# HG changeset patch # User bgruening # Date 1535055302 14400 # Node ID e9cbaf6cbc3521032cf92a06ef0e4e83c78805d1 # Parent addf8e0f2654c42af538b414827f08dd39c2af18 planemo upload for repository https://github.com/bgruening/galaxytools/tree/master/tools/sklearn commit 8cf3d813ec755166ee0bd517b4ecbbd4f84d4df1 diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 main_macros.xml --- a/main_macros.xml Fri Aug 17 12:27:15 2018 -0400 +++ b/main_macros.xml Thu Aug 23 16:15:02 2018 -0400 @@ -1424,19 +1424,19 @@ - @article{scikit-learn, - title={Scikit-learn: Machine Learning in {P}ython}, - author={Pedregosa, F. and Varoquaux, G. and Gramfort, A. and Michel, V. - and Thirion, B. and Grisel, O. and Blondel, M. and Prettenhofer, P. - and Weiss, R. and Dubourg, V. and Vanderplas, J. and Passos, A. and - Cournapeau, D. and Brucher, M. and Perrot, M. and Duchesnay, E.}, - journal={Journal of Machine Learning Research}, - volume={12}, - pages={2825--2830}, - year={2011} - url = {https://github.com/scikit-learn/scikit-learn} - } + @article{scikit-learn, + title={Scikit-learn: Machine Learning in {P}ython}, + author={Pedregosa, F. and Varoquaux, G. and Gramfort, A. and Michel, V. + and Thirion, B. and Grisel, O. and Blondel, M. and Prettenhofer, P. + and Weiss, R. and Dubourg, V. and Vanderplas, J. and Passos, A. and + Cournapeau, D. and Brucher, M. and Perrot, M. and Duchesnay, E.}, + journal={Journal of Machine Learning Research}, + volume={12}, + pages={2825--2830}, + year={2011} + } + @@ -1454,4 +1454,48 @@ + + + @article{DBLP:journals/corr/abs-1711-08477, + author = {Ryan J. Urbanowicz and + Randal S. Olson and + Peter Schmitt and + Melissa Meeker and + Jason H. Moore}, + title = {Benchmarking Relief-Based Feature Selection Methods}, + journal = {CoRR}, + volume = {abs/1711.08477}, + year = {2017}, + url = {http://arxiv.org/abs/1711.08477}, + archivePrefix = {arXiv}, + eprint = {1711.08477}, + timestamp = {Mon, 13 Aug 2018 16:46:04 +0200}, + biburl = {https://dblp.org/rec/bib/journals/corr/abs-1711-08477}, + bibsource = {dblp computer science bibliography, https://dblp.org} + } + + + + + + @inproceedings{Chen:2016:XST:2939672.2939785, + author = {Chen, Tianqi and Guestrin, Carlos}, + title = {{XGBoost}: A Scalable Tree Boosting System}, + booktitle = {Proceedings of the 22nd ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining}, + series = {KDD '16}, + year = {2016}, + isbn = {978-1-4503-4232-2}, + location = {San Francisco, California, USA}, + pages = {785--794}, + numpages = {10}, + url = {http://doi.acm.org/10.1145/2939672.2939785}, + doi = {10.1145/2939672.2939785}, + acmid = {2939785}, + publisher = {ACM}, + address = {New York, NY, USA}, + keywords = {large-scale machine learning}, + } + + + diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 sk_whitelist.py --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/sk_whitelist.py Thu Aug 23 16:15:02 2018 -0400 @@ -0,0 +1,757 @@ +# class or function names from scikit-learn +SK_NAMES = ( + 'sklearn._ASSUME_FINITE', 'sklearn._isotonic._inplace_contiguous_isotonic_regression', + 'sklearn._isotonic._make_unique', 'sklearn.base.BaseEstimator', + 'sklearn.base.BiclusterMixin', 'sklearn.base.ClassifierMixin', + 'sklearn.base.ClusterMixin', 'sklearn.base.DensityMixin', + 'sklearn.base.MetaEstimatorMixin', 'sklearn.base.RegressorMixin', + 'sklearn.base.TransformerMixin', 'sklearn.base._first_and_last_element', + 'sklearn.base._pprint', 'sklearn.base.clone', + 'sklearn.base.is_classifier', 'sklearn.base.is_regressor', + 'sklearn.clone', 'sklearn.cluster.AffinityPropagation', + 'sklearn.cluster.AgglomerativeClustering', 'sklearn.cluster.Birch', + 'sklearn.cluster.DBSCAN', 'sklearn.cluster.FeatureAgglomeration', + 'sklearn.cluster.KMeans', 'sklearn.cluster.MeanShift', + 'sklearn.cluster.MiniBatchKMeans', 'sklearn.cluster.SpectralBiclustering', + 'sklearn.cluster.SpectralClustering', 'sklearn.cluster.SpectralCoclustering', + 'sklearn.cluster._dbscan_inner.dbscan_inner', 'sklearn.cluster._feature_agglomeration.AgglomerationTransform', + 'sklearn.cluster._hierarchical.WeightedEdge', 'sklearn.cluster._hierarchical._get_parents', + 'sklearn.cluster._hierarchical._hc_get_descendent', 'sklearn.cluster._hierarchical.average_merge', + 'sklearn.cluster._hierarchical.compute_ward_dist', 'sklearn.cluster._hierarchical.hc_get_heads', + 'sklearn.cluster._hierarchical.max_merge', 'sklearn.cluster._k_means._assign_labels_array', + 'sklearn.cluster._k_means._assign_labels_csr', 'sklearn.cluster._k_means._centers_dense', + 'sklearn.cluster._k_means._centers_sparse', 'sklearn.cluster._k_means._mini_batch_update_csr', + 'sklearn.cluster._k_means_elkan.k_means_elkan', 'sklearn.cluster.affinity_propagation', + 'sklearn.cluster.affinity_propagation_.AffinityPropagation', 'sklearn.cluster.affinity_propagation_.affinity_propagation', + 'sklearn.cluster.bicluster.BaseSpectral', 'sklearn.cluster.bicluster.SpectralBiclustering', + 'sklearn.cluster.bicluster.SpectralCoclustering', 'sklearn.cluster.bicluster._bistochastic_normalize', + 'sklearn.cluster.bicluster._log_normalize', 'sklearn.cluster.bicluster._scale_normalize', + 'sklearn.cluster.birch.Birch', 'sklearn.cluster.birch._CFNode', + 'sklearn.cluster.birch._CFSubcluster', 'sklearn.cluster.birch._iterate_sparse_X', + 'sklearn.cluster.birch._split_node', 'sklearn.cluster.dbscan', + 'sklearn.cluster.dbscan_.DBSCAN', 'sklearn.cluster.dbscan_.dbscan', + 'sklearn.cluster.estimate_bandwidth', 'sklearn.cluster.get_bin_seeds', + 'sklearn.cluster.hierarchical.AgglomerativeClustering', 'sklearn.cluster.hierarchical.FeatureAgglomeration', + 'sklearn.cluster.hierarchical._TREE_BUILDERS', 'sklearn.cluster.hierarchical._average_linkage', + 'sklearn.cluster.hierarchical._complete_linkage', 'sklearn.cluster.hierarchical._fix_connectivity', + 'sklearn.cluster.hierarchical._hc_cut', 'sklearn.cluster.hierarchical.linkage_tree', + 'sklearn.cluster.hierarchical.ward_tree', 'sklearn.cluster.k_means', + 'sklearn.cluster.k_means_.FLOAT_DTYPES', 'sklearn.cluster.k_means_.KMeans', + 'sklearn.cluster.k_means_.MiniBatchKMeans', 'sklearn.cluster.k_means_._init_centroids', + 'sklearn.cluster.k_means_._k_init', 'sklearn.cluster.k_means_._kmeans_single_elkan', + 'sklearn.cluster.k_means_._kmeans_single_lloyd', 'sklearn.cluster.k_means_._labels_inertia', + 'sklearn.cluster.k_means_._labels_inertia_precompute_dense', 'sklearn.cluster.k_means_._mini_batch_convergence', + 'sklearn.cluster.k_means_._mini_batch_step', 'sklearn.cluster.k_means_._tolerance', + 'sklearn.cluster.k_means_._validate_center_shape', 'sklearn.cluster.k_means_.k_means', + 'sklearn.cluster.k_means_.string_types', 'sklearn.cluster.linkage_tree', + 'sklearn.cluster.mean_shift', 'sklearn.cluster.mean_shift_.MeanShift', + 'sklearn.cluster.mean_shift_._mean_shift_single_seed', 'sklearn.cluster.mean_shift_.estimate_bandwidth', + 'sklearn.cluster.mean_shift_.get_bin_seeds', 'sklearn.cluster.mean_shift_.mean_shift', + 'sklearn.cluster.spectral.SpectralClustering', 'sklearn.cluster.spectral.discretize', + 'sklearn.cluster.spectral.spectral_clustering', 'sklearn.cluster.spectral_clustering', + 'sklearn.cluster.ward_tree', 'sklearn.config_context', + 'sklearn.covariance.EllipticEnvelope', 'sklearn.covariance.EmpiricalCovariance', + 'sklearn.covariance.GraphLasso', 'sklearn.covariance.GraphLassoCV', + 'sklearn.covariance.LedoitWolf', 'sklearn.covariance.MinCovDet', + 'sklearn.covariance.OAS', 'sklearn.covariance.ShrunkCovariance', + 'sklearn.covariance.empirical_covariance', 'sklearn.covariance.empirical_covariance_.EmpiricalCovariance', + 'sklearn.covariance.empirical_covariance_.empirical_covariance', 'sklearn.covariance.empirical_covariance_.log_likelihood', + 'sklearn.covariance.fast_mcd', 'sklearn.covariance.graph_lasso', + 'sklearn.covariance.graph_lasso_.GraphLasso', 'sklearn.covariance.graph_lasso_.GraphLassoCV', + 'sklearn.covariance.graph_lasso_._dual_gap', 'sklearn.covariance.graph_lasso_._objective', + 'sklearn.covariance.graph_lasso_.alpha_max', 'sklearn.covariance.graph_lasso_.graph_lasso', + 'sklearn.covariance.graph_lasso_.graph_lasso_path', 'sklearn.covariance.ledoit_wolf', + 'sklearn.covariance.ledoit_wolf_shrinkage', 'sklearn.covariance.log_likelihood', + 'sklearn.covariance.oas', 'sklearn.covariance.outlier_detection.EllipticEnvelope', + 'sklearn.covariance.robust_covariance.MinCovDet', 'sklearn.covariance.robust_covariance._c_step', + 'sklearn.covariance.robust_covariance.c_step', 'sklearn.covariance.robust_covariance.fast_mcd', + 'sklearn.covariance.robust_covariance.select_candidates', 'sklearn.covariance.shrunk_covariance', + 'sklearn.covariance.shrunk_covariance_.LedoitWolf', 'sklearn.covariance.shrunk_covariance_.OAS', + 'sklearn.covariance.shrunk_covariance_.ShrunkCovariance', 'sklearn.covariance.shrunk_covariance_.ledoit_wolf', + 'sklearn.covariance.shrunk_covariance_.ledoit_wolf_shrinkage', 'sklearn.covariance.shrunk_covariance_.oas', + 'sklearn.covariance.shrunk_covariance_.shrunk_covariance', 'sklearn.decomposition.DictionaryLearning', + 'sklearn.decomposition.FactorAnalysis', 'sklearn.decomposition.FastICA', + 'sklearn.decomposition.IncrementalPCA', 'sklearn.decomposition.KernelPCA', + 'sklearn.decomposition.LatentDirichletAllocation', 'sklearn.decomposition.MiniBatchDictionaryLearning', + 'sklearn.decomposition.MiniBatchSparsePCA', 'sklearn.decomposition.NMF', + 'sklearn.decomposition.PCA', 'sklearn.decomposition.RandomizedPCA', + 'sklearn.decomposition.SparseCoder', 'sklearn.decomposition.SparsePCA', + 'sklearn.decomposition.TruncatedSVD', 'sklearn.decomposition._online_lda._dirichlet_expectation_1d', + 'sklearn.decomposition._online_lda._dirichlet_expectation_2d', 'sklearn.decomposition._online_lda.mean_change', + 'sklearn.decomposition.base._BasePCA', 'sklearn.decomposition.cdnmf_fast._update_cdnmf_fast', + 'sklearn.decomposition.dict_learning', 'sklearn.decomposition.dict_learning_online', + 'sklearn.decomposition.factor_analysis.FactorAnalysis', 'sklearn.decomposition.fastica', + 'sklearn.decomposition.fastica_.FLOAT_DTYPES', 'sklearn.decomposition.fastica_.FastICA', + 'sklearn.decomposition.fastica_._cube', 'sklearn.decomposition.fastica_._exp', + 'sklearn.decomposition.fastica_._gs_decorrelation', 'sklearn.decomposition.fastica_._ica_def', + 'sklearn.decomposition.fastica_._ica_par', 'sklearn.decomposition.fastica_._logcosh', + 'sklearn.decomposition.fastica_._sym_decorrelation', 'sklearn.decomposition.fastica_.fastica', + 'sklearn.decomposition.fastica_.string_types', 'sklearn.decomposition.incremental_pca.IncrementalPCA', + 'sklearn.decomposition.kernel_pca.KernelPCA', 'sklearn.decomposition.nmf.EPSILON', + 'sklearn.decomposition.nmf.INTEGER_TYPES', 'sklearn.decomposition.nmf.NMF', + 'sklearn.decomposition.nmf._beta_divergence', 'sklearn.decomposition.nmf._beta_loss_to_float', + 'sklearn.decomposition.nmf._check_init', 'sklearn.decomposition.nmf._check_string_param', + 'sklearn.decomposition.nmf._compute_regularization', 'sklearn.decomposition.nmf._fit_coordinate_descent', + 'sklearn.decomposition.nmf._fit_multiplicative_update', 'sklearn.decomposition.nmf._initialize_nmf', + 'sklearn.decomposition.nmf._multiplicative_update_h', 'sklearn.decomposition.nmf._multiplicative_update_w', + 'sklearn.decomposition.nmf._special_sparse_dot', 'sklearn.decomposition.nmf._update_coordinate_descent', + 'sklearn.decomposition.nmf.non_negative_factorization', 'sklearn.decomposition.nmf.norm', + 'sklearn.decomposition.nmf.trace_dot', 'sklearn.decomposition.non_negative_factorization', + 'sklearn.decomposition.online_lda.EPS', 'sklearn.decomposition.online_lda.LatentDirichletAllocation', + 'sklearn.decomposition.online_lda._update_doc_distribution', 'sklearn.decomposition.online_lda.gammaln', + 'sklearn.decomposition.pca.PCA', 'sklearn.decomposition.pca.RandomizedPCA', + 'sklearn.decomposition.pca._assess_dimension_', 'sklearn.decomposition.pca._infer_dimension_', + 'sklearn.decomposition.pca.gammaln', 'sklearn.decomposition.sparse_encode', + 'sklearn.decomposition.sparse_pca.MiniBatchSparsePCA', 'sklearn.decomposition.sparse_pca.SparsePCA', + 'sklearn.decomposition.truncated_svd.TruncatedSVD', 'sklearn.discriminant_analysis.LinearDiscriminantAnalysis', + 'sklearn.discriminant_analysis.QuadraticDiscriminantAnalysis', 'sklearn.discriminant_analysis._class_cov', + 'sklearn.discriminant_analysis._class_means', 'sklearn.discriminant_analysis._cov', + 'sklearn.discriminant_analysis.string_types', 'sklearn.ensemble.AdaBoostClassifier', + 'sklearn.ensemble.AdaBoostRegressor', 'sklearn.ensemble.BaggingClassifier', + 'sklearn.ensemble.BaggingRegressor', 'sklearn.ensemble.BaseEnsemble', + 'sklearn.ensemble.ExtraTreesClassifier', 'sklearn.ensemble.ExtraTreesRegressor', + 'sklearn.ensemble.GradientBoostingClassifier', 'sklearn.ensemble.GradientBoostingRegressor', + 'sklearn.ensemble.IsolationForest', 'sklearn.ensemble.RandomForestClassifier', + 'sklearn.ensemble.RandomForestRegressor', 'sklearn.ensemble.RandomTreesEmbedding', + 'sklearn.ensemble.VotingClassifier', 'sklearn.ensemble._gradient_boosting._partial_dependence_tree', + 'sklearn.ensemble._gradient_boosting._predict_regression_tree_stages_sparse', 'sklearn.ensemble._gradient_boosting._random_sample_mask', + 'sklearn.ensemble._gradient_boosting.predict_stage', 'sklearn.ensemble._gradient_boosting.predict_stages', + 'sklearn.ensemble.bagging.BaggingClassifier', 'sklearn.ensemble.bagging.BaggingRegressor', + 'sklearn.ensemble.bagging.BaseBagging', 