Mercurial > repos > bgruening > hicexplorer_hicsummatrices

directory /test-data/ @ 11:6d1526527417 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
name size permissions
[up] drwxr-xr-x
dir. find_TADs/ drwxr-xr-x
file Li_chrX30-35_cool.png 34954 -rw-r--r--
file Li_et_al_2015.cool 3220802 -rw-r--r--
file Li_et_al_2015.h5 14215139 -rw-r--r--
file bedgraph_chrx_2e6_5e6.bg 262649 -rw-r--r--
file bigwig_chrx_2e6_5e6.bw 109391 -rw-r--r--
file compare_matrices_log2ratio.h5 105480 -rw-r--r--
file compare_matrices_pearson_ratio.cool 624482 -rw-r--r--
file covariance_small_50kb.cool 9937387 -rw-r--r--
file covariance_small_50kb.h5 8812778 -rw-r--r--
file diagnostic_plot.png 12249 -rw-r--r--
file distVsCounts.txt 3988 -rw-r--r--
file dm3_genes.bed.gz 98624 -rw-r--r--
file dm3_genes.bed6.gz 33265 -rw-r--r--
file domains.bed 33733 -rw-r--r--
file hicAggregateContacts_results1.png 14354 -rw-r--r--
file hicCorrectMatrix_result1.npz.h5 51969 -rw-r--r--
file hicCorrelate_heatmap_result1.png 17235 -rw-r--r--
file hicCorrelate_scatter_result1.png 5168 -rw-r--r--
file hicFindTADs_TAD_score.tabular 821275 -rw-r--r--
file hicFindTADs_find_score.bedgraph 815904 -rw-r--r--
file hicMergeMatrixBins_result1.npz.h5 115489 -rw-r--r--
file hicPlotDistVsCounts_result1.png 26097 -rw-r--r--
file hicPlotDistVsCounts_result2.png 246884 -rw-r--r--
file hicPlotTADs_result1.svg 517449 -rw-r--r--
file hicSumMatrices_result1.npz.h5 51968 -rw-r--r--
file li_32-33mb_interactions.bedgraph 537727 -rw-r--r--
file li_32mb_interactions.bedgraph 11446 -rw-r--r--
file li_viewpoint_32-33Mb.png 126913 -rw-r--r--
file li_viewpoint_32Mb.png 104683 -rw-r--r--
file master_TADs_plot.png 275963 -rw-r--r--
file master_matrix_plot.png 139656 -rw-r--r--
file obs_exp_small_50kb.cool 155027 -rw-r--r--
file obs_exp_small_50kb.h5 156306 -rw-r--r--
file pca1.bedgraph 104642 -rw-r--r--
file pca1.bw 27925 -rw-r--r--
file pca2.bedgraph 104642 -rw-r--r--
file pca2.bw 27934 -rw-r--r--
file pearson_small_50kb.cool 4821667 -rw-r--r--
file pearson_small_50kb.h5 8494947 -rw-r--r--
file pearson_small_50kb_transform.cool 9789836 -rw-r--r--
file raw_qc_report 786 -rw-r--r--
file small_matrix_50kb_pearson_pca1_plot.png 750752 -rw-r--r--
file small_matrix_50kb_pearson_pca1_plot.svg 1309957 -rw-r--r--
file small_test_R1_unsorted.bam 6135374 -rw-r--r--
file small_test_R1_unsorted.sam 206058 -rw-r--r--
file small_test_R2_unsorted.bam 6139816 -rw-r--r--
file small_test_R2_unsorted.sam 202880 -rw-r--r--
file small_test_matrix.h5 275687 -rw-r--r--
file small_test_matrix_2.h5 132228 -rw-r--r--
file small_test_matrix_50kb_res.h5 125850 -rw-r--r--
file small_test_matrix_result_sorted.bam 28556 -rw-r--r--
file tad_classification.bed 164265 -rw-r--r--
file tad_score.gz 1309246 -rw-r--r--
file test_regions.bed 2558 -rw-r--r--