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# hal (simMouse_chr6:0.084509,simRat_chr6:0.091589)mr;

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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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s	mr.mrrefChr0	4112	63	+	130230	TACATCCTGCAACATAAAACTTTTAATAGTGTCAAAAGATGGTATGTAGTGGCATAGTAGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	4322	60	+	636262	TACATCCTGCAACATAAAACTTTTAATAGTGTCAAAAGATGGTATGTAGTGGCATA---GCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	4103	63	+	647215	TAAATCTAGCAACATAAAACCTTTAATAGTGTCAAAAGATGGTTTGTAGTGGCATAGTAGTGG

a
s	mr.mrrefChr0	4175	17	+	130230	CACACCCTATTCTACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	4382	17	+	636262	CACACCCTATTCTACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	4174	17	+	647215	CACACCCTATTCTACAA

a
s	mr.mrrefChr0	4192	19	+	130230	TACTCTTATCCTCAAGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	4401	19	+	636262	TACTCTTATCCTCAAGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	4191	19	+	647215	TACTCTTTCCCTCCAGGGA

a
s	mr.mrrefChr0	4211	136	+	130230	GTGTTTGGTAGGCTCAGAGGCATAGTTAGCAATAGTTGCTACTGCACTGCAAGGATCCCAAAGGCATGCACCATGATTTGCTCATCCCAATGAATAAGAATCATGAACCCACCCTAACTTTGTGGGCCCAGATGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	4421	135	+	636262	GTGTTTGGTGGGCTCGGAGGCACAGTTAGCAATAGTTGCTACTCCATTGCAAGGATCCCAAAGGCTTGCACCGTGATTTGCTCATCCCAATGAATAAGAATCATGAACCCACCTT-ACTTTGTAGGCCCAGATGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	4210	136	+	647215	GTGTTTGGTAGACCCAGATGCATAGGTAGCAGTAGTTGCTACTGCACTGCGAGGATCCCAAAGGCATGCACCATGATTTGCTCATGCTGATGCCTAAGAAGCACAAACCCACCCTAACTTTGTGGGTCCAAATGCT

a
s	mr.mrrefChr0	4347	14	+	130230	TGACAACGGGAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	4564	14	+	636262	TGACAACGGGAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	4346	14	+	647215	TGACAAAGGGAATT

a
s	mr.mrrefChr0	4361	37	+	130230	TTATTAATAGGCTAGGGGTGTTGTTCACAGTACCTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	4578	37	+	636262	TCATTAATAGGCTAGGGATGTTGTTCACAGTACCTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	642057	18	-	647215	TTGCTATTCGTCCAGGGG-------------------

a
s	mr.mrrefChr0	4398	23	+	130230	CATCGTACACCAAGGTATAACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	4616	23	+	636262	CATCGTACACCAAGGTATAACCA

a
s	mr.mrrefChr0	4421	255	+	130230	ACCTCAGCTTTCATCTATGTTTATTGAGCCCCCCTGTTTGTCATAGTGAAGATTGCAAGACAAAGAATGTGCTGATCTAAATTTTTTGATTAGTGGATGCAGCTGGTTGCACCATCAACACAGACGGCAGCAGCATTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATCCCACTGCAGACCTTGTTGCAGCCTTTTGTGGAAAGTGCTGTGGATGGTGGCAGCCTCCATGGGGTGATACCCAATGCCAGCGGCAACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	4650	255	+	636262	ACCTCAGCTTTCATCTATGTTTATTGAGCCCCCCTGTTTGTCATACTGAAGATTGCAAAACAAAGAATGTACTGATCTAAATTCTTTAATTAGTGGATGTGGCTGGTTGCACCATCAACACAGACAGCAGCATCACTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATCCCGCTGCAGACCTTGTTGCAGCCTTTTGTGGAAAGTGCTGTGGATGGCAGCAGCCTCCATGGGGTGATACCCAATGCCAGCGGCAACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	642075	254	-	647215	ACCTTAGCTTGCACCCATGTATATCAAGCCCCCCTGTTAGTCACAGTGAAGATTGCAAGACAAAGAAAGTGCTGATCTAAATTTTTTGATTAGTGGATACAGCTGGTTGCTCCATCAGCACAGATGGCAGCAGCATTACTTGTGATTGCATCAATATTGGGCAATGCCACTGCAGACCTTATTGCAGCTTATTA-GGAAAGTGCTGTGGACAGTGGCAGCTTCCATGGGGTGATACCCGATGCCAGTGGCAACTG

a
s	mr.mrrefChr0	4676	108	+	130230	CTGTGCTGCAACTCTTGAAAGTATGAGAGATGAGCTACAGAGAGTACACAGTAGCCAGGGAGGTATTTTACCAATGTAGTAGGATCTTGCTAACATGGGATTGCTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	4905	108	+	636262	CTGTGCTGCAACTCTCGAAAGTATGAGAGATGAGCTACAGACAGTACACAGCAACCAGCGGGGTATTTTACCAGTATAGTAGGATCCTGCTAACATGGGATTGCTAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	642397	108	-	647215	CTATGGTGCAGCTCTTGAAAGTATAAGAGATGGGCTGCACAGGGTACGCAGTAGCCAGGTAGGTATTTTACCAATGTAGTAGGATCTTCCTAAGATGGGATTGTTAAG

a
s	mr.mrrefChr0	4784	151	+	130230	GATATGCTGTACTGAGAAGGGTGGAGGAACATATAGATTCAACTAGTGATCACAAGAAAAAAGCATTTATGGTGAATTGTTATAGGGCTATATTTGATGACAATATAGTATAAGCTGTTAAAATGGAAAAATGATGAGCAGCATAATATGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	5013	135	+	636262	GATATGCTGTACTGAGAA-----GAGGAACATATAGATTCAACCAGTGACCACAAAAAAAAAGAATTTATGGTGAATAGCTATAGGGCTATATTTGATGACAATATAGTATAAGCTGTTAAAATGGA-----------CATCATAATATGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	642515	151	-	647215	GTTATACTGTACTGAGAAGGGTGGAGGAACATATAGATTCAACTAGGGATCACAAGAAAAAAACATTTATGGTGAATTGTTATAGGGCTATATTTGAGGACAATATAGTATAAGCTGTTGAAATGGAAAAATGATGAGCAGCGTAATATGC

a
s	mr.mrrefChr0	4935	32	+	130230	AGGCTTCTTTAATGTATATAACAACAGAGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	5149	32	+	636262	AGGCTTCTTTAATGTATATAACAACAGAGTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	642666	32	-	647215	AGGCTTCTTAAATGTATTTAACAACAGAGTAC

a
s	mr.mrrefChr0	4967	209	+	130230	CATGGTTAGACTTAGCACAGAATGGATAATTCAGACAGTATGGATAATTCAGAGAGCTACCTTGAACCTTGAAATATGAGTAGTGGGAAGGAAAGGTTCAAGAAAAGTACCTATTTCATGAATCTGTCTTATGATATGCTATGTTTTGCTTAACATCACCTTGAGGGGTGGGGCCCTGGCAGCTGTTAAAATCTGATAATTCTAGCAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	5182	209	+	636262	CATGGTTAGACTTGGCACAGAATGGATAATTCAGACAGTATGGATAATTCAGAGAGCTACCTTGAACCTTGAAATATGAGTAGTGGGAAGGAAAGGTTCAAGAAAAGTACCTAGCTCATGAATCTGTCTCATGATATGCTATGTTTTGCTTAACATCACCTTGAGGGGTGGGGCCCTGGCAGCTGTTAAAATCTGATAATTCTAGCAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	642698	152	-	647215	CATGGTTAGATTTAGCACGGTATAGATAATTCAGACAGTATTGATAATTCAGAGAACTACCTTGTATCTTGAAATAGGATTAGTAGGAGAGAAAAT----AAAAAAGTACCTATTTCATGGATCTGTCTTGTGGTATGCTATGTTTTGCTTAACAT-----------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr0	5176	100	+	130230	TGAGATGTTGAGACCATTTCTAGTGTAGATTTAACAGGAAATTTCAGTATTTTTTAAGAGTTGAGCAGGACTTCACACCACTGAACACTTATCATGAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	5449	100	+	636262	TGAGATGTTGAGACCATTTCTAGTGTAGATTTAACAGGAAATTTCAGTATTTTTTAAGAGTTGAGCAGGACTTCACACCACTGAACACTTATCATGAGAT

a
s	mr.mrrefChr0	5276	41	+	130230	TCATAAGAGCATGTAGAGTAAAATTCAGCACAGGACTAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	5551	41	+	636262	TCATAAGAGCATGTAGAGTAAAATTCAGCACAGGACTAGAT

a
s	mr.mrrefChr0	5317	204	+	130230	AGGCTATGCCTTTGTCACTAGAAATGCACACCACGTTTCTAATTTGAATCAACGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTATAATAAGTTGCAGCCTATGCTTTTATCACTAGAAACGCACACCACATATCTAATCTGAATCAATATTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGATAGGTCATGTCTCTACACTTAAATGTTCTGGTTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	5603	204	+	636262	AGGCTATGCCTTTGTCACTAGAAATGCACACCACGTTTCTAATTTGAATCAACGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTATAATAAGTTGCAGCCCATGCTTTTATCACTAGAAACGCACACCACGTATCTAATCTGAATCAATGTTACAATGAGTGTTGAAAGTTAGCTAGATCATGTCTCTACACTTAAATGTTCTGATTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	5192	116	+	647215	----------------------------------------------------------------------------------------TGAAGGCTACGCTTTTGTCACTAGAAACTCACACCACATATCTAATTTAACTCAACATTACAATAAGTGTTGAAAGTTAGATATGTCATGTCCCTACACTTAAGTGTTCTGGTTTC

a
s	mr.mrrefChr0	5521	169	+	130230	AACTCCAAAGAACCTGGCAACCCTCTACCTTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGCATTATATACTTAATGCATAAACAATTGAAGGGGATGCAAGTGCCACCACTAGAACATGCAAAGGTATAAAGGGAACTCACATAAGAGAGCAGTTGAGTTTATCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	5807	169	+	636262	AACTCCAAAGAACCTGGCAACACTCTACCGTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGCACTATATACTTAAGGGATAAACAATTGAAGGGGAAGCAAGTACCACCACTAGAACATGTATAAGTACAACGGGAACTCACATAAAAGAACAGTTGAGTTTATCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	5309	169	+	647215	AACTCAAAAGAAACTGGTGACCCTCTACCTTTGGTGACCTCTGTAGGTATTCATAGAGAGTTGAATTATATACTTAATGCATAAACAATTGAAGGGGCTGCAAGTGCCACCACTAGAACATGCAAAGATATAAAGGGAGCTCACACAAGAGAGCAGTTGAGCTTATCTA

a
s	mr.mrrefChr0	5690	128	+	130230	CTTGCATGTTACTAGAGAGTCCATGAGCTCTTTAGTTAGATGACTTGTGGGTGTCATAAGGTTAATGTGGACAAGTAAGCTAGGGGCTTTCATAAGGTAGGGGCTTTCAAACTGCTGGAAGTTCAGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	5976	128	+	636262	CTTGAATGTTATTAGAGAGTCCATGAGCTTTTTAGTTAGATGACTTGTGGGTGCCATAAGATTAATGTAGACAAGTAAGCTAGGGGCTTTCATAAGGTAGGGGCTTTCAAACTGCTGGAAGTTCAGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	5479	111	+	647215	CTTGCATGTTACTAGAGAGTCCATAAGCTCTTTAGGTAGATGACTTGTGGGTGTCATAAGGTTAATGTGGACAAGTA----------------GAGGTAGGGGCTTTCACCCTG-TGGAATTTCAGGA

a
s	mr.mrrefChr0	5818	327	+	130230	TGAAATATCCTTGTTATAGAGCCTTCTCATACATTCCAGGCATTGGCATAGACATCCGAACTTCAGACAGCTCTTCAATTAAAATCCTCTCCTCCTAATTGTTGAGAGAGTGATGGCTAAGCAACATGGGCTTCATTTAGTCCAGTCCACTGCTCCCGGCATCCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAGTGCAGGCAGCAATTGCCTTACAATCTTCGAGAGGGTGACGGCTAAGCACCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAATGCAGGCATAAATTGCCTTGCTATCTCTTAGAGGAACACTCACAATCTGATGTACTTATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	6110	327	+	636262	TGAAATATCCTTGTTATAGAGCCTTCTCATACATTCCAGGCACTGGCATAGACATCCGAACTTCAGACAGCTCTTCAATTAAAATCCTCTCCTCCCAATTGTTGAGAGAGTGCTGGATAAGCAACATGGGCTTCATTTAGTCCAGTCCACTGCTCCCGGCATCCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAGTGCAGGCAGCAATTGCCTTACAATCTTCGAGAGAGTGATGGCTAAGCACCTGTAGATGCAGCAGTACAGGCTTTAATGCAGGCACAAATTGCCTTGCTATCTCTTAGAGGAATACTCACAATCTGATGTACTTATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	5590	327	+	647215	CGAAATATCCTTGTTATAGAGCCTTATCATACCGTACTGGCATCGGCATGGACCTCCGAACTGCAGCCAGTTCTTCAAGTAAAATCAACTTCTCCTAATTGTTGAGAGAATGATGACTAAGCAACATGGGCTTCAATTTGTCCAGTCCAATGCTCCCAGCATCCTGTAGATGCAGCAATACAGGCTTTAGTGCAGACAGCAAATGCCTTACAATCCTTGAGAGGGTGACGGCTAAGCACCTGTGGATGCAGCAGTACAGCCTGTAATGCAGGCATAAATTGCCTTGCTATCTCTTAGAGGAACACTCACAATCTGATGTACTTATCA

a
s	mr.mrrefChr0	6145	52	+	130230	CAATTTATTAATGTATATGAGGGCTAACAACCGGTGGTCAGTAGATTCAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	6437	52	+	636262	CAATTTATTAATGTATATAAGGGCTAACATCCAGCGGTCAGTAGATTCAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	5918	52	+	647215	AAATTTATTAATGTATATGAGGGCTATCAATGGGTGGTCAGCAGATTCAAAG

a
s	mr.mrrefChr0	6197	9	+	130230	TGCATTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	6489	9	+	636262	TGCATTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	5975	9	+	647215	TGCATTTGT

a
s	mr.mrrefChr0	6206	90	+	130230	ATTTGTAGTAACTAAAATAACCAATAGACAATTAGTACACAGAAGGTGTTATTGAGCTATCAGCCCCACAAGCTTCACCTTAGTTAGGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	6498	89	+	636262	ATCTGTAA-AACTAAAATAACCAACAGACAATTAGTACACAAAAGGTGTTACTGAGCTATCAGTCCCACAAGCTTCACCTTAGTTGGGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	5985	90	+	647215	ATTTGTAGTAACTAAAATAACTGATAGACAGTTAGTGCTCAGAAGGTGTTATTGGGCTATCAGCCCCATGAGCTTCACCTTAGTTAGGAA

a
s	mr.mrrefChr0	6296	12	+	130230	TAACGTGAACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	6592	12	+	636262	TAACGTGAACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6075	12	+	647215	TAACGCTAACCA

a
s	mr.mrrefChr0	6308	52	+	130230	CAGGTTCAGATAGCTTCCTGTGCCCATGTCTGCATGACTCCCAGAGCCTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	6604	52	+	636262	CAGGTTCAGATAGGTTCCTGTGCCCATGTCTGCATGACTCCCAGCGCATGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6088	52	+	647215	CAGGTTCAGATAGCTTCCCGTGCCCATAAATGCATGACTCCCAGAGCCTGTG

a
s	mr.mrrefChr0	6360	7	+	130230	CACCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	6658	7	+	636262	CACCGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6140	7	+	647215	CACCACT

a
s	mr.mrrefChr0	6367	184	+	130230	TATTAATGCACCAAAGCATTATGATCTTAAGTAGCACTAGCACTGAATTTCAATCTAGACCGTCTGGCCCAAAAGCAATCTGAGATGGAAAGGAATCACACAGAGAGAAGGGTAGTATTGATGAAGCCAGGCTACAGCTTGAAACCAACTAGCAAGTTTTAATTCAATAGCCATAAAGAACTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	6674	182	+	636262	TATTAATGCACCAAAGCATTAGGATCTTAAGTAGCACTAGCACTGAATTTCAATCTAGACCGTTTGGCCCAAAAGCAATCTGATATGGAA--GAATCACACAGAGAGAAGGGTAGTATTGATGAAGCCAGGCTACAGCTTGAAATCAACTAGCAAGTTTTAATTCAATACCCATAAAGAACTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6147	180	+	647215	TATTAATGCATCAGTGCATTATGATATTAAGTAGCATTAGCACTGAATGTCAATCTA----GTCTGGCCCAAAAGCAATCTGAGATGGAAAGGAATCACAAAGAGGGAAGGGTAGTATTGGTGGGGCCAGGCTATGGCTCGGAACCAACCAGCAAGTTTTAATCCAATAGCCATATAGAACTAA

a
s	mr.mrrefChr0	6551	178	+	130230	AACCAAGCGCAGTAATGTAACAGGCAGCATGGAGTGGCAAGTGACCAGAGCAGTGCAGTATTGGTCATTTATGTATTAGCAATTCTAAGCACAATTGGTGTCATACTATGTAAAACAGTTTTGGTGAAACCATCACAGATCAGCAATGTGTCTTTGAATGGAGCCCAATGATAAGATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	6856	178	+	636262	AACCAAGCACAGTAATGTAACAGGCAGCATGGAGTGGCAAGTGACCAAAGCAGTGCAGTATTGGTCATTTATGTGTTAGCAATTCTAGATGCAATTGGTGTCAAACTATGTAGAACAGTTTTGGTTAAACCATCACAGATCAGCAATGGGTTTTTGAATGGAGCCCAATGATAAGATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6375	174	+	647215	AACCAAGCGCAGTCATGTAATAGGCA----GGAGTGGCAAGTGACTAGCGCAGTTCAGTATTGGTCATTTATGCAGTAGCAATTCTAAGCACAACCAGTGTCATACTATGTAAAACAGTTTTGGTGAAACCATCACAGATCAGCAATGTGTCTTTGAATGGAACCCAATGAAAAGATT

a
s	mr.mrrefChr0	6729	63	+	130230	CAATGCCCTATTGCTAGAGGGAAATTGACCACCCAGCTACTACACATGATGATGGAGTACCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	7034	63	+	636262	CAATGCCCTATTGCTAGAGGGAAATTGACCACCCAGCTACTACACATGATGATGGAGTACCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6550	63	+	647215	CAATTCCCTATTGTTAGAGGGAGATTGACTACCCAGTGACTACTCATAATGACAGTGCATCAA

a
s	mr.mrrefChr0	6792	14	+	130230	TCCTGAGGATATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	7098	14	+	636262	TCCTGAGGATATGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6613	14	+	647215	CCCTGAGGATATGA

a
s	mr.mrrefChr0	6806	73	+	130230	AATTTCCATTGGAGCTGAATCAGGGGATAGACTGCTGACATCCAACAAAGGTGATGAAGTTACACAAAATTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	7112	73	+	636262	AATTTCCATTGGAGCTGAATCAGGGGATAGACTGCTGACATCCAACAAAGGTGATGAAGTTACACAAAATTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6630	73	+	647215	AATTTCCATTTTAGGTGAATCAGGGGATACACTGCTGATATCAAACAAAAGTCGTGAAGTTGCACAAAATTAC

a
s	mr.mrrefChr0	6879	58	+	130230	ACTAAATCATAGTCATGGCTAAAAGGTATGGACAACTACATACAGTTTATTTAGGTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	7185	58	+	636262	ACTAAATCATAGTCATGGCTAAAAGGTATGGACAACTACATACAGTTTATTTAGGTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6704	58	+	647215	ACTAAATCACTGTCATGGCTAGGAGGTGTAGACAAATACATACAGTTCAATTATATTG

a
s	mr.mrrefChr0	6937	31	+	130230	TACTCTGCTTTGCTATTTGCTGAGTGGCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	7243	31	+	636262	TACTCTGCTTTGCTATTTGCTGAGTGGCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6764	31	+	647215	TATTCTACTTTGCTATTTGCAGGGTGACTTC

a
s	mr.mrrefChr0	6968	4	+	130230	TAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	7281	4	+	636262	TAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6795	4	+	647215	TAAT

a
s	mr.mrrefChr0	6972	57	+	130230	ATCAATCCATTTTTGGGATGTCATGACCCTTGTAGAAGGTGACCTGCCTTAGCTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	7290	57	+	636262	ATCAATCCATTTTTGGGATGTCATGACCCTTGTAGAAGGTGACGTGCCTTAGCTGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6799	57	+	647215	CTTGATCCATTTTTGGGATGTCATCACCTTTGGAGGAGGTGACCCACCTTAGCTGCT

a
s	mr.mrrefChr0	7029	53	+	130230	GTATTTACCGATCAGCATTGCTGTCACCAAGTGCCGGGAAGTTGTCTTCTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	7347	53	+	636262	GTATTTACCGACCAGCATTGCTGTCACCAAGTGCCGAGAAATTGTCTTCTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6857	53	+	647215	GTATTTACCAATCGACATTGCTGTTGCCAAGCACCGGGAAGTTGTCTTCTTGG

a
s	mr.mrrefChr0	7082	10	+	130230	ATGACTCTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	7409	10	+	636262	ATGACTCAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6910	10	+	647215	ATGACTCTAA

a
s	mr.mrrefChr0	7092	13	+	130230	GTCCACATGCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	7420	13	+	636262	GTCCACATGCATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6920	13	+	647215	GTCCATATGCATG

a
s	mr.mrrefChr0	7105	42	+	130230	ATACCACAAGCCTTTGGGAGCTGGTACTGACTCAAATGGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	7467	42	+	636262	ATACCACAAGCCTTTGGGAGCTGGTACTGACTCAAATGGTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6933	42	+	647215	ATACCACAGGTCTTGGGAAGCTTGTACTGTCTCAGATGATCA

a
s	mr.mrrefChr0	7147	58	+	130230	AGTGATCATCAACAGAACGAGACAGCTGAGCAGTCATGAGCCTACTTTCTCTTGGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	7926	58	+	636262	AGTGATCATCAACAGAACGAGACAGCTGAGCAGTCATGAGCCTACTTTCTCTTGGATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	6975	58	+	647215	AGTGCTCATCAATAGAACAAGCCAGCTGAGCAGTCATGAGTCTATCTTCTCTTGGATG

a
s	mr.mrrefChr0	7205	61	+	130230	CTGGGATGGGACTAGCAATCATTCATACCTGAGAGAAGTAATAGAGTAAGCCTCTTATACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	7984	61	+	636262	CTGGGATGGGACTAGCAATCATTCATACCTGAGAGAAGTAATAGAGTAAGCCTCTTATACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	7041	61	+	647215	CTGGGATGGGACTAGCAACCACTGGCACCTGAGAGAAGCACTAGAGTAAGCCTCGTACATA

a
s	mr.mrrefChr0	7266	9	+	130230	CCTATGTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	8048	9	+	636262	CCTATGTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	7102	9	+	647215	CCTATGTTG

a
s	mr.mrrefChr0	7275	38	+	130230	GCTACAGACTTGATAGCGAGGTACAAAAGGAAGCTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	8057	38	+	636262	GCTACAGACTTGATAGCGAGGTACAAAAGGAAGCTATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	7112	38	+	647215	GCTTCAGACTTCACAGCAAGTTCCGAAAGGAAGCTATA

a
s	mr.mrrefChr0	7313	24	+	130230	TTTGGTTCATATCTATGAAGTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	8096	24	+	636262	TTTGGTTCATATCTATGAAGTGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	7150	24	+	647215	TTTGGTTCATGTCTACAAAGTGTG

a
s	mr.mrrefChr0	7337	18	+	130230	AGTGTGTGGGGCAGTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	8129	18	+	636262	AGTGTGTGGGGCAGTATT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	9613	303	+	130230	Catagggaagcccacgcattgacaatcacttgagattcagtctggagaagctgggatggcttgggatgtataaacttataaatttcacaagactcatggtatgtaatggaatatattaacagaatcacatgattagatcattggataatggtggtgcacagattgaattaaacaaacaggatcacatcacaggttagccataatgaatgagttagaaagtgaccgataacagtgcctgaatgttgcctgcacaagcataaagctgctttccagtggttatggttggacacttgtgtaatccct
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	10547	303	+	636262	Catagggaagcccacgcattgacaatcacttgagattcagtctggagaagctgggatggcttgggatgtataaacttataaatttcacaagactcatggtatgtaatggaatatattaacagaatcacatgattagatcattggataatggtggtgcacagattgaattaaacaaacaggatcacatcacaggttagccataatgaatgagttagaaagtgaccgataacagtgcctgaatgttgcctgcacaagcataaagctgctttccagtggttatggttggacacttgtgtaatccct
s	simRat_chr6.simRat.chr6	9879	303	+	647215	CACAgggaagcttgtacatttacaattacttgagactcattctggagaagctgggatggcttgggatatatagacttgtaaatgtcacaagactcatgctatataatggagtatattaatggaattagatcaggagatcaatggataatggtgatggacaaattgaattaaacaaacaggatcacatcacagggtaaccacaatgaacaagttaagaattgacgcatgaccgcacctgaatgttggcagCATAAGCACAAAGCTGCTTTCCAGTGATTATGGTTGGACACTTGTGTAATCACT

a
s	mr.mrrefChr0	9916	47	+	130230	ttgagtgtcactagagggcaccaaggacgttccataatcatcGAGTA
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a
s	mr.mrrefChr0	9963	84	+	130230	CCCAATTGTTAAAGGATCTCAAATATTCCCAGATCAGATTACAGGATCACAATCTGTCAATGCTAGAAGAATAGTGGTCTAGCA
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a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	10544	64	+	647215	ACACTTAAACAGGTCATCGGTGACCTGTTTGGGGCATGTCTTTATATTTGAAGACAGCAAACTA

a
s	mr.mrrefChr0	10271	19	+	130230	CATCTTGATATTAGCCTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	11208	19	+	636262	CATCTTGATATTAGCCTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	10608	19	+	647215	CATCTTGATATTAGCCTCA

a
s	mr.mrrefChr0	10290	29	+	130230	TGTTAATTCCCATATGTATCAGGGGTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	11227	29	+	636262	TGTTAATTCCCATATGTATCAGGGGTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	10630	29	+	647215	TGTTACCTCCCATATGTATCTGGGGAGTT

a
s	mr.mrrefChr0	10319	17	+	130230	GCTTCTTCTGTCACTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	11257	17	+	636262	GCTTCTTCTGTCACTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	10659	17	+	647215	GCTTCTTGTGTCGCTGT

a
s	mr.mrrefChr0	10336	68	+	130230	CTGTAACACCCAATACAGACACTACAAAGAACATTCAACCACAGGAGTACTGTATTCAGGCAGTGCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	11274	68	+	636262	CTGTAACACCCAATACAGACACTACAAAGAACATTCAACCACAGGAGTACTGTATTCAGGCAGTGCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	10677	68	+	647215	CTGCAATATCCAATACAGACACTATAAAGAATGTTCAACCACAGGAGTACTGTATTCAGGTAGTGCCT

a
s	mr.mrrefChr0	10404	47	+	130230	ACGAAGGTTTTTACCATGAAAATGGTATTGAGCAAATGACCCTGTCT
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a
s	mr.mrrefChr0	10451	59	+	130230	TCACTAGAAGGAACATTCCCAGATAATAAAGGTCTGTTCAAGACTGAGACAACTTTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	11395	59	+	636262	TCACTAGAAGGAACATTCCCAGATAATAAAGGTCTGTTCAAGACTGAGACAACTTTCCA
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a
s	mr.mrrefChr0	10510	9	+	130230	TGTTAATAC
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a
s	mr.mrrefChr0	10519	146	+	130230	GCGTATTGAACCTGGGATTGAAAGACTGTGGTCATCTGGTGTGGCTCTATTAACTACCACACTGATATAACATTGATGTTCGTCAATGTTACACTAGTGTGGCAATTAATGAAGCCACAGCATATAACCACAGTCTCTTAATCCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	11463	146	+	636262	GCGTATTGAACCTGGGATTGAAAGACTGTGGTCATCTGGTGTGGCTCTATTAACTACCACACTGATATAACATTGATGTTCGTCAATGTTACACTAGTGTGGCAATTAATGAAGCCACAGCATATAACCACAGTCTCTTAATCCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	10910	146	+	647215	GCGTGTTGAGCCTGGGAGTAAGAGACTATGGTTATCTGGTGTGTCTCTGCTAATTACCACACTAATGTAACATTGATGTGTATCAGTGTTACACCAGTGTGGCAATTAATGAAGCCACACCAGATGGCCACAATCTCTTAACCCCA

a
s	mr.mrrefChr0	10665	3	+	130230	ACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	11609	3	+	636262	ACC
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a
s	mr.mrrefChr0	10668	19	+	130230	TCAGTCAGAAGAAAAATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	11612	19	+	636262	TCAGTCAGAAGAAAAATAC
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a
s	mr.mrrefChr0	10687	16	+	130230	TTTCAGTATTAGCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	11632	16	+	636262	TTTCAGTATTAGCATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	11086	16	+	647215	TTTCAGTATTAGTATG

a
s	mr.mrrefChr0	10703	9	+	130230	AATGCTAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	11648	9	+	636262	AATGCTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	11157	9	+	647215	AATTATACA

a
s	mr.mrrefChr0	10712	124	+	130230	CTCAGTCTTGGACCAATTCTGATTGTCTAGGAATTTTCCTTTTGGTGACCTGTTGGACAGGGCCATTCGCTCATATTCATTTTCATGGTGAAGACGTTTGTTGGTCTATTCACTGGTTAGAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	11657	124	+	636262	CTCAGTCTTGGACCAATTCTGATTGTCTAGGAATTTTCCTTTTGGTGACCTGTTGGACAGGGCCATTCGCTCATATTCATTTTCATGGTGAAGACGTTTGTTGGTCTATTCACTGGTTAGAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	234007	124	-	647215	CTCAGTCTTGGACAGATTTTGATTGTCTAGGAATATGCCTTTTGGTGACCTGTTGGACAGGGCCATTTGCTCATATTCATTTTCATGGTGAAGACTTTTGTTGGTTTATTCACTGATTGGACTG

a
s	mr.mrrefChr0	10836	65	+	130230	CTACCTGAATATAGTACTCCTGTAGTGGCACATACTTTGTAGTGTCTGTATTGGATATTGCAGGG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	234131	65	-	647215	CTACCCGAATACAGTACTCCTGTAGTGGAACATTCTTTGTATTGTCTGTATTAGATATTGCAAGA

a
s	mr.mrrefChr0	10901	51	+	130230	CAGGTTAAGTACACATTTAAGGTATAGTACTTCTTGCAATTTATGATGATC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	234196	51	-	647215	CAGATCAAGTTCACATTTAGGGTATAGTACTTCTTGCAACTTATGATGATA

a
s	mr.mrrefChr0	10952	45	+	130230	ACTGTAATTATTGATTTGGTCTTTAGCAACCTCAGGTAAAATGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	11900	45	+	636262	ACTGTAATTATTGATTTGGTCTTTAGCAACCTCAGGTAAAATGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	234250	45	-	647215	ACTGTAATTATTAATTTGGTGTCTAGAAACCTCAGATAAAATGTT

a
s	mr.mrrefChr0	10997	44	+	130230	AGTGATCCAGGCACAGCTTACTCCCAGCCTAACAAAGTCAAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	11945	44	+	636262	AGTGATCCAGGCACAGCTTACTCCCAGCCTAACAAAGTCAAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	234296	44	-	647215	AATGATCCAGGCACAGTTTGCTCCCAACCTCACAAAGTCAAATT

a
s	mr.mrrefChr0	11041	23	+	130230	TTAAGCACAAACCTGTACTCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	12022	23	+	636262	TTAAGCACAAACCTGTACTCATG
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a
s	mr.mrrefChr0	11064	69	+	130230	CCTATTCCGACACCCCCATTTTAATACCCTTATGCATATTCCATTATTGAGTGACCCCGTGTTTGTCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	12045	69	+	636262	CCTATTCCGACACCCCCATTTTAATACCCTTATGCATATTCCATTATTGAGTGACCCCGTGTTTGTCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	234364	69	-	647215	CCTATTTCCACACCCCCATTTTAATACCCTTAGGCATAATCTATTATGGGGGGACCCTATGATTGTCAT

a
s	mr.mrrefChr0	11133	66	+	130230	TGAACCCTTGGTAGGGGGACCCACAGTTCTTGAAAGTCTGGTCCGGGAATGGTGGCAATTCTGGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	12114	66	+	636262	TGAACCCTTGGTAGGGGGACCCACAGTTCTTGAAAGTCTGGTCCGGGAATGGTGGCAATTCTGGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	234436	66	-	647215	TGACCCCATGGTGGGGGGACCCAGAGTTGCTGAAGGTTTGGTCCGGGAATGGTGGCAATTCTGGGA

a
s	mr.mrrefChr0	11199	5	+	130230	TATGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	12180	5	+	636262	TATGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	234506	5	-	647215	TATGC

a
s	mr.mrrefChr0	11204	116	+	130230	GAGGTGCTTCCTTGTTTGGATTGAATTGTTATCTATTTTCCTTTTCTGACATGATCTCCTTTCTTGTGTCTATCTTTTAGGACACTTATCTCAGTTGACTCCTAGGTAAATCCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	12392	116	+	636262	GAGGTGCTTCCTTGTTTGGATTGAATTGTTATCTATTTTCCTTTTCTGACATGATCTCCTTTCTTGTGCCTATCTTCTAGGACACTTATCTCAGTTGAGTCCTAGGTAAATCCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	234511	116	-	647215	GAGATTCTTCCTTGTCAGGATCGATTTGTTACCTATTTTCCTCTCATCACCTGAGCTCCTTTTTTGTGTCTATCTTTTAGGACACTTATATCAGTTGACTCCTAGGTACCTCCCTT

a
s	mr.mrrefChr0	11320	92	+	130230	AGCACTTAGTGAAAAAATTACTCCTATATTTTGGCACTGGGCACCTACAACCTTAGTCCTTGCTGATCCAATATGTGAGCAGGAGAAGTTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	12509	92	+	636262	AGCACTTAGGGAAAGAGTTACTCCTACATTTTGGCACTGGGCTCCTACAACCTTAGTCCTTGCTGATCCAATATGTGAACAGGAGAAGTTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	234627	92	-	647215	AGGACTTAGTGAAAAAATTACTCCTCTTTTTTGGCACTGGGCACCCACAACCTTAGTCCTTGCTGATCCAATACGTGAGCAGGAGAGGTCTC

a
s	mr.mrrefChr0	11412	49	+	130230	TGGCTACTGATCCCGCTCCTACTTCTATCTCTCACCAAAACTCATTGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	12618	49	+	636262	TGACTACTGATCCCACTCCTACTTCTATCTCTCACCAAAACTCATTGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	234719	49	-	647215	TGGTTACTGATCCTGCTCTTTCTTGTGTCTCTGACCAAAACTCATTGCA

a
s	mr.mrrefChr0	11461	142	+	130230	ACTCCTCCAAGTGATGTTATACAAATACGTTGTCTATTAATATATCCACACAAAGTTGTTATCCTAGCACTAATGCATGAGCTACACATGGGTGAGTACCATACACTGAAGGGTCATTAAACCATTGATAGCTTTTGGGAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	12669	142	+	636262	ACTCCTCCAAGTGATGTTATACAAATATGTTGTCTATTAATATATCCACACAAAGTTGTTGTCCTAGCACTAATGCATGGGCTACACATGGGTGAGTACCATACTCTGAAGGGTCACTGAACCATTGATAACTTCTGGGAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	234768	142	-	647215	ACTCCTCCAAATGATGTTGTAAAAATACGTGGTCTATTAATATATACACACGAAGTTGTTATCTTAGCACTAATGCATGAACTACACATGGGTGAGTACCATACACTGAAGGGTCATTAAACCATTGATAGCTTTTGGAAAA

a
s	mr.mrrefChr0	11603	195	+	130230	GTCCTCAATGTGTTACAATGGCTTTTTATCCCTCTAAATTCAGAATTGGGTATGATATGAGTGAAGCTATTTTCAGATGGACCACTCTAATGTCCGATGGACCTCTCATTCATCAGTCATTCCTCCATCCTAAACAGAAGATAGCTTGTATTGATAAAGGACACTGGTACTCTTCACAACAGATTTTCAAACTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	12811	168	+	636262	GTCCTCAATGTGTTA--------------------AAATTCAGAATTGGGCATGATATGATTGAAGCTGTTTTCAGATGGACCACCCTAATGTCCGATGGACCTCTCATTCAT-------TCCTCCATCCCAAACAAAAGATAGGTTGTATTGATAAAGGACACTGGTACCTTGCACAACAGGTTTTCAAACTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	234917	187	-	647215	GTCCTCAATGTGTTACAATGGCTTTTTATCCCTCTAAATTCAGAATTGGGTATGATATGAGTGAAGCTATTTTTAGATGGACCACTCTACTATCCAATGGACCTCTCAGTCATCAGTCATTCCCCCCTCCTGAACAGAAGATATCTT--------AAAGGGCACTGGTACTCTTCACAACATACTTCCAAACTAA

a
s	mr.mrrefChr0	11798	42	+	130230	CTATGACTGGTTGGTCTCTGTTATTAATCATATACTAGAGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	13004	42	+	636262	CTATGACTGGTTGGTCTCGGTTGTTAATCATATACTAGAGGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	235104	41	-	647215	CGATGACTGGATGGTCTCTGTCAT-AATCAAATACTAGAGAC

a
s	mr.mrrefChr0	11840	169	+	130230	TAAGGCCATGTAACTTGATTCTTGTAGAGCTTAATATTCTCATCTGTATCCTGTCAAGCATTGAATGGCATTTACTGATAACCTATAATGTTGGTAATATGGAGATGGTAATAAAGAGTACAATGGACTGATAAAGATTAGTTAGTTTTGTATCTACAACCACCCTAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	13050	164	+	636262	TAAGGTCATATAACTTGATTCTTGTAGGGCTTAATATTCTCATCTGTATCCTGTCAAGCATTGAGTTGCATTTACTAATAACCTATAATGTTGGTAATATGGAGATGGTAATAGAGA-----ATGGACTGGCAAAGGTTAGTTAGTTTTGTATCCAAAACCACCCTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	235145	163	-	647215	TAAGGCCATGTGACTTGACTCTTGTAGAGCTTAATATTCTCACA---ATGCTGCCAAGCATTGAATGGCATTTACTGATAAGCTATAATGTTA--AATA-GGAGATGGTAATAAAGAGTACAATGGACTGATGAAGATTGGTTAGTTTTGTATCTGCAAGCGCCCTAAA

a
s	mr.mrrefChr0	12009	111	+	130230	TTGCTTTTCACAATTCTTTATCCTAATGGGCTTGGAGCACATGGCAAGAACCTTACAGCAATTTTTCAAGCTTGTTTCTATTCCTTGGTGTCCTTTCACTTCTAAACAGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	13214	97	+	636262	TTGCTT--CACAATTC------------AGCTTGGAGCACATCGCAAGAACCTCTCAGCAACTTTTCATGCTTGTTTCTATTCCTTGGTGTCCTTTCACTTCTAAACAGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	235309	105	-	647215	TTGCTTTTCACAATTCTTTATCCTAATGGGCTTGGAGCACATGGCAAGGTCTTTACAGCGATTTTTGAAGCTTGTTTCTATTTCTTGGTATGCTTTCACTTTCAC------

a
s	mr.mrrefChr0	12120	70	+	130230	TTCTGGAGCAAATCAAGGTACTCCAATAGACCATTGTCAACTACTCTACCAACTGCCAGATGAAGGACCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	13318	70	+	636262	TTCTGGAGCAAATCAAGGTACTCCAATAGACCATTGTCAACTACTCTATCAACTGCTAGATGAAGGACCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	235414	68	-	647215	TTTTAAAAAAAATAAAGGTACTCCAATAAACCATTGTCAACTACTCAACCAACTGCCAGC--AAGAATCC

a
s	mr.mrrefChr0	12190	161	+	130230	AGGCCTAGCTTAGTCTCCAAAAGCGAATCCTTTTTTAGCCACAATTACCCTGTATGATGACTTAGGAGGCTCATACCTCCATCAGAAACTGGCTTCATTCCTCCATCAGAAAACAAGCCTTATAGGTCAACATACACTCATCATTAATTAGCCTTCTCAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	13388	140	+	636262	---------------------AGCGAATCCTTTTTTTAACACAATTACCCTGTATGATGACTTAGGAGGCTCATACCTCCATCACAAACTGGCTTCATTCCTCCATTAGAAAACAAGCCTTATAGGTCAATATACAATCATCATTAATTAGCCTTCTCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	235514	149	-	647215	AGGCCTAGCTTAGTCTCCAAAAATGAATTCTCTTTTAGCCACAATTACCCTGTATGATGACTGAGGATGCTCATATCTCAATCAGACACTGGCTTCATTTCTCCATCAGAAAACAAGTCTTATAGGTCAACATACACTCATCAATAATT------------

a
s	mr.mrrefChr0	12351	104	+	130230	AGCTCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTGGGCTCAAAGGCCAGGAGGCACCTTAGTCGTGACTGACTTTAGATACATGCTGTTAGAAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	13532	104	+	636262	AGCTCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTGGGCTCAAAGGCCAGGAGGCACCTTAGTCGTGACTGACTTTAGATACATGCTGTTAGAAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	235663	104	-	647215	GGATCACCTGGGGGGCTGGTGGAGGAGTATGCTCCTCTGGCTTGGCTGGAACGCTAGGGGAAACCCAAGTCATGACTGACTTTAGGTACATGCTGTTAGAAACT

a
s	mr.mrrefChr0	12455	19	+	130230	GTGTGAATTGTAATGAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	13636	19	+	636262	GTGTGAATTGTAATGAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	235786	19	-	647215	GTGGGAATTGTAATGAAAG

a
s	mr.mrrefChr0	12474	50	+	130230	TAGGACTCATACTATCATTAGTAAAGACCTGTGATTAAAAGGCAGTTACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	13659	50	+	636262	TAGGACTCATACTATCATTAGTAAAGACCTGTGATTAAAAGGCAGTTACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	235805	50	-	647215	TAGGACTCACACTGTCCTTAGTAAACACTCATGATTAAAAGGCAGTTATA

a
s	mr.mrrefChr0	12524	56	+	130230	CGCATGCCAAATGTTGGTCATTTGCACTGTTAGTGTGCACTGGATGCATGGTAGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	13709	56	+	636262	CGCATGCCAAATGTTGGTCATTTGCACTGTTAGTGTGCACTGGATGCATGGTAGGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	235859	56	-	647215	CTCATGCTAAACGTTGGTCATTTTCACTGATTCTATGCACTGGGTGCGTGGTAGGC

a
s	mr.mrrefChr0	12580	81	+	130230	TGCAGAGATGTACCATGCTTCAGAAATGGTTCAACTGCACCCAATGTTATCGTGGTCGTATGATGTCCAATACTTGAGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	13765	81	+	636262	TGCAGAGATGTACCATGCTTCAGAAATGGTTCAACTGCACCCAATGTTATCGTGGTCGTATGATGTCCAATATTTGAGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	235916	81	-	647215	TGCAGGGATGTACCATGCTCCAGATCTGGCTCAACTACACCCAATGTTATTGTGGTCGTATAATGTCCAATACTTGAAGTT

a
s	mr.mrrefChr0	12661	28	+	130230	TGAATTATGAGTAGACTTTTGAAACGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	13847	28	+	636262	TATATTATGAGTAGACTTTTGAAACGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	235997	28	-	647215	TGAATTATGAGTAGACTTTTGAAATGAG

a
s	mr.mrrefChr0	12689	136	+	130230	ATTATCCACAGGAGTCAGGTGTAGTCATGTTCCCCCTCTGTAGCATTTTACTCATTGAGTAGCTTAGCTTTTAAGATTTTAAGACTCCCTTGAAGTGGGCTGGAATTTGCAATGAAGATATATGGTGGTGAGTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	13876	136	+	636262	ATTATCCACGGGAGTCAGGTGGAGTCATGTTCCCCCTCTGTAGCGTTTTAATCATTGAGTAGCTTAGCTTTTAAGCTTTTAAGACTCCCTTGAAGTGGGCTGGAATTTGCAATGAAGATATGTGGTGGTGAGCACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	236025	136	-	647215	ATTACCCACAGGAGTCAGGTGTATTGATGTTCCCCCTCTCAAGCATTTAACTCATTGAGCAGCTTAGCTTTTAAGATTTTAAAACCCCCTTGAAGTGGGCTGGAATTTGCAATGAAAACATATGGTGGTGATTCCA

a
s	mr.mrrefChr0	12825	76	+	130230	GAGCATATCTGTATTAGACTATGTATCACTGTACAGAAGAATGTAGCTTAGTTTGCAAAGGTTGTTAGATAGCCGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	14039	76	+	636262	GAGCACATCTGTATTAGACTATGTACCACTGTACAGAAGAATGAAGCTTAGTTTGCAGAGGGTGTTCGATGGCCGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	236161	72	-	647215	GAGCATATCTGTATTAGACTATGTATCACTGTGCAGGAGAATATA----AGTTTGCAAAGTTTGTTAGATAGCCGT

a
s	mr.mrrefChr0	12901	137	+	130230	AATGAAAGAATTATCATTACCACTTTCTTTCAGGAGGTATTTACTTTACATCATGAAGGTGACTTTTTCTCTGATACAGCCTTCTCATCCAGTGAAGCTGTCCACATGAGCTCTAATACCGGGTATATACATCAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	14115	136	+	636262	AATGAAAGAATTATCATTACTACTTTCTTTCAGTAGGTATTTACTTTACATCATGAATGTGACTTTTCCTCTGATA-AGCCTTCTCATCCAGTGAAGCTGTCCACATGAGCTCTAATACCGGGTATATACATCAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	236237	117	-	647215	AATGAAAGAATTATCATAGCCACTTTCTTTCTGGAGGTATTTACTTTACATCATCAAGGTGGCTTCTTCTCTGACACAGTCTTCTCATCCAGTGTAGCTGTCAG--------------------GTATACATCAAAA

a
s	mr.mrrefChr0	13038	14	+	130230	GTTGCACTAAAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	14252	14	+	636262	GTTGCACCAAAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	236354	14	-	647215	GTTGCACTAAAGTT

a
s	mr.mrrefChr0	13052	201	+	130230	CATCGTATTGTGCCCATATATTTGAGGGTTGGCCTTGTCAATTCAGGGTTGCCCTGAGGATCACCACTAGGCCACTCACTGGCTTACTATCATTGAGCATTGCTGCCTTTGATGTCTTATGTCTTCGATGGATGTTACAGCTGCAGGTGCACCCCACAAACGCTAGATTGTGGGCGAAATCACTACTCAACAGAAGTGTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	14266	201	+	636262	CATCGTATTGTGCCCATATATTTGAGGGTTGGCCTTGTCAATTCAGGGTTGCCCTCAGGATCACCACTAGGCCACTCACTGGATTACTATCATTGAGCATTGCTGCCTTTGATGTCTTATGTCTTTGATGGATGTTACAGCTGCAGGTGCACCCCACAAATGCTAGATTGTGGGTGGAGTCACTACTCAACAGAAGTGTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	236369	200	-	647215	TACCATATTGTGCCT-TGTATGTGCAGGTTGGGCTTGTTAATTCAGGGTTGCCATGAGGATCACCACTAGGCCACTCGCTGGCTTACTATCATGGAGCATTGCTCCCTTTGATGTCTCATGTCTTCGATGAATGTTATAGCTGCAGGTGCACCCCATAAACACTAGATTGTGGGCGACATCACTACTCAACAGAAGTGTAT

a
s	mr.mrrefChr0	13253	132	+	130230	TAGCACTGGACCACAGAGATTGCCTCCAATTCTCCTACAGCAGAACCTGGTGCATGAACATGTCTTGTTGTCTGCTGACCTCTCTACAGTCATTGACCATGGTTTGGCATCTGGAGAAGTTACCTTGCCAGT
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a
s	mr.mrrefChr0	13385	465	+	130230	AAAACCCTAACTTGTAATAGTCAAATCCTCCAACCATTGGTAACCTGTATTTTCTTAAAACACTACAAACTGACCACACAGGTTGAATTAATACCTATTACAATTAAGGATGTTGTTCCTACTCTACTTTATGTTTGGCCATTCACAATCACAGCTCAAACTATGAATGACACAAGTAAATGATATAGAGATATTTAGTCCGATGAGTTCTAAGTCACTAGTTTGAGCTGTAGGTAGTAGAAGAGTGCTATTTCAATTCTATGTTCTACAATTTAAGAAGCTAGCAGAATGTAACACGACCTGCATAGGATAACCCTCCAGAGGCCCCCTGATAGATAGTTAAGGTAGGTACAATGTCATGATTACTAACCACTTTGTTATCCAGATAAGAAAACGGACTCTATGGGTAGTGATTAAGCTATTCTAATATTAAGTCCTATATTATGACCCTAATGGGTACTATGT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	14904	391	+	130230	AAACACATGATAGAAAGGGTTGACAGGGCTAAAGTGTTGGGTAAAAAGTGACAAGGCCTGGAAGCATACTTATTTCAGACTGCAGCTTCATGTCCAATTTGTGGGCCTAATAACTGCTAAAGAATTCCACAAGAATAGTGTTTAATATATTAACCATTAACCACTTGAAACAGACTACATTGTCTTGGAGGACGTGTCTTTTCACTGAGAGGTTGTTCATTTTTTGGAGGGTTTAATAGGCAAGTAGGTGAATCCATCTCTGATCTAAACAAAATAAGACACTGTATTCTACATTAGAGTGTCATTCACTAATTCACTGATGGATCAGGGCCCAGCACACAAATTGGGAAATTCGCAGTACTTTACTGTAGTGTGGCAGTGCCACCATTTT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	16405	111	+	130230	GAAAAGTTTGATGTGTACAAGTCACGCCCTTCACGCCATTAGTGAACTCATGGATAACAGCAATCACACAGCTGTCGGTCTTTCCATAGTAGAAAGCCAAGGAGGGTAACT
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a
s	mr.mrrefChr0	16516	118	+	130230	CTATAAGCTGGGAGAGCCTGTTACCCCTAACAAGTAGAATTGTAATTCATTAAAATTAAGTATAATGAAGGGTAAAGTGTAATGAGGTGTATGCTGTTGCTATGTGCAATAGCGGAAA
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	16680	82	+	130230	TTAAGTTTAATACTATGATTATGGTATGCTGACTCAATTGCAATTGGGGTAAGATTAAGGCCAGGTCAGGGTAAATTACAAC
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a
s	mr.mrrefChr0	16762	95	+	130230	ACTAAACACACACTATTTCCATGTGTTCTTGAGCTGAACTTGATCTAATCCATCATGTCACCCTGTTGTCCGTAGTGCATGAATTGATACAGTCA
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a
s	mr.mrrefChr0	16857	165	+	130230	TTTGAGTAACCGAACCCCTATAATAGCAGTTATACAGCACAATATTGAATGTGCTGAATATGCTCTTTTACCCTAATGACATGAACCTCTGTTCATTCTTGAATTTGGTGGGACTATTAATCTTGATGTTGTGTGTTTATGTCATCCCATGGTAAATGACAAGAC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	240245	165	-	647215	TTTGAGTAACCGAACCCCTGTAATAGCAGTTACACTGCACAATATTCAAGATGCTGAATATTGTCTTTTTCCCTAACGCCATGAACCTCTGTTTATTCTTGAATTTGGTGGGACTATAAATCTTGATGTTGTGTGTTTATGTCATCCCGTGGTAAATGACAAGAC

a
s	mr.mrrefChr0	17022	195	+	130230	CCAAGGAGGTAGAAGCCAATACCTCTCCCCAGACGACCCCTAGTCTTTAGATCCATTCAGTGTTTAAAATCTAATAACATTGTGTCTGCAGGATCCATATATGCCTCTAATGCACCTGCTATAGAACTGTACAATGTGGTGTGATGATAAGTTGAATCTGGAGTCTTGCTAATGGAGAGCCAGATAGCTCAGTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	18375	193	+	636262	CAAAGGAG--AGAGGCCAATACCTGTCCCAAGACAACCCTTAGCCTTTAGATCCATTCAGTGTTTAAAATCTAATAACATTGTGTCTGCAGAATCCATATATGCCTCTAATGTCCCTGCTATAGAACTGTACAATGTGTTGTGATGATAGGTTGAAACTGGGGTCTTGCTGATGGAGAGCCATATAGCCCAGTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	240415	194	-	647215	CCAAGGAGGTAGAAGCCAAAACCTCTCCCCAGGCGACACCAAGTCTTTGGATTCATTCAGTGTTTAAAATCTTATAACATTGGGTCTGCAAGATCCATACA-GCCTCTAATGCACATGCTTTAGAACTGTACCATGTGGTGTGATGATAAGTTGAATCTGGAGTCTTGCTAATGGAGAGCCGGATAGCTCAGTAG

a
s	mr.mrrefChr0	17217	100	+	130230	CATTTGTCCAAAGGCAAGATCATTGTTGGTTTTTCCCTAACTGTTGCATAACAGTAATCAAATGTCTTTGAAACCAATATAATTTTTGATAACCTTAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	18568	100	+	636262	CAATTGTCCAAAGGCAAGATCATTGTTGGTTTTTCCCTAACTGTTGCCTAACGGTAATCAAATGTCTTTGAAACCAGTGTAACCTTCGATAACCTTGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	240614	100	-	647215	GATTTGTCCAAAGGCAAGATCATTTTTGGTTTTTCCCTAACTGTTGCATAACAACAATCAAATGTCTTTGAGATGAATATAATTTTTGATAACCTTAACT

a
s	mr.mrrefChr0	17317	33	+	130230	GATGCTCTAATGCTCTGGATTGCCTGATAGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	18668	33	+	636262	GATGCTCTAATGCTCTGGGTTGCCTGATAGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	240716	33	-	647215	GATGCTCTAATGCTCTGGATTGCCTGATAGCAA

a
s	mr.mrrefChr0	17350	139	+	130230	TAACAAGGTAGTTGGTGCTACATCTTTAAGCAATAGCTCACACAAGCAAACAAGATAATGCACAGCCACGTATTTGCACTGACCAGCATCAACTATGTGATGGACCCGCCATAATGGGGCAGCATTATTCAGTCCAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	18702	138	+	636262	TAACAAGCTAGTTGGTGCTACATCTTTAAACAATAGCTCACACAAGCAAACTAGACAATGCACAGCCACATATTTGCACTGATCAGGATCAACTATGTGATGGACCCGCCATCATGGAGCAGCATTATTCAGTCCAGG-
s	simRat_chr6.simRat.chr6	240749	139	-	647215	TAGCGAGGCAGTTGGTGCTACATCTTACAGCAATACCTCACACAAACAAACAAGATAATGCACAGTCCTGTATTTGGACAGACCAGCATCAGCTATGTGATGGACCCGTCACAATGGGGCAGTGTTATTCAGACCAGGT

a
s	mr.mrrefChr0	17489	18	+	130230	TAACATTGATGAGGCTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	18840	18	+	636262	TAACATTGATGAGGCTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	11458	10	+	647215	TAATATTGAC--------

a
s	mr.mrrefChr0	17507	189	+	130230	CTCCCAAACCCAGCGGCAGCGCATGTTGACAGCCCAACTATAGTTCTATTATACTTATTTATAGTTGTATACATATCAAGTATATTCATTATCCCAAACTACAATTCCCCTACTTTTGTTGTAAAAGTTGATTTTCTTCCCCCTGATGGGAGGATCTTTTGGCTCTTTTTTAGCTGCTGTGTACCAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	18861	189	+	636262	CTCCCAAACCCAGCGGCAGCGCATGTTGACAGCCCAACTATAGTTCTATTATACTTATTTATAGTTGTATACATATCAAGTATATTCATTATCCCAAACTACAATTCCCCTACTTTTGTTGTAAAAGTTGATTTTCTTCCCCCTGATGGGAGGATCTTTTGGCTCTTTTTTAGCTGCTGTGTACCAACT

a
s	mr.mrrefChr0	17696	162	+	130230	ATGTAATTGAGTATACATTCCGAACTGCCTAATGTGCCTGCAATCTATCAGTAGTGAAGCCTTGCCCATGCCTGAGGTAGCTCACAGGTCAGAGGAATATGCCCAGCACTTTAGGACATTATAGGATTCCCCAGCAAATCAACAATCATCCACTGGTGGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	19051	162	+	636262	ATGTAATTGAGTATACATTCCGAACTGCCTAATGTGCCTGCAATCTATCAGTAGTGAAGCCTTGCCCATGCCTGAGGTAGCTCACAGGTCAGAGGAATATGCCCAGCACTTTAGGACATTATAGGATTCCCCAGCAAATCAACAATCATCCACTGGTGGACT

a
s	mr.mrrefChr0	17858	21	+	130230	CTACAGAGAGAATTATGTTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	19352	21	+	636262	CTACAGAGAGAATTATGTTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	11468	11	+	647215	----------ACATATGTTCA

a
s	mr.mrrefChr0	17879	13	+	130230	GTACTTAGTGCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	19373	13	+	636262	GTACTTAGTGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	11482	13	+	647215	GTACCAGCTGCAC

a
s	mr.mrrefChr0	17892	9	+	130230	TGCCACCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	19391	9	+	636262	TGCCATTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	11495	9	+	647215	TGCCACCTT

a
s	mr.mrrefChr0	17901	178	+	130230	ACTTAGGCTTGATGAGGAAGTCCTTTAATTCCTGGTGTGTCCCTCTTTCACTACCTCAGCTCTTCTGTCGTCTGCCAGACAGACTTTTTATGCTGAGTATAATGACTCATCAAGCCTGGCAATACTCACTGTTTTTTTGACTTGTTTTCAATGTAAGTTTCAGGTGCTCTGTTAGAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	19400	178	+	636262	ATATAGACTTGAGGAGGAAGTCCTTTGATCCCTGGTGTGTCCCTCTTTCACTACCTCAGCTCTTCTGTCATCTGCCAGACAGACTTTTTATGCTGAGTATAATGACTCGTCAAGCCTGGCAATACTCACTGTTTTTTTGACTTGTTTTCAATGTAAGTTTCAGGTGCTCCATTAGAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	11511	178	+	647215	ACTCAGGGCTAATGAGGAAGTCCTTTAATTCACCGTCTATCTCTCTTTCACTACCTCAGCTCTTCTGCCGTCTGCCACAGAGACTTTTTATGCTGAGTATAATGACACATCAAGCCTGGCAATACTCACTGTTTTTTTGACCTGTTTTCAATGTAAGTTTCAGGTCCTCTGTTAGAAG

a
s	mr.mrrefChr0	18079	91	+	130230	GACACTGTAATCCCTCTTAGGTAAGCCATGCTAGTGTAATTAATCAAGCTACGAGGCATAGACCCTATAGAATTGCTGCTTCATTACCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	19581	91	+	636262	GACACTGTAATCCCTTTTAGGTAAGCTATGCTAGTGTAATTAATCAAGCTACGAGGCATAGACCCTATGGAATTGCTGCTTCATTACCATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	11689	91	+	647215	GACACTGTGGTCCCTCTTTGGTAAGTCATGTTCGTATGATTAATCAAGCTACGAGGCCTAGACCCTACAGAATTGCTGCTTCATTACCATC

a
s	mr.mrrefChr0	18170	136	+	130230	TATTATGATTTATGCTAGGTGAAGAGTTGTAATGTTAACTTAGTTCTGAGCCTTAAGATAAAGACTTGCTCCACTATAGTACATGATAGAGTGACATAACTCAATTGGGGGCGGTAAGGACTTAGTCATCCATATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	19678	128	+	636262	TATTATGATTTATGCTAGGTGAAGAGT------GTTGACTTAGTT--GAGCCTTAAGATAAAGACTTGCTCCACTATAGTACATGATAGAGTGACATAACTCAATTGGGGGCAGTAAGGACTCGGTCATCCATATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	11780	135	+	647215	TATTATGATT-ATGCTAGTTGAGGAGTTGTAATGGTAACTTAGTTCTGAACCTTAAGAGAAAGACTTGCTCCACTATAGTACATGGTAAAGTGACATAACTCAATTGGGGGCGGTAAGGACTTAGTCATCCATATC

a
s	mr.mrrefChr0	18306	15	+	130230	CTTAGAGATAACCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	19830	15	+	636262	CTTAGAAATAACCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	11915	15	+	647215	CTTAGAGATAACCCC

a
s	mr.mrrefChr0	18321	146	+	130230	TCTCCCCCACCAGGATGTGGCATAGACTGGAGTTCCTTTTAGTGAAACAATCAATTGTGTGACAGTAGGCCAACAAGAGCATATAATGCACCAAGCAGCTTGGATGTTTGGCCATTGGCACATCAGCAACTGGTGGCTCACCCAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	19845	146	+	636262	TCTCCCCCACCGGGATGTGACATAGACTGGAGTTCCTTTTAGTGAAACAATCAATTGTGTGAATGCAGGCCGACAAGAGCATATAATGCACCAAGCAGCTTGGTTGTTTGGCCATTGACATATCAGCAACTAGTGGCTCATCCAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	11931	146	+	647215	TCTCCCCCACCAGGATTTGGCATAGAGTAGAGTTCCTTTTAGTGAAACAATCAATTGCATAACAGTAGGCCAGCAAGAGCTTATAATGCACCAAGCAGCTTGCATGTTTGGCCATGAGCACATCAGTAACTGGTGGCTCACCCAAT

a
s	mr.mrrefChr0	18467	167	+	130230	GGTATTGACAGGTTCAGTAAACACTTGTAGGAACCAAGGTGAATGATTTTCCTTTATGAACCCAATATAGTAACTTTAATTCTTTGTTTAAGACCTAGTAACTATAGCCAATTGTTAAGGACCCACTTTGCAATCAGGATGGATGTTAAATGACTTATGTAATGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	19991	153	+	636262	GGTATTAACAGGTTCAGTAAACACCTGTAGGAACCAAG--------------TCTATGCACCCAATATAGTAACTTTAATTCTTTGTTTAAGACCTAGTAACTATAGCCAATTGTTAAAGACCCACTTTGCAATCAGGGTGGATGTTAAGTGACTTATGTAATGGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	12082	167	+	647215	GGTACTGAAAGGTTCGGTAAACACTTGTAGGAACCAAGGTGAATGATTTTCCTTTATGAACCCAATATAGCAACTATAGTGCTTTGTTTAAGACCCAGTAACTATAGCCAATTGTTAAGGACCCAATTTGCGATCAGGATAGATGTTAAATGACTGATGTAATAGAG

a
s	mr.mrrefChr0	18634	190	+	130230	ACTGATGTAATGGAGCACATAATTATGCACTTTTGAAACCAAGGTTGTGAACATAATTGTGAGCTTATGAAGTCAAGCTAGCAAGACATAGGACTGGCTTGATGTTTTAAAGTTTAGTAAATGTAAATTGGTTGCTCTTTTTGTGGTTCCATCTATCATGTGATGTCTCAGCTTGGAATTAAGGCATGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	20284	185	+	636262	ACTGATGTAATTGAGCACATAATTTTGCACTTTTGAAACCATGGTTGTGAACATAATTGTGAGCTTATGAAGTCAAGCTAGCAAGACATAGGACTGGCTTGATGTTTTAAAGTTTAGTAAATGTAAATTG-----TTTTTTTGTGATTCTATGTATCATGTGATGTCTCAGCTTGGAATTAAGGCATGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	12249	190	+	647215	ACAGATGTAATGGAGCACATAATTATGCACTTTTGAAACCAAGGTTGCTAACATAATCGTGATCATATAGAGTCAAGCTAACAAGACATAGGACTGGCTTGATGTTTTAACATTTAGTAAATGTAAATTGGTTGCTCTTTTTCTGGTTCCATCTACCATGTGATCTCTCAGCCTGGAGTTAAGGCATGGT

a
s	mr.mrrefChr0	18824	196	+	130230	AAACTAAATGAAGTTACACCATGACCATCCTACTGAGTGCCTAAACTGGCTAACACTGGTTTAGCCTACATGGCTACACAAATGTGGGCACCCTTCAGATGTCAAGAGCTTACTATAACTGCCAACCAGTGGGCCAGGATCTGCAGTGCAGCCCTCTCCATCCACCCACTGAATGGAATGAATGTTGATGTCACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	20470	196	+	636262	AACCTAAATGAAGTTACACCACGACCATCCTACTGAGTGCCTAGACTGGCTAACTCCGGTTTAGCCTACCTGGCTACACAAATGTGGGCACCCTTTAGATGTCAAGAGCTTACTATAACTGCCAGCCAGCGGGCCAGAATCCACAGTGCAGCCCTCCCCATCCACCCACTAAATGGAATAAATGTTGATGTCACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	12439	195	+	647215	AAACTAAATAAAGTTACACCATGACCATCCTACTGAGTGCCTAAACTGGCTAACACTGGTTTAGC-TACATGGATACACAAATGTGGGCAACCTTCAGATGTCTACAGCTTCCTATAACTGCAAACCAGTGGGCCAGGATCTGCAGTGCAGCCCTCTCCATCCACTCACTGAATGGTATGAAAGTTGATGCCACCA

a
s	mr.mrrefChr0	19020	32	+	130230	TCACCCCTACTATTGGTACACATGTAGATGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	20666	32	+	636262	TCACCCCTACTATTGGTACACATGTAGATGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	12638	32	+	647215	TCACCCCTACTATTGATACACACTCTGACAAA

a
s	mr.mrrefChr0	19052	23	+	130230	TTTTATGAGTATGTGCAATCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	20703	23	+	636262	TTTTATGAGTATGTGCAATCCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	12670	23	+	647215	TTTTGATAGGATATGCAATCCTG

a
s	mr.mrrefChr0	19075	70	+	130230	CCTGCATGTGGGCACACATTGACAAAATATTGTCAATCACCCCTCTTGTCAAACATCAGGCACTGGCCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	20772	70	+	636262	CCTGCATGTGGGCACACATTGACAAAATATTGTCAATCACCCCTCTTGTCAAACATCAGGCACTGGCCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	12693	70	+	647215	CCTTCCTGGGCATCCGCATTGACAGTATATTGTCAATAACTCCTCTTTTCAAACATGAGGCGCAGGCTAG

a
s	mr.mrrefChr0	19145	7	+	130230	GATCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	20842	7	+	636262	GATCTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	12767	7	+	647215	GATCTTA

a
s	mr.mrrefChr0	19152	43	+	130230	AGCATTCTCTCTAGTCAGCAGTATAATTAGATTAGACTGACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	20849	43	+	636262	AGCATTCTCTCTAGTCAGCAGTCTAATTAGATTAGACTAACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	12778	43	+	647215	AGCACTCCCTCTAGTCAGCAATATAATTAGATAGGACTGACAC

a
s	mr.mrrefChr0	19195	72	+	130230	ATTTGTAATCTTGTGCTTTATAACAAAGGTGTGTGACGTACATATAAATTGTGTAATGAGCTGCAGTGTCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	20893	72	+	636262	ATTTGTAATCTTGTGCTTTATAACAAAGGTGTGTGACATACATATAAATTGTGTAATGAGCTGCAGTATCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	12821	72	+	647215	ATTTGTAATCTTGTGCCTAATAGCAAAGGTGTGTGACGTACATCTAGATTGTGTAATGACCTGTAGTGTCAA

a
s	mr.mrrefChr0	19267	190	+	130230	CCAATTGGGACCTTATAATGCTTCAGTTTAGAATCATCTTATAAACCATGTGAAATCAATAATGTCAGACACATTGGTCTATATATCTTAAAGTTATGTGCATGTGACCCCTCAAGTGTCTGCATTGCTGGATTAATATATATGTTAATCTTAGAATTTACACCTAAGAGGATCAGTGTACATCCCTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	20967	189	+	636262	CCAATTGGGACCTCGTAACGCTTCAGTCTAGAATCAACTTATAAACTATGTGAAATCAATAATGTCAGACACATTGGTCTGTATATCTTAAAGTTATGTGTATGTGACCCCTAAAGTGTCTACATTGCTGCATTAACATATATGTTAATCTTAGAATCTACACATAAGAGGATCAGTGTACATCCC-TTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	12893	190	+	647215	CCAATTGGGATCTTATAATGCTTCAGTTTAGAAACATCTTATAAACCATGTGAAATCAATAATGTCAGACATATTGGTCTATATATCGTAAAGTTATGTGCATGTGACCCCTCGAGTGTCTGCATTGCTAGATTAATATATATGTTAATCTTAGAACTTACTCCTAAAAGGATCAGTGTACATCCCTTTC

a
s	mr.mrrefChr0	19457	324	+	130230	AATGTCCCATGTATCTGCACTAGTCATTTATACGTAGTTCAATAGTTCCTATATCTTAGTATTTACTTGATATCGCAGATTTTGAGCATGAGGCTCACATCCAGTGGCTGTCCATCAACAAACCTATCCATAGGTCATGAGAATACATGTCTTTGCTTCCCTTGTCTTGAGAATGATCTCTGAATACCACATGTAAAAGGATATGGTTACAGCTAGTCCTTTTTTACCGAGCTTGTTTTCTGCAGTTTATCCAACACACTTCCAGTTATGCAAATACTTGCATTTCTTCACTATGTAGATGTGGAAGCCTTCTGAGGGCCAAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	21156	324	+	636262	AATGTCCCATGTATCTGCACTAGTCATTTATACAAAGTTCAATAGTTTCTATATCTTAGTATTTACTTGATATTGCAGGTTTTGAGCATGAGGCTCACATCCAGTGGCTGTCCATCAACCAACCCATCCATAGGTCATGAAAATACAGGTCTTTGCTTCCCTTGTCATGAGAATAATCTCTGAATACCACAGGTAAAAGGATATGGTTACAGCTAGGTCTTTTTTACCGAAATTGTTTTCTGCAGTTTATCCAACACACCTCCAGTTATGCAAATACTTGCATTTCTTCACTATGTAGACGTGGAAGCCTTCTGAGAGCCAAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	13088	323	+	647215	AATGTCCCATGTATCTGTACTAGTCTTTTAGACGTAGTTCAATAGTTCTTATATCTTAGTATTTACTTGATACCGCAGATTTTGAGCATGAGGATCACATGCAGTGGCTGTCCATCAACAAATCTATCCATAGGTCATG-GAATACATGTCTTTGCTTCCCTTGTCTTTAAGATGATCTCTGAATACCACATGTAAAAGGATATGGTTACAGCTAGTCATTTTTTACCGAGCTTGATTTCTGTACTTTATCCAACACACTCCCAGCTATGCAAATACTTGCATTTCTTCATTATGTAGGTGTGGAAGCCTTCTGAGGACCAAGC

a
s	mr.mrrefChr0	19781	68	+	130230	TGTGCTGGCAAAATAGATGCAGGAAAATGAAACAAAGTTGTCTGAGGCATAACTTGATCATGCCATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	21481	66	+	636262	TGTGCTAGCAAAATGGATGCAGGAAAAT--AACAAAGTTGTCTGAGGCATAACTTCATCATGCCATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	13411	67	+	647215	TGTGATGGCAAAG-AGATGCTGGAAAATGAAAGAAAGTTGTCTGAGGAACAACTTGATCATGCCATAT

a
s	mr.mrrefChr0	19849	285	+	130230	CATACATGGGTAGAAAAGTAGACTTATATGAATGTTCTTGTTTTAGTGGTATGACCTATTGGTTTTCTTAGACATTTCAGCCACTTAATATGGTGGGTCCTACAAAGTGCTTCTCCCCAGTATGCCTTCCTTAAGGGCTAAAGCATAGAGTGCTGGTGCTGATACAGAGCATGTATTGTATGTGAATAATGTGTATTTAATCCTCTTTCTCCACAAGTGTCTGTTATTACCTGGGATCTTCCCTTGTCATGTTTAACAAAAATGGTAAATTGCTACTAAGATGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	21549	277	+	636262	CATACATGGGTAGAAAA-------TATATGAAGGTTCTTGTTTTAGTGGTATGACCTATTGGTTTTCTTAGGCATTTCAGCCATTTAATATGGTGGGTTCTAAAAAGTGC-TCTCCCCAGTATGCCTTCCTTAAGGGCTAAGGTATAGAGTACTGGTGCTGATACAGATCATGTATTGTATGTGAATAATGTGTATCTAATCCTCTTTCTCCACAAGTGTCTGTTATTACCTGAGAACTTCCCTTGTCATGTTTAACAAAAATGGTAAATTGCTACTAAAATGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	13478	284	+	647215	GATGCAGGGGTAGAATAGTAGACTTATATGAATGTCCTTGTTTTAGGGGTATGACCTATTGGTTTTCTTAGACATTTGAGCCACTTAATAGGGTGGGTCGTACACAGTGCTTCTCCCAAGAATGTCTCCCTTAAGGGCTAAATCATAGAGTGCT-GTGCTGATATAGAGCACGTATTGTATGTGAATAATGTGTATTTAATCCTCTTGCTCCACAAGTGTCTGTTGTTCCCTGGGATCTTCCCTTGTCATGTTTAACCGAGATGGTAAATTGCTACTAAGGTGTG

a
s	mr.mrrefChr0	20134	16	+	130230	GTATGCAATACACATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	21840	16	+	636262	GTATGCAATACACATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	13762	16	+	647215	GTATACTGTACACATA

a
s	mr.mrrefChr0	20150	61	+	130230	TGCAATATACATGTGTAATGAGATATAATCACTAACTAGAACCCATTACATGCAGACACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	21862	59	+	636262	TGCAATATACATGTGTAATGAGATATAA--ACTAACTAGAACCCATTACATACAGACACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	13778	61	+	647215	AGCAATAAACAAGCGCAATGAGATATAATCCCTAACAAGACACCATTACATGCAGACACTA

a
s	mr.mrrefChr0	20211	5	+	130230	ACATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	21922	5	+	636262	ACATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	13839	5	+	647215	ATATT

a
s	mr.mrrefChr0	20216	38	+	130230	GAGCTTTATATTCTAATAAGGAGTTCTTGGCTGGCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	21930	38	+	636262	GGGATTTATATTCTAATAAGGGGTTCTTGGCTGGCATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	13844	38	+	647215	GAGCTTTGTATTCTAATGGGGACTTCTTGGCTGGCATG

a
s	mr.mrrefChr0	20254	75	+	130230	ATTTGTTAATACATTGATGTTGTGCCATTGCTGTTTTATTATTATGATTACTATAGGTCTGACACTGCTATAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	21968	75	+	636262	ATTTGTTAATACATTGATGTTGTGCCATTGCTGTTTTATTATTATGATTGCTATAGGTCTGACACTGCTATAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	13892	75	+	647215	ATTTGTTAATACATTGATGTTGTGCCATTGCTGTTCCTTTATTACACTTAACGTAGGCCTGACATTGCTGTAGGT

a
s	mr.mrrefChr0	20329	238	+	130230	TGTAGACTGTATTAGCTTCAATGGGAAACCCTCTCATTACTACAACTGCTGGCATCCTAAAAAAATGAGCCCCTCTAACATAATACAGGCTACCTCCCTGCTGAATGCTGGGCATTTTTAACTTTAGAATAGACCATGTAGTCAGCTACAGAGAGATAATGCATGTTGTAGCCTGGATCAGCTACAGTGGGACAATGAACTATATAGCCTGGCAAAGGCAAAATGCCACAGACTTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	22044	231	+	636262	TGTAAACTGTATTAGCTTCAAAGAGA------CTCATTACTACAACTGCTGGCATCCTAAAAAAATGAGCCCCTCTAACATAATACAGGATACCTCCGTGCTGAATGCTGGGCATCTTTAACTTTAGAAAAGACCATGTATTCAGCTACAGAGAGATAATGCATGTTGTAGCCTGGATCAGCTACAGTGGGACAATGAACTATATAGCCTGGCAAAGGTAAAA-ACCACAGACTTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	13967	238	+	647215	TGTAGCCTTTATTAGTTTCAATGGCAAACCCTCTCATTACTGCAACTGCTGGCATCCTAAAAAAATAAGCCCCTCTAACATAATACAGGCTACCTGACTGCTGAACACTGGGCACTTCTAATTTTGGAATAGACCATGTAGTCAGCTTCAGAAAGATAATGCATGGTGTAGCCCGGATCAGCTACAGAGGGACAATGCACTATATAGTCTGGCAGAGGCAAAATGGCACAGACTTTTT

a
s	mr.mrrefChr0	20567	77	+	130230	TTTTGCCCACATATTTTATCATGTACATCTCTTGTGATGCACTCGCCTCAACCTTGTAAAGCCTTTTATCATAGGTG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	14208	77	+	647215	TTTTGCCCACATATTTTATCATGTACATCCCTCATGATGCACTAGTCTCTTCCCTTTGAATCCTTTTATCATAGGTG

a
s	mr.mrrefChr0	20644	54	+	130230	GTGTGTATTTATCAGTATGTGAGGGCATAAAGGTGCCAGTTAGAATGATTGAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	22353	54	+	636262	GTGTGAATTTATCAGTGTGTGAGGACATAGAGGTGCTGGTTCGAATGATTGAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	14285	54	+	647215	TTGTGTATTTACCATTATGTCAGGGCATAAAAGTGACAGTTAGAATCATTGAAA

a
s	mr.mrrefChr0	20698	13	+	130230	TTTGAACCATTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	22407	13	+	636262	TTTGAACCATTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	14340	13	+	647215	TTGGAATCATTGG

a
s	mr.mrrefChr0	20711	29	+	130230	CGCTTCCTTGCTCATTTAAACACTGGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	22434	29	+	636262	CGCTTCCTTGCTCATTTAAACACTGGCAT

a
s	mr.mrrefChr0	20740	11	+	130230	CACATCAGGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	22467	11	+	636262	CACATCAGGAT

a
s	mr.mrrefChr0	20751	40	+	130230	TAAGTGCCTAATATTGGGTGCAAATATTGTTACATGTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	22479	31	+	636262	TAAGTGCCTGATATTGGGTGCAA----TGTTGGAT-----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	14353	35	+	647215	-----GCGCATTGTCGGGTGCAAATATTGTTACATGTAGA

a
s	mr.mrrefChr0	20791	13	+	130230	CATGAACTTGTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	14390	13	+	647215	CATGAACTTGTTG

a
s	mr.mrrefChr0	20804	32	+	130230	AATCTCAGATTACTTGCACAGCTATGATTACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	14411	32	+	647215	AATCTCAGATTACTTGCACAGCTATGATTACT

a
s	mr.mrrefChr0	20836	19	+	130230	GGATGGAGCACAGGATAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	14449	19	+	647215	GGATGGAGCACAGGATAAC

a
s	mr.mrrefChr0	20855	54	+	130230	TCATGTAGCACCTTCAGGCCAGATCAAGTGTTTGGATGAAAATTCCTCTCAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	14469	54	+	647215	TCATGTAGCACCTTCAGGCCAGATCAAGTGTTTGGATGAAAATTCCTCTCAAAT

a
s	mr.mrrefChr0	20909	132	+	130230	TGGCAAAGTGACAGTAAGACATGACCAGTACTTTGCTGCTCTTATATTTTGTGCATCCATAGGAGCAGGTGTTCAGCATGACATCATAGGGAGGAGCAGGTAAGCTGTTGTATAACAGGTTTGTGCCAAAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	22510	97	+	636262	-----------------------------------CTGCTCTTATATTTTGTGCATCCATAGGAGCAGGTGATCAGCATGACATCATAGGGAGGAGCAGGTAAGCTGTTGTATAACAGGTTTGTTCCAAAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	14525	132	+	647215	TGGCAAAGTGACAGTAAGACATGACCAGTACTTTGCTGCTCTTATATTTTGTGCACCTATAAGAGCAGGTGTTCAGCAGTACACCATAGGGAGGAGCAGGTACACTGTTGTATAACAGGTTTGTGCAAAAAC

a
s	mr.mrrefChr0	21041	104	+	130230	ACAGTGATTTAAAAGGGTACAGATACCTTTGATCTGGGGAAAGCACCTGGATATCATATCATGAGGAGCGAACAGCATGAGATTCAATTTATTGCATTGAATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	22607	103	+	636262	ACAGTGATTTAAAAGGGCACAGATACCTTTGATCT-TGGAAAGCACCTAGATATCACATCATGAGGAGCGAACAGCATGAGATTTAATTTAGTGTATTGAATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	14662	103	+	647215	ACAGTGATTTAAAAGGGTACAGATACCTTTGATATGGGGAAAGCACCTGCATCTTATATC-TGAGGAGCGAACAGCATGAGATTCGGTTTATTGCATTGAAGTT

a
s	mr.mrrefChr0	21145	37	+	130230	GAAGACAGATATTGTAATGCATTTGGGGGGTTTCTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	22710	17	+	636262	GAAGACGGTTACTGTAA--------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	14834	37	+	647215	GAAGACAGATATTGTAATGCATTTGGGGGGTTTCTAT

a
s	mr.mrrefChr0	21182	56	+	130230	GTATGGCAGATCAATTACACAAATCTGTTGTGATGATCCTACAAAGTAATTGAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	22727	41	+	636262	---------------CACACAAATCTGTTGTGATGATCCTACTGAGTAATTGAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	14872	56	+	647215	GTATGGCAGATCAATTGCACTAATCTCTTGTGCTGATCCTACAAAGTAATTGAGGT

a
s	mr.mrrefChr0	21238	25	+	130230	GACCCCCATCAATTAGCAAGTAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	22768	25	+	636262	GACCCCCATCAATTAGCAAGTAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	14967	25	+	647215	AACCCCCATTGATGAGCACGTAAGT

a
s	mr.mrrefChr0	21263	641	+	130230	CTTACCAGAAGCAGACCAGTTGTATTAGTGTAGAATATATGTAGGTGCTACTTGTCACTGACAACCACTTTTACCATTAAGAGCAGCTAAAATCTTCCTGTTTTACATCTAGCTATGAATGTTCTCTCTTGGCATCGATAACCATTTGCAGTACTAGACACACAAAGGGCATCGCTTAGCATGTGCCAACCTTCAACTTCAATTTCTTACTCTTTGACAAGTATATAACTTAATATACCTTACACTTCCAACCCTGTAACAGATAGCTGATTTATTTCCCTGCCAGGTTTCCTTTCCATAATGTCTAGTCCCTGCAGTGTTTCGTTTGCTGGGTAGCTAACTTAGCCTGCTATGATGCTGCCAATTTACAGTCTCCCAAACCTAACACATTGCCCCCTAGACTTTGCCCATACCCTCGTATAGAGACAGTCCAAGTGGTTTCGGTTTCTTTAATTTAGTAATCTCTACACTCTAGAGGTGTGCTATACTAACAGGATGAAGGGGTCTCACATACCAGGGGTTGCCCTTTGAGGTGATAAAACACTATGACTTTATATTTCATGGCAAAATTTGAGACAAAGCTGGTTGTCCCTATGGGCAGTAACTGACTTTGTTTGATCTGTATTGTATGTGATCTGTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	22804	633	+	636262	CTTACCAGAAGCAGACCAGTTGTATTAGTGTAGAATATATGTAGGTGCTACTTGTCACTGACAACCACTTTTACCATTAAGAGCAGCTTAAATCTTCCAGTTTTACATCTAGCTATGAATGTTCTCTCTTGGCATCGATAACCATTTGCAGTACTAGACACACAAAGGGCATCGCTTAGCATGTGCCAACCTTCAACTTCAATTTCTTACTCTTTGACGAGTATATAACTTAATATACCTTACACTTCCAACCCTGTAACAGATAGCCGATTTGCTTCCCTGCCAGGTTTCCCTTCCATAATGTCTAGTCCCTGCAGTATTGCATTTGTTGGGTAGCTAACTTAGCCCGCTATGCTGCTGCCAATTAACAG-----CAAACCTACCACATTGCCCCCTGGACTTTGCTCATGCCCTCGCATAGAGACAGTCCAAGTGGTTTCGGTTTCTTGAATTTACTAATCTCTACACTCT---TGTGCACTATACTAACAGGATGAAGGGGTCTCACATACCAGGGGTTCCCCTTTGAGGTGATGAAACACTATGACTTTATATTTCATGGCAAAATTTGAGACAGAGCTGGTTGTCCCTATGGGCAGTAACTGACTTTGTTCAATCTGTATTGTATGTGATCTGTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	14992	615	+	647215	CTTACCGGAAGCAGACCAGCTGTGTTAGTGAAGAATATATGTAGGTGCTACTTGTC-------ACCACTTGTA--ACTGACAGCAGCTAAAATCTTCCTGATTTACATCTAGCTATGAACGTTCGCCCTTGGCATCACCAACCATTTGTAGTACTGGAGATAGGTAAGGCACTGCTTAGCATGAGCCAACCTTCAACCT-GATTTCTTACTCTTCGACAAGTATATAGCTTAATATA-----------CAACCCTGTAACAGATAGCTGATTCATTTCCCTGTCAGATCTCCTTTCTGTAATGTCTAATCCCTGCAATGTTTCGTTTGCTGGGTAGCAAACTTAGCCTGCTATGATGCTGCCAATTTACAGTCTCCCAAACCTAACACATTGCTCCCTAGACTTTGCCCACACACTAGTAAAAAGACAGCCCAATTCGTTTCAGTTTCTTTAATTCAGTAGTCTCTACACTCTAGAGGTGTGCTAAACTAACAAGAAGAAGGGGTTTCACACACCAGGGGTTGCCCTTTGAGGTGATAAAACACTATGACTTTATATTTCATGGCAGAATTTGAGACAAAGCTGGTTGTCCCTATGGGCAGTAACTGACTTTGTCTGATCTGTATT-----TGATCTGTCT

a
s	mr.mrrefChr0	21904	53	+	130230	CAATAGTACTTTTTATGATTGTATGTGTTAATGATCATTCAGGAATCCGCTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	23437	53	+	636262	CAATAGCACTTTTTATGAGTGTATGTGTTAATGATCATTCCAGAATCCGCTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	15608	53	+	647215	CAGTAATGCTTTTTATGATTGTATGTGTTAATGATCATTTAGGAATCAGCTGA

a
s	mr.mrrefChr0	21957	42	+	130230	AAGACAAATTATCTGAGAGGTGGCGAACTAAAGCATAGACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	23490	37	+	636262	AAAA-----TACCTGAGAGGTGGCGAACTAAAGCATAGACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	15664	42	+	647215	TGGACAAATCATCTGAGAAGTGGCAAACTAATGCTTAGACAA

a
s	mr.mrrefChr0	21999	319	+	130230	AATACCTGAAGAGTGGTGAGTAGTTGAGTGTGATGTCTATCAATGAGGAAGCTCGCACTTCACTGTAAGAGAACCTACTAAAAGCTATGATGAGTACAACCAAGATTGACCACTGGGCATGGATTGGAGTCTGACTAGAGCATATCTTATCTTCAATTCTCACACATCTGTAGTGTGTTATTCCTGGAAGTTTTAAAGCTAGTTTATGTTTGACCTAATGCAGTTAAGGCCCCACTTATTTTAAAGCTAAGACATAACTAACAGTCTGGAGGCTAGGACTGATTTGGGGTTGCATAATCTTGCCACACTTTACCTGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	23535	304	+	636262	AATACCTGAAGAGTGGTGGGTAGT---------------TCAATGAGGAAGCTCGCACTTAGCTGCAAGAGAACCTACTAAAAGCTATGATTAGTACAACCAAGATTAACCACTGGGCATGGATTGGAGTCTGACTAGAGCATATCTTATCTTCAATTCTTACACATCTGTAGTATGTTATTCCTGGAAGTTTTAAAGCTAGTTTATGTTTGACCTAATGCAGTTAAAGCCTCACTTATTTCAAAGCTAAGACATACCTGACAGTCTGGAGGCTAGGACTGATTTGGGGTTGCATAATCTTGCCACAGTTTACCTGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	15706	316	+	647215	AATACCTGAAGACTGGTGAGTAGTTGAGTGTGATGTCTATCAATGAGGCAGCTGGCACTTCACTGTAAGAGAACCTACTAAAAGCTAT-ATGAGTACAATCAAGATTGACCACTGGGCATGGATTGGAGTCTGGCTAGAGCGTATCTTATCTTCAATTCTCACACCTCTGTTTTGTGTTATCCCTGGAAGTTTTAAAGCTAGCTTATGTTTAACCTAATCCAGTC-AGGCCCCACTTATTTTAGG-CCATGACATAACGAACAGTCTGGAGGCTAGTACTGATTTGTGGTTGCATAATCTTGCTACACTTTACCTGTTT

a
s	mr.mrrefChr0	22318	27	+	130230	CCTAACCTATCAAAAGATGCTTCATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	23839	27	+	636262	CCTAACCTATCAAAAGGTGCTTCATAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	16024	27	+	647215	CCTAACCTATCAAAAGATGCTTCCTTG

a
s	mr.mrrefChr0	22345	223	+	130230	CAATTCCATGAGGACAGATAGGTAATTAAGGATATGAGAGCAGACACATATTTGTAATAAAGTACACATCTAACTGATCAAGGGCCAATTCTAATTTATTGCCTATTTAGATCCCCAATTTAAATCCCTATATAGCAACTAGTCTCATCCCAAACATGCATGATATAGCACCTCTGCGATTGTAGTAACCTCTACTAGACCTAAGGACCGTTTGTAGGCATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	23869	222	+	636262	CAATTCCATGAGGACAGATAGGTAATTAAGGATATGAGAGCAAACACCTATTTGTAATAAAGTACACATCTAACTGATGAAGAGTCAGTTCTAATTTATTGCCTATTTAGATCCCCAATTTAAATCCCTATATAGCAACTAGTCTCATCCCAAACATGCATGATATAGCACCTCTGCGATTTTAGTAACCTCTACTAGACCTAAGGACAATTTGTAGGTGTG-
s	simRat_chr6.simRat.chr6	16051	222	+	647215	CAAGTCTGCAAGGACAGATAGGTAATTTA-GATATGAGAGCAGACACATATTTGTATTAAAGTACACATCTAACTAATCAAGGGCCAATTCTAGTTTATTGGCTATTTAGATCTCCGATGTAAATCCTTAGATATAATCTAGTCTCATCCCAAACATGCTTGATATAGCACCTAAGTGACTGTAGTCACCTCTGCTAGACCTGAGGACCGTTTGTAGTCATGT

a
s	mr.mrrefChr0	22568	367	+	130230	GGGAGCAAATACTCATACCCATACTCAGTTGCTATTATAGTGATACAGTTCTCTTGGCTAGCTTTCCATAATGTCAGCTGGTGAGGCCCACTTTAATGATACAGTGTTCACAACTGTAGCCCACACTCACTGGTGTAAGTTGCTTGTGAGACTGACCATGCTCACGAACTCTGTCTCAACCTAGTTAGCAAGCGTGTCATTAATTACCTTAGTAATATTAGTCAGAAGTAAGGGTTGTCACAGGTGGCCAGCATCACCTCCAAGAAGCAGTGTTCTGTGCACACAATGGATACTGGATCTACACGGAGCTAAACTTGCAGAAGAGGCCTCCAGTCCATGAGTTTCCAATTAAAGTGCCATTTTTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	24091	367	+	636262	GGGAGCAAATACTCATACCCATACTCAGTTGCTATTATAGTGATACAGTTCTCTTGGATAGCTTTCCATAATGTCAGCTGATAAGGCCCACTTTAATGGTACAGTGTTCGCAACTGTAGCCTACACTCACCAGTGTATGTTGCTTGTGAGACTGACCATGCTCATGAACTCTGTCTCAACCTAGTCAGGAAGCCTGTCATTAATTACCTTGGTAATATTAGTCAGAAGTAAGGGTTGTCACAGGCAGCCAGCATCACCTCCAAGAAGCAGTGTTCTGTGCACAAAATGGGTACTGGATCTACAAGGAGCTAAACTTGCGGAAGAGGCCTCCAGTCCATGAGTTTCCTATTAAAGTGCCATTTTCGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	16277	365	+	647215	AGGAGCAAATACTTGTACCCACACCTGGTTGCTATTGTAGTGATACTGTACACTTGGCTAGCTTTACATAATGTCAGCTGGTGAGGCACACTCTAATGATGCAGTGTTCACAACTGTAGCCCACACTCATTGGTGTAAGTTGCCTATGAGACTGACCATGCTCACGAACTCTGTCTCGTCGTAGTTAGCAAGTGTGTCATCAATTATCTTAATAATATTAG--GGAAGTAAGAGTTGACACAGATGGCCACCAGCACCTCCAAGAAGCAGTATTCAGTGCACACAATGGATACTGGATCTACACGGAGGTAAACTTGCAGAAGAGGCCTCCAGTCCATTAGTTTCCAATCAAAGTGCCATTTCTGTG

a
s	mr.mrrefChr0	22935	79	+	130230	AATAACAACTCCAAGCAAAATCAGGGTGACAGTAATAAAGTGTGCTAGTGGACCAGAATAGTCAGGCGAGTTAGGCTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	24458	79	+	636262	AATAACAACTCCAAGCAAAATCAAGGTGACAGTAATAAAGTGTGCTAGTGGACCAGAATAGTCCGGGGAGCTAGGCTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	16647	79	+	647215	GACAACCAGCTCAGGCACAGTCAGGGTGACAGCAATAAAGTGTCCTAGTGGATCAGAATAGTCAGGCTAGTTAGGCCAA

a
s	mr.mrrefChr0	23014	160	+	130230	TAAATTAGAGCTGCAAGCAACAAAATTACTGGAGTAGCAGAATTTGTGTCTGGCCCCTAATCCTGCTTAAATAACAACCTGGAAGTTTATAGCAGGGGGAGATTATGCTAGGCAAGAATTACAGGAGCTTCATAAATATAAATGGTTATACCGTAAAATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	24537	160	+	636262	TAAATTAGAGCTACAAGTAACAAGATTATTGGAGTAGCAGAATTTGTGTCTGGCCCCTAATCCTGCTTAAATAACAACGTGGAAGTTTATAGCAGGGGGAGATTCTGTTAGGCAAGAATTACAGAAGCTTCATAAATATAAATGGTTATACCGTGAAATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	16727	159	+	647215	TGATTTAAAGCTGCAAGCAACAAAATTACTGGAGGAGCAGAATTCGTGT-TGGCCCCTAATCCTGCTTAAATGACAACCTGGAAGTTTATAGCAGGGGGAGATTATGCTGGGCTAGAATTACAGGAGCTTCATAAATATAAATGGTCATAGCATAAAATC

a
s	mr.mrrefChr0	23174	96	+	130230	CAACTTTTAGTTGTAGGTCCTATACCGGATACAACTGAGTGGAAAGACACAGACAAGGACAATAAATGTTATTATGTACAGATCCCCTGGCCCTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	24701	96	+	636262	CAACTTTTAGTTGTAGGTCCTATACCGGATACAACTGAGTGGAAAGACACAGACAAGGACAATAGATGTTATTATGTACAGATCCCCTGGCCCTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	16886	49	+	647215	-----------------------------------------------CACAGACAAGGACAATAAATGTCATTCTGTACAGATTTCCTGACCCTCC

a
s	mr.mrrefChr0	23270	160	+	130230	CCTGCCCAGGATACATAAGCTTACTGCATTGGATTATTTGAGATATCGCAGCATAATATCTTGATGCACTCCATTTTTGGTCAATAATGTCAGGCTGGCATGAGATCCTATGTGATTCAGCTCCTTGTTCTAGTCAATTCCACCTTATTCCTGCAGTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	24797	157	+	636262	CCTGCCCAGGATACATAAGTTTACTGCATTGGA-TATTTAAGATATCGCA-CACAGTATCTTGATGCACTCCATTTTTGGTCAATAAGGTCAGGCTGGCATGAGATTCTATGTGATTCAGCTCCTTGTTC-AGTCAATTCCACCTTATTCCTGCAGTAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	16936	160	+	647215	CCTGCCCAGGAGGCATAGGCTTATTGCATTGGATTATTTGAGCTATCACAGCATAATATCTTCATGCACTCTATTTTGGGTCAATACTGTCAGGCTGGCATGAGATCCTGTGTGATTTAGCTCCTTGTTCTAGCCAACTCCACCATATCCTTGCAGTATA

a
s	mr.mrrefChr0	23430	12	+	130230	GGCTAAGGAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	24955	12	+	636262	GGCTAAGGAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	17096	12	+	647215	GGCTAGGGAATC

a
s	mr.mrrefChr0	23442	196	+	130230	ATTAGTGCACATTAATTTTGATGATGCCATAGTGCATTTGAAATGTATTAATAGGTATATTCTTAACTCAGTGTGACGGGTTATAAATTATTTCTTATCATGGAAGTAAAATACATTTTGTTTGGTGTGAAATACAAACCCCATTCTAACCACCCCTAAAGGAGGGAGACTAACCTGTATTCCTCCCACTGCAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	24967	193	+	636262	-TTAGTGCACATTAATTTTG-TGATACCATAGTACATTTGAAATGTATTAATAGGTATATTCTTAACTCAATGTAACGGGTTATAAATTATTTCTTATCATGAAAGTGAAATACA-TATGTTTGGTGTGAAATACAAACCCCATTCTAACCACCTCTAAAGGAAGGAGACTAACTTGTATTCCTCCCACTGCAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	17113	196	+	647215	ATTAGTTCACATTAATTTTGAGGATGCCATAGTGCCATTGTAATGAATTAATAGGTATATTCTTACCTCAGTGTGACAGGTTATAAATTATTTCTTATCGTGGAAGTAAACTAGATTTTGTTTGGCATGAAACACAAACCCCATTCTAACTACCCCTAAAGGGGGCAGACTAACCTGCATTCCTCCCTCTGTAACC

a
s	mr.mrrefChr0	23638	34	+	130230	TGCAGACAGAGAAACATGCATCATCAACACCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	25161	34	+	636262	TGCAGACAGAGAAACATGCATCATCAACACCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	17309	34	+	647215	TGCAGACAGAGACACATGCATCATCAAAACCTTT

a
s	mr.mrrefChr0	23672	11	+	130230	CTACAACACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	25197	11	+	636262	CTACAACACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	17343	11	+	647215	CTACAACACTA

a
s	mr.mrrefChr0	23683	40	+	130230	ATTTGCACATCAAGACTATATTTACACATCAAAAATATGA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	17354	40	+	647215	ATTCGCACATCCAGACTCTATTTGCAAATCAAAAATATGA

a
s	mr.mrrefChr0	23723	195	+	130230	CAATTCTAAACTTGTCAGTACCCCAGACACACAATCTTTTATTGAGTCACCAGTCATCTTTTTCACATACTGTCATGATTTCTGTATCCCATGCTTTTTGTAAGTCAATGCTTATATTTCTGTATATGGATGGATTGCTATTGGTGTAAACTTCAAAATCTAGTGTGTGGCTTCTCTATGGTGTGGTTACCAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	25249	195	+	636262	CAATTCTAAACTTGTCAGTACCCCAGCCACACAATCTTTCAATGAGTCACCAGTCATCTTTTTCACATACTGTCATGATTTCTGTATCCCATGCTTTTTATAATTCAATGCTTATATTTCTGTATATGGATGGATTGCTAGTGCTGTAAACTTCAAACTCTAGTATGTGGCTTCTCTGTGGTGTGGTTACCAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	17401	194	+	647215	CAATTCTCAACTTGACAGTACCCCAGACACACAATCTTATATTGAGTCACCAGTTATCTTTCTTACATACTGCCATCATTTCTGTATCCCATGC-TTTTGTAAGTCAATACTTATATTTCTGTATCTGGATGGATTGGTATTGGTGTAAACTTCAAAAACTAGTGTGTGGCCTCTCTATGGTTTGGTTGCCAGCA

a
s	mr.mrrefChr0	23918	18	+	130230	GAAATTTCCCCTGGGGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	25445	18	+	636262	GTGATTTCTCCTGGGGCC
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a
s	mr.mrrefChr0	23936	357	+	130230	AATACGTTAACTGGCTTAGTGTACAAATGCTGCTAAAGAACATATGAATATCCAAATTGCTCCATGTTGACATCCCATGTGATTTAACCCACATACTTACCATCTCTTCCACTTAATGTTCAACCTCTGAACCCAATGTGGTCCCCTTGTGAGGGATTCCATGAGAATTCCTTTTAAAAGGAGTGTCAATCTTGCCAGTGGTTATGCCTTAATCCCTCCACCTGAGAGTTGCCCATGCAGCCAGTGTCAGTTAGTGTTTTGGTTGATGCCCCAGATTGATGCCCCACAGTATAGCAACCACAGTTTGCCAGCAACCATCTGAATAAACTGGGTCAGGAGCAACCACCTAGCCTTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	25465	357	+	636262	AATACGTTAACTGGCTTAGTGTACAAACACTGCTATAGAACATATGAATATCCGAATTGCTCCATGTTGACATCCCATGTGATTCTACCCACATACTTACCATCTCTTCCACTTAATGTTCAACATCTGAACCCAATGTAGCCCCCTTGTGAGGGATTCCATGAGAACTCCTTTCAAATGGGGTGTCAATCTTGCCAGTGGTAATGCCTTAATCCCTCCACCTAAGAGTTGCCCATGCAGCCAGTGTCAGTTAGTGTTTTGGTTGATGCCCCAGATTGATGCCCCACAGTATAGCAACCACAGTTTGCCAGCAATAATCTGAGTAAACTGGGTCAGGAGCAACCACCTAGCCTTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	17613	342	+	647215	AATACGTTTACTAGCTTAGTGTACAAATGCTACTAAAGAACATATCAATCTCCAAATTGCTCCATGTTGACATCCCATTTGATTTAACCCACATACCTACCATCC----------ATGTGTGACCTATAAACCCAATGTGGTCCCCTTATGAGGGATTCCTTGAGAATTCCTTTTGAAAGGAGTGTCCATCTTGCCAGTGGTTGTGCCTTAATTCCTCCACCTGAGG-----CTATGCAGCCAGTATTGGTTTTTGTTTTGATTGATGCCCCAGATTGATGCCCAACAGTATAGTAACCACAGTTCACCAGCGACCATCTGAATAAACTGGGTCAGGAGCAACCACCTAGGCTTGCA

a
s	mr.mrrefChr0	24293	82	+	130230	CACAGGTGAGTCAATTAGAATTGAAGGACTCTGAGGTGAGATGAGCTTTTTGGGGGACACTTGCCATTTTGAGTTATATAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	25823	82	+	636262	CACAGGCAAGTCAATTAGAATTGAAGGACGCTGAGGTGAGATGAACTTTTGGGGGGACACTTGCCATTTTGAGTTATATAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	17955	78	+	647215	CACAGGTGAGTCAATTAGAATTGAAGGACTCTGAGGTGAGATGAGCTTTTTGGGGGACACT----ATTTCGAGTTATATAGC

a
s	mr.mrrefChr0	24375	15	+	130230	ATGTATCAATGACCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	25905	15	+	636262	ATGTATCAGTGACCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	18034	15	+	647215	ATGTTTCAATGACCC

a
s	mr.mrrefChr0	24390	5	+	130230	ATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	25924	5	+	636262	ATCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	18049	5	+	647215	TCCAA

a
s	mr.mrrefChr0	24395	69	+	130230	AATTCCTTTGTAGTTAATCTTCAGAAATATAACACAAGGCACATAGCTCTGCTGACTGCTGGCAAAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	25929	69	+	636262	AATTCCTTTGTAGTTTACCTTCAGAAATATAACACAAGGCACATAGCTCTGCTGACTGCTGGCACACCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	18058	67	+	647215	ATTTCCTTTGT-GTTAATTTTCGGAGATTTAACACAAGGCGCATA-CTCCAGTGACTGCTGGCAAGACC

a
s	mr.mrrefChr0	24464	166	+	130230	ATTGGTATATCTCCACATGTTGTAGGGGGACCAATGGCACAATGTGGATGTGGATGAGGGATCTATAATTCAAACTAATCCCCCACTTATCTTTTCTATTTTTATGCCAATCATGTTAGGCTTATGAGATAGGTTAGGTCATGTGATGGATCTAAAGAACTGCCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	26010	145	+	636262	ATTGGTATATCTCCACATGTGGTAGGGGGTC--------CAATGTGGCTGTGGATGAGGGATCTATAA-----ACAAATCCTCCACTTATCTTTTCTATTTTTATG-----CATGTTAGGCTCCTGAGATAGGCTAGGTCATGTGATGGGTCTAAAGAACTGC---
s	simRat_chr6.simRat.chr6	18125	166	+	647215	ATTGGTATATCTCCACATGTTGTAGGGGGACCAATGGCACAATGTGGATGTGGATGAGGGATCTATATTTCAAAGTAATCCCCCCCTTATCTTTATTATTTTTATGCCAATCATGTTAGGCTTATGATGTAGGTTAGGTAATGTGATGGATCTAAATAACTGCCAC

a
s	mr.mrrefChr0	24630	81	+	130230	CATCCAATGAGTCATCATTTTATGACACTGACTGACCTTCTTAATCACGGCTGTAGCCTCTTAGTTAGAAATGCAACAGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	26155	79	+	636262	--TCCAGTGAGGCACCGTTCTATGACACTGACTGACCTTCTTAAGCAGGGCTGTAGGCTCTTAGTTAGAAATGCAACAGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	18292	81	+	647215	CATCCAATGAGTCATCATTTTATGACACTGAGAGTCCTTCTTAATCACGGCTATAGCCTCTTAGTTAGAAATGCAACAGAC

a
s	mr.mrrefChr0	24711	120	+	130230	TGTACTCAACCATTCATAAGGAAAGTTTCAAAACCATTTGACATCCAGAGCACCCGTTGTACAATCACCCATTGATAACAATGTGAGGTATGGTGGAGCCAGAACTCCATGGGTCAGCCC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	18373	120	+	647215	TGCACTCAACAATTCGTAAGGAAGGTTTCAAAACCATTTGACATCCAGAGCACCCATTGTACAATCACTGATTGAACACAATGCGAGGTATGGTGGAGCCAGAACTCCATGGGTCAGCCC

a
s	mr.mrrefChr0	24831	94	+	130230	GGGTGTATTACCATTAGCCTCAATTCCTTGGACCTCATTTTAAAATATTATCTTTAACCCCTCCTGTAATTACGAAAAATTAGAGCAGAGAAGG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	18493	84	+	647215	AGGTGTATTACCATTAGCCTCAATTCCTTGGTCATGATTTTAAAATATTGTCTCTAACCCCTCCTGTAATTAGGAAAAATTAGA----------

a
s	mr.mrrefChr0	24925	144	+	130230	GGCAACCACTAGAATGTATAAGTGGGCAAGATTATTTAAGGGATCTAATCTCTTGCACTGGTGATAGGTTTACGGTTGGCTAATTGACTCACAGACAAACAAATGGTCACGACTTAGCTGAATTTCTCCATTGGCTCCTACATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	26457	140	+	636262	GGCAACCACAAGAATGTGTAAGTGGACAAG---ATTTAAGAGATCTAATCACTTGCACTGGTGACAGGTTT-CGGTTGGCTGATTGACTCACAGACAAACAAATTGTCCCGGCTTAGCTGAATGTCTCCATTGGCTCCTACATG
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a
s	mr.mrrefChr0	25069	358	+	130230	TCCTCATATCACAAAAGAGGGTAAGCAGTGGCACTCAGAAGACACAGAGCTGTCACCTGGGAGAGCAGATGTGGCCTGAGAGACCAGACTCAGTCATTTGATGGTGTAATGGTTGGCCCTGATCATCAGGGACTGCAGTGTCAACAAGATAAGTATTTAGTAAGCATAAGTACCTGGATGTGGGGCTAGAGCCCCTAGGGTCCAGACAACTATGTAAGAGAGTTTGAGATCTGGCAAAAGTGTAATGTTCCCCATTGGCTGTCTTTGTTGTTATCATCTAGATTTTTTCTCATGGTGGGACATTGATCCTTTAACCAAAAACAAAGGTATCTACTGCCAATCAAGAGTACATACTGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	26597	358	+	636262	TCCTCATATCACAAAAGAGGGTAAGCAGTGGCGCTCAGAAGACACAGAGCTGTCACCTGGGAGAGCAGATGTGGCCTGAGAGACCAGACTCAGTCATTTGATGGTGTAATGGTTGGCCCTGATCATCAGGGACTGCATTGTCAACAAGATAAGTATTTAGTAAGCATAAGTACTTGGATGTGGGACTAGAGCCCCTAGGGTCCAGACAACCATGTAAGAGAGTTTGAATTCTGGCAAAAGTGTAATGTTCCCCATTGGCTGTCTTAGTTGTTATCATCTAGATTTTTTCCCAGGGTTGGACATTGATCCTTTAATCAAAAACAAAGGTGTCTACTGCCAATCAAGTGTACATACTGCC
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a
s	mr.mrrefChr0	25427	66	+	130230	ACTTACTGCCTTAAACAGACCCTTTCCAAGAAGGCCCTACTCACTAAAATGTTAGTCAAGTTAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	26961	66	+	636262	ACTTACTGCCTTAAACAGACCCTTTTCAAGAAGGCCCTATTCACTAAAATGTCAGTCAAGTTAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	19082	66	+	647215	ACCTGCTGCCTTAAACAAACCCTTTCCAAGAAGGCCCTGCTCTCTAAACTGTTAGTCAGTTTAATG

a
s	mr.mrrefChr0	25493	391	+	130230	TACTTACTGAGTTGATCCCACTTCCACTAGAGGTAGTTACAATCATATGGAAGTTTAGTAGTTATGGTCCTTTAAGATTTATAATGTTTCTCCCTTTTCCCCCATACTATCTGTCCAAGGTTGATTGGGGTCCTTTCCTTTGCCAAGACTCTTACCGAATAACTTAGCTAGTGGGCATACAACCAAGCTGGTTTTTTTGGATTTCAGAGGGAATCTCGTCCTGTGGGCTTTGAGTTGCGTTCCTTCAACTTCAGTACAGTTCTTTGGGCTATCTGTACATATAAGTCTGAACTCCTGCCCACATATAAGGTACAGATTAAATCTAATCTCATGACATTACTTCCTTTCCAATCTAAGTAGCAGTCACACTTATGTGAACTCACTCGCTTTC
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a
s	mr.mrrefChr0	25884	79	+	130230	CAATTTAAGTTGCAGTCTCACTTATAAGAATTTTAATGTGTTTCAGCCTTCATAATCAGCGTGATATAATCATAAGCCC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	19522	79	+	647215	CAATCTAAGTAGCAGTCACACTTATATGAATTTTGATGTGTCTCATCTTTCATAATCAGCATGATGTAATCATAAGCCC

a
s	mr.mrrefChr0	25963	161	+	130230	TCACAAGCACATGATTCCCCCCTCAGCACAGCCTGGACAAATGAACAGCCTGGAGTAGACACATGATTCTCTTTAGAATGAAATCATAAGGTTATTCCTGCGCACAGTTATATGCCTTGCTTGTAATTATCATGGGCCTAGCCCTTCACAAGAACATTAAG
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a
s	mr.mrrefChr0	26124	227	+	130230	CATTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAATTAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTAAATGAATAGTCGTATTAGTTTACATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGTCTCCCAATCATCCTACTGCAATGTGTTGGGATTAGATGTTGACAGATCATTTTGAAGAGCCCTCAAGGGCTCTGCATCTCAAATAGAACTACTAAAGTAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	27659	221	+	636262	CATTCCTAATGTAAAAATACATCTATTTACATTGCTAGCTTGGTAATTAGTGTGATAGAACTAACCCTTGGTACTAAATGAATAGTCATATTAGTTTACATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGTCTCCCAATCATCCTGCTGCAA-----TGGGATTAGATGTTGACAGATCATGTTGAAGAG-CCTCAAGGGCTCTGCAGCTCAGATAAAACTACTAAAGTAGT
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a
s	mr.mrrefChr0	26351	26	+	130230	AACATAGGCCTATTATGAACATGTTA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	19981	26	+	647215	ACCTTAGGCCTATTATGAACCTGTTA

a
s	mr.mrrefChr0	26377	37	+	130230	GTGTACATAGGATAATAGATAGTGCTCTAGCAGTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	27907	37	+	636262	GTGTACATAGGATAATAGATAGTGCTCTAGCAGTGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	20008	37	+	647215	GTGTATATGGAATAATAATTAGTTCTATAGTGGCAGT

a
s	mr.mrrefChr0	26414	59	+	130230	AAGACTATCATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGCCTCCCAATCATCCTACTGCAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	27945	59	+	636262	AAGACTATCATTCATTTAGCCATACTCTTTACTGGCCTCCCAATCATCCTACTGCAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	20045	59	+	647215	AAGACTATCATTCTTTTAGCCATACTCTTTACTGGACTCCCAATCATCCTACTGCAATG

a
s	mr.mrrefChr0	26473	22	+	130230	TGTTGGGATCAGGTGTGGACAG
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a
s	mr.mrrefChr0	26495	6	+	130230	CTTACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	28026	6	+	636262	CTTACT
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a
s	mr.mrrefChr0	26501	89	+	130230	ATTTTATTGAAGAGCCCGCAAGGGCCTCGCAGCCCAAATAAAACAACTAAAGTAGTAAGCTTAGGCTTATTATGAACATGTTATGTGCA
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a
s	mr.mrrefChr0	26590	71	+	130230	CACAGAATAATATTTAGTTTGCTAGCAGTGGTAAGACTATCACCAGCACATTTGACCATGATTAAGGGGGA
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a
s	mr.mrrefChr0	26661	216	+	130230	CTACCAATGGCACACGTCCACACAACATTGTCCAGATTGAATACTAAAACTGGACCTTGGGGGGAGCTGATGGTTCTCCTCTTTTTCTCTCATCCTGCCTGTCACATCTGAAGAATTTTGTGACTACACTGCTTGAAGAGAGCATCTATTCACCAGAGGTTGCTCTGCTCTAGTAAACCAGATGGGGGTGACTAACTAGATAAATTATTGCACTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	28188	213	+	636262	CTACCAACGGCATGCGTCCACACAACATCCTCCAGATTGAATACTAAAACTGGACCTTGGGCGGAGCTGATAGTTCTCCTCTTTTTCT---ATCCTGCCCGTCATATCTGAAGAATTTTGTGACTACACTGCTTGAGGAGAACACCTATTCGCCAGAGGTTGCTCTGCTCTAGTAGACCAGGTGGGGGTGACCAACTACATAAATTATTGCACTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	20322	214	+	647215	CAACCAATGGCACACGTCCACACAACATTGTCCAGTTTGTATACGAGAACTGGACCTTGGGGGAAGCTGATGGGTCTCCTCTTTTTCTCTCATCCTACCTG--ACATCTGAAAAATTTTGTGATTACACTGCCTGAAGGGAGCATCTATTCACCAGAGGTTGCTCTGCACTAGTAAACCAGATGGGGGTGACTAACTAGTTAAATAATTGGGCTAT

a
s	mr.mrrefChr0	26877	46	+	130230	TGGTCAAGAAAAGAGGTGCCCACATCAATCCTAACCAGAATAAGCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	28407	46	+	636262	TGGTCAAGAAAAGAGGTGCCCACATCAATCCTGACTAGAATAAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	20536	41	+	647215	-----ATGAAAAGAGGTGTCTACATCAATCCTAACCAGAATAAGCG

a
s	mr.mrrefChr0	26923	187	+	130230	GAGACCTGTGGCTTACTCTTAATAGCAATGTTTGTTTACTAATCTCTTACATGGGGCATTAACAGATTGCAAACTGTTAACTACCAACCTATTGAAATGTGTTCTATGGTTTCATGTTATACCTGGAGTTATGTCAATAGTATTGACTGTCAAGTTTATTTTATGGTAGTAGGGGTTGGTACTGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	28458	175	+	636262	GAGACCTGTGGCTTAGACTTAATAGCAATGTTTGTTTACTAACCTCTTACATGGGGCATTAACAGATTGCAAACTAGTAACTACCAACCCATTGAAATGTGTTCTATGGTCTCATGTTATACCTGGAGTTATGTTAATAGTATTGACTGTCAAGTTTATTTTATGGTAGTAGGGG------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	20577	187	+	647215	GAAACCTATGGCTTACTCTTAATAGCGATGTTTGTTTACTAATCTCTTACATGGGGCACTAACAGATTGCAAACTGTTAACTACCAACCTATTGAACTGTGTTCTATGGTTTCATGTTATACCTGGAGTTATGCCAATAGTAGTGACTATCAAGTTTATTTTATGGTTGTCGGGGTTGGTACTGTAC

a
s	mr.mrrefChr0	27110	5	+	130230	CCAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	20765	5	+	647215	CCAGC

a
s	mr.mrrefChr0	27115	34	+	130230	ACTTTTAGGGCACTTGTTTGGGGGCTTGTCCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	28633	30	+	636262	ACTTTTAGGGCACTTGTTTGGGG----GTCCACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	20772	34	+	647215	ACATTTAGGGCACTTGTTACGGGGCTTGTCCACA

a
s	mr.mrrefChr0	27149	206	+	130230	TAGTTAATAAGCTGTGTTGTGGAGCTATGGAGCAGGCATGAATTGTGGCTGGTTAATAAGGTGAGTTAGTCGGTTCCTCATAACCAGTTATGTAGATATGAGTGCATGCATTTTTCTCTTTATTGTCAATTTATGATTCTTACTCCCCAGATCCAGTGGGTGTGCTTTGTCATGAGTGAGAGACCTACTGGCTATTTAAATTGTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	28678	206	+	636262	TAGTTAATAAGCTGTGTTGTGGAGCTATGGAGCAGGCATGAATTGTGGCTGGTTAATAAGGTGAGTTAGTCGGTTCCTCATAACCAGTTATGTAGATATGAGTGCATGCAGTTTTTTCTTTATTGTCAATTTATGATTCTTACTCCGCAGATCCAGTGGGTGTGCTTTGTCATGAGTGAGAGACCTACTGGCTATTGAAATTGTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	20806	206	+	647215	TAGTTAATAAGCTGTGTTGGGCAGCTATGGAGCAGGCATGAATTATAGCTGGTTAATAAGGTGAGTTAGTCAGTACCTCATAACCAGCTATGTTGGCACAATTGCACGCATTGTTCTCCTTATTGTCAATTTATGATTCTTACTCTCCAGATCCAGTGGGTGTACTTTGTCATGAGTGAGAGACCTAGTGGATATTTGAATTGTAG

a
s	mr.mrrefChr0	27355	42	+	130230	ACTGCGCATTATGGTATTTGTTTACTTCTAGTCCCTGCATAG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	21012	42	+	647215	ACTGCACGTTAAGGTATTTATTTACTCCTAGTCCCTGCATAG

a
s	mr.mrrefChr0	27397	160	+	130230	CTACCACTGTTGTGTACCTGGAGTCATGTTCCAATACATATAGCGATGTCAGGCACCGCAGTGAGCCAAAGTGGGATGTAGTGAGAGAGTATCCAGAATTAGGATATGCAAAACTGTATTGACTAAAGCTAGGTAGAACAAGGGACCCTTAAGTGTTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	28934	160	+	636262	CTACCACTGTTGTGTACCTGGAGTCGTGTTCCAGTTTATATAGCGATGTCAGGCACCGCAGTGAGCCAAAGTGGGATGTAGTGAAAGAGTATACAGAATTAGGATATGCAAAACTGTATTGACTAAAGCTAGGTAGAACAAGGGGCCCTTAAGTGTTAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21054	157	+	647215	CTACCTCTGCTGTGTACATGGAGTCATGTTCCAATACATATAGTGATATCCGGAACTGCAGTGAGTC-AAGTAGGATGTAGTGAGAGAGTATCCAAAAGTAG--TATCCAAAACTATATTGACTAACACTAGGTAGACCAAGGGACCCTTGAGTGTTAAG

a
s	mr.mrrefChr0	27557	176	+	130230	ATGTCCACTAGTCTTACTCCTAACTTTTGGCCTTCTCTGTAACATTGTGCTTATCTTGAACGAGATCCATTTGATTTGTCCTCTTTCTAGAAGCCTGGCTCTATTCAATGATTGTTCTAGTCTGTTCATTTAGTTTCTTGTGTTGCATGTAGTTACACACACCCATCATTATGAAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	21211	168	+	647215	ATGTCCACTAGTCTTACTCCTATCTTTTGGCCTTGGATGTAACGCCGTGCTTATCTTGAACGACAGCTATTTGATTTGTCCTCTTT--------CTGGCCCATTTTAATGATTGTTCTAGTCTGTTCATCTAGTTTCTTGTGTTGCATGTAGTTACAAACACCCATCATTACAAAA

a
s	mr.mrrefChr0	27733	68	+	130230	TAGAGTGAGGGACCCACCATCAGATAAGACCTTCTGGGGTAGAGGAAATAGAAGGCATTTGGACCAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	29271	68	+	636262	TAGAGTGAGGGACCCACCATCAGATAAGACCTTCTGGGGTAGAGTAAATAGAAGACATTTGAACCAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21395	68	+	647215	TAGAGTGGGGGACCCACCCTCAGATAAGACCTTCTGGGGTAGAGGAAATAGTGGGCATTTGGACCAAA

a
s	mr.mrrefChr0	27801	45	+	130230	CAATCCCTTCAGTTGCAAAAGAAGCTGGAAACCACAAGCTAATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	29340	45	+	636262	CAATCCCTTCAGTTGCAAAAGAAGCTGGAAACCATAAGCTAATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21463	45	+	647215	CAATCCCTTCAGTTGCAAGAGAAGCTGGATATCACAAGGTAATTA

a
s	mr.mrrefChr0	27846	15	+	130230	GCCTTACCTAAATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	29385	15	+	636262	GCCTTGCCTAGATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21509	15	+	647215	GCCTTACTTAAATAG

a
s	mr.mrrefChr0	27861	100	+	130230	ATAAACTATAATTATCATGACTTCAGGCATTTCAGCCTTTCTTGTATCCAACAATAGTTGACTATGGCACTTAGATTTTCCAGCTCCGATATGAGGTTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	29403	98	+	636262	ATAAACTATAGTTATCATGACTTCAGGCATTT-AGCCTTTCTTGTCTCCACCAATAGTTGACC-TGGCACTTAGATTTTCCAGCTCCGATATGAGGTTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21524	100	+	647215	ATAAACTATAATTATCATGACTTCAGGCGTTTCCGCCTCTCTTGTACCCAACAGTAGTTGACTACGGCACTTAGATTTTCCAGCTCTGATAAGAGATTCA

a
s	mr.mrrefChr0	27961	63	+	130230	AATATAGCCCAAGATTTGGCTTTACTAGAGAGATGCCAATGATTTCAAAGGGTGTTAAGAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	29503	63	+	636262	AATATAGCCCAAGATTTGGTTGCACTAGAACAATGCCAATGATTTCAAAGGGTCTTAAGAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21624	63	+	647215	AAAATACCCCAAGATTTGGCTTTACAAGAGAGATGCCAATGATTCCAAGGGTTGTTAAGAATA

a
s	mr.mrrefChr0	28024	5	+	130230	GGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	29567	5	+	636262	GGATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21687	5	+	647215	GTATG

a
s	mr.mrrefChr0	28029	102	+	130230	TTGGGTGTTTATCTAATGTGAACAACCTAGACTGTCTGTTGGTCTTTGGCCTTACTGGGGCATAAGACTGGATCTCTTTTTTGATTTATTGGTAGCCAAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	29572	102	+	636262	TTGGGTGTTCATGTAATGTGAACAGCCTAGACTGTCTGTTGGTCTTTGGCCTTACTGGGGCATAAGACTGGATCTCTTTTTTGATTTATTGGTAGCCAAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21807	102	+	647215	TTGGGTGTTTATCTAATGAGAACAACCTAGACTGTACATTTTCCTTTGACCTTACTGTAGCACAAGGCTGGGGCTCTTTTTTGAGTCATTGGTAGCCAAAGT

a
s	mr.mrrefChr0	28131	178	+	130230	GGCAGAGGTTCTTTTTGGACAAAACCAAAGAAAAAACTGAAAAAAGTAAAATCAGGTCCCTTCCAGAATTTTAGACCCGGTTGGTTTGTCACTAGGCTTGAAAGTAGGTCTAAGTGACTCCTTGCATCTAAGAAGTCAGATGAAGAACCACAGTGCTTGTGATTAAGGCACCACCTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	29674	178	+	636262	GGCAGAGGTTCTTTTTGGACAAAACCAAAGAAAAAACTGAACAAAGTAAAATCAGGTCCCTTCCAGAATTTTAGACCCGGTTGGTTTGTCACTAGGCTTGAAAGTAGGTCTAAGTGACTCCTTGCATCTAAGAAGTCAGATGAAGAACCACAGTGCTTGTGATTAAGGCACCACCTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21933	178	+	647215	GGTAAAGAATCTTTTTGGACAAAACCAAAGAAAAAAATGAAAAAAGTAAACTCAGGTCCCTTCCAGAATTTTAGACTGGGTTGGTTTGTCACTAGGCTTGAAAATACGTCTACGTGGCTCCTTACATCTAAGAGGTCAGATGAAGAACCACAATGCTTGTGATTAAGGCACCACCTGA

a
s	mr.mrrefChr0	28309	16	+	130230	TTTGGGAAGGCCCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	29853	16	+	636262	TTTGGGAAGGCCCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22111	16	+	647215	TTTGGGAAGCCCCATT

a
s	mr.mrrefChr0	28325	26	+	130230	ACTGAGTTCCCACCTACTTTTGTTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	29873	26	+	636262	ACAGAGTTCCCACCTACTTTTGTTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22127	26	+	647215	ACTGAGTCCCCACCTACTTTTGTTCC

a
s	mr.mrrefChr0	28351	94	+	130230	ACTTTTTACCAGGCTGCTTGCTTTAGGAGAGTACCTATAAACTTGGTGCTTCCCCATGGTAAGTTTGTATGATAGTCATCAGGGTTACTAGAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	29904	94	+	636262	ACTTTTTACCAGGCTGCTTGCTTTAGGAGAGTACCTATAAACTAGGGGCTTCCCCATGGTAAGTTTATATGATAGTCATCAGGTTTACTAGAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22153	94	+	647215	ACTTTAAACCAAGCTGATTGCTTTAGGAGAGGACCTACGAACTTAGTGCTTCCTCATGGTAAGTCTGTAGAATAGTCATCAGGGTTCCTAGAGA

a
s	mr.mrrefChr0	28445	12	+	130230	TTGTTATAAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	29998	12	+	636262	TTGTTATAAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22255	12	+	647215	TGATTCCAAAGA

a
s	mr.mrrefChr0	28457	86	+	130230	GGATGTTGGGTGTTTATCTGTTAAATGTGAACAGGGTTGCATTATGTGCTTTGTCTTTACTCCTGCTACTGGGGCCTGAGGACTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	30010	86	+	636262	GGATGTTGGGTGTTTATCTGTTAAATGTGAACAGGGTTGCATTATGTGCTTTGTCTTTACTCCTGCTACTGGGGCCTGAGGACTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22274	86	+	647215	AGATGTTGGGTATTTATCTGTTAGATGTGAACAGGGTTGTAATATGTGCTTTCTCTTTAGTCTCACTACTGGGGCCTGAGGACTAG

a
s	mr.mrrefChr0	28543	160	+	130230	GTCTGACTCTTCATACACAGGTGGCCAAAGTGGCAGCAATTCTTTTTGGACAAAACCAAGGAAAAAACTGAAGAAAGTAAAATTGTGTCCTTTGCAGAATATTAGACCCAGTTAGTTAGTCACTAGGCTCAAAAACAGCTATAAGTGGACCTTCTTGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	30096	160	+	636262	GTCTGACTCTTCATACACAGGTGGCCAAAGTGGCAGCAATTCTTTTTGGACAAAACCAAGGAAAAAACTGAAGAAAGTAAAATTGTGTCCTTTGCAGAATATTAGACCCAGTTAGTTAGTCACTAGGCTCAAAAACAGCTATAAGTGGACCTTCTTGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22376	160	+	647215	GTCTGACTCTCCATACATGGGTGGCCAACGTGGCAGCAGTTCTTTTCAGACAAAACAAAGGGAAAAACTGAAGAAAGTAAGATCGTGTCCTTTTCAGAATTTTAGACCCAGCTAGTTAGTAACTAGGCTTGAAAACAGGTATAAGTGGACCTCCTGGCAT

a
s	mr.mrrefChr0	28703	103	+	130230	CTATGAAATCAGATCAAGTAGCATGGTGCTTGTGGTTAAGGCACTACTTGATTTGAGAAGTCCCACCACTAAGTTCCCACTTAATTTTTACTAGACAGGATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	30376	103	+	636262	CTATGAAATCAGATCAAGTAGCATGGTGCTTGTGGTTAAGGCACTACTTGATTTGAGAAGTCCCACCACTAAGTTCCCACTTAATTTTTACTAGACAGGATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22536	103	+	647215	CTATGCAATCAGATCAAGTAGCATTGTGCTTAAGATTAAGGCACAACTTGATCTGAGAAATCCCACCACTAAATTCCCACTTAATTTTTACTAGACAGAATTT

a
s	mr.mrrefChr0	28806	39	+	130230	CACCTTGGGAAAGTATTCACAAATTTGAGGCTTCCCTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	30479	39	+	636262	CACCTTGGGAAAGTATTCACAAATTTGAGGCTTCCCTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22641	39	+	647215	CACCTTAGGTAAGTATCCACAAACATGGGGCTCCCTTGT

a
s	mr.mrrefChr0	28845	33	+	130230	GTAAGTATGTATGTGAGCCATCAATCAGCTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	30519	33	+	636262	GTAAGTCTGTATGCTAGCCATCAATCAGCAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22680	33	+	647215	GTAAGTATGTATGTGGGCCACCAATCAGCTGTA

a
s	mr.mrrefChr0	28878	180	+	130230	TTTAGTCTTCTTAAGGAACAGCTGGTAGTTTGGGGTGTAAGTTTACTCTAATCACTCACTATAAAATGACCAGTGTCCTGTCCCTATGGTTGGCTACTACTCTTGATATACGCAGGATTAACAGCCAAAGGTTAGCCGTTCCATTGGTATGCTATGTCTGTAGCTACAACCTGATACACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	30552	179	+	636262	TTTAGTCTTCGTAAGG-ACAGCTGGCAGTTTAGGGTGTAAGTTCACTCTAATCACTCACTATAAAATGACCAGTGTTCTGTCCCTATGGTTGGCTACTACTCTTGACATACGCAGGATTAACAGCCAAAGGTTAGCCGTTTCATTGGTATGCTAAGTCTGTAGCTACAACCTGATACACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22714	180	+	647215	TTTAGTGTTCTTAAGGAACAATTGGTAGCTCGGGGTGTAAGTTTACTCTAGTCACTCACTATAAAATTACCGGTGTCTTGTCCCTATGCTTGGCTACTACTTATTATATACACAGGATTAACAGCCACAGGTTAGCCCTCCCATTGGTATGCTATGTCTGTAGCTATAACCTGATACACC

a
s	mr.mrrefChr0	29058	26	+	130230	TGTATTATAGGGATATTAGACATCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	30732	26	+	636262	TGTATTATGGGGATATTAGACATCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22894	23	+	647215	TGTATTATAGGGATATTAGACAT---

a
s	mr.mrrefChr0	29084	42	+	130230	CTTGCACCACAAGGTGGTGATGCACCATGAGTCTACTAATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	30759	42	+	636262	CTTGCACTACATGATGGTGATGTACCATGAGTGTACTAATGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22917	42	+	647215	ACTGCACCACAAGGTGGGGGTGCACGATGAGTCTAGTAATGA

a
s	mr.mrrefChr0	29126	28	+	130230	CCAGAGAACTTGAGAAAATGTGGTAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	30898	28	+	636262	CCTGAGAACTTGAGAAAATGTGGTAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22959	27	+	647215	CCAAAGAACTAGAGAAAATGTGGTTGC-

a
s	mr.mrrefChr0	29154	9	+	130230	GTGCCCCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	30927	9	+	636262	GTGCCCCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22986	9	+	647215	GTGCCCCTA

a
s	mr.mrrefChr0	29163	38	+	130230	CAGGCCTTCCCCAATTTCAATTTATATGCTGCTATCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	31028	38	+	636262	CAGGCCTTCCCCAATTTCAATTTATATGCTGCTATTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22995	38	+	647215	CAGGCCTTCCCCAATTTCTATTTATATGCTGCTATCCA

a
s	mr.mrrefChr0	29201	41	+	130230	AGGTTAACATTAAGTTAGTTAGATGTTGCTTGATTTTCAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	31098	41	+	636262	AGGTTAACATTAAGTTAGTTGGATGTTGCTTGATTTTCAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23033	41	+	647215	AGTTTAACACTGAGTTAGTTAGACGTTGCTTGATCCTTAAG

a
s	mr.mrrefChr0	29242	129	+	130230	CTTCTCTCTGCACTTGGATGTGCATATGATCGATGGAACATTTGCCAATCTGCATAAGAGTAATTCTTATATATTCCTGAATAGAGATCATCAGTAGATAAATAGCACCATCCTAGCATCATGGAGAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	31139	119	+	636262	---------GCACCTGGATGTGCATATGATCAATGGAACATTTGCC-TTCTGGGTAAGGGTAATTCTTATATATTCCTGAATAGAGATCATCAGTAGATAAATAGCACCATCCTAGCATCATGGAGAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23090	129	+	647215	CTTCTCTCTGCACTTGGATGTGCATATGCGCGATGGCACAAACGTCAATCTGCATAAGAGTAATTCTTATATATTCATGGTTAGAGATCATCAGTAGATAATTAACAACATTCTAGCATGACAGAGGGC

a
s	mr.mrrefChr0	29371	77	+	130230	CATTAGTACTACGCTTTCTCCTTTTCTTCCCATAAGCTGTGTGTGAGTGCCTGACTTACTTAAGAGTTCTCCCCTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	31258	77	+	636262	CATTAGTACTACGCTTTCTCCTTTTCTTCCCATAAGCTGTGTGTGAGTGCCTGACTTACTTAAGAGTTCTCCCCTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23247	77	+	647215	CATTAGTAGTATGCTTTCTCCTTTTCTTGCCATAAGCTGTATGTCAGTGTTTGACTTACTTAAGAGTTCTCCCTTTC

a
s	mr.mrrefChr0	29448	69	+	130230	CCTGTACCATACCTGTGTGGTATGGGGGATGCCATCCTCTCTTATGAAAAGTAACTTAAAGTCCTGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	31335	69	+	636262	CCTGTACCATACCTGTGTGGTATGGGGGATGCCATCCTCTCTTATGAAAAGTAACTTAAAGTCCTGCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23327	69	+	647215	CCTGCACCATACCAGTGTGGTATGAGAAATGCCATCCTCTCTAATCAAAAGTAACTTAAAGTCTTGTCA

a
s	mr.mrrefChr0	29517	7	+	130230	GATAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	31518	7	+	636262	GATAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23396	7	+	647215	GATATCA

a
s	mr.mrrefChr0	29524	24	+	130230	CACTCCCATAATATTACATTCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	31526	24	+	636262	CACTCCCATAATATTGCATTCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23403	24	+	647215	CACTCACATAATATTACATTCATT

a
s	mr.mrrefChr0	29548	42	+	130230	AAGGTGAATATTAATTATCTCTGTGCATTCATGATAGCACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	31550	42	+	636262	AAGGTGAATATTAATTATCTCTGTGCATTTATGATAGCGCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23429	42	+	647215	AAGGTGAATATTAATTATCTCTGTGCATTCATGGTAGCAATG

a
s	mr.mrrefChr0	29590	44	+	130230	TGGAACTTTTTCTGTGTACCAGCAGGCAACTACACCTATATTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	31592	44	+	636262	TGGAACCTTTTCTGTGTACCAGCAGTCAACTACACTTACATTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23479	41	+	647215	TGCAACTTTTTCTGTGTACCAGCAGGCA---ACACCTATTTTTT

a
s	mr.mrrefChr0	29634	183	+	130230	GGACTCTGCTGCTCAACGGGTCCTTCTACCCATGAGTCGCTCTGTATGTTCCATTGTGGCCTTTACTGTTACACCTTGTGAGGACAAACCACTAGAGGCTTTTATTAAAGTGGTTGTTTGGATGGGTGTGGTCAGAATATTGGTGAAGTTACATTCTAGATATAGTCTTTGTAGGATACCCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	31639	173	+	636262	GGACTCTGCTGCTCAACGGGTCCTTCTACCCATGAGTCGCTCTGTATGTTCCATTGTGGCCTTTATTGATACACCT---------AAACTACTAGAGGCTTTTATTAAAGTGGTTGTTTGGATGGGT-TTGTCAGAATATTGGTGATGTTACATTCTAGATATAGTCTTTGTAGGATTCCCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23520	182	+	647215	GGG-TCTGCTGCTCAATTGATCCCTCTACCCATGACTCACTTTGTATGTTCGATTGTGCCCTTTACTGTTACACCTTGTGAGGACAAGCCACTAGAGGTGTTTATTAATGTTGCTGTTTGGTTGAGTGTGGCCAGAATATTGGTGAAGTTACATGCTAGATAGAGTCTATGTAGGTTACCCCT

a
s	mr.mrrefChr0	29817	93	+	130230	TCAACTAATCCTTTCTAAGAGGCCTACTGAACTCTCCAATGTCGCCATTCTTGTTTTGTTGATAGCCAGTTCCAACCCACTCTGATTTTGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	31812	61	+	636262	TCAACTAATCCTTTCTCAGAGGCATACTGAACTCTCCAATGCCACCATTCTTGTTTTGTTG--------------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23703	93	+	647215	TCAACTAATCGTTTCTAAGGGGCCTACTGGACTCTCCGATGTTGCCATTCTTGTTTTGTTGATAGCCAGTTCCAACCCACTCTGATTTTGATG

a
s	mr.mrrefChr0	29910	19	+	130230	ACTATTCTTAGATGTTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	31873	15	+	636262	----TTCTTAGATGTTGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23798	19	+	647215	ACTACTCTTACATGTTGTA

a
s	mr.mrrefChr0	29929	234	+	130230	TTTTTAAACAGGCTTCTCTTGTACAGCTATACCAACCAGTCACTAACTTGTCAGGTGACTCCAGGGCTGCTAAGGGCTGCATGCCTTTCTAGGCCTGTATCAAGTTATTCAGCGTTACAGATAAAGTAGTATTCCAATTGGAATAGGGGTGGTGTCTGACTCATTTTAGGGGCGAAGAAGTTTGTAGCAAATTTTGAAAAAATGTTAACTTAACCACCAACTATCAATAGAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	31889	234	+	636262	TTTTTAAACAGGCTTCTCTTGTACAGCTATACCAACCAGTCACTAACTTGTCAGGTGACGCCAGGGCTGCTGAGGGCTGTATCCCTTTCTAGGCCTGTATCAAGTCATTTAGGGTTACAGATAAAGTAGTATTCCAATTGGAATAGGGGTGGTGTCTAACTCATTTTAGGGGCGAAGAAGTTTGTAGCAAATTTTGAAAAAATGTTAACTTAACCACCAACCATTAATAGAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23817	220	+	647215	TTTTTAAATAGGCTCCTCTTATACAGCTATATTAATCAGTCACTAACTTGTCAGG-GGCTCAAGGGCTGCTAAGGGCTGCATGCCTTTCTAGGCCTGTATCAAGTTATTCAGCGTCAGAGATAAAGTAGTATACCACTTGGAT-AGAGGTGGAGTCTG---------AGGGGCGAGGAAGTTTGTAACAACTTTTGAAAAAATGTTA---TAACCTCCAACTATCAATAGAGAT

a
s	mr.mrrefChr0	30163	130	+	130230	ATACTGATGTCCTGTCCTAGTCCAAGTCTTGATGCCTAGATAGTGGGTAAAGACAAAATATGGTCACCAAAGGGAACTATATAATGAACCAGTAAATACAGAACATTTGGTATCAGTGTGGAAGTCTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	32124	130	+	636262	ATACTGGTGTCCTGTCCTAGTCCAAGTCTTGATGCCTAGATAGTGGGTAAAAACAAAATATGGTCACCAAAGGGAACTATATAATGAACCAGTGAATACAGAACATTTGGTATCAGTGTGGAAGTCTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	24037	127	+	647215	ATACTGATACTCACTCTTAGTT---GTCTTGAAGTCTAGATTGTGGGTAAAGACAAAATATGGTCACCAAAGGGAACTATATAATGAACCAGTAAATACAGAACATTCGGTATCAGTGTGGAAGTCTGTA

a
s	mr.mrrefChr0	30293	81	+	130230	TCCCAGATTTCATGTATATGACTCAATAGATTATGTTGGGGCTCTTTCCCCATTCGTAGTAGTCAAGGGCTGAAGATCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	32254	67	+	636262	TCCCAGATTTCATGTATA--------------ATGTTGGGGCTCTTTCCCCATTCGTAGTAGTCAAGGGCCGAAGATCATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	24165	81	+	647215	TCCCAGATTTCATGCATATGACTCAATAGATTATGTTGGGGCTCTTTCCCCACTCGTAGTACATAAGGTCTGAAGATGATC

a
s	mr.mrrefChr0	30374	90	+	130230	CATCTCGCAACGATACTTGGAACATGACCTGGTAGTCAGCCCACCTTGAAACAGCAGAGTAAGTATGAGTTACTGACAAACATGACTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	32321	89	+	636262	CATCTCGCAACGATACTTGGAACATGACCT-GTGGTCAGCCCACCTTGAAACAGCAGAGGAAGTATGAATTACTAACAAACATGACTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	24559	90	+	647215	TATCTCGCAAGTCTACTTGGAACACGACCTGGTAGTAACCCCACCTTGCAACAGCAGAGTAAGTCTGAGTTACTGACAAACATGACTCTG

a
s	mr.mrrefChr0	30464	373	+	130230	ATTGATATAACAAGGGCAATTAACGCCAAGCATCAATGAGAAGATGGTCGATGCGGATGATATAAGGCGTTTTTAAATTACAGTAACTGTCACATAGAACGTTAAATCAGGTTTTTCAGCAACACTCTCATATAATAATTCTATGGTGGACAAAAAATGGTTGAGGCCAGATCAGTTACTACAGGTTAATTAAATTCTTAGAATGTTTTAGTGCTCCAATGCTTCATCCTGATTGTTGATGAATACAGGAGCACTATAGGAAAACTTTCACGGAATGCTTAATAGGATATGATAGGCTCCTTTTGTTCCAATTTGAAAATTTACTACCAGTGATGCCTAGTACCATTCTACAGATCGCACAAGAACAAGGCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	32410	373	+	636262	ATTGATATAACAAGGGCAATTAACGCCAAGCATCAATGAGAAGATGGTCGATGCGGATGATATAAGGCGTTTTTAAATTACAGTAACTGTCACATAGAACGTTAAATCAGGTTTTTCAGCAACTCTCTCATATAATAATTCTATGGTGGACAAAAATTGGTTGAGGCCAGATCAGTTACTACAGGTTAATTAAATTCTAAGAATGTTTTAGTGCTCCAATGCTTTAGCCTGGTGGTTGGCAAATACAGGAGCACGCTAGGTAAACTTTCATGGAATGCTTAATAGGATATGATAGGCTCCTTTTGTTCCAATTTGAAAATTTACTACCAGTGATGCCTAGTACCATTCTACAGATCGCACAAGAACAAGGCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	24650	372	+	647215	ATGGGTAGAACACAGGCAAATTAGGCCATGCATTGATGAGAAAATGGTAAACGCAGATGATATAAGATCTTGTTAAAAATCAGTCACTGTCACATAGAGTGTTAAATCAGGTTTCTCAGTCAGACTCTCACATAATAATTCTATGGTGGACAAAAAATGGTTGAGGCCACATCAATTAGTACAGGTTACTTAAATTCTTAGAATGTTTTAGTGCTCAAATGC-TCATCCTGATTATTGATGAATACAGGAGCACTATGGGAAAACTTTCACAGAATGCTTAATAGGATACGATCAGCTCCTTTTGTTCTAATTTGAAGATTTACTACCAGTGCTGCCAAGAACCACCCTACAGATCATACAAGAACAAAGCAC

a
s	mr.mrrefChr0	30837	74	+	130230	AGACATATGCTTAGGGCACTTCCAGGCTATGGCAATCTCTTTCTGTGGTAATTTGAAGCTTCACTACCAGTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	32783	74	+	636262	AGACATATGCTTAGGGCACTTCCAGGCTATGGCAATCTCTTTCTGTGGTAATTTGAAGCTTCACTACCAGTGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	25038	69	+	647215	AGAAATATGCCTAGGGCACTTCCAGGCTATGACAATCTCTTTCTGTGGGGACTTGAAG-----CTACCAGTGGT

a
s	mr.mrrefChr0	30911	79	+	130230	ATTTAATTACTACTCTATGAATAACCCAAGAGCTAAGCGCTCTTAAGTTTACTCCAGTCATATCATTAAAGGCAATTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	32857	78	+	636262	ACTTAATTACTACTCTCTGAATAA-CCAAGAGCTAAGCGCTCTTATGCTGACTCCAGTCATATTATTAAAGGCAATTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	25114	79	+	647215	GTTTAATTACTACTCTATGAATAACCCAAGAGCTAAGCACTCTCAAGTTTACTTCATTCCTGTCATTAAAGGCAATTCC

a
s	mr.mrrefChr0	30990	339	+	130230	AGACTAAGTCACAACACAAATTTGAACAAGGTGGGGTACAAGGGACCTTTTGTTAATTGTCTGATATTGTGTGGATTATTTATATCGTCTTACATCGTTCCTGCTGCCCAATTGCATACCTTTCAGCATAGTAGTCCTTGCTCCCCACTCACATACAAACACACTGGGGCATATATAAATGTAAACTACACTCCACCAAACTAGAAGAGTAATGAGGTGTCTCCACCTTCAATGGGAGCAACTCTACATATGTATGGTATTGCCTATATGCTAGCCACACTACCCCAAAGCAAGGGCGAACTGGTTGTATGAAAGCCTCCTTTTAGTTTCAAGGACTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	32936	331	+	636262	AGACTAAGTCACAACACAAATTTGAACCAGGTGGGGTAGAAGGAACCCTTTGTTAATTGTCTGATATTGTG-GCATTATTTATAT--TCTCACATCGTTACTGCTGCCCAATTGCATACCTTTCAGCATAGCAGTCCTTGCCCACCACTCACATCCAAACACACTGGGGCATATATAAATGTAAACTGCACTCCACCAAACTAGAAGAGAAATGA-----CTCCACCTTTGATGGGAGCAACTCTACATATGTATGGTATTGCCTATAAGCTAGCCACACTACCTCAAAGCCAGGGCGAACTGGTTGTATGAAAGCTTCCTTTTAGTTTCAAGGACTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	25193	327	+	647215	AGACTAAGTCACAACATCAACTTGCACAGGGTGGCATACAAGGGACCTTTTGTTACTTGTCTGATATTGTGTGGGTTATCTGAATCGTCTTACATCATTCCGGCTGCCCAATTGCATATCTTTCAGCATAGTAGTCCCTATTCCCCACTCA-ATACAAACACACTGGGGCATTTAT---------TTACATTCCACCAATCTAGAAGAGTAATGCGGTGTCTCCACCTTCACTGGGAGCAAATCTACATGTGTATGGTATTGCCTATATGCTCTCCACACTGCCCCAAAGTAAGGGCTAACTTGTTGTACGAAAGCCTCCTTTTAGTT--GAGGACTGA

a
s	mr.mrrefChr0	31329	91	+	130230	CAAACATTAAGTAAAAGGGAGTCATTCTGCATTCTATGTACATGTATGTCTATGCACCTAAGTGTACATAGCTGGGCTGCTCCAATATAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	33267	91	+	636262	CAAACATTAAGTATAAGGGAGTCATTCTGCATTCTATGTACAGGTATGTCTATGCACCTAAGTGTACATAGCTGGGTTGCTCCAATATAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	25521	86	+	647215	CAAACCTTAAGCAAAAG-----CACTTTGCATCCTCTCTACATGTATGAATCTGCACCTAGGTGTACATAGCTGGGCTGCTCCAATATAGC

a
s	mr.mrrefChr0	31420	34	+	130230	TCTACCGTTACTCCAATATATCAGTTTATCAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	33360	34	+	636262	TCTACCGTTACTCCAATATATCAGTTTATTAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	25607	34	+	647215	TCTACCGTTACTCCAATATATCAGTATATCAAAT

a
s	mr.mrrefChr0	31454	156	+	130230	CATGCAAAGTGAAATAACACTAAATTGCTGGGTGATTTTCTCAAGACCTAGGGAGTCAAGAGTAAGCGCATTGTGTTTATTTGTAGAGTTCTAAGCCCTGAGTTTACTCTGATTTCCTTACTTTCTAATCTAACCAGCATGAATCCCCTTAGGTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	33394	156	+	636262	CATGCAAAGTGAAATAACACTAAATAGCTGGGTGATTTTCTCAAGACCTAGGGAGTCAAGAGTAAGCACATTGTGTTTATTTGTAGAGTTCTAAGCCCTAAGTTTACTCTGGTTTCCTTACTTTCTAATGTAACCAGTATGAATCCCCTTAGGTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	25643	137	+	647215	CATG----------------TAAATTGCTGGGTGATTATCGCCAAACCTAAGGAGTTGAGAG--ATCGCATTATGTTTCTTTGTAGAGTTCTAAGCCCTGACTTTACTCTCATTTTCTTACTTTCTAATCTAA-CGGCATGAATCCCCTTAGGTCT

a
s	mr.mrrefChr0	31610	196	+	130230	CTCCCTTTTCTTTATTATCTCGTTATCTTTATTAGCTGCTTCCATTCATCCCAGCTGAACTGCACATCTCTTCAACTGACTTAAGACTCCTACTAACCTGTGGGCCCAGAAGTCACTCTAAGACTAGTGAACTTACTATCAGGATTATCCTCAAGACTTAATAACAGGCTCCTTTCCATAGCCCTCCAAATGGCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	33551	196	+	636262	CCCCCTTTTCTTTATTATCTCGTTATCTTTATTAGCTGCTTCCATTCATCCCAGTTGATCTGCACAGCTCTTCAACTGGCTTAAGACTCCTACTAACCTATGGGCCAAGAAGTCACTCTAAGACTAGTGAACTTACTATCAGGATTATCCTCAAGACTTAATAACAGGCTCCTTTATATAGCCCTCCAAATGGCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	25780	186	+	647215	CTCCCTTTTCTTTGTTAACTAGTTATCTTTATTAGGTGGTTCCATTCATCCCAGCTCAACTGCAAATCTCTTCAACTGACTTAAGATTCCTACTAACCTGCGGGCCCAGAAGCCACTCTAAGACTAGTGAATTTATTACCAGGATTATCCTCAAGGCTGAATAACAGGCTCCTTTCCAT-GCCCTCC---------

a
s	mr.mrrefChr0	31806	102	+	130230	GATGAACTACTGCCCAACCAGATCAAGACTCCTAGTGAAACCTTGCCTCTCATCTCAGTAGGGTTGCTGAAGACACCACCACAAGTGATACTATAGTTATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	33752	102	+	636262	GATGAACTACTGCCCAACCAGACCAAGACTCCTGGAGAAACCTTGCCTATCATCCCAGTAGGGTTGCTGAAGACACCACCATGAGTGTTACTATAGTTATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	25966	85	+	647215	----------------ACCTGATCAAGACTCCCAATGGCACCTTGCCTCTTATCTCTGT-GGGTTGTTGAAAACACTACCACAAGTGATACTCTAGTTATTA

a
s	mr.mrrefChr0	31908	28	+	130230	AGATGTACTTTCAGATATGAACTGCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	33855	28	+	636262	AGATGTATTTTTAGATATGAACTGCTTT
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a
s	mr.mrrefChr0	31936	43	+	130230	TTTGAATCTGGACTACTAGACCCTTCTTTAGTGCTTCATGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	33888	43	+	636262	TTTGAATCTGGACTACTAGACCCTTCTTTAGCGCTTCATGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26079	33	+	647215	----------GGCTACTACACCCTTCTTTAGTGCTTCatggac

a
s	mr.mrrefChr0	31979	158	+	130230	GTACATTCACTGTGATTAGCCTTAGGCTCTCATACATTGAGTGGTGGCACCCAGCTGGTTGAACATGATCACCTATGACACATTTCACTCTGTGAGATAGTGGTATGACATATCACAGGGGCTGGCTTGGGAGTCAATGTGGCTCCTTGTCCCGCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	33931	158	+	636262	GTACATTCACTATGATTAGCCTTAGGCTCTCATACATTGAGTGGTGGCACCCAGCTCGTTGAACATGATAACCTATGACACATTTCACCCTGTGAGATAGTGGTATGACATATCACAGGGGCTGGCTTGGGAGTCAATGTGGCTCCTTGTCCCGCAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	156489	154	+	647215	GTACATTCACTGTGTTTAGCTTTAGGCTCTCATACATTGAGTGGTGGCACCCAGCTGGTTGAACATGGTCACCTATGACACATTTAACTCTGTGAGATAGTGGTATGAC----CACAGAGGCTAACCAGGGAGTCAATCTGGCTCCTTGTCCAGCAGA

a
s	mr.mrrefChr0	32137	2	+	130230	tc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	34089	2	+	636262	TC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26173	2	+	647215	cc

a
s	mr.mrrefChr0	32139	20	+	130230	aagcactaggggagtagcaa
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	34091	20	+	636262	AAGCACTAGGGGAGTAGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26192	20	+	647215	gagcactaggggggtaggaa

a
s	mr.mrrefChr0	32159	31	+	130230	ttttaacgtatggacactaatcagccactCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	34115	31	+	636262	TTTTAACGTATGGACACTAATCAGCCACTCA
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a
s	mr.mrrefChr0	32190	9	+	130230	AATAGTTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	34146	9	+	636262	AATAGTTCA
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a
s	mr.mrrefChr0	32199	27	+	130230	GGATTTGCAATCCAGTTGAGTGCTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	34155	27	+	636262	GGATTTGCAATCCAGTTGAGTGCTATT
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a
s	mr.mrrefChr0	32226	61	+	130230	AAACTTGTCTTGTCTCATGAGTCCCCTTGCATAATTTTTCCATGACAGAGTAAATATCTAT
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a
s	mr.mrrefChr0	32287	246	+	130230	ATTTTGTTGTAGGGAACCTACTTAATTGGAAAGTCATTATGGATAGTTAGTGTTGCTGTGTGTGTGGCTTACACCCTCATCTACTAATTATGATAGGTGGAGATACAATAATATAGAATCCAAGCTTGAGAGGAAAGGTTTCAATAGGTCAAGAGCAATACCAAATTGTCATACACTGTGATGTGGATTATCTCTGCTTTCATCATGTACATTTATAAACTCACTTGTCCTTTTGCAGTGCCCGTG
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a
s	mr.mrrefChr0	32533	96	+	130230	CTACTCCTATTAACTTACATTCCTTATTTCCCTCTAATTTTTCACTCATTGCCCCCATCTCAGTCAAAATACTGCTGGACCCCTCTCCAATTCCCT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	26588	96	+	647215	CTACTCCTATTACAGTACATTCCTTGTTCTCCCCTAATTTTTCACTCATTGCCCCCATCTCAGTCAAAATACTGCTGGACCCCTCTCCAAGTCCCT

a
s	mr.mrrefChr0	32629	66	+	130230	GAATTTGCAGAAAGTTGGCCCCAATATCGCTATTACATTGCAAATTGTTATGACAAAGATAGCTCC
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a
s	mr.mrrefChr0	32695	17	+	130230	CAGTCCTAGAGTAACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	34699	17	+	636262	CAGTCCTTGAGTAACAT
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a
s	mr.mrrefChr0	32712	54	+	130230	GTTGTGGGCAATGCCTGCTGTCCAGTGATCTTGACATCAACAGTTCTTACGGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	34716	54	+	636262	GTTGTGGAGAACACCTCCTGTCCAGTGATCTCGACATCAACAGTTCTTACAGGA
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a
s	mr.mrrefChr0	32766	81	+	130230	GCACTTGTTGCCATTGGGAGGAAGGTATCATCAGATTAACAAGTTAATTCCCCAGGGCCAGAGGCTATAAATGGTGGTAGA
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a
s	mr.mrrefChr0	32847	189	+	130230	CTGAAGAGAAGTTCATATGTTGCACATCATCTGTACCTATGCTCAACTGCACCTTTCCTGGAATTCCATTTTGAAGTGAAGTGCTGGATTTTTTGAAATGCTGCTCACTAATCAAGATTAACAATTCAGAATAAGTTTCTACTTGTATAATAGGTTTCTCAGCTAGCTCAGTATTTCATTTCCATCTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	34851	185	+	636262	CTGAAGAGAAGTTCATGTGTTGCACATCATCTGTACCTATGCTCAAATGCACCTTTCCTGGAATTCCATTTTGAAGTGATGTGCTGGATTTTTTGAAATGCTG----CTAATAAAGATTAACAATTCAGAATAAGTTTCTACTCATATAATAGGTTTCTCAGCTAGCTCAGTATTTCATTTCCATCTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26890	189	+	647215	ACAAAGAGAAGTTCATATGAAGCACATCATTTGAATCTATGTTCGACTGCATCTCTCCTGGGATCCCATTTTTAAGTGAAGTGTCGGATTTTTTGAAAACCTGCTCACTAATCAAGATGAACAACTCAGAATAAGTTTCTACTTGCATAATCGGTTTGTCAACTCGCTTAGTATCTCATTTCCATCTAG

a
s	mr.mrrefChr0	33036	237	+	130230	TAAATTTAGATTTTGTTAGAAAGGTCACTAAATCTTAATGGCAACAAGTGGCACTGTTGGACTCCCATGTGAATCTAGAACAAGCCACTCACCGCTAAACAAAGGGATCATAGGAGCAAAGAGGGTTTCCTTGAATGGGCTCAAACAGCATTTGCGTCAAATGATTCACTCACAAAATAGACTTTGAATGTGTCACGAGACTTTTAACTTGAAGTCCAATCAAGGATAACTGACAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	35036	209	+	636262	TAAATCTAGATTTTGTTAGAAAGGTCACTAAATCTTAATGGCAACAAGTGGCACTGTTGGACTCCCATGTGAATCTAGAACAAGCCACTCACCGCTAAACAAAGGGATCATAGGAGCAAAGGGGGTTTCCTGGAATGGGCTCAAACAGCACTTGCGTCAAATGATTCACTCACAAAATAGACTTTGAATGTGTCATGAGACTTTTAACT----------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	27099	236	+	647215	TAAATTTAGATTTTGTCAGAAAGGTCACTAAACCTTAACGGCGACAAGTGGTAATGTTGCACTACTATATGACTCTAGAACAAGCCACTCACTCCTAAACAAAGGGACCATCGGTGCAAAGAGAGTTTCCTTGAATGTGATTAAACAGTATTTGTGTCAAATGA-TCACTCACAAAATAGACTTTGAATGTGTCACGAGACTTTTAACCTGAAGTCCAATCAAGGATAACTGACAGT

a
s	mr.mrrefChr0	33273	101	+	130230	CGTTGGTCTAGGGGACATTAGTTTGCAACCTTGTTTAACGAACCCCCAACTAATTGAACTGGAATACTAAGATGGATTCCTCTGAACAAGGAGACATGCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	35245	101	+	636262	CGTTGGTCTAGGGGACATTAGTTTGCAACCTTGTTTAACGAACCCCCAACTAATTGAACTGGAATACTAAGATGGATTCCTCTGAACAAGGAGACATGCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	27556	101	+	647215	CGTTGGTCTGGGGGACATTAGATTGCAACCTTGTTTAATGAACCTCCAACTAATTGAACTGGAGCACTAAGATGGATTCCCCTGAACAAGGAGACATGCTA

a
s	mr.mrrefChr0	33374	81	+	130230	GATCCTTGCCAGCCTAACAAGAGGACAGTACCACACCCCCTGCTAATAATGGGACTGAATCAACTATAATCAACTATTGGC
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a
s	mr.mrrefChr0	33455	150	+	130230	AATAAGTGATATCATAATTTTGTATAATTGATTAACAATCTTCTTACAGCTATAACAAGTTCCACAACACAATGATAGCAAAAGTACCCAGGGTAATAAGTAACCATATGATAAAGCTCAAGAACTTAACCATTGCACACTCTTCCAGTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	27743	150	+	647215	AATAAGTGATATCATAATTTTATATAATTGAGAAACAATCTTCTTACAGGTATAACAAGTTCCACAACACCATTATAGCAAAAGTACCCAGGGCAATAAGTAACCATATGATAAATCTCAAGAATCTAACCATTGCACACTCTTCCAGTT

a
s	mr.mrrefChr0	33605	211	+	130230	AAAGCCTGTGTATGATGAATTACAAATCCTACAAAGGACAAAAGATTCTCTCGCCTGTGAGAACAACCCCTACAGGGTTTTAGCCCCTGAAGCTTTAGACTGTGCCTACCCTTATTATGAACAGAAAGTGCACACTCTGTTCACCTTAACTTAGGGCAGCATGAGATCATGTTAATTGCTCATAAAAGATGTATTGACAATTTGAGGGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	35589	206	+	636262	AAAGCCTGTGTATGATGAATTACAAATCCTCCAAAGTACAAAAGATTCTCTCGCCTGTGAGAACAACCACTACAGGGTTTTAGCCCCTGAAGCTTTAGACTCTGTGTTCCCTTTTTATGAACAGAAAGTGCACACTCTG-----CTTGACTTAGGGCAACATGAAATTATGTTAATTGCTCGTAAAAGATGTATTGGCAATTTGAGGGTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	27893	211	+	647215	AAAGCCTGTGTATGATGAGTTACAAATCCTACAAAGGACAAAAGATTCTCCTGCCTGTGAGAACAACCCCTGCAGGGTTTTAGCCCCTGGGTCATTAGGCTGTGCCAACCCTGATTATGAACAGAAAGTGCACACTCTGTTCACCTTAGTTTAGGGCAGCCTGAGATCATGTTAGTTGCTCATAAAAGATGTATTGACAATTTGAGGACGT

a
s	mr.mrrefChr0	33816	481	+	130230	ATTCTTGCTTTATGTGGTTGCCATCCATCTCAATGTCATACTTCCATCAGCATGTGGCCTGTCCTCAGCCCTTTATCTCTATGCCCAAAGCTCCAAACCCAATTTTTGCAGCTACACTACACCTACAAGCTACAACCTTAGTGAATACTCTGCATGGCCACTACATGTTATGTCACATTCACCAGCTATGGATACTTTACAGAGTGATCAAGAGCAATGGGGTACAAAGTGGAATGCACACTCAATTAAGACAAAGAATGTAAAGAGAATGTATACACAGGGTGTCTACATAGTCAATGATCTTGCTCTTGTTGCTTGGTCTTCGTTGCTTGCTCTTGTTGACAGTCACATTACATCTGAACAACGTATACTGGTGCTTCAAAGTACACTCCCCTAGGTAGATAAATAGGCTGCACACTGGAAGGCCATGAAAGTCCATGACAATTACTGCTAGTAGCTAGTAACTTTCTAGAGAAAGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	35796	467	+	636262	ATTCTTGCTTTATGTGGTTGCCATCCATCTCAATGTAATACTCCCATCAGCGTGTGGCCTGTCCTGAGCCCTTTATCTCTATGCCCAAGGCTCCAAACCCAATTTTTGCATCTACAC------------CTACAACCTTAGTGAATCCTCTACATGGCCACTACATGTTATGTAACAT--ACCAGCTATGGATACTTTACAAAGTGACCAAGAGCAATGGGGTACAAAGTGGAATGCACACTCAGTTAAGCCAAAGAATGTAAAGAGAATGTGTACACAGGATGTCTACATAGTCAATCATCTTGCTCTTTTTGCTTGGTCTTCGTTGCTTGCTCTTGTTGACAGTCACATTACATCTGAACAACGCATACCGGTACTTCAAGGCACACTCCCCTAGGTAGATAAACGGGCTGCAGACTGGAAGGCAATGAAAATCCATGACAATTTCTGCTAGTAGCTAGCAACTTTCTAGAGAAAGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	28104	477	+	647215	ATTCTTGCTTTATGTGGTTGCCATCCATGTCAGTCTCATATCTACATCAGCATGTGGTCTGTCCTCAGCCCTTTCTCTCTATGCCCAAAGCTCAAAACCCAATTTTTGCAGCTACACTACACCTACAAGCTATAACCTTAGTGAATACTCTGCATGGCCACTACATGTTATGTCACATTCACCAGCTATGGATGGTTGGCTGAGTGGTCAAGAGTAATGGGGCAGAAAATGAAATGCACTCTAAATTAAAACAACGAATGTAAAGAGAATGTACACATAGGGTGTCTACATAGTCAATGTTTTTGCTCTTGTTGCTTGTTCTTTATTACTTGCTCTTGTTGACAGTCATATTAAATCTGAACAACGTATACTGATGCTTCAAAGTACACTTCTCTAGGTAGAT---TAGGCTGCACACTGGAAGG-CATGAAAGCCTGTGACAATTACTGCTCATTACTAGTAACTTTCTAGAGAAAGGTG

a
s	mr.mrrefChr0	34297	105	+	130230	TTGGAGGATTGGACACACTGGTGGTTATGACAAGCTATTGAGGCCAGCATTGAAACAGAAGCAATTGATAGTCCAAACATGTGACATTAACATTGTTTAGATTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	36263	102	+	636262	TTGGAGGATTGGACACACTGGTGGTT---ACAAGCCATCGAGGCCAGCATTGAAACAGAAGCAATTGACAGTCTAAACATGTGACATTAACATTGTTTAGATTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	28589	105	+	647215	GTGGAGGATTGGACACACTGGTGGGCATGATAAGCTGTTGAGGCCAGCATTGAAACAGAAGAAATTGATGGTCCAAACATGTGACATTAACATTGTTTAGATTTT

a
s	mr.mrrefChr0	34402	37	+	130230	ATGACGCACTGTCAAGCAATCACATGCACCTGTAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	36371	37	+	636262	ATGACGCACTGTCAAGCAATCACATGCACCTGTAGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	28694	37	+	647215	GTGATGCACTGTCAAGCAATCACAGGCACCCTTAGAA

a
s	mr.mrrefChr0	34439	30	+	130230	GCGCCTGCTTGCCTCATGTAAGAGGTTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	36408	30	+	636262	GCGCCTGCTTGCCTCATGTAAGAGGTTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	28732	30	+	647215	GAGCCTGCTTGCCTCATGCCAGAGATTTGT

a
s	mr.mrrefChr0	34469	77	+	130230	CATGTAACTCGCTGTGTATATTCTAGATCCCCTGTCCAACTCGCACACTGTTGAGTGATCATAGGCAGTTGTAGAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	36438	77	+	636262	CATGTAACTCGCTGTGTATATTCTAGATCCCCTGTCCAACTCGCACACTGTTGAGTGATCATAGGCAGTTGTAGAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	28764	77	+	647215	CATGCAGCTCCCTGTGTATATTCTAGATCCCCTGTCTAACTTGCATGGTGTTGAGTGATCACAGGAAACTGTAGAAG

a
s	mr.mrrefChr0	34546	37	+	130230	ACTCAGTACCCTTCACCTGTGGAAGAAGCCTGGATGA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	28842	37	+	647215	ACTCAGTGCCCTTCATCTGTGGCAGGAGCCTGCCTGA

a
s	mr.mrrefChr0	34583	143	+	130230	CCGAACAACCTTAATGTACCAATAGTAAAGGCACATAAAAAGCAAGCTAGTCGGCCTGTCTAACTAGCCAAGTTTTTAGACCAAACATGATGTCCCCTTATGACCAATCACTAATCTTTCATTCATATTAGGAGCAATTAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	36558	143	+	636262	CCGAACAACCTTAATGTACCAATAGTAAAGGCACATAAAAAGCAAGCTAGTCGGCCTGTCTAACTAGCCAAGTTTTTAGACCAAACATGATGTCCCCTTATGATCAATCACAAATCTTTCATTCATATTAGGAGCAATTAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	28879	143	+	647215	CCAAACAACCTTAATGTACCAATAGGAAAGGCACATAAAAAGCAAGCTAGTCAGCCTGTCTAACTAGCCAAGTTCTTAGGACAATCATGATGTCCCATCATGACCAATCACTAATCTTTAACTCATGTTAGGAGCAATTAACT

a
s	mr.mrrefChr0	34726	603	+	130230	ATGTTAGCAGCAATTTGGTGACTTATGAGGCTACTACTGGTGTCTCTGGACATGCAATATCACACTTTGCACACATGTCTTTATTTGCAGTAACAACAAACAATCTTGATATATTTCTAATTGGCCAGATCAGCACATGAATTATTCAAACCAATGGTGGTTTTGAAAAATGAATGCATCTCACATGCATTTGACATGAgattgatttctattaacatgccTGTACATCAGTGTCATCTACATATGGGGTGACGATGTTGTTAATGGTTATTCAAATAAAACTTCAAATCTGCAACTGACATAAAGTGCTTCCTCATTTCACACTACCATGTAGCCTGTTGATGTGTACCCCCCCAGGTTCACTCATTCAATATGTTCCCACACTCATCTAGCCCAATTTCCTGAGTTGGATTATACTTGAGGAAAGCCCTAGAAAATTTCCAACCTTCAATGACAAAATGGCATGATCCTTCTGGCAAAAAGTCTTAGTACACTCATAATAATTTCCCTAACCACCTCTGCAGTTCACTTCTAGGGGCTATGTGCACAGCCCAGTCGCAGGATCGATGGAGGATCTCATGATAGCTATTGTGTATCTAGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	36701	572	+	636262	ATGTTAGCAGCAACTTGGTGACTTATGAGGCTACTACTGGTGACTCTGGACATGCAATATCATACTTTGCACACATGTCTTTATTTGCAGTAACAACAAACAATCTTGACATATTTCTAATTGGCCAGATCAGCACATGAATTACTCACACCAATGGTGGTTTTGAAAAATGAATGCATCTCACATGCATTTGACATGA----------------------TGTACATCAGTGGTATCTACATACGGGGTGACGATGTTGTTAATGGTTATTCAAATAAAACTTTAAATCTACCACTGACATAAAGTGCTTCCTCATTTCACACTACCATATAGCCTGTTGACACGTACCCCCCCAGGTTCACTCATTCAATATGCTCCCTCAACCATCTAGCCCAATTTCCTGAGTTGGATTATACTTGAGGAAAGCCCTAGAAAATTTCCAACCTTCAATGACAAAATGGCATGATCCTTCTG-CAAAAAGTCTTAGTACACTCATAATAATTTCCCTAA--------GCAGTGCACTTATATGGGCTATGTGCACAGCCCAGTCACAGGATCGATAGAGGATCTCCTGGTAGTTATTGTGTATCTAGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29023	602	+	647215	AAGTTAGCAGCAATTTGGTGACTTATGAGGCTACTACTGGTGTCTCTAGACATGCAATGTCACACATTGCACACATGTCTTTATCTGCAGTAACAACAAACAATCTTTGTATATTTCTAATTGGCCAGATGAGCACATGAATTATTCAAAACAGTGGTGGTTTCCAACAATGAATGCACGTCACATACATTTGACATGAGATTGATTTCTATTAACATGCCTATACATCAGTGTCATCTACATATGCGGAGAGGATGTTGTTAA-GGTTATTCAGATGAAACTCCAAATCTGCAACTGACATAAAGTGCTTCGCCATTTCATACTACCATGTAGCCTGTTGATGTGTACCCCTCCAGGTTCAGTCATTCAATATGTTCCAATACTCATCTAGCCCAATTTCCTGAGTTGGATTATACTTGCGAAAAGCCCTAGAAAATTTCTGACCTTTAATGACAAAATGGCATGATCCTTCTGGCAAAAAGTCTCAGTACACTCACAATAATTTCCCTAGCCACCTCTGCAGTTCACTTCTAGGGGCTCTGTGCACAGCCAAGTCGCAGGATCCATGGAAGATCTCATGATAGCTATTGTCTATCTAGCAT

a
s	mr.mrrefChr0	35329	15	+	130230	TGAGCACCTTATTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	37291	15	+	636262	TGAGCACCATATTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29625	15	+	647215	TGAGCACCTTGTTCT

a
s	mr.mrrefChr0	35344	63	+	130230	TTAGGAAAACCACAGCTCTGATAGGGGGTCAATTAGGAAAACGGCAGTTCCACTTGATTGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	37306	40	+	636262	-----------------------GGGGGTCAATTAGGAAAACGGCAGCTCCACTTGATTGGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29649	63	+	647215	TTAGGAAAACCACAGCTCTGATAGGGGGTCAATTAGGAAAACCGCAGTTCCGCTAGATTAGCA

a
s	mr.mrrefChr0	35407	34	+	130230	GTAAGAGTAAGTGGTGAAACTAATAGTGACATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	37346	34	+	636262	GTAAGAGTAAGTGGTGAAACTAGTAGTGACATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29718	34	+	647215	GTAAGAGTAAGTGGTGAAACTAATAGTGACAAAA

a
s	mr.mrrefChr0	35441	69	+	130230	CAATTACATATTCGGTCATATGTAGCCCAAACTTTTTTAACAATCAATCTTTTGAAGAATATTTACATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	37553	69	+	636262	CAATTACATATTCGGTCATATGTAGCCCAAACTTTGTTAACAATCAATCTTTTGGAGAGTATTTACATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29752	69	+	647215	CAATTACATATTCCGTCATATGTAGCCCAAACTTTTTCAACAATTAATCTTTTGAAGAATAATTACATG

a
s	mr.mrrefChr0	35510	83	+	130230	CCTCTATATTGCACTGTCTACTTTTCAGTTGATTTGCTGAGTGGCATTAGCATATGTAGTACCATTTACTTTGTAATCAATAC
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a
s	mr.mrrefChr0	35593	15	+	130230	GCTGAGTGGCCTAAG
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a
s	mr.mrrefChr0	35608	16	+	130230	GCTTGAATATGAACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	37722	16	+	636262	GCTTGAATATGAACAT
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a
s	mr.mrrefChr0	35624	19	+	130230	GGGTAATAAAATATTGTAC
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a
s	mr.mrrefChr0	35643	202	+	130230	ATGATGCATGAATGAGGTTCATATCTGCATATCATCTGCGTATTAATACAAAGGCTGATGTACACAACACCTTGAAAGTTGTGAACATCATGAAGCCTGAAAGGATGTCAGTCCAGTTTTGAGTATCAGGTGATAGATAGCCTGTTTTATGGGGTGAAGGGTGTTGAGTCCTTCTGCACGTGCCCGTGATCACTTGTCACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	37766	202	+	636262	ATGATGCATGAATGAGGTTCATATCTGCATATCATCTGCGTATTAATACAAAGGCTGATGTACACAACACCTTGAAAGTTGTGAACATCATGAAGCCTGAAAGGATGTCAGTCCAGTTTTGAGTATCAGGTGATAGATAGCCTGTTTTATGGGGTGAAGGGTGTTGAGTCCTTCTGCACGTGCCCGTGATCACTTGTCACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29958	202	+	647215	ACTATGCATTAAAGAGGTTCATATCTCCATAGGATCTGCGTATTAATACAGAGGTTGATGTACACGACACCCTGAAAGTTGTGAACATCATGAAGCCTGAATGGATGTTAGTCCAATTATGAATGTCAGGTGATAGATAGCATGTTTTGCAGGGTGAAGGGTGTTGGGTCGTTCTGCACATGCCTATGATCATTTGTCACCA

a
s	mr.mrrefChr0	35845	30	+	130230	TGAGGCGGGCAGACCCCTTCTAGAGGTGCC
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a
s	mr.mrrefChr0	35875	28	+	130230	TGATTGTTTCACATCATGTGAAGCAGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	38000	28	+	636262	TGATTGTTTCACATCATGTGAAGCAGGG
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a
s	mr.mrrefChr0	35903	60	+	130230	AGGCTCAGCAGCCTGGTACTAACTGTGCCTGCATGACCATGCTTGCCTTTTAATGGAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	38029	60	+	636262	AGGCTCAGCAGCCTGGTACTAACTGTGCCTGCATGACCATGCTTGCCTTTTAATGGAGCT
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a
s	mr.mrrefChr0	35963	5	+	130230	CATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	38092	5	+	636262	CATGA
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a
s	mr.mrrefChr0	35968	43	+	130230	TACTGTATGAAATCTGAACAAGGTAAAGCATAACCCATTTCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	38099	43	+	636262	TACTGTATGAAATCTGAACAAGGTAAAGCATAACCCATTTCAA
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a
s	mr.mrrefChr0	36011	60	+	130230	CATATTCTGATCCCCTCTGAGATACCTCAATATTTTCCACTTTTTGGTTTAATGGGTATG
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a
s	mr.mrrefChr0	36071	36	+	130230	TGGGAGGGTATCTTAGTCTAATAACTTGTCCTAGTG
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a
s	mr.mrrefChr0	36107	20	+	130230	ATTTTCAAGGTTATATATCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	38241	20	+	636262	ATTTTCAAGGTTATATATCC
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a
s	mr.mrrefChr0	36127	23	+	130230	CACACTATCTGAGGTGCCCACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	38265	23	+	636262	CACACTATCTGAGGTGCCCACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	30444	23	+	647215	CACACCATTTGAAGTTCCCACTT

a
s	mr.mrrefChr0	36150	15	+	130230	ATTACCACCAGCTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	38288	15	+	636262	ATTACCACCAGCTCC
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a
s	mr.mrrefChr0	36165	236	+	130230	TAAAGTGTGAGTTTTAACTCTTCACTTTGCCTAATCAATAACTGAGTATGTTCCTTTCTTATCTCATCACAATCTTATCCTCTGGGTAGCATTCCTGAGGTCTATAACACATTATACCCAGACCAGAAACAATTCAAGTGAGAACATAGGCAACTGAACCAGTTAGTTCAGATAACCAGAACTTGCTAGCTTTAATGTACTTGATCCATTTTCTCATAAATGAAAGGATAACAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	38303	236	+	636262	TAAAGTGTGAGTTTTAACTCTTCACTTTGCCTAATCAATAACTGAGTATGTTCCTTTCTTATCTCATCACAATCTTATCCTCTGGGTAGCATTCCTGAGGTCTATAACACATTATACCCAGACCAGAAACAATTCAAGTGAGAACATAGGCAACTGAACCAGTTAGTTCAGATAACCAGAACTTGCTAGCTTTAATGTACTTGATCCATTTTCTCATAAATGAAAGGATAACAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	30499	236	+	647215	TAAAGTGTGAGTTTCAACTCCACACTTTGTCTAATCAATAACTGAAAATGCTCCTTACTTTTCTCATTACAACCTTATCCTCTGGGTAGCACTCCTGAGGCCTATATCACATTATACACAGACCAGAAACCATTCAAGGGAGAACATAAGTGACTGAACCAGTGAGTTAAGATAATTAAAACTTGCTAGCTCTATTGTCCTTGATTCATTTTCTCGTAGTCGAAAGGATAACAGAT

a
s	mr.mrrefChr0	36401	63	+	130230	ATTCATTTATGCTCAATTTGGTATGCACTTGCACAAACCACTTGAGATGAAAACAATTTACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	38539	63	+	636262	ATTCATTTATGCTCAATTTGGTATGCACTTGCACAAACCACTTGAGATGAAAACAATTTACAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	30738	63	+	647215	ATTCATTTATGTTCAATTTGGTGTGCAATGGTATAAACCACTTAAGATGAACACAATTTACAT

a
s	mr.mrrefChr0	36464	9	+	130230	CACCATTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	38602	9	+	636262	CACCATTGT
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a
s	mr.mrrefChr0	36473	34	+	130230	TAAATATTGGGGCTCACACACCTCAAGGTCTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	38616	34	+	636262	TAAATATTGGGGCTCACACACCTCAAGGTCTTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	30811	34	+	647215	CAAATATCGGAGCTTATGCACCTTAATGGTTTCT

a
s	mr.mrrefChr0	36507	48	+	130230	GCAAGATGGCAGGTCCAGTCCTTTTATGAGCAGTATGATAGGCCCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	38655	48	+	636262	GCAAGATGGCAGGTCCAGTCCTTTTATGAGCAGTATGATAGGCCCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	30845	48	+	647215	GCCAGATGGCAGGTCCAGTCCTCTTATGATCAGTCTGGCAGGCCCATT

a
s	mr.mrrefChr0	36555	56	+	130230	ATCTTAATCCTACACAAACCTGCATAGTTGACTTTTATGTTTAACTAGTCCTGAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	38738	56	+	636262	ATCTTAATCCTACACAAACCTGCATAGTTGACTTTTATGTTTAACTAGTCCTGAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	30893	56	+	647215	ACATTAATCCTACAATGAACTGTGTAGTTGACTTTTATGTTTAACTACTCCTGAAC

a
s	mr.mrrefChr0	36611	63	+	130230	CAGTTCACAGCCTTTTGAGTTGGTATAAATGTCCATGGACATCATATGGCCTCTGGATGCCCC
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a
s	mr.mrrefChr0	36674	33	+	130230	CAGACAGTTGTGTGAGGACACAATATTGTGATC
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a
s	mr.mrrefChr0	36707	144	+	130230	AAAAGCATTTGTCACACATGAACCCAGCCTGAATTGGATTGATTGTGTCAATCATACCCTGGCCAAGTATGGGAGGGAATTGGTGATCAGGTTGACATATACTCTGTTACCCAAAAGCAAGACATCAGTCCACCATTTGTCATA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	31160	144	+	647215	AAGAGCATCTGTCACACATGGACCGAGCCTGAATTGGATTGATTGTGCCAATAATCCCCTGGCCAAGTACAAGAGGAAATTGTTGGTCAGGTTGACATATACTCTGTTACCCAAGAGCAAGACATCAGTCCACCATTTGTCATC

a
s	mr.mrrefChr0	36851	255	+	130230	TATTAAGCAGGCTTTGTTAAGGAGCATCAACAGGTACTAGATACCTCCTTGCCACCTGCCTCCTTGCACAGGGCTGCGGAGAGAAGATATGATGTGGTAATGGTGTTGGGGTAGTGAGATTGAGATAGTAGTGTGCATGGTATATCACCTTACTGGACTGTTTCTTACATTGGTATAATGGAGTAGTCCAAGGGAACAAGGACAAGTTCCAGGAGGAATGGTGGACATTCCAATTTTCCCTAGATTAGTTAAGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	39046	255	+	636262	TACTAAGCAGGCTTTGTTGAGGAGCATGAACAGGTACTAGATACCTCCTTGCCACCTGCCTCCTCGCACAGGGTTGCGGAGAGAAGATATGATGTGGTAACGGTGTAGGGGTAGTGAGATTGGGATAGTAGTGTGCATGGTATATCACCTTACTGGACTGTTTCTTACATTGGTATAATGGAGTAGTCCAAAGGAACAACGACAAGTTCCAGGAGCAATGGTGGACATTCTAATTTTCCCTAGATTAGTTAAGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	31311	255	+	647215	CATTTGTCACTTATTGTTAAGGAGGAACAGCAGGTACTAGCTACCTGCCTGCTGCCTGCTTCCTTGCACAGGGCTGAGGAGAGAAGATGTGATGGGGTAATGGTGGTGGGGTAGCAAGATTGAGCTAGTAGTGTGCATCGTATATGACCTTACTAAACTGTTTCTGACATTGGTATAATGGAGTAGTCCACGGGAACAAGGAAAAGTTCCAGAGGGAATGGTGGACGGTCCAATTTTCCCTAGATTAGTTAACAC

a
s	mr.mrrefChr0	37106	51	+	130230	TACAAAGAGATACGAATGTGTTGATGTTAAAAAGTTCCAACTTCTGCCTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	39301	51	+	636262	TACAAAGAGATACGAATGTGTTGATGTTAAAAAGTTCCAACTTCTGCCTGA
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a
s	mr.mrrefChr0	37157	367	+	130230	TATCTATTAGAGGAGTTATTACATTACCATAACTAGAGAAGCCTTGTATGAAGCGGAAGGCACAGACTCCACACACCCTATTGGCAGACCAGAACTTTTATCTGGTTGGTTGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTATATTGAAACAGGTAGAACCCAGATCGCAGTTAGGCGCATGAATCTGTGAGAGCAGCAGGGCCTTTGCTATCCCTTCGCAATTCAGATGGAATAGTACCATACAGTACCATTAATTGAGCCATTGGATGAGGTGATCTCCTGTCAGATGCTCCCAAAGTAGGCAGGTAACAATGAAGGCTGATTGCAGCATATCTAATGGAATAGATAACACTTGATGCCGGTCATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	39360	364	+	636262	TATCTATTAGAGGAGTTATTACATTACCATAACTAGAGAAGCCTTGTACGAAGTGGAAGGCACAGACTCCACACACC---TTGACAGACCAGAACTTTTACCTGGTTGGATGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTATATTGGAACAGGTATAACCCAGATCGCAGTTAGGCGCATGAATCTGTGAGAGCAGCAGGGCCTTTGCTATCCCTTCGCAATTCAGATGGAATAGTACCATACAGTACCATTAATTGAGCCATTGGATGAGGTGATCTCCTGTCAGATGCTCCCAAAGTAGGCAGGTAACAATGAAGGCTGATTGCAGCATATCTAATGGAATAGATAACACTTGATGCCGGTCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	31618	367	+	647215	TGTCTATTGGAGGAGTTACTGCATTACCATATCTAGAGAAGCCTTGTGTGAAGCGGAAGGCACAGACTCCACACACCCTATTGGTAGACCAAAGCTTTTATCTGGGTGATTGCTTCTAAATATGCACTTCCTCCAGAATTGTATTGAAACAGATAGAACCCAGATCACAGCTAGGCACATAAGTCAGTATGATTAGCAGGGCCTTTGCTGCCCCTTAACAATTCAAATGAAACCGTGCCATATAGTACCATTAATTAGGCCATCAAATGAGACGATCTCCTGTCTGATGCTCCCAAAGTAGGTGGGGAACAATGAAGGCTGATCACAGAATATCTGATGGCATGGGTAACAATTAAGCTCGATCATA

a
s	mr.mrrefChr0	37524	552	+	130230	CAGGGAAGCTTCGGCTTCTTCCTTCTTCCTCAGCTGGCTAATAGAAAGAGGACTCCTAAGTAATGGCTCTTAAGTGACTCCTAATTTACTAGTTACCTCCTTTTATACCTGACCAGCTAATATTAGTCCTACTTGTTGATGGTTGAAGGCCCCACCCTTGACTCCTCTGCTTTAGTAGGTGGATAGGCTTCTACTTAACTAAGTCAATAGGTTCACCATTTGTACTTCATGCAATGAATGAATACAAGCATATTTTACTTCTAAACACAAGTATGCTATTCTTGAAGAATAATGAGTTAGAGGAATCAGCTAGGGTCAACTTTCTTGTAGGTGATACATACAATTTGGATAAGCATTAGCGTAAACTGGAGTTTAGATCTTGACAGGTGTGAGCTACTCAAAACATTTCTACCCAACTCAAAGAATAAGTAAGAAGTTCATGAGATTTCGTTAGTGGCTTTTCAGGTTCAGTGTGTCCTGGCACCCTCAACCTTAAGAGAATGAGTTAAAATGGGATACTTCATAGCTGCAAATATTTCCAGGTATCTAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	39725	552	+	636262	CAGGGAAGCTTCGGCTTCTTCCTTCTTCCTCAGCTGGCTAATGGAAGTAGGACTCCTAAGTAATGACTCTTAAGTGACTCCTAATTTACTACTTACCTCCTTTTATACCTGACCAGCTAATATTAGTGCTACTTGTTGATGGTTGAAGGCCCCATCCTTGACTCCCCTGCTTTAGTAGGTGGATAGGCTTCTACTTAACTAAGTCAATAGGCCCACCATTTGTACTTCATACAATGAATGAATACAAGCATATTTGATCTCCAAACACAGGTATGCTATTCTTGAAGAATAATGAGGGAGAGGAATCATCTAGGGTCCATTTTCTTTTAAGTGATACATAAAATTTGGATAAGCATTAGCGTAGACTGGAGTTTAGATCTTGACAGGTGTGAGCTACTCAAAACATTTCTACCCAACTCAAAGAATAAGTAAGAAGTTCATGAGATTTCGTTAGCGGTTTTTCAGGTTCAGTGTGTCCTGGCACCCTAAACCTTAAGAGAATGAGTTAAATTGGGATACTTCATAGCTGCAAATATTTCCAGGTATCTAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	31985	520	+	647215	CAGGAAAGCTTTGCCTTCTTCCTTCTTCCTCACCTGGCTAATAGAAAGAGGACTACTAAGTGATCGCTCCTAAGTGACTCCTAATTTACTAGTTACCTGCTTTTATTCCTGACCAGCTAATATTAGTCCTACTTGTTGATGGTTGAAAGCCCCACCCTTGACTGCTCTGCTTTAATAGGTGGATAGGCTTTTAATTAACTAAGTCAATAAGTTTGAAATTTGTACTTCATGCAATGAATGAATACAAGCACATTTTACTTCTAAGCACAAGTATGCTATTCTTGAAGAATAATGAGTTAAAGGAATCAGCTAGGGTCAGCTTGCTTGTAGGTGATACATAC-----------GCATTAGTGTAAACTGGAGTTTGGATCTTAGCAGGGGTGAGCTACTCAAAACATTTCTACCCAACTCAAAGAATAAGTAAGAAGTTTATGAGATTTCATTAGTGGCTT---------------------CACCCTCAACCTTAAGAGAATGAGTTAAAATGGGATACTTCATAGGTGCAAATATTTCCAGATATCTAGAT

a
s	mr.mrrefChr0	38076	329	+	130230	GTACAGGTATGCCTAAATATGATGCCAATCCATTATAGCAAGTGACTACAGTAGAGAATGTATAACAATTGTGAGCAGCCCATCCCTCCTAGATTACACACCTATATTAGGTATAGTTACTTAGATAAATTAACCAAGCCTCCACCACAATGACTTTCTTACTTCAGAGGGTGTCTTCTTCTCATAGGTTATTAGAGTCCACCAAGAATATCATATGGGTTCACATTTGGGGTCCTATCTCTTGATGGTGTGCTAGATGGAGGAAGCTAATTTGATATTTGTAATGGATCACCAGTCACTTAATGTGTCAGAAACAAACATTGCTTCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	40289	329	+	636262	GTACAGGTATGCCTAGATAGGATGCCAATCCATTATAGCAAGTGACTACAGTATAGAATGTATAACAATTGTGAGCAGCCCATCCCTCCTAGATTACACACCTATATTAGGTATAGTTACTTAGACTAATTGGCCAAGCCTCCACCACAATGACTTTCTTGCTTCAGAGGATGTCTTCCTCTCATAGGTTATTAGAGTCCACCAAGAATATCGTATGGGTTCACATTTGGGGTCCTGTCTCTTGATGGTGTGCTATACGGAGGAAGCTCATTTGATATTTGTAATGGATCACCACTCACTTAATGTGTTACAAACAAACATTGCTTCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	32505	329	+	647215	GTCCAGGTATGCCTAAATCTGATGCCAATCCATTTTAGCAAGTTACTACAGTAGAGAATGTATGGCAATGGTGTGCAGTCCATCCCTCCGAGATTATACACCTATATTATATATAGCTATTTAGATAAATTAACCAAGCCTCCACCACAATGACTTTCTTACTTCAGAGGGTTTCTTCTTTTCATAGTTTATTAGAGTCCACCAAGAATATCATATGGGTTCACATTTGGGATCCTATCTGTTGATGGTACACTAGATGGAGGAAGCTAATTTGGTATCTGTAATGGATCACCAGTCAGTTAATGTGTCAGAAACAAACACTGGTTCCT

a
s	mr.mrrefChr0	38405	95	+	130230	AGGGCTAAGAAGCAGAGAGTGCTTGCACAAACACCTTAAACTGTTGTTAGCCATATAttgtgttcctgaagttagtctctcattactgcctttct
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	40622	95	+	636262	AGGGCAAAGAAGGAGAGAGTGCTTGTGCAAACACCTTAAACTGTTGTTAGCCATATAttgtgttcctgaagttagtctctcattactgcctttct
s	simRat_chr6.simRat.chr6	32834	94	+	647215	AAGGCTAGAAAGCAGAGAGTGCTTGCACAAACACCTTATACTGTTG-GAGCCATATAttgtgttcctgaagtaagtctctcaaaactgcctttct

a
s	mr.mrrefChr0	38500	139	+	130230	tggacattctgtttacttaaagagcttgttagcatatggtcaatgtgcagaccctgaaattgctgcttaactccttagtgTACTTGACTgtaccttgtctgcatctacaaaagttgtttgctgatgcccctgttcctaa
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a
s	mr.mrrefChr0	38639	43	+	130230	gttacaccatcattactgaagaaaagagttatacagggtccag
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a
s	mr.mrrefChr0	38682	67	+	130230	gaggactgacttggatcttcagcctCGACCAGTGGGCCCGTGACCAAACACTGTTGTCTGTGCCCTC
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a
s	mr.mrrefChr0	38749	97	+	130230	CCTTTCATTCCTAGTCTCATGCACCTCCCTGTAACAACTGCGGGCTCCCTGGAGTGTCCTCTTTGAGTGACCTCTTTGAGAGGGAGGTTTGTACTGA
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a
s	mr.mrrefChr0	38846	26	+	130230	CATGTGTGAGTATGTTCCAATTCTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41066	26	+	636262	CATGTGTGAGTATGTTCCAATTCTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33299	26	+	647215	CATATGTACGTATGTTATAATCTGGT

a
s	mr.mrrefChr0	38872	8	+	130230	CAGCTTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41092	8	+	636262	CAGCTTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33326	8	+	647215	CAGCTTCA

a
s	mr.mrrefChr0	38880	3	+	130230	CAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41101	3	+	636262	CAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33334	3	+	647215	CAC

a
s	mr.mrrefChr0	38883	86	+	130230	CCATAGTAAACCTGTCTTGCCCAACCCACACCATCTGCCCCGGCTTCAATTTGTCAAGATGGTGCAAAGGCAGTCCTGGACACATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41107	86	+	636262	CCATAGTAAACCTGTCTTGCCCAACCCACACCATCTGCCCCGGCTTCAATTTGTCAAGATGGTGCAAAGGCAGTCCTGGACACATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33337	86	+	647215	CCATAGTCAACTGGTCTTGCCTAAGCCACACCATCTGCTCTGTCTTCAACATGTCAAGATGGTGTAAAGGTAACCCTGAACACATG

a
s	mr.mrrefChr0	38969	365	+	130230	TCAGGAGCTGGATCCCTTATCTTTTTTAACTTATCAACGTGTCTTTGCCCTATCACTCCCACAGTTATGCGCCAGTCACTCTGAGTAGCACAGACAACTCTATTTCGACATTCAACATTCGAATTTGTATCTAGAACACAACACGTGGAATTGTTTTCAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAAGCAGCATATTTTGTCTTGAAAGGGCTGAGTGTGGAACCAACAGTGACTTGTTCCTCTACTCTAGTGTGGGGGTGTCACAGGACAGATTATACATATAGCAGGAATAGAAATTTAGACAGATGTTTGGCAGGATGTTATCTACAGATAATATTATCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41193	364	+	636262	TCAGGAGCTGGATCCCTTATCTTTTTTAACTTATCAACGTGTCTTTGCCCTATCACTCCCACAGTTATGCGCCAGTCACTCTGAGTAGCACAGACAACTCTATTTCGACATTCAACATTCGAATTTGTATCTAGAACACAACACGTGGAATTGTTTTCAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAAGCAGCATATTTTGTCTTGAAAGGGCTGAGTGTGGAACCAACAGTGTCTTGTTCCTCTACTCTAGCGTGGGGGTGTCACAGGACAGATTGTACATATAGCAGGAATAGAA-TTTAGACAGATGTTTGGCAGAATGTTATCTACAGATAACATTATCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33425	365	+	647215	TCTGGGGCTCAATCCCATCTCTTTTTTAACTTATCAGCGTGTCCTTGTCCCATCACCACCACAGTATTGTCACAGTTGCGCAGAGTAGCACAGACAACTCCATTTGGAAATCCAACAATCAAGCCTGTATTCAAAACACAACACTTTGAATTGTTTTGAGACTTGTGGCCTGGCCTGTATTGAACAAAATTGAGGTACTGTCCTAAAGGCAGCATATTTTGTCTTGGAAGGGCTGAGTGTGGAGCCATCAGTGAGATGTTACTCTACTCTGGTGTGGGGGTGTCACAGGACAGAGTATACATATAGCAGGAATAGAAATTTACATAGATGTTTGGCAGGATGTTATCTACAGATTATATTATCTG

a
s	mr.mrrefChr0	39334	86	+	130230	TGCGGCAAGTTGCACTTCCCTTGTGTGTGCTGTCTTTTCTCAAGCTAGATTGCTTGCCCACTAAGTTTGCACCATATTAACAATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41574	85	+	636262	TGCGGCAAGTTGCACTTCCCTTGTGTGTGCTGTCTTTTCTCAAGC-AGATTGCTTGCCCACTAAGTTTGCAGCATACTAACAATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33790	86	+	647215	TGCAATAAGTTGCACTTCCCTTGTGTGTGCTGTCTATTCTCAAGCTATATTGCTTGCCCACTAAGTTTGCACCAGATCAACAATAA

a
s	mr.mrrefChr0	39420	40	+	130230	TGAACTTACATACTTAGGGTTCCTGAGTCTTTGAAGGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41659	40	+	636262	TGAACTTACATACTTAGGGCTCCTGAGTCTTTGAAGGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33946	40	+	647215	TGAACTTACATACGTGGAGTTCGTGAGTCTTTAAAGGAAT

a
s	mr.mrrefChr0	39460	39	+	130230	CTGGTAGAAAAGCCAAAATGGACCTACCACAGGGCCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41699	39	+	636262	CTGGTAGAAAAGCTAAAATGAACCTACCACAGGGCCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	612973	39	-	647215	CTGGTAGAAAAGCCAAAATGGACCTACCACAGGGCTACT

a
s	mr.mrrefChr0	39499	18	+	130230	TTACTATAGGAGTAAAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41738	18	+	636262	TTACTATAGGAGTGGAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	613017	18	-	647215	TTACTATAGGAACAAAGG

a
s	mr.mrrefChr0	39517	16	+	130230	CAGAAATAAGCTATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41756	16	+	636262	CAGAAATAAGCTATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	613038	16	-	647215	CTGAGATAAGCTATTA

a
s	mr.mrrefChr0	39533	57	+	130230	GGAAAGCAAATAGACAATAAACTGTGGAAACCACACATCTACAAGATGACTGCTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41773	57	+	636262	GGAAAGCAAATAAACAAGAAACTGTGGAAACCACACATCTACAAGATGACTGCTAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	613054	57	-	647215	GGAAAGCAAATAGATAATAAACTGTGGAAACCCCCCATCTACAAGACAACTGCTAAG

a
s	mr.mrrefChr0	39590	70	+	130230	TGGAGTCTCTGAAATGATATGTGATATGTTTACCAATCACTTTTCCACATATGTGTGATGCACTATAGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41830	70	+	636262	TGGAGTCTCTGATATGATATGTGATATGTTTATCAATCATTTTTCCACATATGTGTGATGCACTATAGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	613146	70	-	647215	TGGAGTCCGTGAAATGATATGTGATATGTTTACCAATCACTTTTCTACAAACATATGATGCACTATAGGA

a
s	mr.mrrefChr0	39660	3	+	130230	TGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41900	2	+	636262	-GG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	34242	3	+	647215	TAA

a
s	mr.mrrefChr0	39663	13	+	130230	TACTGGGCCTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41902	13	+	636262	TACTGTTCCTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	34246	13	+	647215	TGCTGGGTATGTA

a
s	mr.mrrefChr0	39676	87	+	130230	GTACTAACCACCAACATGTGAGACATGGTGAACATAAAAAGTCCTGTGGTCACAGTAAACTTTTGAAAACATAAGCTAAGGAAAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	41923	86	+	636262	GTACTAACCACCAGCATGTGAGACATGGTGTGCATAAAAAG-CCTGCGGTCACATTAGACTTTTGAAAACATAACCTAAGGAAAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	34259	87	+	647215	GTAACAACCACCAACATGTGCGCCATGGTGAACATCAAAAGTCCTGTGGTCACTGTAAACTCTTGAAAACATAAGCTAAGGAAAGCT

a
s	mr.mrrefChr0	39763	49	+	130230	TTGCTCACACATGACTAGAGATATACCAACCATCCCAATAAGATAATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	42009	49	+	636262	TTGCTCACACATGACTAAAGATCTACCAACCATCCCAATAGGAGAATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	34353	49	+	647215	TTGCTCACACATGACTAGAGACATACCAACCATCCCAATAAGATAATTG

a
s	mr.mrrefChr0	39812	268	+	130230	TGATTGTGCTAGTTGATGATAATGCAGTATCAGACAGAAAGAAGGATTAACTTCATTACATCACTTTGTAGTAAGGGTATTCCTGACCATGCTAGAGCGTTTTGGACCACCTCTGGTTAAAGGCTCATTATATAATCCATAACTGCTGTCAGGTCAGGTGTAAGTGGTTTAGACTCTACTGCATAGCTCATAGTTTTCAGCTGGTGCTTAATTGGGTGCCAATCAACTGTATCCAATGAACTGTAGTCTTGCACTTGGTGCTTCACGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	42058	264	+	636262	CCAT----CTAGCTGATGATAATGCGGTATCAGACAAAAAGACGGATTAACTTCATTACATTGCTTTGTAGTAAGGGTAATCCTGACCATGCTAGAGCGTTTTGGACCACCTCTGGTTAAAGGCTCATTATATAATCCATAACTGCTGTCATGTCAGGTGTAAGTGGTTTAGACTCTACTGCATAGCTCATAGTTTTCAGCTGGTGCATAATTGGGTGCCAATCAACAGTATCCAATGAATTGTGGTCTTGCACTTGGTGCTTCACGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	34404	245	+	647215	TGATTGTGCTAGTTGATGATATAGTAGTATCAGACAGAAAGAACGATTCACTTCATT-CATCACTTTGGAGTAAGGGTATTCCTGTCCATGC-----ATTTTCAGACCAT--------AAAGGCTCATTATACACTCCGTAACTGCTGTCAGGTCAGGTGTA---------GGCTGTACTGCAAAGCTCATAGTTGTCAGCTGATGCTTAATTGGGCGCCAATCAACTGCATCCAATGAACTGTAGTCTTGCATTTGGTGCTGCACGA

a
s	mr.mrrefChr0	40080	165	+	130230	TCCACGAGAACATTATTCCATTGGGAATACTAGATGATTTACTAACACTTAAGGGGTTGGAGACAATATCACAGTACTGGCAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGTTGGGAGTTTGATGTAGTGGCAAAGGACTGGGAACTCTTTACAGCTAGAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	42336	165	+	636262	TCCACGAGAACATTATTCCATTGGGAATACTAGATGATTTACTAACACTTAAGGAGTTGGAGACAATATCACAGTGCTGACAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGTTGGAAGTTTGATTTAGTGGCAAAGGACTGGGAATGCTTTACAGCCAGAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	34649	165	+	647215	TCCACGAGAACGTCATTCCATTGGGAGTACTAGATGAACTGCTAACACTTGAGGGGTTGGAGACAATATCTCAGTACTGGCAGCCAAGATAATTACACATGAGCCATCGAAAGATGGGAGTTTGATGTAGTGGCAAAGGACTGGGAACTCTCTACAGCTATTAAA

a
s	mr.mrrefChr0	40245	115	+	130230	TAGTGGAAGGGGCCTGGAGAACATTTGGAGAACATTAACAGTAATGACTAGTAACAAATGGAAGAACTTAGCAAGAAGGATTGGTAGAAGATCTGCTACCTAGGGATTCTATTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	42502	115	+	636262	TAGTGGAAGGCGCCTGGAGAACATTTGGAGAACATTAACAGTAATGAATAGTAGTGAATGGAACAACTTAGCAAGAAGGATTGGTAGAAGATCTGCTACCTAGGGATTCTATTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	34814	114	+	647215	TAGTGGAAGGGGTCTGGAGAACATTTGGATAACATCAACAGTAATGACTAGTAACAAA-GGAAGAACTTAGTGAGAAACATTGGTAGAAGATCTGCTACCTAGGGATTCTATGCC

a
s	mr.mrrefChr0	40360	124	+	130230	TCTTGTTTGGTAGATTCCAGTATACGACTGTTAAGAGGCTGAGGACAAACTAGGTTTACTTTCTTAATAGACATCAAGCAGCTGAACTTAGAGAGGCTCTCTTACAGTGCACCATTTTGATCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	42617	124	+	636262	TCTTGTTTGGTAGATTCCAGTATACAACTGTTAAGAGGCTGAGGACAAACTAGGTTTACCATCTTAATAGACATCAAGCAGTTGAACTTAGAGAGGCTCTCTCACAGTGCACCATTTTGATCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	34933	123	+	647215	TCTGGTTGGGTGAATTCCAGTATATGACTGTTAAGAGACGGAGGACAAACTAGGTT-CATTTCTTAATAGACATCAAGCAGCTGAACTTAGAGAGGCTCTCTTACAGTGCACCATTGCGACCTA

a
s	mr.mrrefChr0	40484	150	+	130230	AAAGCTTCAGGTGACCACATTAAGATTTAAAGCAGGACATCTGATTGCAGGCTTCACTGGTTATCCCAACTATTGTCCAGACTATAGCAGAAAGAGTATAAACCTGCACTTCAGATGTACGTCCCTAAAGAACAGCTAAGACTGTCCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	42745	145	+	636262	AAAGCTTCAGGTGACCACATTAAGATTTAGAGCAGGACATCTGATTGCAAGCCTCACTGGTTATCCCAACTATTGTCCAGACTATAGCAGAAAGAGTATAAACCTGAATTCCCGATGTATGTCCCTAAAGAACAGCTGAGACTGT-----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	35056	150	+	647215	AGAGCTTCAGGTGACCAAATTAAGATTTAAAGGAGAACATCTGATTGCAGGCTTCACTGGTTATCCCAACTATTGTCCAGACTATAGCAGAAAGAGTATAAACCTGCACTTCAGATGTACGTCCCTAAAGAACAGCTAAGTCTGTCCACA

a
s	mr.mrrefChr0	40634	475	+	130230	AATGTAAACCAATAGTCCATCTATATCCTTGCAAGTTCAATCTCCTTTTCACATAGTTGGTAACTTGTATATACCCTCAGGGTCAAACAGATCGAGTGTAAGAAAACACTTGGGGAATGACTTGGCACATTGATTTTAATTCAGGTGAATGATGGCCTATTTTAGGGAATCCTCAAGATCTTCTGTTCTGCCTTATGAAGGGCATATCATGCTATTACCTCAATGCAGACTAACTACCTTGTACATGTACAATCTGTCATATTTGGTACAATGGTTTTCAGGTTCACAAGAAGTGTCAAGGAAATAACATGGTGTTTATGCCAATTGCCAAAAACTATCAAGAAAATAACCTGAGTACAATTACTTAATTTCATGGGGAAGCTGGTTGTCACCTTTATAGTTCAAGGTGGGTGGCCACGGCAAACCCATTGTAAGTATGATCCATTCATCCTGATGACACTCATAATTACACAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	42890	457	+	636262	AATGTAAGCCAATAGTCCATCTACATCCTTAGAAGTTCAATCTCCTTTTCACATAGTTGGTAACTTGTATATACCCTCAGGGTCAAACAGATT-----------AACACTTTGGGAATAACTTGGCACATTGATTTTAATTCAGGTGAATGATGGCCTATTTTAGGGAAGCATCAAGATCTTCTGTTCTGCCTTATGAAGAGCATATC--GCTATTACCTCAATGCAGACTAACTACCTTGTACATGTACAATCTGTCATATGTGGTACA-----TTTTAGGTTCGCAAGAAGTGTCAAGGATATGACATGGTGTTTATGCCAATTGCCAAAAACTATCAAGAAAATAACCTGAGTACAATTACTTAATTCTATGGGGAAGCTGCCTGTCACCTTTATAGTTCAAGGTGGGTGGCTACGCCAGACCCATTGTAAGTATGATCCATTCCTTCTGATGACACTCATAATTACCCAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	35208	470	+	647215	AATGTAAACCAATAGTCCATTTATATCCTTGCTAGTTCAATCTCCTTTTCACACAGTTGAT----TGTATATACCCTCAGAGTCAAACAGATCGAGTGTAAGAAAACACTTGGAGAATGACTTGGCAGGTTGATTTTAAACCAGGTGAATGATGGCCTATTTTAGGGAATCCTCAAGATCTTCTGTTCTGCCTTATGAAGGGCATATCATGCTATGACCTCAATGCAGACTATCTATCTTGTACATATACAATATGTCATACTTGCTACAATGGTTTTCAGGTTCACAAGAAGTGTCAAGCAAATAACATGGTATGTATGCCAATTGCCAAA-ACTATCAAGATCATAACCTGAGTACAGTTACTTCATCTCATGGGGAAGCTGGTTGTCACTTTTGTAGTTCAAGGTGAATGGCCATGGCAAACCCATTGTAAGTATCATCTATTCATCTTGATGACAATCATAATTACAAGTG

a
s	mr.mrrefChr0	41109	130	+	130230	TGTAAAGAATTTATTTTGTCATTTGCTTTTTTGACATTGCAGGGATCAATGCATTTTAAGGACTATGTCCTGGGTTGGTTGCTCTAGCACAGGCTAATGTTCCTCAGTTATATTGGACTTAGATTCAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	43347	130	+	636262	TGTAAAGAATTTTTTTTGTCACTTGCTTTTTTAACATTGGATGGATCAATCCATTTTAAGGAATATGTCCTGGGTTGGCTACTCTAGCATAGGCTAATGTTTCTCAGTTATATTGGACTTAGATTCAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	35678	130	+	647215	TGAGAAGAGTTTATTTTGTCATTTGCTATTCTGACGTTGCAGGGATCAATGCATTTTAAGGACTATGTCCTGGGTTGGTTGCTCTAGCACAGGGTAATGTTCCTCAGTTATATTGGACTTAGAACACAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	35808	130	+	647215	TGTAAAGAATTTATTTTGTCATTTGCTCTTTTGACATTGCAGGGATCAATGCATTTTAAGAACTATGTCATGGGTCGGTTGCTCTGGCACAGGTTAATGTTCCTCAGTTGTATTGGACTTAGATTCAAAG

a
s	mr.mrrefChr0	41239	171	+	130230	CCTGATAAATTGATCTATATTTGTTGGATTGATCACCTGCCATTTGTCATGTGAAACACAATCACAACTGTGGCTAGTTCCGATGTTTAGATATTTCCTTACTATAAGCGAGTGCATGTTTGGTGGGCACCCAGTCTTCTTGGCCCATATGTTAGATGAGAAGGACTAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	43477	165	+	636262	CCTGATAAATTGATCTATATTTGTTGGATTGATCACCTGCCATTTGTCATGTGAAACACAATCACAACTGTGGCTAGTTTTGATGTTTAGATACTTCCCTGCTCTAAGCGAGTGCATGTTTGGTGGGCACCCAGTCTTCTTGGCCCATATGTCAGA------GGACTAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	35938	170	+	647215	CCTGATAAA-TGATCTACATTTGTTGGATTGATGCCCTGCTTTTTGTCATGTGAGACACAATCACAAGTGCGGCTCGTTCCTAAGATTAGATATTTCTTTACTATAAGTGAGTGCATGTTTTGTGGGCATCCAGTCTTCTTGGCCCATATGTTAGATGAGAAGGACTAAAA

a
s	mr.mrrefChr0	41410	186	+	130230	CATATCCTCATGGTTGATCACAGCTATCCCTTGGGCAGGAAAGTAAACTTTATTTTTCTTTCATATAATGAATTACTAATAGATTTTCTGCCTTCTTTCTTGGTTGAGTAACACAATGCATAAAAGTAGACTCAGACTCAAGCAGATCGAACACCATACAAACTCAATCTGATGGAACATCATCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	43642	186	+	636262	CATATCCTTATGGTTGATCACATCTATCCCTTGGGCATGAAAGTAAACTTCATTTTTCTTTCATATAATGAATTACTAATAGATTTTCTGCCCTCTTTCTTGGTTGAGTAAGACAATGCATAAAAGGAGACTCAGGCTCAAGCAGATCGAACACCATACAAACTCAATCTGACGGAACATCATCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36109	186	+	647215	CATACCCTCACGGTTGATCACAGCTATCCCTTGGGCAGGAAAGTAAACTTTATTTTTCTTTTCTATCATGAATTACTAATAGATTTCCTGTCTTCTTTCTTGGTTGAGTAACACAATGCATAAAAGTAGACTCAAACTCAAGCAGATCGAACACCATACTAACACAATCTAATGGAACATTATCCA

a
s	mr.mrrefChr0	41596	129	+	130230	TACCCATGGCCTTAAAGCACATTGATTTAAAGTGAATTGTCCCAAATGGCATTACAAGTTGTTGTCCATTGGCTGACTAATTAATtcgtTGGCTGACTAATTGATTCTTTCTACTGAGACTCCATCTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	43829	129	+	636262	TGCCTATGGCCATAAAGCACATTGATTTAAAGTGAACTGTCCCGAATGGCATTACAAGTTGTTGTCCATTGGCTGGCTAATCAATTCGTTGGCTGACTAATTGATTCTTTCTACTGAGATGCCATCTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36295	129	+	647215	TACCCATGGCCTTAGAGCACGTTGATTTAAAGAGAATTGTCGCAGATGGCATTACAAATTGTTGTCCATCGGCCTACTAattgattgattggctgactgattgattCTTTCTACTGAGACTCCAGCTAG

a
s	mr.mrrefChr0	41725	10	+	130230	GGCCTGTCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	43958	10	+	636262	GGGCGGTCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36442	10	+	647215	GGCCTGTCTC

a
s	mr.mrrefChr0	41735	68	+	130230	ATTTGAACAATCCTCTGCATTTAAGCAATCCACCAGCCATTACCCTGCTTAGCTCCGAATATATATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	43969	68	+	636262	ATTTGAACAATCCTCTGCATTTAAGCAATCCACCAGCCATTACCCTGCTTAGCTCCGAATATATATGT
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a
s	mr.mrrefChr0	41803	55	+	130230	GTTGATTAATCCCACACCCAGCACCATGGTGTCAGTGTGCATTAGGAACACAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	44041	55	+	636262	GTTGATTAATCCCACACCCAGCACCATGGTGTCAGTGTGCATTAGGAACACAGAA
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a
s	mr.mrrefChr0	41858	226	+	130230	TAACAAAATGGTCTTGCAACCAGTTAAGCCACTGCCTATTTATGCAGCCAGTCCGTACCCCCACTTGCATACACTTTTGAAATTATGCATAGAATTCAGAGCTGTGAATTTGATCCAGTTGGGTCCTGTGCTATGATGCACTTGAACACCATGCAGAGCCAATTTTCCAATTGCCTTAGTGGGATGATTGTCTCAGAATTTCTCCTGATGTTCAACTAAGCCAATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	44096	221	+	636262	TAACAAAATGGTCTTGCAACCAGTTAAACCACTGCCTATTTATGCAGCC-GTCTGTACCT----TTGCATACACTTTTGAAATTATGTGTAGAATTCAGAACTGTGAATTTGATCCAGTTGGGGCCTGTGCTATGATGCATTTGAACACCGTACAGAGCCAATTTTCCAATTGCCTTTGTGGGATGATTGTCTCAGAATTTCCCCTGATGTTCGACTAAGCCAATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36576	219	+	647215	TAACGAGATG-------AACCAGTTTAGCCGCTGCCTATTTATGCAGCCAGTCCTAACCCCCACTCACATACACTTTTGAAATTGTACATAGAATTGAGAGCTGTGAATTTGGTCCAGTTGTGTCATGTGCTATGATGCACTTGAACACCATGCAGAGCAGATTTTCCAATTGCCTTAGTGGGATGATTGTCTCTGAATTTCTCCTAATGTTCAACTAAGCCAATC

a
s	mr.mrrefChr0	42084	227	+	130230	ACAGCTGAGTCAACAGCCAAAGAGTAAATATAAGAGAGTGCTAGTGATCAGAAATTATCTTGTTAATACCATCAGAGGATGTAATACATGGATAGGCTGGGAGCATCTTCAGTCAAGTAGCATATAGCTATGATAATTGGGATGAACCCTTCATATCACGCAGTGTGTATATGTAGTTGAAAGAAGTGCACAATCCAGTCATAAACACAGAGTAATGATTTGCCATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	44317	222	+	636262	ACAGCTGATTCAACTGCCAGAGAGTAAATATGAGAGAGTGCTACTGATCAGAAATTAGCTTGTTAATACCATCAGAGGATGTAATACATGGATAGGCTGGGAGCATCATCAGTCAAGTGGCATAT-----TGATAATTGGGACGAACCCTCCATATCACGTAGTGTGTATATGTAGTTGAAAGAAGTGCACAATCTAGTCATAAACACAGAGTAATGATTTGCGATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36870	227	+	647215	ACTGCTGAGTCAACAGCCAAAGAGTAAATATAAGAGAGTGCTAGTGATCAGAGATTTTCTTGTTAATACCATCAGAGGATGTAATACATGGATAGGCTGGGACCATCTTCTGTCAAGTAGCATATAGCTATGATAATTGCGATGAACCCTTCATTTCACACAGTGTGTATATGTGATGGAAAGAAGCGCCCAAACCAGTCACAAACGTAGAGTAATAATTTGCCATA

a
s	mr.mrrefChr0	42311	10	+	130230	GCTATTGCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	44540	10	+	636262	GCTATTGCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37097	10	+	647215	GCACTTTCAC

a
s	mr.mrrefChr0	42321	39	+	130230	TTTCACATCACTATGTATGTGTTGGCATGTGAGATATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	44550	39	+	636262	TTCAACATGACTATGTTTGTGTTGGCATGTGAGATATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37113	38	+	647215	CTTCACATCA-CATGCATAGGCTTACACGCGAGATATGG

a
s	mr.mrrefChr0	42360	327	+	130230	TCAGGCTGTCTGGTCTGCCACACTGGAGGGTGATATCCTAGGAGTCAATAGGAGGCAGCTGAGACACTATCAGGGGGCCAACTAGTTTTTTCAAAACCGTATAATAATTGGCATAACTCCAAGACAACAGAAAATTATAACAGTATAACTGGCCTCAGTCATTCAAGAACTGCAGCAACTGGGCCCACCTACCTGCTGTTTATCAATCTTTGATAGAGTACTGAATTTTACTAGATATAAAAAAACTATAGCCATTGAGCAAACTCATGCGATTCACTGATCAGAATCATATGGGTGAATGATACATTATACTGGCTGTGATACTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	44589	327	+	636262	TCAGGCTGTCTGGTCTGGCACATTGGAGGGTGATATGCTAGGAGTCAATAAGAGTCAGCTGAGACACTATCAGGAGCCCAACTAGTTTTTTTAAAACCATATAATAATTGGCATAACTCCAAGGCAACAGGAAGTTATAACAGTATAACTGGCCTCACTCATTAAAGAACTGCAGCAACTGGGCCTGCCTACCTGCTGTTTATCAATCTTTGATAGAGTACTGAATTTTACTAGATATAAAAAAACTATAGCCATTAAGTAAACTCATGCTATTCACTGATAAGAATCATATGGGTGGATGATATATTGTACTGGCTGTGATAATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37152	317	+	647215	TCTACCAGTCTGGTCTGCCACACTGGAGGGTGATATCCTAGGAGGCCATAGGAGGCAGCTGAGACACTATCAGGGGGCTAACTAGCTTTTTCAAGACTGTATAATGAGTGGCATAACTCCAAGACAGCAGAAAATTATAATAGTATA---GACCTCAGTCATTCAAAAACTGCAGCAACTGGGCCCATGTACCTGCTGTTAATCAATCTTTGATAG-GTTCTGGACTTTAGTAGATGTAAAAAAACTAT------TGAGCAAACTCATGCGATTCACTGACCAGAATTATATGGGTGAATGATACGTTATACTGGCGGTGATACTCT

