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date | Fri, 13 May 2022 05:26:10 +0000 |
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##gff-version 3 Pipo GenBank gene 258 566 . + 1 ID=CPT_Pipo_001;Name=CPT_Pipo_001; Pipo GenBank mRNA 273 566 . + 1 ID=CPT_Pipo_001.t01;Parent=CPT_Pipo_001; Pipo GenBank CDS 273 566 . + 1 ID=CPT_Pipo_001.p01;Name=CPT_Pipo_001;Note=detected two transmembrane domains,8782901 HHPR;Parent=CPT_Pipo_001.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 273 566 . + 1 Parent=CPT_Pipo_001.t01; Pipo GenBank RBS 258 261 . + 1 Name=CPT_Pipo_001;Parent=CPT_Pipo_001; Pipo GenBank gene 841 1031 . + 1 ID=CPT_Pipo_002;Name=CPT_Pipo_002; Pipo GenBank mRNA 852 1031 . + 1 ID=CPT_Pipo_002.t01;Parent=CPT_Pipo_002; Pipo GenBank CDS 852 1031 . + 1 ID=CPT_Pipo_002.p01;Name=CPT_Pipo_002;Note=4.9466e-34 [Acinetobacter phage vB_ApiP_P1];Parent=CPT_Pipo_002.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 852 1031 . + 1 Parent=CPT_Pipo_002.t01; Pipo GenBank RBS 841 844 . + 1 Name=CPT_Pipo_002;Parent=CPT_Pipo_002; Pipo GenBank gene 1090 1303 . + 1 ID=CPT_Pipo_003;Name=CPT_Pipo_003; Pipo GenBank mRNA 1100 1303 . + 1 ID=CPT_Pipo_003.t01;Parent=CPT_Pipo_003; 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Pipo GenBank mRNA 14805 15038 . + 1 ID=CPT_Pipo_031.t01;Parent=CPT_Pipo_031; Pipo GenBank CDS 14805 15038 . + 1 ID=CPT_Pipo_031.p01;Name=CPT_Pipo_031;Note=1.07353e-42 [Acinetobacter phage Fri1];Parent=CPT_Pipo_031.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 14805 15038 . + 1 Parent=CPT_Pipo_031.t01; Pipo GenBank RBS 14794 14796 . + 1 Name=CPT_Pipo_031;Parent=CPT_Pipo_031; Pipo GenBank gene 15023 15925 . + 1 ID=CPT_Pipo_032;Name=CPT_Pipo_032; Pipo GenBank mRNA 15035 15925 . + 1 ID=CPT_Pipo_032.t01;Parent=CPT_Pipo_032; Pipo GenBank CDS 15035 15925 . + 1 ID=CPT_Pipo_032.p01;Name=CPT_Pipo_032;Note=1.95456e-38 [phiKMVp21],contains membrane domain in the extracellular region.;Parent=CPT_Pipo_032.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 15035 15925 . + 1 Parent=CPT_Pipo_032.t01; Pipo GenBank RBS 15023 15027 . + 1 Name=CPT_Pipo_032;Parent=CPT_Pipo_032; Pipo GenBank gene 15972 16101 . + 1 ID=CPT_Pipo_033;Name=CPT_Pipo_033; Pipo GenBank mRNA 15982 16101 . + 1 ID=CPT_Pipo_033.t01;Parent=CPT_Pipo_033; Pipo GenBank CDS 15982 16101 . + 1 ID=CPT_Pipo_033.p01;Name=CPT_Pipo_033;Note=3.59438e-20 [Acinetobacter phage Abp1],PubMed: 24153188,hhpred ID: 9162599 HHPR,potential ATPase-dependent domain;Parent=CPT_Pipo_033.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 15982 16101 . + 1 Parent=CPT_Pipo_033.t01; Pipo GenBank RBS 15972 15976 . + 1 Name=CPT_Pipo_033;Parent=CPT_Pipo_033; Pipo GenBank gene 16123 17087 . + 1 ID=CPT_Pipo_034;Name=CPT_Pipo_034; Pipo GenBank mRNA 16134 17087 . + 1 ID=CPT_Pipo_034.t01;Parent=CPT_Pipo_034; Pipo GenBank CDS 16134 17087 . + 1 ID=CPT_Pipo_034.p01;Name=CPT_Pipo_034;Note=1.21811e-55 [phiKMVp22 protein];Parent=CPT_Pipo_034.