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C T 75.2 PASS NS=368;DP=2111;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2096;AA=9;SR=1153|943;SA=5|4;SB=0.55556;AB=0.47059;ABR=8;ABA=9;RUN=2;SNP;TS +20 61098 . C T 99.0 PASS NS=366;DP=1780;AC=140;AN=732;AF=0.19126;RA=1457;AA=317;SR=600|857;SA=132|185;SB=0.4164;AB=0.56587;ABR=262;ABA=198;RUN=2;SNP;TS +20 61388 . T C 46.6 PASS NS=314;DP=1036;AC=2;AN=628;AF=0.0031847;RA=1025;AA=6;SR=709|316;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=1;SNP;TS +20 61409 . A G 36.0 PASS NS=340;DP=1212;AC=1;AN=680;AF=0.0014706;RA=1207;AA=4;SR=876|331;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 61517 . C T 13.8 PASS NS=363;DP=2032;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2019;AA=7;SR=1200|819;SA=7|0;SB=1;AB=0.72727;ABR=8;ABA=3;RUN=4;SNP;TS +20 61535 . A G 0.0666 PASS NS=362;DP=2048;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2037;AA=4;SR=1150|887;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 61848 . A G 0.0723 PASS NS=370;DP=2478;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2458;AA=9;SR=1313|1145;SA=2|7;SB=0.22222;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 61986 . G A 0.054 PASS NS=364;DP=2106;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2072;AA=26;SR=906|1166;SA=0|26;SB=0;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 62100 . T C 82.3 PASS NS=363;DP=2082;AC=3;AN=726;AF=0.0041322;RA=2069;AA=8;SR=1052|1017;SA=2|6;SB=0.25;AB=0.5;ABR=7;ABA=7;RUN=1;SNP;TS +20 62255 . T C 99.0 PASS NS=361;DP=2204;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2195;AA=6;SR=1247|948;SA=6|0;SB=1;AB=0.57143;ABR=8;ABA=6;RUN=1;SNP;TS +20 62348 . A G 99.0 PASS NS=350;DP=1861;AC=2;AN=700;AF=0.0028571;RA=1845;AA=10;SR=949|896;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.23077;ABR=3;ABA=10;RUN=1;SNP;TS +20 62420 . A G 46.8 PASS NS=364;DP=1821;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1812;AA=3;SR=933|879;SA=0|3;SB=0;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 62471 . G A 43.6 PASS NS=350;DP=1782;AC=2;AN=700;AF=0.0028571;RA=1772;AA=7;SR=891|881;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.69231;ABR=9;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 62530 . A G 1.17 PASS NS=364;DP=2137;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2129;AA=4;SR=1034|1095;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 62553 . T C 0.193 PASS NS=345;DP=2009;AC=2;AN=690;AF=0.0028986;RA=1986;AA=5;SR=869|1117;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=2;SNP;TS +20 62727 . C T 8.51 PASS NS=347;DP=1801;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1794;AA=2;SR=906|888;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 62739 . T C 7.0 PASS NS=342;DP=1646;AC=1;AN=684;AF=0.001462;RA=1623;AA=7;SR=812|811;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 62783 . A G 17.3 PASS NS=328;DP=1471;AC=1;AN=656;AF=0.0015244;RA=1455;AA=8;SR=665|790;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 63054 . A G 48.5 PASS NS=364;DP=2097;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=2082;AA=8;SR=1090|992;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.52941;ABR=9;ABA=8;RUN=2;SNP;TS +20 63055 . A G 0.234 PASS NS=362;DP=2088;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2078;AA=4;SR=1096|982;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 63063 . T C 0.0841 PASS NS=363;DP=2065;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2059;AA=2;SR=1083|976;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 63141 . T C 2.61 PASS NS=360;DP=1900;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1891;AA=2;SR=1041|850;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 63351 . A G 30.7 PASS NS=369;DP=2363;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2354;AA=5;SR=1414|940;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 63360 . C T 38.4 PASS NS=367;DP=2348;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2334;AA=4;SR=1363|971;SA=0|4;SB=0;AB=0.63636;ABR=7;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 63466 . A G 0.305 PASS NS=369;DP=2343;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2334;AA=3;SR=1290|1044;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 63521 . G A 33.5 PASS NS=370;DP=2387;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2376;AA=3;SR=1217|1159;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 63680 . A G 0.841 PASS NS=371;DP=2758;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2741;AA=5;SR=1422|1319;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 63733 . C T 99.0 PASS NS=366;DP=2571;AC=58;AN=732;AF=0.079235;RA=2363;AA=200;SR=1311|1052;SA=101|99;SB=0.505;AB=0.50291;ABR=173;ABA=171;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 63746 . C T 0.0651 PASS NS=369;DP=2564;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2552;AA=3;SR=1391|1161;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 63799 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2322;AC=331;AN=734;AF=0.45095;RA=1274;AA=1026;SR=610|664;SA=489|537;SB=0.47661;AB=0.53157;ABR=564;ABA=494;RUN=3;SNP;TS +20 63967 . A G 99.0 PASS NS=370;DP=2363;AC=21;AN=740;AF=0.028378;RA=2276;AA=68;SR=911|1365;SA=26|42;SB=0.38235;AB=0.48837;ABR=63;ABA=66;RUN=1;SNP;TS +20 63983 . C T 0.569 PASS NS=371;DP=2349;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2334;AA=3;SR=892|1442;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 64016 . G A 32.3 PASS NS=370;DP=2259;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2231;AA=15;SR=854|1377;SA=1|14;SB=0.066667;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=2;SNP;TS +20 64062 . G A 62.0 PASS NS=370;DP=2274;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2264;AA=6;SR=953|1311;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=3;SNP;TS +20 64175 . A G 97.6 PASS NS=369;DP=2213;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2192;AA=10;SR=838|1354;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.22222;ABR=2;ABA=7;RUN=3;SNP;TS +20 64560 . A G 0.0799 PASS NS=358;DP=1831;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1824;AA=4;SR=1057|767;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 64587 . A G 1.36 PASS NS=357;DP=1971;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1963;AA=3;SR=1234|729;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 64597 . T C 0.152 PASS NS=359;DP=1981;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1974;AA=3;SR=1238|736;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 64618 . G A 0.794 PASS NS=361;DP=2018;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2011;AA=3;SR=1263|748;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=4;SNP;TS +20 64624 . T C 5.08 PASS NS=364;DP=2000;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1994;AA=3;SR=1238|756;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 64625 . A G 99.0 PASS NS=363;DP=1995;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1980;AA=7;SR=1229|751;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=1;SNP;TS +20 64647 . T C 0.188 PASS NS=362;DP=1911;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1899;AA=5;SR=1157|742;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 64656 . C T 2.15 PASS NS=368;DP=1875;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=1866;AA=3;SR=1113|753;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 64672 . T C 48.3 PASS NS=365;DP=1877;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1869;AA=5;SR=1097|772;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.375;ABR=3;ABA=5;RUN=1;SNP;TS +20 64771 . A G 0.563 PASS NS=365;DP=2023;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2017;AA=2;SR=1315|702;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 64898 . G A 49.7 PASS NS=371;DP=2342;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2329;AA=7;SR=1249|1080;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS +20 65122 . T C 1.23 PASS NS=368;DP=2280;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2265;AA=3;SR=976|1289;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 65240 . G A 89.4 PASS NS=364;DP=2106;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=2087;AA=8;SR=941|1146;SA=0|8;SB=0;AB=0.25;ABR=2;ABA=6;RUN=1;SNP;TS +20 65241 . T C 0.371 PASS NS=364;DP=2101;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2087;AA=8;SR=934|1153;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 65562 . A G 6.8 PASS NS=325;DP=1375;AC=2;AN=650;AF=0.0030769;RA=1343;AA=4;SR=759|584;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 65578 . T C 3.24 PASS NS=327;DP=1379;AC=1;AN=654;AF=0.0015291;RA=1375;AA=3;SR=790|585;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 65632 . C T 40.9 PASS NS=366;DP=1714;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1703;AA=5;SR=918|785;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.2;ABR=1;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 65850 . G A 0.111 PASS NS=307;DP=1146;AC=1;AN=614;AF=0.0016287;RA=1128;AA=3;SR=696|432;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 65900 . G A 99.0 PASS NS=325;DP=1412;AC=530;AN=650;AF=0.81538;RA=271;AA=1129;SR=145|126;SA=639|490;SB=0.56599;AB=0.47594;ABR=178;ABA=193;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 65986 . G A 8.36 PASS NS=370;DP=2269;AC=3;AN=740;AF=0.0040541;RA=2255;AA=6;SR=1197|1058;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 66029 . T C 0.101 PASS NS=339;DP=1544;AC=1;AN=678;AF=0.0014749;RA=1526;AA=7;SR=748|778;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 66060 . C T 6.42 PASS NS=324;DP=1304;AC=1;AN=648;AF=0.0015432;RA=1297;AA=3;SR=613|684;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 66248 . C T 12.0 PASS NS=288;DP=1080;AC=1;AN=576;AF=0.0017361;RA=1074;AA=2;SR=440|634;SA=2|0;SB=1;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 66370 . G A 99.0 PASS NS=262;DP=824;AC=404;AN=524;AF=0.77099;RA=185;AA=629;SR=79|106;SA=267|362;SB=0.42448;AB=0.55801;ABR=101;ABA=79;RUN=1;SNP;TS +20 66388 . C T 0.809 PASS NS=269;DP=809;AC=1;AN=538;AF=0.0018587;RA=798;AA=3;SR=351|447;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 66620 . C T 2.19 PASS NS=338;DP=1326;AC=1;AN=676;AF=0.0014793;RA=1319;AA=3;SR=634|685;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=4;SNP;TS +20 66705 . C T 4.94 PASS NS=292;DP=835;AC=8;AN=584;AF=0.013699;RA=819;AA=10;SR=483|336;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.5;ABR=6;ABA=6;RUN=1;SNP;TS +20 67080 . A G 0.371 PASS NS=355;DP=1745;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1732;AA=4;SR=907|825;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 67461 . A G 99.0 PASS NS=357;DP=1894;AC=4;AN=714;AF=0.0056022;RA=1872;AA=14;SR=841|1031;SA=8|6;SB=0.57143;AB=0.5;ABR=13;ABA=13;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 67563 . A G 3.64 PASS NS=360;DP=1912;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1904;AA=4;SR=1033|871;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 67573 . C T 4.67 PASS NS=364;DP=1888;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1878;AA=6;SR=1028|850;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 67641 . C T 99.0 PASS NS=364;DP=1910;AC=23;AN=728;AF=0.031593;RA=1837;AA=67;SR=897|940;SA=35|32;SB=0.52239;AB=0.52679;ABR=59;ABA=53;RUN=1;SNP;TS +20 67644 . T C 40.4 PASS NS=365;DP=1899;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=1887;AA=9;SR=933|954;SA=4|5;SB=0.44444;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 67646 . G A 3.98 PASS NS=365;DP=1897;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1877;AA=6;SR=923|954;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 67760 . C T 67.6 PASS NS=367;DP=2169;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2152;AA=5;SR=1181|971;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 67765 . C T 99.0 PASS NS=369;DP=2200;AC=3;AN=738;AF=0.004065;RA=2178;AA=11;SR=1201|977;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.42857;ABR=6;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 67831 . C T 0.781 PASS NS=371;DP=2294;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2281;AA=5;SR=1237|1044;SA=2|3;SB=0.4;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=4;SNP;TS +20 68015 . C T 0.113 PASS NS=369;DP=2466;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2453;AA=5;SR=1313|1140;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.875;ABR=14;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 68055 . A G 0.102 PASS NS=370;DP=2540;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2522;AA=5;SR=1296|1226;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.86667;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 68075 . T C 0.0657 PASS NS=370;DP=2582;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2562;AA=8;SR=1291|1271;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 68190 . T C 0.109 PASS NS=368;DP=2678;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2661;AA=5;SR=1481|1180;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 68205 . A G 31.9 PASS NS=369;DP=2686;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2672;AA=6;SR=1492|1180;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 68264 