'sklearn.ensemble.bagging.MAX_INT', + 'sklearn.ensemble.bagging._generate_bagging_indices', 'sklearn.ensemble.bagging._generate_indices', + 'sklearn.ensemble.bagging._parallel_build_estimators', 'sklearn.ensemble.bagging._parallel_decision_function', + 'sklearn.ensemble.bagging._parallel_predict_log_proba', 'sklearn.ensemble.bagging._parallel_predict_proba', + 'sklearn.ensemble.bagging._parallel_predict_regression', 'sklearn.ensemble.base.BaseEnsemble', + 'sklearn.ensemble.base.MAX_RAND_SEED', 'sklearn.ensemble.base._partition_estimators', + 'sklearn.ensemble.base._set_random_states', 'sklearn.ensemble.forest.BaseForest', + 'sklearn.ensemble.forest.ExtraTreesClassifier', 'sklearn.ensemble.forest.ExtraTreesRegressor', + 'sklearn.ensemble.forest.ForestClassifier', 'sklearn.ensemble.forest.ForestRegressor', + 'sklearn.ensemble.forest.MAX_INT', 'sklearn.ensemble.forest.RandomForestClassifier', + 'sklearn.ensemble.forest.RandomForestRegressor', 'sklearn.ensemble.forest.RandomTreesEmbedding', + 'sklearn.ensemble.forest._generate_sample_indices', 'sklearn.ensemble.forest._generate_unsampled_indices', + 'sklearn.ensemble.forest._parallel_build_trees', 'sklearn.ensemble.forest.accumulate_prediction', + 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.BaseGradientBoosting', 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.BinomialDeviance', + 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.ClassificationLossFunction', 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.ExponentialLoss', + 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.GradientBoostingClassifier', 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.GradientBoostingRegressor', + 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.HuberLossFunction', 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.INIT_ESTIMATORS', + 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.LOSS_FUNCTIONS', 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.LeastAbsoluteError', + 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.LeastSquaresError', 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.LogOddsEstimator', + 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.LossFunction', 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.MeanEstimator', + 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.MultinomialDeviance', 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.PriorProbabilityEstimator', + 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.QuantileEstimator', 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.QuantileLossFunction', + 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.RegressionLossFunction', 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.ScaledLogOddsEstimator', + 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.TREE_LEAF', 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.VerboseReporter', + 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.ZeroEstimator', 'sklearn.ensemble.gradient_boosting.expit', + 'sklearn.ensemble.iforest.INTEGER_TYPES', 'sklearn.ensemble.iforest.IsolationForest', + 'sklearn.ensemble.iforest._average_path_length', 'sklearn.ensemble.iforest.euler_gamma', + 'sklearn.ensemble.partial_dependence._grid_from_X', 'sklearn.ensemble.partial_dependence.partial_dependence', + 'sklearn.ensemble.partial_dependence.plot_partial_dependence', 'sklearn.ensemble.voting_classifier.VotingClassifier', + 'sklearn.ensemble.voting_classifier._parallel_fit_estimator', 'sklearn.ensemble.weight_boosting.AdaBoostClassifier', + 'sklearn.ensemble.weight_boosting.AdaBoostRegressor', 'sklearn.ensemble.weight_boosting.BaseWeightBoosting', + 'sklearn.ensemble.weight_boosting._samme_proba', 'sklearn.ensemble.weight_boosting.inner1d', + 'sklearn.feature_extraction.DictVectorizer', 'sklearn.feature_extraction.FeatureHasher', + 'sklearn.feature_extraction._hashing.transform', 'sklearn.feature_extraction.dict_vectorizer.DictVectorizer', + 'sklearn.feature_extraction.dict_vectorizer._tosequence', 'sklearn.feature_extraction.grid_to_graph', + 'sklearn.feature_extraction.hashing.FeatureHasher', 'sklearn.feature_extraction.hashing._iteritems', + 'sklearn.feature_extraction.image.PatchExtractor', 'sklearn.feature_extraction.image._compute_gradient_3d', + 'sklearn.feature_extraction.image._compute_n_patches', 'sklearn.feature_extraction.image._make_edges_3d', + 'sklearn.feature_extraction.image._mask_edges_weights', 'sklearn.feature_extraction.image._to_graph', + 'sklearn.feature_extraction.image.extract_patches', 'sklearn.feature_extraction.image.extract_patches_2d', + 'sklearn.feature_extraction.image.grid_to_graph', 'sklearn.feature_extraction.image.img_to_graph', + 'sklearn.feature_extraction.image.reconstruct_from_patches_2d', 'sklearn.feature_extraction.img_to_graph', + 'sklearn.feature_extraction.stop_words.ENGLISH_STOP_WORDS', 'sklearn.feature_extraction.text.CountVectorizer', + 'sklearn.feature_extraction.text.ENGLISH_STOP_WORDS', 'sklearn.feature_extraction.text.HashingVectorizer', + 'sklearn.feature_extraction.text.TfidfTransformer', 'sklearn.feature_extraction.text.TfidfVectorizer', + 'sklearn.feature_extraction.text.VectorizerMixin', 'sklearn.feature_extraction.text._check_stop_list', + 'sklearn.feature_extraction.text._document_frequency', 'sklearn.feature_extraction.text._make_int_array', + 'sklearn.feature_extraction.text.strip_accents_ascii', 'sklearn.feature_extraction.text.strip_accents_unicode', + 'sklearn.feature_extraction.text.strip_tags', 'sklearn.feature_selection.GenericUnivariateSelect', + 'sklearn.feature_selection.RFE', 'sklearn.feature_selection.RFECV', + 'sklearn.feature_selection.SelectFdr', 'sklearn.feature_selection.SelectFpr', + 'sklearn.feature_selection.SelectFromModel', 'sklearn.feature_selection.SelectFwe', + 'sklearn.feature_selection.SelectKBest', 'sklearn.feature_selection.SelectPercentile', + 'sklearn.feature_selection.VarianceThreshold', 'sklearn.feature_selection.base.SelectorMixin', + 'sklearn.feature_selection.chi2', 'sklearn.feature_selection.f_classif', + 'sklearn.feature_selection.f_oneway', 'sklearn.feature_selection.f_regression', + 'sklearn.feature_selection.from_model.SelectFromModel', 'sklearn.feature_selection.from_model._calculate_threshold', + 'sklearn.feature_selection.from_model._get_feature_importances', 'sklearn.feature_selection.mutual_info_._compute_mi', + 'sklearn.feature_selection.mutual_info_._compute_mi_cc', 'sklearn.feature_selection.mutual_info_._compute_mi_cd', + 'sklearn.feature_selection.mutual_info_._estimate_mi', 'sklearn.feature_selection.mutual_info_._iterate_columns', + 'sklearn.feature_selection.mutual_info_.digamma', 'sklearn.feature_selection.mutual_info_.mutual_info_classif', + 'sklearn.feature_selection.mutual_info_.mutual_info_regression', 'sklearn.feature_selection.mutual_info_classif', + 'sklearn.feature_selection.mutual_info_regression', 'sklearn.feature_selection.rfe.RFE', + 'sklearn.feature_selection.rfe.RFECV', 'sklearn.feature_selection.rfe._rfe_single_fit', + 'sklearn.feature_selection.univariate_selection.GenericUnivariateSelect', 'sklearn.feature_selection.univariate_selection.SelectFdr', + 'sklearn.feature_selection.univariate_selection.SelectFpr', 'sklearn.feature_selection.univariate_selection.SelectFwe', + 'sklearn.feature_selection.univariate_selection.SelectKBest', 'sklearn.feature_selection.univariate_selection.SelectPercentile', + 'sklearn.feature_selection.univariate_selection._BaseFilter', 'sklearn.feature_selection.univariate_selection._chisquare', + 'sklearn.feature_selection.univariate_selection._clean_nans', 'sklearn.feature_selection.univariate_selection.chi2', + 'sklearn.feature_selection.univariate_selection.f_classif', 'sklearn.feature_selection.univariate_selection.f_oneway', + 'sklearn.feature_selection.univariate_selection.f_regression', 'sklearn.feature_selection.variance_threshold.VarianceThreshold', + 'sklearn.gaussian_process.GaussianProcess', 'sklearn.gaussian_process.GaussianProcessClassifier', + 'sklearn.gaussian_process.GaussianProcessRegressor', 'sklearn.gaussian_process.correlation_models.absolute_exponential', + 'sklearn.gaussian_process.correlation_models.cubic', 'sklearn.gaussian_process.correlation_models.generalized_exponential', + 'sklearn.gaussian_process.correlation_models.linear', 'sklearn.gaussian_process.correlation_models.pure_nugget', + 'sklearn.gaussian_process.correlation_models.squared_exponential', 'sklearn.gaussian_process.gaussian_process.GaussianProcess', + 'sklearn.gaussian_process.gaussian_process.MACHINE_EPSILON', 'sklearn.gaussian_process.gaussian_process.l1_cross_distances', + 'sklearn.gaussian_process.gpc.COEFS', 'sklearn.gaussian_process.gpc.GaussianProcessClassifier', + 'sklearn.gaussian_process.gpc.LAMBDAS', 'sklearn.gaussian_process.gpc._BinaryGaussianProcessClassifierLaplace', + 'sklearn.gaussian_process.gpc.erf', 'sklearn.gaussian_process.gpc.expit', + 'sklearn.gaussian_process.gpr.GaussianProcessRegressor', 'sklearn.gaussian_process.kernels.CompoundKernel', + 'sklearn.gaussian_process.kernels.ConstantKernel', 'sklearn.gaussian_process.kernels.DotProduct', + 'sklearn.gaussian_process.kernels.ExpSineSquared', 'sklearn.gaussian_process.kernels.Exponentiation', + 'sklearn.gaussian_process.kernels.Hyperparameter', 'sklearn.gaussian_process.kernels.Kernel', + 'sklearn.gaussian_process.kernels.KernelOperator', 'sklearn.gaussian_process.kernels.Matern', + 'sklearn.gaussian_process.kernels.NormalizedKernelMixin', 'sklearn.gaussian_process.kernels.PairwiseKernel', + 'sklearn.gaussian_process.kernels.Product', 'sklearn.gaussian_process.kernels.RBF', + 'sklearn.gaussian_process.kernels.RationalQuadratic', 'sklearn.gaussian_process.kernels.StationaryKernelMixin', + 'sklearn.gaussian_process.kernels.Sum', 'sklearn.gaussian_process.kernels.WhiteKernel', + 'sklearn.gaussian_process.kernels._approx_fprime', 'sklearn.gaussian_process.kernels._check_length_scale', + 'sklearn.gaussian_process.kernels.gamma', 'sklearn.gaussian_process.kernels.kv', + 'sklearn.gaussian_process.regression_models.constant', 'sklearn.gaussian_process.regression_models.linear', + 'sklearn.gaussian_process.regression_models.quadratic', 'sklearn.get_config', + 'sklearn.isotonic.IsotonicRegression', 'sklearn.isotonic.check_increasing', + 'sklearn.isotonic.isotonic_regression', 'sklearn.kernel_approximation.AdditiveChi2Sampler', + 'sklearn.kernel_approximation.KERNEL_PARAMS', 'sklearn.kernel_approximation.Nystroem', + 'sklearn.kernel_approximation.RBFSampler', 'sklearn.kernel_approximation.SkewedChi2Sampler', + 'sklearn.kernel_ridge.KernelRidge', 'sklearn.linear_model.ARDRegression', + 'sklearn.linear_model.BayesianRidge', 'sklearn.linear_model.ElasticNet', + 'sklearn.linear_model.ElasticNetCV', 'sklearn.linear_model.Hinge', + 'sklearn.linear_model.Huber', 'sklearn.linear_model.HuberRegressor', + 'sklearn.linear_model.Lars', 'sklearn.linear_model.LarsCV', + 'sklearn.linear_model.Lasso', 'sklearn.linear_model.LassoCV', + 'sklearn.linear_model.LassoLars', 'sklearn.linear_model.LassoLarsCV', + 'sklearn.linear_model.LassoLarsIC', 'sklearn.linear_model.LinearRegression', + 'sklearn.linear_model.Log', 'sklearn.linear_model.LogisticRegression', + 'sklearn.linear_model.LogisticRegressionCV', 'sklearn.linear_model.ModifiedHuber', + 'sklearn.linear_model.MultiTaskElasticNet', 'sklearn.linear_model.MultiTaskElasticNetCV', + 'sklearn.linear_model.MultiTaskLasso', 'sklearn.linear_model.MultiTaskLassoCV', + 'sklearn.linear_model.OrthogonalMatchingPursuit', 'sklearn.linear_model.OrthogonalMatchingPursuitCV', + 'sklearn.linear_model.PassiveAggressiveClassifier', 'sklearn.linear_model.PassiveAggressiveRegressor', + 'sklearn.linear_model.Perceptron', 'sklearn.linear_model.RANSACRegressor', + 'sklearn.linear_model.RandomizedLasso', 'sklearn.linear_model.RandomizedLogisticRegression', + 'sklearn.linear_model.Ridge', 'sklearn.linear_model.RidgeCV', + 'sklearn.linear_model.RidgeClassifier', 'sklearn.linear_model.RidgeClassifierCV', + 'sklearn.linear_model.SGDClassifier', 'sklearn.linear_model.SGDRegressor', + 'sklearn.linear_model.SquaredLoss', 'sklearn.linear_model.TheilSenRegressor', + 'sklearn.linear_model.base.FLOAT_DTYPES', 'sklearn.linear_model.base.LinearClassifierMixin', + 'sklearn.linear_model.base.LinearModel', 'sklearn.linear_model.base.LinearRegression', + 'sklearn.linear_model.base.SPARSE_INTERCEPT_DECAY', 'sklearn.linear_model.base.SparseCoefMixin', + 'sklearn.linear_model.base._pre_fit', 'sklearn.linear_model.base._preprocess_data', + 'sklearn.linear_model.base._rescale_data', 'sklearn.linear_model.base.center_data', + 'sklearn.linear_model.base.make_dataset', 'sklearn.linear_model.base.sparse_center_data', + 'sklearn.linear_model.bayes.ARDRegression', 'sklearn.linear_model.bayes.BayesianRidge', + 'sklearn.linear_model.cd_fast.enet_coordinate_descent', 'sklearn.linear_model.cd_fast.enet_coordinate_descent_gram', + 'sklearn.linear_model.cd_fast.enet_coordinate_descent_multi_task', 'sklearn.linear_model.cd_fast.sparse_enet_coordinate_descent', + 'sklearn.linear_model.coordinate_descent.ElasticNet', 'sklearn.linear_model.coordinate_descent.ElasticNetCV', + 'sklearn.linear_model.coordinate_descent.Lasso', 'sklearn.linear_model.coordinate_descent.LassoCV', + 'sklearn.linear_model.coordinate_descent.LinearModelCV', 'sklearn.linear_model.coordinate_descent.MultiTaskElasticNet', + 'sklearn.linear_model.coordinate_descent.MultiTaskElasticNetCV', 'sklearn.linear_model.coordinate_descent.MultiTaskLasso', + 