# HG changeset patch # User cristian # Date 1650356923 0 # Node ID f7287f82602f8c499b72271e004be4e646ca7012 # Parent 91261b42c07e12e18f6f6c13988e30e9c6bf963f "planemo upload commit 486235d6560c9e95bd42152ad19bf7c3941cdc1b" diff -r 91261b42c07e -r f7287f82602f GO_MWU.R --- a/GO_MWU.R Thu Apr 14 13:28:05 2022 +0000 +++ b/GO_MWU.R Tue Apr 19 08:28:43 2022 +0000 @@ -120,6 +120,17 @@ source_local("gomwu.functions.R") + +nn <- strsplit(opt$input, "[/.]") +if (length(nn[[1]]) == 3) { + dir <- nn[[1]][1] + name <- nn[[1]][2] + ext <- nn[[1]][3] +} else if (length(nn[[1]]) == 2) { + dir <- "." + name <- nn[[1]][1] + ext <- nn[[1]][2] +} # It might take a few minutes for MF and BP. Do not rerun it if you just want # to replot the data with different cutoffs, go straight to gomwuPlot. If you # change any of the numeric values below, delete the files that were generated @@ -145,7 +156,7 @@ # ----------- Plotting results # change this to a pdf output -pdf() +pdf(paste0(dir,"/","Rplots.pdf")) results <- gomwuPlot(opt$input, opt$goAnnotations, opt$goDivision, # genes with the measure value exceeding this will be counted as "good genes". @@ -168,7 +179,7 @@ # if there are too many categories displayed, try make it more stringent with level1 = 0.05,level2=0.01,level3=0.001. # text representation of results, with actual adjusted p-values -write.table(results[[1]], "results.tsv", sep = "\t") +write.table(results[[1]], paste0(dir, "/", "results.tsv"), sep = "\t") # ------- extracting representative GOs @@ -212,7 +223,7 @@ } } -mwus <- read.table(paste("MWU", opt$goDivision, opt$input, sep = "_"), header = T) +mwus <- read.table(paste0(dir,"/",paste("MWU", opt$goDivision, name, sep = "_"), ".", ext), header = T) best_GOs <- mwus[mwus$name %in% annots, ] -write.table(best_GOs, "best_go.tsv", sep = "\t") +write.table(best_GOs, paste0(dir, "/","best_go.tsv"), sep = "\t") dev.off() diff -r 91261b42c07e -r f7287f82602f RBGOA.xml --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/RBGOA.xml Tue Apr 19 08:28:43 2022 +0000 @@ -0,0 +1,116 @@ + + "Rank Based Gene Ontology Analysis" + + r-ape + r-getopt + + Rscript GO_MWU.R -v + + + + + + + + + +
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process" 0.740229279465042 +-826 0.0589131672132562 5 25 "GO:0009116;GO:1901657" "nucleoside metabolic process" 0.190390113555035 +-658 0.000169872729510334 5 159 "GO:0009117;GO:0006753;GO:0055086" "nucleobase-containing small molecule metabolic process" 0.00264801607766109 +-1233 0.0419705780106553 2 13 "GO:0009148;GO:0009147;GO:0006183;GO:0046039;GO:1901070;GO:1901068;GO:0006228;GO:0009209;GO:0009220;GO:0046051;GO:0009208;GO:0009218;GO:0006241;GO:0046036" "pyrimidine nucleoside triphosphate metabolic process" 0.158888616754624 +-878 0.000107713754652745 3 94 "GO:0009150;GO:0006163;GO:0009259;GO:0072521;GO:0019693" "purine-containing compound metabolic process" 0.0020388674987841 +-100 0.918424767410114 4 5 "GO:0009166;GO:1901292;GO:0034655" "nucleoside phosphate catabolic process" 0.947535148358189 +605 0.300780198504543 6 14 "GO:0009190;GO:0009187" "cyclic nucleotide metabolic process" 0.514237113572283 +-809 0.327395667499449 5 7 "GO:0009225" "nucleotide-sugar metabolic process" 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process" 0.00793295622470059 +-74 0.914616120700368 4 10 "GO:0019751;GO:0006066" "alcohol metabolic process" 0.947535148358189 +-425 0.00666230433742404 3 200 "GO:0019752;GO:0043436;GO:0006082" "organic acid metabolic process" 0.0495553839016374 +-1299 0.0213340700195007 3 15 "GO:0022904;GO:0022900" "respiratory electron transport chain" 0.108721702983994 +138 0.306756584162427 6 270 "GO:0030001" "metal ion transport" 0.520596595522829 +208 0.77531711451507 2 9 "GO:0030036;GO:0030029" "actin cytoskeleton organization" 0.870589132824125 +-241 0.691179299365759 3 13 "GO:0030154;GO:0048869" "cell differentiation" 0.82135656651088 +-517 0.0133084412523018 3 111 "GO:0030163;GO:0043248" "protein catabolic process" 0.0864933796794997 +604 0.269186783029441 3 16 "GO:0030258" "lipid modification" 0.469305904623696 +530 0.0299259383416497 3 81 "GO:0031214;GO:0009888;GO:0110148" "biomineral tissue development" 0.129127425649056 +440 3.23901055381702e-05 1 452 "GO:0032501" "multicellular 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molecule metabolic process" 0.00764176702898063 +-377 0.0772274233355341 3 106 "GO:0044283" "small molecule biosynthetic process" 0.216670236097804 +208 0.0504554194395585 2 447 "GO:0045087;GO:0006955;GO:0002376;GO:0098542;GO:0006952;GO:0051707;GO:0043207;GO:0044419;GO:0009605;GO:0009607" "defense response" 0.173645274694584 +112 0.899923092827386 2 6 "GO:0045454" "cell redox homeostasis" 0.947535148358189 +1549 4.5604692372625e-06 6 42 "GO:0045824;GO:0002832;GO:0031348;GO:0032102;GO:0045088;GO:0050777;GO:0002831;GO:0048585;GO:0031347;GO:0032101;GO:0002683;GO:0080134" "negative regulation of innate immune response" 0.000134280483097174 +-884 0.000885976633591531 2 68 "GO:0046034" "ATP metabolic process" 0.00903014645775983 +1 0.998901520474908 2 8 "GO:0046112;GO:0009112" "nucleobase metabolic process" 0.998901520474908 +-1281 0.0156908584305704 3 17 "GO:0046129;GO:0046128;GO:0042451;GO:0042455;GO:0009119;GO:0042278;GO:0009163;GO:1901659" "nucleoside biosynthetic process" 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process" GO:0009117;GO:0006753;GO:0055086 5 isogroup6730 -2.6 +"nucleobase-containing small molecule metabolic process" GO:0009117;GO:0006753;GO:0055086 5 isogroup6778 0.1 +"nucleobase-containing small molecule metabolic process" GO:0009117;GO:0006753;GO:0055086 5 isogroup6843 -0.4 +"nucleobase-containing small molecule metabolic process" GO:0009117;GO:0006753;GO:0055086 5 isogroup7019 -6.5 +"nucleobase-containing small molecule metabolic process" GO:0009117;GO:0006753;GO:0055086 5 isogroup703 2.7 +"nucleobase-containing small molecule metabolic process" GO:0009117;GO:0006753;GO:0055086 5 isogroup7069 -0.4 +"nucleobase-containing small molecule metabolic process" GO:0009117;GO:0006753;GO:0055086 5 isogroup7129 -4.2 +"nucleobase-containing small molecule metabolic process" GO:0009117;GO:0006753;GO:0055086 5 isogroup7399 2.9 +"nucleobase-containing small molecule metabolic process" GO:0009117;GO:0006753;GO:0055086 5 isogroup7767 0 +"nucleobase-containing small molecule metabolic process" 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stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup30035 0.1 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup32208 0.1 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup33725 0.7 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup34870 0.5 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup3719 -0.1 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup37368 0 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup375 0 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup3849 0.1 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup39332 0.4 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup39846 1.2 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup40309 0.1 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup40748 -0.2 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup41233 -0.9 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup4187 1.7 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup42138 -0.5 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup42496 -0.6 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup43415 -0.9 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup45053 1.6 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isogroup8333 1.2 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup8623 1.4 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup8676 -0.1 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup9075 -0.3 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup9195 -1 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup9587 4.3 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 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stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup17564 0.2 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup18327 0.3 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup18828 0.7 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup18866 2.4 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup1913 1 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup19828 -0.7 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup2203 0.8 