Mercurial > repos > cpt > cpt_find_spanins

--- a/findSpanin.py	Fri Sep 20 04:44:18 2024 +0000
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                         if each_posp[1] in pair_dict["pairs"]["pair_number"].keys():
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+>MT648818 Acinetobacter phage FG02, partial genome
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+>NC_005833.1|ORF29 length 235 aa, 705 bp, from 23664..24369[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF44 length 108 aa, 324 bp, from 29277..29601[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF45 length 134 aa, 402 bp, from 40341..40743[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF47 length 378 aa, 1134 bp, from 40821..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF48 length 363 aa, 1089 bp, from 40866..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF49 length 349 aa, 1047 bp, from 40908..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+FICRPEMF*
+>NC_005833.1|ORF53 length 284 aa, 852 bp, from 41103..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF56 length 247 aa, 741 bp, from 41214..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF59 length 202 aa, 606 bp, from 41349..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+NHDESGMVWLRAALAAFYEDEPRVNVDVSPAAMMMTSFGKTLIGYTHGHQMRKADTRLSV
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+>NC_005833.1|ORF60 length 192 aa, 576 bp, from 41379..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF61 length 157 aa, 471 bp, from 41484..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF62 length 136 aa, 408 bp, from 41547..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF63 length 133 aa, 399 bp, from 41556..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+EVGRFICRPEMF*
+>NC_005833.1|ORF64 length 110 aa, 330 bp, from 41625..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MMMTSFGKTLIGYTHGHQMRKADTRLSVMATDFRKLFGQSDYVYTHSGHWHSQKITETNL
+GIDEVHGQLGSPDAYSANGGWRSQRQAAVIVYHKEFGEVGRFICRPEMF*
+>NC_005833.1|ORF65 length 109 aa, 327 bp, from 41628..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MMTSFGKTLIGYTHGHQMRKADTRLSVMATDFRKLFGQSDYVYTHSGHWHSQKITETNLG
+IDEVHGQLGSPDAYSANGGWRSQRQAAVIVYHKEFGEVGRFICRPEMF*
+>NC_005833.1|ORF66 length 108 aa, 324 bp, from 41631..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MTSFGKTLIGYTHGHQMRKADTRLSVMATDFRKLFGQSDYVYTHSGHWHSQKITETNLGI
+DEVHGQLGSPDAYSANGGWRSQRQAAVIVYHKEFGEVGRFICRPEMF*
+>NC_005833.1|ORF67 length 161 aa, 483 bp, from 42027..42510[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MNWHEHYEYRDGVLYHKVKPCRRHDVNIGDVAGRVAKNGYHYVVHKNRPYKRSRVIWEMF
+NGEIPDGFVIDHLNHNATDDRIDNLECKPRRENMVNVKLRIDSTTGVTGVSRKRDNKWRA
+YITIMGKQKCKSFDTFEEACAQRIEWSVTHDFHPNHGGTY*
+>NC_005833.1|ORF68 length 103 aa, 309 bp, from 42201..42510[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF69 length 163 aa, 489 bp, from 43092..43581[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+RECDALLIKHIGVAQRYVDKKVKVDIPVTMRASLYSFTFNVGTGAFGSSTMLKLINQRKH
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+>NC_005833.1|ORF70 length 148 aa, 444 bp, from 43137..43581[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+LTLTPTLLERIEGIEYEVYYDIAGVPTVCSGITGPDVIPGKKYTKRECDALLIKHIGVAQ
+RYVDKKVKVDIPVTMRASLYSFTFNVGTGAFGSSTMLKLINQRKHKEACNQLWRWVYYYN
+PKTKKREVSRGIKNRRAEEYAYCVKEL*
+>NC_005833.1|ORF71 length 146 aa, 438 bp, from 43143..43581[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+LTPTLLERIEGIEYEVYYDIAGVPTVCSGITGPDVIPGKKYTKRECDALLIKHIGVAQRY
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+>NC_005833.1|ORF72 length 222 aa, 666 bp, from 448..1114[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+LTHAGRRVTLRLETRCYMLIMVYIETKEKAMSSYQSDAVQAAIKAAYEKAGVTVEQRPEA
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+INEKFKSSFITPIVSRHFSKIGKSVKVSVTMNDEKLRVVTISVSDEEVPVKKRRSRKKVS
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+>NC_005833.1|ORF73 length 205 aa, 615 bp, from 499..1114[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF74 length 202 aa, 606 bp, from 508..1114[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+EFTFDANKMAEAAARKSMPDADEHDVAKGAESWLLGKTDEINEKFKSSFITPIVSRHFSK
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+FTFDANKMAEAAARKSMPDADEHDVAKGAESWLLGKTDEINEKFKSSFITPIVSRHFSKI
+GKSVKVSVTMNDEKLRVVTISVSDEEVPVKKRRSRKKVSLADCLDSFVPDVDDLEKGDVT
+VSTVRDLVRQMKAHIEKCGL*
+>NC_005833.1|ORF76 length 192 aa, 576 bp, from 538..1114[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF78 length 134 aa, 402 bp, from 712..1114[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+VRQMKAHIEKCGL*
+>NC_005833.1|ORF79 length 125 aa, 375 bp, from 739..1114[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+VVTISVSDEEVPVKKRRSRKKVSLADCLDSFVPDVDDLEKGDVTVSTVRDLVRQMKAHIE
+KCGL*
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+RSRKKVSLADCLDSFVPDVDDLEKGDVTVSTVRDLVRQMKAHIEKCGL*
+>NC_005833.1|ORF81 length 109 aa, 327 bp, from 1126..1453[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF82 length 149 aa, 447 bp, from 4417..4864[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+IDELMENYGGDFSQGSFDDWANYEISCW*
+>NC_005833.1|ORF83 length 129 aa, 387 bp, from 4477..4864[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF84 length 108 aa, 324 bp, from 4540..4864[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MITSKEVNPYIMQNLGNNEYMAYGCNAVYKHVKIRKRVVRAFKKIAIKYWKMSKKDAGRW
+ARNVADSYFYRNGESCYFLIDELMENYGGDFSQGSFDDWANYEISCW*
+>NC_005833.1|ORF85 length 165 aa, 495 bp, from 5464..5959[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+RLVWIYHNGKIPDGMEVDHMDGDITNNRIENLRLVTRTINNRNQKKRSDNTTGVSGVTFM
+KDRGKYRAQVRNKRLGQFDTIEEAAKAVKDERDRLGLFTKRHGV*
+>NC_005833.1|ORF86 length 164 aa, 492 bp, from 5467..5959[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+VSIDNKSMVRELFTYSDGVLYWKAKSSKYSRAKIGGAAGSKDKDGYIIIRVRNETRGAHR
+LVWIYHNGKIPDGMEVDHMDGDITNNRIENLRLVTRTINNRNQKKRSDNTTGVSGVTFMK
+DRGKYRAQVRNKRLGQFDTIEEAAKAVKDERDRLGLFTKRHGV*
+>NC_005833.1|ORF87 length 157 aa, 471 bp, from 5488..5959[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MVRELFTYSDGVLYWKAKSSKYSRAKIGGAAGSKDKDGYIIIRVRNETRGAHRLVWIYHN
+GKIPDGMEVDHMDGDITNNRIENLRLVTRTINNRNQKKRSDNTTGVSGVTFMKDRGKYRA
+QVRNKRLGQFDTIEEAAKAVKDERDRLGLFTKRHGV*
+>NC_005833.1|ORF88 length 183 aa, 549 bp, from 8371..8920[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MLNKEDVFMSEPKNAPVVQGGNFKELYKKKFGTVLAKNRAMTPEQLFDLSVKYFEWAEDN
+AIKASESASFQGGVYESLVHKPRVFTWTGYRLFIGASEAAIIKWKREEEYSEVMEFVESV
+INEQKFQLAANGVINASFIGKDLGIDKPASINIENSSASASTVVATTEDAMKEAVNSILD
+ML*
+>NC_005833.1|ORF89 length 175 aa, 525 bp, from 8395..8920[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MSEPKNAPVVQGGNFKELYKKKFGTVLAKNRAMTPEQLFDLSVKYFEWAEDNAIKASESA
+SFQGGVYESLVHKPRVFTWTGYRLFIGASEAAIIKWKREEEYSEVMEFVESVINEQKFQL
+AANGVINASFIGKDLGIDKPASINIENSSASASTVVATTEDAMKEAVNSILDML*
+>NC_005833.1|ORF90 length 143 aa, 429 bp, from 8491..8920[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MTPEQLFDLSVKYFEWAEDNAIKASESASFQGGVYESLVHKPRVFTWTGYRLFIGASEAA
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+>NC_005833.1|ORF91 length 133 aa, 399 bp, from 8521..8920[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+VKYFEWAEDNAIKASESASFQGGVYESLVHKPRVFTWTGYRLFIGASEAAIIKWKREEEY
+SEVMEFVESVINEQKFQLAANGVINASFIGKDLGIDKPASINIENSSASASTVVATTEDA
+MKEAVNSILDML*
+>NC_005833.1|ORF92 length 528 aa, 1584 bp, from 8944..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+IAGRRGNTIFNVTPGSGKTEVFSIHLPVYAMLKCKKVRNLNVSFADSLVKRNSKRVREII
+SSNEFQELWPCKFGTSKDEEMQVLNEDGKVWFELISAAAGGRITGSRGGYMTPGFSGMVM
+LDDIDKPDDMFSKVKRERTHMLLKNTIRSRRMHNETPIIAIQQRLHAQDSTWFMMNGGMG
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+LREADQYTFDSQYQQKPIALGGSVFNSEWWTYYGSSLDADEPDPGKYDYRFITADTAQKT
+GELNDYTVFCLWGKKNDKVYFIDGIRGKWEAPDMERQFTAFVNQAWRHNKSMGVLRKIYV
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+EHSAFTYDDTHPHDDIVDNFMDAANIELLTIDDPIERMKRLAGMVKR*
+>NC_005833.1|ORF93 length 523 aa, 1569 bp, from 8959..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MIQWEDLNATQKLAIKKMSEANFEKMIRIWFQLMQAQQFQPNWHHLYLCHEVEEIIAGRR
+GNTIFNVTPGSGKTEVFSIHLPVYAMLKCKKVRNLNVSFADSLVKRNSKRVREIISSNEF
+QELWPCKFGTSKDEEMQVLNEDGKVWFELISAAAGGRITGSRGGYMTPGFSGMVMLDDID
+KPDDMFSKVKRERTHMLLKNTIRSRRMHNETPIIAIQQRLHAQDSTWFMMNGGMGIEFDQ
+ISIPALVTEEYGKTLPDWLQPYFERDVLSSEYVELDGVKHYSFWPSKESVHDLLALREAD
+QYTFDSQYQQKPIALGGSVFNSEWWTYYGSSLDADEPDPGKYDYRFITADTAQKTGELND