'sklearn.linear_model.coordinate_descent.MultiTaskLassoCV', 'sklearn.linear_model.coordinate_descent._alpha_grid', + 'sklearn.linear_model.coordinate_descent._path_residuals', 'sklearn.linear_model.coordinate_descent.enet_path', + 'sklearn.linear_model.coordinate_descent.lasso_path', 'sklearn.linear_model.enet_path', + 'sklearn.linear_model.huber.HuberRegressor', 'sklearn.linear_model.huber._huber_loss_and_gradient', + 'sklearn.linear_model.lars_path', 'sklearn.linear_model.lasso_path', + 'sklearn.linear_model.lasso_stability_path', 'sklearn.linear_model.least_angle.Lars', + 'sklearn.linear_model.least_angle.LarsCV', 'sklearn.linear_model.least_angle.LassoLars', + 'sklearn.linear_model.least_angle.LassoLarsCV', 'sklearn.linear_model.least_angle.LassoLarsIC', + 'sklearn.linear_model.least_angle._check_copy_and_writeable', 'sklearn.linear_model.least_angle._lars_path_residues', + 'sklearn.linear_model.least_angle.lars_path', 'sklearn.linear_model.least_angle.solve_triangular_args', + 'sklearn.linear_model.least_angle.string_types', 'sklearn.linear_model.logistic.LogisticRegression', + 'sklearn.linear_model.logistic.LogisticRegressionCV', 'sklearn.linear_model.logistic.SCORERS', + 'sklearn.linear_model.logistic._check_solver_option', 'sklearn.linear_model.logistic._intercept_dot', + 'sklearn.linear_model.logistic._log_reg_scoring_path', 'sklearn.linear_model.logistic._logistic_grad_hess', + 'sklearn.linear_model.logistic._logistic_loss', 'sklearn.linear_model.logistic._logistic_loss_and_grad', + 'sklearn.linear_model.logistic._multinomial_grad_hess', 'sklearn.linear_model.logistic._multinomial_loss', + 'sklearn.linear_model.logistic._multinomial_loss_grad', 'sklearn.linear_model.logistic.expit', + 'sklearn.linear_model.logistic.logistic_regression_path', 'sklearn.linear_model.logistic_regression_path', + 'sklearn.linear_model.omp.OrthogonalMatchingPursuit', 'sklearn.linear_model.omp.OrthogonalMatchingPursuitCV', + 'sklearn.linear_model.omp._cholesky_omp', 'sklearn.linear_model.omp._gram_omp', + 'sklearn.linear_model.omp._omp_path_residues', 'sklearn.linear_model.omp.orthogonal_mp', + 'sklearn.linear_model.omp.orthogonal_mp_gram', 'sklearn.linear_model.omp.premature', + 'sklearn.linear_model.omp.solve_triangular_args', 'sklearn.linear_model.orthogonal_mp', + 'sklearn.linear_model.orthogonal_mp_gram', 'sklearn.linear_model.passive_aggressive.DEFAULT_EPSILON', + 'sklearn.linear_model.passive_aggressive.PassiveAggressiveClassifier', 'sklearn.linear_model.passive_aggressive.PassiveAggressiveRegressor', + 'sklearn.linear_model.perceptron.Perceptron', 'sklearn.linear_model.randomized_l1.BaseRandomizedLinearModel', + 'sklearn.linear_model.randomized_l1.RandomizedLasso', 'sklearn.linear_model.randomized_l1.RandomizedLogisticRegression', + 'sklearn.linear_model.randomized_l1._lasso_stability_path', 'sklearn.linear_model.randomized_l1._randomized_lasso', + 'sklearn.linear_model.randomized_l1._randomized_logistic', 'sklearn.linear_model.randomized_l1._resample_model', + 'sklearn.linear_model.randomized_l1.lasso_stability_path', 'sklearn.linear_model.ransac.RANSACRegressor', + 'sklearn.linear_model.ransac._EPSILON', 'sklearn.linear_model.ransac._dynamic_max_trials', + 'sklearn.linear_model.ridge.Ridge', 'sklearn.linear_model.ridge.RidgeCV', + 'sklearn.linear_model.ridge.RidgeClassifier', 'sklearn.linear_model.ridge.RidgeClassifierCV', + 'sklearn.linear_model.ridge._BaseRidge', 'sklearn.linear_model.ridge._BaseRidgeCV', + 'sklearn.linear_model.ridge._RidgeGCV', 'sklearn.linear_model.ridge._solve_cholesky', + 'sklearn.linear_model.ridge._solve_cholesky_kernel', 'sklearn.linear_model.ridge._solve_lsqr', + 'sklearn.linear_model.ridge._solve_sparse_cg', 'sklearn.linear_model.ridge._solve_svd', + 'sklearn.linear_model.ridge.ridge_regression', 'sklearn.linear_model.ridge_regression', + 'sklearn.linear_model.sag.get_auto_step_size', 'sklearn.linear_model.sag.sag', + 'sklearn.linear_model.sag.sag_solver', 'sklearn.linear_model.sag_fast.MultinomialLogLoss', + 'sklearn.linear_model.sag_fast._multinomial_grad_loss_all_samples', 'sklearn.linear_model.sag_fast.sag', + 'sklearn.linear_model.sgd_fast.Classification', 'sklearn.linear_model.sgd_fast.EpsilonInsensitive', + 'sklearn.linear_model.sgd_fast.Hinge', 'sklearn.linear_model.sgd_fast.Huber', + 'sklearn.linear_model.sgd_fast.Log', 'sklearn.linear_model.sgd_fast.LossFunction', + 'sklearn.linear_model.sgd_fast.ModifiedHuber', 'sklearn.linear_model.sgd_fast.Regression', + 'sklearn.linear_model.sgd_fast.SquaredEpsilonInsensitive', 'sklearn.linear_model.sgd_fast.SquaredHinge', + 'sklearn.linear_model.sgd_fast.SquaredLoss', 'sklearn.linear_model.sgd_fast._plain_sgd', + 'sklearn.linear_model.sgd_fast.average_sgd', 'sklearn.linear_model.sgd_fast.plain_sgd', + 'sklearn.linear_model.stochastic_gradient.BaseSGD', 'sklearn.linear_model.stochastic_gradient.BaseSGDClassifier', + 'sklearn.linear_model.stochastic_gradient.BaseSGDRegressor', 'sklearn.linear_model.stochastic_gradient.DEFAULT_EPSILON', + 'sklearn.linear_model.stochastic_gradient.LEARNING_RATE_TYPES', 'sklearn.linear_model.stochastic_gradient.PENALTY_TYPES', + 'sklearn.linear_model.stochastic_gradient.SGDClassifier', 'sklearn.linear_model.stochastic_gradient.SGDRegressor', + 'sklearn.linear_model.stochastic_gradient._prepare_fit_binary', 'sklearn.linear_model.stochastic_gradient.fit_binary', + 'sklearn.linear_model.theil_sen.TheilSenRegressor', 'sklearn.linear_model.theil_sen._EPSILON', + 'sklearn.linear_model.theil_sen._breakdown_point', 'sklearn.linear_model.theil_sen._lstsq', + 'sklearn.linear_model.theil_sen._modified_weiszfeld_step', 'sklearn.linear_model.theil_sen._spatial_median', + 'sklearn.linear_model.theil_sen.binom', 'sklearn.manifold.Isomap', + 'sklearn.manifold.LocallyLinearEmbedding', 'sklearn.manifold.MDS', + 'sklearn.manifold.SpectralEmbedding', 'sklearn.manifold.TSNE', + 'sklearn.manifold._barnes_hut_tsne.gradient', 'sklearn.manifold._utils._binary_search_perplexity', + 'sklearn.manifold.isomap.Isomap', 'sklearn.manifold.locally_linear.FLOAT_DTYPES', + 'sklearn.manifold.locally_linear.LocallyLinearEmbedding', 'sklearn.manifold.locally_linear.barycenter_kneighbors_graph', + 'sklearn.manifold.locally_linear.barycenter_weights', 'sklearn.manifold.locally_linear.locally_linear_embedding', + 'sklearn.manifold.locally_linear.null_space', 'sklearn.manifold.locally_linear_embedding', + 'sklearn.manifold.mds.MDS', 'sklearn.manifold.mds._smacof_single', + 'sklearn.manifold.mds.smacof', 'sklearn.manifold.smacof', + 'sklearn.manifold.spectral_embedding', 'sklearn.manifold.spectral_embedding_.SpectralEmbedding', + 'sklearn.manifold.spectral_embedding_._graph_connected_component', 'sklearn.manifold.spectral_embedding_._graph_is_connected', + 'sklearn.manifold.spectral_embedding_._set_diag', 'sklearn.manifold.spectral_embedding_.spectral_embedding', + 'sklearn.manifold.t_sne.MACHINE_EPSILON', 'sklearn.manifold.t_sne.TSNE', + 'sklearn.manifold.t_sne._gradient_descent', 'sklearn.manifold.t_sne._joint_probabilities', + 'sklearn.manifold.t_sne._joint_probabilities_nn', 'sklearn.manifold.t_sne._kl_divergence', + 'sklearn.manifold.t_sne._kl_divergence_bh', 'sklearn.manifold.t_sne.string_types', + 'sklearn.manifold.t_sne.trustworthiness', 'sklearn.metrics.SCORERS', + 'sklearn.metrics.accuracy_score', 'sklearn.metrics.adjusted_mutual_info_score', + 'sklearn.metrics.adjusted_rand_score', 'sklearn.metrics.auc', + 'sklearn.metrics.average_precision_score', 'sklearn.metrics.base._average_binary_score', + 'sklearn.metrics.brier_score_loss', 'sklearn.metrics.calinski_harabaz_score', + 'sklearn.metrics.classification._check_binary_probabilistic_predictions', 'sklearn.metrics.classification._check_targets', + 'sklearn.metrics.classification._prf_divide', 'sklearn.metrics.classification._weighted_sum', + 'sklearn.metrics.classification.accuracy_score', 'sklearn.metrics.classification.brier_score_loss', + 'sklearn.metrics.classification.classification_report', 'sklearn.metrics.classification.cohen_kappa_score', + 'sklearn.metrics.classification.confusion_matrix', 'sklearn.metrics.classification.f1_score', + 'sklearn.metrics.classification.fbeta_score', 'sklearn.metrics.classification.hamming_loss', + 'sklearn.metrics.classification.hinge_loss', 'sklearn.metrics.classification.jaccard_similarity_score', + 'sklearn.metrics.classification.log_loss', 'sklearn.metrics.classification.matthews_corrcoef', + 'sklearn.metrics.classification.precision_recall_fscore_support', 'sklearn.metrics.classification.precision_score', + 'sklearn.metrics.classification.recall_score', 'sklearn.metrics.classification.zero_one_loss', + 'sklearn.metrics.classification_report', 'sklearn.metrics.cluster.adjusted_mutual_info_score', + 'sklearn.metrics.cluster.adjusted_rand_score', 'sklearn.metrics.cluster.bicluster._check_rows_and_columns', + 'sklearn.metrics.cluster.bicluster._jaccard', 'sklearn.metrics.cluster.bicluster._pairwise_similarity', + 'sklearn.metrics.cluster.bicluster.consensus_score', 'sklearn.metrics.cluster.calinski_harabaz_score', + 'sklearn.metrics.cluster.completeness_score', 'sklearn.metrics.cluster.consensus_score', + 'sklearn.metrics.cluster.contingency_matrix', 'sklearn.metrics.cluster.entropy', + 'sklearn.metrics.cluster.expected_mutual_info_fast.expected_mutual_information', 'sklearn.metrics.cluster.expected_mutual_info_fast.gammaln', + 'sklearn.metrics.cluster.expected_mutual_information', 'sklearn.metrics.cluster.fowlkes_mallows_score', + 'sklearn.metrics.cluster.homogeneity_completeness_v_measure', 'sklearn.metrics.cluster.homogeneity_score', + 'sklearn.metrics.cluster.mutual_info_score', 'sklearn.metrics.cluster.normalized_mutual_info_score', + 'sklearn.metrics.cluster.silhouette_samples', 'sklearn.metrics.cluster.silhouette_score', + 'sklearn.metrics.cluster.supervised.adjusted_mutual_info_score', 'sklearn.metrics.cluster.supervised.adjusted_rand_score', + 'sklearn.metrics.cluster.supervised.check_clusterings', 'sklearn.metrics.cluster.supervised.comb2', + 'sklearn.metrics.cluster.supervised.completeness_score', 'sklearn.metrics.cluster.supervised.contingency_matrix', + 'sklearn.metrics.cluster.supervised.entropy', 'sklearn.metrics.cluster.supervised.fowlkes_mallows_score', + 'sklearn.metrics.cluster.supervised.homogeneity_completeness_v_measure', 'sklearn.metrics.cluster.supervised.homogeneity_score', + 'sklearn.metrics.cluster.supervised.mutual_info_score', 'sklearn.metrics.cluster.supervised.normalized_mutual_info_score', + 'sklearn.metrics.cluster.supervised.v_measure_score', 'sklearn.metrics.cluster.unsupervised.calinski_harabaz_score', + 'sklearn.metrics.cluster.unsupervised.check_number_of_labels', 'sklearn.metrics.cluster.unsupervised.silhouette_samples', + 'sklearn.metrics.cluster.unsupervised.silhouette_score', 'sklearn.metrics.cluster.v_measure_score', + 'sklearn.metrics.cohen_kappa_score', 'sklearn.metrics.completeness_score', + 'sklearn.metrics.confusion_matrix', 'sklearn.metrics.consensus_score', + 'sklearn.metrics.coverage_error', 'sklearn.metrics.euclidean_distances', + 'sklearn.metrics.explained_variance_score', 'sklearn.metrics.f1_score', + 'sklearn.metrics.fbeta_score', 'sklearn.metrics.fowlkes_mallows_score', + 'sklearn.metrics.get_scorer', 'sklearn.metrics.hamming_loss', + 'sklearn.metrics.hinge_loss', 'sklearn.metrics.homogeneity_completeness_v_measure', + 'sklearn.metrics.homogeneity_score', 'sklearn.metrics.jaccard_similarity_score', + 'sklearn.metrics.label_ranking_average_precision_score', 'sklearn.metrics.label_ranking_loss', + 'sklearn.metrics.log_loss', 'sklearn.metrics.make_scorer', + 'sklearn.metrics.matthews_corrcoef', 'sklearn.metrics.mean_absolute_error', + 'sklearn.metrics.mean_squared_error', 'sklearn.metrics.mean_squared_log_error', + 'sklearn.metrics.median_absolute_error', 'sklearn.metrics.mutual_info_score', + 'sklearn.metrics.normalized_mutual_info_score', 'sklearn.metrics.pairwise.KERNEL_PARAMS', + 'sklearn.metrics.pairwise.PAIRED_DISTANCES', 'sklearn.metrics.pairwise.PAIRWISE_BOOLEAN_FUNCTIONS', + 'sklearn.metrics.pairwise.PAIRWISE_DISTANCE_FUNCTIONS', 'sklearn.metrics.pairwise.PAIRWISE_KERNEL_FUNCTIONS', + 'sklearn.metrics.pairwise._VALID_METRICS', 'sklearn.metrics.pairwise._chi2_kernel_fast', + 'sklearn.metrics.pairwise._pairwise_callable', 'sklearn.metrics.pairwise._parallel_pairwise', + 'sklearn.metrics.pairwise._return_float_dtype', 'sklearn.metrics.pairwise._sparse_manhattan', + 'sklearn.metrics.pairwise.additive_chi2_kernel', 'sklearn.metrics.pairwise.check_paired_arrays', + 'sklearn.metrics.pairwise.check_pairwise_arrays', 'sklearn.metrics.pairwise.chi2_kernel', + 'sklearn.metrics.pairwise.cosine_distances', 'sklearn.metrics.pairwise.cosine_similarity', + 'sklearn.metrics.pairwise.distance_metrics', 'sklearn.metrics.pairwise.euclidean_distances', + 'sklearn.metrics.pairwise.kernel_metrics', 'sklearn.metrics.pairwise.laplacian_kernel', + 'sklearn.metrics.pairwise.linear_kernel', 'sklearn.metrics.pairwise.manhattan_distances', + 'sklearn.metrics.pairwise.paired_cosine_distances', 'sklearn.metrics.pairwise.paired_distances', + 'sklearn.metrics.pairwise.paired_euclidean_distances', 'sklearn.metrics.pairwise.paired_manhattan_distances', + 'sklearn.metrics.pairwise.pairwise_distances', 'sklearn.metrics.pairwise.pairwise_distances_argmin', + 'sklearn.metrics.pairwise.pairwise_distances_argmin_min', 'sklearn.metrics.pairwise.pairwise_kernels', + 'sklearn.metrics.pairwise.polynomial_kernel', 