# HG changeset patch
# User bgruening
# Date 1580949438 18000
# Node ID 3ee0ef312022ac9b141b5d2f668fe597951da451
# Parent  1ce9b1d72ec37f152e5eaa0247eb8448a8928fcf
"planemo upload for repository https://github.com/bgruening/galaxytools/tree/master/tools/flye commit 1143ac8397d6fefb3f18d33bb752ee3f13c072d6"

diff -r 1ce9b1d72ec3 -r 3ee0ef312022 flye.xml
--- a/flye.xml	Sun Dec 02 12:53:28 2018 -0500
+++ b/flye.xml	Wed Feb 05 19:37:18 2020 -0500
@@ -1,4 +1,4 @@
-<tool id="flye" name="Assembly" version="2.3.7">
+<tool id="flye" name="Flye assembly" version="2.6">
     <description>of long and error-prone reads</description>
     <macros>
         <import>macros.xml</import>
@@ -35,6 +35,12 @@
     #if $m:
         -m '$m'
     #end if
+    #if $asm:
+        --asm-coverage '$asm'
+    #end if
+    ${plasmids}
+    ${meta}
+    ${no_trestle}
     2>&1
     ]]></command>
     <inputs>
@@ -51,12 +57,16 @@
         </param>
         <param argument="-i" type="integer" value="1" label="number of polishing iterations" />
         <param argument="-m" type="integer" optional="true" label="minimum overlap between reads (default: auto)" />
+        <param name="asm" argument="--asm-coverage" type="integer" optional="true" label="reduced coverage for initial disjointing assembly" />
+        <param argument="--plasmids" type="boolean" truevalue="--plasmids" falsevalue="" checked="False" label="rescue short unassembled plasmids" />
+        <param argument="--meta" type="boolean" truevalue="--meta" falsevalue="" checked="False" label="perform metagenomic assembly" />
+        <param name="no_trestle" argument="--no-trestle" type="boolean" truevalue="--no-trestle" falsevalue="" checked="False" label="skip trestle stage" />
     </inputs>
     <outputs>
-        <data name="scaffolds" format="fasta" from_work_dir="out_dir/scaffolds.fasta" label="${tool.name} on ${on_string} (scaffolds)"/>
-        <data name="assembly_info" format="tabular" from_work_dir="out_dir/assembly_info.txt" label="${tool.name} on ${on_string} (assembly_info)"/>
+        <data name="consensus" format="fasta" from_work_dir="out_dir/assembly.fasta" label="${tool.name} on ${on_string} (consensus)"/>
         <data name="assembly_graph" format="graph_dot" from_work_dir="out_dir/assembly_graph.gv" label="${tool.name} on ${on_string} (assembly_graph)"/>
         <data name="assembly_gfa" format="txt" from_work_dir="out_dir/assembly_graph.gfa" label="${tool.name} on ${on_string} (Graphical Fragment Assembly)"/>
+        <data name="assembly_info" format="tabular" from_work_dir="out_dir/assembly_info.txt" label="${tool.name} on ${on_string} (assembly_info)"/>
