Mercurial > repos > devteam > picard

view test-data/random_phiX_1.fastqsanger @ 3:bf1c3f9f8282

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Fix for FastqToSam MAX_Q usage detection.
author Daniel Blankenberg <dan@bx.psu.edu>
date Fri, 03 May 2013 17:13:01 -0400
parents 1cd7f3b42609
children
line wrap: on
line source

@random_phiX_region_0
TTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCTTT
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_1
GTTAGTGCTGAGGTTGACTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTA
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_2
AATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTTTCCA
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_3
GGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTC
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_4
ACGCAAAAAGAGAGATGAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGAC
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_5
AGCTAAAGAATGGAACAACTCACTAAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCA
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_6
CACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGATGGTGTTAATGC
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_7
AACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGTTGGCG
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_8
CTCGTGCTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTT
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_9
CAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGACTTAGTTCA
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_10
TACAGTATGCCCATCGCAGTTCGCTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTC
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_11
TATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGA
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_12
AGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGGTGATA
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_13
TTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCA
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_14
CCGGGCAATAACGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGC
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_15
AACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTT
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_16
GCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACTGGACAATCA
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_17
CATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAG
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_18
TGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGA
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
@random_phiX_region_19
GCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACT
+
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~