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	44916	211	+	636262	GATCTAACATGTAATTTAACAAGAGACTTAAGCTATGCAACAGGCCTCTCATCAGGAGACCAGTAACTGGGGCAGCGAGGGATTAGAAAGCTGTTTCTGATTGTCTGGTACCTCTGAATGAGCATGCTTCTACTGAGGGTTTATCAAGGTCTATGGGTGAAGTATATTGGAGGGACCTTTGCACTGGGAACTAAAGTGTGGTCCTCCCAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37484	198	+	647215	GTTCTAATGTGTAATTTAACAAATAACTTAAGCTAC-------------TATCAGGCGACTGCTAACTTGAGCAGTGAAGGACTAGAAAGCTGTTTCTGATTCTCTGGTACCTCTGAATGAGCATACTTCTACTGAGGATTTACCAGGGTCTGTGGGTGAAGTGTATTGGAGGGACCTTTGCACTGGGAACCAGAGTATGGTCCTCCCAAT

a
s	mr.mrrefChr0	42898	48	+	130230	ATTTATAGTGATGCATGCCTGGGAGTCAATGCATTACAGAATCATATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	45128	48	+	636262	ATTAATAGTGATGCATGCCTGGAAGTCAATGCATTACAGAATCATATA
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a
s	mr.mrrefChr0	42946	16	+	130230	TGATCTTCAATAGGGA
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	43017	248	+	130230	TGACATTAGAGGACCATTGCTTATGCAAAGATCTTATGGTCCACTACCCTGTTGATTTAGATTTGACTGACTATGATGCAGGTAGTGTCTAGCAGTCCTAAGTCAACACATGGGTGTGTGTAAACTAATTGTTCTTTAGGTCCCTTGCATTCAGGCAATCACATGCCACACAATGGAGATGGCTGTAATGGGTGGAGACTATGTGGCACTTGATGAAGACACATCAGCTTTAAGAAGAGGACAGCTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	45261	248	+	636262	TGACATTAGAGGACCATTGCTTATGCAGAGATCTTATGGTCCACTACCCTGTTGATTTAGATTTGACTGACTATGATGCAGATAGTGTCTAGCAGTCCTAAGTCAACACATGGATACGTGTAAACTAATTGTTCTTTGGGTCCCTTGCATTCAGGCAATCACATGCCACACAATGGAGATGGCTGTAATGGGTGGAGACTATGTGGCACTTGATGAAGATACATCAGCTTTAAGAAGAGGACAGCTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37810	244	+	647215	TGACATCGGAGGACCATTGCTTATGCAAAGATCTTATGATCCACTACCCTGTTGGTTTAGATTTGACTGACTACGATGCATGTAGCGCCTAGCATTCCCAAGTCAACTCATGGGTGTGTGTAAACTAATTGTCCTGCAGGTCCCTTGCATTCAGGTAATCACATACCACACA---GAGATGGCTGTA-TGGATGGAGACTATGTGGTACTTGAAGAAGACACATCAGCTTCAAGAATAGCACAGCTGA

a
s	mr.mrrefChr0	43265	90	+	130230	CAGCAGTCTTTGTAACTAATGATGAACAAGCCTTGTGGTGAGGCCAGGCCCTATCCTGACAAACTAGTGTTCCCACTAAACTCACAACAG
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a
s	mr.mrrefChr0	43355	31	+	130230	GATGATTGGACAATAATGACTGTTGAGGCCT
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a
s	mr.mrrefChr0	43386	21	+	130230	ACTTGCTATTACCAGTTTGTT
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a
s	mr.mrrefChr0	43407	224	+	130230	GTCGGCTCTGTTGGGAAAGCCAACAATTGATCCACAGCTAAGTAAACAAATGGCAATTAGGAGCATAGCTTCAAATGCTAGAATGGTCTGTCTGTATGTTACAGGGCCCATATTGTCTTGTGTAATGACCCAAGGTCTGTAATGACCCAAGGTATGTGCTACATATGCCATGCCACCATGTCCTATATCCTGCACACCCCCCCTAGAACAGTATTCTAGAGCTA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	38379	204	+	647215	---AGAACTGTTGGGAAAGCCATCGATTGATATACAGCTAAGTAAACAAATGGCAATTGGGAGCATAGCTTCAAATGCTAGAATGGTCTGTCTGTATGTTACAGGGCCCATTTTGTGTTGTATAATGACCCAAGGCTTT-----------------TGCTACATATGCCATGCCACCATGGCCTATATCCTGCACACCCCCCCTAGAACAGTATTCTAGAGCTA

a
s	mr.mrrefChr0	43631	40	+	130230	GAGCTCTTAATTTTATCCTTACTGTCATCTAGCTAGTTAG
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a
s	mr.mrrefChr0	43671	7	+	130230	CACTAGT
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a
s	mr.mrrefChr0	43678	139	+	130230	GGACTTAGAAATTGGCATAAGGATGATTAGTTGCACCTTAAACTTTAATTGTTCAGTCTTAATAACCTTGCACAATCTGACTCAGGCTGAACATCCCCTAGTACAACCTATTGGAGTGGTGTGAATGTGTTATGTGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	45920	92	+	636262	-----------------------------------------------ATTGCTCAGTTTTATTAGCCATACACAATCTGAGCCAGGCTGAACATCCCCTAGTACAACCCATTGGAGTGGTGTGAATGTGTCATGTGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	38655	139	+	647215	GGACTTAGAAATTGGCATAAGGATGATTAGTTGCACCTTAAACTTTAATGGTATAGTCTTAACAATCTTGCACCATCTGACTGAGGCTGAATATCCCCTAGCACAACCTATTGGAGTGGTGTGAATGTGTTATGTGGTG

a
s	mr.mrrefChr0	43817	15	+	130230	GAATCTGCTATGTGT
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a
s	mr.mrrefChr0	43832	23	+	130230	ACTCTCTAGCAAATGGATAGTGT
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a
s	mr.mrrefChr0	43855	346	+	130230	TAGGTAGCCAATACCTATGGACGTGACTGATATCCAGAAAGCTAAAATAAATATAGGATGATTGGCAGGAACCAAGTTTTAGAGCCGTCTTAAGGTCCCTGAGGCATAGCAAAGCAACAGCTGCTAATTGCAGTCTTAGGACTCCTCCCCATCAAGACTCCATCTGCAAGTTGCATGAGTACCCTGGTGAAAGTGTTGTGTGGCTCAGCATCAAAAGGTAGGTAGTATAATTCACCTTTTGCTAGACTTGTTTATGCATATTTATAAAGCTTGATTATTGCTTCTTGAGAGGATGTGTTCTTAACATGTTTATAGCACAAAATAATTTATAATTGATTTGGAACTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	38832	346	+	647215	TAGATAGCCAATACATATGGGCGTGACTGATATCCAGAAAGCTAAAATAAATATAGAAAGATTGGCAGGAACCAAGTTTTAGAGCCATCTTAAGGTCCCTGAGACATGGCAAGGCAACAGCTGCTAACTGTAGTCATAGGACTCCTCCCCATCAAGACTCCAGCTGCAAGTAGCATGAGCGCCCTAGTGAGAGTGTTGTGTGGCACAGCATCAAAAAGTAGGTAATATAATTCACCTTTTTCTAGACTTGTTTATGCATATTTATAAAACTTAATTACTACATCTTGAGAAGATGTGTTCTTAACATGTTTATAGCACAAAATAATTTAAAATTGATTTGGAACTT

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	46407	260	+	636262	CTAGACTTCTCACTCCTACAATGGTGCAGTGTGTAAAAGGCACTAGAGATTTTAGATGTAAGACAAAAAACCAATATTGCTAGA--TGTGAAATATTCACAATGTGAACATAGACTTTATTGCCTATGTTAACCTATGGTATTCTTCCAACCTCGAAAAAGTAGAGTGGAAAACACATGTTGGAATTGCAAACGTGAAGCATACACATCGGATCACACATTCTAACAAACCTAACTGATTTAATACACCAACATCATAATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	39179	262	+	647215	CTAAACTTCTCACTCCTGCAATAGTGCAATGCGTAGAAGGCACCAGAGATTTTAGAGGCAAGACAAAACACTAATATTGCTAGACTTGTGATATATTCACAATTTGAACAAAGCCTGTATCGCCTAAGTAGACCTATGGTATTCGTCCAACTATGGAAAAGCAGAGTGGTAAACACATGTTGGAATTGCAAGTCGGAAGCATACACAACAAATCACACATTCTAACAAACCCAACTGGTTTTATACATCAACATCACAATAT

a
s	mr.mrrefChr0	44463	260	+	130230	GAGACTATCATATTAGAATCCTGGTGGAGGATGCCAGGTGGATGTTTACACACAGGATAATTAGATGAATTAGACGATGGAAGCAACTGAGTCCTCTGCAGCTCTAACGCCTTATTCACAATTTCACCCTACTCTTCAGTGGTATACAGACTAAGCCGAGCTGGTATTACTGTGGACAACTAGGCACTACTGTTTAGATGAGCCTGACATTAGCAAGCATACACAAGGTTATTGATTGGAGCCTTCCAATGAGAATGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	46692	255	+	636262	GAGGATGTCATATTAGAATCCTGTTGGAGGATGCCAGGTGGATGTTTGCACACAGGATAATTAGATGAATCAGACGATGGAAGCAACTAAGTCTTCTGCAGCTCTAACGCCTTATCCACAATTTCACCCTACTCTT-----GTATACAGACTAAGCCGAACTGGTATTACTGTGGCCAACTAGGCACTACTGTTTAGATGAGCCTGACATTTGCAAGCATACACAAGGTTAGTGATTGGAGCCTTCCAATAAGAATGGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	39441	260	+	647215	AAGACCATCATATTAGAATCCTGGTGGAAGACGCCAGGTGGATGGTTACACACACGATAGTTAGATGAGTTAGAAGATGGAAACAACTGAGTCCTCTGGAGCTCTAACACCTTATTCACAATTTCACCCTACTCTCCAGTGGTATACAGACTAAGCCAAGCTGGTATTACTGTGGACAACTAGGCACCACTGTTAAGATGAGCCTGACACTAGCAAGCATGTACAAGGTTATTGATTGGAGCTTTCCAATGAGAATGGTG

a
s	mr.mrrefChr0	44723	161	+	130230	CAGTCACAGTGCATGCAAAAAAGTACATATGGACTTTAAGTGAGAGTGAGGCCCAAAATCTTACAAGGTGGACAATCAGCATAAGCTAAACTGCCTAACCACCCTGTTGTTGCAGGATTGCTAAACCTAGTGATTATGACCTAAGCTTCAGTGCTGAGAAT
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a
s	mr.mrrefChr0	44884	105	+	130230	TATTCTAACACTAGCATTATATGGCAATTAGATTATATCCAACTGGATAGTAGATTGATGGGATACAGGAGGAGCACAAATCAAGACAATTCCAGTAGATGTGTG
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a
s	mr.mrrefChr0	44989	188	+	130230	CCTTACACTTTAGTAGGGCTAGATGAGAGAGGGCATAGACATGCAGACTACAATCGATGATAACCCTTTGTCAGTCAGATTCAAGCACTTTGCAGCTGGGTTCGTGATTACCAGCTTTTGCTATGCCTAATGATGGTGTTTCAGGGCCTTCAGAAGTAGGCCAATCCTAGCAAGGTTAAATAGAAGAA
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a
s	mr.mrrefChr0	45177	121	+	130230	AGGCTTAAAGATTTTCTCACTCTAACACAGGTGTTAGATCACATGTACAGATTCTGTGGATTAAAAAGGAGCTACAGGTAGTGTATACACACAAATTGAGTCAAAAATAAAGATCATGTAG
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a
s	mr.mrrefChr0	45298	102	+	130230	ATATGTGTTAAGATCCATGGCTAGCATTGGCCCACTAGGATAGTCATAGTTTGAGGGGGTGGCAGACCTAAACCTTGGGGAAAGAACAATAGAGAATTAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	47519	102	+	636262	ATATGTGTTAAGATCCATGGCTAACATTGGCCCACTAGGATAGTCATAGTTTGAGGGGGTGGCAGACCTAGACCTTGGGGAAAGAACCATACAGAATTAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	40279	102	+	647215	ATACGCGTTAAGATCCATGGCTAGCATTAGCCCACTAGGATAGTCATAGTCTGAGGGGGTGGCAGACTTAATCCTTCAAGAAAGAACAATAGAGAATAAGTA

a
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a
s	mr.mrrefChr0	45420	203	+	130230	ATGTATAGAACAATAGAGCAGGTACATAAAACAATATTTTAGTTGATAATTCTTAGATCTTTGCTAATTCTTCGTTCTTTGCCCATGCACTGCTCCATGTTAAAGTGCTTGAAGAGGGCAAGAACCTCTTTCTAATCACACTTTAGGACCCATGATGTTATAATGATCTTCAAGTGAAGCAGAAATTCCATTCATATTTATGC
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a
s	mr.mrrefChr0	45623	135	+	130230	ACTACCATGTACGCCCCAGAGAAATTCTCATATCTGACTAGGTTACATAGCTATCGTCTACTGGGTTTAGTTCAGGGCAACCTTTTAATAAACTGATTCAATTGCTATTGAGTGCAAGAATCACTGACAAACCAC
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a
s	mr.mrrefChr0	45758	58	+	130230	TGAATATTGAAGAAATCAGCTGTGGCTAGTTTGAGGGCAAACCCTAATATCTGGTAAA
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a
s	mr.mrrefChr0	45816	65	+	130230	TGGTTAGTCCCCTCTGCTCATACAGGTATCCCCATCCCTATACACCACTAACACCACAGAACTAC
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a
s	mr.mrrefChr0	45881	180	+	130230	TCAGATATTATGAGTTACATCCATGTAGGCTAGCAATATTTTTTAGTACTCCTGCACTTGGTTGCAGACAAGGTGTCATACAGATTTCATACTGAACTGGACCCTCTGTTTAGACTACGGGGCTGACCTGTTAATATGTATCCTTAAAAAAATGGATTCAATCATTATTGGAGCAAAAAA
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a
s	mr.mrrefChr0	46061	131	+	130230	TGTACAAGTTCTTGATTGTAGAAGGTAGAAGCATCATACATCAGAGAGATTGTGTCATCCTAATTCCCAGAATATATTTCCAGTTTAACAGTTGGCTCCAGGAGGATTGAATGGAAATAGTGCTTTTTGAT
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a
s	mr.mrrefChr0	46192	7	+	130230	CCTATCA
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	48422	294	+	636262	AAGTATTATGTACCTACATATCCCCATATACTATGATGATAACGGTATCAGAAAAAGGGTTGCTATTAGGAAGTAAGTATTGTCAACTTTTAGCCTCTTGTACTTAAACAGCAAGCTCAAG-TCACATTCACAGTAAGCACCTAAGATCAA-TGTATATTGTTGCCATGGCAACAATTTAACAACTCGAGGTTGGTAGCAAAGAATGCTTACAGATCTGATGAACTGAATAACAGTCTTAGCAGGGCACTGATGCTACCTGGCTTCACCTATACAACTCTTCATCTATGCAACTAG
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a
s	mr.mrrefChr0	46495	69	+	130230	AGCTGTTTGTGTATGGAACATTCTTGTTTGTATTATTCTCACAGGTTGTGACACAAAAATCTTGAAGTA
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a
s	mr.mrrefChr0	46564	259	+	130230	CTATGTGCACATCTCCCAGATTGATTGACTGACACTCCAGAAACTGTTTAGGAAGGAATTGCCCTGGTTGATTCTGTTTATAAGTCAGAACCACCTATTATACACATGAACAGTCTTGTATTTTTCAAACCTTCGTGATGACAAAAATACAATAGTAGGACAGTGCAAGCATCTATTAGTATCATCATTAAGTTTCTCCAGATATCTTGATGTTTCAACAAGCTGGCTTTAACTTGTATTCGAAAAATTAGTCCGTCCA
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	46882	241	+	130230	TTAAGCTGAGTCCTGACAATGCAGAGATAAATTCCCTGTCTAAGCACCCCAGAAGCAAACACCATCTATATTAGTTCCCTAGCCTCTATTCTGGTTGGGAACTCAAATCTATAAAATATAGTATCTCCACATGAAACAGAACCCCTTTATGACGAGGACTCAATTAGAATAATTAGAATGTTGCTCAAACAGTGGAGTATTTTATTGCCATTTTTATTGCCTTGAGATTATGCTCAAAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	49143	241	+	636262	TTAAGCTGAGTCCTGACAATGCAGAGATCAATTCCCTGTCTAAGCACCCCAGAAGCAAACACCATCTATATTAGTTCCCTGGCCTCTATTCTGATTGGGAACTCAAATCTATAAAATATAGTATCTCCACATGAAACAGAACCCCTTTATGACGAGGACTCAATTAGAATAATTAGAATGTTGCTCCAACAGTGGAGTATTTTATTGCCATTTTTATTGCCTTGAGATTATGCTCAAAGGT
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a
s	mr.mrrefChr0	47123	59	+	130230	CATGTCAAGTGAATCTGATTCCATTTTGTTGCTGTATTAATGTATCATCTTTGCTTTGA
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a
s	mr.mrrefChr0	47182	21	+	130230	TATAGGGTATCTTTGACAACT
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a
s	mr.mrrefChr0	47203	44	+	130230	TAATGCCTCAAAATAACATATTAGCTGGTCCATATTAAAAAGCA
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a
s	mr.mrrefChr0	47247	28	+	130230	TCCTCATTTAACTTGTATCACCTGCTTT
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a
s	mr.mrrefChr0	47275	5	+	130230	TTCAG
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a
s	mr.mrrefChr0	47280	94	+	130230	CAGAGGTTGCTAATTACTTATATTGGAGAATTTATATTAGTCACTTACGTAGTGGGTATGCTTTTTCTCAATTATACAGATCATTTCAAGAAGA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	42283	94	+	647215	CAAAGGTTGCTAATTACTTATGTTGGAGAATTTATATCAGTCACTTACATAGTGGGTACGCTTTCTCTCAATTATACAGATCATTTCAAGAGGA

a
s	mr.mrrefChr0	47374	140	+	130230	TAGGCCTATGGTTTGTAGGTATCTTACACACATGGTTCTATTAGTTTTGTGAATTGCACTTTGCAACTCATTATTCTATGATACTCCCACTTCACTTCCCTTTTCACTGCACTAGTCACCAAGTctactatagtccttct
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	179036	124	-	636262	TAGGCCTTTGGTTTGTAGGTATCTTACACACATAGTTCTATTAGTATTGTGAATTGCACTTTGCAACTCATTATTCTATGATACTCCCACTCTACTTCCCTTTTCACTGCACTAATCACCAAGT----------------
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a
s	mr.mrrefChr0	47514	32	+	130230	TATACTTTGTTGACTTCAATACCTTATACTAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	42530	32	+	647215	TGTACTTTGTTGACTTCAATACATTTTACTAA

a
s	mr.mrrefChr0	47546	59	+	130230	GATTATGTGTATATCTATACAACTGGTAGGCAGAGGTGTAGCAAATTGCATTTGCATCA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	42575	59	+	647215	GACCATGTGTATATCTGTACAACCGGTAGGCATAGGTGTAGCAAATTGCATTTGTATCA

a
s	mr.mrrefChr0	47605	51	+	130230	TGAAGTCCTTAAAGACCTCAATTCTAAATTCATTTGCCAACCGTGCATCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	49748	51	+	636262	TGAAGTCCTTAAAGACCTCAATTCTAAATTCATTTGCCAACCGTGCATCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	42634	51	+	647215	TGAATTTCTTAAAGACTTCAAGCCTAAATTCATTTGCCGATTGTGCAGCAC

a
s	mr.mrrefChr0	47656	31	+	130230	TTTGCAATGATTGAGCTTTAAACTTCTAGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	49813	31	+	636262	TTTGCAATGATTGAGCTTTAAACTTCTAGCC
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a
s	mr.mrrefChr0	47687	99	+	130230	AGAATAGATGAGCAATGTGGAACCTTGCCTTAGATCTTGGCCTTGCTCTTTCACTGTGCAAAATGCTGTTTCATGCTGTAATTTCAGGTGATACCTACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	49844	99	+	636262	AGAATAGATGAGCAATGTGGAACCTTGCCTTAGATCTTGGCCTTGCTCTTTCACTGTGCAAAATGCTGTTTCATGCTGTAATTTCAGGTGATACCTACT
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a
s	mr.mrrefChr0	47786	9	+	130230	AGGTGATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	49948	9	+	636262	AGGTGATAC
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a
s	mr.mrrefChr0	47795	14	+	130230	TTGTGACACTCTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	49965	14	+	636262	TTGTGACACTCTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	42839	14	+	647215	TTATGTCACTCTCA

a
s	mr.mrrefChr0	47809	126	+	130230	CTTAAAAATGACCAGTCACCCATGGTTTTGTAGCTTTGAATTAGATGTGTACAGAAGTAGATATTCTTCTTCCAGTAAATCAACTATAGCAGTATCGTCATTTCAGCCCTTGTGAGTCTCATAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	49979	126	+	636262	CTTAAAAATGACCAGTCACCCATGGTTTTGTAGCTTTGAATTAGATGTGTACAGAAGTAGATATTCTTCTTCCAGTAAATCAACTATAGCAGTATCGTCATTTCAGCCCTTGTGAGTCTCATAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	42856	126	+	647215	CTTAATAATGACTAGCTACCCATGGTATCGTAGCTCTGTATTAGATATGAACAGAAGTAGATATTCTTCTTCCAGGAAATCATCTATAGCAATATGGTCATTTTAGCCCTTGTGAGTCTCATAACT

a
s	mr.mrrefChr0	47935	31	+	130230	CATTGGTCTTGTAACCCTATAGCTTGTCAGC
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a
s	mr.mrrefChr0	47966	41	+	130230	AGGACAGAAATTACTTGTACACTCTTATACTTGCTGTAATA
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a
s	mr.mrrefChr0	48007	9	+	130230	TGAGTTTGA
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a
s	mr.mrrefChr0	48016	18	+	130230	CTTGGCAGACTTATTCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	50192	18	+	636262	CTTGGCAGACTTATTCTG
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a
s	mr.mrrefChr0	48034	14	+	130230	ATTGCCGGATGCCT
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a
s	mr.mrrefChr0	48048	18	+	130230	ACTCAGTAGCATTAAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	50224	18	+	636262	ACTCAGTAGCATTAAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	43097	18	+	647215	GCTCAGTAACATTAAGTT

a
s	mr.mrrefChr0	48066	126	+	130230	GTATTTGGTACATTGGCTTCCATCTTCAAAGTTACAATAGCTTACAGGTTCACTTTGTCTTTTTGCACCTTAGGCAAGTTGAAGTATCAAGACCTTCATTCTGATAATTCAAATTAAGTTGGTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	50242	88	+	636262	GTATTTGGTACATTGGCT--------------------------------------GTCTTTTTGCACCTTAGGCAAGTTGAAGTATCAAGACCTTCGTTATGATAATTCAAATCAAGTTGGTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	43123	126	+	647215	TTATTTGATACATTGGCTTCCATCTTCAAAGTTACAATAGCTTACAGGTTCACTTTGTCTTTTTGCACCTTAGGCAAGTTGAAGTATCAAGACCTTCATTCTGATAATTTGAATTGAGTTGGGGTA

a
s	mr.mrrefChr0	48192	90	+	130230	GCCATAATCTGTATTGAGGGTAGATCATGGTCCTTGTCCTAGTATACAGTAAAAAGTGAGAAACTTCCAATCAATGACTTTAAGGTTACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	50330	72	+	636262	------------------GGTAGATCATGGTCCTTGTCCTAGTATACAGTAAAAAGTGAAAAACTTCCAATCAATGACTTTAAGGTTACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	43253	90	+	647215	GCCATAATCTGTATTGAGGGTAGATCATGGTCTTTGTCCTAGTATGCAGTAAAAAGTGCGAGACTGCAAATCAATGACTTTAAGGTTACA

a
s	mr.mrrefChr0	48282	150	+	130230	TTTTATCCTATCTTTTTTCTCAATAACTCCTCAAGTGAGTTAATTTGTCTGGACGATTATAAGTGCTCTATACCCTCACATTGCAATTTCAGCGTCTGCTGCAACATCTTAACTTACCAGTAAGGGTATTGACACCTCAGGCTGAGTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	50402	150	+	636262	TTTTATCCTATTTTTTTTCTCAATAACTCCTCAAGTGAGTTAATTTGTCTGGATGATTATAAGTGCTCTATACCCTCACACTGCAATCTCAGCGTCTGGTGCAACATCTTAACTTATCAGTAAGGGTAATGACACCTCAGGCTGATTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	43350	150	+	647215	TTTCATCCTATCTTTTTTCTCAATAACTACTCAGGTGAGTTAATTTGTCTGGACGATGGTAAGTGCTTTACACCCTCACCTTACAATTTCAGTGTCTGCTGCAACATCTTAACTTACCAGTAAAGGTATTAACAACTCAAGCTGAGTAAT

a
s	mr.mrrefChr0	48432	289	+	130230	ACAAACAATGACAGTGGGTCAAAGTAATCCTTACAACTTCCCCAATAGGTTGTTCAGCCACAATGCAATTAAGTAAACCAAAGTTCATGATCATTGATGATAGACCTTTCATTAATCATGACTACATTGCTATTATTATCCCTTTATTTCCTTGGTTTAGACCCTGACTTATTCCTTTCAGTGTAGGTCTACTCCTTTTACTGTATTCTAATTTTCTATGGCAGAGCATTCCTTATCAATGAACCCACCCATAGTCTATATTGCAGGAGTCACATGGAGATCCTGAGCC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	43500	289	+	647215	ACAAACAATGTCAGTGGGTCAAAAAAACCCTTACAACTTATCCAATAAGTTGTTCAGCCACAATGCAATTGAGTAAGCCAAAGTTCAGGACCCTTGATGATAGACCTTCCATTAATCATGACTACACTGCTATTATTATCCCTTTTTTTCCTTGGTTTGGACCCTGATTTATTCCTTCCAGTGTAGGTCTACTCTTTTCACTGTGTTCTAATTTTGTCTGGCAGAGCATTGCTTATCAATGACCCCACCCATAGTCCGTATTCCTGGAGTTGCATGGTGATCTTGAGCT

a
s	mr.mrrefChr0	48721	12	+	130230	GTTGGTTAATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	50888	12	+	636262	GTTGGTTAATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	43789	12	+	647215	GCTGGTTAGATG

a
s	mr.mrrefChr0	48733	3	+	130230	CTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	50902	3	+	636262	CTG
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a
s	mr.mrrefChr0	48736	4	+	130230	GTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	50905	4	+	636262	GTGG
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a
s	mr.mrrefChr0	48740	318	+	130230	CTCTAGCCAGTCTCTTCTATTAACATACGTGGTCACCTTATAGTACATGAATACCTTGTGCAATGATCACCTAATGCCATAAGGCCAGGAATCTATGTTAATCATGACTCAACCCTATGACTCAAGGGCTTAAATGATATATACACACCAGCCTTTTTACAAAACACCAGCCTTTTCATTGATTTACACATGTATTTAAGTATACCTGTTTATGGGATGTTATCAATAAAAGAAACTATAATATCTTATAATTTTGAGATGCATTATGTTAGATCAGAGATACAGCTGCTTCAATAATTAGGCCACCCTGTTCATTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	50953	314	+	636262	CTCTAGCCAGTCTCTTCTATGGACATATGTGGTCACCTTATAGTACATGAATACCTTGTGCAATGATCACCTAATGCCATAAGGCCAGGAATCTATGTTAATCATGACTCAACCCTATGACTCAAGGGCTTAAATGATATATACACACCAGCCTTTTTACAAAACACCAGCCTTTTCATAGATTTA----TGGATTTAAGTATACCTGTTTATGGGACGTTATCAATAAAAGAAACTGTAATATCTTATAAATTTGTGATGCATTATGTTAGATCAGAGATACAGTTGCCTCTATAATTAGGCTGCCCTGTTCATTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	43809	314	+	647215	CTCACTTCATTCTCCTCGATTAGCATGCGTGGTCACTATATAGTACATGAATCCCTTGTGCAATGATCACCTAATGCCATAAGGCCAGGAATCTATGTTAATCATGACTCAATCTTAT---TCAAGGGCTTGAATGATATATACACACAAGCCCTTCTACAAAACACCAGCCTTTTCATTGATTAACACATTTATTTAAGTATACCCATTTATGGAATGTTATCAATAAAAGAAACTATAATATCTTATAATTTTAAGATGCATTATGTTAGATCAGAGATACAGCTCCTTCAATAAT-AGCCCAACTTGTTTATTTC

a
s	mr.mrrefChr0	49058	19	+	130230	GCATTGTGTCAACTATTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	51268	19	+	636262	GCATTGTGCCAACTATTAA
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a
s	mr.mrrefChr0	49077	11	+	130230	TAATTTGTAAC
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a
s	mr.mrrefChr0	49088	90	+	130230	GAACAAGGCCTCTCCTGTGCCACATCCCAAGAACTGTAGGGCTTAGCAAAATTGAAAAGGTTGTTAGGACAAACTAGTATAGGTAATACA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	44155	90	+	647215	AAACAAGGTCTCTCCTGTGCCACATCACAAGAACTGTGGAGCTTAGTAAAATTAAAGAGGGTGTTAGGACAAGCTAGTATGGGTAATACA

a
s	mr.mrrefChr0	49178	140	+	130230	TGAATGAGTATCAGAGGCTAATACAAGAATTCCCAAGATATGAGCAGCAGGTATGGGTTTCGTGTGGCATTAATGGGATTAAACAGCTGAGTTCACAAATCCACTGGTTGTTTAACATGTGGTTCCATACAGCCTGGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	51392	140	+	636262	CGAATGACTATCAGAGGCTAATACAAGAATTCCCAAGATATGAGCAGCAGGTATGGGTTGCGTGTGGCATTAATGGAATTAAACAGCTGAGTTCACAAATCCCTTGGTCGTTTAACATGTGGTTCCATACAGCCTGGATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	44245	140	+	647215	TGAACCAGTATCAGAGGATAATACAAGAATTCCCAAGATATGAGCAGCAGGTATGGGCTTTGTGTGGCACTAATGGGATTAAACAGCTGAGTTCACACATACACTAGTTGTTTAACATGTGGTTCCATACAGCCCAGATG

a
s	mr.mrrefChr0	49318	108	+	130230	TTGTGAGTACAGTATCCATGTAAGCAGCAAAGAAGATGATACTTTTGTATTCATATAGTTATGGATTATTATGCCTGCTAATCTTCATTATTGGTTGATTCATATGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	51532	108	+	636262	TTGTGAGTACAGTATCCATGTAAGCAGCAAAGAAGATGATACTTTTGTATTCATATAGTTATGGATTATTATGCCTGCTGATTTTCATTATTGGTTGATTCATATGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	44400	108	+	647215	TTATGATTGCAGTACTCATGTAAGCAGCAAAGAAGATGTTACTTTTGTATTCATATAGTTATGGATTATTACACCTGCTAATCTTCATTATTGGTTGCTTCATATGAT

a
s	mr.mrrefChr0	49426	42	+	130230	GATCTCCACAGGTGAGCTAGTTTTAATACTGACTGATCATCA
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a
s	mr.mrrefChr0	49468	31	+	130230	CCTTTCCAGGTTTCACCCTGTTCCCTCCTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	51682	27	+	636262	CCTTTC----TTTCACCCTGTCCTTTTCTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	44562	31	+	647215	CCTTTCCAGGTTTCACCCTGTTCCCTCCTAT

a
s	mr.mrrefChr0	49499	198	+	130230	ATAGAGGAACCTGGGTGTGTAGGAGCTTGATGTCAATTCTGCAGAGTAGTACATTGCTGCTTCTGAATCCACTCAGAGTTTAATCTCACCATCTAGGAACCGTGCTCCTTGCTACTATTAATTTACACACCTCTTTAAAATTTCTGTTATCACCCTTGTGGTCCATAACAATAATATCACCCTTTTACTTATAACTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	51742	197	+	636262	ATAAAGGAACCTGGGTGAGTAGGAGTTTGATGTCAATTCTGCAGAGTGGCACATTGCTGCTTCTGAATCCACTCAGA-TTTAATCTCACCATCTAGGAACCACACTCCTTGCTACTATTAATTTACACACCTCTTTAAAATTTCTGTTATCACCCTTGTGGTCCATATCAATAATATCACCCTTTTACTTATAACTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	44593	198	+	647215	TTAGAGGAACCTGGGTGTGTAGGATCTTGATGTCAATCCTACAGAGTAATAGATTGCTGCTTCTGAATCCACGCAGAGTTTAATCTCAGCATCTAAGAACCGTGCTCCTTGGTACTACTAATTTACACACCTCTTTAAAGTTTCTGTCATCACCCTTGTGGCCCATAACAATCATATCACCCTTTTACTTATTACTGA

a
s	mr.mrrefChr0	49697	227	+	130230	TGGCCTGTGAGCTGGAGGTTCTCAAGGCAACATTTACTTATGGTTCTGGTGCAATATCCAACTTATGTCTTTAATGTATCTTGTCTGGGGTCGTGCCTTTGATTTACAATCACTTTTGTCAGTGTGCATAGTGCTATATGATGTCAGAACTCTTACTTGGAGAAACTCATCTCATCAAGTAAATGTATCTGTCACATGAAGGGGAGCAGCTAGGGGGATATGCTGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	51946	215	+	636262	CATCCTGTGAGCTGGAGGTTCTCAAGGCAACAATTACTTATGGTTCTGGTGCAATATCCAACTTGTATCTTTAATGTATTTTGTCTGGGGTCCTGCCCTTGATTTACACTCACTTTTGTCAGTGTGCATAGTGCTATATGATTTCAGAACTCTTATTTGGAGAAAATCAT-TCATCAAGTAAATTTATCTGTC---TGAAGGGGAG--------GGGATATGCTGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	44791	227	+	647215	TGGCCTGTGAGCTTGAGGTTCTCAAGGCAACATTTACTTATGATTCTGGTGCAATATCCAATTCATGTCTTTAATGGATCTTGTCTGGCGTGGTGCCTTTGATTTCCAATCACTTTTATCAGAGTGCACAGTGCTATATGATGTCAGAACTCTTACTTGGAGAAACTCATCTCATCAACTAAATGTATCCGTCACATGAAGGGGAGCAGCTAGGGGGATACGTTGAC

a
s	mr.mrrefChr0	49924	167	+	130230	GACTACTCATCTGTCAATGGACCTAACCCAAACCTGGGGTACCATGAAATATTTTTTAATTCTTGCTATTTCTCACATTGCACCACATAGGGTTCAGATGACTGGTGGTAGAGCAAGATTAAGCCAGCTGAACAACTGTTCAGGATCTAAGTCTCCCATCACCAAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	52162	167	+	636262	AACTACTCATCCATCAATGGACCTAACCCAAACCCAGGGTACCATGAAATATTCTTTAATTCTTGCTATTTCTCACAATGCACCACATAGAGTTCAGATGACTGGTGCTAGAGCATGATTAAGCCAGCTGAACAACTGGTCAGGATCAAAGCCTCCCATCACCAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	45018	167	+	647215	GACTACTCATCTGTCAATGGACCAAACCCAGACCTGGGGCACCATGAAATATTTTTTAATTCTTGTTCTTTTTCATATTGCACCACATATGGTTCAGATGACTGGTGGTGGAGCAAGATTAAGCCATCTGAACAATTGTTCGGGATCTAAGTCTCCCATCACCAAGG

a
s	mr.mrrefChr0	50091	117	+	130230	GACCCTCTCAGACATTAACTGTCATTCACTGTAGGTGATCCAGTAGTGGATGTAAAGTAGTGCATGTTCATATACAAACTCTATATGCTATGTGAATGCTGCAACTGAGAGTCCCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	52330	117	+	636262	GACCCTCTCAGACATTAACTGTCATTCACTGTAGGTGATCCAGTAGTGGATGTAAAGTAGTGCATGTTCATATACAAGCTCTATATGCAATGTGAATGCTGCCACTGAGAGCCCCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	45185	86	+	647215	GACCCTCTCAAATATTAACTGTCAATCACTGTAGTTA------------------------------TCTTATACAAACT-TATATGCTATTTGAATGCTGCAGCTGAGAATCCCTA

a
s	mr.mrrefChr0	50208	103	+	130230	AGGCATGGTTAACAATATCATTGATGTGACTGTCAAGTGTCCCTAAGTCCCAGCTGACAGTCCATATATTAATATGCTCAAATGACCCCATTGAAGTCCTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	52447	103	+	636262	AGGCATGGTTAACAATATCATTGATGTGACTGTAAGGTGTCCCTAAGTCCCAGTTAACAGTCCATATATTAATATGCTCAAATGACCCCATTGAAGTCCTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	45274	103	+	647215	AGGCATGGTTAAGAATATCATTGATGTGACTGTCAAGTGTCCTTAAGTCCCAGCTGACAGTCCATGTATTAATATGCTTAAATGACCCCATTGAAGTCCTGAT

a
s	mr.mrrefChr0	50311	141	+	130230	CACACTGCATAGATTAGGGAGTGTAGTGGTGGGTGAAGAGAAGAATCTTCATTCCCAATTCCCATCCCAAAAGACTCAGCAACTGTTTGTAAGTAACAATTCCCTTTACTAATGAACATCAATGAAAATGCAGGATACGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	52550	140	+	636262	CACACTGCGTGGGTTAGGGAGT-TAGTGGTGGGCGAACAGAAGAATCTTCATTCCCAATTCCCATCCCAAAAGACTCAGCAACTGTTTGTAAGTAATAATTCTCTTTACTAATGAACATCAATGGAAATGCAGGATACGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	45385	134	+	647215	CACCCTGCATATATTAGGGAGTGTAGTGGTTGATGAAGAGAAGAATCTT-------AATTCCTATTCCTAAAGACTCAGCAACCGTTTGTAAGTAACAATTCCCTTTACTAATGAACATCAATGAAAATGCAGGATTCTAT

a
s	mr.mrrefChr0	50452	75	+	130230	CTGAGGAACTATATTCAGGAAAGATTAGTTAGATGACACTGACAAATGAAGCAAAAGCCTCCCATTTTAGTACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	52718	75	+	636262	CTGAGGAACTATATTCAGGAAAGACTAGTTAAATGACACTGACAAATGAAGCATAAGCCTCCCATTTTAGTACAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	45519	75	+	647215	CTTAAGCACTATATTGGGGAAGGATTAGCTAGATGACAGTGGTAAATGAAGCAAAAGCCTCCCAGTTTAATACAG

a
s	mr.mrrefChr0	50527	85	+	130230	GCCTCTTTCGAGGGACCTAAGAAGGGTTAGGCATTTTAGGATTCTGTTCCATAATCTCTTAGTACACCACTCCTGGCTCAACTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	52793	85	+	636262	GCCTCTTTCGAGGGACCTAAGAAGGGTTCGGCATTTTAGGATTCCGTTCCATAATCTCCTAGTACTCCACTCCCAGCTCAACTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	45596	66	+	647215	GC-------------------AAGGGTAAGGCATTTTAGGATTCTGTTCTATAATCTCTTAGTACACTGTTCCTGGCTCAACTAA

a
s	mr.mrrefChr0	50612	109	+	130230	AAGTGCATACATCTTCCAGCAAGTGGAAGCTCACAGGTCTCAGGATAATGTGTAGCGTCATTATTGACTTGTTTCATGGCTTTTGCATCTAAATTGTGCTTTACCTGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	52878	57	+	636262	----------------------------------------------------TAGCGTCATTATTGACTTGTTTCATGGCTTTTGCATCTAAATTGTGCTTTACCTGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	45881	109	+	647215	AAGTGCATACATCTTCCAGCAAGTGGAAGCTCACAGGTCTCAGGATAATGTGTAGCATCACTATTGACTCATTTTACTATTGACTCACTCATTTTATGTCTTTCATACC

a
s	mr.mrrefChr0	50721	9	+	130230	TATATAGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	52947	9	+	636262	TATATAGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	45990	9	+	647215	TAAACACTG

a
s	mr.mrrefChr0	50730	24	+	130230	CACAACTGAATTTCAGCCAATGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	52973	24	+	636262	CACAACTGAATTTCAGCCAATGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	45999	24	+	647215	TACAACCGATTATTATGCAATGAG

a
s	mr.mrrefChr0	50754	93	+	130230	CACAGATAACATATAAGAGCATGAGCCATGCAATATAGTCAGAAGACAGGTGGGAGTCATGAATTACTGGGATTCTCAATCAATCATTGGCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53003	93	+	636262	CACAGATAACATATAAGAGCATGAGCCATGCAATATAGTCAGAAGACAGGTGGGAGTCATGAATTACTGGGATTCTCAATCAATCATTGGCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46023	93	+	647215	CACAGATAACATGTAGGAGCATGAGCCATGCAATATAGTATGGAGACAGGTGGGATACTCTAATTACTGGGATTCTCAACAACTCATCAGCTC

a
s	mr.mrrefChr0	50847	30	+	130230	GACACTGATGCAGGTCCAAGATGATATATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53102	30	+	636262	GACACTGATGCAGGTCCAAGATGATATATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46116	30	+	647215	GACACTGACACAGGTCCAATCTGATGCTTA

a
s	mr.mrrefChr0	50877	71	+	130230	TGGAGAAAGATGGGATAGGTAGGCTTTCCTAGTTGTGAATAGAGAACGCATCATACTACTTGCACCTTGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53158	71	+	636262	TGGAGAAAGATGGGATAGGTAGGCTTTCCTAGTTGTGAATAGAGAACGCATCATACTACTTGCACCTTGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46146	71	+	647215	TGGAGAAAGATTAGATATGTAGGCTTCCCTATTTGTGAATCAAGAATGCATCATACTACTTGCACCATGTC

a
s	mr.mrrefChr0	50948	111	+	130230	ATAACCTGACCTACTGGTTGCAAAATAATTGTGATCCTTATCACATTTCTTATTGACACATGTCTCTGGTAGACAAGACACATAGGGTTGCTAATGACTGCTTGTTGTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53229	111	+	636262	ATAACCTGACCTACTGGTTGCAAAATAATTGTGATCCTTATCACATTTCTTATTGACACATGTCTCTGGTAGACAAGACACATAGGGTTGCTAATGACTGCTTGTTGTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46348	111	+	647215	ATAACCTGACCTATTGGTTGCACGATATTTGTGATCCATACCACATCTCTTATTTCCACATGTCTTTGGTAGACAAGACACGTGGGGTTGCTAATGACTGCTTGTTATGGG

a
s	mr.mrrefChr0	51059	13	+	130230	TGATGACTGTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53340	13	+	636262	TGATGACTGTAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46502	13	+	647215	TGATAACTGTGAA

a
s	mr.mrrefChr0	51072	34	+	130230	ACCTACTCACCGGGAGGGATCTCCTGTATGACGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53353	34	+	636262	ACCTACTCACCGGGAGGGATCTCCTGTATGACGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46516	34	+	647215	ACCTGCTCACCGGGAGGGATCTCCTGTATTACGG

a
s	mr.mrrefChr0	51106	8	+	130230	ACTTCCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53387	8	+	636262	ACTTCCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46551	8	+	647215	AATTCTAC

a
s	mr.mrrefChr0	51114	13	+	130230	ACATAGTGGTTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53411	13	+	636262	ACATAGTGGTTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46559	13	+	647215	ACATCATGGTTGG

a
s	mr.mrrefChr0	51127	41	+	130230	CTAAAGGTGGCCTtcactgggagggacctcctgtatgatag
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53444	41	+	636262	CTAAAGGTGGCCTtcactgggagggacctcctgtatgatag
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46572	41	+	647215	CTAAAGGTGGCCTTCACTGGAAGGGATCTCCTGTATGTTGG

a
s	mr.mrrefChr0	51168	24	+	130230	cttgaggtggcctagcccccactc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53527	24	+	636262	cttgaggtggcctagcccccactc
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46613	24	+	647215	CTAGaggtggcctaccccccactt

a
s	mr.mrrefChr0	51192	65	+	130230	agtccctttgtttgttaccaggtgcactagcgttttctttggaaagtttccagtAGCTCATAAGt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53551	65	+	636262	agtccctttgtttgttaccaggtgcactagcgttttctttggaaagtttccggtAGCTCATAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46638	65	+	647215	ggtccctgactttgctaccaggggcactagcgttttctttggaaagtttccagtagctcataagt

a
s	mr.mrrefChr0	51257	10	+	130230	gaggcccagt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53618	10	+	636262	GAGGCCCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46703	10	+	647215	gagacccagt

a
s	mr.mrrefChr0	51267	38	+	130230	AAGGGTGATCACACAAATTAGCTCTCTATCTGGTCAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53628	38	+	636262	AAAGGTGATCACTCAAATTAGCTCTCTATCTGGTCAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46763	38	+	647215	AAGGGTGATCACACAAATTAGCTTGCTATCGGGTCAAT

a
s	mr.mrrefChr0	51305	353	+	130230	TTTTATCAAGTACCCAGTGTAAAGGGTCAGGTAGACTTGATTGTGCCCTAATCATGCATTCATAGAGGTCACCAAAGAGTATGCATACTAAGTTGACACTGCTTAGCTCTAGAGGTAGTTAAGGGCGCTCAAATTTTATACAAAATAAGACTATCAGAACTCCAATTCAGTTGACAAGCCACCAACTGAGTTTGGCTACCTCTAGCAATGCCCTTAAGGCTCTTATGTCCAATGTGATCCTAATCTAATCATCATAATGTTCATTGACCTCCAGGAGTTTATTGTTTAATGATTAACTATTTAAACTTCCTATCTCGTGAACTGTGTAAGACTGATTGCAGGGGTTGCTGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	53685	350	+	636262	TTTTATCAAGTACCCAGTGTAAAGGGTCAGGTAGACTTGATTGTGCACTAATCATGTATTCATAGAGGTCACCAAA-AGTATGCACACTGAGTTGCCATAGTTCAGCTCCAGAGGTAGTTAAGGGCGCTCAAATTTTATACAAAATAAGACTATCAGAACTCCAATTTAGTTGATGTGCCAGCAACTGAGTTTGGCTACCTCTAGCAGTGCCCTTAAGGCACTTAAGTCCAGTGTGAT--TAATCTAATCATCATAATTTTCATTGACCTCCAGGAGTTTATTGTTTAATGATTAACTATTGAAATTTCCTATCTCGTGAACTGTGTAAGACTGATTGCAGGGGTTGCTGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46801	353	+	647215	GTTTATCAAGTACCCAGCGTAAAGGGTCAGGTAGACTTGATTGTGCCCTAATCATGCATTTATAGAGATCACCAAAGAGTATTCATACTAAGTTGACACTGCTTAGCTCTAGAGGTATTTGATGGATTTCAAATTTTCTATAAAATAAGACTCTCAGAACTCCAATTCAGTTGACAAGCAACCAATCAAGTTTGGCTACCTCTAGCAATGTCCTTGAGGCTCTTATATTCAATGTGATCCTAATCTAAACATCATAGAGTTCATTGAGCTCCAGGAGTTTATTGCTTGATGATTAAATATTTAAGCTTCCTACCTTGTGAACTGTGTAAGACTGATTGCAGGGGTTGCTGCAT

a
s	mr.mrrefChr0	51658	347	+	130230	ATAAGACAGACCCCCCACACTCTAGGAGCTTATTAAATCTACAGTGAATTTCTTCTGAGCACTCAAGGGAGTGATGCTGGCAAGAAGGCAATAAGCCAATAAGAAAAGTCCCCAGAGGTCCCAGAAGAGTTCCAACTGCCCAGCAGTGCAATGGCTGTGACCATTTCACAGGTTAAGAGCTATCGAGGGAGATCATGATGGGGTCTTGACATATTGTATTTCAACAATCATTAAATTAGCTGGGGTTGGGGAGTTTGTGGGTTCATAAACCATTAGTTAAGTCCTTAAATGGGTCAGATGAATGAGATTAGCTGTGCCGGCTGAGTGATAAATGATCATGATGCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54037	335	+	636262	ATAAGACAGACCCCCCACACTCTAGGAGCTTATTAAATCTACAGTGAATTTCTTCTGAGCACTCAAGGGAGTG----TGGCAAGAAGGGAACAAGCCAATAAGAAAAGTACCCAGAGGTCACAGAAGAGT--------CCCAGCAGTGCAATGGCTGTGACCATTTCACAGGTTAAGAGCTATCAAGGGAGATCATGATGGGGTCTTGACATATTGTATTTCAACAATCATTAAATTAGCAGGGGTTCGGGAGTCTGTGGGTTCATAAACCATTAGTTAAGTCCTTAAATGGGTCAGGTGAATGAGATAGGCTGCGCCGGCTGAGTAATAAATGATCATGATGCATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47154	341	+	647215	ATAAGACACACCCCCCATACTCTAGGAGCTTATTAGATCTACAGTGAATTTCTTCTGAGCACCCAAGGGAGTGATGCTGGCAAGAATGCTGTAACCCAATAAGAAAAGTCCCCAGTGGTCCCAGAAGAGTTCCAACTGCCCAGCAGTGCAATT------ACCATTTCACAGGTTAAGAGCCATCGAGGGAGATTATGATGGGATCCTGATATACTTTATTTCAACAATCATTAGGTTAGCTGAGGTTGGGGAATTCGTGGGTCCATAGACCATCATTTAAGTTCTGAAATGGATCAGATGAACAAAATTAGCCGTGCCGGCTGAGTGATAAATGATCAGGATGCATG

a
s	mr.mrrefChr0	52005	11	+	130230	TAAGTTGCTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54376	8	+	636262	TAAGTTTT---
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47495	11	+	647215	TAAGTTGCTAG

a
s	mr.mrrefChr0	52016	77	+	130230	GGCAATGAAAAATGCTTAGGGTCCCAAGGGTTTGGTTTACATCCTTCTTTTTGGGGTTTAAAAGGACTGCTGACATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54384	77	+	636262	GGCAATAAAAAGTGCTTAGGGTCCCAAGGGTTTGGTTTAAATCCTTCTTTTTGAGGTTTAAAAGGACTGCTGACATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54578	77	+	636262	GGCAACGAAACATACTTAGTGTCCCAAGAGTTTTGTTTACATCCCTCTTTTTGGGGTTGAAAAGGAATGCTGACATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47506	62	+	647215	GGCAATGAGAAATGCTTCGGGTCCCAAGGGTTTGGTTTACATCCTTCTTTTGGGGGAGT---------------ATC

a
s	mr.mrrefChr0	52093	6	+	130230	CTAAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54461	6	+	636262	CTAAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54656	6	+	636262	TTAAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47568	6	+	647215	CTGAAC

a
s	mr.mrrefChr0	52099	1	+	130230	A
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54662	1	+	636262	A
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47574	1	+	647215	A

a
s	mr.mrrefChr0	52100	24	+	130230	TATTGTTGGAGATATGAGATGCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54467	24	+	636262	TATTGTTGGAGATATGAGGTGCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54663	24	+	636262	TATTGTTGGAGATATGAGATGCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47575	24	+	647215	TATTATTGTAGATATGAGATGCTG

a
s	mr.mrrefChr0	52124	1	+	130230	T
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54687	1	+	636262	T
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47599	1	+	647215	T

a
s	mr.mrrefChr0	52125	82	+	130230	TCCTAAAGACTTTCCTCTAGGTAACCGTTATGTTGTTTGCTTTGCCCATACCATACTGGACCAAGGCACAGTTTGATTATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54491	82	+	636262	TCCTAAAGACTTTCCTCGAGGTAACAGTTATGTTGTTTGCTTTGCCCATATCATACTGGACCTAGGCACAGTTTGATTATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54688	82	+	636262	TCCTAAAGAATATCCTCTAGGTAACCATTATGTTGTTTGCTTTGCATGTACCATACTGGACCAAGGCACAGTTTGATTAGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47600	79	+	647215	TCCTAAAGACTTTCCTCTAGGTAACCGTTATGTTGTTTGCTTTGCCCATGCTATACTGGACTAAGGCACAGTTTGATAA---

a
s	mr.mrrefChr0	52207	29	+	130230	TCACACTTTGGTTATCACACAAATTTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54789	29	+	636262	TCACACTTTGGTTATCACACAAATTTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47679	29	+	647215	TCACACTTTGATTATCACATAAGTTTGAT

a
s	mr.mrrefChr0	52236	5	+	130230	TATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54573	5	+	636262	CATAG
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a
s	mr.mrrefChr0	52241	80	+	130230	CACAGCATCTTGTCATTGTCTAGATTATGCTTCCAAGGACCCATAGGCATAAAATATAACAACCAATAGGCAATGTGAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54823	78	+	636262	CACAGCATCTTGTCATTGTCTAGAATATG--TCCAAGGACCCATAGGCATAAAATATAACAACCAATAGGCAATGTGAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47713	80	+	647215	CACACCACCTTGTCATTGTTGAGATTATGCTTCCAAGGACCCATAGGCATGAAATATAACAACCAATAGGCAATGTCAGA

a
s	mr.mrrefChr0	52321	55	+	130230	ACAGGACAGTAGTGAATCACCTGGCACTAAATTGGTGCACCAGCTCAGATATAGG
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a
s	mr.mrrefChr0	52376	23	+	130230	AAATTCGAGGACTATCATCATTA
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a
s	mr.mrrefChr0	52399	224	+	130230	TTTACTTCCTACTGAGTATGTGCCAGGCCTACATATTTTTCCACTGAGTATGTACCAGGTGTGCAACTGTTCCTTCATTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCCTGAAATTTTTGCCTGCCTGTATCAGGCCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTCGGCATACCTATCTTTTGCATTCATTAGGTAGAATTGGCACAATGTCCACTGAAGCTCCATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	54979	224	+	636262	TTTACTTCCTACTGAGTATGTGCCAGGCCTACATATTTTTCCACTGAGTATGTACCAGGTGTGCAACTGTTCCTTCATTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCCTGAAATTTTTGCCTGCCTGTATCAGGCCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTCGGCATACCTATCTTTTGCATTCATTAGGTAGAATTGGCACAATGTCCACTGAAGCTCCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48124	224	+	647215	TTTGCTTCACACTTAGTATGTGCCAGGTCTAAATCTGATTTCACTGAGTATGTGCTAGGCCTGCAACCATTTCTTCGTTACTAGTATAAAACAGCTCATGCCCTTGAAATTATTGCATTGATGTATCAGACCTAAAAATGGTATTAATCTTCAGGGACTGCTGGGCATACGTGTCTCTTGCATTCAGTAGGTATAATTAGAGTAATATGCACTGAGGCTCCATG

a
s	mr.mrrefChr0	52623	99	+	130230	TGACATCTAACACAGTATGCCCCTTGTGATTGGCTCACCAGAAGATTGAGTTTAAATGCAATTGTGTGTCTATATACATTGAGCGGCCAACGTTGTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	55203	99	+	636262	TGACATCTAACACAGTATGCCCCTTGTGATTGGCTCACCAGAAGATTGAGTTTAAATGCAATTGTGTGTCTATATACATTGAGCGGCCAACGTTGTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48349	99	+	647215	TGACAACTAACACAGTATCTCCCGTGTGAATGGCCCACAAGAGGATTCAGTCGAAGAGCAATTGTGTGGCTGTATACAATGAATGGCCAACATTGAATG

a
s	mr.mrrefChr0	52722	111	+	130230	CCATGAGTGCCTATTGGATCTCTTAACTTGGCGCGGGCAGGTTGCACCCCATGTAAGCTGAAACTACACTATTGCAATTATGGCAGAGCCTGATAGACAACCTGCTGTAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	55302	109	+	636262	CCATGAGTGCCTATTGGATCTCTTAACTTGGCGCGGGCAGGTTGCACCCCATGTAAGCTGAAACTACACTATTGCAATCA-GGCAGAGCCTG-TAGATAACCTGCTGTAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48487	111	+	647215	ACATAGGTGCCTATTGGATCTCTTAACTCGGCACGGGCAGGTTGTGCCCCATGTAAACCGAAGGCACATTATTGCAATTATGGCAGGGCCTGATAAACAACCTGCTGTAAT

a
s	mr.mrrefChr0	52833	50	+	130230	GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACATTGACCTTGCAACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	55411	50	+	636262	GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACAATGAACTTGCAACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48601	50	+	647215	GACTGCTATAGAGCATATCAAGGTTATGGCCAACATTGACCTTGCAACTA

a
s	mr.mrrefChr0	52883	110	+	130230	TAAACTTTTGAGAGCATTGGATAGTTTACATGCCTCGATAGTACTTAGAAATGTTTTCATAAGCATAAATTATTGGTTTTTCTGGCTTTTCAAGATCATGGGTCTTAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	55473	103	+	636262	TAAACTTTTGAGAGCACTGGATAGTTTACATGCCTCGATAGTACTTAGAAACGTTTTCATAAGCATGAATTATTGATTTTTCGGGCTTTTCAAGATCATGGGT-------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48651	110	+	647215	TAAATTTTTAAGAGCATTGGACAGTTTACATGCCTCGATAGTACTTAGAAATGCTTGCACAAGCATAAATTATTGGTTTTTCTGGCTTTTCAAGATCATGGATCTTAATT

a
s	mr.mrrefChr0	52993	266	+	130230	TCTAATTAACTACACCACTTGTTCTGAGGAATTAATACTAAGGGGGATGACATTTCCCTAGCTATCAGAGCATTGCCGGATGACATTGGTTGGCTTCCCGGACCTGCAGAAGAACAAACCACCCAAACATGTTGCACTGAAGATGATTCTGTTGTCCTCCCACATGACAGCTTATGGTAACAAAACACTCATTGGAAGGAGTGAAAGGGTGACTCACAGTCCGCAGAGAGGGAAGGGGACACAAACCCACTATAGAGATGTTCTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	55576	265	+	636262	TCTAACTAACTACACCACTTGTTCTGAGGAATTAATACTAAGGGGGATGACATTTCCCTAGCTATCAGAGCATTGCCGGATGACATTGGTTGGCTTCCCGGGCCTGCAGAAGTACAAACCACCCAAGCATGTTGTGCCAAAGATGGTTCTGTTGTCCTTCCACATGACAGCTTAAGGTAACAAAACACTCATTGGAAGGAGTGAAAGGGTGACTCACAGTCCACAGAGAGCGAAAGGG-CACTAACCCATTATAGAGATGTTCTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48765	263	+	647215	TTTAATTAACTACACCACTTGTTCTGAGGAATTCATACTAAGGGAGATGACATTTTCCTAGCTATAGGGGCATTGCTGGAGGGCATTGGTTGGCTTCCTGGACCTGCAGGAGAACAAAC-GCCCAAACATGTTGCACTGAAGATAATTCTGTTGCCCTCCCATATGACAGGTTATGGTAACAAAACACTCATTGGAATGAGTGAAACGGTGACTCACAATGCGCT--GGAGCGAGTGGACACAAACCCGCTATAGAGATGTTCTGG

a
s	mr.mrrefChr0	53259	205	+	130230	GCCCTCAATGATAAGGGCAAGGCCCCACCACTTAGGAGAGAGCAACTTCAGAGTAGTCAGTAGTCATAAAAAATTAGCTTAGCAAATGCAATTGGAAGTTATGAACAGGATGAAGTTGCTCACTACGAACATGCTTTATATAATATGAGACATGTTAAATCGATATGAGAAGTGGTGGACTGAATAGTAGTGCCTTCCCAATTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	55842	204	+	636262	ACGCTCAATGATAAGGGCAAGGTCCCACCACTTAGGAGAGAGCAGCTTCAAAGTAGTCAGTAGTCATTAAAAATTAGCTTAGCAAATTCAATTGGAAGTTATGAACAAGATGAAGTTGCTCACTATGAACATGCTTTATATAATATGAGACATGTTAAATCGATATGAGAAGTGATGGACTGAATACTTGTGCCTTCCCAATAC-
s	simRat_chr6.simRat.chr6	49028	189	+	647215	GCCCTCAATGCAAAGGGCAAGGCCCCACCACTTAGGAGAGAACAACTTCAGAGTAGTTAGTATTCATAAAA---TAGCTTAGCAAATG-----GGATGCTAAGGACAGGATGAAGTGGCTCAGTACGAACGTGCTTTATACAATATGAGTCGTGTTGAATCGATAT--------GTGGACGGAATTGTAGCGCCTTCATAATTCA

a
s	mr.mrrefChr0	53464	61	+	130230	TGTGGGTTCCTACCACAAGCAAACTTATAATTCTTGTAAAGTTAGAAAGTCTGCTTGGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	56046	61	+	636262	TGTGGGTTCCTACCACAAGCAAACTTATAACTCTTGTAAAGTTAGAAAGTCTGCTTGGTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	49221	61	+	647215	CGTGCGTTCCTGCCACAAACAAACTTAAAATTCTTGCAAAGTTAGAAGGTCTGCTTGGTAT

a
s	mr.mrrefChr0	53525	8	+	130230	GGGATTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	56111	8	+	636262	GGGATTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	49282	8	+	647215	GAGATTGC

a
s	mr.mrrefChr0	53533	3	+	130230	ATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	56131	3	+	636262	ATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	49290	3	+	647215	ATA

a
s	mr.mrrefChr0	53536	271	+	130230	ATCACTGTATAATTTTGATAAACTGGTTCCCACTAAATAAGTTTAAAATTGGAGTGATCTATGAGTCTGCATTTTGGTATGGATTTGTGCCACATCCACAACCAGGGCTCAAGATGTAAGCAGTGGTGGTGGTATAGGGTATCCCACTTAGTTTCAGTGATCAACATTTCTTTGTTAATATGAGTGTTGTATATATAGCATCAGTTGTACAGGTAGCATCAGAACTGGCATTGATGATAAAGGGTAACGGATCAGCAAAGCTGTCAGGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	56134	267	+	636262	ATCACTGTGTAATTTCAATAAACTGGTTCCCACTAAATGAGTTAAAAATTGGAGTGATCTATGAGTCTGCATTTTGGTATGGACTTGTGCCACATCCACAACCAGGGCTCAAGATGTAAGCAGTGGTGGTGGTATAGGGTACCCCAATTAGTTTCAGGGATCAACATTTCTGTGTTAATATGAGT-TTGTTCATATATCATC---TGTACAGGTAGCATCAGAATCGGCATTGATGATAAAGGGTAACGGATCACCAAAGCTGTCAGGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	49294	266	+	647215	ATCACTGAATAATTTTGATAAACTGGTTCCCACTAAATAAGTTTAAGATTGGAAAGATTTATGAGCCTGCATTTTGGTATGGATTTGTGCCAGATCCGCAACCAGGACGCAAGATGTAAGCAGTGGTGATGGTATTGGATATCCCACTTAGTTTCAGTGATCAAAATTTCTTTGTTAATATGAGTGTTGTATATATAGCATCAGTTGTACAGGTATCATCA--ACTGGCGTTGATGATAAAGGGTAACGGATCAGCAAAGCCG---GGCAA

a
s	mr.mrrefChr0	53807	29	+	130230	CCACATCTTCCATAACTGAATTCTATTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	56401	29	+	636262	CCACCACTTCCATAACTGAACTCTATTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	49561	29	+	647215	CCACATCTTCCATAACTGACTTATAGTAA

a
s	mr.mrrefChr0	53836	37	+	130230	TTGAATGTTTAAAGATACAGAAAGCACTTGGTATTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	56430	37	+	636262	TTGAATGTTTAAAGATACAGAAAGCACTTGGTATTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	49856	37	+	647215	TTAAATGTTTAAGGATACAGAAAGCACTTGGTATTTC

a
s	mr.mrrefChr0	53873	94	+	130230	CATAGGATCAACATAGTCTTTACACCAACCCACTCAACTTTACTGTACAGATGTATTAAGACTGTCTAGCTGTTTCTTCTCAAGTGCATGTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	56467	94	+	636262	CATGGGATCAACATAGTCTTTACAGCAACCCACTCAACTTTACTGTACAGGTGTATTAAGACTGTCTAGCTGTTCCGTCTCAAGTGCATGTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	49895	94	+	647215	CATAGGATCAACATAGTCTTTACACCAACCCACCCAACTCTACTGTACAGATGTATTAAGACTGACTAGTGGTTTCTTCTCAAGTCGTTGTGGT

a
s	mr.mrrefChr0	53967	133	+	130230	AATGTTAGATCAGTGTCCACTAAATGTATGTCTTAAGAATTGTTCATTGGAGAGAGTGCATAAAGCATCCTAGAATCTTAGCCCAATACATATATGAGATATTCAACTGGAGCCGTAATTACATGACTTGACG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	56562	133	+	636262	AATGTTAGATCAGTGTTCACTAAATGTATGTCTTAAGGATTGTTCATTGGAGAGAGTGCATAAAGCATCCTAGAACCTTAGCCCAATACATATACTAGATATTCAGCTGGAGCCATAATTACATGACTTGACG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	49989	133	+	647215	AATGGAAGATCAATGTCCACTAAATGTATGTTTTAAGAATTGGTCACTGGGGAGGGTGCATAAAGCATCGTAGAATCTTAGCCCAATACATATATGAGATATTCAACTGGGGCTGCAACTACATGACTTTGCG

a
s	mr.mrrefChr0	54100	123	+	130230	AGAAATTCTTGGGGATCAATGGGTGTCATTGCCTGACTGACACTAGTTGATGGAGGTCTGCTGTCTAGGAAAGTTATGATATTTAAACTAGGTTGTAGCGGAAGACTTGCATATCCATTTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	56794	120	+	636262	AGAAATTCTTGGAGATCAATGGGTGCCGTTACCTGACTGACACTAGTTGATGGAGGTCTGCTGTCTAGGAAAGTTATAATATTTAAACTAGCTAGTAGCGG---ACTTGCATATCCATTTAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	50122	123	+	647215	ACAAATTCTAGGGGAGCAATTGATGTCATTGCCTGACTGACACTAGTTGATGGAGGTCTGCTATCTAGGAAAACTATGATATTTAAACTAGGTTGTAGTGGAAGACTTGCATTTCCATTTAGA

a
s	mr.mrrefChr0	54223	304	+	130230	GTATGTGCCTAATCCAGTCATTAAGAGTTTTGAATGTCATTTTGTCAATGGCACAGAGATAGGGGCACTAGCAACAACCCCTTGACCACTTCAGGGCATATTGCCAGTGATGGGGAATAAGGATAGGTAATCAATCTCCAAGGAGGTAAACTCAAGGAAGGGGCCACTGGTCTTGTAGATTAACTATCAATGTATTTATATATTTTACACCCACAGATGCTCAGCAATTCTTTAGTAGTCTTGGGTCAACAACCCCATTGCTGTTTCAAACTACTCAGAACCCTTCTGCTACATTAAAACACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	56917	295	+	636262	GTATGTGCATAATCCAGTCATTAAGAGTTTTGAATGTCATTTTGTCAATGACACAGGGATAGGGGCACTAGCAACAACCCCTTGACCACTCCAGGGCATATTGCCAGTGATGGTGAA---------GTAATCAATCTCCAAGGAGGTAAAATCAAGGAAGGGGCCACTCGTTTTGTAGATTAACCATCAATGTATTTATATATTTCACACCCACAGATGCTCAGCAAGTCTTTAGTAGTCTTGGGTCAACAATTCCATTGCTGTGTCAAACTACTCAGAAGCCTTCTGCTACATTAGAACACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	50245	297	+	647215	GTATGAGCCTAATCCAGTCATTAAGAGTTTTGAATGTCATTTTGTCAATGGCACAGAGATAGGGGCACTAGCAACAACCCCTTGAACACTTCAGCACGTATTGCCAGTAATAGGGAATAAGGATAGGTAATCAATTTACAAGGAGGTAAACTCAAGGAGGCGGCCACCGATCTTGTAGATTAACTATCAATGTGTTTATTCATTTTACACCCACAGATGCTCAGCAATTCTTTAGGAGTCTAGGGTCAACGACCCCATTGTTGTTTCAAACTACTCAGAACCATTCTGCTACATTAA-------

a
s	mr.mrrefChr0	54527	64	+	130230	CCTAGCCCTTCTTGATGACCCTAGGGTTTTCTCATTCATAAGACATCACACCAGGTCCATGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	57215	64	+	636262	CCTAGCCCTTCTTGATGACTCTAGGGTTTTCTCATTCATAAGACATCACACCAGGTCCATGAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	50542	45	+	647215	-------------------CCTAGGGTTTTCTTATTCATAAGACCTCATGCCAGGTCCATGACA

a
s	mr.mrrefChr0	54591	160	+	130230	CTGATGAGGCTCCCTACTTTTGAGGAATGAAGATGCATTACTTTCTATTCCATACGTTGTTTAGTGTCAGTCATGCCCTACAATCACACTGACACAAGTTCAGTTTAACAGGGGTTATAACTATATATCTACTTTCATTGTCCCAATAACTGACCTATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	57279	160	+	636262	TTGATGAGCCTCCCTACTTTTGAGGAATGGCAATGCACTATTTTCTATTCCATACATTGTTTAGTATCAGTCATACCCTACAATCACAATGACACAAGTTCAGTTTAACAGGGGTTATAGCTATATATCTATTTTCATTGTCCCATCAACTGACCTATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	50591	160	+	647215	CTGAAGAGGCTCCCTATTCTTGTGGAACAAAGATGTGTTACTTTCTATTCCATGTGTTGTTTAGTGCCAGTTGTGCCCTACAATTACACTGACACAAGATCAGTTTAACAGGGGTTATAACTATATATCTACCTTCATTGTCTCAATAACTGACCTACTT

a
s	mr.mrrefChr0	54751	226	+	130230	CAACAGATTCCCCTGAAAAGTCTATCTTCTGGGTATTTTGGCCATGAACATCAAATCAATAGTGGATTCATAGTCATGTTCTGGGGGACATCAGTTTATGAGAATGGTCATGCAGGCCCAAGAAGGACCAAGAGTCATTCTGCCAATGTCATCAGTCTGGAGCATGTCCATGCTCTAGAGATACCCAATGACTGCCCTGCAGAAGCCAGCTTAACCAAAAATTCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	57439	226	+	636262	CAACAGATTCCCCTGAAAAGTCTATCTTCTGGGTATTTTGGCCATGAACATCAAATCAGTAGTGGATTCATAGTCATGTTCTGGGGGACATCAGTTTATGAGAGTGGTCATGCAGGCCCAAGAAGGACCAAGAGTCATTCTACCAGTGTCATCAGTCTGGAGAATGTCCATGCTCTAGGGATACCCAATGACTGCCCTGCAGAAGCCAGCTTAACCAAAAATCCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	50759	225	+	647215	CATCAGATTTCCCTGGAACGTCTATGTTCTGGGGATTTTGGCCATGAATATCAAATCAATAGTGGATTCATAGTCATGTTCTGGAGGACATCAGTTTATGAGAATG-TGATGTAGGACCAAGAGGGACCAAGAGTGATTCTGCGAATTTCATCAGTCTATAGCATGTCCATGCTCCAGAGATACCCAATGACTGCCCTGCAGAAGCCAGCTTAAGCAAAAATTTAT

a
s	mr.mrrefChr0	54977	70	+	130230	GTGGTCCCTAGAGTGGTGCCTGAACCAGACTGTTAACACAAACAAACAAGATGTTCTCATTCAGCTAACG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	57672	70	+	636262	GTGGTCCCTAGGGTGGTGCTTGAACCAGACTGTTAACACAAACAAACAAGATGTTCTCATTCAGCTAACG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	50984	70	+	647215	ATGGTCCCTAGAGTGGTGCCTGAACAAGACTGTTCACACAAGCAGACAAGATGTTCTCATTCAGTTAACA

a
s	mr.mrrefChr0	55047	42	+	130230	TGGATCATTGCAAAATTAGGGCACAGGATCATGCGTCACTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	57748	42	+	636262	TGGATCATTGCAAAGTTAGGGCACAGGACCATGCGTCACTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	51054	42	+	647215	TGGATGATTGCCAAATTAGGACACAGGATCACGCGTCACTTT

a
s	mr.mrrefChr0	55089	50	+	130230	TGGACACCTCTCTCTTAGACATTCCTACATGTGAACAGGACAACATACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	57791	50	+	636262	TGGACACCTCTCTCTTAGACATTCCTAGATTTGAATAGGACCACATACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	51096	50	+	647215	TAGATACCTCCCTTTTAAACATTGCTACGTGGGAACAGGACAACATACAT

a
s	mr.mrrefChr0	55139	45	+	130230	TCCATTGCACCTGTTTGTACCTGGCCTGGGTAAACTGTATACCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	57843	45	+	636262	TCCATTGCACCTGTTTGTACCTGGCCTGGGTAAACTGTATACCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	51146	45	+	647215	TCCATTGCACCTGTTTGTACCTAGCCTGGGTAAACTTTATACCAC

a
s	mr.mrrefChr0	55184	178	+	130230	GGATAACAGATCACTAACTTTTGCAGCATCTATGTGATAAATCTGTTTGGGTGAAAGTCTGATTGGGTGTCTGGATGCAATGTCAGTATGCTAATGACCTATGGGTGTATTCTTGTTCAGTACTTCCTATGCACAAGACCATAGTGCACATCAAGCACTTCTTATAGACACTAATAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	57888	178	+	636262	GGATAACAGATCACTAACTTTTGCAGCATCTATGTGATAAATCTGTTTGGGTGAAAGTCTGATTGGGTGTCTGGATGCAATGTCAGTATGCTAATGACCTATGGGTGTATTCTTGTTCAGTACTTTGTATGCACAAGACTATAGTGCGCATCAAGCACTTCTTATAGACACTAATAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	51193	178	+	647215	GGATAACCGATCACCAACTTTTGAAGCATCTATGTAATAAATCTGGTTGAGTGCAAGTCTGGATGGGTGCATGGATGCAATGTCAGTGTGCTAACGACCTATGGGTGAATTCTTGGCCAACACTTCCTATGCACAGGATCATGGTGCACATCATGCACTCCTTATAGACACTGGCAAT

a
s	mr.mrrefChr0	55362	84	+	130230	GATGACAAGAGCATTATTTGATACTTGTTAAGGGTGGATCAACTTGTATCCTCTCTGTCAGTTTTGATCATCTGTGTCTATGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	58066	84	+	636262	GATGACAAGAGCATTATTTGATACTTGTTAAGGGTGGATCAACTTGTATCCTCTCTGTTAGTTTTGGTCATCTGTGTCTATGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	51372	84	+	647215	GATGACAAGATCATTATTTGATACTTGTCAAGGACGGATCAACTTGTATCCTCTCTGTCAGCTTTGATCATCTGTGTTTATGCC

a
s	mr.mrrefChr0	55446	175	+	130230	ACATACCCACACAATCTGTGTCCATACCACATATTACACATTCATTATTTAGATTAGATAATTTAAACAATCCTTGCAGCCACTGGATCACCTGATGCTTACCATGCATGTGCCCTGCATGTGACTATAATTGATGGGGTAAAGATATTAAAATGATGGCCTTTATCATACTTCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	58150	172	+	636262	ACATACCCAGACAATCTGTGTCCACACCACATATTACACATTCATTATTTAGATTAGATAATTTAAACAATCCTTGCCGCCACTGGG-CACCTGATGCACACCATGCATGTGCCCTGCATGTGACTATAACTGATGCG-TAAAGATATTAAAATG-TGGCCTTTATCATACTTCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	51457	168	+	647215	ACATACCCACACAATCTGTCTCCATGCCACATATTACACATTCA-------GATTAGATAATTTAGACAATCCTTGCAGCCACTGGATCACCTCATGCTTACCATGCATGTGCCATGCATGTGACTATAATTGATGGGGTAAAGATATTAAAATGATGGCCTTTATCATACTGCG

a
s	mr.mrrefChr0	55621	101	+	130230	TGTAACTACACAGTTTAATGAGCATTCCAAGTGTCACACATATTCAGTTTGTTATGTTTGATATTCAATCATTGTGTGTCTTACAGAAACCCTTGTAAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	58322	101	+	636262	TGCAACTACACAGTTTGTTGAGCATTGCAAGTGTCACACATATTCAGGTTGTTATGTTTGATATTCAATCATTATATGTCTTACAGAAACCCTTGTAAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	51626	96	+	647215	TATAACTACACAGTTCAATGGGCATCCCAGGTGTCACACATATTCAGTTTGCTA-----GATATTCATTCATTGTGTATCTTACAGAAACCTCTGTAAGAT

a
s	mr.mrrefChr0	55722	89	+	130230	ATGTAAACTACAATGATGCGCTCTGACTCAATACTTGTATAACTGAGTCAAGACAAATATTAACATCTGCATGTGTTCACATCACAAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	58482	89	+	636262	ATGTAAACTACAATGATGCACTCTGACTCAATGCTTAAATAACTGAGTCAAGACAAATATTAGTGTCTGCATGTATTCACATCACAAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	51722	89	+	647215	ATGTAAACTACAATGATGCGCTTTGACTCAATACTTGTGTAGATGAGTCAAGACAAATATTAACATCTGCATGTGTTCACATCACAAGG

a
s	mr.mrrefChr0	55811	362	+	130230	ACTGTGAGTTTGCTAGGAGTGTGTCTTAGGGAAGACATCTGCATGAATCAATTTAGGGTATTTTGTGAATAGTCACTATACCGAGGTGAAGACATATTTTGAAAAAATTGTAGGTATCAAGCCCTTTAACATAAAGGGAAATATAAGAATAGGCCTTGTACGAGTTCTGACATGCCTGCACTGAGATGATGTCTTAAAATAACTTGCATTTGGTCTGGGGCCATTAATATTTAATTGCAAACAATGAGGTTGTCAACATGTTCTTATAAGTGAGGGTAGAAAGAGACTGGCTGATTCAGTAAGTGTTACAGTACATAGTCTCAATGTTATGGGTACTTCTGAGGTACTTACAGTGCTACATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	58572	341	+	636262	ACTGTGAGTTTGCTAGAAGTGTGTCTTGGGGAAGATGTCT------ATCAATTTAGGGTATTTTGTGAATAGTCACTATTCCGAAGTGAAGACAT-----CAAAAAATTGCAGGTATCAAGCTCTTTAACATAAAGGGCAATATAAGAATCAGCCTTGTACGGG-----ACATGCCGGCACTGAGATGATGTCTTAAAGTAACCTGGCTTTGGTCTAGAGCCATTAATATTTGATTGCCAACAATGAGGTTGTCAACATATTCTTATAAGTCTGGGTAGAAAGGGACTGACTGATTCAGTAA-TGTTACAGTCCATAGTCCCATTGTTATG----CTTCTGAGGTACTTACAGTGCTAAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	51811	361	+	647215	ACTGTGAGTTTGCTAGGAGTGTGTCTTAGGGAAGACATCTGCATGACTCAATTTAGGGTATTTTGTGAATAGTCACTTTACCGAGGTGAAGACATATTTTGAAAAAATTGTAGGTATAAAGCCCTTTAACATAAATGGAAATAGAAGAATAGGCCTTGTAGGAGTTCTGACATGCCTGCACTGAG-TGATGTCTTAAAAAAACTTGCATTTGGTTTGGGGCCATTAGTATTTAATTCCAGACAATGAGGTTGTCCACATGCTCTTATAAGTGAGGGTAGAAAGAGACTGGCTGACTCAGTAAGTGTTACAGTATATAGTCTCAACGTTATGGGTACTTCTGAGATACTTACAGTGCTACATA

a
s	mr.mrrefChr0	56173	89	+	130230	AAATTATTAAGTTAATTCAACCATAGTTAATCTTAATTCAACTATAGCCTTTTTTGTTCCTATCAAAAGGTTGTTGTAAAAAAACCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	58913	88	+	636262	AAATTATTAACTTAATTCAACCATAGTTAATCTTAATTCAACTATTGCCTTTTTTGTTCCTATCAAAAGGTCGTTGTAAAAAAACCT-T
s	simRat_chr6.simRat.chr6	52179	89	+	647215	AAATTATCAAGATAATTCAACTATAGTTAATCTTAATTCAACTATAGCCTTTTTAATTCCTGTCATAAGATTGTTGTAAAAAAACCCAT

a
s	mr.mrrefChr0	56262	20	+	130230	GTCCAGCGTGCAATTCACCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	59001	20	+	636262	ATCCAGCGTGCAATTCACCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	52321	20	+	647215	GTCCAGCATGCAATTTACCT

a
s	mr.mrrefChr0	56282	235	+	130230	TAACCATTGTAAATCAGTTGATTGCACTTAATGACTGACACTGTATGGGGCTGGTGCAAATCACTTAGCTTTTGTTCTTTTTGTATAGTTAAAAGAAAGTTGTGTGAAATGCAATTTTTAAAATTTGGTGAAATTTGCTGAGTTTAGAGCAATGATCCTCCATATTCATTTCAAGTATGAGAATTGACATTTGTTACATATCCTGCATCCTAAACATAGTTTGGATATGATATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	59030	235	+	636262	TAACCATTGTAAATCAGTTGATTGCACTTAATGACTGACACTGTATGGGGCTGGAGCAAATCACTTAGCTTTCGTTCTTTTTGTATAGTTAAAGGAAAATTGTGTGAAATGCAATTTTGAAAATTTGGTGAAATTTGCTGAGGTTAGAGCAATGATCCTCCATGTGCATTTTAAGCATGAGAATTGACGTTTGTTACATATCCTGCGTCCTAAACATAGTTTGGATATGATATGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	52341	232	+	647215	TAGCCATTGTAGATCAGTTGATTACACTTAATTACTGACACTGTATGGGGCTCGTGCAAATTACTTGGCTTTTGTTCTTTTTGTATAGTTAAAAGAAAGTTGTGTGAAATGCAATTTTTGAAATTTGGTGAAACTTGCTGAGTTTAGAGCAAAAATCC---ATATTCATCTCAAGTATGATAATTGACATTTGTTTCATATCCTGCATCCTAAACTTAGTTTGGGTATGATATGA

a
s	mr.mrrefChr0	56517	209	+	130230	TAAGCTAGTTCAACGAAGGCTATGGAACAATGCTGGCAACCCAAGACTTAACCAGTATTAATCACTTTTATTACTCCACAGGCTGTGCGTTCCAGTCATCAGTCAAGCTGTTCGGTCACACTCATGTCAGCAAGTATACAGCCAGGGACTTACAGTCTGTATAATTTGTCGTTGCTTTTTCTTGTGGCAACAGAAGTCATCTTATTACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	59265	156	+	636262	TAAGCTAGTTCAACGAAGGCTATGGAACAATCCTGGCAACCCAAGACTTAAC------TAATCACTTTTATTACTCCACAGGCTGTGCGATC--------------------------CACTCATGCCAGCAAGTATACAGCCAGGGATTTACAGTCTGTATAATTTGTCTGTATAATTTATTGTTGC---------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	52580	209	+	647215	GAAGCTAGTTTAAAGAAGGCTATGAAACAATGATGGTAATGCAAGATTTGACCAGTATTAATCACTTTTATTACTCCACAGGATGTGCATTCCAGTCATCAGTCAAGCTGTTCGGTCACACTCATGTCAGCAAGTATACAGCCAGGGACTTACAGTATGTATAATTTACCGTTGCTTTTGCGTGAGGAAACAGAAGTCATCTTATTACT

a
s	mr.mrrefChr0	56726	207	+	130230	TTTATCACAAGGCAACAGAAGTCATCTGGCCAGTTCTCTCCTATGTTATAACTTAGAGGTGCTAAAGACTGCATTCCCAAGGTAATTCTACCTACACTAGCAGATGGAATCAACTGCATCCTTTTCACTAAGTGAAATAATATTCTTTGAATTTGGCTATCTGGTTGATTGTCCATACTAACATAGATGCTATAAACTCTTTTTAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	59421	207	+	636262	TTTATCACAAGGCAACAGAAGTCATCTGGCCAGTTCTCTCCTATGTTATAACTTAGAGGTGCTAAAGACTGCATGCCCAAGGTCATTCTACCTACACTAGCAGATGGAATCAACTGCATCCTTTTCACTAAGTGTAATAATATTCTTTCAATTTGACTATCTGGTTGATTGTCCATACTAACATAGATGCCATAAGCTCTTTTTAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	52878	207	+	647215	TTTATCATGAGGGAACAGAAGTCATCTTGCCAGTCCTCTCCTATGTTATAACTTAGAGGTGCTAAAGACTGCACTCCCAAGGCAATTCTACCTACACGAGCAGATGGAATCAACTGCATCCTTTTCACTAAGCGAAATAATATTCTTTGGATTTGGCTATCTGGGTGATTGACCATACTAATATAGATGCTATACACACTTTTTAGG

a
s	mr.mrrefChr0	56933	210	+	130230	CTTCATTCTGCTCTTGGTTACAATGTAATTCATCACAGATGTGAATTGGTCACAGAATGTACAGGGCAATGTGGTCCTGCTGCTTTTAACACCAAGTTACTCCCATGGGGAGAACTGCACCTGCTTGTACTGCTCTCACATATTCAAAGAGTATATACAACACTAATTGTATTAGGGGCCAATGTACCATCTAAAGAAAGGTTAACAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	59638	204	+	636262	CTTCATTCTGCTCTTGGCCACAATGCAAACC-TCACAGATGTGAATTGGTCACAGCACGTACAGGGCAATGTGGTCCTGCCACTTTTAACAGCAAGTTACTCCCATGGGGAGAACTGCACCTGCTTGTACTGCTCTCACATATTCAAAGAGTA-----AACACTAATTGTATTAGGGGCTAATGTACTGTCTAAAGAAAGGTTAACAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	53085	207	+	647215	CTTCATTCTGCA---AGTTAAAGTATAGTTCACCACAGATGAGAGTTGGTCACAGAATGTACAGGACTATGTGGTCCTTCTGCTTTGAACACCGAGTTACTTCCATGGGGATAATTGCTCCTGCTTGGACTGGTCCCACATATTCGACGAGTATATACAATACTAATTGTATTGGGGGCCAATGTACCATCTATAGAAAGGTTAACAGCT

a
s	mr.mrrefChr0	57143	153	+	130230	CCATATATTCTTTAAGTTGCCAGTAACCCAGCTACGTGTCTGGTCACAGGGAAATTGTGTATGTTTGCATGTTTTGTGTATACATTATTAAACTGTCTATGATTTTTAGTGAACATTGTAAGAGCTGTGCTTTGATTTACGTGGGGTTTAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	59842	142	+	636262	-----------TTGAGTTGCCAGTAACCCAAATACGTGTCTGGTCACAGGGAAATTTTGTATGCTTGCATGTTTTGTGTGCACATTATTGAACTGTCTATGATTTCTAGTGAACATTGTAAGAGCTGTGCTTTGATTTACGTGGGGTTTAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	53294	149	+	647215	CCATATATTCTTTAAGTTG---GTAACCCAGCTATGTATGTGACCACAGGGAAATTGTGTATGTTTGCATGTTGTATGTATACATTATCAGATTGTCTATCATTTTTAGTGAACATTATAAGAGCTAT-CTTTAATTTATGTGGGGCTTAAAA

a
s	mr.mrrefChr0	57296	7	+	130230	GAGTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	59984	7	+	636262	GAGTGTT
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a
s	mr.mrrefChr0	57303	3	+	130230	AAT
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a
s	mr.mrrefChr0	57306	11	+	130230	TCTAGAGACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	60027	11	+	636262	TCTAGAGACTA

a
s	mr.mrrefChr0	57317	55	+	130230	AGTAAGTACAAAGCTGTCAGATCCCCTTCCAAAAGTTAAATGTAATGTCCAAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	60042	55	+	636262	AGTAAGTACAAAGCTGTCAGATCCCCTTCCAAAAGTTAAATGTAATGTCCAAACA

a
s	mr.mrrefChr0	57372	133	+	130230	TTTAGAAATAACAGGTGTCTATGTGTAGGCCAGTAAAGGTCATTTTGTACTTTCTTGGATGTCCTCTAGAAAGAGGATATAGGTAGGCTGGCTGCAACATTACTAGAGATCCTTCGGTAAGGACTTTTAAGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	60098	133	+	636262	TTTAGAAATAACAGGTGTCTATGTGTAGGCCAGTAAAGGTCATTTTGTACTTTCTTGGATGTCCTCTAGAAAGAGGATATAGGTAGGCTGGCTGCAACATTACTAGAGATCCTTCGGTAAGGACTTTTAAGGA

a
s	mr.mrrefChr0	57505	48	+	130230	TATGATGGCCTGTGACCTGTGTGAATGCATGCGTGTTCTTTACTCTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	60235	48	+	636262	TATGATGGCCTGTGACCTGTGTGAATGCATGCGTGTTCTTTACTCTTG

a
s	mr.mrrefChr0	57553	11	+	130230	TAGGGTATACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	60285	11	+	636262	TAGGGTATACT

a
s	mr.mrrefChr0	57564	25	+	130230	TTAGTGGAAATTTCTCAGGTACCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	60299	25	+	636262	TTAGTGGAAATTTCTCAGGTACCCT

a
s	mr.mrrefChr0	57589	12	+	130230	GTGCCTCTCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	60326	12	+	636262	GTGCCTCTCCAT

a
s	mr.mrrefChr0	57601	35	+	130230	GTCATCTAGGTCTATAACTTCACTAGACTTTTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	60380	35	+	636262	GTCATCTAGGTCTATAACTTCACTAGACTTTTTCT

a
s	mr.mrrefChr0	57636	16	+	130230	TTCTATTAGTCAAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	60419	16	+	636262	TTCTATTAGTCAAGTT

a
s	mr.mrrefChr0	57652	9	+	130230	GTGGTTCAT
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a
s	mr.mrrefChr0	57661	41	+	130230	TGATTGCCAGGTGGGTTGCATGCCATCTGTCATTGCACCCT
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a
s	mr.mrrefChr0	57702	173	+	130230	TAATACCCTGTAGGCATGGTTATGTCTCCCAAGAGAGCCTGCTAGATAGATGACAGTTCGATAGAATTGGTATCTAACTTGGAACCACTCTTGCCAATTTACTATTTGGTTCATGTTCCGCAGTATGCTCTTCGAGCTTTTATGCGTGTGGGTAAGAAGGGAGGGTTGAGTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	60518	173	+	636262	TAATACCCTGTAGGCATGGTTATGTCTCCCAAGAGAGCCTGCTAGATAGATGACAGTTCGATAGAATTGGTATCTAACTTGGAACCACTCTTGCCAATTTACTATTTGGTTCATGTTCCGCAGTATGCTCTTCGAGCTTTTATGCGTGTGGGTAAGAAGGGAGGGTTGAGTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	53512	173	+	647215	CAATACCCTGTAGGCTGACCACTGTCTCCCAATAGGGCCTGATAGCTAGATGACAATTTGATAGAATTGGTATCTAACTTGGAACCAAATTTGGCAATTTACTATTTGGTTCATGTTCCACAGGATACTCCTCGAGCTTCTTCGCACGGGGGTAAGAAGGGAGGGTTGAGTTT

a
s	mr.mrrefChr0	57875	27	+	130230	GATCTAAGCGGGAACTTATACCCATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	60691	27	+	636262	GATCTAAGCGGGAACTTATACCCATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	53690	27	+	647215	GATCTAGACAGGAACTTATACCCATAT

a
s	mr.mrrefChr0	57902	81	+	130230	ATCCTAGGTAGTGGGTAGGATTGGATTGAGCTAAAGGGTTACCAGTAAATTAATACAGTCTGTGCATGCAACATGACTTTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	53718	81	+	647215	ATCCTAGGTAGTGGGTAGGATTGGATTAAGCTAAAGACTTACCAGTAAATTAATACAGTCTGTGGGATCAACATGACTTTT

a
s	mr.mrrefChr0	57983	54	+	130230	GCAAATAACCTATAGTATAAGGAATGGAAGTGTTAAAGGCCGAAATATCCTTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	60808	54	+	636262	GCAAATAACCTATAGTATAAGGAATGGAAGTGTTAAAGGCCGAAATATCCTTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	53799	54	+	647215	GGAAATAACCGTTAGTATAGGGGGTGGAAGTGTTAAAGGCCGAAATATCTTTCA

a
s	mr.mrrefChr0	58037	42	+	130230	GTTCTCAGTTCAAAGAGGCATGGGTTAGATCCAGTGGTTTCT
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a
s	mr.mrrefChr0	58079	288	+	130230	ACTGGTAAAAGTAAAATTGAATAGGATTAGGATGTAACATTCATCTTTCTTAGTCTATGAATTCAACCATTATGGTAAATCTTTCCCCAAAGTTGCATTCCAGGGGTCTGGATTTCCTATTAACTTTTGAACATTTATCTATGCTTCTACTACCCCAACTATACAAGAGATAGACATCTACAATGGTGGTCAGGTCTGTAGACCCAATTGTGCTGGCTGTCCGATAGGCAGGGGTATCATTTTAACGACTACCAACCAGCCCCATAGACACTGTCAGCTTTCCTAGCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	60916	280	+	636262	ACTGGTAAAAGTAAAATTGAATAGGATTAGGATGTAACATTCATCTTTCTTAGTCTATGGAATCACCCATTATGGTAAATCTTAGCCGAAAGTTGCATTCCAGGGGTCCAGACTTCCTATTAACTTTTGAA--------TATGCTTCTACTACCCCAACTATATGAGAGATAGGCATCTACAATGGTGGTCAGGTTTGTAGACCCAATTGTGCTGGCTGTCCAATAGGCAGGGGTATCACTTTAACGGCTACCAACCAGCCCCATAGACACTGTCAGCTTTCCTAGCG
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a
s	mr.mrrefChr0	58367	10	+	130230	AAAATAGTAG
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a
s	mr.mrrefChr0	58377	247	+	130230	CATCTCATATATTACTGTGCCTAATTCTATGAACCACTTTTACTAAAAATTGTATGATTTTCCTTAGCTGTTACATTCAGACAATGGCTAAATTTTATAGAAAGTACTACTGGGAGCCACTAAAGGAACGCGAACCATTTCAGATGATAAGATGGCGTGCAACTCTTGCAGAATGCCCTGACCACTTTTTTCATTCATGCGGTAAGACCCTATGAAAAGCATTGAGTGCACTGATAACTACCAATCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	61205	247	+	636262	CATCTCATATATTACTGTGCCCAATTCTATGAACCACTTTTACTAAAAATTGTATGATTTTCCTTAGCTGCTACATTCAGACAATGGCTAAATTTTATAGAAAGTACTACTGGGGGCCACTAGAGGAACGCGAACCATTTCAGATGATAAGATGGCGTGCAACTCTGGCAGAATGCCCTGACCACTTTTTTCATTCATGCGGTCAGACCCTATAAAAAGCATTGAGTGCACTGATAATTACCAATCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	54212	244	+	647215	CAACTCATATATTACTG-GCCTAATTCTATTAACCACTTTAACTAAAAATTGTATGATTTTCCCTAGCCGTTA--TTCAGACAATGGCTAAATTTTATAGAAAGTACTACTGGGAGCCACTAAAAGGACGTGAACCATTTCTGACGATAAGATGGCGTACAACTATTGCAGATTGCCCTGACCACTTTTTTCATTTATGTGGTAGGACCCTATGATAAGCATTGAGTACACTGATAACTACCAATCC

a
s	mr.mrrefChr0	58624	67	+	130230	ATGGCCTGACCTCTAATAGAGAGTATAAAACAATCTCAACACTTAGTTTTAAAACTTAATATACACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	61458	67	+	636262	ATGGCCTGACCTCTAATAGAGAGTATAAAACAATCTCAACACTTAGTTTTAAAACTTAATATACACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	54456	67	+	647215	ACAGCCTGACCGCTAATAGAGAATATGAAACTATCTCAACACTTAGTTTTAAAACTTAATATACACT

a
s	mr.mrrefChr0	58691	37	+	130230	TAGTCTCTAAACTTAATATACACTCCATTGCTACTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	61535	37	+	636262	TAGTTTCTAAACTTAATATACACTCCATTGCTACTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	54523	37	+	647215	TAATCTCAAAACATAACATACATCCCATTGATACTAT

a
s	mr.mrrefChr0	58728	29	+	130230	GTGACTTTGGAGCCTAAGGTAGGAGACGT
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a
s	mr.mrrefChr0	58757	525	+	130230	GGTTCCCAAAAAATTTTGCCTATATCTGTTGTGTGTAGAAGTTGAAAGTAAGATTGCAGGTCATATGCAATGATCATTGAGTTGAAATATATCTTGGCATTGTTGTGTCTGTCATCGAATAATGATCTTAGTAAACAGACATTGTGCAAAGTAGACAGACACAATGACTCTTTTGAATCTCCCAGCAGGGATGTCTTGACAAAGCTTGCAAGATTCTATGATGCACTGTTGCATCCATCACTGTTTTTCCATATCATTAAAAATATCATATGGTATTCATGGCCCTGTTCATACAACTAAAGTGCCTATAGTCTGTTATTGTAATAGATGCAAGTGTGAGGGTGATTTGACAGATCATGTACCCATCAGTCATTGCTAGTTTCGCAAGCTATTTGGAGCTACATTTTCCTGGTCCTGATGTCATGTGCTATGAGATCAGTTGACTAATTAAGAGAGTGTGTTGTTTATAAAGGATCGTTTCCTGCTGATAGTTCACATTCTGAGGTAACAAGATGGATAGCGAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	61640	512	+	636262	GGTTCCCAAAAAATTTTGCCTATATCTGTTGTGTGTACAAGTTGAAAGTAAGGTTGCAAGTCATATGCAATGAGCACTGAGTTGAAATATATCCTGGCCTTGTTGTGTCTATCATCGATTAATGATCTTAGTAAACAGACATTGTGCAAAGTAGACAGACACAATGACTCTTTTGAATCTCCCAGCAGGGATGTCTTGACAAAGCTTTCAAGATTCTATGATGCACTGTTGCA-CCATTACTGTTTTTCCATATCATTAA--------TTTGGTATTTGTGGCCCTGTTCATACAACTAAAGTGC----AGTCTATCATTGTAATAGATGCCAGTGTGAGGGTGAATTGACAGATCATGTACCCATGAGTCATTGCTAGTTTCGCAAGCTATTTGGAGATACATCTTCATAGTCCTGATGTCATGTGCTATGGGATCAGTTGACTGATTAAGAGAGTGTGTTGTTTATAAAGGATCATTTCCTGCTGATAGTTCACATTCTGAGGTAACAAGATGGATAGTGAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	54589	524	+	647215	GGTTCCCCAAAAATTTTGCCTATATCTGTGGTATGTAGAGGTTGACAGTAAGATTGCAGGTCATTTGCAATGATCATTGAGTT-AAATATATTTTTCCATTGTTGTGTCTGTCGTCGAATAATGGTCTTAGTAAACAGGCATTGTTCAAAGTAGACAGACACAATGACTATTTGGCATCTCCTAGCAGGGATGTCTTGACAAAGCTTGCAAGATTCAATGATGCACTGTTGCATCCATCACTATTTTTCCATATCATTAAAAATATCATATGGTATGCATGACCCTGTTAATACAACTAAAGTGCCTATGGTCTGTTATTGAAGCAGATGCAAGTGTAAGGGTCTTCTGACAGGTCGTGTACCCATCAGTCATTACTAGCTTTGCAGGCTATTGGGAGCTACAGTTTCCTGGTCATGATGTCATGTGCTATGAGATGAGCTGGCTAATTGAGAGAGTGTGTTGTTTATAAAGGAGCGTTCACTGCTGATAGTTCACATTCTGAGGTAACAAGATGCATAGCGAAA

a
s	mr.mrrefChr0	59282	24	+	130230	TAGTGCCGCAATTTAAGAAGCTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	62152	24	+	636262	TAGTGCCGCAATTTAAGAAGCTGA
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a
s	mr.mrrefChr0	59306	174	+	130230	TGTGTTATCATGTATTGTAACATTTTAAAAAAAGAGCAAAGGTGGAGAAAACCAAAATCTAGGGAGTGTAATGTCTTCTTTTAAGACACATTCAGATAACATGGTCAGAGCTTGCTTGTAGCATAAGATTAGTTGCCATGGGTTATCTGCCCAGCTTAGTAGATAAGATGCAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	62181	174	+	636262	TGTGTTATCATGTATTGTAACATTTTAAAAAAAGAGCAAAGGTGGAGTAAGCCAAAATCTAGGCAGTGTAATGTCTTCTTTTAAGACACATTCAGATAACATGGTCAGAGCTGACTTGTAGCATAAGATTTGTTGCAATGGGTTATCTGGCCAGTGTAGTAGATAAGATTCCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	55138	173	+	647215	TGTGGTATCATGTATTGTAACATTTTAAAAAATGAGCAAAGGTGGAGAAAACCCAAATCCAGGGAGTGTAATGTCTTCTTTTAAGACAC-TTCAGAGAACATGGACAGAGCTTGCTAGTAGCATAAGATTACTTGCCATGGGTTATCTGCCCAGCTTAGTAGATAAGATGCAAA

a
s	mr.mrrefChr0	59480	210	+	130230	CTGTCAGCCTAAGCTTTTATTAAACTGCTGGGAGTTTAGGATAGCTTGATATGCCTGAACTCTGTGACAATAATCCCAGTGCAGAGAGACGCAGTTTTTAATGTTCTTTACTGATACTTAGACTTTGGTTGGATGCACCACGCCCTTTTATATTTCATAACCCTTATTCGTAGTGAATTGCAGCAATTGTCAGTGCAAATCAACTCAAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	62356	208	+	636262	CTGTTGGCCTAAGCTTTTAATAAA-TGCTGGGAGTTTAGGATAGCCTGATATGCCTGAACTCTATGACAATAATCCCAGTGCAGAGAGACACAGTTTTTAATGTCCCTTATTGATACTTAGACTTTGGTTGGATGCACCACGCCCTTTTATATTTCATAACCCTTGTCTGTAGTGAATCGCAGCAATTGTCAGTGCAAATCAAC-CAAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	55311	210	+	647215	CTCTCAGCCTAAGCTGTTATTAAACTGCTGTGAGTTTAGGATAACTTGATATGCCTGCACTCTGTGACAATAATCCTAGTGCACAGAGGGGTGGGTTTTAGTGTTCTTAACTGATACTTATACTTTGGTTGGATGCACCAGGCCCTTTTATATTTCATAATCCTTATTCGTAGTGAATTGCAGCAATTGTCAGTACAAATCAACTCAAGG

a
s	mr.mrrefChr0	59690	54	+	130230	TTAGTGCATGCTGACAATAATGTACTTACTATATTAACCAGTCCTCCTCTCTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	62564	54	+	636262	TCAGGGCATGCTAACAATAATGTACTTGTTATATTAACCAGTCCTCCTCTCTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	55523	53	+	647215	CTGGTGCACACTGACAATAATTTAATTACTAT-TTAACCAGTCTTCCTCTCTAC

a
s	mr.mrrefChr0	59744	292	+	130230	AGTAGTCAGACTAACACCATCCCCCAATATCCTCTTTTTGAACTATGGATGGCATCTTTACCTGGGACTTGGCCAGCACCTGTATACAACTGATCAGTGGATAGGTGAAAATACATATTGAAACTATTTGAAACTATAATGCTGTGGTTGGGCAGTGCACAGCAAAGGGTTCTTTAAGAACTCCTGAGCAGCACAACCTTGGGCCCTTGTACTAAATTAAACAAAGCTTTGACAGACAGCTAGCATGCTGTGGTGTCCCTCAGGGGATAAACCCTTCCACAATGCACTACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	62619	279	+	636262	AGTAGTCAGACTAACACCATCCCCCAATATCCTCTTTTTGAACTATGGATGGCATCTTTACCTGGGACTTGGCCAGCGCCTGTATACAACTGATTAGTAGATAGGTGGAAATACATATTGAAACTA------------ATGATGTGGTTGGGCAGCGCACAGCAAAGGGTTCTTTAAGAACTCCTGAGCAGCACAACCGAGGGCCCTTGTACTAAATAAGACAAAGCTTTGACAGACAGCTAGC-TGTTGTGGTGTCCCTCAGGGGATAAACCCTTCCACAATGCACTACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	55576	287	+	647215	AGTAGTCAGACCAATACCATCCCCGAATATCCTCTTTTTGAACTATGGATGGCATCTTTACCTGGGACTTGGTCAGCACCTGTATACAACTAATCAGTGAATAGGTGAAGATACATATTGAACCTATTTGAAACTATAAGGCTGTGGTTGGGCAGTGGACAGCAACAGGTTCTTTAAGAACTCCTGAGCAGCACAATCTTGGGCCCTTATTCTAAATTAAACAAAGCTTCATCAGACAACTAGCATGCTGTGGTGTCCCTCAAGGGATAAACCCT-----AGTGCACTACCG

a
s	mr.mrrefChr0	60036	68	+	130230	GAAATTACCACCCTGCCTTTATCTCAGACATGTGGAGTGTGGCAGCTCAGGAGCTTCTGTGCAATAGC
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a
s	mr.mrrefChr0	60104	29	+	130230	ATGAATTAGTCAAGAAATAATTGCACACT
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a
s	mr.mrrefChr0	60133	6	+	130230	TCAAAT
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a
s	mr.mrrefChr0	60139	140	+	130230	TGCCTGCTCACCAGCTGTTACGGGTGCTAAGGACATTCCTCTCCTGTAGGCTGAGGGTCCACATCTTCACTTAACCCAAATGCCGCTTTATACTGGGTCTAATGGGATGATACAAGAACAACAGCAATGATGTGGCATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	63005	139	+	636262	TGCCTGCTCACCAGCTGTTACGGGTGCTAAGGACATTCCTCTCCTGTAGGCTGAGGGTCCACTTCTTCACCTAACCCAAATGCTGCTTTATACTGGGTCTAATGGGATGATACAAGA-CTACAGCAAAGATGTGGCATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	55931	120	+	647215	-----------------GTATGGGTGCTAAGGACATTCCTCTCATGTAGGCTGAGGGTCCATATCTTCACTTAA---AAATACCACCTGATACTGGGTTTCATGGGTTTATACAAGAACAACAGCAATGATGTGGCATAA

a
s	mr.mrrefChr0	60279	136	+	130230	AAAATTAGTTAGGAGGAATAATGGAACATGAAAGTTAGAGATCCCATGCACTTACTTCTGATATACAAGAAATAAACTTTACATGTCTCAAATAGTCACATAGTCACAAATACTTGTGCAAACCACATGTCTCTGG
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a
s	mr.mrrefChr0	60415	168	+	130230	GGTTTAATGCACCCAGGCAGACATTAAAGACATCCTTGACTGACATAAGTGCATGTACACTCTTAAGCAACTAAGCCTTGATGGAGGCATGTTGGTGCCTTAGCAAGACAGCAAAACACAGTAGACAGTGGGTCATTTTTTGAACTAGTGTAAAATAAGTTCATACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	63257	126	+	636262	---------------------------AGACATCCTTGACTGACAT-------TGTACACTCTTAAGCAACTAGGGCTTGATGGAGGCATGTTGGTGCCTCAACAAGACA--------CAGTAGACAGTGAGTCATTTTTTGAACTAGTGTAAAATAGGTTCATACTA
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a
s	mr.mrrefChr0	60583	63	+	130230	CTTAATGTACCTGCAAATCATTTGCTTCTCACAAGATTCCCAATAGTGGTGTTACAAATATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	63383	63	+	636262	CTTAATGTACCTGTACATCACTTGCTTGTCACAAGATATCCAATAGTGGTGTTGCAAATACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	56367	63	+	647215	TTTAATGTACCTGCAAATCATTTGCTTCTCACAAGATTCCCAATAGTGGTGTTACAAATATTG

a
s	mr.mrrefChr0	60646	101	+	130230	AGAACTGACACAGGATCATGAGTCGGTAACAACTTCATAAAGTTCGCACCCTAATTAGCTTAGCAGAAGTGCCAGGTATTGGCACCTGGGCAAGTGACAAC
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a
s	mr.mrrefChr0	60747	489	+	130230	CAGATCAAGTGACATTATAATTAACTCAGTATTCAACAATGGAGGTCCCTCCCCTCCACCACCACTTGATGAACTTTTGAGTTATGGTGGAGAATTTTCAGTTGCAGTTTCATTGTCAATTTAATGAATGAGTACTCAGTTACAAGCGAATGATTTGGAAAAGCTATATCCTCAAACGGATGATTTGAGAATTGCTGACCTTATCTTTACCTGTTGGCTATGATTATGACTTTGTTTGAAAGCCTATCATGATAGTGCTCACTAGGCTCATATCAAGCATTGATGTTGTGTAGATTTAATTAAATTCAGTAGCTGTGTATGAAAGCCTAACATGCTAGAGCTTCCCAGGCTCATATCAAAGATGGATGTATTACAGGCTTAAATAAATTCAGTACTGGGAGGGAAGGAAACCAGAAGAATCATTGTTAAATATTTGTGACCCCGACACCCCTCTAGAGCATTCTTAATGCTGGATACCATCCAGCTTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	63549	489	+	636262	CAGATCAAGTGACATTATAATTGACTCAGTATTCAACAATGGAGGTCCCTCCCCTCCACCACCACCCGATGAACTTTTGAGTTATTGTGGAGAATTTGTAGTTGCAGTTTCATTGTCAATTTAATGAATGAGTACTCAGTTACAAGCGGGTGATTTGGAAAAGCTATATCCTCAAACAGATGATTTGAGAATTGCTGACCTTATCCTTTCCTGTTGGCTATCATTATGACTTTGTTTGAAAGCCTATCATGATAGTGCTCACTAGGCTTGTATCAAGCATTGATGTTGTGTAGGTTTAATTAAATTCAGTAGCTGTGTATGAAAGCCAAACATGCTAGAGCTTGCTAGGCTCATATCAAAAATGGATGTGTTACAGGCTTAATTAAATTCACTACTGGGAGGGAAGGAAACCAGAAGAATCATTGTTAAATATTTGTGACCCCGACACCCCTCTAGAGCATTCTTAATGCTGGATACCATCCAGCTTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	56512	468	+	647215	--------------------TTAACTCAGTATTCGACAATGGAAGTCCCTCCCC-CCACGACCACTTGATGAACTTTTGAGTTATGGTGGAGGATTTTCAGTTGCAGCTTCATTGTCAATCTAATGAATGACTACTCAGTTACAAGGGAATGATTTGGAAAAGCTACATTCTCAAATGGATGATTTGAGAATTGCTAAGCTTGTTTTTACCTCCTGGCTATGATTATGATTTTGTTTGAAAGCCTATCATGGTAGTGCTCACCAGGCTCATATCAAGCATTGATGTTTTATAGAGTTAATGAAATTCAGCAGCTATGTATGAAAGCCTACCATGCTGGACCTTCCCAGGCTCATATCAAGGATTGATGCATTACAGGCTTAAATAAACTAAGTACTGGGAGGAAAGGAAATCAGAATAAACATCGTTTAATCTTTGTGACCCTCACACTCCTCTGGACCATTCTTAATACTGGATACCATCCAGCTTAC

a
s	mr.mrrefChr0	61236	48	+	130230	GATAATTACTTTAATACCTGTACAGGCTAGCTAGTCTATTGCAGTACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	64038	48	+	636262	GATAATTACTTTAATACCTGTACAGGCTAGCTAGTCTATTGCAGTACC
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a
s	mr.mrrefChr0	61284	137	+	130230	TGTGAGGGTTGGGTTATATAATCCTTAAGTACCCGATAAGTCACATCCGTGATTACTCTAAACAGTCGGAATGATCAAGTCTTTATTTGACACATTAATCGCTTAAAAGGTCCATTCAAAATGAGTACAAGATTTAG
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a
s	mr.mrrefChr0	61421	10	+	130230	GTTAGAGGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	64380	10	+	636262	GTTAGAGGTT
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a
s	mr.mrrefChr0	61431	42	+	130230	TGTTAATAAACAGTGTGTAGAGGATAAACAGCAGTTATACGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	64390	42	+	636262	TTTTGATATTCAGTGTGTAGAGGATAAACAGCAGTTATACGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	64700	21	+	636262	TGCTACTCAACTATACGTTGA---------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	57179	42	+	647215	TGTTAATAAACAGTGTGTAGAGGATAAACAGTAATTATAAAT

a
s	mr.mrrefChr0	61473	13	+	130230	ATGAGATTTGAGT
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a
s	mr.mrrefChr0	61486	14	+	130230	TTGGCTGATAGTAT
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a
s	mr.mrrefChr0	61500	12	+	130230	GTAAATCAAAGG
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a
s	mr.mrrefChr0	61512	1	+	130230	G
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a
s	mr.mrrefChr0	61513	151	+	130230	AGGGACCTTGCAGACACAATGGTATGTTGAGGGTAGACAATAATTGTATATTTAACATTTTAATCCAAGGTAGCAGGTTTTTGGGGGACAGGAGTGTGGCAATCGTAAAGAGGTTATTTGCGGAGACCTTCGTGTAACCAAAGGATGCACC
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	64761	151	+	636262	AGGGACCTTGCAGACACAATGGTATGTTGAGGGTAGACAATAATTGTATATCTAAAATTTTAATCCAAGGTAGCAGGTTTTTGGGGGACAGGAGTGTGGCAATCGTAAAGAGGTTATTTGCGGAGACCTTCGTGTAACCAAAGGATGCACC
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a
s	mr.mrrefChr0	61664	25	+	130230	TTTGAAACTGAGTTGGGAGAGATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	64675	25	+	636262	TATGAAACTGAGTTGGGAGAGATTA
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a
s	mr.mrrefChr0	61689	49	+	130230	TGCCACTCAACTAGAAGGGCTACAAGGTATTACCGCCAAATAAAATGGG
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a
s	mr.mrrefChr0	61738	244	+	130230	TAGCCAATTTCTTATTGCACTGGGACCAAATAGCAGAAAGTTATTTAGACAACTTAATCTTTTGATGATGAATGTGCATTGTCTGTTATTTGTCATGATCAAGTTGTGTCTGGTACCTGACAATGAAGCCCCATCTCGTAAGATATGTGGCTGACGATGGGGCAGAATCTGTGCTGTGACCCCCTGATAAGTATTCCTTTCCTAAACACCAAAAGAATCATTAAATTCTTAGCCTAATCTCACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	64992	244	+	636262	TAGTCAATTTCTTATTGTACTGGGACCAAATAGCAGAAAGTTATTTAGACAACTTAAACTTTTGATGATGAATGCGCATTGTCTGTTATTTGTCATGATCAAGTTGTGTCTGGTACCTGACAATGAAGCCCCATCTCGTAAGATATGTGCCTGATGATGGGGCAGAATCTGTGCTGTGACCCCCTGATAAGTATTCCTTCCCTAAACACCGAAAGAATCATTAAATTCTTGGCCTAATCTCACC
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a
s	mr.mrrefChr0	61982	82	+	130230	GTCAAGAATCAATATAATTGCTCTAGGTCAATATGGTTCGTGGTGCCGTGTTGATTTGATATAATTGCTCTAGGTCAATATG
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a
s	mr.mrrefChr0	62064	84	+	130230	TTCATGCTGCCATGCTGGGTCTGGCGTTAATGGTTTAACTTGTGTCCAATGCCTGACACTTTTGTACCATAGGTATCACAGCAC
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a
s	mr.mrrefChr0	62148	117	+	130230	TTGCTGCTAAGAGCTGCTGTGGTACTTATTTAGTTAATGATAGTGCCTGAGCTAGCAGAAAACCATGATATGGGCGGGAGCTCAGTAACTAGGTTGGGTAACTAATAACTAAATATT
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a
s	mr.mrrefChr0	62265	136	+	130230	GACTTGCCTCTCAATATGACAAGCCTTTACAGTGAATAGACATGAAGGTTCAGTTTTCAAGCTAATCAGGGAGAAGATCCAGTTAAGTATGGACAAGTCTTTAATTGATTACTAGTTCCCTATTGGTTCATTTTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	65580	136	+	636262	GACTTGCCTCTCAATATGACTAGCCTTTACAATGAATAGACATGAAGGTTCAGTTTTCAAGCTAATCAGGGAGAGGATCCAGTTAAGTATGGACAAGTCTTTAAATGATTACTAGTTCCCTACTGGTTCATTGTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	58014	136	+	647215	GAGTTGCCTCTCTATATGACAAACATTTACAGTGAATAAACATGAAGGTTCAGTTTTCAAGCTAAGCAGGGAGGAGATCCAGTTAAGTATGGACAAGTTTACAATTGATTACTGGTTCCCTATTGGTTCATTTTGG

a
s	mr.mrrefChr0	62401	77	+	130230	ATATGGGCAATAGCTAAGCCAGTGAAGAAAGATCTTCTAAATAGCCCTCATCTAACAGCTAAGTATCATACTGTAAT
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a
s	mr.mrrefChr0	62478	238	+	130230	ACCCCTTATGATTCCAAAACCATAACACAGCCTGTTCAAAGAGTCACACAGAGAATAACTGGAGACATAGTAAAGACTGAGCGCCAATTGACAATGGGGACATTCAGGACTACATGCAAGCAATAGAACAAGTTTGACGCAGAATTATTGCACTGTAGGTTAATTTTTGATAGGATGATTTCCAATATTATGCACAAATGGACACTGAAGCATATACTGCTCAGAGGGGAGCGTAcga
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	65808	238	+	636262	ACCCCTTATGATTCCAAAACCATAACACAGCCTGTCCAAAGAGTCCCACAGAGAAGAACTGTAGACATATTAAAGACTGAGCGCCAATTGACAATGGGGACATTCAGGACTACGTGCAAGCAATAGAACAAGTTCGACGCAGAATTATTGCACTTTAGATTAATTTTTGATGGGATGATTTACAATATTATGCACCAATGGACACTGAAGCATATACTGCTCAAAGGGGAGCGTACGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	58227	209	+	647215	--------------------------ACAGCCTGTTCAAAGAGTCACACAGAGAATGACTGGAGACGTAGTAAATACTGAGCGCCAATTGACAATTGACACATTCAGGACTACATGCAAGCAATAGAACAAGTTTGGTGCAGAATTATTGCACTGTAGGCTAATTTCTGAAAGGATGATTTCCAATATTATGCACAGATGGACACTGAAGCATATACTGCTCAGAGGAGATCATA---

a
s	mr.mrrefChr0	62716	152	+	130230	gaatacaactaaatttctctgtcataaaTCTAGTGCTCTTGTTTGTCTGTGCAATGCAACAAGAGGACagTGATGAGTATTTTTGATTAGATcAAGAACAGgttcaaatATCCACCTTTTGCGGCTACATTATGGTTTATCTAAGGAACCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	66048	151	+	636262	GAATACAACTAAATTTCTCTGTCATAAATCTAGTGCTCTTGTTTGTTTGTGCAATGCAACAAGAGGACAGTGATGAGTAATTTTGATTAGAT-AAGAACAGGTTCAAATATCCACCTTTTGCGGCTACATTGTGGTTTATCTAAGGATCCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	58436	114	+	647215	----------------------------TCTACTGCTCGCGTTGGTCTGGGCAATGCAACATGAGGAC--TGATGAGTATTTCTGATTAGATCAAGAACAA--------ATCCACCTTTTGCAGCTACATCATGGTTTATCTAAGGAACCTT

a
s	mr.mrrefChr0	62868	171	+	130230	TTATGAGCACCTACCCATACTGACTTGCTTTAAATGAaagcatgttaagtaaGATCTCTGGCTACAAACAACATGCTGCAACCCAGCTGCCTCAAATCACTTTCAACCATCAGTTCCAATCATAAAGTTACTAGGATATTACATACACTAGATACccaagtgagctcatta
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	66206	155	+	636262	TTATGAGCACCTCCCCATACTGACTTGCTTTAAATGAAAGCATGTTAAGTAAGATCTCTGGCAACAAACAACATGCTGCAACCCAGCTACCTCAAATCACTTTCAAGCACAAGTTCCAATCATAAAGTTACTAGGATATTACATACACTAGATAC----------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	58550	156	+	647215	TTATGAGCACCTAACCATCATGATTTGCTCCGAATGA---------------AGTCTCTGGCTACAAACAACATGCTGCAACCCAGCTGACTCCAATCACTTTCAGCCATCAGTTCCAATCATAAAGCTGCTAGGATATGACATACACTAGATACCCAAGTGAGCTCATTA

a
s	mr.mrrefChr0	63039	86	+	130230	GCTAATTGGAGtatataATTTGTATTGCAACTAATAAGTAGCACTCAATCTGAGTAAGACATATTATCTGTGGATTATGGCCTCAG
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a
s	mr.mrrefChr0	63125	66	+	130230	TGTGTTAAACTTGAACTCACTAGCTTTACTCAAAGGAAGATAGTCAAACAAGATCCTTACACCCCT
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a
s	mr.mrrefChr0	63191	210	+	130230	CCCTTTCACCCCCTACATTATGGCTATGTACTAACCAGGAGATCTGAACCAAAGACAAGGGCAAAAGACCCGGGCCAATGAGTTCTCTGTACAACATTATGTGTCCTTACCTATCTATGTATTCCATTCTTAATGATTTGGCAAGAAACACTGAGTTAAgCCTTCACTCTGTCCCATAGGTGGTGCTGGTAATCAAGTTAACATGTTCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	66952	209	+	636262	CCCTTTCACTCTCTACATCATGGGTATGTACTAACCAGGAGATCTGAACCAAAGACAAGAGCTAAGGACCCAGGCCAATGAGTTCTCTGTACAACATTACATATCCCTACCTATCTATGTATCCCATTCTTAATAATTTGGCAAAAAACACTGAGTTCA-CCTTCACTCTGTCCCATAAGTGGTACTGGTAATCAAGTTAACATGTTCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	58876	207	+	647215	CCCTTCCATCCCCTACATTATGGCTATGTAGTAACCAGGAGATCTGAACCCAGGAC---GGCATAAGACCTGGTCCAATGAGTTCTCCGTACAACATTATGTGTCCTTAAGCATCTAAGCACTTGATTGCTAATGATTTGGAAAGAAACAGTGAGTTAAGCCTTCACTCTGTCCCATAGGTGGTGCTGGTTTTCAAGTTAACATGTTCTT

a
s	mr.mrrefChr0	63401	145	+	130230	ccttcctcctttgcccaagttaaacaccggatgctgatagaactctcaatcttcaaacagtgccagaaattaatagtaaaaactattctagtctatacccttcaaagtactggtgcttagaaaatgcttatgtaacagagacttc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	67163	145	+	636262	CCTTCctcctttgcccaagttaaacaccggatgctggtagaactctcaatcttcaaacagtgccagaaattaatagtaaaaactattctagtctatacccttcaaagtactggtgcttagaaaatgcttatgtaacagagacttc
s	simRat_chr6.simRat.chr6	59083	71	+	647215	-----CTCCTTTGCCCAAGTTAAACACCAGGTGCTGACAGAAGTCTCAGTCTtc-aacagtgcaagaaaataatagt--------------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr0	63546	100	+	130230	attgcaaactgcaaggctataaattgggacaacatatatgccgtacttattcatacaaaggaggtgagacttccagttcaacaTGCAATCGATAAGAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	67398	100	+	636262	attgcaaactgcaaggctataaattgggacaacatatatgccgtacttattcatacaaaggaggtgagacttccagttcaacaTGCAATCGATAAGAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	59154	100	+	647215	atagcaaaccacaaagctataaattgggacaacatatatgccgtacttattcctacaaaagaggTGAGACTTCCAGTTAAGCAAGAGATCAATAAGAAAA

a
s	mr.mrrefChr0	63646	131	+	130230	CCCACACTGCACCTCACCCTTTTAGCATTGTACTGAAGAAACTGTGTCATGTCAGGCAATATAGCGCACACCCAAGACTAGCACATTAAACAACACCTGACAAAGTGTACTTTCACATAGTTCATCTTAAC
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a
s	mr.mrrefChr0	63777	9	+	130230	AAGTGAGGA
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	64439	246	+	130230	ccacaaattaaggatcacaatccttgctgatcttggcattttataatggaagccactaatagttcaaaggttattagatgttcttggggcacactgttgtgaattcatttgtggacctcgaatttacttaagctaatatacagctttagcaggactgccactgagacactgatggccctgttcaccacatgtaaaaaaacctctgtggaattcacctgtaacaggaaaaggggacttgtgatagag
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a
s	mr.mrrefChr0	64685	41	+	130230	tgattccgagttaaaaaaattggccagccgaataacattac
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a
s	mr.mrrefChr0	64726	18	+	130230	gatttcaggtttcacaat
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	68639	18	+	636262	gatttcaggtttcacaat
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	64746	84	+	130230	caaccattgccgaaacaacactccactggtataaacagatcattactatacaatatgcgtataagatagaTCATTCTAGGGATA
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	65898	143	+	130230	AGTTGTGTGCAACATTGACTTTAAAGGGATGAACACCTGTTGAAGTCAGCCTGAAAAAAAGTATAAAACAACATTCCTTTGCATGAAATTGCCTATAAAACCAGGAAAAGGCAGCCACATCCTACCCTTACTTAACTGCGTAG
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a
s	mr.mrrefChr0	66041	236	+	130230	TGTTTTAATCTACCTAGCATGGTTATGAATGTTTTAGTCTGTGCAAGTGGAAAGCCCTTCCACTATTGCTTTCTTTAATGGGAACACTGTGAATTGAGCACAAGCCTGCCAGTCCACGGCACTATTGGTGCCTTGTCACTGGTCCAGCTTTTTTCTAAGTTCAAGAACTCTACGCCATCTTAACGCTAGACTCAATTCATGCACAATTGGGTGTAAATGAGTTAGACCATACCCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	69958	235	+	636262	TGTTCTAATCCACCTAACATGGTTATGAATGTTTTAGTCTGTGCAAGTGGAAAGCCCTTCCACCATTGCTTTCTTTAAT-GGAACACTGTGCATTGAGCATAAGCCTGCCAGTCCACGACACTATTGGTGCCTTGTCACTGGTCCAGCTTTTTTCTAAGTCCAAGAACTCTACGCCATCTTAACGCTAGATTCGATTCATGCATAGTTGGGTGTAAATGAGTTAGACCATACCCAG
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a
s	mr.mrrefChr0	66277	267	+	130230	CTGCTGTACTTCAGTTGGTGCAGGAGCATTGTTAACACCGGGATTCAATGTCTGGTGCTCTGCATCTAGGTTCTAGGACCAAGTGAGACACAAGTTTGCAGTTGAAATGTGCAGGAAAGAAAGAAGCACTCACTGTGTGTCATTGTATAGTTCCAAAAACATCAATTTGAACCTGGTCAAATACACAGAGTAGCCACTGTGTCAGGATATTCATCTGGGGTTGGAATGAACTTACTGCGGGTGTGAGTCAGGCCTGTATAATGATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	70196	266	+	636262	CTGCTGTACATCAGTTAGTGCA-GAGCATTGTTAACACCGGGATTCAATGTCTGGTGCTCAGCATCTAGATTCTAGGACCAAGTGAGTCACAAGTTTGCAGTTGAAATGTGCAGGAAAGAAAGAAGCACTCACTGTGTGTCATTGTACAGTTCCAAAAACATCAATTTGACTCTGGTCAAATACACAGAGTAGCCACTGTGTCAGGATACTCATCTGGGGTTGGAATGAACTTACTGCGGGTGTGAGTCAGGCCTGTATAATGATGT
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a
s	mr.mrrefChr0	66544	80	+	130230	CCTTTTCCAAGATGTGAAATTGGGGATTGAGAATGAGTGGCGTGCAAGGATTTTTACTTAGTCTACTGTCATTCAATCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	70462	77	+	636262	CCTTTTCCAAGACGTGAAACTGGGGATTGAGAACGAGTGGCGTGCAAGGATTTTTACTTAATCTGCTGTCATTCAAT---
s	simRat_chr6.simRat.chr6	62195	79	+	647215	TCTTTTCCAAGATGTGAAATTGGGGATTGAGAATGAGTGG-GTGCAAGGATTTTTACTTAGTCTACTGTCATCCAACCCT

a
s	mr.mrrefChr0	66624	175	+	130230	AATCCTCATGAACTGTCTGTCAATAATCTGGCATATATTGTCCTGTTGTGAATAGATGGTTATGTGCCCTAACTTAAATCCATCTTAGGATATTTCACCCTCCACTAAGGATAATCATGTTTTACTAAGTCTAATAAAAAGTATATTAGCTCCAACCAGATTTGATGTGATAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	70631	169	+	636262	------CATGAACGGTCTGTCAATAATTTGGCATATATTGTCCTGTTGTGAATAGATGGTTATGTGCCCTAACTTAAATCTATCTTAGGATCTTTCACCCTCCACTAAGGATACTTATGTTTTACTAAGTCTAATGAAAAGTATATTAGCTCCAACCAGATTTGATATGATAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	62276	175	+	647215	AATCCTCAAGAATTGTCTGTCAATAATCTGGCATATATTGTCCCATTGTGAATAGATGGTTATGTGCCCTGATTTAAATCCATCTTAGGATATTTCCCCCTCCACTGAGGATAATCATGTTCTACTAAGTCTAATAGAAAGTATATCAGCTCCAACCAGATTTGATGTGATAAAT

a
s	mr.mrrefChr0	66799	296	+	130230	CATACATAGGTAGAAGGAACTATTCATGTCTAGGGAGGCTCATGATATCAGCTTCCTTGATGTTTATTACCCAGCCCACAAAATCCTTACAAAACTTTGGTCCCATTGGGCAGAACACCCAACTAGATCCAAAGTCTAATGTTCTAATGTGTGTTTCTTAGGGACAAGCCCAATTTGGTCTTCAAGCATTCATGGACTCTATAATGCACCCCTGGACACATGTAAGGTACATAAGCTTTTTAGCTTCTCCTGCTCCTCCCTAACTATGGCAAGTTAAGTTTCACCATATCATGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	70801	296	+	636262	CATACATAGGTAGAAGGAACTATTCATGTCTAGGGAGGCTCATGATATCAACTTCCTTGATGTTTATTACCCAGCCCACAAAATCCTTACAAAACTTTGGTCCCATTGGGCAGAACACGCAACTATATCCAAAGTCTAATCTTCTAATGTGTGTTTCTTAGGGACAAGCCCAATTTGGTCTTCAGGCATTCATGGACTCTATAATGCACCCCTGGACACACATAAGGTACATAAGCTTTTAAGCTTTGCCTGCTCCTCCCTAACTATGGCAAGTTAAGTTTCACCATATCATGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	62451	290	+	647215	CATACATAGGTAGAAGGAATTATTCATCTCTGGGGAGGCTCATGATATCAGCTTCCTTGAAATTTATTACCTAGCCCACAAAATCCTTCCAAAACTTTGGTCCCATTGGGCAGAACACCCCACTTGATCTAAATTCTAATGTTCTAATGTATGTTTCTTATGGACAAGCCCCATCTGGCCTTCAAGCACTCGTGGACTCTATAATGCACCCCTGGACACATGGAAGGCACATAAGCTTATTAGCTTCTCCTGCTCCTCCCCAACTAT------TTAAGTATCACCATATCATGCTT

a
s	mr.mrrefChr0	67095	148	+	130230	AATAAGAGTGTAATGTTATTGATGGCATCTCATTTTTGGATGCCCAAGATGATCACAGGGTTCGGCATGACAAAAGTTATTCAATTTTTGCAGGTCTTTCAACTAGTATTGTTCAGCATCTAAAATCCTTTACAGTCTTATCTCCACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	71097	147	+	636262	AATAAGAGTGTAATGTTATTGATGGCATTTCATTTTTGGAAGCCCAAGATGATCACAGGGAACGGCATGCCAAAAGTTTTTTGATTTATGCAGGTCTTTCAACTAGTATG-TTCAGCATCTAAAATCCCTTACAGTCTTATCTCCACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	62743	148	+	647215	AATAAGAGCGTACTGTTATTGATGGCACCTAATCTTTGGATGCCCAGGATGATCATAGGGTTCAACATGACAAAAGTTATTCAATTTTTGCAGGTCTTTCGACTAGTATTGTTCAGCATCTCAAATCCTTGACAGTCTTATCTCCACC

a
s	mr.mrrefChr0	67243	25	+	130230	TGAATCTCTTTGTTTGTTTTTAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	71264	25	+	636262	TGAATCTCTTTGTTTGTTTTTAATG
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a
s	mr.mrrefChr0	67268	35	+	130230	TGCATATAGGTAGCTGCATTAACTGAGCTATAGTC
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a
s	mr.mrrefChr0	67303	298	+	130230	ACACACCTCATTCGCGATTCTCCTATTTTTCCTCTGTGATGAGGCTTATATTGCCTTACGAGATGCAAGGGACGAAGACACTTCTGCACCATTGAATTTGTTATCAGGTCTATAATTCTGTGTGCATGAAAGGCAATGGAACTAAGAATTAAACCCCTCATTCTAGGTAACTCCCCCTTACATCAGTGATTCATTATCTGTGCATGCAGATGGATATGCACATAGATTTCCACTCATTGCATACACCTGATTTCTAAGGTGGTATTCCACCTCTTGCCACACCCTTATACAGATTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	71329	297	+	636262	ACACACCTCAT-CGCAATCCTCCTATTTTTTCTCTGTCATGAGGCTTATAATGCCTTACGAGATGCAAGGGACGAAGACACTTCTGCACCATTGAATTTGTTATCAGGTCTATAATTCTGTGTGCATGAAAGGCAATGGAACTAAGAATTAAACCCCTCATTCTAGGTATCTACCCCTTACATCAGTGATTCATTATCTGTGCATGCAGATGGATATGCACATAGATTTACACTCATCGCATACACCTGATTTCTAAGGTGGTATTCCACCTCTTGACAGACCCTTATACAGATTTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	62952	298	+	647215	GCACACCTCATTCCCGGTTCTCCTATTTTTCCTCTGTGATGAGGCTTATATTCCCTTATGAGACACAATTTACAAAAGGATTTCTGCACCATTGAATATGCTATCAGGCCTATATTTCTGTGTGCATGAAAGGCATTGGAGCTAACAGTTAAACCCCTCATTCTTGATAACTCCCCCTTACATCAGTGATTCATTATCTGTGCATGCAGATGGATATGCACATAGATTTCCACTCATTGCATACTCCTGATTTTTAAGGCGGTATTCCACCGCTTGCCACATCCTTATACAGAGTTCT

a
s	mr.mrrefChr0	67601	174	+	130230	CTTGCCACATCCTTATACAATGTGTGGTTATGTGCACATGTGCCATGGTAATGACATCAATATAGTTGCCCAGTTTTGTTGCAGCCCAATAGGTACATAACTAGAGAATCACTTGGACGTGGAGGATCACCTGGGAATATAAGACTAAGGCACTCAGATTTATAGGATGGCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	71626	174	+	636262	CCTGCCACATCCTTATACAATGTGTGGTTATGTGCACATGTGCCATGGTAATGACATCAATATAGCTGCCCAGTTTTGTGGCAGCCCAATAGGTACATAACTGGAGAATCACTTGGACGTGGAGGATCACCTGGGAATATAAGACTAAGGCACTCAGATTTATAGGATGGCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	63267	174	+	647215	CTTGCCACATCCTTATACAATAAGTACTTATGTGCACATGAGCCATGGTAATGTCATCATCATAGTTGCCCAGTTTTGTTGCAGCCCATTAGGTACATAAGTAGAGAATCCCCTGGGAGTGGAGACTTACCTGGGAATCTAAGACTAAGGCACTCAAATTTATACGATGGCTTT

a
s	mr.mrrefChr0	67775	745	+	130230	GTGGGCTGGGGGAGAAGGAGAGTATCATAGGCATGCACAGGGTTCAGGCCATCCAGTGATAGCTTCCCCTAGGAGCAATTTCCAGAAAGCCCCAATAACCAAGTCCACTTCCAGTCTTAGACTTCAAAATAAATGGGCTATGCTTTAGCCCATTTAGTACATCCTGATTGAAGAATCAGCTGGGGGGAATTAGTCCAAGTTAGAACAGAAGTGACAGAAGGGAACATTGTATATGCACCTTTGCAGTTAGATCAAATCATCATATAGGTTCACATATACTCCTGCATGCCCAACCTCTAGGTAACTGTATAAATTAGTTCCATCCATGGAATAACGGCTGCGTAGTGGTTAGTGAAGTGTTGTGCAAGGCTTAGCAGACAGTGCCAGAGTCAAGGTCTGGAAGTTCTGTTTCTGATAATAACAGATATTCAACTTTTAATGCCGTCTTTTTGGGAAAATTAGCAGCTCACTCCACATTCCTCCAGAAGTACCTTGAGGAAACTACATTTGCTGATACATAGACTTCCCCACTGTGCTGTTTAGTAACCAACCAGTACATAACAATGCAATAATGTACCACTCCCTTGGTTAAATCTCTTGACTATCCATTGTCAATTGAAGGACCATGTCTGAGTAACCCAAGTGATAAGTGAACCAAATAAGAAAGTCATGAAAATTAATTATGTTACTATTAAGAGTGGCCAATGGAACCAGCCCATCTCATGCGTTTAAACTATCAAGACTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	71814	737	+	636262	GTGGGTTGGGGAAGAAGGGGACTATCATAAGCATTCACAGGGTTTAGGTCACCCAGTGATAGCTTCCCCTAAGAGCAATTTCTGGAAAGCCCCAATTACCAAGTCCACTTCCAGTCCTAGACTTCAAAATAAATGGGCTATGCTATAGCCCATTTAGTGCATCCTGGTTGAAAAATCAGATGGGGGGAATTAGTCCAAGTTAGAACAGAAGTGTCAGAAGGGAGCAATGTATATACACCTTTACAGTTAGATCAAAGCATCATATAGGTTCACATATACTCCTGCATGCCCAACCTCTAGGTAACTGTATAAATTAGTTTCATCCATGGAATAACGGCTGCGTAGTGGTTAGTGAAGTGTTGTGCAAGGCTTGGCAGACAGTGCCAGAGTCAAGGTCTGGAAGTTCTGTGTCTGATAATAACAGATACTCCACTTTTAACGCCGTCTTTTTGGGAGAATTAGCAGCTCACTCCACATTGCTCCAGAAGTACCTTCAGGAAACCACATTTGCCAATACATAGAC--CCCCACTGTGCTGTTTAGTAACCAACCAGTACATTACGATGTAATA---TACCACTCCCTTGGTTA--CCTCTTGACTATCCATTACCAATTGAAGGACCATGTTTTAGTAACCCAAGTGATAAGTGAAGCAACTAAGAAAGTCATGAAAATTAATAATGTTACTATCAAGAGTGGCCAATGGA-CCAGCTCATCTCATGCGTTCAAATTATCAAGACTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	63441	738	+	647215	GTGCGCTGGGAGAGAAGGAGAGTATCATAGGCATGCACAGGGTTCAGGCCATCCAGTGATAGCTTCCCCTAGGAGAGATTTCCAGAAAGCCCCAATAACCAAGTCCACTTCCCCTCTTAGACTTCAAAATATATGGGCTATACGTTAGCCCATTTAGTACATCCTGATTGAAGAATCAGCTGGGGGGAATTAGTCCAAGTTAATATGGAAGTGACAGAAGGGAACATTGGACATGCACCATTGCAGTTAGATCAAATCATTATACAAGTTCATATACACTCCTGCATACCCAACCTTTAGGTAACTGTATAAGTTAGTTCCGTCCATGAAATAATGGCTGCATAGTGGTTAGTGAAGTGTTGCGT--GTCTTAGCAGACAGTGCCAGAGCCAAGGTCTGGAAGTTCTGTTTCTAATAATAATACATATTCAACTTCTAATGTC-----TTTTGTAAGCTTCGCAGCCCACTCAACATTCCACCAGAAGGACCTTGAGGAAACTACATTTGCTGATACCTAGACTTCCCCACTCTGCTCTTTCGGAACCAACCAGTACATAACAATGCAATAATGTATCACTCCCTTGGGTAAATCTCCTGACTATCCCTTGTCAATTGAAGGACCATGTCTGGGTAACCCAAGCGGTAAGTTAACCAAATAAGAAAGTCATGAAAATTAATTATGCTGCTGTTAAGAGTGTCGGATGGAACCAGCCCATCTCATGCGTATAAACTATCAAGACGC

a
s	mr.mrrefChr0	68520	252	+	130230	CTTGCTTGCTACCTACAATAGTGTGCTCATACTCCAACAAAGAGAGCTTAAGCTCCTATAGCAACTAAGTCCCTATAAAACCATGAGCTGGTGAAGCTAAGTCGTATAACCAGGCTGTTGGCAAAGGTCATCCACTTTGTAATTGACTATCCTTTATGTCTCCCTGTCACAAGTTGGTTGTCATTACAACGATTCCTAGGTTACCTAAATTACTGGTGCAAACGTAGCCCATGTCCAAACATTCAAAGCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	72555	252	+	636262	CTTGCTTGCCACCTACAATAGTGTGTTCATACTCCAACAAAGAGAGATTAAGCTCCTATAGCAACTAAATCCATATAAAACCATGAGCTGGAGAAGCTAAGTCGTATAGCCAGACTGTTGGAAAAGGTCATCCACTTTGTAATTGACTATCCTTTATGTCTCCCTGGGACAAGCCAGTTGTCAGTACAATGCTTCCTAGGTTACCTAAATTACTGGTGCAAATGTAGGCCATGTCCAAACATTCAAAGCACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	64179	252	+	647215	CTTGCTTGCTACCTACAATAGTGTGCTCATACTCCAACAAAGAGAGCTTAAGCTCCTATAGCAACTAAGTCCCCATAAAACCTCTAGCTGGTGAAGCTAAGTTGTATAACCAGGCTGTTGGCAAAGGTCATCCACTTTGTAATTGACTATGCCTTATGACGACCTGTCACAAGTTGGTTGTTATTACTACGATTCCTAGGTTACCTAAATTACTGGTGCAAACATAGCCCATGTCCAAACATCCAAAGCACA

a
s	mr.mrrefChr0	68772	28	+	130230	TTATACTATTAAAAGTATCCCAACACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	72810	28	+	636262	TTATACTATTAAAAGTATACCAACACAG
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a
s	mr.mrrefChr0	68800	209	+	130230	CATCAAATGCAATGTCTATTGTCCACTCCTAATTTCTTCTTACTGCAATGAACATGTACAGCTTTCTGACTGAATGGATCCCTACATGTTACAGTGACCACATTTGACTGTATTGTAAGTTGTCAAACATATACCACTCAGAGAACGGGTTAATTAACCTCATATTAATTTTTATCACCTATCCTTGTCAACTGAGGCTAATAATCGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	72840	209	+	636262	TCTCAAATGCAACGGCTATTGTCCACTCCCAATTTCTTCTTACTGCGATGAACATGTACAGCCTTCTGACTGAATGGACCCCTACATGTTACAGTGACCACATTCGACTGTATTGTAAGTCATCAAACATATACCACTCAGAGAACGGGTTAATTAACCTCATATTAATTTTTATCACCTATCCTTGTCAACTGAGGCTAATAATCGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	64459	209	+	647215	CATAAAATGCAATGTCTATTGTCCAGGCCTAATTTCTTTTTGCTGCAGTGAACATGTACAGCTTTCTGACTGGATGGATCCCTACATGTTATAACGACCACATTTCGTTGTACTGTAAGTTGTCAAACATATACTGCTCAGAGAATGTATTAATTAACCTCATAGTAATTTTTATCACTCGTCGATGTCAACTGAGACTAATGAGCAGT

a
s	mr.mrrefChr0	69009	35	+	130230	GACATACTGCAAGTCAGGATACCAACCTTAGATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	73049	35	+	636262	GACATACTGCAAGTCAGGATACCAACCTTAGATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	64669	35	+	647215	GACACACTGCAACTCAGGATACCAACTGTAAATTC

a
s	mr.mrrefChr0	69044	14	+	130230	AAGATTTATTAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	73089	11	+	636262	AAGATTTATTA---
s	simRat_chr6.simRat.chr6	64704	14	+	647215	AAGATTTATTAATA

a
s	mr.mrrefChr0	69058	30	+	130230	CAGATGCAGGTGCTACACATACTGAAGAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	73100	13	+	636262	-----------------CATACTGAAGAAC
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a
s	mr.mrrefChr0	69088	477	+	130230	CCAGGACTTCCTTTACATATTTCATAGGAATGTGGAGTGAGTTGAATCAATCCTCCAAGCTGCATCCTGACTTACTTAAGAACTGGAAGCAAGTATAATATGTGTAGTCCTATCCAGGCATATATATGGTGAACTAACTGAGATCTGATATTAACCTGAAGTTGTTTTTACCAAACCATTTGTGCAACAGACTTTATAAGGTTTACTTGATTATTCAACATAGGGATACTTTCTTGTTTCTCTGCATGTAAGGAACCCAATACTGCTGACCAACTAGTCTTCCCTGACTGGTAATTTCATGATTGTATATTGGGAAGGGAAGACTAATCATTGCCCTATGTTTCTCTTAGGGGTTGCCTAACATCAAAATCCACCCATCTAAATACACCAGGTCTTTATCTACCTCAAATGAATTTATAAGCAAAGTACTGTGCTCAGGTAATTTCACCCCCCCTCATAGCATCCACTGAGCACAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	73113	459	+	636262	CCAGGACTTCCTTTACATATTTCATAGGAACGTGGAGTGAGTTGAATCAATCCTCCAAGC-GCATCCTGACTTTCTTAGGAACTGGAAGC--------------CAGTCCTATCCAGACATATATATGGTGAACTAACTGAGGTCTGATATTAACCTGAAGTTGTTTTTACCAAGCCGTTTGTGCA---GACTTTTTGAGGTTTACTTGATTATTCAACATAGGCATACTTTCTTGTTTCTCTGCACGTAAGGAACCCAATACTGCTGACCAACTAGTCTTACCTCACTGGTAATTTCACGATTGTATATTGGGAAGGGAAGACTAATCAATGCCCTATGCTTCTCTTAGGGGTTGCCTAACATTGAAATCCACCCATCTAAATACACCAGGTCTTTATCTACCTCAAATGAATTTATAAGCAAAGTACTGTGCTCAGGTAATTTCACCCCCCCTCATAGCATCCACTGAGCACAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	64750	469	+	647215	CCAGGGCTTCCTCTGCATATTTCATAGGAATGTGGAGTGAGTTGAATGAATTCTCCAAGCTGCATCCTGACTTACTTAAGAACTGGAAGCAAGTATAATATGTGTAGTCCTATCCAGGCATATATATGATGAACTAACTGAGATCTGATATTAACCTGAAGTTGTCTTTAACCAACCATCTGTGCAACAGACTTTATAAGTTCTATTTGATTATTCAATATGGGGATACTTTCTTGTTTCTTGGCATGTAAGGAACCCAATACCGCTGAGCAACTGGTCTTCCCTGACTGGTAATTTCATGATTGTATATTGGGCTGGGAAGACTATTCATTGCCCTATGTTTCTCTTAGGGGTTGCCTAACATCAAAATTCACCGATCTAAATACACCAGGTCTTTATCTACCTCAAATGAATTTATAAGCAAA--------CTCAGGTAACTTCAACCCCCCTGAGAGCATCCACTGAGTACAGG

a
s	mr.mrrefChr0	69565	33	+	130230	GGAGTGTTCTCAATTACTAATCAGGTACACCGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	73572	33	+	636262	GGAGTGTTCTCAATTACTAATCAGGTGAACAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	65232	33	+	647215	GCAGTGTTCTCAATTACTAATCAGGTACCCCGC

a
s	mr.mrrefChr0	69598	266	+	130230	AAAAAGAAGAGATACACCATCTTTGCTTCTAAGGACTGACAGTGTCCCATGTTTTCAATTTCATTGAGTCTTCAATTTCATTGAGTTGAACTTATCTCCTAAGCCCTATTATGGAGATTATACTTTCAAATTGGAGATTTCACTTTTAAAATGATTGATCAGATCCATAGTTATGACCATATAGTCACATACCTAAACAGAAAGAGCTGTTCAAGAAGTGTGTATGTTTCCTCTCTGAGCGTCACTAATGTTTTAAAGCCTGGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562255	234	-	636262	AAAAAGAAGACATACACCATCTTTGCTTCT-AGGACTGAGAGTGTCCCA-------------------TTTTCAATTTCATTGAGTTGAACTTATGTCCTAA--CCTATTATGGAGATTATACTTTCAAATTGGAGATTTTACTTTTAAAATGATTAATCAGATCCATAGTTATGACCATATAGTCAGATATCTAAATAAAAAGAGCTGTTCAAGAAGTGTGTGTGTTTCCTCTCTG----------ATGTTTTAAAGCCTGGTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	65265	264	+	647215	AAAAAGAAGAGATACACCAT-TTCGCTGCTAAGGACTGACAGTGTCCTATGTTTTCAATTTCATTGAGTCTTCAGTTTCATTGAGTTGTAACTATCTCCTAAGCCCTATTATGGAGAGTATACTTTCAAATTGGAGATTTCACTTTTAAAATGATTGAACAGAT-CATAGTGATGACCAGATAGTCACATACCTAAACAGAGAGAGCTGTTCACGAAGTGTGTATGTTTCCTCGCTGAGCGTCACTAATGTTTTAAAGCCTGGTAT

a
s	mr.mrrefChr0	69864	44	+	130230	AATGAATCTTGCCATGATCGACATAAGCATTCTAAAGCATGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562491	44	-	636262	AATGAATCTTGCCATGATCGACATAAGCATTCTAAAGCATGGTG
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a
s	mr.mrrefChr0	69908	96	+	130230	CAATAAATATTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATATCTAGTGGTTGTGATAACAGTCCAGGGGGAGGCACCCATCTACTTTATCTAACATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562535	96	-	636262	CAATAAATGTTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATACCTAGTGGTTGTGATAACAGTCCAGGGGGAGGCATCCATCTACTTTATCTAACATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	65581	96	+	647215	TAATAAATATTTTATGACTTGTTAAGAGAGCTCACTAATATCTAGTGGTTGTGAGGACACTCAAGGGAGATGCACCCATCTACTTTATCTAGCATT

a
s	mr.mrrefChr0	70004	23	+	130230	TATTTGGTAAGACTCCAGGCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	74007	10	+	636262	T-TTGGGTA----AC--------
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a
s	mr.mrrefChr0	70027	308	+	130230	CATGCCGTTCAAGTAACCTTACCAGATTTCACAATGATGTTTGAGAGTCAGCTGTTGTAGAGCTTGTCTCATTTATAGCAGATGATCAAGTTGTTTATAGCAGATGATCAAGTGCAAAAGATAGTTATAGGGCCATTATTGGGAGCTACTGCATCTGAATTTTTGAACGTCAACACCATTTGCCAGAGTGATGAGTGCCAAAGAGGAGCAAACCCTTGATATAAGATAGTCTATCAAATCTTTTCTGGACAACTAGATTTTTTCACAATATGCACGATGACAAACCTTTTCTAGTCAAGATTCAAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	74017	295	+	636262	-------------TAACCCTACCAGATTACACAATGACGTATGGGAATCAGCTATTGTAGAGCTTGTCCCTTTTATAGCAGATGATCAAGTCCTTTATAGCAGATGATCAAGTCCAAGAGATAGCTATAGGGCCATTATTGGGAGCTACTGCATCTGAATTTTTGAACTTCAACACCATCTGCCACAGTGATGAGTGCCAAAGAGAAGCAAACCCTTGATATAAGATAGTCTATCAAATCTTTTCTGGACAACTGCATTTTTTCACAACATGCACGATGACAGACCTTTTCTGGTCAAGATTCAGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	65706	289	+	647215	CATGCCGTTCAAGTAACCTTACCAGACCTCACAATGATGTTTGAGAGTCAGCTGTTGTGGTGCTTGTCTCATTTATAGCAGATGATCAAGTTGT-----------------GTGCAAAAGATAGTTATAGGGCCATTATTAGGAGCTACTGCATCTGAATT--TGTACGTCAACACCATTTGCCAGAGTAATGAGTCCCAAAGAGGAGCAAACTCTTGGTATAAAATGGTCTATCGAATCTTGTCTGGACAACTAGATTCTTTCACAATATGCATGATGGCAAACCTTTTCTAGCCAAGATTCAAAGT

a
s	mr.mrrefChr0	70335	177	+	130230	ATACTGGCTCTGGTAAAAGGAGGCTCTTGCCATGCCAAGGAAAAGAAATGTACACATTAACTGTTAACCATTTACAAACACTGACCTAAATTAAATAATGAATGACTGCAGGGTACCATGGATTCAGTGAATCATGCCTGCCCATGGGTAGTGTTAGTATTTCCTTGCTGAAGCAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	74316	177	+	636262	ATACTGGCTCTGCTAAAAGGACGCTCTTGCCATGCCAAGGAAAAGAAATGTACACATTAACTGTTAACCATTTACAACCACTGACCTAAATTAACTAATGCATGACTGCAGGGTACCCTGGATTCAGTGAATCATGCCTGTCCATGGTTAGTGTTAATATTGCCTTTCTGAAGCAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	65995	177	+	647215	ATACTGGCTCTGGTGAAAGGAGGCTCTTGCCATGCCAAAAGGAAGAAATGTAAGCATTAACTGTTAACCATTTACAAACGGTAACCTAAATTAAATAATCAGTGACTGCAGGGTACTATAGATTCAGTGAATCTTGCCTGCCCATGGGTATTGTTAGTATTTCCCTGCTGAAGCAAT

a
s	mr.mrrefChr0	70512	1	+	130230	T
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	74495	1	+	636262	T
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a
s	mr.mrrefChr0	70513	5	+	130230	TGATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	74496	5	+	636262	TCATT
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a
s	mr.mrrefChr0	70518	113	+	130230	ATATCCTGACACCTGCTAAGGTGGAGGTGCCCAGGTGGCTAACTTGGCCTATTCCTCTGATTGGGAATGTGCCACTGATTCATGTTTGAGGTCTACATCCAAGCATGTCATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	74501	109	+	636262	ATATCCACACACC----AAGGTTAGGGTGCCCAGGTGGCTAACTTGGCCTGTTCCTCTGATTGGGAATGTGCTACTGATACATGTTTGAGGTCTACATCCAAGCATGTCTTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66187	113	+	647215	ATAGCGTGAAACCTGCTAAGGTGGAAGTGCCCAAGTGGCTAACTTGGCCTATTCCTCTGATTGAGAATGTGCCACTGATTCATGTTTGAGGCCTACTTCCAAGCATTTCATAG

a
s	mr.mrrefChr0	70631	36	+	130230	AGCAGGCCCTTGCTTGAAATAGCCTGTGTTGCCCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	74844	29	+	636262	AGTTGGCCTTTGCTTGA-------TGTGCTTACTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66300	36	+	647215	AGCAGGTCCTCGCTTGAAATAGCCTGAATTGCCCCC

a
s	mr.mrrefChr0	70667	7	+	130230	TGAAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	74873	2	+	636262	TG-----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66338	7	+	647215	TGAAACA

a
s	mr.mrrefChr0	70674	21	+	130230	GATGAGCTCATGCAAGTTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	74875	20	+	636262	-ATAGGCCCCTGCAAGTTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66359	21	+	647215	GATGAGCTCAGGCAAGTTGTT

a
s	mr.mrrefChr0	70695	279	+	130230	CAATGCAAAGTAGGATTCTTATTTCTCCTATTGCCAGCAGCCTCCCAGGTGTCTGGCCTAGTTAGGGATATTTATGGGGATGGGTTCACCTGAAAATTTGTAGCCCAAGCACTGCATACACCTCCTTCTAGACCCATAAACTCACCATTAACCCTACCCCCCAAATTGGTTCAGTTGCTCAACCGAACTCAGCTGAACTACAAAAGGTTAAAGCTGATTGAATGATGATAACCTGTGGGTGAGTCCTTTCTTGTTATTCCTCTCTATTTTGATTACAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	74895	279	+	636262	CAATGCAAAGTAGGATTCTTACTTCTCCTATTGCCAGCAGCCACCCAGGCGTGTGGCCTAGTTAGGGATACTTTTGGGGATGGGTTCACCTGAAAATTTGTAGCCCAAGCTTTGCATACACCCCCTTCTAGACCCATAAACTCGCCATTACCCCTACCCCCCAAGTTGGTTTGGTTGCTCAACCAAACCCAGCTGAACTACAAAAGGCTAAAGCTGCTTGAATGATGATGACCTGTGGGTGAGTCCTTTCATGTTATTCCTCTCTATTTTGATTACAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66400	279	+	647215	CAATGCAGTGTAGGATTCTTATTTTGCCTATTGCCATGAGTCTCCCAGGTGTCTGGCCCCAGTAGGGATATTTATGGGGATGGGGTCACCTGAGAATTTGTAGCCCAAGCACTGCATACACCTCCTTCTAGAGCCATGAACTCACCATTAACCCTACCCCCCAAATTGGTTCAGTTGCTTAACCGAACTCAGCTGAACTACAAATGGTTAAAGTTGATTGAATGATGATAACCTGTGAGTGAGTCCTTTCTTGTTATTCCTCCGTATTTTGATTACAGC

a
s	mr.mrrefChr0	70974	13	+	130230	CAAGGTTCTTCTG
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a
s	mr.mrrefChr0	70987	44	+	130230	ACAGCTTTTCAGTAGGAAGCAAGCGCCAAAAAAAACAACTTGTC
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a
s	mr.mrrefChr0	71031	15	+	130230	AAGATGGAGTTTTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	75239	15	+	636262	AAGATGGAGTTTTAC
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a
s	mr.mrrefChr0	71046	14	+	130230	GTGGCAGGGGATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	75254	14	+	636262	GTGGCAGGGGATAT
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a
s	mr.mrrefChr0	71060	268	+	130230	AAAGGGAGGGGTATTTAAGTTTGAACCTGTTTAGGAACCTTTAAGTGGATGAACTTAGTGCTGGGGATTTTCACATAATTTGTTCCCCCATCTGTTGCTATAATTGGTATATCATCAACCACTAGGGAGAGCCTGCTGAAACTTGCAAGTGCATCTCCACCATACTCAATCATTCTTGCCATATAGCAACATGTGATCATTTTGCTGAATGATTTGCTGCCAGCTTGGTTATAAACCTCTAAGAATAATCATCATTGTCTCGCATATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	75272	268	+	636262	AAAGGGGGGGGTATTTAGGTTTGAACCTGTTGAGGAATTTTTAAGTGGATGAACTTAGTGCTGGGAATTTTCACATCATTTGTTCCCCCATCTGTTGCTATAATTGGTATATGATCAACCACTAGGGAGAGCCTGCTGAAACTTGCAAGTGCATCTCCACCATACTCAATCATTCTTGCCACATCACATCATGTGATCATGTTGCTGAATAATTTGCTGCCAGTTTGGTTATAAGCCTCTAAGAAAAATCATCATTGTCTCGCATATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67008	267	+	647215	AAAGGGAAGGGTATTTAAGTTTGAACCTGTTTAGGAACCTTTAAGTGGTTGAACTTAGTGCTGGGGATTTTCACATAATTTGTGCCCCCATCTGTTGCTACAATTGGTATATCATCAACCACTAGGGAGAGCCTACTCTAAGTCGCAGGTGCATCTCCACTATAGTCAGTCATTCTTGGCATATAGCAACATGTGATCATTTTACTGAACGATTTGCTGCCAGCTTTGTTATAAACCT-TAAAAATAATCATCATTGTCTCATGTATC

a
s	mr.mrrefChr0	71328	119	+	130230	TATTGAAGCCTAGTTTTGTATAGATTATTTGTGTGTAGCTGGCTGGAAAAGTGCTCATGACGAAAGAGATATAGAGACTATGTTGTGACTCCTTTGTCAGCTCCAAAACATTATTTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	75541	119	+	636262	TTTTGAAGCCTAGTTTTGTATAGATTATTTGTGTGTAGCTGGTTGCAAAAGTGCTCATGACGAAGGAGATATAGAGACTATGTAGTGACTCCTTTGTCAGCTCCAAAACATTATGTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67275	119	+	647215	CATTGAAGCTTGGTTTCTTATAGATTATTTGTGTGTAGTTGGCTGGAAAAGTGCCCATGACACAAGAGATATAGAGACTTTGTTGTGACTCCTTTGTCAGCTCTAAAACATTATTTGAT

a
s	mr.mrrefChr0	71447	29	+	130230	GATCTGCAATGACTTGCTTACCTCTGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	75660	29	+	636262	GATCTGCAATGACTTGCTTACCTCTGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67427	29	+	647215	GATCTGCAATGACTAGCTTACTTTTGAAT

a
s	mr.mrrefChr0	71476	139	+	130230	TATCAAGACATGGATCAAAGGGGATGAGTGTCCCTTACAGGGCTGTATGAGGCTCTTTTACTCTGGAGAGAATCCCCTCATTATCTGACCAAAATTGGGACATTTGGCTATATTGAGGGACACAATAATCTTGGTTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	75689	139	+	636262	TATCAAGACATGGATCAAAGGGGACGAGTGTCCCTTACAGGGCTGTATGAGGCTCTCTTACTCTGGAGAGAATCCCCTCATTATCTGACCAAAATTGGGACATTTGGCTATATTGAGGGACACAATAATCTTGGTTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67460	138	+	647215	TATTAAGACACGGATCAAAGGGGATGGGTGTCCCTTACACAGATGTATTAAGCTGTTTTACTCTGGAG-GAATCCCCTCATTATCTGGCCAAAATTGGTACATGTGGCTATATTGTGGCACACAATAATCTTGGTTGAT

a
s	mr.mrrefChr0	71615	43	+	130230	GGGCTTATATACATCAATTATGGAATGATTGTGCTGCTGATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	75828	43	+	636262	GGGCTTAAATACATCAATTATGGAATGATTGTACTGCTGATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67761	43	+	647215	GGGCTTATATACATCAATTATGGAATGATTGTGTTGCTGATGT

a
s	mr.mrrefChr0	71658	72	+	130230	TGAGTTTCCCTACAATTAGGGAGCAGGATTACTGAAATGTAGCAGTGCATAAGGCCAACAATTCACAGAAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	75878	72	+	636262	TGAGTTTCCCTACAATTAGGGAGCAGGATTACTGAAATGTAACAGTGCATAAAGCCAACAATTCACAGAAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67804	72	+	647215	GGAGTTTCCCCACAATTAGGAAGCAGGACTACTGAAATGTAGCAGTGTATAAGGTCAACAATCCCCAGAGAG

a
s	mr.mrrefChr0	71730	116	+	130230	AAAATCCTGTCTCCTAGAACAACAGTAACATTGAGCGTTGCAAATCAAGACAGATGTAAATCAACTTGCACCAAGTCACTGTTCCTGGCTGAAGAACCACAAAGATCCAAGAGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	75950	116	+	636262	AAAATCCTGTCTCCTAGAACAACAGTAATATTGACCGTTGCAAATAGAGATAGATGTAAATCTTCTTGCACCAAGTCACTGTTCCTGGCTGAAGAACCACAAAGATCCAAGAGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67884	116	+	647215	AAAATCCTGTCCCCTAGAACATCAGTAACATTGAGCATTGCAAAGCAAGACAGATGTAAATCAACTTGCACCAAGTCACTGTTCCTGGCTGATGAACCATAAAGATCAAAGAGGCT

a
s	mr.mrrefChr0	71846	162	+	130230	TTCCCATACTGCCAAAATTATTGATTCCCTTCCTGGTCTCCTGGCAGGGGAGGGATTGAATCTTGCACTGAACAGTTTACAGACCTTTACACTCAGGTAAGAGCTGCTATCCTTGTGAGAAAAGATGAAAGATGGATAGCACAACCGAGTTCTCCTGATAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	76066	161	+	636262	TTCCCATACTGCCAAAATTATTTATTCCCCTCCTGGTCCCCTGGCAGGGGAGGGATTGA-TCTTGCACTGAACAGTCTGCAGACCTTTACTCTCAGGTAAGAGCTGCTATCCTTGTGAGAAAAGATGAAAGATGGATTGCACAACCGAATTCTCCTGATACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68001	162	+	647215	TTACTATACTGCCAAAATTAATGATTCCCTTCCTGGTCTTCTGGCAGGGGAGGGGTTGAATCTTGCACTCAACTGTTGATGGACCTTTACACTCAGGTAAGAGCTGCTATCCTTGTGTGAAAAGATGAAAGATGAATAGCACAACCGAGTTCTCCTGATAGC

a
s	mr.mrrefChr0	72008	17	+	130230	TGGCATATCTAGGGGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	76227	17	+	636262	TGGCATATCTAGGGGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68172	17	+	647215	TGCAAACTGCAGGGTGG

a
s	mr.mrrefChr0	72025	4	+	130230	TATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	76244	4	+	636262	CTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68249	4	+	647215	TACA

a
s	mr.mrrefChr0	72029	15	+	130230	GCTCTAATCCAAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	76248	15	+	636262	GGTCCAATCCTAAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68257	15	+	647215	GCGATAATTCAAAAA

a
s	mr.mrrefChr0	72044	7	+	130230	GGCAGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68286	7	+	647215	GGCAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	184505	7	+	647215	GGCTACC

a
s	mr.mrrefChr0	72051	174	+	130230	TGACATGAGGAACCAATGACTACTTCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAAACACCATGGACCCAGGAAGATTTTGGCCACTATGAACCCATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	76263	174	+	636262	TGACATGAGGAACCAATGACTACTTCTGAGAGACTGTTAAATGCAGCTGGTCAGTTTGACAGCCACACTATTTAATGGGCACACCCTAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTTAAACTTTAGGGAGATGTCAAACACCATGAACCCTGGAGGATTTTAGTCACTATGAACCCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68334	172	+	647215	TGACATGAGGAATTGATGAC--CTTCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTTCTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAAACACGATGGACCCAGGAAGATTTTGGCCACTATGAACCCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	184512	155	+	647215	-----------------TGC--GTCCAGAGAGACTATTAAAGGCAGCTGGTCAGTCTGACAGTCACACTCTTTAATAGCCACACCATAATGCAATGCTACTCCCCCTTTTTAAAACTTTATGGAGATTTCAGACACTATGGGCCCAGGAAGATTTTGACCACTACGAACCCATA

a
s	mr.mrrefChr0	72225	59	+	130230	GGTAGGCACCCTATCAGTCTAGGAGGCAAGTCCTTCTGCCCTTTGCAGTTGTGCTTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	76437	59	+	636262	GGTAGGCACCATATCAGTCTAGGAGGCAAGTCCTTCTGCCCTTTGCAGTTGTGCTTATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68506	59	+	647215	GGTAGGCAGCCTATAAGTTTAAGAGGCAAGTCCTTCTGCCCTTTGCAGTTGTATTTATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	184668	10	+	647215	GGTAGGCACC-------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr0	72284	39	+	130230	CATAAGCAAGAAACACCAATTCTCATGAATCAATGCTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	76496	39	+	636262	CACAAGCAAGAAACACCAATTCTCATGGATCAATGCTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68566	39	+	647215	CATAAGAAAGAAACACCAATTATTGTGAATCAATGCTCC

a
s	mr.mrrefChr0	72323	85	+	130230	TCCTAAGAAGAACTGGCAGCAAACCCGATGCCCCTCCCCCAAAGATGACAAGCTGTGGGCCTGGGAATGATACTAACAGGCCAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	76535	78	+	636262	TCCTAAGAAGAACTGGCAGCAAACCAGATGCCCCTCCCCCAAAGATGACAAGCTGTGGGTCTGGGAATGATACTAACC-------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68609	79	+	647215	TTCAGAGGAGAACTGGCAGCAAACCCGATGCCC------CAAAGATGACAAGCTGCAGGCCTGGGAATGATACTAACAGGCCAAA

a
s	mr.mrrefChr0	72408	490	+	130230	TTCATCAGGCCAAAAAGATATGCTCCTACAAACTAGACATAGTGTCCCATGGTAATCAAACATATCACAGTCCTGCTGATCCTCTTTAACATGAGCTGCTTATAATAATCCGTACCATTGTAGAACATCTCTCCCTTTGTTCCACAAAACTCTGCTATTTGCTATTTCTACAAATGTGTGGTGTTATTCACTTAGCATCAAGGCAAAGCTGAAAGTGGGGTATGATGGGTCACTGCCAACAATGCCTATACACATCTGTGTAGAATCTAGCTAATATGCCCACCTAATACAGAGATGGTCATTGTCCCTCATACTCAAACCCACCAAAGCTGAATTACTGCAAGTTAGCTATAAATATGTATGAATTAACTGGTCAGAACACCAAGTCTAGCCAACTTATATAGGTCACAAGTGGACCAAAGACGCAGGATGTAAGACTGGTGGGGGGACCCCTAGTAGGTACCATTGTGGATCTATGGTAAATTAATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	76613	476	+	636262	-------------AAAGATATGCTCCTAGAAACTAGACAGAGTGTCCCATTGTAATTGAACATATTACAGTCCTGCTAATCCTCTTTAACATGACCTGCTTGTCATAATCTGTCCCATTGTAGAACATTTCTCCCTTTGTTCCACAAAACTGTGCTATTTGCTATTTCTACAAATGTGTGGTGTTATTCACTTAGCATCAAGGCAAAGCTGAAAGCGGGGCATGATGGGCCACTGCCAACAATGCTTATACACATCTGTGTAGAATCTAGCTAATATGCCCACCTAATACAGAGATGGTCATTGTCCCTCGTACTCAAACCCATCAAAGCTGGATTACTGCAAGTTAGCTGTAAATATGTATGAATACACTCATCAG-ACACCAAGTCTAGCCAACTTATATAGGTCACAAGTGGACCAAAGACGCAGGATGTAAGACTGGTGGGGGGACCCCTAGTAGGTACCATTGTGGATCTATGGTAAATTAATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68689	490	+	647215	TTCATCAGGCCAAAAAGATATGCTCCTACAAACTTGACATAGTTTCCCATGGGAATCAAACATATCACAGCCCTTCTGATCCTCTTTGACATGAGCTGCTTATAGTAGTCCGTACCATAGTAGAACATCTCTCACTCTGTTCCACAAAACTCTGCAATTTGCTAGTTCTACAAATGTGTGGTGTTATTTACTCAGTACCGACACGAAGCTGAAAGTGGGGTATGATGAGTCATTGCCAAGAATACCTACACACATCTGTGTAGAATCTAGCTAGCATGTCCACCCAAGACAGAGATGGTCATTGTCCCTCATACTCAAACCAACCAAGGCTGAAGTCCTGCAAGTTAGCTATAAATATGTATTAATTAACTGGTCAGAACACCAAATCTAGTAGCCTTAAATAGGTCACAAATGGACCATACACACAGGATGTCAGACTGATTGGGGGACTCCTAGTAGGTACCATTGTGGACTTATAGTTAATTAATTC

a
s	mr.mrrefChr0	72898	129	+	130230	TTTATGACAGAGATGTGTACTTGTTCACTTCCCCATCATCTCTTACCTAGGATCACTCTGCCCATTTGTCAGCCACACTGTTTACCATCCATGGGCGGTTCTCTTTCCTCTGCGTTATGGGATGGCCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	77090	129	+	636262	TTTATGACAGAGATGTGTACTTGTTCACTTCCCCATCATCTCTTACCTAGGATCACTCTGCCCATTTGTCAGCCACACTGTTTACCATCCATGGGCGGTTCTCTTTCCTCTGCGTTATGGGATGGCCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69179	129	+	647215	TTCATGACAGAGATGTATACCTGTTCACATCCCCATCATCTCTTGCCTAGCATCTGTCTGCCCATGTGTCAGCCACCCTGTTTACCATCCATGGGAGGTTCTCTTTCTTCTGTGTCTCGGATAGGACCT

a
s	mr.mrrefChr0	73027	33	+	130230	TGGTACCATGGAGCTGATGCTTCTCACACAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	77219	33	+	636262	TGGTACCATGGAGCTGATGCTTCTCACACAGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69558	33	+	647215	TGGTACCATGAAGCTGATGATTATCACACAGAG

a
s	mr.mrrefChr0	73060	209	+	130230	TTTGAATCATCTATGAGTTCAACTAATGAAATAACACCTAGTGACAACTGCCCAGCATATCTGTACCACAGTACACTCCAGGTTCATAGGCCTCCATTTCTAGATACTAGAATAATTATGTGaggattgagacttgaggttgatcttattgttcggtgtagttcacatcacacctccagttcagtttcattgctcagatctcaggtccc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	77254	209	+	636262	TTTGAATCATCTATGAGTTCAACTAATGAAATAACACCTAGTGACAACTGCCCAGCATATCTGTACCACAGTACACTCCAGGTTCATAGGCCTCCATTTCTAGATACTAGAATAATTATGTGaggattgagacttgaggttgatcttattgttcggtgtagttcacatcacacctccagttcagtttcattgctcagatctcaggtccc
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69591	209	+	647215	TTTGAATCATGTATGAGTTCAACTAATGGAATAATACCTAGTGACAATTGCCCAGCATATTTGTACCACAGCACACTCCAGGTTCATATGTCTCCATTTCCACATATTAAAACAGTTATGTGaggattgagactccaggttgatctacttgcttggtgtagttcacataacacctccagtttagtttcgtggctcagatctcaggtcCC

a
s	mr.mrrefChr0	73269	169	+	130230	ccagactgaaggctgcttggatatcaagaaggaagtttggagttgttacaaaatacccttgtagtgtctcatcttcaagacttaatatacaccaaatagaagacttttacggtatgagcactggggggtgggcaaacagcttcaggatcgccaccccaaccaagtgcca
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	77463	169	+	636262	ccagactgaaggctgcttggatatcaagaaggaagtttggagttgttacaaaatacccttgtagtgtctcatcttcaagacttaatatacaccaaatagaagacttttacggtatgagcactggggggtgggcaaacagcttcaggatcgccaccccaaccaagtgcca
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69804	169	+	647215	CCGGACTGAAGGCTGCTGGGATATCAAGAAGGATGTTCAGAGTTGTTACAAAATACCCGTGCAGTGTCTCAGCTTTAAGACTTAACATACACCAAATAAaagacttttatggtatgagcagtgaggagtgggcaaacaccttcaggattgccacaccatctaagtgcta

a
s	mr.mrrefChr0	73438	43	+	130230	gcattctttaagtagactgactatagacagaatgcagtggtgt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	77632	43	+	636262	gcattctttaagtagactgactatagacagaatgcagtggtgt
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69975	43	+	647215	gtattctttaagtagactgattatagacaagatgcagtgatgt

a
s	mr.mrrefChr0	73481	31	+	130230	aacttcacaaacacaaTGTCCCCTCCAAGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	77675	31	+	636262	aacttcacaaacacaaTGTCCCCTCCAAGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70024	31	+	647215	aacttcacaaacacgaTGTCCCCTCCAAGTC

a
s	mr.mrrefChr0	73512	19	+	130230	TGGAAAGTTGCTTGAATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	77751	19	+	636262	TGGAAAGTTGCTTGAATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70055	19	+	647215	TGGAAAGTTAGTTGAATCA

a
s	mr.mrrefChr0	73531	108	+	130230	CCTGCTTGGTTCTCAAATAGTACTGTAAGGTTGCCTGCTATTATTCGGTCTTACAATGCTGTGGAATTGTTACCCTACTGGGGATTGCTTTTTTAGATTCTATTGCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	77770	108	+	636262	CCTGCTTGGTTCTCAAATAGTACTGTAAGGTTGCCTGCTATTATTCGGTCTTACAATGCTGTGGAATTGTTACCCTACTGGGGATTGCTTTTTTAGATTCTATTGCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70075	108	+	647215	CCAGTATGATTCTAAAACAGTAATGTAAGGGTGCCTTCTACTATTTTGTTCTACAATGCTATGGAATTGCTACCCTAGTGGGGATTGCTTTTTTAAGTTCTCAGGCTA

a
s	mr.mrrefChr0	73639	29	+	130230	TAATATTACAACATCAGGTGTTGGAAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	77879	29	+	636262	TAATATTACAACATCAGGTGTTGGAAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70183	29	+	647215	CAATATTACAACCTCAGGTGTTGGAAGAT

a
s	mr.mrrefChr0	73668	18	+	130230	AAAGGGTGAGGTGACGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	77914	18	+	636262	AAAGGGTGAGGTGACGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70212	18	+	647215	AAAGGGTGAGATGATGGG

a
s	mr.mrrefChr0	73686	72	+	130230	TGGACTAGTTCCAGGAAATCCCCTTTCTGTGTGTGTGTGGCATGCTGATTGACTGCTTTTTTCTGTCTGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	77932	72	+	636262	TGGACTAGTTCCAGGAAATCCCCTTTCTGTGTGTGTGTGGCATGCTGATTGACTGCTTTTTTCTGTCTGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70231	72	+	647215	TGAACTGGTTCCAGGAATCCCACTTTATGTGTGTGTGGGCCCTGCTGGTTGACTGCTCTTTTCTATCTGTAT

a
s	mr.mrrefChr0	73758	41	+	130230	CTAGATACCTATGTATCAGATTTTATGCACTATCAGCATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	78004	41	+	636262	CTAGATACCTATGTATCAGATTTTATGCACTATCAGCATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70349	41	+	647215	CTAGATATCTATGTATCAGATTTGATGCACCCTCACAATAC

a
s	mr.mrrefChr0	73799	20	+	130230	TCTATGCACTATCAGCAATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	78045	20	+	636262	TCTATGCACTATCAGCAATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70391	20	+	647215	TCTACCCAATGACAGTAAGC

a
s	mr.mrrefChr0	73819	135	+	130230	CATCTACCCAATGATAATAAATAAGCTGCAACAGGCAGGAAGGTGGCCTGTCCAAATAACAAATAAGCCTTCACACAATCCATCATGCTCAGCTCCAATATAAGGCAGATGTGGCCATGTACATGTGGTAGGTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	78065	135	+	636262	CATCTACCCAATGATAATAAATAAGCTGCAACAGGCAGGAAGGTGGCCTGTCCAAATAACAAATAAGCCTTCACACAATCCATCATGCTCAGCTCCAATATAAGGCAGATGTGGCCATGTACATGTGGTAGGTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70415	135	+	647215	CATCTACCCAATGACAATAAATAAACTGCAACAGGCCGGAAGGTGGCCTGTCTAAATAACAAGCAAGCTTTCACACAATGCATCATGCCAAGCTCCATTACAAGGCAAACATGGTCATGTACATGTGGTAAGTAC

a
s	mr.mrrefChr0	73954	62	+	130230	TCGGCTCTGAGCTCCTCAGGTGGCCAATCACCATCTAGCTTCAGTGCAAATTCTAGTTGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	78201	62	+	636262	TCGGCTCTGAGCTCCTCAGGTGGCCAATCACCATCTAGCTTCAGTGCAAATTCTAGTTGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70550	62	+	647215	TTGGCTCTGAGCCCCTCAGGTGGCCAATCACCATCTAGCTTCAGGGCAAATTCTAGCTAAGT

a
s	mr.mrrefChr0	74016	79	+	130230	GATAGCACCCCCCATTTGGATCCAGGGACTAGTGGGCAGTTAATCTTTTGCTCTAGCCCATGCGTATCAATAATTAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	78294	79	+	636262	GATAGCACCCCCCATTTGGATCCAGGGACTAGTGGGCAGTTAATCTTTTGCTCTAGCCCATGCGTATCAATAATTAGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70612	79	+	647215	TATAGCACCCCCCATTTGGATCCAGGCACAAAAGGGGAGTTTGTCTCTTGCTCTAGCCCATGTGTATCGAAAATTGGAA

a
s	mr.mrrefChr0	74095	40	+	130230	TGCTTCCATGGGCATCACAAATTATAAGACAAGTAGTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	78432	40	+	636262	CACTCCCATGGGCATCACAAATTATAAGACAAGTAATAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70691	40	+	647215	TGCTTCCATGGGCATCACAGATTAGAAGACAAGTAGTAGA

a
s	mr.mrrefChr0	74135	41	+	130230	ACTTATCTTGCCTGGATACACTTAAACAACTAGCACTCTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	78472	27	+	636262	ACTTATCTTGCCT--CTACCCTAAAAAAA------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70751	41	+	647215	ACTTATCTTGCCTGGATACAGTTAGACAACTAGCACTCTAT

a
s	mr.mrrefChr0	74176	88	+	130230	AAAAAAAGCCCAAACCAAAAAAAGCTTAAAGGTAGTTATGTAGCTGTCAACAAGCACCTTTGGGCGAAGTGGTAAACCATGTTAACGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	78499	88	+	636262	AAAAAAAGCCCAAGCCAAAAAAAGCTTAAAGGTAGTTATGTAGCTCTCAACAAGCACCTTTGGGCGAAGTGGTAAACCATGTTAACGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70795	88	+	647215	AAAAAAAGCCAAAACCAAAAAAAGCTTAAAGGTAGTTATGCAGCTGTCAACAAGCAACTGTGGTGAAAGTGGTAAACCATGTTAGCAA

a
s	mr.mrrefChr0	74264	42	+	130230	CAGCAGAGTTTGGTCCGGGTCTGTGCAGGGAAAGAATTGCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	78592	42	+	636262	CAGCAGAGTTTGGTCCGGGTCTGTGCAGGGAAAGAATTGCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70883	42	+	647215	CAGTAGAGTTTGGTTGGGGTGTGTGGAGGGAAAGAATTGCCG

a
s	mr.mrrefChr0	74306	330	+	130230	CTTAGACCAGAGTTTATCACATGCTAGCTCTGAGTAGCTTTGGTGCCTAGTCTGTGTCGAATGGCAATTCCCACCATATCATTGTTGCACTTATGCTGTTTTCATACATTCTTTGTACATCTTATGCCACATAAATTTTTAGCTTGCTCACTATCTAGTATATACAGTTTTATACCAACCGATAACAGCTGTTTCTTTGAGACCAGTGCTTTTGGAAGCCTTTCATTTATAATGTGGGTACATGTGAGGTGGATTTCTTATCACTTTGCAGTTTTTGTAGCTTGTATCATTTTCATAACATTAATTACATCATCTTAAAGTTTATACAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	78635	325	+	636262	CTTAGACCAAAGTTTATCACATGCTAGCT----GTAGCCTTGGTGCCTAGTCTGTGTGGAATGGCAAT-CCCACCATATCATTGTTGCACTGATGCTGTTTTCATATATTCTTTGTACATCCTATGCAACATAAATTTTTAGTTTGCTCACTATCTAGTATATACAGTCTTACACCAACCGATAACAGCTGTTTCTTTGAGACCAGTGCTTTTGGAAGCCTTTCATTTATAATGTGGGTACAAGTAAGGTGCATTTCTCATCACTTTGCAGTTTTTGTAGCTTATATCATTTTCATAACATTAATTACATCATCTTAAAGTTTATACAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70925	330	+	647215	CTTAGACCAGAGTTTACCACATGCTAACTCTGAGTAGCTTTGGTGCCTAGCCTATGTCTAATGGCGTTTCCTACCATATCATTTTTGCACTTATGCTATTTTCATACATTCTTTGTACATCTTATGCCACACAAATTTTTAGCTTGTCTACTATCTAATATATACAGTTTTATACCAAACGATGACAGCTGTTTCTGTGAGACCAGTGTTTTTGGAAGCCTTTCATTTGTAATGTGGGTACATGTGGGATGGATTTCTTATCACTTTGCAGTTTTTGTCACATGTACCATTTTCTTGGCCTTAATTACATCATCTTTAGGTTTATACAAT

a
s	mr.mrrefChr0	74636	47	+	130230	ATGATGTTTTAACAGGCTGGCGTTGGCTTCGGCTTATGTCTAAGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	78961	47	+	636262	ATGATGTTTTAACAGGCTGGCGTTGGCTTCGGCTTATGTCTAAGTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	71255	47	+	647215	ATGATGTTTTAACAGGCTGGCCTTGGCTTCAGCTTACATCTAAATGT

a
s	mr.mrrefChr0	74683	380	+	130230	TTTATGTGTCTTCAAGCACCTATGTGGACAGTACTGACATTGCTTCACTGCCTGCTTCCTATATATGTATATTTCTTTTAGGTGTTTACATCCTGTCATCACAAAGCGCCACACTGATTACTTATTTCTAAAACACTAGCAATGGCTCCACCTACAACTTTTCTACTTTTTACTGCTAACTCTATCATCTGGGCTTTGTTAAACTCAACATGTGTTCTTTGCTTGTTGGCTTACTCTAAAAGGCTGAAATCATTGTGGCTATGTATGTGTTAAATCCATATCAGGGCTTCATACATCTGGGCCTCCCTTGTTTTGGTAGAACTCTGACACTCTCCATGATATACCGAACAGACTTGTTTCAATGAATGTTAGTCTCAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	79008	363	+	636262	-----------------ACCTGTGTGGACAGTACTGACATTGCTTCACTGCCTGCTTCCTAAATATGTATATTTCTTTTAGGTGTTTACATCCTCTCATCACACAGCGCCACACTGGTTACTTACTTCTAAAACACTAGCGATGGCTCCACCTACAACTTTTCTACTTTTTACTCCTAACTCTATCATCTGGGCTTTGTTAAACTCAACATGTGTTCTTTGCTTGCTGGCTTACTCTAAAAGGCTGAAACAGTTATGTCTATGTATGTGTTAAATCCATATCAGGGCTTCATACATCTGGGCCCCCCTTGTTTTGGCAGAACTCTGACTCTCCCCATGATATACCGAACAGACTTGTTTCAATGAATGTTAATCTCAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	71304	370	+	647215	TTTATGTGTCTTCAAGCACCCACGTGGACAGTACTGACATTGCT-CACTGCCTGCTTTCTATATATGTATAATTCTTTTAGGTGTTTACATCCTGTCATCACAAAGGGGCACACTAATTACTTATTTTTAAAACACTAGCAACGGCTCCACCTAGAACTTTTCTACTTTGTACTGCTAACTCTATCAGCTGGGCTTTGTTAAACTCAGC---------TTGCTTGTTGGCTTACTCTAAAAGGCTGTAATCATTGTGGCTTTGTATGTGTTAAATCCATATCAGGGCTTCATACATTTCGGCCTCCCTTGTTTTGGTAGAGCTCTGGCAATATCCATGTGATACCCAACGGGCTTGTCTCAACGAATGTTAGTCTCAGCT

a
s	mr.mrrefChr0	75063	20	+	130230	AAGAGGCTGGTTTCTGAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	79372	20	+	636262	AAGAGGCTGGTTTCTGAGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	71674	20	+	647215	AAGAGGCTGGTTTCTGAGAG

a
s	mr.mrrefChr0	75083	567	+	130230	AATTGGCAGACTATACCATTGTGATTCTTAATTACACATCCTGGGACCTCCCTATCTGTGTTGGAGTTTGTCAGATTGTGACCTTTAACAGCAACGGAGAGCAACTTTACTGCTCAGCACTCAGATTTAATTAGTGTTTATTACAGTTGTGCCTGCCTTGGAATCTACACCTATCATTCTCTCTAACTGAAGAAGCAAAATCTGATCACCACATTTCAGCATTATCTCTCCCACTCTGCGCACTCTCTGAGTCTTATTGTGAAGGGCCAATAGAGTTTTAGATCAACGAACCTCTAGCCCAATGCACCCGAGCATTTATGAATACGGCCGTCTGTGTATTCTGTACTTCCAATCCTGGACACCAGATGTCTCTTCAGTACAGGAAATGATAGTGGTTCTAAAAAGTTTGTGATTACAGTGATTTCTACTCTAGTGTTCTTTAGCAACTAAGTGCACAATTTTTGTTTTTAAGTTGAAAGTTGAGAAGTTGATGCGCCTTGGAAATCTGAGAACCTTTCCCTCCCACTGGGATTTGAGTACATAAATCTGACACGTTCCATTCTCTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	79393	566	+	636262	AATTGGCAGATTATACCATTGTGGTTCTTAATTACACATCCTGGGACCTTCCTATCTGTGTTGGAGTATGTCAGATTATGACTTTTAACAGCAACGGAGGGCAACTTTACTGTTCAGCACTCAGATTTAATTAGTATTTATTGCAGTTGTGCCTGCTTTGGAATCTACTCCTGTCATTCTTTCTA-CTGAAGAAGCAAAATCTGACCAATGCCCTCAAGCATTATCTCCCCCACTCTTCGCACTCTCTGGGTCTTATTGTGAAGGGCCAGTAGAGTTTTAAATCAACGAACCTCTAGCCCAATGCACCCGAACATTTATGAATACGGCCGTTTGTGTATTCTGTACTTCCCATCCTGGACACCAGATGTCTCTTCAGTACAGGAAATGATAGTGGTTCTAAAAAGTTTGTGATTACAGCGATTTCTACTTTCATGTTCTTTAGCAACTAAGTGCACAATTTTCGTTTTTAAGTTGAAAGTTTAGAAGTTGATGTGCCTTGGACATCTGAGAATCTTGCCCTCCCACTGGGATTTGAGTACATAAATCTGACACGTTCCATTCTCTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	71694	539	+	647215	AATTGACAGACTATACCATTGTGATCCTTAATTACACATCCTGGGACCTCCCTATCTGTGTTGGAGTTTGTCAAAGTGTTACCTTTCACAGCAATGGGGAGCAACTTTACTGCTCAGCAATCTGATTTAATTAGTGTTTATTACAGTTGTGCCTGCCTTGAAATCTACACCTAGCGTTCCCTCTAACTGAAGAAGCAAAGTCTGATCACCACATTTCACCATTATCTCTCCCACTCTGAGTACCCTCTGAGTCTTGTTGGGAAGGGC--ATAAAGTTTCAGATCAATGAAC------------------AAGCATTTATGAATAGGGCCATCTGTGTATTCTGTACTTCCAATGCTGGACCATAGATGTCTCTTCAGTACA-----TGATATTGGTTCTAAAAAGTTTGTGATTACAGTGATTTCTACTCTAGTGTTCCTTCACAACTAAGTGCA---TCTTTGTTTTTAAGTTGAAAGTTGAGAAGTTGATGCGCCTTAGAAGTCTGATGACCTTTCCCTCCCACTGGAATTCGAGCACATAAACCTGAGACATTCCATCCTCTCT

a
s	mr.mrrefChr0	75650	536	+	130230	TCAACGATCACAATCTGTGTTACTTCTAGGACACTACAGCCTGGCAAGTATTCTGCCCATCTTGAGATAATCTGTAAAAATTCCATAAGATGTCTGAATTATCTTAGATTTGCGAGAAGAGATGACTTGGTATAGAGAAGAGGGATCAGATGCCTCCTGCCAGTGGGTGGTTGGCCACCATGCAGGATCTTACCTCTAGCACTTGTGGGGCATTTCAGTACTGACGGTTTCCCTAATGAATGAAAGCACAAATCAATAATAAAGTGACCTGTCTTAATAATCATTGAAATACATTGTGTTATAGTTATTCCACATACATATGATTGGTATGAACACTATAAGGGTGGCATAAACTAAGATGTTCTACCTGACATCTTAAATCTCCCTATGAGATAACAGAATAATGAGTAGAGGCATCCCCATCCAAACATGCTCATTACATGAAAGATGGGGGAACGCTCCTTTTATTCATGCAATGGCACAATGAATCGAATAGGCTCTGGATTCTCAGTTGCACAATGATGATTGGTGTCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	79959	531	+	636262	----CAATCACAATCTGTGTTACTTCTAGGACACTACAGCCTGGCAAGTATTCTGCCCATCTTGAGATAATCTGTAAAAATTCCATAAGGTGTCTGAATTATCTTAGATTTCCGAGAAAAGATGACTTGGTATAGAGAAGAGGGATCAGATGCCTCCAGCCAGTGGGTGGTTGGCCACCATGTAGGATCTTACCTCTAGTACTTGTGGGGCATTTCAGTACTGATGGTTTCCCTAATGAATGAGAGCACAAATCAATAATAAAGTGACCTGTCTCGATAATCATTAAAATACACTGTGTTATAGTTATTCCACATACATATGATTACTAGGAACACTTTAAGGATGGCATAAACTAAGATGTTCTACCTGACATCTTAAATCTCCCTATGAGATAACAGAATACTGAGTAGAGGCATCCC-ATCCAAACATGCTCATTACATGAAAGATGGGGGATCGCTCCTTCTATTCCTGCAATGGCACAATGGATCGAATAGGCTCTGGGTTCTCAGTTGCACAATGACGATTGGTGTCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72239	536	+	647215	TCAATGATCACAATCCGTTTTACTTCTAGGACACTACAGCCCGGCAAGTATTCTGCCCATCTTGAAATAATCTGTAAAAGTTCCATAAGACGTCTGAATTATCTTAGATTTGCAAGGAGAGATGACTTGGTATAGAGAAGGAGGATCAGATGCCTCCTGCCAGTGGGTGGCTGGCTACCGTGCAGGATCCTACCTCCAGCTCTTTTGGGGCATTTCAATACTGACAGTTCCTCTAATGAATGAAAGCACAAATCACTAATAAAGTGACCTGTCTTAATAATCATTGAAATAGATTGTGTTATAATTATTCTACATACATATGATTGGTATCAATGCTATAAGGGTGGCATAAACTAAGACGTTCTACCTGACATCTCAGATCTCCCTCAGAGCTAACAGAATAATGAGTAGAGGCATCCCCATCAAAACATGCTCATTACATGAAAGATTGGGGAAGGCTCCTTTTATTCATGCAATGGTGTTGTGAATTGAATAGGCTCTGGATTCTCAGTTGCACAATGATGATTGGTGTTATT

a
s	mr.mrrefChr0	76186	120	+	130230	AAGGTCCAATTAGTGTGGCTACAAATTGACATGAGTGAACATTATGAAAAATTATCTTGTTTGTTCACCATCCATAACATTGCAGGCAATACTACAAATTGTAGTTTTACCTACCTTCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	80490	120	+	636262	ACGGTCCAATTAGTGTGGCTACAAATTGACATGAGTGAACATTATGAAAAATTATCTTGTTTGTTCACCATCCATAACATTGCAGGCAATACTACAAATTGTAGTTTTACCTACCTTCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72776	120	+	647215	AAGGTCCAATTTGTGTGGCTACAAATTGACACGAGTGAGCATTATAATAAATTTTCTAGTTTGTTTATCATCCATAAAATTGCAAGCAATACCTCAGATTTCAGTTTTATCTACCTCCTT

a
s	mr.mrrefChr0	76306	7	+	130230	ATCTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	80611	7	+	636262	ATCTGCT
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a
s	mr.mrrefChr0	76313	5	+	130230	CTAAC
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a
s	mr.mrrefChr0	76318	42	+	130230	CATTATATGTAATGCAGCCAGGATTCATCTGCATCTTCTAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	80633	42	+	636262	CATTATATGTAATGCAGCCAGGATTCATCTGCATCTTCTAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72908	42	+	647215	CATTATCTGTAATTAAACCAAGATTCATTTTCATCTTGTAAT

a
s	mr.mrrefChr0	76360	85	+	130230	TACGTGGCCCCACTTGATATGCCCTCCTAAACATGGCCCCACCTGAGGTCTCCTCCCAATTTTTTTGGGACTCAGGACCCCATAG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	72951	85	+	647215	CACATGGCCCCACCTGATGCGCTCCCCCAAACATGGCCCGACCTGAGGTGCCCTCCCAATTTTTTTCAGACTCAGGACTGCATAA

a
s	mr.mrrefChr0	76445	9	+	130230	AGAACAACC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	73036	9	+	647215	GGAACAACC

a
s	mr.mrrefChr0	76454	69	+	130230	TTGTGTCTTCTGTTCCAGCGGATTAATGGGGTTGGTGAGTCTGCAGAACTCTGGATAAGGCTATCCTGG
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a
s	mr.mrrefChr0	76523	89	+	130230	CTGTTGTTGGGAACTAGGCTCTGGATTCTCGGTTATACAATGAATTAGATTTGGTACTCTTAACAGTCCAGTCAGTGTGGCTATAAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	80849	89	+	636262	CTGTTGTTGGGAACTAGGCTCTGGATTCTCGGTTATACAATGAATTAGATTTGGTACTCTTAACAGTCCAGTCAGTGTGGCTATAAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	73114	89	+	647215	GTGTTGTTGGAAACAAGGCTCTGGATTCTCAGTTACACAATGAATTAGATTTGGTATTCTTAACAGTCCAATCAGTGTGGCTATAAACT

a
s	mr.mrrefChr0	76612	111	+	130230	GAATGAGCATATTCTCCTGTTTGTTTATCATCCATAAAATTGCGGGCAATTCTACAGATTTCAGTTTGACATATCTCCTTATCTGTAATTCAGTCAAGATTCATCTGCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	80938	111	+	636262	GAATGAGCATATTCTCCTGTTTGTTTATCATCCATAAAATTGCGGGCAATTCTACAGATTTCAGTTTGACATATCTCCTTATCTGTAATTCAGTCAAGATTCATCTGCATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	73208	111	+	647215	GAGTGATCATATTATCCTGTTTGTTTGCCATCAATAACATTGCAGGCAATACCACAGATTTCAGTTTGACCTATCTCCTTATCTGTAATTCAGTCAAGACTTGTCTGCATC

a
s	mr.mrrefChr0	76723	40	+	130230	GTAAATGCCCCATATGGCCCCACCTTATGTGCCCTCCCAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	73319	40	+	647215	ATAAATGCCTCACATGGCCCCACCTTATGTGCCTTCCCAA

a
s	mr.mrrefChr0	76763	47	+	130230	TCTGCTCTCCCAATTTATTTGCCCTCCCAATTTATTTCGGACTCAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	81091	47	+	636262	TCTGCTCTCCCAATTTATTTGCCCTCCCAATTTATTTCGGACTCAGG
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a
s	mr.mrrefChr0	76810	86	+	130230	TAGAGGACAACCTTCTGTCTTCTGTTCCAGAGGATTATTGGGGCTGGACTCTATAGAACTCTGGATAAGGCCACTCTGACAACTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	81138	86	+	636262	TAGAGGACAACCTTCTGTCTTCTGTTCCAGAGGATTATTGGGGCTGGACTCTATAGAACTCTGGATAAGGCCACTCTGACAACTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	73413	86	+	647215	TAGAGGACAACCTTCTGTCTTCTGTTCCAGAGGATTATTGGAGCTGGACTCTTCAGAACTCTGTATAAGGCTATCCTGACAACTCA

a
s	mr.mrrefChr0	76896	24	+	130230	CTTCTCTCATCTTGTGTTGATGAA
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a
s	mr.mrrefChr0	76920	21	+	130230	TCCTCTTGAGCCACCCAAAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	81249	21	+	636262	TCCTCTTGAGCCACCCAAAGG
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a
s	mr.mrrefChr0	76941	6	+	130230	TATCAG
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a
s	mr.mrrefChr0	76947	72	+	130230	ATTGTATTACTATGATCATCTCCAAACTTTCAGGCACACCTTGCCTCTAGCCCAGAATAGCTACCTCAATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	81276	72	+	636262	ATTGTATTACTAAGATCATCTCCAAACTTTGAGGCAGACCTTGCCTCTAGTCCAGAATAGCTACCTCAATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	616162	72	-	647215	ACTGTATTACTATGATCATCTCAAAACTTTCAGGCACACTTTGCCTCTAGCCCAGAATAGCTACCTCAATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	73551	72	+	647215	ATTGTATTACTATGATCATCTCCAAACTTTCAGGCACACCTTGTCTCTAGCCCAGAATAGCTACCTTAATTT

a
s	mr.mrrefChr0	77019	29	+	130230	TGATCTGTGTATGTATACATATTGCTCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	81350	29	+	636262	TGATCTGTGTGTGTATACACATTGTTCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	616234	29	-	647215	TGATCTGTCTATGTATACATATTGCTCTT
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a
s	mr.mrrefChr0	77048	1	+	130230	C
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	81379	1	+	636262	C
s	simRat_chr6.simRat.chr6	73652	1	+	647215	C

a
s	mr.mrrefChr0	77049	3	+	130230	ACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	81380	3	+	636262	GTT
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a
s	mr.mrrefChr0	77052	56	+	130230	CTAACCATGTTCCTTAACCTAACCTGGAACAGTTGAATTTTACTTATAGTGGACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	81383	56	+	636262	CTAACCATGTTCCTTAACCTAACCTGGAACAGTTGAATTTTACTTATAGTGGACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	73656	56	+	647215	CTAACCATGTTGTTCAACTTAACCTGGGACCGTTGAATTGTATGCATAATGCACTG

a
s	mr.mrrefChr0	77108	73	+	130230	TAATCGTTGAACGGGTTACTATGAGGTGCTCTTTCTTCCTCTTGAGTATTATGTGGTCCATATCCAACTGCTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	73712	73	+	647215	TAATCATTGATCAGATTACTCCAAAGCGCTCCCTCTTCCTGTTGATTAAAATGTGGACCATATCGAATTGCTT

a
s	mr.mrrefChr0	77181	146	+	130230	CTGTAGTCAAGAGCGGATTATGAATTTGTGGGGCCAGCCACACTCCCCTAAAATAAACTCTTATCTACTATAGACTTGTGCACCTATTAAGACTTGTGCCATTATTATTTACCATTTAAGGATGTTATAACCTAAGCGCTGTGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	81605	143	+	636262	CTGTAGTCAAGAGCGGATTATGAATTTGTGG---CAGCCACACTCCCCTAAAATAAATTCCTATCTATTATAAACTTGTGCACCTATTAAGACTTGTGCCATTATTATTTACCATTTAAGGATGTTATAATCTAAGCGCTGTGGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	73785	146	+	647215	TGGTAGCCAACAATAGATTTTGAATCTGCTGGGCCAGCCACGTCCCCTGAAAATAAACTCTTACCTACTATAGATTTGTGCACTTATTAAGACTTGTGCCATTATTATTTACCATTTAAAGATGTTATAACCTATGCGCTGTGGCA

a
s	mr.mrrefChr0	77327	67	+	130230	TGTCTGTTAGAACCTAATGTGGGATAACTGGTGCCAAGGTCAGTTCAGACTCAGCATGCAAACATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	81755	67	+	636262	TGTCTGTTAGAACCTAATGTAGGATAACTGGTGCCAAGGTCAGTTCAGACTCAGCATGCAAACATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	73931	67	+	647215	TGTCTGTTAGGATCTAATGTGGGATAACTGGTGCCAAGGTCACTTCAGACTCAGCCTGGAAATGTAT

a
s	mr.mrrefChr0	77394	19	+	130230	GACTTCTATAAACTCTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	81822	19	+	636262	GACTTCTATAAACTCTATA
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a
s	mr.mrrefChr0	77413	51	+	130230	AGGTTTGTCATTTTCTACATGTGGCACACTAGTGATTTGCACTTCTCTTGT
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a
s	mr.mrrefChr0	77464	42	+	130230	GCTCATGGTATGTTTGGGTGGGGAGTTCACAAGATTCTCTGT
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a
s	mr.mrrefChr0	77506	101	+	130230	GAAAAATCCATCCTAGTTTGCTGATGCCAGTGTTAATGAGGGAAATTTGACTTTTGTATAAGATCGGTGTGTGTTGTTTCTGCAAACCAGGGTTTATGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	81950	101	+	636262	GAAAAATCCATCCTAGTTAGCTGATGCCAGTGTTAATGAGGGAAATTTGACTTTGGTGTAAGATCGGTGTATGTTGTTTCTACAAACCAGGGATTATGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	74113	101	+	647215	GAAAAACCCATCCTAGTTTGCTGATGCCAGCGCTAATGAGGGAAATTTAGCTTTTGTATAAGATCAGTGTGTATTATTTCTGCAAATCAAGGTTTATGACT

a
s	mr.mrrefChr0	77607	110	+	130230	ACAATCCTCCCATACAATCTGTTGAATTTCCACTAACATTAGTGGTGACTTTAAGGCTGCTGAGTTTAATACCTCACGTTAATTTTAGAGGCGTTTTAATTACAGTAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	82054	110	+	636262	ACAATCCTCCCATACAATCTGTTGAATTTCCACTAGCATTAGTGGTGACTTTAAGGCTGCTGAGTTTAATACCTAACGTTAATTTTAGAAGCGTTTTAATTACAGTAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	74214	110	+	647215	ATACTCCTCCCATACAATCTGTTGAATTTTCACTTACATTAGTACTGACTCTAAGGCCACTGAGTTTAATACCTCAAGTTAATTTTAGAGGCATTTTAATTATAGTAACT

a
s	mr.mrrefChr0	77717	158	+	130230	AGCTACAGAGAGGAGCTCTAATTGACACCAATCCTGACACAATTTTGATAATTGTAAAGTTAATGGCTAAGCCTTCATAGATGGCAATGGTGGGGTATAACCATGTCTTGTTAATATGGGTTTGTCCAGCCCATTAAGTATAGTCAATGTAAGGGGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	82164	158	+	636262	AACTATAGAGAGGAGCTCTAATTGACACCAATCCTGATACAATTTTGATAATTGTCAAGTTAATGGCTAAGCCTTCATAGATGGCAATGTTGGGGTATAACCATGTCTTGTTAATATGGGTTTGTCAAGCCCATTAAGTATAGTCAATGTAAGGGGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	74387	158	+	647215	AGCTACAAAGAGGAGCTCTAATTGACACCAATCCGGACTCAATTCTGAGAATCGTAAAGTTAATGGCTAAGCCTTCATATATGACAATGGTGGGGTATAACCATGTCTTGATAATATAGGTTTGTCCAGCCTGTCAAGTATAGTCAATGTAAGGGGGC

a
s	mr.mrrefChr0	77875	301	+	130230	TGTGATGAACAGGTTATGATCTATATGTTAATGATCTAGAAGAAGCATGTTACCAAATACTGCCATCGCATTCAGATCCATAAATAGACATCTAGGGCAAAGCACATATTACTTTTTAACCATGCCACATATCTTTCCTTAACCTGAGTATCCAGCATATAATAATGGGAACATTAATCAAAGCTACTTGGGTACCTAAGGTGATCGGTCTGCATGCTCAAATTCTTAGAGCTCACATTACGTTTAACACCACTAGGAAAAGTGACTAGCCTGTCAGAAGGTGTCATGTCACTAATAATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	82324	298	+	636262	TATGATGAACAGGTTACGACCTATATGTTAATGATCTAGAAGAAGTATGTTACCAAACACTGCCATCGCATTCAGATCCATAAGTAGACATCTAGGGCAAAGCACATATTCCTTTTTAACCATGCCACTTATCTTTCCTTAACCTGAGTATCCAGCATATAATAATAGGAACA--AATCAAAGCTACTTGGGTACCTAATGTGATCGGTCTGCATGCTCAAATTCTTAGAGCTCAC-TTACGTTTAACACCACTAGGAAAAGTGACTAGCCTGTCAGAAGGCGTCATGTCACTAATAATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	74545	284	+	647215	CGTGATGAACAGGCTATGATCTATATGTTAACGACTTAGAGGAAGCATGTTACCAAATG-TGCCATCAAATTCAGATCCATAAATAGACATCTAGAGCAGAGCACATATTACTTTTTGACCGTGCCACATATCTTTCCTTAACCTGAGTATCCAGCATATAATGATGGGAACATTAATCAAAGCTACTTGGGTAC-TAAGGT---------------TCAAATTCTGAGAGCTTACATCACGTTTAATACCACTAGGAAAAGTGACTAGCCTGTCAGAAGGTGTCATGTCACTAATAATAT

a
s	mr.mrrefChr0	78176	177	+	130230	TCCTGCTTTCATACACCCTACTAAATGTCATTACAGCATAAGGTTATGTTGTTGATATTACTCCCTTTCCACTGCACATTTTTAATTCTCAGTTTaTTGACTGACTCCCTAATGACtacACATGcttcaataatatactgctcaagaacTATCACATCCTAGTGACTGAACCCAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	82622	176	+	636262	TCCTGATTTCATACACCCTATTGAATGTCATTACTGTATAAGGTTATGTTGTTGATACTACTCCCTTTCCACTGCACATTTTTAATTCTCAGTTT-TCAACTGACTCCCTAATGACTACACATGCTTCAATAATATACTGCTCAAGAACTATCACATCCTAGTGATTGAACCCAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	74844	149	+	647215	TCCTGCTTCCATACACCCTACTAAGTGTCATTACAGCATGAGGCTATGCTGTTGAGATTACTCCCTTCCCACTGCGCATTTTTAATTCTCTGTTTATTGACTGACTCCCTAATGAC---ACATG-------------------------TATCACATCTTAGTGACTGAACCCAATG