+YTVFCLWGKKNDKVYFIDGIRGKWEAPDMERQFTAFVNQAWRHNKSMGVLRKIYVEDKAS
+GTGLIQNLRKKTPISITPLQRNKDKVTRAMDAQPVIKAGRVVLPEEHPMLAEIIAEHSAF
+TYDDTHPHDDIVDNFMDAANIELLTIDDPIERMKRLAGMVKR*
+>NC_005833.1|ORF94 length 506 aa, 1518 bp, from 9010..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+LKNTIRSRRMHNETPIIAIQQRLHAQDSTWFMMNGGMGIEFDQISIPALVTEEYGKTLPD
+WLQPYFERDVLSSEYVELDGVKHYSFWPSKESVHDLLALREADQYTFDSQYQQKPIALGG
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+>NC_005833.1|ORF95 length 498 aa, 1494 bp, from 9034..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF96 length 490 aa, 1470 bp, from 9058..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF97 length 472 aa, 1416 bp, from 9112..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+MDAANIELLTIDDPIERMKRLAGMVKR*
+>NC_005833.1|ORF99 length 441 aa, 1323 bp, from 9205..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF100 length 438 aa, 1314 bp, from 9214..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+RMHNETPIIAIQQRLHAQDSTWFMMNGGMGIEFDQISIPALVTEEYGKTLPDWLQPYFER
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+TYYGSSLDADEPDPGKYDYRFITADTAQKTGELNDYTVFCLWGKKNDKVYFIDGIRGKWE
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+PIIAIQQRLHAQDSTWFMMNGGMGIEFDQISIPALVTEEYGKTLPDWLQPYFERDVLSSE
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+>NC_005833.1|ORF102 length 427 aa, 1281 bp, from 9247..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF103 length 388 aa, 1164 bp, from 9364..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+MLLKNTIRSRRMHNETPIIAIQQRLHAQDSTWFMMNGGMGIEFDQISIPALVTEEYGKTL
+PDWLQPYFERDVLSSEYVELDGVKHYSFWPSKESVHDLLALREADQYTFDSQYQQKPIAL
+GGSVFNSEWWTYYGSSLDADEPDPGKYDYRFITADTAQKTGELNDYTVFCLWGKKNDKVY
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+ITPLQRNKDKVTRAMDAQPVIKAGRVVLPEEHPMLAEIIAEHSAFTYDDTHPHDDIVDNF
+MDAANIELLTIDDPIERMKRLAGMVKR*
+>NC_005833.1|ORF104 length 375 aa, 1125 bp, from 9403..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF105 length 358 aa, 1074 bp, from 9454..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF106 length 351 aa, 1053 bp, from 9475..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF107 length 349 aa, 1047 bp, from 9481..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF108 length 339 aa, 1017 bp, from 9511..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF109 length 328 aa, 984 bp, from 9544..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF125 length 428 aa, 1284 bp, from 10582..11866[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF127 length 382 aa, 1146 bp, from 10720..11866[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF147 length 213 aa, 639 bp, from 13093..13732[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+VEVTEDVANHIEKLTAQIATIQGKADGFEAERDALKVKVDSLPELVKAEVEKQKADAAAR
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+AEVTAVAETAGVKHDGLDIKDVKIAVVKAMLDKDVSEKSDAYIDAMFDVAKDSDIMAIQR
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+AVPTPEVDV*
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+>NC_005833.1|ORF154 length 228 aa, 684 bp, from 14365..15049[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF159 length 114 aa, 342 bp, from 14707..15049[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF160 length 320 aa, 960 bp, from 15139..16099[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF161 length 305 aa, 915 bp, from 15184..16099[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF162 length 290 aa, 870 bp, from 15229..16099[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+ALAQKLDSWSNADSTGAMYGVKLGLKYNGQEYSAGMAMSLVGSGAAVKAQILFEASRFAI
+MTGMNGQTQYPFVVENGQVILSSAIIKNGFITNAMIGNFIQSNNYVFNQSGWRLDKGGTF
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+>NC_005833.1|ORF283 length 386 aa, 1158 bp, from 27403..28561[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+VDDSGSLYSTSRHKGDLIMHLPNGAQIFVETSRGVEVEATAITNAENPVATVASKGDLAK
+GDYVIVTQSTWAKMVSRVLIVTDAQETSITLAGIDTSDTLVFPAGGTMSFAKITGWTEIP
+CVQEIGQDGGEQQYYTYQCLSDDKEQQIPTFKSAVSLTYTFAHEFDNPIYPILRKLDSSG
+QVTAVRMYVPKASEMRMWAGILSFNDIPSTQVNEMETVELAVSLKGDFTFISSTLASPGA
+*
+>NC_005833.1|ORF335 length 223 aa, 669 bp, from 18089..18758[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MHLPNGAQIFVETSRGVEVEATAITNAENPVATVASKGDLAKGDYVIVTQSTWAKMVSRV
+LIVTDAQETSITLAGIDTSDTLVFPAGGTMSFAKITGWTEIPCVQEIGQDGGEQQYYTYQ
+CLSDDKEQQIPTFKSAVSLTYTFAHEFDNPIYPILRKLDSSGQVTAVRMYVPKASEMRMW
+AGILSFNDIPSTQVNEMETVELAVSLKGDFTFISSTLASPGA*
+>NC_005833.1|ORF336 length 213 aa, 639 bp, from 18119..18758[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+VETSRGVEVEATAITNAENPVATVASKGDLAKGDYVIVTQSTWAKMVSRVLIVTDAQETS
+ITLAGIDTSDTLVFPAGGTMSFAKITGWTEIPCVQEIGQDGGEQQYYTYQCLSDDKEQQI
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+STQVNEMETVELAVSLKGDFTFISSTLASPGA*
+>NC_005833.1|ORF337 length 184 aa, 552 bp, from 18206..18758[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+LAKGDYVIVTQSTWAKMVSRVLIVTDAQETSITLAGIDTSDTLVFPAGGTMSFAKITGWT
+EIPCVQEIGQDGGEQQYYTYQCLSDDKEQQIPTFKSAVSLTYTFAHEFDNPIYPILRKLD
+SSGQVTAVRMYVPKASEMRMWAGILSFNDIPSTQVNEMETVELAVSLKGDFTFISSTLAS
+PGA*
+>NC_005833.1|ORF338 length 168 aa, 504 bp, from 18254..18758[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MVSRVLIVTDAQETSITLAGIDTSDTLVFPAGGTMSFAKITGWTEIPCVQEIGQDGGEQQ
+YYTYQCLSDDKEQQIPTFKSAVSLTYTFAHEFDNPIYPILRKLDSSGQVTAVRMYVPKAS
+EMRMWAGILSFNDIPSTQVNEMETVELAVSLKGDFTFISSTLASPGA*
+>NC_005833.1|ORF339 length 164 aa, 492 bp, from 18266..18758[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+VLIVTDAQETSITLAGIDTSDTLVFPAGGTMSFAKITGWTEIPCVQEIGQDGGEQQYYTY
+QCLSDDKEQQIPTFKSAVSLTYTFAHEFDNPIYPILRKLDSSGQVTAVRMYVPKASEMRM
+WAGILSFNDIPSTQVNEMETVELAVSLKGDFTFISSTLASPGA*
+>NC_005833.1|ORF340 length 134 aa, 402 bp, from 18356..18758[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MSFAKITGWTEIPCVQEIGQDGGEQQYYTYQCLSDDKEQQIPTFKSAVSLTYTFAHEFDN
+PIYPILRKLDSSGQVTAVRMYVPKASEMRMWAGILSFNDIPSTQVNEMETVELAVSLKGD
+FTFISSTLASPGA*
+>NC_005833.1|ORF341 length 102 aa, 306 bp, from 18452..18758[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+LSDDKEQQIPTFKSAVSLTYTFAHEFDNPIYPILRKLDSSGQVTAVRMYVPKASEMRMWA
+GILSFNDIPSTQVNEMETVELAVSLKGDFTFISSTLASPGA*
+>NC_005833.1|ORF342 length 200 aa, 600 bp, from 24365..24965[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MNDVKVIKLSGSLGRRFGVFHRYAVDSYPEAIRALSSQVDGFKEYMQSEVGSRSKFAIFV
+DGVNVGHHEEEKFKCAKEIRIVPIPTGSKTGGLFQVVLGAAIMVAAFYTGGASLALMGTM
+SSSLFMMGGAMVLGGVMQMISPQPGGANFEVQSSKNKPSYAFGGAVNTTAAGYPLPVPYG
+YRAGGGATFSAGSYAEDMS*
+>NC_005833.1|ORF343 length 192 aa, 576 bp, from 24389..24965[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+LSGSLGRRFGVFHRYAVDSYPEAIRALSSQVDGFKEYMQSEVGSRSKFAIFVDGVNVGHH
+EEEKFKCAKEIRIVPIPTGSKTGGLFQVVLGAAIMVAAFYTGGASLALMGTMSSSLFMMG
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+FSAGSYAEDMS*
+>NC_005833.1|ORF344 length 155 aa, 465 bp, from 24500..24965[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MQSEVGSRSKFAIFVDGVNVGHHEEEKFKCAKEIRIVPIPTGSKTGGLFQVVLGAAIMVA
+AFYTGGASLALMGTMSSSLFMMGGAMVLGGVMQMISPQPGGANFEVQSSKNKPSYAFGGA
+VNTTAAGYPLPVPYGYRAGGGATFSAGSYAEDMS*
+>NC_005833.1|ORF345 length 141 aa, 423 bp, from 24542..24965[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+VDGVNVGHHEEEKFKCAKEIRIVPIPTGSKTGGLFQVVLGAAIMVAAFYTGGASLALMGT
+MSSSLFMMGGAMVLGGVMQMISPQPGGANFEVQSSKNKPSYAFGGAVNTTAAGYPLPVPY
+GYRAGGGATFSAGSYAEDMS*
+>NC_005833.1|ORF346 length 136 aa, 408 bp, from 24557..24965[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+VGHHEEEKFKCAKEIRIVPIPTGSKTGGLFQVVLGAAIMVAAFYTGGASLALMGTMSSSL
+FMMGGAMVLGGVMQMISPQPGGANFEVQSSKNKPSYAFGGAVNTTAAGYPLPVPYGYRAG
+GGATFSAGSYAEDMS*
+>NC_005833.1|ORF347 length 103 aa, 309 bp, from 24656..24965[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+LGAAIMVAAFYTGGASLALMGTMSSSLFMMGGAMVLGGVMQMISPQPGGANFEVQSSKNK
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+>NC_005833.1|ORF348 length 355 aa, 1065 bp, from 30377..31442[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MFQVFTSSQLSNDEYHRNEGWASEYVSGSSLAEIYQTCPANWRFKKNETTKALEFGTQSH
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+PLEFPRLAYNHGYYLKMALQHDLLRRAIQAGAFEGNFPEDIPIVVRLLAQEKKEPYIALA
+YRMTMEQIRIGRNQYISVVHTYKACSEMDVWPGYAGDASEIELETPSWVRYQNK*
+>NC_005833.1|ORF349 length 241 aa, 723 bp, from 30719..31442[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MMVDCGEELNVQYLIELIAEAEARAEGKQLVDADKYDACMKMRAILEQNPDHEACINSET