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 16134 17087 . + 1 Parent=CPT_Pipo_034.t01; Pipo GenBank RBS 16123 16126 . + 1 Name=CPT_Pipo_034;Parent=CPT_Pipo_034; Pipo GenBank gene 17064 17646 . + 1 ID=CPT_Pipo_035;Name=CPT_Pipo_035; Pipo GenBank mRNA 17077 17646 . + 1 ID=CPT_Pipo_035.t01;Parent=CPT_Pipo_035; Pipo GenBank CDS 17077 17646 . + 1 ID=CPT_Pipo_035.p01;Name=CPT_Pipo_035;Note=1.49572e-124 [Acinetobacter phage vB_AbaP_B09_Aci08],hhpred ID: 9993830 HHPR hits: 3H38_A%2C 1MIW_A%2C 3AQL_B,potential putative tRNA nucleotidyl transferase-related protein;Parent=CPT_Pipo_035.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 17077 17646 . + 1 Parent=CPT_Pipo_035.t01; Pipo GenBank RBS 17064 17067 . + 1 Name=CPT_Pipo_035;Parent=CPT_Pipo_035; Pipo GenBank gene 17630 18083 . + 1 ID=CPT_Pipo_036;Name=CPT_Pipo_036; Pipo GenBank mRNA 17643 18083 . + 1 ID=CPT_Pipo_036.t01;Parent=CPT_Pipo_036; Pipo GenBank CDS 17643 18083 . + 1 ID=CPT_Pipo_036.p01;Name=CPT_Pipo_036;Note=6.07803e-35,NP_877462.1[Pseudomonas phage phiKMV],IPR004211;Parent=CPT_Pipo_036.t01;product=putative DNA endonuclease VII; Pipo GenBank exon 17643 18083 . + 1 Parent=CPT_Pipo_036.t01; Pipo GenBank RBS 17630 17632 . + 1 Name=CPT_Pipo_036;Parent=CPT_Pipo_036; Pipo GenBank gene 18074 19022 . + 1 ID=CPT_Pipo_037;Name=CPT_Pipo_037; Pipo GenBank mRNA 18087 19022 . + 1 ID=CPT_Pipo_037.t01;Parent=CPT_Pipo_037; Pipo GenBank CDS 18087 19022 . + 1 ID=CPT_Pipo_037.p01;Name=CPT_Pipo_037;Note=InterPro:IPR004843,Metallo-dependent phosphatase-like;Parent=CPT_Pipo_037.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 18087 19022 . + 1 Parent=CPT_Pipo_037.t01; Pipo GenBank RBS 18074 18077 . + 1 Name=CPT_Pipo_037;Parent=CPT_Pipo_037; Pipo GenBank gene 19007 19672 . + 1 ID=CPT_Pipo_038;Name=CPT_Pipo_038; Pipo GenBank mRNA 19022 19672 . + 1 ID=CPT_Pipo_038.t01;Parent=CPT_Pipo_038; Pipo GenBank CDS 19022 19672 . + 1 ID=CPT_Pipo_038.p01;Name=CPT_Pipo_038;Note=2.64031e-7,NP_944963.1,InterPro:IPR027417;Parent=CPT_Pipo_038.t01;product=deoxynucleotide monophosphate kinase; Pipo GenBank exon 19022 19672 . + 1 Parent=CPT_Pipo_038.t01; Pipo GenBank RBS 19007 19011 . + 1 Name=CPT_Pipo_038;Parent=CPT_Pipo_038; Pipo GenBank gene 19671 22098 . + 1 ID=CPT_Pipo_039;Name=CPT_Pipo_039; Pipo GenBank mRNA 19681 22098 . + 1 ID=CPT_Pipo_039.t01;Parent=CPT_Pipo_039; Pipo GenBank CDS 19681 22098 . + 1 ID=CPT_Pipo_039.p01;Name=CPT_Pipo_039;Note=3.40462e-76 NP_041960.1,IPR002092,T7-like RNA polymerase;Parent=CPT_Pipo_039.t01;product=RNA