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=2558;AC=98;AN=738;AF=0.13279;RA=2173;AA=376;SR=1055|1118;SA=202|174;SB=0.53723;AB=0.48951;ABR=280;ABA=292;RUN=1;SNP;TS +20 68474 . A G 31.0 PASS NS=370;DP=2532;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2507;AA=14;SR=1171|1336;SA=2|12;SB=0.14286;AB=0.58333;ABR=7;ABA=5;RUN=1;SNP;TS +20 68505 . A G 0.483 PASS NS=369;DP=2490;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2477;AA=3;SR=1140|1337;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 68535 . G A 99.0 PASS NS=369;DP=2573;AC=12;AN=738;AF=0.01626;RA=2503;AA=58;SR=1186|1317;SA=32|26;SB=0.55172;AB=0.50893;ABR=57;ABA=55;RUN=1;SNP;TS +20 68618 . G A 99.0 PASS NS=368;DP=2561;AC=21;AN=736;AF=0.028533;RA=2451;AA=93;SR=1224|1227;SA=48|45;SB=0.51613;AB=0.45517;ABR=66;ABA=78;RUN=1;SNP;TS +20 68749 . T C 99.0 PASS NS=368;DP=2323;AC=426;AN=736;AF=0.5788;RA=983;AA=1334;SR=457|526;SA=640|694;SB=0.47976;AB=0.47215;ABR=568;ABA=632;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 68799 . T C 1.55 PASS NS=367;DP=2269;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2213;AA=15;SR=1064|1149;SA=14|1;SB=0.93333;AB=0.66667;ABR=8;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 68815 . C T 0.275 PASS NS=367;DP=2245;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2226;AA=3;SR=1051|1175;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 68926 . T C 0.43 PASS NS=369;DP=2139;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2120;AA=4;SR=904|1216;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.61538;ABR=8;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 69094 . G A 99.0 PASS NS=362;DP=2092;AC=318;AN=724;AF=0.43923;RA=1227;AA=857;SR=691|536;SA=451|406;SB=0.52625;AB=0.49681;ABR=389;ABA=392;RUN=1;SNP;TS +20 69145 . A G 0.195 PASS NS=367;DP=1999;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=1991;AA=5;SR=1033|958;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 69305 . T C 0.123 PASS NS=367;DP=1964;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=1956;AA=3;SR=1101|855;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 69355 . C T 4.52 PASS NS=367;DP=2009;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2000;AA=3;SR=970|1030;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 69376 . G A 0.665 PASS NS=367;DP=2085;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2077;AA=3;SR=1003|1074;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 69408 . C T 99.0 PASS NS=366;DP=2154;AC=38;AN=732;AF=0.051913;RA=2013;AA=133;SR=894|1119;SA=60|73;SB=0.45113;AB=0.51685;ABR=138;ABA=128;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 69656 . T C 0.253 PASS NS=366;DP=2096;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2090;AA=2;SR=1030|1060;SA=0|2;SB=0;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 69668 . T C 40.6 PASS NS=365;DP=2114;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2104;AA=6;SR=1026|1078;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 69835 . A G 0.671 PASS NS=363;DP=1953;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1943;AA=5;SR=936|1007;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 69966 . T C 0.661 PASS NS=351;DP=1768;AC=2;AN=702;AF=0.002849;RA=1762;AA=4;SR=773|989;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 70470 . A G 4.57 PASS NS=359;DP=1690;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1681;AA=2;SR=1065|616;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 70490 . C T 0.934 PASS NS=358;DP=1682;AC=5;AN=716;AF=0.0069832;RA=1665;AA=12;SR=962|703;SA=11|1;SB=0.91667;AB=0.2;ABR=1;ABA=4;RUN=5;SNP;TS +20 70611 . G A 0.143 PASS NS=362;DP=1806;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1788;AA=5;SR=1077|711;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 70696 . T C 1.72 PASS NS=365;DP=1849;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1839;AA=4;SR=983|856;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 70785 . A G 99.0 PASS NS=368;DP=1990;AC=14;AN=736;AF=0.019022;RA=1938;AA=40;SR=1005|933;SA=20|20;SB=0.5;AB=0.51852;ABR=42;ABA=38;RUN=1;SNP;TS +20 70804 . C T 4.03 PASS NS=369;DP=2057;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2042;AA=5;SR=1069|973;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 70917 . T C 1.54 PASS NS=369;DP=2193;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2182;AA=2;SR=1110|1072;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 70920 . A G 99.0 PASS NS=368;DP=2172;AC=13;AN=736;AF=0.017663;RA=2121;AA=45;SR=1084|1037;SA=24|21;SB=0.53333;AB=0.38462;ABR=25;ABA=40;RUN=2;SNP;TS +20 70980 . G A 99.0 PASS NS=368;DP=2339;AC=39;AN=736;AF=0.052989;RA=2221;AA=106;SR=1223|998;SA=71|35;SB=0.66981;AB=0.57416;ABR=120;ABA=89;RUN=1;SNP;TS +20 71015 . T C 0.569 PASS NS=371;DP=2398;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2390;AA=5;SR=1364|1026;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 71037 . T C 0.223 PASS NS=369;DP=2289;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2279;AA=4;SR=1353|926;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 71079 . C T 99.0 PASS NS=370;DP=2338;AC=60;AN=740;AF=0.081081;RA=2168;AA=166;SR=1421|747;SA=102|64;SB=0.61446;AB=0.53086;ABR=129;ABA=113;RUN=1;SNP;TS +20 71093 . G A 99.0 PASS NS=365;DP=2393;AC=93;AN=730;AF=0.1274;RA=2085;AA=299;SR=1382|703;SA=194|105;SB=0.64883;AB=0.5317;ABR=260;ABA=225;RUN=1;SNP;TS +20 71281 . G A 66.6 PASS NS=369;DP=2496;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2481;AA=11;SR=1273|1208;SA=4|7;SB=0.36364;AB=0.66667;ABR=12;ABA=6;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 71290 . A G 0.526 PASS NS=368;DP=2466;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2448;AA=4;SR=1262|1186;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 71454 . T C 0.691 PASS NS=370;DP=2518;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2498;AA=5;SR=1203|1295;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 71543 . A G 1.37 PASS NS=369;DP=2378;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2369;AA=6;SR=1023|1346;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=3;SNP;TS;CpG +20 71809 . G A 27.3 PASS NS=354;DP=1947;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1937;AA=3;SR=923|1014;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 71850 . T C 0.131 PASS NS=358;DP=2062;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=2055;AA=2;SR=1053|1002;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 71859 . G A 14.4 PASS NS=355;DP=2030;AC=3;AN=710;AF=0.0042254;RA=2010;AA=7;SR=1055|955;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 72036 . G A 99.0 PASS NS=349;DP=2037;AC=6;AN=698;AF=0.008596;RA=2022;AA=11;SR=1106|916;SA=5|6;SB=0.45455;AB=0.60714;ABR=17;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 72287 . A G 0.0526 PASS NS=369;DP=2216;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2210;AA=2;SR=1016|1194;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 72406 . C T 0.0949 PASS NS=366;DP=2205;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2191;AA=2;SR=1075|1116;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 72604 . A G 2.22 PASS NS=363;DP=2084;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2079;AA=3;SR=1043|1036;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 72665 . G A 99.0 PASS NS=365;DP=2216;AC=3;AN=730;AF=0.0041096;RA=2198;AA=11;SR=1006|1192;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.5;ABR=10;ABA=10;RUN=2;SNP;TS +20 72719 . C T 99.0 PASS NS=360;DP=2045;AC=12;AN=720;AF=0.016667;RA=2005;AA=33;SR=968|1037;SA=19|14;SB=0.57576;AB=0.52174;ABR=36;ABA=32;RUN=3;SNP;TS +20 72772 . A G 0.311 PASS NS=371;DP=2065;AC=2;AN=742;AF=0.0026954;RA=2051;AA=5;SR=1145|906;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 72815 . T C 25.8 PASS NS=367;DP=2079;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2062;AA=8;SR=1133|929;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 72882 . T C 4.28 PASS NS=369;DP=2031;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2013;AA=5;SR=914|1099;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 72887 . A G 2.42 PASS NS=367;DP=2020;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2004;AA=6;SR=906|1098;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 72890 . A G 1.25 PASS NS=366;DP=2018;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2006;AA=3;SR=910|1096;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 72892 . G A 99.0 PASS NS=365;DP=2011;AC=36;AN=730;AF=0.049315;RA=1913;AA=88;SR=863|1050;SA=43|45;SB=0.48864;AB=0.56647;ABR=98;ABA=73;RUN=5;SNP;TS +20 72894 . T C 77.5 PASS NS=365;DP=2035;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2010;AA=11;SR=921|1089;SA=4|7;SB=0.36364;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 73369 . C T 5.68 PASS NS=365;DP=1955;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1943;AA=6;SR=800|1143;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=4;SNP;TS +20 73416 . C T 0.0527 PASS NS=362;DP=1908;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1894;AA=3;SR=937|957;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 73767 . A G 3.17 PASS NS=284;DP=893;AC=1;AN=568;AF=0.0017606;RA=883;AA=3;SR=402|481;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 73858 . C T 96.7 PASS NS=341;DP=1497;AC=9;AN=682;AF=0.013196;RA=1483;AA=13;SR=916|567;SA=8|5;SB=0.61538;AB=0.64516;ABR=20;ABA=11;RUN=1;SNP;TS +20 73888 . G A 0.0568 PASS NS=351;DP=1692;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1679;AA=4;SR=945|734;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 73957 . G A 13.1 PASS NS=368;DP=2167;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2158;AA=3;SR=1176|982;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 74009 . C T 3.44 PASS NS=369;DP=2230;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2224;AA=2;SR=1283|941;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 74142 . A G 0.849 PASS NS=370;DP=2293;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2273;AA=7;SR=1239|1034;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 74232 . T C 0.106 PASS NS=366;DP=2368;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2348;AA=6;SR=1206|1142;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 74247 . T C 99.0 PASS NS=365;DP=2372;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2353;AA=9;SR=1194|1159;SA=2|7;SB=0.22222;AB=0.3;ABR=3;ABA=7;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 74281 . C T 3.59 PASS NS=366;DP=2430;AC=2;AN=732;AF=0.0027322;RA=2418;AA=5;SR=1176|1242;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=2;SNP;TS +20 74347 . G A 99.0 PASS NS=371;DP=2504;AC=76;AN=742;AF=0.10243;RA=2237;AA=253;SR=1152|1085;SA=127|126;SB=0.50198;AB=0.52459;ABR=224;ABA=203;RUN=1;SNP;TS +20 74617 . A G 4.15 PASS NS=365;DP=2159;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2139;AA=6;SR=1030|1109;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 74747 . C T 0.125 PASS NS=355;DP=2085;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=2069;AA=10;SR=1059|1010;SA=9|1;SB=0.9;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=2;SNP;TS +20 74776 . T C 0.0648 PASS NS=357;DP=2083;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2066;AA=5;SR=1096|970;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 74801 . T C 0.234 PASS NS=361;DP=1925;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1921;AA=2;SR=960|961;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 75026 . G A 6.27 PASS NS=361;DP=2078;AC=3;AN=722;AF=0.0041551;RA=2063;AA=9;SR=1109|954;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=6;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 75040 . T C 2.13 PASS NS=367;DP=2087;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2076;AA=3;SR=1074|1002;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 75280 . A G 0.0778 PASS NS=350;DP=1862;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1823;AA=17;SR=786|1037;SA=0|17;SB=0;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=1;SNP;TS +20 75389 . C T 2.19 PASS NS=361;DP=2144;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2136;AA=4;SR=1054|1082;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 75514 . C T 0.116 PASS NS=369;DP=2263;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2248;AA=7;SR=1190|1058;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 75516 . A G 99.0 PASS NS=369;DP=2296;AC=5;AN=738;AF=0.0067751;RA=2273;AA=14;SR=1217|1056;SA=3|11;SB=0.21429;AB=0.42105;ABR=8;ABA=11;RUN=1;SNP;TS +20 75880 . G A 4.19 PASS NS=369;DP=2153;AC=3;AN=738;AF=0.004065;RA=2139;AA=7;SR=1037|1102;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.5;ABR=5;ABA=5;RUN=3;SNP;TS +20 75999 . T C 99.0 PASS NS=371;DP=2394;AC=21;AN=742;AF=0.028302;RA=2315;AA=63;SR=1290|1025;SA=41|22;SB=0.65079;AB=0.50794;ABR=64;ABA=61;RUN=1;SNP;TS +20 76282 . G A 2.2 PASS NS=370;DP=2122;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2113;AA=2;SR=1137|976;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 76388 . G A 99.0 PASS NS=371;DP=2615;AC=3;AN=742;AF=0.0040431;RA=2588;AA=14;SR=1183|1405;SA=7|7;SB=0.5;AB=0.54167;ABR=13;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 76407 . C T 0.047 PASS