Mercurial > repos > dereeper > roary_plots

diff Roary/t/data/expected_g2_g5_pan_genome_reference.fa @ 0:c47a5f61bc9f draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Uploaded
author dereeper
date Fri, 14 May 2021 20:27:06 +0000
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/Roary/t/data/expected_g2_g5_pan_genome_reference.fa	Fri May 14 20:27:06 2021 +0000
@@ -0,0 +1,70 @@
+>1_1 hly
+ATGAAAACACGTATAGTCAGCTCAGTAACAACAACACTATTGCTAGGTTCCATATTAATG
+AATCCTGTCGCTAATGCCGCAGATTCTGATATTAATATTAAAACCGGTACTACAGATATT
+GGAAGCAATACTACAGTAAAAACAGGTGATTTAGTCACTTATGATAAAGAAAATGGCATG
+CACAAAAAAGTATTTTATAGTTTTATCGATGATAAAAATCACAATAAAAAACTGCTAGTT
+ATTAGAACGAAAGGTACCATTGCTGGTCAATATAGAGTTTATAGCGAAGAAGGTGCTAAC
+AAAAGTGGTTTAGCCTGGCCTTCAGCCTTTAAGGTACAGTTGCAACTACCTGATAATGAA
+GTAGCTCAAATATCTGATTACTATCCAAGAAATTCGATTGATACAAAAGAGTATATGAGT
+ACTTTAACTTATGGATTCAACGGTAATGTTACTGGTGATGATACAGGAAAAATTGGCGGC
+CTTATTGGTGCAAATGTTTCGATTGGTCATACACTGAAATATGTTCAACCTGATTTCAAA
+ACAATTTTAGAGAGCCCAACTGATAAAAAAGTAGGCTGGAAAGTGATATTTAACAATATG
+GTGAATCAAAATTGGGGACCATATGATAGAGATTCTTGGAACCCGGTATATGGCAATCAA
+CTTTTCATGAAAACTAGAAATGGTTCTATGAAAGCAGCAGAGAACTTCCTTGATCCTAAC
+AAAGCAAGTTCTCTATTATCTTCAGGGTTTTCACCAGACTTCGCTACAGTTATTACTATG
+GATAGAAAAGCATCCAAACAACAAACAAATATAGATGTAATATACGAACGAGTTCGTGAT
+GACTACCAATTGCATTGGACTTCAACAAATTGGAAAGGTACCAATACTAAAGATAAATGG
+ACAGATCGTTCTTCAGAAAGATATAAAATCGATTGGGAAAAAGAAGAAATGACAAATTAA
+>1_2 speH
+ATGAACAATAACATCACGAAAAAAATTATTTTATCAACAACATTGTTACTATTAGGTACA
+GCATTTACACAATTTCCTAATACACCTATCAATTCTTCATCTGAAGCGAAAGCTTATTAT
+ATAAATCAAAACGAAACTAACGTTAATGAGTTAACTAAATATTACTCGCAAAAATATTTA
+ACCTTCTCTAACAGTACGTTATGGCAAAAAGATAACGGTACGATTCATGCAACGTTGTTA
+CAGTTTTCTTGGTATAGTCATATTCAAGTTTATGGACCTGAAAGTTGGGGCAATATCAAC
+CAATTAAGAAATAAAAGCGTTGATATTTTTGGCATAAAAGACCAAGAAACCATTGATTCT
+TTTGCATTATCTCAAGAAACGTTTACTGGTGGTGTTACTCCTGCAGCAACATCTAACGAT
+AAACACTATAAACTGAATGTAACATATAAAGATAAAGCAGAAACGTTTACTGGCGGATTT
+CCAGTTTATGAAGGCAATAAGCCTGTTTTAACTTTAAAAGAATTAGATTTTCGTATTCGT
+CAAACATTAATTAAAAGTAAAAAATTATATAATAATTCTTATAATAAAGGACAAATTAAA
+ATAACAGGTACAGACAATAACTACACAATAGATTTAAGTAAAAGGTTGCCATCAACTGAT
+GCAAATAGATATGTTAAAAAACCTCAAAATGCAAAAATTGAAGTTATCCTCGAAAAATCA
