:8,5:10,6 | |
| 15250 chr22 23547439 . T G . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=2.5731e-08;SPV=0.37075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:20,9:7,6:13,3 0/1:.:34:21,13:8,7:13,6 | |
| 15251 chr22 23548649 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=1.1086e-15;SPV=0.44591 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:13,11:11,12 0/1:.:32:15,17:5,9:10,8 | |
| 15252 chr22 23549254 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=3;GPV=1.3843e-19;SPV=0.49871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:24,29:16,19:8,10 0/1:.:35:15,20:9,6:6,14 | |
| 15253 chr22 23551338 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=5.9704e-09;SPV=0.70871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:15,12:10,6:5,6 0/1:.:27:16,11:8,5:8,6 | |
| 15254 chr22 23552690 . C T . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=2.6125e-09;SPV=0.91117 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:12,16:6,10:6,6 0/1:.:17:10,7:6,3:4,4 | |
| 15255 chr22 23554178 . C T . PASS DP=104;SS=1;SSC=2;GPV=8.5037e-15;SPV=0.55517 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:34,21:17,14:17,7 0/1:.:49:30,19:17,15:13,4 | |
| 15256 chr22 23554502 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=7;GPV=6.4906e-14;SPV=0.18436 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:11,10:9,7 0/1:.:30:12,18:1,7:11,11 | |
| 15257 chr22 23556136 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=4.9329e-10;SPV=0.92024 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:7,13:8,2 0/1:.:31:20,11:12,8:8,3 | |
| 15258 chr22 23557731 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.037375 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:30,16:12,7:18,9 0/1:.:37:16,21:7,10:9,11 | |
| 15259 chr22 23557777 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=5;GPV=1.4308e-12;SPV=0.28396 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:28,18:13,8:15,10 0/1:.:31:16,15:6,10:10,5 | |
| 15260 chr22 23559207 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=1.3131e-11;SPV=0.89306 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:30,22:19,12:11,10 0/1:.:29:20,9:13,7:7,2 | |
| 15261 chr22 23560894 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=5.8719e-16;SPV=0.92964 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:22,27:14,17:8,10 0/1:.:34:20,14:12,8:8,6 | |
| 15262 chr22 23561055 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.0403e-12;SPV=0.9473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:7,12:12,9 0/1:.:33:21,12:15,6:6,6 | |
| 15263 chr22 23561426 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=1;GPV=2.3391e-18;SPV=0.73564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:13,8:8,16 0/1:.:47:24,23:11,14:13,9 | |
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| 15265 chr22 23566458 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=7;GPV=3.6481e-18;SPV=0.16462 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:10,11:9,8 0/1:.:41:15,26:10,14:5,12 | |
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| 15306 chr22 23596509 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=6.9925e-15;SPV=0.82062 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:7,11:10,9 0/1:.:39:21,18:10,11:11,7 | |
| 15307 chr22 23597165 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=6.161e-17;SPV=0.78686 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:10,21:5,16:5,5 0/1:.:31:12,19:7,14:5,5 | |
| 15308 chr22 23597500 . C G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=1.0051e-11;SPV=0.9008 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:10,14:3,5 0/1:.:22:12,10:8,4:4,6 | |
| 15309 chr22 23597713 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=4;GPV=0.001503;SPV=0.37658 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:36,4:24,4:12,0 0/1:.:33:28,5:17,4:11,1 | |
| 15310 chr22 23597824 . G A . PASS DP=96;SS=1;SSC=1;GPV=1.249e-18;SPV=0.79408 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:25,28:15,8:10,20 0/1:.:43:23,20:11,9:12,11 | |
| 15311 chr22 23598144 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=7;GPV=1.1052e-12;SPV=0.18554 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:7,5:12,10 0/1:.:29:12,17:8,10:4,7 | |
| 15312 chr22 23598289 . C T . PASS DP=96;SS=1;SSC=4;GPV=4.1632e-19;SPV=0.3384 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:18,14:8,10 0/1:.:46:21,25:15,12:6,13 | |
| 15313 chr22 23601346 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.5567e-13;SPV=0.8727 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:14,12:7,10 0/1:.:32:19,13:7,4:12,9 | |
| 15314 chr22 23603385 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=2.9605e-18;SPV=0.80319 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:28,31:16,18:12,13 0/1:.:35:19,16:9,10:10,6 | |
| 15315 chr22 23603689 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=1;GPV=2.6525e-14;SPV=0.74058 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:34,26:13,11:21,15 0/1:.:31:19,12:9,8:10,4 | |
| 15316 chr22 23604532 . C G . PASS DP=70;SS=1;SSC=6;GPV=2.7419e-13;SPV=0.24811 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:13,11:11,8 0/1:.:27:12,15:6,3:6,12 | |
| 15317 chr22 23604803 . C G . PASS DP=74;SS=1;SSC=4;GPV=3.125e-12;SPV=0.35356 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:8,9:16,7 0/1:.:34:18,16:10,12:8,4 | |
| 15318 chr22 23604976 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=10;GPV=2.3908e-17;SPV=0.092922 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:14,13:8,8 0/1:.:33:11,22:8,13:3,9 | |
| 15319 chr22 23605165 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=5;GPV=2.0818e-20;SPV=0.28468 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:12,14:10,14 0/1:.:34:12,22:5,11:7,11 | |
| 15320 chr22 23605307 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=3;GPV=8.7243e-19;SPV=0.46527 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:15,15:7,7 0/1:.:49:23,26:15,14:8,12 | |
| 15321 chr22 23605628 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,25:0,28 1/1:.:32:0,32:0,12:0,20 | |
| 15322 chr22 23607368 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=2.7611e-16;SPV=0.82879 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:26,28:12,18:14,10 0/1:.:32:18,14:8,6:10,8 | |
| 15323 chr22 23607557 . T C . PASS DP=40;SS=1;SSC=5;GPV=4.1855e-09;SPV=0.27296 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:10,9:5,7:5,2 0/1:.:21:8,13:6,11:2,2 | |
| 15324 chr22 23607810 . T G . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=7.3839e-17;SPV=0.74909 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:11,8:7,13 0/1:.:45:23,22:13,14:10,8 | |
| 15325 chr22 23608459 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.7425e-15;SPV=0.79978 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:9,12:6,8 0/1:.:36:18,18:8,7:10,11 | |
| 15326 chr22 23608805 . G C . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=2.2978e-14;SPV=0.68755 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:14,10:10,9 0/1:.:46:27,19:14,6:13,13 | |
| 15327 chr22 23609070 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=1;GPV=1.0508e-14;SPV=0.74685 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:11,15:15,6 0/1:.:45:27,18:15,12:12,6 | |
| 15328 chr22 23609973 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=3.2861e-10;SPV=0.87585 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:10,12:14,6 0/1:.:28:19,9:10,8:9,1 | |
| 15329 chr22 23610440 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.5807e-10;SPV=0.86319 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:8,10:11,6 0/1:.:31:20,11:12,8:8,3 | |
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| 15368 chr22 23645769 . A T . PASS DP=69;SS=1;SSC=6;GPV=2.0601e-12;SPV=0.23623 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:13,9:12,9 0/1:.:26:12,14:4,9:8,5 | |
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| 15372 chr22 23647108 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=3.7425e-15;SPV=0.54401 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:10,14:7,5 0/1:.:35:16,19:6,11:10,8 | |
| 15373 chr22 23647253 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=5;GPV=3.4211e-15;SPV=0.25418 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:10,8:5,9 0/1:.:31:11,20:5,15:6,5 | |
| 15374 chr22 23647636 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=6;GPV=6.6242e-17;SPV=0.24787 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:9,13:11,8 0/1:.:34:13,21:8,8:5,13 | |
| 15375 chr22 23648247 . T G . PASS DP=48;SS=1;SSC=6;GPV=1.9036e-25;SPV=0.22429 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 1/1:.:23:2,21:2,14:0,7 | |
| 15376 chr22 23649233 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=5.6308e-13;SPV=0.92066 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:11,12:13,11 0/1:.:31:20,11:14,3:6,8 | |
| 15377 chr22 23650233 . G C . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=3.55e-15;SPV=0.39992 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:14,14:14,6 0/1:.:43:23,20:9,9:14,11 | |
| 15378 chr22 23650554 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=1.7321e-11;SPV=0.70157 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:10,13:14,6 0/1:.:27:16,11:6,3:10,8 | |
| 15379 chr22 23650864 . G T . PASS DP=70;SS=1;SSC=6;GPV=2.7512e-17;SPV=0.2487 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:10,15:11,12 0/1:.:22:7,15:4,9:3,6 | |
| 15380 chr22 23652594 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=3.6893e-16;SPV=0.6161 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:9,11:11,15 0/1:.:25:11,14:5,7:6,7 | |
| 15381 chr22 23654380 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=7.8163e-15;SPV=0.71273 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:8,6:9,12 0/1:.:42:22,20:8,8:14,12 | |
| 15382 chr22 23654778 . T C . PASS DP=94;SS=1;SSC=4;GPV=5.2686e-25;SPV=0.33823 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:21,33:12,15:9,18 0/1:.:40:13,27:8,15:5,12 | |
| 15383 chr22 23655037 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=8.7556e-14;SPV=0.61242 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:9,8:6,11 0/1:.:27:12,15:9,8:3,7 | |
| 15384 chr22 23655118 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=7.191e-13;SPV=0.74786 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:11,8:9,12 0/1:.:29:16,13:8,7:8,6 | |
| 15385 chr22 23657440 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=2;GPV=2.2152e-16;SPV=0.58785 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:25,25:13,10:12,15 0/1:.:34:17,17:7,11:10,6 | |
| 15386 chr22 23657920 . C G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=2.0466e-12;SPV=0.97479 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:11,19:2,12:9,7 0/1:.:29:17,12:5,5:12,7 | |
| 15387 chr22 23658071 . G C . PASS DP=62;SS=1;SSC=5;GPV=3.7283e-09;SPV=0.29473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:26,14:19,6:7,8 0/1:.:22:12,10:7,4:5,6 | |
| 15388 chr22 23658299 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.1004e-10;SPV=0.96082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:6,13:17,8 0/1:.:24:17,7:6,3:11,4 | |
| 15389 chr22 23658907 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=4.8496e-12;SPV=0.81817 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:13,17:8,4:5,13 0/1:.:27:14,13:7,8:7,5 | |
| 15390 chr22 23659094 . G C . PASS DP=59;SS=1;SSC=5;GPV=1.5211e-10;SPV=0.3006 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:12,12:9,3 0/1:.:23:11,12:5,5:6,7 | |
| 15391 chr22 23659456 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.3846e-12;SPV=0.93449 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:13,10:7,14 0/1:.:21:13,8:5,3:8,5 | |
| 15392 chr22 23660335 . T G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.8211e-18;SPV=0.94061 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:15,26:8,16:7,10 0/1:.:41:21,20:11,9:10,11 | |
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| 15394 chr22 23660938 . T A . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=2.7841e-07;SPV=0.63188 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:20,11:6,1:14,10 0/1:.:25:15,8:4,2:11,6 | |
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| 15435 chr22 23684228 . G C . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=1.1519e-11;SPV=0.61612 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:13,8:9,11 0/1:.:24:13,11:6,3:7,8 | |
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| 15437 chr22 23685742 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,24:0,17 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
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| 15440 chr22 23686440 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.0669e-14;SPV=0.96675 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:7,10:12,14 0/1:.:37:23,14:13,6:10,8 | |
| 15441 chr22 23687465 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=3.367e-12;SPV=0.81518 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:14,7:11,14 0/1:.:29:18,11:7,5:11,6 | |
| 15442 chr22 23688180 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=6.2815e-12;SPV=0.79903 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:33,22:12,11:21,11 0/1:.:30:20,10:8,5:12,5 | |
| 15443 chr22 23688384 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=6;GPV=1.4855e-11;SPV=0.24947 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:22,14:10,6:12,8 0/1:.:32:16,16:9,10:7,6 | |
| 15444 chr22 23692101 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=2.4772e-18;SPV=0.69158 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:10,18:12,10 0/1:.:34:16,18:5,11:11,7 | |
| 15445 chr22 23693783 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=1.5461e-16;SPV=0.43747 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:11,15:12,8 0/1:.:35:16,19:5,12:11,7 | |
| 15446 chr22 23694470 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=3;GPV=7.8163e-15;SPV=0.46466 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:15,10:10,13 0/1:.:29:14,15:8,10:6,5 | |
| 15447 chr22 23695899 . A C . PASS DP=87;SS=1;SSC=7;GPV=1.0454e-16;SPV=0.16847 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:16,11:10,9 0/1:.:41:18,23:11,14:7,9 | |
| 15448 chr22 23696660 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=2.5784e-18;SPV=0.53847 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:6,12:13,14 0/1:.:32:13,19:9,11:4,8 | |
| 15449 chr22 23702328 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=1;GPV=4.883e-13;SPV=0.72158 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:13,18:11,8:2,10 0/1:.:26:12,14:6,6:6,8 | |
| 15450 chr22 23708034 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=5.9704e-09;SPV=0.97528 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:7,9:9,8 0/1:.:21:15,6:9,3:6,3 | |
| 15451 chr22 23709844 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=3.7062e-14;SPV=0.90807 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:13,21:8,10:5,11 0/1:.:29:15,14:6,8:9,6 | |
| 15452 chr22 23713215 . C A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=3.7062e-14;SPV=0.83075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:16,23:7,11:9,12 0/1:.:24:12,12:6,3:6,9 | |
| 15453 chr22 23713755 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,23:0,24 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 15454 chr22 23714152 . C G . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,27:0,28 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 | |
| 15455 chr22 23714350 . G A . PASS DP=99;SS=1;SSC=1;GPV=1.7348e-18;SPV=0.63185 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:28,27:9,12:19,15 0/1:.:44:23,21:14,9:9,12 | |
| 15456 chr22 23715349 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,15:0,27 1/1:.:51:0,51:0,21:0,30 | |
| 15457 chr22 23715854 . C G . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=2.2863e-14;SPV=0.52294 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:8,8:9,7 0/1:.:45:23,22:10,9:13,13 | |
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| 15459 chr22 23717746 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=5.6371e-17;SPV=0.5761 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:12,9:8,17 0/1:.:28:12,16:7,8:5,8 | |
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| 15499 chr22 23752028 . G C . PASS DP=65;SS=1;SSC=3;GPV=1.5381e-13;SPV=0.415 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:10,9:10,11 0/1:.:25:11,14:5,5:6,9 | |
| 15500 chr22 23752289 . T G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.4855e-11;SPV=0.9001 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:7,6:11,12 0/1:.:32:20,12:13,9:7,3 | |
| 15501 chr22 23752725 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=8.7033e-16;SPV=0.4794 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:8,7:10,15 0/1:.:29:12,17:3,9:9,8 | |
| 15502 chr22 23754277 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=7.2168e-14;SPV=0.47778 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:18,17:9,5 0/1:.:29:15,14:10,9:5,5 | |
| 15503 chr22 23754539 . T A . PASS DP=79;SS=1;SSC=7;GPV=3.6481e-18;SPV=0.196 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:13,11:10,14 0/1:.:31:11,20:6,7:5,13 | |
| 15504 chr22 23756069 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=10;GPV=1.5805e-15;SPV=0.093945 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:6,9:15,8 0/1:.:35:13,22:6,8:7,14 | |
| 15505 chr22 23756518 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=3;GPV=2.3694e-14;SPV=0.46395 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:5,12:9,10 0/1:.:18:6,12:3,6:3,6 | |
| 15506 chr22 23756678 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=6;GPV=3.104e-14;SPV=0.21409 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:17,9:6,11 0/1:.:27:11,16:4,5:7,11 | |
| 15507 chr22 23756956 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.0367e-13;SPV=0.94968 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:9,11:10,12 0/1:.:29:18,11:12,7:6,4 | |
| 15508 chr22 23757353 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=1;GPV=3.4899e-11;SPV=0.65443 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:8,2:6,13 0/1:.:26:13,13:9,4:4,9 | |
| 15509 chr22 23757414 . A C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.0601e-12;SPV=0.86331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:9,2:8,16 0/1:.:34:20,14:14,6:6,8 | |
| 15510 chr22 23758467 . A G . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=5.635e-11;SPV=0.90533 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:5,7:8,12 0/1:.:18:10,8:4,5:6,3 | |
| 15511 chr22 23759346 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.4568e-12;SPV=0.82906 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:11,12:14,11 0/1:.:23:14,9:11,7:3,2 | |
| 15512 chr22 23761300 . C A . PASS DP=76;SS=1;SSC=7;GPV=6.2136e-19;SPV=0.16151 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:9,12:9,9 0/1:.:37:12,25:8,10:4,15 | |
| 15513 chr22 23761941 . A T . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=4.6878e-13;SPV=0.96142 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:34,27:16,9:18,18 0/1:.:29:21,8:11,2:10,6 | |
| 15514 chr22 23762449 . T G . PASS DP=59;SS=1;SSC=3;GPV=1.8424e-11;SPV=0.45553 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:18,16:6,8:12,8 0/1:.:25:12,13:7,8:5,5 | |
| 15515 chr22 23763821 . C G . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,17:0,35 1/1:.:46:0,46:0,16:0,30 | |
| 15516 chr22 23764487 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,28:0,16 1/1:.:34:0,34:0,25:0,9 | |
| 15517 chr22 23765614 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=1.2945e-16;SPV=0.74435 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:29,29:15,16:14,13 0/1:.:32:17,14:7,7:10,7 | |
| 15518 chr22 23766101 . C G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,26:0,22 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 15519 chr22 23766225 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,34:0,7 1/1:.:22:0,22:0,18:0,4 | |
| 15520 chr22 23766569 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,27:0,28 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 15521 chr22 23766790 . A G . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,24:0,29 1/1:.:42:0,42:0,19:0,23 | |
| 15522 chr22 23767275 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 1/1:.:43:0,43:0,23:0,20 | |
| 15523 chr22 23767363 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,28:0,22 1/1:.:43:0,43:0,28:0,15 | |
| 15524 chr22 23767587 . T G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,30:0,22 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 | |
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| 15526 chr22 23770713 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 1/1:.:24:0,24:0,15:0,9 | |
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| 15555 chr22 23796157 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,22:0,20 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 | |
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| 15568 chr22 23801315 . C G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,24:0,23 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 | |
| 15569 chr22 23802093 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 1/1:.:30:0,30:0,22:0,8 | |
| 15570 chr22 23803208 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,27:0,19 1/1:.:50:0,50:0,21:0,29 | |
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| 15577 chr22 23806086 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,26:0,14 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
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| 15584 chr22 23809396 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 15585 chr22 23809792 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,18:0,29 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 | |
| 15586 chr22 23809921 . T A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,33:0,8 1/1:.:23:0,23:0,18:0,5 | |
| 15587 chr22 23809952 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,30:0,11 1/1:.:21:0,21:0,16:0,5 | |
| 15588 chr22 23810928 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 | |
| 15589 chr22 23812924 . G C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 | |
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| 15593 chr22 23813841 . T A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 | |
| 15594 chr22 23813922 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 | |
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| 15596 chr22 23815223 . G T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,29:0,16 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 15597 chr22 23815491 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,14:0,24 1/1:.:47:0,47:0,27:0,20 | |
| 15598 chr22 23815497 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,14:0,25 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 | |
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| 15626 chr22 23830954 . A C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 | |
| 15627 chr22 23831820 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,34:0,13 1/1:.:40:0,40:0,15:0,25 | |
| 15628 chr22 23832116 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 15629 chr22 23832221 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 1/1:.:28:0,28:0,11:0,17 | |
| 15630 chr22 23832948 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,22:0,31 1/1:.:24:0,24:0,9:0,15 | |
| 15631 chr22 23833021 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,23:0,31 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 | |
| 15632 chr22 23835324 . A C . PASS DP=110;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:63:0,63:0,39:0,24 1/1:.:47:0,47:0,27:0,20 | |
| 15633 chr22 23836092 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,30:0,21 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 | |
| 15634 chr22 23836403 . C G . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,25:0,27 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 | |
| 15635 chr22 23837537 . G C . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,22:0,35 1/1:.:45:0,45:0,25:0,20 | |
| 15636 chr22 23839465 . A G . PASS DP=114;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,33:0,23 1/1:.:58:0,58:0,31:0,27 | |
| 15637 chr22 23841011 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,29:0,17 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
| 15638 chr22 23843024 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=2;GPV=1.0786e-09;SPV=0.6183 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:9,2:8,11 0/1:.:28:16,12:6,4:10,8 | |
| 15639 chr22 23844171 . T G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 | |
| 15640 chr22 23844536 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,31:0,22 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 | |
| 15641 chr22 23844926 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,27:0,17 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
| 15642 chr22 23845299 . T C . PASS DP=116;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:68:0,68:0,41:0,27 1/1:.:48:0,48:0,27:0,21 | |
| 15643 chr22 23845433 . G A . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,22:0,29 1/1:.:47:0,47:0,22:0,25 | |
| 15644 chr22 23845633 . A G . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,22:0,31 1/1:.:46:0,46:0,19:0,27 | |
| 15645 chr22 23847248 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,27:0,23 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 | |
| 15646 chr22 23847256 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,28:0,21 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
| 15647 chr22 23848827 . G A . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,32:0,24 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 | |
| 15648 chr22 23849329 . T C . PASS DP=106;SS=1;SSC=0;GPV=1.9065e-22;SPV=0.83864 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:22,30:6,18:16,12 0/1:.:54:27,27:15,11:12,16 | |
| 15649 chr22 23849415 . G A . PASS DP=117;SS=1;SSC=3;GPV=7.3719e-22;SPV=0.47153 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:33,30:15,14:18,16 0/1:.:54:27,27:10,15:17,12 | |
| 15650 chr22 23849894 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,24:0,27 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 | |
| 15651 chr22 23851806 . T C . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,26:0,27 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
| 15652 chr22 23852754 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,15:0,29 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
| 15653 chr22 23852879 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,29:0,16 1/1:.:40:0,40:0,24:0,16 | |
| 15654 chr22 23853040 . G T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 1/1:.:21:0,21:0,9:0,12 | |
| 15655 chr22 23853149 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 1/1:.:24:0,24:0,12:0,12 | |
| 15656 chr22 23853645 . T C . PASS DP=39;SS=1;SSC=0;GPV=3.6742e-23;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,4:0,17 1/1:.:18:0,18:0,1:0,17 | |
| 15657 chr22 23853695 . A G . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=7.9107e-15;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,1:0,12 1/1:.:12:0,12:0,0:0,12 | |
| 15658 chr22 23855318 . G A . PASS DP=48;SS=1;SSC=1;GPV=0.0061774;SPV=0.75737 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:27,5:22,2:5,3 0/1:.:16:14,2:11,1:3,1 | |
| 15659 chr22 23855406 . G T . PASS DP=69;SS=3;SSC=13;GPV=1;SPV=0.04513 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:40,8:38,6:2,2 0/0:.:21:21,0:21,0:0,0 | |
| 15660 chr22 23859375 . T G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,23:0,21 1/1:.:37:0,37:0,14:0,23 | |
| 15661 chr22 23860192 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:29:0,29:0,21:0,8 | |
| 15662 chr22 23861612 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,28:0,18 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 15663 chr22 23861676 . G C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,24:0,24 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 | |
| 15664 chr22 23861971 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,15:0,25 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
| 15665 chr22 23862686 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,28:0,13 1/1:.:38:0,38:0,24:0,14 | |
| 15666 chr22 23865270 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 1/1:.:35:0,35:0,23:0,12 | |
| 15667 chr22 23866183 . G A . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,13:0,13 1/1:.:20:0,20:0,10:0,10 | |
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| 15709 chr22 23898914 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
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| 15717 chr22 23905106 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,24:0,16 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 15718 chr22 23905123 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
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| 15720 chr22 23905607 . G C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,17:0,23 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 | |
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| 15722 chr22 23906127 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 | |
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| 15724 chr22 23906525 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,16:0,24 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 | |
| 15725 chr22 23906574 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,20:0,27 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 | |
| 15726 chr22 23906594 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,23:0,26 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
| 15727 chr22 23906904 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,30:0,21 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 | |
| 15728 chr22 23907271 . A C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 | |
| 15729 chr22 23907299 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 | |
| 15730 chr22 23907386 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,23:0,21 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
| 15731 chr22 23907429 . A C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 1/1:.:31:0,31:0,20:0,11 | |
| 15732 chr22 23907501 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 1/1:.:18:0,18:0,9:0,9 | |
| 15733 chr22 23907552 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,22:0,25 1/1:.:26:0,26:0,13:0,13 | |
| 15734 chr22 23907613 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,25:0,22 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 | |
| 15735 chr22 23908168 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 | |
| 15736 chr22 23908458 . C A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,27:0,21 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
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| 15738 chr22 23909157 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,26:0,17 1/1:.:45:0,45:0,24:0,21 | |
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| 15780 chr22 23927332 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
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| 15782 chr22 23927543 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
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| 15792 chr22 23935643 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 15793 chr22 23936066 . A C . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,11:0,21 1/1:.:20:0,20:0,11:0,9 | |
| 15794 chr22 23938500 . C T . PASS DP=39;SS=1;SSC=0;GPV=3.6742e-23;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,13:0,7 1/1:.:19:0,19:0,15:0,4 | |
| 15795 chr22 23938681 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,24:0,10 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
| 15796 chr22 23939195 . C T . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 1/1:.:20:0,20:0,12:0,8 | |
| 15797 chr22 23939206 . T C . PASS DP=34;SS=1;SSC=0;GPV=3.5146e-20;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,8:0,8 1/1:.:18:0,18:0,11:0,7 | |
| 15798 chr22 23939207 . G A . PASS DP=30;SS=1;SSC=0;GPV=8.4556e-18;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,9:0,8 1/1:.:13:0,13:0,9:0,4 | |
| 15799 chr22 23939563 . C T . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 1/1:.:14:0,14:0,6:0,8 | |
| 15800 chr22 23946480 . A G . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=1.4508e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,7:0,7 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 | |
| 15801 chr22 23949485 . T G . PASS DP=30;SS=1;SSC=0;GPV=8.4556e-18;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,13:0,1 1/1:.:16:0,16:0,14:0,2 | |
| 15802 chr22 23949527 . A C . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,15:0,1 1/1:.:16:0,16:0,16:0,0 | |
| 15803 chr22 23949740 . C G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,25:0,5 1/1:.:34:0,34:0,26:0,8 | |
| 15804 chr22 23949991 . C A . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,22:0,32 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 15805 chr22 23950301 . G T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 | |
| 15806 chr22 23950688 . G A . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=2.8292e-11;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,10:0,3:0,7 1/1:.:15:0,9:0,2:0,7 | |
| 15807 chr22 23950770 . G A . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,15:0,8 1/1:.:18:0,18:0,8:0,10 | |
| 15808 chr22 23951128 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=10;GPV=5.2873e-05;SPV=0.087184 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:23,4:7,0:16,4 0/1:.:26:17,9:10,1:7,8 | |
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| 15859 chr22 23971817 . G T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,27:0,12 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 15860 chr22 23972069 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=8;GPV=4.3784e-17;SPV=0.13555 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:10,11:16,13 0/1:.:30:11,19:4,11:7,8 | |
| 15861 chr22 23980940 . T C . PASS DP=22;SS=1;SSC=0;GPV=4.7526e-13;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:12:0,12:0,5:0,7 1/1:.:10:0,10:0,5:0,5 | |
| 15862 chr22 23981323 . T C . PASS DP=28;SS=1;SSC=0;GPV=1.3074e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,16:0,2 1/1:.:10:0,10:0,7:0,3 | |
| 15863 chr22 23981658 . T C . PASS DP=39;SS=1;SSC=0;GPV=3.6742e-23;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,16:0,8 1/1:.:15:0,15:0,8:0,7 | |
| 15864 chr22 23981687 . G A . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,14:0,7 1/1:.:19:0,19:0,11:0,8 | |
| 15865 chr22 23981861 . C G . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,30:0,26 1/1:.:42:0,42:0,23:0,19 | |
| 15866 chr22 23987771 . A G . PASS DP=17;SS=1;SSC=0;GPV=4.2852e-10;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,3:0,6 1/1:.:8:0,8:0,5:0,3 | |
| 15867 chr22 23987843 . C T . PASS DP=26;SS=1;SSC=0;GPV=2.0165e-15;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,7:0,6 1/1:.:13:0,13:0,5:0,8 | |
| 15868 chr22 23988632 . A C . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=7.9107e-15;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,15:0,2 1/1:.:8:0,8:0,8:0,0 | |
| 15869 chr22 23989559 . A C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 1/1:.:25:0,25:0,18:0,7 | |
| 15870 chr22 23989713 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,26:0,23 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 | |
| 15871 chr22 23991671 . C A . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=2.2598e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,13:0,9 1/1:.:14:0,14:0,8:0,6 | |
| 15872 chr22 23991829 . T C . PASS DP=29;SS=1;SSC=0;GPV=3.3259e-17;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,13:0,3 1/1:.:13:0,13:0,11:0,2 | |
| 15873 chr22 23991859 . A C . PASS DP=28;SS=1;SSC=0;GPV=1.3074e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,10:0,5 1/1:.:13:0,13:0,10:0,3 | |
| 15874 chr22 23992015 . T C . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=5.7269e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,15:0,6 1/1:.:16:0,16:0,8:0,8 | |
| 15875 chr22 23992230 . A G . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=1.4508e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,8:0,18 1/1:.:12:0,12:0,7:0,5 | |
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| 15877 chr22 23992517 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,14:0,24 1/1:.:21:0,21:0,13:0,8 | |
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| 15934 chr22 24047011 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,26:0,15 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 | |
| 15935 chr22 24047235 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,26:0,21 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 15936 chr22 24050156 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,11:0,20 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
| 15937 chr22 24051936 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
| 15938 chr22 24054572 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 | |
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| 15940 chr22 24056422 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 1/1:.:23:0,23:0,7:0,16 | |
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| 15943 chr22 24060734 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,14:0,29 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 15944 chr22 24065057 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
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| 15991 chr22 24139663 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 1/1:.:47:0,47:0,26:0,21 | |
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| 16000 chr22 24149093 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,29:0,24 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
| 16001 chr22 24150331 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,36:0,21 1/1:.:21:0,21:0,14:0,7 | |
| 16002 chr22 24151104 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:23:0,23:0,17:0,6 | |
| 16003 chr22 24152818 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,28:0,16 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 | |
| 16004 chr22 24154335 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
| 16005 chr22 24154622 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=3.3388e-14;SPV=0.82054 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:8,14:16,9 0/1:.:34:20,14:13,7:7,7 | |
| 16006 chr22 24155941 . T G . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,33:0,27 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 | |
| 16007 chr22 24156904 . C A . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,27:0,25 1/1:.:38:0,38:0,24:0,14 | |
| 16008 chr22 24160539 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 | |
| 16009 chr22 24162350 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,31:0,15 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
| 16010 chr22 24163771 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 16011 chr22 24165396 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,24:0,27 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 | |
| 16012 chr22 24168509 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 | |
| 16013 chr22 24168814 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,26:0,27 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 16014 chr22 24170926 . G T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 1/1:.:41:0,41:0,8:0,33 | |
| 16015 chr22 24171063 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,25:0,26 1/1:.:41:0,41:0,28:0,13 | |
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| 16017 chr22 24179984 . T C . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,34:0,27 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 | |
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| 16060 chr22 24214759 . G C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,26:0,27 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
| 16061 chr22 24214812 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,28:0,25 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
| 16062 chr22 24215749 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:37:0,37:0,24:0,13 | |
| 16063 chr22 24215795 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 | |
| 16064 chr22 24216147 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,17:0,28 1/1:.:47:0,47:0,19:0,28 | |
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| 16066 chr22 24217984 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,22:0,25 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 | |
| 16067 chr22 24219538 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,25:0,23 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
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| 16069 chr22 24221033 . C G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,27:0,16 1/1:.:26:0,26:0,16:0,10 | |
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| 16071 chr22 24221303 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,29:0,17 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 | |
| 16072 chr22 24221547 . C G . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,26:0,30 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
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| 16076 chr22 24222888 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=1.0977e-18;SPV=0.37385 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:13,16:7,9 0/1:.:34:13,21:6,12:7,9 | |
| 16077 chr22 24222893 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,26:0,21 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 | |
| 16078 chr22 24228902 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,27:0,16 1/1:.:23:0,23:0,15:0,8 | |
| 16079 chr22 24229650 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 16080 chr22 24229691 . A T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,17:0,10 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
| 16081 chr22 24231745 . A G . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,30:0,29 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 | |
| 16082 chr22 24231942 . T A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=6.9925e-15;SPV=0.87738 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:7,13:13,11 0/1:.:32:18,14:12,7:6,7 | |
| 16083 chr22 24232960 . G A . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,21:0,30 1/1:.:45:0,45:0,21:0,24 | |
| 16084 chr22 24234125 . C A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,20:0,27 1/1:.:40:0,40:0,16:0,24 | |
| 16085 chr22 24235154 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 1/1:.:21:0,21:0,12:0,9 | |
| 16086 chr22 24235349 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:42:0,42:0,26:0,16 | |
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| 16088 chr22 24235823 . A G . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,22:0,32 1/1:.:43:0,43:0,23:0,20 | |
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| 16121 chr22 24257346 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=17;GPV=1;SPV=0.019379 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:12,39:12,17:0,22 1/1:.:37:2,35:2,11:0,24 | |
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| 16127 chr22 24259422 . G C . PASS DP=125;SS=1;SSC=7;GPV=1.2875e-10;SPV=0.1659 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:56,14:16,4:40,10 0/1:.:55:39,16:15,12:24,4 | |
| 16128 chr22 24259565 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,17:0,26 1/1:.:27:0,27:0,7:0,20 | |
| 16129 chr22 24259598 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=2.3014e-37;SPV=0.84575 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:2,43:0,19:2,24 1/1:.:28:2,26:0,10:2,16 | |
| 16130 chr22 24259701 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 | |
| 16131 chr22 24259872 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=2.1774e-09;SPV=0.64108 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:11,10:10,7 0/1:.:16:9,7:7,3:2,4 | |
| 16132 chr22 24260883 . T C . PASS DP=104;SS=1;SSC=3;GPV=1.0698e-09;SPV=0.47544 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:48,16:19,7:29,9 0/1:.:40:29,11:11,4:18,7 | |
| 16133 chr22 24261123 . C G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 1/1:.:30:0,30:0,8:0,22 | |
| 16134 chr22 24261561 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=2;GPV=6.1418e-13;SPV=0.567 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:38,22:22,16:16,6 0/1:.:35:22,13:12,7:10,6 | |
| 16135 chr22 24261746 . C G . PASS DP=131;SS=1;SSC=0;GPV=1.8702e-08;SPV=0.92084 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:79:62,17:32,13:30,4 0/1:.:52:45,7:26,5:19,2 | |
| 16136 chr22 24261904 . T C . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,31:0,26 1/1:.:46:0,44:0,18:0,26 | |
| 16137 chr22 24262297 . G T . PASS DP=86;SS=1;SSC=4;GPV=5.0202e-14;SPV=0.36991 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:32,22:17,12:15,10 0/1:.:32:17,15:9,7:8,8 | |
| 16138 chr22 24263109 . A G . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,7:0,12 1/1:.:22:0,22:0,13:0,9 | |
| 16139 chr22 24263110 . T C . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,6:0,13 1/1:.:22:0,22:0,13:0,9 | |
| 16140 chr22 24263413 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=1.0605e-35;SPV=0.65079 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:1,40:0,15:1,25 1/1:.:22:0,22:0,14:0,8 | |
| 16141 chr22 24264106 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,8:0,16 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
| 16142 chr22 24267758 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 1/1:.:26:0,26:0,16:0,10 | |
| 16143 chr22 24268019 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,14:0,23 1/1:.:24:0,24:0,8:0,16 | |
| 16144 chr22 24270234 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,10:0,13 1/1:.:27:0,27:0,16:0,11 | |
| 16145 chr22 24270235 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 | |
| 16146 chr22 24270269 . A G . PASS DP=47;SS=1;SSC=18;GPV=1;SPV=0.013655 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:16,8:6,4:10,4 0/1:.:23:7,16:1,6:6,10 | |
| 16147 chr22 24270372 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=7.3681e-12;SPV=0.95385 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:1,15:0,7:1,8 1/1:.:25:2,8:0,2:2,6 | |
| 16148 chr22 24270867 . C G . PASS DP=102;SS=1;SSC=7;GPV=1.0469e-22;SPV=0.1724 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:28,29:18,20:10,9 0/1:.:45:17,28:9,16:8,12 | |
| 16149 chr22 24273497 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 1/1:.:35:0,35:0,14:0,21 | |
| 16150 chr22 24274751 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,9:0,15 1/1:.:34:0,34:0,12:0,22 | |
| 16151 chr22 24279369 . A T . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=5.693e-13;SPV=0.58323 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,17:7,10:7,7 0/1:.:27:12,15:7,8:5,7 | |
| 16152 chr22 24280640 . T A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=5.8009e-12;SPV=0.92748 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:9,13:10,7 0/1:.:30:19,11:9,6:10,5 | |
| 16153 chr22 24281057 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:24:0,24:0,9:0,15 | |
| 16154 chr22 24284592 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:37:0,37:0,14:0,23 | |
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| 16156 chr22 24285611 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,10:0,24 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
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| 16205 chr22 24375987 . A C . PASS DP=43;SS=1;SSC=3;GPV=1.8298e-08;SPV=0.41375 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:8,6:3,2:5,4 0/1:.:29:14,15:4,9:10,6 | |
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| 16207 chr22 24378407 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=2;GPV=3.5259e-08;SPV=0.6007 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:13,9:6,4:7,5 0/1:.:29:17,12:7,7:10,5 | |
| 16208 chr22 24378939 . C T . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 16209 chr22 24379380 . C T . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=4.4825e-12;SPV=0.96619 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:4,14:2,7:2,7 0/1:.:25:11,14:4,4:7,10 | |
| 16210 chr22 24379676 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 1/1:.:28:0,28:0,18:0,10 | |
| 16211 chr22 24381266 . A T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 16212 chr22 24381641 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=2.7389e-14;SPV=0.43746 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:11,8:8,11 0/1:.:31:14,17:7,11:7,6 | |
| 16213 chr22 24384612 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 1/1:.:34:0,34:0,23:0,11 | |
| 16214 chr22 24385712 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:28:0,28:0,9:0,19 | |
| 16215 chr22 24388080 . T A . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=1.3059e-08;SPV=0.79003 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:15,13:4,4:11,9 0/1:.:23:14,9:3,2:11,7 | |
| 16216 chr22 24390830 . G C . PASS DP=34;SS=1;SSC=8;GPV=1.7305e-07;SPV=0.14037 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:11,8:5,4:6,4 0/1:.:15:5,10:1,3:4,7 | |
| 16217 chr22 24393664 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 1/1:.:36:0,36:0,9:0,27 | |
| 16218 chr22 24396371 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=3;GPV=1.2401e-12;SPV=0.40067 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:15,13:9,4:6,9 0/1:.:36:17,19:9,10:8,9 | |
| 16219 chr22 24396798 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 1/1:.:17:0,17:0,9:0,8 | |
| 16220 chr22 24397748 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=1.4203e-17;SPV=0.58867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:14,20:6,11:8,9 0/1:.:39:16,23:8,11:8,12 | |
| 16221 chr22 24400322 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
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| 16223 chr22 24406596 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,20:0,26 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 | |
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| 16272 chr22 24459573 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
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| 16275 chr22 24466629 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.1052e-12;SPV=0.81158 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:14,17:7,11:7,6 0/1:.:32:17,15:7,2:10,13 | |
| 16276 chr22 24466770 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,25:0,19 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
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| 16279 chr22 24469219 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,19:0,31 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 | |
| 16280 chr22 24471041 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 | |
| 16281 chr22 24471914 . G C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 1/1:.:38:0,38:0,11:0,27 | |
| 16282 chr22 24472621 . A G . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 1/1:.:20:0,20:0,12:0,8 | |
| 16283 chr22 24473691 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,14:0,21 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 16284 chr22 24474096 . T A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,8:0,20 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 | |
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| 16289 chr22 24479155 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 16290 chr22 24480832 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
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| 16292 chr22 24482250 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
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| 16322 chr22 24511618 . A T . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,21:0,8:0,13 1/1:.:20:0,20:0,11:0,9 | |
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| 16331 chr22 24541519 . A G . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:63:0,63:0,32:0,31 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
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| 16334 chr22 24543321 . A C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,25:0,21 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
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| 16339 chr22 24548814 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 | |
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| 16341 chr22 24549449 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 | |
| 16342 chr22 24549771 . C G . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=8.7026e-15;SPV=0.77069 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:13,13:10,11 0/1:.:31:17,14:7,6:10,8 | |
| 16343 chr22 24550428 . T A . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,33:0,22 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 | |
| 16344 chr22 24551484 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
| 16345 chr22 24552204 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 16346 chr22 24553746 . G C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,27:0,22 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 | |
| 16347 chr22 24555118 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,29:0,18 1/1:.:31:0,31:0,21:0,10 | |
| 16348 chr22 24555328 . T C . PASS DP=108;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:67:0,67:0,25:0,42 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 | |
| 16349 chr22 24557088 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,26:0,20 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 16350 chr22 24557259 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 16351 chr22 24557381 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 1/1:.:42:0,42:0,22:0,20 | |
| 16352 chr22 24557603 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 | |
| 16353 chr22 24558864 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 | |
| 16354 chr22 24559732 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 1/1:.:35:0,35:0,7:0,28 | |
| 16355 chr22 24560504 . G A . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 1/1:.:20:0,20:0,11:0,9 | |
| 16356 chr22 24560691 . C T . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=2.2598e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,9:0,12 1/1:.:15:0,15:0,7:0,8 | |
| 16357 chr22 24560716 . T C . PASS DP=26;SS=1;SSC=0;GPV=2.8292e-11;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,9:0,3:0,6 1/1:.:13:0,10:0,7:0,3 | |
| 16358 chr22 24562049 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,26:0,14 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 | |
| 16359 chr22 24562148 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=5.8102e-14;SPV=0.67738 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:29,22:15,11:14,11 0/1:.:37:22,15:10,8:12,7 | |
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| 16361 chr22 24564159 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 1/1:.:24:0,24:0,14:0,10 | |
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| 16403 chr22 24600615 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=1.6045e-17;SPV=0.51023 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:11,10:10,14 0/1:.:36:16,20:5,9:11,11 | |
| 16404 chr22 24600663 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=5.6308e-13;SPV=0.45513 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:12,8:13,10 0/1:.:35:19,16:9,5:10,11 | |
| 16405 chr22 24601022 . A C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 1/1:.:42:0,42:0,17:0,25 | |
| 16406 chr22 24601342 . G C . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=2.0677e-18;SPV=0.44579 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:25,25:17,12:8,13 0/1:.:41:19,22:10,12:9,10 | |
| 16407 chr22 24601879 . T C . PASS DP=96;SS=1;SSC=9;GPV=4.4327e-20;SPV=0.11587 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:31,28:21,11:10,17 0/1:.:37:14,23:8,11:6,12 | |
| 16408 chr22 24602433 . T A . PASS DP=67;SS=1;SSC=5;GPV=1.7027e-12;SPV=0.29833 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:15,10:9,9 0/1:.:24:11,13:5,5:6,8 | |
| 16409 chr22 24606807 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=6;GPV=7.6248e-11;SPV=0.2063 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:21,13:14,8:7,5 0/1:.:29:14,15:11,6:3,9 | |
| 16410 chr22 24606813 . C G . PASS DP=66;SS=1;SSC=7;GPV=4.4405e-12;SPV=0.16898 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:21,14:14,8:7,6 0/1:.:31:14,17:12,6:2,11 | |
| 16411 chr22 24607291 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=3;GPV=2.0241e-17;SPV=0.44417 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:10,17:10,8 0/1:.:30:12,18:5,14:7,4 | |
| 16412 chr22 24607967 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=6.5235e-17;SPV=0.60561 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:14,13:10,13 0/1:.:33:16,17:8,11:8,6 | |
| 16413 chr22 24608239 . T G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=4.9467e-16;SPV=0.86948 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:25,25:18,13:7,12 0/1:.:43:25,17:13,7:12,10 | |
| 16414 chr22 24608641 . T C . PASS DP=100;SS=1;SSC=6;GPV=2.223e-19;SPV=0.21152 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:12,10:17,14 0/1:.:47:21,26:7,11:14,15 | |
| 16415 chr22 24610703 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=2;GPV=4.7997e-07;SPV=0.5354 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:18,11:10,3:8,8 0/1:.:17:10,7:5,5:5,2 | |
| 16416 chr22 24610743 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 1/1:.:19:0,19:0,10:0,9 | |
| 16417 chr22 24612601 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=11;GPV=4.6505e-14;SPV=0.073377 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:32,18:21,9:11,9 0/1:.:35:16,19:11,8:5,11 | |
| 16418 chr22 24613908 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=4.4044e-13;SPV=0.708 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:7,12:12,5 0/1:.:39:22,17:15,12:7,5 | |
| 16419 chr22 24614421 . G A . PASS DP=46;SS=1;SSC=1;GPV=6.654e-13;SPV=0.68283 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:6,12:5,5:1,7 0/1:.:28:10,18:8,12:2,6 | |
| 16420 chr22 24615450 . A T . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=6.4769e-21;SPV=0.46408 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:13,16:10,13 0/1:.:39:16,23:8,13:8,10 | |
| 16421 chr22 24615934 . A T . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=3.0367e-13;SPV=0.73233 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:9,7:10,12 0/1:.:33:18,15:12,9:6,6 | |
| 16422 chr22 24616791 . G T . PASS DP=58;SS=1;SSC=10;GPV=1.6514e-11;SPV=0.091029 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:20,14:9,5:11,9 0/1:.:24:9,15:4,9:5,6 | |
| 16423 chr22 24618277 . C G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=8.2552e-11;SPV=0.87344 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:11,8:3,6 0/1:.:36:22,14:15,10:7,4 | |
| 16424 chr22 24618473 . A C . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=9.3487e-14;SPV=0.56889 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:12,13:12,6 0/1:.:38:21,17:9,6:12,11 | |
| 16425 chr22 24619361 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.8199e-14;SPV=0.63529 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:11,11:7,11 0/1:.:26:12,14:5,6:7,8 | |
| 16426 chr22 24619406 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=9;GPV=3.7826e-06;SPV=0.12085 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:23,7:12,6:11,1 0/1:.:21:12,9:3,8:9,1 | |
| 16427 chr22 24619777 . C G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=6.2104e-12;SPV=0.96152 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:10,7:7,16 0/1:.:19:12,7:7,4:5,3 | |
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| 16475 chr22 24661745 . C G . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=8.7556e-14;SPV=0.52227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:8,8:7,10 0/1:.:28:12,16:2,8:10,8 | |
| 16476 chr22 24665867 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=3;GPV=7.3164e-12;SPV=0.46077 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:23,12:16,9:7,3 0/1:.:53:33,20:19,7:14,13 | |
| 16477 chr22 24665874 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=4;GPV=1.5023e-06;SPV=0.37349 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:30,6:20,5:10,1 0/1:.:55:43,12:20,6:23,6 | |
| 16478 chr22 24668567 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=1.8278e-16;SPV=0.7349 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:10,17:7,6 0/1:.:34:16,18:10,10:6,8 | |
| 16479 chr22 24668997 . C G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=4.0755e-15;SPV=0.93411 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:11,11:10,14 0/1:.:35:21,14:15,7:6,7 | |
| 16480 chr22 24672592 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.037013 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:26,10:14,6:12,4 0/1:.:24:11,13:5,9:6,4 | |
| 16481 chr22 24672593 . T G . PASS DP=58;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.038523 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:26,11:15,7:11,4 0/1:.:21:9,12:4,8:5,4 | |
| 16482 chr22 24672997 . C T . PASS DP=48;SS=1;SSC=3;GPV=3.6075e-09;SPV=0.39945 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:15,12:9,9:6,3 0/1:.:21:10,11:7,6:3,5 | |
| 16483 chr22 24674216 . T C . PASS DP=47;SS=1;SSC=3;GPV=0.0012811;SPV=0.47123 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:20,4:8,2:12,2 0/1:.:23:18,5:13,4:5,1 | |
| 16484 chr22 24674444 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=5.2873e-05;SPV=0.95552 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:19,9:8,3:11,6 0/1:.:25:21,4:10,1:11,3 | |
| 16485 chr22 24674589 . A G . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=0.00021011;SPV=0.92449 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:12,7:10,6:2,1 0/1:.:19:15,4:5,2:10,2 | |
| 16486 chr22 24674998 . T C . PASS DP=45;SS=1;SSC=2;GPV=2.7295e-10;SPV=0.54013 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:11,13:5,6:6,7 0/1:.:21:9,12:3,8:6,4 | |
| 16487 chr22 24675402 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=3.1807e-12;SPV=0.8117 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:10,15:5,6:5,9 0/1:.:29:14,15:7,11:7,4 | |
| 16488 chr22 24675812 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=5;GPV=7.191e-13;SPV=0.25214 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:17,12:9,7:8,5 0/1:.:40:19,21:11,10:8,11 | |
| 16489 chr22 24676320 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=3;GPV=6.451e-11;SPV=0.46656 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:11,11:3,3:8,8 0/1:.:29:13,16:6,9:7,7 | |
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| 16491 chr22 24678240 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=6.4394e-10;SPV=0.9422 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:11,8:5,7 0/1:.:34:23,11:12,5:11,6 | |
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| 16538 chr22 24700846 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=3;GPV=1.3596e-16;SPV=0.44955 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:11,17:14,9 0/1:.:29:13,16:9,7:4,9 | |
| 16539 chr22 24701011 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.5502e-15;SPV=0.88402 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:9,11:15,16 0/1:.:31:18,13:7,5:11,8 | |
| 16540 chr22 24701281 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=9.6585e-18;SPV=0.88882 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:15,28:9,11:6,17 0/1:.:28:13,15:6,9:7,6 | |
| 16541 chr22 24702404 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=3.2512e-15;SPV=0.70446 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:10,18:10,7 0/1:.:25:12,13:4,6:8,7 | |
| 16542 chr22 24703931 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.1494e-07;SPV=0.9672 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:10,8:7,6 0/1:.:24:18,6:10,2:8,4 | |
| 16543 chr22 24704477 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=8.8908e-21;SPV=0.80561 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:21,34:5,14:16,20 0/1:.:31:14,17:2,9:12,8 | |
| 16544 chr22 24704669 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=2.781e-14;SPV=0.74137 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:15,8:8,14 0/1:.:34:19,15:16,9:3,6 | |
| 16545 chr22 24705603 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.034893 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:14,8:10,12 0/1:.:27:8,19:6,10:2,9 | |
| 16546 chr22 24706066 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.0806e-19;SPV=0.91643 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:12,26:10,13:2,13 0/1:.:36:16,20:12,10:4,10 | |
| 16547 chr22 24706127 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=3.5024e-11;SPV=0.57193 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:12,14:10,3 0/1:.:27:15,12:8,9:7,3 | |
| 16548 chr22 24708388 . T C . PASS DP=59;SS=3;SSC=13;GPV=1;SPV=0.040518 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:11,6:5,11 1/1:.:26:6,20:2,13:4,7 | |
| 16549 chr22 24710141 . G T . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=5.9795e-14;SPV=0.70969 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:11,16:12,6 0/1:.:31:17,14:8,12:9,2 | |
| 16550 chr22 24710360 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=1.1052e-12;SPV=0.43202 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:13,6:8,14 0/1:.:22:10,12:6,3:4,9 | |
| 16551 chr22 24711599 . G C . PASS DP=42;SS=1;SSC=8;GPV=3.7193e-07;SPV=0.13032 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:16,8:9,6:7,2 0/1:.:18:8,10:4,2:4,8 | |
| 16552 chr22 24712800 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=17;GPV=1;SPV=0.016135 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:30,16:17,10:13,6 0/1:.:38:15,23:7,12:8,11 | |
| 16553 chr22 24714428 . T G . PASS DP=59;SS=1;SSC=11;GPV=1.8424e-11;SPV=0.076456 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:19,12:7,8:12,4 0/1:.:28:11,17:5,12:6,5 | |
| 16554 chr22 24714689 . T G . PASS DP=63;SS=1;SSC=7;GPV=6.161e-17;SPV=0.16232 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:13,17:7,6:6,11 0/1:.:33:9,23:3,10:6,13 | |
| 16555 chr22 24714909 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,26:0,20 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 16556 chr22 24717772 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=1.1473e-10;SPV=0.87585 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:9,7:7,11 0/1:.:22:13,9:4,3:9,6 | |
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| 16588 chr22 24740562 . G A . PASS DP=43;SS=1;SSC=2;GPV=5.2508e-08;SPV=0.56476 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:12,10:2,6:10,4 0/1:.:21:11,10:5,4:6,6 | |
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| 16592 chr22 24747007 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6514e-11;SPV=0.91226 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:9,13:4,8:5,5 0/1:.:36:20,16:10,7:10,9 | |
| 16593 chr22 24748087 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=1.2588e-07;SPV=0.59787 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:15,8:7,1:8,7 0/1:.:34:22,12:11,7:11,5 | |
| 16594 chr22 24748709 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=1.5236e-09;SPV=0.79635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:11,12:7,5:4,7 0/1:.:27:15,12:9,6:6,6 | |
| 16595 chr22 24749232 . C T . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=7.7415e-08;SPV=0.92877 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:12,12:7,5:5,7 0/1:.:24:16,8:7,6:9,2 | |
| 16596 chr22 24749486 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 | |
| 16597 chr22 24749504 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=9;GPV=2.7365e-11;SPV=0.10378 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:27,12:15,5:12,7 0/1:.:38:20,18:11,10:9,8 | |
| 16598 chr22 24750977 . A T . PASS DP=55;SS=1;SSC=4;GPV=8.49e-10;SPV=0.33804 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:16,11:11,8:5,3 0/1:.:28:14,14:13,12:1,2 | |
| 16599 chr22 24751192 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=6.2985e-12;SPV=0.64817 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:11,9:11,9 0/1:.:30:17,13:7,9:10,4 | |
| 16600 chr22 24752621 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=4.4405e-12;SPV=0.75729 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:5,8:10,7 0/1:.:36:20,16:14,6:6,10 | |
| 16601 chr22 24753181 . T C . PASS DP=49;SS=1;SSC=2;GPV=1.1173e-08;SPV=0.53992 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:13,10:9,2:4,8 0/1:.:26:14,12:7,8:7,4 | |
| 16602 chr22 24755671 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=3;GPV=3.686e-22;SPV=0.49201 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:15,25:6,11:9,14 0/1:.:43:15,28:8,13:7,15 | |
| 16603 chr22 24755923 . C A . PASS DP=69;SS=1;SSC=8;GPV=6.8388e-10;SPV=0.14419 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:22,10:10,5:12,5 0/1:.:36:18,16:5,8:13,8 | |
| 16604 chr22 24755924 . A C . PASS DP=72;SS=1;SSC=5;GPV=1.6064e-11;SPV=0.28778 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,14:10,8:12,6 0/1:.:35:17,16:5,8:12,8 | |
| 16605 chr22 24758586 . T A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=3.0519e-14;SPV=0.96128 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:11,11:6,10 0/1:.:42:26,16:16,10:10,6 | |
| 16606 chr22 24759176 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=5;GPV=1.1134e-08;SPV=0.30832 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:26,12:10,9:16,3 0/1:.:27:16,11:8,5:8,6 | |
| 16607 chr22 24759177 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=4.6893e-11;SPV=0.66635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:9,9:17,10 0/1:.:25:15,10:8,5:7,5 | |
| 16608 chr22 24760167 . A C . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=2.8183e-16;SPV=0.74832 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:22,27:6,17:16,10 0/1:.:28:14,14:8,10:6,4 | |
| 16609 chr22 24761344 . A T . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=3.2981e-15;SPV=0.78334 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:7,12:11,8 0/1:.:41:22,19:11,11:11,8 | |
| 16610 chr22 24762359 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=1.7027e-12;SPV=0.58759 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:15,10:7,10 0/1:.:25:13,12:7,9:6,3 | |
| 16611 chr22 24762630 . G C . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=7.7158e-19;SPV=0.66972 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:6,14:12,10 0/1:.:42:19,23:9,10:10,13 | |
| 16612 chr22 24763458 . G T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=1.0476e-18;SPV=0.90327 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:6,19:11,7 0/1:.:43:22,21:9,14:13,7 | |
| 16613 chr22 24763525 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=4.9663e-15;SPV=0.5099 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:9,8:10,8 0/1:.:48:25,23:17,8:8,15 | |
| 16614 chr22 24763895 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=8.2973e-14;SPV=0.79975 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:6,9:10,10 0/1:.:34:18,16:3,11:15,5 | |
| 16615 chr22 24764331 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=1.1614e-17;SPV=0.76133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:23,27:8,10:15,17 0/1:.:37:19,18:11,13:8,5 | |
| 16616 chr22 24765607 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=5.0247e-17;SPV=0.88844 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:17,24:12,17:5,7 0/1:.:40:21,19:13,12:8,7 | |
| 16617 chr22 24765924 . G C . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=2.5278e-15;SPV=0.79265 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:11,12:13,11 0/1:.:40:23,17:11,7:12,10 | |
| 16618 chr22 24766192 . G T . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=8.9875e-21;SPV=0.98008 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:19,34:11,18:8,16 0/1:.:40:22,18:10,8:12,10 | |
| 16619 chr22 24766332 . G T . PASS DP=73;SS=1;SSC=3;GPV=1.5635e-16;SPV=0.41116 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:10,11:12,15 0/1:.:25:10,15:6,8:4,7 | |
| 16620 chr22 24766543 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=1.2401e-12;SPV=0.77725 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:8,13:10,7 0/1:.:26:14,12:5,5:9,7 | |
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| 16622 chr22 24767657 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=3.9286e-14;SPV=0.69312 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:15,11:9,14 0/1:.:23:12,11:6,5:6,6 | |
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| 16672 chr22 24796465 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,24:0,14 1/1:.:32:0,32:0,21:0,11 | |
| 16673 chr22 24796519 . T A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
| 16674 chr22 24796776 . A T . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=0.00096618;SPV=0.93706 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:3,6:3,2:0,4 0/1:.:17:3,2:2,1:1,1 | |
| 16675 chr22 24798597 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 | |
| 16676 chr22 24798855 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,14:0,23 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 | |
| 16677 chr22 24799162 . G C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 16678 chr22 24801436 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=6.4906e-14;SPV=0.78809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:11,13:7,9 0/1:.:27:14,13:10,6:4,7 | |
| 16679 chr22 24801861 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,17:0,28 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
| 16680 chr22 24802538 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 1/1:.:27:0,27:0,16:0,11 | |
| 16681 chr22 24802560 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
| 16682 chr22 24805350 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,24:0,34 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 | |
| 16683 chr22 24805711 . A C . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,18:0,35 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 | |
| 16684 chr22 24805779 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,16:0,35 1/1:.:38:0,38:0,15:0,23 | |
| 16685 chr22 24806082 . G C . PASS DP=72;SS=1;SSC=5;GPV=9.5353e-13;SPV=0.30209 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:27,20:13,12:14,8 0/1:.:25:12,13:6,7:6,6 | |
| 16686 chr22 24806123 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=2.4655e-13;SPV=0.46377 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:12,10:11,11 0/1:.:25:12,13:7,8:5,5 | |
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| 16688 chr22 24806840 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.043509 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:36,22:14,9:22,13 0/1:.:38:16,22:7,7:9,15 | |
| 16689 chr22 24808547 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:29:0,29:0,22:0,7 | |
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| 16704 chr22 24817970 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,24:0,17 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
| 16705 chr22 24818151 . C G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,14:0,33 1/1:.:20:0,20:0,8:0,12 | |
| 16706 chr22 24818241 . A T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,16:0,28 1/1:.:28:0,28:0,6:0,22 | |
| 16707 chr22 24818461 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,23:0,14 1/1:.:21:0,21:0,18:0,3 | |
| 16708 chr22 24818715 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,16:0,24 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
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| 16715 chr22 24822255 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 1/1:.:26:0,26:0,13:0,13 | |
| 16716 chr22 24823026 . A G . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,28:0,24 1/1:.:46:0,46:0,17:0,29 | |
| 16717 chr22 24823465 . T G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,22:0,10 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 16718 chr22 24823519 . G T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 | |
| 16719 chr22 24823730 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,28:0,13 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 | |
| 16720 chr22 24823816 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,10:0,28 1/1:.:40:0,40:0,15:0,25 | |
| 16721 chr22 24824405 . A T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,25:0,22 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 | |
| 16722 chr22 24824479 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,25:0,24 1/1:.:28:0,28:0,18:0,10 | |
| 16723 chr22 24834874 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=1.7848e-09;SPV=0.8985 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:12,7:9,9 0/1:.:29:20,9:10,5:10,4 | |
| 16724 chr22 24836661 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=3.104e-14;SPV=0.4973 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:8,10:10,8 0/1:.:34:16,18:8,4:8,14 | |
| 16725 chr22 24841311 . C G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=2.5278e-15;SPV=0.95795 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:13,12:10,14 0/1:.:38:24,14:11,7:13,7 | |
| 16726 chr22 24842325 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=4.2971e-18;SPV=0.98088 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:17,31:5,12:12,19 0/1:.:32:18,14:4,7:14,7 | |
| 16727 chr22 24843590 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.8275e-16;SPV=0.80725 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:17,28:8,10:9,18 0/1:.:22:10,12:6,4:4,8 | |
| 16728 chr22 24844500 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=6.5235e-17;SPV=0.87811 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:10,15:12,13 0/1:.:33:18,15:10,8:8,7 | |
| 16729 chr22 24844587 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
| 16730 chr22 24845414 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=6;GPV=1.1315e-12;SPV=0.2007 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:25,16:11,6:14,10 0/1:.:33:16,17:12,12:4,5 | |
| 16731 chr22 24845870 . G C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.5685e-14;SPV=0.97074 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:11,21:5,9:6,12 0/1:.:33:18,15:6,8:12,7 | |
| 16732 chr22 24846625 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=2.4039e-14;SPV=0.99246 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:12,23:8,11:4,12 0/1:.:33:20,13:7,7:13,6 | |
| 16733 chr22 24846741 . A C . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=7.3303e-11;SPV=0.99435 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:8,17:3,9:5,8 0/1:.:27:17,10:7,2:10,8 | |
| 16734 chr22 24847009 . T G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=7.5673e-13;SPV=0.88783 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:9,11:6,10 0/1:.:24:13,11:6,7:7,4 | |
| 16735 chr22 24848093 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=6;GPV=6.4956e-13;SPV=0.24213 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:10,6:12,11 0/1:.:29:13,16:7,10:6,6 | |
| 16736 chr22 24848661 . T A . PASS DP=91;SS=1;SSC=1;GPV=6.8291e-20;SPV=0.6827 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:11,17:10,10 0/1:.:43:20,23:10,7:10,16 | |
| 16737 chr22 24848912 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.2981e-15;SPV=0.95855 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:9,12:11,14 0/1:.:33:20,13:10,7:10,6 | |
| 16738 chr22 24849151 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.1883e-17;SPV=0.85804 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:19,28:10,15:9,13 0/1:.:32:16,16:8,8:8,8 | |
| 16739 chr22 24850145 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=11;GPV=3.9427e-17;SPV=0.065736 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:13,10:10,5 0/1:.:50:21,29:12,14:9,15 | |
| 16740 chr22 24850767 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=10;GPV=8.2973e-14;SPV=0.091429 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:10,9:11,6 0/1:.:33:13,20:5,3:8,17 | |
| 16741 chr22 24850970 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=2.581e-13;SPV=0.65999 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:12,8:12,11 0/1:.:38:22,16:10,8:12,8 | |
| 16742 chr22 24851663 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=1.3287e-16;SPV=0.6114 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:7,13:11,11 0/1:.:30:13,17:10,8:3,9 | |
| 16743 chr22 24852782 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,18:0,10 1/1:.:27:0,27:0,9:0,18 | |
| 16744 chr22 24860924 . T A . PASS DP=22;SS=1;SSC=4;GPV=0.047826;SPV=0.35385 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:7,2:6,2:1,0 0/1:.:8:2,2:0,1:2,1 | |
| 16745 chr22 24869823 . G T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 16746 chr22 24870005 . G A . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,34:0,19 1/1:.:45:0,45:0,25:0,20 | |
| 16747 chr22 24875077 . G C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:25:0,25:0,15:0,10 | |
| 16748 chr22 24881571 . C A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,14:0,27 1/1:.:29:0,29:0,9:0,20 | |
| 16749 chr22 24884567 . T G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 | |
| 16750 chr22 24886798 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 1/1:.:22:0,22:0,4:0,18 | |
| 16751 chr22 24887635 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=4.3784e-17;SPV=0.60252 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:24,28:10,17:14,11 0/1:.:28:13,15:8,7:5,8 | |
| 16752 chr22 24887811 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.3908e-17;SPV=0.84461 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:11,9:6,17 0/1:.:33:16,17:8,11:8,6 | |
| 16753 chr22 24887942 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=12;GPV=2.9394e-12;SPV=0.053169 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:12,6:12,11 0/1:.:21:7,14:6,3:1,11 | |
| 16754 chr22 24888313 . T G . PASS DP=64;SS=1;SSC=3;GPV=8.2552e-11;SPV=0.40815 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:12,5:12,12 0/1:.:23:12,11:8,3:4,8 | |
| 16755 chr22 24888851 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=4.39e-14;SPV=0.55879 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:13,12:10,10 0/1:.:28:14,14:8,7:6,7 | |
| 16756 chr22 24889794 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=5.295e-10;SPV=0.85106 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:5,5:15,12 0/1:.:25:16,9:6,3:10,6 | |
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| 16801 chr22 25011002 . T A . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=1.4766e-14;SPV=0.79316 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:9,13:8,7 0/1:.:36:19,17:12,7:7,10 | |
| 16802 chr22 25011513 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=1.5461e-16;SPV=0.42311 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:25,25:11,9:14,16 0/1:.:31:14,17:7,5:7,12 | |
| 16803 chr22 25012375 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=12;GPV=5.0221e-16;SPV=0.062721 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:12,14:12,7 0/1:.:28:9,19:7,8:2,11 | |
| 16804 chr22 25014299 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=1.1473e-10;SPV=0.95206 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:10,9:4,9 0/1:.:24:15,9:6,5:9,4 | |
| 16805 chr22 25017109 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=5.9519e-12;SPV=0.73778 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:15,10:7,5 0/1:.:47:30,17:16,13:14,4 | |
| 16806 chr22 25018197 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=1.2682e-14;SPV=0.81602 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:12,22:6,13:6,9 0/1:.:23:10,13:6,9:4,4 | |
| 16807 chr22 25018461 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=4;GPV=9.6585e-18;SPV=0.36753 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:7,12:8,8 0/1:.:36:13,23:5,10:8,13 | |
| 16808 chr22 25018867 . G T . PASS DP=61;SS=1;SSC=9;GPV=2.6864e-14;SPV=0.10268 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:10,7:7,9 0/1:.:28:9,19:6,9:3,10 | |
| 16809 chr22 25018988 . A C . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.8979e-14;SPV=0.88785 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:7,20:3,14:4,6 0/1:.:21:8,13:4,6:4,7 | |
| 16810 chr22 25019021 . G A . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,16:0,11 1/1:.:17:0,17:0,9:0,8 | |
| 16811 chr22 25020056 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,27:0,20 1/1:.:35:0,35:0,25:0,10 | |
| 16812 chr22 25020325 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=16;GPV=1;SPV=0.024659 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:22,13:10,7:12,6 0/1:.:40:15,25:4,10:11,15 | |
| 16813 chr22 25023557 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=7.7551e-09;SPV=0.70925 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:20,14:6,11:14,3 0/1:.:24:15,9:9,4:6,5 | |
| 16814 chr22 25024729 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 16815 chr22 25024825 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=1.8199e-14;SPV=0.52841 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:11,10:8,12 0/1:.:25:11,14:7,9:4,5 | |
| 16816 chr22 25028612 . C A . PASS DP=72;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.029631 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:27,17:7,6:20,11 0/1:.:28:10,18:4,6:6,12 | |
| 16817 chr22 25029315 . A G . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,26:0,32 1/1:.:46:0,46:0,23:0,23 | |
| 16818 chr22 25029373 . T C . PASS DP=106;SS=1;SSC=3;GPV=9.4706e-18;SPV=0.43092 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:36,27:18,12:18,15 0/1:.:43:23,20:12,11:11,9 | |
| 16819 chr22 25029472 . A C . PASS DP=95;SS=1;SSC=1;GPV=1.1672e-21;SPV=0.73484 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:21,30:10,15:11,15 0/1:.:44:20,24:10,13:10,11 | |
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| 16821 chr22 25030701 . T G . PASS DP=73;SS=1;SSC=4;GPV=1.5805e-15;SPV=0.32843 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:11,16:10,5 0/1:.:31:13,18:8,10:5,8 | |
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| 16850 chr22 25045034 . G T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,13:0,28 1/1:.:28:0,28:0,10:0,18 | |
| 16851 chr22 25045176 . T A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,16:0,29 1/1:.:29:0,29:0,12:0,17 | |
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| 16860 chr22 25049557 . C G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,14:0,21 1/1:.:18:0,18:0,12:0,6 | |
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| 16869 chr22 25052108 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,21:0,24 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 | |
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| 16871 chr22 25052686 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,24:0,16 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
| 16872 chr22 25052779 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,31:0,17 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 | |
| 16873 chr22 25053199 . T A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,28:0,20 1/1:.:20:0,20:0,9:0,11 | |
| 16874 chr22 25054036 . A C . PASS DP=50;SOMATIC;SS=2;SSC=7;GPV=1;SPV=0.18182 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:30:6,0:4,0:2,0 0/1:.:20:3,2:2,1:1,1 | |
| 16875 chr22 25055013 . T A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 1/1:.:31:0,31:0,20:0,11 | |
| 16876 chr22 25055624 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,27:0,18 1/1:.:31:0,31:0,10:0,21 | |
| 16877 chr22 25056467 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 | |
| 16878 chr22 25057587 . C G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,23:0,20 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 | |
| 16879 chr22 25058406 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:26:0,26:0,13:0,13 | |
| 16880 chr22 25058457 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 1/1:.:25:0,25:0,10:0,15 | |
| 16881 chr22 25058657 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,27:0,24 1/1:.:33:0,33:0,22:0,11 | |
| 16882 chr22 25058691 . A C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 1/1:.:21:0,21:0,14:0,7 | |
| 16883 chr22 25058845 . A T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,19:0,27 1/1:.:28:0,28:0,12:0,16 | |
| 16884 chr22 25059120 . A C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,22:0,11 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 16885 chr22 25059316 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=5;GPV=3.9143e-11;SPV=0.29075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:10,7:9,9 0/1:.:21:9,12:4,5:5,7 | |
| 16886 chr22 25059373 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 | |
| 16887 chr22 25060142 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 16888 chr22 25060605 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,27:0,21 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
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| 16890 chr22 25061982 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 1/1:.:18:0,18:0,11:0,7 | |
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| 16934 chr22 25084215 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=2.2152e-16;SPV=0.67082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:10,14:14,11 0/1:.:35:18,17:14,6:4,11 | |
| 16935 chr22 25084905 . G C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,25:0,19 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
| 16936 chr22 25085014 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=4.8769e-15;SPV=0.55227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:10,8:7,10 0/1:.:38:18,20:7,8:11,12 | |
| 16937 chr22 25085103 . G C . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=3.6641e-16;SPV=0.77466 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:9,11:11,13 0/1:.:35:18,17:6,11:12,6 | |
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| 16939 chr22 25085451 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=1.7063e-13;SPV=0.87893 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:11,9:8,11 0/1:.:37:22,15:11,7:11,8 | |
| 16940 chr22 25085590 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=6.5895e-16;SPV=0.96059 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:12,27:4,12:8,15 0/1:.:22:11,11:1,2:10,9 | |
| 16941 chr22 25086487 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=1.3916e-15;SPV=0.9574 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:12,15:9,12 0/1:.:33:20,13:10,9:10,4 | |
| 16942 chr22 25086631 . C G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.6279e-15;SPV=0.96449 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:23,30:10,15:13,15 0/1:.:24:15,9:5,4:10,5 | |
| 16943 chr22 25087024 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 1/1:.:22:0,22:0,7:0,15 | |
| 16944 chr22 25087218 . A C . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=5.7269e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,13:0,8 1/1:.:16:0,16:0,5:0,11 | |
| 16945 chr22 25087800 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=3;GPV=6.58e-14;SPV=0.46331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:11,9:11,9 0/1:.:37:19,18:14,8:5,10 | |
| 16946 chr22 25087814 . T C . PASS DP=92;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.57609 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:1,52:0,27:1,25 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 | |
| 16947 chr22 25087954 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=6;GPV=1.5567e-13;SPV=0.23926 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:8,4:18,15 0/1:.:30:14,16:8,4:6,12 | |
| 16948 chr22 25088188 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=6;GPV=2.7419e-13;SPV=0.24811 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:10,10:14,9 0/1:.:27:12,15:7,8:5,7 | |
| 16949 chr22 25089400 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=17;GPV=1;SPV=0.017386 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:26,12:11,6:15,6 0/1:.:28:11,17:7,12:4,5 | |
| 16950 chr22 25090005 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=5;GPV=9.653e-15;SPV=0.30574 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:17,9:9,12 0/1:.:32:15,17:7,12:8,5 | |
| 16951 chr22 25091182 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=8.503e-12;SPV=0.99657 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:14,19:6,9:8,10 0/1:.:41:29,12:18,6:11,6 | |
| 16952 chr22 25091877 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.4568e-12;SPV=0.91146 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:10,9:8,10 0/1:.:34:21,13:8,6:13,7 | |
| 16953 chr22 25092600 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 1/1:.:38:0,38:0,15:0,23 | |
| 16954 chr22 25092761 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=9.8334e-16;SPV=0.56927 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:16,16:8,9 0/1:.:29:14,15:7,9:7,6 | |
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| 16956 chr22 25093954 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=5;GPV=1.1494e-07;SPV=0.30779 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:23,11:13,4:10,7 0/1:.:21:12,9:7,3:5,6 | |
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| 17005 chr22 25134929 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=2.3891e-13;SPV=0.98514 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:12,13:12,13 0/1:.:30:21,9:12,3:9,6 | |
| 17006 chr22 25135219 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.0977e-18;SPV=0.99397 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:17,35:7,14:10,21 0/1:.:27:16,11:7,8:9,3 | |
| 17007 chr22 25135706 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,29:0,17 1/1:.:23:0,23:0,14:0,9 | |
| 17008 chr22 25135992 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
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| 17010 chr22 25136586 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=12;GPV=1.0148e-14;SPV=0.050124 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:19,13:8,5:11,8 0/1:.:38:14,24:5,7:9,17 | |
| 17011 chr22 25138717 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=8.9089e-11;SPV=0.7172 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:6,7:11,7 0/1:.:34:20,14:8,5:12,9 | |
| 17012 chr22 25140571 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,28:0,30 1/1:.:29:0,29:0,10:0,19 | |
| 17013 chr22 25141393 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=2.4078e-13;SPV=0.87437 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:15,22:7,11:8,11 0/1:.:23:12,11:5,6:7,5 | |
| 17014 chr22 25143664 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=1.9669e-13;SPV=0.55075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:10,13:6,3 0/1:.:35:17,18:5,11:12,7 | |
| 17015 chr22 25143872 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=4;GPV=6.58e-14;SPV=0.31953 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:13,8:13,12 0/1:.:31:15,16:12,6:3,10 | |
| 17016 chr22 25144008 . A C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.4906e-14;SPV=0.96524 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:18,26:10,12:8,14 0/1:.:23:14,9:3,4:11,5 | |
| 17017 chr22 25144875 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=4.8851e-14;SPV=0.43386 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:12,8:14,15 0/1:.:25:12,13:8,5:4,8 | |
| 17018 chr22 25144995 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=3;GPV=7.2383e-18;SPV=0.43659 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:7,12:9,8 0/1:.:40:16,24:10,20:6,4 | |
| 17019 chr22 25146552 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=2.6525e-14;SPV=0.89669 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:11,12:11,8 0/1:.:49:31,18:18,12:13,6 | |
| 17020 chr22 25147373 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.783e-13;SPV=0.86995 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:5,12:8,7 0/1:.:29:15,14:9,7:6,7 | |
| 17021 chr22 25148064 . T C . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=1.6529e-10;SPV=0.98998 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:7,18:4,3:3,15 0/1:.:17:10,7:2,5:8,2 | |
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| 17023 chr22 25149942 . G C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=6.8178e-12;SPV=0.88306 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:27,24:17,12:10,12 0/1:.:20:13,7:8,5:5,2 | |
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| 17071 chr22 25204610 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=4.6768e-16;SPV=0.88892 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:7,12:14,14 0/1:.:34:19,15:11,9:8,6 | |
| 17072 chr22 25204732 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=5.2507e-16;SPV=0.81257 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:8,9:13,15 0/1:.:37:20,17:6,9:14,8 | |
| 17073 chr22 25205229 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 | |
| 17074 chr22 25205498 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=3;GPV=7.3839e-17;SPV=0.49175 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:17,17:6,6 0/1:.:38:18,20:12,10:6,10 | |
| 17075 chr22 25206602 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
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| 17078 chr22 25207957 . G C . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 1/1:.:16:0,16:0,10:0,6 | |
| 17079 chr22 25208510 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,20:0,29 1/1:.:31:0,31:0,10:0,21 | |
| 17080 chr22 25208749 . T G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,30:0,17 1/1:.:35:0,35:0,24:0,11 | |
| 17081 chr22 25208975 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=6.6242e-17;SPV=0.69598 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:9,9:8,14 0/1:.:35:16,19:11,6:5,13 | |
| 17082 chr22 25209017 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,22:0,25 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 | |
| 17083 chr22 25210064 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,27:0,11 1/1:.:30:0,30:0,18:0,12 | |
| 17084 chr22 25210894 . C G . PASS DP=68;SS=1;SSC=11;GPV=2.2072e-13;SPV=0.072465 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:16,6:4,7 0/1:.:35:14,21:9,7:5,14 | |
| 17085 chr22 25211008 . C G . PASS DP=71;SS=1;SSC=6;GPV=1.0404e-13;SPV=0.20436 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:12,10:9,6 0/1:.:34:15,19:5,9:10,10 | |
| 17086 chr22 25211292 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=3.1677e-14;SPV=0.98213 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:14,26:7,14:7,12 0/1:.:22:13,9:6,6:7,3 | |
| 17087 chr22 25212581 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 1/1:.:34:0,34:0,12:0,22 | |
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| 17089 chr22 25213224 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=2.7231e-11;SPV=0.81446 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:9,10:7,6 0/1:.:31:18,13:11,3:7,10 | |
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| 17133 chr22 25230818 . A T . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=3.2861e-10;SPV=0.61823 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:22,14:11,10:11,4 0/1:.:34:21,13:6,2:15,11 | |
| 17134 chr22 25231933 . A T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=3.2811e-12;SPV=0.81831 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:7,5:10,14 0/1:.:27:15,12:10,4:5,8 | |
| 17135 chr22 25232130 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=3;GPV=9.2302e-10;SPV=0.42694 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:11,7:7,6 0/1:.:25:13,12:9,8:4,4 | |
| 17136 chr22 25232419 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=1.0222e-17;SPV=0.72621 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:9,17:13,9 0/1:.:38:19,19:14,15:5,4 | |
| 17137 chr22 25232647 . C T . PASS DP=34;SS=1;SSC=0;GPV=3.5146e-20;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,7:0,10 1/1:.:17:0,17:0,8:0,9 | |
| 17138 chr22 25233031 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=1.1213e-16;SPV=0.79446 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:5,14:9,8 0/1:.:35:16,19:6,10:10,9 | |
| 17139 chr22 25233394 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=9;GPV=1.8524e-14;SPV=0.10244 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:15,9:10,9 0/1:.:32:13,19:5,11:8,8 | |
| 17140 chr22 25233467 . G C . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,24:0,30 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 | |
| 17141 chr22 25233519 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,22:0,33 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 17142 chr22 25234630 . T C . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,27:0,14 1/1:.:53:0,53:0,31:0,22 | |
| 17143 chr22 25236771 . G C . PASS DP=99;SS=1;SSC=10;GPV=1.4447e-17;SPV=0.087934 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:66:39,27:24,8:15,19 0/1:.:33:14,19:8,8:6,11 | |
| 17144 chr22 25237879 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=1.4766e-14;SPV=0.71706 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:10,7:12,17 0/1:.:27:14,13:6,5:8,8 | |
| 17145 chr22 25238053 . G C . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 1/1:.:24:0,24:0,9:0,15 | |
| 17146 chr22 25238055 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 1/1:.:23:0,23:0,8:0,15 | |
| 17147 chr22 25238167 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 17148 chr22 25238992 . T A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.4154e-13;SPV=0.96614 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:14,19:9,7:5,12 0/1:.:41:25,16:12,8:13,8 | |
| 17149 chr22 25240112 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 1/1:.:30:0,30:0,22:0,8 | |
| 17150 chr22 25240200 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,19:0,10 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 | |
| 17151 chr22 25240563 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,26:0,17 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 | |
| 17152 chr22 25240713 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=8;GPV=4.1337e-13;SPV=0.15434 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:11,7:8,8 0/1:.:30:12,18:7,6:5,12 | |
| 17153 chr22 25241405 . T A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:33:0,33:0,11:0,22 | |
| 17154 chr22 25241452 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=1.1574e-13;SPV=0.99154 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:15,23:7,13:8,10 0/1:.:34:22,12:9,7:13,5 | |
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| 17156 chr22 25243761 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.2216e-16;SPV=0.92425 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:10,22:5,11:5,11 0/1:.:33:15,18:7,9:8,9 | |
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| 17198 chr22 25273826 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=3.1307e-16;SPV=0.98845 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:13,27:5,14:8,13 0/1:.:30:17,13:7,11:10,2 | |
| 17199 chr22 25276174 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 17200 chr22 25277312 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=3.9974e-20;SPV=0.69039 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:16,26:9,13:7,13 0/1:.:39:16,23:11,10:5,13 | |
| 17201 chr22 25277610 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=3;GPV=2.751e-10;SPV=0.49802 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:22,14:13,7:9,7 0/1:.:31:18,13:7,9:11,4 | |
| 17202 chr22 25279178 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=3;GPV=2.098e-14;SPV=0.41106 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:9,11:10,9 0/1:.:28:12,16:8,8:4,8 | |
| 17203 chr22 25280052 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=1.1034e-11;SPV=0.71576 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:27,19:10,10:17,9 0/1:.:32:20,12:10,8:10,4 | |
| 17204 chr22 25280526 . A G . PASS DP=52;SS=1;SSC=2;GPV=9.8643e-08;SPV=0.61197 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:16,10:6,7:10,3 0/1:.:26:16,10:8,3:8,7 | |
| 17205 chr22 25280966 . C G . PASS DP=81;SS=1;SSC=5;GPV=1.3916e-15;SPV=0.29197 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:10,14:14,6 0/1:.:37:17,20:7,9:10,11 | |
| 17206 chr22 25281554 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=6.2293e-15;SPV=0.72247 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:7,11:9,7 0/1:.:41:21,20:12,11:9,9 | |
| 17207 chr22 25282204 . C G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=7.0781e-20;SPV=0.84095 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:17,28:14,16:3,12 0/1:.:39:18,21:7,11:11,10 | |
| 17208 chr22 25282359 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,22:0,30 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 | |
| 17209 chr22 25282455 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=6.7818e-18;SPV=0.8237 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:6,13:13,13 0/1:.:38:19,19:9,9:10,10 | |
| 17210 chr22 25282610 . C T . PASS DP=105;SS=1;SSC=2;GPV=1.3044e-19;SPV=0.55121 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:30,28:20,21:10,7 0/1:.:47:24,23:14,11:10,12 | |
| 17211 chr22 25283110 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=3.9615e-14;SPV=0.96262 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:13,11:4,9 0/1:.:46:29,17:13,8:16,9 | |
| 17212 chr22 25283264 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=1.6633e-17;SPV=0.6646 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:13,12:12,14 0/1:.:39:20,19:11,8:9,11 | |
| 17213 chr22 25284812 . G T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=8.6344e-12;SPV=0.90589 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:8,14:8,5 0/1:.:27:16,11:10,5:6,6 | |
| 17214 chr22 25285602 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=3.2889e-10;SPV=0.81294 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:5,10:11,6 0/1:.:24:14,10:5,4:9,6 | |
| 17215 chr22 25286794 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 1/1:.:19:0,19:0,10:0,9 | |
| 17216 chr22 25288722 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=6;GPV=8.8847e-06;SPV=0.22598 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:22,7:10,6:12,1 0/1:.:21:13,8:6,4:7,4 | |
| 17217 chr22 25289141 . A T . PASS DP=47;SS=1;SSC=1;GPV=1.9354e-07;SPV=0.72209 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:5,5:10,6 0/1:.:21:13,8:5,2:8,6 | |
| 17218 chr22 25289266 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=6;GPV=2.9186e-09;SPV=0.23904 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:20,11:10,6:10,5 0/1:.:27:14,13:8,2:6,11 | |
| 17219 chr22 25289538 . A G . PASS DP=44;SS=1;SSC=3;GPV=5.7286e-08;SPV=0.48921 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:12,9:8,5:4,4 0/1:.:23:12,11:5,5:7,6 | |
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| 17221 chr22 25290645 . A C . PASS DP=53;SS=1;SSC=2;GPV=2.7227e-11;SPV=0.53959 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:9,10:5,5 0/1:.:24:11,13:6,4:5,9 | |
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| 17272 chr22 25314926 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=3.2889e-10;SPV=0.75492 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:7,7:11,10 0/1:.:21:12,9:4,3:8,6 | |
| 17273 chr22 25315536 . A T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
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| 17275 chr22 25317403 . A C . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:65:0,65:0,40:0,25 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 17276 chr22 25317966 . A G . PASS DP=24;SS=1;SSC=0;GPV=3.101e-14;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,5:0,6 1/1:.:13:0,13:0,7:0,6 | |
| 17277 chr22 25318251 . A T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
| 17278 chr22 25318609 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 1/1:.:35:0,35:0,23:0,12 | |
| 17279 chr22 25318759 . C G . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,27:0,18 1/1:.:41:0,41:0,17:0,24 | |
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| 17281 chr22 25319602 . C G . PASS DP=79;SS=1;SSC=10;GPV=3.2342e-19;SPV=0.085786 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:12,16:12,11 0/1:.:28:8,20:5,7:3,13 | |
| 17282 chr22 25320101 . C G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,27:0,21 1/1:.:30:0,30:0,18:0,12 | |
| 17283 chr22 25323321 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 1/1:.:38:0,38:0,14:0,24 | |
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| 17286 chr22 25331426 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
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| 17332 chr22 25391035 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,28:0,23 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
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| 17337 chr22 25394534 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,31:0,14 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 | |
| 17338 chr22 25394652 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 17339 chr22 25395313 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=3.0926e-11;SPV=0.6924 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:12,13:3,4 0/1:.:22:11,11:10,9:1,2 | |
| 17340 chr22 25397052 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,25:0,26 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 | |
| 17341 chr22 25398058 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 | |
| 17342 chr22 25399767 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=7;GPV=6.3361e-18;SPV=0.1832 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:6,15:11,7 0/1:.:30:9,21:3,9:6,12 | |
| 17343 chr22 25400627 . A C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,25:0,15 1/1:.:33:0,33:0,21:0,12 | |
| 17344 chr22 25401200 . C T . PASS DP=105;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,31:0,30 1/1:.:44:0,44:0,28:0,16 | |
| 17345 chr22 25402665 . C G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,24:0,19 1/1:.:37:0,37:0,23:0,14 | |
| 17346 chr22 25402889 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,23:0,27 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 | |
| 17347 chr22 25403046 . T C . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,33:0,26 1/1:.:40:0,40:0,17:0,23 | |
| 17348 chr22 25403057 . T A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,26:0,18 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 | |
| 17349 chr22 25404545 . T G . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:20:0,20:0,8:0,12 | |
| 17350 chr22 25404827 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,8:0,23 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 | |
| 17351 chr22 25404872 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
| 17352 chr22 25404944 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=6.4366e-11;SPV=0.9818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:4,9:12,11 0/1:.:25:17,8:8,5:9,3 | |
| 17353 chr22 25405547 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 17354 chr22 25407863 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 1/1:.:31:0,31:0,10:0,21 | |
| 17355 chr22 25408116 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,29:0,22 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 17356 chr22 25408344 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,26:0,22 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
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| 17358 chr22 25408501 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:25:0,25:0,17:0,8 | |
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| 17399 chr22 25429125 . G A . PASS DP=102;SS=1;SSC=1;GPV=3.9685e-16;SPV=0.72329 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:32,25:18,18:14,7 0/1:.:45:27,18:14,13:13,5 | |
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| 17403 chr22 25431062 . G C . PASS DP=87;SS=1;SSC=3;GPV=1.0711e-20;SPV=0.47355 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:23,31:10,18:13,13 0/1:.:33:13,20:6,8:7,12 | |
| 17404 chr22 25431560 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=2.3391e-18;SPV=0.79551 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:14,11:8,15 0/1:.:44:23,21:15,9:8,12 | |
| 17405 chr22 25431760 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=1.3458e-12;SPV=0.94702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:10,18:6,10:4,8 0/1:.:28:15,13:8,7:7,6 | |
| 17406 chr22 25432061 . G C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=2.133e-08;SPV=0.8523 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:8,4:10,9 0/1:.:28:19,9:8,5:11,4 | |
| 17407 chr22 25432191 . G A . PASS DP=41;SS=1;SSC=2;GPV=4.6506e-10;SPV=0.51021 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:10,13:8,9:2,4 0/1:.:18:7,11:1,8:6,3 | |
| 17408 chr22 25434688 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=9;GPV=6.2985e-12;SPV=0.10443 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:27,16:20,5:7,11 0/1:.:27:12,15:7,6:5,9 | |
| 17409 chr22 25434969 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,23:0,14 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 17410 chr22 25435333 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=1.1574e-13;SPV=0.52688 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:13,12:11,10 0/1:.:26:13,13:7,7:6,6 | |
| 17411 chr22 25435494 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=1.9669e-13;SPV=0.63599 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:8,6:12,15 0/1:.:26:13,13:8,3:5,10 | |
| 17412 chr22 25435858 . T A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=2.6699e-12;SPV=0.79528 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:11,11:5,4 0/1:.:41:24,17:11,5:13,12 | |
| 17413 chr22 25436275 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=2.0601e-12;SPV=0.5793 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:9,9:12,9 0/1:.:30:16,14:11,8:5,6 | |
| 17414 chr22 25436452 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=3;GPV=2.6279e-15;SPV=0.45168 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:12,12:9,8 0/1:.:36:17,19:11,11:6,8 | |
| 17415 chr22 25437240 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=3.9615e-14;SPV=0.67019 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:9,10:16,11 0/1:.:37:21,16:11,7:10,9 | |
| 17416 chr22 25437629 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=6;GPV=9.7292e-12;SPV=0.21551 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:34,20:17,9:17,11 0/1:.:22:11,11:4,6:7,5 | |
| 17417 chr22 25437851 . T A . PASS DP=81;SS=1;SSC=9;GPV=3.3388e-14;SPV=0.10192 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:32,21:14,14:18,7 0/1:.:28:12,16:4,7:8,9 | |
| 17418 chr22 25438375 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=1.2401e-12;SPV=0.69135 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:15,16:7,6:8,10 0/1:.:33:17,16:7,9:10,7 | |
| 17419 chr22 25438634 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=1.3291e-09;SPV=0.73464 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:9,8:8,5 0/1:.:31:19,12:12,6:7,6 | |
| 17420 chr22 25439302 . C A . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 1/1:.:20:0,20:0,8:0,12 | |
| 17421 chr22 25439547 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.1669e-16;SPV=0.88782 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:6,18:4,9:2,9 0/1:.:30:11,19:4,10:7,9 | |
| 17422 chr22 25439833 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=5;GPV=7.0184e-11;SPV=0.26447 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:12,13:10,2 0/1:.:25:12,13:6,5:6,8 | |
| 17423 chr22 25441015 . A T . PASS DP=27;SS=1;SSC=0;GPV=0.0014461;SPV=0.88009 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:6,6:3,5:3,1 0/1:.:9:4,2:1,1:3,1 | |
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| 17425 chr22 25442528 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=4;GPV=1.8728e-19;SPV=0.33617 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:12,11:10,12 0/1:.:45:19,26:9,12:10,14 | |
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| 17472 chr22 25515089 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,28:0,16 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 | |
| 17473 chr22 25515104 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=2.581e-13;SPV=0.78811 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:10,10:12,9 0/1:.:40:24,16:11,6:13,10 | |
| 17474 chr22 25515333 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=3.0367e-13;SPV=0.79047 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:9,8:7,9 0/1:.:38:21,17:12,10:9,7 | |
| 17475 chr22 25516096 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=4.1486e-16;SPV=0.86351 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:22,27:11,13:11,14 0/1:.:31:17,14:9,9:8,5 | |
| 17476 chr22 25516826 . C A . PASS DP=77;SS=1;SSC=4;GPV=2.2863e-14;SPV=0.38348 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:9,4:15,16 0/1:.:33:16,17:9,8:7,9 | |
| 17477 chr22 25517042 . G T . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=3.7837e-11;SPV=0.65019 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:13,7:6,8 0/1:.:33:19,14:8,8:11,6 | |
| 17478 chr22 25517060 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=8.7033e-16;SPV=0.44554 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:8,14:8,5 0/1:.:34:14,20:8,10:6,10 | |
| 17479 chr22 25517801 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.4906e-14;SPV=0.90698 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:8,11:7,10 0/1:.:31:17,14:10,8:7,6 | |
| 17480 chr22 25518760 . C G . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=5.1713e-16;SPV=0.74484 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:16,25:7,13:9,12 0/1:.:25:11,14:8,2:3,12 | |
| 17481 chr22 25519523 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=11;GPV=2.2536e-12;SPV=0.077659 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:23,13:16,6:7,7 0/1:.:34:15,19:4,12:11,7 | |
| 17482 chr22 25519689 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=3.6448e-13;SPV=0.73764 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:14,17:4,6:10,11 0/1:.:32:16,16:7,8:9,8 | |
| 17483 chr22 25519883 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.8278e-16;SPV=0.7993 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:17,24:10,17:7,7 0/1:.:33:16,17:13,6:3,11 | |
| 17484 chr22 25521227 . C G . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=1.8624e-11;SPV=0.50356 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:11,9:12,7 0/1:.:32:18,14:9,7:9,7 | |
| 17485 chr22 25521454 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=5;GPV=6.4394e-10;SPV=0.25542 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:21,11:8,2:13,9 0/1:.:33:18,15:10,4:8,11 | |
| 17486 chr22 25522014 . A T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.1391e-19;SPV=0.89158 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:13,25:9,15:4,10 0/1:.:42:19,23:10,11:9,12 | |
| 17487 chr22 25522232 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=5;GPV=1.1574e-13;SPV=0.25163 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:25,20:13,9:12,11 0/1:.:27:12,15:4,6:8,9 | |
| 17488 chr22 25523736 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=3.2889e-10;SPV=0.85389 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:13,14:5,2:8,12 0/1:.:29:17,12:4,2:13,10 | |
| 17489 chr22 25523810 . T G . PASS DP=56;SS=1;SSC=6;GPV=1.3458e-12;SPV=0.21839 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:7,7:7,6 0/1:.:29:11,18:5,6:6,12 | |
| 17490 chr22 25523991 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=1.0894e-19;SPV=0.87056 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:3,23:1,18:2,5 1/1:.:21:4,17:2,12:2,5 | |
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| 17536 chr22 25727125 . G C . PASS DP=61;SS=1;SSC=5;GPV=9.1717e-09;SPV=0.28825 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:19,9:5,4:14,5 0/1:.:33:19,14:9,6:10,8 | |
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| 17538 chr22 25730048 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 17539 chr22 25730091 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=3;GPV=8.6344e-12;SPV=0.49027 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:15,13:6,6:9,7 0/1:.:34:17,17:8,10:9,7 | |
| 17540 chr22 25731453 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,14:0,23 1/1:.:22:0,22:0,13:0,9 | |
| 17541 chr22 25731993 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=10;GPV=8.7026e-15;SPV=0.08904 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:25,17:11,9:14,8 0/1:.:36:15,21:7,10:8,11 | |
| 17542 chr22 25732572 . G C . PASS DP=89;SS=1;SSC=10;GPV=4.5631e-21;SPV=0.089064 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:26,28:12,15:14,13 0/1:.:35:11,24:6,9:5,15 | |
| 17543 chr22 25732873 . G T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 1/1:.:22:0,22:0,11:0,11 | |
| 17544 chr22 25733958 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=5.6872e-15;SPV=0.86484 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:15,23:12,14:3,9 0/1:.:28:14,14:7,8:7,6 | |
| 17545 chr22 25734820 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=4;GPV=2.3357e-19;SPV=0.32906 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:10,20:0,12:10,8 1/1:.:32:8,24:2,12:6,12 | |
| 17546 chr22 25735079 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=1.0148e-14;SPV=0.56876 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:15,12:4,9 0/1:.:30:14,16:7,7:7,9 | |
| 17547 chr22 25735331 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=1;GPV=1.5236e-09;SPV=0.71804 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:13,13:9,8:4,5 0/1:.:24:13,11:8,6:5,5 | |
| 17548 chr22 25736123 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=8;GPV=2.2152e-16;SPV=0.13732 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:11,8:14,11 0/1:.:40:17,23:10,12:7,11 | |
| 17549 chr22 25736369 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=4;GPV=5.349e-11;SPV=0.36865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:7,8:12,7 0/1:.:25:12,13:4,3:8,10 | |
| 17550 chr22 25736872 . A C . PASS DP=71;SS=1;SSC=4;GPV=2.4568e-12;SPV=0.31807 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:14,11:10,6 0/1:.:30:15,15:7,6:8,9 | |
| 17551 chr22 25736976 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=10;GPV=1.0691e-15;SPV=0.094391 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:30,19:17,8:13,11 0/1:.:40:18,22:8,12:10,10 | |
| 17552 chr22 25737189 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=1.0454e-16;SPV=0.84848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:26,29:13,16:13,13 0/1:.:32:18,14:10,4:8,10 | |
| 17553 chr22 25737466 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=1.658e-10;SPV=0.67923 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:29,18:12,9:17,9 0/1:.:28:18,10:8,3:10,7 | |
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| 17606 chr22 25768029 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,15:0,24 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 | |
| 17607 chr22 25768112 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 | |
| 17608 chr22 25769547 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,25:0,20 1/1:.:31:0,31:0,20:0,11 | |
| 17609 chr22 25769840 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=1.8081e-15;SPV=0.58713 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:9,9:9,11 0/1:.:36:17,19:6,6:11,13 | |
| 17610 chr22 25770044 . C A . PASS DP=65;SS=1;SSC=6;GPV=4.8389e-15;SPV=0.23763 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:6,9:11,9 0/1:.:30:11,19:6,11:5,8 | |
| 17611 chr22 25770933 . G C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,27:0,20 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 | |
| 17612 chr22 25771738 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.5805e-15;SPV=0.81086 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:14,19:6,10:8,9 0/1:.:40:20,20:7,10:13,10 | |
| 17613 chr22 25771901 . G A . PASS DP=99;SS=1;SSC=4;GPV=8.6823e-16;SPV=0.31698 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:27,17:13,12:14,5 0/1:.:55:30,25:13,11:17,14 | |
| 17614 chr22 25772110 . G T . PASS DP=89;SS=1;SSC=2;GPV=3.011e-15;SPV=0.52175 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:29,23:16,12:13,11 0/1:.:37:20,17:10,10:10,7 | |
| 17615 chr22 25774832 . G C . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,24:0,28 1/1:.:52:0,52:0,28:0,24 | |
| 17616 chr22 25775083 . A G . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,29:0,22 1/1:.:46:0,46:0,21:0,25 | |
| 17617 chr22 25776489 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=2.1026e-20;SPV=0.44783 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:19,30:9,19:10,11 0/1:.:29:10,19:4,12:6,7 | |
| 17618 chr22 25777235 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:46:0,46:0,26:0,20 | |
| 17619 chr22 25777694 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 | |
| 17620 chr22 25778201 . G T . PASS DP=44;SS=1;SSC=11;GPV=2.0219e-08;SPV=0.066828 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:15,8:5,2:10,6 0/1:.:21:8,13:3,8:5,5 | |
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| 17622 chr22 25778430 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=1;GPV=3.5316e-15;SPV=0.69447 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:11,20:4,10:7,10 0/1:.:26:10,16:7,8:3,8 | |