NS=369;DP=2638;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2620;AA=7;SR=1141|1479;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=1;ABA=1;RUN=3;SNP;TS +20 76519 . T C 55.2 PASS NS=367;DP=2405;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2395;AA=6;SR=1135|1260;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS +20 76526 . G A 97.7 PASS NS=365;DP=2372;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2355;AA=6;SR=1100|1255;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.625;ABR=10;ABA=6;RUN=1;SNP;TS +20 76559 . G A 0.0519 PASS NS=366;DP=2361;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2351;AA=3;SR=1069|1282;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 76614 . T C 0.355 PASS NS=364;DP=2186;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2180;AA=2;SR=1061|1119;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 76668 . T C 0.299 PASS NS=370;DP=2308;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2288;AA=7;SR=1196|1092;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 76689 . T C 14.1 PASS NS=369;DP=2386;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2371;AA=7;SR=1247|1124;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 76796 . T C 18.7 PASS NS=368;DP=2408;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2393;AA=9;SR=1269|1124;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.76667;ABR=23;ABA=7;RUN=1;SNP;TS +20 76801 . G A 1.02 PASS NS=364;DP=2385;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2372;AA=4;SR=1252|1120;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 76915 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2285;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=2256;AA=11;SR=1262|994;SA=8|3;SB=0.72727;AB=0.5;ABR=10;ABA=9;RUN=1;SNP;TS +20 76920 . G A 65.7 PASS NS=367;DP=2288;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2276;AA=7;SR=1297|979;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.58824;ABR=10;ABA=7;RUN=2;SNP;TS +20 76934 . A G 40.7 PASS NS=368;DP=2253;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2238;AA=6;SR=1276|962;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 76962 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=2127;AC=599;AN=738;AF=0.81165;RA=436;AA=1670;SR=226|210;SA=898|772;SB=0.53772;AB=0.51024;ABR=299;ABA=281;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 77013 . C T 47.1 PASS NS=370;DP=2371;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2361;AA=5;SR=1049|1312;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.57143;ABR=8;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 77025 . A G 99.0 PASS NS=370;DP=2398;AC=4;AN=740;AF=0.0054054;RA=2351;AA=24;SR=1035|1316;SA=5|19;SB=0.20833;AB=0.57143;ABR=24;ABA=18;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 77115 . A G 0.997 PASS NS=371;DP=2355;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2344;AA=4;SR=1291|1053;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 77225 . T C 0.928 PASS NS=366;DP=2199;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2192;AA=3;SR=986|1206;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 77264 . C T 0.0587 PASS NS=369;DP=2275;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2261;AA=5;SR=1054|1207;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TS +20 77393 . G A 32.7 PASS NS=367;DP=2297;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2277;AA=11;SR=1261|1016;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=3;SNP;TS;CpG +20 77655 . T C 0.0462 PASS NS=371;DP=2542;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2533;AA=3;SR=1188|1345;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 77816 . G A 99.0 PASS NS=369;DP=2224;AC=16;AN=738;AF=0.02168;RA=2161;AA=45;SR=1004|1157;SA=21|24;SB=0.46667;AB=0.53571;ABR=45;ABA=37;RUN=1;SNP;TS +20 77870 . A G 0.0585 PASS NS=368;DP=2214;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2176;AA=15;SR=836|1340;SA=3|12;SB=0.2;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 77871 . C T 28.8 PASS NS=368;DP=2215;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2200;AA=11;SR=831|1369;SA=6|5;SB=0.54545;AB=0.75;ABR=9;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 77884 . T C 2.39 PASS NS=369;DP=2325;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2308;AA=4;SR=832|1476;SA=3|1;SB=0.75;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 77890 . T C 13.2 PASS NS=369;DP=2347;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2324;AA=5;SR=842|1482;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 78254 . C T 99.0 PASS NS=345;DP=1534;AC=11;AN=690;AF=0.015942;RA=1494;AA=34;SR=751|743;SA=18|16;SB=0.52941;AB=0.58824;ABR=50;ABA=34;RUN=1;SNP;TS +20 78455 . G A 99.0 PASS NS=342;DP=1209;AC=3;AN=684;AF=0.004386;RA=1190;AA=12;SR=657|533;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.45;ABR=9;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 78515 . G A 15.5 PASS NS=201;DP=435;AC=1;AN=402;AF=0.0024876;RA=429;AA=2;SR=37|392;SA=0|2;SB=0;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 79234 . T C 99.0 PASS NS=185;DP=299;AC=221;AN=370;AF=0.5973;RA=126;AA=171;SR=83|43;SA=113|58;SB=0.66082;AB=0.57447;ABR=27;ABA=20;RUN=1;SNP;TS +20 79509 . A G 6.23 PASS NS=341;DP=1250;AC=1;AN=682;AF=0.0014663;RA=1242;AA=3;SR=618|624;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 79697 . A G 6.18 PASS NS=129;DP=195;AC=1;AN=258;AF=0.003876;RA=191;AA=2;SR=53|138;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 80071 . G A 99.0 PASS NS=299;DP=809;AC=271;AN=598;AF=0.45318;RA=473;AA=335;SR=453|20;SA=325|10;SB=0.97015;AB=0.53559;ABR=158;ABA=137;RUN=1;SNP;TS +20 80079 . G A 27.1 PASS NS=316;DP=898;AC=7;AN=632;AF=0.011076;RA=888;AA=8;SR=851|37;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.73333;ABR=22;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 80095 . A G 0.0807 PASS NS=324;DP=1080;AC=3;AN=648;AF=0.0046296;RA=1063;AA=7;SR=935|128;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.61538;ABR=8;ABA=5;RUN=2;SNP;TS +20 80251 . T C 2.09 PASS NS=369;DP=2247;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2212;AA=25;SR=1205|1007;SA=5|20;SB=0.2;AB=0.22222;ABR=2;ABA=7;RUN=3;SNP;TS +20 80359 . T C 0.834 PASS NS=367;DP=2201;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2177;AA=7;SR=1148|1029;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 80448 . A G 0.782 PASS NS=367;DP=2320;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2310;AA=4;SR=1056|1254;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 80655 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2328;AC=646;AN=732;AF=0.88251;RA=331;AA=1993;SR=147|184;SA=829|1164;SB=0.41596;AB=0.56156;ABR=260;ABA=203;RUN=1;SNP;TS +20 80838 . C T 76.1 PASS NS=365;DP=2253;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2239;AA=6;SR=953|1286;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 80887 . G A 58.7 PASS NS=361;DP=2159;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2148;AA=6;SR=901|1247;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 81001 . T C 39.3 PASS NS=364;DP=1961;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1955;AA=3;SR=979|976;SA=3|0;SB=1;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 81017 . C T 0.602 PASS NS=358;DP=1953;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1946;AA=3;SR=966|980;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 81071 . A G 99.0 PASS NS=363;DP=1794;AC=6;AN=726;AF=0.0082645;RA=1756;AA=20;SR=873|883;SA=8|12;SB=0.4;AB=0.38462;ABR=10;ABA=16;RUN=1;SNP;TS +20 81298 . G A 99.0 PASS NS=360;DP=1942;AC=5;AN=720;AF=0.0069444;RA=1923;AA=17;SR=1058|865;SA=11|6;SB=0.64706;AB=0.40909;ABR=9;ABA=13;RUN=1;SNP;TS +20 81481 . A G 0.751 PASS NS=354;DP=1746;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1737;AA=3;SR=786|951;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 81561 . A G 0.396 PASS NS=348;DP=1704;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1696;AA=3;SR=816|880;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 81692 . T C 4.66 PASS NS=347;DP=1557;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1550;AA=5;SR=624|926;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 81966 . G A 15.2 PASS NS=187;DP=338;AC=1;AN=374;AF=0.0026738;RA=329;AA=4;SR=172|157;SA=4|0;SB=1;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 82012 . T C 57.6 PASS NS=161;DP=273;AC=49;AN=322;AF=0.15217;RA=222;AA=41;SR=75|147;SA=16|25;SB=0.39024;AB=0.6;ABR=15;ABA=10;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 82119 . G A 1.23 PASS NS=223;DP=490;AC=1;AN=446;AF=0.0022422;RA=486;AA=2;SR=322|164;SA=1|1;SB=0.5;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 82168 . G A 0.0662 PASS NS=223;DP=456;AC=1;AN=446;AF=0.0022422;RA=447;AA=3;SR=316|131;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 82204 . T C 60.6 PASS NS=275;DP=670;AC=17;AN=550;AF=0.030909;RA=633;AA=23;SR=366|267;SA=16|7;SB=0.69565;AB=0.5;ABR=11;ABA=11;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 82215 . G A 99.0 PASS NS=313;DP=849;AC=97;AN=626;AF=0.15495;RA=715;AA=126;SR=411|304;SA=85|41;SB=0.6746;AB=0.49645;ABR=70;ABA=71;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 82217 . G A 99.0 PASS NS=314;DP=864;AC=493;AN=628;AF=0.78503;RA=182;AA=666;SR=108|74;SA=392|274;SB=0.58859;AB=0.46875;ABR=75;ABA=83;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 82223 . C T 99.0 PASS NS=325;DP=994;AC=20;AN=650;AF=0.030769;RA=956;AA=34;SR=548|408;SA=18|16;SB=0.52941;AB=0.53488;ABR=23;ABA=19;RUN=1;SNP;TS +20 82258 . A G 14.1 PASS NS=355;DP=1549;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=1536;AA=8;SR=883|653;SA=3|5;SB=0.375;AB=0.61538;ABR=8;ABA=5;RUN=3;SNP;TS +20 82309 . G A 0.136 PASS NS=356;DP=1542;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1528;AA=6;SR=935|593;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=5;SNP;TS +20 82359 . T C 15.4 PASS NS=365;DP=1749;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1734;AA=8;SR=1094|640;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=3;SNP;TS +20 82416 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=1849;AC=16;AN=738;AF=0.02168;RA=1813;AA=31;SR=1060|753;SA=14|17;SB=0.45161;AB=0.57627;ABR=34;ABA=25;RUN=1;SNP;TS +20 82460 . C T 9.05 PASS NS=363;DP=1665;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1657;AA=3;SR=856|801;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=2;SNP;TS +20 82571 . T C 12.6 PASS NS=351;DP=1817;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1807;AA=4;SR=940|867;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 82701 . T C 99.0 PASS NS=351;DP=1848;AC=103;AN=702;AF=0.14672;RA=1578;AA=267;SR=848|730;SA=159|108;SB=0.59551;AB=0.5063;ABR=241;ABA=235;RUN=1;SNP;TS +20 82898 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2131;AC=3;AN=734;AF=0.0040872;RA=2111;AA=11;SR=1035|1076;SA=7|4;SB=0.63636;AB=0.68966;ABR=20;ABA=9;RUN=3;SNP;TS +20 83034 . T C 1.7 PASS NS=367;DP=2054;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2021;AA=8;SR=1049|972;SA=6|2;SB=0.75;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 83129 . A G 0.056 PASS NS=367;DP=2217;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2204;AA=6;SR=1098|1106;SA=0|6;SB=0;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TS +20 83231 . G A 2.47 PASS NS=339;DP=1326;AC=1;AN=678;AF=0.0014749;RA=1312;AA=5;SR=685|627;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 83501 . G A 0.105 PASS NS=362;DP=2022;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2015;AA=2;SR=889|1126;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 83613 . T C 0.232 PASS NS=367;DP=2011;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2004;AA=4;SR=1083|921;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 83629 . C T 5.45 PASS NS=363;DP=1970;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1962;AA=3;SR=1038|924;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 83765 . A G 1.78 PASS NS=369;DP=2031;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2018;AA=3;SR=1058|960;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 83777 . T C 0.0484 PASS NS=368;DP=2022;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2013;AA=6;SR=1109|904;SA=6|0;SB=1;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 83929 . G A 99.0 PASS NS=365;DP=2235;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=2216;AA=10;SR=999|1217;SA=2|8;SB=0.2;AB=0.61538;ABR=16;ABA=10;RUN=1;SNP;TS +20 83934 . C T 0.265 PASS NS=365;DP=2214;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2192;AA=3;SR=983|1209;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 83966 . C T 0.338 PASS NS=370;DP=2246;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2222;AA=6;SR=1045|1177;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 83971 . C T 22.1 PASS NS=368;DP=2238;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2220;AA=11;SR=1057|1163;SA=7|4;SB=0.63636;AB=0.5;ABR=8;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 84003 . A G 0.091 PASS NS=365;DP=2098;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2068;AA=12;SR=1047|1021;SA=1|11;SB=0.083333;AB=0.85714;ABR=12;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 84079 . G A 45.3 PASS