comparison test-data/297_reference.fa @ 0:de9cd3998571 draft

planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/sr_bowtie commit 19d31884000f86a5e5e07cd98ecd29fe6c9b1a7e
author artbio
date Sat, 02 Sep 2017 10:52:05 -0400
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:de9cd3998571
1 >FBgn0000005_297
2 AGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG
3 CACTCTAGTAATTTTCCATAACTGTATCCCAGCTGCGCAGACTCGTTTATCTTTTGCAGC
4 GCAGCGTTCTTTGTAAACATCCTAAAGACCTGCCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCA
5 ACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAA
6 ATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCA
7 AAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCC
8 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCA
9 GTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAATGGAAAATAAGTTAAAT
10 TTTATAGTCCTGTGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGTGAAAACTCTTCAACTTCA
11 ATTATAATTCCAATTCGGTTATCCAATAATAAGTGGAAGTGAAATACGAAACAAAAATAT
12 TAAGTCCAAAGGCAACTAAGTTTTAAAACCAACATATAAAAATAAAAAATTAAAACAATA
13 TAGAATTTTAATAATACAACACAAAAATTTACAAAACAAAAAAACAAACAAGTGAAACTA
14 GAAAGCTTAAAAATAATAATAACATTGAATCCGAAACAAAACAAAAAAATAAAACACAAA
15 AGTTAAAAATTTTACAATAAAAATGTCACAACCAATTATTGCGCTGAGCGACATAAACCT
16 TGCCGAAGCCCGTCGGCAGCTTAAAGACATTATGCCATTCAAGGGTGATCCAGAAACCCT
17 TCACACCTTTATCAGCAGAGTGGATTACGTAATTTCGCTCTACCAAACAAATGATGTCCG
18 ACAACAGAGGATTCTACTGGGAGCCATCGAAAGGAACTTGGACGGACAAATTACACGATC
19 TTTGGGACTTCCGAACGTCGAAGATTGGCCTACCCTTAAAGCAAGACTCATCGCGGAATT
20 TAAAATTCAAACACCAAACTACAAACTTCTGGAGAACTTCAGGGAGACACCATACAGAGG
21 AAGCCTAAGAGCATTCTGCGAAGAAGCGGAGAGACGACGTCAATTACTAATTTCGAAACT
22 ACACCTGGAAGGTAACCAATCGGATTTTCTTATTTATATTCAGGGTATTAAAGAATCTAT
23 TAAGATACTGATAAGGAAACTACCAATACAATTATTCACTATTTTAGCCCATCACGATAT
24 TACAGACTTAAGATCCTTAATTACCATTGCACAAAATGAGGGAATTTATGAAGAACACAT
25 TAATTTTGAATTTTATGAAAAACCAGAATATCGTAATAAAAATTCAAATTCTAACCAGAA
26 TTCGAAAACACAAAAATTCAATACAAATGTTCAAACTCAAAATCGACCAAGTTACTCACA
27 ATATTCCCAACCCTTCCAACCTAATTTTAATCAATACATTCAACCATTTAGACCTAGCTA
28 TACACAGCAGATAACTAACAACCCACCCATGTGGCACGCACCTAATTATTTCAGACCCAA
29 CCAATACATAAACCCACAACCCATTATTCAAAAAAATCATTTCCAACAATATCCCAACAA
30 AGCCCAATTTCCCCAAACAACGCATTTTAGAGGAAATACATACCCTCGACTACAACAACC
31 CTCTACATATAAAAATACTAACTTCCCGATTACTAAACGACTAAGACCATCGGACAGTGA
32 ACAAACTAAAATGTCTATTGACGAAATTAGATTCCAAGACGCGCATGAATTCGAACAAGT
33 CCAACCTAATTATTACGAGCAACAGTATTTTAACCAAAATCAATACAATCCGTATCAAAA
34 TCATAGCTTCATTAATGAAGGGCAACAACAAGTTCAATTTGTACAAATTAATAACAAACA
35 AAACCAAAATAATTCTGAACTAAACGAAAATTTTCGGTTAACAGTTCCGGAAAATACGAA
36 TACATAAAAATAGTATACAAAGGGCGTTCATACAAATGCCTTCTAGACACAGGATCAACA
37 ATTAATATGATCAATGAAAATATATTTTGTCTTCCCATTCAAAATAGTAGATGTGAAGTT