'sklearn.metrics.pairwise.rbf_kernel', + 'sklearn.metrics.pairwise.sigmoid_kernel', 'sklearn.metrics.pairwise_distances', + 'sklearn.metrics.pairwise_distances_argmin', 'sklearn.metrics.pairwise_distances_argmin_min', + 'sklearn.metrics.pairwise_fast._chi2_kernel_fast', 'sklearn.metrics.pairwise_fast._sparse_manhattan', + 'sklearn.metrics.pairwise_kernels', 'sklearn.metrics.precision_recall_curve', + 'sklearn.metrics.precision_recall_fscore_support', 'sklearn.metrics.precision_score', + 'sklearn.metrics.r2_score', 'sklearn.metrics.ranking._binary_clf_curve', + 'sklearn.metrics.ranking.auc', 'sklearn.metrics.ranking.average_precision_score', + 'sklearn.metrics.ranking.coverage_error', 'sklearn.metrics.ranking.label_ranking_average_precision_score', + 'sklearn.metrics.ranking.label_ranking_loss', 'sklearn.metrics.ranking.precision_recall_curve', + 'sklearn.metrics.ranking.roc_auc_score', 'sklearn.metrics.ranking.roc_curve', + 'sklearn.metrics.recall_score', 'sklearn.metrics.regression._check_reg_targets', + 'sklearn.metrics.regression.explained_variance_score', 'sklearn.metrics.regression.mean_absolute_error', + 'sklearn.metrics.regression.mean_squared_error', 'sklearn.metrics.regression.mean_squared_log_error', + 'sklearn.metrics.regression.median_absolute_error', 'sklearn.metrics.regression.r2_score', + 'sklearn.metrics.regression.string_types', 'sklearn.metrics.roc_auc_score', + 'sklearn.metrics.roc_curve', 'sklearn.metrics.scorer.SCORERS', + 'sklearn.metrics.scorer._BaseScorer', 'sklearn.metrics.scorer._PredictScorer', + 'sklearn.metrics.scorer._ProbaScorer', 'sklearn.metrics.scorer._ThresholdScorer', + 'sklearn.metrics.scorer._check_multimetric_scoring', 'sklearn.metrics.scorer._passthrough_scorer', + 'sklearn.metrics.scorer.accuracy_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.adjusted_mutual_info_scorer', + 'sklearn.metrics.scorer.adjusted_rand_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.average', + 'sklearn.metrics.scorer.average_precision_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.check_scoring', + 'sklearn.metrics.scorer.completeness_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.deprecation_msg', + 'sklearn.metrics.scorer.explained_variance_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.f1_scorer', + 'sklearn.metrics.scorer.fowlkes_mallows_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.get_scorer', + 'sklearn.metrics.scorer.homogeneity_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.log_loss_scorer', + 'sklearn.metrics.scorer.make_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.mean_absolute_error_scorer', + 'sklearn.metrics.scorer.mean_squared_error_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.median_absolute_error_scorer', + 'sklearn.metrics.scorer.mutual_info_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.name', + 'sklearn.metrics.scorer.neg_log_loss_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.neg_mean_absolute_error_scorer', + 'sklearn.metrics.scorer.neg_mean_squared_error_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.neg_mean_squared_log_error_scorer', + 'sklearn.metrics.scorer.neg_median_absolute_error_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.normalized_mutual_info_scorer', + 'sklearn.metrics.scorer.precision_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.qualified_name', + 'sklearn.metrics.scorer.r2_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.recall_scorer', + 'sklearn.metrics.scorer.roc_auc_scorer', 'sklearn.metrics.scorer.v_measure_scorer', + 'sklearn.metrics.silhouette_samples', 'sklearn.metrics.silhouette_score', + 'sklearn.metrics.v_measure_score', 'sklearn.metrics.zero_one_loss', + 'sklearn.model_selection.BaseCrossValidator', 'sklearn.model_selection.GridSearchCV', + 'sklearn.model_selection.GroupKFold', 'sklearn.model_selection.GroupShuffleSplit', + 'sklearn.model_selection.KFold', 'sklearn.model_selection.LeaveOneGroupOut', + 'sklearn.model_selection.LeaveOneOut', 'sklearn.model_selection.LeavePGroupsOut', + 'sklearn.model_selection.LeavePOut', 'sklearn.model_selection.ParameterGrid', + 'sklearn.model_selection.ParameterSampler', 'sklearn.model_selection.PredefinedSplit', + 'sklearn.model_selection.RandomizedSearchCV', 'sklearn.model_selection.RepeatedKFold', + 'sklearn.model_selection.RepeatedStratifiedKFold', 'sklearn.model_selection.ShuffleSplit', + 'sklearn.model_selection.StratifiedKFold', 'sklearn.model_selection.StratifiedShuffleSplit', + 'sklearn.model_selection.TimeSeriesSplit', 'sklearn.model_selection._search.BaseSearchCV', + 'sklearn.model_selection._search.GridSearchCV', 'sklearn.model_selection._search.ParameterGrid', + 'sklearn.model_selection._search.ParameterSampler', 'sklearn.model_selection._search.RandomizedSearchCV', + 'sklearn.model_selection._search._CVScoreTuple', 'sklearn.model_selection._search._check_param_grid', + 'sklearn.model_selection._search.fit_grid_point', 'sklearn.model_selection._search.sp_version', + 'sklearn.model_selection._split.BaseCrossValidator', 'sklearn.model_selection._split.BaseShuffleSplit', + 'sklearn.model_selection._split.GroupKFold', 'sklearn.model_selection._split.GroupShuffleSplit', + 'sklearn.model_selection._split.KFold', 'sklearn.model_selection._split.LeaveOneGroupOut', + 'sklearn.model_selection._split.LeaveOneOut', 'sklearn.model_selection._split.LeavePGroupsOut', + 'sklearn.model_selection._split.LeavePOut', 'sklearn.model_selection._split.PredefinedSplit', + 'sklearn.model_selection._split.RepeatedKFold', 'sklearn.model_selection._split.RepeatedStratifiedKFold', + 'sklearn.model_selection._split.ShuffleSplit', 'sklearn.model_selection._split.StratifiedKFold', + 'sklearn.model_selection._split.StratifiedShuffleSplit', 'sklearn.model_selection._split.TimeSeriesSplit', + 'sklearn.model_selection._split._BaseKFold', 'sklearn.model_selection._split._CVIterableWrapper', + 'sklearn.model_selection._split._RepeatedSplits', 'sklearn.model_selection._split._approximate_mode', + 'sklearn.model_selection._split._build_repr', 'sklearn.model_selection._split._validate_shuffle_split', + 'sklearn.model_selection._split._validate_shuffle_split_init', 'sklearn.model_selection._split.check_cv', + 'sklearn.model_selection._split.train_test_split', 'sklearn.model_selection._validation._aggregate_score_dicts', + 'sklearn.model_selection._validation._check_is_permutation', 'sklearn.model_selection._validation._fit_and_predict', + 'sklearn.model_selection._validation._fit_and_score', 'sklearn.model_selection._validation._incremental_fit_estimator', + 'sklearn.model_selection._validation._index_param_value', 'sklearn.model_selection._validation._multimetric_score', + 'sklearn.model_selection._validation._permutation_test_score', 'sklearn.model_selection._validation._score', + 'sklearn.model_selection._validation._shuffle', 'sklearn.model_selection._validation._translate_train_sizes', + 'sklearn.model_selection._validation.cross_val_predict', 'sklearn.model_selection._validation.cross_val_score', + 'sklearn.model_selection._validation.cross_validate', 'sklearn.model_selection._validation.learning_curve', + 'sklearn.model_selection._validation.permutation_test_score', 'sklearn.model_selection._validation.validation_curve', + 'sklearn.model_selection.check_cv', 'sklearn.model_selection.cross_val_predict', + 'sklearn.model_selection.cross_val_score', 'sklearn.model_selection.cross_validate', + 'sklearn.model_selection.fit_grid_point', 'sklearn.model_selection.learning_curve', + 'sklearn.model_selection.permutation_test_score', 'sklearn.model_selection.train_test_split', + 'sklearn.model_selection.validation_curve', 'sklearn.multiclass.OneVsOneClassifier', + 'sklearn.multiclass.OneVsRestClassifier', 'sklearn.multiclass.OutputCodeClassifier', + 'sklearn.multiclass._ConstantPredictor', 'sklearn.multiclass._check_estimator', + 'sklearn.multiclass._fit_binary', 'sklearn.multiclass._fit_ovo_binary', + 'sklearn.multiclass._partial_fit_binary', 'sklearn.multiclass._partial_fit_ovo_binary', + 'sklearn.multiclass._predict_binary', 'sklearn.naive_bayes.BaseDiscreteNB', + 'sklearn.naive_bayes.BaseNB', 'sklearn.naive_bayes.BernoulliNB', + 'sklearn.naive_bayes.GaussianNB', 'sklearn.naive_bayes.MultinomialNB', + 'sklearn.naive_bayes._ALPHA_MIN', 'sklearn.neighbors.BallTree', + 'sklearn.neighbors.DistanceMetric', 'sklearn.neighbors.KDTree', + 'sklearn.neighbors.KNeighborsClassifier', 'sklearn.neighbors.KNeighborsRegressor', + 'sklearn.neighbors.KernelDensity', 'sklearn.neighbors.LSHForest', + 'sklearn.neighbors.LocalOutlierFactor', 'sklearn.neighbors.NearestCentroid', + 'sklearn.neighbors.NearestNeighbors', 'sklearn.neighbors.RadiusNeighborsClassifier', + 'sklearn.neighbors.RadiusNeighborsRegressor', 'sklearn.neighbors.approximate.GaussianRandomProjectionHash', + 'sklearn.neighbors.approximate.HASH_DTYPE', 'sklearn.neighbors.approximate.LSHForest', + 'sklearn.neighbors.approximate.MAX_HASH_SIZE', 'sklearn.neighbors.approximate.ProjectionToHashMixin', + 'sklearn.neighbors.approximate._array_of_arrays', 'sklearn.neighbors.approximate._find_longest_prefix_match', + 'sklearn.neighbors.approximate._find_matching_indices', 'sklearn.neighbors.ball_tree.BallTree', + 'sklearn.neighbors.ball_tree.BinaryTree', 'sklearn.neighbors.ball_tree.CLASS_DOC', + 'sklearn.neighbors.ball_tree.DOC_DICT', 'sklearn.neighbors.ball_tree.NeighborsHeap', + 'sklearn.neighbors.ball_tree.NodeData', 'sklearn.neighbors.ball_tree.NodeHeap', + 'sklearn.neighbors.ball_tree.NodeHeapData', 'sklearn.neighbors.ball_tree.VALID_METRICS', + 'sklearn.neighbors.ball_tree.VALID_METRIC_IDS', 'sklearn.neighbors.ball_tree.kernel_norm', + 'sklearn.neighbors.ball_tree.load_heap', 'sklearn.neighbors.ball_tree.newObj', + 'sklearn.neighbors.ball_tree.nodeheap_sort', 'sklearn.neighbors.ball_tree.offsets', + 'sklearn.neighbors.ball_tree.simultaneous_sort', 'sklearn.neighbors.base.KNeighborsMixin', + 'sklearn.neighbors.base.NeighborsBase', 'sklearn.neighbors.base.PAIRWISE_DISTANCE_FUNCTIONS', + 'sklearn.neighbors.base.RadiusNeighborsMixin', 'sklearn.neighbors.base.SupervisedFloatMixin', + 'sklearn.neighbors.base.SupervisedIntegerMixin', 'sklearn.neighbors.base.UnsupervisedMixin', + 'sklearn.neighbors.base.VALID_METRICS', 'sklearn.neighbors.base.VALID_METRICS_SPARSE', + 'sklearn.neighbors.base._check_weights', 'sklearn.neighbors.base._get_weights', + 'sklearn.neighbors.classification.KNeighborsClassifier', 'sklearn.neighbors.classification.RadiusNeighborsClassifier', + 'sklearn.neighbors.dist_metrics.BrayCurtisDistance', 'sklearn.neighbors.dist_metrics.CanberraDistance', + 'sklearn.neighbors.dist_metrics.ChebyshevDistance', 'sklearn.neighbors.dist_metrics.DiceDistance', + 'sklearn.neighbors.dist_metrics.DistanceMetric', 'sklearn.neighbors.dist_metrics.EuclideanDistance', + 'sklearn.neighbors.dist_metrics.HammingDistance', 'sklearn.neighbors.dist_metrics.HaversineDistance', + 'sklearn.neighbors.dist_metrics.JaccardDistance', 'sklearn.neighbors.dist_metrics.KulsinskiDistance', + 'sklearn.neighbors.dist_metrics.METRIC_MAPPING', 'sklearn.neighbors.dist_metrics.MahalanobisDistance', + 'sklearn.neighbors.dist_metrics.ManhattanDistance', 'sklearn.neighbors.dist_metrics.MatchingDistance', + 'sklearn.neighbors.dist_metrics.MinkowskiDistance', 'sklearn.neighbors.dist_metrics.PyFuncDistance', + 'sklearn.neighbors.dist_metrics.RogersTanimotoDistance', 'sklearn.neighbors.dist_metrics.RussellRaoDistance', + 'sklearn.neighbors.dist_metrics.SEuclideanDistance', 'sklearn.neighbors.dist_metrics.SokalMichenerDistance', + 'sklearn.neighbors.dist_metrics.SokalSneathDistance', 'sklearn.neighbors.dist_metrics.WMinkowskiDistance', + 'sklearn.neighbors.dist_metrics.get_valid_metric_ids', 'sklearn.neighbors.dist_metrics.newObj', + 'sklearn.neighbors.graph._check_params', 'sklearn.neighbors.graph._query_include_self', + 'sklearn.neighbors.graph.kneighbors_graph', 'sklearn.neighbors.graph.radius_neighbors_graph', + 'sklearn.neighbors.kd_tree.BinaryTree', 'sklearn.neighbors.kd_tree.CLASS_DOC', + 'sklearn.neighbors.kd_tree.DOC_DICT', 'sklearn.neighbors.kd_tree.KDTree', + 'sklearn.neighbors.kd_tree.NeighborsHeap', 'sklearn.neighbors.kd_tree.NodeData', + 'sklearn.neighbors.kd_tree.NodeHeap', 'sklearn.neighbors.kd_tree.NodeHeapData', + 'sklearn.neighbors.kd_tree.VALID_METRICS', 'sklearn.neighbors.kd_tree.VALID_METRIC_IDS', + 'sklearn.neighbors.kd_tree.kernel_norm', 'sklearn.neighbors.kd_tree.load_heap', + 'sklearn.neighbors.kd_tree.newObj', 'sklearn.neighbors.kd_tree.nodeheap_sort', + 'sklearn.neighbors.kd_tree.offsets', 'sklearn.neighbors.kd_tree.simultaneous_sort', + 'sklearn.neighbors.kde.KernelDensity', 'sklearn.neighbors.kde.TREE_DICT', + 'sklearn.neighbors.kde.VALID_KERNELS', 'sklearn.neighbors.kde.gammainc', + 'sklearn.neighbors.kneighbors_graph', 'sklearn.neighbors.lof.LocalOutlierFactor', + 'sklearn.neighbors.nearest_centroid.NearestCentroid', 'sklearn.neighbors.quad_tree.CELL_DTYPE', + 'sklearn.neighbors.quad_tree._QuadTree', 'sklearn.neighbors.radius_neighbors_graph', + 'sklearn.neighbors.regression.KNeighborsRegressor', 'sklearn.neighbors.regression.RadiusNeighborsRegressor', + 'sklearn.neighbors.unsupervised.NearestNeighbors', 'sklearn.pipeline.FeatureUnion', + 'sklearn.pipeline.Pipeline', 'sklearn.pipeline._fit_one_transformer', + 'sklearn.pipeline._fit_transform_one', 'sklearn.pipeline._name_estimators', + 'sklearn.pipeline._transform_one', 'sklearn.pipeline.make_pipeline', + 'sklearn.pipeline.make_union', 'sklearn.preprocessing.Binarizer', + 