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| 17674 chr22 25794948 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 | |
| 17675 chr22 25795114 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,10:0,22 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 | |
| 17676 chr22 25795193 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 | |
| 17677 chr22 25796110 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,26:0,26 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 | |
| 17678 chr22 25796364 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
| 17679 chr22 25796639 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 1/1:.:17:0,17:0,9:0,8 | |
| 17680 chr22 25796708 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,13:0,22 1/1:.:23:0,23:0,14:0,9 | |
| 17681 chr22 25797069 . C A . PASS DP=78;SS=1;SSC=9;GPV=3.2213e-16;SPV=0.12048 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:13,14:10,5 0/1:.:36:14,22:11,15:3,7 | |
| 17682 chr22 25798753 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.0403e-12;SPV=0.79661 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:15,11:9,11 0/1:.:27:16,11:7,6:9,5 | |
| 17683 chr22 25799761 . G C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,23:0,23 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 | |
| 17684 chr22 25800293 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=7;GPV=8.2907e-11;SPV=0.19763 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:31,14:12,4:19,10 0/1:.:35:20,15:14,5:6,10 | |
| 17685 chr22 25800931 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=4;GPV=1.1653e-16;SPV=0.39674 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:7,4:12,12 0/1:.:53:26,27:13,6:13,21 | |
| 17686 chr22 25801838 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=3.104e-14;SPV=0.57974 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:12,11:8,10 0/1:.:29:14,15:7,9:7,6 | |
| 17687 chr22 25801961 . C A . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=3.104e-14;SPV=0.68608 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:11,11:5,7 0/1:.:36:18,18:7,8:11,10 | |
| 17688 chr22 25801962 . T G . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=3.2512e-15;SPV=0.67693 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:11,12:5,8 0/1:.:34:16,18:6,8:10,10 | |
| 17689 chr22 25802050 . G T . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=1.6571e-10;SPV=0.73466 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:18,16:9,8:9,8 0/1:.:26:15,11:7,8:8,3 | |
| 17690 chr22 25802385 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=3.5019e-16;SPV=0.61495 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:6,7:8,15 0/1:.:28:11,17:5,6:6,11 | |
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| 17719 chr22 25826089 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 | |
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| 17730 chr22 25832830 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
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| 17732 chr22 25834592 . G A . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:63:0,63:0,32:0,31 1/1:.:38:0,38:0,26:0,12 | |
| 17733 chr22 25834673 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=3.0519e-14;SPV=0.8961 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:12,16:11,8 0/1:.:33:20,13:12,9:8,4 | |
| 17734 chr22 25835000 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=1.2823e-13;SPV=0.78983 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:7,11:10,7 0/1:.:38:21,17:12,13:9,4 | |
| 17735 chr22 25835345 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=5;GPV=2.7512e-17;SPV=0.2875 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:10,11:10,15 0/1:.:24:8,16:4,10:4,6 | |
| 17736 chr22 25835721 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=1.0222e-17;SPV=0.56633 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:8,16:15,9 0/1:.:38:18,20:7,11:11,9 | |
| 17737 chr22 25835984 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=5.2028e-13;SPV=0.77571 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:8,9:16,12 0/1:.:32:19,13:10,5:9,8 | |
| 17738 chr22 25836143 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=1.548e-18;SPV=0.41603 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:23,28:13,12:10,16 0/1:.:30:12,18:7,12:5,6 | |
| 17739 chr22 25836304 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=6;GPV=2.7512e-17;SPV=0.23228 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:9,9:7,10 0/1:.:35:12,23:6,14:6,9 | |
| 17740 chr22 25836560 . G A . PASS DP=91;SS=1;SSC=7;GPV=6.8291e-20;SPV=0.1636 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:18,13:6,10 0/1:.:44:17,27:7,16:10,11 | |
| 17741 chr22 25836649 . A C . PASS DP=78;SS=1;SSC=10;GPV=1.0364e-16;SPV=0.083474 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:11,9:11,9 0/1:.:38:14,24:8,13:6,11 | |
| 17742 chr22 25838637 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=2.5278e-15;SPV=0.56732 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:32,27:21,13:11,14 0/1:.:28:15,13:7,9:8,4 | |
| 17743 chr22 25839823 . A T . PASS DP=90;SS=1;SSC=5;GPV=1.6187e-21;SPV=0.28564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:24,30:10,15:14,15 0/1:.:36:13,23:8,16:5,7 | |
| 17744 chr22 25844267 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=6.8178e-12;SPV=0.96006 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:9,13:11,8 0/1:.:30:20,10:6,7:14,3 | |
| 17745 chr22 25845234 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=4.0755e-15;SPV=0.57689 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:17,12:9,12 0/1:.:31:16,15:9,8:7,7 | |
| 17746 chr22 25845930 . C A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=1.5391e-12;SPV=0.97702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:8,16:13,6 0/1:.:35:24,11:9,8:15,3 | |
| 17747 chr22 25846554 . G C . PASS DP=73;SS=1;SSC=6;GPV=1.4898e-10;SPV=0.2164 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:28,14:14,7:14,7 0/1:.:31:17,14:11,4:6,10 | |
| 17748 chr22 25848537 . G C . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=8.6008e-14;SPV=0.73069 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:8,8:17,14 0/1:.:33:19,14:6,11:13,3 | |
| 17749 chr22 25849035 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=7;GPV=2.9254e-10;SPV=0.18655 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:24,12:10,10:14,2 0/1:.:32:17,15:6,11:11,4 | |
| 17750 chr22 25849211 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=2;GPV=2.4776e-16;SPV=0.54365 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:16,14:6,7 0/1:.:42:21,21:7,10:14,11 | |
| 17751 chr22 25850020 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.041248 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:29,12:14,6:15,6 0/1:.:35:17,18:12,8:5,10 | |
| 17752 chr22 25851489 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=2.4148e-10;SPV=0.54166 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:19,13:12,7:7,6 0/1:.:33:19,14:8,8:11,6 | |
| 17753 chr22 25851640 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=8;GPV=3.2342e-19;SPV=0.14641 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:13,16:8,8 0/1:.:34:11,23:6,15:5,8 | |
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| 17755 chr22 25855500 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=2.785e-19;SPV=0.89925 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:15,25:5,13:10,12 0/1:.:45:22,23:12,8:10,15 | |
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| 17812 chr22 25930551 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
| 17813 chr22 25930729 . G C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
| 17814 chr22 25932399 . T C . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=6.3493e-10;SPV=0.9058 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:1,9:0,5:1,4 1/1:.:14:3,11:2,4:1,7 | |
| 17815 chr22 25932422 . C T . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,10:0,14 1/1:.:16:0,16:0,5:0,11 | |
| 17816 chr22 25933372 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=11;GPV=4.6624e-13;SPV=0.071058 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:12,6:12,12 0/1:.:23:8,15:6,6:2,9 | |
| 17817 chr22 25934403 . T G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 1/1:.:40:0,40:0,16:0,24 | |
| 17818 chr22 25934967 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=4.8717e-12;SPV=0.51289 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:18,7:5,12 0/1:.:25:13,12:8,5:5,7 | |
| 17819 chr22 25935297 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,19:0,23 1/1:.:35:0,35:0,15:0,20 | |
| 17820 chr22 25935383 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.0173e-19;SPV=0.82553 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:12,26:4,9:8,17 0/1:.:33:13,20:4,7:9,13 | |
| 17821 chr22 25936516 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=4;GPV=1.4675e-17;SPV=0.36318 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:15,22:8,8:7,14 0/1:.:30:10,20:4,4:6,16 | |
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| 17823 chr22 25937710 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=2;GPV=2.025e-08;SPV=0.57706 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:20,12:16,7:4,5 0/1:.:26:16,10:8,7:8,3 | |
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| 17869 chr22 25986568 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=4;GPV=4.2836e-15;SPV=0.3752 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:7,10:14,11 0/1:.:30:13,17:5,8:8,9 | |
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| 17871 chr22 25988504 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=2;GPV=7.0184e-11;SPV=0.61293 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:11,8:12,11 0/1:.:20:11,9:7,5:4,4 | |
| 17872 chr22 25989061 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=2.781e-14;SPV=0.32515 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:14,13:13,8 0/1:.:31:15,16:4,10:11,6 | |
| 17873 chr22 25989742 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=10;GPV=1.4722e-11;SPV=0.098134 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:8,11:13,5 0/1:.:20:7,13:4,9:3,4 | |
| 17874 chr22 25989955 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=4.0316e-12;SPV=0.6981 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:12,8:10,13 0/1:.:22:12,10:6,4:6,6 | |
| 17875 chr22 25990054 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=16;GPV=1;SPV=0.022442 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:35,20:12,8:23,12 0/1:.:31:12,19:4,6:8,13 | |
| 17876 chr22 25990408 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=4.9668e-14;SPV=0.55318 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:11,10:4,7 0/1:.:33:15,18:8,10:7,8 | |
| 17877 chr22 25990611 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=3;GPV=2.6363e-08;SPV=0.44786 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:14,10:8,7:6,3 0/1:.:23:12,11:9,6:3,5 | |
| 17878 chr22 25991004 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=9;GPV=8.6008e-14;SPV=0.1132 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:29,18:16,8:13,10 0/1:.:33:15,18:10,7:5,11 | |
| 17879 chr22 25991772 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=7.9293e-13;SPV=0.70408 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:10,11:10,8 0/1:.:31:17,14:7,7:10,7 | |
| 17880 chr22 25992371 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=6.58e-14;SPV=0.93668 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:11,10:8,12 0/1:.:36:22,14:11,4:11,10 | |
| 17881 chr22 25993121 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=1.2661e-10;SPV=0.93356 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:14,17:6,9:8,8 0/1:.:26:16,10:8,4:8,6 | |
| 17882 chr22 25993383 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=3.6451e-12;SPV=0.83808 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:7,9:7,7 0/1:.:34:19,15:11,10:8,5 | |
| 17883 chr22 25994406 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=1;GPV=1.4887e-13;SPV=0.72831 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:12,18:5,10:7,8 0/1:.:27:12,15:3,4:9,11 | |
| 17884 chr22 25994693 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=1.3424e-14;SPV=0.55097 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:8,9:8,11 0/1:.:28:12,16:6,8:6,8 | |
| 17885 chr22 25994998 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=5.349e-11;SPV=0.56492 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:9,7:8,8 0/1:.:27:14,13:6,7:8,6 | |
| 17886 chr22 25995317 . A C . PASS DP=40;SS=1;SSC=2;GPV=3.8741e-10;SPV=0.57779 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:9,13:6,6:3,7 0/1:.:18:7,11:4,6:3,5 | |
| 17887 chr22 25997077 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=8.2552e-11;SPV=0.64775 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:6,10:14,6 0/1:.:28:16,12:12,4:4,8 | |
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| 17935 chr22 26090472 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=7;GPV=2.2597e-11;SPV=0.18316 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:18,12:9,6:9,6 0/1:.:31:14,17:6,6:8,11 | |
| 17936 chr22 26091706 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=5.0547e-18;SPV=0.88333 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:11,24:7,11:4,13 0/1:.:33:14,19:7,8:7,11 | |
| 17937 chr22 26092065 . C A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.0786e-09;SPV=0.9016 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:7,8:7,6 0/1:.:30:19,11:9,4:10,7 | |
| 17938 chr22 26095081 . A C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=4.8441e-11;SPV=0.9742 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:9,11:6,9 0/1:.:23:15,8:5,6:10,2 | |
| 17939 chr22 26095668 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=4.3784e-17;SPV=0.79777 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:8,16:11,9 0/1:.:36:18,18:7,7:11,11 | |
| 17940 chr22 26098646 . T G . PASS DP=57;SS=1;SSC=4;GPV=1.9179e-08;SPV=0.35316 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:9,3:10,7 0/1:.:28:16,12:7,8:9,4 | |
| 17941 chr22 26099955 . G T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=4.8441e-11;SPV=0.90316 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:12,15:7,10:5,5 0/1:.:31:18,13:9,8:9,5 | |
| 17942 chr22 26100068 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=1;GPV=3.4899e-11;SPV=0.66196 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:12,13:6,6:6,7 0/1:.:30:15,15:11,7:4,8 | |
| 17943 chr22 26101141 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=3;GPV=1.4722e-11;SPV=0.45658 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:12,11:7,7:5,4 0/1:.:34:16,18:10,9:6,9 | |
| 17944 chr22 26102199 . T G . PASS DP=56;SS=1;SSC=4;GPV=3.2889e-10;SPV=0.36443 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:14,10:9,7:5,3 0/1:.:32:16,16:7,9:9,7 | |
| 17945 chr22 26103067 . C T . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=1.9143e-06;SPV=0.80268 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:10,9:6,4:4,5 0/1:.:18:11,7:7,5:4,2 | |
| 17946 chr22 26103334 . G A . PASS DP=45;SS=1;SSC=2;GPV=1.6979e-07;SPV=0.55074 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:13,9:10,5:3,4 0/1:.:23:13,10:5,8:8,2 | |
| 17947 chr22 26104418 . G C . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=1.6778e-09;SPV=0.99097 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:8,14:3,9:5,5 0/1:.:29:19,10:11,6:8,4 | |
| 17948 chr22 26105918 . C T . PASS DP=43;SS=1;SSC=3;GPV=1.8298e-08;SPV=0.42193 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:9,7:4,5:5,2 0/1:.:27:13,14:4,8:9,6 | |
| 17949 chr22 26106543 . A G . PASS DP=45;SS=1;SSC=6;GPV=3.0122e-06;SPV=0.22126 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:12,4:8,2:4,2 0/1:.:29:17,12:8,5:9,7 | |
| 17950 chr22 26109599 . A G . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=1.3761e-09;SPV=0.9011 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:8,11:4,6:4,5 0/1:.:30:17,13:13,6:4,7 | |
| 17951 chr22 26112555 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=8;GPV=1.2104e-08;SPV=0.14603 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:10,4:6,2:4,2 0/1:.:36:18,18:11,6:7,12 | |
| 17952 chr22 26114837 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=3;GPV=2.9283e-09;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:6,5:3,3:3,2 0/1:.:35:17,18:8,6:9,12 | |
| 17953 chr22 26116715 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=5;GPV=6.4039e-15;SPV=0.25711 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:9,12:5,11:4,1 0/1:.:33:10,23:5,17:5,6 | |
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| 17955 chr22 26120085 . C A . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.9694e-09;SPV=0.89462 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:10,12:6,5:4,7 0/1:.:27:16,11:9,6:7,5 | |
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| 18004 chr22 26217096 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 18005 chr22 26217192 . G C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 | |
| 18006 chr22 26219272 . G A . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=2.2598e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,7:0,11 1/1:.:20:0,18:0,9:0,9 | |
| 18007 chr22 26221294 . A T . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 1/1:.:21:0,21:0,11:0,10 | |
| 18008 chr22 26221712 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,27:0,11 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 18009 chr22 26221939 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,27:0,17 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 18010 chr22 26222099 . T G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 18011 chr22 26222462 . C G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 | |
| 18012 chr22 26224278 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=6.5868e-13;SPV=0.69001 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:11,14:7,7:4,7 0/1:.:34:16,18:9,12:7,6 | |
| 18013 chr22 26224525 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=5;GPV=1.5685e-14;SPV=0.28837 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:10,9:5,6 0/1:.:35:14,21:7,8:7,13 | |
| 18014 chr22 26224851 . G C . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,16:0,9 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 18015 chr22 26225389 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=9.8643e-08;SPV=0.96953 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:12,12:7,5:5,7 0/1:.:28:20,8:11,3:9,5 | |
| 18016 chr22 26225695 . A G . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,17:0,9 1/1:.:23:0,23:0,10:0,13 | |
| 18017 chr22 26225710 . C G . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=2.8784e-06;SPV=0.8679 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:14,10:10,5:4,5 0/1:.:20:14,6:2,5:12,1 | |
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| 18020 chr22 26228189 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=2.783e-13;SPV=0.53871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:7,7:8,10 0/1:.:29:13,16:7,6:6,10 | |
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| 18058 chr22 26252974 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=7;GPV=5.5558e-19;SPV=0.1687 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:11,10:10,12 0/1:.:39:14,25:7,11:7,14 | |
| 18059 chr22 26253098 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 18060 chr22 26253455 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=12;GPV=2.098e-14;SPV=0.056324 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:8,10:11,4 0/1:.:34:12,22:6,7:6,15 | |
| 18061 chr22 26253882 . A T . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=1.6574e-14;SPV=0.40736 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:10,9:12,11 0/1:.:32:15,17:8,7:7,10 | |
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| 18063 chr22 26254399 . C G . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=1.16e-09;SPV=0.42879 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:21,14:13,6:8,8 0/1:.:26:13,11:8,2:5,9 | |
| 18064 chr22 26254639 . T C . PASS DP=52;SS=1;SSC=2;GPV=7.3303e-11;SPV=0.5976 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:5,5:9,10 0/1:.:23:11,12:7,7:4,5 | |
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| 18068 chr22 26257648 . G A . PASS DP=45;SS=1;SSC=3;GPV=2.7295e-10;SPV=0.45987 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:10,11:4,3:6,8 0/1:.:24:10,14:4,5:6,9 | |
| 18069 chr22 26258270 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=4.883e-13;SPV=0.80583 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:9,14:2,9:7,5 0/1:.:34:16,18:9,7:7,11 | |
| 18070 chr22 26258271 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.8984e-15;SPV=0.90748 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:8,18:2,9:6,9 0/1:.:34:15,19:9,8:6,11 | |
| 18071 chr22 26258731 . A C . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=6.4161e-12;SPV=0.79003 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:9,14:4,9:5,5 0/1:.:28:13,15:8,9:5,6 | |
| 18072 chr22 26259101 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=3.6279e-14;SPV=0.99888 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:6,22:1,12:5,10 0/1:.:28:16,12:4,5:12,7 | |
| 18073 chr22 26259786 . C T . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 1/1:.:24:0,24:0,10:0,14 | |
| 18074 chr22 26260604 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=9;GPV=2.2597e-11;SPV=0.12008 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:18,11:7,6:11,5 0/1:.:32:14,18:7,10:7,8 | |
| 18075 chr22 26261051 . A G . PASS DP=48;SS=1;SSC=5;GPV=1.2355e-09;SPV=0.28196 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:13,10:5,4:8,6 0/1:.:25:11,14:5,5:6,9 | |
| 18076 chr22 26262333 . A T . PASS DP=47;SS=1;SSC=6;GPV=3.5655e-11;SPV=0.21827 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:9,8:2,2:7,6 0/1:.:30:11,19:8,9:3,10 | |
| 18077 chr22 26262473 . T G . PASS DP=59;SS=1;SSC=3;GPV=2.0466e-12;SPV=0.46615 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:13,13:9,4:4,9 0/1:.:33:15,18:7,10:8,8 | |
| 18078 chr22 26262590 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=5.8009e-12;SPV=0.71288 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:11,10:7,6:4,4 0/1:.:48:27,21:18,14:9,7 | |
| 18079 chr22 26263812 . G C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 | |
| 18080 chr22 26263902 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.8522e-13;SPV=0.98865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:7,19:4,10:3,9 0/1:.:26:14,12:5,4:9,8 | |
| 18081 chr22 26265534 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=6;GPV=1.5567e-13;SPV=0.22388 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:11,7:13,10 0/1:.:34:16,18:6,8:10,10 | |
| 18082 chr22 26266007 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=2.2591e-14;SPV=0.4656 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:6,8:8,10 0/1:.:28:11,17:6,12:5,5 | |
| 18083 chr22 26266236 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.2003e-16;SPV=0.99442 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:8,22:4,12:4,10 0/1:.:37:20,17:5,9:15,8 | |
| 18084 chr22 26268087 . A C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 18085 chr22 26268652 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,6:0,12 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 | |
| 18086 chr22 26269708 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,12:0,7 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 | |
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| 18128 chr22 26289138 . A T . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,10:0,11 1/1:.:25:0,25:0,15:0,10 | |
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| 18131 chr22 26291555 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,26:0,25 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
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| 18133 chr22 26294441 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.02e-15;SPV=0.97813 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:15,27:5,14:10,13 0/1:.:28:16,12:4,9:12,3 | |
| 18134 chr22 26294595 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=2.4039e-14;SPV=0.69138 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:5,7:10,11 0/1:.:35:17,18:10,11:7,7 | |
| 18135 chr22 26294892 . G T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=7.3738e-16;SPV=0.85476 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:15,24:7,16:8,8 0/1:.:29:14,15:8,8:6,7 | |
| 18136 chr22 26295408 . G C . PASS DP=56;SS=1;SSC=5;GPV=1.3048e-11;SPV=0.28961 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:9,4:7,10 0/1:.:26:11,15:7,10:4,5 | |
| 18137 chr22 26295753 . C A . PASS DP=51;SS=1;SSC=2;GPV=1.6778e-09;SPV=0.57202 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:15,13:8,5:7,8 0/1:.:23:12,11:6,6:6,5 | |
| 18138 chr22 26295999 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=1.0345e-10;SPV=0.43928 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:13,11:6,9:7,2 0/1:.:31:15,16:9,8:6,8 | |
| 18139 chr22 26296220 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=5;GPV=4.2407e-10;SPV=0.31068 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:21,14:16,10:5,4 0/1:.:24:12,12:7,7:5,5 | |
| 18140 chr22 26296490 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,33:0,24 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 | |
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| 18142 chr22 26299769 . C A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 1/1:.:47:0,47:0,23:0,24 | |
| 18143 chr22 26299816 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 | |
| 18144 chr22 26300817 . T A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
| 18145 chr22 26301056 . G C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 1/1:.:44:0,44:0,26:0,18 | |
| 18146 chr22 26301229 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,10:0,21 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
| 18147 chr22 26302926 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,13:0,29 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
| 18148 chr22 26303914 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=1.0051e-11;SPV=0.66856 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:10,12:5,6 0/1:.:21:10,11:6,5:4,6 | |
| 18149 chr22 26304629 . T A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,10:0,19 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 18150 chr22 26305839 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 1/1:.:29:0,29:0,9:0,20 | |
| 18151 chr22 26306049 . A C . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,20:0,11 1/1:.:20:0,20:0,9:0,11 | |
| 18152 chr22 26306807 . T G . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
| 18153 chr22 26307587 . G T . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,15:0,5 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
| 18154 chr22 26307622 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,18:0,6 1/1:.:31:0,31:0,22:0,9 | |
| 18155 chr22 26308949 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,21:0,10 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 | |
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| 18157 chr22 26309565 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
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| 18201 chr22 26328595 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=10;GPV=3.2512e-15;SPV=0.08006 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:11,10:12,10 0/1:.:27:9,18:4,9:5,9 | |
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| 18205 chr22 26330079 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=6;GPV=2.4568e-12;SPV=0.23121 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:11,6:13,10 0/1:.:31:15,16:6,10:9,6 | |
| 18206 chr22 26330400 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.0786e-09;SPV=0.93614 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:13,14:7,9:6,5 0/1:.:31:20,11:12,5:8,6 | |
| 18207 chr22 26330988 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,26:0,12 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 | |
| 18208 chr22 26331761 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=7.5695e-19;SPV=0.6152 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:18,27:5,17:13,10 0/1:.:32:13,19:9,13:4,6 | |
| 18209 chr22 26333039 . T G . PASS DP=73;SS=1;SSC=6;GPV=1.5635e-16;SPV=0.20876 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:9,12:9,6 0/1:.:37:14,23:6,11:8,12 | |
| 18210 chr22 26333755 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=1.0137e-17;SPV=0.64439 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:5,6:13,18 0/1:.:36:16,20:8,12:8,8 | |
| 18211 chr22 26334033 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=5;GPV=2.8183e-16;SPV=0.26067 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:11,13:11,8 0/1:.:34:14,20:8,10:6,10 | |
| 18212 chr22 26334849 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=5;GPV=2.2863e-14;SPV=0.29156 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:12,11:11,7 0/1:.:36:17,19:13,7:4,12 | |
| 18213 chr22 26336242 . T G . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.1526e-12;SPV=0.92158 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:11,19:4,8:7,11 0/1:.:25:13,12:4,5:9,7 | |
| 18214 chr22 26336432 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,11:0,8 1/1:.:32:0,32:0,21:0,11 | |
| 18215 chr22 26336977 . T A . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=5.9795e-14;SPV=0.74716 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:7,6:11,12 0/1:.:40:22,18:11,12:11,6 | |
| 18216 chr22 26337804 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=4;GPV=1.3489e-13;SPV=0.3343 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:9,6:5,7 0/1:.:37:16,21:8,8:8,13 | |
| 18217 chr22 26338175 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=1;GPV=4.883e-13;SPV=0.76316 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:11,16:4,8:7,8 0/1:.:30:14,16:5,6:9,10 | |
| 18218 chr22 26338380 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=2.4039e-14;SPV=0.51697 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:15,16:10,7:5,9 0/1:.:37:17,20:9,11:8,9 | |
| 18219 chr22 26338569 . A T . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,19:0,8:0,11 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 18220 chr22 26338769 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=7.3575e-14;SPV=0.88432 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:9,11:7,10 0/1:.:31:17,14:8,7:9,7 | |
| 18221 chr22 26339799 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=2.7419e-13;SPV=0.99804 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:11,21:4,10:7,11 0/1:.:38:25,13:18,5:7,8 | |
| 18222 chr22 26339963 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=4;GPV=1.1574e-13;SPV=0.32712 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:12,11:10,7 0/1:.:32:15,17:7,13:8,4 | |
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| 18224 chr22 26342766 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=2.7611e-16;SPV=0.79135 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:30,31:12,12:18,19 0/1:.:25:14,11:5,6:9,5 | |
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| 18273 chr22 26376114 . A T . PASS DP=71;SS=1;SSC=5;GPV=3.0367e-13;SPV=0.27477 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:10,7:10,8 0/1:.:36:17,19:12,9:5,10 | |
| 18274 chr22 26378614 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=10;GPV=6.9672e-12;SPV=0.096158 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:16,10:10,4:6,6 0/1:.:34:14,20:6,11:8,9 | |
| 18275 chr22 26381128 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=2.7262e-09;SPV=0.95009 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:7,9:4,5:3,4 0/1:.:41:26,15:14,7:12,8 | |
| 18276 chr22 26381829 . A T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=1.6778e-09;SPV=0.96238 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:8,12:4,6:4,6 0/1:.:31:19,12:3,7:16,5 | |
| 18277 chr22 26381985 . T G . PASS DP=54;SS=1;SSC=4;GPV=4.2301e-08;SPV=0.32082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:16,8:12,3:4,5 0/1:.:30:17,13:7,8:10,5 | |
| 18278 chr22 26382495 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=5;GPV=2.9283e-09;SPV=0.26511 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:9,6:4,3:5,3 0/1:.:31:14,17:8,6:6,11 | |
| 18279 chr22 26385284 . C T . PASS DP=39;SS=1;SSC=0;GPV=3.4806e-08;SPV=0.80016 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:7,9:1,5:6,4 0/1:.:23:12,11:5,4:7,7 | |
| 18280 chr22 26386695 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=2.3224e-12;SPV=0.94552 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:10,16:2,6:8,10 0/1:.:34:19,15:12,11:7,4 | |
| 18281 chr22 26390556 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=5.6945e-14;SPV=0.6889 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:11,9:4,9 0/1:.:33:16,17:9,8:7,9 | |
| 18282 chr22 26391343 . T G . PASS DP=78;SS=3;SSC=17;GPV=1;SPV=0.017876 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:18,14:8,10 1/1:.:28:7,21:3,15:4,6 | |
| 18283 chr22 26392086 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 | |
| 18284 chr22 26392344 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=1.1875e-15;SPV=0.63523 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:8,11:8,9 0/1:.:35:16,19:7,8:9,11 | |
| 18285 chr22 26393189 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.2266e-05;SPV=0.93468 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:32,12:18,10:14,2 0/1:.:21:18,3:7,1:11,2 | |
| 18286 chr22 26394073 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,27:0,18 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 | |
| 18287 chr22 26394074 . G T . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=4.5064e-15;SPV=0.43302 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:14,14:11,7 0/1:.:36:18,18:8,11:10,7 | |
| 18288 chr22 26394738 . G T . PASS DP=71;SS=1;SSC=5;GPV=3.0367e-13;SPV=0.30242 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:25,20:14,15:11,5 0/1:.:26:12,14:6,6:6,8 | |
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| 18290 chr22 26395033 . G T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=9.3121e-14;SPV=0.83085 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:12,7:5,13 0/1:.:33:18,15:7,8:11,7 | |
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| 18337 chr22 26416947 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=6;GPV=4.1337e-13;SPV=0.23585 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:15,12:8,6:7,6 0/1:.:37:16,21:6,13:10,8 | |
| 18338 chr22 26416948 . G C . PASS DP=65;SS=1;SSC=6;GPV=4.0316e-12;SPV=0.24419 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:16,11:8,6:8,5 0/1:.:38:18,20:8,12:10,8 | |
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| 18344 chr22 26427394 . A G . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,10:0,17 1/1:.:14:0,14:0,3:0,11 | |
| 18345 chr22 26427905 . G T . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,19:0,7 1/1:.:22:0,22:0,19:0,3 | |
| 18346 chr22 26429231 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=5.349e-11;SPV=0.55437 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:6,1:10,13 0/1:.:29:15,14:1,1:14,13 | |
| 18347 chr22 26429384 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,13:0,25 1/1:.:32:0,32:0,12:0,20 | |
| 18348 chr22 26431369 . T G . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=9.545e-12;SPV=0.6847 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:11,9:9,10 0/1:.:24:13,11:5,6:8,5 | |
| 18349 chr22 26434512 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,25:0,30 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 | |
| 18350 chr22 26435111 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=7.3575e-14;SPV=0.75787 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:12,9:6,12 0/1:.:29:15,14:7,8:8,6 | |
| 18351 chr22 26435658 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=7;GPV=8.6344e-12;SPV=0.1615 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:11,8:10,7 0/1:.:26:11,15:6,3:5,12 | |
| 18352 chr22 26436137 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.030275 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:29,19:15,11:14,8 0/1:.:35:13,22:6,11:7,11 | |
| 18353 chr22 26436252 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=1.033e-12;SPV=0.5391 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:35,22:16,7:19,15 0/1:.:30:18,12:10,8:8,4 | |
| 18354 chr22 26436874 . T A . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=4.5813e-10;SPV=0.76221 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:15,13:10,6:5,7 0/1:.:32:19,13:14,8:5,5 | |
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| 18356 chr22 26437220 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=5;GPV=2.3891e-13;SPV=0.286 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:22,14:15,6:7,8 0/1:.:44:23,21:12,10:11,11 | |
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| 18397 chr22 26462142 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=2;GPV=1.1441e-25;SPV=0.54348 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:1,24:0,9:1,15 1/1:.:21:0,21:0,9:0,12 | |
| 18398 chr22 26462371 . G T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 | |
| 18399 chr22 26463120 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.8769e-15;SPV=0.9883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:12,22:7,14:5,8 0/1:.:39:23,16:14,4:9,12 | |
| 18400 chr22 26463499 . G T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,27:0,16 1/1:.:28:0,28:0,11:0,17 | |
| 18401 chr22 26463558 . A C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
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| 18403 chr22 26464303 . G C . PASS DP=90;SS=1;SSC=7;GPV=1.8206e-18;SPV=0.19396 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:19,9:6,13 0/1:.:43:18,25:10,10:8,15 | |
| 18404 chr22 26465579 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,31:0,23 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 | |
| 18405 chr22 26466075 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=6.4328e-08;SPV=0.84162 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:24,14:10,6:14,8 0/1:.:25:18,7:9,3:9,4 | |
| 18406 chr22 26466187 . C A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 1/1:.:42:0,42:0,25:0,17 | |
| 18407 chr22 26466246 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,23:0,11 1/1:.:47:0,47:0,30:0,17 | |
| 18408 chr22 26466806 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,14:0,25 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 | |
| 18409 chr22 26467066 . G T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 1/1:.:23:0,23:0,9:0,14 | |
| 18410 chr22 26467127 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,28:0,13 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 | |
| 18411 chr22 26467593 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,30:0,21 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 | |
| 18412 chr22 26467673 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,24:0,12 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 | |
| 18413 chr22 26468692 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,18:0,25 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 | |
| 18414 chr22 26469074 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 1/1:.:28:0,28:0,12:0,16 | |
| 18415 chr22 26469088 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,26:0,15 1/1:.:23:0,23:0,12:0,11 | |
| 18416 chr22 26469272 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 1/1:.:14:0,14:0,8:0,6 | |
| 18417 chr22 26470007 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=4;GPV=4.3139e-18;SPV=0.35169 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:13,12:7,7 0/1:.:49:22,27:16,17:6,10 | |
| 18418 chr22 26471524 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=1;GPV=9.9959e-10;SPV=0.73486 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:13,5:6,11 0/1:.:22:13,9:4,3:9,6 | |
| 18419 chr22 26471689 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,17:0,26 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 18420 chr22 26474536 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=1.0364e-16;SPV=0.5069 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:9,13:9,7 0/1:.:40:18,22:9,15:9,7 | |
| 18421 chr22 26474643 . C T . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 18422 chr22 26475102 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 1/1:.:36:0,36:0,14:0,22 | |
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| 18424 chr22 26477449 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 | |
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| 18466 chr22 26511235 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=4.39e-14;SPV=0.55258 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:12,11:9,9 0/1:.:32:16,16:3,8:13,8 | |
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| 18468 chr22 26512467 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=3.5113e-17;SPV=0.6208 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:11,11:14,15 0/1:.:36:18,18:7,7:11,11 | |
| 18469 chr22 26513784 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=8.9568e-18;SPV=0.93876 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:22,31:9,15:13,16 0/1:.:32:18,14:5,10:13,4 | |
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| 18472 chr22 26519199 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=10;GPV=5.0311e-18;SPV=0.094298 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:17,12:9,13 0/1:.:30:10,20:7,10:3,10 | |
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| 18474 chr22 26519398 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=1.0137e-17;SPV=0.56761 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:18,23:10,8:8,15 0/1:.:37:16,21:8,10:8,11 | |
| 18475 chr22 26520756 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,27:0,18 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 18476 chr22 26521086 . A T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,16:0,29 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 | |
| 18477 chr22 26521111 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=3;GPV=1.2581e-11;SPV=0.47159 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,18:4,6:19,12 0/1:.:25:13,12:1,6:12,6 | |
| 18478 chr22 26521112 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=2;GPV=9.1717e-09;SPV=0.53506 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:24,14:8,2:16,12 0/1:.:23:14,9:4,1:10,8 | |
| 18479 chr22 26521223 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=7.8163e-15;SPV=0.55362 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:9,12:14,10 0/1:.:32:16,16:7,10:9,6 | |
| 18480 chr22 26521452 . C G . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=2.4776e-16;SPV=0.71398 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:10,15:14,10 0/1:.:36:19,17:6,8:13,9 | |
| 18481 chr22 26523647 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,30:0,18 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 18482 chr22 26524304 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=7.6248e-11;SPV=0.70599 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:11,12:9,5 0/1:.:26:15,11:8,6:7,5 | |
| 18483 chr22 26526728 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 1/1:.:32:0,32:0,21:0,11 | |
| 18484 chr22 26526803 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=2.3224e-12;SPV=0.40765 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:10,8:4,5 0/1:.:33:15,18:7,10:8,8 | |
| 18485 chr22 26527189 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,17:0,24 1/1:.:31:0,31:0,20:0,11 | |
| 18486 chr22 26527545 . C G . PASS DP=89;SS=1;SSC=9;GPV=1.2945e-16;SPV=0.12367 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:27,19:14,9:13,10 0/1:.:43:19,24:7,13:12,11 | |
| 18487 chr22 26527941 . T C . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,26:0,29 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 | |
| 18488 chr22 26528183 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=5.8059e-16;SPV=0.87082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:16,23:9,13:7,10 0/1:.:35:18,17:12,8:6,9 | |
| 18489 chr22 26528785 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=9;GPV=1.662e-19;SPV=0.11517 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:14,11:7,11 0/1:.:39:13,26:5,11:8,15 | |
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| 18491 chr22 26529339 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=4;GPV=8.8908e-21;SPV=0.3708 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:22,29:13,17:9,12 0/1:.:35:13,22:9,13:4,9 | |
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| 18542 chr22 26561104 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=3.5019e-16;SPV=0.81973 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:12,22:6,10:6,12 0/1:.:30:13,17:5,10:8,7 | |
| 18543 chr22 26561341 . G T . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=1.5567e-13;SPV=0.63851 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:11,13:9,5 0/1:.:37:20,17:12,13:8,4 | |
| 18544 chr22 26561433 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=7.6248e-11;SPV=0.51071 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:12,7:9,9 0/1:.:26:14,12:5,5:9,7 | |
| 18545 chr22 26561505 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=1.5502e-15;SPV=0.4084 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:12,10:9,8 0/1:.:43:21,22:9,8:12,14 | |
| 18546 chr22 26561808 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=4.8851e-14;SPV=0.41737 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:12,13:10,6 0/1:.:33:16,17:9,9:7,8 | |
| 18547 chr22 26562138 . A G . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=1.1121e-18;SPV=0.98467 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:21,31:11,14:10,17 0/1:.:43:26,17:10,6:16,11 | |
| 18548 chr22 26564436 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=2.4219e-17;SPV=0.84231 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:25,31:8,16:17,15 0/1:.:28:15,13:6,8:9,5 | |
| 18549 chr22 26564924 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=3.0519e-14;SPV=0.77698 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:12,10:11,12 0/1:.:35:20,15:13,7:7,8 | |
| 18550 chr22 26565604 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=10;GPV=1.3267e-12;SPV=0.089865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:31,18:14,11:17,7 0/1:.:27:12,15:5,8:7,7 | |
| 18551 chr22 26566067 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,26:0,11 1/1:.:28:0,28:0,20:0,8 | |
| 18552 chr22 26567064 . G C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,21:0,26 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 | |
| 18553 chr22 26567473 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
| 18554 chr22 26567542 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=6.6743e-16;SPV=0.34979 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:10,12:10,8 0/1:.:35:15,20:5,12:10,8 | |
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| 18556 chr22 26570637 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 18557 chr22 26571408 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,24:0,25 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
| 18558 chr22 26572246 . T G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
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| 18583 chr22 26583205 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,10:0,22 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
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| 18585 chr22 26584111 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
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| 18588 chr22 26585075 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 | |
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| 18593 chr22 26586102 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 1/1:.:24:0,24:0,12:0,12 | |
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| 18595 chr22 26587323 . G T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,30:0,17 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
| 18596 chr22 26587543 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,13:0,33 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 18597 chr22 26588507 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=1.8624e-11;SPV=0.59428 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:12,10:14,9 0/1:.:26:15,11:7,4:8,7 | |
| 18598 chr22 26588672 . C A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=5.8719e-16;SPV=0.92324 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:18,23:12,9:6,14 0/1:.:42:24,18:19,11:5,7 | |
| 18599 chr22 26590011 . T C . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,27:0,21 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 | |
| 18600 chr22 26590351 . A C . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=2.6279e-15;SPV=0.71188 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:11,9:10,14 0/1:.:33:17,16:11,6:6,10 | |
| 18601 chr22 26590862 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=1.0404e-13;SPV=0.56569 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:16,8:8,15 0/1:.:24:12,12:6,4:6,8 | |
| 18602 chr22 26590911 . A T . PASS DP=64;SS=1;SSC=7;GPV=1.0507e-11;SPV=0.18849 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:10,9:15,9 0/1:.:21:9,12:3,5:6,7 | |
| 18603 chr22 26594645 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 18604 chr22 26594646 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=4.9329e-10;SPV=0.89732 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:10,7:7,9 0/1:.:28:18,10:9,6:9,4 | |
| 18605 chr22 26596256 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=7.8163e-15;SPV=0.55362 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:12,9:11,13 0/1:.:32:16,16:9,8:7,8 | |
| 18606 chr22 26596888 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=7;GPV=5.3252e-12;SPV=0.19533 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:12,5:12,11 0/1:.:28:13,15:9,9:4,6 | |
| 18607 chr22 26597742 . T G . PASS DP=73;SS=1;SSC=7;GPV=4.8769e-15;SPV=0.16818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:16,10:9,12 0/1:.:26:10,16:4,7:6,9 | |
| 18608 chr22 26598311 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 18609 chr22 26600003 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=3;GPV=3.9107e-13;SPV=0.49594 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:31,20:13,10:18,10 0/1:.:36:21,15:11,6:10,9 | |
| 18610 chr22 26600982 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=9;GPV=6.9925e-15;SPV=0.11712 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:9,7:18,14 0/1:.:28:11,17:6,8:5,9 | |
| 18611 chr22 26601518 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 1/1:.:26:0,26:0,20:0,6 | |
| 18612 chr22 26601766 . A T . PASS DP=59;SS=1;SSC=6;GPV=1.8826e-14;SPV=0.24868 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:6,13:10,6 0/1:.:24:8,16:7,5:1,11 | |
| 18613 chr22 26602199 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=3.6451e-12;SPV=0.84566 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:7,11:9,7 0/1:.:30:17,13:8,9:9,4 | |
| 18614 chr22 26602835 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=8.503e-12;SPV=0.83939 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:18,13:6,7 0/1:.:30:19,11:12,6:7,5 | |
| 18615 chr22 26602997 . A C . PASS DP=93;SS=1;SSC=4;GPV=7.8526e-18;SPV=0.38233 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:28,25:14,14:14,11 0/1:.:40:19,21:10,11:9,10 | |
| 18616 chr22 26603817 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=7.3575e-14;SPV=0.67019 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:11,9:9,13 0/1:.:26:13,13:6,7:7,6 | |
| 18617 chr22 26604154 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,19:0,24 1/1:.:24:0,24:0,16:0,8 | |
| 18618 chr22 26605725 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=5;GPV=9.9959e-10;SPV=0.27842 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:19,12:8,7:11,5 0/1:.:26:13,13:9,7:4,6 | |
| 18619 chr22 26606428 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=4;GPV=1.6045e-17;SPV=0.39777 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:17,19:6,6 0/1:.:33:14,19:7,12:7,7 | |
| 18620 chr22 26608125 . A C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 1/1:.:42:0,42:0,16:0,26 | |
| 18621 chr22 26608334 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=4.4044e-13;SPV=0.99498 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:9,12:9,12 0/1:.:33:23,10:13,4:10,6 | |
| 18622 chr22 26609506 . T A . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=2.0525e-15;SPV=0.63618 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:12,14:6,10 0/1:.:25:11,14:8,8:3,6 | |
| 18623 chr22 26610344 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=8;GPV=6.2293e-15;SPV=0.14967 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:8,8:13,8 0/1:.:38:16,22:8,10:8,12 | |
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| 18662 chr22 26645319 . C G . PASS DP=76;SS=1;SSC=3;GPV=2.3308e-15;SPV=0.40209 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:9,11:12,9 0/1:.:35:16,19:7,9:9,10 | |
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| 18673 chr22 26650698 . A T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,19:0,25 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 18674 chr22 26650721 . A C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=5.0108e-11;SPV=0.95909 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,19:10,9:10,10 0/1:.:32:22,10:10,5:12,5 | |
| 18675 chr22 26651290 . G A . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,9:0,14 1/1:.:19:0,19:0,10:0,9 | |
| 18676 chr22 26652043 . G T . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=3.9394e-09;SPV=0.63984 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:19,12:8,8:11,4 0/1:.:32:20,12:14,9:6,3 | |
| 18677 chr22 26652444 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=2.7815e-13;SPV=0.83835 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:27,23:13,12:14,11 0/1:.:32:20,12:11,7:9,5 | |
| 18678 chr22 26652624 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,23:0,25 1/1:.:44:0,44:0,19:0,25 | |
| 18679 chr22 26652956 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=3.7425e-15;SPV=0.71024 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:11,14:6,7 0/1:.:33:16,17:7,6:9,11 | |
| 18680 chr22 26653068 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=2.4039e-14;SPV=0.65345 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:14,11:5,11 0/1:.:27:13,14:9,9:4,5 | |
| 18681 chr22 26653155 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=3;GPV=2.1298e-18;SPV=0.42307 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:10,17:11,7 0/1:.:38:16,22:9,13:7,9 | |
| 18682 chr22 26654015 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=6.2136e-19;SPV=0.89884 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:16,30:6,12:10,18 0/1:.:30:14,16:4,7:10,9 | |
| 18683 chr22 26654232 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=7.9203e-12;SPV=0.51632 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:8,10:16,7 0/1:.:32:18,14:10,9:8,5 | |
| 18684 chr22 26655374 . G C . PASS DP=89;SS=1;SSC=5;GPV=1.2945e-16;SPV=0.28319 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:8,9:14,8 0/1:.:50:24,26:12,11:12,15 | |
| 18685 chr22 26656370 . G C . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5383e-09;SPV=0.86859 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:15,14:10,5:5,9 0/1:.:27:17,10:10,5:7,5 | |
| 18686 chr22 26656544 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 18687 chr22 26656618 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 | |
| 18688 chr22 26656926 . A T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,16:0,25 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
| 18689 chr22 26657156 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=6;GPV=8.7581e-18;SPV=0.20338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:10,10:16,10 0/1:.:48:22,26:13,15:9,11 | |
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| 18691 chr22 26658235 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,20:0,35 1/1:.:31:0,31:0,10:0,21 | |
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| 18737 chr22 26678294 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=6.5235e-17;SPV=0.9942 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:16,28:7,14:9,14 0/1:.:39:24,15:13,8:11,7 | |
| 18738 chr22 26678438 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=7;GPV=1.4126e-14;SPV=0.18485 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:28,19:16,13:12,6 0/1:.:36:17,19:6,7:11,12 | |
| 18739 chr22 26679233 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=3;GPV=1.7439e-13;SPV=0.49706 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:10,8:7,9 0/1:.:32:15,17:6,6:9,11 | |
| 18740 chr22 26680342 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=2.4219e-17;SPV=0.79167 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:22,27:13,13:9,14 0/1:.:35:18,17:9,8:9,9 | |
| 18741 chr22 26680887 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=4.1486e-16;SPV=0.80961 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,24:12,16:8,8 0/1:.:36:19,17:11,9:8,8 | |
| 18742 chr22 26681021 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=9;GPV=2.8662e-18;SPV=0.10658 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:10,9:14,12 0/1:.:40:15,25:7,10:8,15 | |
| 18743 chr22 26681268 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=20;GPV=1;SPV=0.0091785 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:27,20:17,11:10,9 0/1:.:32:9,23:2,15:7,8 | |
| 18744 chr22 26682503 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=2.7611e-16;SPV=0.81855 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:10,13:14,13 0/1:.:36:20,16:11,7:9,9 | |
| 18745 chr22 26682597 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=6;GPV=8.9568e-18;SPV=0.20118 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:13,9:12,14 0/1:.:37:15,22:5,14:10,8 | |
| 18746 chr22 26682992 . G T . PASS DP=79;SS=1;SSC=19;GPV=1;SPV=0.010973 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:30,15:9,8:21,7 0/1:.:34:13,21:4,9:9,12 | |
| 18747 chr22 26683225 . G T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.2905e-14;SPV=0.84473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:16,13:8,11 0/1:.:34:20,14:12,4:8,10 | |
| 18748 chr22 26684187 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.1519e-11;SPV=0.94056 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:6,11:13,10 0/1:.:25:16,9:8,4:8,5 | |
| 18749 chr22 26685233 . T G . PASS DP=70;SS=1;SSC=11;GPV=7.191e-13;SPV=0.063491 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:26,17:14,8:12,9 0/1:.:26:10,16:5,10:5,6 | |
| 18750 chr22 26685399 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,22:0,27 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 18751 chr22 26685982 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=3.6481e-18;SPV=0.67704 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:18,25:8,13:10,12 0/1:.:36:16,20:7,13:9,7 | |
| 18752 chr22 26686140 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=5.2598e-09;SPV=0.42512 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:25,12:14,4:11,8 0/1:.:32:20,12:8,7:12,5 | |
| 18753 chr22 26686760 . A T . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=2.0466e-12;SPV=0.74467 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:7,8:6,8 0/1:.:30:15,15:10,6:5,9 | |
| 18754 chr22 26687743 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=9;GPV=3.2213e-16;SPV=0.11458 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:14,12:10,8 0/1:.:34:13,21:9,10:4,11 | |
| 18755 chr22 26688163 . G T . PASS DP=71;SS=1;SSC=6;GPV=8.7106e-13;SPV=0.20953 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:12,7:10,8 0/1:.:34:16,18:8,10:8,8 | |
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| 18757 chr22 26688692 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=8.6933e-09;SPV=0.69459 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:15,7:8,8 0/1:.:22:14,8:6,3:8,5 | |
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| 18801 chr22 26707713 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=6;GPV=1.3907e-10;SPV=0.23904 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:20,14:12,6:8,8 0/1:.:24:11,13:6,7:5,6 | |
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| 18812 chr22 26713171 . A T . PASS DP=29;SS=1;SSC=3;GPV=7.3681e-12;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:2,11:1,8:1,3 1/1:.:14:1,12:0,7:1,5 | |
| 18813 chr22 26713512 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=21;GPV=1;SPV=0.0071164 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:13,8:11,8 0/1:.:37:11,26:6,9:5,17 | |
| 18814 chr22 26714056 . G T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 18815 chr22 26714296 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=4.411e-14;SPV=0.62837 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:12,18:7,7:5,11 0/1:.:27:11,16:6,9:5,7 | |
| 18816 chr22 26714423 . C G . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=8.8612e-15;SPV=0.63797 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:7,9:9,10 0/1:.:34:16,18:9,13:7,5 | |
| 18817 chr22 26714864 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=3.2981e-15;SPV=0.72017 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:10,17:12,6 0/1:.:34:18,16:11,7:7,9 | |
| 18818 chr22 26715358 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=12;GPV=1.5052e-15;SPV=0.059884 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:36,21:9,7:27,14 0/1:.:36:16,20:6,9:10,11 | |
| 18819 chr22 26717548 . G T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,11:0,26 1/1:.:22:0,22:0,10:0,12 | |
| 18820 chr22 26717551 . G T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,14:0,26 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 | |
| 18821 chr22 26717734 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=4;GPV=3.2889e-10;SPV=0.32721 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:6,5:13,9 0/1:.:23:11,12:7,7:4,5 | |
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| 18823 chr22 26717860 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=8.637e-13;SPV=0.80471 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:9,10:6,9 0/1:.:27:14,13:9,4:5,9 | |
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| 18873 chr22 26749677 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=1.6574e-14;SPV=0.67887 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:13,13:5,6 0/1:.:37:19,18:11,13:8,5 | |
| 18874 chr22 26749796 . C G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 | |
| 18875 chr22 26750325 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=8;GPV=8.8662e-16;SPV=0.13779 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:31,22:19,13:12,9 0/1:.:34:15,19:6,8:9,11 | |
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| 18878 chr22 26753090 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,28:0,19 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 | |
| 18879 chr22 26757001 . G T . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,29:0,21 1/1:.:44:0,44:0,18:0,26 | |
| 18880 chr22 26757529 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,27:0,20 1/1:.:45:0,45:0,30:0,15 | |
| 18881 chr22 26760694 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=2.0579e-15;SPV=0.93715 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:14,21:4,11:10,10 0/1:.:40:22,18:15,4:7,14 | |
| 18882 chr22 26761616 . T G . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,6:0,15 1/1:.:19:0,19:0,8:0,11 | |
| 18883 chr22 26761857 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 18884 chr22 26763869 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 | |
| 18885 chr22 26768036 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=6;GPV=6.58e-14;SPV=0.23787 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:10,14:16,5 0/1:.:32:15,17:9,8:6,9 | |
| 18886 chr22 26768999 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=12;GPV=1.4766e-14;SPV=0.055199 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:15,10:11,9 0/1:.:28:10,18:2,5:8,13 | |
| 18887 chr22 26770577 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.1086e-15;SPV=0.89241 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:15,15:6,11 0/1:.:32:18,14:12,7:6,7 | |
| 18888 chr22 26774762 . T G . PASS DP=59;SS=1;SSC=8;GPV=3.1153e-09;SPV=0.13372 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:18,8:9,5:9,3 0/1:.:33:17,16:11,10:6,6 | |
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| 18890 chr22 26776042 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=8;GPV=1.16e-09;SPV=0.1524 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:18,9:12,8:6,1 0/1:.:32:16,16:9,9:7,7 | |
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| 18943 chr22 26820095 . G A . PASS DP=23;SS=1;SSC=0;GPV=1.2146e-13;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,1:0,12 1/1:.:10:0,10:0,2:0,8 | |
| 18944 chr22 26820463 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,24:0,19 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 18945 chr22 26821956 . A C . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=8.8612e-15;SPV=0.78901 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:7,8:9,13 0/1:.:32:16,16:5,5:11,11 | |
| 18946 chr22 26822309 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=7.0184e-11;SPV=0.9838 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:8,11:7,8 0/1:.:28:19,9:14,7:5,2 | |
| 18947 chr22 26822773 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=3.1307e-16;SPV=0.96153 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:11,22:5,6:6,16 0/1:.:37:19,18:7,5:12,13 | |
| 18948 chr22 26823408 . A C . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=9.5854e-11;SPV=0.37662 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:11,8:12,7 0/1:.:28:15,13:9,5:6,8 | |
| 18949 chr22 26823918 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=7;GPV=2.3338e-15;SPV=0.18697 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:6,13:8,3 0/1:.:31:10,21:8,11:2,10 | |
| 18950 chr22 26824029 . C A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.0316e-12;SPV=0.94916 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:7,9:8,10 0/1:.:31:19,12:8,6:11,6 | |
| 18951 chr22 26824213 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.1634e-08;SPV=0.69703 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:21,12:10,5:11,7 0/1:.:33:22,11:13,4:9,7 | |
| 18952 chr22 26824294 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=4;GPV=2.0643e-11;SPV=0.35152 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:12,12:7,6:5,6 0/1:.:27:11,16:5,10:6,6 | |
| 18953 chr22 26824524 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.4154e-13;SPV=0.83825 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:13,8:7,13 0/1:.:33:19,14:8,6:11,8 | |
| 18954 chr22 26825031 . C A . PASS DP=49;SS=1;SSC=11;GPV=1.1173e-08;SPV=0.070273 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:4,6:15,4 0/1:.:20:8,12:1,8:7,4 | |
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| 18956 chr22 26828145 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,15:0,34 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 | |
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| 19007 chr22 26849664 . C G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 1/1:.:36:0,36:0,15:0,21 | |
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| 19012 chr22 26852062 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 1/1:.:38:0,38:0,11:0,27 | |
| 19013 chr22 26852256 . C T . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=1.3852e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,9:0,7 1/1:.:17:0,17:0,9:0,8 | |
| 19014 chr22 26852816 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 1/1:.:26:0,26:0,9:0,17 | |
| 19015 chr22 26853389 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 19016 chr22 26854823 . A T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,14:0,7 1/1:.:40:0,40:0,17:0,23 | |
| 19017 chr22 26855404 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,12:0,8 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 | |
| 19018 chr22 26855516 . C G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 | |
| 19019 chr22 26856880 . T A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 | |
| 19020 chr22 26856896 . A C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 1/1:.:37:0,37:0,23:0,14 | |
| 19021 chr22 26857390 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,19:0,10 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 19022 chr22 26857597 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 | |
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| 19024 chr22 26857828 . G C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,25:0,17 1/1:.:17:0,17:0,12:0,5 | |
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| 19072 chr22 26913835 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=2;GPV=7.7239e-15;SPV=0.5193 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:8,6:18,14 0/1:.:42:23,19:7,9:16,10 | |
| 19073 chr22 26914018 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=5;GPV=3.3502e-13;SPV=0.31389 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:13,11:7,4 0/1:.:37:18,19:14,9:4,10 | |
| 19074 chr22 26914153 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=1.5643e-13;SPV=0.83834 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:12,13:14,8 0/1:.:41:26,15:10,9:16,6 | |
| 19075 chr22 26915028 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=2.0579e-15;SPV=0.84133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:4,14:15,10 0/1:.:32:17,15:9,4:8,11 | |
| 19076 chr22 26916293 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 19077 chr22 26917022 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=2.4776e-16;SPV=0.71398 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:15,14:9,11 0/1:.:36:19,17:11,9:8,8 | |
| 19078 chr22 26917474 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=10;GPV=7.0292e-13;SPV=0.087822 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:33,18:12,12:21,6 0/1:.:30:14,16:9,8:5,8 | |
| 19079 chr22 26917802 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=8.5141e-10;SPV=0.85396 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:7,10:14,5 0/1:.:34:23,11:13,8:10,3 | |
| 19080 chr22 26919760 . G T . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5031e-08;SPV=0.90976 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:11,11:5,5:6,6 0/1:.:31:20,11:6,2:14,9 | |
| 19081 chr22 26921107 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=4;GPV=1.3846e-12;SPV=0.35281 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:9,7:8,7 0/1:.:34:16,18:8,6:8,12 | |
| 19082 chr22 26921376 . G C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=1.5211e-10;SPV=0.80122 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:11,11:8,7 0/1:.:22:13,9:8,5:5,4 | |
| 19083 chr22 26921474 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=2.9394e-12;SPV=0.77692 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:5,10:9,6 0/1:.:32:17,15:9,9:8,6 | |
| 19084 chr22 26921723 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=1.6064e-11;SPV=0.75399 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,17:13,9:7,8 0/1:.:32:19,13:12,6:7,7 | |
| 19085 chr22 26921890 . T G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=8.6835e-16;SPV=0.84661 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:8,12:9,10 0/1:.:38:20,18:6,11:14,7 | |
| 19086 chr22 26922256 . T A . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=2.1774e-09;SPV=0.96254 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:9,12:5,5:4,7 0/1:.:33:21,12:10,8:11,4 | |
| 19087 chr22 26923134 . A T . PASS DP=65;SS=1;SSC=4;GPV=1.3846e-12;SPV=0.35575 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:12,7:6,8 0/1:.:32:15,17:10,6:5,11 | |
| 19088 chr22 26923505 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=5.0108e-11;SPV=0.60209 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:26,18:8,14:18,4 0/1:.:27:16,11:4,8:12,3 | |
| 19089 chr22 26924510 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=4.4277e-12;SPV=0.36756 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:28,17:17,8:11,9 0/1:.:34:19,15:11,6:8,9 | |
| 19090 chr22 26924716 . G C . PASS DP=89;SS=1;SSC=10;GPV=1.0691e-15;SPV=0.084563 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:28,17:11,7:17,10 0/1:.:44:20,24:9,17:11,7 | |
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| 19092 chr22 26925209 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=1.0886e-16;SPV=0.50248 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:11,20:7,9:4,11 0/1:.:28:9,19:7,8:2,11 | |
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| 19141 chr22 26965031 . C T . PASS DP=40;SS=1;SSC=2;GPV=1.2997e-08;SPV=0.59157 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:4,4:1,2:3,2 0/1:.:32:15,17:8,6:7,11 | |
| 19142 chr22 26965502 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=5.6397e-13;SPV=0.83466 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:9,17:4,9:5,8 0/1:.:25:11,14:3,7:8,7 | |
| 19143 chr22 26965668 . C G . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=3.8991e-08;SPV=0.83987 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:6,8:4,2:2,6 0/1:.:26:14,12:10,5:4,7 | |
| 19144 chr22 26966185 . G T . PASS DP=39;SS=1;SSC=1;GPV=1.0268e-07;SPV=0.78577 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:6,7:2,4:4,3 0/1:.:26:14,12:6,4:8,8 | |
| 19145 chr22 26966271 . G C . PASS DP=39;SS=1;SSC=0;GPV=1.1402e-08;SPV=0.99861 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:1,8:1,4:0,4 0/1:.:30:17,13:10,5:7,8 | |
| 19146 chr22 26967361 . A G . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=4.3347e-08;SPV=0.93453 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:4,7:2,3:2,4 0/1:.:30:17,13:8,7:9,6 | |
| 19147 chr22 26967669 . T C . PASS DP=55;SS=1;SSC=5;GPV=2.9502e-14;SPV=0.26596 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:10,12:5,3:5,9 0/1:.:33:11,22:4,17:7,5 | |
| 19148 chr22 26968114 . A T . PASS DP=53;SS=1;SSC=2;GPV=2.7227e-11;SPV=0.55159 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:13,14:6,12:7,2 0/1:.:26:12,14:6,2:6,12 | |
| 19149 chr22 26971009 . G C . PASS DP=62;SS=1;SSC=6;GPV=5.295e-10;SPV=0.20471 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:16,8:4,4:12,4 0/1:.:38:20,18:9,7:11,11 | |
| 19150 chr22 26971738 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=4;GPV=3.4338e-13;SPV=0.3926 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:27,17:12,9:15,8 0/1:.:41:23,18:8,10:15,8 | |
| 19151 chr22 26971989 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=9;GPV=1.3287e-16;SPV=0.10621 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:5,4:11,10 0/1:.:42:15,27:8,13:7,14 | |
| 19152 chr22 26973038 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=3;GPV=7.3738e-16;SPV=0.4981 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:18,23:12,10:6,13 0/1:.:27:11,16:5,11:6,5 | |
| 19153 chr22 26975128 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=4;GPV=4.2444e-12;SPV=0.39454 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:7,6:7,8 0/1:.:28:12,16:6,9:6,7 | |
| 19154 chr22 26976434 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=3.5259e-08;SPV=0.91961 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:11,11:3,4:8,7 0/1:.:29:19,10:12,3:7,7 | |
| 19155 chr22 26977373 . G C . PASS DP=50;SS=1;SSC=1;GPV=5.2124e-10;SPV=0.73099 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:7,8:2,3:5,5 0/1:.:35:18,17:7,10:11,7 | |
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| 19157 chr22 26978282 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=3.316e-09;SPV=0.48031 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:12,7:5,1:7,6 0/1:.:41:24,17:15,13:9,4 | |
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| 19204 chr22 27017298 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.4766e-14;SPV=0.79786 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:5,7:10,11 0/1:.:40:21,19:10,10:11,9 | |
| 19205 chr22 27017697 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=7.7551e-09;SPV=0.88272 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:7,8:10,6 0/1:.:27:18,9:10,5:8,4 | |
| 19206 chr22 27017959 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=5;GPV=3.1807e-12;SPV=0.28179 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:7,8:7,6 0/1:.:26:10,16:4,8:6,8 | |
| 19207 chr22 27018464 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=6.7171e-08;SPV=0.97832 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:9,12:6,5:3,7 0/1:.:25:17,8:9,3:8,5 | |
| 19208 chr22 27019550 . T C . PASS DP=28;SS=1;SSC=8;GPV=5.6872e-14;SPV=0.1455 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,3:0,14 1/1:.:11:2,9:0,2:2,7 | |
| 19209 chr22 27020630 . T C . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,7:0,22 1/1:.:16:0,16:0,8:0,8 | |
| 19210 chr22 27020862 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 1/1:.:32:0,32:0,21:0,11 | |
| 19211 chr22 27022296 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=5.0221e-16;SPV=0.87347 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:7,10:6,10 0/1:.:40:20,20:9,10:11,10 | |
| 19212 chr22 27023827 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=1.1758e-13;SPV=0.62214 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:5,4:11,15 0/1:.:28:13,15:5,6:8,9 | |
| 19213 chr22 27024150 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=1.0182e-13;SPV=0.98818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:11,22:8,12:3,10 0/1:.:29:17,12:9,6:8,6 | |
| 19214 chr22 27024355 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.7389e-14;SPV=0.8702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:13,18:4,10:9,8 0/1:.:38:20,18:6,10:14,8 | |
| 19215 chr22 27025173 . T G . PASS DP=66;SS=1;SSC=7;GPV=4.4405e-12;SPV=0.18991 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:8,6:17,12 0/1:.:23:10,13:6,6:4,7 | |
| 19216 chr22 27025669 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=8.6344e-12;SPV=0.71074 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:12,12:6,6 0/1:.:26:14,12:10,8:4,4 | |
| 19217 chr22 27026902 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=9;GPV=6.2985e-12;SPV=0.109 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:22,12:12,10:10,2 0/1:.:36:17,19:7,9:10,10 | |
| 19218 chr22 27027044 . T A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.4721e-10;SPV=0.85884 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:14,12:11,6 0/1:.:28:19,9:13,2:6,7 | |
| 19219 chr22 27027601 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=1.8199e-14;SPV=0.98338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:9,19:3,5:6,14 0/1:.:38:21,17:7,10:14,7 | |
| 19220 chr22 27028785 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=1.0404e-13;SPV=0.79978 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:10,10:8,10 0/1:.:33:18,15:4,8:14,7 | |
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| 19222 chr22 27031341 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=1.0222e-17;SPV=0.55881 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:11,10:13,16 0/1:.:36:17,19:10,11:7,8 | |
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| 19272 chr22 27051687 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=5.635e-11;SPV=0.9981 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:4,14:2,7:2,7 0/1:.:32:19,13:8,9:11,4 | |
| 19273 chr22 27052066 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=2.7227e-11;SPV=0.95289 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:7,13:2,3:5,10 0/1:.:33:18,15:8,7:10,8 | |
| 19274 chr22 27052318 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=1.6778e-09;SPV=0.64848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:12,11:9,3:3,8 0/1:.:28:15,13:10,8:5,5 | |
| 19275 chr22 27053062 . C A . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,11:0,11 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
| 19276 chr22 27053808 . G A . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,10:0,3 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
| 19277 chr22 27053930 . A G . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=5.7269e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,10:0,1 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 19278 chr22 27053978 . A G . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=8.3984e-11;SPV=0.92373 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:5,11:3,10:2,1 0/1:.:29:14,15:8,5:6,10 | |
| 19279 chr22 27054499 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=4;GPV=4.3451e-09;SPV=0.39702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:6,7:9,4 0/1:.:24:12,12:5,9:7,3 | |
| 19280 chr22 27054620 . G C . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=3.4899e-11;SPV=0.45446 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:12,11:8,8:4,3 0/1:.:32:15,17:7,10:8,7 | |
| 19281 chr22 27055218 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=9;GPV=2.3048e-12;SPV=0.1199 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:11,9:3,5:8,4 0/1:.:32:11,21:4,7:7,14 | |
| 19282 chr22 27056759 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 | |
| 19283 chr22 27056834 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=4;GPV=1.1034e-11;SPV=0.39069 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:30,18:16,10:14,8 0/1:.:30:17,13:8,6:9,7 | |
| 19284 chr22 27057809 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=3;GPV=1.7439e-13;SPV=0.40841 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:5,5:11,10 0/1:.:35:16,19:7,8:9,11 | |
| 19285 chr22 27058060 . C A . PASS DP=62;SS=1;SSC=4;GPV=8.6344e-12;SPV=0.39337 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:11,8:5,5 0/1:.:33:16,17:8,9:8,8 | |
| 19286 chr22 27059447 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=5;GPV=6.2003e-16;SPV=0.26144 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:9,10:7,8 0/1:.:33:12,21:7,10:5,11 | |
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| 19288 chr22 27061561 . A C . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=1.2401e-12;SPV=0.69204 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:6,8:8,7 0/1:.:35:18,17:6,6:12,11 | |
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| 19333 chr22 27087656 . C G . PASS DP=73;SS=1;SSC=8;GPV=3.6826e-13;SPV=0.1509 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:13,8:10,7 0/1:.:35:16,19:6,11:10,8 | |
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| 19335 chr22 27088218 . G T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 19336 chr22 27088427 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=5.8427e-13;SPV=0.54251 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:15,14:5,7:10,7 0/1:.:38:19,19:11,8:8,11 | |
| 19337 chr22 27088514 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.7321e-11;SPV=0.87298 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:7,9:10,7 0/1:.:37:23,14:13,4:10,10 | |
| 19338 chr22 27089149 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=3;GPV=3.2981e-15;SPV=0.46394 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,23:13,12:12,11 0/1:.:31:15,16:7,12:8,4 | |
| 19339 chr22 27089650 . T G . PASS DP=77;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.038315 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:27,11:15,6:12,5 0/1:.:39:19,20:5,5:14,15 | |
| 19340 chr22 27089997 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=5;GPV=1.4154e-13;SPV=0.25379 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:9,7:14,10 0/1:.:34:16,18:8,9:8,9 | |
| 19341 chr22 27090760 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,25:0,23 1/1:.:38:0,38:0,25:0,13 | |
| 19342 chr22 27090809 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=6;GPV=2.1215e-17;SPV=0.23281 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:27,26:11,10:16,16 0/1:.:30:12,18:6,9:6,9 | |
| 19343 chr22 27091016 . G C . PASS DP=90;SS=1;SSC=5;GPV=4.9177e-17;SPV=0.26895 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:17,9:10,13 0/1:.:41:19,22:10,8:9,14 | |
| 19344 chr22 27091270 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,28:0,22 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 | |
| 19345 chr22 27092564 . T G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 1/1:.:37:0,37:0,23:0,14 | |
| 19346 chr22 27092642 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,14:0,23 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 | |
| 19347 chr22 27092898 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.51852 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:1,41:1,21:0,20 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 | |
| 19348 chr22 27093331 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 | |
| 19349 chr22 27093348 . A C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 1/1:.:38:0,38:0,15:0,23 | |
| 19350 chr22 27093621 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 19351 chr22 27093853 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,10:0,16 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
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| 19354 chr22 27094766 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,27:0,27 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
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| 19356 chr22 27095081 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,25:0,31 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
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| 19408 chr22 27113957 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 19409 chr22 27114270 . G T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 1/1:.:31:0,31:0,22:0,9 | |
| 19410 chr22 27114566 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,26:0,26 1/1:.:36:0,36:0,15:0,21 | |
| 19411 chr22 27114664 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 1/1:.:19:0,19:0,6:0,13 | |
| 19412 chr22 27114884 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 | |
| 19413 chr22 27115705 . C G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 | |
| 19414 chr22 27116021 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=8;GPV=6.2293e-15;SPV=0.15083 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:9,9:10,5 0/1:.:42:18,24:12,14:6,10 | |
| 19415 chr22 27116263 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,24:0,11 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 | |
| 19416 chr22 27116827 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,9:0,14 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 | |
| 19417 chr22 27116839 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,8:0,13 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 | |
| 19418 chr22 27118877 . C T . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 1/1:.:19:0,19:0,7:0,12 | |
| 19419 chr22 27119802 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 | |
| 19420 chr22 27120985 . T C . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 1/1:.:20:0,20:0,8:0,12 | |
| 19421 chr22 27121729 . A C . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,10:0,14 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
| 19422 chr22 27121838 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,19:0,8 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 | |
| 19423 chr22 27122986 . G A . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,13:0,19 1/1:.:19:0,19:0,4:0,15 | |
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| 19425 chr22 27124479 . C G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.3846e-12;SPV=0.99247 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:15,23:4,11:11,12 0/1:.:27:18,9:8,8:10,1 | |
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| 19472 chr22 27161387 . C A . PASS DP=55;SS=1;SSC=5;GPV=6.4034e-09;SPV=0.25445 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:18,10:6,3:12,7 0/1:.:27:14,13:7,9:7,4 | |
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| 19474 chr22 27163450 . T A . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,10:0,7 1/1:.:27:0,27:0,17:0,10 | |
| 19475 chr22 27163940 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=3;GPV=4.0316e-12;SPV=0.43463 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:9,8:7,5 0/1:.:36:18,18:9,8:9,10 | |
| 19476 chr22 27164614 . A T . PASS DP=42;SS=1;SSC=2;GPV=1.6451e-08;SPV=0.62213 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:9,9:6,5:3,4 0/1:.:24:12,12:4,5:8,7 | |
| 19477 chr22 27165119 . T A . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=3.594e-10;SPV=0.50252 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:13,10:7,5:6,5 0/1:.:34:18,16:6,5:12,11 | |
| 19478 chr22 27165538 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=3;GPV=1.0182e-13;SPV=0.4707 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:9,5:7,13 0/1:.:28:12,16:5,7:7,9 | |
| 19479 chr22 27166239 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=5.9795e-14;SPV=0.51437 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:12,12:10,7 0/1:.:35:18,17:11,6:7,11 | |
| 19480 chr22 27167651 . C A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.7958e-17;SPV=0.95816 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:14,24:7,7:7,17 0/1:.:41:22,19:13,11:9,8 | |
| 19481 chr22 27168140 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=1.1758e-13;SPV=0.51492 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:7,15:10,4 0/1:.:27:12,15:3,5:9,10 | |
| 19482 chr22 27169426 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=3.5003e-14;SPV=0.54919 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:6,12:11,5 0/1:.:37:18,19:12,10:6,9 | |
| 19483 chr22 27170657 . C G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,25:0,12 1/1:.:36:0,36:0,23:0,13 | |
| 19484 chr22 27171158 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=2;GPV=3.316e-09;SPV=0.52075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:19,12:11,7:8,5 0/1:.:29:17,12:8,10:9,2 | |
| 19485 chr22 27171358 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=7.7752e-12;SPV=0.54847 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:15,14:9,7:6,7 0/1:.:32:16,16:9,7:7,9 | |
| 19486 chr22 27171583 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=7;GPV=1.1758e-13;SPV=0.16236 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:10,7:9,10 0/1:.:27:10,17:5,9:5,8 | |
| 19487 chr22 27171992 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=4;GPV=1.7985e-10;SPV=0.32138 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:9,8:13,7 0/1:.:24:12,12:3,6:9,6 | |
| 19488 chr22 27172155 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 1/1:.:27:0,27:0,17:0,10 | |
| 19489 chr22 27172260 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=5.8009e-12;SPV=0.47596 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:13,7:8,9 0/1:.:32:17,15:11,5:6,10 | |
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| 19491 chr22 27174017 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 1/1:.:28:0,28:0,11:0,17 | |
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| 19539 chr22 27197277 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.0669e-14;SPV=0.67674 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:7,14:14,6 0/1:.:39:21,18:8,8:13,10 | |
| 19540 chr22 27198149 . C A . PASS DP=58;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.047063 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:9,6:10,8 0/1:.:25:8,17:2,9:6,8 | |
| 19541 chr22 27198218 . T A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=6.4034e-09;SPV=0.98576 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:8,10:6,6 0/1:.:25:18,7:7,5:11,2 | |
| 19542 chr22 27199620 . G T . PASS DP=57;SS=1;SSC=6;GPV=2.7262e-09;SPV=0.24475 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:18,10:5,5:13,5 0/1:.:29:15,14:8,8:7,6 | |
| 19543 chr22 27200874 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 | |
| 19544 chr22 27201443 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=5;GPV=3.642e-14;SPV=0.30073 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:14,8:14,12 0/1:.:34:17,17:6,7:11,10 | |
| 19545 chr22 27203370 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=5;GPV=3.6641e-16;SPV=0.31535 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:27,26:15,11:12,15 0/1:.:26:11,15:4,5:7,10 | |
| 19546 chr22 27203456 . T G . PASS DP=86;SS=1;SSC=5;GPV=3.2684e-19;SPV=0.28665 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:13,12:10,13 0/1:.:38:15,23:7,11:8,12 | |
| 19547 chr22 27203884 . G T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 19548 chr22 27207714 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=9.6585e-18;SPV=0.56347 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:12,18:7,5:5,13 0/1:.:41:16,25:6,13:10,12 | |
| 19549 chr22 27207946 . C A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,26:0,16 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 19550 chr22 27208187 . C A . PASS DP=72;SS=1;SSC=5;GPV=2.5789e-19;SPV=0.30202 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:16,24:11,12:5,12 0/1:.:32:10,22:5,11:5,11 | |
| 19551 chr22 27208354 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,13:0,22 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 | |
| 19552 chr22 27210076 . T G . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=2.7262e-09;SPV=0.59457 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:8,8:10,5 0/1:.:26:15,11:9,8:6,3 | |
| 19553 chr22 27210222 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.7389e-14;SPV=0.84779 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:12,20:7,4 0/1:.:26:14,12:7,10:7,2 | |
| 19554 chr22 27210816 . T C . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=1.0345e-10;SPV=0.45772 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:18,16:11,9:7,7 0/1:.:21:10,11:5,7:5,4 | |
| 19555 chr22 27212125 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=5.88e-11;SPV=0.41107 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:9,7:9,7 0/1:.:28:14,14:5,5:9,9 | |
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| 19557 chr22 27214676 . A C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
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| 19594 chr22 27247341 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=8;GPV=8.7033e-16;SPV=0.14975 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:14,9:6,11 0/1:.:29:10,19:4,8:6,11 | |
| 19595 chr22 27248912 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=9.8334e-16;SPV=0.81168 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:11,14:9,10 0/1:.:34:18,16:7,8:11,8 | |
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| 19598 chr22 27249297 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,12:0,23 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 | |
| 19599 chr22 27249903 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,24:0,21 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
| 19600 chr22 27250415 . A T . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,12:0,11 1/1:.:29:0,29:0,12:0,17 | |
| 19601 chr22 27250621 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=5.5047e-12;SPV=0.68696 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:6,6:10,12 0/1:.:24:12,12:7,4:5,8 | |
| 19602 chr22 27250794 . C G . PASS DP=59;SS=1;SSC=3;GPV=8.221e-09;SPV=0.42157 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:21,12:13,10:8,2 0/1:.:26:15,11:9,6:6,5 | |
| 19603 chr22 27250908 . C A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,26:0,17 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 19604 chr22 27252252 . A C . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=1.6045e-08;SPV=0.85261 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:5,6:12,8 0/1:.:23:15,8:5,4:10,4 | |
| 19605 chr22 27252447 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=10;GPV=1.7027e-12;SPV=0.093016 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:22,14:11,11:11,3 0/1:.:31:13,18:9,10:4,8 | |
| 19606 chr22 27254459 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=2.6864e-14;SPV=0.43705 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:10,9:7,12 0/1:.:23:9,14:5,7:4,7 | |
| 19607 chr22 27254603 . C T . PASS DP=43;SS=1;SSC=1;GPV=3.4574e-12;SPV=0.631 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:8,16:6,6:2,10 0/1:.:18:6,12:4,7:2,5 | |
| 19608 chr22 27256328 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=4.3182e-16;SPV=0.8488 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:10,9:3,11 0/1:.:39:19,20:13,12:6,8 | |
| 19609 chr22 27256329 . G T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=3.2512e-15;SPV=0.90179 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:12,19:9,8:3,11 0/1:.:39:20,19:14,12:6,7 | |
| 19610 chr22 27257227 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=1.7985e-10;SPV=0.86207 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:6,6:8,8 0/1:.:33:20,13:6,7:14,6 | |
| 19611 chr22 27260947 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 1/1:.:30:0,30:0,9:0,21 | |
| 19612 chr22 27261546 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 19613 chr22 27261643 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 19614 chr22 27262331 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,29:0,18 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
| 19615 chr22 27262582 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=6;GPV=2.2597e-11;SPV=0.20003 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:12,6:9,9 0/1:.:25:11,14:3,9:8,5 | |
| 19616 chr22 27263068 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 | |
| 19617 chr22 27263269 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 1/1:.:26:0,26:0,16:0,10 | |
| 19618 chr22 27263386 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
| 19619 chr22 27263668 . A C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,28:0,14 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
| 19620 chr22 27263670 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,28:0,15 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
| 19621 chr22 27263763 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 19622 chr22 27263813 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 | |
| 19623 chr22 27264003 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 | |
| 19624 chr22 27264013 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
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| 19651 chr22 27278871 . T G . PASS DP=52;SS=1;SSC=1;GPV=7.3303e-11;SPV=0.7863 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:14,17:6,10:8,7 0/1:.:21:11,10:5,3:6,7 | |
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| 19653 chr22 27279277 . A T . PASS DP=56;SS=1;SSC=2;GPV=1.3458e-12;SPV=0.52862 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:9,5:7,14 0/1:.:21:9,12:5,6:4,6 | |
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| 19655 chr22 27286974 . C G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.39e-14;SPV=0.80547 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:6,14:15,9 0/1:.:29:16,13:8,4:8,9 | |
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| 19661 chr22 27301343 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=5;GPV=8.9502e-10;SPV=0.30697 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:30,15:16,12:14,3 0/1:.:26:15,11:12,4:3,7 | |
| 19662 chr22 27301524 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=4.0755e-11;SPV=0.88476 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:9,10:15,11 0/1:.:23:15,8:6,5:9,3 | |
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| 19664 chr22 27304958 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,13:0,24 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 | |
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| 19666 chr22 27305356 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,28:0,10 1/1:.:28:0,28:0,19:0,9 | |
| 19667 chr22 27307574 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=1.8624e-11;SPV=0.50356 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:12,9:11,7 0/1:.:32:18,14:7,9:11,5 | |
| 19668 chr22 27307974 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 19669 chr22 27307975 . T G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 19670 chr22 27308624 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.3908e-17;SPV=0.98647 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:14,28:6,17:8,11 0/1:.:34:19,15:13,6:6,9 | |
| 19671 chr22 27310442 . T A . PASS DP=47;SS=1;SSC=1;GPV=3.2755e-06;SPV=0.7283 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:16,9:7,4:9,5 0/1:.:22:15,7:8,3:7,4 | |
| 19672 chr22 27310980 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,29:0,9 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 | |
| 19673 chr22 27311170 . A C . PASS DP=94;SS=1;SSC=1;GPV=2.5559e-17;SPV=0.6804 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:27,26:11,11:16,15 0/1:.:41:22,19:13,9:9,10 | |
| 19674 chr22 27312352 . A C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.4531e-16;SPV=0.9984 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:14,29:6,11:8,18 0/1:.:33:21,12:11,8:10,4 | |
| 19675 chr22 27312682 . A T . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=1.973e-16;SPV=0.62587 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:12,10:10,13 0/1:.:38:19,19:9,5:10,14 | |
| 19676 chr22 27312746 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=1;GPV=1.8611e-17;SPV=0.77261 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:12,11:12,15 0/1:.:41:22,19:13,12:9,7 | |
| 19677 chr22 27312891 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=5.9795e-14;SPV=0.76232 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:8,9:12,11 0/1:.:36:20,16:6,7:14,9 | |
| 19678 chr22 27314742 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=4;GPV=8.038e-16;SPV=0.36021 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:28,23:13,13:15,10 0/1:.:35:17,18:8,9:9,9 | |
| 19679 chr22 27315095 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=8;GPV=3.0367e-13;SPV=0.15615 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:16,11:10,8 0/1:.:26:11,15:5,9:6,6 | |
| 19680 chr22 27315683 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=8.2907e-11;SPV=0.84055 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:29,19:11,13:18,6 0/1:.:32:22,10:11,3:11,7 | |
| 19681 chr22 27315800 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.3078e-18;SPV=0.91853 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:17,29:8,12:9,17 0/1:.:34:17,17:8,6:9,11 | |
| 19682 chr22 27316614 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.034795 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:24,4:12,2:12,2 0/1:.:25:15,10:7,7:8,3 | |
| 19683 chr22 27316720 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=1.374e-15;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:3,10:14,9 0/1:.:36:16,20:7,5:9,15 | |
| 19684 chr22 27317035 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 | |
| 19685 chr22 27317247 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.8278e-16;SPV=0.84387 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:18,26:8,16:10,10 0/1:.:30:15,15:7,7:8,8 | |
| 19686 chr22 27317413 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,19:0,23 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 | |
| 19687 chr22 27317867 . G C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.7389e-14;SPV=0.85981 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:6,12:9,8 0/1:.:34:18,16:5,6:13,10 | |
| 19688 chr22 27318613 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=4.0856e-15;SPV=0.76415 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:9,10:4,10 0/1:.:31:14,17:8,15:6,2 | |
| 19689 chr22 27321755 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=7;GPV=3.7458e-16;SPV=0.18984 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:30,22:14,12:16,10 0/1:.:37:17,20:12,10:5,10 | |
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| 19691 chr22 27322656 . A G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,34:0,20 1/1:.:39:0,39:0,28:0,11 | |
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| 19743 chr22 27355316 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 1/1:.:38:0,38:0,15:0,23 | |
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| 19748 chr22 27356822 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
| 19749 chr22 27359775 . G T . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=1.7375e-10;SPV=0.93738 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:7,12:4,10:3,2 0/1:.:31:17,14:9,9:8,5 | |
| 19750 chr22 27359945 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,9:0,10 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
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| 19752 chr22 27360174 . G A . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,10:0,11 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
| 19753 chr22 27360339 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,14:0,7 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 | |
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| 19803 chr22 27393673 . G T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.1315e-12;SPV=0.83825 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:10,8:10,11 0/1:.:35:21,14:11,5:10,9 | |
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| 19809 chr22 27397328 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.5003e-14;SPV=0.79564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:11,11:6,9 0/1:.:34:18,16:9,8:9,8 | |
| 19810 chr22 27397680 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=1.2581e-11;SPV=0.34947 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:16,11:8,3:8,8 0/1:.:39:20,19:12,8:8,11 | |
| 19811 chr22 27397885 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=1.3693e-11;SPV=0.61997 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:9,9:8,5 0/1:.:36:20,16:11,8:9,8 | |
| 19812 chr22 27398095 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.0619e-14;SPV=0.83301 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:12,13:9,10 0/1:.:32:18,14:8,6:10,8 | |
| 19813 chr22 27402368 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=8.2315e-13;SPV=0.96742 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:8,18:2,7:6,11 0/1:.:27:14,13:8,5:6,8 | |
| 19814 chr22 27402531 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=6;GPV=5.9704e-09;SPV=0.23589 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:15,8:12,5:3,3 0/1:.:31:16,15:9,12:7,3 | |
| 19815 chr22 27402694 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=2;GPV=3.9115e-10;SPV=0.62488 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:9,8:8,6 0/1:.:27:15,12:9,7:6,5 | |
| 19816 chr22 27403045 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=2.0466e-12;SPV=0.63135 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:10,12:6,6 0/1:.:25:12,13:5,8:7,5 | |
| 19817 chr22 27404494 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 19818 chr22 27404874 . G C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=4.411e-15;SPV=0.95514 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:8,20:3,9:5,11 0/1:.:30:14,16:10,8:4,8 | |
| 19819 chr22 27406119 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=5.2507e-16;SPV=0.74765 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:12,11:10,13 0/1:.:36:19,17:11,9:8,8 | |
| 19820 chr22 27408809 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,22:0,20 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 | |
| 19821 chr22 27410417 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=1.5461e-16;SPV=0.60901 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:12,17:11,8 0/1:.:33:16,17:7,10:9,7 | |
| 19822 chr22 27418121 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=1.0691e-15;SPV=0.66686 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:27,24:16,15:11,9 0/1:.:38:21,17:10,7:11,10 | |
| 19823 chr22 27418353 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=4;GPV=5.3981e-16;SPV=0.39642 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:28,21:15,11:13,10 0/1:.:44:23,21:15,10:8,11 | |
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| 19825 chr22 27419774 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=8.7033e-16;SPV=0.58888 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:8,12:9,10 0/1:.:30:13,17:4,10:9,7 | |
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| 19874 chr22 27443791 . C G . PASS DP=74;SS=1;SSC=5;GPV=5.0242e-18;SPV=0.30508 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:9,14:10,10 0/1:.:31:11,20:6,10:5,10 | |
| 19875 chr22 27444828 . G C . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 1/1:.:18:0,18:0,13:0,5 | |
| 19876 chr22 27444930 . G A . PASS DP=35;SS=1;SSC=0;GPV=7.8434e-05;SPV=0.82705 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:13,8:10,4:3,4 0/1:.:14:10,4:6,3:4,1 | |
| 19877 chr22 27445263 . A C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=1.7985e-10;SPV=0.85242 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:12,9:6,8 0/1:.:26:16,10:7,5:9,5 | |
| 19878 chr22 27445465 . C A . PASS DP=50;SS=1;SSC=1;GPV=0.0058219;SPV=0.77471 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:16,4:6,1:10,3 0/1:.:25:16,3:8,2:8,1 | |
| 19879 chr22 27445557 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 | |
| 19880 chr22 27445624 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 1/1:.:40:0,40:0,25:0,15 | |
| 19881 chr22 27445730 . T G . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=7.191e-13;SPV=0.349 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:9,7:9,7 0/1:.:37:18,19:10,11:8,8 | |
| 19882 chr22 27445834 . T A . PASS DP=77;SS=1;SSC=3;GPV=2.7365e-11;SPV=0.44345 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:24,14:16,7:8,7 0/1:.:39:23,16:11,8:12,8 | |
| 19883 chr22 27446021 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.3693e-11;SPV=0.90982 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:9,10:7,7 0/1:.:34:21,13:14,9:7,4 | |
| 19884 chr22 27446354 . A T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 1/1:.:26:0,26:0,9:0,17 | |
| 19885 chr22 27447792 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=4;GPV=5.8427e-13;SPV=0.36472 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:9,13:14,7 0/1:.:24:11,13:6,8:5,5 | |
| 19886 chr22 27447844 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 1/1:.:28:0,28:0,12:0,16 | |
| 19887 chr22 27448140 . T G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.9668e-14;SPV=0.99106 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:11,22:6,9:5,13 0/1:.:32:19,13:10,6:9,7 | |
| 19888 chr22 27449018 . A T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 19889 chr22 27450561 . G C . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=4.1537e-13;SPV=0.69197 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:12,17:7,9:5,8 0/1:.:27:12,15:7,8:5,7 | |
| 19890 chr22 27450914 . A T . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=6.5868e-13;SPV=0.56492 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:13,15:9,9:4,6 0/1:.:31:14,17:5,8:9,9 | |
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| 19892 chr22 27452452 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=5;GPV=1.5394e-06;SPV=0.30892 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:20,8:13,5:7,3 0/1:.:23:14,9:12,8:2,1 | |
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| 19947 chr22 27485844 . T A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 | |
| 19948 chr22 27485882 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
| 19949 chr22 27485924 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 19950 chr22 27486078 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=2;GPV=3.9115e-10;SPV=0.57706 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:11,7:9,9 0/1:.:22:12,10:4,5:8,5 | |
| 19951 chr22 27487227 . T A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=3.5146e-20;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,18:0,12:0,6 0/1:.:32:0,16:0,4:0,12 | |
| 19952 chr22 27487304 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=5.2507e-16;SPV=0.9624 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:11,16:8,10 0/1:.:37:22,15:11,5:11,10 | |
| 19953 chr22 27487355 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.8183e-16;SPV=0.9903 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:18,30:10,18:8,12 0/1:.:29:18,11:10,4:8,7 | |
| 19954 chr22 27488033 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,15:0,10 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 | |
| 19955 chr22 27488300 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,22:0,20 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 | |
| 19956 chr22 27488975 . T A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
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| 20017 chr22 27513246 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 | |
| 20018 chr22 27513645 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 | |
| 20019 chr22 27514177 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.034175 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:23,9:10,4:13,5 0/1:.:36:17,19:10,12:7,7 | |
| 20020 chr22 27517009 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=2.0525e-15;SPV=0.63618 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:8,17:10,7 0/1:.:25:11,14:8,9:3,5 | |
| 20021 chr22 27517051 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=4;GPV=4.9329e-10;SPV=0.3279 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:22,14:15,4:7,10 0/1:.:25:13,12:5,10:8,2 | |
| 20022 chr22 27517217 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
| 20023 chr22 27517426 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
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| 20083 chr22 27555215 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=9.9959e-10;SPV=0.55894 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:12,8:9,8 0/1:.:20:11,9:6,4:5,5 | |
| 20084 chr22 27555626 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=4;GPV=3.2317e-11;SPV=0.34933 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:19,13:8,4:11,9 0/1:.:33:17,16:13,10:4,6 | |
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| 20144 chr22 27601091 . C G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 1/1:.:21:0,21:0,11:0,10 | |
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| 20146 chr22 27606490 . G C . PASS DP=85;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.041553 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:29,22:18,10:11,12 0/1:.:34:12,22:8,14:4,8 | |
| 20147 chr22 27606491 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=11;GPV=5.8719e-16;SPV=0.073815 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:30,22:19,10:11,12 0/1:.:31:12,19:8,12:4,7 | |
| 20148 chr22 27607305 . T C . PASS DP=98;SS=1;SSC=5;GPV=5.7745e-20;SPV=0.26942 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:10,10:16,14 0/1:.:48:21,27:5,7:16,20 | |
| 20149 chr22 27608533 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=2.4283e-11;SPV=0.7016 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:27,19:17,11:10,8 0/1:.:29:18,11:9,7:9,4 | |
| 20150 chr22 27608866 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=6;GPV=1.4082e-10;SPV=0.24163 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:30,16:11,5:19,11 0/1:.:26:14,12:2,4:12,8 | |
| 20151 chr22 27610565 . G T . PASS DP=20;SS=1;SSC=6;GPV=6.4422e-06;SPV=0.25077 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:4,4:4,4:0,0 1/1:.:12:3,9:3,9:0,0 | |
| 20152 chr22 27611780 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=1.5461e-16;SPV=0.59345 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:26,28:12,13:14,15 0/1:.:27:13,14:9,10:4,4 | |
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| 20155 chr22 27613344 . G A . PASS DP=102;SS=1;SSC=4;GPV=3.3683e-22;SPV=0.32396 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:26,28:15,10:11,18 0/1:.:48:20,28:11,11:9,17 | |
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| 20186 chr22 27625767 . T G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,26:0,14 1/1:.:29:0,29:0,11:0,18 | |
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| 20211 chr22 27638966 . G C . PASS DP=100;SS=1;SSC=7;GPV=7.5496e-23;SPV=0.18325 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:66:31,35:19,16:12,19 0/1:.:34:12,22:5,10:7,12 | |
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| 20213 chr22 27640135 . G T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:36:0,36:0,23:0,13 | |
| 20214 chr22 27640508 . T G . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=6.9407e-09;SPV=0.81798 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:11,13:5,7:6,6 0/1:.:20:11,9:5,4:6,5 | |
| 20215 chr22 27640659 . G C . PASS DP=50;SS=1;SSC=3;GPV=5.4249e-12;SPV=0.40478 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:11,13:5,7:6,6 0/1:.:26:10,16:4,9:6,7 | |
| 20216 chr22 27641893 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 | |
| 20217 chr22 27641999 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
| 20218 chr22 27642389 . A G . PASS DP=103;SS=1;SSC=1;GPV=1.1453e-15;SPV=0.69823 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:30,22:17,11:13,11 0/1:.:51:31,20:16,8:15,12 | |
| 20219 chr22 27642757 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,29:0,18 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
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| 20222 chr22 27646550 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 | |
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| 20284 chr22 27697714 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=5.8009e-12;SPV=0.8187 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:10,10:9,8 0/1:.:32:19,13:10,9:9,4 | |
| 20285 chr22 27697779 . G C . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=2.1215e-17;SPV=0.59285 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:16,12:7,14 0/1:.:34:16,18:11,12:5,6 | |
| 20286 chr22 27698049 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=2.3066e-15;SPV=0.93913 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:5,16:16,8 0/1:.:41:25,16:9,9:16,7 | |
| 20287 chr22 27698158 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=7;GPV=1.0977e-18;SPV=0.18577 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:8,11:12,11 0/1:.:37:13,24:7,12:6,12 | |
| 20288 chr22 27698397 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 1/1:.:29:0,29:0,9:0,20 | |
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| 20290 chr22 27699490 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=1.8524e-14;SPV=0.55608 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:13,13:10,9 0/1:.:30:15,15:7,7:8,8 | |
| 20291 chr22 27699785 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=8.3232e-17;SPV=0.96752 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:19,27:8,14:11,13 0/1:.:39:23,16:15,9:8,7 | |
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| 20349 chr22 27740740 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=2.6374e-16;SPV=0.51027 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:6,8:10,13 0/1:.:32:13,19:2,8:11,11 | |
| 20350 chr22 27740757 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 1/1:.:31:0,31:0,10:0,21 | |
| 20351 chr22 27740758 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 1/1:.:33:0,33:0,10:0,23 | |
| 20352 chr22 27740989 . C A . PASS DP=64;SS=1;SSC=4;GPV=2.2534e-10;SPV=0.3343 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:21,13:11,6:10,7 0/1:.:30:16,14:8,8:8,6 | |
| 20353 chr22 27741443 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=4.1337e-13;SPV=0.50617 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:10,7:5,8 0/1:.:34:16,18:9,11:7,7 | |
| 20354 chr22 27742018 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=1.3291e-09;SPV=0.85488 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:15,13:8,3:7,10 0/1:.:33:21,12:10,7:11,5 | |
| 20355 chr22 27742648 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=3;GPV=1.3458e-12;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:13,15:7,11:6,4 0/1:.:28:12,16:7,7:5,9 | |
| 20356 chr22 27744224 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=6.9925e-15;SPV=0.96947 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:10,17:9,9 0/1:.:31:19,12:10,10:9,2 | |
| 20357 chr22 27744978 . A G . PASS DP=50;SS=1;SSC=5;GPV=1.7375e-10;SPV=0.27315 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:15,13:7,9:8,4 0/1:.:22:9,13:5,4:4,9 | |
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| 20359 chr22 27745313 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=6;GPV=9.798e-13;SPV=0.22308 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:8,7:9,7 0/1:.:31:13,18:7,7:6,11 | |
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| 20414 chr22 27822308 . C A . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=3.1807e-12;SPV=0.74405 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:14,19:6,13:8,6 0/1:.:21:10,11:5,8:5,3 | |
| 20415 chr22 27822466 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 1/1:.:37:0,37:0,25:0,12 | |
| 20416 chr22 27824281 . T A . PASS DP=90;SS=1;SSC=3;GPV=5.5445e-18;SPV=0.49068 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:25,25:10,13:15,12 0/1:.:40:19,21:13,11:6,10 | |
| 20417 chr22 27824700 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=1.973e-16;SPV=0.54314 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:7,10:14,11 0/1:.:41:20,21:13,12:7,9 | |
| 20418 chr22 27825703 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=9.392e-17;SPV=0.70063 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:16,24:9,11:7,13 0/1:.:30:13,17:6,10:7,7 | |
| 20419 chr22 27826203 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=9;GPV=4.5631e-21;SPV=0.11956 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:14,16:10,10 0/1:.:39:13,26:8,11:5,15 | |
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| 20479 chr22 27921413 . C A . PASS DP=71;SS=1;SSC=7;GPV=3.7425e-15;SPV=0.18005 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:11,10:10,9 0/1:.:31:12,19:7,5:5,14 | |
| 20480 chr22 27921681 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=8.9089e-11;SPV=0.91336 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:5,9:11,7 0/1:.:33:21,12:13,7:8,5 | |
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| 20482 chr22 27923290 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=5;GPV=9.8368e-17;SPV=0.28095 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:14,19:9,11:5,8 0/1:.:31:10,21:5,9:5,12 | |
| 20483 chr22 27923523 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=9.149e-19;SPV=0.81043 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:15,25:7,15:8,10 0/1:.:38:17,21:13,9:4,12 | |
| 20484 chr22 27925229 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,14:0,22 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
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| 20543 chr22 27983880 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=5.0119e-12;SPV=0.48992 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:32,20:16,12:16,8 0/1:.:29:17,12:6,6:11,6 | |
| 20544 chr22 27984381 . A T . PASS DP=78;SS=1;SSC=6;GPV=2.6615e-19;SPV=0.25015 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:15,14:6,13 0/1:.:30:10,20:6,11:4,9 | |
| 20545 chr22 27984600 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,23:0,21 1/1:.:21:0,21:0,6:0,15 | |
| 20546 chr22 27984782 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
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| 20548 chr22 27985849 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=8;GPV=1.4308e-12;SPV=0.13638 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:28,16:11,14:17,2 0/1:.:33:16,17:9,10:7,7 | |
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| 20606 chr22 28030140 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=5.2507e-16;SPV=0.94061 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:8,17:12,9 0/1:.:36:21,15:7,7:14,8 | |
| 20607 chr22 28034664 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=5.058e-19;SPV=0.95953 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:10,24:5,15:5,9 0/1:.:41:19,22:6,10:13,12 | |
| 20608 chr22 28037088 . A G . PASS DP=42;SS=1;SSC=2;GPV=5.4836e-09;SPV=0.54263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:7,7:2,4:5,3 0/1:.:28:13,15:9,5:4,10 | |
| 20609 chr22 28037247 . C A . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,10:0,12 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 | |
| 20610 chr22 28037308 . G C . PASS DP=50;SS=1;SSC=4;GPV=4.3451e-09;SPV=0.37986 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:14,10:9,7:5,3 0/1:.:26:13,13:10,7:3,6 | |
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| 20613 chr22 28041647 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=4;GPV=7.7752e-12;SPV=0.35137 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:11,9:6,5 0/1:.:30:14,16:7,9:7,7 | |
| 20614 chr22 28043238 . A G . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=1.3852e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,11:0,7 1/1:.:15:0,15:0,8:0,7 | |
| 20615 chr22 28045483 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=4.6624e-13;SPV=0.72825 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:7,8:11,12 0/1:.:27:14,13:7,4:7,9 | |
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| 20618 chr22 28048442 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=6.5868e-13;SPV=0.65632 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:6,7:7,9 0/1:.:30:14,16:5,8:9,8 | |