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+PYIALAYRMTMEQIRIGRNQYISVVHTYKACSEMDVWPGYAGDASEIELETPSWVRYQNK
+*
+>NC_005833.1|ORF350 length 240 aa, 720 bp, from 30722..31442[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MVDCGEELNVQYLIELIAEAEARAEGKQLVDADKYDACMKMRAILEQNPDHEACINSETA
+QREISIFGEISGVKVKVRLDHLDYKENVPGRVLTGYDENGDPVFEDVIFPEALIITDFKT
+TMSANPLEFPRLAYNHGYYLKMALQHDLLRRAIQAGAFEGNFPEDIPIVVRLLAQEKKEP
+YIALAYRMTMEQIRIGRNQYISVVHTYKACSEMDVWPGYAGDASEIELETPSWVRYQNK*
+>NC_005833.1|ORF351 length 202 aa, 606 bp, from 30836..31442[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MKMRAILEQNPDHEACINSETAQREISIFGEISGVKVKVRLDHLDYKENVPGRVLTGYDE
+NGDPVFEDVIFPEALIITDFKTTMSANPLEFPRLAYNHGYYLKMALQHDLLRRAIQAGAF
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+YAGDASEIELETPSWVRYQNK*
+>NC_005833.1|ORF352 length 200 aa, 600 bp, from 30842..31442[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MRAILEQNPDHEACINSETAQREISIFGEISGVKVKVRLDHLDYKENVPGRVLTGYDENG
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+>NC_005833.1|ORF353 length 119 aa, 357 bp, from 31085..31442[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MSANPLEFPRLAYNHGYYLKMALQHDLLRRAIQAGAFEGNFPEDIPIVVRLLAQEKKEPY
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+>NC_005833.1|ORF355 length 147 aa, 441 bp, from 35453..35894[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+NRSLPPQLGQGWCFLLKTLFGNPQIDWKASRHNPFMYGKTSSF*
+>NC_005833.1|ORF360 length 101 aa, 303 bp, from 35591..35894[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF361 length 673 aa, 2019 bp, from 36524..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF367 length 552 aa, 1656 bp, from 36887..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF368 length 521 aa, 1563 bp, from 36980..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+IKILQYSHHIAHPVRVTHRRNQKKEDIISRKDFGMEDIPE*
+>NC_005833.1|ORF369 length 506 aa, 1518 bp, from 37025..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MEQMRGEKGKIIMDGDIPLIGNDGKPLLGTKRSQYTIVIMEMMRRCKKVHGHDLRIFGMT
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+LTLLIQLLGRGMRLLKSWQVAEGMVKQDHLVWDFAGTMDELGQLYFDPILEQAQFQKRFE
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+DVVARVCRCCDASLVDPNLKLSGKAYTKNDWYEVKNFEVTLTKNQKGIIYKYTLINDDGD
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+>NC_005833.1|ORF370 length 503 aa, 1509 bp, from 37034..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MRGEKGKIIMDGDIPLIGNDGKPLLGTKRSQYTIVIMEMMRRCKKVHGHDLRIFGMTGSE
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+GVQDFTEKDMKAMEDEILHDKSLTQRIMQMVAKKAEERNAVLITCAGVRHCKEAAAALPP
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+>NC_005833.1|ORF376 length 448 aa, 1344 bp, from 37199..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF377 length 429 aa, 1287 bp, from 37256..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF379 length 374 aa, 1122 bp, from 37421..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF380 length 371 aa, 1113 bp, from 37430..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF381 length 356 aa, 1068 bp, from 37475..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF401 length 523 aa, 1569 bp, from 44516..46085[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+ARQAMEPDFAAGGKYSHSMLRGHLGKFDKHALRIASVLHTIKNWEGESPNRSNREIDLET
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+>NC_005833.1|ORF402 length 499 aa, 1497 bp, from 44516..46013[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF403 length 429 aa, 1287 bp, from 44516..45803[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+IDVITEIAKKNKGRAPIHSIVAKCRNVTPFNGQQKVAERIDSLLITLEEMNYTCRIDDIV
+FINPRLMG*
+>NC_005833.1|ORF404 length 423 aa, 1269 bp, from 44516..45785[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+MG*
+>NC_005833.1|ORF405 length 410 aa, 1230 bp, from 44516..45746[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+REIDLETMQEAIMIFNELSRTYLSSASAAGYAGDEAESRKLIDVITEIAKKNKGRAPIHS
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+>NC_005833.1|ORF406 length 409 aa, 1227 bp, from 44516..45743[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF407 length 389 aa, 1167 bp, from 44516..45683[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+YLSSASAAGYAGDEAESRKLIDVITEIAKKNKGRAPIHSIVAKCRNVTPFNGQQKVAERI
+DSLLITLEEMNYTCRIDDIVFINPRLMG*
+>NC_005833.1|ORF408 length 334 aa, 1002 bp, from 44516..45518[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MADIVFAVSDPTPEGLAKVAAVQGHFSVISDEATAINTLLGLTYGGSDKKSNSELILKAW
+DKNHMEVARSNQDNNLSLCPVGSICVIAQDETIKGIMDAGQRGIGVSERFLLVREEPLLG
+TRILCDENGDALYKEVDRGLVSKYYRLVHNIMKEDNVVLSVSRNAMRELNLARQAMEPDF
+AAGGKYSHSMLRGHLGKFDKHALRIASVLHTIKNWEGESPNRSNREIDLETMQEAIMIFN
+ELSRTYLSSASAAGYAGDEAESRKLIDVITEIAKKNKGRAPIHSIVAKCRNVTPFNGQQK
+VAERIDSLLITLEEMNYTCRIDDIVFINPRLMG*
+>NC_005833.1|ORF409 length 296 aa, 888 bp, from 44516..45404[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+LSVSRNAMRELNLARQAMEPDFAAGGKYSHSMLRGHLGKFDKHALRIASVLHTIKNWEGE
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+RAPIHSIVAKCRNVTPFNGQQKVAERIDSLLITLEEMNYTCRIDDIVFINPRLMG*
+>NC_005833.1|ORF410 length 270 aa, 810 bp, from 44516..45326[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+IDSLLITLEEMNYTCRIDDIVFINPRLMG*
+>NC_005833.1|ORF411 length 238 aa, 714 bp, from 44516..45230[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF412 length 223 aa, 669 bp, from 44516..45185[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+LVREEPLLGTRILCDENGDALYKEVDRGLVSKYYRLVHNIMKEDNVVLSVSRNAMRELNL
+ARQAMEPDFAAGGKYSHSMLRGHLGKFDKHALRIASVLHTIKNWEGESPNRSNREIDLET
+MQEAIMIFNELSRTYLSSASAAGYAGDEAESRKLIDVITEIAKKNKGRAPIHSIVAKCRN
+VTPFNGQQKVAERIDSLLITLEEMNYTCRIDDIVFINPRLMG*
+>NC_005833.1|ORF413 length 195 aa, 585 bp, from 44516..45101[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+LVSKYYRLVHNIMKEDNVVLSVSRNAMRELNLARQAMEPDFAAGGKYSHSMLRGHLGKFD
+KHALRIASVLHTIKNWEGESPNRSNREIDLETMQEAIMIFNELSRTYLSSASAAGYAGDE
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+>NC_005833.1|ORF414 length 194 aa, 582 bp, from 44516..45098[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+VSKYYRLVHNIMKEDNVVLSVSRNAMRELNLARQAMEPDFAAGGKYSHSMLRGHLGKFDK
+HALRIASVLHTIKNWEGESPNRSNREIDLETMQEAIMIFNELSRTYLSSASAAGYAGDEA
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+IDDIVFINPRLMG*
+>NC_005833.1|ORF415 length 187 aa, 561 bp, from 44516..45077[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF416 length 183 aa, 549 bp, from 44516..45065[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MKEDNVVLSVSRNAMRELNLARQAMEPDFAAGGKYSHSMLRGHLGKFDKHALRIASVLHT
+IKNWEGESPNRSNREIDLETMQEAIMIFNELSRTYLSSASAAGYAGDEAESRKLIDVITE
+IAKKNKGRAPIHSIVAKCRNVTPFNGQQKVAERIDSLLITLEEMNYTCRIDDIVFINPRL
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+>NC_005833.1|ORF417 length 169 aa, 507 bp, from 44516..45023[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MRELNLARQAMEPDFAAGGKYSHSMLRGHLGKFDKHALRIASVLHTIKNWEGESPNRSNR
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+VAKCRNVTPFNGQQKVAERIDSLLITLEEMNYTCRIDDIVFINPRLMG*
+>NC_005833.1|ORF418 length 159 aa, 477 bp, from 44516..44993[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MEPDFAAGGKYSHSMLRGHLGKFDKHALRIASVLHTIKNWEGESPNRSNREIDLETMQEA
+IMIFNELSRTYLSSASAAGYAGDEAESRKLIDVITEIAKKNKGRAPIHSIVAKCRNVTPF
+NGQQKVAERIDSLLITLEEMNYTCRIDDIVFINPRLMG*
+>NC_005833.1|ORF419 length 145 aa, 435 bp, from 44516..44951[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+ASAAGYAGDEAESRKLIDVITEIAKKNKGRAPIHSIVAKCRNVTPFNGQQKVAERIDSLL
+ITLEEMNYTCRIDDIVFINPRLMG*
+>NC_005833.1|ORF420 length 132 aa, 396 bp, from 44516..44912[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+LRIASVLHTIKNWEGESPNRSNREIDLETMQEAIMIFNELSRTYLSSASAAGYAGDEAES
+RKLIDVITEIAKKNKGRAPIHSIVAKCRNVTPFNGQQKVAERIDSLLITLEEMNYTCRID
+DIVFINPRLMG*
+>NC_005833.1|ORF421 length 103 aa, 309 bp, from 44516..44825[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF422 length 228 aa, 684 bp, from 37340..38024[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+MIATLTINDINASSSIEAIYATAFRTCFRIFAVFKTLLELRLLKYRIEIKLTQLIHRTCK
+IPYQMVLLNHSFSNLPGFKQSHTPTQKLNQQSERSYLAEYDTEIPIWNVNASSERHYLKG
+VFNFSGPYIVKNLLARFVVCVASNNCIGASRRKCCRCLFAVAHTSTCNQDRIAFFCLFGD
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+>NC_005833.1|ORF423 length 189 aa, 567 bp, from 37340..37907[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+LRLLKYRIEIKLTQLIHRTCKIPYQMVLLNHSFSNLPGFKQSHTPTQKLNQQSERSYLAE