a
s	mr.mrrefChr0	78353	130	+	130230	GGGGAAAGGAAAGTAAATCGCAGAGTTAACATCTCCAGACCATTTTTCTATAGATCATCACCTATGCAAGTGGAGGCTGGGTCTACTTGGTTAGATCCCAACTGACATCAGTTGGCATACCCAGCACGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	82798	126	+	636262	GGGGAAAGCAAAGTAAATCGCAGAGTTAACATCTCCAGACCATTTTTCTATAGATCATCA----TGCAAGTGGAGGCTGGGTCTACTTGGTTAGATCCCAACTGACATCAGTTGGCATACCCAGCACGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	74996	130	+	647215	GGGGACAGGTAAGTAAATTGCAGAGTACACATCTTGAGACAATCTTTCCATAGATCATCACCTATGCAAGGGGAGGCTGGGTCTCCTTGGTCAGAGTCAGACTGACATCAGTTGGCATACCCAGTATGGG

a
s	mr.mrrefChr0	78483	91	+	130230	GCGGCCTTCTAAATCCAACCATCCATGCAGACCCTTATCCTCACAGGAGGTTAGCTTGGGACACCAAAGCATAGGGTATCAGGAACCTCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	82924	91	+	636262	GCGGCCTTCTAAGTCCAACCATCCATGCAGACCCTTAGCCTCACAGGAGGTTAGCTTGGGACACCAAAGCATAGGGCATCAGGAACCTCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	75191	91	+	647215	GAGGCCTTCCAAATACAACCATCCATGCAGACCCTTATGCTCAGAGGATGCTAGCTTGGGACACCAAAGCACAGGGTGTCATGAACCCCTG

a
s	mr.mrrefChr0	78574	108	+	130230	GCCTCCGAACCCAGGGCACTCTATGGAACACTATTCTCTCATCGTCCCAGAAATTATATAGTTTCTGAGCTTGTACTTCAAACTCATCCATAGGTAGGTCCAGTCAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83021	108	+	636262	GCCTCCGAACCCCGCACACTCTATAAAACACTATTCTCTCATCGTCCCAGAAATTATATAGTTTCTGAGCTTGTACTTCAAACTCATCCATAGGCAGGTCTAGTCAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	75282	108	+	647215	GCCTCCAAACCCAGGGCACTCTATGGGACACTATCCTCTCATCAACCTAGAAATTACATAGCATCTGAGCCGGTGCTTCAAACTCATACATAGGTAGGGCCAGTCTAT

a
s	mr.mrrefChr0	78682	239	+	130230	TTCACCCCTCAAGCTGCTTATTTTGTAAATAGGTAATGTAGCGCCTGTCCAGTCTACATGGTCCAACTGGTTGTTGTATAGAGATTCTTATTGCTGATATTCCATGATCTAGCCATTGTTTTGTGGTACAATTGTTGCCCTTCTGCTCTCAAATCAGAACCAAGAAACATTCGTAATATGTAATTTTTCAATCTAGACAAGAAACTTAACGATGTTTAGATTTTGCGCTGTGCCTGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83129	239	+	636262	TTCACCCCTCAAGCTGCTTTTTTTGTAAATGGGTAATGTAACGCCTGCCCAGTCGACATGGTCCATCTGATTGCTGTATAGAGATTCTTATTGCTGATATTCCATGATCTAGCCATTGCTCTGTGGTACAATTATTACCCTTCTGCTCTCAAATCAGAACCAAGAAACATTCGTAATATGTAATTTTTCAATCTAGACAAGAAACTTAACGATGTTTAGATTTTGCGCTGTGCCTGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	75391	239	+	647215	TTCACCCATCAAGCTGCTTATTTTGTAAATAGGTAATGCAGTGCCTGTCCAGCCTACATGGTCCAACTAGTTGTTGTATAGCAACTCTTATTGCTCATATTCCATGATCTAGCCATTGTTTTGTGGTACAATTGATGCCCTTCTGCACTTAAATCAGAGCCAAGAAACATCTGTAATATGCAATTTTTCAACCTAGACAAGAAACTTAACATTGTTGAGATTTCGCACAGCACCCTGTG

a
s	mr.mrrefChr0	78921	22	+	130230	CAAAGCCCCAGAAAAAGGCAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83368	22	+	636262	CAAAGCCCCAGAAAAAGGCAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	75631	22	+	647215	CAGAGCTCCAAAAACAGGCAAA

a
s	mr.mrrefChr0	78943	85	+	130230	TGTGGGTATGTACACACGGGTAGTGCTTGGCTATGACCATGTGCCACATCGCCATGTACAGACGGTTAGTGGCTGGGTATGAGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83396	85	+	636262	TGTGGGTATGTACACACGGGTAGTGCTTGGCTATGACCATGTGCCACATCGCCATGTACAGACGGTTAGTGGCTGGGTATGAGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	75653	85	+	647215	CGTGGCTATGTACACACAGTTAGTGCTTGACTATGAGCCTGCCCTGTGTGCCCATGTACACATGGTTAGTGCCTGGCTATGAGCC

a
s	mr.mrrefChr0	79028	31	+	130230	CACAGAGTCTGCCTGCCTCACACAAGAGGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83481	31	+	636262	CACAGAGTCTGCCTGCCTCACACAAGAGGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	75766	31	+	647215	CACAGAGTCTGTCAGCCTCATGCTTGAGGTT

a
s	mr.mrrefChr0	79059	46	+	130230	TGCCAGGCGTAGTTCCCCACATTGTAGATCTCCTGTCCGATTCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83512	46	+	636262	TGCCAGGCGTAGTTCCCCACATTGTAGATCTCCTGTCCAATTCATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	75809	46	+	647215	TGTCAGGCGAAGTCCCCCACTATGTAGAGCTCCTGTCCGATTCACA

a
s	mr.mrrefChr0	79105	102	+	130230	GATAGGCACCTACTTCATGTCCAGAATGAGCCTCCCCATAGTACTGTGACTGGGCTATACCGTCTGTGTCTATTAGTCTGATAGTTCTTATAGCAGGTATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83558	102	+	636262	GACAGGCACCGGCGTCATGTCCAGAATGAGCCTCCCCATAGTACTGTGACTGAGCTATACCGTCTGTGCCTATTAGTCTGATAGTTCTTATAGCAGGTATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	76185	101	+	647215	GATACGCACCTATTTCATGTCCAGAATGAGCCTCCGCACAGTATTGTG-CTGGGCTATCACATCTGTGTCTATTGGTCTGATAGTTCCTATGGCAGGTATGG

a
s	mr.mrrefChr0	79207	6	+	130230	CAATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83660	6	+	636262	CAATAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	76287	6	+	647215	CCACTG

a
s	mr.mrrefChr0	79213	11	+	130230	ACCTTGACAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83666	11	+	636262	ACCTTGACAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	76295	11	+	647215	ACCCTGTAAGC

a
s	mr.mrrefChr0	79224	90	+	130230	ATTTTGTAATTTTTCTAGAGCATAGTTAGTTGGCGTTACAGTTAGTTGGCAGGTAGGAAAAATAGCATGTCAAGGAAATGCCCACTAAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83677	90	+	636262	ATTTTGTAATTTTTCTAGAGCATAGTTAGTTGGCGTTACAGTTAGTTGGCAGGTAGGAAAAATAGCATGTCAAGGAAATGCCCACTAAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	76309	90	+	647215	ATTTTGTAATTTTTCTAGAGCATAGTTAGTTAGCATTACAATTAGTTGGCAGGTTAGGAAAATTACATGTCAAGGAAACGCCCACTAAGT

a
s	mr.mrrefChr0	79314	29	+	130230	GCCTAGCTGTGTGTCTTTATAGGTTTACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83892	29	+	636262	GCCTAGCTGTGTGTCTTTATAGGCTTACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	76399	13	+	647215	----------------TTACAACTTTTCA

a
s	mr.mrrefChr0	79343	10	+	130230	TTACAATCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83921	10	+	636262	TTACAATCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	76419	10	+	647215	TTACAACCAT

a
s	mr.mrrefChr0	79353	561	+	130230	CCACATGGAAAATTAGCTCGGTCTTATTTTGCCTCTGTCATATATCCCTAGGTCGTTTGGCATTTGGGGTGATAGCAACAGATTAATGCCACCAATGCCCAACTCCCAGTTGCAAATGAAATGTAGCTTCTGGAGCATTGTCAACACCAACAGGCAGCATAAGCTCAAATGAATATTGTATATGTTAAATACATAGCCCAAAAATACATTCATTTACCTATATGTGTTGTTGCTGTGGTCCAGGAGATCTATGTCACTGCATGGTACGTACCATTGGAATGGATCACACATTATGGCTTTGGCGTTAAGATCAAGACTCTGTCCAGGAAGACTATGGATCCATTGTCTCAGTCATAGCTGCTGGTTGTGTTACAGTGAGGTTGATCAAAACTTGGCGAGTTTTGAGGGAAAGTCACCTAATCGATTTTAAATGCTAGTCACCTATGGGTTGAGATCTATGAAAGCTACATTGGATGATCTCCTCTCTATTGGTTTGATTAGTTTTTTGGGTTTTTAGTCAGAAATGCTAGCAACTCAAAGTATGGGCTTAGCGTTAGACTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83931	557	+	636262	CCACGTGGAAAATTAGCTCGGTCTTACTTTGCCTCTGTCATATATCCCTAGGCCGTTTGGCATTTGGGGTGATATCAACAGATTAATGCCACCAATGCCCAACTCCCAGTTGCAAATGAGATCTAGCTTCTGGAGCATTGTCAACACCATGAGGGAGGGTAACCTCAAATGGATATTGTATATGTTA--TACATAGCCCAAAATTACATTCATTTACCTATATGTGTTGTTGCTGTGGTCCAGGAGATCTATGTCACTGCATGGTACGGACCATTGGAATGGATCACACATTTTGGCTTTGGCGTTAAGATCAAGACTCTGTCCAGGAAGACTATGGATCCATTGTCTCAGTCATAGCTGCTGGTTGTGTTACAGTGAGGTTGATCAAAACCTGGCGAGTTTTGAGGGACAGTCAGCTAATCAATTTTAAATGCTAGTCACCTATGGGTTGACATCTATGAAAGCTA--TTGGATTATCTCCTCTCTATTGGTTTGATTAGTTTTTTGTGTTTCTAGTCAGAAATGCTAGCAACTCAAAGTATAGGCTTAGCGGTAGACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	76430	560	+	647215	CTGCATCACCAATTAGCTCGGTCTTATTTCGCCTCTGTCATAAATTCCAAGGTCGTTTGGCATTTGGGGTGATAGCAACAGATTAATGCCACCAATGCCCACCTTCCAGTTACAAAGGAAATGTAGCTTCTGGAGCATTGTAAACACCAACAGGCAGCATAAGCTCAAATGACTATTTTATATGTTAAATCCATAGCCAAAAAATACATTCTTGTATCTATATGTGTTGTTGCCATTGTACAGGAGATCTATGCCACTACATGGCATGTACCATTGGAATGGATCACACATTATGTCTTTGGCGGTGAGATCAAAACTCTTAACAGAAAGACTGCGGGTGCATTGTCTCAGTCAAAGCTGCTTGTTGTGTTAAAATGTGGTTGATCAAAGCTTGGCAAGTTTGGAGGGAAAGTCACCTAATCGATCTTCAATGCTAGTCACCTATGGGTTGAGATCTATGAAAGCTACATTGAATGATCTCCTCTCCATTGGTTTGACTAGTTTTTTGGGTTTTTAGTCAGAAATGCTAGAAACTTAAAGTATGGGGTCAGTGTTAGACT-

a
s	mr.mrrefChr0	79914	18	+	130230	GTGAGACAACACTACATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	84490	18	+	636262	GTGAGACAACACTACAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	76990	13	+	647215	-----ACAACACTACATG

a
s	mr.mrrefChr0	79932	7	+	130230	ATATAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	84508	7	+	636262	ATATAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77009	7	+	647215	ATATCAC

a
s	mr.mrrefChr0	79939	74	+	130230	CCAGAAGTAGTAATGATGGTCAGTCATATCATGGATATAGCAATCAATCTCTATCTGGCTACTTCTCCGTATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	84520	74	+	636262	CCAGAAGTAGTAATGATGGTCAGTAATATCATGGATATAGCAATCAATCTCTATCCAGCTACTTCTTTGTATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77016	64	+	647215	----------TAGCGATGGTCAGTCACATCATGGATATAGCCATCAATCTATATCTGGCTACTTCTCCGTATTG

a
s	mr.mrrefChr0	80013	182	+	130230	TACACGCCTGGGACATACATTTTTAAGCAGAATAAAGCTTTTCTAAATTTAGGAATCATATGTATAAAACGAAGATGGAGGTTAACTGCATCAACAACAACTTTGTAATGTCTCTATACATTGCATTGTGGCCCATCATGACTCTTGGGCTAGTATTGCTAGTTTATAGCAACTCCACATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	84595	182	+	636262	TACATGCCTGGGACATACTTTTATAAGGAGAATAAAGCTTTTCTAAATTTAGGAATCACATGTATCACACCAAGATGGAGGTTAACTGCATCAACAGCACGTTTGTAATGTCTCTATACATTGCATTGTGGCCCATCATGACTCTTGGGCTAGTATTGCTAGTCTATAGTGACTCCACCTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77080	182	+	647215	TACACTCCTGGTACATACATTGTTACCCAGAATAAAGCTTTTGTAAATCTAGGAATCATATTTATAAAGCGAAGATGGAGGTTAACTGCGTCAACAACAACTTTGTAAGATCTCTATACATTGCATTGTGGCCCATGATGACTCTTGGGCGAGTATTGCCAGATTATAGCAACTCCACATGC

a
s	mr.mrrefChr0	80195	96	+	130230	GACTGAGACTGGAGGTGCTAAGAAGTCCTACTGAGTATTATGGCGATCAACTTGCAATAAGAACCTGGTATAGTAAAAAGTAAGGCAACCTGTTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	84777	96	+	636262	GAGTGAGACTGGAAGTGCCAAGAAGTCCTACTGAGTATTATGGCGAGCAACTTGCAATAAGAACCTGGGATAGTAAAAAGTAAGGCAACCTGTTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77263	90	+	647215	TACTAAGACTGGAGGTGCTAAGAA------CTGAGTATTATGGTGATCAACTTCCAATAAGAACCTGGTATAGTAAGAAgtaaggcaacctgttaa

a
s	mr.mrrefChr0	80291	84	+	130230	ATAAAAAGACTCACatGATCTTAttATGTGGACAATGATGAGGTGTCCGCAAAATAGAATTATGTACATCTGACCAATCATGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	84873	84	+	636262	ATAAAAAGACTCACATGATCTTATTATGTGGACAATGATGAGGTGTCCGCAAAATAGAATTATGTACATCTGACCAATCATGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77360	84	+	647215	ataaaaagaatcacacgatcttattgtatggacaATCATCAGATATCGGCAAAATAGAATTATGCACATCTGACCAATCATGTG

a
s	mr.mrrefChr0	80375	26	+	130230	TTCCCCCACATGCCTTGCCTTTTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	84957	26	+	636262	TTCCCCCACATGCCTTGCCTTTTTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77450	25	+	647215	CCCCCCCACATGCCTCGCCAC-TTTA

a
s	mr.mrrefChr0	80401	73	+	130230	ACGAAATGGCTGGAACTGTAAAGCCAGGCAACTTTATTGCATCTCCTGACCGGGGGGGCACAACTCTAGCGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	84989	73	+	636262	ACGAAATGGCTGGAACTGTAAAGCCAGGCAACTTTATTACATCTCCTGACCGGGGGGGCACAACTCTATGGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77475	73	+	647215	ACGAAATGGTTGGTACTGTAAAGCCAGGCAACTTTATTGCTTCTCCTGACTGAGGGGGCAGAACCCTAGCGTA

a
s	mr.mrrefChr0	80474	100	+	130230	AAACAGAGTTGACTAGTGTGGTTGAAGATACTAAGAAGTCTGCCACTGTTTAATGTTCTTTTTGGGGACAGAACACTTATGGGCAAGCCAAGTTGTAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	85120	100	+	636262	AAACAGAGTTGACTAGTGTGTTTGAAGATACTAAGAAGTCTGCCACTGTTTAGTGCTCTTTTTGGGGACAGAACACTTATGGGCAAGCCAAGTTGTAAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77548	100	+	647215	AAACAGAGTTGACTAGTGTGGTTGAAGATACTAAGAAGTGTGCTGTTGTTTAATGTTCTTTTTGGGGGCAGAACACTTATGGGCAAGCCAAGTTGTAAGA

a
s	mr.mrrefChr0	80574	65	+	130230	ATGATAAGAAAGTACTCCATGCCTCAAACTAATGGATATAGCAAATTGATACATGAAGGTGAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	85222	65	+	636262	ATGATAAGAAAGTACTCCGTGCTTCAAACTAATGGATATAGCAAATTGATACATGAAGGTGAAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77648	65	+	647215	ACAATAAGAAAGTACTCCATGCCTCAAACCAACGGAGATAGTAAATTGACACATGAAGGTGAAGA

a
s	mr.mrrefChr0	80639	281	+	130230	GTCCAGTCTAGTGGTCATGTACTACAGTTTGCGGCTTGTTTGAGGGAATCCTTATGACTGTGTGCGGTACTGGTCCCTAGGAGGCAAGAGGTATTATGCTGGAAACAAAAACATTAGCCTTTTAAAGCAAGTACCTAAAAGCACAGACAAGAGAGTGCTGGATGAGACCATAGAGACCTTCCTGATGGATATGAAAATAGGCATAGAAAATAAGCATGAGATGATCTGATGGTTATGCCTAGTCACTAAGATCTGACATATACGGGCTACAGTCTACTAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	85305	277	+	636262	GTCTGGTCTAGTCGTCATGTACTACAGTTTGCAGCTTGGTTGAGGGAATCCTTATGACTGTGTGCGGTACTGGTCCCTAGAAGGCAAGAGGTCTTATGCTGGAAACAAAAACATTAGCCTTTTAAAGCAAGTACCTAAAAGCACAGACAAGAGAATGAAGGATGA--CCATAGAGACTTT--TGATGGATATGAAAATAGGCATAGAAAATAAGCATGAGATGATCTGATGGTTATGTCTAGTCACTAAGATCTGACATATACGGGATACAGTTTACTAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77713	276	+	647215	GTCCAGTATAGTGGTCATGCACTACAGTGTGCGGCTTTTT----GGGGCTCCTATGTATTTGTGGCGTATTAGTCCCTAGGAGACAGAAGGTATTATGCTGGAGACAAAAACATTAGCCTTCTAAAGCAAGTGCCTAGAAGCACAGATAAGGGAGTGCTGGATGAGACCATAGAGACCTTCCTGATGGATATGAAAATAGGCATAGAAAATAAGCATGAGTTGATCTGCTGGT-ATGCCTAGTCAGTAGGATTTGCCACATACGGGCTACAGTCCACCAAC

a
s	mr.mrrefChr0	80920	77	+	130230	CCATTAGCTTAGCCAACCCTAAGATCATGACATCTCTAAGATTGCAATGACCTAACACGGGGCTAGGGATTATGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	85583	77	+	636262	CCGTTAGCTTAGCTGACCCTAAGATCATGACATCTCTAAGATTGCGATGACCTAACACGGGGCTAGGGACTATGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77989	76	+	647215	CCATTAGCTTAGCCAACCCTA-GATCATGACATCTCTAAGATTGCAATGGCCTAACACACGGCTAGGGATTATGGAG

a
s	mr.mrrefChr0	80997	121	+	130230	ATTATCTAGCTAGTTTTCAGTTTTGGCACTGCCCCCCCCTTTTGTTTACCTCATCAGTCTTCCATAAAATTAGTTTGGCAGTTCAGCTTGAAATAGCTCTCACAGGATGTTGCCCCATTTG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	78066	103	+	647215	ATTACCTAGCCAGTTTTCTGTTCTGGCACTGCCCCCCCCTTTTGTTGATTTCATCAGTTTTCCGTAAAATTTGTTTAGCAGTTCAGCTTGA------------------TTGCCCCATTTG

a
s	mr.mrrefChr0	81118	17	+	130230	AGGGTAGTGACTCAGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	85786	11	+	636262	AGGGTAGTGAC------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	78169	17	+	647215	AGGATAGTGACTCAGTC

a
s	mr.mrrefChr0	81135	127	+	130230	AATGGTGTATTGAATATCTTAACTCTGGAAGACACAGAATACGCACCCTTGAATAAGTTTTTCCTGAAATGGGGTATCAAAAATCTTAACTCTGGAAGACATAGAATCTGTATTCTTGAGTGAGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	85797	127	+	636262	ATTGTTATATTGAATATCTTAACTCTGGAAGACACAGAACACACACCCTTGAATAAGTTTCTCCTGAAATGGGGTATCAAAAATCTTAACTCTGGAAGACATAGAATCTGTATTCTTGAGTGAGCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	78187	127	+	647215	AATGGTGTATTGAAAATCCTAACTCTGGAAAACGTTGAATAAGCACCCTTGAATCAGTTTTTCCTGAAAGGGGGTATCAAAAATCTTAGCTCTGGAAAACATAGAATCTGTATTCTTGAATCAGCTT

a
s	mr.mrrefChr0	81262	22	+	130230	TACAAGAAGGTAGGTGTTCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	85932	22	+	636262	TACAAGAAGGTAGGTGTTCCTT

a
s	mr.mrrefChr0	81284	170	+	130230	TTCTAGTATCAGATGGAAAGAGTGAACTCACATGTGAAAGTGCAGATGGGATTGTTGATGGAATGTTTAGATCCCCAATATTTGTCCCACCTCAGTCACCTACAAAATGTGATGCTACTGGGCCTGATCGAGAAGGGAGTTATGAAGTGTCCTTTGCCCCAATCCACTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	85955	170	+	636262	TTCTAGTATCAGATGGAAAGAGTGAACTCACATGTGAAAGTGCAGATGGGATTGTTGATGGAATGTTTAGATCCCCAATATTTGTCCCACCTCAGTCACCTACAAAATGTGATGCTACTGGGCCTGATCGAGAAGGGAGTTGTGAAGTGTCCTTTGCCCCAATCCACCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	78314	36	+	647215	--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGAGTCATGATGCATCCTTTGTCCCAATCCACTAC

a
s	mr.mrrefChr0	81454	61	+	130230	ACCCGGCCTTGATATGTGTCTGCAACCTGTAGGATGTACCCTGACCTGTTGGATTTTCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	86128	61	+	636262	ACCCGGCCTTGATATGTGTCTGCAACCTGTAGGATGTACCCTGACCTGTTAGATTTTCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	78350	61	+	647215	ACCTGGCCTCAATATGTGTCTGCGACCTCTAGGATGTACCCTGACCTGTTGCATTTTCTTT

a
s	mr.mrrefChr0	81515	104	+	130230	TTATAGTTAATGACTGGCATGTTCTGTACATTGATTGGGAGATTAATTGATTAGTTAACTGACTACTTTAGTTAGTGTTCTTTGTAGCTCCTCACTCACATGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	86196	104	+	636262	TTATGGTTAATGACTGGCATGTTCTGTACATTGATTGGGAGATTAATTGATTAGTTAACTAACTACTTTAGTTAGTGTTCTTTGTAGCTCCTCACTCACATGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	78411	104	+	647215	TTATAGTTAATGACCGGCATGTTCTGTACGTTGATCTGGAGATTAATTGATTAGTTAACTGACTACTTTAGTTGGTGTTCTTTATAGTTCCTCACTCACATGTG

a
s	mr.mrrefChr0	81619	20	+	130230	ATATGATACTGTGCTTCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	86399	20	+	636262	ATATGATACTGTGCTTCCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	78515	20	+	647215	ATATGATACTCTGCTTCCTA

a
s	mr.mrrefChr0	81639	19	+	130230	CTTTCATCTAGGCGTGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	86420	19	+	636262	CTTTCATCTAGGCGTGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	78535	19	+	647215	CATTCATTTAGGCATGAGT

a
s	mr.mrrefChr0	81658	6	+	130230	CTGTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	86442	6	+	636262	CTGTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	78554	6	+	647215	CAGGTC

a
s	mr.mrrefChr0	81664	75	+	130230	ATAGGAGATGGGGAAGATGGGAAGGCTGGCAGTATTTCGCCATAGTATGTCACTGCTGTGGTCCTAAACTAAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	86452	75	+	636262	AGAGAAGATGGGGAAGATGGGAAGGCTGGCAGCATTGCGCCATAGTATGTCACTGCTGTGGTCCTAAACTAAGTT
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a
s	mr.mrrefChr0	81739	55	+	130230	TTCACTTATGCTGCTGCCACCCACTCAATTGCTTGCTTTTTTTTTATAGTTGTAT
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	81901	11	+	130230	tcctaggttgt
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a
s	mr.mrrefChr0	81912	82	+	130230	ggaatgggctcttcaaccacttggttaacaaaggtgcacatcaggatccccaaatccattagggtgtcagcaaataatcatg
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	82052	67	+	130230	ttggtcctagcttctggactaggactcttatgttctgagaacttggcgaatagcaaatagttctaga
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	82261	38	+	130230	AAGTACATAACAAAAGGTTAATGATTCACATACCCTAA
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	82459	207	+	130230	ATACCAATCTTCAAAGGAAAACATCAGGCAAGAACCCCCAACCCAGGAGAAAAAGAGCTGCTTGCATTAACTGGATTCACTGGTGAGCAGCATATCTAGAGTGCTCCAGTATATAGATATTCTGCAAATCATAGACTTCTTTGTGGGGCAACTATTCATGGAGCCTGGTCTTCTCAGTTTAAAAAACCTCAGGTAGGTGTTTGTCAT
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a
s	mr.mrrefChr0	82666	37	+	130230	TTACCAGCCTGAACATAAGGAAATATTAACACCGGTT
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a
s	mr.mrrefChr0	82703	2	+	130230	CA
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a
s	mr.mrrefChr0	82705	28	+	130230	TAGTGCCAGCCTTCATATGGCTTTAACC
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	82766	11	+	130230	TACACAGGTAC
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a
s	mr.mrrefChr0	82777	68	+	130230	GGTCACATGTTACTCATAAAGCTATTATAGTCCAGACTACACAGTTGGGCCTCTTGCAATGAATAATA
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a
s	mr.mrrefChr0	82845	87	+	130230	TACAGAGATCTTCCAAGTCGGCTTCGAAACATACTCATGTGCTCAATCCTGTTATTCCTAAAACAGACACACTGCTGGGCAGTTACT
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a
s	mr.mrrefChr0	82932	373	+	130230	GAACACAAGGGTGGTACTATCTGATGAACTCTCACATTTTGGCTTCAGTACGCTCCATCAAATCATAGAGTAATGCTCATTAACTGGGAATCTTCTCTCCTGAAGCCAACCCATGTGTAACCAGGTGTCTCTGTATGATTGACTTCCTCCAGACCAGCATTATCAGCAAAGGCAGATTTATTGCCAGGCCCTCAGCTGCAAGTTGCTATAGTTAATTTCTTGTCTCTGTGCCTCATCATTATTAACCAATGTCGATTTCATGGTGGATGGTCAACGGGTTTACTGGAGATTAGCAAATTATATGACACTAGCAGAACAATAGGAAGGTTCAGCTGGAGAAAGATCACAAGCTACAGCTGCCAAGACTCAAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	87756	280	+	636262	----------------------------------------------------------------------------------------AATCTTCTCTCCTGAAGCCAACGCATGTGTAACCAAGTGTCTCTGTATGATTGACTTCCTCCAGACCAGCATTCTCAGCAAAGGCAGATTCATTGCCAGGCCCTCAGCTGCAAATTGCTATAGTTAATTTCATGGCTCTGTGCCTCATCATTATTT-----TGTAGATTTCATGGTGGATGGTCGACGGGTTTACTGGCGATTAGCAAACTATATGACACTAGCAGAACAATAGGAAGGTTCAGCTGGAGAAAGATCACAAGCTATAGTTGCCAAGACTCAAAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79856	373	+	647215	GAACACAAGGGTGGTACTATCTGATGAACTCTCACATTTTGGCTTCAGTACGCTCCATCAAATCATAGAGTAATGCTCATTAACTGGGAATCTTCTCTCCGGAAGCCAACCCATGTGTAAACAGATGTCTCTGTATGATTGACTTCCTCCAGACCAGCATTATCAGCCAAGTCAGATTTATTACCATGCCCTCAGCTGCAAGTTGCAATAGTTAATTTCTTGTCTCTACGCCTCATCATTATTAACCAATGTCAATGTCATGGTGGATAATCAACGGATTTAATGGAGATTAGCGGATTATATGACACTAGCAGAACAATAGGAGGGTTCAGCTAGAGAAAGGTCATGAGCTACAGCTGCCAAGACTCAACTG

a
s	mr.mrrefChr0	83305	387	+	130230	AGGGGTTATAGCAGCATCAAACAAATAAGCTGATGGATGTAAGCTTAAGCTGAAAGAGAATTGAAAATTACCTCTCGCCAAAAAGGTGAAAGTACTTTGTCGGAACACAATATCAGACTTTGGCTAATTCCAGAGAAAATTCTAATATGAATATTAGCGTGAATAGTAGAAGGGGGTTAAATGCACAGAGGGGATAGGGCTCTACTGGGATCAGACAAACATGAAGCTAAGTAGTAGTTTAGGACAGTTGTAGCCCCAAGGGACCAATTGTCATGTATCTGATACACCGGACCTGTCCTCATGGTCCCTGTCTTCATAAAACAAATCTCAATACGGTAATTAATCCTGAGAAGCAAAGAATGAATAACCAAAGCATTACTTGACAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	88040	380	+	636262	AGGGGCTATAGCAGCATTAAACAAATAAGCTGACGGATGTAAGCTTGAGCTGAGAGAGAATTGAAAATTACCTCTCGCCAAAGAGGTGAAAGTACTTTGTC-------ATTATCAGACTTTAGATCATACCAGAGAAAATTCTAATATGAATATTAGCATGAATAGTAGAAGGCGGTTAAATGCACAGAGGGGATAGGGCTCTACTGGGATCAGACAAACATGAAGCTAAGTAGTAGTTTAGGACAGTTGTAGCCCCAAGGGACCAATTGTCATGTATCTGATACACCGGTCCTGTCCTCATGGTCCCTGTCTTCATAAAACAAATCTCAATATGGTAATGTGTCCTGAGAAACAAAGAATGAATAACCAAAGCATTACTTGACAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80229	384	+	647215	---AATTATAGCAGCATCAAACAAATAAGCTTATGGATGTAAGCCTAAGCTGAAAGAGAATTGAAAATTACCTCTCACCAAAAAGGTGAAAGTACTTTGTCGGAACACAATATCAGACTTTGGCTAATTCCAGAGAAAATTGGAATATGAATATCAGCGTGAATAGTAGAAGGGGATTGAATGCACAGAGGGTATAGGGCTCCACTGGGGTCAGACAAACACCAAGCTGACTTGTAGCTTAGGACAGTTGTAGCCTCAAAAGACAAATTGTCATGTATCTGATACACTGGACCTGTCTTCATGGTCCCTGTCCTCATGAAGCAAATCTCAATACGGCAATTAATCCTGAGAAGCACAGTATTAATAAGCAAAGCATTACTTGGCAAG

a
s	mr.mrrefChr0	83692	39	+	130230	TGATAGTTAACACATTGTCTGAGCCTTCTGGTTGGCAGA
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a
s	mr.mrrefChr0	83731	44	+	130230	CCAGACAATTCACCTTTTAGTGGTTGCATAATGCAAACCATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	88476	44	+	636262	CTAGACAAGTCACCTTTTAGTGGTTGCATAATGCAAACCATCAA
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a
s	mr.mrrefChr0	83775	22	+	130230	CTCCATCATTTACTATTGGAGC
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a
s	mr.mrrefChr0	83797	7	+	130230	AGTTAAT
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a
s	mr.mrrefChr0	83804	22	+	130230	CTTCTTCCACCATTGAACATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	88550	22	+	636262	CTTCTTCCACCATTGAACATTG
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a
s	mr.mrrefChr0	83826	87	+	130230	GACTCATCTTGTAAGTATACCCCCCATACATAGGCTAAGAATCCATTTCAGTCTGTGGTACGAAATTTAGTCTGTTAGGGGAAATTG
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a
s	mr.mrrefChr0	83913	50	+	130230	ATGAAATCCCAACCTATGGGATGCAGATCTGGCAGAAAGGTAACAACAAA
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a
s	mr.mrrefChr0	83963	59	+	130230	CCACTCACTTTAATAACACAAAAAAGCAATTGAATCACTGTGTCCTCTACTGAATTCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	88713	59	+	636262	CTACTCACTTTAATAACACAAAAAAGCAATTGAATCACTGTGACCTCTACTGTATTCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80886	59	+	647215	CCCCTTATTTTAATAACACAGAAAAACAATCAAATCACTGTGTCCTCTACTGACTTCGC

a
s	mr.mrrefChr0	84022	18	+	130230	AATGGTATCCCACCATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	88780	18	+	636262	AATGGTATCTCACCATGG
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a
s	mr.mrrefChr0	84040	50	+	130230	TCAAATTACCATCATGAGTTCATTAATGGAGGGATAGGGAATTTAACAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	88800	44	+	636262	TCAAATTA------TGAGTTCATTAATGGAAGGACAGGGAACTTAACAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80958	50	+	647215	TCAAATTACCATCATGAGGTCATTAATGGAGGAATAGAGAATTTAAGAAG

a
s	mr.mrrefChr0	84090	230	+	130230	GTAACATAATCCAGGACAGTAGAAGTCTAGTGTCAATGCCTGCAATTCTATTAGTAAGGTGCTAGCTGTCATTGGCTGCAAATACCAATTTATGACAAGTACCCACTTGTGACCCTGTTTTGCACCATAACTTCCTTTCCTGCATGGAACCTCCATCCTTATTATTCACATCTTCATGAACTGACTCTTGCATCAGAGATTTTACGATAGCAACCCTCTTAGCCTGCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	88844	230	+	636262	GTGACATAATCCAGGACAGTAGAGGTCTAGTGCCAATGCCTGCAATTCTGTTAGTAAGGTGCTAGCTGTCATTGGCTGCAAATACCAATTTATGACAAGTACCCACTTGTGACCTTGTTTTGTGCCATAACTCCCTTTCCTGCATGGAACCTCCATTCTTATTATTTATATCCTCATGAACTGACTCCTGTATCAGGGATTTTACGATAGCAACCCTCCTGGCCTGCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81171	217	+	647215	GTAACATAATCCAGGACAGTAGAAGTCTTGTGTCAGTGCCTGCAATTCTATTAGTAAGGTGCTAGC-------------AAATACCAATTTATGACAAGTACCCACTTGGCACCCTGGTTTGCACCATAACTTCCTTTCCTGAATGGAACTACCATCCTTATTATTCACATGTTTATGAACTGACTCTTGCATTAGAGATTTTACTATAGCAACCTTCTTAGCCTGGCTT

a
s	mr.mrrefChr0	84320	350	+	130230	AAATAGACAGAAGGAATATTATAATATATTTTGCTTAAGGTACCAATGCAGAGGTCCCTGTCCCCACACTATAGACTTTTTGCTGCTGCCAAACCACATCCTGGTGGGTGATAATAGCCCATCAAGACATTAGTAGCATGGTGTGTTTCTGTAAGTTCTCCCATACTAAAACATAACTGCTAGTTGCCAGTGATGTGTCATACAATGCTCCTGTGGCACATGCTTGCGGCTAGAGCCATGCCTAACTCCCAATGAAAGCCCTTAGGTGGGCAAAATTGTCATCACAATATTTAAAAAGCCATCTTCCTTGCCTCAACAGTGATGAGCTAAAAACTTTAAGAATAAGTAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	89081	340	+	636262	AAATAGATAGAAGGAATATTATAATATATTCTGCTTAAGGTACCAATGCAGAGGTTTCTGTCCCCACACTATAGACTTTTTGCTTCTGCCAAACCAC-TCCTG-TGGGTGATAGTAGCCCATCAAGACATTAGTAGCATGGTGTGTTCTTATAAGTTCTCCCATACTAAA--------GTTAGTTGCCAGTGATGTGTCATGTAATGCTCCTGTGGCACATGCTTCCGGCTAGAGCCATGCCTAATTCCCAATGAGAGCCCTTAGGTGTGCGAAATTGTCATCACAATATTTAAAAAGCCATCTTCCTTGCCTCAACAGTGATGAGCTAAAAACTTTGAGAATAAGTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81388	348	+	647215	AAGTAGACAGAAGGAATACCGTAATATATTTTGCTTAGGGTACCAATGTAGAGGTCCCTGTCCCCACTCTAGAGACTTTTTGCTGCTGCCAAACCACATCCTGGTGGGTGATAATAGCCCACCAAGACATTAGTAGCATGGTGTGTTTCTGTAAGTTCTCCCATACCAAAACATAACTGCTAGTTGGCGGTGATGTGCCATACAATGCTC-TGTGGCACATGCTTGCGGCTAGAGCCATGCCTAACTTCCAATGAAAGCCCTTAGGTGGGCAAAATTGTCATCACAATATTTAAAAAGCCATCTTCCTTGCCTTAACAGTGATGTTCTAAGAACCT-AAGAAGATGTAAC

a
s	mr.mrrefChr0	84670	47	+	130230	AACGTATCAGCACTACACTGCTTTGTAATAAGTATATCATCTGCTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	89421	47	+	636262	AACCTTTCAACATTACGCTGTTTTGTAATAAGTATATCATCTGCTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81737	41	+	647215	AAAGAAGCAGCACTCCAATACTTTATG-TAGG-----CGTCCCCCAG

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	89468	122	+	636262	GAAGATGTAGCCAAAGAAGC-----------ATACTCATTCATAAAGCACCAGCTTATAGTAAGCCTTGCAACTTCAGACCAGTGCATTGCATACCCTGAATTATGAACGGATGTCAATGGACTAGCTTTCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81780	133	+	647215	GAATAGTCAACTGCAAGAGCACTTTTATCTTCTACTCATCCACAAAGCACCAGCTTACAGGAAGCCTTGAAACTTCACAGCAGTGTGTTGCATACCCTGAACTATTAATGGGTGTCAATGGACTAGCTCTCAA

a
s	mr.mrrefChr0	84850	140	+	130230	GTATCACATGGTGTCTTGGTCATGGGTACtaaagagttcaataggacttggttggagtgtgagtcccaaaactttatactttcccctcagcacttacaccctgagaaagaggctacgttccatgaggcgtcttATATAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	89592	140	+	636262	GTATCACATGGTGTCTTGGTCATGGGTACtaaagagttcaataggacttggttggagtgtgagtcccaaaactttatactttcccctcagcacttacaccctgagaaagaggctacgttccatgaggcgtcttATATAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81913	140	+	647215	GTACCAGATACTGTCTTGGTCATGGGTACtaaagagttcaatagcacttggttggagtacaaatcccaaaactttctactttcccgtcagcacttactccctgagaAACAGGCTGCCTTCCATGTGCCTTCTTATATAGT

a
s	mr.mrrefChr0	84990	55	+	130230	GATTCCAGTTAACTCCTCTGGTTCACTTGACAAAGTTACACCCTCATATAGCCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	89733	55	+	636262	GATTCCAGTTAACTCCTCTGGTTCACTTGACAAAGTTACACCCTCATATAGCCCA
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a
s	mr.mrrefChr0	85045	60	+	130230	AATCTTTTAGAGACCCCCCAAGATGCATTCTGTGAACGTCAAGATTTGGTGCTTTATCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	89788	60	+	636262	AATCTTTTAGAGACCCCCCAAGATGCATTCTGTGAACGTCAAGATTTGGTGCTTTATCTA
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a
s	mr.mrrefChr0	85105	20	+	130230	ACCCAGAGCTGTGACCCCTT
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a
s	mr.mrrefChr0	85125	59	+	130230	CAATCAGCCATTGGTCTGAGGCACCTGGGGTTACGCTCTCATTAAGTAAACTATGAAAG
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a
s	mr.mrrefChr0	85184	17	+	130230	TATAGGAGTCCACTGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	89928	17	+	636262	TATAGGAGTCCACTGGA
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a
s	mr.mrrefChr0	85201	407	+	130230	GAAGTGTGTCATGGTATTACCAGCTCATCCTGTTCCACTCCATCTTCTTGCTAAGAGGCACCAGAAAACAGAGGCAGCATATTTGAATGCCAGCTTGAACATAGCAGGCAAGCGGGTGCAATTGTCCAAACTCATGTAGAGATAAAGGTGAGCCTAGGTCTGGTGTGTGGGATATACCTGGCTAATTGAGTGAATAGCAAACTGTGCAAAGGTCCCACTGGTGCTGCCAAATCCCCCACTCACTCACTCACTCAACCTTATAACAGTGTTTTATCAGTAAGTAGTACTTGTGTGTAACTTATGTCACAGTCCATCCAAGCATGAGGAGCTATCAGGGAGGCCCTCGGTCAGTTCTTCTTTTTTCAGATCAGAGTTTTTGCCATGGATACAGGTACCTTTAATGGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	89953	398	+	636262	GAAGTGTGTCATGGTATTACCAGCTCATCCTGTTCCACTCCATCTTCTTGATA----GCACCACAAATCAGAGGCAGCATATTTGAATGCCAGCTTGAACACAGCAGGCAAGCGGGTGCAAGTATCCAAACTCATGTAGGGATAAAGCTAAGCCTAGGTCTGGTGTGTGGGATATACCTGAATAATTGAGTGAATAGCAAACTGTGCATGGGTCCCACTGGTGCTGCCAAATACCCCACTCATTCACTCACTCAACCCTATAACAGTATTTTATCAGTAAGTAGTATTTGTGTGTAGCATATGTCACAGTCCATCCCAGCATGAGGACCTATCAGGGAGGCCCTTGGTCAGTTCTTCTTGT-----ATCAGAGTTTTTGCCATGGATACAGGTACCTTTAATTGTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	82277	399	+	647215	GGAGTATTTCGTGGTATCCCCTGCTCATCTCATTCCACTTCATCTTCTTGCTAAGAGGCACCAGAAAACAGAAGCAGTATACTTGAATGCCAGCCCGAACATAACAGGCAAGCAGGTGCAATTGTCCAGACTCATGTAGAGATGAAGGTGAGCCTAGGTATGGCGTGTGGGATAGACCTGGCTAATCGAGTGAATGGCAACCTGTGCAAAGGTCCCACTGGTGCTGCCAAATCCCCCACTCACTCGC--------ACTTATGACAGTGTTTTATCAGTAAGGCGTGCTTGTGCGTAACTTTTGTCACAGTCTGTCCAAGCATGAGGAGCTATCAGGGAGGCCCTCGATCAGTTCTTCTTTTTTCAGCTTAGAGTTTTTGCCCTGGGCACAGGTATCTTTAATGGTAT

a
s	mr.mrrefChr0	85608	49	+	130230	TAGCCATAAATGGTACTGGGCAGAGCAGGTGTTAGACTAAGGTTGTCAA
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a
s	mr.mrrefChr0	85657	22	+	130230	CCATTTGTCAAGCAAGGTAATA
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a
s	mr.mrrefChr0	85679	203	+	130230	TGCCAGAAGTGCTCTGGCAACACTGTTGGAGCCACATTTTCTTCTAACCCAGAGGGGGGTTGTGAAGTGGGTTTAATGTTATCAGGATAGGTGGTGCATTGAGAACCTATAATCAATCCAAGGTTAAAAGGTTAGTCAGAACAATACTGATGCCAGTATTGTTGATGGGCCGGTAGTAATGTCCAAACGACGGGATGATCATA
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a
s	mr.mrrefChr0	85882	11	+	130230	GGTGCTCTATC
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a
s	mr.mrrefChr0	85893	67	+	130230	AGGTACTTACTTGGGTACTACTCTTCTGGCTATGCACTACAATGATGCAGATATGATAGGTCCCTTT
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a
s	mr.mrrefChr0	85960	84	+	130230	GGAATTACAAAAGACATGCATATTATTGGGGAGACGTACTATAAGTAAGCATTTTAACCTCAACAGTAGATGAGGAAATGCAGG
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a
s	mr.mrrefChr0	86044	8	+	130230	CAAGATGG
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a
s	mr.mrrefChr0	86052	235	+	130230	AACATAGGACTATTGAGAACTCCAAGGCGAGGGGGCTGGTGCAATAAAGCTCTCACTGCATAGAAGAGATAGGGTGGCAATACTCCCCAATAGAAAATAATCCAGCATAGACTCATTGGGTTGCAGGAGTGGGGGACCACAGTCAATTGGCAGTGCCTGGAAAAGTCTAAACTCTATCTAGGAAAGTCATCTGCACTTAGAAACCTAGATGGGGGTTGCAACAACGGGGGACCAC
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a
s	mr.mrrefChr0	86287	9	+	130230	GTCAGTTGA
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a
s	mr.mrrefChr0	86296	159	+	130230	CTATGCCTATAAATGGTCTAAATTCTAGCTAAAAAAGTCAACTACATTTAGGACTTGCTAATATACATAAGAGTACCCACAATGGACCTGGTGTAGTCTGTGAGAAAACTATCAAAGACTTAGTGGCTCTGGGGTTGAAGATATCTGATAAGATGGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	91056	159	+	636262	CTATGCCTATAGATGGTCTAAATTCTAGCTAAAAAAGTCAGCTACATTTAGGACTTGCTAATATACATAAGAGTACCCACAATGGACCTTGTGTAGTCTGTGACAAAACTATCAAAGACTTAGTGACTCTGGGGTTGAAGATATCTGATAAGATGGTCA
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a
s	mr.mrrefChr0	86455	91	+	130230	AGTAATATATTAATCGTCCACCTTGCATAAAGGTGACCCACGCCATGGCAAAATTTAATTGGGTTCCATGTGCTATGGTACCTCCAATTAA
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a
s	mr.mrrefChr0	86546	42	+	130230	TCTGGTCATAGTAGCTTGGGAAAAATAAATCAAGACAAGGGT
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a
s	mr.mrrefChr0	86588	13	+	130230	AATTTAAATGGGT
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a
s	mr.mrrefChr0	86601	9	+	130230	TCCATGTCC
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a
s	mr.mrrefChr0	86610	12	+	130230	ATGGTACCTCTA
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a
s	mr.mrrefChr0	86622	303	+	130230	TTAATCTGGTCACAGTAACTTGGGAAAAAATAATTAAGACAAGGGTGGCTGTTTATTATGTGAGGCTAGAACAGTGTCTAGATTATCTCTACTTAGTATACTCTCACTACATGTGGTGGGGACAGATTATCCTCAATTAATATTGTTGGGACTGTCCCTGAACCATCAATATATTCTTTATCTTAGGGTTGCCCGATACAACCGTCAACTAATATAATATGGATGCCTATAACTTGATGCCCTCAGGTCAATGTATGGAGAGCAAGAAGTAAACATGATTCTTCAATAGCAGCACACTTCAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	91417	303	+	636262	TTAATCTGGTCACAGTAACTTGGGAAAAATAAATCAAGACAAGGGTGGCTGTTTATTATGTGAGGATAGAACAGTGTCTAGATTATCTCTACTTGGTATACTCTCACTACATGTGGTGGGGACAGATTATCCTCAATTAATATTGTTGGGATTATCCCTGAACCATCAATATATTCTTTATCTTAGGGCCACCCAACACAACCGTCAACTAATCTAACATGGATGCCTATAACTTGATGCCCTCAGGTCAATGTATGGAGAGCAAGAAGTAAACATGATTCTTCAATAGCAGCACACTTCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83696	303	+	647215	TTAATCTGGTCGCAGTAACTTGGGAAAAAATAATTGAGATAAGGGTAGGTGTTAAATATGTGGGGCTAGCACAGTGTCTAGATTATCTTGACTCAATATACTCTCACTACATGGGGTGGGGACAGTTTACCCTCAATCAATATTGTTGGGACTGTCACTGTATCATCAATATATTCTTTATCTTAGGGTTGCCTGATACAACCGTCAACTAATATAATATTGATGCCTATAACATTGTGCCCTCAGGTCAATGTATGGAGAGCAAGATGAAAGCATGATTCGTCAATAGCAGTGCACTTCAAT

a
s	mr.mrrefChr0	86925	55	+	130230	ATATTATCAACCCGGAGCTTCGCAGGCTAGTACCCACCCTTATATCAGATAGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	91721	55	+	636262	ATATTACCAACCCAGAGCTTCGCAGGCTAATACCCACTCTTATATCAGATAGGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83999	53	+	647215	ATATTATCAACCCGGAGCTTGGCCGG-TAGAACTGACCCTATTATCAGATAGAC-

a
s	mr.mrrefChr0	86980	5	+	130230	GCCAG
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a
s	mr.mrrefChr0	86985	152	+	130230	CCAGCACTGTGGAAACAAACAATTATAAACTATGGGAAGGTGTAAAAACTGTATAGATCTATTGTGTTCTGTACCACTTTGGAGTTCCATTGGCCTATCATCAGGACATGTTAGTGGTAGTTGTCATGGAGAGTTAGCCAGACCTGAGCTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	91789	152	+	636262	CCAGCACTGTGGAAACAAACAATTATAAACTATGGGAAGGTGTAAAAACTGTATAGATCTATTGTGTTCTGTACCACTTTGGAGTTCCATTGGCCTATCATCTGGACATGTTAATGGTAGTTGTCATGGAGAGTTAGCCAGACCTGAGCTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	84057	92	+	647215	------------------------------------------------------------ATTATGTTCGGTATCATTATGGAGTCCCATTGGTCTATCATCAGGACATGTTAGTGGTAGTTGTCATGTGGAGTTAGCCAGACCTGAGCTCG

a
s	mr.mrrefChr0	87137	284	+	130230	TTCAGATTTGATTCAGATACCACTCTTGAACCTCTAGAAACATTTGCTGTACTGAGAGGTAAGTATGTTACTCCCTCATCAACAGGTGCAATGCACTGTGTTGCAGAATACAGTCCTTGCATCATAACAGATTTTGTCTGGTTGCCCAAACCCCTAGCACTTGAGCTGAGAATCCTCAGACTGGCACCCAAGAAGCTGTGTTACATAGTATTACTCAAGCTGGAGCAGTGATATTGTATGCACCAGGTTTTGATTCGGCTTTATGTTTATAGCTGCTCAAATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	91941	284	+	636262	TTCAGATCTGATTCAGGTGCCACTCTTAAACCCCTAGAAACATTTGCTGTACTGAGAGGTAAGTATGTTGCTCTCTCATCAACAAGTGCAGTATACTGTGTTGCAGACTACAGTCCTTGCATCATAACAGATTTCATCTGGTTGCCCAAACCCCTAGCACTTGAGCTGAGAGTCCTCAGACGGGCGCCCAAGAAGCTGTGTCACATAGGATTACTCAAGCTTGAGCAGTGATATTGTATGCACCAGGTTTTGATTCGGCTTTATGTTTATAGCTGCTCGAATAA
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a
s	mr.mrrefChr0	87421	82	+	130230	TTATAATTTACTTATGTTTACAGATGATGCCTAAACAGATTTAGATGTGGGTAAGTGAATTATAGACTAATGTTTAAGCATT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	84438	68	+	647215	CTGT-----------GTTTACAGATGAT---TAAACAGATTTAGATATGGGTAAGTGAATTATGGACTAATGTTTATGCATT

a
s	mr.mrrefChr0	87503	372	+	130230	GGTGGATACCCATACCTGCTAGCAGTATCTGAGGGCATGGCTACACAAGCCCCCAATAAGTATGACATGATCTGCTGTGCAATGCTCCTCCCTGCATAGAATGGCTATGATCAAATAAGAGCCAATTTAGTACATAGTACTAGTGCCTTGAATACTGCCTAACATTGTTTAGATTTTGCACAGTGCCTCGTGCAAAGCTCCAATTAAAGGCAAATGCGTGCATTCCCATTTAGTACTTGACATGCTGTCGAGCACTCATAGGTGCCTATAGAAGGAGCCTGCCCTCCTCATGCAAGCACCCTAATGGTCCAAAATGTCACTGCTATTCAAAGTACTATAAACCTTGTAAAATTTTACAAACATAGTTGTCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	92315	362	+	636262	GGTGGATACCCATACCTGCTAGCAG---------GCATGGCTACACAAGTCCCAAATAAGTATGATATGATCTGCTGTGCAATGCTCCTCCCTGCATAGAATGTCTATGATCAAATAAGAGCCAATTTAGTACATAGTACTAGTGCTTTG-ATACTGCCTAACATTGTTTAGATTTTGCACAGTGCCTCGTGCAAAGCTCCAATTAAAGGCAAATGCGTGCATTCCCATTTAGTACTTGACATGCTGTCGAGCACTCATAGGTGCCTATAGAAGGAGCCTGCCCTCCTCATGCAAGCACCCTAATGGTCCAAAATGTCACTGCCATTCAAAGTACTATAAACCTTGTAATATTTTACAAGCATAGTTGTCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	84506	362	+	647215	GGCAGATACCCAACCCTACTAGCAGTATCTGAGGGTGTGGCTTCAGAAGCCCCCA----------CATAATCTGCTGTGCAATGCTCCTCCCTGCATAGAATGGCTATGATCAAGTAAGAGTCAATTTAGTACATAGTAATAGTGCCTTGAATACTGCCTAACTTTGTTCAGATTTTGCGCAGCAGTTCGTGCAAAGCTCCAATAAAAGGCAAATGTCTGTATACACATTTAGCACTTGACACGCTATCAAGCAGTCAAAGGCACCCATCGAAGGAGCCTGCCCACCTCATGCAAACACCCTACTGGTCCAAAATGTCACTTCTATTCAAAGTACTATAAACCTTGTAAAACTCTACAAACATGATTGTCAG

a
s	mr.mrrefChr0	87875	20	+	130230	TATGATATGGAATGCTAGAA
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a
s	mr.mrrefChr0	87895	146	+	130230	CTTAAAAGAAGAACATCACAAGCTTAAGAGTTTTTCAGCCAAATAATCTTTGATGGAAGAAGCTGAAGAGATTACTGACAACTACTTACACGCCTTGTTGACCACTCATTCCCTTGGAAACAGCATTATGGGAAGGAGTAACAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	92701	146	+	636262	CTTAAAAGAAGAACATCACAAGCTTAAGAGTTTTTCAGCCAAATAATCTTCAATGGAAGAAGCTGAAGAGATTACTGACAACTACTTACACGCCTTGTTGACCACTCATTCCCTTGGAAACAGCATTATGGGAAGGAGTAACAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	84889	145	+	647215	CTTAAAAGAAGAACATCACAAGCTTAAGAGTTCTTCAGCCAAATAATCTCTGATGGAA-AAGCTGAGGAGATTACTGACAACTACTTACACACCCTGTAAACCGCTAATTCCCTTGGAAAGAGCCTTATAGGAAAGAACATCAGGT

a
s	mr.mrrefChr0	88041	575	+	130230	GCCTAGGAAGACCTAGTCCCTCTGATGCATCCTTTATGAGTTCAGCAGTGAAAATGTATTTGAGATCCATAGGACAGAAAGCATATAAGTACAAACACTAGTATGATTTGTCCATGACTTGTGATGTGACTGTTCCAGACACTAGGTCTCCTTGCTGCATGCACTATGCGACCTGTTGAATCCTGCCCAGTTAAATATATTGTTGAAATAAATTCTGTCTTCTGATTTTTGATAGACCAGATCTTGTCCTCCACATTAATAGGTGATGGGGCAAGGGTACAATAACTGAAAGGGAACGCCGACCCTACTAAAAGGATAGACAGAGTTAAACCGCCTTCAGTTACAAATGTTTGAATTGGTGATTGGGATTGATAACATAACGTAGGTAGTTGCTTTTAGCATAGCATTATAACACAGGTACCCTAATAATCAGAAACTAGATCTAAGATGCAATGGTGAACCATCTTTTTAAAGCGCATAAGCAGGCTTGAGCTTGGGTGCTGAAACAGCATAGGTGCCCAGTGGAGTCATCCCAGTGCCCTGAATTTGGCAAGGAAGCACCACTGAAGGTCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	92885	567	+	636262	GCCTGGGAAGACCTAGTCCCTCTGATGCACCCTTTATGAGTTCAGCAGTGAAAA-GTATTTGAGATCCATAGGACAGAAAGCATATAAGTACAAACACTAGTATGATTTGTCCATGACTTGTGATGTGAATGTTCCAGACACCAGGTCTCCTTGCTGGATGCACTATACGACCTGTTAAATCCTGCCCAGTTAAAGATATTGTTGGAACAAATTCTGTCTTCTGATTTTTGATAGACCAGATCTTGTCCTCCGCA------GGTGATAGGGCAAGGATACAAAAA-TGAAAGGGAACGCCGGCCCTACTAAAAGGATAGACAGTGTTAAACCGCCTTCAGTTGTAAATGTTTGAATTGGTGATTGGGATTGATAACATAATGCCGGTAGTTGCTTTTAGCATAGCATTATGACACAGGTACCCTAATAATCACAAACTAGATATAAGATGCAATGGTGAACCATCTTTTTAAAGCGCACAAGCAGGCTTGAGATTGGGTGTTAAAACAGCATAAGTGCCCAGTGGAGTCATCCCAGTGCCCTGAATTTAGCAGGGAAGCACCACTGAGGGTCCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	85034	534	+	647215	GCCTAGGAAGACCTAGTCCCTCTGATGCATCCTTAA-GAGTTCAGCGGTGAAAATGTATTTTAAATCCAAAAGACAGATAGCATATAAGTGAAAACAGTAGTATGATCTGCCCATGACTTGTGATGTGACTGTTCCAGACACTAGGTCTCCTTGCTGCCTGCATAATGTTACCTGTTGAATCCTGCCCTGTTAAATATGTTGTTGAAATAAATTCCGACTTCTGACTTTTGCTAGACCAGATTTTGTCCTCCACATTAATAGGTGATGGGGCAAGGGTATAATAACTGAAAGGGAAAGCGGACCTTACTAAAAGGATAGACAGAGTTAAACCACCTTTAGTTAC------------------------TTCATGACATAACATAGGTA----------------TGATATAACACAGGTACCTTAATAATCAGGAATTAGATCTAAGGCGCAATGGTCAACCACCTTTTTGAAGAGCATAAGCAGGCTTGATCTTGGGTGCTGAAACAGCTTAGGTGCCCAGTGGAGTAATCCTGGTGCCCTGAATTTGGCAAGGAAGCACCACTGAAGGTCCTG

a
s	mr.mrrefChr0	88616	48	+	130230	AACATATCCCTATCCCCACTCACCGGTAGTGATTGGATCAAAAGTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	93482	48	+	636262	AACATATCCCTATCCCCACTCACCGGTAGTGATTGGATCAAAAGTAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	85568	48	+	647215	AACACATTCCTATCCCTAGCCACCGGTAGGGATTGGATCAAAAATAGG

a
s	mr.mrrefChr0	88664	18	+	130230	AGGACTTGCAATTGTTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	93530	18	+	636262	AGGACTTGCAATTGTTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	85618	18	+	647215	AGAACTTGTAATTGTTCC

a
s	mr.mrrefChr0	88682	106	+	130230	CTCTTGGCCAGCCAATTTTCCAATATCTGGTAATAGGCAGAACCACCTCTTCTGTGAAGGCATTAGATTCCAATATAATGGAGGATGTCGATTCCTCTGAATGTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	93549	106	+	636262	CTCTTGGCCAGCCAATTTTCCAATATCTGGTAATAGGCAGTACAACCTCCTCTGTGAAGGCATTAGATTCCAATATAATGGAGGATGTCGATTCCTCTGAATGTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	85636	102	+	647215	CTCTTGGACAGCCAATTTTCCAATATCTGGTAATAGGCAGAACCACCTCTTCTG----GGCATCAGATTCCAACGTAATGGAGGATGTTGATTCCTCTGAATGTGC

a
s	mr.mrrefChr0	88788	418	+	130230	ACTGAAGTGAGATTCCTGGGTTAGTTTCACATTCAATGGCAGTGGGTCAATGTAGCAATGTCAACTTTTCAGCTATACTACTCTCCACTATCAACAATATTGGGGTCAGTTGAGCCAGGGTGCATAATGGAGGCACAACTTGTCCAGTCAGGAAGGATAGACATGCACATTGACTGTTGGGGCAATGCCAGCTAATATTATAAAGATCTGCCTGAGGGTGGAAAACTAGCATTCCCAAACTAATGTCCTAGAGATTTTTATGGGTACAGATGAAACAAAGTCACAAGGACCCTTTCAGCTCTATGAGGAGGAAGAATTGAGGGGCAAGTAATTACATGGCAGAGAAGGAACACAAATTGGAAACTTGTGCCCATGACAATGGTATCAAGTCAAATAGATTAATATATAATAAGCTTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	93655	412	+	636262	ACTGAAGTGAGATTCCTGGGTTAGTTTCACATCCAATGTCAGTGGGTCAATGTAGCTACGTCAACTTGTCAGTTATACTACTCTCCTCTATCAACAATATTGGGGTCAGTAGAGCCAGTGTGCATAATGGAGGCACAACTTGTCCAGTCAGGAAGGATAGACATGCACATTGACTGTCGGGGCAATGCCAGCTAATATTCTAAAGATCTGCCTGAGGGGGGAAAACTAGCATTCCCAAACTAATGTCCTAGAAATTTTTATGGGTACAGATG------AGCCACAAGGACCCTTTCAGCTCTATCAGGAGGAAGAATTGAGGGGCAAGTAAATACATGGCAGAGAAGGAACACAAATCGGAAACTTGTGCCCATGACAATGGTACCAAGTCAAATAGATTAATATATAAAAAGTTCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	85781	418	+	647215	ACTGAAGTGAGATTCCAGGGTTAGTTATACATTCAATGGCAGTGGGTCAATGTGGCAATGTCAACTTTTGAGCTATACTACTCTCCACTATTAACAATATTGGGATCAGTTGGGCCAGGGTGCATAATGGAGGCATAACTTGTCCCGTCAGGAGGGATAGACATGCACATTGACTGTTGGAGCAATGCTCGCTAATATTATAAAGACCTGCCTGAGGGTGGAAAACTAGGATTCCCAAACTAATGCCCTAGAGATTTTTGTGGGTACAGATGAAACAAAGTCACAAGGACCCTTTGAGCTCTATGGGGAGGAAGAATTGAGGGTCGAGTAATTACATGGCGGAGAAGGAATACAAATTGGAAACTTGTGCCCATGACAATGGTGTCAAGTCAAATAGATTAATATATAATAAGCTTAA

a
s	mr.mrrefChr0	89206	78	+	130230	TATACAATAATTAGATGCAAAATTGACTAAGCATCTGTGTGGACATGTGCTGATTGTTATATTAACTGCCTGTGCCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	94070	78	+	636262	TATACAATAATTAGATGCAAAATTGACTAAGCATCTGTGTGGACATGTGCTGATTGTTATATTAACTGCCTGTGCCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	86199	78	+	647215	TATACAATACTTAGATGCAAAATTGATAAAGCATTTGTGTCAACATGTGCTGATAGTAATATTAACTACCTGTGCCAA

a
s	mr.mrrefChr0	89284	161	+	130230	GCATATTGACATATACTATGACATGCTTAACTCTCTTACTTACAAGCCAAGGTTCCCTATTTTGCTTATACCTCACAGTGATCCAGATTGGCCCATGAGTTCATGTGAAAGGTTACATTAATCTATGTGCTATTAACACCTGTGGAAGGAGTGTGCCCACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	94149	161	+	636262	GCATATTGACATATACTATGACATGCTTAACTCTCTTACTTACAAGCCAAGATTCCTTATTTTGCTTAAACCTCACAGTGATCCAGATTGGCCCATGAGTTCATGTGGAAGGTTACATTAATCTATGTGCTATCAACACCTGTGGAAGGAGTGTGCCCACC
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a
s	mr.mrrefChr0	89445	226	+	130230	CACTCACTGTCAAGGAATCACACTTGTATATCATAAGATGATCTAGCACCACACTGACAGTGATGTCTAGTTAGACATCTAATGCCCATGTTGAACTATTTCACACCACCATCTGGCATATAAATATAAGTAGACATCTGCATCATATGACAGCTGAAACTAGTCTGAGCAAAAGCATGTCCTGAGATGCGAGTATAGAAGTACCATCCAGTAAAAAGCACCTAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	94310	226	+	636262	CACTCACTGTCAAGGAATCACACTTGTATATCATAAGCTGATCTAGCACCACACTCACAGTGATGCCTAGTTAGACATCTAATGCCCATGTTGAACTATTTCACACCACCATCTGGCATATAAATATAAGTAGACATCTGCATCATATGACAGCTGAAACTAGTCTGAGCAAAAGCATGTCCTGAGATGCGAGTATAGAAGTACCATCCAGTAAAAAGCACCTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	86439	226	+	647215	TACTCACCATCAAGGAACCACACCTGTATATCATAAGATGACCTAGTACCACACTGACAGTGATGTGTAGTTAGACACCTAATGCCCAGGTTGAACTGTTTCACACCACTACCTGGCATATACATGTAAGTACGCATCTGCATTATAGGACAGCTGGCGCTAGTCTGAGGAAAAGCATTTCCTGAGATGTAAGTTTATAAGCACCATCCAGCAAAAAGCACCTAAA

a
s	mr.mrrefChr0	89671	139	+	130230	TATCATAGCAATAGAATCAAACAGAATGTGGTTGAAGGCCTGACATGCCAACTACCCTTTGGCTATTATGACCGCTCCTCCCTCCTTTGGCCCCAAGCTATCAGTGGACACTTTGCTGAGCTGATATAACAACCTGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	94536	139	+	636262	TATCATAGCAATAGAATCAAACAGAATGTGGTTGAAGGCCTGACATGCCAACTACCCTTTGGCTATTATGACCGCTCCTCCCTCCTTTGGCCCCAAGCTATCAGTGGACACTTTGCTGAGCTGATATAACAACCTGTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	86671	139	+	647215	TATCATAGGAGTAGAATTGAAAAGGATGTGGTTGATGGTCTGACATGCCCACTACCCTTTGGCCATTATCACCACTCCTCCCTCATTTGGCCCCGAGCTATCAGTAGATGCTTTGCTGAGATTACATGACAAACAATCT

a
s	mr.mrrefChr0	89810	21	+	130230	CCATATTTCCAATTGGTGACA
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a
s	mr.mrrefChr0	89831	21	+	130230	CTTCAAAGTGTATTAACATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	94730	21	+	636262	CTTCAAAGTGTATTAACATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	86831	21	+	647215	TTTCAAAGTACATTAAGACCT

a
s	mr.mrrefChr0	89852	127	+	130230	GGACTCAGAGACAGAAAATTGGAGCTATATAAAATATTGTATTCCATAGCCAAATGAAACAGTAACGGAATGGGCAGTCATGTGTGGTACACCCAAAAAGAAAATCTCAGGACGATTGTTATTGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	94787	127	+	636262	GGACTCAGAGACAGAAAATTGGAGCTATATAAAATATTGTATTTCATAGCAAAATGAAACACTGACGGAATGGGCAGTCATGTGTGGTACACCCAAAAAGAAAATCTCAGGAAGATTGCTATTGGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	86852	116	+	647215	GGACTC-GAGACACAA------ATCTGTAT-GAATATTGTATTCCATAGCCCAATGAAACAGTAATGGAATGGGCAGTCACACTTGGTACACCTGAAAAGAAAATCTCAGGACCATTGTTAT---TG

a
s	mr.mrrefChr0	89979	92	+	130230	TTGTAACCAAAAGAGTGAAGGTAGACACTAAAACTCCGATCTCAGTAAACACCTTATGATTTACATACAGTCAAGGTTGGTTTTATCAACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	94914	83	+	636262	TTGTAACCAAAAGTGTGAAGGTAGACACTAAAACTCTGATCTCAG---------TATGATTTACATACAGTCAAGGTTGGTTTTATCGACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	86969	92	+	647215	TTATAACCAAAAGAGTGAAGGTAGACACTAAAACTCCGATCTCAGTAAACACCTCCTGATTTACATACAATCAAGGTTGGTTTTATCAACAT

a
s	mr.mrrefChr0	90071	58	+	130230	ACCAATTAAAAACCATACTGTTGTGAGTTTTTTGAGTTCTGTCTGCCACATAAAGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	94997	55	+	636262	ACCAATTAAAAACCATATTGCTGTGAGTTTTTT---TTCTGTCTGCCACATAAAGGAG
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a
s	mr.mrrefChr0	90129	55	+	130230	TTCAAGTCCCAATATAAAGGAGTTTAGCAGAATAATGGCACAGCAGGTAGAAGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	95052	55	+	636262	TTCAACTCCCAATAAAAAGGAGTTTAGAAGAATAATGGTACAGCAGGTAGAAGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	87138	55	+	647215	TTCAGGCCCCAATATAAAGGAGTTTAGCGGAATAATGCCATAGCTCGTAGATAGA

a
s	mr.mrrefChr0	90184	90	+	130230	GCACTACCTGCATTGGTAGGTTGAGGCTTTCTTACTGAGCATCCCTCCTTGGCCTTTGCAATGGCCACTGACTGGACATGTCAAGAAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	95119	89	+	636262	GCGCTACCTGAATGGGTGGGTTGAGTCTTTCTTACTGAGCA-CCCTCCTTGGTCTTGGCTATGGCCACGGACTGGACATGTCAAGAAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	87193	90	+	647215	GCACTACCCGCATTGGTAGATTGAGGCTTTCTTACTGAGAATCCCTCCTTGGCCTTTGGAATGGCCACTGACTGGGCATGTCAAGAAATG

a
s	mr.mrrefChr0	90274	162	+	130230	ATGGTTTCAAGCAAGATAGGGACACAAGGTTGTTATAAAACCAGCAATGTACTAATGGAAAGGGCCCAATCAAGGTACAGCACTTAGTTTATGTATTGACTCCTGTAGGAGTGCTGTGTGAGGTTGGTGTGATCATTACAAATAGTGGACTGAGCACTCGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	95208	145	+	636262	AGGGCTTCAAGCAAGATCAGGACGCAAGGTTGTTAT---ACCAGCAATGTACTAATGGAAAG--------------ACAGCACTTAGTTTATGTATTGACTCCTGTAGGAGTGCTGTGGGAGGTTGGTGTGATCATTACAAATAGTGGACTGAGCACTCGGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	87285	162	+	647215	ATGGTCTCAAGCTAGATAGGGACACAAGGTTGTTATAAAACCAGCAGTGTACTCATGCAAAGGGCCCAATCAAGGTACAGCACTTAGTTTATGTACTGACTGCTTTATGAGTGCTGTGTGAGGGTGGTGTAATCGTTACAAGTAGTGGACTGAGCACTCGGC

a
s	mr.mrrefChr0	90436	172	+	130230	AAGTAATTCAAGTAACCCTGATCTACCTGTCTGCATACTGATGCCGCATGGTGATTTCCGGGGATTTAAAATAACATAAGTACTGTGTGTGTAGCCTTGTCCTAAAACTTGCTGGTGGTCTATATAGTTACATGGCAATAATGGCATTTTCTATGAAGAATGTGAGGGAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	95355	164	+	636262	AAGTAATTCAA--------AATCTGCCTGTCTGCATACTGATACCGCATGGTGATTTCCGGGGATTTAAAATAATATCAGTAGCGTGTGTGTAGCCTTGTCCTAAAACTTGCTGGTGGTCTACATAGTTACATAGCAATAATTGCATGTTCTATGAAGAATGTGAGGGAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	87447	167	+	647215	AAGTAATCCAAGTAACCCTGATCTACCTGTCTGCATACTGATGCCATAAGGTGATTTCCAGATATTTAAAATAACATAAATACTGTGTGTCTAGCCTTGTCCTAGAA----GTGGTGGT-GATATAGTTACATGGCAATAATGGCAATTGCTATGATGAATGTGAGGGAGGT

a
s	mr.mrrefChr0	90608	32	+	130230	CATTGGCCACCTCCTGCTTCTGGCATAGCTTC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	87615	32	+	647215	CACTGGCCACCCCCTGCCTCTGGCATAGCTTC

a
s	mr.mrrefChr0	90640	157	+	130230	GGTAGACCTGGTAAGTACCAGTAAATGGACACAAGTATAAGCTACATATAGGACCATGACAAACAATAAAGTCAGTTAATGACAACTCTTTTCAGAGAATCAAAAGAAAAGGCAAATGCAGTCTACTTAGATAGGAACGGCAATTAAAATATGCCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	95563	157	+	636262	GGTAGACATGGCAAGTACCAGTAAATGGACACAAGTATAAGCTACATATAGGACCATGACAAACAATAAAGTCAGTTAATGACAACTCTTCTCAGAGGATCAAAACAAAAGGCAAATGCAGTCTACTTAGATAGGAACGGCAATTAAAATATGCCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	87647	134	+	647215	AGTAGAGCTGGTGAGTACTATTAAATGGAC-CAAGTATAATATACATATAGGACCATGGGAAATAATACAGTCAGTCAATGACAACTCTTTTCAGAGAATCAAAAGTAAAGGTGAACGCAGTCTACTTAGATAGA----------------------

a
s	mr.mrrefChr0	90797	10	+	130230	AAAATTATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	95726	10	+	636262	AAAATTATTG
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a
s	mr.mrrefChr0	90807	59	+	130230	TTGGTGCTAATAATTTATGGAAAATTAAAGTAGACAACATTCCCGTTACTAGCTTTCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	95736	59	+	636262	TTGGTGCTAATAATTTATAGAAAATTAAAGTAGACAACATTCCCGTTACTAGCTTTCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	87790	25	+	647215	TTGGTGCCAATAGTTTATGGCAAAT----------------------------------

a
s	mr.mrrefChr0	90866	22	+	130230	AGTACCAATAAGTTCATAAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	95796	22	+	636262	AGTACCAACAAGTTCATAAGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	87815	15	+	647215	-------ATAAAGTCATAAAGA

a
s	mr.mrrefChr0	90888	117	+	130230	AAGGGGCGGGACTAACCATAGTGTGGTGTTATTATCCACATTCTTACTCTATGCCTCTTAAAGATTGCTCCTGGCCACATGTCACTGGATTCATGAGCCTGATAAGTTTTGGCTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	95820	116	+	636262	AAGGGGCGGGACTAACCATAGTGT-GTGTTATTATCCACATTCTTACCCTATACCTCTTAAAGATGGCTCCTGGCCACATGACACTGGATTCATGAGTCTGATAAGTTTTGGCTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	87830	117	+	647215	AAGCGGTGGGACTAACCATAGTGTGGTGTTATTATCTACATTAATCCTCTATGCCTCTTAAAGATTGCTCCTTGCCACATGTCATTGGGTTGATGAGCGCGATGAGTTTGGGCTGCA

a
s	mr.mrrefChr0	91005	277	+	130230	GGGAACATTAATAGCATTGATGTACATGGATTAGGTGTGATATAACCTAAGGAATAATAATGCATCTCAAGTGATGATATATTCATCACCTTTGTTTAGGATAAAGAGCTGCAAACTGAAAAATGACATATGAACTGTTAATGTTGTTTGGCTGGCTGTGGGACCCAGCACTTTTTATGGATCTTGACCAATCACAGCTTTGCATGCTAAATACAACTGCCATCTACATACTTCATGTCAAATACACAATTGATGGATTGAGCACTGTCATGTATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	95936	276	+	636262	GGGAACATTAATAGCATTGATGTACACGGATTGGGTGTGATATAGTCTGAGGAATAATAATGCATCTCAAGTGATGATATATTCATCACCTTTGTTTAAGATAAAGAGCTGCAAACTGAAAAATGACATATGACTTGTTAATGTTGTTTGGCTGGCTGTGGAACCCAGCACTTTTTATGGATCTTGACCAATCACAGCTCTGCATGC-AAATACAACTGCCATCTACATACTTCATGTCAAATATACAATTGATGGATTGAGCACTGTCATGTATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	87949	277	+	647215	GGGAGCATTAATAGCATTGATGTACATGGATTAGGTGTGATATAACCTAAGGAATAACAATGCATCTCAAGTGATGATACATTCATCACCTTTGTTTAGGATATAGAGCTGTAAACTGAAAAACTGCATATGAACTGTTAATGTTGTTTGGCTGGCTGTGGGACCCAGAACTTTTTATGGATCTTGACCTATCACAGCTTTGCATGCTAAATACAACTGCCTTCTACATTCTGCATATCAATTACATGATTAATGGATTGAGCACTGTCATGTTTAT

a
s	mr.mrrefChr0	91282	61	+	130230	GTTGTGATGGTTGTGTCTTCAATACTGCTAATTGTTCTGTATTAAGCCATTAGCCTTGAAG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	88226	61	+	647215	GTTGTGATGGTTGTGTCTTCAATACTGTTACTTGTTCTGTATTAAGCCATGAGCCTTGAGG

a
s	mr.mrrefChr0	91343	11	+	130230	CATATTTATGC
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a
s	mr.mrrefChr0	91354	26	+	130230	CTAATGGGGTACTGACCTCTGATCCT
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a
s	mr.mrrefChr0	91380	32	+	130230	TAACATCTACAGAAGGGCTGCTTGCCTCTGGC
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a
s	mr.mrrefChr0	91412	138	+	130230	TCATAGGATGGTGCTGTTACACTTCTCATCCATGGTTCCTAGCTTTTTTGTGATGTTGCTGTGCTTGCAGTATACACCATGGTGCAGTATACACCATGTTTCAACTGGTCTAGCTAAAATTGTCAGTGGGTAAGCACA
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a
s	mr.mrrefChr0	91550	7	+	130230	AATACAA
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a
s	mr.mrrefChr0	91557	62	+	130230	TATATACTAATGAAAACTGATAAAGATGTTGGAGCTCAGATAATTGTATTTCGTCTGGATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	96491	61	+	636262	TATA-ACTAATGAAAACTGATAAAGATGTTGGAGCTCAGATAATTGTATTTCGTCTGGATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	88596	62	+	647215	TATATGTTAATGAAAACCGATAAGGACGTGGCAACCCAGATAATCGCATTACGCCTGGAACA

a
s	mr.mrrefChr0	91619	7	+	130230	TACACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	96552	7	+	636262	TACACAG
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a
s	mr.mrrefChr0	91626	108	+	130230	ATACTGTGGGGGCCATGTAATTGCAGTTACAGTGAGGGACTAGCTTAACTCATACACCAGGATATGGGTGCACCAGGATATGGAGGGATATGCAAGATACTGATTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	96559	108	+	636262	ATACTGTGGGGGCCATGTAATTGCAGTTACAGTGAGGGACTAGCTTAACTCATACACCAGGATATGGGTGCACCAGGATATGGAGGGATATGCAAGATACTGATTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	88670	108	+	647215	ATACTATAGGAGTCATGCAATTGCAATCACAGTGAGGGACTGGCTTAACTTGTGCACCTGGATATGGGTGCACCAGGATATGTAGGGGTATGGGAGATACTGATTGCA

a
s	mr.mrrefChr0	91734	31	+	130230	ACAACATTAAGATTGCATCAAACATTAATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	96667	31	+	636262	ACAACATTAAGATTGCATCAAACATTAATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	88783	31	+	647215	AAAACATTAAGATTGCAACAAACATTAATTT

a
s	mr.mrrefChr0	91765	40	+	130230	ATTGGCCTTAAAAATTGATTTCCCCACTCCTAAGGTTGTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	88815	40	+	647215	ATTGGCCATAAAAATTGAGTTCACTGCTCCTAAGGTTATT

a
s	mr.mrrefChr0	91805	176	+	130230	GACAAATTTGTAAGAAACACCAGGTGAGCAGGTTCATATGATTTCAATCCAATTCGCAGATCCTACTTTGCATCATTTAGTACTGCTATATGCATAATCCTGGCTTAGCCCAATGACCTTTCTGCTGAAAGCCACTTCCCACGATTATAGGCACATCTGACACTCAGATCTCCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	96738	169	+	636262	GACAAATTTGTAAGAAACACCAGGTGAGCAGGTTCATATGATTTCAATCCAATTCGCAGATCCTACTTTGTGTCATTTAGTCCTGCTATATACATAATCCTGGCTTAGCTAAATGACCTTTCTGCTGGAAGCCACTTCCCACGATTAAAGG-------GACACTCAGCCCTCCCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	88857	176	+	647215	GACAAAATTGTAGGAAGCACAAGGTGAACAGGTTCATATGATTCAATCCTATTTTGCAAATCTTACTTTGCATCATTTAGTACTGCTATATGCATAGTCCTGGCTTAGCCCAATGACCTTTCTGCTGAAAGCCACTTCCCACAATTATCGGCACATCTGACACTCAGATGTCCCAT

a
s	mr.mrrefChr0	91981	28	+	130230	CCTCTTTTGGCTAGTCAGGTCACACCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	96907	28	+	636262	CCTCTTTTGGCTAGTCAGGTCACACCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	89034	28	+	647215	CCTCTTTTGACTAGCCAGGTCACAGCCT

a
s	mr.mrrefChr0	92009	319	+	130230	TTAAATTGTTTAATGATGTCTACACATTTCTAGTCTAAACATTTCTAATGTTCACAAATTTAACAAGAACACCTGTAAGTATAAGCCTAGTATTGTGTGCATGGTGTGGAATTGTGCTCTTTTATTCATGTCATAGCTGACATCCCCATAAAGAATCCTCTGATGGAAGCCCAGTGTAAGTCTTAACTGGTACTTGTTCATAGGCTGGATAGAGAAGAGAACACATGGTCTGAATTGGATTCCAAAGCAGTAACAAAATAGATTCCAAAACAGCAGTGTATCTAGATATGGTTCTATTCATGTTTTCAAATTGGAATGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	96935	318	+	636262	TTAAATTGTTTAATGATGTCTACACATTTCTAGTCTAAACATTTCTAATGTTCACAAAATTAACAAGAACACCTGTAAGTATAAGCCTAGTATTGTGTGCATGGTGTGGAATTGTGCTCTTTTATTCATGTCATAGCTGACATCCCCATAAAGAATCCTCTGATGGAAGCCCAGTGTAAGTCTTAACTGGTACTTGTTCATACGCTGGATAGAGAAGAGAAT-CACGGTCTAAATTGGATTCCAAAGCTGTAACAAAATAGATTCCAAAACAGCAGTGTATCTAGATATGGTTCTATTCATGTTTTCAAATTAGAATGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	89067	307	+	647215	TTGAATTGTTCAATGAAGTCTACACATTTCTAGTCTAAACAATTCGAATGTTTGCAAATTTATCAAGAACACCCATAAGTATAAGCCTTGTATTGTGTGCATGGTGTGGAATTGTGCTCTTTTATTTATGTCATAGCTGACATCCCCATAAAGAATCCTCTGATGGAAGCCCAGTGTAAATCTT-ACTGG-----------AGGCTGGATAGAGAAGAGAACACATGGTCTGGATTGGAGTCCAAAGCAGTAACAAAATAGATACTAAAACAGCGGTGTATCTAGAGATGGTTCTATTCATGTTTTCAAATAGGAGTGC

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	97253	173	+	636262	ATCAAAAATTCTGAATAGCCTAGTGTGGTTGATGCATATGAGATTAAAACAGAGCCCACTTCACTACAAATTGGTTGTAAACATATCAGACAATATTTTACTAATGTTTTGGGATCGACTTTTGTTCTATCATACCCTCCCGATAATCATATACTTAGATGAGGCCCCCTCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	89375	173	+	647215	ATCAAAAATTATGAACAGCCTAGTGTAATTGCTGCATATGAGATTGGAACAGAGTGCACTGCACTACAAATGGGTTGTAAACATATCAGACTATATTTTACTAATTCTTTGGGATTGACTCTTGTTCTATCACCTCCACCCGAGAATCACATACTCTGATGTGCTCCGCTCTG

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	97427	211	+	636262	GAAACAATAAATGTTTCATGAACTGGCCCTCTCTTCAACAGTAGGCAAGCTCCCCTAGGTATTGTCTGTCCACATTTCTTGAGCTAAGCATATTTGTATGAATCACTCTACAAAGAGCCAAGTGGTTTTTCTGGTCAACATAAATTCTAGATGTCATCTTAATGTAGGGTTATATGCCTGCCATTGAGAATGTATTTCTGCGGAAGCAATT
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	97638	29	+	636262	GGACTTACTGAGCTTAACTTTGTTCTGAT
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a
s	mr.mrrefChr0	92741	42	+	130230	TTAACACAGTGCCTCATGCAACACCCCAGTAAAAGACAAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	97667	42	+	636262	TTAACACAGTGCCTCATGCAACACCCCAGTAAAAGACAAACA
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a
s	mr.mrrefChr0	92783	69	+	130230	CATCCGGGTATATGAGGCTAGTGCTTGGAGCTATACCAATGTAATACTATACTTCATGATCTCTCTGAT
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	92864	62	+	130230	TCTTCTTCTGCTTTGGCAATGGATCTGTAATGTTGTAAAACATCTGCCTAAACAGTTTATAC
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a
s	mr.mrrefChr0	92926	189	+	130230	CCCTAAGCCTTATTTAAGAGAAGCAGCTTTGCAAAGCTATGCTTGGTCATGCCCGCCAGTTAATTTGTTTATATTGTGTTCTTCGGAGATGTATTTTCTATGATCAGGATCGGTTTGGTATGTATGCCATGACTGCTAACAAAGAATTTAACAGGTTCAAAGGAGAAATCAATGCCCAGGTAGACTGGT
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	93146	34	+	130230	CCTAGCTGAGGTTGTGTATGTGACTTTACTGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	98081	34	+	636262	CCTAGCTGAGGTTGTGTATGTGACTTTACTGCTT
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a
s	mr.mrrefChr0	93180	35	+	130230	AGCTCACAGTAGGTGTGCTTCTCACTCCCCTGGGA
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a
s	mr.mrrefChr0	93215	213	+	130230	GAACATATAGATTCAAGGCAACACACTCTCTATGGGTATGGAAATATCAAAGTAAATTGGTTATGTGCATCACATTTTATTGCAAGTCTGTCAAAACTTGCTACGTCTGGGATTATCTTTGGTTCCCACCGACACAATGGTGTTACAGAATGTATTTAGTGACAATTAATCACTTTTTGAGGTCTGCATGACCTCTAAAATATCAGTTTTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	98151	213	+	636262	GAACATATAGATTCAAGGCAACACACTCTCTATGGGTATGGAAATATCAAAGTAAATTGGTTATGTGCATCACATTTTATTGCAAGTCTGTCAAAACTTGCTACGTCTGGGATTATCTTTGGTTCCCACCGACACAATGGTGTTACAGAATGTATTTAGTGACAATTAATCACTTTTTGAGGTCTGCATGACCTCTAAAATATCAGTTTTCCA
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a
s	mr.mrrefChr0	93428	43	+	130230	ACTAGCATTCAACCAGACAGTTTTTTACTGGTTAGGACTATCC
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a
s	mr.mrrefChr0	93471	38	+	130230	ATCCTTTCCCACAAGATGCCGACCCTGTAAGATATTAA
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a
s	mr.mrrefChr0	93509	42	+	130230	TTTTTTTTACTGATTTTGCAGGTCATATTGAATGACTATTAA
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a
s	mr.mrrefChr0	93551	38	+	130230	TCGTTTTCTGAGTCCTGCACGACCTCTATAATATCAAC
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a
s	mr.mrrefChr0	93589	55	+	130230	TACCAACTAGCATTCAACCATACAGTTCTCCTATCCTATTGTTTCTCATAAGATG
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a
s	mr.mrrefChr0	93644	6	+	130230	GACCCC
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a
s	mr.mrrefChr0	93650	36	+	130230	TTGCAAGGTTTAAGCATCTCTCCATCTGGCTACAAT
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	93703	84	+	130230	GTGGTCTAATTTGTGGGAAGCCTAGGATATGTTTGCCAAACTCTCTCACCAGCAAAACACCAGCAAAACTTGACCCAGAATCTT
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a
s	mr.mrrefChr0	93787	187	+	130230	GTTTTAAGTTGTAATAGTTATCAGATTATATTAACTCTTTAAATACAATTAGATAATTGTTGTAGTAATACAAAATAATTAAATAAGCAGCAAGTGCCTCAAACTTCTTGTCACATCAGTCTAACAACTCCTACACAAATACACAATGCCATTTTTGTTGCCATCCAGGCCACAAGAAGCTTGCCAA
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a
s	mr.mrrefChr0	93974	103	+	130230	CCCCACAAAAACAGGAATCATTCCAGCTTACTACTAACTTGCTAGGCTCAAAATTTGTCAATTTATGAGCAGCTGGAATGTGGGGTTGGTAAATACCATATTT
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	94086	22	+	130230	ACGATCATTAGGTTTATTAGGA
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a
s	mr.mrrefChr0	94108	114	+	130230	CCATTAGGCTTTGGGCACATGAACCATTGACTTTAGTGAAAAGCCTGTAGCCTAGTTCAGAATTCCTTAATTCACTAGCCCGGCTCACACCCCATATAATGACTGTCCGTCTAG
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	94306	78	+	130230	TCTTAAACATATTGCTCAACCACCTCTTTGGGAATTTGCATCCGCTTGCTTCAGCTCATTGATGAAGATATGGAACAT
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a
s	mr.mrrefChr0	94384	42	+	130230	GCAGCATATGTGGGCAGGCAATTCCTAGGATTTCTCAATTCA
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a
s	mr.mrrefChr0	94426	92	+	130230	CTTAGACAAATCAGATTCATGCACCAAGAACTAACCAAACGCCTCTTCTTGGGAATGTGAAATGGCGACATGCGGAACAATAAATTCTGTCC
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a
s	mr.mrrefChr0	94518	85	+	130230	GGAGTCCTCAATGCTTTCTCCAAGGGTAGAGTCCTTAGTGCTTTTTTGAAGAGGCCTCTGTGTATGCAGACTGTTGTAATGTCAT
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a
s	mr.mrrefChr0	94603	26	+	130230	TGCCAATGGAAAATACCACCAACACA
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a
s	mr.mrrefChr0	94629	3	+	130230	AGA
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a
s	mr.mrrefChr0	94632	184	+	130230	TATTAAGTCACAGAACAGTGGAGTGATTCAGAAGCCTCCCATCACCAGGACTAATGAACCTAAAAAAGGGTATTGACAGGCAGGTCATATTTCAGACAAACATTTGGCCATCACAAACTAAGGTTTCACATGGGACTTAAACAATGACAACTTCCAGAGGACATGACCTCTATCATGGGGTTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	99597	139	+	636262	TATTGAGTCACAGAACAGTGGAGTGATTCAGAAGCCTCCCATCATCAGGGTTAAT---------------------------------------------CATGTGACCATCACAGACTAAGGTTTCACATGGGACTTAAACCATGACTACTTCCGCAGGACATAACCTCTATCATGGGGTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	91711	184	+	647215	TATCAAGTCACAGACCAGTGGAGTGATTCAGAAGCCTCCCAGCACCAGTACTAATGAACCTAAAAAAGGGTATTGACAGGCAGGTCATATTTCAGACAAATATTTGGCCATCACAAACTAAGGTTTCACATGGGACTTAAACAGTGACAACTTCCAGAGGACATGTCCTCCATCACGGGGTTGG

a
s	mr.mrrefChr0	94816	410	+	130230	TGCATACACCAACTTGACCTGTTTCGATGGTGCTGGGATACTTCATACAACAGATATAGTGTATCAAGATAGCCTACATCAGGTCTGCAAACCTATATCAAAGTTTAATGAATGGGTTACAATAGCTAATTGCATTGGATAGTCACGTACATACACATAATTAATGAAGGCCACCGACACTGGTATGAGCAAAGTAGGCTTTTCCATGCAACCCCCACATCTATGCTCCCTCCCTCCATACTATACTTGTCCAGCCATGCAGGTGATTATGACTAACCACTCTGCCCATCACTGTTAGGCAAGTATACCACCAACACTTGTACTGTCCGCTGGGTTATCTAAGGCATAATTAATGTAGTATTGGTAGAACAAATAGTTGACACCCAAGATGGCTTACTTTGTCCACAGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	99736	407	+	636262	TGCAAGCACCACCTTGACCTGTTTCGATGGCGGTGGGATACTTCACACAACAGATATAATGTATCAAGATAGAATACATCAGGTCTGCAAACGTATATTAAAGTTTAATGAATGGGTTACCATAGC---TTGCATTGGATTGTCACGTACATACACATAATTAATGAAGGCCACCGACACTGGTATGAGCAAAGTAGGCTTTACCATGCAACCCCCACATCTATGCTCCCTCCCTCGATACTATACTTGTCCAGTCACACAGCTGATTATGACTAACCACTCTGCCCATCACTGCTAGGCAAGTATACCACCAACACTTGTACTGTCCGCTGGGTTATCTAAGGCCTAATTAATGTAGTATTGATAGAACAAATAGTTGACACCCAAGAGGGCTTACCTTGTCCACAGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	91896	397	+	647215	TGCATACACCGATTTGACCTGTTTACATGGTGCTCGGATGCTTCATGCAACAGTTATAGTGTACCAAGCTAGCCTACATCAGGTATGCAAACCTACATCAAAGT--------TAGGTTACAATAGCTAATTGCATTGGATAGTCACATATGTACACATGATTAATAAGGGTGACCCACATCGGTATGACCAAAGTAGGCTTTTCCTTGCAACCTCCACATCTATGCTCCCTCCCTCCACACTATCCCTGTCCAGCCATGCAGGTGATTATGACTAACCATTCTGCCCAT-ACTGTTAGGCAAGTATACCACCAACACTTGTACTGTCTGCTGGGTCATCTAAGGCATAATTAATGTAGTATTCGTAGAACTAATAGTTGACACCCAAGATGGCTTACTGT----ACAGGA

a
s	mr.mrrefChr0	95226	143	+	130230	TGATTCGACAATTTCTCTTGACAGGCTTTTGAAACTAACTAAGTTTTGGTGACATCTAGAGCCATGTCAAGTGCCACTTACACAATGTTCCATTTACTTAACCAACGTGTGGCCAAAATATCATTTCTAACCAGACCAGCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	100144	142	+	636262	CGATTCGACAATTTCTCTTATCAGGCTTGCGAAACTAACTAAGTTTTGGTGACATCTAGAGCCATGTCAAGTGCCACTAACACAATGTTCCATTTACTTAACCAACGTGTGGCCAGAATATCATTTCTAG-CAGACCAGCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	92293	143	+	647215	TGATTCGACAATTTCTCTTGAGAGGCTTTTGAAACTAACTAAGTTGTGGTGACATCTAGAGCCATGTCAAGTGCCACTTACACGATGTTCCATTTACTTAATCAATGTATGGCCAAAAAATCATTTCTAACCAGACCAGTGTG

a
s	mr.mrrefChr0	95369	20	+	130230	GCAACTGTACAATATCTGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	100286	20	+	636262	TCAACAGTGCAATATCTGGC
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a
s	mr.mrrefChr0	95389	33	+	130230	TCCTGCAATTGGTAGGGCATTCATGGTATACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	100306	33	+	636262	TCCTGCAATTGGTAGGGTATTCATGGTATACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	92463	33	+	647215	CCCTGTAATTGGTAGTGCATTCATGGTATGTTT

a
s	mr.mrrefChr0	95422	21	+	130230	TTAGTTGTTAAGGTCCTAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	100343	21	+	636262	TTAGTTGTTAAGGTCCTAGAA
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a
s	mr.mrrefChr0	95443	19	+	130230	AAGCTATACTCTTCTAGGG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	92517	19	+	647215	AAGCTATACTCTTCTAAGG

a
s	mr.mrrefChr0	95462	374	+	130230	CTATTAAGCCAAGAATTTAGGGGTCTTGAGGGTTTCTCCATGGAAATAATCTCCATAAGAACCTGGATTGTATTCACTGTCTCACTTAAGTTTTTCTTAATAGTCTGACATGCTTTGCAAGTCTATTTCAGATATAGGTCCAGTCCTAGAGTAGACAAGTCCTAGAATAGACATGGCTTATGCTAGCCTGCCGAGAAGAGATTAGCAAGTTGAATGCTGCATATACTGCATCTGAATTCACTGCAATAAGGCCATTATTATATGTAACACATAGGGGAAGGCTATGGCTCCATGTGAAGAGGCGAGAACCTTTATGGTTCATTCTACCCTCTCTCTAACGTACCTTTATGGTTCATTCTACCCTCTCTCCAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	100388	366	+	636262	CTATTAAGCCAAGAATTTAGGAGTCTTGAGGGTTTCCCCATGGAAATACTCTCCATAAGAACCTGGATTGTATACACTGTCTCACTTAAGTTTTTCTTAATAGTCCGACATGCTTTGCAAGTCTATTTCAGATATAGGTCCAGTCCTAGAGTAGACAAGTCCTAGAATAGACATGGCTTATGCTAGGCTGCCGAGAAGAGATCAGCAAGTTGAATGCTGCATATA------CTGGATTCACTGCAATAAGGCCATGATTATATGTAATGCATAGAGGAAGA--ATGGCTCCATGTGAAGAGGCGAGACCCTTTACAGTTCAGTCTACCCTCTCTCTAACGTACCTTTATGGTTCATTCTACCCTCTCTCCAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	92537	370	+	647215	CTATTGAGCCCAGAGTTTAGGGGTCCT----GTCTTTCCATGGAAATAATTTCCCTAAGAACCTGGATTGTATTCACTGTCGCACTTGAGTTTTTCTTAATAGTCTGACATGCTCTGCAAGTCTATTGCAGATATAAGTCCAGTCCTAGAGTAGATAAGTTCTATAATAGGCATGGCTTATGCTAGCCTGCCGAGAAGAGGTTATTAGGTTGAATGCTGCATATGCTGCATCTGAATTCACTGAAATAAGGCCATTACTATATGTAACACGTAGGGGAAGGCTATGGGTCCATGTGAAAGGGCATGAACCTTTATGGTTCATTCTACCCTCTCTCTAACATACCATTATGATTCATTCTGCCCTCTCTCTGACT

a
s	mr.mrrefChr0	95836	25	+	130230	TAATGATGGTGATGAAATGGTCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	100754	25	+	636262	TAATGATGGTGATGAAATGGTCATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	92908	25	+	647215	GAATGATGTTGATGAAATGGTCATT

a
s	mr.mrrefChr0	95861	65	+	130230	CAAACTCATGTGGATTAGATGGTGTTTAATCAGGAGTATGTACACATAATGTCCACAACCTTCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	100797	61	+	636262	CTAACTCATGTGGATTAGATGGTG-TTAATCAGGAG---ACACACATAATGTCCACAACCTTCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	92933	65	+	647215	CAAACTCATGTGGATTATATGGTGTTTAATAAGGAGTATGTAAACATGACGTCCACAACCTACCT

a
s	mr.mrrefChr0	95926	26	+	130230	TCTTCAGGATCACCTCTTTAGCAAGA
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a
s	mr.mrrefChr0	95952	144	+	130230	GCACCAAAATGACATGCACCTGGTCTTGATCACTCACAGGATGTGAGTATCTCACAGGAGGGATCTACACTATTACAGAATGCACCTGTACTATCCTGGATTCTCACAACACATTTGCAGCGATCAAGGAGCTTCAAATACACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	100908	144	+	636262	GCACCAAAATGACATGCACCTGGTCTTGATCACTCACAGGATGTGAGTATCTCACAGGAGGGATCTACACTATTGCAGAATGCACCTGTACTAGCCTGGATTCTCACAACACATTTGCAGTGATCAAGGAGCTTCAAATACACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	93027	144	+	647215	GCACCAAAATGACATGCATCTGGTCTTGATCACTCACAGGGTGTGAGTATCTCACAGAAGGGATCTACACTATTACAGAATGCACCTGTACTATCCTGGATCCGCACAACACATTTGCAGCCATCAAGGAGCATCAAGTGCACA

a
s	mr.mrrefChr0	96096	270	+	130230	CATTGCAACAATATTTTGAACCCCATAGACTCTTATAGATGGCCTACAAACAGTGCGAAATCCACTACTTGGACACTGTATGCCTGCTTAGATAGCACACTTGCTTTATATCGGTGATAACACATTATTGCTAATATTCCCATAGGAATGAAACTATTGCTCAGTGCCACTGACAACAAATTAGAAGCTCATACCAAGTGCTACAGGAACTAGGAGGTGTGGTTGCATGATTAAGTTTTTAGACTGTAGGTATGCCAATCAAATCAGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	101096	270	+	636262	CACCGCAACAATATTTTGAACCCCATAGACTTTAATAGATGGCCTACAAACAGTGCGAGATCCACTACTTGAACACCGTATGCCTGCTTAGATAGCATAATTGCTTTATATCGGTGATGACACATACTGGCTAGTATTCCCATAGGAATGAAACAATTGCTCAGTGCAACTGACTACAAATTAGAAGCTCATACCAAGTGCTACAGGAACTAGGAGGTGTGGTTGCATGATTAAGTTTTTAGATTGTAGGTATGCCAATCAAATCAGGGG
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a
s	mr.mrrefChr0	96366	25	+	130230	TTTGGTCAACTATTACCTCATACTA
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a
s	mr.mrrefChr0	96391	51	+	130230	ATATTCTGTGGGCTATCAATGACTGGCAAACTTTGCAGTGAACGGTGCTTG
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a
s	mr.mrrefChr0	96442	113	+	130230	CTAAGTTAGATGTCTAGGGGATGCTTGTTGATAGGTAAGGGAGGAGCCTAATGTTGTGATAAAAAAAAAAAACCCCACTAGGACAAAGAAAAGCCAATTAGAACAATACCGAA
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a
s	mr.mrrefChr0	96555	269	+	130230	ATTGATTATTCCAGTGGAAGATGCTTGAAAAAATTAAATCTCCTGTTGATCCGATATCGCCAGGGAAGAAAGACCCTGAAGAGGGTGCTTTCTGGAGATGCTCAAAAACTCATGTGTTTACCTCACAAATAGTTATCACTTGTTAACATCGCTGACCCTGGACCCAGGAGGGGACAGTCAAATCAACAGATATTTCTGTTCTGATGTGTATAGATGAATTCATTGATCACCACTTGGCTATCAACTGGATAGGATTGTTTTCACTTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	101560	235	+	636262	ATTGATTATTCCAGTCGAAGGTGCTCAAAAAAATTAAATCTCCTGTTAATCCGATATCACCAGGGAGGAAAGACCCCGGAGAGGATGCTTTCTGGAGATGCTCAAAAACTCATGTGTCTACCTCACAAATAGTTATCACTTGTCAACATTGCTGACCCTGGAGCCAG----------------------------------TGATGTGTATAGATGATTTCATTGATCACCACTTGGCTACCCACTGGATATGATTGTTTTTATTTTTG
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	96847	22	+	130230	CTTAGTAAGGAAACTAATGCGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	101818	22	+	636262	CTTAGTAAGGAAACTAATGGGA
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a
s	mr.mrrefChr0	96869	348	+	130230	TGTTGTGTGCTCATGGAATGTAACAATTGTTGTAGTGCACATCATGAGCCGTATGAGTCAGCAGGCCTTCAATAGATGGCCACAGACTCTTGACTAACAGACTTTGTGATGTCAGGAGTAGGAAGTATCAAAGAATCATGTTGGCAAGTTGTAGCCTATTTGAACCTCTCACATGTGATCTGAGATTTAACGATCTTATAGGGGACTCTGTGATGTCTGCAATAAATTACCTAGATGTCATTTGCATCATTGGTGCTGCTCACACTTTTTGGTAAGTGGCTGCATTCTGAGATGACACCAATGTTTAACAGGCTTGGTTTGAGCTCTCCTGTCTCTGTATGGCAAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	101840	334	+	636262	TGTTGTGTGCTCCTGGAATGCAACAATTGTTGTAGTGCACATCATGAGCCGTATGAGTCACCAGGCCTTCCATAGCTTGCCACAGACTCTTGATTAACAGGCTTTGTGATTTCAGGAGTAGGAAGAATCAAAGAATCATGTCGGCAAGTTGTAGCCTATTTCAACCTCTCACATGTGATCTGAGATTTAACGATCTCATAGGGGACTCTGTTATGTCTGCAATAAATTACCTAAATGTCATTTGGATCATTGGTGCTGCTGACACTTTTTGGTAAGTGGCTGCATTCTGCAATGGCACTAATGTTTAACAGGCTTGGTTTGAGC--------------ATGGCAAACA
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a
s	mr.mrrefChr0	97217	139	+	130230	AAAGAGTCAAACATTAAGAATCATCCTGGAGGTATCCGACCATTCGTACACTCACAGAAGTTTTAGCGCGCATGCAAAGGAAAATGGCCTCCTCTCCATATGGTTTTGTCTATATGGTTCTACTTAATCTTTAACCTAA
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a
s	mr.mrrefChr0	97356	3	+	130230	GAA
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a
s	mr.mrrefChr0	97359	323	+	130230	TTCTTAATCAAGTTGGCATTTTTGCCCATGGCACCTCAAGTGACATCAACTCTAACGTTGACATTGTGCTTACCTGATGGTTGCAGCATGATCTTGTATAGATGGCTTCTCACAAAAGATGCCTTGCAAGGAAACAGTAGCTTACCATGGATGCTTTTGTTTAAACGGAGTTATACATGAGTGTTATTTCTCTGTATCTATGTCAACAAGCTCTGTATATACAATGGAACTTGCATGGGTTTTGACGGCTCGTATGTCATCAAATATGATGTCTAAGTTGGGATACCATCCAGAAGGGGAGGACATTACCAGCTCCTCAATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	102316	319	+	636262	TTCTTAATCAAGTTGGCA--TTTGCCAATGGCACCTCAAGTGACATCAACTCTAACGTTGGCATTGTGCTCTCCTGATGGTTGCAGCATGATCTGGTATAGATGGCTTCTCACAAAAGATGCCCCGCAAGGAAACAGTG--CTACCATGGGTGCTTTTGTTTAAGCGGAGTTATACCTGAGTGTTGATTCTCTGTATCTATGTCAACAAGCTCTGTATATACAATGGAACTTACATGGGTTTTAACAGCTTGTATGTCATCAAATATGATGTCTAAGTTGGGATACCATCCAGAAGGGGAGGACATTACCAGCTCCTCAGTTT
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a
s	mr.mrrefChr0	97682	115	+	130230	AACACTAGGAAGATAACAGTAGTTTTTGCTTATGCCACCCTAAAGAATATATTTATTTTCTTTGACCTATTGATTGCCCTATGGATGCTCTGCCACAGTTCACTTTTATTGATTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	94788	115	+	647215	AACACTAGGAAAATAGCATCAGTTTTTATTTATTCCACCCTAAAGAATATATTTATTTTCTCTGACCTATTGATTGCCCTATTGATGCTCCGCCACAGTTCACTTCTATAGACTT

a
s	mr.mrrefChr0	97797	135	+	130230	AACATTGCTAAGTACATGTGTGTGTAGTCTTACATATTTTATCCAGTAGTAAGCTTTATAACTTTCATGTACAGTAAGGCACATCAAATAATCACCCTCATCTGGAGAGATAATCATCCTTGCATTTGTATATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	102750	135	+	636262	AACATTGCTAAGTACATGTGTGTGTAGTTTTACATATTTTAGCCAGTAGTAAGCTTTATAACTTTCATGTACTGTAAGGCACATCAAATAATCACCCTCATCTGGAGAGATAATCATCCTTGCATTTGTATATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	94914	122	+	647215	AACATTGCTAATTA-------------TCTTCCATATTTTCTCCAGTAGGGAGTTTTATAACCATCATGTACAGAAAGGCACAGCAAATAATAACCCTCATCTGGAGAGATAATCATCCTTGCATCTGTATATAT

a
s	mr.mrrefChr0	97932	307	+	130230	GTCTAAATGGTATACAGTAGTTGCCCTCCCATTAATAACTGTTTATAGAACTTTCTCTTGGAGTTGTGTTGTGCATGTGATGCCTGTCTTGATTAGTGCAAAGTCTACTCCAAAAACCTTGGGTACACACCGATAACACTGCAATTGACCAATCTGGCTCATCCGAGTGTAGATCATATACCTGAGCCTAGTTCCTATCTGTCCTAACTAATTTTTAATTGCTGTAGTTTACATACATACTGAGCATAGGACTGAGTAAACATTATTGGGCTAAAGGACAGAGAGTTAGGTCACTTTGGACAGTTGC
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	98270	6	+	130230	GCCGGC
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a
s	mr.mrrefChr0	98276	170	+	130230	AACAGGCTGACATTAGCTTGATAGTATTTCTAACTGGCATGCCAAATGTTTAAACTTATAACAGGAGGTAGGTCAAGTGGGACAACATATCTTTGCAATATCTTATAGACACACATGGTCCATAAAAAGTGGTTCACCACTGATGGAAGTCACATGAGGAGGGTATCAAG
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a
s	mr.mrrefChr0	98446	201	+	130230	GTTAGACCATGTGTGCTACAATGCAACAGATGGGGCTTCCACATCCAGGGAAGAATAATTGACTAAGACTGCATTAAACTATAGTAGCCTAGCCCATTTGCCAGTGTAACCACACCTCACTCGGTACAGTAGGTCAGAACATATCATACTCTGATATGGGGGAGTGTACAATAGTGTGAAGGAGCAGGTCACCTAGATTAA
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a
s	mr.mrrefChr0	98647	101	+	130230	CTGCTCATAGTAGTTACAGGCTAAAGAGCGCTTATCATTGTCCAGTGAGTGATTGCTTCAGCAATTTAACAAGACAACCATGAAGTAAACAGTGGAATCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	103594	101	+	636262	CTGCTCATAGTAGTCACAGGCTAAAGAGCGCTTATCATTGTCCAGTGAGGGATTGTTTCAGCAATTTAACAAGACAACCATGAAGTAAACAGTGGAATCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	95761	101	+	647215	CTGCTCATAGTAGTTGCTGGCTCAAAAGTGCTAATCATTGTCCAAGGCTTGATTGCTTCAGCAATTTAACAAGACAACCATGAATTAAACAATGGAATCCT

a
s	mr.mrrefChr0	98748	209	+	130230	TACTAGTATAGGCAATGCATTGTTTATAACTTCCACCAAGATACTCCTTTAGTTAGGCTATATAGGATGAAAAGCCTTAACCTGTAGGATGTATCCAAATGTAGGGGGCAAGCCAGGAGTGTGCTGGACAGAAAGGTTTTCGTCACACAGACAGTCAGAAACAGGTGGATGGCAAAGAATGTTACAACAATCCTAACTAAGGTCAAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	103695	209	+	636262	TGCTAGTATAGGCAATGCATTGTTTATAACTTCTGCCAAGATACTCCTCTAGTTAGGCTATATAGGATGAAAAGCCTTAACCTGTAGGATGTATCCAAATGTAGGGGGCAAGCCATGAGTGTGCTGGACAGAAAGGTTTTCGTCACACAGACAGTCAGAAACAGGTGGATGGCAAAGAACGCTACAACAATCCTAACTAAGGTCAAATT
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a
s	mr.mrrefChr0	98957	18	+	130230	TCCACATTGAATTGATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	103907	18	+	636262	TCCATATTGAATTGATCA
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a
s	mr.mrrefChr0	98975	45	+	130230	GGTTGGTGTTTCTTTAAGTACCACTGTCACACTAAGTAACACACT
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a
s	mr.mrrefChr0	99020	27	+	130230	AGGGAGAGTGAGAATAGCTTGACGTGT
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a
s	mr.mrrefChr0	99047	48	+	130230	TACATGGTCCTGTCCCCTTGTTCAATGTATCTACCTCTCGTCCCTTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	104016	48	+	636262	TACATGGTCCTGTCCCCTTGTTCAATGTATCTACCTCTCGTCCCTTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	96203	48	+	647215	TACGTGGCCCTGTCCCCTTATTCAATGTATGTACCTCTCGTCCCTTTT

a
s	mr.mrrefChr0	99095	116	+	130230	CATTGCGTGTATCTTTGCCCATCACCTGTTAGGTGATGCCAAGTTTAAGGGTGACACCTCTTGATAGATCACAATTTTTATCCTCCAAAACGAATGAACTCAGTACTCTATTTCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	104064	116	+	636262	CATTGCGTGTATCTATGCCCATCACCTGTTAGGTGATGCCAAGTTTACGGGTGACACCTCTTGATAGATCACAATTTTTATCCTCCAAAACGAATGAACTCAGTACTCTATTTCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	96255	63	+	647215	CATTGTGTGTATTTTTACCCATCATATGTTATGTGATGACAAGTTTAAGGCTGACACCT-----------------------------------------------------TCAA

a
s	mr.mrrefChr0	99211	8	+	130230	TCACTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	104180	8	+	636262	TCACTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	96321	8	+	647215	TCTCTTTT

a
s	mr.mrrefChr0	99219	127	+	130230	AGCGACTTCAGCCAATGTCATCCCAAGGTTATTCAACTGAGGTGGCCACAGTGAAGTGCTTTTTCTTGGAAACCTCTTTTGTGAACCTCCTTTTCTGGCTATCCAAGCTTTCATTCAGGTCTAATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	104199	127	+	636262	AGCGACTTCAGCCAATGTCATCCCAAGGTTATTCAACTGAGGTGGCCACAGTGAAGTGCTTTTTCTTGGAAACCTCTTTTGTGAACCTCCTTTTCTGGCTATCCAAGCTTTCATTCAGGTCCAATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	96329	127	+	647215	AGCAAAGTCAGCCAATGTCATTCCAAGTTTATTCAACTGAGGTGGCCACAGTGAATCGCTTTTTTTTGTCAACCTCTTTTGCAAACTGCCTTTTCTGGCTATCCAAGCTATCATTCAGGTCTAATGT

a
s	mr.mrrefChr0	99346	93	+	130230	CTGACCCATGACTACCAAGATATCATATAGTTATGCCTCCAAATTCCAGTCCTGGGCTTTGCTCCCTGGAGTTTCAGGCCTCGGCTTTTGTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	104326	93	+	636262	CTGACCCATGACTACCAAGATATCAGATAGTTATGCCTCCTAATTCCAGTCCTGGGCTTCGCTCCGTGGAGTTTCAGGCCGCTGCTTTTGTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	96460	85	+	647215	CTGACCCATGA--------ATACCATATATTGATGCCTCCAAATTCCAGTCCTGGGCTTTGCTGCCTGAAGTTTCAGGCCTCGATTTTTGTCT

a
s	mr.mrrefChr0	99439	167	+	130230	TTTACAATACATAAATGGGGGACCTTTTTAAAAGTGTCATTAAATCATGCAACCTATTATTAGCCATGTGTGGAAGAAGAGAAGAAGGTGAAGCTTTCTTTTTTGATTGAGCTCATTTCTTACCCATTCATATCAGATATTCTATGATAAGCCTGAATTGTTACTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	104423	164	+	636262	TTTACAATACATAAATGGGGGACCTTTTTAAAAGTGTCATTAAATCACACAACCTATTATTAGCCATGTGTGGAAGAAGAGAAGAAGGTGGAGCTTTCTTTTATGATTGAGCTCATTTCTTACCCATTCATATCAGATATTCTATGATAAGCCTGAATTGTTAC---
s	simRat_chr6.simRat.chr6	96545	167	+	647215	TTTACAATACATAAATGGGGGACCTTTTTAAAAGTGTCATTACATCATGCAGCCTATAATTCACTATGTGTGGAAGAAGAGAAGAAGGTGAAGTTTTCTTTTTGGATTGGGCTCATTTGTTACCCATTCGTGTCAGATATAGTATGATAAGCCTGAATTGTTACTTA

a
s	mr.mrrefChr0	99606	71	+	130230	CGTTACATTGGGAGTAACCTAGCAGTCCCATTGGGAGTATCAGAGAAGAAATCGAGATAGTCCCCCTCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	104587	53	+	636262	------------------CTAGCAGTCCCTTTGGGAGTATCAGAAAAGAAATCGAGATAGTCACCCTCCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	96714	71	+	647215	CGTTACATTGGGAGTAACCTAGCAGTTACATTGGGAGTATCAGAGAAGATATCGAGATAATCCCCTTCCAT

a
s	mr.mrrefChr0	99677	289	+	130230	AGCCTAATTAATGCTACAGGTCCATTTTGATTGCTTAGGCTACTTTTGTAAAGCTTGTATCTCTGAAGCCCTCTGACTATCACATATGGTCGGGGTGGGGACAGCCCTGTTGCTCTCATAGAGTTATGTGCTTAGCTGCATTTAGATGTGCCATCATATTTGGTTCCATGAAATAGTTGTTGTTTAATGACATAATGAGGAATAGCCTCACCATCACTACTACCCCATGATCTCACTGCTTTAGCGTGGGGAGTGGGTTAGGGCATCCCAGAACACCTCAAGAGAGAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	104641	279	+	636262	AGCCTAATTGATGCTACAGGTCCATTTTGATTGCTGAGGCTACTTTTGTAAAGTTTGGATCTCT-AAGCCCTCTGACTATCACATACAGTCAGGGTGGGGACAGCCCTGTTGCTCTCATAGAGTTATGTGCTTGGCTGCATTTAGATGTGCCATCATATGTGGTTCCATGAAATAGTTGTTGTTTAATGACATAATGAGGAATAGCCTCACCATCACTACTACCCCATGATCACACTGCTTTAGCATGGGGA-----TTAGGGCATTCCAGAAC----CAAGAGACAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	96785	287	+	647215	AGCCTAATTAATGCTCCA--TCCACTTTGATTGCCTAGGCTACTTTTGTAAAACTTGTATCTCTGAAGGCCTCTGACTATCACATATGGTCGGGGTGGGGACAGCCATCTTGCTCTCATAGAGTTATGTGCTTAGCTACATTTAGACGTGCCATCATCTTTGGTACCATGAAGTAGTTGTTGTCTAATATCATAACGAGGAATAGCCTCACCATCACTACTACCCCATGATCTCACTGCTTATGCGTGGGGAGTGGGTTAGGGCATCCCAGAACACCTCAATAGAGAAA

a
s	mr.mrrefChr0	99966	103	+	130230	ATCATTTCTAGGATTATGGACGAGGCAAGCACTACAAATACAGAAGTATGCAACACCATTGCACATAGGTACCTCTATATGAAGCCAATATTCTTGCTACCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	104924	90	+	636262	ATCTTTTTTAGGATTATGGGCAATACAAGCACTATAA------AAGTATGCAACACCATTGCACATAGGAACCTCTATGTGAAGCCAATATTCTTG-------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	97072	103	+	647215	ATCATTTCTAAGATTATAGATGAGGCAAGCACTACAAATACAGAAGTATGCAACATCATTGCACATAGGTACCTCTATATGAAGCCAATATTCTTGCTACCTC

a
s	mr.mrrefChr0	100069	13	+	130230	TGAAGTCAATATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	105014	1	+	636262	------------T
s	simRat_chr6.simRat.chr6	97179	13	+	647215	TGAAGTCAATATT

a
s	mr.mrrefChr0	100082	64	+	130230	ACAATTCAATATGTCAAATTTCCACAAGTGACCATCCGTAACCAAGAGATCACAGTGACAAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	105015	64	+	636262	AAAATTCAATATGTCAAATTTCCACAAGTGACCATCCGTAACCAAGAGACCACAGTGACAAATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	97197	64	+	647215	ACAATTCAATATGTCAAATTTCCACAAGTGATCATCCATAACCAAGAGATCACAGTGACAAATT

a
s	mr.mrrefChr0	100146	60	+	130230	GATCTTTTGATTCATTTGAGACCTGTTTCCAGGTGGACTTGATAGGTCCTAATGTAATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	105089	59	+	636262	GATCTTTTGATTCATTTGAGACCTGTTTCCAGGTGGACTTAATAGGTCCT-ATGTAATAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	97261	60	+	647215	GACCCTTTGATTCACTTGAGACCTGTTTCCAGGTGGACTTGATAGGTCCCAATGTAATAG

a
s	mr.mrrefChr0	100206	200	+	130230	ACTCCCACATGCACCAGGATGATTTCTACTACAAAAACAAGTCTACTGGTGATTCCAAGCTTACTCTACCATCTTGTGTATAAGTACACTGACCATAGCAAGTCTATTTTGAAATCTATTAGATGTGGCTGCTGAGTCTCTAACTCGGTGCTCATCTGTTTGCATTCTGTAGATTGAAGTATCATACTTCCATTCCTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	105150	179	+	636262	ACTCCCACATGCACCA--ATGAATTCTACTACAAAAACAAGTCTACTGGTGATCCCA-------TCTACCATCTTGTGTATAAGTACACTGACCATAGCAAGTCTATTTTGAAATCTATTAGGTGTGGCTGCTTA------------GTGCTCAACTGTTTGCATTCTGTAGATTGAAGTATCATACTTCCATTCCTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	97321	200	+	647215	ACTCCCCCATGCACCAGGATGATTTCTGCTACAAAAACAAGTTCACTGGTGATTCCAAGCTTACTCTACCTTCCTGTGTATAGGTACACTGACCATAGCAAGTTTATCTTGAAATCTATTAGATGTGGCTGCTGAGTCTCTAACTCGGTGCTCATCTGTTTGCATTCTGTAGATTGAAGTATCATACTGCCGTTCCTGCA

a
s	mr.mrrefChr0	100406	113	+	130230	AATTTCTGTAAGGAGATCACCCCCCTCCTGCACTTCAACTTCCTTCTTTTACACAATTCAGAATGTAACTTGTCTGTTGGGGGCATGCTTGTCCTCCAATCTAAATACAGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	105329	113	+	636262	AATTTCTGTAAGGAGATCACCCCCCTCCTGCACTTCAACTTCCTTCTTTTAGACCATTCGGAATGTAACTTGTCTGTTGGGGCCATGCTTGTCCTCCAATCTAAATACAGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	97531	112	+	647215	AATTTCTGCAAGAAGAGCACCCCCCTCCTGCACTTCAACTTTCTTTTTCTACACAATTCAGAATGTAACTTGTCTGTTGGGGGCATGCTTGTTGTCCAATCTAAATACGGAA-

a
s	mr.mrrefChr0	100519	89	+	130230	CTCTTCAGCCTGTGCACTCCACTCTCCCACTCAGGTTTATTAGCATTCACAGTAGGAGCATACTGTTCCCAGTTGATGATTCCCAATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	105443	89	+	636262	CTCTTCAGCCTGTGCACTCCACTCTCCCACTCAGGTTTATTAGCACTCACAGTAGGAGCATACTGTACCCAGTCGACGATTCTCAATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	97643	88	+	647215	-TTTCCAGCCTGCGCATTCCACTCTCCCACTCAGGTTTAATAGCATTCTGAGTAGGAGCATACTATTTCCAGTTGATGATTCCCAATGC

a
s	mr.mrrefChr0	100608	43	+	130230	TGGTTTACTCTTGGATGTTCACTTCCAATTAGCTAAATTCTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	105536	43	+	636262	TGGTTTACTCTTGGATGTTCACTTCCAATTAGGTAAATTCTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	97731	43	+	647215	TGGTTTACTCTTGAATATTCACTTCCAATTAGCTAAATTCTGA

a
s	mr.mrrefChr0	100651	383	+	130230	TAGGCCCTTCCAAGTCTCCATTAGCCAGCAAGGTCTGCTGAAATCTGCTGGTGATCATAGAAAGGGATTAACTTTAACTTTGTTCCATATTACCTCAAGAATAGCTGTAGGTCCCAGTAAGTACAAACAGTAACATATGTAGATATGTCATTTACCACCCCTTATTACTATTTGTGTATAATTTGGAAGGTAATACTTTGGCAGGGCTTTGAAGTTTCAATGAATTTAGTTATCGTGACCCTTTTCTCAGAGTCATTATATTTTGTGCCCTCCCTATTTCTTTCATCTGTTTTCATTGGAATGATGGTAGTCAGAATGTGTAGTGATTATCAGTATGGCAGTAATTTTAATCACTGATGGTTACAAGGCACATGGGTGTATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	105579	383	+	636262	TAGGCCCTTCCAAGTTCCCATTAGCTAGCAAGGTCTACTGAAATCTGCTGGTGATGATAGAAAAGGATTAACTTTAACTTTGGTCCATATTACCTCAAGAATCGCTGTAAGTCCCAGTAAGTGCAAACAGCAACATATGTAGAAATGTCATTTACCACCCCTTACTACTATTTGTGTATAATTTGGAAGGTAACACTTTGGCAGGGCTTTGAAGTTTCAATGAATTTAGTTATCGTGATCCTTTTCTCAGAGTCATTATATTTTGTGCCCTCCCTATTTCTTTCATCTGTTTTAATTGCAATGATGGTAGTCAGAATGTGTAGTGATTATCAGTATGGCAGTAATTTTAATCACTGATGGTTACAAGGCACATGGGTGTATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	97791	383	+	647215	GAGGCCCTTCCAAGCCTCCATTACCCAGCAAGGTCTGCTGAAATCTGCTGGTGATCATAGAAAGCGATTAACTTTAACTTTGTTCCATATTACCTCAAGAGTAGTTGTAGGTCCCAGTAAGTACAAACAGTAAGATATGAAGATATGTCATTTACCACCCCTTATTACTCTTTATTTGTATTTTGAAAGGTAGTACTTTAACAGGGCTTCAAGGGTTCAATGAATTTAGTCATCATGACCCTTTTGTCAAAGTCTTTATATTTTGTGCCCTCCCTACTTCTTTCACCTGCGTTCATTGGAATTATGGTAGGCAGAACGTTTAGTATTTATCACTATGACATTAATTTTAATTACTGATGGTTACCATGCATGTGAGTGTATTA

a
s	mr.mrrefChr0	101034	581	+	130230	TTTGATCAGGTACAAGATGACATCTTCCACTTCCATACCTAAGTCTTGCATATCACTCTCCCATAAAAGCTCTTGTATGTTGATTGGTGTGCTGCTGTAACCATTGCAGCTGGGTACCCAGTGCAGTAATTGTCTCCTTGTTAACAACATTTGCAACTGAATTTAGTTACAACATTGTTGCTTTGTTTAGCACATCCATATGTTTGGGACATAACCAATAAAAACTTTCAAGGGGCCTGTGGATATGACCTTGTTTAACTATAGTGGTAGTTGCATTTAATGTGAAACATCTTTTTCTGGATACCTGGAACAACATGACATCATGTTCTAGTGGGTCTAAGGCATTCACGAGTTTGGAGAACACCATCCGGGTAGTCAAAATGCCTATCTGTCCCATACGATGGGAGGTCTGCATTAACTTGGTAGAGGTCTAGAGGTCATCTATTCACCAACCACAATGGGAGTGAGCCAAAGCAAGCTGGTGACTGGCCAAATGGGATATTCCTTCTTGTTCAATGGGGTCCATCTTAGGCCCCCAGTGTGATTAATAGGGGCTTCGATAACCTAGGGTGTGACATAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	105967	580	+	636262	TTTGATCAGGTACAAGATGACATCTTCCACTTCCATACCTAAGTCTTGCATATAATTGTCCCACAAAAGCTCTTGTATGTTGATTGGTGTGCTGCTGTAACCACTGCAGCGGGGTACCCAGTGCAGTAATTGTCTTCTTGTTAACAACCTTTGCAACTGAATTTAGTTGCAACATTGTTGCTTTGTCTAGCACATCCATATGTTTGGGACATAGCTAATAAAAACCTTCAAGGGGCCTGTGGATATGACCTTGTTTAACTATAGTGGTAGTCACATTTAATGTGAAACATCTTTTTCTGGATACCTGGAACAACATGACATCATGTTCTAGTGGGTCTAAGGCATTCAC-AGTTTGGAGAACACCATCCCGGTGGTCAAAATGCCTATCTGTCCCATACGATGGGAGGTCTGCATTAACTTGGTAGAGGTCTAGAGGTCAGCTATTCACCAACTACGATGGGAGTGAGCCAAAGCAAGCCGGTGACAGGCCTAATGGGATATTCCTTCTTGTTCAATGGGGTCCATCTTAGGCCCCCAGTGTGATTAATAGGGGCTTCGATAACCTAGGGTGTGACATAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	98174	552	+	647215	TTTGATCAGGTACATGATGGCATCTTCCACTTCCATACTTAAGTCTTGCATATCACACTCCCATACAAGCTCTTGTATGGTAATTGGTGTG-TGCTAAA---ATTGCAGCTGGGTTGCCATTACAGTAATTTTCTCCTTGTTAACAACATTTACAACTAAATTTAGTTACAACATTGTCAGTTTGTTTAGCATATCTGTATGTTTGAGACATAACCAATAAAAACTCTCAAGGGGCCTGTGGATATGACCTTGTTTAACTATAGTGGTAGTTGCATTTATTGTGGAACCTCTTCTTCTGGACACCTGGAACAACATGGTGTCATGTTCTAATGGGTCTAAGGCTTTCACGACTTTGGAGAACACCATCCGGGAAGTCAAAATGCCTATATGTCCGACACGCTGGGAGGTCTGCATTAACTTGGCAGAGGCCTAGAGGTCATCTATTTACCAACCACAATGGAAGAGATCCAGGGCAAGCTGGTGACTGGTCAA-------------------------GGGTCCATCTTAGGTCTCCAGTGTGATTAATGGGGGCTTCAATAACCAAGGGTGTGACCTAAT

a
s	mr.mrrefChr0	101615	40	+	130230	TTCGCCAGCCCAATTGCCAGCTCAAATAGCACCAGCTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	106547	40	+	636262	TTCGCCAGCCCAATTGCCAGCTCAAATAGCACCAGCTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	98727	40	+	647215	TCCCCCAGCCCAATTGCCAGCTCACATGGATCTGGTTGTA

a
s	mr.mrrefChr0	101655	14	+	130230	TGTACACATCATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	106587	14	+	636262	TGTACACATCATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	98785	14	+	647215	TATACACATCGCTC

a
s	mr.mrrefChr0	101669	69	+	130230	GGCCAACGGCCAGTGCAATGAGGTCAAGTCTTACTTAATGTATGCAACAAAGATCAGATGGGCTCATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	106601	69	+	636262	GGCCAACGGCCAGTGCAATGAGGTCAAGTCTTACTTAATGTATGCAACAAAGATCAGATGGGCTCATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	98800	69	+	647215	GGTCAATGGCCAGTGCAAAGAGCTCATGTCATACTTTATGCATGCAACAAAGATCAGATGGGCGGATTT

a
s	mr.mrrefChr0	101738	64	+	130230	ACTGTCATAGATTGATTCTAGGTAGGTTTGCCATGTAAAAATGTTACAACACTTTGATGTCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	106670	64	+	636262	ACTGTCATAGATTGATTCTAGGTAGGTTTGCCATGTAAAAATGTTACAACACTTTGATGTCTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	98870	64	+	647215	ACTGTCATAGATCTGTTCTAGGTAGGTTTGCCATGTAAAGATGTAACAACACTTTGATCTCTTA

a
s	mr.mrrefChr0	101802	190	+	130230	ATGTCTTAGTGACCAGAAACCTCAGATTTACTCATAGATAATTAAAATAAAATGTCACATGAACCTGTGCGGCTGTAGGTTATTAGATCAAAGAGGCCTGTCTAGATGCCGAAGAGTGTAATGGAGATTGTGTACCGGAGTGGTTTCTTTTCAGTGACTTTTCTGACTATCATCATTAATGTTTGTTGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	106736	190	+	636262	ATGTCTTAGTGACCAGAAACCTCAGATTTACTCATAGATAATTAAAATAAAATGTCACATGAACCTGTGCGGCTGTAGGTTATTAGATCAAAGAGGCCTGTCTAGATGCCGAAGAGTGTAATGGAGATTGTGTACCGGAGTGGTTTCTTTTCAGTGACTTTTCTGACTATCATCATTAATGTTTGTTGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	98934	190	+	647215	ATTGCTTAGTGACCAGAAATCTCAGATTTACTCATCGATAATTAAAAAAAAAGGTGACATAAACCTGTGTAGCTGTCGGTTATTAGATCAAAGAAGCCTGTGTATATGCAGAAGAATGTAGTGGAAATTGTGTACCCAAGTGGTTTCTTTTCAGTGTCTTTTCTGACTATCATCATTAAGGTTTGTTCTC

a
s	mr.mrrefChr0	101992	22	+	130230	TATAAGTTGATCCCAACTCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	106972	22	+	636262	TATAAGTTGATTCCAACTCATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	99124	22	+	647215	TACAAGTTGATCCCAAATCACA

a
s	mr.mrrefChr0	102014	215	+	130230	TGTTAGAATGCTGGTGGTTATGTGAAATTTTTAAACACACCACATATTACCCAAACCTCCCACAGATGTGCAGACTAACCTCACTTACTTTTTAGTACTTTGCCAGCGTGAAGCAACAATAAAATCTAGAGGATGAGCATAAATAAATCGAGAATTAGGCTAATCCTTTGAAGTTTGGCATCTGAGAGCACATCTGCTCCAATGCATACCTATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	107040	208	+	636262	TGTT-------TGGTGGTCATGTGAAATTTTTAAACACACCTCATATTACGCAAACATCCCACAGATGTGCAGACTAACCTAACTTAGTTTTTAGTACTTTACCAGCGTGAGGCAACAATAAAATCTAGAGGATGAGCATAAATAAATCGAGAATTAGGCTAATCCTTTGAAGTTTGGCATCTGAGAGCACATATGCTCCAATGCATACCTATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	99146	208	+	647215	TGTTAGAATGCTGGTAGTTATGTGAAATTTTTAAATACACCACATACTACCCAAACCTGCCACAGATTTGCAGACTAAACTCACTTACTTTTTAATCCTTTGCCAGCTTGAAGCAACGG-------TATAGGATGAGCACAAATAAATAGGGAATTAAGCTAGTCCTTTGAAGTTTGGCATCCCAGACAAGATCTGGTCTGATGCATACCTATAC

a
s	mr.mrrefChr0	102229	153	+	130230	TGGTTTGTGGTGCCCTGTGTATATACATCTCTAGTACATACCACAATTCATGGCCCTGCACAGATAGCTTGTGGTCTAGTTTGTTCCCCAATGTTCCCTCTTTTACCCCACAGCCACAACCAAGACAAATTACTTATGGAATGTAGCTATAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	107248	153	+	636262	TGGTTTGTGGTGCCTTGTGTATATACATTTCTAGTACATACCACAATTCAAGGCCTTGCACAGATAGCTTGTGGCCTAGTTTGTTCCCCAATGTTCCCTCTTTTACCCCACAGCCACAACCAAGACAAAATACTTATGGAATGTAGCTATAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	99372	153	+	647215	TGGTTTGTGGTGCCCTGCGTATATACACCTCTAGTACATAGCAGAACTCATGACCCTGCACAGATAATTTGTGGTGCAGTTTGTTCCCCAATGTTCACTCTCATACCAAACAGCCACAACCAAGACCAGTTACTTATAGAATGCAACTATAGC

a
s	mr.mrrefChr0	102382	142	+	130230	ATATTGTCAGGGGTCATGGTGTGATGAACTAAGGTGTGGACTAGGACATAGCTGGATGGTAACTGCATATGGCTTTCACCCAGCTACCTAACCTTACAGTAAGACAGAACCTAAGCACTAGCTATTTAATATCTCATGGTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	107406	142	+	636262	ATATTGTCAGGGGTCATAGTGTGATGAACTAATAAGTGGACTAGGACATGGCTGGCAGGTAACTGCATATGGCTTTCTCCCAGCTACCTAACCTTACAGTAAGACAGAACCTAAGCACTAGCTATTTAATATCTCATGGTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	99525	90	+	647215	ATATTGTCAGGGGTCACGGTGTGATGAACTAAGGTGTGGACTAGGACATAGCTGAATGGCAACTGCATATAGCTTTCACCTAGCTACCTG----------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr0	102524	16	+	130230	AAACATGGGTGACAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	107549	16	+	636262	AAATGTGGGTGACAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	99615	16	+	647215	AATCATAGGTGACGAT

a
s	mr.mrrefChr0	102540	17	+	130230	GCAAGCATATACAACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	107565	17	+	636262	GCAAGCATATACAACAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	99632	17	+	647215	ACAAGCGTATACAACAG

a
s	mr.mrrefChr0	102557	4	+	130230	AGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	107586	4	+	636262	AGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	99649	4	+	647215	AGCT

a
s	mr.mrrefChr0	102561	57	+	130230	AAAAATCAATCTTGAGGCGAAAGTGTCCCTTATGTCTGGAGTTTCATTCCATATATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	107599	57	+	636262	AAAAACCAGTCTTGAGGCGAATGTGTCCCTTATGTCTGGAGTTTCACTCCATATATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	99653	57	+	647215	AAAAATCAATCTTGAGGTGAAAGTGTCCCTTATGTCTGAAGTTTCATTCCATATACG

a
s	mr.mrrefChr0	102618	282	+	130230	TAGAGGCCATCATAAGATTGTACTCAACAAACATCACCACCCCTGCTTTATCTTGTCTGGTTACAACACAGTTACCTTCTTGGTGGTAAAGACTACTTCATCTGTCTCAAAAAGTAATCATCAGGCAATGAGAGGTCAAGCATTTGGATAGTACCTACTTATCAGGGATTAGCTCAAAGTGAAACTGAATAACAAGTTGAAGGTGCTAACGCTTATTGATAGCACAAAATGATTCCACGTACAATACTGAGAAAGGAATGCAAACAGGAACGCAAAAGGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	107656	280	+	636262	TAGAGGCCATCATAAAATTGTACTCAACAAACATCACCACCCCTCCTTCATCATGTCTGGTTACAACACAGTTACCTTCTTGGAGGTAAAGACTACTTC-TTTGTCTCAAAAAGTAATCATCAGGCAATGAGAGGTCAAGCATTTGGATAGTACCTACTTATCAGGGACTAGCTCAAAGTGAAACTGAATAACAGGTTGAAGGTGCTAA-GCTTATTGATAGCACAAAATGGCTCCACGTACAATACTGAGAAAGGAATGCAAACAGGAACGCAAAAGGGCA
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	111614	274	+	636262	AAAGCCCTTTTTCCTTGCCACAAGCTATCCACAGGTTTGACTACACTTTGACTACATGATAAAATATAGCTGTGCACCAATATTGCTGGGCTTATTAGAGTATCAATATTACAGTAGTAATTGGATGGTATGTGTGGCACCAAAATCCCTTTATGCCAAAGGGTACTATCCATGTATTACAACCCACAATGCC-----CTCTGAAAGTAAGATGTTGCCAGAGTTCTAACAATTCATAATGTAGATGGAGTTGCCTGACAATGTCATGGAGGACATATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	103884	269	+	647215	AAGGCCCTTTTCCCTTGCCACAAGCTACCCACAGGTCTAACTGCAGTTTAACTACCTGATAAAATATAGCCGTGCACCAACATTGCT-GGCTGGTTAGAGTATC---------GTAGTAATTGGATGGTATGCGGGTCACAAAAATCCCTTTATGCCGTAGGGTACTATTCATGTATTACAACCCACAATGCTCTCCACTCCGAAAGTAAGAAGTTATCAGAGTTGTAACAATTCATAATGAAGATGTAGATGCCTTACAATCTCATAGAGTGCATATG

a
s	mr.mrrefChr0	106655	7	+	130230	TGGCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	111894	7	+	636262	TGGCATG
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a
s	mr.mrrefChr0	106662	103	+	130230	TTTTTAGTGGTTATGCCATTTGTTCATTCCAAGAGGAACAGCCCTCTTATTGTTCACCAACACAAGTTTAGGATATAAAGCTTATATTTTGTAACATGCTCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	111914	103	+	636262	TTTTTAGTGGTTACGCCATTTGTTCATTCCACGTGAAACAGCCCTCTTATTGTTCACCAACATAAGTTTAGGATATAAAGCTTGTATTTTGTTACAAGCTCCT
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	107168	170	+	130230	GAACTTCTTTGAGCCTGTAGGCAATTAAAAGAAGTTAAGGAGACTGGTTTTTTAAAAGGCCCTCAGTGTTGCATTAGTCATAAACCTCAAGATGAAGGTGGTGGACTCCTAGAAATGTGTCAACCTATAACCTTCAGTATTCATTGTTAAAACTTATACTATTTCATTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	112436	170	+	636262	GAACTTCTTTGATCCTGTAGGCAAGTAAAAGAAGTTAAGGAGACTGGGTTTTTAAAAGGCCCTCAGTGTTGCATTAGTCATAAACCTCAAGAGCAAGGTGGTGGACTCCTAGAAATGTGTCAACCCATAAGCTTCAGTATTCATTGTTAAGACTTATACTATTTCATCTC
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a
s	mr.mrrefChr0	107338	275	+	130230	TGGATGTTGTTGTAGTCTAGGACACACAATCCTTAGTTCATAAATTTCATGCATTGTCTTCTTGCAGGGTGGCCTTCACTGCCAAGACTTGCTGTTGTTATATGAAAGACTATAGTGCTGATACTGACCCACCGGCAGCCAGGGGCTCCTTTTCTCACGTTGCCTGATATAACCTTCTTGTTAAACTGTAACTACTAAAGATCTATCATGGATTTATCCTACCCTGCAGCAACTATGTTGCATAGTCAGCAAATGAGTATAATACAAGTAGATTG
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	107632	24	+	130230	AAACTGAGTTTGATACCAGTACAT
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a
s	mr.mrrefChr0	107656	47	+	130230	TAACATTTGTTCATTTCAGCCATGGAACAAAAGTAGTGCAATACAAA
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	107962	34	+	130230	TCTAAACTGTGGTGAGGGTAGTACAGAGCCGGGT
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a
s	mr.mrrefChr0	107996	158	+	130230	GTCATAGCTCTTTGCAAAGGTTCTCTATCACAAGCTTCAGATTGAGGTTTTGTATGCTGCAAATGGGATATATACTTAGAAGTATGGGTTTGGGCACACATCCCTAGTCTGAAAGAAGTTTCTCACAAGAGTCTACGTCAATTATGTGACTGACAGAT
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	108338	165	+	130230	ATCATATGCAGGTCACAAATCTCAATAGTGTCCATAAACATTTTCCATAAACATTTCCACATAAAGAGTTCATCTAGGAAAGGTTATGCAAAATGCCTACTATGGAAATTTTGACAACAGAAAGAAGTGAACTAAGACACCAAACAATAAACATTTAAACAGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	113613	153	+	636262	ATCACATGCAGGGCATA-----------TGTCCATAAACATTTTCCATAGACACTTCCACGTAAAGAGTTCATCTAGGAAAGATTATGCAAAGTGCCTACTATGGAAATTTTGACAACAGAAAGAAGTGAACTAGGACACCAAACAAT-AACATTTAACCAGCAA
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a
s	mr.mrrefChr0	108503	206	+	130230	GACATGGGCTAATCATTGCATAATAATGCCAAGAATGAATTACCAAGAAAGAATAACCTTAATAGTTCCATGATATGGTGGTGGGGAAATCAGACCATTAGTGATCTACCACCATCTTATTGTGCCACATTAAAATGGAGGGGGGGCACAAAATGGACTCAATTATTGTAATGACAATACTTTGGTGGTAGGTTTAATCTTTAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	113815	206	+	636262	GACGTGGGCTATTCATTGCATAATAATGCCAAGAATGAAGTACCAAGAAAGAATAACCATAATAGTTCCATGATATGGTGGTAGGGAAATCAGAACACTAGTGATCTACCACCATCTTATTGTGCCACATTAAAATGGAGGGGAGGCACAAAATGGACTCAATTATTGTAATGACAATATTTTGGCAGTAGGTTTAATCCTTAGCA
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a
s	mr.mrrefChr0	108709	94	+	130230	GAAGTATTCCTAAAAAGAATAAGCACTCTTCTGTCTGAGCTTGGCTGCCCAAGGCTTTGATAGGCAAAAGGACACAGGTTGAGGGCACAAAGTT
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a
s	mr.mrrefChr0	108803	70	+	130230	ACTTACAGGAGTGTCAATGGGGATGTTGATCGGGGAAGTCTTCTTGAACCTGGCTTTTGACCAAGATGAT
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	108964	15	+	130230	TGGGAATGTCAATGG
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a
s	mr.mrrefChr0	108979	316	+	130230	GGAAGGTATTATTGGACCATACTTTTTTCATCTATGATTATCTCAAGTCATATTGCTACTTGATTATAGTAAGGAATCCTCCTCACATACTTATTGGTACTTCAAATCCTAATACTATGGAAGCCAAGTACTGGGGCTCTCTGAGATAGCAGGCCTTAACCTATTTATCCAATGGTTTAGTTATCTCCTGGCTGCCATTTTGGACAGATGTTAATCAGATCATAAGACTAGAGTACCTTGTAAGTGACATTTTGGGGGAGAAAAAAACCTACAAAGACAAAGAAGTGAGCTCAAACATGCAATTGACTTACCTTCT
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	109777	14	+	130230	TGAAGTAAGACTCT
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a
s	mr.mrrefChr0	109791	50	+	130230	AGCTAGTTAGATGTGGGTCAAGCAAAGTACAAAAAGTGGTGAGAACTGAA
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a
s	mr.mrrefChr0	109841	230	+	130230	TTGAAGTTGGGTACCAAGTAGAGAAAGTAGCAAAAGACAGGAGATTGTGTGGAAGGACATCTTTGACAGTGATCTGAGACATCCAATCTGACCTTTCTCTATTGCATACCACAGAAATGGTGTAAGATTGTTCCTTCTTTATCGGTTGCATAATCTCAGAGAACACATCATAATTTTTGCATAACTATTAGGGTCCACATCTGATGATTAGTATGGTGAGTACGGCATGT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	112025	3	+	130230	CAA
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	113459	53	+	130230	AAGGTTGAATTCTGAAGCAATTGTTGACTGAATGGGCTCTCCTTGTAGCACAT
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	113523	10	+	130230	TAGCACAACA
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a
s	mr.mrrefChr0	113533	64	+	130230	TATCCTCCATGCGCTCACCATAATTCCTATGTTTACCACCACAGATAAGTTTGTATCCTGCAGC
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a
s	mr.mrrefChr0	113597	80	+	130230	TCACTATCCTATGATGGCCACCACAGATAGGTCCGTATCCTGCAGCACACTATGGAGGGCACAGCCGCCCAACTTTTTTG
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a
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a
s	mr.mrrefChr0	113690	281	+	130230	TCTGGACACAATAGTAGCACTCTTTTTGCCAGTATATGGCTGAGCATGAGTTACTCTTACTAATTGGATCATGCGATCTAAATTAGAAACACTTTATGGGGTGGAGATGGCCCCTGCTAGTCATGTACTGCTAAATAAATGCATTGAATACATAGTCCTGTTAACATCTGACACAGCTGGCTTTTCGAGCTGGCTGTGCTCAACCTTATCATGTACTATGATAAAGCTCACCAATGTTGGATACACTGAGATCTCTGCTTTTTATGAATTACTGGGAAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119006	281	+	636262	TCTGGACACAATAGCAGCACTCTCTGTGCCAGTATATGCCTGAGCATGAGTTACTTTTACTAATTGGATCACACCATCTAAATTAGAACAACTTTATGGGGTGGAGATGGCCCCTCCTAAGCATGTACTGCCAAATAAATGCATTGAATACATAGTCCTGTTAACATCTGACACAGCTGGCTTTTCGAGCTGGCTGTGCTCAACCTTATCATGTACTATGATAAAGCTCACCAATGTTGGATACACTGAGATCTCTGCTTTTTATGAATTACTGGGAAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	111796	281	+	647215	TCTGGGGAGAATAGTAGCACTCTTTTTGCCAGTATATGGCTGAGCATGAGTTACTCTTACTAATTGGATCATGCGACCTAAATCAGAAACACTTTATGGGGTGGAGATGGCCCCTGCTAGTCATGTACTGCTAAATAAATGCACTGAATACATAGTCCTGTTAATAGCTGACGAAGCTCGCTGTTTGAGCTGGCTGTGCTCAATATTATCACGTGCTATGATAAAGATCACCAATGTCGGATACACTGAGATCTGCGCTTTTTATGGACTACTGGGAAGTA

a
s	mr.mrrefChr0	113971	17	+	130230	AGAGATTTACTGTTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119288	17	+	636262	AGAGATTTACTGTTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112077	17	+	647215	AGGAAGTTACTGTTTGC

a
s	mr.mrrefChr0	113988	8	+	130230	CAGCCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119305	8	+	636262	CAGCCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112105	8	+	647215	TAGCCCTT

a
s	mr.mrrefChr0	113996	48	+	130230	TAAGCTTTTCTATATTTAGCGTTGAAGAGCTAGCCAGTTTTAATGAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119313	48	+	636262	TAAGCTTTTCTATATTTAGCGTTGAAGAGCTAGCCAGTTTTAATGAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112131	48	+	647215	TAAGCTTTTCTATATTTTGAGTTGGAGTACTAGCCAGTTTTAATGAGC

a
s	mr.mrrefChr0	114044	33	+	130230	AAAGGACATATAGACCCAATTAGACTTCAAGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119361	33	+	636262	AAAGGACATATAGACCCAATTAGACTTCAAGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112180	33	+	647215	AAAGGACCTGTTGACCTAATTAAATCTCAAGTG

a
s	mr.mrrefChr0	114077	30	+	130230	ACTAGTCTTCTGACATCCTGCGCTGGCAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119394	30	+	636262	ACTAGTCTTCTGACATCCTGCGCTGGCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112231	30	+	647215	ACTAGTCTTCTGTCATCTTTCCCTGGCAGT

a
s	mr.mrrefChr0	114107	8	+	130230	CACAGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119425	8	+	636262	CACAGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112261	8	+	647215	TACATCAT

a
s	mr.mrrefChr0	114115	35	+	130230	TGCCAGTCAAAATTAGTGGTTCTGTATCGGGAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119474	35	+	636262	TGCCAGTCAAAATTAGTGGTTCTGTATCGGGAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112269	35	+	647215	TCCATGTTAAAATCAGTGGTTCTGTAGCTAGAATT

a
s	mr.mrrefChr0	114150	23	+	130230	GACTTTCTTATCTTCATCTATCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119509	23	+	636262	GACTTTCTTATCTTCTTCTATCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112305	23	+	647215	GAATTTCTTATCTTCATCTATCC

a
s	mr.mrrefChr0	114173	10	+	130230	ACATGAACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119537	9	+	636262	ACA-GAACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112328	10	+	647215	ACATGAACAC

a
s	mr.mrrefChr0	114183	8	+	130230	AGCTATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119547	8	+	636262	AGCCATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112338	8	+	647215	AGCTGTCA

a
s	mr.mrrefChr0	114191	174	+	130230	GGTGCTTTAATTCATTTAGAACCCCTAATCTATAAATGCAGCGATTGCAATGTATGTATAAATTAACTAGGTCCTGGCCACATGGGTATTGATCTTTGAAGACATCTGTTTGTATCTTGAAGAAATGATTTTGTGGCTGAGTATTAGTGTGCACGAGCAAATAGTGGGTTCAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119638	172	+	636262	AGTGCTTTAATTCATTTAGTACCCCTAATCTATAGATGT-GCGATTGCAATGTATGTATAAATTAGCTAGGTCCTGGACCCATGGGTATTGATCTTTGAAGATGTCTGTTTGTATTTT-AAGAAATGATTTGGTGGCTGAGTATGAGTGCGCATGGGCAAATAGTGTGTTCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112346	170	+	647215	GGTGCTTTAATTCATTTAGAATGTCTAATCCATAAATGCAGAGGTTGCAATGTATATATAAATTAACTAGG----GGCCACATGGGTATTGATCTTTGAAGACATCTATTTGTATCTTGAAGTAGTGATCTTGTGGCTGAGTACTAGTGTGCACGAGCAAATAGTGGGTACAAC

a
s	mr.mrrefChr0	114365	56	+	130230	TAACTATGTCTGTCCAAAAGGGCTTAAATTAAAGGATGAACTGCACTCTTGGTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119811	56	+	636262	TAACTATGTCTGTCCAGAAGGGCTTAAATTAAAGGATGAGCTGCACTCTTGGTATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112516	56	+	647215	TAACTATGTCTGCTGAAAAGGGCTTAAATTAAAGAATGAACTGCACTCTTGGTTTA

a
s	mr.mrrefChr0	114421	185	+	130230	TAATTTCCAAGTTTAGGATGACCTAACCCCAGCCTAGCCTTGAGCTTGTTGTCCACATGACATGTTAAAGGGACACAGAGAATGAGTAGTCAGGCTTAACAAAATTTGGTACACCAGTGCTAGCATCTTAGTCCCACACATTGTTTAACAGGGGGTTCAGGTAACAAGGGTGTAATCTAATGTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	119867	183	+	636262	TAATTTCCTAGTTTAGGATGACCTAACCCTAGCCTAGCTTTAAGCTTGTTGTCTACATTACATGTTAAAGAGACACAGAGAATGAGTAGTTAGGCTTAACAAAAT--GGTACACCAGTGCTAGCATCTTAGTCCCACACATTGTTTAACAGGGGGTTCAGGTAACAAGGGTGTAATCTAATGTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112575	185	+	647215	GAATGTCCAAGTTTAACATGATCTAATCCCAGCCTAGCCTTGAACTTGTTGTCCACATGGCATGTAACAGGGATACAGAGAATGAGTAGTCAGGCTTAACAAAATTTGGTACACTAGTGCTAGCATCTTAGTCCTACACATTGCTTAATGGGGGGTTCAGATAACAAGGGTGGAATCTAATTTCC

a
s	mr.mrrefChr0	114606	26	+	130230	AAGATTGATATCTGTCCCCAAGATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	120050	26	+	636262	AAGATTGATATCTGTCCCCAAGATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112761	26	+	647215	AAGATTGATATCGATCCCCAAGATTG

a
s	mr.mrrefChr0	114632	11	+	130230	TAGCCCACTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	120077	11	+	636262	TAGCCCACTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112787	11	+	647215	CAGCTAACTCA

a
s	mr.mrrefChr0	114643	161	+	130230	TGTACCTGCATATAATTGTCAATAACAGAACTGCATGACAAAAAGAGAATATCAGAGTGTGAATCTGCTTCTACCGCCTTGGGAGGCCTGCATACTTAAACCTACATCTTAGGCTCTGTGTCCTACATCCAGATGGATATAGAGCTAATAACAGAACTTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	120092	161	+	636262	TGTACCTGCATATAATTGTCAATAACAGAACTGCATGACAAAAAGAGAATATCAGAGTGTGAATCTGCTTCTACCGCCTTGGGAGGCCTGCATACTTAAACCTACATCTTAGGCTCTGTGTCCTACATCCAGATGGATATAGAGCTAATAACAGAACTTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112798	161	+	647215	TATACCTGTGTACCATTGTTAATTACTGAACCGCATGACAAAAAGAGAATAGCAGAGTGTGAATCTGGTTCTATAGCCTTGAAAGGTTTGCATACTGATACATACATCTTTGGTTCCACGTCCTACATCCAGGTGGATAAAAAGCTAATAACAGAACTTGA

a
s	mr.mrrefChr0	114804	84	+	130230	ACACATAGTACTGTAACCCTTTGAGCCATATTGAATGTGGCATCGCTGCAATTGCAGTGTTTGCCATGTCATGACCAATCCAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	120253	84	+	636262	ACACATAGTACTGTAACCCTTTGAGCCATATTGAATGTGGCATCGCTGCAATTGCAGTGTTTGCCATGTCATGACCAATCCAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	112975	84	+	647215	ACACATAGTGCTGTAACCCTTTGAGCCATATCAAATGTGGCATTCGTGCAATTGCAGTGTATGCCATGTTTTGATCAATTGAAC

a
s	mr.mrrefChr0	114888	362	+	130230	TAAAACTGTTCTAAAAGACAAGTCAATAAGCACTATTACAACATAAACATATCCAGACTCTGTTACCAAGAACAGCTAATGATGTTGTGCCTCAGTTGATTCCAGCCTATCAATTAGCAGAACACACAAGCCTGTGGCAGACTACATTAACTTTTTTTATTATACACCTTGTATTATACACCCCCACACCAAAAAGTTCAAAATCAAAAAAAACTATAGCACATCTACTAGATTGATGAACGTAGGGCCTTCCGGGCCTGATAGGTAAAGGTATAATTGAGTGCATCTGTGAGAGATGCATTAAGTAGAGGGAGTTCTATGGCTATCTCTCCAGATAAACCTTACCACTGCGGGGCTGGGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	120337	362	+	636262	TAAAACTGTTCTAAAAGACAAGTCAATAAGCACTATTACAACATAAACATATCCAGACTCTGTTACCAAGAACAGCTAATGATGTTGTGCCTCAGTTGATTCCAGCCTATTAATTGGCAGAACACACAGGCCTGTGGGAGACTGCATTAACCTTTTGTATTATACACCTTGTATTATACACCCCCACACCAAAAAGTTCAAAATCAAAAAAAACTATAGCATATCTACTAGATTGATGAACGTAGGGCCTTCCGGGCCTGATAGGTAAAGGTATAATTGAGTGCATCTGTGAGAGATGCATTAAGTAGAGGGAGTTCTATGGCTATCTCTCCAGATAAACCTTACCACTGCGGGGCTGGGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	113061	222	+	647215	TAAAACTGTTCTAAAAGGCAAGTGAGTAAGTACTATTACTACATAATTGCATCCAAACTCTGTTACCAAGAAAAGCTAATGATGTTGTCCCTCAGTTGATTCCACCCCATCAATTAGCAAAACACACGAGCCTATGGCACACTACATTAACTTTCTTTA--------------TCATACACCCCCACACCAAAAAGTTCAAGGTCAAAAAAGACTATAGCACATCTACCAGGCCGA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr0	115250	52	+	130230	CTAGGTTTAGCTACAGTGAACGTTGAAGAATGAGAAGGTTGAACAGGTCAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	120709	52	+	636262	CTAGGTTTAGCTACAGTGAACGTTGAAGAATGAGAAGGTTGAACAGGTCAGT

a
s	mr.mrrefChr0	115302	75	+	130230	GACTAGAAACTGACATTTCTTTCCACTAAAGAGGGAGGGACAGGATGGTTCTAACATACTGGCCATAGCTGAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	120762	75	+	636262	GACTAGAAACTGACATTTCTTTCCACTAAAGAGGGAGGGACAGGATGGTTCTAACATACTGGCCATAGCTGAGTT

a
s	mr.mrrefChr0	115377	41	+	130230	ATTGTTTAGGAAGCAAAATGGTGAGTGAGTGATGTTTTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	120849	41	+	636262	ATTGTTTAGGAAGCAAAATGGTGGGTGAGTGATGATTTATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	113283	41	+	647215	ATTGTCTAGGAATCAAAATGGAGAGTGAGTGATGTTTTAGA

a
s	mr.mrrefChr0	115418	15	+	130230	AAATACCTGCCCCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	120893	15	+	636262	AAACACCTGCCCCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	113324	15	+	647215	AAATACCTGGCCAGC

a
s	mr.mrrefChr0	115433	164	+	130230	ACAATGGTATTAACCCTTAACCGTGACACAATTTTATTTGTATGCAGCAGGTCCAGCAAAGGCCTACAACAGTACTTTTATTGGTTTTAGCTCATATCTGTGGGTGGCAACCCCATTGTAAAGGCAATGTGTGGATCCTCTACTTACACTGCACCTGACCATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	120908	157	+	636262	AAAATGGTATTAACCCT-------GACACAATTTTACTTGTATGCAGCAGGTCCAGCAAAGGCCTACAACAGTACTTTTATTGGTTTTAGCTCATATCTGTGGGTGGCAACCACATTGTAAAGGCGATGTGTGGATCCTCTACTTACACTGCACCTGACCATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	113344	163	+	647215	ACAATCTTACTAACCCTTAACCGTGGCACAATTTTATTTGTATGCAGCAGGTCCAGCAAAGGCTTATAACAATACTTTCATTGGTTTTGGCTAATATGTGTGGGTG-CAGACCCATAGTAAAGGCAGTGTGTGAATCCTCTACTTATACTGCACCTGACTATGG

a
s	mr.mrrefChr0	115597	355	+	130230	GAGAGAAAAATATTAGTGTCTGGGAATTCTTAAGTAAGATGTAGCTCTTGCTTATTCCTTTAGGACACGGCACTAATGGGTGAGACCATAGTATTAATCTTTCTGCATGATATGAAGAATGCCAAGACTTGTTATTTTTCTTAAAACTTAAGAAATCCTCCTACAGATGTGAGGTTTGTCAAACATAGCTAGGCAGTATCAAAACATCAAAAACTTCCATGTACCATTCTTAATCCTTAATCATGTCAGCGCAGTTCCCTACTTTTCACAGTTTATGTAATTGATTGTGATCTTCACAATACATTATAAGTGTTTGGATCTTTTGAGTCTTGATATGATGAGTTACCACCTTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	121065	338	+	636262	GAGAGAAAAATATTTGTGTCTGGGAATTCTTAATTAAGATGTAGCTCTTGCTTATCTCTTTAGGACACG--ATTAATGGGTGATACCATAGTTTTAATCTTTCTGCATGATATGAAGAATGCCAAGATTTGTTATTTTTCTTATAACTTAAGAAATCCTCCTATAGATGTGGGGTATGTCAAACATAGCTAGGCAACATCAAAACATCAAAAAGTTCCATGTACCATTCTTAATCCTTAATCATGTCAGCGCGGTTCCCTACTTTCCACAG---------------GTGATCTTCACAATACAGTATAGGTGTTTGGATCTTTTGAGTCTTGATATGATGAGTTACCACCTTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	113510	348	+	647215	GAGAGAAAGATATTAGTGTCTGGGAAGTCTTAAGAAAGATGTAGCTCCTGCTTATTCCTTTAGGACACGGCACTAATGGGTGAGACCATAGTATTAATCTATTTGCATAATATGAGGAATGCCAAGACTTGTTATTTTTCCTAAAACTTAAGAAACCCTCCTACAGGTGTGAGGTTCGTCAAACATAGCTGGGCAGTATCAAAA-------AACTCATGTATACCATTCTTAATCCTTAATCACGTCAGCGCAGTTTCCTACTTTTCACAGTTTATGTAATTGATTGTGGTCCTCACAACTCATTATAAGTATTTGGATCTTTTGAGTCCTGATATGATGAATTACTGTCTTGAA

a
s	mr.mrrefChr0	115952	81	+	130230	TCCAGGAGGAATCCCTCGAAGTACAGTGACAACTTCTCAACAGGATGTGTACAGCCAGCATAGCATATAAAAGCTTGATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	121403	81	+	636262	TCCAGGAGGAATCCCTTGCAGCATAGTGACAACTTCTCAACATGATGTGTACAGCCAGCATAGCATATAAAAGCTTGATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	113859	81	+	647215	TCTATGAGGGATCCCTCAAGGTGCAGTGACAACTTCTCAACAGGGTGGGTACAGCCATCATAGAGTATAAAACCTTGATAT

a
s	mr.mrrefChr0	116033	19	+	130230	AACATGGCTTAATTATATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	121487	19	+	636262	AACATGGCTTAATTATATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	113940	19	+	647215	CACATGGCTTAGTTATATT

a
s	mr.mrrefChr0	116052	71	+	130230	TATTACCACAGCACTTCATCCATTTAATGACCTGGAGCTACCTTTGGCGTTCCAACCCTGAATAGCACATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	121506	71	+	636262	TATTACCACAGCACTTCATCCATTTAATGACCTGGAGCTACCTTTGGCGTTCCAACCCTGAATAGCACATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	113962	71	+	647215	TATGAACATGGCGCTTCATCGATCTAATAACCTGGAGGTAGCTTTGGTGTTTCAACCCTGAATAGCACGTT

a
s	mr.mrrefChr0	116123	16	+	130230	CATATTATTTCCTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	121579	16	+	636262	CATATTATTTCCTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	114033	16	+	647215	CATCTTATTTCTTGTC

a
s	mr.mrrefChr0	116139	38	+	130230	CTAGGTCTTATCATCCGTTAACACAGACAGTTGTATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	121615	38	+	636262	CTAGGTCTTATCATCCGTTAACACAGACAGTTGTATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	114049	38	+	647215	CTAGGTCTTGTCATCAGTTAAGACAGGGAGTTGTATGG

a
s	mr.mrrefChr0	116177	60	+	130230	TGAGCCTCCAGGAGATCTGCAGTATTTACGCATAACAATGTATAGACATGCTGCTATTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	121653	60	+	636262	TGAGCCTCCAGGAGATCTGCAGTATTTACGCATAACAATGTATAGACATGCTGCTATTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	114093	60	+	647215	GGAGCCTCCAGGAGACCTGCAGTATTTTCACATAGCAATGTGTAGACATGCTGCTATTGA

a
s	mr.mrrefChr0	116237	24	+	130230	CTGTCTGGCTCAGGTATGATGGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	121713	24	+	636262	CTGTCTGGCTCAGGTATGATGGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	114154	24	+	647215	CTGTCTGGCTCAGGTATGGTGGTT

a
s	mr.mrrefChr0	116261	93	+	130230	TCTAAGATTCATACTTGGTTCGGGCCTATTAGTTATTTGTGCACTTTGGCATGCTGCTCTGTGTGTTGACTATATCATAAGACATTATACCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	121737	93	+	636262	TCTAAGATTCATACTTGGTTCGGGCCTATTAGTTATTTGTGCACTTTGGCATGCTGCTCTGTGTGTTGACTATATCATAAGACATTATACCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	114181	93	+	647215	TTTAAGATTCATACTTGGTTTGAGCCTATTAGTTATTAGTGCACTTGGGCAGGCTGCTCTGTGTGTTGACTACATGATTAGTGATTATGCCAA

a
s	mr.mrrefChr0	116354	138	+	130230	AAAGGATAGCCTCTGTTGTGCTTCTTTGTCACTATCTCATCCTAACTGTGTGAAAGTAATTGTTAGAGATCACCTAGGCATACATATAAGTCTTCGCACCTGTTTCATTCTCTTGGTGATCCCAATGAGCAAAGGTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	121834	138	+	636262	AAAGGATAGCCTCTGTTGTGCTTCTTTGTCACTATCTCATCCTAACTGTGTGAAAGTAATTGTTAGAGATCACCTAGGCATACATATAAGTCTTCGCACCTGTTTCATTCTCTTGGTGATCCCAATGAGCAAAGGTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	114274	138	+	647215	AAAAAATAGCCTCTTTTGTGCTTTGTTGGCATTATTTCATCCTGACTGTGCAAGAGTAGTACTTAGAAATCATGTAGACATACATATAAGTCTTCTGAACTGTTTCACCCTCTTGGTGACCCCGATGAGCAAAGGTTG

a
s	mr.mrrefChr0	116492	133	+	130230	CTACAAAGTGCCACTCTACATATTGATAAGAGACTCCATTAATTCTTCCTGAGGTTTCCATTGATGACAAGGATGATTGTTTTTCTCTTTTATTTTTGACTTGATCATTGGGAACAATAATGGCCTTATTTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	121975	133	+	636262	CTACAAAGTGCCACTCTACATATTGATAAGAGACTCCATTAATTCTTCCTGAGGTTTCCATTGATGACAAGGATGATTGTTTTTCTCTTTTATTTTTGACTTGATCATTGGGAACAATAATGGCCTTATTTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	114412	133	+	647215	CAACTAAGTGCCACTCTGCAGATTGATAACAGACCCCATTAAACCTTCCTGAGGTTTCCATTGATGTCAAGAGTGATTTTTTTCCTCTTTTATATTTGATGTCTTTAGCTTAGTTGTCCTTGGGCTTAGTTAC

a
s	mr.mrrefChr0	116625	452	+	130230	ACCTGGTCATTGGGAACAATAATGGCCTTACTTGAAAAATATTTAAGGGGCTATCAAGTTCTACAAGTTGACCCATATCAGCCCAATATGCTGCACATCGCATAAGTTATTTACAGTATGTGATTATCTTGCCAATAGGCAGCAAAATCCCCGGGTTCTTTGGTTTAGACACATCAGCAACTTGGGATGAGGTTGAACATGAGCTGTAAAGGAAGTGAGATACTTGGCCCATCGAAGATTTGTGCTTTTAATGCACAATAAAGCATTGCTCCAAGTAGTTCAAGAATGGCTATTTTATCCTATAGATTTTATTGGAACTCCTGCATTAAACTTAACGAAACCAGATGTGCTAACCATGATAATGATATGTAAGGTTGGTGGGTTCCGTCATGACTGTAAGTGCGTATCAAACACTGATGGCTTTTGCAAAGATTAGGATTCGCAATCTGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	122108	438	+	636262	ACTTGATCATTGGGAACAATAATGGCCTTATTT-AAAAATATTTCAGGGGCTATCAAGTTCTACAAATTGACCCATATTAGCCCAATATGCTGCACATCATGTAAGTTATTTCCAGTAGGCGATTATGTTGCCAATAGGCAGCAAAATCACCGGGTTCTTTGGTTTAGACACAT--------TGGGATGAGGTTGAACATCAGCCGTAAAGGAAGTGAGCTACTTGGCCCATCGAAGAATTGTGCTTTTAATGCACAATAAAGCAT-GCTCCAAGTAGTTCAAGAATGGCTATTTTATCCTATAGATTTTATTGGAGCTCCTGCATTAAGCTTAACAAAACCAGATGTGCCAACCATGATAATGATATGTAAGGTTGGTGGGTACCGT----ACTGTAAGTGCGTATCAAACACTGATGGCTTTTGCAAAGATTAGGATTCGCAATCTGTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	114550	452	+	647215	ACCTGGTCATTGGGAACAATAATGGCCTGACTTGAAAAACACTTAAGGGGCTGTCAAATTCTACAAGTTGACCCATATCAGCCCAATATGCTTCAACTTGCATAAGTTATTTACAGTATGTGATTATCTCTCCAGTAGGCAGCTAAACCCCCAGGTTCTTTTGTTTAGACACATCAGCAACTTGGGATGAAGTTGAACATGAGCTGTGCAGGAAGTGAGATACTTGGCCCATTGAATATTTGTGCTTTTAATGCACAATAAAGCATTGGTCCAAGTAGTTCAGTAATGGCTATTTTTTCCTATAGATTTTATTTGAACTCCTGCATTACACTTTATGAAACCAGATGTGCTAACCAGGATAATGATATGTAAGATTGGTAGGTTCTGTCATGACTGTAAGTGTATATCAAACACTGATGGCTTATGCAAAGATTAGGATTCGCAATCTGTCA

a
s	mr.mrrefChr0	117077	210	+	130230	TCCTGGAACCTAGGAAAGTGGCACACCCTGCTAAACTATTGTGTTGTGCCTTTTACCATGAACATATAGATAGCAAAAATGAGCCCCCTTCTTGAAAACCCCATAAGCCAACTGGCATTCATTAGACGACCATCTTATCTTATAGGTTGGGCCTTTTGTGTTGCTGGGACATAAGCTTCAGACTCCTGCTATGCTTGTATTATAAAGAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	122546	209	+	636262	TCCTGGAACCTAGGAAAGTGGCACACCCTGCTAAACTATTGTGTTGTGCCTTTTACCATGACCATATAGATAGTAAAATCGAACCCCCTTCTTGAAAACCCCATAAGCCAACTGGCATTCATTAGACGACCATCTTATCTTATAGGTTGGGCCTTTTGTGTC-GTGGGACATAAGCTTCAGACTCCTCCTATGCTTGTATTATAAAGAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	115006	209	+	647215	TCCTGGAAC-TAGGAAAGTGGGACACCCTGCTAAACTATTGTGTTGTGCCTTTTACCACGAACATATATATAGCAAAAATGAGCCCCCTTCTTGGAAACCCCATAAGGCAACTGGCATTCATTGGACAACCATCTTGTCTTACAGGTTGGGCCTTTTGTGTTGCTTGGATGTAAGCTTCAGTCTGCTGCTATTCTTGTGTTATAAAGAGA

a
s	mr.mrrefChr0	117287	82	+	130230	TCTTCTTTTCAGCATTTAGAGGTAAAACATTGTGCTCACAAAGGCTATACCATTGATGAATGATTTAGTCCCACGTAGAGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	122755	82	+	636262	TCTTCTTTTCAGCATTTAGAGGTAAAACATTGTGCTAACAAAGGCAATACCATTGATGAATGTTTTAGTCCCCTGTAGATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	115251	81	+	647215	TCTTCCTTTCAGCATTTAGTGGTAAA-CATTGTGCCCACGAAGGCTATATCATTGATGAACGATTTAGTCCCACGTAGAGGC

a
s	mr.mrrefChr0	117369	38	+	130230	TACACAATTGTGGCGTCCTTATTGAGAGTTTGATCAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	122841	38	+	636262	TACACAATTGTGGTGTCCTTATTGAAAGTTTGATCAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	115332	38	+	647215	TACACAATTGTGGCATCCTGATTGAGAGTTTGATCAAG

a
s	mr.mrrefChr0	117407	219	+	130230	AAAATTTTGATCAAGATGTGAGTGCAAAGCACTCACTATGAGTTTTTAACTGACACAACTTGGGTGGAGCTTTTAAATACTACTCAAAAGATTTTAACTCTAACTCATGTGTTCCTTTGCACCAGGTGGAACTATTGAATACTAACTATAAGCTCTAACTCATTTGTTCCTTTGAGCCTTTCAGCTTTAGTTAGAGTTTCACAGTTTGTGAATAGCTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	122880	219	+	636262	AAAATTTTGATCAAGATGTGAGTGCAAAGCACTCACTATGGGTTTTTAACTGACGCAACTTGGGTTGAGCTATTAAATACTACTCAAAAGATTTTAACTCTAACTCATGTGTTCCTTTGCACCAGGTGGAACTGTTGAATACTAACTATAAGCTTTAACTAATTTGTTCCTTTGAGCCTTTCAGCTTTTGTTAGAGTTTCACAGTTTGTGAATAGAGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	115370	218	+	647215	AAAATTTTGATCAAGATGTGAGTGTAAATCATT-GCTATGAGTTCTTAACTGACACAACTCGGGTGGAGCTTTCCAATACTAATTAAAGGATTTTAACTCTAACTCATTTGTTCCTTTGCACCAGGTGGAACTATTGAATACCAATTAAAAGCTCTAACTCATATGTTCTTTTTAGTCTTTCAGCTTTAGTTAGAGTTTCACAGTTTGTGAATAGCTCC

a
s	mr.mrrefChr0	117626	170	+	130230	AATAATTAGCAGTCATTATTTGCTTGTATTGCTATGATAAGCAACCATAGCTGAGCTATGACTGTGTTGCTGTGAAGTACTAGATAAAGGACTCTGCTTATTAGCATGGTCCAGGTTACTATCCGACTTCAAGTGCCCCCAATGTCCTTAGCTCATATGACCAACAGATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	123101	170	+	636262	AATGATTAGCAGTCATTATTTGCTCGTATTGCTATGATAAGCAACCATAGTTGAGCTATGACTGTGTTGCTGTGAAGTACTAGATAAAGGACTCTGCTTATTAGCATGGTCCAGGTTGCTATCCGACTTCAAGTGGCCCCAATGTCCTTAGCTCATATGACCAACAGATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	115588	170	+	647215	AATAACTAGCAGTCATTATTTTCTTGTATCGCGATGATAAGCAACCATAGCTGAGCTATGACTGTGTTGCTGCGAAGTACTAGATAAAGGTCTCTGCTTACTAGCATCGTCCAAGCTATTATCTGACTTCAAGTGCTCCCAATGTCCCCAGCTCATATAACCAACAGATC

a
s	mr.mrrefChr0	117796	281	+	130230	TAAGATACATCATTCTAGGTAGATTAGATTTGGTCAGCTGGTATAGCACTACATGATTTATAAATTTGGCAACAATTATAAATTTAGGCACAATAGTGTGGAGGTTATCATGACTTTGGTATTTCTAAATAAAGAGACTAGGCCTAATTTTTTAAATGCATGCAACTGCACAGCTTCAGTCTCTCTCCACCTTCCACACATGTAAACAGGGTAATTCAGCATATTTTTGGTTGACGGTGCTCCCCCCAAAGAATCCACTGTAAAAACAAACTCTCATGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	123272	256	+	636262	TAAGATACATCATTCTAGGTAGCTCAGATTTGGTCAGCTGGTATGGCACTATATTATTTATAAATTTGGCAACAATTATAAATTTAGGCACAATAGTGTTGAGGTTATCAGGACTTTGGTATTTCTAAATAAAGAGACTAGCCCTAATTTTTTAATTGCATGCAACTACACAGCTTCAGTCTCTCTCCACCTTCCACACATGGCCACAGGGTAATTCAGCACATTTTTA-------------------------CCACTGCAAAAACAGACTCTCATGCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	115758	281	+	647215	TAAGATACATCATTCTAGGTAGATTAGATTTAGTCAGCTGGTATAGCACTACATGATTCATAAGTTGGGCAGCAATTGTAAATTTAGGCACAATAGTGTGGAGGTTATCATGACTCTGGTATTTCTAGGTAAAGAGACTAGGGCCAATTTTTTGAATCCACGCAACTGCACAGCTTCAGTCTCTCTGCACCTTCCACACATGTAAGCAGGGTAATTCAGCATATTTTCGGTTGACGGTGCTCCCCCCAAAGAATCCACTGTAAAAACAAACTCTCATCCTT

a
s	mr.mrrefChr0	118077	20	+	130230	ACCAGACTATGATTTTAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	123547	20	+	636262	ATCAGACTATGATCTTAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	116039	20	+	647215	ACCAAACAATGATTTTAATT

a
s	mr.mrrefChr0	118097	23	+	130230	AATGCAACATCAAAAATACAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	123567	23	+	636262	AATGCAACATCAAAAATACAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	116060	23	+	647215	AATGCAACATCAAATATACAATT

a
s	mr.mrrefChr0	118120	123	+	130230	CATCAAAAGACATATATATTGATGTTTCAACCTCCCATAAGCTCATATGTGTTCATACTGGATTCAAGAACATGACAAGACAGATTTTTATGCAGTTTTCAAAGGTGATTAATCCAATTCTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	123592	123	+	636262	CATCAAAAGACATATATTTTGATGTCTTAACCTCCCATAAGCTCATAAGTGTTCCTACTGGATTTAAGGACATGACAAGACAGATTTTTATGCAGTTTTCAAAGGTGATTAATCCAATTTTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	116083	123	+	647215	CACCAAAAAACATATATATTGATGTTTCAACCTCCCATAAGCTCATATGTGTTTATACTGGATTCAAGAACATGACATGACAGGTTTTTATGTAGTTTTCAAAGGTGATTGACCCAATTCTCT

a
s	mr.mrrefChr0	118243	161	+	130230	TTTCACATGAAATTTGCTTTGTAATTGTTAATATGAATTTTATACTCTATTCTATGACATGCTTTCACACGTCAGGGATTGCTGTAAACTGCTGTTCACATGGGGTAAGCTATTGTCTGATGTCTTGATGGCAGTATGAAATATGATTAAAAAATTTGGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	123716	161	+	636262	TTTCACATGAAATTTGCTTTGTAATTGTTAATATGAATTTTATACTCTATTCTATGACATGCTTTCACACGTCAGGGATTGCTGTAAACTGCTGTTCACATGGGGTAAGCTATTGTCTGATGTCTTGATGGCAGTATGAAATATGATTAAAAAATTTGGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	116206	65	+	647215	CTCCACATGAAATTTGCTTTGTAATCATTAATGTGATCTTTATACTCTATTACATGACAGGCTTT------------------------------------------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr0	118404	92	+	130230	AACAAACATAACTGCTTAACTTGCAACAAATGAGGATGCATGGCTTGTTTCTGTATTTGAGGGTTATACTGAGCCGAGTACACTCACCTGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	123906	92	+	636262	AACAAACATAACTGCTTAACTTGCAACAAATGAGGATGCATGGCTTGTTTCTGTATTTGAGGGTTATACTGAGCCGAGTACACTCACCTGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	116271	92	+	647215	GTCAGACTTAGCTGCTTAACTTGTGACAGATGTGGATGCTTGGCTCGTTTCTGTATCAGAGGGCTAGGCTGAGCCGAGTACACTCACCTGAC

a
s	mr.mrrefChr0	118496	502	+	130230	TCAATAGTCCCTGCCCTAACCCACTCATTTATCGTTATATTTTTTTTCACATTTGTATTGCTCCCAGTCACACAGGGGGCATCTTTCAAACTAAAGTCTATGTCTGTGCTATTTGGCTAGGACGCGCCGTTGACTTCCACATAAACCTCAACTGCAAGCTGACACATAACGGATTTTCACTTTGGGCTTTAGAAAATACAGCAACTCAGTTCCAATAACTCTGTACCTCAAGTTAATTTCAATGAGGGCCTTTTGGGTGGTAGTAGGGTAAAATAGACATTTAGCTAAAGCTTCTTTTAAGGTACAACAGCATAATATATTGTCATTATATGTAAAAGCTCATTGCTGTTTTGGAAAATGGTGAACAAGCAGGTAAGTGCTCAGCAAGGTGGCACAATCACATTCTGACTTAACCTACTTATTTGACTTGCATTCACTGTGGCAGGATCAATTCTGGTAAATTGTCAGTGATGGCTATAAACTTCAAATTAGGATTGTCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	123998	491	+	636262	TCGATTGTCCCTGCCCTAACCCACTCATTTATTGTTATATTTTTTTTCACATTTGT--TGCTTCCAGTCACACAGGGGGCATCTTTCAAACTAAAGTCTATGTCTGTGTTATTCGGTTAGGATGCGTTGTTGACTTCCACATAAACCTCAACTGCAAGCTGACACATAACGGATTT-CACTTTGGGCTTTAGAAAATACAGCAACTCAGTTCCCATAGCTCTGTACCTCAAGTTAATTTCAATGAGGGCCTTTTGGGTGGTAGTAGGGTAAAATAGACATTTAGCTAAAGCTTCTTTTAAGGTACAACAGCATAAAATATTGTCATTATATGTAAAAGCTCATT--------GGAAAATGGTGAACAAGCAGGTAAGTGCTCAGTCAGGTGGCACAATCACATTCTGACTTAACCTATTTATTTGACTTGTGTTCATTGTGGTAGGATCAATTCTGGTAAATTGTCAGTGATGGCTATAAACTTCAAATGAGGATTGTCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	116365	482	+	647215	TCAATAGTCCCTGCCCTAACTTTCTCACTTATCGTTATTTTTTTTTTCACATTTGTATTGCTCCCAGTCACACAGGTGGCATCTTTCAAACTAAAGTCTACGTTTGTGCTATTTGGCTCGTACGCACCATTGGCCTCCACATAAA--------------------ACAATGGATTTTCACTTTGGGCTTTGGAAAATACAGCAACTCAGTTACAATAACTCCGTACCTTAAGTTAATTCCAATGAGGGCCTTTTGGTTGGTAGTAGGGAACAATAGATATTTAGCTAAAGCTTCTTTTAGGGTACAACAGCATAATAAATTGCCATTATATGTAAAAGCTCATTGCTGTTTTGGAAAGTGGTGAACAAGCTGGTAAGTGCCAGGCAGGGTGGTACATGCACATTCTGACTAAACCTACTTATTTGACATGCATGCACTATGGCAGGAGTGGTTCTGGTAAATTGTCGATGATGGCTATAAACTTCAAATTAGGATTGTCACT

a
s	mr.mrrefChr0	118998	19	+	130230	GGGATCTTTATTCAATGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	124489	19	+	636262	GGGATCTTTATCCAATGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	116848	19	+	647215	GGGATCTTTATTCAGTGAT

a
s	mr.mrrefChr0	119017	71	+	130230	CTGAGTGTGACAGCACAATCCACACAATGCTAGCTAAATGCGCATGACAGCTTGATCTCGGTTGTTCAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	124509	71	+	636262	CTGAGTGTGACAGCACAATCCACACAATGCTAGCTAAATGTGCATGACAGCTCAATCTTGGTTGTTCAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	116867	71	+	647215	CTGAATGTGACAGCACAAGACACATAATGCTAGATAAATGCACATGACACCTTGATGTCGGTTGTCacact

a
s	mr.mrrefChr0	119088	411	+	130230	GTCCGAGACCACGGTAAGGCCAGGCCTATGGACCAAGGAACATTGATCTAAATTGGACTATGAGCACAAGTCAAGCTTTTTTGGGTTAAGGTCACCCTTAAAGGATTGTATGCATTAATATCCAGAGGCCAATGGCAGTGTACGGATTAAAATCAGGATGGTTTGTAATTTTATTGCACTAACATGCAGAGGCCAATGGCAGTATTTTGGCTTATATCCAGATGATTCGCTTAGAGAGTTATCAGTTACAGGCCATTATTTGGATGGCCTGTGTAGTGAGAGAGCCACTTGATAACTGAATTATGCAGTTAGAATAGCACCAACCTCGAGTAAATTTGGAGGCTAGCCAAACCCCCCCCACCCCTGACTCAACCTCAGGTATAATCATACCAATACCAGCCATATTAGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	118690	411	+	647215	GTCCGAGACCACGGTAAGGCCAGGCCTATGGACCAAGGAACATTGATCTAAATTGGACTATGAGCACAAGTCAAGCTTTTTTGGGTTAAGGTCACCCTTAAAGGATTGTATGCATTAATATCCAGAGGCCAATGGCAGTGTACGGATTAAAATCAGGATGGTTTGTAATTTTATTGCACTAACATGCAGAGGCCAATGGCAGTATTTTGGCTTATATCCAGATGATTCGCTTAGAGAGTTATCAGTTACAGGCCATTATTTGGATGGCCTGTGTAGTGAGAGAGCCACTTGATAACTGAATTATGCAGTTAGAATAGCACCAACCTCGAGTAAATTTGGAGGCTAGCCAAACCCCCCCCACCCCTGACTCAACCTCAGGTATAATCATACCAATACCAGCCATATTAGATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	119121	411	+	647215	GTCCGAGACCACGGTAAGGCCAGGCCTATGGACCAAGGAACATTGATCTAAATTGGACTATGAGCACAAGTCAAGCTTTTTTGGGTTAAGGTCACCCTTAAAGGATTGTATGCATTAATATCCAGAGGCCAATGGCAGTGTACGGATTAAAATCAGGATGGTTTGTAATTTTATTGCACTAACATGCAGAGGCCAATGGCAGTATTTTGGCTTATATCCAGATGATTCGCTTAGAGAGTTATCAGTTACAGGCCATTATTTGGATGGCCTGTGTAGTGAGAGAGCCACTTGATAACTGAATTATGCAGTTAGAATAGCACCAACCTCGAGTAAATTTGGAGGCTAGCCAAACCCCCCCCACCCCTGACTCAACCTCAGGTATAATCATACCAATACCAGCCATATTAGACT

a
s	mr.mrrefChr0	119499	20	+	130230	GTGGAGGAAAGCAGGGGCCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	119101	20	+	647215	GTGCAAGAAAACAGGGGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	119538	20	+	647215	GTGGAGAGAGGCACGAGCCG

a
s	mr.mrrefChr0	119519	55	+	130230	CAGGAATCATGGACCAGGGGGTGTAACTTGTTCTGCAGATAAAAGAACAATCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	124580	55	+	636262	CAGGAATCATGGACCAGAGGGTGTAGCTTGTTCTGCAGATAAAGGAACAATCATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	123093	55	+	647215	caggaatcattgaCCAGGGAGAGTTACTTGTTTTGCAGATGAAAGAACAATATTG

a
s	mr.mrrefChr0	119574	20	+	130230	AGTGGAGGAATTAACAGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	124636	20	+	636262	AGTGGAGGAATTAACAGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	123148	20	+	647215	GGCGGAGGAATGAACAGAAT

a
s	mr.mrrefChr0	119594	250	+	130230	AAACAAGCCCCAAAATAACACCTGAGCAGCTATTGTGAGACCTATGTCAGATTGTGACTGATGCAATGTTTGATCAGCAGAACAATAGCAGGGAGCCGAGAAGTGTATGAATGTATGGTGATGAGCCCGAAGTGTTCTGGGTTTTCAGTATAGCACCATTGCCCTGCTCAAGAGGGTTCAGTATTGTTGCCCAATGTTGCGATGTGATCCTCTTAGAAGGAAATGCAAATAGCTGGTAGACATCAGCAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	124663	250	+	636262	AAACAAGACCCAAAATAACACCTAAGCAGCTATTGTGAGACCCATGTCAGATTTTGACTGATGCAATGTTTGATCAGCAGAACAATAGCAGGGAGCTGAGAAGTGTATGAATGCAGGGTGATGAGCCCGAATTGTTCTGGGTTTTCAGTATAGCACCATTGCCCTGCTCAAGAGGGTTTAGTATTGTTGCCCAATGTTGTGGTGTGATCCTCTTAGAAGGAAAAGCAAATAGCCGGTAGACATTATCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	123168	245	+	647215	AAACGAGCCCCAAAATAACGACTGAGCAGCTATTGTGAGACCTGTGTCAGATTGTGACTGATGCAATGTTTGATCAGCAGAACAATAGCG-----CCGAGAAATTTATGAATGTATGGTCATGAGCCTGAAGTGTTCCGGGTTTTCAGTATAGCACCACTGCCCTGCTCAAGAGGGTTCAGTATTGTTGCCCAATGTTGCGATGTGAGCCTCTTAGAAGGAAATGCAAATAGCTGGTAACCATCAGCGGT

a
s	mr.mrrefChr0	119844	175	+	130230	GTGGCAATAGTGAGGATGGTCCTCATATACGATGTTTGCTACAAACTTAGCATCCTGGGATGTTGATTCATAGGAAGGTCCAGACAGGGATGCCACCCCATAAGAAGCATGCTTTATATCATATCTTACTGAGATGTAACTTAATGCAAAGTGTGAGTTTGTACTGATCTACTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	124914	172	+	636262	GTCGCAATAGTGAGGATGAGCCTCATATACGATGTTTACTACAAACTTACCATACTGGGATGCTGATGG---GGAAGTTCCAGACAGGGATGCCACCCCATATGAAGTATGCTTTATATCCTGCCTTACTAAGGTGTGACTTAATGCAAAGTCTAAGTTTGTACTAATCTACTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	123413	174	+	647215	GTGGCAATTGTGAGGATGGTCCTCATATAGGATGTTTGCTACACGCTTAGCTTCCTGGGATGTTGGTTCATAGGGAGGTCCACACAGGGATGCCACCCCATAAGAAGCAT-CTTTATGTCACATCTCACTGAGATGTAACTTAATCCAAAGTGTGAGTTTGTACTGATCTATCCA

a
s	mr.mrrefChr0	120019	235	+	130230	ACGAGAAGGCTCGTAAATATCATGACCAGAATTGGATGTGTTCATTAAGGCCAGCGCAAAGCAGTTCAAGTGAATAAAGCCACCCTACCCTTAACCTCTCATAAGCACCTAACCTATGGTGGGAGGCTGATTGGACTCCACTAACTGTAGGATGCACAGTTCTATGGTAACTGTTCTCTTTTTTCAACAACATTTTATGTCTAGACTGCTAGGGCCTAGCAAGCTAAGTAGCAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	125086	231	+	636262	ACGAGAGGGCTCGTAAATATCATGACCAGAATTGGATGTGTTCATTAAGGCCAGCGCAAACCTGTTCAAGTGAATAAAGCCACCCTACCCTTTACCTCTCTAAAGCACCTAACCTATGATGGGAGGCTGAT-GGACTCCACTAACTGTAGGATGCACAGTTCTACGGTAACTGTTCTCTTCTTTCAACACTATTTTATGTCTAGA---CTAGGGCCTAGCAAGCTAAGTAACAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	123588	222	+	647215	ACGAGGAGCCTCATAAATATCATGACCAGAATTGGATTTGTTCGTTGAGGTCAGTGCAAAGCAGTCCCAGTGCATAAAGCCGCCCTACCCATAACCACTCATAAGCACCTAACCTATGGTGGAAGGCTGATTGGACTCCACTA-------------CAGTTCTATGATAATCGTTCTTTTTTTTCAACAACTTTTTATGTCTAGACTGCTAGGGCCTAGTAAGTTAAGTAGCAAT

a
s	mr.mrrefChr0	120254	123	+	130230	TACCACCACTTCAGCCCTCAACTGATGCTAACATATCATGTGATGGATTACTCTGGGACTTCAACTTATTGTGTTATTGGGCAATGCTATGTGTGGTTTACCTTTACCAACCGCTTGAGCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	125317	123	+	636262	TACCACCACTTCAGCCCTCAACTGATGCTAACATATCATGTGATGGATTACTCTGGGACTTCAACTTATTGTGTTATTGGGCAATGCTATGTGTGGTTTACCTTTACCAACCGCTTGAGCACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	123812	123	+	647215	TACCACCACTTCAGCCCTTAACCAACGCCAACATATCATGTGATGGATTACTCTTCAACTTCAACTTTTTACATCATTGGGCAAGGCTATGTGCGGTTTACCTTTACCAACCACTCGCTCATT

a
s	mr.mrrefChr0	120377	43	+	130230	TCAAACACCCCTATTACTACTTAATAGCATTAGGAATTATAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	125442	43	+	636262	TCAAACACCACTAGTACTACTTAATAGCATTAGGAATTATAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	123935	43	+	647215	TCAAACACCCCTATTACTACTTAGTAGCATTAGGAATTATAAC

a
s	mr.mrrefChr0	120420	125	+	130230	ATAAATTATTAATCCCCAATCAAACCACTCCCTCACTTCTCAAACACCCCAATTATTGGATAATATAGGCATAAGGAATTATAACTGACACTGATGAATTATTAATTGACAATTGAATCAGTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	125493	122	+	636262	ATAAATTATTAATCCCCAATCAAACTACTCCCTCACTTCTCAAACACCCCAATTACTG---CATATAAGCATAAGGAATTATAACTGACACTGATGAATTATTAATTGACAATTAAATCAGTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	123978	113	+	647215	ATAAATTATTAATCCCCAATCGAACC------------CTAAAACACCCCTATCATTAGATAATATAGGCATAAGGAGCTATAACAGACCCTGATGAATTATTAATTGACAATTGAATCACTGAA

a
s	mr.mrrefChr0	120545	332	+	130230	CTTTTCCATACATTCAGCATTTTTTCTTTTGTAAAACCTGCGCCTTTAGATCATATTCTAAGTAAGGGTAAGAATAGATTCACTTCCTTGTGGCATTCTGCAGCAGTATACACTATTGTCTGTCTCAGATAACAATCAAATAGTTAGCAGCCAGTTAAAGACAAATGACATATCTTAAGAAGAAGGTACTCTCCAAACTGACTGGCAAATATACCTCAAACTACTCACTAACCTAAAATATGCAAGTTCCCCAATGGGCTGACCACGAATTGAAGTTAACTAACAGATGTTACTCATTTTTTATCATTCAACTCTCACAAGGGTCATGTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	125616	331	+	636262	CTTTTTCATACATTCAGCATTTTTTCTTTTATAAAACCTGCGCCTTTGGATCATATTCTAAGTAAGGGTAAGAATAGATTCACTTCCTTGTGGCATTCTGCAGCAGTATACACTATTGTCTGTCTCAGATAACAATCAAATAGTTAGCAGCCAGTTAAAGACAAATGACGTATCTTAAGAAGAAGGTGCTCTCCAAACTGACAGGCAAATATACCTCAAACTACTCACTAACCTAAAATATGGAAGTTCCCC-ATGGGCTGACCACGAATTGACGATAGCAAACAGATGTTACTCATTTTTTATCATTCAACTCTCACAAGGGTCATGTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	124091	327	+	647215	CTTTTCCATACATTCAGCATTTTTTCTTTTGTAACACCTGCGCCTTTAGATCATATTCTAAGTAAGGGTATTAATGGACTCACTTCCTT-TCACATTCTGCAGTGGTAGACACTATTGTCTGTCTCAGAT-ATAATCAAATAGCAAGCAGCCAGTCAAAGACAAATGACATATCTTAAGAAGAAGGTACTCTCCAAACTTACTGGCAAATATCCCTCAAACTACTCACTAACCTAAAATGTGCAAGTTCCCCAATGGGCTGACCACAAATTGAAGTTAACTAGCAGATGTTCCTCATTTTTTATCATTCAACTCTCATAAGGG---TGTGCA

a
s	mr.mrrefChr0	120877	87	+	130230	TCTAAATACAGATACCTTAATTTCTTCCAATGAAAAAAAGTGAAAAAAGACACCACCCTATGTGGTGTCACTGCTCCTCTGGTGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	125971	87	+	636262	TCTAAATACAGATACCTTAATTTCTTCCAATGAAAAAAAGTAAAAAAAGACACCACCCTATGTGGTGTCACTGCTCCTCTGGTGTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	124418	87	+	647215	TCTAAATACAGATACCTTAATTTCCTCCAATGGAAAAAAGTGAAAAAAGACACCGCGCTACGTGGTGTCACTGCTCCTGTGGTGTAC

a
s	mr.mrrefChr0	120964	16	+	130230	ATCTGACAGGTCCAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	126063	16	+	636262	ATCTGACAGGTCCAGC
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a
s	mr.mrrefChr0	120980	47	+	130230	TACCGTTTTAACCGACAAGTATGTCAGTAGAGGCGGATTAGGGTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	126079	47	+	636262	TACCGTTTTAACCGACAAGTATGTCAGTAGAGGCGGATTAGGGTTTT
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a
s	mr.mrrefChr0	121027	53	+	130230	GTAACTCACGGATCATGCGAGGAATGATAGTATGCAACACACTATAGGAGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	126129	53	+	636262	GTAACTCACGGATCATGCGAGGAATGATAGTATGCAACACACTATAGGAGTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	124571	53	+	647215	GTACCTCACATGTCTTGCCAGGAATGATAATATGCCACACACTACAGGAGTCA

a
s	mr.mrrefChr0	121080	19	+	130230	CACAATTACCATCCCAGCA
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a
s	mr.mrrefChr0	121099	158	+	130230	GGATTCGCAGGAAACATTTATTAATAGGTAACAGGCCAGATACTTGTCTCTTGGTGACATTGTCTCTTAGTAATAACAATGTACTAACTCTCCAGCCATTCTTAAATACACCTGTAGAGAAAGAGATATGAATTAGTATATGTAAGAATCACAACCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	126218	158	+	636262	GGATTCGCAGGAGACATTTATTAATAGGTAACAGGCCATATACTTGTCTCTTGGTGACATTGTCTCTTAGTAATAACAATGTACTAACTCTCCAGCCGTTCTTGAACACACCTGTAGAGAAAGTGATATGAATTAGTATATGTAAGAGTCACAACCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	124643	151	+	647215	GGATTCGCAGGAAACATTTATTTATAGGTAACAGGCCAGATACTTGTCTCGTGGTGATATTGTCTCTTAGTTATAACAAAGTACTTATTCTCCAGCCATTCTTAAATTCACCTGTAGGGAAAGAGATC-------GTATATATAAGAATCACAATCAG

a
s	mr.mrrefChr0	121257	319	+	130230	GGTCATCCCCTTATTATAACTTCTGTCTGGGACTATACTTCTGGTTGGGACTATATAGGGCAGCTGTCTCAGGGTTGCTCATTACAAACTAACATGACATATTATGACATGAATGATATGAAGGCATGCAAAGACATTTTTTTCTTCTGTGCTCACCTAACTCTACCGAATCAGTGACAGCCTAAAGCTTAATAATGTTACTCACCTCCCAATTTGATCGTCCTAAGAATGCTACCCGGGTGTGACTAGCTGAGCCACTCTGTGCAATGACCTGGTCAAACAGTTAATGAAATATTCTAGCTCAAAGCTCAACTTAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	126376	303	+	636262	GGTCATCCCCTTGTTATAACTTCTGTCTGGGACTATACTTCCGGTTGGGACTATATAGGGCAGCTGACTCAGGGTTGCTCAGTACAAACTAACATGACATATTATGACATGAATGATATAAAGGCATGCAAAGACATATTTTTCTTCTGTGCTCACCTTACTCTACCGAATCAGTGACAGCCT--------------TTACCCACCTCCCATTTTGATTGTCCTAAGAATGGTACCCGGGTGTGACTAGCTGAGCCACTCTGTGCAATGAACTGGTCAAACACTTAATGAAATATTCTATCTCAAAGCTCAACTTAA--
s	simRat_chr6.simRat.chr6	124795	319	+	647215	AGAGTTCCCCTTATTATAACTTCTGTTTGGGACCATACTCCTGGTTGGGACTATATAGGGCGGATGTTTCAGGGTTGCTCATTACAATCTAACATAACATATTATGGCATGAATGATATGAAGGCGTGCAAAGAGATTTTGTTCTTCTGTGCTCACCTAACTCTACCAAATCACTGGCAGCTTAAAGCTTAATAATGTTCCTCTCCTCCCAATTTGATCGTCCTAAGAATGCTACCAGGGTGTGACTAGCTGAGCCACTGTGTGCAATGACCTGGTCAAACAGTTAATGAAATATTCTAGCTCAAAGCTCAACTTGTAG

a
s	mr.mrrefChr0	121576	24	+	130230	TGGGGAAATATACCTACACAGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	126679	23	+	636262	-TGGGAAATACACCTACACAGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	125117	24	+	647215	TGGGGAAATATATCCATACAGGAG

a
s	mr.mrrefChr0	121600	102	+	130230	AATATGTAGTGGCATTGCCTGCAAGTAGGTGCAAATTAATACCTTCTTCAGTGCACCAGCTGTATAGGAGGACCTCACACACTTGCAGACTCGCACTAGAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	126703	102	+	636262	AATATGTAGTGGCATTGCCTGCAAGTAGGTGCAAATTAATACCTTCTCCAGTGCACCAGCTGTATAGAAGGACCTCACACACTTGCAGACTTGCACTAGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	125141	87	+	647215	AATATGTAGTGACATTGCCTGCCTGCA-----------ATACCTTCTTCAGTGTACCAGCTGCATAGGAGGACCTCACATAC----AGATGCTTACTAGAAC

a
s	mr.mrrefChr0	121702	46	+	130230	AATTTATTTGTGATATCCCATAGCAGATGTACCAGAGGATGCACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	126809	46	+	636262	AATTTATTTGTGATATCCCATAGCAGATGTACCAGAGGATGCACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	125228	46	+	647215	AATTATTTTGCAATATCCCGTAGCAGATGTACCAGGGGATCCCCAA

a
s	mr.mrrefChr0	121748	321	+	130230	GACCACTTTGAGTTACAATCTAACACTAATGCTGAGAAAATAAAATAAGCACAGCTCCAAATCACCACAGTTGATTGATACAAGCAAAACTAACACTGCTCTGTGTCTTCTGGTACTCATCAGAAACACCATAAGTTGTATTAACATCCATTCTGGGGCCAAGCCATGAGGGATCACTTATGGGATTCAAGGCTTTGGAGAGAGGTAACTTCATTACCTCCTCTAGAATAGCCATGACCATTCAGTGTTCTTATGTCCAAACTACACTTACTGTATCTCATAACACAAACTGGATGAATCAATGATGTCATCCTGTGTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	126855	320	+	636262	GACAACTTTGAGTTATAATCTAACACTAATGCTGAGAAAATAAAATAAGCACAGCTTCAAATCACCACAGTTCATTGATACA-GCAATACTGACACTGCTCTGTGTCTTCTGGTACTCATCAGAAACACCATAAGTTGTATTAACATCCATTCTGGGGCCAAGCCATGAGGGATCACTTATGGCATTCAAGGCTTTGGAGACAGGTAACTTCATTACCTCCTCTAGAATAGCCATGACCATTCAGTGTTCTTATGTCCAAACTACACTTACTGTATCTCATAACACAAACTGGATGAATCAATGATGTCATCCTGTGTATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	125275	319	+	647215	GACCAATTTGAGTTACAATCTAACACTAATGCTGGGAAAATAAAATAGGCACAGCTCCAAATCACCACAGTTGATTGTTACAAGCAAAAGTAACACTGCTCTACGTC--CTGGTACTCATCAGAAGCATCAGAAGTTGAATTAACATCCATTTTGGGGCCAAGCCATGAGGGATCACTTATGGGATTCGGGGCTTTGGAGAGAGGTATCTTTGTTACCTCCTCTAGAGAAGCCATGCTCATTCAGTGTTCTTATGTCCAAACTACACTTTCTGTATCTCATAACAGAAACTGTATAAATCAATGATGACATTCTGTGTAGA

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	127175	192	+	636262	GGTGCAACTCAATGCTGTGAAGAGAATAGTTTGTCTTATAAACTAGCATATATTGTCCTGTTGCTTGGGGAATAGATGAAGATTCGCACCTTGCACCAACCTGGATTCCTGCTAGGATATCTCATCACCTCACCAGCATGAGATCTCAGATCAATAGCTCTAACAATCTGTCAGAAAAGAAATTTTACCAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	125597	192	+	647215	GGTGCAACTCAATGTCATGAAATGAACAGACTTTCTTATAATCTGACATATATTGTCCTGTTGCTTGGGGAATGGATGAATATTTGCACCTTGCATCAACCTGGATTCACGTTAGGATATCTCATCACCTCACCAGCATGAGATCTCAAATCAATAGCTCCAATGATCTGTCACAAAATTAACTTTACCAGC

a
s	mr.mrrefChr0	122261	421	+	130230	GCTAACCCAGACATTTTAAGTATCCAGTTCCCTTTCCGGCAGACATCTCAGCAACATTAGGTTGTCTGCAAAAGCCAGGTTATGTTCTACACCTGAGAGGTACTCTTGATGCACTGAGCCTTTACCACCCTCTAAAGTTTCAAGCTTTATAGAATAGGTAGAATTAGAAATGAACGGTACACACCATGGACATGAGGGGCTAAATTCTGCAGAGTGAAAGGCTGATCCAACCAAATGCCTTTTAATGTCTTTTATTTGTAGATGCCCTGACTCCTGTATGTTTCATAGCAATCTATGTGTATATCAGCGGCCTACTTGTTATTGAATGGTTCTGAAGTGCAAAGTTATCCTTCAAGTAAAAAGCATATAACCAAACAAAACTTGGCCGTGGTGAATCAACACAAAATTCTTAGATAGTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	127367	420	+	636262	GCTAACCAAGACATTTTAAGTACCCAGTTCCCTTTCCGGCAGACATCTAAGCAACATTAGGTCGTCTGCAAAAGCCATGTTATATTCTACACCTGAGAGGTACTCCTGATGCACTGAGCCTTTACCACCCTCTAAGGCT-CAGACTTTATAGAATAGGTAGAATTAGAAATGAACGGTACACACCATGCACATGAGAGGCTAAACTCTGCAGAGTGAAAGGCTGCTCCAACCAAATGCCTTTTAATGTCTTTTATTTGTAGATGCCCTGACTCCTGTATGTTTCACAGCAATCTATGTGTATATCAGCGGCTTACTTGTTATTGGATGGTTCTGAAGTGCAAAGTTATCCTTTAAGTAAAAAGCGTATAACCAAACAAAACTTGGCCGTGGTGAATCAACACAAAGTTCTTAGATAGTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	125791	417	+	647215	GGTAACCCAGACATTTTAAGTATCCAATTCCCTTTGCGGCAGAGATCTCAGCAATGTTAAGTTGTCTGCAAAAGCCAGGTTATGTTCTACATATGAAAGGTACTCTTGATGCACTGAGTTTTTACAACCCTCTAAAGTTTCAAGCTTTATTGAATAGGTAGAATTAGAAATGAATGGTACACACCATGGACTTGAGGGGCTGAATTCTGCAGAGTGAAAGGCCAATCCAACCAAATGCCTCTCAATGACCTTA----GTAGGTGCCCTAACTCATGTATACTTTATAGCAATCTATGTGTATATCCGTGGCCTCCTTGTTATTGAATGGCTCTGAAATGCAAGGCTGTCCTTCAAGTAAAAAGTATAAAACCAAACAAAACTTGGCCGTGGTGAATCAACATAAAATTCTTACATAGTGAT

a
s	mr.mrrefChr0	122682	234	+	130230	TCAAAGCCTTGTTACCTACTACACATAATCTTGTGTTCCTAACATTATGGCATGTCACTAGACCCTAGCAGGTCTCATTACCTCCAACAGGCTGCCTTGTGTCACCAACATTGCTCACTCTTTGGTGCATCAAAGCATCTGAAAAAATATGACATACAATATTCTTTGAAAGGGGCTCAACGGATCTGAACAAAGTCCAGCTTTGTCCCTTGACACTTAAAAAGGATGGTGTGA
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a
s	mr.mrrefChr0	122916	533	+	130230	CCCTGAGAAATACATATTAAGGTTTGATAGGCATCCACTGGGAATGCCACCTTTAGGTAGAAGATTATAACAATACATTGCTTAACCAATACATTGCTCTTGAGGAGAAGATGCGAAAATACTTATCTGTTCATATAGTCTGAGTCTGTATGTAAATGTAGATATGTGTGGAAATGTAGCTGTGTGTTGCAATTCAAGCTCCCTCTGGATCATCATATGTTATACTCTTCATGTATAGGTAGGTATACCAGAGCACCAATGGAACTTTTAATCAGTGACAGTGTCAGAGAATTAGTCATTCTGAATGCACAAAATTCTGGGAAACTTTAGGTCACAATCTGGCCCAAAAAAGTTGCTTGCATTTAATTTCCACATTATTCCCATGGATGATTAACAACCAGATTAGCACGAGCTTTGCCACATTACTTGCATTTCATTATTTTTACAAATTAAGGCTGCCACTATTGAAAGTCCATCTGTTCCATTAGTGAAAATTCTTGATTGAAAAGATCACTCACAATATAGACTATAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	128023	529	+	636262	CCCTGAGAAATACATA---ATGTTTGACAGGCCTCCACTGGGAATGCCACCTTTAGGTAGAAGATTATAACAATACATTGCTTAACCAATACATTGCTCTTGAGGAGAAGATGCGAAAATACTTATCTGTTCATATAGTCTGAGTCTGTATGTAAATGTAGATATGTGTGGAAATGTGGCTGTGTGTTGTGATTCAAGCTCCCTCTGGATCATCAGATGTTATACTCTTCATTTATGGACAGGTATACCAGAGCACCAATGGAACTTTTAATCAGTGACAGTGTCAGATAATTAGTCATTCTGAATGCACAAAATTCTGGGAACCTTTAGGTCACAATTTGGCCCCAAAAAGTTGCTTGGATTTAATTCCCACATTATTCCCATGGATGATTGACAGCCAGATTAGCATGAGCTTTGCCACATTACCTGCATTTCATTATTTTTTCAAATTAAGGCTGCCACTATTGAAAGTCCATCTGA-CCATTAGTGAAAATTCTTGATTGACAAGATCACTCACAATATAGACTATAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	126446	524	+	647215	CCCTGAGAAATACATATTAAGGTTTGATAGGCATCCATTGGGAATGTTACCTTTTTGTTGAATATTGTACCAATACATTGCTTAACCAATACATTGCTTACTAGGAGAAGATGCAAAAATACTTATCTGTTCATACACCCTGACTCTGTATGTAAATCTAGCTATGTACAGAAATGTATCTGTGTGTTGCAATTCAAGCTCCCTCTGTATCATCGTATGTTATGCCCTCCATGTATAGGTAGGTATACCAGAGCACCAATGGAGATTTTAATCAGTGACAATGTCAGAGAATTA--CATCCTGGATGCATAAAATTCTGGAAAACTTTAGGTCACAATCTGGCCCAAAAA-GTTGCTTGCATT-AATTTCCACACGATTCCCATGGATGATCATCAACCAAATTAGCACAAGC-----CACATTACTTGCAGTTCATTATTTTTACAAAGTAAGGCTGCCACTATTGAAAGTCCATCTGTTCCATTAGTGAGAATTCTGGATCAAAAAGACCAGCCACAATCTAGACTATAAG