'sklearn.preprocessing.FunctionTransformer', 'sklearn.preprocessing.Imputer', + 'sklearn.preprocessing.KernelCenterer', 'sklearn.preprocessing.LabelBinarizer', + 'sklearn.preprocessing.LabelEncoder', 'sklearn.preprocessing.MaxAbsScaler', + 'sklearn.preprocessing.MinMaxScaler', 'sklearn.preprocessing.MultiLabelBinarizer', + 'sklearn.preprocessing.Normalizer', 'sklearn.preprocessing.OneHotEncoder', + 'sklearn.preprocessing.PolynomialFeatures', 'sklearn.preprocessing.QuantileTransformer', + 'sklearn.preprocessing.RobustScaler', 'sklearn.preprocessing.StandardScaler', + 'sklearn.preprocessing._function_transformer.FunctionTransformer', 'sklearn.preprocessing._function_transformer._identity', + 'sklearn.preprocessing._function_transformer.string_types', 'sklearn.preprocessing.add_dummy_feature', + 'sklearn.preprocessing.binarize', 'sklearn.preprocessing.data.BOUNDS_THRESHOLD', + 'sklearn.preprocessing.data.Binarizer', 'sklearn.preprocessing.data.FLOAT_DTYPES', + 'sklearn.preprocessing.data.KernelCenterer', 'sklearn.preprocessing.data.MaxAbsScaler', + 'sklearn.preprocessing.data.MinMaxScaler', 'sklearn.preprocessing.data.Normalizer', + 'sklearn.preprocessing.data.OneHotEncoder', 'sklearn.preprocessing.data.PolynomialFeatures', + 'sklearn.preprocessing.data.QuantileTransformer', 'sklearn.preprocessing.data.RobustScaler', + 'sklearn.preprocessing.data.StandardScaler', 'sklearn.preprocessing.data._handle_zeros_in_scale', + 'sklearn.preprocessing.data._transform_selected', 'sklearn.preprocessing.data.add_dummy_feature', + 'sklearn.preprocessing.data.binarize', 'sklearn.preprocessing.data.maxabs_scale', + 'sklearn.preprocessing.data.minmax_scale', 'sklearn.preprocessing.data.normalize', + 'sklearn.preprocessing.data.quantile_transform', 'sklearn.preprocessing.data.robust_scale', + 'sklearn.preprocessing.data.scale', 'sklearn.preprocessing.data.string_types', + 'sklearn.preprocessing.imputation.FLOAT_DTYPES', 'sklearn.preprocessing.imputation.Imputer', + 'sklearn.preprocessing.imputation._get_mask', 'sklearn.preprocessing.imputation._most_frequent', + 'sklearn.preprocessing.label.LabelBinarizer', 'sklearn.preprocessing.label.LabelEncoder', + 'sklearn.preprocessing.label.MultiLabelBinarizer', 'sklearn.preprocessing.label._inverse_binarize_multiclass', + 'sklearn.preprocessing.label._inverse_binarize_thresholding', 'sklearn.preprocessing.label.label_binarize', + 'sklearn.preprocessing.label_binarize', 'sklearn.preprocessing.maxabs_scale', + 'sklearn.preprocessing.minmax_scale', 'sklearn.preprocessing.normalize', + 'sklearn.preprocessing.quantile_transform', 'sklearn.preprocessing.robust_scale', + 'sklearn.preprocessing.scale', 'sklearn.random_projection.BaseRandomProjection', + 'sklearn.random_projection.GaussianRandomProjection', 'sklearn.random_projection.SparseRandomProjection', + 'sklearn.random_projection._check_density', 'sklearn.random_projection._check_input_size', + 'sklearn.random_projection.gaussian_random_matrix', 'sklearn.random_projection.johnson_lindenstrauss_min_dim', + 'sklearn.random_projection.sparse_random_matrix', 'sklearn.set_config', + 'sklearn.setup_module', 'sklearn.svm.LinearSVC', + 'sklearn.svm.LinearSVR', 'sklearn.svm.NuSVC', + 'sklearn.svm.NuSVR', 'sklearn.svm.OneClassSVM', + 'sklearn.svm.SVC', 'sklearn.svm.SVR', + 'sklearn.svm.base.BaseLibSVM', 'sklearn.svm.base.BaseSVC', + 'sklearn.svm.base.LIBSVM_IMPL', 'sklearn.svm.base._fit_liblinear', + 'sklearn.svm.base._get_liblinear_solver_type', 'sklearn.svm.base._one_vs_one_coef', + 'sklearn.svm.bounds.l1_min_c', 'sklearn.svm.classes.LinearSVC', + 'sklearn.svm.classes.LinearSVR', 'sklearn.svm.classes.NuSVC', + 'sklearn.svm.classes.NuSVR', 'sklearn.svm.classes.OneClassSVM', + 'sklearn.svm.classes.SVC', 'sklearn.svm.classes.SVR', + 'sklearn.svm.l1_min_c', 'sklearn.svm.liblinear.set_verbosity_wrap', + 'sklearn.svm.liblinear.train_wrap', 'sklearn.svm.libsvm.LIBSVM_KERNEL_TYPES', + 'sklearn.svm.libsvm.cross_validation', 'sklearn.svm.libsvm.decision_function', + 'sklearn.svm.libsvm.fit', 'sklearn.svm.libsvm.predict', + 'sklearn.svm.libsvm.predict_proba', 'sklearn.svm.libsvm.set_verbosity_wrap', + 'sklearn.svm.libsvm_sparse.libsvm_sparse_decision_function', 'sklearn.svm.libsvm_sparse.libsvm_sparse_predict', + 'sklearn.svm.libsvm_sparse.libsvm_sparse_predict_proba', 'sklearn.svm.libsvm_sparse.libsvm_sparse_train', + 'sklearn.svm.libsvm_sparse.set_verbosity_wrap', 'sklearn.tree.DecisionTreeClassifier', + 'sklearn.tree.DecisionTreeRegressor', 'sklearn.tree.ExtraTreeClassifier', + 'sklearn.tree.ExtraTreeRegressor', 'sklearn.tree._criterion.ClassificationCriterion', + 'sklearn.tree._criterion.Criterion', 'sklearn.tree._criterion.Entropy', + 'sklearn.tree._criterion.FriedmanMSE', 'sklearn.tree._criterion.Gini', + 'sklearn.tree._criterion.MAE', 'sklearn.tree._criterion.MSE', + 'sklearn.tree._criterion.RegressionCriterion', 'sklearn.tree._splitter.BaseDenseSplitter', + 'sklearn.tree._splitter.BaseSparseSplitter', 'sklearn.tree._splitter.BestSparseSplitter', + 'sklearn.tree._splitter.BestSplitter', 'sklearn.tree._splitter.RandomSparseSplitter', + 'sklearn.tree._splitter.RandomSplitter', 'sklearn.tree._splitter.Splitter', + 'sklearn.tree._tree.BestFirstTreeBuilder', 'sklearn.tree._tree.DepthFirstTreeBuilder', + 'sklearn.tree._tree.NODE_DTYPE', 'sklearn.tree._tree.TREE_LEAF', + 'sklearn.tree._tree.TREE_UNDEFINED', 'sklearn.tree._tree.Tree', + 'sklearn.tree._tree.TreeBuilder', 'sklearn.tree._utils.PriorityHeap', + 'sklearn.tree._utils.Stack', 'sklearn.tree._utils.WeightedMedianCalculator', + 'sklearn.tree._utils.WeightedPQueue', 'sklearn.tree._utils._realloc_test', + 'sklearn.tree.export.SENTINEL', 'sklearn.tree.export.Sentinel', + 'sklearn.tree.export._color_brew', 'sklearn.tree.export.export_graphviz', + 'sklearn.tree.export_graphviz', 'sklearn.tree.tree.BaseDecisionTree', + 'sklearn.tree.tree.CRITERIA_CLF', 'sklearn.tree.tree.CRITERIA_REG', + 'sklearn.tree.tree.DENSE_SPLITTERS', 'sklearn.tree.tree.DecisionTreeClassifier', + 'sklearn.tree.tree.DecisionTreeRegressor', 'sklearn.tree.tree.ExtraTreeClassifier', + 'sklearn.tree.tree.ExtraTreeRegressor', 'sklearn.tree.tree.SPARSE_SPLITTERS', + 'sklearn.utils.Bunch', 'sklearn.utils._get_n_jobs', + 'sklearn.utils._logistic_sigmoid._log_logistic_sigmoid', 'sklearn.utils._random._sample_without_replacement_check_input', + 'sklearn.utils._random._sample_without_replacement_with_pool', 'sklearn.utils._random._sample_without_replacement_with_reservoir_sampling', + 'sklearn.utils._random._sample_without_replacement_with_tracking_selection', 'sklearn.utils._random.sample_without_replacement', + 'sklearn.utils.arrayfuncs.cholesky_delete', 'sklearn.utils.arrayfuncs.min_pos', + 'sklearn.utils.as_float_array', 'sklearn.utils.assert_all_finite', + 'sklearn.utils.axis0_safe_slice', 'sklearn.utils.check_X_y', + 'sklearn.utils.check_array', 'sklearn.utils.check_consistent_length', + 'sklearn.utils.check_random_state', 'sklearn.utils.check_symmetric', + 'sklearn.utils.class_weight.compute_class_weight', 'sklearn.utils.class_weight.compute_sample_weight', + 'sklearn.utils.column_or_1d', 'sklearn.utils.compute_class_weight', + 'sklearn.utils.compute_sample_weight', 'sklearn.utils.deprecated', + 'sklearn.utils.deprecation.DeprecationDict', 'sklearn.utils.deprecation._is_deprecated', + 'sklearn.utils.deprecation.deprecated', 'sklearn.utils.extmath._deterministic_vector_sign_flip', + 'sklearn.utils.extmath._impose_f_order', 'sklearn.utils.extmath._incremental_mean_and_var', + 'sklearn.utils.extmath.cartesian', 'sklearn.utils.extmath.density', + 'sklearn.utils.extmath.fast_dot', 'sklearn.utils.extmath.fast_logdet', + 'sklearn.utils.extmath.log_logistic', 'sklearn.utils.extmath.logsumexp', + 'sklearn.utils.extmath.make_nonnegative', 'sklearn.utils.extmath.norm', + 'sklearn.utils.extmath.np_version', 'sklearn.utils.extmath.pinvh', + 'sklearn.utils.extmath.randomized_range_finder', 'sklearn.utils.extmath.randomized_svd', + 'sklearn.utils.extmath.row_norms', 'sklearn.utils.extmath.safe_min', + 'sklearn.utils.extmath.safe_sparse_dot', 'sklearn.utils.extmath.softmax', + 'sklearn.utils.extmath.squared_norm', 'sklearn.utils.extmath.stable_cumsum', + 'sklearn.utils.extmath.svd_flip', 'sklearn.utils.extmath.weighted_mode', + 'sklearn.utils.fast_dict.IntFloatDict', 'sklearn.utils.fast_dict.argmin', + 'sklearn.utils.fixes._parse_version', 'sklearn.utils.fixes.divide', + 'sklearn.utils.fixes.euler_gamma', 'sklearn.utils.fixes.makedirs', + 'sklearn.utils.fixes.np_version', 'sklearn.utils.fixes.parallel_helper', + 'sklearn.utils.fixes.sp_version', 'sklearn.utils.fixes.sparse_min_max', + 'sklearn.utils.gen_batches', 'sklearn.utils.gen_even_slices', + 'sklearn.utils.graph.connected_components', 'sklearn.utils.graph.graph_laplacian', + 'sklearn.utils.graph.graph_shortest_path', 'sklearn.utils.graph.single_source_shortest_path_length', + 'sklearn.utils.graph_shortest_path.graph_shortest_path', 'sklearn.utils.indexable', + 'sklearn.utils.indices_to_mask', 'sklearn.utils.linear_assignment_._HungarianState', + 'sklearn.utils.linear_assignment_._hungarian', 'sklearn.utils.linear_assignment_._step1', + 'sklearn.utils.linear_assignment_._step3', 'sklearn.utils.linear_assignment_._step4', + 'sklearn.utils.linear_assignment_._step5', 'sklearn.utils.linear_assignment_._step6', + 'sklearn.utils.linear_assignment_.linear_assignment', 'sklearn.utils.metaestimators._BaseComposition', + 'sklearn.utils.metaestimators._IffHasAttrDescriptor', 'sklearn.utils.metaestimators._safe_split', + 'sklearn.utils.metaestimators.if_delegate_has_method', 'sklearn.utils.multiclass._FN_UNIQUE_LABELS', + 'sklearn.utils.multiclass._check_partial_fit_first_call', 'sklearn.utils.multiclass._is_integral_float', + 'sklearn.utils.multiclass._ovr_decision_function', 'sklearn.utils.multiclass._unique_indicator', + 'sklearn.utils.multiclass._unique_multiclass', 'sklearn.utils.multiclass.check_classification_targets', + 'sklearn.utils.multiclass.class_distribution', 'sklearn.utils.multiclass.is_multilabel', + 'sklearn.utils.multiclass.string_types', 'sklearn.utils.multiclass.type_of_target', + 'sklearn.utils.multiclass.unique_labels', 'sklearn.utils.murmurhash.murmurhash3_32', + 'sklearn.utils.murmurhash.murmurhash3_bytes_array_s32', 'sklearn.utils.murmurhash.murmurhash3_bytes_array_u32', + 'sklearn.utils.murmurhash.murmurhash3_bytes_s32', 'sklearn.utils.murmurhash.murmurhash3_bytes_u32', + 'sklearn.utils.murmurhash.murmurhash3_int_s32', 'sklearn.utils.murmurhash.murmurhash3_int_u32', + 'sklearn.utils.murmurhash3_32', 'sklearn.utils.optimize._LineSearchError', + 'sklearn.utils.optimize._cg', 'sklearn.utils.optimize._line_search_wolfe12', + 'sklearn.utils.optimize.newton_cg', 'sklearn.utils.random.choice', + 'sklearn.utils.random.random_choice_csc', 'sklearn.utils.resample', + 'sklearn.utils.safe_indexing', 'sklearn.utils.safe_mask', + 'sklearn.utils.safe_sqr', 'sklearn.utils.seq_dataset.ArrayDataset', + 'sklearn.utils.seq_dataset.CSRDataset', 'sklearn.utils.seq_dataset.SequentialDataset', + 'sklearn.utils.shuffle', 'sklearn.utils.sparsefuncs._csc_mean_var_axis0', + 'sklearn.utils.sparsefuncs._csr_mean_var_axis0', 'sklearn.utils.sparsefuncs._get_elem_at_rank', + 'sklearn.utils.sparsefuncs._get_median', 'sklearn.utils.sparsefuncs._incr_mean_var_axis0', + 'sklearn.utils.sparsefuncs._raise_error_wrong_axis', 'sklearn.utils.sparsefuncs._raise_typeerror', + 'sklearn.utils.sparsefuncs.count_nonzero', 'sklearn.utils.sparsefuncs.csc_median_axis_0', + 'sklearn.utils.sparsefuncs.incr_mean_variance_axis', 'sklearn.utils.sparsefuncs.inplace_column_scale', + 'sklearn.utils.sparsefuncs.inplace_csr_column_scale', 'sklearn.utils.sparsefuncs.inplace_csr_row_scale', + 'sklearn.utils.sparsefuncs.inplace_row_scale', 'sklearn.utils.sparsefuncs.inplace_swap_column', + 'sklearn.utils.sparsefuncs.inplace_swap_row', 'sklearn.utils.sparsefuncs.inplace_swap_row_csc', + 'sklearn.utils.sparsefuncs.inplace_swap_row_csr', 'sklearn.utils.sparsefuncs.mean_variance_axis', + 'sklearn.utils.sparsefuncs.min_max_axis', 'sklearn.utils.sparsefuncs_fast._csc_mean_variance_axis0', + 'sklearn.utils.sparsefuncs_fast._csr_mean_variance_axis0', 'sklearn.utils.sparsefuncs_fast._csr_row_norms', + 'sklearn.utils.sparsefuncs_fast._incr_mean_variance_axis0', 'sklearn.utils.sparsefuncs_fast._inplace_csr_row_normalize_l1', + 'sklearn.utils.sparsefuncs_fast._inplace_csr_row_normalize_l2', 'sklearn.utils.sparsefuncs_fast.assign_rows_csr', + 'sklearn.utils.sparsefuncs_fast.csc_mean_variance_axis0', 'sklearn.utils.sparsefuncs_fast.csr_mean_variance_axis0', + 'sklearn.utils.sparsefuncs_fast.csr_row_norms', 'sklearn.utils.sparsefuncs_fast.incr_mean_variance_axis0', + 'sklearn.utils.sparsefuncs_fast.inplace_csr_row_normalize_l1', 'sklearn.utils.sparsefuncs_fast.inplace_csr_row_normalize_l2', + 'sklearn.utils.stats._weighted_percentile', 'sklearn.utils.stats.rankdata', + 'sklearn.utils.tosequence', 'sklearn.utils.validation.FLOAT_DTYPES', + 'sklearn.utils.validation._assert_all_finite', 'sklearn.utils.validation._ensure_sparse_format', + 'sklearn.utils.validation._is_arraylike', 'sklearn.utils.validation._num_samples', + 'sklearn.utils.validation._shape_repr', 'sklearn.utils.validation.as_float_array', + 'sklearn.utils.validation.assert_all_finite', 'sklearn.utils.validation.check_X_y', + 'sklearn.utils.validation.check_array', 'sklearn.utils.validation.check_consistent_length', + 'sklearn.utils.validation.check_is_fitted', 'sklearn.utils.validation.check_memory', + 'sklearn.utils.validation.check_non_negative', 'sklearn.utils.validation.check_random_state', + 'sklearn.utils.validation.check_symmetric', 'sklearn.utils.validation.column_or_1d', + 'sklearn.utils.validation.has_fit_parameter', 'sklearn.utils.validation.indexable', + 'sklearn.utils.weight_vector.WeightVector' +) + + +# class or function names from skrebate +SKR_NAMES = ( + 'skrebate.MultiSURF', 'skrebate.MultiSURFstar', + 'skrebate.ReliefF', 'skrebate.SURF', + 'skrebate.SURFstar', 'skrebate.TuRF', + 'skrebate.multisurf.MultiSURF', 'skrebate.multisurfstar.MultiSURFstar', + 'skrebate.relieff.ReliefF', 'skrebate.scoring_utils.MultiSURF_compute_scores', + 'skrebate.scoring_utils.MultiSURFstar_compute_scores', 'skrebate.scoring_utils.ReliefF_compute_scores', + 'skrebate.scoring_utils.SURF_compute_scores', 'skrebate.scoring_utils.SURFstar_compute_scores', + 'skrebate.scoring_utils.compute_score', 'skrebate.scoring_utils.get_row_missing', + 'skrebate.scoring_utils.ramp_function', 'skrebate.surf.SURF', + 'skrebate.surfstar.SURFstar', 'skrebate.turf.TuRF' +) + + +# class or function names from xgboost +XGB_NAMES = ( + 'xgboost.Booster', 'xgboost.DMatrix', + 'xgboost.VERSION_FILE', 'xgboost.XGBClassifier', + 'xgboost.XGBModel', 'xgboost.XGBRegressor', + 'xgboost.callback._fmt_metric', 'xgboost.callback._get_callback_context', + 'xgboost.callback.early_stop', 'xgboost.callback.print_evaluation', + 'xgboost.callback.record_evaluation', 'xgboost.callback.reset_learning_rate', + 'xgboost.compat.PANDAS_INSTALLED', 'xgboost.compat.PY3', + 'xgboost.compat.SKLEARN_INSTALLED', 'xgboost.compat.STRING_TYPES', + 'xgboost.compat.py_str', 'xgboost.core.Booster', + 'xgboost.core.CallbackEnv', 'xgboost.core.DMatrix', + 'xgboost.core.EarlyStopException', 'xgboost.core.PANDAS_DTYPE_MAPPER', + 'xgboost.core.PANDAS_INSTALLED', 'xgboost.core.PY3', + 'xgboost.core.STRING_TYPES', 'xgboost.core.XGBoostError', + 'xgboost.core._check_call', 'xgboost.core._load_lib', + 'xgboost.core._maybe_pandas_data', 'xgboost.core._maybe_pandas_label', + 'xgboost.core.c_array', 'xgboost.core.c_str', + 'xgboost.core.ctypes2buffer', 'xgboost.core.ctypes2numpy', + 'xgboost.core.from_cstr_to_pystr', 'xgboost.core.from_pystr_to_cstr', + 'xgboost.cv', 'xgboost.f', + 'xgboost.libpath.XGBoostLibraryNotFound', 'xgboost.libpath.find_lib_path', + 'xgboost.plot_importance', 'xgboost.plot_tree', + 'xgboost.plotting._EDGEPAT', 'xgboost.plotting._EDGEPAT2', + 'xgboost.plotting._LEAFPAT', 'xgboost.plotting._NODEPAT', + 'xgboost.plotting._parse_edge', 'xgboost.plotting._parse_node', + 'xgboost.plotting.plot_importance', 'xgboost.plotting.plot_tree', + 'xgboost.plotting.to_graphviz', 'xgboost.rabit.DTYPE_ENUM__', + 'xgboost.rabit.STRING_TYPES', 'xgboost.rabit._init_rabit', + 'xgboost.rabit.allreduce', 'xgboost.rabit.broadcast', + 'xgboost.rabit.finalize', 'xgboost.rabit.get_processor_name', + 'xgboost.rabit.get_rank', 'xgboost.rabit.get_world_size', + 'xgboost.rabit.init', 'xgboost.rabit.tracker_print', + 'xgboost.rabit.version_number', 'xgboost.sklearn.SKLEARN_INSTALLED', + 'xgboost.sklearn.XGBClassifier', 'xgboost.sklearn.XGBModel', + 'xgboost.sklearn.XGBRegressor', 'xgboost.sklearn._objective_decorator', + 'xgboost.to_graphviz', 'xgboost.train', + 'xgboost.training.CVPack', 'xgboost.training.SKLEARN_INSTALLED', + 'xgboost.training.STRING_TYPES', 'xgboost.training._train_internal', + 'xgboost.training.aggcv', 'xgboost.training.cv', + 'xgboost.training.mknfold', 'xgboost.training.train' +) + + +NUMPY_NAMES = ( + 'numpy.core.multiarray._reconstruct', 'numpy.ndarray', + 'numpy.dtype', 'numpy.core.multiarray.scalar', + 'numpy.random.__RandomState_ctor' +) diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/gbc_model01 Binary file test-data/gbc_model01 has changed diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/gbr_model01 Binary file test-data/gbr_model01 has changed diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/nn_model01.txt --- a/test-data/nn_model01.txt Fri Aug 17 12:27:15 2018 -0400 +++ b/test-data/nn_model01.txt Thu Aug 23 16:15:02 2018 -0400 @@ -1,14 +1,13 @@ ccopy_reg _reconstructor -p0 +p1 (csklearn.neighbors.classification KNeighborsClassifier -p1 +p2 c__builtin__ object -p2 -Ntp3 -Rp4 +p3 +NtRp4 (dp5 S'n_neighbors' p6 @@ -25,108 +24,87 @@ ndarray p10 (I0 -tp11 -S'b' -p12 -tp13 -Rp14 +tS'b' +tRp11 (I1 (I48 -tp15 -cnumpy +tcnumpy dtype -p16 +p12 (S'i8' -p17 I0 I1 -tp18 -Rp19 +tRp13 (I3 S'<' -p20 NNNI-1 I-1 I0 -tp21 -bI00 +tbI00 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00' -p22 -tp23 -bsS'algorithm' -p24 +tbsS'algorithm' +p14 Vbrute -p25 +p15 sS'_sklearn_version' -p26 +p16 S'0.19.1' -p27 +p17 sS'metric' -p28 +p18 S'minkowski' -p29 +p19 sS'classes_' -p30 +p20 g9 (g10 (I0 -tp31 -g12 -tp32 -Rp33 +tS'b' +tRp21 (I1 (I4 -tp34 -g19 +tg13 I00 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00' -p35 -tp36 -bsS'metric_params' -p37 +tbsS'metric_params' +p22 NsS'p' -p38 I2 sS'effective_metric_params_' -p39 -(dp40 +p23 +(dp24 sS'radius' -p41 +p25 NsS'leaf_size' -p42 +p26 I30 sS'_fit_method' -p43 -g25 +p27 +g15 sS'weights' -p44 +p28 Vuniform -p45 +p29 sS'_tree' -p46 +p30 NsS'effective_metric_' -p47 +p31 S'euclidean' -p48 +p32 sS'outputs_2d_' -p49 +p33 I00 sS'_fit_X' -p50 +p34 g9 (g10 (I0 -tp51 -g12 -tp52 -Rp53 +tS'b' +tRp35 (I1 (I48 I4 -tp54 -g19 +tg13 I01 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00,\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x003\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00:\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00+\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00-\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00*\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x002\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x005\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00-\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00+\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00#\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x008\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xc3\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xbd\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc5\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xce\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb2\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xdd\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc8\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc3\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xad\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xce\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xbd\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xce\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc3\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x93\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa2\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xab\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa6\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc1\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb1\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x9d\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xaf\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x94\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa4\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa8\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa8\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff6\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00*\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x000\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1f\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00!\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x17\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00&\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00"\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00#\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x000\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00A\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00=\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00+\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00<\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x007\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x005\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00,\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00A\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x004\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x008\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00V\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00]\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00^\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\\\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00[\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00W\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00[\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00Q\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00N\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00W\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00I\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00a\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00o\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x17\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x14\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1a\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00!\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\t\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\t\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1a\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x13\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x15\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1b\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x0f\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xb6\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa4\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x9d\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x8d\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa0\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x93\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa0\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x9a\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa6\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x95\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb2\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb4\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb7\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xcf\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xcf\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb1\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x9e\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc5\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc8\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc3\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xac\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb5\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xba\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff+\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x0f\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00$\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00>\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00F\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00/\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x004\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00.\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00"\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00-\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x002\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00-\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00-\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xa4\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa0\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa8\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x8e\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x96\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa3\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x94\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x92\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x94\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x96\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x96\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x99\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x04\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1f\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf9\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xfb\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\t\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf8\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x04\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x15\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x12\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00' -p55 -tp56 -bsb. \ No newline at end of file +tbsb. \ No newline at end of file diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/nn_model02.txt --- a/test-data/nn_model02.txt Fri Aug 17 12:27:15 2018 -0400 +++ b/test-data/nn_model02.txt Thu Aug 23 16:15:02 2018 -0400 @@ -1,14 +1,13 @@ ccopy_reg _reconstructor -p0 +p1 (csklearn.neighbors.classification RadiusNeighborsClassifier -p1 +p2 c__builtin__ object -p2 -Ntp3 -Rp4 +p3 +NtRp4 (dp5 S'n_neighbors' p6 @@ -24,213 +23,168 @@ ndarray p10 (I0 -tp11 -S'b' -p12 -tp13 -Rp14 +tS'b' +tRp11 (I1 (I48 -tp15 -cnumpy +tcnumpy dtype -p16 +p12 (S'i8' -p17 I0 I1 -tp18 -Rp19 +tRp13 (I3 S'<' -p20 NNNI-1 I-1 I0 -tp21 -bI00 +tbI00 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00' -p22 -tp23 -bsS'algorithm' -p24 +tbsS'algorithm' +p14 Vauto -p25 +p15 sS'_sklearn_version' -p26 +p16 S'0.19.1' -p27 +p17 sS'metric' -p28 +p18 S'minkowski' -p29 +p19 sS'classes_' -p30 +p20 g9 (g10 (I0 -tp31 -g12 -tp32 -Rp33 +tS'b' +tRp21 (I1 (I4 -tp34 -g19 +tg13 I00 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00' -p35 -tp36 -bsS'outputs_2d_' -p37 +tbsS'outputs_2d_' +p22 I00 sS'metric_params' -p38 +p23 NsS'p' -p39 I2 sS'effective_metric_params_' -p40 -(dp41 +p24 +(dp25 sS'radius' -p42 -F1.0 +p26 +F1 sS'leaf_size' -p43 +p27 I30 sS'_fit_method' -p44 +p28 S'kd_tree' -p45 +p29 sS'weights' -p46 +p30 Vuniform -p47 +p31 sS'_tree' -p48 +p32 csklearn.neighbors.kd_tree newObj -p49 +p33 (csklearn.neighbors.kd_tree BinaryTree -p50 -tp51 -Rp52 +p34 +tRp35 (g9 (g10 (I0 -tp53 -g12 -tp54 -Rp55 +tS'b' +tRp36 (I1 (I48 I4 -tp56 -g16 +tg12 (S'f8' -p57 I0 I1 -tp58 -Rp59 +tRp37 (I3 S'<' -p60 NNNI-1 I-1 I0 -tp61 -bI00 +tbI00 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00F@\x00\x00\x00\x00\x00\x00P@\x00\x00\x00\x00\x00\x00S\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x80I@\x00\x00\x00\x00\x00\x00H@\x00\x00\x00\x00\x00@R\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00M@\x00\x00\x00\x00\x00@P@\x00\x00\x00\x00\x00\x80H\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x80E@\x00\x00\x00\x00\x00\x80N@\x00\x00\x00\x00\x00\x80H\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x80F@\x00\x00\x00\x00\x00\x80E@\x00\x00\x00\x00\x00\xc0S\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00E@\x00\x00\x00\x00\x00\x00N@\x00\x00\x00\x00\x00\x80X\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00I@\x00\x00\x00\x00\x00\x80K@\x00\x00\x00\x00\x00\x80M\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x80J@\x00\x00\x00\x00\x00\x80J@\x00\x00\x00\x00\x00\x00L\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x80F@\x00\x00\x00\x00\x00\x00F@\x00\x00\x00\x00\x00\x80N\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x80E@\x00\x00\x00\x00\x00@P@\x00\x00\x00\x00\x00\x00U\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x80A@\x00\x00\x00\x00\x00\x00J@\x00\x00\x00\x00\x00\xc0R\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00L@\x00\x00\x00\x00\x00\x00L@\x00\x00\x00\x00\x00\x80Q\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\x80N\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x80U@\x00\x00\x00\x00\x00\x80E@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\xc0P\xc0\x00\x00\x00\x00\x00@W@\x00\x00\x00\x00\x00\x00.@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\x80M\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x80W@\x00\x00\x00\x00\x00\x00B@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\x00I\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00W@\x00\x00\x00\x00\x00\x00O@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\x80S\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\xc0V@\x00\x00\x00\x00\x00\x80Q@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\x80A\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\xc0U@\x00\x00\x00\x00\x00\x80G@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\x00L\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\xc0V@\x00\x00\x00\x00\x00\x00J@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\x80N\xc0\x00\x00\x00\x00\x00@T@\x00\x00\x00\x00\x00\x00G@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\xc0T\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x80S@\x00\x00\x00\x00\x00\x00A@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\x00I\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\xc0U@\x00\x00\x00\x00\x00\x80F@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\xc0P\xc0\x00\x00\x00\x00\x00@R@\x00\x00\x00\x00\x00\x00I@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\x00I\xc0\x00\x00\x00\x00\x00@X@\x00\x00\x00\x00\x00\x80F@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\x80N\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\xc0[@\x00\x00\x00\x00\x00\x80F@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00@[\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x007@\x00\x00\x00\x00\x00\x00W\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00\x80W\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x004@\x00\x00\x00\x00\x00\x00X\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00@U\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00:@\x00\x00\x00\x00\x00\x00V\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00\x80V\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x80@@\x00\x00\x00\x00\x00\x80\\\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00\x80O\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00"@\x00\x00\x00\x00\x00\x80Z\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00\xc0S\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00"@\x00\x00\x00\x00\x00@W\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00\xc0X\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00:@\x00\x00\x00\x00\x00\x00[\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00@T\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x003@\x00\x00\x00\x00\x00\x80[\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00\x00[\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x005@\x00\x00\x00\x00\x00\x00[\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00\x00W\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00;@\x00\x00\x00\x00\x00\x80Z\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00\x00V\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00\x80Z\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00\x00V\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00.@\x00\x00\x00\x00\x00\xc0Y\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08@\x00\x00\x00\x00\x00\x00K@\x00\x00\x00\x00\x00\x80R\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x10@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08@\x00\x00\x00\x00\x00\x00E@\x00\x00\x00\x00\x00\x00W\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00?@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08@\x00\x00\x00\x00\x00\x80C@\x00\x00\x00\x00\x00\xc0X\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1c\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08@\x00\x00\x00\x00\x00\x00H@\x00\x00\x00\x00\x00\xc0\\\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x14\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08@\x00\x00\x00\x00\x00\x80C@\x00\x00\x00\x00\x00\x00X\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08@\x00\x00\x00\x00\x00\x00?@\x00\x00\x00\x00\x00@[\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00"@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08@\x00\x00\x00\x00\x00\x80@@\x00\x00\x00\x00\x00\x00X\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00 \xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08@\x00\x00\x00\x00\x00\x007@\x00\x00\x00\x00\x00\x80Y\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x10@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08@\x00\x00\x00\x00\x00\x00C@\x00\x00\x00\x00\x00\x80V\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x005@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08@\x00\x00\x00\x00\x00\x00A@\x00\x00\x00\x00\x00\xc0Z\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08@\x00\x00\x00\x00\x00\x80A@\x00\x00\x00\x00\x00\x80S\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x002@' -p62 -tp63 -bg9 +tbg9 (g10 (I0 -tp64 -g12 -tp65 -Rp66 +tS'b' +tRp38 (I1 (I48 -tp67 -g19 +tg13 I00 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x04\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x05\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x06\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x07\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\t\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\n\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x0b\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x0c\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\r\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x0e\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x0f\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x10\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x11\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x12\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x13\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x14\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x15\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x16\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x17\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x18\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x19\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1a\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1b\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1c\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1d\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1e\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1f\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00 \x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00!\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00"\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00#\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00$\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00%\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00&\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00(\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00)\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00*\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00+\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00,\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00-\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00.\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00/\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00' -p68 -tp69 -bg9 +tbg9 (g10 (I0 -tp70 -g12 -tp71 -Rp72 +tS'b' +tRp39 (I1 (I1 -tp73 -g16 +tg12 (S'V32' -p74 I0 I1 -tp75 -Rp76 +tRp40 (I3 S'|' -p77 N(S'idx_start' -p78 +p41 S'idx_end' -p79 +p42 S'is_leaf' -p80 +p43 +g26 +tp44 +(dp45 g42 -tp81 -(dp82 -g79 -(g19 +(g13 I8 -tp83 -sg80 -(g19 +tp46 +sg43 +(g13 I16 -tp84 -sg42 -(g59 +tp47 +sg26 +(g37 I24 -tp85 -sg78 -(g19 +tp48 +sg41 +(g13 I0 -tp86 +tp49 sI32 I1 I16 -tp87 -bI00 +tbI00 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x000\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xd2 \xd7\x95\xa0\x89\x80@' -p88 -tp89 -bg9 +tbg9 (g10 (I0 -tp90 -g12 -tp91 -Rp92 +tS'b' +tRp50 (I1 (I2 I1 I4 -tp93 -g59 +tg37 I00 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@[\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\xc0\\\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x80\\\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08@\x00\x00\x00\x00\x00\x00M@\x00\x00\x00\x00\x00\xc0[@\x00\x00\x00\x00\x00\x80Q@' -p94 -tp95 -bI30 +tbI30 I1 I1 I0 @@ -239,68 +193,50 @@ I0 csklearn.neighbors.dist_metrics newObj -p96 +p51 (csklearn.neighbors.dist_metrics EuclideanDistance -p97 -tp98 -Rp99 -(F2.0 +p52 +tRp53 +(F2 g9 (g10 (I0 -tp100 -g12 -tp101 -Rp102 +tS'b' +tRp54 (I1 (I1 -tp103 -g59 +tg37 I00 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00' -p104 -tp105 -bg9 +tbg9 (g10 (I0 -tp106 -g12 -tp107 -Rp108 +tS'b' +tRp55 (I1 (I1 I1 -tp109 -g59 +tg37 I00 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00' -p110 -tp111 -btp112 -btp113 -bsS'effective_metric_' -p114 +tbtbtbsS'effective_metric_' +p56 S'euclidean' -p115 +p57 sS'outlier_label' -p116 +p58 NsS'_fit_X' -p117 +p59 g9 (g10 (I0 -tp118 -g12 -tp119 -Rp120 +tS'b' +tRp60 (I1 (I48 I4 -tp121 -g19 +tg13 I01 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00,\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x003\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00:\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00+\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00-\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00*\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x002\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x005\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00-\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00+\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00#\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x008\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xc3\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xbd\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc5\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xce\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb2\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xdd\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc8\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc3\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xad\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xce\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xbd\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xce\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc3\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x93\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa2\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xab\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa6\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc1\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb1\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x9d\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xaf\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x94\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa4\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa8\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa8\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff6\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00*\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x000\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1f\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00!\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x17\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00&\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00"\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00#\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x000\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00A\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00=\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00+\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00<\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x007\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x005\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00,\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00A\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x004\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x008\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00V\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00]\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00^\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\\\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00[\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00W\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00[\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00Q\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00N\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00W\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00I\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00a\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00o\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x17\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x14\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1a\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00!\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\t\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\t\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1a\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x13\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x15\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1b\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x0f\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xb6\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa4\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x9d\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x8d\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa0\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x93\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa0\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x9a\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa6\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x95\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb2\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb4\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb7\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xcf\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xcf\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb1\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x9e\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc5\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc8\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xc3\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xac\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xb5\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xba\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff+\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x0f\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00$\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00>\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00F\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00/\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x004\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00.\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00"\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00-\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x002\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00-\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00-\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xa4\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa0\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa8\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x8e\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x96\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xa3\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x94\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x92\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x94\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x96\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x96\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x99\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x04\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x1f\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf9\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xfb\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\t\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf8\xff\xff\xff\xff\xff\xff\xff\x04\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x15\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x12\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00' -p122 -tp123 -bsb. \ No newline at end of file +tbsb. \ No newline at end of file diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/nn_model03.txt --- a/test-data/nn_model03.txt Fri Aug 17 12:27:15 2018 -0400 +++ b/test-data/nn_model03.txt Thu Aug 23 16:15:02 2018 -0400 @@ -1,14 +1,13 @@ ccopy_reg _reconstructor -p0 +p1 (csklearn.neighbors.nearest_centroid NearestCentroid -p1 +p2 c__builtin__ object -p2 -Ntp3 -Rp4 +p3 +NtRp4 (dp5 S'centroids_' p6 @@ -19,73 +18,54 @@ ndarray p8 (I0 -tp9 -S'b' -p10 -tp11 -Rp12 +tS'b' +tRp9 (I1 (I4 I4 -tp13 -cnumpy +tcnumpy dtype -p14 +p10 (S'f8' -p15 I0 I1 -tp16 -Rp17 +tRp11 (I3 S'<' -p18 NNNI-1 I-1 I0 -tp19 -bI00 +tbI00 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xab\xaa\xaa\xaa\xaa\x8aG@\x00\x00\x00\x00\x00\xc0K@UUUUUEQ\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00@\xab\xaa\xaa\xaa\xaajV\xc0\xab\xaa\xaa\xaa\xaa*3@\x00\x00\x00\x00\x00\xa0Y\xc0\x00\x00\x00\x00\x00\x00\xf0?\xc5N\xec\xc4N\xecM\xc0;\xb1\x13;\xb1SV@\x14;\xb1\x13;\xb1F@\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x08@\xe9\xa2\x8b.\xba\xe8B@\x8c.\xba\xe8\xa2\x0bX\xc0t\xd1E\x17]t\x19@' -p20 -tp21 -bsS'metric' -p22 +tbsS'metric' +p12 Veuclidean -p23 +p13 sS'classes_' -p24 +p14 g7 (g8 (I0 -tp25 -g10 -tp26 -Rp27 +tS'b' +tRp15 (I1 (I4 -tp28 -g14 +tg10 (S'i8' -p29 I0 I1 -tp30 -Rp31 +tRp16 (I3 S'<' -p32 NNNI-1 I-1 I0 -tp33 -bI00 +tbI00 S'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x02\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00' -p34 -tp35 -bsS'_sklearn_version' -p36 +tbsS'_sklearn_version' +p17 S'0.19.1' -p37 +p18 sS'shrink_threshold' -p38 +p19 Nsb. \ No newline at end of file diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/pipeline01 Binary file test-data/pipeline01 has changed diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/pipeline04 Binary file test-data/pipeline04 has changed diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/rfc_model01 Binary file test-data/rfc_model01 has changed diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/rfr_model01 Binary file test-data/rfr_model01 has changed diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/searchCV01 Binary file test-data/searchCV01 has changed diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/svc_model01.txt Binary file test-data/svc_model01.txt has changed diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/svc_model02.txt Binary file test-data/svc_model02.txt has changed diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/svc_model03.txt Binary file test-data/svc_model03.txt has changed diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 test-data/svc_prediction_result03.tabular --- a/test-data/svc_prediction_result03.tabular Fri Aug 17 12:27:15 2018 -0400 +++ b/test-data/svc_prediction_result03.tabular Thu Aug 23 16:15:02 2018 -0400 @@ -25,7 +25,7 @@ 1 -50 97 45 2 1 -61 111 45 2 2 -109 23 -92 2 -2 -94 20 -96 3 +2 -94 20 -96 1 2 -85 26 -88 2 2 -90 33 -114 0 2 -63 9 -106 0 @@ -33,7 +33,7 @@ 2 -99 26 -108 1 2 -81 19 -110 0 2 -108 21 -108 1 -2 -92 27 -106 0 +2 -92 27 -106 1 2 -88 2 -106 3 2 -88 15 -103 3 3 54 -74 4 3 diff -r addf8e0f2654 -r e9cbaf6cbc35 utils.py --- a/utils.py Fri Aug 17 12:27:15 2018 -0400 +++ b/utils.py Thu Aug 23 16:15:02 2018 -0400 @@ -2,7 +2,7 @@ import os import pandas import re -import pickle +import cPickle as pickle import warnings import numpy as np import xgboost @@ -10,10 +10,62 @@ import sklearn import ast from asteval import Interpreter, make_symbol_table -from sklearn import metrics, model_selection, ensemble, svm, linear_model, naive_bayes, tree, neighbors +from sklearn import (cluster, decomposition, ensemble, feature_extraction, feature_selection, + gaussian_process, kernel_approximation, linear_model, metrics, + model_selection, naive_bayes, neighbors, pipeline, preprocessing, + svm, linear_model, tree, discriminant_analysis) N_JOBS = int( os.environ.get('GALAXY_SLOTS', 1) ) +class SafePickler(object): + """ + Used to safely deserialize scikit-learn model objects serialized by cPickle.dump + Usage: + eg.: SafePickler.load(pickled_file_object) + """ + @classmethod + def find_class(self, module, name): + + bad_names = ('and', 'as', 'assert', 'break', 'class', 'continue', + 'def', 'del', 'elif', 'else', 'except', 'exec', + 'finally', 'for', 'from', 'global', 'if', 'import', + 'in', 'is', 'lambda', 'not', 'or', 'pass', 'print', + 'raise', 'return', 'try', 'system', 'while', 'with', + 'True', 'False', 'None', 'eval', 'execfile', '__import__', + '__package__', '__subclasses__', '__bases__', '__globals__', + '__code__', '__closure__', '__func__', '__self__', '__module__', + '__dict__', '__class__', '__call__', '__get__', + '__getattribute__', '__subclasshook__', '__new__', + '__init__', 'func_globals', 'func_code', 'func_closure', + 'im_class', 'im_func', 'im_self', 'gi_code', 'gi_frame', + '__asteval__', 'f_locals', '__mro__') + good_names = ('copy_reg._reconstructor', '__builtin__.object') + + if re.match(r'^[a-zA-Z_][a-zA-Z0-9_]*$', name): + fullname = module + '.' + name + if (fullname in good_names)\ + or ( ( module.startswith('sklearn.') + or module.startswith('xgboost.') + or module.startswith('skrebate.') + or module.startswith('numpy.') + or module == 'numpy' + ) + and (name not in bad_names) + ) : + # TODO: replace with a whitelist checker + if fullname not in SK_NAMES + SKR_NAMES + XGB_NAMES + NUMPY_NAMES + good_names: + print("Warning: global %s is not in pickler whitelist yet and will loss support soon. Contact tool author or leave a message at github.com" % fullname) + mod = sys.modules[module] + return getattr(mod, name) + + raise pickle.UnpicklingError("global '%s' is forbidden" % fullname) + + @classmethod + def load(self, file): + obj = pickle.Unpickler(file) + obj.find_global = self.find_class + return obj.load() + def read_columns(f, c=None, c_option='by_index_number', return_df=False, **args): data = pandas.read_csv(f, **args) if c_option == 'by_index_number': @@ -48,7 +100,7 @@ if inputs['model_inputter']['input_mode'] == 'prefitted': model_file = inputs['model_inputter']['fitted_estimator'] with open(model_file, 'rb') as model_handler: - fitted_estimator = pickle.load(model_handler) + fitted_estimator = SafePickler.load(model_handler) new_selector = selector(fitted_estimator, prefit=True, **options) else: estimator_json = inputs['model_inputter']["estimator_selector"] @@ -132,9 +184,9 @@ if load_scipy: scipy_distributions = scipy.stats.distributions.__dict__ - for key in scipy_distributions.keys(): - if isinstance(scipy_distributions[key], (scipy.stats.rv_continuous, scipy.stats.rv_discrete)): - syms['scipy_stats_' + key] = scipy_distributions[key] + for k, v in scipy_distributions.items(): + if isinstance(v, (scipy.stats.rv_continuous, scipy.stats.rv_discrete)): + syms['scipy_stats_' + k] = v if load_numpy: from_numpy_random = ['beta', 'binomial', 'bytes', 'chisquare', 'choice', 'dirichlet', 'division',