polymerase; Pipo GenBank exon 19681 22098 . + 1 Parent=CPT_Pipo_039.t01; Pipo GenBank RBS 19671 19675 . + 1 Name=CPT_Pipo_039;Parent=CPT_Pipo_039; Pipo GenBank gene 22190 22399 . + 1 ID=CPT_Pipo_040;Name=CPT_Pipo_040; Pipo GenBank mRNA 22202 22399 . + 1 ID=CPT_Pipo_040.t01;Parent=CPT_Pipo_040; Pipo GenBank CDS 22202 22399 . + 1 ID=CPT_Pipo_040.p01;Name=CPT_Pipo_040;Note=1.62918e-40 [Acinetobacter phage vB_AbaP_AS11];Parent=CPT_Pipo_040.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 22202 22399 . + 1 Parent=CPT_Pipo_040.t01; Pipo GenBank RBS 22190 22194 . + 1 Name=CPT_Pipo_040;Parent=CPT_Pipo_040; Pipo GenBank gene 22383 22647 . + 1 ID=CPT_Pipo_041;Name=CPT_Pipo_041; Pipo GenBank mRNA 22396 22647 . + 1 ID=CPT_Pipo_041.t01;Parent=CPT_Pipo_041; Pipo GenBank CDS 22396 22647 . + 1 ID=CPT_Pipo_041.p01;Name=CPT_Pipo_041;Note=6.15327e-54 blast to [Acinetobacter phage vB_AbaP_B09_Aci08];Parent=CPT_Pipo_041.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 22396 22647 . + 1 Parent=CPT_Pipo_041.t01; Pipo GenBank RBS 22383 22387 . + 1 Name=CPT_Pipo_041;Parent=CPT_Pipo_041; Pipo GenBank gene 22646 24212 . + 1 ID=CPT_Pipo_042;Name=CPT_Pipo_042; Pipo GenBank mRNA 22656 24212 . + 1 ID=CPT_Pipo_042.t01;Parent=CPT_Pipo_042; Pipo GenBank CDS 22656 24212 . + 1 ID=CPT_Pipo_042.p01;Name=CPT_Pipo_042;Note=InterPro:IPR020991,2.31306e-51 NP_041995.1[bacteriophage T7];Parent=CPT_Pipo_042.t01;product=head-tail connector protein; Pipo GenBank exon 22656 24212 . + 1 Parent=CPT_Pipo_042.t01; Pipo GenBank RBS 22646 22650 . + 1 Name=CPT_Pipo_042;Parent=CPT_Pipo_042; Pipo GenBank gene 24211 25081 . + 1 ID=CPT_Pipo_043;Name=CPT_Pipo_043; Pipo GenBank mRNA 24221 25081 . + 1 ID=CPT_Pipo_043.t01;Parent=CPT_Pipo_043; Pipo GenBank CDS 24221 25081 . + 1 ID=CPT_Pipo_043.p01;Name=CPT_Pipo_043;Note=score%3D0 blast to [Acinetobacter phage vB_AbaP_B3];Parent=CPT_Pipo_043.t01;product=putative scaffolding protein; Pipo GenBank exon 24221 25081 . + 1 Parent=CPT_Pipo_043.t01; Pipo GenBank RBS 24211 24215 . + 1 Name=CPT_Pipo_043;Parent=CPT_Pipo_043; Pipo GenBank gene 25083 26128 . + 1 ID=CPT_Pipo_044;Name=CPT_Pipo_044; Pipo GenBank mRNA 25097 26128 . + 1 ID=CPT_Pipo_044.t01;Parent=CPT_Pipo_044; Pipo GenBank CDS 25097 26128 . + 1 ID=CPT_Pipo_044.p01;Name=CPT_Pipo_044;Note=1.92669e-49 NP_877471.1 [phiKMV] PMID: 16436440,Q7Y2D3;Parent=CPT_Pipo_044.t01;product=major capsid protein; Pipo GenBank exon 25097 26128 . + 1 Parent=CPT_Pipo_044.t01; Pipo GenBank RBS 25083 25087 . + 1 Name=CPT_Pipo_044;Parent=CPT_Pipo_044; Pipo GenBank gene 26170 26369 . + 1 ID=CPT_Pipo_045;Name=CPT_Pipo_045; Pipo GenBank mRNA 26184 26369 . + 1 ID=CPT_Pipo_045.t01;Parent=CPT_Pipo_045; Pipo GenBank CDS 26184 26369 . + 1 ID=CPT_Pipo_045.p01;Name=CPT_Pipo_045;Note=detected coil segment,PMID: 20816983,hhpred ID: 1724640 HHPR pdb: 2XDJ;Parent=CPT_Pipo_045.