diff test-data/glimmer_w_icm_trans-table-11_genomic.out @ 2:8a7c41685ebe draft default tip

"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/glimmer commit 274d1f6804bfd0362fdcd2383bfdb32ca8fd634e"

--- a/test-data/glimmer_w_icm_trans-table-11_genomic.out	Tue Oct 30 18:51:01 2018 -0400
+++ b/test-data/glimmer_w_icm_trans-table-11_genomic.out	Sun Mar 20 10:08:56 2022 +0000
@@ -1,61 +1,69 @@
 >gi|333028963|ref|NZ_CM001166.1| Streptomyces sp. Tu6071 plasmid pTu6071, whole genome shotgun sequence
-orf00001      897     2918  +3     3.19
+orf00001      891     2918  +3     3.28
 orf00002      938      144  -3     2.86
-orf00003     7368     7237  -1     2.50
-orf00006    10347    11945  +3     2.93
-orf00007    12238    12110  -2     6.22
-orf00008    15088    13067  -2     2.95
-orf00009    15045    16529  +3     3.36
-orf00014    21385    20276  -2     2.90
-orf00016    23037    21382  -1     2.93
-orf00017    23031    24797  +3     2.92
-orf00020    27291    27115  -1     1.92
-orf00021    28556    28960  +2     2.51
-orf00022    29040    30026  +3     0.40
-orf00025    33151    32942  -2     1.06
-orf00028    38242    34754  -2     2.97
-orf00031    43300    43100  -2     6.70
-orf00032    43402    43497  +1     0.97
-orf00033    45157    44963  -2     1.68
-orf00034    47430    46852  -1     0.78
+orf00004     4695     5606  +3     0.63
+orf00005     5833     6183  +1     1.21
+orf00006     7368     7237  -1     1.69
+orf00009    10347    11945  +3     2.93
+orf00012    12238    12110  -2     4.26
+orf00013    13564    13067  -2     2.78
+orf00014    13521    16529  +3     3.62
+orf00018    21385    20276  -2     2.90
+orf00020    23037    21382  -1     2.93
+orf00021    23031    24797  +3     2.92
+orf00023    27291    27115  -1     8.70
+orf00024    28860    30026  +3     0.20
+orf00025    33151    32942  -2     3.88
+orf00027    36932    38236  +2     3.00
+orf00028    36949    34754  -2     2.95
+orf00029    43300    43100  -2     3.03
+orf00032    47445    46852  -1     2.60
 orf00036    51314    48354  -3     2.96
-orf00037    55329    55069  -1     1.43
+orf00037    55290    55069  -1     3.18
 orf00040    59457    56431  -1     2.96
-orf00041    59669    60169  +2     2.15
-orf00042    60516    60881  +3     0.34
-orf00043    62032    60959  -2     2.90
-orf00044    61997    62821  +2     3.73
-orf00046    66395    62922  -3     2.97
-orf00047    70996    71166  +1     0.90
-orf00049    81960    81835  -1     1.90
-orf00050    87355    89982  +1     2.96
-orf00051    90028    90390  +1     1.66
-orf00053    91917    92009  +3     0.65
-orf00054    93540    93307  -1     1.81
-orf00055    96379    94568  -2     2.94
-orf00056    96523    96383  -2     0.37
-orf00057    99628   100467  +1     3.23
-orf00058    99645    98455  -1     2.91
-orf00062   100811   102931  +2     2.95
-orf00065   103074   105521  +3     2.96
-orf00066   106200   105847  -1     0.32
-orf00067   108365   108069  -3     4.89
-orf00068   110498   109947  -3     0.90
-orf00069   110907   110791  -1     2.13
-orf00074   117071   116538  -3     0.81
-orf00075   117733   117443  -2     0.01
-orf00076   118776   118399  -1     3.59
-orf00077   119740   119582  -2     0.41
-orf00078   123152   123484  +2     2.86
-orf00079   123767   123925  +2     0.89
-orf00080   126459   124906  -1     2.93
-orf00084   128992   126704  -2     2.95
-orf00085   129178   129011  -2     1.85
-orf00086   132172   130337  -2     2.94
-orf00088   134993   136987  +2     2.94
-orf00089   137523   137245  -1     1.14
-orf00092   140512   137825  -2     2.96
-orf00093   142487   140766  -3     2.94
-orf00094   143056   142484  -2     0.89
-orf00095   143578   143099  -2     0.42
-orf00097   147016   144230  -2     2.96
+orf00041    59669    60169  +2     3.46
+orf00043    60516    60881  +3     1.56
+orf00045    60878    62821  +2     2.93
+orf00046    63564    66248  +3     3.14
+orf00047    63596    62922  -3     2.84
+orf00048    70422    70520  +3     0.07
+orf00049    75466    75654  +1     2.06
+orf00051    81960    81835  -1     6.45
+orf00052    87355    89982  +1     2.96
+orf00053    90028    90390  +1     0.39
+orf00055    91917    92009  +3     1.32
+orf00056    93406    93576  +1     2.94
+orf00057    93837    93998  +3     1.65
+orf00059    96379    94568  -2     2.94
+orf00060    99628   100467  +1     3.07
+orf00061    99645    98455  -1     2.91
+orf00063   100811   102931  +2     2.95
+orf00066   103074   105521  +3     2.96
+orf00067   106200   105847  -1     1.02
+orf00068   107401   106526  -2     0.12
+orf00069   108365   108069  -3     3.46
+orf00070   110498   109947  -3     1.27
+orf00071   111060   110791  -1     1.52
+orf00073   112883   113158  +2     0.43
+orf00075   115660   115022  -2     1.43
+orf00076   115768   115661  -2     0.06
+orf00077   116553   115729  -1     0.92
+orf00078   117080   116538  -3     0.58
+orf00080   118857   118399  -1     2.71
+orf00083   123230   123484  +2     3.73
+orf00084   123689   123925  +2     4.44
+orf00085   126459   124906  -1     2.93
+orf00089   128992   126704  -2     2.95
+orf00090   129178   129011  -2     2.06
+orf00091   131737   130337  -2     2.92
+orf00092   132830   131802  -3     4.65
+orf00093   134324   134983  +2     0.80
+orf00094   134993   136987  +2     2.94
+orf00095   137523   137245  -1     3.06
+orf00096   137942   139042  +2     5.32
+orf00097   139202   140140  +2     5.82
+orf00098   137941   137825  -2     2.04
+orf00099   142487   140766  -3     2.94
+orf00100   143056   142484  -2     1.32
+orf00101   143545   143099  -2     2.75
+orf00103   147016   144230  -2     2.96