+AACTAA
+>1_3 argF
+ATGAAAAATTTACGAAACAGAAGTTTTTTAACTTTATTAGACTTTTCACGACAAGAGGTA
+GAATTCTTATTAACACTCTCCGAGGATTTAAAACGTGCTAAATATATTGGCACTGAAAAG
+CCTATGTTAAAAAATAAAAATATTGCACTGTTATTTGAAAAAGATTCTACAAGAACGCGA
+TGTGCATTTGAAGTTGCAGCGCATGATCAAGGTGCAAATGTAACTTATTTAGGCCCAACT
+GGATCACAAATGGGTAAAAAAGAAACAACTAAAGATACTGCACGTGTGCTTGGTGGAATG
+TATGATGGCATTGAATACCGTGGTTTTTCACAAAGAACAGTAGAAACTTTAGCTGAAAAT
+TCAGGCGTACCAGTGTGGAATGGTTTAACTGATGAAGATCATCCTACTCAAGTTCTTGCT
+GATTTCTTAACAGCAAAAGAAGTCTTAAAAAAAGATTATGCAGATATTAACTTTACATAT
+GTTGGAGATGGTCGTAATAACGTTGCAAATGCATTAATGCAAGGTGCTGCCATTATGGGT
+ATGAACTTCCATTTAGTTTGTCCAAAAGAATTAAATCCAACAGATGAATTATTAAATCGC
+TGTAAAAATATTGCCGCTGAAAATGGTGGCAACATATTAATCACAGATGATATTGACCAA
+GGTGTAAAAGGTTCGGATGTAATTTACACTGATGTTTGGGTATCAATGGGTGAACCTGAT
+GAAGTATGGAAAGAACGACTTGAATTATTGAAACCATATCAAGTAAATAAAGAAATGATG
+GATAAAACTGGTAATCCAAATGTTATTTTTGAGCATTGCTTACCATCTTTCCATAATGCT
+GATACGAAAATTGGTCAACAAATTTTTGAAAAATATGGTATTCGAGAAATGGAAGTTACA
+GATGAAGTATTCGAAAGTAAAGCTTCAGTTGTATTCCAAGAAGCTGAGAACAGAATGCAT
+ACAATCAAAGCAGTCATGGTTGCTACATTGGGTGAATTTTAA
+>1_6 group_6
+ATGACTGGACTAGCAGAAGCAATCGCAAATACTGTGCAAGCTGCACAACAACATGATAGT
+GTGAAATTAGGCACAAGTATCGTAGACATCGTTGCTAACGGTGTGGGTTTACTAGGTAAA
+TTATTTGGATTCTAA
+>2_7 group_7
+ATGACTGGACTAGCAGAAGCAATCGCAAATACTGTGCAAGCTGCACAACAACATGATAGT
+GTGAAATTAGGCACAAGTATCGTAGACATCGTTGCTAACGGTGTGGGTTTACTAGGTAAA
+TTATTTGGATTCTAA
+>3_5 yfnB
+TTGGGATATAAAAATATTTTGATAGACTTTGATGATACAATTGTTGATTTTTATGATGCA
+GAAGAATGGGCGTTTCACTATATGGCGAATGTTTTTAATCATAAAGCAACAAAGGATGAT
+TTTTTAACATTTAAAAAAATCAATCACCAACATTGGGAAGCTTTTCAACAAAATAAATTA
+ACGAAGTCTGAAGTATTATCAGAACGATTTGTGAATTACTTCAAACATCATCAAATGGAA
+GTTGATGGGCATCGTGCAGATGTGTTATTTAGAAATGGATTAGCAGAAGCTAAAGTTAAA
+TACTTTGATCAAACATTAGAAACAATTGTCGAATTATCGAAAAGACATGATTTATATATT
+GTTACTAATGGTGTAACCGAAACGCAAAAGAGAAGGTTAAATCAGACGCCGTTGCATAAA
+TATATTAAAAAGATATTTATATCTGAGGAAACAGGATATCAAAAACCTAATCCGGAATTT
+TTTAATTATGTTTTTAATGATATTGGTGAGGATGAAAGACAGCACTCGATTATAGTTGGA
+GATTCTTTAACATCTGACATTCTAGGTGGAATCAATGCGGGTATAGCTACTTGCTGGTTT
+AATTTTAGAGGATTTGATCATAATCCAGGAATTATACCTGATTATGAAATTAATTCATGG
+AAACAACTAAATGATATTGTACGTTAA