NS=360;DP=1898;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1874;AA=10;SR=901|973;SA=7|3;SB=0.7;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=3;SNP;TS +20 84201 . G A 99.0 PASS NS=355;DP=1809;AC=4;AN=710;AF=0.0056338;RA=1784;AA=14;SR=830|954;SA=9|5;SB=0.64286;AB=0.5;ABR=11;ABA=11;RUN=2;SNP;TS +20 84351 . G A 1.43 PASS NS=363;DP=2151;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2138;AA=4;SR=1159|979;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 84358 . T C 0.98 PASS NS=360;DP=2134;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2108;AA=13;SR=1150|958;SA=9|4;SB=0.69231;AB=0.8;ABR=12;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 84488 . A G 0.241 PASS NS=365;DP=2176;AC=2;AN=730;AF=0.0027397;RA=2139;AA=9;SR=1014|1125;SA=3|6;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=3;SNP;TS;CpG +20 84499 . G A 27.9 PASS NS=364;DP=2141;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2118;AA=11;SR=1047|1071;SA=5|6;SB=0.45455;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=2;SNP;TS +20 84504 . G A 35.0 PASS NS=366;DP=2125;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=2098;AA=13;SR=1028|1070;SA=10|3;SB=0.76923;AB=0.36364;ABR=4;ABA=7;RUN=2;SNP;TS +20 84666 . G A 99.0 PASS NS=368;DP=2163;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2140;AA=15;SR=1118|1022;SA=6|9;SB=0.4;AB=0.28571;ABR=4;ABA=10;RUN=4;SNP;TS;CpG +20 84727 . G A 88.5 PASS NS=371;DP=2412;AC=2;AN=742;AF=0.0026954;RA=2393;AA=10;SR=1261|1132;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.5625;ABR=9;ABA=7;RUN=1;SNP;TS +20 84892 . C T 99.0 PASS NS=368;DP=2536;AC=8;AN=736;AF=0.01087;RA=2499;AA=25;SR=1170|1329;SA=12|13;SB=0.48;AB=0.55102;ABR=27;ABA=21;RUN=1;SNP;TS +20 84906 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=2485;AC=7;AN=738;AF=0.0094851;RA=2422;AA=30;SR=1127|1295;SA=20|10;SB=0.66667;AB=0.58491;ABR=31;ABA=20;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 84934 . C T 0.156 PASS NS=369;DP=2365;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2353;AA=4;SR=1081|1272;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 84949 . G A 1.84 PASS NS=369;DP=2295;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2281;AA=5;SR=1075|1206;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 85116 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2259;AC=49;AN=734;AF=0.066757;RA=2119;AA=129;SR=989|1130;SA=54|75;SB=0.4186;AB=0.50679;ABR=112;ABA=106;RUN=1;SNP;TS +20 85180 . A G 2.49 PASS NS=366;DP=2123;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2111;AA=3;SR=882|1229;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 85182 . C T 6.7 PASS NS=365;DP=2111;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2100;AA=2;SR=874|1226;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 85195 . A G 0.062 PASS NS=354;DP=2020;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=2010;AA=5;SR=851|1159;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.875;ABR=14;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 85371 . A G 3.11 PASS NS=349;DP=2019;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=2008;AA=2;SR=1054|954;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 85388 . G A 2.07 PASS NS=364;DP=2082;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2071;AA=4;SR=1054|1017;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 85492 . T C 2.17 PASS NS=369;DP=2347;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2323;AA=6;SR=1170|1153;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 85530 . G A 1.82 PASS NS=366;DP=1908;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1900;AA=3;SR=984|916;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 85875 . A G 38.7 PASS NS=357;DP=1986;AC=2;AN=714;AF=0.0028011;RA=1979;AA=6;SR=1078|901;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS +20 86115 . G A 99.0 PASS NS=356;DP=2026;AC=16;AN=712;AF=0.022472;RA=1969;AA=51;SR=1039|930;SA=28|23;SB=0.54902;AB=0.48837;ABR=42;ABA=44;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 86458 . C T 0.0675 PASS NS=362;DP=1974;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1959;AA=2;SR=1098|861;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 86691 . C T 0.306 PASS NS=359;DP=2285;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2274;AA=4;SR=1261|1013;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 86719 . A G 0.0505 PASS NS=362;DP=2130;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2108;AA=9;SR=1090|1018;SA=0|9;SB=0;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=1;SNP;TS +20 86757 . A G 2.16 PASS NS=364;DP=2159;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2147;AA=4;SR=1029|1118;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 87112 . G A 99.0 PASS NS=350;DP=1657;AC=181;AN=700;AF=0.25857;RA=1252;AA=400;SR=740|512;SA=233|167;SB=0.5825;AB=0.51139;ABR=247;ABA=236;RUN=4;SNP;TS;CpG +20 87230 . G A 0.205 PASS NS=347;DP=1809;AC=4;AN=694;AF=0.0057637;RA=1779;AA=26;SR=812|967;SA=1|25;SB=0.038462;AB=0.71429;ABR=15;ABA=6;RUN=8;SNP;TS +20 87254 . C T 99.0 PASS NS=333;DP=1705;AC=3;AN=666;AF=0.0045045;RA=1687;AA=11;SR=755|932;SA=5|6;SB=0.45455;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TS +20 87265 . A G 0.41 PASS NS=335;DP=1686;AC=1;AN=670;AF=0.0014925;RA=1680;AA=3;SR=813|867;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 87313 . A G 1.57 PASS NS=354;DP=1886;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1880;AA=2;SR=941|939;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 87362 . A G 99.0 PASS NS=345;DP=1823;AC=26;AN=690;AF=0.037681;RA=1732;AA=89;SR=879|853;SA=46|43;SB=0.51685;AB=0.46809;ABR=66;ABA=75;RUN=1;SNP;TS +20 87471 . T C 0.608 PASS NS=349;DP=1783;AC=1;AN=698;AF=0.0014327;RA=1768;AA=5;SR=935|833;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.86667;ABR=13;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 87682 . G A 0.887 PASS NS=355;DP=1823;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1803;AA=4;SR=925|878;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 87790 . C T 99.0 PASS NS=345;DP=1766;AC=16;AN=690;AF=0.023188;RA=1705;AA=49;SR=867|838;SA=32|17;SB=0.65306;AB=0.5102;ABR=50;ABA=46;RUN=2;SNP;TS +20 88003 . A G 1.57 PASS NS=343;DP=1528;AC=1;AN=686;AF=0.0014577;RA=1524;AA=3;SR=698|826;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 88031 . T C 1.06 PASS NS=347;DP=1727;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1710;AA=4;SR=899|811;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 88058 . T C 0.444 PASS NS=367;DP=2138;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2122;AA=7;SR=1196|926;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 88072 . C T 99.0 PASS NS=372;DP=2307;AC=6;AN=744;AF=0.0080645;RA=2286;AA=17;SR=1310|976;SA=6|11;SB=0.35294;AB=0.54545;ABR=18;ABA=15;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 88123 . C T 0.301 PASS NS=357;DP=2104;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2091;AA=5;SR=1202|889;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 88155 . T C 99.0 PASS NS=364;DP=2136;AC=17;AN=728;AF=0.023352;RA=2082;AA=41;SR=1144|938;SA=30|11;SB=0.73171;AB=0.60494;ABR=49;ABA=32;RUN=1;SNP;TS +20 88162 . G A 47.4 PASS NS=369;DP=2151;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2139;AA=7;SR=1175|964;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.61538;ABR=8;ABA=5;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 88565 . A G 0.361 PASS NS=331;DP=1574;AC=1;AN=662;AF=0.0015106;RA=1565;AA=3;SR=773|792;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 88750 . T C 5.86 PASS NS=360;DP=1753;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1747;AA=2;SR=887|860;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 88814 . T C 0.327 PASS NS=335;DP=1461;AC=1;AN=670;AF=0.0014925;RA=1447;AA=4;SR=749|698;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 88874 . C T 3.41 PASS NS=346;DP=1464;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1450;AA=3;SR=694|756;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 88880 . T C 69.1 PASS NS=352;DP=1515;AC=9;AN=704;AF=0.012784;RA=1470;AA=16;SR=727|743;SA=11|5;SB=0.6875;AB=0.6;ABR=21;ABA=13;RUN=1;SNP;TS +20 89032 . C T 87.2 PASS NS=356;DP=1715;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1703;AA=6;SR=753|950;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.16667;ABR=1;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 89057 . T C 11.1 PASS NS=346;DP=1555;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1546;AA=2;SR=644|902;SA=2|0;SB=1;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 89061 . C T 3.13 PASS NS=338;DP=1513;AC=1;AN=676;AF=0.0014793;RA=1503;AA=3;SR=618|885;SA=3|0;SB=1;AB=0.78571;ABR=11;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 89208 . T C 1.55 PASS NS=348;DP=1527;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1515;AA=2;SR=795|720;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 89661 . G A 47.0 PASS NS=366;DP=2184;AC=2;AN=732;AF=0.0027322;RA=2175;AA=5;SR=1085|1090;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 89784 . C T 4.3 PASS NS=350;DP=1854;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1848;AA=3;SR=1005|843;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 90407 . G A 99.0 PASS NS=368;DP=2398;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2378;AA=11;SR=1117|1261;SA=3|8;SB=0.27273;AB=0.35714;ABR=5;ABA=9;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 90509 . G A 0.677 PASS NS=370;DP=2346;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2331;AA=2;SR=1216|1115;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 90541 . C T 99.0 PASS NS=371;DP=2334;AC=4;AN=742;AF=0.0053908;RA=2300;AA=23;SR=1229|1071;SA=11|12;SB=0.47826;AB=0.41667;ABR=15;ABA=21;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 90542 . G A 0.692 PASS NS=371;DP=2337;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2318;AA=16;SR=1245|1073;SA=2|14;SB=0.125;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=3;SNP;TS;CpG +20 90570 . G A 23.7 PASS NS=370;DP=2343;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2331;AA=6;SR=1221|1110;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=3;SNP;TS +20 90688 . T C 0.367 PASS NS=370;DP=2304;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2272;AA=15;SR=946|1326;SA=6|9;SB=0.4;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 90795 . C T 0.18 PASS NS=368;DP=2454;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2443;AA=4;SR=1318|1125;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 90814 . T C 43.3 PASS NS=368;DP=2403;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2388;AA=10;SR=1294|1094;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.6;ABR=12;ABA=8;RUN=1;SNP;TS +20 90984 . A G 99.0 PASS NS=361;DP=2035;AC=150;AN=722;AF=0.20776;RA=1619;AA=410;SR=766|853;SA=181|229;SB=0.44146;AB=0.5;ABR=331;ABA=330;RUN=1;SNP;TS +20 91053 . G A 1.89 PASS NS=361;DP=2062;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2051;AA=4;SR=1080|971;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 91072 . G A 9.59 PASS NS=361;DP=2180;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2166;AA=8;SR=1078|1088;SA=1|7;SB=0.125;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 91088 . C T 99.0 PASS NS=363;DP=2177;AC=616;AN=726;AF=0.84848;RA=386;AA=1782;SR=187|199;SA=833|949;SB=0.46745;AB=0.49684;ABR=236;ABA=239;RUN=1;SNP;TS +20 91217 . T C 0.0587 PASS NS=369;DP=2369;AC=2;AN=738;AF=0.00271;RA=2361;AA=5;SR=1348|1013;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.8;ABR=12;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 91227 . C T 99.0 PASS NS=369;DP=2355;AC=25;AN=738;AF=0.033875;RA=2274;AA=74;SR=1302|972;SA=44|30;SB=0.59459;AB=0.46018;ABR=52;ABA=61;RUN=3;SNP;TS +20 91346 . G A 99.0 PASS NS=369;DP=2207;AC=150;AN=738;AF=0.20325;RA=1744;AA=456;SR=974|770;SA=250|206;SB=0.54825;AB=0.49656;ABR=361;ABA=363;RUN=2;SNP;TS +20 91497 . A G 0.291 PASS NS=370;DP=2513;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2504;AA=3;SR=1280|1224;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 91508 . G A 99.0 PASS NS=369;DP=2483;AC=621;AN=738;AF=0.84146;RA=424;AA=2039;SR=222|202;SA=1036|1003;SB=0.50809;AB=0.52604;ABR=303;ABA=270;RUN=1;SNP;TS +20 91707 . C T 99.0 PASS NS=369;DP=2273;AC=112;AN=738;AF=0.15176;RA=1930;AA=291;SR=948|982;SA=137|154;SB=0.47079;AB=0.53738;ABR=230;ABA=197;RUN=1;SNP;TS +20 91716 . C T 99.0 PASS NS=368;DP=2309;AC=6;AN=736;AF=0.0081522;RA=2285;AA=18;SR=1117|1168;SA=7|11;SB=0.38889;AB=0.60465;ABR=26;ABA=17;RUN=2;SNP;TS +20 91718 . C T 61.6 PASS NS=368;DP=2338;AC=3;AN=736;AF=0.0040761;RA=2322;AA=10;SR=1129|1193;SA=8|2;SB=0.8;AB=0.5;ABR=9;ABA=9;RUN=2;SNP;TS +20 91863 . A G 1.48 PASS NS=364;DP=2501;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2488;AA=4;SR=1261|1227;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=4;SNP;TS +20 91951 . G A 99.0 PASS NS=364;DP=2528;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=2504;AA=12;SR=1185|1319;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.62069;ABR=18;ABA=11;RUN=1;SNP;TS +20 91971 . G A 99.0 PASS NS=367;DP=2448;AC=4;AN=734;AF=0.0054496;RA=2412;AA=26;SR=1136|1276;SA=9|17;SB=0.34615;AB=0.54545;ABR=24;ABA=20;RUN=1;SNP;TS +20 92080 . T C 99.0 PASS