         <data name="flye_log" format="txt" from_work_dir="out_dir/flye.log" label="${tool.name} on ${on_string} (log)"/>
     </outputs>
     <tests>
@@ -64,27 +74,43 @@
             <param name="inputs" ftype="fasta" value="nanopore.fasta"/>
             <param name="mode" value="--pacbio-raw"/>
             <param name="g" value="10000"/>
-            <output name="scaffolds" file="result1_scaffolds.fasta" ftype="fasta" compare="sim_size"/>
             <output name="assembly_info" file="result1_assembly_info.txt" ftype="tabular" compare="sim_size"/>
             <output name="assembly_graph" file="result1_assembly_graph.dot" ftype="graph_dot" compare="sim_size"/>
             <output name="assembly_gfa" file="result1_assembly_graph.gfa" ftype="txt" compare="sim_size"/>
+            <output name="consensus" file="result1_assembly.fasta" ftype="fasta" compare="sim_size"/>
         </test>
         <test>
             <param name="inputs" ftype="fasta" value="nanopore.fasta"/>
             <param name="mode" value="--nano-raw"/>
             <param name="g" value="10000"/>
-            <output name="scaffolds" file="result2_scaffolds.fasta" ftype="fasta" compare="sim_size"/>
             <output name="assembly_info" file="result2_assembly_info.txt" ftype="tabular" compare="sim_size"/>
             <output name="assembly_graph" file="result2_assembly_graph.dot" ftype="graph_dot" compare="sim_size"/>
             <output name="assembly_gfa" file="result2_assembly_graph.gfa" ftype="txt" compare="sim_size"/>
+            <output name="consensus" file="result2_assembly.fasta" ftype="fasta" compare="sim_size"/>
+        </test>
+        <test>
+            <param name="inputs" ftype="fasta" value="nanopore.fasta"/>
+            <param name="mode" value="--nano-corr"/>
+            <param name="g" value="10000"/>
+            <param name="i" value="2"/>
+            <param name="asm" value="40"/>
+            <output name="assembly_info" file="result3_assembly_info.txt" ftype="tabular" compare="sim_size"/>
+            <output name="assembly_graph" file="result3_assembly_graph.dot" ftype="graph_dot" compare="sim_size"/>
+            <output name="assembly_gfa" file="result3_assembly_graph.gfa" ftype="txt" compare="sim_size"/>
+            <output name="consensus" file="result3_assembly.fasta" ftype="fasta" compare="sim_size"/>
         </test>
         <test>
             <param name="inputs" ftype="fasta" value="nanopore.fasta"/>
             <param name="mode" value="--pacbio-raw"/>
