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comparison test-data/2way.maf @ 0:d4368a5a3fc7
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CCTGCCCTGCTCAAAATCCAATCACAGCTCCCTAACACGCCTGAATCAACTTGAAGTCCTGTCTTGAGTAATCCGTGGGCCCTAACTCACTCATCCCAACTCTTCACTCACTGCCCTGCCCCACACCCTGCCAGGGAGCCTCCCGTGGCACCGTGGGGACACAAAGGAACCAGGGCAAAGCTCCCTCAGCCCCATTCAAAGAGGCCTGGCCCACAGGCTCACGGAAAGTCAGCCTCTCATGCCCCGAGAGCTGAGTGCAAGGGAGAGGCAGCGCTGTCTGTGCTTCCCATGCAGAAGCACCCCCCTCCCACCCCTGTGCAGGCCGGCCTTCGCGGCAGACCACCATACACCACGTTCCAAGCCACACTGAGGCCTCCCTCCAAGCCTGCAGCCCCCATTTCCAGACCCTGCCAGGGCAACCTGCATATCCACCTCCCTACCCTGCCCCCCTCTTCCAGGAGTCTGCCCTATGTGGAGTAAGCACgtggttttcctcttcagcaactatttcctttttactcaagcaatggccccatttcccttggggaatccatctctctcgcaggcttagtcccagagcttcaggtggggctgcccacagagctcctcagtctaagccaagtggtgtgtcatagtcccctggccccattaatggattctgggatagacatgaggaccaagccaggTGGGATGAGTGAGTGTGGCTTCTGGAGGAAGTGGGGACACAGGACAGCATTCTTTCCTGCTGGACCTGACCCTGTGTCATGTCACCTTGCTACCACGAGAGCATGGCCTGTCTGGGAATGCAGCCAGACCCAAAGAAGCAAACTGACATGGAAGGAAAGCAAAACCAGGCCCTGAGGACATCATTTTAGCCCTTACTCCGAAGGCTGCTCTACTGATTGGTTAATTTTTGCTTAGCTTGGTCTGGGGAGTTCTGACAGGCGTGCCACCAATTCTTACCGATTTCTCTCCACTCTAGACCCTGAGAAGCCCACGCGGTTCATGCTAGCAATTAACAATCAATCTCGCCCTATGTGTTCCCATTCCAGCCTCTAGGACACAGTGGCAGCCACATAATTGGTATCTCTTAAGGTCCAGCACGAGGTGGAGCACATGGTGGAGAGACAGATGCAGTGACCTGGAACCCAGGAGTGAGGGAGCCAGGACTCAGGCCCAAGGCTCCTGAGAGGCATCTGGCCCTCCCTGCGCTGTGCCAGCAGCTTGGAGAACCCACACTCAATGAACGCAGCACTCCACTACCCAGGAAATGCCTTCCTGCCCTCTCCTCATCCCATCCCTGGGCAGGGGACATGCAACTGTCTACAAGGTGCCAAGTACCAGGACAGGAAAGGAAAGACGCCAAAAATCCAGCGCTGCCCTCAGAGAAGGGCAACCACGCAGTCCCCATCTTGGCAAGGAAACACAATTTCCGAGGGAATGGTTTTGGCCTCCATTCTAAGTGCTGGACATGGGGTGGCCATAATCTGGAGCTGATGGCTCTTAAAGACCTGCATCCTCTTCCCTAGGTGTCCCTCGGGCACATTTAGCACAAAGATAAGCACAAAAGGTGCATCCAGCACTTT--GTTACTATTGGTGGCAGGTTTATGAATGGCAACCAAAGGCAGTGTACGGGTCAAGATTATCAACAGGGAAGAGATagcatttcctgaaggcttcctaggtgccaggcactgttccattcctttgcatgttttgattaatttaatatttaaaataattctaccaggaag--------------ctaccattattaccacaacttcacaaatgagaacaccgaggcttagaggggttgggttgcccaaggttacagaggaagaaaacaggggagctggatctgagccaaggcatcaactccaaggtAACCCCTCAGTCACTTCACTGTGTGTCCCCTGGTTACTGGGACATTCTTGACAAACTCGGGGCAAGCCGGTGAGTCAGTGGGGGAGGACTTTCAGGAAGAGGTGGGTTCCCAGTTGGTGACAGAAGAGGAGGCTGCAAAGTGAAGGAGCAGGGGCTCCAGGTCTGGCGACAACCAGGGAAGGGACAGGGCAGGGATGGCTTGGACCACGAGAGGCACCTGAGTCAGGCAGTCACATACTTCCCACTGGGGTCTACCATGTGAGGCATGGTGTGGGATCCTGGGAAGGAGACCAAGCCTCATTTCAGTTTGCTTATGGCCAAAGACAGGACCTGTGTACCCGACAACCCCTGGGACCTTTACCAAAAAAAGAGCAAACACCATTCACTCACTCATGTTAGATAAACACTGAGTGAAGTCACTGGAGCCCAAGGACTGTGCGAGGTCAGCACTGCCAATACAAGAAGCTGCAGCCCTCCAGCTCGCctccctcaatggccactccgtgctccagccatgctggcttccttttaggtcctccacctccaggctgtagttcatgtgcttctttctggaatgttcttcccaacctacccactcaaccctcagactttaccataaatgtcatttcctcacgtctgccttccctgacctgagaccaagccaggCTTCCCATGACGAGCCTCACAGTACCCCATCTCCCCTGAACAGATGCAGTAATAACCTACATAACccggggccatgatctatggctttgaatcctggctctgtcactaggccaggtctctcagcccttctgtgcctcagtttcctcatctataaaatgagatgacggcagtgcctgctcatgaagtgtgagttaatgcactcaaatcaatggttgtgcacggtttatatgaatattagtgattaCAAAATATTATCAatagaccttgtcacaactgttattgaagaactaatcatctattgcttatttaggtctttctctcctgccagaatgtgcgctccaggtggagaggtatgttgccttatccgtggctggatatatagagattcccacactgccttgcacacgagcactgctgggtaaatatttgttggctgcaggaaAACGTGAAGGAATAGGCCCTCCAATGGGAGGAAAAGCATGAGTTGTGAGAGCAGAGCCACCACAGGAAACCAGGAGGCTAAGTGGGGTGGAAGGGAGTGAGCTCTCGGACTCCCAGGAGTAAAAGCTTCCAAGTTGGGCTCTCACTTCAGCCCCTCCCACACAGGGAAGCCAGATGGGTTCCCCAGGACCGGGATTCCCCAAGGGGGCTGCTCCCAGAGGGTGTGTTGCTGGGATTGCCCAGGACAGGGATGGCCCTCTCATCAGGTGGGGGTGAGTGGCAGCACCCACCTGCTGAAGATGTCTCCAGAGACCTTCTGCAGGTACTGCAGGGCATCCGCCATCTGCTGGACGGCCTCCTCTCGCCGCAGGTCTGGCTGGATGAAGGGCACGGCATAGGTCTGACCTGCCAGGGAGTGCTGCATCCTCACAGGAGTCATGGTGCCTGTGGGTCGGAGCCGGAGCGTCAGAGCCACCCACGACCACCGGCACGCCCCCACCACAGGGCAGCGTGGTGTTGAGACAACACAGCCCTCATCCCAACTATGCACATAGCTTCAGCCTGCACAGATAGGGGAGTAGGGGACAGAGCATTTGCTGAGAGGCCAGGAGCGCATAGATGGGACTCTGCTGATGCCTGCTGAGTGAATGAGGGAAAGGGCAGGGCCCGGGACTGGGGAATCTGTAGGGTCAATGGAGGAGTTCAGAGAAGGTGCAACATTTCTGACCCCCTACAAGGTGCTTGCTACCTGCCAGGCACCCTTTCCATACCTTGTCTCAGTTCAGCTCCCCACCTTGGATAAACAAGAAACCTTGGTTGCAGAGGAAAAAAGAGGCTGGAAACAAAGGGGTAGAAATGGGGTAGCAGGGGAGATTGCCTGATCAACTGCCAAATGGTACACAGTTCTGGAAAAGCACAAAAAATGTGCACACACGGGTTCTTCCCACTTTAACCCCTGAGGAATCTGAGGCCTGCTCCTGAAACAGACTGGGCAGTGGCTAGTGACTCTAGGTATAGGAGTATCCAGCCCTGCTCACCCAGGCTAGAGCTTAGGGGGACAAGAGGAAAGAGGTGCCTGTGGGGGTGGAGGACAGGAAGGAAAAACACTCCTGGAATTGCAAAGTGAGGGCAGAGTCTATTTATATTGGGTTTAATTAACTCCTCTCCCTGGTGCCACTAAAGCAGCAATCACACTGCAGACAGCACTGATTTGATTGGCAAGAGATGCACCAGGCAGAATATTAAGGGACCAGGCCCCTATAAATAGGCCTAATCACAGCCCCTCACTGGAAAATGGTAAGGAAGACATTAATCAGGCCTGGCACTGTGCCCTAGACCTGCTCCCCTAGGCACTACAGTGGGGCCCTTGGTTGCAACACAAGTAGGTAGGGATGGATGAGTGTGGCATGAAGGGCCTAGGAGATTTCACTTGGGTTTAAAATGCTGTGACCTTGAGTAAGTTGCCGTCTCTGAATCTGATCCTTTCGATTTCCCATTCTCCAAACTGAGAACTAGCACTGCTGAGACGTGGTTATTTCCAATAATAATTTGTATATTTTACATAACGCACCACACCAACATCTTCACCCAGTTGGAGCCTACTCCTTTGCTCCCGCTGCTGGCTTCCCCAGCCCTCCCTTCTGCCCTCCTCAGGCCAGCACTTTTCAGTGAGTTCCTCCTTTGCATACAGGCTTTCCAGATCTGTACTTGCCTTGAATACTCATCAGAGCCCAGGAGTTACTCCTCACCTCCCACTTATTTTTCCTCCCATCAAATAACTAAAGCATGGCCAGCTGATGCCCAGCCAACTGAGAAACCCAACCCTCTGAGACCAGCACACCCCTTTCAAGCATGTTCCTCCCTCCCCTTCTTTGTATTTATACTGATGCAAGTTTGCTGGCTGTcctaacttatttctgtgcctcagttctcccatatgtaagatcacaaagggggtaaagaTGCAAGATATTTCCTGTGCACATCTTCAGATGAATTTCT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| 285 | |
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| 329 | |
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| 333 | |
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| 335 s hg18.chr1 219723 401 + 247249719 gaaaccccgtctctaccaaaaatacaaaaattagatgggcaggacggcatgtgcctgtagtcccaggtaatcaggaggctgaggagggaggatcgtttgcacccaggaggtagaggttgcagtgagctgacattgcacctttgcactccagcctgggcgatagagccagaccctgtctcaaaaaaaaTTTTTTT-AAATgaaaactatagccattgtgagttatcagattctagtcttgtttcttgtttctgggctatttttacctctttgtaaactggatcctgccatctgatgaattttGTCCCACAATGATACTTGGGGAACAAGAAGCCAAGTATTGTCTCTCCTACTAATGTATCTATTGTCAGTTAATTTGAAGGTCTCCAACCCTGGAACAAAGT | |
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| 340 s panTro2.chrUn 1540276 270 + 58616431 TAGAAGAGGAAGGTTCTGCTCCCCAAaatgcataaccaaattgtggtacattcatgtaatggaatactatttagccatagaaaggaacaagctatcaactgacacaaagacatgagtgaatcttgcatgcacattgctaaatggaagaagacagtctgaggaggatacacacaatgtgatctcatttaatgagacactggagaaggcaaactatacagatgggaagccattggctccatggggtgggggtttgaagcattccatatgata | |
| 341 | |
| 342 a score=49220 | |
| 343 s hg18.chr1 220394 611 + 247249719 ctttaatagtgggatatctgccacaatgcatttgtcgaaatatgcagaattttacagccaaatggttaaagcaaactctattcaaattaaatcaaattactcaggatgtggagtatcccaggacagaatacatcatgtgaaaaagaatttatgctacaaattacgatggtttggatgtggtttgtccccacaaaaactcatgttgaaatttgactcccactgtgtcagtgtggggcggtggggcctagtggacggtgtttgggtcgtggggacggatccctcatgaaaggattaatgtcctccatgggggtgagtgagttctgttctcacaggaatagat-aattcctgcaggagcaggtaattaaaaagagtctggcttccttggcttccctcttgctttcacttctgctatgtgatctctggtgcaccccttgctccccttccactttccaccatgaggtgaaaaagactgaggccccgccagatgcaactgcccaatctcagacattccagccaccagtattgtgaaccaaatgaaacttttttacttataaattacgcagcctcaggtattctgttacagaagcacaaaatggactaagacacaaatc | |