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| 20672 chr22 28091486 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.043847 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:15,6:10,3:5,3 0/1:.:30:13,17:5,5:8,12 | |
| 20673 chr22 28091743 . C G . PASS DP=54;SS=1;SSC=8;GPV=3.0926e-11;SPV=0.14005 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:7,8:8,3 0/1:.:28:11,17:4,11:7,6 | |
| 20674 chr22 28092117 . G T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,9:0,16 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 | |
| 20675 chr22 28092503 . C G . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=3.4899e-11;SPV=0.88727 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:12,16:2,9:10,7 0/1:.:27:15,12:7,4:8,8 | |
| 20676 chr22 28094369 . C A . PASS DP=53;SS=1;SSC=5;GPV=8.7266e-12;SPV=0.28525 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:11,8:5,8 0/1:.:21:8,13:5,8:3,5 | |
| 20677 chr22 28097002 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=5;GPV=2.9965e-10;SPV=0.26487 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:11,7:7,6 0/1:.:24:11,13:5,7:6,6 | |
| 20678 chr22 28097441 . A C . PASS DP=56;SS=1;SSC=5;GPV=4.2444e-12;SPV=0.30273 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:7,8:7,5 0/1:.:29:12,17:8,10:4,7 | |
| 20679 chr22 28099480 . T G . PASS DP=60;SS=1;SSC=8;GPV=7.5673e-13;SPV=0.1373 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:8,4:10,11 0/1:.:27:10,17:6,5:4,12 | |
| 20680 chr22 28101832 . A G . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=1.977e-10;SPV=0.81689 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:7,12:5,8:2,4 0/1:.:24:11,13:4,7:7,6 | |
| 20681 chr22 28102660 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=12;GPV=5.693e-13;SPV=0.05298 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:9,11:8,2 0/1:.:28:9,19:7,8:2,11 | |
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| 20683 chr22 28104743 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=2.2057e-13;SPV=0.98517 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:8,12:14,13 0/1:.:32:22,10:6,4:16,6 | |
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| 20733 chr22 28196180 . T A . PASS DP=39;SS=1;SSC=7;GPV=3.6006e-09;SPV=0.17348 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:8,6:5,1:3,5 0/1:.:25:9,16:2,7:7,9 | |
| 20734 chr22 28207492 . A T . PASS DP=57;SS=1;SSC=1;GPV=4.8496e-12;SPV=0.74398 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:3,8:10,8 0/1:.:28:14,14:9,4:5,10 | |
| 20735 chr22 28210745 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=6.3255e-14;SPV=0.76388 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:11,17:7,7:4,10 0/1:.:31:14,17:7,10:7,7 | |
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| 20737 chr22 28216411 . A T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=4.7339e-09;SPV=0.81503 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:11,11:2,8:9,3 0/1:.:29:17,12:4,3:13,9 | |
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| 20739 chr22 28219465 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,24:0,13 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 20740 chr22 28220092 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=3.2811e-12;SPV=0.80966 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:6,5:8,11 0/1:.:33:18,15:9,6:9,9 | |
| 20741 chr22 28222466 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=4.0316e-12;SPV=0.62329 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:10,5:4,8 0/1:.:38:20,18:11,7:9,11 | |
| 20742 chr22 28223230 . A C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.4655e-13;SPV=0.94745 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:18,23:9,13:9,10 0/1:.:28:17,11:11,6:6,5 | |
| 20743 chr22 28223895 . C A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 | |
| 20744 chr22 28224596 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=5.9704e-09;SPV=0.82977 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:11,7:5,7 0/1:.:24:15,9:12,6:3,3 | |
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| 20746 chr22 28228331 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=1.2505e-10;SPV=0.48075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:21,13:9,6:12,7 0/1:.:36:21,15:10,5:11,10 | |
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| 20870 chr22 28428762 . C A . PASS DP=60;SS=1;SSC=6;GPV=2.0452e-11;SPV=0.22907 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:11,9:9,6 0/1:.:25:11,14:8,11:3,3 | |
| 20871 chr22 28431226 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=3;GPV=6.6743e-16;SPV=0.42005 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:10,8:11,14 0/1:.:32:14,18:9,8:5,10 | |
| 20872 chr22 28435931 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=2.5807e-10;SPV=0.69149 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:7,6:12,8 0/1:.:33:20,13:7,4:13,9 | |
| 20873 chr22 28437514 . C A . PASS DP=71;SS=1;SSC=6;GPV=8.7106e-13;SPV=0.20953 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:13,5:9,10 0/1:.:34:16,18:6,10:10,8 | |
| 20874 chr22 28438781 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=2.3224e-12;SPV=0.78333 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:6,8:7,8 0/1:.:31:16,15:8,9:8,6 | |
| 20875 chr22 28441916 . T C . PASS DP=48;SS=1;SSC=5;GPV=3.6075e-09;SPV=0.28941 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:6,6:9,5 0/1:.:22:10,12:7,7:3,5 | |
| 20876 chr22 28445851 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=2;GPV=5.635e-11;SPV=0.51788 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:11,12:4,10:7,2 0/1:.:27:12,15:6,7:6,8 | |
| 20877 chr22 28449291 . A G . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,3:0,8 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 | |
| 20878 chr22 28449510 . G T . PASS DP=59;SS=1;SSC=10;GPV=5.349e-11;SPV=0.098005 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:15,8:10,3:5,5 0/1:.:36:16,20:12,10:4,10 | |
| 20879 chr22 28449893 . G C . PASS DP=54;SS=1;SSC=6;GPV=1.0051e-11;SPV=0.24961 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:10,8:5,4:5,4 0/1:.:36:15,21:8,8:7,13 | |
| 20880 chr22 28450592 . A T . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=1.9611e-10;SPV=0.76082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:11,13:8,5:3,8 0/1:.:27:14,13:7,10:7,3 | |
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| 20934 chr22 28527329 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=2.7231e-11;SPV=0.81446 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:4,7:12,9 0/1:.:31:18,13:9,6:9,7 | |
| 20935 chr22 28527945 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=2.0525e-15;SPV=0.68163 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:16,22:7,10:9,12 0/1:.:29:13,16:7,8:6,8 | |
| 20936 chr22 28529554 . T A . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=3.7062e-14;SPV=0.55908 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:11,12:7,10 0/1:.:23:10,13:5,7:5,6 | |
| 20937 chr22 28529972 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,27:0,18 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
| 20938 chr22 28537118 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=7;GPV=2.4568e-12;SPV=0.19797 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:28,19:13,10:15,9 0/1:.:24:11,13:7,8:4,5 | |
| 20939 chr22 28538325 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=2;GPV=1.7502e-16;SPV=0.56846 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:12,13:13,13 0/1:.:31:15,16:7,10:8,6 | |
| 20940 chr22 28544876 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.7649e-17;SPV=0.95204 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:18,31:8,15:10,16 0/1:.:24:13,11:7,7:6,4 | |
| 20941 chr22 28546694 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=7;GPV=5.3252e-12;SPV=0.16509 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:21,13:12,8:9,5 0/1:.:34:16,18:7,9:9,9 | |
| 20942 chr22 28547489 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=6;GPV=6.2104e-12;SPV=0.23998 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:6,7:14,10 0/1:.:22:9,13:3,7:6,6 | |
| 20943 chr22 28549184 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=10;GPV=1.5419e-14;SPV=0.097581 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:27,16:12,9:15,7 0/1:.:41:19,22:11,15:8,7 | |
| 20944 chr22 28549527 . T A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,10:0,18 1/1:.:40:0,40:0,17:0,23 | |
| 20945 chr22 28550200 . G C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,13:0,7 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 | |
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| 21001 chr22 28624303 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=1.2446e-15;SPV=0.32706 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:11,11:12,9 0/1:.:37:17,20:5,10:12,10 | |
| 21002 chr22 28624768 . G C . PASS DP=63;SS=1;SSC=8;GPV=3.2811e-12;SPV=0.1297 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:10,8:11,7 0/1:.:27:11,16:5,7:6,9 | |
| 21003 chr22 28626444 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=5.7384e-17;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:10,9:10,12 0/1:.:41:19,22:10,7:9,15 | |
| 21004 chr22 28628315 . T G . PASS DP=75;SS=1;SSC=8;GPV=1.5567e-13;SPV=0.13554 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:21,13:11,6:10,7 0/1:.:41:19,22:4,14:15,8 | |
| 21005 chr22 28632144 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.8389e-15;SPV=0.90238 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:13,22:3,11:10,11 0/1:.:30:15,15:8,6:7,9 | |
| 21006 chr22 28633045 . C A . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=3.9394e-09;SPV=0.75132 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:19,13:13,4:6,9 0/1:.:31:20,11:10,9:10,2 | |
| 21007 chr22 28633202 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=17;GPV=1;SPV=0.018869 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:19,9:11,4:8,5 0/1:.:34:13,21:6,12:7,9 | |
| 21008 chr22 28635632 . A T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,14:0,29 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 21009 chr22 28637015 . T G . PASS DP=58;SS=1;SSC=2;GPV=4.411e-15;SPV=0.505 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:7,10:6,10 0/1:.:25:9,16:6,9:3,7 | |
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| 21011 chr22 28637557 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.6481e-18;SPV=0.94848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:15,27:5,12:10,15 0/1:.:37:19,18:7,9:12,9 | |
| 21012 chr22 28638976 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,12:0,26 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 | |
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| 21014 chr22 28642616 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 1/1:.:21:0,21:0,14:0,7 | |
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| 21068 chr22 28696732 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=4.0755e-15;SPV=0.95725 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:6,17:14,8 0/1:.:36:22,14:11,8:11,6 | |
| 21069 chr22 28697251 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,32:0,21 1/1:.:27:0,27:0,18:0,9 | |
| 21070 chr22 28697290 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=3.7425e-15;SPV=0.7442 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:22,27:16,12:6,15 0/1:.:22:11,11:5,7:6,4 | |
| 21071 chr22 28697765 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=8;GPV=1.8199e-14;SPV=0.13253 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:10,12:10,6 0/1:.:28:10,18:3,6:7,12 | |
| 21072 chr22 28698096 . T A . PASS DP=56;SS=1;SSC=10;GPV=6.8457e-09;SPV=0.085416 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:23,11:13,8:10,3 0/1:.:22:10,12:7,10:3,2 | |
| 21073 chr22 28698364 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=1.8765e-12;SPV=0.75838 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:8,8:8,8 0/1:.:36:20,16:9,7:11,9 | |
| 21074 chr22 28703766 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.7389e-14;SPV=0.97987 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:13,22:2,12:11,10 0/1:.:34:20,14:8,8:12,6 | |
| 21075 chr22 28704576 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=1.0284e-10;SPV=0.57239 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:10,6:14,11 0/1:.:26:15,11:5,6:10,5 | |
| 21076 chr22 28704723 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,21:0,25 1/1:.:27:0,27:0,8:0,19 | |
| 21077 chr22 28704901 . C A . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=7.6248e-11;SPV=0.3313 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:10,10:13,6 0/1:.:24:12,12:7,7:5,5 | |
| 21078 chr22 28705369 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,15:0,24 1/1:.:23:0,23:0,8:0,15 | |
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| 21127 chr22 28746989 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=9.149e-19;SPV=0.81484 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:20,32:7,15:13,17 0/1:.:26:12,14:9,5:3,9 | |
| 21128 chr22 28748449 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=11;GPV=9.5353e-13;SPV=0.06334 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:28,17:14,8:14,9 0/1:.:27:11,16:5,7:6,9 | |
| 21129 chr22 28751305 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=5.8719e-16;SPV=0.97043 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:15,16:4,10 0/1:.:38:23,15:11,6:12,9 | |
| 21130 chr22 28751563 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=7.8044e-17;SPV=0.88494 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:16,28:9,16:7,12 0/1:.:25:12,13:10,9:2,4 | |
| 21131 chr22 28752303 . C A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=4.6893e-11;SPV=0.98275 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:14,10:10,13 0/1:.:23:17,6:6,1:11,5 | |
| 21132 chr22 28753051 . C G . PASS DP=59;SS=1;SSC=5;GPV=1.8826e-14;SPV=0.28353 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:4,6:11,12 0/1:.:26:9,17:2,7:7,10 | |
| 21133 chr22 28753485 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=9.6585e-18;SPV=0.70213 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:14,23:8,12:6,11 0/1:.:34:14,20:9,12:5,8 | |
| 21134 chr22 28753899 . G C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=1.548e-18;SPV=0.87103 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:17,27:8,16:9,11 0/1:.:37:18,19:7,15:11,4 | |
| 21135 chr22 28754056 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=5;GPV=3.5003e-14;SPV=0.27176 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:8,5:13,13 0/1:.:32:14,18:10,10:4,8 | |
| 21136 chr22 28754634 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.1404e-14;SPV=0.79874 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:5,8:8,12 0/1:.:30:14,16:2,3:12,13 | |
| 21137 chr22 28756040 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=9.798e-13;SPV=0.98166 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:17,25:8,9:9,16 0/1:.:20:13,7:11,5:2,2 | |
| 21138 chr22 28757559 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=5;GPV=4.39e-14;SPV=0.2808 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:7,9:14,8 0/1:.:35:16,19:10,10:6,9 | |
| 21139 chr22 28757771 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,24:0,22 1/1:.:46:0,46:0,25:0,21 | |
| 21140 chr22 28758467 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.8211e-18;SPV=0.65909 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:22,29:14,15:8,14 0/1:.:31:14,17:7,10:7,7 | |
| 21141 chr22 28758615 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=4;GPV=5.9795e-14;SPV=0.35139 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:25,20:10,11:15,9 0/1:.:31:15,16:8,8:7,8 | |
| 21142 chr22 28760460 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=1.2446e-15;SPV=0.32706 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:10,11:13,9 0/1:.:37:17,20:5,10:12,10 | |
| 21143 chr22 28761499 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=9.8334e-16;SPV=0.74105 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:14,17:8,8 0/1:.:31:16,15:5,9:11,6 | |
| 21144 chr22 28764449 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=5;GPV=4.39e-14;SPV=0.28307 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:14,10:9,9 0/1:.:31:14,17:8,9:6,8 | |
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| 21146 chr22 28766032 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=1.0476e-18;SPV=0.62397 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:22,27:11,13:11,14 0/1:.:37:17,20:10,10:7,10 | |
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| 21195 chr22 28825689 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=1.7375e-10;SPV=0.92581 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:9,14:2,4:7,10 0/1:.:27:15,12:3,5:12,7 | |
| 21196 chr22 28826942 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=4;GPV=1.9033e-15;SPV=0.31963 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:12,11:10,6 0/1:.:45:22,23:11,13:11,10 | |
| 21197 chr22 28827181 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=4.883e-13;SPV=0.52098 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:14,17:7,7:7,10 0/1:.:26:11,15:6,5:5,10 | |
| 21198 chr22 28827654 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=5.8719e-16;SPV=0.88817 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:9,15:11,9 0/1:.:39:22,17:14,6:8,11 | |
| 21199 chr22 28830582 . T G . PASS DP=79;SS=1;SSC=6;GPV=1.1715e-11;SPV=0.20631 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:29,15:15,11:14,4 0/1:.:35:19,16:7,7:12,9 | |
| 21200 chr22 28832496 . G C . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=4.8137e-09;SPV=0.99883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:5,15:2,3:3,12 0/1:.:21:14,7:4,4:10,3 | |
| 21201 chr22 28834803 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,16:0,27 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 21202 chr22 28835835 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=5;GPV=1.19e-16;SPV=0.3076 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:14,11:4,6 0/1:.:44:19,25:8,13:11,12 | |
| 21203 chr22 28839691 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=1.8424e-11;SPV=0.67218 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:11,10:8,9 0/1:.:21:11,10:7,6:4,4 | |
| 21204 chr22 28841594 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=3.1084e-18;SPV=0.88769 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:10,24:5,15:5,9 0/1:.:32:13,19:4,9:9,10 | |
| 21205 chr22 28842177 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=5.4147e-14;SPV=0.96483 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:10,12:9,12 0/1:.:32:20,12:11,5:9,7 | |
| 21206 chr22 28847953 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=4.8769e-15;SPV=0.63194 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:9,7:9,13 0/1:.:35:17,18:5,7:12,11 | |
| 21207 chr22 28850290 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=9.8334e-16;SPV=0.4059 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:15,12:6,8 0/1:.:37:17,20:11,13:6,7 | |
| 21208 chr22 28854237 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=5;GPV=2.7389e-14;SPV=0.26824 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:8,8:11,9 0/1:.:33:14,19:6,6:8,13 | |
| 21209 chr22 28855001 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=4;GPV=2.8662e-18;SPV=0.36878 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:12,11:9,11 0/1:.:42:18,24:10,9:8,15 | |
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| 21211 chr22 28860270 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=7.7752e-12;SPV=0.45458 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:18,16:10,7:8,9 0/1:.:27:13,14:9,8:4,6 | |
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| 21259 chr22 28914303 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=10;GPV=1.8278e-16;SPV=0.084723 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:7,8:16,13 0/1:.:30:10,20:5,5:5,15 | |
| 21260 chr22 28914793 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=5.4216e-18;SPV=0.97243 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:10,29:6,11:4,18 0/1:.:24:11,13:6,7:5,6 | |
| 21261 chr22 28918202 . C A . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=3.9615e-14;SPV=0.63413 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:14,12:9,7 0/1:.:41:23,18:13,9:10,9 | |
| 21262 chr22 28918538 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=1.3117e-10;SPV=0.90909 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:1,14:0,8:1,6 1/1:.:27:1,6:0,3:1,3 | |
| 21263 chr22 28918542 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=9;GPV=7.8434e-05;SPV=0.10868 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,5:9,3:7,2 0/1:.:27:7,7:3,4:4,3 | |
| 21264 chr22 28918544 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=7;GPV=1.9778e-09;SPV=0.17491 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:27,12:12,9:15,3 0/1:.:29:16,13:6,8:10,5 | |
| 21265 chr22 28918911 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=7;GPV=2.0308e-13;SPV=0.19356 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:25,16:19,7:6,9 0/1:.:37:18,19:11,10:7,9 | |
| 21266 chr22 28921571 . C G . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=1.7321e-11;SPV=0.40192 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:25,17:9,8:16,9 0/1:.:28:15,13:9,5:6,8 | |
| 21267 chr22 28925020 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=1.8221e-14;SPV=0.98096 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:11,8:11,17 0/1:.:39:26,13:13,11:13,2 | |
| 21268 chr22 28925552 . T G . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=6.2985e-12;SPV=0.62628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:5,7:11,6 0/1:.:41:23,18:12,5:11,13 | |
| 21269 chr22 28925672 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=1.1519e-11;SPV=0.70003 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:10,8:4,5 0/1:.:38:21,17:9,10:12,7 | |
| 21270 chr22 28929935 . G A . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.0643e-11;SPV=0.94128 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:9,16:5,10:4,6 0/1:.:26:14,12:7,7:7,5 | |
| 21271 chr22 28936150 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=1.4104e-19;SPV=0.58253 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:15,25:7,13:8,12 0/1:.:35:13,22:3,14:10,8 | |
| 21272 chr22 28938612 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=2.6864e-14;SPV=0.67186 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:12,17:6,10:6,7 0/1:.:32:14,18:9,9:5,9 | |
| 21273 chr22 28939510 . G C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,13:0,13 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 21274 chr22 28944624 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=4.034e-13;SPV=0.78209 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:9,11:12,9 0/1:.:33:19,14:12,5:7,9 | |
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| 21328 chr22 29034009 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=3.673e-15;SPV=0.90299 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:26,29:13,14:13,15 0/1:.:25:15,10:8,5:7,5 | |
| 21329 chr22 29035133 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=3;GPV=1.7027e-12;SPV=0.47471 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:6,9:15,9 0/1:.:28:14,14:7,9:7,5 | |
| 21330 chr22 29035638 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=1.8081e-15;SPV=0.45937 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:12,14:10,9 0/1:.:29:13,16:8,8:5,8 | |
| 21331 chr22 29035875 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=5;GPV=5.5047e-12;SPV=0.28149 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:18,16:8,11:10,5 0/1:.:24:10,14:6,8:4,6 | |
| 21332 chr22 29036734 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=4.2836e-15;SPV=0.55382 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:15,9:6,14 0/1:.:28:13,15:4,6:9,9 | |
| 21333 chr22 29037107 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=2.7231e-11;SPV=0.68186 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:5,8:14,9 0/1:.:27:15,12:10,4:5,8 | |
| 21334 chr22 29038965 . T G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,16:0,11 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 21335 chr22 29039409 . C A . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.1753e-14;SPV=0.64906 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:10,7:13,14 0/1:.:37:20,17:7,9:13,8 | |
| 21336 chr22 29039908 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=8;GPV=1.5685e-14;SPV=0.15775 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:9,9:10,9 0/1:.:28:10,18:7,8:3,10 | |
| 21337 chr22 29042339 . A T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=9.545e-12;SPV=0.83234 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:11,10:7,9 0/1:.:26:15,11:11,5:4,6 | |
| 21338 chr22 29042797 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=5;GPV=2.4219e-17;SPV=0.3029 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:15,17:10,7 0/1:.:35:15,20:6,8:9,12 | |
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| 21396 chr22 29079221 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
| 21397 chr22 29079595 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 1/1:.:40:0,40:0,15:0,25 | |
| 21398 chr22 29080856 . C G . PASS DP=58;SS=1;SSC=2;GPV=3.9115e-10;SPV=0.51075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:9,6:8,7 0/1:.:28:15,13:7,6:8,7 | |
| 21399 chr22 29081396 . T G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 | |
| 21400 chr22 29081853 . T G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
| 21401 chr22 29082268 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=1.1004e-10;SPV=0.73376 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:9,12:12,4 0/1:.:31:19,12:18,7:1,5 | |
| 21402 chr22 29082386 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,13:0,27 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
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| 21405 chr22 29083102 . T G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:33:0,33:0,11:0,22 | |
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| 21449 chr22 29106740 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=8;GPV=4.8769e-15;SPV=0.13128 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:9,10:14,9 0/1:.:31:12,19:4,8:8,11 | |
| 21450 chr22 29107203 . C T . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,6:0,16 1/1:.:22:0,22:0,10:0,12 | |
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| 21452 chr22 29108085 . A T . PASS DP=77;SS=1;SSC=6;GPV=2.2863e-14;SPV=0.21616 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:13,7:10,10 0/1:.:37:17,20:11,13:6,7 | |
| 21453 chr22 29111483 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=5;GPV=5.4147e-14;SPV=0.292 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:8,7:15,11 0/1:.:34:16,18:8,7:8,11 | |
| 21454 chr22 29111592 . C A . PASS DP=50;SS=1;SSC=5;GPV=1.2104e-08;SPV=0.29613 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:16,10:9,3:7,7 0/1:.:24:12,12:7,7:5,5 | |
| 21455 chr22 29113793 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=4.9329e-10;SPV=0.5872 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:7,7:8,4 0/1:.:35:20,15:12,9:8,6 | |
| 21456 chr22 29114136 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=1.6778e-09;SPV=0.83485 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:12,13:2,9:10,4 0/1:.:26:15,11:8,4:7,7 | |
| 21457 chr22 29114462 . T C . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,18:0,8 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
| 21458 chr22 29114511 . C T . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=3.0805e-08;SPV=0.94557 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:8,13:4,7:4,6 0/1:.:17:10,7:6,4:4,3 | |
| 21459 chr22 29115449 . A C . PASS DP=69;SS=1;SSC=6;GPV=2.0601e-12;SPV=0.20161 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:21,14:11,7:10,7 0/1:.:34:16,18:8,8:8,10 | |
| 21460 chr22 29115529 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=4;GPV=3.3502e-13;SPV=0.3966 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:12,6:7,9 0/1:.:38:19,19:10,7:9,12 | |
| 21461 chr22 29115741 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=2.5807e-10;SPV=0.35519 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:16,9:10,3:6,6 0/1:.:41:23,18:9,7:14,11 | |
| 21462 chr22 29115950 . G A . PASS DP=53;SS=1;SSC=2;GPV=5.5473e-09;SPV=0.54788 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:9,7:6,4 0/1:.:27:15,12:6,5:9,7 | |
| 21463 chr22 29117299 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=4;GPV=1.3095e-14;SPV=0.31878 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:10,12:9,5 0/1:.:36:16,20:10,11:6,9 | |
| 21464 chr22 29117741 . G A . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=1.4216e-06;SPV=0.90157 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:16,11:8,5:8,6 0/1:.:22:16,6:8,2:8,4 | |
| 21465 chr22 29117851 . T A . PASS DP=69;SS=1;SSC=5;GPV=7.191e-13;SPV=0.29814 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:10,10:14,9 0/1:.:26:12,14:8,4:4,10 | |
| 21466 chr22 29118315 . G C . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=5.9704e-09;SPV=0.68091 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:14,11:8,7:6,4 0/1:.:29:17,12:10,7:7,5 | |
| 21467 chr22 29118968 . T G . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=1.0326e-13;SPV=0.47564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:9,12:7,4:2,8 0/1:.:34:13,21:7,8:6,13 | |
| 21468 chr22 29119191 . G A . PASS DP=42;SS=1;SSC=1;GPV=5.4836e-09;SPV=0.64539 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:8,9:4,4:4,5 0/1:.:25:12,13:8,8:4,5 | |
| 21469 chr22 29119393 . A T . PASS DP=55;SS=1;SSC=2;GPV=8.49e-10;SPV=0.57384 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:10,8:6,5:4,3 0/1:.:37:20,17:6,9:14,8 | |
| 21470 chr22 29121690 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=2.1991e-10;SPV=0.79995 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:9,12:5,4 0/1:.:22:12,10:8,6:4,4 | |
| 21471 chr22 29122808 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=1.2905e-14;SPV=0.46232 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:10,12:17,10 0/1:.:33:17,16:8,5:9,11 | |
| 21472 chr22 29123154 . C T . PASS DP=44;SS=1;SSC=3;GPV=2.3136e-09;SPV=0.48921 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:12,12:10,6:2,6 0/1:.:20:9,11:5,5:4,6 | |
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| 21534 chr22 29187835 . C A . PASS DP=79;SS=1;SSC=5;GPV=6.0779e-13;SPV=0.27983 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:24,15:12,8:12,7 0/1:.:40:21,19:11,9:10,10 | |
| 21535 chr22 29190070 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=2.4039e-14;SPV=0.87433 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:11,11:6,12 0/1:.:28:15,13:5,7:10,6 | |
| 21536 chr22 29190844 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
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| 21591 chr22 29237086 . C G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,18:0,29 1/1:.:29:0,29:0,11:0,18 | |
| 21592 chr22 29237245 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
| 21593 chr22 29237837 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
| 21594 chr22 29237946 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,24:0,25 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 21595 chr22 29239413 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=1.4126e-14;SPV=0.8473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:27,26:13,13:14,13 0/1:.:30:18,12:7,6:11,6 | |
| 21596 chr22 29241635 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 | |
| 21597 chr22 29241669 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,15:0,21 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
| 21598 chr22 29241950 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 21599 chr22 29242481 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 | |
| 21600 chr22 29243203 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,16:0,27 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
| 21601 chr22 29244524 . A C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,28:0,26 1/1:.:27:0,27:0,19:0,8 | |
| 21602 chr22 29244716 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,23:0,25 1/1:.:18:0,18:0,9:0,9 | |
| 21603 chr22 29245750 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,30:0,18 1/1:.:47:0,47:0,21:0,26 | |
| 21604 chr22 29246008 . A G . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,24:0,27 1/1:.:49:0,49:0,15:0,34 | |
| 21605 chr22 29247432 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,25:0,19 1/1:.:28:0,28:0,8:0,20 | |
| 21606 chr22 29247549 . A C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=1.8221e-14;SPV=0.98648 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:10,14:14,13 0/1:.:35:24,11:12,4:12,7 | |
| 21607 chr22 29249275 . G C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,30:0,14 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 21608 chr22 29249667 . G T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,20:0,23 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 21609 chr22 29249768 . C G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 | |
| 21610 chr22 29249787 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
| 21611 chr22 29250106 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,17:0,26 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 21612 chr22 29250286 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 1/1:.:19:0,19:0,12:0,7 | |
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| 21662 chr22 29317056 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 1/1:.:36:0,36:0,12:0,24 | |
| 21663 chr22 29317061 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,22:0,10 1/1:.:36:0,36:0,12:0,24 | |
| 21664 chr22 29321337 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=7;GPV=1.2446e-15;SPV=0.1819 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:13,12:13,9 0/1:.:33:14,19:8,9:6,10 | |
| 21665 chr22 29322915 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=5.7269e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,22:0,10:0,12 1/1:.:25:0,15:0,7:0,8 | |
| 21666 chr22 29324419 . A C . PASS DP=60;SS=1;SSC=4;GPV=2.2591e-14;SPV=0.39592 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:6,10:10,10 0/1:.:24:9,15:2,5:7,10 | |
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| 21668 chr22 29329904 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=7.8606e-18;SPV=0.64798 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:14,23:6,13:8,10 0/1:.:33:13,20:10,8:3,12 | |
| 21669 chr22 29331877 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=4.9005e-18;SPV=0.82587 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:15,11:6,15 0/1:.:42:22,20:10,11:12,9 | |
| 21670 chr22 29332794 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.046494 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:11,8:12,8 0/1:.:33:12,21:8,12:4,9 | |
| 21671 chr22 29334636 . A G . PASS DP=95;SS=1;SSC=7;GPV=1.798e-25;SPV=0.19157 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:19,27:4,20:15,7 0/1:.:49:15,34:6,22:9,12 | |
| 21672 chr22 29342557 . C T . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=1.4147e-20;SPV=0.83126 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:22,30:12,20:10,10 0/1:.:44:22,22:10,14:12,8 | |
| 21673 chr22 29344739 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=1.9611e-10;SPV=0.75354 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:8,5:6,11 0/1:.:21:11,10:6,6:5,4 | |
| 21674 chr22 29346852 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=5;GPV=4.6708e-19;SPV=0.28084 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:12,8:7,14 0/1:.:40:15,25:8,12:7,13 | |
| 21675 chr22 29347493 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=1.7027e-12;SPV=0.56844 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:12,10:8,8 0/1:.:29:15,14:10,6:5,8 | |
| 21676 chr22 29352870 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=4;GPV=3.0665e-16;SPV=0.36379 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:15,7:7,11 0/1:.:47:23,24:12,19:11,5 | |
| 21677 chr22 29356191 . C G . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=6.8289e-22;SPV=0.79771 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:22,31:10,20:12,11 0/1:.:46:22,24:10,13:12,11 | |
| 21678 chr22 29356632 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=5;GPV=4.1212e-16;SPV=0.30643 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:31,24:16,7:15,17 0/1:.:35:17,18:11,11:6,7 | |
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| 21730 chr22 29418735 . A T . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=5.8719e-16;SPV=0.71824 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:11,17:13,8 0/1:.:34:18,16:8,10:10,6 | |
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| 21735 chr22 29424040 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=6.4906e-14;SPV=0.60484 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:10,11:11,12 0/1:.:23:11,12:7,8:4,4 | |
| 21736 chr22 29424241 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=7;GPV=3.7837e-11;SPV=0.18964 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:21,12:13,3:8,9 0/1:.:34:17,17:9,9:8,8 | |
| 21737 chr22 29424685 . G A . PASS DP=46;SS=1;SSC=3;GPV=7.8109e-06;SPV=0.4183 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:17,7:9,4:8,3 0/1:.:22:14,8:9,4:5,4 | |
| 21738 chr22 29428534 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=3;GPV=4.3702e-09;SPV=0.48854 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:22,12:10,4:12,8 0/1:.:31:19,12:9,7:10,5 | |
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| 21740 chr22 29429418 . A G . PASS DP=45;SS=1;SSC=3;GPV=2.6125e-09;SPV=0.44926 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:10,9:4,4:6,5 0/1:.:26:12,14:6,6:6,8 | |
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| 21795 chr22 29499665 . T G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,24:0,13 1/1:.:35:0,35:0,26:0,9 | |
| 21796 chr22 29501800 . T A . PASS DP=92;SS=1;SSC=1;GPV=2.4816e-20;SPV=0.73453 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:24,32:11,8:13,24 0/1:.:36:17,19:7,10:10,9 | |
| 21797 chr22 29502056 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=2;GPV=4.3451e-09;SPV=0.53607 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:8,6:8,7 0/1:.:21:11,10:4,6:7,4 | |
| 21798 chr22 29508365 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=3.7458e-16;SPV=0.97177 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:28,32:13,15:15,17 0/1:.:29:19,10:13,6:6,4 | |
| 21799 chr22 29509062 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.4655e-13;SPV=0.86331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:9,10:8,10 0/1:.:32:18,14:12,6:6,8 | |
| 21800 chr22 29509388 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=8.8612e-15;SPV=0.95634 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:18,27:10,14:8,13 0/1:.:24:14,10:7,4:7,6 | |
| 21801 chr22 29510712 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=4;GPV=6.4906e-14;SPV=0.3329 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:10,7:10,12 0/1:.:29:12,16:5,13:7,3 | |
| 21802 chr22 29511412 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=3;GPV=1.525e-20;SPV=0.45123 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:12,11:8,14 0/1:.:44:18,26:10,12:8,14 | |
| 21803 chr22 29512165 . G T . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=1.5391e-12;SPV=0.64113 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:28,21:14,10:14,11 0/1:.:29:17,12:11,7:6,5 | |
| 21804 chr22 29512860 . G T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.8851e-14;SPV=0.98749 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:24,30:9,18:15,12 0/1:.:20:14,6:5,3:9,3 | |
| 21805 chr22 29514801 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=4.7649e-17;SPV=0.61755 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:10,12:9,14 0/1:.:28:12,16:5,8:7,8 | |
| 21806 chr22 29516896 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=8.5945e-18;SPV=0.9938 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:14,30:6,8:8,22 0/1:.:33:19,14:10,6:9,8 | |
| 21807 chr22 29517283 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=1.0364e-16;SPV=0.81356 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:14,13:3,10 0/1:.:38:19,19:8,7:11,12 | |
| 21808 chr22 29517812 . A C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 | |
| 21809 chr22 29519155 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=6.5425e-16;SPV=0.68152 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:16,13:8,11 0/1:.:36:19,17:12,6:7,11 | |
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| 21811 chr22 29519808 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=6;GPV=6.6743e-16;SPV=0.23926 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:5,6:11,8 0/1:.:45:19,26:6,16:13,10 | |
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| 21862 chr22 29561581 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=2.6374e-16;SPV=0.35748 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:13,15:7,8:6,7 0/1:.:41:16,25:5,12:11,13 | |
| 21863 chr22 29561922 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 21864 chr22 29561955 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0345e-10;SPV=0.84998 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:10,8:7,11 0/1:.:19:11,8:7,1:4,7 | |
| 21865 chr22 29562645 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 | |
| 21866 chr22 29563159 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.6571e-10;SPV=0.85035 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:9,7:6,8 0/1:.:30:18,12:8,8:10,4 | |
| 21867 chr22 29563311 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 1/1:.:30:0,30:0,11:0,19 | |
| 21868 chr22 29563346 . T A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 | |
| 21869 chr22 29564346 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=7.9293e-13;SPV=0.75264 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:10,12:14,11 0/1:.:23:13,10:5,5:8,5 | |
| 21870 chr22 29564779 . T G . PASS DP=68;SS=1;SSC=9;GPV=4.0755e-11;SPV=0.11194 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:27,15:10,8:17,7 0/1:.:26:12,14:6,7:6,7 | |
| 21871 chr22 29566058 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.7502e-16;SPV=0.66196 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:9,14:13,10 0/1:.:36:18,18:6,9:12,9 | |
| 21872 chr22 29566088 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,22:0,25 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 | |
| 21873 chr22 29566454 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=2;GPV=1.2435e-09;SPV=0.51643 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:12,7:10,8 0/1:.:23:13,10:4,3:9,7 | |
| 21874 chr22 29567519 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=6;GPV=4.5064e-15;SPV=0.20791 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:28,21:14,8:14,13 0/1:.:33:15,18:7,8:8,10 | |
| 21875 chr22 29568661 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=10;GPV=7.8163e-15;SPV=0.098996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:29,22:12,10:17,12 0/1:.:26:10,16:3,9:7,7 | |
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| 21928 chr22 29601022 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.4568e-12;SPV=0.91973 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:11,12:8,8 0/1:.:32:20,12:10,9:10,3 | |
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| 21930 chr22 29601362 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=5.8427e-13;SPV=0.99591 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:15,24:8,11:7,13 0/1:.:28:19,9:4,3:15,6 | |
| 21931 chr22 29601585 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=4;GPV=1.2905e-14;SPV=0.35762 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:15,8:11,12 0/1:.:36:18,18:8,9:10,9 | |
| 21932 chr22 29603247 . G C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=1.1753e-14;SPV=0.91196 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:15,13:8,12 0/1:.:33:20,13:8,8:12,5 | |
| 21933 chr22 29603795 . C A . PASS DP=98;SS=1;SSC=4;GPV=3.7449e-17;SPV=0.36675 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:30,23:14,14:16,9 0/1:.:45:23,22:13,9:10,13 | |
| 21934 chr22 29603889 . G C . PASS DP=105;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:66:0,66:0,44:0,22 1/1:.:39:0,39:0,15:0,24 | |
| 21935 chr22 29605458 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=7.2383e-18;SPV=0.99376 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:12,28:8,15:4,13 0/1:.:36:20,16:5,9:15,7 | |
| 21936 chr22 29606088 . G T . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=8.6008e-14;SPV=0.66526 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:9,9:12,9 0/1:.:41:23,18:15,11:8,7 | |
| 21937 chr22 29606141 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=2.2863e-14;SPV=0.54361 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:7,6:13,12 0/1:.:39:20,19:13,11:7,8 | |
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| 21939 chr22 29606614 . T G . PASS DP=90;SS=1;SSC=5;GPV=1.3474e-22;SPV=0.29873 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:20,27:9,13:11,14 0/1:.:43:15,28:6,11:9,17 | |
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| 21941 chr22 29610758 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=1.9451e-10;SPV=0.69064 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:9,8:12,9 0/1:.:24:14,10:5,3:9,7 | |
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| 21994 chr22 29672862 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=17;GPV=1;SPV=0.018667 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:20,11:14,10:6,1 0/1:.:36:13,23:8,11:5,12 | |
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| 21996 chr22 29674234 . T A . PASS DP=86;SS=1;SSC=3;GPV=3.1151e-17;SPV=0.47745 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:20,15:7,12 0/1:.:32:15,17:7,10:8,7 | |
| 21997 chr22 29675369 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=3.5003e-14;SPV=0.53931 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:11,9:10,12 0/1:.:29:14,15:9,9:5,6 | |
| 21998 chr22 29675955 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=4;GPV=5.6815e-11;SPV=0.35161 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:26,15:14,10:12,5 0/1:.:32:18,14:11,7:7,7 | |
| 21999 chr22 29677580 . C A . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=9.653e-15;SPV=0.65852 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:13,17:11,6 0/1:.:32:17,15:13,7:4,8 | |
| 22000 chr22 29679098 . A C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.7703e-18;SPV=0.79835 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:18,30:10,13:8,17 0/1:.:27:12,15:6,8:6,7 | |
| 22001 chr22 29680731 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=2.2769e-16;SPV=0.99671 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:8,26:4,11:4,15 0/1:.:28:15,13:7,8:8,5 | |
| 22002 chr22 29681372 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 22003 chr22 29685261 . C A . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=1.3907e-10;SPV=0.51432 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,14:9,5:8,9 0/1:.:27:14,13:8,6:6,7 | |
| 22004 chr22 29685726 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=3.125e-12;SPV=0.96304 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:11,17:9,4 0/1:.:33:22,11:14,6:8,5 | |
| 22005 chr22 29686580 . A G . PASS DP=94;SS=1;SSC=2;GPV=8.6242e-23;SPV=0.62358 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:22,33:11,18:11,15 0/1:.:39:16,23:9,9:7,14 | |
| 22006 chr22 29690155 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=2;GPV=1.2009e-19;SPV=0.52178 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:25,27:9,14:16,13 0/1:.:43:20,23:10,9:10,14 | |
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| 22126 chr22 29904590 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=6;GPV=1.7703e-18;SPV=0.23593 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:5,13:15,12 0/1:.:30:10,20:5,9:5,11 | |
| 22127 chr22 29906175 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=2;GPV=2.3224e-12;SPV=0.60512 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:8,4:6,11 0/1:.:31:15,16:7,8:8,8 | |
| 22128 chr22 29906249 . T C . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=4.7339e-09;SPV=0.84102 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:13,13:2,9:11,4 0/1:.:26:15,10:9,7:6,3 | |
| 22129 chr22 29907077 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=7.7752e-12;SPV=0.45748 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:12,9:7,8 0/1:.:25:12,13:6,5:6,8 | |
| 22130 chr22 29908245 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=5.6872e-15;SPV=0.83554 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:10,16:6,7:4,9 0/1:.:40:19,21:10,4:9,17 | |
| 22131 chr22 29908345 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 22132 chr22 29909314 . C G . PASS DP=80;SS=1;SSC=7;GPV=8.6008e-14;SPV=0.19039 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:25,16:15,4:10,12 0/1:.:39:19,20:7,9:12,11 | |
| 22133 chr22 29909765 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
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| 22189 chr22 29972395 . T G . PASS DP=61;SS=3;SSC=41;GPV=1;SPV=6.7178e-05 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:23,9:9,2:14,7 1/1:.:29:6,23:3,12:3,11 | |
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| 22192 chr22 29977106 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=4.4044e-13;SPV=0.94162 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:12,11:7,10 0/1:.:35:22,13:10,8:12,5 | |
| 22193 chr22 29979545 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=4.8851e-14;SPV=0.68616 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:9,9:11,11 0/1:.:34:18,16:8,6:10,10 | |
| 22194 chr22 29981013 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=1.0364e-16;SPV=0.536 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:11,16:11,9 0/1:.:31:14,17:5,12:9,5 | |
| 22195 chr22 29986807 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=4.0806e-19;SPV=0.40996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:18,27:9,7:9,20 0/1:.:29:10,19:6,10:4,9 | |
| 22196 chr22 29987273 . G C . PASS DP=74;SS=1;SSC=5;GPV=1.8278e-16;SPV=0.30216 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:7,12:12,8 0/1:.:35:14,21:9,11:5,10 | |
| 22197 chr22 29987627 . A C . PASS DP=74;SS=1;SSC=5;GPV=3.125e-12;SPV=0.28071 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:25,16:15,9:10,7 0/1:.:33:17,16:11,5:6,11 | |
| 22198 chr22 29988993 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=1.5461e-16;SPV=0.89024 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:11,6:6,17 0/1:.:41:22,19:11,6:11,13 | |
| 22199 chr22 29990925 . A T . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=7.3575e-14;SPV=0.51133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:6,7:9,8 0/1:.:38:18,20:10,8:8,12 | |
| 22200 chr22 29991171 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=2.7419e-13;SPV=0.88419 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:8,8:8,11 0/1:.:35:20,15:10,10:10,5 | |
| 22201 chr22 29992769 . T G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=7.5673e-13;SPV=0.8627 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:11,16:4,10:7,6 0/1:.:33:17,16:8,9:9,7 | |
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| 22203 chr22 29993411 . G T . PASS DP=67;SS=1;SSC=10;GPV=1.9669e-13;SPV=0.088959 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:20,14:10,8:10,6 0/1:.:33:13,20:8,9:5,11 | |
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| 22260 chr22 30065753 . C A . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=1.6514e-11;SPV=0.70049 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:15,16:9,12:6,4 0/1:.:27:14,13:7,7:7,6 | |
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| 22263 chr22 30070110 . G T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.2756e-16;SPV=0.86102 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:14,25:5,14:9,11 0/1:.:26:12,14:2,5:10,9 | |
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| 22324 chr22 30149160 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=4;GPV=2.7419e-13;SPV=0.31875 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:9,7:11,9 0/1:.:34:16,18:9,8:7,10 | |
| 22325 chr22 30150256 . C T . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=2.7295e-10;SPV=0.84929 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:9,14:4,7:5,7 0/1:.:22:11,11:6,5:5,6 | |
| 22326 chr22 30153043 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=1.5211e-10;SPV=0.86964 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:13,14:5,9:8,5 0/1:.:32:19,13:10,4:9,9 | |
| 22327 chr22 30153082 . A C . PASS DP=50;SS=1;SSC=1;GPV=1.7754e-11;SPV=0.6645 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:9,12:5,4:4,8 0/1:.:29:13,16:8,7:5,9 | |
| 22328 chr22 30154941 . G A . PASS DP=46;SS=1;SSC=6;GPV=3.158e-10;SPV=0.21835 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:10,8:2,3:8,5 0/1:.:28:11,17:0,9:11,8 | |
| 22329 chr22 30156522 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
| 22330 chr22 30157181 . C A . PASS DP=50;SS=1;SSC=5;GPV=5.2124e-10;SPV=0.28546 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:13,10:8,5:5,5 0/1:.:27:12,15:6,7:6,8 | |
| 22331 chr22 30159227 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=9.545e-12;SPV=0.86834 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:6,8:8,8 0/1:.:33:19,14:10,9:9,5 | |
| 22332 chr22 30161292 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=3;GPV=5.8427e-13;SPV=0.45999 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:12,11:9,8 0/1:.:27:13,14:9,6:4,8 | |
| 22333 chr22 30163691 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,13:0,28 1/1:.:35:0,35:0,10:0,25 | |
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| 22335 chr22 30166998 . A C . PASS DP=57;SS=1;SSC=7;GPV=2.7262e-09;SPV=0.17943 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:12,6:7,4 0/1:.:28:14,14:7,12:7,2 | |
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| 22390 chr22 30222900 . C A . PASS DP=87;SS=1;SSC=3;GPV=7.1095e-15;SPV=0.45391 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:30,23:16,15:14,8 0/1:.:34:18,16:9,8:9,8 | |
| 22391 chr22 30223185 . T G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=1.8826e-14;SPV=0.99006 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:10,24:6,12:4,12 0/1:.:25:14,11:7,5:7,6 | |
| 22392 chr22 30223441 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=5;GPV=3.7062e-14;SPV=0.27198 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:11,13:8,7 0/1:.:24:9,15:4,9:5,6 | |
| 22393 chr22 30223626 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=1.1808e-19;SPV=0.69129 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:7,15:12,11 0/1:.:42:19,23:10,14:9,9 | |
| 22394 chr22 30223706 . G T . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=4.1486e-16;SPV=0.32326 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:11,11:11,9 0/1:.:38:17,21:10,13:7,8 | |
| 22395 chr22 30224124 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=5.0242e-18;SPV=0.48809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:18,25:9,11:9,14 0/1:.:31:12,19:5,12:7,7 | |
| 22396 chr22 30224548 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=8.8662e-16;SPV=0.67876 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:28,26:15,15:13,11 0/1:.:33:18,15:11,11:7,4 | |
| 22397 chr22 30224638 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,26:0,29 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 22398 chr22 30225624 . C A . PASS DP=102;SS=1;SSC=3;GPV=3.3369e-21;SPV=0.45784 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:29,31:16,14:13,17 0/1:.:42:19,23:7,16:12,7 | |
| 22399 chr22 30229905 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=3.9286e-14;SPV=0.98355 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:13,21:6,11:7,10 0/1:.:38:23,15:7,7:16,8 | |
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| 22454 chr22 30342172 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=8;GPV=1.0148e-14;SPV=0.14559 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:12,12:10,7 0/1:.:29:11,18:6,11:5,7 | |
| 22455 chr22 30342598 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.9669e-13;SPV=0.94368 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:7,11:8,10 0/1:.:31:18,13:8,5:10,8 | |
| 22456 chr22 30342748 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.040326 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:21,14:8,7:13,7 0/1:.:31:11,20:7,8:4,12 | |
| 22457 chr22 30344159 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.2407e-10;SPV=0.88338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:10,12:9,6 0/1:.:22:14,8:10,4:4,4 | |
| 22458 chr22 30345899 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=2;GPV=3.195e-13;SPV=0.58178 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:10,12:6,6 0/1:.:28:13,15:8,7:5,8 | |
| 22459 chr22 30350415 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=5.9761e-15;SPV=0.95797 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:16,11:6,14 0/1:.:38:24,14:10,4:14,10 | |
| 22460 chr22 30352229 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=5.1674e-21;SPV=0.68563 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:9,23:5,9:4,14 0/1:.:36:11,25:7,12:4,13 | |
| 22461 chr22 30353352 . G C . PASS DP=64;SS=1;SSC=3;GPV=2.9719e-11;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:11,9:7,5 0/1:.:32:17,15:13,8:4,7 | |
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| 22464 chr22 30356707 . G T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=9.1061e-12;SPV=0.86809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:13,9:8,9 0/1:.:36:23,13:11,7:12,6 | |
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| 22519 chr22 30437703 . T G . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=4.9329e-10;SPV=0.529 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:17,12:12,9:5,3 0/1:.:32:18,14:8,10:10,4 | |
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| 22521 chr22 30438263 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=6;GPV=3.3388e-14;SPV=0.21885 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:32,23:18,16:14,7 0/1:.:26:12,14:6,8:6,6 | |
| 22522 chr22 30440683 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=4;GPV=4.3139e-18;SPV=0.38396 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:26,26:14,16:12,10 0/1:.:36:16,20:12,10:4,10 | |
| 22523 chr22 30441524 . A T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.19e-16;SPV=0.91202 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:23,31:11,13:12,18 0/1:.:25:14,11:8,4:6,7 | |
| 22524 chr22 30442283 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=2.2534e-10;SPV=0.62666 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:13,6:10,11 0/1:.:24:14,10:7,6:7,4 | |
| 22525 chr22 30443359 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=4.4044e-13;SPV=0.94162 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:13,11:6,10 0/1:.:35:22,13:10,5:12,8 | |
| 22526 chr22 30443991 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=1.5567e-13;SPV=0.33191 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:12,10:15,11 0/1:.:27:13,14:2,3:11,11 | |
| 22527 chr22 30446108 . T A . PASS DP=73;SS=1;SSC=4;GPV=1.5805e-15;SPV=0.32843 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:11,15:10,6 0/1:.:31:13,18:6,10:7,8 | |
| 22528 chr22 30446333 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=7.7856e-21;SPV=0.44296 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:16,29:6,13:10,16 0/1:.:29:9,20:4,11:5,9 | |
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| 22585 chr22 30491366 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.045386 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:38,21:23,10:15,11 0/1:.:36:16,20:8,9:8,11 | |
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| 22588 chr22 30493152 . G C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.1391e-19;SPV=0.83111 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:14,25:9,13:5,12 0/1:.:41:18,23:11,13:7,10 | |
| 22589 chr22 30493980 . G C . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=9.9942e-16;SPV=0.54075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:6,5:7,14 0/1:.:31:12,19:6,11:6,8 | |
| 22590 chr22 30495872 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=3.0367e-13;SPV=0.58281 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:12,11:11,10 0/1:.:27:14,13:10,7:4,6 | |
| 22591 chr22 30496268 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=2;GPV=1.3937e-18;SPV=0.59017 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:9,7:11,16 0/1:.:46:21,24:7,13:14,11 | |
| 22592 chr22 30496568 . C A . PASS DP=70;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.046579 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:27,18:16,10:11,8 0/1:.:25:9,16:3,10:6,6 | |
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| 22647 chr22 30535320 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=3;GPV=1.1558e-14;SPV=0.43461 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:4,6:16,14 0/1:.:31:14,17:5,8:9,9 | |
| 22648 chr22 30535891 . T A . PASS DP=49;SS=1;SSC=7;GPV=0.00011358;SPV=0.18101 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:23,5:11,2:12,3 0/1:.:21:14,7:4,4:10,3 | |
| 22649 chr22 30536686 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=9.798e-13;SPV=0.69139 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:7,11:8,6 0/1:.:31:15,15:9,9:6,6 | |
| 22650 chr22 30536834 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=3.3771e-18;SPV=0.59538 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:7,8:7,14 0/1:.:36:14,22:7,12:7,10 | |
| 22651 chr22 30538064 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=3.6481e-18;SPV=0.78817 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:19,28:9,13:10,15 0/1:.:32:15,17:8,8:7,9 | |
| 22652 chr22 30538348 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=6.4906e-14;SPV=0.71179 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:12,15:6,6 0/1:.:28:14,14:7,5:7,9 | |
| 22653 chr22 30538829 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.0284e-10;SPV=0.88893 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:5,13:14,4 0/1:.:31:20,11:14,8:6,3 | |
| 22654 chr22 30539272 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=9;GPV=2.4857e-19;SPV=0.10971 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:11,12:13,8 0/1:.:48:19,29:8,15:11,14 | |
| 22655 chr22 30539442 . C G . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=4.1486e-16;SPV=0.395 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:12,12:12,11 0/1:.:33:15,18:6,11:9,7 | |
| 22656 chr22 30540240 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=12;GPV=2.4655e-13;SPV=0.058967 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:16,5:7,10 0/1:.:31:12,19:5,5:7,14 | |
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| 22717 chr22 30598646 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
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| 22724 chr22 30609113 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=1.7683e-12;SPV=0.57437 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:15,2:8,14 0/1:.:41:24,17:11,6:13,11 | |
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| 22849 chr22 30755548 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=9.5353e-13;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:10,8:10,8 0/1:.:36:19,17:12,8:7,9 | |
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| 22918 chr22 30858750 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=1.8605e-16;SPV=0.67266 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:12,26:8,17:4,9 0/1:.:18:6,12:3,10:3,2 | |
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| 22978 chr22 30922757 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=8;GPV=4.3774e-11;SPV=0.15797 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:24,13:15,6:9,7 0/1:.:32:16,16:10,8:6,8 | |
| 22979 chr22 30923661 . C G . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=1.1519e-11;SPV=0.67062 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:8,7:11,10 0/1:.:29:16,13:10,8:6,5 | |
| 22980 chr22 30923945 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 22981 chr22 30925860 . C A . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=5.8861e-19;SPV=0.64844 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:9,14:13,12 0/1:.:42:20,22:9,10:11,12 | |
| 22982 chr22 30927913 . G C . PASS DP=78;SS=1;SSC=7;GPV=9.8334e-16;SPV=0.18644 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:8,11:12,5 0/1:.:42:18,24:9,15:9,9 | |
| 22983 chr22 30927932 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=1.5419e-14;SPV=0.79279 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:11,7:9,12 0/1:.:45:26,19:17,8:9,11 | |
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| 23049 chr22 31002750 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=2;GPV=7.3839e-17;SPV=0.56638 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:15,13:11,14 0/1:.:31:15,16:8,12:7,4 | |
| 23050 chr22 31003967 . A C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,19:0,29 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 23051 chr22 31004032 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=2.0619e-14;SPV=0.60865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:12,10:11,12 0/1:.:31:16,15:9,11:7,4 | |
| 23052 chr22 31007044 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=9.1717e-09;SPV=0.917 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:12,12:9,4 0/1:.:24:17,7:11,6:6,1 | |
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| 23108 chr22 31049413 . C G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,20:0,29 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
| 23109 chr22 31050429 . T A . PASS DP=52;SS=1;SSC=6;GPV=5.1348e-09;SPV=0.22789 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:18,11:11,3:7,8 0/1:.:23:11,12:6,5:5,7 | |
| 23110 chr22 31051666 . C G . PASS DP=99;SS=1;SSC=3;GPV=5.0376e-18;SPV=0.46994 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:28,24:16,9:12,15 0/1:.:47:24,23:11,14:13,9 | |
| 23111 chr22 31051899 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=6.58e-14;SPV=0.83044 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:7,9:9,8 0/1:.:44:25,19:11,8:14,11 | |
| 23112 chr22 31053516 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=4;GPV=4.1368e-18;SPV=0.3855 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:9,11:8,12 0/1:.:33:12,21:5,13:7,8 | |
| 23113 chr22 31055471 . C G . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=1.0364e-16;SPV=0.54955 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:13,15:8,9 0/1:.:33:15,18:6,10:9,8 | |
| 23114 chr22 31055978 . G C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,15:0,28 1/1:.:26:0,26:0,13:0,13 | |
| 23115 chr22 31057219 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=2.7815e-13;SPV=0.39918 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:11,7:13,9 0/1:.:42:23,19:7,14:16,5 | |
| 23116 chr22 31057278 . T G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,23:0,25 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
| 23117 chr22 31060020 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=2.4772e-18;SPV=0.66496 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:24,30:17,22:7,8 0/1:.:30:14,16:8,7:6,9 | |
| 23118 chr22 31060366 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=3.2213e-16;SPV=0.65116 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:12,7:9,17 0/1:.:33:16,17:8,9:8,8 | |
| 23119 chr22 31060847 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=1.1744e-10;SPV=0.98686 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:9,8:9,11 0/1:.:32:23,9:8,6:15,3 | |
| 23120 chr22 31062217 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,23:0,20 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 | |
| 23121 chr22 31063208 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=2.0452e-11;SPV=0.40145 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:9,9:8,5 0/1:.:29:14,15:8,7:6,8 | |
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| 23167 chr22 31100851 . C A . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,11:0,20 1/1:.:22:0,22:0,7:0,15 | |
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| 23169 chr22 31101124 . G T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:31:0,30:0,11:0,19 | |
| 23170 chr22 31101677 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 23171 chr22 31103532 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=1.3287e-16;SPV=0.97721 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:14,27:6,12:8,15 0/1:.:31:17,14:8,9:9,5 | |
| 23172 chr22 31104685 . G T . PASS DP=58;SS=1;SSC=8;GPV=2.9186e-09;SPV=0.14002 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:23,12:4,2:19,10 0/1:.:23:11,12:4,4:7,8 | |
| 23173 chr22 31105087 . C G . PASS DP=98;SS=1;SSC=1;GPV=1.8815e-21;SPV=0.65965 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:26,33:16,12:10,21 0/1:.:39:18,21:8,11:10,10 | |
| 23174 chr22 31105802 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=4;GPV=1.0222e-17;SPV=0.36829 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:14,14:13,13 0/1:.:32:14,18:5,12:9,6 | |
| 23175 chr22 31106746 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=3;GPV=1.249e-18;SPV=0.41892 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:27,25:12,11:15,14 0/1:.:44:21,23:12,14:9,9 | |
| 23176 chr22 31107574 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=4;GPV=3.104e-14;SPV=0.39449 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:6,5:14,14 0/1:.:31:14,17:2,2:12,15 | |
| 23177 chr22 31108143 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=1.0669e-14;SPV=0.339 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:9,7:15,12 0/1:.:37:18,19:9,9:9,10 | |
| 23178 chr22 31109531 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=4.1537e-13;SPV=0.99556 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:9,22:7,10:2,12 0/1:.:25:15,10:10,4:5,6 | |
| 23179 chr22 31109534 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 23180 chr22 31110775 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=5.2318e-13;SPV=0.76985 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:7,11:9,7 0/1:.:32:17,15:7,6:10,9 | |
| 23181 chr22 31111063 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 1/1:.:24:0,24:0,12:0,12 | |
| 23182 chr22 31111777 . C G . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 1/1:.:18:0,18:0,10:0,8 | |
| 23183 chr22 31112262 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=1;GPV=8.2643e-08;SPV=0.69683 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:5,8:10,3 0/1:.:24:14,9:7,5:7,4 | |
| 23184 chr22 31112697 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=5;GPV=8.0818e-14;SPV=0.27694 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:32,18:17,11:15,7 0/1:.:43:24,19:11,11:13,8 | |
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| 23186 chr22 31115405 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=2.0241e-17;SPV=0.60472 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:9,14:8,9 0/1:.:35:15,20:8,11:7,9 | |
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| 23238 chr22 31157524 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=3.1307e-16;SPV=0.88651 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:13,22:8,13:5,9 0/1:.:35:17,18:10,8:7,10 | |
| 23239 chr22 31158778 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=6.5271e-15;SPV=0.81614 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:28,26:13,11:15,15 0/1:.:32:19,13:8,6:11,7 | |
| 23240 chr22 31159720 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=5;GPV=2.7262e-09;SPV=0.29911 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:20,12:11,5:9,7 0/1:.:26:13,12:8,5:5,7 | |
| 23241 chr22 31160117 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,28:0,24 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 | |
| 23242 chr22 31160773 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,24:0,26 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 23243 chr22 31162563 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 1/1:.:22:0,22:0,13:0,9 | |
| 23244 chr22 31162834 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
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| 23247 chr22 31167569 . A C . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 | |
| 23248 chr22 31168348 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 1/1:.:32:0,32:0,11:0,21 | |
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| 23295 chr22 31206786 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=9.3487e-14;SPV=0.9717 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:12,11:11,14 0/1:.:33:22,11:7,5:15,6 | |
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| 23297 chr22 31209069 . G A . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.9694e-09;SPV=0.8534 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:13,14:7,5:6,9 0/1:.:22:13,9:11,5:2,4 | |
| 23298 chr22 31210963 . C G . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=1.374e-15;SPV=0.60096 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:8,10:8,9 0/1:.:37:17,20:7,9:10,11 | |
| 23299 chr22 31211848 . G C . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=7.3223e-19;SPV=0.98242 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:22,30:11,11:11,19 0/1:.:49:30,19:20,9:10,10 | |
| 23300 chr22 31215563 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 1/1:.:23:0,23:0,12:0,11 | |
| 23301 chr22 31220183 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=5.2318e-13;SPV=0.77235 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:8,15:10,5 0/1:.:28:15,13:8,7:7,6 | |
| 23302 chr22 31220315 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,21:0,27 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 23303 chr22 31220578 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=3;GPV=7.6319e-16;SPV=0.40925 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:9,12:10,7 0/1:.:38:17,21:10,10:7,11 | |
| 23304 chr22 31220888 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,19:0,30 1/1:.:28:0,28:0,9:0,19 | |
| 23305 chr22 31222361 . G A . PASS DP=51;SS=1;SSC=24;GPV=1;SPV=0.0032054 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:10,21:1,12:9,9 0/1:.:20:15,5:8,3:7,2 | |
| 23306 chr22 31222611 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,14:0,26 1/1:.:22:0,22:0,6:0,16 | |
| 23307 chr22 31223716 . A T . PASS DP=58;SS=1;SSC=6;GPV=1.7621e-13;SPV=0.22397 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:9,7:5,7 0/1:.:30:11,19:9,11:2,8 | |
| 23308 chr22 31225806 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=3.125e-12;SPV=0.8174 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:12,12:11,8 0/1:.:31:19,12:8,3:11,9 | |
| 23309 chr22 31226494 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=1.1337e-06;SPV=0.79261 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:26,10:12,7:14,3 0/1:.:36:28,8:10,4:18,4 | |
| 23310 chr22 31227456 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=6.0532e-18;SPV=0.52018 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:8,10:11,16 0/1:.:30:12,18:6,12:6,6 | |
| 23311 chr22 31231884 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=1.7985e-10;SPV=0.52494 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:14,7:7,9 0/1:.:24:13,11:10,9:3,2 | |
| 23312 chr22 31234910 . G T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=4.2444e-12;SPV=0.98921 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:7,16:4,3:3,13 0/1:.:33:19,14:7,4:12,10 | |
| 23313 chr22 31236065 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 23314 chr22 31236255 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=5;GPV=1.0345e-10;SPV=0.25445 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:12,11:7,4 0/1:.:21:9,12:4,9:5,3 | |
| 23315 chr22 31237036 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=8.6835e-16;SPV=0.7141 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:14,15:4,6 0/1:.:38:19,19:12,7:7,12 | |
| 23316 chr22 31240078 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=9;GPV=1.1491e-11;SPV=0.12028 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:14,10:6,3:8,7 0/1:.:31:12,19:4,8:8,11 | |
| 23317 chr22 31242041 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 23318 chr22 31242462 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
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| 23320 chr22 31242946 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,32:0,15 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
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| 23370 chr22 31283683 . C A . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=7.8126e-18;SPV=0.71982 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:13,12:8,14 0/1:.:37:18,19:9,8:9,11 | |
| 23371 chr22 31283755 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=9;GPV=5.8102e-14;SPV=0.10962 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:30,16:10,7:20,9 0/1:.:42:21,21:8,9:13,12 | |
| 23372 chr22 31284254 . G T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.8496e-17;SPV=0.81648 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:4,9:13,14 0/1:.:42:21,21:2,9:19,12 | |
| 23373 chr22 31285076 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.8183e-16;SPV=0.88036 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:8,11:11,15 0/1:.:32:17,15:12,9:5,6 | |
| 23374 chr22 31285164 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.7502e-16;SPV=0.96074 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:18,26:11,11:7,15 0/1:.:38:22,16:8,10:14,6 | |
| 23375 chr22 31285382 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=1.0454e-16;SPV=0.62855 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:14,12:9,11 0/1:.:41:21,20:10,12:11,8 | |
| 23376 chr22 31286462 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=3;GPV=2.3308e-15;SPV=0.40699 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:14,9:6,10 0/1:.:37:17,20:12,8:5,12 | |
| 23377 chr22 31287573 . G T . PASS DP=59;SS=1;SSC=4;GPV=1.8424e-11;SPV=0.35292 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:9,9:9,6 0/1:.:26:12,14:7,7:5,7 | |
| 23378 chr22 31287578 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=5.5047e-12;SPV=0.94067 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:8,10:5,9 0/1:.:26:15,11:8,7:7,4 | |
| 23379 chr22 31287725 . C A . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 1/1:.:20:0,20:0,13:0,7 | |
| 23380 chr22 31287927 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=4;GPV=4.39e-14;SPV=0.36557 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:12,10:9,8 0/1:.:34:16,18:9,12:7,6 | |
| 23381 chr22 31289143 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.037577 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:27,20:12,9:15,11 0/1:.:39:14,25:10,13:4,12 | |
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| 23383 chr22 31290116 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=1.5643e-13;SPV=0.96967 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:27,25:16,15:11,10 0/1:.:36:25,11:13,8:12,3 | |
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| 23443 chr22 31380260 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=5;GPV=9.2302e-10;SPV=0.26587 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:21,14:11,11:10,3 0/1:.:21:10,11:7,8:3,3 | |
| 23444 chr22 31382004 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
| 23445 chr22 31383062 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=10;GPV=4.1486e-16;SPV=0.081813 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:6,6:20,14 0/1:.:34:13,21:8,11:5,10 | |
| 23446 chr22 31385806 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=8.7556e-14;SPV=0.47506 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:10,9:7,11 0/1:.:24:10,14:5,7:5,7 | |
| 23447 chr22 31386701 . A C . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=2.4568e-12;SPV=0.58925 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:10,10:12,8 0/1:.:31:17,14:8,6:9,8 | |
| 23448 chr22 31387920 . T A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.4655e-13;SPV=0.96546 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:5,9:10,12 0/1:.:33:20,13:8,3:12,10 | |
| 23449 chr22 31388413 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=1.5388e-12;SPV=0.93164 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:8,15:7,4 0/1:.:32:19,13:9,9:10,4 | |
| 23450 chr22 31389983 . G A . PASS DP=48;SS=1;SSC=9;GPV=1.0268e-08;SPV=0.10705 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:14,7:8,5:6,2 0/1:.:27:12,15:6,8:6,7 | |
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| 23505 chr22 31493580 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,10:0,19 1/1:.:38:0,38:0,14:0,24 | |
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| 23507 chr22 31496135 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 | |
| 23508 chr22 31498324 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 | |
| 23509 chr22 31498849 . C T . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,10:0,16 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 | |
| 23510 chr22 31499288 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 | |
| 23511 chr22 31500186 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
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| 23513 chr22 31500839 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 1/1:.:37:0,37:0,23:0,14 | |
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| 23578 chr22 31612398 . A T . PASS DP=19;SS=1;SSC=4;GPV=5.9414e-09;SPV=0.32164 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:2,9:1,6:1,3 1/1:.:8:0,8:0,4:0,4 | |
| 23579 chr22 31615943 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,17:0,25 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 | |
| 23580 chr22 31624658 . C G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
| 23581 chr22 31624759 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
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| 23647 chr22 32046789 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 | |
| 23648 chr22 32047674 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=5;GPV=6.6743e-16;SPV=0.27371 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:11,13:9,6 0/1:.:36:15,21:7,9:8,12 | |
| 23649 chr22 32048230 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 1/1:.:26:0,26:0,20:0,6 | |
| 23650 chr22 32049095 . T A . PASS DP=30;SS=1;SSC=5;GPV=2.6212e-16;SPV=0.3 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:1,8:0,4:1,4 1/1:.:21:0,21:0,11:0,10 | |
| 23651 chr22 32054375 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 1/1:.:25:0,25:0,17:0,8 | |
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| 23653 chr22 32060152 . C T . PASS DP=43;SS=1;SSC=8;GPV=3.6826e-09;SPV=0.15839 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:4,8:2,6:2,2 1/1:.:23:1,11:0,7:1,4 | |
| 23654 chr22 32060154 . C T . PASS DP=43;SS=1;SSC=2;GPV=1.4658e-07;SPV=0.55396 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:12,9:8,7:4,2 0/1:.:22:12,10:7,6:5,4 | |
| 23655 chr22 32060158 . C T . PASS DP=39;SS=1;SSC=4;GPV=5.7558e-06;SPV=0.39104 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:12,6:8,5:4,1 0/1:.:21:12,9:7,7:5,2 | |
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| 23708 chr22 32412368 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=2;GPV=6.7391e-19;SPV=0.57502 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:27,30:8,10:19,20 0/1:.:34:16,18:4,5:12,13 | |
| 23709 chr22 32413845 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=1.7502e-16;SPV=0.4084 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:12,13:10,8 0/1:.:39:18,21:8,14:10,7 | |
| 23710 chr22 32424970 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=5;GPV=1.7375e-10;SPV=0.28196 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:14,12:11,6:3,6 0/1:.:24:10,14:7,9:3,5 | |
| 23711 chr22 32432221 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=7.191e-13;SPV=0.8702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:11,8:7,12 0/1:.:31:18,13:6,7:12,6 | |
| 23712 chr22 32433107 . T G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 | |
| 23713 chr22 32434098 . C A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,20:0,10 1/1:.:28:0,28:0,12:0,16 | |
| 23714 chr22 32435553 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,24:0,9 1/1:.:36:0,36:0,23:0,13 | |
| 23715 chr22 32436083 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 1/1:.:40:0,40:0,32:0,8 | |
| 23716 chr22 32436239 . A C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
| 23717 chr22 32436379 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=7.2544e-12;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,9:0,6:0,3 1/1:.:32:0,11:0,6:0,5 | |
| 23718 chr22 32436887 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 1/1:.:43:0,43:0,16:0,27 | |
| 23719 chr22 32439511 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,17:0,24 1/1:.:24:0,24:0,8:0,16 | |
| 23720 chr22 32439707 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,24:0,14 1/1:.:27:0,27:0,20:0,7 | |
| 23721 chr22 32440312 . A T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,23:0,20 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 | |
| 23722 chr22 32440722 . C G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 1/1:.:37:0,37:0,23:0,14 | |
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| 23846 chr22 32496320 . A C . PASS DP=84;SS=1;SSC=2;GPV=1.5419e-14;SPV=0.60283 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:14,9:10,11 0/1:.:40:22,18:12,11:10,7 | |
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| 23848 chr22 32497933 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=3;GPV=5.295e-10;SPV=0.3986 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:19,12:12,9:7,3 0/1:.:31:17,14:6,7:11,7 | |
| 23849 chr22 32499744 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,9:0,18 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
| 23850 chr22 32499905 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 23851 chr22 32500126 . A T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 1/1:.:21:0,21:0,11:0,10 | |
| 23852 chr22 32500603 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,9:0,18 1/1:.:20:0,20:0,9:0,11 | |
| 23853 chr22 32500810 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,10:0,22 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
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| 23855 chr22 32501244 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,21:0,11 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 | |
| 23856 chr22 32501543 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=1.2581e-11;SPV=0.36471 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:10,11:13,6 0/1:.:26:13,13:7,9:6,4 | |
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| 23909 chr22 32542102 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 1/1:.:28:0,28:0,10:0,18 | |
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| 23913 chr22 32544207 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=5.2028e-13;SPV=0.75746 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:12,7:11,13 0/1:.:34:20,14:10,5:10,9 | |
| 23914 chr22 32544674 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,24:0,22 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 23915 chr22 32545981 . G C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
| 23916 chr22 32546366 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 | |
| 23917 chr22 32547211 . G C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,27:0,20 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
| 23918 chr22 32548041 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,24:0,22 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 | |
| 23919 chr22 32548497 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 23920 chr22 32549820 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,26:0,14 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 23921 chr22 32550127 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 23922 chr22 32550333 . G A . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 1/1:.:23:0,23:0,16:0,7 | |
| 23923 chr22 32552440 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,23:0,11 1/1:.:26:0,26:0,7:0,19 | |
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| 23975 chr22 32594736 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=2;GPV=2.4078e-13;SPV=0.53269 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:8,9:9,11 0/1:.:23:10,13:3,7:7,6 | |
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| 23978 chr22 32597046 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=5;GPV=9.1368e-20;SPV=0.25951 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:16,16:11,11 0/1:.:39:16,23:10,8:6,15 | |
| 23979 chr22 32597238 . C T . PASS DP=39;SS=1;SSC=2;GPV=1.0268e-07;SPV=0.59412 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:4,4:10,9 0/1:.:12:6,6:4,1:2,5 | |
| 23980 chr22 32597239 . A G . PASS DP=40;SS=1;SSC=5;GPV=1.1326e-07;SPV=0.28637 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:5,2:10,9 0/1:.:14:6,8:4,1:2,7 | |
| 23981 chr22 32601780 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
| 23982 chr22 32602746 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=3.1151e-17;SPV=0.97382 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:21,30:14,10:7,20 0/1:.:35:21,14:8,7:13,7 | |
| 23983 chr22 32604083 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=1.0016e-19;SPV=0.73331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:18,26:8,12:10,14 0/1:.:42:19,23:8,13:11,10 | |
| 23984 chr22 32604408 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=5;GPV=4.4443e-21;SPV=0.29601 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:16,25:5,12:11,13 0/1:.:36:11,25:2,14:9,11 | |
| 23985 chr22 32604569 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=10;GPV=6.8419e-20;SPV=0.096105 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:8,9:9,14 1/1:.:32:8,24:4,11:4,13 | |
| 23986 chr22 32604867 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 1/1:.:24:0,24:0,9:0,15 | |
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| 23988 chr22 32605472 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=8;GPV=1.5052e-15;SPV=0.12986 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:35,22:16,7:19,15 0/1:.:36:17,19:11,9:6,10 | |
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| 24046 chr22 32676160 . A C . PASS DP=84;SS=1;SSC=5;GPV=1.2581e-22;SPV=0.28372 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:21,33:8,13:13,20 0/1:.:30:9,21:5,5:4,16 | |
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| 24048 chr22 32676653 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 1/1:.:22:0,22:0,11:0,11 | |
| 24049 chr22 32676775 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=9.3121e-14;SPV=0.83085 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:10,11:5,7 0/1:.:37:20,17:9,10:11,7 | |
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| 24053 chr22 32678520 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=2;GPV=3.2602e-09;SPV=0.56162 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:13,12:6,4:7,8 0/1:.:22:11,11:4,3:7,8 | |
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| 24100 chr22 32740951 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=7.191e-13;SPV=0.54584 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:18,16:6,9:12,7 0/1:.:35:18,17:10,6:8,11 | |
| 24101 chr22 32742598 . A T . PASS DP=62;SS=1;SSC=5;GPV=9.798e-13;SPV=0.3029 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:7,6:10,9 0/1:.:30:13,17:4,7:9,10 | |
| 24102 chr22 32742696 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=4.9329e-10;SPV=0.78467 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:9,9:13,9 0/1:.:21:13,8:4,2:9,6 | |
| 24103 chr22 32743244 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=5;GPV=1.7361e-15;SPV=0.31525 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:9,11:9,10 0/1:.:27:10,17:5,9:5,8 | |
| 24104 chr22 32743506 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=5.349e-11;SPV=0.78729 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:10,9:9,10 0/1:.:21:12,9:5,2:7,7 | |
| 24105 chr22 32744425 . T A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.8851e-14;SPV=0.82555 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:9,14:9,6 0/1:.:36:20,16:12,9:8,7 | |
| 24106 chr22 32744668 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=3.6641e-16;SPV=0.55326 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:9,11:9,8 0/1:.:42:20,22:10,10:10,12 | |
| 24107 chr22 32746167 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=2.8964e-11;SPV=0.88708 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:11,5:14,14 0/1:.:34:23,11:13,5:10,6 | |
| 24108 chr22 32746168 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=7.0292e-13;SPV=0.89731 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:10,7:15,15 0/1:.:34:22,12:12,6:10,6 | |
| 24109 chr22 32746922 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=6.5235e-17;SPV=0.60054 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:25,27:14,12:11,15 0/1:.:31:15,16:8,10:7,6 | |
| 24110 chr22 32747542 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=8;GPV=6.4906e-14;SPV=0.12893 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:12,7:8,9 0/1:.:31:12,19:6,8:6,11 | |
| 24111 chr22 32747676 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=6.4956e-13;SPV=0.71943 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:12,12:10,10 0/1:.:24:13,11:5,4:8,7 | |
| 24112 chr22 32748100 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=1.8278e-16;SPV=0.64399 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:18,23:4,10:14,13 0/1:.:33:15,18:7,6:8,12 | |
| 24113 chr22 32748312 . C G . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=4.8851e-14;SPV=0.40319 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:13,9:6,7 0/1:.:39:19,20:12,12:7,8 | |
| 24114 chr22 32748460 . C G . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.5388e-12;SPV=0.76985 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:8,10:8,7 0/1:.:33:18,15:7,5:11,10 | |
| 24115 chr22 32748888 . T G . PASS DP=74;SS=1;SSC=9;GPV=4.8851e-14;SPV=0.11171 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:19,12:9,5:10,7 0/1:.:43:19,24:2,10:17,14 | |
| 24116 chr22 32749304 . C T . PASS DP=34;SS=1;SSC=5;GPV=1.9819e-11;SPV=0.29724 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:7,15:0,6:7,9 1/1:.:12:2,10:0,6:2,4 | |
| 24117 chr22 32752098 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=2;GPV=3.642e-14;SPV=0.56944 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:10,11:17,11 0/1:.:33:18,15:10,5:8,10 | |
| 24118 chr22 32752933 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
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| 24169 chr22 32771865 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,24:0,23 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 24170 chr22 32771883 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 | |
| 24171 chr22 32772896 . C G . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=6.4956e-13;SPV=0.68608 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:9,8:8,9 0/1:.:34:18,16:8,7:10,9 | |
| 24172 chr22 32773388 . C T . PASS DP=45;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.036883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:11,8:5,6:6,2 0/1:.:26:7,19:4,9:3,10 | |
| 24173 chr22 32773503 . C T . PASS DP=46;SS=1;SSC=4;GPV=2.9283e-09;SPV=0.38416 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:13,11:6,5:7,6 0/1:.:22:10,12:5,4:5,8 | |
| 24174 chr22 32773827 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=4.4405e-12;SPV=0.93159 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:11,10:10,13 0/1:.:22:14,8:8,4:6,4 | |
| 24175 chr22 32774391 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=2;GPV=1.8211e-18;SPV=0.52457 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:12,12:9,14 0/1:.:35:15,20:9,13:6,7 | |
| 24176 chr22 32774697 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=9.149e-19;SPV=0.56995 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:19,27:15,16:4,11 0/1:.:32:13,19:4,8:9,11 | |
| 24177 chr22 32775531 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=6.4956e-13;SPV=0.61051 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:14,8:6,11 0/1:.:29:15,14:10,9:5,5 | |
| 24178 chr22 32775705 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=2.7419e-13;SPV=0.9549 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:7,10:9,11 0/1:.:33:20,13:9,7:11,6 | |
| 24179 chr22 32775852 . G T . PASS DP=62;SS=1;SSC=3;GPV=1.0182e-13;SPV=0.49027 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:8,11:7,6 0/1:.:30:13,17:6,7:7,10 | |
| 24180 chr22 32775945 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=5;GPV=4.6624e-13;SPV=0.25542 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:10,10:11,8 0/1:.:26:11,15:5,8:6,7 | |
| 24181 chr22 32776019 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=4.2836e-15;SPV=0.67682 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:12,12:5,8 0/1:.:35:17,18:8,10:9,8 | |
| 24182 chr22 32776239 . T G . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=7.9293e-13;SPV=0.44143 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:12,9:11,10 0/1:.:28:14,14:6,8:8,6 | |
| 24183 chr22 32776626 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=1.0637e-08;SPV=0.78512 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:24,15:12,8:12,7 0/1:.:25:17,8:9,4:8,4 | |
| 24184 chr22 32777069 . G C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,12:0,25 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 | |
| 24185 chr22 32777245 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=2.2536e-12;SPV=0.75157 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:10,8:7,8 0/1:.:37:21,16:12,8:9,8 | |
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| 24245 chr22 32828523 . T A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
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| 24311 chr22 32880969 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,17:0,26 1/1:.:20:0,20:0,8:0,12 | |
| 24312 chr22 32881012 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,17:0,23 1/1:.:22:0,22:0,14:0,8 | |
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| 24315 chr22 32882215 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 | |
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| 24387 chr22 32950630 . T G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 | |
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| 24442 chr22 32985361 . G T . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=5.9795e-14;SPV=0.76232 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:10,8:10,12 0/1:.:36:20,16:14,10:6,6 | |
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| 24444 chr22 32986568 . C G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=5.857e-18;SPV=0.90153 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:9,15:8,11 0/1:.:39:20,19:11,11:9,8 | |
| 24445 chr22 32986770 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 | |
| 24446 chr22 32986771 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 1/1:.:36:0,36:0,12:0,24 | |
| 24447 chr22 32986971 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 24448 chr22 32986988 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 | |
| 24449 chr22 32987119 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=5;GPV=7.6319e-16;SPV=0.27973 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:15,13:9,10 0/1:.:29:12,17:8,12:4,5 | |
| 24450 chr22 32987399 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=1.2581e-11;SPV=0.58035 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:6,6:11,8 0/1:.:35:19,16:10,7:9,9 | |
| 24451 chr22 32987434 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 1/1:.:44:0,44:0,26:0,18 | |
| 24452 chr22 32987505 . G C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 24453 chr22 32987578 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 | |
| 24454 chr22 32987814 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=9;GPV=2.1236e-16;SPV=0.10339 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:10,12:14,10 0/1:.:29:10,19:4,9:6,10 | |
| 24455 chr22 32988115 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
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| 24513 chr22 33018179 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=3.3502e-13;SPV=0.6034 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:10,11:10,7 0/1:.:34:18,16:7,9:11,7 | |
| 24514 chr22 33019884 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=2.2863e-14;SPV=0.56513 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:7,10:16,11 0/1:.:33:17,16:7,7:10,9 | |
| 24515 chr22 33020216 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=1.8221e-14;SPV=0.55012 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:13,11:14,10 0/1:.:38:21,17:11,7:10,10 | |
| 24516 chr22 33020472 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
| 24517 chr22 33020493 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=3.9115e-10;SPV=0.72971 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:8,4:9,11 0/1:.:26:15,11:6,5:9,6 | |
| 24518 chr22 33021622 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=7.8044e-17;SPV=0.84732 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:11,20:5,9:6,11 0/1:.:38:17,21:7,9:10,12 | |
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| 24573 chr22 33061122 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=3;GPV=7.8126e-18;SPV=0.48763 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:11,14:10,9 0/1:.:40:18,22:10,14:8,8 | |
| 24574 chr22 33061898 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=7.6926e-15;SPV=0.76079 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:5,10:10,10 0/1:.:33:16,17:9,10:7,7 | |
| 24575 chr22 33062394 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=7;GPV=1.7375e-10;SPV=0.19805 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:14,11:5,3:9,8 0/1:.:25:10,15:5,9:5,6 | |
| 24576 chr22 33063145 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=4.8441e-11;SPV=0.69715 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:6,4:8,10 0/1:.:30:16,14:6,5:10,9 | |
| 24577 chr22 33064358 . A C . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=2.6279e-15;SPV=0.54361 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:12,8:8,12 0/1:.:37:18,19:13,9:5,10 | |
| 24578 chr22 33064506 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.9669e-13;SPV=0.99282 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:18,27:10,19:8,8 0/1:.:22:15,7:5,2:10,5 | |
| 24579 chr22 33066131 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=5.5248e-15;SPV=0.74509 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:13,11:9,14 0/1:.:27:14,13:4,6:10,7 | |
| 24580 chr22 33066380 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=1.6045e-08;SPV=0.98324 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:8,12:9,5 0/1:.:20:15,5:9,2:6,3 | |
| 24581 chr22 33066655 . T G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,23:0,14 1/1:.:25:0,25:0,18:0,7 | |
| 24582 chr22 33066753 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=2.3308e-15;SPV=0.74923 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:12,14:7,8 0/1:.:35:18,17:10,10:8,7 | |
| 24583 chr22 33067050 . T G . PASS DP=63;SS=1;SSC=9;GPV=3.6448e-13;SPV=0.10726 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:13,6:8,11 0/1:.:25:9,16:3,5:6,11 | |
| 24584 chr22 33067236 . A C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 24585 chr22 33067564 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=1.3095e-14;SPV=0.74837 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:13,13:8,11 0/1:.:27:14,13:5,10:9,3 | |
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| 24587 chr22 33069582 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
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| 24644 chr22 33113010 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 1/1:.:20:0,20:0,9:0,11 | |
| 24645 chr22 33113580 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=2.1626e-19;SPV=0.42932 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:10,10:14,16 0/1:.:41:18,23:11,13:7,10 | |
| 24646 chr22 33113607 . T G . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=4.0755e-15;SPV=0.72778 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:10,13:13,10 0/1:.:35:19,16:9,11:10,5 | |
| 24647 chr22 33115208 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=12;GPV=3.5003e-14;SPV=0.053918 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:19,10:6,8 0/1:.:28:10,18:6,10:4,8 | |
| 24648 chr22 33115405 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.041872 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:9,6:15,10 0/1:.:28:10,18:5,7:5,11 | |
| 24649 chr22 33116120 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=4.2429e-17;SPV=0.35519 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:16,23:8,12:8,11 0/1:.:27:9,18:4,14:5,4 | |
| 24650 chr22 33116757 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=1.1574e-13;SPV=0.82185 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:4,4:11,13 0/1:.:40:22,18:11,6:11,12 | |
| 24651 chr22 33116847 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.8765e-12;SPV=0.98599 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:14,20:10,8:4,12 0/1:.:34:22,12:10,6:12,6 | |
| 24652 chr22 33117099 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=2.2803e-11;SPV=0.89915 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:9,9:12,9 0/1:.:35:23,12:7,8:16,4 | |
| 24653 chr22 33118147 . T G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=7.7752e-12;SPV=0.95263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:13,18:9,11:4,7 0/1:.:30:18,12:12,4:6,8 | |
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| 24655 chr22 33121668 . G T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.0403e-12;SPV=0.81372 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:12,10:13,13 0/1:.:25:15,10:9,6:6,4 | |
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| 24696 chr22 33170478 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=4;GPV=3.7837e-11;SPV=0.34083 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:10,11:14,5 0/1:.:27:14,13:6,8:8,5 | |
| 24697 chr22 33170601 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=8;GPV=2.7171e-10;SPV=0.14328 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:18,12:8,6:10,6 0/1:.:24:10,14:5,9:5,5 | |
| 24698 chr22 33172029 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=7;GPV=6.249e-18;SPV=0.16775 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:28,23:10,11:18,12 0/1:.:40:17,23:10,6:7,17 | |
| 24699 chr22 33172574 . G T . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=1.3761e-09;SPV=0.90153 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:11,14:7,8:4,6 0/1:.:24:14,10:6,9:8,1 | |
| 24700 chr22 33174711 . C T . PASS DP=48;SS=1;SSC=5;GPV=2.8521e-08;SPV=0.3098 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:8,4:4,3:4,1 0/1:.:36:19,17:4,9:15,8 | |
| 24701 chr22 33174859 . C T . PASS DP=46;SS=1;SSC=3;GPV=1.2413e-06;SPV=0.42363 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:13:9,4:7,1:2,3 0/1:.:33:20,13:9,9:11,4 | |
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| 24703 chr22 33175152 . C T . PASS DP=31;SS=1;SSC=0;GPV=3.5853e-07;SPV=0.94201 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:10:3,7:2,4:1,3 0/1:.:21:11,10:9,5:2,5 | |
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| 24705 chr22 33175669 . G A . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=3.0805e-08;SPV=0.9123 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:9:3,6:2,2:1,4 0/1:.:29:15,14:6,6:9,8 | |
| 24706 chr22 33175841 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=5;GPV=2.4256e-08;SPV=0.2846 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:9,5:7,3:2,2 0/1:.:32:16,16:7,10:9,6 | |
| 24707 chr22 33176674 . A T . PASS DP=41;SS=1;SSC=4;GPV=3.8262e-11;SPV=0.39476 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:6,8:3,5:3,3 0/1:.:27:9,18:3,4:6,14 | |
| 24708 chr22 33177176 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=3;GPV=5.349e-11;SPV=0.49122 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:10,8:5,1:5,7 0/1:.:41:21,20:11,9:10,11 | |
| 24709 chr22 33177543 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.6571e-10;SPV=0.80557 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:11,11:7,8:4,3 0/1:.:38:22,16:13,6:9,10 | |
| 24710 chr22 33178088 . C G . PASS DP=55;SS=1;SSC=1;GPV=3.4899e-11;SPV=0.67295 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:10,11:7,5:3,6 0/1:.:34:17,17:4,6:13,11 | |
| 24711 chr22 33178228 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=10;GPV=1.6514e-11;SPV=0.083253 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:13,7:10,1:3,6 0/1:.:38:16,22:8,11:8,11 | |
| 24712 chr22 33178338 . G C . PASS DP=52;SS=1;SSC=11;GPV=1.4035e-08;SPV=0.068331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:14,5:6,4:8,1 0/1:.:33:16,17:9,7:7,10 | |
| 24713 chr22 33179130 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=2.3224e-12;SPV=0.71868 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:11,13:9,4:2,9 0/1:.:36:18,18:6,5:12,13 | |
| 24714 chr22 33179318 . A G . PASS DP=49;SS=1;SSC=7;GPV=5.6162e-07;SPV=0.17327 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:16,6:10,3:6,3 0/1:.:27:15,12:14,5:1,7 | |
| 24715 chr22 33180502 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=6;GPV=8.2728e-11;SPV=0.23583 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:10,9:7,5 0/1:.:22:9,13:3,9:6,4 | |
| 24716 chr22 33180719 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=11;GPV=1.1614e-17;SPV=0.071995 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:28,22:16,12:12,10 0/1:.:37:14,23:9,12:5,11 | |
| 24717 chr22 33181083 . G C . PASS DP=71;SS=1;SSC=5;GPV=7.5261e-19;SPV=0.30242 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:14,20:8,9:6,11 0/1:.:37:12,25:4,13:8,12 | |
| 24718 chr22 33181224 . C T . PASS DP=60;SS=3;SSC=22;GPV=1;SPV=0.0056915 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:7,6:12,8 1/1:.:27:6,21:3,5:3,16 | |
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| 24768 chr22 33236126 . G T . PASS DP=50;SS=1;SSC=2;GPV=3.2974e-08;SPV=0.52454 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:12,8:5,4:7,4 0/1:.:30:17,13:8,5:9,8 | |
| 24769 chr22 33239281 . C A . PASS DP=56;SS=1;SSC=3;GPV=1.1473e-10;SPV=0.49247 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:14,12:7,9:7,3 0/1:.:30:15,15:5,9:10,6 | |
| 24770 chr22 33239294 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,16:0,10 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
| 24771 chr22 33239863 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=7.3575e-14;SPV=0.57812 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:14,2:6,19 0/1:.:27:13,14:4,8:9,6 | |
| 24772 chr22 33240010 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=4;GPV=3.9115e-10;SPV=0.34525 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:20,14:6,10:14,4 0/1:.:24:12,12:6,6:6,6 | |
| 24773 chr22 33249830 . C G . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 | |
| 24774 chr22 33251922 . C T . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,11:0,11 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
| 24775 chr22 33253836 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,20:0,23 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 24776 chr22 33254273 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 24777 chr22 33256468 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 1/1:.:47:0,47:0,22:0,25 | |
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| 24780 chr22 33258058 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 1/1:.:25:0,25:0,15:0,10 | |
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| 24834 chr22 33334435 . A C . PASS DP=49;SS=1;SSC=12;GPV=1.3761e-09;SPV=0.056205 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:15,8:8,6:7,2 0/1:.:26:10,16:7,10:3,6 | |
| 24835 chr22 33334483 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=5;GPV=2.4568e-12;SPV=0.30274 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:10,13:13,3 0/1:.:32:16,16:12,8:4,8 | |
| 24836 chr22 33334847 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,27:0,19 1/1:.:29:0,29:0,22:0,7 | |
| 24837 chr22 33334905 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=1.6516e-12;SPV=0.58197 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:18,8:10,12 0/1:.:31:18,13:10,9:8,4 | |
| 24838 chr22 33335049 . T C . PASS DP=100;SS=1;SSC=11;GPV=5.5539e-18;SPV=0.063342 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:35,23:13,12:22,11 0/1:.:42:18,24:6,11:12,13 | |
| 24839 chr22 33335167 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=3;GPV=1.9118e-16;SPV=0.39819 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:28,22:11,5:17,17 0/1:.:43:22,21:15,12:7,9 | |
| 24840 chr22 33335848 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=1.5381e-13;SPV=0.64719 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:7,7:8,10 0/1:.:33:16,17:11,9:5,8 | |
| 24841 chr22 33336843 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 1/1:.:29:0,29:0,23:0,6 | |
| 24842 chr22 33337541 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=9;GPV=1.7206e-15;SPV=0.12075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:16,13:12,7 0/1:.:35:15,20:7,9:8,11 | |
| 24843 chr22 33338254 . G C . PASS DP=85;SS=1;SSC=3;GPV=2.4776e-16;SPV=0.46206 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:14,11:11,12 0/1:.:37:18,19:7,9:11,10 | |
| 24844 chr22 33338410 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 1/1:.:19:0,19:0,9:0,10 | |
| 24845 chr22 33338467 . T A . PASS DP=57;SS=1;SSC=5;GPV=2.4613e-05;SPV=0.2947 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:27,7:12,2:15,5 0/1:.:23:16,7:8,4:8,3 | |
| 24846 chr22 33338857 . T G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=4.5064e-15;SPV=0.85555 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:12,12:14,15 0/1:.:29:17,12:9,5:8,7 | |
| 24847 chr22 33339380 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=5.3416e-11;SPV=0.46312 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:21,13:9,8:12,5 0/1:.:38:22,16:11,6:11,10 | |
| 24848 chr22 33340121 . G T . PASS DP=71;SS=1;SSC=8;GPV=3.7425e-15;SPV=0.14544 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:14,15:10,7 0/1:.:25:9,16:4,12:5,4 | |
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| 24850 chr22 33340668 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=5.2318e-13;SPV=0.68986 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:9,14:9,5 0/1:.:29:15,14:7,9:8,5 | |
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| 24896 chr22 33385668 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=5.6671e-10;SPV=0.34391 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:23,14:16,7:7,7 0/1:.:26:14,12:9,4:5,8 | |
| 24897 chr22 33386022 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=1.7985e-10;SPV=0.59192 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:10,9:9,6 0/1:.:27:15,12:8,7:7,5 | |
| 24898 chr22 33386229 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=5;GPV=5.8009e-12;SPV=0.30886 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:11,10:12,6 0/1:.:30:15,15:8,8:7,7 | |
| 24899 chr22 33386608 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 1/1:.:33:0,33:0,10:0,23 | |
| 24900 chr22 33386714 . T A . PASS DP=62;SS=1;SSC=2;GPV=1.0182e-13;SPV=0.5293 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:13,15:5,8:8,7 0/1:.:34:15,19:5,11:10,8 | |
| 24901 chr22 33387519 . A T . PASS DP=59;SS=1;SSC=6;GPV=2.756e-17;SPV=0.24434 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:13,22:11,13:2,9 1/1:.:24:6,18:6,8:0,10 | |
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| 24904 chr22 33388252 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=4.7115e-08;SPV=0.73486 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:10,7:10,6 0/1:.:23:15,8:6,7:9,1 | |
| 24905 chr22 33389125 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,26:0,22 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
| 24906 chr22 33389405 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=23;GPV=1;SPV=0.0045641 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:32,19:14,10:18,9 0/1:.:37:12,25:5,9:7,16 | |
| 24907 chr22 33389570 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,21:0,25 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
| 24908 chr22 33389890 . C A . PASS DP=53;SS=1;SSC=7;GPV=6.6943e-07;SPV=0.16642 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:20,7:11,5:9,2 0/1:.:26:15,11:10,6:5,5 | |
| 24909 chr22 33390184 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 | |
| 24910 chr22 33390265 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=8;GPV=1.1875e-15;SPV=0.14942 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:18,16:5,7:13,9 0/1:.:37:14,23:5,10:9,13 | |
| 24911 chr22 33390356 . G C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=1.5391e-12;SPV=0.98568 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:10,8:10,14 0/1:.:36:25,11:9,5:16,6 | |
| 24912 chr22 33390445 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=11;GPV=1.19e-16;SPV=0.063738 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:14,8:10,11 0/1:.:36:13,23:6,9:7,14 | |
| 24913 chr22 33391286 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=7.8324e-17;SPV=0.8076 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:12,24:6,12:6,12 0/1:.:27:11,16:8,4:3,12 | |
| 24914 chr22 33393568 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=7;GPV=1.6045e-17;SPV=0.19151 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:14,13:9,9 0/1:.:36:14,22:10,13:4,9 | |
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| 24916 chr22 33394155 . A T . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=2.068e-13;SPV=0.50942 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:9,8:6,10 0/1:.:26:11,15:6,7:5,8 | |
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| 24968 chr22 33433612 . A C . PASS DP=48;SS=1;SSC=1;GPV=1.3341e-10;SPV=0.78324 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:12,16:11,9:1,7 0/1:.:20:10,10:6,8:4,2 | |
| 24969 chr22 33434190 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=2.6279e-15;SPV=0.62724 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:15,13:8,11 0/1:.:30:15,15:8,5:7,10 | |
| 24970 chr22 33434241 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=11;GPV=4.0755e-11;SPV=0.07462 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:28,15:14,10:14,5 0/1:.:25:11,14:5,6:6,8 | |
| 24971 chr22 33434472 . G T . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=2.2536e-12;SPV=0.77094 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:8,11:16,11 0/1:.:24:14,10:11,6:3,4 | |
| 24972 chr22 33435235 . C G . PASS DP=62;SS=1;SSC=3;GPV=2.9394e-12;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:7,7:9,8 0/1:.:31:15,16:7,8:8,8 | |
| 24973 chr22 33435813 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=5;GPV=1.0404e-13;SPV=0.27715 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:8,6:12,10 0/1:.:35:16,19:8,12:8,7 | |
| 24974 chr22 33436162 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=3;GPV=1.7922e-12;SPV=0.44372 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:11,11:3,5:8,6 0/1:.:36:16,20:6,8:10,12 | |
| 24975 chr22 33436331 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=3;GPV=1.4887e-13;SPV=0.48054 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:9,11:6,6:3,5 0/1:.:37:15,22:5,12:10,10 | |
| 24976 chr22 33436749 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:23:0,23:0,8:0,15 | |
| 24977 chr22 33436781 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.041885 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:22,12:8,7:14,5 0/1:.:30:12,18:4,10:8,8 | |
| 24978 chr22 33437099 . A C . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=7.8044e-17;SPV=0.63473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:14,21:3,15:11,6 0/1:.:34:14,20:10,14:4,6 | |
| 24979 chr22 33437867 . T A . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=2.8926e-12;SPV=0.52977 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:14,10:6,5 0/1:.:38:21,17:7,9:14,8 | |
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| 25036 chr22 33476586 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.028336 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:31,21:11,10:20,11 0/1:.:31:11,20:7,8:4,12 | |
| 25037 chr22 33477561 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=1.8275e-17;SPV=0.62752 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:14,23:9,12:5,11 0/1:.:31:12,19:7,12:5,7 | |
| 25038 chr22 33477935 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=9.149e-19;SPV=0.81043 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:15,25:11,13:4,12 0/1:.:38:17,21:5,13:12,8 | |
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| 25041 chr22 33479776 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=8;GPV=1.5211e-10;SPV=0.15642 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:15,10:9,6 0/1:.:19:8,11:5,5:3,6 | |
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| 25044 chr22 33485005 . G C . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=1.6778e-09;SPV=0.85304 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:5,7:9,8 0/1:.:22:13,9:7,5:6,4 | |
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| 25096 chr22 33534029 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,13:0,22 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
| 25097 chr22 33534270 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 25098 chr22 33534467 . G T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.2981e-15;SPV=0.97358 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:18,25:11,19:7,6 0/1:.:36:22,14:12,8:10,6 | |
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| 25101 chr22 33536395 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
| 25102 chr22 33536528 . T A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 25103 chr22 33536638 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 | |
| 25104 chr22 33537107 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,12:0,28 1/1:.:38:0,38:0,12:0,26 | |
| 25105 chr22 33537534 . T G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,36:0,20 1/1:.:32:0,32:0,12:0,20 | |
| 25106 chr22 33537598 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,33:0,19 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
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| 25108 chr22 33537850 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,18:0,25 1/1:.:30:0,30:0,18:0,12 | |
| 25109 chr22 33537984 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,23:0,26 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 25110 chr22 33538478 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,30:0,17 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 | |
| 25111 chr22 33538499 . A C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,24:0,21 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 | |
| 25112 chr22 33538759 . G T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 | |
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| 25161 chr22 33560094 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=2.8075e-15;SPV=0.3781 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:8,13:12,9 0/1:.:27:11,16:6,10:5,6 | |
| 25162 chr22 33561460 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=8;GPV=1.8524e-14;SPV=0.14913 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:14,9:12,11 0/1:.:29:12,17:6,12:6,5 | |
| 25163 chr22 33562703 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 1/1:.:42:0,42:0,19:0,23 | |
| 25164 chr22 33563090 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=6.8178e-12;SPV=0.78029 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:7,12:15,7 0/1:.:30:18,12:10,7:8,5 | |
| 25165 chr22 33563390 . C A . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=3.1307e-16;SPV=0.76547 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:14,21:8,8:6,13 0/1:.:35:16,19:7,8:9,11 | |
| 25166 chr22 33563652 . T G . PASS DP=65;SS=1;SSC=12;GPV=1.1519e-11;SPV=0.055603 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:22,12:12,5:10,7 0/1:.:31:13,18:5,5:8,13 | |
| 25167 chr22 33564690 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=3;GPV=2.4191e-07;SPV=0.4283 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:8,5:11,5 0/1:.:22:13,9:9,3:4,6 | |
| 25168 chr22 33565536 . C G . PASS DP=49;SS=1;SSC=2;GPV=2.1763e-07;SPV=0.59635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:16,10:7,4:9,6 0/1:.:23:14,9:5,4:9,5 | |
| 25169 chr22 33565649 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=2.2597e-11;SPV=0.43144 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:15,12:8,7:7,5 0/1:.:34:17,17:8,12:9,5 | |
| 25170 chr22 33565650 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=3.6008e-20;SPV=0.91246 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:4,23:0,12:4,11 0/1:.:27:7,20:2,14:5,6 | |