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	128552	14	+	636262	TGCGCATTGCTCAC
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a
s	mr.mrrefChr0	123463	26	+	130230	CAGGCCTTACGAGGCGGCAAACCAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	128567	26	+	636262	CGAGCCTTACGAGGCGGCAAACCAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	126985	26	+	647215	CAGGCCTTACGAGGCAGCAAACCAGC

a
s	mr.mrrefChr0	123489	234	+	130230	AATTAGCAACCAATTGAGCAAGCAGGTTATGATGCACATTTAAAATAACCTGAGAGTAGTTTTTCTATCATCCATGTGACGAACTAAACTAGCCGCTACCCTAACACCACTTTTGTGTGATGTACATGAGCAAAGGAAAGCAATAATCTACCTATAGCCATGTTGTACTTCAACCTTTGTTTTGCTAGTTTACTCCACATTGTAATACCAGCAAACCATTGCTAAATATTATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	128593	229	+	636262	AATTAGCAACCAATTGAGCAAACAGGTTATGATGTGCATTTAAAATAACCTGAGAGTAGTTTTTCCATCATCCATGCGGCAAACTAAACTAGCTGCTACCCAAACACCACTTTTGTGTGATGTACATGAGCAAAGGAAAGTGATAATCTACCTATAGCCATGTCATAC-----CCTTTGTCTTGCTAGTTGACTCCACATTGTAATACCAGCAGAACATTGCTAAATATTATCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	127044	232	+	647215	AGTTAGCAACCAATTGAGCAAGCAGGTTATGAAGCACATTTAAAATAACCTTAGAGTTGTTTTTCTGTCATCCATGTGATGAGCTAAACTAGCCGCAACCCTAACAACACTTTTGTGTGATGTACAGGAGCATATGAAAGCAATAAT--ACCTATAATCATGATGTACTTCAACCTTAGTTTTGCTAGTTTAGCCCACATTGTAACACCAGCAAACTGTTGTTAAATATTATTT

a
s	mr.mrrefChr0	123723	19	+	130230	ATTTCAATTTAACCAGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	128822	19	+	636262	ATTTCAATTTAACCAGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	127277	19	+	647215	ACTTCAATTTAAGCAGACC

a
s	mr.mrrefChr0	123742	209	+	130230	GTTTACAATCCACTAACCCTCTCAGATCACTCAATGTGTTGAATCCGCTGGAATATTACATCAGAAGTGAATCCCCAGTATATAGGTATTTGTAAGTGTTGACATCTGAATGTTAATATTTCGAGATGCAAGGTGTCACATGAGGTTTCTCGCCAGTCCCAGGAGGTTAGGTTTCTCACCAACATCACATGATGAGGTGTATGAGGTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	128841	209	+	636262	GTTTACAGTCCACTGACCCTCTCAGATCACTCAATGTGTTGAATCCGCTTGAATATTACATCAGAAGTGAATCCCCAGTATATAGTTATTTGTAAGTGTTGACATCTGAATGTTAATATTTCGAGATGCAAGGTGTCACATGAGGTTTCTCGCCAGTCACAGGAGGTTAGGTTTCTCACCAGCATCACATGATGAGGTGTATGAGGTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	127297	138	+	647215	GTTTACAATCCACTAACT---TCAGATCACTCCATGTGTTGAATCCACAGGAATATTACAGCAGAAGTGATTCCCCAGTATACAAGTGT---------------------------------------------------------------CCAGTCCCATGAAGTT-----TCTTGCCAACATCACGTGATGAGGTGCATGAGGTGT

a
s	mr.mrrefChr0	123951	195	+	130230	CTTCATATAACATGGGTCCACAAAAGTTCTGTGTCCAGGGGCACTGGGGTCTTGCCTAAGCAATAGAGAATGTACAGTATCTTATGACTTATAATGTGAGGACTTGACTTTGGTACTGACTTTGACCTACTTATGTGGCTCTAGAAGTGCTGACAACTCTTATATGGTAGATGTTACTGAGATCACTATATAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	129056	194	+	636262	CTTCATATAACATGG-TCCACAAAAGTTCTGTTTCCAGGGGCACTGGTGTCTTGCCTAAGCAATAGAGAATGTACAGTATCTTATGACTTATAATGTGAGGACTTAACTTTGGTACTGATTTTGACCTACTTATGTGGCTCTAGAAGTGCTGACAACTCTTATATGGTAGATGTTACTGAGATCACTATATAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	127435	125	+	647215	CTTTACAAAACATGGGTTCACAAAAGTTCTGGGTCCAGGGGCACTGGGGTCTTGTCTAAGCAA----GAATGTACAGTATCTTATGACTTACAATGTGAGGACTTGAATTTGGTACTGACTTTGACCTA------------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr0	124146	88	+	130230	TATTATGACAGTCCTTTGTGATTATAGGAAAACTTTAAAAACTCTTTGATCTATCATGCAGAACATGGTCTCAAGTCGATGAAATTGT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	127560	88	+	647215	TATTATGACAGTCCATTGTGATTATAAGAAAACTTTCGAAACTATTTGATCTATCATGCAGAACATGGTCTCAAGTTGATGAGATGGT

a
s	mr.mrrefChr0	124234	2	+	130230	AT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	127653	2	+	647215	AT

a
s	mr.mrrefChr0	124236	355	+	130230	AGTTGTAACCAATTATATTGCATATGTGTTATTCAACAAGAAAGCAGTAACATTTTTCAAGTATACCCAAGTTACTATGAAGGTCAATTGCTACAAGTCTGATGGTTGTTTGCTCACAAGAGGGTCCAATGATTAATGTTATCATTCATATGTTTGAACTTGAGATAGGTTGCATTGCACACCCATAGGCTATTACAATGTTCCTCAATTGAGTTTTTCTATCTAGTATCTTTCCATATCAATTAATATTCTTTGTCAAAAGTCTTTATGGATATCAAGTCATTCCATGTTCGGATTAGCAATCAGTAATTAACCCAAACGCTGGAGTTCCAGTATATATTTGCCCAATCTGTTC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	127657	353	+	647215	AGTTGTAACCAATTAGATTTCATATGTGTTATTCAACAAGAAA-CAGTAACACTTTTCCAGTATACCCAAGTTACTATGAAGGTCAATTACTATAAGTCTGATGGTTGTTTACTTGCAAGAGAGTCCAATGATTAATGTTATCATTCATATGTTTGAATGTGAGATAGGTTGCATTGCACACCCATAGGCTCTCACAATGTTCCTCAATTGAGTTTTTCTATCCAGCAATTTACCATTTCAATTAATATTCTTTGTCAAAAGTCTTTATGGATATCTAGTCATTCCATGTTCGGATTAGCAATTAGAAATTAATCCAAAC-CTGGAGTTCCAGTATATATTTGCCTAAACTGTTC

a
s	mr.mrrefChr0	124591	33	+	130230	TAACTACTGTGAACAGTAATACAGGGGGCCTAC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	128011	33	+	647215	CAACTACTGTGAACAGTGAAATAGGGGGCCTAC

a
s	mr.mrrefChr0	124624	133	+	130230	TGCAACACAGCACCCACAAAAGAGTGAGAACTACTTTGGCCAGATCTTGTCCATTTCAATAATCATGTGCACCCATCATGCCCCCATCACTGACATCTAAGGCCTTGGATGTATTAATATGGCAAGAGGCCTG
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a
s	mr.mrrefChr0	124757	274	+	130230	AATGCTTACGGAGCGGTCCCCAGTAATTACTAGTTTATGTACACACTAATTGTTTAAAAATGGGCTTATTAAAAATCTAAGCTTGGGCTAACCCCTCCTTAGTTGGAATTGAAATCGAACAATATTATCTTAAGGACAACCTGGCTTCATACAATGTGGCAATCAGTAGCGGTTGCTTTGTTATTCTTTTGGTAATCTACAAGAATGTGTGCCGTTAACAGGCTGGAACGGGGACTCATGTAATACAGCTCCTTGTTTGGTGGATTACAGCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	129990	259	+	636262	AATGCTTACGGAGCGGTCCCCAGTAACTACTAGTTTATGTACACACTAATTGTTTAAAAAT-GGCTTATTAAAAATCTAAGCTTGGGCTAACCCCTCCTTAGTTGGAATTGAAATCGAACAATATTATCTTAAGGA--------------ACAATGTGGCAATCAGTAGCGGTTGCTTTGTTATTCTTTTGGTAATCTACAAGAATGTGTGCCGTTAACAGGCTGGAACGGGGACTCATGTAATACAGCTCCTTGTTTGGTGGATTACAGCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	130311	259	+	636262	AATGCTTACGGAGCGGTCCCCAGTAATTACTAGTTTATGTACACACTAATTGTTTAAAAAT-GGCTTATTAAAAATCTAAGCTTGGGCTAACCCCTCCTTAGTTGGAATTGAAATCGAACAATATTATCTTAAGGA--------------ACAATGTGGCAATCAGTAGCGGTTGCTTTGTTATTCTTTTGGTAATCTACAAGAATGTGTGCCGTTAACAGGCTGGAACGGGGACTCATGTAATACAGCTCCTTGTTTGGTGGATTACAGCTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	128177	247	+	647215	--------------------CAGTAATTACTAGTTTATGTACACACTAATTGTTTAAAAATGGGCTTATTAAAAATCTAAGCTTGGGCTGACCCCTCCTTCGTTGG----AACATCCAACAATATTATCTTAACAACAACCTGGCTTCATACAATCAGCCAATCAGCAGGGGTTTCTTTGCTATTCTTTTGATTAT---CAAGAATGTGTGCTGTTAACAGGTTGGAAGGGAGACTTATGTAATGCAGCTCCTTGGTCGGTGGATTACAGCTTA

a
s	mr.mrrefChr0	125031	62	+	130230	CCCTCTTGTTTAATTAATGAGGGGGCTTGAACCTCTTGCAGCTCCTTGTTTAGTGGTTCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	130249	62	+	636262	CCCTCTTGTTTAATTAATGAGGGGGCTTGAACCTCTTGCAGCTCCTTGTTTAGTGGTTCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	130570	62	+	636262	CCCTCTTGTTTAATTAGTGAGGGGGCTTGAACCTCTTGCAGCTCCTTGTTTAGTGGTTCTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	128441	61	+	647215	CCCTCTTGTATAATTAATGAAAGGCCAAGGGTCCCATGCAGCTCCTTGTGTGGTGATTC-TA

a
s	mr.mrrefChr0	125093	52	+	130230	CCCCTTCAGTCCGATTGATGAGGGTGTGACCCTAATGTCTCTCAGACCGATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	130632	52	+	636262	CCCTTTCAGTCCGATTGATGAGGGTGTGACCCTAATGTCTCTCAGACCGATA
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a
s	mr.mrrefChr0	125145	23	+	130230	CCACCCAAAACACATTACAAAAT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	513642	21	-	647215	ATAAGGGCTAGGAGCTTTGGG

a
s	mr.mrrefChr0	129239	359	+	130230	CTGAACAATTGATCTCCTATAGTACATCCTAAACTCACTCCCAGGCATAGTAAGCAACTATATCTGGCAAGGCCTTCTGCCATTTTCTACTGTGTTCTTTAATTAGACCTGAAGTTTTCTGAGGATCTGTCACATTTGGCTTGGCTGAATTCTCAGGTTCTCAAGTTGAAATTGTTCTGATTAATTTTCACTCTTCTTATGGTAACCCTCAATACATTCTGCTTGATTGCTCTTTCTACATACATGCATGGCTGGGGGTCTACCTTTATGCATCACACTGGGTGGGCTGATTGGGTTTTGCTGTAGAAGGGGCCCAGGATAGTTGGGAATGTTATGATCACTTTGTCCTTGTTAGAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	134910	359	+	636262	CTGAACAATTGAACCCCTATAGTACATCCTAAACTCACTCCTAGGCATAGTCAGCAACTATATCTGGCAAAGCCTTCTGCCATTTTCTACTGTGTTCTCTAATTAGACCTGAAGTTTTCTGAGGATCTGTCACATTTGGCTTGGCTGAATTCTCAGGTTCTCAAGTTGAAATTGTTCTGATGAATTTTTACTCTTATTATGGTAACCCTCAATGCATTCTGCTTGATTGCTCTTTCTCCATACATGCATGGGTGGAGGTCTACCTCTATGCTTCACACTGAGTGGGCTGATTGGGTTTTGCTGTAGAAGGGGCCCAGGATAGTTGGGAATGTTATGAGCACTTTGTCCTTGTTAGAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	513663	359	-	647215	CTGAACAGTTGATCTCCTATAGTACCTCCTAAGCTTACTCCCAGGCATAGTAAGCAACTATATCTGGCTAGCCCTTCCGCCATGATCTAATGTGTTCTTTTAATAGACCTGAAGTGTTCTGAGGATCTGTCATGTTTGGCTTGGCTGAATTGTTAGTTTCTCAGGTTGAGATTGTTCTGACTAATTCTCACCCCTCTTATGGTAACCCTCAGCACATTCTGCTTGATTGCTCTTTCTACATACATGCATGGCTGAGGGTCTGCTTTTATGCATCACACTGGATGAGCTAATTGGCTTTTGCTGTAGAAGTGACCCAGGATAGTTGGGAAAATAATCATCACTTTGTCTCTGTTACAAAG

a
s	mr.mrrefChr0	129598	125	+	130230	CCTTCTCAGGCTCTGACAATCAGGCATAACACAGCTAGTTAATCAATCCTTGATGTGCTCAGCTGTGAATGGGAGTGGGATCTTGAAGGAAGTTGGTTAATAAAAAGTATATCAACTCAATTAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	135275	125	+	636262	CCGTCTCAGGCTCTAACAATCAGGCATAACACAGCTAGTTAATCAATCCTTGATGTGCTCAGGCGTGAACGGGAGTGGGATCTTGAGGGAAGTTGGTTAATAGAAAGTATGTCAACTCAGTTAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	514022	125	-	647215	ACTTCTCAGTCTCTGACACTTGGGCATAACTCAGCTAGTTAATCAATCCTTGATATGCTCTGCTGTTAATGGGAGGGGGATCTTGAAGGAAGTTAGTTAATAAAGAGTAAATCAACTGAATTAAT

a
s	mr.mrrefChr0	129723	87	+	130230	GTGCCAAAATAATGTTTGCTTGTCTATAGCACAAATACAACGGAAAAGTAACAGAATGTATAAAGCACCCTGCAAGATTTAAAAGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	135400	87	+	636262	GTGCCAAAATAATGTTTGCTTGTCTATAGCACAAATACAATGGAAAAGTGACAGAATGGATAAAGCACGCTGCAATCTTTAAAAGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	514150	87	-	647215	GTACCAAGATAATGTTCCCTTGTTTGTAGCATGAATACATCTGAAAAGTAACAGTATGTATAAATCACCCTGTGAGATTTAAATGCG

a
s	mr.mrrefChr0	129810	62	+	130230	GGGGTTTTGACATTAGATGTACGCACCCTGCAATCACCCTGGGGTGTTGTTATATATATCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	135487	62	+	636262	TGGGTTTTGACATTAGATGTACGCACCTTGCAATCACCCTGGGGTGTTGTTATATATATGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	514253	62	-	647215	GGCGTTTCGAAATTAGATGTACGCACCCTGCAATCACCCCGGGGTGTTGTTATATATATCTC

a
s	mr.mrrefChr0	129872	104	+	130230	AGGATGTCTCAACCTGCTCACATCTCTCAACTTGGGGTCTAAGGGCCTGTCTTCATATAAATAACTAGGACTACTTAATTTGAACAAATGAAAAACAGACAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	135550	102	+	636262	AGGATATCTCAACCTGCTCACATCTCTCAACTTGGGGTCCAAGGGCCCA--TTCATATAAATAGCTAGGACTACCCAATTTGAATAAACAAAAAACAGACAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	514315	104	-	647215	AGGATGTCTCAACCTGCTCACATCTCTCACCTTGGGGTCTAAGGGTCTGTCTTCATATAAATAACTAGGATTACTTGATTTGAACAAATGAAAAACAGACAGAT

a
s	mr.mrrefChr0	129976	105	+	130230	GGATAATTTTCTAGAGGGTAACAACCATCTGCCATACAATTAGCATTCTCCTAACGTAGGAGGGACAGGAGAAAGTGTAGGCCTACAGATTTTCAGTACAGGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	135652	105	+	636262	GGATAATTTGTTAGAGGGTTACAACCATCTGCCATATAATTAGCATTCTCCTAACGTACAAGGGACGGGAAAAAGTGTAGACCTACAGATTTTCAGCACAGGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	514426	105	-	647215	GGATAACTTTCTAGAGGGTAACAACCAACTGCCATACAATCAGCACTCTCCTAATGTAGGACAGACAGGGGAGAGTGTAGGCCTACAGATTTCCAGTACAGGGGG

a
s	mr.mrrefChr0	130081	11	+	130230	CATTCTTATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	135757	11	+	636262	CATTCTTATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	514535	11	-	647215	CATTCTTATAA

a
s	mr.mrrefChr0	130092	80	+	130230	TCCCACTCTTTGGTTTCTCAGGAGTTGCCTCTTGGGCTAGGTTAGGTGAAACCTTTAAGGTCAGCTAGCCTGTTCAGGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	135771	80	+	636262	TCCCACTCTTTGGTTTCTCAGGAGTTGCCTCTTGGGCTAGGTTAGGTGAAACCTTTAAGGTCAGCTAGCCTGTTCAGGGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	514546	80	-	647215	TCCCACTCTTGGGCGCCTCATGAGTTGCCTCTGGAGCTGGATTTGGTGAGACCTTTTAGGTCACCTAGCGTGTTCAGGGC

a
s	mr.mrrefChr0	130172	50	+	130230	ATGAGGAGTAGACGAAAGTGCCACTAGTGAAAAGTACCTACATAATTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	135851	50	+	636262	ATGAGGAGTAGACGAAAGTGCCACTAGTGAAAAGTACCTACATAATTGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	514627	50	-	647215	ATGAGCAGCAGATGGAAGCGCGACAGGTGAAAAGTATATACATAATTGTG

a
s	mr.mrrefChr0	130222	8	+	130230	ACATCTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	135902	8	+	636262	ACATCTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	514677	8	-	647215	GCATCTCA

a
s	mr.mrrefChr1	0	107	+	670	TACTATGTGTCCATGGAGTTATGACAGGTTTGAGTCTCCAAACACCAGGAATCTGTTTGATCCTGAGGGTTTGTAATTTTCTATTCCAAGCCACCATCCAAAAGGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	635573	82	+	636262	TACTATGTGTCCATGGAGTTATGACAGGTTTGAGTCTCCAAACACCAGGAATCTGTTTGATCCTGAGGGTTTGTAA-------------------------AAGGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	613	107	-	647215	TACTACATGGCCATGGAGTTTTACTGGGTTTGAGTCTCCAGGCGCCAGAAACCTGTTCGATCCTGAGGTTTTGTAATTTTCTATTCCAAGCCACCATCCAAAAGGGA

a
s	mr.mrrefChr1	107	22	+	670	TATCTGTACTAGATGCCTCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	635659	22	+	636262	TGTCTCTACTAGTTGCCTCATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	720	22	-	647215	TATCTGTACTAGATGCCTCATC

a
s	mr.mrrefChr1	129	44	+	670	CAGGAGGTTATCTGTGCTTGATACCTGCCATTAGTGTGAAATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	635684	44	+	636262	CAGCAGATTATCTGTGCTTGATACCTGCCATTAGTGTGAAATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	742	44	-	647215	CAGGAGGTTACGTATGCTTCATATCTGCCAGTAGTGTGAAATGG

a
s	mr.mrrefChr1	173	218	+	670	CTATTCTTACTGCGACCCACTTGAGTAGTATTGATGTGATCTAGTGGCCATCCTGATAACAGACGAGATGCCAAGGATTAGAAGCGAAAAATTTAAAACTAATTTGAACACAAGATGAGAACCTATAAGTTGGCCAAAGACAGTGAGAAATACCCTGAACCAACCTAGGTGCCAACAATCTCTACAGTTCAGTGCCTGAGATTCAAGAGAGGCCCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	635728	215	+	636262	CTATTCTTACTGTAACCCAATTGAGTAGT---TATGTGATGTAGTGGCCATCCTGATAACAGACGAGATGCCATGGATTAAAAGTGAAAAATTTAAAACTTATCTGAACACAAGATGAGAACCTATAAGTTGGCCAAAGACAGTGAGAAATACCCTGAACCAACCTAGGTGTCAACAATTTCTACAGTTCGGTGCCTAAGATCCAAGAGAGGCCCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	787	218	-	647215	CTATTCTTACTGCGACCCACTTGAGTAGTATTGATGTGCTCTATTAGCCATCCTGATAACAGACAAGATGCCAAGGGTTAGAAGCAAAAAATTTAGAACTAATTTGAATACAAGACGAGAACCTATAAGTTGGCCAAAGACAGTGAGAAATGCCCTGCACCAACCTAGGCGCCAACAATCTCTACAGTTTAGTGCCTGAGGTTCACAAGTGGCACAGA

a
s	mr.mrrefChr1	391	101	+	670	CTCTTTTGACCCCTTTGCTAGCTGTAACTACGATATTATGACATTTGGCAGTATGACCCTCACACTGAGACTTTAGAACTGGAGCAAGTACTTTTGTGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	635943	101	+	636262	CCGTTTTGACCCCTTTGCTAGCTGTAACTACGATATTGTGATGTTTGGCAGTATCACCCTCACACTGAGACTTTAGATCTGGAGCAAGTACTTTTGTGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	1007	101	-	647215	CTCTCTTGACCCCTTTGCTAGCAGTAAATACAATACTATGACATTTGGCAGTATGACCCTCACACTGAGACTTTAGAACTGGAGCAAGTACTTTTGTGCCA

a
s	mr.mrrefChr1	492	62	+	670	ATGAACCACTCAAGAACATTATGAGCCTTATAGGGACAACATATTATTAACCTCATGGAGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	636055	62	+	636262	ATGAACCACTCAAGAACATTATGAGCGTTATAGGGACAACATATTATTAACCTCATGGAGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	647041	62	+	647215	CAGTACCACTCAAGAACATTATGAGCCTTATAAGGACAACACATTGTTAGCCTCATGGAGAC

a
s	mr.mrrefChr1	554	116	+	670	ATTGCCAAAGATGTATTAAATACTGTTATCCCATGTTATATTCACAAACAACTCTCATCCCAACAAATGCTTTGTACACATTAAGACTCACAAATTGAAGACACTGTTGTGAGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	636146	116	+	636262	ATTGCCAAAGATATATTGAATACTGTTATCCCATGTTATATTCACAAACAACTCTCATCCCAACGAATGCTTTGCACACATTAAGACTCACAAATTGAAGACACTGTTGTGAGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	647103	112	+	647215	ATTGCCAAAGATGTATTAAATACTGTTATCCCATGTTATATTCACAAACAAC-CTCATCCCAACAAATGCTTTGTACACATTAAGACTTACA---TAAAGACATTGTTGTGAGAAT

a
s	mr.mrrefChr2	0	16	+	16	CCTATAGTATAGGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	370394	16	-	647215	CCTATAGTATAGGGTG

a
s	mr.mrrefChr3	0	202	+	181019	ACTGTCCTTATACAGCTTTTTGTGTCTATCCTGGTGAAAAAATTAAGCTGATTGGAGCTCTAGTGGCGTAAAAGAAATCAGAATGGGAATCATACATACAAGGGGGCTTGGTTTCACTCCCTGCAACTACTTTAGATACAGCTAAGAAGGAAAGATAGGACTTGAGGGCTAGGATGCTCCACACTGTTGTGTTTTAACCTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	441679	201	+	636262	ACTGTCCTTATACAGCTTTTTGTGTCTATCCTGGTGAAAAAATTAAGCTGATTGGAGCTCTAGTGGCGTAAAAGAAATCAGAATGGGAATCATACATACAGGGGGGCTTGGTTGCACTCCCCGCAACTACTTTAGA-AAATTTAAGAAGGAAAGATAGGACTTGAGGGCTAGGATGCTCCACACTGTTGTGTTTTAACCTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	453762	202	+	647215	GCTGTCCCTATACAGCTTTTTTTGTTTATCCTGTTTAAAAAATTAAACTGGTTGGAGCTTTAGTGGCATCCAGGAAACCAGAATGGGAGTCATACATACAAGGGGGCTTGGGCTCACTGCCTGCAACTACTTTAGATACAGCTAAGAAGGAAAGATAGGACTGGAGGGCTAGCATGCTCAACACTTTTGTGTTTTAACCTGC

a
s	mr.mrrefChr3	202	47	+	181019	AACACCCAATCCATCACCTACCTCACCTTATCAATACGTTTTACTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	441880	47	+	636262	AACACCCAATCCATCACCTACCTCACCTTATCAATACGTTTTACTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	453965	47	+	647215	AACACCCAATCCATCACCTCCCTCACCTTGTCGATTTGTTTTACTGT

a
s	mr.mrrefChr3	249	74	+	181019	CTGGTAGGAGTGCACACTTTTTGCCTTATTTGACAGGACACTGACTTTTTCTCTTTGTTGTCAGTAATGTTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	441929	74	+	636262	CCGGTAGGAGTGCACACTTTTTGCCGCATTTGACAGGACACTGACTTTTTCTCTTTGTTGTCAGTAATGTTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	454012	74	+	647215	CTGGTAGGAGAGCACACTCTTTCCCTTATTTAACAGGACACTGACTTTTTCTATATGTTGTCAGTAATATTGCG

a
s	mr.mrrefChr3	323	151	+	181019	CCTCTCTGTTACTTCTCATCGAGTTTTGTTTGAAGCTACTCCTTTCGAACAGTCTTTAATTGTCCAAACTGAATGAAACAAAGCATAAACATACGTTATATTCATGGCTGCTGGTCATCTAATTACAGAGAGTGATAAGGTAGATAACTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	442003	151	+	636262	CCTCTCTGTTACTTCTCATCGAGTTTTGTTTGAAGCTACTCCTTTCGAACAGTCTTTAATTGTCCAAACTGAATGAAACAAAGCATAAACATACGTTATGTTCATGGCTGCTGGTCATCTAATTACAGAGAGTGATAAGCGAGATAACTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	454087	146	+	647215	TCTCTCTGTTACTGCTCATTGAGTTTTGGTTGAAACTACTCTTTGTGAACAGTCTTTAATTATCCAAACGAAATGAGACAAAACATACACATACCTTATATTCAT-----CTGGTCATCTAATTACCAAAAGAGATAAGGTAGATAACTCA

a
s	mr.mrrefChr3	474	303	+	181019	CCTTCCCTATATTTCCATCCTAGTGGCATAGTAGCTTTCGTGGAGCCATCTGCTGGGGGCCCAGGACTCAGTTGCAGCAGCTTAAGAAATCTCAACAACCTTAGACCCCCTAGCCTTAAATAGTGTATAAAGTGATGCTTGTTTCCAGAAATAACTTAGAACAACAAGGGTGATTAACATTACTCATGTTAGGTTCTGTTGGGTACTATACTGGGAAGAATGCATATAGTCAGTACATTCATACGCTGAATACCTGGGCAGGAAAGGATCCATCTTGGAAGAAGATCTGCCTTAAAGAACAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	442164	274	+	636262	CCTTCCCTATATTTCCATCCTAGTGGCACAGTAGCTTTTGTGGAGCCATCTGCTGGGGGCCCAGGACTCAGTTGCAGCAGCT----AAATCTCAACAACC-TAGACCCCCTAGCCTTAGATAGTGTATAAAGTGATGCTTGTTTCCAAAAATAACTTAGAACAACAAGGGTGATTAACATTACTCATGTTAGGTTCTGTTGGGTACTATACTGGGTAGAGTGCATATAGTCAGTACATTCATACGCTGAAAACCTGGGCAGGAAAGGATCCATCTTGAA------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	454233	303	+	647215	CCTTCCCTATATTTCCATCCTAATGGCATAGTAGCCTTCATAGAGCCATCTGCTGGGGGCCAAGGACTCAGTTGCAGCAGCTTAAGAAATCTCCACAACCTTAGACTCCCAAGCCTTAAATAGTGTATCAAGTGATGTATGCATCCAGAAATAACTTAGAACAATAAGGGTGATTAACATTACTCATGGAAGGTACTGTTGGGTACTATACTGGGAAGAATGCATATAGTCAGTACATTGATGTCATGAATACCTGGACAGGATGGGATCCATCTTTGAAGAAGATCTGCCTTAAAGAACAGG

a
s	mr.mrrefChr3	777	123	+	181019	ATCGTTGATATAGGGACATGTAGTGCACCCTCAGTCCAGTATCAAAAGACAGATGTTAAAGGGGTTGATAGTTTTTTCTGTGGTGTGAGGCAGTTTTGTAAAACATCTAGCGAACCTCAGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	442438	119	+	636262	----TTGATATAGGGACATGTAGTGCACCCTCAGTCCAGTATCAAAAGACAGATGTTAAAGGGGTTGATAGTTTTTTCTGTGGTGTGAGGCAGTTTTGTAAAACATCTAGCGAACCTCAGCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	454537	123	+	647215	ATCGTTGTGATAAGGACCTGTAGTGTACCCACAGCACAGCATTAAAAGTCAGAGGTTAATGGGGTTGATAATTTTTTCTGTGGTGTGGGGCAGTTTTATAATACAGTTAGTGAGCCGCAGGTT

a
s	mr.mrrefChr3	900	63	+	181019	AATAAAAGGATCACACATTAATGTTGCACCAATGGCACCAACCAGTGATACAGATCCAGCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	442559	63	+	636262	AATAAAAGGATCACACATTAATGTTGCACCAATGGCACCAACCAGTGATACAGATCCAGCATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	454660	63	+	647215	AATAAAAAGATTGCACATTAATGTTGCACCAACGGCACCGGCCAGGGATACAGATCCAGCATG

a
s	mr.mrrefChr3	963	27	+	181019	GTTCAACTCTCTATTACACATCAAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	442625	27	+	636262	GTTCAACTCTCTATTACACATCAAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	454723	27	+	647215	GTTCATCTCTCTATTACACATCAAACC

a
s	mr.mrrefChr3	990	19	+	181019	CAGTAATGAAAGAGTCTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	442654	19	+	636262	CAGTAATGAAAGAGTCTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	454750	19	+	647215	CATTAATAAAAGAGGCTCA

a
s	mr.mrrefChr3	1009	156	+	181019	TTTACAGTGTGAGAGATGCATTAGCATAGCATAACTCATAAGGATGGATGGTCATTTCTGTCTGATATGGGCTTGTAACATCCTACTATATAGGGCTGACTAAAGTCAATATTACAATGTGTAGGTAGTACAAAAACTGATTCTCAATTACTTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	442674	156	+	636262	TTTACAGTGTGAGAGATGCATTTGCATAGCATAACTCATAAGGATGGATCGTCTTTTCTGTCCAATATGGGCTTGTAACATCCTACTATATAGGGCTAGCTAAAGTCAATATTATAATGTGTAGGTAGTACAAAGACTGATTCTCAATTACTTCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	454769	155	+	647215	TTTATGGTGTGAGAGATGTATTAGCATAGCATAACACATAGGGATGG-TGGTCATTTTTGTCTGATATGGCCGTGTACCATCCTACTATATAGGGCTGATTACAGTCAACATTACAATGTGCAGGTAGTACAAAAACTGATTCTCAATTACTTTCT

a
s	mr.mrrefChr3	1165	491	+	181019	GCTTCTTACAAGGGGTGCCTTGCGGCACCCTGGGTAGAGACCCATACACATATACACCACGGAAACCATGGTCGACCAAATGATCTTAATAAGACTGGCAAATGTTTCTTCAAAGGGCTAAATAGGCAGCCTACTATAACAGCTAAGGGGCTCACGCATTAATCAGTATCCATGTGCTGTATGCACATAGAATTCTTACTTAAGGAAGGATATGATAGCTTAGTTTGAATGCAATAGCCTCACATGATCAAATTGTACTTTCAAGTGAGGTTCCACAGCAATAAAATGGAGTAGACTGACCTTTGGAAAGACACTTTACACTCCGTCAGGTCAATATTGTCTTAAGTTACATCTCAGGACAGCCCTTTTCCCACTCAAGCCGGAGTTATAACTACACTCAGCAGACCAGCAAAACCAGAAGCCATTAGTATCAATACACCAACGCGGCGGGAAAGTACATGGGCTTGCGGGTGCTCCGCCGCCACGTTTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	442830	468	+	636262	GCTTCTTACAAGGGGTGCCTTG-------CTGGGTAGAGGCCCACACACATATACCCCACGGAAACCATGACCGTCCAAATGACCTTAATAAGACTGGCAAATGTTTCTTCAAAGGGCAAAATAGGCAGCCTACTATAACAGC-AAGGGGCTCACGCATTAATCAGTATCCATGTGCTGTATGCACATAGAATTCTTACTTAAGGAAGGATATGATAGCTTAGTTTGGATGCAATAGCCTCACATGATCAAATCGTACTTTCAGGTGAGGTTCCACAGCAATAAAATGGAGTAGACTGACCTTTGGAAAGTCACTTTACACTCTGTCAGGTCAATACTGTCTTAAGTAACATCTCAG--CAGCCCTTTTCCCACTCAAGCCAGAGTTATAACCACACT---TGGACCATGAAAA-------CCATTAGTATCAACACACCAACGCGGCGGTAAAGTGCATG---TTGCGGGTGCTCCGCCTCCACGTTTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	454925	480	+	647215	AATTTTTAGAAGGGGTCCCTTGCGGCACCCTGGTAAGAGACCCATATATATATACACCACGGATAGCAAGGTGGACCAAATGATCTTAATAATACTAGCAAATGT-----------GCTAAATGGGCAGCCTACTATAACAGCTAAGGGGCTCATCCTTCAATCAGTATCCAAGTGCTGTATGCACATAGAACTCTTACTTAAGGAAAGATATGCTAGCTTAGTGTGAATGCAATAGCCTCACATGAACAAATTGTACTTTCAAGTGAGGTTCCACGGCTATAAAATGGAGTAGACTGACCTCTGGAAAGAAACTCTACACTCCGGCAGGTCAATATTGTCTTAAGCTACATCTCAGGACAGCCCCATTCCCACTCAAGCCGGAGTTATAACTACACTCAGCAGGCCAGCAAAACCAGAAGCCATGAGTATCAATCCACCAACGCGGCGGGAAAGTACATGGGCTTGTGGGTGCTCCGCCGCCACGTTTTC

a
s	mr.mrrefChr3	1656	79	+	181019	GCCGGTCGTGATGCTCGCGTTCATGTCCGCAGGACCCGCCCGGGGCCCTACTCCCTTGACCAACGATATCTCGTCGCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	443298	79	+	636262	GCCTGTCGTGATGCTCGCGTTCATGTCCGCAGGACCCGCCCGGGGCTCTACTCCCTTGACCAACGATATCTCGTCGCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	455475	73	+	647215	GCCGGTCGTGATGGTCGTGTTCATGTCCGCGAAACCCGCCCGAGGCCCCACTCCCTTGACCAACGTTATCACG------

a
s	mr.mrrefChr3	1735	57	+	181019	GGACGGGCGGAAACTGAATGTTGCATTTTCCGCGCAATGGAGACGTGCTATATCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	443378	57	+	636262	GGACGGGCGGAAACTGAACGTTGCATTTTCCGCGCAATGGACACGTGTTATATCAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	455548	53	+	647215	----GGGTCGAAACTGAATGTTGCACTTTCCGCGCAATGGAGATTTGCTACATCAGA

a
s	mr.mrrefChr3	1792	146	+	181019	TGTCATAGGTCAAAATATTCCGGTCGATGGGGCGGCTAAAGCAATTCATGCGTTGGCCTTTTAAATAACCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATCTACTGATTGGTTGACTTGCAACAGTCCCATAGTGATTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	443435	146	+	636262	TGACATAGGTCAAAATATTCCGGCCGCTGGGGCGGCTAAAGCAATTCATGCGTTAGCCTTTTAAATAGCCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATGTACTGACTGGTTGACTTGCAACAGTCCCATAGTGATTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	455602	146	+	647215	TGTCAAAGGTCGAAATACTCCGGTCGATGGGGCGGCTAAAACAATTCATGCGTTGACCTTTTGAATAACCTTCTAAAATCAATACTTGTTACTCATTTTTTTGATCTACAGATTGGTCAACTTGCAACAGTCCCATAGTGGTTTGA

a
s	mr.mrrefChr3	1938	30	+	181019	AACAAGCCACAGTTCCATAGTGGTTTAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	443589	30	+	636262	AACAAGCATCAGTCCCATAGTGGTTTAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	455748	30	+	647215	AACAAGCCACAGTTCCATAGTGGTTTGACA

a
s	mr.mrrefChr3	1968	417	+	181019	AGCAAGAATGTCCTGTCCTATCTGGTCCGTATCACCTCTGTGATCTATAGACATCTCAGATTCAATACATTAATAGACTTAAATTGGGTCATGCAGCTCAAATTTTGAGACAGCCTAGCACTGCAGTGAGGAACATGGGCCTAATGTCTTCATACCATAGCATAACCATTTCGTATATAATTTGGCTATGAAGATATAGTTTTAATGTGACCCAGCTAAAGAATTGGAAGTCAAATTACTGGGCTCACCAGTGATCGGTGTTACACGATCGGTTTGTATAGTTGCATGCCTCAGCACTAGGCATGTTTGCAAGCCTAACCAAGGCTACAAGAAAGAAGGCAAAACAGGAGGATTACTGGGCTATAGCAACATAGTACTACATGACCAGGTGGAGCAATGCAAAATTTCTGCATGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	443633	416	+	636262	AACAAAAATGTCCTGTCATATCTGGTCCGTATCACCCCTGTGATCTATAGACATCTCAGATTCTATACATTAATAGACTTAAATTGGGTCATGCAGCTCAAATTTTGAGGCAGCCCAGCACTGCAGTGAGGAACATGGGTCTAATG-CTTCATACCATAGCATAACCATTTCGTATATAACTTGGCTATGAAGTTATGGTTTTAATGTGACCCAGTTAAAGAATTGGAAGTCAAATTACTGGGCTCACCAGTGATCGGTGTTACACGATCGGTTTGTATAGTTGCATGCCTCAGCACTAGGCATGTTTGCAAGCCTGACAACGGCTACAAGAAAAAAGGCAAAACAGGAGGATTACTGGGCTATAGCAACATAGTACTACATGACCGGTGGGAGCAATACAAAGTTTCTGCACGCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	455778	415	+	647215	AGAAAGAATGTGCTGACCTATCTGGTCTGTACCAACTCTGTGATCTACGGACAACTAAGA-GCAATACATTAATGGAC-TAAATTGAGTCATGCAGCTCAAATTTTGAGACAGCCTAGCACTGCAGTGAGGAACATGTGCCTAATGTTTTCATACCATGTCTTTATCACTTCGTATCTAATCTGGCTATGAAGATATAGTGTTAATATGACCCAGCGAAAGAATTGGAAGTCTGATTACTAGGCTCACCAGTGGACGGTGTTGCATGTTCCGTCCATATAGCTGCATGCCTCAGAACTAGGCATGTCTGCAAGCCCAACCAAGGCTACAAGAAAGAAGGCAATGCAGGAGGATTACTGGGCTATATTAACATAGTACTACATGACCAGGTGAAGTATTGCAAAATTTTTGCATGCCT

a
s	mr.mrrefChr3	2385	489	+	181019	GTGTTAGCTGGTCCAGACAAGCCTTAAGTTTAGATTATGAATACTGGATCTAACCTAACAGAGATACCTGGAGATAGTACTAGGGTCCGTAATTGAAGTTAATTTCAGTAGCTAACAATAATGCCTGCATGATGGCATGAAAACATTGTTGGCTTTATGTTCACATTTTCCAGTTATAGGGGAACTTGTAGTGCACAGCTTGCATTACCTCCTTTATATTGGCTGGAATCTTACAACAAACAATATGCGGACCTCATTACCATCTAAGATTTGTAGTGTGACACTAATACTTCGACATCAAGCATAGGCCTCAGGGAATGCTGTTTCCCAGTGTGCACAAAAAAATTCTTAACACTCCTTTAATCATGGGTGCATGGTAGACGAATTTCTTAAATAAACTGTTGTGTTGTCTCAGTATCTGATGTTGGGTGTGGGAATGATAAGTTTAAGCCTCGCACTCTTAGTCCCATTGTCAGCCTGACTTATATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	444050	446	+	636262	GTGTTAGCTGGTCAAGACAAGCCTTAAGTTTAGATTGTGAATACTGGATCTAGTCCAACTGAGATACCTGGAGACAGTAGTAGGGTCCGTAATTCAAGTTCATTTCAGTAGCCAATAGTAATGCCTGCATGATGGCATGGAAGCATTGTTGGCTTTACACTCACATTTTCCAGTTATAGGGGAACTTGTAGTGCACAGCTTGCATTACCTCCTTTATATTGGCTGGAGTCTTACAACAAACAATATGCGAACCTCCTTACCATCTAAGATTTGTAGTGTGACACTGACAC-TCGGCATCAAGCATAGGCCTCAGGGAATGCTGTTTCCCAGTGTGCACAAAAAAATCCTTAACACTCCTTTAATCATGGGTGCATGGTAGACGAATTTCTTAAATAAACCGTTGTGTTATCTCAGTATCTGATGTTGGGTGTGGGAATGGTAAGTTT------------------------------------------
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	444496	335	+	636262	-------------------------------------------ACCTGGTGGATTGGTAAATGTGCATATCAACTACTGGGAGATGGTTGGTTGCAGGCTTTTCTTCAGTGCTAGGGCAATAGAAATTTTAGCAGCTTAGTATCTACGATAAGTTATCTTTAACATCACAAATTATAACAGTCAGGTGTACTGT-CATGGTACTC-TATCACAGCAGTAATAAGAAGTCTAGGAACAGTGTATGAGAATTCTCAGTACTGTAAGCTTGTGGTGAACATATGCTACTCCTGTCTACCCCTTTTCCAAGTGCTGAATCAAGTTAGCCAAGATCCTATATGTAGTCCCTATTTTTGCCATCCTATGTACAGGATGTAGCATGC------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	456688	363	+	647215	AGAGTGATAGCCCACCATGATCCTTCAATGCTCCTTATTTGTGATCTGTTGGATTGGTAAATGTGTATATCATATCCTTGGAGAGGGTTG----CAGGCTTTTCTTCAGGGCCAGGGCGAGCAAAATTTTGGTGGTTTAGT-------TTAGATTATCTTTAACATCACAAATTCTGACCGTGAGGTGTACTGTACATGGTACTTTTATCA---CAGTAATAAGAAATCTAGAGACAGTGTATGGTAATTCTCAGTACTGTATGCTAGTGGTGAACATGTGCTACTCCTG--------TTATCCAA-TGCTGAATGGAGTTAACTGAGATTCTATATATAGTCCTTATCGTTGACATCCTATGTACAAGGTGTAGCATGCATGGCA

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	444831	100	+	636262	------------AATTCCTGGGATGTGTTTCAATCTTGATCCACTCAATATGAATGGGACTTTGCTGAGTACATCTTGGGGTATATTCACAGACTGAAGTTGGCAATTCACA
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	3481	73	+	181019	CTTCTTGAGAATCCAAGTCCTAATTACTGCCCTATATGTGTGGATTTAATGTGTCAGGATTAGGTCACAAGTA
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a
s	mr.mrrefChr3	3554	85	+	181019	AAGGACCTAACAAAGCCAACTTACTTCGCTAAATAGATCCTGTCTTACCCAAAGCAATATATTCTTGTTCATAATAAGTAATTAT
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	3682	50	+	181019	ATGCACAGGTTAAAGGGTCACCAGCATTTCTGAGAGTGGGTTCATAATCA
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a
s	mr.mrrefChr3	3732	54	+	181019	TCAGCTGCTGGCGAAAGTTTACCCTCTATCTCACTCAACTGCTAGGCCTAGCAA
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a
s	mr.mrrefChr3	3786	60	+	181019	AGAATTGGCCCTAGTATTGGCTAGTCCCCTTGGTTTATATCACTTTAGATCCCACTTCAG
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a
s	mr.mrrefChr3	3846	157	+	181019	TCCCACTTCAAGCAACATGTAAGTTCCATAGAAGTGCTTATCACATCTAGTTTCAAAATTCTCTAAACCTATAACTACAGAGGCATACAACCCTCTTCTGCAGGCTTCCAAACAAAGGAAGAGACCTGCTGTGGTGGGCTCATCAGTCACTCTCTAT
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a
s	mr.mrrefChr3	4003	70	+	181019	CCTGGATTGTGTTTAGTGGCATTACAATAATTGCCCCAATGATTCCCATGGGGGTTTCAAGTCATACTTC
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	4204	14	+	181019	TGTGAGAGTTTAGT
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	4222	4	+	181019	GAGA
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	4248	138	+	181019	TACTAAACTAATTTTCACAGCTAAGAGGTTCAGTCACAAGGTGCAATAGTGATTTTAATGATATTATCTATTGTTTAATTATTCCATGATCAGATACAATGAAGATGTCTGAGACAATCTATCCAACCTGCAAACAAT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	4645	75	+	181019	actaGGGGATTAGCAAATATCAGCTGCTTTGATAATAGGGAGTGATATTCTTCAAAAAAGACTTTTGGGTAGATT
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a
s	mr.mrrefChr3	4720	74	+	181019	AAACTTCTGGCATGGATCTCGGCTGCTGCATCAGGTGTCAACCCTGCAGCCTTGACAGCATACAGAGAGACCAG
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a
s	mr.mrrefChr3	4794	221	+	181019	TTACCTTTTAAGAGGCTAGAACCTACACAGGGAGGTAATAGTAGCAAGAAGTTCTATAACTGCCCAAAGGGAGCCCAAAGGGAAAGCACATGGAGGTGCTTGACTTTAAGATTTTAAAAATGGGGTGAACACATGCAACATCATGTGCAATTAGCAGCTGGGATCTAGCATCCCTAGCACTTATCCAAGGTATGCATCAATCAATCATAGACAGTTATACC
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a
s	mr.mrrefChr3	5015	143	+	181019	AAATAACTAGTATCACTGGATTGATCTACTGTAACAGAACTGTTATCAGTCCCAGCTATAACAAACGTAATGAATACCTCATACACAGTCCTAATAGAATTGCACGTCATCTGGAAAGTAAGCTTCACAACATTACTTGTTGT
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a
s	mr.mrrefChr3	5158	109	+	181019	CTTATGGAGTGGTATCCTCCCATAGGATGGTATAATTAAAATTTCTTCCTCTTCACTCCATTCCCTATCCAGTACCATTGCTCACTTCACGTTATAGTGGTTTGCTTAC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	459093	109	+	647215	CTCATAGGGTGGTATCCTCCCATAGAATGGCATAATAAATATTTCTTCCTCTTCACTTCATCTTCTATTCAGTACCATTGCTCAATCTACGTTATAGTGGTTTGCTTAC

a
s	mr.mrrefChr3	5267	68	+	181019	TAGGATGACTCCCTCTCCACTCTGCAGAGTATCCAGCATGTGACTTCCTGAGCCATGTTGCATCCCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	447025	68	+	636262	TAGGATGACTCCATCTCCACTCAGCAGGGTATCCAGCATGTTACTTCCTTAGCCATGTTGCATCCCAA
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a
s	mr.mrrefChr3	5335	78	+	181019	ACTAGAAGGTTCAGAAGGCAATGTATTAGTACGCTGTGAGTTATATGGAACTATAACCTGACAAGCATTGCAGCCTAG
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a
s	mr.mrrefChr3	5413	35	+	181019	TTTAGGTTTAGAACTGAGTCTGTGTTAACTGGTGG
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a
s	mr.mrrefChr3	5448	48	+	181019	TGACAGAGATATAGAATCTGTAGATAAGAGAAGGACTCATTTGATGAC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	459370	12	+	647215	TAAGAGAAGTAT------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr3	5496	90	+	181019	TATTAACTACAAGCTGAATTGGAAATCAGGAAATCATCTTAAATAATTCAAGTGTGATTACAAGTTACTTGTGGGTGCTGGGAGTATTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	447258	87	+	636262	TATTGACTATGAGCTAAATCAGAAATCAGGAAATCATCTTAAATAATTCAAGTGTGATTACAAGTTACCTGTGGGTGCTGGGAG---TCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	459382	86	+	647215	----AACTACAAGCTGTATTGGAAATCAGGCAATCATCTTAAATAATTCAGGTGTGATTACAACTTACTTGTAGGTGCTGGAAGTATTTT

a
s	mr.mrrefChr3	5586	56	+	181019	CCCTTGCAAAGAGAACAGAGGAGGAATAACAAGAGCAACTTTCCTTGAGCATAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	447345	56	+	636262	CCCTTGCAAAGAGAACAGAGGGGGAATAACAAGAGCAACTTTCCTTGAGCATAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	459505	56	+	647215	CCCATGCAAAGAGAACAGAGGAGGAATAACAAGAGCAACTTTCCTCGAGCATAAAG

a
s	mr.mrrefChr3	5642	19	+	181019	CATAACACAAGTCTATTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	447425	19	+	636262	CATAACACAAGTCTATTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	459561	19	+	647215	CATAATAGAACTCTATTTC

a
s	mr.mrrefChr3	5661	252	+	181019	ATCAATTTTTACGATGTACCTATAGAATCTTTTTTAGCTAATTCAAACAATGTCATCACCAATCTATTCAACTGAGGTGACCACAATGGATTGCTTTATAATAATACATAATTGTGAAAGAAAAGAACCAGGCCAGCAGACCACAATTAAGGTAACTCATGGGGTGCGTGGCTCTGAGGATATAAGCGCAACAGTAGTATGACCACCAGAATATACATGATTCTGATAGGGAGGGGAACGGATACCACAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	447444	252	+	636262	ATCAATTTTTACGATGTACCTATAGAATCTTTTTTAGCTAATTCAAACAATGTCATCACCAATCTATTCAACTGAGGTGACCACAATGGATTGGTTTATAATAATACATAATTGTGAAAGAAAAACACTAGGCCAGCAGACTACAATTAAGGTAACTTATGGGGTACGTGGCTCTGAGGATATAAACACAACAGTAGTATGACCACCAGAATATACATGATTCTGATAGGGAGGGGAACGGATACCACAGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	459581	248	+	647215	ACCACTTTTTACAGTGTACCTAAAGGATTTCTCTTAGCTAGTTTAGACAATGTCATCCCAAACCTATTCATCTGAGGTGGCCACAATGGATCGCTTTATAATAGTACATAACTATGAAAGAAATGAACCAGGCCGGCAGACCACAATTAAGGTAACTCACGGGGTGTGTGGCTCTGAGGATATAAGTGCAACAGCAGTATGAGCACCAAAATATACAGGATGTTGAGAGGGA----GACAGACACCACAGAG

a
s	mr.mrrefChr3	5913	28	+	181019	TTTAGACACGCCTGAGTTTGGGAAGGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	447698	28	+	636262	CTTAGACACACCTGAGTTTGGGAAGACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	459829	28	+	647215	TTTAGACATGCTTAAGTCTGGGAAGGCC

a
s	mr.mrrefChr3	5941	75	+	181019	AACTCTATACTAAGTAATGGTACATAAGTGCTGTCGCCTTGCTGGCACAACAGAATGATAAGCAGAACATGTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	447727	75	+	636262	AACTCTATACTAAGTAATGGTACATAAGTGCTATCACCTTGCTGGCAGAACAGAATGATAAGCAGAACATGTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	459857	75	+	647215	AACTCTATACTAAGTAATCGTACATTATTGCTGTCGCCACACTGGGACAGCAGAATGGTAAGGAGAACATGTCTC

a
s	mr.mrrefChr3	6016	45	+	181019	ATAATAAGTATCCAATCAATCTATCTGTTAAAGGCCAATTCCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	447808	45	+	636262	ATAATAAGTATCTAATCAATCTATCTGTTAAAGGCCACACCCTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	459932	34	+	647215	-----------CCAATCCTTTTCTTGGTTAATGTAGAATTCCTTA

a
s	mr.mrrefChr3	6061	16	+	181019	GTTAATGTACATTTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	447854	16	+	636262	GTCAAGCTATAGCTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	459966	16	+	647215	GTTAGTGTACATTGTC

a
s	mr.mrrefChr3	6077	64	+	181019	TTTTAAAACCAGCAAGCCTAAAATATCACTTCAAGAAACCCTTACTAGATGATCATAAATCTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	447878	64	+	636262	TTTCAAAACCAGCAAGCCTAAAATATCACTTCAAGAAACCCTTACTAGATGACCATAAATCTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	459982	64	+	647215	TTTTAAAACCAGCAAGCCTAAAATATCACTTCAAGAAATCCTTATTAGATGATCATAAATCTAC

a
s	mr.mrrefChr3	6141	17	+	181019	TCTTGCACCCAGAGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	447943	17	+	636262	TCTTGCACCCAGGGACA
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a
s	mr.mrrefChr3	6158	163	+	181019	TCATAGTATCCTTCCTGCTGTATGTTTAAGATCCCAAAATTGATATTCAAGGTTTTGTATCCTTTGTTGTTGGTTTGACTATTATGGGTGGCACAGCGGTGTTTCCATCATCACACGATATTTTGGAGGGCCAACCATGGAGGTTTGCAACTTTGCATCGCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	447963	162	+	636262	TCATAGTATCCTTCCTGCTGTATGTTTAAGATCCCAAAATTGATATTCACTGTTTTGTATCCCTTGTTGTTGGTTCGACTATTATGGGTGGCACAGCGGGGGTTCC-TCATCACACGATATTTCGGAGGGTCAACCATGGAGGTTTGCAACTTTGCATCGCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	460063	162	+	647215	CCATAGTATTCTTGCCGCTGTATGTTTAAATCCCCAAAATTAATATTCGAGGTTTTGTATTCTTTGTCATTCGTTTGACTATTATGGGTGTTACAGCAGTGTTTCCAGCATCACATGAGATTTTGGAGTGCCAAACATGGAGGTTT-CAACTTTGCATCACAC

a
s	mr.mrrefChr3	6321	335	+	181019	CAACAATTATCTAGTATCAGGGTGTATACATTCCAATAAGATACTCAATTGGAATAGGGGACTAATAACACATGAGTTACATGAAAGACCTGAGCTAGGCCCCATGAGAAAGAAGGAAACAAGGTACGTTCTTTACTGGAAGGAAATAGAAGATGAAATCTCTTTTATGGCTGATAGTGAAAGATCACCGGAATAACAACAAGAACAGCATTTATTGTCTTACTTCTATTCTTGTACCAATCTGACTGAATCTCACATAGATAATTATCAACACCCTGACTAATGTATGTGGAACAATGTCCAAAAAGGGAGACCTTGGGGGTTTGAAACAGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	448142	335	+	636262	CAACAATTCTCTAGTATCAGGGTGTATGCATTCCAATAAGATCCTTAGTTGGAATAGGGGACTAAGAACACATGAGCTACATGAAAGACCTGAGCTAGGCCCCATGAGAAAGAAGCAAACAAGGTACGTTCTTTACTGGAAGGAAATAGAAGATGAAATATCTTTCATGGCTGATAGTGAAAGATCACCTGAATAACATCAATAACAGCATTCATTGTCTTACTTCTATTCTTGTACCAATCTGACTGAATCTCACATAGATAATTATCAATACCCTGACAAATGTATGTGGAACAATGTCAAAAAAGGGAGACCTTGGGGGTTTGAAACAGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	460225	312	+	647215	CAACAATTAGCTAGTATCAGGGTGAATATATTCCAATAAGATACTCAATTGGAATAGGGGACTAGTAACACATGAGTTACATGAAAGAC--------------------AAGACGGAAACAACGTACGTTCTTTA---TAAGGAAATAGAAGATGAAATCTCTTTTGTGGCTGATAGTTAAAGATTACCGTAATAACAACAAGAACAGCATTTGTTGTCTTACTTGTATTCTTGTACTAAACTGAATGAATCTCACATAGATAATTATGAACACCCTGACTAATGTATGTGGAACGAGGTCCAAAGAGAGAGACCTTGGGGGTTTGAAACAGAAT

a
s	mr.mrrefChr3	6656	122	+	181019	AATGGAATGTCAGTTTAGTATTGATATAGCGAACTTTGCTCTTGAAGGCAAAGTCTCTACAATCTGACCAATCAGATAACTGTGGTGGAAACTCAGCCCTCTGCCACGTCCACAATGTGGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	448477	122	+	636262	AATGGAATGTCAGTTTAGTATTGATATAGGGAACTTTGCTCTTGGAGGCAAAGTCTCTACAATCTGACCAATCAGATAACTGTGGTGGAAACTCAGCCCTCTGCCACGTCCACAATGTGGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	460551	122	+	647215	AATGGAATTTCAGTTTAGTATTGATGTAGCGAACTTTGCTCGTGAAGGCAAAGTCTCAACAATTCTACCAATCAGATAACAGTTGTGGAAACTCAGCCCTCCGCCACATCCACAATGTGGAT

a
s	mr.mrrefChr3	6778	138	+	181019	ATCAAGTGAAGAAAAAGCCACAGCCATTCCCTTAAGCTGGGATGGTATGGAACTTTGCCATAAACATAACAACATTTGTTGTTACTGATCTTATATTCTGAAGTGGGACTGTATAAATTTCTAAAATGTACTCTGAAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	460673	138	+	647215	ATCAATTGAAGAAAAAGCCACAGCCATTCCCTTAAGCTGGGATGGCATGGACGTATGCCATAAACATAACAACATTTGTTGTTACTGATCTTATATTCTGGAGTGGGACTGTATAAATTTCTAAAATGTACTCTGAAA

a
s	mr.mrrefChr3	6916	37	+	181019	TGTACTCAATTGAAGGATCTAGTAGTTGTTGAGCCTA
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a
s	mr.mrrefChr3	6953	23	+	181019	CAGAGCTTCATAATGGTTAGGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	448784	23	+	636262	TAGAGCTTCATAATGGTTAGGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	460849	23	+	647215	CGGAACTTCATAGTGGTTAGGCA

a
s	mr.mrrefChr3	6976	420	+	181019	GGTAGTTTCTCCCATGGCTTATTGATAATCTAGGCCAAAATAATGCTAGACCATACACCATACTGATGAATTTGTGTAAAGGACTAATGCAGCTATCACTCTTAGCTGTCCCACTTCCATGTGTTCTAGTCTTCTATCCCCCAGTCAGTCTGACGTTCCATGGTAGTTCTCCCACACAATCTGCCATGGTCCAAGCATGCTGGCTGATAAACCCTGACAAAGAATCCACTATCACTCTTAGCTATTAGTTTTAATCATGAGATTTAGTTTTTCATTTCCACATTGGGCTTGCAATCCATCACAGTTCTTTCACACAAGCCACCAACTTCATGAACTGTCAAATTTGAACTTGGACCTGAATGGTTAACCCCAAGTACTACCTGTGGTCCTCATTCTGAGCTTGGAAAATGTGCTGCATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	448808	415	+	636262	GGTAGTTTCCCCCATGACTTATTGATAATCTAGGCCTAAA----GCTAGACCATACACCATACTGATGAATCTGTGTAAAGGACTAATGCAGTTATCGCTCTTAGCTGTCCCACTTCCATATGTTCTAGTCTTCTATCCCGCAGTCAGTCTGACGTTCCATGGTAGTTCTCCCATGCAATCTGCCATGGTCCAAGCATGCTGGCTGATAAACCCTGACAAAGAATCCACTATCATTCTTAGCTATTAGTTTTAATCATGAGATTTAGTTTTTCATTTCCACATTGGGCTTGCAATCCATCACAGTTCTCTCATACAGGTTACCAACTTCATGAACTGTCAAATTTGAACTTGGACCTGAATGGTTAACCCCAAGTACTACCTGTGGTCCTCATTCGGAACTTAGAAAATGTGCTGCATC-
s	simRat_chr6.simRat.chr6	460872	399	+	647215	GGTAGTTCCTCCCATGGCTTATTGATAATATAGGCCAAAATAATGCTAGACCAT-----GTACTTATGAATTCGTGTAAAGGACTTATGCTGCTATCACTCTTAGCCGTCA-------ATGTGCTCTAGTCTTCTATCCCCCAGTTGTGCTGAAGTTCGATGGTAGTTCTCCCACACAATCTGCCATGGCCGAAGCATGCTGGCTGATTAACCTTGACAAAGAATCCACTAT-GCTCTTAG-TATTAATTTTAGTCATGTGAATTAGTTTTTTATTTCCACATTGGCCCTGCAATCCGTCACAGTTCTTTCACACAAGCCACCAACTTCATGAACTGTCAAACTTGAAGTTGACCTTGAATGGTTATTGCCAAGTACTACCTGTACTCCTCATTCTGAGGTTGG-------GCTGCATCT

a
s	mr.mrrefChr3	7396	4	+	181019	TTCT
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a
s	mr.mrrefChr3	7400	853	+	181019	AACAAATGCAGAAATTCTACCAAAGTACTCCAAAGATGCCTATCTTGCTATCAAATGGGAAGTTGTTGCAAGAAAGGAGTAGACAAATACTGAAAGGCTGATTGACTGATAGAGGCATTAATCCAGGATATGCACCTTCAGACTCCAGTTCATGGCTAATTTGCGACAACACACCTGCAAGTTACTAAAAATGTGGAGATTATTCACACATCTATGTTTAGATTTCACTGCCAGACTAAAAAGGAGTAGGTAACTAGACATGCACTGATTGTTATGGATATGTTGCATTAAGTTGACACAAGGGGGGGGATGATGATTTACAGATCTTATTAAGGTATTACAGTTTTAGTTGAAAGTACAGCATGACAGCCACAGATACCTTCTAATAAACATTGTCTTGTTTCTCCACCTTGTAATATCAATAGCCATATAGTACATGTCCTGCCCAAATTGTAGCTGTGAAGAGTCCCTATGATCTAGTGACTGGGTCCCATGCATCTTCACAGAACCATTGGGATACTGCTTTACTGGCTGCTTCAGGTGATCGTTGAATACCTGACTTGTTAGTAGCCTGAAGAGTTTGCTGGGTCCCAGCATCCTGCACCTTGACAGGAGAACCTTGAGTTCCAACCTCCTGTACTTTAACAGAGCGTTGTGTCCCAGTGTCTCGAGGCTCCACTGGTCGTTGTGTGCCAGCTTCCCTCACAGCTATTGAGGAGCGCTTAGTCTTGGATTTCTGTGTGGCTACATCTTTAGCAAGGGCTTTCCCCGAACCTTGCAATGTTATGAAACATACCATGTCTATTTGTCTCCACATGAGCTGTAGTGGAAACATGACAGATGATCATTCAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	449223	839	+	636262	AACAAATGCAGAAATTCTACCAAAGTACTCCAAAGACGCCTGTCTTGCTATCAAATGGGAAGCTATTACAAGAAAGGAGTAGACAAATACTGAAAGGCTGATTGACTGATAGAGGCATTAATCCAGGATATGCACCTTCAGACTCGAGTTCATGGCTAATTT-------CATACCTGCAACTTACTAAAAATGTGGAGATTATTCACACATCTATGTTTAGATTCCACTGCCAGACTGAAAAGGAGTAGGTAACCAGACATGCACTGATTGTTATGGATATGTTGCATTAAGTTGACACAAGGGGGGGTATGATGATTTACAGATCTTATTAAGGCATTACAGGTTTAGTTGAAAGTGCAGCATGACAGCCACAGATACCTTCTAATAAACATTGTCTTGTTTCTCCACCTTGTAATATCAATAGCCATATAGTACATGTCCTGCCCAAATTGTAGCTGTGAGGAGTCCCTATGATCTAGTGACTGGGTCCCATGCATCTTCACGGAACCATTGGGATACTGCTTTACTGGCTGCCTCAGGTGATCGTTGAATACCTGACTTGTTAGTAGCCTGAAGAGTTTGCTGGGTCCCAGCATCCTGCACCTTGACAGGAGAACCTTGAGTTCCAACCTCCTGTACTTTAACAGAGCGTTGTGTCCCAGTGTCTCGAGGCTCCACTGGTCGTTGTGTGCCAGCTTCCCTCACAGCTATTGAGGAGCGCTTAGTCCTGGATTTCTGTGTGGCTACATCTTTAGCAAGGGCTTTCCCTGAACCTTGCAATGTTATGAAACATACCATGTCTATTTGTTTCCTCATGAGCTGTAGTGGAAACATGCC-------CATTCAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	461283	804	+	647215	AAGAACTGCAGAAATTCTACCAAAGTACTCCAAAGATCCCTATCTTGCTA--AAATGGGGATTTGTTGCAAGGAAGGGGTAGACAAATACTGAAAGACTGACTAACTGATAGAGGCATTAAATCAGGAAATGCACCTTCAGACTCCAGTACATGGCTAATTTGCGACAATACAGCTGCAAGTTACTAAAAATGTGGAAACTATTCACACATCCATGTTTAGATTTCACTGCCAGACTAAAAAGGAGTAGCTAACTAGACATGCACTGATTATTATGGATATGTTGCA--AAGTTGATAAAAAGGGAGGGATGATGATTTATAGATCTTATTAAGGTATTACAGTGTTAGTTGAAAGTACAGCATGACAACCACAGATTCCTTCTAATAAACATTG-----------------------------------------ATGTCCCACCC----TATAGTTGTGAAGAGTCCCTATGATCTAGTGACTGGGTCCCAAGCATCTTCACAGAACCATTGGGATACTGCTTTACTGGCTGCTTCTGGTGAGCGTTGAATACCTGACTTGTTAGTGGCCTGAAGAGTTTGCTGGGTCCCAGCATCCTGCACCTTGACAGGAGAACCTTGAGTTCCAACCTCCTGTACTTTAACAGAGCGTTGTGTCCCAGTGTCTCGAGGCTCCACTGGACGTTGTGTACCAGCTTCCCTCACAGCTATTGAGGAGCGCTTAGTCTTGGATTTTTGTGTGGCTACATCTTTAGCAAGGGCTTTCCCCGAACCTTGCAATGTTATGAAATATACCGTGTCTAATTGTCACCACGTGAGCTGTAGTGGAAACATGACAGATGATCAGTCAGT

a
s	mr.mrrefChr3	8253	130	+	181019	TCTTAGACAGGTCATGTATTCCAACAGGTCAATAAGTGTTTAGTGCCCTACCATGATTGGTAAAGAAGACCTGCCTAGCAGATGGAATTAAGACATAAACCATTTCATAGTTTCCACAGCCTTTGAACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	450065	130	+	636262	TCTTAGACAGGTCATGTATTCCAACAGGTTGATAAGTGTTTAGTGCCCTACCATGATTGGTAATGAAGACTTGCCTAGCAGTTGAAATTAAAACATAAACCATTTCTTAGTTTCCACAGCCTTTGAACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	462087	129	+	647215	TCTTAGACAGGTCATGTATTCCTACAGATCAACAAGTGTTTAGTGCCCTACCATAATTGGTAAAGAGGACCTGACTAGCAGATGGAATTAAGACATAAACCATTTCAAAGTTTC-ACATCCTTTGAACAA

a
s	mr.mrrefChr3	8383	25	+	181019	CATTACCAGCTCAAACTGACTAGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	450195	25	+	636262	CATCACCAGCTCAAACTGACTAGCC
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a
s	mr.mrrefChr3	8408	22	+	181019	ACACAGAAAACCTTTTGCCCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	450220	22	+	636262	ACACAGAAAACCTCCTGCCCAA
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a
s	mr.mrrefChr3	8430	494	+	181019	AGCAAGTGATGATAGTCAGCCAGGTTCATAATCATTTTTATGTCTTCCTGGAAGGAAGATCTTCCAAATACCAGGATTTCTGCTTCACCATTAGGATCTAGGCGATTGACATGAACTAAGATTTGAGACATACCCTGGACATGTGGAATACGTTCCCCACCCCGGCCTGTGTGGGATGGACTAGCATGTGCAAGGAAATGATCAGCTTTATTTTGTGCAAGACAGGAGGGCTGCACTAAGTGACCTGCTGATCCACAACTACTCAAGAAAGTTACCACAGATCACAATCACCTCTTACCAAAGATCTTGTCCACCAACCAGACCTCCAGCCGTACTACTTTTGGATTCTTGAGGAACTCTGAGTGAAACCAAGAAAATTGCTGAGGGAGGTGACTGAGCACCTCTACTGGCATTGCCCTAAGCTGCATCAAATGTACAAGCGATGGGCTGGGAGCATCCATAGCAGACAGGCAATCATAAGGTACTTACTTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	450289	381	+	636262	AGCAAGTGATG---------CAGGTTCATAATCATTTTTATGTCTTCCTGGAAGGAAGATCTTACAAATATCAGGATTTCTGCTTCACCATTAGGATCTAGGCGATTGACATGAACTAAGATTTGAGACATACCCTGGACATGTGGAATACGTTCCCCACCCCGGCCTGTGTGGGATGGACTA--------------------------------------------------------------------------------------------------------TGACCTCTTACCAAAGATCTTGTCCACCAACCAGACCTCCAGGCGTACTACTTTTGGATTCTTGAGGAACTCTGAGTGAAACCAAGAAAATTGCTGAGGGAGGTGACTGAGCACCTCTACTGGCATTGCCCTAAGCTGCATCAAATGTACAAGCGATGGGCTGGGAGCATCCATAGCAGACAGGCAATCATAAGGTACTTACTTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	462268	488	+	647215	AGCAAGTGATGATAGTCAGCCAGGTTCATAATCATTGTTATGTCTTCCCAGAAGGAAGATCTTCCAATTACCAGGAATACTGCTTCACCATTAGGATCTAGGCAATTGACATGAACTAGGATTTGAGACATACCCTGGACATGTGGAATACGTTCCCCACCCCGGCCTGTGTGGGATGTATTAGCATGTGCAAGGAAATGATCAGCTTTATTTTGTGCAAGACAGGAGGGCTGCACTAAGTGACCTGCTGATCCACAACTACTCAAGAAAGTTACCACAGATCACAATCACCTCTCACC------CTTGTCCACCAACCAGACCTCCAGCTGTACTACTTTTGGATTCTTGAGGAACTCTAAGTGAAACCAAGAAAACTGCTGAGGGAGGTGACTGAGCACCTCTACTGGCATTGCCCTAAGCTGCATCAAATGTACAAGTGGTGGGCCGGGAGCATCCATGGCAGACAGGCAGACATAAGGTACCTGCTTGAA

a
s	mr.mrrefChr3	8924	148	+	181019	ACTTCGCCTGGAGTCAACCCTGCAAGATTCAACTACTTCCCTAGAAGTGCATCACAGTAGAACTGAGGGATATAAGCAGGCAGGGCCACTATAAGATTATTGAGACTTCTGCTGCAATAGAGACTTTGCAATTAAGCAGTCTTGGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	450670	141	+	636262	ACTTCTCCTGG-------CCTGCAAGATTCAACTACTTCCCTAGAAGTCCATCACAGTAGAACTGAGGAACATAAGCAGGCAGGGCCACTATAATATTATTGAGACTCCTGCTGCAATAGAAACTTTGCAATTAAGCAGTCTTGATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	462759	148	+	647215	ACTTCGCCTGGAGTCAACCCTGTAATATTCGACTACTGCTCTAGAAATGCATCATAGTACAACTTAGGGATATAAGCAGGCAGAACCACTAAAAGATTATCAAGACTTCTATTGCAATAGAGACGTCGCAATTAAGCAGAGTTGGTGT

a
s	mr.mrrefChr3	9072	91	+	181019	AAGTGTTAGGTCTTTTGCTTAGTTGCTTTTAGCGTTGTGTCTTGGCCCTTATTCGCTTCATACAACCACACAGACACATTTTCAGCTATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	450816	91	+	636262	AAGTGTTAGGTCTTTTGCTTAGTTGCTTTTAGCGTTGTGTCTTGGCCCTTATTCGCTTCATACAACCACAGAAACACAGTTTCAGCTATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	462907	90	+	647215	AAGTGTTATGTCTTGTGCACAGTCACTGTTAGTGTTATGTCTTG-CCCTTAGTTGCTTAGCACAACTACACAGACAGATTAACAGCTATAA

a
s	mr.mrrefChr3	9163	53	+	181019	TAACACCATGTCTGTATGAGAATCCATTGTCTTCCAAGGGGAAGCACTTGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	450907	53	+	636262	TAACACCATGTTTGTATGAGAATCCATTGTCTTCCAAGGGGAAGGACGTGTAT
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a
s	mr.mrrefChr3	9216	125	+	181019	TGAGTCTACTATTCATTGGGCTAGATGCCTATGTTTACATGTTTCAAACTATAATGCATGTTCTAGTTTAACTTGCTTTGCTTTTCTGCAGGTCATCCCCTCGAGCAGATGAATACTATCTCTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	450960	124	+	636262	TGAGTCTACTATTCACTGGGCTAG-TGCCTGTGTATGCATGTTTCAAACTTTAATGCATGTTCTAGTCTAACGTGCTACCCCTTTCTACAGGTCATCCCCTCGAGCAGATGAATACTATCTCTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	463052	125	+	647215	TGAGTCTACTATTCATTGGGCTAGATGCCTATATTTACACATTTCAAACTATAATGCATCTTCTAGTTTAGGTTGCTTTGCTTTTCTGCAGGTCAGCCCCTCGAGCAGATGAATACTATCTCTAT

a
s	mr.mrrefChr3	9341	96	+	181019	TAATGGCTACAAGGCAACAACAGAAGCTTATTAGGTGTAAGATCCGAGAGACATCTCTATGACTACTAATCTCCAAGAACTATAATCTGCAGCTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	451084	95	+	636262	TAATGGCTAC-AGGCAAGAACAGAAATTTATTAGGTGTAAGATCCGAGAGACATCTCTATGACTAGAGATCTCCAAGAACTATAATCTGCAGCTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	463192	79	+	647215	TAATGGCTACAAGGCAACAACAGAAGCTTACAA-----------------ACATTTCTATGACTACTAATCCACAAGAACTATAATCTGCAGCTCT

a
s	mr.mrrefChr3	9437	9	+	181019	CAGCTCATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	451183	9	+	636262	CAGCTCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	463271	9	+	647215	CAGCTCATA

a
s	mr.mrrefChr3	9446	193	+	181019	CTCGGATTCTGTACTATGAATTTACAGAACCCTGGTATAGGTCTGTGAAAATGTTGTCATGTTAATTTCATTACTGTCATATCATGATGAATTAATCCCTGTGCTGTCCATAGAAGTTAATAGGCTAGGCATAAATACACAGATCTTGTTTTGGGTCTTAAGATGTCAGATGGAGAAAACACTCTAAATCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	451193	193	+	636262	CTCGGAGTCTGTACTATGCAATTACAGAACCCTGGTATAGGGCTGTGAAGATACTGTCATGTTAATTTCATTATTGTCATATCATGATGAACTAATCCCTGTGCTATCCATAGAAGTTAATAGGCTAGGCATAAATAAACAGATCTTGTTTTGGGTCTTAAGGTGTCAGATGGAGAAAACACTCTAAATCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	463280	190	+	647215	CTCGGATTCTGTACTATGAATTTAAAGAACCCTGGTATAGGTCTGTGAAAATGTTGTCATGTTAAGTTTATTACTGTTGTATCATGATGAATCAATTCCTGTGCTGTCCATCGAAGTTAATAG---GGGCATAAATACACAGATCTTGTTCTGGGTCTTAGGATGTCAGATGGAGAAAACACTCTAAATCATT

a
s	mr.mrrefChr3	9639	36	+	181019	CTACTTACCTTGGTGTTTTCCCTCAAGACAAGCGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	451388	36	+	636262	CTACTTACCATGGTGTTTTCCCTCAAGACAAGCGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	463470	35	+	647215	CTACTTACCTCGGTGTTTTCCCTCAAGATAAGTGC-

a
s	mr.mrrefChr3	9675	74	+	181019	AGTGGTATGCAAATAAATACTGATAGATTGACATTGATGGAAGTTGAACACATGGGAAGTGACGACTATCTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	451433	53	+	636262	AGTGGTATGCAAATAAATACTGATAGGTTG---------------------ATGGGAAGTGATGACTAACTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	463505	73	+	647215	AGTGGTATGCAAATAG-TACTGATAGATTGACATTGATGGAAGTTGAACACATGGGAAGTGACGACTATCTTGA

a
s	mr.mrrefChr3	9749	9	+	181019	CAGGTAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	451489	9	+	636262	CAGGTAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	463578	9	+	647215	CAGGGAATG

a
s	mr.mrrefChr3	9758	198	+	181019	TCTTACTAGCCACAGTGAAGATTATCTTGAACCCAGGTAATTATTAAATGTCTTACTAGTCACTGTACTAGGGGAAGCCGGACCAGTTGGGATTCCTAGATATGGGTCAGGTGGTCCCTGTATGCATTTTCATATTCAATAGTTCACATGCGAATGCTCTGTGGAAGCTAATGAGCGATACTGTCTTCTGGTACTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	451498	198	+	636262	TCTTACTAGCCACAGTGAAGATTATCTTGAACCCAGCTAATTATTATATGTCTTACTAGTCACTGTACTAGTGGAAACCGGACCAGTTGGGATTCCTAGATATGGGTCAGGTGGTCCCTGTATGCATTTTCATATTCAATAGTTCACATGCGAATGCTCTGTGGAAGCTAATGAGCGATACTGTCTTCTGGTACTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	463595	100	+	647215	CCACACTAGCCACAGTGATGACTATCCTGAACCCAGGCAATTATTAAATGTCTTACTAGTCACTGTACTAGGGGAAGCCTAACCAGTTGGGATTCCTAGA--------------------------------------------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr3	9956	64	+	181019	CTTTGGTTGGGACAACCATTAATCATCAACACAAGCTTTTGAGTACATTCTAAAAACTCAACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	451700	64	+	636262	CTTTGGTTGGGACAACCATTAATCATCAACACAAGCTTTTGAGTACATTCTAAAAACTCAACTT

a
s	mr.mrrefChr3	10020	74	+	181019	TCTAGTGTGAATGTTGTTGAACTCCTGTTTTGTTAATGGTTCAAAAACAGCCTTCCCTTGGTTTAAATAAGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	451769	69	+	636262	TCTAGTGTGAATGTTGTTGAACTCCTGTTTTGTTAATGGTTCAAAAACAGCCTTCCCTTGGTTTAAATA-----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	463695	5	+	647215	---------------------------------------------------------------------AGCCA

a
s	mr.mrrefChr3	10094	22	+	181019	AATCATTATGAGGTATTGCCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	451838	22	+	636262	AATCATTATGAGGTATTGCCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	463724	22	+	647215	AATCATGATGAGGTTTTGCCCA

a
s	mr.mrrefChr3	10116	360	+	181019	CAAATGCTAATGGGTTGACTTAGGGGGGCTACTGCCACAAATATCAGTAGGGTGACATACGGGGACTAGTGTAAGCCCCCTTGTAGACCAAGATAATGACAGATTGCTATAAAATGCATGTGATGTTCATACTATACCAGTATTCAAGGTGTCTCCCTAACTCTATGTTCCCTTTTTGATCTAAGCTCCTGTCTCCCTGTAATCCTTTTCCTGCCCCAGCTTCCCCAGTGTATCAACCAAGAATTGAATAACCTGAATAAATTGCACGATTTCTGTGTATAGCTGGAAACCAGTATATTTATGGTTCACCTGCATTGGTGAACCATTTTCCATAAGTATGTACACCAGCAAAGTAATGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	451865	354	+	636262	CAAATGCTAATGGGTTGACTTAGGGGGGCTACTGCCACAAATATCAGTGGGGTGACATACGGGGACTGGTGTAAGCCCCCTCGTAGACCAAGATA---ACAGATTGCTATAAAATGCATGTGATATTCATACTATACCAGTATTCGAGGTGTCTCCCAAATCCTATGTTCCCTTTTTGATCTAAGCTCCTGTCTCCCTGTAATCA---GCCTGCCCCAGTTTCCCTAGTGTATCACCCAAGAATTGGATAACCTGGATAAATTGCACGATTTCTGTGTATAGCTGGAAACCAGTATATTCATGGTTCACCTGCACTGGTGAGGCATTTTCCATAAGTATGTACACCGGGAAACTAATGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	463746	360	+	647215	CAAATACTAATGGGTTGACTTAGGGGGCCTACTGTCGCAAATATCAGTAGGGTGACATATAGGCACTACTGTTAGCCCCCTTGTAGACCAAGATAATGACAGATTGCTATAAAATGCATGTGATGTTCATACTATACCAGTACTCAAGGTGTCTCCCTAACTCTATGTTCCCATTTTGATCTAAGCTTCTGTCTCCCTGTACTCCTTTTCCTTCCCCAGCTTCCCCAGTGTATCAACCAAGAATTGAATCACCTAAATAAATTGCACGATTTCTGTGTGTAGCTGGAAACCAATATATTTATGGTTCACCTGCATTGGTGAACCATTCTCAATAAGTATGTACACCAGCAAAGTAATGGA

a
s	mr.mrrefChr3	10476	396	+	181019	AATTTCTTTTTGTGTGATGTGAAGTGTAGACCCCCGTGGCAAGTACAGAGAGTAGAAGGTATTACTGTGTTTGGGTTTGTGGACTTGAAATGACAATCAGGGATGATCATTGTCCCTTGAAGAGTTGAGCAGTATTTCCACAACTCTTGCCATAGTGATAATTGGCTGTGCTCAGCAGTGCTACTCTATGTCAAGAGTACAACTCCATTAAAAATATGCATGTCTTAACATTGATCATTACTAGGACATGTTATTGAATTTGCCAATTTTGCAGGTGTAGTAATGAAACTAGCTTGCATATGAAGGGACTTGTTTCCTTGTTAAAACAGGAGCAGAGCTGTGAATTTCATTGATCAAATCAGTATAACAACAGGAACAGGGATGTGAATTCTACAT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	464106	394	+	647215	AATTTCTCATTGTGTGTTGTGAAGTGTAGACCCCAGAGGTAAGTACAGAAAGTAGATGGTATCAGTGTGTTTGGGTTTGTGGACTTGAAATGACAATCACGAA-GATCATTGTCTCCAG-AGAGTTGAGCAGTATTTTAACAAGTCTTGCCATAGTGGCAATTGGCTGCCCTCAACAGTGCTACTCCATGTCAAGAGTGCAACTCCATTAAAAATATGCATGTCTTAACAATCATAATTACCAGGACTCGTTATTGAATTTGCAAATTTTGCAGGTGTAGTAATGAAACTAGCTTGCTTATGAAGGGACCTGTTTCCTTGTTAAAACAGGAGCAGAGCTGTGAATTTTATTGATTAAATCAGTATAGCAACAGGAACAGGGATGTGAATTCTACAT

a
s	mr.mrrefChr3	10872	53	+	181019	ACATGGGTTCAATCAAAGTAAGAGCCTACATTTTATACACATGAGCTCAATTT
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a
s	mr.mrrefChr3	10925	47	+	181019	CACTCAATACCAATGTCAATGGTCATGTCAAGATGCCTGGTCTTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	452686	47	+	636262	CACTCAATACCAATGTCAATGGTCATGTCAAGATGCCTGGTCTTGCT
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a
s	mr.mrrefChr3	10972	77	+	181019	GATTGGTTCAGCTGAAAGAGGTGTAGTGTTTAGAAAATCCTCTTAATGGATGGCATGTTATCCTTAATAAATCAATA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	464614	77	+	647215	GATTGATTCAGCTAAAAGAGGTGTAATGTTTAGAAAAACCTCTTAATGGATGGAATGTTATCCTTAAAAAATTAATA

a
s	mr.mrrefChr3	11049	252	+	181019	AAGTTGGGCACATCAAACAAGAACCATATAATTCCAAAGAGTGGCAATCCTGTGATAGCCAGAGACAATGGGGCTGTCTACAGCCTGGCAGTGTATTCCCAGATACAGCATCAAGGTTTCTATAATCTCAGTAGAGTTATTTTAAATTGGAAAACATGTGGTGAAGTAAAATGTAAACATGTCCTCCTAATCCCTGGCCTTTGCAGAAAATGTTGTCATGATGATATCCTTGACACTTATATCAGCTATCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	452810	247	+	636262	AAGT--GGCACATCAAACAAGAACCATATAATTCCAAAGAGTGGCAATCCTGTGATAACCAGAGACAATGGGGGTGTCTATAGCCTGGCAGTGTATTCCCAGGTGCAGCATCAAGGTTTCTATAATCTCAGTA--ATTATTTTAAATTGGAACACATGTGGTGGAGTAAAATGTAAACATGTCCTCCTGATCCCTGGCCTTTGCAGAAAATGTTGTCATGATGATATCCTTGACACCTATATCAG-TATCAG
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a
s	mr.mrrefChr3	11301	417	+	181019	GTTTTGGAGGTTTCACTCCAATGAGAACCTATGCTAGTTCCTTTCTTCCAAATACACTGACTCTTGTGTATCAGAAACAAACCTGAAAGAAATCGTGAGTGTAACTGATCGGGGTGAGTGGATTAGACATTACATCCATACATATTTACCTGGCCTATACAATAAACTCCCCCTAAAAACTGCAACAAAAATGAAGCCTTTGAGAAACTGTAAGACAAATGAAATGGCTTGTCAGTAGTTGAATAAGCCTAACCAATGCAAAAAATATCCACAGGTCACTTGAAGCTGTGTACCAGGCCTAGCTTGGATTTCCTATCTCTGGCTGATGCTGGTGAGAAGCTCTGCACAGGCACCAATACCAATAGAACACTTGCCCCCTCAGGCAATGGTTACAACCACATGGAAAATTCATCTGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	453057	389	+	636262	TTTTTGGAGGTTTCACTCCAATGAGAACCTATAATAGTTCCTTTCTTCCAAATACACTG---------------------------AAGTAACCGTGAGTATAACTAATCGGGGTGAGTGAATTAGACATTACATCCATACACATTTACCCAGCCTATACAATAAACTCCCCGTAAAAACTGCAACAAAAATGAAGCCTTTGA-AAACTGTCAGACAAATGAAATTGCTTATCAGTAGTCAAATAAGCCTAACCAATGCAAAAAATATCCACAGGTCACTTGAAGCGGTGTACCAGGCCTAGCTTGAATTTCCTATCTCTGGCTGATGCTGGTGAGAAGCTCTGCACAGGTACCAATACCAATAGAACACTTGATCCCTCAGGCAATGGTTACAACCACGTGGAAAATTCATCTGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	464945	413	+	647215	GTTTTGGAAATTTTACTCCAATGAGAACCTATGCTAGTTCCTTTCTTCCAAATACACTGACTCTTGTGTATCAGAAACAAACCTGAAAGAAATCCTGAGTGTAACTGATCAGGGTGCGTGGACTAGACATTACATCCATGCATATTTA--TGGCCTATACAATAACCTCCCCCTAAAAACTGCAACAAAAATGAAGCCTTTGAGAAACCATAATACAAATGAACTGGCTTGTCATTAGTTGAATAAGCCTAACCAATGCAAAAAATATCCACAGGTCACTTGAGGCTGTGTACCAGGCCTAACTTGGATTTTCTATCTCTGGCT--TGCTGGTGGGAAGCTCAGCACAGGCACCAATACTAATAGAACACTTGCCCCCTCAGGCTACGGTTACCACCACATGGGAAAGTCATCTGGA

a
s	mr.mrrefChr3	11718	316	+	181019	TGGCAAAGTCCATCTTGATTATAATTGAGGGACATGTGATTATACAATGGGCATCATGCTACAAAAAGTTGTGGAAACACTCAGTAAGCAGAAAGTTTTTTGGACAGGTGAATGTATCAAAAAATCTACTGCATGACCATGTGATGAGAATATGCAGGTTAAGGGCCAGACTAAACTAATAGGTTTAGTACAGGTGTGAACACTCTTAAATAATTTAGGACAAAGCAACAAGTGGGAAACTATAGGGTACAGGTGTGAACACTCTTTAATAATTTACAACAAAGAAACAAAGAAACAAGTGGTAAACTATAGGGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	453446	236	+	636262	--------TCCATCTTGATTATAATTGAAGGACATGTGGTTATACAATGGGCAGCATGCTACAAAAAGTTGTGGAAACACTCAGTAAGCAGAAAGTTTATTGGACAGGTGAATGTATCAAAAAATGTACTGCATGACCACATGATGAAAATATGCTGGTTAAGGGCCAGACT---CTAAGATGTTCA-------------------------------------------------------------ACAGGTATGAACACTCTTTGATAATTTACAACAAAGA--------AACAAGTGGTAAACTATAGGGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	465362	316	+	647215	TGGCAAAGTCCATCTTGATTATGATTGAGGGACATGTGATTATACAATGGGCATCATGTGACAAAAAGGTGTAGAAATAGTCAGTAAGCAGAAAGTTTTTTGGATGGGTGTATGTATCAAAAAATCTACTGCATGACCATGTGATGAGGATAAACAGGTTAAGGGCCTGAGTAAACTAATAGAAGTTGTACAGGTGTGAACACTCTTAAATAATTTAGGACAAAGCAACAAGTGGGAAACTATAGGGTACAGGTGTGAACACTCTTTAATAATTTACAACAAAGAAACAAAGAAACAAGTGGGAAACTATAGGGAA

a
s	mr.mrrefChr3	12034	116	+	181019	GCAGTCAGCTAGGCTTATTAAAAACCTGGCAGTTTTGAAGGTCAGAATATGGGGGGTGCGACTACAAGCAACTATGGGGAAGCTGGACACTTGGCAGTCAGGACTAGACAAGAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	453683	116	+	636262	GCAGTCAGCTAGGCTTATTAAAAACCTGGCAGTTTTGAAGGTCAGAATATGGGGGGTGCGACTACAAGCAACTATGGGGAACCTGGACACCCGGCAGTCAGGACTAGACAAGAGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	465678	105	+	647215	ACAGTCAGCTAGGCTTATTAAAGACCTGGCAGTTTTGAAAGTCAGAATATGGGGGGTGCAACTACAAGCAACTATGGGGAAGCTAGACACTTGGCAGTCAGGTCT-----------

a
s	mr.mrrefChr3	12150	28	+	181019	TATGTGTCTAAGCCTGACTTAGCCGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	453809	28	+	636262	TATGTGTCTAAGCCTGACTTAGCCGGCA

a
s	mr.mrrefChr3	12178	16	+	181019	CTATCAGACAATCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	453847	16	+	636262	CTATCAGACAATCACA

a
s	mr.mrrefChr3	12194	22	+	181019	GGGCTGACAGGCTGCAATGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	453867	22	+	636262	AGGCTGACAGGCTGCAATGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	465783	22	+	647215	GGGCTGACAGGCTGCAATGAAT

a
s	mr.mrrefChr3	12216	344	+	181019	AGTAAAATTTACTCCATGGAAGAATGGAAGATATGATTTGGATTCTCCTGGCTTGGCCTATTTTCTTGTTCTTGCTATGTGGTTTGTGAGATATATGGTGTCCATCAGAAATTATTCTAGTAATCTGATTAGTAGAAAGGGATAAGAAGAATAAGGTTCAACAGTGAGACAAGTTAGGTCCACTAACTAGTTGTTCAGATCACATCCCATGGTTGGAACTCTCTTTCATCTGCCTCTGGGGTCTCTTATTAATAGTTCGATGCTCAGTCAGAGTTGTTTTGGCCTGGTGTCTTTAATGTTTCAATGCATTAAACCCTTAATGCCCCCATCATTGGTACACCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	453897	344	+	636262	AGTAAAATTTACTCCATGGAAGAATGGAAGATATGATTTTGATTGCCCTGGCTTGGCCTATTTTGTTGTTCTTGCTATGTGGTTTGTGAGATATATGGTGTCCATCAGAAATTATACTAGTCATCTGATTAGTAGAAAGGGATAAGAAGGGTAAGGTTCAACAGTGTGACAAGTTAGGTCCACTAACTAGTTGTTAAGATCACATCCCATGGTTGGAACTCTCTTTCATCTGCCTCTGGGGTCTTTTATTAATAGTTCGATGCTCAGTCAGAGTTGTTTTGGCCTGGTGTCTTTAACGTTTCAATGCATTAAACCCTTAATGCCCCCATCATTGGTATACCCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	465805	343	+	647215	AGTAAAATCTACTCCACAGAATAATGGCAGATGTGATTTGGATTCTCCTGGCTTGGCCTATTCTCTTGTTCTTGCTATGTTGTTCGTGAGA-ATATGGTGCCCATGAGAAATTATTCTAGTAATCTGATCAGCACAAAGGGATCTGACTAATAAGGCTCAACAGTGATACAAGTTAGGTCCACTAACTAGTTGTTCAGATCACATCCCATGGTTGGAACTCTTATTCGTCTGCCTGTGGGGTCTCTTATCAATTGTTCAATCTTCAGTCAGAACTGTGTTGGCCTGGTTTCTTTAATGTTTTAATCCATTAGACCCTAAATGCCCCTGGCATTGGTACACTCAT

a
s	mr.mrrefChr3	12560	82	+	181019	TACTGACAAATACAGTGACTTTCCACAAAAGTGATAAAAAGTAATCATCATAGAAGTTTCAATCATTCTATGGAGGGTTCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	454241	82	+	636262	TAATGACAAATACAGTGACTTTCTATAAAAGTGATAAAAAGTAATCATCATAGAAGTCTCAATCATTCTGTGGAGGGTTCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	466153	82	+	647215	CACTTACAAATACAGTAACTTTCCACGAAAGTGATAAAAAGTAATCATCTTAGGATTTCCAATCATTCCATGAAGGGTTCTT

a
s	mr.mrrefChr3	12642	19	+	181019	TGATGTTATGAGTCATGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	454323	19	+	636262	TGATGTTAAGATTTATGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	466241	19	+	647215	TGAAATTATGAGTCATTGC

a
s	mr.mrrefChr3	12661	64	+	181019	CGAGCACCCCTAATAAACCAATGTGGAACCCTACTCAACCAGAGAGAGCCCAACTGTGTTATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	454342	64	+	636262	CGAGCACCCCTAATAAACCAATGTTAAACCCTACTCAACCAGAGAGTGCCAAACTGTGTTATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	466276	63	+	647215	CACGCA-CCCTAATAGGCCAATGTGGAACTGCACTTAACTAGAGAGAGCCCATCTGTGTTATGT

a
s	mr.mrrefChr3	12725	26	+	181019	CCTTTATTCTTAGAATCTAGATCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	454406	26	+	636262	CCTTTATTCTTAGAATCTAGATCAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	466340	11	+	647215	CCTTTATTGTT---------------

a
s	mr.mrrefChr3	12751	54	+	181019	TGGTGTTTAGATACCAACCTAAGGTGATGTGCTCTCTCCTAGCTTGGTCAGAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	454440	54	+	636262	TGGTGTTTAGATACCAACTCAAGGTGATGTGCTCTCTCCTAGCTTGGTCAGAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	466351	41	+	647215	-------------CCCACCTAAGGTCATGTGTTTTCCCCTAGCTTGGTTAGACG

a
s	mr.mrrefChr3	12805	70	+	181019	AACTTTTATGGGCAAACACAGATAGCAATTCCAATGAATATGAGTGTTAACCTGATAAGTAAACTTAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	454494	70	+	636262	AACTTTTGTGGGCAAACACAGATACTAATTCCAATGAATATGAGTGTTAACCTGACATGTGAACTTAAGT
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a
s	mr.mrrefChr3	12875	567	+	181019	AGTTAGTAGCACACTGGGGGACATTCGGGTCTAACCAAGTATGAAAAAGGGAGGTTCCCTCGTGTTTACAAGCCAACCTCCTACCCTGTAGCCTGTTTTGCATCCATGAGTAATTAAAAAATTACTGAAGTGGCACATGCCTTTTTACAATGCCACAGAGATCCTTTAAGTTCTTCTTCTCAACTGTATAGATATTGCGTGCTGTAAATATTCCATTGTTTATGCGGGGCATGTTACATAAACTTCTCAGTCTCAGTCATATATGACAACTTACTATTTAAGCACCCTAATTTGCTGCCCTGATTTCAGCTGCCCTAGCTCCACTCTAGGAGGTCAATGACTGGCATTGACCATGTTTGAACTGGCATTAACCATGTATGAGCCTCAGGTACGTCTTTCTTAATTTTATACTACTATGTATATCAAATAGATGAATAATGCTTGCTTGTAGTGAGAATAAGAAATACCTATATAGCCCCTTACAAATTTTGTCAATACGATTAAGAGTTAGTCCTCTCTAGGGCAATAGGTTAGCAGAAGTAAAATTGTGCTGAAGATGTAAATTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	454571	560	+	636262	AGTTAGTAGCACACTGGGGGACATCCGGGTCTAACCAAGTATGAAAAAGGGAGGATCCCTCGTGTTTACAAGCCAACCTCCTACCCTGTAGCCTGTTTTGCATCCATGAGGAATTAATAAATTACTGAATTG------GCCTTTTTACAATGCTGCAGAGATCCTTTAGGTTCTTCCCCTCGACACTATAGATATTGCGTGCTGTAAATATTCTATTGTTTATGCGGGGCTTGTT-CATAAACCTCTCAGTCTCAGTCATATATGACAACTTACTATTCAAGCACCCTAATCTGCTGCCCTGATTCCAGCTGCCCTAGCTCCACTCTAGGAGGTCAATGACTGGTATTGACCATGTTTGAACTGGCATTAACCATGTATGAGCCTCAGGTACGTCTTTCTTAATTTTATACTACTATGTATATCAAATAGATGAATAATGCTTGCTTGTAGTGAGAATAAGAAATACCTATATAGCCCCTTACAAATTTTGTCAATACGATTAAGAGTTAGTCCTCTCCAGGGCAATAGATTAGCAGAAGTAAAATTGTGCTGAAGATGTAAATTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	466461	567	+	647215	CATTAGTAGCACATTGGGGGACATTTTGGTCCAACCAAATATGACAAAGGGAGGTTCTCTTGTGTTTACAAGCCAACCTCCTAACCTGTAGCCTGTTTTGCATCCATGGGTAATTAGAAAATCAGTGAAGTGGCACATGCCCTTTTACAATGCCACAGAGATCCTTTAAGCTCTTCTTCTCAACTGTATAGATATTGCGTCCTGTCACTATTCCATTGTTTGTGCTGAGCATGTTATGTAATCTCCTCAGTGTCAGTCATATATGACAACTTACTACTTAGGCACCCTAATTTGCTGCCCTGACTTCGGCTGCCCTAGCTCCACTGTAGGAGATCAATGACTGGCATTAACCATGTTTGAACTGGCATTAACCATGTATGAGCCTCAGGTACATCTTTGTTAGCTTTATACTACTATGTATGTCAAATTGATGAATCATTCTTGCTTGTGGTGAGAATAAGAAATACCTATATAGCCCCTTACAAATTTTGTCAAAACATGTAAAAGTCAGCCCCCTTTAGGGCAATAGGTTAACATAAGAAAAAATGGGCTGAAAATGTAAATTGT

a
s	mr.mrrefChr3	13442	140	+	181019	GTGCTACATCCCCAGTATAAGGTTAGGAAACAACAAAAGTAAAATTCTCTCTTAGGGTTGAGTTGGCAAGTCAACATTGAGAAATCTTCATTGACAATAATTTCTTGCATGAACATTCTGTTATGTCACTCAGAGCAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	455131	139	+	636262	GTGCTACATCCCCAGTATAAGGTTAGGAAGTAACAAAAGTAAAATTCTCTCTTGGGGTT-AGTTGACAAGCCAACATTGAGAAATCTACATTGACAATAATTTCTTGCATGCACATTCTGTTATGTCACTCAGAGCAGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	467029	140	+	647215	GTGCTACATCCCCAGTAAAAGGTTAGGAAACAAGAAAAGTAAAATTCCCTCTCAGGGTTGAGTGGGCAAGTCAACATTGAGAAATCTTCATTGACAATAATTTTTTGGGTGAACATTCTGTTATGTCCTTAGGATTTGAA

a
s	mr.mrrefChr3	13582	11	+	181019	CATACCAGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	455281	11	+	636262	CATACCAGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	467169	11	+	647215	CATACAAGCAA

a
s	mr.mrrefChr3	13593	44	+	181019	TAGGATTTGAACATACAAGAATTTCATAAGTAGCCTGTGATCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	455292	44	+	636262	TAAGAGTTGAAAATACAAGAATTTCATAAGTAGCCTGTGATCTT
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a
s	mr.mrrefChr3	13637	179	+	181019	TCACCATTAGTCCTAGGCTTAGGACCTAAGATAGACCTACAAGGGCCTACCAGTATCACACAAAATAACCAAGAAACAAATATGACCAATCTTCTGTCAGTTGAGAAAAAGCATGTGTTGCTATACGATTTCTCAAACACCTGCCATCTGTGCATGTGTGTGTAAAAATACAGAATCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	455336	179	+	636262	TCACCATTAGTCCTAGGCTTAGGACCTAAGATAGACCTACAAGGGCCTACCAGTATCACACAAAATAACCAAGAAACAAATATGACCAATCTTCTGTCAGTTGAGAAAAAGCATGTGTTGCTATACGATTTCTCAAACACCTGCCATCTGTGCATGTGTGTGTAAAAATACAGAATCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	467286	179	+	647215	TTACCATGAGTTCTAGGCTTAAGACCTAGGCTAGACCTACAAGGGTCTACCAGTATCACACGAAACAATCAAGAAACAGATATGATCAATCTTCTGTCAGTTAAGAAAATCCACTTGTTGCTATCTGATTTCTTAACCGCCTGCCACATGTGCATGTATTTGTGAAAATACAGAATTAC

a
s	mr.mrrefChr3	13816	107	+	181019	ATAATGCATGTTCTACACCTGGAGCCACCCTCATGATTTTAGTGCGTCCTAGTCCTGTTGCCGTAATACACATTAGAATGTGCTCCACCAAATGTGATAATGATACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	455520	107	+	636262	ATAATGCATGTTCTACACCTGGAGCCACCCTCATGATTTTAGTGCGTCCTAGTCCTGTTGCCGTAATACACATTAGAATGTGCTCCACCAAATGTGATAATGATACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	467465	107	+	647215	ATTATGTATGTTCTACACCTAAAGCCACCCTCATGATTTTAGTGTATCCTAGTCTTGTTGCAGTAATGCACATTATAATGGGCTCCACCAATTGTAATAATGAGACT

a
s	mr.mrrefChr3	13923	31	+	181019	GATGGATGTTTATGCTACTACTTAAGGAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	455627	31	+	636262	GATGGATGTTTATGCTACTACTTAAGGAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	467573	31	+	647215	GATGGATGTTTATCCTACTACTTAAGCAATA

a
s	mr.mrrefChr3	13954	299	+	181019	AAGTAAATTGAGTGAGGGTGTATAGAGCTGAAGATCTTAGGCTACAGGCAATGGGTGCCAAAAGTGTTCATTACCTAAACTAAATCATTAAGCACCTGGGACTGTTATTTTTTTTGGATGTGTGTAGGTGTTGGCAACTTAGGGTTTGATCCACATTGAGATCACAGGATATATATTATACTAGTTCAGTCATGGGACACTGCCTTGTTGGGATTGTAAAAGTCATGTCCCAATGGGATAATTCTAGGACAGTGATCTAGGACGGTGCAGATGAACTTCAAGTACATGGAGTCCAAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	455667	299	+	636262	AAGTAAATTGAGTGAGGGTGTATAGAGCTGAAGATCTTAGGCTACAGGCAATGGGTGCCAAAAGTGTTCATTACCTAAACTAAATCATTAAGCACCTGGGACTGTTATTTTTTTTGGATGTGTGTAGGTGTTGGCAACTTAGGGTTTGATCCACATTGAGATCACAGGATATATATTATACTAGTTCAGTCATGGGACACTGCCTTGTTGGGATTGTAAAAGTCATGTCCCAATGGGATAATTCTAGGACAGTGATCTAGGACGGTGCAGATGAACTTCAAGTACATGGAGTCCAAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	467604	299	+	647215	AACTAAGTTGATGGAGGGTGCATAGAGACAGAGCTCCTAGGATACAGGCAATGAGTGTCAAAAGTGTCCCTGACTTAAAATAAATTGTTAAGCACCTGGGACTGTTATTTTTTTTGGATGGGTGTAGGTGTTGGCAACTTAGGGTTTGATCCAGATTGAGAGCACAGGATATATACCATACTGGTTCAATCATGGGACACCATTTTGGTGGGATTGTAAAAGTTATGTCTCGATGGAACAATTCAAGAATAGTAATCTTGGAAAGCATAGACAAACTTCAAGTACATCGAGTCCAAAGT

a
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a
s	mr.mrrefChr3	14297	270	+	181019	GTTTATGATTGTTGGAAAGGGCTAACTGGGATTCGTCATCCAAAGATTTGCCTTTGAGCGTTCTAGACCACGGTTTGATACTGGATGTGATGGACCTTGAGCAGTAGATTATCGAGGCATGTGTGGTTATTAGGGAGTCAGTCAATAAACTGAGAATTAAAAATGTCCAGTGGAAAGGGAGTAATGTCAACAGCACAAGCTTATACTGAAATGTTATTCAATAAGTTGTATGGAAGCAGGAATATTAACAGTGACACAACACCTTCTAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	458568	270	+	636262	GTTTATGATTGTTGGAAAGGGCTAACTGGGATTCGTCATCCAAAGATTTGCCTTTGAGCGTTCTAGACCACGGTTTGATACTGGATGTGATGGACCTTGAGCAGTAGATTATCGAGGCATGTGTGGTTATTAGGGAGTCAGTCAATAAACTGAGAATTAAAAATGTCCAGTGGAAAGGGAGTAATGTCAACAGCACAAGCTTATACTGAAATGTTATTCAATAAGTTGTATGGAAGCAGGAATATTAACAGTGACACAACACCTTCTAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	467967	270	+	647215	GTTTGTGATTGTTGGAAAGGGCTAACTACAATTCGTCATCCAAAGATCTGCCTTTGAACAGTCTAGACCATTGTTTGACACTGGATGTGATGGATCTTGACCAGTACATTATTGAGGCATCTATAATCATTACGGAGTCAGTTGATAAACTGAGGATTAAATATGTGCAGTGGAAAGGGAGTAATGTCAACAGCACAGCCTTATACTGAAATGACATTCAATAGAGTGCATGTCAGCAGGAATATTATTAGTGACACAACACCTTCTGAC

a
s	mr.mrrefChr3	14567	10	+	181019	AGTTGCTTTT
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a
s	mr.mrrefChr3	14577	9	+	181019	CCAGTGGTG
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a
s	mr.mrrefChr3	14586	39	+	181019	TTAAACATGATGAAGGCTCTCAGAATTTGAATATGCCGA
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	458909	156	+	636262	ATGAGCATTGGTACTCAAGTAACTTTGATTAATGTTCCCATTATTATATTGAGCTGGTATGATCAGGCTAAGCAATGATATGTGAGATGGCCAAAGTAATATGCACTTTGCTCCAGGTGTCTATTTTTGGAACTGAACCTGATGGCAGCATTTGAT
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a
s	mr.mrrefChr3	14781	57	+	181019	ATAGGGTCACTTTAAGGTTGTGTCTTATCTAGGAGTCAAATTTGTCGACTTGTAAGT
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	14863	41	+	181019	AACGCACAAGCCTGAGATCACATTTTACAAGCATTACTCAG
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a
s	mr.mrrefChr3	14904	35	+	181019	TACACCTTGATTTCTAAACTATGCAGCATCCAGAC
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a
s	mr.mrrefChr3	14939	33	+	181019	CACCCAGCATGAGATATAACATTTAGAGCTCGA
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a
s	mr.mrrefChr3	14972	206	+	181019	GTTGTATGAGCTTTTATAACATACCATATGAGTATGTAAACTCATCAAGTTTTAGTACGTACAGACAATCTCCCATAAGTTTCAAGGATGCCCTTCAAGCACTGTCATTTAAACTGCCATTAAAGCTGATGCCATATATAATAACTAGTGGCTATCAAGATTTTTGGTTCTACAAACACTCATGCATTCTGTTGTACATTTTTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	459390	206	+	636262	GTTGTATGAGCTTTTATAACATACCATATGAGTATGTAAACTCATCAAGTTTTAGTACGTACAGACAATCTCCCATAAGTTTCAAGGATGCCCTTCAAGCACTGTCATTTAAACTGCCATTAAAGCTGATGCCATATATAATAACTAGTGGCTATCAAGATTTTTGGTTCTACAAACACTCATGCATTCTGTTGTACATTTTTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	468667	206	+	647215	GTTGTATATGCTCTTATAACATACCATATGAGGGTGTAAACTCATCAAGGTTTAGTATGTACAAATAACCCCCCATAAGTTTCAAAGATGACCTTTCAGCTCTGTCATTTAAACTGCTATTAAGACTGAGGCCATCTATGATAATTGGTGGCTATCAAGTTTTTTGGTTCTACAAATACTCATGCATTCTGTTGTACATTTTCGTT

a
s	mr.mrrefChr3	15178	84	+	181019	GGAAATCCCTCCCTTAGCATCTGAATTGTCTTAGCAACATCATTCCTTAATTGGAGGATGCCCACAACAAGATGCACACCTTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	459597	84	+	636262	GGAAATCCCTCCCTTAGCATCTGAATTGTCTTAGCAACATCATTCCTTAATTGGAGGATGCCCACAACAAGATGCACACCTTAT
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a
s	mr.mrrefChr3	15262	51	+	181019	TCCCTGTCTCAGCCTGATCAGTTCATTGAACTTGACATGGAAGAAAATTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	459683	51	+	636262	TCCCTGTCTCAGCCTGATCAGTTCATTGAACTTGACATGGAAGAAAATTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	468957	51	+	647215	TCCCTGTCTCAGCCTGATCGGTTAATTGAACTTGACATGGGAGAAAATTTT

a
s	mr.mrrefChr3	15313	61	+	181019	TGCAAGGCTGCCCTTCAATTGCATGGCAACCTTCTGATCAAACCAGTGAACAATCTGATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	459734	61	+	636262	TGCAAGGCTGCCCTTCAATTGCATGGCAACCTTCTGATCAAACCAGTGAACAATCTGATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	469048	61	+	647215	GGCAAGGCTGCCCCTCAATTGCATGGCAACCTTCTGATCGAACCAGTGAACAATCCCATAC

a
s	mr.mrrefChr3	15374	225	+	181019	TAGGGCCAAAAATCGAGTTGGTTGAAATTGACAGCCACTTCCCCACAGAGTAAAACAGTTTCATGCCCTGCATGCCACTCCTCAAGTTTGGTGATTCAGAACACTTGCCTATCGTGTCCACATCATCGCTAGGCCAACCAAAAaccttgatgagtctgagttttacaattttcaaatcactactgctggaagggctgcaagcaagttGATTGTCTAAAATGTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	459806	225	+	636262	TAGGGCCAAAAATCGAGTTGGTTGAAATTGACAGCCACTTCCCCACAGAGTAAAACAGTTTCATGCCCTGCATGCCACTCCTCAAGTTTGGTGATTCAGAACACTTGCCTATCGTGTCCACATCATCGCTAGGCCAACCAAAAACCTTGATGAGTCTGAGTTTTACAATTTTCAAATCACTACTGCTGGAAGGGCTGCAAGCAAGTTGATTGTCTAAAATGTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	469109	225	+	647215	TAGGGCGAAAGATCGGGTTAGTTGAAATTGACAGCCACTCCCCCATAGAGCAAAACAGTTTCATGGCCTGCATATCACTCTTCTAGTGTGGTGATTCAGAACACTTGCCTATCATGTCCACATCATCACTAGGCCAACCAAAAaccttgatgagtctgaactttgcgactttcaaatcactagtgctggaagggctgcaaacaagttGATTTTGTAAAATGATGT

a
s	mr.mrrefChr3	15599	98	+	181019	AAGAGGGAGTAAGTCAGTGACACAACCTTATTGTAAGTTAGACAGTGAAAAGGAGATTCTAACAGCTCCATAGCTTTATGTCAAGATACTTACCTTAC
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a
s	mr.mrrefChr3	15697	9	+	181019	AGTTACACC
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a
s	mr.mrrefChr3	15706	88	+	181019	AAGCATATAGGAGCCAGTAGGTGGGTCGGGCCATTCATAGTTAAGAGCACACGTGGGGCAAGGAATGTCTTAAGCTGTTGAGAAGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	460139	88	+	636262	AAGCATATAGGAGCCAGTAGGTGGGTCGGGCCATTCATAGCTAAGATTACACGTGGGGCAAGGAATGTCTTAAGCTGTTGAGAAGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	469443	88	+	647215	AAGCATATACAAGCCAGTAGGTGGGTCGAGCCATCTATAGTTAAGAGCACACATGGGGCAAGGAATGTCTTAAGCTGTTGAGAAGCAT

a
s	mr.mrrefChr3	15794	154	+	181019	AAAGTTCAGATGACGCAGATGAGACACCGATGGCTGGTAGCGTGAGGCGCCATGTAACCCCAAGCGACTAGGTAAGTTGCAGGTATCTCTTCGGACCAGTCAGAATAGCAACGAAACTGGATGCTCAATCTAACGTTCAGGCCAGCGGGCCCGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	460233	154	+	636262	AAACCTCAGATGACGCAGATGAGACACGGATGGCTGGTAGCGTGAGGCGCCATGTAACCCCAGGCGACTAGGTAAGTTGCAGGTATCTCTCCGGACCAGTCAGAATAGCAACGAAGCTGGATGCTCAATCTAACGTTCAGGCCAGCGGGCCCGC
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a
s	mr.mrrefChr3	15948	64	+	181019	TGGAGATCAGGAGTGAGTCATAGCCAACTGTCTGGTAGTCTGGAGGTGGATTACATAGCACTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	460387	55	+	636262	TGGAGATCAATAATAAGTCATAGCTAA---------ACTCTGGAGGTGGATTACATAGCACTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	469682	64	+	647215	GAGAGATCAGGAGTGAGTCATAGCCGACTGTCTGGTAGTCTGGAGATGGATTACATTGCACTTT

a
s	mr.mrrefChr3	16012	156	+	181019	TCTAGCACAGTTACCTTGGACACACTATAGCTCAACAGGCTCCAATTGTGTAACCTCTAAGCTGTAAGTGACAGAGGGTTAGCTAGTAATATTGAGGATGTTAAAAGACAGGGGGGGAtggctGTGACAATACAAATATATGTGGAATGGAGTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	460442	156	+	636262	TCTAGCACAGTTACCTTGGACACACTAGAGCTCAACAGGCTCCAATTGTGTAACCTCTAAGCTGCAAGTGACAGAGGGTTAGCTAGCAATATTGATGATGTTAAAAGATAGGGGGGGATGGCTGTGGCAATACAAATATATGTGGAGTGGAGTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	469775	151	+	647215	CCTAGCACAGTTACCTTGGACACACTATAGCTCAACATGCTCCAATTGCTTAACCTCTAAGCTGTAAGTGACAGAGTGTTAGCTAGTAATATTGAGGATGTTAAAAGACAGGGGGGGG-----GGGACAATACAAGCATATGCGGAATGGAGTATG

a
s	mr.mrrefChr3	16168	132	+	181019	AGAGgcaaaacggagtgggaatgttagcaacacaacacattcatgagggagtaatgtACTGACCCTATACGGTACACGATCAGGACGTCCTACCCTTCGAGAATAAATTAATATGAAGGGATTCTGGTCTTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	469956	132	+	647215	AGAGgcaaaatggagggggaatgttagcaacacaacacactcatgagggagtaacatACTGACCCTATACGGTACACGATCAGGACGTCCTACCCTTCGAGAATATATTAATATGAAGGAATTCTCGTCTTT

a
s	mr.mrrefChr3	16300	7	+	181019	GGGCAGG
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a
s	mr.mrrefChr3	16307	18	+	181019	AGAGCATTCCCCAACCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	351930	18	-	647215	AGTGCATTCCCCAACCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	470088	18	+	647215	GAATCATTGACCCACCCA

a
s	mr.mrrefChr3	16325	33	+	181019	GTGTGATTAGATCAGTAAACTATCCCACCCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	351948	33	-	647215	GTATGATTAGATCAGTAAACTATCCCACCCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	470110	33	+	647215	GTGTGATTAGTTCAGTAAACTATCCCACCCAGT

a
s	mr.mrrefChr3	16358	6	+	181019	CTAGAG
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a
s	mr.mrrefChr3	16364	55	+	181019	GATTGATTTGTAGAGATTGAAAGGACGTGATGCTTGGCCTATAATGCTCCATAAA
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a
s	mr.mrrefChr3	16419	24	+	181019	AGATCTATAGATAAAGTTGGAGAG
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a
s	mr.mrrefChr3	16443	1	+	181019	T
s	simRat_chr6.simRat.chr6	470234	1	+	647215	T

a
s	mr.mrrefChr3	16444	96	+	181019	GAAGGGCTCACATGCTAAGCCTGTAATATCCAGGTGAATACAGTAGAACCATATTGACCCAAAAGAATTTGCTGTTCTTGGATGGTATGGTACTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	352005	96	-	647215	GAAGGGCTCACATGCTAAGCCTGTAATATCCAGGTGGATATAGTAGAACCATATTGACCCAAAAGAATTTGCTATCCTTGGATATTATGGTACTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	470235	96	+	647215	GAAGGGCTCACATGCTAAGCCTGTAAAACCCAGGTGAATACAATAGAACTTTATTGACCCAAGAGATTTTGCTGTTCTTGGATGGTATGGTACTAG

a
s	mr.mrrefChr3	16540	22	+	181019	ATGTGTGATTGACCCACACTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	460732	17	+	636262	-----TGATTGACCCACACTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	352101	5	-	647215	ATGTG-----------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	470332	5	+	647215	ACCTC-----------------

a
s	mr.mrrefChr3	16562	21	+	181019	TGTTCATCAGGGTTTTTACCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	460749	21	+	636262	TGTTCATCAGAGTTTTTACCG
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a
s	mr.mrrefChr3	16583	42	+	181019	TATGGATGATGGTCCCGGCAACGACACGTCACACACGGATAG
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a
s	mr.mrrefChr3	16625	437	+	181019	GTCAAAAAGGGGTCAGTCATTTCTACTGGTAGAATCTATTGACCTATTGTCAGCGTGCATACGAATGCAAACTCATTCCCTCCATGTTATATGCCCTTTAACCCACCCGAAACGAAGAGTAGCCGGATCAGAAGAACTTGATGGCAGCAGGCCCAATAGATTGCTGTCTAGCCGGGCCAGACTTAGAGGTGTGGACACTGAATAGAGAATTATAGGTATTTTGGTAAATCGTCGACCATGCACAGGAAGTCGTAGAACCGCGCCGCGGGAGCGGCGGCGGCCAGAACCATTCCGTGACAAGTGGGATATTCAGCAACCTAGTATCTCGTTGCCACTAGCACACACACCTGACAGACCCTTACTCGCAGCCCTTTAAGATTAAATGAAGTTGTTGAACTTTTAACAACAACCATGCAGGTATGCTGCAAGCAGGCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	460822	432	+	636262	GTCAAAAAGGGGTCAGTCATTTGTACTGGTAGAATCTATTGACATATTGTCAGCGTGCATACGAATGCAAAGTCATTCCCTCCATGTTATATGCCTTTTAACCCACCCGAAACGAAGAGTAGCCGGATCAGAAGAACTTGATGGCAGCAGGCCCAATAGATTGCTGTCTAGCCGGGCTAGACTTAGAGGTGTGGACACTGAATAGAGAATTGTAGGTGTTTTGGTAAATCGTCGACCAGGCACAGGAAGTCGTAGAACCGCGCCACGGGAGGGGCGGCGGCCAGGGACATTCCGTGACAAGTGGGAT-TTCAGCTACCTAGTAACTCGTTTCCACTAGCATACACACCTGACAG----TTACTCGCAGCCCTTTAAGATTAAATGAAGTTGTTGAACTTTCAACAACAGCCATGCAGGTATGCTGCAAGCAGGCACA
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	17625	179	+	181019	TAACTCTTCCAGACAGCATTGCTATACAGCACACCCTACACTATCCTCAGGTTAGGTGACTATTTTATAATCATGTTTTGTGCTTTTTGTTTTGATTGTTAAACTCTTGACTCGTTTGGAATTGGTTCAGTTGCACTTTTGACCTGTACCAATATCATACATTGCAAAGCACTAATCAT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	18236	70	+	181019	CATTGTCCACCTTCATTAACTTCAGATATGGTTGGTCGTAATAGTGCTTACTCTCTTATCCATTAAAACA
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	18799	20	+	181019	TGTGGTGAATCCTGAAATAG
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	18827	14	+	181019	ACTAGACTGCCCAG
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a
s	mr.mrrefChr3	18841	38	+	181019	ATAGGAACTCAACAATAACTGGAGTACCTTAGGTAATG
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a
s	mr.mrrefChr3	18879	392	+	181019	AGCAACTGGGGAATTTTACTGTAAAAGACTCTAGATTGTGTCCAGAAAGCATTACAAAATCAATGTGATGACCCCATAAGGAAAAGGTGCAGCTCTGTTAGAACAGCTGCTAGGCGGCAGGTGAGTCCAGCAATGACCTGAGTAACTTACACGATGATCTGAGTACTATATATATATATAGATGTCAGCATCCATAGAATTTTTTCATTCTAGTCTCTGGAGTCTCCTTGAGACTTTATGAACATAAATGGCAGCATTAGAAGTTTTGTAGCTTTACCTATGTACTGCCATAGGTGTATTATCTCACTAAGTCGACTCTTGTGTCATGTGGTAATACTTTATAGGATTCACCTCAGCACCTGCATTGCTCACCATTGAACTGATGGAGGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	463095	385	+	636262	AGCAACTGGGGAATTTTACTGTAAAAGACTCTAGATTGTGTCCAGAAAGCATTACAAAATCAATGTGATGACACCATAAGGAAAAGGTCC---TCTGTTAGAACAGCTGCTAGGCGGC----GAGTCCAGCAATGACCTGAGTAACTTACACGATGATTTGAGTACCATATGTATATATAGATGTCAGCATCCATAGAATTTTTCCATTCTAGTCTCTGGAGTCTCCTTGAGACTTTATGAACATAAATGGCAGCATTAAAAGTTTTGTAACTTTACCTATGTACTGCCATAGATGTGTTATTTCACTAAGTTGACTCTTGTGTCATGTGGTAATACTTTATAGGCTTCACCTCAGCACCCGCATTGCTCACCATTGAACTGATAGAGGCAA
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	19333	18	+	181019	AACACAATGATATGCTAG
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a
s	mr.mrrefChr3	19351	62	+	181019	TCAGAGATGAAAACAGCATTTACATCTACGCTAGACAAATGCAACATTTGTCTCACAAAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	463513	41	+	636262	TCAGAGATGAAAACAGCATTTACAT---------------------TTTGTCTCACAAAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	473261	60	+	647215	TGAGA--CGAAACCAGAATTCACGTCTACGCTAGACAAATGCAACATTTGTCTCACACAATT

a
s	mr.mrrefChr3	19413	176	+	181019	GGACTTCTTAAGTTTGAGTTTGTAGAAATAAAAGGCAATTGCTGTGATCCCGTAGAGATAAATGTGAAAGGTAACATTATCAACTGCTAATAGTAAATGTTATCAAGGTTAGAGATGGAGTTACATACCTATTAGACATCAGACATATAAGTGACACCAAAATTTGATGTTGGGTG
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a
s	mr.mrrefChr3	19589	11	+	181019	GCGTAAGGAAA
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a
s	mr.mrrefChr3	19600	217	+	181019	CATATGGAGTTTGAGCCCCTGACACAGATCAGCATCAAATATCTCTGTGCCAAATTATACTAGGCACACCTGGATACTAAGACTGGCCTGGTTTAGATAGCTTGTCCCAATATTTATGCACACATTTATGAAGGGTGGGAAAGATGAGACAAGGGATCTAATAATATCAGTAGAGAGGTCTGCAAAAGTCCTAGTAGTTTTGGGTGTGTTGGGTGTG
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a
s	mr.mrrefChr3	19817	132	+	181019	GTGGAATATCTCTCCTGAACATGTCAGTTCATACAGGCTCCATATAATTCCCAAGATTGGATACACACACACATCGTGTGAGTGTAGATGATGAGAGGTTGTTAGGTTGGCAAAACTGCCATATGGAGTTTT
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a
s	mr.mrrefChr3	19949	102	+	181019	AACCACAGCTACCTAACAGTATTATTAATACCAGAGTGGAGCTGGAAAAATGCTAGACCATCTACTGTGTTACACTTAGACCTGGTAAGGGGAAGATGTTTA
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a
s	mr.mrrefChr3	20051	214	+	181019	TTGAGGAAGTTTAATGCTAAGACCTGAGTCAATCTATAGCACTCCAAAAATGAGTTGTCTGTCCATTGTTTTCATAGTGAGCCCTAGTGCGTGAAAGTTTAGAATAGTAAAACCAAATTGGGGAGGGGGAGGGTCAAATCACTTCTGATGATATAGTATTTTTATCATTCACCTTAGTAGTGTACATATGTGCAGGTGTAAGAACATACATGGG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	473984	213	+	647215	TTGAGGAAGTTTAAAGTGAAGAC-TGAGTCAATCCAAAGCACTCTAAAACTGAGTTGTCTGTCCATTGTTTTCATAGTGAGCCCTAGTGCATGAAAATTTAGGATAGTAAAATCAAATTGAGGAGGGGGAGGGTCAAGTCACTTCTGATGATACAGTTTTTTTATAATTCACCTTAGTGGTGTACATATGTGCAGGTGTGAGGACATACATGGA

a
s	mr.mrrefChr3	20265	57	+	181019	GCTACATAAATATCTGTAGCACATTGTTGACAGATAGGAGCTATAATATCTTGTTAA
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	20358	22	+	181019	GTCTTTATGACTTTCCAGCCTT
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a
s	mr.mrrefChr3	20380	51	+	181019	CCTATTCCAAATGTAAATTGATTTGAACTAGGCAACAGGGTCACCTAAAAT
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a
s	mr.mrrefChr3	20431	13	+	181019	ATAACCTGGACAC
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a
s	mr.mrrefChr3	20444	14	+	181019	TGAGGGAGAACCAC
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a
s	mr.mrrefChr3	20458	45	+	181019	ATGGTCTTTCCCGTGTTAATTGTCTTGGATGGAAAGCACTGGATT
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a
s	mr.mrrefChr3	20503	51	+	181019	AGTTCATTAGAACTCCAGACTCAATGTTGTTCAGGCAGCATTTCAAGACTC
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a
s	mr.mrrefChr3	20554	247	+	181019	AACTTTCAATATATTACGATACTTAACAGACAGTTGGTATTGGAGGATGTGACTGCTAGGGTTTACCACATAGATCAATACCAACCAGTGGATACCTTAGCTTGTAGCATCATCTAGTACAAATTGTATGTTAGTCAGTTCAAGAACCTCCAAGCACTAACATAGCCACTTACTCAAACACTAGATAATAGCCATTATCTTTAGAGTACTACTCCCTTGCTCACACCTGAATGGTAAGAGATCACTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	464821	247	+	636262	AACTTTCAATATATTACAATGTTTAACAGACAGTTGGTATTAGAGGATGTGACTGCTAAGGTTTACCACATAGATCAACACCAGCCAGTGGATGCCTTAACTTATGGCATCATCCAGCCCAAATTGTATGTTAGTCAGTTCAAGAACCTCCAAGCACTAATGTAGCCACTTACTCGAACACTAGATAATAGCCATTATCTTTAGAGTACCACTCCCTTGCTCACACCTGAATGGTAAGAGATCACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	474507	247	+	647215	AACTTTCAATATATTAGGATACTTAACAGACAGTTGGTATTGGAGGCTGTGACTGTCAGGGTTTAGCACATAGATCAATACCAACCAGTGGGTACCTTAGCTTGTAGCATCGTCTAGTACAAATTGTATGATAGTCAGTTCAAGAATTTCCATGTACTAACATAGCCACTTACTCAAACACTAGATAATAGCCATTATCTTTAGAGTACTACTCCCTTGATCACACCTTAATGGTTAGAGATCACCG

a
s	mr.mrrefChr3	20801	157	+	181019	AAAAGTTATTATAATAACAGATGAGTTATCTTCCCAAGTAATTGGTTTCTCTTGGTAACTGTGTTGTGAACAGTTATTTTCTTCCAGTCAGTGGGATGAGCATTTTGGTTGTGACAGTACAACTGATATGAGTTCTTGTGCCATTAACAATGCATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	465078	157	+	636262	AAAAGTTATTATAATCACAGATGAGCTATCTTCCCCAATAATTGGTTTCTCTTGGTGACTGTGTTGTGAACAGTCATTTTCTTCCAGTCAGTGGGATGAGTATTTTGGTTGTAACAGTACAACTGATATGAGTTCTTGTGCCATTAACAATGCATTC
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a
s	mr.mrrefChr3	20958	440	+	181019	ACTTGAGGTTGTGCAGCACTGTTTAATCTAATAGTGTTGTGTTGAAGTCAGTAGCATGCATTGGGCTAATGACATGTGATATTGCTACTTGCTTAAGGATGTCAGTAACAAGTTGCTACTTGTTAAGGACCACATAATAAAACAGCCTATCTGTTCACTAGCATCAAACTTTTTAACACCATGATTCTTGGAGAGCCCAAATTAATACTAATGTGAGGGATCCAATTGAAGATCCAACAGTCAATGGGACCTGAGGTGGCTCAGGTCCATACGGGAGAAATACATGTGGATTAGAGCCACATGCTCTTGGCATTTAATTTAACTATGTGCGGTGTGTAATGGTTGTCCACAATCCCTAATTGTGAAAGCGTTAGAACATTTGGTCCTATAAGGCCATACATGAGTTTTCTGTCATTATCATTAGGAGCTAGGAACCAGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	465235	412	+	636262	ACTTGAGGTTGTGCAGCACTGCTGAATCTAATAGTGTCGTGTTGAAGTCAGTAGCATGCATTGGGCTAATGACATGTGATATTGCTGCTTGCTTAAGGATGGCAGTTACAGGTTGCTACTTGTTAAGGACCACATAATAGAACAGCCCA--------CTGGCATCAAACTTTTTAACACCATGATTCTTGGAGAGCCCAAATTAATACTAATGCAAGGGATCCGTTTGAAGATCCAACAGTCAATGGGACCTGAGGTGGCTCAGGTCCATACGGGAGAAATACATGTCAATTAGAGCCACATGCTCTTGGCATTTAATTTAACTATG--------------------CACAATCCCTTATTGTGAAAGTGTTAGAACATTAGGTCCTATAAGGTTATACATGAGTTTTCTGTCATTATCATCAGGAGCTAGGAACCAGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	474913	440	+	647215	ACTTGAGTTTGAGCAGCACTGTTTAATCAAATAGTGTTGTGTTGAAGTCAGTAGCATGCGTTGGGCTAATGAGGTGTGATGTTGCTACTTGCTTAGGGACATCAGTAATGAGTTGGTACTTGTTAAGGACCTCATGACAAATCAGCCTATCTGTTCACTAGTATCAAACTTTTTAACACCATGAATCTTGGAGAGCCCAAATTAACACTAATGTGAGAGATCCAATGTAAGCTCCAACAGCAAATGGGACGTGAGGTGGCTCAGGTCTATAGGAGAGAAATACATGTGGATTAGAGCCACATGCTCTTGGCTTTTAATTTAACTATGTGCGGTGTGTAATGGTTGTCCGCTATCCCTAATTTTGAAAACTTTTGAACATTTGGGCCTATAAGGCCATATGCGAGTTTTCCGTCATTGTCAATAGGAGCTAGGGACCAGTC

a
s	mr.mrrefChr3	21398	49	+	181019	TAACCAGCTTTAGCTAAATATAAGTGCTGATGTGATTTGTCATGATTTG
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a
s	mr.mrrefChr3	21447	46	+	181019	GCAGGATCTGCCCCATGTTGTCCGACTGGGGATAAAGGATGGAGTG
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a
s	mr.mrrefChr3	21493	47	+	181019	CATTGAATGGTACCAGTGACATTGGAATTACCAGGGATACTCATAGC
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a
s	mr.mrrefChr3	21540	145	+	181019	AATAGACAAAGCACTACACTGTCAAAGCCATTTGCAGTTCGTCAGGAACTTGACTTAATAAGTTTATCCAGTTGTACTTGCAGCACCAAGCAGTACAACCTGACTGGACTTTGCCTCTCTCCTAGATAAGACTTTTAAGGTAATA
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a
s	mr.mrrefChr3	21685	82	+	181019	GCAAAATTTGGGTTTCCCTCTGTGATCACCTGGAGTACAACGCTCTGCACCTGTGGTCCTGATTATCATCATAGTGGAAACA
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a
s	mr.mrrefChr3	21767	12	+	181019	TAGCTGACATAC
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a
s	mr.mrrefChr3	21779	15	+	181019	TAGGGCCTCAATGGA
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a
s	mr.mrrefChr3	21794	308	+	181019	GTGATTGTATAATTATGCGATCTGGCCTACAAACAGTCCTATCTGACTACAATGATGTGTAGGGGAACAgggatcccttatggtgtaatatgtgttgatattttaaaattgtatgctgatcctcctgtatggcctgaagtcTTAAACTCATAAGGAATCCTAATCTTGTCTCATCTACATGCACATTAACTAAGCAAATCCTATTTCATTAAAAAGGTTAAGCAAAGCACAAAAAAATCCAGAAGAATGGGAAGCACAAACTAGTAGTTAAGAAAGCAGAAAGAGCAGTGGTGGAGTAGGGAAAAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	466061	308	+	636262	GTGATTGTATAATTATGCGATCTGGCCTACAAACAGTCCTATCTGACTACAATGACGTGTAGCGGAACAGGGATCCCTTATGGTGTAATATGCGTTGATACTTTAAAATTGTATGCTGATCCTACTGTATGGCCTGGAGTCTTAAACTCATAAGGAATCCTAATCTTGTCTCATCTACATGCACAGTAACTAAGCAAATCCTATTTCGGCAAAAAGGTTAAGCAGAGCGCAAAAAAATCTAGAAGAATGGGAAGCACAAACTAATAGTTAAGAAAGCAGAAAGAGCAGTGGTGGAGTAGGGAAAAGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	476009	305	+	647215	---GTTAAATAATTATGTGCCCTGGCCTACAAACCGTCCTATCTGACTATATTGATGTGTAGGGGAACAgggatccctccttgtgtaatatgtgttgattttgtaaagttatatgctgatcctcctgtatggcctgaagtcTTAAACTAATAAGGAACCCTAATCTTGTCTCATCTACATGAACATTAGCTAAGCAAATCCCATTTCATTATAAAGGTTAAGCAAAGCACAAAAAACTTCTGATGAATGGGAAGCACAAACAAGTACTTAAGAAAGCAGGAAGACCAGTGATGGAGTAGGGAAAAGAA

a
s	mr.mrrefChr3	22102	175	+	181019	GCATTAAGTCAGATTATAGTTAATTCTGGATTACCAATCTTCGATAGCACTATATCCTACAAGTAGTCGGCATTTTACACCTGACAGCCATCAAATATAAAGTGCCACAAGGGTAACAGGGCAGGCTCAGAAAGCTTAAATGGCTGTGACTGTTGGTTAAACAAAATGCAGATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	466370	172	+	636262	GCAT---GTCAGATTATAATTAAGTCTGGATTTCCAATCTTCGATAGCTCTATATCCAACAAGTAGTCGGCATTTTACACCTGACAGCCATCAAATATAAAGTGCCACAAGGGTGACAGCACAGGCTCAGAAAGCTTAAATGGCGGTGACTGTTCGTTAAACAAATTGCAGATAC
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a
s	mr.mrrefChr3	22277	129	+	181019	ACTGCACCCCATCACTCAGTGGTTGCTCTTGGAAATGACATATGCATATATCACTGTCTACATGGCTGCTACCTAAGTGCCTAGGGCTTGTGCTCCGTCATAAAGACTGCTTCAAGGAGTGCAATAAAC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	476487	127	+	647215	ACTGTGCCCCATCACTCAGTGGTTGCTCTTGCAAATGACATATGCATATATCATTGTCTATATTGCTGC--GCCAAGTGTCTTAGGCTTGTGCTCCGTCATAAAGACTGCTTCAAGGAGTGCAATAATC

a
s	mr.mrrefChr3	22406	263	+	181019	GATACTTCATGTTTTATGTAAATACTCCAAGCCAACATTTTAGGGCAGGGTTTCCCATTATGAGAGTAGTGATCATTGTCCAAATTACAGCCAGTTCTATAGTCCTTACACTCCACCTTGAACAGGCCACATTAACCAGCACAGTCGGGCATGTCAGTTATCCTAAAAGCAGAATCAGATTAACTTACTACTTGTCACACTAAAATTAACTTTAGGTAAAGATAGTGTCTAACCAGTGACTATTCAATATACTAACCAGTGAC
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a
s	mr.mrrefChr3	22669	171	+	181019	CAGCCAACGTGCACCATGCTGCTTCTGGTAGAACATGCTGTCATACTTAACTCAACTGATTAGGAGGCAAGTCACCCAGATCTTTTCAAGTTATGTATATCTCTGAGTTTAGCTAGGAGCCAGATGAAGTGACTATGCACTAGATGGGGTGTGGTATGGGCTGCTATATCT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	476871	136	+	647215	CAACCAACGTGCACCATACTGCTTCTGGTAGAAAAGGCCGTCATACTTAACTCATCTGATTAGGAGGCAAGTCACCCAAATCATTTCAAGTTATGTATATCTCTGAGTTTAGCTAGGAGCCAGGC-AACTGACTATG----------------------------------

a
s	mr.mrrefChr3	22840	86	+	181019	TAGGTAGCTAGAGTAAGGGTACAAAGTGGTCCATGTTACCCAAGGACTGCTCAAAGTGAAAGCATCGAAGAGTATTAGACAGGAAA
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a
s	mr.mrrefChr3	22926	55	+	181019	CAGGTGTGAGTTAATATCACCTATATTGAAAGTTACTATCAGAAATACTACTACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	467194	55	+	636262	CAGGTGTGAGTGAATATCACCTATATTGAAAATTACTATCAGAAATACTACCACC
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a
s	mr.mrrefChr3	22981	6	+	181019	CATAAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	477135	6	+	647215	CATAAA

a
s	mr.mrrefChr3	22987	39	+	181019	CTTAATAAAACATAGCTAATAATCCCAACTTTCTATCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	467266	39	+	636262	CCTAATAAAACATAGCTAATAATCTCAACTTTCTATCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	477141	37	+	647215	CTTAA--AAACATAGCTAATAATCCCAACTGTCTATCCA

a
s	mr.mrrefChr3	23026	96	+	181019	GAGGGGGTTCATTCATGCCACAAAGATGCTGTCAATAAGCCAGTTGAGCCCAGTGAAGGGCACAATAGCCATGGAGGGTCCCTAAAGAAATTGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	467305	96	+	636262	GAGGGAGTTCATTCATGCCGCAAAGATGCTGTTGATAAGCCAGTTGAGCCCAGTGAAGGGCACAATAGCCATGGAGGGTCCCTAAAGAAATTGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	477180	96	+	647215	GAGGGGGTTCATTCAGGCCACAACAATGCTGTCAATAGGCCAGTTGAGTCCACTGGAGGTCTCAATGGCCACGGAGGGTCCCTCAGGAAACCATCA

a
s	mr.mrrefChr3	23122	57	+	181019	TGCCGCTTGTATTTTAAAAGTGGGCAAACAAATTCTCTGCTGTTATCACTGGGGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	467428	57	+	636262	TGCCGCTTGTATTTTAAAAGTGGGCAAACAAATTCTCTGCTGTTATCACTGGGGCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	477276	57	+	647215	TGCAGCTTCTATTTTAATAGTTAGCGAGCAAATTCTATGCTGTTATCACTGGCACTT

a
s	mr.mrrefChr3	23179	18	+	181019	TGAACTGCTCTCAATGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	467485	18	+	636262	TGAACTGCTCTCAATGGT
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a
s	mr.mrrefChr3	23197	337	+	181019	CAAGGAACCTATGCATTCCTTCCCCCCCTTGTTCACTCACTGTTACCAGGGGGCTGGAATGTATTGGTTATTAAGCATGCTACTGGTATCAAATTCCAGGGTGCTGTGGTGACACCCAGGGGAAACAAAAGTATAACCTGGCATAACTCATTTGCTTAAAAAGCACCAAAAGATGTGTCCTTAACTAATTATAATAACTTACTATGCAGGTTCTATGTATCAAGGAATTACCTCTGCCTAACTTATTAACCGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTACCCTGCCTGATGGCTAAGGGTCTTTAAGACTGGGCAACTACCCTTCACAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	467504	337	+	636262	CAAGGAACCTATGCATTCCTTCCCCCCCTTGTTCACTCACTGTTACCAGGGGGCTGGAATGTATTGGTTATTAAGCATGCTACTGGTATCAAATTCCAGGGTGCTGTGGTGACACCCAGGGGAAACAAAAGTATAACCTGGCATAACTCATTTGCTTAAAAAGCACCAAAAGATGTGTCCTTAACTAATTATAATAACTTACTATGCAGGTTCTATGTATCAAGGAATTACCTCTGCCTAACTTATTAACCGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTACCCTGCCTGATGGCTAAGGGTCTTTAAGACTGGGCAACTACCCTTCACAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	477373	337	+	647215	CTAGGTACCTATGTATTCCTTCCCCCCCTTGCACACTCACTGTTAGCAGGGGGCTGGCATATATTCATTATTAAGCATGCTACTGATATCAAATCCTAGGGCGCTGTGGTGACATTCAGGGCAAACAAAAGTACAACCTGGCATAATTCATTTGCTTAAAAAGCACTAGAAGGTGTGTTCCTCACTAATTACAATAACTTACTATGAGGGTTTTATGTGTCAAGGATTAACTTCTGCCTAACTTATGAAGTGTTATCAGTTTCTCTTTTCAGTCTGGGAGATCTATACTGCCTGATGGCTGAGGGTCTTTGAGACTGGGCAACTACATTTCACTTTT

a
s	mr.mrrefChr3	23534	24	+	181019	GGCTAATCATGTTTCCATGTGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	467841	24	+	636262	GGCTAATCATGTTTCCATGTGGCA
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a
s	mr.mrrefChr3	23558	30	+	181019	ATCAGGAATATTGGCTATGATCCTTTTTAC
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a
s	mr.mrrefChr3	23588	20	+	181019	CACCATAACTGCACCCCAAG
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a
s	mr.mrrefChr3	23608	13	+	181019	AGTTAGCTAAGTG
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a
s	mr.mrrefChr3	23621	104	+	181019	TGTAAAGAAACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGATTGTCTTAGTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTCCCTATGCTTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	467938	104	+	636262	TGTAAAGAAACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGATTGTCTTAGTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTCCCTATGCTTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	477853	104	+	647215	CGGCAAGATACCAACTGCCAAAGTGTCTCAACAATACAATCATGACATTTTGTTCCCAAGCTTGTCTTATTATAGAGGTGAGTTCCCAATTTTCCTATGCTTAT

a
s	mr.mrrefChr3	23725	98	+	181019	GGATCTTATCAGCACCCTTTTAAGAGGATACCTTCCCTTGCAAGGACTTGTTTTAAAGCACTTCACTGTCTGGGCTGCCCCAGGGATGTGTATTATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	468045	98	+	636262	GGATCTTATCAGCACCCTTTTAAGAGAATACCTTCCTTTGCAAGGTCTTGTTTTAAGGCACTTCACTGGCTGGGCTGCCCCAGGGATGTGTATTATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	477957	98	+	647215	GGATTGTATTAGCACTGTCTTAAGAGGATACCTTCCCTTGCAAGGACATGTTTAAAAGCACTTCACTCTCTGGGCTACTCAAGGGACATGTATTATCA

a
s	mr.mrrefChr3	23823	58	+	181019	ACACAAACCTCAGACAGTTTAACTCTCCAGGCTCTATAGAATGATCTGGGAACACAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	468168	32	+	636262	ACACAAGCCTCAGACAGCTTAATGCTCCAGGC--------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	478055	58	+	647215	ACACAAACCTCAGACAGTTTAACTCTCCAGGCTCTATAGAATGATCTGGGAACACAGA

a
s	mr.mrrefChr3	23881	356	+	181019	ACAGCTCCATTCAGATGGGCAGGGGCTATGGACCTGCTGCTTCCACAGTTGCATCTGCCGCTTCCCACAGTTGCCATAAGCTGTATATCGAAACTTCCAGCTTCACCTAACCCCACCATGACAGGATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATGTGCAACTGTTTACCATGCACAACCTTAGGGGCAAGTAAAAACTTATGTATCTGCTTCTTGTATAGTTTGACAATTCATCAGGGCTCCGATGTGGGGTCAACCATCACTATCAAGGATCAACCAAAATTCCAGGCTGGGTGTCACATTGTCTTTCTTCACACTTCAAGCTGTGGTACATGCAGGTATAATTTAGACATTCATATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	468200	337	+	636262	ACAGTTCCATTCAGATGGGCAGGGGCTATGGACCTGCCGCTTCCACAGTTGCATCTGCCGCTTCCCACAGTTGCCATAAGCTGTATATCGAA-------------------CCCACCATGACAGAATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATTTGCAGCTGTTTGCCATGCACAACCTTAGGGGCAAGTAAAAACTTATGTATCTGCTTCTTGTATAGTTTGACAATTCAGCAGGGCTCTGATGTGGGGTCAAGCATCACTACCAAGGATCAACCATCATTCCAGGCTGGGTGTTGCATTGTCTTTCTTCACACTCCAAGCTGTGGTACATGCAGGTATAATTTAGGCATTCATATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	478117	353	+	647215	ACAGCTCCATTCAGATGTGCATTGGCTATGGACCTGCTGCTTCGACAGTTGCATCTGCTGCTTCCCACAGTTGCCATAGGTTGTATATCAACACTTCCAGCTTCACCTAACCCCACCCTGACAGGATGAGAACCACAAGTATTCCCAGGATGCATGACTGTTCACCATGCACAACCTTAAGGGCAAGTAAAAACTAATCTGTCTGCTTCCAGTATAATTTGACAATTCATCAGGGCTCCGATGTGGGGTCAACCATCACTATGACAGATCACCCAAAATTCCATGCCAGGTGTCACCTTGTCTCTCTTCACACTTCAAGCTGTG---CACCCAGGTATAATTTAGACATTCAAATT

a
s	mr.mrrefChr3	24237	313	+	181019	TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACCACACCACAGCCGTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAATGGAACTCCTCTGCATTGTGCTTTCCTGTGCTCTGTAATGACTTGTGGGATGATCCCATTGTATGAACTAAAGTACTGATGCCATTGAACACAAGGGGTTACAGAGTGGACATAAGACTGTGTCCTGCAACTTGGACAACATCTCAGGTTAAGGATTGTTATTAATACTGCAATCCATTTGCACTTTGGCTCTTTAATTAGATACTTGATAACTAACATTGTCACCCTCCAAGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	468537	308	+	636262	TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACTACAACACAGCTGTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAGTGGAACTCCTCTGCAGTGTGCTTTCCCGTGCTCTGTAATGACTTGTGGGATGATCCCATTGTATGAACTCAAGTACCGATGCCACTGACCACAACGGGTTAC-GAGTGGACATAAGACTCTCTCCTGCAACTTGGACAACATCT----TTAAGGATTGTTATTAATGCTCCAATCCATTTGCAATTTGGCTCTTTAATTGGATGCTTGATAACTAACATTGTCACCCTCCAAGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	478472	313	+	647215	TGGTGGTCCATAATCTAAAGTTACCACACCACAGCCTTTCCCACCTTTGGGGTAAAAATGTGTCAAGAGTGGGCAAATTGGACTCCTCTACATTGTACTTTGCTGTGCTCTGTAAGGGCTTGGGGGATAATCCCATTGTGTGAACTAAAGTACTTTTGCCATTGAACCTAAGGCATTACAGAATGGACATAAGACTGTGTCCTGCAACTTCAACCACGTCTCAGGTAAAGGACAGTTATTAACAGTGCAATCCATTTGCACTTTGGCCCTTTAACTAGATAATTCGTGACTAACATTGTCCCTCTCCAAAGGG

a
s	mr.mrrefChr3	24550	131	+	181019	CTTCAAAGTTGCAAACAGAGCATACGCAAGTCAATTGCATACCGGAGCCCTCAAATGGCAATTAGTCCCAAGCCAACAATGATTGTGGGCCCACACGTTATGTTGTAGAATTCATTGGTTATAACGACTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	468846	131	+	636262	CTTCAAAGTTGCAAACAGAGCATACGCAAGTCAATTGCATACCGGAGCCCTCAAATGGCAATTAGTCCCAAGCCAACAATGATTGTGGGCCCACACGTTATGTTGTAGAATTCATTGGTTATAACGACTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	478785	131	+	647215	CTTCAAAGTTGCAAGCAAAGTATACACAAAGCAATTGCATACTGGAGCACTCAAATGGCAGATAGCCCCAAGCCAATAATGACTGTGGGCCCACCCGTTATGATGTAGCACTGACTGGTTATAACGACTTG

a
s	mr.mrrefChr3	24681	20	+	181019	GACCTGACTTATCACACCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	468985	20	+	636262	GACCTGACTTATCACACCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	478916	20	+	647215	GACCTGGCTTATCACACTAT

a
s	mr.mrrefChr3	24701	512	+	181019	TGATTACCAACAAACTGTGGATTTACTGATCACTATACAGCACTCATTGCCTCGTTTATCATAGCCAAAGCAGTAAGAATCTTTAACAGCGCTGTCTGCAAGGTAGGCCGAATACAATTGAAGGCTTTGATTTCATCACAGGATAGTCACATGCTAATGAATAGTGTTAGTGGCAGCTCTACAATAAATAAGTTATTTTGCTGGTTTGTTCTAGTAGTGTAAATCTCCACAAGATATTGAGGTAATGGAAAATAAACAGTGTCAACGCGAGGTGATTGCTCTTTATATAATGGAATGTATATATAAGCTCTAATATGCTTGACACACATTTGAGACATGTGATACTGAACTACAAGAAATGCTCACAATTGCTAGGCTTTGTATTATTTTGGATGATGATTAATTATCCTGTGGTACGACTCATGTTGATTCTCAGTATATACTAGAACTGGACCAATAGTGGTCCATGAATACCTCCCTGTGCCTATCTTCTCGTCTTTCAAGCATATGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	469006	506	+	636262	TGATTACCAATGAA-TGTGGATTTACTGATCACTATACAGCACTCATTGCCCTGTTTATCATGGCCAAAGCAGTAAGAATCTTTAACAGCGCTGTCTGCAAGGTAGGCCGAATACAA-TGAAGGCTTTGGTTTCATCACAGGATAGTCACATGCTAATGAATAGTGTTAGTGGCAGCTCTACAATAAATAAGTTATTTTG--GGCTTGTTTTAGCAATGTAAGTCTCCACAAGATATTGAGGTAATGGAAAATAAACAGTGTCAACGCGAGGTGATTGCTCAGCTTATAATGGAATGTATATATAAGCTCTAATATGCTTGACACACATTTGAGACATTTGATACCAAACTACAAGAAATGCTCACAATTGCTAGACTTTGTATTATTTTGGATGATGATTAATTATCCTGTGGTACGACTCATGTTGATTCTCAGTATATACTAGAACC--ACCTATAGTGGTCCATGAATACCTCCCTGTGCCTATCTTCTCGTATTTCAAGCATGTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	478936	472	+	647215	TGGTTACCAACAAACTGTGGA----------------CAGCACTCACTGGCTCGTTTATCACAGCCAAAGCAGCAAGGATCTTTAGCAGCTCTGTCTGCAAGGGAGGTTGAGTACAATTGAAGGTTTTGATTTCATCACAGG-TGGGTACATGCTAATGAATAGTGTTGGTTACAGCTCTACAATAAATAAGTTATTTTGCTAGTTTGTTCTGGTAGTTTAGATCTCCACAAGATATTGCAGTAATGGAAAATA-----------------------GCTTTTTATATAATGGAATGCATATATAAGCCCTAAAATGCTTGACACACATTTTAGACATGTGATACTGTACTACAAGAGATGCTCACAACTGCTAGGTTTTGTATTATTTTGGATGATGATTAATTATCCTGTGGTATCATTCATATTGACTCTCAGTACATACTAGAGCTGGACCAATAGTGGTCCATGAATGCCTTGCTGTGCCTATCTTCTTGTCTTTGAACCATATGTT

a
s	mr.mrrefChr3	25213	451	+	181019	TGGAGCCAGTCACCTGGATGGAGATGTTACTATGACTGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAGGTGGCACCATATAAGGTAGGGGGTCCCTTTGTTTATAATTCACAAATACGCATATACCATTGAAACACACCAAAACCCTGCGTACACAAGCCTGGTAATAGCTAATATTAACTTGCAAGATTGGAACACAGGATTGGCCAGGTTACCTGGCTGGCAGGAGAGACCCTTTAGCATTGGCATCCCTTGACAGCCTGAGTTGATGATTTAGGGTTAGTCTACAAAAAACAATAAATGTAAGAACCATCATTTTTCTCATACAGTTAATTGTCTCATACAGGTGAAGGTAGTCTAAAGGCTGCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTGACCTTGTTTTACAAGGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGTTACCAGTCTTTAGGTAGAATAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	469515	435	+	636262	TGGA---------ATGGA----GATGTTACTATGACTGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAG-TGGCACCATATAAGGTAGGGAGACCCTTTATTTATAAT-CACAAATACGCATGTACCATTGAAACACACCAAAGCCCTGCGTACACAAGCTTGGTGATAGCTAATATTAACTTGCAAGATTGGAACACAGGATTGGCCAGGTTACCTGGCTGGCAGGAGAGACCCTTTAGCACTGGCATCCCTTGATAGCCTGAGTTGATGATGTAGGATTAATCTACAAAAAACAATAAATGTAAGAACCATCATTTTTCTCATACAGTTAATTGTCTCATACAGTTGAAGGTAGTGTAGAGGCTGCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTGACCTTGTTTTACAAAGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGT-ACCAGTCTTTAGGTAGAATAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	479408	426	+	647215	TGAAGCCAGTCACCTGGATGGAGATCTTACTATG--TGTGCCTGATTTGCTGGAGGAGTGTAGGTGGCACCATATAAGGTAGGGGGTCCCTTTGTTTATAATTCACAAATACACACATACCATTGAAACACACCAAAACTCTGCGTACAC----CTGATAATAGCTAATATTAACTTGAAAGATTGGAACACAGGATTGGCAAGGTCACCTGGCTGACAGTAGAGACCCTTTAGCATTGGCATCC--TGGCAGCCTGAATTGATGATTTACGGTCAGTCTATGAAAACCAATAAATGTAAGAACCACCATTT-----------------GCCTCATTCAGGTAAAGGTAGTCCAATGGCTCCAGTTTCTTTAACTAAACTCAAAGCTCATCTTGTTTTACAAGGCTGGTGTGTTTGGGCTTTATGAGTTACCAGTCTTTAGGTAGAATACT

a
s	mr.mrrefChr3	25664	19	+	181019	TAAAATTTGTATGAAACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	469950	7	+	636262	TAAAATT------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	438821	19	+	647215	TAAAATTTGTATGAAACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	479834	19	+	647215	TAAAATTTGTATGAAACTT

a
s	mr.mrrefChr3	25683	1	+	181019	T
s	simRat_chr6.simRat.chr6	479853	1	+	647215	T

a
s	mr.mrrefChr3	25684	42	+	181019	AAGGCTCTTAAGAATGAACAGCTTCAAGAGGTAACGATAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	469957	4	+	636262	--------------------------------------AATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	438840	42	+	647215	GAGGCTCTTAAGAATGAACAGCTTCACGGGGTAACGATTGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	479854	42	+	647215	AAGGCTCTTCGAAATGAACGGCTTCAAGAGGCAACGATAATT

a
s	mr.mrrefChr3	25726	134	+	181019	CATACATTTTTGTCAGAGACATGGCCCAGTGTAAACTTAGCATCATAAAAACTTTTATTTCTGGTACATTTATACTATGTCAACTAAAGTAAGAATTTTACTACTTGAGTAGGTTGTGAATTTCTACCAAAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	469961	133	+	636262	CGTACATCTTTGTCATAGACATGGCCCAGTGTAAACCTAGCATTGTAAAAACTTTGATTTCCTGTACATTTATACTATGCCA-CTAAAGTAAGAATTTTACTACTTGAGTAGGTTCTGAATTTCTACCAAAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	438886	133	+	647215	CACACATTTTTGTCAGAGACATGGCCCAGTATGAACTTAGCATCATATAAATTTTTATTTCTGGTACATTTATACTATGTAAACTAAAGTAAGAATTTTGCTACTGGAGGAGTTTGTGAATTTCTATCCAAG-C
s	simRat_chr6.simRat.chr6	479896	130	+	647215	CATACATTTTTGTCAGAGGTATGACCAAGTGTAAACTTAGCATCATAAAAACTTTTA---CTGGTACATTTATACTACATCAACTAAAGTAAGAATTTTACTACTTGAGTAGGTTGTGAATTCCTACCAAAG-A

a
s	mr.mrrefChr3	25860	10	+	181019	ATCTCCCAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	470094	10	+	636262	ATCTCCCAAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	480026	10	+	647215	ATCTCACAAA

a
s	mr.mrrefChr3	25870	430	+	181019	AATGAGTTTGTAAAATCAATGGATTGATAGTGATGGGGTTGTATATATGACTCCTTTCACTCTGCATGCTAACATTGTTCAGAATTTATTTTTGTAGATGACTTTTCATGTTATGGCAGGAGTATCAATTGGCTTGAGCCATCAGAAAATTGTTCATCCCTGAATAGCTTGTGCACTTGGAGACAGCTGTGATCTCTGAGTGAACCTCTTAGACAAGATAGCTACATAAACCTATAGAGTACACCTAAGTTCTCTTTGCACTACCCCTCAGATCTATTGTAAACTCAGAGCTGTCCACACGTCCTAAATTACTTACACTGCAAAAAGCCACTGATGTTGCTAAGTCTTATGTGTGTTCAAGTCCACCCAACACTCTGGATCACTATGTTATCAAAACCACTACAAATCTCCACATGTTTCGCATTAGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	470104	429	+	636262	AATGAGTTTGTAAAATCAATGGATTGATGGTGGTGGGGTTGTATGTAGGACTCCTTTCACTCTGCATGCTAACATTGTTCAGAATTTATTTTTGTAGATGACTTTTCATGTTATGGCAAGAGTATTAATTGGCTTGAGCCATCAGAAAATTGTTGATCCTTGAATAGCTTGTACACTTGGAAACAGCTGTGATCTCTGAGTGAACCTCTTAGACAAGATAGCTACATAAACCTATAGAGTATACCTAAGTTCTCTTTGTGCTACCCCTCAGATCTATTGTAAACTCAGAGCTGTCCA-ACGTCCTAAATCACTTACAGTGCAAAAAGCCACTGATGTTGCTAAGTCTTATGTACATTCAAATCCACCCCACACTCTGGATCACTATGTTATCAAAACCACTACAAATCTCCACATGTTTCACATAAGGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	480036	430	+	647215	AATGAGTTTGTAAAATCGATGGATTAATAGTGATTGGGTTGTATATGTGACTCCCGTCACTTTGCATGCTAATCTTGTTCAGAATCTATTTTTGTAGGTGACTATTCTTGTTATGACTGGAGTATCAATTGGCTTGGGCCATCAGAAAAATGTTCATCCCTGAATAGCTTGTGCACTTGGAGACAGCTATGACCTCTGAGTGAGCTTTATAGACAAGATTGCTACATAAACCTTGATAGTACACCCAAGTTCTTTTTGCACCACCCCTCGGATCTATTGTAAACTCAGAGCTGTCCACAGATCCTAAATTACTTAAACTGCAAAAAGCCACTGATGTTGCTAAGTCTTATGTGTGTTCAAGTCCACCCAGTACTCTGAATCATTATTTTATCAAAACCACTACACACCTCCAGGTGTTTCGCATTAGGCA

a
s	mr.mrrefChr3	26300	55	+	181019	TATGGGCACTTGCTATGACCACTACCTGAGGAGTGGTAGGTAGAGCGAGGAGTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	470536	55	+	636262	TGTGGGCGCTTGCTATGACCACTACTTGAGGAATGGTAGGTAGAGCGAGGAGTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	480466	55	+	647215	TATGGGCACTTGCTATGACTACTACCTGAGGAGTGGTAGGTAGATTGAGGAGTAG

a
s	mr.mrrefChr3	26355	8	+	181019	AGGTAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	470591	8	+	636262	AGGTAGAA
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a
s	mr.mrrefChr3	26363	38	+	181019	TAAATATACAAATACATACGACTGAGCACTAATTAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	470599	38	+	636262	TAAATATACAAATACGTACGGCTGAGCACTAATTAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	480534	38	+	647215	TAAACATATAAATACATATGACTGGGCACTAATTAGTA

a
s	mr.mrrefChr3	26401	110	+	181019	GTATCACATCAGATCTAGGCACTAAAACTCAATTTATGACCAGTGCTTTTATGACCATAGCTAAGCCCAACTAAAAAAGGAAGTAGCAATGAAAAAATCAGCTTAGCAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	470637	110	+	636262	GTATCAAATCAGATCTAGGTACTAAGACTCAATTTAAGACCAGTGCTTTCATGACCATAGCTAAGCCCAACTAAAAAAGGAAGTAGCAATGAAAAAATCAGATTAGCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	480590	110	+	647215	GTATTACATCTGATCTAGGCACAAAAACTCAATTTATGACTGACGCTTTTATGACCGTAGCTAAGCCCAACTAATAAAGGAAGTAGCAACGAAAAAATCAGCTTACCAGT

a
s	mr.mrrefChr3	26511	71	+	181019	AACACCAGGTTGAGACAACTGTCTTCAACCTGGTTAGGTAGACACAAGAAGGGCCTTTATTATGTTCTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	470751	71	+	636262	AACACGGCATTGAGACAACTGTCTTCAACCTGGTTAGGTAGATGCAACAAGGGCCTTTATTATGTTCTTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	480700	71	+	647215	AACACCAGGTTGAGACAACTATCTTCAACCTGGTGAGGTAGACATAAGGAGGGCCATTATTATGTTCTTCT

a
s	mr.mrrefChr3	26582	100	+	181019	TCCACCCACAGAAAGCAGGAGTTATCTTACACTTGAGGTTCCACTTAGGGAGGTTTGTGGAAGATTTACTACAAGGGTGAGGGGCAGGCTCGTTGAGCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	470823	100	+	636262	TCCACCCACAGAAAGCAGGAGTTATCTTACACTTGAGGTTTCACTTAGGAAGGTTTGTGGAAGATTGACTACAAGAGTGAGGGGCCGGCTGGTTGAGCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	480771	86	+	647215	TCCACCCACAGAATGC-----------TACACTTGTGGTTCCACTTAGGGAGGTTTGTGGAA---TTACTACAAGGGTGAGGGGTAGGTTCATTGAGCTC

a
s	mr.mrrefChr3	26682	37	+	181019	TAGATGCAGAATTATGTAGGGACTATTACTAGGGTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	470935	37	+	636262	TAGATGCAGAATTATGTAGGGACTATTACTAAGGTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	480857	37	+	647215	AAGATGCAGTTTTATGTAGGGACTATTACTAGGCTAG

a
s	mr.mrrefChr3	26719	137	+	181019	CAAAAGACATTTACTGCATGGCCTTAAAGACAGATATCAATTTTGCCCCTGTATCTTCCTGTCTTGGCATGTAATGACTCTCACATTCTTCAGGAGTATGTTGTCCAGGAGACCTTAGTAAATCTTTGCTCATTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	470976	137	+	636262	CAAAAGACATTCACTGCATGGCCTTAAAGACAGAAATCAATTTTGCCCCTGTATTTTCCTGTCTTGGCAGGTAATGACTCTCACATTCTTCACGAGTATGTTGTCCAGGAGACCTTAGTAAATCTTTGCTCATTAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	480894	136	+	647215	-GAAAGCCATTTACTGCATCACCTTAGAGTAAGATATCCATTTTGCCCCTTTACCTACTTGTCTTGGCATGTAATTACTCTCATATTCTTCAGGAGTCTGTTGACCGGGAGGCCTTATTAACTCTTCGCTCATTAGA

a
s	mr.mrrefChr3	26856	144	+	181019	TATGCTAACCCTCATCTGCCATCACCATTATTTAAGAACATTGGTCTATGAGCTTATGCTTAAGAGGACCCCTGGCTGTGTCCGTGTTTGGTATTGTTTGGCTTTTGTCTGCATCCATCCTTAGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	471113	144	+	636262	TATACTAACCCTCATCTGCCATCACCATTATTTAAGAACATTGGTCTATGAGTTTATGCTTAAGATGAACCCTGGCCGTGTCCGCGTTCCATATTGTTTGGCTTTTGTCTGCATCCATCCTTGGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	481032	144	+	647215	TGTGCTAACCCTCAACTGCCATCCCCATTGTTTAAAAACACTGGTCTATGAGCTTGTGGTTAAGAGGACCCCTGGATGTGTCCATGTTTGGTATTGTTTAGCTTTTGTCACCAACCATCCTCAGCTAGCAGAGTTAGCAGCTAC

a
s	mr.mrrefChr3	27000	52	+	181019	ATAGGCTGACAATCAAATCATTCCACCTGTTATTATCATCAATTCATAGAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	471257	52	+	636262	ATCGGCTGACAATCAAATCATTCCACATATTATTATCATCAATTCATAGAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	481184	52	+	647215	ATAGGCTAACAACCAAACCATTCCGACCGTTATCATCATTAATTCATAGAGA

a
s	mr.mrrefChr3	27052	23	+	181019	ACAGGGTTAGGATACTTGATTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	471313	21	+	636262	ACAGGG--TGGATGCTTGATTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	481236	23	+	647215	ACAGGGTTAGGATACTTGATTGG

a
s	mr.mrrefChr3	27075	132	+	181019	AAGAAATGCTAACATTGCAAATTGGCATTGGGATTTGTCTAAATCTGCTTAGAGTATCTAGTTGAACAGCCCCCAGAAGGTGACCAAACGTTGGAGAAAGCAGATAACACTCAATACAATAAAGCTGGGGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	471334	131	+	636262	AAGAAATGCTAACATTGCAAATTGGCATTGGAATTTGTCTAAATCTGCTTAGGGTATCTAGTTGAATAGCCCCCAGAAGGTGACC-TACATTGGAGAAAGCAGATAACACTCAATACAATAAAGCTGGGGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	481261	132	+	647215	CAGTAGTGCAAACATTGCAAATTGGCGTTGGGATTTGTCTAAATCCGCTTAGAGTATCTAGTTGATCAGCCCTGGGAAGGTGACCAAATGTTGGAGAAAGCAGAAAACACTCAAGACACTAAAGCTGGGGGA

a
s	mr.mrrefChr3	27207	204	+	181019	TGAGATGGACAAACCATCATCAGAGGGACCAATTTTCTCTGATTATGCTGAGTTAGTGTACATCCAGATTTGATCTCTCTTAGAATCTCAAATGGCAAATGTTAGACAATCTTTTGGATGCAATTTCTAGAGCATAGGTTCTAATTCATGCCAATGGAGAGGCAAGGATGTATAACACTTATTTTATGAGGCATGCTTGTTACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	471466	200	+	636262	GGAGACGGACATACCATCATCAGAGGGACCAAGTTTCTCTGATTATACTGAGCCAGGGTACATCCAGGTTTGAACTCTCTTAGAATCTCAAATAGCACA--CTAGATAATCTTTTGGATGCAATTTCTAGAGCATAGGTTCTAATCCATGCCAAAGGAGAGGCAAGGATATATAACACTCATTTTA--AGGCATGCCTGCTACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	481393	176	+	647215	TGAGATGGACAAACCCTCCTCAGAGGGACCAATTTTCTCTGATTATGCTGAGTTGGTGTACTTCTAGATTTGATTTCTCTTCGAATCTCAAATGGCAAATGTTAGACAATC----------------------------TCTAATTCATGCACATAGAGAGGCAAGGATGTATAACACTTATTTTATGGGGCATGCTTGTTACA

a
s	mr.mrrefChr3	27411	156	+	181019	GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTTACTGATATCATTGGACCTACCTGTAATGGGGAAGCCCTCTGGACCATGCAAGGCTGAGGAGTGGACCACTAGATGGAATTGCTAGTACAAGAATTAAATAGATCATCATGATTGTAGCACTATAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	471666	131	+	636262	GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTT-------------------------ATGGGGAAGCCTTCTGGACCATGCAAGGCTGAGGAGTAGACCACTAGATGGAATTGCTAGTATAAGAATTAAATAGATCGTCATGATTGTAGCACTATAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	481570	156	+	647215	GATAGCAAGAAACATTAGCCCTATGTGTTTACTGATATCATTGGACCTACCTGTAATGGGCAAGCCCTTTGGTCCATGCAAGGCTGAGGAGTGGACCACTAGATGGAATTGCCAGTACAAGAATTAAATAGATCATTATGATTGTAGCACTATGAA

a
s	mr.mrrefChr3	27567	11	+	181019	AAAGGGTAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	471797	11	+	636262	AAAGGGTAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	481730	11	+	647215	AAAGATTAAAT

a
s	mr.mrrefChr3	27578	192	+	181019	CCTGCTCATATCAATGATTAAAAGGAAAAACCAAGGATGTTCAAGTGAGAAAACAAGAAAATGGATGATCCTACTAGTAAGGAGGTGTAAATTATTCAATTAGCATCTATGGTCAGTTACATTAATGGTACAGAAGCAGGGGTACTCAGATGCTTAATAATTTTGACCTTGAGCTATTCCAGATCTAATGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	471808	192	+	636262	CCTGCTCATGTCAATGACTAAAAGGAAAGACCAAGGATGTTCAAGTGAGAAAATAGGAAAATGGATGATCTTACTAGTGAGGAGGTGTAAGTTATTCAATTAGCATCTATTGTCAGTTACATTAATGGTAAAGAAGCAGGGGTCCTCAGATGCTTAATAATTTTGACTTTGAGCCATTCCAGATCTAACGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	481830	191	+	647215	ACTATGAATATCAAAGATTAAATGGAAAAAGCAAGGATGTTTAA-TCAGAAAACAAGAAAATGGATCATCCTACTAGTAAGGAGGTGTAAAGTATTCAATTAGCATTTATGGTCAGTTACATTAATCGTACAGAAGCATAGGTACTCAGATGCTTAATAATTTTGACCTTGAGCTGTTCCCAATCTAGTGTA

a
s	mr.mrrefChr3	27770	94	+	181019	ACTTACTACACTTCACCCTGCCTTAGTGCATGGTCCTGGCCTGAGCTCTGATAACCTGGGTGGACAACTAGGCTCTGAACTCTGATTGCAGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	472004	94	+	636262	ACTTACTACACTTCACCCTGCCTTAGTGCATGGTCCTGGCTTGAGCTCTGATAACCTGGGTGGACAACTAGGCTCTGAGCTCTGATTACAGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	482021	94	+	647215	ACATACTACACTTCACCCTGCCTTACTGCATGGTCCTGGCCTGAGCTTTGATAACCTGGGTGGACAACTAGGCTCTGAAATCTGATTGCAGACA

a
s	mr.mrrefChr3	27864	32	+	181019	GCAGTTGCATGACTATGATGATCCTTGTACTC
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a
s	mr.mrrefChr3	27896	27	+	181019	TTGGCCAGACAAAGTCTTAATGTTTTT
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a
s	mr.mrrefChr3	27923	41	+	181019	AGGGGGAGTTATCGTCACTTTCTATTGTCTGGTGTCCTTCC
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a
s	mr.mrrefChr3	27964	219	+	181019	AAGCAAGCGACCAACAAAAACAGGTGACTAACTGCAGAATTGTACGATTATGACTCTGCTCATTTGGAGGACCATATCTAATGCAGGTACCAGCACCCCTAGCCACCCTATCCAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCAATGCACCTCCTTGTTGATTGGAATCCATCATCTAATGTACCCCAGACTGAGAGCCAACTCAAATGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	472203	219	+	636262	AAGCAAGCGACCAACAAAAACAGGTGACTAACTGCAGAATTGTACGATTATGACTCTGCTCATTTGGAGGACCATATCTAATGCAGGTACCAGCACCCCTAGCCACCCTATCCAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCAATGCACCTCCTTGTTGATTGGAATCCATCATCTAATGTACCCCAGACTGAGAGCCAACTCAAATGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	163646	219	-	647215	GTGCAAGCAACCAACAAAACCAGATGGCTAACTACAGAATTGTACTATTGTGACTCTGCTCGTTCGGAGGACAATTTCTATTTCAGGTACCAGTATCCCTAGCCACCCTATACAAAACTGAGAAGTTCAAGGCTGGTGAGTGCTCTTATGCGATGAGCCTCCATGTTGAGTGGAATCCATCATCTAATATACCCCAGACTAATAGCCAATTTAAATCGC

a
s	mr.mrrefChr3	28183	172	+	181019	CTGCAATAGTTTATGTATGTGTTCCCTACACTCATAGCCACCTCAAAAGGTGGCAGCCACCCCTTACATATGTAAAAAGATCTAAGGGGCTTATATGGATTTCAAGCCTACTCATGTTTTTAGATTATCTGCTGAGTGTTTTTGGCTTGCACCTGTATCCTGGATATCTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	472422	172	+	636262	CTGCAATAGTTTATGTATGTGTTCCCTACACTCATAGCCACCTCAAAAGGTGGCAGCCACCCCTTACATATGTAAAAAGATCTAAGGGGCTTATATGGATTTCAAGCCTACTCATGTTTGTAGATTATCTGCTGAGTGTTCTTGGCTTGCACCTCTATCCTGGATATCTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	163870	172	-	647215	CTGCAATAGTTTATGTATGTGTTCCATATACTAATAGCCACCACAAAAGGTTTCGACCCTCCCTTACATATATATGAAGATCCAAAGGGCTCACGTGGACCTCAAGCCTACTCATGTTTTTAGATTATCTGTAGAGTGTTTTTGGCTTGCATCTGTATCCTGGATATCTATT

a
s	mr.mrrefChr3	28355	206	+	181019	CTGGATGCCTGACATTGGAAAAGATGGGGGCCATGGATGAATTAAATGTATAAAGTTGAGGACACACTATCATGTAACAGTCTGGTCAGTAATCAATTAAAAGAAGCCAAACTCGGAAGGCTCCAGACCAGGGGTACATTGAGTGCTACATGGATTGCAAATTCACAGTCAATAGTGAATATTGGCTACCAGTACATTCTTAAAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	472595	202	+	636262	CTGGATGCCTGACATTGGAAAAGATGGGGACCATGGATGAATTAAATGCATAAAGTTGATGACACACTACCATTTAACAGTCTGGTGAGTAATCAATTAAAAGA--CCAAACTCGG-AAGCCCCAGACCAGGGGTACATTGAGTGCT-CATGGATTGCAAATTCACAGTCAATAGTGAACATTGGCCACCAGTACGTTCTTAAAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164042	203	-	647215	CTGGGTGACTGACATTGGAAAAGATGGGGGTTGTGGATGAACTAAATGTAAAAAGTTGAGGACA---TATCATGTTACAGTTTGGGCAGTAATCAATTGAAAGAAGCCAAACTCGGAAGGCTCCAGACCTGGGATACATTGAGTGCTACATGGATTACAAATTCACAGTCAATAGTGACTATTAGCTACTGGTACATTCTTTAAAC

a
s	mr.mrrefChr3	28561	57	+	181019	ATCTAAGCTTAAACCTAATAGTCAGGATATTGCAATGTAGTGCCTGGAACTTTGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	472799	57	+	636262	ATCTAAGCTTAAACCTAATAGTCAGGATATTGCAACATAATGCCTGGAACTTTGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164245	57	-	647215	ATCTAAGCTTAGCCCAAATAGTCAGGATATTGTAATGTAGTGCCTGGAAGTGTGCAT

a
s	mr.mrrefChr3	28618	10	+	181019	TCAATTCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	472857	10	+	636262	TCAATTCCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164302	10	-	647215	TCAATTCCAT

a
s	mr.mrrefChr3	28628	17	+	181019	CCTATATTCCCACAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	472867	17	+	636262	CCTATACTTCCACAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164313	17	-	647215	CCTGTATTCCCACAGTA

a
s	mr.mrrefChr3	28645	24	+	181019	CTGGAATTGAATTGGAAGTTAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	472896	24	+	636262	CTCGTATTGAATTGGAAGTTAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164330	24	-	647215	TTGAAATCGAATTGCAAGTTAGCA

a
s	mr.mrrefChr3	28669	261	+	181019	TTCTTTTCCTTGTTTGGTTTGTCTGCTAGAAGGATTAGTACGTCATGTTTTGTCTTCTACAATGGCAGTGTAGCTGACCTGAAAACTAAGTTGCAAGCTCATGCATGGTTCTTATGGAGCTTTCTATGGTGTGACCTTGAGGGGGAGATCTAGAGGAACTTATCTTATAAGTGAAGATAGTAGCTCTGACATGATGGATGAGGAATCCCTCTTGAGTATACAGTGCCACCCAGGATGAAATCTCAAGGAACTCCAAAGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	472920	251	+	636262	TTCTTTTCCTTGTTAGATTTGTCTGCTAGAAGAACTAGTACATCATGTTTTATCTTCTGCAATGGCAGTATAGCCGACCTGAAAACTGAGTTGCAAGCTCATGCATGGTTATTATGGGGCTTTCAATGGTGTGAC----------AGATCTAGAGGAACTTATCTTATAAGTGAAGATAGTAGCTCTGACATGATGGATGTGGAATCCCTCTTAAGTATACATTGCCACCCAGCATGAAATCTCAAGGAACTCCAAAGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164355	258	-	647215	TTCTTCCCCTAGTTTGGTTTGTCTGCTAGAAGGATTGGTACGTCATGTTTTGTGCTCCACAATGTGAGTGTAGCTCACCTGAAAATTAAGTTGCAAGCTCATGCATGGTTCTTATGGAGCTTTCTATGGTGTGACCTTGAGGGGGAAATCTAGAGGAAC---TCTAATTAGTGAAGATAATAGCTCTGATGTGATCAATGAGGAATCCCTCTTGAGTATACAGTGCCACCCAGGATGAAATCTCAAAGACCTCCAATGACA

a
s	mr.mrrefChr3	28930	62	+	181019	CAGGAATCCCCACCTCACTGTCTTGAAATAGCTCACATAAAGGAAAGAGTCTTTTAAGAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473172	62	+	636262	CAGGAATCCCCACTTCACTGTCTTGAAATAGCTCACATAAAGGAAAGAGTCTTTTAAGAGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164613	62	-	647215	CAGGAATCCCCACCTCACTGGCTTGAAATAGTTCACATAAAGGAAAGAGTCTTTCAAGAGAC

a
s	mr.mrrefChr3	28992	19	+	181019	CTCCACTTATATGAGTTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473234	19	+	636262	CTCCACTTATATGAGTTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164677	19	-	647215	CTCATCTTATATGAGTTAA

a
s	mr.mrrefChr3	29011	110	+	181019	GGTGATGTTTTAGGTGTCACTCCCTTAGGTGTCGCTTCTTTGACACTGTTCATGACACTTAGTATGATATATTCATATGGCTTGCCATCCCGATTATATGGTCAAATTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473253	110	+	636262	GGTGATGTTTTAGGTGTCACCCCCTTAGGTGTCGCTTCTTTGACACTGTTCATAACACTTAGTATGATATATTCATATGGCTTGCCATCCCGATTATATGGTCGAATATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164697	110	-	647215	GGTGAGGTTTTGGGTGTCACTCACTTGGGTGTCACTGCCTTGACACTGTTCATGCCACTTAGTATGATATATTCATATGGCTTGCCATCCCGATTATATGGTCAACTTTG

a
s	mr.mrrefChr3	29121	114	+	181019	AATAGAGCAGGGGTAGACCATGATATTGGGTAGAACAGGATTTTCCAATACCAATACTTCTGTCAAGCACCAGAGGAATATAGATCAAGGTTGAGAAAGTATTGATATTTTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473363	113	+	636262	AATAGAGCAGGGTTCGACCATGATATTGGATAGAACAGGATTTTCCAATA-CAATACTTCTGTCAAGCACCAGAGGTATACAGATCAAGGTTGAGAAAGTATTGACATCTTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164849	114	-	647215	AATAGAGCAGGGGTAGAATATGATATTGGGTATAATGGGCTTTTCCACTACCAATACTTCTGTCTAGCATCAGAGGAATCTAGATCAAGGTTAAGACAGTATTGGTATTTTTCT

a
s	mr.mrrefChr3	29235	99	+	181019	TTGCTACAGCTGTTGAGCATTTCTATGTGTTTTGGAATCTTGGGCAGATCACAAGAATAGGTTTATTTGGGGTAAATAAAGTCACTTTAAGATGAGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473477	99	+	636262	TTGCTACAGCTGTTGAACATTTCTATGTGTTTTGGAATCTTGGGCAGATCACAAGCATAGGTTTATTTGGAGTGAATAAAGGCACTTCAAGATGAGTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164963	99	-	647215	TTGCTAGAGCTGTTGAGCACTTCTATGCATTTTGGAATTTTGGGCAGATCACAAGAAAAGGTTTACTTGGGGTAAATAAGGTCGCTTTAAGATGTGTAC

a
s	mr.mrrefChr3	29334	193	+	181019	TAGTTAAGCTACATCATCGGAATTGGTGGATGAGTATAATTGCATCAAAGGCATAGAAGAAGTAACGTGGAGAACGATTCAGCTTTTCATGACATGCTAGAAAGTTTACCCCCTATCAATAATCACCAAGGTGAGTAATCTTGACGACCAGGGGACCACTAGGAATCCTTACTGATAGAACTTATATCATGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473576	192	+	636262	TAGTTAAGCTGCATCATCGGAATTGGTGGATGAGTATAATTGCATCAACGGCATACAAGAAGTGACGTGGAGAATG-TTCGGCTCTTCATAACATGCTAGAGAGTTTTCCCACTGTCAAGAATCACCAAGGTCAACAATCTTGACGACCAGGGGACCACTAGGAATCCTTACCGCTAGAGCCTATATCATGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	483642	191	+	647215	TAATTAAGCTACATTATCGG-ATTGGTGGATGAATATAATTGCATCAAAGGCATAGAAGAA-TAAGGTGGAGAACGATTCAGCTTTTCATGACATGCTAGAAAGGTTACCCCCTATTAATAATCACCAAGGCGAGTAATCTTGACGACCAGGGGACCTCTAGAAAACCTTGCTGATAGAACTTATATCATTCA

a
s	mr.mrrefChr3	29527	233	+	181019	TACTAAAGGCATGCAGATGTGTTGCCAGCTCTCAACCAAGAGTCAAGAGTCAATTTAATCTGCAGATTAATAAAGATGCTGTCCAGTGCTCATGCAGTAGCTTTCTGCCTTGAATTATTCTGATGTCCATCCATCAATAACTCTGATCACTTGAGAGCAGGACTGTCTACAGGTTGTGCACCTGTGTTGAAAGGTGCTAGACTGGACCTGGGTCCATATTCAGAAGAGATCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473768	232	+	636262	TACTAAAGGCATGCAGATGTGTTGCCAGCTCTCAACCAAGAGTCAAGAGTCAATTTAATCTGCATATTAATAAAGATGGTGTCCAGTGCTCATGCAGTAGCTTTCTGCCTTGAATTATTCTGATGGCCATCCATCAATAGCTCTGATTACTTGAGAGCAGGACTGTCTACAGGTTGTGCACCTGTGTTAAAAGGTACTA-ACTGGACCTGGGTCCATATTCAGAAGAGATCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	483837	232	+	647215	TACTAAAGGCATGCGGATGTGTTGCCAGCTCTCATTCAAGAGTCAAGCGTCCATTTAATATGTAGCTTAATAAAGTTGCTGTCCAGTGATCATTCAGTAACTTTCTGCCTTGAATTG-TCTGATGTCCATCCATTAATAACTCTAATCACTTGAGAGCAGGACTGTCCACAGGTTGTACACCTCTGTTGAAAGGTGCTAGACTGGCCCTTAGTCCATATTCAGAAGAGATCCT

a
s	mr.mrrefChr3	29760	22	+	181019	GCACCATTGTCACTTCTTTGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474000	22	+	636262	GCACCATTGTCACTTCTTTGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	484070	14	+	647215	GTAACAAAATCAGT--------

a
s	mr.mrrefChr3	29782	179	+	181019	TGCCAGATACCAAATTGAAACCTCTGTATTAGTATAGCATGTGCATTATTTATAACAACAGCTCCTAATGGCCCTACCTAGAAGGGGCAAAAGGCAAGGCAGATTGAGGGAGCCTGACTTGTCATAATTCGCGCTTTTCCAAAGGGCCTTCCATGATGATGTTGGTCAAATCATTTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474036	179	+	636262	TGCCAGATACCAAATTGAAACCTCTGTATTAGTATAGCATGTGCATTATTTATAACAACAGCTCCTAATGGCCCTACCTAGAAGGGGCAAAAGGCAAGGCAGGTTGAGGGAGCCTGACCTGTCATAATTGGCGCCTTACCAAAGGGCTCTCCAAAATGATGTTGGTCGAATCATCTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	484084	106	+	647215	----------------------------------------------------------------------GCCCTACGCAGAAGGGGCAAAATGCAAGGCAGATTGAGAGAGCTTGACTTTTCATAATCCGCGCTTTTCCACAGGGCCTTCCGTGATGATGT---TCAAATCATTTTTG

a
s	mr.mrrefChr3	29961	17	+	181019	TGAATATAGGTCTAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474233	17	+	636262	TGGATAGAGGTCTAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	484190	12	+	647215	TTAGTGT-GGTCT----

a
s	mr.mrrefChr3	29978	39	+	181019	ATAGAAAGTACGGTGCCCTTGTGTGAATTCAAGTTACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474256	39	+	636262	ATAGAAAGTACGGTGCCCTTGTGTGAATTCAAGTTACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	484202	39	+	647215	ATAGAAAGCGCAGTGCCCTGGTGTGAATTCAAGTTACTT

a
s	mr.mrrefChr3	30017	123	+	181019	GGACTAGAAAATACATGATGCTGAAGCCTGCCATTCAAGGATTAATAATACCCAAGAAGGCACTCCTCTTATCCCCATGTATAAAAACAACCGCATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474298	123	+	636262	GGACTAGAAAATACATGATGCTGAAGCCTGCCATTCAGGGATTAATGATACCCAAAAAGGCACTCCTCTTATCCCTATGTATAAAAACAACCGCATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	484241	123	+	647215	GGACTAGAAAGTACATCATGCTGAAGTCTACTATTCAAGGATGAGTAATACCCATGAGGGCACTCCTCTCATCCCCATGGGTAAAAACAACCACATGCATTACAACAATACAAAAGTATCAGA

a
s	mr.mrrefChr3	30140	12	+	181019	AAGATGGATTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474722	12	+	636262	AAGATGTAACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	484364	12	+	647215	GAGATGGATTTG

a
s	mr.mrrefChr3	30152	367	+	181019	GTATTTGCTTAAATATAGAGGCCTGACAAGTCTTTTTGGACAGAATTGGAGGATTGCAAATAATAACATTTCCCTTGGTTCTCGTAACAAGATTGTAATGTTGGGTTGGAACTAAGGTAGTTAGAATTTAGCATTGCAGCAATCTAGTACTTGTATGTGACACACGGTTGGAATGGCTCACCCAACCCCAAGCTCCTTGAATTGAGTGACTGGGTAGTTTAGCAGGTTAACATCTTGAAGGTTAGTAAGCACAAAGGTGATGATTGACTCTTCAAGTGTTGATTGATAGGACAGCAAGGGGTTGCACAGTTCCAGCAGGTTTCCATGTCCAACACAAGGTATTGTAATCTTCTCTAAATTGGGAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474735	313	+	636262	GTATTTGCTTAATTATATAGGCCTGACAAGTCTTTTTGGACATAATAAAAGGATTGCAAATAATAACATTTCCC---------------------------------------------------ATTTAGTATTGCAGCAATCTAGTACTTCTATGTGACG---GGTTGGAGTGACTCACCCAACCACATACTCCTTGAATTGAGTTACTGGGTAGTTTAGCAGGTTAACACCTTGGAAGTTAGTAAGCACAAGGGTGATGATTGAGTCTTCAAGTATTGATTGATACAACAGCAAGGGGTTGCACAGTTCCAGCAGGTTTCCATGTCCAACACAAGGTATTGTAATCTGCTCTAAATTAGGAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	484376	367	+	647215	ATATTTACTTAAACATAGAGGCCTGACAAGCCTTTTTAGAGAGAAATGGACGATTGCAAATAATAACATTTCCCTTGGTTCTCGTAACAAGATTGTAATGTTGGGTTGGAACTAAGGTAGTTAGAACTTAGCAATGCAGCAGTCGAGTACTTGTAGGTGACACACGGTTGGAATGGCTCACCCAATCCCAAGCTCCCTGAATTGAGTGATTGGGTAGTTTAGCAGGTTAACATCTAGAAGGTTAGCAAGCACAAAGGTGATGATTGACTCTTCAAGTGTCGATGGATAGGACAGCAAGGGGTTGCAAGGTTCCAGCAGGTTTCCATGTTCAACACAAGGTATTGTAATCCTCTCTAGATTGGGAGCA

a
s	mr.mrrefChr3	30519	31	+	181019	CCCATGCATCCCAGACTCAGCATTTTCAGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	475049	31	+	636262	CCCATGCATCACAGACTCAGCATTTTCAGCC
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a
s	mr.mrrefChr3	30550	174	+	181019	CTACTATGGCTGTTAGCTGGCTTTTTAAGCACAATTAATCCAAACGTTGAGACGCAACGATCATTAGAAGACCTTCATGGGCCATCCATTGTTATAGACAAACAGTGTTCATAGAGTGATAGTGAACAGGGATGGTCTACAGCCTGAGTGGCCCACCTAATTCACATCGAGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	475084	160	+	636262	CTACTATGGCTGTAAGCTGGCTTTTTAAGCACAATTAATTTGAACGGCAAGACCCGACGATCATTAGAAGACCTCCATGGGCCATCCGTTGTTCCAGACAAACAGTATTCTTAGAGTGATGGTGA--------------CAGCCTGAGTGGCCCACCTAATTCACATCGAGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	484774	174	+	647215	CTACAATGGCTGTTAGCTTGCTTTTTAAGCACAATTAATCCAAATGTTGAGACGCAACGATCCTTAGACGGCCTTCATGGGCCATCAATTGTTATAGACAAATAGTGTGCAAAGAGTGATAGTGAACAGGGATGGTCTATAGCCTTAATGGCCCACCTAATTCATATAGACAGT

a
s	mr.mrrefChr3	30724	37	+	181019	GAATGATTCGGGGTTAGCATTCCTCCAGCTGTAGGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	475638	37	+	636262	GAATGATTCGGGGTTAGCATTCCTCCAACTGTAGGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	484948	37	+	647215	GTATGAGTTGGGGTTAGGTTTCCTCCAGCTGTAGGTT

a
s	mr.mrrefChr3	30761	54	+	181019	TGCACAAGTAATAGAATGTGCTGGATGATGTGTTAAATATTGCTACATTGGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	475675	54	+	636262	TGCACAAGTAATAGAATGCATTGGATGATGTGTTAAATATTGCTACATTGGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	484988	52	+	647215	TGCACAAGT--CAGAATGTGCTGGACGATATGCAGGATATCACTACATTGGAAT

a
s	mr.mrrefChr3	30815	101	+	181019	GAGTCCTACCAGGGTGCTTTAAACATCAAGACGCGTTGCCAGCAGCAAACCACCCATTCATTGGACATTTGGGTACAGCAACCAGGAAGACTGACCAAGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	475729	101	+	636262	GAGTCCTACCAGGAGGCTTTAAACATCAAGACGCGTTGCCAGCAGCAAACCACCCATTCATTGGACATATGGGTACAGCAACTAGGAAGACTGACCAAGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	485044	101	+	647215	GAGCCCTACCAGAGTGATTTGAACATCAAGACTGGTCACCAGCAGCAAACCACCCATTCATTGAACATTTGGGTACAGCAACCAGAAAGACTGACCAAGAC

a
s	mr.mrrefChr3	30916	70	+	181019	AACCAGTACATAGATATCCGTCCTATTTGGGTGTAAAATGGAGCTAACAGCTTATCCTACGAGCAGTGGG
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a
s	mr.mrrefChr3	30986	80	+	181019	ACTGTTTAGACTTCACACAGTGCCGTGTGAAAATTTCTAAAAAAAGGCAAACACGGCCCGGTAAACATGGCTAGTGCTTG
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	31106	62	+	181019	CGAGAAGTCAAGCAATCTCCCTGCATGCATTGTCGATCCCCTGTTCAATTCACACATCCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	476236	62	+	636262	CGAGAAGTCAAGCAATCTCCCTGCATGCATTGTCGATCCCCTGTTCAATTCACACATCCCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	485357	62	+	647215	TGAGAAATCAAGCACTCCCCCTGCATACATTGTTTATCCCATGTCTGTTTCACACACGTCAA

a
s	mr.mrrefChr3	31168	14	+	181019	GTCCTGACAGGTCC
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a
s	mr.mrrefChr3	31182	23	+	181019	CCAATTCATGCACTGTCAAGCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	476355	23	+	636262	CCAATTCATGCACTGTCAAGCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	485433	23	+	647215	CCGATTCATGCACTGTCAAGTAA

a
s	mr.mrrefChr3	31205	27	+	181019	GACAGGCATCTGGTTCATGTCTAGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	476379	27	+	636262	GACAGGCATCTGGTTCATGTCTAGAAT
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a
s	mr.mrrefChr3	31232	56	+	181019	GCCTGCCCGCACTACAGTGGACAGTAACTCATTGTCTATTGGTGGGCATAGTGCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	476406	56	+	636262	GCCTGCCCGCACTACAGTGGACAGTAACTCATTGTCTATTGGTGGGCATAGTGCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	485485	56	+	647215	GCCCGCCTACGCTACAGTAAACAATAACTGATTGCCTGTTGATGGACATAGTGTTC

a
s	mr.mrrefChr3	31288	18	+	181019	AGTCACCTCTTTCAAACA
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a
s	mr.mrrefChr3	31306	42	+	181019	TTTTAGCGTGTATGTTTCATTGGTAATATTTAGCATGTATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	476499	42	+	636262	TTTTAGCGTGTATGTTTCATTGGTAATATTTAGCATGTATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	485560	42	+	647215	TTCAAACAAATATAAAGGATTGGTAATAATTAGCATCTGTGT

a
s	mr.mrrefChr3	31348	148	+	181019	AGTCTATGGATTGTGAATATTTAGAATTGGCAGGCAGGAATTTAAAATCAATTTGGCAGACACACGTACTGGCTTTAACATCAATTCAATAAGCCAACAAACCCTCCCTTCAACATCCCTGAATCTCTCAGAGAAGGACATTAATGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	476550	148	+	636262	AGTCTATGGATTGTGAATATTTAGAATTGGCAGGCAGGAATTTAAAATCAATTTGGCAGACACACGTACTGGCTTTAACATCAATTCAATAAGCCAACAAACCCTCCCTTCAACATCCCTGAATCTCTCAGAGAAGGACATTAATGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	485602	148	+	647215	ATTTTAGGCGTTGTGGACATTTAGAATTTGTGGGCAGGAATTTAAAATCAACTTGGCATACACACGTACTGGATTTAACATCAAATCAATAAGCCAACAAACCTTCCCTTCAACAGCCCTGAATCTCTCAGAGAAGGACATCAGCTTG

a
s	mr.mrrefChr3	31496	21	+	181019	TTCCCTCTGCATCAATATATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	476699	21	+	636262	TTCCCTCTGCATCAATATATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	485750	21	+	647215	TTCCCTCTGCAACACTCTATA

a
s	mr.mrrefChr3	31517	23	+	181019	GTCCTCTGTCGAACTCACAGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	476730	23	+	636262	GTCCTCTGTCGAACTCACAGATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	485771	23	+	647215	GTCCTCTGTTAAACACACAAATG

a
s	mr.mrrefChr3	31540	109	+	181019	AAGTTACTGCATGGTGTATCAAGGTTTAGTTTTGAGTCTAAGTGACCTGATTTCTATGCAAAGTGGTATTGCATCAAACTTGAGGATTGTCTATTGGAAATATACAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	476753	109	+	636262	AAGTTACTGCATGGTGTATCAAGGTTTAGTTTTGAGTCTAAGTGACCTGATTTCTATGCAAAGTGGTATTGCATCAAACTTGAGGATTGTCTATTGGAAATATACAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	485801	109	+	647215	AAGTTATCGCATGGTGTATCAAGGTTTAGTTTTGAGTGTAGGTGACCTGATCACTATGCAAAGTGGTATTTCATCAAACTTCAAGATTGTCTTTTGGAAATATACAAAG

a
s	mr.mrrefChr3	31649	8	+	181019	CATAACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	476863	8	+	636262	CATAACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	485910	8	+	647215	CATAAGAT

a
s	mr.mrrefChr3	31657	85	+	181019	TGTCCACAATACTTTAAGtcacttctcataggaaggatggcatctcccctgcaactgtaacaatgaatgtacacactagaatggt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	476885	85	+	636262	TGTCCACAATACTTTAAGtcacttctcataggaaggatggcatctcccctgcaactgtaacaatgaatgtacacactagaatggt
s	simRat_chr6.simRat.chr6	485918	85	+	647215	TGTACACAATACTTTAAGTTACTCCTTATAGGAAGAATGGCATCTCCCCTGCAACTGTAACACTGAATGTACACACTAGTATGGG

a
s	mr.mrrefChr3	31742	63	+	181019	acagggaaaagcataacttctcaaactgagccatccacTGGCACACAGCTTATTGGAAGGAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	476970	63	+	636262	acagggaaaagcataacttctcaaactgagccatccacTGGCACACAGCTTATTGGAAGGAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	486010	63	+	647215	ACAGGGAAGAGCATAACTTCTCAAGCTGAGTCATCCACTGGCAAGTAGCTTACAGGAAGGCAC

a
s	mr.mrrefChr3	31805	23	+	181019	AGGAGAAAGCATAGTACTAATGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	477033	23	+	636262	AGGAGAAAGCATAGTACTAATGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	486083	23	+	647215	AGAAGGAAGCATAGTACTAATTC

a
s	mr.mrrefChr3	31828	113	+	181019	TTCACTCACCTACTAGTCCACATTCAATTGTAGGTGCTCTGTGAGAATGCACACCCCCCCTCCCTGGAGGGCATGGTCTGAAGGCTTTAGAACCTTGAGTTATAATCCGGCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	477061	113	+	636262	TTCACTCACCTACTAGTCCACATTCAATTGTAGGTGCTCTGTGAGAATGCACACCCCCCCTCCCTGGAGGGCATGGTCTGAAGGCTTTAGAACCTTGAGTTATAATCCGGCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	486106	113	+	647215	TTCATTCACCTATTCGTCCACATTCAATTGTAGGAGCTCTGTGAGTATGCACACCCCCCCTCCCTGCAAGGCATGGTCTGAATGGTTTAGACCCTGGAACCATAACCCAGCCT

a
s	mr.mrrefChr3	31941	81	+	181019	GTTATTGTGTACAGGCTGAATGGAGGACTAGTGATGGAGAATCTTTAAGTGCACAATTATATACTCAAAGTTTGATAAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	477175	81	+	636262	GTTATTGTGTACAGGCTGAATGGAGGACTAGTGATGGAGAATCTTTAAGTGCACAATTATATACTCAAAGTTTGATAAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	486219	81	+	647215	GCTAGTGTGTAAAGGCTCATCAGAGGACTAGCGCTGGAAAATTTTTAAGAGCACAATTCTGTACCCAAAGTTTGGTAAAAT

a
s	mr.mrrefChr3	32022	108	+	181019	CTATAACCTGTTAGAGTTCAAAAGCACTCTCTCTGTCTCACCAGACTGTTCGAAGTTCGAGCTAATGCCATTATTAATACTTAATTCCCTTTTGCTGGTTAAAAGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	477256	108	+	636262	CTATAACCTGTTAGAGTTCAAAAGCACTCTCTCTGTCTCACCAGACTGTTCGAAGTTCGAGCTAATGCCATTATTAATACTTAATTCCCTTTTGCTGGTTAAAAGGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	486314	108	+	647215	CTAAACCCTGTTAGAGTTCAAAAGCCATCTCTCTGTCCCACCAGTCTGTTAGAAGTGGGAGCTAATGCCATTCTTCATACTTAATTCCCTTTTACTTGTTAAAAGGCA

a
s	mr.mrrefChr3	32130	20	+	181019	GGGCCTCCCAGCTTGTATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	477364	20	+	636262	GGGCCTCCCAGCTTGTATGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	486424	20	+	647215	GGGCCTCCCAGCATTTATGG

a
s	mr.mrrefChr3	32150	77	+	181019	CAATCAAACTATTGTAACTGTCTCAAACGAGTGTAACTGTGGCAGGGTAACCTGAACTCACATAATCTTGGCTGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	477747	77	+	636262	CAATCAAACTATTGTAACTGTCTCAAACGAATGTAACTGTGGCGGGGTAACCTGAACTCAAATGATCTTTGCTGGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	477824	77	+	636262	CAATCAAACCATTGTAACTGTCTCAAACAAGTGTAACTGTGGCAGGGTAACCTGAACTCACACAATCTTGGCCGTAG

a
s	mr.mrrefChr3	32227	113	+	181019	GGTTCAGCCCCCTGGCTGTAAAGATTTAACTGCTGTGTGAGGTTGTACATTGTGGCTATGACGACTTGGGCTGAAGAGAAGACCATTAGAATGTGTCCCCAGAAGTGTAATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	477938	113	+	636262	GGTTCAGCCCCCTGGCTGTAAAGATTTAACTGCTGTGTGAGGTTGTACATTGTGGCTATGACGACTTGGGCTGAAGAGAAGACCATTAGAATGTGTCCCCAGAAGTGTAATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	486444	113	+	647215	GGTTCAGACCCCTGGCTGTATAGAATTAGATGCTGTGTGATGTTACACATTGTCGCTATGACAACTTGGGCCAAGAATAAGACCATTAGAGCCTGTCCCCAGAAGTGTAATTA

a
s	mr.mrrefChr3	32340	80	+	181019	AAGATTCCAGCTTTACTGCCTGAAAGGGGCTGAGTACTATTGTGTGCACACCTATTATTGCCCCTGGGTTTAGGAAGGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	478051	80	+	636262	AAGATTCCAGCTTTACTGCCTGAAAGGGGCTGAGTACTATTGTGTGCACACCTATTATTGCCCCTGGGTTTAGGAAGGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	486562	80	+	647215	AACATTCCAGCTTCACTACCTGAAAAGGGTTGAGTACTATTGTGTGAACACCTATTATTACCCCTGGGTTCAGGAAGCAT

a
s	mr.mrrefChr3	32420	22	+	181019	ACATTGTGAAGGGAATACTAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	478131	22	+	636262	ACATTGTGAAGGGAATACTAAT
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a
s	mr.mrrefChr3	32442	19	+	181019	CCTCCTCTTGTTCATCAGG
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a
s	mr.mrrefChr3	32461	11	+	181019	CATCAGACACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	478218	11	+	636262	CATCAGACACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	486684	11	+	647215	CACCATATGAC

a
s	mr.mrrefChr3	32472	750	+	181019	TTTTCGGATTTGATTGTAAAGTTAGGAGTACCAGCTAGCAATCACTGAGTGCATTCAATGCAGTGTTGCATCCAGTCTCCCAGACTGAGAGTGCTAGGGTGTCAAAAAAAACCCTTAAAAGGCGTTCAGGCTGAGAGTGCTGGGTCTTTAAGAAAAGCCTTAAGAAGATAAACACATGAAGAGATTCACCATGAGACATAATTTTTCTTACCAAATATCAGACTGCTAGAGCATGGGATAAGGAGACTCATCTTAAAATGGACTGTAGACCATGGTTTTGACATGGTGCCAGTAGATATCTCTAAAGCCTCGTGCATGTCCGCTTAATTGCAGGTGTGACCAGTAGGCTATTGAATGTGCTAATCAAGGCAAGTCAAGAATATTATTGGATAGACTAAGGTTGTTCTCCACACTACCTCATTATGCATCAAGCTACCAATAATTATTTCAACCACTACACAACCCATGAGCTTTTGTTGGGGCTACACACACTGCATTTTGAAAAGTGTCTACAATTGAACTTTTCTTTGTTCAAGGTTGGATGCTGTTGAAATTGAATGAGTGTTTCAGTGACATGCCACTATAAGTGTTACCATCAGTTTGGAGAGAGGTAGGTTTCTATCCACCCGACTGCCTTCAGATAGAGGTAACTTTTCTAGGGCAGACACTTCATTCACTTATCTTCACTCTACCTATGGTATGTGATAAATCAGCTCATAATCAAGAATAAAAAGTAATTGAACACGCTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	478230	750	+	636262	TTTTCGGATTTGATTGTAAAGTTAGGAGTACCAGCTAGCAATCACTGAGTGCATTCAATGCAGTGTTGCATCCAGTCTCCCAGACTGAGAGTGCCAGGGTGTCAAGAAAAACCCTTAAAAGGCGTTCAGGCTGAGAGTGCTGGGGCATTAAGAAAAGCCTTAAGAAGATAAACACATGAATAGATTCACCATGAGATGTAATTTTTCTCACCAAAGATCAGACTGCTAGAGCATGTGATAAGGAGACTCATCTTAAAATGGACTGTGGACCATGGTTTTAACATGGTGCCAGTAGATATCTCTAAAGCCTCGTGCTTTTCCCCTTAATTGCAGGTCAGACCAGTAGGCTATTGAATGTGCTAATCAAGGCGAGTCAAGAATATTATTGGATAGACTAAGTTTGTTGTCCACACTACCTCATTATGCAGTGAGCTACCAATAATTATTTCAACCACTACACAACCCATGAGCTTTTGTTGGGGCCACACACACTGCATTTTGAAAAGTGTCTACAATTGAATTTTTCTTTGTTTAAGGTTGGATGCTGTTGAAATTGAATGAATGTTTCAGTGACATGCCACTATAAGTGTTACCATCAGTTTGGAGGGAGGTAGGTTTCTATCCATCCGACTGCCTTCAGATAGAGGTAACTTTTCTAGGGCAGACACTACATTCACTTATCTTCACTCTACCTATGGTATGTGAAAAATCAGCTCATAATCAAGAGTAAAAAGTGATGGAACACGCTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	486695	726	+	647215	TCTTCAAATTTGATCGTAGGGTGATAAGTACCAGCTAGCAATCACTGAATGCGTTGAATGCAGTGTCACATCCAGTCTTCCAGACTAGGAGTGCTGGGGTGTCAAAAAAAACCATTAAAAGGTGTTCAACTGGAGAGTGCCGGGTCTTTATGAAAAACCTTAAGAAGATAAAAACATGAAGAGATTCACCATGAGACATAATTTTACTTTCCAAATATCAGACTGCTAGTGCATGGGATAAGGAGACTCATCTTAA-GTACACTGTAGACCATGGTCTTGATGTGGTGCGAGTAGATATCTCTAAAACCTCGTGCATGTCCGCTTAATTGCGGGTGTGACAAGTAGGCTATTGAATGTGCTAATCAAGGCAAGTTGAGAATATTGTTGGATAGACTAAGGTTGTTCTCCACACTACCTCGTGATGAATCAAGTTACCAATAATTATTGCATGCAATACACAACCCATGACCTTCTGTTGCGGCTACACACACTGCAATCTGAATGGGGTCTACAATTGAACTTTTCTTTGTTCAAGGATGGATGCCGTTGAAATTGAATGAGTATTTGAGTGACATGCCACTATAAGTGTTACCATTAGTCTGGAGAGTGTTGGGTTTCTAGCCACCAGA-----------------------TTCTAGGGCAGACCCTTTGTTCGCTTATCTGCACTCTACCTATGGTATGTGATAAATCAGCCCATAATCAAGAATAAAAAGTAATTGAACACACTTG

a
s	mr.mrrefChr3	33222	274	+	181019	GAAGACAATGAGTGTCCCCAAATCCATTTGACTTGGCAGGCTAGCAAATTTGTGATCTAGTTTTCTTCTTTGCCAGATTGTGACAGTGGTACAGGATGGCCATGGTATGGCTCTGGGCTTTAGGGACTGGTCTCATTTTCAACAGAAGAGGGTTGAAGGATTCTCCCATGGAATAACACTGGATCAATCTAAGACATTTGGAATGTGCACTGGAGATGTTAATGTCTTCACAAAAATGTAATTACAGCTTCTTATACAATGTCAATGTTAACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	478980	273	+	636262	GAAGACAATGAGTGTCCCCAAATCCATTTGACTTGGCAGGCTAGCAAATTTGTGATCTAGTTTTCTTCTCTGCCAGATTGTGATAGTGGTACAGGATGGCCATGGTATGGCTCTGGGCTTTAGGGACTG-TCTCATTTTCAACAGAAGAGGGTTGAAGGACTCTGCCATGCAATAACTCTGGATCAGTCTAAGACATTTGGAATGTGCACTGGAGATGCTTCTGTCTTCACAAAAATGTAATTACAGCTTCTTATACAATGTCAATGTTAACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	487435	274	+	647215	TAAGACAATGAGTGTCCCCAAATCCATTTTACTTGGGGGGCTCGCAAATTTGTGATCTGGTTTTCTTGTTTGCCAAATTGTGACAGAGGTACAGGATAGCCAGTGCATAGCTCTGAGCTTTAGGGACTGGTCCCATTCTCAAGAGGAGAGGGTTGAAGGATTCTCCCATGGAATACCACTGGACCAATCAACGAAAATTAGAATGTGCACTGGAGATGTTAATATCTTCATAAAAATGTAATTACAGCCTCTTACTCAATGTCAATGTCAATTT

a
s	mr.mrrefChr3	33496	209	+	181019	CTATGCACATAAGGGGTGGGCAGAGAATCCCAAATATAGACCATCTCTCTAGCCCCAATGCCAAGCTGCTGTAGTGCACACAGAGGTCGTACTAAAGGAACATTTAAGAAGATACACACTTTTCAAGCCCCTTACACTATTTAGTCTGAATCTGATTCTCTATTTATTGTCCAATGATGGTGGGCCCCCGATTTAGTGTCTGCTTATCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	479274	209	+	636262	CTATGCACATAAGGCGTGGGCAGAGAATCCCAAATATAGACCATCTCTCTAGCCCCAATGCCCAGCTGCTGTAATGCACATAGAGGTCGTATTAAAGGAACATTTAAGAAGATACACACTTTTCATGCCCCTTACACTAGTTCATCTGAACCTGACTCTCTATTTATTGTCCAATGATGGTGGGCCCCCGATTTAGTGTCTGCTTATCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	487709	194	+	647215	CTATGCACATAAGGGGTGGGTAGAGAATTCCAAATATAGACCATCTC--------------CAAGCTGCTATAGTGTACACAGAGGCCAAACTAAAGGAACATTTAAGAAGATACATATCTGTCAAGCCCCTTAC-CTATTTAGTCGGAATCTGATTCTCAATTCGTTGCCCCATGGTGGTGGGCCCCCGATTTAACGTCTGCTTATTG

a
s	mr.mrrefChr3	33705	213	+	181019	CATGCAATTTCAGTCTTATTGGGTTTGACATATTAGTGTCTCAAAGTATCGTTTGCACTTTAAAGATGTACCATGTGGCCGATCAACTGGCAACCACTGTGAGGCTTCTGCCTTTTTGTCCCTATACATCCACCATGTAATAGTTCCCCAATCTCAGACTTATCATAACTACCACAACAAATAAATCCTACATACTGTCAGCAAGCTCACTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	479487	213	+	636262	CATGCAATTTCAGTCTTATTGGGTTTGACATATTAGTGTCTCAAAGTATCGTTTGCACTTTAAAGATGTACCATGTGGCCGATCAACTGGCAACCACTGTGAGGCTTCTGCCTTTTTGTCCCTATACATCCACCATGTAATAGTTCCCCGATCTCAGATTTATCATAACTACCACAACAAATAAATCCTACATACTGTCAGCAAGCTCACTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	487903	78	+	647215	---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTAATAGTTCCCCAATCTCAGACTTATCATAACTACCACTGCAAATAAATCATATAGACTGTCGGCAAGCTCACTTT

a
s	mr.mrrefChr3	33918	414	+	181019	TATACACTGTCAACAAACTCACCTTTATTTCATGGTGCCCATGTCCACTACTTATTGCAGATTCTGACCAAAGTGCATAAGTCCACTAATCAAACTTAAGAAATACTGCCATAATGTTAGTGTGTCACTGTCTCTTCAATCTGCACGTCTGGTAGATACATGTCATTCTTGACCTTGAGCAGTTGATGACTTTATGTATAAAAAGCTTTTACTGATTAATTGATTTTGCTGATTAGTACAAAGTCATTGGCAGTTCTCTAACTTAAGACATTATGGGCTCAGGCCCCTTACATCCCATACTTGAAATAAACAGTTTTGACAGCAACTGTCCGAGTTGGAAATCGCAAGCTCCTTTTGTGCTGACCTTTGTGGTTGTGTGTGGGTTGTTACTTTCAATTAATCGGGTCTCCCGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	479707	414	+	636262	TATACACTGTCAACAAACTCACCTTTATTTCATGGTGCCCATGTCCACTACTTATTGCAGATTCTGACCAAAGTGCATAAGTCCACTAATCAAACTTAAGAAATACTGCCATAATGTTAGTGTGTCACTGTCTCTTCAATCTGCACGTCTGGTAGATACATGTCATTCTTGACCTTGAGCAGTTGATGACTTTATGTATAAAAAGCTTTTACTGATTAATTGATTTTGCTGATTAGTACAAAGTCATTGGCAGTTCTCTAACTTAAGACATTATGGGCTCAGGCCCCTTACAACCCATACTTGAAATAAACAGTTTTGACAGCAACTGTCTGAGTTGGAAGTTGCAAGCTCCTTTTGTGCTGACCTTTGTGGTTGTGTGTGGGTTGTTACTTTCAATTAATTGGGTCTCCCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	487981	414	+	647215	TATACATTGTCGGCAAGCTCACTTTTATTTCATGATGCCCATGTCCACAAATCATTGCAGATTCCAGCCAAAGTGCATAAGTCCCCTAATCAAATTTAAGAAGTACTGCCAAAATGTTAATGTGTCACTATATCTTCGATCTGGACCTTTGGCAGATATATGTCATTATTGACCTTGAACTGTTGATAACTTTATGTATGAAAGGCTTGTCCTGTTTAGTTGAATCTGCTGACTAGTACAAAGTCACTGGCAGTTCCCTAACTTAAGACATTATGGGCACAGGCCCCTTACATCTCGTACTTGAAATAAACAGTTTTGACTGCTACTGTCCGAGTTCAAAATCGTAAGCTCCTTTTGTGCTGACCCTTGTGCATGTGTGTGGGTTGTAACTTTTACTTGATCAGGTCTCCCGTA

a
s	mr.mrrefChr3	34332	11	+	181019	CCCATGCAATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	480123	11	+	636262	CCCATGCAATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	488395	11	+	647215	CCCATGCAATC