             <param name="g" value="10000"/>
-            <param name="i" value="2"/>
-            <output name="scaffolds" file="result3_scaffolds.fasta" ftype="fasta" compare="sim_size"/>
-            <output name="assembly_gfa" file="result2_assembly_graph.gfa" ftype="txt" compare="sim_size"/>
+            <param name="i" value="1"/>
+            <param name="meta" value="true"/>
+            <param name="plasmids" value="true"/>
+            <param name="no-trestle" value="true"/>
+            <output name="assembly_info" file="result4_assembly_info.txt" ftype="tabular" compare="sim_size"/>
+            <output name="assembly_graph" file="result4_assembly_graph.dot" ftype="graph_dot" compare="sim_size"/>
+            <output name="assembly_gfa" file="result4_assembly_graph.gfa" ftype="txt" compare="sim_size"/>
+            <output name="consensus" file="result4_assembly.fasta" ftype="fasta" compare="sim_size"/>
         </test>
     </tests>
     <help><![CDATA[
diff -r 1ce9b1d72ec3 -r 3ee0ef312022 macros.xml
--- a/macros.xml	Sun Dec 02 12:53:28 2018 -0500
+++ b/macros.xml	Wed Feb 05 19:37:18 2020 -0500
@@ -1,7 +1,7 @@
 <macros>
     <xml name="requirements">
         <requirements>
-        <requirement type="package" version="2.3.7">flye</requirement>
+        <requirement type="package" version="2.6">flye</requirement>
             <yield/>
         </requirements>
     </xml>
diff -r 1ce9b1d72ec3 -r 3ee0ef312022 test-data/result1_assembly.fasta
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/result1_assembly.fasta	Wed Feb 05 19:37:18 2020 -0500
@@ -0,0 +1,667 @@
+>contig_1
+TTCGTTATTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTCGATTTTTTGGCATAAAGTCTAAAATTG
+AGCTACAGACTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTCAAACCACAAATAGTTTGCACACACA
+AAATTTGAAATCTGTGCGACCACTACTCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTAT
+GACTCAGGATTCAACGAAATTTCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATAGAGATGTGTACA
+TTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTTCGAA
+TCTGAACTCGAATCAGAATCAGATGTGAGTCAAATATTTTTGTCTGATGGATCAGGTTTA
+AGACTAGACTGTATTTCAAAAGACTTATTACCTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTTCCTATT
+TTTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACATATTGTTGATAATAGTGGGTCGAGGAATCAATAGC
+TCTGTGGAAAATATCATCATCGTATTGATCAAACTATTTTTCCTTGCATGTGATAATCGG
+TCCTTTTGCTTCAGGATTTATTCCGGGCTTCATAGCATTTCGCCTAGGCATCAAATTAGA
+CAACGCCGAATTATTGATTTGATAGCCGTGGACCAATTACTTTATGGATCGTTAGTGACA
+TAGGATACCATGGATACGTTTACATATATATAATTGAAAAGTTATATCGCAAAAGAACGA
+AATTTGTCGGAATTTATAAAATAGTTGGATGATATTGCTATTAAAATAATGTGAAACTTT
