Mercurial > repos > bgruening > hicexplorer_hicplotdistvscounts

directory /test-data/ @ 6:476afe8a72fc draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
name size permissions
[up] drwxr-xr-x
dir. find_TADs/ drwxr-xr-x
file Li_chrX30-35_cool.png 53981 -rw-r--r--
file Li_et_al_2015.cool 14371559 -rw-r--r--
file Li_et_al_2015.h5 14215139 -rw-r--r--
file bedgraph_chrx_2e6_5e6.bg 262649 -rw-r--r--
file bigwig_chrx_2e6_5e6.bw 109391 -rw-r--r--
file covariance_small_50kb.cool 9943128 -rw-r--r--
file covariance_small_50kb.h5 9304839 -rw-r--r--
file diagnostic_plot.png 12182 -rw-r--r--
file dm3_genes.bed.gz 98624 -rw-r--r--
file dm3_genes.bed6.gz 33265 -rw-r--r--
file domains.bed 33733 -rw-r--r--
file hicBuildMatrix_result1.bam 5045696 -rw-r--r--
file hicCorrectMatrix_result1.npz.h5 55572 -rw-r--r--
file hicCorrelate_heatmap_result1.png 17439 -rw-r--r--
file hicCorrelate_scatter_result1.png 9989 -rw-r--r--
file hicFindTADs_TAD_score.tabular 821275 -rw-r--r--
file hicFindTADs_find_boundaries.bed 0 -rw-r--r--
file hicFindTADs_find_boundaries.gff 0 -rw-r--r--
file hicFindTADs_find_domains.bed 0 -rw-r--r--
file hicFindTADs_find_score.bedgraph 815904 -rw-r--r--
file hicMergeMatrixBins_result1.npz.h5 160066 -rw-r--r--
file hicPlotDistVsCounts_result1.png 26030 -rw-r--r--
file hicPlotDistVsCounts_result2.png 248459 -rw-r--r--
file hicPlotTADs_result1.svg 517449 -rw-r--r--
file hicSumMatrices_result1.npz.h5 55571 -rw-r--r--
file li_32-33mb_interactions.bedgraph 537727 -rw-r--r--
file li_32mb_interactions.bedgraph 11446 -rw-r--r--
file li_viewpoint_32-33Mb.png 125600 -rw-r--r--
file li_viewpoint_32Mb.png 104447 -rw-r--r--
file master_TADs_plot.png 452212 -rw-r--r--
file master_matrix_plot.png 140531 -rw-r--r--
file merged_matrix.npz.h5 614905 -rw-r--r--
file obs_exp_small_50kb.cool 160844 -rw-r--r--
file obs_exp_small_50kb.h5 185453 -rw-r--r--
file pca1.bedgraph 104385 -rw-r--r--
file pca1.bw 27931 -rw-r--r--
file pca2.bedgraph 104326 -rw-r--r--
file pca2.bw 27934 -rw-r--r--
file pearson_small_50kb.cool 9795670 -rw-r--r--
file pearson_small_50kb.h5 8569032 -rw-r--r--
file raw_qc_report 791 -rw-r--r--
file small_matrix_50kb_pearson_pca1_plot.png 750752 -rw-r--r--
file small_matrix_50kb_pearson_pca1_plot.svg 857329 -rw-r--r--
file small_test_R1_unsorted.bam 6135374 -rw-r--r--
file small_test_R1_unsorted.sam 206058 -rw-r--r--
file small_test_R2_unsorted.bam 6139816 -rw-r--r--
file small_test_R2_unsorted.sam 202880 -rw-r--r--
file small_test_matrix.h5 275687 -rw-r--r--
file small_test_matrix_2.h5 132228 -rw-r--r--
file small_test_matrix_50kb_res.h5 125850 -rw-r--r--
file small_test_matrix_result.bam 4724313 -rw-r--r--
file small_test_matrix_result_sorted.bam 28556 -rw-r--r--
file tad_classification.bed 164265 -rw-r--r--
file tad_score.gz 1309246 -rw-r--r--