| 25171 chr22 33565932 . C T . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,12:0,9 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 25172 chr22 33566468 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,13:0,26 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 25173 chr22 33566963 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=7.7752e-12;SPV=0.82495 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:9,13:8,6 0/1:.:25:14,11:9,5:5,6 | |
| 25174 chr22 33567205 . G T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.19e-16;SPV=0.9181 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:19,27:9,13:10,14 0/1:.:33:18,15:11,7:7,8 | |
| 25175 chr22 33567771 . C T . PASS DP=49;SS=1;SSC=7;GPV=8.6234e-06;SPV=0.19219 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:22,7:10,4:12,3 0/1:.:20:12,8:10,5:2,3 | |
| 25176 chr22 33567804 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=2.3338e-15;SPV=0.60079 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:7,9:6,11 0/1:.:28:11,17:6,9:5,8 | |
| 25177 chr22 33567952 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 25178 chr22 33568590 . A C . PASS DP=60;SS=1;SSC=2;GPV=2.3224e-12;SPV=0.58646 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:6,6:11,12 0/1:.:25:12,13:6,4:6,9 | |
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| 25236 chr22 33618889 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 1/1:.:29:0,29:0,19:0,10 | |
| 25237 chr22 33619702 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 | |
| 25238 chr22 33620007 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 1/1:.:26:0,26:0,16:0,10 | |
| 25239 chr22 33620228 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=1.1558e-14;SPV=0.54135 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:10,10:8,9 0/1:.:34:16,18:11,11:5,7 | |
| 25240 chr22 33620970 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,11:0,25 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
| 25241 chr22 33620973 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,8:0,18 1/1:.:29:0,29:0,19:0,10 | |
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| 25244 chr22 33622704 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=24;GPV=1;SPV=0.003723 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:25,12:12,8:13,4 0/1:.:38:13,25:8,12:5,13 | |
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| 25302 chr22 33664816 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,21:0,31 1/1:.:40:0,40:0,17:0,23 | |
| 25303 chr22 33665067 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 25304 chr22 33665170 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 | |
| 25305 chr22 33665229 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 1/1:.:39:0,39:0,15:0,24 | |
| 25306 chr22 33665265 . G T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 1/1:.:44:0,44:0,19:0,25 | |
| 25307 chr22 33665402 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=4.6893e-11;SPV=0.64328 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:22,16:9,8:13,8 0/1:.:32:19,13:12,7:7,6 | |
| 25308 chr22 33665677 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,27:0,16 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 | |
| 25309 chr22 33665832 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
| 25310 chr22 33670398 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
| 25311 chr22 33673161 . T G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 | |
| 25312 chr22 33688001 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 | |
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| 25359 chr22 33725257 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.5975e-09;SPV=0.83936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:12,9:11,8 0/1:.:24:16,8:9,4:7,4 | |
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| 25361 chr22 33725877 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 25362 chr22 33728576 . A C . PASS DP=47;SS=1;SSC=3;GPV=1.1545e-10;SPV=0.42354 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:12,13:4,2:8,11 0/1:.:22:9,13:6,3:3,10 | |
| 25363 chr22 33728786 . C G . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=5.6671e-10;SPV=0.45353 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:16,10:6,5:10,5 0/1:.:37:21,16:7,7:14,9 | |
| 25364 chr22 33728990 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=2.4148e-10;SPV=0.86035 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:15,12:8,7 0/1:.:23:15,8:10,5:5,3 | |
| 25365 chr22 33730979 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 25366 chr22 33731864 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=2.0601e-12;SPV=0.64109 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:12,9:13,13 0/1:.:22:12,10:3,5:9,5 | |
| 25367 chr22 33732996 . C G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=8.2552e-11;SPV=0.9723 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:7,10:10,9 0/1:.:28:19,9:10,4:9,5 | |
| 25368 chr22 33733584 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=1.8424e-11;SPV=0.92949 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:4,9:11,10 0/1:.:25:15,10:5,5:10,5 | |
| 25369 chr22 33735695 . T G . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=9.7868e-13;SPV=0.79203 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:8,13:3,8:5,5 0/1:.:33:15,18:11,9:4,9 | |
| 25370 chr22 33736149 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=4;GPV=3.1807e-12;SPV=0.3433 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:11,11:7,7:4,4 0/1:.:32:13,19:6,9:7,10 | |
| 25371 chr22 33736969 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 | |
| 25372 chr22 33737427 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=3;GPV=3.5024e-11;SPV=0.46008 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:22,16:13,9:9,7 0/1:.:28:15,13:5,4:10,9 | |
| 25373 chr22 33737910 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=5;GPV=5.5473e-09;SPV=0.27292 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:18,11:12,6:6,5 0/1:.:24:12,12:6,7:6,5 | |
| 25374 chr22 33738318 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 1/1:.:24:0,24:0,12:0,12 | |
| 25375 chr22 33738747 . A C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.3875e-11;SPV=0.85992 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:13,8:11,10 0/1:.:33:22,11:13,8:9,3 | |
| 25376 chr22 33739021 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
| 25377 chr22 33739057 . C G . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=2.4655e-13;SPV=0.35977 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:8,8:11,8 0/1:.:34:16,18:10,8:6,10 | |
| 25378 chr22 33739446 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=1.6045e-17;SPV=0.80849 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:9,12:6,9 0/1:.:45:22,23:13,12:9,11 | |
| 25379 chr22 33739486 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,25:0,13 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 | |
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| 25381 chr22 33740956 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=6;GPV=8.8612e-15;SPV=0.24601 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:10,10:10,9 0/1:.:30:12,18:4,10:8,8 | |
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| 25435 chr22 33766581 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=6;GPV=8.6344e-12;SPV=0.2355 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:12,7:10,10 0/1:.:23:10,13:4,8:6,5 | |
| 25436 chr22 33767774 . A T . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=2.0619e-14;SPV=0.5195 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:18,13:6,9 0/1:.:30:15,15:12,6:3,9 | |
| 25437 chr22 33768699 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=2;GPV=8.6344e-12;SPV=0.62102 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:15,8:4,10 0/1:.:25:13,12:11,6:2,6 | |
| 25438 chr22 33768781 . C T . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,19:0,9 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 | |
| 25439 chr22 33770094 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=6.4366e-11;SPV=0.44485 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:11,8:6,5 0/1:.:31:16,15:10,11:6,4 | |
| 25440 chr22 33770152 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 | |
| 25441 chr22 33770679 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=5;GPV=5.8427e-13;SPV=0.26881 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:10,4:8,10 0/1:.:35:16,19:4,9:12,10 | |
| 25442 chr22 33772491 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=12;GPV=7.191e-13;SPV=0.060993 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:23,14:10,7:13,7 0/1:.:32:13,19:8,13:5,6 | |
| 25443 chr22 33772676 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=1.6574e-14;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:10,8:10,11 0/1:.:35:17,18:12,10:5,8 | |
| 25444 chr22 33773305 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=7;GPV=1.5635e-16;SPV=0.19229 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:8,6:11,13 0/1:.:35:13,22:1,12:12,10 | |
| 25445 chr22 33773407 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=9;GPV=1.5062e-09;SPV=0.10726 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:21,9:10,5:11,4 0/1:.:33:17,16:7,7:10,9 | |
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| 25447 chr22 33774545 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=3.2811e-12;SPV=0.73484 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:15,16:6,8:9,8 0/1:.:32:17,15:6,7:11,8 | |
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| 25498 chr22 33801394 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=1.5887e-13;SPV=0.98922 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:7,21:4,11:3,10 0/1:.:23:12,11:4,5:8,6 | |
| 25499 chr22 33801815 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=3.9115e-10;SPV=0.86086 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:8,6:7,9 0/1:.:28:17,11:6,3:11,8 | |
| 25500 chr22 33805751 . G A . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,18:0,7:0,11 1/1:.:22:0,14:0,6:0,8 | |
| 25501 chr22 33806297 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 | |
| 25502 chr22 33806506 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=7;GPV=4.0856e-15;SPV=0.19462 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:10,9:4,5 0/1:.:36:13,23:6,12:7,11 | |
| 25503 chr22 33806783 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,16:0,26 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
| 25504 chr22 33806827 . A T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 25505 chr22 33806984 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=3;GPV=7.6926e-15;SPV=0.46591 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:9,10:9,10 0/1:.:30:13,17:5,6:8,11 | |
| 25506 chr22 33807208 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=3.6826e-13;SPV=0.9569 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:11,14:10,10 0/1:.:28:18,10:12,5:6,5 | |
| 25507 chr22 33807250 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,26:0,20 1/1:.:28:0,28:0,11:0,17 | |
| 25508 chr22 33807509 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=8;GPV=5.9795e-14;SPV=0.14338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:11,8:17,12 0/1:.:28:12,16:7,7:5,9 | |
| 25509 chr22 33807730 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=2.7512e-17;SPV=0.66973 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:6,13:8,9 0/1:.:34:14,20:12,9:2,11 | |
| 25510 chr22 33808216 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,30:0,19 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
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| 25512 chr22 33808507 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=7.2383e-18;SPV=0.88896 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:16,27:8,10:8,17 0/1:.:33:16,17:10,9:6,8 | |
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| 25563 chr22 33831283 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=9.3121e-14;SPV=0.88651 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:4,11:14,11 0/1:.:30:17,13:3,4:14,9 | |
| 25564 chr22 33832599 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=5.4147e-14;SPV=0.64804 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:17,10:4,10 0/1:.:34:18,16:10,5:8,11 | |
| 25565 chr22 33833964 . T G . PASS DP=51;SS=1;SSC=3;GPV=9.3266e-08;SPV=0.47933 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:17,10:7,5:10,5 0/1:.:24:14,10:10,4:4,6 | |
| 25566 chr22 33834266 . G T . PASS DP=64;SS=1;SSC=6;GPV=2.9719e-11;SPV=0.20417 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:18,11:11,7:7,4 0/1:.:35:17,18:7,10:10,8 | |
| 25567 chr22 33837579 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=8.221e-09;SPV=0.63269 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:10,8:10,5 0/1:.:26:16,10:8,4:8,6 | |
| 25568 chr22 33838475 . C A . PASS DP=47;SS=1;SSC=18;GPV=1;SPV=0.014996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:18,7:10,5:8,2 0/1:.:22:8,14:7,9:1,5 | |
| 25569 chr22 33840407 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=6.4299e-17;SPV=0.65565 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:12,19:5,11:7,8 0/1:.:37:15,22:10,12:5,10 | |
| 25570 chr22 33840781 . A C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=2.068e-13;SPV=0.94616 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:12,21:5,13:7,8 0/1:.:26:14,12:8,6:6,6 | |
| 25571 chr22 33841423 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=3;GPV=4.9668e-14;SPV=0.46178 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:15,16:6,11:9,5 0/1:.:34:15,19:8,14:7,5 | |
| 25572 chr22 33842156 . T G . PASS DP=85;SS=1;SSC=4;GPV=8.3232e-17;SPV=0.36878 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:12,12:12,10 0/1:.:39:18,21:13,8:5,13 | |
| 25573 chr22 33842843 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=4;GPV=6.4299e-17;SPV=0.3826 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:11,14:4,8:7,6 0/1:.:43:16,27:7,11:9,16 | |
| 25574 chr22 33846737 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=8.7266e-12;SPV=0.98799 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:13,23:3,8:10,15 0/1:.:17:11,6:5,4:6,2 | |
| 25575 chr22 33846917 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=3.5003e-14;SPV=0.71993 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:13,12:6,9 0/1:.:31:16,15:12,10:4,5 | |
| 25576 chr22 33847646 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=3.9143e-11;SPV=0.78849 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:13,15:5,8:8,7 0/1:.:28:15,13:10,10:5,3 | |
| 25577 chr22 33848575 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=22;GPV=1;SPV=0.0051204 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:26,15:12,5:14,10 0/1:.:35:11,24:3,14:8,10 | |
| 25578 chr22 33849228 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=1.8643e-13;SPV=0.7268 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:11,9:10,10 0/1:.:37:21,16:12,10:9,6 | |
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| 25627 chr22 33892702 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=3;GPV=1.8384e-09;SPV=0.43829 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:10,8:8,6 0/1:.:20:10,10:6,6:4,4 | |
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| 25629 chr22 33895477 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=3;GPV=3.0519e-14;SPV=0.41785 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:11,13:12,5 0/1:.:39:20,19:12,12:8,7 | |
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| 25631 chr22 33895762 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=2.0601e-12;SPV=0.50375 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:5,7:18,12 0/1:.:27:14,13:6,7:8,6 | |
| 25632 chr22 33895882 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=7.5673e-13;SPV=0.70344 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:8,6:5,10 0/1:.:31:15,16:4,7:11,9 | |
| 25633 chr22 33897528 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=4.883e-13;SPV=0.95892 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:7,15:5,7:2,8 0/1:.:35:18,17:9,10:9,7 | |
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| 25635 chr22 33899789 . A T . PASS DP=66;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.038491 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:27,13:8,9:19,4 0/1:.:26:11,15:4,10:7,5 | |
| 25636 chr22 33899886 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=9;GPV=2.781e-14;SPV=0.11123 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:25,16:11,8:14,8 0/1:.:38:17,21:7,12:10,9 | |
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| 25639 chr22 33902522 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=4.8717e-12;SPV=0.54441 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:11,8:14,13 0/1:.:21:11,10:5,5:6,5 | |
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| 25643 chr22 33910367 . A T . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=3.1153e-09;SPV=0.75132 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:9,8:11,7 0/1:.:24:15,9:6,7:9,2 | |
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| 25695 chr22 33967866 . A T . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=8.2514e-08;SPV=0.81267 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:6,8:4,5:2,3 0/1:.:23:12,11:7,5:5,6 | |
| 25696 chr22 33968260 . T C . PASS DP=49;SS=1;SSC=1;GPV=1.5284e-10;SPV=0.6567 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:12,14:3,7:9,7 0/1:.:23:11,12:9,6:2,6 | |
| 25697 chr22 33969453 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=1.213e-15;SPV=0.63583 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:10,18:5,8:5,10 0/1:.:30:11,19:6,7:5,12 | |
| 25698 chr22 33973415 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=5;GPV=1.7439e-13;SPV=0.28895 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:14,12:7,7 0/1:.:26:11,15:7,7:4,8 | |
| 25699 chr22 33973707 . T G . PASS DP=50;SS=1;SSC=1;GPV=1.5236e-09;SPV=0.72685 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:4,5:10,9 0/1:.:22:12,10:6,4:6,6 | |
| 25700 chr22 33973914 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=3;GPV=8.2315e-13;SPV=0.47239 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:11,14:6,10:5,4 0/1:.:28:11,17:7,9:4,8 | |
| 25701 chr22 33974167 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=8;GPV=3.2974e-08;SPV=0.13303 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:14,6:7,3:7,3 0/1:.:30:15,15:8,6:7,9 | |
| 25702 chr22 33975119 . C G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=5.693e-13;SPV=0.90114 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:8,14:4,6:4,8 0/1:.:36:18,18:9,8:9,10 | |
| 25703 chr22 33977304 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=7.4725e-14;SPV=0.71071 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:9,13:5,7:4,6 0/1:.:38:17,21:7,11:10,10 | |
| 25704 chr22 33978252 . T A . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=0.00046348;SPV=0.89103 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:3,5:3,3:0,2 0/1:.:21:5,4:3,3:2,1 | |
| 25705 chr22 33978254 . T A . PASS DP=46;SS=1;SSC=3;GPV=0.00056532;SPV=0.4215 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:18,4:10,2:8,2 0/1:.:24:18,6:7,5:11,1 | |
| 25706 chr22 33978255 . T A . PASS DP=43;SS=1;SSC=3;GPV=0.00010032;SPV=0.40401 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:16,5:10,2:6,3 0/1:.:22:15,7:11,1:4,6 | |
| 25707 chr22 33978446 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=4;GPV=3.2512e-15;SPV=0.32182 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:10,14:12,9 0/1:.:25:10,15:7,8:3,7 | |
| 25708 chr22 33979627 . T G . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=1.1404e-14;SPV=0.75874 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:15,22:6,11:9,11 0/1:.:26:12,14:3,5:9,9 | |
| 25709 chr22 33979718 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=4.1337e-13;SPV=0.76194 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:10,8:8,13 0/1:.:25:13,12:6,5:7,7 | |
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| 25711 chr22 33982023 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=1.5381e-13;SPV=0.70159 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:8,11:12,12 0/1:.:22:11,11:8,5:3,6 | |
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| 25767 chr22 34040126 . G T . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=9.8751e-14;SPV=0.99702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:5,21:3,9:2,12 0/1:.:23:12,11:10,8:2,3 | |
| 25768 chr22 34040806 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=3;GPV=5.635e-11;SPV=0.44751 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:9,9:8,5:1,4 0/1:.:32:14,18:11,10:3,8 | |
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| 25770 chr22 34045533 . C G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.5805e-15;SPV=0.97199 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:18,28:7,13:11,15 0/1:.:27:16,11:7,4:9,7 | |
| 25771 chr22 34046274 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=3;GPV=8.2728e-11;SPV=0.43547 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:9,7:7,8 0/1:.:22:10,12:3,7:7,5 | |
| 25772 chr22 34046632 . C G . PASS DP=68;SS=1;SSC=3;GPV=7.3738e-16;SPV=0.41711 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:10,10:5,8 0/1:.:35:14,21:8,11:6,10 | |
| 25773 chr22 34047317 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=1.768e-06;SPV=0.40648 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:23,9:15,4:8,5 0/1:.:23:15,8:4,2:11,6 | |
| 25774 chr22 34048376 . C G . PASS DP=66;SS=1;SSC=5;GPV=5.2318e-13;SPV=0.31014 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:7,9:9,4 0/1:.:37:17,20:6,11:11,9 | |
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| 25826 chr22 34100046 . C A . PASS DP=66;SS=1;SSC=5;GPV=1.7439e-13;SPV=0.31388 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:14,11:3,4 0/1:.:34:15,19:12,13:3,6 | |
| 25827 chr22 34103036 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=4;GPV=1.3287e-16;SPV=0.36802 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:8,12:10,9 0/1:.:33:13,20:6,14:7,6 | |
| 25828 chr22 34103569 . A C . PASS DP=76;SS=1;SSC=7;GPV=7.7351e-17;SPV=0.19832 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:16,14:6,8 0/1:.:32:12,20:7,9:5,11 | |
| 25829 chr22 34104712 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=2.4039e-14;SPV=0.57432 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:8,9:10,11 0/1:.:30:14,16:9,10:5,6 | |
| 25830 chr22 34107070 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=2.4039e-14;SPV=0.82443 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:10,9:6,12 0/1:.:31:16,15:8,8:8,7 | |
| 25831 chr22 34108875 . C T . PASS DP=53;SS=1;SSC=1;GPV=7.091e-10;SPV=0.6411 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:12,11:8,6:4,5 0/1:.:30:16,14:8,6:8,8 | |
| 25832 chr22 34109914 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=5.8009e-12;SPV=0.47596 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:13,9:8,7 0/1:.:32:17,15:5,11:12,4 | |
| 25833 chr22 34114644 . C G . PASS DP=55;SS=1;SSC=6;GPV=1.0345e-10;SPV=0.22156 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:11,7:8,4:3,3 0/1:.:37:17,20:3,14:14,6 | |
| 25834 chr22 34114926 . T A . PASS DP=51;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.032935 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:16,8:9,4:7,4 0/1:.:27:10,17:5,6:5,11 | |
| 25835 chr22 34117019 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=5;GPV=8.9089e-11;SPV=0.26015 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:20,12:7,5:13,7 0/1:.:33:17,16:9,4:8,12 | |
| 25836 chr22 34117788 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=8;GPV=4.9329e-10;SPV=0.14758 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:18,9:14,7:4,2 0/1:.:34:17,17:10,9:7,8 | |
| 25837 chr22 34118527 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,9:0,18 1/1:.:28:0,28:0,9:0,19 | |
| 25838 chr22 34118821 . A C . PASS DP=45;SS=1;SSC=2;GPV=8.3984e-11;SPV=0.52318 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:8,10:5,3:3,7 0/1:.:27:11,16:3,8:8,8 | |
| 25839 chr22 34120305 . T G . PASS DP=49;SS=1;SSC=3;GPV=1.1173e-08;SPV=0.49375 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:11,8:5,2:6,6 0/1:.:30:16,14:10,3:6,11 | |
| 25840 chr22 34120562 . C T . PASS DP=38;SS=1;SSC=12;GPV=9.0682e-10;SPV=0.057935 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:7,4:3,3:4,1 0/1:.:27:8,19:6,10:2,9 | |
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| 25893 chr22 34183382 . C A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 1/1:.:37:0,37:0,13:0,24 | |
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| 25897 chr22 34189365 . T A . PASS DP=44;SS=1;SSC=3;GPV=5.7286e-08;SPV=0.42186 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:8,6:7,5 0/1:.:18:9,9:4,7:5,2 | |
| 25898 chr22 34189666 . G A . PASS DP=46;SS=1;SSC=4;GPV=8.7676e-12;SPV=0.33267 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:11,14:3,10:8,4 0/1:.:21:7,14:5,7:2,7 | |
| 25899 chr22 34189863 . G C . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0345e-10;SPV=0.93382 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:13,17:5,12:8,5 0/1:.:25:15,10:7,6:8,4 | |
| 25900 chr22 34190213 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=5;GPV=1.2122e-15;SPV=0.29197 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:9,8:8,13 0/1:.:26:9,17:6,10:3,7 | |
| 25901 chr22 34190492 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 | |
| 25902 chr22 34190613 . C A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=5.1348e-09;SPV=0.99383 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:10,15:5,8:5,7 0/1:.:27:19,8:10,5:9,3 | |
| 25903 chr22 34191054 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=3;GPV=5.2124e-10;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:15,14:4,7:11,7 0/1:.:21:10,11:8,7:2,4 | |
| 25904 chr22 34191167 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=3.7578e-08;SPV=0.95556 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:13,13:5,5:8,8 0/1:.:26:18,8:13,7:5,1 | |
| 25905 chr22 34191560 . G A . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,12:0,11 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 | |
| 25906 chr22 34191570 . T A . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 1/1:.:24:0,24:0,10:0,14 | |
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| 25908 chr22 34192338 . A C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 | |
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| 25959 chr22 34207244 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.0284e-10;SPV=0.96721 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:10,10:12,11 0/1:.:24:17,7:10,3:7,4 | |
| 25960 chr22 34207332 . A T . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=1.7439e-13;SPV=0.39069 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:13,9:6,9 0/1:.:29:13,16:7,9:6,7 | |
| 25961 chr22 34207999 . G T . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,19:0,7 1/1:.:23:0,23:0,10:0,13 | |
| 25962 chr22 34208264 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=2.2536e-12;SPV=0.83658 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:13,12:5,6 0/1:.:34:20,14:11,7:9,7 | |
| 25963 chr22 34208272 . A T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,23:0,13 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 25964 chr22 34209122 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=4;GPV=1.1316e-19;SPV=0.35989 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,15:0,6:0,9 0/1:.:32:2,21:0,8:2,13 | |
| 25965 chr22 34209174 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,10:0,17 1/1:.:35:0,35:0,13:0,22 | |
| 25966 chr22 34209345 . G T . PASS DP=69;SS=1;SSC=8;GPV=4.6119e-19;SPV=0.15846 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:5,13:10,8 0/1:.:33:9,24:2,11:7,13 | |
| 25967 chr22 34209968 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=1.5211e-10;SPV=0.82263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:8,8:7,7 0/1:.:29:17,12:8,6:9,6 | |
| 25968 chr22 34210310 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=1.4766e-14;SPV=0.63902 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:10,6:7,12 0/1:.:38:19,19:6,9:13,10 | |
| 25969 chr22 34210850 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=4.3451e-09;SPV=0.94183 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:8,7:6,9 0/1:.:20:13,7:7,4:6,3 | |
| 25970 chr22 34211724 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=2.2975e-07;SPV=0.96872 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:8,9:2,6:6,3 0/1:.:33:23,10:12,5:11,5 | |
| 25971 chr22 34212428 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
| 25972 chr22 34212523 . A C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=3.4211e-15;SPV=0.96321 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:9,20:5,11:4,9 0/1:.:34:17,17:10,12:7,5 | |
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| 26036 chr22 34246541 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 1/1:.:26:0,26:0,19:0,7 | |
| 26037 chr22 34246732 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 | |
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| 26093 chr22 34313455 . T A . PASS DP=74;SS=1;SSC=4;GPV=5.5248e-15;SPV=0.31878 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:11,9:9,9 0/1:.:36:16,20:7,10:9,10 | |
| 26094 chr22 34313631 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=7.4725e-14;SPV=0.65583 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:11,15:8,8:3,7 0/1:.:34:15,19:5,12:10,7 | |
| 26095 chr22 34313945 . G T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 26096 chr22 34314014 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=1.0137e-17;SPV=0.87327 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:15,24:10,13:5,11 0/1:.:39:19,20:8,14:11,6 | |
| 26097 chr22 34314262 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 26098 chr22 34315131 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=3.2974e-08;SPV=0.79215 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:13,11:7,6:6,5 0/1:.:26:16,10:7,9:9,1 | |
| 26099 chr22 34315569 . C A . PASS DP=55;SS=1;SSC=4;GPV=1.0345e-10;SPV=0.34219 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:15,12:10,6:5,6 0/1:.:28:13,15:10,8:3,7 | |
| 26100 chr22 34316328 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.044051 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:29,17:17,5:12,12 0/1:.:36:15,21:9,8:6,13 | |
| 26101 chr22 34317252 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 1/1:.:38:0,38:0,26:0,12 | |
| 26102 chr22 34318171 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=3;GPV=1.9611e-10;SPV=0.44111 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:6,9:8,4 0/1:.:24:11,13:11,7:0,6 | |
| 26103 chr22 34319424 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=1.9669e-13;SPV=0.54785 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:12,12:5,5 0/1:.:33:16,17:9,6:7,11 | |
| 26104 chr22 34319890 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=6;GPV=3.3933e-17;SPV=0.22248 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:16,22:11,8:5,14 0/1:.:27:8,19:4,12:4,7 | |
| 26105 chr22 34319907 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,23:0,21 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 26106 chr22 34320509 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=12;GPV=7.8903e-14;SPV=0.059224 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:30,18:17,8:13,10 0/1:.:31:13,18:9,6:4,12 | |
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| 26108 chr22 34321269 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=5;GPV=7.8163e-15;SPV=0.28822 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:26,22:18,9:8,13 0/1:.:29:13,16:8,9:5,7 | |
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| 26154 chr22 34354883 . C A . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=9.2302e-10;SPV=0.89712 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:12,13:4,8:8,5 0/1:.:31:19,12:7,9:12,3 | |
| 26155 chr22 34357283 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=4.0316e-12;SPV=0.72359 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:6,11:9,4 0/1:.:35:19,16:11,6:8,10 | |
| 26156 chr22 34358206 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=3.195e-13;SPV=0.86285 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:11,16:5,9:6,7 0/1:.:35:18,17:10,8:8,9 | |
| 26157 chr22 34358255 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=1.374e-15;SPV=0.54722 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:8,4:6,12 0/1:.:42:19,23:9,9:10,14 | |
| 26158 chr22 34358487 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=8.7106e-13;SPV=0.99754 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:15,23:6,13:9,10 0/1:.:33:23,10:10,4:13,6 | |
| 26159 chr22 34358627 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=1.2435e-09;SPV=0.77093 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:8,6:8,7 0/1:.:31:19,12:7,4:12,8 | |
| 26160 chr22 34358869 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=9.5854e-11;SPV=0.81702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:12,11:8,6 0/1:.:29:18,11:11,8:7,3 | |
| 26161 chr22 34359013 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=1.5211e-10;SPV=0.92658 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:10,9:4,7 0/1:.:29:18,11:13,6:5,5 | |
| 26162 chr22 34359169 . G T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=3.3502e-13;SPV=0.95403 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:6,7:11,14 0/1:.:34:21,13:7,6:14,7 | |
| 26163 chr22 34359436 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=2.0466e-12;SPV=0.99414 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:9,19:2,11:7,8 0/1:.:31:19,12:9,9:10,3 | |
| 26164 chr22 34359844 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=7;GPV=2.068e-13;SPV=0.17508 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:11,9:6,3:5,6 0/1:.:39:15,24:8,12:7,12 | |
| 26165 chr22 34359906 . T A . PASS DP=62;SS=1;SSC=11;GPV=9.6098e-15;SPV=0.066095 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:4,4:12,10 0/1:.:32:10,22:7,10:3,12 | |
| 26166 chr22 34361776 . T A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=5.693e-13;SPV=0.80178 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:11,16:6,9:5,7 0/1:.:31:15,16:8,6:7,10 | |
| 26167 chr22 34362712 . C A . PASS DP=55;SS=1;SSC=7;GPV=6.4034e-09;SPV=0.18655 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:9,5:10,5 0/1:.:26:13,13:10,8:3,5 | |
| 26168 chr22 34363026 . A C . PASS DP=40;SS=1;SSC=9;GPV=1.5388e-05;SPV=0.11473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:14,4:7,2:7,2 0/1:.:22:12,10:8,4:4,6 | |
| 26169 chr22 34363251 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=6.6743e-16;SPV=0.54299 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:8,13:10,7 0/1:.:37:17,20:9,7:8,13 | |
| 26170 chr22 34363668 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=1;GPV=1.2682e-14;SPV=0.64684 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:11,18:5,9:6,9 0/1:.:28:11,17:6,7:5,10 | |
| 26171 chr22 34363943 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.043506 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:24,15:10,8:14,7 0/1:.:27:10,17:8,12:2,5 | |
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| 26224 chr22 34396316 . T C . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=8.743e-07;SPV=0.91716 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:11,11:3,5:8,6 0/1:.:18:12,6:3,1:9,5 | |
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| 26228 chr22 34399388 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=7.9293e-13;SPV=0.88724 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:8,10:9,9 0/1:.:34:20,14:8,8:12,6 | |
| 26229 chr22 34400718 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=3;GPV=2.098e-14;SPV=0.44054 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:7,12:10,6 0/1:.:32:14,18:8,7:6,11 | |
| 26230 chr22 34401169 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=3;GPV=4.6624e-13;SPV=0.45568 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:15,14:9,6:6,8 0/1:.:36:17,19:10,9:7,10 | |
| 26231 chr22 34402488 . T G . PASS DP=50;SS=1;SSC=6;GPV=5.635e-11;SPV=0.22578 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:11,9:8,4:3,5 0/1:.:30:12,18:9,11:3,7 | |
| 26232 chr22 34402974 . A G . PASS DP=48;SS=1;SSC=3;GPV=1.3341e-10;SPV=0.40423 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:11,11:6,6:5,5 0/1:.:26:11,15:4,9:7,6 | |
| 26233 chr22 34403089 . G A . PASS DP=53;SS=1;SSC=9;GPV=5.5473e-09;SPV=0.12284 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:9,4:10,6 0/1:.:24:11,13:6,11:5,2 | |
| 26234 chr22 34403271 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=4;GPV=2.4512e-10;SPV=0.3444 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:6,10:10,3 0/1:.:24:11,13:7,5:4,8 | |
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| 26236 chr22 34404799 . G T . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=8.1588e-16;SPV=0.69064 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:10,17:4,11:6,6 0/1:.:35:14,21:6,7:8,14 | |
| 26237 chr22 34405307 . G C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.0507e-11;SPV=0.99761 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:13,21:5,11:8,10 0/1:.:30:21,9:13,5:8,4 | |
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| 26293 chr22 34435372 . T G . PASS DP=57;SS=1;SSC=5;GPV=1.4887e-13;SPV=0.29019 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:10,11:5,6 0/1:.:25:9,16:1,8:8,8 | |
| 26294 chr22 34435543 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=1.0404e-13;SPV=0.64563 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:11,8:9,12 0/1:.:31:16,15:11,6:5,9 | |
| 26295 chr22 34437034 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=7;GPV=3.5017e-13;SPV=0.17162 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:8,5:8,12 0/1:.:22:7,15:4,5:3,10 | |
| 26296 chr22 34437578 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=3.6641e-16;SPV=0.77466 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:14,12:6,12 0/1:.:35:18,17:8,8:10,9 | |
| 26297 chr22 34438708 . A G . PASS DP=40;SS=1;SSC=3;GPV=1.2997e-08;SPV=0.46116 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:13,13:8,8:5,5 0/1:.:14:6,8:6,3:0,5 | |
| 26298 chr22 34439241 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=2;GPV=1.5502e-15;SPV=0.58327 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:10,14:10,5 0/1:.:43:22,21:15,12:7,9 | |
| 26299 chr22 34439961 . G A . PASS DP=53;SS=1;SSC=3;GPV=5.5473e-09;SPV=0.42358 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:15,10:9,6:6,4 0/1:.:28:15,13:9,7:6,6 | |
| 26300 chr22 34440444 . T G . PASS DP=60;SS=1;SSC=4;GPV=4.5813e-10;SPV=0.39739 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:18,12:10,5:8,7 0/1:.:30:16,14:4,10:12,4 | |
| 26301 chr22 34441636 . G C . PASS DP=38;SS=1;SSC=5;GPV=3.0605e-09;SPV=0.30545 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:8,8:5,3:3,5 0/1:.:22:8,14:4,5:4,9 | |
| 26302 chr22 34442212 . G T . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=5.635e-11;SPV=0.89314 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:8,13:5,5:3,8 0/1:.:29:15,14:9,9:6,5 | |
| 26303 chr22 34442978 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=1.8765e-12;SPV=0.62776 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:11,10:3,4:8,6 0/1:.:47:25,22:9,10:16,12 | |
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| 26352 chr22 34473579 . C A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.3907e-10;SPV=0.9323 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:9,12:6,9:3,3 0/1:.:37:22,15:11,7:11,8 | |
| 26353 chr22 34473957 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=6.4299e-17;SPV=0.84363 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:10,19:3,9:7,10 0/1:.:39:17,22:7,7:10,15 | |
| 26354 chr22 34475750 . G T . PASS DP=58;SS=1;SSC=4;GPV=1.0786e-09;SPV=0.32551 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:15,9:5,6:10,3 0/1:.:34:18,16:8,8:10,8 | |
| 26355 chr22 34476214 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=3.1469e-07;SPV=0.53542 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:23,11:12,5:11,6 0/1:.:23:15,8:6,4:9,4 | |
| 26356 chr22 34476814 . T C . PASS DP=47;SS=1;SSC=7;GPV=7.2254e-08;SPV=0.17678 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:17,9:9,3:8,6 0/1:.:21:10,11:7,4:3,7 | |
| 26357 chr22 34477604 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 26358 chr22 34477671 . A T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=4.1537e-13;SPV=0.85694 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:8,14:5,6:3,8 0/1:.:34:16,18:12,12:4,6 | |
| 26359 chr22 34478109 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.6893e-16;SPV=0.94836 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:9,18:5,10:4,8 0/1:.:44:22,22:8,11:14,11 | |
| 26360 chr22 34479239 . A G . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,6:0,8 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 | |
| 26361 chr22 34479649 . A G . PASS DP=52;SS=1;SSC=22;GPV=1;SPV=0.0053259 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:17,4:10,1:7,3 0/1:.:31:13,18:5,9:8,9 | |
| 26362 chr22 34479725 . C T . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=3.1919e-07;SPV=0.93772 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:8,10:4,7:4,3 0/1:.:22:14,8:9,1:5,7 | |
| 26363 chr22 34479799 . G A . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,16:0,9 1/1:.:23:0,23:0,12:0,11 | |
| 26364 chr22 34479951 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=1;GPV=3.4899e-11;SPV=0.68857 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:8,9:3,6:5,3 0/1:.:38:19,19:8,9:11,10 | |
| 26365 chr22 34480816 . A G . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,10:0,8 1/1:.:27:0,27:0,17:0,10 | |
| 26366 chr22 34483069 . A C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=2.4512e-10;SPV=0.99073 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:8,15:4,8:4,7 0/1:.:30:19,11:12,6:7,5 | |
| 26367 chr22 34483988 . A G . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=1.4508e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,11:0,5:0,6 1/1:.:27:0,27:0,10:0,17 | |
| 26368 chr22 34485164 . A G . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,11:0,10 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 26369 chr22 34485425 . A G . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,11:0,8 1/1:.:28:0,28:0,12:0,16 | |
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| 26423 chr22 34519555 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=4;GPV=1.3489e-13;SPV=0.32425 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:15,14:9,7:6,7 0/1:.:35:15,20:4,12:11,8 | |
| 26424 chr22 34520673 . A C . PASS DP=49;SS=1;SSC=1;GPV=4.8824e-11;SPV=0.64045 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:12,15:6,6:6,9 0/1:.:22:10,12:9,4:1,8 | |
| 26425 chr22 34526895 . G A . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=8.2514e-08;SPV=0.99514 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:4,11:2,4:2,7 0/1:.:22:14,8:5,4:9,4 | |
| 26426 chr22 34527447 . A C . PASS DP=37;SS=1;SSC=1;GPV=8.2514e-08;SPV=0.72896 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:5,6:2,2:3,4 0/1:.:26:13,13:8,10:5,3 | |
| 26427 chr22 34527865 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=3;GPV=3.0926e-11;SPV=0.41388 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:11,10:8,9:3,1 0/1:.:33:15,18:6,6:9,12 | |
| 26428 chr22 34535272 . T C . PASS DP=48;SS=1;SSC=6;GPV=2.8521e-08;SPV=0.23981 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:18,11:11,3:7,8 0/1:.:19:9,10:5,6:4,4 | |
| 26429 chr22 34535844 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=4;GPV=2.0619e-14;SPV=0.34188 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:27,23:12,10:15,13 0/1:.:26:12,14:9,7:3,7 | |
| 26430 chr22 34536386 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=5;GPV=3.5017e-13;SPV=0.30075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:5,10:9,6 0/1:.:25:9,16:6,9:3,7 | |
| 26431 chr22 34538356 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=5;GPV=2.7907e-15;SPV=0.29971 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:10,14:3,8:7,6 0/1:.:32:10,22:5,9:5,13 | |
| 26432 chr22 34540241 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=2.1774e-09;SPV=0.84381 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:12,12:6,3:6,9 0/1:.:30:18,12:13,4:5,8 | |
| 26433 chr22 34541284 . A T . PASS DP=60;SS=1;SSC=8;GPV=3.316e-09;SPV=0.15823 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:21,10:8,4:13,6 0/1:.:29:15,14:6,4:9,10 | |
| 26434 chr22 34541730 . C G . PASS DP=60;SS=1;SSC=2;GPV=1.6571e-10;SPV=0.52047 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:9,9:9,5 0/1:.:28:15,13:13,9:2,4 | |
| 26435 chr22 34542119 . T C . PASS DP=49;SS=1;SSC=2;GPV=3.0726e-08;SPV=0.58134 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:6,4:9,7 0/1:.:23:13,10:7,6:6,4 | |
| 26436 chr22 34542511 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=9.2779e-11;SPV=0.86187 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:12,15:6,8:6,7 0/1:.:27:15,12:9,4:6,8 | |
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| 26438 chr22 34544090 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=5.3252e-12;SPV=0.71146 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:13,12:7,4:6,8 0/1:.:43:24,19:13,10:11,9 | |
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| 26493 chr22 34747910 . C A . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,10:0,8 1/1:.:30:0,30:0,21:0,9 | |
| 26494 chr22 34747999 . G A . PASS DP=45;SS=1;SSC=1;GPV=6.2178e-08;SPV=0.72079 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:9,8:4,2:5,6 0/1:.:28:16,12:11,4:5,8 | |
| 26495 chr22 34748420 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=5.2124e-10;SPV=0.96412 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:6,11:2,4:4,7 0/1:.:33:19,14:8,8:11,6 | |
| 26496 chr22 34749580 . G C . PASS DP=30;SS=1;SSC=0;GPV=8.4556e-18;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,7:0,7 1/1:.:16:0,16:0,7:0,9 | |
| 26497 chr22 34749740 . A G . PASS DP=49;SS=1;SSC=6;GPV=1.1173e-08;SPV=0.2321 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:15,9:7,7:8,2 0/1:.:25:12,13:8,5:4,8 | |
| 26498 chr22 34753499 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 1/1:.:36:0,36:0,24:0,12 | |
| 26499 chr22 34755215 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=6.6365e-15;SPV=0.68441 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:4,13:13,9 0/1:.:28:13,15:8,7:5,8 | |
| 26500 chr22 34756605 . T C . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,9:0,6 1/1:.:32:0,32:0,22:0,10 | |
| 26501 chr22 34757668 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=2;GPV=1.0345e-10;SPV=0.53314 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:8,7:6,3:2,4 0/1:.:40:20,20:9,7:11,13 | |
| 26502 chr22 34758092 . C A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.1519e-11;SPV=0.83658 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:11,12:5,6:6,6 0/1:.:42:24,18:14,7:10,11 | |
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| 26504 chr22 34759101 . A T . PASS DP=54;SS=1;SSC=4;GPV=2.7171e-10;SPV=0.35647 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:11,8:5,3:6,5 0/1:.:35:17,18:6,8:11,10 | |
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| 26562 chr22 34792803 . C T . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=5.7269e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:16:0,16:0,12:0,4 1/1:.:21:0,21:0,13:0,8 | |
| 26563 chr22 34792884 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,8:0,6 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 | |
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| 26566 chr22 34793409 . G A . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,11:0,6 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
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| 26625 chr22 34809694 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 | |
| 26626 chr22 34809849 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=3;GPV=1.6784e-14;SPV=0.45208 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:16,6:8,12 0/1:.:43:23,20:8,9:15,11 | |
| 26627 chr22 34810274 . T A . PASS DP=67;SS=1;SSC=4;GPV=1.3693e-11;SPV=0.38003 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:11,9:10,6 0/1:.:31:16,15:12,6:4,9 | |
| 26628 chr22 34810881 . A C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,10:0,15 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 | |
| 26629 chr22 34811185 . T C . PASS DP=36;SS=1;SSC=1;GPV=2.1194e-09;SPV=0.74444 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:5,9:2,5:3,4 0/1:.:22:9,13:3,7:6,6 | |
| 26630 chr22 34811288 . A G . PASS DP=26;SS=1;SSC=0;GPV=5.4125e-06;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,3:0,2:0,1 1/1:.:13:0,7:0,6:0,1 | |
| 26631 chr22 34812180 . A T . PASS DP=58;SS=1;SSC=19;GPV=1;SPV=0.010339 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:19,6:12,2:7,4 0/1:.:33:14,19:8,6:6,13 | |
| 26632 chr22 34812543 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 1/1:.:23:0,23:0,14:0,9 | |
| 26633 chr22 34812617 . G T . PASS DP=48;SS=1;SSC=2;GPV=1.2355e-09;SPV=0.61338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:12,12:10,4:2,8 0/1:.:24:12,12:5,7:7,5 | |
| 26634 chr22 34813145 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 1/1:.:24:0,24:0,14:0,10 | |
| 26635 chr22 34813532 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 26636 chr22 34814417 . C A . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=1.1052e-12;SPV=0.45654 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:5,7:9,6 0/1:.:36:17,19:8,7:9,12 | |
| 26637 chr22 34814425 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=2.2597e-11;SPV=0.61778 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:12,11:6,4:6,7 0/1:.:38:20,18:6,9:14,9 | |
| 26638 chr22 34814723 . G A . PASS DP=47;SS=1;SSC=2;GPV=2.6363e-08;SPV=0.52792 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:12,9:6,5:6,4 0/1:.:26:14,12:5,8:9,4 | |
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| 26640 chr22 34815285 . G T . PASS DP=51;SS=1;SSC=2;GPV=1.9611e-10;SPV=0.5689 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:10,10:3,3:7,7 0/1:.:31:15,16:5,6:10,10 | |
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| 26693 chr22 34830680 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=4.5813e-10;SPV=0.74172 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:14,12:7,5:7,7 0/1:.:34:20,14:8,8:12,6 | |
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| 26695 chr22 34831079 . C A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 1/1:.:21:0,21:0,13:0,8 | |
| 26696 chr22 34831217 . T C . PASS DP=35;SS=1;SSC=0;GPV=4.7526e-13;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,13:0,10:0,3 0/1:.:17:0,9:0,8:0,1 | |
| 26697 chr22 34831341 . G T . PASS DP=26;SS=1;SSC=1;GPV=4.6796e-05;SPV=0.67591 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:8,7:7,4:1,3 0/1:.:11:6,5:5,2:1,3 | |
| 26698 chr22 34831997 . C T . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=9.761e-10;SPV=0.81189 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:10,13:4,4:6,9 0/1:.:23:12,11:6,7:6,4 | |
| 26699 chr22 34832181 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=10;GPV=9.2779e-11;SPV=0.086393 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:17,11:13,8:4,3 0/1:.:26:10,16:5,10:5,6 | |
| 26700 chr22 34832302 . C G . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 26701 chr22 34832744 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 26702 chr22 34832795 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 26703 chr22 34832887 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=1.5567e-13;SPV=0.62019 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:13,11:13,12 0/1:.:26:14,12:10,4:4,8 | |
| 26704 chr22 34833090 . T G . PASS DP=56;SS=1;SSC=4;GPV=4.2444e-12;SPV=0.39454 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:8,5:6,9 0/1:.:28:12,16:5,7:7,9 | |
| 26705 chr22 34833236 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=8.8612e-15;SPV=0.69638 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:9,10:9,12 0/1:.:29:14,15:5,12:9,3 | |
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| 26707 chr22 34833838 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=7.6926e-15;SPV=0.70194 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:4,7:10,11 0/1:.:36:17,19:5,9:12,10 | |
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| 26762 chr22 34872150 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 1/1:.:30:0,30:0,18:0,12 | |
| 26763 chr22 34875610 . T A . PASS DP=68;SS=1;SSC=7;GPV=1.8765e-12;SPV=0.1814 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:8,12:15,4 0/1:.:29:13,16:9,9:4,7 | |
| 26764 chr22 34878308 . G T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
| 26765 chr22 34879532 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 26766 chr22 34880793 . C G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,19:0,9 1/1:.:48:0,48:0,25:0,23 | |
| 26767 chr22 34881047 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 1/1:.:28:0,28:0,12:0,16 | |
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| 26770 chr22 34881756 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 26771 chr22 34882112 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 | |
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| 26831 chr22 34920292 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 1/1:.:27:0,27:0,8:0,19 | |
| 26832 chr22 34920459 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.0507e-11;SPV=0.92314 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:10,12:9,9 0/1:.:24:15,9:10,5:5,4 | |
| 26833 chr22 34922743 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=3.6448e-13;SPV=0.33647 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:12,6:6,11 0/1:.:28:12,16:4,9:8,7 | |
| 26834 chr22 34926653 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=4.4405e-12;SPV=0.9149 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:9,13:10,8 0/1:.:26:16,10:9,7:7,3 | |
| 26835 chr22 34926834 . G A . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=8.3984e-11;SPV=0.84975 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:12,19:10,13:2,6 0/1:.:14:7,7:3,5:4,2 | |
| 26836 chr22 34929354 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=4;GPV=5.2028e-13;SPV=0.38968 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:29,21:21,15:8,6 0/1:.:27:14,13:8,7:6,6 | |
| 26837 chr22 34929536 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=4.0755e-15;SPV=0.76004 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:15,14:12,13 0/1:.:27:15,12:8,9:7,3 | |
| 26838 chr22 34931371 . C A . PASS DP=59;SS=1;SSC=3;GPV=5.349e-11;SPV=0.45594 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:8,8:9,6 0/1:.:28:14,14:8,8:6,6 | |
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| 26840 chr22 34931783 . A C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 | |
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| 26891 chr22 34946728 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
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| 26894 chr22 34947368 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
| 26895 chr22 34947634 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=5.857e-18;SPV=0.98417 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:16,29:9,19:7,10 0/1:.:37:21,16:7,6:14,10 | |
| 26896 chr22 34948328 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 | |
| 26897 chr22 34948669 . T A . PASS DP=65;SS=1;SSC=5;GPV=4.6624e-13;SPV=0.26015 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:9,7:11,10 0/1:.:28:12,16:6,9:6,7 | |
| 26898 chr22 34948731 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=7.7752e-12;SPV=0.66561 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:10,12:9,7 0/1:.:23:12,11:6,6:6,5 | |
| 26899 chr22 34950266 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=8.6008e-14;SPV=0.85058 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:8,11:10,7 0/1:.:44:26,18:14,6:12,12 | |
| 26900 chr22 34951143 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 | |
| 26901 chr22 34951371 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=1.3489e-13;SPV=0.61089 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:10,8:4,8 0/1:.:34:16,18:7,9:9,9 | |
| 26902 chr22 34951673 . G T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,16:0,8 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 | |
| 26903 chr22 34951745 . A C . PASS DP=64;SS=1;SSC=7;GPV=4.3049e-14;SPV=0.18979 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:14,12:7,8:7,4 0/1:.:38:15,23:6,16:9,7 | |
| 26904 chr22 34952096 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=8.637e-13;SPV=0.59031 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:11,12:6,5:5,7 0/1:.:38:18,20:8,9:10,11 | |
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| 26957 chr22 35001303 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=5;GPV=1.2401e-12;SPV=0.30865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:5,9:12,5 0/1:.:33:15,18:8,3:7,15 | |
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| 26961 chr22 35003625 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=3.5019e-16;SPV=0.99321 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:9,25:3,12:6,13 0/1:.:30:16,14:9,8:7,6 | |
| 26962 chr22 35004295 . A C . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=2.6864e-14;SPV=0.7716 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:11,17:7,5:4,12 0/1:.:33:15,18:5,11:10,7 | |
| 26963 chr22 35004376 . G T . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=1.6451e-08;SPV=0.97108 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:10,15:1,7:9,8 0/1:.:17:11,6:3,2:8,4 | |
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| 26965 chr22 35004649 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=3;GPV=3.7814e-18;SPV=0.44015 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:10,12:13,12 0/1:.:40:18,22:7,9:11,13 | |
| 26966 chr22 35004794 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=9;GPV=8.9568e-18;SPV=0.10765 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:30,27:13,16:17,11 0/1:.:28:10,18:4,9:6,9 | |
| 26967 chr22 35005423 . C A . PASS DP=86;SS=1;SSC=6;GPV=6.5271e-15;SPV=0.22515 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:6,8:17,7 0/1:.:48:24,24:12,12:12,12 | |
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| 26969 chr22 35008043 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=3;GPV=8.3706e-15;SPV=0.40936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:15,17:13,3 0/1:.:41:22,19:9,8:13,11 | |
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| 27028 chr22 35055959 . C G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 1/1:.:23:0,23:0,15:0,8 | |
| 27029 chr22 35056239 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=2.2528e-17;SPV=0.46857 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:12,17:9,12:3,5 0/1:.:40:15,25:6,18:9,7 | |
| 27030 chr22 35057270 . A C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=2.95e-15;SPV=0.87327 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:8,12:12,12 0/1:.:34:19,15:10,9:9,6 | |
| 27031 chr22 35057803 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=3;GPV=4.9467e-16;SPV=0.47381 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:30,24:13,16:17,8 0/1:.:38:20,18:5,10:15,8 | |
| 27032 chr22 35057834 . T C . PASS DP=96;SS=1;SSC=1;GPV=4.1861e-22;SPV=0.74222 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:22,32:14,11:8,21 0/1:.:42:19,23:10,9:9,14 | |
| 27033 chr22 35058471 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=3;GPV=9.1061e-12;SPV=0.42953 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:22,14:9,7:13,7 0/1:.:39:22,17:12,6:10,11 | |
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| 27036 chr22 35059365 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=4.7339e-09;SPV=0.64069 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:5,5:13,10 0/1:.:18:10,8:2,7:8,1 | |
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| 27093 chr22 35091642 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=8;GPV=1.8278e-16;SPV=0.12617 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:8,12:11,5 0/1:.:38:14,24:7,10:7,14 | |
| 27094 chr22 35092124 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=1.5635e-16;SPV=0.52977 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:8,15:9,6 0/1:.:35:15,20:8,10:7,10 | |
| 27095 chr22 35093406 . G C . PASS DP=65;SS=1;SSC=4;GPV=4.0316e-12;SPV=0.34399 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:9,5:8,8 0/1:.:35:17,18:7,11:10,7 | |
| 27096 chr22 35093923 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=4;GPV=2.3224e-12;SPV=0.38029 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:9,7:9,10 0/1:.:25:11,14:8,6:3,8 | |
| 27097 chr22 35094932 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=7.9293e-13;SPV=0.53283 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:9,7:13,12 0/1:.:29:15,14:7,5:8,9 | |
| 27098 chr22 35095304 . G C . PASS DP=66;SS=1;SSC=3;GPV=4.4405e-12;SPV=0.4419 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:7,11:15,7 0/1:.:26:13,13:6,10:7,3 | |
| 27099 chr22 35096320 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=9;GPV=7.7752e-12;SPV=0.11802 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:16,10:11,7:5,3 0/1:.:35:15,20:11,9:4,11 | |
| 27100 chr22 35099315 . A T . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=6.3255e-14;SPV=0.54447 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:13,17:8,11:5,6 0/1:.:29:12,17:5,14:7,3 | |
| 27101 chr22 35099819 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=4.0826e-18;SPV=0.78862 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:10,24:5,13:5,11 0/1:.:28:10,18:3,12:7,6 | |
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| 27103 chr22 35103117 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=1.5567e-13;SPV=0.77612 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:7,4:10,13 0/1:.:41:23,18:13,5:10,13 | |
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| 27131 chr22 35121397 . T C . PASS DP=55;SS=1;SSC=4;GPV=3.4899e-11;SPV=0.33303 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:11,8:6,7 0/1:.:23:10,13:2,9:8,4 | |
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| 27151 chr22 35132213 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 27152 chr22 35133148 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=1.5824e-16;SPV=0.87718 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:11,15:11,9 0/1:.:45:26,19:15,10:11,9 | |
| 27153 chr22 35135401 . T G . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=1.5635e-16;SPV=0.56709 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:9,10:10,14 0/1:.:30:13,17:6,8:7,9 | |
| 27154 chr22 35135619 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=5.9795e-14;SPV=0.95252 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:9,18:10,5 0/1:.:34:21,13:11,8:10,5 | |
| 27155 chr22 35135705 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=2.7171e-10;SPV=0.87013 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:7,8:7,8 0/1:.:24:14,10:7,4:7,6 | |
| 27156 chr22 35136352 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=4;GPV=4.8851e-14;SPV=0.33087 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:13,9:10,10 0/1:.:32:15,17:8,7:7,10 | |
| 27157 chr22 35136741 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=4.8769e-15;SPV=0.70757 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:12,13:7,9 0/1:.:32:16,16:8,10:8,6 | |
| 27158 chr22 35137415 . T G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 1/1:.:36:0,36:0,15:0,21 | |
| 27159 chr22 35137627 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 1/1:.:37:0,37:0,23:0,14 | |
| 27160 chr22 35138137 . G T . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=4.0316e-12;SPV=0.68628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:10,8:11,12 0/1:.:24:13,11:7,6:6,5 | |
| 27161 chr22 35138579 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.7321e-11;SPV=0.87519 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:10,11:11,8 0/1:.:30:19,11:7,7:12,4 | |
| 27162 chr22 35138940 . G C . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=1.1519e-11;SPV=0.6858 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:11,11:9,7 0/1:.:27:15,12:6,6:9,6 | |
| 27163 chr22 35140387 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
| 27164 chr22 35141479 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 | |
| 27165 chr22 35141693 . T G . PASS DP=86;SS=1;SSC=18;GPV=1;SPV=0.015624 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:9,8:15,10 0/1:.:44:14,30:11,13:3,17 | |
| 27166 chr22 35142705 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,23:0,25 1/1:.:44:0,44:0,25:0,19 | |
| 27167 chr22 35143724 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=1.9669e-13;SPV=0.54251 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:8,14:11,5 0/1:.:29:14,15:9,7:5,8 | |
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| 27169 chr22 35145440 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=2.242e-08;SPV=0.9702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:5,7:11,7 0/1:.:30:22,8:9,1:13,7 | |
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| 27224 chr22 35165403 . T A . PASS DP=88;SS=1;SSC=8;GPV=1.3937e-18;SPV=0.14589 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:14,11:9,9 0/1:.:45:18,27:13,14:5,13 | |
| 27225 chr22 35165677 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,23:0,19 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 27226 chr22 35165733 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=7.7351e-17;SPV=0.77818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:9,15:10,11 0/1:.:31:15,16:7,9:8,7 | |
| 27227 chr22 35165802 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=8;GPV=4.6505e-14;SPV=0.15208 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:26,15:12,8:14,7 0/1:.:44:22,22:12,10:10,12 | |
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| 27230 chr22 35165927 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=8.9788e-17;SPV=0.6851 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:10,16:9,8 0/1:.:34:16,18:9,12:7,6 | |
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| 27233 chr22 35166242 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,16:0,28 1/1:.:42:0,42:0,17:0,25 | |
| 27234 chr22 35166564 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,14:0,22 1/1:.:40:0,40:0,14:0,26 | |
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| 27294 chr22 35181389 . A C . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=9.545e-12;SPV=0.59309 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:10,11:11,8 0/1:.:23:12,11:7,8:5,3 | |
| 27295 chr22 35181391 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 27296 chr22 35181857 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=6;GPV=4.9005e-18;SPV=0.20026 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:29,26:19,13:10,13 0/1:.:34:14,20:8,7:6,13 | |
| 27297 chr22 35181886 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=3.9427e-17;SPV=0.93571 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:15,18:8,11 0/1:.:36:21,15:8,8:13,7 | |
| 27298 chr22 35182111 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,25:0,17 1/1:.:28:0,28:0,20:0,8 | |
| 27299 chr22 35182422 . A T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,25:0,11 1/1:.:30:0,30:0,20:0,10 | |
| 27300 chr22 35182459 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0412e-23;SPV=0.87879 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:1,28:1,16:0,12 1/1:.:26:1,15:1,7:0,8 | |
| 27301 chr22 35183033 . T G . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=3.5019e-16;SPV=0.57945 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:4,11:9,9 0/1:.:31:12,19:1,10:11,9 | |
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| 27303 chr22 35183468 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:20:0,20:0,11:0,9 | |
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| 27350 chr22 35200157 . C T . PASS DP=46;SS=1;SSC=1;GPV=3.1446e-06;SPV=0.77133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:13,8:10,7:3,1 0/1:.:25:17,8:8,2:9,6 | |
| 27351 chr22 35200239 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=3.104e-14;SPV=0.82892 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:11,11:5,9 0/1:.:34:18,16:7,6:11,10 | |
| 27352 chr22 35200318 . A C . PASS DP=51;SS=1;SSC=11;GPV=2.0643e-11;SPV=0.072489 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:6,8:11,6 0/1:.:20:6,14:2,7:4,7 | |
| 27353 chr22 35201033 . C A . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5031e-08;SPV=0.84519 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:11,10:1,2:10,8 0/1:.:32:20,12:6,6:14,6 | |
| 27354 chr22 35201745 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=9;GPV=2.72e-12;SPV=0.10587 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:6,6:11,10 0/1:.:20:6,14:1,9:5,5 | |
| 27355 chr22 35203000 . C A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.4721e-10;SPV=0.87391 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:9,7:9,7 0/1:.:39:26,13:13,7:13,6 | |
| 27356 chr22 35203199 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=4.1212e-16;SPV=0.75563 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:14,13:11,11 0/1:.:41:23,18:10,10:13,8 | |
| 27357 chr22 35203541 . C G . PASS DP=82;SS=1;SSC=20;GPV=1;SPV=0.0081535 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:31,17:16,12:15,5 0/1:.:34:12,22:4,7:8,15 | |
| 27358 chr22 35203789 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.6242e-17;SPV=0.91165 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:17,27:5,9:12,18 0/1:.:31:16,15:6,9:10,6 | |
| 27359 chr22 35204112 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.5381e-13;SPV=0.85395 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:13,13:6,11 0/1:.:22:12,10:6,4:6,6 | |
| 27360 chr22 35204501 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=7.0184e-11;SPV=0.96761 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:12,8:7,13 0/1:.:22:15,7:6,4:9,3 | |
| 27361 chr22 35206589 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=8;GPV=3.594e-10;SPV=0.14483 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:22,14:12,7:10,7 0/1:.:21:9,12:1,6:8,6 | |
| 27362 chr22 35207029 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=5;GPV=1.8496e-17;SPV=0.25337 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:8,8:13,12 0/1:.:41:17,24:11,11:6,13 | |
| 27363 chr22 35207574 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=11;GPV=9.3121e-14;SPV=0.075174 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:6,11:14,2 0/1:.:37:15,22:7,17:8,5 | |
| 27364 chr22 35207843 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=11;GPV=3.7947e-21;SPV=0.077097 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:13,11:10,13 0/1:.:41:13,28:5,8:8,20 | |
| 27365 chr22 35209033 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.032481 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:18,11:6,5:12,6 0/1:.:29:10,19:2,9:8,10 | |
| 27366 chr22 35210118 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=5.2318e-13;SPV=0.84165 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:11,11:7,10 0/1:.:27:15,12:6,9:9,3 | |
| 27367 chr22 35212224 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.034e-13;SPV=0.92834 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:12,7:7,14 0/1:.:34:21,13:12,7:9,6 | |
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| 27421 chr22 35258642 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=2.8926e-12;SPV=0.85908 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:13,12:6,6 0/1:.:36:22,14:15,8:7,6 | |
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| 27424 chr22 35262232 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.045707 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:30,17:18,8:12,9 0/1:.:25:10,15:6,7:4,8 | |
| 27425 chr22 35264882 . G T . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=1.5805e-15;SPV=0.52464 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:5,5:14,16 0/1:.:33:15,18:10,7:5,11 | |
| 27426 chr22 35267530 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=4;GPV=4.8717e-12;SPV=0.38003 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:10,6:11,10 0/1:.:30:15,15:5,8:10,7 | |
| 27427 chr22 35268334 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=6.4956e-13;SPV=0.69138 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:8,5:10,13 0/1:.:32:17,15:8,5:9,10 | |
| 27428 chr22 35268948 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.2435e-09;SPV=0.95238 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:5,7:11,9 0/1:.:28:19,9:13,3:6,6 | |
| 27429 chr22 35270522 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=7.2168e-14;SPV=0.70715 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:13,14:10,7 0/1:.:34:19,15:17,6:2,9 | |
| 27430 chr22 35272786 . T G . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=1.0507e-11;SPV=0.78338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:9,6:8,11 0/1:.:30:17,13:11,6:6,7 | |
| 27431 chr22 35274744 . G C . PASS DP=71;SS=1;SSC=3;GPV=3.3305e-17;SPV=0.46939 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:7,11:10,12 0/1:.:31:12,19:5,7:7,12 | |
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| 27433 chr22 35276519 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=9.3487e-14;SPV=0.77932 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:10,10:11,9 0/1:.:41:24,17:15,10:9,7 | |
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| 27488 chr22 35319123 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=9.653e-15;SPV=0.48012 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:15,12:10,10 0/1:.:32:16,16:8,7:8,9 | |
| 27489 chr22 35320601 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=3;GPV=1.7027e-12;SPV=0.47471 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:8,8:13,10 0/1:.:28:14,14:4,6:10,8 | |
| 27490 chr22 35321253 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=5;GPV=1.2461e-13;SPV=0.30384 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:6,11:11,10 0/1:.:18:6,12:3,7:3,5 | |
| 27491 chr22 35322168 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=7.0292e-13;SPV=0.98784 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:9,9:8,11 0/1:.:44:30,14:13,6:17,8 | |
| 27492 chr22 35325931 . T G . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=1.8524e-14;SPV=0.372 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:13,11:13,12 0/1:.:26:12,14:7,6:5,8 | |
| 27493 chr22 35327838 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,25:0,27 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 | |
| 27494 chr22 35328666 . C A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,25:0,25 1/1:.:25:0,25:0,15:0,10 | |
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| 27498 chr22 35335101 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=6;GPV=4.411e-14;SPV=0.2233 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:7,10:9,9 0/1:.:22:7,15:5,7:2,8 | |
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| 27533 chr22 35358119 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=5.349e-11;SPV=0.89411 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:8,15:8,3 0/1:.:25:15,10:6,5:9,5 | |
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| 27549 chr22 35369182 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=1.6571e-10;SPV=0.48806 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:14,7:8,10 0/1:.:21:11,10:6,7:5,3 | |
| 27550 chr22 35369836 . C G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,23:0,23 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
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| 27553 chr22 35370937 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,28:0,18 1/1:.:24:0,24:0,9:0,15 | |
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| 27557 chr22 35372375 . G T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 27558 chr22 35373035 . C G . PASS DP=54;SS=1;SSC=4;GPV=9.2779e-11;SPV=0.39228 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:10,9:6,5 0/1:.:24:11,13:5,6:6,7 | |
| 27559 chr22 35374475 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,12:0,25 1/1:.:21:0,21:0,8:0,13 | |
| 27560 chr22 35375696 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=1.1558e-14;SPV=0.79564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:5,13:11,7 0/1:.:35:18,17:12,11:6,6 | |
| 27561 chr22 35376664 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.2823e-13;SPV=0.98304 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:11,18:8,7 0/1:.:29:19,10:10,4:9,6 | |
| 27562 chr22 35378038 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=5.88e-11;SPV=0.77586 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:11,10:10,10 0/1:.:19:11,8:9,3:2,5 | |
| 27563 chr22 35379557 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=6;GPV=2.2591e-14;SPV=0.22907 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:7,5:7,10 0/1:.:31:11,20:4,14:7,6 | |
| 27564 chr22 35379696 . T G . PASS DP=38;SS=1;SSC=2;GPV=1.0241e-15;SPV=0.61636 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:3,15:0,11:3,4 1/1:.:20:3,17:2,11:1,6 | |
| 27565 chr22 35379767 . G A . PASS DP=45;SS=1;SSC=1;GPV=7.724e-09;SPV=0.67125 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:11,11:8,2:3,9 0/1:.:23:12,11:5,4:7,7 | |
| 27566 chr22 35379896 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 | |
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| 27568 chr22 35380865 . A G . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=2.4927e-08;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,8:0,3:0,5 1/1:.:22:0,6:0,2:0,4 | |
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| 27616 chr22 35409727 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=2.785e-19;SPV=0.93294 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:18,30:8,12:10,18 0/1:.:37:19,18:7,7:12,11 | |
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| 27618 chr22 35410383 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 | |
| 27619 chr22 35410822 . T C . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=4.11e-18;SPV=0.98369 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:20,28:9,18:11,10 0/1:.:49:30,19:19,9:11,10 | |
| 27620 chr22 35411365 . C G . PASS DP=87;SS=1;SSC=8;GPV=3.5896e-20;SPV=0.12845 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:26,28:14,13:12,15 0/1:.:33:11,22:9,11:2,11 | |
| 27621 chr22 35411479 . A G . PASS DP=105;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,29:0,25 1/1:.:51:0,51:0,29:0,22 | |
| 27622 chr22 35414059 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
| 27623 chr22 35415255 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.3916e-15;SPV=0.64043 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:7,11:17,13 0/1:.:33:17,16:8,6:9,10 | |
| 27624 chr22 35415583 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=4.794e-13;SPV=0.84101 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:13,13:8,7 0/1:.:35:21,14:11,6:10,8 | |
| 27625 chr22 35417165 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=8.0845e-10;SPV=0.95602 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:14,9:10,10 0/1:.:26:19,7:8,2:11,5 | |
| 27626 chr22 35417431 . T A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,26:0,21 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 | |
| 27627 chr22 35418120 . G T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=8.6344e-12;SPV=0.86492 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:6,9:12,11 0/1:.:24:14,10:7,5:7,5 | |
| 27628 chr22 35418670 . A T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,9:0,24 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 | |
| 27629 chr22 35418969 . C G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.4655e-13;SPV=0.9066 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:9,9:5,9 0/1:.:37:21,16:14,8:7,8 | |
| 27630 chr22 35419070 . C A . PASS DP=74;SS=1;SSC=7;GPV=5.5248e-15;SPV=0.17445 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:12,11:9,6 0/1:.:36:15,21:8,12:7,9 | |
| 27631 chr22 35419303 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 27632 chr22 35419887 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=4.8769e-15;SPV=0.78101 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:7,10:12,13 0/1:.:31:16,15:6,6:10,9 | |
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| 27634 chr22 35420269 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=1.0508e-14;SPV=0.92595 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:16,8:7,14 0/1:.:47:30,17:10,8:20,9 | |
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| 27691 chr22 35447308 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,24:0,17 1/1:.:39:0,39:0,16:0,23 | |
| 27692 chr22 35447347 . G C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,19:0,23 1/1:.:45:0,45:0,16:0,29 | |
| 27693 chr22 35447385 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,14:0,25 1/1:.:36:0,36:0,7:0,29 | |
| 27694 chr22 35447493 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,25:0,11 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 | |
| 27695 chr22 35447762 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,17:0,23 1/1:.:26:0,26:0,9:0,17 | |
| 27696 chr22 35448758 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,23:0,14 1/1:.:42:0,42:0,28:0,14 | |
| 27697 chr22 35449551 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
| 27698 chr22 35449560 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=8;GPV=2.3916e-18;SPV=0.14605 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:13,18:7,7:6,11 0/1:.:34:9,25:5,15:4,10 | |
| 27699 chr22 35449590 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=0.0059136;SPV=0.81553 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,4:6,0:10,4 0/1:.:30:18,3:13,1:5,2 | |
| 27700 chr22 35450175 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 | |
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| 27752 chr22 35479534 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=1.1034e-11;SPV=0.57495 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:26,17:13,6:13,11 0/1:.:35:21,14:13,8:8,6 | |
| 27753 chr22 35479622 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=2.5839e-09;SPV=0.42569 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:30,14:18,4:12,10 0/1:.:30:19,11:10,6:9,5 | |
| 27754 chr22 35480254 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=2.3066e-15;SPV=0.94777 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:13,14:10,12 0/1:.:37:23,14:9,8:14,6 | |
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| 27756 chr22 35480668 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=18;GPV=1;SPV=0.012667 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:5,11:14,3 0/1:.:30:8,22:3,9:5,13 | |
| 27757 chr22 35480895 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=2.781e-14;SPV=0.90561 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:13,14:8,9 0/1:.:35:21,14:8,8:13,6 | |
| 27758 chr22 35481618 . C G . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=1.1213e-16;SPV=0.75628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:5,9:8,11 0/1:.:38:17,21:9,9:8,12 | |
| 27759 chr22 35482078 . C G . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.3596e-16;SPV=0.74207 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:9,10:10,13 0/1:.:38:19,19:6,6:13,13 | |
| 27760 chr22 35483265 . A C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,19:0,31 1/1:.:32:0,32:0,8:0,24 | |
| 27761 chr22 35483594 . G A . PASS DP=30;SS=1;SSC=1;GPV=9.7202e-07;SPV=0.76049 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:7,9:3,5:4,4 0/1:.:14:7,7:4,4:3,3 | |
| 27762 chr22 35484616 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,26:0,15 1/1:.:23:0,23:0,14:0,9 | |
| 27763 chr22 35484838 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,21:0,36 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 | |
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| 27765 chr22 35485159 . T G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,26:0,18 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 | |
| 27766 chr22 35485306 . A G . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,23:0,36 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 | |
| 27767 chr22 35485344 . A G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,27:0,27 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 | |
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| 27824 chr22 35509216 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,25:0,21 1/1:.:24:0,24:0,9:0,15 | |
| 27825 chr22 35509497 . T C . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,11:0,17 1/1:.:12:0,12:0,3:0,9 | |
| 27826 chr22 35510088 . G C . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 1/1:.:20:0,20:0,14:0,6 | |
| 27827 chr22 35510388 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=7.0184e-11;SPV=0.96074 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:8,13:10,7 0/1:.:24:16,8:10,3:6,5 | |
| 27828 chr22 35511205 . T C . PASS DP=55;SS=1;SSC=11;GPV=8.49e-10;SPV=0.066182 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:18,9:10,3:8,6 0/1:.:28:12,16:6,11:6,5 | |
| 27829 chr22 35511833 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=7;GPV=1.5381e-13;SPV=0.1909 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:9,10:9,5 0/1:.:32:13,19:5,12:8,7 | |
| 27830 chr22 35511847 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.8851e-14;SPV=0.96855 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:9,12:6,9 0/1:.:38:23,15:15,8:8,7 | |
| 27831 chr22 35512881 . T A . PASS DP=51;SS=1;SSC=3;GPV=6.451e-11;SPV=0.49243 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:9,9:5,3:4,6 0/1:.:33:15,18:7,13:8,5 | |
| 27832 chr22 35516422 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 | |
| 27833 chr22 35516500 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=1.5211e-10;SPV=0.50474 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:11,11:9,5 0/1:.:23:12,11:5,5:7,6 | |
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| 27892 chr22 35554178 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=2.1212e-20;SPV=0.91794 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:21,33:8,13:13,20 0/1:.:37:19,18:9,11:10,7 | |
| 27893 chr22 35554601 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=12;GPV=2.1366e-11;SPV=0.05326 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:32,16:19,8:13,8 0/1:.:25:11,14:6,8:5,6 | |
| 27894 chr22 35554805 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=1.5567e-13;SPV=0.32281 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:11,8:15,12 0/1:.:29:14,15:5,10:9,5 | |
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| 27898 chr22 35556556 . A C . PASS DP=84;SS=1;SSC=7;GPV=1.1819e-13;SPV=0.18052 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:26,15:15,10:11,5 0/1:.:43:22,21:13,11:9,10 | |
| 27899 chr22 35559335 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=3.6826e-13;SPV=0.74635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:10,15:11,5 0/1:.:32:18,14:10,5:8,9 | |
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| 27953 chr22 35587276 . C G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=2.2152e-16;SPV=0.81191 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:13,15:10,11 0/1:.:35:19,16:9,12:10,4 | |
| 27954 chr22 35589027 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 27955 chr22 35589118 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.5635e-16;SPV=0.95571 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:14,25:6,11:8,14 0/1:.:34:18,16:10,10:8,6 | |
| 27956 chr22 35590590 . C A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,19:0,23 1/1:.:35:0,35:0,12:0,23 | |
| 27957 chr22 35592556 . C T . PASS DP=112;SS=1;SSC=3;GPV=1.3759e-22;SPV=0.48113 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:31,32:19,22:12,10 0/1:.:49:23,26:8,17:15,9 | |
| 27958 chr22 35593209 . T G . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 | |
| 27959 chr22 35593221 . G A . PASS DP=32;SS=1;SSC=0;GPV=5.4567e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,11:0,4 1/1:.:17:0,17:0,8:0,9 | |
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| 28022 chr22 35639774 . T C . PASS DP=89;SS=1;SSC=2;GPV=3.8591e-22;SPV=0.57039 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:13,12:4,14 0/1:.:46:18,28:7,12:11,16 | |
| 28023 chr22 35640166 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=3;GPV=6.2293e-15;SPV=0.44688 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:9,9:13,12 0/1:.:32:15,17:6,5:9,12 | |
| 28024 chr22 35641031 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.4154e-13;SPV=0.87082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:6,11:10,7 0/1:.:40:23,17:14,13:9,4 | |
| 28025 chr22 35642239 . G A . PASS DP=91;SS=1;SSC=4;GPV=6.249e-18;SPV=0.36708 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:28,26:21,19:7,7 0/1:.:37:17,20:9,13:8,7 | |
| 28026 chr22 35646939 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=2;GPV=4.4109e-17;SPV=0.54264 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:14,13:9,9 0/1:.:44:22,22:12,15:10,7 | |
| 28027 chr22 35647588 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,13:0,25 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
| 28028 chr22 35648440 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=5;GPV=1.1753e-14;SPV=0.27711 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:22,16:14,9:8,7 0/1:.:43:21,22:14,12:7,10 | |
| 28029 chr22 35650945 . A T . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=1.2269e-12;SPV=0.78013 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:10,6:9,11 0/1:.:39:23,16:13,6:10,10 | |
| 28030 chr22 35652319 . T A . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=6.8388e-10;SPV=0.71105 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:20,14:10,6:10,8 0/1:.:32:20,12:9,6:11,6 | |
| 28031 chr22 35653103 . A G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,9:0,15 1/1:.:28:0,28:0,18:0,10 | |
| 28032 chr22 35658100 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 | |
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| 28094 chr22 35722255 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=6;GPV=1.374e-15;SPV=0.23301 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:10,10:9,8 0/1:.:35:14,21:5,11:9,10 | |
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| 28096 chr22 35722889 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=1.7439e-13;SPV=0.88769 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:7,12:12,12 0/1:.:23:13,10:6,4:7,6 | |
| 28097 chr22 35724276 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=1;GPV=2.4146e-13;SPV=0.71634 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:13,21:8,15:5,6 0/1:.:19:8,11:5,6:3,5 | |
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| 28149 chr22 35824399 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=7;GPV=1.1653e-16;SPV=0.19936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:9,6:17,14 0/1:.:42:19,23:13,14:6,9 | |
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| 28151 chr22 35825857 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=8;GPV=1.0148e-14;SPV=0.12653 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:15,9:9,12 0/1:.:25:9,16:5,7:4,9 | |
| 28152 chr22 35826422 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=8;GPV=5.3252e-12;SPV=0.1378 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:25,16:15,11:10,5 0/1:.:27:12,15:4,4:8,11 | |
| 28153 chr22 35828284 . A T . PASS DP=85;SS=1;SSC=8;GPV=8.3232e-17;SPV=0.1503 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:13,13:16,11 0/1:.:32:13,19:6,9:7,10 | |
| 28154 chr22 35830254 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=2.0452e-11;SPV=0.6915 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:8,10:6,4 0/1:.:32:17,15:9,9:8,6 | |
| 28155 chr22 35832808 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=9.545e-12;SPV=0.34598 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:8,9:9,4 0/1:.:33:16,17:6,7:10,10 | |
| 28156 chr22 35833369 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=7.4725e-14;SPV=0.80295 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:11,17:4,13:7,4 0/1:.:32:15,17:5,5:10,12 | |
| 28157 chr22 35835047 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=2;GPV=2.0643e-11;SPV=0.59399 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:10,12:5,4:5,8 0/1:.:29:13,16:4,7:9,9 | |
| 28158 chr22 35835310 . G T . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.3541e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,10:0,7 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 | |
| 28159 chr22 35836107 . G A . PASS DP=29;SS=1;SSC=2;GPV=0.00015195;SPV=0.60436 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:7,4:4,1:3,3 0/1:.:18:11,7:5,3:6,4 | |
| 28160 chr22 35840671 . T G . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=1.0051e-11;SPV=0.70716 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:12,15:4,7:8,8 0/1:.:27:13,14:5,7:8,7 | |
| 28161 chr22 35841773 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=1.5388e-12;SPV=0.39069 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:9,8:7,5 0/1:.:37:18,19:8,10:10,9 | |
| 28162 chr22 35841883 . T A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,28:0,14 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
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| 28212 chr22 35939261 . G A . PASS DP=31;SS=1;SSC=7;GPV=3.5853e-07;SPV=0.17902 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:9,7:3,2:6,5 0/1:.:15:5,10:2,8:3,2 | |
| 28213 chr22 35942005 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.6199e-12;SPV=0.95611 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:10,16:5,10:5,6 0/1:.:35:20,15:10,5:10,10 | |
| 28214 chr22 35942290 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=9;GPV=1.2624e-13;SPV=0.10312 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:12,14:7,5:5,9 1/1:.:24:6,18:5,9:1,9 | |
| 28215 chr22 35943494 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=3;GPV=1.2581e-11;SPV=0.41965 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:12,9:8,6 0/1:.:31:16,15:10,12:6,3 | |
| 28216 chr22 35943950 . A T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=8.9788e-17;SPV=0.95443 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:15,25:8,11:7,14 0/1:.:37:20,17:10,6:10,11 | |
| 28217 chr22 35944800 . C G . PASS DP=60;SS=1;SSC=9;GPV=1.6571e-10;SPV=0.11008 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:21,12:13,5:8,7 0/1:.:27:12,15:9,6:3,9 | |
| 28218 chr22 35946342 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=5;GPV=6.5441e-13;SPV=0.31359 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:24,15:15,8:9,7 0/1:.:41:22,19:13,8:9,11 | |
| 28219 chr22 35948254 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.040733 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:29,13:16,7:13,6 0/1:.:38:18,20:10,9:8,11 | |
| 28220 chr22 35953412 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=3.2861e-10;SPV=0.43658 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:26,15:15,8:11,7 0/1:.:29:17,12:9,5:8,7 | |
| 28221 chr22 35955703 . T G . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=4.4405e-12;SPV=0.62702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:9,8:11,10 0/1:.:28:15,13:6,7:9,6 | |
| 28222 chr22 35960301 . T G . PASS DP=45;SS=1;SSC=4;GPV=7.1237e-12;SPV=0.3632 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:9,12:6,6:3,6 0/1:.:24:8,16:3,9:5,7 | |
| 28223 chr22 35960302 . C A . PASS DP=46;SS=1;SSC=2;GPV=9.8982e-11;SPV=0.54592 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:9,11:6,5:3,6 0/1:.:26:11,15:4,9:7,6 | |
| 28224 chr22 35963805 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=3;GPV=5.9795e-14;SPV=0.46604 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:8,7:9,7 0/1:.:45:23,22:15,11:8,11 | |
| 28225 chr22 35964726 . A C . PASS DP=52;SS=1;SSC=3;GPV=2.1991e-10;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:13,12:7,7:6,5 0/1:.:27:13,14:8,6:5,8 | |
| 28226 chr22 35967344 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=1.6045e-08;SPV=0.95269 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:10,11:3,6:7,5 0/1:.:33:22,11:15,3:7,8 | |
| 28227 chr22 35971487 . C T . PASS DP=53;SS=1;SSC=2;GPV=2.005e-09;SPV=0.5227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:10,8:9,7 0/1:.:19:10,9:6,2:4,7 | |
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| 28282 chr22 36052299 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=4.0755e-15;SPV=0.64516 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:12,11:11,11 0/1:.:36:19,17:8,9:11,8 | |
| 28283 chr22 36052763 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=7.6319e-16;SPV=0.86996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:10,5:7,18 0/1:.:36:19,17:8,8:11,9 | |
| 28284 chr22 36053110 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.043019 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:16,10:10,7:6,3 0/1:.:24:8,16:7,7:1,9 | |
| 28285 chr22 36053426 . C T . PASS DP=33;SS=1;SSC=3;GPV=1.364e-06;SPV=0.45071 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:12,10:3,2:9,8 0/1:.:11:5,6:0,1:5,5 | |
| 28286 chr22 36055052 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=5;GPV=6.6743e-16;SPV=0.26284 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:10,11:11,9 0/1:.:34:14,20:7,11:7,9 | |
| 28287 chr22 36055767 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=3.2861e-10;SPV=0.91035 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:11,13:12,5 0/1:.:29:20,9:12,5:8,4 | |
| 28288 chr22 36056052 . T A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.39e-14;SPV=0.81048 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:7,9:15,15 0/1:.:27:15,12:8,6:7,6 | |
| 28289 chr22 36056697 . C G . PASS DP=71;SS=1;SSC=4;GPV=3.7425e-15;SPV=0.33188 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:7,12:13,8 0/1:.:31:13,18:11,10:2,8 | |
| 28290 chr22 36056964 . T A . PASS DP=73;SS=1;SSC=35;GPV=1;SPV=0.00027407 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:27,9:19,5:8,4 0/1:.:37:12,25:5,19:7,6 | |
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| 28292 chr22 36060244 . T C . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,13:0,7 1/1:.:20:0,20:0,8:0,12 | |
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| 28350 chr22 36115846 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 | |
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| 28352 chr22 36116935 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,41:0,18 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 | |
| 28353 chr22 36117333 . G C . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:62:0,62:0,29:0,33 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 | |
| 28354 chr22 36117710 . C G . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=2.8026e-45;SPV=0.58228 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:1,45:1,25:0,20 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 28355 chr22 36118804 . C G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,11:0,21 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
| 28356 chr22 36119221 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,19:0,23 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
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| 28360 chr22 36121950 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,20:0,23 1/1:.:26:0,26:0,10:0,16 | |
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| 28414 chr22 36149089 . A T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 | |
| 28415 chr22 36149522 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,28:0,23 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 | |
| 28416 chr22 36149613 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=4;GPV=4.0755e-15;SPV=0.3963 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:27,23:12,15:15,8 0/1:.:31:15,16:12,5:3,11 | |
| 28417 chr22 36149732 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=9;GPV=8.7243e-19;SPV=0.11564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:14,12:15,12 0/1:.:40:16,24:8,10:8,14 | |
| 28418 chr22 36149778 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,28:0,21 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 28419 chr22 36150310 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=2.1298e-18;SPV=0.95944 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:18,30:6,21:12,9 0/1:.:35:19,16:13,8:6,8 | |
| 28420 chr22 36152358 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,9:0,20 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 | |
| 28421 chr22 36153118 . T A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=6.6445e-15;SPV=0.97043 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:7,18:1,12:6,6 0/1:.:35:17,18:8,10:9,8 | |
| 28422 chr22 36154019 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 | |
| 28423 chr22 36154734 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=5;GPV=2.098e-14;SPV=0.29628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,14:9,6:6,8 0/1:.:38:16,22:7,10:9,12 | |
| 28424 chr22 36155110 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.1656e-17;SPV=0.66126 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:15,27:6,12:9,15 0/1:.:24:9,15:5,5:4,10 | |
| 28425 chr22 36155868 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=4.2977e-14;SPV=0.92526 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:27,26:9,11:18,15 0/1:.:31:20,11:13,6:7,5 | |
| 28426 chr22 36156291 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=1.5824e-16;SPV=0.4605 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:9,14:16,7 0/1:.:45:23,22:9,14:14,8 | |
| 28427 chr22 36156354 . T C . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,24:0,26 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 | |
| 28428 chr22 36157133 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=2.8926e-12;SPV=0.56399 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:13,9:13,11 0/1:.:27:15,12:9,8:6,4 | |
| 28429 chr22 36158540 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,28:0,18 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 | |
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| 28431 chr22 36159318 . A T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 1/1:.:24:0,24:0,10:0,14 | |
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| 28485 chr22 36187409 . C T . PASS DP=24;SS=1;SSC=6;GPV=0.00011047;SPV=0.20682 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:8,4:1,0:7,4 0/1:.:12:5,7:0,1:5,6 | |
| 28486 chr22 36188203 . T G . PASS DP=98;SS=1;SSC=2;GPV=1.5597e-18;SPV=0.59024 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:28,27:10,14:18,13 0/1:.:43:22,21:11,10:11,11 | |
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| 28488 chr22 36188350 . C G . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=3.6959e-18;SPV=0.97934 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:19,27:10,14:9,13 0/1:.:50:30,20:15,12:15,8 | |
| 28489 chr22 36188381 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=1.6633e-17;SPV=0.97144 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:19,27:8,14:11,13 0/1:.:44:26,18:15,10:11,8 | |
| 28490 chr22 36188382 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,23:0,24 1/1:.:43:0,43:0,24:0,19 | |
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| 28492 chr22 36189114 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=9.3121e-14;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:7,13:12,5 0/1:.:33:16,17:6,11:10,6 | |
| 28493 chr22 36189194 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=1.1653e-16;SPV=0.89667 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:8,11:9,10 0/1:.:50:28,22:8,15:20,7 | |
| 28494 chr22 36189810 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=8.9788e-17;SPV=0.8762 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:18,26:13,10:5,16 0/1:.:33:17,16:6,9:11,7 | |
| 28495 chr22 36190300 . A C . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,24:0,32 1/1:.:43:0,43:0,24:0,19 | |
| 28496 chr22 36190451 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=5;GPV=1.2112e-18;SPV=0.26421 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:29,30:17,21:12,9 0/1:.:28:11,17:6,6:5,11 | |
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| 28538 chr22 36213886 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=3.7837e-11;SPV=0.90465 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:9,5:7,11 0/1:.:35:22,13:8,3:14,10 | |
| 28539 chr22 36214525 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=3;GPV=2.5383e-09;SPV=0.48556 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:12,8:7,4:5,4 0/1:.:36:20,16:10,9:10,7 | |
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| 28541 chr22 36215817 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=5.88e-11;SPV=0.63817 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:10,9:4,4:6,5 0/1:.:41:22,19:13,11:9,8 | |
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| 28546 chr22 36217907 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=3;GPV=4.2301e-08;SPV=0.45122 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:16,9:11,4:5,5 0/1:.:29:17,12:8,6:9,6 | |
| 28547 chr22 36218116 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=5;GPV=4.5894e-09;SPV=0.29594 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:20,9:11,5:9,4 0/1:.:37:22,15:13,6:9,9 | |
| 28548 chr22 36218365 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=5.295e-10;SPV=0.8385 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:7,9:9,5 0/1:.:32:20,12:7,4:13,8 | |
| 28549 chr22 36219664 . A G . PASS DP=50;SS=1;SSC=3;GPV=9.2544e-12;SPV=0.46513 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:3,11:2,7:1,4 1/1:.:22:2,13:2,5:0,8 | |
| 28550 chr22 36220843 . C A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=2.7419e-13;SPV=0.97301 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:7,12:8,9 0/1:.:34:21,13:6,5:15,8 | |
| 28551 chr22 36220845 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=6.58e-14;SPV=0.93243 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:9,12:9,9 0/1:.:38:23,15:8,5:15,10 | |
| 28552 chr22 36223478 . C G . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=4.9668e-14;SPV=0.7769 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:8,12:9,10 0/1:.:26:13,13:8,6:5,7 | |
| 28553 chr22 36225207 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=5;GPV=5.88e-11;SPV=0.3085 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:7,5:11,8 0/1:.:29:14,15:4,10:10,5 | |
| 28554 chr22 36225663 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=4.794e-13;SPV=0.94369 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:9,15:13,8 0/1:.:31:20,11:13,4:7,7 | |
| 28555 chr22 36228421 . A T . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,29:0,24 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
| 28556 chr22 36228455 . G C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,23:0,23 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 | |
| 28557 chr22 36228649 . A C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,15:0,27 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 | |
| 28558 chr22 36229268 . T A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 28559 chr22 36229458 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=5;GPV=4.6768e-16;SPV=0.26785 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:28,25:18,10:10,15 0/1:.:28:12,16:6,8:6,8 | |
| 28560 chr22 36229839 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=12;GPV=9.392e-17;SPV=0.061131 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:11,15:8,3 0/1:.:33:10,23:7,14:3,9 | |
| 28561 chr22 36230508 . G T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 1/1:.:26:0,26:0,10:0,16 | |
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| 28563 chr22 36230586 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=2.2536e-12;SPV=0.66038 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:12,5:11,15 0/1:.:27:15,12:6,3:9,9 | |
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| 28592 chr22 36257697 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,30:0,22:0,8 1/1:.:25:0,25:0,19:0,6 | |
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| 28621 chr22 36265284 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 28622 chr22 36265490 . C A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 1/1:.:29:0,29:0,12:0,17 | |
| 28623 chr22 36265520 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,18:0,27 1/1:.:24:0,24:0,10:0,14 | |
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| 28625 chr22 36265796 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 28626 chr22 36266702 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=1.6064e-11;SPV=0.70664 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:11,15:11,3 0/1:.:29:17,12:9,7:8,5 | |
| 28627 chr22 36267202 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,26:0,16 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 | |
| 28628 chr22 36267581 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 28629 chr22 36268293 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,24:0,23 1/1:.:29:0,29:0,9:0,20 | |
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| 28685 chr22 36324734 . C T . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=3.1107e-17;SPV=0.98263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:8,13:15,16 0/1:.:44:28,16:13,6:15,10 | |
| 28686 chr22 36326489 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=2;GPV=5.2507e-16;SPV=0.58795 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:14,9:9,14 0/1:.:36:18,18:6,8:12,10 | |
| 28687 chr22 36327652 . T G . PASS DP=99;SS=1;SSC=10;GPV=2.1398e-20;SPV=0.080413 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:31,26:13,14:18,12 0/1:.:42:16,26:10,15:6,11 | |
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| 28690 chr22 36332211 . A G . PASS DP=102;SS=1;SSC=2;GPV=2.7774e-19;SPV=0.50773 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:29,27:12,16:17,11 0/1:.:46:23,23:13,8:10,15 | |
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| 28817 chr22 36498751 . C A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=2.1366e-11;SPV=0.86132 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:16,16:10,5 0/1:.:26:17,9:12,5:5,4 | |
| 28818 chr22 36499099 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
| 28819 chr22 36499574 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=3.6481e-18;SPV=0.55513 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:9,15:11,11 0/1:.:33:14,19:5,13:9,6 | |
| 28820 chr22 36499927 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.6641e-16;SPV=0.99136 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:14,25:4,14:10,11 0/1:.:40:24,16:14,12:10,4 | |
| 28821 chr22 36500482 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.2823e-13;SPV=0.87526 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:7,16:14,7 0/1:.:29:17,12:12,5:5,7 | |
| 28822 chr22 36502627 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=3.125e-12;SPV=0.85563 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:18,12:7,10 0/1:.:27:17,10:9,5:8,5 | |
| 28823 chr22 36503091 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1534e-09;SPV=0.82896 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:25,17:11,7:14,10 0/1:.:22:15,7:4,2:11,5 | |
| 28824 chr22 36504224 . T C . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,18:0,33 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 | |
| 28825 chr22 36504759 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=1.0765e-21;SPV=0.40945 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:16,25:8,14:8,11 0/1:.:41:14,27:7,12:7,15 | |
| 28826 chr22 36505098 . G C . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=7.6501e-21;SPV=0.90639 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:20,32:7,19:13,13 0/1:.:40:20,20:9,7:11,13 | |
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| 28828 chr22 36507202 . T G . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,26:0,23 1/1:.:47:0,47:0,20:0,27 | |
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| 28887 chr22 36554693 . C T . PASS DP=53;SS=1;SSC=1;GPV=2.3048e-12;SPV=0.66836 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:12,17:8,10:4,7 0/1:.:23:10,13:8,8:2,5 | |
| 28888 chr22 36557113 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=6;GPV=7.7158e-19;SPV=0.24663 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:11,10:10,12 0/1:.:41:16,25:10,14:6,11 | |
| 28889 chr22 36557768 . A C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 | |
| 28890 chr22 36558148 . T G . PASS DP=52;SS=1;SSC=2;GPV=2.1991e-10;SPV=0.61033 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:8,9:7,6 0/1:.:22:11,11:5,6:6,5 | |
| 28891 chr22 36558892 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=5;GPV=2.0677e-18;SPV=0.25526 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:31,29:18,21:13,8 0/1:.:31:13,18:6,8:7,10 | |
| 28892 chr22 36559114 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.5003e-14;SPV=0.94971 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:6,15:16,13 0/1:.:21:13,8:8,4:5,4 | |
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| 28894 chr22 36561287 . A C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,20:0,28 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
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| 28958 chr22 36684469 . G T . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 | |
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| 29019 chr22 36732210 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,22:0,27 1/1:.:38:0,38:0,15:0,23 | |
| 29020 chr22 36732550 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,25:0,22 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 | |
| 29021 chr22 36732762 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,21:0,32 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 | |
| 29022 chr22 36733236 . G T . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 1/1:.:44:0,44:0,30:0,14 | |
| 29023 chr22 36734033 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:32:0,32:0,21:0,11 | |
| 29024 chr22 36734666 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,24:0,22 1/1:.:41:0,41:0,15:0,26 | |
| 29025 chr22 36735497 . T A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,15:0,27 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
| 29026 chr22 36735814 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 | |
| 29027 chr22 36735889 . C G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
| 29028 chr22 36737368 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 | |
| 29029 chr22 36739260 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
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| 29089 chr22 36798957 . G C . PASS DP=101;SS=1;SSC=3;GPV=8.35e-20;SPV=0.44461 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:67:34,33:11,19:23,14 0/1:.:34:16,18:8,9:8,9 | |
| 29090 chr22 36799000 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=3;GPV=1.5964e-18;SPV=0.40636 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:27,28:15,9:12,19 0/1:.:34:15,19:9,8:6,11 | |
| 29091 chr22 36799312 . G T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=4.8717e-12;SPV=0.79691 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:8,8:8,8 0/1:.:35:20,15:9,10:11,5 | |
| 29092 chr22 36799586 . C G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=7.6319e-16;SPV=0.91104 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:17,24:11,14:6,10 0/1:.:35:19,16:8,7:11,9 | |
| 29093 chr22 36799729 . G C . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=5.349e-11;SPV=0.59948 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:10,10:10,8 0/1:.:21:11,10:4,3:7,7 | |
| 29094 chr22 36799849 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=1.8765e-12;SPV=0.65609 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:8,8:15,13 0/1:.:24:13,11:4,5:9,6 | |
| 29095 chr22 36799853 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=9.3121e-14;SPV=0.59923 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:8,8:15,15 0/1:.:24:12,12:4,5:8,7 | |
| 29096 chr22 36800404 . T C . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 1/1:.:19:0,19:0,12:0,7 | |
| 29097 chr22 36800636 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=1.5381e-13;SPV=0.5471 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:11,11:5,6 0/1:.:32:15,17:7,10:8,7 | |
| 29098 chr22 36802978 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=6;GPV=3.9143e-11;SPV=0.20606 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:6,5:13,10 0/1:.:22:9,13:7,7:2,6 | |
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| 29100 chr22 36804090 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.2401e-12;SPV=0.96063 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:12,18:8,8:4,10 0/1:.:34:20,14:11,4:9,10 | |
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| 29151 chr22 36860309 . G T . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=4.034e-13;SPV=0.59211 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:11,8:9,9 0/1:.:37:20,17:11,9:9,8 | |
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| 29155 chr22 36862944 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=1.8524e-14;SPV=0.54531 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:11,12:8,6 0/1:.:38:19,19:7,10:12,9 | |
| 29156 chr22 36863563 . T C . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=7.9107e-15;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,3:0,10 1/1:.:12:0,12:0,1:0,11 | |
| 29157 chr22 36864070 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=4;GPV=6.4906e-14;SPV=0.34215 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:9,10:10,8 0/1:.:30:13,17:6,8:7,9 | |
| 29158 chr22 36864559 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,28:0,17 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 | |
| 29159 chr22 36867664 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,17:0,26 1/1:.:28:0,28:0,10:0,18 | |
| 29160 chr22 36867804 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=6.2293e-15;SPV=0.35128 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:11,10:13,12 0/1:.:29:13,16:7,10:6,6 | |
| 29161 chr22 36868672 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.046422 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:17,5:1,8 0/1:.:25:8,17:6,7:2,10 | |
| 29162 chr22 36869037 . G C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,23:0,24 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 | |
| 29163 chr22 36869344 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=1.8081e-15;SPV=0.43725 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:15,12:9,13 0/1:.:25:11,14:2,10:9,4 | |
| 29164 chr22 36870280 . A G . PASS DP=100;SS=1;SSC=9;GPV=6.5817e-19;SPV=0.11757 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:35,27:19,20:16,7 0/1:.:38:16,22:12,12:4,10 | |
| 29165 chr22 36870937 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=6.4956e-13;SPV=0.77974 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:9,13:10,7 0/1:.:29:16,13:10,5:6,8 | |
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| 29213 chr22 36913484 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=11;GPV=6.6801e-08;SPV=0.078133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:26,8:11,5:15,3 0/1:.:30:17,13:9,9:8,4 | |
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| 29216 chr22 36915816 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=1.5211e-10;SPV=0.78456 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:11,10:7,7 0/1:.:24:14,10:6,5:8,5 | |
| 29217 chr22 36916703 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=2.8393e-15;SPV=0.88334 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:14,25:7,13:7,12 0/1:.:23:11,12:7,10:4,2 | |
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| 29219 chr22 36919551 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.027426 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:25,10:16,6:9,4 0/1:.:31:14,17:8,7:6,10 | |
| 29220 chr22 36919691 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=12;GPV=1.6064e-11;SPV=0.059172 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:29,16:11,6:18,10 0/1:.:24:10,14:2,8:8,6 | |
| 29221 chr22 36919925 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.3049e-14;SPV=0.86814 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:16,23:12,14:4,9 0/1:.:25:13,12:9,5:4,7 | |
| 29222 chr22 36920091 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=8.6008e-14;SPV=0.84596 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:12,10:11,12 0/1:.:35:21,14:8,6:13,8 | |
| 29223 chr22 36923039 . T G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=7.5673e-13;SPV=0.92864 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:16,23:10,11:6,12 0/1:.:21:12,9:7,7:5,2 | |
| 29224 chr22 36924292 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=5;GPV=1.1021e-09;SPV=0.30998 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:5,6:11,8 0/1:.:17:7,10:2,2:5,8 | |
| 29225 chr22 36924313 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=6;GPV=4.1537e-13;SPV=0.20191 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:7,12:10,6 0/1:.:21:7,14:2,3:5,11 | |
| 29226 chr22 36924557 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=1.0364e-16;SPV=0.83011 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:23,30:14,12:9,18 0/1:.:25:13,12:6,8:7,4 | |
| 29227 chr22 36924831 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=1.374e-15;SPV=0.75292 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:24,30:11,17:13,13 0/1:.:18:9,9:5,6:4,3 | |
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| 29229 chr22 36928981 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=2.0069e-13;SPV=0.89329 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:33,25:19,17:14,8 0/1:.:34:23,11:16,5:7,6 | |
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| 29287 chr22 36979495 . C A . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,18:0,5 1/1:.:21:0,21:0,13:0,8 | |
| 29288 chr22 36979869 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=3;GPV=4.1486e-16;SPV=0.49558 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:10,11:11,10 0/1:.:38:18,20:11,15:7,5 | |
| 29289 chr22 36980691 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=5.8874e-07;SPV=0.81142 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:15,10:9,2:6,8 0/1:.:25:17,8:8,3:9,5 | |
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| 29291 chr22 36981053 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=8.8612e-15;SPV=0.39123 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:14,9:7,13 0/1:.:26:11,15:3,11:8,4 | |
| 29292 chr22 36982410 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=4.794e-13;SPV=0.66739 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:14,7:11,14 0/1:.:30:17,13:13,5:4,8 | |
| 29293 chr22 36983505 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=6.9925e-15;SPV=0.59075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:10,8:10,12 0/1:.:36:18,18:9,10:9,8 | |
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| 29295 chr22 36984027 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=2.0466e-12;SPV=0.65936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:13,15:7,11:6,4 0/1:.:31:15,16:10,8:5,8 | |
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| 29352 chr22 37014388 . C A . PASS DP=93;SS=1;SSC=1;GPV=2.6362e-18;SPV=0.70001 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:12,14:9,9 0/1:.:49:25,24:12,12:13,12 | |
| 29353 chr22 37014926 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=3.5731e-11;SPV=0.8503 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:30,20:12,13:18,7 0/1:.:32:22,10:12,7:10,3 | |
| 29354 chr22 37015541 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=7;GPV=5.7384e-17;SPV=0.18224 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:9,14:14,6 0/1:.:39:16,23:6,7:10,16 | |
| 29355 chr22 37015662 . T A . PASS DP=65;SS=1;SSC=8;GPV=1.5381e-13;SPV=0.15835 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:7,11:15,8 0/1:.:24:9,15:4,5:5,10 | |
| 29356 chr22 37017566 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=2.5784e-18;SPV=0.55362 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:16,22:6,11:10,11 0/1:.:39:16,23:6,12:10,11 | |
| 29357 chr22 37018942 . G A . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=2.6525e-14;SPV=0.43528 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:30,20:20,10:10,10 0/1:.:41:23,18:12,6:11,12 | |
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| 29418 chr22 37074184 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,24:0,24 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 | |
| 29419 chr22 37074496 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=6;GPV=4.1486e-16;SPV=0.24941 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:13,10:9,9 0/1:.:39:17,22:10,13:7,9 | |
| 29420 chr22 37074564 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,23:0,25 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 | |
| 29421 chr22 37075345 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=4.7154e-12;SPV=0.95166 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:27,23:11,14:16,9 0/1:.:30:21,9:10,4:11,5 | |
| 29422 chr22 37078039 . G A . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=6.7391e-19;SPV=0.42335 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:12,12:14,15 0/1:.:38:17,21:8,6:9,15 | |
| 29423 chr22 37080103 . C T . PASS DP=97;SS=1;SSC=1;GPV=3.8987e-14;SPV=0.79362 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:32,23:16,10:16,13 0/1:.:42:27,15:12,10:15,5 | |