+TTTTCCAAAGATTTTCGTTAAAGCTGGTTATCGACGAGAATTTGGTACTTGCAGCTCTTC
+TTGCCGTATTACCATCATTGCTATTACCGCTGCCATTCTGCTTCGGCATGCTTACTCGAA
+GGCCCATTTCTCTCCACATTTCCTCCTGGATATATTTTTTCGAATACTCATTTTTTTAAC
+CTTGTCCTCTCCTTTTATATGCCACTTTTTTTATCTCAGCTCTGTATGATACGTTTTAAA
+ACAAATTCAAAAAAACGGATCAGGCATGTAAATCGGACTTACCCCAAATTGTAAAGCAGC
+ACTTTTGGTACAAAAGGTTTCTGAACTAAAATTTGAAATTTTCAACATTTGTGTTGGGCT
+GACTCCACAGATCGGACAACGTGGAGTAGATTTACAGTGTCTGTTAATACGTTTAGGACT
+TTTCCATCTATAAGTGTCATGTGCATTTCATAGCTAAATTCTATGTCACGATTTTCATCA
+TGTTAAGTGAATGGCGTAAGATTTTTTTTTAATTTGATTATCTAACTGATTTTTCCATCA
+TTATGTGGACAGCAGTTTCCTTTATCAACTCAATTTTAGGAGTCTGCAAAATCCAGATGG
+ACTGCGGTGCTCTGTTTATCCAGATATGCCGATTAAACGAATCTATAATTTATGGGTATG
+ACAGAAGTTACAAATAAAGATTGATCAGAAATTGGTGTGCCAAGTGCTTCCAGTTTCATA
+TTTCTGCTTGTAAGCACTATGACCAGTTGTCCCATCAAATCCGTAGCTGCAAATTAATTT
+GATTTAAAGATATCTGGAAATTCGCCGAATACATCAGATTGCAGCAATTAATCTTTGCGC
+TTGTATGATCAAAGAGATTTTGTAATAGCACTTGAGCAGTGTTTCCATTACTTCACCCTC
+TGGTCGGCACTGTAATTTAGCTTCGATCACTTCATTATACGGCGGATATATATCGCCGTT
+ATGGCTGTTAAAAGCCTGGTGCTTATATATTGCTGTTTTGTCAGCGTGTTTTCCAGGAGA
+TAAGCTAGAGCTGTCTGGTGAAAGAGTTGGTTTTGGCATTGAACATCCTCGATTCGCTTG
+GAAATTCTGGTGTTTTAAAGTTTCTTTAAGAACAAAGGCAACGTCCTCTTGCATTCTTTT
+CTAGCAGACGCAGTTGCTGCATGAATCAAAAGACTTGTGTCGTGGTCACTTTCACTTGCC
+AGATTCGATGCCAGTTTCCTTTTAATCTTTCTCCTGCATTTTGGTAAGATAAGTTTCGGC
+GTCCCATTTGCTGGGGTATATTGGAGTTTTCAAAATCACTAATCACTTTTCTAGTAGAAA
+ATAATTGCTTCAGAGGACGATATATTGACGCATAAAAGAAATTTAGGCTTTATGCCACGG
+ATGTCTGGACCACAGTGCGCTGCTACGCTACGCTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAG
+TTCATTTCGACCCATATAATTGAAGATAAGGATAGTAGTTCGATGCATTTTCCTAAACTA
+ATCCGTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAAGAAATCTCTTATTGAGTAATTTTTG
+CTTGTCCACGACAAAATAAAGGAAAAAATAATTAAGATAGGAATGCAAATGTTGGTATTT
+AAGTTTACATTACTACTTTTGTTTGTTTGGCTTACTTTACATTAGAATTATGTATGATTA
+ATTGATATTTAAACTATAAAATTCTTTAAATTAAGAGACCTAGATATACGATTCATTAAG
+GCAAGGTATTTTTAGCACACTAGTTTAGGAATATCTGACTTTATATATGCACGTGTGTTA
+TTATTATTTTGTTTGTTCACGCTATGCCGTACTTACGCACTTTCCATCGATGTCAGCAGG
+CCTGAATGCGATGATGATCTGCTGTATAGTATTAATATATAAATTGGGAGAAAATCACAT
+ATATGTGTTTGTCAGATCTCCCACAGAGTTAAAGCTAGAATTAGAATCGTAGAGGTTTAT
+AGTAAATATTTTTTGAGGCAAAATTAACACATATATGAAGAAACTATTCCAAGATACTCA
+AGACTGGACACGATCATTCGTGTTGTGGCTACTTCAGGTTCGCAGCATACGCAGCTGGCG
+CAAGAACTCAGCAAACCAGCTCTGCGATCTTCACTTGGTTAGCAGAAGAAAGGACAAGCC
+AACACCGCTGCACGCGGTGGGTGCTCTGATGCAAGCAGTTGTGAGATCTTTCTGCGATCG
+ATGAAGCCACCGTAAATTTTACACGTGGTCAAAGTTAGGGCGAAGAACAATGCCGATGCA
+ACTAAGACTTCTACTTCACGATTTAAACTATCACTTGGCGGTATTTGCCTTGAAAAGCTC
+TTATCTGGTCTACACGATGCTCGTGGATTTATAATCAGGGACTTTGCATCCGATTAAACT
+GCCTCGATCACGCCTTCCGAAAGAGAGCGGTGGTATGCAAATCAAGTGTAATGACCGTAG