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+MDVDHINHERDDNRIENLRLVTRQDNLRNKGVVSSNTGVMGVYWNKKTNRYTANITINKK
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+>NC_005833.1|ORF430 length 136 aa, 408 bp, from 44104..44512[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF431 length 312 aa, 936 bp, from 34981..35917[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF433 length 306 aa, 918 bp, from 34981..35899[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+*
+>NC_005833.1|ORF443 length 180 aa, 540 bp, from 34981..35521[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF460 length 654 aa, 1962 bp, from 32694..34656[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF463 length 614 aa, 1842 bp, from 32694..34536[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+*
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--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/usp/_out_usp.fna	Fri Sep 20 05:02:00 2024 +0000
@@ -0,0 +1,8398 @@
+>NC_005833.1|ORF1 length 190 aa, 570 bp, from 2262..2832[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+AGCAATGGCGGCTACCCGATGCGACCAGGTTATGAGAATCGCACGTTCCCGGTTATCGTT
+GACTTCATTGGGACAACTGACAACTTGGTATACGTTAGCCATGAGCAACTTAAGGCAGTT
+GGATTCGTTGGCGGTATGAATAAAGAAGCGCTTTGCTTCTTCCATCGATGTCCAGAGCCG
+ATCGGTATTGAGTGCGAGTTAGTATACTAA
+>NC_005833.1|ORF2 length 163 aa, 489 bp, from 2343..2832[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+GACCCTATCGTGGTTGACGCGGTTAAGTGCGACTCAAGTACTGGAGGCTACCGCGTTAAG
+GTTGATGACCTTGTAAAAGCTGGCGTGTACGATCTTGATTATGGCCTGTCGGTTAGCCCG
+GTATTTGGCCCAGCTGACTTCAACGAGAAAGACGGAACGATGTTCTTTTTTGATTGGGAA
+GTGAAGGCAAACATCAAGCCGCGCAAGGTTCGTCTTCTCAGCAATGGCGGCTACCCGATG
+CGACCAGGTTATGAGAATCGCACGTTCCCGGTTATCGTTGACTTCATTGGGACAACTGAC
+AACTTGGTATACGTTAGCCATGAGCAACTTAAGGCAGTTGGATTCGTTGGCGGTATGAAT
+AAAGAAGCGCTTTGCTTCTTCCATCGATGTCCAGAGCCGATCGGTATTGAGTGCGAGTTA
+GTATACTAA
+>NC_005833.1|ORF3 length 140 aa, 420 bp, from 2412..2832[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+AACATCAAGCCGCGCAAGGTTCGTCTTCTCAGCAATGGCGGCTACCCGATGCGACCAGGT
+TATGAGAATCGCACGTTCCCGGTTATCGTTGACTTCATTGGGACAACTGACAACTTGGTA
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+CTTTGCTTCTTCCATCGATGTCCAGAGCCGATCGGTATTGAGTGCGAGTTAGTATACTAA
+>NC_005833.1|ORF4 length 115 aa, 345 bp, from 2487..2832[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+TTCCCGGTTATCGTTGACTTCATTGGGACAACTGACAACTTGGTATACGTTAGCCATGAG
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+CGATGTCCAGAGCCGATCGGTATTGAGTGCGAGTTAGTATACTAA
+>NC_005833.1|ORF5 length 139 aa, 417 bp, from 3576..3993[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+GAGCAAACCGTAGCTCTGACCGACGACACGGGCCGCAACCGAATTGCAACCGTAACTCAC
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+CGCAAGCGCACCTTCCGCGTCAACGGCAATGTTGCAGCTAACAAGATCCATAACGTCAAG
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+CTTGCCGCCTCGCTTGTTCTCCTGGTCGCTGCTATTTCGCTGCTTTCCATCATGTAA
+>NC_005833.1|ORF6 length 136 aa, 408 bp, from 3585..3993[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+GTAGCTCTGACCGACGACACGGGCCGCAACCGAATTGCAACCGTAACTCACAACGGTGAA
+GGTCTTCGCTGGAATAGCGGCGGCACTAAGTTCGCAACGTTCGGCAAGAAGCGCAAGCGC
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+GTTGACCGCAAGCCAGCGCTGAAGTTTAAAGAGAAGGTGGATTTATTCAATCTTGCCGCC
+TCGCTTGTTCTCCTGGTCGCTGCTATTTCGCTGCTTTCCATCATGTAA
+>NC_005833.1|ORF7 length 125 aa, 375 bp, from 3618..3993[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+AAGATCCATAACGTCAAGCCGTCGGAAGTTGACCGCAAGCCAGCGCTGAAGTTTAAAGAG
+AAGGTGGATTTATTCAATCTTGCCGCCTCGCTTGTTCTCCTGGTCGCTGCTATTTCGCTG
+CTTTCCATCATGTAA
+>NC_005833.1|ORF8 length 177 aa, 531 bp, from 4947..5478[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+AACCCAATCCAGAGCACGATCGATGTGATGAACTCTATGTTTGCCGCTGGGTATCATGTG
+ATCATTTTAACCGGGCGAAGTGATGAGGTGCGTTACGCATCTGAGTTATGGCTTAAGCAT
+CACGGCGCTCGATATGATTACTTAGTCATGCGACCGCATACCGACAACCGCAAAGACACG
+GTAATGAAAGAAGAGGCAGTGCGCGCTATCGGCATTGATAACATTCTTGCGGCTTGGGAT
+GACTCAGTGAATATAATAAAAAAATTCAGAGATCTAGGGATAACCACATATCAGGTTTGT
+GAATATGCCTGTGATAGTCGAGAGGATTTAAATAGTCATGGTGTCGATTGA
+>NC_005833.1|ORF9 length 158 aa, 474 bp, from 5004..5478[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+GTGGCAATCTTTGACTTTGACGGGACACTTAGCGATGGATCTGGTCGACTTCACCTGCTG
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+GATAACCCAATCCAGAGCACGATCGATGTGATGAACTCTATGTTTGCCGCTGGGTATCAT
+GTGATCATTTTAACCGGGCGAAGTGATGAGGTGCGTTACGCATCTGAGTTATGGCTTAAG
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+ACGGTAATGAAAGAAGAGGCAGTGCGCGCTATCGGCATTGATAACATTCTTGCGGCTTGG
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+>NC_005833.1|ORF10 length 134 aa, 402 bp, from 5076..5478[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+TTGCACTTGACTGAAAGCTGGTCTGAGTTTAACCGAGCGGCAATATTTGATAACCCAATC
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+ACCGGGCGAAGTGATGAGGTGCGTTACGCATCTGAGTTATGGCTTAAGCATCACGGCGCT
+CGATATGATTACTTAGTCATGCGACCGCATACCGACAACCGCAAAGACACGGTAATGAAA
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+>NC_005833.1|ORF11 length 132 aa, 396 bp, from 5082..5478[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+TTGACTGAAAGCTGGTCTGAGTTTAACCGAGCGGCAATATTTGATAACCCAATCCAGAGC
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+>NC_005833.1|ORF12 length 109 aa, 327 bp, from 5151..5478[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+GATTTAAATAGTCATGGTGTCGATTGA
+>NC_005833.1|ORF13 length 108 aa, 324 bp, from 5154..5478[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF14 length 105 aa, 315 bp, from 5163..5478[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGTTTGCCGCTGGGTATCATGTGATCATTTTAACCGGGCGAAGTGATGAGGTGCGTTAC
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+CATGGTGTCGATTGA
+>NC_005833.1|ORF15 length 191 aa, 573 bp, from 5961..6534[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGAAAACAGCTATCATTTTAAACGGCGCACCTGGTGCGGGAAAGGACACTATCGGATGC
+ATCCTGGCTGACACTTACGATCATGTAGCGCTACGCAGCTTCAAAGCGCCAATGTTTGAG
+ATTGCCCGAGCAATCCTGGGTGAGACTAATTTCGAGTATTTCATGTTCTTGTATGAGGAC
+CGTCGCTATAAAGAAGAGCCAGCGTCAATCCTGAACGGTAAAAGCCCGCGCCAGTTTATG
+ATCTGGATTAGCGAGGAGGTCATCAAGCCGCAGTTCGGAAATCGCTTCTTCGGTATGCGA
+GCGGAAAGTAAGGTGAAAGAGTCGCATTCACTTTCGGTATTTACTGACGGTGGATTCAAA
+GACGAGATCTTGCAGATGATTGAAGGTGACATCCAGGTCAAGCTGTGTCGAATCCATCGC
+AACGGTTGCAACTTTGACAACGACAGTCGCGACTATATCTATCTTGACGATATGATCGGG
+GTCAACGGTTATCAGGAGTGTGACTTCTTTTCTGTCGAAGGCCATCCAGAAATTACCGCT
+CAGCACATAGCCGCCACGTTCATCAATAAATAG
+>NC_005833.1|ORF16 length 154 aa, 462 bp, from 6072..6534[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+GGTATGCGAGCGGAAAGTAAGGTGAAAGAGTCGCATTCACTTTCGGTATTTACTGACGGT
+GGATTCAAAGACGAGATCTTGCAGATGATTGAAGGTGACATCCAGGTCAAGCTGTGTCGA
+ATCCATCGCAACGGTTGCAACTTTGACAACGACAGTCGCGACTATATCTATCTTGACGAT
+ATGATCGGGGTCAACGGTTATCAGGAGTGTGACTTCTTTTCTGTCGAAGGCCATCCAGAA
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+>NC_005833.1|ORF17 length 137 aa, 411 bp, from 6123..6534[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF18 length 135 aa, 405 bp, from 6129..6534[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF19 length 112 aa, 336 bp, from 6198..6534[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGATCTGGATTAGCGAGGAGGTCATCAAGCCGCAGTTCGGAAATCGCTTCTTCGGTATG
+CGAGCGGAAAGTAAGGTGAAAGAGTCGCATTCACTTTCGGTATTTACTGACGGTGGATTC
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+CGCAACGGTTGCAACTTTGACAACGACAGTCGCGACTATATCTATCTTGACGATATGATC
+GGGGTCAACGGTTATCAGGAGTGTGACTTCTTTTCTGTCGAAGGCCATCCAGAAATTACC
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+>NC_005833.1|ORF20 length 159 aa, 477 bp, from 13743..14220[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+GTTGGCGCTGCCGTACAAGTTGTTCAAGCTCAGGCGGTTGATGGTCATAAGTTGGTTAAG
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+AACGCTCAAAATCAGATGATTTACGAAGATGGCGGCGCTATCAACGTGATGACTTCAGGC
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+GATGTTGATGGTCAGGAAAAATCTGATGGCACGATCGAAACAACCTGGACCTACGCTGGC
+GGTTGGACTAAATACAAAGATATTCAGCTTGTTGAGGTTCAGTTGCATCAACTGTAA
+>NC_005833.1|ORF21 length 148 aa, 444 bp, from 13776..14220[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+ATCGAAACAACCTGGACCTACGCTGGCGGTTGGACTAAATACAAAGATATTCAGCTTGTT
+GAGGTTCAGTTGCATCAACTGTAA
+>NC_005833.1|ORF22 length 141 aa, 423 bp, from 13797..14220[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF23 length 102 aa, 306 bp, from 13914..14220[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF24 length 133 aa, 399 bp, from 17688..18087[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF25 length 110 aa, 330 bp, from 17757..18087[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+ATGGCGACACTTGACACTTTTGGTTGGTGTACGCAGGTTCAAGGGGGCGGTGGCTCCCTT
