# HG changeset patch
# User cmonjeau
# Date 1441896043 0
# Node ID a53ce9294c0abf6e80382975bd7bddd6444a59a3
# Parent  8b2edb8a315edb62cd9584957a453eb13a5acb07
fix logs output

diff -r 8b2edb8a315e -r a53ce9294c0a commet.py
--- a/commet.py	Thu Sep 10 14:37:19 2015 +0000
+++ b/commet.py	Thu Sep 10 14:40:43 2015 +0000
@@ -35,7 +35,7 @@
         parser.add_argument("-e", dest="minshannonindex")
         parser.add_argument("-m", dest="maxreads")
 
-        parser.add_argument("--output")
+        parser.add_argument("--output_logs")
         parser.add_argument("--output_vectors")
         parser.add_argument("--output_dendro")
         parser.add_argument("--output_matrix")
diff -r 8b2edb8a315e -r a53ce9294c0a commet.xml
--- a/commet.xml	Thu Sep 10 14:37:19 2015 +0000
+++ b/commet.xml	Thu Sep 10 14:40:43 2015 +0000
@@ -20,6 +20,7 @@
 --output_vectors $output_vectors
 --output_dendro $output_dendro
 --output_matrix $output_matrix
+--output_logs $output_logs
 --output_heatmap1 $output_heatmap1
 --output_heatmap2 $output_heatmap2
 --output_heatmap3 $output_heatmap3