+TTTGCTGACAATCCAGAGCTCAGGAATTTTTGTGGTACATTTTATATTCAGTTTTGCCAG
+GATTTGGATTTGGCTATAATGGTTTGTTACCAAATGAGTGCGATAGCGCACATATAAGGT
+GCCATTTTGGCTCGACTCCACGACCTCCTCCGGTCGAGGTCGTAGCTGAAGCTACCTGGC
+TCAGTAACTTCTCTAAAGGGTCAGCTAGCATGTCTACGATGCTGTGCACCCAGGCACTAC
+TATGTTTGGAGGGACTTGGGTACAGCAGCCTCCACTGGCCCCTACCTGTTTCGCCAGCGG
+CTACGTCTCTTCGATGAGCAGTGCAACAAATCGATTGGTATTTGACTGCGGCTACTCAGT
+ATCGCTGACCTCATCGACTTTGTGCCAGTTTAACCGTCTTTCTTATGGGGCACGGTGAAC
+TGTATAATTTCGCCGGCCTCTAGGGATTCGTTGTCCTTACATTATCTCTTTCAATTTCAT
+TGGAGCTGGAGGTGGAGCTGCCAATGGCCGATATATTTCATGGAATTTTCGAGTACCTTA
+TGTGCTGGATTTCGATGATGTGGGTGCGGCGGGTGGCGGCTCCTTACGCTTCCTATGGAT
+TATTTTTAGGCACAAGCGTATGCCAACGAATTTCTTCTTAGAAAGTGGACATGGCCGCTT
+TATCCATTTCCAGTGGAGTCTGCCATGGTAATTGCGTGCAAGAGCACGTGTCGTTTAAGT
+TTTTGCCTCTTCTGGATGTGTATGATGGCACGTTTGGCAGCGGTCGGGCGTAGAAAATAT
+TTCTGTTGCTGGCAGCGACGGCAGTGCAGCCGACCGGTACAGTACCGTTCAGCTTCGAGA
+ACGATCCGCATGCGCACAGGCAGCATTTGCCTGTGTTGAAGTTACCGTTATTCACTCGAT
+TTTCGGTAGCCAAACAGATCGCTCGGCGTAAGAAGTAGTCGTCGTGAATTTTCCGCTGGC
+ACGTATACGCACTGCGAGTTCGATCTTGACTGACTGAGCTATCACGTGTAAATCCATTTT
+GTTTGTGTGTTACAGAAGTTGCGAAATTCGCTACTTGTGAAGCATCGTCCTCGATCCGCT
+ATAATCCTGCGGACGCTAAATGTCGATATGGCGCTGCACTGCTACTGCATGCAACTAATC
+GAGTCTCAATTCCAGGTCTGGTACAAATGGGCGTGCTTGGTAGAAAGCATCAATTTGTAC
+AATGACGCATATTCCTTTTCGTCTTTCTTGCCACTCAATTTCAATTTCTCAATGGTATCT
+TCATGCCATCATGTGCACTATGGCCTCGTGTATATGATTAACAACGGACCATCTAAACGC
+CTCGAAATAACAGGAAAGCATCGCGTCTTGCCATTTCTTTGAATAATACGATGGAACAGA
+CTGTTTCTAATCTCATACGTGTTCGCTAATTCTCTCTGCATCTCGTCACTATTCAACTCG
+CTCATAATATTCAATGTTTTCATCGCGCTGCTGCTCGGATGCTAGCCAGTTAGTGTGATA
+GTTGCCAAGTCAACTCTTACTTCTACAACTTTGCTTGACTTTGCTTCTAGAGCTACAGGA
+TTCCTTGACAAGAAATCAACATGAGCCATTTGGCTTTCTTTACGATATTCAACGTGGTAC
+TCAAAGAGACCACCATTGCACCTGGTTTTATGTGTTTTTTTGGCAGAAATTTGAAATGAT
+GACCTATCTTCACCAAATTTGGGTTTTGTTGTTCTTTACTTCCCCAAGATGATTCACAAA
+GTTTCAAGTGATTTGGTCAACTTTCATATAGCTGCCATTTAAACAGATAGGCCGATATGC
+CATAAAAATATTTACCTTACCAAAGAAAAAAAATGTTGTATCTATATTTAATTACATATT
+TTATTGATATTATATACAGAAAATCAAATAAAATAAAATCATATTAAGATGTATATGATG
+GTCCAAATGATTTTGTCCTGAAATTAAAAAATAAATTTATCATATGTCATTGTTATGCTA
+TTATACTTACAAAATTAAACTTATTATTTATTAATTAAAAAAAACTCTTGGTCTGAGGCT
+ATTACATCAAGTTCATGATCTTTCTGTAGAAGTTCTCTTTTATCGTCCTCCTCGCCCTCG
+TCGATGTTCCTGGCAATCACCATGATCATCATGATCGCTTCCAACGCATGGTGATTTAAG
+TAGAGAAATGACCTCTTGCGGCATATTTTGTTTTATTTTTCCTTTGTCTTTCTTTTAGAT
+AAATACTAGACAACAAAGGATCAGACGTATCTAGAGCTCTGTTAAAAATATCGGTCATAG
+TATCTAGGCGACTGCATTTTCTTGCATGTCTTCTCCGATCGCTCTTATATAATTTGTTCC
+TCGATTCGGACGCATGCTCACCAAGACAGCCAACAGGCACCAAACAATTATCTATAATTT
+CATGCCAATGAAATTGTGAACATAGGATACCAAGGATATTTGTTTTGATAGGCCAAAAAA