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+>NC_005833.1|ORF27 length 256 aa, 768 bp, from 23601..24369[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+ATGCAGATAGGGCAAAACGTTCCGGTATGGAACCATGCAGGGATTTACCTGGGAGATAAT
+CAGATCTTGCATCATGCCTTCGGCAAGCTATCTCGTCGTGATATTTATTCCGGATGGTAT
+CAGGATCATACTGTTTTAATCGTTCGCCATAAGGATCTTAAATTATGA
+>NC_005833.1|ORF28 length 245 aa, 735 bp, from 23634..24369[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+GAATGCTGCGGGGTAGTCACCCAAAAGGGCCGCGTGCAAAAATACCATCGCATTGATAAT
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+GACGATGCGGAATCAACAACAATAGCAATTGTTCACAGCCACACAGGAGACGGGGCTACA
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+GTTAGCGTGCCGGAAGGGGATATGCGATTTGTGAAGCCGGAGAAATTGCCTCTGATTGGT
+CGTCCGTGGTCATTAGGATCATTCGACTGTTACGGTCTTGTTATGGCGTGGCACAAAGAG
+CACGGCGTAGAATTGCGCGATCGCCGATTGAATTTTGAATGGTGGAAACCTGAGTACGGA
+ATTAATCTCTATCAGGATTATTACAAGCAGGATGGCTTCGTTGAGATTCCAGATCAGAAT
+AATCCGTCATTCGGTGATATGGTAATCATGCAGATAGGGCAAAACGTTCCGGTATGGAAC
+CATGCAGGGATTTACCTGGGAGATAATCAGATCTTGCATCATGCCTTCGGCAAGCTATCT
+CGTCGTGATATTTATTCCGGATGGTATCAGGATCATACTGTTTTAATCGTTCGCCATAAG
+GATCTTAAATTATGA
+>NC_005833.1|ORF29 length 235 aa, 705 bp, from 23664..24369[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+GTGAAGCCGGAGAAATTGCCTCTGATTGGTCGTCCGTGGTCATTAGGATCATTCGACTGT
+TACGGTCTTGTTATGGCGTGGCACAAAGAGCACGGCGTAGAATTGCGCGATCGCCGATTG
+AATTTTGAATGGTGGAAACCTGAGTACGGAATTAATCTCTATCAGGATTATTACAAGCAG
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+>NC_005833.1|ORF30 length 214 aa, 642 bp, from 23727..24369[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+ATAGGGCAAAACGTTCCGGTATGGAACCATGCAGGGATTTACCTGGGAGATAATCAGATC
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+>NC_005833.1|ORF44 length 108 aa, 324 bp, from 29277..29601[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+ATGTTAGCATTATATCAAACGGCAAGATTTCATTTATGGAAGGTATGCCGAGAAAAATGC
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+ATGATTGACGCGGAAGGTAACGAGAAGATTCGTTGGGTTAAGACATCAGTTGATAATGAG
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+TTTGATTTGCACATTGGTGCTCTTGCTCACAAACATGAGTGCGGCGAAAACTACGACACA
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+>NC_005833.1|ORF51 length 316 aa, 948 bp, from 41007..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+CATTACGACTCTTTGGAGTCTAAGACTCCAGCGTCAGGCCATTACTTAGATTCTGACAGT
+CGTTACGCTAAGCTTGTTTATGTCGCAATCCGATCAGTACGACGCGCAGTCTCTCGAATG
+CTGGAGAAGCACCAAGTTATTGATATTAAAGCAATAAGTGGGAATCACGACGAATCAGGG
+ATGGTTTGGTTGCGCGCTGCGCTTGCTGCATTTTATGAAGATGAGCCGCGCGTAAATGTT
+GATGTTAGCCCTGCCGCAATGATGATGACCAGCTTTGGTAAGACCCTTATTGGATACACT
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+AAGTTGTTTGGTCAAAGTGATTACGTTTACACGCATAGCGGTCACTGGCACAGTCAAAAG
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+TACTCTGCCAATGGCGGTTGGAGGTCTCAGCGTCAAGCTGCTGTGATTGTCTATCACAAG
+GAATTTGGTGAGGTTGGACGATTCATTTGTCGACCTGAAATGTTCTAA
+>NC_005833.1|ORF52 length 309 aa, 927 bp, from 41028..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGATTGACGCGGAAGGTAACGAGAAGATTCGTTGGGTTAAGACATCAGTTGATAATGAG
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+TTTGATTTGCACATTGGTGCTCTTGCTCACAAACATGAGTGCGGCGAAAACTACGACACA
+GCGACAGCAGAGAAGGTTATGAATGGGTTCTTTGACTACGCTGTAGATAAGGCGCCAAAC
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+AAGACTCCAGCGTCAGGCCATTACTTAGATTCTGACAGTCGTTACGCTAAGCTTGTTTAT
+GTCGCAATCCGATCAGTACGACGCGCAGTCTCTCGAATGCTGGAGAAGCACCAAGTTATT
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+TTCATTTGTCGACCTGAAATGTTCTAA
+>NC_005833.1|ORF53 length 284 aa, 852 bp, from 41103..41955[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGGAAAAAGCGCGTGAAGCATTCTGTTCAGAGTTGCCTAAGGCTATTCCATCTGAATCA
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+TTGGTATTGGGTGGCGATTTCCTACATTACGACTCTTTGGAGTCTAAGACTCCAGCGTCA
+GGCCATTACTTAGATTCTGACAGTCGTTACGCTAAGCTTGTTTATGTCGCAATCCGATCA
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+>NC_005833.1|ORF95 length 498 aa, 1494 bp, from 9034..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+ATGCAGGCGCAGCAGTTCCAGCCTAACTGGCATCACCTTTACCTATGTCACGAAGTGGAG
+GAAATTATTGCAGGGCGGCGAGGGAATACAATCTTTAACGTCACACCAGGTTCCGGTAAA
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+AAGCGACTCGCCGGGATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF97 length 472 aa, 1416 bp, from 9112..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+GTGGAGGAAATTATTGCAGGGCGGCGAGGGAATACAATCTTTAACGTCACACCAGGTTCC
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+GGGATGGTAATGCTAGACGATATCGACAAGCCTGATGATATGTTCTCAAAGGTTAAGCGT
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+CTTGACGCTGACGAGCCAGATCCGGGTAAATATGATTACCGATTCATCACTGCCGATACC
+GCTCAGAAGACAGGCGAGCTAAACGACTACACGGTATTTTGTTTGTGGGGCAAGAAGAAT
+GATAAGGTTTACTTTATCGACGGCATTCGCGGAAAGTGGGAAGCGCCGGATATGGAGAGG
+CAATTTACAGCTTTCGTCAATCAGGCATGGAGGCACAATAAATCAATGGGGGTACTTCGT
+AAAATTTATGTGGAAGATAAGGCGAGCGGTACGGGCTTAATCCAGAACCTCAGGAAAAAG
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+>NC_005833.1|ORF111 length 317 aa, 951 bp, from 9577..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+TGGTTCATGATGAATGGCGGTATGGGTATTGAGTTTGACCAAATCTCAATACCGGCGCTG
+GTGACGGAAGAATACGGAAAGACACTTCCTGATTGGTTGCAGCCTTACTTTGAGCGTGAT
+GTTTTATCGTCTGAGTATGTAGAATTGGATGGCGTTAAGCATTACTCTTTTTGGCCAAGC
+AAGGAAAGCGTTCACGACCTGTTGGCGTTACGAGAAGCAGATCAGTATACCTTTGATTCT
+CAGTATCAGCAGAAACCGATCGCGCTGGGTGGCTCCGTGTTTAACTCAGAGTGGTGGACT
+TATTACGGCAGCAGTCTTGACGCTGACGAGCCAGATCCGGGTAAATATGATTACCGATTC
+ATCACTGCCGATACCGCTCAGAAGACAGGCGAGCTAAACGACTACACGGTATTTTGTTTG
+TGGGGCAAGAAGAATGATAAGGTTTACTTTATCGACGGCATTCGCGGAAAGTGGGAAGCG
+CCGGATATGGAGAGGCAATTTACAGCTTTCGTCAATCAGGCATGGAGGCACAATAAATCA
+ATGGGGGTACTTCGTAAAATTTATGTGGAAGATAAGGCGAGCGGTACGGGCTTAATCCAG
+AACCTCAGGAAAAAGACCCCGATCTCAATCACTCCATTGCAGCGTAACAAAGACAAAGTT
+ACCCGAGCTATGGATGCTCAGCCAGTTATTAAAGCCGGGCGCGTGGTTCTGCCAGAAGAG
+CACCCTATGCTTGCTGAAATTATCGCTGAACACAGTGCCTTCACTTACGATGACACCCAT
+CCGCATGATGATATCGTCGATAACTTCATGGATGCGGCGAACATCGAATTGCTGACCATT
+GATGATCCTATCGAGAGAATGAAGCGACTCGCCGGGATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF112 length 295 aa, 885 bp, from 9643..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGATGAATGGCGGTATGGGTATTGAGTTTGACCAAATCTCAATACCGGCGCTGGTGACG
+GAAGAATACGGAAAGACACTTCCTGATTGGTTGCAGCCTTACTTTGAGCGTGATGTTTTA
+TCGTCTGAGTATGTAGAATTGGATGGCGTTAAGCATTACTCTTTTTGGCCAAGCAAGGAA
+AGCGTTCACGACCTGTTGGCGTTACGAGAAGCAGATCAGTATACCTTTGATTCTCAGTAT
+CAGCAGAAACCGATCGCGCTGGGTGGCTCCGTGTTTAACTCAGAGTGGTGGACTTATTAC
+GGCAGCAGTCTTGACGCTGACGAGCCAGATCCGGGTAAATATGATTACCGATTCATCACT
+GCCGATACCGCTCAGAAGACAGGCGAGCTAAACGACTACACGGTATTTTGTTTGTGGGGC
+AAGAAGAATGATAAGGTTTACTTTATCGACGGCATTCGCGGAAAGTGGGAAGCGCCGGAT
+ATGGAGAGGCAATTTACAGCTTTCGTCAATCAGGCATGGAGGCACAATAAATCAATGGGG
+GTACTTCGTAAAATTTATGTGGAAGATAAGGCGAGCGGTACGGGCTTAATCCAGAACCTC
+AGGAAAAAGACCCCGATCTCAATCACTCCATTGCAGCGTAACAAAGACAAAGTTACCCGA
+GCTATGGATGCTCAGCCAGTTATTAAAGCCGGGCGCGTGGTTCTGCCAGAAGAGCACCCT
+ATGCTTGCTGAAATTATCGCTGAACACAGTGCCTTCACTTACGATGACACCCATCCGCAT
+GATGATATCGTCGATAACTTCATGGATGCGGCGAACATCGAATTGCTGACCATTGATGAT
+CCTATCGAGAGAATGAAGCGACTCGCCGGGATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF113 length 294 aa, 882 bp, from 9646..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGAATGGCGGTATGGGTATTGAGTTTGACCAAATCTCAATACCGGCGCTGGTGACGGAA
+GAATACGGAAAGACACTTCCTGATTGGTTGCAGCCTTACTTTGAGCGTGATGTTTTATCG
+TCTGAGTATGTAGAATTGGATGGCGTTAAGCATTACTCTTTTTGGCCAAGCAAGGAAAGC
+GTTCACGACCTGTTGGCGTTACGAGAAGCAGATCAGTATACCTTTGATTCTCAGTATCAG
+CAGAAACCGATCGCGCTGGGTGGCTCCGTGTTTAACTCAGAGTGGTGGACTTATTACGGC
+AGCAGTCTTGACGCTGACGAGCCAGATCCGGGTAAATATGATTACCGATTCATCACTGCC
+GATACCGCTCAGAAGACAGGCGAGCTAAACGACTACACGGTATTTTGTTTGTGGGGCAAG
+AAGAATGATAAGGTTTACTTTATCGACGGCATTCGCGGAAAGTGGGAAGCGCCGGATATG
+GAGAGGCAATTTACAGCTTTCGTCAATCAGGCATGGAGGCACAATAAATCAATGGGGGTA
+CTTCGTAAAATTTATGTGGAAGATAAGGCGAGCGGTACGGGCTTAATCCAGAACCTCAGG
+AAAAAGACCCCGATCTCAATCACTCCATTGCAGCGTAACAAAGACAAAGTTACCCGAGCT
+ATGGATGCTCAGCCAGTTATTAAAGCCGGGCGCGTGGTTCTGCCAGAAGAGCACCCTATG
+CTTGCTGAAATTATCGCTGAACACAGTGCCTTCACTTACGATGACACCCATCCGCATGAT
+GATATCGTCGATAACTTCATGGATGCGGCGAACATCGAATTGCTGACCATTGATGATCCT
+ATCGAGAGAATGAAGCGACTCGCCGGGATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF114 length 290 aa, 870 bp, from 9658..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGGGTATTGAGTTTGACCAAATCTCAATACCGGCGCTGGTGACGGAAGAATACGGAAAG