| 29424 chr22 37080153 . A G . PASS DP=105;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,28:0,33 1/1:.:44:0,44:0,23:0,21 | |
| 29425 chr22 37081692 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=1.7206e-15;SPV=0.81453 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:12,15:14,12 0/1:.:30:17,13:9,5:8,8 | |
| 29426 chr22 37081930 . T C . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=1.3979e-18;SPV=0.88354 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:29,33:20,22:9,11 0/1:.:35:20,15:12,8:8,7 | |
| 29427 chr22 37082214 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=1.973e-16;SPV=0.62206 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:11,7:15,20 0/1:.:30:15,15:9,7:6,8 | |
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| 29491 chr22 37118299 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=5;GPV=5.4147e-14;SPV=0.292 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:10,10:13,8 0/1:.:34:16,18:6,7:10,11 | |
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| 29546 chr22 37168437 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=5;GPV=1.5805e-15;SPV=0.31515 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:12,10:10,12 0/1:.:29:12,17:8,6:4,11 | |
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| 29548 chr22 37169452 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=2.2057e-13;SPV=0.63765 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:8,12:14,6 0/1:.:39:22,17:14,10:8,7 | |
| 29549 chr22 37170661 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=1.3937e-18;SPV=0.90023 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:18,26:11,15:7,11 0/1:.:44:23,21:11,7:12,14 | |
| 29550 chr22 37170990 . T G . PASS DP=84;SS=1;SSC=5;GPV=1.2581e-22;SPV=0.28986 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:16,24:10,12:6,12 0/1:.:44:14,30:8,16:6,14 | |
| 29551 chr22 37171136 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=2;GPV=7.8126e-18;SPV=0.6172 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:8,10:9,10 0/1:.:47:22,25:9,10:13,15 | |
| 29552 chr22 37172311 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.5066e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,22:0,17:0,5 1/1:.:28:0,21:0,13:0,8 | |
| 29553 chr22 37173621 . A C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.1404e-14;SPV=0.94952 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:11,21:6,11:5,10 0/1:.:31:16,15:6,10:10,5 | |
| 29554 chr22 37173756 . G T . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=9.545e-12;SPV=0.55247 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:9,4:8,11 0/1:.:31:16,15:11,7:5,8 | |
| 29555 chr22 37173970 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,22:0,6 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 | |
| 29556 chr22 37174044 . G C . PASS DP=71;SS=1;SSC=3;GPV=2.4568e-12;SPV=0.39951 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:14,11:9,6 0/1:.:31:16,15:9,7:7,8 | |
| 29557 chr22 37174974 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.6516e-12;SPV=0.90914 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:12,6:13,16 0/1:.:32:21,11:11,7:10,4 | |
| 29558 chr22 37175457 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:22:0,22:0,15:0,7 | |
| 29559 chr22 37175458 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,22:0,20 1/1:.:26:0,26:0,16:0,10 | |
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| 29618 chr22 37203666 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=9.3454e-17;SPV=0.66829 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:7,16:17,9 0/1:.:37:19,18:8,7:11,11 | |
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| 29673 chr22 37273280 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=3.9427e-17;SPV=0.97484 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:22,30:14,18:8,12 0/1:.:36:22,14:12,8:10,6 | |
| 29674 chr22 37274784 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=3;GPV=2.2152e-16;SPV=0.41215 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:13,12:13,12 0/1:.:34:16,18:6,10:10,8 | |
| 29675 chr22 37275636 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=5;GPV=3.5003e-14;SPV=0.25241 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:14,13:11,9 0/1:.:24:10,14:4,9:6,5 | |
| 29676 chr22 37275855 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=9;GPV=3.9318e-11;SPV=0.11212 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:34,14:18,8:16,6 0/1:.:36:20,16:10,8:10,8 | |
| 29677 chr22 37276728 . A G . PASS DP=99;SS=1;SSC=1;GPV=2.1012e-22;SPV=0.7841 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:26,37:14,21:12,16 0/1:.:36:17,19:10,9:7,10 | |
| 29678 chr22 37277066 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.0532e-18;SPV=0.84257 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:17,28:7,8:10,20 0/1:.:30:14,16:6,8:8,8 | |
| 29679 chr22 37277399 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=1.4766e-14;SPV=0.71777 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:8,8:11,13 0/1:.:33:17,16:7,5:10,11 | |
| 29680 chr22 37279177 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=8;GPV=3.104e-14;SPV=0.14604 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:8,12:16,8 0/1:.:26:10,16:5,6:5,10 | |
| 29681 chr22 37283884 . G C . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=2.95e-15;SPV=0.59092 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:7,10:16,13 0/1:.:32:16,16:9,8:7,8 | |
| 29682 chr22 37283907 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=5.3252e-12;SPV=0.86885 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:6,11:14,9 0/1:.:28:17,11:9,7:8,4 | |
| 29683 chr22 37284086 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=9.545e-12;SPV=0.99667 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:13,21:9,9:4,12 0/1:.:29:20,9:9,6:11,3 | |
| 29684 chr22 37284957 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=9;GPV=1.0345e-10;SPV=0.10875 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:17,12:4,3 0/1:.:19:7,12:6,10:1,2 | |
| 29685 chr22 37284958 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=8;GPV=5.3076e-14;SPV=0.13562 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:17,14:0,4 0/1:.:23:7,16:7,12:0,4 | |
| 29686 chr22 37285945 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,19:0,27 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
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| 29688 chr22 37286784 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,22:0,20 1/1:.:35:0,35:0,13:0,22 | |
| 29689 chr22 37286914 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,33:0,20 1/1:.:20:0,20:0,9:0,11 | |
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| 29809 chr22 37400774 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=6;GPV=6.1418e-13;SPV=0.22007 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:32,15:18,7:14,8 0/1:.:48:28,20:13,9:15,11 | |
| 29810 chr22 37400937 . G C . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=1.1691e-15;SPV=0.75563 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:15,14:10,9 0/1:.:42:24,18:15,11:9,7 | |
| 29811 chr22 37401098 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=6;GPV=2.5784e-18;SPV=0.20095 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:25,30:13,15:12,15 0/1:.:22:7,15:5,4:2,11 | |
| 29812 chr22 37401931 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.6045e-17;SPV=0.72029 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:16,15:7,14 0/1:.:29:14,15:11,9:3,6 | |
| 29813 chr22 37402330 . C G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.5805e-15;SPV=0.92707 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:17,25:7,14:10,11 0/1:.:31:17,14:8,7:9,7 | |
| 29814 chr22 37403329 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=1.8278e-16;SPV=0.56317 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:10,15:8,7 0/1:.:34:15,19:11,12:4,7 | |
| 29815 chr22 37403597 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=3.2999e-18;SPV=0.90026 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:18,26:10,16:8,10 0/1:.:43:22,20:15,14:7,6 | |
| 29816 chr22 37403960 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=6.5952e-22;SPV=0.54812 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:16,29:11,17:5,12 0/1:.:35:12,23:5,10:7,13 | |
| 29817 chr22 37404135 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=24;GPV=1;SPV=0.0037738 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:22,33:11,13:11,20 0/1:.:32:23,9:14,5:9,4 | |
| 29818 chr22 37404783 . T C . PASS DP=96;SS=1;SSC=1;GPV=1.3754e-21;SPV=0.66887 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:20,27:7,17:13,10 0/1:.:49:22,27:10,7:12,20 | |
| 29819 chr22 37404784 . G A . PASS DP=99;SS=1;SSC=3;GPV=6.8289e-22;SPV=0.45534 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:23,27:7,17:16,10 0/1:.:49:21,28:10,7:11,21 | |
| 29820 chr22 37407081 . T C . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,22:0,31 1/1:.:49:0,49:0,21:0,28 | |
| 29821 chr22 37407435 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=8;GPV=1.1404e-14;SPV=0.14324 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:10,10:8,8 0/1:.:27:9,18:5,7:4,11 | |
| 29822 chr22 37407680 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.7321e-11;SPV=0.90144 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:6,8:9,7 0/1:.:40:25,15:18,6:7,9 | |
| 29823 chr22 37408136 . G A . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=2.4827e-23;SPV=0.82147 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:20,35:11,21:9,14 0/1:.:39:17,22:8,7:9,15 | |
| 29824 chr22 37409239 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=2.2057e-13;SPV=0.97599 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:13,19:10,6 0/1:.:31:21,10:14,5:7,5 | |
| 29825 chr22 37411264 . A C . PASS DP=85;SS=1;SSC=8;GPV=9.1568e-13;SPV=0.14809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:34,18:19,8:15,10 0/1:.:33:17,16:9,8:8,8 | |
| 29826 chr22 37412173 . G C . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=1.8524e-14;SPV=0.36962 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:12,11:11,9 0/1:.:32:15,17:7,7:8,10 | |
| 29827 chr22 37413102 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=8.8662e-16;SPV=0.80866 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:26,26:13,13:13,13 0/1:.:35:20,15:7,6:13,9 | |
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| 29829 chr22 37414653 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=5.3416e-11;SPV=0.85653 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:10,8:8,7 0/1:.:39:25,14:10,9:15,5 | |
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| 29883 chr22 37554117 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=1.5567e-13;SPV=0.37292 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:10,8:12,9 0/1:.:36:18,18:8,9:10,9 | |
| 29884 chr22 37554523 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=9;GPV=8.9089e-11;SPV=0.11987 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:25,14:12,6:13,8 0/1:.:26:12,14:9,10:3,4 | |
| 29885 chr22 37554543 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 1/1:.:26:0,26:0,17:0,9 | |
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| 29887 chr22 37555444 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=1;GPV=4.1632e-19;SPV=0.64392 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:29,31:16,15:13,16 0/1:.:36:18,18:7,8:11,10 | |
| 29888 chr22 37556486 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=2.8075e-15;SPV=0.79122 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:3,10:12,11 0/1:.:33:16,17:10,10:6,7 | |
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| 30019 chr22 37667863 . G A . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 1/1:.:23:0,23:0,15:0,8 | |
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| 30021 chr22 37668643 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 30022 chr22 37669330 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,28:0,19 1/1:.:31:0,31:0,11:0,20 | |
| 30023 chr22 37669648 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,27:0,28 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 30024 chr22 37670102 . A T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,15:0,24 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 | |
| 30025 chr22 37670128 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 | |
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| 30029 chr22 37674914 . A G . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,36:0,23 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 | |
| 30030 chr22 37675036 . G A . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,37:0,24 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
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| 30092 chr22 37719685 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,21:0,12 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
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| 30101 chr22 37731620 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 1/1:.:23:0,23:0,9:0,14 | |
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| 30103 chr22 37733079 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,25:0,24 1/1:.:35:0,35:0,14:0,21 | |
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| 30157 chr22 37786699 . A G . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 1/1:.:47:0,47:0,12:0,35 | |
| 30158 chr22 37787365 . G C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,25:0,16 1/1:.:19:0,19:0,13:0,6 | |
| 30159 chr22 37787463 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,31:0,17 1/1:.:32:0,32:0,11:0,21 | |
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| 30161 chr22 37788646 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 | |
| 30162 chr22 37788678 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 30163 chr22 37788865 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,29:0,17 1/1:.:31:0,31:0,21:0,10 | |
| 30164 chr22 37789964 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,27:0,23 1/1:.:26:0,26:0,17:0,9 | |
| 30165 chr22 37789987 . T G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,24:0,25 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 30166 chr22 37790393 . G A . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,28:0,27 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 | |
| 30167 chr22 37790395 . A G . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,27:0,28 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 | |
| 30168 chr22 37791771 . C A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,14:0,21 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 30169 chr22 37792277 . C A . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.52874 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:1,45:0,21:1,24 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 | |
| 30170 chr22 37793347 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,28:0,21 1/1:.:33:0,33:0,21:0,12 | |
| 30171 chr22 37794075 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,30:0,18 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 30172 chr22 37797094 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,21:0,12 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
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| 30174 chr22 37797630 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,24:0,17 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
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| 30232 chr22 37897616 . A C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,19:0,23 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 | |
| 30233 chr22 37899264 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,19:0,30 1/1:.:44:0,44:0,19:0,25 | |
| 30234 chr22 37899510 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 1/1:.:29:0,29:0,11:0,18 | |
| 30235 chr22 37900161 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,25:0,25 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
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| 30242 chr22 37910699 . G A . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,32:0,23 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 | |
| 30243 chr22 37910764 . T C . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,26:0,26 1/1:.:51:0,51:0,23:0,28 | |
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| 30295 chr22 37997601 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=8.503e-12;SPV=0.70795 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:12,8:10,9 0/1:.:35:21,14:13,10:8,4 | |
| 30296 chr22 38000213 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=6;GPV=6.7818e-18;SPV=0.22318 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:10,9:11,11 0/1:.:42:17,25:5,12:12,13 | |
| 30297 chr22 38001027 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=5;GPV=1.5391e-12;SPV=0.29853 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:23,14:12,8:11,6 0/1:.:41:22,19:9,8:13,11 | |
| 30298 chr22 38001790 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=2.8393e-16;SPV=0.31802 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:17,24:8,16:9,8 0/1:.:22:7,15:7,9:0,6 | |
| 30299 chr22 38003091 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=6.4299e-17;SPV=0.65345 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:9,14:5,8 0/1:.:32:13,19:8,6:5,13 | |
| 30300 chr22 38003972 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=8;GPV=4.034e-13;SPV=0.14301 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:26,17:12,9:14,8 0/1:.:31:14,17:5,7:9,10 | |
| 30301 chr22 38009410 . C T . PASS DP=102;SS=1;SSC=1;GPV=2.3465e-18;SPV=0.64985 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:18,10:8,14 0/1:.:52:28,24:11,10:17,14 | |
| 30302 chr22 38010140 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.8183e-16;SPV=0.87365 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:21,28:9,15:12,13 0/1:.:28:15,13:7,9:8,4 | |
| 30303 chr22 38010775 . A C . PASS DP=71;SS=1;SSC=4;GPV=1.1875e-15;SPV=0.39424 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:14,17:10,10 0/1:.:20:8,12:4,4:4,8 | |
| 30304 chr22 38013589 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.7502e-16;SPV=0.90486 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:10,17:12,11 0/1:.:32:18,14:8,8:10,6 | |
| 30305 chr22 38014806 . A T . PASS DP=38;SS=1;SSC=1;GPV=5.1339e-06;SPV=0.70279 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:11,8:8,6:3,2 0/1:.:18:11,7:8,4:3,3 | |
| 30306 chr22 38015780 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=5;GPV=1.4154e-13;SPV=0.26711 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:13,7:12,12 0/1:.:30:14,16:3,8:11,8 | |
| 30307 chr22 38019535 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=5;GPV=2.8662e-18;SPV=0.31302 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:11,15:14,11 0/1:.:34:14,20:5,15:9,5 | |
| 30308 chr22 38019714 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=3;GPV=4.9663e-15;SPV=0.4901 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:26,22:13,12:13,10 0/1:.:35:18,17:8,5:10,12 | |
| 30309 chr22 38021503 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=5;GPV=4.716e-22;SPV=0.25945 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:13,11:7,14 0/1:.:45:16,29:9,19:7,10 | |
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| 30311 chr22 38028205 . G T . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=1.1052e-12;SPV=0.54346 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:10,10:8,8 0/1:.:27:13,14:7,9:6,5 | |
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| 30357 chr22 38093551 . G T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=4.6768e-16;SPV=0.84051 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:10,8:9,15 0/1:.:39:21,18:6,9:15,9 | |
| 30358 chr22 38094049 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=5.857e-18;SPV=0.99162 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:15,29:5,13:10,16 0/1:.:38:22,16:11,9:11,7 | |
| 30359 chr22 38094794 . G C . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=1.1744e-10;SPV=0.59377 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:11,9:11,6 0/1:.:32:19,13:7,8:12,5 | |
| 30360 chr22 38095363 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=5.1992e-08;SPV=0.94627 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:7,7:11,7 0/1:.:26:19,7:10,5:9,2 | |
| 30361 chr22 38099004 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=7.2383e-18;SPV=0.52692 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:21,28:11,14:10,14 0/1:.:27:11,16:4,7:7,9 | |
| 30362 chr22 38099405 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.7683e-12;SPV=0.88024 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:11,3:11,16 0/1:.:39:25,14:12,7:13,7 | |
| 30363 chr22 38101712 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=4;GPV=7.7158e-19;SPV=0.34202 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:15,18:8,8 0/1:.:35:14,21:8,14:6,7 | |
| 30364 chr22 38102876 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=5;GPV=1.4168e-09;SPV=0.26447 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:22,12:13,8:9,4 0/1:.:28:15,13:10,9:5,4 | |
| 30365 chr22 38102978 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=2.0601e-12;SPV=0.50375 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:17,12:6,7 0/1:.:27:14,13:10,5:4,8 | |
| 30366 chr22 38103925 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=1.6514e-11;SPV=0.70732 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:4,9:14,10 0/1:.:21:11,10:5,3:6,7 | |
| 30367 chr22 38104119 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=1.374e-15;SPV=0.72006 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:10,14:9,10 0/1:.:29:14,15:5,7:9,8 | |
| 30368 chr22 38104375 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=2.4039e-14;SPV=0.74321 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:11,7:7,15 0/1:.:28:14,14:7,5:7,9 | |
| 30369 chr22 38104588 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=3;GPV=5.3252e-12;SPV=0.41216 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:14,8:6,7 0/1:.:33:17,16:10,7:7,9 | |
| 30370 chr22 38104820 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=3;GPV=2.1236e-16;SPV=0.44965 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:10,7:8,13 0/1:.:37:16,21:4,13:12,8 | |
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| 30421 chr22 38143991 . G A . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=8.2643e-08;SPV=0.80952 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:10,6:8,8 0/1:.:17:11,6:4,3:7,3 | |
| 30422 chr22 38144619 . C T . PASS DP=45;SS=1;SSC=5;GPV=2.7295e-10;SPV=0.28387 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:13,13:7,6:6,7 0/1:.:19:7,12:4,4:3,8 | |
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| 30424 chr22 38145929 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=4;GPV=7.7752e-12;SPV=0.33973 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:14,11:7,5:7,6 0/1:.:36:17,19:8,13:9,6 | |
| 30425 chr22 38146067 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=10;GPV=8.8612e-15;SPV=0.087436 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:12,7:8,9 0/1:.:33:12,21:8,8:4,13 | |
| 30426 chr22 38146339 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.0601e-12;SPV=0.89907 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:11,14:10,8 0/1:.:26:16,10:12,3:4,7 | |
| 30427 chr22 38146492 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=5.5248e-15;SPV=0.58713 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:9,8:10,12 0/1:.:35:17,18:7,5:10,13 | |
| 30428 chr22 38146606 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=5.4067e-14;SPV=0.75294 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:30,24:17,12:13,12 0/1:.:33:20,13:13,4:7,9 | |
| 30429 chr22 38147280 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=4.1486e-16;SPV=0.65696 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:15,10:9,16 0/1:.:30:15,15:11,5:4,10 | |
| 30430 chr22 38147446 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=6;GPV=1.5731e-10;SPV=0.25006 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:28,14:13,8:15,6 0/1:.:32:18,14:6,8:12,6 | |
| 30431 chr22 38149055 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=6;GPV=3.6641e-16;SPV=0.22126 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:7,10:13,7 0/1:.:42:18,24:7,13:11,11 | |
| 30432 chr22 38149356 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=1;GPV=1.8611e-17;SPV=0.76873 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:13,11:9,13 0/1:.:45:24,21:14,8:10,13 | |
| 30433 chr22 38149612 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.039314 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:8,7:11,9 0/1:.:33:10,23:3,15:7,8 | |
| 30434 chr22 38149801 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=5.9984e-21;SPV=0.70135 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:17,28:8,18:9,10 0/1:.:39:16,23:12,16:4,7 | |
| 30435 chr22 38150111 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=6.58e-14;SPV=0.92854 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:8,7:9,13 0/1:.:40:24,16:11,5:13,11 | |
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| 30437 chr22 38155159 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=3.5446e-19;SPV=0.70504 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:13,27:7,10:6,17 0/1:.:28:10,18:4,9:6,9 | |
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| 30496 chr22 38195818 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,26:0,20 1/1:.:26:0,26:0,17:0,9 | |
| 30497 chr22 38196960 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=4.3182e-16;SPV=0.96623 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:14,25:6,13:8,12 0/1:.:33:18,15:8,6:10,9 | |
| 30498 chr22 38197121 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=3;GPV=3.2889e-10;SPV=0.45165 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:8,9:12,7 0/1:.:20:10,10:6,5:4,5 | |
| 30499 chr22 38197421 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=6;GPV=2.8393e-15;SPV=0.23375 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:8,7:6,9 0/1:.:32:11,21:9,12:2,9 | |
| 30500 chr22 38197634 . T A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 1/1:.:32:0,32:0,11:0,21 | |
| 30501 chr22 38197800 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,26:0,16 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 30502 chr22 38197895 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 | |
| 30503 chr22 38197923 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
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| 30505 chr22 38198562 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,27:0,15 1/1:.:36:0,36:0,25:0,11 | |
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| 30553 chr22 38230550 . G T . PASS DP=76;SS=1;SSC=4;GPV=2.4531e-16;SPV=0.34333 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:9,11:14,13 0/1:.:29:12,17:4,11:8,6 | |
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| 30555 chr22 38232300 . C A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 1/1:.:25:0,25:0,9:0,16 | |
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| 30557 chr22 38232578 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=8;GPV=5.0119e-12;SPV=0.1274 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:32,16:19,7:13,9 0/1:.:33:17,16:7,10:10,6 | |
| 30558 chr22 38232733 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=9;GPV=1.0403e-12;SPV=0.12534 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:27,17:12,9:15,8 0/1:.:29:13,16:6,10:7,6 | |
| 30559 chr22 38233513 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 1/1:.:27:0,27:0,9:0,18 | |
| 30560 chr22 38233893 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:21:0,21:0,12:0,9 | |
| 30561 chr22 38234266 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,19:0,24 1/1:.:22:0,22:0,11:0,11 | |
| 30562 chr22 38234281 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 1/1:.:21:0,21:0,11:0,10 | |
| 30563 chr22 38234950 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:17:0,17:0,10:0,7 | |
| 30564 chr22 38235762 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 30565 chr22 38237419 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=1.1315e-12;SPV=0.54009 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:13,10:10,8 0/1:.:33:18,15:12,10:6,5 | |
| 30566 chr22 38237660 . A C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,26:0,21 1/1:.:41:0,41:0,16:0,25 | |
| 30567 chr22 38238260 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 1/1:.:36:0,36:0,23:0,13 | |
| 30568 chr22 38238382 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 1/1:.:37:0,37:0,23:0,14 | |
| 30569 chr22 38239353 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=7.8903e-14;SPV=0.77092 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:9,9:10,9 0/1:.:42:24,18:13,11:11,7 | |
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| 30621 chr22 38277784 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=9.1061e-12;SPV=0.86611 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:10,14:17,8 0/1:.:26:17,9:5,5:12,4 | |
| 30622 chr22 38278454 . A T . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=1.5635e-16;SPV=0.75809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:17,24:12,12:5,12 0/1:.:32:15,17:5,9:10,8 | |
| 30623 chr22 38278833 . C T . PASS DP=44;SS=1;SSC=2;GPV=1.5811e-07;SPV=0.52753 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:4,7:14,6 0/1:.:13:7,6:2,3:5,3 | |
| 30624 chr22 38278994 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.8059e-17;SPV=0.83645 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:21,30:11,11:10,19 0/1:.:26:13,13:4,7:9,6 | |
| 30625 chr22 38279732 . C A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=5.0247e-17;SPV=0.83078 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:6,7:13,18 0/1:.:37:19,18:7,8:12,10 | |
| 30626 chr22 38280010 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=2;GPV=2.4621e-08;SPV=0.51581 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:23,12:11,6:12,6 0/1:.:27:17,10:7,4:10,6 | |
| 30627 chr22 38280416 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=5;GPV=1.8121e-08;SPV=0.27644 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:21,11:11,5:10,6 0/1:.:24:13,11:6,7:7,4 | |
| 30628 chr22 38280417 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=5;GPV=5.2124e-10;SPV=0.28359 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,13:9,5:7,8 0/1:.:22:9,12:4,7:5,5 | |
| 30629 chr22 38280831 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=4;GPV=9.2779e-11;SPV=0.39111 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:6,6:11,9 0/1:.:22:10,12:5,7:5,5 | |
| 30630 chr22 38281055 . G A . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=1.4682e-08;SPV=0.99146 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:6,13:0,2:6,11 0/1:.:22:14,8:2,1:12,7 | |
| 30631 chr22 38281443 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=1.6064e-11;SPV=0.90187 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:27,24:16,11:11,13 0/1:.:18:12,6:6,3:6,3 | |
| 30632 chr22 38281961 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.5381e-13;SPV=0.86262 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:8,9:7,11 0/1:.:30:16,14:5,9:11,5 | |
| 30633 chr22 38282558 . T G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 1/1:.:27:0,27:0,18:0,9 | |
| 30634 chr22 38283399 . T G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=6.5868e-13;SPV=0.94274 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:15,23:9,9:6,14 0/1:.:21:12,9:5,6:7,3 | |
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| 30684 chr22 38366021 . C A . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.0405e-07;SPV=0.79439 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:14,10:8,3:6,7 0/1:.:29:19,10:12,6:7,4 | |
| 30685 chr22 38367787 . A G . PASS DP=44;SS=1;SSC=5;GPV=2.0219e-08;SPV=0.26354 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:12,8:5,5:7,3 0/1:.:24:11,13:2,6:9,7 | |
| 30686 chr22 38367910 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=3.4211e-15;SPV=0.57397 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:5,14:10,7 0/1:.:27:11,16:6,8:5,8 | |
| 30687 chr22 38368383 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=1.7985e-10;SPV=0.82036 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:10,6:6,9 0/1:.:30:18,12:10,6:8,6 | |
| 30688 chr22 38368727 . C A . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=1.4722e-11;SPV=0.54342 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:7,9:10,8 0/1:.:23:11,12:8,8:3,4 | |
| 30689 chr22 38369029 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 | |
| 30690 chr22 38369333 . C A . PASS DP=58;SS=1;SSC=5;GPV=1.6514e-11;SPV=0.29268 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:12,9:10,2:2,7 0/1:.:37:17,20:9,8:8,12 | |
| 30691 chr22 38370224 . C A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.2446e-15;SPV=0.87099 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:10,14:5,5 0/1:.:46:25,21:14,13:11,8 | |
| 30692 chr22 38373016 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=2;GPV=1.6778e-09;SPV=0.54611 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:13,11:4,8:9,3 0/1:.:27:14,13:5,3:9,10 | |
| 30693 chr22 38373206 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=5;GPV=7.0184e-11;SPV=0.31364 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:19,13:11,5:8,8 0/1:.:30:15,15:11,9:4,6 | |
| 30694 chr22 38373517 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=1.3489e-13;SPV=0.61089 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:9,10:5,6 0/1:.:34:16,18:7,9:9,9 | |
| 30695 chr22 38375835 . C G . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=1.19e-16;SPV=0.77092 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:6,14:13,10 0/1:.:36:18,18:11,11:7,7 | |
| 30696 chr22 38378398 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=2.0525e-15;SPV=0.92589 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:11,20:4,13:7,7 0/1:.:36:18,18:10,10:8,8 | |
| 30697 chr22 38378735 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=8.49e-10;SPV=0.94831 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:4,10:11,7 0/1:.:23:15,8:11,3:4,5 | |
| 30698 chr22 38379588 . T G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 1/1:.:27:0,27:0,17:0,10 | |
| 30699 chr22 38379965 . C G . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=4.4405e-12;SPV=0.75729 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:6,8:9,7 0/1:.:36:20,16:10,8:10,8 | |
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| 30748 chr22 38427131 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=3;GPV=5.8861e-19;SPV=0.40545 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:12,16:11,8 0/1:.:43:19,24:10,13:9,11 | |
| 30749 chr22 38428628 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=7.191e-13;SPV=0.47037 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:11,11:10,7 0/1:.:30:15,15:5,6:10,9 | |
| 30750 chr22 38429103 . A G . PASS DP=38;SS=1;SSC=0;GPV=2.68e-07;SPV=0.85701 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:11,12:3,8:8,4 0/1:.:15:9,6:1,3:8,3 | |
| 30751 chr22 38430390 . G A . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=1.3144e-17;SPV=0.97234 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:25,30:11,12:14,18 0/1:.:43:27,16:18,10:9,6 | |
| 30752 chr22 38435656 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=6;GPV=8.056e-13;SPV=0.24776 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:28,16:19,7:9,9 0/1:.:39:21,18:15,4:6,14 | |
| 30753 chr22 38436405 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=1.1883e-17;SPV=0.49925 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:13,12:7,12 0/1:.:35:15,20:7,11:8,9 | |
| 30754 chr22 38436753 . T A . PASS DP=73;SS=1;SSC=3;GPV=2.8926e-12;SPV=0.41078 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:11,11:13,6 0/1:.:32:17,15:6,10:11,5 | |
| 30755 chr22 38437261 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=7.3294e-21;SPV=0.75703 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:21,34:11,16:10,18 0/1:.:30:13,17:7,12:6,5 | |
| 30756 chr22 38439001 . G T . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=2.4283e-11;SPV=0.66564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:26,18:13,10:13,8 0/1:.:31:19,12:7,6:12,6 | |
| 30757 chr22 38441005 . G A . PASS DP=91;SS=1;SSC=4;GPV=6.249e-18;SPV=0.37938 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:11,9:11,11 0/1:.:49:23,26:15,9:8,17 | |
| 30758 chr22 38442725 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,22:0,12 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 | |
| 30759 chr22 38443480 . C A . PASS DP=94;SS=1;SSC=7;GPV=7.0123e-24;SPV=0.1591 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:25,33:10,20:15,13 0/1:.:36:11,25:6,12:5,13 | |
| 30760 chr22 38444108 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=9;GPV=4.6768e-16;SPV=0.10976 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:8,9:16,9 0/1:.:39:16,23:8,11:8,12 | |
| 30761 chr22 38446037 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 1/1:.:34:0,34:0,22:0,12 | |
| 30762 chr22 38450885 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,23:0,21 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
| 30763 chr22 38452198 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,25:0,16 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 | |
| 30764 chr22 38452517 . G A . PASS DP=101;SS=1;SSC=1;GPV=2.4886e-19;SPV=0.75787 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:25,27:12,17:13,10 0/1:.:49:26,23:9,12:17,11 | |
| 30765 chr22 38453414 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=5.8059e-16;SPV=0.97629 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:19,30:11,15:8,15 0/1:.:25:15,10:7,5:8,5 | |
| 30766 chr22 38455072 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 1/1:.:42:0,42:0,29:0,13 | |
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| 30825 chr22 38620398 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 1/1:.:49:0,49:0,29:0,20 | |
| 30826 chr22 38622174 . T A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 1/1:.:42:0,42:0,19:0,23 | |
| 30827 chr22 38628956 . G T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,13:0,24 1/1:.:19:0,19:0,12:0,7 | |
| 30828 chr22 38630867 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=3;GPV=4.9663e-15;SPV=0.47963 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:18,13:7,8 0/1:.:37:19,18:6,8:13,10 | |
| 30829 chr22 38634879 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=7;GPV=1.3846e-12;SPV=0.19463 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:14,7:6,8 0/1:.:30:13,17:5,7:8,10 | |
| 30830 chr22 38636265 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 30831 chr22 38662955 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 | |
| 30832 chr22 38666235 . T A . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=1.1744e-10;SPV=0.66546 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:11,9:13,8 0/1:.:28:17,11:11,7:6,4 | |
| 30833 chr22 38667647 . A G . PASS DP=97;SS=1;SSC=8;GPV=1.0479e-24;SPV=0.13189 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:10,20:13,9 0/1:.:45:14,31:8,12:6,19 | |
| 30834 chr22 38677205 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,25:0,19 1/1:.:28:0,28:0,11:0,17 | |
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| 30836 chr22 38702738 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
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| 30892 chr22 38801225 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=7.9203e-12;SPV=0.52151 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:16,11:12,9 0/1:.:25:14,11:8,5:6,6 | |
| 30893 chr22 38801764 . T A . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=8.0283e-15;SPV=0.5174 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:16,22:6,11:10,11 0/1:.:23:9,14:4,6:5,8 | |
| 30894 chr22 38801934 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.0403e-12;SPV=0.93728 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:9,13:13,10 0/1:.:28:18,10:12,8:6,2 | |
| 30895 chr22 38802235 . G T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=2.2152e-16;SPV=0.8635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:8,12:13,13 0/1:.:38:21,17:11,8:10,9 | |
| 30896 chr22 38803610 . C T . PASS DP=34;SS=1;SSC=0;GPV=3.7603e-09;SPV=0.95789 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:1,12:0,6:1,6 1/1:.:13:2,6:0,2:2,4 | |
| 30897 chr22 38803931 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=3.2317e-11;SPV=0.65332 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:10,9:13,10 0/1:.:23:13,10:7,4:6,6 | |
| 30898 chr22 38804638 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 30899 chr22 38804958 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 1/1:.:25:0,25:0,16:0,9 | |
| 30900 chr22 38805010 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=4;GPV=4.5813e-10;SPV=0.38672 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:15,9:7,6 0/1:.:23:12,11:9,7:3,4 | |
| 30901 chr22 38806012 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=5;GPV=1.2581e-11;SPV=0.28107 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:10,5:14,12 0/1:.:25:12,13:4,9:8,4 | |
| 30902 chr22 38806386 . G T . PASS DP=38;SS=1;SSC=1;GPV=9.2415e-08;SPV=0.74259 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:10,11:9,9:1,2 0/1:.:17:9,8:5,6:4,2 | |
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| 30962 chr22 38859586 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,29:0,20 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 | |
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| 30964 chr22 38859888 . G C . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,32:0,20 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 | |
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| 30966 chr22 38861392 . G A . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,26:0,29 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 | |
| 30967 chr22 38862073 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,35:0,26 1/1:.:34:0,34:0,24:0,10 | |
| 30968 chr22 38862546 . G A . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=8.4556e-18;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,13:0,6:0,7 1/1:.:25:0,17:0,7:0,10 | |
| 30969 chr22 38865130 . C G . PASS DP=106;SS=1;SSC=2;GPV=1.9065e-22;SPV=0.53716 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:28,32:15,18:13,14 0/1:.:46:21,25:13,14:8,11 | |
| 30970 chr22 38868420 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=5.0311e-18;SPV=0.83385 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:17,25:4,13:13,12 0/1:.:39:19,20:14,8:5,12 | |
| 30971 chr22 38869598 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=1.3846e-12;SPV=0.56018 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:14,10:6,9 0/1:.:26:13,13:6,9:7,4 | |
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| 31033 chr22 38896312 . A G . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=7.9107e-15;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,6:0,3 1/1:.:16:0,16:0,8:0,8 | |
| 31034 chr22 38896351 . T C . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=5.7269e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,9:0,8 1/1:.:20:0,20:0,10:0,10 | |
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| 31037 chr22 38897218 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
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| 31099 chr22 38954574 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,28:0,16 1/1:.:26:0,26:0,9:0,17 | |
| 31100 chr22 38956452 . T G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,21:0,25 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
| 31101 chr22 38956453 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,23:0,26 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 | |
| 31102 chr22 38956649 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=1.1574e-12;SPV=0.79783 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:32,22:17,13:15,9 0/1:.:35:23,12:14,7:9,5 | |
| 31103 chr22 38958386 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,6:0,22 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
| 31104 chr22 38966728 . A G . PASS DP=93;SS=1;SSC=7;GPV=1.9118e-16;SPV=0.19231 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:30,21:17,8:13,13 0/1:.:42:20,22:12,14:8,8 | |
| 31105 chr22 38967825 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=2.8662e-18;SPV=0.90123 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:21,30:12,17:9,13 0/1:.:34:18,16:6,9:12,7 | |
| 31106 chr22 38968406 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=24;GPV=1;SPV=0.0036006 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:17,27:10,13:7,14 0/1:.:27:20,7:11,3:9,4 | |
| 31107 chr22 38969160 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=3;GPV=2.0619e-14;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:8,9:12,9 0/1:.:38:19,19:13,7:6,12 | |
| 31108 chr22 38969771 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=6;GPV=1.1213e-16;SPV=0.21971 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:10,12:9,9 0/1:.:31:11,20:6,13:5,7 | |
| 31109 chr22 38970113 . T C . PASS DP=24;SS=1;SSC=0;GPV=3.101e-14;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,7:0,7 1/1:.:10:0,10:0,2:0,8 | |
| 31110 chr22 38970957 . A T . PASS DP=106;SS=1;SSC=0;GPV=5.2046e-25;SPV=0.93886 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:19,35:10,20:9,15 0/1:.:52:25,27:15,16:10,11 | |
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| 31112 chr22 38973135 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=4;GPV=5.3416e-11;SPV=0.38732 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:22,13:10,7:12,6 0/1:.:37:21,16:8,9:13,7 | |
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| 31159 chr22 39009174 . A C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=3.9286e-14;SPV=0.97473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:9,14:10,12 0/1:.:27:17,10:8,5:9,5 | |
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| 31162 chr22 39009937 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=3;GPV=3.7283e-09;SPV=0.40796 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:23,13:10,10:13,3 0/1:.:26:15,11:5,2:10,9 | |
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| 31164 chr22 39010706 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=3.841e-15;SPV=0.91329 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:29,27:14,15:15,12 0/1:.:36:23,13:11,6:12,7 | |
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| 31166 chr22 39011111 . G A . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=7.1315e-15;SPV=0.96736 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:28,25:16,16:12,9 0/1:.:48:33,15:22,8:11,7 | |
| 31167 chr22 39011394 . T C . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=2.8631e-15;SPV=0.87276 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:33,26:19,16:14,10 0/1:.:43:28,15:15,8:13,7 | |
| 31168 chr22 39011541 . G T . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=5.0311e-18;SPV=0.64809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:9,10:12,17 0/1:.:33:15,18:5,7:10,11 | |
| 31169 chr22 39011680 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=3.2213e-16;SPV=0.56761 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:10,12:11,11 0/1:.:34:16,18:8,12:8,6 | |
| 31170 chr22 39012302 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=6.8291e-20;SPV=0.8704 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:19,28:6,14:13,14 0/1:.:44:22,22:12,8:10,14 | |
| 31171 chr22 39012836 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=6;GPV=5.9795e-14;SPV=0.20222 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:27,20:10,8:17,12 0/1:.:29:13,16:5,6:8,10 | |
| 31172 chr22 39013440 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=5;GPV=3.013e-20;SPV=0.25631 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:27,33:19,13:8,20 0/1:.:26:9,17:4,9:5,8 | |
| 31173 chr22 39014495 . C G . PASS DP=54;SS=1;SSC=3;GPV=1.0051e-11;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:13,14:2,4:11,10 0/1:.:27:12,15:3,6:9,9 | |
| 31174 chr22 39014939 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=5.2028e-13;SPV=0.88991 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:12,7:11,15 0/1:.:32:20,12:4,7:16,5 | |
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| 31292 chr22 39105039 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=4;GPV=2.6864e-14;SPV=0.35067 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:10,10:7,10 0/1:.:24:9,15:4,7:5,8 | |
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| 31294 chr22 39105818 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=8.6835e-16;SPV=0.88642 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:9,13:12,14 0/1:.:29:16,13:9,3:7,10 | |
| 31295 chr22 39106690 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=2.7512e-17;SPV=0.63443 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:15,23:9,10:6,13 0/1:.:32:13,19:10,9:3,10 | |
| 31296 chr22 39108597 . C A . PASS DP=91;SS=1;SSC=2;GPV=3.55e-15;SPV=0.51355 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:29,22:15,14:14,8 0/1:.:40:22,18:8,10:14,8 | |
| 31297 chr22 39109217 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 1/1:.:28:0,28:0,8:0,20 | |
| 31298 chr22 39109227 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=1.4855e-11;SPV=0.55709 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:13,9:9,8 0/1:.:29:16,13:3,5:13,8 | |
| 31299 chr22 39109388 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.029272 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:27,20:11,12:16,8 0/1:.:28:9,19:5,14:4,5 | |
| 31300 chr22 39110197 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.5381e-13;SPV=0.87207 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:13,18:10,12:3,6 0/1:.:34:18,16:8,10:10,6 | |
| 31301 chr22 39110577 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=1.4154e-13;SPV=0.58713 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:8,10:11,7 0/1:.:38:20,18:11,7:9,11 | |
| 31302 chr22 39111474 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=6.2985e-12;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:8,5:12,10 0/1:.:35:19,16:14,9:5,7 | |
| 31303 chr22 39113154 . C G . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=3.1261e-20;SPV=0.94264 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:23,31:15,19:8,12 0/1:.:48:27,21:13,14:14,7 | |
| 31304 chr22 39113582 . G C . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=6.5235e-17;SPV=0.78786 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:7,15:10,6 0/1:.:45:23,22:9,11:14,11 | |
| 31305 chr22 39114856 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=8;GPV=8.2973e-14;SPV=0.13372 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:10,6:12,11 0/1:.:30:12,18:4,8:8,10 | |
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| 31307 chr22 39118329 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
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| 31357 chr22 39210066 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=2.1366e-11;SPV=0.81143 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:11,9:13,10 0/1:.:30:19,11:8,5:11,6 | |
| 31358 chr22 39210313 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=4;GPV=5.0547e-18;SPV=0.36154 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:12,16:5,10 0/1:.:25:8,17:5,10:3,7 | |
| 31359 chr22 39210689 . C A . PASS DP=64;SS=1;SSC=7;GPV=4.0856e-15;SPV=0.16639 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:9,12:9,7 0/1:.:27:9,18:7,11:2,7 | |
| 31360 chr22 39210740 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:25:0,25:0,15:0,10 | |
| 31361 chr22 39210928 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=2;GPV=8.49e-10;SPV=0.56822 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:6,5:10,8 0/1:.:26:14,12:6,6:8,6 | |
| 31362 chr22 39211921 . G T . PASS DP=18;SS=1;SSC=0;GPV=1.1019e-10;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:0,9:0,4:0,5 1/1:.:9:0,9:0,7:0,2 | |
| 31363 chr22 39212467 . G T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.1404e-14;SPV=0.79874 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:8,13:5,7 0/1:.:30:14,16:5,9:9,7 | |
| 31364 chr22 39213004 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
| 31365 chr22 39213510 . G C . PASS DP=51;SS=1;SSC=6;GPV=4.3121e-14;SPV=0.234 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:3,1:10,18 0/1:.:19:5,14:0,5:5,9 | |
| 31366 chr22 39213527 . T C . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,2:0,26 1/1:.:16:0,16:0,2:0,14 | |
| 31367 chr22 39213746 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=1.1315e-12;SPV=0.67984 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:14,12:6,5 0/1:.:37:21,16:14,13:7,3 | |
| 31368 chr22 39214434 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,19:0,27 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 | |
| 31369 chr22 39214642 . A C . PASS DP=70;SS=1;SSC=6;GPV=1.5594e-19;SPV=0.23186 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:17,27:4,11:13,16 0/1:.:26:7,19:1,9:6,10 | |
| 31370 chr22 39215448 . T A . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=2.4655e-13;SPV=0.73314 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:8,4:11,16 0/1:.:30:16,14:6,3:10,11 | |
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| 31417 chr22 39247930 . A C . PASS DP=18;SS=1;SSC=0;GPV=3.7078e-06;SPV=0.85294 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:9:2,7:0,3:2,4 0/1:.:9:3,6:0,3:3,3 | |
| 31418 chr22 39248268 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=2.8075e-15;SPV=0.37205 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:9,9:7,8 0/1:.:36:15,21:12,13:3,8 | |
| 31419 chr22 39249311 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=10;GPV=1.0669e-14;SPV=0.097131 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:27,18:14,8:13,10 0/1:.:35:15,20:9,12:6,8 | |
| 31420 chr22 39250196 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=6;GPV=1.0476e-18;SPV=0.22515 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:11,9:13,15 0/1:.:38:15,23:9,12:6,11 | |
| 31421 chr22 39250762 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=2.7625e-15;SPV=0.90338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:14,8:13,19 0/1:.:34:21,13:11,9:10,4 | |
| 31422 chr22 39251085 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=5;GPV=3.2999e-18;SPV=0.30489 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:18,7:6,17 0/1:.:38:16,22:9,10:7,12 | |
| 31423 chr22 39251235 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,24:0,23 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 31424 chr22 39251575 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=1.4126e-14;SPV=0.66836 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:18,16:7,6 0/1:.:36:20,16:15,8:5,8 | |
| 31425 chr22 39252092 . A G . PASS DP=106;SS=1;SSC=6;GPV=1.1977e-18;SPV=0.20963 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:66:38,28:17,15:21,13 0/1:.:40:19,21:11,13:8,8 | |
| 31426 chr22 39259031 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=4;GPV=1.8643e-13;SPV=0.34231 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:27,20:10,9:17,11 0/1:.:30:15,15:6,8:9,7 | |
| 31427 chr22 39260218 . C A . PASS DP=89;SS=1;SSC=12;GPV=4.5631e-21;SPV=0.053165 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:25,25:14,14:11,11 0/1:.:39:12,27:4,11:8,16 | |
| 31428 chr22 39262537 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=5.8719e-16;SPV=0.54113 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:11,7:9,12 0/1:.:44:22,22:13,8:9,14 | |
| 31429 chr22 39262621 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 1/1:.:42:0,42:0,26:0,16 | |
| 31430 chr22 39263083 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.6045e-17;SPV=0.75206 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:10,21:10,5 0/1:.:35:17,18:11,12:6,6 | |
| 31431 chr22 39263482 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=5.4147e-14;SPV=0.74113 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:9,12:13,10 0/1:.:31:17,14:10,5:7,9 | |
| 31432 chr22 39263722 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=6;GPV=7.8163e-15;SPV=0.21302 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:10,10:12,7 0/1:.:38:17,21:11,9:6,12 | |
| 31433 chr22 39263768 . C T . PASS DP=105;SS=1;SSC=2;GPV=4.4301e-20;SPV=0.62155 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:30,30:16,15:14,15 0/1:.:45:23,22:13,12:10,10 | |
| 31434 chr22 39264185 . A G . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,33:0,25 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 | |
| 31435 chr22 39264824 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=8.2973e-14;SPV=0.35024 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:7,8:14,11 0/1:.:29:13,16:6,5:7,11 | |
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| 31437 chr22 39265082 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=1.4813e-17;SPV=0.91564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:12,18:8,8 0/1:.:43:24,19:16,12:8,7 | |
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| 31489 chr22 39295888 . C A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,28:0,16 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
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| 31493 chr22 39298220 . A C . PASS DP=89;SS=1;SSC=3;GPV=5.1181e-19;SPV=0.48733 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:8,11:11,10 0/1:.:49:22,27:11,15:11,12 | |
| 31494 chr22 39298589 . C G . PASS DP=84;SS=1;SSC=5;GPV=2.0818e-20;SPV=0.25392 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:11,14:12,15 0/1:.:32:11,21:6,11:5,10 | |
| 31495 chr22 39298617 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,20:0,26 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 | |
| 31496 chr22 39298934 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=1.1134e-08;SPV=0.57071 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:26,14:20,7:6,7 0/1:.:25:16,9:5,6:11,3 | |
| 31497 chr22 39299176 . G T . PASS DP=94;SS=1;SSC=1;GPV=3.2424e-19;SPV=0.72374 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:23,27:13,9:10,18 0/1:.:44:22,22:14,14:8,8 | |
| 31498 chr22 39299500 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=2.0753e-17;SPV=0.80381 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:12,12:12,14 0/1:.:42:23,19:9,7:14,12 | |
| 31499 chr22 39300124 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=8.221e-09;SPV=0.5415 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:18,11:6,9:12,2 0/1:.:30:18,12:9,7:9,5 | |
| 31500 chr22 39300477 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=8.9089e-11;SPV=0.82984 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:11,11:11,8 0/1:.:24:15,9:8,5:7,4 | |
| 31501 chr22 39300633 . C A . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=4.794e-13;SPV=0.64787 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:14,10:10,10 0/1:.:32:18,14:12,8:6,6 | |
| 31502 chr22 39300882 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,25:0,20 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 31503 chr22 39301007 . G C . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,23:0,33 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 | |
| 31504 chr22 39301336 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=2.0619e-14;SPV=0.77752 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:14,12:9,12 0/1:.:29:16,13:10,7:6,6 | |
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| 31551 chr22 39330554 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,15:0,20 1/1:.:27:0,27:0,17:0,10 | |
| 31552 chr22 39330804 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=2;GPV=2.3224e-12;SPV=0.58646 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:6,11:11,7 0/1:.:25:12,13:4,7:8,6 | |
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| 31554 chr22 39332304 . C T . PASS DP=41;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.035633 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:14,9:12,5:2,4 0/1:.:18:5,13:2,6:3,7 | |
| 31555 chr22 39332570 . C A . PASS DP=77;SS=1;SSC=8;GPV=3.879e-12;SPV=0.12691 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:24,12:15,5:9,7 0/1:.:41:21,20:11,7:10,13 | |
| 31556 chr22 39332709 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 | |
| 31557 chr22 39333552 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=8;GPV=1.3843e-19;SPV=0.12869 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:16,17:11,10 0/1:.:34:12,22:9,15:3,7 | |
| 31558 chr22 39333661 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=4.794e-13;SPV=0.60885 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:16,14:11,8 0/1:.:27:15,12:8,7:7,5 | |
| 31559 chr22 39333787 . C A . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,27:0,31 1/1:.:43:0,43:0,17:0,26 | |
| 31560 chr22 39333956 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=3.2684e-19;SPV=0.90368 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:21,32:11,17:10,15 0/1:.:33:17,16:9,11:8,5 | |
| 31561 chr22 39334027 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=2;GPV=6.5425e-16;SPV=0.60668 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:15,12:11,13 0/1:.:33:17,16:13,10:4,6 | |
| 31562 chr22 39334125 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=4.0755e-11;SPV=0.69353 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:11,7:12,11 0/1:.:27:16,11:9,6:7,5 | |
| 31563 chr22 39334695 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,28:0,20 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 | |
| 31564 chr22 39334912 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,15:0,20 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 31565 chr22 39335380 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=4.9547e-08;SPV=0.85907 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:15,12:7,3 0/1:.:20:14,6:3,2:11,4 | |
| 31566 chr22 39335565 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=6.0302e-11;SPV=0.55704 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:30,19:17,12:13,7 0/1:.:25:15,10:11,6:4,4 | |
| 31567 chr22 39335719 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=5.3169e-12;SPV=0.83659 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:32,23:8,11:24,12 0/1:.:27:18,9:3,3:15,6 | |
| 31568 chr22 39335737 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=8.6928e-11;SPV=0.71475 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:34,20:10,10:24,10 0/1:.:27:18,9:6,4:12,5 | |
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| 31570 chr22 39336660 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,27:0,22 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
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| 31615 chr22 39369599 . C G . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=3.2606e-19;SPV=0.58506 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:13,22:4,10:9,12 0/1:.:38:14,24:7,12:7,12 | |
| 31616 chr22 39370435 . C G . PASS DP=81;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.029311 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:26,15:12,7:14,8 0/1:.:40:16,24:6,8:10,16 | |
| 31617 chr22 39371006 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=2.6279e-15;SPV=0.71178 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:14,9:9,16 0/1:.:29:15,14:5,6:10,8 | |
| 31618 chr22 39372429 . C T . PASS DP=29;SS=1;SSC=2;GPV=2.6068e-06;SPV=0.55002 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:10,10:5,6:5,4 0/1:.:9:4,5:3,4:1,1 | |
| 31619 chr22 39373090 . G T . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=2.5259e-14;SPV=0.62256 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:11,14:13,8 0/1:.:32:17,15:6,7:11,8 | |
| 31620 chr22 39373325 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=8;GPV=7.2383e-18;SPV=0.13069 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:11,14:10,8 0/1:.:33:11,22:6,12:5,10 | |
| 31621 chr22 39373813 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=6.0779e-13;SPV=0.67707 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:28,22:16,13:12,9 0/1:.:29:17,12:9,9:8,3 | |
| 31622 chr22 39374592 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=5;GPV=2.0308e-13;SPV=0.31319 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:16,8:12,12 0/1:.:30:15,15:8,8:7,7 | |
| 31623 chr22 39374775 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=9;GPV=2.8411e-14;SPV=0.12252 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:32,17:13,8:19,9 0/1:.:43:22,21:10,12:12,9 | |
| 31624 chr22 39378235 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=6;GPV=3.7814e-18;SPV=0.20021 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:15,12:11,12 0/1:.:37:15,22:5,7:10,15 | |
| 31625 chr22 39378443 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
| 31626 chr22 39378520 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
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| 31630 chr22 39379263 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,23:0,24 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 | |
| 31631 chr22 39379395 . A T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
| 31632 chr22 39379578 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,27:0,15 1/1:.:27:0,27:0,9:0,18 | |
| 31633 chr22 39379645 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=7;GPV=8.1842e-23;SPV=0.18991 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:7,26:3,15:4,11 1/1:.:24:2,21:2,8:0,13 | |
| 31634 chr22 39379781 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,24:0,22 1/1:.:23:0,23:0,12:0,11 | |
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| 31679 chr22 39416981 . C A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 1/1:.:44:0,44:0,24:0,20 | |
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| 31682 chr22 39423044 . G C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,17:0,32 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
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| 31689 chr22 39426111 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,24:0,28 1/1:.:27:0,27:0,10:0,17 | |
| 31690 chr22 39427010 . A G . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,26:0,32 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 | |
| 31691 chr22 39428445 . C T . PASS DP=114;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:68:0,68:0,34:0,34 1/1:.:46:0,46:0,24:0,22 | |
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| 31693 chr22 39429317 . T G . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,32:0,28 1/1:.:39:0,39:0,26:0,13 | |
| 31694 chr22 39429487 . A T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,20:0,27 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 | |
| 31695 chr22 39430783 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,23:0,24 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 | |
| 31696 chr22 39431548 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,24:0,25 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 | |
| 31697 chr22 39432720 . A G . PASS DP=95;SS=1;SSC=2;GPV=1.0426e-22;SPV=0.62266 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:24,35:13,15:11,20 0/1:.:36:15,21:8,10:7,11 | |
| 31698 chr22 39433081 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=3.6681e-13;SPV=0.75769 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:12,11:13,8 0/1:.:42:26,16:14,11:12,5 | |
| 31699 chr22 39433731 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
| 31700 chr22 39433968 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 31701 chr22 39434118 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=7.7239e-15;SPV=0.82675 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:29,26:17,17:12,9 0/1:.:33:20,13:14,6:6,7 | |
| 31702 chr22 39435273 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,19:0,24 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
| 31703 chr22 39435981 . T A . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,29:0,26 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 | |
| 31704 chr22 39436108 . A G . PASS DP=90;SS=1;SSC=2;GPV=4.9177e-17;SPV=0.51313 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:27,25:14,17:13,8 0/1:.:38:19,19:13,15:6,4 | |
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| 31706 chr22 39438097 . C G . PASS DP=40;SS=1;SSC=0;GPV=9.3017e-24;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,1:0,22 1/1:.:17:0,17:0,0:0,17 | |
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| 31751 chr22 39464125 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,27:0,10 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 | |
| 31752 chr22 39464584 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 | |
| 31753 chr22 39464863 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 31754 chr22 39466336 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,31:0,19 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
| 31755 chr22 39469470 . A G . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=1.5531e-19;SPV=0.98299 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:21,32:11,19:10,13 0/1:.:44:26,18:16,12:10,6 | |
| 31756 chr22 39471656 . C G . PASS DP=85;SS=1;SSC=11;GPV=2.4776e-16;SPV=0.077752 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:9,10:15,6 0/1:.:45:19,26:12,11:7,15 | |
| 31757 chr22 39473204 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
| 31758 chr22 39473714 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=3.6893e-16;SPV=0.55427 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:11,14:8,10 0/1:.:28:12,16:6,6:6,10 | |
| 31759 chr22 39473992 . T G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 1/1:.:30:0,30:0,11:0,19 | |
| 31760 chr22 39476068 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=4.1486e-16;SPV=0.86351 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:22,27:12,16:10,11 0/1:.:31:17,14:11,8:6,6 | |
| 31761 chr22 39476122 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:30:0,30:0,21:0,9 | |
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| 31763 chr22 39478309 . A C . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,19:0,34 1/1:.:40:0,40:0,14:0,26 | |
| 31764 chr22 39478785 . A G . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,22:0,33 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 | |
| 31765 chr22 39479590 . G C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 | |
| 31766 chr22 39479961 . T G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 1/1:.:39:0,38:0,13:0,25 | |
| 31767 chr22 39480055 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=5.8719e-16;SPV=0.83808 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:12,13:7,9 0/1:.:42:23,19:11,10:12,9 | |
| 31768 chr22 39480833 . A G . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=1.8728e-19;SPV=0.97858 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:19,32:9,14:10,18 0/1:.:39:22,17:10,7:12,10 | |
| 31769 chr22 39482993 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=7;GPV=1.1086e-15;SPV=0.19289 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:28,24:17,12:11,12 0/1:.:27:11,16:5,6:6,10 | |
| 31770 chr22 39483674 . A T . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=4.3049e-14;SPV=0.59002 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:5,5:10,13 0/1:.:31:14,17:9,5:5,12 | |
| 31771 chr22 39484995 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=1.8081e-15;SPV=0.73933 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:10,14:9,9 0/1:.:32:16,16:6,11:10,5 | |
| 31772 chr22 39485135 . T G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=8.6835e-16;SPV=0.88712 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:20,26:10,14:10,12 0/1:.:31:17,14:9,7:8,7 | |
| 31773 chr22 39491681 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=11;GPV=1.1391e-19;SPV=0.075579 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:12,11:10,13 0/1:.:34:10,24:5,11:5,13 | |
| 31774 chr22 39492769 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,32:0,16 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
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| 31776 chr22 39501158 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=7;GPV=2.0579e-15;SPV=0.19251 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:9,9:14,11 0/1:.:32:13,19:10,8:3,11 | |
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| 31825 chr22 39578585 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=7;GPV=1.8643e-13;SPV=0.19946 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:29,20:17,11:12,9 0/1:.:28:13,15:6,6:7,9 | |
| 31826 chr22 39579410 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=3.7814e-18;SPV=0.58341 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:25,28:10,15:15,13 0/1:.:34:16,18:4,8:12,10 | |
| 31827 chr22 39579686 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=2.4655e-13;SPV=0.36675 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:10,7:15,15 0/1:.:22:10,12:2,9:8,3 | |
| 31828 chr22 39579909 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.8496e-17;SPV=0.86595 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:17,24:12,11:5,13 0/1:.:41:21,20:11,12:10,8 | |
| 31829 chr22 39582034 . T G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,29:0,19 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 | |
| 31830 chr22 39583506 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 1/1:.:27:0,27:0,16:0,11 | |
| 31831 chr22 39584970 . T G . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,31:0,27 1/1:.:28:0,28:0,9:0,19 | |
| 31832 chr22 39585808 . C G . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=1.4722e-11;SPV=0.88207 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:8,7:6,11 0/1:.:25:14,11:4,5:10,6 | |
| 31833 chr22 39586716 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 1/1:.:23:0,23:0,10:0,13 | |
| 31834 chr22 39587939 . A C . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 1/1:.:21:0,21:0,7:0,14 | |
| 31835 chr22 39588081 . A T . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 1/1:.:24:0,24:0,14:0,10 | |
| 31836 chr22 39588389 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=5;GPV=1.8121e-08;SPV=0.31253 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:11,7:8,3 0/1:.:27:15,12:4,6:11,6 | |
| 31837 chr22 39588831 . G T . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=4.5631e-21;SPV=0.71167 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:20,30:7,19:13,11 0/1:.:39:17,22:4,10:13,12 | |
| 31838 chr22 39588868 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,29:0,20 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 | |
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| 31893 chr22 39628763 . C A . PASS DP=103;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.041913 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:35,30:15,14:20,16 0/1:.:38:13,25:8,13:5,12 | |
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| 31895 chr22 39629232 . G C . PASS DP=78;SS=1;SSC=5;GPV=1.0137e-17;SPV=0.29578 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:11,10:12,16 0/1:.:29:11,18:4,6:7,12 | |
| 31896 chr22 39630136 . C A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.0403e-12;SPV=0.85165 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:12,10:11,12 0/1:.:28:17,11:11,3:6,8 | |
| 31897 chr22 39630304 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=4.1212e-16;SPV=0.64051 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:29,26:12,11:17,15 0/1:.:35:19,16:15,12:4,4 | |
| 31898 chr22 39630943 . A T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=7.8903e-14;SPV=0.8061 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:8,7:14,14 0/1:.:36:21,15:9,9:12,6 | |
| 31899 chr22 39631516 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=5.6303e-12;SPV=0.97441 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:8,8:14,12 0/1:.:41:29,12:11,6:18,6 | |
| 31900 chr22 39631651 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=5;GPV=1.2905e-14;SPV=0.25337 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:15,6:9,11 0/1:.:41:20,21:11,8:9,13 | |
| 31901 chr22 39632190 . T C . PASS DP=102;SS=1;SSC=1;GPV=1.4543e-16;SPV=0.74363 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:19,13:10,11 0/1:.:49:29,20:17,12:12,8 | |
| 31902 chr22 39634472 . C A . PASS DP=86;SS=1;SSC=3;GPV=1.3655e-13;SPV=0.45147 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:31,21:16,8:15,13 0/1:.:34:19,15:8,8:11,7 | |
| 31903 chr22 39635627 . G T . PASS DP=97;SS=1;SSC=4;GPV=5.0692e-20;SPV=0.32147 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:31,31:13,21:18,10 0/1:.:35:15,20:10,10:5,10 | |
| 31904 chr22 39635689 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=4.4277e-12;SPV=0.42492 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:33,21:22,10:11,11 0/1:.:25:14,11:8,4:6,7 | |
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| 31906 chr22 39636872 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=8;GPV=1.973e-16;SPV=0.15277 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:8,15:19,7 0/1:.:34:14,20:6,9:8,11 | |
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| 31964 chr22 39716530 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=8;GPV=2.3775e-13;SPV=0.12759 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:33,15:13,6:20,9 0/1:.:47:26,21:13,10:13,11 | |
| 31965 chr22 39716936 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=2.0241e-17;SPV=0.91989 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:15,26:5,12:10,14 0/1:.:34:17,17:6,14:11,3 | |
| 31966 chr22 39720542 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=4;GPV=5.1181e-19;SPV=0.35675 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:7,8:10,9 0/1:.:55:24,31:9,12:15,19 | |
| 31967 chr22 39720812 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=7;GPV=9.6585e-18;SPV=0.16951 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:13,11:6,12 0/1:.:29:9,20:4,6:5,14 | |
| 31968 chr22 39721392 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=7.9293e-13;SPV=0.83807 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:6,8:12,11 0/1:.:33:19,14:13,7:6,7 | |
| 31969 chr22 39722468 . A G . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=3.4393e-24;SPV=0.97254 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:17,34:11,17:6,17 0/1:.:52:26,26:18,12:8,14 | |
| 31970 chr22 39723790 . C G . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=2.0525e-15;SPV=0.65917 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:6,6:11,17 0/1:.:27:12,15:6,7:6,8 | |
| 31971 chr22 39723978 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=2.4655e-13;SPV=0.4615 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:13,14:9,6 0/1:.:27:13,14:9,3:4,11 | |
| 31972 chr22 39724139 . T A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=2.5259e-14;SPV=0.95594 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:26,29:11,14:15,15 0/1:.:23:15,8:7,6:8,2 | |
| 31973 chr22 39724281 . C G . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.1753e-14;SPV=0.65999 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:9,13:15,9 0/1:.:35:19,16:12,11:7,5 | |
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| 32030 chr22 39883088 . A C . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=3.0926e-11;SPV=0.79288 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:12,15:4,9:8,6 0/1:.:27:14,13:9,6:5,7 | |
| 32031 chr22 39883526 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=3.4211e-15;SPV=0.60785 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:14,20:8,10:6,10 0/1:.:29:12,17:7,9:5,8 | |
| 32032 chr22 39884029 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=7.6319e-16;SPV=0.61933 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:25,28:13,13:12,15 0/1:.:23:11,12:3,3:8,9 | |
| 32033 chr22 39885671 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=1.7361e-15;SPV=0.59547 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:8,12:9,11 0/1:.:26:11,15:6,7:5,8 | |
| 32034 chr22 39885691 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=3;GPV=6.4956e-13;SPV=0.41216 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:11,9:9,8 0/1:.:31:15,16:8,8:7,8 | |
| 32035 chr22 39890016 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,24:0,19 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 32036 chr22 39890751 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=5;GPV=2.3224e-12;SPV=0.3029 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:8,6:8,8 0/1:.:30:13,17:7,8:6,9 | |
| 32037 chr22 39892381 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=5.7384e-17;SPV=0.44668 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:13,12:13,15 0/1:.:29:13,16:7,8:6,8 | |
| 32038 chr22 39892826 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=4;GPV=1.5805e-15;SPV=0.3412 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:9,8:11,12 0/1:.:33:14,19:8,9:6,10 | |
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| 32097 chr22 39967544 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=2.95e-15;SPV=0.40811 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:17,15:8,8 0/1:.:30:14,16:11,13:3,3 | |
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| 32162 chr22 40079583 . A T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=1.1819e-13;SPV=0.85244 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:14,17:11,5 0/1:.:37:23,14:14,8:9,6 | |
| 32163 chr22 40083807 . G A . PASS DP=45;SS=1;SSC=8;GPV=7.724e-09;SPV=0.13257 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:11,6:6,4:5,2 0/1:.:28:12,16:3,8:9,8 | |
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| 32166 chr22 40089023 . A T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=4.9663e-15;SPV=0.88314 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:12,10:7,11 0/1:.:43:25,18:15,9:10,9 | |
| 32167 chr22 40089815 . A C . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=1.3284e-10;SPV=0.70699 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:11,9:12,7 0/1:.:32:20,12:8,6:12,6 | |
| 32168 chr22 40097856 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=5.6671e-10;SPV=0.44045 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:19,12:15,8:4,4 0/1:.:32:18,14:11,11:7,3 | |
| 32169 chr22 40099135 . A C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.0856e-15;SPV=0.87533 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:13,22:8,15:5,7 0/1:.:29:14,15:11,12:3,3 | |
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| 32221 chr22 40162591 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=3.3502e-13;SPV=0.69584 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:13,13:7,6 0/1:.:33:18,15:8,6:10,9 | |
| 32222 chr22 40164596 . G C . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=7.2254e-08;SPV=0.8852 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:9,9:5,4 0/1:.:20:13,7:9,4:4,3 | |
| 32223 chr22 40164806 . C A . PASS DP=42;SS=1;SSC=5;GPV=5.4836e-09;SPV=0.27324 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:11,9:8,5:3,4 0/1:.:22:9,13:2,6:7,7 | |
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| 32225 chr22 40165755 . G T . PASS DP=70;SS=1;SSC=4;GPV=3.2512e-15;SPV=0.32307 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:9,5:8,12 0/1:.:36:15,21:10,13:5,8 | |
| 32226 chr22 40165959 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=1.4766e-14;SPV=0.98842 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:18,27:6,17:12,10 0/1:.:30:18,10:10,4:8,6 | |
| 32227 chr22 40166873 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=1.7586e-19;SPV=0.99065 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:14,34:5,17:9,17 0/1:.:28:15,13:7,4:8,9 | |
| 32228 chr22 40167016 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6365e-15;SPV=0.85727 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:14,21:9,10:5,11 0/1:.:32:16,16:7,9:9,7 | |
| 32229 chr22 40167681 . C A . PASS DP=38;SS=1;SSC=4;GPV=7.5297e-07;SPV=0.35955 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:11,7:9,5:2,2 0/1:.:20:10,10:4,8:6,2 | |
| 32230 chr22 40170114 . T C . PASS DP=42;SS=1;SSC=1;GPV=5.5097e-10;SPV=0.73519 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:12,17:3,5:9,12 0/1:.:13:6,7:1,1:5,6 | |
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| 32234 chr22 40171890 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=1.7586e-19;SPV=0.51176 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:18,28:12,13:6,15 0/1:.:30:11,19:9,9:2,10 | |
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| 32290 chr22 40223704 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=5;GPV=1.0977e-18;SPV=0.30403 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:9,11:11,13 0/1:.:35:13,22:3,11:10,11 | |
| 32291 chr22 40223775 . C A . PASS DP=85;SS=1;SSC=3;GPV=2.0941e-21;SPV=0.47481 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:22,33:11,16:11,17 0/1:.:30:11,19:5,6:6,13 | |
| 32292 chr22 40224463 . C A . PASS DP=77;SS=1;SSC=3;GPV=2.6279e-15;SPV=0.44345 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:14,11:10,12 0/1:.:30:14,16:8,5:6,11 | |
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| 32295 chr22 40227245 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=8;GPV=1.9611e-10;SPV=0.13795 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:11,10:8,5 0/1:.:17:6,11:0,7:6,4 | |
| 32296 chr22 40227426 . T C . PASS DP=38;SS=1;SSC=4;GPV=9.0682e-10;SPV=0.3323 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:11,14:7,7:4,7 0/1:.:13:4,9:1,3:3,6 | |
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| 32299 chr22 40228543 . A G . PASS DP=47;SS=1;SSC=6;GPV=1.0643e-11;SPV=0.20358 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:12,13:9,11:3,2 0/1:.:22:7,15:6,12:1,3 | |
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| 32349 chr22 40284696 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=8;GPV=2.1236e-16;SPV=0.13554 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:10,9:11,10 0/1:.:35:13,22:9,9:4,13 | |
| 32350 chr22 40288279 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=2;GPV=7.7158e-19;SPV=0.5207 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:8,9:10,13 0/1:.:44:19,25:10,14:9,11 | |
| 32351 chr22 40290122 . C A . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,20:0,34 1/1:.:43:0,43:0,17:0,26 | |
| 32352 chr22 40291753 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=2;GPV=2.7815e-13;SPV=0.57783 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:27,20:14,16:13,4 0/1:.:35:20,15:10,12:10,3 | |
| 32353 chr22 40292913 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=8.056e-13;SPV=0.91806 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:9,10:12,9 0/1:.:43:28,15:10,7:18,8 | |
| 32354 chr22 40293375 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=5.295e-10;SPV=0.98749 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:9,11:10,9 0/1:.:23:17,6:9,2:8,4 | |
| 32355 chr22 40298166 . T A . PASS DP=65;SS=1;SSC=4;GPV=3.2317e-11;SPV=0.36909 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:20,14:12,7:8,7 0/1:.:31:16,15:6,9:10,6 | |
| 32356 chr22 40298311 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,27:0,14 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
| 32357 chr22 40298715 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=8.4463e-20;SPV=0.88317 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:16,27:6,17:10,10 0/1:.:42:20,22:12,10:8,12 | |
| 32358 chr22 40301577 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=3.125e-12;SPV=0.77868 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:12,10:9,8 0/1:.:35:21,14:8,10:13,4 | |
| 32359 chr22 40307884 . C G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=5.693e-13;SPV=0.88133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:14,21:8,17:6,4 0/1:.:23:12,11:9,2:3,9 | |
| 32360 chr22 40308048 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=3.6885e-12;SPV=0.86926 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:8,8:5,11 0/1:.:23:12,11:7,9:5,2 | |
| 32361 chr22 40317857 . T A . PASS DP=88;SS=1;SSC=6;GPV=1.1653e-16;SPV=0.20266 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:33,27:14,12:19,15 0/1:.:28:12,16:7,6:5,10 | |
| 32362 chr22 40319299 . A G . PASS DP=52;SS=1;SSC=1;GPV=6.8522e-13;SPV=0.67224 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:9,14:5,7:4,7 0/1:.:29:12,17:6,8:6,9 | |
| 32363 chr22 40319899 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=3.7958e-17;SPV=0.58412 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:12,12:9,13 0/1:.:33:15,18:7,8:8,10 | |
| 32364 chr22 40320618 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=5;GPV=1.3693e-11;SPV=0.26551 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:11,7:9,6 0/1:.:34:17,17:8,8:9,9 | |
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| 32409 chr22 40543906 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=1.0148e-14;SPV=0.51081 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:7,8:9,9 0/1:.:37:17,20:9,9:8,11 | |
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| 32411 chr22 40547028 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=5;GPV=2.6615e-19;SPV=0.3131 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:21,28:8,15:13,13 0/1:.:29:10,19:6,12:4,7 | |
| 32412 chr22 40549066 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=7.191e-13;SPV=0.38585 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:13,12:10,7 0/1:.:27:13,14:10,7:3,7 | |
| 32413 chr22 40550101 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=5;GPV=1.3596e-16;SPV=0.31489 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:8,8:14,13 0/1:.:37:16,21:10,10:6,11 | |
| 32414 chr22 40550303 . A C . PASS DP=81;SS=1;SSC=4;GPV=9.3487e-14;SPV=0.33475 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:27,19:18,12:9,7 0/1:.:35:18,17:6,2:12,15 | |
| 32415 chr22 40552657 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=7;GPV=3.125e-12;SPV=0.15961 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:27,16:14,8:13,8 0/1:.:31:15,16:9,7:6,9 | |
| 32416 chr22 40554777 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=7.8903e-14;SPV=0.43094 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:15,15:12,6 0/1:.:31:16,15:7,6:9,9 | |
| 32417 chr22 40559560 . A T . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=1.8275e-16;SPV=0.61854 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:14,21:9,7:5,14 0/1:.:32:13,19:7,9:6,10 | |
| 32418 chr22 40563256 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=10;GPV=3.6448e-13;SPV=0.089995 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:7,10:16,9 0/1:.:21:7,14:2,5:5,9 | |
| 32419 chr22 40563916 . C A . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=1.4766e-14;SPV=0.79316 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:2,14:15,6 0/1:.:36:19,17:9,8:10,9 | |
| 32420 chr22 40565290 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=9.7292e-12;SPV=0.86868 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:13,6:13,15 0/1:.:29:19,10:9,5:10,5 | |
| 32421 chr22 40568384 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=3;GPV=7.2464e-10;SPV=0.48325 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:22,13:10,5:12,8 0/1:.:32:19,13:8,8:11,5 | |
| 32422 chr22 40570492 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=8.8612e-15;SPV=0.4207 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:7,12:12,8 0/1:.:30:13,17:6,12:7,5 | |
| 32423 chr22 40573789 . C G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.4855e-11;SPV=0.91112 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:9,8:10,11 0/1:.:30:19,11:10,9:9,2 | |
| 32424 chr22 40576543 . C T . PASS DP=57;SS=3;SSC=17;GPV=1;SPV=0.018406 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:7,12:11,8 1/1:.:19:3,16:3,9:0,7 | |
| 32425 chr22 40580584 . C G . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=4.4405e-12;SPV=0.59159 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:6,7:11,8 0/1:.:34:18,16:8,12:10,4 | |
| 32426 chr22 40581936 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=6.5895e-16;SPV=0.61483 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:9,15:4,4:5,11 0/1:.:37:14,23:8,8:6,15 | |
| 32427 chr22 40582114 . C G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=5.8079e-10;SPV=0.83485 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:11,13:6,10:5,3 0/1:.:27:15,12:8,5:7,7 | |
| 32428 chr22 40591726 . T G . PASS DP=70;SS=1;SSC=6;GPV=9.3121e-14;SPV=0.23671 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:8,7:12,9 0/1:.:34:15,19:3,7:12,12 | |
| 32429 chr22 40596511 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=7.3575e-14;SPV=0.75364 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:9,16:12,8 0/1:.:23:12,11:6,6:6,5 | |
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| 32431 chr22 40602445 . A C . PASS DP=67;SS=1;SSC=4;GPV=6.4906e-14;SPV=0.36683 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:10,11:6,4 0/1:.:36:16,20:8,10:8,10 | |
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| 32548 chr22 40831082 . C G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,22:0,20 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
| 32549 chr22 40835049 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 32550 chr22 40836339 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,20:0,27 1/1:.:48:0,48:0,21:0,27 | |
| 32551 chr22 40837385 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=2.781e-14;SPV=0.87348 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:15,14:8,10 0/1:.:32:19,13:9,10:10,3 | |
| 32552 chr22 40845941 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 1/1:.:22:0,22:0,9:0,13 | |
| 32553 chr22 40847168 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=1.8765e-12;SPV=0.78547 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:14,10:5,9 0/1:.:30:17,13:7,8:10,5 | |
| 32554 chr22 40848394 . C G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 32555 chr22 40851934 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 1/1:.:37:0,37:0,11:0,26 | |
| 32556 chr22 40852027 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 1/1:.:39:0,39:0,15:0,24 | |
| 32557 chr22 40853518 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
| 32558 chr22 40856287 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=3.7814e-18;SPV=0.94231 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:19,28:12,14:7,14 0/1:.:40:22,18:7,11:15,7 | |
| 32559 chr22 40860798 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,12:0,12 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
| 32560 chr22 40870526 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.0786e-09;SPV=0.86083 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:11,8:8,9 0/1:.:22:14,8:10,6:4,2 | |
| 32561 chr22 40872921 . T G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,27:0,23 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 32562 chr22 40876139 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,15:0,34 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
| 32563 chr22 40892023 . T G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 32564 chr22 40895726 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=1.3809e-19;SPV=0.53673 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:17,24:12,11:5,13 0/1:.:40:16,24:7,14:9,10 | |
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| 32566 chr22 40901097 . A T . PASS DP=73;SS=1;SSC=8;GPV=2.8926e-12;SPV=0.14092 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:23,13:9,6:14,7 0/1:.:37:18,19:7,8:11,11 | |
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| 32622 chr22 41027879 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,27:0,10 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 32623 chr22 41027900 . A T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,33:0,12 1/1:.:27:0,27:0,16:0,11 | |
| 32624 chr22 41028049 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 1/1:.:42:0,42:0,15:0,27 | |
| 32625 chr22 41028061 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,17:0,27 1/1:.:39:0,39:0,14:0,25 | |
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| 32628 chr22 41030873 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,28:0,20 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
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| 32630 chr22 41032973 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=7;GPV=1.7502e-16;SPV=0.17951 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:7,10:18,11 0/1:.:36:15,21:4,14:11,7 | |
| 32631 chr22 41033080 . G A . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
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| 32692 chr22 41075443 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
| 32693 chr22 41077057 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,21:0,11 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 32694 chr22 41077862 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 1/1:.:29:0,29:0,19:0,10 | |
| 32695 chr22 41078073 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 32696 chr22 41080333 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 | |
| 32697 chr22 41080795 . A C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,19:0,23 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
| 32698 chr22 41081186 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=1.9669e-13;SPV=0.63528 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:9,12:12,10 0/1:.:24:12,12:3,4:9,8 | |
| 32699 chr22 41082478 . G A . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 1/1:.:19:0,19:0,15:0,4 | |
| 32700 chr22 41083636 . C G . PASS DP=50;SS=1;SSC=10;GPV=5.635e-11;SPV=0.091318 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:12,8:8,3:4,5 0/1:.:30:11,19:7,14:4,5 | |
| 32701 chr22 41083668 . G A . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=9.6314e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,8:0,9 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 | |
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| 32703 chr22 41088923 . G C . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,10:0,18 1/1:.:26:0,26:0,9:0,17 | |
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| 32753 chr22 41142107 . C G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 1/1:.:28:0,28:0,12:0,16 | |
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| 32755 chr22 41143420 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 1/1:.:41:0,41:0,14:0,27 | |
| 32756 chr22 41144275 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,18:0,30 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 32757 chr22 41145020 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:33:0,33:0,12:0,21 | |
| 32758 chr22 41145523 . G C . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,24:0,32 1/1:.:42:0,42:0,26:0,16 | |
| 32759 chr22 41149607 . G C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,14:0,24 1/1:.:34:0,34:0,12:0,22 | |
| 32760 chr22 41149619 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=5.8427e-13;SPV=0.73449 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:6,8:12,11 0/1:.:30:16,14:8,4:8,10 | |
| 32761 chr22 41151412 . C G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 32762 chr22 41152004 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 32763 chr22 41153005 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,25:0,23 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 32764 chr22 41153293 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 1/1:.:35:0,35:0,14:0,21 | |
| 32765 chr22 41153917 . A C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 | |
| 32766 chr22 41154950 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
| 32767 chr22 41155035 . T A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,19:0,23 1/1:.:25:0,25:0,15:0,10 | |
| 32768 chr22 41162228 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,23:0,21 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 32769 chr22 41163211 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,12:0,32 1/1:.:27:0,27:0,10:0,17 | |
| 32770 chr22 41166173 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,15:0,20 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 | |
| 32771 chr22 41168283 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
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| 32773 chr22 41170591 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,22:0,11 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
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| 32825 chr22 41222876 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
| 32826 chr22 41223346 . T A . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,25:0,22 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 | |
| 32827 chr22 41224821 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=2;GPV=7.3839e-17;SPV=0.57678 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:12,16:11,8 0/1:.:37:18,19:10,10:8,9 | |
| 32828 chr22 41225710 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 | |
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| 32830 chr22 41230659 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,19:0,24 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
| 32831 chr22 41231523 . A G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,30:0,15 1/1:.:48:0,48:0,19:0,29 | |
| 32832 chr22 41231771 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,15:0,25 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 | |
| 32833 chr22 41231920 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,19:0,26 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 | |
| 32834 chr22 41232136 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 | |
| 32835 chr22 41232366 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 | |
| 32836 chr22 41239200 . C G . PASS DP=108;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:65:0,65:0,29:0,36 1/1:.:43:0,43:0,12:0,31 | |
| 32837 chr22 41241115 . G T . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,28:0,29 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 32838 chr22 41243724 . T G . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,16:0,10 1/1:.:29:0,29:0,19:0,10 | |
| 32839 chr22 41244094 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,18:0,26 1/1:.:34:0,34:0,24:0,10 | |
| 32840 chr22 41244655 . C T . PASS DP=108;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,26:0,32 1/1:.:50:0,50:0,20:0,30 | |
| 32841 chr22 41244846 . T C . PASS DP=103;SS=1;SSC=1;GPV=8.9855e-19;SPV=0.633 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:29,27:17,13:12,14 0/1:.:47:25,22:19,13:6,9 | |
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| 32899 chr22 41287802 . A C . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=8.7033e-16;SPV=0.74421 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:17,24:9,13:8,11 0/1:.:28:13,15:6,9:7,6 | |
| 32900 chr22 41287999 . A T . PASS DP=71;SS=1;SSC=3;GPV=1.3284e-10;SPV=0.49041 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:29,18:14,8:15,10 0/1:.:24:14,10:5,4:9,6 | |
| 32901 chr22 41288089 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=1.8199e-14;SPV=0.51036 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:12,15:8,8 0/1:.:23:10,13:6,9:4,4 | |
| 32902 chr22 41288422 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=4.3774e-11;SPV=0.33206 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:28,18:19,6:9,12 0/1:.:23:12,11:5,5:7,6 | |
| 32903 chr22 41289933 . G C . PASS DP=86;SS=1;SSC=10;GPV=1.3655e-13;SPV=0.091865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:32,17:17,7:15,10 0/1:.:37:18,19:5,10:13,9 | |
| 32904 chr22 41290158 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=4.7339e-09;SPV=0.87023 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:8,4:7,11 0/1:.:21:13,8:4,3:9,5 | |
| 32905 chr22 41291661 . G C . PASS DP=52;SS=1;SSC=2;GPV=2.1991e-10;SPV=0.60906 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:13,13:7,5:6,8 0/1:.:26:13,13:9,5:4,8 | |
| 32906 chr22 41291849 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=2.4078e-13;SPV=0.6801 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:5,9:9,9 0/1:.:28:13,15:3,7:10,8 | |
| 32907 chr22 41292546 . C G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 1/1:.:31:0,31:0,23:0,8 | |
| 32908 chr22 41293403 . A C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,23:0,27 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
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| 32956 chr22 41345540 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=5;GPV=3.2981e-15;SPV=0.28905 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:11,9:12,10 0/1:.:37:17,20:5,9:12,11 | |
| 32957 chr22 41346784 . A T . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=9.5353e-13;SPV=0.68173 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:8,10:11,7 0/1:.:36:20,16:9,6:11,10 | |
| 32958 chr22 41346984 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=3;GPV=6.7529e-11;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:24,14:13,3:11,11 0/1:.:38:23,15:11,8:12,7 | |
| 32959 chr22 41348018 . C G . PASS DP=88;SS=1;SSC=5;GPV=3.3945e-16;SPV=0.26724 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:12,7:14,13 0/1:.:42:20,22:11,11:9,11 | |
| 32960 chr22 41349351 . A G . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,24:0,26 1/1:.:44:0,44:0,26:0,18 | |
| 32961 chr22 41350208 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=5.8427e-13;SPV=0.98142 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:6,6:7,14 0/1:.:34:21,13:9,6:12,7 | |
| 32962 chr22 41354618 . T C . PASS DP=92;SS=1;SSC=1;GPV=2.4857e-19;SPV=0.70465 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:24,29:10,12:14,17 0/1:.:39:19,20:5,10:14,10 | |
| 32963 chr22 41357565 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
| 32964 chr22 41366519 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=1.0137e-17;SPV=0.86095 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:16,25:9,16:7,9 0/1:.:37:18,19:9,12:9,7 | |
| 32965 chr22 41371482 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=2.4219e-17;SPV=0.68037 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:7,10:11,11 0/1:.:45:22,23:4,11:18,12 | |
| 32966 chr22 41372858 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=2.7365e-11;SPV=0.77329 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:27,19:15,13:12,6 0/1:.:31:20,11:9,4:11,7 | |
| 32967 chr22 41379537 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.046194 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:11,14:10,10 0/1:.:41:11,30:9,15:2,15 | |
| 32968 chr22 41381096 . G T . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=4.6768e-16;SPV=0.62333 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:15,17:11,10 0/1:.:28:14,14:7,8:7,6 | |
| 32969 chr22 41381291 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=5.88e-11;SPV=0.82846 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:5,8:14,11 0/1:.:22:13,9:4,3:9,6 | |
| 32970 chr22 41381457 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=5.8925e-20;SPV=0.9334 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:16,30:10,13:6,17 0/1:.:37:18,19:8,11:10,8 | |
| 32971 chr22 41381938 . C T . PASS DP=96;SS=1;SSC=3;GPV=2.489e-16;SPV=0.44366 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:29,22:19,16:10,6 0/1:.:45:24,21:19,12:5,9 | |
| 32972 chr22 41385090 . C G . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=8.038e-16;SPV=0.77458 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:26,26:15,15:11,11 0/1:.:34:19,15:10,7:9,8 | |
| 32973 chr22 41387655 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=4;GPV=1.3095e-14;SPV=0.39338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:7,5:14,15 0/1:.:31:14,17:8,9:6,8 | |
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| 32975 chr22 41388863 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=7;GPV=8.9089e-11;SPV=0.17637 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:20,11:10,8:10,3 0/1:.:34:17,17:10,8:7,9 | |
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| 33032 chr22 41426301 . T G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 | |
| 33033 chr22 41426789 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 | |
| 33034 chr22 41426852 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 33035 chr22 41427622 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 | |
| 33036 chr22 41427799 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=6.0487e-10;SPV=0.9429 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:8,8:9,8 0/1:.:31:21,10:8,5:13,5 | |
| 33037 chr22 41428832 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,26:0,24 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 33038 chr22 41429338 . T G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,26:0,17 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
| 33039 chr22 41430104 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=3;GPV=4.2407e-10;SPV=0.46615 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:8,5:10,8 0/1:.:28:15,13:9,3:6,10 | |
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| 33091 chr22 41493359 . A T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,22:0,25 1/1:.:25:0,25:0,17:0,8 | |
| 33092 chr22 41499050 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,21:0,29 1/1:.:36:0,36:0,14:0,22 | |
| 33093 chr22 41499405 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=6;GPV=3.9286e-14;SPV=0.23854 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:8,6:14,12 0/1:.:32:14,18:8,12:6,6 | |
| 33094 chr22 41506499 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=5.6815e-11;SPV=0.68485 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:11,7:12,9 0/1:.:34:21,13:14,5:7,8 | |
| 33095 chr22 41507809 . A C . PASS DP=88;SS=1;SSC=2;GPV=2.7625e-15;SPV=0.5704 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:12,11:17,13 0/1:.:35:19,16:11,10:8,6 | |
| 33096 chr22 41509274 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=1.1574e-13;SPV=0.76699 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:5,9:14,11 0/1:.:33:18,15:9,6:9,9 | |
| 33097 chr22 41510321 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=5;GPV=7.3738e-16;SPV=0.28692 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:6,5:11,14 0/1:.:32:12,20:3,9:9,11 | |
| 33098 chr22 41511281 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 | |
| 33099 chr22 41512401 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.6242e-17;SPV=0.85274 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:19,28:10,13:9,15 0/1:.:28:14,14:9,7:5,7 | |
| 33100 chr22 41515521 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=4.2301e-08;SPV=0.79203 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:11,10:7,3 0/1:.:23:15,8:7,1:8,7 | |
| 33101 chr22 41516746 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=2.0601e-12;SPV=0.75399 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:11,11:9,8 0/1:.:30:17,13:6,7:11,6 | |
| 33102 chr22 41517409 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.047272 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:30,16:14,8:16,8 0/1:.:42:19,23:5,9:14,14 | |
| 33103 chr22 41517473 . T C . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=1.229e-21;SPV=0.96771 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:21,33:5,17:16,16 0/1:.:49:27,22:11,8:16,14 | |
| 33104 chr22 41517840 . A G . PASS DP=108;SS=1;SSC=0;GPV=7.9558e-24;SPV=0.87704 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:26,38:14,20:12,18 0/1:.:44:22,22:15,11:7,11 | |
| 33105 chr22 41518589 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=5;GPV=7.2639e-16;SPV=0.30473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:10,11:16,10 0/1:.:38:18,20:10,12:8,8 | |
| 33106 chr22 41518856 . T G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=1.1808e-19;SPV=0.83801 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:7,13:10,13 0/1:.:44:21,23:12,12:9,11 | |
| 33107 chr22 41519809 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=0.00069868;SPV=0.68377 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:42,7:20,4:22,3 0/1:.:23:20,3:9,1:11,2 | |
| 33108 chr22 41519997 . C G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.8806e-09;SPV=0.82995 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:25,17:15,9:10,8 0/1:.:25:17,8:6,3:11,5 | |
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| 33110 chr22 41527640 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=3.7425e-15;SPV=0.76531 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:6,14:13,10 0/1:.:28:14,14:11,6:3,8 | |
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| 33167 chr22 41626031 . C G . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
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| 33169 chr22 41631081 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=2.7419e-13;SPV=0.42476 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:11,12:12,8 0/1:.:27:13,14:10,6:3,8 | |
| 33170 chr22 41631500 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
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| 33229 chr22 41686325 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=3.4041e-18;SPV=0.61847 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:7,18:5,14:2,4 0/1:.:32:9,23:1,16:8,7 | |
| 33230 chr22 41686493 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,40:0,19:0,21 1/1:.:22:0,22:0,7:0,15 | |
| 33231 chr22 41686787 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,26:0,17 1/1:.:21:0,21:0,12:0,9 | |
| 33232 chr22 41687025 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=8;GPV=2.8183e-16;SPV=0.12691 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:18,13:6,8 0/1:.:32:12,20:7,15:5,5 | |
| 33233 chr22 41689486 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,16:0,28 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 | |
| 33234 chr22 41691272 . C T . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=8.9137e-21;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,9:0,10 1/1:.:17:0,16:0,7:0,9 | |
| 33235 chr22 41692154 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,26:0,18 1/1:.:20:0,20:0,10:0,10 | |
| 33236 chr22 41692577 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,21:0,25 1/1:.:23:0,23:0,12:0,11 | |
| 33237 chr22 41693619 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,21:0,24 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
| 33238 chr22 41694065 . A C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,26:0,25 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 | |
| 33239 chr22 41696221 . C A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,32:0,19 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
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| 33242 chr22 41701234 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 1/1:.:36:0,36:0,15:0,21 | |
| 33243 chr22 41701458 . A T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 1/1:.:37:0,37:0,14:0,23 | |
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| 33296 chr22 41738535 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=2;GPV=2.6362e-18;SPV=0.53996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:12,15:12,9 0/1:.:45:22,23:12,9:10,14 | |
| 33297 chr22 41738786 . T A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 1/1:.:26:0,26:0,16:0,10 | |
| 33298 chr22 41738891 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,29:0,22 1/1:.:35:0,35:0,23:0,12 | |
| 33299 chr22 41739747 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 | |
| 33300 chr22 41740926 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
| 33301 chr22 41742102 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,33:0,18 1/1:.:26:0,26:0,17:0,9 | |
| 33302 chr22 41742196 . G T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,26:0,26 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 33303 chr22 41743050 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,25:0,16 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
| 33304 chr22 41743074 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,20:0,23 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
| 33305 chr22 41743497 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,16:0,26 1/1:.:25:0,25:0,7:0,18 | |
| 33306 chr22 41744156 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
| 33307 chr22 41745448 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 1/1:.:32:0,32:0,11:0,21 | |
| 33308 chr22 41745636 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,27:0,16 1/1:.:22:0,22:0,13:0,9 | |
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| 33310 chr22 41746382 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,13:0,28 1/1:.:38:0,38:0,25:0,13 | |
| 33311 chr22 41747533 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,27:0,16 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 | |
| 33312 chr22 41747568 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,23:0,20 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 | |
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| 33314 chr22 41748368 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=5.9795e-14;SPV=0.61987 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:13,8:10,13 0/1:.:32:17,15:10,12:7,3 | |
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| 33362 chr22 41789182 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=5.2318e-13;SPV=0.59929 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:14,9:6,11 0/1:.:26:13,13:8,8:5,5 | |
| 33363 chr22 41790262 . T G . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=3.2811e-12;SPV=0.35722 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:9,9:10,7 0/1:.:28:13,15:8,8:5,7 | |
| 33364 chr22 41792887 . C G . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=3.9143e-11;SPV=0.70434 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:15,16:6,7:9,9 0/1:.:25:13,12:6,8:7,4 | |
| 33365 chr22 41793131 . G A . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.2355e-09;SPV=0.80994 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:13,15:5,8:8,7 0/1:.:20:11,9:5,4:6,5 | |
| 33366 chr22 41793226 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=1.7754e-37;SPV=0.54545 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:1,35:0,21:1,14 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 33367 chr22 41793380 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=3;GPV=2.2152e-16;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:11,13:13,10 0/1:.:37:18,19:7,10:11,9 | |
| 33368 chr22 41793403 . T G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,25:0,24 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 | |
| 33369 chr22 41793547 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 33370 chr22 41794305 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=4.9663e-15;SPV=0.99222 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:20,27:11,13:9,14 0/1:.:36:24,12:13,7:11,5 | |
| 33371 chr22 41798557 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 1/1:.:26:0,26:0,13:0,13 | |
| 33372 chr22 41798563 . C G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 33373 chr22 41798720 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=4;GPV=9.3487e-14;SPV=0.35191 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:21,13:7,7 0/1:.:33:17,16:14,10:3,6 | |
| 33374 chr22 41798724 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,34:0,14 1/1:.:33:0,33:0,25:0,8 | |
| 33375 chr22 41800463 . A G . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,26:0,27 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 | |
| 33376 chr22 41800907 . C G . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=8.4968e-24;SPV=0.6514 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:15,31:9,12:6,19 0/1:.:38:13,25:5,13:8,12 | |
| 33377 chr22 41801266 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.0403e-12;SPV=0.95328 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:11,14:9,8 0/1:.:31:20,11:9,4:11,7 | |
| 33378 chr22 41802089 . G C . PASS DP=63;SS=1;SSC=17;GPV=1;SPV=0.01705 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:8,6:9,7 0/1:.:33:9,24:3,16:6,8 | |
| 33379 chr22 41802533 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=2.783e-13;SPV=0.42823 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:9,6:7,11 0/1:.:28:12,16:2,7:10,9 | |
| 33380 chr22 41803043 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=1.7027e-12;SPV=0.73888 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:10,9:8,9 0/1:.:31:17,14:11,10:6,4 | |
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| 33382 chr22 41804320 . A C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:35:0,35:0,14:0,21 | |
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| 33428 chr22 41851691 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=8;GPV=5.6671e-10;SPV=0.15835 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:23,12:13,8:10,4 0/1:.:28:14,14:7,6:7,8 | |
| 33429 chr22 41851928 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 1/1:.:23:0,23:0,14:0,9 | |
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| 33431 chr22 41855186 . T A . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=2.005e-09;SPV=0.90568 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:11,10:3,5 0/1:.:24:15,9:8,4:7,5 | |
| 33432 chr22 41855806 . G T . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=1.1473e-10;SPV=0.74955 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:11,12:8,7 0/1:.:18:10,8:4,7:6,1 | |
| 33433 chr22 41856585 . C G . PASS DP=79;SS=1;SSC=5;GPV=2.6276e-20;SPV=0.25505 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:8,12:11,14 0/1:.:34:11,23:6,13:5,10 | |
| 33434 chr22 41859521 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=1.0454e-16;SPV=0.63965 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:19,15:8,12 0/1:.:33:17,16:10,9:7,7 | |
| 33435 chr22 41859701 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=5;GPV=5.4147e-14;SPV=0.30192 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:25,20:14,11:11,9 0/1:.:30:14,16:5,9:9,7 | |
| 33436 chr22 41860084 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,19:0,29 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 | |
| 33437 chr22 41860810 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.7502e-16;SPV=0.7402 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:10,11:11,13 0/1:.:37:19,18:9,8:10,10 | |
| 33438 chr22 41862045 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=3.3388e-14;SPV=0.67889 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:11,8:14,14 0/1:.:34:19,15:7,7:12,8 | |
| 33439 chr22 41863094 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.7502e-16;SPV=0.73486 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:10,12:14,15 0/1:.:31:16,15:4,6:12,9 | |
| 33440 chr22 41866427 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 | |
| 33441 chr22 41866443 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=6.2985e-12;SPV=0.90179 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:15,10:4,9 0/1:.:32:20,12:8,8:12,4 | |
| 33442 chr22 41868265 . G T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.19e-16;SPV=0.86745 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:23,30:13,15:10,15 0/1:.:26:14,12:8,3:6,9 | |
| 33443 chr22 41870164 . T G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=4.4109e-17;SPV=0.84734 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:27,30:12,6:15,24 0/1:.:32:18,14:6,5:12,9 | |
| 33444 chr22 41870415 . A G . PASS DP=51;SS=1;SSC=3;GPV=5.8079e-10;SPV=0.45694 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:10,9:7,6 0/1:.:19:9,10:5,3:4,7 | |
| 33445 chr22 41871601 . C A . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=5.6815e-11;SPV=0.57921 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:26,17:13,11:13,6 0/1:.:30:18,12:8,8:10,4 | |
| 33446 chr22 41874840 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=5.8719e-16;SPV=0.78363 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:11,11:11,13 0/1:.:37:20,17:9,6:11,11 | |
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| 33448 chr22 41882562 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=4;GPV=5.9761e-15;SPV=0.34439 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:29,22:18,11:11,11 0/1:.:34:17,17:6,11:11,6 | |
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| 33494 chr22 41919367 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=10;GPV=1.1034e-11;SPV=0.082306 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:27,12:11,9:16,3 0/1:.:39:20,19:10,11:10,8 | |
| 33495 chr22 41919786 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=25;GPV=1;SPV=0.0027867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:22,14:13,8:9,6 0/1:.:46:13,33:7,19:6,14 | |
| 33496 chr22 41920492 . G C . PASS DP=105;SS=1;SSC=0;GPV=1.8127e-16;SPV=0.92129 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:67:36,31:9,18:27,13 0/1:.:38:25,13:16,7:9,6 | |
| 33497 chr22 41921474 . A T . PASS DP=78;SS=1;SSC=10;GPV=5.6308e-13;SPV=0.08849 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:31,18:16,10:15,8 0/1:.:29:13,16:4,10:9,6 | |
| 33498 chr22 41924127 . G C . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=8.8662e-16;SPV=0.72872 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:15,16:10,8 0/1:.:38:21,17:14,9:7,8 | |
| 33499 chr22 41924543 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=3;GPV=4.2487e-10;SPV=0.43261 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:29,15:13,8:16,7 0/1:.:31:19,12:9,6:10,6 | |
| 33500 chr22 41925247 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,27:0,15 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 | |
