Mercurial > repos > cmonjeau > stacks
comparison STACKS_procrad.py @ 2:c9e10e0d6c10
fix discard file
| author | cmonjeau |
|---|---|
| date | Mon, 24 Aug 2015 15:39:12 +0000 |
| parents | d6ba40f6c824 |
| children |
comparison
equal
deleted
inserted
replaced
| 1:ccfa8e539bdf | 2:c9e10e0d6c10 |
|---|---|
| 34 parser.add_argument('--enzyme1') | 34 parser.add_argument('--enzyme1') |
| 35 parser.add_argument('--enzyme2') | 35 parser.add_argument('--enzyme2') |
| 36 parser.add_argument('--outype') | 36 parser.add_argument('--outype') |
| 37 parser.add_argument('--qualitenc') | 37 parser.add_argument('--qualitenc') |
| 38 parser.add_argument('-D', action='store_true') | 38 parser.add_argument('-D', action='store_true') |
| 39 parser.add_argument('--discard_file') | |
| 39 parser.add_argument('-t') | 40 parser.add_argument('-t') |
| 40 parser.add_argument('-q', action='store_true') | 41 parser.add_argument('-q', action='store_true') |
| 41 parser.add_argument('--activate_advanced_options') | 42 parser.add_argument('--activate_advanced_options') |
| 42 parser.add_argument('-r', action='store_true') | 43 parser.add_argument('-r', action='store_true') |
| 43 parser.add_argument('-w', default='0.15') | 44 parser.add_argument('-w', default='0.15') |