a
s	mr.mrrefChr3	34343	52	+	181019	TAAAGCACCATGCTCCGTCTAAGCTCCCATCCTGTTCCAGTAAACAAGCAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	480135	52	+	636262	TAAAGCACCATGCTCCGTCTAAGCTCCCATCCCGTTCCAGTAAATAAGCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	488406	52	+	647215	TAATGCAGCATGCTCAGTCTAAATTCCCGTCCTGTTCCAGTAAACAAGCCAC

a
s	mr.mrrefChr3	34395	103	+	181019	TCACAGATGCACTCTGAGACCCACCCCACTAAGATAGTCTACACCACTCAGCTTGCAGTGGAGACTGTTCCTTAATGAACATAGGGGCCTACATAAGTTGGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	480189	103	+	636262	TTGCAGATGCACTCTGAGACCCACCCCACTAAGATAGCCTACACCACTCAGCTTGCAGTGGAGACTGTTGCTTAATGAACATAGGGGCCTACATAAGTTGGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	488458	103	+	647215	TCACAGATACACACTGAGATGCACCCCACTGAGGTAGTCCACACCAGCCAGCTTGCAGTGGAGACTGTTCCCTAATGAACATTGTGGTCTACATAAGTTGGAT

a
s	mr.mrrefChr3	34498	272	+	181019	ACCATAGAGGCAACATTTGCCATGGTCAGACTTCAATAAGCAGCTGGCACAGAAACAGTTACTTCTCTGATCTCGTACCACATCCTGTTATTATACCACCCCCTACCAATAATCTACTAGAGCCAAGATTAGGGGGAATGCCCCAACCTCTTGACCCACGACATTTGTAATTTATGAACATAAGGTAAACATAGGTACATTATTGTGCATAGGAGGAACGCACGTTCACATCTGTATCTTCCCATGGCATAGTCTCTCTAACAAGCATCGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	480292	272	+	636262	ACCATAGAGGCAACATTTGCCATGGTCAGACTTCAATAAGCAGCTGGCACAGAAACAGTTACTTCTCTGATCTCGTACCACATCCTGTTATTATACCACCCCCTACCAGTAATCTACTAGATCCAGGATTAGGGGGAATGCCCCAACCTCTTGACCCACGACATCTGTAATTTATGAAGGTAAGGTAAACATAGGTACATTATTGTGCATAGGAGGAACGCACGTTCACATCTGTATCTTCCCATGGCATAGTCTCTCTAACAAGCATCGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	488565	239	+	647215	ACTATAGAGGCAACATTTGCCATGGTCAGATTAC-----------------------------ACTCTGATCTCATACCTCGTCCTGTTATTATACCACCCCCTACCAATAATCTACTAAAGCCAAGATTAGGGGGAATGCCCGAACCTCTTGACCCACAACATTGGTAATTTATGAACATAAGGT----ATAAGTAAATTATCGTGTACAGGAGGAATGTGCATTCACACCCGTATCTTCCCATGGCATAGTCTCCCTAACAATCGTCGCA

a
s	mr.mrrefChr3	34770	38	+	181019	ATAGTCTCTATGCCCATAGGTCGGTCTTGTGGTTAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	480569	38	+	636262	ATAGTCTCTATGCCCATAGGTCGGTCTTGTGGTTAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	488804	38	+	647215	ATAGTCTTTAATCCCATGGGTCTGTCTTGTTTTAGAAT

a
s	mr.mrrefChr3	34808	26	+	181019	GCTGTACTTTGACATGTCAAGGGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	480610	26	+	636262	GCTGTACTTTGACATGTCAAGGGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	488842	26	+	647215	GCTGCACTTTGACATGTTAAGGGGTG

a
s	mr.mrrefChr3	34834	198	+	181019	CTAGATTGCATGCCCGTGGCAGACCATCTCAACCAAGGCTTGCATGGTTGCATGGGAAACCACACAGTAGGCTCTTGTTTAACTAAAGTAGATTAACAATCTGCAAGGGGACCAAGATACATGAGATTGCATTAAGACTTCATTTACTCACTGACTATAGTTTGATATGAGCACCAATGCCAATGTCTGGAGTGTACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	480637	198	+	636262	CTAGATTGCATGCCCGTGGCAGACCATCTCAACCAAGGCTTGCATGGTTGCATGGGAAACCACACAGTAGGCTCTTGTTTAACTAAAGTAGATTAACAATCTGCAAGGGGACTAAGATACATGAGATTGCATCAAGACTTCATTTACTCACTGACTATAGTTTGGTATGAGCACCAATGCCAATGTCTGGAGTGTACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	488868	198	+	647215	CAAGATTTCATCCTCATGGCAGACCATCTCAACCAAGGCTTGCATGTTTACATGTGAAACCACACGGGAGGCTCTTGTTTCACTAAAGTAGCTTAACAATCTACAAGGGGACCAAGATACATGAGCTTGCATTAAGACTTTATTTACTCACTGACTATGGTTTGATATAAGAACCAATACCAATTCCTAGAGTGTATT

a
s	mr.mrrefChr3	35032	35	+	181019	GGAAAGACGTGCGATGCACTGTCAATTTTCCAAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	480835	35	+	636262	GGAAAGACGTGCGATGCACTGTCAATTTTCCAAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	489072	35	+	647215	GGAAAGATGTGTGATGCACTGTCGATTTTCCAAGC

a
s	mr.mrrefChr3	35067	137	+	181019	ATAGAGCTAAATAATGAGTTATACTGGTACTCTACTTGAATCAGCTAGGTCTCTTTCTGCCTGTCCAACCACCATATAGCACTTTTTAGCATCACATTGCCTTTGATTCCAATCTGAAGCTGAGTACAGGATACTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	480870	137	+	636262	ATAGAGCTAAATAATGAGTTATAATGGTACTCCACTTGAATCAGCTAGGTCTCTTTCTGCCTGTCCTACCACCATATAGCACTTTTTAGCATCTCATTGCCTTTGATTCCAACCTGTAACCAAGTACAGGATACTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	489116	137	+	647215	ATAGTGCTAAATAATAAGATATACTGTGACTCTGCTTGAATCAGCTAGGTTTGTTCCTACCTGGCCAACCAACACATAGCAGCTTTTAGCATAACATTGTCTTTGATTCCAGTCCAAAGCTGAGGACAGGACACTGA

a
s	mr.mrrefChr3	35204	92	+	181019	ATATGATGACGGACAGATACCTCTAACATGGGGGAGTTTCACTCCTTATAAGTTAAGAAGATGCCACCTCCAGTCATTGGATTAGTCAAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	481007	92	+	636262	ATATGATGATGGACAGATACCTCTAACAAGGTGGAGTTTCACACCTTATAAGTTAAGAAGATGCCACCTCTAGTTCTTGGATTAGCCAAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	489255	92	+	647215	ATATGATGACGGACAGATACCTCTAATATGGGGGAGTTTTACTCCTAGTAAGTTAAAAAGATGCCACCTCCAGTCACTGGATTAGTCAAAAA

a
s	mr.mrrefChr3	35296	58	+	181019	CAAGTCACCCTCACCCAGGAGATGAAGCATGCCAGGCTAGTTAATGTGGCATAGTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	481100	58	+	636262	CAAGGCACCCCCAACCAGGAGATGAAGCATGCCAGGCTAGTTAATGTGGCATAGTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	489347	58	+	647215	CAAGTCGCCCTCACCTTGGAAGTGAAGCATGCCAGGCTAGTTAATGTGGCATAGTAGA

a
s	mr.mrrefChr3	35354	9	+	181019	ATAGTTAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	489408	9	+	647215	ATAGTTAGA

a
s	mr.mrrefChr3	35363	31	+	181019	GAGATATTTACGAAAGTCATCCTGGGGGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	489421	31	+	647215	GAGATATTTACGAAAGTCATCCTGGGGGAAT

a
s	mr.mrrefChr3	35394	242	+	181019	ACTGGCTGTGACAAAGGAATACCACAGCATTTACCTGGTAACTTATAGGCATTTGAACTAAAAGGGTATGATGTCCTCATTTGTCTCAGCTGGGATCTGGGGCCCAATAGCCTGAGAGACATGCCTGAGGAATGCCCTGAGATTAGCACAAGGCATAAGGGTATCCACCTCAGCTCTCTAGAGTGCTGGCAAATGAAAGACTAAGTCCAGTACATATATAAACGTGAGTGGTGTCTCCTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	481158	169	+	636262	-------------------------------------------------------------------------TCCTCATTTGTCTCAGCTGGGATCTGAAGCCCAATAGCCTGAGAGAAATGCCTGAGGAATGCCTTGAGATTAGCACAAGGCATAAGGGTATCCACCTCAGCTTTTTAGAGTGCTGGTAAATGGAGAACTAAGTCCAATGCATATACACACCCAAGTGGTGTCTCCTCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	489455	242	+	647215	ACTGGCTGTGACAAAGGAATACCACAGCATTTACCTGGTAACTTATAGGCATTTGAACTAAAAGGGTATGATGTGCTTATTTGTCTCAGTTGGGATCTGGGGCCCAATTGCCTGAGAGACATGCCTGAGACATGCCCTGATATTAGCACAAAGCATAAGGGCATTCACCTCAGCTCTCTAAAGTGCTAGCAAATGAAAGACTAAATCTCGTACCTATATAAACGTGAATGGCATCTGACCCA

a
s	mr.mrrefChr3	35636	41	+	181019	ATCAGTACAGCCCATTAAACCTTCTGTGGATTGCTTGAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	481371	41	+	636262	ATTAGTACAGCCCATTAAACCCTCTGTGGATGGCTTGAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	489697	37	+	647215	ATCAGTACAGCCAATTAAACCTTC----ACTTGCTTGGACA

a
s	mr.mrrefChr3	35677	16	+	181019	TTAAGACAAGCCTCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	481412	16	+	636262	TTAAGACAAGCCTCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	489739	11	+	647215	TTAAGAAAAGT-----

a
s	mr.mrrefChr3	35693	208	+	181019	ACTAATCAGTTACCCTCAGGTCTGACCCACATCCTTTCTTGTATTGTTTACCAAGCTACATCCCACATTCCAGTGCTTGCCCATTAAGTCCACCATCCATGAATATATATACTGATAGTAGAGAAATAACTGAGTTCAGTGCAAGAGACCCATGCGTTTGATGTGGATCACGATAATAATACCTAATGGATAACGTGCAATCATTACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	481429	208	+	636262	ACTAATCAGTTACCCTCAGGTCTGACCCGCATCCTTGCTTGTATTGTTTACCAAGCTACACCCCACATCCCAGTGCTTGCCGATTAAGTCCACCATCCATGGATATATATACTGATAGTAGAGAAATAACTGAGTTCAGTGCAAGAGACCCATGCGTTTGATGTGGATCACGATAATAATACCTAATGGATAACGTGCAATCATTACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	489750	204	+	647215	----ATCAGTAATCCTCAGCTCTGACCCACATCCTTTCTTGTATTGTTTACCAAGCTACATTCCACATTCCAGTGCTTGCCCACTAAGTCCACCAGCCATGAATATATATGTTAATAGTGGGAAAATTACCGAGTTTGCTGCAAGAGACGCATGAATTTGATGTGGTTAATGATAACAATACCTAATGGATAACTTGCAATCATTAGA

a
s	mr.mrrefChr3	35901	118	+	181019	TAAAAATTTATTAAGCTCTTGTAGTAAGGGGCACCTGCACAGATGTTGCCTTCTCACTTAGTTGTCCTGCATTACATGTATGATGTTCTCCTTACAGATGAGTTGGATCAAAACCTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	481637	118	+	636262	TAAAAATTTATTAAGCTCTTGTAGTAAGGGGCACCTGCACAGATGTTGCCTTCTCACTTAGTTGTCCTGCATTACATGTATGATGTTCTCCTTACAGATGAGTTGGATCAAAACCTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	489955	118	+	647215	TAACAACCTATTATACTGGTGTAGCAAGGAGCACCTGCAAGGATGCTGCCTTCTCATTCAGTTGTGATGTGTTACATGTATGATGTTCCCCTTACAGATGAGTTGGATCAAAGCCTGC

a
s	mr.mrrefChr3	36019	2	+	181019	CA
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a
s	mr.mrrefChr3	36021	19	+	181019	TCAGTGGGTGCAAGAAGAA
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a
s	mr.mrrefChr3	36040	35	+	181019	CAACAAAGTAAGCACTTCTCTCCCAGATACTGCTT
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a
s	mr.mrrefChr3	36075	23	+	181019	ACAATCAATCCAGCTGCTAACAT
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a
s	mr.mrrefChr3	36098	122	+	181019	TCTTAATGAAGTTGTGAGGATGTTAGATGATTATGTCACGGTGTTACATACTGCACATAAGTTCAATATCTTGTCATGATAACCCCTATTTTGAGGCATCTATCCCCCTGAGCAGGAATGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	481848	122	+	636262	TCTTAATGAAGTTGTGAGGATGTTAGATGATTATGTCACGGTGTTACATACTGCACATAAGTTCAATATCTTGTCATGATAACCCCTATTTTGAGGCATCTATCCCCCTGAGCAGGAATGCT
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a
s	mr.mrrefChr3	36220	79	+	181019	GATGATTCAGTGGAGACTATTGATGATTCAGTGGGTTTCAATACATGATTCCTGAATAGTTGGCACACACTGCTGAATA
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a
s	mr.mrrefChr3	36299	68	+	181019	ATAAGCGTGCTTTAATACACCAAAATGCATTACCAGCAAGCATTATTTTTGGAGCTGGTCATGCCTGA
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a
s	mr.mrrefChr3	36367	52	+	181019	CTACCCCACTACTGAAGTCGCTCCTAGGGCATTACCTGCACCAACTAGCTAC
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a
s	mr.mrrefChr3	36419	16	+	181019	TGTGCACCATACCTGT
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a
s	mr.mrrefChr3	36435	71	+	181019	ATTCCATTGGTAAGCCCATGTGAAAAAATATTTATAGCTAAATTCTTGGATTAGCAGACCACAATCCTGCA
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a
s	mr.mrrefChr3	36506	14	+	181019	CCAGTGTTGCCCCA
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a
s	mr.mrrefChr3	36520	318	+	181019	TAATTTTATCACCTCTCTACATCAAATGATATCATGCTAGTAGGAAAACTATTTAACAGACTGAGCAATGTTTTGATTTGGTTGATGATAATTATACCTAATGGTCAACATGAAATTATAGGGTAGAAATCTATAATGCTCTTGTAGAGCAGGGCATGGAATGTCTTATTGTAGTATGTTGCCTTCTTATTCAGATGCCCTGTGTCTGAAATATTTCTCCAATCAGATAAGCTGTATCTAAACTTGGTCACTGAAACTCTCATTGTATCGTGTACAAATGGAAACAATAAAGCAAATATTTATCAATAAAGCATGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	482312	318	+	636262	TAATTTTATCACATCCCTACATCAAATGATATCATGCTAGCAGGAAAACGACTTAACAGACTGAGCAATGTTTTGATTGGGTTGATGATAGTTATAACTAATGGTCAACATGAAATTATAGGGTAGAAATCTATAATGCTCTTATAGAGCAGGGCATGGAATGTTTTATTGTAGTATGTAGCCCTCTTATTCAGATGCCATGTATCTGAAATACTTCTCCAATCAGATAAGCTGTATCTAAACTTGGTCACTGAAACTCTCATTGCACCATGTACAAATGGAAACAATAGAGCCAATACTTATCAATAAAGCATGTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	490579	315	+	647215	TAATTTTATCACCTCTCTCCATCAAATGATATCATCCTATTAGGAAAACTATTTAACAGCCTGAGCAATGTTATGATCTGGTTGATAATAATTATACCTAATGGTCAACATGAAATTATGGGGTAGAAATCTATAATGCCCT-GCAGAGCAGGGCATGGAATTTCTTATTGCAGTATGTTGTCTT--TATTCGGATGCCCTGTGTCAGAAATATTTCTCCAATCAAATAAGCTGTATCTATACTTGGTCACCAAAACTCTCAGTGTGTCGTGCACAAGTGGAAGCATTAAAGCAAATATTTATCAATACAGCAAGCAT

a
s	mr.mrrefChr3	36838	231	+	181019	CTCTCCGTAATACTCTACTAAGTTTTCTAGCTGCTGACGTGTTGTTATGAGGTTTTCAAGTTGATAAACATCCTGGGGCTACATGCTGTACTTGAACCTGGTGTGGTGGGGACTGTAGGAGTACTACTGATTAGCTGGCACTTAACCCAAGTGTCCAACTGTAAATTCAGCATGGTTTTGGGGATCTGAGTCTGAAAACTGTTATTTCAAAAGTTTTGTCTCTTGAGTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	482633	214	+	636262	CTCTCCGCAATACTCTTCTAAGTTTTTTAGCTGCTGACGTGTTGTTACAAAGTTTTCAAGTTGAGATACATCCTGGGGCTACATGCTGTACTTGAACCTGGTGTGGTGGGGACTGTAGGAGTACTACTGATTAGCTGGCACTTAACCCAAGTGTCCAACTGTAAATTCAGCATGGTTTTGGGGATCTGAGTCTGAAAACTGTCATTTCAAAAGA-----------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	490894	228	+	647215	CTCACTGTAATACTCTACTAACTCTTCTAGCTTCTGAC---TTGTTATGAGGTTTTCAAGTAGATAAAAATCCTGGGGCTACATGCTGTACTTGAGCCTGGTGTGGTGGGGACTGTAGGAGTAATATTGATTACCTGGCACTTAACCCAAGTATCCAACTGTAAATTCAGCATGGAGTTACAGATCTGACTCTGAAAGCTCTTGTTTGAAAAGTTTTGTCTCTTGAGTATG

a
s	mr.mrrefChr3	37069	22	+	181019	CAACCTGTGAACTAGTGGGATA
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a
s	mr.mrrefChr3	37091	11	+	181019	AAATATGATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	482869	11	+	636262	AAATATGATAT
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a
s	mr.mrrefChr3	37102	66	+	181019	GTATGAGGAGTCCCCTTTGTTCAGAGATGATGTAGAATAGCTAATGACACTGTAATAAGTCAATGC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	491168	66	+	647215	GTATGAGGAGTCCCCTTTGTTCAGAGCTAATGTAGAATAGCTAATGACCCTGTAATAAGTGAACAC

a
s	mr.mrrefChr3	37168	60	+	181019	ATTATCATCAACTATGTTTATTAGAATTGGACATGGTGTAACTCATATGCCATTGGGATA
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a
s	mr.mrrefChr3	37228	57	+	181019	GCTACCATGCCCTTACTTGAATAAAACAATGTACTCAAATGTATATTGTATATACTC
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a
s	mr.mrrefChr3	37285	31	+	181019	CCATTGTTATGTCAGTGCTGAGCCAAAATGT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	491391	23	+	647215	CCATTGTCATGTCAGTGCTGAGC--------

a
s	mr.mrrefChr3	37316	14	+	181019	GAACTGTTATTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	483097	14	+	636262	GAACTGTTATTATA

a
s	mr.mrrefChr3	37330	106	+	181019	ATTTGTAAGTAGATTGACCACAGTCATACATCATTAAGAAGCAAGATATATAGTGGGATAATTCAAGAACAGTGCCCCTAGGATGACTGATCTCAATGACTGATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	483116	93	+	636262	ATTTGTAAGTAGATTGACCACAGTCATACCTCATTAAGAAACAAGATATATAGTGGGA-------------GTGCCCCTAGGATGACTGATCTCAATGACTGATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	491414	103	+	647215	--TTGTA-GTAGATAAACCACAGTCATACATCGTTAAGAAGCAGTATATATAGTGTGATAATTCAAGAACAGTGCCCATAGAATGACTGATCTCGATGACTGGCCT

a
s	mr.mrrefChr3	37436	61	+	181019	CTAATAAAAAATGTATTAGGGTAGCAAAGTGTTTGTATATAGGAAAGGTTCTGTGCCCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	483209	61	+	636262	CTGACAAAAAAAGTATTAGGGTAGCAAAGTATTTGTATATAGGAAAGGTTCTGTGCCCACT
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a
s	mr.mrrefChr3	37497	32	+	181019	CCTAAACAATACTCTCCATCATTGTTACGGGT
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a
s	mr.mrrefChr3	37529	48	+	181019	ATAAACATCCTTACAAGGAATACACTACATGTGTTCAAGTTATTGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	483303	48	+	636262	AGAAACATCCTTACAAGGAATACACTACATGTGTTTGAGTTATTGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	491611	48	+	647215	ATAAACATCCTCACAAGGAACTCACTACATGTGTTCAAGTTATTGGGG

a
s	mr.mrrefChr3	37577	115	+	181019	TCTAAACTCAGTGTGGGTCATGCTCTGGCATTAACGTAGTAGTCAAAATCAAGTGGGTGTGGATTGTCTGAGTATGACCTGAGTAGGAGAATTGCCTCATTGAAACAGTCCTCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	483470	105	+	636262	TCTAAGCTCAGTGTGGGTCATGCTCTGGCATTAACGTAGTAGTCAAAATCAAGTGGGTGTGGATTGCCTGAGTATGACCTGAGTAGGAGAATTGCCTCATTGAAA----------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	491659	115	+	647215	TCTAAACCCAGTGTGGGTGATGCTCTGGCATTAACGTAGTAGTCAAAATCAAGTAGGTGTGGATTGTGTGAGTAGGACCTCAGTCAGAGGATTGCCACATTGGAACAGTCCTCAT

a
s	mr.mrrefChr3	37692	33	+	181019	ACAATCGGGTGTTGGAGGTAATTGGTATTCTTT
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a
s	mr.mrrefChr3	37725	376	+	181019	GTTATTTGTTGAAATCTTGTTCTCATATTTAATCAGTATAAGACACCTGGTGTCTTGCCCCTTTATGCATATATAATGTCTCACCATCGGGGAGCCCCTAAAGCCTCCACCTGTGTTATTGCCAGTCGGCGTAGTTTAACAGTGTCACAAGCCCCTGATAGGAGACCAGCAGGAGAATTAAATTGGTCAGGTCCCGAAGGGTATAGTGTAGGCAGAGGTGGTTGTTGGAGGGCTACCTCAAGACACCCAGAGGCAGTTGCTGTGGGTCCTGATGAGCTATTGTTTCTTGCACTTACAAGCCACTTTGTTGGTGCAGTAATTAGTCAATCTCCTACCAAAATGCATGGGGTAACACTGGGGTTGGACCAACACAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	483608	372	+	636262	GTTATTTGTTGAA-TCTTGTTCACAT---TAATTGGTAAAAGACACCTGGTATCTTGCCCCTTTATGCATATATAATGTCTCACCATCGGGGAGCCCCTAAAGCCTCCACCTGTGTTATTGCCAGTCGGCGTAGTTTAACAGTGTCACAAGCCCCTGATAGGAGACCAGCAGGAGAATTAAATTGGTCAGGTCCCGAAGGGTATAGTGTTGGCAGAGGTGGTTGTTGGAGGGCTACCTCAAGACACCCAGAGGCAGTTGCTGTGGGCCCTGACGAGCTATTGTTTCTTGCACTTACAAGCCACTTTGTTGGTGCAGTAATTAGTCAATATCCTATCAAAATGCATGGGGTAACACTGGGGTTGGACCAACGCAGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	491812	375	+	647215	GTTATTTGGTGAAATCTGGTACTCGTATTTAATCAGTATAAGACACCTGGTGTATTGCCCCTTTATGCATATATAATGTCACACCATCGGGGAGCCCCTAAAGCCTCTACCTGTGTTATTGCCAGGCGGCGTAGTTTAACAGTGTCACAAGCACCTGATAGGAGACCAGCAGGAGAATTAAATTGGTCAGGTCCCGAAGGGTATAGTGTAGGCAGAGGTGGTTGTTGGAGGGCTACCTCACGACACCCGGAGGCAGTTGCAGTGGGTCCTGATGAGCTATTGTTTCTTGCACTTACAAGTCACTTTGTTGGTGCAGTAATTAGTCATTCTCCTACCAAAAAGCACGGGGTAACAA-GGGTTCGGACCAACACAGAA

a
s	mr.mrrefChr3	38101	85	+	181019	CAGAGTTTAAGTCTATCTCCTACTCTGCTAGCCCAATGCTCCTCTTAATACCATGACACCTGATATGGAATAGGCATAGGTACCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	483980	85	+	636262	CAGAGTTTAAGTCTATATCCTACTCTGCTAGCCCAATACTCCTCTTAATACCATCACACCTAATATGGAATAGAAATAGGTACCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	492188	85	+	647215	CAGGGTTTAAGTCTATCTCTTACTCTGCTAGGTGGATGCTCCTCTTAACACCATGACACCTGATATGGAATAGGCATAGGTACCC

a
s	mr.mrrefChr3	38186	203	+	181019	AAGAAGTGTTAGTATAAAATAGAATAATGTGTTAGCTAGGGTACACGCACACATGCAGTTCCTTCCTGGTGACCCACCTGTACCCAGATCTTGGCACCAGTATGTTCCACAACTTCTCAACTGCCCTTCCCCTACCAATTAATTAAGCAGGTTGTGTTTACGACATAAAGCTTTCCAAAGTTGGCAATAATGGGACTATGATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	484066	203	+	636262	AAAAAGTGTTAGTATAAAATAGAATAATATGTTAACTAGGGTACATGCACACATGCAGCTCCTTCCTGATGACCCACCTGTACCCAGATCTTGGCACCAGTATGTTCCACAACTTCTCAACTGCCCTACCCCTACCAATTAATTAAGCAGGTTGTGTTTACGACACAAAGCTTTCCAAAGTTGGCAATAATGGGACTATGATT
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a
s	mr.mrrefChr3	38389	73	+	181019	CAGTGATTGGCATCTGTGTAGGCATCTGTCTTTTTGCAGGTGAACACTTTTCTATCATGGATGTGAGGGTCCT
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a
s	mr.mrrefChr3	38462	60	+	181019	TGTTGATAGGCCTACAGAAATTCACAGAGTTGGCAAATATAATTGACACAGTTGGCATAC
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	39921	100	+	181019	TGTTGCTGTGTAAAGTAGAACAAGTGCCTTAGTGGTCAGATCAATAGTTATTAATTCATTGCAGATATACTGCTTTGGATGTCTGAGCTCTTTCACAGGC
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	40535	576	+	181019	TACCTGTATGAGAGCCTCCAAACTAGGGAGTTTAGGACTTTTTTAGCTTACTTCTACATGCATCTTAAAACTCACAATTGATGTAAAATGGCCATTAAGCAACAAATCATTCCAGCCATGGCTTCATGTATAGTGAGCAGTACTACTCATCTTTGCTCTATCCTAGGAACCCAGTTTACAGTAGATACATGGCACATAGGTTCCATTGATTGCTATGTTGAGAATTTGGTAGTGCTACTTACAATAGTACTATGTAGGATGAACTTCATATCTTCATCTGAACATTTCCGGTTGGTTGGGATTCCTTCTGGTAGTAAAGAGTAACACCAGTTAATGTATTGGCCTAACACATCATTGCTGCTATTGTGGTGGTTGGAGTTTGTTGGTGTTTGGAGTGAGTTAGGGTGCGAAGTGTTTTGGCCCATGTTACTTAGATGATGTTATCGTTATTTGAGAACTCATATGACAGGAAGCAGGCCGTGGTGGATCGAAAATAAAGAAGGTAAAGAATATACAAACTCCAACCAACACCACCATTCAGGTATGATACATTCACATGTTTAATATATTTGTACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	486405	555	+	636262	-----------GAGCCTCCAAGCTAGGGAGTTTAGGACTTTCGTAGCTTACTTCTACATGCATCGTAAA---CACAACTGATGTAAAATGGCCATTAAGCAACAAATCATTCCAGCCATGGCTACATGTATAGTGAGCAGACCTACTCATCTTTGCTCTATCCTAGGAACCTTGTTTACAGTAGATACATGGCACATAGGTTCCATCGATTGCTATGTTTAGAATTTGATAGTGCTACTTACAATAGTACTATGTAGCATGAACTTCCTATCTTCATCTGAACATTTCCGGTGGGTTGGGATTCCTTCAAGTAGTAAAGAGTAACACCAGTTAATGTATAGGCCTAACACATCATCACTGCTATTGCGGTGGTTGGAGTTTGTTAGTGTCTGGAGTGAGTTAGGATGCGAAGTGTTTTGACCCATGT-------ATGATGTTATAGTTATTTGAGAACTTGTATGACAGGAAGCAGGCCGTGGTGGATCGAAAATAAAGAAGGTAAAAAATATACAAACTCCGACGAACACCACCATTCAGGTATGATACATTCATATGTTTAATATATTTGTACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	494770	562	+	647215	TACCTGTATGAGAGCCTCCAAACTAGGAAGTTGAGGACTTCTTTAGCTTACTTCTACATGCATCTTAAAACTCACAATTGATTTAACATGGCCACTAAGGAACAAACCATTCCAGCCATGGCTTTATGTATAATGATCAGTACTACTCTTCTTTGCTCTATCCTTGGAATACATTCTACAGTAGATACATGGCAGGTAGGTGCCATTGATTTCTATGTTGAGAATTTAGTAGTGCCACTTACAATAGTACTATGTAGGATGA-CTTCATATCTTCATCTCAACATTACCAGTTGGTTGGGATTCCTTCTGGTAGTAAAGAGTGAGATCAGTTAATGTATTGGCCTAACATGTCAGTGCTGCTATTGTGGTGGTTGGATTTTGTTGGTAGTTGGAGTGTGTTTGGGTGCGAAGTGTTTTGGCCGATGTTACTTAGATGATGTTATCATTATTTGCGAGCTCATATGACAGGAAGCAGGCCGTGGTGGATCGAAAATAAAGAAGGTAAAGAATATACAAACTCCAACCAACACCACCATTCAGGTATGGTAGCTTCACATGTCTA-------------

a
s	mr.mrrefChr3	41111	120	+	181019	ACAGCCCATAGCTGTACAGCCCATTGTCTGACCAACTTGGAATCTAAGTTTTTCCTTCTTTAGGGACAGACAAGCCTTAGGTAAAACCTCCATGATGAGAGAGACAAAAAGGAAGCAGTG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	495332	68	+	647215	----------------------------------------------------CCCATCTTTAGGCACAGAAAAGCTTTAGGTAAACCCTCCATGGTTAGAGAGACAAAAAGGAAGCAGTG

a
s	mr.mrrefChr3	41231	143	+	181019	AGCACTACTCTCTTCCTGTTCAAGATTAGGGAGTATTTTAATCTTAGATAGGCCCTAGCATCTGCTTTTTTAAAAACAATCTACCTCACTTCCCTGAGGAAAACCTATAGCTGCTCTATCGTTGCGGATGAAGCTCTATTCTA
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a
s	mr.mrrefChr3	41374	24	+	181019	TACACAATTACTTTCTTCACTTCA
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a
s	mr.mrrefChr3	41398	130	+	181019	CGTCAGATAGCTCGAGACTCTAAAGTATTCTGCACAATATGTATATAGACAAATCAAAGGGGTGAGATTTAGTGGACATAAACTAGGTACAACCTAGTACTACTGAGCTTACGTTGTTGTAGAACAAAAT
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	41561	29	+	181019	ATACCTCTTTTACACACAATTTCTAACCC
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a
s	mr.mrrefChr3	41590	22	+	181019	TACCAATAGTCACTTGGGTGCC
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a
s	mr.mrrefChr3	41612	59	+	181019	ATTTCAGTCCACTATACATGGCCACTTCAAGATTATTCTAATAATGCATAATGCCTAGA
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a
s	mr.mrrefChr3	41671	147	+	181019	CCCAGGGCATAGACCCCAACAATCATTCTCTTCATGGTGTGCTAGTCTGATAGATCCATGGAGCTTTGGTGTAATATTTCACACACCACTATATAGCATGCTCCCTTTGTCTATGTGAGATATTAAGTAAGTCTGATAAATACTACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	487567	147	+	636262	CCCAGGGCATAGACCCCAACAATCATTCTCTTCATGGTGTGCTAGTCTGATAGATCCATGGAGCTTTGGTGTAATATTTCCCACACCACTATATAGCATGCTCCCTTTATCTATGTGGGATGTTAAGTAAGTCTGATAAATACTACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	495840	147	+	647215	CCCAGGGCATAGATCCCATCAATCATTCTCTTCATGTTCTGTTAGCCTATTAGATCTACGGAGCTTTGGTGTCATATTTCAAATACCACCATTTAGCATGCTCCCTTTGTCTATGTGAGATATTAGGTAAGCCTGATAAATACTACT

a
s	mr.mrrefChr3	41818	64	+	181019	TGGTTGACTTTCAATTTGTCCCAAATCTCAATCTTTGTTTTTATTCATCTTACCAGTTCTTGGT
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a
s	mr.mrrefChr3	41882	11	+	181019	AGGACCACCAA
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a
s	mr.mrrefChr3	41893	18	+	181019	TGGTCAAGCCACAATGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	487798	18	+	636262	TGGTCAAGCCACAATGGA
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a
s	mr.mrrefChr3	41911	46	+	181019	ATGAATGTCTGAATCTCAGCAGGATACCAATACCTAACGGCAACAG
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a
s	mr.mrrefChr3	41957	97	+	181019	GGTAAGGCTAGATGACATATGTACTTTCATATGGAGTAATCAAAGAGAGTTTCCAGGAATCACTCACCCCCATCCATCAGAGTGTCTAATCTGCCCC
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a
s	mr.mrrefChr3	42054	56	+	181019	AGGACTCACGGGAGACAGACATATAGCAGTAATTTTCCAGACAAGGCGATGTGCTG
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a
s	mr.mrrefChr3	42110	50	+	181019	GAGGCTATCCTAGTTGGAAATCAAGTTTTCATTAAAGTACCCACACTTAC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	496078	36	+	647215	--------------TGGAAATCAAGTTTTCATTAAAGTGCCCACACTTAC

a
s	mr.mrrefChr3	42160	40	+	181019	TTCAGAGGAAGGATACAGTCATGCAAAAGTGGAACCCTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488076	40	+	636262	TTCATAAGAAGGATACAGTCATGCAAAAGTGGAACCCTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	496114	40	+	647215	TTCAGAGGGAGGATACAGTCATGTAAAAGCGGAACCCTAA

a
s	mr.mrrefChr3	42200	17	+	181019	CTATCAGGCAAAGGTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488135	17	+	636262	CTGTCAGGCAAAGGTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	496154	17	+	647215	CTATCAGGCAAAGGTGG

a
s	mr.mrrefChr3	42217	123	+	181019	CCTAACAGCCTAAAATCACAGTGACCTAGCCAACTCACAGTGACCTAGCCAGGGAGAATGGGAAATGGAAAAATCAACAAATGGAGAAATCAACAACATGATGTGCAATTCTCTATATACATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488154	123	+	636262	CCTAGCAGCCTAAAACCACAGTGACCTAGCCAACTCACAGTGACCTAGCCAGGGAGAATGGGAAATGGAAAAATCAACAAATGGAAAAATCAACAACATGATGTGCAATTCTCTATATACATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	496171	101	+	647215	CCTAACAGACCAAAATCACAGTGACCTAGCCAACTCACAGTGACCTAGCAAGGGAGAA----------------------ATGGAGAAATTAGCAATATGATGTGCAATTCTCCATATACATG

a
s	mr.mrrefChr3	42340	54	+	181019	AGTCAGATCAAATAAACAGTTGATGTACCCGCTTCATATTAGTGCAAAAGTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488291	54	+	636262	AGTCAGATCAAGTAAACAGTTGGTGTCCCTGCTTCATATTAGTGCAAAAGTAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	496272	33	+	647215	AGTCAGATCAAATAAACAGTTGATGTACCCACT---------------------

a
s	mr.mrrefChr3	42394	26	+	181019	CATTGAATCACTGCAGGCTTAGGGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488373	26	+	636262	CATTGAATCACTGCAGGCTTAGGGTT

a
s	mr.mrrefChr3	42420	27	+	181019	TACAGATTCATAAATTCTCATTCCCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488400	27	+	636262	TACAGATTCATAAATTCTCATTCCCAC

a
s	mr.mrrefChr3	42447	18	+	181019	TAGAGAGACGAGAGACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488430	18	+	636262	TAGAGAGACGAGAGACAA

a
s	mr.mrrefChr3	42465	295	+	181019	TCAAATGACAGGCCCAGGAATGGTGAACTTCAAATAGATATTTTTATGACACCCAGAACATTGTTATAATGTTTATAGAATTACTTCATACACCAGTAAGAGTAAATACTGTAGGAAAAATATTCTTAGATGTGTAGTCCCATTCAATTCTAGTGGCATTTCTGGTCTAGCAGCTCCTGGTATTTGTAAGCAAGCTCTGGCCTCAGGTAACTATAGTATTTATTACGTACCAGTATTAGACAATGAGTTCAAGTTGCGCTAGTAAGTGCCTTGGCATTTTACTTGTTACCACTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488449	295	+	636262	TCAAATGACAGGCCCAGGAATGGTGAACTTCAAATAGATATTCTTATGACACCCAGAACAGTGTTATAATGTTTATAGAATTACTTCATACACCAGTAAGAGTAAATGCTGTCAGAAAAATATTCTTAGATGTGTAGTCCCATGCAATTCTAGGGGCACTTCTGGTCTTGCAGCTCTTGGCATTTGTAAGCAATCTCTGGCCTCAGGTAACTATAGTATTTATTACATACCAGTATTAGACAATGAGTTTAAGTTGCGCTAGTGAGTGCCTTGGCATTTTACTAGTTACCACTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	496305	269	+	647215	-------------CCAGGAATAGTAAACTTCAAATAAATATTTTTACGCCACCCAGAACATTGTTATAATATTTATAGAGTTACTTCATATACCAATAGGAGTAAATACTGTAGGAAA------------CGTGTAGTCCCATTCAATTCTAGTGGCATTTCGGATCTAGCAGCTCCTGGTATTTTTAAGCAAGCCCTGGCCTCAGGTCATTACAGTATTTATTAAGT-CCAGTATTAGACAATGAGTTCAAGTTGTACTAGTAAATGCCTTGGCATTTTATATGTTTCCACTGC

a
s	mr.mrrefChr3	42760	23	+	181019	TGGATGGATAACAAGCGCCACCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488744	23	+	636262	TGGGTGGATAACAAGCGCCACCC
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a
s	mr.mrrefChr3	42783	48	+	181019	TTGTAAATTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAGTGGATGGAGCGCTGGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488767	48	+	636262	TTGTAAGTTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAATGGATGGAGCGCTGGTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	496603	48	+	647215	TTGTAAATTGTTTTAGTTTTTTTCTCTTAGTGGATGGAGTGCTGGTGT

a
s	mr.mrrefChr3	42831	14	+	181019	AGTGCTTTGGATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488817	14	+	636262	AGTGCTTTGGATGT
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a
s	mr.mrrefChr3	42845	115	+	181019	CATGTTAATCCACTCCACCCTCCAAGGGCAATATTGCAGTCACCTGGTTTCACACACATGCTAGTGGTTTACTCCTAAACAGGCCTGTTCTTCAATCATTAGCTCTTGCAGCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488831	114	+	636262	CATGTTAATCCACTCCACCCTCCAAAG-CAATATTGCAGTCACCTGGTTTCACACACATGCTAGTGGCTGACTCCTAAATGGGCCGGTTCTTCAACCATTAGCTCTTGCAGCTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	496670	115	+	647215	CATGTTAATCCACTCGACCCTGCAAGGGCAATATTGCAGTCACCTGATTTTGCACACATGCTAGTGGTTTACTCCTAAACAGGCCTGTTCTTGAATCATTAGCTCTTGCTGCGTA

a
s	mr.mrrefChr3	42960	35	+	181019	AGCCCAGAGTTTAGGCCTCATTTGAGATTGTGCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488958	33	+	636262	AGCCTAGAGTTCAG--CTAATTTGAGATTGTACTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	496785	35	+	647215	AGGCCAGAGTTTAGGCCTCATTTGATATTGTGCTT

a
s	mr.mrrefChr3	42995	53	+	181019	TCAAACTCACATAAGGTCAAAGCTCATGTACACTGGGAGGCTCCATACTCTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	488992	53	+	636262	TCAAACTCATATAAGGTTGAAGCTCATGTACACTGGGAGGCTCCATACTCTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	496820	53	+	647215	TCAAACTCACATAAGCTCAAAGCTCATGTACACTGGGAGGTTCCGTACTCTAC

a
s	mr.mrrefChr3	43048	21	+	181019	CTGTCTTATTATAGCCTGTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	489054	21	+	636262	CTGTCTTATTATAGCCTGTTA
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a
s	mr.mrrefChr3	43069	46	+	181019	AAGCATGATTTATACTGTGACATGACTCTCTATTCAACATAGTTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	489075	45	+	636262	AAGCAT-ATTTATACTGTGACATGACTCTCTATTCAACATAGTTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	496898	46	+	647215	AAGCATGATTGTTATTCTGACATGACGCCCTATTAAAGATAGGTAA

a
s	mr.mrrefChr3	43115	93	+	181019	TTGTATTTTTTCCTGGAGTGAAGCCAGGGTATAAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTGTTGCTGTGCAGATTATAAATTGTGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	489121	80	+	636262	TTGTGTTTTTTCCTGGAGTGAGGCCAAGGTATAAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTG--------CAGATT-----TTGTGGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	496944	93	+	647215	TCGTATTTATTCCTGGACTGAAGCCAGGGTATTAGGTAGAGTATTTAAAGAACTGCATTTAAACTTGTTGCTGTGCAGATGATAAATTGTGAA

a
s	mr.mrrefChr3	43208	217	+	181019	TGAGGCAAACTCTCCCCATGGGCACTGAGCCTCTATTGATTGTCATGCCTCCATCTTATCTACTTGCTTTTCAAACTTTGTAGGTTTGCCCAGATATAGCAGGGAGATATGTTTAAATGGGCATTGTAGAGATAGTACCTCAACAGTGCCCGCTCATTCAGGGTTTAGCTTATGCACTTGAGGCTGTATTACATTTCTCCCTCTTGTACCTTCTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	489202	214	+	636262	TCGGGTGAACTCTCCCCATGGGCACTAAGCTTCTATTGATTATCATGCCTCTATCTTATCTACTTCCTTCTCAAACCTTGCAGGTTTGCCCAGATATAGCAGGGAGATATGTTTAAATGG-CATTGTAGAGATAGTACCTCAACAGTGCCCACTCATTCAGGGGTTCGCTTATGCACTTGAGGCTGTATTACATTTCTCCCTCTTGTACCTTC--TT
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a
s	mr.mrrefChr3	43425	118	+	181019	CCAATCACCAACAATCCCATTGCGTTTATCAATCAATCTTGTATCCTGATGACCAGGTAGCACATAATAAATAAAAATGGAGTGACAACAATACACCAGTTGCTATATGTTGTCTCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	489417	118	+	636262	CCAGTCACCAGCAGCCCCATTGCGTTTATCACCCAATCTTGTATCCTGATGACCAGGTGGCATCCAATAAATAAAAATTAAGTGACAACAGTATACCAGTTGCTATATGTTATCTCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	497252	118	+	647215	CCAATCACCAACAATCAAATTGCGTTTATCAATCAATCTTGTATTCTGATGACCAAGTAGCACATAATAGATAAAAATGGAGTGACAACAATACACCAGTTGATATATGTTGTCTCCC

a
s	mr.mrrefChr3	43543	368	+	181019	GAATCTAGGTACTTTGGGGAAGGACTCTTGGGAGTTCACAGTCCTGGGACACACTATTAGAATCTGATTCACCCAGATTATACAGGAACAGCCTGAATCATTAGTCAAGGTCTTTGGCAGTAAGGCTATGCAATCTAAAGCAAAAGCGGTAATTGAAAATTTTGTTAAAAAGTTGGAAGAAAATTACAATCCAGAATGTGGAATTGGTGCATTCCATGACTCAGATCTAGTCCAAAGGTTATGTCAGTGTAAAGGGTTTGGATGTGAATTCTGGTACCAACATAAAGGGGACTACATACCAAGTGTTACTGTACAAATTCATGGTCAGATCTAAATTTATACACTAAGTAATCGTGATTTTCAGCTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	489535	323	+	636262	GAATCTAGGTACTTCGGGGAAGGACTCTTGGGCGTTAACAGTCCTGGGACACACTATTAGATTCTGATTCACCCAGATAATACAGGAACAGCCTGAATCATTAGTCAAGGTCTTTGGCAGTAAGGCTATGCAATCAAAGGCAGAAGCGGTAATTGAAAATTTTGTTAAAAAGTTGGAAGAAAATTACAATCCAGAATGTGGAATTGGTTCATTCCATGACTCAGATCTAGTCCAAAGGTTATGTCAGTGTAACAGGTTTGGATGTGAATTCTGGTATGAACACAAAGGGGACCACGTACCAAGTCTTACCGTACAAATTCATG---------------------------------------------
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a
s	mr.mrrefChr3	43911	27	+	181019	CTCCAAGGTGAATCAGTGTTGTGTCAA
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a
s	mr.mrrefChr3	43938	19	+	181019	CCTATTAATTCCATTGGTG
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a
s	mr.mrrefChr3	43957	49	+	181019	TAGTTACTTGAAAGCTCCAGTGCTTGCTTAATGCCACAATATCATACCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	489900	49	+	636262	TAGTTACTTGAAAGCTCTGGTGCTTGCTTAATGCCACAATATCATACCT
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a
s	mr.mrrefChr3	44006	41	+	181019	TACAGCACATCAGGGAAATGATAGTTCACTATATTATCCTA
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a
s	mr.mrrefChr3	44047	119	+	181019	GAACCACTAAGCAATCACATCTACAAGATGAGAATTATATATATGAGAGCAATTGACATGGAGATCTGGAAGGTATGGCTCTAACCTGTGCAGTCTGTATCAATGGGTGGCTCAACTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	490109	119	+	636262	GAACCACTAAGCAATCATATCTACAAGATGAGAATTATATATATGAGAGCAATTGACATGGAGATCGTGAAGGTAAGGCTCTAACTTGTGTGGTCTGTATCAGTGCGTGGCTCAACTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	497890	116	+	647215	GAACCACTAAGTAATCTCATCTGCAGTATGACAATTATATATATGAGAGCAATTGACATGGAGATCTGGTAGGTGTGGCTCT---CTGTGCAGTCTGCATCAATGGGTGGCTCAATTCA

a
s	mr.mrrefChr3	44166	76	+	181019	TCTTGACATGATGAAGTTCTTACAGTGGTTCCTGGGGAGAAATAATGGAAAGGTGCAATAGATATCTGTAGTCCAA
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a
s	mr.mrrefChr3	44242	10	+	181019	TAAACTGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	490305	9	+	636262	TAAATTGTC-
s	simRat_chr6.simRat.chr6	498086	10	+	647215	TAAACTGTTA

a
s	mr.mrrefChr3	44252	15	+	181019	ATGACTAACAACTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	498112	15	+	647215	ATGACTAACAACTAT

a
s	mr.mrrefChr3	44267	152	+	181019	CTCTGAGTACTCAGCAGGGGGGTGATCCTTAACAATGCACAACATTGGTTAATTCCATACTAATGTGTTTATTACACACATTATCAAAGGATGACCTATGCAACTCTCAGGAGAGTTCAATGGCAATGAAGATTACTCAAAATCCAATCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	498129	152	+	647215	CTCTGAGTACTCAGCAGGGGGGTGATCCTTAACAATGCACAACATTGGTTAATTCCATACTAATGTGTTTATTACACACATTATCAAAGGATGACCTATGCAACTCTCAGGAGAGTTCAATGGCAATGAAGATTACTCAAAATCCAATCATT

a
s	mr.mrrefChr3	44419	20	+	181019	TCCTTTTATTGCCCAGTGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	498287	20	+	647215	TCCTTTTATTGCCCAGTGTG

a
s	mr.mrrefChr3	44439	69	+	181019	AGGTGAGTGAGCAAAAGCAAACTACTGCTAAAGCTCAAGTTCCTAACATTATATTGAACTAGATTCTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	498308	69	+	647215	AGGTGAGTGAGCAAAAGCAAACTACTGCTAAAGCTCAAGTTCCTAACATTATATTGAACTAGATTCTCC

a
s	mr.mrrefChr3	44508	385	+	181019	CTTGGTACCAATGCACTGGGAACCTCTTTTATCTTGCAGCCAAGAACTTACACATGTGCTGCATACCTACTTACTTATATATCCCAGATAAGATTATTATATATCCCCAACACACAGTGCATCAATTAAGGATGCCCTATGAGGGACTTAGACAGAACTATCTCGGTGAGATCATTAGTGTTGAATGCCATGTTGCAGTACGATGGTGAGGTGACTGGCTCAGATCTCAAGCCGGTGTTATAGAGTACAGACCACTGCCGAAGTAGACATTGGGTAATTTAAATTAGATGGTGTAAGTTGCCAGCAAGAGTTGCTACAAGATCTCATAAACTTACACACCTTGACAGGATCCAGGAAAAACCCTGATCTCTCAACTCTATCCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	490314	382	+	636262	CTTGGTGCCAATGCACTGGGAACCTCTTTTATCTTGCAGCCAAGAACTTACACATGTGCTGCATACCTTCTTACTTATATATCCCAGATAAGTTTATTATATATCCCCAACACACAGTGCATCAATTAAGGATGGCTTATGAGGGACTTTGACAGAACTATCTCGGTGTGATCATTAGTGTTGAATGCCATGTTGCAGTACAATGGTGAGGTGACTGACTCAAATCTCAAGCTGGTGTTATAGAGTGCAGACCAT-GCCAAAGTAGACATTGGGTAATTTAAATTAGATGGTGTAAGTTGCCAGCAAGAGTTGCTACAAGATCTCATAAACTTACGCACCTTGACTGGATCCAGGAAAAACCCTGATCTC--AACTCTATCCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	498386	384	+	647215	CTTGGCACCAATGCACTGGGAACTTCTCTTATCTTGCAGCCAAGAACTTACACATGTGCTGCATACCTACTTACTTATATATCCCAGATAAGAGTATTATTTA-CCCCAAGACATGGTGCATCAATCAAGTATGCTCTATAAGGGACTTAGATAGAACTATCTAGGTGAGATCATTAGTGTTGAATGCCATGCTGCAGTACGATGGTGAGGTGACTGGCTCAGATCTTGAGCCGGTGTTATAGAGTACAGACCACTGCTGGAGTAGGCATTGGGTAATTTAAATTAGATGGTACATGTGGCCAACAAAAGTTGCTTCAGGATCTCATAACATTAAATACCTTGACAAGATCCAGGAAAAACCCTGCTCTCTCGATTCTAGCCATT

a
s	mr.mrrefChr3	44893	77	+	181019	TTTCCTTTGAATTCAGTTCAACACCTCCCCATCACATTCAGGACCATTTTCCTGGGGCTGAGTTCACAATGCCATAT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	498770	77	+	647215	TTTCCTGTGAATTCAATTCTACACCTCCCTATCACATTCAGGACCATTTTCCTGGGGCTGAGTTGACAATGCCATAT

a
s	mr.mrrefChr3	44970	27	+	181019	GTAACATAACATAATAGTAAGGGGTGC
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a
s	mr.mrrefChr3	44997	64	+	181019	CCCTCTTTCTGTAAGGGGTGCTCCTTTTTGTTGTACAACCAGCCACAAAATTGGCCCAAAAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	490811	62	+	636262	CCCT--TTCTCTAAGGGGTGCTCCTTCTTCTTGTACAACTAGTCACAAAATTGCCCCAAAAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	498923	64	+	647215	GCCTCTTTCTGTAAAGGGTGCCCTTTTTTGTTGTACCACCAACCATAAAATTGGCCCAAAAATT

a
s	mr.mrrefChr3	45061	31	+	181019	ATTTTAACCTATAGTGCAAAGTGTCCCAGTA
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a
s	mr.mrrefChr3	45092	71	+	181019	TTTTGTCTTTTAGTTCATCAATTGGGATACAACTATAGCATAGGGAGTTCCAGTTTCTTGCCTCTGAATCC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	499044	71	+	647215	TTTTGTCTTTCAGTTCACCAATTGGGATACAACTATCGCGCAGGGAGTTCCAGGTTTTTGCCTCTGAATCC

a
s	mr.mrrefChr3	45163	161	+	181019	TTAAGAGACACTTAAAAATATTCACATGTATTGATGGCTAGTAGGGGGGGGCATGTTTAAAGCAGGAGGATGTGTTGCCAGGTGTTCAGTACTAGCTTATGCATTATGCATGAAGTACACTGGATCCTGAGTACATATGAATAGAGGCCTTCGTGGAATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	490981	159	+	636262	TTAAGAGACACTTAAAAATATTCAAATGTATTGATGGCTAGTA-GGGGGGGCATGTTTAAAGCAGGAGGATGTGCTGCCAGGTGCTCAGTACTAGCTTATGCATTATGCATGAAGTACACTGGATATTGAGTACATATGAGTAGTGGCCTTCGTGGAATG-
s	simRat_chr6.simRat.chr6	499115	161	+	647215	TTAAGAGACACTTAAGCATATGCACGTGTATTGACGGCTAGTAGGGGGGGGCATGTTTAAAGCAGGAGGATGTGTTTCCAGGTGTTCAGTACTTGCTTATGCATTATGCATGAAGTACGCTGGATCCTGAGTACATGTGAATAGAGGCCTTCGTGGCATGT

a
s	mr.mrrefChr3	45324	606	+	181019	TCATTGGCATTAGAAAAATTACTTGCAGATTCCCAGCCACCAACTGGAAAAGATGGAAGAATGACAGATAATAATGTTATCTCAGGCCAGCAACCACTAATAGATTGGGATCAAATCAAGGAGGAGGGATTAAAATGGCAAAAGAGTGAGTGGGCAGGTTGGGCCTGTTGACCATGTACTCCAAAGTTATCCATGTGTTAGGGTGCTTTTGATACCTTGGTGTTTCTATACTTGAATCACAGGATAAGCATTCACTAGACTAGTACCAGCTGTCATAATGTAAACGGTCTATATCTTTACTGCCGACAAGGAATGGTGAGAACCAGTTCAACATGTCTAGTTTACAATTGAAACTACCCTACACATGACCTCAATGGCCCATCTGGCCCCACTAGGTGATCAGAAGTAACTAGGGGCCTTTGTCTTGTAAACAAATTGCTAAGAGTTAAAGTAATGTAATAAGACATGTCAACCTGCTTGGTGTCTAGCGAAACAACCAGCAAATTCCAATGTGTGTGCTTTGTTTTGATAGATTATAAAACAAGTATGATGATTTTCATTTGTTAAGTGATAATCACGATTTGTCATCTGTGTGTCTAGCCCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	491140	560	+	636262	TCATTGGCATTAGAAAAATCACTTGTAGATTCCCAGCCACCAACTGGAAAAGATGGAAGAATGACAGATAACAATGTTATCTCAGGCCAGCAACCACTAATAGATTGGGATCAAATCAAGGAGGAGGGATTAAAATGGCAAAAGAGTGAGTGGGCAGGTTGGGCCTGTTGACCATGTACTCCAAAGTTATCCATGTGTTAGGGTGCTTTTGATACCTTCATGTTTCTATGCTAGAATCACAGGATAAGCATTCACTATACTAGTACCAGCTGTTGTAATGTAGACGTTCTATATCTTTACTGCCGACAAGGGATGATGACAACCAGTTCAACATGTCTAGTTTTCCATCAAAACTACCCTGCACATGACCTAAATGGTCCATCTGGCCCCACTAGGTGATCAGAAGTGACTAGGGGCCTTTGTCTTGCAAACAAATTGCT-AGAGTTAAAGTAATGTAATAAGACATGTCAACCTGCTTGGTGTCTAGTGAAACAACCGGCAAATTCCAATGTGTGTGCTTTGTTTTGATAGATTATAAGACACATATAATAACTTTCATT---------------------------------------------
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a
s	mr.mrrefChr3	45930	107	+	181019	AGTAAAACAGAAAATTCTGTGATACACTGACAAGGTTCCTGCAGAAATATTCCTTATGCAGCCTTTTCTAGGAATGGCCAGTGTGTTTGTTTCCTTTACTTCAATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	500061	107	+	647215	AGTAAAACAGAAAATTCTGTGATACACTGACAAGGTTCCTGCAGAAATATTCCTTATGCAGCCTTTTCTAGGAATGGCCAGTGTGTTTGTTTCCTTTACTTCAATGG

a
s	mr.mrrefChr3	46037	285	+	181019	ACTACAACACAGCTACATTCctgtaatgcaatggaaaggactatatgacattggtacTgGAGAGACAGCTGGAGACACTTGATTCTAGACCCTCACTTGATTTCTACAGCATGTCACTTCCTACTCGTTTCAATATGGTAGTACTTGAGAATTGATGGTATGCCAATAGTTTTTGAAACGATTGGTTTGGATTGTCTGACTAGGCAAATGTTATATGTGTCTGATGACCAGCTAACTAATCAGTTACTGAGATATGAACACATGGTAATTCACAAGCCTAATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	491700	226	+	636262	---------------------------------------------------------T-GAGAGACAGCTGAAGTCACTTGATTCTAGACCCTCACTTAATATCT-CAGGTTGTCACTTCCTACTTGTTTCAATATGGTAGCACTTGAGAATTGATGGTATGCCAATAGTATGTGAAGCGATTGGTTTGGAATGTCTGACCAGGCAAATGTTATATGTGTCTGATGACCAGCTAGCTAATCAGTTACTGGGATATGAACACATGGTAAATCTCAAGCTTGATCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	500175	283	+	647215	ACTACAACACAGCTACATTCCTGTAATGCAATGGAAAGGACTATATGACATTGGTACTG-AGAGACAGCTGGAGACACTTGATTGTAGACCCTCACTTGATTTCTACAGCATGTCACTTCCTACTCATTTCAATATGGTAGTGCTTGAGAATTGATGGTATGCCGATAGTTTTTCGAACGATTGGTCTGGATTGTCTGATTAGGCAAATGCTATATGTGTCTGAAGACCAGCTAACTAATCAGTTACTGAGATATGAACACATGGCAATTCAC-AGCCTAATCAA

a
s	mr.mrrefChr3	46322	69	+	181019	TTTTATGAGATTGGATGTTAACACACTAGGATGGAGAACGTCTCATGAGCAGGGTATACTCCCTTTCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	491930	69	+	636262	TTTTATGAGATTGGATGTTAACACTCTAGGATGCTGTACATCTCATGAGCAGGGTATACTCCCTTTCTT
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a
s	mr.mrrefChr3	46391	47	+	181019	ATCGACCCGCAGGTTCAGGGACCCAATGCTCATAAGAGACCATGGGC
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a
s	mr.mrrefChr3	46438	30	+	181019	ATCCTTGTTAAGTCTGTTAATAGTAAGCAC
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a
s	mr.mrrefChr3	46468	97	+	181019	ATCAGACCAAATAATGGGTTTGCTTATGTATACCTGGTTGGCATCAACTTTTTAATTGACTCTTCCAATGGACTCTCTATTGTGTCTGGATCTTGAG
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a
s	mr.mrrefChr3	46565	88	+	181019	ATTTTTGCCAACTTTGTGGGTGGACTAAGTACAAGAGGCGAGCACCCTATCTTGACCAGCTGGATCTGGCTCATGTCATGAACAGCTA
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a
s	mr.mrrefChr3	46653	7	+	181019	GAAGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	492270	7	+	636262	GAAGACA
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a
s	mr.mrrefChr3	46660	18	+	181019	GGATCCTCTTCCAGTGGA
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a
s	mr.mrrefChr3	46678	75	+	181019	CACCAAGGACACAACTGTGTGAAAAAGCCTTTAGTGGGAAATCTAGGACTCCATCCATAAGTCATGCTTGCAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	492305	75	+	636262	CACCTAGGATGTAAATGGGTGAAAAAGCCTTTAGTGGGAAATCTAAGACTCCATCCATAAGTCACGCTTGCAATG
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a
s	mr.mrrefChr3	46753	223	+	181019	GAGAAGCATTTATAACCTAGGGCATCAAATAGGACTGACCCCTCAGGCAAAATTGTCAGAGACATGCTATTGTAGTGAGGTCTTAAGGAGACAAGTGTCATGATAGCTTGTTGAATCATAAAGTTAAAGAATACTAGGTATGTGCATAATAACTGTGCTGGAAAACATCAGTGACATTACGCAAACTTGATTAGCCATATGCAGTTGTAAGCATTGACGGCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	492381	223	+	636262	GAGATGCATTTATAACCTGGAGCATCAAATAGGACTGACCCCTCAGGCAAAATTGTCAGAGACCTGCTATTGTAGTGAGACCTCAAGGAGACAAGTTTCATGATAGCTTGTTGAATCATAAAGTTAAAGAATACTAGGTATGTGCATGATAACTGTGCTGGAAAACATCAGTGACATTACGCAAACCTGATTAGCCATACGCAGTTGTAAGCATTGACGGCAT
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a
s	mr.mrrefChr3	46976	44	+	181019	TCTGCTACAATGATAGAGGTCTGTTAAAATGACTTTGGCTAGAT
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a
s	mr.mrrefChr3	47020	16	+	181019	TGGTTGAAACTTGGTG
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a
s	mr.mrrefChr3	47036	6	+	181019	CCTAGA
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a
s	mr.mrrefChr3	47042	65	+	181019	GCAAAAGATCAGTCTAGTCCTGTCCAGCAACCATGCATTTGAGATCAAAATCCAGAGGAAAGGAT
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a
s	mr.mrrefChr3	47107	88	+	181019	TATTAGTTGAGATGGAAAAGTGGCCTTAAGGTCCCGATCTGCATTTATGACACCTTAGTTTAATGTTAAAGGCCTCTAGCCAGTTCTA
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	492845	88	+	636262	TATTAGATGAGATGGAAAAGTGGCCTTAAGGTCCCGATCTGCATTTATGACACCTTAGTTTAATGTTAAAGGCCTCTAGCCAGTTCTA

a
s	mr.mrrefChr3	47195	24	+	181019	GTCTTGATTTGATTGCCGAAGGAT
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	47256	43	+	181019	ACAGCCAGTGATAATAACAGACAGTGTAATGTCATGACAGCAG
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a
s	mr.mrrefChr3	47299	214	+	181019	TACAAAAATAATATGGATGGTTAAGAGTAGTGGGTACAGAATTGAAGGATGCAGCATAATACAAAGGCCCTTGACATTGGACCATCATTACTGTCGCTGACAACTTCATCTAGGCTTGATACTCTTCGCAACCCAATGGTAGAGCATTCAATAACTATGTTTGGCTTGGTTAACACCACCCTAAGCTCCTAGTACTGATTAATTAGCTTTAGCC
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a
s	mr.mrrefChr3	47513	128	+	181019	AGCAGACCAGCAGAGATTGGTCTTTTTTATTTTGGAACCCTTGCCCTTGGCTTGCACAGGTTAAGGAAGATGACAACCTTAACTTGATGCCTGTAAGTTCATCAAGTTCAGCAGCTTTGTGAAATTTG
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	47649	31	+	181019	CTTCAGTAGAGGAAATGAAGGTGCTGGTGCT
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a
s	mr.mrrefChr3	47680	3	+	181019	ACT
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	47711	9	+	181019	GAAGAGCTG
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a
s	mr.mrrefChr3	47720	331	+	181019	GTGCTGTGTCATTCAACCATAATGAAAAGAGATCCAAATGAATTGTTTCACCCTGTTATCATTGTTACCAAGCATGTGACCTCAGTGTAAGTTTCAGTCATAAGGATGAGTATCTTCCCCCAGACCTACCACCAATCAAGAAAAACTTTTATAAGGAGTCCACTGCAATGAGCACCATGACAAAAGTGCAAGCAGATAGTTGGAAGTATATCCCCATCCCACCATAGAGGGAAACAGAAATACTGTGCCACTGGACTGTGATAATGTATATGGACATATGTCAATGGGAGAATAATGTTAAGTCATAGCATCTGAGAATAATGTTAAGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	493552	327	+	636262	GTGCTGTGTCATTCAACCATAATGAAAAGAGATCCAAATGAATTGTTTCACCCTGTTATCATTGTTACCAAGC-TGTGACCTCAGTGTAAGTTGCTGTCATAAGGATGAGTATCTTCCCCCAGACCTACCACCAATCAAGAAAAACTTTTATAAGGAGTCCACTGCAATGAGCACCATGACAAAAGTGCAAGCAGATAGTTGGAAGTATATCTCCATCACACCACAGAGGGAAACAGAAATACTGTGCCACTGGACTGTGATAATGCATATGGACACATGTTAA---GAGAATAATGTTAAGTCATAGCATCTGAGAATAATGTTAAGTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	501681	316	+	647215	GGACTGGGAGGTCTAACAATAATGAAAAGAGATCCTAATGAATTGTTTCAACCTGTTGCCATTGTTTGCAGCCATCTAACTTCAGTGTAAGTTTCAGTCATAAGGATGGGTATCTTCCCCAAGACCTACCACCAATCAAGAAAAACTTTTATAAGGAGTCCACTGCAATGAGCACCATGACAAAGGTGCAAGCAGATAGTTGGAAGTATACCCCCACTCCATCATAGGGGGAAAGAGAAATAATGCGCCACTGGGCTGTGATAACCTATATGGATTTACGTCAATGGGAGAATAATGTTAAGTCATAGCATCTGGT---------------

a
s	mr.mrrefChr3	48051	73	+	181019	TAGCATCATGAAGGGATGGAGTTTAGGGTCAGCATCATGGATGGTCAATTGGAGCCTAATGTCTAGCACAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	493882	73	+	636262	TAGCATCATGAAGGGAAGGAATTTAGGGTCAGCATCATGGATGGTCAATTGGAGCCTAATGTCTAGCACAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	501997	61	+	647215	------------GGGATGGAGTTTAGGCTCAGCATCATGGATGGTCAACTGGAGCCTAATGTCTAGCACAAGA

a
s	mr.mrrefChr3	48124	52	+	181019	tttgtgtgtgtaaagtcacgatgttgggaccctttgaggggtattttgtata
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	493955	52	+	636262	tttgtgtgtgtaaagtcacgatgttgggaccctttgaggggtattttgtata
s	simRat_chr6.simRat.chr6	502062	52	+	647215	TCTGTGTATATAAAGTCATGATGTTGGGCTCCTTTGGGGGGCATCTTATATA

a
s	mr.mrrefChr3	48176	24	+	181019	acctgctaaagttagttgctcccc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	494007	24	+	636262	acctgctaaagttagttgctcccc
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a
s	mr.mrrefChr3	48200	18	+	181019	tcaagcatcaactgatgc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	494031	18	+	636262	tcaagcatcaactgatgc
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a
s	mr.mrrefChr3	48218	76	+	181019	agcatcctAGACCTACCTACATGAATGAACAATGTATAGTGAAGGGTGATGACATATCTCATGCAATGTGAGACTC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	502177	76	+	647215	AGTATCCTAAACCTACCTACATGAATGAACAATGCATAGTGAAGAGTGATGACATGTCTGATGCAATATGAGACTC

a
s	mr.mrrefChr3	48294	9	+	181019	TTTTTATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	494411	9	+	636262	TTTTTATGT
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a
s	mr.mrrefChr3	48303	64	+	181019	AAGTATGAGGGGGTGAGGACCCTAGTTCTAGATGTGGTAAAATAggagtggggggggaggaggg
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	494420	64	+	636262	GAGTAGGAGGGGGTGAGGACCTTAGTTCTGGATGTGGTAAAATAggagtggggggggaggaggg
s	simRat_chr6.simRat.chr6	502264	64	+	647215	AATGATGAGGGGGTGAGGACCCTAGTTCTAGAGGTGGTAAAATAGGGGCagggggggaggaggg

a
s	mr.mrrefChr3	48367	232	+	181019	agggtgggggggggggaggggagggAAGTAAAGGAGGTAAAGTTTAAAGCATAACAGTGCTTTGTAAACAAATTTCACAAAATAGCATATTGCGCCAAGTTTTATAAATTGAATTCTGTTATGGTTAGGCACAGATAAGGGCTCACATTGGGTCATGACTGGTTATGTTAAAGGTAGACTCATTTTTTCTTCAATTAACAACTTGGCAAAGGCTTTTAGGTTTAAATATGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	494485	210	+	636262	agagtggggggggggtaggggagggAAGTAAAGGAGGTAAGGTTTAAAGCATAACAGTGCTTAGTAAACAAATTTCACAAAATGGCATATTGCGCAAAGTTATGTAAATTGAATTCTGTTATGGTTAGGCACAGATAAAGGCTCACATTGAGTTATGACTGGTTATGTTAAAGGTAGACTCATTTTTTCTTTGATT----------------------GGATTAAATATGGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	502328	230	+	647215	agggtgggggggagggaggggagggaggTAAAGGAGGTAAAGTTTAAAGCATAATAGTGCTCTGTAAACAAATTTCACAAAATAGCACATTGC-CCAAGTTTTATGAATCGTATTCTGTTCTGGTTAGGCACAGATAAGGGCCCACATTGGCGCATTACTCACTATGCTAAAGGTATACTCA-TTCTTCTTCAATTAACAACTTGGCAAAGGCTTTTAGGTTTAAATATGAC

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	494695	519	+	636262	GAGAAGGTTTTTCATATCATTTTTCATGCAAGTCAAAATGCTCAGTTGGACAAGGTAATTTTTCTATTGGGGAATTTAATCATTATGATCTAACTTACTGTAAAGGCACGATCAGAGTTACTTTATCTAGGGATTACATACTGTCAGACCCAGTTACTTTTAATATCTCTCCACAAGTTTCCTCCATAACTATAAACTGATTGTATAGGGTAATCAGC-----AGCCTAATAATAAGAAAGTTATTTAATAGTGCTCTTTTAGTTTGGATGGCTTTTTAATTTAAAGGGAAGAAAATTTTAACTTAACATGGGATGACTTAAAGGATGGAGAAAAACATCCCTTGAACCCCTGTACTTTCGACGATGCTTCTCCATGTTATCATCCTGATGTTACCGAAAACATAAAGAAGCCCTTTCAGAAACCTATGCCAATTCATGTAAGATAACGTGATTGAACAATGGATGTAACACTGCTAGGTTTATTGGGTTCAATGCGACCTCTCTTTAGAAAGAAGATAACGTA
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a
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	495326	323	+	636262	TAGAGATAAAGTGACTCAATGCTCACTTCTGAGATACAGAGGTTTGATCATAACACAATCAACATCACCTAGGACAGAGTGACCTCATTCTAGGAGACAGTGTGTACTGAGCAACGAAGTACAGGTTTTGGCCAAAATTCTGAGCACTGCCAGGAGCTGTTCTAATAAGAGTGAAATTTTTTTAGTCCCATGCGTGGCCACTATTGTATGGTATAGATCTGATAGGTGTAGCCCGTGCTGGCACAGGGAAGACGTTGTGCTATGTAATGCCCGGTCTCATTCACCTGGTGCTCCAGCCGAGGTTGCCTTATGTATTATTCCTG
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	49814	29	+	181019	GATTGGCTAGAGTGAACTGTCCACATCTC
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	49850	5	+	181019	TATAA
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	49979	2	+	181019	AT
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a
s	mr.mrrefChr3	49981	14	+	181019	CTCTTAGTTATGCA
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a
s	mr.mrrefChr3	49995	38	+	181019	GTAGAGAGGTGGATCATCAGCAGTTTTTTTGCAGCATA
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	50037	5	+	181019	AGATG
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	50143	16	+	181019	ACTTGCTACACATACT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	50278	9	+	181019	TATTCCCAA
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	50296	1	+	181019	A
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a
s	mr.mrrefChr3	50297	51	+	181019	TACCTTAATCATAGTTTGCACATTTTACAACTTCAATTTACAGGTTCATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	195076	51	-	636262	TAGCTCCATCATAGATTGAACATTTTACCATATCAACTTCCAGGTTCATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496298	47	+	636262	---CATAA-CACACTTGGCACTTTTGACAACTTCAATTCAAAAGTTCATTA
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a
s	mr.mrrefChr3	50348	15	+	181019	CTCCAGTCATGGAAG
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496349	15	+	636262	CCCCAGACCTGGAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	197043	15	-	647215	CTCCTGTCATGGAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	508778	15	+	647215	CCCCAGTGATAGAAG

a
s	mr.mrrefChr3	50363	1	+	181019	C
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496364	1	+	636262	C
s	simRat_chr6.simRat.chr6	508793	1	+	647215	C

a
s	mr.mrrefChr3	50364	8	+	181019	CAATAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	195142	8	-	636262	CAATAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496365	8	+	636262	CAATTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	197058	8	-	647215	TAATAGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	508794	8	+	647215	CAATAGCA

a
s	mr.mrrefChr3	50372	7	+	181019	TTTAACT
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a
s	mr.mrrefChr3	50379	53	+	181019	CACAAGTCATGACCCCAAGTCATGGAAGCCAACAGAAACACATGGGAGCTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	195150	53	-	636262	ACACAGCCATGGCCCCAATCTGTGGAAGTGAACAGAAACACATGGGAGATTTG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	197066	53	-	647215	CACAAGTCATGGCCCCAAGCCATGGAAGTGAACAGAAACACATGGGAGATTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	508809	53	+	647215	TACAAGTCATGACCCCAAGTCATTGAAGCCAACAGAAACGCATGGAAACTTGG

a
s	mr.mrrefChr3	50432	13	+	181019	TCAGGAACTAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496433	13	+	636262	TTGGGAACTAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	197119	13	-	647215	TCAAGAACCAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	508862	13	+	647215	TCTGGAATTAAAA

a
s	mr.mrrefChr3	50445	6	+	181019	TTTTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	195203	6	-	636262	TATCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496446	6	+	636262	CTCTGT
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a
s	mr.mrrefChr3	50451	47	+	181019	CTATCTTAAGCTTAAGGGGTCAAAGGAATAGACCTAGTACCTTAGTC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	509109	38	+	647215	CTACGTTAAGCTTAA---------GGGGTAGACCTAGAACCTTAGTC

a
s	mr.mrrefChr3	50498	1	+	181019	C
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a
s	mr.mrrefChr3	50499	29	+	181019	TGACACCTACACATGAGCTAGCAATTCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496500	29	+	636262	TGACACCTACACATGAGCTAGCAATTCAA
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a
s	mr.mrrefChr3	50528	17	+	181019	GTGGAAGAAGGTGACTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496529	17	+	636262	GTGGAAGAAGGTGACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	197215	17	-	647215	GTGGAGGAAGACGGCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	509177	17	+	647215	GTGGAAGAAGGTGACTG

a
s	mr.mrrefChr3	50545	41	+	181019	TTGTAAATATTTTCACAAAGGGCTCCAGAGGTGGATAGGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496546	41	+	636262	TTGTAAATATTTTCACAAAGGGCTCCAGAGGTGGATAGGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	197254	41	-	647215	GTGGGAACTTTTTCTCAAAGGCGTCCAGAGGCAAATAGGTT
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a
s	mr.mrrefChr3	50586	2	+	181019	AT
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a
s	mr.mrrefChr3	50588	101	+	181019	TTGTTCTCTCCAGCATTACCTGTACCATTGTAGTACTCTGATAATTACGCCCTTTCATTCTTTACCTTTATTTTTTTGGGTACAAATTCTCCTCTCAGTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496589	100	+	636262	TTGTTCTCTCCAGCATTACATGTACCATTGCAGTACTCTGATAATTAAGCCCTTTCATTCTTTACTTTTATTTTTTTGGGTGCAA-ATCCACTCTCAGTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	197295	101	-	647215	CTGGTCTCTCAAGCATTACCTGTACCATTGTACTCCCCTGATACTTCCTCTCTTTCATACTTTATCTTCTTTTTTTTAGGTACAAATTCTCCTATCAGTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	509237	100	+	647215	TTGTTCTCTCGAGCATTACCTGTACCCTTTTAGTACTCTGTGAATTATGCCCTTTCATTCTTTACCTTTACTTTTTTGGGTACAA-TTCTCCTCTTGGTTC

a
s	mr.mrrefChr3	50689	14	+	181019	TACCTCCTTGCTTC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	509337	14	+	647215	TACCTCCTTACTTC

a
s	mr.mrrefChr3	50703	1	+	181019	A
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496703	1	+	636262	A
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a
s	mr.mrrefChr3	50704	6	+	181019	GAAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496714	6	+	636262	GAAGGT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	509352	6	+	647215	GAAGAT

a
s	mr.mrrefChr3	50710	259	+	181019	CTTTAGTAGTCATAGTTGTCTTGGCTATCCAGTTTGGTACCTCTGGGGCCGAGTGATATTCACCAAATCTCATTTTTCAGGGAGTTGTTATCTCACTCCTACAACGCTAGTCCGTTTCAGGTGGACTCTCACATATTGAGGATCCAAAGCCACCTGCTATGGACTTTCTGTTGAGGTCTGGCTCTTCGTACTAGAGCATTTGTATATATTGTGGTGATAGTAACAAAGATGATCAGATACAAGATCTGAAGAATGGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496720	259	+	636262	TTTTAGTAGTCATAGTTGTCTTGGCTATCCAGTTTGGTACCTCTGGGGCCGAGTGGTATTCACCAAATCTCATTTTTCAGGGAGTTGTTGGCTCCTTCCTGCAACACTAGTCCATTTCAGGTGGGCTCTCACAAATTGAAGATCCAAAGCCACCTGCTATGGACTTTCTGTTGAGGTCTGGCTCTTCGTACTAGAGCATCTGTATACATTGTGGTGATAGTAACAAAGATGATCAGATACAAGATCTGAAGAATGGTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	509358	258	+	647215	CTTTAGTAGGCTTAGTTGTCTTTGCCATGCAATTTGTTACCTCTGGGGCCAAGTGA-ATTCACCAAATCTCATTTTTCAGGGAATTGCTATCTCACTCCTACAACGCTAGTCAGTTTCAGGTGGACTCTCACATATTGAGGATCCAAAGCCACCTGCTGTGGACTTTCTGTTGAGGTCTGGCCCTTTGTACTAAAGCATTTGTATATATTGTGGTGATAGTAACAAAGATGATCAGATACAAGATCTGAAGAATGGTGT

a
s	mr.mrrefChr3	50969	73	+	181019	GGATATTATAATTGTAACACCTGGCAGATTAAATGATTTGCAAATGAGTAACTTTGTTAATTTGAAGAATATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	496979	73	+	636262	GGATATTATAATTGTAACACCTGGCAGATTAAATGATTTGCAAATGAGTAACTTTGTTAATTTGAAGAATATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	449557	73	+	647215	AGATATTCAAATTGTGATACCTGGCAAATTAAATGATTTGCAGATGAGTAACTTTCTTAATTTGAAGAATATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	509616	73	+	647215	GGATATTATAATTGTAACACCTGGCAGACTAAATGATTTGCAAATGAGTAACTTTGTTAATTTGAAAAACATA

a
s	mr.mrrefChr3	51042	26	+	181019	ACTTACTTGGTGTCAGGTCTATCGGA
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a
s	mr.mrrefChr3	51068	9	+	181019	GGTTAGGTT
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a
s	mr.mrrefChr3	51077	1	+	181019	A
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a
s	mr.mrrefChr3	51078	42	+	181019	TCATATCCTCAGAGTGAATGGTTGAGGGTTGGTTACCCATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	497087	42	+	636262	TGATATCCTCAGAGTGAATGGCTGAGGGATGGTTACCCACTG
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a
s	mr.mrrefChr3	51120	24	+	181019	GTTGGCCATAGTAGCTGTTTAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	497129	24	+	636262	GCTGGCCATAGTAGCTGTTTGATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	449800	12	+	647215	TTTG------------ATATAATA
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a
s	mr.mrrefChr3	51144	9	+	181019	GTCTGTTAA
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a
s	mr.mrrefChr3	51153	21	+	181019	GATAGGAATATAACGCTGTCC
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a
s	mr.mrrefChr3	51174	78	+	181019	CTCAGCCCTATTGCTAACTCTGGGCCATATAAGGCACTTCTAAAGTCAGAAGCCTGAACAAAGGAGACTCCTCATACA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	509838	78	+	647215	CTCAGCCCTATTGCTAACTCTGGGCCATACAAGGCACTTCTAAAGTCAGCAGCCTGAGCATAGGTGACCCCTCGTACA

a
s	mr.mrrefChr3	51252	28	+	181019	TCATATTGTATCCCACTAGTTTACAGGT
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a
s	mr.mrrefChr3	51280	365	+	181019	TGTCATACTCAAGAGACAAAACTTTAGAAATGAGAGTTTTCAGAATTAGACCTGTAACTTCGTGCTACCTCACGACAACTCAGCAGCACCTCATGGATGACATGAATGCATTCCTGTGTGATGGAAGTTAATGTAGACGGGAAACTAACTTGTACACCTGCAAAATGAATACACATTCTTACACAGTACCTTGTTGTACCATAAACCTCCCTACAGAGATTGGGCTTCATTATGTGAGTCAAGTTAAAGGTTGGACATTATGAAGCCCTTAATTTGAAGCTTCAGGCAATTTGAGGATTAGATAATACAACCAGAAaatgggcaaggtctctgattcactttgcacacgggagaaatggtacttc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	497293	365	+	636262	TGTCATACTCAAGAGACAAAACTTTAGAAATGAGAGTTTTCAGAATTAGACCTGTAACTCCATGCCACCTCACGACAACTCAGCAGCACCTCATGGATGACATGAATGCATTCCTGTGTGATGGAAGTTAATGTAGACGGGAAACTAACTTGTACACCTGCAAAATGAATACACATTCTTACACAGTACCTTGTTGTACCATAAACCTCCCTACAGAGATTGGGCTTCATTATGTGAGTCAAGTTAAAGGTTGGACATTATGAAGCCCTTAATTTGAAGCTTCAGGCAATTTGAGGATTAGATAATACAACCAGAAaatgggcaaggtctctgattcactttgcacacgggagaaatggtacttc
s	simRat_chr6.simRat.chr6	509944	365	+	647215	TGTCATACTCAAGAAACAGAGCTTTTGAGATGAGATTTTTTGGAATTGGATCTGTAACTTCGTGCTACCTCATGACAACTCAGCAGCTCCTCATGGATGACATGAATGCATTCCTGTGTGATGATAGTTGATATAGACAGGAAACTAACTTGTATACCTGCAAAATGTATACACTTTCTTACACATTACTTTGATGTTCCATAAACCTCCCTACAGAGATTGGGCTTCATTATGTGAGTCAAGTTAAAGGTTACTCATTATAAAGCCCTTAATTTGAAGCTTTAGGCAATGTGAGGATTAGATAACACAATCAAAAagtgggcaagacctctgattcactctgcacatgagaaagatgTTACGCC

a
s	mr.mrrefChr3	51645	85	+	181019	tgagggtggcgttccgcccacagactctactaccccactgctgggtgcccctgggttcttttttgaaggattCATAGTGGTAGTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	510309	85	+	647215	TgagggtggcattccgcccacagagccacctaccccattgcttggtgtccctgggttctctttgAAGGGATCTATAGTGGTAGTT

a
s	mr.mrrefChr3	51730	50	+	181019	GAAGATATGGTCAATGTGAATAAAAGGCAGTGGTCATGTACACGTGATTA
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a
s	mr.mrrefChr3	51780	133	+	181019	GTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCGCTTGACAAGATGTCAACCGATCACAGAAGATGTCTGCCCACCTCATGGAAGAGGTTTGTCATGCATAGTTCCCCCTGCATGTTACTATTACTAGACCTTACTGACGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	497848	133	+	636262	GTGCTTGGCTATGAGCCTGCCCCGCTTGACAAGATGTCAACCGATCACAGAAGATGTCTGCCCACCTCATGGAAGAGGTTTGTCATGCATAGTTCCCCCTGCATGTTACTATTACTAGACCTTGCTGATGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	510445	133	+	647215	ATGCTTGACTATGAGCCTGCCCTGCTTGATGAGACGTCAAGCAATCACAGAAGTTGTCTGCCCGCCTCATGCAAGAGGTTTATCCTGCATAACTCCCCCTGCATATTACTATTATTAGGCCTTACTAACGCCA

a
s	mr.mrrefChr3	51913	111	+	181019	CTAAAGTTGAATGTTCTAACATACCTATACTCTCTTCCCTCCTACTAGAGTTATCAGTTATGCAGAGTTGCTTGGGACTCGACATTACCCTTATGCATCTGGCTTGTTTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	497981	111	+	636262	CTAAAGGTTAATGTTCCAACATACCTATACCCTCTTCTCTCCTACTAGAGTTATCAGTTCTGCAGAGTTGCTTGGGACTCGACATTACCTTTATGCATCTGGATTGTTTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	510579	109	+	647215	CTAGAGTTGAATGTTCTAACATACCTATACTCTCTTCCCTCCTACTGGAATTATTGGTCAT--AGAGTTGCTTGGGATTGGACATTACCCTTATGCATCTGGCTTGTTTAG

a
s	mr.mrrefChr3	52024	329	+	181019	TTCAGCCACAATGTTAGTTGTGAGTATTTAGGTGCATTATTCCTGGTTAAGGATCTGCAATTTTGTTAAGGTCTTACTGTATGAGAGATATTTGAGGGTACCAAGCACTGAGCACCCATCGGACCTTTTGGCGGTGTATAGACCATGGTGACTCTCTTGGGTGTGATGTGTGTTGTAATTTAAACAAATTTGAAGCTAGCTGCCTGTTCTCTTATTCAGGGCTGTTAGTCTAAGTCTGACAATTAAAATTAGGACTAAATAGATGTCTCTTCTAACTTTGATTTGGGAATTGACTAATTTTTTGGGATTACACTTGATCAGGCTAGGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	498098	329	+	636262	TTCAGCCACAATGTTCGTTGTGAGTATTTAGGTGCATTATTCCTGGCTTGGGATCTGCAATTCTGTTAAGGCCTTACTGTATGAGAGATATTTGAGGGTGCCAAGCACTGGGCCCCCAACGGACCTTTTGGCGGTGTAGAGACCATGGTGACTCTCTTGGGTGTGATGTGTGTTGTAATTTAAACAAATTTGAAGCTGGCTGACTGTTCTCTTATTCAGGGCTGTTAATCTAAGTCTGACAATTAAAATTAGGACTAAATAGATGTCTCTTCTAACTTTGATTTGTGAGATGACAAATTTTTTGGAATTACCCTTGATCAGACTAGGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	510688	316	+	647215	ATCAGCCACAGTGTTAGTTGTGAGTATTTAGGTGCACTAATCCTGGTTAAGGATCTGCAATTTTGTTAAGATCTTACTGTAT-------------GGGTACCAACAACTGAGCACCCATTGAGCATTTTGGCAGTGTGTAGACCATGATGATTCTCTTGGGTGCACTGTGTGTTGTAATTTATACAAATTTGAAACCAGCTGCCTGTTCTCTTATTCAGGGCTGTTAGTCTAAGTCTGACAATTAAAATTAGGACTAAATAGATGTTTCTTCTAACTTAGTTTTGGGGATTCACTAATTTTTTGGGACTACACTTGATCAGGGCAGGCC

a
s	mr.mrrefChr3	52353	7	+	181019	ATTATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	498427	7	+	636262	ATTATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	511011	7	+	647215	ACTACGT

a
s	mr.mrrefChr3	52360	234	+	181019	TGACAGTCAGTAGATAGGTTGTATTGTTGATATGGGTTCTGGTGGAGGAGTCTAAACAACTCAAAGGAGGTTTTGGATGACGCGAAAAGGATGTTAGAGATGGGTTATAAACCCCAAGTAATGAGGATTCTATTAGATGTATGTCCAGACAAACAAGCATTGATGACCAGGTTGGAAATCACAAACAGGCATTGACATGACCAGGTTGGGAATTGCACTTCCCTAAGTGCTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	498434	234	+	636262	TGACAGTCCACAGAAAGGTTGTATTGTTGATATGGGTTCTGGTGGAGGAGTCTAAACAATTGAAAGGAGGTTTTGGATGACGCGAAAAGGATGTTAGAGATGGGTTATAAACCCCAAGTAATGAGGATTCTACTAGATGTATGTCCAGACAAACAAGCATTGATGACCAGGTTGGAAATCACAGACCAGCATTGACATGACCAGGTTGGGAATTGCACTTCCCTAAGTGCTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	511022	234	+	647215	TGACAGTCAGTAGATAGATTGTATTGTTGATATGGGTTCTGGTGGAGGAGACTAAGCAACTCAAAGGAGGTCTTGGAGGACGCAAAAAGAATGTTAGAGATGGGTTACAAACCCCAAGTAATGAGGATTCTATTAGACGTATGTCCAGACAAGCAAGCATTGATGACCAGGTTGGAAATCACAAGCAGACATCAGGATGATCAGACTGGGAATCGCACTTCCCTAACTGGTATG

a
s	mr.mrrefChr3	52594	71	+	181019	ACTATGAAGATCCTTTTGCTAGTCAGAAGGGTATGAAAGTGGGCTCTCTCTCTCGCCTTTTGCTTTGTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	498670	71	+	636262	ACTATGAAGATCCTTTTGCTAGTCAGAAGGGTATGAAAGTGGGCTCTCTCTCTCGCCTTTTGCTTTGTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	511256	71	+	647215	ACTGTGAACATCCTTTTGCTAGTCAGAAGGGTATGAAAGTGGGCTCTCTCTCTTGCCTTTTGCTTTATTGA

a
s	mr.mrrefChr3	52665	10	+	181019	AAAGTGTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	498743	10	+	636262	GCAGTGTAAG
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a
s	mr.mrrefChr3	52675	63	+	181019	CAGGTCTTGGGGCAATATTAGGAGGTTAATAAACTTTTGTTATAATCTCGAGTGCATAGTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	498753	31	+	636262	CAGGTC--------------------------------GTTATAATCTCGAGTGCATAGTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	622335	31	+	636262	CAAGTC--------------------------------GTTATAATCTCGAGTGCATAGTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	511337	63	+	647215	CAGGTTTTGGGGCAATATTAGGAGGTTAATAAACTTTTATTATACTCTTGAAGGTATAGCGAG

a
s	mr.mrrefChr3	52738	48	+	181019	ATAATGCAGAAATGGACCCCATCACCCATCAGACCAGATAACCCTAAA
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a
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a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	514791	71	+	647215	AGCAGTTGATTGAACCCATACTTCCAGTAGGAGCATATATTGTGAATAATGAACAGATAGTGACAGGGGCT

a
s	mr.mrrefChr3	56078	270	+	181019	GGGGATCTCTCATATTACCTATCTCCCTCATGCACAGACTGGAGCTTCATGAAACAATAACTTGCCAATGGGATGACTCTGGGTTATCTATGCATGCATAAATACCTATTTACTTACATATTCATTGCCATAGGTCAGTTATAACAATAAGAATGTGCATTTATTGCCATGCCAACTTCTAAACACCTGAATAAGAGGTATTTTGACAGACAAATTGGTAATTCCTCTAACAACCGAACATGAAGAATTCTTATACACTGAATACTAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	503574	265	+	636262	-TGGATCTCTCATATTACCTATCTCCCTCATGCAGAGACTGGAGCTCCATGAAACAATAACTTGACAAC--GATGACTCTGGGTTATCTATGCATGCATAA--ACCTCCTCACTTACATATTCATTGCCATAGGTCAGTTATAACAATAAGAATGTGCATTTACTGCCATGCCAACTTCTAAACACCTGAATAAGAGTTATTTCGACAGACAAATTGGTAATTCCCCTAACAACCGAACATGAAGAATTTTTATGGACTGAATGCTAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	514863	270	+	647215	GGGGATCCCTCATGCTATCTACCTCCCTCATGTACAGACTGGAGCTTCATGAATCAATAACTTGCCAATGGGACCACTCTGGGTTATCAAGGCATGCATAAATACCTATTTACTTACATATTCATCACCACAGGTCAGTTATAACAATGAGAATGTGCATTTATTGCCATGCCAACTTCTAAACAACTGAATAAGATGTACTTTGGCAGACTAAATGGTAATTCATAAAATGACCAAACATGAAGTATTCTTATACACTGAATACTAATT

a
s	mr.mrrefChr3	56348	114	+	181019	TTTAACTTTTAAAATCTGCTCTGGATTGTAAGACTTAGAACAATAAAACAATTGTGTACACTGTAGTGAGAGGTGAATGCCATGAGTATTCAATTACATGCTAGGGTTTCATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	503839	108	+	636262	------TTGTAAAATCTGCTCTGGATTGTAAGACTTAAAACAATAAAACAATTGTGTACACTGTACTGAGAGGTGAATGCCATGAGTATTCAATTATGTGCTTGGGTTTCATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	515135	107	+	647215	TTTAACTTTTAAAATCTGCTCTGGATTGTAAGACTTAGAACGATAAAGCTATTGTGTTCACTGTAGTGAGGGATGAATGTC-------TACAATTACATCCTAGGGTTTCATTC

a
s	mr.mrrefChr3	56462	286	+	181019	ATTTAATCAACTTGCGATGAAAAGCCATCTCTTAGTTACTATTGCTTGGTCTTATTACACTCCTCATAGTTCCATTACTATCACCTTATGAACTCATTGTAACGTAAAGTTCAGTCATTTTGATTTTGTATAATAATAAGTGATTTCCTGTGCTGCTTTATCACTGTAGGGCCTGCAGAGGCCCGCCCTTACCCAGCAGTCTGGCGGAAGTACTCACAGGGCCTAGTCTTTCAACAAAATGTTGAATAACAATGTAGGTGGGATATGAGTTAAATGTCATTGAACG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	503947	285	+	636262	ATTTAATCAACTTGCGATGAAAA-CCATCTCTTAGTTACTATAGCTTGGTCTTATTACACTCCTCATAGTTCCATTACTATCACCTTATGAACTCGTTGTAACATAAAGTTCAGTCATTTTGATTTTGTATAGTAATAAGTGATTTCCTGTGCTGCTTTATCACCGTAGGGCCTTCAGGGGCCCGCCCTTACCCAGCAGTTTGGCGGAAGGACTCACAGTGCCTAGTCTTTCAACAAAATGTTGAAGAACCATGTAGGTGGGATTTGAATTAAATGTCATTGAACG
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	56967	226	+	181019	AAGCATTATTGACCCCCTGTAGGGAGACTTATCTGCCCAACTATTTACACAAACACTAAGTTGAAACTGTCTCCTGAAGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCAAGTGATTTAATACTTGGAACCAACTCAGTAGCTTTGCAAGCAGATAAGGAACAGCGGGATCAAGAGAAGCTAGAAAATTTTAAAACAGGTGTGTTCTCAGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	504451	226	+	636262	AAGCATTATTGACCCCCTGTAGGGAGACTTATCTGCCCAACTATTTACACAAACACTAAGTTGAAACTGTCTCCTGAGGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCGAGTGATTTAATACTTGGAACCAACTCAGTAGCTTTGCAAGCAGATAAGGAGCAGCGGGATCAAGAAAAGCTGGAAAATTTTAAAACAGGTGTATTCTCAGATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	515762	226	+	647215	AAGCATGATTGACCCTTTGTAGGGAGGCTTATCTGCCCAACTATTTACATGAACACTAAGTTGAAGCTGTCACCTGAAGTCATCAGGATGGACTACCTTTCCTACAGTGCAGATCAATTACCAAGTGATCTAATACTTGGTACCAACTCGGTAGCTTTGCAAGCAGATAAAGAACAGCAGGATCAAGAGAAGCTAGAAAATTTTAAAATGGGTCTGTTCTCAGATG

a
s	mr.mrrefChr3	57193	571	+	181019	CAGGTACGTATTCCAGGTTGGATGCCTATTATTACCTGCTGATCAACTGTTTCCATCCTATGAGCTGACCTCGATCATGCATAGTCTAATTTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATGAAACCAATGATTGATAAGGAGATAAACTATGGTGAGTGCTTTAGTATGGGTCTGGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAAATAGTTGATGTAGGCTTACTAATAGATATGTATCGACATTGTCTAACTATTTCTTCTAGGACAGGACAGAATCCTGGTTGCAGCTGATCTTGGCACTCGAGGTGTCCATGATGTGTCTCACATTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTTGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCATGAATAGTAGGCCATCTCTGTTAGCTTTTCATACCTCTCACTGTAGACCACCATAATTGCCCTTCATGAGTGTACTGCATACTCACAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCCATCAGAATAAAATATCTTATCCATTGGAGTCCCAAATCTATGAATAAATTATCAAACACAAGTTAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	504678	565	+	636262	CAGGTACGTTTTCTAGGTTGGGTGCCTATTACTACCTGCTGACCAACTGTTTCCATCCTATGAGCTGACCT--GTTATGCATAGTCTAATCTTTCAGGAGCAGTTCCCAAAGCAAATGAAACTGATGATTAATCAGGAGATAAACTATGGTGAA-GCTTTAGTATGGGTCTAGTATCTCCCCAGCTTTAACCTGACTAAATAGTTGATGTAGGCTTACCAATAGATATGCATCGACAGTGTCCAACTATTTCTTCTAGGACAGGACAGAATCCTGGTTGCAGCTGATCTTGGCACTCGAGGTGTCCATGAGGTGTCTCACACTCATAATCTTGACTTTCCACGAAACATTGAGCATGTGCACCATGTAGTAGCAGGGAGAGCAGGGTAAGCTTGAATAGTAGGCCATC---GTTAGCTTTTCATACCTCTCACTGTAGACCACTATAATTGCCCTTCGTGAGTGTACTGCATACTCCTAGCTTACAAACTGAATTCCAGTTCCATTAGAATAAAATATCTTATCCATTTGAGTCCTAAATCTATGAATAAATTATCAAACACAAGTTAAAA
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	505243	253	+	636262	CTGTATGTGATCGTGTCTTGTGCCACCTATTTGTAAGAAGAACTGGTGTTTCTATTTTAACCACAATCAGAAATGATTGGAGAGTTGCCACTGAATTGATCAATATTCTTGAAAGAGCAAATCATGTGCAACAACCATCATTTCATGCACCCTGTTGGTTACACGAAAACTCCTGCTAATCCATTCAGGCAACTGCACCAGAAAAAGAGTATGGGATATACCAAGAGTGAAGGACATATCCATGGAGTTTGGT
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a
s	mr.mrrefChr3	58017	95	+	181019	ATAACAAGGTATGGATATGGGTACCCACAACAGAGAGAGTCAACATATGGTTTATATGGTTTAAACTGTTTGAGCTTGTTTAATTGCTTCAGGCC
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a
s	mr.mrrefChr3	58112	23	+	181019	AACTGTGAATTTAGCTTAAAGTA
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a
s	mr.mrrefChr3	58135	31	+	181019	CAGTTCTATGAACATGTAGGCGTTAACAGGA
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a
s	mr.mrrefChr3	58166	81	+	181019	CTAAAACTTATTACCCCTTAGCAGGTAAGAATGCCCCTGGCAACTTCATATCTGAACAGCTATATTGACAACCTGCTCTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	505600	81	+	636262	CTAAAACTTATTACCCCTTAGCAGGTAAGAATGCCCCTGGCAACTTCATATCTGAACAGCTATATTGACAACCTGCTCTTC
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a
s	mr.mrrefChr3	58247	18	+	181019	AACTCATATCTCACAGAG
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a
s	mr.mrrefChr3	58265	23	+	181019	ACACAATAATAAGAAGTTGGTCT
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a
s	mr.mrrefChr3	58288	232	+	181019	CAGAGCATCCCAGAAGAGCTAGTTTCAATGGTTGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGAGGAGTGAGATGGAGAGAAAGATGGAAAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCACCAATTTTTTCAGGGAGGCAGGTGTGGTACCTCCAACTATATTATTGGCTTTTAGCTACAAAACTGCTTACTCTAGATGCTAGTAGAAATGTTTTCAATTAGTTCCCATTACTTTGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	505739	226	+	636262	CAGAGCATCCCAGAAGAGCTAGTTTCAATGGTTGAGATGCTAAAGGCACATCAACAGCGGACTGAGATGGAGAGAAAGATAGAGAGACCTCAAGGGAGGCCTAAGAAATTCCACCAGTTTTTTCAAGGAGGCAGGTGTGGTACCTCCAACTATATTATTGGCTTTTAGCTACAAAGCTGCTTACTCTAAATGC------AAATGTCTTCAATTAGGTCCCATTACTTTGACT
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a
s	mr.mrrefChr3	58520	262	+	181019	AGTATACAAGCAACTGTTCCCATCGTTTATTCAAAATTTTAAGGCTCTCAGGATGCATTGATGGTGCCAAAAGATGGGCCTCTGTTCTTGATAATGAGATATCTTACTCTGGGAAATCTAGATGTAAACCAACATTTCGGGGTTTTGTGGACTCACCAAGACTTGATTAATCCGAAAGGCAGGCCTATTCACATGATGCTGAGATATCTTATTCTGGGAGATGTAGATGTAAAAGCTCTACACAATGAAGGACCTTAGTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	505965	260	+	636262	AGTGTACAAGCAGCTGTTTCCATAGTTTATTCAAAATTTTAGGGCTCTCAGGATGAACTGATGGCACCAAAAGGTGGGCCT--GTTGTTGATACTGAGATATCTTACTCTGGGAGATCTAGATGTAAACCAACATTTCGGGGCTTTGTGGACTCACCAATACTTGATGAATCCGAAAGGCAGGCCTATTCACTTGATGCTGAGATTTCTTATTCTGGGAGATGTAGATGTAAAAGCTCTACACAACGAAGGACTTTAGCGGT
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	58835	31	+	181019	GCATAATCCTACATACTAAGGCTATATAACA
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a
s	mr.mrrefChr3	58866	160	+	181019	TAATGCCACTTGGCTTTTGATAAAGGTAGAGACAAGCGGTAACCCATTATACATAATGGGTATTTGGAAATCTGGGACCCAATGTAAAATATAATGTATGATCCTACATACTGAGACCACATTAATAATTGGTCAACTAGTCTTCCATTAGGGCAGAGGC
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a
s	mr.mrrefChr3	59026	207	+	181019	CACATTTTAACTACTTGTACAGGGTCATGAAATGGGTACCTTGAAGACTTTGCTTGGAAGACCAATAATTTTTTGATTGTGCAGGTGCTTATCTTTTCCAGGGCACTGCTGATGATAAAGATTCTTCTAGTGTAATGTTAGAATAATTCACCTATTAGTAGCTCAGTAAAAAATGGTTTTGGTACTCTAGTAAGCCTGGAGACATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	506525	205	+	636262	CGCAGTTTAACTACTTGTACAGGGTCATGAAATGGGTACCTTGAAGACTTTGCTTGGAAGACCAATAATTTTTTGATTGTGCAGGTGCTTATCTTTCCCAGGTCACTGCTGATGATAAAGATTCTTCT-GTGTAATATTAGAATCATTCACCTATTAGTAGCTTAGTAAAAAATG-TTTTGGTACTCCAGTAAGTCTGGAGACATGT
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a
s	mr.mrrefChr3	59233	51	+	181019	CTGGATGTATGCTTACTCACTTACCCACAACATACTTCACTCAAGAGTTAG
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	59371	98	+	181019	CAGAAAAAACAAAGATCCATCAGTGGCTAGTACCCCATAAGGAATTTGTGTTTCCCCCAGTTGGTAATAATCCTATTGTGCAGAATTAAGGATAAAAT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	518187	98	+	647215	CCGAAAAAACAAAGATCCATGAGTGGCTAGTAACCCACAAGGAATTTGTGTTTCCCCCAGTTGGTAATCATCCTATTGTGCAGAATTAAGGATAACAT

a
s	mr.mrrefChr3	59469	123	+	181019	TTTTTGGCTTGGCTGATCAATTGAAAATGACTTGCCATGTCAGTATGGAATTGCATTATTCCTAATGTAAAGAAGGCTGGTATATCCAGACTTTCTTTGGTTCAATTTCACCAAGGAGAGAGG
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a
s	mr.mrrefChr3	59592	103	+	181019	TAATAGCAAAATTAGGGAGTCCTCTCTCTTAGTTGTATAAGTACCACCAAATTGAATGAGGGTCAATCTATCTCCCAGTTACATTCACATGAAGCTATCAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	507105	103	+	636262	TATTAGCAAAATTAGGGAGTCCTCTCTCATAGTTGTATAAATACCACCAAATTGAATGAGGGTCAATCTATCTCCCAGTTACATTCACGTGAAGCTATCAAAT
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a
s	mr.mrrefChr3	59695	180	+	181019	ATCCTCTCATCAAACGTAATGAAAGTTCACAGAACGTCACATGTCTTGCAATACTTTAAGAAGTTGGTTTCTGTGAAGAGTCTGACTCCCAAAAATGTTATGTTTCAAGGAAGTCTCCTTTGACCTATGGACACTATAACACTGCTTGTCCCAAATTTCCATGCCATTAGATTCCTTTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	507208	180	+	636262	ATCCTCTCATCAAACGTAATGAAAGTTCACAGAACGTCACATGTCTTCCAGTACGTTAAGAAGTTGGTTTCTGTGAAGAGTCTGACTCCCAAAAATGTTATGTTGCAAGGAAGTTTCCTTTGGCCTATGGACTCTATAACACTGCTTGTCCCAAATTTCCATGCCATTAGAGTCCTTTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	518513	177	+	647215	ATCCTCTTGTCTAATTTCATGAGAGTTCACAGAAAGTCACATGTCTTGCAATACTTTAAGAAGTCGGATTTTGTGAACAGGCTGATTTCCTAAAATGTTATGCTTCAAGCAGGACTCCTTTGACCTATGGGCACTATAACACT---TTTCTCAAATTTTCACGCCATTAGGTTCCTTTGC

a
s	mr.mrrefChr3	59875	28	+	181019	AAGGAGACAAGTGACACATTGGAACTTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	518690	28	+	647215	AAGGAGACAGGCGACACATTGGAAATTT

a
s	mr.mrrefChr3	59903	100	+	181019	TTTGAATCAGCCATGTCTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAGCCTCTGCATCTATCATCCAAGGCTGCTTTTTATTGAAAGTTGCCCGCTGGATTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	507415	93	+	636262	-------CAGCCATATTTGTACACAATAGTCTATCTGTAACCCAGCCTCTGCGTCTATTATCCAAGGCTGCTTTTTATTGAAAGTTGCCCGTGGGATTAG
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a
s	mr.mrrefChr3	60003	641	+	181019	CACCTTAATGTACTTGTTATCTTGGGAAGGCTGTCAACTAGATTTACAGCGGCACACCAGCAGCATTAGATACATAGGTCAGCATACAGCATGATGCTGTTTAAGAAATGTTGGGCCTAAAGGATACTGCAGCCACTCTGGGTCCTAACTTATGTAAGGGTAGAGTGTCTAAGGGGCCAAAAAAGTAGTCCCAAAAGAGCCTATACACACACGTAATTTACAGAAGTCTAGCACGAAGCATTATGCAATGCTATATTTCACACTTTGAAATCTAAAGTGAATAGGGTGACTAGGACAATGGACACAGGCATATAATAGTGCCAAAGAAATACCACCCCATAACAGATCAGTCTATCTTGTCCTTCATACAAGTAAACTCTAATACATTCCAAGTGGGACCATTATGACCCTATTACCTGTACCCTTCTCTTGCATAAGCCCAGATTTTAAGCTATCAAGTCTGCAAAGTTAAGGGGAAGACTTGTGGTACAAAAGTTGAGTCAGAATCTCCTGAAATGGGCAGGAGCTGAGCCCAATGTGATCTTGACACCCTGGAGCCATAGCAACAAATAATTCATAGGAGGCTGTCAGACAGGGCATATGTCACAGAGAGGCAGAATCTTGCTACTTATGACAATTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	507509	641	+	636262	CACCTTAATGTACTTGTGATCTTTGGGAGGTTGTCAACTAGATTTATAGCAGCACATCAGCGGCATTTTATACATGCATCACCATACAGCATGATGCTGTTTAAGAAATGCTGGGCCTAAAGGATACTGCAGCCACTCTGGGTCCTAACTTATGTAAGGGCAGAGTGTCTAAGGGTCCAAAAAAGAAGTCCCAAAAGAGCCTATACACACACGTAATTTACAGAAGTCTAGCACGAAGCATTATGCAATGCTATATTTCACACTTCGAAATCTAAAGTGAATAGGGTGACTAAGACAATGGACACAGGCATATATTAGTGCCAGAGAAATACCACCCCATAACAGATCAGTTTACCTTGTCCTTCATACAAGTAAACTCTAATACATTCCAAGTGGGACCATTATGGCCCTATTACCTGTACCCTTCTCTTGCATAAGCCCAGATTTTAAGCTATCAAGTCTGCAAAGTCACGGGGAAGACTTGTGGTACAAAAGTTGAGCCAGAATCTCCTGAAATGGTCAGGAGCTGAGCCCAATGTGGTCTTGACACCCTGGAGCCATAGCAACAAATAATTCATAGGAAGCTGTCAGACAGGGCATGTGTCACAGAGAGGCAGAATCTTGCTACTTATGACAGTTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	518847	631	+	647215	CACCTTAATGTGCTGGTTATCTTGAGAAGGCTGACAACTAAAAGTACAGCGGCACACCAGCAGCATTAGATACATAGGTCAGTGTACAGCATGATGTTGTTGAAGAAATGTTGGGCCTAAAGGATACTGCAGCCACGCAGGGTCCTAACTTATTTAAGGATAGAATGTCTATGAGGCCTAAAGAGTAGTCCCAAAAGAGCCTATACACACACATAGTTTACAGAAGTCTAGCATGAAGCATTATGCAATGCTATATTTCATACTTTGGAATCTAAAGTGAATAGGGTGAATAGGACTGTGGACCCGGGCAAATAATAATGCCAAAGGAATACCACCACATAACAGATCAGTCTATTTTGTCCTTCATACACATAAACTCTAATACTTTCCAAGTGGGACCATTATGACCATATTACCTGTACCCTTCTGTTCCATAAGCCCAGATTTTAAGCTATCAAGTCTGCAAAGTTAAGAAAAGGACATGCAGTACAAAAGTTAAGTCAGAATCTCCTGAAATGGGCATGAGGTGAGCCAAAGGTGATCTTGACACCCTGG--------CAACAAATAATTCATAGGAGGTTGTCTGGCAGAGCATATGTCACAGAGA--GAAAATCTTGCTTATTTTGACAATTCC

a
s	mr.mrrefChr3	60644	155	+	181019	GTAGACCTAACAGAAAAATCAACTTCTGAGTTACTCATGATTGTCTGGGCTATTCAGGGGGCTATAGTATGAACACATTTAAAGATTTCAAAGAAGCTCTAAGATCTCCTCATTTTTAGATCAGCCTTCTTCAAAGTTCAGATTGAGTCAGTAAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	519478	155	+	647215	GCAGACCTAACAAAAAAATCAACTTCTGATTTACTCATGACTGTTTGGGCTATTCAGCGGGCTATAACAAAAAGACATTTAAAGATTTCAAAAAAGCTCTAAGATCTCCTCATTCTTAGAGCAGCCTTCTTCCAAGTTCAGATTAAGTTAGTAAA

a
s	mr.mrrefChr3	60799	83	+	181019	GATGGAACAGTTTCCTGCCCCAAAAGTTCAACCACTTGGCCGGCATTACCACAACCAATCAGCACTACTAATAGAACTGTTAG
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a
s	mr.mrrefChr3	60882	5	+	181019	TGTTA
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	61022	161	+	181019	ATCCATTGTTTCACAGGGCAGTATAAAGGGGAAGCAATTGATTGAGACTGTGGAACACAGTGTCTTAGTACGAAATAAAAGATTGACACTTTCAGGAACTCTAATTACAATGCATTTATATGGGACCCTTTAGAATGTAGCTTTGAGTAACCTAGGACAGG
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a
s	mr.mrrefChr3	61183	97	+	181019	TCTGCAAGTTACTGGGATTGCTTTACTGTCCCTCAAGGTTCCTAATCTTGACTTTACAATTAACAAGTGTGGTCCTTGGAAAATGCGTTTCCTTCAC
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a
s	mr.mrrefChr3	61280	130	+	181019	GTTTTTACTACAGGAAAACTTTAGCAATGTTCCTGGTACTCAGGACAGGTTATATCACAACAGGGTTACTGTTCTAGTTAGAGTATTCTGACACTGTTGATACCCTGGCCATCAATTGTGCTCAATCTAT
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a
s	mr.mrrefChr3	61410	31	+	181019	CCAGCCATCATCCCTCGGAGGATACCTAGCC
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a
s	mr.mrrefChr3	61441	45	+	181019	CAGGCCTATTAGGACTACAGATTGTGATCCAATCTTACACACTCC
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a
s	mr.mrrefChr3	61486	165	+	181019	ATTTAGCTTTCATACTGACCTGCTATCCATACATAGGCCTAAGGCATCAGGTAAGTCCAGCAACCCCCATTACTGCCAGGGTGGATGGTTCAATAACATATAGAACAGGACAGCTTATAGTAATGGGGATGCTAAAAAAAATCTAAGGACAGTCCTGAGCCAGGA
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a
s	mr.mrrefChr3	61651	299	+	181019	CATTTTAATTCATTTCAGGGCGTCAAGTTACAGGAGGCACAGTAATCTCTGGTGCCAGAGAAGTAATCTGCCACCTAAGTAGACTTGAGGTAGACTTCAAGGACATGTGTTACCAGACTGTATACGATTAGCCACTATCCACGACCAATACTTTCTAGCAGTACCAGAAAGAGGGATTTTAAAGGATTGAGGAATACAGATAGCACATTAATTCCTCAATCTATTATGGGAAATAAAACCCAGTTGATGATAGAGAGTTGTAGGGCTCACCTCAGGGTGATTCAGGTATATAAGCAGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	509206	299	+	636262	CATTTTAATTCATTTCAGGGCGTCAAGTTATAGGAGGCACAGTAATCTCTGGACTCAGAGAAGTAATCTGCCACCCAAGTAGACTTGAGGTAGACTTCAAGGACATGTGGTACCAGACTGTATAAGGTTAGCCACTATCCCCGACCAATACTTTCTAGCATTACCAGAAAGAGGGATTTTAAAGGATTGAGGGGTACAGATAGCACATTAATTCCTCAATCTATTATGGGAAATAAAACCCAGTTGATGATGGAGAGTTGTAGGGCTCACCTCAGGGTGATTCAGGGATATAAGCAGCC
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a
s	mr.mrrefChr3	61950	22	+	181019	TACATAAACATATAACTTCTTG
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a
s	mr.mrrefChr3	61972	84	+	181019	GTCTTATGCAATAGCTGAAAAATAAAAAATTACTGGTGACAACCAGTTATGAGATGCTTCTTAGCTCTGGGCATTATGGTGTAC
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a
s	mr.mrrefChr3	62056	54	+	181019	CCAGTTTGTGAAGAAGGATGTAACAGCTTCATATTTGTCCAATTCTTACCAGAC
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a
s	mr.mrrefChr3	62110	276	+	181019	AAGTAGAGAGTGACATACTTGGCAATTCCGGATCTACCTAGCCGGCTGGACACACCTTGAAAGACAAATACCTAGCTCAGTGATTGAATATGATTGATAATTGTTCTACCTCAATGCTGAATGTACTGGTCTCTGTGTTAATGTGACTAGACATACAGATACATGGATGAACACAGAAAAATAAATTTGGTCATCCAAAGATGTATGGCTTTTAGAAAAAAACTAGTGGAAAGAAATCCAGATAAGGTTCCTGGGTCCACACCTTCCATGTTTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	509666	276	+	636262	AAGTAGAGAGAGTAATACTTGGCTATTTCGGATCTACCTAGCCGGGTTGACACGCCTCGAAAGACAAATACCTAGATCAGTGATTGAATATGATTGGAAATTGTTCTACTTCAATGCTGAATGTACTGGTCCCTGTGTTAATGTGACTAGACATACAGAGTCATGGATGAAAACAGAAAAGTAAATTTGGTCATGCAAAGATGTATGGCTTTTAGAAGAAAACTAGTGGTAAGAAATCCAGATAAGGTTTCTGGTTCCACACCTTCCATGTTTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	520966	272	+	647215	AACTAGAGAATGACATACTTGGCAATCCCTGACCTACCTAGCCAGCTGGACACACTTTGAAAGACCAATACTTAGCTCAGTGATTGAATATGATTGATAATCGTACTACCTAAAGCCTGGATGTACTGGTCTGTGTACTAATGTGACTAGACATACAGATACATGGCTGAACACAGAAAAATAAATTTGGTCATCCAAATGTGTATGGCTTTTAGAAAAAGACTAGCGGAA----GTCCAGATAAGGTTCCTGGGTCCACACCTTCCATGCTTGCA

a
s	mr.mrrefChr3	62386	7	+	181019	TGAGTTA
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a
s	mr.mrrefChr3	62393	3	+	181019	TAC
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a
s	mr.mrrefChr3	62396	13	+	181019	AAGACATTTCTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	509952	13	+	636262	AAGACATTTCTAC
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a
s	mr.mrrefChr3	62409	2	+	181019	TT
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a
s	mr.mrrefChr3	62411	7	+	181019	TTAATAG
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a
s	mr.mrrefChr3	62418	4	+	181019	GCCA
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a
s	mr.mrrefChr3	62422	146	+	181019	GTTGGGGATTAATGGCCTGCCAAATTGGTTTTATAGCATGTGTTACAGCATGGCTGTAGGAGTCCTAGTGTGCAGTGGATCTCTGTTTCTAAACTTGATGATATAATTATCATCCTTGTTTCATATATCTGGAACATGCCTGAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	509978	143	+	636262	GTTGGTGATTAGTGGCCTGCCATATTGGTTTTATAGCATGTATTACAGCATGGCTGTAGGAGTCCTAGTGCGCAGTGGATCTCTGTTTCTAAACTTGATGATATAAGTATCATCCCTGTTTCAT---CCTGGAACATGCCTGAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	370180	146	-	647215	GTTGGGAATATAAAGCCTACTGAGTAAGCCTTGCTACATGTGTTACAGTGTGGTTGTAAGAGTCTTGGTGTGCAATTTGCTCCTCCTTCTACATTTGATGCTGGAATTATCCTTCTTGCTCCATGTATGAATGATAGGGCTGACCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	521274	146	+	647215	GTTGGGGATTAATGGCCTGCCAAATTGGTTTTATAGCATGTCTCGCAGCATGGCTGCAGGACTCCTAGTGTCCGGTGGATCTCTGTTTCTAAACTTGATGATATAAATATCATCCTTGTTTCATAATTCTGGAACATGCCTCAGCT

a
s	mr.mrrefChr3	62568	31	+	181019	GGGTGGCGCATATATCATTCTTTTTTTGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	510121	31	+	636262	GGGTGGCGCATATACCATTCTTTTTTTGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	370326	31	-	647215	TGGTGGTACGGTTATTCTCCATGCTCTGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	521421	31	+	647215	GGGTGGCGCATGTATCATTCTTTTTTTGGAT

a
s	mr.mrrefChr3	62599	2	+	181019	AC
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a
s	mr.mrrefChr3	62601	37	+	181019	ACATATACAAGTCTGAGGTCAATGCATCATAAGAAAC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	521454	35	+	647215	ACATATACAAATCTGAGGTCA--GCATCATAAGAAAC

a
s	mr.mrrefChr3	62638	14	+	181019	ACTTTATGTCACAA
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a
s	mr.mrrefChr3	62652	247	+	181019	GAGGTGATTCTTAATTGCAGTATTCGGGCAAAAAGGGTTTATGTGTAAGACTGTTTCTGCAAGATATAATTGTTCGCTTGCCAGAAAATGTCATGGATTGTTTGGCATAACCTCACAAAATCAGCCATCATTTCCTTAGAAGTGGGTTTGATAATTCATATGTAGACATACAGGAAGTGCTTACATTCACTCTTGTCTAGTCTTCAGTCTCTTGTCATCTTCCTGCAATCCCTTATCCGCCTGCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	510203	232	+	636262	GAAGTGATTTTTGATTGCAGTATTCGGGCAACAAGGGTTCATGTGTAAGACTGTTTCTGCAAGACATAATTGTTCGCATGCCAGAAAATGTCATGGATTGTTTGGCATAACCTCACAAAAGCAGCCATCATTTCCTTAGAAGTGGGTTTGATAATTCATATGTAGACATAA---------------TCACTCTCGTCTAGTCTTCAATCTCTTGTCATCTACCTGCAATCCCTTATCCGTATGCACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	521541	246	+	647215	GGGGTGATTCTCAATTGCAGCATTCGGGCAAAAAGGGTTTATGTGTAAGGCTGTTTCTGCAAGATCTAATTGTTTGCTTGCCAGAAAAAGTCATGGATTGTTTGGCATAGCTTCACCAAATGGGCCATC-TTTCCTTAGAAGTGTTTTTGATAATTCGTATGTAGACATACAGGAAGTGCTTACATTCACTCTTGTCTAGTTTCCAGTCTCTTGTGATCTTCCTGCAATCCCTTATCCTCCCGCGCA

a
s	mr.mrrefChr3	62899	35	+	181019	CACTTAACTTAAGTCCCTGTGTGACGCTAAGGACA
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a
s	mr.mrrefChr3	62934	171	+	181019	TTTTGTTATCAACACAGTAGATAGATAGATAAATCAATTTAATATGTAGCTTCTCAGTCTATACAGTTGATGGTCCTGCAAGGGGCATGCCTCACTTAGCTGGAGGTACTCTGATACACACTTGAAGACCTAAAGTCAAGCATAGAGAGTGAATATCTAGCTGATCCCAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	510470	167	+	636262	TTTTGCTATCAGCACAGT----AGATAGATAAATCAATTTAGTATGTAGCTTTACAGTCTATACAGTTGATGGTCCTGCAAGGGGCATGCCTCACTTAGCTGGAGGTACTCTGATACACACTTGAAGACCTAAAGTCAAGCATAGAGAGTGAATATCTAGCTGATCCCAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	521838	171	+	647215	TATTGTTATCAACACAGTAGATAGATAGATAAATCACTTTAATATGTAGCTCCTCAGTCTATACGGTTGATGGTACTGCAAAGAGCATGTCTTACTAAGCTGGAGGTACTCTGACATGCACTTGAAGACATAAAGTCAAACATAGAGAGTTAAGGTCTGGCTGAACTCAAT

a
s	mr.mrrefChr3	63105	46	+	181019	AGCTTATCTACCAACACAGTGCAGTATAATACTTGGGTTTCCAGCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	510637	46	+	636262	AGCTTATCTACCAACACAGTGCAGTATAATACTTGGGTTTCCAGCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	522020	46	+	647215	AGCTTATCTGTCAACACAGTGCTACATAATACTTGGACTTCCAGCA

a
s	mr.mrrefChr3	63151	20	+	181019	CAAAAGATGCAACTTGCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	510683	20	+	636262	CAAAAGATGCAACTTGCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	522067	20	+	647215	CAATAGATGAAACTTGCGCA

a
s	mr.mrrefChr3	63171	27	+	181019	AATCAAAGGCTGTCATGTATACACTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	510704	27	+	636262	AATCAAAGGCTGTCATGTATACACTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	522087	27	+	647215	GATCAAGAGCTGTCGTGTATACACTGC

a
s	mr.mrrefChr3	63198	108	+	181019	TGAAGTGTGGAACTGTTCTTTGGTGTTGCAAAATGGTGTTTGTCCCCAAAGATGGGCCCATTGTTGCCAATCCATGGTGAGAGCCTCAGTAAGTTGCACGTCTCTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	510736	108	+	636262	TGAAGTGTGGAACTGTTCTTTGGTGTTGCAAAATGGTGTTTGTCCCCAAAGATGGGCCCATTGTTGCCAATCCATGGTGAGAGCCTCAGTAAGTTGCACGTCTCTTTG
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a
s	mr.mrrefChr3	63306	18	+	181019	TATTCGATCACAAGTTCA
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a
s	mr.mrrefChr3	63324	43	+	181019	ATACTCCAATTAGCATTATACACTATCTAGGGATAGATACATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	510879	42	+	636262	ATACTCCAATTAGCATTCTACACT-TCTAGGGATAGATACATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	522240	43	+	647215	ATAATCCAATTAGAATTATACACTATCCAGGGAAGGATACATA

a
s	mr.mrrefChr3	63367	37	+	181019	CCAAGCTTCTTCCATTAACAACTGATAAACATTCCAA
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	63446	81	+	181019	TTGTAGGACAGTATAGTAAACACTAAAAAGCTCCCACAAAGGATGCCAATCCTCTCGTTGGTTGGTCTGGCTAAGAAAGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	511002	81	+	636262	TTGTAGGACAGTATAGTAAACACTAAAAAGCTCCCACAAAGGATGCCAATCCTCTCGTTGGTTGGTCTGGCTAAGAAAGTG
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a
s	mr.mrrefChr3	63527	58	+	181019	GTTGTTCTTGTACCCCATCATATTTTTATGATTTTGTTAACTATGAACATACTTAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	511089	57	+	636262	GTTGTTCTTGTACCCCATCATA-TTTTATGAGTTTGTTGACCATGACCATACTTAAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	522443	58	+	647215	GGTGTTCTAGTACCCTATCACATTTTTACAATTTTGTTAACTATGAACATACTTAAGA

a
s	mr.mrrefChr3	63585	145	+	181019	AAGAATCAGCAAGGATGTGCAGAAAAAATACCTAGTAATTGGCGAATTTTGTTCACAATCTATTTACAAGTCATTAATTGGATGTTTTATTATTCTATTAACCTGTTATCTTGCCTCTGTTGTAAGGATACTCATAGGAACCCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	511146	135	+	636262	-------AGCAAGGATGTGCATAAAAAATACCTATTCGTTGGCGAATTCTGTTTAAAATCCATTTACAAGCCATTAATTGGATGTTTTG-TACTCTATTAACCTGTTATCTTGCCTCTGTTGGAAGGATA--CATAGGAACCCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	522504	143	+	647215	AAGAATCAGTAAGGATGTGCAGAAAAAATATCTAGTAATTGGCCAATTTTGTTCCCAAACTATTT-CAAGTCATTAATTGGATGTTTTATTATTCTACTAACCTGTTATCTCATCTCT-TTGTGAGGATACTCCTAGGACCCCCC

a
s	mr.mrrefChr3	63730	994	+	181019	CAGACTAGGAGCTATAAAATTTGAAATAAGCTGGCAAAAAGATACACCTCATGCTGTTTATAGAGAAGAATAACAATGAATAACATGAAGTCTTTCTAACATAGACTTGTAAGTTTATTGTATCGGATAACATGTTTTTTCTTCATTCCCTTGATCACCAACCCCTTCCTTCCTTTTTTGTATCAGACCAAAAGGACATACCACACCTCCCCACACCTTCAGGTTGTTTTTCTATTATGGTCATGTATCTATCATTGGGACAACATCTGAGGAGTTTCATAAGCTAACCCCTTGGACATGGATGTTCCAGCTGGAATCCATGAACCTAATTCACCAGAGCCAACATGGTTGCTAACTTTTGCGCTTGGAATGCTTGCTCAAATTTACAGCCATATGATAGTGGGATACACCCTTTTGGATGCATATATTATGGCTGCAAGATAAGTGGAACTTAATCTCCGGTAACTCTGGCAGTCTCTGAAATAATTGTGATGGAAAAGTGCAACCCACATTGTGTCTGGTGGCATAAAATGTGACTAACACACCAGAGAATGGGCCTTTAGCAAGAAAAAGCATTTTGACAAATAAATTACACACAATTCCTATTGTACAGACGGACCATGTACAATATTCTAGGATTTCTTTTGTCCCTTAATGTCTCTCCACGTCTTGCCCTAGCGATCCCCACTGCTAGCAGATCACCATCTGGGGGGTAACAAACATAAAGGATCTGCTGGTGCAATCACAAATTTTTTCGTTTGTTAGTGTTTGAACATAGGGGTAATGGTGCTTCTGCTTGTCATTCAATTCTTTCTGTCATGATCTTATTGTGAAATCACACTCTCTGGTTGATATCAAGTCCCAACTTTAGACACTGGGCTGTGGAGAACATATAACGTGCATTCCTGGTTCTACCCTGCTATCTTTTGTATGATTCCAGCCTGGCCATAGGCTTATGTtgctgacatcactaccttatactgcattgtTGCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	511281	934	+	636262	CAGACTAGGAGCTATAAAATTCGAAATAAGCTGGCAAAAAGATACACCTCATGCTGTTCATAGAGAAGAATAACAATGAAGAACATGAAGTCTTCCTAACATAGACTTGTAAGTTTATTGTATTGGAAAACATGTTTTTTCTTTATTCCTTTGATCACGGATCCCTTCCTTCCTTTTTTGTATCCGACCAAAAGGACATACCACACCTCCCGACACCTTCAGGTAGTTCTTCTACTATGGGCATATATCTATCATTGGGACAACATCTGAGAATTTTGGTAAGCTAACCCCTTGGACATGGATGTTCCAGCAGGAATTCATGGACCCAATTTGCCGGAGCCACCATGGTTGCTAACTTTTTTGCTTGGAATGCTTGCTCAAATTTACAGCTATATGATAGTGGG------------------ATATATTATAGCTGCCAGATAGGTGGAACTTAATACCCGGTAACTCTGGCA------TAAATAATTGTGATGAAAAAGTGCAACCCACATTGTGTCTGGTGACATAAAATGTGAC-TAAACACCAGAGAATGGGCCTTTAGCAATAAAAAGCATTTTGACAAATAAATTACACACAATTCCTATTGTACAGCTGGACTATGTACAATATTTTTGGATTCATTTTGTTCCCTCACAGTTCTCCATGACTTGCCCCAGCGATCTCTACTGCTGGCAGATCACCATCTGGGGGGTGACATACATAAAGGATCTGCTAGTGCAATCACAAGTATTGTGATTTGTTAGTGTTTGAACGTAGGGCTAATGGTGCTTCTGCTTGTGATTCAATTCTTACTGTCATGATCTTATTGTGAAATCACACTCTCTGGTTGATATCAAGTCCCAACTTTAGACACTGGGCTGTGGAGAACATATAACGTGCATTCCTGGTTCTAACCTGCTATCTTTTGTATGATTCAAGCCTGGCCATAGGCTTATGT-----------------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	522649	974	+	647215	CAGACTAGGAGCCTTAAAATTTGAAATAAGCTGTCAAAAAGATACACCTCATGCTGTTT-----GAAGAATAACAATGAGTAACATGAAATCTCTCTAACATAGACTTGTAAGTGTATTGTATCGGATAACATGTTTTTTCTTCATTCCCTTGATCACCAACCCCTTCCTTCCTTTTTTGTATCAGAG----------TACCACACCTCCCCACACCTTCAGGTTGTTTTTCTATTACGGTCATGTATCAATCATTGGGACAACATCTGA-GAGTTTCATAAGCTAACTCGTAGGACAAGGATGTTCCAGCTGGAATCCATGAACCTGATTCACCAGAGCCAACATGGTTGCTAAC--TTGCACTTGGAATGCTTGATCAAATTTACAGCCTTATGATAGTGGGATACACCCTTTTGGATGCATATACTATGGCTGCAAGATAAGTGGAACTAAATCTCCAGTAACTCTGGCAGTCTCTGAAATAATTGTGATGGTAAAGTGCAAGCTACATTGTGTCTGGTGGCATAGAATGTGACTAACACTCCAGAGAATGGGCCTTTAGCAAGAATAAGCATTTTAACAAATAAATTACACACAATTCCCATTGTACAGACGGACCATGTACAATATTCTAGGATTTCTTTTGTCCCTTAATGTCTCTCCACCTCTTGTCCTAGCAA--CCCACTGCTAGCAGATCATCATCTGGGGGGTAACAAACATCAAGGATCTGCTGGTGCAATCACAAATTTTTTCGTTTGGTAGTGTTTGAACATAGGGGTAATGGTGCATCTACTTGTCATTCAATTCTTTCTGTCAAGATCTTACTGTGAAATTGCACTCTGTGGTTGAAATCAACTCCCAACTTTAGACGCTGGGCTGTGGAGAACATATGATGTGCATGCCTGGTTATACCCTCCTATCTTTTGTATGATTCCAGCCCAGCCGTAGACTTATGTTGCTGACATCACTACCTTATACTGCATTGTTGCAG

a
s	mr.mrrefChr3	64724	45	+	181019	CTCACCTTatctttgaaCTCCTTATCACtAGCTgatctggaagtc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	512215	28	+	636262	-----------------CTTATTATCACTAGCTgatctggaagtc
s	simRat_chr6.simRat.chr6	523624	44	+	647215	CTCACCTTATCTTTGAACGCCTTATCAC-AGCTGATGTGGAAGTC

a
s	mr.mrrefChr3	64769	502	+	181019	tcttaaaaattgggaagccaagacctattgagctgtactgtgtcatagtaaccaaactagaaaagggatatggaatctaGGTCGACAGTATTGAATCACAGACTCTCTACAATTGATTGTCACTGTTCAATCTAACTATTTTTGGGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTTCAAGTGGAGTGGCTACTGCAGTAGGCTTGTCTATAGCAAACCTAAACAAGTTTCTGCCTAATGTATCGGAACACTAATACCTCTATAACACTAAACTAAGATCAAGGTTCACTTGCTCGGCCTTTTTATTGGCCTTTAAACAATATTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCAACATAACTAGGAGCATCAAATAACGGAATTGTCAAAAGGTCCTTTTAGTATGTAATGCATTCTAGAATTTTTGGGACTAGGAGTAAACATGCCCTAGAGTATCCCTCCAGGTTTATACAAAATGTGCTTAGGGTAGCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	512244	476	+	636262	tcttaaaactgggcaagccaagacctattgagctgcactgtgtcatagtaaccaaactagaaaagggatatggattctagGTAGACAGTATTGAATCATAGACT---TACAATTTATTATCGCTGT------------------GGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTTCAAGTGGAGTGGCTATTGCTGTAGG-TTGGCTCTAGCAAACCTAAACAAGTTTCTCCCTAATGTATCAGAACACTAATACCTCTATAACACTAAACTAAGATCAAGGTTCACTTGCTCGGCCTTTTTATTGGCCTTTAAACAATACTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCAACACAACTAGGCACATCAAATAACGGAATTGTGGAAAGGTCCTTTTAGTATGTAATGCAGTCTAGAAATTTTGGGACTAGGAGTAAACATGCCCTAGAGTATCCCTT---ATTCATCCAAAATGT-CTTAGGGTAGCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	523668	502	+	647215	TCTTAAAAATTGGGAAACCAAgacctattgagctgtgctgtgccatagtaaccaaattagaaaagggatatggaatctaTGTCGACTGTATTGAATGACTGACTCTCTACTATTGATTGTCACTGTTCAATCTAACTATTTTTGGGGATGTCTGATGAGATCAGATAACAACTTCCCAGTGAAGCGGCTACTGCAGTAGGCTTGTATATAGTAAACCTAAACTAGTTTCTGCCTAATGAATGGGTACACTAATACCTCCATAACACTAAACTAAGATCTAGGTTCACTTTCTTGGCCTTTTTATTGGCCCTTAAACAATGTTAAGTCTATCAAGTGTGAAGTATTATTCCCCTGTGGACTTCGACATAATTAGGAGCATCAAATAACTGTGTTGCCAAAAGGTCCTTTTATTATGTAAACCATCCTAGAATTTTTGGGACTAGGAATAAACATGCCCTAGAGTAACCCCCCAGGTATGTACAAAATGTGCTTAGGGTAGCCC

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	512721	167	+	636262	TGTACACCCCGAATAAGTGATTTGTGTACTTCAAATAACCCCCATGAGCGTTGAGATTCCCCATACATGTCTCTTGTCTAGAGTTAATAATTGACTGTTTTGATTGCCAGAACTTCTGGTCTAGACAGGAACAGTGTCGGCTATAATAGTTAACTGTCAAGATAGCA
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a
s	mr.mrrefChr3	65438	73	+	181019	TGTTAAATTCACATTCTTGTTATGCATAATTGCACCCAAATGTAAAAATTGAGTATAGCTGATAGCAAACTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	512888	73	+	636262	TGTCAAATTCACATTTTTGCTATGCATAATTGGACTCAAATGTAAAAGGTGGGTATAGCTGATAGCAAACTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	524334	71	+	647215	TGTTAAATTCACAACCTTGTTATGCATAATGGCACCCAAATCTAAAAATAGAGTATA--TGATAGCAAACTTG

a
s	mr.mrrefChr3	65511	146	+	181019	AACATTAGATTTTACATTCTACCCTACTTTCAAATAGGAAGGTATGTTAAATGGCAGTGACTAAGACCCAGTATAAGTAGTAAGAGCAGCCTAACCATGATGTAGATTCTTAAATGCAATGTGGTGAATATGACAACAGTATTGAT
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	65726	129	+	181019	GAAGAGGATAAGGAGCGGGTTTTCTGCTTAAAGAGAACCTGAGAATCAAGGGAATCAGGTAATAAGAAAAGTCATCTACTCTGAGCCAGTACAATGCTAATTTGAAGGAGAACCTATACTTGATATGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	513176	65	+	636262	GAAGAGGATAAGGAGCGAGTTTTCTGATTAAAG----------------------------------------------------------------TAACTTGAAGGAGAACCTATACTTGATATGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	524626	129	+	647215	GAAGAGGATAAGGAGCGGGTTTTCTGCTTAAAGAGAACCTGAGAATCAAGGGAATCAGGTAATAAGAAAAGTCATCTACTCTGAGCCAGTACAATGCAAATTTTAAGGAGAACCTATACTCGATATGCT

a
s	mr.mrrefChr3	65855	23	+	181019	TAATTGGTAACTAAGTCACAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	513241	23	+	636262	TAATTGGTAACTAAGTCATAAAT
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a
s	mr.mrrefChr3	65878	156	+	181019	AAGTGAATATTACCGATGCATGCTGAGATGGACAAGCAGTTAGATACCATTATGGAATCCAAGGTAGGGGTAGAAAGATAGGTGGTGGAATTTATGATCTATAAAAAACTGGGATAACACCAGCATTTAAGTACTTAATTTACCCCTCCAAAGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	513276	150	+	636262	AAGTGAATATTACCCATGCATGCTGAGATGGGCAAGCAGTTAGATACCATTATGCAATCTAAGGTAGGGGTACAAAGATAGGTAGTGGAATTTATGATCTATAGCAATAT------ACACCAGCATTTGAGTACTTAATTTCCCCCTCCAAAGAAT
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a
s	mr.mrrefChr3	66034	201	+	181019	CCAAAGAATTAGAGACTGTAGAGTACAGTTTTAAGGATGCTGAAAGTAATAAGCAAAGGAAAGTGAACCTGGATATAGGGGCTGGGTTGATCTAGGGTAAATATCTGATGAAAACAGTAGTTAGGTGCTAACGTGTGTTACTGTGGACCAAACCAGGGCACTATGACCTGAGCTACCATACTAAGTTCCTCAAAGAGGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	513437	187	+	636262	CCAAAGAATTAGAGACTGTTGAGTACAGTGTTAAGGATGCTGAAAGTAATTAGCAAAGGAAAGTGAACCTGGATATAGGGGCTGGGTTGATTTATGGTAAATATCTGATGAAAACAGTAGTTAGGTGCTAACGTGTGTTACTGTGGACCAAACCAGGGCACTATGACCTGAGCTCCCAGACTAAGTT--------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	524924	192	+	647215	CCAAAGAATTAGATGCTGTAGAATACAGTTTTAAGGGTGCTGAAAGTAATAAGCAAAGGAAAGTGAACCTGGATATAGGTGCTGGGTCGATCTAGGGTAAATATCTGATGAAAACAGTAGTTAGGTGCAAA--------ATTGTGGACTGAACTAGGGCACTAC-ACCTGAGCTACCATACTAAGTTCCTCAAAGAGGCTT

a
s	mr.mrrefChr3	66235	32	+	181019	GAAGAGGCTTTTATCCACAAAGAGGCTTGTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	525128	32	+	647215	GAAGAGGCTTTTATCCACAAAGAGGCTTGTTC

a
s	mr.mrrefChr3	66267	19	+	181019	TGGACTAGATGACTCTCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	525236	19	+	647215	TGGACTAGATGACTCTCTT

a
s	mr.mrrefChr3	66286	147	+	181019	GGATGATGCGTTCTGTATAGTGAATGTGACTATTCAGGGTGGGGAGGGTCAAAATGGACTAGATACAACCTTAACTTTAAATATGAACTGTCCTTGAGTGTATTTGAAACGTTTCATTCTCTCAGTGCCCTAATGAACAGAAAATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	513624	124	+	636262	-----------------------ACATGACTATTCAGGGTGGGGAAGGTCAAAATGGACTAGATGTAACCTTAACTTTAAATATGAACTGTCCTTGAGTGTATTTGAAACGTTTCATTCTCTCAGTGCCCTAATGAACAGAAAATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	525265	147	+	647215	GGATGATGCGTTCTGTATAGTGAATGTGACTATTCAGGGTGGGGAGGGTCAAAATGGACTAGATACAACCTTAACTTTAAATATGAATTGTCCTTGAGTGCATTTGAAACACTTCATTCTGTCAGTGCTCTACCGAACAGAAAATCA

a
s	mr.mrrefChr3	66433	17	+	181019	CTATCATGTGGAATAAA
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a
s	mr.mrrefChr3	66450	65	+	181019	TCCCCACAAGGCAGCGTGTATGGCTGTGTATGCCACCACTTGCTCAGAAATGGTGTCTTTATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	513767	65	+	636262	TCCCCACAAGGCAGCATGTATGCCTGTGTATGCCACCACTTGCTCAGAAATGGTGTCTTTATCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	525429	65	+	647215	TTCCTGCAAGGCAATGTGTATGGCTGTGTATGTCCCCACTTGCTGAGAAGTGGTGTCTTTAGCAA

a
s	mr.mrrefChr3	66515	197	+	181019	CCCGACTGTTTGCTATGTAACTCCCTGTGGCCCTGCTTTGTGTATAAACACTCAATATCCTTGGTATTCTGTAGTATGTCTTGGTTCATTTCTTCGAATAGCTGCTCTGTTATATACCATCTCCTTGTGTAGATAAAATCTAATATGAATATAGTAGCATCTATGTGTTGTGCATATTATGTTGACTATATGTGTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	513834	176	+	636262	CCCCACTGATTGCTATGTAATT-----------TGCTTTGTGTATAAACACTCAATATCCTTGGCATTCTGTAGTATGTCTTGGTTCATTTCTTCGAATAGCTGCTCTGTTATATACCATCTCA----------AATATCTAATATGAATATAGTAGCATCTATGTGTTGTGCATATTATGTTGACTGTATGTATTA
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a
s	mr.mrrefChr3	66712	128	+	181019	ACATGCCCAGCCCATGTCCCAACTAGGATCAAAGGATGGAGCCTTAATGAAAGGACCGCTAGAGCCTTAATAAAGCCTTATTTGATAGAATAGGTATACCTGGCTTCCTATTTGCAGATAAATGAGTG
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a
s	mr.mrrefChr3	66840	132	+	181019	ATGGGTCAACAGCCCAGAGCCCTAGAGGTGATTGGCAGGTAAGAAAGGGGTATGATTAAAGACTTGTTCATTGATTTTGACTTGAGAATAAACACTCTAGGCAGACTTATAAATTGATATTTAGTCTTACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	514138	127	+	636262	ATGGATCAACACCCCAGAGCCCTAGA--CGATTAGCAGGTTAAAAAGGGGTATGATTAAAGACTTGTTCATTGATTTTGAC--GAGAAT-AACACTCTAGGCAGACTTATAAATTGATACTTATTCTCACTA
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a
s	mr.mrrefChr3	66972	103	+	181019	TCAGGGTGGCTGTGTGAGTCATGCCATTGCCACTATTATCTCTCCTAGAGACTCAACATCATCACATCAGATTTTTCCAGTGCTTTCTTCTTGATGTGTGTGT
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a
s	mr.mrrefChr3	67075	16	+	181019	GAAAGTAACTGATAAG
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a
s	mr.mrrefChr3	67091	14	+	181019	CACCAAGCCTACAG
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a
s	mr.mrrefChr3	67105	294	+	181019	GGGACACCATCACTTGATTTTATGACACTAACTGCAGTTGCAGCTAATTTGTTGATATAATGATTTGCCAATCTATCTAAAGAGTGTTAAGATACATCTAGGGAGTACACCCACAAGCATTCTTACATCTTGCTGTGGGAACTAATGAAGGAATACACTGAATAGAAGGTTACACGCAGTGGCTCAATACCGAAGGATATTAACAGTAGGAGGCATATGGCACTAAGCTTCAACATGTGAAAGTCAACTGTCATATGAGGAATCTACCCTCTGGCATAGTGTACACTGTGTAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	121701	293	-	636262	GGGACACCATCACTTGATTTTATGACACTAACTGCAGTTGCAGCTAATTTGTTGATATAATGATTTGCCAATCTATCTAAAGAGTGTTAAGATACATCTAGGGAGTACACCCACAAGCTTTCTTACATCTTGCTTTGGTAAGTAATGTAGG-ATACTCTGGATAGAAGGTCACACGCAGTGGCTCAATACCGAAGGATATTAACAGTAGGAGGTCTACGGCACTAAACTTCAGAATGTCAAAGTCAATTGTCATATGAGGAATATACCCTCTGTCATAGTGTACACCATGTACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	526073	279	+	647215	GGGACACTGTCATTTGATTTTCTGATACTAACTGCAGTTGCAGCTAATTTGCTGATATAAGATGTTGCCAACCCATCTAAAGAGTATTAATATACATATAGGGAGTATACCTGAAAACATTCTTACATCTTGCTGTGGGAACTAATGAAGGAATACACTGAATAGATGGTTACATGCAAGGTCTCA---------------AACAGTAGGAGGCATATAGCACTAAGCTTCAACATGTGAAAGTCAACTGTCATATGAGGAATCCACCCTCTGGCATAGCGTACACTGTATAGC

a
s	mr.mrrefChr3	67399	80	+	181019	CAATGCAACTAAGTCCTGGTGACTACACAGGATAGTAATATAGATCTAGGGTGTTCATACTCTTGCCTTCCAAGATTGAC
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a
s	mr.mrrefChr3	67479	35	+	181019	TATCACCCAGGGAAACTCTACCCAGTTACAACTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	514793	35	+	636262	TATCACCCAGGGAAACTTTACCCAACTACAACTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	526429	35	+	647215	CATTGCCCAGGGAAACTCTACCCAGTTGCAACTCT

a
s	mr.mrrefChr3	67514	315	+	181019	TGTAATTCAGACAGGCTTGACTCCAGGGTCTAAGCTAACTGCAGAAAGTTAACATGTTTAAACACTTGGGATGATTGCCTAATGTATTTCATGCAGACCATAAAAGAGCATGCTCGCCCTGTGGCATCATCAGAAAGGTTGCCCACTTGCAAGTGTTGCTGCATCAGGTTGGACTAGCACGTTGACATTGTGGTAGGTCAGAAATGCAGCTAGTGCTACATCAGGGCGGACTAGCATGATGACATTGTGGGAAATCAGAAATGCAGCTAGTAACTAATGAGTTGTTTGGGAATACTATCAGGGAGCTTCAAATAG
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	68200	52	+	181019	ATAGCCCTTAGTTGTTTGCCTCATTTAGATTACCTTCAGATCCTGTGGTATC
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a
s	mr.mrrefChr3	68252	12	+	181019	CAAACTATAAAA
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	68314	366	+	181019	TCTACATTAATTATACGATGGTCTTCTTTTAACCAATATCTGTATTCAGACTTTTGTGCCTGTTACTTGAGGATCTAGGAGTGGAATAGGCAGTCATCGCATAAGTGACTTTACGGGTAACTCAAATTTTATCCATAATCCTGTTTCATTGAGAACATTTCTATACCCAAAGCGACTATAATTCAAGAGAACTGAGAAGTTATACTGCTTTTAGACATGTGTAGCACCAAAGCATCCTGTTGTGTTCTTAAGATGGCTGGACTCTTTTTTCTGCTCCTGCTAATTTATACATCAAAAGTACCACAAAGAGTTGGGATCAATTAAGTATTACAGAATCCATTGAGGCTTCAGCACTGTTAACAGCTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	527264	366	+	647215	TCTACACTAATTATATAATAGTCTTCTTTTAACCAATATCTGTATTCGGACTTTTGTGCCTGTTTCTTGAGGATCTAGGAGTGGGGTAGGCAGTCATCACATAAGTGGCCTTACGGATAACTCCCATTTTAGCTTTAATCCAGTTTCATTGAGAACATTTCTATACCCAAAGCGACTATAATTCAAGAGAACTGAGAAGTTACACTGCTTTTAGACATGTCTAGCATCAACACATCATCTTGTGTTCTTAAGATGGCTGGACTGTTTTGCCTGCTCCTGCTAATTTATACATCAAAAGTACCACAAAGAGTTGGGATCAACTAAGTCTTACAGGATCCACTGAGGCTTCAGCATTGTTAACTACTT

a
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a
s	mr.mrrefChr3	68708	14	+	181019	GTAACAGCAGGGTA
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a
s	mr.mrrefChr3	68722	89	+	181019	CATGTTCATTTCGTTAGAGAGGAGTCCATTCAACTGGGTCTAGTTCAAGATTGAGCTGGTAATAACCTCACTCTGCTTTATTGCCCAAA
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a
s	mr.mrrefChr3	68811	79	+	181019	CACTGCTATATACTACCCATAGAAGCTATTTCTCTTTATCATCTTGGCTGACTATCTACTTTCACACTTATAGCCAAGC
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a
s	mr.mrrefChr3	68890	116	+	181019	TCTACTCATCAGAATATTATCCATGTAAATGGGTTATACATCAATTGCCTCACTCTAGATGTTTAGTCACTGTGGGCTACCCCACAGGTTCACACCACGAGACTAGCCAGGTCAGT
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a
s	mr.mrrefChr3	69006	5	+	181019	AATTT
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a
s	mr.mrrefChr3	69011	14	+	181019	AGATAAGCCATCAC
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a
s	mr.mrrefChr3	69025	165	+	181019	CCAGCCTAGTTCACTTGCATTAATGGCTCATTGTTAGTCTTTGAGAGCTGCCACTTTCACTTTTAGAAAGTAGATTTTTTGAGGTGACCATCAGTCAGCTTGGGGCTTAGTGGAACCCTCCTCCCTTTCCTGTGCTTGGATGGTAATTTGAGAGAAGGGAAGCTG
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	69283	35	+	181019	TATAACAGCAAGCATACAAGGTATGGAAAGTTTAA
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a
s	mr.mrrefChr3	69318	104	+	181019	CTAAATTCTTACGATTTCACATGAAATGAAGTCATGCAGCCCACAAAAAATAACTGTAATAACCCTGGTCTGCACATAGGGCTGTCAGAGTACTGCACATGTTC
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	69432	18	+	181019	ACTAGTTCATACAGGGCC
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a
s	mr.mrrefChr3	69450	81	+	181019	CTAACACCATTTGAGCTATGGGGCTAAGAGTTAAGTCCATTGCCTCAGCATATTAACACTTATCTCAGGCTTGGCAGACTG
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a
s	mr.mrrefChr3	69531	149	+	181019	ACTCAGGGTCCATTCTCAGTACCATCAACTATAATATATGAGGCTGTAGTGATCTCTTGGCCTGATAAAACAGCCTGACATATGGACGCCTGCAAAAGGCTAGCAGTGCCTATATTGTAACCATCAGTAGTATGGCATGTGTGTGGTGG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	528507	149	+	647215	ACTCAATGTCCATTCTCAGTACCATTATCTATAATGTAGGAGGCTGTGGTGATCTCTTGGCCTGATAAAACAGCCTGACATATGGACACTTTCAAAAGGCTAGCAATGTCTATATTGTAACCATCAGTCATATGTAAAGTGTGTGGTGA

a
s	mr.mrrefChr3	69680	187	+	181019	AATCTACATTGTTTGGAACTTGATACCATCTTCAGGTTGTCAGGTCTACCACGGTACTGCTCACCTCAATGCTATCAGGATGCCCATTCGTCTGTTTATTATCTTGACATGGATATCCCCTCTTCAGGGAAGTGGAGAATTAGTGACACAGATAGTATAACATTATATATAGTAACCAGGCCGGGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	517064	187	+	636262	AATCTACATTGTTTGGAACTTGATACCATCTTCAGGTTGTCAGGTCTACCACGGTACTGCTCACCTCAATGCTATCAGGATGCCCATTCGTCTGTTTATTATCTTGACATGGATATCCCCTCTTCAGGGAAGTGGAGAATTAGTGACACAGATAGTATAACATTATATATAGTAACCAGGCCGGGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	528656	187	+	647215	GATCTACATTGTAAAGCACTTGATACCATCTCCAGGTTGTCAGGTTGACCACAGTACTGCTGGCCTCATTGTTGTTACCACACCCATGTGTCTGTTTATTATCTTAACATGGATCTCCCATCCTCAGGGAGGAAGAGAGTTAGTGACAGAGATAGCTTATCATCATATGTAGTCACCAGGCTGGTCT

a
s	mr.mrrefChr3	69867	54	+	181019	TCCCCTTATCTATTGGAGATGACTGATTCTTCTGCTGTCTTTCCCTGAAGTTAA
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a
s	mr.mrrefChr3	69921	16	+	181019	CTATAATAAAAGGCAA
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a
s	mr.mrrefChr3	69937	83	+	181019	ACGCACTAGCTTGCCATATGAAGGGGGGCTGACTTTAGATTTGCTGTGCTCGTTAAATGTAATTTGCTATTTCCCCAGTGTAT
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	70024	416	+	181019	ATTGATAGTCCAATGTCTTGTAGCTTAGTTCACtcagtgtattccatacagctcttctaggtcagttcacaagggtgtgacttcatgtcatcctgggggttgtgcaaacaactttggaatttgtatacaaaGATCTAGAATGTGAGACACAGTCTGATTGGTCACATTTCAAGGGCTTATTCCTATCTTGCCAATTGCCTAGTACAATCTTAGCTTAAGGAACGAATATACCATGGCCATGGGATGGGCCCAGTGAGGGGGAGAACATCAGTGTCTAAAATATCCACCTGGCATGTGATGTATACATGAATTGCTAATTCCAAGGTAGGGTGAATTAATTGTTAATGTCAGAGATAAGAGGTCATAAATGATAAACATGACATACATTCTCTCTTGTTTCTTTTGCTGGCAGATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	517782	306	+	636262	ATTGATAGTCCAATGTCTTGTAGCTTAGTTCACtcagtgtattccatacagctcttctaggtcagttcacaagggtgtgacttcatgtcatcctgggggttgtgcaaacaactttggaatttgtatacaaaGATCTAGAATGTGAGACACAGTCTGCATGATCATATATCAAGGGCTTATTCCTATCTTGCCAATTGCCTAGTACAG---TAGCTTAAGGAACGAATATACCATGGACATGTGGTGGGCCCTGTGAGGGGGAGAACATCAATGTCTAAAATATCCACCTGGCTTGTGATGTATACATGA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------
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a
s	mr.mrrefChr3	70440	8	+	181019	CTGTATGA
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a
s	mr.mrrefChr3	70448	16	+	181019	ACGCTCACCCCTCAGT
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a
s	mr.mrrefChr3	70464	24	+	181019	ATTACATATGAGAAGATTTTGACC
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a
s	mr.mrrefChr3	70488	65	+	181019	GACAAAGGGGAGCCCATCTCTCTCACTATCCAAATAAGCTTGTATGCTGTACGTGCTTCCCTCCT
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a
s	mr.mrrefChr3	70553	133	+	181019	AAACTCCACAAGTTATACATGCAAGCACTGAAATCCCATATCCCATACACCAGGCGCTCATTTGGATCTAGCTGGCCATGGAGGTAATCTCAGAGTAGACTACAAGAGTGCTAGATGTAACAGCAACAAATGG
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a
s	mr.mrrefChr3	70686	94	+	181019	TTGTAATAATTAACCATCTTGTATTCTGAAATGTATATTGGACTATATAACTGGTATATTTATTTGTATTTATTCTCACTATCCTTGAAGCAGC
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a
s	mr.mrrefChr3	70780	97	+	181019	TAGATACAAGCCACCTGGCACAGTGCAAGCTTACAAGCCTATAATGTTCGGACTTGGGGATTAATTAACCTGTTACCATCAAACACCCTGTCTTAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	518407	97	+	636262	TAGATACGAGCCACCTGGCACAGTGCAAGCTTATAAGCCTATAATGTTCAGACTTGGGGATTAATTAACCTGTTATCATCAAACACCCTGTGTTAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	529796	97	+	647215	CAGATACAAGCCACCTGGCACAGTGCAATCTTACGAGCCTCTAATGTTCGGGCTTGGGGATTAATTAACCTATTACCGTCAAACACCCTGTCTTAGG

a
s	mr.mrrefChr3	70877	221	+	181019	GATGTGACCTGTCTTAGTTTATAAAATTTTACAGTATTCAAGTGGCTTGTTAAGCCGCCATGATTGTTCCCAATGCTAAGTCACATTGGCCCACCAATGCATATTCTTTATGGTATTGTTCTGTGTGAGATCATTAGAGATGTAAACCCACAACAGAATGGTTGGATTGTCTCTTCAACGATGCTACAAAGGGAAATGGTATGTATGAAATCTGTGAGGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	518529	221	+	636262	GATGTGACCTGTCGTAGTTTATAAAATTTTACAGTATTCAAGTGGCTTGTTAAGCCGTCATGATTCTTCCCATTGTTAAGTCACATTGGCCCACCAATGCACATTCTTTATGGTATTGTTCTGTGTGAGATCACTAGAGATGTAAACCGACAACAGAATGGTTGGATTGTCTCTTCAACGATGCTACAAAGGGATATGGTATGTATGAAATCTGTGAGGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	529893	218	+	647215	GATGTGACCTGTCTTAG---ATAAAATCTCGCAATATTCCAGTGGCTTGTTAAGCCACGATGATTGTTACCAATGCTAAGTCTCGTTTGCCCACCAATCCATATTCTCTATGGTATTGTTCTGTGTAAGATCATTGGAGATGTAAACCCACCACAGAATGGTTGCATGGTCCCTTCAGTGATGCTACCAGGGGAATTGGTATGTATGAAATCTGTGATGCT

a
s	mr.mrrefChr3	71098	43	+	181019	AGCAGGCATACCAAAAGATAGTTAGCTCAATGTGTTGATAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	518750	43	+	636262	AGCAGGCATACCAAAAGATAGTTAGCTCAATGTGTCAAGAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	530114	43	+	647215	AGCAGGCATACTATAAGATAGTTAGCTCAATGTGTTGATAAAT

a
s	mr.mrrefChr3	71141	143	+	181019	AGATAATAGAGGATCACCAACACTTGATTGCGTACACTAATTGATCAACGAATACGAGCTTAAGTCACCTTTATGCTCAACACCTAGATTTCTCAGTATTGTTTGCTAAGAAGAGAGTCAACATGGTATATCCCCACTTACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	518794	139	+	636262	AGATAATAGAGGATCACCAACACTTGATTGCTTATA-TAACTGATCAACGAATACGAGCTTAAGTCACCTTTATGCTCAACACCTAG---CCTCAGTATTGTTTGCTAAGAAGAGAGTCAACATGGTATATCCCCACTTACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	530157	135	+	647215	AGATAATAGATGATCACCAA--------TCCGTACACTAATGGATCAACGAATACGAGTTTGAGTCACGTTTATGCTCAACACCTAGATTTCTCAGTATTGTATGCTAAGAAGAGGGTTTAAAGGGTATATCTCCACTCACCA

a
s	mr.mrrefChr3	71284	173	+	181019	AACCCTCCAGGTTGTTTAAGCTAGGTTGCCAGGGTCAGGAATTCCCTACAGAGTCTTATAAGGACCTGGTATCCGAGTGACTGGGCATCCCAAGTTCATTGTGTTCACCTACTTCAATCCACAGTTTCTAGGCCATAGCAATAACCCACCATGCAATGTTTGCCAAGAAGCCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	518933	156	+	636262	AACCCTCCAGGTTGTTTAAGCTAGGTTGCCAGGGTCAGGAATTCCCTAGAGAGTCTTATAAGGACCTGGCAT-----------------CCAAGTCCATTGTGTTCACCTACTTCAATCCATAGTTTCTAGGCCGTAGCAATAACCCACCATGCAATGTTTGCCGAGAAGCCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	530295	173	+	647215	AACCCTCGAGGTTATCTAAAGTAGGTTGCCAGGGTCAGGAATTCCCTACAGAGTCTCATAAGGATCTGGTATCCGAGTGACTGGGCATCCCAAGTTCATCATGTTCACCTATTTCAATCCACAGTTTCTAGGCTATAGCAACGACCATCCATGCACTGTTTGCTAAGAAGCCG

a
s	mr.mrrefChr3	71457	26	+	181019	GGGCACAAAAATGTATTTGGGATTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	519091	26	+	636262	GGGCACAAAAATGTATTTGGGATTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	530468	26	+	647215	GGGCACAAAAACATAATTGGGATTTG

a
s	mr.mrrefChr3	71483	24	+	181019	CTGGCAAAAAACATGCTCATAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	519117	24	+	636262	CTGGCAAAAAACATGCTCATAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	530499	24	+	647215	CTGGCAAAAAACATGCTCATGACA

a
s	mr.mrrefChr3	71507	17	+	181019	AAAGGCAGGTGACACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	519145	17	+	636262	AAAGGCAGGTGACACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	530523	17	+	647215	AAGGGCAGGTGACACAT

a
s	mr.mrrefChr3	71524	37	+	181019	GTGTTAGAGTATGAAGAGATTTTTTGTTACCCCCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	519175	37	+	636262	GTGTTAGAGTATGAAGAGATTTTTTGTTACCCCCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	530540	21	+	647215	----------------AGATTTTTTGTTAACCCCTTT

a
s	mr.mrrefChr3	71561	60	+	181019	GACGACTTATGCAAATGATAACAGGATTATGTCTGAATTTAAACAAATATGTGACACAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	519213	60	+	636262	GACGACTTATGCAAATGATAACAGGATTATGTCTGAATTTAAACAAATATGTGACACAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	530561	60	+	647215	GACGACTTATGCAAATGATACCAGAATTTTGCCTTAGTCTCAACGAAAGCCACCCACAAC

a
s	mr.mrrefChr3	71621	8	+	181019	ATCGACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	519273	8	+	636262	ATCGACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	530622	8	+	647215	ATAGACAT

a
s	mr.mrrefChr3	71629	54	+	181019	TGTATATTTTTTATTTTTCTGCAGAACTATCTGTTGATGACATAACTGCTTTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	519283	54	+	636262	TGTATATTTTTTATTTTTCAACAGAACTATCTGTTGATGACATAACTGCTTTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	530630	54	+	647215	TGTATATTTTTGATTTTTCTGCAGAACTATCTGTTGATGACATAACTGCTTCAA

a
s	mr.mrrefChr3	71683	9	+	181019	TCAGCCATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	519338	9	+	636262	TCAGCCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	530684	9	+	647215	TCAGTCATA

a
s	mr.mrrefChr3	71692	334	+	181019	TGCACCAGGACCACCATGTACTGTGATTTCTGTATCTCTTCTTCTCACAGAGGAAATTAGTCAGCAATGGAGTAGGGTGATGGTTTTAGTAAGCTAGTCCAAAAAACATTTCCCTGTGAATCAATCTCATGATATGGTAGGTTCTGATTGTGATATTCAGTGACACCAGCCAGATCTTGAGTGTTTAGTTGTCTAGTCGCAGCCAAGGCACCATTGAGTTTGATAGTCAAGTTTTGTAACTGTCCTGGGGTTTAATTGAATCCAGCATAGACTACTATGATGTGGAGAAGTTAGTGAACTTGTATATCTTGCCTAGCCATTATTAGGTAATATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	519347	306	+	636262	TGCACCAGGATCACCATGTACTGTGATTTCTGTATCTCTTCTTCTCACAAAGGAAATTAGTCAACAATGGAGTAGGGTGATGGTTTTAGTAAGCTAGTCCAAAAAACATTTCCCTGTGAATCATTCTCATGATC----------------------------ATGCCAGCCAGATCTAGAGTGTTTAGTTGTCTTGTCGCAGCCAAGGCACCTTTGAGTTTAATAGTCAAGTTTTGTAACTGTCCTGGGGTTTAATTGAATCCAGCATAGACTACTATGATGTGGAGAAGTTAGTGAACTTGTATATCTTGCCTAGCCATTATTAGGTAATATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	530702	334	+	647215	TGCACCAGGACCACCATGTGCTCTGATTTCTGTATCTCTGCTTTGCACAGGGGAAATTAGTCAGCAATGGAGTAGGGTGATGGTTTTAGTAAGCTAGACCAAAAAACATTTCCCTGTGAATCAATCTCGTGATATGGTAGGTTCTGATTGTGATATTCAGTGCCACTAGCGAGATCTTGAGTGGTTGGTTGTCTACTCTTGGCCAAATTACCATTAAGTTTGATAGTAAAGTTTTGTCACTGCCCTGGGGTTTAATTGAACCCTGCATAGGCTACTATGATAAGGAGAAGTTAGTGAACTTGTTCATCTTGCCTAACCATTATTAGGTAATATA

a
s	mr.mrrefChr3	72026	76	+	181019	CCCTTGTGAATCAGGTACAGTGATTTTATGCCGGCCTTGGCACCATCAaatagacatttggctgttagagaagaag
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	519654	76	+	636262	CCCTTGTGAATCAGGTACAGTGATTTTATGCCGGCCTTGGCACCATCAaatagacatttggctgttagagaagaag
s	simRat_chr6.simRat.chr6	531036	76	+	647215	CCCTTATGAATCAGGTATAGTGATTTTATGCTGGCCATTGAACCATCAAATAGACACTCACTTGCCAAAGAAGAAG

a
s	mr.mrrefChr3	72102	76	+	181019	tccacgctccaaagaagcatttacaaaagtgtacattctcgtaactcgtctcaTGAAGCTTGTAAGGGATGTGCGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	519730	76	+	636262	tccacgctccaaagaagcatttacaaaagtgtacattctcgtaactcgtctcaTGAAGCTTGTAAGGGATGTGCGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	531127	76	+	647215	tctacgctccaaagaagcatctacaaaagtgtacatgctcataacccgtcCCATGAGGATTGTAAGGGATGTACGT

a
s	mr.mrrefChr3	72178	65	+	181019	TGGTGAAGCCGCTGATATCTGCACTACAGTCTGCCCACTATAATTTCCCACACCCCACAACTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	519828	65	+	636262	TGGTGAAGCCGCTGATATCTGCACTACAGTCTGCCCACTATAATTTCCCACACCCCACAACTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	531203	65	+	647215	TGGAGAAGCAGTCGATATGTGCACATAGGTCTGCCCACTATAAGTTCCCACACCTTTCTACTAAC

a
s	mr.mrrefChr3	72243	141	+	181019	GTGGGAGCGATACTCTGAAGAGCCATTAGAAGGACTTAAGAAGCCTAATATATGAGAAGGACAGTACAGAAACCTATCATAGTGGAAAAGCACATGAAGAGGACCAGCACTCAAACTCTGAAGAGCCATAACGTGGACAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	519893	141	+	636262	GTGGGAGCGATACTCTGAAGAGCCATTAGAAGGACTTAAGAAGCCTAATATATGAGAAGGACAGTACAGAAACCTATCATAGTGGAAAAGCACATGAAGAGGACCAGCACTCAAACTCTGAAGAGCCATAACGTGGACAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	531269	141	+	647215	GTGGGGGTGTTACTCTGAAGACCCATGAAAAGGACTTAAGAAACCTAAGATATAAGAAGGATGTTTCAGAAGCCTAATGCAGTGGAGAAGCACACGAAGAGGACCAGCAGTGAAACTCTGAAGAGTCATAACACGGACAAT

a
s	mr.mrrefChr3	72384	23	+	181019	CAAGAAACACAATATAGTGGAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520034	23	+	636262	CAAGAAACACAATATAGTGGAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	531453	23	+	647215	CAAGGACAATCATATATTGGGGA

a
s	mr.mrrefChr3	72407	113	+	181019	GAAAGCGGTCATGGTCATAAGTGCCATCTCCAAGTACACCTAATATGGTGAGGGAACAAAAACAGTCAAGTAATCCTCACATGGCATGATGGACAGGAGAATGCAGGTAAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520064	113	+	636262	GAAAGCGGTCATGGTCATAAGTGCCATCTCCAAGTACACCTAATATGGTGAGGGAACAAAAACAGTCAAGTAATCCTCACATGGCATGATGGACAGGAGAATGCAGGTAAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	531476	113	+	647215	GAGAACGGCCATACTCAAAAGTGCCACCTTCAAGTACACCTAATATAGTGAGTGAACAAAAAGAGTCTAGTAAACCTCTCATAGCATGATGGACAAGAGCATTCAAGTAAGAA

a
s	mr.mrrefChr3	72520	49	+	181019	CAAGCAAACCTCATCTGGTATAAAGGAGCATAAGAGATAGATTGTATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520177	49	+	636262	CAAGCAAACCTCATCTGGTATAAAGGAGCATAAGAGATAGATTGTATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	531602	49	+	647215	CAAGTAAACCTCATTCGGTATGAAGGAGCATAAGAAATAGATTGTATTA

a
s	mr.mrrefChr3	72569	12	+	181019	TAGTCAGACTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520226	12	+	636262	TAGTCAGACTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	531654	12	+	647215	TAGTAGGAGTAG

a
s	mr.mrrefChr3	72581	17	+	181019	ATGAAATGCATGTGCGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520238	17	+	636262	ATGAAATGCATGTGCGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	531669	17	+	647215	ATGAAATGCATGTGTGA

a
s	mr.mrrefChr3	72598	39	+	181019	TCAGTTTTTCCATCAACCAGACATCTTACCACTAAATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520256	39	+	636262	TCAGTTTTTTCATCAACAAGACACTTTACCACTAAATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	531686	39	+	647215	TCAGTTTCTCCATCAAACAGGCATCTTACAACCGAATCT

a
s	mr.mrrefChr3	72637	19	+	181019	AATGTGTTACCTGTTGCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520295	19	+	636262	AACGTGTTACCTGTTGCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	531726	19	+	647215	AATGTGTTACCTGTTGTCT

a
s	mr.mrrefChr3	72656	163	+	181019	AATCACATTACAGTGTTACAGATGGTTCTCTCTTTGAGCTGACCTACTGCTCATTATTATACTCAATACCACTCATGCTGATAGAAATCACTAGTCTGCCAGCTTTGGCAGTGAGTGGTGCATTTGGGCCATAAGGTATGTTACTATGCTTGCTATGTAGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520315	149	+	636262	AATCACACCACAGCGTTACAGATGGTTCTCTCTTTGCGCTGACCTACTGCTCATTATTATACTCAATACCACTCATGCTGATGGAAATCACTAGTT--------------GTGAGTGGTGCATTTGGGTCATAAGGTATGTTACTATGCTTGCTATGTAGTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	531745	163	+	647215	AATCACATTACAGTGTTACAGACGGTTCTCTCTTTGAGCTGACCTACTGCTCATTATTATACTGAATACTACTCATGCTGATAGAAATCATTAGTCTGCCAGCTTTGGCAGTGAGTGGTACACTTGGGCCATAAGGTATCTTCCTATGCTTGCTATTTAGTAT

a
s	mr.mrrefChr3	72819	100	+	181019	TAATGTAGCCTTGTGTTTCTCCTGTGTCTAGTTACCTGACAGAATTTCCACTCAGTTAAATACGAACCCAGCCACTTCAAATGTCAAGTGACAGTAGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520465	100	+	636262	TAACCTGGCCTTGTGTTTCTCCTGTGTCTAATTAACTGACAGAATTTCCACTCAGTTAGATACGAACCCAGCCACTTCAAATGTCAAGAGACAGTAGTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	531908	100	+	647215	TAATGCACCCTGGTGTTTCTCCTGTGTCTAGTTACCCGAAAGAGTTTCCATTCAGTTAAATATGTATCCAGCCACTTCAAATGTAAAGTGACAGTAGTAT

a
s	mr.mrrefChr3	72919	7	+	181019	AGGGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520565	7	+	636262	AGGGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	532011	7	+	647215	AGAGACA

a
s	mr.mrrefChr3	72926	8	+	181019	GTGGTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520573	8	+	636262	GTGGTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	532018	8	+	647215	GTAGTATA

a
s	mr.mrrefChr3	72934	151	+	181019	AGGATCTAACCATAGTGTTGTCAGAGGATTGAACTTCACCATTGAGAGTAGCTTATACCATGATGAAATCTTGCTTTAATATGTTGTTCTTGCAGTTCCTCTGAGAGGCCTGCCCCTCTCAGGCAATTACCAAATATACCATGCATTAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520594	151	+	636262	AGGATCTAACCATAGTGTTGTCAGAGGATTTAACTTCACCATGGAGAGTAGCTTATACCATGATGAAATCTAGCTCTAATATGTTGTTCTTGCGGTTCCTCTGAGAGGCCTGCCCCTCTCAGGCAATTATCAAATATACCATGCATTAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	532026	150	+	647215	GGGGTCTAACCATAGTGTTGTCGGAGGGTTGAACGTTATCCGTGAGAGTAGCTGATATCATGATGAAATCTTGCCTTAATATGTTGCTCTTGCAGTTCCTCG-AGGGACCTGCCCCTCCCAGGGAATTACCAAATGTCCGATGGATGGGAT

a
s	mr.mrrefChr3	73085	99	+	181019	TCCCCAAATAGCAACTTAATGGTCAACTATACAGGGCCATGTAGTACCTGGATGCTAGATTATGTAAAGGGATGCTGCCTTGGCTAAAGAAACAAGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520747	99	+	636262	TCCCCAAATAGCAACTTAATGGTCAACTATACAGGGCCATGTAGTACCTGGATGCTAGATTATGTAAAGGGATGCTGCCTTGGCTAAAGGAACAAGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	532176	99	+	647215	TCCCCAAATAGCAACTTAATGGTCAACTATACAGGGCCATGTACTACCTGGAGGCTAGATTACGTAAGGAGATGCTGCCTTGGCTAAAGAAATAAGAGG

a
s	mr.mrrefChr3	73184	734	+	181019	GACTTACACAGTATATAAATACACAGAAAGCACCTGGTGAGCAGCAGAACAGACAGATACACAGCTGCAGGCATTAGACTGCACGCAGGTATCTAACACTGGCATATAGGGAATCTCAAGGACTTTAGAATATTTCAAGCAAGAGTCTCCCAAAAATGGTGGCAACTAGAGTGGTCTTTAATATGAGGCATGTAAGGTTTTAGGAAATAGGTGAAATGCGGCCTTGTCACTGTAATGCTTTTTTGGCCTCAATTGAATTAATTGTATGCTCATTGGATAGAAGTCTTGCAACTTGAGAACTGGAGACTGGAGGTTGGTGCTAAGTTATGATCCTGCTAAATCAGATGGCACAGGAGGTTAAAGTCCATTGAGCCTCATGGTGAAAGGTTAAAGTCTATAATGAAAAATAAAGATAAGGGAGACCCATATGGTTTGTTGGTATGGAAGATATGGTAGGTGAGTAGGAGGCCCATACACTTTATCCCCCCACAGAATACAGGGCAAAACTGTTGTTATTATATTTTGTGGGTCACAAATGGAGCATAAAAGACACTTGTACAAGTGAACACCAGTACCTATCAGCATGCACATGACAAAATGACAAGGTCATTTTAAGTACTAACTAAACAAATATGGTATTTGTCTCAAAGGTACAATGTGGTGGTATCTGGCATTATCACAGCATAAACTATGACTGGTGCAAGTTAGTTATTAGCCGGGGGGACATGTACATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	520846	719	+	636262	GACCTAAACAGTATATAAATACACAG---GCACCTGGTGAGCAGCAGAACGGACAGATATACAGCTGTAGGCATCAGACAGCACACAGGTATCTAACACTGGCGTTTAGGGAATCTTGAGGACTCTAAG-----------AAGAGTCTTCCAAAAATGGTGGCAACTGGTGTGGTCTTTAGTAAGAGGCATGTAAGGCTTTAGGAAATAGGTGAAATGTGGCCTTGGCACTGTAATGCTTTGTTGGCCTCAATTGAATTAATTGTCTGCTCATTGGATAGAAGTCTTGTAACTTGAGAACTGGGGACTGGAGGTCGGCGCTAAGTTATGATCCTGCTAAATCAGATGCCACAAGAGGTTAAAGTCCATTGAGCCTCATGGTGAAAGGGCAAAGTCTATAATGAAAAATAAAGATAAGGGAGACCCATATGGTTTGTTGGTATGGAAGATCTGGTAGCTGAGTAGGGGGCCCATACACTTTATCCCCCCACAGAGTACAGGGCAGAACTGTTGTTATTATATCTTGTGGTTCATAAATAGAGCATAAAAGACACTTGTACAAGTGAACACCAGTCCCTATCAGCATGCACAAAACAAAATGACAAGGTCATTTCAAGT-CTAACTAAATAAATATGGTATTTGTCTCAAAGGTACAATGTGGTGGTATGTGGCTTTATCACAGCATAAACTATGACTGGTGCAAGTTAGTTATTAGCCGGGGGGACATGTACATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	532276	730	+	647215	GATTTACACAGTATGAAAATACACAGAAAGCACCTGGTGAGCAGCAGAACAGACAGGGACACAGCTGCAGGCATTGGACTGCCCGCAGGTATTTAACACTGA-ATATCGAGAACCTCAAGGACTTTAGAATATTTCAAGCAAGGGGCTCCCAAAAATGGCGGCAGCTAGAGTGGTCATTAATATCAGGCATGTAAGGTTTCAGGAAACAGGTGAAATGCAGCCTTGTCACAATAATGCATCTTTGGCCTCAATTAAATTAATTGTATGCTCATTGGATAGAAGTCTTGCAACTTGAGAACTAGAGACTGGAGCTTGGTGCTAAGTTTTGATCCTGCTAAGTCAGATGGCACAGGAGGTTAAAGTCCACCGAGCATGATGATGAAAGGTTAAAGTCTATAATGAAAAATAAAGACAAGGGAGACCCATATGGTTTGTCAGTATGGAAGATATGGTAAGTGAGTAGGAGGCCCATACACTCTATCCCCCCACAGAATACAGGGCAAAACTGTTGT--TTATATTTTGTGGGTCGCAAATGCAGCATAAAAGACACTTGTACAAGTGAACACCAGTACCTATCAGCATGCACATGACAAAATGACAAGGTCATTTTAAGTACTAACAAAACAAATATGGTATTTGTCTCAAAGGCAC-ATGTTGTGGTATCTGACATTATCACAGCATAATCTATGACTGGTGTGAGCTCGTTATCAGCCACAGGGACGTGTATATA

a
s	mr.mrrefChr3	73918	14	+	181019	GCTGTTCCAAGTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	521858	14	+	636262	GCTGCTCCAAGTGC
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a
s	mr.mrrefChr3	73932	216	+	181019	CTACACAAATAAGTATAAGGAGACTGTTATAAAAGTGCTTATAGCTCATATCCCCTCAATTTACAACACAGAACCAGAGTTGTCCAAATAGTGGTTCTCTAGGCATGGCTTAAATAAATAAGGGCTTAATAATTGGACAATAAAGTTCACATAGAGTGGCAGATTTGTTCCAAATTTAGTGTAAATCATCTAGGGTGGACCCCTGACCTGGTTGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	521879	216	+	636262	CTACACAATTGAGTATAAAGAGGCTGTTATAAAAGTGCTTATAGCTCATATCCCCTCAATTTACAACACTGAACCAGAGTTGTCCAAATAGTGCTTCTCTCGGCGTGGCTCAACTAAATAAGGGCTTAATAATTGGACGATTAAGTTCATATAGAGTGGCAGATTTGTTCCAAATTTAATGTAAACCATCTAAGGTGGACCCCTGACCTGATTGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	533020	216	+	647215	CTACACAAACACGTATGAGGAGATTGTTCTAAAAGTGCTTATAGCTCATGACCCCTCAATTTACAACACAGAACCAGAGTTGTCCAAATAGTGGTTCTCTAGGCATGGTTTAAATAAATAAGGGCTTAATAATTGGACAATAAAGTTCACTTAGAGTGACAGACTAGTTCCAAATTTAGTGTAAATCATCTAGGGGGGACCCCTGGCCTGGCTGGC

a
s	mr.mrrefChr3	74148	55	+	181019	GAATGGCAAAGATCAATGCCCCATGACTACATGTAAATATCTGACACTTATGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	522095	55	+	636262	GAAGGGAAAAGTTCAACGCCTCATGACTACATGTAAATATCTGACACTTATGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	533241	55	+	647215	GAATGGCAAAGATTAATGCCCCATGACTACATGTAAATATTTGACACTTATATTT

a
s	mr.mrrefChr3	74203	251	+	181019	ACACAATAGCCTGTTCAAGATTTCTTCTTCAGTTAATGTGATGGTTGGGAACAACATGTTAGTTTTGATGAACATCTGGTGCGGTTGTTGTAGCCTGGATGGAACCAAGAAATTAAAAGAAGTAGAAGAAAACTTAACTGCACATGAGGGAAAGACATCCTTGTTCTTCTGAGAACAGTATTGATATGATTGGCAATTGTATTTAGTAGTTGTACATGACCTCACAAGTAAGCTGAATCCCAAGTCCAAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	522166	242	+	636262	ACACAATAGCCTGTTCAAGATTTCTTCTTCAGTTAATGTGATGGTTGGGAACAACATGTTAGTTTTGATGAAAATCTGGTGCGGTTGTTGTAGCCTGGATGGAACCAAGGCAATAAAAGAAGT-GAAGAAGCCTTAACTGCACATGAGGGAAAGACATCCTTGTTCTTCTGAGAACAGTATTGATATGATTGGCAATTGTATATA--------ACATGACCTCACAAGTAAGCTGAATCCCAAGTCTAAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	533296	251	+	647215	ACTCAATAGTCTGATCAAGATGTCTTCTTCAGGTAATGTGATGGTTGGGTACAACATGTGAGCTTTGATGAACATCTAGTGCGGTTGTTGTAGCCTGGATTGTACCAAGAAATTAAAAGAAGTAAAAGAAAACTTAACTGCACATGAGGGGAAGACATCATTGTTCTTCTGAGAACTGTATTGATTTCATTGGCAGGTGTACTTAGTAGTTGTACATGACCTCACAAGTAAGCTGTATCCTAAGTCCAAGC

a
s	mr.mrrefChr3	74454	14	+	181019	AGAAACAGAGCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	522408	14	+	636262	AGAAACAGTGTATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	533550	14	+	647215	ATAAACAAACCACT

a
s	mr.mrrefChr3	74468	40	+	181019	ATAAACAGTGTGTGTAGGTGCAACATGCATTCAATCAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	522437	40	+	636262	AGAAACAGTGTATCTAGGTGCAACATGCATTCAATCAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	533564	39	+	647215	ATAAACAGTGTGTGTAGGTGCAACATGCACTC-ATCAATA

a
s	mr.mrrefChr3	74508	249	+	181019	AAATGTTAGTAGACAGATGAGGCTAATCAACTAGCTAACCTTTACAATGTCATACCTAAGTGCGAGTGGGAACAAACATACAGGATTTTGTCCATAATTGTGCCAGATACCTAAATCAGTGGCATTTTATCTGCCTACTTCCCTTGCACTCTCCTACTTTCCTTGGGGCTTACTAGCACGACCACATCATTGCAGCACACATCCAAATGGGGATCAACTCCCATGTGTTATATGGCATATTAGAAGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	522481	249	+	636262	AAATGCTAGTAGGCAGATGACTCTAATCAACTAGCTAATCTTTACAATGTCATACCTAAGTGCGAGTGGGAACAAACATACAGGATTTTGGCCATAATTGCACCAGATACCTAAATCAGTGGCATTTTATCTGCCTACTTCCCTTGCACTCTCCTACTTTCCTTGGGGCTTACTAGCACGATCACATCATTGCAGCACACATCCAAAGGGGGATCAACTCCCATGTGTTATATGGCATATTAGAAGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	533603	249	+	647215	AAATGTTAGTAGATAGCTGAGGCTAATCAACTAGCTAACCTTTACAATGTCATACCTGAGTGCGAGTGGAAACCAACATACAGGATTTTCTCCATAGTTGTGCCAGATACCTAAATCAGTGGCACTTTATCTGCCTACTTCTCTTGCACTCTCCTACTTTCCTTGGGCCTTAATAGAACCACCACATCGTTGCAGCACGCATCCAAATGGGGATCAACTCCCATGTGTTAGATGGCATGTCAAAAGAAG

a
s	mr.mrrefChr3	74757	66	+	181019	CAGCAAAAACTGAAATGGACGGGTGTGCAAATCTTTGATACAATGTAAGTCTATGACTCATGAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	522731	66	+	636262	CAGCAAAAACTGAAATGGACGGGTGTGCAAATCTTTGATACAATGTAAGTCTATGACTCATGAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	533852	66	+	647215	TGGCAAAAACAGAAAGAGATGGGCGTGCAAATCTTCGATACAATGTAAGTATATGACTCATGAGTA

a
s	mr.mrrefChr3	74823	159	+	181019	CTGGAAATTGGTTATTATTGCTATTGGATATACTCACAGTTAGTTCTTTCTTGGGCAGGGCTATTCACACACTCACTTGCCAAAAGGAATGACCATTTACTACTTACCTTCCACCTAACCCATGAATAATTAAATAACAACCCTGCATTGGTACAAGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	522998	159	+	636262	CTGGAAATTGGTTATTATTGCTATTGGATATACTCACAGTTAATTCTTTCTTGCGCAGGGCTATTCACACACTCGTTTGCCAAAAGGAATGACCATTTACTACTTACCTTGCACCTAACCCATGAGTAATGAGATAACAACCCTGCATTGGTACAAGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	533918	158	+	647215	CTGTAAATTGGTGATTATTGCTATTGGATATACTCACAGTTAGTTCTTTCTTGGGCATTTCCATTCACACACTCACTTGCCAACAGGAATGACTATTCACTATTTACCTTCCA-CTAACCCATGAATAGTTAAATCACAGCTGTACATTGGTACAAGAC

a
s	mr.mrrefChr3	74982	65	+	181019	AATATCCATGAGAAGCTCTGAATGGCACAAGTGGCCCTATCATCAATAAATCAATGTTTCCCTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	523157	63	+	636262	AATATCCATGAGAAGCCCTGAATGGCACAAGTGTCCCCATCATCAATGAATCA--GTTACCCTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	534119	65	+	647215	AATGTCCATGAGAAGCTCTGCATGGCACAAGTGGCCCTATCATCAACAAATCAATGTTTCCCTGA

a
s	mr.mrrefChr3	75047	125	+	181019	CTGTCAGAATATTGTACTGATCACATTACATCAGGACACAATTTTTATTTTACTGTCAGCAGCAACTAGGGGATAATTGCGTTTAGTTTCCCTACTTAGAAATGAAGTGTCTTGAACAGGTGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	523220	125	+	636262	CTGTCAGAATACTGTACCGATCACATTACATCAGGACACAATTTTTATTTTACTGTCAGCAGCAACCAGGGGATAATTGCGTTTAGTCTCCCTACTTAGAAATGTAGTGTCTTAAACAGGTGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	534185	124	+	647215	CTGTCAGAATATTGTACTGAGCACACTACATCAGGACACAATTTTTA-TTTACTGGCAGCAGTAACTGGGAGATAATCACATTTAGTTTCCCTGCTTAGAATTGAATTGTCTTGAACTGGCACAT

a
s	mr.mrrefChr3	75172	180	+	181019	GTACCCTCTAGCACCTATATGGTGAAATCCAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAACTAGTTTATTGTTTCTCCGTTGAGATTCACACTTAAGATCCACCTGACCTTAGGTGATCTCCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATGCCTACTAATTCAATGCATCCTTTGATGATACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	523346	173	+	636262	GTACCCTCTAG-------ATGGTGAAATCAAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAACTAGTTTATTGTTTCTCCGTTGAGATTCACACTTAAGATCCACCTGACCTGAGGTGATCTCCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATGCCTACTAATCCAATGCATCCTTTGATGATACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	534309	175	+	647215	GTACCCTCTAGCACCTATATGATGAAATCCAGTACAAAAGGAATGTATCATCTGAGCTATTTTATTGCTTCTCTGTTGAGATTCACACTTAAGATCCG-----CCTTAGGTGATCTTCATCTGCAGTGTGCTTTTTCTGGGGTTATACCTACTAATTGAATGCATCCTTTGATGATACAT

a
s	mr.mrrefChr3	75352	121	+	181019	TGCGGAGGGTAAATGCCCATGCCACTCGTTACTAGACTACCCTAAGCTTTTCTTTGGTCCTTTAGTATTACTTAACTATATTGCTTTGTGACAAAGTTTTGACATTAGACTATTATAGGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	523529	121	+	636262	TGCAGAGGGTAAATGCCCATGCCTTTTGTTACTAGACTACCCTGAGCCTTTCTTTGGTCCTTTAGTATTATCTAACTATATTGCTTTGTGACAGAGTTTTGACATTAGACCATTATAGGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	534484	119	+	647215	TGCGGAGGGTAAATGCCCATGCCACTCGTTACTAGACTACCCTATGCTTTTCTTTGGTCCTTTAGTATTACTT-ACTATATCGCTTTGAGACAAAGTTTTAACA-TAGACTATTATATGGA

a
s	mr.mrrefChr3	75473	320	+	181019	TTTTGGTGCCATTTTTTGCTTCAGACTACCATGCTAACTGGACATGAGGACTGGCTGGAATCTAGGCCATTCCAGTAATGGTGTGCTTGTCCATGTGTGAGCTCTTATGTGCAGCAGACCACAAATTCATGAGAAATAGTCTTTCCAGAGCCATTTTGCTACTTATACATGAACCCGGTTCTCTAAATTGATTCCCAATGCAGATGAAATATCAAGGGCAATGCTCAGTTCTAGAGCAAATGTGTAACATTCATAGGTTTATAGTTTTCTGTTCCTACATCCTTAGTGCCAGACCATCCGACTTCCAGCCACTTGGACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	523704	315	+	636262	TTTTGGTGCTGTTTTTTGCTTCAGACTACTGTGCTAACTGGACATGAGGACTGGCTGGAATCTAGGCCATTCCAGTAATGGTGTGCTTGTCCATGTGTGTGCTCTAATGTGCAGCAGACCACAAATTCATGAGAAGTAGTCTTTCTAGAGCCATTTTGCCACTTATACATCAACCCAGTCCTCTAAATCGATTCCCAATGCAGATGAAATATCAAGGGCAATGCTCAGTTCTAAAGCAAATGTGTAGCATTCATAGGTTTATAGTTTTCTGTTCCCACATCCATAGTGCCAGACCATCCGACTTCCAGCC-----GACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	534603	306	+	647215	TTTTGGTGCCATTCTTTGCTTCAGACTACCATGCTAATTGGACATGAGGACTGGCTGCAGTCTAGGCCATTCCAGCAATGGTGTGCTTGTCCATGTGTGAACTTCTA-------------ACAAATTCATGTGAAATAGCCTTTCCAGATCCATTTTGCTACTCATTCATGAACCTGGTTCTCCAGATTGATTCCCAATGCAGAGGAAGTATCAAGGGCAATGCTCAGTTCTAGAGCAAATGTGTAACATTTGTAGGTTTATAA-TTTCTGTTCCTAAATACTTAGTGCCAGTCCATCCAACTACCAGCCACTTGGACCA

a
s	mr.mrrefChr3	75793	214	+	181019	GCCCTTCCACAAGCTGCCATGGCCCAAATCTTAAAGTGTTGTCATTACAAACATGACAGGGCGCAGCCGTCTAGGAGGTCGAGAGTTGTGAGGGCGTACACTAATGACTCACACTCATGAAAGCATTATAGATTACTTGTGTATGGAGCATGGCCTTGTGTTATCTTCCAAGCACCATTCCTGCCAGGTGTGAATTGACACACTGGGCAGCCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	524022	214	+	636262	ACCCTTCGACAAGCTGCCATGGCCCAAGTCTTAAAGTGTTGTCATCACAAACATGACAGGGCGCAGCCGTCTAGGAGGTCGAGAGTTGTGAGGGCGTACACTAATGACTCACACTAATGAAAGCATTATAGATTACTTCTGTGTGGAGCATGGCCTTGTGTTATCTTCCAAGCACCATTCCTGCTAGCTGTGAGTTGACACACTGGGCAGCCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	534909	211	+	647215	GTCCTTCCACAGGCTGCC---GCCCAAATCTTAAGGTTTTGTCATTACAAACATGACAGGGCCCACCCGTCTAGGAGGTTGAAAGCTGTGAGGGTGTACACTAATGACTCACACTCATGAAAGCATTATAGAATACTTGTGCATGGAGCATGTCCACCTATTATCTTCCAAGCACCATTTCTGCCAAGTATGAATTGACATACTAGCCATTCAC

a
s	mr.mrrefChr3	76007	149	+	181019	ATCCTGGTCTGAAGTGAAAAGGTACCATATAAAAGAAAGTTATGGGGACACATTCTCCATAGTATCAATAGGGTAATCATAGTCTTAGGAATTCCAAATTGTATCAAATTTTGACACAGTAAGCGGACACCTTCACATGTTAGAGGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	524236	149	+	636262	ATCCTGGTCTGAAGTAAAAAAGAGCCATATAAAAGAGAGTTATGGGGAAGCATTCTCCATAGTATCAATGGGGTAATCATAGTCTTAGGAATTCCAAATTGTATCAAATTTTGACACAGTAAGCAGACACCTTCACATGTTAGAGGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	535178	142	+	647215	ATCCTG-------GGGACCAGGTACAGTAATGGAAGAAATTATGGGGACACATTCTTGATAGTGCCAACAGGGTAACCATAGTCTTAGGAACTCCATATTGTAACAACTTTTGACACAGTAAGAGGACACCTTCACATGTCAGAGGACA

a
s	mr.mrrefChr3	76156	162	+	181019	CGCTAAACTCCCCCAGATGCAGCAATGGTGGTGTCTTGGATCTTCAATGTGTTGTAATGCAGAAGTGAATGATGAGATATGGATGCATGCACATACTTCAAGCCTATCTTGGATGGTAAAATTTGTGAAACTTAACAGCTTCTATTGACTGGAAGGAAAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	524385	149	+	636262	-------------CAGACACAGCAATGGTGGTGTCTTGGATCTCTGATGTGTTGTAATTCAGAAGTGAATAATGAGATATGGATGCATGCACTTACCTCAAGCCTATCTTGGATGGTAAAATTTGTGAAACTTAACAGTATCTATTGACTGGAAGGAGAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	535324	161	+	647215	CGCTAAACTCCCCCAAATGCAGCAATGGTGGTGTCTTGGATCTTCAATGTGTTGTAATGCAGAAGTGAATGATCAGATATAG-TATGTGTGCATACTTCAATCCTATCTTGGATGGTACGATTTGTGGGACTTAACAGCTTCTATTGACTTGAAGGAAGAAG

a
s	mr.mrrefChr3	76318	101	+	181019	TATTATAATTCTTTATAGCTACATTTGCATCACAGTTACAGGTGAGGTGATACATTAGCAGTTGGACAATGATGAAAGAGTCTATTGGGTTTAAGAACTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	524535	96	+	636262	TATTATAATTCTTTATAGCTACACTTGCATCACAATTACAGGTGAGGTGATACATCAGCAGTTGGATAATGATGAAAGAGTTCATTGGGTTTAAGA-----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	535485	101	+	647215	TATTATAATTCTTTATGGCTACATTTGCAGCACAGTTACAGGTGAGGTGATACATTAGCAATTGGACAATGTTGAAAGAGTCTATTGGGTTTAAAAACTCA

a
s	mr.mrrefChr3	76419	5	+	181019	CCAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	535587	5	+	647215	CCAAG

a
s	mr.mrrefChr3	76424	94	+	181019	CAATCAATTCTGATATCAATAATATGCCAGTTTTGTCCCTTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAGTTAATCCAATATTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	524631	92	+	636262	CAATCAATTCTGATATTAATAATAAGCCAGTTTTGTCCCTTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAATAACACC--TATTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	535593	94	+	647215	CAATCTATTCTGATATCTATAATATGCTAGTCTTGTCCATTGGAGATTTTCTATCTGTCCTTAACATTAGATTCCTTAGTTAATCCAATATTGA

a
s	mr.mrrefChr3	76518	233	+	181019	ATGAGGATCATATACTCATCAGCACAAAGAATAAAACTAAACTTAAATGGATACTATGCCTTATCAATAAAAGTTGTTAGGGACCATGTTAGAAAACCAGTGTTAGGCTGGAGTCCTTAAGAAGGCTGGTCACTCAACTGGAGCCTTGGGTGGCCTCCAATCTCAGTTCAAATTTGAGCTACTGGATGGATTAATAGTTTGCTGTAGACAGTGAAGGAGCCATAATACTAGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	524723	217	+	636262	-------------ACACATCTGCACAAAGAATAAA---GAACTTAGATGGATACTATGCCTTATCAATAAAAGTTGTTGGGGACCATGTTAGAAAACCAGTGTTAGGCTGGAGTCCTCAAGAAGACTGGTCACTCAACTTGAGCCTTGTGTGGCCTCCAATCTCAGTTCAAATTTGAGCTACTGGATGGATTAATAGTTTGCTGTAGACAGTGAAGGAGCCATAATACTGGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	535692	232	+	647215	ATGAGGATCATATACTCATTAGTACAAAGAATAAAACTAAACTTAAATGGATACTATGCCTTATCAATTAAAGTTGTCAGGGACCATGGTAGCAAACCAGTGTTAGGCTGGAGACCTTAAGAAGGCTGGTCACTCAACTGTAGCCTCGGGTGACCTCAAATTCCAGTTCAGGTTTGAGCTATTGGTTGTATTAATAGTTTACTGTAGACATTTAA-GAGCCATAATACTAGGA

a
s	mr.mrrefChr3	76751	37	+	181019	CTGCCATGCACTGTAGCACATCCTGCATACCTGAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	524940	37	+	636262	CTGCCCTGCACTGTAGCACATCCTGCATACCTGAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	535925	37	+	647215	CTGCCACACACTGTATCACATCCAGCGTACCTGAGCC

a
s	mr.mrrefChr3	76788	125	+	181019	GAAAAGCAACATGAATTCCACCCCACAGGGAGTGTAGTGAGTAAATAGCCTAGTAATGGGCTGTTTCTGTGATCAACATCATGTTCCCCTGATACTACTTCCCAAGGAGTCACTCTGTCATGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	524978	125	+	636262	GAAAAGCAACATGAATTCCACCCCACAGGGAGTGTAGTGAGTAAATAGCCTAGTAATGGGGTGATTCTGTGATCAACATCATGTTCCCCTAATGCTACTTCCCATGAAGTCACTCTGTCATGATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	535962	125	+	647215	GAAAAGCAACATGAATTCCACCCCACAGAGGGTTTATTGGTTAAATAGCCTAGTAATTGGCTGTTTCTGTGATTGACATTATGTTTCCCTGATACTAATTCCCAAAGAGTCACTCTATAATGATG

a
s	mr.mrrefChr3	76913	177	+	181019	TACCATTACCTGATAGTTAAATACTACCAGTTCACTGAAAAACCCAATAGTTGTGTGCCAACTGTTCACTAAGCTGTTACAGGTGAGTTAGAGCCCTATCTCCCTTTACTGGACTGTACCCTTGGAATAGGCAAGGATCAATAGGAAGCTCTGGATCAGTACTATTTATATGTTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	525105	176	+	636262	TACCATTATCTGGTAGTTAAATACTACCAGTTCACTGAAAAACCCAATAGTTGTGTGCCAACTGTTCACTAAGCCGTTACAGGTGAGTTAGAGCCCTATCTCCCTTTACTGGACTGTACACTCGG-ATGGGTAAAGATCAATAGAAAGCTCTGGATCAGTACTATTTATATGTTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	536087	175	+	647215	TACCATTACCTGATAGTTAAATACTACCAGTTCATGGAAAACCCCAATAGTTGTGTGCCAACTGTCCATTAAGCTGTTACAGGTGAGTTATAGCCCTACCTCCCTTTACTGGACTATACCCATGGAAAAAGCAAGGATCAATAGGAAGCTCTGGG--AGTACTATTGATATGTTGGG

a
s	mr.mrrefChr3	77090	66	+	181019	CATTGCTATCAGAGGATAAGTGCACAGATGACAGGTGCACTCAGGGAGGCTAAGGAGGGAATGGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	525281	45	+	636262	-------GGTAGAGGACAAGTGCACAGATGACAGGTGCACTCAGGGAGGCCA--------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	536265	66	+	647215	CATTGCTATCAGAGGATAAGTGCACAGTGGACAGGTGCACTCAGGGAGGCTAAGGAGGGAATGGCT

a
s	mr.mrrefChr3	77156	12	+	181019	GTGCAGTTAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	536365	12	+	647215	GTGCAGTTAATT

a
s	mr.mrrefChr3	77168	224	+	181019	TAAGTGAATAAAAGAGAACATAGTGAACAAAGAGGGGCATATGTCTTGAAAAATTGTTTCCCTGAAGGACGATCAGAGAACTACCACATACAGCAGCAAGACTTTTGGAATTGCCCAAGATTATGCAACCACCCTGCTGCCTCTAGGGGCCTTCTTTTCTAATCAGAGTAATGACTTGGGGTAAGGGTCTACACCCTTAGAAAAAGGGCCGGAGTAATAAAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	525326	198	+	636262	TAAGTTAATAAAAGAGTAATTAGTGAACAAAGAGTGGCATATGTCTTGAAGAATTGTTTCCTTGAAGAACGATCAGAGAACTACCACATACAGCAGCAAAACTTTTGGAATTG-------TTATTCAACCACCCTGCTGCCTCTTGGGGCCTTCTTTTCTAATCAGAGTAATGATTTGGTGTAAGGGTCTACACCCTTAGATAAA-------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	536378	224	+	647215	TAAGTGAATAAAAGAGAACATAGTGAACAGAGAGGGGAATATGTATTGAAAAATTGTTGCCCTGAAGGACAATCAGAGAATTACCACATACAGTAGCAAGACTTTTGGAATTGCCCAAGATTATGCAACCACTCTGCTGCCTCTAGGGGCCCTCTTTTCTAATCAGAGTAATGACAAGGGGTAAGGGTCTGCACCATTAGAAAAAGGGCCGGAGTAATAAAAAT

a
s	mr.mrrefChr3	77392	25	+	181019	TCCAGAGGAGGTTGGTGAAATGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	525524	25	+	636262	TCCAGAGGAGGTTGGTGAAATGTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	536606	25	+	647215	TCCAAAGGAGGATGGTGAAATGTAC

a
s	mr.mrrefChr3	77417	47	+	181019	AAAAATTACCTCCAAAGAGGGACGGTGAAATGTACAGATCAATGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	525550	44	+	636262	AAAAATTACCTCCAAAGAAGGACGGTGAAA---ACAGATCAATGTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	536631	46	+	647215	GAAAATTACCTCCACAG-GGGAGGGTGAGATGTACAGATCAATGTCA

a
s	mr.mrrefChr3	77464	145	+	181019	TACCTATATCCATAGTTGTTTAAGATCTTGACTGTCTTGCCTACCAAAAACTACACACAGATACTTGTCTAGATTAGGGCCCTGCAGGACAATAACTTGTGAGTAATGTCATTCTGTGGTCACTGCCTTCCTATCTCAGTTGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	525594	145	+	636262	TGCCTATATCCATAGTTGTTTAAAATTTTGACTGTCTTGCCTACCAAAAACGACACACAGATACTTGTCTAGATTAGGGCCCTGCAGAACAATAACTTGTGAGTAATGCCATTCTGTGGTCACTGCCTTCCTGTCTCAGAAGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	536697	145	+	647215	TACCTACATCCATAGTTGTTTAAGATCTTGACTCTCTTGCCTACCAAAAAATACACACAGATACTTGTCTAGATTAGGGCCTTGCAGGACAATAACTTGCGAGTAATGTCCTTCTGTGTGTACTGCCTTCCTATTTGAGTTGAGT

a
s	mr.mrrefChr3	77609	310	+	181019	GGGCAATAAGGGTAGGAGGTGAATAAAATTTTTGAATAAAACTCTAGGTTGACACTCATCAGTGACACACATGCATGCATTCCTGCCATGCACAGGGAAGCATTGCATTGGCTAATCAAAGAGATGAGTAACTATATATGGTATAGATCAACTCTATCTTCCACAACAAATAAGCAGCCTTTTAATGGTGTGCTGTGGAATCTTTTGTTCTCATTGCCATCTGTTATCATTTAATCTGCAGCATATCTCAAGAAACAGTTAAAGGTCTGCAGAACAGGAAGGACCACATGTGTTTTTTCTTTATTACCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	525741	271	+	636262	GGGCAATAAGGGTAGGAGGTGAATAAAGTGTTTGAATAAAACTCTAGATTGACACTTATCAG-------------------------------------GCGTTGCGTTGGCTAATCAAAGAAATGAGTAACTGCATATGGCATAGATCAACTCTATCTTCCACAACAAATAAGCAGCCTTTTAGTGGTGTGTTGT--AATCTTTTGTTCTCATTGCCATCTGTTATCATTTGATCTGCAGCATATTTTGAGAAACACTTAAAGGTCTGTAGAACAGGAAGGACCACATATGTTTTTTCTTTATTGCCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	536842	310	+	647215	GGGCAATAAGAGTAAGAGGTAAATACAACTTTGAGATAAAACACTAGGTCAACACTCATCAGTGACACACATGCATGCATTCCTGCCATGCACAGGGAAGCATTACATTGGCTAATCAAAGAGATGAAAAACTATATATGGTATAAATCAACTCTTTCTTCCACAACAAATAAGCCGCCTTTTAATGGTATGCTGTGGAATCTGTTGTTCTCATTGCCATCTGTTGTCATTTAATCTGCAGCCTATCTCAAGAACCTGTTAGAGGTCTGCAGAGCAGGAAGGACAACATGTGTTTTTTCCTTATCACCCT

a
s	mr.mrrefChr3	77919	320	+	181019	ACCTTATTGACATGACCCTCAAATGATTAAAGATTTCTGCAATCATAACACCAGTTTACCTCACTCCTAGCTAACCAATGGGCCCTTGAGTTTATATGGTTATGTGTACATCCCAAAGCTAAGAATTGTCAGGTGTTAAGAACCCAAGATATAGTTTCTCAGTATTTGTTTTCAATACGTCTATGTCACCTAACCCTACCTTCCTCTTATTTATCCACTTGTCTATCTGACATCTGAAATTGGAGGCATCTAAAGCTAGAAGGCAATTGGAGGAGAGCAATAATAGACCTCTGTCAATCTAGTCATGGAATGATAATTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	526012	305	+	636262	ACCTTGTTGACATGACCCTCAAATGATTAACGATTTCTGCAATCATAACACCAATTTACCTCACTCCTGGTGAACCAATGGGCCCTTGAGTTTATATGGTTATGTGTACATCCCAAAGCTAAGAATTGTCTGGTTATAACAACCCAAGATATAGTCTCTCAGTATTTGTTTTCAATACGGCTA--------AACCCTACCTTCCTCTTATTTATCCACTTGTCTTTCTGACATCTGAAA-------CACCTGAAGCTAGAAGCCAACTGGAGGAGAGCAATACTAGACCTCTATCAATCTAGTCATGGAATAATAATTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	537164	319	+	647215	ACCTTATTGGCATGACCCTCTAATGATCAAAGATTTCTGGAATCATAACACCAGTTTACCTCACTCCGAACTAACCACTGGGTGCTTGAGTTTATATGGTTATGTGTAGATCCCTAAGCTAAGAATTGTTAGATGTTAGGAACCCAAGATATAGTTTCTCAGTATTTGTTTTCAATACGTCTGTGTCACCTAACCCT-CCTTCCTCTTATTTATCCACCTGTCTATCCGACCTCTGAAATTGGAGGCATCTAAAGCTAAAAGGCGATTGGAGGAGAGCAATAATAGACCTCTGTCAAGCTAGTCATGGAATGATAATTGT

a
s	mr.mrrefChr3	78239	93	+	181019	ATCCCAGATTGTCTCCACCCATGAAGTGCACAGAAGAACACCTAAGTATTAAGAGAAGAGATTAAAGCAGGCTAAAGTCATAGGGGGTCTTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	526327	93	+	636262	ATCCCAGGTTGTCTCCACCCATGAAGTGCACAGAAGAACACCTAAGTATTAGGAGAAAGGATTAAAGCAGGCTAAAGTCATAGACGGTCTCGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	537483	92	+	647215	ATCCCGGATTG-CTCCACCCATGAAGTGCATAGAAGAACAGCTAAATATTAAGTGAAGAGATTAAAGCAGACTAAGGTAATAGGGGGTCTTGG

a
s	mr.mrrefChr3	78332	58	+	181019	CGGATCAACAGGGTGTTAATGACAGCTATGTGTGGTAGATGGTGCTAGAAATGCTAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	526420	58	+	636262	CGGATCAACAGGGTGTTAATGACAGCTATGTGTAGTACATGGTGCTAGAAGGGCAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	537576	58	+	647215	TGGATCAACAGGGTGTTATTGACAGCTATGTGTGGTAGATGGTAGTAGAAATGCTAGT

a
s	mr.mrrefChr3	78390	17	+	181019	CATCCATTCATGTGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	526484	17	+	636262	CGTCCATTCATGTGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	537634	17	+	647215	CATTCATTCATGTGCCA

a
s	mr.mrrefChr3	78407	159	+	181019	CAGCCTGCAGCCTGTCATGTGCCAAAGAGACCCTCAGTCTCGGAGACTTGAACAACATCTACAGCATATGACTAGCCTGTAGCCTTTCTGCTGCAGAAATCAAACAGCATAGGCAGTATGTGAACTGAAAGTCCCCTCAGGTTATATCTCACAAGGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	526592	158	+	636262	CAGCCTGCAGCCTGTCATGTGCCAAAGA-ACCCTCACTCTTGGAGACTTCAACAACATCTACAGCATATGACTGGCCTGTGGCCTTTCTGCTGCAGAAATCAAGCAGTATAAGCAGTATGCCAACTGAAAGTCCCCTCAGGTTATATCTCACAAGGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	537651	159	+	647215	TAGCCTGCAGCCTTTCATGTGCCAAAGAGACCTTCGGTCTCGGAGACACGGACAACATCGACAACATATGACTAGCCTGCAGCCTTTCTGCACCAGAAATCAGACAGCAGAGGCAGTAAGTGAACTGAAAGTCCCCTCATGTTATATCTCACAACGTAG

a
s	mr.mrrefChr3	78566	177	+	181019	CACACAAGAGAGACTAGAAGACAAATTGATTCTATATCACTCATTTTCTCTACTCTGGGTTCCTCTACAGAAAATAGTAAGCAGCAATACTTAGGTCCAATGTTTACTATGCCTGGACAACAGAAACCCAACTATCCACTATCCTTTTATCTGGGTTGCAACTCAGTTTCCCTAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	526751	174	+	636262	CACACAAGAGAGACTAGAAGACAAATTGATTCTACATCACTCATTTTCTCTACTCCGGGTTCCTCTACAGAAAATAGTAAGCAGCAATACTTAGGTCCAATGTTTGCT---CCTGGACAACAGAAACCCAACTATTCACTATCCCTTTATCTGGGTTGCAACTCAGTTTCCCTAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	537810	174	+	647215	CACACAAGAGAGA-TAGAAGACAAACTGATCCTATATCACTCATCCTCTCTACTCTGGGTTCCTCTACAGAAGATAGCAAGCAGCAATACTTGGGTATGATGTTTACCATGCTTGGCCAACAGAAACCCCACTATCCACTATTCTTTTATCTGGGTTGTAACTCAGTTTCCCTAA--

a
s	mr.mrrefChr3	78743	183	+	181019	CACTTTTGTTTAGTTTGGAATAAGTCACATTGATCAACTGGGACCCTAATGTCATGACTTCAGTCCTGCCACCACAATCCTGTTTTGAAAGATGTATTGTGCTACCTCTTTCCTGGTGACAAAGTGTCTGCCTTTCCCGAGCTAGTTCCTTATGATTACCTGTTCATATGTCTCATCAGATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	526927	183	+	636262	CACTTTTGTCTAGTTTGGAATAAGTCACATTGATCAACTGGGACCCTAATGTCATGACTTAAGTCCTGCCACCACGATTCTGACTAGGAAGATGTATTGTGCTACCTCTTTCCTGGTGACAAAGTGTCTGCCTTTCCTGAGCTCTTTCCTTATGATTACCTGTTCATATGCCTCATCAGATAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	537984	172	+	647215	CACTTCTGTTCAGTTTAGAATCAGTCACATTGCTCAACTGCCACCCTAATGTCACGGCTTCAGTCCTTCCACTACAATCCCGTTTTGAAAGATGTACT---CCCGCTCTTTCA----GACAAAGTTTCTGCCTTTCCCGAGCCAGTTCCTTATGAT----TGTTCAGATGTCTCATCAGATAG

a
s	mr.mrrefChr3	78926	200	+	181019	GAGCTCTAACATGATTGGATGTTGATAGAGTGATATTAAAATAATAGTAGCTGACGGCCCGTAGTTTAAGTCAATGATGCCCACTGGCTAGAAGTCCATGAAAACTTCTTAACTAATCATACGCAGAGATGACACTGTAACCTCAACAAGTTGCAGACTCGCTGAGGCGTCAGTAGAAATTTACAACAATTCACCCTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	527110	200	+	636262	GACCTCTAACATGATTGTGTGTTGATAGAGTGATATTAAAATACTAGTAGCTGACGGCCCGTAGTTTAAGTCAATGATGCCCACTGGCTAGAAGTCCATGAAAACTTTTTAACTAATCATATGCAGAGATGACACTGTAACCTCAACAAGTTGCAGACTCGCTGAGGCGTCAGTAGAAATTTAGAACAACTCACCCTGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	538158	131	+	647215	GAGTTGTAACATGATTGGATGCTGATAGAGTGGTATAAAAATAATTGT-------------TAGTTTAAGTCAATGATGTCTGCCGGCCAGAAGTCCATGAAAACTTCTTCACTAATCATAC--------------------------------------------------------ATTTACAACAATTCACCCTGGG

a
s	mr.mrrefChr3	79126	126	+	181019	TAACTAACTCAAGTCTATTGCTCCCCTGTGGAATTAATTGTTATGAAACCATTTGAGCATCTATTTATCTGATGTTCATATAGGAATGCACTAGTTCCACTGTTGTTTGTAACTGAACCATATGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	527310	75	+	636262	TAACTAACTCAAGTCTATTGCTCCCCTGTGAAATTAATTGTTATGAAACCATTTGAGCATCTATTTATCTGATGT---------------------------------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	538292	126	+	647215	TAACTAACTCAGGTCTATTGCTCCCCTGTGGAGTTAATTGTGATGAAACCATTTGAGCATCTATTTATCTGATGTTCATATAGGAATGCACTAGTTCCACTGTTGTTTGTAACTGAACCATATGCC

a
s	mr.mrrefChr3	79252	37	+	181019	GTACTGGGACGTAAGCAACATGGACATGGATATGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	527385	34	+	636262	---CTGGGACGTAAGCAACATGGACATGGATATGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	538420	37	+	647215	GTATTGGGATGTAAGCAACCTGGACATGGGTATGTGA

a
s	mr.mrrefChr3	79289	97	+	181019	TTTTGTTCTGAAtaaaagggctcaccaccacttgtagttgcagtccaaatcctagaactctttactaacccctgagtgcttgcaaccaaaaagtcac
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	527419	97	+	636262	TTTTGTTCTGAATAaaagggctcaccaccacttgtagttgcagtccaaatcctagaactctttactaacccctgagtgcttgcaaccaaaaagtcac
s	simRat_chr6.simRat.chr6	538459	97	+	647215	TTTTGTTCTGAAtaaatgagttcaacaccacttgtagtcgcagtccaaatcctaaaactatttactaacccccgaatgcttgcgaccgaaaagtctt

a
s	mr.mrrefChr3	79386	130	+	181019	acaactccttgaaatgttttttgacatgttatttacatatggtccctaagctgggatgAATAGCGAATGGCCCACACTAATACTGCCCCTTTTCTCTATGGTTAATCTATTCTGTCCACATTAAGTCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	527516	130	+	636262	acaactccttgaaatgttttttgacatgttatttacatatggtccctaagctgggaTGAATAGCGAATGGCCCACACTAATACTGCCCCTTTTCTCTATGGTTAATCTATTCTGTCCACATTAAGTCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	538558	130	+	647215	aaaaccccttggaatgttttttgacatgtcattcacatatggtccataagcagggaccAATAGCAAATTGCCCACTCGAATACATCCTCCTTTCTCTATGGTTAATTTATTCTGTCCACATTAAGACTTT

a
s	mr.mrrefChr3	79516	20	+	181019	CAGCTGGGACTCCTAAAGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	527654	20	+	636262	CAGCTGGGACTCCTAAAGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	538688	20	+	647215	TAGCTGGCCCTCCTTGAGTT

a
s	mr.mrrefChr3	79536	24	+	181019	GGTTACTGGTCTGGTGGTCAtgaa
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	527675	24	+	636262	GGTTACTGGTCTGGTGGTCATGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	538708	24	+	647215	GGCTACTGGTTTGGGGGTCAtgaa

a
s	mr.mrrefChr3	79560	19	+	181019	ttacaccgttgtcaatagg
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	527699	19	+	636262	TTACACCGTTGTCAATAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	538733	19	+	647215	ttaaacccttgtcaactgg

a
s	mr.mrrefChr3	79579	17	+	181019	gatccagcaaaggaaga
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	527718	17	+	636262	GATCCAGCAAAGGAAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	538770	17	+	647215	gatccagcaaaggacga

a
s	mr.mrrefChr3	79596	300	+	181019	gtcacatggaatccccagAAAACTTCTGTTCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCTTATGCAGCTGTTGACATGTGCATATCTACCTGTGCATATCTACCAGGTATAACATAGATGGAAATGAAGTTCTTACAAGACACAAGTATACTCATCCCCCTTAAGCAAGGTTAAAAAAACATTATTCCACTTTATGCAATTAAAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGGAGTAAATCTTCTACAACTACAAATATATTAATGCCTACTTTGCATTTTGAATGGTCTGAGGTCACTATTTCAGTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	527735	198	+	636262	GTCACATGGAATCCCCAGAAAACTTCTGTTCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCTTATACAGCTGTTGGCATGTGCATATCTACCTGTGCATATC------------------------------------------------------------------------------------------------------AAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGGAGAAAATCTTCTACAACTACAAATATATTAATGCCTCCTTTGCGTTTTGAATGGTCTGAGGTCACTATTTCAGTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	538788	279	+	647215	gtcacatggaatccctagGCACCTTCTGTGCAGTGATATGTAATTACTAGGGGCCTATGCGGCTGCTGACATGTGCATATCTACCTGTGCATATCTACCAGGTATAACATAGATGGAAATGAAGTTCTTACAAGACACAAGTATACTCATCCCCCTTAAGCAAGGTTAAAAAAACATTATTCCACTTTATGCAATTAAAACAACACTTTCTCATGTTGGGAGAAGTAGGTCTTCTAGAACTACAAATA----AATGTCTACTTTGCATTTTGAATAGTATGAG-----------------

a
s	mr.mrrefChr3	79896	228	+	181019	GAGCTAGGGATAACTAACTAAGCTCCCTTGTCTCTTGGCTTCAGCAGACGTTTATGTCATTTATCTATCATTACATCTGATATCTGCTACTACTTGAGTGAACTGCACTGAGCTAACCAACATGTGGTCCAGATCAAGGGAGAAGCCACATATGCAAAGCACAATTCTGTATTGGTTTGTCAGGCTAGAGATTGTATTCACCCTACTTGATTAACATCCTTAATCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	527935	210	+	636262	GAGCTAGGGATAACTAACTAAGCTCCCTTTTCACTTGGCTTCAGCAGACGTTTATGTCACTTATCTATCATTACATCTGATATC------------------CTGCACTGAGCTAACCAACAGGTGATCCAGATCAAGGGAGAAGCCACATATGCAAAGCACAATCTTGTATTGGCTTGTCAGGCTGGAGATTGTATTCACCCTACTTGATTAACATCCTTAATCTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	539067	197	+	647215	------------------------CTCTTGTCTCTTG------GCAAACGTTAATGTCATTTATTGATCATTACATCTGATATCTGCTACTACTTGAGTGAATCGCACTTAGCTAACAAACATATGGTCCAGCTCAAGGAAGAAGCCGCATATGCAACACACAATTCTCTATC-GTTGGCCAAGCTAGAGATTGTACTTCTCCAACTTGATCAACATCCTTAATCCAT

a
s	mr.mrrefChr3	80124	21	+	181019	GCGTTTTGTGGATATTGACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	528175	21	+	636262	GCGCCTTGTGGATATTGACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	539264	21	+	647215	GAGTTGTGTGGATATTGAGTA

a
s	mr.mrrefChr3	80145	626	+	181019	CCACAAAGGAGTGACTGTGAGAACTATGTTAAACTATTCATCCTTGTTCATGTGTTCTAACTGGTTGGTGTCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAGATATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGTAGCATTTATGATTTAGGTTACAATCATGAATATAAAATACAGTAGCTTTTGGTACCAGCTATCAGTAACCGTGAAAACAGATGCTGTACATTCACTAAGTCCGGGCTGGAAGCACATGAATGATAAAGAACTTTCTGAATTACTCCCAAATATAAAATTTCATCAGCAGACTATGGCAAAGTGGCTTCAATTCTTTTTAAGGCATAGGCCTCTACCATGGCTGATGAGTTGTGTTCTGATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGATTTTGACAGTAAACTAGAGCATCACATGGGCTAATGACGAATCACAGCATAGGAATACTGCAACCTTCAGGGTTAATATTAGTCTAGTCAATCGGTACCAATTATGGTATCTCTGACTGTCATTTGCCAGACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTATCTGCATACACTACCACAAGAGGAATACTTGTTTGCACTCCTTTAACAGCTAATGCACAATGTATGACTTGACGACAAGTCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	528196	622	+	636262	CCACAAAGGAGTGACTGTGAGAACTATATTAAACTATTCACCCTTGTTCATGTGTTCTAACTGGTCGGTGCCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAGAGATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGTAGCATTTATGATTTAGGTTACAATCATGAATATAAAATACAGTAGCTTCTGGTACCAGCTATTAGTAACCGTGAAAACAGATGCTGTACATTCACTAAGTCCGGGCTGGAAGCACATGAATGATAAAGAACTTTCTGAATTACTCCC--ATATAAAATTTCATCAGTAGACTATGGCACTGTGGCTT-AATTCTTTTTAAGGTATAGGCCTCCACCATGGCTGATGAGCTGTGTTCTTATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGATGTTGACAGTAAACCAATGCATCACATGGGCTAATGACGAATCATAGCATAGGAATACTGCATCCTTCAGGGTTAATATTAGTCTAGTCAATCGGTACCAATTATGGTATCTCTGACTGTCATTTGCCAGACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTTTCTGCATACACTACTACAAGAGGAATACTTGTCTGCACTCCCTT-ACGGCTAATGCACAATGTACAACTTGACCACAAGTCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	539286	624	+	647215	CCACAAAGGAGTGACTGTAAGAACTATGACAAACTACTCATACTTGTTCATGTGTTCTAA-TGGTTGATGTCTACCCTGGATTTTAATTCTGACCAACTATACCCTACAAGAAGCCAGATAGGGGGCACTTATGATTTAGGTCACAATCATGAATTTAAAATTCAGTAGCTTTTAGTACCAGCTATCAGTAACTATGAAAATAGATGACATCCATTCACTATGTCCTGGCTGGAATCACCTGGATGATAAAGAACTTTCCTAATTACTCCCAAATATAAGTTTTCGTCAGCAGACTATGGCAAAGTGGCTTCAATTCTCTTTAAGGCATAGGCCTCTACCATGGCTGATGAGTTGTGTTCTGATCTCCTTGTTCTATTGACCCTGTGGTTTTGACAGTAAACTGGAGCATCACATTGACTAACAAAGAATCACGTCATGTGAATACTGCAACGTTCAGGGTTAATATTAGCCTAGTCAATCAGTACCAATTATGGTATCTCCGACTGTCACTTGCCACACAGTTCCAAGTAGGCTGTAACCTATCAGCATACACTAACACAAGAGGAATACTTGTTTGCACCCCTTTAACAGCTAGTGCACGATGCATGACTT-ACGAGGAATCTG

a
s	mr.mrrefChr3	80771	13	+	181019	TTTGGTCAATAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	528827	13	+	636262	TTGGGTCAATAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	539910	13	+	647215	TCTGATCTATATG

a
s	mr.mrrefChr3	80784	8	+	181019	ATCTGACA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	539928	8	+	647215	GTCTGACA

a
s	mr.mrrefChr3	80792	19	+	181019	TGACCCGGATTGTTAAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	528850	19	+	636262	TGACCCGGATTGTTAAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	539936	17	+	647215	--ATCCGGATCAGTAATAT

a
s	mr.mrrefChr3	80811	10	+	181019	GTTTCATTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	528869	10	+	636262	GTTTCATTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	539966	10	+	647215	ATCTCATTCA

a
s	mr.mrrefChr3	80821	19	+	181019	CATCAGACAGATTCCTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	528879	19	+	636262	CATCAGACAGATTCCTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	539979	17	+	647215	CATTAAAC--CTGGCTTGT

a
s	mr.mrrefChr3	80840	135	+	181019	CTGAATACCTTGATCTACATAGTTAAGTCTATGGATGAAAGACAGAAGGATGAAGCTTTCATGCCTACAGCCTTTGTGGTTTAAGATAAGATATCCTTGGCTAATAGAGCCACTCATAGTGCTTACTTTATCAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	528898	135	+	636262	CTGAAAACCTTAATCTGCATAGTTAATTCTATGGATGAAAGACAAAAGGATGAAGCTTTCACACCTACTGCCTTTGTGGTTTAAGATAAGATATCCTTGGCTAATAGAGCCACTCATAGTGCTTACTTTATCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	540000	135	+	647215	CTGAATGCCTTGATCCACACAGTTAAGTCTATGAATGAAAGACAGAAGGATGAACCTTTCATGCCTACAGCCTTTTTGGGTTAAGATAAGATATCCTTGGCTAATAGAGCCACTCATAGTCCTTATGTTATCAGT

a
s	mr.mrrefChr3	80975	41	+	181019	TTCCAAGAAAGCGGAAACCTAACTGCATATGTTACCTCAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	529033	41	+	636262	TTCCAAGAAAGCGGAAACCTAACTGCATATGTTACCTCAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	540138	41	+	647215	TTCCCAGAAAGCACAAACCTATGTGCTTATGTTACCTCAAG

a
s	mr.mrrefChr3	81016	71	+	181019	ATAATTGTATGCACCCCCTCAACAGCTAAAAGGAGATTGGGAAACTTGACCACAATTAATGTCAAATGCGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	529074	71	+	636262	ATAATTGTATGCACCCCCTCAACAGCTAAAAGGAGATTGGGAAACTTGACCACAATTAATGTCAAATGCGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	540183	71	+	647215	ATAATTGTCTGCACCCCCTCAACAGCTAGAAGGAGATTGGGAAACTTTACCACAATTCATGTCAAATGTGT

a
s	mr.mrrefChr3	81087	14	+	181019	GGGAACGAGGTCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	529145	14	+	636262	GGGAACGAGGTCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	540256	14	+	647215	GGGAAGAAGGTCCG

a
s	mr.mrrefChr3	81101	161	+	181019	ACTGGTAAGGATATGACTGACCTTGATTGTCAAACTGTTCCAAATAAATCACACAGATCCCTTGTCTGTACATCTTACCTTGCTTTTCGCAAATGCTCTACATAGTTAAGTGTATTAATCAAGGGCAGCAGGCTGCAGCTTTCATGTCTATAGCCTGTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	529159	161	+	636262	ACTGGTAAGGATATGACTGACCTTGATTGTCAAACTGTTCCAAATAAATCACACAGATCCCTTGTCTGTACATCTTACCTTGCTTTTCGCAAATGCTCTACATAGTTAAGTGTATTAATCAAGGGCAGCAGGCTGCAGCTTTCATGTCTATAGCCTGTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	540288	161	+	647215	ACTGGTAAGGATATGGCTGACTTTGATTGTCAAACTGTTCCAAACAAATGACACAGATCCCTTGTCTGTAGGTCTTACTCTACCTTTGGCAGATGCTCTACATAGTTAAGTGTCTTAATCAAAGGCAGAATGATGCAACTTTCATGTCTATAGCCTTCATG

a
s	mr.mrrefChr3	81262	454	+	181019	TCTCCTATTTTATCAGTATATCTTCTAGGGTTCATCACAAATGTTGCAGGACTCTGCATCCCGTCTACACACTTATAAATTGTTGATAAGAATACACTTGCTGTATGCCTAGGAAACGCTTAATATAAAATCACTCATGTAAGTACATGGGTCTGAAGTGGGGGAACAGGCACCCAGCGCACACTTAACCTTTTGCACTTAAAGTTCTCGTGCCCTTTATGACTAAGAATTAATAATTGAAAGTGTGCTGCCACCCAATAATACAAGACTCATATAGAATGGTATTGACAGATGAACAGTTTATACATCTCGCTGATTTTTCCTGAATGGGTTTGAAGAACATTACAACAAGGATGAGGCTACTCATGATGACCATTCACAACTTCAATATCCAGAGATCCCAAAGTAGGAAATAGCTATTGAAGTGAGCGGGGTTACACAGCAGGACTTAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	529320	429	+	636262	TCTCCTATTTTATCAGTATATCTTCTAGGGTTCATCACAACTGTTGCGGGACTCTGCATCCCGTCTACATACTT---------------GAATACACTTGCTGTATGCTTAGGAAACGCCTAATATAAAATCACTCACGTAAGTACCTGGGTCTGAAGTGCAGGAACAGGCACCCAGCGCACACTTAACCTTTTGCACTTAAAGTTCTC-TGCCCTTTATGACTAAGAATTAATAATTGAAAGTGTGCTGCCACCCAATAACACAAGACTCATATAGAATGGCATGGACAGATGAACAGTTTATAC--CTTGCTGATTTTTCCT------GTTTGAACAACATTACAACAAGGATGAGGCTACTCATGATGACCATCCACAACATCAATAACCAGAGAT-CCAAAGTAGGAAAAAGCTATTGAAGTGAGTGGGGTTAAATGGCAGGACTTAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	540504	453	+	647215	TCTCCTATTTTATCAGTATGTCTCCTAGGGTTCATCACAAATATTGCAGAACTTTGTATCCCGTCTACACACCTATAAATTGTTGATAAGAATACACTTGCTGTGTGCCTAGGAAATGCTTAACATAAAAGCACTCATGGAAGTACATGGGTCTGAAGTAGGGGGACAGGCACTCAGTGCACACTTAACCTTTTGCACTCAGTGTTCTTGTGCACATTATGACCAAGAATTAATAATTGATAGTGTGCTGCCACCCAATAATACAAGACTTATATAGACTGGTATTGACAGATGAACACTTTATACATCTCTCTGATTTTTCCTGAATGGGTTTGAAGAACCTTACAACAAGGATGAGACT-CTCATGAAGACCCTTCACAACTACAATATCCAGAGATCCCGAAGTGGGGAATAGCTATTGAAGTGAGCGGGGTTACACAGCAGGCCTTAATG

a
s	mr.mrrefChr3	81716	57	+	181019	ATTGAGATTTTGAACAGCACCTCATACAAAGCTCCAATAAAAGGGCAAAAGTGGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	529751	57	+	636262	ATTGAGATTTTGAACAGCACCTCATACAAAGCTCCAATAAAAGGGCAAAAGTGGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	540957	57	+	647215	ATTGAGATTTTGAACAGCACCTCATAGAAAGCTCTGATGAAAGGGAAAAAGTGGCCA

a
s	mr.mrrefChr3	81773	50	+	181019	GATGTGTGTGGTTAGGATTCGGCGGATGAGCCTGCCGGCGTCATGCACTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	529808	50	+	636262	GATGCATGTGGGTAGGATTCAACGGATGAGCCTGCCGGCGTCATGCACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	541016	50	+	647215	GGTGTGTGTGGTTAGGATTTGGCTACTGAGCCTGCCTGCGTCATGCACTG

a
s	mr.mrrefChr3	81823	38	+	181019	TAGGTGATGACAGGTTCATCATATAGTGCAAAATCAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	529858	38	+	636262	TAGGTGATGACAGGTTCATCATATAGTGCAAAATCAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	541067	38	+	647215	TAAGTGATCACAGGTTGGTCATACAGTGCAAAATCAGG

a
s	mr.mrrefChr3	81861	55	+	181019	GAAAGTCTTGAAGCTGGGTCCCTGTATACATAGTGCCTTGCAATCTTGCAACTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	529896	55	+	636262	GAAAGTCTTGAAGCTGGGTCCCTGTATACATAGTGCCTTGCAATCTTGCAACTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	541128	55	+	647215	GACAGTCCTAAGGCAGGGTCCCTGTATACCTAGTACCTTGCAATCTTGCAACTGA

a
s	mr.mrrefChr3	81916	121	+	181019	CCCTATGAGTTATCCATTGGTCTGGGGGACATGAGGCTGAACTCTAATTAATTGAACTGAACCAGTCATGGATTTCGGTGAACAAAGGGGGAATGGAACAATTATGGTGAACACACATTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	529952	121	+	636262	CCCTATGAGTTATCCATTGGTCTGGGGGACATGAGGCTGAACTCTAATTAATTGAACTGAACCAGTCATGGATTTCGGTGAACAAAGGGGGAATGGAACAATTGTGGTGAACACACATTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	541183	121	+	647215	ACCTATGAGTTATCCATTGGTCTGGGGGACATGTGGCCGAACCCTAATTAATCGAACTGAACCAGTCATGGATTCCAGTGAACAAAGGGGGAATGGGGCAATCATGCTGAATACATATTTA

a
s	mr.mrrefChr3	82037	86	+	181019	GGTTGTGCAGCTCACCTCACTGGTGCTTACTTACAAATTAACCACCCAGATTTGTAAGGTGAGTCAGGCTTTGAAAGATCATGTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	530081	86	+	636262	GGTTGTGCAGGTCACCTCACTGGTGCTTACTTACAAATTAATCCCCCAGATTTGTAAGGTGAGTTAGGCTTTAGAAGATCATGTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	541304	85	+	647215	GGTTGTGCAGCTCACCTCACTGGTGCTTACTTACAAA-TAACCACTCAGATTTGTAAGGTGAGTCAGACTTTGAAAGGTTATGTGG

a
s	mr.mrrefChr3	82123	150	+	181019	TTTAAGTAGATTTGGAGCTAGATTGCTCTTAAACCAGTTTGCCTTAAACATAAACTCCATATCCCCTAATATCCACTCAGCATGTCTCAAAAGACATGCATGTACTTACTTACTATGTTATCATAGGCACATGCATAACATGATTTCTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	530167	150	+	636262	TTTAAGGAGATTTGGAGCTAGATTGCTCCTAAACCAGTTTGCCTTGAATATAAACTTCATATCCACTAATATCCACTCAGCATGTCTCAAAAGACATTCATGTACTTACTTACTATGTTATCATAAGCACATGCATAACATGATTTCTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	541395	150	+	647215	TCTGGGTAGATTTGGAGTTAGATCACTCTTAAACCAGTTTGCCCTAAACATATACTCCACATCCCCTAGTGTCCACCCAGCATATCTCTAAAGACATGTATGTACTTAGTGACTATGTTATCCTGGGTACATGGTTAACATGATTTCTCA

a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	89133	118	+	181019	AACTAATACATACACTAGTCATTATATGCCTCAATTTACATAGATTTTAGCCTAGACATGGAAAAGTCTGTAGTGGACTCCTGGATGACTTGTGCCAACATACTACATGCCAGATTCA
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a
s	mr.mrrefChr3	89251	121	+	181019	ATAAAGATGGTCTCCGTGTCATATGATAAAACGAGCCAAATATAGACAATCAATAGGTTTATGTTACTATATGGTATACTACCAATGAATTGAATTTAATTAGTTTGTGTTCATTACATTA
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a
s	mr.mrrefChr3	89372	86	+	181019	GCAAACCGAAAAACAGTGCAATATACTAGACCTGGAACCACAAGTTACTATACATCAAATAATTCGTTCTGTTTCTCTCAGGCCTC
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a
s	mr.mrrefChr3	89458	70	+	181019	AACATAATAATTGAGCCAAATTGAGTTGGTGGGTCTACTAAGCCACCAGACTGGCCAGACAGCTGCAGCC
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a
s	mr.mrrefChr3	89528	123	+	181019	GAGTTCTAGGTATAGTAATATGcaaagacagcaatatttgataactggtgccagagtatttggtgtcctatctgttaggagctAAACTAAAATGAGCTGCATGGCACCCCTGGCCCTCTCAGT
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a
s	mr.mrrefChr3	89651	179	+	181019	CTAGAGGAGTAATATGGACTCCACCAGACAAGGAACTACATCGTGTGGAATTCTACCCTACTCCTCATTCCTAATCctttcagctgccaaagtgtgttccagaggattatttgggtcacaggattcaatattctgacattaaaatgacttgcaagcttgagacaccaaggaaggtagag
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a
s	mr.mrrefChr3	89830	98	+	181019	aaactgaggcttggtctacaagatggggatactacagTTAACTGcAAACCTACACAATATGTAATGTATTCATCATAAGAAGGCTAGCCTCATGGAAT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	551571	97	+	647215	aaactgaggcttggtctacaagatggggatactaccaCCAACTG-AAACCTACACAATATGTACTATATTCATCATAAGAAGGCTAACCACATGGAAT

a
s	mr.mrrefChr3	89928	41	+	181019	AATATACAAAACTAACAATGGGCAAAGAATGTGAATAGGTG
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a
s	mr.mrrefChr3	89969	126	+	181019	CTAGGGAAGATATCCCTTAAGGATATACTAGTGCATAGCCCACTTTAGTGGCTGCGTTTTAACTGACATAGAGAAGGATTATAAACACTAATAACATAACTAATCAACCCCAAGGGAGACAGTAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	539771	126	+	636262	CTAGGGAAGATATCCCTTAAGGATATACTAGTGCATAGCCCACTTTAGTGGCTGCGTTTTAACTGACATAGAGAAGGATTATAAACACTAATAACATAACTAATCAACCCCAAGGGAGACAGTAGT
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	90104	84	+	181019	TTAAAATATAAATGAAACAAGAGTGAGACCTTAAATCAGTTCTATggagtggtcattagaatacttcagagtaaaaatgagaca
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a
s	mr.mrrefChr3	90188	14	+	181019	tttttgagaaaatt
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a
s	mr.mrrefChr3	90202	36	+	181019	gagaataataAAAGCCTTGAGGTTTGATGCAAGTGT
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a
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	540177	234	+	636262	AATGCAGAGCTCACTTAGTTAaatgtgatccacctagtgaattgaaaagcaagacctgggaaaatgaaaagaagctttcatatccactaagataattccaagaagcatgccaggcagtaggaatactccatgcagttaaagacctgttggaaactgttcccatcaaatttacaactcttaagaaggggtcacttgtttgacagatcacatacttcctgtgcattcaccacaaat
s	simRat_chr6.simRat.chr6	552083	234	+	647215	GATGCAGTGCTCAATTAGTTTAATGTGATCCAGCAAGTCAATTCAAAACCCAGATCTGGGAAATTGAAAAGAAGTTGTCATATCCAGTAAGATAATTCCAAGAAACATGCCAGGcagtaggcatactccatgtagttaaggtcctgttggaaactgttcccaacaaatttacaaccttaaagaaggggtcacttgtttgacaggttgcatacttcttgtgcattcaccacaagt

a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	90966	48	+	181019	CTTAGTGAATCTTTCTGTTTTAATGCAGAGAAAATTAGCTATTTACTG
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a
s	mr.mrrefChr3	91014	54	+	181019	TTGTGAATTGCAACTCACACTATATCAAGCGAAATAAAAATAATAATCATCAAC
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a
s	mr.mrrefChr3	91068	6	+	181019	AGTACA
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a
s	mr.mrrefChr3	91074	146	+	181019	AATAGCTTGGTAGTATATCCCTGATAACACTACCACCTGCCCTCTGTATAGTACAAATTCTACACCTGTTCATATTTCTTAGTGATTCATTTGTCTCTCATAGACTGATGTGAGGTATATGGAGGAATCTCCAATTCCAGTACTGA
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a
s	mr.mrrefChr3	91220	219	+	181019	TTAGGGCTTGGGCAGCCATGATATTTAGGAGATAATCTGCTATGATTCACTGTTGATCTACTTGTCATTGGCTCACAAAAAGTTGTGGCCCCAAGTTAGATTGAGTAGGGATTTGTAACCTCAGATATGGCTTGTGAAGGGCACACACCTTAACTAATATGACTCCAACTCGCATACATATTCTAACTGTGCCTGCCTTAAGCTAACTACTGTCCTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	541199	218	+	636262	TTAGGGCTTGGGCAGCCATGATATTTAGGAGATAATTTGCTATGATTCGCTGTTGATCAACTTGTTGTTGGCTCACGAAAAGTTGTGGCCCCAAATTAGATTGAGTAGGGATTTGTAACCTCAGATATGGCTTGTGAAGGGCACACATCTTATCTAATATAATTCCA-CTCGCATCCATATTCTAACTAGGCCTGCTTTAAGCTAAGTACTGTCCTGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	552998	218	+	647215	TTAGGGCTAGGGCAGCCATGATATTTAGGAGATAATCTGCTATGATTTACTGTTGATCTATTTGTCATTGGCTCACAAAAAGTTGCAGCCCCAAGTTAAATTGAGTAGGGATTTGTAACCTCAGACGTGGCATTTGAAAGGCACATACCCGAACTAATATGACTCCAACTTGCACACATATTCTAACTGTGCCTGCCTTAAGCGAACTACTGTC-TGTG

a
s	mr.mrrefChr3	91439	48	+	181019	TTTAAAGTGGGAGATGGAATTAGTTGAATTTCAAAAAGTGAGAGTCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	541472	48	+	636262	TTTAAAGTGGGAGATGGAATTAGTTGAATTACAAAAAATGAGAGCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	553216	48	+	647215	TTTAGAGTGGGAGATGGAATTAGTTGAGTTTCAAGAAGCGAGAGTCTT