+CACTTTTACAAAATGTTTTTAAATTTTTCTGAGTCAATTTCATATTGTGAGGAAATCGTT
+ATTAAAATAATATAAAACTATAAAGAATGTCGTAATCAATATTTAATATTGACGACAGTA
+AGGCTGTATTAGAAAATGCCCTTTTGGCTGTATTGCCATCTTTTGAATAACCGCTTCCAT
+TCAGTAACGGCTTGTCCACATTGAGACCCATTTTCTCCATCATTTGTTTTTGTGTAAAAT
+GCTTTCGTTTCACTAATTTAGGTTTATCAAAGTCCTTTACATCCCAAGTTTTAGCTCTGT
+ATGCAAGTTTTAAAACAAATTCAAAGCAGATCCACGCATGTAAAGGGCTTATTCCAAACT
+GAAGAGTTTGAGACTTAGTATCAAAAATATCTGAATTAAAATCATTCACATTCATTAAAT
+GCGTTGGCTTTGCTCCGCAAATCAGGGCAACATTAGCAAGAGTTACATCCTGTTAATATG
+TTTAAGACTTTATCGTCTGTTAGTGTCATTTGACAGACATATTTTACAAATATATTAATG
+TTGTTTATTTTATGCAAATATATGTGCAGCTTACGAGTCAGGGTATCCAAGTTTTCTTTT
+CTGCTAATATAAGCTCTCGAGTTTTCTTAATGAATTAAATTTTAAAGGATGACAAACCGT
+ATAGATTGTGGCGATCTGTTGATCCAAATTATTTTTGTTCATTGTGTACTAATTTATAGC
+GATCCATCATATACATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAATACTATTTCAAT
+TGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTCTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTC
+TCTGCAGAGTGGCGAGTCGATCAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATAGTAAGGA
+TGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATATTAGGTATGTATGAC
+TAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGG
+CCGTCCTGACAACTAGATCTTCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGC
+TAAGGGTCCTGTTCCTTATTTTATATTTCTTAGTAGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAAC
+ATTTTTTTAGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAA
+TTATACTTTCTATTTCGTAAAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTATTTTGTACAGAGTTT
+CTTATATTTTTTTTATTTTTCTATTTTTCTATATTTTTCTATTTTGTAGACTCTTAATTT
+TTTCTTTGCCAGTGTTTTATATTCTGTATGCTCCATACATCCCGGTAAGGATTGCGAGAA
+ATTTGAAATCCATTAACATCTTCCAGAAGGTAGCGATCATTTTGAGAACTTTGCTTATGA
+CATAGGGTCCTTTATGCTTTGGAATTAACTTCTTAGCTATGCCTGTTGTTGAGTCAAAAT
+TTTTAACCATGACGTAGTCGCCTTTTGTGAACACTCCTGATCGTTTTCGTTTTTTGTCAA
+CATATTCTTTATTGTATGCTTGTGCTATTTTCTGACTTGCCTCGCCTTTATTTCTAATAC
+TTTCTAAATCTCTTTCTTCAATCGTTTCTCCAATTTCCTCAATTTTTTCTTTTAACTCAT
+CCATAATTTGTCCTTTTTGTTGTAAACCAAATAACATTATGCTAGGATACTGTTTAATGC
+TGCGGTGTTGTGCATTGTTCAGGGGTATATTCGACCTTTTCGAAGACTAAGTCCCAGTGT
+AGACCTTGATCAGGTTCAATTAACTTGCTAATCATTGGACCAAGACTTCGGCTTATACGT
+TCAACTTGACCGTTGGCTTGTGGCGATCCTGTTGCAATTTTTATGTGTTTAACATTGCAT
+TCTTTCAAAAATGAGTCAAAATCGCCAGACGTGAAACATGCTCCTCTATCTGATATGATA
+CACTTAGGCCAACTGTATGCTCGACTTCTTTTAACGACTTCTTTTGTGTTCGTAGTTTTT
+GTTGCGTATAGTCTGACAAACTTTGTGAATGCATCTACTATCACTAGAATATGTTTCTTC
+GGTCTACCCAAGTCTACTGGACCATAATGGTCAATATGGATGATTTCAAAGGTTTGTTTC
+CCTTAGGTATGTTGTGTAGAAATCCTTCTGTTTTTCCTGTTTTGGGACTGAATAAAATAC
+ATTTTAAACAGTTGCTGATATGTGTGCTACACTTCTGTTTTAAATTTGGAAACCAATAGT
+TTTTCATTATAGCTTCCATCATTTTGTCTCTTCCTACGTGTCCAAGTTCGTTGTGATTCT