NS=363;DP=2461;AC=10;AN=726;AF=0.013774;RA=2425;AA=32;SR=1182|1243;SA=15|17;SB=0.46875;AB=0.46341;ABR=19;ABA=22;RUN=1;SNP;TS +20 92207 . T C 1.8 PASS NS=360;DP=2413;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2409;AA=2;SR=1146|1263;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 92366 . A G 99.0 PASS NS=359;DP=2411;AC=131;AN=718;AF=0.18245;RA=1937;AA=464;SR=930|1007;SA=219|245;SB=0.47198;AB=0.50995;ABR=282;ABA=269;RUN=1;SNP;TS +20 92383 . T C 0.775 PASS NS=364;DP=2395;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2377;AA=6;SR=1138|1239;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 92441 . T C 2.12 PASS NS=364;DP=2420;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2406;AA=6;SR=1351|1055;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 92492 . G A 0.0468 PASS NS=366;DP=2377;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2366;AA=2;SR=1174|1192;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 92527 . A G 99.0 PASS NS=371;DP=2105;AC=644;AN=742;AF=0.86792;RA=317;AA=1752;SR=144|173;SA=822|930;SB=0.46918;AB=0.51415;ABR=218;ABA=198;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 92712 . T C 0.198 PASS NS=361;DP=2260;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2241;AA=10;SR=1190|1051;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 92774 . T C 0.403 PASS NS=364;DP=2560;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2548;AA=3;SR=1242|1306;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 92816 . T C 0.817 PASS NS=369;DP=2431;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2407;AA=12;SR=1073|1334;SA=2|10;SB=0.16667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 92865 . T C 10.2 PASS NS=346;DP=2171;AC=2;AN=692;AF=0.0028902;RA=2155;AA=5;SR=1041|1114;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 92891 . A G 99.0 PASS NS=353;DP=2023;AC=99;AN=706;AF=0.14023;RA=1744;AA=258;SR=877|867;SA=137|121;SB=0.53101;AB=0.47804;ABR=185;ABA=200;RUN=1;SNP;TS +20 92972 . G A 9.84 PASS NS=362;DP=2148;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2140;AA=6;SR=1068|1072;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 93066 . C T 0.0559 PASS NS=356;DP=2150;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2137;AA=3;SR=1048|1089;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 93114 . C T 0.601 PASS NS=356;DP=2138;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2132;AA=2;SR=970|1162;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 93169 . C T 99.0 PASS NS=352;DP=2227;AC=25;AN=704;AF=0.035511;RA=2133;AA=88;SR=999|1134;SA=36|52;SB=0.40909;AB=0.44681;ABR=63;ABA=77;RUN=1;SNP;TS +20 93327 . T C 99.0 PASS NS=352;DP=1862;AC=25;AN=704;AF=0.035511;RA=1797;AA=60;SR=792|1005;SA=20|40;SB=0.33333;AB=0.53535;ABR=53;ABA=46;RUN=3;SNP;TS +20 93343 . T C 1.43 PASS NS=351;DP=1897;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1886;AA=3;SR=804|1082;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 93356 . C T 0.0835 PASS NS=365;DP=1919;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1910;AA=2;SR=804|1106;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.78571;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 93389 . A G 10.9 PASS NS=361;DP=1775;AC=2;AN=722;AF=0.0027701;RA=1758;AA=5;SR=744|1014;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 93406 . T C 99.0 PASS NS=350;DP=1595;AC=7;AN=700;AF=0.01;RA=1573;AA=18;SR=651|922;SA=10|8;SB=0.55556;AB=0.55;ABR=22;ABA=18;RUN=1;SNP;TS +20 93428 . T C 3.27 PASS NS=334;DP=1422;AC=1;AN=668;AF=0.001497;RA=1415;AA=3;SR=565|850;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 93440 . A G 99.0 PASS NS=327;DP=1360;AC=157;AN=654;AF=0.24006;RA=1041;AA=315;SR=395|646;SA=136|179;SB=0.43175;AB=0.50992;ABR=180;ABA=172;RUN=2;SNP;TS +20 93499 . T C 99.0 PASS NS=365;DP=1887;AC=82;AN=730;AF=0.11233;RA=1681;AA=203;SR=679|1002;SA=79|124;SB=0.38916;AB=0.48855;ABR=128;ABA=134;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 93684 . A G 60.8 PASS NS=182;DP=336;AC=34;AN=364;AF=0.093407;RA=256;AA=30;SR=174|82;SA=19|11;SB=0.63333;AB=0.34783;ABR=8;ABA=14;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 93718 . T C 99.0 PASS NS=260;DP=565;AC=55;AN=520;AF=0.10577;RA=498;AA=64;SR=267|231;SA=37|27;SB=0.57812;AB=0.5;ABR=30;ABA=30;RUN=2;SNP;TS +20 93739 . A G 99.0 PASS NS=278;DP=706;AC=75;AN=556;AF=0.13489;RA=582;AA=91;SR=316|266;SA=55|36;SB=0.6044;AB=0.48235;ABR=41;ABA=44;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 93931 . G A 99.0 PASS NS=325;DP=1064;AC=167;AN=650;AF=0.25692;RA=811;AA=248;SR=366|445;SA=126|122;SB=0.50806;AB=0.55128;ABR=129;ABA=105;RUN=1;SNP;TS +20 94019 . C T 0.498 PASS NS=360;DP=1907;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1900;AA=5;SR=1175|725;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 94036 . G A 99.0 PASS NS=355;DP=1929;AC=25;AN=710;AF=0.035211;RA=1850;AA=68;SR=1138|712;SA=44|24;SB=0.64706;AB=0.48958;ABR=47;ABA=49;RUN=1;SNP;TS +20 94087 . T C 25.9 PASS NS=364;DP=1913;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=1901;AA=7;SR=1020|881;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 94091 . T C 99.0 PASS NS=363;DP=1926;AC=93;AN=726;AF=0.1281;RA=1686;AA=228;SR=919|767;SA=116|112;SB=0.50877;AB=0.4822;ABR=149;ABA=156;RUN=1;SNP;TS +20 94179 . G A 9.12 PASS NS=356;DP=1627;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1617;AA=3;SR=942|675;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 94588 . G A 0.244 PASS NS=364;DP=2022;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=2006;AA=7;SR=1153|853;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.80952;ABR=17;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 94704 . G A 99.0 PASS NS=361;DP=2028;AC=2;AN=722;AF=0.0027701;RA=2015;AA=8;SR=958|1057;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.41667;ABR=5;ABA=7;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 94717 . T C 57.7 PASS NS=365;DP=1994;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1985;AA=6;SR=926|1059;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.55556;ABR=5;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 94760 . A G 99.0 PASS NS=356;DP=2012;AC=22;AN=712;AF=0.030899;RA=1957;AA=50;SR=987|970;SA=19|31;SB=0.38;AB=0.55046;ABR=60;ABA=48;RUN=2;SNP;TS +20 94794 . T C 0.713 PASS NS=365;DP=2100;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2091;AA=2;SR=1072|1019;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 95052 . T C 54.2 PASS NS=361;DP=1889;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1877;AA=5;SR=937|940;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 95104 . A G 4.49 PASS NS=362;DP=1930;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1921;AA=3;SR=930|991;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 95186 . T C 6.33 PASS NS=359;DP=1991;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1986;AA=3;SR=977|1009;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0;ABR=0;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 95601 . A G 10.6 PASS NS=368;DP=2205;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2172;AA=14;SR=1077|1095;SA=2|12;SB=0.14286;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 95603 . T C 0.0469 PASS NS=347;DP=1778;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1758;AA=5;SR=858|900;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 95619 . C T 33.4 PASS NS=368;DP=2234;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2205;AA=8;SR=1105|1100;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.57143;ABR=8;ABA=6;RUN=1;SNP;TS +20 95627 . C T 99.0 PASS NS=368;DP=2216;AC=6;AN=736;AF=0.0081522;RA=2175;AA=22;SR=1082|1093;SA=10|12;SB=0.45455;AB=0.40541;ABR=15;ABA=21;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 95836 . T C 5.74 PASS NS=365;DP=2341;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2320;AA=11;SR=1153|1167;SA=7|4;SB=0.63636;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 95989 . C T 0.0518 PASS NS=364;DP=2264;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2235;AA=5;SR=1159|1076;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 96026 . C T 83.3 PASS NS=362;DP=2328;AC=2;AN=724;AF=0.0027624;RA=2304;AA=10;SR=1145|1159;SA=4|6;SB=0.4;AB=0.57895;ABR=11;ABA=8;RUN=2;SNP;TS +20 96141 . T C 0.0737 PASS NS=367;DP=2161;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2126;AA=13;SR=1101|1025;SA=13|0;SB=1;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 96166 . C T 1.2 PASS NS=367;DP=2187;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=2169;AA=7;SR=1101|1068;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 96325 . C T 0.047 PASS NS=364;DP=2278;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2256;AA=8;SR=1018|1238;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TS +20 96369 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2148;AC=9;AN=732;AF=0.012295;RA=2087;AA=37;SR=1003|1084;SA=14|23;SB=0.37838;AB=0.5;ABR=21;ABA=20;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 96579 . G A 24.7 PASS NS=359;DP=1704;AC=5;AN=718;AF=0.0069638;RA=1670;AA=17;SR=848|822;SA=9|8;SB=0.52941;AB=0.52632;ABR=10;ABA=9;RUN=1;SNP;TS +20 96646 . G A 0.141 PASS NS=364;DP=1850;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=1823;AA=6;SR=961|862;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=2;SNP;TS +20 96670 . C T 2.72 PASS NS=366;DP=1963;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=1953;AA=4;SR=1050|903;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 96695 . C T 13.0 PASS NS=364;DP=1927;AC=2;AN=728;AF=0.0027473;RA=1894;AA=13;SR=1024|870;SA=12|1;SB=0.92308;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 96815 . A G 0.711 PASS NS=371;DP=2127;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2098;AA=18;SR=1051|1047;SA=1|17;SB=0.055556;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 96891 . C T 4.45 PASS NS=365;DP=2401;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2387;AA=4;SR=1293|1094;SA=1|3;SB=0.25;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 96931 . A G 99.0 PASS NS=365;DP=2424;AC=256;AN=730;AF=0.35068;RA=1586;AA=831;SR=882|704;SA=463|368;SB=0.55716;AB=0.50916;ABR=389;ABA=373;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 97122 . C T 99.0 PASS NS=366;DP=2087;AC=168;AN=732;AF=0.22951;RA=1606;AA=470;SR=818|788;SA=230|240;SB=0.48936;AB=0.49234;ABR=257;ABA=261;RUN=1;SNP;TS +20 97285 . T C 0.442 PASS NS=363;DP=2215;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2169;AA=24;SR=1010|1159;SA=6|18;SB=0.25;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 97371 . G A 99.0 PASS NS=365;DP=2386;AC=16;AN=730;AF=0.021918;RA=2319;AA=54;SR=1350|969;SA=26|28;SB=0.48148;AB=0.48958;ABR=47;ABA=49;RUN=1;SNP;TS +20 97394 . A G 99.0 PASS NS=346;DP=2074;AC=185;AN=692;AF=0.26734;RA=1552;AA=509;SR=904|648;SA=280|229;SB=0.5501;AB=0.46933;ABR=176;ABA=199;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 97458 . A G 68.2 PASS NS=365;DP=2315;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2304;AA=7;SR=1121|1183;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.45455;ABR=5;ABA=6;RUN=2;SNP;TS +20 98008 . T C 99.0 PASS NS=335;DP=1359;AC=19;AN=670;AF=0.028358;RA=1305;AA=48;SR=640|665;SA=24|24;SB=0.5;AB=0.48571;ABR=34;ABA=36;RUN=3;SNP;TS +20 98439 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=2319;AC=29;AN=738;AF=0.039295;RA=2221;AA=84;SR=1227|994;SA=55|29;SB=0.65476;AB=0.56627;ABR=94;ABA=71;RUN=1;SNP;TS +20 98491 . C T 99.0 PASS NS=370;DP=2385;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2364;AA=8;SR=1167|1197;SA=6|2;SB=0.75;AB=0.55556;ABR=10;ABA=8;RUN=1;SNP;TS +20 98688 . T C 99.0 PASS NS=362;DP=2160;AC=28;AN=724;AF=0.038674;RA=2090;AA=64;SR=1092|998;SA=29|35;SB=0.45312;AB=0.54839;ABR=68;ABA=55;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 98741 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2469;AC=26;AN=734;AF=0.035422;RA=2377;AA=81;SR=1083|1294;SA=40|41;SB=0.49383;AB=0.51538;ABR=67;ABA=63;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 98905 . T C 0.0446 PASS NS=368;DP=2477;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2462;AA=9;SR=1319|1143;SA=3|6;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=2;ABA=1;RUN=1;SNP;TS +20 98930 . G A 99.0 PASS NS=370;DP=2431;AC=159;AN=740;AF=0.21486;RA=1920;AA=502;SR=1041|879;SA=269|233;SB=0.53586;AB=0.54773;ABR=350;ABA=287;RUN=1;SNP;TS +20 98957 . A G 99.0 PASS NS=370;DP=2423;AC=2;AN=740;AF=0.0027027;RA=2404;AA=13;SR=1270|1134;SA=6|7;SB=0.46154;AB=0.41176;ABR=7;ABA=10;RUN=1;SNP;TS +20 98991 . T C 4.43 PASS NS=370;DP=2386;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2377;AA=3;SR=1217|1160;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 99228 . C T 48.9 PASS NS=368;DP=2404;AC=4;AN=736;AF=0.0054348;RA=2382;AA=12;SR=1087|1295;SA=5|7;SB=0.41667;AB=0.5;ABR=9;ABA=9;RUN=4;SNP;TS +20 99563 . T C 0.153 PASS NS=365;DP=2130;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2126;AA=3;SR=906|1220;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 99612 . A G 1.43 PASS NS=370;DP=2190;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2185;AA=2;SR=1213|972;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 99632 . T C 2.53 PASS NS=369;DP=2206;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2197;AA=3;SR=1231|966;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 