| 33501 chr22 41925587 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=3.011e-15;SPV=0.69163 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:15,11:8,9 0/1:.:46:26,20:12,11:14,9 | |
| 33502 chr22 41926012 . C G . PASS DP=92;SS=1;SSC=2;GPV=4.9467e-16;SPV=0.59695 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:26,22:19,13:7,9 0/1:.:44:24,20:13,12:11,8 | |
| 33503 chr22 41926712 . G C . PASS DP=84;SS=1;SSC=3;GPV=5.456e-15;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:13,7:10,12 0/1:.:42:22,20:11,15:11,5 | |
| 33504 chr22 41927909 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=4.9663e-15;SPV=0.64173 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:11,13:12,8 0/1:.:39:21,18:8,7:13,11 | |
| 33505 chr22 41928517 . G C . PASS DP=85;SS=1;SSC=4;GPV=5.9761e-15;SPV=0.36878 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:8,9:16,9 0/1:.:43:22,21:12,11:10,10 | |
| 33506 chr22 41928618 . T G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,29:0,20 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 | |
| 33507 chr22 41928696 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=5.2507e-16;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:14,18:12,7 0/1:.:31:15,16:8,7:7,9 | |
| 33508 chr22 41928721 . G A . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=2.1626e-19;SPV=0.4673 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:27,30:19,16:8,14 0/1:.:34:15,19:8,10:7,9 | |
| 33509 chr22 41930013 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=5;GPV=2.2591e-14;SPV=0.30048 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:4,6:10,10 0/1:.:30:11,19:4,6:7,13 | |
| 33510 chr22 41930162 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=7;GPV=4.6624e-13;SPV=0.17842 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:7,10:15,8 0/1:.:25:10,15:6,11:4,4 | |
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| 33512 chr22 41931046 . G C . PASS DP=55;SS=1;SSC=9;GPV=1.1491e-11;SPV=0.12352 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:7,7:13,10 0/1:.:18:6,12:2,6:4,6 | |
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| 33555 chr22 41961684 . T G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=2.6503e-23;SPV=0.888 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:4,25:3,16:1,9 1/1:.:31:7,24:4,13:3,11 | |
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| 33557 chr22 41965332 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,24:0,20 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
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| 33564 chr22 42002602 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,30:0,16 1/1:.:35:0,35:0,15:0,20 | |
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| 33566 chr22 42016929 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 1/1:.:25:0,25:0,9:0,16 | |
| 33567 chr22 42028156 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=2.4078e-13;SPV=0.45883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:4,12:12,6 0/1:.:26:11,15:5,9:6,6 | |
| 33568 chr22 42045408 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 | |
| 33569 chr22 42062252 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.2981e-15;SPV=0.90204 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:9,14:13,12 0/1:.:31:18,13:9,8:9,5 | |
| 33570 chr22 42077856 . C G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,25:0,24 1/1:.:44:0,44:0,24:0,20 | |
| 33571 chr22 42078134 . C G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 | |
| 33572 chr22 42079564 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,26:0,22 1/1:.:48:0,48:0,29:0,19 | |
| 33573 chr22 42079699 . T G . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,27:0,25 1/1:.:48:0,48:0,23:0,25 | |
| 33574 chr22 42080750 . A C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,19:0,25 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 | |
| 33575 chr22 42080766 . A T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,22:0,23 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 33576 chr22 42081646 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 33577 chr22 42085396 . G C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,27:0,18 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
| 33578 chr22 42085408 . T A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,25:0,19 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
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| 33631 chr22 42113655 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=3;GPV=8.0818e-14;SPV=0.46735 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:32,20:20,11:12,9 0/1:.:41:24,17:13,8:11,9 | |
| 33632 chr22 42114979 . C G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,26:0,12 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 33633 chr22 42114998 . A C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,24:0,14 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 | |
| 33634 chr22 42115525 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,12:0,31 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
| 33635 chr22 42115546 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,18:0,32 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
| 33636 chr22 42115818 . G C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:19:0,19:0,7:0,12 | |
| 33637 chr22 42115821 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:19:0,19:0,8:0,11 | |
| 33638 chr22 42116293 . G C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 33639 chr22 42116609 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 33640 chr22 42117257 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 | |
| 33641 chr22 42117757 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,28:0,27 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 | |
| 33642 chr22 42117820 . G C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,21:0,25 1/1:.:40:0,40:0,15:0,25 | |
| 33643 chr22 42118186 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,28:0,23 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 33644 chr22 42119633 . G C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,26:0,14 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 33645 chr22 42120201 . A C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 | |
| 33646 chr22 42120225 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 1/1:.:26:0,26:0,12:0,14 | |
| 33647 chr22 42120618 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
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| 33649 chr22 42121632 . C G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
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| 33700 chr22 42146869 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 33701 chr22 42147016 . C A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 1/1:.:26:0,26:0,13:0,13 | |
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| 33703 chr22 42147458 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:24:0,24:0,15:0,9 | |
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| 33705 chr22 42147462 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 1/1:.:25:0,25:0,16:0,9 | |
| 33706 chr22 42148061 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,16:0,27 1/1:.:22:0,22:0,11:0,11 | |
| 33707 chr22 42150456 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,32:0,17 1/1:.:36:0,36:0,23:0,13 | |
| 33708 chr22 42151144 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=4.2836e-15;SPV=0.65931 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:9,10:10,12 0/1:.:31:15,16:6,5:9,11 | |
| 33709 chr22 42151748 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 | |
| 33710 chr22 42152889 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
| 33711 chr22 42152944 . G A . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,15:0,7 1/1:.:20:0,20:0,13:0,7 | |
| 33712 chr22 42153093 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=10;GPV=2.553e-12;SPV=0.082681 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:38,18:18,10:20,8 0/1:.:30:15,15:8,8:7,7 | |
| 33713 chr22 42155833 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,25:0,23 1/1:.:33:0,33:0,21:0,12 | |
| 33714 chr22 42156869 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 | |
| 33715 chr22 42174182 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=3;GPV=6.8178e-12;SPV=0.40622 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:15,9:13,11 0/1:.:23:12,11:7,5:5,6 | |
| 33716 chr22 42175631 . G C . PASS DP=74;SS=1;SSC=11;GPV=5.5248e-15;SPV=0.077701 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:6,9:17,8 0/1:.:34:13,21:7,9:6,12 | |
| 33717 chr22 42182603 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=1.7502e-16;SPV=0.48927 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:14,11:9,12 0/1:.:36:17,19:10,10:7,9 | |
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| 33719 chr22 42188912 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=7.6926e-15;SPV=0.61268 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:10,12:10,12 0/1:.:24:11,13:6,9:5,4 | |
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| 33767 chr22 42313894 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=1;GPV=1.1672e-21;SPV=0.69834 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:23,32:14,12:9,20 0/1:.:40:18,22:7,10:11,12 | |
| 33768 chr22 42314600 . A G . PASS DP=104;SS=1;SSC=5;GPV=1.6875e-16;SPV=0.29876 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:37,24:14,14:23,10 0/1:.:43:23,20:8,11:15,9 | |
| 33769 chr22 42314997 . G C . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=8.2973e-14;SPV=0.72236 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:9,7:10,14 0/1:.:29:15,14:5,10:10,4 | |
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| 33773 chr22 42317038 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=4.0755e-15;SPV=0.91275 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:15,14:9,13 0/1:.:30:18,12:10,3:8,9 | |
| 33774 chr22 42318651 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=1.0691e-15;SPV=0.99079 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:10,19:12,9 0/1:.:39:26,13:15,9:11,4 | |
| 33775 chr22 42319385 . G C . PASS DP=88;SS=1;SSC=2;GPV=5.8102e-14;SPV=0.58172 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:29,21:11,11:18,10 0/1:.:38:22,16:13,6:9,10 | |
| 33776 chr22 42320478 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=1;GPV=7.8526e-18;SPV=0.77719 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:27,29:14,19:13,10 0/1:.:37:20,17:7,12:13,5 | |
| 33777 chr22 42320626 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=3;GPV=2.3067e-17;SPV=0.47564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:28,25:13,15:15,10 0/1:.:40:20,20:12,10:8,10 | |
| 33778 chr22 42320834 . G C . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=6.8291e-20;SPV=0.86987 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:25,35:15,15:10,20 0/1:.:31:16,15:7,8:9,7 | |
| 33779 chr22 42321102 . A G . PASS DP=94;SS=1;SSC=5;GPV=9.8683e-19;SPV=0.26161 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:27,24:15,10:12,14 0/1:.:43:19,24:11,19:8,5 | |
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| 33781 chr22 42326512 . T C . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=4.5567e-18;SPV=0.85993 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:27,29:12,15:15,14 0/1:.:42:24,18:18,15:6,3 | |
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| 33834 chr22 42369362 . C G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,30:0,19:0,11 1/1:.:28:0,26:0,12:0,14 | |
| 33835 chr22 42370103 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.2981e-15;SPV=0.79696 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:12,15:11,10 0/1:.:31:17,14:6,7:11,7 | |
| 33836 chr22 42370728 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,23:0,25 1/1:.:28:0,28:0,18:0,10 | |
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| 33838 chr22 42373646 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,22:0,10 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 | |
| 33839 chr22 42373719 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 | |
| 33840 chr22 42374540 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,23:0,25 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
| 33841 chr22 42374653 . G C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,28:0,16 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 | |
| 33842 chr22 42375220 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,19:0,9 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 | |
| 33843 chr22 42375346 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 | |
| 33844 chr22 42375386 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,14:0,12 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
| 33845 chr22 42375511 . T C . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,11:0,9 1/1:.:28:0,28:0,12:0,16 | |
| 33846 chr22 42375637 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 | |
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| 33849 chr22 42379942 . G T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,13:0,29 1/1:.:32:0,32:0,22:0,10 | |
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| 33898 chr22 42415156 . T G . PASS DP=68;SS=1;SSC=3;GPV=6.4956e-13;SPV=0.42188 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:11,9:11,10 0/1:.:27:13,14:5,6:8,8 | |
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| 33901 chr22 42415913 . A C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.4569e-15;SPV=0.80886 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:15,24:6,14:9,10 0/1:.:26:12,14:5,9:7,5 | |
| 33902 chr22 42416465 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=7.191e-13;SPV=0.74786 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:11,11:9,9 0/1:.:29:16,13:9,5:7,8 | |
| 33903 chr22 42419119 . G A . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,35:0,22 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 | |
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| 33906 chr22 42422412 . A C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
| 33907 chr22 42422971 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 1/1:.:30:0,30:0,11:0,19 | |
| 33908 chr22 42423149 . A G . PASS DP=28;SS=1;SSC=0;GPV=1.3074e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,12:0,1 1/1:.:15:0,15:0,13:0,2 | |
| 33909 chr22 42424244 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,26:0,17 1/1:.:18:0,18:0,10:0,8 | |
| 33910 chr22 42424258 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,26:0,16 1/1:.:19:0,19:0,11:0,8 | |
| 33911 chr22 42424421 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,19:0,31 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
| 33912 chr22 42425179 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
| 33913 chr22 42425495 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,30:0,23 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
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| 33915 chr22 42428252 . C G . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=9.33e-16;SPV=0.85264 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:31,26:14,15:17,11 0/1:.:43:27,16:14,6:13,10 | |
| 33916 chr22 42429033 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=4;GPV=1.5964e-18;SPV=0.32966 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:19,12:8,15 0/1:.:35:15,20:7,13:8,7 | |
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| 33968 chr22 42475826 . G C . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=2.0241e-17;SPV=0.31892 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:9,12:10,10 0/1:.:34:13,21:6,11:7,10 | |
| 33969 chr22 42476080 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,16:0,27 1/1:.:29:0,29:0,11:0,18 | |
| 33970 chr22 42476122 . T A . PASS DP=80;SS=1;SSC=3;GPV=4.1486e-16;SPV=0.4866 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:12,10:11,13 0/1:.:34:16,18:8,11:8,7 | |
| 33971 chr22 42477317 . A T . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=3.7837e-11;SPV=0.65019 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:12,9:7,6 0/1:.:33:19,14:13,11:6,3 | |
| 33972 chr22 42477624 . G C . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=1.1491e-11;SPV=0.46627 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:12,12:3,6:9,6 0/1:.:31:14,17:9,9:5,8 | |
| 33973 chr22 42477936 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,24:0,21 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 | |
| 33974 chr22 42478283 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 1/1:.:24:0,24:0,12:0,12 | |
| 33975 chr22 42478625 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=9;GPV=1.0403e-12;SPV=0.11117 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:25,15:16,9:9,6 0/1:.:33:15,18:8,9:7,9 | |
| 33976 chr22 42478767 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,26:0,22 1/1:.:22:0,22:0,10:0,12 | |
| 33977 chr22 42478775 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,31:0,21 1/1:.:21:0,21:0,9:0,12 | |
| 33978 chr22 42478948 . T A . PASS DP=63;SS=1;SSC=5;GPV=2.7231e-11;SPV=0.31564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:12,10:11,7 0/1:.:23:11,12:8,7:3,5 | |
| 33979 chr22 42490870 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.8075e-15;SPV=0.8947 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:15,23:6,6:9,17 0/1:.:31:16,15:8,10:8,5 | |
| 33980 chr22 42490881 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,10:0,24 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 33981 chr22 42492273 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=5;GPV=1.0476e-18;SPV=0.28827 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:5,12:19,13 0/1:.:37:15,22:6,11:9,11 | |
| 33982 chr22 42496072 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=6;GPV=5.0311e-18;SPV=0.25016 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:10,16:12,7 0/1:.:37:14,22:9,9:5,13 | |
| 33983 chr22 42496327 . T A . PASS DP=71;SS=1;SSC=8;GPV=3.5003e-14;SPV=0.13889 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:11,9:11,8 0/1:.:32:13,19:5,11:8,8 | |
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| 34034 chr22 42550365 . C T . PASS DP=111;SS=1;SSC=2;GPV=9.8264e-27;SPV=0.53602 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:25,36:10,15:15,21 0/1:.:50:20,30:13,14:7,16 | |
| 34035 chr22 42550874 . C A . PASS DP=119;SS=1;SSC=4;GPV=3.2643e-28;SPV=0.39207 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:28,37:14,17:14,20 0/1:.:54:21,33:11,19:10,14 | |
| 34036 chr22 42552230 . T C . PASS DP=118;SS=1;SSC=2;GPV=2.1425e-33;SPV=0.54929 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:72:24,48:15,25:9,23 0/1:.:46:15,31:7,12:8,19 | |
| 34037 chr22 42552879 . T G . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=2.1727e-19;SPV=0.50733 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:18,27:8,12:10,15 0/1:.:32:12,20:6,8:6,12 | |
| 34038 chr22 42554355 . T G . PASS DP=141;SS=1;SSC=0;GPV=1.1124e-17;SPV=0.94089 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:81:49,32:28,7:21,25 0/1:.:60:43,17:18,9:25,8 | |
| 34039 chr22 42557509 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,17:0,10 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
| 34040 chr22 42559391 . G C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.0403e-12;SPV=0.93728 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:7,14:15,9 0/1:.:28:18,10:8,6:10,4 | |
| 34041 chr22 42559747 . C G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=6.7529e-11;SPV=0.96303 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:8,10:16,10 0/1:.:32:23,9:10,4:13,5 | |
| 34042 chr22 42559968 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=2.4039e-14;SPV=0.91746 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:17,24:8,17:9,7 0/1:.:27:15,12:10,7:5,5 | |
| 34043 chr22 42562679 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,27:0,17 1/1:.:35:0,35:0,13:0,22 | |
| 34044 chr22 42562681 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=2.4283e-11;SPV=0.99263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:13,14:7,7 0/1:.:34:25,9:9,4:16,5 | |
| 34045 chr22 42563135 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=5;GPV=1.2401e-12;SPV=0.30865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:17,14:10,4:7,10 0/1:.:33:15,18:3,10:12,8 | |
| 34046 chr22 42565631 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=4;GPV=2.4219e-17;SPV=0.37967 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:25,25:12,10:13,15 0/1:.:34:15,19:8,9:7,10 | |
| 34047 chr22 42565854 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=8.6835e-16;SPV=0.59945 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:13,12:11,14 0/1:.:27:13,14:6,7:7,7 | |
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| 34049 chr22 42567387 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=12;GPV=2.4655e-13;SPV=0.058371 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:11,10:13,6 0/1:.:29:11,18:4,12:7,6 | |
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| 34095 chr22 42614811 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=4;GPV=1.8036e-20;SPV=0.3392 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:24,28:13,17:11,11 0/1:.:38:15,23:7,12:8,11 | |
| 34096 chr22 42615240 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=2.3224e-12;SPV=0.96454 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:12,19:10,12:2,7 0/1:.:29:17,12:10,8:7,4 | |
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| 34098 chr22 42615668 . T C . PASS DP=97;SS=1;SSC=2;GPV=4.6917e-19;SPV=0.53463 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:28,28:9,19:19,9 0/1:.:41:20,21:8,9:12,12 | |
| 34099 chr22 42616196 . C G . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=2.9719e-11;SPV=0.62628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:6,6:13,10 0/1:.:29:16,13:8,4:8,9 | |
| 34100 chr22 42616847 . A C . PASS DP=71;SS=1;SSC=8;GPV=9.6585e-18;SPV=0.13161 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:9,5:8,14 0/1:.:35:11,24:4,8:7,16 | |
| 34101 chr22 42617212 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=4;GPV=5.8925e-20;SPV=0.32222 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:15,16:7,12 0/1:.:33:12,21:8,11:4,10 | |
| 34102 chr22 42617230 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,31:0,17 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
| 34103 chr22 42617548 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=6;GPV=1.2112e-18;SPV=0.22845 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:12,8:10,13 0/1:.:44:18,26:9,9:9,17 | |
| 34104 chr22 42617830 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=2;GPV=5.8079e-10;SPV=0.5748 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:2,9:15,7 0/1:.:18:9,9:1,4:8,5 | |
| 34105 chr22 42618461 . C T . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=6.7171e-08;SPV=0.83473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:13,12:9,4:4,8 0/1:.:21:13,8:6,2:7,6 | |
| 34106 chr22 42619486 . G T . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=5.4067e-14;SPV=0.86283 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:10,7:15,15 0/1:.:40:25,15:9,5:16,10 | |
| 34107 chr22 42619710 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=5;GPV=1.0016e-19;SPV=0.2848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:25,29:17,18:8,11 0/1:.:32:12,20:8,14:4,6 | |
| 34108 chr22 42619789 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=3;GPV=9.3454e-17;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:11,13:11,8 0/1:.:43:21,22:13,10:8,12 | |
| 34109 chr22 42622179 . C A . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=1.5388e-12;SPV=0.32264 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:12,5:9,12 0/1:.:28:13,15:4,8:9,7 | |
| 34110 chr22 42623246 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=9.7625e-15;SPV=0.43901 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:30,21:23,11:7,10 0/1:.:40:22,18:14,13:8,5 | |
| 34111 chr22 42624316 . A G . PASS DP=99;SS=1;SSC=3;GPV=1.8953e-23;SPV=0.44277 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:68:29,39:15,21:14,18 0/1:.:31:12,19:4,12:8,7 | |
| 34112 chr22 42625135 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=6;GPV=1.1653e-16;SPV=0.20286 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:28,22:15,10:13,12 0/1:.:38:17,21:6,15:11,6 | |
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| 34114 chr22 42625707 . T A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.39e-14;SPV=0.86257 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:6,7:14,16 0/1:.:30:17,13:7,6:10,7 | |
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| 34162 chr22 42667240 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=1.3424e-14;SPV=0.57523 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:8,11:7,8 0/1:.:30:13,17:9,8:4,9 | |
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| 34164 chr22 42667952 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=17;GPV=1;SPV=0.015863 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:30,13:15,7:15,6 0/1:.:25:10,15:6,8:4,7 | |
| 34165 chr22 42668834 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.0148e-14;SPV=0.80818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:11,12:8,12 0/1:.:27:14,13:7,7:7,6 | |
| 34166 chr22 42668851 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,26:0,24 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
| 34167 chr22 42668998 . T A . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=1.7985e-10;SPV=0.7545 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,15:6,5:11,10 0/1:.:29:17,12:8,7:9,5 | |
| 34168 chr22 42669254 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=3;GPV=3.6279e-14;SPV=0.43729 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:11,15:7,7:4,8 0/1:.:30:11,19:4,9:7,10 | |
| 34169 chr22 42670373 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=6;GPV=1.6045e-17;SPV=0.22338 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:25,25:18,13:7,12 0/1:.:31:12,19:6,9:6,10 | |
| 34170 chr22 42670525 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=5.0242e-18;SPV=0.67326 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:9,12:8,14 0/1:.:31:13,18:6,7:7,11 | |
| 34171 chr22 42671048 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=7.5695e-19;SPV=0.95588 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:15,30:7,11:8,19 0/1:.:32:16,16:11,9:5,7 | |
| 34172 chr22 42672233 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=3.6451e-12;SPV=0.77577 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:9,8:7,9 0/1:.:31:17,14:10,8:7,6 | |
| 34173 chr22 42672512 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=3.4211e-15;SPV=0.95858 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:16,29:11,18:5,11 0/1:.:18:10,8:2,5:8,3 | |
| 34174 chr22 42672705 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=1.3078e-18;SPV=0.50635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:23,30:12,12:11,18 0/1:.:27:11,16:6,7:5,9 | |
| 34175 chr22 42673734 . T G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=5.8719e-16;SPV=0.92413 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:10,10:9,14 0/1:.:40:23,17:10,10:13,7 | |
| 34176 chr22 42674799 . T G . PASS DP=93;SS=1;SSC=1;GPV=7.8526e-18;SPV=0.78509 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:29,31:8,14:21,17 0/1:.:33:18,15:9,7:9,8 | |
| 34177 chr22 42675303 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=8;GPV=2.3891e-13;SPV=0.13585 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:26,15:9,8:17,7 0/1:.:39:19,20:6,8:13,12 | |
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| 34179 chr22 42678372 . T C . PASS DP=97;SS=1;SSC=9;GPV=1.5531e-19;SPV=0.10246 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:34,29:11,12:23,17 0/1:.:34:13,21:6,13:7,8 | |
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| 34233 chr22 42710576 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=9;GPV=6.4906e-14;SPV=0.10834 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:14,9:9,10 0/1:.:25:9,16:4,8:5,8 | |
| 34234 chr22 42710759 . C A . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=6.5868e-13;SPV=0.71236 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:11,12:4,7 0/1:.:25:12,13:7,5:5,8 | |
| 34235 chr22 42711018 . C G . PASS DP=54;SS=1;SSC=7;GPV=2.9233e-13;SPV=0.1748 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:14,15:5,3:9,12 0/1:.:25:8,17:4,9:4,8 | |
| 34236 chr22 42711987 . A T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.8851e-14;SPV=0.91788 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:7,12:9,8 0/1:.:38:22,16:9,8:13,8 | |
| 34237 chr22 42712657 . C G . PASS DP=107;SS=1;SSC=0;GPV=5.5596e-16;SPV=0.98772 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:32,30:22,19:10,11 0/1:.:45:32,13:22,9:10,4 | |
| 34238 chr22 42714109 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=7.7158e-19;SPV=0.81167 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:21,30:10,20:11,10 0/1:.:33:16,17:12,9:4,8 | |
| 34239 chr22 42714730 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=4.3784e-17;SPV=0.64922 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:11,12:9,12 0/1:.:36:17,19:11,8:6,11 | |
| 34240 chr22 42715430 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=6;GPV=1.1473e-10;SPV=0.22171 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:13,8:6,6 0/1:.:23:10,13:5,7:5,6 | |
| 34241 chr22 42716469 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=1.2446e-15;SPV=0.58881 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:12,12:10,10 0/1:.:36:18,18:9,7:9,11 | |
| 34242 chr22 42716668 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=2.8059e-17;SPV=0.5699 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:24,30:11,13:13,17 0/1:.:23:10,13:5,8:5,5 | |
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| 34362 chr22 42779817 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
| 34363 chr22 42779953 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 1/1:.:25:0,25:0,16:0,9 | |
| 34364 chr22 42780349 . A T . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=1.4722e-11;SPV=0.55352 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:5,7:9,7 0/1:.:29:14,15:7,10:7,5 | |
| 34365 chr22 42780828 . C G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 1/1:.:23:0,23:0,8:0,15 | |
| 34366 chr22 42781553 . A C . PASS DP=82;SS=1;SSC=5;GPV=5.3169e-12;SPV=0.2808 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:28,15:14,8:14,7 0/1:.:39:22,17:9,11:13,6 | |
| 34367 chr22 42783291 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=4;GPV=7.0781e-20;SPV=0.35322 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:11,19:12,10 0/1:.:32:12,20:6,14:6,6 | |
| 34368 chr22 42783580 . C G . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=4.9668e-14;SPV=0.7769 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:8,15:9,7 0/1:.:26:13,13:8,5:5,8 | |
| 34369 chr22 42784048 . G A . PASS DP=47;SS=1;SSC=0;GPV=6.1512e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 1/1:.:16:0,16:0,9:0,7 | |
| 34370 chr22 42784412 . A C . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=6.6743e-16;SPV=0.69598 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:8,12:11,11 0/1:.:33:16,17:7,13:9,4 | |
| 34371 chr22 42785169 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.3979e-20;SPV=0.86884 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:18,33:9,12:9,21 0/1:.:31:14,17:4,8:10,9 | |
| 34372 chr22 42785797 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,15:0,22 1/1:.:30:0,30:0,12:0,18 | |
| 34373 chr22 42786485 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=7;GPV=5.0202e-14;SPV=0.17274 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:30,18:16,11:14,7 0/1:.:38:19,19:13,12:6,7 | |
| 34374 chr22 42786755 . C G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=8.6835e-16;SPV=0.98593 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:21,31:11,15:10,16 0/1:.:25:16,9:7,5:9,4 | |
| 34375 chr22 42787385 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=6;GPV=2.2757e-12;SPV=0.21371 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:32,17:18,11:14,6 0/1:.:35:19,16:12,10:7,6 | |
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| 34377 chr22 42788129 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,27:0,21 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 | |
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| 34423 chr22 42832339 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=6.6365e-15;SPV=0.60105 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:10,8:7,13 0/1:.:29:13,16:3,8:10,8 | |
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| 34430 chr22 42836812 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=5;GPV=1.2219e-20;SPV=0.2517 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:27,28:14,20:13,8 0/1:.:40:16,24:4,10:12,14 | |
| 34431 chr22 42836967 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 1/1:.:22:0,22:0,10:0,12 | |
| 34432 chr22 42837259 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=2;GPV=1.0134e-13;SPV=0.59795 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:28,22:12,10:16,12 0/1:.:32:18,14:7,9:11,5 | |
| 34433 chr22 42839150 . C A . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=5.6397e-13;SPV=0.83479 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:11,20:5,13:6,7 0/1:.:20:9,11:3,7:6,4 | |
| 34434 chr22 42839972 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=3;GPV=3.7425e-15;SPV=0.41583 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:13,11:7,10 0/1:.:30:13,17:5,10:8,7 | |
| 34435 chr22 42840122 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=8;GPV=9.6098e-15;SPV=0.12623 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:11,10:8,10 0/1:.:23:7,16:5,8:2,8 | |
| 34436 chr22 42840565 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=8;GPV=3.0519e-14;SPV=0.14795 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:27,18:13,13:14,5 0/1:.:35:16,19:7,9:9,10 | |
| 34437 chr22 42841270 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=1.3846e-12;SPV=0.66496 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:11,9:10,12 0/1:.:23:12,11:5,5:7,6 | |
| 34438 chr22 42841633 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=2.0241e-17;SPV=0.89756 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:14,24:5,10:9,14 0/1:.:37:18,19:4,13:14,6 | |
| 34439 chr22 42842049 . G A . PASS DP=40;SS=1;SSC=4;GPV=8.743e-07;SPV=0.35693 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:12,7:8,1:4,6 0/1:.:21:11,10:2,4:9,6 | |
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| 34490 chr22 42878883 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=16;GPV=1;SPV=0.023958 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:27,20:16,11:11,9 0/1:.:41:14,27:8,17:6,10 | |
| 34491 chr22 42879244 . G A . PASS DP=109;SS=1;SSC=1;GPV=7.8862e-21;SPV=0.75725 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:31,33:17,18:14,15 0/1:.:45:24,21:13,10:11,11 | |
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| 34493 chr22 42881916 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=8.5141e-10;SPV=0.56049 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:31,18:12,3:19,15 0/1:.:21:13,8:6,3:7,5 | |
| 34494 chr22 42883276 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=11;GPV=7.8044e-17;SPV=0.075733 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:12,13:8,8 0/1:.:28:8,20:1,10:7,10 | |
| 34495 chr22 42883605 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=1.973e-16;SPV=0.83688 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:8,13:13,12 0/1:.:37:20,17:12,5:8,12 | |
| 34496 chr22 42883802 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=4.2836e-15;SPV=0.80754 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:9,11:10,13 0/1:.:29:15,14:5,4:10,10 | |
| 34497 chr22 42884644 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=3.0774e-18;SPV=0.76241 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:18,27:10,12:8,15 0/1:.:33:15,18:8,11:7,7 | |
| 34498 chr22 42885575 . G C . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=1.1762e-18;SPV=0.61755 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:16,26:10,14:6,12 0/1:.:31:12,19:9,11:3,8 | |
| 34499 chr22 42885873 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=11;GPV=1.1762e-17;SPV=0.074419 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:11,10:7,8 0/1:.:36:11,25:1,11:10,14 | |
| 34500 chr22 42886455 . T G . PASS DP=84;SS=1;SSC=11;GPV=0.00024398;SPV=0.069433 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,4:12,3:11,1 0/1:.:35:11,7:6,4:5,3 | |
| 34501 chr22 42886760 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=1.8643e-13;SPV=0.95079 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:6,11:10,8 0/1:.:42:26,16:15,13:11,3 | |
| 34502 chr22 42886795 . A C . PASS DP=66;SS=1;SSC=9;GPV=5.1713e-16;SPV=0.11367 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:8,5:8,11 0/1:.:34:11,23:10,13:1,10 | |
| 34503 chr22 42887983 . C T . PASS DP=50;SS=1;SSC=3;GPV=5.635e-11;SPV=0.48212 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:13,14:2,3:11,11 0/1:.:23:10,13:3,6:7,7 | |
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| 34546 chr22 42923314 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=3;GPV=1.0404e-13;SPV=0.45599 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:9,10:11,8 0/1:.:33:16,17:10,6:6,11 | |
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| 34548 chr22 42924295 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.3846e-17;SPV=0.78603 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:12,8:7,18 0/1:.:35:17,18:4,6:13,12 | |
| 34549 chr22 42925505 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=1.6064e-11;SPV=0.96622 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:11,8:9,13 0/1:.:28:19,9:9,6:10,3 | |
| 34550 chr22 42926789 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=10;GPV=1.4569e-15;SPV=0.092984 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:10,5:6,10 0/1:.:34:11,23:5,11:6,12 | |
| 34551 chr22 42927308 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=1.3554e-18;SPV=0.75895 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:10,24:4,12:6,12 0/1:.:29:10,19:5,10:5,9 | |
| 34552 chr22 42928177 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=5;GPV=2.0579e-15;SPV=0.26659 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:11,6:11,14 0/1:.:33:14,19:7,10:7,9 | |
| 34553 chr22 42928559 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=5;GPV=9.9959e-10;SPV=0.27842 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:19,12:11,6:8,6 0/1:.:26:13,13:9,6:4,7 | |
| 34554 chr22 42928756 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=7;GPV=2.6864e-14;SPV=0.16745 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:8,9:8,7 0/1:.:29:10,19:6,12:4,7 | |
| 34555 chr22 42929263 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=8.503e-12;SPV=0.70795 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:11,8:11,9 0/1:.:35:21,14:10,6:11,8 | |
| 34556 chr22 42929768 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=3.673e-15;SPV=0.81446 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:10,8:9,13 0/1:.:40:22,18:10,12:12,6 | |
| 34557 chr22 42930104 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=12;GPV=1.1753e-14;SPV=0.050405 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:27,16:13,9:14,7 0/1:.:38:16,22:9,5:7,17 | |
| 34558 chr22 42930801 . G T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=8.9089e-11;SPV=0.99127 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:6,13:8,5 0/1:.:33:23,10:13,4:10,6 | |
| 34559 chr22 42931310 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=1.2401e-12;SPV=0.6003 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:9,10:10,9 0/1:.:26:13,13:7,7:6,6 | |
| 34560 chr22 42932413 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=5;GPV=4.0856e-15;SPV=0.30993 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:12,13:4,4:8,9 0/1:.:39:15,24:4,12:11,12 | |
| 34561 chr22 42933813 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=1.3916e-15;SPV=0.54473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:11,8:10,12 0/1:.:40:20,20:9,7:11,13 | |
| 34562 chr22 42935099 . T G . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=1.2642e-08;SPV=0.69174 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:26,14:16,3:10,11 0/1:.:28:19,9:10,5:9,4 | |
| 34563 chr22 42936510 . T C . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=3.1807e-12;SPV=0.69749 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:12,16:5,3:7,13 0/1:.:26:12,14:3,4:9,10 | |
| 34564 chr22 42937421 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=6.6743e-16;SPV=0.67719 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:13,7:8,18 0/1:.:29:14,15:6,7:8,8 | |
| 34565 chr22 42938392 . T G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=7.6319e-16;SPV=0.85662 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:11,17:10,10 0/1:.:28:15,13:10,8:5,5 | |
| 34566 chr22 42938568 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.0619e-14;SPV=0.99529 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:11,15:6,11 0/1:.:33:22,11:12,2:10,9 | |
| 34567 chr22 42940225 . A T . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=3.6681e-13;SPV=0.72502 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:30,22:9,10:21,12 0/1:.:34:21,13:10,4:11,9 | |
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| 34618 chr22 42979694 . A T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.4855e-11;SPV=0.87151 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:11,13:9,6 0/1:.:29:18,11:13,4:5,7 | |
| 34619 chr22 42979695 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.7027e-12;SPV=0.88403 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:9,13:10,8 0/1:.:27:16,11:12,4:4,7 | |
| 34620 chr22 42979944 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=4.6624e-13;SPV=0.64425 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:7,7:9,10 0/1:.:32:16,16:7,7:9,9 | |
| 34621 chr22 42980874 . A T . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=1.5731e-10;SPV=0.51662 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:29,17:12,9:17,8 0/1:.:28:17,11:7,7:10,4 | |
| 34622 chr22 42983367 . C G . PASS DP=39;SS=1;SSC=1;GPV=2.9336e-07;SPV=0.76668 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:8,8:2,6:6,2 0/1:.:23:13,10:6,3:7,7 | |
| 34623 chr22 42983486 . T C . PASS DP=47;SS=1;SSC=1;GPV=2.2538e-13;SPV=0.74212 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:9,19:5,14:4,5 0/1:.:19:7,12:6,4:1,8 | |
| 34624 chr22 42984542 . G C . PASS DP=50;SS=1;SSC=3;GPV=1.7375e-10;SPV=0.49555 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:13,13:8,7:5,6 0/1:.:24:11,13:8,5:3,8 | |
| 34625 chr22 42985282 . T G . PASS DP=108;SS=1;SSC=0;GPV=8.2747e-17;SPV=0.93844 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:19,11:5,12 0/1:.:61:39,22:25,12:14,10 | |
| 34626 chr22 42985453 . G A . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=1.3188e-20;SPV=0.91329 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:25,32:8,17:17,15 0/1:.:47:26,21:11,6:15,15 | |
| 34627 chr22 42985644 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=6;GPV=1.3655e-13;SPV=0.24152 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:30,18:19,11:11,7 0/1:.:38:20,18:5,12:15,6 | |
| 34628 chr22 42986156 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.3078e-18;SPV=0.93219 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:19,32:12,14:7,18 0/1:.:29:15,14:12,4:3,10 | |
| 34629 chr22 42988011 . C A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=7.9293e-13;SPV=0.80783 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:15,10:7,12 0/1:.:26:15,11:7,4:8,7 | |
| 34630 chr22 42990685 . C G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.0977e-18;SPV=0.84322 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:15,25:7,8:8,17 0/1:.:39:18,21:9,10:9,11 | |
| 34631 chr22 42991909 . C A . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=2.6615e-19;SPV=0.536 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:17,25:10,14:7,11 0/1:.:36:14,22:5,12:9,10 | |
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| 34687 chr22 43039662 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=3;GPV=3.0665e-16;SPV=0.47314 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:14,10:12,13 0/1:.:38:19,19:7,12:12,7 | |
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| 34740 chr22 43102820 . T A . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=2.72e-12;SPV=0.80212 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:12,18:4,10:8,8 0/1:.:23:11,12:3,7:8,5 | |
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| 34742 chr22 43103304 . G A . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=1.8298e-08;SPV=0.95319 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:8,12:3,6:5,6 0/1:.:23:14,9:5,4:9,5 | |
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| 34745 chr22 43106701 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=3;GPV=2.2152e-16;SPV=0.41215 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:8,10:18,14 0/1:.:34:16,18:8,9:8,9 | |
| 34746 chr22 43107348 . G C . PASS DP=44;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.04414 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:17,12:5,5:12,7 0/1:.:15:4,11:1,8:3,3 | |
| 34747 chr22 43107541 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=5.8427e-13;SPV=0.86391 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:8,11:7,7 0/1:.:34:19,15:9,8:10,7 | |
| 34748 chr22 43107967 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.4855e-11;SPV=0.9641 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:12,11:9,11 0/1:.:25:17,8:8,4:9,4 | |
| 34749 chr22 43108320 . A T . PASS DP=74;SS=1;SSC=4;GPV=6.0302e-11;SPV=0.32186 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:27,15:15,8:12,7 0/1:.:32:18,14:12,10:6,4 | |
| 34750 chr22 43108321 . A C . PASS DP=67;SS=1;SSC=10;GPV=1.3693e-11;SPV=0.098312 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:23,13:15,7:8,6 0/1:.:31:14,17:10,11:4,6 | |
| 34751 chr22 43108322 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=5;GPV=4.8717e-12;SPV=0.28496 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:10,9:11,6 0/1:.:31:15,16:9,10:6,6 | |
| 34752 chr22 43109065 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=7;GPV=2.8662e-18;SPV=0.19857 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:15,10:9,13 0/1:.:38:15,23:7,8:8,15 | |
| 34753 chr22 43109151 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,28:0,22 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
| 34754 chr22 43109438 . C A . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=1.9239e-18;SPV=0.89023 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:25,28:13,13:12,15 0/1:.:47:27,20:11,9:16,11 | |
| 34755 chr22 43109689 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=5;GPV=7.3738e-16;SPV=0.28692 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:12,11:5,8 0/1:.:32:12,20:6,10:6,10 | |
| 34756 chr22 43110259 . T A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 | |
| 34757 chr22 43110629 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=4.1486e-16;SPV=0.73686 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:16,19:8,8 0/1:.:29:15,14:7,10:8,4 | |
| 34758 chr22 43110747 . C A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,28:0,10 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 | |
| 34759 chr22 43113611 . C A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,27:0,32 1/1:.:28:0,28:0,9:0,19 | |
| 34760 chr22 43113626 . T C . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=1.0792e-17;SPV=0.84817 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:32,33:15,16:17,17 0/1:.:31:18,13:8,2:10,11 | |
| 34761 chr22 43114213 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=5;GPV=3.0665e-16;SPV=0.30871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:17,9:10,13 0/1:.:38:18,20:7,6:11,14 | |
| 34762 chr22 43115819 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=4.5064e-15;SPV=0.95461 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:23,27:11,11:12,16 0/1:.:32:20,12:9,6:11,6 | |
| 34763 chr22 43117150 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=5;GPV=9.8334e-16;SPV=0.29536 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:10,13:16,11 0/1:.:28:12,16:5,10:7,6 | |
| 34764 chr22 43118855 . C G . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=8.9568e-18;SPV=0.77454 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:9,12:10,12 0/1:.:42:21,21:9,11:12,10 | |
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| 34766 chr22 43121980 . C G . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=3.9005e-19;SPV=0.56287 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:7,10:8,11 0/1:.:44:18,26:11,16:7,10 | |
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| 34806 chr22 43159584 . A C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=2.7611e-16;SPV=0.85518 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:8,7:9,13 0/1:.:49:27,22:14,9:13,13 | |
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| 34808 chr22 43161557 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=6.5868e-13;SPV=0.72569 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:6,10:8,8 0/1:.:27:13,14:6,5:7,9 | |
| 34809 chr22 43161853 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=9;GPV=1.5388e-12;SPV=0.11136 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:21,14:10,8:11,6 0/1:.:31:13,18:8,9:5,9 | |
| 34810 chr22 43163131 . G T . PASS DP=103;SS=1;SSC=4;GPV=1.0129e-24;SPV=0.37047 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:27,36:12,11:15,25 0/1:.:40:15,25:5,13:10,12 | |
| 34811 chr22 43163731 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=8.5972e-13;SPV=0.65099 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:33,23:15,4:18,19 0/1:.:28:17,11:6,4:11,7 | |
| 34812 chr22 43164106 . G T . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=1.2401e-12;SPV=0.6017 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:14,13:6,7 0/1:.:24:12,12:8,7:4,5 | |
| 34813 chr22 43164424 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=2.9254e-10;SPV=0.5019 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:24,15:15,7:9,8 0/1:.:29:17,12:8,8:9,4 | |
| 34814 chr22 43165379 . A G . PASS DP=90;SS=1;SSC=9;GPV=1.1691e-15;SPV=0.11514 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:30,19:17,9:13,10 0/1:.:41:19,22:12,15:7,7 | |
| 34815 chr22 43165669 . T G . PASS DP=80;SS=1;SSC=5;GPV=1.0669e-14;SPV=0.25793 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:11,7:13,11 0/1:.:38:18,20:8,11:10,9 | |
| 34816 chr22 43165753 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,21:0,29 1/1:.:36:0,36:0,14:0,22 | |
| 34817 chr22 43165797 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=1.4766e-14;SPV=0.54006 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:10,7:11,14 0/1:.:31:15,16:3,6:12,10 | |
| 34818 chr22 43166699 . G A . PASS DP=102;SS=1;SSC=5;GPV=8.3539e-25;SPV=0.31495 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:25,33:17,21:8,12 0/1:.:44:16,28:9,16:7,12 | |
| 34819 chr22 43167705 . A G . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,28:0,27 1/1:.:42:0,42:0,22:0,20 | |
| 34820 chr22 43171273 . C A . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=5.0247e-17;SPV=0.59804 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:7,16:15,9 0/1:.:34:16,18:5,10:11,8 | |
| 34821 chr22 43171539 . T A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=7.2383e-18;SPV=0.9989 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:13,32:8,16:5,16 0/1:.:31:19,12:14,6:5,6 | |
| 34822 chr22 43172506 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=3.3771e-18;SPV=0.8851 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:16,30:10,18:6,12 0/1:.:26:12,14:6,7:6,7 | |
| 34823 chr22 43173296 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=2.7526e-17;SPV=0.94617 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:19,27:10,15:9,12 0/1:.:39:22,17:10,5:12,12 | |
| 34824 chr22 43174062 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=1.6633e-17;SPV=0.97294 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:22,30:16,16:6,14 0/1:.:38:23,15:15,7:8,8 | |
| 34825 chr22 43174457 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=3;GPV=1.1808e-19;SPV=0.43917 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:24,29:15,11:9,18 0/1:.:34:14,20:5,8:9,12 | |
| 34826 chr22 43174653 . A C . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=9.3487e-14;SPV=0.70168 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:26,22:11,11:15,11 0/1:.:33:19,14:9,8:10,6 | |
| 34827 chr22 43174913 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=1.19e-16;SPV=0.61389 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:16,10:4,13 0/1:.:36:17,19:13,13:4,6 | |
| 34828 chr22 43176174 . G T . PASS DP=57;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.038401 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:27,5:17,2:10,3 0/1:.:25:15,10:9,5:6,5 | |
| 34829 chr22 43178283 . G A . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=5.7269e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:18:0,18:0,3:0,15 1/1:.:19:0,19:0,2:0,17 | |
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| 34831 chr22 43178511 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 | |
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| 34884 chr22 43210901 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=8.9788e-17;SPV=0.7334 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:9,14:12,13 0/1:.:29:14,15:10,8:4,7 | |
| 34885 chr22 43211034 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,29:0,17 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
| 34886 chr22 43212667 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
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| 34888 chr22 43213904 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,29:0,26 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 | |
| 34889 chr22 43213953 . C G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,26:0,19 1/1:.:29:0,29:0,11:0,18 | |
| 34890 chr22 43214201 . A G . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,19:0,26 1/1:.:53:0,53:0,29:0,24 | |
| 34891 chr22 43214802 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=2.7625e-15;SPV=0.90409 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:11,11:11,12 0/1:.:43:26,17:12,4:14,13 | |
| 34892 chr22 43217545 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,22:0,23 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 34893 chr22 43217582 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.8183e-16;SPV=0.95628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:15,24:6,10:9,14 0/1:.:38:21,17:14,8:7,9 | |
| 34894 chr22 43218999 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=3.5019e-16;SPV=0.84449 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:13,24:9,11:4,13 0/1:.:27:12,15:6,5:6,10 | |
| 34895 chr22 43219555 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=2.1366e-11;SPV=0.97611 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:12,12:11,10 0/1:.:28:20,8:11,4:9,4 | |
| 34896 chr22 43221033 . A C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=2.5129e-20;SPV=0.88365 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:18,31:8,17:10,14 0/1:.:36:17,19:9,7:8,12 | |
| 34897 chr22 43222186 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=3.2999e-18;SPV=0.72263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:14,11:7,15 0/1:.:39:19,20:6,13:13,7 | |
| 34898 chr22 43222613 . A G . PASS DP=95;SS=1;SSC=5;GPV=3.5188e-22;SPV=0.29617 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:10,9:12,17 0/1:.:47:18,29:12,17:6,12 | |
| 34899 chr22 43223056 . C G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,27:0,17 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 | |
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| 34901 chr22 43223639 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=5;GPV=2.1626e-19;SPV=0.30268 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:28,29:15,9:13,20 0/1:.:34:14,20:6,6:8,14 | |
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| 34959 chr22 43273006 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,16:0,27 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
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| 35020 chr22 43307723 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 | |
| 35021 chr22 43307985 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,18:0,21 1/1:.:24:0,24:0,14:0,10 | |
| 35022 chr22 43308279 . C G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
| 35023 chr22 43309672 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,24:0,14 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 | |
| 35024 chr22 43309923 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,29:0,23 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 | |
| 35025 chr22 43310767 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,31:0,21 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 35026 chr22 43310987 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,22:0,36 1/1:.:32:0,32:0,11:0,21 | |
| 35027 chr22 43311990 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 35028 chr22 43312898 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,17:0,25 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 | |
| 35029 chr22 43312916 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,17:0,26 1/1:.:45:0,45:0,24:0,21 | |
| 35030 chr22 43314344 . C G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,31:0,22 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
| 35031 chr22 43315074 . G C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,20:0,28 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 35032 chr22 43316779 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,21:0,29 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
| 35033 chr22 43318710 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 1/1:.:29:0,29:0,19:0,10 | |
| 35034 chr22 43319282 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=12;GPV=4.9663e-15;SPV=0.058638 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:31,20:14,8:17,12 0/1:.:32:13,19:9,9:4,10 | |
| 35035 chr22 43320318 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=4.2836e-15;SPV=0.95111 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:12,13:2,9 0/1:.:36:20,16:10,8:10,8 | |
| 35036 chr22 43321058 . A C . PASS DP=87;SS=1;SSC=5;GPV=3.5896e-20;SPV=0.29449 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:23,27:9,11:14,16 0/1:.:37:14,23:7,7:7,16 | |
| 35037 chr22 43321191 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=3.2512e-15;SPV=0.49812 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:10,12:12,13 0/1:.:23:10,13:5,6:5,7 | |
| 35038 chr22 43324441 . G C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=3.5113e-17;SPV=0.88198 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:24,29:14,15:10,14 0/1:.:34:19,15:8,4:11,11 | |
| 35039 chr22 43324591 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=2.4776e-16;SPV=0.92225 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:6,10:14,15 0/1:.:40:23,17:15,10:8,7 | |
| 35040 chr22 43325112 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=9.545e-12;SPV=0.86834 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:8,11:6,5 0/1:.:33:19,14:10,9:9,5 | |
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| 35090 chr22 43375028 . C G . PASS DP=88;SS=1;SSC=12;GPV=1.3142e-17;SPV=0.060699 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:29,22:13,13:16,9 0/1:.:37:14,23:7,7:7,16 | |
| 35091 chr22 43375804 . G T . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=7.3738e-16;SPV=0.71308 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:8,10:5,9 0/1:.:36:16,20:7,11:9,9 | |
| 35092 chr22 43376652 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,20:0,23 1/1:.:32:0,32:0,13:0,19 | |
| 35093 chr22 43377287 . T G . PASS DP=43;SS=1;SSC=4;GPV=1.3525e-07;SPV=0.31987 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:10,6:6,1:4,5 0/1:.:27:13,13:5,8:8,5 | |
| 35094 chr22 43377871 . A T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=7.3839e-17;SPV=0.80245 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:10,10:12,16 0/1:.:36:19,17:7,9:12,8 | |
| 35095 chr22 43379128 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=5;GPV=4.0755e-11;SPV=0.26437 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:23,14:7,3:16,11 0/1:.:31:16,15:8,7:8,8 | |
| 35096 chr22 43379906 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=1.5062e-09;SPV=0.5822 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:11,8:9,5 0/1:.:30:18,12:6,7:12,5 | |
| 35097 chr22 43380055 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=6.5235e-17;SPV=0.94716 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:20,28:7,13:13,15 0/1:.:35:20,15:8,8:12,7 | |
| 35098 chr22 43381403 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=9;GPV=5.5248e-15;SPV=0.11947 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:11,11:11,6 0/1:.:35:14,21:7,9:7,12 | |
| 35099 chr22 43382201 . G C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=9.9942e-16;SPV=0.96846 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:10,23:5,12:5,11 0/1:.:30:15,15:8,9:7,6 | |
| 35100 chr22 43382425 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=8.2973e-14;SPV=0.5514 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:8,6:8,10 0/1:.:37:18,19:9,5:9,14 | |
| 35101 chr22 43383514 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=1.3287e-16;SPV=0.65931 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:16,22:8,13:8,9 0/1:.:34:15,19:8,9:7,10 | |
| 35102 chr22 43383861 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=4;GPV=2.0619e-14;SPV=0.33106 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:23,19:16,8:7,11 0/1:.:35:16,18:8,9:8,9 | |
| 35103 chr22 43384220 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=1;GPV=2.3391e-18;SPV=0.72785 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:9,13:15,14 0/1:.:41:21,20:8,10:13,10 | |
| 35104 chr22 43385021 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=8;GPV=7.0173e-18;SPV=0.14765 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:11,12:13,6 0/1:.:50:22,28:12,13:10,15 | |
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| 35106 chr22 43385122 . T G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,15:0,24 1/1:.:43:0,43:0,22:0,21 | |
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| 35153 chr22 43416181 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=2.8926e-12;SPV=0.9787 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:7,9:10,11 0/1:.:36:24,12:13,7:11,5 | |
| 35154 chr22 43416308 . C G . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=2.2534e-10;SPV=0.59434 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:22,16:6,8:16,8 0/1:.:26:15,11:6,4:9,7 | |
| 35155 chr22 43416825 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 35156 chr22 43417891 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=4;GPV=4.6768e-16;SPV=0.37566 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:8,9:9,6 0/1:.:49:23,26:7,13:16,13 | |
| 35157 chr22 43418238 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=2.751e-10;SPV=0.53642 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:10,7:13,8 0/1:.:29:17,12:5,8:12,4 | |
| 35158 chr22 43418877 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=12;GPV=1.9866e-19;SPV=0.057489 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:11,7:12,15 0/1:.:38:12,26:5,18:7,8 | |
| 35159 chr22 43419419 . G C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,25:0,26 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
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| 35161 chr22 43419662 . C A . PASS DP=54;SS=1;SSC=2;GPV=4.2301e-08;SPV=0.56142 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:21,13:10,7:11,6 0/1:.:20:12,8:6,2:6,6 | |
| 35162 chr22 43420212 . T G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 35163 chr22 43420247 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,26:0,21 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 35164 chr22 43420478 . G C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,24:0,23 1/1:.:32:0,32:0,12:0,20 | |
| 35165 chr22 43420814 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,43:0,20:0,23 1/1:.:30:0,30:0,20:0,10 | |
| 35166 chr22 43422109 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=7.0292e-13;SPV=0.42963 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:27,18:14,6:13,12 0/1:.:36:20,16:10,7:10,9 | |
| 35167 chr22 43422180 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:36:0,36:0,14:0,22 | |
| 35168 chr22 43422197 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=2.3594e-19;SPV=0.99262 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:13,29:4,14:9,15 0/1:.:42:23,19:7,9:16,10 | |
| 35169 chr22 43423279 . A T . PASS DP=78;SS=1;SSC=4;GPV=4.1488e-12;SPV=0.38591 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:30,19:15,10:15,9 0/1:.:29:16,13:8,7:8,6 | |
| 35170 chr22 43423752 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.39e-14;SPV=0.80128 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:10,11:10,11 0/1:.:31:17,14:6,9:11,5 | |
| 35171 chr22 43424281 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,27:0,16 1/1:.:24:0,24:0,15:0,9 | |
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| 35229 chr22 43459269 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 35230 chr22 43459946 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=6.4956e-13;SPV=0.60432 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:8,13:11,5 0/1:.:31:16,15:10,7:6,8 | |
| 35231 chr22 43460163 . C A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=1.4168e-09;SPV=0.96938 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:5,5:11,11 0/1:.:30:21,9:9,5:12,4 | |
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| 35234 chr22 43461434 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,13:0,22 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
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| 35237 chr22 43463084 . A T . PASS DP=57;SS=1;SSC=5;GPV=1.4722e-11;SPV=0.25331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:16,13:10,4:6,9 0/1:.:28:12,16:9,11:3,5 | |
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| 35296 chr22 43526619 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=11;GPV=3.642e-14;SPV=0.072592 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:29,17:16,9:13,8 0/1:.:36:16,20:3,8:13,12 | |
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| 35298 chr22 43526662 . C G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=1.3937e-18;SPV=0.88208 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:22,30:11,17:11,13 0/1:.:36:19,17:7,5:12,12 | |
| 35299 chr22 43528050 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=31;GPV=1;SPV=0.0006981 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:10,15:13,11 0/1:.:24:21,3:11,1:10,2 | |
| 35300 chr22 43528285 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=5;GPV=4.6768e-16;SPV=0.29197 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:8,8:12,9 0/1:.:44:20,24:10,16:10,8 | |
| 35301 chr22 43529210 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 1/1:.:51:0,51:0,28:0,23 | |
| 35302 chr22 43530130 . G C . PASS DP=85;SS=1;SSC=7;GPV=5.9761e-15;SPV=0.18305 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:28,19:8,10:20,9 0/1:.:38:18,20:8,10:10,10 | |
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| 35357 chr22 43594273 . T C . PASS DP=21;SS=1;SSC=0;GPV=1.8578e-12;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:13:0,13:0,8:0,5 1/1:.:8:0,8:0,6:0,2 | |
| 35358 chr22 43595441 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=8;GPV=3.9143e-11;SPV=0.14113 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:15,10:8,6:7,4 0/1:.:31:13,18:6,14:7,4 | |
| 35359 chr22 43595946 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=3;GPV=2.2072e-13;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:6,6:11,10 0/1:.:35:17,18:5,10:12,8 | |
| 35360 chr22 43597727 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=1.1404e-14;SPV=0.39957 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:7,5:9,14 0/1:.:28:11,17:5,8:6,9 | |
| 35361 chr22 43598189 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=1.1491e-11;SPV=0.4435 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:8,7:6,7 0/1:.:27:12,15:6,8:6,7 | |
| 35362 chr22 43598491 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=5;GPV=3.4721e-10;SPV=0.29399 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:27,14:13,9:14,5 0/1:.:30:17,13:10,8:7,5 | |
| 35363 chr22 43599709 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=1.1574e-13;SPV=0.76699 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:9,9:10,11 0/1:.:33:18,15:10,6:8,9 | |
| 35364 chr22 43600408 . A C . PASS DP=96;SS=1;SSC=2;GPV=6.9139e-16;SPV=0.53056 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:29,22:15,10:14,12 0/1:.:45:25,20:16,11:9,9 | |
| 35365 chr22 43601595 . T A . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.8211e-18;SPV=0.73034 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:18,25:12,13:6,12 0/1:.:39:18,21:10,10:8,11 | |
| 35366 chr22 43602101 . C G . PASS DP=107;SS=1;SSC=0;GPV=1.6025e-19;SPV=0.98098 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:25,32:13,22:12,10 0/1:.:50:31,19:15,9:16,10 | |
| 35367 chr22 43602844 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=5.0221e-16;SPV=0.99536 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:15,29:8,20:7,9 0/1:.:29:18,11:10,4:8,7 | |
| 35368 chr22 43607198 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=5;GPV=1.4766e-14;SPV=0.2788 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:12,8:8,9 0/1:.:36:16,20:10,10:6,10 | |
| 35369 chr22 43607539 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=4.4044e-13;SPV=0.93029 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:6,12:11,7 0/1:.:39:24,15:14,7:10,8 | |
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| 35371 chr22 43611497 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=1.1494e-07;SPV=0.45033 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:16,8:11,3:5,5 0/1:.:31:19,12:11,7:8,5 | |
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| 35491 chr22 43780148 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,22:0,10 1/1:.:36:0,36:0,23:0,13 | |
| 35492 chr22 43782092 . A G . PASS DP=43;SS=1;SSC=0;GPV=1.5066e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,8:0,7 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 35493 chr22 43782248 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=5;GPV=1.3907e-10;SPV=0.29951 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:17,12:8,5:9,7 0/1:.:29:14,15:9,8:5,7 | |
| 35494 chr22 43784502 . A T . PASS DP=35;SS=1;SSC=9;GPV=1.9562e-07;SPV=0.11709 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:11,7:5,3:6,4 0/1:.:17:6,11:1,1:5,10 | |
| 35495 chr22 43784513 . G A . PASS DP=29;SS=1;SSC=1;GPV=0.0017241;SPV=0.66409 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:5,3:3,1:2,2 0/1:.:14:8,5:0,1:8,4 | |
| 35496 chr22 43784678 . C T . PASS DP=25;SS=1;SSC=0;GPV=3.698e-07;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:11:0,5:0,4:0,1 1/1:.:14:0,7:0,7:0,0 | |
| 35497 chr22 43785378 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
| 35498 chr22 43787032 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 35499 chr22 43790569 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,27:0,19 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
| 35500 chr22 43791187 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 35501 chr22 43791807 . A C . PASS DP=62;SS=1;SSC=8;GPV=8.6344e-12;SPV=0.15264 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:18,12:13,7:5,5 0/1:.:32:14,18:7,3:7,15 | |
| 35502 chr22 43792841 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,15:0,23 1/1:.:22:0,22:0,8:0,14 | |
| 35503 chr22 43792916 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,20:0,23 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
| 35504 chr22 43793068 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 35505 chr22 43793493 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:43:0,43:0,20:0,23 | |
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| 35555 chr22 43842525 . T G . PASS DP=85;SS=1;SSC=3;GPV=1.2718e-13;SPV=0.44976 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:25,17:12,11:13,6 0/1:.:43:24,19:13,13:11,6 | |
| 35556 chr22 43842641 . C A . PASS DP=89;SS=1;SSC=7;GPV=1.4813e-17;SPV=0.16612 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:11,13:16,9 0/1:.:40:17,23:11,13:6,10 | |
| 35557 chr22 43843094 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=8;GPV=3.2213e-16;SPV=0.14484 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:12,16:14,7 0/1:.:29:11,18:4,12:7,6 | |
| 35558 chr22 43843316 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=2;GPV=1.132e-20;SPV=0.5349 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:16,25:9,15:7,10 0/1:.:40:15,25:8,15:7,10 | |
| 35559 chr22 43843619 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=9;GPV=2.785e-19;SPV=0.12496 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:14,12:10,12 0/1:.:37:13,24:7,13:6,11 | |
| 35560 chr22 43844282 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=1.2222e-12;SPV=0.87356 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:29,21:24,14:5,7 0/1:.:40:27,13:20,8:7,5 | |
| 35561 chr22 43844805 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=1.7781e-13;SPV=0.68283 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:30,21:16,12:14,9 0/1:.:39:24,15:13,7:11,8 | |
| 35562 chr22 43845095 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,19:0,24 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 | |
| 35563 chr22 43845396 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=2;GPV=2.1318e-14;SPV=0.63037 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:14,13:13,8 0/1:.:40:23,17:12,9:11,8 | |
| 35564 chr22 43845521 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=2.0308e-13;SPV=0.77974 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:27,24:12,10:15,14 0/1:.:27:16,11:9,6:7,5 | |
| 35565 chr22 43845693 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=5.2507e-16;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:28,27:8,10:20,17 0/1:.:27:13,14:6,8:7,6 | |
| 35566 chr22 43846187 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=5;GPV=1.3284e-10;SPV=0.29301 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:21,11:13,3:8,8 0/1:.:39:22,17:8,4:14,13 | |
| 35567 chr22 43847894 . C G . PASS DP=87;SS=1;SSC=4;GPV=1.1614e-17;SPV=0.35763 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:11,8:14,16 0/1:.:38:17,21:6,8:11,13 | |
| 35568 chr22 43848422 . C A . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=5.5445e-18;SPV=0.72895 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:13,17:11,10 0/1:.:39:20,19:11,10:9,9 | |
| 35569 chr22 43848741 . A G . PASS DP=93;SS=1;SSC=3;GPV=9.1368e-20;SPV=0.42441 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:25,27:14,14:11,13 0/1:.:41:18,23:8,11:10,12 | |
| 35570 chr22 43849106 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.39e-14;SPV=0.90223 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:6,6:11,15 0/1:.:35:20,15:9,7:11,8 | |
| 35571 chr22 43849201 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=1.374e-15;SPV=0.9223 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:7,9:7,13 0/1:.:36:19,17:8,10:11,7 | |
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| 35628 chr22 43900894 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.6641e-16;SPV=0.95816 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:10,13:4,9 0/1:.:43:24,19:11,16:13,3 | |
| 35629 chr22 43901262 . G C . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.4836e-09;SPV=0.98685 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:6,13:1,4:5,9 0/1:.:23:14,9:3,6:11,3 | |
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| 35633 chr22 43901806 . A T . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=6.2136e-19;SPV=0.62567 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:20,31:10,18:10,13 0/1:.:25:10,15:6,11:4,4 | |
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| 35681 chr22 43923560 . T C . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=2.5665e-09;SPV=0.80599 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:9,15:2,5:7,10 0/1:.:13:6,7:0,2:6,5 | |
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| 35683 chr22 43928291 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=1.8199e-14;SPV=0.52841 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:9,10:10,12 0/1:.:25:11,14:7,5:4,9 | |
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| 35688 chr22 43932952 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.0637e-08;SPV=0.95698 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:12,8:13,10 0/1:.:21:16,5:9,1:7,4 | |
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| 35690 chr22 43935180 . G C . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=1.8081e-15;SPV=0.39326 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,20:12,7:8,13 0/1:.:34:15,19:9,9:6,10 | |
| 35691 chr22 43936805 . A T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,27:0,18 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 | |
| 35692 chr22 43941730 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=2;GPV=7.5673e-13;SPV=0.56331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:8,12:9,7 0/1:.:24:11,13:7,6:4,7 | |
| 35693 chr22 43942169 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=8.9089e-11;SPV=0.66538 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:11,9:8,6 0/1:.:31:18,13:11,8:7,5 | |
| 35694 chr22 43942254 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,20:0,23 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 35695 chr22 43943175 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=6.6365e-15;SPV=0.66775 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:18,23:10,10:8,13 0/1:.:26:12,14:6,7:6,7 | |
| 35696 chr22 43943911 . C G . PASS DP=89;SS=1;SSC=3;GPV=2.1539e-24;SPV=0.49468 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:19,34:12,15:7,19 0/1:.:36:12,24:4,11:8,13 | |
| 35697 chr22 43945024 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=7;GPV=2.9719e-11;SPV=0.18979 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:11,4:12,11 0/1:.:26:12,14:7,3:5,11 | |
| 35698 chr22 43946106 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=8.5972e-13;SPV=0.68408 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:12,12:16,8 0/1:.:36:22,14:7,7:15,7 | |
| 35699 chr22 43946236 . A G . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,29:0,18 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 | |
| 35700 chr22 43946445 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=5.456e-15;SPV=0.74239 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:28,26:13,12:15,14 0/1:.:30:17,13:8,2:9,11 | |
| 35701 chr22 43946811 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=1.0182e-13;SPV=0.63594 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:6,10:11,11 0/1:.:24:11,13:5,5:6,8 | |
| 35702 chr22 43947472 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=1.2718e-13;SPV=0.97929 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:12,12:11,12 0/1:.:38:26,12:18,9:8,3 | |
| 35703 chr22 43948131 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=7.0292e-13;SPV=0.70531 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:13,14:13,6 0/1:.:35:21,14:12,3:9,11 | |
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| 35705 chr22 43950046 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=6.4769e-21;SPV=0.81024 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:19,29:8,12:11,17 0/1:.:43:20,23:2,9:18,14 | |
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| 35755 chr22 43974559 . A C . PASS DP=71;SS=1;SSC=10;GPV=3.7425e-15;SPV=0.087627 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:10,9:11,8 0/1:.:33:12,21:7,9:5,12 | |
| 35756 chr22 43974735 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,23:0,23 1/1:.:47:0,47:0,22:0,25 | |
| 35757 chr22 43975845 . C G . PASS DP=71;SS=1;SSC=5;GPV=1.0404e-13;SPV=0.27892 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:9,4:12,13 0/1:.:33:15,18:7,3:8,15 | |
| 35758 chr22 43977699 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=11;GPV=1.0222e-17;SPV=0.075256 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:10,8:19,16 0/1:.:33:12,21:3,9:9,12 | |
| 35759 chr22 43978067 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=1.9973e-11;SPV=0.85987 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:10,7:11,11 0/1:.:33:21,12:6,5:15,7 | |
| 35760 chr22 43978704 . A T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=4.6768e-16;SPV=0.84053 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:12,14:10,12 0/1:.:33:18,15:11,10:7,5 | |
| 35761 chr22 43979364 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=5.5558e-19;SPV=0.99493 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:14,31:5,14:9,17 0/1:.:37:21,16:13,9:8,7 | |
| 35762 chr22 43979367 . A C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,21:0,29 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 | |
| 35763 chr22 43979627 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=3.9989e-17;SPV=0.96582 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:16,30:7,14:9,16 0/1:.:26:14,12:5,7:9,5 | |
| 35764 chr22 43980455 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=2.9186e-09;SPV=0.86438 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:16,16:3,0 0/1:.:23:15,8:11,5:4,3 | |
| 35765 chr22 43981341 . G T . PASS DP=83;SS=1;SSC=5;GPV=1.4126e-14;SPV=0.31297 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:12,8:14,11 0/1:.:38:19,19:9,12:10,7 | |
| 35766 chr22 43981562 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=2.0985e-15;SPV=0.71259 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:30,28:18,17:12,11 0/1:.:27:15,12:10,5:5,7 | |
| 35767 chr22 43983685 . G C . PASS DP=62;SS=1;SSC=5;GPV=1.0182e-13;SPV=0.27893 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:8,9:9,8 0/1:.:28:11,17:2,8:9,9 | |
| 35768 chr22 43983942 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 1/1:.:30:0,30:0,15:0,15 | |
| 35769 chr22 43983958 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
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| 35771 chr22 43985665 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,24:0,21 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 | |
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| 35822 chr22 44023991 . T C . PASS DP=93;SS=1;SSC=5;GPV=6.6848e-17;SPV=0.26017 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:31,24:13,8:18,16 0/1:.:38:18,20:9,12:9,8 | |
| 35823 chr22 44024135 . G C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.4203e-17;SPV=0.86995 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:15,26:10,20:5,6 0/1:.:32:15,17:8,6:7,11 | |
| 35824 chr22 44024169 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,28:0,11 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 35825 chr22 44024238 . C G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
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| 35827 chr22 44024622 . A C . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=2.1447e-18;SPV=0.69998 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:19,29:11,17:8,12 0/1:.:28:12,16:6,11:6,5 | |
| 35828 chr22 44024979 . A T . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=2.4816e-20;SPV=0.82647 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:21,30:10,11:11,19 0/1:.:41:20,21:12,10:8,11 | |
| 35829 chr22 44025545 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=9;GPV=2.4219e-17;SPV=0.10175 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:29,25:14,16:15,9 0/1:.:30:11,19:4,12:7,7 | |
| 35830 chr22 44025683 . G T . PASS DP=86;SS=1;SSC=4;GPV=3.6681e-13;SPV=0.38213 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:32,20:15,10:17,10 0/1:.:34:19,15:9,4:10,11 | |
| 35831 chr22 44026453 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=10;GPV=2.6276e-20;SPV=0.088083 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:13,11:10,18 0/1:.:27:7,20:3,7:4,13 | |
| 35832 chr22 44026758 . T C . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=8.1517e-15;SPV=0.45033 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:12,19:4,11:8,8 0/1:.:24:8,16:7,6:1,10 | |
| 35833 chr22 44026849 . A G . PASS DP=30;SS=1;SSC=0;GPV=8.4556e-18;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:14:0,14:0,9:0,5 1/1:.:16:0,16:0,12:0,4 | |
| 35834 chr22 44028228 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=9;GPV=7.9203e-12;SPV=0.10203 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:29,16:15,5:14,11 0/1:.:28:13,15:8,8:5,7 | |
| 35835 chr22 44028543 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.0977e-18;SPV=0.95137 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:14,27:7,14:7,13 0/1:.:38:19,19:12,10:7,9 | |
| 35836 chr22 44028769 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=6;GPV=3.2342e-19;SPV=0.24759 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:9,9:10,14 0/1:.:37:13,24:5,7:8,17 | |
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| 35892 chr22 44077625 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=2.781e-14;SPV=0.34305 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:9,9:11,6 0/1:.:44:22,22:7,10:15,12 | |
| 35893 chr22 44077872 . G A . PASS DP=94;SS=1;SSC=5;GPV=1.0497e-19;SPV=0.31513 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:26,26:16,16:10,10 0/1:.:42:18,24:8,15:10,9 | |
| 35894 chr22 44078626 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=6.5669e-19;SPV=0.63321 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:21,28:8,15:13,13 0/1:.:34:15,19:5,11:10,8 | |
| 35895 chr22 44086511 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 35896 chr22 44091134 . C G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.0601e-12;SPV=0.88936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:13,13:7,8 0/1:.:28:17,11:11,7:6,4 | |
| 35897 chr22 44092196 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=1.0508e-14;SPV=0.86831 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:29,25:14,16:15,9 0/1:.:38:24,14:15,7:9,7 | |
| 35898 chr22 44092695 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=4.4405e-12;SPV=0.34987 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:11,9:12,9 0/1:.:25:12,13:3,7:9,6 | |
| 35899 chr22 44092916 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=4;GPV=2.1215e-17;SPV=0.39303 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:10,10:16,17 0/1:.:30:13,17:9,11:4,6 | |
| 35900 chr22 44093988 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,29:0,19 1/1:.:29:0,29:0,19:0,10 | |
| 35901 chr22 44094016 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=7;GPV=3.5003e-14;SPV=0.18821 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:11,12:13,8 0/1:.:27:11,16:7,7:4,9 | |
| 35902 chr22 44094885 . C G . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=3.673e-15;SPV=0.75926 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:10,6:12,17 0/1:.:35:19,16:5,9:14,7 | |
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| 35954 chr22 44126432 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=9;GPV=4.794e-13;SPV=0.10133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:27,16:13,8:14,8 0/1:.:33:15,18:8,8:7,10 | |
| 35955 chr22 44126953 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=5.349e-11;SPV=0.74467 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:4,5:11,10 0/1:.:29:16,13:9,6:7,7 | |
| 35956 chr22 44127381 . G T . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,34:0,9 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 | |
| 35957 chr22 44127384 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,32:0,10 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 | |
| 35958 chr22 44127713 . G A . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=5.5473e-09;SPV=0.94492 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:10,6:7,11 0/1:.:19:13,6:7,2:6,4 | |
| 35959 chr22 44128540 . G T . PASS DP=94;SS=1;SSC=3;GPV=2.0929e-16;SPV=0.45219 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:29,23:9,3:20,20 0/1:.:42:22,20:14,5:8,15 | |
| 35960 chr22 44129211 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.2505e-10;SPV=0.8231 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:7,9:12,6 0/1:.:36:23,13:12,7:11,6 | |
| 35961 chr22 44129494 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=1.3596e-16;SPV=0.33128 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:12,9:8,10 0/1:.:41:18,23:7,13:11,10 | |
| 35962 chr22 44129754 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=3;GPV=1.2823e-13;SPV=0.43997 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:8,7:10,8 0/1:.:40:20,20:4,7:16,13 | |
| 35963 chr22 44130967 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.0507e-11;SPV=0.94078 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:11,10:10,13 0/1:.:20:13,7:7,2:6,5 | |
| 35964 chr22 44131347 . T G . PASS DP=87;SS=1;SSC=5;GPV=1.0711e-20;SPV=0.29612 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:22,27:15,12:7,15 0/1:.:38:14,24:12,9:2,15 | |
| 35965 chr22 44131965 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=6;GPV=4.1488e-12;SPV=0.23561 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:28,16:16,7:12,9 0/1:.:34:18,16:5,3:13,13 | |
| 35966 chr22 44134540 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=2.8662e-18;SPV=0.94257 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:18,28:8,14:10,14 0/1:.:39:21,18:7,12:14,6 | |
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| 35968 chr22 44136265 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=3;GPV=5.8102e-14;SPV=0.42791 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:27,18:11,8:16,10 0/1:.:43:24,19:10,8:14,11 | |
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| 36017 chr22 44171764 . T C . PASS DP=53;SS=1;SSC=2;GPV=1.5031e-08;SPV=0.54775 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:19,13:11,7:8,6 0/1:.:21:12,9:5,6:7,3 | |
| 36018 chr22 44173323 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=6.0532e-18;SPV=0.57047 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:15,21:8,13:7,8 0/1:.:39:16,23:8,12:8,11 | |
| 36019 chr22 44173460 . T C . PASS DP=92;SS=1;SSC=9;GPV=6.9016e-22;SPV=0.11284 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:16,10:8,16 0/1:.:42:14,28:7,13:7,15 | |
| 36020 chr22 44173919 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.3875e-11;SPV=0.97752 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:9,8:15,13 0/1:.:30:22,8:8,1:14,7 | |
| 36021 chr22 44175200 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=1.6693e-13;SPV=0.92541 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:35,28:17,20:18,8 0/1:.:26:18,8:9,5:9,3 | |
| 36022 chr22 44176196 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=7.7158e-19;SPV=0.99746 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:14,31:6,17:8,14 0/1:.:39:23,16:8,9:15,7 | |
| 36023 chr22 44177152 . C G . PASS DP=68;SS=1;SSC=6;GPV=6.4956e-13;SPV=0.24213 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:8,3:14,14 0/1:.:29:13,16:8,7:5,9 | |
| 36024 chr22 44177875 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=1;GPV=9.9959e-10;SPV=0.7843 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:6,9:11,6 0/1:.:25:15,10:5,3:10,7 | |
| 36025 chr22 44178120 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=2.7231e-11;SPV=0.51492 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:15,12:8,4:7,8 0/1:.:36:19,17:9,6:10,11 | |
| 36026 chr22 44178524 . G A . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 1/1:.:20:0,20:0,7:0,13 | |
| 36027 chr22 44178667 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=1.2581e-11;SPV=0.80347 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:11,14:13,8 0/1:.:20:12,8:7,4:5,4 | |
| 36028 chr22 44179093 . A T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=4.1537e-13;SPV=0.86135 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:6,12:8,10 0/1:.:20:10,10:4,4:6,6 | |
| 36029 chr22 44180252 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=4;GPV=4.2509e-20;SPV=0.39224 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:16,9:5,16 0/1:.:42:17,25:7,13:10,12 | |
| 36030 chr22 44180775 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=2.0452e-11;SPV=0.79644 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:9,10:8,8 0/1:.:25:14,11:11,7:3,4 | |
| 36031 chr22 44182618 . C G . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.1753e-14;SPV=0.68313 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:10,16:16,8 0/1:.:31:17,14:13,10:4,4 | |
| 36032 chr22 44184381 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=5;GPV=2.4772e-18;SPV=0.26883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:15,14:5,6 0/1:.:44:18,26:14,15:4,11 | |
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| 36094 chr22 44213730 . C A . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,12:0,8 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 36095 chr22 44216775 . G C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,10:0,27 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 | |
| 36096 chr22 44216881 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,23:0,19 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
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| 36098 chr22 44216937 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=6;GPV=4.6893e-11;SPV=0.2091 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:25,14:15,9:10,5 0/1:.:31:16,15:11,7:5,8 | |
| 36099 chr22 44217223 . C T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=2.5024e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,20:0,6 1/1:.:25:0,25:0,16:0,9 | |
| 36100 chr22 44217400 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.040263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:27,25:16,15:11,10 0/1:.:25:7,18:3,13:4,5 | |
| 36101 chr22 44217642 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=7.7752e-12;SPV=0.46293 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:11,7:10,12 0/1:.:21:10,11:2,3:8,8 | |
| 36102 chr22 44217983 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,23:0,27 1/1:.:35:0,35:0,15:0,20 | |
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| 36152 chr22 44233929 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=1.1052e-12;SPV=0.44413 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:9,5:9,12 0/1:.:28:13,15:8,4:5,11 | |
| 36153 chr22 44235254 . T A . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,7:0,18 1/1:.:29:0,29:0,8:0,21 | |
| 36154 chr22 44235284 . C T . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=2.0219e-08;SPV=0.96343 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:7,11:2,2:5,9 0/1:.:26:16,10:6,2:10,8 | |
| 36155 chr22 44238417 . C G . PASS DP=87;SS=1;SSC=4;GPV=3.9107e-13;SPV=0.35546 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:33,20:15,13:18,7 0/1:.:34:19,15:10,13:9,2 | |
| 36156 chr22 44238739 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.029134 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:13,9:10,13 0/1:.:33:9,24:3,11:6,13 | |
| 36157 chr22 44239335 . C A . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=1.3095e-14;SPV=0.66938 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:12,16:8,6 0/1:.:30:15,15:8,8:7,7 | |
| 36158 chr22 44239508 . C A . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=3.9143e-11;SPV=0.85887 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:11,14:3,6:8,8 0/1:.:31:17,14:8,5:9,9 | |
| 36159 chr22 44240761 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=8.8612e-15;SPV=0.84131 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:11,16:7,11:4,5 0/1:.:42:21,21:10,13:11,8 | |
| 36160 chr22 44241550 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=8;GPV=2.2536e-12;SPV=0.15265 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:20,12:9,6:11,6 0/1:.:38:18,20:9,12:9,8 | |
| 36161 chr22 44242113 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=3.7425e-15;SPV=0.79047 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:5,7:11,14 0/1:.:34:17,17:4,8:13,9 | |
| 36162 chr22 44242829 . C G . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=4.39e-14;SPV=0.7192 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:4,11:13,7 0/1:.:38:20,18:6,8:14,10 | |
| 36163 chr22 44243240 . T C . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=1.5733e-23;SPV=0.90184 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:19,34:5,17:14,17 0/1:.:45:21,24:9,9:12,15 | |
| 36164 chr22 44244728 . G A . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=6.4769e-21;SPV=0.99749 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:19,39:11,23:8,16 0/1:.:33:20,13:12,6:8,7 | |
| 36165 chr22 44245172 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=5.7384e-17;SPV=0.48287 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:9,13:13,10 0/1:.:37:17,20:5,6:12,14 | |
| 36166 chr22 44247449 . G A . PASS DP=94;SS=1;SSC=3;GPV=3.3469e-20;SPV=0.4579 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:25,28:8,15:17,13 0/1:.:41:18,23:6,13:12,10 | |
| 36167 chr22 44247744 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,21:0,29 1/1:.:32:0,32:0,12:0,20 | |
| 36168 chr22 44249812 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=3.7947e-21;SPV=0.79565 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:22,35:9,21:13,14 0/1:.:31:14,17:4,7:10,10 | |
| 36169 chr22 44250035 . C G . PASS DP=62;SS=1;SSC=26;GPV=1;SPV=0.0022084 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:15,23:6,9:9,14 0/1:.:24:19,5:9,2:10,3 | |
| 36170 chr22 44250429 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=3.2317e-11;SPV=0.63038 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:11,8:11,10 0/1:.:25:14,11:4,6:10,5 | |
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| 36220 chr22 44312385 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=3;GPV=2.9254e-10;SPV=0.46255 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:26,16:13,11:13,5 0/1:.:26:15,11:4,7:11,4 | |
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| 36222 chr22 44313107 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=4.4443e-21;SPV=0.73297 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:15,30:9,8:6,22 0/1:.:32:12,20:4,11:8,9 | |
| 36223 chr22 44313874 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=1.1213e-16;SPV=0.51928 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:13,15:6,10 0/1:.:27:11,16:7,9:4,7 | |
| 36224 chr22 44313995 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=3.642e-14;SPV=0.841 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:28,26:14,12:14,14 0/1:.:28:17,11:6,4:11,7 | |
| 36225 chr22 44314878 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=6;GPV=5.2507e-16;SPV=0.24597 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:28,24:15,14:13,10 0/1:.:30:13,17:7,5:6,12 | |
| 36226 chr22 44315014 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=1.3095e-14;SPV=0.87965 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:22,27:16,12:6,15 0/1:.:23:13,10:9,5:4,5 | |
| 36227 chr22 44315709 . C A . PASS DP=82;SS=1;SSC=7;GPV=1.662e-19;SPV=0.18108 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:13,17:9,8 0/1:.:35:12,23:7,14:5,9 | |
| 36228 chr22 44317298 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,23:0,29 1/1:.:43:0,43:0,18:0,25 | |
| 36229 chr22 44317669 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=6.4769e-21;SPV=0.81528 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:22,33:7,15:15,18 0/1:.:36:17,19:8,11:9,8 | |
| 36230 chr22 44319917 . C T . PASS DP=101;SS=1;SSC=6;GPV=1.7322e-17;SPV=0.24696 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:37,27:18,12:19,15 0/1:.:37:18,19:11,9:7,10 | |
| 36231 chr22 44320918 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=2.2978e-14;SPV=0.73044 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:14,13:12,8 0/1:.:42:25,17:12,7:13,10 | |
| 36232 chr22 44321051 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=9;GPV=1.3142e-17;SPV=0.11846 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:31,26:16,12:15,14 0/1:.:31:12,19:2,10:10,9 | |
| 36233 chr22 44321525 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.8211e-18;SPV=0.74622 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:21,29:13,17:8,12 0/1:.:32:15,17:7,8:8,9 | |
| 36234 chr22 44321767 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=9.5353e-13;SPV=0.64808 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:8,9:15,11 0/1:.:29:16,13:9,8:7,5 | |
| 36235 chr22 44322934 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=2.4655e-13;SPV=0.56952 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:11,13:13,10 0/1:.:22:11,11:9,3:2,8 | |
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| 36343 chr22 44400959 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=1.6064e-11;SPV=0.8939 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:7,9:13,10 0/1:.:30:19,11:10,6:9,5 | |
| 36344 chr22 44401843 . C A . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=5.295e-10;SPV=0.69615 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:14,9:7,7 0/1:.:25:15,10:4,7:11,3 | |
| 36345 chr22 44401934 . G C . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=5.456e-15;SPV=0.70395 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:16,14:9,9 0/1:.:36:20,16:10,7:10,9 | |
| 36346 chr22 44402766 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=3;GPV=8.8662e-16;SPV=0.46939 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:9,12:16,9 0/1:.:41:21,20:9,10:12,10 | |
| 36347 chr22 44403214 . T G . PASS DP=93;SS=1;SSC=1;GPV=8.0818e-14;SPV=0.72378 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:15,11:13,9 0/1:.:45:28,17:8,12:20,5 | |
| 36348 chr22 44403505 . G T . PASS DP=68;SS=1;SSC=3;GPV=7.3575e-14;SPV=0.48867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:9,8:10,11 0/1:.:30:14,16:5,7:9,9 | |
| 36349 chr22 44406215 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=8.5972e-13;SPV=0.8524 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:31,24:18,12:13,12 0/1:.:29:19,10:7,4:12,6 | |
| 36350 chr22 44408312 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=3.2342e-19;SPV=0.69024 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:7,15:7,7 0/1:.:43:18,25:10,16:8,9 | |
| 36351 chr22 44413059 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=5;GPV=2.1212e-20;SPV=0.30369 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:25,28:11,16:14,12 0/1:.:38:15,23:7,10:8,13 | |
| 36352 chr22 44413313 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=9;GPV=1.0016e-19;SPV=0.10552 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:12,12:12,12 0/1:.:38:13,25:7,16:6,9 | |
| 36353 chr22 44413785 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=1.4855e-11;SPV=0.7176 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:9,8:11,9 0/1:.:31:18,13:5,5:13,8 | |
| 36354 chr22 44413984 . G T . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=2.8075e-15;SPV=0.44405 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:13,10:8,14 0/1:.:24:10,14:4,8:6,6 | |
| 36355 chr22 44414118 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=7;GPV=2.3553e-09;SPV=0.19257 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:19,11:9,5:10,6 0/1:.:25:12,13:6,7:6,6 | |
| 36356 chr22 44414412 . T C . PASS DP=47;SS=1;SSC=2;GPV=1.0643e-11;SPV=0.54199 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:8,11:6,5:2,6 0/1:.:28:11,17:4,12:7,5 | |
| 36357 chr22 44415542 . C G . PASS DP=64;SS=1;SSC=3;GPV=3.6451e-12;SPV=0.49383 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:8,7:8,7 0/1:.:34:17,17:6,9:11,8 | |
| 36358 chr22 44416156 . G A . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=4.7115e-08;SPV=0.96487 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:8,10:8,4 0/1:.:26:19,7:10,5:9,2 | |
| 36359 chr22 44416655 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.0601e-12;SPV=0.95731 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:6,12:13,10 0/1:.:28:18,10:11,7:7,3 | |
| 36360 chr22 44416881 . T G . PASS DP=66;SS=1;SSC=6;GPV=4.4405e-12;SPV=0.25055 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:22,16:14,8:8,8 0/1:.:28:13,15:8,12:5,3 | |
| 36361 chr22 44418300 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.8211e-18;SPV=0.8774 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:19,29:9,17:10,12 0/1:.:34:17,17:8,7:9,10 | |
| 36362 chr22 44418457 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=6.2985e-12;SPV=0.74357 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:12,8:10,11 0/1:.:29:17,12:5,8:12,4 | |
| 36363 chr22 44419333 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=6;GPV=5.5047e-12;SPV=0.2202 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:15,12:7,8:8,4 0/1:.:31:13,18:9,8:4,10 | |
| 36364 chr22 44419606 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=3.7062e-14;SPV=0.578 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:5,8:8,8 0/1:.:34:15,19:6,14:9,5 | |
| 36365 chr22 44420319 . C G . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=2.0601e-12;SPV=0.5793 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:18,12:3,6 0/1:.:30:16,14:8,9:8,5 | |
| 36366 chr22 44420727 . G T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=2.7419e-13;SPV=0.88724 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:7,6:10,14 0/1:.:33:19,14:15,8:4,6 | |
| 36367 chr22 44421242 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=1.4855e-11;SPV=0.9001 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,18:9,9:9,9 0/1:.:32:20,12:8,8:12,4 | |
| 36368 chr22 44421743 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=5;GPV=7.8044e-17;SPV=0.29793 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:8,13:9,8 0/1:.:31:11,20:7,9:4,11 | |
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| 36370 chr22 44424916 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,27:0,21 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 | |
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| 36418 chr22 44446631 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=10;GPV=5.6371e-17;SPV=0.095169 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:8,12:13,8 0/1:.:33:11,22:5,11:6,11 | |
| 36419 chr22 44447370 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=1;GPV=2.133e-08;SPV=0.74068 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:16,4:4,9 0/1:.:26:17,9:8,5:9,4 | |
| 36420 chr22 44447578 . T A . PASS DP=77;SS=1;SSC=6;GPV=2.2863e-14;SPV=0.21115 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:22,16:8,7:14,9 0/1:.:39:18,21:7,6:11,15 | |
| 36421 chr22 44447858 . A T . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=6.9672e-12;SPV=0.78259 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:3,5:13,13 0/1:.:26:14,12:6,5:8,7 | |
| 36422 chr22 44449285 . G C . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=7.5071e-11;SPV=0.66052 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:26,16:14,5:12,11 0/1:.:36:23,13:15,8:8,5 | |
| 36423 chr22 44450292 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=9;GPV=4.034e-13;SPV=0.12167 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,14:11,5:12,9 0/1:.:37:17,20:10,6:7,14 | |
| 36424 chr22 44450642 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.39e-14;SPV=0.80128 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:10,14:10,8 0/1:.:31:17,14:8,6:9,8 | |
| 36425 chr22 44450776 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=2.8662e-18;SPV=0.72848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:6,9:11,13 0/1:.:46:22,24:10,8:12,16 | |
| 36426 chr22 44452488 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=5;GPV=5.88e-11;SPV=0.27685 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:14,12:12,8 0/1:.:14:6,8:2,4:4,4 | |
| 36427 chr22 44452902 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=4.7649e-17;SPV=0.7257 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:21,30:15,18:6,12 0/1:.:22:10,12:9,6:1,6 | |
| 36428 chr22 44453538 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=3.2684e-19;SPV=0.81579 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:21,30:13,15:8,15 0/1:.:35:17,18:10,9:7,9 | |
| 36429 chr22 44453681 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=2.0677e-18;SPV=0.81415 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:26,31:13,10:13,21 0/1:.:34:18,16:6,13:12,3 | |
| 36430 chr22 44454560 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=7;GPV=2.5259e-14;SPV=0.19356 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:15,12:10,6 0/1:.:35:16,19:7,10:9,9 | |
| 36431 chr22 44455210 . A C . PASS DP=70;SS=1;SSC=4;GPV=1.02e-15;SPV=0.35183 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:10,10:9,11 0/1:.:30:12,18:5,7:7,11 | |
| 36432 chr22 44455578 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=6.7818e-18;SPV=0.77682 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:11,9:7,15 0/1:.:41:20,21:11,12:9,9 | |
| 36433 chr22 44455886 . C G . PASS DP=88;SS=1;SSC=3;GPV=4.4296e-19;SPV=0.4296 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:25,28:8,17:17,11 0/1:.:35:15,20:6,9:9,11 | |
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| 36435 chr22 44456837 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.2981e-15;SPV=0.95687 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:10,16:9,9 0/1:.:35:21,14:10,5:11,9 | |
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| 36488 chr22 44548133 . G C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 1/1:.:32:0,32:0,22:0,10 | |
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| 36492 chr22 44550641 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,16:0,24 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 | |
| 36493 chr22 44550785 . C A . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=7.5676e-40;SPV=0.57143 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:1,39:1,24:0,15 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 36494 chr22 44550849 . C G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,23:0,23 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
| 36495 chr22 44550903 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 | |
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| 36497 chr22 44551601 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 | |
| 36498 chr22 44552028 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 | |
| 36499 chr22 44552217 . T G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 1/1:.:36:0,36:0,11:0,25 | |
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| 36501 chr22 44555821 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,40:0,9 1/1:.:26:0,26:0,18:0,8 | |
| 36502 chr22 44556081 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,16:0,32 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
| 36503 chr22 44557620 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 | |
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| 36505 chr22 44559153 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,27:0,20 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
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| 36534 chr22 44574347 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,18:0,27 1/1:.:19:0,19:0,10:0,9 | |
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| 36536 chr22 44575668 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,13:0,22 1/1:.:28:0,28:0,10:0,18 | |
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| 36547 chr22 44579008 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,23:0,21 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 | |
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| 36551 chr22 44579724 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,27:0,26 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 | |
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| 36554 chr22 44582843 . C A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,27:0,14 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 36555 chr22 44583508 . C A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,25:0,13 1/1:.:26:0,26:0,10:0,16 | |
| 36556 chr22 44583580 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,30:0,15 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 | |
| 36557 chr22 44583710 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,22:0,23 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 36558 chr22 44583735 . C G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:33:0,33:0,15:0,18 | |
| 36559 chr22 44583932 . C A . PASS DP=48;SS=1;SSC=2;GPV=2.8521e-08;SPV=0.58773 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:6,2:11,11 0/1:.:18:10,8:3,4:7,4 | |
| 36560 chr22 44584262 . T G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 36561 chr22 44584418 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,30:0,12 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 36562 chr22 44584958 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 36563 chr22 44584960 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 36564 chr22 44585083 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,27:0,19 1/1:.:24:0,24:0,15:0,9 | |
| 36565 chr22 44585211 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 36566 chr22 44585446 . A C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,33:0,22 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 36567 chr22 44585877 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,21:0,19 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
| 36568 chr22 44589065 . C G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=7.1262e-11;SPV=0.86267 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:14,10:11,8 0/1:.:34:23,11:11,9:12,2 | |
| 36569 chr22 44589436 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 | |
| 36570 chr22 44589533 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=12;GPV=8.6835e-16;SPV=0.060525 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:11,7:14,12 0/1:.:33:12,21:3,14:9,7 | |
| 36571 chr22 44590052 . G C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=2.1298e-18;SPV=0.99595 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:16,32:7,18:9,14 0/1:.:35:21,14:13,11:8,3 | |
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| 36573 chr22 44591284 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
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| 36623 chr22 44634872 . C T . PASS DP=96;SS=1;SSC=5;GPV=4.4461e-21;SPV=0.2621 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:28,30:16,14:12,16 0/1:.:38:15,23:2,14:13,9 | |
| 36624 chr22 44635283 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=2.5278e-15;SPV=0.58764 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:27,23:16,13:11,10 0/1:.:37:20,17:9,8:11,9 | |
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| 36626 chr22 44636237 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=2.6699e-12;SPV=0.83527 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:10,11:9,7 0/1:.:35:21,14:14,9:7,5 | |
| 36627 chr22 44636420 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=6.9672e-12;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:7,8:10,8 0/1:.:27:13,14:3,6:10,8 | |
| 36628 chr22 44636724 . G A . PASS DP=48;SS=1;SSC=2;GPV=5.3443e-07;SPV=0.52923 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:16,9:6,4:10,5 0/1:.:23:14,9:1,6:13,3 | |
| 36629 chr22 44636737 . C T . PASS DP=45;SS=1;SSC=4;GPV=7.1237e-12;SPV=0.3956 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:10,14:4,5:6,9 0/1:.:21:7,14:4,2:3,12 | |
| 36630 chr22 44636983 . T C . PASS DP=30;SS=1;SSC=1;GPV=6.1809e-05;SPV=0.69919 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:10,7:4,3:6,4 0/1:.:13:8,5:5,2:3,3 | |
| 36631 chr22 44637303 . T C . PASS DP=45;SS=1;SSC=7;GPV=8.5784e-10;SPV=0.17112 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:9,8:7,6 0/1:.:15:5,10:2,8:3,2 | |
| 36632 chr22 44638194 . T A . PASS DP=49;SS=1;SSC=6;GPV=4.6489e-10;SPV=0.23678 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:14,11:5,6:9,5 0/1:.:24:10,14:6,9:4,5 | |
| 36633 chr22 44639360 . C T . PASS DP=106;SS=1;SSC=8;GPV=5.9484e-22;SPV=0.15391 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:30,27:16,21:14,6 0/1:.:49:20,29:15,21:5,8 | |
| 36634 chr22 44639566 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=1.2112e-18;SPV=0.50527 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:10,8:13,18 0/1:.:38:17,21:7,8:10,13 | |
| 36635 chr22 44639749 . A C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=1.0476e-18;SPV=0.82917 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:16,23:9,8:7,15 0/1:.:47:23,24:7,14:16,10 | |
| 36636 chr22 44640166 . C A . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=1.2435e-09;SPV=0.68588 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:9,9:11,6 0/1:.:25:15,10:7,9:8,1 | |
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| 36638 chr22 44643085 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=19;GPV=1;SPV=0.011786 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:27,13:16,3:11,10 0/1:.:38:15,23:5,14:10,9 | |
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| 36689 chr22 44681981 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=3;GPV=4.3139e-18;SPV=0.408 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:13,11:10,12 0/1:.:42:19,23:7,13:12,10 | |
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| 36694 chr22 44684769 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=2.95e-15;SPV=0.40908 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:9,7:15,15 0/1:.:32:15,17:3,8:12,9 | |
| 36695 chr22 44684875 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=1.2446e-15;SPV=0.59015 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:9,15:15,9 0/1:.:32:16,16:4,9:12,7 | |
| 36696 chr22 44685109 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=4;GPV=7.8163e-15;SPV=0.3734 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:12,12:14,11 0/1:.:28:13,15:3,10:10,5 | |
| 36697 chr22 44685691 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=3.0665e-16;SPV=0.98033 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:26,32:14,13:12,19 0/1:.:29:19,10:9,4:10,6 | |
| 36698 chr22 44685906 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
| 36699 chr22 44686182 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,14:0,24 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 36700 chr22 44686206 . G T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,17:0,24 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 36701 chr22 44686264 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=5.4444e-14;SPV=0.42308 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,15:0,7:0,8 0/1:.:20:1,10:1,4:0,6 | |
| 36702 chr22 44686265 . A G . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=4.7003e-10;SPV=0.86667 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:1,12:0,9:1,3 1/1:.:20:1,7:1,3:0,4 | |
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| 36756 chr22 44735653 . C G . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,29:0,26 1/1:.:41:0,41:0,26:0,15 | |
| 36757 chr22 44735675 . T G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,26:0,23 1/1:.:44:0,44:0,25:0,19 | |
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| 36759 chr22 44736611 . G A . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=3.0906e-19;SPV=0.86589 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:26,29:11,17:15,12 0/1:.:48:27,21:17,15:10,6 | |
| 36760 chr22 44738317 . G A . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:63:0,63:0,33:0,30 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
| 36761 chr22 44738668 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,29:0,14 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
| 36762 chr22 44739757 . G C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,23:0,23 1/1:.:35:0,35:0,12:0,23 | |
| 36763 chr22 44740480 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=3;GPV=2.4634e-33;SPV=0.45763 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,13:0,19 1/1:.:27:1,26:0,15:1,11 | |
| 36764 chr22 44740591 . G C . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=1.8578e-12;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,13:0,5:0,8 0/1:.:15:0,8:0,6:0,2 | |
| 36765 chr22 44740611 . T C . PASS DP=50;SS=1;SSC=10;GPV=5.8768e-13;SPV=0.087302 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,15:0,8:0,7 0/1:.:21:3,10:2,3:1,7 | |
| 36766 chr22 44741892 . A G . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=1.4168e-09;SPV=0.99684 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:8,11:7,7 0/1:.:29:22,7:12,4:10,3 | |
| 36767 chr22 44741903 . A C . PASS DP=60;SS=1;SSC=2;GPV=4.1102e-31;SPV=0.62595 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:2,33:2,14:0,19 1/1:.:25:1,24:1,8:0,16 | |
| 36768 chr22 44744651 . C T . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,26:0,14:0,12 1/1:.:16:0,16:0,5:0,11 | |
| 36769 chr22 44747504 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,22:0,12 1/1:.:35:0,35:0,23:0,12 | |
| 36770 chr22 44747573 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,26:0,12 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
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| 36772 chr22 44748226 . G T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 | |
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| 36826 chr22 44769998 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=4;GPV=2.6615e-19;SPV=0.39043 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:6,9:11,14 0/1:.:38:14,24:6,10:8,14 | |
| 36827 chr22 44770116 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 1/1:.:37:0,37:0,12:0,25 | |
| 36828 chr22 44770288 . C A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=1.1875e-15;SPV=0.97103 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:16,27:7,16:9,11 0/1:.:28:16,12:6,5:10,7 | |
| 36829 chr22 44770395 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 1/1:.:23:0,23:0,15:0,8 | |
| 36830 chr22 44770510 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,42:0,23:0,19 1/1:.:18:0,18:0,11:0,7 | |
| 36831 chr22 44770908 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 1/1:.:25:0,25:0,14:0,11 | |
| 36832 chr22 44771270 . G A . PASS DP=51;SS=1;SSC=10;GPV=6.4161e-12;SPV=0.083946 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:15,13:4,9:11,4 0/1:.:23:7,16:3,11:4,5 | |
| 36833 chr22 44771591 . G C . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=3.0926e-11;SPV=0.79288 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:12,15:5,8:7,7 0/1:.:27:14,13:6,7:8,6 | |
| 36834 chr22 44772968 . A T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.4154e-13;SPV=0.99036 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:15,22:9,14:6,8 0/1:.:37:24,13:16,4:8,9 | |
| 36835 chr22 44773496 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 | |
| 36836 chr22 44773892 . C A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,22:0,30 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
| 36837 chr22 44774722 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,17:0,25 1/1:.:25:0,25:0,9:0,16 | |
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| 36839 chr22 44774933 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 1/1:.:33:0,33:0,22:0,11 | |
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| 36891 chr22 44786327 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=1.0222e-17;SPV=0.60537 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:10,13:8,7 0/1:.:48:23,25:14,12:9,13 | |
| 36892 chr22 44786987 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=3;GPV=4.8717e-12;SPV=0.40619 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:16,14:7,4 0/1:.:26:13,13:11,6:2,7 | |
| 36893 chr22 44792520 . G T . PASS DP=75;SS=1;SSC=6;GPV=1.4104e-19;SPV=0.22709 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:6,12:11,11 0/1:.:35:11,24:8,14:3,10 | |
| 36894 chr22 44801588 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=5.0311e-18;SPV=0.97678 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:17,30:11,25:6,5 0/1:.:34:19,15:11,7:8,8 | |
| 36895 chr22 44802129 . A G . PASS DP=90;SS=1;SSC=6;GPV=5.8861e-19;SPV=0.22427 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:27,26:8,14:19,12 0/1:.:37:15,22:8,12:7,10 | |
| 36896 chr22 44802614 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=4.8717e-12;SPV=0.77875 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:14,12:7,8 0/1:.:26:15,11:5,6:10,5 | |
| 36897 chr22 44802667 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=3;GPV=2.4088e-15;SPV=0.41948 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:9,12:10,10 0/1:.:27:11,16:8,5:3,11 | |
| 36898 chr22 44803178 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=3;GPV=3.011e-15;SPV=0.39912 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:33,25:20,14:13,11 0/1:.:31:16,15:12,9:4,6 | |
| 36899 chr22 44803839 . T C . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=4.8137e-09;SPV=0.99601 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:7,16:3,10:4,6 0/1:.:18:12,6:5,3:7,3 | |
