view Roary/t/data/core_alignment_gene_lookup/expected_core_gene_alignment.aln @ 0:c47a5f61bc9f draft

Uploaded
author dereeper
date Fri, 14 May 2021 20:27:06 +0000
parents
children
line wrap: on
line source

>query_1
ATGAATCTACCTTTACCTGATAATTATGAATTTGTGTTTTTATCTGGTGGATTATCTGGG
CATGCTGCAATGATGTCATTTTTTAATGTTTGTGGCATTGGATATTTGTATCATCATATG
GATTTAATGAAAAATAGATATATAGATTATTACCATTTTTCTAGGATTGAAAATTTATAT
TCAATTATAACATATGGACAATACAGTTTAACGCAAGGAATGAATAATATAGGTAAATAT
TTGACTTTAATTAATAAAATTCCAATTCTTTTTTTGGTAAGAGATCCCATATCAAGACTA
AAAACCGGAGTAAATCATCCTATTCTAAATCCAAAAAGTATGAAGGAGATATGTTTAAAC
AATGATTATAGTGATGTGTTTAAGAATAAAATGTATGTTGGCGATATTGGAAAAAATTTT
TACTATTCAGAAAAGCCAAGCATGAAATATTTACCTAGATTGAAATATGAAAATTTGGGA
ATATTTTTAAAACCACAAGAATTTGAGCGTTTAAAGCAAGATTCTAAGCTATTTGATGTT
GCTAAAAGATATTTGAATAATTTTATTGAAGCTTTAGAAGAGAGAATAGACCTAGAAAAA
GCTAAATTATTTAAAGAAAAAGACGTGTTAAACTATTTAAAAGAAAATAAAGAATTAAGA
GTTAAGTTAAAAAACATATTAGATAAAGAACTTGTTCATATTAAACAACATCGTCCAGAT
ATAGTAGCTTCTTGGAAATACTATCAAGAATTTGAACAAATGTGCAAGGAGTTGAATGGT
AATATTTAG
>query_2
ATGAATCTACCTTTACCTGATAATTATGAATTTGTGTTTTTATCTGGTGGATTATCTGGG
CATGCTGCAATGATGTCATTTTTTAATGTTTGTGGCATTGGATATTTGTATCATCATATG
GATTTAATGAAAAATAGATATATAGATTATTACCATTTTTCTAGGATTGAAAATTTATAT
TCAATTATAACATATGGACAATACAGTTTAACGCAAGGAATGAATAATATAGGTAAATAT
TTGACTTTAATTAATNNNNNNNNNATTCTTTTTTTGGTAAGAGATCCCATATCAAGACTA
AAAACCGGAGTAAATCATCCTATTCTAAATCCAAAAAGTATGAAGGAGATATGTTTAAAC
AATGATTATAGTGATNNNNNNNNNAATAAAATGTATGTTGGCGATATTGGAAAAAATTTT
TACTATTCAGAAAAGCCAAGCATGAAATATTTACCTAGATTGAAATATGAAAATTTGGGA
ATATTTTTAAAACCACAAGAATTTGAGCGTTTAAAGCAAGATTCTAAGCTATTTGATGTT
GCTAAAAGATATTTGAATAATTTTATTGAAGCTTTAGAAGAGAGAATAGACCTAGAAAAA
GCTAAATTATTTAAAGAAAAAGACGTGTTAAACTATTTAAAAGAAAATAAAGAATTAAGA
GTTAAGTTAAAAAACATATTAGATAAAGAACTTGTTCATATTAAACAACATCGTCCAGAT
ATAGTAGCTTCTTGGAAATACTATCAAGAATTTGAACAAATGTGCAAGGAGTTGAATGGT
AATATTTAG
>query_3
ATGAATCTACCTTTACCTGATAATTATGAATTTGTGTTTTTATCTGGTGGATTATCTGGG
CATGCTGCAATGATGTCATTTTTTAATGTTTGTGGCATTGGATATTTGTATCATCATATG
GATTTAATGAAAAATAGATATATAGATTATTACCATTTTTCTAGGATTGAAAATTTATAT
TCAATTATAACATATGGACAATACAGTTTAACGCAAGGAATGAATAATATAGGTAAATAT
TTGACTTTAATTAATAAAATTCCAATTCTTTTTTTGGTAAGAGATCCCATATCAAGACTA
AAAACCGGAGTAAATCATCCTATTCTAAATCCAAAAAGTATGAAGGAGATATGTTTAAAC
AATGATTATAGTGATGTGTTTAAGAATAAAATGTATGTTGGCGATATTGGAAAAAATTTT
TACTATTCAGAAAAGCCAAGCATGAAATATTTACCTAGATTGAAATATGAAAATTTGGGA
ATATTTTTAAAACCACAAGAATTCGAGCGTTTAAAGCAAGATTCTAAGCTATTTGATGTT
GCTAAAAGATATTTGAATAATTTTATTGAAGCTTTAGAAGAGAGAATAGACCTAGAAAAA
GCTAAATTATTTAAAGAAAAAGACGTGTTAAACTATTTAAAAGAAAATAAAGAATTAAGA
GTTAAGTTAAAAAACATATTAGATAAAGAACTTGTTCATATTAAACAACATCGTCCAGAT
ATAGTAGCTTCTTGGAAATACTATCAAGAATTTGAACAAATGTGCAAGGAGTTGAATGGT
AATATTTAG