38 TTAACATCAAATGGCCCTATTACCTTGAACGACTTGATTATGTTACCCAGAAATAGTATT
39 TTCAAAAAAACCGAACCATTTTATGTGCACAGATTTTCTAATAATTACGATATGCTAATT
40 GGCAGAAAATTGTTGAAAAATGCTCAATCAGTTATTAATTACAAAAATGATACAGTTACC
41 CTTTTTGATCAAACATACAAATTAATTACTTCAGAATCCGAAAGAAACCAAAATTTGTAT
42 ATCCAAAGGACACCAGAATCAATTGCAAGCTCAGATCAGGAATCAATAAAAAAATTAGAT
43 TTTTCACAGTTTCGATTAGATCACCTAAATCAGGAGGAAACTTTTAAGTTAAAAGGCTTG
44 TTAAATAAATTTAGAAATCTTGAATATAAGGAGGGAGAGAAATTAACATTTACAAATACA
45 ATTAAACACGTACTAAATACAACACATAACTCCCCAATTTATTCGAAACAATACCCACTT
46 GCGCAAACACACGAAATCGAAGTAGAAAACCAAGTACAGGAAATGCTGAATCAGGGATTA
47 ATTAGGGAAAGTAATTCTCCATACAATAGTCCTACTTGGGTCGTACCAAAGAAACCGGAT
48 GCTTCTGGTGCAAATAAGTACAGGGTAGTAATTGATTATAGAAAGCTAAATGAAATAACC
49 ATACCTGACAGATATCCAATTCCAAATATGGACGAAATTCTTGGCAAACTGGGTAAATGC
50 CAATATTTTACAACGATCGATCTGGCAAAGGGATTTCATCAAATAGAAATGGACGAAGAA
51 TCAATTTCTAAAACTGCATTCTCCACAAAAAGCGGTCATTACGAATACCTTCGAATGCCA
52 TTTGGCCTTAGGAATGCACCCGCTACTTTTCAAAGGTGCATGAATAATATCCTTCGACCG
53 TTGCTTAACAAACACTGTTTGGTGTATCTGGATGATATTATAATTTTTTCAACATCCCTT
54 ACAGAACATTTAAATTCAATACAATTAGTTTTTACAAAGCTTGCAGATGCAAATTTAAAA
55 TTGCAACTAGACAAATGTGAGTTCTTAAAAAAGGAAGCTAACTTTCTTGGTCACATAGTT
56 ACCCCTGATGGTATTAAACCAAATCCTATTAAAGTTAAAGCCATAGTTTCATACCCAATT
57 CCGACAAAAGATAAAGAGATAAGAGCTTTCCTTGGATTAACAGGTTATTATCGCAAATTT
58 ATTCCAAATTACGCAGACATAGCAAAACCCATGACCAGCTGCTTAAAAAAAAGGACAAAG
59 ATAGATACACAAAAACTTGAGTACATAGAGGCATTCGAAAAACTTAAGGCTTTGATAATT
60 CGTGACCCAATTTTACAATTACCTGATTTTGAAAAGAAATTTGTTTTAACCACAGATGCA
61 AGTAACTTGGCCCTCGGGGCTGTCCTTTCTCAAAACGGTCATCCTATATCTTTTATTAGT
62 AGAACACTTAACGATCACGAATTAAATTACAGTGCTATCGAAAAAGAATTACTTGCCATA
63 GTTTGGGCCACAAAAACTTTTCGACATTATTTACTAGGACGACAATTTCTCATTGCCAGT
64 GACCATCAACCTCTTAGATGGCTTCATAACTTAAAGGAACCAGGTGCTAAGTTAGAAAGA
65 TGGAGAGTTAGATTAAGCGAATACCAATTTAAAATAGATTATATTAAAGGGAAAGAAAAT
66 TCAGTTGCCGATGCATTATCAAGAATTAAAATTGAAGAAAATCATCATAGTGAAGCTACT
67 CAACATAGTGCAGAAGAGGACAATAGCAACCTTATTCATTTAACAGAAAAACCAATAAAT
68 TATTTCAAAAAACAAATAATCTTTATTAAATCCGATAAAAATAAAGTAGAGCATTCAAAA
69 ATATTCGGTAACTCCATTACCACAATTCAATATGACGTAATGACACTTGAAAAGGCCAAA
70 CAAATTTTACTCGATCACTTTATCCATAGAAACATTACCATTTATATTGAGAGCGATGTA
71 GATTTTGAAATCGTTCAAAGAGCACACATAGAAATTGTTAATACCACCTACACAAAAGTA
72 ATTCGCAGTCTTTTCCTATTAAAGAACGTTGGTTCATACGCCGAATTCAAAGAAATCATA
73 CTTCAATCACATGAAAAACTTTTACACCCTGGTATACAGAAAATGACAAAATTATTTAAA
74 GAAAATCACTTCTTTCCAAATAGCCAACTATTAATTCAGAATATAATAAACGAATGCAAC
75 ATATGCAATTTGGCCAAAACAGAACATAGAAACACCAAAATGCCTTTAAAAATCACACCC
76 AACCCGGAACATTGCCGAGAAAAATTTGTAGTAGATATTTATTCATCTGAGGGAAAACAT
77 TACATCAGTTGCATTGATATTTATTCTAAATTCGCTACACTTGAGCAAATTAAAACTAAG
78 GATTGGATAGAATGCAGAAACGCATTAATGCGCATTTTTAATCAACTAGGAAAACCCAAA