99667 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2225;AC=5;AN=734;AF=0.006812;RA=2197;AA=21;SR=1101|1096;SA=9|12;SB=0.42857;AB=0.54545;ABR=24;ABA=20;RUN=1;SNP;TS +20 99704 . T C 0.0612 PASS NS=370;DP=2145;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2141;AA=2;SR=997|1144;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 99734 . C T 0.0662 PASS NS=366;DP=2113;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2101;AA=6;SR=956|1145;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 99801 . G A 99.0 PASS NS=367;DP=1968;AC=88;AN=734;AF=0.11989;RA=1750;AA=214;SR=977|773;SA=103|111;SB=0.48131;AB=0.46021;ABR=133;ABA=154;RUN=1;SNP;TS +20 100133 . T C 2.2 PASS NS=359;DP=2041;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2033;AA=3;SR=936|1097;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 100134 . A G 72.1 PASS NS=360;DP=2052;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2042;AA=5;SR=942|1100;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 100184 . A G 68.0 PASS NS=360;DP=2141;AC=3;AN=720;AF=0.0041667;RA=2125;AA=12;SR=1021|1104;SA=4|8;SB=0.33333;AB=0.58824;ABR=10;ABA=7;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 100272 . C T 99.0 PASS NS=352;DP=1860;AC=85;AN=704;AF=0.12074;RA=1684;AA=174;SR=855|829;SA=90|84;SB=0.51724;AB=0.48826;ABR=104;ABA=109;RUN=6;SNP;TS +20 100277 . A G 0.355 PASS NS=351;DP=1863;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1857;AA=3;SR=938|919;SA=0|3;SB=0;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 100279 . T C 99.0 PASS NS=349;DP=1846;AC=9;AN=698;AF=0.012894;RA=1829;AA=13;SR=926|903;SA=3|10;SB=0.23077;AB=0.52381;ABR=11;ABA=10;RUN=2;SNP;TS +20 100308 . A G 5.47 PASS NS=354;DP=1794;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1781;AA=3;SR=814|967;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 100495 . G A 99.0 PASS NS=359;DP=2056;AC=85;AN=718;AF=0.11838;RA=1866;AA=181;SR=948|918;SA=93|88;SB=0.51381;AB=0.548;ABR=137;ABA=113;RUN=1;SNP;TS +20 100505 . T C 99.0 PASS NS=357;DP=2026;AC=83;AN=714;AF=0.11625;RA=1853;AA=167;SR=909|944;SA=83|84;SB=0.49701;AB=0.57025;ABR=138;ABA=104;RUN=1;SNP;TS +20 100554 . T C 5.56 PASS NS=361;DP=1910;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1902;AA=3;SR=827|1075;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 100564 . T C 0.454 PASS NS=359;DP=1868;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1865;AA=2;SR=825|1040;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 100569 . A G 0.0539 PASS NS=353;DP=1836;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1825;AA=3;SR=832|993;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 100592 . T C 6.17 PASS NS=350;DP=1763;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1756;AA=3;SR=892|864;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 100645 . C T 99.0 PASS NS=355;DP=1769;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=1753;AA=12;SR=929|824;SA=8|4;SB=0.66667;AB=0.42857;ABR=9;ABA=12;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 100678 . C T 99.0 PASS NS=351;DP=1593;AC=77;AN=702;AF=0.10969;RA=1411;AA=177;SR=563|848;SA=177|0;SB=1;AB=0.69182;ABR=220;ABA=97;RUN=4;SNP;TS +20 100699 . C T 99.0 PASS NS=348;DP=1572;AC=178;AN=696;AF=0.25575;RA=1157;AA=387;SR=473|684;SA=178|209;SB=0.45995;AB=0.49265;ABR=201;ABA=204;RUN=2;SNP;TS +20 100764 . C T 20.8 PASS NS=353;DP=1810;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1805;AA=3;SR=774|1031;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 100816 . A G 1.13 PASS NS=346;DP=1873;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1867;AA=2;SR=836|1031;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 100881 . T C 0.499 PASS NS=353;DP=1949;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1943;AA=2;SR=1035|908;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 100904 . T C 4.63 PASS NS=358;DP=1912;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1906;AA=2;SR=1075|831;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 101020 . T C 1.07 PASS NS=357;DP=1819;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1807;AA=4;SR=962|845;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 101355 . T C 99.0 PASS NS=362;DP=2122;AC=25;AN=724;AF=0.03453;RA=2066;AA=51;SR=947|1119;SA=17|34;SB=0.33333;AB=0.58036;ABR=65;ABA=47;RUN=1;SNP;TS +20 101362 . G A 99.0 PASS NS=362;DP=2073;AC=86;AN=724;AF=0.11878;RA=1825;AA=242;SR=817|1008;SA=107|135;SB=0.44215;AB=0.54505;ABR=242;ABA=202;RUN=3;SNP;TS +20 101437 . C T 99.0 PASS NS=364;DP=1982;AC=21;AN=728;AF=0.028846;RA=1917;AA=58;SR=1001|916;SA=24|34;SB=0.41379;AB=0.46667;ABR=42;ABA=48;RUN=1;SNP;TS +20 101449 . A G 99.0 PASS NS=362;DP=1984;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1971;AA=10;SR=1065|906;SA=5|5;SB=0.5;AB=0;ABR=0;ABA=10;RUN=1;SNP;TS +20 101513 . T C 99.0 PASS NS=364;DP=2010;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=1985;AA=11;SR=952|1033;SA=4|7;SB=0.36364;AB=0.47059;ABR=8;ABA=9;RUN=1;SNP;TS +20 101515 . G A 25.8 PASS NS=364;DP=1991;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=1979;AA=5;SR=946|1033;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=2;SNP;TS +20 101567 . A G 31.0 PASS NS=359;DP=1818;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1808;AA=5;SR=875|933;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.375;ABR=3;ABA=5;RUN=1;SNP;TS +20 101918 . C T 99.0 PASS NS=368;DP=2159;AC=29;AN=736;AF=0.039402;RA=2069;AA=83;SR=1068|1001;SA=46|37;SB=0.55422;AB=0.59296;ABR=118;ABA=80;RUN=3;SNP;TS +20 102181 . T C 99.0 PASS NS=370;DP=2299;AC=310;AN=740;AF=0.41892;RA=1354;AA=940;SR=740|614;SA=508|432;SB=0.54043;AB=0.51446;ABR=427;ABA=401;RUN=2;SNP;TS +20 102203 . T C 99.0 PASS NS=369;DP=2327;AC=7;AN=738;AF=0.0094851;RA=2305;AA=15;SR=1223|1082;SA=11|4;SB=0.73333;AB=0.72727;ABR=24;ABA=9;RUN=2;SNP;TS +20 102205 . A G 7.9 PASS NS=368;DP=2331;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2314;AA=5;SR=1222|1092;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 102312 . A G 39.1 PASS NS=369;DP=2482;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2466;AA=6;SR=1292|1174;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.63636;ABR=7;ABA=4;RUN=2;SNP;TS +20 102441 . T C 99.0 PASS NS=370;DP=2720;AC=18;AN=740;AF=0.024324;RA=2616;AA=92;SR=1328|1288;SA=36|56;SB=0.3913;AB=0.51075;ABR=95;ABA=91;RUN=1;SNP;TS +20 102485 . A G 0.539 PASS NS=372;DP=2911;AC=1;AN=744;AF=0.0013441;RA=2902;AA=4;SR=1393|1509;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 102510 . C T 0.0965 PASS NS=368;DP=2818;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2807;AA=3;SR=1294|1513;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 102511 . G A 0.0598 PASS NS=369;DP=2815;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2803;AA=6;SR=1297|1506;SA=5|1;SB=0.83333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 102519 . G A 9.8 PASS NS=369;DP=2741;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2734;AA=4;SR=1271|1463;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 102524 . A G 99.0 PASS NS=370;DP=2710;AC=31;AN=740;AF=0.041892;RA=2605;AA=99;SR=1195|1410;SA=45|54;SB=0.45455;AB=0.54082;ABR=106;ABA=90;RUN=1;SNP;TS +20 102631 . G A 2.6 PASS NS=367;DP=2311;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2298;AA=4;SR=1160|1138;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 102760 . A G 0.319 PASS NS=371;DP=2530;AC=1;AN=742;AF=0.0013477;RA=2521;AA=5;SR=1100|1421;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 102799 . G A 99.0 PASS NS=367;DP=2411;AC=188;AN=734;AF=0.25613;RA=1818;AA=585;SR=812|1006;SA=250|335;SB=0.42735;AB=0.49346;ABR=377;ABA=383;RUN=1;SNP;TS +20 103002 . G A 59.3 PASS NS=365;DP=2072;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2051;AA=6;SR=1068|983;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 103119 . T C 5.14 PASS NS=362;DP=2079;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2070;AA=2;SR=950|1120;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 103487 . A G 99.0 PASS NS=367;DP=2018;AC=26;AN=734;AF=0.035422;RA=1949;AA=62;SR=873|1076;SA=26|36;SB=0.41935;AB=0.52577;ABR=51;ABA=46;RUN=1;SNP;TS +20 103565 . A G 31.2 PASS NS=360;DP=2009;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2002;AA=5;SR=1066|936;SA=3|2;SB=0.6;AB=0;ABR=0;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 103645 . T C 3.37 PASS NS=362;DP=1984;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=1980;AA=3;SR=1009|971;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 103694 . C T 9.34 PASS NS=360;DP=2012;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2005;AA=2;SR=1039|966;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 103722 . T C 3.92 PASS NS=365;DP=2168;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2161;AA=4;SR=1157|1004;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 103762 . G A 5.05 PASS NS=367;DP=2133;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2122;AA=2;SR=1144|978;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 103813 . G A 99.0 PASS NS=362;DP=1974;AC=23;AN=724;AF=0.031768;RA=1909;AA=59;SR=1009|900;SA=35|24;SB=0.59322;AB=0.58779;ABR=77;ABA=54;RUN=1;SNP;TS +20 103826 . T C 1.89 PASS NS=360;DP=1939;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1930;AA=2;SR=993|937;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 104292 . A G 0.304 PASS NS=360;DP=2180;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2177;AA=2;SR=1102|1075;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 104520 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2249;AC=90;AN=732;AF=0.12295;RA=1999;AA=247;SR=942|1057;SA=126|121;SB=0.51012;AB=0.52493;ABR=200;ABA=181;RUN=2;SNP;TS +20 104532 . C T 9.69 PASS NS=370;DP=2249;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2239;AA=3;SR=1069|1170;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 104534 . T C 99.0 PASS NS=371;DP=2257;AC=27;AN=742;AF=0.036388;RA=2156;AA=93;SR=1027|1129;SA=49|44;SB=0.52688;AB=0.51852;ABR=84;ABA=78;RUN=1;SNP;TS +20 104604 . T C 99.0 PASS NS=364;DP=2148;AC=30;AN=728;AF=0.041209;RA=2078;AA=61;SR=1065|1013;SA=29|32;SB=0.47541;AB=0.52632;ABR=50;ABA=42;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 104899 . C T 99.0 PASS NS=358;DP=1718;AC=155;AN=716;AF=0.21648;RA=1331;AA=378;SR=675|656;SA=191|187;SB=0.50529;AB=0.49703;ABR=251;ABA=251;RUN=2;SNP;TS +20 105131 . T C 0.314 PASS NS=354;DP=1957;AC=1;AN=708;AF=0.0014124;RA=1953;AA=2;SR=1047|906;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 105407 . T C 6.06 PASS NS=347;DP=1867;AC=1;AN=694;AF=0.0014409;RA=1860;AA=2;SR=843|1017;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 105450 . A G 1.12 PASS NS=353;DP=1846;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1842;AA=2;SR=803|1039;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 105477 . A G 0.259 PASS NS=350;DP=1929;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1925;AA=2;SR=871|1054;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.84615;ABR=11;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 105540 . A G 2.1 PASS NS=348;DP=1862;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1855;AA=4;SR=957|898;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 106063 . T C 0.044 PASS NS=362;DP=2061;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2041;AA=5;SR=905|1136;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 106098 . A G 99.0 PASS NS=362;DP=1933;AC=14;AN=724;AF=0.019337;RA=1875;AA=55;SR=915|960;SA=20|35;SB=0.36364;AB=0.43023;ABR=37;ABA=49;RUN=1;SNP;TS +20 106204 . A G 14.8 PASS NS=367;DP=1984;AC=2;AN=734;AF=0.0027248;RA=1967;AA=6;SR=965|1002;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 106550 . T C 0.176 PASS NS=348;DP=1664;AC=1;AN=696;AF=0.0014368;RA=1657;AA=3;SR=738|919;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 106604 . T C 0.162 PASS NS=359;DP=1894;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1887;AA=3;SR=817|1070;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 106609 . A G 22.0 PASS NS=360;DP=1886;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1872;AA=5;SR=801|1071;SA=3|2;SB=0.6;AB=0;ABR=0;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 106613 . A G 99.0 PASS NS=363;DP=1933;AC=17;AN=726;AF=0.023416;RA=1878;AA=52;SR=795|1083;SA=23|29;SB=0.44231;AB=0.45833;ABR=44;ABA=52;RUN=1;SNP;TS +20 106635 . G A 99.0 PASS NS=364;DP=1892;AC=261;AN=728;AF=0.35852;RA=1263;AA=626;SR=506|757;SA=246|380;SB=0.39297;AB=0.48309;ABR=300;ABA=321;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 107011 . A G 33.8 PASS NS=303;DP=833;AC=1;AN=606;AF=0.0016502;RA=827;AA=4;SR=348|479;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 107071 . G A 0.0548 PASS NS=297;DP=963;AC=1;AN=594;AF=0.0016835;RA=954;AA=4;SR=622|332;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 107118 . C T 0.0477 PASS NS=310;DP=1008;AC=3;AN=620;AF=0.0048387;RA=1002;AA=3;SR=698|304;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0;ABR=0;ABA=1;RUN=1;SNP;TS +20 107152 . A G 38.9 PASS NS=307;DP=943;AC=5;AN=614;AF=0.0081433;RA=930;AA=9;SR=548|382;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.75;ABR=3;ABA=1;RUN=3;SNP;TS;CpG +20 107201 . G A 99.0 PASS