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 26184 26369 . + 1 Parent=CPT_Pipo_045.t01; Pipo GenBank RBS 26170 26174 . + 1 Name=CPT_Pipo_045;Parent=CPT_Pipo_045; Pipo GenBank gene 26371 26674 . + 1 ID=CPT_Pipo_046;Name=CPT_Pipo_046; Pipo GenBank mRNA 26381 26674 . + 1 ID=CPT_Pipo_046.t01;Parent=CPT_Pipo_046; Pipo GenBank CDS 26381 26674 . + 1 ID=CPT_Pipo_046.p01;Name=CPT_Pipo_046;Note=potential tail needle. hhpred ID number: 3392758 HHPR pdb hit: 4ZXQ,PMID: 26574546;Parent=CPT_Pipo_046.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 26381 26674 . + 1 Parent=CPT_Pipo_046.t01; Pipo GenBank RBS 26371 26375 . + 1 Name=CPT_Pipo_046;Parent=CPT_Pipo_046; Pipo GenBank gene 26730 27372 . + 1 ID=CPT_Pipo_047;Name=CPT_Pipo_047; Pipo GenBank mRNA 26746 27372 . + 1 ID=CPT_Pipo_047.t01;Parent=CPT_Pipo_047; Pipo GenBank CDS 26746 27372 . + 1 ID=CPT_Pipo_047.p01;Name=CPT_Pipo_047;Note=InterPro:IPR033767 tail tubular protein gp11,1.20181e-16 NP_877472.1;Parent=CPT_Pipo_047.t01;product=tail tubular protein A; Pipo GenBank exon 26746 27372 . + 1 Parent=CPT_Pipo_047.t01; Pipo GenBank RBS 26730 26733 . + 1 Name=CPT_Pipo_047;Parent=CPT_Pipo_047; Pipo GenBank gene 27371 29672 . + 1 ID=CPT_Pipo_048;Name=CPT_Pipo_048; Pipo GenBank mRNA 27381 29672 . + 1 ID=CPT_Pipo_048.t01;Parent=CPT_Pipo_048; Pipo GenBank CDS 27381 29672 . + 1 ID=CPT_Pipo_048.p01;Name=CPT_Pipo_048;Note=7.22201e-87 phiKMV;Parent=CPT_Pipo_048.t01;product=tail tubular protein B; Pipo GenBank exon 27381 29672 . + 1 Parent=CPT_Pipo_048.t01; Pipo GenBank RBS 27371 27375 . + 1 Name=CPT_Pipo_048;Parent=CPT_Pipo_048; Pipo GenBank gene 29659 30343 . + 1 ID=CPT_Pipo_049;Name=CPT_Pipo_049; Pipo GenBank mRNA 29672 30343 . + 1 ID=CPT_Pipo_049.t01;Parent=CPT_Pipo_049; Pipo GenBank CDS 29672 30343 . + 1 ID=CPT_Pipo_049.p01;Name=CPT_Pipo_049;Note=7.47139e-159 [Acinetobacter phage IME200];Parent=CPT_Pipo_049.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 29672 30343 . + 1 Parent=CPT_Pipo_049.t01; Pipo GenBank RBS 29659 29662 . + 1 Name=CPT_Pipo_049;Parent=CPT_Pipo_049; Pipo GenBank gene 30347 33241 . + 1 ID=CPT_Pipo_050;Name=CPT_Pipo_050; Pipo GenBank mRNA 30356 33241 . + 1 ID=CPT_Pipo_050.t01;Parent=CPT_Pipo_050; Pipo GenBank CDS 30356 33241 . + 1 ID=CPT_Pipo_050.p01;Name=CPT_Pipo_050;Note=1.5824e-89 [Acinetobacter phage AB3];Parent=CPT_Pipo_050.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 30356 33241 . + 1 Parent=CPT_Pipo_050.t01; Pipo GenBank RBS 30347 30351 . + 1 Name=CPT_Pipo_050;Parent=CPT_Pipo_050; Pipo GenBank gene 33240 36349 . + 1 ID=CPT_Pipo_051;Name=CPT_Pipo_051; Pipo GenBank mRNA 33251 36349 . + 1 ID=CPT_Pipo_051.t01;Parent=CPT_Pipo_051; Pipo GenBank CDS 33251 36349 . + 1 ID=CPT_Pipo_051.p01;Name=CPT_Pipo_051;Note=putative membrane protein,blast to phiKMV with score %3D7.0935e-9;Parent=CPT_Pipo_051.