Mercurial > repos > fabad > sparql_uniprot
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| author | fabad |
|---|---|
| date | Sun, 22 Oct 2017 15:57:18 -0400 |
| parents | 84c9f65ed7c6 |
| children | |
| files | sparql_uniprot.py |
| diffstat | 1 files changed, 5 insertions(+), 5 deletions(-) [+] |
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--- a/sparql_uniprot.py Sun Oct 22 15:27:01 2017 -0400 +++ b/sparql_uniprot.py Sun Oct 22 15:57:18 2017 -0400 @@ -174,7 +174,7 @@ def sparqlwrap(proteinId, proteinName, geneName, organismName, diseaseAnnotation, domainName, similarityAnnotation, locationAnnotation, functionAnnotation, pharmaceuticalAnnotation, output): query = buildQuery(proteinId, proteinName, geneName, organismName, diseaseAnnotation, domainName, similarityAnnotation, locationAnnotation, functionAnnotation, pharmaceuticalAnnotation) - print query + print (query) # Creamos un objeto del tipo SPARQLWrapper indicando en que # direccion esta el servicio que recibe consultas en sparql @@ -193,20 +193,20 @@ # Esta es la instruccion que realiza la consulta a # uniprot. Devuelve un objeto de python que hay que # tratar. - print "Ejecutando query" + print ("Ejecutando query") results = sparql.query() # Con esto, convertimos el objeto devuelto por # el servicio al formato que especificamos antes. # En este caso, json. - print "Conviertiendo a json" + print ("Conviertiendo a json") json = results.convert() - print "Fin conversion a json" + print ("Fin conversion a json") # Dentro de la variable results tenemos informacion # (metadatos) de lo que ha devuelto el servidor de # uniprot. - print results.info() + print (results.info()) # Imprimir resultados printResults(json, output)