NS=317;DP=936;AC=24;AN=634;AF=0.037855;RA=883;AA=51;SR=486|397;SA=36|15;SB=0.70588;AB=0.40278;ABR=29;ABA=43;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 107457 . T C 99.0 PASS NS=350;DP=1623;AC=91;AN=700;AF=0.13;RA=1430;AA=185;SR=730|700;SA=101|84;SB=0.54595;AB=0.52964;ABR=134;ABA=117;RUN=1;SNP;TS +20 107682 . T C 1.66 PASS NS=328;DP=1188;AC=1;AN=656;AF=0.0015244;RA=1174;AA=7;SR=513|661;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 107739 . C T 19.1 PASS NS=309;DP=939;AC=1;AN=618;AF=0.0016181;RA=931;AA=4;SR=333|598;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.25;ABR=1;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 107955 . C T 0.385 PASS NS=353;DP=1950;AC=2;AN=706;AF=0.0028329;RA=1935;AA=7;SR=1127|808;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=2;SNP;TS +20 107972 . T C 8.26 PASS NS=356;DP=1989;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1981;AA=3;SR=1113|868;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 107980 . T C 3.5 PASS NS=353;DP=2021;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2005;AA=6;SR=1111|894;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 107995 . A G 0.878 PASS NS=353;DP=2018;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=2007;AA=2;SR=1100|907;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 108015 . T C 6.58 PASS NS=353;DP=1948;AC=1;AN=706;AF=0.0014164;RA=1941;AA=3;SR=1097|844;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 108017 . C T 0.235 PASS NS=355;DP=1935;AC=1;AN=710;AF=0.0014085;RA=1924;AA=4;SR=1088|836;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=5;SNP;TS +20 108135 . G A 0.105 PASS NS=359;DP=1667;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1654;AA=4;SR=1019|635;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 108187 . A G 99.0 PASS NS=357;DP=1712;AC=83;AN=714;AF=0.11625;RA=1508;AA=195;SR=874|634;SA=103|92;SB=0.52821;AB=0.54895;ABR=157;ABA=128;RUN=1;SNP;TS +20 108192 . G A 99.0 PASS NS=359;DP=1741;AC=3;AN=718;AF=0.0041783;RA=1721;AA=14;SR=975|746;SA=7|7;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=6;ABA=12;RUN=4;SNP;TS +20 108333 . G A 3.94 PASS NS=360;DP=2056;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=2044;AA=5;SR=980|1064;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 108642 . T C 0.532 PASS NS=216;DP=749;AC=1;AN=432;AF=0.0023148;RA=741;AA=3;SR=201|540;SA=0|3;SB=0;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 109258 . T C 3.83 PASS NS=370;DP=2046;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2039;AA=3;SR=1134|905;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 109358 . T C 0.707 PASS NS=358;DP=2101;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=2093;AA=5;SR=1099|994;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 109385 . A G 1.51 PASS NS=363;DP=2269;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2254;AA=8;SR=1091|1163;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 109440 . T C 0.386 PASS NS=362;DP=2222;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2218;AA=3;SR=1057|1161;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 109575 . A G 0.588 PASS NS=364;DP=2020;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2008;AA=4;SR=931|1077;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 109707 . G A 0.971 PASS NS=323;DP=1467;AC=1;AN=646;AF=0.001548;RA=1455;AA=3;SR=669|786;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 109725 . T C 0.908 PASS NS=336;DP=1492;AC=1;AN=672;AF=0.0014881;RA=1479;AA=7;SR=670|809;SA=6|1;SB=0.85714;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 109736 . T C 0.074 PASS NS=342;DP=1489;AC=1;AN=684;AF=0.001462;RA=1478;AA=5;SR=680|798;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 109783 . T C 99.0 PASS NS=342;DP=1544;AC=26;AN=684;AF=0.038012;RA=1472;AA=66;SR=641|831;SA=28|38;SB=0.42424;AB=0.46364;ABR=51;ABA=57;RUN=2;SNP;TS +20 109889 . T C 0.545 PASS NS=365;DP=2083;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2077;AA=4;SR=1096|981;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 109901 . A G 99.0 PASS NS=364;DP=2112;AC=28;AN=728;AF=0.038462;RA=2028;AA=78;SR=1064|964;SA=39|39;SB=0.5;AB=0.46479;ABR=66;ABA=74;RUN=1;SNP;TS +20 109933 . G A 0.166 PASS NS=357;DP=1915;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1908;AA=3;SR=1017|891;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 109997 . C T 0.0475 PASS NS=346;DP=1655;AC=1;AN=692;AF=0.0014451;RA=1639;AA=11;SR=790|849;SA=10|1;SB=0.90909;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=8;SNP;TS +20 110082 . A G 99.0 PASS NS=337;DP=1696;AC=5;AN=674;AF=0.0074184;RA=1677;AA=14;SR=1008|669;SA=5|9;SB=0.35714;AB=0.47826;ABR=11;ABA=12;RUN=1;SNP;TS +20 110098 . A G 99.0 PASS NS=347;DP=1831;AC=242;AN=694;AF=0.3487;RA=1250;AA=577;SR=767|483;SA=353|224;SB=0.61179;AB=0.51826;ABR=298;ABA=277;RUN=3;SNP;TS +20 110124 . T C 0.105 PASS NS=365;DP=2096;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2091;AA=3;SR=1273|818;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 110234 . G A 0.759 PASS NS=350;DP=1744;AC=1;AN=700;AF=0.0014286;RA=1727;AA=4;SR=739|988;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 110315 . T C 0.0966 PASS NS=337;DP=1589;AC=1;AN=674;AF=0.0014837;RA=1583;AA=3;SR=729|854;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 110404 . G A 26.7 PASS NS=351;DP=1839;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1826;AA=5;SR=727|1099;SA=4|1;SB=0.8;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 110417 . G A 7.25 PASS NS=363;DP=1934;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1923;AA=4;SR=782|1141;SA=0|4;SB=0;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 110427 . A G 0.108 PASS NS=364;DP=2009;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2000;AA=3;SR=826|1174;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 110520 . A G 8.32 PASS NS=351;DP=1771;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1759;AA=3;SR=809|950;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 110536 . T C 55.6 PASS NS=359;DP=1709;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1697;AA=6;SR=784|913;SA=4|2;SB=0.66667;AB=0.42857;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 110564 . T C 1.51 PASS NS=360;DP=1650;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1637;AA=5;SR=750|887;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 110702 . C T 99.0 PASS NS=244;DP=491;AC=104;AN=488;AF=0.21311;RA=368;AA=102;SR=39|329;SA=6|96;SB=0.058824;AB=0.50617;ABR=41;ABA=38;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 110773 . G A 0.095 PASS NS=223;DP=443;AC=18;AN=446;AF=0.040359;RA=425;AA=14;SR=61|364;SA=3|11;SB=0.21429;AB=0.57895;ABR=11;ABA=7;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 110875 . C T 99.0 PASS NS=165;DP=461;AC=14;AN=330;AF=0.042424;RA=439;AA=21;SR=7|432;SA=0|21;SB=0;AB=0.52941;ABR=18;ABA=16;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 110970 . G A 99.0 PASS NS=88;DP=160;AC=37;AN=176;AF=0.21023;RA=125;AA=32;SR=6|119;SA=0|32;SB=0;AB=0.54545;ABR=12;ABA=9;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 110976 . G A 67.8 PASS NS=80;DP=137;AC=6;AN=160;AF=0.0375;RA=127;AA=8;SR=4|123;SA=0|8;SB=0;AB=0.4;ABR=2;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 110979 . A G 99.0 PASS NS=41;DP=61;AC=39;AN=82;AF=0.47561;RA=29;AA=30;SR=4|25;SA=0|30;SB=0;AB=0.375;ABR=3;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 111531 . G A 0.0614 PASS NS=6;DP=8;AC=4;AN=12;AF=0.33333;RA=3;AA=4;SR=0|3;SA=0|4;SB=0;AB=0;ABR=0;ABA=0;RUN=7;SNP;TS +20 116405 . G A 49.6 PASS NS=55;DP=69;AC=26;AN=110;AF=0.23636;RA=52;AA=16;SR=49|3;SA=16|0;SB=1;AB=0;ABR=0;ABA=0;RUN=2;SNP;TS +20 116545 . G A 95.2 PASS NS=65;DP=84;AC=19;AN=130;AF=0.14615;RA=70;AA=13;SR=67|3;SA=13|0;SB=1;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 116787 . A G 99.0 PASS NS=293;DP=885;AC=195;AN=586;AF=0.33276;RA=619;AA=263;SR=450|169;SA=196|67;SB=0.74525;AB=0.52709;ABR=107;ABA=95;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 117254 . T C 99.0 PASS NS=360;DP=1886;AC=3;AN=720;AF=0.0041667;RA=1869;AA=10;SR=1183|686;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.6087;ABR=14;ABA=9;RUN=1;SNP;TS +20 117305 . T C 3.02 PASS NS=359;DP=2077;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2064;AA=3;SR=1224|840;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 117312 . G A 0.499 PASS NS=364;DP=2121;AC=3;AN=728;AF=0.0041209;RA=2108;AA=8;SR=1235|873;SA=5|3;SB=0.625;AB=0.7619;ABR=16;ABA=5;RUN=2;SNP;TS +20 117329 . T C 6.59 PASS NS=361;DP=2185;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2178;AA=2;SR=1178|1000;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 117475 . T C 1.49 PASS NS=367;DP=2292;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2284;AA=4;SR=1049|1235;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 117575 . A G 0.598 PASS NS=358;DP=2097;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=2089;AA=3;SR=957|1132;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TS;CpG +20 117719 . T C 99.0 PASS NS=363;DP=2041;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2030;AA=8;SR=948|1082;SA=7|1;SB=0.875;AB=0.36364;ABR=4;ABA=7;RUN=2;SNP;TS +20 117769 . A G 3.93 PASS NS=358;DP=1977;AC=1;AN=716;AF=0.0013966;RA=1968;AA=4;SR=942|1026;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 117770 . C T 1.74 PASS NS=359;DP=1977;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1969;AA=2;SR=938|1031;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 117892 . C T 99.0 PASS NS=363;DP=2099;AC=4;AN=726;AF=0.0055096;RA=2082;AA=14;SR=1169|913;SA=6|8;SB=0.42857;AB=0.56667;ABR=17;ABA=13;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 117968 . G A 69.7 PASS NS=362;DP=2113;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2094;AA=9;SR=1143|951;SA=6|3;SB=0.66667;AB=0.33333;ABR=3;ABA=6;RUN=2;SNP;TS +20 117971 . T C 0.191 PASS NS=361;DP=2106;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2096;AA=4;SR=1139|957;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 118008 . G A 99.0 PASS NS=369;DP=2249;AC=98;AN=738;AF=0.13279;RA=1978;AA=264;SR=1025|953;SA=161|103;SB=0.60985;AB=0.51459;ABR=194;ABA=183;RUN=1;SNP;TS +20 118034 . A G 43.1 PASS NS=368;DP=2280;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2262;AA=8;SR=1177|1085;SA=2|6;SB=0.25;AB=0.63636;ABR=7;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 118087 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2284;AC=95;AN=732;AF=0.12978;RA=1966;AA=308;SR=1170|796;SA=194|114;SB=0.62987;AB=0.51454;ABR=230;ABA=214;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 118150 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2270;AC=96;AN=732;AF=0.13115;RA=1946;AA=312;SR=1208|738;SA=191|121;SB=0.61218;AB=0.50302;ABR=250;ABA=246;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 118166 . C T 75.1 PASS NS=369;DP=2290;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2268;AA=8;SR=1313|955;SA=2|6;SB=0.25;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS +20 118169 . T C 0.287 PASS NS=369;DP=2281;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2254;AA=14;SR=1275|979;SA=9|5;SB=0.64286;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 118222 . A G 99.0 PASS NS=367;DP=2462;AC=20;AN=734;AF=0.027248;RA=2368;AA=84;SR=1080|1288;SA=41|43;SB=0.4881;AB=0.47134;ABR=74;ABA=82;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 118252 . T C 41.3 PASS NS=369;DP=2588;AC=1;AN=738;AF=0.001355;RA=2562;AA=10;SR=1173|1389;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 118410 . T C 99.0 PASS NS=366;DP=2417;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=2365;AA=26;SR=1156|1209;SA=17|9;SB=0.65385;AB=0.52174;ABR=12;ABA=11;RUN=1;SNP;TS +20 118535 . G A 99.0 PASS NS=370;DP=2547;AC=25;AN=740;AF=0.033784;RA=2432;AA=98;SR=1401|1031;SA=47|51;SB=0.47959;AB=0.51872;ABR=97;ABA=89;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 118618 . C T 1.78 PASS NS=367;DP=2563;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2546;AA=3;SR=1375|1171;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 118657 . C T 0.168 PASS NS=368;DP=2612;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2602;AA=3;SR=1428|1174;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.85714;ABR=12;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 118780 . T C 0.605 PASS NS=368;DP=2715;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2696;AA=6;SR=1421|1275;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 118803 . C T 2.66 PASS NS=370;DP=2742;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2728;AA=4;SR=1422|1306;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.83333;ABR=10;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 118954 . G A 0.29 PASS NS=357;DP=2361;AC=3;AN=714;AF=0.0042017;RA=2337;AA=8;SR=1048|1289;SA=4|4;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=2;ABA=4;RUN=2;SNP;TS +20 118963 . C T 0.62 PASS NS=359;DP=2420;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2411;AA=4;SR=1067|1344;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 119295 . C T 5.3 PASS NS=370;DP=2159;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2150;AA=7;SR=909|1241;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 119420 . A G 2.58 PASS NS=365;DP=2001;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=1996;AA=3;SR=955|1041;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 119421 . A G 72.7 PASS NS=366;DP=2005;AC=3;AN=732;AF=0.0040984;RA=1990;AA=10;SR=951|1039;SA=5|5;SB=0.5;AB=0.52941;ABR=9;ABA=8;RUN=1;SNP;TS +20 119518 . C T 0.149 PASS NS=356;DP=1941;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1932;AA=2;SR=900|1032;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.85714;ABR=12;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 119534 . A G 99.0 PASS NS=360;DP=2109;AC=39;AN=720;AF=0.054167;RA=1989;AA=114;SR=879|1110;SA=47|67;SB=0.41228;AB=0.47396;ABR=91;ABA=101;RUN=3;SNP;TS +20 119596 . A G 99.0 PASS NS=366;DP=2103;AC=39;AN=732;AF=0.053279;RA=2004;AA=97;SR=874|1130;SA=41|56;SB=0.42268;AB=0.54706;ABR=93;ABA=76;RUN=1;SNP;TS +20 119714 . G A 0.547 PASS NS=314;DP=1079;AC=1;AN=628;AF=0.0015924;RA=1068;AA=6;SR=496|572;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 119730 . A G 99.0 PASS NS=308;DP=1035;AC=49;AN=616;AF=0.079545;RA=956;AA=69;SR=376|580;SA=24|45;SB=0.34783;AB=0.52427;ABR=54;ABA=48;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 119734 . T C 4.93 PASS NS=310;DP=1053;AC=1;AN=620;AF=0.0016129;RA=1034;AA=10;SR=379|655;SA=2|8;SB=0.2;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=3;SNP;TS +20 119897 . T C 0.0526 PASS NS=263;DP=770;AC=1;AN=526;AF=0.0019011;RA=760;AA=7;SR=349|411;SA=4|3;SB=0.57143;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 119918 . A G 44.3 PASS NS=294;DP=924;AC=3;AN=588;AF=0.005102;RA=911;AA=11;SR=340|571;SA=2|9;SB=0.18182;AB=0.52632;ABR=10;ABA=9;RUN=1;SNP;TS +20 119945 . T C 0.0906 PASS NS=335;DP=1320;AC=1;AN=670;AF=0.0014925;RA=1312;AA=3;SR=458|854;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.7;ABR=7;ABA=3;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 119983 . T C 18.0 PASS NS=351;DP=1675;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=1664;AA=4;SR=800|864;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=1;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 120093 . T C 99.0 PASS NS=336;DP=1402;AC=35;AN=672;AF=0.052083;RA=1335;AA=61;SR=744|591;SA=39|22;SB=0.63934;AB=0.53153;ABR=59;ABA=52;RUN=1;SNP;TS +20 120127 . T C 99.0 PASS NS=345;DP=1541;AC=39;AN=690;AF=0.056522;RA=1447;AA=87;SR=872|575;SA=51|36;SB=0.58621;AB=0.47436;ABR=74;ABA=82;RUN=1;SNP;TS +20 120289 . T C 1.51 PASS NS=359;DP=2131;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2120;AA=4;SR=1226|894;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 120327 . A G 99.0 PASS NS=365;DP=2183;AC=3;AN=730;AF=0.0041096;RA=2172;AA=9;SR=1158|1014;SA=4|5;SB=0.44444;AB=0.52941;ABR=9;ABA=8;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 120353 . T C 99.0 PASS NS=361;DP=2069;AC=15;AN=722;AF=0.020776;RA=2029;AA=35;SR=1056|973;SA=16|19;SB=0.45714;AB=0.34043;ABR=16;ABA=31;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 120463 . T C 0.168 PASS NS=357;DP=2200;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2187;AA=4;SR=1102|1085;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 120464 . T C 0.96 PASS NS=357;DP=2188;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=2158;AA=17;SR=1089|1069;SA=3|14;SB=0.17647;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 120471 . A G 99.0 PASS NS=355;DP=2155;AC=292;AN=710;AF=0.41127;RA=1332;AA=818;SR=667|665;SA=419|399;SB=0.51222;AB=0.50122;ABR=411;ABA=408;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 120487 . A G 0.161 PASS NS=361;DP=2223;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2217;AA=2;SR=1044|1173;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 120491 . G A 2.04 PASS NS=361;DP=2213;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2201;AA=3;SR=1022|1179;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=4;SNP;TS +20 120535 . G A 3.2 PASS NS=366;DP=2332;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2321;AA=5;SR=1104|1217;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 120553 . G A 99.0 PASS NS=363;DP=2295;AC=38;AN=726;AF=0.052342;RA=2196;AA=93;SR=1087|1109;SA=46|47;SB=0.49462;AB=0.5509;ABR=92;ABA=75;RUN=1;SNP;TS +20 120746 . A G 0.107 PASS NS=356;DP=2078;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2073;AA=3;SR=1040|1033;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 120761 . A G 4.72 PASS NS=360;DP=2025;AC=2;AN=720;AF=0.0027778;RA=2013;AA=7;SR=1011|1002;SA=2|5;SB=0.28571;AB=0.72727;ABR=8;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 120863 . T C 7.31 PASS NS=356;DP=2117;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=2108;AA=2;SR=1114|994;SA=1|1;SB=0.5;AB=0;ABR=0;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 120911 . T C 4.66 PASS NS=364;DP=2171;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2152;AA=3;SR=1110|1042;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 121040 . C T 0.0497 PASS NS=351;DP=2064;AC=1;AN=702;AF=0.0014245;RA=2047;AA=3;SR=1039|1008;SA=3|0;SB=1;AB=0.8;ABR=4;ABA=1;RUN=1;SNP;TS +20 121125 . A G 2.32 PASS NS=362;DP=2128;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2124;AA=3;SR=1089|1035;SA=3|0;SB=1;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 121188 . G A 99.0 PASS NS=363;DP=1947;AC=35;AN=726;AF=0.048209;RA=1842;AA=103;SR=897|945;SA=51|52;SB=0.49515;AB=0.4069;ABR=59;ABA=86;RUN=2;SNP;TS +20 121235 . C T 0.234 PASS NS=360;DP=1946;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1935;AA=3;SR=820|1115;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 121288 . G A 43.3 PASS NS=364;DP=2030;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2021;AA=5;SR=756|1265;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.625;ABR=5;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 121493 . C T 99.0 PASS NS=304;DP=848;AC=120;AN=608;AF=0.19737;RA=641;AA=202;SR=285|356;SA=94|108;SB=0.46535;AB=0.59302;ABR=204;ABA=137;RUN=18;SNP;TS +20 121543 . C T 73.2 PASS NS=355;DP=1309;AC=2;AN=710;AF=0.0028169;RA=1270;AA=6;SR=571|699;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.33333;ABR=3;ABA=5;RUN=1;SNP;TS +20 121727 . T C 0.137 PASS NS=365;DP=2073;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2064;AA=4;SR=1229|835;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 121761 . G A 0.814 PASS NS=363;DP=1992;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=1983;AA=4;SR=1067|916;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 121787 . A G 5.77 PASS NS=368;DP=1959;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=1946;AA=6;SR=952|994;SA=3|3;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 121824 . C T 99.0 PASS NS=366;DP=1902;AC=299;AN=732;AF=0.40847;RA=1098;AA=764;SR=470|628;SA=353|411;SB=0.46204;AB=0.48175;ABR=330;ABA=346;RUN=1;SNP;TS +20 121975 . C T 0.0658 PASS NS=368;DP=2209;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2200;AA=2;SR=1147|1053;SA=2|0;SB=1;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 121976 . G A 99.0 PASS NS=368;DP=2174;AC=320;AN=736;AF=0.43478;RA=1282;AA=888;SR=680|602;SA=467|421;SB=0.5259;AB=0.50249;ABR=404;ABA=399;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 121986 . A G 29.8 PASS NS=366;DP=2153;AC=4;AN=732;AF=0.0054645;RA=2143;AA=7;SR=1159|984;SA=3|4;SB=0.42857;AB=0.69565;ABR=16;ABA=7;RUN=1;SNP;TS +20 122072 . T C 0.195 PASS NS=369;DP=2181;AC=4;AN=738;AF=0.0054201;RA=2151;AA=13;SR=1122|1029;SA=13|0;SB=1;AB=0.76;ABR=19;ABA=6;RUN=1;SNP;TS +20 122202 . C T 2.54 PASS NS=365;DP=2275;AC=1;AN=730;AF=0.0013699;RA=2262;AA=3;SR=1021|1241;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 122337 . A G 13.1 PASS NS=370;DP=2216;AC=1;AN=740;AF=0.0013514;RA=2208;AA=4;SR=1130|1078;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 122411 . C T 1.75 PASS NS=366;DP=2162;AC=1;AN=732;AF=0.0013661;RA=2155;AA=3;SR=1002|1153;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=2;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 122508 . G A 99.0 PASS NS=358;DP=2024;AC=118;AN=716;AF=0.1648;RA=1718;AA=301;SR=831|887;SA=133|168;SB=0.44186;AB=0.51299;ABR=237;ABA=224;RUN=4;SNP;TS +20 122511 . T C 99.0 PASS NS=363;DP=2032;AC=20;AN=726;AF=0.027548;RA=1967;AA=59;SR=932|1035;SA=27|32;SB=0.45763;AB=0.39706;ABR=27;ABA=41;RUN=2;SNP;TS +20 122548 . C T 99.0 PASS NS=356;DP=1990;AC=37;AN=712;AF=0.051966;RA=1899;AA=86;SR=950|949;SA=49|37;SB=0.56977;AB=0.51471;ABR=70;ABA=66;RUN=6;SNP;TS +20 122706 . G A 13.0 PASS NS=362;DP=2089;AC=3;AN=724;AF=0.0041436;RA=2063;AA=10;SR=944|1119;SA=6|4;SB=0.6;AB=0.4375;ABR=7;ABA=9;RUN=5;SNP;TS +20 122770 . T C 0.0898 PASS NS=359;DP=2007;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=2001;AA=3;SR=951|1050;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 123021 . C T 0.0437 PASS NS=368;DP=2290;AC=2;AN=736;AF=0.0027174;RA=2281;AA=4;SR=1221|1060;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.76923;ABR=10;ABA=3;RUN=3;SNP;TS +20 123037 . T C 99.0 PASS NS=367;DP=2305;AC=4;AN=734;AF=0.0054496;RA=2285;AA=13;SR=1267|1018;SA=10|3;SB=0.76923;AB=0.63333;ABR=19;ABA=11;RUN=2;SNP;TS +20 123073 . C T 0.404 PASS NS=371;DP=2357;AC=2;AN=742;AF=0.0026954;RA=2341;AA=7;SR=1293|1048;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.66667;ABR=6;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 123251 . T C 71.0 PASS NS=363;DP=2413;AC=1;AN=726;AF=0.0013774;RA=2393;AA=10;SR=1226|1167;SA=7|3;SB=0.7;AB=0.5;ABR=4;ABA=4;RUN=1;SNP;TS +20 123318 . T C 99.0 PASS NS=367;DP=2371;AC=24;AN=734;AF=0.032698;RA=2289;AA=73;SR=1174|1115;SA=41|32;SB=0.56164;AB=0.5;ABR=56;ABA=56;RUN=1;SNP;TS +20 123499 . C T 99.0 PASS NS=367;DP=2330;AC=5;AN=734;AF=0.006812;RA=2298;AA=18;SR=1062|1236;SA=6|12;SB=0.33333;AB=0.38462;ABR=10;ABA=16;RUN=2;SNP;TS +20 123500 . A G 0.191 PASS NS=367;DP=2342;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2317;AA=13;SR=1062|1255;SA=3|10;SB=0.23077;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=3;SNP;TS;CpG +20 123513 . A G 1.47 PASS NS=368;DP=2373;AC=1;AN=736;AF=0.0013587;RA=2358;AA=5;SR=1071|1287;SA=2|3;SB=0.4;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=3;SNP;TS +20 123564 . T C 0.229 PASS NS=372;DP=2373;AC=1;AN=744;AF=0.0013441;RA=2348;AA=10;SR=1045|1303;SA=3|7;SB=0.3;AB=0.72727;ABR=8;ABA=2;RUN=5;SNP;TS +20 124059 . C T 37.8 PASS NS=358;DP=1984;AC=3;AN=716;AF=0.0041899;RA=1971;AA=7;SR=971|1000;SA=5|2;SB=0.71429;AB=0.44444;ABR=4;ABA=5;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 124060 . G A 34.6 PASS NS=359;DP=1991;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1983;AA=3;SR=995|988;SA=2|1;SB=0.66667;AB=0.5;ABR=3;ABA=3;RUN=2;SNP;TS;CpG +20 124148 . A G 0.344 PASS NS=358;DP=1957;AC=2;AN=716;AF=0.0027933;RA=1947;AA=6;SR=989|958;SA=1|5;SB=0.16667;AB=0.8;ABR=12;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 124229 . T C 0.672 PASS NS=356;DP=1979;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1972;AA=4;SR=1025|947;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.8;ABR=8;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 124230 . A G 0.0816 PASS NS=356;DP=1970;AC=1;AN=712;AF=0.0014045;RA=1959;AA=4;SR=1026|933;SA=1|3;SB=0.25;AB=0.81818;ABR=9;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 124249 . A G 99.0 PASS NS=359;DP=1969;AC=41;AN=718;AF=0.057103;RA=1864;AA=101;SR=974|890;SA=55|46;SB=0.54455;AB=0.51977;ABR=92;ABA=85;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 124335 . C T 99.0 PASS NS=361;DP=2035;AC=4;AN=722;AF=0.0055402;RA=2013;AA=15;SR=929|1084;SA=10|5;SB=0.66667;AB=0.3913;ABR=9;ABA=14;RUN=1;SNP;TS +20 124412 . C T 99.0 PASS NS=357;DP=2005;AC=307;AN=714;AF=0.42997;RA=1207;AA=795;SR=602|605;SA=400|395;SB=0.50314;AB=0.51286;ABR=379;ABA=360;RUN=1;SNP;TS +20 124607 . A G 2.28 PASS NS=357;DP=1872;AC=1;AN=714;AF=0.0014006;RA=1865;AA=2;SR=930|935;SA=1|1;SB=0.5;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 124827 . T C 1.7 PASS NS=367;DP=2059;AC=1;AN=734;AF=0.0013624;RA=2048;AA=4;SR=987|1061;SA=2|2;SB=0.5;AB=0.6;ABR=3;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 124848 . A G 36.5 PASS NS=364;DP=2077;AC=1;AN=728;AF=0.0013736;RA=2060;AA=6;SR=966|1094;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.57143;ABR=4;ABA=3;RUN=1;SNP;TS +20 124878 . G A 0.22 PASS NS=361;DP=2060;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=2049;AA=4;SR=974|1075;SA=3|1;SB=0.75;AB=0.77778;ABR=7;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 124920 . A G 76.0 PASS NS=361;DP=1956;AC=1;AN=722;AF=0.001385;RA=1949;AA=6;SR=984|965;SA=2|4;SB=0.33333;AB=0.14286;ABR=1;ABA=6;RUN=1;SNP;TS;CpG +20 124998 . T C 99.0 PASS NS=366;DP=2204;AC=29;AN=732;AF=0.039617;RA=2131;AA=66;SR=1132|999;SA=36|30;SB=0.54545;AB=0.54902;ABR=56;ABA=46;RUN=1;SNP;TS +20 125121 . C T 99.0 PASS NS=364;DP=2075;AC=208;AN=728;AF=0.28571;RA=1472;AA=599;SR=826|646;SA=335|264;SB=0.55927;AB=0.49868;ABR=377;ABA=378;RUN=1;SNP;TS +20 125381 . A G 4.69 PASS NS=362;DP=2102;AC=1;AN=724;AF=0.0013812;RA=2094;AA=3;SR=919|1175;SA=1|2;SB=0.33333;AB=0.66667;ABR=4;ABA=2;RUN=1;SNP;TS +20 125450 . G A 0.364 PASS NS=359;DP=1881;AC=1;AN=718;AF=0.0013928;RA=1868;AA=5;SR=862|1006;SA=1|4;SB=0.2;AB=0.71429;ABR=5;ABA=2;RUN=2;SNP;TS +20 125470 . A G 0.602 PASS NS=360;DP=1870;AC=1;AN=720;AF=0.0013889;RA=1855;AA=5;SR=909|946;SA=3|2;SB=0.6;AB=0.75;ABR=6;ABA=2;RUN=1;SNP;TS