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 33251 36349 . + 1 Parent=CPT_Pipo_051.t01; Pipo GenBank RBS 33240 33245 . + 1 Name=CPT_Pipo_051;Parent=CPT_Pipo_051; Pipo GenBank gene 36341 38392 . + 1 ID=CPT_Pipo_052;Name=CPT_Pipo_052; Pipo GenBank mRNA 36356 38392 . + 1 ID=CPT_Pipo_052.t01;Parent=CPT_Pipo_052; Pipo GenBank CDS 36356 38392 . + 1 ID=CPT_Pipo_052.p01;Name=CPT_Pipo_052;Note=potential tail fiber/tail spike,5924656 HHPR hit 5JS4_C%3B 6EU4_C%3B 5W5P (To be published by Leiman),PMID: 28209973;Parent=CPT_Pipo_052.t01;product=tailspike protein; Pipo GenBank exon 36356 38392 . + 1 Parent=CPT_Pipo_052.t01; Pipo GenBank RBS 36341 36344 . + 1 Name=CPT_Pipo_052;Parent=CPT_Pipo_052; Pipo GenBank gene 38392 38737 . + 1 ID=CPT_Pipo_053;Name=CPT_Pipo_053; Pipo GenBank mRNA 38402 38737 . + 1 ID=CPT_Pipo_053.t01;Parent=CPT_Pipo_053; Pipo GenBank CDS 38402 38737 . + 1 ID=CPT_Pipo_053.p01;Name=CPT_Pipo_053;Note=7.76278e-74,IPR006481,detected three transmembrane domains;Parent=CPT_Pipo_053.t01;product=holin; Pipo GenBank exon 38402 38737 . + 1 Parent=CPT_Pipo_053.t01; Pipo GenBank RBS 38392 38396 . + 1 Name=CPT_Pipo_053;Parent=CPT_Pipo_053; Pipo GenBank gene 38715 39281 . + 1 ID=CPT_Pipo_054;Name=CPT_Pipo_054; Pipo GenBank mRNA 38724 39281 . + 1 ID=CPT_Pipo_054.t01;Parent=CPT_Pipo_054; Pipo GenBank CDS 38724 39281 . + 1 ID=CPT_Pipo_054.p01;Name=CPT_Pipo_054;Note=IPR023346 1.63e-19,Random endo-hydrolysis of N-acetyl-beta-D-glucosaminide (1->4)-beta-linkages in chitin and chitodextrins.;Parent=CPT_Pipo_054.t01;product=endolysin; Pipo GenBank exon 38724 39281 . + 1 Parent=CPT_Pipo_054.t01; Pipo GenBank RBS 38715 38718 . + 1 Name=CPT_Pipo_054;Parent=CPT_Pipo_054; Pipo GenBank gene 39280 39598 . + 1 ID=CPT_Pipo_055;Name=CPT_Pipo_055; Pipo GenBank mRNA 39290 39598 . + 1 ID=CPT_Pipo_055.t01;Parent=CPT_Pipo_055; Pipo GenBank CDS 39290 39598 . + 1 ID=CPT_Pipo_055.p01;Name=CPT_Pipo_055;Note=1.10536e-8 [phiKMV];Parent=CPT_Pipo_055.t01;product=hypothetical protein; 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Pipo GenBank gene 41624 41839 . + 1 ID=CPT_Pipo_058;Name=CPT_Pipo_058; Pipo GenBank mRNA 41636 41839 . + 1 ID=CPT_Pipo_058.t01;Parent=CPT_Pipo_058; Pipo GenBank CDS 41636 41839 . + 1 ID=CPT_Pipo_058.p01;Name=CPT_Pipo_058;Note=1.12427e-36,Acinetobacter phage vB_AbaP_B5;Parent=CPT_Pipo_058.t01;product=hypothetical protein; Pipo GenBank exon 41636 41839 . + 1 Parent=CPT_Pipo_058.t01; Pipo GenBank RBS 41624 41628 . + 1 Name=CPT_Pipo_058;Parent=CPT_Pipo_058;