| 344 s panTro2.chrUn 56831951 612 - 58616431 ctttaatagggggatatctgccacaatgcatttatcaaaatacacagaattttatgaccaaatgggtaaatcaaactctattcaaattaaacaaaattactcaggatgtggagtatcccaggacagaatgcatcacgtgaaaaagaatttatgctacaaattactatggtttggatgtggtttgtccccgcaaaatctcatgttgaaatttgacccccaatgtggcagtgtgaggcggtggggcatagtggatggtgtttgggtcatggggacggatccctcatgaatagattaatgtcctccacagggatgactcagttctgctctcataggaatggattaattcctgcaggagtgggtaattaaaaagagtctggcttccttggcttcccttttgctttcacttttgctatgtgatctctggtgcaccccttgctccccttccgctttccaccatgaggtgaaaaagactgaggccccaccagatgcaactgcccaatctcagacattccagctactagtattgtgagccaaatgaatcttttttacttataaattagccagcatcaggtattctgttacagaagcacaaaatggactaggtaaaaactc | |
| 345 | |
| 346 a score=282229 | |
| 347 s hg18.chr1 221014 3176 + 247249719 actttgaaaatgaatagaatctgtaggctgaaggcacatgaactatacttcattattggattccattttataaagttctttccaacagaagcaattgtgaacaattgtaaaaccacagtgtctgtatctggagtaaaacaatgacttacataagtcgcagatggtgggaaccagctttctcactgttgaagtgggaggttacaaattagcaagacgagaaggctagaatgattcctgtgatagtagatcagaggtggagacatcaacgtaaacttatgcttagtttaatatagatacacacagttctacatagaaaactttataattaggtgtgtgtaggtaggttagacacgcacatatacttcctagcattgctaatgagggacaagatacaatgtgcattcagcagccacatgtaagttttcccaccattctgaaaggaatcaggctctttgaagaaatgtctgatactagaactgggacagtaaatataggagccaggataatctggaagtatcagaaagtaagtactaaaaaaattaaaatatatcaaacaaaaataaaagccaataaaaacagctaccgatggccaacacaggaaggaattgtgcaacataatgctatagtgtcaaataataactaaagcttaaagtaattatctaggtgtctgtatttgtatacctaggtgaataagcaaatggagttgcatagaaatctcctttgcaaaagaattccaaataactgatgtagacactcagccatcaagaaggtggagccaactcctcactccgtaagtgtgggctctgcatagtgacttgctccaaaagaacacatgcagtacggacaaggaggaaaaataacttcacagtggagaaatctgacaaacagtagctctgccaaatgatccaagtgaatatcaaagctgacagttcaccttgagaacatgaagtgacaatggggggcattctacaaaattcctgaccaatcctcctcagtgctatgaaggtcatcatgagatggaaagcctgacacactgtcacagccaggaagagcctatgtgatgactacatgccgtgcgggatcctggatgggatcctgggtcagagtaagatagaactaagggaatccaaatgaaatatgaacttcagttaataacagtctatcagtattggttcattaactgcggcaaattatgtaagatattaataagccatgtgagacacactgatagaagatgttaataagagaggaaactaggttgcggctacatgggaaatctctgctttttttttttgacgatttctgtgtaagtaaaaaaaagacgtaaaataaaactttatttaaaaCACAGTTTTTTTAACACTTCCTTGTTTAATTATTTATACCATGAATTACTAGTAATTGACACTGTTAACTAGTCCTGTTTTTTAAAATAAGAGCAATTATGACACAAAAAATTAAACAGTGCAGACTGATATATAAATCAAAACAAATGTCCTTTACATGTTTTCTGTTACAGTAGTAACA-ATATGTGTAAACTTAATTATCATATTTTTTTCTTGTGCTGTGGTTGTGTCCTGGGTTCATTCTCTAAAATGCTGTTCACCTTAGACCAGGAAAAATATTAACCATACAGACTCTGTTTCAAGTCATAGCTGAATATTTTCAAAAGAGTGACTTTGTAAAAACATGTTCCAATGGCAAATTGATTCATTGTGATGGGATCAATTATTCCAAAGACTTCTTGTCTTTATTTTGTTCCCATGCCTACCTTTTAGCCATAATACAACAGAATCAAATATTGGCCACTGGGAAAAAA--TATTCAAAGAAAGAAAGAATGTGAACAGAACTTATGACCATGATGATTCAATGTTTTACCACAATGCTTTCTAAAACAAAAGAGTCTAAAAGGATATTCAAAGTCAATTTCCTCAGCGAGGATTTGCAGAAAATGAGGAAACTAGAAAAACAAAAATGGCGGGACATTCTACGGGTGATTTTAAATGTTGCTATGTTTTATGGGAAAAAATACTTTACCTTTTAAAGAATCACAAAGAATTATTGGAAACCCAAACTCTGGAATGTTTGCAAATTTAGTTGAGCTTCTGTGTAATTATGTCTATATAGGTAGCCATGAAGTTGATGATTTCTTAAAAATCTGTGCCTTATTTGTGTAATAAAAGACACAATGAATAATTAATACTCATAGGAACACTTACgaagggaaaataaatcttggggactcaaaatcactaagctaaagggaaaagtcaagctgggaactgcttagggcaaacccgcctcccattctatccaaa-acacccgtctgatcacctagataaatgcatacctgattgcctcacatggagagggtaatcagcaatgcaaaagaatgaaaccatttgtctcttacctacctgtgacctggaagccccctgtctggccttctcacctttctggactgaaccaatgtacatcttacacgtattgattgatctctcgtgtctccctaaagtgtataaaaccaagctgtgccccgaccaccttgggcccatgttgtcaggatctcctgaggaggcatcacaggcgcacatcctcaagattggcaaaataaactttctaaaaaatctgagagctgtctcagattttcagggttcacaCATGTAATGTAGGATGTCAATGTTTATAAAAGGGATGTTATTCTATCTACTATTAGAAATATGCTGTCAATTAACCTTAAACTTTCTCAACACAATAAAAAATGTTGATGAGGTACAAATAATATATCTAGGCTTAAATAGTGTTGCAAGTTTTAATATGCCTACTTTTCAATTTTTCAATACTATCTTTACTAATTTAACACTGTAAGAAAAATGAGTAATTAAAACATGAATAAAAGTGTTTACAGGGGATGCACATGTTTCCTCCAGCCTCTGCCTATACCCAACTTTCATCCCAACTGTCCTGATGGTGGCTCTAAGCATTTCTCCTTTCTCTATACCAAGATATCTCCCCAGAAACAAACCCAAATCTTACTATATGTTATGGCACGCTATGATGATGAGCAGCGATGAGCAGCCGAAGCCTCAAGGAAGGGATGCTTTTGTAAAACAAGACTTGTGGAATATAACATGTGAAAGTAAAGCCCATGGCAGAACTCCCTCCTCAGCACACGG | |
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| 349 | |
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| 361 | |
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