| 36900 chr22 44804987 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=19;GPV=1;SPV=0.01184 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:26,12:15,7:11,5 0/1:.:27:10,17:6,10:4,7 | |
| 36901 chr22 44806739 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=1.2269e-12;SPV=0.60685 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:15,6:9,13 0/1:.:32:18,14:11,10:7,4 | |
| 36902 chr22 44806952 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=2.6864e-14;SPV=0.44201 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:11,13:2,7:9,6 0/1:.:37:15,22:9,10:6,12 | |
| 36903 chr22 44807366 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=4.6505e-14;SPV=0.7186 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:28,23:12,7:16,16 0/1:.:34:20,14:9,4:11,10 | |
| 36904 chr22 44807653 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=12;GPV=8.8662e-16;SPV=0.06282 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:32,21:21,8:11,13 0/1:.:34:14,20:7,7:7,13 | |
| 36905 chr22 44809848 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=1.3655e-13;SPV=0.6138 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:14,13:12,6 0/1:.:41:24,17:13,9:11,8 | |
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| 36907 chr22 44810181 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=2.0525e-15;SPV=0.94083 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:17,28:5,14:12,14 0/1:.:22:12,10:5,7:7,3 | |
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| 36961 chr22 44851335 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=1.2446e-15;SPV=0.32625 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:10,8:14,13 0/1:.:35:16,19:7,12:9,7 | |
| 36962 chr22 44853999 . C T . PASS DP=40;SS=1;SSC=3;GPV=6.0618e-06;SPV=0.4029 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:14,7:5,3:9,4 0/1:.:19:11,8:3,2:8,6 | |
| 36963 chr22 44854541 . G C . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=8.8612e-15;SPV=0.78012 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:7,7:10,15 0/1:.:30:15,15:5,6:10,9 | |
| 36964 chr22 44855543 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=1.4126e-14;SPV=0.83477 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:10,9:16,16 0/1:.:32:19,13:10,4:9,9 | |
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| 36966 chr22 44856352 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 1/1:.:30:0,30:0,11:0,19 | |
| 36967 chr22 44857199 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,24:0,19 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 36968 chr22 44857496 . C G . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=1.1875e-15;SPV=0.75612 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:7,15:11,9 0/1:.:29:14,15:8,13:6,2 | |
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| 36970 chr22 44858203 . G T . PASS DP=83;SS=1;SSC=4;GPV=1.0957e-13;SPV=0.34588 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:28,19:19,13:9,6 0/1:.:36:19,17:8,8:11,9 | |
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| 37023 chr22 44899539 . G C . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=1.9973e-11;SPV=0.53251 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:19,13:6,7:13,6 0/1:.:40:23,17:7,8:16,9 | |
| 37024 chr22 44901992 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=2;GPV=1.3907e-10;SPV=0.61062 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:10,6:6,8 0/1:.:28:15,13:8,9:7,4 | |
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| 37026 chr22 44905577 . C T . PASS DP=97;SS=1;SSC=1;GPV=1.4966e-22;SPV=0.66533 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:24,34:14,18:10,16 0/1:.:39:17,22:12,9:5,13 | |
| 37027 chr22 44905692 . C G . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=3.125e-12;SPV=0.48138 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:14,12:11,6 0/1:.:31:17,14:11,7:6,7 | |
| 37028 chr22 44906008 . A C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=3.9005e-19;SPV=0.98548 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:11,26:4,12:7,14 0/1:.:43:22,21:9,11:13,10 | |
| 37029 chr22 44906386 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=2.5259e-14;SPV=0.76321 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:12,8:9,13 0/1:.:36:20,16:11,9:9,7 | |
| 37030 chr22 44906988 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.2446e-15;SPV=0.82061 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:13,10:10,16 0/1:.:31:17,14:12,8:5,6 | |
| 37031 chr22 44907245 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
| 37032 chr22 44907248 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=7;GPV=4.8851e-14;SPV=0.18221 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:15,6:9,12 0/1:.:32:14,18:7,12:7,6 | |
| 37033 chr22 44907835 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=1;GPV=1.4887e-13;SPV=0.75257 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:14,21:7,14:7,7 0/1:.:22:10,12:6,5:4,7 | |
| 37034 chr22 44908626 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=3;GPV=7.7158e-19;SPV=0.4729 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:24,29:12,15:12,14 0/1:.:31:13,18:8,8:5,10 | |
| 37035 chr22 44909339 . G A . PASS DP=102;SS=1;SSC=5;GPV=1.0469e-22;SPV=0.25959 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:29,32:16,18:13,14 0/1:.:41:16,25:8,21:8,4 | |
| 37036 chr22 44910752 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=1.1875e-15;SPV=0.53358 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:5,11:12,9 0/1:.:34:15,19:6,10:9,9 | |
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| 37038 chr22 44912051 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=1.0977e-18;SPV=0.43258 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:18,23:12,16:6,7 0/1:.:38:15,23:3,10:12,13 | |
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| 37089 chr22 44946341 . T A . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=3.6826e-13;SPV=0.51399 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:11,11:14,10 0/1:.:27:14,13:7,5:7,8 | |
| 37090 chr22 44946495 . T C . PASS DP=55;SS=1;SSC=1;GPV=1.0326e-13;SPV=0.77773 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:14,23:5,11:9,12 0/1:.:18:8,10:2,5:6,5 | |
| 37091 chr22 44946628 . T A . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=7.8044e-17;SPV=0.74421 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:15,24:8,13:7,11 0/1:.:30:13,17:9,11:4,6 | |
| 37092 chr22 44946945 . A G . PASS DP=98;SS=1;SSC=1;GPV=7.1046e-13;SPV=0.72213 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:39,23:21,9:18,14 0/1:.:36:24,12:11,8:13,4 | |
| 37093 chr22 44947529 . G T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=8.9568e-18;SPV=0.93876 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:22,31:9,13:13,18 0/1:.:32:18,14:6,4:12,10 | |
| 37094 chr22 44949162 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=7.9176e-20;SPV=0.85235 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:19,27:6,12:13,15 0/1:.:46:23,23:13,11:10,12 | |
| 37095 chr22 44949279 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=8;GPV=4.794e-13;SPV=0.13425 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:25,15:12,6:13,9 0/1:.:36:17,19:10,9:7,10 | |
| 37096 chr22 44949614 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 37097 chr22 44949953 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=1.7439e-13;SPV=0.98676 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:15,24:6,14:9,10 0/1:.:27:17,10:10,5:7,5 | |
| 37098 chr22 44950414 . C A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 | |
| 37099 chr22 44951015 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 1/1:.:21:0,21:0,7:0,14 | |
| 37100 chr22 44951038 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 1/1:.:18:0,18:0,7:0,11 | |
| 37101 chr22 44952292 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=8;GPV=3.2545e-20;SPV=0.12905 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:7,11:13,13 0/1:.:36:11,25:6,10:5,15 | |
| 37102 chr22 44952436 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=7.9293e-13;SPV=0.96153 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:9,10:9,12 0/1:.:30:19,11:11,6:8,5 | |
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| 37104 chr22 44952938 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=9.1061e-12;SPV=0.63392 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:13,11:12,7 0/1:.:32:19,13:9,8:10,5 | |
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| 37155 chr22 44994652 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=1.3655e-13;SPV=0.73168 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:14,14:13,7 0/1:.:38:23,15:10,3:13,12 | |
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| 37158 chr22 44997454 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 | |
| 37159 chr22 44997714 . G T . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=2.6845e-08;SPV=0.78489 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:20,12:9,4:11,8 0/1:.:32:22,10:13,7:9,3 | |
| 37160 chr22 44997902 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=5.8059e-16;SPV=0.8862 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:14,21:10,11:4,10 0/1:.:39:20,19:15,10:5,9 | |
| 37161 chr22 44998703 . G C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 1/1:.:43:0,43:0,16:0,27 | |
| 37162 chr22 44998859 . C G . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=2.0308e-13;SPV=0.42613 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:29,22:17,14:12,8 0/1:.:27:14,13:4,8:10,5 | |
| 37163 chr22 44999021 . C G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 37164 chr22 44999211 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,17:0,26 1/1:.:44:0,44:0,19:0,25 | |
| 37165 chr22 44999587 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:37:0,37:0,13:0,24 | |
| 37166 chr22 44999889 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=4.0755e-15;SPV=0.57689 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:13,9:13,15 0/1:.:31:16,15:8,4:8,11 | |
| 37167 chr22 45000167 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 37168 chr22 45000559 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=2.1298e-18;SPV=0.58752 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:25,31:13,13:12,18 0/1:.:27:12,15:6,7:6,8 | |
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| 37218 chr22 45019966 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=3;GPV=1.5635e-16;SPV=0.42458 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:14,13:4,8 0/1:.:34:14,20:11,14:3,6 | |
| 37219 chr22 45020016 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.6641e-16;SPV=0.88359 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:17,23:6,6 0/1:.:27:15,12:12,8:3,4 | |
| 37220 chr22 45020830 . G C . PASS DP=22;SS=1;SSC=7;GPV=9.1981e-05;SPV=0.19743 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:11:7,4:7,4:0,0 0/1:.:11:4,7:4,7:0,0 | |
| 37221 chr22 45021602 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.0856e-15;SPV=0.86012 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:14,23:9,11:5,12 0/1:.:27:13,14:8,10:5,4 | |
| 37222 chr22 45022514 . C T . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=1.0469e-22;SPV=0.9959 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:20,39:8,14:12,25 0/1:.:43:25,18:12,5:13,13 | |
| 37223 chr22 45022567 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,18:0,30 1/1:.:38:0,38:0,17:0,21 | |
| 37224 chr22 45022803 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=1.2435e-09;SPV=0.41354 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:19,12:12,7:7,5 0/1:.:29:16,13:7,6:9,7 | |
| 37225 chr22 45023521 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=20;GPV=1;SPV=0.00988 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:23,12:19,8:4,4 0/1:.:32:11,21:5,7:6,14 | |
| 37226 chr22 45028479 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=1.6574e-14;SPV=0.76377 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:13,13:9,11 0/1:.:28:15,13:8,8:7,5 | |
| 37227 chr22 45029214 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=1.2661e-10;SPV=0.88822 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:8,9:6,7 0/1:.:27:16,11:9,7:7,4 | |
| 37228 chr22 45031446 . T A . PASS DP=71;SS=1;SSC=9;GPV=3.6893e-16;SPV=0.12238 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:16,14:9,8:7,6 0/1:.:41:15,26:8,6:7,20 | |
| 37229 chr22 45032105 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=4;GPV=6.58e-14;SPV=0.35772 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:12,12:9,4 0/1:.:40:20,20:11,11:9,9 | |
| 37230 chr22 45033734 . G C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.5381e-13;SPV=0.86695 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:14,19:7,5:7,14 0/1:.:32:17,15:11,5:6,10 | |
| 37231 chr22 45033810 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 1/1:.:28:0,28:0,9:0,19 | |
| 37232 chr22 45034715 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=3.9239e-21;SPV=0.41248 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:18,27:7,17:11,10 0/1:.:37:13,24:4,16:9,8 | |
| 37233 chr22 45035574 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=1.1574e-13;SPV=0.94398 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:15,13:7,13 0/1:.:24:15,9:10,5:5,4 | |
| 37234 chr22 45036131 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=2;GPV=7.9176e-20;SPV=0.58282 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:10,13:11,12 0/1:.:46:21,25:13,12:8,13 | |
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| 37236 chr22 45036753 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=3;GPV=4.2977e-14;SPV=0.4846 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:28,21:12,5:16,16 0/1:.:35:19,16:10,9:9,7 | |
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| 37291 chr22 45129309 . A C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 | |
| 37292 chr22 45129603 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,25:0,11 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 37293 chr22 45131462 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 37294 chr22 45132192 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=4;GPV=4.2836e-15;SPV=0.32318 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:8,13:10,4 0/1:.:37:16,21:12,16:4,5 | |
| 37295 chr22 45134238 . C A . PASS DP=85;SS=1;SSC=4;GPV=8.3232e-17;SPV=0.36878 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:10,12:14,10 0/1:.:39:18,21:10,12:8,9 | |
| 37296 chr22 45134995 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=2.581e-13;SPV=0.53394 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:27,20:16,12:11,8 0/1:.:34:19,15:12,7:7,8 | |
| 37297 chr22 45137116 . T A . PASS DP=57;SS=1;SSC=3;GPV=3.594e-10;SPV=0.46082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:6,6:11,7 0/1:.:27:14,13:9,4:5,9 | |
| 37298 chr22 45138414 . G T . PASS DP=60;SS=1;SSC=20;GPV=1;SPV=0.0098612 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:8,1:11,9 0/1:.:31:10,21:8,13:2,8 | |
| 37299 chr22 45138807 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=7.6248e-11;SPV=0.55587 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:9,8:9,6 0/1:.:31:17,14:10,6:7,8 | |
| 37300 chr22 45139001 . T A . PASS DP=84;SS=1;SSC=4;GPV=7.3839e-17;SPV=0.39332 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:15,11:11,14 0/1:.:33:15,18:7,12:8,6 | |
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| 37302 chr22 45140330 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=3;GPV=4.9668e-14;SPV=0.49182 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:13,14:12,11:1,3 0/1:.:38:17,21:12,7:5,14 | |
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| 37348 chr22 45180520 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=1.8278e-16;SPV=0.50346 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:9,12:12,13 0/1:.:28:12,16:5,7:7,9 | |
| 37349 chr22 45181530 . A T . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=9.1412e-06;SPV=0.87675 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:22,11:8,1:14,10 0/1:.:18:14,4:5,1:9,3 | |
| 37350 chr22 45181656 . C A . PASS DP=57;SS=1;SSC=6;GPV=4.411e-14;SPV=0.2233 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:10,9:6,10 0/1:.:22:7,15:4,10:3,5 | |
| 37351 chr22 45181923 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=5.0311e-18;SPV=0.53161 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:23,28:10,22:13,6 0/1:.:30:13,17:10,8:3,9 | |
| 37352 chr22 45182608 . A G . PASS DP=42;SS=1;SSC=4;GPV=2.607e-06;SPV=0.33913 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:16,8:11,3:5,5 0/1:.:18:10,8:6,6:4,2 | |
| 37353 chr22 45183072 . C T . PASS DP=34;SS=1;SSC=4;GPV=1.7305e-07;SPV=0.33217 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:21:11,10:11,9:0,1 0/1:.:13:5,8:4,5:1,3 | |
| 37354 chr22 45183541 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=4.794e-13;SPV=0.56797 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:25,20:6,9:19,11 0/1:.:31:17,14:9,3:8,11 | |
| 37355 chr22 45183850 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=4.0755e-11;SPV=0.8186 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:8,4:9,11 0/1:.:36:22,14:12,12:10,2 | |
| 37356 chr22 45184278 . G C . PASS DP=89;SS=1;SSC=5;GPV=1.6142e-19;SPV=0.31319 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:25,27:15,13:10,14 0/1:.:37:15,22:2,12:13,10 | |
| 37357 chr22 45185525 . C G . PASS DP=65;SS=1;SSC=3;GPV=4.6624e-13;SPV=0.44346 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:9,9:10,9 0/1:.:28:13,15:5,7:8,8 | |
| 37358 chr22 45185640 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=6;GPV=7.0184e-11;SPV=0.25067 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:21,14:12,7:9,7 0/1:.:27:13,14:6,6:7,8 | |
| 37359 chr22 45186979 . G C . PASS DP=60;SS=1;SSC=8;GPV=2.0452e-11;SPV=0.15678 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:20,14:6,7:14,7 0/1:.:26:11,15:4,4:7,11 | |
| 37360 chr22 45187725 . G T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.0856e-15;SPV=0.86301 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:11,19:4,6:7,13 0/1:.:34:16,18:5,9:11,9 | |
| 37361 chr22 45188219 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=5;GPV=6.6743e-16;SPV=0.29425 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:9,10:9,7 0/1:.:40:17,23:13,9:4,14 | |
| 37362 chr22 45189049 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
| 37363 chr22 45189151 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=5.8059e-16;SPV=0.67273 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:5,9:12,12 0/1:.:36:17,19:9,10:8,9 | |
| 37364 chr22 45190636 . G T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 | |
| 37365 chr22 45191864 . T G . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=1.2581e-11;SPV=0.38014 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:16,11:8,7 0/1:.:24:12,12:2,6:10,6 | |
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| 37415 chr22 45242465 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=5;GPV=7.8903e-14;SPV=0.25149 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:27,19:17,13:10,6 0/1:.:33:16,17:7,9:9,8 | |
| 37416 chr22 45242654 . G T . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=2.581e-13;SPV=0.50953 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:13,13:13,6 0/1:.:36:20,16:12,7:8,9 | |
| 37417 chr22 45242915 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=11;GPV=2.4857e-19;SPV=0.075484 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:34,31:15,17:19,14 0/1:.:27:9,18:4,8:5,10 | |
| 37418 chr22 45244019 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.8275e-16;SPV=0.84199 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:13,23:6,10:7,13 0/1:.:31:14,17:9,6:5,11 | |
| 37419 chr22 45244255 . A T . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=1.1213e-16;SPV=0.75628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:13,20:8,8:5,12 0/1:.:38:17,21:6,10:11,11 | |
| 37420 chr22 45244605 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=6;GPV=2.0241e-17;SPV=0.22906 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:12,8:8,14 0/1:.:33:12,21:6,10:6,11 | |
| 37421 chr22 45245698 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=2.8449e-19;SPV=0.89633 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:25,33:11,17:14,16 0/1:.:35:19,16:9,8:10,8 | |
| 37422 chr22 45247338 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=1.7027e-12;SPV=0.77749 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:11,12:11,10 0/1:.:23:13,10:8,6:5,4 | |
| 37423 chr22 45248490 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=2;GPV=4.2509e-20;SPV=0.51628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:7,14:15,14 0/1:.:38:16,22:7,12:9,10 | |
| 37424 chr22 45248620 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=5;GPV=1.8036e-20;SPV=0.29461 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:16,14:7,12 0/1:.:41:16,25:10,13:6,12 | |
| 37425 chr22 45248944 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=2.5278e-15;SPV=0.57364 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:26,22:14,10:12,12 0/1:.:39:21,18:12,10:9,8 | |
| 37426 chr22 45249120 . G T . PASS DP=89;SS=1;SSC=3;GPV=1.0691e-15;SPV=0.40936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:28,22:13,8:15,14 0/1:.:39:20,19:5,3:15,16 | |
| 37427 chr22 45249418 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=3.5003e-14;SPV=0.53709 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:6,12:16,10 0/1:.:27:13,14:6,6:7,8 | |
| 37428 chr22 45249805 . G C . PASS DP=31;SS=1;SSC=0;GPV=2.1486e-18;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:17:0,17:0,10:0,7 1/1:.:14:0,14:0,6:0,8 | |
| 37429 chr22 45250087 . C T . PASS DP=49;SS=1;SSC=3;GPV=8.6234e-06;SPV=0.46199 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:18,7:9,3:9,4 0/1:.:24:16,8:9,3:7,5 | |
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| 37481 chr22 45303057 . T G . PASS DP=42;SS=1;SSC=3;GPV=5.4836e-09;SPV=0.47039 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:13,13:7,5:6,8 0/1:.:16:7,9:3,6:4,3 | |
| 37482 chr22 45303554 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,20:0,28 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 37483 chr22 45303899 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=9;GPV=9.5353e-13;SPV=0.12228 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:23,14:13,6:10,8 0/1:.:35:16,19:8,8:8,11 | |
| 37484 chr22 45305247 . G T . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=8.056e-13;SPV=0.58386 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:26,18:15,10:11,8 0/1:.:39:23,16:10,10:13,6 | |
| 37485 chr22 45305851 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=4;GPV=3.6826e-13;SPV=0.32636 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:26,20:21,14:5,6 0/1:.:27:13,14:8,6:5,8 | |
| 37486 chr22 45307563 . A G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=2.8888e-20;SPV=0.98908 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:19,34:11,18:8,16 0/1:.:40:23,17:13,11:10,6 | |
| 37487 chr22 45309161 . C A . PASS DP=75;SS=1;SSC=9;GPV=6.2293e-15;SPV=0.10251 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:14,7:7,8 0/1:.:39:16,23:9,13:7,10 | |
| 37488 chr22 45309360 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=7.8163e-15;SPV=0.95718 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:7,9:10,14 0/1:.:37:22,15:7,6:15,9 | |
| 37489 chr22 45313079 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.6624e-13;SPV=0.9485 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:12,18:3,13:9,5 0/1:.:35:20,15:8,9:12,6 | |
| 37490 chr22 45315278 . T C . PASS DP=52;SS=1;SSC=6;GPV=2.38e-11;SPV=0.25007 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:8,10:8,5 0/1:.:21:8,13:4,9:4,4 | |
| 37491 chr22 45315973 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=1.4855e-11;SPV=0.53409 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:8,9:13,7 0/1:.:31:17,14:11,8:6,6 | |
| 37492 chr22 45316282 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=8;GPV=1.4154e-13;SPV=0.15379 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:19,12:8,8:11,4 0/1:.:43:20,23:9,14:11,9 | |
| 37493 chr22 45317139 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=22;GPV=1;SPV=0.0058095 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:26,17:14,8:12,9 0/1:.:29:8,21:2,17:6,4 | |
| 37494 chr22 45317883 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=6;GPV=4.6672e-22;SPV=0.21924 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:21,30:8,14:13,16 0/1:.:33:10,23:6,12:4,11 | |
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| 37546 chr22 45354370 . G T . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=4.883e-13;SPV=0.5466 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:7,9:6,7 0/1:.:28:12,16:8,6:4,10 | |
| 37547 chr22 45355579 . G T . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=2.2597e-11;SPV=0.49079 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:9,13:12,5 0/1:.:22:11,11:5,7:6,4 | |
| 37548 chr22 45360201 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=5.3076e-14;SPV=0.9573 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:5,13:5,6:0,7 0/1:.:40:19,21:9,12:10,9 | |
| 37549 chr22 45362107 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=2;GPV=3.1807e-12;SPV=0.58471 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:13,16:7,6:6,10 0/1:.:25:11,14:4,6:7,8 | |
| 37550 chr22 45368285 . G T . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=1.3846e-12;SPV=0.65067 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:7,10:11,8 0/1:.:29:15,14:8,7:7,7 | |
| 37551 chr22 45368994 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.8769e-15;SPV=0.97553 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:18,27:11,10:7,17 0/1:.:28:17,11:8,6:9,5 | |
| 37552 chr22 45369197 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 37553 chr22 45370605 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=1.1744e-10;SPV=0.73693 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:12,7:14,12 0/1:.:24:15,9:9,3:6,6 | |
| 37554 chr22 45370809 . C G . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=1.7027e-12;SPV=0.72414 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:9,12:7,4 0/1:.:35:19,16:9,8:10,8 | |
| 37555 chr22 45371489 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=5.8009e-12;SPV=0.70711 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:9,7:8,8 0/1:.:37:21,16:10,9:11,7 | |
| 37556 chr22 45371575 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
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| 37617 chr22 45401547 . A G . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,37:0,24 1/1:.:43:0,43:0,16:0,27 | |
| 37618 chr22 45401906 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,17:0,28 1/1:.:32:0,32:0,20:0,12 | |
| 37619 chr22 45402074 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.8081e-15;SPV=0.94515 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:16,24:7,13:9,11 0/1:.:34:19,15:7,8:12,7 | |
| 37620 chr22 45402201 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=5;GPV=4.4405e-12;SPV=0.30037 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:18,13:13,7:5,6 0/1:.:35:17,18:6,6:11,12 | |
| 37621 chr22 45403396 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 | |
| 37622 chr22 45404670 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=3.9394e-09;SPV=0.38859 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:19,10:9,4:10,6 0/1:.:34:20,14:11,5:9,9 | |
| 37623 chr22 45405045 . A T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=2.4148e-10;SPV=0.93308 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:15,5:3,12 0/1:.:30:20,10:11,5:9,5 | |
| 37624 chr22 45405364 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=5;GPV=7.191e-13;SPV=0.30639 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:17,8:9,13 0/1:.:22:10,12:4,4:6,8 | |
| 37625 chr22 45405551 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=1.5381e-13;SPV=0.62329 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:6,11:12,9 0/1:.:27:13,14:6,6:7,8 | |
| 37626 chr22 45407455 . A C . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
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| 37628 chr22 45407654 . T G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 1/1:.:24:0,24:0,15:0,9 | |
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| 37679 chr22 45432011 . G T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,14:0,23 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 37680 chr22 45432153 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 | |
| 37681 chr22 45432666 . G A . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=4.5213e-16;SPV=0.97879 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:7,12:14,14 0/1:.:44:28,16:9,7:19,9 | |
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| 37684 chr22 45432980 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,24:0,30 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 | |
| 37685 chr22 45433113 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,25:0,26 1/1:.:34:0,33:0,13:0,20 | |
| 37686 chr22 45433207 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,26:0,25 1/1:.:41:0,41:0,17:0,24 | |
| 37687 chr22 45434003 . G T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,35:0,14:0,21 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 | |
| 37688 chr22 45434217 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 37689 chr22 45434479 . T G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 1/1:.:48:0,48:0,27:0,21 | |
| 37690 chr22 45434859 . C G . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,20:0,29 1/1:.:46:0,46:0,25:0,21 | |
| 37691 chr22 45434867 . A G . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,27:0,30 1/1:.:47:0,47:0,26:0,21 | |
| 37692 chr22 45434904 . C G . PASS DP=104;SS=1;SSC=1;GPV=9.9137e-19;SPV=0.66966 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:29,27:15,11:14,16 0/1:.:48:26,22:11,13:15,9 | |
| 37693 chr22 45435345 . G C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=9.8334e-16;SPV=0.9135 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:15,17:8,12 0/1:.:26:15,11:9,5:6,6 | |
| 37694 chr22 45437141 . T G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.7958e-17;SPV=0.98837 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:17,30:7,13:10,17 0/1:.:32:19,13:11,6:8,7 | |
| 37695 chr22 45437338 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=5;GPV=1.1614e-17;SPV=0.29971 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:10,11:12,9 0/1:.:45:20,25:11,8:9,17 | |
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| 37697 chr22 45437773 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,25:0,20 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
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| 37749 chr22 45470643 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 1/1:.:38:0,38:0,9:0,29 | |
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| 37752 chr22 45472019 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=6.2341e-26;SPV=0.97361 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:13,38:4,18:9,20 0/1:.:40:17,23:8,9:9,14 | |
| 37753 chr22 45473210 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=1.3852e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,21:0,11:0,10 1/1:.:21:0,12:0,7:0,5 | |
| 37754 chr22 45473433 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=4.7649e-17;SPV=0.5366 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:7,13:12,12 0/1:.:29:12,17:8,9:4,8 | |
| 37755 chr22 45473612 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 37756 chr22 45474786 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.0284e-10;SPV=0.91041 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:10,9:7,7 0/1:.:34:22,12:11,4:11,8 | |
| 37757 chr22 45475470 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=9;GPV=3.642e-14;SPV=0.11934 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:24,14:11,10:13,4 0/1:.:44:21,23:11,13:10,10 | |
| 37758 chr22 45475587 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=3;GPV=3.2424e-19;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:14,13:9,11 0/1:.:47:22,25:15,12:7,13 | |
| 37759 chr22 45477769 . G C . PASS DP=76;SS=1;SSC=1;GPV=4.794e-13;SPV=0.77818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:9,8:7,7 0/1:.:45:26,19:11,9:15,10 | |
| 37760 chr22 45477815 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=8;GPV=3.9427e-17;SPV=0.14093 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:22,16:11,8:11,8 0/1:.:50:22,28:9,12:13,16 | |
| 37761 chr22 45478446 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=2.098e-14;SPV=0.59381 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:7,13:12,9 0/1:.:26:12,14:9,10:3,4 | |
| 37762 chr22 45478493 . C G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,24:0,23 1/1:.:31:0,31:0,20:0,11 | |
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| 37764 chr22 45479942 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=5.9704e-09;SPV=0.68091 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:14,11:9,7:5,4 0/1:.:29:17,12:12,9:5,3 | |
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| 37813 chr22 45494149 . C G . PASS DP=63;SS=1;SSC=8;GPV=7.6248e-11;SPV=0.14715 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:22,13:17,4:5,9 0/1:.:28:13,15:7,5:6,10 | |
| 37814 chr22 45494347 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=1.1086e-15;SPV=0.34225 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:28,26:8,17:20,9 0/1:.:25:11,14:4,10:7,4 | |
| 37815 chr22 45495355 . A C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,30:0,19 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
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| 37820 chr22 45497854 . C A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,13:0,19 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 | |
| 37821 chr22 45497858 . C A . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=5.4147e-14;SPV=0.63373 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:11,6:8,12 0/1:.:38:20,18:9,13:11,5 | |
| 37822 chr22 45498242 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=3.104e-14;SPV=0.59439 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:7,5:10,13 0/1:.:35:17,18:6,6:11,12 | |
| 37823 chr22 45499282 . T G . PASS DP=64;SS=1;SSC=7;GPV=4.0856e-15;SPV=0.19824 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:9,11:10,10 0/1:.:24:8,16:2,8:6,8 | |
| 37824 chr22 45499338 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,18:0,27 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 | |
| 37825 chr22 45503775 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=1.6298e-15;SPV=0.94674 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:10,8:12,15 0/1:.:49:31,18:17,6:14,12 | |
| 37826 chr22 45503922 . A C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.6893e-16;SPV=0.98368 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:14,27:7,12:7,15 0/1:.:30:17,13:10,5:7,8 | |
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| 37829 chr22 45509673 . G C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.1519e-11;SPV=0.95786 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:9,13:8,7 0/1:.:28:18,10:11,7:7,3 | |
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| 37890 chr22 45559017 . T A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 | |
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| 37898 chr22 45565333 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,24:0,26 1/1:.:25:0,25:0,17:0,8 | |
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| 37952 chr22 45721135 . G T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=3.594e-10;SPV=0.9744 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:11,15:4,9:7,6 0/1:.:31:20,11:12,5:8,6 | |
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| 37954 chr22 45733880 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=10;GPV=3.4211e-15;SPV=0.08205 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:9,12:11,9 0/1:.:22:6,16:3,5:3,11 | |
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| 37956 chr22 45745671 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,19:0,18 1/1:.:31:0,31:0,20:0,11 | |
| 37957 chr22 45746634 . G C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 37958 chr22 45746785 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,11:0,19 1/1:.:25:0,25:0,16:0,9 | |
| 37959 chr22 45746928 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=9.149e-19;SPV=0.97707 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:13,28:5,15:8,13 0/1:.:37:19,18:12,10:7,8 | |
| 37960 chr22 45747223 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=6.5895e-16;SPV=0.71175 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:10,18:4,11:6,7 0/1:.:33:13,20:6,7:7,13 | |
| 37961 chr22 45749735 . T A . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 1/1:.:26:0,26:0,17:0,9 | |
| 37962 chr22 45749926 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,15:0,9 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 | |
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| 37965 chr22 45751766 . T A . PASS DP=35;SS=1;SSC=2;GPV=0.02381;SPV=0.6 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:1,2:1,1:0,1 1/1:.:15:0,2:0,0:0,2 | |
| 37966 chr22 45753268 . T A . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:26:0,26:0,10:0,16 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 | |
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| 38031 chr22 45860915 . A G . PASS DP=27;SS=1;SSC=0;GPV=5.1363e-16;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,13:0,2 1/1:.:12:0,12:0,9:0,3 | |
| 38032 chr22 45860924 . G A . PASS DP=42;SS=1;SSC=1;GPV=5.4836e-09;SPV=0.72676 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:10,12:5,9:5,3 0/1:.:20:10,10:4,6:6,4 | |
| 38033 chr22 45862233 . A C . PASS DP=98;SS=1;SSC=1;GPV=1.8717e-20;SPV=0.78045 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:15,12:8,17 0/1:.:46:23,23:12,11:11,12 | |
| 38034 chr22 45863180 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,12:0,25 1/1:.:25:0,25:0,13:0,12 | |
| 38035 chr22 45865807 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=1.249e-18;SPV=0.84818 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:25,29:15,13:10,16 0/1:.:42:23,19:9,12:14,7 | |
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| 38089 chr22 45906682 . C G . PASS DP=116;SS=1;SSC=0;GPV=7.4357e-23;SPV=0.93238 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:74:33,41:14,17:19,24 0/1:.:42:24,18:11,12:13,6 | |
| 38090 chr22 45907121 . A C . PASS DP=90;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.049612 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:31,20:18,10:13,10 0/1:.:39:16,23:5,14:11,9 | |
| 38091 chr22 45908001 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=1.2446e-15;SPV=0.32331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:11,8:15,15 0/1:.:31:14,17:6,6:8,11 | |
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| 38093 chr22 45908560 . A C . PASS DP=104;SS=1;SSC=2;GPV=8.0005e-18;SPV=0.56051 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:33,27:20,15:13,12 0/1:.:44:24,20:11,9:13,11 | |
| 38094 chr22 45909862 . C G . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=3.7458e-16;SPV=0.63162 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:13,10:11,12 0/1:.:43:23,20:11,11:12,9 | |
| 38095 chr22 45910144 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=4;GPV=2.1212e-20;SPV=0.32299 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:9,12:15,15 0/1:.:40:16,24:7,8:9,16 | |
| 38096 chr22 45911052 . T A . PASS DP=96;SS=1;SSC=5;GPV=1.249e-18;SPV=0.27009 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:14,11:11,10 0/1:.:50:23,27:9,14:14,13 | |
| 38097 chr22 45911408 . T G . PASS DP=92;SS=1;SSC=1;GPV=7.6832e-19;SPV=0.71785 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:24,28:9,18:15,10 0/1:.:40:20,20:8,10:12,10 | |
| 38098 chr22 45911859 . G C . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=8.038e-16;SPV=0.62255 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:27,25:11,8:16,17 0/1:.:34:18,16:8,10:10,6 | |
| 38099 chr22 45912503 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=4.6893e-11;SPV=0.59894 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:15,10:9,7 0/1:.:29:17,12:12,10:5,2 | |
| 38100 chr22 45913456 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=5;GPV=2.0677e-18;SPV=0.27002 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:29,27:12,15:17,12 0/1:.:35:15,20:10,14:5,6 | |
| 38101 chr22 45914013 . C G . PASS DP=81;SS=1;SSC=7;GPV=1.1753e-14;SPV=0.18942 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:30,22:14,11:16,11 0/1:.:29:13,16:4,3:9,13 | |
| 38102 chr22 45914771 . A C . PASS DP=84;SS=1;SSC=4;GPV=2.4219e-17;SPV=0.31963 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:12,14:11,8 0/1:.:39:17,22:9,15:8,7 | |
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| 38155 chr22 45957540 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.026856 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:26,17:19,11:7,6 0/1:.:29:10,19:4,11:6,8 | |
| 38156 chr22 45958224 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=2;GPV=3.681e-19;SPV=0.51687 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:28,29:9,14:19,15 0/1:.:38:18,20:8,9:10,11 | |
| 38157 chr22 45958705 . A G . PASS DP=105;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:62:0,62:0,30:0,32 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 | |
| 38158 chr22 45958870 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=3;GPV=1.8221e-14;SPV=0.41414 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:14,6:11,12 0/1:.:43:23,20:14,9:9,11 | |
| 38159 chr22 45959052 . G C . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=4.4206e-13;SPV=0.73614 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:30,21:16,9:14,12 0/1:.:38:24,14:13,6:11,8 | |
| 38160 chr22 45960554 . T C . PASS DP=106;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,28:0,29 1/1:.:49:0,49:0,25:0,24 | |
| 38161 chr22 45960674 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,19:0,32 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 38162 chr22 45961897 . A G . PASS DP=109;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,34:0,24 1/1:.:51:0,51:0,31:0,20 | |
| 38163 chr22 45962866 . G T . PASS DP=97;SS=1;SSC=4;GPV=1.6307e-20;SPV=0.31934 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:29,30:14,18:15,12 0/1:.:38:16,22:12,11:4,11 | |
| 38164 chr22 45964116 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,19:0,26 1/1:.:29:0,29:0,20:0,9 | |
| 38165 chr22 45964203 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=3;GPV=1.0669e-14;SPV=0.4867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:13,10:7,7 0/1:.:43:22,21:19,15:3,6 | |
| 38166 chr22 45964354 . C G . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=2.2346e-17;SPV=0.85649 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:33,30:13,20:20,10 0/1:.:41:25,16:13,10:12,6 | |
| 38167 chr22 45965325 . C A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,33:0,19 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 | |
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| 38169 chr22 45967859 . A G . PASS DP=86;SS=1;SSC=4;GPV=1.0222e-17;SPV=0.33308 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:13,14:9,7 0/1:.:43:19,24:12,16:7,8 | |
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| 38229 chr22 46011851 . G A . PASS DP=99;SS=1;SSC=2;GPV=2.1398e-20;SPV=0.5978 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:26,29:10,17:16,12 0/1:.:44:21,23:12,12:9,11 | |
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| 38290 chr22 46066035 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=7.1262e-11;SPV=0.56034 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:22,13:14,6:8,7 0/1:.:42:26,16:13,9:13,7 | |
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| 38293 chr22 46071730 . G T . PASS DP=68;SS=1;SSC=7;GPV=2.9254e-10;SPV=0.18655 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:24,12:9,6:15,6 0/1:.:32:17,15:11,11:6,4 | |
| 38294 chr22 46073040 . G A . PASS DP=32;SS=1;SSC=3;GPV=4.1013e-07;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:8,8:4,4:4,4 0/1:.:16:7,9:4,6:3,3 | |
| 38295 chr22 46073437 . G C . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=9.653e-15;SPV=0.38736 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:13,16:12,5 0/1:.:33:16,17:7,6:9,11 | |
| 38296 chr22 46073759 . G C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 1/1:.:47:0,47:0,21:0,26 | |
| 38297 chr22 46074411 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=1.9732e-14;SPV=0.72456 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:13,14:16,10 0/1:.:34:20,14:14,7:6,7 | |
| 38298 chr22 46077860 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=6.2293e-15;SPV=0.7893 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:10,10:8,11 0/1:.:36:19,17:9,7:10,10 | |
| 38299 chr22 46078320 . A C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,24:0,21 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 | |
| 38300 chr22 46078643 . A C . PASS DP=107;SS=1;SSC=6;GPV=2.193e-23;SPV=0.23881 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:27,28:16,16:11,12 0/1:.:52:21,31:11,14:10,17 | |
| 38301 chr22 46079585 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=4;GPV=1.5461e-16;SPV=0.35484 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:9,12:14,10 0/1:.:36:16,20:9,12:7,8 | |
| 38302 chr22 46079831 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=5;GPV=1.8206e-18;SPV=0.31494 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:15,10:11,15 0/1:.:39:17,22:9,10:8,12 | |
| 38303 chr22 46081510 . C G . PASS DP=86;SS=1;SSC=1;GPV=3.2999e-18;SPV=0.69574 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:24,29:13,12:11,17 0/1:.:33:16,17:8,8:8,9 | |
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| 38305 chr22 46083536 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,20:0,26 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
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| 38351 chr22 46106990 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=4;GPV=1.0476e-18;SPV=0.39089 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:8,18:14,6 0/1:.:40:17,23:11,8:6,15 | |
| 38352 chr22 46107409 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=6.5235e-17;SPV=0.69951 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:12,17:9,7 0/1:.:38:19,19:11,8:8,11 | |
| 38353 chr22 46107888 . C A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,28:0,16 1/1:.:35:0,35:0,23:0,12 | |
| 38354 chr22 46108287 . C T . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=4.5644e-16;SPV=0.8011 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:33,26:18,14:15,12 0/1:.:45:28,17:15,9:13,8 | |
| 38355 chr22 46108438 . A G . PASS DP=111;SS=1;SSC=4;GPV=8.0465e-28;SPV=0.37683 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:23,33:9,16:14,17 0/1:.:55:20,35:12,15:8,20 | |
| 38356 chr22 46109457 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,19:0,27 1/1:.:43:0,43:0,18:0,25 | |
| 38357 chr22 46109561 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=10;GPV=6.5271e-15;SPV=0.09029 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:33,21:14,11:19,10 0/1:.:32:14,18:9,7:5,11 | |
| 38358 chr22 46109926 . C G . PASS DP=93;SS=1;SSC=1;GPV=8.9875e-21;SPV=0.64479 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:27,35:10,20:17,15 0/1:.:31:14,17:9,10:5,7 | |
| 38359 chr22 46110106 . T C . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:65:0,65:0,36:0,29 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
| 38360 chr22 46110529 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=2.8453e-12;SPV=0.75273 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:34,22:19,15:15,7 0/1:.:32:21,11:8,8:13,3 | |
| 38361 chr22 46110547 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=1.6142e-19;SPV=0.64699 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:14,12:9,17 0/1:.:37:17,20:13,8:4,12 | |
| 38362 chr22 46110617 . C G . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,26:0,29 1/1:.:43:0,43:0,19:0,24 | |
| 38363 chr22 46111531 . C G . PASS DP=85;SS=1;SSC=6;GPV=2.8662e-18;SPV=0.20967 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:14,11:9,11 0/1:.:40:16,24:9,12:7,12 | |
| 38364 chr22 46111790 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,23:0,23 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 38365 chr22 46112056 . A C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,31:0,23 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
| 38366 chr22 46112130 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,24:0,19 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 38367 chr22 46112170 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,25:0,19 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 38368 chr22 46112572 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,29:0,23 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 | |
| 38369 chr22 46112885 . C G . PASS DP=102;SS=1;SSC=3;GPV=9.3783e-20;SPV=0.42156 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:18,14:8,10 0/1:.:52:25,27:12,20:13,7 | |
| 38370 chr22 46113522 . A G . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,29:0,28 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 | |
| 38371 chr22 46114074 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=7.8126e-18;SPV=0.64685 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:13,16:8,9 0/1:.:38:18,20:7,12:11,8 | |
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| 38373 chr22 46114861 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 1/1:.:26:0,26:0,11:0,15 | |
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| 38420 chr22 46410075 . C T . PASS DP=102;SS=1;SSC=2;GPV=1.0678e-21;SPV=0.57439 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:30,35:17,21:13,14 0/1:.:37:17,20:5,7:12,13 | |
| 38421 chr22 46411303 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=3.8073e-21;SPV=0.92776 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:16,27:10,17:6,10 0/1:.:52:26,26:16,18:10,8 | |
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| 38423 chr22 46412175 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=4.39e-14;SPV=0.93644 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:16,21:8,7:8,14 0/1:.:36:21,15:12,10:9,5 | |
| 38424 chr22 46412419 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.6242e-17;SPV=0.92598 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:15,25:7,18:8,7 0/1:.:35:18,17:5,8:13,9 | |
| 38425 chr22 46412981 . C A . PASS DP=106;SS=1;SSC=2;GPV=4.9457e-20;SPV=0.58289 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:29,28:17,13:12,15 0/1:.:49:25,24:15,10:10,14 | |
| 38426 chr22 46413135 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=4;GPV=1.282e-20;SPV=0.37497 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:7,12:14,14 0/1:.:41:16,25:8,9:8,16 | |
| 38427 chr22 46413924 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=2.4531e-16;SPV=0.52883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:16,18:10,10:6,8 0/1:.:42:19,23:10,12:9,11 | |
| 38428 chr22 46414232 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=8.7026e-15;SPV=0.99 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:18,26:7,14:11,12 0/1:.:34:22,12:7,3:15,9 | |
| 38429 chr22 46415144 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=10;GPV=6.0917e-20;SPV=0.093157 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:10,14:12,14 0/1:.:27:7,20:3,13:4,7 | |
| 38430 chr22 46415410 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,17:0,27 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 38431 chr22 46415452 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=1.1391e-19;SPV=0.34051 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:7,9:12,16 0/1:.:36:13,23:6,10:7,13 | |
| 38432 chr22 46417538 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=11;GPV=4.1486e-16;SPV=0.078187 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:14,12:13,9 0/1:.:32:12,20:7,11:5,9 | |
| 38433 chr22 46417739 . G C . PASS DP=89;SS=1;SSC=2;GPV=4.4109e-17;SPV=0.54662 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:15,12:10,12 0/1:.:40:20,20:12,10:8,10 | |
| 38434 chr22 46418221 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.6279e-15;SPV=0.8461 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:15,12:5,12 0/1:.:33:18,15:9,8:9,7 | |
| 38435 chr22 46418774 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=10;GPV=2.7611e-16;SPV=0.098459 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:26,18:14,8:12,10 0/1:.:42:18,24:7,13:11,11 | |
| 38436 chr22 46420031 . G C . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=3.6641e-16;SPV=0.61264 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:9,14:13,10 0/1:.:33:16,17:9,11:7,6 | |
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| 38493 chr22 46457424 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=2.2803e-11;SPV=0.86332 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:25,20:16,8:9,12 0/1:.:29:19,10:8,9:11,1 | |
| 38494 chr22 46457585 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=4.9663e-15;SPV=0.93557 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:7,14:15,11 0/1:.:36:22,14:13,6:9,8 | |
| 38495 chr22 46457691 . A G . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,28:0,32 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 | |
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| 38497 chr22 46459038 . G T . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=3.3945e-16;SPV=0.69996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:27,26:12,11:15,15 0/1:.:35:19,16:14,6:5,10 | |
| 38498 chr22 46459089 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=5;GPV=3.2414e-14;SPV=0.25309 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:36,21:16,12:20,9 0/1:.:37:20,17:9,11:11,6 | |
| 38499 chr22 46459425 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=2;GPV=2.0677e-18;SPV=0.52693 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:8,18:17,8 0/1:.:40:19,21:8,9:11,12 | |
| 38500 chr22 46460211 . A C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=5.5491e-21;SPV=0.88828 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:3,23:3,11:0,12 0/1:.:35:5,20:4,10:1,10 | |
| 38501 chr22 46460306 . C A . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=7.191e-13;SPV=0.6687 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:7,13:14,7 0/1:.:28:15,13:6,6:9,7 | |
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| 38551 chr22 46484186 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=1;GPV=6.3812e-16;SPV=0.67122 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:15,13:14,11 0/1:.:42:24,18:15,9:9,9 | |
| 38552 chr22 46485481 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=2.4531e-16;SPV=0.61405 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:9,8:13,18 0/1:.:28:13,15:4,10:9,5 | |
| 38553 chr22 46485887 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,10:0,25 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 | |
| 38554 chr22 46486087 . G T . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=8.0845e-10;SPV=0.56131 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:22,13:12,7:10,6 0/1:.:34:21,13:5,3:16,10 | |
| 38555 chr22 46486420 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=2.0579e-15;SPV=0.69808 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:17,13:4,11 0/1:.:30:15,15:10,12:5,3 | |
| 38556 chr22 46486736 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=8;GPV=2.3908e-17;SPV=0.12982 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:11,4:8,14 0/1:.:39:14,25:7,12:7,13 | |
| 38557 chr22 46486922 . T A . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=3.0926e-11;SPV=0.91094 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:12,17:8,7:4,10 0/1:.:25:14,11:8,5:6,6 | |
| 38558 chr22 46487064 . A G . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=4.2444e-12;SPV=0.7687 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:5,3:9,15 0/1:.:24:12,12:6,3:6,9 | |
| 38559 chr22 46487909 . C G . PASS DP=24;SS=1;SSC=0;GPV=3.101e-14;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,14:0,1 1/1:.:9:0,9:0,9:0,0 | |
| 38560 chr22 46488062 . G T . PASS DP=39;SS=1;SSC=4;GPV=8.1342e-07;SPV=0.39335 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:15,10:14,10:1,0 0/1:.:14:7,7:6,5:1,2 | |
| 38561 chr22 46488410 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=6;GPV=4.8769e-15;SPV=0.23191 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:17,6:8,17 0/1:.:25:10,15:6,6:4,9 | |
| 38562 chr22 46488591 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=11;GPV=3.642e-14;SPV=0.067628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:28,16:15,9:13,7 0/1:.:38:17,21:9,8:8,13 | |
| 38563 chr22 46489299 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=3.7283e-09;SPV=0.77462 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:14,9:9,7 0/1:.:23:15,8:7,3:8,5 | |
| 38564 chr22 46489710 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.4154e-13;SPV=0.89915 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:9,8:12,15 0/1:.:30:18,12:8,4:10,8 | |
| 38565 chr22 46489802 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=4;GPV=1.8206e-18;SPV=0.38186 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:11,11:16,16 0/1:.:36:16,20:6,11:10,9 | |
| 38566 chr22 46490139 . C A . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=1.5391e-12;SPV=0.72616 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:15,13:9,6 0/1:.:35:21,14:11,7:10,7 | |
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| 38624 chr22 46506890 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=8.5141e-10;SPV=0.99807 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:15,8:7,13 0/1:.:27:22,5:10,4:12,1 | |
| 38625 chr22 46506971 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,26:0,23 1/1:.:25:0,25:0,16:0,9 | |
| 38626 chr22 46507079 . G A . PASS DP=97;SS=1;SSC=8;GPV=4.9529e-22;SPV=0.14373 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:29,31:17,15:12,16 0/1:.:37:13,24:7,13:6,11 | |
| 38627 chr22 46507468 . G C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,35:0,24 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 38628 chr22 46508376 . C T . PASS DP=24;SS=3;SSC=13;GPV=1;SPV=0.04469 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:10,5:6,4:4,1 1/1:.:9:2,7:1,5:1,2 | |
| 38629 chr22 46509055 . C G . PASS DP=92;SS=1;SSC=4;GPV=7.6832e-19;SPV=0.39559 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:26,26:12,12:14,14 0/1:.:40:18,22:10,9:8,13 | |
| 38630 chr22 46509169 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=3;GPV=3.879e-12;SPV=0.43107 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:26,17:9,10:17,7 0/1:.:34:19,15:9,7:10,8 | |
| 38631 chr22 46509170 . C A . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=1.5391e-12;SPV=0.50626 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:27,19:10,12:17,7 0/1:.:32:18,14:9,7:9,7 | |
| 38632 chr22 46509636 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=3;GPV=3.1677e-14;SPV=0.42089 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:11,8:6,12 0/1:.:25:10,15:7,9:3,6 | |
| 38633 chr22 46509794 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=5.8719e-16;SPV=0.97043 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:9,16:10,10 0/1:.:38:23,15:12,5:11,10 | |
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| 38692 chr22 46533462 . C G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=4.4277e-12;SPV=0.95579 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:14,9:9,12 0/1:.:35:24,11:13,6:11,5 | |
| 38693 chr22 46533795 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=2;GPV=2.4776e-16;SPV=0.55024 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:10,16:15,8 0/1:.:36:18,18:9,10:9,8 | |
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| 38699 chr22 46540893 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=5.0247e-17;SPV=0.77218 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:19,24:12,10:7,14 0/1:.:38:19,19:7,8:12,11 | |
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| 38749 chr22 46558472 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,27:0,19 1/1:.:36:0,36:0,12:0,24 | |
| 38750 chr22 46558869 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=1;GPV=3.7452e-32;SPV=0.64912 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:1,36:1,15:0,21 1/1:.:20:0,20:0,9:0,11 | |
| 38751 chr22 46559097 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,26:0,18 1/1:.:25:0,25:0,15:0,10 | |
| 38752 chr22 46559201 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=3.7062e-14;SPV=0.37663 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:18,20:11,9:7,11 0/1:.:25:10,15:4,7:6,8 | |
| 38753 chr22 46560090 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,24:0,19 1/1:.:39:0,39:0,26:0,13 | |
| 38754 chr22 46560220 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 | |
| 38755 chr22 46560237 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 38756 chr22 46560401 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 1/1:.:42:0,42:0,14:0,28 | |
| 38757 chr22 46560559 . A G . PASS DP=110;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,40:0,19 1/1:.:51:0,51:0,40:0,11 | |
| 38758 chr22 46560589 . A G . PASS DP=107;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,43:0,17 1/1:.:47:0,47:0,36:0,11 | |
| 38759 chr22 46561131 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=4;GPV=1.3095e-14;SPV=0.31878 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:9,8:10,9 0/1:.:36:16,20:9,9:7,11 | |
| 38760 chr22 46561343 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,27:0,28 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
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| 38818 chr22 46583833 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=6;GPV=2.6699e-12;SPV=0.21791 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:26,17:13,6:13,11 0/1:.:29:14,15:8,7:6,8 | |
| 38819 chr22 46584611 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=2.6279e-15;SPV=0.78509 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:11,12:9,11 0/1:.:34:18,16:11,7:7,9 | |
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| 38821 chr22 46586121 . C G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=9.7292e-12;SPV=0.86868 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:13,11:13,10 0/1:.:29:19,10:9,6:10,4 | |
| 38822 chr22 46586824 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=5;GPV=4.0755e-15;SPV=0.30543 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:11,9:15,12 0/1:.:34:16,18:9,8:7,10 | |
| 38823 chr22 46586825 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=3;GPV=1.4126e-14;SPV=0.41565 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:12,9:15,12 0/1:.:35:18,17:11,6:7,11 | |
| 38824 chr22 46587121 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.8278e-16;SPV=0.92761 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:13,22:7,11:6,11 0/1:.:39:20,19:8,11:12,8 | |
| 38825 chr22 46587475 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=1.3095e-14;SPV=0.49482 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:9,8:10,11 0/1:.:34:16,18:8,6:8,12 | |
| 38826 chr22 46587708 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=5.4147e-14;SPV=0.54776 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:13,12:7,6 0/1:.:37:19,18:9,8:10,10 | |
| 38827 chr22 46588561 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.7502e-16;SPV=0.81648 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:9,11:8,10 0/1:.:44:23,21:10,13:13,8 | |
| 38828 chr22 46588779 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=1.0144e-08;SPV=0.49661 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:24,13:11,5:13,8 0/1:.:26:16,10:6,6:10,4 | |
| 38829 chr22 46588912 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=2;GPV=7.8126e-18;SPV=0.56848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:14,9:7,15 0/1:.:39:18,21:7,8:11,13 | |
| 38830 chr22 46588956 . T G . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=1.3937e-18;SPV=0.72527 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:15,10:6,16 0/1:.:41:20,21:10,10:10,11 | |
| 38831 chr22 46589890 . C G . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=1.1574e-13;SPV=0.39904 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:8,9:10,6 0/1:.:39:19,20:9,10:10,10 | |
| 38832 chr22 46590687 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=5.0119e-12;SPV=0.67332 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:31,21:18,8:13,13 0/1:.:29:18,11:5,6:13,5 | |
| 38833 chr22 46590851 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=1.0669e-14;SPV=0.61544 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:12,14:12,8 0/1:.:34:18,16:8,8:10,8 | |
| 38834 chr22 46592750 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=4;GPV=2.0601e-12;SPV=0.36203 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:6,9:14,6 0/1:.:34:17,17:7,8:10,9 | |
| 38835 chr22 46593371 . T G . PASS DP=82;SS=1;SSC=9;GPV=1.8496e-17;SPV=0.10337 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:13,13:13,10 0/1:.:33:12,21:4,12:8,9 | |
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| 38957 chr22 46677904 . G A . PASS DP=99;SS=1;SSC=11;GPV=3.1724e-16;SPV=0.076108 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:34,19:12,9:22,10 0/1:.:46:22,24:10,9:12,15 | |
| 38958 chr22 46677964 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=11;GPV=2.1268e-13;SPV=0.069515 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:34,15:10,3:24,12 0/1:.:44:23,21:9,9:14,12 | |
| 38959 chr22 46677978 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=5.4526e-21;SPV=0.8124 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:17,27:7,7:10,20 0/1:.:46:21,25:11,10:10,15 | |
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| 38962 chr22 46680021 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.1753e-14;SPV=0.65999 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:9,5:15,17 0/1:.:35:19,16:11,4:8,12 | |
| 38963 chr22 46681180 . A C . PASS DP=63;SS=1;SSC=8;GPV=2.7231e-11;SPV=0.14503 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:22,14:13,10:9,4 0/1:.:27:12,15:8,10:4,5 | |
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| 38965 chr22 46683179 . T A . PASS DP=90;SS=1;SSC=4;GPV=1.8206e-18;SPV=0.32248 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:25,24:14,12:11,12 0/1:.:41:18,23:11,11:7,12 | |
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| 39021 chr22 46730787 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=11;GPV=7.5695e-19;SPV=0.071189 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:24,27:14,15:10,12 0/1:.:26:7,19:4,12:3,7 | |
| 39022 chr22 46731178 . C T . PASS DP=98;SS=1;SSC=4;GPV=5.2692e-19;SPV=0.34208 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:29,26:12,13:17,13 0/1:.:43:20,23:13,13:7,10 | |
| 39023 chr22 46736132 . C A . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=3.86e-20;SPV=0.96079 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:18,29:8,14:10,15 0/1:.:48:26,22:7,12:19,10 | |
| 39024 chr22 46738250 . G T . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=4.1102e-31;SPV=0.92402 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:1,33:0,23:1,10 0/1:.:44:2,24:2,15:0,9 | |
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| 39026 chr22 46738830 . C T . PASS DP=104;SS=1;SSC=1;GPV=1.4089e-21;SPV=0.63629 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:26,30:15,17:11,13 0/1:.:48:23,25:12,9:11,16 | |
| 39027 chr22 46740066 . C T . PASS DP=101;SS=1;SSC=2;GPV=1.7322e-17;SPV=0.57144 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:30,25:16,9:14,16 0/1:.:46:25,21:15,10:10,11 | |
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| 39029 chr22 46740210 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=4.3139e-18;SPV=0.64831 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:14,7:9,19 0/1:.:39:19,20:10,8:9,12 | |
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| 39082 chr22 46783423 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=8;GPV=3.2981e-15;SPV=0.15152 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:29,23:12,12:17,11 0/1:.:27:11,16:8,7:3,9 | |
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| 39085 chr22 46786377 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=1.7985e-10;SPV=0.47773 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:6,7:13,7 0/1:.:28:15,13:10,7:5,6 | |
| 39086 chr22 46788224 . C G . PASS DP=79;SS=1;SSC=9;GPV=2.2057e-13;SPV=0.12302 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:27,16:11,12:16,4 0/1:.:36:17,19:4,7:13,12 | |
| 39087 chr22 46788886 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=4;GPV=8.0283e-15;SPV=0.38429 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:13,9:2,10 0/1:.:27:10,17:6,13:4,4 | |
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| 39089 chr22 46789707 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=12;GPV=1.9033e-15;SPV=0.06286 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:26,16:16,9:10,7 0/1:.:42:18,24:7,10:11,14 | |
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| 39149 chr22 46841413 . G T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=5.4147e-14;SPV=0.79476 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:19,20:7,6:12,14 0/1:.:36:20,16:6,7:14,9 | |
| 39150 chr22 46841850 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=2.6374e-16;SPV=0.61437 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:18,25:9,14:9,11 0/1:.:26:11,15:7,6:4,9 | |
| 39151 chr22 46843245 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=6;GPV=5.0311e-18;SPV=0.21577 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:13,10:11,15 0/1:.:32:12,20:2,7:10,13 | |
| 39152 chr22 46843314 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=5;GPV=5.7384e-17;SPV=0.30446 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:11,13:13,10 0/1:.:35:15,20:7,10:8,10 | |
| 39153 chr22 46843348 . T A . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.2581e-11;SPV=0.63243 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:20,17:10,9:10,8 0/1:.:29:16,13:10,6:6,7 | |
| 39154 chr22 46843802 . G T . PASS DP=64;SS=1;SSC=2;GPV=3.6451e-12;SPV=0.51881 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:13,10:7,8 0/1:.:26:13,13:7,5:6,8 | |
| 39155 chr22 46844313 . C G . PASS DP=80;SS=1;SSC=10;GPV=3.673e-15;SPV=0.088484 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:31,23:17,10:14,13 0/1:.:26:10,16:4,7:6,9 | |
| 39156 chr22 46844847 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.6481e-18;SPV=0.97465 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:13,26:8,13:5,13 0/1:.:40:21,19:9,9:12,10 | |
| 39157 chr22 46846151 . G C . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=3.5113e-17;SPV=0.54029 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:13,15:10,8 0/1:.:41:20,21:8,6:12,15 | |
| 39158 chr22 46846436 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.3916e-15;SPV=0.71598 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:15,12:7,11 0/1:.:36:19,17:12,7:7,10 | |
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| 39211 chr22 46885343 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,24:0,27 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 39212 chr22 46886068 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=5.7237e-22;SPV=0.82647 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:17,29:6,14:11,15 0/1:.:45:20,25:12,14:8,11 | |
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| 39214 chr22 46886354 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=2.95e-15;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:18,11:5,11 0/1:.:33:16,17:8,11:8,6 | |
| 39215 chr22 46888176 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,24:0,28 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 | |
| 39216 chr22 46888553 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:40:0,40:0,16:0,24 | |
| 39217 chr22 46888670 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 | |
| 39218 chr22 46888937 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,25:0,32 1/1:.:20:0,20:0,8:0,12 | |
| 39219 chr22 46888993 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.2446e-15;SPV=0.76766 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:27,29:10,11:17,18 0/1:.:24:13,11:6,6:7,5 | |
| 39220 chr22 46889590 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,15:0,25 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 39221 chr22 46890263 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=2.0241e-17;SPV=0.55228 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:9,14:10,11 0/1:.:31:13,18:6,8:7,10 | |
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| 39224 chr22 46892514 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,30:0,17 1/1:.:25:0,25:0,9:0,16 | |
| 39225 chr22 46892530 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 1/1:.:31:0,31:0,12:0,19 | |
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| 39279 chr22 46922779 . T G . PASS DP=70;SS=1;SSC=6;GPV=1.0148e-14;SPV=0.22318 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:7,10:13,8 0/1:.:32:13,19:8,8:5,11 | |
| 39280 chr22 46923102 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.029855 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:17,7:6,10 0/1:.:31:10,21:6,8:4,13 | |
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| 39282 chr22 46924079 . C A . PASS DP=88;SS=1;SSC=4;GPV=4.2509e-20;SPV=0.39224 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:12,10:9,15 0/1:.:42:17,25:8,12:9,13 | |
| 39283 chr22 46925224 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=1;GPV=3.3933e-17;SPV=0.7062 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:12,22:3,16:9,6 0/1:.:31:12,19:9,11:3,8 | |
| 39284 chr22 46925387 . G T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.0806e-19;SPV=0.91643 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:12,26:10,9:2,17 0/1:.:36:16,20:4,6:12,14 | |
| 39285 chr22 46925496 . T G . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=5.2491e-17;SPV=0.70007 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:15,25:9,13:6,12 0/1:.:27:11,16:5,5:6,11 | |
| 39286 chr22 46925981 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=3;GPV=1.7922e-12;SPV=0.48568 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:15,16:6,11:9,5 0/1:.:27:12,15:9,7:3,8 | |
| 39287 chr22 46926196 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=2;GPV=3.594e-10;SPV=0.53918 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:15,12:9,3:6,9 0/1:.:30:16,14:11,6:5,8 | |
| 39288 chr22 46927041 . C T . PASS DP=48;SS=1;SSC=1;GPV=3.6075e-09;SPV=0.69916 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:9,9:4,6:5,3 0/1:.:30:16,14:7,6:9,8 | |
| 39289 chr22 46927275 . G C . PASS DP=69;SS=1;SSC=12;GPV=2.8075e-15;SPV=0.058967 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:14,8:5,7 0/1:.:35:12,23:5,16:7,7 | |
| 39290 chr22 46927895 . C G . PASS DP=54;SS=1;SSC=3;GPV=3.0926e-11;SPV=0.49603 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:4,9:10,5 0/1:.:26:12,14:6,5:6,9 | |
| 39291 chr22 46928139 . A C . PASS DP=47;SS=1;SSC=1;GPV=1.0643e-11;SPV=0.6362 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:8,12:7,2:1,10 0/1:.:27:11,16:4,9:7,7 | |
| 39292 chr22 46928809 . C T . PASS DP=48;SS=1;SSC=4;GPV=5.3443e-07;SPV=0.32777 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:15,7:10,3:5,4 0/1:.:26:15,11:9,6:6,5 | |
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| 39344 chr22 46962022 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=9;GPV=2.8411e-14;SPV=0.114 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:35,19:21,11:14,8 0/1:.:38:19,19:13,12:6,7 | |
| 39345 chr22 46962239 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,15:0,26 1/1:.:38:0,38:0,12:0,26 | |
| 39346 chr22 46962996 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,14:0,19 1/1:.:31:0,31:0,17:0,14 | |
| 39347 chr22 46964493 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.2446e-15;SPV=0.81446 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:10,11:8,10 0/1:.:41:22,19:10,13:12,6 | |
| 39348 chr22 46965721 . G A . PASS DP=107;SS=1;SSC=0;GPV=6.7916e-22;SPV=0.7976 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:26,32:16,19:10,13 0/1:.:49:25,24:16,9:9,15 | |
| 39349 chr22 46966020 . G C . PASS DP=97;SS=1;SSC=3;GPV=5.0692e-20;SPV=0.43223 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:27,28:5,9:22,19 0/1:.:42:19,23:5,11:14,12 | |
| 39350 chr22 46966143 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=11;GPV=8.038e-16;SPV=0.07354 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:32,22:13,8:19,14 0/1:.:32:13,19:6,6:7,13 | |
| 39351 chr22 46966453 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.2293e-15;SPV=0.93996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:15,19:7,9 0/1:.:25:15,10:8,7:7,3 | |
| 39352 chr22 46967517 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 1/1:.:45:0,45:0,25:0,20 | |
| 39353 chr22 46967922 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=0.00015455;SPV=0.74147 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:35,7:20,4:15,3 0/1:.:36:31,5:17,1:14,4 | |
| 39354 chr22 46967935 . A T . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,24:0,27 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 | |
| 39355 chr22 46967977 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=2.0677e-18;SPV=0.42792 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:28,28:11,14:17,14 0/1:.:35:16,19:10,10:6,9 | |
| 39356 chr22 46968323 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=5.8102e-14;SPV=0.73018 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:13,10:11,9 0/1:.:45:27,18:14,10:13,8 | |
| 39357 chr22 46968560 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=1.0637e-08;SPV=0.98963 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:11,5:13,14 0/1:.:21:17,4:11,2:6,2 | |
| 39358 chr22 46969305 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=3.7958e-17;SPV=0.32559 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:16,17:6,6 0/1:.:34:14,20:10,10:4,10 | |
| 39359 chr22 46969437 . G T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,18:0,23 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
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| 39416 chr22 47004008 . C T . PASS DP=47;SS=1;SSC=9;GPV=7.2254e-08;SPV=0.10297 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:17,8:13,6:4,2 0/1:.:22:10,12:4,6:6,6 | |
| 39417 chr22 47004963 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=2.751e-10;SPV=0.54001 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:10,5:10,8 0/1:.:34:20,14:15,7:5,7 | |
| 39418 chr22 47006174 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=3.125e-12;SPV=0.48138 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:14,12:11,6 0/1:.:31:17,14:8,7:9,7 | |
| 39419 chr22 47006455 . T G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 | |
| 39420 chr22 47006668 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,19:0,24 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 | |
| 39421 chr22 47007697 . G A . PASS DP=41;SS=1;SSC=10;GPV=9.3546e-07;SPV=0.081715 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:12,4:11,4:1,0 0/1:.:25:12,13:11,13:1,0 | |
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| 39423 chr22 47008450 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=1.8624e-11;SPV=0.73192 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:8,10:12,6 0/1:.:35:21,14:13,9:8,5 | |
| 39424 chr22 47008630 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.5461e-16;SPV=0.69039 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:12,15:11,11 0/1:.:32:16,16:9,7:7,9 | |
| 39425 chr22 47008741 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=7;GPV=8.6008e-14;SPV=0.15864 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:28,18:18,10:10,8 0/1:.:34:16,18:10,8:6,10 | |
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| 39477 chr22 47032717 . G A . PASS DP=108;SS=1;SSC=1;GPV=2.5491e-23;SPV=0.73799 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:27,35:17,15:10,20 0/1:.:46:22,24:13,11:9,13 | |
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| 39479 chr22 47033775 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.0669e-14;SPV=0.63515 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:12,16:14,8 0/1:.:30:16,14:10,6:6,8 | |
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| 39482 chr22 47034809 . G A . PASS DP=64;SS=1;SSC=7;GPV=3.6451e-12;SPV=0.16436 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:13,11:8,4 0/1:.:28:12,16:6,9:6,7 | |
| 39483 chr22 47035640 . A C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=2.5259e-14;SPV=0.91729 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:12,9:7,13 0/1:.:37:22,15:14,8:8,7 | |
| 39484 chr22 47036523 . G C . PASS DP=109;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,30:0,30 1/1:.:49:0,49:0,30:0,19 | |
| 39485 chr22 47036914 . G C . PASS DP=101;SS=1;SSC=6;GPV=8.35e-20;SPV=0.24344 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:27,23:14,14:13,9 0/1:.:51:23,28:13,14:10,14 | |
| 39486 chr22 47037802 . G T . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=1.3489e-13;SPV=0.68621 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:8,6:7,12 0/1:.:31:15,16:6,9:9,7 | |
| 39487 chr22 47038392 . C G . PASS DP=84;SS=1;SSC=1;GPV=1.5419e-14;SPV=0.63562 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:26,22:16,12:10,10 0/1:.:36:20,16:11,7:9,9 | |
| 39488 chr22 47040427 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=5.8427e-13;SPV=0.91004 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:7,10:7,8 0/1:.:35:20,15:10,8:10,7 | |
| 39489 chr22 47040655 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=7;GPV=2.0452e-11;SPV=0.15853 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:22,16:10,9:12,7 0/1:.:22:9,13:2,4:7,9 | |
| 39490 chr22 47041123 . G C . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.5502e-15;SPV=0.75398 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:7,12:15,11 0/1:.:37:20,17:11,7:9,10 | |
| 39491 chr22 47041670 . C T . PASS DP=107;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:64:0,64:0,31:0,33 1/1:.:43:0,43:0,26:0,17 | |
| 39492 chr22 47041832 . A T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,28:0,16 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 | |
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| 39494 chr22 47041977 . A G . PASS DP=106;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,28:0,31 1/1:.:47:0,47:0,24:0,23 | |
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| 39552 chr22 47050061 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,28:0,22 1/1:.:28:0,28:0,11:0,17 | |
| 39553 chr22 47050919 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=1.7063e-13;SPV=0.57393 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:26,22:14,15:12,7 0/1:.:28:15,13:7,6:8,7 | |
| 39554 chr22 47053193 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=7;GPV=2.5129e-20;SPV=0.19626 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:23,27:6,13:17,14 0/1:.:35:12,23:5,6:7,17 | |
| 39555 chr22 47055015 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.6516e-12;SPV=0.91199 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:11,10:11,10 0/1:.:37:24,13:11,9:13,4 | |
| 39556 chr22 47063014 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 | |
| 39557 chr22 47094831 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,29:0,10 1/1:.:22:0,22:0,17:0,5 | |
| 39558 chr22 47097099 . G C . PASS DP=58;SS=1;SSC=4;GPV=0.0064484;SPV=0.34388 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:33:30,3:13,1:17,2 0/1:.:25:21,4:11,1:10,3 | |
| 39559 chr22 47098550 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=8.5945e-18;SPV=0.64369 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:10,11:9,15 0/1:.:32:14,18:6,12:8,6 | |
| 39560 chr22 47098712 . C A . PASS DP=98;SS=1;SSC=8;GPV=8.064e-16;SPV=0.13906 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:34,20:15,10:19,10 0/1:.:44:22,22:7,9:15,13 | |
| 39561 chr22 47100119 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=1.4308e-12;SPV=0.98213 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:26,26:14,14:12,12 0/1:.:25:18,7:11,4:7,3 | |
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| 39563 chr22 47100744 . T G . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=4.6768e-16;SPV=0.62656 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:9,16:13,7 0/1:.:36:18,18:11,8:7,10 | |
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| 39611 chr22 47136086 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=4.6768e-16;SPV=0.45303 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:13,14:9,7 0/1:.:38:18,20:11,10:7,10 | |
| 39612 chr22 47136371 . T C . PASS DP=118;SS=1;SSC=4;GPV=1.0255e-26;SPV=0.3193 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:70:32,38:18,17:14,21 0/1:.:48:19,29:7,15:12,14 | |
| 39613 chr22 47138329 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=3;GPV=3.9427e-17;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:15,12:8,10 0/1:.:43:21,22:10,14:11,8 | |
| 39614 chr22 47139056 . A G . PASS DP=102;SS=1;SSC=6;GPV=1.0469e-22;SPV=0.21262 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:11,10:14,16 0/1:.:51:20,31:11,14:9,17 | |
| 39615 chr22 47140354 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=1.0403e-12;SPV=0.62517 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:9,11:10,5 0/1:.:38:21,17:9,7:12,10 | |
| 39616 chr22 47141058 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=3;GPV=2.3891e-13;SPV=0.42986 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:29,21:14,11:15,10 0/1:.:30:16,14:7,7:9,7 | |
| 39617 chr22 47141119 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,26:0,24 1/1:.:28:0,28:0,10:0,18 | |
| 39618 chr22 47141406 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=3;GPV=4.2836e-15;SPV=0.4153 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:13,9:12,17 0/1:.:21:9,12:4,6:5,6 | |
| 39619 chr22 47141604 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=3;GPV=4.8717e-12;SPV=0.4835 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:13,8:8,9 0/1:.:29:15,14:9,6:6,8 | |
| 39620 chr22 47143861 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=9.3454e-17;SPV=0.90327 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:11,18:10,8 0/1:.:39:22,17:10,6:12,11 | |
| 39621 chr22 47143937 . G C . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,28:0,22 1/1:.:45:0,45:0,22:0,23 | |
| 39622 chr22 47144333 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=3;GPV=2.2863e-14;SPV=0.47018 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:15,10:8,10 0/1:.:34:17,17:8,10:9,7 | |
| 39623 chr22 47144558 . C G . PASS DP=122;SS=1;SSC=1;GPV=1.675e-23;SPV=0.76595 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:31,34:20,14:11,20 0/1:.:57:30,27:14,15:16,12 | |
| 39624 chr22 47144995 . A T . PASS DP=103;SS=1;SSC=1;GPV=3.4393e-24;SPV=0.75131 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:26,39:13,12:13,27 0/1:.:38:17,21:7,4:10,17 | |
| 39625 chr22 47145649 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.5805e-15;SPV=0.83609 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:11,11:7,13 0/1:.:31:16,15:8,9:8,6 | |
| 39626 chr22 47146116 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,32:0,16 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 | |
| 39627 chr22 47147397 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.0134e-13;SPV=0.79916 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:16,17:9,5 0/1:.:35:21,14:15,11:6,3 | |
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| 39629 chr22 47147763 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=2;GPV=3.1349e-22;SPV=0.50858 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:19,29:13,17:6,12 0/1:.:40:15,25:9,17:6,8 | |
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| 39680 chr22 47161995 . G A . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,23:0,33 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 | |
| 39681 chr22 47162334 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=7.7462e-07;SPV=0.82173 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:16,9:6,6:10,3 0/1:.:32:23,9:13,4:10,5 | |
| 39682 chr22 47162538 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=5;GPV=7.7752e-12;SPV=0.26395 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:11,13:11,5 0/1:.:21:9,12:6,9:3,3 | |
| 39683 chr22 47162624 . T C . PASS DP=47;SS=1;SSC=1;GPV=2.9526e-26;SPV=0.6383 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:1,29:0,17:1,12 1/1:.:17:0,17:0,11:0,6 | |
| 39684 chr22 47162809 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,30:0,14:0,16 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
| 39685 chr22 47162816 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,29:0,14:0,15 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 39686 chr22 47162869 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=3;GPV=1.3284e-10;SPV=0.44172 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:22,13:10,8:12,5 0/1:.:36:21,15:13,6:8,9 | |
| 39687 chr22 47162953 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,40:0,19 1/1:.:29:0,29:0,12:0,17 | |
| 39688 chr22 47163041 . C T . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=2.8914e-22;SPV=0.8865 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:22,33:15,16:7,17 0/1:.:46:23,23:12,13:11,10 | |
| 39689 chr22 47163162 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,14:0,27 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 39690 chr22 47163806 . G T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.7502e-16;SPV=0.86071 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:23,28:11,9:12,19 0/1:.:31:17,14:8,6:9,8 | |
| 39691 chr22 47163942 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=4;GPV=4.6708e-19;SPV=0.39155 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:9,12:11,13 0/1:.:36:14,22:9,10:5,12 | |
| 39692 chr22 47164154 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=5.4067e-14;SPV=0.68165 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:15,12:12,9 0/1:.:39:23,16:13,6:10,10 | |
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| 39694 chr22 47164266 . T G . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,30:0,25 1/1:.:44:0,44:0,32:0,12 | |
| 39695 chr22 47164534 . C G . PASS DP=107;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:58:0,58:0,26:0,32 1/1:.:49:0,49:0,17:0,32 | |
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| 39751 chr22 47190493 . A G . PASS DP=109;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,25:0,23 1/1:.:61:0,61:0,21:0,40 | |
| 39752 chr22 47191508 . A C . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=1.1875e-15;SPV=0.72824 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:6,7:9,13 0/1:.:36:17,19:7,9:10,10 | |
| 39753 chr22 47192082 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,25:0,9 1/1:.:31:0,31:0,26:0,5 | |
| 39754 chr22 47192097 . C G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=3.2811e-12;SPV=0.87608 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:10,13:6,6 0/1:.:28:16,12:12,10:4,2 | |
| 39755 chr22 47193947 . T C . PASS DP=96;SS=1;SSC=1;GPV=3.6959e-18;SPV=0.65837 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:12,15:12,9 0/1:.:48:25,23:18,10:7,13 | |
| 39756 chr22 47195886 . G T . PASS DP=88;SS=1;SSC=4;GPV=1.0943e-12;SPV=0.35821 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:32,18:19,7:13,11 0/1:.:38:22,16:15,8:7,8 | |
| 39757 chr22 47197328 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=6.0302e-11;SPV=0.69066 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:25,17:16,10:9,7 0/1:.:32:20,12:9,5:11,7 | |
| 39758 chr22 47197581 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=5.8615e-20;SPV=0.95317 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:17,29:7,14:10,15 0/1:.:44:23,21:12,14:11,7 | |
| 39759 chr22 47197930 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=4.6768e-16;SPV=0.97404 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:22,30:14,14:8,16 0/1:.:29:18,11:8,6:10,5 | |
| 39760 chr22 47198388 . C T . PASS DP=97;SS=1;SSC=5;GPV=5.1676e-21;SPV=0.29552 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:29,31:8,17:21,14 0/1:.:37:15,22:9,6:6,16 | |
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| 39819 chr22 47215790 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,26:0,25 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 | |
| 39820 chr22 47217526 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=5.0247e-17;SPV=0.77997 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:18,23:6,9:12,14 0/1:.:40:20,20:10,13:10,7 | |
| 39821 chr22 47218980 . C G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 1/1:.:29:0,29:0,12:0,17 | |
| 39822 chr22 47219407 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=4.9329e-10;SPV=0.79588 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:6,9:13,7 0/1:.:26:16,10:11,4:5,6 | |
| 39823 chr22 47219786 . A T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,26:0,19 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 39824 chr22 47219999 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 1/1:.:21:0,21:0,15:0,6 | |
| 39825 chr22 47220340 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=1.2269e-12;SPV=0.56267 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:13,7:9,10 0/1:.:36:20,16:8,6:12,10 | |
| 39826 chr22 47221382 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.3308e-15;SPV=0.81399 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:12,12:8,12 0/1:.:32:17,15:9,8:8,7 | |
| 39827 chr22 47221724 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=4.794e-13;SPV=0.81753 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:11,12:13,10 0/1:.:30:18,12:8,6:10,6 | |
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| 39886 chr22 47254499 . A G . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 1/1:.:24:0,24:0,12:0,12 | |
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| 39888 chr22 47256864 . C A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.6279e-15;SPV=0.84835 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:10,9:12,17 0/1:.:29:16,13:8,8:8,5 | |
| 39889 chr22 47257708 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=4;GPV=9.5854e-11;SPV=0.34795 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:26,17:16,9:10,8 0/1:.:23:12,11:8,6:4,5 | |
| 39890 chr22 47257718 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 1/1:.:21:0,21:0,11:0,10 | |
| 39891 chr22 47257799 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.4104e-19;SPV=0.86867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:15,30:7,17:8,13 0/1:.:30:13,17:5,8:8,9 | |
| 39892 chr22 47258685 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.8059e-17;SPV=0.99714 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:14,30:6,10:8,20 0/1:.:33:20,13:6,8:14,5 | |
| 39893 chr22 47259322 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,28:0,21 1/1:.:36:0,36:0,25:0,11 | |
| 39894 chr22 47259525 . C A . PASS DP=79;SS=1;SSC=5;GPV=2.2057e-13;SPV=0.30161 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:30,21:19,11:11,10 0/1:.:28:14,14:8,3:6,11 | |
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| 40033 chr22 47412963 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,20:0,24 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 | |
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| 40089 chr22 47542815 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,27:0,19 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 | |
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| 40092 chr22 47543848 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 40093 chr22 47543932 . T A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
| 40094 chr22 47544679 . C G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 1/1:.:27:0,27:0,19:0,8 | |
| 40095 chr22 47545159 . A C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 40096 chr22 47546771 . G C . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,11:0,19 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
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| 40098 chr22 47547539 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,23:0,17 1/1:.:26:0,26:0,17:0,9 | |
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| 40100 chr22 47547996 . G A . PASS DP=105;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:66:0,66:0,30:0,36 1/1:.:39:0,39:0,25:0,14 | |
| 40101 chr22 47548629 . G A . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,9:0,19 1/1:.:16:0,16:0,5:0,11 | |
| 40102 chr22 47555124 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.0148e-14;SPV=0.86952 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:8,11:10,13 0/1:.:28:15,13:4,11:11,2 | |
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| 40104 chr22 47562465 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=3;GPV=2.9719e-11;SPV=0.46411 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:5,12:17,5 0/1:.:25:13,12:6,9:7,3 | |
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| 40153 chr22 47623663 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=4.2487e-10;SPV=0.93311 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:8,7:15,10 0/1:.:35:25,10:14,3:11,7 | |
| 40154 chr22 47624050 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=9;GPV=1.1558e-14;SPV=0.10919 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:15,8:10,13 0/1:.:25:9,16:0,9:9,7 | |
| 40155 chr22 47625237 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=1;GPV=1.5964e-18;SPV=0.7558 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:22,27:14,15:8,12 0/1:.:40:20,20:11,6:9,14 | |
| 40156 chr22 47625916 . C G . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=4.1212e-16;SPV=0.66568 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:31,28:11,11:20,17 0/1:.:31:17,14:8,6:9,8 | |
| 40157 chr22 47626271 . C A . PASS DP=64;SS=1;SSC=3;GPV=1.3424e-14;SPV=0.41167 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:9,13:9,8 0/1:.:25:10,15:2,12:8,3 | |
| 40158 chr22 47626454 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=6;GPV=1.6919e-21;SPV=0.24896 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:24,34:13,20:11,14 0/1:.:26:8,18:2,10:6,8 | |
| 40159 chr22 47627492 . G T . PASS DP=78;SS=1;SSC=4;GPV=2.0308e-13;SPV=0.3246 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:6,6:17,10 0/1:.:39:20,19:11,10:9,9 | |
| 40160 chr22 47628069 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=5;GPV=3.642e-14;SPV=0.30073 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:14,9:14,11 0/1:.:34:17,17:6,9:11,8 | |
| 40161 chr22 47630699 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=4;GPV=3.2424e-19;SPV=0.3196 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:27,26:13,12:14,14 0/1:.:41:18,23:4,15:14,8 | |
| 40162 chr22 47631005 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=7;GPV=2.8926e-12;SPV=0.16014 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:30,19:17,10:13,9 0/1:.:24:11,13:2,6:9,7 | |
| 40163 chr22 47632271 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.3907e-10;SPV=0.8419 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:12,12:7,7 0/1:.:20:12,8:6,5:6,3 | |
| 40164 chr22 47632288 . C G . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.9694e-09;SPV=0.89052 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:14,11:2,6 0/1:.:16:10,6:7,4:3,2 | |
| 40165 chr22 47632386 . T C . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=5.349e-11;SPV=0.5873 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:11,13:8,4 0/1:.:23:12,11:3,7:9,4 | |
| 40166 chr22 47632755 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=8.9788e-17;SPV=0.71107 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:12,19:11,10 0/1:.:25:12,13:6,8:6,5 | |
| 40167 chr22 47633339 . G C . PASS DP=67;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.037234 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:23,18:12,8:11,10 0/1:.:26:8,18:2,10:6,8 | |
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| 40219 chr22 47664862 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=8;GPV=7.2168e-14;SPV=0.15448 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:28,19:14,9:14,10 0/1:.:31:14,17:8,9:6,8 | |
| 40220 chr22 47665021 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=2.95e-15;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:5,3:12,13 0/1:.:45:22,23:11,8:11,15 | |
| 40221 chr22 47665524 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=8.6933e-09;SPV=0.7305 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:16,11:9,5:7,6 0/1:.:33:21,12:13,5:8,7 | |
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| 40223 chr22 47667436 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,8:0,14 1/1:.:30:0,30:0,8:0,22 | |
| 40224 chr22 47667507 . C T . PASS DP=35;SS=1;SSC=3;GPV=6.3952e-08;SPV=0.47167 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:14:7,7:2,3:5,4 0/1:.:21:9,12:5,4:4,8 | |
| 40225 chr22 47669396 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=5;GPV=8.8612e-15;SPV=0.27036 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:10,10:8,7 0/1:.:34:14,20:7,13:7,7 | |
| 40226 chr22 47670048 . C A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:28:0,28:0,19:0,9 | |
| 40227 chr22 47670167 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 40228 chr22 47670531 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=3.6448e-13;SPV=0.42811 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:9,9:9,9 0/1:.:27:12,15:5,9:7,6 | |
| 40229 chr22 47671026 . G A . PASS DP=62;SS=1;SSC=9;GPV=9.9575e-19;SPV=0.10166 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:12,18:8,12:4,6 1/1:.:32:7,25:4,13:3,12 | |
| 40230 chr22 47671284 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.5388e-12;SPV=0.77476 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:17,18:8,5:9,13 0/1:.:31:17,14:6,7:11,7 | |
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| 40287 chr22 47711037 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,17:0,19 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 40288 chr22 47711394 . C T . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=3.5049e-07;SPV=0.65756 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:23,11:10,9:13,2 0/1:.:26:18,8:7,4:11,4 | |
| 40289 chr22 47711721 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=11;GPV=6.4034e-09;SPV=0.06321 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:23,11:15,4:8,7 0/1:.:21:9,12:3,8:6,4 | |
| 40290 chr22 47711946 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=1;GPV=1.0507e-11;SPV=0.6809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:16,12:7,9 0/1:.:20:11,9:6,3:5,6 | |
| 40291 chr22 47712637 . G A . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=3.9115e-10;SPV=0.69168 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:15,13:8,4:7,9 0/1:.:30:17,13:7,3:10,10 | |
| 40292 chr22 47713106 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=7;GPV=8.2973e-14;SPV=0.1981 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:13,8:7,8 0/1:.:33:14,19:4,13:10,6 | |
| 40293 chr22 47713571 . A C . PASS DP=89;SS=1;SSC=6;GPV=6.2306e-14;SPV=0.25049 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:33,20:18,10:15,10 0/1:.:36:19,17:8,7:11,10 | |
| 40294 chr22 47714087 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=9;GPV=1.525e-20;SPV=0.11871 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:10,6:15,20 0/1:.:38:13,25:5,13:8,12 | |
| 40295 chr22 47715653 . C T . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=1.093e-09;SPV=0.89984 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:8,15:3,9:5,6 0/1:.:17:8,8:3,6:5,2 | |
| 40296 chr22 47716708 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,25:0,23 1/1:.:44:0,44:0,24:0,20 | |
| 40297 chr22 47716805 . G C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=2.5278e-15;SPV=0.8941 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:14,9:9,15 0/1:.:40:24,16:7,6:17,10 | |
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| 40356 chr22 47755105 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,28:0,14 1/1:.:22:0,22:0,8:0,14 | |
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| 40358 chr22 47756319 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,26:0,16 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
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| 40418 chr22 47808831 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=9;GPV=1.9732e-14;SPV=0.11988 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:28,16:15,10:13,6 0/1:.:43:21,22:9,13:12,9 | |
| 40419 chr22 47808998 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=2;GPV=5.0108e-11;SPV=0.60209 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:26,18:13,11:13,7 0/1:.:27:16,11:5,2:11,9 | |
| 40420 chr22 47810607 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=2.0579e-15;SPV=0.3442 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:12,7:10,14 0/1:.:32:14,18:8,9:6,9 | |
| 40421 chr22 47810750 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,25:0,19 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 | |
| 40422 chr22 47811106 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,29:0,23 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 40423 chr22 47811209 . A C . PASS DP=83;SS=1;SSC=3;GPV=1.973e-16;SPV=0.44218 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:27,26:9,12:18,14 0/1:.:30:14,16:7,9:7,7 | |
| 40424 chr22 47811569 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=1.1875e-15;SPV=0.9797 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:12,23:6,11:6,12 0/1:.:36:20,16:11,7:9,9 | |
| 40425 chr22 47811893 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=3.673e-15;SPV=0.75466 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:12,14:9,8 0/1:.:37:20,17:14,7:6,10 | |
| 40426 chr22 47812123 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=10;GPV=8.3706e-15;SPV=0.096468 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:26,14:11,5:15,9 0/1:.:49:24,25:14,11:10,14 | |
| 40427 chr22 47812142 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:51:0,51:0,27:0,24 | |
| 40428 chr22 47812237 . C G . PASS DP=99;SS=1;SSC=5;GPV=2.1398e-20;SPV=0.30215 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:13,17:13,8 0/1:.:48:21,27:12,14:9,13 | |
| 40429 chr22 47812294 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=3.011e-15;SPV=0.84817 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:29,27:23,10:6,17 0/1:.:33:20,13:5,6:15,7 | |
| 40430 chr22 47813259 . G T . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=2.9905e-13;SPV=0.71392 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:27,21:15,13:12,8 0/1:.:35:21,14:9,7:12,7 | |
| 40431 chr22 47813460 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=5.0547e-18;SPV=0.9573 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:13,30:6,18:7,12 0/1:.:25:12,13:6,8:6,5 | |
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| 40433 chr22 47813685 . C T . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=5.5445e-18;SPV=0.92916 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:20,27:12,11:8,16 0/1:.:43:24,19:10,11:14,8 | |
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| 40552 chr22 47897471 . T C . PASS DP=52;SS=1;SSC=3;GPV=7.5157e-12;SPV=0.47463 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:13,15:7,7:6,8 0/1:.:24:10,14:5,7:5,7 | |
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| 40556 chr22 47899013 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=6;GPV=2.4088e-15;SPV=0.21453 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:8,7:10,11 0/1:.:32:12,20:8,11:4,9 | |
| 40557 chr22 47902310 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=6;GPV=7.2383e-18;SPV=0.22045 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:7,6:12,15 0/1:.:36:13,23:5,10:8,13 | |
| 40558 chr22 47902610 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=8;GPV=4.8441e-11;SPV=0.15444 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:12,8:9,7 0/1:.:22:9,13:4,5:5,8 | |
| 40559 chr22 47902717 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 1/1:.:31:0,31:0,20:0,11 | |
| 40560 chr22 47903042 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=3;GPV=1.2401e-12;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:7,6:9,9 0/1:.:33:16,17:7,4:9,13 | |
| 40561 chr22 47903713 . T A . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=7.7752e-12;SPV=0.74288 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:8,8:8,9 0/1:.:28:15,13:8,9:7,4 | |
| 40562 chr22 47904280 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 1/1:.:25:0,25:0,11:0,14 | |
| 40563 chr22 47904645 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=4;GPV=3.2606e-19;SPV=0.38608 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:7,10:10,16 0/1:.:30:10,20:3,12:7,8 | |
| 40564 chr22 47907448 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=9.392e-17;SPV=0.53283 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:14,19:10,9:4,10 0/1:.:37:15,22:7,8:8,14 | |
| 40565 chr22 47908704 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=9.545e-12;SPV=0.65402 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:12,9:5,7 0/1:.:30:16,14:5,4:11,10 | |
| 40566 chr22 47909320 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=7.8044e-17;SPV=0.60011 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:15,22:5,7:10,15 0/1:.:32:13,19:5,12:8,7 | |
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| 40568 chr22 47909678 . T G . PASS DP=47;SS=1;SSC=3;GPV=1.1021e-09;SPV=0.44331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:12,11:3,7:9,4 0/1:.:24:11,13:5,8:6,5 | |
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| 40617 chr22 47951160 . G T . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=4.4405e-12;SPV=0.59159 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:6,6:11,9 0/1:.:34:18,16:7,8:11,8 | |
| 40618 chr22 47961175 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=3;GPV=4.9005e-18;SPV=0.45921 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:22,22:11,13:11,9 0/1:.:45:21,24:12,14:9,10 | |
| 40619 chr22 47961478 . A G . PASS DP=93;SS=1;SSC=1;GPV=2.8449e-19;SPV=0.75164 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:23,28:11,16:12,12 0/1:.:42:21,21:11,6:10,15 | |
| 40620 chr22 47963064 . A T . PASS DP=48;SS=1;SSC=3;GPV=4.1182e-10;SPV=0.48085 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:14,14:8,7:6,7 0/1:.:20:9,11:6,3:3,8 | |
| 40621 chr22 47963191 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=7;GPV=3.6448e-13;SPV=0.1761 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:11,6:8,10 0/1:.:28:11,17:5,12:6,5 | |
| 40622 chr22 47964424 . G T . PASS DP=58;SS=1;SSC=5;GPV=2.9186e-09;SPV=0.28149 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:18,10:8,7:10,3 0/1:.:30:16,14:9,6:7,8 | |
| 40623 chr22 47964736 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=3.2811e-12;SPV=0.87608 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:7,12:9,7 0/1:.:28:16,12:8,5:8,7 | |
| 40624 chr22 47964775 . T C . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=2.2597e-11;SPV=0.46129 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:18,15:12,7:6,8 0/1:.:28:14,14:4,9:10,5 | |
| 40625 chr22 47975972 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=1.3588e-18;SPV=0.55539 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:14,25:6,14:8,11 0/1:.:29:10,19:5,11:5,8 | |
| 40626 chr22 47977694 . T G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=7.3303e-11;SPV=0.95252 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:10,16:6,10:4,6 0/1:.:26:15,11:8,5:7,6 | |
| 40627 chr22 47978335 . C A . PASS DP=50;SS=1;SSC=10;GPV=1.5236e-09;SPV=0.092395 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:16:11,5:2,3:9,2 0/1:.:34:15,19:6,6:9,13 | |
| 40628 chr22 47980305 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=1.4855e-11;SPV=0.76796 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:18,16:7,9:11,7 0/1:.:34:20,14:8,8:12,6 | |
| 40629 chr22 47980430 . A C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=6.0532e-18;SPV=0.95561 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:13,26:4,15:9,11 0/1:.:36:18,18:11,12:7,6 | |
| 40630 chr22 47980613 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=7.191e-13;SPV=0.96278 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:13,18:8,7:5,11 0/1:.:38:23,15:9,7:14,8 | |
| 40631 chr22 47981214 . A G . PASS DP=48;SS=1;SSC=1;GPV=1.0268e-08;SPV=0.7439 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:14,13:3,3:11,10 0/1:.:21:12,9:5,1:7,8 | |
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| 40688 chr22 48026879 . G T . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=2.4568e-12;SPV=0.78163 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:8,7:9,9 0/1:.:38:22,16:16,7:6,9 | |
| 40689 chr22 48027283 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=5.2028e-13;SPV=0.51267 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:13,13:12,6 0/1:.:33:18,15:13,4:5,11 | |
| 40690 chr22 48027430 . G C . PASS DP=54;SS=1;SSC=2;GPV=2.9233e-13;SPV=0.61986 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:13,19:6,10:7,9 0/1:.:22:9,13:5,6:4,7 | |
| 40691 chr22 48028928 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=2.8393e-15;SPV=0.76625 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:12,20:4,5:8,15 0/1:.:30:13,17:7,9:6,8 | |
| 40692 chr22 48029682 . T C . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=3.6279e-14;SPV=0.94832 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:7,17:4,12:3,5 0/1:.:32:15,17:6,4:9,13 | |
| 40693 chr22 48031372 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=2.7262e-09;SPV=0.83422 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:19,16:14,10:5,6 0/1:.:22:14,8:9,5:5,3 | |
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| 40695 chr22 48035227 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=6.2985e-12;SPV=0.91637 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:24,23:11,14:13,9 0/1:.:23:15,8:10,4:5,4 | |
| 40696 chr22 48035425 . C T . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=7.091e-10;SPV=0.91246 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:6,8:9,9 0/1:.:21:13,8:3,4:10,4 | |
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| 40755 chr22 48081521 . T C . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,23:0,33 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 | |
| 40756 chr22 48081538 . C G . PASS DP=105;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,24:0,37 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 | |
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| 40758 chr22 48081632 . A C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,21:0,28 1/1:.:32:0,32:0,12:0,20 | |
| 40759 chr22 48081667 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=4.4277e-12;SPV=0.36756 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:28,17:10,8:18,9 0/1:.:34:19,15:4,4:15,11 | |
| 40760 chr22 48081889 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=10;GPV=4.034e-13;SPV=0.093833 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:26,16:15,10:11,6 0/1:.:32:14,18:10,6:4,12 | |
| 40761 chr22 48081964 . A G . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,31:0,26 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 | |
| 40762 chr22 48082112 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,21:0,26 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 40763 chr22 48082173 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=2.2057e-13;SPV=0.38162 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:11,7:13,10 0/1:.:38:20,18:11,10:9,8 | |
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| 40818 chr22 48120878 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=4;GPV=1.0016e-19;SPV=0.33196 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:23,27:14,16:9,11 0/1:.:36:14,22:8,15:6,7 | |
| 40819 chr22 48121464 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=5.5248e-15;SPV=0.7481 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:9,9:11,14 0/1:.:31:16,15:5,6:11,9 | |
| 40820 chr22 48122637 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=4.0755e-11;SPV=0.63808 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:11,9:10,7 0/1:.:31:18,13:9,4:9,9 | |
| 40821 chr22 48125352 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=1.0051e-11;SPV=0.76735 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:8,9:6,9 0/1:.:22:11,11:3,8:8,3 | |
| 40822 chr22 48129875 . T C . PASS DP=51;SS=1;SSC=0;GPV=1.0643e-11;SPV=0.88531 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:9,17:5,7:4,10 0/1:.:24:10,11:4,8:6,3 | |
| 40823 chr22 48130047 . G A . PASS DP=48;SS=1;SSC=5;GPV=3.6075e-09;SPV=0.28196 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:14,10:7,2:7,8 0/1:.:24:11,13:4,8:7,5 | |
| 40824 chr22 48130883 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 1/1:.:26:0,26:0,17:0,9 | |
| 40825 chr22 48131484 . C A . PASS DP=81;SS=1;SSC=2;GPV=3.3388e-14;SPV=0.54057 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:14,6:8,12 0/1:.:41:22,19:16,6:6,13 | |
| 40826 chr22 48133582 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=5;GPV=2.2863e-14;SPV=0.30602 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:9,15:17,6 0/1:.:30:14,16:7,8:7,8 | |
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| 40888 chr22 48242375 . C A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 1/1:.:31:0,31:0,11:0,20 | |
| 40889 chr22 48244181 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 | |
| 40890 chr22 48252690 . C T . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=1.3852e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,14:0,7 1/1:.:12:0,12:0,8:0,4 | |
| 40891 chr22 48252691 . A G . PASS DP=44;SS=1;SSC=1;GPV=1.7144e-24;SPV=0.65909 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:1,28:1,19:0,9 1/1:.:15:0,15:0,11:0,4 | |
| 40892 chr22 48252692 . T C . PASS DP=39;SS=1;SSC=0;GPV=3.6742e-23;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:25:0,25:0,17:0,8 1/1:.:14:0,14:0,9:0,5 | |
| 40893 chr22 48253161 . T G . PASS DP=36;SS=1;SSC=0;GPV=0.00019879;SPV=0.92682 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:11,7:6,5:5,2 0/1:.:18:14,4:8,3:6,1 | |
| 40894 chr22 48253637 . T G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.3846e-17;SPV=0.85058 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:18,26:14,14:4,12 0/1:.:36:18,18:12,12:6,6 | |
| 40895 chr22 48255914 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,28:0,29 1/1:.:31:0,31:0,10:0,21 | |
| 40896 chr22 48256159 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=8.6835e-16;SPV=0.61067 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:12,13:10,11 0/1:.:31:15,16:8,7:7,9 | |
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| 40898 chr22 48256684 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=2.4148e-10;SPV=0.88467 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:18,16:11,9:7,7 0/1:.:31:20,11:14,4:6,7 | |
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| 40953 chr22 48284257 . A C . PASS DP=42;SS=1;SSC=3;GPV=6.6622e-06;SPV=0.42806 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:19:13,6:9,2:4,4 0/1:.:23:14,9:9,4:5,5 | |
| 40954 chr22 48284258 . A T . PASS DP=41;SS=1;SSC=3;GPV=2.4696e-06;SPV=0.42303 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:13,7:9,3:4,4 0/1:.:21:12,9:9,4:3,5 | |
| 40955 chr22 48285323 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,12:0,21 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
| 40956 chr22 48285525 . C T . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=6.9602e-07;SPV=0.75418 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:14,8:6,3:8,5 0/1:.:32:22,10:8,6:14,4 | |
| 40957 chr22 48286557 . C T . PASS DP=46;SS=1;SSC=5;GPV=2.4659e-12;SPV=0.26496 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:15:7,8:5,4:2,4 0/1:.:31:10,21:3,13:7,8 | |
| 40958 chr22 48286752 . A G . PASS DP=33;SS=1;SSC=7;GPV=6.1763e-11;SPV=0.15936 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:12:5,7:3,5:2,2 1/1:.:21:4,17:1,7:3,10 | |
| 40959 chr22 48287706 . A G . PASS DP=57;SS=1;SSC=3;GPV=4.8496e-12;SPV=0.49358 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:10,10:5,6:5,4 0/1:.:37:17,20:7,12:10,8 | |
| 40960 chr22 48288009 . A G . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:22:0,22:0,8:0,14 1/1:.:27:0,27:0,10:0,17 | |
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| 40962 chr22 48288289 . T C . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,6:0,13 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 | |
| 40963 chr22 48288383 . T C . PASS DP=42;SS=1;SSC=0;GPV=5.9562e-25;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,8:0,11 1/1:.:23:0,23:0,13:0,10 | |
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| 41022 chr22 48312844 . T A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,48:0,26:0,22 1/1:.:32:0,32:0,18:0,14 | |
| 41023 chr22 48313094 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 | |
| 41024 chr22 48313142 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=3.3502e-13;SPV=0.52611 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:7,13:15,6 0/1:.:31:16,15:8,8:8,7 | |
| 41025 chr22 48313178 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,26:0,27 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 | |
| 41026 chr22 48313376 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,19:0,29 1/1:.:29:0,29:0,9:0,20 | |
| 41027 chr22 48313394 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=3.367e-12;SPV=0.39377 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:28,19:11,7:17,12 0/1:.:28:15,13:4,7:11,6 | |
| 41028 chr22 48313754 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=1.9973e-11;SPV=0.57888 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:14,9:10,8 0/1:.:31:18,13:13,9:5,4 | |
| 41029 chr22 48314345 . G T . PASS DP=65;SS=1;SSC=2;GPV=2.4148e-10;SPV=0.55999 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:10,4:13,12 0/1:.:26:15,11:8,6:7,5 | |
| 41030 chr22 48314668 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=1;GPV=1.5731e-10;SPV=0.74373 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:9,6:15,10 0/1:.:34:22,12:9,9:13,3 | |
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| 41032 chr22 48315351 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,29:0,26 1/1:.:25:0,25:0,15:0,10 | |
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| 41079 chr22 48331184 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=5.456e-15;SPV=0.93549 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:3,12:16,10 0/1:.:43:26,17:18,8:8,9 | |
| 41080 chr22 48331447 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=2.7526e-17;SPV=0.77733 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:9,15:10,8 0/1:.:43:22,21:7,13:15,8 | |
| 41081 chr22 48332261 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=5;GPV=3.1677e-14;SPV=0.27039 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:13,13:9,5:4,8 0/1:.:36:14,22:3,10:11,12 | |
| 41082 chr22 48333376 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=4.3139e-18;SPV=0.89523 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:20,27:12,14:8,13 0/1:.:41:22,19:12,12:10,7 | |
| 41083 chr22 48333738 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=7;GPV=1.9118e-16;SPV=0.19231 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:30,21:13,8:17,13 0/1:.:42:20,22:11,10:9,12 | |
| 41084 chr22 48334257 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.19e-16;SPV=0.91574 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:20,28:11,17:9,11 0/1:.:31:17,14:9,7:8,7 | |
| 41085 chr22 48335101 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.0601e-12;SPV=0.84131 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:10,10:11,11 0/1:.:27:16,11:9,6:7,5 | |
| 41086 chr22 48337347 . G A . PASS DP=52;SS=1;SSC=6;GPV=6.4344e-10;SPV=0.21578 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:7,10:12,4 0/1:.:19:8,11:4,6:4,5 | |
| 41087 chr22 48338797 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=9;GPV=4.3139e-18;SPV=0.10911 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:30,26:16,18:14,8 0/1:.:32:12,20:9,14:3,6 | |
| 41088 chr22 48340184 . C A . PASS DP=89;SS=1;SSC=2;GPV=4.9005e-18;SPV=0.5966 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:27,29:10,17:17,12 0/1:.:33:16,17:4,7:12,10 | |
| 41089 chr22 48340310 . G C . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=6.5271e-15;SPV=0.56458 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:28,23:10,13:18,10 0/1:.:35:19,16:10,8:9,8 | |
| 41090 chr22 48342321 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=7.2168e-14;SPV=0.96713 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:18,22:6,12:12,10 0/1:.:38:24,14:10,5:14,9 | |
| 41091 chr22 48342651 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.3908e-17;SPV=0.91013 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:19,30:12,17:7,13 0/1:.:27:14,13:9,7:5,6 | |
| 41092 chr22 48343300 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=1.0284e-10;SPV=0.88858 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:12,9:13,12 0/1:.:21:14,7:6,3:8,4 | |
| 41093 chr22 48343635 . G A . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=2.7262e-09;SPV=0.98603 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:9,12:6,5 0/1:.:25:18,7:5,4:13,3 | |
