Mercurial > repos > dcouvin > pmlst_v2
diff pmlst/pmlst_db/inchi1.fsa @ 0:cfab64885f66 draft default tip
Uploaded
author | dcouvin |
---|---|
date | Mon, 06 Sep 2021 18:27:45 +0000 |
parents | |
children |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/pmlst/pmlst_db/inchi1.fsa Mon Sep 06 18:27:45 2021 +0000 @@ -0,0 +1,189 @@ +>HCM1_043_1 +GGCTGCTGAAGGCGCGTTGCAGAATGGCCAGCCCGTCCGCTATCTGGAAACCAAAGAAAG +CTCTCCGTATCTCATCGTACACCCTGACGCCTCACTGCCGTCGGTGACGCAAAACGTCTG +GATGCACGCTGATCATGATGGCTGGGAAGAGCATTTCAACGGAGAGACCGATGCCCTGAC +TCCAGAGATGAGCGAGCAGTTCCGCCAGCAGGTTTATGCACTGCTGACGCCGGAATCCCA +TACCACCTCTTCAGAAATGAGACTGACTTTGCAGGACTGGCAACTGGGTGAAGCCGAGAT +CCCAGAAGAAGACTGTCAGCCCTACCAGGTGAAGGTGTTAGCAGAAAATAA +>HCM1_043_2 +GGCAGTTGATGAAGCTTTGCTGGATGGCCAGCCTGTCCGCTATCTGGAAACAAAAGAAAG +CTCCCCATATCTCATCGTACACCCTGACGACTCACTACCGTCTCTGACGCATAACGTTTG +GATGCACGCTGATCCTGATGGCTGGGAAGAACATTTCGATGGCGAGGACAATCCCCTGAT +GGAGGAGTTGAGCCAGCAGTTCCGCCAGCAGGTGTATGCGCTTCTGACGCCGGAATCGCA +GGCAACGCCTTCAGAGATTATCCGGACGTTACAGGACTGGCAACTGGGTGAAACCCAGCT +GCCAGAAGAAGACTGTCAGTCCTATCAGGTGAAGGTGTTGTTAGAAGAGAA +>HCM1_043_3 +GGCTGCTGAAGGCGCGTTGCAGAATGGCCAGCCCGTCCGCTATCTGGAAACCAAAGAAAG +CTCTCCGTATCTCATCGTACACCCTGACGCCTCACTGCCGTCGGTGACGCAAAACGTCTG +GATGCACGCTGATCCTGATGGCTGGGAAGAGCATTTCAACGGAGAGACCGATGCCCTGAC +TCCAGAGATGAGCGAGCAGTTCCGCCAGCAGGTTTATGCACTGCTGACGCCGGAATCCCA +TACCACCTCTTCAGAAATGAGACTGACTTTGCAGGACTGGCAACTGGGTGAAGCCGAGAT +CCCAGAAGAAGACTGTCAGCCCTACCAGGTGAAGGTGTTAGCAGAAAATAA +>HCM1_064_1 +GGTGGGAACTAAAGAGAAGCGATACAGAAATTTTGAGGTTGACGCTTCTGATGAGTTGTC +GAGCATGGAGCTGGCCCGTTCAGAAGGATACGATGACATTCGGATCACTGGTCTTAAGCT +TTCGATGTCAACCGATTTTAAGTGTTGGCTCGGTTGCATAATGGCGTTCAGCAAATATGG +TTTCGCTTCCGATAAAATCACATTGTCATTCAATGAGTTTGCAAAAATGTGTGGTATCAG +TTCTACAAACATAAACAAGCGAACTCGCTCACGATTTCAGGAGGCGCTAGCAAACCTAGC +TTCCGTTGTGATTTCTTTCCGTGATTCAAAAACTGAACGTTTTACTGTCACGCACCTTGT +GCAGAAAGCAGTGATTGATCCTAAGAAGGACACCGTAGAGTTGGTGGGCGATCCCTCAAT +GTGGGAGCTTTACCGGTATGATCATAAAACCTTACTTAGTTTGCAGGTGCTTTCGGTTCT +CGCTAAAAAAGAGGCAGCACAAAGCCTGTACATATATTTTGAGGCGA +>HCM1_064_2 +GGTGGGAACTAAAGAGAAGCGATACAGAAATTTTGAGGTTGACGCTTCTGATGAGTTGTC +GAGCATGGAGCTGGCCCGTTCAGAAGGATACGATGACATTCGGATCACTGGTCTTAAGCT +TTCGATGTCAACCGATTTTAAGTGTTGGCTCGGTTGCATAATGGCGTTCAGCAAATATGG +TTTCGCTTCCGATAAAATCACATTGTCATTCAATGAGTTTGCAAAAATGTGTGGTATCAG +TTCTACAAACATAAACAAGCGAACTCGCTCACGATTTCAGGAGGCGCTAGCAAACCTAGC +TTCCGTTGTGATTTCTTTCCGTGATTCAAAAACTGAACGTTTTACTGTCACGCACCTTGT +GCAGAAAGCAGTGATTGATCCTAAGAAGGACACCGTAGAGTTGGTGGGCGATCCCTCAAT +GTGGGAGCTTTACCGGTATGATCATAAAACCTTACTTAGCTTGCAGGTGCTTTCGGTTCT +CGCTAAAAAAGAGGCAGCACAAAGCCTGTACATATATTTTGAGGCGA +>HCM1_064_3 +GGTGGGAACTAAAGAGAAGCGATACAGAAATTTTGAGGTTGACGCTTCTGATGAGTTGTC +GAGCATGGAGCTGGCCCGTTCAGAAGGATACGATGACATTCGGATCACTGGTCTTAAGCT +TTCGATGTCAACCGATTTTAAGTGTTGGCTCGGTTGCATAATGGCGTTCAGCAAATATGG +TTTCGCTTCCGATAAAATCACATTGTCATTCAATGAGTTTGCAAAAATGTGTGGTATCAG +TTCTACAAACATAAACAAGCGAACTCGCTCACGATTTCAGGAGGCGCTAGCAAACCTAGC +TTCCGTTGTGATTTCTTTCCGTGATTCAAAAACTGAACGTTTTACTGTCACGCACCTTGT +GCAGAAAGCAGTGATTGATCCTAAGAAGGACACCGTAGAGTTGGTGGGCGATCCCTCAAT +GTGGGAGCTTTACCGGTATGATCATAAAACCTTACTTAGCTTGCAGGTGCTTTCGGTTCT +CGCTAAAAAAGAGGCAGCACAAAGTCTGTACATATATTTTGAGGCGA +>HCM1_064_4 +GGTGGGAACTAAAGAGAAGCGATTCAGAAATTTTGAGGTTGATGCTTCTGATGAGTTGTC +GAGCATGGAACTGGCCCGGTCAGAAGGATACGATGACATCCGGATCACTGGCCTTAAGCT +TTCGATGTCCACGGACTTCAAGTGTTGGCTTGGGTGCATTATGGCGTTCAGTAAATATGG +ATTCGCCTCCGAGAAAATAACATTGTCGTTCAATGAGTTTGCAAAAATGTGTGGTATCAG +TTCTACAAATATCAACAAGCGAACCCGTTCACGATTTCAGGAAGCGCTGGCAAACCTCGC +GTCCGTTGTTATTTCTTTCCGTGATTCTAAAACTGAACGCTTCACTGTCACACACCTTGT +GCAGAAAGCTATGATTGACCCTAAGAAGGACACAGTAGAGCTCGTGGGTGATCCCTCGAT +GTGGGAGCTTTACCGGTATGATCATAAAACCCTATTAAGCTTACAGGTACTGTCGGTTCT +CGCCAAAAAAGAAGCTGCACAGAGCCTGTACATCTATTTTGAGGCAA +>HCM1_099_1 +TGCAGGCAGTTATAGACCATACGCAGGCTATCCGCGCTCAGAGTAATAACTCGGAAGCAG +TTAACGACATCATTCGCAGACGTGATGAGATTCAGGGAAATTCACAGCTCAGCGAGTCTG +CACTGAAATCCGTCGAAAATAAACCAGAAGTTATGCGCAGTCAGTCTTCGAATATCGAAA +AGATGTTTGGTTCATCAGGAATCACCGCCGCTGACTTCGAGCGTAAAATAGACAGCAGTC +GGGAAGAGGTGCTCTCGACAGAAAACGGTATCACTATCTTTGCGTCATTTAGCTTGCCTG +ATTACGTCCTGGAAGATCTACTCCGTACCGCGTCAGAACATAAGGCGAGAGTGGTTTTTA +ATGGTCTGAAGAAAGGCACTACACGCCTCCCTGAAACTCAGGCAGCTATCA +>HCM1_099_2 +TGCAGGCAGTTATAGACCATACGCAGGCTATCCGCGCTCAGAGTAATAACTCGGAAGCTG +TTAACGACATCATTCGCAGACGTGATGAGATTCAGGGAAATTCACAGCTCAGCGAGTCTG +CACTGAAATCCGTCGAAAATAAACCAGAAGTTATGCGCAGTCAGTCTTCGAATATCGAAA +AGATGTTTGGTTCATCAGGAATCACCGCCGCTGACTTCGAGCGTAAAATAGACAGCAGTC +GGGAAGAGGTGCTCTCGACAGAAAACGGTATCACTATCTTTGCGTCATTTAGCTTGCCTG +ATTACGTCCTGGAAGATCTACTCCGTACCGCGTCAGAACATAAGGCGAGAGTGGTTTTTA +ATGGTCTGAAGAAAGGCACTACACGCCTCCCTGAAACTCAGGCAGCTATCA +>HCM1_099_3 +TGCAGGCAGTTATAGACCATACGCAGGCTATCCGCGCTCAGAGTAATAACTCGGAAGCAG +TTAACGACATCATTCGCAGACGTGATGAGATTCTGGGAAATTCACAGCTCAGCGAGTCTG +CACTGAAATCCGTCGAAAATAAACCAGAAGTTATGCGCAGTCAGTCTTCGAATATCGAAA +AGATGTTTGGTTCATCAGGAATCACCGCCGCTGACTTCGAGCGTAAAATAGACAGCAGTC +GGGAAGAGGTGCTCTCGACAGAAAACGGTATCACTATCTTTGCGTCATTTAGCTTGCCTG +ATTACGTCCTGGAAGATCTACTCCGTACCGCGTCAGAACATAAGGCGAGAGTGGTTTTTA +ATGGTCTGAAGAAAGGCACTACACGCCTCCCTGAAACTCAGGCAGCTATCA +>HCM1_099_4 +TGCAGGCGGTTATCGATCATACTCAGGCTATACGCGCTCAGAATAATAATTCTGAAGCAG +TTAATGACATTATTCGCAGACGTGATGAAATTCAGGGAAATATTCAGCTGAACGACTCAG +CACTGAAGTCTGTCGAAAATAAACCAGAAGTAATGCGCAGCCAGTCGACGAATATCGAAA +AAATGTTTGGTACCTCAGGGATCACCGCCGCTGACTTCGAACGAAAAATAGATAGCAGAC +GGGAAGAGGTGCTTTCGACAGAAAACGGTATCACTATCTTTGCGTCATTTAGCCTGCCTG +ATTACGTCCTAGAAGATCTACTCCGTACCGCGTCACAAAATAAGGCGAGAGTGGTTTTTA +ATGGTCTGAAGAAAGGCACGACGCGTCTTCCGGAGACTCAGGCTGCAATCA +>HCM1_116_1 +GTGATTATAGCGATGAGAGATTTGTCAAGCTAATTGAAGGATTCATATGTCATGAAGCAG +GACACGGTCGTTATACAGAGCATGAAGTATACCGTGAAGCTTTTGTTGGAGAATTGATCA +ATGCAGATGGCTTCATCAGTATTGATGATGACTTGAAGGCTGATTTTCAAAACCTAAAAC +AAAAGCAAAAAGCATATGCTCGTGCTTGTCGACTAAAAGGACTTATTAATCTTTTTGATG +ATGTCCAGATGGAAGAGAAGACGGGTATTGATTATCAGGAGGCAAAAAAACGCCTCGCGG +TGACTTATGCCTTGATGGTTGAAGCTGGGCGTATGACGGTTGATATTTCTTCAACCCCTC +AAAACCCGGTTCAGTTTATTGAAATGTACCTGCTTAATACATTGCGGGTTAACGTTCTCC +AACAAGAAGGGCATAAAGAAACGCTTGACCCATTTTTCGATTATGCAAAGAAAATCCTTG +CACCTGTAACT +>HCM1_116_2 +GTGATTATAGCGATGAGAGATTTGTCAAGCTAATTGAAGGATTCATATGTCATGAAGCAG +GACACGGTCGTTATACAGAGCATGAAGTATACCGTGAAGCTTTTGTTGGAGAATTGATCA +ATGCAGATGGCTTCATCAGTATTGATGATGACTTGAAGGCTGATTTTCAAAACCTAAAAC +AAAAGCAAAAAGCATATGCTCGTGCTTGTCGACTAAAAGGACTTATTAATCTTTTTGATG +ATGTCCAGATGGAAGAGAAGACGGGTATTGATTATCAGGAGGCAAAAAAACGCCTCGCGG +TGACTTATGCCTTGATGGTTGAAGCTGGGCGAATGACGGTTGATATTTCTTCAACCCCTC +AAAACCCGGTTCAGTTTATTGAAATGTACCTGCTTAATACATTGCGGGTTAACGTTCTCC +AACAAGAAGGGCATAAAGAAACGCTTGACCCATTTTTCGATTATGCAAAGAAAATCCTTG +CACCTGTAACT +>HCM1_116_3 +GTGATTATAGCGATGAGAAATTCGTCAAGCTAATTGAAGGGTTTATATGTCATGAAGCTG +GACACGGTCGCTATACAGAACATGAAGTATACCGTGAAGCTTTTGTTGGGGAACTGATTA +ATGCAGATGGCTTCATCAGTATAGATGATAAGCTGAACGCTGAATTTCAAACCCTTAAAC +AAAAGAAAATCGCATATGCCCGGGCTTACCGTCTACATGGACTTATTAATCTCTTTGATG +ATGTCCAGATGGAAGAGAAAACGGGTATTGACTATCAGGAGGCAAAAAAGCGCCTCGCGG +TAAGTTATGCCTTGATGGTTGAAGCTGGGCGAATGACGGTTGATGTTTCTTCAAGCCCTC +AAAACCCTGTTCAGTTTATTGAAATGTTCCTGCTTAATACATTGCGGGTTAACGTTCTCC +AGCAAGAAGGGCATAAAGAAACGCTTGATCCATTTTTCGATTATGCAAAGAAAATCCTTG +AGCCTGTAATT +>HCM1_116_4 +GTGATTATAGCGATGAGAAATTCGTCAAGCTAATTGAAGGGTTTATATGTCATGAAGCTG +GACACGGTCGCTATACAGAACATGAAGTATACCGTGAAGCTTTTGTTGGGGAACTGATTA +ATGCAGATGGCTTCATCAGTATAGATGATAAGCTGAACGCTGAATTTCAAACCCTTAAAC +AAAAGAAAATCGCATATGCCAGGGCTTACCGTCTACATGGACTTATTAATCTCTTTGATG +ATGTCCAGATGGAAGAGAAAACGGGTATTAACTATCAGGAGGCAAAAAAGCGCCTCGCGG +TAAGTTATGCCTTGATGGTTGAAGCTGGGCGAATGACGGTTGATGTTTCTTCAAGCCCTC +AAAACCCTGTTCAGTTTATTGAAATGTTCCTGCTTAATACATTGCGGGTTAACGTTCTCC +AGCAAGAAGGGCATAAAGAAACGCTTGATCCATTTTTCGATTATGCAAAGAAAATCCTTG +AGCCTGTAATT +>HCM1_178ac_1 +GTCCAGGTTTTCGTTTCACCATTAACATCAGTGTATTTATATTTCGCAGGGCGCGGTTCG +CGAACTTTTTTAGGTGCTCCGGACTTTGCAGAGAAAGAACTCAGTAACTCTTCAGGGTCA +ATTCCATCTTCAAGCATTAATTGACGCAGGGATTCAATCTTCTCCAGACGCGCTTTCAGC +TCAGCTTCTTTTGAAGATTCTTCCTGACGTCGTTCTTCAACAACAACGCTTAATTTTTCC +AGCAGTTCTTCAAGGATCTCTAACGGCAGTTCACGGCCCTGCGCACGAAGAGTACGAATG +TTGTTTAATGATTTGAGTGCTTCGGACATATGACCTCACTAAGAGTAATAAATAAAATCA +ATAGAATACTTTGCGATATTACACTCTTTTATTATTT +>HCM1_178ac_2 +GTCCAGGTTTTCGTTTTACCATTAACATCAGTGTATTTATATTTCGCAGGGCGCGGTTCG +CGAACTTTTTTAGGTGCTCCGGACTTTGCAGAGAAAGAACTCAGTAACTCTTCAGGGTCA +ATTCCATCTTCAAGCATTAATTGACGCAGGGATTCAATCTTCTCCAGACGCGCTTTCAGC +TCAGCTTCTTTTGAAGATTCTTCCTGACGTCGTTCTTCAACAACAACGCTTAATTTTTCC +AGCAGTTCTTCAAGGATCTCTAACGGCAGTTCACGGCCCTGCGCACGAAGAGTACGAATG +TTGTTTAATGATTTGAGTGCTTCGGACATATGACCTCACTAAGAGTAATAAATAAAATCA +ATAGAATACTTTGCGATATTACACTCTTTTATTATTT +>HCM1_178ac_3 +GTCCAGGTTTTCGTTTCACCATTTTCATCGGTAAACGAATATTTCGCCGGACGCGGATCG +CGAGCTTTTTTTGGTGCGCTGGATTTAGCAGAGAAAGAGCTCAGAAGTTCTTCAGGATCG +ATTCCGTCTTCAAGCATTAATTTACGCAGGGAATCGAGTTTTTCCTGACGTGCTTCCTGC +TCAGCTTTTTTGGAAGATTCTTCCTGACGGCGTTCGTCTACGACAACGCTTAATTTTTCC +AGCAGTTCTTCAAGAACCTCTAATGGCAGTTCACGGCCCTGCGCACGAAGAGTACGAATG +TTGTTTAATGCTTTTAGTGCTTCGGACATATGGCCTCACTTAGAGATTTTGAAATTAAAA +GGATACGGAATGATAGTACACTGTTTTAATATTTTAC +>HCM1_259_1 +CTCCCGTTTTTTCGGGATTGATGCGGAGTTGGTCTTTACGCTTTTTGATAATGAGGGCGG +AAAAGTCGGGACGTTCAGCCGTAATAAAAATGGCACTTATGATATTGGGCCTATGCAGAT +CAATTCGTCCAACCTGCCAGAAATACGCGACCATTTTCCGTCTGTTACGTGGCGGGTGCT +GGCCTATGACGCCTGTGCCAGTTTCTGGGTGGGCACCTGGTGGCTTTACCGGAAGATTGT +TGACCGGAAGGGTAACGTATTTGAAGGGATTGCCGATTACAACAGCAAAACCCCTAAGGT +CCGGGCGACGTATATCTTCAACTTCATGATCAAATACAATCGCCGGATTCAGCGCCGAAA +TGGAATGGACGAATTATATCAGTGGAC +>HCM1_259_2 +CTCCCGTTTTTTCGGGATTGATGCGGAGTTGGTCTTTACGCTTTTTGATAATGAGGGCGG +AAAAGTCGGGACGTTCAGCCGTAATAAAAATGGCACTTATGATATTGGGCCTATGCAGAT +CAATTCGTCCAACCTGCCGGAAATACGCGACCATTTTCCGTCTGTTACGTGGCGGGTGCT +GGCCTATGACGCCTGTGCCAGTTTCTGGGTGGGCACCTGGTGGCTTTACCGGAAGATTGT +TGACCGGAAGGGTAACGTATTTGAAGGGATTGCCGATTACAACAGCAAAACCCCTAAGGT +CCGGGCGACGTATATCTTCAACTTCATGATCAAATACAATCGCCGGATTCAGCGCCGAAA +TGGAATGGACGAATTATATCAGTGGAC +>HCM1_259_3 +CTCCCGTTTTTTCGGGATTGATGCGGAGTTGGTCTTTACGCTTTTTGATAATGAGGGCGG +AAAAGTGGGGACGTTCAGCCGTAATAAAAATGGCACTTATGATATTGGGCCTATGCAGAT +CAATTCGTCCAACCTGCCGGAAATACGCGACCATTTTCCGTCTGTTACGTGGCGGGTGCT +GGCCTATGACGCCTGTGCCAGTTTCTGGGTGGGCACCTGGTGGCTTTACCGGAAGATTGT +TGACCGGAAGGGTAACGTATTTGAAGGGATTGCCGATTACAACAGCAAAACCCCTAAGGT +CCGGGCGACGTATATCTTCAACTTCATGATCAAATACAATCGCCGGATTCAGCGCCGAAA +TGGAATGGACGAATTATATCAGTGGAC +>HCM1_259_4 +CTCCCGCTTTTTCGGGATTGATGCAGAATTGGTCTTTACGCTTTTTGATAATGAAGGCGG +AAAAGTGGGAACGTTCAGCCGGAATAAAAATGGCACTTATGATATTGGACCTATGCAGAT +CAATTCGTCCAATCTGCCGGAAATACGTGGCCACTTTCCGTCTGTTACCTGGCGGGTATT +GGCCTATGACGCCTGTGCCAGTTTCTGGGTAGGTACCTGGTGGCTTTACCGGAAAATTGT +AGACCGAAATGGTAATGTATTTGAAGGGATTGCCGATTACAACAGCAAAACCCCTAAGGT +CCGGGCGAGGTATATCTTTAACTTCATGGTCAAATACAATCGCCGGATTCAGGGCCGGAA +TGGCATGGACGAGTTATATCAGTGGAC