+ACACTTCCTGATTGGTTGCAGCCTTACTTTGAGCGTGATGTTTTATCGTCTGAGTATGTA
+GAATTGGATGGCGTTAAGCATTACTCTTTTTGGCCAAGCAAGGAAAGCGTTCACGACCTG
+TTGGCGTTACGAGAAGCAGATCAGTATACCTTTGATTCTCAGTATCAGCAGAAACCGATC
+GCGCTGGGTGGCTCCGTGTTTAACTCAGAGTGGTGGACTTATTACGGCAGCAGTCTTGAC
+GCTGACGAGCCAGATCCGGGTAAATATGATTACCGATTCATCACTGCCGATACCGCTCAG
+AAGACAGGCGAGCTAAACGACTACACGGTATTTTGTTTGTGGGGCAAGAAGAATGATAAG
+GTTTACTTTATCGACGGCATTCGCGGAAAGTGGGAAGCGCCGGATATGGAGAGGCAATTT
+ACAGCTTTCGTCAATCAGGCATGGAGGCACAATAAATCAATGGGGGTACTTCGTAAAATT
+TATGTGGAAGATAAGGCGAGCGGTACGGGCTTAATCCAGAACCTCAGGAAAAAGACCCCG
+ATCTCAATCACTCCATTGCAGCGTAACAAAGACAAAGTTACCCGAGCTATGGATGCTCAG
+CCAGTTATTAAAGCCGGGCGCGTGGTTCTGCCAGAAGAGCACCCTATGCTTGCTGAAATT
+ATCGCTGAACACAGTGCCTTCACTTACGATGACACCCATCCGCATGATGATATCGTCGAT
+AACTTCATGGATGCGGCGAACATCGAATTGCTGACCATTGATGATCCTATCGAGAGAATG
+AAGCGACTCGCCGGGATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF115 length 277 aa, 831 bp, from 9697..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+GTGACGGAAGAATACGGAAAGACACTTCCTGATTGGTTGCAGCCTTACTTTGAGCGTGAT
+GTTTTATCGTCTGAGTATGTAGAATTGGATGGCGTTAAGCATTACTCTTTTTGGCCAAGC
+AAGGAAAGCGTTCACGACCTGTTGGCGTTACGAGAAGCAGATCAGTATACCTTTGATTCT
+CAGTATCAGCAGAAACCGATCGCGCTGGGTGGCTCCGTGTTTAACTCAGAGTGGTGGACT
+TATTACGGCAGCAGTCTTGACGCTGACGAGCCAGATCCGGGTAAATATGATTACCGATTC
+ATCACTGCCGATACCGCTCAGAAGACAGGCGAGCTAAACGACTACACGGTATTTTGTTTG
+TGGGGCAAGAAGAATGATAAGGTTTACTTTATCGACGGCATTCGCGGAAAGTGGGAAGCG
+CCGGATATGGAGAGGCAATTTACAGCTTTCGTCAATCAGGCATGGAGGCACAATAAATCA
+ATGGGGGTACTTCGTAAAATTTATGTGGAAGATAAGGCGAGCGGTACGGGCTTAATCCAG
+AACCTCAGGAAAAAGACCCCGATCTCAATCACTCCATTGCAGCGTAACAAAGACAAAGTT
+ACCCGAGCTATGGATGCTCAGCCAGTTATTAAAGCCGGGCGCGTGGTTCTGCCAGAAGAG
+CACCCTATGCTTGCTGAAATTATCGCTGAACACAGTGCCTTCACTTACGATGACACCCAT
+CCGCATGATGATATCGTCGATAACTTCATGGATGCGGCGAACATCGAATTGCTGACCATT
+GATGATCCTATCGAGAGAATGAAGCGACTCGCCGGGATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF116 length 265 aa, 795 bp, from 9733..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+TTGCAGCCTTACTTTGAGCGTGATGTTTTATCGTCTGAGTATGTAGAATTGGATGGCGTT
+AAGCATTACTCTTTTTGGCCAAGCAAGGAAAGCGTTCACGACCTGTTGGCGTTACGAGAA
+GCAGATCAGTATACCTTTGATTCTCAGTATCAGCAGAAACCGATCGCGCTGGGTGGCTCC
+GTGTTTAACTCAGAGTGGTGGACTTATTACGGCAGCAGTCTTGACGCTGACGAGCCAGAT
+CCGGGTAAATATGATTACCGATTCATCACTGCCGATACCGCTCAGAAGACAGGCGAGCTA
+AACGACTACACGGTATTTTGTTTGTGGGGCAAGAAGAATGATAAGGTTTACTTTATCGAC
+GGCATTCGCGGAAAGTGGGAAGCGCCGGATATGGAGAGGCAATTTACAGCTTTCGTCAAT
+CAGGCATGGAGGCACAATAAATCAATGGGGGTACTTCGTAAAATTTATGTGGAAGATAAG
+GCGAGCGGTACGGGCTTAATCCAGAACCTCAGGAAAAAGACCCCGATCTCAATCACTCCA
+TTGCAGCGTAACAAAGACAAAGTTACCCGAGCTATGGATGCTCAGCCAGTTATTAAAGCC
+GGGCGCGTGGTTCTGCCAGAAGAGCACCCTATGCTTGCTGAAATTATCGCTGAACACAGT
+GCCTTCACTTACGATGACACCCATCCGCATGATGATATCGTCGATAACTTCATGGATGCG
+GCGAACATCGAATTGCTGACCATTGATGATCCTATCGAGAGAATGAAGCGACTCGCCGGG
+ATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF117 length 249 aa, 747 bp, from 9781..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+TTGGATGGCGTTAAGCATTACTCTTTTTGGCCAAGCAAGGAAAGCGTTCACGACCTGTTG
+GCGTTACGAGAAGCAGATCAGTATACCTTTGATTCTCAGTATCAGCAGAAACCGATCGCG
+CTGGGTGGCTCCGTGTTTAACTCAGAGTGGTGGACTTATTACGGCAGCAGTCTTGACGCT
+GACGAGCCAGATCCGGGTAAATATGATTACCGATTCATCACTGCCGATACCGCTCAGAAG
+ACAGGCGAGCTAAACGACTACACGGTATTTTGTTTGTGGGGCAAGAAGAATGATAAGGTT
+TACTTTATCGACGGCATTCGCGGAAAGTGGGAAGCGCCGGATATGGAGAGGCAATTTACA
+GCTTTCGTCAATCAGGCATGGAGGCACAATAAATCAATGGGGGTACTTCGTAAAATTTAT
+GTGGAAGATAAGGCGAGCGGTACGGGCTTAATCCAGAACCTCAGGAAAAAGACCCCGATC
+TCAATCACTCCATTGCAGCGTAACAAAGACAAAGTTACCCGAGCTATGGATGCTCAGCCA
+GTTATTAAAGCCGGGCGCGTGGTTCTGCCAGAAGAGCACCCTATGCTTGCTGAAATTATC
+GCTGAACACAGTGCCTTCACTTACGATGACACCCATCCGCATGATGATATCGTCGATAAC
+TTCATGGATGCGGCGAACATCGAATTGCTGACCATTGATGATCCTATCGAGAGAATGAAG
+CGACTCGCCGGGATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF118 length 230 aa, 690 bp, from 9838..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+TTGGCGTTACGAGAAGCAGATCAGTATACCTTTGATTCTCAGTATCAGCAGAAACCGATC
+GCGCTGGGTGGCTCCGTGTTTAACTCAGAGTGGTGGACTTATTACGGCAGCAGTCTTGAC
+GCTGACGAGCCAGATCCGGGTAAATATGATTACCGATTCATCACTGCCGATACCGCTCAG
+AAGACAGGCGAGCTAAACGACTACACGGTATTTTGTTTGTGGGGCAAGAAGAATGATAAG
+GTTTACTTTATCGACGGCATTCGCGGAAAGTGGGAAGCGCCGGATATGGAGAGGCAATTT
+ACAGCTTTCGTCAATCAGGCATGGAGGCACAATAAATCAATGGGGGTACTTCGTAAAATT
+TATGTGGAAGATAAGGCGAGCGGTACGGGCTTAATCCAGAACCTCAGGAAAAAGACCCCG
+ATCTCAATCACTCCATTGCAGCGTAACAAAGACAAAGTTACCCGAGCTATGGATGCTCAG
+CCAGTTATTAAAGCCGGGCGCGTGGTTCTGCCAGAAGAGCACCCTATGCTTGCTGAAATT
+ATCGCTGAACACAGTGCCTTCACTTACGATGACACCCATCCGCATGATGATATCGTCGAT
+AACTTCATGGATGCGGCGAACATCGAATTGCTGACCATTGATGATCCTATCGAGAGAATG
+AAGCGACTCGCCGGGATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF119 length 205 aa, 615 bp, from 9913..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+GTGTTTAACTCAGAGTGGTGGACTTATTACGGCAGCAGTCTTGACGCTGACGAGCCAGAT
+CCGGGTAAATATGATTACCGATTCATCACTGCCGATACCGCTCAGAAGACAGGCGAGCTA
+AACGACTACACGGTATTTTGTTTGTGGGGCAAGAAGAATGATAAGGTTTACTTTATCGAC
+GGCATTCGCGGAAAGTGGGAAGCGCCGGATATGGAGAGGCAATTTACAGCTTTCGTCAAT
+CAGGCATGGAGGCACAATAAATCAATGGGGGTACTTCGTAAAATTTATGTGGAAGATAAG
+GCGAGCGGTACGGGCTTAATCCAGAACCTCAGGAAAAAGACCCCGATCTCAATCACTCCA
+TTGCAGCGTAACAAAGACAAAGTTACCCGAGCTATGGATGCTCAGCCAGTTATTAAAGCC
+GGGCGCGTGGTTCTGCCAGAAGAGCACCCTATGCTTGCTGAAATTATCGCTGAACACAGT
+GCCTTCACTTACGATGACACCCATCCGCATGATGATATCGTCGATAACTTCATGGATGCG
+GCGAACATCGAATTGCTGACCATTGATGATCCTATCGAGAGAATGAAGCGACTCGCCGGG
+ATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF120 length 158 aa, 474 bp, from 10054..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+TTGTGGGGCAAGAAGAATGATAAGGTTTACTTTATCGACGGCATTCGCGGAAAGTGGGAA
+GCGCCGGATATGGAGAGGCAATTTACAGCTTTCGTCAATCAGGCATGGAGGCACAATAAA
+TCAATGGGGGTACTTCGTAAAATTTATGTGGAAGATAAGGCGAGCGGTACGGGCTTAATC
+CAGAACCTCAGGAAAAAGACCCCGATCTCAATCACTCCATTGCAGCGTAACAAAGACAAA
+GTTACCCGAGCTATGGATGCTCAGCCAGTTATTAAAGCCGGGCGCGTGGTTCTGCCAGAA
+GAGCACCCTATGCTTGCTGAAATTATCGCTGAACACAGTGCCTTCACTTACGATGACACC
+CATCCGCATGATGATATCGTCGATAACTTCATGGATGCGGCGAACATCGAATTGCTGACC
+ATTGATGATCCTATCGAGAGAATGAAGCGACTCGCCGGGATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF121 length 135 aa, 405 bp, from 10123..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGGAGAGGCAATTTACAGCTTTCGTCAATCAGGCATGGAGGCACAATAAATCAATGGGG
+GTACTTCGTAAAATTTATGTGGAAGATAAGGCGAGCGGTACGGGCTTAATCCAGAACCTC
+AGGAAAAAGACCCCGATCTCAATCACTCCATTGCAGCGTAACAAAGACAAAGTTACCCGA
+GCTATGGATGCTCAGCCAGTTATTAAAGCCGGGCGCGTGGTTCTGCCAGAAGAGCACCCT
+ATGCTTGCTGAAATTATCGCTGAACACAGTGCCTTCACTTACGATGACACCCATCCGCAT
+GATGATATCGTCGATAACTTCATGGATGCGGCGAACATCGAATTGCTGACCATTGATGAT
+CCTATCGAGAGAATGAAGCGACTCGCCGGGATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF122 length 117 aa, 351 bp, from 10177..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGGGGGTACTTCGTAAAATTTATGTGGAAGATAAGGCGAGCGGTACGGGCTTAATCCAG
+AACCTCAGGAAAAAGACCCCGATCTCAATCACTCCATTGCAGCGTAACAAAGACAAAGTT
+ACCCGAGCTATGGATGCTCAGCCAGTTATTAAAGCCGGGCGCGTGGTTCTGCCAGAAGAG
+CACCCTATGCTTGCTGAAATTATCGCTGAACACAGTGCCTTCACTTACGATGACACCCAT
+CCGCATGATGATATCGTCGATAACTTCATGGATGCGGCGAACATCGAATTGCTGACCATT
+GATGATCCTATCGAGAGAATGAAGCGACTCGCCGGGATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF123 length 109 aa, 327 bp, from 10201..10528[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+GTGGAAGATAAGGCGAGCGGTACGGGCTTAATCCAGAACCTCAGGAAAAAGACCCCGATC
+TCAATCACTCCATTGCAGCGTAACAAAGACAAAGTTACCCGAGCTATGGATGCTCAGCCA
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+GCTGAACACAGTGCCTTCACTTACGATGACACCCATCCGCATGATGATATCGTCGATAAC
+TTCATGGATGCGGCGAACATCGAATTGCTGACCATTGATGATCCTATCGAGAGAATGAAG
+CGACTCGCCGGGATGGTTAAGCGGTAA
+>NC_005833.1|ORF124 length 437 aa, 1311 bp, from 10555..11866[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+TTGACGGCCCTTTTTATTGGAGGAAACATGAAAATTGTTAAGCATGATGGATATAACGAT
+ATCTTTAACGGCGGCGCGGACGGATCGCCTAAGCCATTCTTTATGTCTGATGCATCATAT
+CACGTCGGTTCTTTCTACAACGACAACGCAACCGCGAAGCGAATTGTGGATGTTATCCCG
+GAAGAGATGGTGACGGCTGGTTTTAAAATGTCAGGCGTTAAGGATGAAAAAGAGTTCAAG
+TCTTTATGGGATAGCTACAAACTTGATTCAAGTCTGGTGGATCTTCTTTGTTGGGCACGA
+CTTTACGGTGGCGCGGCGATGGTGGCAATCATCAAAGACAACCGGATGTTAACCAGTCAG
+GCAAAGCCTGGAGCTAAACTTGAAGGCGTCCGAGTTTATGATCGATTTGCTATCACTGTT
+GAAAAGCGAGTCACCAATGCAAGATCTCCTCGCTATGGTGAGCCTGAAATTTACAAGGTA
+TCCCCTGGCGACAATATGCAGCCGTACCTGATTCATCACTCAAGAGTCTTTATTGCTGAT
+GGTGAACGAGTGGCGCAACAGGCAAGAAAGCAGAATCAAGGATGGGGAGCTTCGGTATTG
+AATAAGTCACTGATTGATGCAATCTGTGACTATGATTACTGTGAATCTCTGGCTACTCAG
+ATCTTGCGACGTAAGCAACAGGCTGTATGGAAGGTCAAAGGTCTTGCCGAAATGTGTGAT