| 41094 chr22 48343644 . C T . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,21:0,12 1/1:.:25:0,25:0,10:0,15 | |
| 41095 chr22 48343830 . A G . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 1/1:.:30:0,30:0,20:0,10 | |
| 41096 chr22 48345200 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=7;GPV=2.95e-15;SPV=0.17971 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:25,20:6,6:19,14 0/1:.:33:14,19:6,11:8,8 | |
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| 41151 chr22 48390769 . G T . PASS DP=61;SS=1;SSC=18;GPV=1;SPV=0.013846 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:17,13:7,7:10,6 0/1:.:31:8,23:6,12:2,11 | |
| 41152 chr22 48390985 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=7;GPV=1.6045e-08;SPV=0.16859 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:20,10:11,4:9,6 0/1:.:24:12,12:7,6:5,6 | |
| 41153 chr22 48391601 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=3;GPV=7.9293e-13;SPV=0.42104 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:8,7:13,10 0/1:.:32:16,16:5,11:11,5 | |
| 41154 chr22 48391988 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.02e-15;SPV=0.83204 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:14,21:6,11:8,10 0/1:.:35:17,18:10,7:7,11 | |
| 41155 chr22 48392224 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=2.5259e-14;SPV=0.98171 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:5,11:13,13 0/1:.:36:23,13:12,8:11,5 | |
| 41156 chr22 48392692 . C G . PASS DP=92;SS=1;SSC=1;GPV=2.4816e-20;SPV=0.74765 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:23,31:16,17:7,14 0/1:.:38:18,20:11,8:7,12 | |
| 41157 chr22 48394830 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=1.5419e-14;SPV=0.95908 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:18,17:6,9 0/1:.:34:22,12:12,7:10,5 | |
| 41158 chr22 48396195 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=6.5235e-17;SPV=0.91887 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:20,27:10,17:10,10 0/1:.:36:20,16:6,9:14,7 | |
| 41159 chr22 48396713 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=6.7818e-18;SPV=0.86532 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:20,28:7,13:13,15 0/1:.:35:18,17:10,9:8,8 | |
| 41160 chr22 48398024 . T A . PASS DP=81;SS=1;SSC=10;GPV=1.1753e-14;SPV=0.087738 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:30,20:17,14:13,6 0/1:.:31:13,18:7,11:6,7 | |
| 41161 chr22 48399178 . G T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=2.781e-14;SPV=0.8996 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:6,8:14,14 0/1:.:37:22,15:13,4:9,11 | |
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| 41214 chr22 48426042 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=4.1056e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:27:0,27:0,16:0,11 | |
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| 41217 chr22 48426729 . A G . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:62:0,62:0,29:0,33 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 | |
| 41218 chr22 48426807 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.662e-19;SPV=0.87694 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:20,33:10,15:10,18 0/1:.:29:14,15:7,7:7,8 | |
| 41219 chr22 48427545 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=2.7419e-13;SPV=0.84155 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:5,11:14,10 0/1:.:30:17,13:5,8:12,5 | |
| 41220 chr22 48427854 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 | |
| 41221 chr22 48428755 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=9.1061e-12;SPV=0.99483 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:10,12:11,11 0/1:.:31:23,8:9,4:14,4 | |
| 41222 chr22 48429179 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=12;GPV=2.8075e-15;SPV=0.053137 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:10,7:10,9 0/1:.:33:11,22:5,12:6,10 | |
| 41223 chr22 48429419 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.041248 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:11,11:7,6 0/1:.:41:12,29:7,20:5,9 | |
| 41224 chr22 48429509 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=5.6308e-13;SPV=0.99525 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:18,23:10,17:8,6 0/1:.:37:26,11:16,4:10,7 | |
| 41225 chr22 48430611 . C T . PASS DP=92;SS=1;SSC=4;GPV=7.6832e-19;SPV=0.39559 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:26,26:12,14:14,12 0/1:.:40:18,22:8,7:10,15 | |
| 41226 chr22 48431475 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=5.2507e-16;SPV=0.91432 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:23,28:12,15:11,13 0/1:.:31:18,13:14,7:4,6 | |
| 41227 chr22 48431672 . C A . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=7.2383e-18;SPV=0.52692 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:21,28:8,11:13,17 0/1:.:27:11,16:4,4:7,12 | |
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| 41229 chr22 48432197 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.7502e-16;SPV=0.96222 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:22,30:13,13:9,17 0/1:.:30:18,12:10,4:8,8 | |
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| 41286 chr22 48455094 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=7;GPV=4.8851e-07;SPV=0.17647 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,7:0,1:0,6 0/1:.:22:3,7:1,6:2,1 | |
| 41287 chr22 48455095 . C A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=9.6148e-08;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,6:0,1:0,5 0/1:.:22:0,7:0,6:0,1 | |
| 41288 chr22 48455266 . C A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 1/1:.:32:0,32:0,21:0,11 | |
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| 41346 chr22 48482251 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=8;GPV=2.2046e-16;SPV=0.15482 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:19,21:10,15:9,6 0/1:.:28:9,19:6,7:3,12 | |
| 41347 chr22 48482724 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,25:0,25 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
| 41348 chr22 48483701 . G T . PASS DP=76;SS=1;SSC=7;GPV=2.3908e-17;SPV=0.16162 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:10,10:10,10 0/1:.:36:13,23:6,12:7,11 | |
| 41349 chr22 48483827 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=7;GPV=7.5261e-19;SPV=0.18884 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:10,10:4,8 0/1:.:39:12,27:6,15:6,12 | |
| 41350 chr22 48483973 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=4.0755e-15;SPV=0.97697 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:13,16:8,11 0/1:.:33:21,12:12,7:9,5 | |
| 41351 chr22 48484359 . A C . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=2.7419e-13;SPV=0.6974 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:8,11:12,9 0/1:.:30:16,14:7,7:9,7 | |
| 41352 chr22 48485158 . C A . PASS DP=74;SS=1;SSC=2;GPV=4.034e-13;SPV=0.52935 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:10,14:19,10 0/1:.:21:11,10:9,7:2,3 | |
| 41353 chr22 48485476 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 1/1:.:24:0,24:0,11:0,13 | |
| 41354 chr22 48485750 . G C . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=1.9793e-19;SPV=0.90412 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:25,31:15,23:10,8 0/1:.:43:24,19:15,15:9,4 | |
| 41355 chr22 48486793 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=3;GPV=7.3839e-17;SPV=0.41568 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:9,10:12,10 0/1:.:43:20,23:6,11:14,12 | |
| 41356 chr22 48487660 . G T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 41357 chr22 48487664 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=7.3575e-14;SPV=0.68133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:10,11:7,8 0/1:.:32:16,16:6,8:10,8 | |
| 41358 chr22 48488045 . T A . PASS DP=50;SS=1;SSC=11;GPV=2.3219e-25;SPV=0.078571 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,13:0,15 1/1:.:22:3,19:1,6:2,13 | |
| 41359 chr22 48488785 . A G . PASS DP=94;SS=1;SSC=3;GPV=9.8683e-19;SPV=0.48771 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:9,19:18,8 0/1:.:40:19,21:11,13:8,8 | |
| 41360 chr22 48489207 . A C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,23:0,19 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 | |
| 41361 chr22 48489240 . T C . PASS DP=76;SS=1;SSC=9;GPV=6.7529e-11;SPV=0.10785 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:26,11:11,6:15,5 0/1:.:39:21,18:9,8:12,10 | |
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| 41420 chr22 48514793 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,31:0,26 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 41421 chr22 48514843 . T C . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,29:0,27 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
| 41422 chr22 48515084 . G A . PASS DP=51;SS=1;SSC=5;GPV=2.1741e-05;SPV=0.26504 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:20:16,4:6,0:10,4 0/1:.:31:21,10:8,4:13,6 | |
| 41423 chr22 48515446 . G T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 1/1:.:42:0,42:0,21:0,21 | |
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| 41429 chr22 48517374 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,26:0,17 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 | |
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| 41431 chr22 48518717 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,25:0,29 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
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| 41482 chr22 48555125 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 | |
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| 41487 chr22 48556854 . A G . PASS DP=109;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,27:0,34 1/1:.:48:0,48:0,24:0,24 | |
| 41488 chr22 48557389 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,24:0,17 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
| 41489 chr22 48557689 . T C . PASS DP=107;SS=1;SSC=2;GPV=0;SPV=0.56075 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:1,59:0,36:1,23 1/1:.:47:0,47:0,21:0,26 | |
| 41490 chr22 48558550 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:33:0,33:0,24:0,9 | |
| 41491 chr22 48560372 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=6.58e-14;SPV=0.94126 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:12,13:8,10 0/1:.:34:21,13:16,6:5,7 | |
| 41492 chr22 48561534 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 1/1:.:33:0,33:0,21:0,12 | |
| 41493 chr22 48562184 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,29:0,20 1/1:.:36:0,36:0,22:0,14 | |
| 41494 chr22 48562276 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,28:0,21 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 | |
| 41495 chr22 48562384 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,24:0,32 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 | |
| 41496 chr22 48563176 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,24:0,26 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 | |
| 41497 chr22 48563280 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=7;GPV=7.2639e-16;SPV=0.17752 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:30,23:17,14:13,9 0/1:.:32:14,18:9,12:5,6 | |
| 41498 chr22 48563454 . T C . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,32:0,29 1/1:.:35:0,35:0,19:0,16 | |
| 41499 chr22 48563491 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:64:0,64:0,31:0,33 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 | |
| 41500 chr22 48572626 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=5.0108e-11;SPV=0.77662 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:6,4:16,13 0/1:.:32:20,12:5,5:15,7 | |
| 41501 chr22 48574296 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=2.8183e-16;SPV=0.5016 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:22,24:11,13:11,11 0/1:.:31:14,17:8,9:6,8 | |
| 41502 chr22 48577915 . C A . PASS DP=93;SS=1;SSC=4;GPV=1.5052e-15;SPV=0.33833 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:35,25:21,15:14,10 0/1:.:33:17,16:13,9:4,7 | |
| 41503 chr22 48578861 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=2.7815e-13;SPV=0.62592 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:12,13:13,6 0/1:.:39:22,16:9,12:13,4 | |
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| 41554 chr22 48604232 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=4.4296e-19;SPV=0.71455 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:13,15:8,12 0/1:.:40:19,21:6,11:13,10 | |
| 41555 chr22 48604617 . G C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,25:0,17 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 | |
| 41556 chr22 48606100 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=2;GPV=2.4531e-16;SPV=0.62662 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:11,14:10,11 0/1:.:30:14,16:11,8:3,8 | |
| 41557 chr22 48607282 . G T . PASS DP=51;SS=1;SSC=1;GPV=2.4191e-07;SPV=0.68087 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:16,10:5,4:11,6 0/1:.:25:16,9:7,3:9,6 | |
| 41558 chr22 48607517 . C G . PASS DP=48;SS=1;SSC=4;GPV=2.8521e-08;SPV=0.37761 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:19,13:13,9:6,4 0/1:.:16:8,8:5,2:3,6 | |
| 41559 chr22 48608062 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
| 41560 chr22 48608124 . C A . PASS DP=65;SS=1;SSC=3;GPV=2.4148e-10;SPV=0.47487 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:24,16:14,3:10,13 0/1:.:25:14,11:6,4:8,7 | |
| 41561 chr22 48608692 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=9;GPV=1.5391e-12;SPV=0.11953 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:29,16:18,7:11,9 0/1:.:33:16,17:8,10:8,7 | |
| 41562 chr22 48608889 . C G . PASS DP=81;SS=1;SSC=3;GPV=2.581e-13;SPV=0.40855 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:26,18:13,8:13,10 0/1:.:37:20,17:9,7:11,10 | |
| 41563 chr22 48608967 . C G . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=3.2981e-15;SPV=0.63256 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:11,10:9,10 0/1:.:39:20,19:11,12:9,7 | |
| 41564 chr22 48609639 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,36:0,21 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 | |
| 41565 chr22 48609918 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=1.5502e-15;SPV=0.93513 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:26,30:9,12:17,18 0/1:.:26:16,10:8,5:8,5 | |
| 41566 chr22 48610302 . G C . PASS DP=92;SS=1;SSC=3;GPV=2.4857e-19;SPV=0.48921 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:9,14:14,11 0/1:.:44:20,24:15,16:5,8 | |
| 41567 chr22 48610453 . A G . PASS DP=111;SS=1;SSC=0;GPV=2.8575e-20;SPV=0.92923 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:28,32:14,13:14,19 0/1:.:51:30,21:16,13:14,8 | |
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| 41569 chr22 48610873 . G A . PASS DP=94;SS=1;SSC=4;GPV=1.2101e-14;SPV=0.36037 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:37,24:15,13:22,11 0/1:.:33:18,15:12,6:6,9 | |
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| 41621 chr22 48632368 . C A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,17:0,23 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 41622 chr22 48632756 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,15:0,31 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 41623 chr22 48633773 . A T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=3.104e-14;SPV=0.88028 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:17,22:6,11:11,11 0/1:.:31:17,14:7,9:10,5 | |
| 41624 chr22 48634262 . A T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,15:0,25 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 41625 chr22 48634267 . C G . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,19:0,25 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 41626 chr22 48634506 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=0.00031486;SPV=0.67013 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:30,6:15,3:15,3 0/1:.:32:27,5:16,2:11,3 | |
| 41627 chr22 48635006 . G T . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 1/1:.:49:0,49:0,25:0,24 | |
| 41628 chr22 48635019 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:52:0,52:0,27:0,25 | |
| 41629 chr22 48635359 . A G . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,47:0,29:0,18 1/1:.:43:0,43:0,21:0,22 | |
| 41630 chr22 48635422 . C T . PASS DP=98;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,27:0,26 1/1:.:45:0,45:0,20:0,25 | |
| 41631 chr22 48635557 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,30:0,25 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
| 41632 chr22 48635970 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 1/1:.:34:0,34:0,23:0,11 | |
| 41633 chr22 48635971 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 | |
| 41634 chr22 48637395 . T C . PASS DP=117;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:66:0,66:0,32:0,34 1/1:.:51:0,51:0,27:0,24 | |
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| 41637 chr22 48638172 . A C . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 1/1:.:25:0,25:0,9:0,16 | |
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| 41670 chr22 48650810 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=7;GPV=4.0594e-37;SPV=0.17823 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 1/1:.:29:2,27:0,18:2,9 | |
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| 41694 chr22 48657527 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,27:0,24 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 | |
| 41695 chr22 48657624 . T G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,21:0,17 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 41696 chr22 48657717 . G C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:39:0,39:0,22:0,17 | |
| 41697 chr22 48657882 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,13:0,28 1/1:.:36:0,36:0,12:0,24 | |
| 41698 chr22 48658237 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,25:0,2 1/1:.:19:0,19:0,18:0,1 | |
| 41699 chr22 48658690 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,28:0,21 1/1:.:44:0,44:0,17:0,27 | |
| 41700 chr22 48658751 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,22:0,20 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 | |
| 41701 chr22 48658782 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 | |
| 41702 chr22 48658932 . G T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,25:0,21 1/1:.:31:0,31:0,20:0,11 | |
| 41703 chr22 48659743 . T A . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 | |
| 41704 chr22 48660012 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,24:0,16 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 | |
| 41705 chr22 48660193 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
| 41706 chr22 48660226 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,24:0,14 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 | |
| 41707 chr22 48660264 . G T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,21:0,13 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 | |
| 41708 chr22 48660364 . C A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,15:0,27 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 | |
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| 41710 chr22 48660744 . C T . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:24:0,24:0,5:0,19 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
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| 41758 chr22 48677380 . G T . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:64:0,64:0,35:0,29 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 | |
| 41759 chr22 48678048 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=4;GPV=1.7418e-16;SPV=0.31792 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:9,9:15,9 0/1:.:50:25,25:13,15:12,10 | |
| 41760 chr22 48678265 . G A . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,32:0,24 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 | |
| 41761 chr22 48678374 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,28:0,20 1/1:.:42:0,42:0,19:0,23 | |
| 41762 chr22 48680600 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=2;GPV=3.3945e-16;SPV=0.61604 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:27,25:13,13:14,12 0/1:.:36:19,17:9,8:10,9 | |
| 41763 chr22 48680956 . C T . PASS DP=97;SS=1;SSC=1;GPV=4.11e-18;SPV=0.65388 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:31,30:16,9:15,21 0/1:.:36:19,17:8,8:11,9 | |
| 41764 chr22 48681301 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=3;GPV=1.2823e-13;SPV=0.48523 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:15,11:9,10 0/1:.:28:14,14:6,7:8,7 | |
| 41765 chr22 48681989 . C A . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,29:0,20 1/1:.:29:0,29:0,11:0,18 | |
| 41766 chr22 48682386 . T C . PASS DP=89;SS=1;SSC=4;GPV=1.6693e-13;SPV=0.39091 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:38,24:17,12:21,12 0/1:.:27:15,12:5,4:10,8 | |
| 41767 chr22 48682689 . G C . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=5.8009e-12;SPV=0.54329 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:19,15:7,6:12,9 0/1:.:35:19,16:12,11:7,5 | |
| 41768 chr22 48683764 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=3;GPV=1.1491e-11;SPV=0.43178 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:8,8:7,7 0/1:.:25:11,14:9,9:2,5 | |
| 41769 chr22 48684215 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,26:0,26 1/1:.:16:0,16:0,9:0,7 | |
| 41770 chr22 48684555 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,20:0,14 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 | |
| 41771 chr22 48684646 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,14:0,26 1/1:.:33:0,33:0,23:0,10 | |
| 41772 chr22 48684726 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,20:0,26 1/1:.:37:0,37:0,27:0,10 | |
| 41773 chr22 48684963 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,26:0,15 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 | |
| 41774 chr22 48685333 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,19:0,29 1/1:.:42:0,42:0,14:0,28 | |
| 41775 chr22 48685653 . T A . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,18:0,11 1/1:.:21:0,21:0,9:0,12 | |
| 41776 chr22 48687848 . T C . PASS DP=58;SS=1;SSC=1;GPV=4.8441e-11;SPV=0.71048 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:16,16:8,4:8,12 0/1:.:26:14,12:6,5:8,7 | |
| 41777 chr22 48688075 . T C . PASS DP=44;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,16:0,7 1/1:.:21:0,21:0,9:0,12 | |
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| 41779 chr22 48689013 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=0;GPV=2.5408e-07;SPV=0.9536 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,14:7,4:11,10 0/1:.:23:15,5:6,2:9,3 | |
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| 41837 chr22 48706971 . C A . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:62:0,62:0,39:0,23 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
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| 41845 chr22 48708680 . C T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 1/1:.:29:0,29:0,13:0,16 | |
| 41846 chr22 48709153 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,26:0,29 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 | |
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| 41894 chr22 48731671 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=4;GPV=5.3252e-12;SPV=0.36192 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:17,12:8,7:9,5 0/1:.:39:20,19:9,12:11,7 | |
| 41895 chr22 48733073 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=4;GPV=1.8728e-19;SPV=0.39434 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:23,25:10,13:13,12 0/1:.:42:18,24:9,15:9,9 | |
| 41896 chr22 48733430 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=2.4039e-14;SPV=0.68133 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:7,12:9,7 0/1:.:33:16,17:8,5:8,12 | |
| 41897 chr22 48733941 . A C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.9668e-14;SPV=0.98061 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:13,23:7,10:6,13 0/1:.:29:17,12:10,5:7,7 | |
| 41898 chr22 48734154 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=2.2536e-12;SPV=0.92824 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:12,13:5,6 0/1:.:34:21,13:9,6:12,7 | |
| 41899 chr22 48734165 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=4;GPV=3.0367e-13;SPV=0.36998 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:14,11:7,6 0/1:.:33:16,17:7,8:9,9 | |
| 41900 chr22 48734524 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=2.3067e-17;SPV=0.79963 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:29,30:14,11:15,19 0/1:.:34:19,15:11,5:8,10 | |
| 41901 chr22 48736472 . C T . PASS DP=38;SS=1;SSC=3;GPV=5.6582e-21;SPV=0.47368 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,17:0,3 1/1:.:18:1,17:1,12:0,5 | |
| 41902 chr22 48736643 . T A . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=6.9925e-15;SPV=0.98101 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:16,24:8,16:8,8 0/1:.:36:22,14:13,8:9,6 | |
| 41903 chr22 48736817 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=4.5064e-15;SPV=0.92052 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:8,9:14,16 0/1:.:35:21,14:9,8:12,6 | |
| 41904 chr22 48737334 . C T . PASS DP=96;SS=1;SSC=7;GPV=1.383e-14;SPV=0.17144 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:36,20:24,10:12,10 0/1:.:40:21,19:13,9:8,10 | |
| 41905 chr22 48737838 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=1;GPV=9.8683e-19;SPV=0.64279 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:30,32:19,18:11,14 0/1:.:32:16,16:9,6:7,10 | |
| 41906 chr22 48739358 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.4154e-13;SPV=0.96873 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:10,17:12,9 0/1:.:26:17,9:7,7:10,2 | |
| 41907 chr22 48740630 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=6;GPV=2.3391e-18;SPV=0.2435 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:30,27:16,16:14,11 0/1:.:35:15,20:6,10:9,10 | |
| 41908 chr22 48742890 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=3;GPV=1.3596e-16;SPV=0.4867 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:13,18:8,4 0/1:.:37:17,20:12,10:5,10 | |
| 41909 chr22 48743119 . T A . PASS DP=113;SS=1;SSC=5;GPV=4.1389e-21;SPV=0.26765 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:66:36,30:26,13:10,17 0/1:.:47:22,25:9,16:13,9 | |
| 41910 chr22 48745249 . G T . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=1.0403e-12;SPV=0.67596 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:8,8:14,11 0/1:.:32:18,14:5,6:13,8 | |
| 41911 chr22 48745897 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=10;GPV=8.3706e-15;SPV=0.092543 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:30,17:13,7:17,10 0/1:.:42:20,22:14,9:6,13 | |
| 41912 chr22 48746660 . C G . PASS DP=123;SS=1;SSC=2;GPV=1.3409e-21;SPV=0.5411 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:76:41,35:24,24:17,11 0/1:.:47:25,22:12,14:13,8 | |
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| 41914 chr22 48750131 . G A . PASS DP=109;SS=1;SSC=2;GPV=8.8646e-17;SPV=0.6031 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:38,27:24,18:14,9 0/1:.:44:26,18:19,7:7,11 | |
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| 41961 chr22 48776112 . G C . PASS DP=61;SS=1;SSC=5;GPV=6.4366e-11;SPV=0.28355 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:20,14:9,10:11,4 0/1:.:27:13,14:6,6:7,8 | |
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| 41964 chr22 48777262 . A C . PASS DP=50;SS=1;SSC=2;GPV=1.2624e-13;SPV=0.55249 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:10,17:2,9:8,8 0/1:.:23:8,15:1,7:7,8 | |
| 41965 chr22 48777622 . C T . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=6.5868e-13;SPV=0.59289 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:12,10:5,10 0/1:.:22:10,12:5,4:5,8 | |
| 41966 chr22 48777645 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 1/1:.:23:0,23:0,8:0,15 | |
| 41967 chr22 48777803 . C T . PASS DP=34;SS=1;SSC=0;GPV=3.5146e-20;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,17:0,3 1/1:.:14:0,14:0,10:0,4 | |
| 41968 chr22 48778397 . C A . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.2435e-09;SPV=0.91239 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:16,15:9,7:7,8 0/1:.:29:19,10:9,3:10,7 | |
| 41969 chr22 48778951 . G T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=2.5839e-09;SPV=0.79526 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:22,13:12,8:10,5 0/1:.:39:27,12:13,10:14,2 | |
| 41970 chr22 48779197 . A G . PASS DP=95;SS=1;SSC=1;GPV=9.7369e-18;SPV=0.77121 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:19,20:6,6 0/1:.:44:24,20:16,12:8,8 | |
| 41971 chr22 48780096 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=15;GPV=1;SPV=0.026322 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:29,17:14,8:15,9 0/1:.:38:15,23:4,8:11,15 | |
| 41972 chr22 48780408 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=2.6276e-20;SPV=0.45031 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:19,29:13,16:6,13 0/1:.:31:11,20:2,11:9,9 | |
| 41973 chr22 48781165 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=0;GPV=2.5602e-33;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,15:0,24 1/1:.:17:0,17:0,6:0,11 | |
| 41974 chr22 48781776 . C T . PASS DP=114;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,24:0,37 1/1:.:53:0,53:0,20:0,33 | |
| 41975 chr22 48782499 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,30:0,14 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 41976 chr22 48784643 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,24:0,19 1/1:.:38:0,38:0,13:0,25 | |
| 41977 chr22 48784723 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,28:0,22 1/1:.:34:0,33:0,22:0,11 | |
| 41978 chr22 48785103 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=4;GPV=1.4203e-17;SPV=0.33734 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:7,10:10,11 0/1:.:35:13,22:9,11:4,11 | |
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| 42100 chr22 48838252 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,23:0,20 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 42101 chr22 48838436 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,27:0,22 1/1:.:34:0,34:0,19:0,15 | |
| 42102 chr22 48838459 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,29:0,20 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 42103 chr22 48838877 . G A . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=2.7774e-19;SPV=0.85305 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:29,32:17,19:12,13 0/1:.:41:23,18:9,8:14,10 | |
| 42104 chr22 48839484 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=5;GPV=3.3945e-16;SPV=0.26113 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:12,9:13,10 0/1:.:44:21,23:13,11:8,12 | |
| 42105 chr22 48839781 . G T . PASS DP=89;SS=1;SSC=4;GPV=5.1181e-19;SPV=0.35914 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:23,24:11,14:12,10 0/1:.:42:18,24:7,9:11,15 | |
| 42106 chr22 48841119 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=5.857e-18;SPV=0.69927 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:21,27:11,12:10,15 0/1:.:34:16,18:6,10:10,8 | |
| 42107 chr22 48841294 . T A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=2.1236e-16;SPV=0.91082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:19,28:11,6:8,22 0/1:.:28:15,13:12,6:3,7 | |
| 42108 chr22 48841486 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=3;GPV=1.3596e-16;SPV=0.49558 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:9,13:11,8 0/1:.:39:18,21:9,7:9,14 | |
| 42109 chr22 48841886 . T C . PASS DP=81;SS=1;SSC=4;GPV=3.9974e-20;SPV=0.33484 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:20,27:12,18:8,9 0/1:.:34:12,22:7,13:5,9 | |
| 42110 chr22 48842099 . C T . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=1.0678e-21;SPV=0.96712 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:26,39:15,25:11,14 0/1:.:37:21,16:16,9:5,7 | |
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| 42112 chr22 48842406 . G A . PASS DP=99;SS=1;SSC=3;GPV=2.3502e-15;SPV=0.43981 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:72:43,29:18,19:25,10 0/1:.:27:15,12:8,6:7,6 | |
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| 42159 chr22 48860498 . A C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=0.0014447;SPV=0.79898 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:32,6:16,3:16,3 0/1:.:26:23,3:14,2:9,1 | |
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| 42161 chr22 48861509 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=5;GPV=7.4725e-14;SPV=0.26534 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:8,8:8,9 0/1:.:27:10,17:6,6:4,11 | |
| 42162 chr22 48861775 . G A . PASS DP=89;SS=1;SSC=10;GPV=3.7458e-16;SPV=0.097308 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:32,22:22,15:10,7 0/1:.:35:15,20:10,14:5,6 | |
| 42163 chr22 48862433 . A G . PASS DP=45;SS=1;SSC=0;GPV=2.6125e-09;SPV=0.99797 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:8,17:4,10:4,7 0/1:.:20:14,6:5,4:9,2 | |
| 42164 chr22 48862510 . A C . PASS DP=48;SS=1;SSC=2;GPV=2.1746e-16;SPV=0.56918 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:27:7,20:0,9:7,11 1/1:.:21:5,16:2,10:3,6 | |
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| 42166 chr22 48863033 . A G . PASS DP=56;SOMATIC;SS=2;SSC=10;GPV=1;SPV=0.082973 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/0:.:31:31,0:22,0:9,0 0/1:.:25:22,3:18,1:4,2 | |
| 42167 chr22 48863247 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=2;GPV=2.2978e-14;SPV=0.52556 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:29,21:20,13:9,8 0/1:.:39:22,17:16,13:6,4 | |
| 42168 chr22 48863916 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=5.7384e-17;SPV=0.70947 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:25,29:9,10:16,19 0/1:.:28:14,14:6,8:8,6 | |
| 42169 chr22 48864257 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,18:0,27 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 42170 chr22 48864371 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=6;GPV=1.7502e-16;SPV=0.24602 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:13,8:11,13 0/1:.:37:16,21:7,13:9,8 | |
| 42171 chr22 48864674 . A T . PASS DP=59;SS=1;SSC=2;GPV=4.2407e-10;SPV=0.5154 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:7,3:13,12 0/1:.:24:13,11:5,4:8,7 | |
| 42172 chr22 48865110 . C G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 42173 chr22 48865473 . C A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=3.5003e-14;SPV=0.79467 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:18,21:6,7:12,14 0/1:.:32:17,15:7,9:10,6 | |
| 42174 chr22 48865594 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=8;GPV=8.5945e-18;SPV=0.15039 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:22,23:12,12:10,11 0/1:.:32:11,21:4,8:7,13 | |
| 42175 chr22 48865827 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=1;GPV=3.1677e-14;SPV=0.6495 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:9,10:6,10 0/1:.:27:12,15:7,8:5,7 | |
| 42176 chr22 48866191 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=1.5193e-08;SPV=0.7291 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:26,13:13,5:13,8 0/1:.:34:24,10:10,6:14,4 | |
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| 42178 chr22 48867296 . G A . PASS DP=109;SS=1;SSC=5;GPV=2.651e-25;SPV=0.26691 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:27,32:14,13:13,19 0/1:.:50:19,31:11,18:8,13 | |
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| 42237 chr22 48897116 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=2.1215e-17;SPV=0.66458 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:24,28:7,17:17,11 0/1:.:31:15,16:6,6:9,10 | |
| 42238 chr22 48897283 . G C . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,25:0,26 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 | |
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| 42240 chr22 48898393 . A G . PASS DP=88;SS=1;SSC=1;GPV=3.9427e-17;SPV=0.74215 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:25,27:15,10:10,17 0/1:.:36:19,17:10,9:9,8 | |
| 42241 chr22 48898977 . A T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=7.2383e-18;SPV=0.82983 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:17,27:11,10:6,17 0/1:.:32:15,17:9,14:6,3 | |
| 42242 chr22 48899896 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=4;GPV=1.2446e-15;SPV=0.32331 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:7,7:19,16 0/1:.:31:14,17:9,7:5,10 | |
| 42243 chr22 48901301 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=5.2318e-13;SPV=0.68858 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:16,17:6,12:10,5 0/1:.:33:17,16:12,12:5,4 | |
| 42244 chr22 48901516 . G A . PASS DP=101;SS=1;SSC=1;GPV=8.35e-20;SPV=0.75494 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:26,29:19,17:7,12 0/1:.:46:24,22:14,14:10,8 | |
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| 42302 chr22 48935661 . C T . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,17:0,13 1/1:.:22:0,22:0,13:0,9 | |
| 42303 chr22 48935730 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=7.7752e-12;SPV=0.66561 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:13,10:6,9 0/1:.:23:12,11:7,5:5,6 | |
| 42304 chr22 48935811 . A G . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.554e-28;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:27:0,27:0,18:0,9 1/1:.:21:0,21:0,9:0,12 | |
| 42305 chr22 48936155 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
| 42306 chr22 48936305 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 | |
| 42307 chr22 48936377 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
| 42308 chr22 48936757 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,20:0,27 1/1:.:26:0,26:0,10:0,16 | |
| 42309 chr22 48937315 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,20:0,20 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
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| 42311 chr22 48937549 . T C . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 | |
| 42312 chr22 48938128 . A G . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 1/1:.:22:0,22:0,10:0,12 | |
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| 42314 chr22 48938253 . A G . PASS DP=46;SS=1;SSC=0;GPV=2.4343e-27;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,14:0,14 1/1:.:18:0,18:0,13:0,5 | |
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| 42366 chr22 48957662 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,28:0,20 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
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| 42369 chr22 48958619 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=3.2317e-11;SPV=0.84225 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:19,18:9,9:10,9 0/1:.:28:17,11:9,6:8,5 | |
| 42370 chr22 48959634 . T C . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.1052e-12;SPV=0.91667 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:14,19:4,10:10,9 0/1:.:30:17,13:9,3:8,10 | |
| 42371 chr22 48959761 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=3.4211e-15;SPV=0.3357 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:7,11:10,10 0/1:.:25:9,16:3,3:6,13 | |
| 42372 chr22 48960117 . T A . PASS DP=33;SS=1;SSC=2;GPV=0.01219;SPV=0.60505 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:19,4:12,0:7,4 0/1:.:10:8,2:1,1:7,1 | |
| 42373 chr22 48960600 . C T . PASS DP=43;SS=1;SSC=1;GPV=1.0581e-06;SPV=0.78102 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:15,11:9,5:6,6 0/1:.:17:11,6:6,2:5,4 | |
| 42374 chr22 48960826 . C A . PASS DP=54;SS=1;SSC=1;GPV=1.0051e-11;SPV=0.76735 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:14,18:7,8:7,10 0/1:.:22:11,11:5,5:6,6 | |
| 42375 chr22 48961104 . G T . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=3.2729e-17;SPV=0.42505 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:15,17:7,8 0/1:.:31:13,18:9,10:4,8 | |
| 42376 chr22 48961736 . G C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,27:0,12 1/1:.:30:0,30:0,20:0,10 | |
| 42377 chr22 48962115 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 1/1:.:21:0,21:0,13:0,8 | |
| 42378 chr22 48962124 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=9;GPV=2.6199e-12;SPV=0.11346 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:21,16:9,6:12,10 0/1:.:24:9,15:7,9:2,6 | |
| 42379 chr22 48962480 . T A . PASS DP=58;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.049283 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:28:20,8:10,6:10,2 0/1:.:30:14,16:8,8:6,8 | |
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| 42498 chr22 49020130 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=2.6374e-16;SPV=0.80522 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:16,25:9,13:7,12 0/1:.:28:13,15:7,9:6,6 | |
| 42499 chr22 49020251 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=3;GPV=2.1236e-16;SPV=0.48174 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:21,24:9,8:12,16 0/1:.:30:13,17:3,5:10,12 | |
| 42500 chr22 49020882 . A T . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=0.0024562;SPV=0.7973 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,5:6,2:8,3 0/1:.:25:12,3:9,1:3,2 | |
| 42501 chr22 49021039 . G C . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=9.8526e-22;SPV=0.82175 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:20,31:15,20:5,11 0/1:.:43:20,23:16,15:4,8 | |
| 42502 chr22 49024363 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=3.0374e-14;SPV=0.88746 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:14,13:15,11 0/1:.:40:26,14:14,10:12,4 | |
| 42503 chr22 49025216 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=1;GPV=8.5867e-14;SPV=0.7339 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:33,23:17,13:16,10 0/1:.:38:24,14:12,5:12,9 | |
| 42504 chr22 49025569 . C A . PASS DP=99;SS=1;SSC=6;GPV=8.6823e-16;SPV=0.2265 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:34,21:20,12:14,9 0/1:.:44:23,21:13,12:10,9 | |
| 42505 chr22 49025737 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=9.3487e-14;SPV=0.8527 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:26,24:11,15:15,9 0/1:.:31:19,12:14,8:5,4 | |
| 42506 chr22 49026451 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=4;GPV=1.0404e-13;SPV=0.3683 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:17,12:7,9 0/1:.:26:12,14:3,9:9,5 | |
| 42507 chr22 49026812 . G T . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=3.2734e-15;SPV=0.85559 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:12,13:11,9 0/1:.:45:27,18:19,11:8,7 | |
| 42508 chr22 49027261 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=6;GPV=7.3611e-17;SPV=0.22884 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:31,23:18,12:13,11 0/1:.:40:19,21:7,13:12,8 | |
| 42509 chr22 49027474 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=6.8178e-12;SPV=0.90947 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:10,10:12,11 0/1:.:28:18,10:10,7:8,3 | |
| 42510 chr22 49027475 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=7.191e-13;SPV=0.9859 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:18,24:9,11:9,13 0/1:.:27:18,9:9,6:9,3 | |
| 42511 chr22 49027730 . G A . PASS DP=93;SS=1;SSC=2;GPV=6.6848e-17;SPV=0.56132 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:27,24:10,16:17,8 0/1:.:42:22,20:8,8:14,12 | |
| 42512 chr22 49028178 . G T . PASS DP=92;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.037446 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:27,23:15,11:12,12 0/1:.:42:14,28:7,9:7,19 | |
| 42513 chr22 49030035 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=1.1758e-13;SPV=0.62214 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:16,19:9,10:7,9 0/1:.:28:13,15:6,8:7,7 | |
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| 42515 chr22 49030440 . A G . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=5.4249e-12;SPV=0.91765 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:9,17:3,9:6,8 0/1:.:24:12,12:4,8:8,4 | |
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| 42566 chr22 49052888 . G C . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=3.0367e-13;SPV=0.76757 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:9,13:14,10 0/1:.:25:14,11:7,6:7,5 | |
| 42567 chr22 49053475 . C G . PASS DP=64;SS=1;SSC=3;GPV=1.3489e-13;SPV=0.4688 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:18,19:6,10:12,9 0/1:.:27:12,15:3,8:9,7 | |
| 42568 chr22 49053478 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=1.8765e-12;SPV=0.7249 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:12,6:9,14 0/1:.:27:15,12:7,4:8,8 | |
| 42569 chr22 49053806 . T G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 | |
| 42570 chr22 49054254 . T G . PASS DP=63;SS=1;SSC=1;GPV=3.2811e-12;SPV=0.65123 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:9,10:8,7 0/1:.:29:15,14:4,6:11,8 | |
| 42571 chr22 49054319 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=1;GPV=2.4039e-14;SPV=0.75838 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:8,11:8,9 0/1:.:32:16,16:8,9:8,7 | |
| 42572 chr22 49055083 . A G . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=2.38e-11;SPV=0.98561 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:10,19:6,10:4,9 0/1:.:23:14,9:6,6:8,3 | |
| 42573 chr22 49056296 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=1.6064e-11;SPV=0.79578 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:22,19:18,13:4,6 0/1:.:28:17,11:6,5:11,6 | |
| 42574 chr22 49057816 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=1.6516e-12;SPV=0.65555 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:27,20:10,8:17,12 0/1:.:32:19,13:10,7:9,6 | |
| 42575 chr22 49058005 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=5;GPV=5.2491e-17;SPV=0.25654 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:8,11:7,8 0/1:.:33:11,22:6,15:5,7 | |
| 42576 chr22 49058936 . C G . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=9.8334e-16;SPV=0.58514 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:12,7:8,14 0/1:.:37:18,19:6,10:12,9 | |
| 42577 chr22 49060158 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=5;GPV=2.8183e-16;SPV=0.30115 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:18,17:10,6:8,11 0/1:.:42:18,24:6,10:12,14 | |
| 42578 chr22 49060910 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=8.6008e-14;SPV=0.97207 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:7,11:8,8 0/1:.:46:29,17:15,6:14,11 | |
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| 42632 chr22 49083146 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,10:0,25 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 42633 chr22 49084771 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=9.4559e-19;SPV=0.67809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:18,31:7,18:11,13 0/1:.:23:9,14:4,8:5,6 | |
| 42634 chr22 49085046 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=3;GPV=1.4855e-11;SPV=0.42658 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:14,13:12,6 0/1:.:23:12,11:6,5:6,6 | |
| 42635 chr22 49085912 . T C . PASS DP=105;SS=1;SSC=0;GPV=1.6516e-22;SPV=0.90652 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:26,37:13,19:13,18 0/1:.:42:22,20:12,10:10,10 | |
| 42636 chr22 49086107 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,27:0,25 1/1:.:32:0,32:0,13:0,19 | |
| 42637 chr22 49086117 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=4;GPV=3.6641e-16;SPV=0.32471 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:8,18:18,7 0/1:.:28:12,16:3,8:9,8 | |
| 42638 chr22 49086596 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=3;GPV=3.0665e-16;SPV=0.46742 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:13,10:12,12 0/1:.:40:20,20:8,11:12,9 | |
| 42639 chr22 49087052 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,15:0,27 1/1:.:30:0,30:0,13:0,17 | |
| 42640 chr22 49087108 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=2.4772e-18;SPV=0.82801 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:21,29:9,14:12,15 0/1:.:34:17,17:10,12:7,5 | |
| 42641 chr22 49087426 . G C . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,25:0,21 1/1:.:32:0,32:0,10:0,22 | |
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| 42643 chr22 49089118 . C G . PASS DP=72;SS=1;SSC=4;GPV=7.3585e-12;SPV=0.35549 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:28,19:15,7:13,12 0/1:.:25:13,12:6,5:7,7 | |
| 42644 chr22 49089430 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=2;GPV=3.7814e-18;SPV=0.56541 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:27,30:17,14:10,16 0/1:.:31:14,16:8,10:6,6 | |
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| 42693 chr22 49111279 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=3;GPV=1.1034e-11;SPV=0.42767 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:28,17:17,11:11,6 0/1:.:33:19,14:11,7:8,7 | |
| 42694 chr22 49111370 . C T . PASS DP=75;SS=1;SSC=6;GPV=9.1061e-12;SPV=0.20027 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:24,13:9,5:15,8 0/1:.:38:20,18:10,8:10,10 | |
| 42695 chr22 49111453 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=2.581e-13;SPV=0.70531 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:8,8:18,13 0/1:.:34:20,14:11,8:9,6 | |
| 42696 chr22 49111710 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=7;GPV=1.5013e-16;SPV=0.16993 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:7,10:8,7 0/1:.:34:11,23:4,10:7,13 | |
| 42697 chr22 49111808 . G A . PASS DP=63;SS=1;SSC=3;GPV=7.6248e-11;SPV=0.46616 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:8,8:11,6 0/1:.:30:16,14:6,6:10,8 | |
| 42698 chr22 49111981 . A G . PASS DP=61;SS=1;SSC=3;GPV=8.7556e-14;SPV=0.45458 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:14,16:10,8:4,8 0/1:.:31:13,18:6,11:7,7 | |
| 42699 chr22 49112077 . C G . PASS DP=87;SS=1;SSC=3;GPV=1.9732e-14;SPV=0.49473 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:27,20:17,9:10,11 0/1:.:40:22,18:14,7:8,11 | |
| 42700 chr22 49112166 . A C . PASS DP=82;SS=1;SSC=4;GPV=5.5558e-19;SPV=0.32395 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:12,14:10,12 0/1:.:34:13,21:6,10:7,11 | |
| 42701 chr22 49112369 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=6;GPV=2.8662e-18;SPV=0.21822 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:18,11:9,16 0/1:.:31:12,19:7,8:5,11 | |
| 42702 chr22 49112531 . A G . PASS DP=75;SS=1;SSC=2;GPV=6.2293e-15;SPV=0.54531 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:6,6:13,13 0/1:.:37:18,19:8,10:10,9 | |
| 42703 chr22 49112655 . G C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=3.104e-14;SPV=0.88217 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:21,26:14,16:7,10 0/1:.:23:13,10:8,7:5,3 | |
| 42704 chr22 49112711 . A C . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,28:0,15 1/1:.:23:0,23:0,11:0,12 | |
| 42705 chr22 49112780 . G C . PASS DP=71;SS=1;SSC=5;GPV=3.5003e-14;SPV=0.25849 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:24,21:11,15:13,6 0/1:.:26:11,15:3,6:8,9 | |
| 42706 chr22 49113720 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=4;GPV=9.1368e-20;SPV=0.3507 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:25,26:11,14:14,12 0/1:.:42:18,24:9,12:9,12 | |
| 42707 chr22 49113844 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,13:0,23 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 | |
| 42708 chr22 49114079 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,27:0,18 1/1:.:37:0,37:0,22:0,15 | |
| 42709 chr22 49114160 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=7.1095e-15;SPV=0.74728 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:14,11:12,12 0/1:.:38:22,16:8,3:14,13 | |
| 42710 chr22 49114456 . G C . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=3.673e-15;SPV=0.69197 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:18,16:6,8 0/1:.:32:17,15:11,9:6,6 | |
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| 42712 chr22 49114655 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=2.6279e-15;SPV=0.95826 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:20,27:8,12:12,15 0/1:.:30:18,12:9,4:9,8 | |
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| 42761 chr22 49134902 . G A . PASS DP=76;SS=1;SSC=3;GPV=2.0619e-14;SPV=0.48551 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:17,15:9,6:8,9 0/1:.:44:22,22:4,11:18,11 | |
| 42762 chr22 49135094 . T C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1534e-09;SPV=0.93424 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:24,18:16,11:8,7 0/1:.:22:16,6:10,2:6,4 | |
| 42763 chr22 49135684 . A T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,21:0,26 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 42764 chr22 49136319 . A G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=7.7158e-19;SPV=0.83521 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:19,28:5,16:14,12 0/1:.:37:18,19:6,4:12,15 | |
| 42765 chr22 49137003 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=2.1212e-20;SPV=0.93153 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:24,37:11,19:13,18 0/1:.:30:16,14:8,9:8,5 | |
| 42766 chr22 49137558 . A G . PASS DP=83;SS=1;SSC=6;GPV=5.8719e-16;SPV=0.22341 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:27,22:11,10:16,12 0/1:.:34:15,19:8,9:7,10 | |
| 42767 chr22 49138553 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=2;GPV=9.9942e-16;SPV=0.58082 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:16,24:9,8:7,16 0/1:.:23:9,14:4,9:5,5 | |
| 42768 chr22 49138572 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,18:0,25 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 42769 chr22 49138951 . T C . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=8.1517e-15;SPV=0.92336 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:10,23:5,10:5,13 0/1:.:22:10,12:7,7:3,5 | |
| 42770 chr22 49139381 . A C . PASS DP=88;SS=1;SSC=2;GPV=1.3142e-17;SPV=0.56884 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:26,27:17,16:9,11 0/1:.:35:17,18:9,6:8,12 | |
| 42771 chr22 49139475 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=1.1753e-14;SPV=0.87386 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:14,12:10,13 0/1:.:32:19,13:9,6:10,7 | |
| 42772 chr22 49139614 . G T . PASS DP=91;SS=1;SSC=4;GPV=1.5824e-16;SPV=0.37433 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:25,20:11,13:14,7 0/1:.:46:23,23:11,16:12,7 | |
| 42773 chr22 49139958 . G A . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=2.5559e-17;SPV=0.85564 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:24,26:11,11:13,15 0/1:.:44:25,19:11,11:14,8 | |
| 42774 chr22 49140665 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=3;GPV=1.1315e-12;SPV=0.47628 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:14,12:11,7 0/1:.:30:16,14:8,10:8,4 | |
| 42775 chr22 49140824 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=3.7958e-17;SPV=0.63722 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:23,28:15,13:8,15 0/1:.:28:13,15:5,6:8,9 | |
| 42776 chr22 49140951 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=1.9732e-14;SPV=0.65714 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:30,24:18,15:12,9 0/1:.:33:19,14:8,6:11,8 | |
| 42777 chr22 49141006 . A T . PASS DP=90;SS=1;SSC=8;GPV=4.1212e-16;SPV=0.13127 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:35,25:20,17:15,8 0/1:.:30:13,17:7,6:6,11 | |
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| 42835 chr22 49157736 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,19:0,25 1/1:.:35:0,35:0,20:0,15 | |
| 42836 chr22 49157911 . G C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=1.4357e-05;SPV=0.80794 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:32,9:17,3:15,6 0/1:.:36:30,6:12,5:18,1 | |
| 42837 chr22 49158345 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=1.19e-16;SPV=0.58302 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:10,14:13,12 0/1:.:30:14,16:8,9:6,7 | |
| 42838 chr22 49160085 . G C . PASS DP=91;SS=1;SSC=2;GPV=4.5213e-16;SPV=0.54501 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:25,21:12,11:13,10 0/1:.:45:24,21:10,5:14,16 | |
| 42839 chr22 49160189 . A T . PASS DP=91;SS=1;SSC=1;GPV=6.7391e-19;SPV=0.74451 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:24,29:16,18:8,11 0/1:.:38:19,19:7,11:12,8 | |
| 42840 chr22 49160190 . A T . PASS DP=92;SS=1;SSC=3;GPV=2.4857e-19;SPV=0.45629 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:26,28:17,18:9,10 0/1:.:38:17,21:7,12:10,9 | |
| 42841 chr22 49160635 . G C . PASS DP=37;SS=1;SSC=0;GPV=5.7269e-22;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:21:0,21:0,6:0,15 1/1:.:16:0,16:0,6:0,10 | |
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| 42906 chr22 49179668 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,28:0,15 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
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| 42973 chr22 49211554 . C T . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,10:0,30 1/1:.:37:0,37:0,14:0,23 | |
| 42974 chr22 49212242 . A T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 1/1:.:27:0,27:0,14:0,13 | |
| 42975 chr22 49212947 . G C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,22:0,25 1/1:.:40:0,40:0,16:0,24 | |
| 42976 chr22 49213195 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.7683e-12;SPV=0.8181 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:11,7:11,11 0/1:.:40:25,15:12,9:13,6 | |
| 42977 chr22 49213620 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=6;GPV=4.8717e-12;SPV=0.22988 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:13,9:11,8 0/1:.:26:12,14:8,7:4,7 | |
| 42978 chr22 49213894 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=9.3454e-17;SPV=0.98515 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:15,24:5,14:10,10 0/1:.:47:28,19:18,12:10,7 | |
| 42979 chr22 49213974 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=9;GPV=5.8719e-16;SPV=0.11183 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:15,10:8,6 0/1:.:44:19,25:13,15:6,10 | |
| 42980 chr22 49214231 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=2.0308e-13;SPV=0.55582 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:25,20:13,8:12,12 0/1:.:33:18,15:3,5:15,10 | |
| 42981 chr22 49214333 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=2.0941e-21;SPV=0.65581 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:21,34:7,23:14,11 0/1:.:30:12,18:5,9:7,9 | |
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| 43036 chr22 49230470 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 1/1:.:31:0,31:0,19:0,12 | |
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| 43039 chr22 49231199 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 | |
| 43040 chr22 49231483 . A G . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,23:0,24 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 | |
| 43041 chr22 49231535 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 1/1:.:34:0,34:0,15:0,19 | |
| 43042 chr22 49231745 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:39:0,39:0,17:0,22 | |
| 43043 chr22 49231924 . C G . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 | |
| 43044 chr22 49232002 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 1/1:.:31:0,31:0,22:0,9 | |
| 43045 chr22 49232073 . A T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 43046 chr22 49232666 . A T . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,19:0,27 1/1:.:35:0,35:0,12:0,23 | |
| 43047 chr22 49232834 . A G . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,50:0,25:0,25 1/1:.:41:0,41:0,22:0,19 | |
| 43048 chr22 49232927 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,21:0,23 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 43049 chr22 49233026 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 1/1:.:39:0,39:0,20:0,19 | |
| 43050 chr22 49233264 . G C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,24:0,24 1/1:.:36:0,36:0,12:0,24 | |
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| 43105 chr22 49253592 . T C . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 1/1:.:27:0,27:0,11:0,16 | |
| 43106 chr22 49253638 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,15:0,26 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 43107 chr22 49253798 . C T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,22:0,20 1/1:.:24:0,24:0,13:0,11 | |
| 43108 chr22 49254026 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,27:0,24 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 43109 chr22 49254231 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,24:0,27 1/1:.:20:0,20:0,16:0,4 | |
| 43110 chr22 49254887 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,24:0,21 1/1:.:27:0,27:0,15:0,12 | |
| 43111 chr22 49255176 . G C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,24:0,25 1/1:.:38:0,38:0,18:0,20 | |
| 43112 chr22 49255782 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,24:0,24 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
| 43113 chr22 49255851 . C T . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,26:0,27 1/1:.:42:0,42:0,25:0,17 | |
| 43114 chr22 49256011 . A C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,19:0,32 1/1:.:29:0,29:0,17:0,12 | |
| 43115 chr22 49256642 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 43116 chr22 49260408 . A G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,22:0,28 1/1:.:29:0,29:0,12:0,17 | |
| 43117 chr22 49261784 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,25:0,17 1/1:.:31:0,31:0,15:0,16 | |
| 43118 chr22 49262720 . T A . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=7.191e-13;SPV=0.85568 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:10,8:5,9 0/1:.:37:21,16:10,9:11,7 | |
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| 43173 chr22 49287332 . A G . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,29:0,17 1/1:.:31:0,31:0,23:0,8 | |
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| 43175 chr22 49287426 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,29:0,19 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 | |
| 43176 chr22 49288903 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 1/1:.:37:0,37:0,26:0,11 | |
| 43177 chr22 49288952 . T A . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,20:0,16 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
| 43178 chr22 49289012 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,22:0,16 1/1:.:44:0,44:0,17:0,27 | |
| 43179 chr22 49289193 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,24:0,12 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 | |
| 43180 chr22 49289314 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,23:0,26 1/1:.:41:0,41:0,20:0,21 | |
| 43181 chr22 49289529 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,21:0,14 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 | |
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| 43310 chr22 49342033 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=4;GPV=2.5259e-14;SPV=0.34125 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:24,19:12,9:12,10 0/1:.:35:17,18:11,8:6,10 | |
| 43311 chr22 49342433 . C A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.6624e-13;SPV=0.91313 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:15,20:7,12:8,8 0/1:.:30:17,13:7,7:10,6 | |
| 43312 chr22 49342548 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=1;GPV=3.6826e-13;SPV=0.74635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:12,14:9,6 0/1:.:32:18,14:5,9:13,5 | |
| 43313 chr22 49343277 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=12;GPV=9.5353e-13;SPV=0.054341 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:25,14:13,5:12,9 0/1:.:33:14,19:8,8:6,11 | |
| 43314 chr22 49343435 . C A . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=9.545e-12;SPV=0.99422 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:15,22:9,11:6,11 0/1:.:26:18,8:12,4:6,4 | |
| 43315 chr22 49343822 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=9;GPV=9.3121e-14;SPV=0.11581 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:21,15:10,9:11,6 0/1:.:34:14,20:5,14:9,6 | |
| 43316 chr22 49344191 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=5.7384e-17;SPV=0.86799 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:17,23:7,9:10,14 0/1:.:42:22,20:10,9:12,11 | |
| 43317 chr22 49344443 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,24:0,18 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 43318 chr22 49344459 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=3.7837e-11;SPV=0.92589 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:18,18:10,6:8,12 0/1:.:31:20,11:10,2:10,9 | |
| 43319 chr22 49344588 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,27:0,22 1/1:.:45:0,45:0,25:0,20 | |
| 43320 chr22 49344705 . G A . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,23:0,22 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 | |
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| 43322 chr22 49344821 . G A . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=4.1632e-19;SPV=0.99294 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:21,33:14,21:7,12 0/1:.:42:26,16:13,11:13,5 | |
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| 43370 chr22 49362628 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=3;GPV=8.2973e-14;SPV=0.44226 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:9,6:12,14 0/1:.:28:13,15:5,10:8,5 | |
| 43371 chr22 49362801 . A G . PASS DP=54;SS=1;SSC=0;GPV=4.0229e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,19:0,13 1/1:.:22:0,22:0,12:0,10 | |
| 43372 chr22 49363017 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=3;GPV=3.4721e-10;SPV=0.43475 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:25,14:18,8:7,6 0/1:.:32:19,13:13,11:6,2 | |
| 43373 chr22 49363238 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,13:0,24 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
| 43374 chr22 49363307 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=1.8765e-12;SPV=0.52847 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:21,18:11,7:10,11 0/1:.:29:15,14:6,7:9,7 | |
| 43375 chr22 49363384 . A T . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=4.9668e-14;SPV=0.87931 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:12,18:6,14:6,4 0/1:.:35:18,17:9,9:9,8 | |
| 43376 chr22 49363688 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=6;GPV=2.1215e-17;SPV=0.21887 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:13,11:9,9 0/1:.:41:17,24:11,12:6,12 | |
| 43377 chr22 49364488 . G C . PASS DP=43;SS=1;SSC=2;GPV=1.727e-05;SPV=0.50586 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:18,8:9,2:9,6 0/1:.:17:11,6:6,4:5,2 | |
| 43378 chr22 49365365 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=8;GPV=3.9615e-14;SPV=0.15531 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:31,20:18,9:13,11 0/1:.:32:15,17:8,8:7,9 | |
| 43379 chr22 49366319 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,27:0,21 1/1:.:40:0,40:0,24:0,16 | |
| 43380 chr22 49367146 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:52:0,52:0,30:0,22 1/1:.:30:0,30:0,16:0,14 | |
| 43381 chr22 49367173 . C T . PASS DP=91;SS=1;SSC=0;GPV=6.7391e-19;SPV=0.89945 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:24,32:13,15:11,17 0/1:.:35:19,16:7,5:12,11 | |
| 43382 chr22 49367771 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,17:0,26 1/1:.:25:0,25:0,12:0,13 | |
| 43383 chr22 49367924 . T C . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:23:0,23:0,15:0,8 1/1:.:29:0,29:0,19:0,10 | |
| 43384 chr22 49368160 . C T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=7.5695e-20;SPV=0.9635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:14,31:8,17:6,14 0/1:.:33:16,17:9,9:7,8 | |
| 43385 chr22 49368447 . C G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,29:0,17 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 43386 chr22 49368552 . A T . PASS DP=81;SS=1;SSC=6;GPV=9.3487e-14;SPV=0.22068 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:25,16:8,6:17,10 0/1:.:40:20,20:8,13:12,7 | |
| 43387 chr22 49368981 . T C . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,38:0,19 1/1:.:44:0,44:0,29:0,15 | |
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| 43389 chr22 49369243 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=5.8861e-19;SPV=0.99437 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:16,30:4,17:12,13 0/1:.:44:26,18:12,9:14,9 | |
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| 43444 chr22 49392843 . C A . PASS DP=80;SS=1;SSC=2;GPV=7.8903e-14;SPV=0.51456 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:26,21:13,17:13,4 0/1:.:33:17,15:12,8:5,7 | |
| 43445 chr22 49392977 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=2;GPV=1.0691e-15;SPV=0.59249 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:28,24:13,15:15,9 0/1:.:37:20,17:14,9:6,8 | |
| 43446 chr22 49393864 . A C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=1.4154e-13;SPV=0.92761 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:19,22:6,7:13,15 0/1:.:33:20,13:10,8:10,5 | |
| 43447 chr22 49395368 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=7.6319e-16;SPV=0.90605 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:11,12:8,14 0/1:.:31:17,14:8,8:9,6 | |
| 43448 chr22 49395825 . C T . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=7.3585e-12;SPV=0.77569 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:24,20:11,8:13,12 0/1:.:28:17,11:12,5:5,6 | |
| 43449 chr22 49396578 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=3;GPV=3.2999e-18;SPV=0.41451 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:21,22:6,13:15,9 0/1:.:43:19,24:8,17:11,7 | |
| 43450 chr22 49396641 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,18:0,29 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 | |
| 43451 chr22 49397296 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=2.2536e-12;SPV=0.98603 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:11,9:9,15 0/1:.:26:18,8:6,3:12,5 | |
| 43452 chr22 49397525 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=2.6699e-12;SPV=0.74857 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:14,12:9,8 0/1:.:29:17,12:7,7:10,5 | |
| 43453 chr22 49398187 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=2;GPV=4.1212e-16;SPV=0.62858 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:28,25:13,12:15,13 0/1:.:37:20,17:13,4:7,13 | |
| 43454 chr22 49398442 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 1/1:.:35:0,35:0,15:0,20 | |
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| 43513 chr22 49429433 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,21:0,27 1/1:.:45:0,45:0,26:0,19 | |
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| 43519 chr22 49432084 . C T . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=1.3979e-20;SPV=0.7192 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:16,27:8,18:8,9 0/1:.:39:16,23:8,12:8,11 | |
| 43520 chr22 49433379 . T C . PASS DP=34;SS=1;SSC=0;GPV=3.5146e-20;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,10:0,10 1/1:.:14:0,14:0,10:0,4 | |
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| 43583 chr22 49506365 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,14:0,22 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
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| 43589 chr22 49507510 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,20:0,18 1/1:.:30:0,30:0,18:0,12 | |
| 43590 chr22 49507762 . G T . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,27:0,17 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 | |
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| 43645 chr22 49532214 . C A . PASS DP=58;SS=1;SSC=0;GPV=1.6283e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,23:0,14 1/1:.:21:0,21:0,8:0,13 | |
| 43646 chr22 49532624 . A C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:40:0,40:0,26:0,14 | |
| 43647 chr22 49533318 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=6.6365e-15;SPV=0.61997 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:16,20:8,9:8,11 0/1:.:31:14,17:6,10:8,7 | |
| 43648 chr22 49533525 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 1/1:.:28:0,28:0,17:0,11 | |
| 43649 chr22 49533849 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=3;GPV=6.2293e-15;SPV=0.45924 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:17,16:10,11:7,5 0/1:.:42:20,22:10,12:10,10 | |
| 43650 chr22 49534067 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=8;GPV=1.374e-15;SPV=0.14013 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:4,9:18,11 0/1:.:30:11,19:7,9:4,10 | |
| 43651 chr22 49534369 . T C . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=5.5248e-15;SPV=0.99167 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:11,21:6,7:5,14 0/1:.:42:25,17:12,10:13,7 | |
| 43652 chr22 49534520 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=8;GPV=6.5425e-16;SPV=0.13631 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:18,13:6,4 0/1:.:43:19,24:17,13:2,11 | |
| 43653 chr22 49534739 . G A . PASS DP=97;SS=1;SSC=6;GPV=1.5531e-19;SPV=0.22901 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:28,25:17,14:11,11 0/1:.:44:19,25:7,10:12,15 | |
| 43654 chr22 49534873 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=3;GPV=9.7292e-12;SPV=0.5 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:23,15:15,6:8,9 0/1:.:38:22,16:11,7:11,9 | |
| 43655 chr22 49534940 . T G . PASS DP=79;SS=1;SSC=1;GPV=3.2342e-19;SPV=0.69426 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:16,25:8,11:8,14 0/1:.:38:16,22:9,12:7,10 | |
| 43656 chr22 49535197 . T G . PASS DP=77;SS=1;SSC=6;GPV=2.6279e-15;SPV=0.21302 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:11,8:10,9 0/1:.:39:17,22:8,14:9,8 | |
| 43657 chr22 49535666 . G A . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=7.1095e-15;SPV=0.73456 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:30,26:11,15:19,11 0/1:.:31:18,13:9,9:9,4 | |
| 43658 chr22 49535712 . T G . PASS DP=85;SS=1;SSC=12;GPV=8.9568e-18;SPV=0.0547 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:53:29,24:13,8:16,16 0/1:.:32:11,21:8,9:3,12 | |
| 43659 chr22 49536637 . A G . PASS DP=72;SS=3;SSC=15;GPV=1;SPV=0.030173 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:26,25:13,10:13,15 1/1:.:21:5,16:3,5:2,11 | |
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| 43661 chr22 49537487 . T C . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=5.2598e-09;SPV=0.95373 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:24,17:11,7:13,10 0/1:.:28:21,7:11,3:10,4 | |
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| 43722 chr22 49569460 . G A . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=1.1666e-20;SPV=0.80099 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:75:35,40:17,17:18,23 0/1:.:28:15,13:9,9:6,4 | |
| 43723 chr22 49569465 . A G . PASS DP=105;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:75:0,75:0,33:0,42 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 | |
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| 43726 chr22 49570169 . A G . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,19:0,19 1/1:.:36:0,36:0,19:0,17 | |
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| 43777 chr22 49597729 . G A . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,18:0,12 1/1:.:25:0,25:0,16:0,9 | |
| 43778 chr22 49597907 . C T . PASS DP=56;SS=1;SSC=1;GPV=2.5383e-09;SPV=0.72582 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:12,4:8,12 0/1:.:20:12,8:5,3:7,5 | |
| 43779 chr22 49598126 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=1.1086e-15;SPV=0.84322 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:21,25:14,12:7,13 0/1:.:33:18,15:6,7:12,8 | |
| 43780 chr22 49599258 . G C . PASS DP=78;SS=1;SSC=2;GPV=9.8334e-16;SPV=0.58514 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:20,21:8,9:12,12 0/1:.:37:18,19:6,7:12,12 | |
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| 43782 chr22 49600446 . G A . PASS DP=108;SS=1;SSC=9;GPV=7.0419e-21;SPV=0.12304 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:33,26:13,15:20,11 0/1:.:49:21,28:11,16:10,12 | |
| 43783 chr22 49600504 . C T . PASS DP=100;SS=1;SSC=2;GPV=7.9032e-21;SPV=0.55616 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:26,29:19,16:7,13 0/1:.:45:21,24:13,14:8,10 | |
| 43784 chr22 49600644 . A G . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=6.4299e-17;SPV=0.6174 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:17,26:7,13:10,13 0/1:.:25:10,15:7,2:3,13 | |
| 43785 chr22 49601073 . G C . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=8.6008e-14;SPV=0.99529 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:19,25:11,10:8,15 0/1:.:36:25,11:13,9:12,2 | |
| 43786 chr22 49601611 . C A . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,42:0,11 1/1:.:40:0,40:0,27:0,13 | |
| 43787 chr22 49603009 . T C . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:48:0,48:0,24:0,24 1/1:.:38:0,38:0,28:0,10 | |
| 43788 chr22 49604058 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=5;GPV=7.6319e-16;SPV=0.30975 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:10,9:11,11 0/1:.:35:15,20:8,11:7,9 | |
| 43789 chr22 49604470 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,17:0,16 1/1:.:40:0,40:0,19:0,21 | |
| 43790 chr22 49606056 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=10;GPV=3.7425e-15;SPV=0.08112 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:22,18:7,13:15,5 0/1:.:31:11,20:6,9:5,11 | |
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| 43793 chr22 49609716 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=1.7418e-16;SPV=0.82257 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:26,26:16,14:10,12 0/1:.:40:23,17:10,11:13,6 | |
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| 43846 chr22 49635992 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,28:0,11 1/1:.:27:0,27:0,17:0,10 | |
| 43847 chr22 49636677 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,28:0,27 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 43848 chr22 49637024 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=13;GPV=1;SPV=0.041891 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:31,25:12,9:19,16 0/1:.:30:10,20:4,10:6,10 | |
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| 43850 chr22 49637873 . T C . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,42:0,14 1/1:.:40:0,40:0,15:0,25 | |
| 43851 chr22 49639077 . G A . PASS DP=107;SS=1;SSC=0;GPV=6.2692e-21;SPV=0.80636 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:28,32:12,12:16,20 0/1:.:47:25,22:10,7:15,15 | |
| 43852 chr22 49639224 . G A . PASS DP=111;SS=1;SSC=0;GPV=1.1157e-21;SPV=0.80221 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:64:30,34:13,15:17,19 0/1:.:47:25,22:13,12:12,10 | |
| 43853 chr22 49640829 . C T . PASS DP=97;SS=1;SSC=3;GPV=1.1927e-17;SPV=0.49048 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:30,26:22,11:8,15 0/1:.:41:21,20:7,11:14,9 | |
| 43854 chr22 49640869 . G A . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:59:0,59:0,35:0,24 1/1:.:37:0,37:0,21:0,16 | |
| 43855 chr22 49640890 . G C . PASS DP=95;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,35:0,19 1/1:.:41:0,41:0,25:0,16 | |
| 43856 chr22 49641055 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=1.2112e-18;SPV=0.95989 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:19,30:9,13:10,17 0/1:.:38:21,17:8,9:13,8 | |
| 43857 chr22 49641339 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.0669e-14;SPV=0.79059 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:25,25:13,12:12,13 0/1:.:30:17,13:8,7:9,6 | |
| 43858 chr22 49643021 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,36:0,20 1/1:.:34:0,34:0,14:0,20 | |
| 43859 chr22 49643252 . T C . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:64:0,64:0,29:0,35 1/1:.:36:0,36:0,16:0,20 | |
| 43860 chr22 49643268 . T G . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,25:0,35 1/1:.:34:0,34:0,13:0,21 | |
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| 43918 chr22 49670332 . A C . PASS DP=83;SS=1;SSC=6;GPV=2.1215e-17;SPV=0.2022 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:24,22:11,10:13,12 0/1:.:37:15,22:4,11:11,11 | |
| 43919 chr22 49672466 . G A . PASS DP=41;SS=1;SSC=0;GPV=2.5278e-17;SPV=0.89742 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:2,18:0,3:2,15 1/1:.:21:4,17:1,5:3,12 | |
| 43920 chr22 49673102 . C T . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,15:0,21 1/1:.:31:0,31:0,16:0,15 | |
| 43921 chr22 49674157 . G A . PASS DP=73;SS=1;SSC=11;GPV=3.6826e-13;SPV=0.075513 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:27,17:15,4:12,13 0/1:.:29:12,17:7,11:5,6 | |
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| 43986 chr22 49699242 . T G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:43:0,43:0,24:0,19 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 | |
| 43987 chr22 49699485 . G A . PASS DP=105;SS=1;SSC=5;GPV=4.922e-21;SPV=0.29635 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:31,29:20,15:11,14 0/1:.:45:20,25:9,14:11,11 | |
| 43988 chr22 49700393 . C G . PASS DP=82;SS=1;SSC=8;GPV=1.3866e-11;SPV=0.13929 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:29,13:16,2:13,11 0/1:.:40:22,18:7,10:15,8 | |
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| 43991 chr22 49702165 . A G . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=2.8026e-45;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,17:0,18 1/1:.:41:0,41:0,25:0,16 | |
| 43992 chr22 49702701 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,18:0,29 1/1:.:37:0,37:0,18:0,19 | |
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| 43994 chr22 49703265 . C G . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=7.3839e-17;SPV=0.99573 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:18,30:11,15:7,15 0/1:.:36:23,13:8,9:15,4 | |
| 43995 chr22 49703685 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=3;GPV=2.1236e-16;SPV=0.49919 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:20,23:7,11:13,12 0/1:.:32:14,18:4,9:10,9 | |
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| 44053 chr22 49761902 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=2.5784e-18;SPV=0.71385 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:18,27:8,17:10,10 0/1:.:32:14,18:7,3:7,15 | |
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| 44056 chr22 49764059 . T C . PASS DP=100;SS=1;SSC=2;GPV=1.2435e-16;SPV=0.60665 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:61:34,27:14,16:20,11 0/1:.:39:22,17:7,12:15,5 | |
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| 44117 chr22 49864950 . C G . PASS DP=26;SS=1;SSC=2;GPV=5.4444e-14;SPV=0.57692 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:1,14:0,1:1,13 1/1:.:11:0,11:0,1:0,10 | |
| 44118 chr22 49865042 . C T . PASS DP=57;SS=1;SSC=0;GPV=6.4572e-34;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 1/1:.:19:0,19:0,10:0,9 | |
| 44119 chr22 49865103 . G A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,24:0,16 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 44120 chr22 49865150 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 1/1:.:33:0,33:0,19:0,14 | |
| 44121 chr22 49865219 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:44:0,44:0,17:0,27 1/1:.:35:0,35:0,16:0,19 | |
| 44122 chr22 49865266 . T C . PASS DP=73;SS=1;SSC=0;GPV=1.69557e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,26:0,20 1/1:.:27:0,27:0,12:0,15 | |
| 44123 chr22 49865425 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=3;GPV=1.8424e-11;SPV=0.46135 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:12,10:8,8 0/1:.:21:10,11:5,3:5,8 | |
| 44124 chr22 49865504 . A T . PASS DP=53;SS=1;SSC=0;GPV=1.5943e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,16:0,17 1/1:.:20:0,20:0,15:0,5 | |
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| 44127 chr22 49866521 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,25:0,25 1/1:.:16:0,16:0,7:0,9 | |
| 44128 chr22 49866824 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=6.75426e-43;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:35:0,35:0,22:0,13 | |
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| 44187 chr22 49935161 . G A . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=2.1212e-20;SPV=0.44511 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:25,30:9,17:16,13 0/1:.:36:15,21:8,8:7,13 | |
| 44188 chr22 49938676 . T C . PASS DP=107;SS=1;SSC=6;GPV=6.7916e-22;SPV=0.24183 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:29,27:15,13:14,14 0/1:.:51:22,29:13,17:9,12 | |
| 44189 chr22 49943170 . C T . PASS DP=122;SS=1;SSC=4;GPV=4.9709e-23;SPV=0.35757 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:32,28:14,9:18,19 0/1:.:62:30,32:10,20:20,12 | |
| 44190 chr22 49951908 . G C . PASS DP=95;SS=1;SSC=1;GPV=3.8073e-21;SPV=0.7318 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:22,30:14,18:8,12 0/1:.:43:20,23:11,14:9,9 | |
| 44191 chr22 49952081 . T C . PASS DP=103;SS=1;SSC=0;GPV=7.329e-18;SPV=0.82964 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:28,27:11,14:17,13 0/1:.:48:28,20:12,8:16,12 | |
| 44192 chr22 49952394 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=5.8564e-22;SPV=0.95402 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:18,38:9,17:9,21 0/1:.:29:14,15:13,4:1,11 | |
| 44193 chr22 49952424 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=9;GPV=3.1101e-09;SPV=0.12227 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:37,13:18,7:19,6 0/1:.:29:17,12:5,9:12,3 | |
| 44194 chr22 49954705 . G A . PASS DP=98;SS=1;SSC=4;GPV=5.898e-15;SPV=0.33741 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:37,23:17,13:20,10 0/1:.:38:21,17:11,8:10,9 | |
| 44195 chr22 49955996 . A G . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=1.8728e-19;SPV=0.81004 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:24,32:10,18:14,14 0/1:.:34:17,17:8,7:9,10 | |
| 44196 chr22 49956770 . T C . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=4.9177e-17;SPV=0.70554 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:31,31:13,12:18,19 0/1:.:28:15,13:7,7:8,6 | |
| 44197 chr22 49957690 . C G . PASS DP=79;SS=1;SSC=3;GPV=3.6641e-16;SPV=0.43258 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:12,13:11,10 0/1:.:33:15,18:3,11:12,7 | |
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| 44253 chr22 50012026 . T C . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,20:0,34 1/1:.:38:0,38:0,14:0,24 | |
| 44254 chr22 50013610 . G T . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=9.545e-12;SPV=0.35494 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:8,3:10,11 0/1:.:31:15,16:7,4:8,12 | |
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| 44256 chr22 50024232 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,30:0,16 1/1:.:23:0,23:0,19:0,4 | |
| 44257 chr22 50024626 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=5;GPV=1.4126e-14;SPV=0.2551 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:15,10:13,10 0/1:.:35:17,18:11,11:6,7 | |
| 44258 chr22 50024802 . T C . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=1.1875e-15;SPV=0.97286 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:15,26:6,12:9,14 0/1:.:30:17,13:9,6:8,7 | |
| 44259 chr22 50025252 . A T . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.4114e-16;SPV=0.82177 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:10,22:6,10:4,12 0/1:.:28:11,17:5,12:6,5 | |
| 44260 chr22 50026282 . C T . PASS DP=76;SS=1;SSC=0;GPV=1.6732e-08;SPV=0.92024 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:27,15:14,7:13,8 0/1:.:34:26,8:13,4:13,4 | |
| 44261 chr22 50026311 . G C . PASS DP=69;SS=1;SSC=6;GPV=2.8075e-15;SPV=0.22708 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:10,11:10,9 0/1:.:29:11,18:5,11:6,7 | |
| 44262 chr22 50026326 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=8;GPV=5.4436e-15;SPV=0.13883 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:15,17:7,10:8,7 0/1:.:27:8,19:3,13:5,6 | |
| 44263 chr22 50028113 . T C . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,22:0,32 1/1:.:30:0,30:0,10:0,20 | |
| 44264 chr22 50028114 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=1;GPV=1.3916e-15;SPV=0.64797 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:26,26:6,15:20,11 0/1:.:29:15,14:4,7:11,7 | |
| 44265 chr22 50029029 . C A . PASS DP=16;SS=1;SSC=1;GPV=0.0012236;SPV=0.69037 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:8:4,4:2,4:2,0 0/1:.:8:4,4:2,1:2,3 | |
| 44266 chr22 50029374 . C A . PASS DP=33;SS=1;SSC=5;GPV=7.2075e-05;SPV=0.31105 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:17:12,5:11,3:1,2 0/1:.:16:9,7:7,6:2,1 | |
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| 44333 chr22 50077207 . C T . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=1.4265e-12;SPV=0.93948 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:28,21:18,13:10,8 0/1:.:44:31,13:15,5:16,8 | |
| 44334 chr22 50077248 . C T . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,27:0,24 1/1:.:48:0,48:0,17:0,31 | |
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| 44394 chr22 50128609 . A G . PASS DP=49;SS=1;SSC=0;GPV=3.925e-29;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,11:0,19 1/1:.:19:0,19:0,10:0,9 | |
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| 44396 chr22 50129638 . A G . PASS DP=69;SS=1;SSC=0;GPV=4.23304e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,18:0,24 1/1:.:27:0,27:0,13:0,14 | |
| 44397 chr22 50131187 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,13:0,26 1/1:.:44:0,44:0,18:0,26 | |
| 44398 chr22 50131361 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,28:0,14 1/1:.:46:0,46:0,21:0,25 | |
| 44399 chr22 50131932 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,22:0,18 1/1:.:30:0,30:0,19:0,11 | |
| 44400 chr22 50132423 . A G . PASS DP=60;SS=1;SSC=0;GPV=1.035e-35;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 1/1:.:26:0,26:0,15:0,11 | |
| 44401 chr22 50132444 . G T . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,17:0,20 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 44402 chr22 50132731 . G C . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:61:0,61:0,36:0,25 1/1:.:31:0,31:0,18:0,13 | |
| 44403 chr22 50133745 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:37:0,37:0,16:0,21 1/1:.:33:0,33:0,20:0,13 | |
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| 44453 chr22 50183798 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=6.9496e-23;SPV=0.75287 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:17,32:9,18:8,14 0/1:.:38:15,23:7,10:8,13 | |
| 44454 chr22 50185653 . C G . PASS DP=72;SS=1;SSC=0;GPV=1.374e-15;SPV=0.96131 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:18,28:10,20:8,8 0/1:.:26:15,11:10,5:5,6 | |
| 44455 chr22 50186480 . G C . PASS DP=85;SS=1;SSC=2;GPV=2.785e-19;SPV=0.51563 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:20,25:11,14:9,11 0/1:.:40:17,23:10,13:7,10 | |
| 44456 chr22 50186650 . G C . PASS DP=101;SS=1;SSC=4;GPV=7.3223e-19;SPV=0.39031 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:29,25:14,14:15,11 0/1:.:47:23,24:6,12:17,12 | |
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| 44458 chr22 50186842 . T C . PASS DP=109;SS=1;SSC=7;GPV=7.8862e-21;SPV=0.19577 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:34,28:21,15:13,13 0/1:.:47:21,26:15,14:6,12 | |
| 44459 chr22 50187020 . C T . PASS DP=87;SS=1;SSC=2;GPV=1.1614e-17;SPV=0.59477 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:27,29:9,12:18,17 0/1:.:31:15,16:8,6:7,10 | |
| 44460 chr22 50188362 . C A . PASS DP=77;SS=1;SSC=2;GPV=5.2028e-13;SPV=0.51267 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:14,12:11,7 0/1:.:33:18,15:10,6:8,9 | |
| 44461 chr22 50188759 . C T . PASS DP=83;SS=1;SSC=5;GPV=4.9663e-15;SPV=0.26592 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:31,24:14,10:17,14 0/1:.:28:13,15:8,5:5,10 | |
| 44462 chr22 50188824 . C T . PASS DP=74;SS=1;SSC=0;GPV=4.34403e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,22:0,24 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
| 44463 chr22 50188878 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=1.3596e-16;SPV=0.9344 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:20,28:10,12:10,16 0/1:.:32:18,14:8,6:10,8 | |
| 44464 chr22 50189275 . G T . PASS DP=78;SS=1;SSC=0;GPV=5.6308e-13;SPV=0.84232 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:22,20:10,9:12,11 0/1:.:36:22,14:11,7:11,7 | |
| 44465 chr22 50190022 . A G . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,23:0,34 1/1:.:43:0,43:0,19:0,24 | |
| 44466 chr22 50190317 . T G . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,36:0,21 1/1:.:42:0,42:0,22:0,20 | |
| 44467 chr22 50190567 . G A . PASS DP=109;SS=1;SSC=2;GPV=2.878e-24;SPV=0.53828 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:28,35:14,9:14,26 0/1:.:46:20,26:13,11:7,15 | |
| 44468 chr22 50190863 . T G . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,28:0,25 1/1:.:48:0,48:0,22:0,26 | |
| 44469 chr22 50191443 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=1.5419e-14;SPV=0.93129 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:24,25:14,15:10,10 0/1:.:35:22,13:10,8:12,5 | |
| 44470 chr22 50191684 . G A . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=9.05e-15;SPV=0.95681 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:26,26:8,11:18,15 0/1:.:38:25,13:9,5:16,8 | |
| 44471 chr22 50192241 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=3.7458e-16;SPV=0.98946 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:21,28:11,18:10,10 0/1:.:40:26,14:15,7:11,7 | |
| 44472 chr22 50192365 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.7683e-12;SPV=0.73939 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:22,17:8,11:14,6 0/1:.:41:25,16:11,6:14,10 | |
| 44473 chr22 50192797 . T C . PASS DP=33;SS=1;SSC=0;GPV=1.3852e-19;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:19:0,19:0,10:0,9 1/1:.:14:0,14:0,7:0,7 | |
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| 44475 chr22 50196097 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=1.2269e-12;SPV=0.38112 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:28,20:12,8:16,12 0/1:.:27:14,13:10,3:4,10 | |
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| 44522 chr22 50216669 . A G . PASS DP=123;SS=1;SSC=6;GPV=1.7395e-29;SPV=0.19961 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:62:28,34:10,18:18,16 0/1:.:61:22,39:10,14:12,25 | |
| 44523 chr22 50216900 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=3;GPV=1.6298e-15;SPV=0.41768 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:32,23:18,14:14,9 0/1:.:39:21,18:15,4:6,14 | |
| 44524 chr22 50217667 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 1/1:.:32:0,32:0,13:0,19 | |
| 44525 chr22 50217999 . G A . PASS DP=60;SS=1;SSC=3;GPV=5.88e-11;SPV=0.43669 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:20,16:13,6:7,10 0/1:.:24:12,12:8,4:4,8 | |
| 44526 chr22 50218581 . C G . PASS DP=113;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:66:0,66:0,38:0,28 1/1:.:47:0,47:0,22:0,25 | |
| 44527 chr22 50218683 . C T . PASS DP=99;SS=1;SSC=0;GPV=1.7348e-18;SPV=0.82961 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:27,29:14,18:13,11 0/1:.:43:24,19:15,11:9,8 | |
| 44528 chr22 50219624 . A G . PASS DP=100;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:62:0,62:0,24:0,38 1/1:.:38:0,38:0,23:0,15 | |
| 44529 chr22 50219845 . C G . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=5.5558e-19;SPV=0.73794 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:17,25:4,8:13,17 0/1:.:40:18,22:8,10:10,12 | |
| 44530 chr22 50223440 . T C . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,25:0,22 1/1:.:41:0,41:0,13:0,28 | |
| 44531 chr22 50223608 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=5;GPV=1.7439e-13;SPV=0.30279 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:19,17:10,9:9,8 0/1:.:30:13,17:9,8:4,9 | |
| 44532 chr22 50224992 . C T . PASS DP=49;SS=1;SSC=3;GPV=1.5129e-11;SPV=0.45061 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:31:14,17:4,7:10,10 0/1:.:18:7,11:4,4:3,7 | |
| 44533 chr22 50226183 . A G . PASS DP=96;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,28:0,25 1/1:.:43:0,43:0,25:0,18 | |
| 44534 chr22 50227658 . T C . PASS DP=91;SS=1;SSC=3;GPV=4.5213e-16;SPV=0.49324 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:28,23:19,11:9,12 0/1:.:40:21,19:14,11:7,8 | |
| 44535 chr22 50227794 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=5;GPV=4.5064e-15;SPV=0.26356 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:25,19:12,8:13,11 0/1:.:38:18,20:10,11:8,9 | |
| 44536 chr22 50229136 . G A . PASS DP=82;SS=1;SSC=3;GPV=5.5558e-19;SPV=0.39918 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:9,12:10,11 0/1:.:40:16,24:13,14:3,10 | |
| 44537 chr22 50230378 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=4;GPV=9.545e-12;SPV=0.37934 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:21,17:12,10:9,7 0/1:.:25:12,13:5,8:7,5 | |
| 44538 chr22 50231720 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=1.7027e-12;SPV=0.67702 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:21,20:13,10:8,10 0/1:.:26:14,12:11,6:3,6 | |
| 44539 chr22 50233725 . G A . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=8.2973e-14;SPV=0.54329 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:19,19:11,10:8,9 0/1:.:31:15,16:12,9:3,7 | |
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| 44541 chr22 50235010 . G A . PASS DP=30;SS=1;SSC=0;GPV=8.4556e-18;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:15:0,15:0,10:0,5 1/1:.:15:0,15:0,10:0,5 | |
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| 44598 chr22 50271558 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=0;GPV=6.6743e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:28:0,28:0,11:0,17 1/1:.:39:0,39:0,24:0,15 | |
| 44599 chr22 50272204 . C G . PASS DP=101;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,24:0,29 1/1:.:48:0,48:0,31:0,17 | |
| 44600 chr22 50272381 . T C . PASS DP=83;SS=1;SSC=1;GPV=1.9866e-19;SPV=0.72825 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:16,24:11,15:5,9 0/1:.:43:19,24:11,12:8,12 | |
| 44601 chr22 50273293 . T G . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=1.1574e-13;SPV=0.60096 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:7,9:13,10 0/1:.:33:17,16:8,9:9,7 | |
| 44602 chr22 50273461 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=3;GPV=2.6279e-15;SPV=0.44638 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:23,22:16,13:7,9 0/1:.:32:15,17:11,7:4,10 | |
| 44603 chr22 50273481 . G C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,45:0,28:0,17 1/1:.:34:0,34:0,17:0,17 | |
| 44604 chr22 50273638 . A G . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=3.8097e-26;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:45:0,26:0,11:0,15 1/1:.:40:0,18:0,11:0,7 | |
| 44605 chr22 50273954 . A C . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=8.7033e-16;SPV=0.73314 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:14,20:7,10:7,10 0/1:.:35:16,19:5,10:11,9 | |
| 44606 chr22 50273956 . T C . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=7.6926e-15;SPV=0.60432 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:15,18:8,10:7,8 0/1:.:35:16,19:6,10:10,9 | |
| 44607 chr22 50274496 . C G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:42:0,42:0,14:0,28 1/1:.:22:0,22:0,6:0,16 | |
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| 44655 chr22 50314905 . G A . PASS DP=92;SS=1;SSC=5;GPV=7.6832e-19;SPV=0.28215 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:21,19:10,11:11,8 0/1:.:52:23,29:8,13:15,16 | |
| 44656 chr22 50315247 . C T . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=1.4813e-17;SPV=0.91637 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:23,29:9,14:14,15 0/1:.:37:21,16:8,9:13,7 | |
| 44657 chr22 50315544 . T C . PASS DP=100;SS=1;SSC=5;GPV=2.223e-19;SPV=0.27437 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:27,23:17,11:10,12 0/1:.:50:23,27:11,8:12,19 | |
| 44658 chr22 50316219 . T C . PASS DP=89;SS=1;SSC=7;GPV=1.2945e-16;SPV=0.17413 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:27,20:11,12:16,8 0/1:.:42:19,23:9,12:10,11 | |
| 44659 chr22 50316343 . C T . PASS DP=88;SS=1;SSC=4;GPV=1.3142e-17;SPV=0.32735 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:25,23:12,12:13,11 0/1:.:40:18,22:8,12:10,10 | |
| 44660 chr22 50317478 . G C . PASS DP=92;SS=1;SSC=3;GPV=6.0531e-17;SPV=0.43808 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:28,24:18,16:10,8 0/1:.:40:20,20:13,15:7,5 | |
| 44661 chr22 50318023 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=14;GPV=1;SPV=0.032875 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:25,17:12,8:13,9 0/1:.:36:13,23:6,9:7,14 | |
| 44662 chr22 50318398 . G A . PASS DP=54;SS=1;SSC=8;GPV=7.7765e-10;SPV=0.12806 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:16,9:7,3:9,6 0/1:.:29:13,16:7,6:6,10 | |
| 44663 chr22 50318683 . G A . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=7.3839e-17;SPV=0.95991 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:17,25:8,12:9,13 0/1:.:42:24,18:14,9:10,9 | |
| 44664 chr22 50318919 . G A . PASS DP=70;SS=1;SSC=2;GPV=1.02e-15;SPV=0.56327 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:17,21:8,11:9,10 0/1:.:32:14,18:6,5:8,13 | |
| 44665 chr22 50319041 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=1;GPV=5.4147e-14;SPV=0.73341 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:12,12:9,9 0/1:.:33:18,15:8,7:10,8 | |
| 44666 chr22 50319546 . T C . PASS DP=70;SS=1;SSC=1;GPV=0.00014598;SPV=0.76759 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:30,7:12,4:18,3 0/1:.:33:28,5:19,2:9,3 | |
| 44667 chr22 50320183 . C A . PASS DP=98;SS=1;SSC=3;GPV=4.5567e-18;SPV=0.44189 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:56:30,26:21,11:9,15 0/1:.:42:21,21:7,11:14,10 | |
| 44668 chr22 50320272 . G T . PASS DP=90;SS=1;SSC=1;GPV=5.5445e-18;SPV=0.65073 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:26,28:9,15:17,13 0/1:.:36:18,18:9,9:9,9 | |
| 44669 chr22 50320444 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:54:0,54:0,21:0,33 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 | |
| 44670 chr22 50320705 . T C . PASS DP=92;SS=1;SSC=2;GPV=6.0531e-17;SPV=0.54852 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:59:31,28:16,15:15,13 0/1:.:33:17,16:10,10:7,6 | |
| 44671 chr22 50321053 . G A . PASS DP=95;SS=1;SSC=2;GPV=9.7369e-18;SPV=0.55254 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:27,25:15,11:12,14 0/1:.:43:22,21:10,13:12,8 | |
| 44672 chr22 50321463 . C A . PASS DP=84;SS=1;SSC=2;GPV=4.2977e-14;SPV=0.50562 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:29,22:15,14:14,8 0/1:.:33:18,15:10,6:8,9 | |
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| 44726 chr22 50379655 . G C . PASS DP=89;SS=1;SSC=2;GPV=5.1181e-19;SPV=0.52586 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:22,25:17,17:5,8 0/1:.:42:19,23:10,14:9,9 | |
| 44727 chr22 50379807 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=3.879e-12;SPV=0.64517 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:26,19:12,9:14,10 0/1:.:32:19,13:6,6:13,7 | |
| 44728 chr22 50383128 . A G . PASS DP=70;SS=1;SSC=6;GPV=2.7419e-13;SPV=0.23217 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:19,14:7,5:12,9 0/1:.:37:17,20:6,10:11,10 | |
| 44729 chr22 50383150 . G T . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,10:0,21 1/1:.:40:0,40:0,18:0,22 | |
| 44730 chr22 50383906 . G A . PASS DP=77;SS=1;SSC=10;GPV=8.5945e-18;SPV=0.081318 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:8,17:16,7 0/1:.:29:9,20:6,9:3,11 | |
| 44731 chr22 50384412 . G A . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=3.9286e-14;SPV=0.59434 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:21,21:13,11:8,10 0/1:.:30:15,15:6,10:9,5 | |
| 44732 chr22 50386121 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=3;GPV=4.0755e-11;SPV=0.47316 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:23,16:10,12:13,4 0/1:.:29:16,13:9,6:7,7 | |
| 44733 chr22 50386439 . C A . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=7.0184e-11;SPV=0.86441 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:17,17:7,8:10,9 0/1:.:28:17,11:8,5:9,6 | |
| 44734 chr22 50386569 . T C . PASS DP=72;SS=1;SSC=2;GPV=5.9452e-09;SPV=0.53209 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:27,13:15,5:12,8 0/1:.:32:21,11:12,5:9,6 | |
| 44735 chr22 50386775 . A G . PASS DP=72;SS=1;SSC=1;GPV=9.3924e-10;SPV=0.78226 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:10,7:10,6 0/1:.:39:26,13:15,7:11,6 | |
| 44736 chr22 50386888 . G A . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=3.7837e-11;SPV=0.56844 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:14,6:6,9 0/1:.:32:18,14:6,8:12,6 | |
| 44737 chr22 50387186 . G A . PASS DP=74;SS=1;SSC=7;GPV=4.0499e-10;SPV=0.18687 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:29,13:16,6:13,7 0/1:.:32:18,14:10,8:8,6 | |
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| 44739 chr22 50391827 . A G . PASS DP=67;SS=1;SSC=1;GPV=6.4906e-14;SPV=0.78481 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:19,23:9,15:10,8 0/1:.:25:13,12:5,7:8,5 | |
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| 44793 chr22 50426445 . A G . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=3.2213e-16;SPV=0.72294 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:22,26:7,11:15,15 0/1:.:30:15,15:5,10:10,5 | |
| 44794 chr22 50426666 . G C . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:35:0,35:0,18:0,17 1/1:.:29:0,29:0,16:0,13 | |
| 44795 chr22 50426704 . A G . PASS DP=73;SS=1;SSC=12;GPV=1.5635e-16;SPV=0.06005 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:23,21:12,9:11,12 0/1:.:29:9,20:8,11:1,9 | |
| 44796 chr22 50426909 . C T . PASS DP=71;SS=1;SSC=1;GPV=8.7106e-13;SPV=0.74404 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:39:20,19:9,10:11,9 0/1:.:32:18,14:12,9:6,5 | |
| 44797 chr22 50427434 . T A . PASS DP=90;SS=1;SSC=0;GPV=2.4713e-14;SPV=0.99396 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:23,26:14,10:9,16 0/1:.:41:29,12:16,5:13,7 | |
| 44798 chr22 50427877 . C T . PASS DP=80;SS=1;SSC=0;GPV=6.5441e-13;SPV=0.89325 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:26,23:16,11:10,12 0/1:.:31:20,11:11,6:9,5 | |
| 44799 chr22 50427924 . A G . PASS DP=87;SS=1;SSC=1;GPV=1.463e-13;SPV=0.78697 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:28,22:15,9:13,13 0/1:.:37:23,14:14,5:9,9 | |
| 44800 chr22 50428130 . T C . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=2.4776e-16;SPV=0.63122 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:23,23:9,6:14,17 0/1:.:39:20,19:6,7:14,12 | |
| 44801 chr22 50428839 . G A . PASS DP=81;SS=1;SSC=0;GPV=1.1753e-14;SPV=0.95807 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:11,13:9,11 0/1:.:37:23,14:15,9:8,5 | |
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| 44803 chr22 50429811 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=1;GPV=6.0917e-20;SPV=0.7334 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:15,27:11,19:4,8 0/1:.:35:14,21:8,12:6,9 | |
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| 44844 chr22 50457358 . C G . PASS DP=113;SS=1;SSC=5;GPV=1.6073e-17;SPV=0.25624 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:39,24:20,12:19,12 0/1:.:50:27,23:11,13:16,10 | |
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| 44853 chr22 50463466 . C T . PASS DP=97;SS=1;SSC=0;GPV=5.0692e-20;SPV=0.79715 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:26,32:10,19:16,13 0/1:.:39:20,19:9,8:11,11 | |
| 44854 chr22 50463961 . A G . PASS DP=94;SS=1;SSC=1;GPV=8.7581e-18;SPV=0.67286 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:27,27:14,16:13,11 0/1:.:40:21,19:8,12:13,7 | |
| 44855 chr22 50464792 . C T . PASS DP=117;SS=1;SSC=1;GPV=1.7744e-20;SPV=0.73324 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:69:36,33:20,20:16,13 0/1:.:48:27,21:16,13:11,8 | |
| 44856 chr22 50466657 . G A . PASS DP=104;SS=1;SSC=8;GPV=8.0005e-18;SPV=0.14848 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:60:36,24:16,13:20,11 0/1:.:44:21,23:9,13:12,10 | |
| 44857 chr22 50466818 . G A . PASS DP=102;SS=1;SSC=0;GPV=2.7774e-19;SPV=0.99263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:58:24,34:11,17:13,17 0/1:.:44:28,16:14,6:14,10 | |
| 44858 chr22 50468089 . G A . PASS DP=104;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:55:0,55:0,30:0,25 1/1:.:49:0,49:0,24:0,25 | |
| 44859 chr22 50469426 . C T . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:31:0,31:0,14:0,17 | |
| 44860 chr22 50470164 . T C . PASS DP=55;SS=1;SSC=0;GPV=1.0149e-32;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:31:0,31:0,8:0,23 1/1:.:24:0,24:0,3:0,21 | |
| 44861 chr22 50470752 . C T . PASS DP=70;SS=1;SSC=0;GPV=1.06597e-41;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,23:0,18 1/1:.:29:0,29:0,22:0,7 | |
| 44862 chr22 50471028 . T C . PASS DP=94;SS=1;SSC=1;GPV=3.2424e-19;SPV=0.72374 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:23,27:13,13:10,14 0/1:.:44:22,22:11,12:11,10 | |
| 44863 chr22 50471996 . C A . PASS DP=89;SS=1;SSC=3;GPV=1.2945e-16;SPV=0.49279 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:57:30,27:14,18:16,9 0/1:.:32:16,16:9,7:7,9 | |
| 44864 chr22 50472446 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:53:0,53:0,18:0,35 1/1:.:29:0,29:0,10:0,19 | |
| 44865 chr22 50472916 . G A . PASS DP=94;SS=1;SSC=2;GPV=7.3611e-17;SPV=0.51253 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:65:35,30:16,10:19,20 0/1:.:29:15,14:4,7:11,7 | |
| 44866 chr22 50473447 . A G . PASS DP=93;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:51:0,51:0,24:0,27 1/1:.:42:0,42:0,20:0,22 | |
| 44867 chr22 50473892 . C T . PASS DP=84;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,25:0,15 1/1:.:44:0,44:0,23:0,21 | |
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| 44924 chr22 50522253 . C T . PASS DP=94;SS=1;SSC=0;GPV=2.9605e-18;SPV=0.9281 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:24,30:5,18:19,12 0/1:.:40:23,17:8,13:15,4 | |
| 44925 chr22 50522740 . A G . PASS DP=111;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:60:0,60:0,30:0,30 1/1:.:51:0,51:0,26:0,25 | |
| 44926 chr22 50523425 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=1;GPV=5.2507e-16;SPV=0.74613 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:42:20,22:10,9:10,13 0/1:.:40:21,19:8,10:13,9 | |
| 44927 chr22 50523779 . T G . PASS DP=97;SS=1;SSC=11;GPV=1.2982e-23;SPV=0.067474 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:25,27:13,14:12,13 0/1:.:45:14,31:6,13:8,18 | |
| 44928 chr22 50524353 . C G . PASS DP=93;SS=1;SSC=3;GPV=2.3067e-17;SPV=0.47046 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:51:27,24:13,15:14,9 0/1:.:42:21,21:10,14:11,7 | |
| 44929 chr22 50524519 . G T . PASS DP=94;SS=1;SSC=1;GPV=2.5559e-17;SPV=0.73497 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:24,24:10,14:14,10 0/1:.:46:25,21:12,11:13,10 | |
| 44930 chr22 50524928 . G C . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=2.4088e-15;SPV=0.87817 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:5,11:9,11 0/1:.:32:16,16:8,8:8,8 | |
| 44931 chr22 50525476 . C T . PASS DP=106;SS=1;SSC=1;GPV=1.1977e-18;SPV=0.70726 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:63:33,30:13,19:20,11 0/1:.:43:24,19:12,8:12,11 | |
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| 44991 chr22 50553789 . C G . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=3.6481e-18;SPV=0.9291 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:18,30:8,15:10,15 0/1:.:31:16,15:8,6:8,9 | |
| 44992 chr22 50553803 . A G . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,26:0,23 1/1:.:33:0,33:0,18:0,15 | |
| 44993 chr22 50554584 . C T . PASS DP=61;SS=1;SSC=1;GPV=2.2597e-11;SPV=0.78793 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:20,20:10,8:10,12 0/1:.:21:12,9:5,3:7,6 | |
| 44994 chr22 50554983 . G A . PASS DP=59;SS=1;SSC=11;GPV=1.8424e-11;SPV=0.076545 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:33:20,13:12,6:8,7 0/1:.:26:10,16:4,9:6,7 | |
| 44995 chr22 50554991 . G A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,17:0,15 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
| 44996 chr22 50555378 . T C . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:47:0,47:0,30:0,17 1/1:.:32:0,32:0,16:0,16 | |
| 44997 chr22 50556179 . A G . PASS DP=80;SS=1;SSC=7;GPV=8.6008e-14;SPV=0.19381 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:54:32,22:15,12:17,10 0/1:.:26:12,14:4,7:8,7 | |
| 44998 chr22 50556180 . C T . PASS DP=81;SS=1;SSC=8;GPV=3.3388e-14;SPV=0.14729 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:52:31,21:15,11:16,10 0/1:.:29:13,16:5,8:8,8 | |
| 44999 chr22 50557084 . G T . PASS DP=81;SS=1;SSC=17;GPV=1;SPV=0.019384 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:22,21:11,10:11,11 0/1:.:38:10,28:5,13:5,15 | |
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| 45001 chr22 50558370 . G A . PASS DP=79;SS=1;SSC=0;GPV=9.653e-15;SPV=0.93505 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:20,24:11,9:9,15 0/1:.:35:21,14:10,6:11,8 | |
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| 45048 chr22 50582768 . G A . PASS DP=88;SS=1;SSC=0;GPV=1.3937e-18;SPV=0.96896 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:19,30:9,20:10,10 0/1:.:39:22,17:10,9:12,8 | |
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| 45051 chr22 50583688 . C A . PASS DP=68;SS=1;SSC=0;GPV=1.6809e-40;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,19:0,20 1/1:.:29:0,29:0,15:0,14 | |
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| 45056 chr22 50586504 . C T . PASS DP=73;SS=1;SSC=6;GPV=2.8926e-12;SPV=0.23423 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:20,12:10,4:10,8 0/1:.:41:21,20:7,15:14,5 | |
| 45057 chr22 50586897 . A G . PASS DP=89;SS=1;SSC=3;GPV=1.0892e-22;SPV=0.40636 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:19,28:10,9:9,19 0/1:.:42:15,27:7,9:8,18 | |
| 45058 chr22 50587166 . C G . PASS DP=83;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:46:0,46:0,24:0,22 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 | |
| 45059 chr22 50587170 . C A . PASS DP=86;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,24:0,25 1/1:.:37:0,37:0,20:0,17 | |
| 45060 chr22 50587812 . G A . PASS DP=68;SS=1;SSC=7;GPV=7.3575e-14;SPV=0.1691 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:18,14:7,8:11,6 0/1:.:36:15,21:8,12:7,9 | |
| 45061 chr22 50588029 . G A . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=9.9117e-30;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:30:0,30:0,23:0,7 1/1:.:20:0,20:0,13:0,7 | |
| 45062 chr22 50588413 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=1.12104e-44;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,19:0,22 1/1:.:34:0,34:0,18:0,16 | |
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| 45064 chr22 50588642 . C A . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=2.68349e-42;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:39:0,39:0,23:0,16 1/1:.:32:0,32:0,14:0,18 | |
| 45065 chr22 50588693 . C T . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:36:0,36:0,21:0,15 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
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| 45118 chr22 50619153 . A G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=6.8178e-12;SPV=0.81995 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:14,9:6,9 0/1:.:33:20,13:11,5:9,8 | |
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| 45120 chr22 50619731 . C T . PASS DP=68;SS=1;SSC=2;GPV=4.0755e-11;SPV=0.58603 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:23,17:16,10:7,7 0/1:.:28:16,12:10,9:6,3 | |
| 45121 chr22 50619782 . C G . PASS DP=71;SS=1;SSC=0;GPV=1.1875e-15;SPV=0.9912 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:16,29:11,16:5,13 0/1:.:26:16,10:10,6:6,4 | |
| 45122 chr22 50620690 . G T . PASS DP=89;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:50:0,50:0,24:0,26 1/1:.:39:0,39:0,21:0,18 | |
| 45123 chr22 50622063 . A G . PASS DP=59;SS=1;SSC=3;GPV=1.5269e-15;SPV=0.48536 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:14,22:7,12:7,10 0/1:.:23:8,15:4,9:4,6 | |
| 45124 chr22 50622771 . G T . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=2.0452e-11;SPV=0.6971 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:30:15,15:8,8:7,7 0/1:.:30:16,14:7,4:9,10 | |
| 45125 chr22 50623623 . G T . PASS DP=72;SS=1;SSC=7;GPV=3.3502e-13;SPV=0.19246 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:25,18:6,12:19,6 0/1:.:29:13,16:10,5:3,11 | |
| 45126 chr22 50623794 . G C . PASS DP=53;SS=1;SSC=1;GPV=2.005e-09;SPV=0.6556 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:26:14,12:7,5:7,7 0/1:.:27:15,12:6,4:9,8 | |
| 45127 chr22 50624226 . T C . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=6.5755e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:29:0,29:0,14:0,15 1/1:.:33:0,33:0,22:0,11 | |
| 45128 chr22 50624290 . C T . PASS DP=55;SS=1;SSC=2;GPV=1.1526e-12;SPV=0.61535 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:23:10,13:3,5:7,8 0/1:.:32:14,18:5,9:9,9 | |
| 45129 chr22 50624463 . C G . PASS DP=73;SS=1;SSC=2;GPV=5.6815e-11;SPV=0.57921 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:26,17:17,11:9,6 0/1:.:30:18,12:14,5:4,7 | |
| 45130 chr22 50624510 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=2;GPV=8.8612e-15;SPV=0.62521 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:17,20:12,13:5,7 0/1:.:32:15,17:5,10:10,7 | |
| 45131 chr22 50624642 . T C . PASS DP=60;SS=1;SSC=4;GPV=5.88e-11;SPV=0.33084 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:35:20,15:9,6:11,9 0/1:.:25:12,13:4,4:8,9 | |
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| 45133 chr22 50625611 . G C . PASS DP=113;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:69:0,69:0,38:0,31 1/1:.:44:0,44:0,22:0,22 | |
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| 45185 chr22 50649472 . T C . PASS DP=75;SS=1;SSC=0;GPV=5.4147e-14;SPV=0.86809 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:21,23:12,12:9,11 0/1:.:31:18,13:8,7:10,6 | |
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| 45188 chr22 50651566 . A G . PASS DP=63;SS=1;SSC=0;GPV=1.657e-37;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:41:0,41:0,21:0,20 1/1:.:22:0,22:0,11:0,11 | |
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| 45190 chr22 50653781 . G A . PASS DP=78;SS=1;SSC=9;GPV=8.7026e-15;SPV=0.12588 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:37:22,15:15,11:7,4 0/1:.:41:18,23:12,13:6,10 | |
| 45191 chr22 50654517 . T C . PASS DP=77;SS=1;SSC=0;GPV=8.9788e-17;SPV=0.81796 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:45:19,26:9,16:10,10 0/1:.:32:16,16:9,7:7,9 | |
| 45192 chr22 50656064 . C T . PASS DP=85;SS=1;SSC=1;GPV=3.4338e-13;SPV=0.72188 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:28,21:12,10:16,11 0/1:.:36:22,14:12,9:10,5 | |
| 45193 chr22 50656679 . G A . PASS DP=80;SS=1;SSC=1;GPV=1.3596e-16;SPV=0.79263 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:49:22,27:12,11:10,16 0/1:.:31:16,15:8,7:8,8 | |
| 45194 chr22 50659344 . T A . PASS DP=60;SS=1;SSC=1;GPV=8.6933e-09;SPV=0.76872 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:29:17,12:11,8:6,4 0/1:.:31:20,11:14,5:6,6 | |
| 45195 chr22 50660015 . A G . PASS DP=64;SS=1;SSC=0;GPV=4.1752e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:40:0,40:0,26:0,14 1/1:.:24:0,24:0,15:0,9 | |
| 45196 chr22 50660705 . G A . PASS DP=66;SS=1;SSC=0;GPV=2.6498e-39;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:38:0,38:0,16:0,22 1/1:.:28:0,28:0,16:0,12 | |
| 45197 chr22 50661004 . G A . PASS DP=75;SS=1;SSC=4;GPV=6.0532e-18;SPV=0.34101 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:50:22,28:10,19:12,9 0/1:.:25:9,16:4,9:5,7 | |
| 45198 chr22 50661243 . T C . PASS DP=78;SS=1;SSC=1;GPV=9.149e-19;SPV=0.72863 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:41:16,25:6,12:10,13 0/1:.:37:16,21:6,7:10,14 | |
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| 45200 chr22 50661961 . C T . PASS DP=62;SS=1;SSC=0;GPV=8.6344e-12;SPV=0.85806 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:17,19:8,10:9,9 0/1:.:26:15,11:9,6:6,5 | |
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| 45256 chr22 50696812 . T C . PASS DP=92;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:56:0,56:0,29:0,27 1/1:.:36:0,36:0,18:0,18 | |
| 45257 chr22 50697023 . G C . PASS DP=85;SS=1;SSC=0;GPV=7.2639e-16;SPV=0.81449 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:55:27,28:17,13:10,15 0/1:.:30:17,13:8,6:9,7 | |
| 45258 chr22 50697117 . T C . PASS DP=82;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:49:0,49:0,26:0,23 1/1:.:33:0,33:0,13:0,20 | |
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| 45260 chr22 50698821 . T C . PASS DP=87;SS=1;SSC=0;GPV=0;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:57:0,57:0,24:0,33 1/1:.:30:0,30:0,14:0,16 | |
| 45261 chr22 50700107 . C A . PASS DP=61;SS=1;SSC=0;GPV=2.609e-36;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:33:0,33:0,22:0,11 1/1:.:28:0,28:0,15:0,13 | |
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| 45263 chr22 50700750 . C T . PASS DP=86;SS=1;SSC=2;GPV=2.3066e-15;SPV=0.60911 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:47:25,22:15,12:10,10 0/1:.:39:21,18:12,11:9,7 | |
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| 45319 chr22 50750975 . A G . PASS DP=66;SS=1;SSC=2;GPV=1.2581e-11;SPV=0.61986 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:24:13,11:6,8:7,3 0/1:.:42:23,19:10,7:13,12 | |
| 45320 chr22 50751283 . T C . PASS DP=66;SS=1;SSC=1;GPV=1.8199e-14;SPV=0.68146 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:34:15,19:9,9:6,10 0/1:.:32:15,17:10,8:5,9 | |
| 45321 chr22 50751556 . A G . PASS DP=50;SS=1;SSC=0;GPV=8.4786e-15;SPV=0.81825 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:25:7,18:6,11:1,7 0/1:.:25:9,16:3,7:6,9 | |
| 45322 chr22 50751818 . A C . PASS DP=46;SS=1;SSC=2;GPV=1.8161e-07;SPV=0.51751 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:18:11,7:6,2:5,5 0/1:.:28:16,12:12,6:4,6 | |
| 45323 chr22 50753709 . A G . PASS DP=48;SS=1;SSC=0;GPV=1.2355e-09;SPV=0.97927 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:22:8,14:4,4:4,10 0/1:.:26:16,10:9,4:7,6 | |
| 45324 chr22 50754275 . C T . PASS DP=69;SS=1;SSC=1;GPV=8.0845e-10;SPV=0.76377 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:32:19,13:10,6:9,7 0/1:.:37:24,13:10,7:14,6 | |
| 45325 chr22 50756251 . T C . PASS DP=80;SS=1;SSC=7;GPV=1.3596e-16;SPV=0.1758 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:43:23,20:8,15:15,5 0/1:.:37:15,22:6,10:9,12 | |
| 45326 chr22 50756702 . G A . PASS DP=65;SS=1;SSC=0;GPV=1.0519e-38;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:34:0,34:0,16:0,18 1/1:.:31:0,31:0,13:0,18 | |
| 45327 chr22 50759160 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=3;GPV=5.8427e-13;SPV=0.45749 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:20,18:12,9:8,9 0/1:.:29:14,15:8,5:6,10 | |
| 45328 chr22 50759324 . A C . PASS DP=52;SS=1;SSC=0;GPV=6.3169e-31;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:32:0,32:0,15:0,17 1/1:.:20:0,20:0,10:0,10 | |
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| 45383 chr22 50794754 . G A . PASS DP=83;SS=1;SSC=2;GPV=8.5168e-09;SPV=0.53699 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:33,13:17,10:16,3 0/1:.:37:26,11:16,6:10,5 | |
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| 45385 chr22 50797270 . C T . PASS DP=79;SS=1;SSC=2;GPV=1.2944e-22;SPV=0.56025 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:48:16,32:8,12:8,20 0/1:.:31:10,21:3,18:7,3 | |
| 45386 chr22 50797531 . T C . PASS DP=117;SS=1;SSC=4;GPV=0;SPV=0.37058 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:64:11,53:9,31:2,22 1/1:.:53:7,46:6,20:1,26 | |
| 45387 chr22 50799183 . G A . PASS DP=86;SS=1;SSC=5;GPV=2.7342e-07;SPV=0.26966 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:46:37,9:10,6:27,3 0/1:.:40:29,11:11,2:18,9 | |
| 45388 chr22 50799702 . G A . PASS DP=91;SS=3;SSC=19;GPV=1;SPV=0.01059 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:44:38,6:14,2:24,4 0/0:.:47:47,0:18,0:29,0 | |
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| 45391 chr22 50806911 . C A . PASS DP=148;SS=1;SSC=5;GPV=9.8563e-09;SPV=0.25404 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:77:66,11:28,5:38,6 0/1:.:71:57,14:27,4:30,10 | |
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| 45396 chr22 50807824 . T C . PASS DP=67;SS=1;SSC=2;GPV=1.8806e-09;SPV=0.61463 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:40:25,15:11,4:14,11 0/1:.:27:17,10:7,3:10,7 | |
| 45397 chr22 50807830 . A C . PASS DP=58;SS=1;SSC=4;GPV=8.0038e-07;SPV=0.34454 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:36:26,10:10,3:16,7 0/1:.:22:14,8:7,2:7,6 | |
| 45398 chr22 50807831 . G T . PASS DP=61;SS=1;SSC=2;GPV=8.7622e-07;SPV=0.56192 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 0/1:.:38:27,11:11,2:16,9 0/1:.:23:16,7:7,3:9,4 | |
| 45399 chr22 50807871 . T G . PASS DP=29;SS=1;SSC=0;GPV=3.3259e-17;SPV=1 GT:GQ:DP:AD:ADF:ADR 1/1:.:20:0,20:0,7:0,13 1/1:.:9:0,9:0,4:0,5 |