Mercurial > repos > bgruening > blobtoolkit
diff test-data/contig.fasta @ 0:7d9ee8cd14b8 draft
planemo upload for repository https://github.com/bgruening/galaxytools/tree/master/tools/blobtoolkit commit 7c0db48ffd4dbee68fb2320fc5a064bc9c3219d9
author | bgruening |
---|---|
date | Mon, 30 Jan 2023 12:39:40 +0000 |
parents | |
children |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/contig.fasta Mon Jan 30 12:39:40 2023 +0000 @@ -0,0 +1,100 @@ +>NZ_JAFJYB010000008.1 Candidatus Symbiopectobacterium endolongispinus isolate SYM 10, whole genome shotgun sequence +AGACGATGGAGTTGATTTGCCCTTCATCCAAGGCACGGCCAGGTTGCAAGTTCAACGTTACGGACGCAGAGGGTGCCCTC +TGTTCGCGAACAAACAGTGAGGGCTTAGGTATCGCCAGATGCACTCGTGCTGTTTGCACGGGTCCGAGCGTTTCAATGGT +CCGTGACAGTTCGCCTTCTAGCGCCCGCTGATAGTTGATCTGCTCGCTAAATTGGCTGATGCCAAACTTTTCCTGATCGA +GCAATTCAAAACCAACCGCCCCGCCTTTGGGAAGTCCCAGTTGAGCCAGGCGTAAACGGGTTTCATACACGTTTTTTGAA +GGGATCAGGATTGCACTGCCACCTTCAGCAAATCGGTAAGGGATATTTATTTTTGTCAGTTCGCTGACAATGGCTCCACC +ATCACGGTCATTGACGTTATTGTAGAGCACCCGGTAATCAGGGCCTTTTGCCCATAGTACCATAGCGACAACAATTGCAA +TTGCAGCGGCCGCCGCAACTAACAGGGGAATTTTAGGATTGGCGCGCAAGCGGTTGAGTATCTCGCCAAACCCTTTTCCA +CCGGACATAAAACCGGTTGCGGCGTTCATACTCGTCCTCTGCTTGGTTGTTGAGCGATAAAATTAACGTTGGTACGTAAC +AAAACAGCACTCCCTGATTGCGCAATCGTTAATACGTGCACCTACTTTTGTCAGCATAGTATTATTTTCCGTAACGGCAA +AAACGATGCTCCGATAAGGTGGCATTTTCCCCGTCTTTTACGCCTTTTAGGATAAGACTGATATGGTAGTTTAGTGCACT +GTGTTAATTGGGTGGTTTTTGTGCGATTAGGAAAAGTGGGGCAATAAGCCCCTTGTCGCAAAATCATTTGCGAAAGATGG +TGCTGTTGTGGGGCATTCCTGTCGGAAAAGGTGAGAGACAATGTCAGTTCAAGGTATTGAGAGCGTAGTGCAGCAATTGC +AGGCTACCGCGTTACAAGCGGGGAACAATCCTGGCGTTAAACCGACTATCGAACCTGGTTTTGCGAGTGAGCTAGAGTCT +GCATTGGATAACATTAGTGGCACTCAACAAGCCGCACGTGAGCAAGCGCAAAAGTTCACCTTGGGTACACCTGGCGTTGA +ATTGAATGATGTGATGGTGGATTTACAGAAATCCTCAATCAATATGCAAATGGGTATCCAGGTACGTAACAAGCTGGTTG +CTGCTTATCAGGAAATAATGAGTCTTTCCGTCTGAGCCGGTATCTGGCTAAATCGAGTTGGTAGGCTTCAGTGTAAAAAA +ACCATTCCGACGACGTCAGAATGGTTTTTTATTGCATGCGGCAAATTGCCCCGGCACCGTCACTCTTGAGGATTAATATT +GCCAGGAATAACACCTTGGGGTGAGAATTCACCGTAGGCTGCATTGACACTATGCTGCTTAACTGACGTTTGCATTAATG +AACTCAGCTCATCCATGCGTTTTTGCAGTAACTCTTTTATTTGCGCTTCACTTTCTACGATTTCTCGCAAAATTTTGCGA +AATTGCAACCGCATCACACTGTCCAGATTATCGGGGATCGGCATCTTGCTCAGATTCTCCACCGACTGGATGTAGATAAT +CTCTTGTTCGACCACTTCATCCCATGCGCCGTTGTTAGCCAGAGCCAATATATGTCGGCTCAGTAGCTGAAGCTGCTGAT +AATCCTTTAGCAGTTGCGAAGGCGTTGTCATTTATGCTGCTCCGCTCTGTACCGCTTGCGGTGTAGGGCCAATCTGGCGC +CAGGCATCAGAGATGCTGTTAAGCAATGTTTCAACTTCGTCGATAACTTTTGCATCATTATGCAAGTTGGCAATCATTAA +ACGTTGAACCATGTAATCATAAAGGGCTGCAAGATTCTCTGCCAACTCACCGCCTTTTTCTATGTCTAAGTCCGCTTTAA +GGCCATTCGTGATGATATCGATAGCTTTGGATAAAGCGTAACCTTTACCAGCAATATCATTCTGCTGTAATAAAATCCGC +GCACGGACCAACGCACTGCGCGCACCGTCAAAAAGCAGAACAATGAGCTGATGTGGGCTGGCGCTCATCACACTGCTTTC +CAGGCCAACTTGGGCATAGGCCTGGCTGCCGTTTCTGCTGTACATCAGTGACTTTCTCCATTAACTACCTTTTGTTTAAG +GCAGCGAGTTGTGTTGTCAGATAATCGCCGGTGCTATTCATTTTAGAAACCAACGTATCCAACTGGGCAAACTGTGCTTT +ATAGCGCGCAATAGTATCTTCGATACTTTGCTGAGTGAGATCGTAGGTTTTCTTAATGGTTTTCAGCGTCGCTGCAATAC +TGTCTTTCGCGGTTTGGATTGCCACTTTGCTGGAATCAAGAACGTTGTCTAAATAATTAGTGACTTGTGTAGCGTAGCCG +GTGGTTTTTCCATCGCCAACGAAGAAATCTAATACCTGACTGGAATTATCTGTCAGTGCAGTTGTTAGCTTATCGCTATC +AATCTCAAGCATGCCGGTTTTGGGGTTTTGTTTAACACCCATTTCGTTAAGCGTACTGATATCCATACCGCTCTGAGCGT +AGGAGATTTGTGTTTTCAGTGAGGTCTGGATACCTCTGACAGTACTGTTACCAAGCAATACACCGTTACTGGTGCTTTGT +GCATCAGAACCAGAATCTACCTCTGTGTATTTGGTCAAGGTACCAATTGTCGTCTGCAGTGCATTGTACGCATCGACGTA +ATTTTGAACGGCTGTCTTCATCGGTGCAATATCACTGGCGATTGATAATGTCTCTGATGAGTTCGTCGCTGTTTGGGGTT +TCAAGATTAGTGTAACGCCGTCAATAGCGTCAGAAATGTGTTACTTTGACGCTCAATCGTCATGCCATTGAGCTTTATTG +ATGCATTTTGCGCGGCAGTCTGCTGCGTCATTGCACCACTGCCAGCACCTGTATCGGAGGTATAATTCAATTTGCCATTC +AGCGTGCCATCACCGGTGACGCTGATAGTCATCTTGGCATCGGTGCCAGTGTCTTTGGCCGTGATAGACAAATAATAAGT +ATCGTCATCCACTTTGATGATACTCGCACCAACATTGCCATTAGCCTTATTAATTGCATCACGGATGCCCACTAATGATG +TTTGGTCATCGGTCAGTTTGATTTCAAGTGGTTTATCCTGACCTGGCTGGCTGATAGTTAGGGTCCGGGTATTGTTTTTT +GTCGCTGATCCCTGCTGTGCTGTATTGCTGGCAAATTCACCCGAGATCAAGGATTGCGCGGTAGCAAGTGTCTTCACTTC +TACACTGTAATTGCCGTTAGTTGCTTTGCTATCCGTTGTTGCAGTGAAGGCGGTATTGGTGCTGCTGACACTGGTTTTAT +TGATACTGCTTGCTTTGGTCAATGCTTCTGCGGCAGTGTTCAGCTTTTCTAGTGCACTCTTAAGGGTGTCAAAGGCTTTA +TCTCGGTTTTCTTAAAGCGTTTGTTGTGCCTTTACCGGGGTTAAGCGAGTCTGTTCATTGGTTGTTAATTGCGAAAGAAT +ATCGCTCATTTCGCTGGTGGAACCTGTGAAGCTGATGCTTGCCATGGTAATTCCTTATGAATAGGTTAATGCCTTCTAGA +AGCTTATCGGCAAATAATGAACAAAGTTTAGTATAATCTTTCAGTAGAACTGAGATGGCACGATGGCATCCGCTACAGCG +TATTTTAATCAGTAATCCACCTCGAAGGAAATTTTAAAAAATCATTAAAGCTTTTGAAAGGAGCGCCGATATCAGGTAGG +ACGGTGATGAAACCGTGGGCGGCAGACGCTGTCCCCCCTAACTGACTTGAATTGAGAAAGGAATACAACTATGGCAGTGA +TCAACACTAACAGCCTGTCTCTGGTAGCACAAAATAACCTGAATAAATCTCAGTCCGCACTGGGGACAGCTATTGAACGT +CTGTCTTCAGGCTATCGCATCAACAACGCTAAAGATGATGCTGCTGGTCAGGCGATTGCTAACCGTTTCACCGCGAACAT +CAAAAGTCTGACTCAGGCTGCTCGTAACGCCAACGACGGTATCTCAATCGCGCAGACTGCTGAAGGTTCTCTGAACGAAA +TCAACAACAACCTGCAACGTATCCGTGAACTGTCTGTTCAGGCGCGGAATGGTACTAACTCTGCATCTGACATCGACTCC +ATCCAGTCTGAAGTTAACCAACGTTTGGAAGAAATTGACCGCGTTGCTTCTCAGACTCAGTTCAACGGTATCAAAGTGCT +GTCCAAAACCAGTGCTGATACGTCTATTTCCATCCAGGTCGGTGCTAACGATAGAGAAACTATCAGCATCACCCTGAAAG +GCAACTCTGGCTGGAACAAATTTTATTCCGCTGGTTCTGCCGCTGCTTCTGGTGGTCAGGTTACTGTTTCCGGTACCGGT +ACTGCTGCTGGTCAACGTCAAGTTGGCGCGAAAGGTGTTGACGTTCTGGATACTACCGTATTGGCTGATGTTGACGCTGC +ACTGAAAGCCGTTGATACGCAACGTAGTGATCTGGGTGCGATTCAGAACCGTTTTGAATCCACCATCAATAACCTGAACA +ACACCGTAACTAACCTGACTGCTGCACGTAGCCGTATTGAAGATGCTGATGTGGCGACCGAAGTGTCTAACATGAGCAAA +AACCAGATTCTGCAACAGGCTGGTACTGCTGTATTGGCCCAAGCCAACCAGGTTCCGCAGACTGTTCTGTCTCTGCTGCG +TTAATTGCTATACTCAGTTTTCAAAGCCAGTCTCCGGGCTGGCTTTTTTTGTTTAAAAGCACAAGTTTTTATTTTTTACG +TTAGTGCCGGATAAACGGCTAGAAGAATAACGTCCTTGCTGGATTGTGCGTGTACCAAGGTTGATAGTCCACAGATTGGT +TTAATTGGGAGTTGGTCAAATGGCGGCTTTAGACAGTAAGTTGGACAACAAGAACAATAGTGACGTAAAGAACACCACGG +CTGAGGACATTGCTCCAACCCCAATGGAACGAGTCTATGGTTCGGTTGAACATATTCGGGCTGTTTCGTGGCTGTACGGC +ATCGACACTGTGCCTGCTGAATATTCGCGTACTTTAGTGCTTGGGTGTGAAGACGGATTAAACTTACTGCCTTTTGCCTC +CGCTTACCCTTCTGCGCAGATCGTTGGGGTCGAATTAGCATCAGAGCCTCTCCCTGAAAAACAGAAAAATGCAGATATCC +TGTTGCCGACCAACCTACATCTTTACAGTTTGTCTCTGGAGGCATTACTGGGCAACTCGTGGGAGAATTTTGATTACATC +ATTGTTCATGGGAGCTTTTCTCTGCTTGCCAATGAGGTGACCGATCTCTTGCTGGCGTTTTTTCAACAAAAGTTGAGTGC +GAAAGGCATTATTGCTCTAGATTGGTTTTGCCAGCCCGGAGCTAAATCCATGGAGGCACTACGCGATGCGATCCAACTTC +ACAGTTGTCGGGGAGAAAATTTTACCGAGCAAGTCGAGCAGGGAAAAGCGATGTTGTCTTGGCTTAATCAGGTATCCCCG +ATGTCAACTGCTACCGAAAGCAGTCTTGGCTTACCTCTGAAGAAAGCGAATGCACTGTCAGACGATTTATTCATACACTA +TTTTCTGGAAAGCAAAAACGAATCCAGTTATTTAGTCGAATTTAATAACCGTATCGAAAATTGCGGTTTGGCCTACGTGG +GTGATGTGAGGCCTGAAACAGAAACGCCCGATTTTTACAATAAAGCGTTAGATGAGCGGTGGCAGGATATCGCCTTTGGA +TGTGGAAAGGTGATGGGTCAGCAATATTTGGATATTGCAGTAAATCGTAGTCAGCGTTTTAGTTTATTGGTATCGCAGAG +TAGGGCTCCAGAAGTATCTGAACAGATTGATTATTCCCGATTGGCGGATATGCGTTGGGCTGGAGGGTTCCGCCGTCAGA +CTTCCGATCTTCGTGTTATTCATAACTCGCTCGCCAGTCATGATAGTGTCGCTGTTTCTACAGACAATATTCTGGCGATG +TGTATCCTTGACACCCTCGGAGATGCTTGGCCGTATAGTGTCAGCTTTGACCAACTCGTCTTTCATTATCGATTGCCAGA +TGATGATCCAGAATCGCCTTTTTCGGCCGATCTTGAGAAGAAAATAATCAATGCCCTGAAAGCATTGCTGAATAAAGGCA +TCTCAAGCCTCCATTTTCAGTTGGACAAAGATCGCCACAGTTTGTGCAATGAGCACCAAGTTGCAGCCAGCGAGAGTGTT +AAGCTCCAGTTGCAGAGTGCGCCAGGATCGCTGTCTGTGATTAATCTGTGGCAAGAAGTGGTGGGGCTTACGGAAGAAGA +ACGGGAACAACTGTTACTTCCAAGCTTAACCCTTACAGCAACCAACCGAACGTTGGTTGACAGCCTTCACCATAAAGGCG +TGTTAAATGCATCTGCACTGGGCTGGAAACGCTATTATCAGCAGGTCGCGCGCAATGCCGAATTGGTTGATCTTAATCGA +GTACCTTGTGCGTTATTACTGTTCTCCAGCGATGTTTCGGCAGGGGGATTCTATACTCGCACCTTTGAACTCCTGGCCAA +TGAAACAGATACAAACGCTGCGAATCAGGATGAAGACTCGATAGATGGTAAGTTGGTTGTTGAAATCAATAGTCTTCTGA +TTAAAAGTAAAAATGAAAAAGCGATCGCGCTGGTAGAGCATGAACGAGAGCGACTTCTGAAAACTATAAATGGTTGTTAT +TATTTATCACGATTTTATCGGCGGGTTGCGGATGATGCATCAACTGCACTGATGCTAACGCGTATATTATCTTATAACTC +AACGAGTTTATTTGTTTACTCAGGGTTGGCTATGGCGCTCTACCAACACCGAGTGTTTTGGACTGCTGGGCGGTTAGCCC +GTGCAATTTTGCGCTGTAACCGGAAAAGCTCGCCAGATTGGTTTTTGCTTGGACTCTTACATAAAGAGAGTAAAACATTA +GATCATGCCGAATACTGTGCACGACAGGCGATGGCATTAGTGCCAAATAGTCAGCAAATCGTTGGTCTATTGGGGGGATG +CCTTTGCGAACAGGCAAAGACCGATGAGGGAATTGCGTTTCTACGTAAAACGATAAGAGATCCGATTTCTGATTACTATG +TCTACAGCCAATTAGCATTTATTCTTTCTCACAGTAAAAATGCGACTGCCCAAGAGCTTATGGATTGTCATTTAGCCTAT +GCCAAAGGCGAAATGGCATGGGCAGCGCATCAGACGTTCGAAGGTTATCAACCTCTCGATAAATCTTTCGATAGGAAACT +GCGTATCGGTTTTGTATCTGGTGACCTTAGAGATTGGCATCCTGCGGGCTTTTTCTTCACACCGATTTGGGATAAGTTAG +ATCGGGAACAGTTTGAATTATACTGCTACAACAACAGCCCCTCCTATTTGTGCAATGCGGGTACGGATCACTTCGAAGCA +ACCGCAGATGCCTGGCGAGATATTCAACATGTCAACCCAATTGAATTAGCCGAAATGATAAAGACGGATAAGATTGATAT +ATTGATCGATCTTTCTGGGCATACCGGGTACAACCGGTTAAGTACCTTTGCGTTAAAACCTGCGCCGATACAAATTTCTT +GGGTTGGCTATCATGCTACCACGGGATTGCCTGTAATGGATTATTACGCGACTATTTTCCCTGTGGCGAAAGATCCCTTA +ATTGAGGCGCAATTTACGGGAAAATTGATCTACCTTTCTCTGCCGAATAGTTTTGACAACAAGGAAGCCACGATCCCCGT +CAACCCATTGCCCGCACTTAAGAACGGCTATTTCACCTTTGGCAGTTTCAACCGCCCGAATAAGGTCAATGATGATGTGT +TAGATGCGTGGGCGGAGATATTAAAACGCGTTCCAACGTCAAGAATGCGTATTGGCAACATGCCGAGCGCTATTTGGGCT