+TGTATAACACTTGTTCTTCCATTTCTATCGGAACGTAGAACAGCAATCTATTTTATTTGT
+CTTTTGTAAACTATACCATTTCTCATCTCATACAATTTATTTTCTGTGTTTTCTAACAAT
+TGCCTGATTTCTTTTAATTTTGTATCTTTCCCTTGACATATAACTAGATTATCTTCGAAA
+CTGTTTGTTTGTATTACCATAATATTTGTACACCTACTCAGTGCGTCAACATGTTGCATG
+CGGCTACCTGCCCTATGCACAATTTCAAAATCATAACCTTGGAATTCTAAAGCCCACCTG
+GCTATTCTAGGGTTTAGCTCTTTTTGCTTAAGGTCAAAATTAATGAGTTACAGTCGGTGA
+CTATTTTAAATGTCCTCCAATGAAGATAAACTCTAAATCTACGTAACGAATAAACAATGG
+CTAAAGTTTCTAACTCGAAACTGTGGTATTTTGATTCAATATCTGTTGTCCGTTTTGAAA
+AGAATGAAACTGGGTGCCATTTCTGGTCGTCCTTCTTTTGCATAAGTACAGCACCGAATC
+CAGAAGAACTTGCATCACAATGCAATTCTGTTTCGTGTTTATGGTTGTATATAGCTAAGA
+CCGGTGACTGTATTAATTTATCTTTTAACATATTAAAACAAATCATTTCTTCACTACCAA
+ATTTGAACGGTTTATCTTTTTTAAGAATGTCGTTCAGTGGTTTAGCTAGTCTAGAAAAAT
+CTTTTATGAACCGTCGAAAATATGAGCATAATCCCAAAACTTTGTACTGTATGAACATTG
+TTAGGTATTGGGAAATTTTTTATTGCCAATTTTATTTTATTTTTATGAACCCAAGATATT
+TTATACTCGATTGCATAAACTCACATTTGTCTATTCTTAATTCAAGTTTATTTTCAACTA
+ATCTTTTAAAAATTTCTTTCAACGTTTCTAAGTGTTCGTTTATATTTTCGGTTGCCAATA
+GAATGTCGTCCATATATACTACTACTTTGTTTTCTCTAATCATATCAGCAAAATGTTGTT
+AACAAATCTTTGGAACACAGACGGGGCGTTTTTGAGGCCAAATGGCATTTACAGCCACTC
+GTATTGGCCTAATGGTGTAACGAAAGAGGTGTATTTTATTGATTCTTTTTTAACATGCAC
+GTGGAAAAACCGTTTTTAACCGTTTTGGTGAAAACAGTTTTCTCATTCATTCTATCTAAC
+AAGTCATCTATAAGAGGTAGAGGATAGTTGTCTTTCATTGTCATTTTATTAAGTTTTCTA
+AAGTCGACGCACATACGTAAGTCTCCAGTTTTCTTTTTCACTAAAACAATAGGCGATGCA
+TATTCCGAGTCGCTTGGTCGTATAAATCCATTTTCCAAATATTCGTCTAATAGTTTTTGT
+AACCTGTCTTTTCTGTGTATGAAAGCCTCCTAGGAAAACAGCTAAACGGTTTCGGGTTTT
+CCAAACACAATTGTATTTCACTTCTAACTGTCGGTTCATTTGGCCTTTTTGCATTTATAT
+AAAAATTTCTAAACAACCTATCGAATTCTAGTTGTAACCTATTGCTAACATTTTCTCCTA
+TTTTGTATTCTAATTCACTTTCAGTTACATGACATATTCTTAGTACTTCCTTATCAAAGT
+TGTCATTTAATTGTTCGTAAACGTTTTTATCTTTTGGCAATTTAAAACTAACGATTTCTT
+TTGAAGTGTTAACAATTTCATCTTCTGATAATTTTGATTTACTGACATTCTTTTGTTGAC
+TAACTCATTCATCTCTTAACGATAGTGGACCAGTTTATTTATGCTGTTGTTAATTTTTTA
+ACGATTTCGGACTAATAATTGCATTTTTAAACGATTTTGGACTGACAATTGAATTTTTAA
+ACGATTTTGGACTAACAATTTCATTTTCTAACGATTTTGGACTAACAATTTCATTTTCTA
+ACGATTGTGAACTAACAATTTCATTTTCTAACGATTTTGGACTAACAATTTCATTTTCTA
+ACGATTTCTCAGGACTATCATTTTGAGTATACATTGATCTTTTGTTTATTTCCATGGGTT
+TTCTCAACGCAATCATTCCCAAGGTGTACGGGTCTAAATTTAAAGTGCATGCAGTTAAAA
+AATCTCTGCCGAGAATAACATTATACCTCATAGACTGGTCGCAAACAATGATTAAACGAA
+AATATATTTGACGGAGCGTAGATTTAATCCAAATTGTGAAGCGAGTCCCTGTAGTTTTCC
+TCTTTTTGATTCTTGCCGCTGCGTGTGTGTGCTTTTCCTCGTTCTCTTCTCGATAGACAC
+GCACGGCCACACTACTATCAGGGCCACACTCGATCTCAATGTTATTGAAATCTCACAATC
+GATTACAACTCGTCCTATCGATAAGTCTCGTGAACAGTTGACCATCGATAGGGCGCCTAT
+TTCAAAATATCATTCCCTTCTCCGACATATTTTTATTGATCCTTTCAATACATAACATGT
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