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	541520	187	+	636262	ACTATGATAGCCTTACCTGGGCCGTGAATAAAGTGACCCCTTAAGCCAAAGGGCACCTAGCGCATATGAGTGGGGTGAGTAATTAATCACCTGCAGTCCGCTACCACCCTAAAACTGCCTATAACTAAATTCACCCCAGCCCAATGTTGAACTAAGACTGATGGGCATTATGGGATGTACTGTAATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	553265	187	+	647215	GCTAGGGTAGCCTTACTTGGGCCATGAATAAAGTGACACTTTAAGCCACAGGGGACCTAGCACATGTGATTGGGTTGAATCATTAATCACCTGCAGTCCACTACCACCCTAACATTGCCTATAACTAAATTCACCACAGACCATTGTTTGACTAGGACTGAAGGGCATTATGGGATGTACTATAATC

a
s	mr.mrrefChr3	91674	96	+	181019	ACTATACCAGGGCCAAGGTGAGGTTACATGTAAATGTCTCAATATTTGATGTGGTCCACAATTTCCCCTTATTAGCATGGAATTGAACTTTTTTTG
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a
s	mr.mrrefChr3	91770	46	+	181019	CATCCTGCTTGCAGGCTTTTAACCATCCACCAGGAAACATAGGTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	541836	46	+	636262	CATCCTGTTTGCTGGCTTTTAACCATCCACCAGGAAATGTAGGTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	553530	46	+	647215	CACTGTGCATGCAGGCTTTTAACCATCCACCAGGAAACATAGGTCT

a
s	mr.mrrefChr3	91816	488	+	181019	ATGGTATTGGCTCTAGTTGCAAGATATGATCTTGGTTAGACTTTACCATGTCATCTGGTTACTATTTTTGATCATCATCTAGGGGCATGTACACATCAACTCCTGCCTGGAGACAGAGGTTGAAGAATAGACATAACAGCAGGagaaatcccatttcagccataagcttgttccctctccacagcattctgactatttaaagagttcagtagtacctggttcgtgggcatatgctaagttctttactacttatggctgtcctcgcaacctgaaaactctcagatctaaaagctggaacccctaaggtgGTATCACATGTGGCTAGTCgCATTATAAAACTGGAGCCCACCAAGCTGTGTGACTTGCAAAGAGGTCTCTTGGATGGTTTCTGAAGCATTGTCACACTGGGATGTTGACAGCTCCAGGAGACTTGTTCACATTGCTTAAGTGGCAGCCACACAAAAAGGTTAGCCTTTAGATAGGCACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	541882	458	+	636262	ATGGTGTCAGCCCCAGTTGTAAGAAATGATCTTGGTTGGGCTTCACCAAGTCATCTGGTTACTAATTTTGATCATCATCTAGGGGCATGCACACATCAACTCCTGTCTGGAGACAGGGGTTGCAGACTAGACATAAAAGCAGGagaaagtccatttcagccataagcttgctccctctc---agcattctgactatttaaagagttcagtagtacctggt----gggcatatgctaggtt--------------actgtccttgcaacctgaaaactctcagatctaaaagctggaacccctaaggtgGTAACACGTGTGGCTAGTCGCATTGTAAAACTGGAGCCCACCAAGCTGTGTGTCTTGCAAA---------TGGATGGTTTCTGAAGCATTGTCTCACTGGGATGTTGACAGCTCCTGGAGAATTGTTCACATCACTTAAGTGGCAGCCACACAAAAAGGCTAGCCTTCAGATAGGCACTA
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a
s	mr.mrrefChr3	92304	63	+	181019	TACGACTAGAGCTACTGTTATTCATATATTCAGCATTTGCCCTATTGCTGTTAGCCCTAGGGT
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a
s	mr.mrrefChr3	92367	81	+	181019	TTCCCTCCACCTAATTTCAGCCCGATGTGGTAAATTGGATAAACACTATTGGTAAGGTACATCCATGTGTTTGATATAACC
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	92850	74	+	181019	AAACATAGGAGAATGAGTTACTGGGAAGTTGGGATACTGGAAATCTAGTATCCACATAAATGTTTAATATTCAT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	93589	54	+	181019	TGGTTTTAATCATTTCCAAACTAACCTAGATTCAGTGCAAGTTAACTGATAAGT
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	93809	124	+	181019	TAGGGGGGGGGGTGTATGGACTGTGATGCCTCATAGTTAGTTTTCATTATGTAAAGTCAATCTTTCACGTTAACAGCAAATTGTTGCCTATAATATATCTGGGACTACAAGCGACACATTGATT
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	94411	197	+	181019	AAGAAACCTTACCTAAGAACATCTCACATCCCAAATTCTGAATGATCATTGCTGTGAGGGTGGGCTACACAAGCACCATTCCATCATCTGGTACAAGTGTTTCCCTTTTGAGCTAAATTGTTGAATTACAGTGACTCAGGTGAAAAGCAAGTTATAGGGGATAGCTATGGGGTTAAAAGGTGTACCCTAGTAGATCC
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	544417	405	+	636262	ACTATCAACAAAAAAAACTAATAAATAATGATCAAC----AGTGCATTCTTGCTTTAGAGGGACTATCATTGTTA-CACCTCCACACGATTTCCCATTCACTGGGTATCTTTATTTTT-ATGTATCTTGGCCACAATTAGGAACAGCAACTGTGTACATCCAAACTTGTACAAGAGTGTTTCATTTTTCTCTGGGTAATTGGGCCTGATCAGATATGGCCATCTGTCCTAACCAATTGGCTGAATCGGTGTGTAAGACAAGGTAGCTATGCATAAGCATTGATATTTAGCTGTGAGCTTTCACTTTGGGTGAGCCCATGTATGGACACATCTCTGTTCCCGTACTAGAAATAAAATTAATTCCTTTGCAAGTTTGGTAACTCCAATACAAGCTATATTCAATAATTATTTG
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a
s	mr.mrrefChr3	95019	170	+	181019	attaatcgTCCAAACTAATGAGTGGATACAGTGAAATAACAGAATCCTCAGAGATGGAAAGTCTGAACCCGACCACCTAGTGTGAAAAACTATCTGAAGCCAAGGTGCTAAGGTGTTGGACACCAGAATCAGAATTGAAGAGCCCTTTCATCTGCAGGCAGGTTACATTG
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	95222	316	+	181019	ATGATAAGTAACAAAGTGGGTTTGCCTACCTTTTGAAACCTTTGAAGTGTAATTAACTTCTTATCTTAGGTGGAATTCAATCTGTGATCAAGTTGAAATGCATTTGCTTCTGGTTACCAAAACATATAATCTTGTGAGATTTAGGGTTCCTTTGAATCTGCATTCAACTGAGGATTAACAATTAACTAGGATAGAGTTGGGACAAAACTGCCATGGGGATCAGAGAGCCTCCAGAAATAAATTTGTTGTGTGATAAGCAAACCTGTGAGATTCAGAAAAGCACAACTGTTAGAAGGGAAGTGAAAAGCAGCATACC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	557245	314	+	647215	ATGATAAGTAGCAAAGTGGGTTTATCTACCTTTAGAAACCTTTGAAGTGTACTTAAGTTCTTACTTTATGTGGAATCCAATCTGCGATAAAGTTGAAGTGAATTTCCTTCTGGGTACAAAAACATAAA--CTTGTGAGTTTTATGGTTCCTTCGAATCTCCATGCAACTGAGGATTAACAATTAGCTAGGATAGAGTTAGGACAAAACTGCCGTGGTGATCAGGGAGCCCCCAGAAATATATCCGTTGTGTGATGGGCAAACCTGTGAGGTTCAGAAAAGCCCAACTATTAAAAGGGAAGTGAAAAGCAGCATACC

a
s	mr.mrrefChr3	95538	22	+	181019	AATTGAATTGATACTGATAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	545343	22	+	636262	AATTGAATCGACACTGATTACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	557561	22	+	647215	AATTAATTTGATACTGATAATT

a
s	mr.mrrefChr3	95560	135	+	181019	TGTTAAGTTTACCTGAGTGTGTGATTGCATGGTTGGCTCAGTCACTTTCCTGAGGAGTCCAACACTACTAGTTGCAAGATTGGGCTGCAACAGAATGTGACTGTGCAAGCAATAATGTGAGAGTCCTAAACCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	545365	135	+	636262	TGTTAAGTTTCCCTGAGTGTGTGATTGCATGGTTGGCTCAGTCACTTTCCTGAGGAGTCCAACACTACTAGTTGCAAGATTGGGCTGCAACAGAATGTGACTGTGCAAGCAATAATATGAGAGTCCTACACCACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	557588	134	+	647215	TGTTAAGTTTACCT-AGTGTGTGATTGCATGGTTGGCTCAGTCACTTGCCTAAGGAGTCCAACACTACTAGTTGCAAGATTGGGCTGCAACAGAATGTGACTGTGCAAACAATAATGTGAGAATCCTGAACCACA

a
s	mr.mrrefChr3	95695	36	+	181019	GCTTGGCATGTATACACCGAGGTGTGATGCAGGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	545500	36	+	636262	GCTTGGCATGTATACATTGAGGTGCAAGGCCGGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	557723	36	+	647215	GCTTGGCATGTATACACCGAGGTGTGATGCAGGCAA

a
s	mr.mrrefChr3	95731	233	+	181019	TTTTGCAGGATAGATTTTAAAGCAGAAAACAGAGCTTGAACATGTTTGAGGATGCAATGACTGTGCAGTATACTAGCATGCTGGGAGTATGGGACAGTGTGTCAGACTAAGGCTCTGGCAGCATTGTTCTTAGTCAGCATAGCCTAGTGAGAATTGCTAAGTCATGACAATAGTGCCAATGTTAGCTTCAGGCAAGCTATAATACAGTTAGTGAAGTACATTGCACAGGAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	545536	233	+	636262	TTTTGCACGATAGATTTTAAAGCAGAAAAGAGAGCTTGAACATGTTTGAGGATGCAATAACTGTGCAGTATACTAGCATGCTGGGAGTATGGGACAGTGTGTCAGACTAAGGCTTTGGCAGCATTGCTCTTAGTCAGCATAGACTAGTGAGAATTGCTAAGTCATGACAATAGTGCCAATGTTTGATTCAGGCAAGCTATAATACAGATAGTGAAGAACATTGCACAGGAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	557760	227	+	647215	TTTTGCAGGATAGATTTTAAAGCAGAAAACAGAGCTTGAGCATGTTTGAGGATGCA-TGACTGTCCA-----CTAGCATGCTGGGAGTATGGGACAGTGTGTCAGACTAAGGCTCTGACAGAATTGTTCTTTGTCAGCATAGCCTAGTGAGAATTGCTAAGTCACGACAATAGATCCAATGTTAGCTTCAGTCCAGCTATAATATGATAAGTAAAGTAGACTGCACAGGAACA

a
s	mr.mrrefChr3	95964	218	+	181019	AGTCGAACATATGTGGATAACAGGCTCCCAGGTACAGTTGGCCTGGAATTAGATTAATGAGACCCAATATTTTGAGTGCTAAGATTACCTGGTCAGTTAGCCAGTATAACACAGATGTTTTTCAAGTGATACATGTTCATTAGCGACATTTCTGACCATAATGCACCACTAGTAGGGAGTGAATTAGAATGGAGTTCATCAGTATCTTAGCTACAGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	545769	213	+	636262	AGCCGAATATATGTGGATAACAGGCTCCCAGGTACCGTTGGTCTGGAATTAGATTAATGAGACCCAATATTTTGAGTGCTAAGATTACCTGGTCAGTTAGCCAGTATAACACAGATGTTTTTCAAGTGATACACGTTCATTAGCGACGTTTCTGACCATAATGCACCACTAGTAGGGAG---ATTAGAATGGAGTTCATCAGTATCTTAGCTACAG--
s	simRat_chr6.simRat.chr6	557996	195	+	647215	AGTCAAACATACTAGGATAACAGGCTCCCAGATACAGTTGGCCTGGAATTGGAGTAACTACACCCAATATTTTGGGTGCTAGGATCACCTGGTCGGTTAGTCAGTATGACACAGATGTTTTTCAAGTGGTACATGTTCATTAGCAACATTTCCGACTGTAATGCACTACCAGTAGGGAGTGAATTAGAATAGA-----------------------CC

a
s	mr.mrrefChr3	96182	37	+	181019	CGAAGCGATCAAGATACCAAACTTGCCCTGATTAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	545982	37	+	636262	CGAAGCGATCAAGATACCAAACTTGCCCTGATTAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	20785	37	-	647215	CACAGGAATCAGGATACCAAGCTTGTCTAGATTAATA

a
s	mr.mrrefChr3	96219	19	+	181019	TTAACTTCAGAGGGTGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546019	19	+	636262	TTAACTTCAGAGGGTGGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	20828	19	-	647215	TAGATTTGAGCAGGTGGCA

a
s	mr.mrrefChr3	96238	14	+	181019	TTACAGTATCATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546038	14	+	636262	TTACAGTATCATGA
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a
s	mr.mrrefChr3	96252	5	+	181019	GTCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546052	5	+	636262	GTCAC
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a
s	mr.mrrefChr3	96257	5	+	181019	ACTAT
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a
s	mr.mrrefChr3	96262	9	+	181019	AGTGATTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546068	9	+	636262	AGTGATTAT
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a
s	mr.mrrefChr3	96271	33	+	181019	ACCCACTAGAGCTAGCTAAAAAAAAAGCTATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546079	33	+	636262	ACCCACTAGAGCTAGCTAAAAAAAAAGCTATAG
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a
s	mr.mrrefChr3	96304	95	+	181019	AGACCAAGTGAGTGCTACTGGGAGATGTGAGTTGCCTTTACTCTCTTATCAGAAATAGAGCCATGGGAGGGCTATTGGGTATCTGCGGCAGTGGC
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a
s	mr.mrrefChr3	96399	174	+	181019	TTTCCACACAGGGCTTGTAGCATGCCCTCTGGCCAGTAAGCAAGCAACAATAAAGTGGAGTCAATTAATGAGAATAACATGGAACCATTTTGTGTACTGCCTGTGTATTGTGGATGGTTCTCTTAGGTTGGCCAGTCTTCTACAACAGTTTGGATGCCTCTGACCAGGGGCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546228	152	+	636262	TT----------GCTAGTTGCATGGCCTCTGGCCAATAAGTGAGCAACAATCGAGTAAAGTTAATTAATGAGAATAAC------------TGTGTAATGCCTGTGTATTGTGGATGGTTCTCTTAGGTTGGCCAGTCTTCTACAACAGTTTGGATGCCTCTGACCAGGGGCTTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	21027	106	-	647215	TTTCCACACAGGGGTTGTAGCATGCCCTCTGGCCAGTAAGCAAGCAACAATAAAGTGGAGTCAATTAATGAGAATAACATGGAACCATCTTGTGTACTGCCTGTGT--------------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr3	96573	11	+	181019	ATTTCTGACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546383	11	+	636262	ATTTCTGACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21308	11	-	647215	ATTTCATGCTA

a
s	mr.mrrefChr3	96584	41	+	181019	GGGGACTGTATTACTAATAATTGGGTCTCAACAAGCAGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546394	41	+	636262	GGGGACTGTATTACTAATAATTGGGTCTCAACAAGCAGCAA
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a
s	mr.mrrefChr3	96625	46	+	181019	CGTCAAAGAAGTTGGCAGTGGGTCATTTGAAACTTATGCAGTAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546435	46	+	636262	CGTCAAAGAAGTTGGCAGTGGGTCATTTGAAACTTATGCAGTAGCA
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a
s	mr.mrrefChr3	96671	14	+	181019	ATGAGTCAACAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546481	14	+	636262	ATGAGTCAACAGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21421	14	-	647215	ATGACTCAACAGAA

a
s	mr.mrrefChr3	96685	98	+	181019	TGCTCAAGGAATTGGAGCCTCTTAGTTGCCCTTTCTACTCCACCCAGTCCACCCAATCTGCTGCTTGAAAACTTGATTCTACATCCTTGAAAAGGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546495	98	+	636262	TGCTCAAGGAATTGGAGCCTCTTAGTTGCCCTTTCTACTCCACCCAGTCCACCCAATCTGCTGCTTGAAAACTTGATTCTACATCCTTGAAAAGGCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21438	98	-	647215	TGCTCAAGGGACTGGAGTGCCTTAGGTGCCCTTTCTAGTCCACCTGGGCCACCGAAACTGCTGCTCAAAAACTTGAATCTACATCTTTGAGAAAGCTT

a
s	mr.mrrefChr3	96783	88	+	181019	TAAGTTTTTCATTTGCCCCCCATCTTATGATCTTAGACACGTTTTCCTCCCACCTGTCTGTACAGGAGGTCTTACAAAAAACTCCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546597	88	+	636262	TAAGTTTTTCATTTGCCCCCCATCTTATGATCTTAGACACGTTTTCCTCCCACCTGTCTGTACAGGAGGTCTTACAAAAAACTCCATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21536	88	-	647215	TAAGTTTTCCATCTGACCCTCGCCATATGATCTTTGACAGGTTTTCCTTCCACCGGTCTGTAAAGGAGCTCTTACAGAAAAGTCCAGG

a
s	mr.mrrefChr3	96871	23	+	181019	AATGTCTTGTCAAAGTTTTGCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546687	23	+	636262	AATGTCTTGTCAAAGTTTTGCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21624	23	-	647215	AAAGTATTGTCAAAGTTTTGCAT

a
s	mr.mrrefChr3	96894	131	+	181019	AGGACCTCAGGGAAATTGATCTCTGAGTGTGAGTGTGATGTTTTGTTAGATTAGTTTGGGGCAGTTGAAAATGAAAGGGCCTGCCCAGCTTATTTATTTCATATCTTTCAATTCTTTGGGTTAAGAAACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546711	131	+	636262	AGGACCTCAGGGAAATTGATCTCTGAGTGTGAGTGTGATGTTTCGTTAGATTAGTTTAGGGTAGTTGAAAATGAAAGGGCTTGCCCAGCTTATTTATTTCATATCTTTCAATTCTTTGGGTTAAGAAACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21647	119	-	647215	AGGACCTCAGGGAAATTGATCTCTGAGAGTTAGTGCTATGTTTTGTTAGATTAGTTTGGGGCA------------AGTGTCTGCCCAGCATATTTATTTCATATCTTTTGATTCTTTGGGTTAAGGAACTT

a
s	mr.mrrefChr3	97025	89	+	181019	AAGCATTAACCACTAAGAGGTAAAGTGGTAAAACCAGTGTTTTGAGGAAAGCAATGTTACTAGGAAATATAATGTGATAAAAGACAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546842	88	+	636262	AATCATTAACCACTAAGAGGTAAAGTGGTAAAACCAGTGTTTTGAGGAAAGCAATGTCACTAGGAAATATAATG-GATAAGAGACAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21787	89	-	647215	AAGTGCTAACCACTCAGAGGTAAAGTGATAAAACCAGTGTTTTGAGGAAAGCGATGTTATTAGATAACATAATGTGATAAAAGACAACC

a
s	mr.mrrefChr3	97114	78	+	181019	TTTATATTTCTTGTCTTGTATACCAGCTACATATTCTAAAATGTTCTGACTGGCATTGGGGGCCTTCTTGAGGTACCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	546930	78	+	636262	TTTATATTTCTTGTCTTGTATACCAGCTACATATTCTTAAATGTTCTGACTGGCATTGGGGGCCTTCTTGAGGTACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21883	75	-	647215	TTTATATCTCTTGTCTTGGATACCAGCTCCATATTCTAAAATGTTCTG---GGCATTGGGGGCCCTCTTGAGGTACCT

a
s	mr.mrrefChr3	97192	378	+	181019	AACATCCCTTGTTGCAAAATCAATACGGCTGGTGATACAGTAAACCCATTACCATTAGTAGTGCCAAACTCCTCCTGCCCTGGTCTAGTATGCCTGTATAAATAGTAGTAGTACATAACAGATACTTTTGTCAATGTCAGTGTCTGTCACTGCTTGACACATTATATGTGTGTGCAGTGCCCTCAGCAGCCATTATGCCACATTGGTTTAGCCTAATATTGTAAACCCTTCTGGTTTGTATTAACCATCAGTGGCCGTTTTTCATTTGCCGCCTTTTTTTGTGTATTGATAGTTAGCGGAATTTATTGTTCCATTAGCCGCAGGTCAGCGAAATAAAATCCCAGTGGCTGCAGGTTAGCAGAAGAAAGTTGACTCGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	547016	378	+	636262	AACATCCCTTGGTGCAAAATCAATACGGCTAATGATACCGTAAACTCATTACCATTTGTAGTGACAAACTCCTCCTGCCCTGGTCTAGTATGCCTGTATAAATAGCAGTAATACATAAAGGATACTTCTGCCAATGTCAGTGTCTGTCACTGCTTGACACATTATATGTGTGTGCAGTGCCCTCAGCAGCCATTATGCCACGTATGTTTAGCCTAATATTGTAAACCCTTCTGATTTGTATTAACCATCAGTGGCCGTTTTTCATTTGCCGCCTTTTTTTGTGTAATGAGACTTAGTGGAATGTATTGTTCTATTGGCCGCAGGTCAGCGAAATAAAATCCCAGTGGCTGCTGGTTAGCAGAAGAAAGTTGACTTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	21958	376	-	647215	AACATCCCTTGTTGTAAAATCAATATGGCTGGTGATACAGTATACCCATTACCATTAGTAT-GCCAAATTCCTCCTGCCCTGGTGTACTATGCCTGTATACATAGTAGTAGTACATAACAGATACTTTTGTCAATGTCAGGGTCTATCACTGCTGGCCACATTATAAGTGTGTGCAGTGCTCTCAGCAGCCATTATGCCACATTGGTTTAGCCTAAT-TTCTAAACCCGTCTGGTTTGTATTAACCATCAGTGGCTAATTTTCACTTGCTGCCTTTTTTTTTGCATTGGTAGTTAGCGGTACTTATTGTTCCAGTAGCCGAAGGTCAGCGAAATAAAATCCCAGTGGCTGCAGGTCAGCAGAAGAAAGTAGACTCGGT

a
s	mr.mrrefChr3	97570	2	+	181019	GT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	547445	2	+	636262	GC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22334	2	-	647215	TT

a
s	mr.mrrefChr3	97572	177	+	181019	AAGTTTTGTATTTCTAAGCTTGGGAGCTATGCTTGCCCAATTTGAATTTATGTGGAGATTCCATTGATGCTAACCAGGAAACCTTAGAAGGAGCCTTAATGGCCACAACACCTCAATCAACTCTAAAACCAAATTCATCATTGATGGGTCTTTCTGATGTTAGGTTTTATGATGTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	547477	177	+	636262	AACTTTTGTGTTTCAAAGCTTGGGAGCTATGCTTGCCCAATTTAAAGTTGTGTGGAGATTCTATTGATGCTAACCAGGAAACCTTAGAAGGAGCCTTAATGGCCACAACACTGCAATCAACTCTAAAACCAAATTCATCATTGATGGGTCTTGCTGATGTTAGGTTTTATGATGTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22336	148	-	647215	AAGTTTTGTATTTCTTAGCGCGGGAGCTATTCTTGCCCAATTTGAATTTATGTGGAGATTCCATTGATGCTA-----------------------------GCCACAACACCTCAATCAACTCTAAAACTGAATTCATCATTGATGGGTCTTTCTGGTGTTGAGTTTTATGATGTTG

a
s	mr.mrrefChr3	97749	226	+	181019	CTCATGATTTTTTGTGAGCATCAACCTCATGGGTAACACATTGATTGCATGCAGAGCTTGGCCAGAATTAGAACGCTTGTTTTGTACAATCCACTCTACATTCATTTTGAGAGAATTGAGCCTTACTATTCTCCATTAAACATAATTAGCCTCTCAACCTTATTAAACAGCAGCCTGTGCACTGTCTTATACATGTATTCTAGGTGCCACATCATTAGCCAGTAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	547654	221	+	636262	CTCATGAATTTTTGTGAGT-TCAACCTCATGCATAACACATTGGTTGCATGCAGAGCTTGGCCAGAATTAGAACGCTTGTTTTGTACAATCCACTGTACATTCATTTTGAGGGAACTGAGCCTTACTATTGTCCACTAAACATAATTAGCC---CAACCTTATTAAACAGCAGCCTGTACACTGTCTTATACATGTATT-TAGGTGCCACATCATTTGCGGGTAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22485	224	-	647215	CGCATGATTTTTTGTGAGCATCAACCTCATGGGTGAAACATTGATTGCATGCAGAGCTTGGCCAAAATTAGAACACTTGTTTTGTACCATCCACTCTACATTCATTTTGAGAGAATCTAG--TAGCTATTCTCCATTAAATATAATTAGCTTCTCAACCTTACTAAACAGCAGCCTATGCACTGTCTCATAGATGTACTCTAGGTGCTACACCATTAGCCAGTAAC

a
s	mr.mrrefChr3	97975	3	+	181019	TTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	547884	3	+	636262	CTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22709	3	-	647215	TTA

a
s	mr.mrrefChr3	97978	126	+	181019	CCAGTGTTAATGATATTGCCACGTGGTATCCTGATATCACACATACCACACTGCATACCTGAATGGCAACAAAGATCCCCACCCTCCAGAGCATTTAAGCCAGGGGGGCCTGGACTGAAGAATTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	547887	126	+	636262	CCGGTGTTAATGATATTGCCACGTGGTATCCTGATATCACACACACCACACTGCACACCTGAATGGCAATAAAGATCCCCACCCTCCAGAACATTTAAGCCAGTGGGGCCTGGACTGGAGGATTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	22720	125	-	647215	CCAGTGTTAGTGATATAGCCAGGTGA-ATCATGATATCACACATACCACACCACATACCTGAATGGCAACACAGATCACAACTCTCGAGAGCATTTCAGCCGGGGGGGCCTGGTATCAAGAATTGA

a
s	mr.mrrefChr3	98104	85	+	181019	GCACTTCAGGCTCACTGATTATTTAGACTTGATTAATCATATCCATCTGCAGTAAGCCAAATAACCAAACTGCTCAATTGGCTGT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	22870	85	-	647215	GTGCTTCAGGCTATCAGATTATTCACACTTGATCAATCATATCCATATGCAGTAAATCAGATAACCAAACTGCTCAATTGGATGT

a
s	mr.mrrefChr3	98189	120	+	181019	TTATTTACGTCCTGGGGTTCATGGCTAACTGCAATGCTAAAGCGCTTTTCCCAACATGCCCCATTTTAAGTACCCACAGTTTACAAGCTCGAGTCCTAAACCCGGGAGTTATCATAGAAT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	22956	118	-	647215	TTATCTACGTCCCGGGGTTCGCGGCTAAGTACAATGCTAAAGCGCTTTTCTGAGCATGCCCCATTTTAAGTACCCACAGTTT--AAGCTCGAGTCATAAACCCAGGAGTTATCATAGAAT

a
s	mr.mrrefChr3	98309	41	+	181019	GTGAGAAGGGGAGAACCAACTTAGTTTTAACTTCAAGTAAC
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a
s	mr.mrrefChr3	98350	146	+	181019	AACCTGTCACCCCCAAGTCAGCCTGGTTGATACCCCCCCTGCGAGGAATCACTAACCAGCCGCTCTGCAGACACGATATGGGGACGTCTCATGTGCCGTCGTCGCAGACGCAATGCGGGGTGGGTATGTTCGCGCGGCGTTGGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	548231	146	+	636262	AACCTGCCCCCCCCAAGTCAGCCTGGTTGATACCCCCCCTACGAGGAACCACTAACCAGCCGCTCTGCAGACACGATATGGGGACGTCTCATGTGCCGTCGTCGAAGACGCAACGCGGGGTGGGTATGTTCGTGCGGCGTTGGGCA
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a
s	mr.mrrefChr3	98496	67	+	181019	ATACGCCCCATCGCTTATTGATTGAGCTCAATATCATCTCTGAGCTCCATGGTCTCCAGCTCCATTG
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a
s	mr.mrrefChr3	98563	145	+	181019	TTTTCCCTGCGACAAGTACCACTGTGGGCATTATCCTGTTCCATTGTACAATGCAAACATTATGTAAAACTGGTTTGAGTGGGGAGCTCAACATACAAGGTCTCCCTTCACATCATAAACAATGACCAAGGTTTATACTAGACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	548444	145	+	636262	TTTTCCCTGTGACAAGTACCACTATGGGCATTATCCTGTTCCATTGTGCAATGCAAGCATTATGTAAAACTGGTTTGAGTGGGAAGCTCAACATACAAGGTCTTCCTTCACATTATAAACAATGACCAAGGTTTATACTAGACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23358	145	-	647215	TTTTCCCTGCAACAAGTACCACTGTGGGCATTATCCTGTTCCATTGTACCTTGCAAACATTATGTATAACTGGTTTGGGTTGGGAGCTCAACATACAAGGTCTCCCCACATATCATAAACACTGTCCAAGGTTTATACAATACAT

a
s	mr.mrrefChr3	98708	70	+	181019	CTTATCCTACTCCACACGCTTCATAACACTAATATGCACTGACCACATGGATCCTATCTGTGGGCATACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	548605	70	+	636262	CTTATCCTACTCCACACGCTTCATAACACTAATATGCACTGACCACATGGATCCTATCTGTGGGCATACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23503	70	-	647215	CCTATCCTACTCCACATGGTTCATAACACTAGTCCAGACTGAAAAAATGGATCCTATCTGTGGGCATACA

a
s	mr.mrrefChr3	98778	93	+	181019	GGCGCAGCAAAGAAGCTTTCATTCCCACTATACCACAAAAAAATGCATTTTTCTATGTGATGCAGGTTATTCAGCCAAGGATATCTCTTCCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	548676	93	+	636262	GGCGCAGCAAAGAAGCTTTCATTCCCACTATACCACAAAAAAATGCATTTTTCTATGTGATGCAGGTTATTCAGCCAAGGATATCTCTTCCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23573	93	-	647215	GGCTCAGCAAGGAAGATTTCTTTCTCATTACACCACACAAAAATGCTGTTTTCTATATGATATGGGTTTTCCAGCCATGGCTGTCTCTTCCTA

a
s	mr.mrrefChr3	98871	55	+	181019	TCTATTGTTAGAATGGGAGAGGACTGACCTTTTCTGTGTTGCAAAATAGGCATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	548769	55	+	636262	TCTATTGTTAGAATGGGAGAGGACTGACCTTTTCTGTGTTGCAAAATAGGCATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23689	55	-	647215	TCTATTGTTGGAATGAGGGATAGCTGACCTGTTCTGAGTTGCATAATAGGCATAT

a
s	mr.mrrefChr3	98926	64	+	181019	TAATTATCTACCCAATAGCATTTGTGTTACAGGGCATATAAAGTTCAAGTGTCTCCTAGTCCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	548824	64	+	636262	TAATTATCTACCCAATAGCATTTGTGTTACAGGGCATATAAAGTTCAAGTGTCTCCTAGTCCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23752	64	-	647215	TACTTATCTACCCAATAGCATTTGCGTTACAGGGCATATAAATCTCAAGTAACTTCTAGTCCTT

a
s	mr.mrrefChr3	98990	51	+	181019	GATCCAGCGTGAGATGGATGCACTAAAAGAGAGACATCAACCATCATGGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	548888	51	+	636262	GATCCAGCGTGAGATGGATGCACTAAAAGAGAGACATCAACCATCATGGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23817	51	-	647215	GATCCAGCATGAAGTGGATGCGCTAAAAGAGAGACATCAAGCATTTTGGGA

a
s	mr.mrrefChr3	99041	243	+	181019	CATAATCAACCAGGCAGAAATGTGGTACCAGCTGAGAGCCTTTGCCCAAAGAGCTATTGATGTGCTACTAGGTATGAGAGGCTGGTCTAATGATAACCAGAATGTCCCTGCCAGCGGGTGTACACAATTATTTGGCCGTTTGCACAATCATTTGGCTGCTGTTGTAAGCCTGCATCCCGTGAGTGTTGAATTTGGAGGTGAGCGCGGGGCGAATATACTCTCCTTTCTGCGTTGGAGGCTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	548939	234	+	636262	CATAATCAACCAGGCAGAAATGTGGTACCAGCTGAGAGCCTTTGCCCGAAGAGCTAT-GATGTGCTACTAGGTATGAGAGACTGGTCTAATGATAGCCAGAATGTCCTTGCCAGCGGGTGAACACAATTATTTGGCCGTTTGCACAATCATTTG--------TGTAAGCCTGCATCCCGTGAGTGTTGAATCTAGAGGTGAGCGCGGGGCGAATATACTCTCCTTTCTGCGTTGGAGGCTTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	23871	235	-	647215	CGTAATCAACCAGGCAGAAATGTAGTACCAGCCAAGAGCCCTTGTCCAAATAGGTATTGATGTGCT-CTAGGTATTTGGGGCTGGT-TATTGATAACCAGAACGTCCCTCCCAGCGGGTGTACACAATCGTTCGGCCGTTTACATAATTATTTGGCTGCTGTTGTAAGCCTGCGTCCCGTGAGTGTTGAATTTGGAAGTGAGCGCGGGGCGAATATACCCTCGTTTCTGCAT------CTTCT

a
s	mr.mrrefChr3	99284	81	+	181019	TACAGGAAGAGTGGCTGTTTATTTCACGGGACAGTCAGAGCTATTCGATTCTGACCCAGTAAGAACTATTGGATTCTGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	549173	81	+	636262	TACAGGATGAGCGGCTGTTTATTTCACGGGACAGTCAGAACTATTCGATTCTGACCCAGTAAGAACTATTATATTCTGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	24107	81	-	647215	TGCAGGAAGAATGGCTGTTTATTTCACGGGACAGTCAGAGCTATTGGATTCCGACGCAGTCAAAACTATTGGATTCCGACT

a
s	mr.mrrefChr3	99365	21	+	181019	TACCACTGGATCCGTATTTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	549254	21	+	636262	TACCCCTGGATCCGTATTTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	24228	21	-	647215	TACCACTGGATCCGTATTTAA

a
s	mr.mrrefChr3	99386	70	+	181019	GTCGCATAACCGCTGGAACGACTTAAATAAGAGCAACGTCGCTCTATTCGTCCGTTAAGGTTAAAGAGCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	549275	70	+	636262	GTCGTGTAACCGCGGGAATGACTTAAATAAGAGCAACGTCGCTCTATTCGTCCGTTAAGGTTAAAGAGCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	24251	70	-	647215	GTCGCAGAACCGCTGGGACGACTTAAATGTGAGCAACGTCGTTCTATTCGTCCGTTAAGGTTAAAGAACG

a
s	mr.mrrefChr3	99456	92	+	181019	CTGCTGGGAAAGGGGATCTGTAAAGGATGCTCAGTAAAGGTTATGCCCACATTAGCTTATGTCACTGCAGGAAGAGATATGGACTACACCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	549345	92	+	636262	CTGCTGGGAAAGGGGAACTGTAAAGGATGCTCAGTAAAGGTTATGCCGACATTAGCTTACGTCGCTGCAGGAAGAGATATGGACTACACCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	24322	92	-	647215	CTGCTGGGAAAGGGGATCTGCAAAGGCTGCTCAGTAAAGGTTATGCCCACGTTAGGTTATGTCACTGCAGGAAGAAATATGGACAACACCCC

a
s	mr.mrrefChr3	99548	90	+	181019	TTTCTTGGTCCTGTGTCATCCTACAAATTTTCCTAGGTCATTTGAAACCATGCACTCATGCAATAAATTAGCTGCTTGACATCACAAGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	549438	90	+	636262	TTTCTTGGTCCTGTGTCATCCTACAAATTTTCCTGGGTCATTTGAAACCATGCACTCATGCTATAAATTAGCTGCTTGACATCAGAAGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	24414	90	-	647215	TTTCTTGGTCATGTCTCATCCTACAAGTTTTCCTAGGTCATTTGAAACCATGCATTCGTGCAATAAATTAGCTGCTTGACATCACAAGAG

a
s	mr.mrrefChr3	99638	93	+	181019	TCATTGAGCTGACCAAAGACTGGTCTCGGCTCTACGTCTAATACCACCAGTGTGTGTGAGCACACAGTTGATAGCTTAGACAGTCAAGTTAAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	24506	93	-	647215	TCATTGAGCTGACCAAAGACTGGTCTCGGCTGGACGTCTAATACCTCCAGTGTTTGTGAACACACAGTGGATAGCTTAGACAGTCAAGTCAAA

a
s	mr.mrrefChr3	99731	231	+	181019	CCCTCACTGTAGTACAGAGATTGAGAGTCATGAGCCTTAAGCTCTTGAGTGGAAAGAGGTTATAAACTTGTCATAGCTACGGGCTGCTATTATCCATCTAGAAAAGTAGCTGGTGGTAATTTTCATGTCCATAGTGTAAATGAGGGATAATAGTGCTACAACCCCTGACAGGGGAGTTTAAAAGAGCTCTTACCTGTAGCTAGAATACTGCTCATTGATAAGACACTACTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	549621	231	+	636262	CCCTCACCGTAGTACAGAGATTGAGAGACATGAGTCTTAAGCTCTTGAGTGGAAAGAGGTTATAAACTTGTTATAGCTAGGGGCTGCTTTTATCCATCCAGAAGAGTAGCTGGTGGTAATTTCCATCTCCATAGTGTAAATGAGGGATAATAGTGCTACAACCCCTGGCAGGGGAGTTTGAAAGAGCTCTCACCTGTAACTAGAATACTGCTCATTGATAAAACACTGCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	24617	231	-	647215	CACTCACTGCAATACAGAGAGTGAGAGTCATGGGCGTTAAGCTCTTGAATGTAGAGAGGTTATAAACTTGTCATAGCTACGGGCTGCTATTATCCATATAGAAAAGTAGCGGATGGTAATTTTCATGTCCATAGTGTATACGAGGGATAATAGTGCTTCAACCCCCGACAGAGGAGTATAAAGGAGCTCTTACCTGCAGCTAGAATACTGCTCATTGACAAGACACCACTG

a
s	mr.mrrefChr3	99962	58	+	181019	CTGGAATTAGAGACACAGTAACTGACCCAGGATATGGATCGGTATTCTCCTAAATCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	549857	58	+	636262	CTGGACTTGGAGACACAGTAACTGACCCGGGATATGGATCGGTATTCTCCTAAATCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	24848	58	-	647215	CTAGAATTAGAGACACAGTGACTGACGCAGGATATGTATTGGTATTCTCCTAAATCTT

a
s	mr.mrrefChr3	100020	23	+	181019	CTGTATGAGCCACCTGCGTGTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	549938	23	+	636262	CTGTATGAGCCACCTGCGTGTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	24906	23	-	647215	CTGTATGAGCTACCTGCTTGTGG

a
s	mr.mrrefChr3	100043	60	+	181019	GAGATTATTGAACTGTACTTCACAATCTGGTAAACCCCCGGTGTTTTGGAAGAAAAATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	549965	60	+	636262	GAGATTATTGAACTGTACTTCACAATCTGATAAACCCCCGGTGTTTTGGAAGAAAAATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	24929	50	-	647215	---------GAACTGTACTTCACAATCTGGTAATCCCCCGGTGTTTTGGAAGAAAA-TCT

a
s	mr.mrrefChr3	100103	82	+	181019	GGTATAAAAGGAGAATAGTATAATTGAAGGACAATAGTATGAAACCAAAACCTCTGCATCTTGGTACAAATTGAGGAATTGT
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a
s	mr.mrrefChr3	100185	21	+	181019	TGAATCTAGCCTTGGCCATAA
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a
s	mr.mrrefChr3	100206	33	+	181019	GGTAATCCCTCAGTCATGTGTTGCTAACAGATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	550143	33	+	636262	GGTAATCCCTCAGTCATGTGTTGCTAACAGATA
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a
s	mr.mrrefChr3	100239	37	+	181019	GAGAAATCAAATAATATACCTGTGTGTACAGTTCCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	550176	37	+	636262	GAGAAATCAAATAATATACCTGTGTGTACAGTTCCCA
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a
s	mr.mrrefChr3	100276	56	+	181019	GCTCATGCCCTTCCTGCCCACAGCCCCCTTTTTGTGTACATATTATCAGTACAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	550213	56	+	636262	GCTCATGCCCTTCCTGCCCACAGCCCCCTTTTTGTGTACATATTATCAGTACAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	25203	56	-	647215	GCTCATGCCCTTCCGGCCCACAGCCCCCTTCTTGTGTACATATTATCAGTACAACT

a
s	mr.mrrefChr3	100332	45	+	181019	GAGCAACTGACTCAAATGACCTAGCTACTGACCCATGGACCAATC
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a
s	mr.mrrefChr3	100377	6	+	181019	CAGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	550346	6	+	636262	CAGTAC
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a
s	mr.mrrefChr3	100383	86	+	181019	TTATTTATGATTTCAGTACTAACTGCTGGCAAATAAAACAGAGGTACACCAATGGGGATGGAATTGATCCAATTGATTGCCGTTAG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	25323	86	-	647215	TTATTTTTGATTACAGCACTAACGGCTGTCAAATAAAACAGAGATTCGTCAACGGGGGTGGAATTGATTCGATTGATTGCTGTTAG

a
s	mr.mrrefChr3	100469	51	+	181019	CATACATATATGGAACCTATACCATAAGAGATGAGCATTAAACCTCAGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	550446	51	+	636262	CATACATATATGGAACCTATACCATAAGAGATGAGCATTAAACCTCAGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	25410	51	-	647215	CATGCATATATGGAACCTACACCATAAGAAATGAGCATTAAACCCCAGCAA

a
s	mr.mrrefChr3	100520	282	+	181019	CATACCAGCCTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACAGTAACTTGTAGTTATCATACCCAAGTGAAAGGGCCATTGGCACCCAAGGTCCACAAAAGTAACAGTTTGTAACCACGCTAGAAGGCAGCTTATAGCCATCTACACATTTCTTCTTAAATCCCAGTGGCACTCTTCTTCTCCTTTTCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCTCACAACTATAAACATTTCAGATTGAAAAGAGTAAGGGAGAGTGTACTGCAGACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	550498	282	+	636262	CATACCAGCCTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACAGTAACTTGTAGTTATCATACCCAAGTGAAAGGGCCATTGGCACCCAAGGTCCACAAAAGTAACAGTTTGTAACCACGCTAGAAGGCAGCTTATAGCCATCTACACATTTCTTCTTAAATCCCAGTGGCACTCTTCTTCTCCTTTTCTTTTCTCTTAGTTCTTTTCTCACAACTATAAACATTTCAGATTGAAAAGAGTAAGGGAGAGTGTACTGCAGACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	25461	282	-	647215	CGTATCAGTTTTAGCATTGTTGTTCATACATACTGTCCTAAAGGGCCCCCTATGATCAACGGTAACTTGTAGTCATCATACCCAAGTGAATAGGCCACTGGCACCAAAGGCCCACAAAGGTAAGAGTTTAGAACCACATTAGCAGGCAGTCTATGACCTTCTAAACATTTCTTCTTCAATTCCAGTACCTCTCTTCTTCTCCCTTTCTTTTCTCCTAGTCCTTTTCTCACAACTATAAACACTCTAGAGCGAGAAGAGTAAAGAAGGTTGTACTGTGGACAC

a
s	mr.mrrefChr3	100802	176	+	181019	CATTTTGGAAGTTGACAACTGATAAGATGGTGCTGATAACTGATATGATGGTGTAGCCTGGGGAAGAGCAACCTCCCACATCCAGTAATGTTAGCCCAGCCTTCCTAGGGCAAGAATATGAGGGAATAAACACAGTTTCTGTAGTTCAGTGTCTGTGATAAGTAAAAGTATCATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	550796	176	+	636262	CATTTTGGAAGTTGACAACTGATAAGATGGTGCTGATAACTGATATGATGGTGTAGCCTGGGGAAGAGCAACCTCCCACATCCAGTAATGTTAGCCCAGCCTTCCTAGGGCAAGAATATGAGGGAATAAACACAGTTTCTGTAGTTCAGTGTCTGTGATAAGTAAAAGTATCATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	25743	176	-	647215	CACTTTTGAAGTTCATAACTGATAAGATGGTGCTGATAACTAGTATGATGGTGTAGCCCAGGGAAGAGCAGCCTCCCACATGCAGTGATGTTAGCCCAGCTTTCCTAGGGCAAGAATATGAGGGGACTGATACAATTTCTCTAGTTCAGTATCTGTGATAAGTAAAAGTATCCTAG

a
s	mr.mrrefChr3	100978	111	+	181019	TCCTACAGTTTTGTCTTAATTGATTGTGCTAATATATTACAGGGAAGTCAAGCTTTTTCTCATCCTAATGTTACTTTTTAACTATGAGATGAAACTCAGGTGATTACTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	550972	111	+	636262	TCCTACAGTTTTGTCTTAATTGATTGTGCTAATATATTACAGGGAAGTCAAGCTTTTTCTCATCCTAATGTTACTTTTTAACTATGAGATGAAACTCAGGTGATTACTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	25924	111	-	647215	TTCTGCCATTTTGCCTTAATTGATTGTGCTAATATATTACAGGGATGTCAAGCTCTTTCTCATCCCAGTGTGGATTCTTAACTAGGAGATGAAACTCAGGTGATTACTGAG

a
s	mr.mrrefChr3	101089	59	+	181019	AATGAAGTATGTACTTAATCAACATATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	551083	59	+	636262	AATGAAGTATGTACTTAATCAACATATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26039	59	-	647215	AATGAGGTATGTACTTAATCAATGCATCTTGCATCCATTCTTCCACCAAAGTTAACCTC

a
s	mr.mrrefChr3	101148	154	+	181019	ATCATCTTCAAGTCAGGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGCTGCAAGGTAGTGTAACACTTAATGGATGACAAACGTTTAGGTATGTTTAGATAGGGGCACATGGAATTAGGGTTGTTTGTCTAAAAGTGCATACGTACATCAACTTATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	551142	154	+	636262	ATCATCTTCAAGTCAGGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGCTGCAAGGTAGTGTAACACTTAATGGATGACAAACGTTTAGGTATGTTTAGATAGGGGCACATGGAATTAGGGTTGTTTGTCTAAAAGTGCATACGTACATCAACTTATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26101	154	-	647215	ATTATCTTTAAGTCAAGGTGAACAGTAGTAACAGGTGGCTGGGTTGAGGAATAGTGTAACACTCAATGGACAGCAAATGTCTAGGTATGTTTAGATTGGGGTACATGGAATTAGGGTTGTTTCTCTAAAAATGCATACATACATCAGCTTGTGG

a
s	mr.mrrefChr3	101302	91	+	181019	TACCCTATCAAAAATCAAGGCAATTATTTTTGAAGTATGACATAGCAAACCTCACAGGTTACTATGCCTTATTGATTTTTCAAACTCACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	551297	91	+	636262	TACCCTATCAAAAATCAAGGCAATTATTTTTGAAGTATGACATAGCAAACCTCACAGGTTACTATGCCTTATTGATTTTTCAAACTCACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26255	91	-	647215	TACCCTACCAAAAATCAAGGAAGTTATTTTTCAAGCATAACATAGCAAACCTTGCAGGTTACAATGCCTTATCGATTCTTTGAACTTACAT

a
s	mr.mrrefChr3	101393	13	+	181019	ATGTGAGAGATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	551397	13	+	636262	ATGTGAGAGATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26346	13	-	647215	ATGTAAGAAATTA

a
s	mr.mrrefChr3	101406	7	+	181019	TGCTAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	551412	7	+	636262	TGCTAGT
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a
s	mr.mrrefChr3	101413	15	+	181019	CATCAGTGATATTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	551421	15	+	636262	CATCAGTGATATTCA
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a
s	mr.mrrefChr3	101428	95	+	181019	TACAAGCAATTATTTAATGCTATGATAGAAGTGCAGGTGAACTTAACTGCTTCACCCAGTTATGGTTAGTGGCCTCCTCTGTCCTTTGAAGAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	551437	92	+	636262	TGCAAGCAATTACTTGATGCTATGATAAAAGTGCAGGTGAACTTAAGTGCTTCACCCAGTTATGGTTAGTGGCCCCCTCTGTCCTTT---GAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26381	94	-	647215	TACAAGCAAT-ATTTAATGCTAGGATAGAAGTGCAGGTGAACTTAACTGCTTCATCCAGTTGTGGTCAGTGGTCTCCTCTGTCCGTTGAAGAGGT

a
s	mr.mrrefChr3	101523	1	+	181019	A
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	551574	1	+	636262	A
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26475	1	-	647215	G

a
s	mr.mrrefChr3	101524	15	+	181019	ACCTGTTACCCTCGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	551575	11	+	636262	GTCTGT----CTCGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26478	15	-	647215	ACTTATTACCCTTGT

a
s	mr.mrrefChr3	101539	353	+	181019	ATAAGCAGGTTGCTTCACACTTGAGTTGCCATTTGCCTACCCACTTAATTCACTGAAGGGATATTATTGGCAGATGCATGTCGTGATGGTCCAGCATGGTCTATATAATGATTTGATTCAACTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCAATGCTTGGGCCCAGAGGAATTTGGAAAAACCTTACATCCTAGGTGAGTGCCCGCCACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGAAAGCCTGCCAAGCCAGCCTAGACTAATCTAGGCTTACGAAACACAATAACCAGTGTTAAAATGCCACCTCACTGTTCTAGATGTACAACCTAATAGAAAAGAAGCACCACTGACAAAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	551586	352	+	636262	ATGACCAGGTTGCTTCACACTTGAGTTGCCATTTGCCTGCCCACTTAATTCACTGAAGGGATATTATTGGCAGATGCATGCTGTGATGGTCCAGCATGGTCTATATAATGATTTCCTTCAACTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCAATGCTCAGCCCCAGAGGAATTTGGAAAAACCTTACATCCTAGGTGAGTGCCCGCCACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGAAAGCCTACCAACCCAGCCTAGACTAATCTAGACTTAAGACACACAATAACCA-TGTTAAAATGCCGTCTAACTGTTCTAGATGTACAACCTAATAGAAGAGAAGCACCACTGACAATACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26498	352	-	647215	AGAGGTGGCTTGCTTCTCGCTTGAGTTACCATTAGCCTACCCCCTCAACTCACTGAAGGATTAATATCGGCAGATGCATGTCGTGATGGGCCAGCACAGTCTTTATAAAGATTTGATTCAATTACACATCTGCCATACCCATGCTTGGGTTCCGAAGCTTGGGCCGAGAAGAATTTGGAAAAATCTTACATCCTAGCTGAGTGCCCACTACAAGCTGGGTGCTGCAACAGGGTA-GCCTGCCAAGCCAGCCTAAACTAACCTGAGCTTACGAAACACAATAACCAGTGTTAAGGTGCCACCTCACTGTTCTAGATGGACAACCTAATAGAAAAGAAGCACCACTGACAAAACT

a
s	mr.mrrefChr3	101892	51	+	181019	TCCCCTACTTGCATTTATGAGTACTAGCACCATAGCTTTCTCAGCTTTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	551938	51	+	636262	TCCCCTACTTGCATTTATAAGTACTAGCACCATAGTTTTTTCAGCTTTATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26863	51	-	647215	TCCACTACTGACATTTGTGAGTACTAGCACCATAGCTTTCTCAGCTTTATA

a
s	mr.mrrefChr3	101943	169	+	181019	TCAAATCACCGTAAGGGATCCTATCTGGTTAGCACTGGCATCTATTATGAAGGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCAATCAGACCCAACTTGACGAGACTGGCAGTCATGAGCTTGATAAAGTTGAGCAGATACAACTGTTGAGATTGCGACATGCAGCACTTAGGATTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	551992	155	+	636262	TCAAATCACTGTAAGGGTTCCTATCTGGTTAGCACTGGCACCAATTATGAAGGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCTATCAGACCCA--------------GCAGTTCTGAGCTTGATAAAGTTGAGCAGATACAACTGCTGAGATTGCAACATGTAGCACTTAGGATTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	26914	169	-	647215	TCAAACCACCGAAAGGGATCCTATCTTGTTAGCACTGGCATCTATTATCAAAGTAAAACAGAGGAAAAGTCTTCAATCAGACCCAACTTGACGAGACTGGCAGTCATGAGCTGGATAAAGTTGAGAAGATACAACTGTTGAGATTGTGACATGCAACACTTAGGATTAT

a
s	mr.mrrefChr3	102112	113	+	181019	AATCAGAGTATATTCTGCAGCACCCCGATTGGGGACAAATACAGAACAATAGTGTCCTGAGCCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAGACCAAGAAATAACTGAATGGGATATGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	552151	112	+	636262	AATCAGAGTATATTCT-CAGCACCCCGCTTGGGGACAAATATAGAACAATAGTGTCCTGAATCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAGACCAAGAAATAACTGAATGGGATATGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	27083	112	-	647215	ACACAGAGGATATTGTGCAGCTCCCCCATTGGAGACACATACAGCACAACAGCGTCCTGAGCCAGCTGATGGTTAGGACAGAGAAACCAATAAATA-CTGAATGCGATGTGTT

a
s	mr.mrrefChr3	102225	205	+	181019	GTAAGTAGCCCTATCATATGGCTTTTTCAGGATTTAGCAGTCTTCACAGAGGCTGTTCATTTGCTGAGGACATTATGAGATACTCTAGAATGAATCCATTATGATGGCCAATGAGGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGACATGGATCATAGGCCATTCGGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGAGTGCTTAGAATTCAAAAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	552263	202	+	636262	GTAAGTAGCCCTATCATACGGTGTTTTCAGGATTTAGTAGTCTTCACAGAGGCTGT--ATTTGCTGAGGACATTATGAGATACTCTAGAATGAATCCATTATGATAGCCAATGAGGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGAGAGGGATCATAGGCCATTCAGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGAGTGCTTA-AATCCAAAAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	27196	205	-	647215	GTAAGTAGGCCTATCATATTGCTTTTTCAGAATTTAGCAGTCTTCACAGAGGCTGTTCATTTGTTGAGGACATCAGGAGATACTCTAGAATGAGTCCATTATGATGGCCAATGAAGTAAAGGGCTAATGAACCAAAGACATGGATCATAGGCCATTCGGGGAATATGACATTCTGTGAGGGAAGTGTGCTTAGAATTCAAAGACA

a
s	mr.mrrefChr3	102430	54	+	181019	AGATGAATCTATGCTTAAATGCCACTCTGATTTTAATAGACATATTGTCTGGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	552465	54	+	636262	AGATGAGTCTATGCTTAACTGCCACTCTGATTTTAATAGACATATTGTCTGGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	27499	54	-	647215	AGGTTAATTTATGCTTAAATGCCATTCTGATTTTAATAGACACTTTGTCTGGTT

a
s	mr.mrrefChr3	102484	11	+	181019	AATCTCAAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	552519	11	+	636262	AATCTCAAGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	27557	11	-	647215	AATCCCAAGAG

a
s	mr.mrrefChr3	102495	38	+	181019	CGCATGTACCAAAGTCATTAGTAGGATTAGGTCAATGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	552531	38	+	636262	CGCATGTACCAAAGTCATTAGTAGGATTAGGTCAATGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	27568	38	-	647215	CGCATGCACCAAAGTCATTAGTAGGACTAGGTCAAAGC

a
s	mr.mrrefChr3	102533	494	+	181019	AAGCGTTCTATATATGATGATGCTGAGCTACAGAGCCTCAATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATGGAAGTAAAAACAGCCTTTCCCACTTATACATGTGCTGGTAGGAATTTCAACTTCAACTGCTGTACTTTTTTTTTAAGGCATGCACATCTTTTGTCTGGGGACAGAGAGGCACTACCCTAACATATGAACTCGCTCACTTGTAAGCTAGGGTGACAAAACAATCTGCCCTCTTAAATGTGATTTTATAATTACGTTACTCTCTGCCTAGAAGTGACATTACAGGCTGCTTGAATAAGAAACTCCCTGTCTGGGTCTGTGCCTAGTCAATTGTGATCCTCCATAGAAATCCAGTTGTGGATATGCTTGGGCACCAAACTCTCATTGTTGTACTGAGAGAACTGACATCAGTTGAAGATAGATTTATTATAGAGGGCTCTAAGTACTCCCTCATATAGTTATTTGTTTATGGGGGCTATGGGCAATAGGCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	552569	492	+	636262	AAGCGTTCTATATATGA-GATGCTGAGCTACAGAGCCTCAATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATAGAAGTAAAAACAGCCTTTCCCACTTATACATGTTCTGGTAGGGATTTCAACTTCAACTGCTGTACTTTTTCTTTAAGGCATGCACATCTTTTG-CTGGGGTCAGAGAGGCACTACGCTAACATATGAACTCGTCCACTTGTAAGCTAGGGTGACAAAACAATCTGCCCTCTTAAATGTGATTTTATGATTATGTTACTCCCTGCCTAGAAGTGACGTTACAGGCTGCATGAATAAGAAACTCCCTGTCTGGGTCTGTGCCTAGTCAATTGTGATCCTCCATAGAAATCCGGTTGTGAATATGCTTGGGCACCAAACTCTCCCTCTTGTACTGAGAGAGCTGACATTAGTTGATGATAGATTTATTATAGAGGGCTCTGAGTACTCCCTCATATAGTTATTTGTTTATGGGGGCTATGGGCAATAGGCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	27615	488	-	647215	AAGCATTCTATCTATGATGATGCTAAGCTACAGACCCTCTATTTTAAAGCTTGGCTTTCATGATGGTAGTAAAAACAGCCTTTCCCGCTTATACATGTGCTGGTAGGAATTTCAACTTTAACTGCTGTACTTTTCTTTTGAGGCATCCACATCTTTTGTCTGACGACAGAGAGGCACCACCCTAACATATGTACTCACTCACTTGTAAGCTAGCGCGACAAAACAATCTGGACTCTTAAATCTGTTC----AATTACTTTACTCTCTGCCCAGAAGTGACAT--CAGGCTGCTTGAATAAGAAAATCCCTGTGTGGGTCTGTGCCTAGTCCATTGTGATCCTCCATAGAAATCCAGTTGTGGATATTCTTGGGCACCAAACTCTCATTGTTGTACTGAGAGAACTGACATCAGTTAAAGACAGATTTAATATAGAGGGCTCTAGGTACTCCCTAATGTAGTTATTTATTTATAGGGGCTATGGGCAATGGGCCC

a
s	mr.mrrefChr3	103027	319	+	181019	TGGACAAACTCTTGGAATAAGATAAGCAGCCAGACTCTATAATAGCACCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCAAAATTCAAGTTCTGTCATTGTTGAGTTTGTAAGTTTCTCCCCATCACTCTTACTATAATGTTGACCCCATATGGGGACGCATATCTTAAATGCCTACTGTTAGGTTAAAATAAACATCATGAGAGCACCTTATCTAATGCTGGTTTCACATGACCCTTGTCGGCCTTGAGTCATCTCTTTATCCAAGCTAATACCCATGTGATGTGCCTAATGGGAATGCTTTGGTGCAGCTATGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	553062	314	+	636262	TGGACAAACTCTTGGAATAAGATAAGC-GCCAGACTCTTTAATAGCACCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCCAAATTCAAGTT---TCATTGTTGAGTTTGCAAGTTTCTCCCCATCACTCTTATTATAATGTTGACCCCATATGGGGACGCATATCTTAAATGCCTACTGTTAGGTTAAAATAAACATCATGACAGCACCTTATCTAATGCCGGTCTCACATGACCCTTGTCGGCCTTGAGTCATCTCTT-ATCCAGGCTAATCCCCATATGATGTTCCTAATGGGAATGCTTTGGTGCAGCTATGCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	28103	312	-	647215	TGGACAAACTCTTGGAGTAAGATAAGCAGCCAGACCCTATAATAGTAGCAAGTTTTTGATGTTTGTGAGAAGGAAAGGCCAAACTTCAAGTTCTGTCATTGTTGAGTTTGT-------TCCCCATCATTCTTACTATTATGTTGACTCCATATGGGGATGCGTATCTTAAATGCCTACTGTTATGTTAAAATAAACACCATGGGAGCACCTTATCTAATGCTGGTTTCACATGACCCTTGTAGGCCTTGAGTCCTCTCTTTATCCAAGCTAACACCCATGTGATGTGCCTAATGGGATTGCTGTGGTGCAACTGTGCTT

a
s	mr.mrrefChr3	103346	57	+	181019	CTGTGTATGAATACAGGATTAATAACTTAATGACATGTCTGATTTAGCCCCTCAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	553376	57	+	636262	CTGTGTATGAATATAAGATTAATAACTTAACGACATGTCTGATTTCGCCCCTCAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	28416	57	-	647215	CAGTGCATAAATACAGGATTAGTGATTCAATGACATGTCTGATTTAGCCCCTCAGCA

a
s	mr.mrrefChr3	103403	32	+	181019	GAGATCAATAATCTCATAAAGTGAAGGTAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	553433	32	+	636262	GAGATCAATAATCTCATAAAGTGAAGGTAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	28481	30	-	647215	GAGACCAATAATCTCATAAACGGAAGGTAA--

a
s	mr.mrrefChr3	103435	167	+	181019	GGCAGTCCCTCCTGTATATTGTATCAGAAGGATCAAGGAAAGATTTAGGTGCCAATATAAGTACCTGAATGTTGGGCTTGACTTCATCTAATGTGACCACTGGAGGACCAGCATAGTGGATGGAGGGCTGGCAATCAGAGCAAATTAAACTTGGGATAACTTATTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	553467	167	+	636262	GGCAGTCCCCCCTGTCTATTGTGTCAGAAGGATCAAGGAAAGATTTAGGTGCCAATATAAGTACCTGAATGTTGGGTTTGACTTCATCTAATGTGACCACTGGAGGACCAGGATAGAGGATGGAGGGCTGGCAATCAGAGCAAATTAAACTTGGGATAACTTATTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	28511	167	-	647215	GGCAGTCCTTTCCGTATATTGTATCAGAAGGATCAGGGAAAGATTTACAAGCCAATATAAGTATCTGAATGTTGGGCTTGACTTCATATAATGTGACCACTGGAGGACCAGCTCAGTGGATGGGTGGCTGGACATCTGAGCAAATTCAACTTGGGCTAACTTATTCC

a
s	mr.mrrefChr3	103602	217	+	181019	TCCAGTTCAATTAGTGGCGGGGATAAGGGGTCCATGCCACTACAGTTTTGGGCAAAGCCATCTTACTCAGCCAGTTATATAAATAAGGGAAGGGAACTTAGTAATCAACCATAATAGGACTGCATATAGTTAATTATGAGCCTTTGATATGCATGGATGTATAATACCCTGATTTCATAGTGTAGTGATTTTATACCCCGGCTTTACATTATACCGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	553634	216	+	636262	TCCAGTTCAATTC-TGGCGGGGATAAGGAGTCCATGCCGCTGCAATTTTGGGCAAAGCCATCTTGCTCAACCAGTTATACAAATAAGGGAAGGGAACTTAGTAATCAATCATAATAGGACTGCATACAGTTAATTAGGAGCCTTTGATATGCATGGATGTACAATACCCTGATTTCATAGTGTAGTGATTTTATAACCCGGCTTTATATTATACCGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	28787	215	-	647215	TCCAGTTCAATTAGGGGTGGGGGTAAGGGGTCCATGCCACTAGAGCTTTGGGCAAAGCCATCTTACTCAGCCAGTTATATAGATAAGAGAAGAGAACTTAGTAATCAACCATAATAGGACTACATATGG--AATTATGAGCCTTTGATATGCATGGATGTATTCTACCCTGATTTTATAGTGTAGTGATTTTATACCCTGGCTTTACACTATACCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	28678	109	-	647215	TCCAGTTCAATTAGTGGCAGGGCTAAGTGGTCCATGCCACTACAGTTTAGGGCAAAGCCATCATACTCAGCCAGTTATATAAATAAGGGAAGGGAACCTAGTACTCAAC------------------------------------------------------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr3	103819	187	+	181019	CGTGCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAATATTTATTATCCAATTATTTGATTTTTGATTGGGTATGACACCCTGTCCCCCCCTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAGGTTTGGTGGCAATGTTACACTATTACCACTATATTTACAATGAGTAACAGATTCCTTTGCACCCTTGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	553850	186	+	636262	CGTGCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAA-ATTTACTATCCAATTATTTACTTTTTGATTGAGTGTGACACCCTGTCCCCCCCTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAGGTTTGGTGGTAATGTTACACTACTACCACTATATTTACAATGAGTAACAGATTTCTTTGCACCCTTGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29005	175	-	647215	TACTCCTTCTCTCTATTTCTGTTTTGTAAGAATGTTTATTATCCAATTATTTGATTTTTGATTGGGTATGTAACCCTGTCCCCCTTTGGTCCTCTTATAATTCTTCTCAAGTGTGCAAGTTTG-TGGCTATGTTACACTTTTACCATTATATTTACAGTGGGTAACAGTTTCCTTA-----------

a
s	mr.mrrefChr3	104006	105	+	181019	CAGAGTATCAGTGCTATAAACACTGGGCTTACAGACATCTGTAGAATAGGATTCTGGAAAAAAGTGAAGGAACACAATGCCAGAGTTAAAACAGCCATATCATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	554037	101	+	636262	CAGAGTATCAGCGCTATAGACACTGGGCTTACAGACACCTGTAGAATAGGATTCTGGAAAAAAGCGAAGGAACACAATGCCAGTGTTAA----GCCATATCATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29180	104	-	647215	-AGAGTATTAGTTCCATAAACACCGGGGTAACAGACATCTGTAGAATAGGATTCTCGTAAAGAGTGAAGGAACATAATGCCAGAGTTAAAACAGCCATTTCATAT

a
s	mr.mrrefChr3	104111	70	+	181019	TCTTTGTTTGTATGAAGAGTCCACACTTCATCTCAAAAAATTTTAGAATGTGCATATAGATACTTTTTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	554138	70	+	636262	TCTTCATTTGTATGAAGAGTCCACACTTCATCTCAAAAAATTTTAGAATGTCCATATAGATACTTTTTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29285	70	-	647215	TCTTTGTTTGGATGAAGAGTCCAAACTTCATCTCAAAAAATTTTAGAATGTGCATACAGATACTTTTTCA

a
s	mr.mrrefChr3	104181	32	+	181019	TCACTCCAGAGGTTAGGGCACACACATTGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474426	32	+	636262	GCATTTGAGAGGTTAGGGCACACACATTGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	554208	32	+	636262	TCACTCCAGAGGTTAGGGCACACACATTGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29355	32	-	647215	TCACTCCAGGGGTTCGGGCACACACATTGTGT

a
s	mr.mrrefChr3	104213	164	+	181019	AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGTCCTGAAAGAATAAGCTCCAGTAATCAGGTTCATGTGGTTAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGTGGTGGAGCAAGTAACCTTAATTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474459	164	+	636262	AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGCCTTGAAAGAATAGGCTCCAGTAATCAGGTTCATGTGGTTAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGTGGTGGAGCAAGTAACCATAAGTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	554240	155	+	636262	AAATAAA------GGCAGGTGGTCCTGAAAGATTACGCTCCAGTAAACAGGTTCATGTGGTAAGCAGCATCCCTAATCTCAAGGGAGGATATTCAAGCAGTGGAGCAAGTAACC---ATTCTGCCATTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATTTATGAGTCCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29387	164	-	647215	AAATAAATGGTCTGGCAGGTGGTCCTGAAAGAATAAGCTGCAGTGCTCAGTTTCCTGTGGCTAGCAGTTTCCCTAATCTCAAGGGAGTATATTTAACTGGTGGAGCATGTAACCTTAATTTTGCCAGTGCTCTTGCTCTCAAACTCTGTGATATATAAGTCCCC

a
s	mr.mrrefChr3	104377	48	+	181019	AAAGCTGCTCATAGTATAACTAAATTCTAATGTCTATATCTAGAAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474623	48	+	636262	AAAGCTGCTCATAGTATAACTAAATTCTAATGTCTATATCTAGAAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	554395	48	+	636262	AAAGCTGCTCATAGTATGACTAAATTCTAATGTCTATATCTAGAAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29552	48	-	647215	AAAGCTGTTCATGGTATAGCTGAATTCTAATGTCCATATCTGGAAATA

a
s	mr.mrrefChr3	104425	51	+	181019	GGTTGTACCATTGTGACAATGACCCTGCCTTAATTACCAACCAGGGGGAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474671	51	+	636262	GGTTGTACCATTGTGACAATGACCCTGCCTTAATTACCGACCAGGGGGAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	554443	51	+	636262	GGTTGTGCCATTGTGACAATGACCCTGCCTTAATCACCAACCAGGGGAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29608	51	-	647215	GGTTGCACCATGATGACAGTGACCCTACCTTAATTAATAACCACGGGGAAA

a
s	mr.mrrefChr3	104476	248	+	181019	AAGATGTACCTGTGCATATCGAGGTATAATTCTTGAGTTAATTCCTTGCAATGGGTGATGACAACCTCAGCCTATCCAAGAATTAGTGTGGTTTACATGTGACCTAAAACCCTCAGAGACTTCAAATTGCCTCCCCCTTTTCTGGGAGTTCCTGTATCGTTGATACTAAAACAAGCTGAACAATCATTTAGTAGAGAGGCCCTGGGAAGGTGGCCTCCTTACTAAGAAACTTGCTCAATGACTGAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	554494	248	+	636262	AAGATGTAACTGTGCATATCGAGGTATAATTCTTGAGTTAATTCCTTGCAACGGGTGATGACAATCTTAGCCTATCCAAGAATTAGTGTGGTTTACATGTGACCTAAAACCCACAGAGACTTCAAATTGCCTCCCCCTTTTCTGGGAGTTCCTGTACCGTTGATACTAAAACAAGATGAATAATCATTTAGTAGAGAGGCCCTGGGAAGGTGGCCTCCTTACTAAGAAACTTGCTCAATGACTAAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29659	214	-	647215	AAGATGTACCTGTGCACATCAAGGTATGGTTTCTGAGGTAATCCCCTACAATGGG-GATGACAGCCTCAGTCTACCCAACAATTAGTGTGGTTTGCATGTGACCTAAAATCCTCAGACACTTCAAATTTCCTCCCCCTTTTGTGGGAGTTCCTGTATGGTTGAGACTAAAACAAGCTGAACAATTATTTAGTA---------------------------------AAACTTGCTCAATGGCTGAGGT

a
s	mr.mrrefChr3	104724	142	+	181019	TTGAATTCTTTTGTCAAGGATTAATACATATTTCGAGTATGAGTCTTGTTAGGTTGAATGAAGAAAGGATGCTGGACTGAAGATCTGATCAACTGGTCTCCAACCAAGATTGGTGATGCTGGAGGACTATTTGCACCTAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	554749	142	+	636262	TTGAATCCTTTTGTCAAGGATTAGTACATATTTCGAGTATGAGTTTTGCTAGGTTGAAAGAAGAAAGGATGCTGGACTGAAAATCTGATCAACTGGTCTCCAACCAAGATTGGTGATGCTCGAGGAATATTTGCACCTAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	29873	141	-	647215	TTGAATTCTTTTGTCAAGGATTAATATATATTTCTAGTATGAGGCTTGTTAGGTTGAATGA-GAAAGGATGCTGGACTGAAGGTCTGATAAATTGGTTTCCAAACAAGATTGGTGATGCTGGAGGACTATTTGGACCTAGGT

a
s	mr.mrrefChr3	104866	33	+	181019	AGCTTAGATTTTAGGGCTATAAGCATAATTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	554891	33	+	636262	AGCTTAGAATTTAGGGCTATAAGCACAATTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	30015	33	-	647215	AGCTTTAATTTTAGGGTTACAAGCATAATTTGT

a
s	mr.mrrefChr3	104899	240	+	181019	TTAAAATGTGTGTGGTCCTGGATGCACTGTATCTTTGCAACTCTATTCTAGAGCCCTTAAAGTACAACCAGGCCTCTACAAATGCACGTGATTGTAAGGCACCAGCAATTGCTGGTGTGGAATAAATGTGCAGCATTCCAGTAAACCTTTATTGATTACAAAGCAAGCATATATGGTTGTCCTCAATGCAGCTCTCATGCATAGCAAACTTTCCTTCAAATATTAGCAACTCTCGGCCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	554924	239	+	636262	TTAAAATGTG-GTGGTCCTGGATGCACTGTATCTTTGCAACTCTATTCTAGAGCTCTTAAAGCACAACCAGGCCTCTACAAATGCACGTGATTGTAGGGCACCAGCAATTGCTGGTGTTGAATAAATGTGCAGCATTCTAGTAAACCTTTATTGATTACAAAGCAAGCATATATGGTTGTCCTCAATGGAACTCTCGTGCATAGCGAACTTTCCTTCAAACATTAGCAACTCTCAGCCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	30057	232	-	647215	TTAGAATGTTTGTGGTCCTGGATGGACTGTACGTTTGCAAATCTATTCTACAGCCCTTAAAGTACAACAGGGCCTCTACAAGTGCACATAATTGTAAGGCACTAGCAATTGCTGTTGTGGAATAGATGTGC--CATGCCACTAAAACTTTATTGGTTACAAAGCAAGCATACATGGTTGTCCTCAATGCAGTTCTCATGCATAGCAAA------TTCAACTATTAGCAACTCTCGGCCCA

a
s	mr.mrrefChr3	105139	250	+	181019	TTTGGAACTAATGGGCTCATTTTGGACTAATGGTGGTACTTCCTGAATGTTTCCTGTTTAACAAGGGTCCCTATTGGGACCCATAGCGTAGAGCAATGCACTGTAACCAATTTTCAAGTATTGCAATGCATTCCCCCAGCACATTAAGTATGGGGAGGAGAAGAATTCCTGACCAGTATTTGTTTGTTTTTAATGATGATTTTATTGTTCTGGCACTATGCTTACTATAACATCTACTCAACCCTCATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	555163	248	+	636262	TCTGGAACTAATGGGCTCATTTTGGACTAATCGTGGTACTTCCTGAATGTTTCCTGTTTAACAAGGGTCCCCATTGGGACCCATAGCGTAGAGCAACGCACCATAACCAATTTTCATGTATTGCAATGCATACCCCCAGCACATGAAGTATGGGGAGGAGAAGGATGCCTGACCAGTATTTGTTTGTCTTTAATGATGATTCTATTGTTCTGGCACTATGCTTACTATAACATCTACT-AACCCTCATG-
s	simRat_chr6.simRat.chr6	30308	250	-	647215	TTTTGACCTCATGGGCCCAGTTTGGACTAATGGTGGTGCTTCCTGAATATTTCCTGTTTAACATGGGTCCCTATTGGGACCCGTAGTGTAGAGCAATGCACTGTAACCAGTTTTCAAGTATTGCAATGCATTCCCCCAGCACATTAAGTATGGGCAGTAGAGGAATTCCTGACCAGTATTTGTTTGTTATTAACGATGATTTTATTGTTCTGGCACTATGCTTACTATAACATCTACTCAACCCTCATGT

a
s	mr.mrrefChr3	105389	481	+	181019	ATGCCCATAGCTGGCGAGGGTACCATATATCAGTCAGGTTTCATCTAGTGTAGGTTCTGTTTTCCTACTGCTAGCAGGCAAAAATAGCCAAGATCATCATTCATGAGTAAGCTGCCATGTTGGCTAATGAGAACTACTGAGAAAACTTCACACATTAGAAAAAGCAGTCTGTAGGTTGTATTTTTGAAAGTGGTTTGTAGGGCAGTCCCTCATTTTAATGTGACTTTGAGTAACCTCAAACTCTATGCCCACTGTTGTGTGCTGAACTGGCCAACAATCCTTGCATCTAAAAGACCCCCTACCCTCCCATATAATTGGATAATTCTCTATGTCCTTGAGGAAAAAATAACCATGTTATACTTTGAAACATAATATACCAGCTCTATATCTTGGTAAAAGCATTGCGTGAATTTGCCTAATCCCCATGAGCACTCTTGTACCAAGACTAAAAACATTGAAACTGTCTCAGGTCAAGATTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	555411	476	+	636262	---CCCATAGCTGGCGAGTGTACCATATATCAGTCAGGTTTCATCTAGTGTAGGTTCTGTTTTCCTACAGCTAGCAGGCGAGAATAGCCAAGATCATCATTCGTGAGTATGCTGCCATGTTGGCTAATGAGAACTACTAAGAAAAATTCACAC-TTAGAAAAAGCAGTCTGTAGGTTGCATTTTTGAAAGTCATTTGTAGGGCAGTCCCTCATTTTAATGTGAC-TTGAGTAACCTCAAACTCTATGCCCACTGTTGTGTGCTGAACTGGCCAACAATCCTTGCATCTAAAAGACCCCCTACCCTCCCATATAATTGGATAATTCTCTATGTCCTTGAGGAAAAAACAACCATGTTATGCTCTGAAACACAATACACCAGCTCTATATCTTGGAAAAAGCATTGCGTGAATTTGCCTAATCCCCATGAGCACTCTTGTACCAAGACTAAAAACATTGAAATTGTCTCAGGTCAAGATTATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	30559	448	-	647215	ATGCCCATAGCTGGCAAGGGTACCATAC--------GGTTTTA-------------CTGTTTTCCGACTGCCAGCAGGAAAAAATAGCCAAGATCATCATTGATGACTAAGCTGCCATGTTGGCTA----------CTGAGTAAACTTCATGCATTAGAAAAAGCAGTTTGTAGCTTGTATTTT--AAAGTGGTTTGTAGCGCAGTCCCTCATTTTAAGGTGACTTTGAGTTTCCTCAAACCTTATGCCCACTCTTGTCTGCTGAACTGGCCAGCAATCCTCGCATCTAAAAGACCAACTTCCCTCCTATGTAATTGGATAATTCTCTATGTCCTTGAGGAAAAAATAACCATGTTATACTTTGAAACATATTATACCGGCTCTATATCTTGATAAAAGCATTGCATTAATTTGCCTACTCCCCATGAGCACTCTTGTACCAAGACTATAAACACTGAAACTGTCTCAGGTTAAGGTTATT

a
s	mr.mrrefChr3	105870	186	+	181019	GTGTACCAGGGCTAAAAACCCTAAGTCTGTTTTAGGTTAAATTTGTTGTAAAGAATATAATAATTGTATAGCAGGCCAATCTATGACAGTTCAATGCATAATTGTTGACTTAGCTTTAAGGTTCTATCACACTGTCTTCTACATTTGGTAACTGTATCATGAGCAACACCCATTTTGTGACTGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	555888	186	+	636262	GTGTACCAGGGCTAAAAACCCTAAGTCTGTTTTAGGTTGAATTTGTTTTAAAGAATATAATAATTGTATAGCAGGCCAATCTACGACAGTTCAATGCATATTTGTTGGCTTAGCTTTAAGATTCTATCACACTGTCTTCTACATTTGGTAACTGTATCATGAGCAACACCCATTTTGTGACTGTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	31007	185	-	647215	GTGCACCAGGGCTAAAGACCCCAAGTATGTTTTAGGTTAAATTTGATGGAAAGAAT-CAGTAATGGTGCAGTGGGCCAATCTATGACAGATCAATGCAAAATTGGTGACTTAGCTTTAAAGTTCTATCACATACTCTTCTACATCTGGAAACCGTATCATGAGCAACACCCATTTTGTGACTGTAT

a
s	mr.mrrefChr3	106056	101	+	181019	TTAGGATTTAGCTTTCCCTCAACTGATGAACTCAAACAATGCTTTAACTGGTCAAACAAGCAAATTAAAGAGTACAATTAGTTACTCTCTGCAATCTCAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	556078	101	+	636262	TTAGGATTTGGCTTTCCCTCAACTGATGAACTCAAACAATGCTTTAACTGATCAAACAAGCAACTTAGAGAGTACAATTAGTTACTCTCTGCAATCTCAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	31192	101	-	647215	TTAAGATTTAGCTTTCGCTCAGCTGATGTACTCAAACAAAACCTTAGCTGGTCAAACAAGCAAATTAAAGAGTACAATTACTTACTCCCTGCAATCTAAAG

a
s	mr.mrrefChr3	106157	288	+	181019	TGAAATTTGGAACAATTAAACAAGTAGTAGCTAAGCCATCAGATTAAATTATGAATAGTTGCACAATCTGCAATCTTGATCATCAGTTCCTAATCACATTACACAGGACCAAGCACTATTCTTTTATGGCAAAGGCTTCGACTAATCACCCTGTGTAAACTTAAATGAATCCACCCAACCCCCAGTAGAAGAGTGGGATAAGTTCAGTGTTGGCTCTGTTGGTACACCTGTCTCCTTTAAGTTAGTGTTCTAGGGGCTCATATAGTAGGTGCCACTGAACTACATCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	556184	288	+	636262	TGAAATTTGGAACAATTAAACAAGTAGTAGATAAGCCATCAGATTAAATTATGAATAGTTGCACAATCTGGAATCTTGATCATGAGTTCCTAATCACATTACACAGGACCAAGCATTATTCTTTTATGGCAAAGGCTCCGACTAATCACCCTGTGTAAACTTAAATGAATCCACCCAGCCCCCAGTAGAAGAGTGGGATACGTTTAGTGTTGACTCTGTTGGTACACCTGTCTCCTTTAAGTTAGTGCTCTAGGGTCTCATGTAGTAGATGCCACTGAACTACATCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	31293	259	-	647215	TTAAATTCAGAACAATTGAATAAGTAGCAGCTAAGCCATCAGATTAAATTATGCAAATTTGCACAATCTGCAATCTTGAACACCAGTTTGTAATCACATTACATAGGACCAAGCACTATTCTTCTATGGCAAAGGTTTCAACTAA-------------------ATG-------CCAAGCCCCAGTAGA---GTGAGATAAGTTCAGTGTTGGCTCTGTTGGTACACCTGTCTTCTTTAAATTAGTATTCTAGGGGCTCATATAGTAGGAGCCACTGAACTACATCTT

a
s	mr.mrrefChr3	106445	43	+	181019	GTTCAATTTAAAAGTTTATTAGGGTGCCGTATTGAGTGGTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	556478	43	+	636262	GTTCAATATAAAAGTTTATTAGGGTGCCGTATTGAGTGGTTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	31552	43	-	647215	GTTCAATTTAAAAATTTCTTGGGCTGCACTATTGAGTGGTGCA

a
s	mr.mrrefChr3	106488	169	+	181019	TGTTTGGTTCAGTAATTGAATCTGTGCTAGGCAAACCTGGGTCTAACAATAGGCCATTTCAACATAAGCACAGCAAGATCAAGTCAGCACTATATCACTGAAACCACCTTGTCTTATATAGTGTTTATGTTGAAATCAGATTGCGACTGTAGTTTTCACTTCTTTTCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	556522	162	+	636262	TGTTTAGTTCAGTAATCAAATCTGTGCTAGGCAAACCTGGGTCTAATGATAGGCCATTTCAACATAAGCACAGTAAGATCAAGTTAGCACTATACCACTGATA-------GTCCTACAAAGTGTTTATGTTGAAATCAGATTGCGATTGTAGTTTTCACTTCTTTACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	31595	166	-	647215	TGTTTGGTTCAGTAACTGAATCTATACTA--CAAACCTGAG-CTAACAATAAGCCATTTCAACCTAAATACAGCGAGCTCAAGTCAGCACTATATCACTGAAACCACCTTATCTTATGTAGCATTTATGATGGAGTCAGATTGCAACTGTAATTTTCACTTCTTTTCAA

a
s	mr.mrrefChr3	106657	107	+	181019	AACGAAACTCCTAGATTGTCTGGCACATACTTTCTTTGACAAGTTCAACAAATTAGGAACTCAAACACCTGATCCTTACATGGCCTTAGTACCCACTGTTACCCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	556687	106	+	636262	AACGAAACTCCTAGATTGTCTGGCACATGCTTTCTTTGACAAGTTCAACAAATTAGGAACTCAAACACCTGATCCTTAC-TTGCTTTAGTACCCTCTGTTACCCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	31761	107	-	647215	AACAAAGCTTCTAGATTGTCTGGCACATACTTTCTTTGACAAGTTCAACTAATTAGGAATTCAAACACCTGATCCTTACATGGCCTTAGTACCCACTGTTATCCATT

a
s	mr.mrrefChr3	106764	29	+	181019	CATGGCTTGCTATTGCAACTTGCCACCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	556793	29	+	636262	CATAGCTTGCTATTGCAACTTGCCACCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	31869	29	-	647215	CATGGCTTGCTATTGCAACTTGTCACCAA

a
s	mr.mrrefChr3	106793	14	+	181019	ACCGTTGATTTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	556822	14	+	636262	ACTGTTGATTTCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	31901	14	-	647215	ACCGCAGATTTCCA

a
s	mr.mrrefChr3	106807	33	+	181019	ACTGCTTGGCTGTAGATGGTACGATTATATAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	556836	33	+	636262	ACTGCTTGGCTGTAGATGGTACGAGTATATAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	31986	33	-	647215	ACTGCTTGGCTGTAGATGGTACGATTATATAAT

a
s	mr.mrrefChr3	106840	128	+	181019	AGCAGACAAAGAGTTATCAAGTACCATGTAGAGCTTAACCCATACAATTGGGACTATTGTTACAATGGATATGGAACAACCAAATTGCCAATGGGCTGTTGGTAAAATAGGAGAGAACATGGAGGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	556883	128	+	636262	AGCAGACAAAGAGTTATCAAGTACAATGTAGACCTTAACTCATACAACTGGGACTATTGTTACACTGGATATGGAACCACCAAATTGCCAATGGGCTGTTGATAAAATAGGAGAGAACATGGAGGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	32019	128	-	647215	AGCAGACAAAGAGTTATCAAGTACCATATGGAGCTTAACCCTTGCAATTGGGACTATTGTTACAATGGATTTGGGACACCCAAATTGCCAATGGGCTGTTGGTAAAATGGGAGAGAACATGGAGGGGG

a
s	mr.mrrefChr3	106968	400	+	181019	CTTTTGCCTTTTACAGTTAAGGAGGAGGGCATGCATTTGAGACAAAACCATTGGTGCAATTTCTCAAAATAAAATCCTGGATAACCACAGATTGGGTTCTAACAAAGATCATCATGACTGGCCCCATGGAAGGGCAGGATGACTGATGCTCATATAGGGAAACAGTAAAGCGGATTTTCAAATAAAATGTCATACCCACATACCATGTTAAAATAGAGGGCCCCATTAGATCTCATCAGAGTTCTTACCACAATCACCCTCTAATCAAGTTTTGTAGTGTGACACCATTTTCTTCTAGGAGATGCATTTCTTGCTTTAAACCAAGTATCTGTAAAATTGCAATCTACAGAAGTTCAAATAAGCATAGCTGCACAAAGTTATTAAGGTGTGAAATATTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	557012	397	+	636262	CTTCTGCCTATCACAGTTAAGGAGGAGGGTATGCATTTGAGACAAAAC-ATTGGTGGAATTTCTCAAAATAAACTCCTGGATAACCACAGATTGGGTTTTAACAAAGATCATTATGACTGGCCCCATGGAAGGGCAGGATAACTGATGCTCATATAGGGAAACAGTAAAGCGGATTTTCAAATAACAC--CCTACCCACATACCATGTTAAAATAGAGGGCCCCATTAGATCTCATCAGAGTTCTTACAACAATCACCCTCTAATCAAGTTTTGTAGTGTGACACCATTTTCTTCTAGGAGATGCATTTCTTGCTTTAAACCAAGTATCTGTAAAATTGCAAGCTACAGAAGTTCAAATAAGCATAGTTGCACGAAGTGATTAAGGTGTCAGATATTATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	32147	397	-	647215	CTTTTGCCTTTTACAGTTAATGAAGAGGGC---CATTTGAGACCAAACCACTGGTGCAATTTCTCAAAATAAAATCCTGGATGACCAAAGATTGGGTTCTAACAGAGATCATCATGACTGGCCCCATGGAAGGGCAGGATGACTGATGCTCAGATCGGGAAACAATTAAGCCGATTCTCAAATAAAATGTCATACCCACATACCATCTCAAAATGGAGGGACCCACTAGATCTCACCAGAGTTCTTACCACAATCACCCTCTGATCAAGTTTTGTTGCGTGACACCAGTTTCTTCTGGGAGATGCAGTTCTTGCTTTAGACCAAGTATCTCTGAAATTGCAATCTACAGAAGTTCAAGTAAGCATAGCCGCACAAAGTTATTAAGGTGTGAAATATTATA

a
s	mr.mrrefChr3	107368	140	+	181019	CCAGATACTAATTATGCCGCCATGCAGATGTCTACATTTGTTAAGCCTTGATCCGCAAAAACCAGCAGCCTCATGACGCTGGGTTACATCAAAGCCAGAATGAAATCCTACCCAACCAATGTATTGGAATGAGAAAGAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	557409	140	+	636262	CTAGATACTAATTATGCCGCCATGCAGATGTCTACATTTGTTAAGCCTTGATCCGCAAAAACCAGCAGCCTCACGACACTGGGTTACATCAAAGCCAGAATGAAATCCTACCCAACCAATGTATTGGAATGAAAAAGAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	32611	140	-	647215	CCAGATACTACTTATGCCGCCATGTAGATGTCCATATTTGTTAAGCCTTAATCCGCAAAAACCAGCAGCCTCATGACGCTGGGTTACATCAAAGCCAGGATGAAATACTACCCAACCAATGTCTTGGGATGAGGAAGAAA

a
s	mr.mrrefChr3	107508	55	+	181019	TACTTTTATGAGCTACTATGTGAGCATAAGGGTGCCCCTTGTGTAGTTTTCTCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	557550	52	+	636262	TACCTTTATGAGCTACTATGTGAGCATAAGGGTGCCCCTTGTGTAGTTTTCT---
s	simRat_chr6.simRat.chr6	32751	53	-	647215	--CTTTTATAAGCTATTATTTGAGCATAAGGGTGCCCCTTGTGTAGTTTTCTCAT

a
s	mr.mrrefChr3	107563	16	+	181019	CCAAAGAAGTGTAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	32808	16	-	647215	CCAAAGAAGTGTAGTT

a
s	mr.mrrefChr3	107579	103	+	181019	GGTCCGAAGATCTCTTAATGGTCATCTCTGAAGATCATGGTCCTCCCCAGATCAGAAGGCGAGACCAGTTCCTTAACTATTGCAGGCTATCAATGAGTCTTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	557602	101	+	636262	GGTCCGAAGAACTCTTAATGGTCATCTCTGAAGATCATGGTCCTCCTC--ATCAGAAGGCGATACCAGTTCCTTAACTATTGTAGGCTATCAATGAGTCTTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	32832	102	-	647215	GGTCCAAAGATTTCTTAATGGTCATCTCTGAAGATCACGGAGCTCCCCAGGTCAGAAGGCGAGACCGGTTCCTTCACTATTGCAGGGTATCAATGAATCTTA-

a
s	mr.mrrefChr3	107682	163	+	181019	GTAACTGAAGACAGCCAATGCAATAGTACTAAGATAGTCCTGTGGATGGGTTTACTTGTGCTTGTGCCTAAGGATAATAATTGAGAGGGGGATTAATGAGGATCAGAGCCTACAAGTTACAGGGTGCTGACAGTGAGCCTAGGTTTGATTTCTATTAGTACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	557704	163	+	636262	GTAACTGAAGACGGCCAATATAATAATACTAAGATAGTCCTTTGGATGGGTTTACTTGTGCTTATGCCTAAGGATAATGATTGAGAGGGGGATTAATAAGGATCAGAGCCTACAAGTTACAGGGTGCTGACAGTGAGCCTAGGTTTGATTTCTATTAGTACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	32934	162	-	647215	GTAACTGAAGACAACCAATGCAA-AGTACTAAGATAGGCCTGTGGATGGGTTTGCCCGTGCTTGAGCCTAAGGACAACAATTGAGAGGGGGATTAATGAGGATCTGAGCCTATAAGTTACAGGGTGCTGGCAATGAGCCTAGGTATGGTTTCTATTAGTACAC

a
s	mr.mrrefChr3	107845	28	+	181019	CGCTTGCCCCACATATTAATCTATGTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	557867	28	+	636262	CGCTTGCCCCACATATTAATCTATGTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33102	28	-	647215	CCCTTGCCCCACATGTTAATCTATGTAG

a
s	mr.mrrefChr3	107873	10	+	181019	GCCTCAGAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	557896	10	+	636262	GCCTCAGAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33130	10	-	647215	GCTTCAGAGG

a
s	mr.mrrefChr3	107883	8	+	181019	ATGTGCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	557911	8	+	636262	ATGTGCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33140	8	-	647215	ATGTGCAG

a
s	mr.mrrefChr3	107891	19	+	181019	ACAGTCTTAATATCTGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	557919	19	+	636262	ACAGTCTTAATATCTGTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33150	19	-	647215	ACAATCTTTATAGCTCAAC

a
s	mr.mrrefChr3	107910	79	+	181019	TGTCCTATCATTACCCCAGTGAATATCATGGAACCCTGAGGTATCTCTGATATGGATATCATGTGATAGACAGCATCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	557938	79	+	636262	TGTCCTATCATTACCCCAGTGAATATCATGGAACCCTGAGGTATCTCTGATATGGATATCATGTGATAGACAGCATCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33170	79	-	647215	TATCCTATCATTACCCCAGTGAACATCATGGTACCCTGAAGTATCTCAGATATGAATATCATGTGAAACACAGCATCCC

a
s	mr.mrrefChr3	107989	45	+	181019	ACTCGTTTTATAGGGTAAAATGTGTTGGGCCCTTCTCCAGATGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	558090	45	+	636262	ACTCGTTTTATAGGGTAAAATGTGTTGGGCCCTTCTCCAGATGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33249	45	-	647215	ACTTGTTTTATGGCGTGAAATGTGTTGGGTCCTCCTACGGGTGCC

a
s	mr.mrrefChr3	108034	17	+	181019	AATGATTGGTTGATAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	558136	17	+	636262	AATGATTGGTTGATAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33294	17	-	647215	AGTGGTTGCTTGACAAC

a
s	mr.mrrefChr3	108051	68	+	181019	ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTAGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	558153	68	+	636262	ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTAGAGATGCCTGTGATTACTTGACAGCACATGAAGCGGGCAGGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33311	68	-	647215	ACATGAGGTGGATAGGCTCCTTCTACAGATGCTGGTGATTATTTGGCAGCACATGAGGCAGGTGGGCT

a
s	mr.mrrefChr3	108119	58	+	181019	CAGCAGCCAAGTAATGACTGCATGCACATGGCCGTGTTTGCCTTTAATGGGAGCTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	439501	58	+	636262	CAGCAGCCAAGTAATGACCGCATGCACATGGCCGTGTTTGCCTTTGATGGGAGCTTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	558222	58	+	636262	CAGCAGCCAAGTAATGACTACATGCACATGGCCGTGTTTGCCCTTAATGGGAGCTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33379	58	-	647215	CACCAGCCAAGTAATGACAGCACGCACATGGCCATGTTTTCCTTTAATGGGAGCTTTG

a
s	mr.mrrefChr3	108177	58	+	181019	CACAAGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	439559	58	+	636262	CACAAGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	558280	58	+	636262	CACATGGGGCACTTGAAATTTCGACAACATTAAGGAGGTCCGAAAAGAGTTTAAGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33438	58	-	647215	CACAAGGAGCACTTGAAATCTTGACAACATTAAGGAGGTCCAAAAAGAGTTTAAGAAT

a
s	mr.mrrefChr3	108235	33	+	181019	GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	558338	33	+	636262	GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33496	33	-	647215	GTAGGAAACCCTGGACTTGCCTTAAAGGTACTT

a
s	mr.mrrefChr3	108268	21	+	181019	ATAGGCCAAATGTTTGATCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	558388	21	+	636262	ATAGGCCAAATGTTTGATCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	33529	21	-	647215	ATAAGCCAAATGTTGGATATC

a
s	mr.mrrefChr3	108289	29	+	181019	ATTGATGAGGTTACAGGGTTTCAGAGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	558409	29	+	636262	ATTGATGAGGTTACAGGGTTTCAGAGGCA
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a
s	mr.mrrefChr3	108318	35	+	181019	TGAGTTACAACCCTGGGGCAACACAATATGTGTAC
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a
s	mr.mrrefChr3	108353	84	+	181019	TCTCTTCAATTTCTGAGGTAGTCAGGATCATATATAACACATAGGGAGTGCAATGCAGGACCTTCCCTGGTACATGTTGGTTAT
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a
s	mr.mrrefChr3	108437	422	+	181019	ATATAAGATTATTCACATAGTGCACATCAAGGTAAGCAACATTTAATAATGCCTGGTAGCTTCTCCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTTGTAAAATTGGGAAATAGATAGTTGAACTGTTCCAATTATAAACTTGTATTCACAATTGCTATCTCATTTCTTCCACTTAACCAGCTACTTTTTCTCTGGTTGATTTAATAGCAAGGGAATTTGTTCTTCCAAACAACTGTTCTATGTTGACCTACTCAGCTGTGTAACACATTAATTGTTGGCTTGGTCAACTTAGGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTCCCCTTACTGGTGTTATGAATGCTAGTATAGTCTTCAGCTCAAATGCTAGTATAATCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTGGGACAAGTTTTAATATTTATGATCCCGTAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	558576	370	+	636262	ATATAAGACTATTCACATAGTGCACATCAAGGCAAGCAACATTTAATAGTGCCTGGTAGCTTC-CCAATAAACTGGTAGGGGCTTTAGCATGTTGTAAAATTGGGAAAGAGACATTAGAACTGTTCCAATTATAAACTTG--TTCACAATTGCTTTCTCATTTCTTCCACTTAACCAGCTACTTTTTCTCTGGTTGATCTAATAGCAAGGGAATATGTTGTTCCAAACAACTGTTCTA--CTGGCCTACTTAGCTGTGTAACACATTAATTGTTGGCTTGGTCAACTTAGGCAGTCCTTTTTCACCTTGGTGCCTT-----------------------------------------------TAATCTCTGCCTTTACCCATGTGCTCTGGGACAAGTTTTAATATTTATGATCCCACAGT
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a
s	mr.mrrefChr3	108859	57	+	181019	ATCCTGTCGTCGTGGACAATAGATTATAGGCCCAGACCAAAGCAACTGTCTACTGAA
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a
s	mr.mrrefChr3	108916	434	+	181019	ATGTACCCATTAGATACTCTAATCAGTGACAGTTCAACCCATATCTCCCAAGGCAGTGGACAGGGGCCACTAAACTCTCTTAGCTTCAGAGCCTCAAATGAGTAGGTCTTGTTGTGGTTGCAGGAGTCATACACTGTGGCCCTAATGACCATGCACTTTGGGGAGTGACTACTATTAATCTTTGATTCAGTGGCACTAATCTAGAGCTAAATTAGGCTTAAAAACCGCTCACTGGCTAGTGAATATCTGCTTCTCTCTCTTTCCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACAGGAGACTATTACCTAGCACTCGTGCAATTAAGTGTGACCAAATCTCCTGAATTATAGAAATTCACTTCCATTCAGTAAACTGTACAGAATAGAAATAAAGGTAGATTTACACAGAAGGAATCAGGAAATGAAACGGTCGGACCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	559010	418	+	636262	ATGTACCCATTAGATACTCTAATCAGTGACAGTTCAACCCACGTCTTCCAAGGCAGTGGATGGGGGCCAATAAACTCTCTTAGCTTCAGAGGTTCAAATGAGTAGGTCCTGTTGTGGTTGCAGGACTCATACACTGTGGCCCTAATAACCATGCACTTTGGGGAGTGACTACTATTAATCTTTGATTCCGTGGCACTGATCTAGGGCTAAATAAGGCTTAAAAACC---------------CATATCTGCTTCTCTCTCTTTCCTATGTTAGGTAATGTTGATGCCACTGGAGACTATTACCTAGCACTC-TGCAATTAAGTGTGCCCAAATCTCCTGAATCATATAAACTCACTTCCATTCAGTAAACTGTACAGAATAGAAATAAAGGTAGATTTACACAGAAGGAATCAGGAAATGAATCGGTCGGACCTA
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a
s	mr.mrrefChr3	109350	171	+	181019	GCGATGTTCCGGCCCTTCGCAAACATGCTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGGCTCCAGGACACACATGTATCGGACGGTCTTCGACCACTTATGGATCGGCAGGGACGAATTGATCCCTCTAACCACATGGAAGCCATAATTTAATTGCTACGCGTGTCTTGCGCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	559429	171	+	636262	GCGATGTTCCGGCTCTTCGTAAACAGCTTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGGCTCCACGACAAACATGTATCAGGCGGTCTTCGACCACTTCTGGATCGGCAGGGACGAATTGATCCCTCTAACCACATGGAAGCCATAATTTAATTGCTACGCGTGTCTTGCACG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	34609	171	-	647215	GCGATGGTCCGGCCCTTCGCCAACATGCTATGAAGGGAAGCATCATCGAAAGAAGGTCTCTAGGACACACATGTATCGGACGGTCTTCTACCACTTATGGATCGGCAGGGACGAATTAATCCCTCTAACCAGATGGCAGTCTTAATTCAATTACTACGCGTGTCTTGCGCG

a
s	mr.mrrefChr3	109521	365	+	181019	GAACACGTTGCGTTTATTCCTGAATCATCGATTCCCCTACTCAAAACATAGCTTCACACCGCTGTAAAGGGCGCAAACTTTGACGACAGTTCGGTAGGGAGGCGAACTTCTATGATGACGTGCGGGAGTGCTCCGATACCATTAGCTGTGGACCGACTTTATGGGTCGACAATATTGTTTAACGACTTGGCTTCCCTGCATCTTATTCTGCTGGCGAAGCCTTAAGCGGAGGGTTTACCAAAGGTGGATGCCAGGGGGACAACTAGGGCTTAATAAATGGAAGCCTGCCCATGATACTCTGTTTCTGTTGTCTGCAGTCATTGAGCAACATATCGCTCAGAGAGACATCTATCCATAGATCTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	559600	355	+	636262	GAACACGTT--GTT---TCCTGATTCATCGATTTCCCTACTCAAAACATAGCTTCACACCGCTGTAAAGGGCGCAAACCTTGACGACAGTTCGGTAGGGAGGCGAACTTCTATGATGACGTACGGGAGTGCTCCGATACCATTAAGTGTGGGCCGTCTTTATGGGTCGACAATATCGTCTAACGACTTGGCTTCCCTGCATCTTATTCTTCTGGCGAAGCCTTAAGCGGAGGGTTTACAAAAGGTGTATGCCAGGGGGACTACTAGGGCTTAATAAATGGAAGCCTGCCCATGATAC-----TTCTGTTGTCGGCTGTCATTGAGCAACATATTGCTCAGAGAGACATCTATCCATAGATCTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	34783	365	-	647215	TAATACGTTGCGTTTATTACTGAATCAACGATTCCCCTACTCAAAACATCGCTTCACAACGCTGTAAAGGGCGCAAACTTTGACTACAGTTCGATAGGGAGGCGAACTTCTATGATGACGTGCGGGAGAGCTCCGATACCATGAGCTGCGGACCGACTTTATGGGACGACAATATTGTTTAACTACTTGGCTTCCCTGCTTCTTAATCTGCTGGCGAAGCCTTAAGCGGAGGGTTTGCCAAAGGTGGATGCCAGGGGGGCAACTAGGGCTGAATAAATGCAAGCCTGCCCATGATACTCTGTTTCTGTTGTCTGCAGTCATTGAGCACCATGTCGCTCAGAGAGACATCTATCCAGAGACCTATG

a
s	mr.mrrefChr3	109886	83	+	181019	CTTTGAGATTGAGCCTTATGTGTGATGCAGCCATGAAAATTGGGTTATTTCAACATTATGTGATACATATTCTATCTTCCGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	559957	83	+	636262	CTTTGTGATTGAGCCTGATGTGTGATGCAACCATGAAAATTGGGTTGTTTTAACAGTATGTGATACCTATTCTATCTTCCGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	35148	83	-	647215	CTTTGAGATTGAGCCTTCTATGTAATACAGCCACAAAAAGTGGATTATTTCAACATTATGCGATACACATTCTATCTTCCAAG

a
s	mr.mrrefChr3	109969	11	+	181019	GTCCAAGCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	560040	11	+	636262	GTCCAAGCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	35235	11	-	647215	TTCCAAGTTCC

a
s	mr.mrrefChr3	109980	13	+	181019	AGCATTCACTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	560051	13	+	636262	AGCATTCACTTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	35247	13	-	647215	AGCCTTCACTTTA

a
s	mr.mrrefChr3	109993	153	+	181019	TGAGTATTGTCAATATATGTAATGAGGCATCTGCATTGACTGTGAGTGGTTATGTATCTGTATGATTTGGTGGGCTTATCAAGAATTATAATGTGAATACTGTTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAAGTACTGCAACTGGGATCATGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	560064	151	+	636262	TGAGTATTGTCAATATATGTAATGAGGCATCTGCATTGACTGTGAAT-GTTATGTATCTGTATGATTTGGTGGGCTTATCAAGGATTATGATGTGAATACTGTTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAACTACTGCAGCTGGGATGATGG-
s	simRat_chr6.simRat.chr6	35273	153	-	647215	TGATTATTGTCAATATATGTAATGGGGCATCTGCATTGACTGTGAGTGGTTATGTATCTTTATGATTTGGTGAGCTTATCAAAAAAAATAATGTGAATACTATTCACTCAAACTGTAATTCTTCTTGGGAAGTACTGCGACTGGGATCACGGG

a
s	mr.mrrefChr3	110146	20	+	181019	TCTGTTTGTCACAGACTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	560215	17	+	636262	---GTTTGCTACAGACTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	35427	20	-	647215	TCTGTTTGTCACACACTTGA

a
s	mr.mrrefChr3	110166	353	+	181019	CATCTAATGCACTTTGCTCATGAACTCACTACAATCTGCAGCTAAGTCAGACTATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATGGCCCGGGTCTTACAATACAAGTTCTACACCACCATTAGAAGCTAGTTGTAGTCTTAAGTCTAAATGAGGGAAACTCTCAGGTGAGGCAATTTAAGTCTGAGGGACACCACTACAATTGTGTATGCAAGGTGTAGCaGTACAAAAAATTTGAGTGCAAGGAGAAGGAGTAACAatgtTAATATGCATTAAGTGGTGGCAGGTGTTGTCAGTACTCTGAAGTGTACTAGCAATAGGCCCGATTCCCTTGCATGTTTAATATATGGCTCCTCAAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	560282	322	+	636262	CATCTAATGCACTTTGCTCATGAACTCACTACAATCTGTAGCTAAGTCAGACTATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATGGTCCGGGCCCTACAATACAAGTTCTACACCACCATTAGGAGCTAGTTGTAGTATTATGTCAAAATGA----------CAGGTGAGGCAATTT-----TGAGGGACACCACTACAATTGTGTATGCAAGGTGTAGT-GTACAAAAAATTCGAGTTCAAGGAGAAGGAGCAACA----TAATAT-----------TGGCACGTGTTGTCAGTACTCTGAAGTGTACCAGCAATAAGCCCGATTCCCTTGCATGTTTAATAAATGGCTCCTCAAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	35447	353	-	647215	CATCTAATGCTGTTTGCTCATGAACTCACCACAACCTGCAACTAAGTCAGACCATCAAATAAACTTACTTTGGGTGATAGCCCGGGTCTTACAATACAAGTTGTACACCACCAATAGAAGCTAGTTGTAGGCTGAAGTCTAAATAAGGGAAACTCTCAGGCGAGGCAATTTAAGTCTGAGGGACACCACTACAATTCTGTATGCAAGGTGTAGCAGTACAAAAAATTTGAGTGCCAGGAGAAGGAGTAACAATGTTAATATGCATTAAGTGGTGGCAGGAGTTGTCAGTACTCTGACATGTACTATCAATAGGCCCTATTCCCTTGCATGTTTAATATATGGCTCCTCAGACA

a
s	mr.mrrefChr3	110519	78	+	181019	AACCAAGGGACGGACCTTATTTATATTGCATTTGCCTGTTGTATGTTATGCCATTCTTATCAGCTTGAGTCTGGGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	560604	78	+	636262	AGCCAAGAGACGGACCTCATTTATATTGCATTTGCCTGTTGTATGCTATGCCATTCTCATCAGCTCGAGCTTGGGTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	35801	76	-	647215	AAGCAGGGGATAGACCTTACT--TATTACATTTGCCTGCTGTTCATTGTGCCATCCTTATCAACTTGAGTCTGGGTAC

a
s	mr.mrrefChr3	110597	168	+	181019	ATCTCAATGCCACCACCAAGGGATCCAACCTAAATTATATCTGGGATGAGTTTCCAGTAAGAAACCTCTCCTTTAGTTGAGCTCTGTCTTTCCATGCTGACTATGGTGAGCATGCTCTAATTAACACACTCACCTTATTGCTAGGTACCCTGCATGTTGCATTGCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	560682	168	+	636262	ATCTCAATGCCACCACAAAGAGATCCAACCTAAATTATATCTGGGACGAGTTTCCAGAAAGAAACCTCTCCATTGGTTGAGCTTTGTCTTTCCACACTGACTATGGTGAGCATGCTCTAATTAACACACTCACCTTATTGCTAGGTACCCTGCATGTTGCATTGCATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	35878	168	-	647215	ATCTCAATCCCACCACCAAGGGATCCAACCTAAATTATGGCTGGGATGAGTATCCAGTAAGAAACCTCTTCTTTAGTTGAGCTCTGTCTTTCCATGCTGAGCATGGCGAGCATACCCTAATTAACGCACTCTCCTTATTGCTAGGTACCCTACAAGTTGCATTGGATG

a
s	mr.mrrefChr3	110765	10	+	181019	AAGGTTTAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	560851	10	+	636262	AAGGTTTAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36046	10	-	647215	AAGTTTTAAT

a
s	mr.mrrefChr3	110775	45	+	181019	TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATATTGATGAGATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	560861	45	+	636262	TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATAATGATGAGATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36067	45	-	647215	TGTCTTACATTAACTCAGGCAGGGTTGCAAATATTGATGAGATTA

a
s	mr.mrrefChr3	110820	254	+	181019	TGTGCCCAAATATAGGGTATATTCCTTGAAGAACATAGCCTGTCTTATGAAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACACAGAAATGAAGGATAATTAAAGAATCTCTATAAGGACCAACATACAAACGATCGTTAATACATACTCATCTCTATTGTTCAACTTACCCAGCTCTAGTTTGGCACTTCTTAATGGACAATACGGTACCATCTCACCCCAAGCCCCCCACGTAGCTATCACCTGTAGCTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	560906	240	+	636262	TGTGCCCAAATATAGGGTATATTCCTTGAAGAACATAGCCTGTCTTATGGAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACGCAGAAATGAAGGATAATTAAATAGTCTCGATA-----------ACAAACGATTGTTAATACATTC---TCTCTATTGTTCAACTTACTCAGCTCTAGTTTGGCACTTCTTAACGGACAATACGGTACCATCCCACCCCAAGCCCCCCACGTGGCTATCACCTGTAGCTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36113	254	-	647215	TGTGCCCAAATATGGGGTATGTTCCTTCGAGAACATACGCTGTCTCATGAAAGACTGTCTTCAGGGTGATATTTGAACCTACACAGAAATGAAGGATAATTAAGGAATCTCTATAAGGACCAACATACAAATGATCGTTAATACATACTCATCTATATTGTTTAACTTGCCCACCTCTAGTTTGGCACTTCTTAATTGACAATTTGGTACCATCTCCCCCCAAGCCCCCCACATAGCTATCACCTGTGTCTGAG

a
s	mr.mrrefChr3	111074	47	+	181019	TGTCTATCTACCTCCTAGTTCACATAACAGGATACCAAAGTGGACCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	561147	47	+	636262	TGAGTATCTACCTCCTTGTTCACATAACAGGATACCAAAGTGGACCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36367	47	-	647215	TATCTATCTATCTCCTATTTCACATCACAGGATACCAAAGTGAAACT

a
s	mr.mrrefChr3	111121	19	+	181019	GGAGTGGACCTGGGATCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	561194	19	+	636262	GGAGTGGACCTGGAATCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36417	19	-	647215	GGAGTGGACCTGGGTTCAT

a
s	mr.mrrefChr3	111140	67	+	181019	TCTCCAAATCCATAGCTGACCCTCATGCCAGAGGCTTTCCTCATGCTGGAGTGGCGGCCCCAGAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	561213	60	+	636262	TCTCCAAATCTGTAGCTGACCCTGATGCCAGAGGCTTTCCCCATGCTGGAGTG-------CAGAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36439	67	-	647215	TCTTCAAATCCATAGCTGACCCTCATGCCAGAGGCTTTCCTCATGCTGGAGTGGCGGCCCCAGAATA

a
s	mr.mrrefChr3	111207	83	+	181019	TTGTTAACATCATCAGTCATTCTTAGAAACAATTAGAAGAAGAACTTGCCTATAAGTTATATGGCACGCAGCAGTTTATTCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	561273	83	+	636262	TTGTTAACATCATCAGTCATTCTTAGAAACAATTAGAAGAAGAACTTGCCTCTAAGTTATATGGCACGCAGCAGTTTATTCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36507	83	-	647215	TTGTTAATATCATCGCTTGTTTTTAGAAACACTTTGAAGAAGAACTTGCCTATAAGTTATATGGCACGCAGCAATTTATCCTT

a
s	mr.mrrefChr3	111290	27	+	181019	GGCCTATGGAAGAATGAGTACATACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	561356	27	+	636262	GGCCTATGGAAGAATGAGTACATACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36641	27	-	647215	GGCCTATGGAAGAATGAATACATACAC

a
s	mr.mrrefChr3	111317	13	+	181019	AATCTTTCATATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	561383	13	+	636262	AATTTTTCATATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36669	13	-	647215	AATCTTTCATATG

a
s	mr.mrrefChr3	111330	137	+	181019	TATAATTATGTGCAATTCTTGACTGATATTCTAAGTTTTATTGAATGAGTCAGAACTTGGTTAAACTGTGGTGATTGGTATGACTGTGGACTTATCGTCAACAGGGATGAATCTGAAGCCATGGACTATATCAACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	561397	135	+	636262	TATAATTATGTGCAATTCTTGACTGATATTCTAAGTTTTATTGAATGAGT-AGAACATGGTTAAACTGTGGTAATTGCTATTACTGTGGGCTTATC-TCAACAGGGATGAATCTGAAGCAATGGACTATATCAACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36682	133	-	647215	TGTAATTATGTGCAATGCT----TGATATTCTAAGTTTTATTGAGTGAGTCAGAATTTGGTTAAACTGTAGTGATTGGTATGACGGTGTACTTATTGTCAACAGGGACAAATCTGAAACCATGGAGTATCTCAACAT

a
s	mr.mrrefChr3	111467	397	+	181019	GCACTTTGTGACCAGGTGTATCAATATGGGATTCTTGTGTATTAGTATTTGCAGACAAGCTTGTACTTTGGACCATAAATCCAAGATTCACCCTTGACTTGTGGTTGATGCACTTGCCACTTAATATTATTTGGCTGTCAGGTGTATTGTCCTGAAATGATGGCTTATAGCAGCTAGAAAAATGTGACATATCTGGTGACAGATACAATTTCCTTTAACAATTCAATATGATTTTTATACAGTTCAAAGAAAGTTTCTCACTGAACTGCCAATCATACCAACCAAAAAGAGTTGTATTAGCAAGCAATCTATTGTTTATGAGTGCCGAGGAATTATTATGAATTTAATTACACATTGAGGCCCTGGGAGTCTTGAGACCACACAAGAGGCATGTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	561532	397	+	636262	GCACTTTGTGACCAGGTGTATCAATATGGGATTCTTGTGTATTAGTATTTGCAGACAAGCTTGTACTTTGGACCATAAATCCAAGATTCACCCTTACCTTGTGGTTGATGCACTTGCCACTTCATATTATTTGGCTGTCAGGTATATTGTCCTGAAATGATGGCTTATAGCGGCTAGAAAAATGTGAAATAGCTGGTGACAGATACAATTTCCTTTAACAACTCAATATGATTTTTATACAGTTTGAAGAACGTTTCTCACTGAACTGCCAATCATAACAACCAAAGAGAGTTGTATTAGCAAGCAATCTATTGCTTATGTGTGCTGAGGAATTATTATGAGTTTAATTACACATTGAGGCCCTGGGAGTCTTGAGACCACACAAGAGGCATGTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	36816	386	-	647215	GCACTTTGTGACCAGTTGTAGCAATTTGGAATTC-TGTGTATTTGTAT------ACAAGCCTGTACTTTAGACTATAGATGCTAGATTCAC--TTGACCTGTGGTTGATACACTTACCACTGAATATTATTTGGCCGTCAGGTGTATTGTCCTGGGATGATGGCTTATAGCAGCTAGTAAAATGTGGCATATCTTGTGACAGATACAATTTGTTTTAACAATTCAATATGATTTTTATACAGTTCAAAGAGAGCTACTCACTGA--TACCAATCATACCAACCAAAAAGAGTTGTATTTGCCAGCAATCTATTGTTAATCAGTGCCGAAGAATTATTATGAATTTAATTATGCATTGAGTCCCTGGGAGCCTTGGGACAATGCAAGAGGCATGTGGT

a
s	mr.mrrefChr3	111864	10	+	181019	GTACATATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	561931	10	+	636262	GTACATATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37202	10	-	647215	ATACATAAAA

a
s	mr.mrrefChr3	111874	120	+	181019	CTTAAAACTGCAGCCCTCCGATTTATTTTGACTCTAGAAACATTGCAGCTGGTGCCCCTTGAATTGGCCATTGATTTGGAGGGCAAGAGTGCTGTTACACCTTCATCAGCTGAGTTGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	561941	120	+	636262	CTTAAAACTGCAGCCCTCCGATTTATTTTGACTCTAGAAACATTGCAGCTGGTGCCCCTTGAATTGGCCATTGATTTGGAGGGCAAGAGTGCTGTTACACCTTCATCAGCTGAGTTGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37213	120	-	647215	CTTGTAATTGCAGGCCTCTGATTTATTTTGTGTCCAGAAATATTGCAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGGCCATCAATTTGGAGGACTTGAGTGCTGTCATACCTTCACCAACTGAAATGGGG

a
s	mr.mrrefChr3	111994	8	+	181019	GAGGTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562065	8	+	636262	GAGGTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37333	8	-	647215	GGAGTGAG

a
s	mr.mrrefChr3	112002	33	+	181019	TCAACCTGCTCAGGACACGCAGAATCGGTCTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562073	33	+	636262	TCAACCTGCTCAGGACACGCAGAATCGGTCTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37347	33	-	647215	TCAACCTAGTCAGGACACACAGAACCAGTCCGA

a
s	mr.mrrefChr3	112035	18	+	181019	GACCCCACAAGAGACATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562128	18	+	636262	GACCCCACAAGAGACATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37380	18	-	647215	GACCCCACAAGTGGCACA

a
s	mr.mrrefChr3	112053	52	+	181019	TTGTATTTTTTGTCCATCTATATTGCGGCTGGTGCCCTCTAAGTTGGCCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562146	52	+	636262	TTGTATTTTTTGTCCATCTATATTGCGGCTGGTGCCCTCTAAGTTGGCCATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37399	52	-	647215	TTGTATTTTTTGTCCATCTATATTGCAGCTGGTGCCCTCTGAATTGGCAATT

a
s	mr.mrrefChr3	112105	17	+	181019	AGAGGACATGAGGTTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562198	17	+	636262	AGAGGACATGAGGTTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37453	17	-	647215	GGAGGACATGAGGTTGC

a
s	mr.mrrefChr3	112122	23	+	181019	GCCTTCATCAACCAAGCTGGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562215	23	+	636262	GCCTTCATCAACCAAGCTGGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37473	23	-	647215	GCCTTCATCAACCAAGCTGGGGG

a
s	mr.mrrefChr3	112145	59	+	181019	GACACATGGGACTCCTAGCCCCCTTGTCAATGGAACTGGAGCAGTTAGATAGATTCACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562238	59	+	636262	GACACATGGGACTCCTAGCCCCCTTGTCAATGGAACTGGAGCAGTTAGATAGATTCACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37521	59	-	647215	AACACATGGAACCCCTGGCCCCCTTTTGAATGGAACCGGAACAGTTTTATGAATTTGCC

a
s	mr.mrrefChr3	112204	24	+	181019	AACAGGGAGCCCACATTCCATGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562298	24	+	636262	AACAGGGAGCCCACATTCCATGTG
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a
s	mr.mrrefChr3	112228	132	+	181019	CTAGCATCACAGGATCTAAGGAACCATGGAATTATAAATCAGTATGGAATGGGCAGCTTAGCATTAGCAAGTCATATGCTTGTGGCATCATATCCCCAAAACAGTACATAACAGTCTGACCCATGCAACATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562322	132	+	636262	CTAGCATCACAGGATCTAAGGAACCATGGAATTATAAATCAGTATGGAATGGACAGCTTAGCATTAGCAAGTCATATGCTTGTGGCATCATATCCCCAAAACAGTACATAACAGTCTGACCCATGCAACATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37618	132	-	647215	CCAGCCTCACAGGGTCGAAGGAACCATGAAATTGTAAATCACTATGGAATGGGCACCTTAGCATTAACAAATCATATGCTTGTGTCATCATATCCCCAAAACAGTACACAACAGTCTGACCCATGCAACAAG

a
s	mr.mrrefChr3	112360	108	+	181019	CATGTTTCTGCATACAATGTGCAAAATCAAGTAGCAGTGGAAATTTAACACTAGACTTGACTTCCATCAAAGAATCGGGTTGTTTTTCCTTGTTATTATTATGCAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562454	108	+	636262	CATGTTTCTGCATACAATGTGCAAAATCAAGTAGCAGTGGAAATCTAACACTAGACTTGACTTCCATCAAAGAATTGGGTTGTTTTCCCTTGTTATTATTATGCAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37754	108	-	647215	CATATTTGTGCATACAATGTGCAAAATCAAGTAGCACTGGAAATTTAACACTAGATTTGACTTCCATCAAAGAAACGGGTTCATTTTCCTTGTTAATATTATGCAGCA

a
s	mr.mrrefChr3	112468	156	+	181019	GGGGACTCAGTTCAACAATTGGTAAAAGCCTGTTCTGAACGACTCCCTCTAATGTGCCAACAGCCTTGAGACTTAGGTGTCTCTGTCTAAAGGGCATTCTGTTCTGCTAGAAGAGGCAACCCAAAATTATACTTAAGACTTATAATCTCCAGGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562562	156	+	636262	GGGGACTCAGCTCAACAATTGGTAAAAGCCTGTTCTGAATGACTCCCTTTAATATGCCAACAGCCTTGAGACTTAGGTGTCTCTGTCTAATGGGCATTCTGTGCTGCTAGAAGAGGCAACCCAAAATTATACCTAAGACGTATAATCGCCAGGGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	37863	156	-	647215	GGGGGCTCAGTTTAATGATTGGTGAAAGCCTGTTCTGAACGACTCCCTCTGATGTGCCAACCGCCTTGAGACTTAGGTGTCTCTCTCTAAAGGGCATCCTGTTCTGGTAGATGAAGCAACCCAAAATTATCCTTAAGACTGACAATCTCCAGGGTG

a
s	mr.mrrefChr3	112624	32	+	181019	ACCTACACCTACTATCATGAAACTACATAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562777	32	+	636262	ACCTACACCTACTATAATGAAACTACATAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	38019	32	-	647215	TCCTACGCCTACCATCATGAAACTACATAATT

a
s	mr.mrrefChr3	112656	212	+	181019	TCTCCAAGGAAAACATCAAATCATTCATCATTCTCTTCTCAACGTCCCATAGGGTTGTACTGCTGACAATCTACTTTACCTCATACCCAAAATCTATCTACCAATGCTCAGAACCTGACAGTCACACTTAAACTGGCTCTAATTTCATGCTGAAATTCaTGAAACTGGGAGTATATAACCAGACTAAAAACGTAAacagtgaagcctACGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	562809	194	+	636262	TCTTCAAGGAAAACATCAAATCATTCATCATTCTCTTCTCAACATCCCATAGGATTGTACTGCTGACAATCTACTTTCCCTGATACCCAAGATCTATCTACCAATGCTCAGAACCTGACAGTCCCCCTTGAACTGGCTCTAATTGCATGCTGAAATTC-TGAAACTGGGAGTATGTAACCAGACTAAAGACTTAA-----------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	38069	212	-	647215	GCTCCAAGGAAGACATCAAAACATTCATCATTCTCTTCTCAATGTCCCACAGGGTAGTACTACTGATAATCTATTTTACCTCATACCCAAAAACTATCCACCAATGCTGAGAACCTGTCAGTCACACTCAAACTGGCTCTAATTTCATGCTGAAATTCATGAATCTGGGAGTGTATAACCAGACTAAAAACGTAAACAGTGAAGCCTACGGT

a
s	mr.mrrefChr3	112868	72	+	181019	GCATCAGATATCAAAACTCTGATTTTGGTCCCCAGGACAATCATCTTCACTAAATTAGCTTACTGGTCGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	563003	68	+	636262	----CAGATAACAAAACTCTGACTTTGGTCCCCAGGACAATTATCTTCAATAAATTAGCTTACTGGTCGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	38282	72	-	647215	GCATTTGATATCAAAGCTCTGATTATGGTCCCCAGGCCAATCATCTTCACTAAATTAGCTTAGTGGTAGTAA

a
s	mr.mrrefChr3	112940	70	+	181019	TCATCTGACTATCAGATCTGACCTCTCTAGTGTAAAGTAAGAGATTGAGTAACACTCGACTTACAGACCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	563072	70	+	636262	CCATCTGGCTATCAGATCTAACCCCCCTAGTGTAAAGTAAGAGATTGAGTAACACTCGACTAACAGACCT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	117294	168	+	181019	TGGTGCCCAATAATACTACTCCATAAAGTCATAGACGTGTTTCatATTCTTCTTTTATGAGTCAAAAAGACTAAGAAACAGGTTCCCTTTGTGATTAGACATAAGTAACCCCCCTTTTTCAACATCCAGCCACCTCAGAAGAATTCTCAGAAAAAAACCATCAATTTG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	42729	163	-	647215	TGGTTTACAATAATACTACTCCATAAAGTCATGGACGCGTTTC--ATTCTTCTTATCTGAGTAAAAAAGACTAAGAAATAGATTCCCTGTGTGATTAGGCATAAGTAACCCCCCTTTTT---CGTCCAGCCACCTCAGAAGAATTCTCACAAGGAAACCATTATTTTG

a
s	mr.mrrefChr3	117462	22	+	181019	TCAGTTATCATTTGAATAAGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	567603	22	+	636262	TCATTTATCATTTGAATAAGGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	42892	13	-	647215	TCAGTTATCACTC---------

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	567631	355	+	636262	TGTTAGTCGAACATAAGGATCCACCCCATATGACCACTCTATATGCCCTGCCCAATGAAATGTTGTGAGATATGGAGTGTGGAATATGAGTTCTAGGGAAGGGCGAACAAGGGCCCATAGGGATCAAGCATGTAGAAGCCTGAGAGTAATAACATTTCAAGGGATAGCTGTCAAGG-ATTTATTTTTTGACTAACCCCTCATCATGCCAACCTATTGTCCTTGCTTGTCTGATGTCTGTATTCTTGATTGTAAATCTGTCTCTCCTGGCTTATCCAGTGTTTACACCAATAAAATGTGAGACTGAAAGGAATGTTAGAATTCAGTAGAACCAAGGGTTAAGGCAGCTGCATGTTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	42905	354	-	647215	--TTAGTCAAGCATCAGTATCCACCCCATATGACCACTCTATTTTCCTTTCCCTATGAAATGTTGTGAGATACAGTGGATGGAATGTAGGTTCTAGGGAATGGCCATCAAGAGCCCATAGGAATCAAGCATGTGGAATCCTGGGAGTAACCATATTTCAAGGGATGGCTCTCAAAGTATTTGTTTCCTCACTAACCCCTCATCGCGCCAACCCACTGTTCTTGCTTGTCTGATGTCTTTATTCCTGATTGTAAATCCAACTCTCTTGGCTTATCCGGTGTTTACACCAATAAAGCGTGGGACTGAAAGGTATTATATGCCTCAGTAGAACCTAGGGTTAAGACAGCTGCCTGTTAT

a
s	mr.mrrefChr3	117840	550	+	181019	TTTTGTGCATGGTGGGATGCATTGGATCTGCCCTTACCTACCAGACCAACACCTATTGATAGGAACTGTAAACATCTCACAGACCACTTGTAATATCTAATGATCAGACTAAAGAATATAATACTCTGTAGCATCTTGTCTGGGTACTGTGCACCAGTGCTGCTCTTGTTACCCTCCCATTAAGTAATGTGTCCACATTCCAAATTGGATGTAGTTTTGTATGGGTGATCTGAATTATTTAGTTTACAGTTGGAAAATAGTGCTGATGGGGGCCTACCATTTTGCACCTGGAATGTTTCCAACAGTGTTCAGTCCAGTGTGATAAGTGTCATCCTAATTTCTAAGCTCCCAGTGTTATTACAGTTAGAGTTCTCCAATGGAATAGGTGGATGCCAATTAATAAATGTATAATCACATTGAGGTCAGTAGAATAACTGGAAAAACAGCAGTAAGGTTGGTTACAGATATCTTGTGATGCACCTCCTGTACAAGAGCACCAACAGCACACCTAAACTTGCAGAATTCTGTGGACAACCATCCCGTTTTTCGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	567986	549	+	636262	TTTTGTGCATGGTGGGAT-TATTGGATCTGCCCTTACCTACCAGACCAACACCTATTGATAGGAACTGTAAACAGCTCACAGACCTCGTGTAATATCTAATGATCAGACTAAAGAATGTAATACTCTGTAGCATCTTGTCTGGGTACTGGGCACCAGTGCTGCTCTTGTTACCCTCCCATTAAGAAATGTGTCCACATTCCAAATTGGATGTAGTTTTGTATGGGTGATCTGAATTATTTAGTTTACAATTGGAAAATAGTGCTGATGGGGGCCTACCATTTTGTACCTGGAGTGTTTCCGACAGTGTTCAGTCCAGTGTGATAAGTGTCATACTAATTTCTAAGCTCCCAGTGTTATTACAGTTAGACTTCTCCAATGAAATAGGTCAATGACAATTAACAAATGTATAATAACATTGAGGTCAGTAGAATAACTGGAAAAACAGCAGTGAGGTTGTTTACAGATATCTTGTGATGCACCTCCTGTACAAGAGAGCCAACAGCACACCTAAACTTACAGAATTCTATGGACAACCATCCCGTTTTTCGT
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	118484	33	+	181019	ATCTGTGCAAGCATCTGGTTGGGGGGAACTGGG
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	118702	100	+	181019	TTGGTCAGGGTCTTGTCTTCCTATTAAGATGAAATTCTTTACATGTTTCTTCACAATGTGAATGTCAGAAGAATGCGCCTCCATAACCTTTGCTGGTTTT
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	118849	53	+	181019	AGTATGATCATGATGGATATATGAAAGTAGGCCTTCTATCAGCTAATGAGAAA
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	119044	149	+	181019	AGTCCCTCCATTGCTAGGATCCTGGGTGTTCTTGCTGGGAACATTATTCTTGCAAGAAATTCTATAGCTGCCCCAAGAGGGCCCTAAGGTAGAGCACATGTAGGTGCTTGATTTTAATATTTTAAAAATGATGTGAACATATGTGACAT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	44480	149	-	647215	ACTACCTCCATTGCTAAGATCCTGGGTGTTCTTGCCTGGAACATTATTCTAGCATGGAATTCTATAGCTACCTAAAGAGAGCCCTAAGGTAGAGCACATATAGGTACTTGAATGTAAGATTTAAAAAATGGAGTGAACACATTCGACAT

a
s	mr.mrrefChr3	119193	302	+	181019	CATGTGCAATTAGCACGCAGAACCTTTCAATatcttgacactctttagtggttcagatttacttagatccctgatccatctgcacttagtctcagctttgatgtaaggagtgagcaaatgtgggggtccagcttcttgttgatggatgtccaatttcaatgtcacttcctgcggagtgactattagcaattctcttagccttctccctgaacaatgaaggatagaacgatcaatgaaagatagaacaatccagttcgctgagaagtaaacagaagtctcgacaagcccactttcttgccagg
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	44635	302	-	647215	CATGTGCACTTAGCACGCAGAACCTCACCATatcttgacactctttagtggttcagaatcacttagatccctgattcatctgcacttagtctcagctttgatgtaaggagtgagcaaatgtgggggtccagcctcttgttgatggatgtccaatttcactgtcacttcttggggagtgactattaacaattctcttagtcttctccctggacaatgaaggatagaacagtcaatgaaggatagaacaatccagtttactgagaagtaaacagaagtctcaacaagcccactttcttgccggg

a
s	mr.mrrefChr3	119495	191	+	181019	tatggtttctgacctcctggtaccagcatattgggtttaatgctgttttggtcccatttactcATAATATATCCAAAAAACCAGGTAGtgaccTTCGAATTGAATTAGTGCTCCCTGCACTGACTAATCAGCATTGGAGAGGGACATAACCAAAGTGGGTGCTCACAGAATCTGCTACTCCTAACACAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	569623	186	+	636262	tatagtttctgacctcctggtaccagcataTTGGGTTTAATGCTGCTTCGGTCCCATTTACTCATAATATTTCCAAAAAACCAGGTAG-----TTCAAATAGAATTAGTGCTCCCTGCACAAACTAATCAGCATTGGACAGGGACATAACCAAAGTGAGTGCTCACAGGATCTGCTACTGCTAACACAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	44940	191	-	647215	tatggtgtctgatctcctggtaccagcacattgggtttaatgctcttttggttgcatttgctcATAATATATCCGAAAAACCAGGTAGTGACCTTTGAATTGAATTAGTGCTCCCTGCACTGACTAATCAGCATTCGAGAGGGACCTCCCTAAAGAGGGTGCTCATAGAAGCTGCTTCTCCTAACACAACA

a
s	mr.mrrefChr3	119686	467	+	181019	AATAATCAAGTTCAAATGTATCAAATACTATAATGTTTGTGTGTATCTGTGTCATAGGGTTTCGGAAATGTTGATTCACTTACTGTTGTACTATTCCTTTAATAACCCAAGCCCTAGATAATAACCTCAACAACTAGCAAGCATAAACGGCTGAATGATTTGCCTAAGTCATTTTGGCCATCTCATGAAGATTAGCTTTTGGTCATAAAGTGTGGTAATTCTGTATTGACCTCAGAAGCTATCTGGTTCAGTGTAATTATTAGGTCATTGTCAACTGTAAGTTACAAGTTTCTACTAATAGAAGTCCTTTGTGTATCTATTGTCATTAAAAAGTGAGTGTCAACGAAATAATTTAAATATTGGGAACTGGGATTACCACAAAAACTACCTTGGCCTTTGCTGCATTTTGCATGGACAACTCAGTGTTATTGTGCTCAATGTATGAACCAGTGGTTTGTTCTATAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	569814	459	+	636262	AATAATCAAGTTGAAATGTGTCAAATACTATTGTGTTTGTGTGTATCCGTGTCATAGGGTTTTGGCAATGTTGATTCACTTACTGTTGTACTACTCCCTTAATAACCCAAGCCCTAGATAATAACCTCAACAACTAGCAAGCATAGACGGCTGAAT--TTTGCCTAAGTCATTTTGGCCATCCCAGGAAGACTAGCTTTTAGTCATAAAGTGTGGTAGTTCTGTATTGACCTCAGAAGCTATCTGGTTCAGTGTAGTTATTAGGTCATGGTCAATTGTAAGTTACAAGTTTCTACTAATAGAAGTCCTTTGAATATCTATTGTCATTAAAAAGTGAGTGTCAACAAAATAATTTAAATATT------CGGGATTACCACAAAAACTACCTTGACCTTTACTACATTTTGCATGGACAACTCAGTGTTATTGTGCTCAATGTATGAACCGGTGGTTTATTCTACAGAG
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	120173	42	+	181019	ATGGAGTTCATCCATGGTGCATATCTAGTTCATCCATGGTGC
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a
s	mr.mrrefChr3	120215	40	+	181019	AAAGTATCTCAGATGCTTTTGTTATTTGGCAAAAGCAAAC
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a
s	mr.mrrefChr3	120255	202	+	181019	AATTAGGTGGCATTGTAGCTGTGGGTGCAATGCTGAACTTAGCCTAGCAGGTGTAGGCTCCCACCATTCCCTTACCTTAGCTGTTTGTTTTGATCTGTGTAACTGCAGGCAAGGAAGATTAACTAGATAAACAAATCCCCTAGACTGCTTAGTCGTGGAAATTATCACAATAAATTGTGATAGTAGACAAGAGTCAGTGGCA
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a
s	mr.mrrefChr3	120457	14	+	181019	AAGGATTTGCAGTC
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a
s	mr.mrrefChr3	120471	158	+	181019	CACTTGGGTTCTAGTTAGGTAAGTATGAGGCATGGGGGACAATACCATATAGTAGTAGGATTCCTTCCACCTTGTTTACAGAGTCTCTTGACTTATACTCACGAGATAATTTCAATAACTGCACAGCCCCAAGACATTTGCTTGAGAGCAATGGTCAT
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a
s	mr.mrrefChr3	120629	158	+	181019	GCATATTGGACCAAGTGTTTCAGCCCTAAGGTGTAGAAAATTCTCCCCATGAATAATGCTCCTCCCAACACATTAGCAATCAATGTGGATGACACAAGATCCAAAATAGTCCTCATTGACATTATGGTCAAGACAGCTTTGTATCATGCAGTGCTACC
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	120837	5	+	181019	TGGGA
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	120880	169	+	181019	AATTAACCTTTTAAAAACAGTGTCTTATGGGATATCTAATGGTGAGGACCTAGCCAAACCCATATAAAATAGGCAACATTCCACTCCACAATTACATCAATTCTCCTGACACACTGCAGCATGGTCCCTGGGTGCAAGTTCATAAGGTATAATCTCTCCATAGTATGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	570917	164	+	636262	AATTAACTTTTTAAAAATAGTGTATTATGGGATATCTAATGGTGAGGACCTAGCCAAACCCATATATAATAGGCAACATCCCACTCTACAATTACATCAATCCCCCTGACACACTGCAGCATGGTCCCTAGATGCAGGTTCATAAGGTATAATCTCTCCAGTGT-----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46439	169	-	647215	AATTAACCTTTTAAAAACAGTTTCTTATGGGATATTTAATGGTGAGGGCCTGGCCAAACCCATATAAAATAGGCAACATTCCACTCCACAGATACATCACTTCTCCTGACACACTGCAGCATAGTCCCTGGGTCCAAGTTCATAAGGTATAATGTCTCCATAGGATGTG

a
s	mr.mrrefChr3	121049	143	+	181019	CAAGAATAAATGGAATGGGTGCCTCCAATGAACATAAACAACAAAGATACATACTAGGAGCAAAGGAAAACATCCATTATGCTGATCAGATCCTACTTCTGATTTTGCACTGCTCTTTTGATTTGCTGTTTAGGCTATGCTGT
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a
s	mr.mrrefChr3	121192	73	+	181019	TAGGGAGTCCTTATTCTGCATGAAATTGTGAGCCATAATGTGGCTTCTTACTGAATCTAGTTATATATACACA
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a
s	mr.mrrefChr3	121265	8	+	181019	CCTTGCAG
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a
s	mr.mrrefChr3	121273	18	+	181019	TGGATATACACACCTTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	571321	18	+	636262	TGGATATACACACCTTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46843	9	-	647215	---------CTACCTTGC

a
s	mr.mrrefChr3	121291	63	+	181019	AGCTATGAAGATAGATAGTTGTGGTAATATGTTAGCCACAATGTGGTCTACTACTCCTAGCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	571341	60	+	636262	AGCTATGAAGATAG---GTTGTGGTAATATGTTAGTCACAATGTGCTCTACTACTCCTAGCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46852	63	-	647215	AGCTCTCAAGATAGATAGTTGTGGTGATATGTTAACCACTATGTGGTCTACCACTCCTGGCCA

a
s	mr.mrrefChr3	121354	77	+	181019	CTTTTGATTTCACTTTAATAAATATGCACACCTTTGGTATAGAGGTATGTGCTTTCTGTTGCCCCTTAGGGGAGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	571402	77	+	636262	CTTTTGATTTCACTTTAATAAATATGTACACCTTTGGTATAGAGGTTTGTGCTTTCTGTTGCCCCTTAGGGGAGTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46915	77	-	647215	CTTTTGATTTTACTTTAATAAATATGCACACCTTTGATATAGAGGTATGTGCTTTTTGTTGCCCCGTAGGGGAGTAC

a
s	mr.mrrefChr3	121431	29	+	181019	TCTTTTGGGGAGTACTCCTTTCTGCTTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	571483	29	+	636262	TCTTTTAGGGAGTACTCCTTTCTGCTTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	46992	29	-	647215	TCTTTTGGGGAGTACTCCTCTCTGCTTTC

a
s	mr.mrrefChr3	121460	13	+	181019	GTCATCATACTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	571512	13	+	636262	GTCCTCATACTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47024	13	-	647215	GTCATCATACTCC

a
s	mr.mrrefChr3	121473	182	+	181019	AATCATTGCACTAAGTTAAGCGAAGGTGTGAGAGACTGAACATGGATGTATAGGTCATAGATTAGAGGCACTCCACCACGAAGGATAAGGACAGCTGGTGTGATAGCTGCAGATGTGACCAGAGGATCTCTGCCCCTTGATCCTGTGCTGAAGCAACTGCTGAATAAGATAGCATGCTCAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	571525	182	+	636262	AATCATTGCACTCAGTTAAGTGAAGGTGTGAGTGACTGAACATGGATGTATAGGACATAGATTTGAGGCATTCCACCGCAAAGGATAAGGACAGCTGGTGTGATAGCTGCATATGTGACCAGAGGATCTCTGCCCCTTGATCCTGTGCTGAAGCAACTGCTGAATCAGATGGCATGCTCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47038	178	-	647215	AATCATTGCACTAGGCTAAGCAAAGATGTGAGAGACTGAACATGGGTGTATAGGTCATAGATCAGAAGCACTCCACCATGAAGGATAAGGACAGCTGGCATGAGTGCTACAGATGTGACCAGAGGAGCCCTCCCCCTTGATCCTGTGCTGAAGCATCTGCGGAATAAGATAGCATGCT----

a
s	mr.mrrefChr3	121655	338	+	181019	GTGTTACTATAGTGCAAGCACTTACAGTCCCCATGGGACTCATTATCAAAGGCCACACCCTGTACATTTGAGTACCCATACATTAACATGTGATGTTTTTATGGTAATTAATGTATCCATAGAGATATAGATCTCAATGACTAAGATGCCTCTGATTGTAGTTTGTTTGGTGCATCATTTCAAAGAAATCAGAGTGCTGGTAATAGATGACCATCCTTGACATTTTGTGGATGTTGGACTACACAAATTTGGATGCCAATGCATCCAGACGGAGCTGCGGGATTGAGATTAAGTGATGGTGGATCAAATGGTATGTTACTATGGAAGCAGTTCCATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	571710	338	+	636262	GTGTTACTATAGTGCAAGCACTTACAGTCCCCATGGGACTCATTATCAAAGGCCACACCCTGTACATTTGAGTACCTATACATTAACCTGTGAAGTTTTGATGGTAATTAATGTATTCATAGAGATATAGATCTCAATGACTAATATGACTCTGATTGTAGTTTGTTTGATGCATCATATCAAAGAAATCAGAGTGCTGGTAATAGATGACCATCCTTGACATTTTGTGGTTGTTGGACTACTCAAATTTGGATGCCAATGCATCCAGACGGAGCTGCGGGATTGAGATTGAGTGATGGTGGATCAAATGGTATGTTACTATGGAAGCAGTTCCATGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47216	338	-	647215	GTACTACTATAGGGGAGGCAATTACAGACCCCATGGGACTTATCATCAAGGGCCACCCCCTGTACATTTGTACAGCCATACATTAACATGTGATGTTTTTATGGTAATTAATGTATCCATAGAGATATTGATGTCAACGACTGAGATGCCTCTGATTGTCGTGTGTTTGGTCCATCATTCCAAAGAAGTCAGATTGCTGGTAATAGATGACCATCCTTGACTTTTTACGGATGCAGGACTACACGAAAAAGAATTCCAATGCAACCAGACAGTGCTGATGGATTGAGATTAAGTCATGAGGGATCAAATGGTATGTTACTATGGAAGCCGTTCTTTTA

a
s	mr.mrrefChr3	121993	57	+	181019	ACTAAGCTCCATAATGCTTGGACTGCCCTGGAGGACTGTATATTAGGTGGGGTAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572049	57	+	636262	ACTAAGCTCCATAATGCTTGGACTGCCCTGGAGGACTGTATATTAGGTGGGGTGGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47554	57	-	647215	CCTGAGCTGCATAATGGTTGGACTGCCTTGGAGGACTGTTTATTAGGTAGAGCAGCT

a
s	mr.mrrefChr3	122050	10	+	181019	AAAGGAGTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572112	10	+	636262	AAAGGAGTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47611	10	-	647215	AAAGGGGAGA

a
s	mr.mrrefChr3	122060	11	+	181019	GAGAGCACCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572123	11	+	636262	GAGAGCACCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47621	11	-	647215	GAGAACACCCC

a
s	mr.mrrefChr3	122071	57	+	181019	TAACATAAAACTTAAATTGAAGGGAGCTATAATTCTGACAAGGTGTTATTACCAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572135	57	+	636262	TAACATAAAACCTAAATTGGAGAGAGCTATAGTTCTAACAAGGTGTTGTTACCTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47632	57	-	647215	TAACATAAGACTTAAATTGAAGGGAGCTTTAATTCTGACAAGATGCCATTGCCAAAA

a
s	mr.mrrefChr3	122128	101	+	181019	TTCATGAGATTAGAATTCTAGATAATTGCATCATGAATTATTGGACAGAGATGAAATCCACATGTCATATGGATTAACTCATAGGTTGCCGGGTATCCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572192	101	+	636262	TTCATGAGATTAGAATTCTAGATAATTGCATCATGAATTATTGGACAGAGATGAAATCCACATGTCATATGGATTAACTCATAGGTTGCCGGGTATCCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47690	101	-	647215	TTCATGGGATTAGAATTCTAGATAGTTGCATCATGAATTAATGGACGTTGATGAGATCCTCATGGCATATGGACTAACTCATAGATTGCCAGCTATACCTT

a
s	mr.mrrefChr3	122229	19	+	181019	AGAAATTGTAGTGCTGACG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572304	19	+	636262	AGAAATTGTAGTGCTGACG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47791	19	-	647215	AGGAATTGTAGGGCTGACT

a
s	mr.mrrefChr3	122248	45	+	181019	TCAAGTTCCTGTTTCCAATGTGACTATTGGTTTGGGGGAGAAGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572329	45	+	636262	TCAAGTTCCTGTTTCCAATGTGACTATTGGTTTGGGGGAGAAGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47810	45	-	647215	TGAAGTTCCTGTTTCCAATCGGACTATTGGTCTAGGGGAAATGGA

a
s	mr.mrrefChr3	122293	59	+	181019	ATAAACATTGCACCTGGCACCATAGGAGTTGGCTGTCAGTCGGGGGGACACTAGATCGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572374	59	+	636262	ATAAACATTGCACCTGGCACCATAGGAGTTGGCTGTCAGTCGGGGGGACACTAGATCGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47856	59	-	647215	ATAAATATTGCACCAGGCACAATAGGTGTTGGCTGTCAGTCCGGGGGATACTAGATTGC

a
s	mr.mrrefChr3	122352	40	+	181019	ACCCTCACTTATCAAACTCTTCTGTTGGTCAAACTGAAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572433	40	+	636262	ACCCTCACTTATCAAACTCTTCTGTTGGTCAAACTGAAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47951	40	-	647215	ACCCTCGCTTATTAAACCCCTCTATTGATAAAACTGAAGG

a
s	mr.mrrefChr3	122392	118	+	181019	TTAACATGGATTCCACTGAATAAGGGGGTACATCACACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGCATGAGCCAGCTGGGTTTAAGAGGGCCGTATCTATGGGGTCCTATCAAGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572473	118	+	636262	TTAACATGGATTCCACTGAATAAGGGGGTACATCACACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGCATGAGCCAGCAGGGTTTAAGAGGGCCATATCTATGAGGTCCTATCAAGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	47992	118	-	647215	GTAACACAGATTCCACTGAACAAAGGGGCACATCATACCACATCCCCAACCAGCCTGCATTAGTATGTATGAGCCAGCTGGGTTTCAGAGGGCTGTTTTTATGGGGTCCTATTAGGCC

a
s	mr.mrrefChr3	122510	57	+	181019	ACTTTTTGACAAAAACTTTATTCATAGAATAAAATGTGGAGATAATCTCAAACATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572595	57	+	636262	ACTTTTTGACAAGAACTTTATTCATAGAATAAAATGTGGAGATCATCTCAAACATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48110	57	-	647215	ACTTCTTGACAAAACCTTTATTCATAGAATAACATGCAGAGATAATCGCAAGTATAC

a
s	mr.mrrefChr3	122567	45	+	181019	AATAGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATCTTCCATCAATTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572652	45	+	636262	AATAGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATTTTCCATCAATTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48215	45	-	647215	AATGGTTCTGAATGTTTCATTCTTATTGTATCTTCCATCAATTTG

a
s	mr.mrrefChr3	122612	249	+	181019	AACACCAAAACATTAAATATTGAGTGTAACCAAAGTGACCAGGCCAATAGTTGAACGGCTTACAGGATCTCTAGTTTATCGTGTTTAAACAAATCTCTAGACCCGTTGAATCTCTAAGCAACCAAAAGTAAAGAAACTGTGTGCAGAGATGTTTTGGAGGTTATATTAGTTATTTTACCTACTTACTTCTGTACAAGTATTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGCGCTGGGAAGGTGCATTCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572703	239	+	636262	AACATCAAAATATTAAATATTGAGTGTAACCACAGTGACCAGGCCAATAGTTGAACGGCTTACAGGA--TCTAGTTTACCGTGTCTAAACAAATCTTTAGACC--------CTCTAAGCAACCAAAAGTAAAGAAACTGTGTGCATGGATGTTTTGGAGGTTATATTAGTTATTTTACCTACTTACTTTTGTACAAGTATTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGCGCTGGGAAGGTGCATTCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48260	246	-	647215	AGACCCAAAACATTAGATATTGAGTGAGACCAAAGTGACCAGGCCAATAGTTGAAAGGCTTACAGGATCTCTAGTTGATTGTGTTTAAACAACTCACTAGACCCGTTGAATCTCTAAGCAACCAAAATTAAAGAAACAGTGCACAGAGAGGTATTGGAGGTTATATTAGTTATTTTGCTTACTTACTTCTACACAAGTACTCACAGTGTTCATCTCCCTCTCTGACATGAAC---AAAGGTGCATTCAG

a
s	mr.mrrefChr3	122861	161	+	181019	TAGGACCATCCTCTACACATATGGCTCCTATTGAATGGGATAATGTATCCATATTTTAAGCACAGTATATTAAGCCTAAACCTTATCTCCTCACCCACTGGGCACTTTGGTGCACCCATACTCTTGCTGTATTTACTTTCCTTATTAGTCTGAGGCTTGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	572943	161	+	636262	TAGGACCATTCTCTGCACATATGGCTCCTATTGAATGGGATAATGTATCTGTATTTTAAGCACAGTATATTAAGCCTAAACCTTATCTCCTCACCTACTGGGCATTATGGTGTACCCATACTCTTGCTGTACTTACTTTCCTTATTATTCTGAGGCTTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48506	161	-	647215	TAGGACCATCCTCTACACATCTGGCTCCTATTAAATGGGATAATGTATCCATGTTTTCAGCACGATATATTAAGGCTACACCTTATCTCCTCACCCACTGGGCACTTTGGTGCACCCATACTCTTAATGTATTTACTTTCCTTATCAGTCTTAGGCTTGGG

a
s	mr.mrrefChr3	123022	7	+	181019	GAGAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	573104	7	+	636262	GAGAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48668	7	-	647215	GAGAAAG

a
s	mr.mrrefChr3	123029	177	+	181019	TGCTGCTTTCAGCGCAGGTTGCGCTAACCATCATGGGTGACCTTTAAATACACATATAGTTATATCGCGTGGCTAAGTATATATTATGCAGATGTATATATGATATTAATTACTGTAGCCATGAGGAGTAAGATTGTTCTGCTCCACCCTTCATACATGTGATAGACACTAATATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	573111	177	+	636262	TGCTGCTTTCAGGGCAGGTTGCACTAACCATCATAGGTGACCTCTAAATACACATATCATTATATCGCGTGGCTGACTGTATAATATGCAGATGTATATATGATATTAATTACTGTAGCCATGAGGAGTAAGATCATTCTGCTCCACCCTTCATACATCTGATAGACACTAATATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48677	177	-	647215	TGCTGCTATCAGCGCGGGTTCAGCTAACCACCATGGGTGACCTTTAGACACAGATATAGCTACATCTTGTGGCTAAGTACATATTATGCAGATGTATTTATGATATTAATTACTGTAGCCACGAGGAGTCAGGCTGTTCTGCTCCACCCTTCATACATGTGATAGACACTAATATCT

a
s	mr.mrrefChr3	123206	10	+	181019	AAGGGAGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	573288	10	+	636262	ACGGGAGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48855	10	-	647215	AAGGGAGCAA

a
s	mr.mrrefChr3	123216	106	+	181019	AACCAGACAAGACATGAATAACTATGTGGGGTCAATGAGAAAACTGTTCTCATAACTGAACACTTCAAGGTACAGATCCTGACTGTATTGGAATCTTGAAAATCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	573299	106	+	636262	AACCAGACAAGACATGAATAATTATGTGGGGTCAGTGAGAAAACTGTTCTAATAACTGAACACTTCAAGGTAGAGCTCCTGACTGTATTGAAATCTTGAAAATCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48865	106	-	647215	GACTAGACAAGACATGAATAACTATGTGGGGTCAATGAGAAAACTGTTCTCATAACTGAACACTTCAAGGTACAAATTCTGACTGTATTGGAATCTTGAAAATCCA

a
s	mr.mrrefChr3	123322	53	+	181019	CTTGAAGCTGCATGTACATATTCCAAGGGGTGTACTAGATTTAATCAGTCAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	573411	53	+	636262	CTTGAAGCTGCATGTACATATTCCAAGGGGTGTACAAGATTTAATCAGTCAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	48971	53	-	647215	ATTGAAATTACATGTACATATTCTAAGGGGTGTACTAGATTTAATCAGTCAGG

a
s	mr.mrrefChr3	123375	840	+	181019	ACAAGTAAGGCCAAGACACACAAATGAGACCATAGATTTCTATAACAATTGCTCCCACAGATCCTTACAGTCTTAAGATCAAATTATCCCAGTGGCACTAATGGACATGTAATGTGTTTTTTCAAGTGGCTTCTCTGAAGCAGTAATTCAAGCCAGTAATTCGAGTCAAAAGTTTGGGCAACTGTGCTTCTAAAAGCCCCAACCAACAAATAGAACTGTTTGGGAACAAGGCAAGTGGGATGCGCTCACCTACCAGAATAAGGAAGCCCATCAGCAGTTCCTCTCCAATATTTGCACATGAAATCACCCTATATTAGCGACTTTTGAATAAGTTTACCATTTAGCTTGCAACACTAAAAAGACCTGCGTGACCTGAATAAAATCAAATTACACTCTAAGGCCTCAACACAATATTGAAGATATTTGATGTACAGATTAGCAATGCAACCTCCTAGCTATGAGCTGATGGAAGCAGAGTTTATGCAGAGGTAATTCTACTAACTTCTGGGAGCTTTTTGAGAGGAACAATTGTGATTGGCTTAGAGACACACCCAGCTGGACGTCTGGATGATCAGCCTTCCATAGGCTTAGCTCAGACACTAGAAAAGTTGGGTTTTGTGGTAGGCAGATTGAAAACTGGAACACCTCCCCGAATTGCCAAAGAGTCTATCAATTTTAGTATCCTTAATAAACATATACCAGATAATCCTTCCACCCCATTTGGCTTTACCAATGAGACTGTCTACAGGTGGTCAGGTCTCTTCCCGTATATGTGGAGGAAATTTGAACTTTCATTGAACTCCTGTTGTACAGATGGTAATCTTTTTGTTCTGGTATCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	573474	811	+	636262	ACAAGTAAGGCCAAGACACACAAATGAGACCATAGATTTCTGTAACAATTGCTCCCACAGGACCTTACAGTTTTAAGACCAAATTATCCCAGTGGCACTAATGGACATGTAATGTGTTTTTTCAAGTGGCTCCTCTGAAGCAG------------------------AGAAGTTTGGGCAACTGTGCTTCTAAAAGCCCCAATCAACAAATAGAACTGTTTGGGAACAAGGCAAGTAGGATGGGCTCACCTACCAGAATAAGGAAGCCCATCAGCAGTTCCTCTCCAATATTTGCACATGCAATCACCCTATATTAGCGACTTTTGAATAAGTTTACCATTTAGCTTGCAACACTAAAAAGACCTGCGTGACCCGAATAAAATCAAATTACACTCTGAGGCCTCAACACAATATTGCAAA-----GATGTACAGATTAGCAATGCAACCTCCCAGCTATGAGCTGATGGAAGCAGAGTTTATGCAGAGGTAATTCTACTAACTTCTGGGAGCTTTTTGAGAGGAACAATTGTGATTGGCCTAGAGACACACCCAGCTGGACGTTTGGATGATCAGCCTTCCATAGGCTTAGCCCAGACGCTAGAAAAGTTGGGTTTTGTGGTAGGCAGATTGAAAACTGGAACACCTCCCCGAATTGCCAAAGAGTCTATCAATTTTAGTATCCTTAATAAACATATACCAGATAATCCTTCCACCCCATTTGGCTTTACCAATGAGACTGTCTACAGGTGGTTAGGTCTCTTCACGTATATGTGGAGGAAATTTGAGCTTTCATTAAACTCCTGTTATACAGATGGTAATCTTTTTGTTCTAGTATCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	49024	837	-	647215	ACAAGTAAGGCCAAGACGCACAAATGAGACCACAAATTTCTATAACAATTGCTCCCATGGATCTTTACAGTCTTAAGATCAAATTATCCCAGTGCCACTAAAGGACACGTAATGTGTTTTCACAAGTGGCTTCTCTGAAGCAGTAATTCAAGCCAGTAATTCGAGTCAAAAGTTTAGGGAACTGAGCTTCTAAAAGCCCCAACCAGCAAGTAGAACTGTTTGGGAACAAGGTAAGTGGGATGCACTCACCTACCAGAATAAGGAAGCCCCTCAGCAGTCCCTCTCTAGTATTTGCCCATGAAATCACCCTACATTAGCCACTTTTGAATAACTTTACCATGCATCTTGCAACACTAAAACGATCT--GTGCCCTGAATATGATTGAGTTACACTCTAATGCCTCAAGACTATATTGAGGATATTTGATGTACAGATTAGCGATGCAACCTCCTAGCTATGAGCTGATGGAAGCAGAGTTTATGCAGAGGTAATTCTACTAACTTCTGGGAGCTTTTTGAGAGGAACAATTGTGATTGGCTTAGAGACACACCCAGCTGGACGTCTGGATGATCAGCCTTCCATAGGCTTAGCTCAGACACTAGAAAAGTTGGGTTTTGTAGTAGGCAGATTGAAAACTGGAACACCTCCCCGAATTGCCAAAGAGTCTATCAATTTTAGTATCCTTAATAAACATATACCAGATAATCCTTCCACCCCATTTGGCTTCACCAATGAGACTGTTCACAGGTGGTCTGGTCTCTTTCCCCCTATGTGGAGGAAATTTGAACTTTCATTGTACTCCTGTTGTACAGATGGTAATA-TGTTGTTCTGGTATCTC

a
s	mr.mrrefChr3	124215	62	+	181019	CTCGCAGTCTATAACATAAAGTGTTTCCGGCACTTAAAGCAGAAGCACACTTGACATCCAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	574285	62	+	636262	CTTGCAGTCTATAACGTAAAGTGTTTCTGGCACTTGAAGCAGAAGCTCACTTGACATCCAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	49891	59	-	647215	TTCCCAGTCTTTAACATAAAGTGTTTCCGGTACTTAAAGAAGAAGCATGCTTGGCTTCC---

a
s	mr.mrrefChr3	124277	169	+	181019	AATCATAAGGTGTTGTGCAGTGCTCCATCTTTACTTTGACCACTCACAAATTGTAGGTATACATTATGCTTGGCTTAGCTTTGGGATTTTTAGAGCCAACTTGTGGTTGGACCAGTAGAATTGTAGTATAGAACATAATTAGAATAACCAAGTTCTCATATCGGTTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	574348	167	+	636262	AATTATAAGGTGTTGTGCAGTGCTCCATCTTTACTTTGACCACTCACAAATTGTAGGTATACCTTATTCTTGGCTGAGCTTTGGGATTTTTAGGGCCAACTTGTGGTTGGATCAGTAGAATCGTAGTATAGAGCATAATTAGAATAACCAAGTTCTCATATCGCTTG--
s	simRat_chr6.simRat.chr6	49950	156	-	647215	AGTCATGAGGTGTTGTGCAGTGCTCCATCTTCACTTTGACCAT-------------GTATTCATTATGCTTGGCTTAGCTTTGAGATTTTTAGAGGCAACTTGTGGTTGAACCAGTAAAATTGTAATTTAGAACATGATTAGACTAACCATGTTCTCATATGGGTTGAA

a
s	mr.mrrefChr3	124446	118	+	181019	TGACTCATTTGGAGGATACCAGATTAAAGGGATGGTGAAAATCTCTACCATTAATATTTTGGTAGTGTCTCTAAGACCTCATTAGTGATCTTATGCACTACTTGTTTGTTAGGAATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	574515	85	+	636262	---------------------------------GGGGTAAATCCCTACCATTAATATTTTGGTTGTGTCTCTAAGACCTCATTGGTGATCTTATGCACCACTTGTTTGTTAGAAATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	50109	116	-	647215	TGACTCATTTGGAGGATACCAGATTAAAGGGATGGTGATAATCTCTACCATT--ATTTTCAGTAATGTCTCTAAGACCTCATTAGTGATCTTATGCACTACTGGTTTGTTGGGAATCT

a
s	mr.mrrefChr3	124564	14	+	181019	CCATGAGTGTGAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	574600	14	+	636262	CCAAGAGTGTGAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	50231	14	-	647215	ACATGAGGGTGAAA

a
s	mr.mrrefChr3	124578	168	+	181019	TAAATGTGAGTTTGGAGGCAGTGTTGGATCTTCAAGCAGTTAGACACAAAAGTTGTTATAGGTATGGCACTACACGCCTGGATGTATTAAATATCTGTGAAGAATTAACTGGTTGCCATGCCTGAGTTACATTATTTTGTAACGAGGCTGTCACCATTTCAAGCTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	574614	168	+	636262	TAAGTGTGAATTTGGAGGCAGTGTTGAATCTTTACACAGTTAGACACAAAAGTTGTTATAGGCATGGCACTACACGCCTGGATGTATTAAATATCAGTGAAGAATTAACTGGTTGCCATGCCTGAGTTACATCATTTTGTAACGGGGCTGTCACCATTTCAAGCTCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	50272	167	-	647215	TTAATGTGAGTTCGGAGGCAGTGTTGGATATTCAAGCAGTTAGACAC-AAAGGTGTTATAGGTATGGCATTACACGCCTGGATGTACTAAATATCTGTGAAGAATTAATTGTTTGCCATGCCCAAGTTACATTATTTTGTAACGAGGCTGTCACCATCTCAAGCTCCA

a
s	mr.mrrefChr3	124746	73	+	181019	CTTCAGTCAATTGCATGATTGACTGACTGTCTTAGTATTACAATGATAGATTTAGAATCTCAAGGAATATAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	574782	73	+	636262	CTTCAGTCAATTGCATGATTGACTGACTGTCTTAGCATTACAATGATAGATTAAGAATCTCAAGGAATATAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	50440	73	-	647215	CTTCAGGCAATTGCATGATTGACTGACTGTCTGAGTATTACAATGATAGGTTTAGAATGTCAGGGAATATAGC

a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	54766	32	-	647215	ACAATGAGACCTGGTATTTGATCATCTGTATT----------------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr3	128980	173	+	181019	TTCTGTAAGAGGTATGTTGTTCAGAATGTAGTATGGATCCTTGGCGGTGTAAATCACCTGGGGGCTCATTCTCATGGTGACTCAACTGGATGCAATATATAGGCTCCCATAATAGATCCCTCATAATACAGATTGGATTGGTCCAAGCAACCTCTCTGGTATCCATAAGGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	579132	169	+	636262	TTCTGTAAGAGGTATGTTGTTCAGAATGTAGTATGGATCCTTGGCGGTGTAAATCACCTGGGGGCTCATTCTCATGGTGACTCATCTGGATGCATTATATAGGCTCCCACACTAGATGCCTCA----ACAGATTGGATTGGTCCAAGCAACCTATCTGGTATCTATAAGGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	54798	132	-	647215	-------------------------------------TCCTTGGTGGTATATGTCACATGTGGGCTCATTCTCATGGTGAGTCAACCGGATCCAATGTATAGGCTCCTATAATAAATCCCTCATAATACAGATTGGATTGGTCCAAGCAAC-TCTCTGGTACCCATAAGG---

a
s	mr.mrrefChr3	129153	155	+	181019	TCTATGGCCCAGTTTATGCAATGTTTCAGCCATCGTCACTTAGCATTTTCATTCAAAACCATGTGTTAAATCAGCTTACTAAGCTGTTATGCAAAGATAATAACATTCAATAAGTGGGTCTTAAATTATAATCTCATGTTCCCCAAACCACAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	579332	155	+	636262	TCTATGGCCCAGTTTATGCAATGTTTCAGCCATCGTCACTTAGCATTTTCATTCAAAACCATGTGTTAAATCAGCTTACTAAGCTGTTATGCAAAGATACTAACATTCAATAAGTGGGTCATAAATTATAATCTCATGTTCCCCCAACTACAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	54930	72	-	647215	-----------------------------------------------------------------------------------CTGTTATGCAAGGATAATAACCCTCAATTCGTGGGTCTTAAATTATAATCTCATGTTCCCCAAACCACAACA

a
s	mr.mrrefChr3	129308	119	+	181019	TTCTTAGCCAGCCATTGGTAACGATTTAGCAATACACTTCAAGGATTATAAAATAGGGGTGTTTTATAAGACAGATGCATGGTAACATTTCAGCTTTACAGTGGTTGGAGTGACAGTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	579487	119	+	636262	TTCTTAGTCAGCCATTGGTAACGATTTAGCAATACACTTCAAGGATTATAAAATAGGGGTGTTTTATAAGACAGATGCATGGTAACATTTCAGCTTTACAATGGTTGGAGTGACGGTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	55006	119	-	647215	TTCCTATCCAGCCATTGGTAACGATCTATCAATAAACTTCAAAGATTTCAAAATAGGGGTGTTTTATAAGACCGACGCATGGTAACAGTTCAGCTTTACAGTGGTTGAAGTGACAGTTC

a
s	mr.mrrefChr3	129427	76	+	181019	CCATCTTCTGCATGTTGACTACTCCCATACTAGAGAGTCCAGGGGAGATGATGACAGAGTGGCTAGAATTGTGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	579609	76	+	636262	CCATCTTCTCCATGTTGACTACTCCTATACCAGGGAGTCCAGGGGAGTTGATGCCAGAGTGGCTAGAATTGTGGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	55125	76	-	647215	CCATATTCTGCATGTTGACTACTCCCATATTAGAGAGTCCAGGCAAGATGGTGACAGGGAGGATAGCATTGTAGGG

a
s	mr.mrrefChr3	129503	128	+	181019	CACTATGGGTTGTTTTCGAGCCATAGTACTTTGTCTTTATAAGTTTTTTGGTGTAAACAAGAGAGTGTCAGATTGTGGGTACAGCGTAAAAGATAGTGCCCTGCTGGTTTATACTTGATGATAGAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	579686	128	+	636262	CACTATGGGTTGTTTTCAAGCCATAGTATTTTGTTTTTATAAGTTTTTTGGTGTAAACAAAAGAGTGTCAGACTGTGGGTACAGCGGAAAACATGGTGCCCTGCTGGTTTATACTTGATGATAGAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	55201	124	-	647215	CACTATGGGTCGTTTTTGAGCAATAGCACTTTGTCTTAATAACTTTTTTGGTGTAAACCAGAGAGTGTCCAATTGTGGGTACAGGGTAAAAGATAGTGCC----TGGTTTATACTTGATGCCCACCCA

a
s	mr.mrrefChr3	129631	107	+	181019	CCCTTTTATATCTAATCCTGTATTACTTCAGCCTGTTGAAAACCTAGCCCATTTATTAAGTTATGGTTCTGTCCATTGTATTATGGGGAACTACTTTTCTAATGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	579814	107	+	636262	CCCTTTTATATCTAATCCTGTATTACTTCAGCCTGATAAAAACCTAGCCTGTTTGTTAAGTTATGGTTCTGTCCATTGCATTGTGGGGAACTATTTTTCTAATGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	55326	107	-	647215	CCCATTTATATCCAATCTAGTATTACCTCATCCTATTGAAAACCTAGCCCATTTATTCAGTTATGGTCCTGTCCATTGTGTGATGGGGAAATACTTTTCTAGTGCAA

a
s	mr.mrrefChr3	129738	27	+	181019	GTGACTAACGTTTTTTTTATTGACACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	579921	27	+	636262	GTGACTAACGTTTCTTTTATTGACACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	55483	27	-	647215	ATGACTATTGTTTTTTATATTGACACA

a
s	mr.mrrefChr3	129765	285	+	181019	CATCTTGAGATTGACCTTTTACACATGGATAAACTTAGTAATTAGCAGTTACACACCTAATATCCAGGCTGATCTAAGTTCTCTGTGGAATCTTCACTTAGTTAGGTGAATAACAATGACACAGGTAGAGCAGTAATTGTACTCTGTTTTGGTGTTCTAGTCTGGAGATCAGCTACCATGTTACCTCACTCATACCAACCCAAGAGTTGAGGAAATTGTGCTTAAGAATCTGCACCTCAACTGCCATGTCAAAGAAACAACACGTGGACCAAGGTATAGCTAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	579948	280	+	636262	CATCTTGAGATTCACCTTTTACACATGGATAACTT----AATTAGCAGTTACACACCTAATATCCAGGCAGATCTAAATTCT-GGTGGAATCTTCACTCAGTTAGGTGAATAACATTGACACAGGTCAAGCAGTAATTGTACTCTGTTTTGGTATTCTAGTCTGGGGATCAGCTACCATGCTACCTGACTCATACCAACCCAAGAGTTGAAGAAATTGTGCTTAAGAATCTGCACCTCAACTGCCATGTCAAAGAAACAACACGTGGACCAAGGTATAGCCAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	55515	285	-	647215	TATCTTGAGATTGCCCTTTTACACTTGGATAAACTTAGTAATTAGCAGTTACATGCCTAATATCCAGGCTGATCTAAGTTCTCTATAGAATCATCACTTGGTTGGGTGAATAACTATGACCTAGGTAGAGCAGTAATTGTACTCTGTTTTGGTGTTCTAGTCTGGAGATCAGCTACCATGTTACCTCACTCATACCAACCCAAGAGTTGAGGAAATTGTGCTTAAGAATCTGCACCTCAACTGCCATGTCAAAGAAACAACACGCGGACCAAGGTATAGGTAGCA

a
s	mr.mrrefChr3	130050	98	+	181019	AATTTTAGAAATTCATTATGCCCTTTCGGCTTTTTATATCTGCTACTATTTCCCGAGGCAGATATTGTCCCTCTATTGAGTCAAAAGTTCTGTGTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	580228	98	+	636262	AATTTTAGAAATTCATTATGCCCTTTCGGCATTTTACATCTGCTACTATTTCCCGAGGCAGATATTGTCCCTCTATTGAGTCAAAAGTTCTGTGTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	55804	95	-	647215	AATTATAGAAATTCATCATGTGCTTTCAGCTTTGTATACCTGCTA---TTTCCCGGGGCAGATATTGTCCCTCTATTGAGTCAAAAGTTCTGTGTTTT

a
s	mr.mrrefChr3	130148	433	+	181019	CCAAACCGCCTGCATCAAGTTTGGTTAGAGCCTGAGGGTATGGATTCAGAGCTTATATATCCTCAAGGGCTATCTATGACACTGCCCTCTGATTTACAGAAGAAGATGATTACATGTAACCGGGGCCTCGAGAAAGCCAAAGTCATTCAGCCAGGTAAGTTCCAGAAGAACATTTGATACAACAACAGCGGTAGTTTAATAGGATTATGTTTAGCTCAACAACAAAAACACAGAGACACTTGTAGCCAATAACCCCCCCTTTGTTAAACTGTTAAACTCACATGTCGTGCAGAAGCTAAGATGGAGTATTATTTTTATTGCCCAAGATGGAGTGTAATGGTGCAATAGGCCTGGCATACCATAAGCTCCCCCTGCCTGGTACCTAGACTTCACTTGTTACAATGAGGCTAGAAGGAACACAGACTTCCTGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	580329	433	+	636262	CCAAACCGCCTGCATCAAGTTTGGTTAGAGCCTGGAGGTATGGACTCAGAGCTTATATATCCTCAAGGGCTATCTATGACACTGCCCTCTGATTTACAAAAGAAGATGATTACCTGTAACCGGGGCCTCGAGAAAGCCAAAGTCATTCAGCCAGGTAAATTCCAGAAGAACATTTGATACAACAACAGCGATAGTCTAATAGGATTATGTTTAGCTCAACAACAAAAACACAGAGATACTTGTAGCCAATAACCCCCCCTTTGTTAAACTGTTAAACTCACATGTTGTGCAGAAGCTAAGATGGAGTATTGTTTTTATTGCCCAAGATGGAGTGTAATGGGGCAATAGGCCTGGCGTACCATGAGCTCCCCCTGCCTGGTACCTAGACTTCAGGTGCTACAATGAGGCTAGAAGGACCACAGACTTCCTGTCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	55899	420	-	647215	CCAAACCGGCTGCATCAAGTTTGGTTAGAGCCTGAGGGGATGGATTCAGAACTTATATATCCTCAAGGGCTATCTATGACACTGCCATCTGATTTGCAGAAGAAGATGATTACATGTAACCGGGGCCTCGAGAAAGCCAAGGTCATTCAGCCAGGTAAGTATCAGAAGAACAATTGATACAACAACAGTGGTAGTTTAATAGGATTATGTTTAGCTCTATAACAAAAACACAGAGACACTTGTAGCCAATAACCCCGCCATTGTTTAA-------------ACCGCGTGCAGAAGCTAAGATGGAGTATTATTTTTATTGCCCAAGATGGAGTGTAATGGTGCAATAGGCCTGGCATACCATAAGCTCCCCCTGCCTGGTACCTGGACTTTACTTGTTACTATGAGGCTACAAGGAACACAGACTTCCTGTCA

a
s	mr.mrrefChr3	130581	32	+	181019	GGTGTACTGTCATAGAAATTGTATAAGACTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	580763	32	+	636262	GGTGTACTGTCATAGATATCGTATAAGACTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	56319	32	-	647215	GGTGTACTGTCATAGAAAGTGTTTAAGTCTCT

a
s	mr.mrrefChr3	130613	63	+	181019	CATCCAAATCTTAAAACACCATATAATGCTGTCTAAATTGGTGAGAATAAAGGATAACACCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	580795	60	+	636262	CATCCAAATCTTAAAACAC---ATAATGCTGTCTAAATTGGTGAGAATAAAGGATAACACCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	56352	63	-	647215	CATCCAAATCTTTAAACACCATATAGTGCCGTCTGACTAGGTGAGAATACAGGATAGCACAAC

a
s	mr.mrrefChr3	130676	97	+	181019	ACTCCTCTGTGCAACCTACTTGAGGTTCAATTTATCTTCATGTTCAAAGTATAATTCAAAAAAAGTGAGTTGTGAGGAGCTTGCATGCAAATGTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	580855	97	+	636262	ACTCCTTTGTGCAACCTACTTGAGGTTCAATTTATCTTCATGTTCAAAGTATAATTCAACAAAAGCGAGTTGTGAGGAGCCTGCATGCAAATGTATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	56418	97	-	647215	CCTCCTCTGTGCAACATACTTTAGGTTCAATTGATCTTCATGTTGAAGGTATAATTCAAAAAAAGTGAGTTGTGAGAAGCTTGCCCACAAATGTTAA

a
s	mr.mrrefChr3	130773	404	+	181019	AAAATACTTTGCCTTACCTAGATTAATCCTTCCCTAATGTCTTTGCTCTTGAAGAATGAGGGTCTGCGGTCCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCAACCCCTCTTTAGAGGCACATCTGTTGCAACGACTTTTCTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACTACCAGCTACAAGGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTGGTTAACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCTGCTGTGCTGTTTTATAAACATTGGTACAGGTCTGTCTATAACAAGTCAACTGAGTCCTTTGTACTCAGATCAGTTCTGGCTTGACATTGTGGTTGTGTTGATTTTCTGTATAGTAATGATACCTGCTCTTAAAATAACCTTCTGCAATCCCCATTCTAAGCAAGCAGGAATAGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	580952	402	+	636262	AAAATACTTTGCCTTACATAGATTAATCCTTCCCTAATGTCTCTGCTCTTGAAGATTGAGGGTCTGCGGTTCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCAACCCCTCTTTAGAGGCACATCTGTTGCAGCGACTTTTCTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACTACCAGCTACAAGGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTAGTTGACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCTGCTGTGCTGTTTTATAAACATTGGTACAGGTCTATCTATAACAGGTCAACTCAGTCCTTTGTACTCAGATCAGTTCTGGCTTGACATTGTGGTTGTGTTGATTTTCTGTCTAGTAATGACACCTGCT--GAAAATAAACTTCTGCAATCCCCATTTTAAGCAAGCAGGAATGGGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	56518	403	-	647215	AAAATACTTTCCTTTACCTAGATTAATCCTTCCTTAATGCCTTTGCTCTTGTAGAAGGAGGGTCTGCCGTCCCATATGATTACTTAGACCCTCGCCAGATCATCCCCTCTTTAGAGGCCCAACTGTTGCAACGACTATTTTTTGCTGGGCAGATCAACAGTACAACGAGCTACAAAGAGGCTGCAGCTCAGGTAGTGTGATTAACAAACATGGCTGGTTTATGTAGGCGGCTGTCCAGTTTTATGAATGTCGGTACAGGTCCGTCTGTAACAAGTCAACTGAGTCATT-GTACTCAGTTCAGCTTTGGCTTGAAATTGTGGCTCTATTGATTTTCTGTATAGCAATGATGCCTGCTCTTAAAATCACCTTCTGCAATCCCCATGCTAAGCAACCAGGAATAGGC

a
s	mr.mrrefChr3	131177	28	+	181019	AACCACCTGGGCCAATCTAGTCCTAGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	581354	28	+	636262	ACTCACCTGGGCCAGTCTAGTCCTGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	56928	28	-	647215	AACCACCTGGGCCAATTTTGTCCTAAGG

a
s	mr.mrrefChr3	131205	51	+	181019	AAACAGACTACCCAACCGCTCTTATACAATGATCATAGGAACTATTGTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	581383	51	+	636262	AAACAAACTACCCAACTGCTCTTATACCATGATCATAGGAACTATCATATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	56956	51	-	647215	AAACAGACTACCCAACCGCTCTTATACAATGATCACTGGAACTATTGTGTG

a
s	mr.mrrefChr3	131256	34	+	181019	TCGTATCTCTGCAGATCTAACTGTTCAGAACCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	581439	32	+	636262	TCGCATCTCTGCAGATCTAACTGTT--GAACTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	57007	34	-	647215	TCGTAGTTCTACAGATTTAACTGTTCAGTACCTG

a
s	mr.mrrefChr3	131290	130	+	181019	CATTACATTCCCTTGCATTCTGTATTCTTGCAAAATCGACCATAGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCCTAATAATCCTATATTGTATAGCTCCAGGCTTGAATGATCGGGTGGTAGCGAAGGATTGTTTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	581471	120	+	636262	CATTACATTCCCTTGCACTCTGTA----------ATCAACCACAGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCTGAATAATCCTATATCGTATAGCTCCAGGCTTGAATCATTGGGTGGCAGCGAAGGATTGTTTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	57044	130	-	647215	TATTACGTTTCCTTGCATTCTGTATTCTTGCAAAATCGACCATTGGTGGGGCAGAGAGCATAAGCCTAATAATCCTATATTGTATAGCGCCAGCCTTAAATGATCTGGTGGTGACTAAGGATTGTTTGAG

a
s	mr.mrrefChr3	131420	157	+	181019	CTGAATTTCACCACAGCACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAACAGCCAATACATGGCAGCCCCCTGCTAACAGTAGGGGGGAAGGAATGCATAGGTACCTAGTGCCACTGAGAGGGTCTCTTAACAGTATGCGTAAGCTGGAAACATTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	581637	157	+	636262	CCGAATTTCACCACAGCACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAACAGCCAATACATGCCAGCCCCCTGCTAACAGTAGGGGGGAAGGAATGCATAGGTACCCAGTGCCACTGAGGGGGTATCTTAACAGTATGCGTAAGCTGAAAACATTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	57174	155	-	647215	CTGAATTT-ACCACAACACCTTAGAATTTCATATCAGAGGTATGCTTAATTGCCAATGCATGGCAGCCCC-TGCTAACGGTAGGGGGGAATGAATGCACAGGTACCTATTGTCACTGAGAGGGTCTCTTAACAGTATGTGGAAGCTGGAAACATTGG

a
s	mr.mrrefChr3	131577	51	+	181019	AGTCCCAATTCTAACAGCACTCTATTTATTGGGTAAATTTTAAAGTGGAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	581794	51	+	636262	AGTCCCAATTCTAACAGCACTCTATTTGTTGGGTAAATTTTAAAGTGGAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	57330	51	-	647215	AATCCCAATTCTAACACCACTGGATTAATTGGGTAAGTTTTAATGGGGAAG

a
s	mr.mrrefChr3	131628	58	+	181019	ATTATCAAGATGTAATTCTGACTTCATAGAGAAGAGATCATAGTCAACCTTCCCACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	581845	58	+	636262	ATTATCAAGATGTAATTCTGACTTCATAGAGAAGAGATCATAGTCAACCTTCCCATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	57382	57	-	647215	GGCTTCAAGACGTAATTCTGACTTCAT-GAGAAGAGATTATAGTCAACCTTCCCACTT

a
s	mr.mrrefChr3	131686	104	+	181019	ACATAGAACTATTTCACACCCTCATGTACTTTGCATTTGTGGTGATATACAAGACCCTCTTGAATACTGAGAGCACATAAGCTGGTGAGAATTAGTATCACCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	581903	104	+	636262	ACATGGAATTATTTTACACCCTCATGTACCTTGCATTTGTGGTGATATACAAGACGCTCTTGAATACTGAGAGCACATAAGCTGGTGAGAATTAGTATCACCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	57443	104	-	647215	ACATAGAACTATTTCACAAAATAATATACTTTGGATTCATGGAGGTATACATGACCCTCTTTAATACTGAGGGCACAAAAGCTTGTGAAAATTAGTACCACCCC

a
s	mr.mrrefChr3	131790	231	+	181019	CTGAGAAGAGAGGCCATGCTCAGACCTAACAGTCACCTTCAGCTAGGGCACAACCAGGGTAGTGCAGGGAAATGCAAGGCCGTGTATGCGCTCAGTAATACCTAACAGCTACCCTTATCCCAAATAAGGCAACTGGTCCCCATTGAGAGCATACTGGATACTCCAGAAAGCTCCCAATCTCCCAAGAGACATCATGCATGAAGGTCAGCCCTCCTAAGGCCATATGAAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	582007	230	+	636262	CTGAGAAGAGAGGCCATGCTCAGACCTGACAGTCACCTTCAGCTAGGGCACAACCAGGGTAGTGCAGGGAAATGCTAGGCCGTGTATGCGCTCCGCA-TACCTAACAGCTATCCTTATCCCCAATAAGGCAACCAGTCCCCATTGAGAGCACACCGGATACTCTGGAAAGCTCTCAATCTCCCAAGAGACATCATGCATGAAGGTCAGCCCTCCTAAGGCCATATGAAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	57548	228	-	647215	CTGAGAAGAGAGGTCATGCTCAGACCTAACAGTCACCTACAGCCAGGGCACAACCAGGGTAGTGGAGGGAAATGCAAGGCCATGTATG---TCAGTAATGCCTAAAAGTTACCCTTAGCCGAAATGAGGCAACTGGTCCCCATTGAGAGCATACTGGATACTCCAGAAAGCTCCCAAGCCCCCAAGAGACATCATGCAGGAAGATCAGCCCTTCTAAGGCCATATGAAAAT