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup23125 -10 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup23212 1.4 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup23900 0 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup23943 -2.6 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup25110 0.5 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stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup40589 0.4 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup4367 -3.5 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup46214 0 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup4721 -0.4 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup4804 1.3 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup5430 0 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup5875 0.5 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup6015 0.3 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup622 2.6 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup670 0.3 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup7194 0.9 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup7226 -0.2 +"regulation of response 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to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup16719 1.5 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup18239 0.5 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup18361 0.7 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup19739 0.6 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup31634 2.4 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup3218 0.3 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup3749 0.1 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup37581 1.5 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup40242 0.3 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup8532 2.9 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup10819 5.5 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup13802 0.1 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stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup45684 1.4 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup5491 0.1 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup5670 4.5 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup6739 0.1 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup8336 0.5 +"regulation of response to stimulus" GO:0001867;GO:0006956;GO:0002252;GO:0002253;GO:0050778;GO:0002684;GO:0048584;GO:0050776;GO:0002682;GO:0048583 5 isogroup9617 0 +"regulation of response to 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communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup16388 0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup1647 -0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup16534 0 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup1781 0.4 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup17954 0.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup18051 0.2 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup18139 -0.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup1884 -1.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup19079 0.7 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup1916 1.5 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup19260 0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup1939 0.7 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup2070 -0.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup2082 0.2 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup2116 0 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup2138 1.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup2235 0.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup2335 1.7 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup2393 1.6 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup24430 -1.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup2504 -1.4 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup25566 1.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup25728 -0.5 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup2630 -0.5 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup26393 0.6 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup27364 0 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup276 -0.2 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup2795 0.4 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup2797 -0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup28404 -0.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup29000 -1.5 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup2971 0.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup30889 -0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup31525 0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup3280 0 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup3340 0 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup33674 1.2 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup33739 0.4 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup34531 0.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup3512 0.4 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup35514 0 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup3558 0.4 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup3563 -0.4 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup35873 1.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup36089 1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup36436 1.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup3662 -6.4 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup3678 0.8 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup37072 0.5 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup37299 0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup381 2.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup38615 -0.2 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup39675 -0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup39976 0.5 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup41009 0 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup41458 0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup4213 0.2 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup42294 1.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup43516 0.2 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup43548 0.5 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup44728 -0.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup4537 0.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup4617 -0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup4626 2.7 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup46295 0.6 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup46517 0.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup4658 -0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup4710 -1.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup4963 -0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup4984 0.9 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup4988 -1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup5185 -0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup5506 0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup5562 -0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup5623 1.9 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup5702 -1.2 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup5718 -8.4 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup573 0.8 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup5741 0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup5825 0.9 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup6097 0 +"regulation of cell 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communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup845 -0.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup8460 1.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup8465 2.2 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup8717 -1.3 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup8762 1.6 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup8982 0.1 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup9096 0.4 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup9404 0 +"regulation of cell communication" GO:0048167;GO:0050804;GO:0099177;GO:0010646;GO:0023051 4 isogroup9569 0.6 +"regulation of cell 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