Mercurial > repos > devteam > emboss_5
diff test-data/emboss_sixpack_out2.sixpack @ 1:7334f6d0ac17
Uploaded emboss functional test input and output data files.
author | devteam |
---|---|
date | Wed, 21 Mar 2012 16:30:01 -0400 |
parents | |
children | 8992d258e42f |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/emboss_sixpack_out2.sixpack Wed Mar 21 16:30:01 2012 -0400 @@ -0,0 +1,134 @@ + + + V R C L K Y L L L S L H R P Q F S * W L F1 + F D A * N T F F C P Y T D H S F P N G F F2 + S M P K I P S F V P T Q T T V F L M A L F3 + gttcgatgcctaaaataccttcttttgtccctacacagaccacagttttcctaatggctt + 10 20 30 40 50 60 + ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| + caagctacggattttatggaagaaaacagggatgtgtctggtgtcaaaaggattaccgaa + T R H R F Y R R K D R C L G C N E * H S F6 + X E I G L I G E K T G V C V V T K R I A F5 + N S A * F V K K Q G * V S W L K G L P K F4 + + + Y T D * K F L C K H * L K A V G L E C Y F1 + T P T R N S C A S T N * K R L A * S V T F2 + H R L E I L V Q A L I E S G W P R V L P F3 + tacaccgactagaaattcttgtgcaagcactaattgaaagcggttggcctagagtgttac + 70 80 90 100 110 120 + ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| + atgtggctgatctttaagaacacgttcgtgattaactttcgccaaccggatctcacaatg + * V S * F N K H L C * N F A T P R S H * F6 + K C R S S I R T C A S I S L P Q G L T N F5 + V G V L F E Q A L V L Q F R N A * L T V F4 + + + R F V * L S A S L A L I K G S F S L L W F1 + G L Y S * A R L L P * S K V H F L Y F G F2 + V C I A E R V S C P D Q R F I F S T L E F3 + cggtttgtatagctgagcgcgtctcttgccctgatcaaaggttcattttctctactttgg + 130 140 150 160 170 180 + ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| + gccaaacatatcgactcgcgcagagaacgggactagtttccaagtaaaagagatgaaacc + R N T Y S L A D R A R I L P E N E R S Q F6 + G T Q I A S R T E Q G S * L N M K E V K F5 + P K Y L Q A R R K G Q D F T * K R * K P F4 + + + K T L W K N T T S T S L S P L V C * L L F1 + R R C G R I Q Q V R V S P P W F A D Y W F2 + D V V E E Y N K Y E S L P P G L L I T G F3 + aagacgttgtggaagaatacaacaagtacgagtctctcccccctggtttgctgattactg + 190 200 210 220 230 240 + ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| + ttctgcaacaccttcttatgttgttcatgctcagagaggggggaccaaacgactaatgac + F V N H F F V V L V L R E G R T Q Q N S F6 + S S T T S S Y L L Y S D R G G P K S I V F5 + L R Q P L I C C T R T E G G Q N A S * Q F4 + + + D T V V I P F A T P R N Y L Y E L F S L F1 + I Q L * Y P S Q H R V T I Y M N Y F P F F2 + Y S C N T L R N T A * L S I * I I F P L F3 + gatacagttgtaatacccttcgcaacaccgcgtaactatctatatgaattattttccctt + 250 260 270 280 290 300 + ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| + ctatgtcaacattatgggaagcgttgtggcgcattgatagatatacttaataaaagggaa + S V T T I G K A V G R L * R Y S N N E R F6 + P Y L Q L V R R L V A Y S D I H I I K G F5 + I C N Y Y G E C C R T V I * I F * K G K F4 + + + Y Y M * * V R L * S S F S K S F T V F D F1 + I I C S R F V F N L P L A S L L L F S T F2 + L Y V V G S S L I F L * Q V F Y C F R P F3 + tattatatgtagtaggttcgtctttaatcttcctttagcaagtcttttactgttttcgac + 310 320 330 340 350 360 + ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| + ataatatacatcatccaagcagaaattagaaggaaatcgttcagaaaatgacaaaagctg + * * I Y Y T R R * D E K L L D K V T K S F6 + K N Y T T P E D K I K R * C T K * Q K R F5 + I I H L L N T K L R G K A L R K S N E V F4 + + + L N V H V L R L F W I I C G Q F N L R C F1 + S M F M F L G C F G * Y A V S L I F V V F2 + Q C S C S * V V L D N M R S V * S S L F F3 + ctcaatgttcatgttcttaggttgttttggataatatgcggtcagtttaatcttcgttgt + 370 380 390 400 410 420 + ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| + gagttacaagtacaagaatccaacaaaacctattatacgccagtcaaattagaagcaaca + R L T * T R L N N Q I I H P * N L R R Q F6 + G * H E H E * T T K S L I R D T * D E N F5 + E I N M N K P Q K P Y Y A T L K I K T T F4 + + + F F L K Y L F M V * F L V C T C S G A S F1 + S S * N I Y S W F N F W F V L V Q G P V F2 + L L K I F I H G L I F G L Y L F R G Q F F3 + ttcttcttaaaatatttattcatggtttaatttttggtttgtacttgttcaggggccagt + 430 440 450 460 470 480 + ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| + aagaagaattttataaataagtaccaaattaaaaaccaaacatgaacaagtccccggtca + K K K F Y K N M T * N K T Q V Q E P A L F6 + N R R L I N I * P K I K P K Y K N L P W F5 + E E * F I * E H N L K Q N T S T * P G T F4 + + + S L F T L F V Y S S S F I F S M I L I * F1 + H Y L L C L Y T A V L L F L V * F * F K F2 + I I Y S V C I Q Q F F Y F * Y D F N L K F3 + tcattatttactctgtttgtatacagcagttcttttatttttagtatgattttaatttaa + 490 500 510 520 530 540 + ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----| + agtaataaatgagacaaacatatgtcgtcaagaaaataaaaatcatactaaaattaaatt + E N N V R N T Y L L E K I K L I I K I * F6 + N M I * E T Q I C C N K * K * Y S K L K F5 + * * K S Q K Y V A T R K N K T H N * N L F4 + + + N N S N G Q K F1 + T I L M V K X F2 + Q F * W S K X F3 + aacaattctaatggtcaaaaa + 550 560 + ----:----|----:----|- + ttgttaagattaccagttttt + F L E L P * F F6 + F C N * H D F F5 + V I R I T L F F4 + +############################## +Minimum size of ORFs : 1 + +Total ORFs in frame 1 : 10 +Total ORFs in frame 2 : 11 +Total ORFs in frame 3 : 8 +Total ORFs in frame 4 : 14 +Total ORFs in frame 5 : 12 +Total ORFs in frame 6 : 14 + +Total ORFs : 69 +############################## +