a
s	mr.mrrefChr3	132021	679	+	181019	CAATCCTTTGTTGAATATGCACACTAACTGGCTCTTTGATTGTTGTCCCAGCATCTGGTATTATTACACTGAGGAGACTATAGTATATAGTCTTGCCAGTTATAGTCTTGCCAGCTGTTCAGGTGGCCAAGTGTCTGTCTAGGGTATTGCTGGTATCAATGCCAGTTTACGGGTTAGCCGCAAGCCCCCCTTTGTAATTAGCCGAACTGAAGGCTACATAGGGGTACTGATTGATGGTGTTCCCACACTGGGCACCAGTGAACCCTATTGCATGTTTGCAAGCTGGGTTGAATTCCGTTTGTCACTGCACCCTGATAATGCTGATAGCCGCCTTACATTGCAAGGTGATTTCTGCGTCAGGAGTGAACATATTATTCTGAATGACATTTCAGTAAATTTATATCTATTTTGTGAAGAATAAAGACATTTTTCTATCTGATAGTGTTCTGCATTGCACTCTCGACTTCATCCCAAGGGTACAAAGAAGCAGGTTGGGTTTTTCAGCAGCAGTATGAGAGAGCTTGTTGGATGAAATCACCTCTAGAAGAAGGAATATCAGTGTTAAGGTCTATTGAATTTTTCAGTTCAAGGTGGAACAAATTGGTTCCTGAGGCCTCCATTAGAACAAGTAGGAGTTTACCCACCAGGTATGTATTGACTCAAATCTCTATAAAGAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	582238	679	+	636262	CAATGCTTTGTTGAATATGTACACTAACTGGCTCTTTGATTGTTGTGCCAGTGTCTGGTATTAATACACTGAGGAGACTATAGTATATAGTCTTGCCAGTTATAGTCTTGCTAGCTGTTCAGGTGGCCAAGTGCCTGTCTAGGGTATTGCTGGTATCAATGCCAGTTTACGGGTTAGCCGCAAGCCCCCCTTTGTAATCAGCCGAACTGAAGGCTACATAGGGGTACTCATTGATGGGGTTCCCGCACTGGGCACCAGTGAACCCTATTACATGTTTGCAAGCTGGGTTGAATTCCGTTTGTCGCTGCATCCTGATAATGCTGATAGCCGCCTTACATTGCAAGGTGATTTCTGCGTCAGGAGTGAACATATTATTCTGAACGACATTTCAGTGAATTGATATTTATTTTGTGAAGAATAAAGGCATTTCTCTATCTGATAGTGTTCTGCATTGCATTCTCGACTCCATCCCAAGGGTACAAAGAAGCGGGTTGGGTTTTTCAGCAGCAGTATGAGAGAGCTTGTTGGATGAAATCACCTCTAGAGGATGGAATATCAGTGCTAAGGTCTATTGAATTTTTCAGTTCAAGGTGGAATAAATTGGTTCCTGAGGCCTCCATTAGAACAAGTAGGAGTTTACCCACCAGGTATGTATTGACTCAAATCTCTATAAAATGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	57776	676	-	647215	CAATCCTTCGTTGAATATGCAGACCAACTTGCTCTCTGATTGTCATCCCAGCATCTGGTATTATTACACTGAGGAGACTATAGCATATAGTCTTGCCAGTTATAGTCTTGCCAGCTGTTCAGA---CCAAGTGTCTGTCTAGGGTATTGCTGGTATCATTGCCAGTTTACGGGTGAGCCGCAAGCCCCCCTTTGTAATTAGTCGAACTGAAGGCTACATAGGGGTACTGATTGATGGTGTTCCCACACTGGGCGCCAGTGAACCCTATTGCATGTTCACTAGCTGGGTTGAATTCTGTTTGTCACTGCACCCTGACAATGCTGATAGCCGCCTTACATTGCAAGGTGATTTCTGCATCAAGAATGAACATATTAGTCTAAATGACATTGCTGTAAATTTATACCTATTTTGTGAAGAATACAGACATTTTTCTAACAGATGGTGTTCTGCATTGCACTATCAACTTCATCCCAAGGGTACAAAGAAGCAGGTTGGGTTTTTCAGCAGCAGTATGAGAGAGCTTGTTGGATGAAATCACCTCTAGAAGAAGGGATATCAGTGTTAAGATCTATTGAATTTTTTAGTTCAAGGTGGAACAAATTGGTACCTGAGGCCTCCATTAGAACAAGCAGGAGTTTACCCACCAGGTATGTATTGACTCAATTTTCTATAAAGAGAG

a
s	mr.mrrefChr3	132700	9	+	181019	GTACCCTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	582920	9	+	636262	GTACCCTGG
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a
s	mr.mrrefChr3	132709	16	+	181019	AGTCATGCTTGTATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	582929	16	+	636262	AGTCATGCTTGTATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	58462	16	-	647215	AGTAATGCTTGTATTA

a
s	mr.mrrefChr3	132725	205	+	181019	TTCACCTGTACAGTCCCTCAACCAATATCTGGCTAAAGGAGTAAACCTCCCCTCTTTTCAAGCAGCATACCATACTAATGTGATGGCTCTCTTGTCTCTTTAGCAACAAGGGCTGCAAGTGATCCCCTAGATCTTTCATGGCTATGTACAAGGGTTATTTTTACACCTACTTAGTCACCTTCATGGCAGCTTCTAACCTCTAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	582946	205	+	636262	TTCACCCGTACAGTCCCTCAACCAATATCTGGCTAAAGGAGTAAACCTCCCCTCTTTTCAAACAGCATACCGTACTAATGTGATGGCTCTCTTGCCTCTTTAGCAACAAGGGCTGCAAGTGACTCCCTAGATCTTTCATGGCTATGGACAAGGGTTATTTTTACCCCTACTTACTCACCTTCATGGCAGCTTCCAACCTCTAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	58478	195	-	647215	TTCACCTGTACAGCCCCTCACCCAATATCTGGT----------AACCCGCCCTCTTTTCAAGCAGCATACCATACTAATGTGATGGCTTTCTTGTCTCTTTATCAACAAGGGCTACCAGTGATCTCCTAGAGCTTTCGCGGCTATCTACAAGGGGCATTTTAACACCTACTTAGTCACCTTCATGACAGTTTCTAACCTGTACTT

a
s	mr.mrrefChr3	132930	60	+	181019	TTTGTACCTCTTTGCAAAGTTAGTCCCTACCAATTGACAACTCTTAGACTACAGAACCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	583152	60	+	636262	TTTGTACCTCTTTGCAAAGTTAGTCCCTACAAATTGACGACTCTTAGACTACAGAACCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	58673	60	-	647215	TTTGTACCTCTTTGCAAGGTTAGTGCCAACCAATGGGCAACCCTTAGACCACAGAACCTT

a
s	mr.mrrefChr3	132990	33	+	181019	GTCCTTTACACCCATGTCACCTTTAGTTGAATC
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a
s	mr.mrrefChr3	133023	74	+	181019	TGGCAATGAAGTCACAAAGGGGGGGCAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGAGGGGTAGCAGCGACTCAGCCCCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	583246	74	+	636262	TGGCAATGAAGTCACCAAGGGGGGGCAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGAGGGGTAGCAGCGACTCCGCCCCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	58768	69	-	647215	-----ATGAAGTCACAAAGGGTGGGTAGCTAGCAATGAAGTCACAAAGGGGGGGGGGTAGGGACTCAGCCCCTG

a
s	mr.mrrefChr3	133097	21	+	181019	AAATTAACTATTACAGCCTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	583320	21	+	636262	AAATTAACTGTTACAGCTTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	58838	21	-	647215	AAACTAACTATTACTGCCTCC

a
s	mr.mrrefChr3	133118	70	+	181019	TTGGGCCTTGACTGTGTGACACAATGGCCCACCCTGTTAGCAGATCTTACCAACTACCCTCTTGATTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	583341	70	+	636262	TTGGGCCTTGACTGTGTGACACAATGGCCCACTCTGTTAGCAGATCATACCAACTACCCTCTTGATTGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	58860	61	-	647215	TTGGGCCTTGACTGTGTGACACAATGGCCCACCCTGTTAGCAGATCTTACCTGCTACCCTC---------

a
s	mr.mrrefChr3	133188	288	+	181019	AAAACCTAGAAATTAAGGGAATTGCAGATGTTAGTCTTTAGAATGGACCAGGAAGTGATATGTAAACTGCCCCTCCCCATGCAGGAATGACCACACCTACCCTGTCTTATCCAGCAATAAGAAGTCTGTGGCACACAGTTTCTGAAAGGGGAATGGAAATTTCCACTCCTCGACACCCTGATCATGAAGGTTGCACCACCCATCTCTTAAAGGATCCCATAATCCAATAGAATTGGTCAGTTATACTAGTCAGGTTTAAGAATGGGACCCTGTGCCAGGTGCAGCGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	583413	282	+	636262	AAAACCTAGAAATTAAGGGAATTGCAGATGTTAGTCTTTAGAATGGACCAGGAAGTGATATGTAAACTGCCCCTCCCCATGCAGGAAC--CCGCACCTACCATGTCTTATCCAGCAATAGGAAGTCTGTGGCACACAGTTTCTGAAGGGGGAATGGAAATTTCCACTCCTCGACACCCCGATCATGAAGGTTGCACCACCCATCTCCTAAAGGATCCCATAATCCAATAGAGTTGGTCAGTTATTCTAGTCAGGTTTAAGAATGGGACCCTGTGC----TGCAGTGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	58921	264	-	647215	------------------------CAGTTGCTAGTCTTTAGAATGAACCAGGAAGTGATATGTAAACTGCCCCTCCCCATACAGGAGTGACCAAACCTACCCTGGCTTATCCAACAATAAGAAGTCTGTGGCACACAGTTTCTAAAAGGGGAATGGAAATTTCCACTCCTCTACACCCTGATCATGAAGGTTGCACCACCTATCTCTTAAAGTAGCCCAAACTTCAATAGAATCAGTCTGTTATACTAGTCAGGTTTAAGAATGGGACCCTGTGCCAGGTGCAGCAGC

a
s	mr.mrrefChr3	133476	24	+	181019	GGTACTAATACGGTCAAAGTTCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	583745	24	+	636262	GGTACCAATACGGTCAAAGTTCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	59185	6	-	647215	TATCCT------------------

a
s	mr.mrrefChr3	133500	61	+	181019	TCAGGTGCAGTGACTACCCTTCCTGTCTCTCATCTTGTCTCATCCAAGTTTACTACATGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	583772	61	+	636262	TCAGGTGCAGTGACTACCCTTCCTGTCTCTCATCTTGTCTCATCCAAGTTTACTACATGTC

a
s	mr.mrrefChr3	133561	5	+	181019	TGCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	583844	5	+	636262	TGCAC

a
s	mr.mrrefChr3	133566	461	+	181019	TTCCACATTAGAGATTTATGTATGGTGCCTCAATAAACATTTTCACATTGTTACTCCAAACTGCGCTGGTCAGACCACAGTATTCTAGCTCACCAATTCCAGACAATTCCACTAAAGACTTTATAAGCCACCACTAGACCATATCAGCTACTCACCTCCCTTTCAGAGAGACAGTTTGTAAAACCTGACTAGTGAACTGGTTAAGCCAATTCCAGTGTAGTGGTCCTCAAATGCCCAATTCTGATTATCGCTAATATAGGTATAAACTAGAAAATGTGTTGTGGTGCCATTACCTATAAGTGCACCTACATGGAGTAAATGTAGTTGGAGGTGAAGCTTCCAACACTTACCATGGACTTTATTTTCAATCATCAGTAAATTTTAGGAGATGTGTATTCACCAAACCCTATTACATATGCATGAGTCTCTGAGATGATTGCAGGGTGTCATTTAGGTACAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	583857	460	+	636262	TTCCACATTTGAGATTTATGTATGGTGCCTCAATAAACATTTTCATGTTGTTACTCCAAACTGAGCTGGTCAGGCCACAGTATTCTAGCTCACCACTTCCAGACATTTCCATTAAAGACTTTATAAGCCACCACTAGACTATATCAGCTACTCACCCCCCTTTCAGAGAGACGGTTTGTAAAACCTGACTAGTGAACTAGTTAAGCCAATTC-AGTGTAGTGGGCCTCAAATACCCAATTCTGATTATCACTAATATAGATATAAACTAGAAAATGTGTTGTGGTGCCATGACATATGAGTGCACCTATATGGAGCAAATGCAGTTAGAGGTGAAGCTTCCAACACTTACCATGGACTTTATTATCAATCATCAGCAAATTGTGGGAGATGCGTACTCACAAAACCCTCTTACATATGCCTGAGTCTCTGAGATGATTGCAGGGTGTCATTTAGGCACAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	59191	443	-	647215	-TCCACACCACAGATTTC---------CCTCAGTAAACATTTTCACATTGTTACTTCAAACTGCACTGGTCAGACCATAGCATTCTTGCTCACCAATTTCAGACAATTCCACTAAAGACTTTATCATCCACCACTAGACCATATCAGCTGCTCACCTCCCTTTCAGAGAGCCA-TGTGCAAATCCTGACTAGTGGACTGGTTAAGCCAATTCCAGTGGAGAGGTGCTCAAATGC-------TGGTTATTGCTAATATAGGTATAAACCAGAAAATGTGTTGTGGTGCCATTACCCATAAGTGCACCTACATGGAGTAAATGTATTTGGAGGTAAAGCTTCCAACACTTACCATGGACTTTATTTTCAATCATCAGTGAACTTCAGGGGAGGTGTATTCACCAACCACTATTACATATGCAGGAGTCTCTGAGATGATTGCAGGGTGTCATCTAGGTGTGTA

a
s	mr.mrrefChr3	134027	14	+	181019	TTCACCACAAGCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	584317	14	+	636262	TTCACCACAAGCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	59754	14	-	647215	TTCACTACAAGAGT

a
s	mr.mrrefChr3	134041	360	+	181019	TGCTATTTGCATCAGTAACTAGATGACATATGAAATGAGGTAAAAGGAATATCCAATATGTGTTTTCACTGGTGGCAACTTCAAAGAAGCCAAGCATCCTGGTTTTGATGGCATGCTCTGATGTTTTCTGGGCTGGGGACTTGGATGCTCAGATGGTTCTTATGATGTACCCAGTAATTTGACAAAGCCTCCGAACCCTGTTAACTTTTATAATCCCTCACCCCCACTCATTTTGTTAAGGTGTCTTAAGGAGACAACCAGCCAATCAGATAAGAGAAAAAATATGGACAGCATTGTCTAACTAAGAAAGAAAAGAATACTGAAACAGTTTCATTGTGCTACATAGAAAGTTAATAACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	584431	360	+	636262	TGCTATATGCATCAGTAACTAGATGACATATGAAATAAGGTAAAAGGAATATCCAATATGTGTTTTCAGTGGTGGCAACTTCAAAGCAGCCAAGCGTCCTGGTTTTGATGGCATGCTCTGATGTTTTCTGGGCTGGGAACTTGGATGCTTGGATGGTTCTTATGGTGTACCTAGTAATTTGACAAAGCCTCCGAACCTTGATAACTTTTATAGTCCCTTGCCCCCACTCATTTTGTTAAGGTGTCTTAAGGAGACAACCAGCCAATCAGATGAGAGAAAAAATATTGACAGCATTGTCTAACTAAGAAAGAAAAGAACACTGAACCAGTTTCATTGTGCTACATAGAAAGTTAATAACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	59768	354	-	647215	TGCTGTTTGCATAAGTAACTAGATGACATATGAAATGAGATAAAAG-AATACCCAATGTGTGTTTTCACTGGTAGTAACTACAGAGAAGCCAGGCATCCCGGTCTTGATGGGGTGCTTCAATCTTTTTTGGGCTGGGGACTTGGATGCTCAGATGGTACTTATGATGTACTCAGTAATTTG-----GCTTTCAAACCCTGTTAAGTTTTATAATCCCACACCCCCACTCATTTTGTTAAGGTGTCTTAAGGAGACAACCAGCAAGTCAGATAAGAGAAAAAATATGGACAGCATTGTATAACTAAGAAAGAGAAGCATACTGAAACAGTGTCCTAGTGCTACATAGAAAGTTAATAACCA

a
s	mr.mrrefChr3	134401	354	+	181019	GCTGTGATAGGTATCTGTAAAAGAGCCCAGACATTTGTCTATCACCTCTGACAATATTTGAGGTCTGCCATATGCAATACCCGCCCACTGATATTAACTTCTGAATTGATTAAACAATGATTAACTAAAGTGATCGAGCTTACCATTGATTAGCTCAGGTATATCGGGTAGAGGATTGTTTGGTGCAAGTATCTACAGGCTGACCAATTTGGGGTAATTGTAATCAATGGGACAGGTGGCTCCATTAACTAATGCATGGTTCACACATCACATGTAAAAAAAAGAAGAATGCCATTTCACCTAGAGTACTACCTGAGTGATGGGTGATTGATTGTTACAAGTATTAATAGATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	584794	347	+	636262	GCTGTGATGGGTATCTGTAAAAGAGCCCAGACATTTGTCTATCACCTCTGACAATATTCGAGGTCTGCCATATGCAATACCCGCCCACTGATATTAACTTCTGAATTAATTAAAGAATCATTAACTAAAGTGATCGAGCCTAGCATTGATTAGCCCAGGTATATTGGGTAGAGGATTGTTTGGTGCAAGCATCTACAGGCTGACCAATTTGGGGTAATTGTAAACAATGGGAGAGGTGGCTCCGTTAAGTAATGTATGTTTCACACATCACATCTAAAAAAAAGAACAGT-------CACCTAAAGTACTACCTGAGTGATGGGTGATTGGTTGTTACAAGTATTAATAGATGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	60122	351	-	647215	GCTTTGACAGGTATCTGCAAAAGAGCTCAAACATTTGTCTATCACCTCTGACAAT---TGGGGTCTGCCATATGTAATACCAGCCCACTGATATTAACTTCTGAATTGATCATACAAAGATTCACTAAACTGAGTGAGCTTACCATTGATTAGCTCACGTATATCGGGTGTAGGATTGTTGGGTGCAAATATCTACAGGCTGACCAATATGGGGTAATTGCAATCAGGGGGACAGGTGGCTCCATTAACTAATGCATGGTTCAGACATCACATGTAAAAAAAAGAAGAATGCCATTTCACCTAGAGTACTACCTGAGTGATGGGTGATTGATTGTTACAAGTATTAATAGATGA

a
s	mr.mrrefChr3	134755	294	+	181019	CTTCTAGTGGCAAGCTATGAGGCTTATTTCAACCCTTAATCCAGGCAGAGATGCGCTTGTTTGATCTACTGACTATTGACACTGTTAAAATCAGCATGATTGGGCGACCGATGAAACACTGCAGATGTGGTCTCTAATAATGTACAAGGCTCTATAGCAGTCAGATATTACTCAATTCCTCAGGCTGCACAGTTCACCTACAACTGATGTCACACATGCACACACCATGAAAGCTCTGGGGTATATAAGTAGGTAAGGAGGAATGCAATCCCTGATAGTGAGAGCCTAGATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	585141	293	+	636262	CTTCTAGTGGCAGGCTATGAGGCTGATTTCAACCCTTAATCCAGGCAGAGATGCGCTTGTTTGATCTACTGACTATTGACACTGTTAAAATCAGCATGATTGAGCGACCGATGAACCACTGCAGATGTGG-CTCTAATAATGTACAAGGCTCTATAACAGTCAGATGTTACTCAATTCCTCAGGCTGCACAGTTCACCTACAACTGATGTCACACATACGCACACCACGAAAGCTCTGGGGTATATAAGTAGGTAAGCAGGAATGCAATCCCTGATAGTGAGAGCCTAAATCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	60474	294	-	647215	CTTGTAGTGGCAAGCTATGAGGCTTTTTTCAACCTTTAATCCAGGCTCAAATGCACTTGTTTAATCTACTGAGTATTGGCACTGTTAAAAACAGCATGACTGGGCAACCAATGAAACACTGCAGAGGTGGTCTCTTATAATGTACAAGGCTCTATAGTAGTTGGATATCGCTTGATTCCTCATGGTTCCCAGTTCATCTACAACTGATGTCACACATGCAAACACCATGAAAGTTCTGGGGTATATAACTAGGTTAGGAGGAATACAATCCCTGATAGTGAGAGCCTAGATCAA

a
s	mr.mrrefChr3	135049	92	+	181019	CTAGCACAAGGGCACCCAGTACCATAATATTTGGGTCTCTTAGGTAGTTATGACAACCCCCTAAACTTTTTGCAAATATGTGGGTCTTCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	585434	91	+	636262	CTAGCACAAGGGCACCCAGTACCATAATATTTGGTTCTCTTAGGTAGTTATGACAACTCC-TAAACTTTTTGCAAATATGTGCGTCTTCATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	60769	91	-	647215	CTAGCACAAGGG-CTCCAGTACCATAATACTTGGGTCTCTTAGGTAGCTATGACAACCCCCTAAACTTTTCACAAATATGTGGGTCTCCATG

a
s	mr.mrrefChr3	135141	34	+	181019	TTTGGTCTAACATCTTATCATGCCGATATGGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	585530	34	+	636262	TCTGGTCTAGCATCTTATCATGCCGATACCAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	60860	34	-	647215	TTTGGTCTAACATCCTAACATGCCCATGTGGATT

a
s	mr.mrrefChr3	135175	154	+	181019	CCATTACTCCAGGGGTATCTTATATCTGACTTATTTGTGAGTCTGCTAATTTCCGTTGGCTCTGGAGATTTGCGTAAGTAATATCTCTCATATGTTCACTATAGGCCACAGTTATAACTGTAGCCCCTACATCAGATGGCCCCTATCTGTTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	585564	140	+	636262	CCATTACTCCAGGGGTATCTTATATCTGACTTATTTGTGAGTCTGCTAATTTCCGTTG--------------CATAAGTAATATCTCTCATATGTTCACTATAGGCCACAGTTATAACTGTAGCCCCTACATCAGATGGCCCCTATCTGTTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	60910	154	-	647215	CCAGTACTCCAGGGGTATCCTGTATCTGATTTATTTGTGAGTTTGCTAACTTCTGTTGGCTCTGGAGATTTGCGTAAGTAATATCTCTCATAAGTTCACTATAGACTATAATGATAACGGTAGCCCCTACATCAGATTGCCCCTATCTGTTGCA

a
s	mr.mrrefChr3	135329	17	+	181019	CCTCTTTGTCAGACCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	585705	17	+	636262	CCTCTTTGTCAGACCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61064	17	-	647215	CCTCTTTGTCAGATCGG

a
s	mr.mrrefChr3	135346	64	+	181019	TTGTCTCACTATTGGATCACCGGCATCAATTGCACCAAGGATATGGATTGCATGCCTGTTTGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	585722	64	+	636262	TTGTCTCACTATTGGATCACCGGCATCAATTGCACCAAGGATATGGATTGCATGCCTGTTTGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61082	64	-	647215	TTGTCTCACTGTCAGACCACCAGCATCAATTGCAATAGGGGTTTAGAGTGCATGCCTGTTTGTC

a
s	mr.mrrefChr3	135410	69	+	181019	TCTGAGGTATGCCAATTTAACCTAGTCATATGTGTTGCACTAGCAAGCTTCAATTTTAGTACCCTCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	585789	69	+	636262	TCTGAGGTATGCCAATTTAACCTAGTCATATGTGTTGCACTAGCAAGCTTCAATTTTAGTACCCTCATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61146	69	-	647215	TCTGAGGTATGCCAAGTTAACCCAGTCATATGTGTTTCTTTAGCAGACTTTGACTTCAGTATCTTCGTC

a
s	mr.mrrefChr3	135479	26	+	181019	TTAAAATCACCCTCTTGTAAGCACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	585870	26	+	636262	TTAAAATCACCCTCTTGTAAGCACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61215	26	-	647215	TTAAAATCACCCTCTTGTAAGCCCAT

a
s	mr.mrrefChr3	135505	8	+	181019	TATCAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	585896	8	+	636262	TATCAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61254	8	-	647215	TACCAATG

a
s	mr.mrrefChr3	135513	98	+	181019	AGCTGTCCCTCCTTAAAGTGATATGTAAAGCTGGTGGTATCAATCAAAGGGTGAACTACCATCAATTAAGGTATCATCATTATACATTCCATCATGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	585904	98	+	636262	AGCTGTCCCTCCTTAAAGTGATATGTAAAGCTGGTGGTATCAATCAAAGGGTGAACTACCATCAATTAAGGTATCATCATTATACATTCCATCATGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61265	98	-	647215	AGCTTTCCCTTCTAAGAGTAACATGTGAATCTAGTAGCATCAATTAAAGGGAGAACTATCATCAATTAAGGTATCATCATAATACATTCCATCATGTA

a
s	mr.mrrefChr3	135611	2	+	181019	AT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586002	2	+	636262	AT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61374	2	-	647215	AT

a
s	mr.mrrefChr3	135613	12	+	181019	AGAGATTTGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586005	12	+	636262	AGAGATTTGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61376	12	-	647215	AGAGATTTACTA

a
s	mr.mrrefChr3	135625	28	+	181019	AGACAGGTTAAATTGCAGGACTAGTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586017	28	+	636262	AGACAGGTTAAATTGCAGGACTAGTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61397	28	-	647215	AGACACGCTAAATCGCAGGACTAGTATG

a
s	mr.mrrefChr3	135653	12	+	181019	GTCggaacacag
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586045	12	+	636262	GTCggaacacag
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61449	12	-	647215	GTAGGAACACAG

a
s	mr.mrrefChr3	135665	6	+	181019	aacaca
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586059	6	+	636262	aacaca
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61461	6	-	647215	GACTCA

a
s	mr.mrrefChr3	135671	22	+	181019	acccatcaaatacccacaaact
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586065	22	+	636262	acccatcaaatacccacaaact
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61473	22	-	647215	ATTTACTCAAAATCAGCAAGGT

a
s	mr.mrrefChr3	135693	16	+	181019	aagattcaaggaacat
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586087	16	+	636262	aagattcaaggaacat
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61509	16	-	647215	AGGACTCAAGGTGCAT

a
s	mr.mrrefChr3	135709	59	+	181019	tcgtaaaatcagtaaggggaagccactaacaattcaaagattactgactgaacattctg
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586103	59	+	636262	tcgtaaaatcagtaaggggaagccactaacaattcaaagattactgactgaacattctg
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61527	59	-	647215	tcttaaaatcagtaaggggaagctgctaacaattcagagattactgtctgaacattctg

a
s	mr.mrrefChr3	135768	32	+	181019	tcttagtcgttcaccggcaaacataattgagc
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	61599	32	-	647215	tcttgatctttcaccagcaaatataattgagc

a
s	mr.mrrefChr3	135800	58	+	181019	accattatcgtgaaatcagtggccttgttcaccacacacagaaagaccactatagatt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586197	58	+	636262	accattatcgtgaaatcagtggccttgttcaccacacacagaaagaccactatagatt
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61631	58	-	647215	actattattgtgaaaccagtggtcttgttcaccacacctaaaaagaccattgttgaat

a
s	mr.mrrefChr3	135858	19	+	181019	tggcctggagtgagaaaag
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a
s	mr.mrrefChr3	135877	171	+	181019	gaacccatggcagaatcctttcttagtgaaagaaatcaagggagtgcagtcatatccttgaactttaagtgttactatcaggtaactattgtgaaagcaacactatacttgcatcaaaagatcagtacaatacaccatggaattagaagtgatggagctaccacatttaag
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586277	171	+	636262	gaacccatggcagaatcctttcttagtgaaagaaatcaagggagtgcagtcatatccttgaactttaagtgttactatcaggtaactattgtgaaagcaacactatacttgcatcaaaagatcagtacaatacaccatggaattagaagtgatggagctaccacatttaag
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61709	171	-	647215	gaacccaaggcagaaccttttcttattgaaaaaaatcaggggagtgcgatcatatcctcgaactttaagtgttactcttgagtaacagtttggaaagcaacactatattagcatcaaaagatcattacaatacaccatgggattagtagtgatggagctaccacacttagg

a
s	mr.mrrefChr3	136048	52	+	181019	aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccattattcaatat
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586448	52	+	636262	aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccattattcaatat
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61906	52	-	647215	aaacgcttcatattatgatgagaaattttaacaaggactcattattcaatct

a
s	mr.mrrefChr3	136100	73	+	181019	gaattggttgttcacctcccaaaaattagagcttgacacttgcccatcaccatataccatgactaatacaagt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586509	73	+	636262	gaattggttgttcacctcccaaaaattagagcttgacacttgcccatcaccatataccatgactaatacaagt
s	simRat_chr6.simRat.chr6	61958	73	-	647215	gaatcagtttattaccttccaaaaattaaaacttgacatttccccattaccttataccatgattaatacaagc

a
s	mr.mrrefChr3	136173	37	+	181019	tgtaactaatctaaagaattgaggttcggagctacca
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	62031	37	-	647215	tgttactggtctaatgaattgaggttctcatccccca

a
s	mr.mrrefChr3	136210	44	+	181019	aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccatta
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586628	44	+	636262	aaacgcttcatattgtgatgagagatcttaacaaggacccatta
s	simRat_chr6.simRat.chr6	62068	44	-	647215	aaaagtgttaagggctgagtagattttctgagaaggacctttta

a
s	mr.mrrefChr3	136254	24	+	181019	caatatgtacttagggaattggtt
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a
s	mr.mrrefChr3	136278	59	+	181019	atacaaaaaaaccacaaggatagagtggccataacatggacatatgtcttgcagaactc
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a
s	mr.mrrefChr3	136337	63	+	181019	aagataaatgatcaacaaacatgagtgggatgtaaacaagggaaagagcacacttacagtaaa
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586928	63	+	636262	aagataaatgatcaacaaacatgagtgggatgtaaacaagggaaagagcacacttacagtaaa
s	simRat_chr6.simRat.chr6	62215	63	-	647215	gagataaatgatcaagaaatatgaatggggtgtaaacaaggtaaagagcatacttagagtaga

a
s	mr.mrrefChr3	136400	25	+	181019	ccaggagtttagcaaataggataga
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	586992	25	+	636262	ccaggagtttagcaaataggataga
s	simRat_chr6.simRat.chr6	62278	25	-	647215	ccatgaggttagtaaataggataga

a
s	mr.mrrefChr3	136425	141	+	181019	acctttgtcacctatttgtccaaaaggggtccagtctctcaggtctcatagcaaactcacccaaatacacaaggagaagcccagtgacataatcaatagacagattggaaccataaacaggctctcactggtaaggggaga
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	587017	141	+	636262	acctttgtcacctatttgtccaaaaggggtccagtctctcaggtctcatagcaaactcacccaaatacacaaggagaagcccagtgacataatcaatagacagattggaaccataaacaggctctcactggtaaggggaga
s	simRat_chr6.simRat.chr6	62310	141	-	647215	accttcgacacctacttgtccaaaaggggcccagtatctaaggtgccacagcaaactcacacagatacgcaaagagaaacccggtaacacgaccaatagatggactgaaaccataaatgggctctcataggcaaggggaga

a
s	mr.mrrefChr3	136566	28	+	181019	cccggtgcaaggaagcaccataggaagt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	587158	28	+	636262	cccggtgcaaggaagcaccataggaagt
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a
s	mr.mrrefChr3	136594	21	+	181019	gtgctgaggtttttcaggacC
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	136632	168	+	181019	GCAGTTATCTATCTCTCAGTCGGCCTGTCAAAGAGGCCTCTGTGGCCACTGCAGTGCTACTCCAATGAGTAACTACAGGGAGGCCTTTGATATTACCATGCCATGCACAACTTAAACAGGACACTGCATAGCTTGTGATATTAAATGCTTAGCAGAAGGGCACAATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	587526	168	+	636262	GCAGTTATCTATCTCTCAGTCGGCCTGTCAAAGAGGCCTCTGTGGCCACTGCAGTGCTACTCCAATGAGTAACTACAGGGAGGCCTTTGATATTACCATGCCATGCACAACTTAAACAGGACACTGCATAGCTTGTGATATTAAATGCTTAGCAGAAGGGCACAATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	62522	168	-	647215	GTGGTTAGCTACTGCTCAGTCAGCCCATCAAAGGGGCATTTGTGGCTACTCTAGTGCTACTCCAATGAGTAACCATGGGGAGGCCTTTGATATTACCATGCCATGTGCAACTCAAACAGGATACTGCATAGCATGTGATAATAAATGCTTGGCAGCAGGGCACAATAA

a
s	mr.mrrefChr3	136800	6	+	181019	ttagac
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	587701	6	+	636262	TTAGAC
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a
s	mr.mrrefChr3	136806	26	+	181019	cttttttaatagcattattgctagat
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	587710	26	+	636262	CTTTTTTAATAGCATTATTGCTAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	62696	26	-	647215	cttttataatcgcattattgctagat

a
s	mr.mrrefChr3	136832	17	+	181019	agtggttaaatccataa
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a
s	mr.mrrefChr3	136849	13	+	181019	tatggtgatcaca
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	587753	13	+	636262	TATGGTGATCACA
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a
s	mr.mrrefChr3	136862	160	+	181019	ggagccaggaaacaagactttttctccttgtcacaACCTGGAGGAATCCTAGTTTTATCCCTAATGCTGCACTTGTTTTCACAAATTGGCCTTCTTTTTCTTTCCCAAAGTTGGAAACAAAGCACCCATGCTCTCCTTGATAACGATCAATAGTATACAC
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a
s	mr.mrrefChr3	137022	680	+	181019	TTGGAAAGTGAGGTGTATTGCTAGTATAATCAGAGCACTTTCCACTCCATTTTTGCAATGTATGACCCAAGCATTTACTCTCGCTCATTCATTACAAGTCTTAATCTACTTGTATGATCAAAACCCTGGGATTATGAGTATCAAGAGTAGGTTATGAAACATCACTTCCCATGTGCTTCAACAATATAGATCCACTGCCGTAGCTGCTCTGGCATACGCACAGCTATACTGCACTTGATAAGGACTTTTAGTATGGGATAGATTTGTTGGTAGGGTAGCCATGGTGTGTAAACGTACTGACCTTCCATCAACCACAGGCTTAGAAAACACAGATGATTGACAATATCATAGTACCTCCTAAAAAGCCAAAAACCCCAAACATATTTCAGTCACTATTGACAACCATTTTCCTTTCTATTATATATTCTTGATCATGTGGATTTGTATATTTACAACGCGCTGCACAGCTGTTTAAAAGTTAAAAATTCTTAGAACAAATTTGGAATCAGCAAGTGCTTCATGTGGAGGGATATCAGTTTCATGTATAAGTGAGTTGTATGATCCTCTAGATGGCATATGTTCCATCCCTGGCTGACCAAATCTGTGTCATTCATGGAGTGATCATCCAATAACAGTGCCACTAGCCGTCCTGTAGTCCCTCTTAGATCCATTTGTCTGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	587928	675	+	636262	TTGGAAAGTGAGGTGTATTGCTAGTATAGTCAGAACATTTTCTACTCTATTTTTGCAATGTGTGACCCAATCATTTACTCTCGCTCATTTATTGCAAGTCTTAATCTACTTGTATGATCAAAACCCTGGGATTATGAGTATCAAGAGTAGGTTATGAAACATCACTTCCCATGTGCTTCAACAATATAGATCCACTGCCGTAGCTGCTCTGGCAGACGCACAGCTATACTGCACTTGATAAGGACTTTTAGTACGGATTAGATTTGTTGGTAGGGTAGCCATGGTGTGTAAAC---CTAACCTTCCATCAGCCACAGGCTTAGAAAACACAAATGATTGACAATATCATAGTACCTTCTACAAAGCCAAGAACCCCAAACGTATTTCAGTCATTGTTGACAACCATTGTTCTTT--ATTATATATTCTTGATCATGTGGACTTGTATATTTACAACGCGCTGCACAGCCGTTTAAAAGTTAAAAATTCTTGGAACAAATGTCGAATCAGCAAGTGCTTCATGTAGAGGGGGAGCAGTTTCATGAATAAATGAGTTGTATGATTCTCTAGATGTCATATGTTCCACCCCTGGCTGACCAAATCTGTGTCATTCCTGTAGTCATCATCAGATAACATTGCCACTAGCCATCCTGAAGTCCCTCTTAAATCCATTTGTCCGTC
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	137740	157	+	181019	ACTCCTGTAAAGTGTGATATGGATAGTCTTTAAGTGCCTGAAAGATAAAAATATAGAGCATAGCCCAGCTCTTTGAGAGATGGTAATCATGAGGGAGTCATATAGGGTAGTTCTTATAAAATGAAGGGCCTGCCTGTTCTATGCTCTGGTATTGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	588773	156	+	636262	ACTCCTGTAAAGTGTGAT-TGGATAGTCTTTAAGTGCCTGAAAGATAAAAATATAGGACATGGCCTAGCTCTTTGAGAGATGGTGATCATGAGGGAGTCGTATAGAGTAGTTCTTATCAAATGAAGGGCCTGCCTATTCTGTGCTCTGGTATTGCAG
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a
s	mr.mrrefChr3	137897	65	+	181019	ACACGGCATTGAATGCATAATATTGTAATATTTTGTTAGTGAGCCAGTTGTTAACATTCATCATG
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a
s	mr.mrrefChr3	137962	276	+	181019	TGTGCATTTGCATTCTTTGATTTGGGCTGCTGTGCCTTAGGGATATTGAGTGATATTGTGGTAGATAAGACAGTAAAGAATCATAGCTCATTTCCATGTGTGTCTCCTCAAGAGAGACATGTTAATGAAATGTTATTTCTACCACAGATCATTGACTCCAGAGAATACAATGTCTTTATCAGCTGTGCTTCAGCTTGCAAGTGGTACATTTATATGTAGAGGAAACAGAGTGGGGGTAAATGTGAAAAGGTTAGCTCTGTATGGCCATGTAGATAT
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	138270	168	+	181019	GTTATGTACAATGATGTATTCAACAGCATGCCTGAACCTATAAAATAAAGTATCCTCCTATAAAATAAGGTATCCTGGATCTTGTAATGTTACCCTATTTTTATAATACATGATGGTATTCCTCTTATTGATCACACTGTGACCCCTTGTGTTAACATAATGAACCTA
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a
s	mr.mrrefChr3	138438	57	+	181019	AAGGTCTTGGGTAGTCCTCCCTAGGACATATAAGGGGAGATAACACTTTAGAACACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	589642	56	+	636262	TAGGTCTTGGGTAGTCCCCCCTAGGACATCTAAGGGG-GATAACAGTTTAGCACACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	64251	57	-	647215	AAGGTCTTGGGTAGTCCTCCCTAGGACATACAAGGAGAGATAGCACTTTAGACCACT

a
s	mr.mrrefChr3	138495	138	+	181019	TTCCCAACTAATAGATGGAGTCTTTATCTGTTATTATAGTTCCACACTAAGCACTCAATTTATAGTGGTAATATGTTATGTGGAGACCACATCACGTCTAAATTGTCTGCGAAACCTCAACCCCTAACCTCACTACAG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	64308	138	-	647215	CTCTCAACTAATAAGTGGAGTCTTTATCTGTTCTTATATCTTCATACTAAGCACTCAATGTATACTGGTAGTATGTTATGTGGAGACCACATCACGTCTAAATTGTCTGCGAAACCTCAATCCCTAACCTCACTACAG

a
s	mr.mrrefChr3	138633	89	+	181019	GAGTTCACAGGTTTTTTTCTGCTTTTCACTCATAAGCATCTCTAATGGCATTGTGATGAAAGGTGAATCTATTGTGACAACTGTTAGAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	64447	85	-	647215	GAGTTCACAGGTTTTT----GCTTTTCACTTATAAGCTTCTCTAATGGCATTGTGATGAAAGGTGAATCCATTGTGACAACTGTTAGAA

a
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a
s	mr.mrrefChr3	138849	30	+	181019	TTTCCCCCTAGTGGAATTCAAATCTCTGTG
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a
s	mr.mrrefChr3	138879	224	+	181019	CTTCATAATGTCTATTTGTAATGCTTTCTTGTCAGATATTATATCTATTTGCTCATGTGTCCACGTTTCTTACAAGCGTAACATTAATATAACATTTGAATAGTACACATGTACGTTAAAGTGACAATTGCTACCCGCAAAGGGTATTTTTCGTGCTTTTCAATCTAGGTGTTACCCCAAGTAGCCCAAAGCATGCTGAATAAGACATGTTATAGGGTCCACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	590065	218	+	636262	CTTCATCATGTCTATGTGTAATGCTTTCTTGTCAGATATTATATCTGATTGCACATGTGTCCACATTTCTTACAAGCGTAACATTAATATAACATTTGAATAGTACACATGTATGTTAAAGTGACAATTGCTACCCGCAAAGGGTATTTTTCGTGCCTTTCAATCTAGGTGTGACCCCAAGTAGCCTAAGACATGTTGA------CATGTTATAGGGTGCACAA
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a
s	mr.mrrefChr3	139103	144	+	181019	AGTACAGTACATGTTAACAATTCTATGTAATACCATGCCATTAGCACCTGTTAGTATGGACTAGACTAAAATTCATCATTCTTTGCATTCACGTTTAATTTATGCAAATTCTAGAGTAAGAAAGGTTCAAAGTCAAACATCTGG
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	139314	181	+	181019	ATGTATCAGCTAACTCAACACTAGCAACCTAACATGCCTATTTACTGCAGTCTTAATAGTAGACATTATAGGTAGAGGTAGTCCTGTGTGAGCTAGATTCCTAGAATCCCTGTCAACAGAAGCAAGAATGTCTTGAGTATAGGCTAAATCCGTCAGAACTGCAGTGGTCATGATTTAATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	590496	181	+	636262	ATGTATTAGCTAACTCAACACTAGCAACCTAACATGCCTATTTACTGCAGTCTTAATAGTAGACATTATAGGTAGAGGTAGTCCTGTGTGAGCCATATTCCTAGGATCCCGGTCAACAGAAGCAAGAATGCCTGGAGTATAGGCTAAATCCGTTAGAACTGCAGTGGTCATGATTTAATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	65147	177	-	647215	ATGTATCAGGGAACATGACACTACCAACCTATCATGCATC----CTGTAGTCTTAATAGTAGACATTATAAGTAGAGGTCGTCCTGTGTGAGCTAGCTTCCTAGAATCCCTGTCAACAGAAGCAAGAATGTCTTGAGTATAGACTAAATCTGTCAGAACTGCAGTGGTCATGATTTAATAT

a
s	mr.mrrefChr3	139495	63	+	181019	GTTTAGGTGGTGCTGTTATCATCTAGGAGGATACTGGTCGCCACCTACATTGACAGAATAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	590677	63	+	636262	GTTAAGGTGGTGCTGTTATCATCTAGGAGGATACTGGTCGCCAACTACATTGACAGAATAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	65326	63	-	647215	GTTTATGTGGTGATGTTATCATCTCGGAGGTTACTGGCCACCACCTACATTGATAGAATAATA

a
s	mr.mrrefChr3	139558	27	+	181019	GGCTAAACATTCACTATTACCCCTACA
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a
s	mr.mrrefChr3	139585	30	+	181019	AGTCTTCTCACTCAATAAATTTTTTTATGG
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a
s	mr.mrrefChr3	139615	79	+	181019	CAGCATCACAATCAGGTAGCATCCAGACCTAAGGGCTCTCCTTGGCAATCTTAACTTGGGGGGTGTCAGAAATTCAGAA
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	139809	13	+	181019	TGATCTATATCCG
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a
s	mr.mrrefChr3	139822	62	+	181019	AATAATTCAAGAAGACTGCACACAGCACTAGTACACTTCTGTGCCTAACTCTAGTGCTTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591023	62	+	636262	AATAATTCAAGAAGACTGCACACAGCACTAGTACACTTCTGTGCCTAACTCTAGTGCTTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	65660	62	-	647215	AATCATTCAGGGAGACTGTGCTCAGCATTGGTGCACTTCTGTGCCCAACTCCAGTGCTTGAT

a
s	mr.mrrefChr3	139884	6	+	181019	TTAGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591086	6	+	636262	TTAGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	65722	6	-	647215	TTCGCC

a
s	mr.mrrefChr3	139890	62	+	181019	TTAGTCAACTAATCCATTGAGGTATGGCACTTTGACAACTTTATGAAAGAGGGATAGCACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591145	62	+	636262	TTAGTCAACTAATCCATTGAGGTATGGCACTTTGACAACTTTATGAAAGAGGGATAGCACAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	65728	62	-	647215	TTAGTCAACTAATCCATTGAGGTATGGCACTTAAGCCCCTTTATGAAAGAGGGATAGCATGG

a
s	mr.mrrefChr3	139952	68	+	181019	CAGGCATAAACTCTGAAAGGAACATATTCAATAGTCTGCAACTGCATATCCTCAATGACATTTTTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591226	68	+	636262	CAGGCATAAACTCTGAAAGGAACATATTCAATAGTCTGCAACTGCATATCCTCAATGACATTTTTGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	65790	68	-	647215	TGTGCATAAACTCTGAAAAGGACATATTCAATAGCCTGTAGCTGCGTATCCTCAATGACATTTTTGCC

a
s	mr.mrrefChr3	140020	120	+	181019	CATAGATATGGATGTGTATGAGTCCTTGATTGATGTCTGTATGAGTACTGTCTACTCAGTAACAATAGACTGGGCAAGTCTTGCCCTATGAGTTACCATAAAAATCGTTCCATAAGTTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591294	120	+	636262	CATAGATATGGATGTGTATGAGTCCTTGATTGATGTCTGTATGAGTACTGTCTACTCAGTAACAATAGACTGGGCAAGTCTTGCCCTATGAGTTACCATAAAAATCGTTCCATAAGTTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	65863	120	-	647215	CAGAGACATGGATGTGCATGAGTCTATGATTGATGTTTGCACGAGTATTGTCTACTTAGTAACAATAGATTGGGCAAGTCTTGCCTTATGAGTTACAGTAAAAATTATTCCCTAAGGTAC

a
s	mr.mrrefChr3	140140	49	+	181019	TCTGCAGAAGTCTCAGTCCTCAATATACACCACCAACTTGCCTCTACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591418	49	+	636262	TCTGCAGAAGTCTCAGTCCTCAATATACACCACCAACTTGCCTCTACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	65983	49	-	647215	TGTACTGAAGTCTCAGACTTCAACATACACCTCGAATATGCATCTACCA

a
s	mr.mrrefChr3	140189	53	+	181019	AACAGGTAGGATATTTATGCCTTTCCTGCACGGATGAAAATGAATCTTCTTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591473	53	+	636262	AACAGGTAGGATATTTATGCCTTTCCTGCACGGATGAAAATGAATCTTCTTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66032	53	-	647215	AACAGGTGGGATGTATATTCATTTCCTGGATGGATGAGAACAAATTCTCTAAA

a
s	mr.mrrefChr3	140242	71	+	181019	GATCATACTGGGGTGCCCCAGATATTCTATTATTCAGCAATTCCCTAGCTCCCATACAACATCAAAGGTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591526	71	+	636262	GATCATACTGGGGTGCCCCAGATATTCTATTATTCAGCAATTCCCTAGCTCCCATACAACATCAAAGGTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66086	71	-	647215	GATCAGACGGGGGTGCCCTAGTGATTCTATTATTCAGCAATCCTCTAACTCCCATACAACACCAAAGGTTG

a
s	mr.mrrefChr3	140313	107	+	181019	TCTTGGCTTGGTGTGATCCATCATCTTAATCCCCCAGTCTGATAAACAGGGTGGTTCAATAAACAAGGGCGCAATCCAATGTCCCCCAGACTGATAAGCAACTAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591597	107	+	636262	TCTTGGCTTGGTGTGATCCATCATCTTAATCCCCCAGTCTGATAAACAGGGTGGTTCAATAAACAAGGGCGCAATCCAATGTCCCCCAGACTGATAAGCAACTAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66185	107	-	647215	TCCTTGTTTGGTGGAATCCATCATCTTAATCCTCCAGTCTGATAAACGGGGGGGTTCAATAAACAAGAGTGCAATCCAATGTCCCCCACACCAATAACCAACTGAAA

a
s	mr.mrrefChr3	140420	18	+	181019	TCCAGTTGTAATACTCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591704	18	+	636262	TCCAGTTGTAATACTCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66296	18	-	647215	TCCAGCTGTAATACTCTA

a
s	mr.mrrefChr3	140438	11	+	181019	TGTATCCGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591722	11	+	636262	TGTATCCGTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66319	11	-	647215	TGTATCCGTCA

a
s	mr.mrrefChr3	140449	26	+	181019	CTGATAGCCAATTCAAGGGGTTTCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591739	26	+	636262	CTGATAGCCAATTCAAGGGGTTTCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66330	26	-	647215	CTAATAGCCAATTCAAGGAGTGTCAG

a
s	mr.mrrefChr3	140475	81	+	181019	TCATACTTTATATATGAGAACAAGATTGAAGGGACACAGAGTGCTATTTTGCATCACCCAATATCAGAAATCCATATCTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591765	81	+	636262	TCATACTTTATATATGAGAACAAGATTGAAGGGACACAGAGTGCTATTTTGCATCATCCAGTATCCGAAGTCCATATCTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66359	81	-	647215	TCATACTTTATATATGCAAACAGGATTGATGTGACACAGAGTGCTATTTTGCATCACCCAATATCAGAAATCCATATCACT

a
s	mr.mrrefChr3	140556	201	+	181019	CTATGGTGGGAGACATTAGATAGGATGACATTCACGCTAGACAAACCATCCTCACTGTTGTCAAAAGTACAATAGTGCTCTGCATTACCAGTACAAGACGTCTGTTTGATTTCTTCTTCTGCCATCTAGGGGACATCTTCTGTTTAGCTCTTCCTATACATATTTTTAGTTGCAATCCATGGCATTGGATCGGGACTCTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	591846	201	+	636262	CTATGGTGGGAGACATTAGGTAGGATGACATTCACGCTAGACAAACCATCCTCACTGTTGTCAAAAGTACAATAGTGCTCTGCATTAGCAGTACCAAAAGTCTGTTTGATTTCTGCTTCTGCCATCCAGGGGACATCTTCTGTTTAGCCCTCCCTATACATATTTTTAGTTGCAATCCATGGCATTGGATCGGGACTCTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66442	155	-	647215	CTATGGTGGGAGACGTTAGATAGGATGACATTC----------------------------------------------CTGCATTACCAGTACAAGACGTCCATTTGATTTCTTCTTCTTTCATCTAGGGGGCATAGACTGTTTATCTATTCCTATACATATTTCTAGTTGCAATACATGGCATTGGATAGGGACTCTGT

a
s	mr.mrrefChr3	140757	16	+	181019	GGCTGTCCTTATTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	592048	16	+	636262	GGCTGTCCTTATTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66597	16	-	647215	GGCTGTCCATATTTTT

a
s	mr.mrrefChr3	140773	250	+	181019	AGCTCCAGTACATGGCATTCGATAGGGTGCTACATTTATTTATATCCCCTAGTGAGGGCTAAAACTAGTCACATTACCTGGTACATTACACAATTAAACCAGATTTAGGGTCTGCTCTGATGGTTTACATAGTCTGATTTATCCCTATGGTGATGCTGGCTCAATTACTCCAACCTTTTGGTTTACAGTAGTTGAGGATAAGTGATAATGGACTTATGTTATTGTCTTACAATTTCTCTATTTATCCCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	592066	250	+	636262	AGCTCCAGTACATGCCATTCTATAGGGTGCTACATTTATTTATATCCCCCAGTGAGGGCTAACACTAGTCACATTACCTGGTACATGACACAATTAGACCAGATATAGGGTCTGCTCTGATGGTTTACATGGTCTGATTTATCCCTATGGTGATGCTGGCTTAATTAGTCCAACCTTTTGGTTACCAGTAGTTGAGGATAAGTGATAATGGACTTATGTTATTGTCTTACAATTTCTCTATTTATCCCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66613	240	-	647215	AGCTGCAATACATAGCATTCGATTGGGTGCTACATTTATTTATATGCACTAGTGAAGGCTAAAACTAGTCTCATTACCTGGTATGTTACACAATCAAATCA-ATTTAGGGTCTGCTCCGATGGTTTACATAGTCTGATTTAACCCTATGGTGGTGCTCATTCATCTACTCCAACCTTTTGGTTTACAGTAATTGAGGATAAGTGATAATGGACTTGTGTTATTGTCTTACAATTTCTCTAT---------

a
s	mr.mrrefChr3	141023	53	+	181019	TCTAATTTATGTAGAGGTGGATAACCCAACCTATGAACATCCTACGCCCAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	592319	53	+	636262	TCTAATTTATGTAGAGGTGGATAACCTAACCTATGAACATCCAACGCCCAAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66853	27	-	647215	-------------------------CCAACCCATGAACATCCTACGCCCAAG-

a
s	mr.mrrefChr3	141076	61	+	181019	GAAGAGGCAAGATCAGTATGTATGCCATCTCCATGACTAGTCAGACAGTCTTGACACACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	592372	60	+	636262	AAAGAGGCAAGATCAGCATGTATGCCATCTCCATG-CTAGTCAGACAGTCTTGACACACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67225	59	-	647215	gaagAG--AAGCTCAGTATGTATGACATCTCCATGACTTGTCAAACAGTCTTGACACACAA

a
s	mr.mrrefChr3	141137	113	+	181019	CTCGGCTAACATCAAGAAAGACTTAATAATATCATGACAAAGTTACCTTGAAGAAAAGTTACCTTCATAGAGATTCAGCAAAGCCTGCAACCATATTTAGAATGAGCTAAATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	592432	113	+	636262	CTTGGCTAACATCAAGAAAGACTTAATAGTATCATGACAGAGTTACCTTGAAGAAAGGTTACCCCCATAGAGATTCAGCAAAACCTGCAACCATATTTAGAATGAGCTAAATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67298	113	-	647215	CTCGGCTAACATCAAGAAAGACTTAATAATATCATGACAAAGTTACCTTGAAGAAAAGTTACCTTTATAGAGATATGGCAAAGCCTCCAACAATATTAAAGCTTGACTGGAGC

a
s	mr.mrrefChr3	141250	4	+	181019	TCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	592551	4	+	636262	TCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67411	4	-	647215	ACAT

a
s	mr.mrrefChr3	141254	98	+	181019	GAGCTAAGTCTTGCTATCTCAACACTAACCCCAGGCTGGCAAGGCAGATATCCATGATGAATACATATAAGAGGTGCACCTGAAGCTAAGTAGAACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	592555	98	+	636262	GAGCTAAGTCTTGCTATCTCAACACTAACCCCAGGCTGGCAAGGCAGATATCCATGATGAATACATACAAGAGGTGCACCTGAGGCTAAGTAGAACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67419	97	-	647215	GAGCTAAGGCTTGCTATCTCAACGCTAACCCCAGGCTGGCAAAGCATACATCCATGATGAA-ACATATAAGAGGTGCACCTGAAGTTAAGTAGAACTG

a
s	mr.mrrefChr3	141352	64	+	181019	TGGCACACTTTGGGTAGCCATGACTTGCACCTGAATGAGGTTACTCAGAGGCCATTAGTGGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	592666	64	+	636262	TGGCACACTTTGGGTAGCCATGACTTGCACCTGAATGAGGTTACTCAGAGGCCATTAGTGGATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67516	64	-	647215	TTGCACACTTTGGGTGGCCATGACTATCATCTCAATGAGGTTATTCAGACATCATTGGGGGATG

a
s	mr.mrrefChr3	141416	31	+	181019	CAGTCAGTAATAAGGGGATGTTCAAGTAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	592730	31	+	636262	CAGTCAGTAATAAGGGGATGTTCAAGTAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67583	31	-	647215	CAGTTAGTAATAAGGGGATGTTCAAGTAAGT

a
s	mr.mrrefChr3	141447	11	+	181019	CAGGTTGTCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	592761	11	+	636262	CAGGTTGTCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67648	11	-	647215	CAGGTTGTCTT

a
s	mr.mrrefChr3	141458	46	+	181019	TTGAGTACCATTAAGTATTGAGTATGGGTCTTGTATTTTAGATCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	592772	46	+	636262	TTGAGTACCATTAAGTATTGAGTATGGGTCTTGTATTTTAGATCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67707	46	-	647215	TTGAGTACCATTGAGTATTGAGTATGTGTCTTGTATTTTGGATTTG

a
s	mr.mrrefChr3	141504	50	+	181019	ATAATACTCCCATAAAATATTATGTTATACACAGTCACTTGTGAATTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	592836	50	+	636262	ATAATACTCCCATAAAAGAACATATTATACACAGTCACTTGTGAATTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67753	49	-	647215	ATAATACTCCCATAAAATATTATGTTATACACAGTC-CTTGTGAATTGAG

a
s	mr.mrrefChr3	141554	297	+	181019	GATATATGGCCCTCCTCATACTGAAAAATTGAGACTGCACACCTTGCCCCTTTTTAGCAATAGTGACACCCAAGGGTGACTAAGATCATTGGTATGTTGTCCCTGCAAAAAGCTTATGCCTGCGAATCAGCAATCCACATCATAATAGTTTCTTCACTAGGAGATGGTAAGCACAATGGTCCCAGGCAAATGCTAATTGAGGTAGGGTGCAGGTAGACATTTTGATCTCTAATTGAAGGGAGAAGCTCGTTGGAGAATCGAAAAAGAACTGAACCAGTGGACACCTCATAATTTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	592958	293	+	636262	GAAATATGGCCCTCCTCATACTGGAAAGTTGAGACTGCATACCTTGCCCCTTTTCAACAATAGTGACACTCGAAGGTGACTAAGACCATTGGTATGTTGTCCCTGCAAAAAACTTATGCCTGCAAATCAGCAATCCACATTATAATGGTTTCTTCACTAGGAGATGGTATGCACAATGGTCCCAGGTAAATACTAACTAAGGTAGGGTGCAGGTAGACATTTTGATCTCTGAT----GGGAGAAGCTTGTTGGAGAATCAAAAAAGAACTGAACCATTGGACACCTCATAATTTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67802	292	-	647215	GATATATGGCCCTCCTCATACAGAAAAATTGAGACTGCACATCTTGCCCCTTTTTAGCAATAGTGACCCCCAAGGCTGACTAAGTTCATTGGTATGTTGTCCCTGCAAAAAGCTCATGCCTATGAATCAGCAATCCACATCATAACAGTGTCTTCACTAGGAGATGGTAAGCGCAATGGTTCCAGGCGAATGCTAATTGAGGTAGGTTGCAGGTTGACATTTTTATCTCTAATTGAAGGGAGAAGCTCGTTGGAGAAGTGAAAAA-----GAACCAGTGGACACCTCGTAATTTTTT

a
s	mr.mrrefChr3	141851	25	+	181019	GGTAGTCATATTATCTTTCTCCTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	593251	25	+	636262	GGTAATCATATTATCTTTCTCCTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68124	25	-	647215	GGTAGTCATGTTATGTTTCTCCTCA

a
s	mr.mrrefChr3	141876	12	+	181019	CTCAGTGTCTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	593276	12	+	636262	CTCAGTGTCTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68155	12	-	647215	CTCAGTCTCTAA

a
s	mr.mrrefChr3	141888	95	+	181019	ATGGACTTGGACTGTTTCACATTGACAGCCCATTTGTGAAAGTAGTCCATGCAAATGGACTATGTAGCCTGATTAGGATCTTAAAGAACTCCATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	593288	95	+	636262	ATGGACTTGGACTGTTTCACATTGACAGCCCATTTGTGAAAGTAGTCCATGCAAATGGACTATGTAGCCTGATTAGGATCTTAAAGAACTTCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68171	95	-	647215	GTGGCCTTAGACTGTGTCACATTGACAGCCTATCGGTGAAAGCAGTCCAAACAAATGGACTAGGTAGCCTGCTTAAGATCTTAACCAACTCTATA

a
s	mr.mrrefChr3	141983	45	+	181019	CCTGTCTCGGGGTCTGGGAGTGGGAGACTGGGATGGTTTAAACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	593383	45	+	636262	CCTGTCTCAGGGTCTGGGAGTGGGAGACTGGGATGGTTTAAACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68403	45	-	647215	TCTGTCTCGGGGTCTGAGAGTGGTAGACGGGGATGGTTTAAACAA

a
s	mr.mrrefChr3	142028	235	+	181019	ATATCAGAGCCTTTGGATGCTCTGCTTAGTCTTGATTCAATAAGCTGGATCTTATCCCAGTGAAGTTGTAACACATCTCTACAGAGCTCTAGACATTCTGAGATATGAGGAAGTTGACATGGCCTCATTGTCCAAAGCAGTTCCTGAATCCTTGAAGAAATACACTAAGTGCAGGGAATTGGCAGAAAGACTGAAGATAGAAGGTCAGGGTCAAAAGTGCCTTTTAAACCACACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	593428	235	+	636262	ATATGGGAGCCTTTGGGTGCTCTGCTTAGTCTTGATTCAATAAGCTGGATCTCATCCCAGCAAAGTTGTAACACTTCTCTACAGAGCTCTAGACATTCTGAGATATGAGGAAGTTGACATGGCTTCATTGTCCAAAGCAGTTCCTGAATCCTTGAAGAAATACACAAAGTGCAGGGAATTGGCAGAAAGACTAAAGATAGAAGGTCAGGGTCAAAAGTGCCTTTTAAACCACACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68449	232	-	647215	ATATCAGAGCCTTTGGATGCTCTGCCTACCCTTAGTTCACTAAGCTGGATCTTAGCCCAGTGAAGTTGTAACATACTTCTACAGAACTCTAGACATTCTGAGATATGAGGAAGTTGACATGGCCTCATTGTCCAAAGCAGTTCCTGAATCCTTGAAGAAATACACTAAGTGCAGGGAATTGGCAGAAAGACTGAAAATAGAAGGTCAGGGTCAAAAAT---TTTTAAACCACACA

a
s	mr.mrrefChr3	142263	180	+	181019	CTCTATTTAGAAGTGTGACCTAATTACACCCTACTGATGTCTTAGCTATCAAATATGCCCCTTCTCAAACATGTCACTCAGACTACCTGTTTAATTGGATATAGGTATTAAACCCATGCTTTCTCATGGACACTGAGACTAGGTTAATGTCTCCATTACTGGAGTACATGTTACATGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	593663	180	+	636262	CTCTATTTAGAAGTGTGACATTATTACACCCTACTTATGTCTTAGCTACCAAACATTCCCCTTCTCAAACATGTCACACAGACTATCTGTTTAGTAGAAAATAGGTATTAAACCCATGCTTTCTCATGGACACTGAGGCAAGGTTAATGTCTCCATTACTGAAATTCATATTACATGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68685	180	-	647215	CTCTATTTAGAAGTGTGACCTAATTAGACCCCACTGATGTCTTACCTATCAAATATGCCCCTTATCAAATATGTCACTTAGACTACCTGTTTAATTGGATATAGGTATTAAACCCATGCTTTCTCATGGACACTGAGACTAGGTTAATGTCTCCATTACTGGAGTACATGTTACATGATT

a
s	mr.mrrefChr3	142443	165	+	181019	TACCTTGCATATCCTTGTAACAGGAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAAAAATGCATATTCTACAGAACCATCCATAACATGTTCTCAATGAGATGAATATGATGCTAAATCTAGAAGTGCCTACCATAGCATCATAGATCATTTTAGAGCAACACATAGAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	593843	160	+	636262	TAGATTGCATATCCTTGTAACAGAAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAAAAATGCATATTCTCCAGAGCCATCCGTATCCTGTTCTCAATAAGATGAA-ATCATGCTTAA--GGGAAGTGCTTACCATAGCATCATAGATCATTTTAGAGCAACA--TAGAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	68873	165	-	647215	TACCTTGCAGATCATCTGAACAGGAATCCTGTAAATCTATTAAGGCAATAACAATACATAGTCTACTGAACCATCCAGAACATGTTCTCAGTGAGATGAGTAGGAGGCAAAATCTAGAAGTCCCTACTGTCGCATCATAGATCGTTTTACAGCAACACATAGAAG

a
s	mr.mrrefChr3	142608	114	+	181019	TGATGTACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGCTCCTCACCTATGGCAAATAACGCCTCTTTAGCAGTAAGTTAACTGTCTGATTGAATTTGACCTTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	594004	114	+	636262	TGATGAACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGCTCCTCACCTCTGGCAAATAACGCTTCTTTGGCAGTAAGTTAATTGTCTGATTGAATTTGACCTTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69038	110	-	647215	CAAAGTACAAACAGTTCTGTGGACTGCTATTATGGTCATTGTCATGGTCCTCACCTATGGCAAA----ACCTTGTTACCTTTTAATGAACTGATGGATTTCAACTAGGCCTATT

a
s	mr.mrrefChr3	142722	86	+	181019	GCTTTTTAATGGACTGATGGGCTTCGCCTATGCCTATTTGATGGCATATCTAACATGTACATAGGGTTTTATGTTATCCACTTTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	594118	86	+	636262	GCTTTTTAATGGACTGATGGGCTTCGCTTATGCCTGTTTAATGGCATATCTAATATGTACATCGGGTTTTATGTTATCCACTTTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69175	84	-	647215	GTTTGATTATCCACTTTTGGGCTTCACCTATGCCTATTTGATAGCATATCTCACATGTACATAGGGTTTGA--TTATCCACTTTAG

a
s	mr.mrrefChr3	142808	128	+	181019	AATTTCTTTTTATTGATGAATTACTGTTTATGCCAAAACTATAAGACTGTTTTCCATATTTGGAGTGAGTCCTGGGTGAGTTTCCCCAGCTGTGTTGCTATTATTTCTGCCCCTGTATGGGATACCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	594204	128	+	636262	AATTTCTTTTTATTGATGAATTCCTGTTTATGCCATAACTATAAGACTGTTTTCCATATTTGGAGTGAGTCCTGGGTGATTTTCCCCGGTTGTGTTGCTATTATTTCTGCCCCTGTATGGGACATCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69272	124	-	647215	AACTTCTTTTTATTCATGAGTTACTGTTTATGCCAAAACTTTAAGACTATTTTCCATGTTTGGGGTGAGTGCTGGGCAAGTTTCCCCAGCTGTCTTGCTATTATTTTT----CTGTATGGAATACGCA

a
s	mr.mrrefChr3	142936	40	+	181019	TGGTGGGCCATGTACCATGGCACTTAGAAAATCAGTTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	594332	40	+	636262	TGATGGGCCATGTACCATGGCACCTAGAAAATCTGTTGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69398	40	-	647215	TGGTGAGCCATGTACCATGGCACTTCGAAAATCAGTTGTG

a
s	mr.mrrefChr3	142976	135	+	181019	GGCTATTTACTTTGGTCAATGGTACTCCTGAATAGAAAAAAAGTCTTGAGACTCCCCAAGTGGTGAGTTGTCCCCATAAAATGGCAAACTGGACCCTTTGATTTGTTTTCTGTACGTAAAGGACTGCAGCTGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	594372	135	+	636262	GGCTATTTACTTTAGTCAATGGTACTCCTGAATAGAAAAAAAGTCTTGAGACTCCCCAAGTGGTGAGTTGTCCCCATAAAATGGCAAACTGGACCCTTTGATTTGTTTTCTGTACGTAAAGGACTGCAGCTGGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69583	135	-	647215	GGCTATTTACTTTGGTCAATGCCACTCCTGAATAGAAGAAGACTATAGAGACTCCCAAATTGGTGAGTTGTCTCCATAAAATGTCAAACTGGACCCTTTAGTCTGTTTTTTGTACATAAAATATTGCAGCAGGAG

a
s	mr.mrrefChr3	143111	24	+	181019	TCCATTGAGTTGGCTATTAGTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	594509	24	+	636262	TCCATTGAGTTGGCTATTAGTCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69718	24	-	647215	TCCGTTGAGTCGGCTATTAGCCCA

a
s	mr.mrrefChr3	143135	31	+	181019	ATGGGAGTGCACAAACTGTGGCACTAAGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	594533	31	+	636262	ATGGGAGTGCACAAACTGTGGCACTAAGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69748	31	-	647215	ATGAGAGTGCACAAACTGCAGGAGTAAGACG

a
s	mr.mrrefChr3	143166	36	+	181019	CCAGGAGATACATGGAATCCCTGGCCCCTCTGTAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	594576	36	+	636262	CCAGGAGATACATGGAATCCCTGGCCCCTCTGTAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69779	36	-	647215	CCTGGAGCTACATGGAATCACTAGCCCCTTCGTAAC

a
s	mr.mrrefChr3	143202	134	+	181019	TGGATGCTATACCACGTGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCCCAGATATAGTGAACTAGTCATTCGTAAAGCCAAACTGCAGGCCCTGTTTATGTGCTTCTTGTGCATCTAGGCTTACGAGAGAGGTTTGTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	594621	132	+	636262	TGGATGCTATACCACGTGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCCCAGATATAGTGAACTAGTCATC--TAAAACCAAACTGCAGGCCCTGTTTATGTGCTTCTTGTGCATCTGGGGTTACAAGAGAGGTTTGTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69815	122	-	647215	TGGGTGCCTTACCACATGAAATCCCTTGCCAGCCTCTTCAGCACAGGTATAGTGAACTAGTCATTCGTAAAGCCAAAGTACAGGTCCTGTTTATGAGCTTCCTGTGCACCTAGGCTTACGAG------------

a
s	mr.mrrefChr3	143336	9	+	181019	GCTCACTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	594757	9	+	636262	GCTCACTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69937	3	-	647215	------TCT

a
s	mr.mrrefChr3	143345	224	+	181019	CTTAGTCTCAGCTTGGGGTGGCATGATACATCCTATACCATATGTCTCCACTTGCCAGATTGTGTAATGGGTACTAAGCCAAGCAAGTCAGACAAGTTATGAGTCAGCAACCAGTTGCCTAAGTTACTAGGTCTAATCTGGTAAAGTATAGTTCATTTGAGGTATTTCAAATGACTTTGAGCTATGCAGACTGTACCTGAATGCAATGCAACGTGGTGCATTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	594767	223	+	636262	CTTAGTCTCAGCTTGAGGTGCCATGATACATCCTATACCATATGTCTCCACTCGCCAGATTGTGTAATGGGTACTTAGCCAAGCAAGTCAGACAAGTTATGAGTCAGCAACGAATTGCCTAAGCTACTAGGTCTAATTTGGTAAAGTATAGTACATTTGAGGGATTTCAAATGACTTTGAGCTATGAATAC-ATACCTGAATGCAATGCAACGAGGCGCACTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	69940	220	-	647215	CTTAATCTCA-CTTGGGGTGGCA--ATGCATTCTATACCACATGTCTCCACTTGTCAGAGTGTGTAATGGGTACTAAGCCAAGCACGTCAGACAGGTTATGAGTCAGCAACCAGTTCCATAAGTTACTAGGTCTAA-CTGGTAAAATATATTTAATTTTAGGTACTTCAAATGACTTTGAGCTATGCAGACTGTACCTGAATGCAATGCAACATGGTGCATTGC

a
s	mr.mrrefChr3	143569	18	+	181019	AAAAGCTCAGGTTTAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	594990	18	+	636262	AAAAGCTCAGGTTAAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70162	18	-	647215	AAAAGCTCAGGTTTAGCC

a
s	mr.mrrefChr3	143587	105	+	181019	AAGTTCCCCCACAGTAACAAGCCTCGAATGCATATAAAAGCCCCTCTATCTTTAAATGAATAGCCAAGGAGTACAACACACCATGAAACACACATATCAATCAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	595009	102	+	636262	AAGTTCCCCCACAG---CAAGCCTCGAATGCATATGAAAGTCCCTCTATCTTTAAATGAATAGCCATGGAGTATGACGCACCATGAAACACACATATCAATCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70180	93	-	647215	AAGTTCGCCCAGAGTAACAAGAC-----------TAAAAGCCCCTCTTTC-TTAAATGAATAGCTGAGGAGTACAACACACTGTAAAACACACATATCTACCAGT

a
s	mr.mrrefChr3	143692	22	+	181019	GTGACATTTCCTTAGGCAAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	595112	22	+	636262	GTGACATTTCCTTAGGCAAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70273	22	-	647215	ATGACATTCCCTTAGGCAAAAA

a
s	mr.mrrefChr3	143714	210	+	181019	GGGCTCAGAGGTAATGCTCAGGAATAGACAGTGTCACTGGGGTCAATTCAATTACTGCTAAGCTATAAGAACAATTGTGGATATGCTTGAAAACTAACAGATTCATTCAACCAATGCATGCATTCCATCTCTCAGATCACAAACAACAAATTGCTAGGAATCCTTACATAAGTAGCAGTTCCTAGGAGTTGGCACACCAGACCATGCCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	595135	210	+	636262	GGGCTCAGAGGTAATGCTCAGGAATAGACAGTGTCACTGGGGTCAATTCAATTACTGCTGAGCTATAAGAACAATTGAGGATATGCTTAAAAGTGGACAGATTCATTCAACCAATGCATGCATTCCATCTCTCAGATCACAAACAACAAATTGCTAGGAATCCTTACATAAGTAGCAGTTCCTAGGAGTTGGCACACCAGACCATGCCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70295	172	-	647215	GGGCTC-------------------------------------CAATTCAATTAC-GCTAAGCTATACGAACGATTGTGTATAGGCCTGTAAACTAACAGATTCATTCAAGCAATGCATGTGTTCCATCTCTTAGATCAGAAACAACAAATTGCTGGAGATTCTTACATAAGTAGCAGCTCCTAGGTGTTGACACACCAGATCTTGCCGT

a
s	mr.mrrefChr3	143924	42	+	181019	AGAGTTAATGTTTGTGTTAGTAGTCAGTTGTCAGCTGTCAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	595493	42	+	636262	AGAGTTAATGTTTGTGTTAGTAGTCAGTTGTCAGCTGTCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70467	42	-	647215	AGAGTTAATCTTTGTGCTAGTAGTCAGCTGTCAGCTGCCGGT

a
s	mr.mrrefChr3	143966	160	+	181019	GGTGCTATGCCAGGTGGGTCGTAGAAACCACACAGTGTTCATTTACTTAACTGATACCTGCCCCACGTGGCCATTTACAGACGGTCAGTGCTTTGCTACACCTTCCCCATGCAGCCATGTACACATGGTATCCCTTATCTAAATGAAAGCTAGGCATCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	595535	160	+	636262	GGTGCTATGCCAGGTGGGTCGTAGAAACCACACAGTGTTCCTTTACTTAACTGATACCTGCCCCACGCCGCCATTTACAGACGGTCAGTGCTTTGCTACGCCTTCCCCATGCAGCCATGTACACATGGTATCCCTTATCTAAAGGAAAGCTAGGCATCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70518	155	-	647215	GGTGCTATGCCAGGTGGGTCATAGAAACCACACAAGGTTCATTTACTTAACTGATACCTGCCCTGCATGGCCATGTACACACGGTCAGTGCTTGGATACACCTGCCCCGCACGGCCGTGTACACACGGTATCCCTTATCTAAATAAAAGC-----ATCCT

a
s	mr.mrrefChr3	144126	232	+	181019	GGGACACCTATCCATGGTAGATGTCATACCACCATATACAGATTTCAGCTCAACCAGGCAGACTGCAGAGTCGTAATATCATGGCCAGAGCTCACCGTATGATATAGAGTCTTAGGACCATATAAAGGCTATAGGGATTTTAGTGCCTATTGTGGTCAAATCCCGTGTTTAATAATTAGGCAGATCAGTTTTTGTCATTCATTTAAAATCCATACCCTGTCAGGCTCAGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	595696	232	+	636262	GGGACACCTATCCATGGTAGATGTCATACCACCATATACAGATTTCAGCTCAACCAGGCAGACTGCAGAGTCGTAATATCATGGCCAGAGCTCACCTTATGATATAGAATCTTAGGACCATATAGAGGCTATAGGGCTTTTAGTGCCTATTGGGGTCAAATCCCGTGATTAATAATCAGGCAGACCAGTTTTTGTCACTCATTCAAAATCCATACCTTGTCAGGCTCAGGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70673	218	-	647215	GGGACACATATCCATGGTATATGACATACCACCATTTACAGATGTCAGATCAACCATGCGGACTGCAGAGTCGTAATATC------------CACTGTATG--ATAGAGTTTTAGGGCCATATTAAGGCTATAGGGATTTTAGTGCCTATTGTCATCAATTCCCCTGTTTAACAATTAACAAAATCAGTGTTTGTCATTTATTTAAAATCCATACCCTGTCAGGCTAACAGT

a
s	mr.mrrefChr3	144358	338	+	181019	TTGTAACTACAGGTTATTGGTACTGACCCAACATGACCATTGAAGCATGCCAACCTTGTAAACAACACAGTAAACCTAGATTTTTAGCCTCAATACACACTCTACATAGTCTTATGATTCTAAAACATCATTGTTACTTATATCTTGATCCGAACTGCACCCAGTTTCTTGATCACTATTGTATAGTTATAAGTGTTATAGAATACAGAGTTCAATGGTTGAGGTGATGACAAATTGCATAATGGTAACAAAGACATGAGACTATTTATATCCTGTATTACATAAGGATTATTGGTCTAAGATACTGGCATAGGAAATTTTGCATGTCATCTTAGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	595931	338	+	636262	TTGTAACTACAGGTTATTGGTACTGACCCAATATGACTGTTGAAGCATGCCAACCTTGTAAACAACACAGTAAAACTAGATTCTTAGCCTCAATACACACTCTACACAGTCTTATGATTCTAAAACATCATTGTTACTTATATCATGACCCAAACTGCACCCAGTTTCTTGATCACTGTTGTATAGTTATAAGTGTTATAGAATGCAGAGTTCAATGGTTCATGTGATGACAAATGGCATAACGGTAACAAAGGCATGAGAGTATTTATATCCTGTGTTACATAAGGATTATTGGTCTAACATACTGGGATGGGAAATTTTGCATGTCATCTTAGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	70891	311	-	647215	--------------------------CCCAACATGACCATTGCAGCATGGCAACCTTGTAACCAACACAGTTTACCTTGATTTTTAGCTTCAATACACACTCTGCATGGTCTTATGATTCTAAAGCATCATAGTTACTGACCTCTTGATCCGAACTGAACCTGGTTTCTTGATCACTATTGTATAGTTAATAGTCTTATAGAATAGAGAGTTCAATGGTTGAGGTAATGAAATATTGCATAATGGTAACAAAGACATGAGACTATTTATATCCTATATTACATAA-AATTATTGGTCCAAGTTACTGGCATAGGAAATTTTGCATGTCACCTTAGCTG

a
s	mr.mrrefChr3	144696	292	+	181019	ATGAGAGCAACACTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGAGTATAATAATTGCTACATATGTAATCCTAGCTTTATGAAGTCCACAATTTGAACAATATATAGTGGAAAGAGAAAGAATTGCATACATGCAATACATGACACAAATGATAATCTGACAGTTATATTATCCCTATCTGTAGCAATTACATGGTGCATGATGGCCCCCTCACTTGGTTAGGCAGGACAAAGACTGAATGCCTTTAAGGAGGTTTATCCTCAATTTCTGTTGCCAATGACCAAACAGGAAAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	596271	292	+	636262	ATGAGAGCAACATTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGAGTATAATAATTGCTACATATGTAAACCTAGCTTTATGAAATCCACAATTTGAACAATATATAGTGGAAAGAGAAAGAATTGCATACATGCAATACATGTCACAAGTGATATTCTGAAAGTTATATTATCCATATTTGTAGCAATTACATGATGCATGATGGCCCCCCCACTTGGTTGGGCAGGACAAAGACTGAATGCCTTTAAGGAGGTTTATCCTCAATTTCTGTTGCCAATGAACAAACAGGAAAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	71202	279	-	647215	ATGAGAGCAACACTTCACATCCTGAATGAGAGTAGAAGTGTGTATAATAATTGCTACATATGTAATCCTAGCTTTATGAAGTCTACAATTCGAACAATATATGGTGGAAAGCAAACGAATTGCATAGATGCAATACATGACACCAATGATAATCTGACAGTTATATTCTCCCTATCTGTAGCAATTACGTGGCGGAAGATGGTCCCCTCACTTGGTTAGGCAGGGCAAAGACTGAATGCCTTTAAGAAGGTTTATGCTC-------------AACAACCAAACAAAAAAACC

a
s	mr.mrrefChr3	144988	40	+	181019	ATACATAATAATTGCAGAATTCCATTATTATGAATCAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	596574	40	+	636262	ATACATAATAATTGCAGAATTTCATTATTATGAATAAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	71481	40	-	647215	ATACATAATAATTGCAGAATTCCATTATTATGAATCAGTT

a
s	mr.mrrefChr3	145028	28	+	181019	CATTCTGAGGACAATCTAGCCAATCTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	596614	28	+	636262	CATTCTGAGGACAATCTAGCCAATCTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	71522	28	-	647215	CATTTTGAGGACAATCTAGCCAAGCTGT

a
s	mr.mrrefChr3	145056	85	+	181019	ATATACACATTTAATGCAGATACGGCAGCATCCCTGGCCACCCAATACCAAATTGAAAAGCTCAGGATGGATCCTACTACTCCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	597072	79	+	636262	ATATACACATTTAATGCAGATACAGCGGCATCCCTGGCCACCCAATACCAAATTGA------CAGGATGGATCCTACTACTCCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	71550	73	-	647215	ATATATAC------------TAAGGCAGCATCCCTGGCCACCCAATATCAAATTAAAAAGCTCAGAATGGATCCTACTACTCCTC

a
s	mr.mrrefChr3	145141	75	+	181019	TCTGTAAAAGAGTGCCTCTTAATATGCATTATCACTTAGCTGGACTGTCTGAGCCTGAGGTCTCATTCTCCACGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	597154	75	+	636262	TCTGTAAAAGAGTGCCTCTTAACATGCATTATCACTTAGCTGGACTGTTTGAGTCTGAGGTCTCATTCTCCACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	71623	75	-	647215	TCTGTAAAGGGGTGCCTCCTAATATGCATTATCACTCAGCTGGACTGTCTGAGCCTAAGGTCTCACTCCTGAGGT

a
s	mr.mrrefChr3	145216	30	+	181019	CTCACTCTCTCCATACAATTATACTATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	597230	30	+	636262	CTGGTATTGTCTTTACAATTACACTATCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	71698	30	-	647215	CTCACTCTCCCCATGCAATTATACTATCAA

a
s	mr.mrrefChr3	145246	149	+	181019	TGTAGTTTAATGAGGATAAGAAAATGGTGCCATATTTACATTTATGAATTAGGAAATGTAGTTGCTACTTTGAACAGACATTGACCAACATGCCTGAAAGAGAACTGAATCTTAATATCTTTAATGCAAGCCTCACTATCTATCATGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	597261	149	+	636262	TGTAGTTTAATGGGGATAAGAAAATGGTGCCAGATTTACATTTATGAATTAGGAAATATAGTTGCTACTTTGAGCAGACATTGACCAACATGCCTGAAAGAGGACTGAATCTTAATATCTTAAATGCAAGCCTCACTATCTATCATGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	71728	138	-	647215	TGTAGTTTAATGAGGATAAGAAGATGGTGCCATATCTAGATTTATGAATTAGGAAATGTAGTTGCTACTTTGGACAGACACTGACC-----------AAGAAAAGTGAATCTTAATATCTTTAATGCAAGCATCCATATCTATCATGAG

a
s	mr.mrrefChr3	145395	15	+	181019	AGCCAACAATGGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	597410	15	+	636262	AGCCAATAATTGCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	71893	15	-	647215	GACCAACAATGGCTT

a
s	mr.mrrefChr3	145410	97	+	181019	TTATCACACAAAGCCATGATGCTTGAGTAGAGTAACGGCATGTGATCATGCTTGTCAATGTTCACCTGTCTAAGTCTGTGCCAAGAAGTGTGCCTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	597426	88	+	636262	TGATCACACAAAGCTATGATGCTTGAGTAGAGTAACGGCATGTGATCATGCTTATCAATGTTCACCTGTCTA---------CAAGAAATGTACCTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	71908	94	-	647215	TTATCACAC---GCCATGATGCTTGAGTAGAGTAGCAGCAGGTGATCATGATTGTCAATGTTCACCTGTCTAAGTCTGTGCCAAGAAGTGTGCCTGT

a
s	mr.mrrefChr3	145507	88	+	181019	CCACCACCTATACTTTTTGTTTGCATCTTTGCTTATGTCAAACCCAGCCCCAGATAGTTCAAATTACTGAAAGAGGGATGTTGTCTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	597516	85	+	636262	CCATCACCTATACTTTTTGTTGGCATCTTTGCTTATGTCA---CCAGCCCCAGATAGTTCAAATTACTGAAAGAGGGATGTTGTCTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72002	88	-	647215	CCACCACCTATACTTTATGCTTGCATCTTTGCTTATGTGAAACCCAGCCCCAGGTGGTTCAAATTCCTGAGAGAGGTATGTTGTCTAC

a
s	mr.mrrefChr3	145595	39	+	181019	CAGAGAGGTGTGTTTGCTAGATAAACCCTCGTAGCTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	597601	39	+	636262	CAGAGAGGTGTGTTTGCTAGATAAACCCTCGTAGCTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72091	39	-	647215	CAGAGAGGTGTGTTTGCTAGATCAACCCTTGATGGTGCA

a
s	mr.mrrefChr3	145634	15	+	181019	CCAATCAATCTATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	597641	15	+	636262	CCAATCAATCTATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72130	15	-	647215	CCCATCAATCCAGTT

a
s	mr.mrrefChr3	145649	120	+	181019	TATATACATAAACTATTTGCAACTTGATCTATTGTACATACCTAAAGTACTGTAGCTGGTGCCCTATGAGTTGGCTATCAGCCTCAGATTCATGGAGACTGGACGCTCATTTATTAAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	597727	120	+	636262	TATATACATAAACTATTTGCAACTTGATCTATTGTACATACCTAAAGTACTGTAGCTGGTGCCCTATGAGTTGGCTATCAGCCTCAGATTCATGGAGACTGGACGCTCATTTATTAAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72145	120	-	647215	TGTATACGTAAGTTAGGTGCATCTTGATCTATTGTACATACCTAAAGTATTGTAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGGCTATCAGCCTCAGAGCCATGGAGAGTGGATGCTCATTTTTTCAACT

a
s	mr.mrrefChr3	145769	57	+	181019	GGAGGAGAAGGATAGAATCGACCCAACCAGGATGGAATCCTTAGCTACCTCGTTAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	597848	57	+	636262	GGAGGAGAAGGATAGAATCGACCCAACCAGGATGGAATCCTTAGCTACCTCGTTAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72265	57	-	647215	GGAGGACAAAAATGGAATTGACCCAATCAGGATGGAATCGTTAGCTCCCTTGTTAAT

a
s	mr.mrrefChr3	145826	214	+	181019	GAAGGAATAGCATGATGGATCCACCAACCAATGAGCTACATTGTGGATGAGATACCTCACTGGCCTGTAGAGACATGATAGGCATACAAAGTACAGCCATGAGGGAACACCTAATATGCAAATACCCATTATCTGTAGGCCCACTTCCTATGGTTCATCCCTGTGTTTAATCTAGCCCTCAAGGCATAATAGCCATAGTGGTTTGACCCTAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	597905	214	+	636262	GAAGGAATAGCATGATGGATCCACCAACCAATGAGCTACATTGTGGATGAGATACCTCACTAGCCCGTAGAGACATGATAGGTATACAAAGTACAGCCATGAGGGAACACCTAAGATGCAAATACCTATTATCTGTAGGCCCACTTCCTATGATTCATCCGTGTGTTAAATTTAGCCCTCAAGGCATAATAGCCATAGGGGTTTGACCCTAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72326	212	-	647215	GAAGGAATAGTCTGATGGATCCACCAACCAATGAGCTACATTGTGGATGAGATACCTCACTGGACTGCAGAGACATGATAGGCACACAAAGTACAGCTATGAGGGAACACCTAATATGCAAATACCCATTATCTGTAGGCCCAC--CCTATGGTTCATCCCTGTGTTTAATCTAGCCGTCAAGGCGTAATAGCCATAGTGGTTTGACCCTAGCA

a
s	mr.mrrefChr3	146040	67	+	181019	GGCTTTCAGACCACAAAATCAAGAATATTCCCATAGTATAGTATATTGAGGAAGACATGGGATCTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	598121	67	+	636262	GGCTTTCAGACCACAAATTCAAGAATATTCCCATAGCATAGTATATTGAGGAAGACATGGGATCTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72538	67	-	647215	GGCATTCATACCTCAAAATCAAGAATAATCCCATAGTATAATATAGTGAGGAAGACGTGGAATCTTG

a
s	mr.mrrefChr3	146107	84	+	181019	TTGGCTCCTTGTTCAGTGGAATCAATCCCTCCAGTTCAATCGACGAAGGGGCTATGGTGAAGGTGGATTCAGTGAGTCTAAGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	598188	84	+	636262	TTGGCTCCTTGTTCAGTGGAATCAATCCCTCCAGTTCAATCGACGAAGGGGCTATGGTGGAAGTGGGTTCAGTGAGTCTAAGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72613	84	-	647215	TTGACTCCTCATTCAGCGAAATCCATCCCTGCAGTTCAACCGATGAAGGGGCTATGGTGAAGGTGGATTTAGTGGGTCTAATGA

a
s	mr.mrrefChr3	146191	35	+	181019	ATTCCAGTGCTTGCAGGAACTGCAGAGATACAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	598273	35	+	636262	ATTCCAGTGCTTGCAGGAACTGCAGAGATACAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72697	35	-	647215	ATGCCAGTGCTTGCAGGAAATGCAGAGATCCATCC

a
s	mr.mrrefChr3	146226	36	+	181019	TATATCATGTTCCACAGGTCCTATAAGCCCCAAGAC
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a
s	mr.mrrefChr3	146262	222	+	181019	TTAAGGGGTAATGACCACCCCAAGATTTCATCTTTGTTCAACCACTTTGACTCATCAACTCACAGGTTTTTCAAAGATTACTCCTGGAATACTACATTTGGATTCTAAACATTTACTTATGGTCATTTGTCATAGCTTTCACTTCCCTTGTCTATGATTTGCCTTGGCCATCATATGATTAGCACTTGTAGAATCAACCCCACCAATAAAGCACACTACAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	598347	222	+	636262	TTAAGGGGTAATGACCATCCCAAGATTTCATCCTTGTTTAACCGCTTTGACACATCAATTCACAGGTTTTTCAGAGATTGCTCCTGGAATACTACATTTGGATTGCAACCATTTACTTATGGTCATTTGTGATAGCTTTCACTTCCCTTGACTATGATTTGCCTTGGCCATCATTTGATTAGCACTTGTAGAATCAACCCCACCAATAAAGCACACTACAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72768	207	-	647215	TTAACAGGTAGTAATCACCCCAAGATTTCCTCTTTGTTCAACCACTTTAACTCATCAAC--------------AAGATTACTCCTGGAATACTACATTCAGATTCTGCACATTTACTTACAGTCATTTGTCATAGCTTTCAGTTCCCTTGTCTATGA-TTGCCTTGGCCATCATATGATCAGCACTTATAGAATCAACCCCACCAATAGAGCACACTACAAT

a
s	mr.mrrefChr3	146484	65	+	181019	CAGATTCGGAAACTGAGGGCAACCTTCAGACATCTATCTTCCTACGGCAAAAGAATTTAGGTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	598584	65	+	636262	CAGGTTCAGAAACTGAGAACAACCTTCAGACACCTATCTTCCTACGGGCAAAGAATTTAGATGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	72975	65	-	647215	CAGATTCGGAGACTGAGGGCAACCTTCAGACATGTATCTTCCTATGGCAAAATAATTTAGGTGAA

a
s	mr.mrrefChr3	146549	18	+	181019	CATATGGCTTGAAAATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	598649	18	+	636262	CATATGGCTTAAAAATAA
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	149097	65	+	181019	TTTCTGAAAGCCTTCTAGAAGGAGCTTCTAATCATCCAAACAAGGTCCTAGGTCAAGCATTACTC
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	149733	51	+	181019	tggctttcatataacatgtatcttagtctacgagcgtgcaacctcaggtca
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a
s	mr.mrrefChr3	149784	288	+	181019	tggcattaggacgtagcaccaatgttcaaggcaaaaaattttgatgtacaccaaacgcaactcgaaaggtcctaacttctagactctatgtatacaaattacatcttgtggagtGATGGTCAGATCTCTCCCCCCAGGTAGTTTTATCAGTTGTACTTTACTGCATGCACTGCGTTAGCAGGGTCACAATCAGGCACAATGCACTACTATGACTCTAGACACTGACAATCACTTTCCCTGCTCATCTTTTTATTGACAGATCTCCATGTCATCTGTCCTACTGCCCCC
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a
s	mr.mrrefChr3	150072	33	+	181019	CTTATCTGTTTCCAACTGTAAGCATACATGTCT
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	150320	144	+	181019	GAACTTATAAGTTGAGTGGATAGGTTGCCGGCAACTCAAGCGCAGTGGAACTTGTTTCCTCAGAAGTAGAAGTTTGCATACCAAAAAGCTACCTTCAATGGAACCTGTACAAAATTGGACATGTGTAGTTTCTACCAATTATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	602521	144	+	636262	GAACTTATAAGTTGAGTGGATAGGTTGCCGGCAACTCAAGCGCAGTGGAACTTGGTTTCTAAGAAGTAGAAGTTTGAATACCAAAAGGCTACCTTCAATGGAACCTGTACAAAATTAGACATGTGTAGTTTCTACCAATTTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	76891	144	-	647215	GAAGTTTTAAATTGAGCAGATGAGTTGGTGGTAACTCAAGCCCAGTGGAATTTGTTCCCTCAGAAGTAGAAGTTTGCATACTGAAAAGCTACCTTCAATGGAACCTGTACAAAATTGGACATGGGTAGTTCCTACCAATCATTT

a
s	mr.mrrefChr3	150464	31	+	181019	ACTTAGGTGGCTCACAATTAGCTTTCTCGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	602666	31	+	636262	ACTTGGGTGGCTCACAATTAGCTTTCTCGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77035	31	-	647215	ACTTAGGTGGCTCACAATTAGCTTTCTTGAA

a
s	mr.mrrefChr3	150495	47	+	181019	TTTGCTGTTAATCTCAGTCCAATTGCACCGTTGTTCAGCCAAATGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	602698	47	+	636262	TTTGCTGTTAATCTCAGTCCAATTGCACCGTTGTTCAGCCAAATGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77066	47	-	647215	TTTGCCATCCATCTCGGTCTAATTGCACACTTGTTCATCCAACTGGA

a
s	mr.mrrefChr3	150542	15	+	181019	GGGAGTCCTAGCCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	602745	15	+	636262	GGGAGTGTTAGCCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77120	15	-	647215	GGAATTCCTCGGCCT

a
s	mr.mrrefChr3	150557	15	+	181019	TTGTAATTGAGATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	602761	15	+	636262	TTGTAATTGAGGTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77135	15	-	647215	TTGCAATTGAGATTA

a
s	mr.mrrefChr3	150572	74	+	181019	GTGATGGATTTGGCCCCCAAACAAGGGGTTACTGTGCATGAGGACCCTTACGAGCCCCACAGCCTGGTATTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	602782	71	+	636262	GTGATGGATTTGGCCCCCAAACAAGGGGCTACTGTGCATGATGTCCCTTACGAGCC---CAGCCTGGTATTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77150	71	-	647215	TTGATGA---TGCCCCCCAAACAAGGAGTTGCAATGCATGAGAACCCTTATTGGCCCCACAGCCTAGTATTTTG

a
s	mr.mrrefChr3	150646	60	+	181019	GTGAATAAGAAATGCATGTAGAGAACATCCATGACAGCTGCCTACTCCACTTTAACATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	602855	60	+	636262	GTGAATAAGTAATGCATGTGGAGAATGTCCATGAAAGCTGCCTACTCCACTTTAACATGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77221	60	-	647215	GTGAATAAGAAATGCATGCAGGAAACATCCATGACGGCTGCCTACTCCACTTTTACATGA

a
s	mr.mrrefChr3	150706	145	+	181019	AATCACCAAGTTGACTTTTGCTTCGGGCTGCTTGTTACAGTGCATGGGCTGACACAGGAGCATCCTCACAATGTCTGATACAGAAGCATTCTCACTATAATGAACATCTTGTAAACACATGTATAGACATTTGTGGTATGGGGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	602916	145	+	636262	AATCACCAAGTTGACTTTTGCTTCAGGCAGCTTGTTACAGTGCATGGGCTGACACAGGAGCATCCTCACAATGTCTGATACAGAAGCATTCTCACTATAATGAACATCTTGTAAACACATCTATAGGCATTTGTGGTATGAGGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77281	145	-	647215	AATTGCCAAGCTGACCTCTGCTTCGGGCTTCTTGTTACTGTGCATGGGGTGACACAGGAGTATTCTCACAATGTCTGATACACAAGTATTCTTACTATAATGAACATCTTGTAAACACATGTATAGACATTTGCAGTACGGGGAT

a
s	mr.mrrefChr3	150851	23	+	181019	AATCTAAATTAAACAAAAGTCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	603063	23	+	636262	AATCTAAGTTAAACAAAAGTCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77426	17	-	647215	------AATTACACAAAAGTCTC

a
s	mr.mrrefChr3	150874	121	+	181019	TATTACATGAAAATCTGCAACAGAGATAGCGGTGAAATGAGATGTAAGTTTCTGCCCGGGAAGCTACAGCACTTAGCATGCCAGAGGGGGATATTACCTACTATTTGTGTCTCCCATTCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	603087	121	+	636262	TATTACATGAAAATCTGCAACAGAGATAGTGGTGAAATGAGATGTAAGTTTCTGCCCGGGAAGCTACAGCACTTAGCTTGCCGGAGGGGGACATTACCTACTATTTGTGTCTCCCTTTCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77443	100	-	647215	AGTTACATGAAAATCTGCAACAGAGACAGCGGTGAAATGAGATGCA---------------------AGCATTTACCATGTCAGAGAGGGATGTTACATACTATTTATGTCTCCCATTCCT

a
s	mr.mrrefChr3	150995	28	+	181019	GCTAAAGAAGCTTCTGTTGATGGCACCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	603208	28	+	636262	GCTAAAGAAGCTTCTGTTGATGGCACCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77545	28	-	647215	GATAAAGAAGCTTCTGTTGATGGCACCC

a
s	mr.mrrefChr3	151023	71	+	181019	TACTGTGTTGATACCTGCTCTCTCCATAGCCCAGGAGTGTGGTCTAAGAAATATTAAGGTATTTACCCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	603244	71	+	636262	TACTGTGTTGATACCTGCTCTCTCCATAGCCCAGGAGTGTGGTCTAAGAAATATTAAGGTATTTACCCACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77573	71	-	647215	TACTGTGTTGATACCTGCCTGGTCCATAGTGCAGGAGTGTTGTCTAGGAAATATTAAGGACTGTACCAACA

a
s	mr.mrrefChr3	151094	113	+	181019	TCACACCATGCTTAATGGTCCACGAGGCTGTAAATGAAATTCAGACAACAACCAGCATTATCAATTCCTGGCAGAATCATTCTGAAGACTGGTGCTATTCACTGCCCTCAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	603316	113	+	636262	TCACACCATGCTTAATGGTCCACGAGGCTGTAAATGAAATTCAGACAACAACCAGCATTATCAATTCCTGGCAGAATCATTCTGAAGACTGGTGCTATTCACTGCCCTCAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77644	113	-	647215	TCACACCATGCATAATCATCCATGAGGCTGTAAATGCAATTAAGCCAACAACCAGCATTATGAATTCCTTACAGAATCATTCAGAAGACTGATGTTATTCACTGCCCACAGCA

a
s	mr.mrrefChr3	151207	282	+	181019	TGTGCCAAGGTCTCACAAAATCTGATAATAACCTTAAAGTTCACTCAAAGGCTCATGTGGACATTGCATTGGGCCCCCAGTTCACTTTTGTCTCATGGGTGGTGAAGACAAATGAGCCAATGGGGCCCTGAGCTCTGCATGATGCAGAGTGTAATCAGGGTGTTGCTACAAGAGATGGTGAAACACTGCCAACATGTCATACTCACCATGTCCTATCTAACTTCAGCATAAACCTGGTCGGGGCTAGAACCATATGTGGCCATATACTGACTTGATTCTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	603480	282	+	636262	TGTGCCAAGGTCTCACAAAATCTGATAATAACCTTAAAGTTCACTCAAAGGCTCATGTGGACATTGCATTGGGCCCCCAGTTCACTTTTGTCTCATGGGTGGTGAAGACAAATGAGCCAATGGGGCCCTGAGCTCTGCATGATGCAGAGTGTAATCAGGGTGTTGCTACAAGAGATGGTGAAACACTGCCAACATGTCATACTCACCATGTCCTATCTAACTTCAGCATAAACCTGGTCGGGGCTAGAACCATATGTGGCCATATACTGACTTGATTCTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	77757	282	-	647215	TGTGCCAAGGTCTCACAGAATCTGATAATAACCTTAAAGTTCGCTCAAAGGCTCATGCTGACATTGCAATAGGCCCCCAGTTTACTTGTGTCTCATGGGGGGTAAAGACTGAGGAGCCAATGGAGCCCTGAACTGTGTATGATACAGAGTGTAATGAAGGTGTTGCAACAAGAGATAGTGAAACCCTGCCAACATGCCATACTCACAATGACCTGTCCAATTCCAGCATACACTTGGTCTGGACTAGAACCATATGTGGCCAAATACTAACTTGATTCATTT

a
s	mr.mrrefChr3	151489	663	+	181019	CCTCTTTACTGGATTGCTTGCACCGTTGCTTGTCAGGTTGAATGACCTGCAGACTGGGGCTGCTAGTCGCTTGCCAGGAATTACTCCTGGGTTAATATTGGTGAATTCTACTCAACGACAGTCTGCAATGATTGACTCAAGTAAGACTATTCAATACTTTTGTGATGCGGACCGTCTACAGGAAATAGAATTACAGCTACCCTGCTATAAAAACTGATGATGAAAAATCATGCATAGCAGCTATGTTAGACTGCAGGTAATGCTATAACCATCCTTTGTCAAAAAAAACAGATTTGCTGCACTATAGGCAGATGAAGAAGAAAGGATCATTGATATTCCAAAAGCACAATTGATGCTCCAATGTCCTAGGTCAATAATCCTGCTTTTATTTTCATTCTGGAGATTAGGGTTGAAAGCATGTTAATTTAGATTCAGACCAGACATCCTTCAAGTGTCATACCAGTGGATGGAATGACATGGTATGAACAGTATGTACAAACAGCAAATTAAGCAGCCATTTTACTAGCCATATATACTACAGGCATTGACCCAAAGACCCCTGAGCCTTCAGATGTGGCATAGTTTAGAACCCAAGCTTAATATTATGTCACTCAATGTGTGACAAACACTCTCCTGCTATTCACCAGTGTCACCTGGCTGAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	603762	656	+	636262	-----TTCCTGGATTGCTTGCACCGCAGCTTGTCAGGTTGAATGACCTGCAGACTGGGGCTGCTAGTCGATTGCCAGGAATTACTCCTGGGTTAATCTTGGTGAATTCTACTCAACGACAGTCTGCAATGATTGACTCAAGTAAGACTATTCAATACTTTTGTGATGCGGACCGTCTACAGGAAATAGAATTACAGCCACCCTGCTATAAGAACTGATGATGAAAAATCATGCATAGCAGCTATGGCAGACTGCAGGTAATGCTATAACCATCCTTTGTCAAAAAAAACAGATATGCTGCACTATAGGCAGATGTGGAAGGAAGGATCATTGATATTCCAAAAGCGCAATTGATGCTCCAATGTCCTATGTCCATAATCATGCTTTTATTTTCATTCTGGAGATTAGGGTTGGAAGCATGTCAATTTAGA-TCAGACCAGACATCCTTCAAGTGTTATACCAGTAGATGGAATTACATGGTATGAACAGCATGTATAAACAGCAAATTAAACAGCCA-CTTACTGGCCATATATACTACAGGCATTGACCCAAAGACCCCTAAGCCTTCAGATTTGGCATAGTTTAGAACCCAAGCTTAATATTATGTTGCTCAATGTGTGACAAACACCCTGCTGCTATGCATCAGTGTCACCTGGCTGAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	78043	652	-	647215	CCTCTTTATTGGATTACTTGCACCCTTCCTCATCAGGTTGAATGACCTGCAGACTGGGGCTGCTAGTCGCTTGCCAGGAATTACTCCTGGGTTAATATTGGTTAATTCTACTCAACGACAGTCTCCAATGATTGACTCAAGTAAGACTATTCAATACTTTTGTGATGTCGACCGACTACAGGAAATAGAATTACAGCTACCCTGCTATAAAAACTGATGATGAAAAATCACGCATAGCAGCTATGTTAGAGTGCAGGGAATGTTATGACTATCCTTTGTCAAAAAAAACAGATTAGCTGCACTATAGGCAGATGAAGAAGAAAGGATCATTGATATTCCAAAAGCACAATTGGTGCTCCAATGTCCTAGGTCAAAAATCCTGCTTGTAATTTTATCCTGGAGATTAGGGTTGAAAGCATGTTAATTTAGATTCAGACCAGACATCCTTCAAATGTCATGCCAGTGGATCGACTGACACAGTATGAACAGTATATACAAACAGCAAATTAAGCAGCCATTTTACTAGCCATGTATAGTACAGGGATTGACCCAAAGACCCCTGAGCCTTCAGATGTGGCATAGTTTAG-----------AATATTATGTCACGCAATGTGTGACAAACACTCTCCTGCTATTCACCAGTGTCACCTGACTGAGG

a
s	mr.mrrefChr3	152152	20	+	181019	CTGTGCCTGAGCATAATCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	604419	20	+	636262	CTGTGCCTGAGCATAGTCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	78695	20	-	647215	CCGTACCTGAGCATAATCTG

a
s	mr.mrrefChr3	152172	19	+	181019	GCCGTTGGGCCCAAAGTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	78718	19	-	647215	GCCGTTGGGCCCAAAGTGC

a
s	mr.mrrefChr3	152191	32	+	181019	ATAGGCACAGAACACTGGGCCCTGTGGCCTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	604439	27	+	636262	-----CACAGCACACTGGGCCCTGTGACCTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	78738	32	-	647215	ATAGGTGTAGAACGCTGGGCCCTTTGGCCAAG

a
s	mr.mrrefChr3	152223	272	+	181019	CCAAGTACCTTGTTAGGGGGAAGATTGATGAAGTTGTTAGGGGTTATGAGTTTATTATCAGCTACTTTATCAGGAAATACTTGTACATGGTTGCAGTCACCCCTGCACAGAACGCTGTGGGTTTCTTAAGGAAGCTGTGGATTTCTTCAAACTACAGTCCTGCAAAACTTCACAAACAGTACCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTTAACCTTCTTAAACTTCATTCAAAGGTTGTATGCCACGATCAAATAACCATCCGTACAGAGCGAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	604467	272	+	636262	CCAGGTACCTTATTAGGGGGAAGATTGATGGAGTTGTTAGGGGTTATGAGTTTATTACCAGCTTCTCTATCAGGAAATACTTGTACATGGTTGCAGTCACCCCTGCACAGAACGCTGTGGGTTTCTTAAGGAAGCTGTGGATTTCTTCAAACTACAGTCCTGCAAAACTTCACAAACAGTATCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTTAACTTTTTTAAACTTCATTAAGAGGTTGTATGCCACGATTAAATGACCGTCCGTACAGAGCGAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	78770	272	-	647215	CCAAGTACCTTGTTCTTAGGAAGGTTGATGAAGTTGTTAGGGGCTAAGAGTTTATTATCAGCTACTTTATCAGGAGATATTCGTAGATGGTTGTGTTCACCCCTGCAAAGAAAGCTGTGCACTTCTTAAGGAAGTGGTGAATTTGCTCACACTACAGTTCTGGAAAACTTCTCAAACAGTACCACCTCTGGTATGTTGAGTAGTTAAACCTTCTTAAGCTTCATTCAAAGGTTGTATGCCACTATCAGATAACCATCTGTACAGAGTGAATG

a
s	mr.mrrefChr3	152495	24	+	181019	ATGAAAAAAGTTCAAGAGGACCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	604750	24	+	636262	ATGAAAAAAGTTCAAGAGGACCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79042	24	-	647215	ATGAAAAAAGTTCAAGAGCGCCCC

a
s	mr.mrrefChr3	152519	7	+	181019	TTAATGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	604775	7	+	636262	TTAATGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79066	7	-	647215	TTGATGC

a
s	mr.mrrefChr3	152526	91	+	181019	TTTTTTGTATATCGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCGGGCTATTGGTCTGGGGGATGCGTACATAAAGTATCGCAGCTAGTACCATTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	604783	91	+	636262	TTTTTTGTATATCGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCGGGCTATTGGTCTGGGGGATGCGTACATAAAGTATCGCAGCTAGTACCATTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79073	91	-	647215	TTTTTGGCTCATAGAGTGTAGCTGGTAGCCTTTGAGCTGGCTTTTGGACTGGGGGACGTGTACATAAAATATTGCAGCTGGCACCATTTGA

a
s	mr.mrrefChr3	152617	20	+	181019	GGACATTAGATTACACCCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	604874	20	+	636262	GGACATTAGATTACACCCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79213	20	-	647215	GGATATTAGATTACACCCTC

a
s	mr.mrrefChr3	152637	8	+	181019	TATACCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	604894	8	+	636262	TATACCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79239	8	-	647215	TGTACCCC

a
s	mr.mrrefChr3	152645	157	+	181019	CCCCTGTTAATTGAACTGGGGGACTAAGATAAATCCTGCTGAACAGGGAAGCATGTCACATAGGATCCTTAGCCAACCTAGTTTGCCTTAGTTTGCATCTACAATTGTGTCTCTATTTATGACCTGCAAACCAACAAAGGACTTGGTACTCTCCCGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	604915	157	+	636262	CCCCTGTTAATTGAACTGGGGGACTAAGATAAATCCTGCTGAACAGGGAAGCATGTCACATAGGATCCTTAGCCAACCTAGTTTGCCTTAGTTTGCATCTACAATTGTGTCTCTATTTATGACCTGCAAACCAATAAAGGACTTGGTATTCTCCCGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79247	157	-	647215	CCCCCATTAGTTGAACTGGGGCACTAAGATAGATTCTGCTGAACAGGGAGGGACGTCACATATGATCCTTGGCCAACCTAATTTGCTTTAGCAAGCTTCTACAATTGTGTCTCTATTTATCACCTGTAAACTAACAAAGGACTTGGTACTCTGCCAT

a
s	mr.mrrefChr3	152802	43	+	181019	ATCTCCCTTGGGTAGGTCTATTTTAGACAAGATAATGCAGTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	605073	43	+	636262	ATCTCCCTTGGGTAGGTCTATTTTAGACAAGATAATGCAGTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79404	43	-	647215	ATTTCCCTTGGATAGGTCTATTTCAGACAAGATAATGCAGTTA

a
s	mr.mrrefChr3	152845	90	+	181019	TCACCATTGCCTGCCAGATTCTTTATAAAGGTGTCCTTACTCAGTCCTGGTGCAGAAAAATTACAGGCAATAGCATTAGACTCCCCCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	605116	90	+	636262	TCATCATAGCCTGCCAGATACTTCATAAAGGTGTCCTTATTCAGTCCCGGTGCAGAAAAATTACAGGCAATAGCATTAGACTCCCCAAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79448	89	-	647215	TCACCATTGCCTTCCAGATTCCTTATAAAGGTGTCCTTACTCAGTCCTGGTGCAGAAGAATTAGAGG-AATAGCATTAGACTCCCCCAGA

a
s	mr.mrrefChr3	152935	250	+	181019	CCAATTGCAGATGACCTACAGTTCCTTGTCTGTGTATGATTTCAGTTCAAGGACTCTTTGCACCAAGGTATGAGATAATCTTTGCTTGTTGCAGATCATTTCCATAGCAATTCAGTATTTTTAAAGGTAGGAGGATTCTACAAAGCCTACAAACCATTCTATTCTTGTTAGATGCCCTTGATTGGCCAATGTACATCACCTATTGAAACATTTATCCTTTAATCAGTACCACATCTGTGGTGAACCAAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	605206	250	+	636262	ACAGTTGCAGGTGACCTACAGTTCCTTGTTTCTGTATGATTTCAGTTCAAGGACTCGTTGCACCAAGGTATAAGATAATCTTTGCCAGTTGCAGGTCATTTCCATAGCAATTCTGTATTTTAAAAGGTAGGAGGATCCTATAAAGCCTACAAACCATTCTATTCTTATTAGATGCCCTTAATTGGCCAATGTACATCACCTATTGAACCATTCATCCTTTAACCAGTACCACATCTGTGGTGAACCAAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79538	250	-	647215	CCAATTGCAGATAACCTCCAGTTCCCTGTCCGTTTATGATTTCAGGTCAAGAAATTTTTGCACCAAGGAAGGAGATAATCTTTGCTTGTTGCAGATCATTTCCATAGCAATTCAGTATTTTTTAACGTAGGAGGATTCTACAAAGCCTAGCAAGCATTCTATTCTTGTTAGATGCCCTTGATTGGCCGATGTACGTCACCTATTGAAACATTTACCCTTTAATCAGTACCACGTCTGTAGTGAACAAAGG

a
s	mr.mrrefChr3	153185	56	+	181019	TTAGCTGGCCTTTGTTTTTACCTCAAGCTGGCAATTGTACTAAGATCTAGTACAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	605458	51	+	636262	TCAGCTGGCCCTTGTTTTGGCCTCAAGCTGTCAATTGTTC-----TCTAGTACAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79788	56	-	647215	TTAAGTCACCTTTGTTTTTACCTCAGCCTGGCAATTGTACTAAGATCTAGTACAGA

a
s	mr.mrrefChr3	153241	70	+	181019	AGAACAAAATGGTCCCTCAAGATCCTCTGAGGGCCCAAAACTGATTCCTTAATCTAACTGTGTCAAGTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	605509	48	+	636262	AGAACAAAATGGTCCCTCAA----------------------GGTTCCTTAATCAAACTGTGTCAAGTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79845	70	-	647215	AGAACGAGATGGTGCCTCAAGATCCTCTGAGGGCCCAAAACTGATTCCTTAATCTAACACTATCAAGTTA

a
s	mr.mrrefChr3	153311	48	+	181019	GAAGTAGACAGGATGGGCTGCACCAGGGTAGGTGAACAACCTATCTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	605562	48	+	636262	GAAGTAGACAGGATGGGCTGCACCAGGATAGGTGAACAACCTATCTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79915	48	-	647215	GAAATATACAGGATGGGCTGCACCAGGGTAGGTGGACAACCTATCTAC

a
s	mr.mrrefChr3	153359	54	+	181019	ATAACCAAAAATAAGTATTAAGCATTGATTCTTTAACACAGAACCTACCATTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	605615	54	+	636262	ATACCCAAAAATAAGTATTAAGCATTGATTCTTTATTACAGCACCTACCATTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	79963	50	-	647215	ATGACT----ATAAGTATTAAGCATTGATCCTTTAACACGGACCACACCATTGG

a
s	mr.mrrefChr3	153413	74	+	181019	GCTGTTTAGTCTCTAGAGGAACAGAACCCGCCATTGTGTTGTTTAGTTTTGAGATGTGAGTATAAGTTAAGGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	605669	74	+	636262	GCTGTTTAGCCTCTAGAGGAACAGAACCCGCCATTGTGTTGTTTAGTTCTGAGATGTGAGTATAAGTTAAGTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80019	66	-	647215	GCTCTTCAGTCTCTAGAGGAACAGAAACCACCA--------TGTAGTTTTGAGATGTGAGTATAACTTTAGGGA

a
s	mr.mrrefChr3	153487	220	+	181019	GTACCCCAGCTTCAACCTGTATGGTGCAAGATTGTTGTCCCTTCAAGAAGGAGTAACCATCATATGCCTTCATGGTAGTTAGCTACTGAACAGGGTTCTCACAGCCTGTCATTAATAAAGCACTGTTGTCTACCCTTTATTAATAGAGTACCCTTTTGAAAGGATCAGATAGCACCATAAACATGTGACTCTGTTAAGAGCCCACTCAGGAAGTATCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	605743	220	+	636262	GTACCCCAGCTTCAATCTGTATGGTGCAAGATTGTAGTCCCTTCAAGAAGGAGTAACCATCATATGCCTTGATGGTAGTTAGCTACTGGACAGGGTTCTCACAGCCTGTCATTATTGAAGCAGTGTTGTCTACCCTTTATTAATAGAGTAACCTTTTGAAAGAATCAGATAGCACCATAAACATATGACTCTGTTAAGAGCCCACTCAGGAAGTATCAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80086	220	-	647215	GTACCCCCGCCTCTACCTGTATGGTGAAAGATTGTTGTCCCCGCAAGAATGTGTAACCGTCATATGCGTTCATGATAGTTAGCTGCTGAACAGGGTTCTCACAGCCTGTCATTAATAAGGCACTGTTGTCTACCCTTTATTAATAGAGTACCCTTTAGAAAGGATCAGATAGCACTATAAACTTGTGACTCTGTTACAAGCCCACTCAGGAAGTATCAGA

a
s	mr.mrrefChr3	153707	102	+	181019	GTCTTGTAGGCGCCTAGAACTCACTTGAACTCTATGCAAGTCTGTAACATGGAGTAAACAAGCAGTTACAAAATCATAGGACAGTCTTCTGTACAAAATCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	605963	102	+	636262	GTCTTGTAGGCGCCTAGAGCTCACTTGAACTCTATGCAAGTCTGTAACATGGAGTAAATAAGCAGTTACAAAATCATAGGACAGTCTTCTGTACAAAATCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80335	102	-	647215	GTCATGTAGGTGGCTAACATCCACATGAACCCTATGCAAGTCTGTCATATGGAGTAGACAAGCAGTTACAAAATCATAGGTCAGTCTTCCGTACAAAATCAT

a
s	mr.mrrefChr3	153809	332	+	181019	AGAACAGTCGTCTGAGGTTTCTTATGTTCATTTACAGTTATTGTTGCATGTCCTGTAATTCAGTAAACTTTTGGCAATGCTGTATATTGCCCTACTAGGGTTGGCATCACTATAGGAATGATTCCCTCAAAACTCATGACTGTAGAGAGGCAGTGGCTCATACTTATGAGACTGCTGGTAGTGGTTTGCACAACTCTAGCTGTTAATCAAGTCATTGCATAGAACCACTAACTCAGGAGAAATGGTAAGTTCACAACCAGTATATAGGTGCAGCAATTGTGTGCAGGCCCTAAGAGCCATATGTATTGGCACTTTGGAGTCAACCCTTTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606065	332	+	636262	AGAACAGTCGTCTGAGGTTTCTTATGTTCATTTGCAGTCATTGTTGCATCTCTGGTGATTCAGTAAACTTTTGGCAATGCTGTATATTCCCCGACTAGGGTTGGCATCACTATAGGAATGATTCCCTCAAAACTCATGACTTTAGAGAGGCAGTGGCTCATATCTATAAGACTGCTGGTAGTGGTTTGCACAACTCTAGCTGTTAATCAAGACATTGCACGAAACCACTAACTCAGGAGACATGGTAAGTTCACAACCAGTATATAGGTGCAGCAATTGTGTGCAGGCCCTAAGAGCCATATGTATTGGCACTTTGGAGTCAATCCTTTATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80443	307	-	647215	AGGACAGGCTTTTGAGGTTTCTATTGTTCATTTACAGTTATGGTTGCATGCTCTGCAATTCAGTAAACTTTT-GCAACACTGTATATTGCCCTACTAGGGTTGGCATC-----------------------AGTCATGACTGTAGAGTGGCCATGGCTCATACTTATGAGACTAGTGGTAGTGGTTTACACAACTCTAGCCGCTAATTGAGTCATTGCATAGAATCACTGGCTCAGGAGAAATGGTAAGTTCACAACCAGTATATAGGTCCAGTAATTATGTGCAGGGCCTAAGAGCCATATGTA-TGGCACTTTGAAGTCAACCCCTTATA

a
s	mr.mrrefChr3	154141	35	+	181019	GGAGTAAATTTTAAACCTTACCAGACAAGCTTCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606397	35	+	636262	GGAGTAAATTTTAAACCTTACCAGACAAGCTTCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80767	35	-	647215	GGAGTGAATTTTTGACCTTACCAGACAATCTTCTC

a
s	mr.mrrefChr3	154176	42	+	181019	ACCATCTAAGTAAAATTAATTAATAGGGCTGCTTTAATCTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606432	42	+	636262	ACCATCTAAGTAAAATTAATTAATAGGGCTGCTTTAATCTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80803	42	-	647215	ACCATCTAAATAAAATTAATTAAAGGGGTTGCTTTAGTATGT

a
s	mr.mrrefChr3	154218	12	+	181019	CACAGTTTTCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606478	12	+	636262	CACAGTTTTCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80845	12	-	647215	CCCTATCCTCTA

a
s	mr.mrrefChr3	154230	15	+	181019	AATGTTTTGTGTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606490	15	+	636262	AATGTTTTGTGTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80859	15	-	647215	ATAGCATTCACCTGT

a
s	mr.mrrefChr3	154245	58	+	181019	GCCTAGCCAACCCTTTTTATAAATTACTAATATCAAGCAGGGCCCAGTAAGGATACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606505	58	+	636262	GCCTAGCCAACCCTTTTTATAAATTACTAATATCAAGCAGGGCCCAGTAAGGATACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80881	58	-	647215	GCCTAACAAACCCTTTCTACATATTACTCAAATCAAGCAGGGCCCAGTAAGGATACGT

a
s	mr.mrrefChr3	154303	22	+	181019	AGTTCTGGTGGATTGCTCAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606563	22	+	636262	AGTTCTGGTGGATTGCTCAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80940	22	-	647215	AGTTCTGGTGGACTGCTCAATG

a
s	mr.mrrefChr3	154325	39	+	181019	CCCATAAGCTGTTGGGATTGCAGGACTATGATGGTAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606585	39	+	636262	CCCATAAGCTGTTGGGATTGCAGGACTATGATGGTAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	80977	39	-	647215	CCAATATGCTGTTGGGATTGCAAGACTTTCATGGTAATT

a
s	mr.mrrefChr3	154364	26	+	181019	ATCATTGCCAATCTGTGAAGTCTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606629	26	+	636262	ATCATTGCCAATCTGTGAAGTCTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81016	26	-	647215	ATTATCCCCAATCTGCGAAGTCTTTA

a
s	mr.mrrefChr3	154390	14	+	181019	GTAGATGGTAACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606663	8	+	636262	GTAGATGG------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81042	14	-	647215	GTAGCTGGTAACCA

a
s	mr.mrrefChr3	154404	94	+	181019	AATTATATCCCAAGTCATATCAATCCTGGTGGGCAGAGGGCAGAAGCTGGCTTGATAAGCTGCTTAGTCTCAACACCAGGGGCCAGCAAAGAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606671	90	+	636262	----ATATCCCAAGTCATATCAATCTTCGTGGGCAGAGGGCAGAAGCTGGCTTGATAAGCTGCTTAGTCTCAACACCTGGGGCCAGCAAAGTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81059	94	-	647215	AATTATATCCCAAGTCTTATCAATCCTGGTGGGCAGAGGGCAGGAGCTGGCTTGATAAGCTGCTTAGTCTCAACACCAAGGGCCCGCAAAGAGG

a
s	mr.mrrefChr3	154498	85	+	181019	TAACTAAGATATTATACCAATCTGCAACATATGCAATCCAATACCCCAATCAAACTGAGCTTGCCAAATTGAGCCAAAATCAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606776	76	+	636262	TAACTAAGATATTGTACCAATCTGTAACATATGCAATCCAATACCCCAATCAAACTGAGCTTGCCAAATTGAGCCA---------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81153	85	-	647215	CAACTAAGATATTATACCAATCTACAGCATAAGCAATCCAATACACCAATCAAACCGAGCTTGCCAAGTTGGGCCAAAATCAGTA

a
s	mr.mrrefChr3	154583	110	+	181019	AAAGGTGGATTGACTAAGTCTCGTATGCCTAAATTGACTATCTATTATGCTTTCCTGACTTACATGAATCCATACACTCAGTGTCTATGGAGTGTGCCAGATGTCATGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606852	67	+	636262	--------------------------GCTTAAATTGACTACATATTAT-CTTTCCTGACTTACATGAATCCATACACTCAGTGTCTATGGAGTG----------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81244	110	-	647215	AAAGGTGGATTGACTAAGTCTCGTATGCCTAAATTGACTATCTATTATGCTTTCTTGACTTACATGAATCCATACACTCAGTGTCTATGGAGTGTGCCAGATGTCATGCA

a
s	mr.mrrefChr3	154693	66	+	181019	ACGACTTTACAATTTACAAGAAAGCCAGACGCAAAAGTAGTGCTCATGGCTTTGCTACTGCTACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81359	66	-	647215	ACGACTTTACAATTTACAAGAAAGCCAGACGCAAAAGTAGTGCTCATGGCTTTGCTACTGCTACAA

a
s	mr.mrrefChr3	154759	22	+	181019	AAATAGGTACAAAAATAGTTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81431	22	-	647215	AAATAGGTACAAAAATAGTTGC

a
s	mr.mrrefChr3	154781	17	+	181019	TAGAGCCACAACGTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81456	17	-	647215	TAGAGCCACAACGTGAG

a
s	mr.mrrefChr3	154798	123	+	181019	TTTATCATACAAGTCAATCCTGTTCTAATCACCTGGACAAGATCACTACAAGCTTGCTGCCACAGATCAAGCTCTTTCTGATAGGAGTCTTGTCTTTATGAAGTGTGTGGAGTGCCTACCTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	606919	123	+	636262	TTTATCATACAGGTCAACCCTGTTCTAATCACCTGGACAAGATCACTACAAGCTTGCTGCCACAGAGAAAGCTCTTTCTGATAGGAGTCTTGTCTTTATGAAGTGACTGGAGTGCCTACCTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81483	111	-	647215	TTAATCATAGAAGTGAATCCTGTTCAAGTCACCTTGATAAGATCGCTGCAAGCTTGCTGCCACAGATCAA------------ATGACTTTTGTCCTTATGAAGTGTGTGGGGTGCCTACTCAA

a
s	mr.mrrefChr3	154921	84	+	181019	TGCCTATGCAAGCATGGATAAGGCAACTTGGAGTGTAGCATTATGCAAGCATGGTATAGACTATTTGGAGTTTGACATACTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	607042	84	+	636262	TGCCTATGCATGCATGGATAAGACAATTTGGAGTGTAGTGTTATGCAAGCATGGTATAGACTATTTGGAGTATGACATACTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81618	84	-	647215	TGCCTATCCAAGCATGGATAAGGCAACTTGGAGTGTAGCATTATGCAGGCATGGTATAGACTATTTGGAGTTTGACATACTTTT

a
s	mr.mrrefChr3	155005	109	+	181019	TTAGTAATTTTAGGTTCCAGTCTGAGCTTCTATTGGACATTATGCAAAAAGCCTTGCATATTGCTAGGAACTTTGGATATTCCAAGGCCATTGGTATAATATCACATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	607130	109	+	636262	TTAGTAATTTTAGGTTCCAGTCTGAGCCTCTATTGGGCATTATGCAAAAAGCCTTGCATATTTCTAGGAATTTCAGATATTCCAAGGCCATTGGTATAATATCACATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81702	103	-	647215	TTAGTACTTTTAGGTCCCAGTCTGAGCTTCTATTGGACACTATGTGAAAAGGCTTGTGTATTGTTAGGAACTTTGGATGTTCCAAGGCCATTGGTATAATATT------

a
s	mr.mrrefChr3	155114	46	+	181019	CAGACATAGGCTAGTCAAGTCCTCCACAGTGACAGACTTAACATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	607240	46	+	636262	CAGACATAGGCTAGTCAAGTCCTCCACAGTGACAGACTTAACATTT

a
s	mr.mrrefChr3	155160	191	+	181019	ACCACTGCCTGCTCATCAGAACCCCACAATTGCCAACATAAAGTTAGAATAATATGTTACTTGTATGTCGACATTAAAACTTTTATCTTAACAATGTTCTAAGAACTACAGCTAACCAGCGGCCTGCCATAATCAAGAATCCATTTCATACTATCTTGAATATGTGGGGGTGCACTACCCAGTGCAGAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	607297	191	+	636262	ACCACCGCCTGCTCATCATAATCCTACAATTGCCAACATATAGTTAGAATAAGATGTTACTTGTATGTCGACTTTAAAACTCTTATCTTAACAATGTTCTAAGAACTACAGCTAACCAGCGGCCTGCCATAATCAAGAATCCATTTCATACTATCTTGAATATGTGGGGGTGCACTACCCAGTGCAGAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81805	191	-	647215	ATCACTGCCTGCTCATCAGAACCCCACAATTGCTAACATAAAGTTAGAATAATATGTTACTTGTATGTCCACATTAAACCTTTTATCTTGACCATGTTCTAAGAACTACAGCTAATCAGCAGCTTTCCATAATCAACAATCCATGTCATACTATCTTGAATATGTGGGGGTGCACTACACAGTGCAGAATG

a
s	mr.mrrefChr3	155351	222	+	181019	GGTTCACTAGGATGCAGCCCTAATGCGCACTGGATAGAGGTACATCTACAACATTGCTGAAAATCCAGGGCAAGAACACATCCATAACATTGCATAAATTTAAAAATGGAGAATGTTGGGGAATGTTGAGGGTATATGCTGGGAAGAATGGCACTCATAGAATAAGAATTGCAGGCTGCTGACATCATGGCTACTATATCACTTTCTGTCCACTGCTAAGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	607490	173	+	636262	GATTCACTAGGATGCAGCCCTAATGTGCACTGCATTGAGGTACATCTACAACATTGCTGAGAATCCAGGGCAAGAATACTTCCATAACCTTGCATAAATTTAAAAATGGAGAATGTTGGGGAATGTTGAGGGTATATCCTGGGAAGAGTGGCATTCA-------------------------------------------------TGTCCACTGTTAAGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	81996	222	-	647215	GGTTCACTGGGATGCAGCCCAAAGGCGCACTGGAGAGAGGTACATCCACAATGTTGCTGGAAATCCAGGGCAAGAACACATCCATAACATTGCATAAATTTAAAAATGGAGAATGTTGGAGAATGTTGAGGGTGTATGCTGGGATGCATGGCACTTATAGAATAAGAATTGCAGGCTGCTGACATCATGGCTACTATATCACTTTCTGTCCACTGCTAAGAC

a
s	mr.mrrefChr3	155573	420	+	181019	CCCAGTGTTGCACACCAATCTTTCCAACCACTACACTCTCGTGTTCTTTTACACTCAATCTAAAGTAGTTACACCCGAGCGTCCCGATTTCTGGATCATGTGCACAGAGACTCACGATCCTGTGAGTTGGCTAAAGTTTTAGCACAAGTAGGCCAAGAACCAGAATAAGCCTTGATTGGACACATTTAGATCAAGCCTCTACTTAGGACTGACTTAATCTGACTTTAACAAGCTTGGCCCAATAGAAATGATATGACTGTTCTTACCGCTCTGATGTGCTAGTAGGACAAAAGATACCAATTGAAAAGATGCCAATGTAAGCTTGGGCCTACACTATATAGGTGAGAAGAGAGTATGATCACTCTTACCCTGAGGTATCGGGGAGCCAAGAATGGTAATTAGTGTTGTAAGATGCTGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	607669	415	+	636262	CCCAATGTTGCACACCAATCTTTCCAACCACTACACTCTCGTGTTCTTTTACACTCAATCTAAAGTAGTTACACCCGAGCGTCCCGATTTCTGGATCATGTGCACAGAGACTCACGATCCTGTGATTTGGTTAAAGTTTTAGCACAAGTAGACCAAGAACCAAAATAAGCCTTGATTGGACACATTTAGATCAAGCCTCCACTTAGAACTGACCTAACCTGACTTTAGCAAGCTTGGCCCAATAGAGATGATATGACTGTTCTTACTGCTCTGACGTGC-----GGACAAAAGATACCAATTGAAAAGATGCCAATGTAAGCTTGGGCCTAGACTATATGGGTGAGAAGATAGTATGATCACTCTTACCCTGAGGTATCGGGGAGCCAAGTATGGTAATTAGTATTGTAAGATGCTGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	82218	404	-	647215	CCCAGTGATGCATGCCAACCTTTCCAACCACAACACTCTCGTGTCCTTTTACACTTGTTCTGAGGTAGTTACACCCGAGTATACCGCTGTCTGGATCATGTGTACAGAGGCTGACCATCCTGTGCGTTGGCAAAAATTTTAGCAGAAGTAGGCCAAGAACCAGAATATACCTTGATTGGACAC-TTTAGATCAAGCCTTTACTTAGGACTGACTTAATCTGACTTTAACAAGCTTGGCCCAATAGAAATGATATGACTGTTCTTATCGCTCTCATGTGCTAGTAGGACAGAAGCGAAC-------------CCAATGTAGGATTGGGCCTACACTATATAGGTGAGAAGAGAGTACGATTACTCTTACCCTGAGGTATCGCGGAGCCAAGAATGGTAAGTAATGTTGTAAAATGCTGC--

a
s	mr.mrrefChr3	155993	40	+	181019	TAGTTCGAGTGCCCCCTAAATGGGCTGCACCAACTGAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	608086	34	+	636262	TTGTTTGAGTGCTCCCTAAATGGGCCGCACTAAC------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	82622	40	-	647215	TAGTTCAAGTGCCCGCCAAATGAGCTGCACCAACTGAATA

a
s	mr.mrrefChr3	156033	304	+	181019	CACTTACAGATATATTGCACGCATCCATAGGTCCTCAAAATTTTACCTGAAGAAAGTCAATAATATACAATGGATGCTAACCTTACCCAATTTTAATCCAGCAAGAACCTAGCTGTAAAAGGCACTTCAGAGGATGTCTGTTACCATCATATGTGATCTAGCTGACCTAGAATTTCAGGAAAAGGGGCAGTCAACATTTTATAGCCATAGTAATAGGAGAAATTAGGAATTGATTTCATCACTGCAGACTCAGATGCTTTTACCTGGGCCTGAACCTTGCTCAATCACCACTTAATCTTTCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	608120	304	+	636262	CACTTACAGATATACTGCACGCATCGATAGGTCCTCAAAATATTACCTGAAGAAAGTCAATGATATACATTGGATCCTAACCTTACCCAATTTTAATGCAGCAAGAACCTAGCTGTAAAAGGCATTTCAGAGGATGTCTGTTACCATCATATGTAATCTAGCTCAGCTAGAATTTCAGGAGAAGGGGCAGTCAACATCTCATAGCCATAGTAATAGGAGAACTTAGGAATTGATTTCATCACTGCAGATTCAGATGCTTTTACCTGGCCTTGAACCTTGCTCAATCACCACTTCATCTACCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	82664	299	-	647215	CACTTACAGATATATTGCACACATCCATAGGTCCTCAAACTTTTCCCTGAAGAAAGTCAATAATATGCAATGGATGCCAACCTTACCCGATCTTAATCCAGCAAGAACCTAGCTGTAAAGGGCACCCT----GATGTCTGTTACCATTGTATGTGATCAAGCAGACCTAGAATTTCATGAAAAGGGGCAGCCAACATTTTGTATGCATAGTAATAGAAGAAATTAGGAGGTGATGTCATCACTGCAGACTCAGATGCTTTTACCTTGGCCTGAACCTTGCTCAATC-CCACTTAGTCTTTCTTT

a
s	mr.mrrefChr3	156337	5	+	181019	GAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	608425	5	+	636262	GAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	82963	5	-	647215	GAATA

a
s	mr.mrrefChr3	156342	9	+	181019	GGCATCTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	608430	9	+	636262	GGCATCTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	82973	9	-	647215	GGCATTTCC

a
s	mr.mrrefChr3	156351	51	+	181019	ATATCATTTTATGTATACGAGAGGGCCCATCCTTAGATATAAGTAGAACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	608439	51	+	636262	ATATCATTTTATGTATACGAGAGGGCCCATCCTTAGATATAAGTAGAACAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	82996	51	-	647215	ACATTATCTTATGTATAGGAGAAGGCCCATCCTAAGATAAAAGTAGAACAG

a
s	mr.mrrefChr3	156402	6	+	181019	TGCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	608492	6	+	636262	TGCCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83047	6	-	647215	TGCATA

a
s	mr.mrrefChr3	156408	7	+	181019	GACTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	608501	7	+	636262	GACTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83053	7	-	647215	GCTTGCA

a
s	mr.mrrefChr3	156415	42	+	181019	GCTTCCAGAGAAAGAACAGCTGGGCCTGAACCTTGCTCAATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	608510	42	+	636262	GCTTCCAGAGAAAGAACAGCTGGGCCTGAACCTTGCTCAATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83060	42	-	647215	GTTTCCAGAGAAAGATCAGTTGGGCCTGAACCTTGCTCAATC

a
s	mr.mrrefChr3	156457	14	+	181019	TCTTTCTTTTGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	608552	14	+	636262	TCTTTCTTTTGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83111	14	-	647215	CCTTTCTTTGGAAT

a
s	mr.mrrefChr3	156471	60	+	181019	AGTCATCTCCAGTAGTCACACTATATATCATCTTATGTATACAAGAGCGCTCATCCTTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	608571	57	+	636262	AATCATCTCCAGTAGTCACACTATATATCATCTTATGTATACAAGAGCGC---CCCTTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83125	60	-	647215	AGTCATCTCCAGTAGTTACACTATATAATATCTTATGTATATGAGACAGTTCATCCTTAG

a
s	mr.mrrefChr3	156531	51	+	181019	CTATGTGTAGAGTTGACTGTCTGTCCAATCCACACTGCTTGCAGTTTCCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	608638	51	+	636262	CTATGTGTAGAGTAGACTGTCTGTCCAATCTGCACTGCTTGCAGTTTCCAG
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a
s	mr.mrrefChr3	156582	65	+	181019	AAGATCAGGCCACTCATCACTTGGTGAGCACAAGTTGGCAGATTTTATAACTCAAGTTATGAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	608689	65	+	636262	AAGATCACGCTACTCATCACCTGGTGAGCACAAGTTGGCAGATTTCATAGCTCGAGTTATGAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83239	62	-	647215	AAGATCAGGCCAC---TCACTTGTCAAGCACAATTTGGCACATTTTATAACTCAAGTTATGAATA

a
s	mr.mrrefChr3	156647	406	+	181019	GTAGCATCATTAAGTTCAATTGGACTCCTCTTTGCCAAAACTGATGCTATTCTCAGTACCATACTCACAGCATGACCCATATATGGGCTGTAATAACAAAAATTGTTATAGGCCCTGCTTGAATGACATTTCAAAGTTCAAGACTGGTGGCCCAATTTGCTGGCTGCTATCTTAGCCACTGATCTGTTGATGTGCAACACTGCTCGAAACTAAGCAACTTGCTCAGTAATGTACAACCCTAGGGTATAATCACACTTCTGTGCTGCTAATACTGTGCCAGTGCCTATTCCCCCCAGTATTTCCTTGGTGATCTGCTGGCTATAGGGTGTACCCCATAATTACACATAAAATGTGTCTACAAACTTAGCTTTACTTGGCACCAGCAACCCCTCTGGGACGAGGTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	608755	405	+	636262	GTAGCATCCTTAAGTTCAATTAGACTCCTCTTTGCCAAAACTGATGCTATTCTCAGTAACATACTCACAGCATGA-CCATATATGGGCTGTAATTGCACAAATTGTTATAGGCCCTGTTTGAATCACATTTCAAAGTTCAAGACTGGTGGCCCAATTTGCTGGCTGCTATCTTAGCCACTGATCTGTTGATGTGCAACACTGCTTGAAACTAAGCAACTTGCTCAGTAATGTACAACCCTAGGGTATAATCACACTTCTGTGCTGCTAATACCGTGTCAGTGCCTATTCCCCCCAGTATTTCCTTGGTGATCTGCTGGCTATAGGGTGTGCCCCATAATTACACATAAAACGTGTCTAAAAACTTAGCTTTACTTGGCACCAGCAGCCCCTCTTGGACGAGGCGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83301	402	-	647215	GTAGCATCACTAGTTTCAATTGGC--TCCCTTTGCCAAGACTGATGCTATTCTTAGGACCATACTCACAGCATGACCCGTATATAGGCTGTAATAATGAAAATTGTTATAGGCCCTGCTTGAATGACATCTCAAAGTTCAAGACCGGTGGCCTAATTTGCTGGTTGCTATCTTAGACACTCATCGATTGATGTGCAACACTGCTCCAAACTAAGCAACTTGCTCAGTAATGTATGACCCTAGGGTACAATCACACTTCAGTGCTGCTAATACTGTGCCAGTGATTATTCCCCCCAATATTTCCTTGGTGATCTACTGGCTATAAGGTCTACCCCATAATTACACATGAAATGTGTCTACAAATTTAGCTTTCCTTGG-CCCAGCAA-CCCTCTGGGACGATATAAT

a
s	mr.mrrefChr3	157053	9	+	181019	AACTTGGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	609160	9	+	636262	AACTTGGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83704	9	-	647215	AACTCGGTC

a
s	mr.mrrefChr3	157062	151	+	181019	AAAACAATATAATCTAAAGAGGACTCAAATGACCATGTATCAGGTATGAGGCTTCGAAGCCGCAAACAAAGCATACGCAAGGCAATTGCATACTAGAGCACTCAAATGGCAAATAGTCTTGAGTTAATAATGACTGTGGGCCCACACATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	609169	151	+	636262	AAAACAACATAATCTAAAGAGGACTCAAATGACCATGTGTCAGGTATGAGGCTTCGAAGCCGCAAACAAAGCATACGCAAGGCAATTGCATACTAGAGCACTCAAATGGCAAATAGTCTTGAGTTAATAATGACTGTGGGCCCACACATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83721	151	-	647215	ATAACTATAAAATTTAAAGAGGACTCAAATGACCATGTATCAGGTATGAGGCTTCGAAGTCACAAACAAGGCATACACAAGGCAACCGAATACCAGGATGCTTAAATGGCTAATATTCCTGAGTGATTAATGACTGTGGGCCCACACATTA

a
s	mr.mrrefChr3	157213	22	+	181019	ATGTAGCACTCACTGGTTATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	609320	22	+	636262	ATGTAGCACTCACTGGTTATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83874	22	-	647215	ATTTAGGACTCACTGGTTATAG

a
s	mr.mrrefChr3	157235	31	+	181019	CACTCACATACCCAGATCCGACTTATCACAT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	83896	31	-	647215	TGCTCACATACCGGGACCCAACTTATCACAC

a
s	mr.mrrefChr3	157266	29	+	181019	GTTACCAACGAACTGCGGATTTACCCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	609374	29	+	636262	GTTACCAACGAACTGCGGATTTACCCATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83932	29	-	647215	GTTACCAACAAACTGCAGATTTACCCATC

a
s	mr.mrrefChr3	157295	16	+	181019	CATTGCAGCACTCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	609404	16	+	636262	CATTGCAGCACTCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83961	16	-	647215	CAATGCACAACTCATT

a
s	mr.mrrefChr3	157311	357	+	181019	GCTCATTTATCATGGTCACAGGAGTCCCCCTATCTCCATGTCTGTATAACTAATAAGGGACTAGTTTAATTGTTCTAACATGATCAGTAAAGAGACACAGAGACAAGACCCTACTGTCTCTATCCCATTAACTGTACATGGTGGGCGAGACATAACAATGATACCTTGTGGCAGTTGTTTATGAAGAGGGCTTAGTATACATGCTCTGATATTACTTACACTTTGGCAGGAGCCTTGTGCAGGTGCTTCTGGCAACTGGTGTTTTGTTGCCTGTGTTGATTAGCACCTTGTTCCCTTAGTTGATAATACAGGCAATTTCATGACATGTGGCAGATATCTGCCCTGTAAACCATCTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	609421	357	+	636262	GCTCATTTATCATGGTCACAGGAGTCCCCCTATCTCCATGTCTGTATAACTAATAAGGGACTAGTTTAATTGTTCTAACATGGTCAGTAAAGAGACGCAGAGACAAGACCCTACTGTCTCTATCCCGTTAATTGTTCATGGTGGGCGAGACATAACAATGATACCTTGCGGCAGTTGTTTATGAAGAGGGCTTAGTATACATGCCCTGATATTACTTACACTTTGGGAGGAGCCTTGTGCAGGTGCTTCTGGCGACTGGTGTTTTGTGGCTTGTGTTGATTAGCACTTTGTTCCCTAAGTTGATAATACAGGCAGTTTCATGACATGTGGCAGATATCTGCCCTGCAAGCCATCTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	83977	352	-	647215	GTTCATTTATCACAGCTATGTGAATCCCTCTATCTCCATGTCTGTATAGCTGATAGCAGACCAGTTCTATTGTTCTAATATTATCAGTAAAGAGACACAGAGACAAGACCCTATTGTCTCTATCTCATTAACTATACATGGTGGGCGAGACATAACAATGA---ATTTTGGCAGTTGTTCATGTAGAGTGCTTAGTAGACATGCTCTGCTATTACTGACACTATGGCAGGAGCCTTGTGCAGGTGCTTCTGGCAACTGGTGTTCTGTTGCCTGTGTTGA-TAGAACCTTGTTCCCTTAGTTGATAA-ACAGGCAATTTCATGACATGTGGCAGATATCTGCCCTGTAAACCATCTAT

a
s	mr.mrrefChr3	157668	39	+	181019	TCTTTGCATCCCCTAATATTAGACATTCACACACAACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	609779	39	+	636262	TCTTTGCATCCCCTAATATTAGACATTCACACACAACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	84329	20	-	647215	TCTTTGCATCCCCTCATATT-------------------

a
s	mr.mrrefChr3	157707	7	+	181019	TGATCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	609819	7	+	636262	TGATCTT

a
s	mr.mrrefChr3	157714	52	+	181019	TGGCCTTTACCTGGAGGCAGCCGTACAGACAAGTCAAAGCCAACATGTTCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	609834	52	+	636262	TGGCCTTTACCTGGAGGCAGCCGTACAGACAAGTCAAGGCCAACGTGTTTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	84349	35	-	647215	-----------------CAGCCGTCCAGACAAATCAAAGCCAACATGTTCTC

a
s	mr.mrrefChr3	157766	333	+	181019	TTATCTCAAGAGAGGATTTTGGAGTCTGTACAGGTGTCCTAACAATGAACTCACACAATCTCCCATCATTCAATCTTTTGCTCAGACTTTTGCCTGGTTGTCAAGACATTTCATTGAAAATGACAAGTGCATGCTTAGGTTCCCCGTACCACATCACTAGGTGGTGACTCAACTATTCAGTTACCTGTTCATTCCAAGCCAGGCTCAAGCTAATGGGAGTCTACATGGCTGTGGCTTTGTTTATACTCCTCTTGGTTTTAAATGAATGGGGATCCTGACCTTCTCAGTTTCGTGAAACCTAACTTGAAGCACTATTGCTTATAATTACAGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	609886	332	+	636262	CTATCTCAAGAGAGGATTTTGGAGTCTGCACAGGTGTCCTAACAATGAACTCACACAATCTCCCATCATTCAATCTTTTGCTTAGCCTTTTGCCTGGTTGTCAAGCCTCTTCATTGAAAATGACAAGTGTATGATTAGGTTCCCCGTACCATATCACCAGGTGGTGACTCAACTATTCAGTTACCTGTTCAATTCAAGCCAGGCTCAAGCTAATGGGAGTCTACATGTCTGTGGCTTTGTTTATACTCCTCTTGGTTTTAAATGAATGGGGATCCTGACCTTCTCAGTTTCGTGAAACCT-ACTTGGAGCACTATTGCTTATAATTACAGCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	84386	322	-	647215	TTATCTC-AGCGAGGATTTTGGAGTCTGTACAGGTGTGCTAGCAATGAACTCACACAATCTCCCATCATTCAATCTTTTGCTCAGACTTTTGCCTGGTTA-CAAGACATTTCATTGAAAGTGACAAGTGCATGCCTAGGTTCCCTGTACCACATCACTGGGTGGTGACTCAACTATTCAGTTACCTGTTTATTCGAGGC---------GCTTATGGGAGTCTACATGGCTGTGGCTCTGTTTATAGTCCTCTTGGATTTAGGTGAATGGGGATCCTGACCTTCTCAGTTTGGTCAAACTTAACTTGAAGCACTTTTGCTTAAATTAACAGCTT

a
s	mr.mrrefChr3	158099	29	+	181019	CATGATTCAAAATCACAATCAGGTAACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	610219	29	+	636262	CATGATCCAAAATCACAATCAGGTGACAC
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a
s	mr.mrrefChr3	158128	76	+	181019	CACCACTGGAGTATTACAAGGTTCGAATATAATTACAATCATCTTTATGGATTACCTGTGTTTGTGACACAGTATA
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a
s	mr.mrrefChr3	158204	62	+	181019	CATATTGACAGACAACCATTTTAAATGGAAAAAAAAGTGATAATTATTCCTCTGGGTACTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	610324	2	+	636262	------------------------------------------------------------TG
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a
s	mr.mrrefChr3	158266	111	+	181019	CTGATGTTTAGTGTTAATGTCTAATTAAATTAAATAACTAAGAGGTTTGAAGTGGTCAACTTTTGATTATCAGTTCCCTTGTCTTAGGTGTGGATCATACTCATATGCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	610326	104	+	636262	CTGATGTTTAATGTTAATGTCTAATTAAATTAACTAACCAAGAGGTCTGAAGTGGTCC-------ATCATCAGTTCCCTTGTCTTAGGTGTGGATCATACTCATATGCAGA
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a
s	mr.mrrefChr3	158377	393	+	181019	CAGACTTTGTATTTGAACCCAGAGTACATACAACATTCATCTGCTACTCCTGCCTGATATATAAGTGTGATTGAGCCTAGGGCTGACTGTCTACTGTAAATGTAACCCACAGAAGTGAGCTCTGCCCCCAGTGTCCAGTCTCATGTGTGCTAACAGTGTTGCTTGGAGCAAGACCCCCCTTCAAGTTTCAGATGCAGTATGTTGTTGATTGTTGGCAGCCAGCCTCCCGGTTTAAGTGAGGAACTATAACTGTAAGTCAATCTATGCACATAGAACTGGTTTATGTCTTCGGTCTTAATGTAGCAAGATGGTGGTTCATGTGTTCAGTCATAATGTAGCAGGATGTGAGTAGAAAGAGCCCCATTTCTAGTTCTTCCAGATTTTCATGGAAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	610430	393	+	636262	CATACTTTGTATTTGAACCCAGAGTACATATAACGTTCATCTGCTACCCCTGCCTGATATACAAGTGTGATTGAACCTAGGGCTGACTGTCTAATGTAAATGTAACCAACAGAAGTGAGCTCTGCCCCCAGTGTGCTGTCTCATGTGTGCTAACAGTGTTGCTTGGAACAAGACCCCCATTCAAGTTTCATATGCAGTATGTTGTCGATTGTTAGCAGCCAGCCTCCCGGTTTATGTGAGGAACTATAACTGTAAATCAATCTATGCACATAGAACGGTTTTATGTCTTCGGTATTAATGTAGCAAGATGGTGGTTCATGTGTTCAGTCAAAATGTAGCAGAATGTGAGTAAAAAGAGCCCCATTTCTAGTTTTTCCAGATTTTCATGGAAGC
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a
s	mr.mrrefChr3	158770	97	+	181019	GACAGGCATGCATTTCTAAAATCGATTAAAATTGGATGCAGCTAACTGTTGACAGTGTGGAAACTGCCCCCTGTACATTAGGGAGGGAATGCCTACT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	85484	92	-	647215	GTCAGGCATGTATTTACAAAAT-CATTAAAATCGGGTGCAGCTAAGTGTTGGCAGTGTGGGAACTGCCCCCTGTACATTAGGGAGGGCATG----CC

a
s	mr.mrrefChr3	158867	25	+	181019	TAGAGTGGAATTGACAATTTAGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	610913	25	+	636262	TAGATTGGAATTGACAATTTAGTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	85576	9	-	647215	TAGAGTGGA----------------

a
s	mr.mrrefChr3	158892	17	+	181019	TTTTCTGAAACAATTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	610947	17	+	636262	TTTGCTGAAACATTTCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	85585	16	-	647215	-TTTCTGAGACAATTCA

a
s	mr.mrrefChr3	158909	23	+	181019	TCCATCATAACTTCGCTCTATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	610968	23	+	636262	TCCATCATAACTTCGCTCGATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	85601	23	-	647215	TCTAACATAACCTTGCTGTATAT

a
s	mr.mrrefChr3	158932	54	+	181019	AACTGTCCATACTATTCAGCTAACAGAACCTTTCTAGCATATCATGAGTGCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	611000	54	+	636262	AACTGTCCATGCTATTCAGCTAACAGAACCTTTCTAGCGTCTCATGAGTGCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	85624	54	-	647215	AACTGTCCATACTATTTAGCTAACAGAACGTTTCTTCCATATCCTGAGTGCACT

a
s	mr.mrrefChr3	158986	37	+	181019	GATCCCTGTGTGTGAAAGGAGTAGGTAATGGGTATTG
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a
s	mr.mrrefChr3	159023	9	+	181019	TGCCCCTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	611092	9	+	636262	TGCGCCTAC
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a
s	mr.mrrefChr3	159032	21	+	181019	CGTGGTCTATACTTACAGAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	611101	21	+	636262	CGTGGTCTATACTTACAGAGC
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a
s	mr.mrrefChr3	159053	3	+	181019	TAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	611123	3	+	636262	TAC
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a
s	mr.mrrefChr3	159056	12	+	181019	CAGGGTATCCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	611127	12	+	636262	CAGGGTATCCCA
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a
s	mr.mrrefChr3	159068	8	+	181019	GGATCATT
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a
s	mr.mrrefChr3	159076	9	+	181019	CCAAGTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	611147	9	+	636262	CCAAGTGTA
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a
s	mr.mrrefChr3	159085	32	+	181019	AGATCTCTGTATGTGACATGTGTTTAAGGCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	611159	32	+	636262	GGATCTCTGTATGTGACATATGTTTAAGGCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	85789	32	-	647215	AGTCTTTTTTATGTGAGATGTGTTTAAGGCCA

a
s	mr.mrrefChr3	159117	195	+	181019	AGGATGATATGCTCATTTGTCATGGAGTGATTTGACCATTTATGCAAATGCATCCTTTTAATGACACTTACTGCACCCTATGATGCTTCACAGTCAAGAAGACAAGATTCATAGGGATATGCAATTTGTGAACTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAAAAGACTAGCAGTTATCTGTCACATAAGGCTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	611191	195	+	636262	AGGAGGATATGCTCATTTGTCATGGAGAAATTTGACCATTTATGCAAACGCATCCTTTTAATCACACTTACTGCACCCTATGATGCTTCACAGTCAAGAAGACAAGGCTCATAGGGATATGCAATTTATGAACTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAAAAGATTAGCAGCTATCTGTCACATCAGGCTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	85828	181	-	647215	AGGATGATATGCTCCTTGGTCATGGAGTGACTTGACCATTTATGTAAATACAT-CTATTAATGACATTTACTGCTCCCCGTGAGGT-------------AGACAAGATTCATAGGGATACGCAATTTGCAAATTACTATCCTACAAACTTCACAAAACACAAGAAGGCTATTAGTTATCTGTCACATAAGGCCCC

a
s	mr.mrrefChr3	159312	49	+	181019	ACAGCTGATCATATGGCTTTAATAACATAACTGGGTAGGACTTGATGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	611386	48	+	636262	ACAGCTGAT-ATATGGCTTTAATAACATAACTGGGTAGGACTTGATGAT
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a
s	mr.mrrefChr3	159361	10	+	181019	ATCTCATAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	611439	10	+	636262	ATCTCATAAG
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a
s	mr.mrrefChr3	159371	38	+	181019	AAAATATGTACATTGACTGTTGTGAAACCCAATTCTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	611449	38	+	636262	AAAATATGTACATTGACTGTTGTGAAACCCAATTCTGG
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a
s	mr.mrrefChr3	159409	43	+	181019	AAAGTGTAGGAGATACCCTAAGTGAAATTCTTCCCAACATTAT
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a
s	mr.mrrefChr3	159452	17	+	181019	CCACTTCAGAGTGTGGG
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a
s	mr.mrrefChr3	159469	18	+	181019	TGACTTTGACCGAGGACT
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a
s	mr.mrrefChr3	159487	90	+	181019	TATCTGGGTACTGTACTTGCAAAGCCCGAAAACATTGGCCTGAGATTCCCCTGGGCTACTTTAAGTAGAAGTTCTACCAACATTATGTCA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	86231	90	-	647215	TATCTGGGTACTGTACTTGCAAAGCCTGAAAACATGGGCCTGGAATTCCCCTAGGACACCTTAGGTAGAAGTTCTCCCAACATCATGTCA

a
s	mr.mrrefChr3	159577	12	+	181019	TTCAATGTGTGG
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a
s	mr.mrrefChr3	159589	111	+	181019	TTTATTAAAGGAGCCACAGCAGTTAAGCCTATGTTTGGTAGCTGGGTAGTGTACTGGCAAAGCCTGAAAACACTTGTTTGGGAAGCCCCTTGTATTGGGACTGGGGGCAAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	86333	111	-	647215	TTCATTGGAGGGTCCACAGCAGTTAAACCTATGGTTGGTGGCTGGTTAGTGTACTTGCAGAGCCCGGAAAGACTCGTGTGGGAACCACCTTGTATTGGGACTGGGTGCAGA

a
s	mr.mrrefChr3	159700	22	+	181019	GGTGGAAGCTACCAACATTAGA
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a
s	mr.mrrefChr3	159722	39	+	181019	GCGACTATGCCACCCTGGGCTAGATCTTAGGAACCCAAA
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a
s	mr.mrrefChr3	159761	36	+	181019	CTAGTTGGGCTGTGAGTATCTTGGGCTGGCGAGAAT
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a
s	mr.mrrefChr3	159797	70	+	181019	AATATCTTACAGATATTTACCATGACTTATATAAGTCCCATGCAGCACACCTCATCATACTGCACCATTA
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a
s	mr.mrrefChr3	159867	14	+	181019	CATAGTAGGAAATA
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a
s	mr.mrrefChr3	159881	31	+	181019	TCCTGTGACCCTACCAAGGGGACATTCACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	611980	31	+	636262	TCCTGTGACCCTACCAAGGGGACATTCACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	86636	31	-	647215	TCCTGCCACCCTACCAAGGGGAGGTTCATGC

a
s	mr.mrrefChr3	159912	34	+	181019	AAGATTTTAGTGCCACTAATCAGATCAGAAAAGT
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a
s	mr.mrrefChr3	159946	98	+	181019	TTAGCCTGTTGAATGAATGCCCTGATAACTATTAGTTGTACTGAGGTCGCAGCACTTGATGACTATTGGTTGTACTATTGCTCTAGCTTGGGCGTCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	612046	98	+	636262	TTAGCCTGTTGAATGAATGCCCTGATAACTATTAGTTGTACTGAGGTCGCAGCACTTGATGACTATTGGTTGTACTATTGCTCTAGCTTGGGCGTCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	86702	98	-	647215	TTAGCCTGTTGAATGAATGCCTTGATTACTGTTGGTTGGACTGCGGTCTCAGCACTTGATTACTGTTCATTGTACTATTGCTTCAGATCGGGTGACAT

a
s	mr.mrrefChr3	160044	26	+	181019	AAAGTATCAAGAGATGGAATGATGGA
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a
s	mr.mrrefChr3	160070	11	+	181019	AACCCCCTATG
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a
s	mr.mrrefChr3	160081	75	+	181019	GAGGTCGCAGCATTTGTCATTTTGATTTGGTTAATCCCAGTCTTATGACCTCCAGGGCATTTAAGCATCCTTCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	612185	75	+	636262	GAGGTCGCAGCATTTGTCATTTTGATTTGGTTAATCCCAGTCTTATGACCTCCAGGGCATTTAAGCATCCTTCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	86850	75	-	647215	GAGGTCTCAGCATTTGTCACTTTGGTTTTGTTACTCCTAGTCTTATGATCTCCAGGGCATATGAGCATCCTTCAA

a
s	mr.mrrefChr3	160156	20	+	181019	CCACAGTTAAAAATCATATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	612260	20	+	636262	CCACAGTTAAAAATCATATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	86930	20	-	647215	TCCCAGTTAGAAATCAAAGG

a
s	mr.mrrefChr3	160176	9	+	181019	TTCTTGCAC
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a
s	mr.mrrefChr3	160185	34	+	181019	TGAATTCTTGCACTGGCCTAAGATAGAATTGAGA
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	160279	74	+	181019	AAAACACTAAAGAATAATCCAGGTGGCAGAGCTAGAATAATGGTTTTACTCAAAGGCGTATTATTTCGCTCCTG
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a
s	mr.mrrefChr3	160353	60	+	181019	GTCCTGCCGATCTTGCTACTATTCTCTTGGCATCATACATTCTAAGCACCTTATCTCCAA
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a
s	mr.mrrefChr3	160413	17	+	181019	GGTTTACTGTGATTGAT
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a
s	mr.mrrefChr3	160430	23	+	181019	AATATGATTTGAGTAGTCTTTGA
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a
s	mr.mrrefChr3	160453	21	+	181019	TGAACAGCCAAGAGACTGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	612582	21	+	636262	TGAACAGCCAAGAGACTGACA
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a
s	mr.mrrefChr3	160474	4	+	181019	ACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	612610	4	+	636262	ACAA
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a
s	mr.mrrefChr3	160478	22	+	181019	CAGGGGGCGAGTGTAGAAGCAG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	87362	22	-	647215	GGGGGGGCAAGTGTAGAAGTAG

a
s	mr.mrrefChr3	160500	31	+	181019	GTGAGTTTATAGAATTGCTTAATCATGAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	612636	31	+	636262	GTGAGTTTATAGAATTGCTTAATCATGAGTT
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a
s	mr.mrrefChr3	160531	95	+	181019	AACAAGGGGTATAGGACATGGTGTGTCTGTACATCCACCCACTCAATGTTTCTCTATTTGCTACTGGGGAGTTTCTTAACCTGGAGATATCCCCT
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a
s	mr.mrrefChr3	160626	100	+	181019	TTCCCTAATGCCCTCTCCCCCATGATAATGGTGCAGATTTCAGTTCTCTCTTCAAATACAAAACTGTTGTTACTGAAATATCAGCTGGAGGTTTATCTCC
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a
s	mr.mrrefChr3	160726	12	+	181019	GCAAGACCATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	612863	12	+	636262	GCAAGACCATCT
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a
s	mr.mrrefChr3	160738	19	+	181019	TAAGACTAGGTCAGGCGAG
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a
s	mr.mrrefChr3	160757	104	+	181019	TGAATGAACAATTGCACACAACTACAAGGGCTTCCATGAAGTCCCCCTATCACGTAGACACCTGAGAACTGCCAGGAATCTAATAGTCAAGGCCTTCTGGATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	612894	104	+	636262	TGAATGAACAATTGCACACAACTACAAGGGCTTCCATGAAGTCCCCCTATCACGTAGACACCTGAGAACTGCCAGGAATCTAATAGTCAAGGCCTTCTGGATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	87791	104	-	647215	TGAATGAAGTTATACACACCACTACAACAGCTTCCGTGTGGTCCCCCTATCACGTAGACACCAGAGAACAGCCAGGGATCTAATGGCCAAAGCCTTATGGATTT

a
s	mr.mrrefChr3	160861	15	+	181019	CAAATTTGATAAGCC
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a
s	mr.mrrefChr3	160876	40	+	181019	TGTTACTATTTAGCTATCATAACCACATCCTGGGCGATAT
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a
s	mr.mrrefChr3	160916	4	+	181019	ATCA
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a
s	mr.mrrefChr3	160920	131	+	181019	GGAATCGTGTCTGGGCATGAGTTATAGTTTTACCATCTTTGACAACAACAAGTCACTTTGACCTTTTATACCTGCTTCTCTCTATTGTTCTTAGAGCATAAAAAAAGGCTGATCTTAACAGCCAATGCCAC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	87998	131	-	647215	GGAATAATGTTTGGGCATGAGTTACAGCAGTGACCTCTTTGACAACAGCAAGTGACTTTGACCTTTTATACCTGCTTCTCTCTATTGTTCTTAGAGCACAAAAAGATGCTGCTTCTAACAGCCAAGAGCAC

a
s	mr.mrrefChr3	161051	91	+	181019	ACATATATCAGATAGGCTCAAATGTTCACTCATCACTTTCGTTCATACAGACTGACAGTTCACTATGTTGAGGGTTACAGGGAGAGAGACC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	88131	91	-	647215	ACATCCATCAGATAGGCTAAAATGTTGAATCATCACTTTTGTCCGTGCAGACTGATAATTCACTATGTTGAGGTTTATAGGGAGAGGGACC

a
s	mr.mrrefChr3	161142	234	+	181019	AATTATCAGGGCATCTTTATGAGATTGCTAACCTAAAAGTGTGGTAATCTGGAAAGCTGAGGAATCTTGTTTGTAGCCATCATGCACTCAGCACTGTACTTGGGGTAGTTTGAAGAGTGGCGCAAGCACATCTTGATTATTTTTTATTTTCCATGACTGCTTTCTTCAATCACGTCCTCAATCATGATATAATCTCTTTTTCTCTCTCATTGTACAGTTTCACTATCTATAATT
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a
s	mr.mrrefChr3	161376	62	+	181019	TTTCATTGGTGCAAACACATTGTGGCAGTTAGTATTACTGAGTCTAACAACCTGGAAGGTCA
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a
s	mr.mrrefChr3	161438	110	+	181019	ATGATGCTCCTGACTTTAGTCGATGAGTCTACACTCAGTCTGTAAGGGGCTGTGTGGGACAAAATAGATTTGCCCCAGAAGATTTGAAGCAATACCAACaccactacatc
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a
s	mr.mrrefChr3	161548	364	+	181019	CAAGGTTTCTTTCTCTGGTTAGCCTTGAATCTCGGTTCATGAGTGTGAACTGATAGTCAACTTAATAACAAACAGCAGATTGAGGTGGACTCGTTATCTGGGACAATGGCTCTTTATATGTATTCTAGTGCATTGTTGTCCTAATTACAGTACACTCTACACACCAGCTGGCAGGTAGGGGCTCCAATGCACACTGTTTGTTTTTAGGTCTAGTCAAACTTGGCAACAAAAGCATAAATTGGCAAGGTTTGAAGTCCTCCATATCTTTCTAACATTCAATCATTATCAGTATGCACATAGATATCACAGATCTAGTGTAATGCAATAAAAGGGAAACTTGCAGCAGTTGATTATAAGTCTTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	614279	358	+	636262	CAAGGTTTCTTTCTCTGATTAGCCTTGAATCTCGGTTCATGAATGCGAACTAATAGCCAACTTAATGACAAGCAGCAGATTGAGGTGGACTTGTTATCTGGGACTATGGCTCTTTATATGTATTCTAGTGCATTGTTGTCCTAATTACAGTACACTCTACACACCAGCTGGCAGGTAGGGGCTCCAATGCACACTGTTTGTTTTAAGCTCTAGTCAAATTTGGCAACAAAAGCATAAATTGGCAAGGTTTG------TCCGTATCTTTCTAACATTCAATCATTATCAGTATGCACATAGATACCACAGATCTAGTGTAATGCAATAAAAGGGAAACATGCAGCAGTTGATTCTACGTCTTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	88668	349	-	647215	CAAGGTCTCTTTCTCTGGTTAGCCTTGAATCTCGGTTCATGAGTGTGATCTGATGGTCAACTTAATAAAAAACAGCAGATTGAGGTGGACTCAT----TGGAACAATGGCTCTTTATACGTATTCTAGTGCATTGTTGTCCTAATTACAGGACACGCTACACACCAGCTAGCAGGTAGAGGCTCCAATGCACACTGTTTGTCTTTAGGTCCAGTCAAGCTTGGCAACAAAGG----AATCCGCAAGGTTTGAAGTCCTCCATAACTTTCTAACATTCTATCATTATCATGATGCACATAGATATCACAAATCTAGTGTAATGCAATAAAAGGGAAGCTTGTAGCAGTTGATTATAAA-------

a
s	mr.mrrefChr3	161912	3	+	181019	GAG
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a
s	mr.mrrefChr3	161915	231	+	181019	GGTCCACTTAAATTAGATGGCTCAAAAGAGCTTTGTGGATGGTACGAACCTACCTCTACAGAAGACAGAAATTACCAGCATGCCTATGAGATTGGTCAATTCATGACACACATCTCATATAGTGTCAAAATGCCTTCCAATGCCCACAAACATTCTGCCACGAGCTTGTGTCTCAATAAACTGGTCTTGCCCATGCACCATCTAGAGTAAGATTGTGAACTGCGGAGCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	614640	202	+	636262	GGTCCACTCAAATTAGATGGCTCAAAAGAGCTTTGTGGATGGTGCAAAC-----------------------------CATGCCTATGAGATTGGTCAATTCATGACACACATCTCATATAGTGTCAAAATGCCGTCCAATGCCCACAAACATTCTGCAACGAGCTTATGTCTCAATAAACTGGTCTTGCCCATGCACTATTTAGAGTAAGATTGTGAACTGCGGAGCCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	626587	231	+	647215	GGTCCACTTGAATTAGATGGCTCAAAAGAGTTTTGTGGATGGTACGAAACTACCTCTACAGAAGACAGAAATTACCAGCATGCCTATGAGATTGGTCAGTTCATGCTGCACATCTCACACAGTGTCAACATGCCTTCCAAAGGCCACAAACTTTCTGCCACAAGCTTGTGTCTCAATGAACTGGTCTTGCCCATGCACCATCTAGAGTTACATTGTTAACTGAGGAGCCAT

a
s	mr.mrrefChr3	162146	302	+	181019	AAAATCAGATTGAATGTATGGTCCTAGGTCAGGAAGTCAGGCTTGAGACTGGAAAATAGTTGGGGTCTTTCTAGAGTGGTTCCTTGACAAGATAGGTGTCGCAATTGAAATACCAAGGTATACCATTTTAGTGTATACCACTTTAGTGGTCTAACAGAAAAGATGGGGTGGGCAAGCTTAAGTGGTCCTGATATGTCTGAGTGACCTCTGTGCCAGGTATGGTGGTCACTTGTGGGCCTTCCATGGATACATTTATGGTAACACTGGCTCTGTACATCCAGCAACATTGTCTTAGACTAGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	614848	302	+	636262	AAAATCAGATTGAATGTATGGTCCTAGGTCAGAAAGTCAAGCGTGAGACAGGAAAATAGTTGGGGTCTTTCTAGAGTGGTTCCTTGACATAATTGGTGTCGCAATTGAAATACCAAGGTATACCATTTTAGTGTATACCACTTTAGTGGTCTAACAGAAAAGATGGGGTGGGCAAGTTTAAGTGGTCCTGATATGTCTGAGTGACCTCTGTGCCAGGAATGTTGGTCACTTGTGGGCCTTCCATGGATACATTTATGGTAACACTGTCTCAGTACATCTGGCAACATTGTCTTAGACTAGCC
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a
s	mr.mrrefChr3	162448	44	+	181019	AAAATAATAGAGTCTTCCACTGACAGATCCAATTCTACCCCACG
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a
s	mr.mrrefChr3	162492	70	+	181019	CTCTACCCCAGGGTATAGTAGTAATTCAGGCCTCACATAATCCAACAGGATGCCATGCAAACAATGCAGA
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a
s	mr.mrrefChr3	162562	19	+	181019	GATACATTGTAAGCAAGTC
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a
s	mr.mrrefChr3	162581	58	+	181019	AATTGCTGGTGGCCCTACCAGTAAACACCTGAGGATGAGCTCGTGAAGTGTCAAATTG
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a
s	mr.mrrefChr3	162639	120	+	181019	GCTATTGGGTAGGAGGCAGGACTCAGGTTCATGATGTGAGCACAGCATGCTGCCTGTGAATCTAGGGGCATGAGGTTTGTATTGTACTATGAGGTCTTGCATATTTGCTAATAGATCCGT
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a
s	mr.mrrefChr3	162759	86	+	181019	CATATGCATGAGACCCAGAGCAAATGCTAAGTGGTTGAAAGCAAATCATCACACATATGATATTGTAGTATTGATTTGGGGGTAAT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	627408	49	+	647215	-----------------------------------TGAAGGCAAACCAT--CATATATGATATTGCAGTATTGGTATGGGGGTAAC

a
s	mr.mrrefChr3	162845	23	+	181019	AAATATATCAGATCAAACTCCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	615574	23	+	636262	ATATATATCAGATCAAACTCCTA
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a
s	mr.mrrefChr3	162868	56	+	181019	TCTCTAGTTTAATCAAATCAGAGGCTAGTCAAAAAGAGAGAAGGACCATATGACAT
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a
s	mr.mrrefChr3	162924	76	+	181019	GTGGGACCTGTATTGACAGGTATTGGCAAGTGTGGACCCTGTGTTAGTCAATGGGCATGAGACTATTTGAGTGACA
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a
s	mr.mrrefChr3	163000	49	+	181019	GCTGTAAACCATCCCCTCACTACTAATACTAAGGGGGGACTACTCAAAG
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a
s	mr.mrrefChr3	163049	82	+	181019	TAGACCTCCCCACAGTAATTGCTTCTTTGCCTGGGCCCTACGGCAATAGCATATGCAGATATGTTAGCATTAGAAATCATAC
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a
s	mr.mrrefChr3	163131	36	+	181019	ATGAGATCTATATTGTAATTCCTGTAATGAGCATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	615920	36	+	636262	ATGAGATATATATTATAATTCCTGTAATGAGCATAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	627750	36	+	647215	ATGAGATCTATATTGTAATTCCTGTAAAAAGAAAAG

a
s	mr.mrrefChr3	163167	260	+	181019	GTGTAAAAGCATCGAACCTTGAATACAAAACAGTGTGTGAATGGGGGTTGTGGCCTAAGGCAAATTGAAGGGTAAGTTAAGAGCACTGATCTAATTTGGCGGCTCATAAGTGATGGTCAAGGCCTGATCTACAGCTAATAAACAAACAGTGCTTATGTAAACTGGTGCCTAGCATGTACACTTTGAAGGGATAATGGGGGAGTAATCAGAATAATTGACATAGTCTTAATGTTGTTTAGATCTGGCACTGTGACTGATGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	615956	259	+	636262	GTGTAAAAGCATCGAACCTTGAATACAAAACAGTGTGTGAATGGTGATTGTGGCCTAAGGCAAATTCAAGGGTATGTTAAGAGCACTGATCTAATTTGGCGTGTCATGAGTGATGGTCAAGGCCTGATCTACAGCTAATAAACAAACAAC-TTTATGTAAACTGGTGGCTAGCATGTACACTTTGAAGGGATAATGGGGGAGTAATCAGAATAATTGACATAGTCTTAATGTTGTTTAGATCTGGCACTGGGACTTATGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	627790	255	+	647215	GGGTAAAAGCA--GAACCTTGAATTCAAAACAGTGTGTGAAGGGGGGCTGTGGCCAAAGGCAAATTGGAGTGTAAGTTCAGAGCACTGGTCTAATTAGG-GGCTCACAAGTGAAGGTCAACGCCTGGTCTACAGCTAATAAACAAATAGTGCTTATGTAAACTGGTGCCTAGT--TTACACTTTTAATGGCTAATGGAGGAGTAATCAAAATAATTGACATAGTCTTAATGTAGTTTAGATGTCGCACTGTGCCTGATGC

a
s	mr.mrrefChr3	163427	60	+	181019	AAAGCTCAAATAAAAGGCAAATGTGGCCATGTACATGCAGTTAGTGCTTGGTGATGAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	616215	60	+	636262	AAAGCTCAAATAAAAGGCAAATGCGGCCATGTATATGCAGTTAGTGCTTGGTGGTGAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	628046	60	+	647215	AAAGCTCAAATAAAAGGCAGACATGGCCATGTACACGCAGTTAGTGCTTGGCTATGAGCA

a
s	mr.mrrefChr3	163487	92	+	181019	CCGCTTGATGGGACAGAATACCACCAGAAAAACCTGTGTACATGATGCAAATAGTGAATATAATCTGACTTTGGCTCATAACATTACTATTG
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a
s	mr.mrrefChr3	163579	215	+	181019	AAACTTGCAAGGAACTGAATAGAGCCTACAATAAACAGCAAAGTTTCCCATCCTCTCAAAAATACTGCCTAGTGATACACCAGTTCTCTAAAGAGAATTACCTTTCTAGCCTTTTGGAAAGTGAAATCATCCCTGAGGAATGACACAAGTTCAATATACAGACAACTTGCCTGGACGGCTGGACTTAAGGTTGTTTGGATTCCGCAAAGTGCCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	616375	202	+	636262	AAACTTGCAAGGAGCTGAATTGAATCTACAATAAACAGCAAAGGTTCCCATCCTCTCAAAAATACTGCCTAGTGATACACCAGTGCTCTAAAGAAAATTACCTTTCTAGCCTTTTGGAAACTGAA-------------AATGACACAAGTTCAATATACAGGCAACTTGTCTGGACGGCCAGACTTAAGGTTGTTTGGATTCCGCAAAGTGCCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	628198	215	+	647215	AACCGTGCAAGGAACTGCATAGAGCCTACAACAAACAGCAAAGTTTCCCATCCTCTCAAAAATACTGCCTAGTGACACACCAGTTCTCTAAAGAGAATTACCTTTCTAGCCTTTCGGAAAGTGAAATCATCCCTGAGGAAAGACACAAGTTCAATATACAGACAACTTGCCGGGATGACTGGACTTAAGGTTGTTTGGATTTCGCACAGTGCCTC

a
s	mr.mrrefChr3	163794	14	+	181019	AAATAAAAAACAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	616588	14	+	636262	AAATAAAAAACAAA
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a
s	mr.mrrefChr3	163808	11	+	181019	CTCAGCCATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	616604	11	+	636262	CTCAGCCATGT
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a
s	mr.mrrefChr3	163819	42	+	181019	ATGCAGTTAGTATTTGGCTATGAGCCTGCACTGCTTGGCGAG
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a
s	mr.mrrefChr3	163861	155	+	181019	ATGTCAAGCGATCACAGGTACCTGTGAAGGAGCCTGCATGTGTCTCTCAAGAGTTTGTCCACCTGCCTCACACTAGAGGTTTGTCATGCATCTTGCACAGCTCCCCGCATACATTCTATATTCCCTGTCTGCCTCTTGTTCAGTTAAGTGATCAT
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a
s	mr.mrrefChr3	164016	9	+	181019	GGCACCTGT
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a
s	mr.mrrefChr3	164025	321	+	181019	CCTCTAGAAGGAGCCTGCCTGTGGGGCTATAATGGGCTCAGTCTTGCATTAGGCCATTTGTGAGCCATAGGGGATCAACCTGGCTTGTGCCAGGTTTGGCCAGCCTACAAGAATTACCAGCCTCCACCAAACCAGCTTCATCTACTATGATTGCCATGATTCTTCTTGTCAAGGTATCACTCACAAATCTATTGGTGATCAGACTTTGGTTATTACATTTCAAATAGTTGTATTGAAACCTCCCTATGTGATTGACACTATAAGTTGAAGTTCAATTTCTGCACTGCATTAGCTCTATAAAGGCAACACTCTCATAGAGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	616824	270	+	636262	CCTCTAGAAGGAGCCTGCCTGTGGGGCTATAATGGGCTCAGTCTTGGATTATGCCGTTAGTGAGCCATAGGTGATCAACCTGGCTTATGCCAGGT---------------------------------------------TCTACTATGATTGCCATGATTCTTCTTGTCAAGGTATCACTCA-AAATCTAGTGGTGATTAGACTTTGGTT-----ATTTCAGATAGTTTTATTGAAACCTCCCTATGTGATTGACAATATAAGCTGAAGTTCAATTTCTGCACTGAATTAGCTCTATGAAGGCAACACTCTCATAGAGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	628647	318	+	647215	TTTGTAGAAGGAGCCTGCCTGTGGGGTTATTATGGGCTCAGTTTTGCATTAGGCCATTTGTGAGCCATAGGGGATGAACCTGGCTAGTGCCAGGTTTGGCCAGCCTACAAGAATTACCAGCCTCCACCAAACCAGCTTCATCTTCTATGATTGCCATGATTCTTCTTATCAAAGTATCACTCACAAATCTATTGGTGATCACACTTTGGTTATTACATTTAAAATAGTTGTATTAAAACCTCCCTATGTGATTGACACTATAAGTTGAAGATCAGTTTTTGCACTGCTTTAGCTCGATAATGGTAACACTCTCATAGA---

a
s	mr.mrrefChr3	164346	84	+	181019	GGGCTGTATCAATAGGGGCTATCAGGTACCCACAAAATGTCTCCCTCAACTCACAGTGTAAGCCCTGGACACAGGAAAGAACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	617095	84	+	636262	GGGCTGTACCAACAAGGGCCATCAGGTACCCACTGAATGTTTCCCTCAACTCACAGTGTAAGCCCTGGACACAGGAAAGAACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	628965	78	+	647215	------TATCCATAGGGGCTATCAGACAACCACAAAATGTCTCCCTCAACTCAAAGTGTAAGCCCTGGATGTGGGAAAGAACTT

a
s	mr.mrrefChr3	164430	151	+	181019	ACATATACACACTCTTGAAGGGTCTACCAAGAGTAACACAACTTGGTAATGACTATGCTCTTTTCAATTGACCTTCTACACTAACATCACACTACAAATCAGGGGGTATAAGACATTCAAACAGTTTCACTAACAAAGTAGGCCAGAAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	617179	143	+	636262	--------ACACTCTAGAAGGGTCTACCAAGAATAACAGAACTTGGTAATGACTATGCCCTTTTCAATTGACCTAATACACTAACATCACACTACAAATCAGGGGGTATAAGACATTCAAACAGTTTCACTAATAAAGTAGGCCAGAAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	629059	151	+	647215	ACATATACACACTCTTGAAGGCTATATCAACAGTAACACAACTTGGTAATGACTATGCTCTTTTCAATTGACCTTCTACACTAACATCACACTACAAATCAGGGGGTATAAGACATTCAAACATTTTCACAAACCAAATAGGCCATTAGAA

a
s	mr.mrrefChr3	164581	6	+	181019	ATGAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	617322	6	+	636262	ATGAGC
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a
s	mr.mrrefChr3	164587	28	+	181019	TCTAAGACCCCAGTTGTTATGTTATAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	617331	28	+	636262	TCTAAGACCCCAGTTACTATGTTATAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	629236	28	+	647215	TCTAAGACCCCAGTTGTTATATCATAAA

a
s	mr.mrrefChr3	164615	254	+	181019	GTTAACTTATTACCTATTCTTGACTCCTCCAAAAAAATTACAGCGCTATGTACCTGATGCTATAGCAGAACAGACATTGCATTGGGGTTGAAGTACCACATTTTGGTTGCCTGAAGTACCACACACCAGTTGACAAAATTCAAAAAAAAGGTACACTGCTTGTTGTATGGGTAGGTTAGCATGAGTAGAAATGGACCATGTGTATTGTGTTGAAAGCCTTGCTACTTAGCCTATGTCACTATTCCCCCACAAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	617359	250	+	636262	GTTAACTTATTACCTACTCTTGACTCCTCCAAAAAAATCACAGCGCTATGTACCTGATGCTATAGCAGCGCAGACAGTGTATTGGGGTTGATGTATCACATT----CTGCCTGAACTACCACAAACCAGTTGACAAAATTCAGAAAAAAGGTACACTGCTTGTTGTATGGGCAGGTTAGCATGACCAGAAATGGACCATGTGTATGGTGTTGAAAGCCTTGCTACTTAGCCTATGTCACTATTCCCCCACAAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	629265	252	+	647215	GTTAGCTTATTACCTATTTTTGACTCCTCCAAAAAAATTACAGTACTATGTACCTGATGCTACAGCAGAACGCACATTGCATTGGGTTTGAAGTACCACATTTTGGTTGCCTGAAGTACCACACACCAGTTGACAAAATTAAAAAAACAGGAACACTGCTTGTTGTACTGGTAGGCTAGCATGAGTAGAAATGGACCATGTGTATTGTGTTGAAAGCC--GCTACTTAGCCTATGTCACTATTTCCCCACTAGG

a
s	mr.mrrefChr3	164869	130	+	181019	CCCACTGGGCAAAGTTGTCTCATATAATCTAGATGAAAGAACAATTCAATTCTCACAAAATGGAACCGTGTTGTACTCTGGTTTTTTCATGGCACTGGGGAACCCTCCACAATTGCCAGGGATAATAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	617617	130	+	636262	CCCACTGGGCAAAGTTGTCTCATATCATCTGGATGAAAGAACAATTCAATTATCACAAAATGGAAACATGTTGTACACTGCTTTTTTCATGGCACTGTGGAACTCTCCACAATTGCCAGGGATAATAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	629517	130	+	647215	CCCACTGGGTAAAATTGCCTCATATAATATAGATGAAAGGACAATTCAATTCTCATAAAATGAAGCCGTGTTATACTCTGGTTTTTTCATGGCACTGGGGAACCTACCACAATTGCCAGGGGTAATAACC

a
s	mr.mrrefChr3	164999	241	+	181019	TATATTCTTCATAGTTAAAAAAAGATTGCAAGAAAGCCTGAGTTTTTCCTGATAAGTTTTACAACCTTACCGGATAACTAGGAAAAATTGGCAATATAACGTAGGGGATATTAAGTGACATAATACCTAATCACCACAATAGATTGATACTGGTGAATGTTATATGGCAGAAGATTAGTAAAAGAACACATTAACTTCTCCTGTGGCTCAGAGGAAAGGATGGGGTTACACATAGGATGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	617750	240	+	636262	TATTTTCTTCATGGTTAAAAAAAGATTGCAAGAAAGCCTGAGTCTTTCCTGATAAGTTTTACAACCTTAACGGATAACTAGGAAAAATTGGCAAAATAGCATAGGGGATATTAAGTGACATAATACCTAATCACCACTATATATTGATA-TGGGGAATGTTATATGGCAGAAGATTAGTAAAAGAACACATTAACTTCTCCTGTGGCTCAGAGGAAAGGATGGGGTTACACATAGGATGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	629647	241	+	647215	TAAATTCTTCATAGTTAAAAAAAGACTGCAAGAAAGCCTGAGTTTTTCCTGATAAGTTTTACAACCTTACTGGATAACTAGGAAAGATTGGCAATACGACGTAGTGGATATTAAGGGACATAATACCTACTCACCACAATAGATTGATACTGGTGAATGTTGTATGGCAGAAGATTAGTAAAGGAACACGTTAACTTCTCCTGTAGCTCAGAGGATAAGATGAGCTTACAGACAATGTGAG

a
s	mr.mrrefChr3	165240	4	+	181019	GTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	617990	4	+	636262	GTTA
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a
s	mr.mrrefChr3	165244	47	+	181019	AGTGGACTGGTCTTTACACTATACCCTTTGTGGGCAAGAGGGGGGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	617995	47	+	636262	AGTGGACTGGTCTTTACACTATACCCTTTGTGGGCAAGAGGGGGGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630119	47	+	647215	AATGGACTGATAGTTACACTAGATCCTTTGTCAGCAAGAGGGGGGGA

a
s	mr.mrrefChr3	165291	18	+	181019	TCAACCAGCTGGGTCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618042	18	+	636262	TCAACCAGCTGGGTCCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630186	18	+	647215	TCAAATGGCTGGGTCCAG

a
s	mr.mrrefChr3	165309	39	+	181019	GTGGCTGGGTAAACCAGGAGTTGAAGGTCTCTAACAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618060	39	+	636262	GTGGCTGGGTAAACCAGGAGTTGAAGGTCTCTAACAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630211	39	+	647215	GTGGCTGGGTAAATCCGGAGTTGGTGGTCTCTAACAAGG

a
s	mr.mrrefChr3	165348	5	+	181019	CCATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618099	5	+	636262	CCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630253	5	+	647215	CCCTA

a
s	mr.mrrefChr3	165353	12	+	181019	CTGAGTACCAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618106	12	+	636262	CTGAGTACCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630258	12	+	647215	CAAAGAACCATC

a
s	mr.mrrefChr3	165365	8	+	181019	AAAAAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618118	8	+	636262	AAAAAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630274	8	+	647215	AAAAAACT

a
s	mr.mrrefChr3	165373	30	+	181019	GGTAATCATAGGTCAGTCAAAACCAGTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618129	30	+	636262	GGTAATCATAGGTCAGTCAAAACCAGTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630282	30	+	647215	GGTTCTGACTGACCAATGGTTGCCTATACT

a
s	mr.mrrefChr3	165403	16	+	181019	TGGCGCAATGGCGCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618160	16	+	636262	TGGCGCAATGGCGCTC
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a
s	mr.mrrefChr3	165419	37	+	181019	ATTGTAGAGGGCCCTTGCAGATAGTTGTGTTGGGTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618176	37	+	636262	ATTGTAGAGGGCCCTTGCAGATAGTTGTGTTGGGTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630330	37	+	647215	ATTATGGTTATGCTTTGCAGATAGTTGTGTTAGAGCT

a
s	mr.mrrefChr3	165456	22	+	181019	TATGTGATTAATGATATCAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618213	22	+	636262	TATGTGATTAATGATATCAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630371	22	+	647215	TATGTGATTAATGATATCAGTT

a
s	mr.mrrefChr3	165478	97	+	181019	ACTTTCAGGATTTTAGCACCCTCCAAAAAGGTCAGAGATAAGCCAGGAAGTACTCAGATAACTGATTGGTGCGGGGTGCGCTGCTAGAAGATTGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618258	97	+	636262	ACTTTCAGGATTTTAGCACCCTCCAAAAAGGTCAGAGATAAGCCAGGAAGTACTCAGATAACTGATTGGTGCGGGGTGCGCTGCTAGAAGATTGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630393	97	+	647215	ACTTTCAGGATTTCAGCACCCTCCAAAAAGGTCTCAAATAAGCCAGGCAGTACTCCGATCACTGATTGGTGTGGGGTGTACTGCTAGGAGATTGCAA

a
s	mr.mrrefChr3	165575	32	+	181019	CATTAGGAAAGGTAGGTAGGGAACTTACATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618356	32	+	636262	CATTAGGAAAGGTAGGTAGGGAACTTACATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630490	32	+	647215	CATTAGGAAAGATAGGTAAGGAACTTACACAC

a
s	mr.mrrefChr3	165607	8	+	181019	AAGGGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618388	8	+	636262	AAGGGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630528	8	+	647215	AAGAGTAT

a
s	mr.mrrefChr3	165615	12	+	181019	CCAAAAGTGGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618397	12	+	636262	CCAAAAGTGGTA
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a
s	mr.mrrefChr3	165627	54	+	181019	CATTTGGTGATTACTATGACCTGTGCATCTGACTTTGTATAACAACATCACAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618409	54	+	636262	CATTTGGTGATTACTATGACCTGTGCATCTGACTTTGTATAACAACATCACAAC
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a
s	mr.mrrefChr3	165681	7	+	181019	AAAATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618463	7	+	636262	AAAATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630613	7	+	647215	GAAATCA

a
s	mr.mrrefChr3	165688	17	+	181019	GGGGCCTTACAACATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618470	17	+	636262	GGGGCCTTACAACATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630621	17	+	647215	GGGACAATACAATGTTC

a
s	mr.mrrefChr3	165705	100	+	181019	AAAAACATTTTCACGACCGGGGGTCATACAACGTTCAAAAGACAGTTTCACTAACAGAGTAGGCCAGGCGAAACAAGGTCCATGACGTAGGTTGTCAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618487	100	+	636262	AAAAACATTTTCACGACCGGGGGTCATACAACGTTCAAAAGACAGTTTCACTAACAGAGTAGGCCAGGCGAAACAAGGTCCATGACGTAGGTTGTCAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630639	100	+	647215	AAAAACAGTTACACAATCAGGGGACATGCAACGTTCGAAAGACAGTTTCACTAATAGAGTAGGCCAGATAAAACAAGGTCCTTGACCTAAGTTGTCATTA

a
s	mr.mrrefChr3	165805	21	+	181019	TAGTCAAATTTCTTATTATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618587	21	+	636262	TAGTCAAATTTCTTATTATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630740	21	+	647215	TAGTCAGATTACTTATTACCA

a
s	mr.mrrefChr3	165826	38	+	181019	ACTCTTAACTCCTTGAAAAAAAGCACAGCACGAGATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618608	38	+	636262	ACTCTTAACTCCTTGAAAAAAAGCACAGCACGAGATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630762	38	+	647215	ACTGTTGACTCATTGAAGAGAAGCACAGCACAAGGTAC

a
s	mr.mrrefChr3	165864	27	+	181019	TACCTCATCTCAATTACCCCCCAGTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618762	27	+	636262	TACCTCATCTCAATTACCCCCCAGTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630800	27	+	647215	CACAGTAGCTCAGTTACCCCCTGGTTC

a
s	mr.mrrefChr3	165891	191	+	181019	TAACAAACAATACAGGAACTAGAATAAACTGTTACTCTTACTGTATAGGTAGGTCAAGTTTGAGTAGACCATCTGTAGTATCACTATGTTACCACAACACAAGATGGCCTCATATAATAAAAATGAAAGGACAATCCCAGTCTCACAGTGAAGATGTGCTACACTCTTAGTTTTTGTTACCACTGGAGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618792	190	+	636262	TAACAAACAATACAGGAACTAGAATAAACTGTTACTCTTACTGTATAGGTAGGTCAAGTTTGAGTAGACCCTCTATAGTATCACTATGTTAGCACAACACAAGATGGATTCATATAACAAAGATGAAAGGACAATCCCAGTCTCACAGTGAAGATGTGCTACACTCTTAGTTTTTGTCACCACTGGAGGA-
s	simRat_chr6.simRat.chr6	630827	191	+	647215	CAACAAACAATACAGGAAATAGAGTAAAATGTTACTCTTAATGTATGGGTAGGTCTGGTTTGAGTACACCATCTGTAGTATCACGATGTTGCCACCACACAAGATGGCCTCATATAATAAAAATGAAAGGACGATCCCAGTCTCCCCGTGAAGATGTGATACACTCTTAGTCTTTGTTACCACTGGAGGAG

a
s	mr.mrrefChr3	166082	127	+	181019	AAGGAATCCTCCATAGTTGCCAGGGATGCTAGCATTTATCATAATTAAAAGGATGTTGCAGGGGGCCCTGAGTTTTTAGTGATATAGGTCTGATAGCTTGTTGAGTACTTGTTTAGTAATATGGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	618982	127	+	636262	AAGGAATCCTCCATAGTTGCCAGGGATGCTAGCATTTATCATAATTAAAAGGATGTTGCAGGGGGCCCTGAGTTTTCAGTGATATAGGTCTGATAGCTTGTTGAGTACTTGTTGAGTAATATTGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	631019	108	+	647215	ACTAGATCCTCCATAGTTGCCAGGGCTGCTAGCATTTATCATAATTAAAAGGACATTGGTGGGGGCCCGGAGTTTTTAATGATA-------------------AGTCTCAGTTTAGTAATATGGTTT

a
s	mr.mrrefChr3	166209	66	+	181019	GGATTTCACACAGTGCTCTTGTACAAAGCTTGAATGAAAGGCAAAGTGTGGTCATGCACCCATGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	619109	61	+	636262	GGATTTCACACAGTGCTCTTGTACAAAGCTTGAATAAAAGGCAAAGTGTGGCCATGTACCC-----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	631128	65	+	647215	AGCTGTCACATAGTGCTCTCATGCAAAGCTCCAATGAAAGGCAA-GTGTGGTCATGCACCCATGGA

a
s	mr.mrrefChr3	166275	16	+	181019	ATTAAAACATGCACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	631194	16	+	647215	ATTAAAACATGCACTA

a
s	mr.mrrefChr3	166291	126	+	181019	TTGCCTGAAATTATAACATGCGCTACTATCATAATCAGCTAAGCAGGTAGTGAAATAAAAACTCATATTTTATAAAAGCACACCTCTTCCAATTTATCTCCAGTAATTTTAGCCCACAATCCCCCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	619170	121	+	636262	TTGCCTAAAATTAAAACATGCGCTATTATCATAATCAGC----CAGGTAGCAAAATAAAAACTCATATTTTATAAAAGCACACCTCTTC-AATTTATCTCCAGTAATTTTATCCCACAATCCCCCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	631213	123	+	647215	TTGCATGCACTTATTGCATGCACTACTATCCTAATCAGCTAAGCAGGTAGTGAAATAAAAACTCATATTTTATAAAAGCCCACCT---ACAACTTGTCTCCAGTAATTTTAGTCCACAATCCCCCC

a
s	mr.mrrefChr3	166417	200	+	181019	ACATCACAGGTGAACTAATAATTGCAAGGGTAGTCTACAGTGTTTCTAGGGTTAAAACCACATGAGAGTTGTCCCTATGGAAGGCTCAAATAGAGTCTTGAAGGAACCCTTAGGCCATTTACTCTTGTTGATATTAAGAAATTGGTAGAGAAAGTAAGAAAAATGACAATCAAACACTTAGAACATACATTGTGCCACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	619300	200	+	636262	ACATCACAGGTGCACTAATAACTGCAAGGGTAGTCTACAGTGTTTCTAGGGTTAAAACCATATGAGAGTTGTCCCTATGGAAGGCTCAAATAGAGTCTTAAAAGAACCCTTAGGCCATTTACTCTTGTTGATATTGAGAAATTGGTAGAGAAAGTAAGAAAAATGACGGTCAAACACTTAGAACATACATTGTGCCATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	631336	200	+	647215	ACATAACAGGTGAATTAATAATTGCAAGGGGAGTATACAGTGTTTCAAGGGTAAAAACAACATGAGAGTTATCCTGATGGAAGGTTCAAATAGAGCCTTGAAGGAACCCCTAGGCCATTTACTCTTATTGATACTAAGAAATTGGTAGGGAAACTAAGAAAAATGACAATCAAACACTTAGAACGTGCATTGTGCCACAA

a
s	mr.mrrefChr3	166617	190	+	181019	GCAGACTTGCAGGCCTTTAGTTCTGTTCCCGGATTGTTTGGCACCTTCTTACTAGCCTCTCACCATCTGTCATGTCTGGGCATAATATCAGGCCACATATCTGTCCTTGTAAAGATGTTAGGCTACAAGAGCAATACCCTGTCACATCTCATTCATCCTTCAACCTGCATTTAGGAGATCTGAGCAATGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	619500	190	+	636262	GCAAACTTGCAGGCCTTTAGTTCTGTGCCCGGATTGTTCAGCACCTTCTTACTAGTCTTCCACCATCTGCCATGTCTGGGCATAATATCAGGCCGCATATCTGTCTTTGTAAAGATGTTAGGCTACAAGAGTAATACCCTGTCACATCTCATTCATCCATCAACCTGCATTTAGGAAATCTGAGCAATCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	631544	190	+	647215	GCAGACTTGCAGGCGTTTAGTTCTGTTCCCAGATTGTTTGGCACCTCCTTACTAGCACCTCACCATCTGTCATGTCTGGGCATAATAGCAGGCCACATATCTGTTCTTGTAAAGATGTTAGACTACAAGAGCAATACCCCTTCACATCTCATTCATCCTTCAACCTGCATTTAGTAGATCTGAACTATGC

a
s	mr.mrrefChr3	166807	54	+	181019	CACTGACTGAACAAACCATTAGCTTACTAGAGGATAGGCAGGCAAGACCAGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	619730	54	+	636262	CACTGATTGAACAAACCATTAGCTTACTAGGGGAAAGACAGGCAAGACCAGTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	631734	54	+	647215	CACTGACTGAGTAAACCATTGTCTTACCAGAGAATAGGCAGGCAATACCAGCGT

a
s	mr.mrrefChr3	166861	142	+	181019	TGGGTTTACTGGCCAATGATAATGCCACATGTTATAGTATGCTGAACAGTGTGTTCGGTTTGGTCCCAAGAGAGACAATTACTTGATTATTACCTGAATGGATATTTCAACACATAGAAGTGGGTGAGAAAGAAAAGTAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	619792	141	+	636262	TGGGTTTACTGCCCAATGATAATGCCACATGTTATAGTATGCTGAACAGTGTGTTCGGCTGGGTCCCAAGGTAGGCAATTACTTGATTATTACCTGAATGAATA-TTCAACACATAGAAGTGGGTGAGAAAGAAAAGTAAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	631788	142	+	647215	TGGGTGTACTGGCCAATGTTAATGCCACATGTTATAGTATGCTGAATAGTGTGTTGGGTCTGGGCCCAAGAGAGACAATTACTTGATTATTACCTTAATGGATATCTCAACATCTAGAAGTGGGTGAGAAAGAAAAGTAAAA

a
s	mr.mrrefChr3	167003	285	+	181019	ATTTGGCTGTAAGACATGTATTGTGACTTTTATGGACTTAACTTACCTGGCCCAGACTTTTTGAAAGTAATTTCAAATCAAAGAGCAATAGAGTGAGATGCCTCATGCCCTATCATTAAAGCTAACCAAGATTAGACTACCTTAGTCATTCCATTTGAGTGATCTTTTAATAGCTGCAAATCCTGCAAATAAATGCATGCCTTCTTTGAGGTTCCATTTTAGAGGGCAATTGTGGATACATAAACTGTAAGAGTCTTATGAGGGCACCAAAAAGGATGCCACAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	619933	284	+	636262	ATTTGGCTGTAAGACATGTATTGGGACTTTTATGGTCTTGACTTACCTGGCCCAGACTTTTTGAAAGTAATTTCAAATCCAACA-CAACAGAGTGAGATGCCTCATGCCCTATCATTAAAGCTAACCAAAATTAGACTACCTCAGTCATTCCATTTGAGTGATCTTTTAATAGCTGCAAATCCTGCAAATAAATGTATGCCTTCTTTGAGGTTCCATTTTAGAGAGCAATTGTGGATACATAAACTGTAAGAGTCTTATAAGGGCACCAAAAAGGATGCCACAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	631933	272	+	647215	ATTTGGCTGCAAGACATGTATTGTGCCTTTTGTGGAATGAATTTACCTGGCCCAGACTTTCAGAAAGTAATTTCAAATCAAAGAGCAATACA------TGCCTAATGCCCTATCACTAAAGCTAACCAAGATTAGACTACTTTTGTCATTCCATTTGAGTGATCTGTTGATAGTTGCTAACCCTGCAAATAAATGCATGCCTTCTTTGAGGTTCCATTTTAAATGTCAGTTGTGGATACATACACTGTAAG-------TGGGGGTGCCAAATAGGATGCCACAGA

a
s	mr.mrrefChr3	167288	32	+	181019	AATGAGACTAGGACAAGGTAACTGATTTACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	620217	32	+	636262	AATGAGACTAGAACAGAGTAACTGATTTACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	632211	32	+	647215	AATGAGACTAGGAAAAGGGAACTGATTTATAG

a
s	mr.mrrefChr3	167320	24	+	181019	TAGTAAGTAGGCCACTGCTACTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	620278	24	+	636262	TAGTAAGTAGGCCACTGCTACTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	632243	24	+	647215	TAGAAAGTAGACCACTGCTACTCT

a
s	mr.mrrefChr3	167344	146	+	181019	GTGCCCCCAAATTCGAACAATTACATGAGGTTCAATCATATAAAAATCATGTCACACAACATAACTAAATAACATATGAGGATCTTGCAGACATCTTTGGCCCCTCGTTCTCCAATAGAGCCTTTGTCAGTGCCTACTTGTATTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	620303	146	+	636262	GTGCCCCCAAATTCGAACAATTACATGAGGTTCAATCATATAAAAATCATGTCACACAACATAACTAAATAACATATGAGGATCTTCCAGACAACTTTGGCCCATGGTTCTCCAATAGAGCCTTTGTCAGTGCCTACTTGTATTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	632267	94	+	647215	GTGCCCCCAAATTTGAACAATTACATGAGGATTAATCATATAAAAATCATGTCACACA-----------TAACATATGACG-TATTGCAGACATCTTTGGCCCCTC----------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr3	167490	133	+	181019	CAATAGAGCCTTTGTCAGTGCCTACTTGTACTACAAAATTCCCTCATCAGCTGGTTTAAATGATGTCTTAGTGTAATCTAACTCTTTTGAGTCTCACCCTTTTGTGACTTATTGGAGTGTGGAAATGTTCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	620495	132	+	636262	CAATAGAGCCTTTGTCAGTGCCTACTTGTATTACAAAATTCCCTTATCAGCTG-TTTAAAGGACGTCTGAGTGTAATCTAACTCTTTTGAGTCTCACCATTTTGTGACTTATTGGAGTGTGGAAATGTTCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	632361	132	+	647215	CAATAGAGCCTTTGTCATTGCCTACTTGTACTACAAAATTCCATCAGCA-CTAGTTCAAATGTTGTCTTAGTGTGGCCTAACTCTTTGGAGTCTTGCCCTTTTGTGACTTATTGGAGTGTGGCACTGTTCTTT

a
s	mr.mrrefChr3	167623	17	+	181019	GCGGTCTGGAGTGATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	620633	17	+	636262	GCGGTCTGGAGTGATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	632493	17	+	647215	GTAGCCTGGAGTGATGT

a
s	mr.mrrefChr3	167640	18	+	181019	TGTGAAGTGATGTTTATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	620655	18	+	636262	TGTGAAGTGATGTTTATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	632510	18	+	647215	TGTCAAGTGATCTTTATC

a
s	mr.mrrefChr3	167658	22	+	181019	CCTATTCTTGCCAATCCATCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	620673	22	+	636262	CCTATTCTTGCCAATCCATCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	632540	22	+	647215	CCTAGTGTTGCCAATCCATCAC

a
s	mr.mrrefChr3	167680	40	+	181019	GAAAGTTCCAGTGAGTTATTGGCAAGTGACCAGTCTGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	620695	40	+	636262	GAAAGTTCCAGTGAGTTATTGGCAAGTGACCAGTCTGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	632564	40	+	647215	GAAAGTTCCAGTGAGTTATAACCAAGTGACCACTCAATTT

a
s	mr.mrrefChr3	167720	106	+	181019	GTATTCCATCAATTTTTGATGTTACCTACTTCACAAACAAAAAACCAGTCCATTACATCCTCTAACTAGCTTGTCCCAAGAGCTGGATGGCGTAGCTCTCCATGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	620735	106	+	636262	GTATTCCATCAACTTTTGATGTTACCTACTTCACAAACAAAAAACCAGTTCATTACTTCCTCTAACTAGCTTGTCCCAAGAGCTGGATGGCATAGCTATCCATGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	632612	106	+	647215	GTATTCCATCAATTTTTGATGTTACCTACTTCACAAACAAAAAACCAGTCCATCACACTCTCTAACCAGCTTGTCCCAAGAGCTGGATGACGTAGCTCTCCATGTT

a
s	mr.mrrefChr3	167826	141	+	181019	GCCCAAAATGATCTGAGTTGACGGTGCTGAAAGAAGTCATAAGCTTTATACTATTTTTTTGATTTGAATGCCATCCAGTTTGGTATTGATAAATGTCTTGGATAGATGGTCTAAAGTTTGAGAAATTGACTTGATATCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	620844	133	+	636262	GCCCAAAATGATCTGAGTTGACGGTGCTGAAAGAAGTCATAAGCTTTATATTATTTTTTTGACTTGAATGCTGTCCAGGTTGGTTTCGATAAATGTCTTGGATAGATGG--------TTGAGAAATTGACTTCATATCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	632718	134	+	647215	GCCCAAAATGATCTGAGCCAACGGTGCTGAAAGGAGTCATAAGCCTTATAC------ATTAATTTGAATGCCAT-CAGTTTGGTATTGATAAATGTCCTGGATAGATGGTCTAAAGTTTGAGAAATTGGATAGGTATCATG

a
s	mr.mrrefChr3	167967	106	+	181019	TCAACTTATCATAAGTTGTGCCATTGATGAGGCCCCCATTGCAACTATGCATACAGATGAAAAGGAGCTTATGTATAATAGGGGTATCATGAATTGTCAATGATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	620979	106	+	636262	TCAACTTATCATAAGTTGTGCCATTGACGAGGCCCCCATTGCAACTATGCATACAGATGAAAAGGAGCTTATGTATAATAGGGGTATCATGAATTGTCAATGATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	632852	32	+	647215	--AATTTGCAATGATTGATCACACTGATTAGGTA------------------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr3	168073	45	+	181019	TGTGAAACCTAATTAAATATTTCTGTAGTACTAGGACCATGAAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	621086	45	+	636262	TGTGAAACCTAATTAAATATTTCTGTAGTCTTAGGACCATGAAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	632884	27	+	647215	------------------ATTTCTGTAGTACTAGAATCATGAAGC

a
s	mr.mrrefChr3	168118	147	+	181019	ACCTTACTAATTCCTTAATTGCAGGCAAGGGCTTACTGGTGCTTCAGTGCTAGGCAGGCATGCCTAGTGAAGTAGACCCAGGGTTACAACTGGACTTCTGTTGGACTGCTATTCTGGATTCGAAAACCTAAGGACTCAGGGCAGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	621131	139	+	636262	ACCTTACTAACTCCTTAATTGCAGGCAA--------TGGTGCTTCAGTGCTAGGCAGGCATGCATAGTGAACTAGACCTAGGGTTACAATTGGACTTCTGTTGGACTGCTATTATGGATTCGAAAACCTAAGGACTCAGGGCAGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	632919	147	+	647215	ACCTTACTAATTCTCTAATTGGAGGTAGGGGCTTACTGGTGCTTCAGTCCTAGGCAGGCATGCCCACTGTAGTAGACCCAGGGTGACACCTGGACTTCTTTTGGACTGCTATTCTGAATTCAAAAACCTAAGGACTCAGGGCAGCAT

a
s	mr.mrrefChr3	168265	19	+	181019	GTCTCCCAAAAATGGTGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	621270	19	+	636262	GTCTCCCGAAAATGGTCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	633074	19	+	647215	GTCTCCCAAAAATGGTGTC

a
s	mr.mrrefChr3	168284	170	+	181019	ATCATACATAGACAGGACAGCTCCTATTGGGATGTCCCTGAAATGCCCAGACCAAAGAAAAAATATCAACCCCAAATGATTGCATTGACTTGACTCCCACCTTGTAATATTGGGAAACTCTGCCAGCTAGTCTCAATTAGAGATGATAGGCTCGTCAGGTTCAGCCCCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	621290	170	+	636262	ATCATACATAGACAGGACAGCTCCTATCAGGATGTCCCTGAAATGCCCAGACCACAGAAAAAATATCAACCCCAAATGATTGCAATGACTTATCTCCCACCTTGTGATATTGGGAAACTCTGCCAGCTAGTCTCAATTAGGAATGACAGGCCTGTCAGGTTCAGCCCCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	633093	170	+	647215	ACCATACATAGACAGGACAGCTCCTATTGGGATGTCCCTGAAGTGCCCAGACCAAAGAAAAAATATCAACCCCAAATGATTGCATTGACTTGACACCCACCTTGTAATATTGGGAAACTCTGCCAGCTAGTCTCAATTAGAGATGATAGGCTCGTCAGGATCAGCCTCCT

a
s	mr.mrrefChr3	168454	96	+	181019	TCTGGTATCAATTTGATACTGTGATCTTCATCTGTGTGAACTCATGACTTTAACAATGAAGATTATAGCCTTGAAAAATGCATCCTGTTGAATGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	621461	96	+	636262	TCTGGTATCAGTTTGATACTGTGATCTTCATCTGTGTGAACTCATGACTTTAACGATGAAGATTATAGCCTTGAAAAATGCAGCCTGTTGAATGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	633263	96	+	647215	TCTGGTATCAATTTGATACCATGATCTTCTTTTGTGTGAAATCATGACTTTAACAAAGAAGATTACATCCTTGAAAAATGCATCCTGCTGAATGTT

a
s	mr.mrrefChr3	168550	113	+	181019	TTGGCATTTTTAACACTGGCTTTCCATTGTAACACCCTCTTTCCCAACAATTTTAATACTGCTGTCTGGCTAGATTAACTGTCTTGCTTAATGTGCTTGACTGAGAGTACTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	621564	113	+	636262	TTGGCATTTTTAACACTGGCTTTCCACTGTAACACCCTTTTTCTCAACAATTTTAATACTGCTGTCTGGCTAGATTGACTGTCTTGCTTAAAGTGCTTGACTGAGAGTACTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	633359	112	+	647215	TTGGGATTTTTAACACTGGCTTCCCATCATAACACACTCCTTCCCAACAATTCTAATACTG-TGTCTAGCTAGATTAACTGTCTTGCTTAATGTGCTTGATTGAGAGTACACA