+GATGATGATGCTCAGTATGCCGCGCGCCTGCGACTTGCTCAGGTAGATGATAACTCCGGC
+GTAGGCCGTGCGATCGGTATCGATGCTGAGACTGAGGAATATGACGTTCTCAACTCTGAT
+ATCAGCGGAGTCCCTGAGTTCTTATCAAGCAAGATGGACCGCATCGTCTCCCTATCCGGG
+ATTCATGAGATTATCATCAAGAATAAGAACGTAGGCGGCGTATCAGCGAGCCAAAACACA
+GCGCTTGAGACTTTCTATAAGCTAGTCGATCGCAAGCGCGAGGAAGATTACAGGCCGCTT
+CTTGAGTTCTTGTTGCCGTTCATTGTTGATGAGGAAGAGTGGTCGATCGAGTTTGAGCCT
+TTGTCTGTTCCGAGTAAGAAAGAGGAATCAGAGATCACGAAGAATAACGTTGAGTCAGTC
+ACGAAGGCTATCACTGAGCAAATCATCGATCTGGAAGAAGCTCGCGACACGTTGCGATCC
+ATTGCCCCTGAGTTCAAACTCAAGGATGGTAATAACATCAACATTCGCGAACCGGAAGAA
+ACAACCGAACCGGAGCCGGGATTAGGGGAGAAGTTAGAAGATGAAAATTAA
+>NC_005833.1|ORF125 length 428 aa, 1284 bp, from 10582..11866[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGAAAATTGTTAAGCATGATGGATATAACGATATCTTTAACGGCGGCGCGGACGGATCG
+CCTAAGCCATTCTTTATGTCTGATGCATCATATCACGTCGGTTCTTTCTACAACGACAAC
+GCAACCGCGAAGCGAATTGTGGATGTTATCCCGGAAGAGATGGTGACGGCTGGTTTTAAA
+ATGTCAGGCGTTAAGGATGAAAAAGAGTTCAAGTCTTTATGGGATAGCTACAAACTTGAT
+TCAAGTCTGGTGGATCTTCTTTGTTGGGCACGACTTTACGGTGGCGCGGCGATGGTGGCA
+ATCATCAAAGACAACCGGATGTTAACCAGTCAGGCAAAGCCTGGAGCTAAACTTGAAGGC
+GTCCGAGTTTATGATCGATTTGCTATCACTGTTGAAAAGCGAGTCACCAATGCAAGATCT
+CCTCGCTATGGTGAGCCTGAAATTTACAAGGTATCCCCTGGCGACAATATGCAGCCGTAC
+CTGATTCATCACTCAAGAGTCTTTATTGCTGATGGTGAACGAGTGGCGCAACAGGCAAGA
+AAGCAGAATCAAGGATGGGGAGCTTCGGTATTGAATAAGTCACTGATTGATGCAATCTGT
+GACTATGATTACTGTGAATCTCTGGCTACTCAGATCTTGCGACGTAAGCAACAGGCTGTA
+TGGAAGGTCAAAGGTCTTGCCGAAATGTGTGATGATGATGATGCTCAGTATGCCGCGCGC
+CTGCGACTTGCTCAGGTAGATGATAACTCCGGCGTAGGCCGTGCGATCGGTATCGATGCT
+GAGACTGAGGAATATGACGTTCTCAACTCTGATATCAGCGGAGTCCCTGAGTTCTTATCA
+AGCAAGATGGACCGCATCGTCTCCCTATCCGGGATTCATGAGATTATCATCAAGAATAAG
+AACGTAGGCGGCGTATCAGCGAGCCAAAACACAGCGCTTGAGACTTTCTATAAGCTAGTC
+GATCGCAAGCGCGAGGAAGATTACAGGCCGCTTCTTGAGTTCTTGTTGCCGTTCATTGTT
+GATGAGGAAGAGTGGTCGATCGAGTTTGAGCCTTTGTCTGTTCCGAGTAAGAAAGAGGAA
+TCAGAGATCACGAAGAATAACGTTGAGTCAGTCACGAAGGCTATCACTGAGCAAATCATC
+GATCTGGAAGAAGCTCGCGACACGTTGCGATCCATTGCCCCTGAGTTCAAACTCAAGGAT
+GGTAATAACATCAACATTCGCGAACCGGAAGAAACAACCGAACCGGAGCCGGGATTAGGG
+GAGAAGTTAGAAGATGAAAATTAA
+>NC_005833.1|ORF126 length 403 aa, 1209 bp, from 10657..11866[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGTCTGATGCATCATATCACGTCGGTTCTTTCTACAACGACAACGCAACCGCGAAGCGA
+ATTGTGGATGTTATCCCGGAAGAGATGGTGACGGCTGGTTTTAAAATGTCAGGCGTTAAG
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+CTTCTTTGTTGGGCACGACTTTACGGTGGCGCGGCGATGGTGGCAATCATCAAAGACAAC
+CGGATGTTAACCAGTCAGGCAAAGCCTGGAGCTAAACTTGAAGGCGTCCGAGTTTATGAT
+CGATTTGCTATCACTGTTGAAAAGCGAGTCACCAATGCAAGATCTCCTCGCTATGGTGAG
+CCTGAAATTTACAAGGTATCCCCTGGCGACAATATGCAGCCGTACCTGATTCATCACTCA
+AGAGTCTTTATTGCTGATGGTGAACGAGTGGCGCAACAGGCAAGAAAGCAGAATCAAGGA
+TGGGGAGCTTCGGTATTGAATAAGTCACTGATTGATGCAATCTGTGACTATGATTACTGT
+GAATCTCTGGCTACTCAGATCTTGCGACGTAAGCAACAGGCTGTATGGAAGGTCAAAGGT
+CTTGCCGAAATGTGTGATGATGATGATGCTCAGTATGCCGCGCGCCTGCGACTTGCTCAG
+GTAGATGATAACTCCGGCGTAGGCCGTGCGATCGGTATCGATGCTGAGACTGAGGAATAT
+GACGTTCTCAACTCTGATATCAGCGGAGTCCCTGAGTTCTTATCAAGCAAGATGGACCGC
+ATCGTCTCCCTATCCGGGATTCATGAGATTATCATCAAGAATAAGAACGTAGGCGGCGTA
+TCAGCGAGCCAAAACACAGCGCTTGAGACTTTCTATAAGCTAGTCGATCGCAAGCGCGAG
+GAAGATTACAGGCCGCTTCTTGAGTTCTTGTTGCCGTTCATTGTTGATGAGGAAGAGTGG
+TCGATCGAGTTTGAGCCTTTGTCTGTTCCGAGTAAGAAAGAGGAATCAGAGATCACGAAG
+AATAACGTTGAGTCAGTCACGAAGGCTATCACTGAGCAAATCATCGATCTGGAAGAAGCT
+CGCGACACGTTGCGATCCATTGCCCCTGAGTTCAAACTCAAGGATGGTAATAACATCAAC
+ATTCGCGAACCGGAAGAAACAACCGAACCGGAGCCGGGATTAGGGGAGAAGTTAGAAGAT
+GAAAATTAA
+>NC_005833.1|ORF127 length 382 aa, 1146 bp, from 10720..11866[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+GTGGATGTTATCCCGGAAGAGATGGTGACGGCTGGTTTTAAAATGTCAGGCGTTAAGGAT
+GAAAAAGAGTTCAAGTCTTTATGGGATAGCTACAAACTTGATTCAAGTCTGGTGGATCTT
+CTTTGTTGGGCACGACTTTACGGTGGCGCGGCGATGGTGGCAATCATCAAAGACAACCGG
+ATGTTAACCAGTCAGGCAAAGCCTGGAGCTAAACTTGAAGGCGTCCGAGTTTATGATCGA
+TTTGCTATCACTGTTGAAAAGCGAGTCACCAATGCAAGATCTCCTCGCTATGGTGAGCCT
+GAAATTTACAAGGTATCCCCTGGCGACAATATGCAGCCGTACCTGATTCATCACTCAAGA
+GTCTTTATTGCTGATGGTGAACGAGTGGCGCAACAGGCAAGAAAGCAGAATCAAGGATGG
+GGAGCTTCGGTATTGAATAAGTCACTGATTGATGCAATCTGTGACTATGATTACTGTGAA
+TCTCTGGCTACTCAGATCTTGCGACGTAAGCAACAGGCTGTATGGAAGGTCAAAGGTCTT
+GCCGAAATGTGTGATGATGATGATGCTCAGTATGCCGCGCGCCTGCGACTTGCTCAGGTA
+GATGATAACTCCGGCGTAGGCCGTGCGATCGGTATCGATGCTGAGACTGAGGAATATGAC
+GTTCTCAACTCTGATATCAGCGGAGTCCCTGAGTTCTTATCAAGCAAGATGGACCGCATC
+GTCTCCCTATCCGGGATTCATGAGATTATCATCAAGAATAAGAACGTAGGCGGCGTATCA
+GCGAGCCAAAACACAGCGCTTGAGACTTTCTATAAGCTAGTCGATCGCAAGCGCGAGGAA
+GATTACAGGCCGCTTCTTGAGTTCTTGTTGCCGTTCATTGTTGATGAGGAAGAGTGGTCG
+ATCGAGTTTGAGCCTTTGTCTGTTCCGAGTAAGAAAGAGGAATCAGAGATCACGAAGAAT
+AACGTTGAGTCAGTCACGAAGGCTATCACTGAGCAAATCATCGATCTGGAAGAAGCTCGC
+GACACGTTGCGATCCATTGCCCCTGAGTTCAAACTCAAGGATGGTAATAACATCAACATT
+CGCGAACCGGAAGAAACAACCGAACCGGAGCCGGGATTAGGGGAGAAGTTAGAAGATGAA
+AATTAA
+>NC_005833.1|ORF128 length 375 aa, 1125 bp, from 10741..11866[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGGTGACGGCTGGTTTTAAAATGTCAGGCGTTAAGGATGAAAAAGAGTTCAAGTCTTTA
+TGGGATAGCTACAAACTTGATTCAAGTCTGGTGGATCTTCTTTGTTGGGCACGACTTTAC
+GGTGGCGCGGCGATGGTGGCAATCATCAAAGACAACCGGATGTTAACCAGTCAGGCAAAG
+CCTGGAGCTAAACTTGAAGGCGTCCGAGTTTATGATCGATTTGCTATCACTGTTGAAAAG
+CGAGTCACCAATGCAAGATCTCCTCGCTATGGTGAGCCTGAAATTTACAAGGTATCCCCT
+GGCGACAATATGCAGCCGTACCTGATTCATCACTCAAGAGTCTTTATTGCTGATGGTGAA
+CGAGTGGCGCAACAGGCAAGAAAGCAGAATCAAGGATGGGGAGCTTCGGTATTGAATAAG
+TCACTGATTGATGCAATCTGTGACTATGATTACTGTGAATCTCTGGCTACTCAGATCTTG
+CGACGTAAGCAACAGGCTGTATGGAAGGTCAAAGGTCTTGCCGAAATGTGTGATGATGAT
+GATGCTCAGTATGCCGCGCGCCTGCGACTTGCTCAGGTAGATGATAACTCCGGCGTAGGC
+CGTGCGATCGGTATCGATGCTGAGACTGAGGAATATGACGTTCTCAACTCTGATATCAGC
+GGAGTCCCTGAGTTCTTATCAAGCAAGATGGACCGCATCGTCTCCCTATCCGGGATTCAT
+GAGATTATCATCAAGAATAAGAACGTAGGCGGCGTATCAGCGAGCCAAAACACAGCGCTT
+GAGACTTTCTATAAGCTAGTCGATCGCAAGCGCGAGGAAGATTACAGGCCGCTTCTTGAG
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+GTTCCGAGTAAGAAAGAGGAATCAGAGATCACGAAGAATAACGTTGAGTCAGTCACGAAG
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+>NC_005833.1|ORF214 length 265 aa, 795 bp, from 21625..22420[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+GCTGCTTCTGTTTTTAGATCTGTATCTTCCGGCGGGGCCGCTGTATCACTTGCTGCCGCA
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+>NC_005833.1|ORF225 length 135 aa, 405 bp, from 22015..22420[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF226 length 126 aa, 378 bp, from 22042..22420[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF227 length 125 aa, 375 bp, from 22045..22420[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF228 length 280 aa, 840 bp, from 22798..23638[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+TTGCGCGGGTTTTTTTGTAGCTGTAGAATGGTTGCAGGTAAACAAGAGGAAAAATCAATG
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+CAATTAACGGTGGCAAACATTGATAGTCGCGTATCTGCGATGATTCGTGCATATAACGGA
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+>NC_005833.1|ORF230 length 261 aa, 783 bp, from 22855..23638[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+TGA
+>NC_005833.1|ORF231 length 218 aa, 654 bp, from 22984..23638[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF232 length 202 aa, 606 bp, from 23032..23638[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGCAGGCCCAGCAAACTGGAACGCTACCGCCGAAGGAAATTACATTCCGTGGCGAGAAA
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+TATGTTGATAAAAGCGTTGCGCGGTTCGATCTCACATCACCTTACGATATGGACGGCATA
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+>NC_005833.1|ORF233 length 157 aa, 471 bp, from 23167..23638[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+GTGGCAAACATTGATAGTCGCGTATCTGCGATGATTCGTGCATATAACGGACTAATGCAA
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+>NC_005833.1|ORF234 length 147 aa, 441 bp, from 23197..23638[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF235 length 139 aa, 417 bp, from 23221..23638[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF236 length 135 aa, 405 bp, from 23233..23638[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF237 length 1173 aa, 3519 bp, from 25042..28561[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGATTCAAAAAGTGATAAGCGGATCTAAAGGTGGGTCACAGAAGCCTCATAACCCAGTT
+GAGATGGAGGACAATCTAATCTCAATCAACAAAATCAAGATCCTGTTAGCTGTATCTGAT
+GGTGAAATTGACGAAACATTCAGCCTGAAGCAGTTGATGTTTAACTCAGTCCCGGTGCAA
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+GTTACTACCGATAACCCATACACAATCTCAGTAACCAACAAAACGCTGTCGGCAATCCGT
+ATCAAAATGTTCATGCCTCGCGGCGTACGAATTGAAAGTAACGGTGATAAAAATGGCGTA