79 TTATTAAAGGCAGACAGAGACGGAGCTTTCTCCAGTTTAGCTTTAAAGCGATGGCTTGAA
80 GAAGAAGAAGTCGAATTACAGCTCAATACAGCAAAAAACGGAGTAGCAGACGTCGAAAGA
81 TTACACAAAACAATAAATGAAAAAATTCGTATAATCAATTCATCTGATGATGAAGAAGTA
82 AAATTAAGCAAGATAGAAACAATCCTCTACACATACAACCAAAAAATTAAACATGACACT
83 ACTGGACAGAGACCTGCTCAAATTTTCTTATACGCTGGGCATCCCATATTAGACACTCAA
84 AAAATTAAAGAGAAGAAAATAGAGAAAATAAATGAAGACAGACGGGAATTTAATATTGAC
85 ACTAATTACAGAAAAGGTCCACTACAGAAAGGCAAATTAGAAAACCCATTTAAACCAACC
86 AAAAATGTAGAACAGACAGACCCTGACCATTACAAAATCACTAATAGAAATAGAGTTACG
87 CACTACTACAAAACACAATTCAAAAAACAAAAGAAAAATAATAAACTCTCAATTTCACAG
88 GCACCTGGTACCCGATAACACTATTGTTTATACTGATCACAGCTGTTCATGGACAACAAA
89 TTCAAATTAATAATATTGACACCAACCACGGATATCTCCTTTTTTCTGATAAGCCAGTAC
90 AGATACCATCCTCCTTTGAACATCACTCCTTAAAAATCAATTTAACTGAAATAGACATCG
91 TGGTTGACTATTTTGAGCAAAGACTACGAACCGATTACCATGCACCCCAGATCAATTTTT
92 TATACAATAAAATAAAAAGAGAACTAGCCAGAATAACCCTGAAACATAGAAACAAACGGG
93 GTTTTATTAACATTGTGGGTTCAGGTTTTAAATACCTATTTGGAACACTAGATGAAAATG
94 ATCGAGTCGAAATACAGAAAAAACTTGAAATCAACGTCCATAACTCAGTAAAATTACATG
95 AACTCAACGACGCCATACGATTGATAAATGACGGAATGCAAAAAATACAGAATTATGAAA
96 ATAACCACACCATCATTGACAGTCTTTTGTTCGAACTAATGCAGTTTACGGAATACATAG
97 AAGATTTGGAAATGGCTATGCAGCTTTCCAGACTTGGACTGTTTAACCCCAAATTACTAA
98 ACTACGACAAACTTGAAAATGTGAACAGCCAAAACATTTTGAACATTAAAACATCCACTT
99 GGATTAACTACAATGATAACCAAGTATTAATCATATCCCACATACCCATTTACCTTTCAC
100 TAATAAGCACAATTAAAATAATTCCTTACCCAGACTCCAACGGCTATCAGCTAGATTACA
101 CAGACACACAATCATATTTTGAAAAAGAAAATAAAGTTTATAATACCGAAAATAAAGAAG
102 TAAAAAATGAATGTGTCACCAATATTATTAAACACTTAAATCCAATTTGTAATTTTAAGC
103 CAGTACACACGAACGAAATAATAAAATACATAGAACCAAACACAATTGTAACTTGGAACT
104 TAACCCAAACAATTCTTAACCAAAATTGCCAAAATTCAATTAATAAAATAAAAATAGAAG
105 GAAACAAAATGATAAGAGTAACGCAATGCAAAATAGAAATCAATAATATAAATTTTAGTG
106 AAACTCTGTTAGAACCAGAAATAGATTTGACACCACTATACACACCACTTAATATAACAA
107 AAATAAAAATTGTAAAACACAACGACATTATTGAGATGATTTCAGAGAACAATATTACAC
108 TTTACATACAAATGATCATTGTAATAATCGCACTAATTTTGTTGTACTCATATTTAAGAT
109 ATGTATCATTTAAACCATTTATGATGTTGTATGCAAAACTTAAAATAAGAAAAAATCAAA
110 ATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAATTCCATTTCCCACACTATATCCAT
111 CAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGACGTATTTGGGTGGT
112 CCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT
113 AACTGTATCCCAGCTGCGCAGACTCGTTTATCTTTTGCAGCGCAGCGTTCTTTGTAAACA
114 TCCTAAAGACCTGCCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGA
115 ACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCA
116 ATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAAC
117 TATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACA
118 TTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACT