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planemo upload for repository https://github.com/galaxycomputationalchemistry/galaxy-tools-compchem/ commit c32fe331f438df7760084b27bafad9f78f01edde
| author | chemteam |
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--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/angle.py Mon Oct 08 13:17:59 2018 -0400 @@ -0,0 +1,72 @@ +#!/usr/bin/env python + +import argparse +import csv +import sys + +import MDAnalysis as mda + +import matplotlib +import matplotlib.pyplot as plt + +import numpy as np +from numpy.linalg import norm + +matplotlib.use('Agg') + + +def parse_command_line(argv): + parser = argparse.ArgumentParser() + parser.add_argument('--idcd', help='input dcd') + parser.add_argument('--ipdb', help='input pdb') + parser.add_argument('--isegid1', help='segid 1') + parser.add_argument('--iresid1', help='resid 1') + parser.add_argument('--iname1', help='name 1') + parser.add_argument('--isegid2', help='segid 2') + parser.add_argument('--iresid2', help='resid 2') + parser.add_argument('--iname2', help='name 2') + parser.add_argument('--isegid3', help='segid 3') + parser.add_argument('--iresid3', help='resid 3') + parser.add_argument('--iname3', help='name 3') + parser.add_argument('--output', help='output') + parser.add_argument('--oangle_plot', help='angle plot') + return parser.parse_args() + + +args = parse_command_line(sys.argv) + +atom1 = "(segid %s and resid %s and name %s)" % \ + (args.isegid1, args.iresid1, args.iname1) +atom2 = "(segid %s and resid %s and name %s)" % \ + (args.isegid2, args.iresid2, args.iname2) +atom3 = "(segid %s and resid %s and name %s)" % \ + (args.isegid3, args.iresid3, args.iname3) + + +def theta(u): + A = u.select_atoms(atom1).center_of_geometry() + B = u.select_atoms(atom2).center_of_geometry() + C = u.select_atoms(atom3).center_of_geometry() + BA = A - B + BC = C - B + theta = np.arccos(np.dot(BA, BC)/(norm(BA)*norm(BC))) + return np.rad2deg(theta) + + +u = mda.Universe(args.ipdb, args.idcd, topology_format="PDB", format="DCD") +data = np.array([(u.trajectory.frame, theta(u)) for ts in u.trajectory]) +frame, theta = data.T + +with open(args.output, 'w') as f: + writer = csv.writer(f, delimiter='\t') + writer.writerows(zip(frame, theta)) + +with open(args.output) as f: + g = [xtmp.strip() for xtmp in f] + data = [tuple(map(float, xtmp.split())) for xtmp in g[0:]] + time = [xtmp[0] for xtmp in data] + angle = [xtmp[1] for xtmp in data] + plt.plot(time, angle) + plt.xlabel('Frame No.') + plt.ylabel('Angle (degrees)') + plt.savefig(args.oangle_plot, format='png')
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/angle.xml Mon Oct 08 13:17:59 2018 -0400 @@ -0,0 +1,91 @@ +<tool id="mdanalysis_angle" name="Angle Analysis" version="@VERSION@"> + <description>Time series of Angles</description> + <macros> + <import>macros.xml</import> + </macros> + <expand macro="requirements" /> + <command detect_errors="exit_code"> +<![CDATA[ + python '$__tool_directory__/angle.py' + --idcd '$dcdin' + --ipdb '$pdbin' + --isegid1 '$segid1' + --iresid1 '$resid1' + --iname1 '$name1' + --isegid2 '$segid2' + --iresid2 '$resid2' + --iname2 '$name2' + --isegid3 '$segid3' + --iresid3 '$resid3' + --iname3 '$name3' + --output '$output' + --oangle_plot '$angle_plot' + 2>&1 +]]></command> + <inputs> + <expand macro="analysis_inputs"/> + <param name="segid1" type="text" value="PRO" label="Segid of atom 1"/> + <param name="resid1" type="text" value="212" label="Resid of atom 1"/> + <param name="name1" type="text" value="OE2" label="Atom name of atom 1"/> + <param name="segid2" type="text" value="HET" label="Segid of atom 2"/> + <param name="resid2" type="text" value="3" label="Resid of atom 2"/> + <param name="name2" type="text" value="C1" label="Atom name of atom 2"/> + <param name="segid3" type="text" value="HET" label="Segid of atom 3"/> + <param name="resid3" type="text" value="3" label="Resid of atom 3"/> + <param name="name3" type="text" value="C2" label="Atom name of atom 3"/> + </inputs> + <outputs> + <data format="tabular" name="output" label="Angle Analysis raw data"/> + <data format="png" name="angle_plot" label="Angle Analysis Plot"/> + </outputs> + <tests> + <test> + <expand macro="tests_inputs"/> + <param name="segid1" value="PRO"/> + <param name="resid1" value="212"/> + <param name="name1" value="OE2"/> + <param name="segid2" value="HET"/> + <param name="resid2" value="3"/> + <param name="name2" value="C1"/> + <param name="segid3" value="HET"/> + <param name="resid3" value="3"/> + <param name="name3" value="C2"/> + <output name="output"> + <assert_contents> + <has_n_columns n="2" /> + </assert_contents> + </output> + </test> + </tests> + <help><![CDATA[ +.. class:: infomark + +**What it does** + +This tool calculates and plot angle between three atoms. + +_____ + + +.. class:: infomark + +**Input** + + - Trajectory file (DCD). + - PDB file. + - Segids, resids and names of the three atoms to calculate angles. + +_____ + + +.. class:: infomark + +**Output** + + - Tab-separated file of raw data of angle between three atoms calculated for each frame. + - Image (as png) of the time series graph. + + + ]]></help> + <expand macro="citations" /> +</tool>
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/dihedrals.py Mon Oct 08 13:17:59 2018 -0400 @@ -0,0 +1,78 @@ +#!/usr/bin/env python + +import argparse +import csv +import sys + +import MDAnalysis as mda +from MDAnalysis.lib.distances import calc_dihedrals + +import matplotlib +import matplotlib.pyplot as plt + +import numpy as np + +matplotlib.use('Agg') + + +def parse_command_line(argv): + parser = argparse.ArgumentParser() + parser.add_argument('--idcd', help='input dcd') + parser.add_argument('--ipdb', help='input pdb') + parser.add_argument('--isegid1', help='segid 1') + parser.add_argument('--iresid1', help='resid 1') + parser.add_argument('--iname1', help='name 1') + parser.add_argument('--isegid2', help='segid 2') + parser.add_argument('--iresid2', help='resid 2') + parser.add_argument('--iname2', help='name 2') + parser.add_argument('--isegid3', help='segid 3') + parser.add_argument('--iresid3', help='resid 3') + parser.add_argument('--iname3', help='name 3') + parser.add_argument('--isegid4', help='segid 4') + parser.add_argument('--iresid4', help='resid 4') + parser.add_argument('--iname4', help='name 4') + parser.add_argument('--output', help='output') + parser.add_argument('--odihedral_plot', help='dihedral plot') + return parser.parse_args() + + +args = parse_command_line(sys.argv) + +atom1 = "(segid %s and resid %s and name %s)" % \ + (args.isegid1, args.iresid1, args.iname1) +atom2 = "(segid %s and resid %s and name %s)" % \ + (args.isegid2, args.iresid2, args.iname2) +atom3 = "(segid %s and resid %s and name %s)" % \ + (args.isegid3, args.iresid3, args.iname3) +atom4 = "(segid %s and resid %s and name %s)" % \ + (args.isegid4, args.iresid4, args.iname4) + + +def psi(u): + A = u.select_atoms(atom1).positions + B = u.select_atoms(atom2).positions + C = u.select_atoms(atom3).positions + D = u.select_atoms(atom4).positions + psi = calc_dihedrals(A, B, C, D) + return np.rad2deg(psi) + + +u = mda.Universe(args.ipdb, args.idcd, topology_format="PDB", format="DCD") +data = np.array([(u.trajectory.frame, psi(u)) for ts in u.trajectory]) +frame, psi = data.T + +zip(frame, psi) + +with open(args.output, 'w') as f: + writer = csv.writer(f, delimiter='\t') + writer.writerows(zip(frame, psi)) + +with open(args.output) as f: + g = [xtmp.strip() for xtmp in f] + data = [tuple(map(float, xtmp.split())) for xtmp in g[0:]] + time = [xtmp[0] for xtmp in data] + dihedral = [xtmp[1] for xtmp in data] + plt.plot(time, dihedral) + plt.xlabel('Frame No.') + plt.ylabel('Dihedral (degrees)') + plt.savefig(args.odihedral_plot, format='png')
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/distance.py Mon Oct 08 13:17:59 2018 -0400 @@ -0,0 +1,57 @@ +#!/usr/bin/env python + +import argparse +import sys + +import MDAnalysis as mda + +import matplotlib +import matplotlib.pyplot as plt + +import numpy as np + +matplotlib.use('Agg') + + +def parse_command_line(argv): + parser = argparse.ArgumentParser() + parser.add_argument('--idcd', help='input dcd') + parser.add_argument('--ipdb', help='input pdb') + parser.add_argument('--isegid1', help='segid 1') + parser.add_argument('--iresid1', help='resid 1') + parser.add_argument('--iname1', help='name 1') + parser.add_argument('--isegid2', help='segid 2') + parser.add_argument('--iresid2', help='resid 2') + parser.add_argument('--iname2', help='name 2') + parser.add_argument('--output', help='output') + parser.add_argument('--odistance_plot', help='odistance plot') + return parser.parse_args() + + +args = parse_command_line(sys.argv) + +atom1 = "(segid %s and resid %s and name %s)" % \ + (args.isegid1, args.iresid1, args.iname1) +atom2 = "(segid %s and resid %s and name %s)" % \ + (args.isegid2, args.iresid2, args.iname2) + +u = mda.Universe(args.ipdb, args.idcd, topology_format="PDB", format="DCD") +x = u.select_atoms(atom1) +y = u.select_atoms(atom2) + +with open(args.output, 'w') as f: + for t in u.trajectory: + r = x.positions - y.positions + d = np.linalg.norm(r) + f.write(str(t.frame) + '\t ') + f.write(str(d) + '\n') + +with open(args.output) as f: + g = [xtmp.strip() for xtmp in f] + data = [tuple(map(float, xtmp.split())) for xtmp in g[0:]] + time = [xtmp[0] for xtmp in data] + distance = [xtmp[1] for xtmp in data] + plt.plot(time, distance) + plt.xlabel('Frame No.') + plt.ylabel('Distance ($\AA$)') + plt.savefig(args.odistance_plot, format='png')
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--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/rdf.py Mon Oct 08 13:17:59 2018 -0400 @@ -0,0 +1,69 @@ +#!/usr/bin/env python + +import argparse +import csv +import sys + +import MDAnalysis as mda +from MDAnalysis.analysis.rdf import InterRDF + +import matplotlib +import matplotlib.pyplot as plt + +import numpy as np + +matplotlib.use('Agg') + + +def parse_command_line(argv): + parser = argparse.ArgumentParser() + parser.add_argument('--idcd', help='input dcd') + parser.add_argument('--ipdb', help='input pdb') + parser.add_argument('--isegid1', help='segid 1') + parser.add_argument('--iresid1', help='resid 1') + parser.add_argument('--iname1', help='name 1') + parser.add_argument('--isegid2', help='segid 2') + parser.add_argument('--iresid2', help='resid 2') + parser.add_argument('--iname2', help='name 2') + parser.add_argument('--inbins', help='Number of bins in the histogram') + parser.add_argument('--istart', help='Starting Point') + parser.add_argument('--iend', help='End point') + parser.add_argument('--output', help='output') + parser.add_argument('--ordf_plot', help='RDF plot') + return parser.parse_args() + + +args = parse_command_line(sys.argv) + +atom1 = "(segid %s and resid %s and name %s)" % \ + (args.isegid1, args.iresid1, args.iname1) +atom2 = "(segid %s and resid %s and name %s)" % \ + (args.isegid2, args.iresid2, args.iname2) +bins = int(args.inbins) +start = float(args.istart) +end = float(args.iend) + +u = mda.Universe(args.ipdb, args.idcd, topology_format="PDB", format="DCD") +x = u.select_atoms(atom1) +y = u.select_atoms(atom2) + +rdf = InterRDF(x, y, nbins=bins, range=(start, end)) +rdf.run() +bins = rdf.bins +bins = np.around(bins, decimals=3) +RDF = rdf.rdf +zip(bins, RDF) + +with open(args.output, 'w') as f: + writer = csv.writer(f, delimiter='\t') + writer.writerows(zip(bins, RDF)) + +with open(args.output) as f: + g = [xtmp.strip() for xtmp in f] + data = [tuple(map(float, xtmp.split())) for xtmp in g[0:]] + time = [xtmp[0] for xtmp in data] + rdf = [xtmp[1] for xtmp in data] + plt.plot(time, rdf) + plt.xlabel('r ($\AA$)') + plt.ylabel('g(r)') + plt.savefig(args.ordf_plot, format='png')
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/Angle_Analysis_raw_data.csv Mon Oct 08 13:17:59 2018 -0400 @@ -0,0 +1,15 @@ +0.0 70.84918975830078 +1.0 70.97154998779297 +2.0 70.3709716796875 +3.0 70.12692260742188 +4.0 71.15946197509766 +5.0 71.91361999511719 +6.0 71.91268920898438 +7.0 71.97418212890625 +8.0 72.15215301513672 +9.0 72.30829620361328 +10.0 71.52912139892578 +11.0 81.56575775146484 +12.0 73.46330261230469 +13.0 67.04185485839844 +14.0 70.07105255126953
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1.00 0.00 PRO +ATOM 200 C THR 15 -1.686 18.687 -2.919 1.00 0.00 PRO +ATOM 201 O THR 15 -2.102 17.703 -3.519 1.00 0.00 PRO +ATOM 202 N TRP 16 -2.291 19.128 -1.809 1.00 0.00 PRO +ATOM 203 HN TRP 16 -1.958 19.933 -1.315 1.00 0.00 PRO +ATOM 204 CA TRP 16 -3.428 18.459 -1.235 1.00 0.00 PRO +ATOM 205 HA TRP 16 -4.091 18.146 -2.032 1.00 0.00 PRO +ATOM 206 CB TRP 16 -3.026 17.205 -0.396 1.00 0.00 PRO +ATOM 207 HB1 TRP 16 -2.566 16.476 -1.100 1.00 0.00 PRO +ATOM 208 HB2 TRP 16 -3.945 16.718 -0.006 1.00 0.00 PRO +ATOM 209 CG TRP 16 -2.071 17.417 0.738 1.00 0.00 PRO +ATOM 210 CD1 TRP 16 -0.704 17.550 0.659 1.00 0.00 PRO +ATOM 211 HD1 TRP 16 -0.144 17.525 -0.271 1.00 0.00 PRO +ATOM 212 NE1 TRP 16 -0.185 17.692 1.925 1.00 0.00 PRO +ATOM 213 HE1 TRP 16 0.760 17.754 2.180 1.00 0.00 PRO +ATOM 214 CE2 TRP 16 -1.190 17.626 2.843 1.00 0.00 PRO +ATOM 215 CD2 TRP 16 -2.403 17.453 2.137 1.00 0.00 PRO +ATOM 216 CE3 TRP 16 -3.603 17.343 2.844 1.00 0.00 PRO +ATOM 217 HE3 TRP 16 -4.539 17.188 2.330 1.00 0.00 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CD GLN 17 -7.384 22.234 -1.348 1.00 0.00 PRO +ATOM 237 OE1 GLN 17 -8.084 22.953 -0.633 1.00 0.00 PRO +ATOM 238 NE2 GLN 17 -6.416 22.743 -2.147 1.00 0.00 PRO +ATOM 239 HE21 GLN 17 -6.339 23.736 -2.184 1.00 0.00 PRO +ATOM 240 HE22 GLN 17 -5.919 22.141 -2.773 1.00 0.00 PRO +ATOM 241 C GLN 17 -6.473 19.689 2.166 1.00 0.00 PRO +ATOM 242 O GLN 17 -6.720 18.544 2.474 1.00 0.00 PRO +ATOM 243 N LYS 18 -6.429 20.684 3.084 1.00 0.00 PRO +ATOM 244 HN LYS 18 -6.218 21.623 2.820 1.00 0.00 PRO +ATOM 245 CA LYS 18 -6.812 20.438 4.456 1.00 0.00 PRO +ATOM 246 HA LYS 18 -7.043 19.394 4.608 1.00 0.00 PRO +ATOM 247 CB LYS 18 -5.718 20.824 5.476 1.00 0.00 PRO +ATOM 248 HB1 LYS 18 -5.574 21.925 5.479 1.00 0.00 PRO +ATOM 249 HB2 LYS 18 -4.765 20.363 5.131 1.00 0.00 PRO +ATOM 250 CG LYS 18 -6.023 20.289 6.889 1.00 0.00 PRO +ATOM 251 HG1 LYS 18 -5.987 19.178 6.847 1.00 0.00 PRO +ATOM 252 HG2 LYS 18 -7.059 20.576 7.186 1.00 0.00 PRO +ATOM 253 CD LYS 18 -5.051 20.821 7.952 1.00 0.00 PRO +ATOM 254 HD1 LYS 18 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HA ARG 39 16.794 3.369 -5.768 1.00 0.00 PRO +ATOM 530 CB ARG 39 17.234 3.571 -3.690 1.00 0.00 PRO +ATOM 531 HB1 ARG 39 18.174 4.147 -3.859 1.00 0.00 PRO +ATOM 532 HB2 ARG 39 17.395 2.913 -2.807 1.00 0.00 PRO +ATOM 533 CG ARG 39 16.115 4.584 -3.390 1.00 0.00 PRO +ATOM 534 HG1 ARG 39 15.155 4.043 -3.224 1.00 0.00 PRO +ATOM 535 HG2 ARG 39 15.982 5.237 -4.281 1.00 0.00 PRO +ATOM 536 CD ARG 39 16.403 5.441 -2.159 1.00 0.00 PRO +ATOM 537 HD1 ARG 39 17.369 5.977 -2.241 1.00 0.00 PRO +ATOM 538 HD2 ARG 39 16.436 4.804 -1.244 1.00 0.00 PRO +ATOM 539 NE ARG 39 15.253 6.408 -2.025 1.00 0.00 PRO +ATOM 540 HE ARG 39 14.476 6.144 -1.469 1.00 0.00 PRO +ATOM 541 CZ ARG 39 15.206 7.583 -2.637 1.00 0.00 PRO +ATOM 542 NH1 ARG 39 16.123 8.069 -3.390 1.00 0.00 PRO +ATOM 543 HH11 ARG 39 16.959 7.530 -3.579 1.00 0.00 PRO +ATOM 544 HH12 ARG 39 15.998 8.996 -3.800 1.00 0.00 PRO +ATOM 545 NH2 ARG 39 14.100 8.338 -2.434 1.00 0.00 PRO +ATOM 546 HH21 ARG 39 14.118 9.288 -2.759 1.00 0.00 PRO +ATOM 547 HH22 ARG 39 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HB3 ALA 106 7.271 4.337 -6.954 1.00 0.00 PRO +ATOM 1467 C ALA 106 5.843 2.175 -6.010 1.00 0.00 PRO +ATOM 1468 O ALA 106 4.645 1.846 -6.017 1.00 0.00 PRO +ATOM 1469 N ARG 107 6.479 2.495 -4.882 1.00 0.00 PRO +ATOM 1470 HN ARG 107 7.455 2.705 -4.885 1.00 0.00 PRO +ATOM 1471 CA ARG 107 5.815 2.700 -3.617 1.00 0.00 PRO +ATOM 1472 HA ARG 107 4.749 2.793 -3.767 1.00 0.00 PRO +ATOM 1473 CB ARG 107 6.098 1.558 -2.617 1.00 0.00 PRO +ATOM 1474 HB1 ARG 107 7.194 1.453 -2.465 1.00 0.00 PRO +ATOM 1475 HB2 ARG 107 5.736 0.615 -3.088 1.00 0.00 PRO +ATOM 1476 CG ARG 107 5.397 1.727 -1.254 1.00 0.00 PRO +ATOM 1477 HG1 ARG 107 4.335 2.006 -1.436 1.00 0.00 PRO +ATOM 1478 HG2 ARG 107 5.864 2.558 -0.680 1.00 0.00 PRO +ATOM 1479 CD ARG 107 5.382 0.455 -0.388 1.00 0.00 PRO +ATOM 1480 HD1 ARG 107 4.831 -0.351 -0.936 1.00 0.00 PRO +ATOM 1481 HD2 ARG 107 4.848 0.660 0.568 1.00 0.00 PRO +ATOM 1482 NE ARG 107 6.777 0.073 -0.075 1.00 0.00 PRO +ATOM 1483 HE ARG 107 7.320 0.718 0.486 1.00 0.00 PRO +ATOM 1484 CZ ARG 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1646 HD2 TYR 117 7.979 8.884 7.941 1.00 0.00 PRO +ATOM 1647 CE2 TYR 117 9.083 7.965 6.342 1.00 0.00 PRO +ATOM 1648 HE2 TYR 117 9.558 7.243 6.987 1.00 0.00 PRO +ATOM 1649 C TYR 117 5.747 13.125 6.790 1.00 0.00 PRO +ATOM 1650 O TYR 117 5.848 13.870 7.774 1.00 0.00 PRO +ATOM 1651 N GLN 118 4.622 13.089 6.063 1.00 0.00 PRO +ATOM 1652 HN GLN 118 4.563 12.500 5.250 1.00 0.00 PRO +ATOM 1653 CA GLN 118 3.397 13.722 6.489 1.00 0.00 PRO +ATOM 1654 HA GLN 118 3.623 14.529 7.169 1.00 0.00 PRO +ATOM 1655 CB GLN 118 2.609 14.270 5.273 1.00 0.00 PRO +ATOM 1656 HB1 GLN 118 2.372 13.424 4.588 1.00 0.00 PRO +ATOM 1657 HB2 GLN 118 3.288 14.954 4.719 1.00 0.00 PRO +ATOM 1658 CG GLN 118 1.312 15.046 5.609 1.00 0.00 PRO +ATOM 1659 HG1 GLN 118 0.575 14.381 6.103 1.00 0.00 PRO +ATOM 1660 HG2 GLN 118 0.861 15.423 4.667 1.00 0.00 PRO +ATOM 1661 CD GLN 118 1.600 16.253 6.497 1.00 0.00 PRO +ATOM 1662 OE1 GLN 118 2.109 17.277 6.025 1.00 0.00 PRO +ATOM 1663 NE2 GLN 118 1.288 16.151 7.803 1.00 0.00 PRO +ATOM 1664 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-9.476 9.295 1.00 0.00 PRO +ATOM 2480 SG CYS 176 4.210 -8.088 10.715 1.00 0.00 PRO +ATOM 2481 C CYS 176 6.652 -7.785 7.322 1.00 0.00 PRO +ATOM 2482 O CYS 176 7.490 -8.652 7.595 1.00 0.00 PRO +ATOM 2483 N PRO 177 6.740 -7.063 6.194 1.00 0.00 PRO +ATOM 2484 CD PRO 177 6.008 -5.823 5.950 1.00 0.00 PRO +ATOM 2485 HD1 PRO 177 5.751 -5.258 6.867 1.00 0.00 PRO +ATOM 2486 HD2 PRO 177 5.081 -6.094 5.403 1.00 0.00 PRO +ATOM 2487 CA PRO 177 7.585 -7.371 5.044 1.00 0.00 PRO +ATOM 2488 HA PRO 177 7.165 -8.250 4.585 1.00 0.00 PRO +ATOM 2489 CB PRO 177 7.447 -6.151 4.110 1.00 0.00 PRO +ATOM 2490 HB1 PRO 177 6.664 -6.366 3.346 1.00 0.00 PRO +ATOM 2491 HB2 PRO 177 8.377 -5.873 3.577 1.00 0.00 PRO +ATOM 2492 CG PRO 177 6.930 -5.043 5.027 1.00 0.00 PRO +ATOM 2493 HG1 PRO 177 7.762 -4.608 5.620 1.00 0.00 PRO +ATOM 2494 HG2 PRO 177 6.390 -4.243 4.479 1.00 0.00 PRO +ATOM 2495 C PRO 177 9.024 -7.720 5.353 1.00 0.00 PRO +ATOM 2496 O PRO 177 9.737 -6.962 5.994 1.00 0.00 PRO +ATOM 2497 N ARG 178 9.461 -8.890 4.845 1.00 0.00 PRO +ATOM 2498 HN ARG 178 8.831 -9.456 4.331 1.00 0.00 PRO +ATOM 2499 CA ARG 178 10.797 -9.403 5.040 1.00 0.00 PRO +ATOM 2500 HA ARG 178 11.284 -8.872 5.846 1.00 0.00 PRO +ATOM 2501 CB ARG 178 10.760 -10.924 5.353 1.00 0.00 PRO +ATOM 2502 HB1 ARG 178 11.802 -11.319 5.390 1.00 0.00 PRO +ATOM 2503 HB2 ARG 178 10.226 -11.424 4.516 1.00 0.00 PRO +ATOM 2504 CG ARG 178 10.063 -11.314 6.674 1.00 0.00 PRO +ATOM 2505 HG1 ARG 178 9.097 -10.767 6.756 1.00 0.00 PRO +ATOM 2506 HG2 ARG 178 10.687 -10.993 7.537 1.00 0.00 PRO +ATOM 2507 CD ARG 178 9.753 -12.813 6.792 1.00 0.00 PRO +ATOM 2508 HD1 ARG 178 9.084 -13.119 5.951 1.00 0.00 PRO +ATOM 2509 HD2 ARG 178 9.239 -13.028 7.759 1.00 0.00 PRO +ATOM 2510 NE ARG 178 11.001 -13.610 6.729 1.00 0.00 PRO +ATOM 2511 HE ARG 178 11.901 -13.124 6.621 1.00 0.00 PRO +ATOM 2512 CZ ARG 178 11.090 -14.913 6.789 1.00 0.00 PRO +ATOM 2513 NH1 ARG 178 9.937 -15.683 6.909 1.00 0.00 PRO +ATOM 2514 HH11 ARG 178 9.087 -15.214 6.909 1.00 0.00 PRO +ATOM 2515 HH12 ARG 178 9.995 -16.660 6.926 1.00 0.00 PRO +ATOM 2516 NH2 ARG 178 12.195 -15.526 6.753 1.00 0.00 PRO +ATOM 2517 HH21 ARG 178 13.025 -14.936 6.589 1.00 0.00 PRO +ATOM 2518 HH22 ARG 178 12.233 -16.512 6.826 1.00 0.00 PRO +ATOM 2519 C ARG 178 11.639 -9.206 3.790 1.00 0.00 PRO +ATOM 2520 O ARG 178 12.783 -9.641 3.727 1.00 0.00 PRO +ATOM 2521 N ASP 179 11.095 -8.530 2.754 1.00 0.00 PRO +ATOM 2522 HN ASP 179 10.175 -8.142 2.776 1.00 0.00 PRO +ATOM 2523 CA ASP 179 11.808 -8.300 1.515 1.00 0.00 PRO +ATOM 2524 HA ASP 179 12.562 -9.065 1.384 1.00 0.00 PRO +ATOM 2525 CB ASP 179 10.822 -8.385 0.304 1.00 0.00 PRO +ATOM 2526 HB1 ASP 179 10.307 -9.366 0.324 1.00 0.00 PRO +ATOM 2527 HB2 ASP 179 11.416 -8.328 -0.631 1.00 0.00 PRO +ATOM 2528 CG ASP 179 9.758 -7.298 0.232 1.00 0.00 PRO +ATOM 2529 OD1 ASP 179 9.641 -6.474 1.152 1.00 0.00 PRO +ATOM 2530 OD2 ASP 179 9.013 -7.294 -0.798 1.00 0.00 PRO +ATOM 2531 C ASP 179 12.536 -6.959 1.569 1.00 0.00 PRO +ATOM 2532 O ASP 179 13.334 -6.612 0.697 1.00 0.00 PRO +ATOM 2533 N LEU 180 12.301 -6.174 2.642 1.00 0.00 PRO +ATOM 2534 HN LEU 180 11.593 -6.441 3.287 1.00 0.00 PRO +ATOM 2535 CA LEU 180 12.971 -4.917 2.878 1.00 0.00 PRO +ATOM 2536 HA LEU 180 12.852 -4.329 1.983 1.00 0.00 PRO +ATOM 2537 CB LEU 180 12.373 -4.109 4.051 1.00 0.00 PRO +ATOM 2538 HB1 LEU 180 12.841 -3.100 4.083 1.00 0.00 PRO +ATOM 2539 HB2 LEU 180 12.602 -4.623 5.009 1.00 0.00 PRO +ATOM 2540 CG LEU 180 10.845 -3.921 3.983 1.00 0.00 PRO +ATOM 2541 HG LEU 180 10.368 -4.928 4.060 1.00 0.00 PRO +ATOM 2542 CD1 LEU 180 10.363 -3.094 5.184 1.00 0.00 PRO +ATOM 2543 HD11 LEU 180 10.819 -2.082 5.177 1.00 0.00 PRO +ATOM 2544 HD12 LEU 180 10.638 -3.600 6.133 1.00 0.00 PRO +ATOM 2545 HD13 LEU 180 9.259 -2.977 5.158 1.00 0.00 PRO +ATOM 2546 CD2 LEU 180 10.383 -3.293 2.658 1.00 0.00 PRO +ATOM 2547 HD21 LEU 180 10.708 -3.906 1.791 1.00 0.00 PRO +ATOM 2548 HD22 LEU 180 10.776 -2.261 2.546 1.00 0.00 PRO +ATOM 2549 HD23 LEU 180 9.274 -3.265 2.625 1.00 0.00 PRO +ATOM 2550 C LEU 180 14.456 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2568 NZ LYS 181 17.139 -3.187 -3.454 1.00 0.00 PRO +ATOM 2569 HZ1 LYS 181 17.057 -4.034 -4.052 1.00 0.00 PRO +ATOM 2570 HZ2 LYS 181 18.114 -2.841 -3.462 1.00 0.00 PRO +ATOM 2571 HZ3 LYS 181 16.508 -2.447 -3.857 1.00 0.00 PRO +ATOM 2572 C LYS 181 17.375 -3.842 3.577 1.00 0.00 PRO +ATOM 2573 O LYS 181 18.451 -4.236 3.975 1.00 0.00 PRO +ATOM 2574 N PHE 182 16.692 -2.858 4.209 1.00 0.00 PRO +ATOM 2575 HN PHE 182 15.795 -2.586 3.885 1.00 0.00 PRO +ATOM 2576 CA PHE 182 17.165 -2.247 5.432 1.00 0.00 PRO +ATOM 2577 HA PHE 182 17.895 -2.904 5.885 1.00 0.00 PRO +ATOM 2578 CB PHE 182 17.799 -0.843 5.227 1.00 0.00 PRO +ATOM 2579 HB1 PHE 182 18.050 -0.377 6.203 1.00 0.00 PRO +ATOM 2580 HB2 PHE 182 17.090 -0.176 4.689 1.00 0.00 PRO +ATOM 2581 CG PHE 182 19.073 -0.952 4.431 1.00 0.00 PRO +ATOM 2582 CD1 PHE 182 20.298 -1.195 5.074 1.00 0.00 PRO +ATOM 2583 HD1 PHE 182 20.316 -1.303 6.147 1.00 0.00 PRO +ATOM 2584 CE1 PHE 182 21.483 -1.313 4.337 1.00 0.00 PRO +ATOM 2585 HE1 PHE 182 22.415 -1.523 4.841 1.00 0.00 PRO +ATOM 2586 CZ PHE 182 21.455 -1.170 2.944 1.00 0.00 PRO +ATOM 2587 HZ PHE 182 22.367 -1.267 2.374 1.00 0.00 PRO +ATOM 2588 CD2 PHE 182 19.065 -0.784 3.038 1.00 0.00 PRO +ATOM 2589 HD2 PHE 182 18.130 -0.583 2.540 1.00 0.00 PRO +ATOM 2590 CE2 PHE 182 20.244 -0.900 2.294 1.00 0.00 PRO +ATOM 2591 HE2 PHE 182 20.210 -0.782 1.220 1.00 0.00 PRO +ATOM 2592 C PHE 182 16.041 -2.145 6.430 1.00 0.00 PRO +ATOM 2593 O PHE 182 14.999 -1.519 6.148 1.00 0.00 PRO +ATOM 2594 N ILE 183 16.206 -2.722 7.622 1.00 0.00 PRO +ATOM 2595 HN ILE 183 17.089 -3.168 7.826 1.00 0.00 PRO +ATOM 2596 CA ILE 183 15.229 -2.733 8.697 1.00 0.00 PRO +ATOM 2597 HA ILE 183 14.482 -1.975 8.505 1.00 0.00 PRO +ATOM 2598 CB ILE 183 14.506 -4.075 8.868 1.00 0.00 PRO +ATOM 2599 HB ILE 183 15.256 -4.867 9.101 1.00 0.00 PRO +ATOM 2600 CG2 ILE 183 13.499 -3.980 10.042 1.00 0.00 PRO +ATOM 2601 HG21 ILE 183 12.751 -3.183 9.850 1.00 0.00 PRO +ATOM 2602 HG22 ILE 183 14.003 -3.775 11.007 1.00 0.00 PRO +ATOM 2603 HG23 ILE 183 12.948 -4.936 10.164 1.00 0.00 PRO +ATOM 2604 CG1 ILE 183 13.793 -4.496 7.555 1.00 0.00 PRO +ATOM 2605 HG11 ILE 183 14.516 -4.486 6.709 1.00 0.00 PRO +ATOM 2606 HG12 ILE 183 12.999 -3.752 7.318 1.00 0.00 PRO +ATOM 2607 CD ILE 183 13.182 -5.901 7.607 1.00 0.00 PRO +ATOM 2608 HD1 ILE 183 12.372 -5.958 8.360 1.00 0.00 PRO +ATOM 2609 HD2 ILE 183 13.954 -6.656 7.860 1.00 0.00 PRO +ATOM 2610 HD3 ILE 183 12.742 -6.180 6.624 1.00 0.00 PRO +ATOM 2611 C ILE 183 15.978 -2.353 9.969 1.00 0.00 PRO +ATOM 2612 O ILE 183 17.006 -2.915 10.303 1.00 0.00 PRO +ATOM 2613 N ASN 184 15.492 -1.311 10.691 1.00 0.00 PRO +ATOM 2614 HN ASN 184 14.640 -0.886 10.405 1.00 0.00 PRO +ATOM 2615 CA ASN 184 16.062 -0.839 11.954 1.00 0.00 PRO +ATOM 2616 HA ASN 184 15.477 0.027 12.224 1.00 0.00 PRO +ATOM 2617 CB ASN 184 15.955 -1.853 13.126 1.00 0.00 PRO +ATOM 2618 HB1 ASN 184 16.523 -1.489 14.010 1.00 0.00 PRO +ATOM 2619 HB2 ASN 184 16.367 -2.839 12.831 1.00 0.00 PRO +ATOM 2620 CG ASN 184 14.500 -2.015 13.543 1.00 0.00 PRO +ATOM 2621 OD1 ASN 184 13.546 -1.656 12.863 1.00 0.00 PRO +ATOM 2622 ND2 ASN 184 14.316 -2.535 14.784 1.00 0.00 PRO +ATOM 2623 HD21 ASN 184 13.370 -2.681 15.045 1.00 0.00 PRO +ATOM 2624 HD22 ASN 184 15.116 -2.844 15.290 1.00 0.00 PRO +ATOM 2625 C ASN 184 17.482 -0.300 11.848 1.00 0.00 PRO +ATOM 2626 O ASN 184 18.295 -0.379 12.755 1.00 0.00 PRO +ATOM 2627 N GLY 185 17.794 0.305 10.682 1.00 0.00 PRO +ATOM 2628 HN GLY 185 17.116 0.281 9.962 1.00 0.00 PRO +ATOM 2629 CA GLY 185 19.092 0.898 10.399 1.00 0.00 PRO +ATOM 2630 HA1 GLY 185 19.388 1.517 11.235 1.00 0.00 PRO +ATOM 2631 HA2 GLY 185 19.008 1.446 9.472 1.00 0.00 PRO +ATOM 2632 C GLY 185 20.186 -0.114 10.198 1.00 0.00 PRO +ATOM 2633 O GLY 185 21.354 0.204 10.294 1.00 0.00 PRO +ATOM 2634 N GLN 186 19.787 -1.367 9.909 1.00 0.00 PRO +ATOM 2635 HN GLN 186 18.820 -1.603 9.872 1.00 0.00 PRO +ATOM 2636 CA GLN 186 20.668 -2.472 9.660 1.00 0.00 PRO +ATOM 2637 HA GLN 186 21.686 -2.137 9.552 1.00 0.00 PRO +ATOM 2638 CB GLN 186 20.575 -3.561 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HB1 ALA 187 22.473 -5.674 6.137 1.00 0.00 PRO +ATOM 2657 HB2 ALA 187 22.349 -4.039 5.385 1.00 0.00 PRO +ATOM 2658 HB3 ALA 187 21.460 -5.416 4.664 1.00 0.00 PRO +ATOM 2659 C ALA 187 19.808 -5.856 6.895 1.00 0.00 PRO +ATOM 2660 O ALA 187 19.640 -6.183 8.062 1.00 0.00 PRO +ATOM 2661 N ASN 188 19.285 -6.558 5.874 1.00 0.00 PRO +ATOM 2662 HN ASN 188 19.369 -6.210 4.945 1.00 0.00 PRO +ATOM 2663 CA ASN 188 18.510 -7.773 6.054 1.00 0.00 PRO +ATOM 2664 HA ASN 188 18.470 -8.026 7.106 1.00 0.00 PRO +ATOM 2665 CB ASN 188 17.089 -7.521 5.493 1.00 0.00 PRO +ATOM 2666 HB1 ASN 188 17.067 -7.612 4.388 1.00 0.00 PRO +ATOM 2667 HB2 ASN 188 16.790 -6.482 5.756 1.00 0.00 PRO +ATOM 2668 CG ASN 188 16.055 -8.447 6.118 1.00 0.00 PRO +ATOM 2669 OD1 ASN 188 16.317 -9.225 7.043 1.00 0.00 PRO +ATOM 2670 ND2 ASN 188 14.805 -8.367 5.613 1.00 0.00 PRO +ATOM 2671 HD21 ASN 188 14.084 -8.907 6.028 1.00 0.00 PRO +ATOM 2672 HD22 ASN 188 14.618 -7.707 4.872 1.00 0.00 PRO +ATOM 2673 C ASN 188 19.221 -8.922 5.348 1.00 0.00 PRO +ATOM 2674 O ASN 188 18.617 -9.934 4.976 1.00 0.00 PRO +ATOM 2675 N VAL 189 20.538 -8.780 5.117 1.00 0.00 PRO +ATOM 2676 HN VAL 189 20.995 -7.976 5.485 1.00 0.00 PRO +ATOM 2677 CA VAL 189 21.397 -9.747 4.444 1.00 0.00 PRO +ATOM 2678 HA VAL 189 20.935 -9.949 3.490 1.00 0.00 PRO +ATOM 2679 CB VAL 189 22.794 -9.178 4.153 1.00 0.00 PRO +ATOM 2680 HB VAL 189 22.659 -8.290 3.491 1.00 0.00 PRO +ATOM 2681 CG1 VAL 189 23.510 -8.710 5.437 1.00 0.00 PRO +ATOM 2682 HG11 VAL 189 23.637 -9.552 6.149 1.00 0.00 PRO +ATOM 2683 HG12 VAL 189 22.945 -7.906 5.947 1.00 0.00 PRO +ATOM 2684 HG13 VAL 189 24.523 -8.326 5.196 1.00 0.00 PRO +ATOM 2685 CG2 VAL 189 23.655 -10.209 3.393 1.00 0.00 PRO +ATOM 2686 HG21 VAL 189 23.090 -10.635 2.538 1.00 0.00 PRO +ATOM 2687 HG22 VAL 189 23.954 -11.046 4.060 1.00 0.00 PRO +ATOM 2688 HG23 VAL 189 24.580 -9.733 3.008 1.00 0.00 PRO +ATOM 2689 C VAL 189 21.457 -11.094 5.144 1.00 0.00 PRO +ATOM 2690 O VAL 189 21.465 -12.152 4.492 1.00 0.00 PRO +ATOM 2691 N GLU 190 21.475 -11.128 6.485 1.00 0.00 PRO +ATOM 2692 HN GLU 190 21.460 -10.272 7.018 1.00 0.00 PRO +ATOM 2693 CA GLU 190 21.429 -12.362 7.237 1.00 0.00 PRO +ATOM 2694 HA GLU 190 22.222 -12.995 6.847 1.00 0.00 PRO +ATOM 2695 CB GLU 190 21.697 -12.162 8.743 1.00 0.00 PRO +ATOM 2696 HB1 GLU 190 21.532 -13.119 9.292 1.00 0.00 PRO +ATOM 2697 HB2 GLU 190 20.960 -11.427 9.133 1.00 0.00 PRO +ATOM 2698 CG GLU 190 23.138 -11.694 9.052 1.00 0.00 PRO +ATOM 2699 HG1 GLU 190 23.382 -10.799 8.441 1.00 0.00 PRO +ATOM 2700 HG2 GLU 190 23.847 -12.504 8.794 1.00 0.00 PRO +ATOM 2701 CD GLU 190 23.310 -11.308 10.517 1.00 0.00 PRO +ATOM 2702 OE1 GLU 190 22.887 -12.108 11.404 1.00 0.00 PRO +ATOM 2703 OE2 GLU 190 23.843 -10.205 10.778 1.00 0.00 PRO +ATOM 2704 C GLU 190 20.146 -13.142 7.058 1.00 0.00 PRO +ATOM 2705 O GLU 190 19.029 -12.669 7.394 1.00 0.00 PRO +ATOM 2706 N GLY 191 20.230 -14.362 6.538 1.00 0.00 PRO +ATOM 2707 HN GLY 191 21.136 -14.684 6.233 1.00 0.00 PRO +ATOM 2708 CA GLY 191 19.077 -15.206 6.271 1.00 0.00 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-11.535 -1.934 9.430 1.00 0.00 PRO +ATOM 3198 C PRO 227 -7.572 -3.435 8.913 1.00 0.00 PRO +ATOM 3199 O PRO 227 -8.130 -4.526 8.947 1.00 0.00 PRO +ATOM 3200 N HSD 228 -6.312 -3.247 9.359 1.00 0.00 PRO +ATOM 3201 HN HSD 228 -5.864 -2.357 9.272 1.00 0.00 PRO +ATOM 3202 CA HSD 228 -5.486 -4.314 9.901 1.00 0.00 PRO +ATOM 3203 HA HSD 228 -6.047 -5.237 9.951 1.00 0.00 PRO +ATOM 3204 CB HSD 228 -4.264 -4.585 9.005 1.00 0.00 PRO +ATOM 3205 HB1 HSD 228 -3.568 -5.309 9.480 1.00 0.00 PRO +ATOM 3206 HB2 HSD 228 -3.715 -3.641 8.808 1.00 0.00 PRO +ATOM 3207 ND1 HSD 228 -4.611 -6.492 7.387 1.00 0.00 PRO +ATOM 3208 HD1 HSD 228 -4.247 -7.211 7.982 1.00 0.00 PRO +ATOM 3209 CG HSD 228 -4.676 -5.145 7.691 1.00 0.00 PRO +ATOM 3210 CE1 HSD 228 -4.935 -6.610 6.083 1.00 0.00 PRO +ATOM 3211 HE1 HSD 228 -4.933 -7.557 5.536 1.00 0.00 PRO +ATOM 3212 NE2 HSD 228 -5.202 -5.447 5.540 1.00 0.00 PRO +ATOM 3213 CD2 HSD 228 -5.013 -4.522 6.536 1.00 0.00 PRO +ATOM 3214 HD2 HSD 228 -5.115 -3.464 6.311 1.00 0.00 PRO +ATOM 3215 C HSD 228 -4.955 -3.943 11.275 1.00 0.00 PRO +ATOM 3216 O HSD 228 -4.140 -3.011 11.386 1.00 0.00 PRO +ATOM 3217 N PRO 229 -5.334 -4.601 12.363 1.00 0.00 PRO +ATOM 3218 CD PRO 229 -6.539 -5.430 12.448 1.00 0.00 PRO +ATOM 3219 HD1 PRO 229 -6.473 -6.313 11.771 1.00 0.00 PRO +ATOM 3220 HD2 PRO 229 -7.417 -4.806 12.179 1.00 0.00 PRO +ATOM 3221 CA PRO 229 -4.763 -4.332 13.665 1.00 0.00 PRO +ATOM 3222 HA PRO 229 -4.495 -3.288 13.760 1.00 0.00 PRO +ATOM 3223 CB PRO 229 -5.870 -4.756 14.649 1.00 0.00 PRO +ATOM 3224 HB1 PRO 229 -6.562 -3.902 14.806 1.00 0.00 PRO +ATOM 3225 HB2 PRO 229 -5.487 -5.087 15.636 1.00 0.00 PRO +ATOM 3226 CG PRO 229 -6.618 -5.870 13.912 1.00 0.00 PRO +ATOM 3227 HG1 PRO 229 -6.073 -6.834 14.015 1.00 0.00 PRO +ATOM 3228 HG2 PRO 229 -7.661 -6.007 14.259 1.00 0.00 PRO +ATOM 3229 C PRO 229 -3.511 -5.153 13.876 1.00 0.00 PRO +ATOM 3230 O PRO 229 -3.330 -6.235 13.307 1.00 0.00 PRO +ATOM 3231 N CYS 230 -2.612 -4.652 14.722 1.00 0.00 PRO +ATOM 3232 HN CYS 230 -2.748 -3.757 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HG21 THR 231 -1.117 -8.657 18.084 1.00 0.00 PRO +ATOM 3251 HG22 THR 231 -2.100 -8.199 19.523 1.00 0.00 PRO +ATOM 3252 HG23 THR 231 -0.743 -9.372 19.685 1.00 0.00 PRO +ATOM 3253 C THR 231 0.193 -4.816 19.251 1.00 0.00 PRO +ATOM 3254 O THR 231 -0.126 -4.077 20.185 1.00 0.00 PRO +ATOM 3255 N THR 232 1.267 -4.564 18.481 1.00 0.00 PRO +ATOM 3256 HN THR 232 1.453 -5.142 17.691 1.00 0.00 PRO +ATOM 3257 CA THR 232 2.132 -3.405 18.607 1.00 0.00 PRO +ATOM 3258 HA THR 232 1.956 -2.918 19.555 1.00 0.00 PRO +ATOM 3259 CB THR 232 3.619 -3.728 18.509 1.00 0.00 PRO +ATOM 3260 HB THR 232 3.841 -4.249 17.546 1.00 0.00 PRO +ATOM 3261 OG1 THR 232 4.004 -4.574 19.585 1.00 0.00 PRO +ATOM 3262 HG1 THR 232 4.858 -4.982 19.302 1.00 0.00 PRO +ATOM 3263 CG2 THR 232 4.467 -2.453 18.629 1.00 0.00 PRO +ATOM 3264 HG21 THR 232 4.238 -1.910 19.568 1.00 0.00 PRO +ATOM 3265 HG22 THR 232 4.313 -1.780 17.760 1.00 0.00 PRO +ATOM 3266 HG23 THR 232 5.544 -2.728 18.647 1.00 0.00 PRO +ATOM 3267 C THR 232 1.729 -2.459 17.503 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HG1 ARG 267 -15.191 -12.355 -1.612 1.00 0.00 PRO +ATOM 3724 HG2 ARG 267 -16.151 -11.853 -0.175 1.00 0.00 PRO +ATOM 3725 CD ARG 267 -14.072 -11.261 -0.075 1.00 0.00 PRO +ATOM 3726 HD1 ARG 267 -14.269 -10.504 0.717 1.00 0.00 PRO +ATOM 3727 HD2 ARG 267 -13.249 -10.892 -0.728 1.00 0.00 PRO +ATOM 3728 NE ARG 267 -13.668 -12.580 0.505 1.00 0.00 PRO +ATOM 3729 HE ARG 267 -13.830 -13.419 0.018 1.00 0.00 PRO +ATOM 3730 CZ ARG 267 -13.100 -12.691 1.734 1.00 0.00 PRO +ATOM 3731 NH1 ARG 267 -12.771 -11.712 2.484 1.00 0.00 PRO +ATOM 3732 HH11 ARG 267 -12.396 -11.778 3.425 1.00 0.00 PRO +ATOM 3733 HH12 ARG 267 -12.737 -10.730 2.220 1.00 0.00 PRO +ATOM 3734 NH2 ARG 267 -12.901 -13.934 2.162 1.00 0.00 PRO +ATOM 3735 HH21 ARG 267 -13.214 -14.692 1.639 1.00 0.00 PRO +ATOM 3736 HH22 ARG 267 -12.471 -14.001 3.070 1.00 0.00 PRO +ATOM 3737 C ARG 267 -18.357 -10.710 -1.564 1.00 0.00 PRO +ATOM 3738 O ARG 267 -18.687 -11.810 -1.129 1.00 0.00 PRO +ATOM 3739 N LEU 268 -19.093 -9.609 -1.318 1.00 0.00 PRO +ATOM 3740 HN LEU 268 -18.777 -8.730 -1.674 1.00 0.00 PRO +ATOM 3741 CA LEU 268 -20.270 -9.578 -0.479 1.00 0.00 PRO +ATOM 3742 HA LEU 268 -20.247 -10.410 0.210 1.00 0.00 PRO +ATOM 3743 CB LEU 268 -20.280 -8.258 0.328 1.00 0.00 PRO +ATOM 3744 HB1 LEU 268 -21.225 -8.164 0.903 1.00 0.00 PRO +ATOM 3745 HB2 LEU 268 -20.215 -7.402 -0.378 1.00 0.00 PRO +ATOM 3746 CG LEU 268 -19.104 -8.157 1.324 1.00 0.00 PRO +ATOM 3747 HG LEU 268 -18.148 -8.372 0.788 1.00 0.00 PRO +ATOM 3748 CD1 LEU 268 -18.970 -6.735 1.886 1.00 0.00 PRO +ATOM 3749 HD11 LEU 268 -19.830 -6.475 2.534 1.00 0.00 PRO +ATOM 3750 HD12 LEU 268 -18.891 -5.995 1.065 1.00 0.00 PRO +ATOM 3751 HD13 LEU 268 -18.050 -6.654 2.504 1.00 0.00 PRO +ATOM 3752 CD2 LEU 268 -19.236 -9.185 2.458 1.00 0.00 PRO +ATOM 3753 HD21 LEU 268 -19.236 -10.221 2.067 1.00 0.00 PRO +ATOM 3754 HD22 LEU 268 -20.170 -9.016 3.032 1.00 0.00 PRO +ATOM 3755 HD23 LEU 268 -18.376 -9.097 3.157 1.00 0.00 PRO +ATOM 3756 C LEU 268 -21.550 -9.742 -1.294 1.00 0.00 PRO +ATOM 3757 O LEU 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CA ARG 302 -17.660 4.928 2.843 1.00 0.00 PRO +ATOM 4241 HA ARG 302 -16.903 5.697 2.864 1.00 0.00 PRO +ATOM 4242 CB ARG 302 -17.016 3.606 2.335 1.00 0.00 PRO +ATOM 4243 HB1 ARG 302 -17.678 2.771 2.663 1.00 0.00 PRO +ATOM 4244 HB2 ARG 302 -16.050 3.463 2.869 1.00 0.00 PRO +ATOM 4245 CG ARG 302 -16.803 3.430 0.814 1.00 0.00 PRO +ATOM 4246 HG1 ARG 302 -17.784 3.505 0.295 1.00 0.00 PRO +ATOM 4247 HG2 ARG 302 -16.449 2.389 0.638 1.00 0.00 PRO +ATOM 4248 CD ARG 302 -15.817 4.382 0.125 1.00 0.00 PRO +ATOM 4249 HD1 ARG 302 -16.085 5.438 0.305 1.00 0.00 PRO +ATOM 4250 HD2 ARG 302 -15.800 4.234 -0.973 1.00 0.00 PRO +ATOM 4251 NE ARG 302 -14.438 4.147 0.687 1.00 0.00 PRO +ATOM 4252 HE ARG 302 -14.064 4.777 1.355 1.00 0.00 PRO +ATOM 4253 CZ ARG 302 -13.612 3.221 0.235 1.00 0.00 PRO +ATOM 4254 NH1 ARG 302 -13.886 2.322 -0.664 1.00 0.00 PRO +ATOM 4255 HH11 ARG 302 -14.832 2.212 -1.013 1.00 0.00 PRO +ATOM 4256 HH12 ARG 302 -13.244 1.620 -0.961 1.00 0.00 PRO +ATOM 4257 NH2 ARG 302 -12.376 3.268 0.762 1.00 0.00 PRO +ATOM 4258 HH21 ARG 302 -12.167 3.967 1.425 1.00 0.00 PRO +ATOM 4259 HH22 ARG 302 -11.676 2.611 0.476 1.00 0.00 PRO +ATOM 4260 C ARG 302 -18.763 5.433 1.923 1.00 0.00 PRO +ATOM 4261 O ARG 302 -19.892 5.004 1.975 1.00 0.00 PRO +ATOM 4262 N TYR 303 -18.402 6.401 1.041 1.00 0.00 PRO +ATOM 4263 HN TYR 303 -17.487 6.793 1.036 1.00 0.00 PRO +ATOM 4264 CA TYR 303 -19.256 6.773 -0.059 1.00 0.00 PRO +ATOM 4265 HA TYR 303 -19.813 5.898 -0.376 1.00 0.00 PRO +ATOM 4266 CB TYR 303 -20.279 7.906 0.273 1.00 0.00 PRO +ATOM 4267 HB1 TYR 303 -20.845 7.609 1.181 1.00 0.00 PRO +ATOM 4268 HB2 TYR 303 -21.018 7.993 -0.552 1.00 0.00 PRO +ATOM 4269 CG TYR 303 -19.692 9.279 0.505 1.00 0.00 PRO +ATOM 4270 CD1 TYR 303 -19.559 10.185 -0.564 1.00 0.00 PRO +ATOM 4271 HD1 TYR 303 -19.792 9.864 -1.569 1.00 0.00 PRO +ATOM 4272 CE1 TYR 303 -19.146 11.505 -0.336 1.00 0.00 PRO +ATOM 4273 HE1 TYR 303 -19.047 12.194 -1.162 1.00 0.00 PRO +ATOM 4274 CZ TYR 303 -18.858 11.931 0.963 1.00 0.00 PRO +ATOM 4275 OH TYR 303 -18.481 13.271 1.193 1.00 0.00 PRO +ATOM 4276 HH TYR 303 -18.154 13.336 2.096 1.00 0.00 PRO +ATOM 4277 CD2 TYR 303 -19.389 9.717 1.804 1.00 0.00 PRO +ATOM 4278 HD2 TYR 303 -19.499 9.031 2.632 1.00 0.00 PRO +ATOM 4279 CE2 TYR 303 -18.966 11.036 2.033 1.00 0.00 PRO +ATOM 4280 HE2 TYR 303 -18.730 11.359 3.033 1.00 0.00 PRO +ATOM 4281 C TYR 303 -18.368 7.121 -1.228 1.00 0.00 PRO +ATOM 4282 O TYR 303 -17.143 7.327 -1.083 1.00 0.00 PRO +ATOM 4283 N TYR 304 -18.944 7.157 -2.418 1.00 0.00 PRO +ATOM 4284 HN TYR 304 -19.937 6.982 -2.496 1.00 0.00 PRO +ATOM 4285 CA TYR 304 -18.260 7.380 -3.665 1.00 0.00 PRO +ATOM 4286 HA TYR 304 -17.258 7.742 -3.480 1.00 0.00 PRO +ATOM 4287 CB TYR 304 -18.251 6.126 -4.590 1.00 0.00 PRO +ATOM 4288 HB1 TYR 304 -17.590 6.310 -5.466 1.00 0.00 PRO +ATOM 4289 HB2 TYR 304 -19.272 5.906 -4.967 1.00 0.00 PRO +ATOM 4290 CG TYR 304 -17.775 4.878 -3.878 1.00 0.00 PRO +ATOM 4291 CD1 TYR 304 -18.642 4.149 -3.039 1.00 0.00 PRO +ATOM 4292 HD1 TYR 304 -19.649 4.499 -2.875 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CG1 VAL 305 -19.774 12.581 -6.555 1.00 0.00 PRO +ATOM 4311 HG11 VAL 305 -20.845 12.306 -6.454 1.00 0.00 PRO +ATOM 4312 HG12 VAL 305 -19.477 12.514 -7.621 1.00 0.00 PRO +ATOM 4313 HG13 VAL 305 -19.639 13.634 -6.232 1.00 0.00 PRO +ATOM 4314 CG2 VAL 305 -19.262 11.843 -4.186 1.00 0.00 PRO +ATOM 4315 HG21 VAL 305 -18.553 11.282 -3.540 1.00 0.00 PRO +ATOM 4316 HG22 VAL 305 -20.289 11.475 -3.982 1.00 0.00 PRO +ATOM 4317 HG23 VAL 305 -19.200 12.914 -3.901 1.00 0.00 PRO +ATOM 4318 C VAL 305 -18.588 9.972 -7.481 1.00 0.00 PRO +ATOM 4319 O VAL 305 -17.372 9.989 -7.737 1.00 0.00 PRO +ATOM 4320 N GLN 306 -19.483 9.748 -8.447 1.00 0.00 PRO +ATOM 4321 HN GLN 306 -20.463 9.658 -8.228 1.00 0.00 PRO +ATOM 4322 CA GLN 306 -19.093 9.728 -9.838 1.00 0.00 PRO +ATOM 4323 HA GLN 306 -18.166 10.277 -9.956 1.00 0.00 PRO +ATOM 4324 CB GLN 306 -18.861 8.305 -10.396 1.00 0.00 PRO +ATOM 4325 HB1 GLN 306 -19.789 7.701 -10.284 1.00 0.00 PRO +ATOM 4326 HB2 GLN 306 -18.075 7.826 -9.766 1.00 0.00 PRO +ATOM 4327 CG GLN 306 -18.401 8.303 -11.874 1.00 0.00 PRO +ATOM 4328 HG1 GLN 306 -17.531 8.983 -12.004 1.00 0.00 PRO +ATOM 4329 HG2 GLN 306 -19.221 8.656 -12.532 1.00 0.00 PRO +ATOM 4330 CD GLN 306 -18.022 6.898 -12.346 1.00 0.00 PRO +ATOM 4331 OE1 GLN 306 -18.902 6.092 -12.690 1.00 0.00 PRO +ATOM 4332 NE2 GLN 306 -16.715 6.603 -12.394 1.00 0.00 PRO +ATOM 4333 HE21 GLN 306 -16.435 5.681 -12.700 1.00 0.00 PRO +ATOM 4334 HE22 GLN 306 -16.025 7.281 -12.145 1.00 0.00 PRO +ATOM 4335 C GLN 306 -20.127 10.469 -10.651 1.00 0.00 PRO +ATOM 4336 O GLN 306 -21.324 10.219 -10.582 1.00 0.00 PRO +ATOM 4337 N ASN 307 -19.670 11.476 -11.419 1.00 0.00 PRO +ATOM 4338 HN ASN 307 -18.688 11.651 -11.403 1.00 0.00 PRO +ATOM 4339 CA ASN 307 -20.495 12.301 -12.292 1.00 0.00 PRO +ATOM 4340 HA ASN 307 -19.818 13.011 -12.740 1.00 0.00 PRO +ATOM 4341 CB ASN 307 -21.185 11.504 -13.437 1.00 0.00 PRO +ATOM 4342 HB1 ASN 307 -21.764 12.187 -14.092 1.00 0.00 PRO +ATOM 4343 HB2 ASN 307 -21.877 10.748 -13.012 1.00 0.00 PRO +ATOM 4344 CG ASN 307 -20.134 10.825 -14.311 1.00 0.00 PRO +ATOM 4345 OD1 ASN 307 -18.980 11.244 -14.373 1.00 0.00 PRO +ATOM 4346 ND2 ASN 307 -20.549 9.746 -15.013 1.00 0.00 PRO +ATOM 4347 HD21 ASN 307 -19.838 9.183 -15.448 1.00 0.00 PRO +ATOM 4348 HD22 ASN 307 -21.492 9.439 -14.954 1.00 0.00 PRO +ATOM 4349 C ASN 307 -21.492 13.167 -11.533 1.00 0.00 PRO +ATOM 4350 O ASN 307 -22.537 13.556 -12.048 1.00 0.00 PRO +ATOM 4351 N GLY 308 -21.144 13.499 -10.270 1.00 0.00 PRO +ATOM 4352 HN GLY 308 -20.286 13.134 -9.915 1.00 0.00 PRO +ATOM 4353 CA GLY 308 -21.920 14.355 -9.380 1.00 0.00 PRO +ATOM 4354 HA1 GLY 308 -22.458 15.094 -9.958 1.00 0.00 PRO +ATOM 4355 HA2 GLY 308 -21.223 14.781 -8.679 1.00 0.00 PRO +ATOM 4356 C GLY 308 -22.934 13.600 -8.573 1.00 0.00 PRO +ATOM 4357 O GLY 308 -23.652 14.168 -7.759 1.00 0.00 PRO +ATOM 4358 N VAL 309 -22.976 12.273 -8.766 1.00 0.00 PRO +ATOM 4359 HN VAL 309 -22.323 11.823 -9.370 1.00 0.00 PRO +ATOM 4360 CA VAL 309 -23.968 11.395 -8.198 1.00 0.00 PRO +ATOM 4361 HA VAL 309 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5574 HB VAL 393 -17.260 -15.175 -5.708 1.00 0.00 PRO +ATOM 5575 CG1 VAL 393 -16.184 -14.738 -7.558 1.00 0.00 PRO +ATOM 5576 HG11 VAL 393 -15.265 -15.067 -8.089 1.00 0.00 PRO +ATOM 5577 HG12 VAL 393 -16.114 -13.644 -7.387 1.00 0.00 PRO +ATOM 5578 HG13 VAL 393 -17.054 -14.931 -8.219 1.00 0.00 PRO +ATOM 5579 CG2 VAL 393 -16.505 -17.020 -6.513 1.00 0.00 PRO +ATOM 5580 HG21 VAL 393 -16.714 -17.584 -5.581 1.00 0.00 PRO +ATOM 5581 HG22 VAL 393 -15.584 -17.431 -6.977 1.00 0.00 PRO +ATOM 5582 HG23 VAL 393 -17.351 -17.187 -7.214 1.00 0.00 PRO +ATOM 5583 C VAL 393 -15.060 -13.819 -4.938 1.00 0.00 PRO +ATOM 5584 O VAL 393 -15.914 -13.340 -4.249 1.00 0.00 PRO +ATOM 5585 N ARG 394 -13.992 -13.097 -5.397 1.00 0.00 PRO +ATOM 5586 HN ARG 394 -13.256 -13.514 -5.918 1.00 0.00 PRO +ATOM 5587 CA ARG 394 -13.813 -11.701 -5.053 1.00 0.00 PRO +ATOM 5588 HA ARG 394 -14.607 -11.348 -4.409 1.00 0.00 PRO +ATOM 5589 CB ARG 394 -12.452 -11.496 -4.331 1.00 0.00 PRO +ATOM 5590 HB1 ARG 394 -12.392 -10.433 -4.005 1.00 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