+AGAGTTGAGTATGAGGTGCAACAAGCTGTTGATGGCGGCTCGTTTGAGACGGTGCTCACC
+GATGTAATCGAAGGCAAAACAATGTCAGGTTACGATCGAAGCAGACGTGTAAACCTACCT
+AACTTCAACAATCAGGTGATATTCAGAGTGGTTCGGAAAACTCCAGACTCTAACGACTCG
+AACGTTGTTGACGCGATTCAGGTAAAGAGCTATGCCGAGGTGATTGATGCCAAATTCCGT
+TATCCGCTGACTGGTCTTCTTTTTGTCGAGTTTGATTCGAAGATGTTCCCAAACCAGTTA
+CCTACGATCTCAATTCGTAAGCGCTGGAAGATTGTAAACGTTCCGTCAAACTATGATCCA
+GAATCACGAACTTATAACGGAAATTGGGATGGAACTTTTAAGAAGGCATGGACGAATAAT
+CCGGCCTGGGTGCTTTATGACCTGATGATTAATCAGCGTTATGGCTTGGATCAGAAAGAG
+CTTGGTATCGCTGTAGATAAATGGGCGCTCTACGAGGCTGCGCAATATTGCGATCAGATG
+GTTCCTGATGGGAAGGGCGGGACGGAACCTCGATACCTTTGCGACGTGATAATCCAGTCT
+CAGACTGACGCTTACAAGGTTATCCGAGATATTTGCTCAATCTTTCGTGGTATGAGCTTT
+TGGAATGGTGAGAGCATTTCGGTAATCATCGACAGGCCGCGTGAACCTGCGTACATCTTC
+ACTAACGACAACGTTGTTAATGGTGACTTCTCCTACACGTTCGCAAGCGAAAAGAGCATG
+TACACGACGTGTAATGTGATGTTTGATGATGAACAAAACATGTATCAGCAGGACGTTGAG
+CCAGTATTCGATCGTGAGGCTACTCTACGGTTTGGGAACAACGTTACGAGCATTACAGCG
+ATCGGTTGCACACGTCGAAGCGAGGCCAACCGACGCGGGAGATGGATTCTGAAAACTAAC
+CTCCGCAGCACTACGGTAAACTTCGCTACCGGGCTTGAGGGCATGATCCCGACAATCGGA
+GATGTTGTGGCAATAGCTGATAACTTCTGGTCAAGTAACTTGACAATGAACCTGTCAGGG
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+GGTGACTTTATTATCGTAAATAAGCCAGATGGCAAGCCTGTGAAGCGCACAATCTCAAGT
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+AACACGGTATTCGCTATCGACCGCACCGACATTGCGTTACAGCAGTACGTCGTGACAAAA
+ATCGATAAGGGCGATGATGATGAGGAATTTACCTACAAAATAACGGCGGTGGAGTACGAT
+CCTAACAAGTATGATGAGATTGATTACGGAGTTAACATCGACGACCGACCGACGAGCATC
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+TTCTATGACGTCCAGTGGCGAAAGGATAACGGCAACTGGCAAAATGTACCGCAGACAGCA
+AACAAAGAGGTATACGTTGAAGGTATTTACGCTGGCAACTATCAGGTTCGCGTTCGCTCA
+GTCGCTGGTTCGGGCACGACTTCAGGCTGGTCAAATATCGTCGCGGCAACGTTGACGGGT
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+CAGTCACCGGATGGAACAGTGGATAACGCAAGTTTGCTTTCTTTGATTCCGTATCCGCAG
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+GTTGACAGGATCGGTAACGTGTCTCAGTGGACTGATTTTGTCAGAGGTATGGCATCAACA
+AACGTTGACGATATCATTGGGGAGATTTCTGTTGATATCGAAAACTCACCTGGTTACGAG
+TGGCTTGTTGATAACGCAACAGACAACGCGGCGCAGAACTCAGCTAACGCAGAGGCAGCA
+ATAGAAAACGCGCTCGCCAATGACAAAGACGCGATCTACATGAAGAAGGAGAACGGAAAA
+CGAAAAGCTGAGTACACGAAATCACTGAAACTTATTGCTGATGAGACGCAGGCACGAGTG
+ACGGCGATCGAGCAATTGAAGGCAAGTTTTGGCGATCAGATTAGCGCTAGCAACAGCGAG
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+>NC_005833.1|ORF275 length 542 aa, 1626 bp, from 26935..28561[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+ATGATCACGATTAACCTGTCAGATAAACAAGCGCGTGAAATACTAGACACTATCGGAGAA
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+>NC_005833.1|ORF314 length 254 aa, 762 bp, from 11855..12617[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGAAAATTAATGGCGTTGCAACACAGTGGCGCTATCCTGAAATGAGCGAGCGCGCAATG
+TCGCGCTCCCTACAGGATGTTGCAGCCAAACTAACTGAAAAAATGCGTGACGAATTAAAG
+CCGATGAAATTTGACGCTACCGACGAAGAGATAGATCAGACAGAGAGGTCATTGCTTGAT
+TACGTCGAATCACTCATCGCTCCGATTATTGGTTCTCTATCATCCGTTGCGCTCACGATC
+TATAAATTCAACTCTAAGCAGTGGCTGCGCATCGCTCGCAATGCTGGAGGTAAGAAGAAT
+CAAGCCGTGATGCTACTTGCCCTGATTGGTCCTACCGCTGCCGAAAGCTGGTACTCAGGA
+CAATATAATCTGTGGCGATCGCAGGTTGCTACTTCTATCAGGAAATTTGCCGCCAACATG
+GTTACTGATTTCACTGATAAACTTCGTGCGGCATCCGGTCAGGGTAAAAGCAAGGATTTT
+GTTGTTGAACTTGCTAAGGAGCGATTTGGTATTTACCGGAACTGGGCCAAAAATAGAGCG
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+ATGAGCGAGCGCGCAATGTCGCGCTCCCTACAGGATGTTGCAGCCAAACTAACTGAAAAA
+ATGCGTGACGAATTAAAGCCGATGAAATTTGACGCTACCGACGAAGAGATAGATCAGACA
+GAGAGGTCATTGCTTGATTACGTCGAATCACTCATCGCTCCGATTATTGGTTCTCTATCA
+TCCGTTGCGCTCACGATCTATAAATTCAACTCTAAGCAGTGGCTGCGCATCGCTCGCAAT
+GCTGGAGGTAAGAAGAATCAAGCCGTGATGCTACTTGCCCTGATTGGTCCTACCGCTGCC
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+AAATTTGCCGCCAACATGGTTACTGATTTCACTGATAAACTTCGTGCGGCATCCGGTCAG
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+>NC_005833.1|ORF338 length 168 aa, 504 bp, from 18254..18758[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF339 length 164 aa, 492 bp, from 18266..18758[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF340 length 134 aa, 402 bp, from 18356..18758[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF341 length 102 aa, 306 bp, from 18452..18758[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+ACCTTCGCGCACGAATTTGATAACCCGATCTACCCGATTCTGCGCAAGCTGGATTCGTCT
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+ATGAACATTAAAAAACAGATTGCATTACTTGGCGATGACTATATAAAGAGAACTCAGGAG
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+AAGACAATCATCTTCGCTATGGTGGCAAAGCAGTGTCAGAAAATGGGCTTAAAAATGCTT
+GTCCTGGCTCGTCAGGGTGAGATTGTCGATCAGGATAGCGAAGAGATCGACAACTTCGGG
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+GAGGGTAAGGAAACAATGGAACAAATGAGGGGCGAGAAAGGGAAAATTATCATGGACGGA
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+ACGATCGTAATCATGGAAATGATGCGGCGCTGTAAAAAGGTTCACGGTCACGATCTCAGA
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+AAAGCATTGGGATTCTGGCGTGAGCGAGTAACTGATATCGACACAAACTATCTGATTGAG
+TTCGGCTCTGTCGTTCCGACTATATTCGGATCAACAGACGGAGTTCATTACGATCTTGAT
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+AAAAAGGCAGAAGAACGCAATGCGGTCCTGATTACATGTGCTGGTGTGCGCCACTGCAAA
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+CAGGTAATGGCGCTCACTACTGGCGTTAACGTTCCAAATTGGGATTTCAGTGTCATACTC
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+AAATCCTGGCAGGTTGCTGAAGGAATGGTTAAGCAGGACCATCTGGTATGGGATTTTGCA
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+AGCTTCTATGCTCGACGATGCGTTAATGTCATTGATGGTGAGCGTTGCGATCATTTCTGG
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+>NC_005833.1|ORF363 length 605 aa, 1815 bp, from 36728..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+GAGATTGTCGATCAGGATAGCGAAGAGATCGACAACTTCGGGGTAACGAACTCCATCTTC
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+>NC_005833.1|ORF378 length 382 aa, 1146 bp, from 37397..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+ATGCAAATGGTCGCCAAAAAGGCAGAAGAACGCAATGCGGTCCTGATTACATGTGCTGGT
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+ATCTCACGCAAAGACTTCGGTATGGAGGATATCCCGGAATGA
+>NC_005833.1|ORF383 length 336 aa, 1008 bp, from 37535..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+AAATACACTCTGATTAACGACGATGGTGATGAGTTCAAGGCGTATGAAAAATTCTTCCCC
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+GATATCATCTCACGCAAAGACTTCGGTATGGAGGATATCCCGGAATGA
+>NC_005833.1|ORF384 length 289 aa, 867 bp, from 37676..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+ATGGCGCTCACTACTGGCGTTAACGTTCCAAATTGGGATTTCAGTGTCATACTCCGCAAG
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+>NC_005833.1|ORF385 length 263 aa, 789 bp, from 37754..38543[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF403 length 429 aa, 1287 bp, from 44516..45803[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+>NC_005833.1|ORF404 length 423 aa, 1269 bp, from 44516..45785[-1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+++ b/test-data/usp/_putative_usp.fa	Fri Sep 20 05:02:00 2024 +0000
@@ -0,0 +1,4 @@
+>NC_005833.1|ORF394 length 134 aa, 402 bp, from 43580..43982[1] of NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
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+REVKVSDSNIGKIDSSVKKSVEVSTIQANTVNAESITVTKSGSWYDPVVCWILVFIVLLL
+FYFLIRKHEKKEA
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@@ -0,0 +1,2 @@
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+ORF394	cpt.py|putative-*.py	CDS	43580	43982	.	+	.	MKLKKTCIAITVAVGVISLSGCSTASALSGLLSDSPDVTAQVGAENTKQLAGVTAKADDKREVKVSDSNIGKIDSSVKKSVEVSTIQANTVNAESITVTKSGSWYDPVVCWILVFIVLLLFYFLIRKHEKKEA;Alias=usp
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/usp/_summary_usp.txt	Fri Sep 20 05:02:00 2024 +0000
@@ -0,0 +1,5 @@
+total potential u-spanins: 1
+average length (AA): 134.0
+median length (AA): 134
+maximum orf in size (AA): 134
+minimum orf in size (AA): 134
\ No newline at end of file
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/usp/t1.fa	Fri Sep 20 05:02:00 2024 +0000
@@ -0,0 +1,699 @@
+>NC_005833.1 Enterobacteria phage T1, complete genome
+GTTGCATGGTGTGCAACTGTTGATGTGATTGTTGCTTAGAATGCAATGATTGTGAGAGGGGGGATCTAGT
+GTTACCAGGTTCGCCTGGTAGTCATCTCCATTTTTAGCAAAAAGTGCTATCGATTACGATTACGCTTGAT
+TGCGTGTTAATCATTGTATATGATTTGCCTAAATCGCAATCGTATACAAAATTACGCCAAATTACGCCTT
+ATAATATACATATAGATATATGTATATATATAATATATAAGTGTTTTTTTTATTTATATATATAGATACT
+ATTATTTGTAATATGGTTGTATAGCGTGTCTTTTATGTTAATCGTTGGATGCTCTGATTATGATGCTCAT
+GTTTATATATACAGTAGTTTTATCGGCGCATATTTATTTAGGGAAATCGATTAACACGATTAACACGATT
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