a
s	mr.mrrefChr3	168663	271	+	181019	AGTTGAACTAGACTCACCTTTTAGTTTCAATTCACTAGTCTGTATCATGTTCACTACTCCACAGGCCAGTCTACTCAGTTTGTTACCTTTTGTTTGCTAGTAGGCTGATCTATTTGAGCCAATATTTTACAACACAGAGATGGGCCTTCATAGACTTTTGTACGCTGTCCAAGCATTCTATGAGCCTAACAGAATTCAGCCCTTTATGGTTCAACATCTTGCATCCTTGAAACCTTGGAATTCCCGGTTGAGCAAATGAAACTTGACAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	621677	270	+	636262	AGTTGAACCAGACTCACCTTTTAGTTTCAATTCACTAGTCCGTATCATATTCACTACTCCACAGGCTACCCTACTCAGTTTGTTACCTTTTGTTTGCTAGTAGGCTCATCTATTTCAGCCAATATTTTACAACACAGAGATGGGCCTTTGTAGACTTTTGTACGCTCTCCAAGCATTTTATGAGCCTAACAGAATTTGGCCCTTTATGGGTCAACATCTTGCATTCTTGAGACCTCGGAATTCCCGGTTGAGCAATTGAAACTT-ACAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	633473	258	+	647215	ATTCGAGCTGGAATCACCTCTTAATTTCAATTCACTAGCCTGTATCATGTTCACTA---------CCAGTCTACTCAGTTTGTTACCTGTGGTTCGCTAGTAGGCTGATCCACTTGAGCCAATATTTTACAACACAGAGATGCGCCTTCATAAGCTTTTGTAAGCTGTCTAAACATCCTATGGGCCTAACAAAATTCAGTCCTTT----TTCAACATCTTGCATCCTTGAAACCTTGGAATTCCCAGTTAAGCATACGAAACTTGACAGCA

a
s	mr.mrrefChr3	168934	112	+	181019	AAGCTTTAGCAGATAAAGGGCACTGCAACCCTCAGTCAAGGAGCTTGGTTCCACAGCACACCATTGAGGATAACCATTGATGGTTCCAAGTTTAGAGGACATGAAGAATTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	621953	112	+	636262	AAGCTTTAGCAGATAAAGGACACTGCAACCCTCAGTCAAGGAGTGTGGTTCCACAGCACACCATTGAGGATAAGCATTGATGGTTCCAAGTTTAGAGGACATGAAGAATTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	633731	112	+	647215	AAGTTGTAGCAGATAAAGGGCACTGCAACCCTAGGACAAAGACCTCGGTTCCACAGCACACCATTGAAGGTAACTTTTGATGGTTCCCAATTTAAAGGACATGAAGAATTTT

a
s	mr.mrrefChr3	169046	23	+	181019	GATCTCAAGGCCTAGTGACCTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	622065	23	+	636262	GATCTCAAGGCCTAGTGACCTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	633844	21	+	647215	GGTCTCAAGGCC--GTGACCTAT

a
s	mr.mrrefChr3	169069	63	+	181019	TTATCTAAGTTCTTTCGTACTAATTTACTGACCATAAGGGTAGTGCATAATTTGATACTATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	622088	35	+	636262	TTATCTAAGTTCTTTCGTACTAATTTACTGACCGT----------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	633870	63	+	647215	TTATCTAAGTTCTTTCATACTAATTTACTGACCACAAGGGTAGTGCATAATTTGATACTATAG

a
s	mr.mrrefChr3	169132	56	+	181019	GCAATCAATTAAAAATTGCCTTTCAAATTGCCCTTATTCAGTCCCAAGGGTGTTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	622123	30	+	636262	--------------------------ATTGCCCTTAATCAGTCCCAAGGGTGTTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	633944	56	+	647215	GCAATCAATTAAAAATTGCCTTTCAAATTACCCTTATTCAGTTTCATGGGCCTTCA

a
s	mr.mrrefChr3	169188	42	+	181019	CCCAACCTAGTGAGGAATGATTCCTAGAATAATATGACTTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	622153	42	+	636262	CCCAACCTAGTGAGGAATGATTCCTAGAATAATATGACTTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	634025	42	+	647215	ACCAAACTAGTGAGGAATGATTCCTATAATAATATGACTTGC

a
s	mr.mrrefChr3	169230	77	+	181019	ATGCTTGAGCATTGTAAAGTTGAGAAGTGAATAGGCTTTAAGAGACAAAATACTCAAAGAGAGAAGAAACAATGCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	622195	77	+	636262	ATGCTTGAGCATTGTAAAGTTGAGAAGTGAGTAGGCTTTAGGAGACAAAATACTCAAAGAGAGAAGAAACAATGCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	634072	67	+	647215	AAGCTTGAGCATCGTAAA----------GAATAGGGTTTAAGAGGCAAAATACTCAAAGAGAGAATAAACAATGCCC

a
s	mr.mrrefChr3	169307	51	+	181019	AATGACTGCGACCAACACTATCTGCCCTTTGACTCAAACAGGGAAGATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	622272	51	+	636262	AATGACTGCGACCAACACTATCTGCCCTTTGACTCAAACAGGGAAGATCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	634140	51	+	647215	AATGCCTGTGACTAACAGTATCTCCCCTTTGACTCAAAGGGTGAAGATCAA

a
s	mr.mrrefChr3	169358	6	+	181019	GAGAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	622324	6	+	636262	GAGAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	634191	6	+	647215	GAGAGA

a
s	mr.mrrefChr3	169364	13	+	181019	GCCCAAATAACTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	634206	13	+	647215	GCCCAAATAACTC

a
s	mr.mrrefChr3	169377	333	+	181019	CACCTGATACTATCTCCCCTTTGAGTAATTGCTAGCTGCAGCCCTTGTGTACCACATCTGACTTTACTTTGAATTCATACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGTAAAGGTAGTGTGCTGTCAGATCACTTATGCTCCATTGTCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGATCCCATGGCAATGTATTAAGCCAATACCTACCATGGGTAGGCATAAACTGTATCACCTGTAGGATAGATGGGGTGACAACTATGAACCTCCATATTCAGCCCAAATAAAGATATATTATATCAAGAACACAGACCACCAAAATTAGCACGCACTTGAATGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	622633	324	+	636262	---------CTATCTCCCCTTTGAGTAATTGCTGGCTGCAGCCCTTGTGTATCACATCTGACTTTACTTTGAATTCCTACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGTAAAGGTAGTGTGCTGTCAGATCACTTATGCTCCATTGTCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGATCCCATGGCAATGTATTAAACCAATACCTACCATGGGTAGGCATAAACTGTACCACCTGTAGGATAGATGGGGTGACAACTATGAACCTCCATATTAAGCCCAAATAAAGATATATTATATCAAGAACACAGACCACCAAAATTAGCATGCGCCTGAATGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	634224	332	+	647215	CACCTGATAATATCTCCCCTTTGACTAATTGCTAGCTGCAACCATAGTGTACCACATCTTACTTTAATTTGAATTCATACAACCAGGTTAATGTGGCCATAGATAGCAAAGGTGGTGTGCTGTCAGATCACTTGTGCTCCATTATCTTTATTCAGGACCATGCCAACTAGAACCCATGGATATGTAATAAGCCGATACTTACCATGGATAGGCATAGACTGTCTCACTCATGGGATTGGTGAGGTGACAACTGTGAACCTCCAT-TTCAGCCCAAATAATTAACTATTATATCAAGAACACAGAACCCCAAACTTAGCACGCACTTGATGGCT

a
s	mr.mrrefChr3	169710	17	+	181019	TGTTCTCCTTGTGGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	622957	17	+	636262	TGTTCTCCTTGTGGGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	634569	17	+	647215	CATGCTACTTGATGCCA

a
s	mr.mrrefChr3	169727	19	+	181019	AAATCATTGTCCTGATTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	622974	19	+	636262	AAACCATTGTCCTGATTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	634721	19	+	647215	AAATCATGACAATGGTTTT

a
s	mr.mrrefChr3	169746	12	+	181019	CATGTGGCCAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	622993	12	+	636262	CATGTGGCCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	634743	10	+	647215	CATGAGGGGA--

a
s	mr.mrrefChr3	169758	31	+	181019	AGGCTGAGAGTGCTTCTCACTCCTCATCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	623006	31	+	636262	AGGCTGAGAGTGCTTCTCACTCCTCATCATG

a
s	mr.mrrefChr3	169789	81	+	181019	TAAGCGTTGTATATAAGATAGGCATATTTGTACTGAATCATTACATACTGAACACACAAGCATTGTATCAAGTAGCATGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	623065	81	+	636262	TAAGCGTTGTATATAAGATAGGCATATTTGTACTGAATCATTACATACTGAACACACAAGCATTGTGTCAAGTAGCATGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	634753	20	+	647215	-------------------------------------------------------ACAGATATTGTATA------CACGGT

a
s	mr.mrrefChr3	169870	321	+	181019	AGGCGACTGTATAGGCTAAAACTGTGTTACAGGTGAAATATCATGCAAATTTAATACTGATATCTTGTACATTGTTTCACATCACTATATGTAGAAAACCAGCCACCAAAGGCTAGTATAATTTGTATGAGGATGAGTAGTGACAATGCAGCAATTCTTCCTCACTCATTCTAGTTCCTAAATATATCTGTGCCTGAGTAACAACTCTGAAAACATACAGGTACTATTTTATATGGCAGATGGTGTCCTGTTGGTAGTGTATTATATCGATTAATGGCTCTCCCAATGAGCACTATCAATTATCCCTCACATCCCACTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	623146	321	+	636262	AGGCGAATGTATAGGCTAAAACTGTGACACAGGTGAAATATCATACACATTTAATACTGATATCTTTAACATTGTTTCACATCACTACATGTAGAAAACCAGCCACCAAATGATAGTATGATTCGTATGAGGATGAGTAGTGACAATGCAGCAATTGTTCCTCACTCTTTCTAGTTCCTAAATATATCTGTGCCTGAGTAACTACTCTGAAAACATACATGTACTATTTTATATGGCAGATGGTGTCCTGTTGGTAGTGTATTATATCTATTAATGGCTCTCCCAATGAGCACTATCAATTACCTCTCACAACCCACTATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	634774	320	+	647215	AGTAGACTGCATAGGCTAAAACTGTGTTACAAGTGAAATATCATGCAAATTTGATACTGGTACCTTGTACTTCGTTTTAGATCTCTATATGTA-AAAACCAGCCTTCAAAGGCTACTATAACTTATATGTGGATGAGTAGTGACAACGCAGCAATTCTTCCTCACTCATTCTAGTTCCAAAATATATCTGTCTTTGAGTAACAACTCTGAAGGCATACAGGTACTATTTTATAGGGCAGATGGTGTCCTGTTGGTAGTGTATGATATAGATTAATGGCTTTCCCAATTAGCACTATCAATTATCCCACACATCCCACTATA

a
s	mr.mrrefChr3	170191	168	+	181019	CTACTTTCCTTATGAGGGTTGGGGCTTGTGTTAATAACTGAGGAGTTGGAACACATCCCCTACTGGGGTTTTGTTTGCTCCTAGCCTCCTGTTGACCCCATATTGACAATCAGAGGCTCCATGCAGTTGAGCATAACACCTTGGGCAAAGATAAAGGGCACCCTTCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	623468	168	+	636262	TTACTTTCTTTATGAAGGTTGGGGCTTGTGTTAATAACTGAGGAGTTGGAACGCATCCCCTACTGGGGTTTTGTTTGCTCCTAGCCTCCTGTTGACCCCATATTGGCAATCAGAGGCTCCATGTAGTTGAGCATAACACCTTGGGCATAGATAAAGTGCACCCTTCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	635094	168	+	647215	CTACTCTCCTTACAAGGGTTGGTGCTTATGTTGATAACTGAAGAGTTGGAGCACATCCCCTACTGGGGTTTTGTTCGCTCCTAGCCTTCTGTTTGCCGCTTAGCGACAATCAGAGGCTCCATGCAGTCAGGCGTAACACCTTAGGCAAAGATAAAGGGCACCCCTCTA

a
s	mr.mrrefChr3	170359	13	+	181019	TCACCTATTTAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	623636	13	+	636262	TCACCTATTTAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	635263	13	+	647215	TCACCTATATAAC

a
s	mr.mrrefChr3	170372	25	+	181019	AATGCTCATACTATCTAGCACTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	623650	25	+	636262	AATACCCACACTATCTAGCACTCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	635276	25	+	647215	AATGCTCGTACTATCTAGCACTCCA

a
s	mr.mrrefChr3	170397	239	+	181019	CTACTCTATCACTATTTATCTCTTAGCCAGAGGTCATCAATTTGATGCAGTCAGGATAACTTTGTGAATTCTCTAAATATGTCTGGCCTACTTTGTTGAATTGGGCTTGTACCTCTTGCATGACCAAAATAATTTTGCAGAGACATGTCATGTCATGTGGTACTTCAGAGTGTGTTTGTGCTCAGAAGGCATCAATTCTAAACAGAGTCACATCATGCCATGGTTGTAGTGACTTATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	623675	239	+	636262	CTACTCTATCACTATTTATCTCTTAGCCAGAGGTCATCAATTAGATGCAGTCAGGATAACTTTGTGACTTCTCAAAATATGTCGGGCCTATTTTGTTGAATTGGGCTAGTACCTCTTGCATGACCAAAGTAATTTTGCAGAAACATGTCATGTCATGTAGTACTTCAGACTGTGTTTGCAATCAGAAGGCATCAATTCTAAACGTAGTCACTTCATGCCATGTTTGTAGCGACTTATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	635305	239	+	647215	CTACTCTATCACTATTTATCTCTCAGCCAGAGGTCATCAATTTGATGCAGTTGGGATAACTTTGTGTATTCTCTACATATGTCTGGCCTACTTTGTCAAGTTGGGCTTGTACCTCTTGCATGACCAAAATAATTTTGTAGAGACATGTTATGTCATGTGGTACTTCAGAGTGTGTTTGTGCTCAGAAGGCATCAATTCTAAACAGAGTCACATCATGCAATGGTTGTACTGACTTATAT

a
s	mr.mrrefChr3	170636	206	+	181019	ATGGTCCCTTCACTAGGTTTAATCCTCATGAAATGGTAGTTAGCTTTTATTCATGATTCCGAACCAGACTGGCTTTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCAGTAGAGAAGGTCTACCCAGGAATAGGTCACTTCTGACTCGGTTCGTTGTATCTCAATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCAAAAAAAATGCACTCCTTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	623921	206	+	636262	ATGGTCCCTTCACTAGGTTTAATCCTCATGAAATGGCATTTAGCTTTCCTTCATGATTCCGTACCAAACTGGCTTTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCGATAGAGAAGGTGTACCCAGGAATAGGTCACTTCTGACTCGGCTCGTTGTATCTCAATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCACAAAGAATGCACGCCTTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	635544	200	+	647215	GTGGTCCCTCCAGTAGGTTTAATCCTCATGAAATG-TAGTTAGCTTTTACTCACGATTCCCATACTGGTGGGGTCTATAACAGTGCTAAATACACATTTGGCTTCAGTAGAGAGAGACTACCCAGGTATAGGTCACTTCTGACTTGGTTCTTTGTATCTCGATCATGAGGTGAGCAAAAACATGCCAAAAAAAACGCATTC-----

a
s	mr.mrrefChr3	170842	103	+	181019	AGTATCACGCACGATAAGTGTCACACGCTCTGCTGCATTAAGTACATGCCATGTCCGATGACATCAAGACCTAACCTAGTATGTCCTGTATCTTGATTTCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	624133	103	+	636262	AGTATCACGCACGATAAGTATCACATGCTGTGCTGCATTAAGTTCATGCCATGTCGGATGACATCAAGATCTAACCTAGTATGTCCTGTATCTTGATTTCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	635744	87	+	647215	---------------AAGTGTCAGACGCTCTGCTGCATTAAGTACATGCCATGTCCTATGACATCAAGACCTAACATAGTATGTCCTGTA-CTAGATTTCGGA

a
s	mr.mrrefChr3	170945	275	+	181019	TACCATTGTAATCATAATATAATGCATGAATGTTAGAAATGAGTTCAGCAGGCAGGTTTTCCCACCTGACTAGTATTAGTGGTAGCCTCTGGTATTTAACCGTCTGAATTCATCTTGTGTTCTAACACTCCAGGGCCCTACGGCAACATTTGTCAGAGCTGCAAATTAAGAACTTTCCTCAGCACTTAGGTGACCTACATGGTCTGTACTAATTCTTCCTTGATTTACTGGTCCAGTTGAGTATTAATTACAACAACCACATGCTATACCAAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	624239	275	+	636262	TACCATTGTAATCATTACATAATGCATGAATATTAGAAATGAGTTCAACAGGCAACTTTTCCCACCTGACTAGTATTAGTGGCAGCCCCTGGTATTTAACCGTCTGAATTCATCTTGTGTTCTAACACTCCAGGGCCCTACGGCAACATTTGTCAGAGCTGCAAATTAAGAACTTTCCTCAGCACTTAGGTGACCTACATGGTCTGTACTAATTCTTCCTTGATTTACTGGTCCAGTTGAGTATTAATTACAACAACCACATGCTATACCAAGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	635831	275	+	647215	TACCATTGTAATCGTAATATAACCCATGAATGTTAGAAATGAGTTCAGCAGGCAGGTTTTACCACCTGACTAGTATTAGTGGTAGCCTCTGGTATTTAACCATCTGAATTCATCTCGTGTTCTAACACTTCAGAGCCATATGGCAATATCCATCAGAGCCGCAAATTAAGAACTTTCCTTGACACTTAGATGACTTATGTTGTCTGTACTAAACCTTTTTTGATTTATTGGTCTGATTGAGTAATAATTACAGCAACCACACACTATACCAAGAA

a
s	mr.mrrefChr3	171220	67	+	181019	TACATTGTTATGGACGTTGTTCCAGCTTACATTCACTTAAGAATGGCTGGCGCATTAAGCCATTAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	624516	67	+	636262	TACATTGTTATGGACGTTGTTCCAGCTTACATTCACTTAAGAATGGCTGGCGCATTAAGCCATTAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	636106	67	+	647215	TACATTGTTACAGACATTGTAACAGATTACATTCACCTAAGGATGACTGGGGCACTGAGCCAACAGG

a
s	mr.mrrefChr3	171287	320	+	181019	TAAAAAACAACTTATGTTACAATGTTAAATCTTTCTCCAGATTTTATAGTGTGACACTCTGTTGTAACACGGGGGTTCAGTCTCGCCAGAAGTGATATGTATACATTTGGAAATTACTAAATTCACAATGTGATTGATACCATATTTAGTTGGGGGAGGTTTATGGGTGCCAACAAATTTGGCCCAGCATGATTGTCATGTCTGCCTTGAAATTGAAATAAAGTCACTTTCATAGCTGTAGTTCTAATCATTGGATATGCATGAGTAACCCAAGGGAGGATATGTGCAATCAGACAGAATTGAGTAATTCTTCCCTGACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	624584	320	+	636262	TAAAAAACAACTTATGTTACAATGTTAAATCTGTTGCCAGACTTTGTAGTGTGACACTCTGTCATATCTCGGGGGTTCAGTCTCGCCAGAAGTGATAAGTATACATTTGAAAGTTACTAAATTCACAATGTGATCAATACCATATTTAGTTGGGGGAGGTTTATGGGTGCCAACAAATTTGGCCCAGCATGATTATCTTGCCTGCCTTGAGATAGAAATAAAGCCACTTTCATAACTGTAGTTCTAATCATTGGATATGCATGAGTAACCCAAGGGAGGATATGTGCAATCAGACAGAATTGAGTAATTCTTCCCTGACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	636173	320	+	647215	CAAAAGACAACTTATGTTATAGTGCTAAACCTTTCTCCAGGTTTTATAGTGTGACACTCTGTTGCAACATGGGGGTTCAATCTCTCGAGAAGTGATATGTATACATTTGGTGATTACTAGATTCACAATGTGACTGATACCATATTTAGTTGGGGTAAGTTTATGCTTGCCAACAAATTTGGTCCAGCATAATTGTCATGTCTGCCTTGAAATTGAAATAAAGTCACTCTCATAGCCATAGGACTATTCGTTGGATATGCATGAGTAACCCAAGGGAGTATACGTTCAATCAGACAGCATTGAGTAATTCTTCCCAGAAC

a
s	mr.mrrefChr3	171607	109	+	181019	CAGGTCTTTAATGGAGAGTATTGTATTGCCAGGGAGTGACTCCCAGGGAGTGACTGACAGTTCTTCTTCTATTCCCCTCCCCTGTCTTCCCCCACTATTAAGTTTTAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	624904	109	+	636262	CAGGTCTTTAATGGAGAGTATTGTATTGCCAGGGAGTGACTCCCAGGGAGTGACTGACAGTTTTTCTTCTATTCCCCCCCCCTGTCTTCCCCCACTATTAAGTTTCAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	636496	109	+	647215	CAGGTCTTTAATGGAAAGTATTGTATTGCCAGGGAGTGACTCCCAGGGAGTGGCTGACAGTTCTTCTTCAATTCCCATCCCCTGTCTTCCCCCACCATTAAACCTTGAG

a
s	mr.mrrefChr3	171716	323	+	181019	TAGTGGGTCCTTGTGAGATACATGATGCCCACCCTGCTGAGTGTTATAATACACAAAATAATGGTGACAATTACCAATATCCCAATGAACAAACCAATTGAAGATATGTATACTCATTAATTAGTATAGAACACTCAAGTGGGTACTCATATTAATGTAGAAAGATATGGCAGTTCTTGGATACTTACAGATTTGCATTACCTGAGAGGATACTTAAATTTCTGAGGTCATTAAAAATTTTACAAGGTCTACTAATTTCACTCGATAAACTATGTCTGTATTGAGATAGCAAGGCTATGAAGTTTTGAGAGACCCACATGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	625013	322	+	636262	TAGTGGGTTGTTGTGAGATACATGATGCCCACCCTGCTGAGTGTTATAATACACAAAATGATGCTGACAATTACCAATATCCCAATGAACAAACCAATTGAAGATATGTACACTCATTAACTAGTATAGAACATTCAAGTGGGTACTCATATTAATGTAGAAAGATATGGCAGTTCTTGGAAACTTACAGATTTGCATTAC-TGAGAGGACACTTAGATTTCTGAGGTCATTAGAAACTTTACAAGGTCTACTAATTTCACTCGATAAAGTATGTCTATATAGAGATAGCAAGGCTATGAGCTTTTGAGAGACCCACACGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	636608	312	+	647215	CAGTTGGTCCATGTCATATACATGATGCCCACTCTGCCGGGTGTTGTAATACATAAGATAATGGTGACAATTATCAATATTCCAATGAACAAACCATTTGAAGAGATGTATACTCATTAATTATTATAGAACACTCAACTGGGTACTCATACTAATGTAACAAGGTTTGGCAATCCTTGGATACTTACAGATTTGCATTACCTGAGAGGATACTTAAGTTTGTGAGGTCATTAAAAATTTTACAGAGTCTACT----------GATAAACTATATCTGTATTGAGATAGCCAG-CTATCAAGTTTTGAGATACCCAAATGTTT

a
s	mr.mrrefChr3	172039	22	+	181019	CAGCACTACAGGAGTATGTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	625353	22	+	636262	CAGCACTACAGGAGTATGTTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	636920	22	+	647215	CAGCACCACAGGAGGATGTGTG

a
s	mr.mrrefChr3	172061	97	+	181019	AGACACTCCATGTGACATTGTCTACTGGGCTAGATAGGATTGTCTCTCATGAAATCTAATTGTTGTATTAGCCAACTTAATGGCATCAATTACGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	625375	96	+	636262	AGACACTCCATGTCACATTGTCCAGTGGGCTAGATAGGATGGTCTCTCATGAA-TCTGATTGTTGTATTAGCCAACTTAATGGCATCAATTACGTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	636944	97	+	647215	AGACTCTCCATTTGGCATTGTCTACTGGGCTAGAAAGGATTTTCTTTCACGAAATCTAATTGTTGTATTAGCCAACTTAATTGCATCAATTAGGTCA

a
s	mr.mrrefChr3	172158	41	+	181019	GCTGGTTGCGGATTACATCAGGCTTATTCCTTGGCTTCCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	625475	41	+	636262	GCTGGTTGCAGATTACAACAGGCTTGTTCCTTGGCTTCCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637041	41	+	647215	GCCAGTTGCGGATCACGTTGCGCTTATTCCTTGGGTTCCCA

a
s	mr.mrrefChr3	172199	106	+	181019	TTGATTAGGGTCCCAAGCTTATCCTGAACTCCAGTGAATAATTCAGATATATTAGGCCCAGGTAGACCCTCCATATGCTATTATCCTTTTACATGCACATAAAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	625517	104	+	636262	TTGATTAGGGTCCCGAGCTTATCCTGGACTCCAGTGAATAATCCAGATATATTAGGCCCA--CAGACCCTCCATATGCTATTTTCCGTCTACATGCACATAAAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637082	95	+	647215	TTGATTCGGGTCCCAAGTTTATCCTGAACTCCAGTGAATAATTCATATATATTAGGCCCAGGTAGACCCCCCATATGCTATTATCTTCTTACATA-----------

a
s	mr.mrrefChr3	172305	15	+	181019	TCTAGGAAGGGTCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	625633	15	+	636262	TCTAGGAAGGGTCTC

a
s	mr.mrrefChr3	172320	5	+	181019	TTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	625659	5	+	636262	TTTGA
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a
s	mr.mrrefChr3	172325	58	+	181019	TAGTCTGACGCACCTGCTATCAGCCCATGTAGTGGAAATTTGGACTGTTATCGGTACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	625665	58	+	636262	TTGTCTGACGCACCTGCTATCAGCCCATGTAGTGGAAATGTGGACTGTTATCGGTACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637182	58	+	647215	TAGTCTGACGCACCTGTTCTCAGCCCATGTAGTGGAATCTTGGACTGTTAGCGGTACC

a
s	mr.mrrefChr3	172383	104	+	181019	TCATCTATTTGTATTGTCCCTGAGTTACCAGTCACAGCAAAGGGACCAGCATACCAGTGCCACAGCACCCAGCTGGGTCCTATGGCAAGTTAGATCCAGATGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	625723	80	+	636262	------------------------GTACCAGTCACAGCAAACGGACCAGCATACCAGTGCCACAGCACCCGGCTGGGTCCTATGGCAATTTAGATCCAGGTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637241	101	+	647215	TCATCTATTTGTATTGTCCCTGAGTTACCAGTC---GCAAAGGCACCAGCATACCAATGCCACAGCACCCAGCTGGGTCTTAGGGCAAGATAGATTCAGATGAG

a
s	mr.mrrefChr3	172487	106	+	181019	GTCTCAGAAGTCTAGACTCAATGATCAAGCAAGTTTACCATCTTTTTGATGTTGCAATACATTATGTGTTCATTGCATGATGTATGGAGTTGGCTCTCTATGATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	625804	106	+	636262	GTCTCAGAAGTCTAGACTCAATGATCAAGCAAGTTTACCATCTTTTTGATGTTGCAATACATTATGTGTTCATTACATGATGTATGGAGTTGCCTCTCTATGATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637342	106	+	647215	GTCTCAGAAGTCTAAACTCAATGATCAAGCAAGTTTACCATCTTTTTGATGTTGCAATGCATTATCCGTTCATTGCGGGATGTATGGAGTTGGCTCTCTATGATTC

a
s	mr.mrrefChr3	172593	28	+	181019	TAATACTCCTTGCAACCACTTGTGGTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	625927	28	+	636262	TACTACTTCTATAAATTACTTATAGTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637448	28	+	647215	TAATAATCCTTGCGACCACTTGTGGTGC

a
s	mr.mrrefChr3	172621	32	+	181019	CCCTGTTAAGTGGTCCTTACAGCCTCTTTCGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	625967	30	+	636262	CCCTGTTAAGTTTTCCTGTC--CCTCCATCGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637476	32	+	647215	CCCCTTTGAATGGTCCTTATAGCCTCTTTCGA

a
s	mr.mrrefChr3	172653	13	+	181019	TCAATTCAAGAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	625997	13	+	636262	TGAACTCATGATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637509	13	+	647215	TCAATTCAACAAA

a
s	mr.mrrefChr3	172666	11	+	181019	CAAGTTGATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626011	9	+	636262	TAAGTTGAT--
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637522	11	+	647215	CAAGCTACTGG

a
s	mr.mrrefChr3	172677	38	+	181019	AAGCATGCTTGTACTCCTTCTAGGAATTACTTATAGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626020	36	+	636262	-ACCATGGTGGGATACCAT-TGGGAATACTGTAGAGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637536	38	+	647215	AAGCAGGCTTGTACTCCTTCTATGAATTACTTATAGGA

a
s	mr.mrrefChr3	172715	5	+	181019	GTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626060	5	+	636262	GTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637574	5	+	647215	GTGAT

a
s	mr.mrrefChr3	172720	225	+	181019	CAACAATACCTTATACATTAGGATGAGGGATGAGGGTACAATCAAAAATGTTCTGGGCACCTGGGATTCTTTTAATATAAATGATTAGCCCCATCACCACCCAATATCAAATAGGCAGGGGCTGGGGATCTCTCCATTATTAAGAACCTGCAGCATGTGACTGCCAAGGACATGAGTTGCTAAAGAATCTGGTCCCATCAGCCCGACCAGCCCAGATTTGTTGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626071	225	+	636262	CAACAATACCTTATACATTAGGATGAGGGATGAGGGTACAATCATAGATGTTCTGGGCACCTGGGATTCTTTTAGTATAAGTGATTAGCCCCATCACCACCCAATATCAAATAGGCAGGGGCTGGGGATCTCTCCATTATTAAGAACCTGCAGCATGTGACTGCCATGGACATGAGTTGCTAAGGAATCTGGTCCCATCAGCCCAACCAGCCCAGATTTGTTAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637579	225	+	647215	CAGCAATACCTTATACATCAGGATGAGGGATGAGGGTCCAATCAAAAATATTATGGGCATCTGGGATTCTTTTAATATAAATGATTAGCCCCATAAGCACCCAAGATCGAATAGGCAGGGGCTGGGGACCTCTCCATTATTAAGAACCTGCAGCAGGTGACCACCAAGGACGTGAGTTGCTAAAGATTCTGGTCCCATCAGCCCGACCAGCCCAGATTTTTTGGA

a
s	mr.mrrefChr3	172945	166	+	181019	GCACAACTTAAATACTATCACTCAAACGAGACTCAAACAAATTCACTTCATGACCACATTCAGAATCAATAATTACGTTGCCTGGAGCATATTTTCAAACTTGGATATGTGCAGTATACTTGTAAATCTATACTTTTGAGTGCCTATTTTTTTGTTGGACCTGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626296	162	+	636262	GCACCACTTAAATACTATCACTCAAACAAGACTCAAGCAAATTCTTTTCATGACCACATTAAGAATCA----TTACATTGCCTGGAGTATATTTTCAAACTTGGATATGTGCAGTATATTGGTAAATCTATACTGTTGAGTGCCTATTTTTTTATTGGACCTGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637814	159	+	647215	GCAAAACTTAAATACTATCACTCAAATGAGACTCAAACAG-TTCACTTCATGACCACACCCAGTATCAATAAGGACGTTGCCTGGAGCTTATTTTCAAACTTAAATATGTGTA-TATACTTGT-----TATACTTTTGAGTGCCTATTTTTTTGTTGGAATGGCTT

a
s	mr.mrrefChr3	173111	35	+	181019	ATTTGCTTTAGCAAATTGGTATGAAAACACTGATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626627	14	+	636262	ACTTGCTAAAGCAA---------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	637973	35	+	647215	ATTCGCTTTAGCAAATTGGTATGAAAACACTGATA

a
s	mr.mrrefChr3	173146	12	+	181019	ACATCTTGTCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638009	12	+	647215	ACATCTTGTCAA

a
s	mr.mrrefChr3	173158	28	+	181019	TGGATATTTGCCCGAGGCACTGTGTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638093	28	+	647215	TGGATATTTGCCCGAGGCACTGTGTGAA

a
s	mr.mrrefChr3	173186	11	+	181019	TCTAAACAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626641	7	+	636262	----ATGAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638122	11	+	647215	TCTAAACAGCA

a
s	mr.mrrefChr3	173197	40	+	181019	TTAAGACTGTGTCATTAGTGATAATCTCTCCTCCAGGGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626651	40	+	636262	TTAAGACTGTGTCATTAGTGATAATCTCTCCTACAGGGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638133	40	+	647215	TTAAGACTGTGTCATTAGTGATAATCTGTCCTCCAGGGCC

a
s	mr.mrrefChr3	173237	10	+	181019	CACGGGGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626704	10	+	636262	CATGGGGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638173	10	+	647215	CACGGGGAAT

a
s	mr.mrrefChr3	173247	107	+	181019	GAACCTTGGGTAGAACCTAAAATCTGCATTTTTTTTGGAAGGTATGTTACTTTTTGCAGGTTAAGTTACTGCACTACACATACAACAGAATCATGCTGTATTCCCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626714	106	+	636262	GAACCTTGGGCAGATCTTCAAA-CTGCGTTTTTTTTGGAAGGCATGTTACTTTTTGCAGGATAAGTTACTGCACTACACATGCAACAGAATCATACCGCATTCCCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638184	107	+	647215	AAACCTTGGGTAGAACCTAGAATCTGCATTTTTTTTGAAAGCTATGTTACTTTTCGCTGGTTAAGTTATTGCACTACATATATAACAGAATCATGCTGTATTGCCCT

a
s	mr.mrrefChr3	173354	38	+	181019	CCTGTTCTAAAAAGCTTGCCCAGGTCTAGGTCCTATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626842	34	+	636262	CCTGTTCTAAAAAGCTTGACCAGGTTTAGGTCCT----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638291	38	+	647215	CCTGTTCTAAAAAACTTGCCCGGGTCTAGGTCCTATAT

a
s	mr.mrrefChr3	173392	20	+	181019	TCATGTTTTCAATGTTATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626876	20	+	636262	TCATGTTTTCAATGTTATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638339	20	+	647215	TCATGTTGCCAATGGTATTT

a
s	mr.mrrefChr3	173412	41	+	181019	TTTGCAGATCTGATGTGTATGAAGGCTATTTTGATTTCTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626898	41	+	636262	TTTGCAGATCTGATGTGTATGAAGGCTATTTTGATTTCTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638359	41	+	647215	TTTGCAGATCTGATGTGTATGAAGGTTATTTTGATTTCTAT

a
s	mr.mrrefChr3	173453	73	+	181019	TCAACATGCCACAACAGCTTCTATCACTGCTGATTTGCATTTCAGCTTAGACTGATAAAGCATCTTAGAACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	626939	73	+	636262	TCAACATGCCACAACAGCTTCTATCACTGCTGATTTGCATTTCAGCTTAGACTGATAAAGCATCTTAGAACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638497	73	+	647215	TGATTATGCCACAACAGCTTCTATTACTGCTGATTTGCATTTTAGCTTATACTGATAAAGCATCTTAAGACAC

a
s	mr.mrrefChr3	173526	109	+	181019	AGTAGCTATGTTCCATTTACCACACTGTAGACTTGCAAACATTGTGTACTTGGGTTATTGACCCACTTTGCTTCTCCCACAGAACGAAATAATTACGGCATTGGACTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627066	109	+	636262	AGTAGCTATGTTCCATTTACCACACTGTAGACTTGCAAACATTGTGTACTTGGGTTATTGACCCACTTTGCTTCTCCCACAGAACGAAATAATTACGGCATTGGACTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638570	109	+	647215	AGTGGCTTTGTTACTTTTACTGCACTGTGGACTTGTAAACATGGCATACTTGGGTTATTGGCCCACTTTGCTCCTCCTACAAAATGAAATAATTATGGCCTTGATCTCC

a
s	mr.mrrefChr3	173635	55	+	181019	ACACTCTTTCATAGCGTTCAAGTTTGGTTATTTATTCTATACCTATCTGGACTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627178	55	+	636262	ACACTCTTTCATAGCGTTCAAGTTTGGTTATTTATTCTATACCTATCTGGACTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638679	55	+	647215	ATACTCTTTCATAGTGTTCGTGTTCGGTTATTAATTCTATACCTATCTGGATTTA

a
s	mr.mrrefChr3	173690	130	+	181019	AGGCAGAAGAGGGGACATATCTTTAACAATGCATATCTTTCAGGACTGGAGGCGTTTGACAAATTCTCAATATCTCTGCAGCAACAATACCCAGCATGATTAGAGACTAAACTACTCTATTCATACTAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627235	130	+	636262	AGGCAGAAGAGGGGACATATCTTTAACAATGCATATCTTTCAGGACTGGAGGCGTTTGACAAATTCTCAATATCTCTGCAGCAACAATACCCAGCATGATTAGAGACTAAACTACTCTATTCATACTGCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638734	130	+	647215	AGGCCAAACAGGGGACGTATCTTTAACAATGCATGGCCTTCAAGACTGGAAGGGTTTGACACATGCTCAATATATACGCAGTAACAATCCCCAGCATGATTAGAGACTAAAATACTCTATTCATACTAGG

a
s	mr.mrrefChr3	173820	74	+	181019	CTTTTTTTAGATGACAATGACAATACCATGTATATACTTTACATCTATATGTCTAAGGATGACTGAGGGCTTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627365	74	+	636262	CTTTTTTTAGATGACAATGACAATACCAGGTATATACTTTACATCTATATGTCTAAGGATGACTGAGGGCTTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638870	74	+	647215	CTTTTTTTAGATGACAATGACAAGACTATGTATATACCTTACATCTATATGTCTAAGGATGACTGAGGGCTTCG

a
s	mr.mrrefChr3	173894	112	+	181019	AGGGCACATATCTCTATGTAGGCCCTCCAATTAGGATCAAACTCATGCTGAACAAGCTTAACAGACTTCAACATCATGGCAAGATCTGAAGCTTGCTATAATAAAACATTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627440	103	+	636262	AGGGCACATATCTCTATGTAGGCCCTCCAAT---------ACTCATGCTGAACAAGTTTAACAGACTTCAACATCATGGCAAGATCTGAAGCTTGCTATAATAAAACATTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	638944	112	+	647215	AGGGCACATATCTCCATGTAGCCCCTCCAATTAGGATCAAACTCAAGCTGAACAAGCTTAATAAACTTTAACATCATGGCAAGATCTGAAGCTCACTATAATAAAAGACTCA

a
s	mr.mrrefChr3	174006	107	+	181019	CAAAATGTGGTCTATGTGTTTGTTCTGTTTGCTTTATGTCATGTACAGAGTTTTGGAGACATGTGCATAACCTACAAGTCACCTTTGGAAATCAATTGCTGCTCTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627544	107	+	636262	CAAAATGTGGTCTATGTGTTTGTTCTGTTTGCTTTATGTCATGTACAGAGTTTTGGAGACATGTGCATAACCTACAAGTCACCTTTGGAAATCAATTGCTGCTCTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639056	107	+	647215	CAAAATGTGGTCTATGTGTTTGTCACACTCGTGTCATGTCATGTACAGAATTTTGGATACACGTGCTTAAGCTGCAAGCCAGCTTCAGAAATCAATTGCTTTACTGC

a
s	mr.mrrefChr3	174113	9	+	181019	GGGCAAAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627660	9	+	636262	GGGCAAAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639163	9	+	647215	AGTCAAAAC

a
s	mr.mrrefChr3	174122	17	+	181019	AATATTTAATGCAGTCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627669	17	+	636262	AATATTTAATGCAGTCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639175	17	+	647215	ATCATCTTACATGTCTG

a
s	mr.mrrefChr3	174139	15	+	181019	TAAGGCCTAACTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627686	15	+	636262	TAAGGCCTAACTGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639193	15	+	647215	TGAGGCTAAACTGCA

a
s	mr.mrrefChr3	174154	18	+	181019	ATCATGTAGAGTTAGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627701	18	+	636262	ATCATGTAGAGTTAGGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639213	18	+	647215	GTCATGTTGAGTTAGGAA

a
s	mr.mrrefChr3	174172	87	+	181019	AAAAAGCAAGTCATCGGCTATAAAAGCACACATGTCCAGTCCTACTCACCATTCTAATTGGGTCTAGACAGTGGGTGCAACAGCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627719	87	+	636262	AAAAAGCAAGTCATCGGCTATAAAAGCACACATGTCCAGTCCTACTCACCATTCTAATTGGGTCTAGACAGTGGGTGCAACAGCTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639232	87	+	647215	AAAAAACAAGTTATCAGCTATAAAACCACACATGTCTGGTCCTACTCACCATTATAATTGGGTCTAGATGGTGGGTGCAACAGCTTA

a
s	mr.mrrefChr3	174259	29	+	181019	CTTCAGCCACCTAATTGCAAAGTTTCATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627806	29	+	636262	CTTCAGCCACCTAATTGCAAAGTTTCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639347	29	+	647215	CTTCGCCCACCTAATTGCAAAGTTTCATA

a
s	mr.mrrefChr3	174288	122	+	181019	TTTCTCAATTGTGTGGCAGGGTCGAATTACAGACAGCTTGGAAGGAAGCACAGGCTATAGGCTTGCCCCTGCAAGTGCAAGTCAGTAATTTTTGGAACAGTATCAGGGCCATTACAAACAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627835	122	+	636262	TTTCTCAATTGTGTGGCAGGGTCGAATTACAGACAGCTTGGAAGGAAGCACAGGCTATAGGCTTGCCCCTGCAAGTGCAAGTCAGTAATTTTTGGAACAGTATCAGGGCCATTACAAACAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639390	122	+	647215	TTTCTCTATTGTACAACAGGGTTGGATTACAGACACCTTGGGAGGAAACACATGCTATAGGTTTGTCCCTGCATGGGCAAGTCAGTAATTTTTGGAACAGTCTCAGGGTCATTACAAACAAC

a
s	mr.mrrefChr3	174410	45	+	181019	TACTTAAGGCCTGATTCTTATGCAACATAATCTGTACTTTTTATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	627957	45	+	636262	TACTTAAGGCCTGATTCTTATGCAACATAATCTGTACTTTTTATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639514	45	+	647215	TAATTATGGTCTGTGTCCTATGGAATATAATATGTACTTTTTATC

a
s	mr.mrrefChr3	174455	76	+	181019	TGATGCAGACTGTGCTCATACCTGCTTTTCCATCAGCTAACACATCTGTGTTAACAGGCTTTAGTGTTGTGTTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628012	76	+	636262	TGATGCAGACTGTGCTCATACCTGCTTTTCCATCAGCTAACACATCTGTGTTAACAGGCTTTAGTGTTGTGTTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639559	76	+	647215	TAATGCAGACTGTGTCCATACCTGATTTTCCATCAGCTAACACATCTGTGTTAACAGGGTTTAGTGTTGTGTTGAG

a
s	mr.mrrefChr3	174531	71	+	181019	TACCCGTGCAAGTCTTGAAGCCTGCCCTGGGTGACCCTCATCAGTTATATTAGTAATAAGCATTTGAGTCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628088	71	+	636262	TACCCGTGCAAGTCTTGAAGCCTGCCCTGGGTGACCCTCATCAGTTATATTAGTAATAAGCATTTGAGTCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639636	71	+	647215	TACCTGCACATGTTTGGAAGCTTGCCCTGGGTGACCCACAGTGGTTGTATTAGTAATAAGCATTTGAGTTG

a
s	mr.mrrefChr3	174602	132	+	181019	GGTGTTTTAGAACTGTTCACAAACAGTTCAGTCAGAGGGGCATTTACTAGGTATTGCTCTGTGACACCTGTCCCTTTGCTGCTAGAATTATCCCTGTCTGTTCCTCTACAAATCCTACCTTATAAACATCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628159	132	+	636262	GGTGTTTTAGAACTGTTCACAAACAGTTCAGTCAGAGGGGCATTTACTAGGTATTGCTCTGTGACACCTGTCCCTTTGCTGCTAGAATTATCCCTGTCTGTTCCTCTACAAATCCTACCTTATAAACATCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639712	132	+	647215	GGTGTCGTAGAACTTTTAGCAAATAGTTCAGTCAGAGGGGCATTGACTAGGTATTGTTCTGTGACACCTGTCCCTTTGTTGCTCGAATTATCCCTATCTATTCCTGTACAAGACCTACGTTATAAAGATTTG

a
s	mr.mrrefChr3	174734	28	+	181019	AACATATCTACCCAGGCACAATGTTGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628291	28	+	636262	AACATATCTACCCAGGCACAATGTTGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639846	28	+	647215	AACATATCTACCCAAACACAATGTTGTC

a
s	mr.mrrefChr3	174762	45	+	181019	ACTCAATTAAGTAATATAAAGACTAGACCAAGACTAGCCTTACCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628319	45	+	636262	ACTCAATTAAGTAATATAAAGACTAGACCAAGACTAGCCTTACCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639875	45	+	647215	ACTCAATTATGTCATATAACGACTAGACCAAGACTAGCCTCACCT

a
s	mr.mrrefChr3	174807	59	+	181019	AAATGGCGGTGACGAACGGTTAAGAGAATTAACATAGGCAGAGTGGGCAAGATATGATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628364	59	+	636262	AAATGGCGGTGACGAACGGTTAAGAGAATTAACATAGGCAGAGTGGGCAAGATATGATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639921	59	+	647215	GAATAGCAGGGGTGGATGGTATAGAGAATCAACATCGGCGGCGCAGTCAAGAGATGATT

a
s	mr.mrrefChr3	174866	86	+	181019	GTCTCTGCTGCCATATCTACAGATTCCATGGGGGTCATTCTGTTCTGAGATGTCAAATCCATAGAATTGTACCATTGCCTCCATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628426	86	+	636262	GTCTCTGCTGCCATATCTACAGATTCCATGGGGGTCATTCTGTTCTGAGATGTCAAATCCATAGAATTGTACCATTGCCTCCATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	639980	86	+	647215	GTCGCTGCTGCCATCTCTACAGATTCTGTGGACATCATTCTGGTCTTAGATGTCAAATCCATAGAATTAAACTATTGCCTCCGTTA

a
s	mr.mrrefChr3	174952	39	+	181019	GACTGAATTCACCATTAACTGGGGTGCATGTATAACCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628532	39	+	636262	GACTGAATTCACCATTAACTGGGGTGCATGTATAACCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	640066	39	+	647215	GTCTGAATTCATCATTGCCTGGGGTGCATGTATAACCGG

a
s	mr.mrrefChr3	174991	4	+	181019	TGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628571	4	+	636262	TGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	640111	4	+	647215	TAAC

a
s	mr.mrrefChr3	174995	61	+	181019	ACCTCTCCTGATCCCCAGAGTGGGGTTGAGTGGTGATGATCCTTGTACATAGTCAGTTTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628575	61	+	636262	ACCTCTCCTGATCCCCAGAGTGGGGTTGAGTGGTGATGATCCTTGTACATAGTCAGTTTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	640122	61	+	647215	GGCTCTCTTGATCCCCAGGGTGATGTTCTGTTGTTATGATTCATGTGCATTGTCAGCTTCA

a
s	mr.mrrefChr3	175056	145	+	181019	TTTCTTCTAAAAGTTGCTCCCACATCGATGGAATTAAAGCTGTATCCATCAACTAGACTTCTATTACAAGCAGTGCTAAGCCATTGGTTCAGTGGTCTAGTATAATAACTGCGTTTAGCACATCCAGTCATTTGACATCCACTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628638	145	+	636262	TTTCTTCTAAAAGTTGCTCCCACATCGATGGAATTAAAGCTGTATCCATCAACTAGACTTCTATTACAAGCAGTGCTAAGCCATTGGTTCAGTGGTCTAGTATAATAACTGCGTTTAGCACATCCAGTCATTTGACATCCACTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	640183	145	+	647215	TTTCTTCTAAAAGTTGCTCCCAAATTGAAGGAATTAAAGATGTAACCATCAACTAGACTTGTATTACAAGCAATGCTAAGCCATTGGTTCAGTGGCTTAGTCTAATAACTGTGTTTAGCACATCCAGCCATTGGACATCCTGTAT

a
s	mr.mrrefChr3	175201	73	+	181019	TCAAACCATCAGCATAGGGCTTTTCTAAGCTCTCCAGTATATGACAACCTCAGAGCACCCCTAGAGAAGCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628783	73	+	636262	TCAAACCATCAGCATAGGGCTTTTCTAAGCTCTCCAGTATATGACAACCTCAGAGCACCCCTAGAGAAGCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	640329	73	+	647215	TCAGACCGTCAGCATGGAACCTCTCAAAGCTCTCCAGTATGTGACAACCTCAGAACATCCCTGGAGAAGCACT

a
s	mr.mrrefChr3	175274	59	+	181019	GTATGTTAAACAAGGACTACTAGTTTAATTTCAAATCACATATGTATACTTGTGAATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628857	59	+	636262	GTATGTTAAACAAGGACTACTAGTTTAATTTCAAATCACATATGTATACTTGTGAATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	640402	59	+	647215	GTACCTAAAACAAGGACTACTAGTTCAATTTCAAATTATATATGTGTACTTGTGCATGA

a
s	mr.mrrefChr3	175333	60	+	181019	TACTTGACAACACAGCTCTCAAAGAGACATGTGCAAAGAACAGCATGGACAGAGAATATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628916	60	+	636262	TACTTGACAACACAGCTCTCAAAGAGACATGTGCAAAGAACAGCATGGACAGAGAATATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	640462	60	+	647215	TTCATGACAGCAGAGTTCTCAAGGGGACGTGTGCAAAGAACAGCGTGCACGGAGAATATC

a
s	mr.mrrefChr3	175393	69	+	181019	ATTCATGGGAAGGATTGACCCTTTAGCAAGCGCATTGAGTAATTTTTGAAAATTTGCCTTCTATTTCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	628980	69	+	636262	ATTCATGGGAAGGATTGACCCTTTAGCAAGCGCATTGAGTAATTTTTGAAAATTTGCCTTCTATTTCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	640522	69	+	647215	ATTTGTGGGAAGGACTGATCCTTTGGCAAGAACACTGGGTAATGTTTGAAAATTTGCCTTCTATCTCTT

a
s	mr.mrrefChr3	175462	324	+	181019	AGTGGAGGTACAAATGCTAGAACCAGAATCGATCACATCCCAGCCAGAGCTGTGGACTCAATGCTTAAGTGGGAACCCAGCACCTTAGCACTTCAAGTCTCTATATGCCTATGGTCACTCAAGGGCATGTGAGGTGAACAAGGGGTCTAGAATGTATGCAGGGGGGGCTGTGCATGACAAACCTCTCGTGTGGGGAGCAGGCTCCCTCTACAGCTGCCTGTGATCGCTCGATACCATGTCAAATGGCAGAGTCTTATAGCCAAGCACTATCCGCATGTATATGGCCGTGTTTGCCATTTATTGGAGCTTTGCACGAGGCACTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	629059	319	+	636262	AGTGGAGGTACAAATGCTAGAACCAGAATCGATCACATCCCAGCCAGAGCTGTGGACTCAATGCTTAAGTGGGAACCCAGCACCTTAGCACTTCAAGTCTCTATATGCCTGTGGTCACTCAAGGGCATGTGAGGTGAAGAGGGGAT-----GTGTACACAGGGGGGGCTGTGCATTACAAACCTCTCATGTGGGGATCAGGCTCCCTCTACAGGTGCCTGTGATCACTTGATACCATGTCAGGTGGCACAGTCTTATAGCTAAGTACTATCTGCATGTATATGGCCGTGTTTGCCATTTATTGGAGCTTTGCACGAGGCACTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	640591	324	+	647215	AGTGGGAGCACATATGCTACAACCATAATTCATTACATCATAGCCAGAGCTGTGGACTCAGTGCTTAAGCAGGGACCTAGCACCTTAGCACTTCAAGTCTCTATATGCCTATGGTCACTCAAGAGCATGTGGGGTGAACAAGGGGTCTAGAATGTATGCAGGGGGAGCTGTGCATGACAAACCTCTTGTGTGGGGAGCAGGCTCTTTATACAGCTGCCTGTGATCGCTCTACATCATGTCAAATGGAGGAGGCTTATAGCCAAGCACTAACCGCATGTATATGGCCGTGTTTGCCTTTTATTGGAGCTTTGCATGAGGCACTGC

a
s	mr.mrrefChr3	175786	47	+	181019	GTCTGAACAATGTTATGTGTCCTCCATATGCACAACCTATTTTTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	629378	47	+	636262	GTCTGAACAATGTCACAAGTCCTCCATATACACAACATATTTTTTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	640923	44	+	647215	ATCTAAACAATGTTATGTGTCCTC---ATGTACAACCTATTGTTTTA

a
s	mr.mrrefChr3	175833	145	+	181019	CATCAGTCAATTAACCAGACTGGAGTTACATTTAAGGGATCCACTCCTTACAAGTGCAAACAATAAGCAGTTAGCTTCTGTGAGCATGCAGGCACAGAGTTGCGAGTTGTCATTTGTAAATTTACCCATTAAGGAATCCCATATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	629509	144	+	636262	CATCAGTCAATTAACCAAACTGGAGTTACATTTAAGGGATCCACTCCTTCCAAGTGCAAACAATAAGCGGTTAGCTTCTATGAGCATGCAGGCACAGAGTTGCGAGTTGTCATTCG-AAGTTTACCCATTAAGGAATCCCATATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	640967	143	+	647215	CATCAGTCAATTAACTGGGTTGGAGTTACATGTAAGGGACCCACTCCTTACAAGTGCAAACAATAAGCAGTAAGCTTATGTGAG--TCCAGCCGCAGAGTTGAGAGTTATCTCTTGTAAATTCACCCATTGAGGAATCTCATACA

a
s	mr.mrrefChr3	175978	4	+	181019	GTCC
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	629670	276	+	636262	TAGTTGTTGAAGCTAGTAGCTACAAATTCTCCTATGTGAGAGAGCAGTCTAGACAGGTGGCAGTCTAAGCAGGCAAGGCATGGTGCCAGCTTATCCTTCTAGA--TTGAAAGTGTATGGAATTTGTTGGAACTCAGACAGGATGTTCTTATGTCCAACAACTGCTTGCCCAGTTGGTAAAAAAGTGCAGCTCACCCAAAAAGTATATTTAATATCATAGGTTGCAGCCTGTGGGGAGCCCTGGTGATTGCCAACTTCCCTGTTGGCCCCATGCACATC
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	176391	16	+	181019	CCTCCCAAATTTTGTA
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	176436	76	+	181019	CTGCATTAGGAATTTAAAGGTTCATTATCTTCCCAAATTTTATAGTTTCTTAGTTGTTGTCAACCAATTCTTCGGT
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	176537	579	+	181019	TGAAATTTTAATGAGTGTTTACTAGGGGCCTTTTTTTTGCAAAAAATATCTGTCCATCCCGTGAGTAAGTTCCAAAGCAGCACACACTGAGAATATTCTCTGGTATGTGAATTTCTCCACTTACACTCAGTACTTCTAATTTGCCTGGTGCAGCATTTTCTGATTTTAGCTTCTAGGCCTTTTCTTTATTTTTGGATCTTTAGGCCAGCTCTATCAATCTATGGGGTTCCACAGAATCATAACACATACTGCTCATGGCCTTGTAAACCCAAGTCCGGAGAGAAGCACTCTCCAGAGTTACACGAACATTGTTTATACGACTTGGAATTTTAGAAGGCCTCAATTTTTGTGCTACAGGCTAGTTCGCTCAGAGTTCTTCAAGCAATATTCCTCACTTGTTTAAATGTAGCCTGTATAATCTCCAGCCTTATTGAATCTGGACTGCAGCTGATTGGGCAACCCCAAGTTATTGTCAAGCTCTGTACATACTAGATTGGACATTCATGGATGAAACTGTGACTGAACAAAAAAAAAATCTTCTTCCTATTATCAGTTTGATTATTCTGAAAATCAGCTAGG
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a
s	mr.mrrefChr3	177116	56	+	181019	AATGAGCAAGATTGGGTAGTTACCATCAGCCCCAGATGGATGCCGAGGTGACCTTA
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a
s	mr.mrrefChr3	177172	50	+	181019	GGTCCGACCGATCCCTCCACTGGAGGGTGTAACGCCTCTCTAGTGCTGGG
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a
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a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	642644	300	+	647215	AAAAAATCTATGTTTACGGCCATAAAAAAAAAAAATCTATGTTTCTGGCATGTTGTTTCTGTAAGGACAGTC---TTCGATTGCTATCGGTTTCCCCGACATGACAGGCAGGCTGCTGGGCC-ACAGGATGA--TGCTTTGATTGCTAGGGGTCTCGTCCGGAACATGGGGGATTTACTCGGATAATAGTGATCCTTCGTGTGATAATTGCAAGTCATTTAACATTTAAGAGGCTACTATTGTCTTGTCTCTCGTCATGTTGATGTACCACACAAAGTTATAGAGCATTGA-GTCGCA----ACTCTCTTA---------

a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	642944	136	+	647215	ATCTGTAATAAGTTTTTTTTCCGTCTTCTTCTCATCTTTTCACTAGGGTCCATCTTCTGTACTATCATTGCTATGCCATCCCATGGACTGAGTATCCTAGGCTGGTCTGGGATCTCAGGTGATATGGCTAGTTTTC

a
s	mr.mrrefChr3	177966	13	+	181019	TCCCCCAATTGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	631654	13	+	636262	TCCCCCAATTGGG
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a
s	mr.mrrefChr3	177979	314	+	181019	CTGGAGTTCCATGGTAGTTCTTCCCCATAATCTGTTAATGGTCCATTGTACAAGTTGAGAATGCATGCCGGCTGACAAGCCTTGACAAAGAATCCATACAGCTACCTCTCTAAGCTCCTTGCTGAGGTTGGAAAATTGTTGGTGATGTATTTTAATATTGGTCATTGACACCAAAAAACCTTGCTTTTGAGATGCCAGCTCTGCTAGCCGGACCTGGATCACCCATTAGAGCTTAGCTATCCAAGGTCTATCATGTTAACAGGAGAGTCAGCCTTGCATGGTAACTGGGGAGCCAGTGTTGGGCAACAGAAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	631667	314	+	636262	CTGGAGTTCCATGGTAGTTCTTCCCCATAATCTGCCAATGGTCCATTGTGCAAGTTGAGAATGCATGCCGGCTGACAAGCCTTGACAAAGAATCCATACAGCTACCTCTCTAAGCTCCTTGCTGAGGTTGGAAAATTGTTGGTGATGTATTTTAATATTGGTCATTGACACCAAAAAACCTTGCTTTTGAGATGCCAGCTCTGCTAGCCGGACCTGGATCACCCATTAGAGCTTAGCTATCCAAGGTCTATCATGTTAACAGGAGAGTCAGCCTTGCATGGTAACTGGGGAGCCAGTGTTGGGCAACAGAGGTA
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a
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a
s	mr.mrrefChr3	178510	353	+	181019	CATGAGAGTTGTCATGCTAGCAGTGATAGCAGGAAAGAATATAACCTAAGGTTGGATTCCAAGTCACTCCTCTAACTCAATTATTGAGATGTAAGACAGTTCTAGGATTCTCATAGACAACCTTAAGCTGTCACTTAGTTTTGTGGTACAACTGAGGTCAACAACCACAAACCATATAGTATAAAGACTTGTTTAGTGTATCAAATGTGCTAATGGTAACAACTAGATGAGCTGAAGTAATTGGTTAGGCATATATAGTGGCTTTAATGAAAGTTTGGTGAGGAGAAAATGAACTTGTTAATTGTTAGGTTGTATTAGTTTGTCTTGGCATTGGATTTGCTGGTCAAAGGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	632220	353	+	636262	CATGAGAGTTGTCATGCTAGCAGTGATAGCAGGAAAGAATATAACCTAAGGTTGGATTCCAAGTCACTCCTCTAACTCAATTATTGAAATGTAAGACAGTTCTAGGATCCTCATAGACAACCTTAAGCTGTCACTTAGTTTTATGACACAACTGAGGTCAACAACCACAAACCATATAGTCTAAAGACTTGTTCAGTGTATCAGATGTGCTAATGGTAACAACTAGATGAGCTGAAGTAATTAGTTAGGCATATATAGTGGCTTTAATGAAAGTGTGGTGAGGAGAAAATGAACTTGTTAATTGTTAGGTTGTATTAGTTAGTCTTGGCATTGGATTTGCTGGTCAAAGGTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	643628	304	+	647215	CATAGGCAACCTTAAGCTGCCACT--TAGCTTTATGACATATTACAT----TTAGGTCACAAGTC------------------CTGAGAGGTGTGGTGGTGCTGAGATTGTC-----CAAC--------------------TGTGGTCAACTTGTGGTCAACAACCATAAATCATATAGTATAAAGACTTGTTTAGTGTATCAAATGTGCTAATGGTAACAACTAAATGAGCTGAAGTAATTGGTTAGGTGTATATAGTGGCTTTAATGAGAGCTTGGTGAAGAGAAAATGAACTTGTCCGTTGTTAGGTAGTATTAGTTTGTCTTGGCATTGGATATGCTGGTCAAAGGTAT

a
s	mr.mrrefChr3	178863	33	+	181019	TGCCTAGGCTATCTAACAAGTAATATAGGTCAG
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a
s	mr.mrrefChr3	178896	31	+	181019	ATTGGGGGTTATTTACCGCCCTGCTATAGGA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	643965	31	+	647215	ATTGGGGGTTATTTACCACCCTGCTATTGGA

a
s	mr.mrrefChr3	178927	183	+	181019	TAATCCTACCAGTGTGACCGGGACCCATGGTCAGGTTTTGTAAGTGCAAAACTTCATTTGGCCAAATGTGCAAAAGATAAGGACAAATATTACTCCCATTTGAGGGTCGAAAATTTTAACAGGGTAGAACATTTTAACTCTTAAAGTTATCAGGTATACACCCTTGATTCAGCTGTCCTTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	632638	175	+	636262	-AATCTTACCAG-------GGGACCCATGGTCAGGTTTTGCAAGTGCAAAACTTCATCTGGCCAAATGTGCAAAAGATAAGGACAAATATTACTCCCATTTGAGGGTCGAAAATTTTAACAGGGTAGAACATTTTAACTCTTAAAGTTATCAGGTATACACCCTTGATTCAGCTGTCCTTTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	643997	182	+	647215	TAATGCTACCAGTGTGACCGGGACCCATG-TCATGTTTTGTAATTACAAAACTTCATTTGGCCAAATGTGCAGAACATAAGGACAAATATTCCTCCGGTTAGAGCGTAGAAAATTTTGACGGGGTAGAAGACTTCAACTCTGAAATTTATCAAGAAGGCACCCTTGATTCAGCTGTTCATTTA

a
s	mr.mrrefChr3	179110	83	+	181019	CAGACTAATGCACCACTTATAGAAAGCACTTGCCAAGTATTATGGGAGCTGTCAAGAATTTAAATGCTTGTAGAGTGCTTTTA
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a
s	mr.mrrefChr3	179193	57	+	181019	TTAAGACACCCTCATAGGACATCTATCTAAATACCTTAGTATAAAACATTGACTATG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	644262	57	+	647215	TTAAGACACCCTTCTGGGACATCTATCTAAATACCTTAGTATAAAACATTGACTATG

a
s	mr.mrrefChr3	179250	68	+	181019	TTGTCCTTCCTCTTCATTGCTTTCCACCTTTTATCAGATGTCACAGCGCTAAATATTTCATATATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	633145	68	+	636262	TTGTCCTTCCCCTTCATTGCTTCCCACCTTTTATTAGATGTCACAGCGCTAAATATTTCATATATCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	644319	68	+	647215	TTGTCCTTGCTCCTCATCAGTCTACACCTTTTATCAGATGTCGCAGTGCTATATGTTCCATATATCGA

a
s	mr.mrrefChr3	179318	81	+	181019	ACCCATGCTTACCAGTTTATCTCTTGTTTTTGACCAGCTATTAAGAGGTCACAATGCAATGTCTTTTAAATGGAACAGTAG
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a
s	mr.mrrefChr3	179399	57	+	181019	GAGGTTGTCTCTTATTTAATAAGCTGTAAAACACTGTGGACTACCTATCACTAGTTA
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a
s	mr.mrrefChr3	179456	20	+	181019	GTAGTCCCTCCATAGCAACT
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a
s	mr.mrrefChr3	179476	63	+	181019	CTAGATATCATAAGGACAGGAGAATAGAATAAATAGATTCCTTGTAGACTAATTCTAATGAAT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	644558	63	+	647215	CTAGATGTCCTGAGGACAGGAGAATTGACTAAATAGATGCCTTGCAAACTAAGTGTGACGGAT

a
s	mr.mrrefChr3	179539	145	+	181019	GCTGCCTGGAATAGTTTGCATATAATGCTGTCAAGCGGATTTTGTGTAGATCATCCAATGATCTGCGGCCACGAAGGGCAAACCTGTGGCGGTTAAAAAGGCACTAATTTCTCAATGGACAAAATTGTCTGATAGAAGGCTTAGT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	644621	145	+	647215	GCTGCTTGGAGTCGTTAGCATAAACTGCTGTCAAGCGCATTTCGTGTAGATCATCCACTGAGCTGTGGCCCCCAAGGGCAAACCTGTGGTGATTAAAAAGGCACTAATTTCTCAATTGAAAAAATTGTCTGATAGAAGACTTCGT

a
s	mr.mrrefChr3	179684	24	+	181019	GATTCATGATTGTGTAGAGGCAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	633593	24	+	636262	GATTCATGATTGTGTAGAGGCAGG
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a
s	mr.mrrefChr3	179708	148	+	181019	AATATGGGAATGCTCTGATTTCATGGGGGAGGCTTGATTGGTTTTCCTTTGTGCAAGTGACCTGACTGGAAAAGCAAATGGTGTACCACTGCCCACTAGGTCTTGCAATAATCTAGGGATGATTGTTTAGGGTTAGAACATAGGTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	633618	148	+	636262	AATATGGGAATGCTCTGATTTCATGGGGGAGGCTTGATTGGTTTTCCTTTGTGCAAGTGACCTGACTGGAAAAGCAAATGGTGTACCACTGCCCACTAGGTCTTGCAATAATCTAGGGATGATTGTTTAGGGTTAGAACATAGGTATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	644791	148	+	647215	CATATGGGGATGTTCTGGTTTCAGGGGGGAGGCTTGATTGGCTTTCATTTGTGCAAGTGACTCGACTGGAAAAGCAAGTGGTGTACCACTGCTCTCTAGGTCTTGCAGTAGTCTAATGATGAATGTGTAGTGTTGGACCATAGGTATT

a
s	mr.mrrefChr3	179856	40	+	181019	TGATTAGTCTAATGACTAATGCATAAAATCTGCTGAATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	633766	40	+	636262	TGATTAGTCTAATGACTAATGCATAAAATCTGCTGAATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	644951	40	+	647215	TGATCAGTCTAATGACGAACATCTAATATCTGCTGGATAT

a
s	mr.mrrefChr3	179896	30	+	181019	TTAAATTTGTGCGGATAATTCAAAGGGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	633806	30	+	636262	TTAAATTTGTGCGGATAATTCAAAAGGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	644993	30	+	647215	TTAAAATTATGCAATTAATTTAAAGGGTAA

a
s	mr.mrrefChr3	179926	110	+	181019	GTGAATGGCCCAATGATTTGGTTCCCAGATGTTTCAATCCGACAACATAATATGACTAGTCCTACAAGAGGCACTACACCATTAGACCCTCCTTCAGAGATAAATTATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	633837	110	+	636262	GTGAATGGCCCAATGATTTGGTTCCCAGATGTTACAATCTGACAACCTAATATGACTAGTCCTCAAAGAGGGACTATACCATTAGACCCTCCTTAAGAGATAATTTATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	645023	110	+	647215	GTGAATGGCCCAGTGAATTGGTTCCCAGATGTTTCAATCCAACAACATAACATGACTAGTCCTACAAGGGGCACTACATCATTAGAGCCTCCTTCAGAGATAAATTATAA

a
s	mr.mrrefChr3	180036	37	+	181019	GTAGAAGTCTATCGATGGTGTGGGGTAATCACCTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	633947	37	+	636262	GTAGAAGTCTATCGATGGTGTGGGGTAATCACCTTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	645136	37	+	647215	GTAGAAGTCGATCGATTGTGTCAGGTAACCATCTTTA

a
s	mr.mrrefChr3	180073	67	+	181019	AGGGGACACACATGGTGCGTTGACTTATGTACTTTCTTGCCGGACGATCCATACCATTTGTCTACCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	634039	67	+	636262	AGGGGACACACATGGTGCGTTGATTTATGTACTATCTTGCCGGACAGTCGATACTATTTGTCTACCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	645173	67	+	647215	AGGGGACACACACGGTGCGTTGACTTATGTACCTTCTTGCCGTACGATCCATACCATTTGTCTACCC

a
s	mr.mrrefChr3	180140	49	+	181019	CTTTGTGAAGCCATTTTTTTGGATGGGGTCAGCCTTCTAGGCTGCTTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	634355	44	+	636262	CTTTGTGAAGCCATTTTTTTGGCT-----CAGCATTCTAGGCTGCTTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	645240	49	+	647215	CTCTGTGGAGCCAGTTTTCTGGATGGGGTCAGCCTTCTAGGCTGCATCA

a
s	mr.mrrefChr3	180189	112	+	181019	GTTCCATTTACCAATACACTCACATTTACGATTATACTATTTTACATCTCGAGTTGGATAAGATTAGACCTCCTAACAGGTGCTGCTCTCCATACATTTGTAATTACTCGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	634400	109	+	636262	GTTCCATTTACCAATACACTCACATTTACAATT---CTATTTTACATCTCGAGTTGGATAAGATTAGACCTCCTAACAGGTGCTGCCCTCCTTACATTTATAATTAGTAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	645289	112	+	647215	GTTCCAGTTACCAATACACTCACATTTATGATCATACTACTTTACATCTTGAGTTGTATAAGATCAGACCTCATAACAGGTGCTTCTTGCCATACATTTGTAATTACTCGCA

a
s	mr.mrrefChr3	180301	24	+	181019	TGATATATTTCTTCCCAGCTATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	634511	24	+	636262	TGGTATATTACTTCCCAGCTATGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	645401	24	+	647215	TGATATATCTCTTACCAGCTATGA

a
s	mr.mrrefChr3	180325	44	+	181019	ACAAACCGCTTGTGTGAGGTGGGAAGACTCCTTCTGTGATCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	634535	44	+	636262	ATGAACCGCTTGTGTGAGGTGGGAAGACTCCTTCTGTGATCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	645427	44	+	647215	ACAAACCACTTGTGTGATGCGGGCAGACTCCTTCTGTGATCATT

a
s	mr.mrrefChr3	180369	59	+	181019	GCCGCATCCATGCTGTGAAGCTTTGCCTGTCAGTGGACCGCAATTCCTCTTGGTCAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	634579	55	+	636262	ATTGCATCCATGCTGTGAAGCTTTGCCTGTCAGTGGACCGCAATTCCTCTTGGTC----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	645501	8	+	647215	GCCG---------------------------------------------------AGCA

a
s	mr.mrrefChr3	180428	269	+	181019	CTGACATGGGGATCATTAAACTACATATATACAAGTAAATATGTGGAACTTATCTTCGATAGGGAGAAACTAGTAAGTCTCTTCCAGAGCAGGCTAACCTATTGCTTATAAATACAAAGTTGTACTCAAATCTGTGCTAATTCAAACCAGTGCTTTGGGTTGCTCTTTTCAGATAACTGACACTTCCTCGATCATTTTATAGCGAGATTCCCTGCTCCTCCCTCATATCAACTGAAAAGAGCCCTGGCCCAAGTAGGGTGAATAGTCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	1003	269	-	636262	CTGACATGGGGATCATTAAACTACATATATACAAGTAAATATGTGGAACTTATCTTCTATGGGGAGAAACTAGTAACTCTCTCCCAGAGCAGGCTAACCTATTGTCTACAAATACAAAGTTGTACTCAAATCTGTGCTTACTCAAACCTGTGCTTTAGTTTAATCTTTTGAGATAACTGACACTTTCTCGATCATTTTACATCGAGATTCCCTGCTCCTCCCTCATATCAACTAAATAGAGCCGTGACCAAAGTAGGGTGAGTAGTCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	645578	219	+	647215	--------------------------------------------------CATCTGTGATAGGGAGAAATTAGTAAGTCTCTTCCAAAACAGGCTTACCTATTGCTTATAAATACAAAGTTGTACTCAGATCTGTGCTAATTCAAACCAATGCTTTGGGTTGCTCTTTCCAGATAACTGACACTTCGTAGATCATTTTATAGTGAGATTCCCTGCTCCTCGCTCATATCAACTGAAAAGAGCCCTGGCCCGAGTAGGGTGAATAGTCTG

a
s	mr.mrrefChr3	180697	65	+	181019	TGTTAAATTGTTGAGGAATGGACCCATTTTATGTACACTCCCCTCTAAGTGATCTTGCTTGATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	1293	63	-	636262	TGTTAAATTGTTGAGGAATGGACCCATTTTATGTACACTCCCCTCTAAGCGATCTTGTG--CTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	645797	65	+	647215	TGTTAAATTGTTGGGGAATGGAAACATTTTATGTATGCTCCCCTCTAAGTGATCTTGCTTGAGTA

a
s	mr.mrrefChr3	180762	18	+	181019	GCTAACAGAACAGCCTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	1358	18	-	636262	GCTAAAAGAACAGCCTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	645862	18	+	647215	GCTAACAGTACAGCTTAG

a
s	mr.mrrefChr3	180780	46	+	181019	CCAACTATCAACCATTCATCGCCTCCTATGACATTGCTTGCTACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	1391	46	-	636262	CCAACTATGTGCCATTCATCGCCTGCTGTGACATTGCTTGCTACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	645880	46	+	647215	CCAACTATCAACCATTTATTGCCTCCTATGACATTGCTTGCTACAT

a
s	mr.mrrefChr3	180826	187	+	181019	ATAGGACCACATCCCATTCAAAAAATACAACCCACTCATGCAATACAACCAACCTATGCAACTGGCCTGGGTGTGTTATTGTGGATCTGCATAGCACTGATTTCTGCCAATTAGGTGGGGGGATCCAACACCTGATTGCCTTGAATCCCAGCTTGGCGTGGTCTCCTTTCTGACCAACAGGTGGGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	1437	173	-	636262	ATGGGACCACATCCCAT-------------CCCAATCAGAAAAAACAACCAACCGATGCAACTGGCCTGGGTGTG-TAGTGTGGATCTGCATAGCACTGATCTTTGCCAATTAAGTGGGGGGATCCAACACCTGATTGCCTTGAATCCCAGCTTGGCGTGGTCTCCTTTCTGACCAACAGGTGGGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	645927	163	+	647215	ACAGGACTGCATCCCAGTCAAAAAATACAACCCACCCATGCAATACAACCCACCTATGCAACTGGCCTGGGTGTGTTATTGTGGAACTGCATAGCACTGATTTCTGCCAATTTGGTGGGGAGATCC--CACCAGATTGCCCTTAA----------------------ATGTGACCAACAGGTGGGTT

a
s	mr.mrrefChr3	181013	6	+	181019	GGACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	1610	6	-	636262	GGACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	646101	6	+	647215	GGCCTA

a
s	mr.mrrefChr4	0	68	+	409	TGCTGATAAATTAGATTGACATATTGTAATTACCAGTAAAGTAAGGCCAGCACTTTGCAAGGATTAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	499913	62	-	636262	------TAAATTAGATTGACATATTGTAATTACCAGTAAAATAAGGTCAGCACTTTGCAAGGATGGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	132120	68	+	647215	TGCTGATAAATTAGATCGACATACCGTAATTACCAGCAAAGTAAGGCCAGCACTTTGCAAGGATTAAC

a
s	mr.mrrefChr4	68	6	+	409	TGACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	500011	6	-	636262	TAACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	132188	6	+	647215	TGATCA

a
s	mr.mrrefChr4	74	297	+	409	ATCAACCAGGATGGATCTACTCAGGAAGTTGAAATACAATATTGCAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATCTTTTTATGGAGCAATACAATCTGCAGGACAGAGAGTTCTGCTTACTAATCAAGCTATAAAGTTATTAAGGAGGGTGAGGATTAACAGAATGTAGTCTAAAGCTATTGAGGTCTGGCCTTATATCTTCACACTTATCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGTGGAGAACCCCACCATATGTTCTCATAAAAAAATATTCACATATGGCATTGGTAAAGGGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	500017	296	-	636262	ATCAACCAGGATGGATCTACTCAGGAAGTTGAAATACAATATTGCAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATATTTTTATGGGGCAATACAATCTGTAGGACAGAGAGTTCTGCTTACT-ATCAAGCAATAAAGTTATTAAGGAGGGTCAGGATTAACAGAATGTAGTCTAAAGCCTTTGAGGTCTGGCCTTATGTCTTCACACTTATCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGTGGATAACCCCACTATATGTTCTCATAAAAAAATATTTACATATGGCATTGGTAAAGGGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	132197	294	+	647215	ATCAACCAGGATGGATCCACTCAGAAAGTCAAAATACTATATTGGAGGATCTTAAAGATCTGCTTACATCTTATTATGGAACAATACAATCTGCAGAACAGAGAGTTCTGCTGACTAACCAAGCTATAAACTTATTAAGGAGGGTGAGGATTGGCAGAATGTAGTCTAAAGATATTGAGGTCAGGCCTTTTATCTTCACACTTGTCTATGTCAAATGGGACTGGGTAAACTTGTGGCGAAGAACCCCACCAT---TTCTCATAAGAAAACATTCACAAATGGCATTGATAAAGGGGT

a
s	mr.mrrefChr4	371	33	+	409	AAGGTTAGCCTAGGAATCTGTGTGTCCTGGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	500313	33	-	636262	AAGGTTAGCCTAGGAATCTGGGTTTCCTGGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	132492	33	+	647215	AAGGTTAGCCTAGGAATCTGTGTGCCCTGGAAC

a
s	mr.mrrefChr4	404	5	+	409	GCACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	500347	5	-	636262	GCACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	132525	5	+	647215	GCACC

a
s	mr.mrrefChr5	0	98	+	294542	TTTCTAGTCTTGACTGATCTTTTCAAGAAGGTGTGAATTGTTTTCACTTTGACAACTAAAGTAAAATGCTCTGCCCACACCAAGCTCCAAGCCCATGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	136356	98	+	636262	TTTCTAGTCCTAACTGATCTTTTCAAGAAGGTGCGAGTTGTTTTCACTTTGACAACTAAAGTAAAATGCTCTGCCCACACCAAGCTCCAAGCCCATGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	134116	98	+	647215	TTTCTAGTCTTGACTGATCTTTTCTAGAAGGTGTGAATTGTTTTCACTTTGATGACTAAAGTAAAATGCTCTGCCCACACCAAGCTCCAAGCCCATGC

a
s	mr.mrrefChr5	98	99	+	294542	AAGAACAAACACCTTAAGCAGAGACTTAATTGAACAGTTCATAAGTATGGGGCTTTCCCCCTCCCTGTCTCTATCTAGTTTTTTTGGCATCAACTTAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	136454	99	+	636262	AAGAACAAGCACCTCAAGCAGAGACTTAATTGAACAGTTCATAGGTATGGGGCTTTCCCCCTCCCTGTCTCCATCTAGTTTTTTTGACATCAACGTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	134215	99	+	647215	AAGAACAAACATCTTTAGCAGTGATTTAATTGGACAGTTCAAAAGTATGGGGCTTTCCCCCTCCCTGTCTGTATCTAGTTTTTTTGGCATCAACTCAAA

a
s	mr.mrrefChr5	197	104	+	294542	CCCAGGCCATAGCTGGCCTCTCATGATCAATAAATAAACATAATAAAACTTTAATTGCTAGCTAAGTTATCCTGGTGGCCAAGCAGTGTAGTTCTCACAGTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	136553	104	+	636262	CCTGGGCCATAACTGGCCTCTCATGATCAATAAATAAACACAATAAGGCTTTAATTGCTAGCTAAGTTATCCTGGTGGCCAAGCAATGTTGTTCTCACAGTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	134322	104	+	647215	CCCAGGCCATAGCTGGCCTCTCATGATCAATAAACAAACGTAACAAAATTTTATTTGCTAGCTAAGTCACCCTGGTGGCCAAGCAGTGTAGTTCTCACACTGTA

a
s	mr.mrrefChr5	301	86	+	294542	CCTCACCAGGGGCATGGTCATTGTACAGCTTCTGTCTTTGCCCTGTATGATCACCTTGCCTTTAAAAACTCCCAATCCTAATACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	136684	84	+	636262	CCTCACCAGGGGCATGGTC--TGTACAGCTTCTGTCTTTGCCCTGTATGATCACCATGCCTTTAAAAACTCCCAATCCTAATACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	134426	86	+	647215	CCTCACCAGGAGGATGGGCATTGTACAGCTTCTCTCTTTGCCCTGTAAGATCACTTTGCCTTTAAAAACTCCCAATCCTAATACAT

a
s	mr.mrrefChr5	387	6	+	294542	GTGGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	136771	6	+	636262	ATGGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	134512	6	+	647215	GTGGCT

a
s	mr.mrrefChr5	393	249	+	294542	CCCAATGTGTTAATTCTTATTTTATACACTTGAACTTACTCAGTGTATCACCAGCATGAGGTGAATAATTCCTCATTATTTTTTGCTGTGGCCTCTGGATGGATCTCTATGACCACATGTAAGAAGAGGCTGGGTCAATGAGATGGGCCCTGCATCAAATATATGGTCCATGAGATAGGACAACAAAAGTAGCCTTACAAAAGAAGTGCCAATAAATGGAAGCACAATAATGGAGTTGAATTTTGTTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	136783	175	+	636262	CCCAATGTGGTAGTTCCTATTTTATACACTTGAACTTGCTCAGTGTATCACCAGCATGAGGTGAATAATTCCTCATTATTTTTTACTGTGGCCTCTGGATGGATCTCTATGACCACATGTAAGAAGAGGCTGGGTCAACGAGATGGGCCCTGCATCAAATATATGGTCCCTGAGT--------------------------------------------------------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	134518	246	+	647215	CCCAATGGGTTGATTCTTATTCTATACACTTATCCTTAC---ATGTATTACCAGCATGAGGTGAATAATTCCTCATTATTTTTTGCTGTGGCCTCTTGATAGGTTTCTATGACTACATGTAAGAAGAGGATGGGTCAATGAGATGGGCCATGCATGAAATAGATGGTCCATGAGATAGGACAACAAAAGTAGCCTTACAAAAGAAGTGCCAATAAATGGAAGCACAATAATGGAGTTGAATTTTGTTGC

a
s	mr.mrrefChr5	642	120	+	294542	AGAAGGAGAGGGCTCAACATTAGGAAATGCTCTTTACCTTTAATATTTCTTATAGCACTCAGCTTAGGCCCAACACAAGTGTTCTGGTAGGCCTCTCTCTTGTATCGCAGGTGTGAACCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	134786	120	+	647215	AGAAGGAGAGGGCTCAACATTAGGAAATGCTCTTTACCTTTAATATTTCTTATAGCACTCAGCTTAGGCCCAACACAAGTGTTCTGGTAGGCCTCTCTCTTGTATCGCAGGTGTGAACCC

a
s	mr.mrrefChr5	762	116	+	294542	CTGTGCTCACTCCTTCTCACCTTCCAGACATGTATTATTGTCATACTACAACCCAAACTATCTGGATCGGGGCTGCTACAACTTGTAGACAGGAGCTATGAGCCTAAGGCATTACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137102	58	+	636262	----------------------------------------------------------TATCTGGATCGAGGCTGCTACCACTTGTAGAAAGGAGCTATGAGCCTAAGGCACTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	134919	116	+	647215	CTGTGCTCACTCCTTCTCACCTTCCAGACATGTATTATTGTCATACTACAACCCAAACTGTCTGGACTGGGGCTGGTACAACTTGTAGGCAGGAGCTATGAGCCTAAGGCATTACA

a
s	mr.mrrefChr5	878	42	+	294542	ATATGCACTTGCTTGTGCATTTGGATGAGAGTAGATGTTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137162	42	+	636262	ATATGCACTTGCTTGTGCATTTCGATGAGAGCAGATGTTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	135035	42	+	647215	ATACGCACTTGCTTGTGCATTTGGATGAGAGTAGATGTTGCA

a
s	mr.mrrefChr5	920	1	+	294542	G
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	136958	1	+	636262	G
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137204	1	+	636262	G
s	simRat_chr6.simRat.chr6	135077	1	+	647215	G

a
s	mr.mrrefChr5	921	12	+	294542	TATTACTGAGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137205	12	+	636262	TTTTACTGAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	135078	12	+	647215	TATTATTGAGTG

a
s	mr.mrrefChr5	933	86	+	294542	ATACATCTAGAGCATGCTCTGTGTGCTCCTCTTCTAATGGAGTGCAcagctaccaagttGTGCTCCTgttctaaTGGAGTGCACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	136959	54	+	636262	ATACATCTAGAGCATGCTCTGTGTGCTCCTCTTCTAATGGGGTGCA-------------GTGCTCCT-------------------
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137217	54	+	636262	ATACTTCTCGAACATGCTCTGTGTACTCCTCTTCTAATGGAGTGCA-------------CTGCTCCT-------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	135090	86	+	647215	ATACAACTAGAGTGTGCTCTGTATGCTCCTGTTCTAATGGAGTGCACAGCTACCAAGTTATGCTCCTGTTCTAATGGAGTGCACAG

a
s	mr.mrrefChr5	1019	80	+	294542	CTAAGTTGATGCAGCACATTTCTTGTAGATAAGAGGCGACTTTCTAGTAAGTCATCAAATGCAAACTAATGAACTCAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137013	79	+	636262	CTAAGTTGATGCAGCACATTCCTTGTAGATAAGAGGCGACTTTCTAGCAAGT-ATCAAATGCAAACCAATGAACTCAGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137271	79	+	636262	CTTAGTTGATGCAGCACATTTCTTGTGGATATGCGGCGACTTTCTAGTAAGT-ATCAAATGAGAACTAATGAACTCAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	135179	78	+	647215	CCAAGTTGAAGCAGCACATTTCTTGTAGATAAGAGGCAACTTTC--GGATGTCATCAAAGGCAAGTTGATGAACTCAATG

a
s	mr.mrrefChr5	1099	9	+	294542	TTAGATTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137093	9	+	636262	TTAGATTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137350	9	+	636262	TTAAATTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	135257	9	+	647215	TTAGATTGT

a
s	mr.mrrefChr5	1108	33	+	294542	CTGTGCCCCATGTATATAAAGTAGTGCCATGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137359	33	+	636262	CTGTGCCTCGTGTATATAAAGTAGTGCCATGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	135266	33	+	647215	CTGTGCCCTATGTATATATAGTAGTGACATATG

a
s	mr.mrrefChr5	1141	67	+	294542	ACCAGCCTGACAAGTGCGTGACATATGGAATGAGAAAGACAAGGGTGCTAACACACAACATTTTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137392	59	+	636262	GCCAACCT--------CGTGACATATGGAATGAGAAAGACAAGGGTGCTAACACACAACATTTTCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	135301	16	+	647215	ATAAGAAAGACAAGTG---------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	1208	78	+	294542	AAGCCTCAGTTTTAGTTTCCTCAGGGCTATAAATATGGCGCGGAAGTAAACCTATAGTCAGGGCAAAGGAGCCTCTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137457	78	+	636262	AAGCCTCAGTTTTAGTTTCCTCAGGGCTATAAATATGGCGCGGAAGTAAACCTATAGTCAGGGCAAAGGAGCCTCTAA

a
s	mr.mrrefChr5	1286	14	+	294542	TCCAGGAGATGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137536	14	+	636262	TCCAGGAGATGGAG

a
s	mr.mrrefChr5	1300	113	+	294542	TCCTTCTGACACAAAGGTCTGTCACTTTTATGGGGTGGCCACACTTATCCACTAACACACCCAGTTTTCCTTCCCTACTTGTACAAGTATATTTGACTTTCATATTCGGATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137552	113	+	636262	TCCTTCTGACACAAAGGTCTGTCACTTTTATGGGGTGGCCACACTTATCCACTAACACACCCAGTTTTCCTTCCCTACTTGTACAAGTATATTTGACTTTCATATTCGGATAG

a
s	mr.mrrefChr5	1413	927	+	294542	CCGAATGCAATGTATGGAGTATTCTCTATATATCCTCTGCATTAGGTGTCAGGGGCATTACATTGTTTTGGTACTGCCTGTAATCAGTGTAAAGATTCATGGGATCATGAGTAAGTACACAGTAGTATTTGATACAGACAAAGGCTCACCCCTGATGGAAGTAGAAGATGGGACAATTCTCTATGATAGTTCAGTGAATATTTGAGCTACTCAGTCTTAGCGTTCCTTACTTTAGTATACAGTAAACTTAGAGTATGAACCTAGCAAAACCCAAAAGAAACTAGATGTAACAGACATGTTACTTGGGTATCAAACTGTGTACATCTCTATCTAACTGCCCTCCGGATCCATGCCTTCTCAACACTACTTTGCACCCAGCTGTACTTTAGCCTTGTTAAGAGTCCAACTGCAGCATGTCCACAGCTGTTATCACCCATATAGGTCCCACAATGATATGGATTTTTGGGTGAAATGCCTAATAGTCTTCTTTGTCCTCAAAACGCCCACAGGGACCAACCATCATGATTTGACTGTCCCTCATAAAAGTACCTATAGACATTAACTGATGCAATTCAAGAATTCCACAGCAGGGCGAGGATAAGCAGGTGGGGTACCAAACAAAAGTATAGTAGACAGTATGTTTGATGACCAAGATCTCAAAGGTGTAGATACTTGATCACCACAATTAGCGATCAACACCAACTCAGTAGAGTAATGGGAAGTAGTGAGATCTTTTTAGGGTGATTAATAACAGTGTCCAGAATCTAACACCAAATGAACTAGAATCCTTTCGTGCTCCTGTTTCTTAGCGCATCAGTTCTAGCAAAGTAGCTAATTAGATTAGACTGGAGATAAACAGCCCCTTTTTACCATTCCTTTTAACATGACCTATACTGTGAGAAGGACTCAGTCGACTTACCTTATAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	137673	925	+	636262	CCGAATGCAATGTATGGAGTATTCTCTATATATCCTCTGCATCGGGTGTCAAGGGCATTACAT-GTTTTGGTACTGCCTGTAGTCAGTGTAAATATTCATGGGATCAGGAGTA-GCACACAGTAGTATTTGATACAAACAAAGGTTCACCCCAGATGGAAGTAGAAGATGAAACAATTGACTATGATAGTTCAGTGAATGTTTGAGCTACTCAGTCTTAACATTCCTTACTTTAGTATATGGTAAACTTAGAGTATGAACCTAGCAAAACCCAAAAGAATCTAGATGTAACAGACATGCTACTTGGGTATCACACTGTGTACAGCTCTATCTAACTGCCCTCCAGATCCATGCCTTCTCAACACTACCTTACAACCAGCTGTACTTTAGTCTTGTTAAGAGGCCAACTGCAGCATGTCCACAGCTGTTATCACCCATATAGGTCCCACAATGATATGGATTTTTGGGTGGAATGCTTAATATTCTTCTTTGTCCTCAAAACGCCCACAGGGACCAACCATCATGATTTGACTGTCCCTCATAAAAGCACCTATAGACATTAACTCATGCAATTTAAGAATTCCACAGCATGGCGAGGATAAGCAGGTGGGGTACCAAACAAATATATTGTAGACAGTATGTTTGATGACTAAGATCTCAAAGGTATAGATACTTGATCACCACAACTAGCGATCAACACCAACTCAGAAGAGTAATGGGAAGTAGTGAGCTCTTTTTAGGGTGATTAATAACAGTGTCCAGAACCTAACACCAAATGCGCTAGAATCCTTTTGTGCTCCTGTTTCTTAGCGCATCAGTTCTAGCAAAGTCGCTAATTAGATTAGACTGAAGATAAACGGCTCCTTTTTACCATTCCTTTTAACATGACCTATACTGTGACAAGGACTCAGTCGACTTACCTGATAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	135317	878	+	647215	---------------------------------------CACTAGGTGTCAGGGGCATTACCTTGTTTTGGTAATGCCTGTAATCAGC-TAAAGAGTCACAGGCTCATGAGTAAGTGCACAGTAGTATTTGATACAGACAAAGGCTCACCCCTGATGGAAGTAGAAGATTGGACAACTCTCGATGATAGTTCAGTGAATATTTCAGCTACTCGGTCTTAGTGTTCCTTACTTTAGTATACAGTACAATTAGAGTATGAACTTAGCCAAACCCAAAAGAAACTAGATGTAACAGACATGTTACTTGGGTATCAAGCTGTGTACATCTCCATCT--------TGCGGATCCATGCCTTCTCAGCACCACTTTGCACCTAGCTGTATTTTAGCCTTGTTAAGGGTCCACCTGCAGCATGTCCAGAGCTATTAGCACCCATATAGATCCCACAATGATATGGCTTTTTGGGTGAAATCCCTAATAGTCTTCGTTGTTCTCAAAACGACCACAGGGACAAAACATCATGATTTGACTGCCCCTCCTAAAAGTACCTATAGACATTAACTGATGCAACTCAAGAATTCCACAGCAGGGCAAGGATAAGCAGGTGGCATAACAGACAAAAGTATAGTAGACAGTATGTTTGATGACCAAGATCCCATAGGTGTAGATACTTGATCACCACAATTAGCAATCAACACCAACCCAGTAGAGTAATAGGAAGTAGTGAGAGCTTTTTAGGGTGATTAATAAGATTGTCCAGAATCTAGCACCAAAGGAACTAGAATCCGTTCGTGCTCCTGTTTCTGTGTGCATCAGCTCTGGCAAAGTAGCTGAT-AGACTAGATTGGAAGTAAACAGCCCCTTTTTACCATTCCTTTTAACATGACCTATACTGTGAGAAGGGCTCAGTAGACTTACCTTCTAGC

a
s	mr.mrrefChr5	2340	22	+	294542	TCATTCTTTGAATATAACCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	138605	22	+	636262	TCATTCTTTGAATACCACCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	136195	21	+	647215	TCATTCTT-GAATATAACCTAT

a
s	mr.mrrefChr5	2362	23	+	294542	ACAATTGGTAGTTGGACAGCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	138627	23	+	636262	TCAATTGGTATTTGGACAACACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	136219	23	+	647215	ACAATTGGTAGTTGGACAGCAAT

a
s	mr.mrrefChr5	2385	17	+	294542	CTACCAATAATCTAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	138651	15	+	636262	CTACCAATA--CTAGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	136242	17	+	647215	CTCCCAATAATCTAGAG

a
s	mr.mrrefChr5	2402	122	+	294542	GGCAATTAGGACACAGTGAAAGTACAAGCGATATTTTATGTTCTATCTGCAATTGGTGCCAAGCTTGACTTGGTGACCCTTCTCTTGTTTAGTTAATCCTGGAGCCACCTTGGATAGCTGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	138667	122	+	636262	GGCAATTAGGACACAGTGAAAGTACAAGCGATATTTTATGTTCTATCTGCAATTGATGCCAAGCTTGACTTGGTGACCCTTCTCTTGTTTAGTTAATCCTGGAGCCACCTTGGATAGCTGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	136259	114	+	647215	GGAAACTAGGACATGGGCAAAGTACAAGCAATATTTTATGTTCTATCTG------GTGCCAACCTTGACTTGGTGACCCTTGTCTTGTTTAGCTAATC--AGAGCCACCTTGGATAGCCATC

a
s	mr.mrrefChr5	2524	132	+	294542	ATAATAATACAATACAGTTAGACATGTAAGGATACTGTTATTCATCTGAGAACTTGTTTACCTTCATTCTTGGGGTTGGCATACCAGATGATAATAAATAGATATGAGCTAAACTGTGATTAAGATTGTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	138789	128	+	636262	ATAATAATACAATACAGTTAGACATGTAAGGATACTGTTATTCATCAGAGAGCTTGTTTACTTTCA----TGGGGTCGGCATACCAGATGATAATAAATAGATATGAGCTAAACTGTGATTAAGACTGTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	136699	132	+	647215	AAAATGATACAATACAGTTAGAGATGCAAGAATACTGTTAATCATCTGAGAACTTGTTTACCTTCATTCTTGGGGTTGGTATACCAGGTGATAAGAAATAAATATGAGCTAAACTGTGATTAAGATTATTTT

a
s	mr.mrrefChr5	2656	134	+	294542	TGTCCTTTGCTCTGTTGTTTGGATTGAGTCCACGATGTTAATTACTGCTTGTGGCTAAACATAAATTTCCCATCTGAATACAAAATCAACTTTGTGTTCTTTCACTAACACCTCAATACAAAGTAATTACCCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	138981	134	+	636262	TGTCCTTTGCTCTGTTGTTTGGATTGAGCCCACAATGTTAATAACTGCTTGTAGCCAAACATAAATTTCCCATCTGAACACAAAATCAACTTTGTGTTCTTTCACTAACACCTCAATACAAAGTAATTACCCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	136831	131	+	647215	TGTCATTTGCTCTGTTGTATGGATTGAGTC---GATGTTAATTACTGCTTGTGGCTAAACATAAATTTCCCATCTGAATACAAAATCAACTTTCTGTTCTTTCTCTAACACCTCAATAGAAAGTAATTACCCAG

a
s	mr.mrrefChr5	2790	292	+	294542	ACTCTTTTTGATCCCAAAGGAACCTGTACTGTTCAAGGTTTTTTCCAACACAACAGAGGAGATGGTTGAGAAGGAGACAGTTAAGATATTTGTAGTATATCCAGACCCCCTATAGGCACCATTCGGCGTGCATGGAGAGCTTGTTTCTTTAGATTGACCTTTTATGCACGATTCAAGACAGTTTGCTGTCATCATTCATATATAACAGCTCCCCCCCACAAAAGGAAGAGGACCTTCAATCTAGCTGACTGCGCCACCATCTTTCAACATAATGTCACAATATTACCACATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	139115	286	+	636262	ACTCTTTTTAATCCCAAAGGAACCTG----GTTCAAGGTTTTTTCCAACACAACAGGGGAGATGGTTGAGAAGGAGACAGTTAAGATATTTGTAGTATATCCGGACACCCTATAGGCAC--TTCGGCGTGCATGGAGAGCTTATTTCTTTAGATTGACCTTTTATGTATGATTCAAGACACTTTGCGGTCATCATTCAAATATAACAGCTCCCCCCTACAAAGGGAAGAGGACCTTCAATCTAGCTGACTGCGCTACCATCTTTCAACATAATGTCACAATACTACCACATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	136965	288	+	647215	ACTCTCTTTGATCCCAAAGGAGCCTGTACTGTTCAAGGTTAATTCCAACACAACAGATAAGACAGTTAAGAAAGAGATGGTTAAGATATTTGTAGTATATCTAGACCCCCTATGGGCACCATGGGGTGTGTATGGCGAGCTCGTTTCTCTAGGTTGATCTTCTATGCACAATTCAAGAAAGTTTGCTTTCATCATTCATATACAACAGCTCCCCCCCACAAAAGGAGGAGGACCTTCA--CTAGTTGACTGTGCCACCATCTATCAACGTCATGTCA--ACATTACCACATG

a
s	mr.mrrefChr5	3082	148	+	294542	GGTGGTGGGTCCGACTGTTATCCAATTGGCCTATGACAATTGCTGCCAAGGCTAAAGCTATTAGAAAGAGTGTTAAGATGTTGGCCATGTGTAACCAGGATACTTAAGAGAGTAACAAGCTGCACCGAGTCAAAACATGCAGGACAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	139401	148	+	636262	GGTGGTGGGTCCGACTGTTATCCAATTGGCCTATGACAATTGGTGCCAAGGCTAAAGCTATTAGAAAGAGTGTTAAAATGTTGGCCATGTGTAACCGGAATACTTAAGCGAGTAACAAGCTGCACCAAGTCAAAACATGCAGGACAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	137257	145	+	647215	GGTGGAGGGTCCAGCTGTTATCCAATTGGCCTATGGCAAACGCTACCAAGGCTACAGGTATCTGAAAGAGTGTTAAGATGTTGGCCATGTGGAACCAGGATACTTAAGATAATAACAAACTGCACCGAGTCA---CATGTGGGACAAT

a
s	mr.mrrefChr5	3230	16	+	294542	GAGAGTCAACAAAAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	139550	16	+	636262	GAGAGTCAACAAAAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	137402	16	+	647215	GAGAGTCAACAAAAGC

a
s	mr.mrrefChr5	3246	27	+	294542	AAAAATTATGTTATTTAAAAGGTAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	139566	27	+	636262	AAAAATTATTTTATTTAAAAGGTAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	137419	27	+	647215	AAAAATTGTGTTATTTAAAAGGCAACT

a
s	mr.mrrefChr5	3273	188	+	294542	AAAGTCAATTACATTAAGTAACAAACCATGTGAGCCTTAAGATCCAAAGTAGATTCCTGAGACTCTATAATTAGGAAATAGAGTTCACAGCTGCGCCCTGCTCTTTAGGCCTATGAATGTCTACCACATAGTTGAGGCACAGTTGCCACAGACCCAAACATGGCCTCGGTGATGGAGTAGAAGCCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	139640	185	+	636262	AAAGTCAATCAC--CAAGTAACAAGCCATGTGAGCCTTAAGATCCAAAGTAGTTTCCTGAGACTCTATAATTAGGAAATAGAGT-CACAGCTGTGCCCTGCTCTTTAGGCCTATGAATGTCTACCACATAGTTGCGGCACAGTTGCCACAGACCCAAACATGGCCTCGGTGATGGAGTAGAAGCCACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	137446	187	+	647215	AAAGTCAATTACATTAAGTAACAAACCATGCGAGTGTTAAGATCCAAAGTAGATGCCTGAGACTCTTTAATTAGGAAAGAGAGTTCACAGCTGCGCCCTACTCTTT-GGCCTATAAATGTCTACCACATAGTTGAGGCACAGTTGCCACAGGCCTAAACATGGCCTAAGTGGTGGAGTAGAAGCCATC

a
s	mr.mrrefChr5	3461	14	+	294542	TGATGGCAACCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	139826	14	+	636262	TGATGGCAACCCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	137633	9	+	647215	TGAT-----CCATG

a
s	mr.mrrefChr5	3475	158	+	294542	GGCCCCTAGCTGAGTGGGCGTATTATGACAGTGGAAGTCGTTACTAGGTAGTCGACACAAAGCTGGAGATGAAGTTTACTTCTTATCTACATCCTCCTAATTTGTACTGAtccAATGCTCAATATCAAATTTGGATATATTGATGAGTGGGGGCTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	139840	120	+	636262	--------------------------------------CGTGCCTAGGTAGTCGACAGAAAGCTGGAGACGAAGTTTACTTCTTATCTGCATCCTCCTAATATGTACTGATCCAATGTTCAATATCAAATTTGGATATATTGATGAGAGGGGGCTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	137701	153	+	647215	GGCCCCTAGCTGAGTGGGCGTATTATGACAGTGGAAGTCGTTACTAGATAGTACACACAAAGCTGCAGATGAACTTTACTTCTGATCTAcatcctcctaatttgtactgatccaatgctcaatatcaaatttggagTTAATGATGAGTGGGAG-----

a
s	mr.mrrefChr5	3633	18	+	294542	GCTGGCATCTCACCCTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	139961	18	+	636262	GCTGGCATCTCACCCTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	137854	18	+	647215	ACTGGCATCCCAGGCTGG

a
s	mr.mrrefChr5	3651	34	+	294542	TATTCACTTGAGAAGTCACTCAAACAAAGTGGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	139982	34	+	636262	TATTCACTTGAGAAGTCACTCAAACAAAGTGGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	137872	34	+	647215	TGCTCACTTGAGAAATCACTCAAACATAATGGAA

a
s	mr.mrrefChr5	3685	153	+	294542	ACTTACACTCATGTCAGAAGTGGCTTGAACACCATTGAACACCTTACAAGCAACAAAGTAGGAAATGTAATTATTGAGTATAAAATCTATCAAGTAGCCAGTAGGTAGTATGGTTGAAGACTGCGTAAATAGTGTCTGTCAAATGTACATAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	140016	153	+	636262	ACTTACACTCATGTCAGAAGTGGCTTGAACACCAATGAACACCTTACCAGCAACAAAGTAGGGAATGTAAATATTGAGTATAAAATCTATCAAGTAGCCAGGAGGTAGTATGGCTGAAGACTGCTTAAATAGTGTCTGTCGAATGTACATAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	137907	151	+	647215	ACTTACACTCTTATCAGAAGTGGTTAGAACACCATTGAACACCTTACAAGCGACAAAGTAGGAAATGTGATCATTGA--ATAAACTCTATCAAGTAGCCAATAGGTAGTATGGTTGATGACTGCGTAAATAGTGCCTGTCAAATGTACACAAT

a
s	mr.mrrefChr5	3838	104	+	294542	ATGAGGGGCTTTAATATACTCTACAGGTTATGCTTATGATACATTACTTAAGACTGGTCTTCTTGCTTGAAGAACACCCTCAAATCTGCATAATCAAAGACTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	140170	104	+	636262	ATGAGGGGCTTTAATATAATCTACAGGTTATGCTTATGATACGTTACTTAAGACTGGTCTTCTTGCTTGAAGACCACCCTCAAATCTGCCTAATCAAAGACTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	138058	104	+	647215	ATGAGGAGCTTTGATATACTCTACAGGTTATGCTTATCATAAATTACTTAAGACTGGTCTTCTTGCTTGAAGAACACCCTCCAAACTGCAATATCAAAGACAGA

a
s	mr.mrrefChr5	3942	69	+	294542	TTGCTAGATTAATGGAGATTATTATGTATGGTATCCTACAGATGTATGAGTAACATTGCACTAATGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	140274	55	+	636262	--------------GAGATTATTATGTACGGGATCCTACAGGTGTATGAGTAGCATTGTACTAATGTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	138168	69	+	647215	TTGCTAGATTAATGGAGATTATTATCTATGGTATCCTACAGATGTATGAGCAACATTGCACTAATGTAT

a
s	mr.mrrefChr5	4011	66	+	294542	TCCCTTGAAGCTTTTGGTCAAGGACCAGAAATTTTTTTGCCTGTGAGCACACTTAGGCAACCGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	140330	66	+	636262	TCCGTTGTAGCTTTTGGTAAAGGGCCAGAAATTTTTTTGCCTGTGAACACACTTAGGCAACCGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	138237	66	+	647215	TCCCTTGAAGCCTTTGGTCAAGGACCAGAAATTTTTTTGGCTATGAGGACACTTAGGCAACAGAGT

a
s	mr.mrrefChr5	4077	89	+	294542	TAGGTTACAAGCAATTGGCATAAGATTGGTCAGAGGCCGTTACTAGGATCCCTAGGCAAATGCTGGAGCTCACCATAGACATCTGTTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	140423	89	+	636262	TAGGCTACAAGCAATTGGCATAAGATTGGTCAGAGGCCGTTACTAGGATCCCTAGGCAGATGCTGGAGCTCACCATAGACATCTGTTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	138303	89	+	647215	TGGGTTACAGACAAATGGCATAAGATTGATCAGAGGCCATTCCTAGGATACCTAAGCAAATGCTGGAGCTTATGATAGATATCTGTCCA

a
s	mr.mrrefChr5	4166	91	+	294542	GGAATGTGATGGTGGTACCAATTAACACTTCGATGGCTGAATGATTTAGGCTGGGCTCATTATTGCAACTGAATGACAATCTTATATTTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	140514	91	+	636262	GGAATGTGATGGTGGTACCAACTAACACTTCGGTGGCTGAATGATTTAGGCTGAGCTCACTATTGCAACTGAATGACAATCTTATATTTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	138392	91	+	647215	GGAATGTGATGGTAGTACCAATTAACACTTAGATGGCTGAATGATTTAGGCTGGGCTCATTATTGCAGCTAAATGACAATCTTATATTTGG

a
s	mr.mrrefChr5	4257	249	+	294542	TCTGTAGCTAGACTTAGCTATAAAAATGATACAGCTGTCACAAAGAAGAATGGTTAAAGATGGAATTTTGTCTGTGGCCAAGGTGGTCACATAACAAAAAGTGAGTAAGTCAGATTAAACATGATGTAGGAACTACATACCATTTGAGCAAAGACATGCATAGTTACAGGAGACTGACATATCCCTGTGTGTGTGGACAGTACCTACACCTGGTGTGTATGGTTCTGAAGGCATAGAGTCGGGATTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	140605	248	+	636262	TCTGTTGCTAGACTTAGCTATAAAAATGATACAGCTGTCACAAAGAAGAATGGTTAAAGATGGAATTTTGTCATTGGCCAAGGTGGTCACATAACAAAGAGTGAGTAAGTTAAATTAAACATGATGTAGGAACAACTTGCCATTTGAGCAAAGACATGCATAGTTAAAGGAGACTGA-ATATCCCTGTGTGTGTGGACAGTACCTGCACCTGGTGTGTATGGTTCTGAAGGCATAAAGTCGGGATTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	138487	241	+	647215	CCTGTAGCTAGACTTAGCTATAATAATGATATAGCTATCACAAAGAAGAATGGTTAAAGATGGAATTTTGTCTGAAGCCAAAGTG-TCACATAACAAAAATTGAGTAAGTCAGATTAAACATGATGTAGGTACTACAGACCATTTGAGCAAAGACATGCATGGTTACAGGAGACTGACATATACCTGTGTGTCTGGACGGTACCTACCCCTGGTGTCTATGGTTCTGGTATCATGGAGCCAG-------

a
s	mr.mrrefChr5	4506	171	+	294542	CCACACAAAGTACTGTGTTTTTGGCCACGAAACTGTCATTTGCTAAATCCCACCTGGCAACAAAGTTTTTCCCTCCTATGCACACCTTATAGCTGAAAAATCGTTCTACATATCAGTAGTTTCAGGTACTATCTGTGAAGTAATTACTGTACCAACACTGGGAAGCAAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	140858	159	+	636262	CCACACAAAGTACTGTGTTTTTGGCCACGAAACTGTCATTTGCCAAATCCCACCTGGCAACAAAGTTTTTCCCTCCT--GCACACCTTATAGCTGAAAAATCGCTCCATATATCAGCAGTTTTAG-------CTGTTAAGTAATTACTGTACCAACA--GGGAAGTAAAG-
s	simRat_chr6.simRat.chr6	138728	170	+	647215	-CACACCAGGTACTGTGCTCTTGACCACAAAGCTGTCATTTGCTAAGTCCCACCTGGCAACAAAGTTTTTCCCTCATATGGACACCTTATAGCTGAAAAATCATTCTACATATCAGTAGTTTCAGGTACTATCTATGGAGTGATTACTTTAACAACTCTGGGAAGCAAAGT

a
s	mr.mrrefChr5	4677	90	+	294542	AGTGTATTCAAAATGTCTTCCTCTAACAGGGGCAATGGTGCTTTTGTATTATTAGATCATTATAGTCAATATCTTACACATATATTTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	141017	88	+	636262	--TGTGTTCAAAATGTCTCCCTCTAACAGGGGCAATGGTGCTTTAGTACTATTAGATCATTATAGCCAATATCTTACACATATATTTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	138981	90	+	647215	AGTGTATTCAAAATGTCCTGATCAAACAGGGGCAATGGTGCTTTTGCATTACTAAGTCATTAGAGTTGATATCTTACACATATATTTGAT

a
s	mr.mrrefChr5	4767	271	+	294542	GCGCTTTCATACATGACTCAGTTTGTGGTAATGATGCACAAATCAACAGACAATTGAGTACAGGCCTTTTTACCATGGGCTTTTTATTTCATTGGCCAGCTATTCATTCACATCACCTTCCCTCATTAAGGGTCAACAGATGAGTACCAGTCTATGATTTGAGCTCCTTTCCTAAAGATAAATCAAATCCTGTGTGTTAATTAAGTGCTTCAATGCTCAAGCCTTTATTTAAGACCAATCATGCCGTTAGTCTGCATAGGTTTTTGATTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	141110	264	+	636262	GTGCTTGCATACATGGCTCAGTTTGTGGTCATGATGCACAAATCAACAGATAATTGAGTACAAGCCTTTTTACCATG---TCTTTATTTCATCGGCCAGCTATTCA----CATCACTTTCCCCCATTAAGGGTCAACAGATGAGTACCAGTCTATCATTTGGGCTTCTTTCATAGAGATAAATCAAATCCCATGTGTTAATTAAGTACTTCAGTACTCAAGCCATTATTTAGGACCCATCATGCCGTTAGTCTGCATAAGTTTGTGATTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	139071	266	+	647215	GCACTTTCATGTATGACTTAGCTTGTGGTAATGATACACAAATCCACAGACAATTGAGTGCAGGCCTTTT-GCCATGGGCTTTTTATTTCATTGGCCAACTATTCATTCACATCACCTTCCCTCACTAAGGGTCAACAGATACGTACCAGTCTATGATTTGAGCTCCTTTCCTAAAGATAAATCAAATCCTGCTTGGTAATTAAGTGCTTCAATGCTTAACCCTTTATTTAA----AATCATACTGTTAGTCTGCATAGGTTTTTGGCTGG

a
s	mr.mrrefChr5	5038	111	+	294542	CCACCTTGTATCATTATGTGTTGTTGTACAGGACCTCCATGCTTCCGATATAAATACTCAGATGTTCAACCAATGATTAGGTTGAGCTTTCCCATGGAGCGACTCACTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	141375	99	+	636262	CCACCTTGTATCATTATGTGTTATTGTACAGGACCTCCATGCTCCCGATGTCAATACTCAGTTGTTCAACCAATGATTAGGTTGAGCTTTGCCATA------------AAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	139337	109	+	647215	CTACCCCGTATCATCACCTGTTGTTGTGCAGGGTCTCCATG-TTCCCATATA-ACACTCAGATGTTCAAACAATGATTAGGTTGCCCTTCCCCATGGAGCGACTCACTAAG

a
s	mr.mrrefChr5	5149	120	+	294542	AACTTAGTCTACAAGGTGCTACTGACTATTTTCTATGTAAAATTCTTATGTTGGTCTAGAAATTCTTATCTTGATCTAGACAAACCCCATTATGACAGGATGTCCATATTACCAGAGAAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	139448	120	+	647215	GACTTAGTCTACAAAGTGCTATTGACTATTTCCTATGTAAAATTCTTAAGTTGGTCTAGAATTCCATATGTTGAACTAGACAAACCCCATTATGAAGGGATGTGCATATTACCAGAGAAA

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	141599	380	+	636262	GATTATGCAAACCCCTAATCCCTCTTCAGTACAATTTTGTTCCTTACCCT---------TTGTAGAAGGCTATTT-GCTACTATTCAATCGTCCCTTCCTCATGACCTTACAGATTCCACTGTCGTTATGATTACATTGCTGGTCATAAAACTCTCGTTACTCATTCGCC-GCATCACCACACTTGGTTGATGCTGCATGTTGGTGTATGCCCAGCTTGGCGTATAATGTCTATGTGTACTGGTACATGGTGAAATGATGAGAAAAATATGTACAAATGTGAGCACATACTATGAAAGTCCGATAGGCCAGTTCTTAAGATCCCCATTCACCACCCTATGACCTGAGGCTCCATAGGCAGACAGCTGCATCATCCTGCTCTAATACCCTTA
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	5712	105	+	294542	ACCCTTGTGTTTACGTCATATGCTCAATTTTTTTATGTTGTGCTTGGTAGATGTGACATGCCCTAGCGGGTGTCAAAGTTAGATCCCGGTGGTGCCTGGGTGGTT
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	5972	320	+	294542	CACCCAGCGTAAATACGGCCACTATCATGACCTAAGTCAGATCCTTATTTAGTTTATGATTGACCCAGTGGGCACTAGCATTCAGGGGCAGTCTAAACAATATTGCCTTGCGTGGTTCGGGCAAACTATGCAGGTGGAGCATTAAAACTCTGCTTCTATGTGACTACCAGGCTCTTGCTTAACAAAGTCGTAAGTATTAAAGCTTCTAAATTGAAATGCTGCATACATGAGGCAGGACCATGAGTGCAGTGAGAGGGGCAAACCATATGGCACAAACTTACTGAATTATTGAATTGTCTCAGTATGTCTCCACCCCATTA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	140255	316	+	647215	CACCCAGCTTAGATAAGGCCACTA----GATCTAAGACAGATCCTTTTTTATGTTATGATTGACCCAGTGGGCACTAGCATCCAGGGGCAGGTCAAACAATATTGCCTTGTGTGGTTCGGGCAAACTATTCAGGTGGAGCATGAAAACTCTCCTTCTATGTGACTACCAGGCTCTTGCTTAACAAAGTCAAAAGTATTAAAGCTTCTGAATTGAAATCCTGTATACATGAGGCAGGGCCATAATTGCAATGAGAGGGGCAAACCATATGGCACAAACCTACTGAATTATTGAATTGTATCAGTATGTCTCTGCCCCATTA

a
s	mr.mrrefChr5	6292	318	+	294542	TTCATGTCAGGGTACACTGGTAGTGATCAGCACTTTACCTGTCAACTCAACCTATTTTTGCTGAATAAACATCTGTATAACTAAAAATGTTGGGGGATTAAGTTATTCTCTAATAGGAGAAAACACCAAGTGCCATCTCATGGAAAGCAAAATGTGTAGAAATAAAAGAATCCATCTTTAGGAGTTATATGGCATCATGTAGACATTTAGGATCTAAGATATAACACAGACTATACCTGAAATAAGATGCCCCTTCATCATACATCCCTTAATCAAGTTTCATGCCATGGATTTGAATAGCCAGTTTATCCAAATGTA
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	6632	225	+	294542	GCTCCTTCTGAATAACCAAGCAAGCTTAAAGGACACAATAATTGTTAATCCCCTTAAACAAGATTGAAAACTTGATTTTAATTTGGTGTACATTTGAATGTCCATCTTCAATAAAGGGTATAGGGTTAAATATCGCATTTAGTATTATCTCTGACCATTTAGAATTTAATTGATGACAACTTCTTGCAGTGCATGGCAGTTTCTGGGTCTGATTGAACTCCTCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	143248	225	+	636262	GCTCCTTCTGAATAACCAAGCAAGCTTAAAGGACACCATAATTGTTAATCCCCTTAAACAAGATTGAAAACTTGATTTTAATTTGGTGTACATTTGAATGTCCATCTTCAATAAAGGGGATAGGGTTAAATATCGCATTTAGTATTAGCTCTGACCATTTAGAATTTAATTGATGACAACTTCTTGCAGTGCATGGCAGGTTCTGGGTCTGATTGAACTCCTCTC
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	6894	78	+	294542	TTCGGATAACCTGATTTGTGTGAGATGGACAGCCTCCTGGACAGTCACCCCTTCAATTTGGTGCAATAATTGGAGTAG
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	6991	98	+	294542	CAATAAGTGGAGGTAGGGCACTTGCAGTGTTAGGGGACCTTCTGTGGAGCATGGTAGCACAAAATCCTAATAAAGGCTTAAGTGTGGGTAGGTTTAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	7089	334	+	294542	TTGGGAGGGCCTTGATTCAGATCATTCAAACTGAGGGCTGGGAGAGAGCTCCAGGGATCGGAAGGATTGGTACCCCATGCTGTACATTCAAGATATTTTTATAAAAAGTTAAAACAATAGAAAAAAATATACACAGTAGAGTGGGGGACCTGCCCTCAGATAAGATCTTGTTGGGTAGAGTCAATAGAAGCAGGTGGGCAAGAATTTTTAATAGTTCCTGGGTCACTAATGTGCTTACACATTTTAAGCATAACTGTGCATTCACAGGACAGTCAAATTCCACCTCTAACTATCATAGTAGTGTAAAAGTGGAGAATGTGCACTTAGTCTAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	143704	334	+	636262	TTGGGAGGGCCTTGATTCAGATCATTCAAACTAAGGGCTGGGAGAGAGTTCCAAGGATCGGAAGGATTGATACCCCATGCTGTACATTCAAGATATTTTTATAAAAAGTTAAAACAATAGACAAAAATATACACAGTAGAGTGGGGGACCCGCCCTCAGATAAGATCTTGTTGGGTAGAGTCAATAGAAGCAAGTGGGCAAGAATTTTTAATAGTTCCTGGGTCACTACTGTACTTACACATTTTAAGCATAACTGTGCATTCACAGGACAATCTAATTCCACCTCTAATTATCGTAGTAGTGTAAAAGTGGATAATGTGTGCTTAGTCTAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	141376	333	+	647215	TTGGGAGGGCCTTGAATCAGATCATTCAAACTGAGGGCTGGGAAAGAGCTCCCGGGTTTGGAGGGATCGGTACCC-ATGCTGTACATTCAAGATATTTTCACAAAAAGTTGAAACAATAGAAATAAAGATACACAGTAGAGTGGGGGACCTGCCCTGAGATGAGACCTTCTTGGGTAGAGTCAATAGAACCCGGTGGGCCAGAATTTATAATAGTTCCTGAGTCACTAATGTGCTTACACATTTTAAGCATAACTGTGCATTCATAGGATGGTCAAGCTCGAACTCTAACTATCATAGTCATATAAAAGTGGAGAATGTGCATTTAGCCTAATT

a
s	mr.mrrefChr5	7423	34	+	294542	ATAAAGAAATCGAATTCCACCCTTTCTTAGCTTT
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a
s	mr.mrrefChr5	7457	19	+	294542	AAAGGTATTCCATGTTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	144124	18	+	636262	AAAGG-ATTCTATGTTGTG
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a
s	mr.mrrefChr5	7476	72	+	294542	CCCCAAGTCACTTTTGTGTTATACCATCTCAATATACAGGTTAGATGATCTACTAATGCAAAGATCTGCGCT
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a
s	mr.mrrefChr5	7548	91	+	294542	TAAAACTGCTTTAATCTAAAAGTTTGGGGCGAGTGCTAATTTGTAAGGTCCCTCATGCCTCATCCATAGGATGCTAGATTTGTTGGACTTC
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a
s	mr.mrrefChr5	7639	37	+	294542	CCCTATGTTACAATCAGTGAATTGTTGTCAGCAGGTT
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a
s	mr.mrrefChr5	7676	73	+	294542	TGTACACAGTCAATGGCAAGTCGTTTTATGAACTGTGACCACCATTAGAGGGTAGGCTATCTATAGTTCCACA
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a
s	mr.mrrefChr5	7749	21	+	294542	GAAGGCTATAGCCACACTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	144415	21	+	636262	GAAGGCTATAGCCAGACTGTA
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a
s	mr.mrrefChr5	7770	25	+	294542	AAGGTTCACATTCAACTATCTGCTC
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a
s	mr.mrrefChr5	7795	541	+	294542	AGGCTGCCTTGCCATTATGTTTACCTTGTCCTATGACTCATTGTTGTGTGTGCAATGTCCTGTGACTGGTGTGCAAGGGAAGCCATAACACCTCTCAAATCCCATCATATGTCACATGCCATCATAGCTCATTCTTTCAAACTTCTGCTTTGGATGAATGTAGTTGTCCTTTGGAGCAAACAAATGCAAGGCAGGTATCCTGTGATCAATTTATTCTAAGTGGTCTCCCACTCATTAGCAGTGAATTCAGCTCCCTTGGACATCCTTTGGTCATCATTTTTCCTATAAAATGCTTTTTAATTTTGACAGGAAACACTAATGCCCTTATGTAGATTTGCTCTATTTGTAGGTATTGCGCACAGTACCCCAGTGAGAGTATTAGCCAACAGACATTGTGCTTGGTGAGTAGTACAGTTGAGGGGATTCATAACAATATATGGAGACTTCATCCTTTACCCTGCAATTATAATACCCAGCTAGCCTATCCCTATTTCAGGGGTGCTGTGCAAGAGGTCATGCATATAGGTAAAAAGCAGTAAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	8336	73	+	294542	TGGCTTCACCCTACAGTTAGCTCGAGCAGAAATCTGTCTATGTGTGTCCTTCCAACTGTTCTGGCTGGTACAA
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a
s	mr.mrrefChr5	8409	41	+	294542	ATGAAGGTGAAACATCCTGCCAATCAGATATCATGCCTCGC
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a
s	mr.mrrefChr5	8450	56	+	294542	CTCAACGGCACAGTAGGCATTTATTCATATGGAAAACTGGAATCTTGGGTTATCAA
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a
s	mr.mrrefChr5	8506	60	+	294542	CAAATATCTCCATGTCTTATCGTGTAAATGCCTGTAACTATCTGCATGTTGAATTTAAAG
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a
s	mr.mrrefChr5	8566	23	+	294542	AAGATGACTATAGTATTGAGATG
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a
s	mr.mrrefChr5	8589	85	+	294542	CAGTTGTGAACCCATACTGATTCTGAAGGGATAGATATACATTTCTGATCTCTTGACAGTGTGAGCTATCAATCTCATATATTAT
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a
s	mr.mrrefChr5	8674	46	+	294542	TCTTAGGGATCCAGGTCCATTTGCCACACAGCTAAGCAGCTATCCT
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a
s	mr.mrrefChr5	8720	97	+	294542	GAAGATGGTTTGGTGTGTCTGTGCCCATTCTAAGTCTGTCGCTGCTGTACAAATAGTCCACTTAAAGCAGGTCACCTATACAATCTGCATGCTTTGA
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a
s	mr.mrrefChr5	8817	32	+	294542	TAATGTGGGAATAATTCTTCAATGAGTACTAA
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a
s	mr.mrrefChr5	8849	8	+	294542	GTTATATC
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a
s	mr.mrrefChr5	8857	12	+	294542	TGGTTGATACAG
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	12275	122	+	294542	GGCCAGAGCTGATGTGTGGTAATTTTTATTGCACGGATGAATCATTCTCCACTCGGTTTAGCTGGGGCAAATTCTTTGATATACCCAATAAGCATTTTTGTCATATTTACTATCCTCTTGCT
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a
s	mr.mrrefChr5	12397	90	+	294542	ATGACATTGTAGAAATGTGACAACTGGGGACTGGGGGCCTGCTGAGGGCCAATACACTGACAGCTGCTGGATACACCATATTGAATCAAG
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a
s	mr.mrrefChr5	12487	140	+	294542	CAGTACTATTACTATTCTTCTCAGATTAGTGAGCAGAATGTTACTACAGCCAAGGGTCTCCATCATAATTCTATATGGTTCAATCCTTGTAAAATGCATGCCCCATCTGAATTTAAACAAATACATGCTTTAGTATGTGT
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a
s	mr.mrrefChr5	12627	20	+	294542	TATGCCTGGGTCAAAATTCA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	147014	277	+	647215	ATTCCCATCCCAAAAATAGGGGGCATCTAATTTGACTTGTGTATGTTGCTATAGAAAGATGTCTTATAGAAAGTGCAATCTTATGAACACCGCCTGCAGACATCCCAATTTTCCCTGGCTTGAAGTACCTCAGATAATGCCCCTGGGAAAAGTCTGGCTAACACTAACACATGAGGCCTGAGTTTTGCTTGCTGTGTCATGGGCTAGCATATGCTATCATCCGAGTGTTGTCAGTTAGGGAGTGTGGGTTGTGAGCGGGTTTGATGACAAGGGATAG

a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	147297	120	+	647215	TATCCTGGGCTTGATGGCATGGGACAGACTCCCATATATGCAACATGTTACTTAACTCTATCCCTTGGAGCTCAATTCATTACTGAGGCATTAAATCATATCTTCTGAGTGTACATGATC

a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	13160	80	+	294542	AGTTGGGTTGGCATGTCAGACCCCAACAGTTATGTTGACTAGACTGGGTATGGGCTTAAGAGGGGCAGCATTAGCCACAT
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	13243	21	+	294542	GTCCCCAAATTATTTAGACAT
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a
s	mr.mrrefChr5	13264	489	+	294542	AACATAAATTCAGTAGATAATTGAGATCTCAAGTCGGAGTTCATAAGGTCAGCCCTTATAGACACCTGACATATTGTGTTTTAGTAGCCACATGCCACATCATTGTGAACCTGTTTTCAAACCCAAGCTATGGATATTTTAGATGCGCCATGCCTGCTAGTCCATTAGCTGCATTGTGTTTGCAGGGACCAACAAGAATGCTACTCATTATAGACATATGGTTTGAGACCCCTGTAAATCTAGTAGAGTGATAAGTAGTAGGCTTCCCTTTTCTAATGTGATTGCTTCTCTACTGTCAGCTCTCTAACTCGATTGCTTCTCTACTGTCAACTCTATCATCTATTGACCAGATGGAGGAAATATCATTTACCATTCCTGAACAGGTTAGTCATCCAGTTGGGGAAGTCACAAATTGGGTTATTATCATATGATGATATAAGCATACAACTCATTAGTCAACTTTGCATTATTGTTCCAAATCACACATGC
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a
s	mr.mrrefChr5	13753	139	+	294542	ACTGGCTCTTCTCTAGTGATGATTGAGATCAGGGGTTCAAGCTTCTGTGGTTGTCCTGAAGTATACTTGGCAACCACACAGATGAGGAGTGGAATGGTATTCTAGTGGTATTCTTGTGCTGATTCTATAAAGGCCATCC
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a
s	mr.mrrefChr5	13892	37	+	294542	TATTCTTGTATTTAATTGTAAGCATTCATGTTAGTTA
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a
s	mr.mrrefChr5	13929	140	+	294542	TGCAACTGAGTGAACTGAATAATGTGGATTATGAACACAGATTAATTGAGGGGAACACAGACTAATTGAGGGTGAAGCAAGACAATTGAGGTGAGGACTAGTTGGTCACTGTTAGAAGGTAATAATCTATGAATACATGC
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a
s	mr.mrrefChr5	14069	183	+	294542	AATCTTGTAACTCATTGTTCAAAGCTAATTTGTATTAGTAGGCTTTGTACTCATAACTGCCAGCATTTATGGTAACTAGCCCTTGAATATCTGTCCAATTATGAACTGGGATAGGAATTATAAAAACTATGTAAGCCATCGTCACCTTGTACCCCCATATATATAGAGACATTTTAATATATG
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a
s	mr.mrrefChr5	14252	149	+	294542	TAAGTTGTTGTCCAGCCTCTATTCCCCATGTTCACATGGCATACACTATCAGTTTTACCAGATTTTAGTATTCTAAACCCTCTATATGGGATCTACCTGTGAGTGTAATTTACTAGTGGGCTGAATATTGGATGGGAACTGCCCATAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	14401	7	+	294542	GGACTGA
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a
s	mr.mrrefChr5	14408	7	+	294542	CTGGACA
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a
s	mr.mrrefChr5	14415	39	+	294542	CTAACCAATTCCTAATCCATAGATCATTTGTTGAGACCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	151316	39	+	636262	CTAACCAATTCCTAATCCATAGATCATTTGTTGAGACCT
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a
s	mr.mrrefChr5	14454	42	+	294542	ACACTTGGGCCTACCATTTGGGCCAGATAGGATTAAGTGGTC
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a
s	mr.mrrefChr5	14496	7	+	294542	ATAAATA
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a
s	mr.mrrefChr5	14503	40	+	294542	GGAATACCATTGAGGTAGGATTTTGTGTTGTAGATCAGGT
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	14562	102	+	294542	GACCAGTAAATTAAGTTGCTGTCTCTTAGATAACATGTGTCCAAGATGTGTAACTTGCTAAGTTTCGTTAAAATAACTTAAATTTAAGGAAGTACCTGTCCT
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a
s	mr.mrrefChr5	14664	339	+	294542	AACTCAAGTTATCATTAGCCATATGTTACCCAAATCCATGCAACTTAAGAACCTGAAATGGTTATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGATGAGGGCAGGCTCCTTGGATAAGTCCCAACACCATGGCGTGGGGGCTCACTGGACTGAGTCTAACTCTCACAGTTGGGAGTATCAATTTCTGATATGGAGCCCTTTTTAGCACAATAAGGTTACCTTACTACAGTCATTAGCAATATACCATAGGGCTCATGGCACGCTACTACAGTAAGCATGTAAGTGAACAACTGCAAGGATGTAAGAGATCATGATATGTGGGCTACCTGAGATAGAATTAATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	151541	335	+	636262	AACTAAAGTTATCATTAGCCATATGTTACCCAAATCTGTGCAACTTAAGAACCTGGAATGGTTATGTGTATATGTTAATCAGATATCAGATGAGGGTAGGCTCCTTGGATAAGTCCCATTACCATGGCGTGGGGGCACACTGGACTGAGTCTAACTCTCACAGTTGGGAGTATCAATTTGTGA----GAGTCCTTTTTAGCACAATAAGGTTACCTTACTACACTCATTAGCAACATACCATAGGGCTCATGGCACGCTACCACAGTAGGCATGTAAATGAACAACTGCAAGGATGTAAGAGATCGTGATATGTGGGCTACCTGAGATAGAATTAATTT
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a
s	mr.mrrefChr5	15003	678	+	294542	AATCCTAAGCCTACCAAAAATCCATTCTTCCCAGCTAACAAGTCAGGTATGACTACTGATACTGGGTGGTGTGGAGTGAATGCCACTAGAAACAATTGGTCTTGTTGGCAAAGTGGGGAACAAGCTTAATAGAAGGCAGTTTTATTCTGGTGTGTGCATCATTTACTTTGACTAATATAGGGAAAGGAATGACAAGTTGCACTGGGTTAAAGAAGTTGCACTGGGTCATGAAACAACGAATACTAGATAGTCCTTCAATACTAAATGTACAGGTTCAATCAGTAACCCCACCTAGGTTACCAGTCAGCAGTGCTGGTAAAAGATCCCTAGTTAGAGTTGATATAGGCTGGGTTCCACTGGGCTCCATGTCACTCTTTGAGTGCGAGTTAACACTTAATGACACTATCACTACTTCACATTGGACACCATATTGACTTGCCAATTCTTTAAATCTTGCAGCGTATAACTGGGTTTCCAGGCAGAATTCGTTAGGCTAAATCCAATAATGACAACTCTTTCCATACCATGATGTCTGATTGGGAAGAATAGGAACAAGAAAGAATCTTTAGACAATAGGATTTTAAACACAAAAATAGTTAATTATGTGTTCCATGGAAGTAAAGTAATTGTTGCATGTCCAAGAGTGGCCTTGGTTTTACACTTGAGGGGGTAAAGGTG
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	15797	177	+	294542	CCAATATTACTTGAATACAATGATTATGTCATAAGATGTCACTCATGTCTGATAACATGACTATGATTATGCTCTTACTGTTGCGTGCCCGAAGGGTATATAGAATCTCAAAAAGCTTGTTCACTTTAACCTAAAGTTTTAACGTTGTTCATTGTCTTTGTATCTATCAATGAAATG
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a
s	mr.mrrefChr5	15974	57	+	294542	TTTCCTCCTAGAGATTGCTCTCTTCTGGTGGCTTCTTTGAGGACTCATGCTTCTTAC
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a
s	mr.mrrefChr5	16031	86	+	294542	GGACCAGTTATTGGATCATATTGATATGATAGGATGTGGAGCGTATTCAAGTCTCTTCCAGCCTTGTCTCGGCACCCTATATAGCC
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a
s	mr.mrrefChr5	16117	28	+	294542	CTGCAAGATAATATCTTACTCTGCAACT
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a
s	mr.mrrefChr5	16145	91	+	294542	GGTGTCTATCTTGGTGTTTAATCCATAATAGGGGAAGCAGGCATGTTAGCATCCCTGGTTTTAATAAGGAAAATGAGACTCAGGCTATTAC
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a
s	mr.mrrefChr5	16236	34	+	294542	AAGTACAAGCTCCAAGTAAGTGGAACCATAGTTC
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a
s	mr.mrrefChr5	16270	123	+	294542	TGAGTAGCACAGGCACCACATAAATGATCACAAACACACTTGTTTAGTAAATGGTATAATTGTTTGATCATGATAGATAAAACTTTGACTCAAACATCTCTATCGCCTGGGTTTATCACATTG
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a
s	mr.mrrefChr5	16393	14	+	294542	CTCTAGAGGTCACA
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a
s	mr.mrrefChr5	16407	12	+	294542	TTACAAGAACAA
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a
s	mr.mrrefChr5	16419	33	+	294542	AAATCGATTTAATGAGGCATTAATTGAGCAAGG
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a
s	mr.mrrefChr5	16452	19	+	294542	CAAGGCCTTTCTGTGTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	153344	19	+	636262	CAAGGCCTTTCTGTGTCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	151085	19	+	647215	CAAGACCTTTCTGTGTTCA

a
s	mr.mrrefChr5	16471	58	+	294542	GACATAATGCCAATACTTGAGACAAGTGTATGTGACAGTGACAACTAAGGATGACCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	153363	58	+	636262	GACATAATGCCAATACTTGAGACAAGTGTATGTGACAGTGACAACTAAGGATGACCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	151110	58	+	647215	GACACAATGCCTATACCTGAAACAAGTGGATGTGACATGGACACCTAAGGATGACCTC

a
s	mr.mrrefChr5	16529	34	+	294542	TATCTTGTATGGGAGTGGGACCCTATGTCCTCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	153421	34	+	636262	TATCTTGTATGGGAGTGGGACCCTATGTCCTCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	151172	34	+	647215	TACTTTGTGTGGAAGTGGGACCCTGTGTCCTCCC

a
s	mr.mrrefChr5	16563	31	+	294542	TCCTCAAGCGGCCCCTTTACCTGCTTAGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	153460	31	+	636262	TCCTCAAGCGGCCCCTTTACCTGGTTAGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	151206	30	+	647215	TCCTCAAGCG-CCCCTTTACCTGCTTAGCAT

a
s	mr.mrrefChr5	16594	77	+	294542	TGCTCACGCGGAGCAAGAAGTGCTGTTTTGCAGATACTTTTTATGAATTGATATCTTTTCAACTTTTATTAGAGTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	153573	65	+	636262	TGATCACACGAAG--AGAGGTGCTGTTTTGCAGATATTTTTTATGAA----------TTCAACTTTTATTAGAGTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	151236	77	+	647215	TGCTCACGCCGAGCAAGAAGTGCTTTTTTGCAGATACTTTTTATGAATTGATATCTTTTCAATTTTTAATAGAGTTG

a
s	mr.mrrefChr5	16671	462	+	294542	TCTTGTGTTAAGTATCTCTGCTGACCTTGATGTTACTCATGCTCAGTTCCCCTAGCGTACTGCAACTCTTTACTTTCTTATGCTGATCTCTTGGAGGCATGGGCATGGCAGCTATGATAATGACTATCACTGAGATTCTTATTAATTACCCTTCAATCTTATTATGATTATAAATTGTGCGCTTGTGACAGAGGGTTTCTTTTTATCACTACAACCACTTTTTTTTTCTGATAGCCAAAAGTGAGATGACAGTCCAGGGGCGTCCCTCAGAATGCTTTGAGTTGTACCTTCCCATAGTGATGAGAGTGATATACACAGAAAATCACTGTGTCTAATAGAATTGTTATACAATGTCCTTCAGTCTTACTAAGAGCACATACCTTGGGGATATGTTACGTAAGTTATACTGTTGATTGGAAAAGGGAAAATCAGTCTCTTTCGCATTCAAATTTCACTGTCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	153639	461	+	636262	TCTTGTGTTAAGTATCTCTGCTGACCTTGATGTTACTCTTGCTCAGTTCCCCTAGCGTACTGCAACTCTTTACTTTCATTTGCTGATCTCTTGGAGGCATGGGCATGGCGGCTACAATAATGACTATTCCTGAGACTCTTATTATTTACCCTTCAATCGTGCTATGATTATAAATTGTACGCTTGTGACAGAGGGTTTCTTTTTATCACTACAACCACTTGTTTTTTCTGACAGCTAAAAGTAACATGACAGTCCAGGGGTGTCCCTCAGAATGCTTCAGGTTGTACCTTCCCACAGTGATGAGAGTGATATACACAGAAAATCACTGTGTATAATAGAATTGTTATACAATGTCCTTCAGTCTTACTGAGAGGACATACCTGGGG-ATATGTTACGTAAGTTATACTGTTGATTGGAAAAGGGGAAATCAGTCTCTTTCGCATTCAAATTTCACTGTCCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	151313	457	+	647215	TCTAGTGGTAGGTATCTCTGCTGACCTTGATGCTACTCATGTTCAGTTCCCCTAGTGTACTGCAGCCCTTTACTTTCTTATGCTGATCTTTTGGAGGCATGGACGTGGCATCTATGGTAATGACTATCACTGAGATTCTTATTAATTACCCTTCAATCTTATTATGATTATAGATTGTGCG---GCGACAGAAGGTTACTTTTTATCACTACAACCACTTTTTTTTTCTGATAGCCACAAGTGAGATGACAGTCCA-GGGCATCCCTC-GAATGCTTTGAGTTGTACCTTCACATGGTGATGAGAGTGACATACACAGAAAACCACTGTGTCTAATAGAATTGTTATACAAAGTCCTTCAGTCTTACCAAGAGCACATACCTTGGGGATATGTTACGTAAGTTATACTGTTGATTGGAAAAGGGAAAATCAGACTCTTCTGCATTTAAATTTTACCGGCCTG

a
s	mr.mrrefChr5	17133	35	+	294542	GGCAGTCTAGCGGACTTGGCTTTGGCATTACTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	154110	35	+	636262	GGCAGTCTAGCGGACTTGGCTTTGGCATTACTTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	151770	35	+	647215	GGCAGTCTAGCAGACTTGGCTTTGGCATCACTTCT

a
s	mr.mrrefChr5	17168	175	+	294542	ACATAAAATGTTCACTCATATGAATTTAGTGCTTCGGTGTAGTATTAATTAAGCTGGGCATGGCACATGTTTTCTATCATTACCTCTTATGGGACAGAACTAGCTTGTCTTAGGAAGTCTCAGTGTTCATTTCTTCAACCTCTCATTTTCCCACCTACTTCCCTCTGTCTGCACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	154145	175	+	636262	ACATAAAATGTTCACTCATATGAATTTAGTGCTTCGGTGTAGTATTAATTAAGCTGGGCATGGCACATGTTTTCTATCATTACCTCTTATGGGACAGAACTAGCTTGTCTTAGGAAGTCTCAGTGTTCATTTCTTCAACCTCTCATTTTCCCACCTACTTCCCTCTGTCTGCACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	151808	175	+	647215	ACTCAAAATGGGCACTCATATGGGTTGAGTGATTAGGTGTAGTAATAATTAAGCAGGGCAAGGCACATGTTTTTTATTATCATTCTTTATGGGACAGAACTAGCTTGTCTTACGAAGTCTCAGTGTTCACTTAATCAAACTCTCATTTTCCCACCTATTTCCCTCTGTCTGCACC

a
s	mr.mrrefChr5	17343	13	+	294542	AGGACTTTGTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	154330	13	+	636262	AGGACTTTGTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	151983	13	+	647215	AGGACTTTGCTGA

a
s	mr.mrrefChr5	17356	5	+	294542	GTGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	154345	5	+	636262	GTGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	151996	5	+	647215	GTGGA

a
s	mr.mrrefChr5	17361	40	+	294542	CTGCAGGCACAACTCCATAGTTGAATTGTTTCACCTTCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	154350	40	+	636262	CTGCAGGCACAACTCCATAGTTGAATTGTTTCACCTTCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	152017	40	+	647215	CTACAGGCATAATACCATAGTTGAATTGTTTCACCTTCAC

a
s	mr.mrrefChr5	17401	4	+	294542	CACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	154390	4	+	636262	CACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	152057	4	+	647215	CACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	52307	4	-	647215	CATA

a
s	mr.mrrefChr5	17405	20	+	294542	TAAATGATCTCTTTAAAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	154394	20	+	636262	TAAATGATCTCTTTAAAGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	152061	20	+	647215	TAAATGATGTCTTTAAAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	52312	20	-	647215	TAGATGATCTCTTTAAAGTA

a
s	mr.mrrefChr5	17425	6	+	294542	GTGCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	154415	6	+	636262	GTGCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	152081	6	+	647215	GTTCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	52332	6	-	647215	GTGCTC

a
s	mr.mrrefChr5	17431	14	+	294542	CTATAATGAAGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	154421	14	+	636262	ATATAATGAACACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	152097	14	+	647215	CTATAATGAAGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	52338	14	-	647215	CTATAATGAAGACA

a
s	mr.mrrefChr5	17445	3	+	294542	ATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	52352	3	-	647215	ATG

a
s	mr.mrrefChr5	17448	73	+	294542	ATGATAGGAAGGAAAGTAAGCTTTATTGAATTTGTTGCCACAATTATCAACACTCAAGAACTGAACCATAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	154435	64	+	636262	CCAATAGTAAGCAAAGTAAGCTTTATTAAATTTGTATCC---------AACACGCAAGAACTGAACCATAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	152111	73	+	647215	ATGATAGGAAGGAAAGCAAGCTTTATTGGATTTGTTGTCACAATTATCAACATTCAAGAACTGAACCATAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	52355	63	-	647215	ATGATAGGAAGGAAAGTAAACTTTATCGAATTTGTTGCCACAATTATC----------AACCGAACCATAATA

a
s	mr.mrrefChr5	17521	133	+	294542	GCCTGGTGTGATGATGGAGAGGGAGCATTCGCTATCTAGCATTAGCTATGTCTACTCCTGGTTATTATACTACATGAGACTTGCCCCCTGATATCAGAACACATGTCAGTTGAAGCCATATGAGGAGGTGGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	154499	120	+	636262	GCCTGGTGTGATGGTGGAGAGGGA-------------AGCATTAGCAATGTCTACTCCTGGTTATTATACTACATGAGACTTGCCCCCTGATATCAGAACACATGTCAGTTGAAGCCATATGAGCAGGTGGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	152184	133	+	647215	GTATGGTCTGATGATGGAGAGGGCGCATTCACTATCTAGCATTAGCTATCTCTACTCCTGGTCATTATACTACATAAAACTTGCCACCTAACATCTCAACACATGTCAGTTGAAGTTATACAAGGAAGTGGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	52419	43	-	647215	GCGTAGTGTGATGACGGAGAGGAAGCATTCGCTATCTATCATT------------------------------------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	17654	485	+	294542	ATGTCAATACTAAGCCCTTAATGATATCTAATGTCTTATTACCACATTGGATAGAAGGTTCATGGACTAAGACATTCAGAGTTGAGTGGAAAAGTTAGCCATAATCCAACCAAAATAGAGAAATTTTGTTAAATTAATACATAGAAGCCCATGTGTCATATTAATAGCAATGCAGGACATTTCAACTATCCAATGAATATATCAGATAAATATGTCTCAAGGACCAGCATAATATGACTTTCAGATCACCACTTGAGTGTCTTAAAATGAATAATAGTGGTCATCAGCTAAGCCAGAAAGATTGTGTAAGTTGTTATGCCAGGTTAGTATCACTCGATAAAGTTACATTTTCTTTTGGGCACTGTACAGTATTTTTGGACTTTTATTAGTACAAGTATAAAATAAATCTATGCAGTTGTTCTAGGGCCCTCAATGTTGTTCATTCATTGATAAGTTCAACATACTCTAAGATAGCTATTTCACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	154619	474	+	636262	ATGTCAATACTAAGCCCTTAATGATATCTAATGTCTTACTACCACATTGGATAGAAGGTTCATGGACTAAGACATTCAGAGTTGAGTGGAAAAGTTAGCCATAATCCAACCATAATAGAGAAATTTTGTTAAATTAATACATAGAAGCCCATGTGTCATATTAATAGCAATGCAGGACATTTCAACTATCCAATGAATATATCATATAAATATATCTCAAGGACCAGCATAATATGACTTTCAGATCACCACTTGAGTGTCTTAAAATGAATAACAGTGGCCATCAGCTAAGCCAGAAGGATTGTGTAAGTTGTTGTGCCAGGTCAGTATCACTTGGTAAAGTTACATTTTCTATTGGGCAGTGTACAGTATTTTTGGACCTTTAATAGTACAAGTATAAAATAAATCTATGCAGT-----TAGGGGCCTCAATGTTGTC------TTGATAAGTTCAACATACTCTAAGATAGCTATTTCACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	152319	456	+	647215	ATGTCAATACTGAGCCCTTAATGATATCTGTTGTC-TATTACCACATTGGATGGAAGGTCCATGGACTAAGACATTCAGAG----------------------ATCCAACAAAAATAGAGAAATCTTGTTAAATTAGTACATGGAAACCCATGTGTCGTATTAATGGCAATGTAGGATATTTCAACTATCAAATGGATATATCAGATGAAAATGTCTCAAGGACCAACATAATATGACTCTCAGATAACCACTTGAGTGTCTTGAAGTGAATAATAGTGGTGTTCAGCTCAGCCAGAAA------GTAAATTGTTATGCTAGGTTAGTATCGCCCAATAGAGTTACATTTTCTTTTGGGCACTGTACAGTATTTTTGTGTTTTTATGAGGACGAGTATAAAATAAATCTATGCAGTTGTTCTAGGGCCCTCAATCTTGTTCATTCATTGATAAGTTTAACATTCTCTACAATAGCTATTACACAA

a
s	mr.mrrefChr5	18139	76	+	294542	TATCCACTATAACTCCATAAGCTTGTCTCCAGTGGAACATATCAAACAGTATGTAGTCAATTTAACAACAGTTTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	155109	76	+	636262	TATCCACTATGACTCCATAAGCTTGTCTCGAGTGGAACATTTCAAACAGGATGTAGTCAATTTAAAAACAGTTTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	152775	76	+	647215	TATCTACTATAACTCCGTGAGCTTGTCTCCAGTGGGTCATATCAAACAGTATGTAGTCAATTTAACCACAGTTTTC

a
s	mr.mrrefChr5	18215	28	+	294542	ACGTAGAGGCCTTTGAATAATGAAAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	155189	28	+	636262	ACGTAGATTCCTTTGAAAAATTAAAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	152851	28	+	647215	ATGTAGAGGCCTTTGAATAATGAACACT

a
s	mr.mrrefChr5	18243	46	+	294542	ATGAGAACGAATGATGTGGGATGCTACTAACTGATTGTAATGATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	155217	46	+	636262	ATGAAAATGAATGATGTGGGACGCTACTGACTAATTGAAAGGATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	152934	46	+	647215	ATGAGAACGAACGATGTGGGATGCTACTAACAGATCATGATGATTG

a
s	mr.mrrefChr5	18289	116	+	294542	ATAGTATCCTCACTATTTTGACCCAGGAGTACAAATCTTAATGAAAAAGTAGCATCTTTTTACACTGCTTCTCATCTAGATAGCTCAGGATCGACCCATGCAATAAGTGTCCTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	155267	116	+	636262	ATAGTATCCTCACTATTTTGACCCAGGAGTACAAATCTTGATGAGACAGTAGCATCTTTTCCAACTGCTTCTCATCTAGATAGCTCAGGATCACCCCATGCAATAAGTGTCCTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	152980	93	+	647215	----------TGCTATTTTGACCCAGGAGT----ATCTTAATGAAAAAGTAACATCTTTTTACACTG---------TAGATAGCTCAGGATTGACCCATGCAATAAGTGTCCTTGG

a
s	mr.mrrefChr5	18405	39	+	294542	TGGGAGAAGTGGTCTTGACTTAGTCTAGAGAATATGATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	155385	39	+	636262	TGGGAGAAGTGGTCTTGACTTTGTCTAAAGAATGTGATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	153073	39	+	647215	TGTGATAAGTGGTCTTGACTTAGTCTAGAGAATATGATT

a
s	mr.mrrefChr5	18444	36	+	294542	GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAGGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	155425	36	+	636262	GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAAGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	153112	36	+	647215	GTAATAACTAGCTTTGATCTAGGAGCAGATAGCATG

a
s	mr.mrrefChr5	18480	10	+	294542	AGATAGGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	155523	10	+	636262	AGATAAGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	153148	10	+	647215	AGATAGCATG

a
s	mr.mrrefChr5	18490	498	+	294542	AACGAAGGTATACCTTGAAGGTCCAACAGTCTATACCCAAGGTACTACATAATTTTTTTGGAACTCTTTACACTCTAGACATTGGAAGCCCTCACCTCGTCATGCTGCATAATGCATAGTTTTTAGCATTTCATCTGAATTTAAATGCGTGGTACCTCGTTGCCACATGAAGGCACCCAATGCCATGTTTAAAACTCACATTTGTATCAGTACAGGAATAGGAAGCGAACATGGGAGACCCACAATATCTTTTCCCACAACATCTTCTCTCTCTTAGGAGTAATCTGCCAATCAAGTGCCCCCAGTTGGGGTAACAACCAGAATTCTGTACATATAATTTACCCAATCCCAAACACTGTCAGAGGAGGACTGACTTGATGTGTTCATTTGACCAAACCTGTGGCATTATTGATACAATTGTACTTATGGCTGTACACATCTGTGCAAAACATTCAACCAAGCCTATCAAACAGCAAATAGGCCAACCAATGAGTCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	155533	481	+	636262	AACAAAGGTATACCTTGAAGGTCCAACAGTCTATACTCAAGGTACTACATCATTGTTTTGGAACTATTTACACTCTAGATATTGGAAGCCCTCACCTCGTCATGCTGCATAATGCATAGTTTTTAGCATTTCATCTGAATTTAAATGCGTGGTACCTCGTTGCCACATGAAAGCACCCAATGCCATGTTGAAAGCTCACATTTGCATCAGTACAGGAATAGGAAGCAAACATGGGAGACCCACAATATCTTTTCCCACAACATCTTCTCACTCTTAGGAGTAATCTGCCATCCAAGTGCCCCCAGCTGGGGTAACAACCCGAATTCTGTACATATAATTTACCCAATCCCAAACACTGTCAGGGGAGGACTGACGTGATGTGTTCATTTGACCAAACCTGTGGCATTATTGATACAATTGTACTTATGGCTGCACACATCTGTGCAAAACATTCAACCAAGCCTAT-------CAAATAGGCCAACCA----------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	153163	483	+	647215	AACGAAGGCATAATTTGAAGGTCCAACAGTCTATACCCAATGTACTACGTAATTTTGTTGGAACTCTTTACACTCTAGACACTGGCAGCCCTCACCTTGTCATACTGCATAATGCATAGTTTTTAGCATTTCATGCTAATTTAAATGACTAGTACCTCATTGCCACCTGAAGACATCCAATGCCATGTTTAAAACTCACATTTGTATCAGTATGGGAATAGGAAGCGAACATAGGAGACCCACAAT---------------ATCTTCTCTATCTTAGGGGTAATCTGCCAATCAAGTGCCCCCTGTTGGGGTAACAACCAGAATTCTGTACATGTAATTTACGCAATCCCAAACACTGTCAGAGGAGGACTGACTTCATGGGATCATTTGACCAAACCTGTGGCAGTATTGAGACAATTGTATTTATCACTGTACACATTTGTGCAAAACATTCAACCAAGCTTGTCAAACAGTAAATAGGCCCACCAATGAGTCATG

a
s	mr.mrrefChr5	18988	344	+	294542	AAGATCGGGCCACAAAAACAGATGAGTCATGAAAGGTCAGGCCACAAAAACAGGACTGAAAGCCTAGGTTCAGACTTAGGATACCTCATTATGTGTAATCTCTCCAATTTCCAGGGAAATAAAGATAGTTGTGGTAAGCTGATCTGGGATGTTTCTATGATTCTTGTCTTTCCAGACCAAGGTGCAATCATGGGATGAGTCTAGGATGATATTAGCAAAGAACAGGATTACTAATTCTCACACCTATACCTAGGTTACACTTATTAATTTTTGACCATATCATATATTCACTGTGTCTCCCGGTCTTACATGTCTAGCTGTACATTTATAACTCCTACAAAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	156014	323	+	636262	---------------------ATGAGTCATGAAAGGTCAGGCCACAAAAACAGGGCTGAAAGCCTAGGTTCAGATTTAGGATACGTCATTATGTGTAATCTCTCCAATTTCCAGGGAAATAAAGATAGGAGTGGTAAGCTGATCTGGGATGTTTCTATGATTCTTGGCTTTCCAGACCAAGGTGCAATCATGGGATGAGTCTAGGATGATATTAGCAAAGAACAGGATTACTAATTCTCACACCTATACCTAGGTTACACTTATTAATTTTTGACCATATCAGCTATTCACTGTTTCTCCCGGTCTCACATGTCTAGCTGTACACTTATAGCTCCTACAAAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	153647	343	+	647215	AAGATCGGGCCACAAAAACAGATGAGTCATGAAAGGTCAGGCCACAAAAACAGGACTGAAAGCCTAGGTTCAGACTTAGGCTACCTCATTATGTGTAACCTCTCCAATTTCAAGGGAAATGAGGATAGTTGTGATAAGTTAAACT-GGATGTTTCTACAATTCTTGTCCTCCCAGACCAACATGCAATCATGGGATGAGTCCAGGATGATATTAGCAAAGAAATGGATTACTAGTTGACACACCTATACCTAGGTTACACTTATTAATTTTTGACCATGTCATATATTCTCTGTGTCTCCAGGTCATCCAGGTCTAGCTGCACATTTACAACTCATACAAAACA

a
s	mr.mrrefChr5	19332	51	+	294542	ACAGAAGAAGGTGGGTGTTTACCCACACTTAAGTGGCTAAGTTTTTGTCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	156344	51	+	636262	ACAGAAGAAGGTAGGTGTTTACCCACACTTAAGTGGCTAAGTTTTTGTCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	153990	17	+	647215	ACATTGGGTGGTGGGTG----------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	19383	8	+	294542	AGTGCTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	156404	8	+	636262	AGTGCTGT

a
s	mr.mrrefChr5	19391	52	+	294542	TAGTGTGTCCCATGACACTTTCAAGCAGAACTTAAGCATTGATGGGTAGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	156416	52	+	636262	TAGTGTGTCCCATGACACTCTCGAGCAGAATTTAAGCATTGATGGGTAAGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	154007	39	+	647215	-------------GCCACTTCCAAGCAGAACTTAGGCATGGATGGGTAGGGG

a
s	mr.mrrefChr5	19443	79	+	294542	TAATCAAAATTGCCTTAACAGCAGTTATAGAGCTGTTTCTTGTTAGCCTCATTGGAGTTGTACTTATAGGCCAAACACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	156469	79	+	636262	TAATCAAGATTGCCTTAACAGCAGTTACAGGGCTGTTTCTTGTTAGCCTCACTGGAGTTGTACTCATAGGCCAAACACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	154046	71	+	647215	TAATCAAAATAACCCTAACAGCAGTTATAGAGCTGTTTCTTGTTAGCCTCAT--------TAATTATTGGCCAAACATA

a
s	mr.mrrefChr5	19522	114	+	294542	CATATCTTGTCCAAAGTGAGGAGAGGTTTAGCACTAATCTTTTAGTACTAGTGTCTTACACCAGCTGGGCAGTCTACTGCATCCGCTATCTTGATGCTATTATTCAGTTAAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	156549	114	+	636262	CCTATCTTGTCCAAAGTGAGGAGAGGTTTAGCACTAATCTATTAGTACTAGTGTCTTACACCAGCTGGGCAGTCTATTGCATCCGCGATCTAAATATTATTACTCAGTTAAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	154117	114	+	647215	CATATCTTGTACAAAGTGAAGTGAGGTTTAGCACTCATCTTTCAGTACTAGAGTCTTACACCAGCTGAGTACTCTGCTGCATCCTCTATCTTGATGCTATTATTCAGTTATACT

a
s	mr.mrrefChr5	19636	124	+	294542	CTAAGTCTGGGGATTCACCTGTCTTCCACTATCAATATGAAATAGAAGCTGTCCAATTATATTCTGCACATATGCCAGTTTTGGATAGGATTCAAATCCTGCACACATTGCAGTTCTTGTGTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	156664	117	+	636262	CTAAGTCTGGGGATTCACCTGTCTTCCACTATCAATATGAAATAGA-------CAATTATATTCTGCACATATGCCAGTTTTGAATAGGATTCAAATCCCGCACACATTGCAGTTCTTGTGTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	154231	124	+	647215	CTAATTCTGGGGATTCACCTGTTTTCCACTATCAATATGAAATAGAAGCTGTCTGACTACATTCTGCACATATCCCAGTTTTGGATAGGATTCAAGTCCTGCACACACTGCAGTTCTTGTGTGG

a
s	mr.mrrefChr5	19760	243	+	294542	GTACTTTCTAGGGGATTGATTGTGTAAGTATTTCTACATAACATATTATTGTTGGTTCAGCACCAATAAAGACTCCTCCATATGAAACTCATACATAATATAGTTTTTAACATAGATGTCTTTGTCACAAAGATGTCATCTTTTCCACATAGATGTCTCATACAGATTCAATTCCTGTGATTGGGCTCTTTGTAAAGTAATTAAACATTGAATTTTTGCCAAAAGTTTTAATTATGACATTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	156781	233	+	636262	----------GGGGATTGATTGTGTAAGTATTTCTACATAAGTTATCATTGTTGGTTCAGCACCACTAAAGACTCCTCTGTATTAAACTCATACATAATGTAGTTTTTAACATAGATGTCTTTGTGACAAAGATGTCATCTTTTTCACATAGATGTCTCATACAGATTCAATTCCTGTGATTGGGCTCTTTGTAAAGTAATTAAACATTGAATTTTTGCTAAAAGTTCTAATTATGACATTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	154356	243	+	647215	GTACTTTCTAGGGGATTGATTGTGTATGTATATCTACATAACATATTATTGTTGGTTCAGCACTAATAAAGACTCCTCCATATGAAACTGATATGTAACATGGTTTTTCACATAGATGTTTTTTTCATATAGGTGTCATCTTTTCCACATAGATGTCTCATACAGATGCAATTCCTGTGATTGAGCTCTTTATAAAGTAACTAAGCATTGAATTTATGCCAAAAGTTTTAATTATGACATTAT

a
s	mr.mrrefChr5	20003	187	+	294542	CTAGACGGGTGACTCTAATCTGTTTCCAAATTACCCATTGTGATTAAAGACTGAGGAACTGCATTCATTGATAGAGTCATGTTTTATCTGAACAGTGACTGTAAGTCGTTCGGCTGATTCAAGCAACATATTGGATGCTTCATTTTCAAAAACTGTCTTCTCCAGAATTCCAAACTCCAGCATTACT
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	20232	72	+	294542	TAATACTTGGTCACATCCAACTGACAATGTACACACCATATTGAGAAAACTAGCAATAGGTGTGCTCCAGAA
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	20452	7	+	294542	GCCCACA
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a
s	mr.mrrefChr5	20459	157	+	294542	GGGCCCCCAGCTATTAGATACCCGAGACACTAAGACCACATGGTGCTTCAATCAGGCATATGTGCTCCCATGTACAGTTCCATTGGGTTTAATTAGCATGTAGTACAGTAAAAAACTACTTAGTGGTAGTAGGTAGGGATTGTGAGTACCATGATCC
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	20630	149	+	294542	TGGAGATAATTTTGGAATTGATAAGCTTGGTGGTCTGGGGTTGTGAGATCTACTAAAGAGGAATTACTTGGCCTGTAGAGAAAGCCCTAGTAATCCTGGATTGTTTTCTGGGGCTTGGAGAGGTACTTCTCTCTGCCATGTCCTTACTC
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a
s	mr.mrrefChr5	20779	46	+	294542	TAGAGCTTGATGGACAATTTGTGACACCAGGTTGTGATAAGCCGAT
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a
s	mr.mrrefChr5	20825	273	+	294542	TACTTTGGGAATTTGCAATGCAATCTACACCTTGTATGTGAATCCAGAAGCTTAAGGGCTTCAGGATACCACATTTAGCTATAGAGAATTATTGATTGTTATTCTTGTTTTGGTTCCTATGAACCGTGAGTCTCATAGCTGATGCAAAAGTATCGTCACTATTCAGAGGAAAAATCAAAACTCCATTGCACCCAACTTGCCCAATCATGTGTATGAATCCCCACTTGGGTTCAAGTACCAGTAAGTTGCATTATGAGACCAGGTGCCCCATCT
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a
s	mr.mrrefChr5	21098	607	+	294542	GGGTCTATCTAACCATGTATGATGTCTGAATTCAGATAGAACAGCATTTGCAACCCTGGAAGGTGTTCTGCTGAGGCTACTAAAAATGGTCCCCAAATGTGGAACAACCCAGTACCACTCGGGTCATGTAACTATTGCTTAAGGAGGGTAAAGGTGTTGTGGGTATCAGATTCTGATGGGTGATGAGATTCTCAAAGCTGCTCTCTAGTACAGCATCCCTACTTCTCCCATCAGGGATCTGGTCTTATACTGACTAAAGATTGCCACAGTATAAGCCTCTCTTTAACTGAAAAGTCTGACTCGTTAGCCCCTTTATTAGGAGGCTCCCTTCGTCTTGCATGGCCAGAAGGCAGTCACATGATTGCCATACCACACAGAAGGGTTGCTGCAGAGCTTTGGGCTGCTACAACAATCTTAGCATGTCCTGAGTGCCACCGATATATCCTCTGTAAACATAATGTGTTATTTTACTTGGCTGCTGATAGTATACCACTGTCAAGCAAGTATTTAGGTAAGATTCTTGTGAGTGGTGGGAAAGTACTTGACTTGTCTGCTGTCTACCTGCCATAACACATCTGCACATTTTTTTCAACCACTGAACTTTCAA
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	21728	27	+	294542	CCCATTCTCTTGAGCTCACATAGTGTG
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a
s	mr.mrrefChr5	21755	31	+	294542	CTCGAACAATGACAGTGTAGTGAACCCAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	158833	31	+	636262	CTCGAACAATGACAGTGTAGTGAACCCAAAT
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a
s	mr.mrrefChr5	21786	40	+	294542	AATGTCATTTCATGTGTGTCCTTCATTAATAGGCTCATAA
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a
s	mr.mrrefChr5	21826	95	+	294542	AGAGTCTCATCTCGTTGACCTGGCCGCAGATGCAGCAGTCAGGTAACCTCTATTCCAGCAAATGCAAAATCTCACACATCTTACTTTAGTTGGGG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	156651	86	+	647215	AAATTCTCATTTAGT---------CACAGATGCAGTAGTCGGGTGACCTCTCTTCCAGAAGATGCAAAATCTCGCACATCTTACTTTAGTTGGAG

a
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a
s	mr.mrrefChr5	21954	3	+	294542	CTC
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a
s	mr.mrrefChr5	21957	198	+	294542	CAAACCCCTTAAGTTGTGTACCAACCATCTACTCCGTAATGCTTCGTACCATATGAAAGTGGGTGAGATTCTCTGCTAGCCATAAGTTGTATGTTCAGTATTTTTGGAATAGACACATTCTTGAAGGAGGACCAGCTCAATTGCAGTATGACTTGACAGGAATGATAGTCAGTAAGTTCTAGTAACTTCCATTATACT
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a
s	mr.mrrefChr5	22155	342	+	294542	GCTCACTGCTTAGTTCACATGCTCAATGCTCAGTTCAGTTATCAACAGAACCTTGGGCAATACGGCGTGCGATTGAATATCAAACCACCAACACTGCAACATGAAAATAGATAACAAATGTTGCTGTGTGCATATGTTCAATCTTTAAACTGCCAACTGGAAACCATTCACACCGTTTGGAAGTAAACCCTAAATTATTGCTACTAGAACTTTTGGCGTGCATTCAGTAAAAGATAGCATATTACTCTTAAAGACCCTAACTTGATGGATGTTCCAAAGATTTTGGGATGTCAAAACAAATGATGGCCCACTGTGTCTCCACATCTGAGCTTGCATGCTCCT
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a
s	mr.mrrefChr5	22497	472	+	294542	ACACCCATGGGGCAGCTATTAAAGACATACCAATAACATGACCATTGTGCTTAATAAGGCGTAAGACCAATGGTATCCAGAGATCCACATATAGCTTGGCTAAACACTAATCATCCCTTAATAGATGGCAAATCAAATACTTAATAGCACAAATATAAAAATCAGCATTTAAAAGATCATGGACAGGCACCACACTCAACAGAGAAGCCTGCTACTAGTGTATACCCTGTTTTTAAATTCTATGACATTTTGCTTGTGGCCTGAGGCCACTATATCCAAAATGATAAACTACTCCACTAAGTCAATGCATGGAGAACATTTAGATTCTGGCCATTTGCCTTTATGTGTTAGGTTATCACCTTATGTAATGCCCTGCAAAGTTTTACTCATCAAGTGCAATTTTCGTAAATGTTCAAGGGTTTAGCACCTAACTGATCTGACACTGGAAGTTCAATTCTGACCTTACAATAGC
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a
s	mr.mrrefChr5	22969	261	+	294542	TTGGTTATGGTTCCCTTAATTGGGCCTCACCATCTTGAGTGTGCGATGCCAGATGACATCACATTAATCCATAATTATTTGCTTTAATAAATTAAAGAAGCTACCCAAGTTTGCAACCCTCCACAGACCCTGTCTGAAAATGTACTGTTCAGAATGCAGTCAAGTGTATTAATACCAAGATTTCCATTGTTATCTCTGACAATCTCCACTTTAACCTGAACTCTCAGAAGAGACAGTAATCAGTAACCTTACGGCAGCAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	160037	256	+	636262	TTGGTTATGGTTCCCTTAATTGGGCCTCACCATCTTGAGTGTGTGCTGCCAGATGACATCACATTAATCCATAATTATTTGCTTTA-----TTAAAGAAGCTACCAAAGTTTGCAACCCTCCACAGACCCTGTCTGAAAATGTACTGTTCAGAGTGCAGTCAAGTGTGTTAATACCAAGATTTCCATTGTTATCTCTGACAATCTCCACTTTAACCTGAACTCTCAGAAGAGACAGTAATCAGTAACCTTACGGCAGCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	157770	199	+	647215	TTGGTTATGGTCCCCTTAATTGGGCCTTACCATCTTGAGTGTGCTATGCCAGATGCCATCACATTAATCCATGATTATTTGCTTTAATAAATTAAAGAAGCTCCCCAATTT-GCGACCCTCCACAGACCCTGGCTGAAAATGTACTGTTCAGAATGCAGTCAAGTGGATTAATACCGAGATTTCAATTGTGATCTCTGAC-------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	23230	111	+	294542	AGGGCAGCAGACTGGGGTTGGCATTGAAAGATATTCTGTGATGCCTCTATTACACTACATAGACCCCCCATGAGTCAACCTATTAACCTGGCAGCTACATTTATAGCCCTC
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a
s	mr.mrrefChr5	23341	45	+	294542	CTCAGGACGTCAAAATTGTTCTATCAACTGCTGGCATAGGACTGG
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a
s	mr.mrrefChr5	23386	332	+	294542	ATTTGTACAATTTAAGCAACACCTTGTGATGAAGACTTTCCATGCAATTCCACATGCAATACATTTCTCTCAATGATACATACAGTTGTGTTTGCAGGGAAGCTGTAAATGAAGTATGGGCAAAAGGAGAAAAGTGTAAGGACAAACTACCAACGTAAGAATTGAATGTAACTTGATATAAATTTTTTATATTAAACCTTTTTAAGCACATCACCTTGTACAAATAGTAAGGATGGATCTGAATATTGAATTAGTTGAGATTTACTAAGTGTTTCTCATTCCATAGCAATGACTTACTCTTCTGTTATAACCATTTGTCTATAAACAAGATT
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a
s	mr.mrrefChr5	23718	22	+	294542	CTTAGTGCTTCTTCTGCTTTCC
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a
s	mr.mrrefChr5	23740	60	+	294542	TAAATGCAAGATGGATGATACAGATTATATACAAAACAGAGTAGGTAGACACCTGTAAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	23800	28	+	294542	ATAAGAGAGGAGTAATATTTGACTCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473853	28	-	636262	ATAAGAGAGGAGTAATATTTGACTCCTT
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a
s	mr.mrrefChr5	23828	12	+	294542	CAGCAGTCAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473881	12	-	636262	CAGCAGTCAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	158506	12	+	647215	CACCAGTCAACC

a
s	mr.mrrefChr5	23840	32	+	294542	AAACCATCAGTTGAATCAGTTGAAGATTATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473893	32	-	636262	AAACCATCAGTTGAATCAGTTGAAGATTATGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	158519	32	+	647215	AAACCATAAGTTGAATCAGCTGAAGGGTATGA

a
s	mr.mrrefChr5	23872	21	+	294542	GATGTTGCACACGCTTATTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473925	21	-	636262	GATGTTGCACACGCTTATTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	158574	21	+	647215	GATGCTGCACACACTTATTGT

a
s	mr.mrrefChr5	23893	37	+	294542	ACCGAACACATACAATCCAGTATCATCTAAGCTCGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473946	37	-	636262	ACCGAACACATACAATCCAGTATCATCTAAGCTCGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	158598	37	+	647215	ACCAAAGACATCTGATCCAGTATCATCTAAGCTTGCA

a
s	mr.mrrefChr5	23930	13	+	294542	ACACTTATCGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473984	13	-	636262	ACACTTATCGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	158635	13	+	647215	ACACTTATCACCA

a
s	mr.mrrefChr5	23943	89	+	294542	GAGACATCTGATATAGTATCATCTAAAGTTAAAACATCTCGGCATGTGATTGGTGTCAACTAAATGAGAAACCCAACTGATTGTCAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	473999	89	-	636262	GAGACATCTGATATAGTATCATCTAAAGTTAAAACATCTCGGCATGTGATTGGTGTCAACTAAATGAGAAACCCAACTGATTGTCAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	158648	89	+	647215	GAGACATCTGAGCCAGTAACGGCTAAGCTTAAAACACCTGGGCATGTCATCAGTATCAACTAAATGAGAGACCCAACTGATTGTCAGTT

a
s	mr.mrrefChr5	24032	72	+	294542	GCATCATTCTTCCCCCATCATACTCCAACTAAATATAGAGAAGCCCTATCACACTCAGGTAGTGGCGCATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474088	72	-	636262	GCATCATTCTTCCCCCATCATACTCCAACTAAATATAGAGAAGCCCTATCACACTCAGGTAGTGGCGCATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	158753	72	+	647215	GCATCATTCTTCCTTCACCATGCTCCATCTAAATGTAGAGAAGCTAAATTACCCTCAGGTAGTGGTACATAA

a
s	mr.mrrefChr5	24104	162	+	294542	GTGACATGTGCCTGGACTCCTCCTCTTCTGAGGCTGGGAATTGAAGCCGCTTATTTTCATTGGAAGGTCAGTTACCATATACATACTTTGCAAAATGCAATAAAGTTTGGATGGGTCAATCAGCGTAGGGTCCCATTGCCTGCATGCATACTAAGTTTGTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474161	162	-	636262	GTGACATGTGCCTGGACTCCTCCTCTTCTGAGGCTGGGAATTGAAGCCGCTTATTTTCATTGGAAGGTCAGTTACCATATACATACTTTGCAAAATGCAATAAAGTTTGGATGGGTCAATCAGCGTAGGGTCCCATTGCCTGCATGCATACTAAGTTTGTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	158825	162	+	647215	GTGACATGTCCCTGGACTCCTCCTCTTCTGAGGCTGGGAATTGAAGTCACTTAGTTTCATTGGAAGGTTAGTTACCATACACATACTTTGTAAAATGCAATAAAGATTGGAGGGGCCAAACAGAGTAGGGTCCCATAGCCTGCATGTACACTAAGGTTGTTT

a
s	mr.mrrefChr5	24266	117	+	294542	ATATCTATTACACCAAGAGGTAAAGCCATTCATTACAGTGTGGTCAGTCAGACCGTCTAGTCACTCAGGGCTTAGTGGTACCCAGCGCGTTTTATGTATGACAAAAGGAACTTGGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474323	117	-	636262	ATATCTATTACACCAAGAGGTAAAGCCATTCATTACAGTGTGGTCAGTCAGACCGTCTAGTCACTCAGGGCTTAGTGGTACCCAGCGCGTTTTATGTATGACAAAAGGAACTTGGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	159004	117	+	647215	ATATCCGTTACATCAAGCTATAAAGCCATACATTACAGTGTGATCACTCAGACAGTCCAGTCACTCCGGGATTAGTGGTACCTAGTGCATTTTTTGTATGGCAAAAGGAACTTGGAA

a
s	mr.mrrefChr5	24383	82	+	294542	AGGAACCCAAGTGGTCCACAGTAAATTAGATGGCCCCAGATTTCTGTAGCCTGTAACAGCTCATGTGGTCATGTCACCCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474440	82	-	636262	AGGAACCCAAGTGGTCCACAGTAAATTAGATGGCCCCAGATTTCTGTAGCCTGTAACAGCTCATGTGGTCATGTCACCCCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	159155	82	+	647215	AGGAAACTAAGTGGCTGACATTAAATTAGGTGGCCCCAGATTTCTGTGGCCTGTCTCAGCTCATGTGGTCATGTCACACCAT

a
s	mr.mrrefChr5	24465	39	+	294542	GGCCTAGCTCAGCCACATCTAGCTATATCTAGAACATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474522	39	-	636262	GGCCTAGCTCAGCCACATCTAGCTATATCTAGAACATAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	159246	39	+	647215	GGCATAGCTCAGCCACATCTAGCTGTATTTAGGACATAG

a
s	mr.mrrefChr5	24504	32	+	294542	ATATAAATAAGATAGCATCTCACTCATCAGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474561	32	-	636262	ATATAAATAAGATAGCATCTCACTCATCAGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	159291	32	+	647215	ATATGTATAAGATAGCATCTCACTCTTAAGGG

a
s	mr.mrrefChr5	24536	107	+	294542	TGAAGCGTGTTGGATCCTTCTACAGGGGCCTGCGATCACTTGACACTGCACGAGGCGGGTAGGATCCTTTCACAGGTGCCTGTGATTGCTTGTTGTTGTAGACGAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474593	107	-	636262	TGAAGCGTGTTGGATCCTTCTACAGGGGCCTGCGATCACTTGACACTGCACGAGGCGGGTAGGATCCTTTCACAGGTGCCTGTGATTGCTTGTTGTTGTAGACGAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	159324	107	+	647215	TAAAGGGTGTTGGGTCCTTCTACAGGGGCCTGTGATCACTTGACACTGTATGAGGCATGTATGATCCTTCTACAGGTGCGTGTGATTGCTTGTTGTTGTGCACAAGG

a
s	mr.mrrefChr5	24643	10	+	294542	CTGTAGGAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474702	10	-	636262	CTGTAGGAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	159431	10	+	647215	CTGTATGAAA

a
s	mr.mrrefChr5	24653	107	+	294542	TCTCAACAACGTTAAGGCTATCAACACAAAATGGAGACAGGAAATTTTGTGATTTATGCCGCAAAAGGTTCCAAGATGGGTATCCATCACCCCAGAGACCCTCGGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474747	107	-	636262	TCTCAACAACGTTAAGGCTATCAACACAAAATGGAGACAGGAAATTTTGTGATTTACGCCGCAAAAAGTTCCAAGATGGGTATCCATCACCCCAGAGACTCTCAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	159441	96	+	647215	TCTCATCAACGTTAAGGCTAT-----------GGAGACACGAAATTTTATGATTTATGCCGCAAAAGGATCCAAGATGGTTCTTCATTGCCCCAGAGACCCTCGGTA

a
s	mr.mrrefChr5	24760	59	+	294542	AGTCTACCCGGAACTATTATATATCAAACATTTAGACCCACTACCTCCAAAATTATGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474854	59	-	636262	AGTCTACCCGGAACTATTATACATCAAACATTTAGACCAATTACCTCCAAAACTATGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	159539	59	+	647215	AGTCTACCTGGAATTATTATATATCAAACATTTAGACCCACTACCTCCAAAATTATGAA

a
s	mr.mrrefChr5	24819	141	+	294542	ATTTAAATACCATAGGTACGGTAGCAGATATAGCACATGTGACATTCCAAACCTGGTTAGTTAAGGTGGGTCAGTATTGCAAGTTTTGTAAAATTAATTGTCTAAGGAAATTTTTATTGTGATGACACAAGATGTCAGTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	474913	141	-	636262	ATTTAAATACTATAGATACGCTAGCAGATATAGCACATGTGGCATTCCAAACCTGGTTAGTTAAGGTTGGTCAGTATTGCAAATTTTGTAAAATTAACTGTCTAAGAGCATTTTTATTGTGATGACACAAGATGTCAGATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	159599	141	+	647215	AGCTAAATACCCTAGGTATGGTATGAGATATAGCACATGTGACATTCCAAACTTAGTTAGTTTAGGTGGGCCAGTATTGCCAGTTTTGTAAAATTAATTGCCCAAGGAAATTTATATTGTGATGACACAGGATGTCAGTTA

a
s	mr.mrrefChr5	24960	44	+	294542	TGTTTTATAGTGAATAACAGAGAACACTGTGCTAGGGGGAGATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	475054	44	-	636262	TGTTTTATAGTGAATAACAGAGAACACTGTGCTAGGGGGAGATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	159760	26	+	647215	TGTTTTACGGTGCA-------GAAAACTGTACT-----------

a
s	mr.mrrefChr5	25004	13	+	294542	TCATGATGCTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	475102	13	-	636262	TCATGATGCTGCT

a
s	mr.mrrefChr5	25017	9	+	294542	AGATAATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	475124	9	-	636262	AGATAATAT

a
s	mr.mrrefChr5	25026	55	+	294542	CATGATGTTGCTTAATCAGTACCCACCCACAGCCCATTACTATAAGTGGGCTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	475134	55	-	636262	CATGATGTTGCTTAATCAGTACCCACCCACAGCCCATTGCCATAAGTGGGCTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	159786	50	+	647215	-----TGTTGGGTAATCAGTACCCACCCACAGCCCATCACTACAAGTGGTCGAGA

a
s	mr.mrrefChr5	25081	183	+	294542	ACTATATATCTTAACCCTTCTGAGAATGAAGTTCTCTTTTAAGAAGTTGGGTATGGAACTGCAAACGCAGCACAAGGCAAGAGTTAGGTACCACAAACAAATCAAACTCTGAGCTGTATAACCATGGGATGTGTGCTGTTCTTTGTGAGGGTATAATATAGGGATCATCTATATAATATATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	475189	183	-	636262	ACTATATATCTTAATCCTTCTGAGAATGAAGTTCTTTTTTAAGAAGTTGGGTATGTAACTGCAAACGCAGCACAAGGCAAGAGTTAGGTACCACAATCAAATCAAACTCTGAGCTGTGTAACCATGGGATGTGCGCCATTCTTTTTGAGGGTATAATATAGGGATCATCTATATAATATATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	159840	178	+	647215	ACTA-ATATCTTAACCCTTCTGAGAATGAAGTTCTCTTTTAAGAAGTTGGGTATGGAACTGGAAACACAGCACAAGGCAAGAGTTAGGTACCACAAACAAATT----CCTGAGCTGTATAACCATGGGATGTGTGCTGTTCTTTGTGAGGATATAACATAGGGATCATCTATATAATATATGT

a
s	mr.mrrefChr5	25264	26	+	294542	GCAGCACATGGATCAGAAAATTGCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	475372	26	-	636262	GCAGCACAGGGATCAGAAAATTGCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	160028	26	+	647215	GCAACACATGGATCAGGAAATTGCTG

a
s	mr.mrrefChr5	25290	69	+	294542	TTGTGTTGACATATTAAGAAAGCATATACTGCATGTTTGCTGGAGATTTTGGATACTCTGTTAGGGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	475407	69	-	636262	TTGTGTTGACATATTAAGAAAGCATATACTGCATGTTAGCTGGAGATTTTGGATACTCTGTTAAGGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	160054	69	+	647215	TTGTGTTTACATACTAAGAAAGCATATACTACATGTTTGCTGGATATGTTGGATACTCTGTTAGGGACT

a
s	mr.mrrefChr5	25359	128	+	294542	GCAGTGCAGCTGCTGACTAGGTTATATTGAATCTTCCAGTGTGAAGCATGGTCATGGGTCTATGCAGTCAGAAATGTCATGTCATAGGCAGTTCATCAGATAACTTCACTTTCTAGCATCACAATGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	162497	128	+	636262	GCAGTGCAGCTGCTGACTAGGTTCTATTGAATCTTCCAGTGTGAAGCATGGTCATGGGTCTACGTAGTCAGAAATGTCATGCCATAGGCAGTCCATCCGATAACATCACTTTCTACCATCACAATGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	160130	122	+	647215	--AGTGCAGCTGCTGGCTAGGTTATATAGAATCTTCCAGTGTCATGTATGGTCAAGGGTCTATGCAGTCAGAAATGTAATGTCATAGGCAGTTCATCAGATAACTTCATTTTCTAGCATCACAA----

a
s	mr.mrrefChr5	25487	57	+	294542	ACCACTACTGTATCCACGCCAACTGCAAGCTTGTCCTAGGCCAATATAGACAACATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	162626	45	+	636262	ACCACTACTGGATCCATGCCAACTGCAAGCT------------ATATAGACAACATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	160252	53	+	647215	----CTACTGTATCCACGTCAACTGTAAACTTGTCCTAGGCCAATATAGACAACATC

a
s	mr.mrrefChr5	25544	50	+	294542	TTCCCATCATAAAGTTTGCATGCTGCACTGAATCTCAAAACCTGACAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	162671	50	+	636262	TTCCCATCATAAAGTGTGCATGCTGCACTGAATCTCAAAACCTAACAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	160306	50	+	647215	TTCCCACCATAAAGTTTGCATGCTGCACTGAATCTCAAAACCTGTCAAGT

a
s	mr.mrrefChr5	25594	14	+	294542	ATTGGTTGAATCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	162721	14	+	636262	ATTGGTTGAATCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	160358	14	+	647215	ATTGGTTGCATCCA

a
s	mr.mrrefChr5	25608	165	+	294542	CCCCTTGCTTAAACATCAGAAATGAATCAGTGAGAATGAAGCAGCAGAATGAATAGCCTATCTGGAGCAACCCTCCTGAACTTTGAAACCATTCAAGGGTCCTCTAAAAGTAGTCTTCAAGATTAGAGGAGTGGTTTTAGCTAAGGTTGGTTAGCCCGCTTACCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	162735	163	+	636262	CCCCTTGCTCAAACATCAGAAATGAATCAGTGAGAATGAAGCAGCAGAATGAATAGCCAATCTGGAGCAACCCTCCTGAATTTTGAAACCATTTAAGGGTCCTCTAAAAGTAGTCG--AAAATTAGAGGAGTGGTTTTAGCTAGGGTTGGTTAGCCCGCTAACCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	160373	163	+	647215	CCCCTTGCTTAAACATCAGAAATGAATCAGTGAGAATGAAGCAGCAGAATGGATAGCCTATCTGGATCATCCCCCCTGAACCTTAAAACTATTCAAGGGTCCTCTAAAAGTAGTCTTCAAGCTTAGAGTAGTGAGC--ACCTAAGGTTGGGTAGCTTGCTTACCT

a
s	mr.mrrefChr5	25773	138	+	294542	CTAAAGGTCTCTATTGTGGGAGCAGGTGTGCGCGACTGTGTGAAATGTGAATGCATTTTATAAAGGAGCTGCTTCAGTGCCAGCATATTCAACTGTTCCCTCTCCCCCCCCACATGAGTTTTGGATCATCAGGAGTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	162898	134	+	636262	CTAAAGGTCTCTATTGTGGGAACAGGTGTGCGCGACTGTATG----GTGGATGCATTTTATAAAGGAGCTGCTTCAGTGCCAGCATATTCAATTGTTCCCTCTCCCCCCCCACATGAGTTTTGGATCATCAGGAGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	160585	138	+	647215	CTAAAGGCCTCAATTGTGGGGGCATGTGTGCGCAACTGTGTGAAATGTGAATACATTTTATAAAGGAGCTGCTCCAGGACCAGCATATCTAACTGTTCCCTCTCCTCCCCCACATGAGTTTTGGATCATCAGGAGTAG

a
s	mr.mrrefChr5	25911	337	+	294542	GTTAGAAGTACACACAGGCCGTTGGCACTCTCCCAAGGAGAACCCACTTACAAGATCACCTTTGACTTCTATCAGTGCAAGTGGGTCAAGCTTCCTGGATCAAAAAGTCTCTTGCCCACATGAGATCTTAAATTGTGATTCACTAGAACTGCTAGTGCCCTTCCAATAATGTTCACCCCACCAACACTTATTTCTTCCATCAGGATCTGGAGGCCATATGCTCATCTCTACACTCATTTCAACACTAGGGCCTGGTAATTGGATCCCAAAATGGTGTAATTGAGCATTTTTGAATGTTTCAACCTTTTTGAAAACCTTACTTGATACAGGGCAGTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	163032	336	+	636262	GTTAGAAGTACACACAGGCTGTTGGCACTCTCCCAAG-AGAACCCACTTACAAGATCACCTTTGACTTCTATCAGTGCAAGTGGGTCAAGCTTCCTGGCTCTAAAAGCCTCTTGCCCACATGAGGTCTTGAATTGTGATTCACTAGAACTGCTAGTGCCCTTCCAATAATGTTCACCCCACCAACACTTATTTTTTCTATCTGGGTCTGGAGGCCATATGCTCATCTCTACACTCATTTCAGCACTGGGGCCTGGTAATTGGATCTCAAAATGGTGTAATTGAGCATTTTTGAATGTTTCAACCTTTTTGAAAACCTTACTTGATACAGGGCAGTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	160726	330	+	647215	GTCAAAAGTAAATACAGACCGTTGGCACTTTCCCAAGGAGAACCCACTAACAAAATCACCTTTGACTCCT------GCAAGCAGGTCGAG-GTCATGGATCAAAAAGTCTCTTGCCCACATAAGATCTTAAATTGTGATTCACTTGGAATGCTAGTGCCCTTCCAATAATGTTCACCCCACCAACACTTATTGCTTCCATCAGGATCTGGAGGCCATATGTTTGTCTCTACACTCATTTCAACACCAGGTCCTGGTAATTGGATCCCAAAATGATGTATTTTAACATTTTTGAATGTTTCAACTTTTTTCAAAACCCTACTTGGTACAGGGCAGTAG

a
s	mr.mrrefChr5	26248	116	+	294542	TCTGAGTCATTTAGAAACATATTATAAAGGAATCAACATGCACCAGATTTTGAAGCCAATTCTGTCAGGCCCAGTACACCCCCCCTGGTTGTACCACCGCTATTCAGGGCATTGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	163370	116	+	636262	TCTGAGTCATTTCGAAACATATTATAAAGGAATCAGCATGCACCAGATTTTGAAGCCAATTCTGTCAGGCTCAGTACACCCCCCCTGGTTGTACCACCGCTATTCAGGGCATTGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	161056	110	+	647215	TCTA---CTTTTAGAAATATATTA---AGGGATCAACATGCCCCAGATTTAGAAGCCATTTCGGTCAGGCCTAGTACACCCTCCCTGGCTGTACCACTGCAATTCAGGGCATTGCA

a
s	mr.mrrefChr5	26364	87	+	294542	TGCACCAGATTGTCTGGTCATCATGGGGCTGGTGCCTGATGACTGCCCATAGATGCGGCCCATACACATGTAGTATGTGGTTCCTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	163486	87	+	636262	TGCACCAGATTGTCTGGTTGTCATGGGGCTGGTGCATGATGACTGCCCATAGATGTTGCCCATACACATGTAGAATGTGGTTCCTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	161168	87	+	647215	TGCCCCAGATTGCTCGGTCATCATGGGGATGGTGCCTGATGACTGCCCATAGACGCGGCCCATACACACGTAGTATGTGGTTCCTAG

a
s	mr.mrrefChr5	26451	84	+	294542	AACCTGTGACTAGCATCACAAAGTAACCATCTGGGAAGTGGAATAATTAAGGAATAGCAAACAGTTATACATGTCTGTGTATCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	163573	84	+	636262	AACCTGTGACTAGCATCACAAAGTAACCATCTGGGAAGTGGAATAATTAAGGAATAGCAAACAGTTATACCTGTCTGTGTATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	161260	77	+	647215	AACCTCTGACTAGCAT-------TAATGATCTGTGAAGTGAAGTAATTAAGGAATAGGAAACTGTTGTATATGTCTGCGTATCG

a
s	mr.mrrefChr5	26535	68	+	294542	GTGCAGTTATGACAGAAAACTTGCAGGGACCTGGAGGATGGTGTTATAATAGACTTGAAACAGGACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	163657	68	+	636262	GTGCAGTTATGACAGAAAACTTGCAGGGACTTCTAGGATGGTGTTATAATAGACTTGAAACAGGACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	161339	68	+	647215	AGGCAGTTATGACTGAAAACTTGCAGGGACCAGGAGGATGATGTTACAATAGACTCGAAATAGGACTA

a
s	mr.mrrefChr5	26603	180	+	294542	TGGAGTTAGTGGTGCAATTCTAGGAAAATCTGGGGAAATTTGTTGTGTGTTTCATCTTTTTGTCACTATCAATATGTAGGACAAGAGGTCAGCAGACCCAGTACACTTGGTTTAGTGTAATGACCTCCATATATGGAGCAATGATAATCTGAATAGATAGATAGGATATATCTACTGCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	163725	179	+	636262	TGGAGTTAATGATGCAATTCTAGGAAAGTCTGGGGAAAGTCGTTGTGTGTTTCATCTTTTTGTCACTATCAATATGTAGGACATGAGGTCAGCCGACCCAGTACACCTGGTTTAGT-TAATGACCTCCATATATAGAGCAATGATATTCTGAATAGATAGGTAGGATATATCTTCTGCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	161424	178	+	647215	TGGAGTTCGTGGTGCAATTCTAGGAAAATCTGGTGAAATTTGTTGTGTG--TGATCTTTTTCTCACTGTCAATATATAGGTCAAGGGGTCAGGAGTCCCAGTATACTTGGTTTAGTGTAGTGACCTCCATATATGGACCAATGATAACCCAAATAGACAGATACGACATGTCTACTGCAA

a
s	mr.mrrefChr5	26783	10	+	294542	CCGCAGTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	163904	10	+	636262	CCGCAGTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	161631	10	+	647215	CCACAATGAG

a
s	mr.mrrefChr5	26793	26	+	294542	AGATCAGCGGTTTAGACAAATAGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	163914	26	+	636262	AGATCAGCGGTCTAGACAAACTGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	161644	26	+	647215	AGATTAGTGGTTTAGACAAATAGTAA

a
s	mr.mrrefChr5	26819	157	+	294542	CTCCTGGCTGGGCTGGTTACCTATTGTGCATACACTGTGTGAGATGAGCCAGTTGGACAACTGGTGAGCACCAACTAGGTCCCTTGTTTGTGATCATGCTAAGAAAATTAATCCTATTGGCTGGTAATTTTAGCTGGCAAAACTATTCACGTCTTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	163940	157	+	636262	CTCCTGGCTGGGCTGGTTATCTATTGTGCATACACTGAGTGAGATGAGCCGGTTGGACAACTGGTGAGTACCAACTAGGTCCCTTGTTTGTGATCATGCTAAGAAAATTAATCCTATTGGCTGGTAATTTTAGCTGGCAAAACTATTCACGTCTTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	161671	153	+	647215	CTCCTGGCTGGGCTGGTTACCTATCGTGTATGCAATGTGTGA----AGCCAGTTGCACCACTGGTAAGCACCAACTAGGTCCCTTGTTTGTGATCATGCTAAGAAAATTTACCCTGTCAGCTGATCACTGCAGCTGGTCCAACTATTCACATCTTAC

a
s	mr.mrrefChr5	26976	131	+	294542	TTGTGTGGCCGGAACTTGTGGATCTGCCAGTGAGTATGCACTCACGCAAAGAACCTCACATAACACAACCATTGGGCTGACCCAGAGTCCAAACATACCAACAAACTGCATTGCTTGTATTGACAACACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	164113	131	+	636262	TTGTGTGGCCGGAACTTGTGGATCTGCCAGTGAGTATGCACTCACGCAAAGAACCTCACATAACACAACCATTGGGCTGACCCAGAGTCCAAACATACCAACAAACTGCATTGCTTGTAGTGACAACACAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	161824	122	+	647215	CTGTGGGGCCGGAACTTCTGAGTCGGCCAGTGAGTATGTACTCACTCGAAGAACCTCACATAACACAACCATTGGGTTGAACTGGAGTCCAAAAATAC---------GCATTGCTTGTATTGACAACACAG

a
s	mr.mrrefChr5	27107	35	+	294542	TTAATTGAGATATCGCTTCAGCCTCATCTGACTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	164245	35	+	636262	TTAGTTCAGATATCGCTTCAGCCTCATCTGACTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	161946	35	+	647215	TTAATTGAGATATCACTTTGGCTTCATCTGACTAC

a
s	mr.mrrefChr5	27142	16	+	294542	AGGAAGGGACGTTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	164280	16	+	636262	AGGAAGGGACGTTAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	161982	16	+	647215	GGGAAGGGATGTTAAA

a
s	mr.mrrefChr5	27158	60	+	294542	ACACTCCCTCTCTGGGTCATGTGTACTCCTGAGTACCTTTATAGCAAATTGACCGGTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	164297	60	+	636262	ACACTCCCTCTCTGGGTCATGTGTACTCCTGAGTACCTTTATAGCAAATTGACCGGTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	161998	60	+	647215	AGACTCCCTCTCTGAGTCATGCGTACTCCTGAATAACTTAATAGCAAACTCACCAGTGTA

a
s	mr.mrrefChr5	27218	28	+	294542	GCATTTGCCTTTTATTGGAACTTTGTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	164357	28	+	636262	GCATTTGCCTTTTATTGGAACTTTGTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	162114	28	+	647215	GCATTTGCCTTTTATTGTAGCTTTATTC

a
s	mr.mrrefChr5	27246	76	+	294542	GAGGTACTGTGCAACTTCTAAACAATGTTAAAGTTTCATTCACACTAGTACTGGAGGAAATCCTGCATTGAAGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	164385	76	+	636262	GAGGTACTGTGCAACTTCTAAACAATGTTAAAGTTTCATTCACACTAGTACTGGAGGAAAGCCTGCATTGAAGTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	162149	76	+	647215	AAGGCATTGTGTAAAGTCTAAACAATGTTAGGGTTTCATTCACACTACCAGTGGAGGAAATCCTACATTGAAGTCT

a
s	mr.mrrefChr5	27322	10	+	294542	CTAATCTAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	164461	10	+	636262	CCAATCTAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	162294	10	+	647215	CTAATCTAGC

a
s	mr.mrrefChr5	27332	17	+	294542	ATGTAACCTCTTCCTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	164474	17	+	636262	ATGTAACCCCTTCCTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	162304	17	+	647215	ATGTAACCTCTTCCTAT

a
s	mr.mrrefChr5	27349	126	+	294542	ATTGACCTTTCCAACCAGACTGTAGCACCATACCGTTAGTCTAAACAGAGGTATTTATGCCATCTCACAATGAAAAACCCTGAGTAGTGAAACTTGGTCAGTCAATTGGCATGTCAACTCTGTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	164491	65	+	636262	ATTGACCTTTCCAACTAGACTGTA-------------------------------------------------------------AGTGAAACTCGGTCAGtcaattggcatgtcaactctgtgag
s	simRat_chr6.simRat.chr6	162329	126	+	647215	ATTGACCTTTCCAACCAGACGGTAGCACCATACCGTTAGTCTAAACAGAGGTATTTATGCCATCTCACAATGAAAAACCCTGAGTAGTGAAACTTGGTCTGTCAATTGGCATGTCAACTCTGTGAT

a
s	mr.mrrefChr5	27475	85	+	294542	ATGATTATGTGGTTCTTTTAATGAGAGCAGGCTATAGGTTCCATCACATTTAGAGGcttTCAGCTGCAACAGAGGTTCATGGCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	164556	85	+	636262	atgatttcatggttctttgaatgagagcaggctataggttccatcacatttagaggcttTCAGCTGCAACAGAGGTTCATGGCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	162460	85	+	647215	ATGATTATGTGGTTCTTTTAATGAGCGCTGGCTACCCGTTTCATTTCATTTAGAGGCTTTGAGCTGCAGCAGAGCTTCATGGCAG

a
s	mr.mrrefChr5	27560	100	+	294542	TAGCTATTGCTCACGTAGCCCCCTTGAGAAGTTAAAGATGTGTGTGATATTAAAGCCATGTAAACCCAATTTGCTTCAGTACAATCTTTATAGCCATATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	164642	94	+	636262	TAGCTATTGCTCACGTAGTCCTCTTGATAAGTTAAAGACGTGTGTGATATTAAAGCCATGTAAAC------TGCTTCAGTACTATCTTTATAGCCATATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	162545	100	+	647215	TACCTACTGCTCACATAGCCTCCTTGAGAAGTTAAAGATGTGTGTGATATTTAAGCCATGTAAATCCAATTTGCTCCAGTACAATCTTTATAGCCATATT

a
s	mr.mrrefChr5	27660	19	+	294542	GAATCACAATACTCAAGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	164969	19	+	636262	GAATCACAAGACTCAAGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	162645	19	+	647215	GAAACACAATACTCACGGG

a
s	mr.mrrefChr5	27679	362	+	294542	TTGGTGTGATAAGGCTCTAGGGCTCTTTCTTCTTCATCTGATGAAGCTTGTGTGGGATGAACATAACCGCTACAGGAATCTCAATTGCATGTACCATTCATGCTATGGATGCCCCACAGAAATATGAACTGCATGCCCTAGTCACACAATGGATGTTGAGTCCACAGTACTGAGATAGGTCATGATACCATACTAATCATGACACAGTCAGTGTGATCAAGATAGCTCATTTAGGGCTATATCACTGCCTATATTCATCATAAAGTGTATGCACAACAAGAACCATGTATACTCCTAAGTTTTTCTAGACTGAGTACTACACTGGTGTGGTGACACTGTGCCATGTAGTATTGGTTGCAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	164991	362	+	636262	TTGGTGTGATTAGACTCTAGGGCTCTTTCTTCTTCATCTGATGAAGCTTGTGTGGGATGAACATAACCGCTACAGGAATCTCAATTGCATGTACCATTCATGCTATGGATGCCCCACAGAAATATGAACTGCATGCCCTAGTCACACAATGGATGTTGAGTCCACAGTACTGAGATAGGTCATGATACCATACTAATCATGACACAGTCAGTGTGATCAAGATGGCTCATTTAGGGCTATATCACTGCCTATATTCATCATAAAGTGTATGCACAATCAGAACCATGCATACTCCTAAGTTTTTCTAGACTGAGTACTACACTGGTGTGGTGACACTGTGCCATGTAGTATTGGTTGCAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	162664	290	+	647215	TTGGTGTGATAAGGCTCCAGGGCTCATGCCTCTTGATCTGATGAGGCTCATGTGTGATGAAAATAACTGCCACAGAAATCTGAATTCCCTGCACCAGCCATGCTATGGATGCACCACAAAAATATGAATTGCATGCCCCAGCCACACAATTGATGCCGAGTCCACAGTACTGAAATAGGGCATGACACCATACTAATCCTGACACAGTCAGTGTGATAAGGATAGCTTGTTTAGGTTTATACCACTGCCTACACTCATCATAAAGTGTATGCACAACAAAAACCATGTAT------------------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	28041	187	+	294542	CAGGTAGAATGTAGCTTCATCTAATATTGGCTAATTAACGACTCAGTACGGAATTTCCAGATGTTGGATCTGTTTAGAGGAAATATGCACGAGAATTTCAGTGCCAAGCGATGATTTCAGTACTTGACTGATAAAGCAGTTGAACTGGATTGTTCTATCTAATGTAGGAGAGGTGGATAGATGGAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	165360	187	+	636262	CAGGTAGAATGTAGCTTCATCTAATATTGGCTAATTAACGACTCAGTACGGAATTTCCAGATGTTGGATCTGTTTAGAGAAAGTATGCATGAGAATTTCAGTGCCAAGCGATGATTCCAGTACTTGACTGATAAAACAGTTGTACTGGATTGTTCTATCTAATGTAGGAGAGGTGGATAGGTGGAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	162954	149	+	647215	-------------------------------------AAGACCCAGTACGGAATTTCCAGATGTTGGATCTGTTTAGAGGAAATATGCACCACAATTTTAGTTCGGAGCGATAATTTCAGTATTTGACTGATAAAGCAG-TGAACTAAATTGTTCTATCTGATGTAGGGGAGGTGGATAGATGCAAG

a
s	mr.mrrefChr5	28228	86	+	294542	ATGAGCACTCTAATAGGGCTAAGTTCAAATTATCCCTAGTTAGGTCAAAAGCCCAATTCTCACACTGTTGGAGTGACCACTCCCGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	165553	83	+	636262	ATGAGCACTC---TAGGGCTAAGTTCAAATTATACCTAGTTAGGTCAAAAGCCCAATTCTCACACTGTTGGAGTGACCACTCCCGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	163103	86	+	647215	GTGAGCACTCTAATAGGGCTAGGTGCCAATTATCGCTAGTTATGTCAAAAGCCCAATTCTCACACCGTTCGAGTGACCACTCCTGT

a
s	mr.mrrefChr5	28314	63	+	294542	GGATTGGTATGTTGAATCAGCCAAGGTGAAATCAAAGTGCTTGAACTTAGTTCCTTGCGGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	165636	63	+	636262	GGATTGGTATGTTGAATCAGCCAAGGTGAAATCAAAGTGCTTGAACTTAGTTCCTTGCGGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	163190	63	+	647215	GGATTGGTATGTTGAATCAGCCAATGTGTGATCAGAGTGCTTGAACTTAGTTCCTTGCAGCTT

a
s	mr.mrrefChr5	28377	44	+	294542	TAAGGGCCGCGCATAAGTTGGTCCCACCTCAATCAATGATAGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	165700	44	+	636262	TAAGGGCCGCGCATAAGTTGGTCCCACCTCAATCAATGATAGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	163253	44	+	647215	TAAGAGTAGCCCATGAGATGGTCCCACCTCAAGCAAGTAAAGGG

a
s	mr.mrrefChr5	28421	23	+	294542	CTATTGTGGTCGCGATTGAGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	165744	23	+	636262	CTATTGTGGTCGCGATTGAGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	163299	23	+	647215	CTATTGTGGTTGCAATTGGGGTG

a
s	mr.mrrefChr5	28444	90	+	294542	GATGAGCTCAGTTGTGTACCTTTACCCCATGCTAGATGTGGTCAGCAGTTACTGGCCCTTGCAAGTCCGCCCAACAGTGCACAAGTGCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	165777	88	+	636262	GATGAGCTCAGTTGTGTACCTTTACCCCATGCTAGATGTGGTCAGCAGACAC--ACCCTTATAAGTCTGCCTAACAGTGCACAAGCGTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	163322	90	+	647215	AATGAGCTCAGTTGTGTACTTTGTCCTCATGGTAGATATAGTCAGCAGTTACTGGCCCTTGCTAGTCCCCCCAACAGTGGACAAGTGCTG

a
s	mr.mrrefChr5	28534	78	+	294542	AGCTCATAGGATTAGAATAGTGGTGGCCTGATATGATTGTATTTCTGAACACGTTCCTGTGGCTGCTAAAATGTCCCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	165882	77	+	636262	AGCTCATAGGATTTGAATAGGCATGGCCTGATATGATTGTA-TTCTGAACACGTTCCTGTGGCTGCTAAAATGTCCCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	163412	78	+	647215	AGCATATAGGATTACAACAGTGGTTGCCTGATCTGATTGTATTTCTGAACTTGTTCCTGTGGCTGCTAAAAAGTCCTG

a
s	mr.mrrefChr5	28612	286	+	294542	CCTCTACTAGAACAATTTCTCCCAGAAATTGCTGGTAACAAGGGGTTCCTTGAGAGATAAGCTAGTTTCTGAAAGCCCAAAGTTCACACTAATCAATTGAGACGTATTCAAACTTGATAATTGTAGTCGCCAGGATTAGAATGACTCACATGTGAAGCAACATGTAGATTTACAGGCTCTTTTATGGAGGGTAATTCAGAGATTAATACTGCTTCTTACGTAAACCACTTGCCCCATAGAGAAACCAACTGAACACCATGTGTAAAGTCAGTATTCACCTCAAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	165960	280	+	636262	CCTCTACTAGAACAATTTCTCCCAGTAATTGCTGGTAACAAG-----CCCTGAGAGATGGGCTAGTTTCTGAAAGCCCAAAGTTCACACTAATCAATTGTGAAGCTTTCAAACTTGATGATTGTAGTCACCAGGATTAGAATGACTCACATGTGAAGCTACAAGTAGATTTACAGGCTCTTCTATGGAGGGTTATTCAGAGATTAATACTGCTTCCTACGTAAACCACTTGCCCCATAGAGAAACC-ACTGAACACCATGTGTAAAGTCAGCATGCACCTCAAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	163490	284	+	647215	CCTCTATTAGAACATTTTTTCCCAGAAAGTGCTGGTAATAAGGGGTTCCTAT-GAAATAAGCTAGTTTCTGAAAACCCAAAGTTCACACGAATCAATTAACGCCTAGGTAGACTTGATAATTGTAGTCGCGACGATTAGGTTGACTCACATATGAAGCAACATGTGGATTTACAGGCTCTTTTATGAAGGGTAATTAAGAGATTAATACTGCTACTTACGTAAACCACTTGC-CTATAGAGAAACTAATTGAACACCATGTGTAAAGTCTGTATTCATCTCAAGTA

a
s	mr.mrrefChr5	28898	287	+	294542	AACACAAGGTAGGATTTGCTTTTTCTTTATCATATAAGATTAATGTTTGGTCTAACCAGAGGACCACCAATCATTTCCACAAACTTTTACAATTTGGAATTGCCTGGAGTCTACAATTTATGGTTAGTCTCTCCCTGATTTTCTCCAAGAGTATCTATAAATAAGACATGATTATCGAGCTGCTGCACAGCATTGTAGTCTGGCGGTACATCATCTTTGAGGTTTTCAGTGTAACAGCAGTGTCTGTTTGTCTACCACATCAAATTCAATTATAGAAGCCAATAGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	166243	269	+	636262	AACACAGGGTAGGATTCGCTTTTTTTTTATCATATAAGATTAATGTTTGGTC---CCAGAGGACCACCAATCATTTCCACAAACTTTTACAATTTGGAATTGCCTGG-----ACAATTTATGGTTGGTTTTGACCTGATGTTCCCCAAGAGTATCTATAAATAAGACATGTTTATTGAGC----------CATTGTAGTCTGGCGGTACATCATCCTTGAGGTTTTTGATGTAACAGCGGTGTCTGTTTGTCTACCACATCAAATTCCATTATAGAAGCCAATAGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	163774	287	+	647215	GACACAAGGTAGGATTTGCTTTTTCTTTATCATATAAGATTAATGTTTGGTCTAAGCAGATGACAACCAAGCATTTCCACCAACTTTTACAATTTGGGATGGCTTGGAGTCTACAATTTATGGCTAATCTCTCCCTGATTTTCTCCTAGAGTATCTATAAATAAGACATAATTATCAAGCTGCTGCACAGCATTGTAGTTTGGGGGTACATCATGTTTGAGGTGTTCAGTGTAGCAGCAGTGTCTGTTTGTCTACTGCAACAAATGCAATTATAGGAGCCAATAGTC

a
s	mr.mrrefChr5	29185	183	+	294542	ACAATTCATACCTTTAATATATTCATTAATCACCTTTAAGCCACTATAGTAGCAAGAAATAATTTCTGCTGCTCACAGGTCTATGTCCCCCCATGGGACTGGGTCCAGGGCATATCACCCACCATTGTCTTGAGGGACTAACCATATATAATGACATGGATAATTCAATTGTATGTCACAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	166515	181	+	636262	ACAATTCATACTTTTAATACATTCATTAATCACCCTTAAGCCACTATAGTAGCAAGAAGTAATTTCTGCTGCT--CAGGTCTATGTCCCCCCATGGGACTGGGTCCAGGGTATAGCACCCACCATTGTCTCGAGGGACTAACCATATATAATGACATGGATAATTCATTTGTATGTCACAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164061	183	+	647215	ACAATTCATACCTTTAATTTATTCATTAATCACCTTTAAGCCACTATAGCAGCAGGAAATAATTTCTGCTGCTCACAGGTCTATTTCCCCCCAGGGGACTGGGTCCAGTGCATATCACCCGCCATTGTCTTGAGGGATTAACCTTATATAACGTCATGGTTAATTCAATTGTGTGTCACAACA

a
s	mr.mrrefChr5	29368	15	+	294542	ATTTAAATTGTCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	166696	15	+	636262	ATTTAAAGTGTCCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164246	11	+	647215	ATTTACATTG-A---

a
s	mr.mrrefChr5	29383	23	+	294542	TACACTGAATGACATAGAATGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	166713	23	+	636262	TACACTGAATGACATAGAATGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164257	19	+	647215	----CTGAATGACATAGTATGTT

a
s	mr.mrrefChr5	29406	162	+	294542	CAACATGAAGTTTCTCCAATGTAGGAAGATGTAATTATGTGGGGTATAGGCACGATGTAAAACAATCAAGGAGTAAAACTCGGCCATGTGGATGGGAAATAAGGAGGGTATCTCTGATAGCAGACATAGCCTATTCTGTCATTCAGCACATAAAGGGGATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	166737	161	+	636262	CAACATGAAGTTTCTCCAATGTACGAAGATGTAATTATGTGGGGTATAGGCACGATGTAAAACCATCAAGGA-TAAAACTCGGCTGTGTGCATGGGATATAAGGAGGGTATCTCTGATTGCAGACATAGCCTATTCTGCCATTCAGCACATAAAGAGGATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164276	162	+	647215	CAACATGAAGTTTCTCCAATGTTGGAAGATGTAATTATGTGGGGTATAGGTATGATGTAAAACAATCAAGGAGTGAAACTAGGCCATGTGGATGGGAATTAAGGAGGGTATTTTTGATAGCAGACATAGCCTATTCTGTCCTTCAGCACATAAAGGGGATAA

a
s	mr.mrrefChr5	29568	208	+	294542	ATCCCCCTGCTAATTTTAGGACATGTTGGATACTTGCCAGACCCCTACAGACCCACTGGTCCCCTGTGTACACTTTTGCTATCTAACATGCAGTCTTAATGAGGACGTGAAAGCTAAAGCATATCTCACATGACAGTGTACTTGGTCTGGTTGAACAAATTGACCAGTTGTGCGCCATTGGAGTTCACCACCTACAAGATATACCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	166898	205	+	636262	ATCCCCCTGCTAGTTTTAGGACATGTTGGAAACTTGCCGGACCCCTACAGACCCACTGGTCCCCTGTGTACACTTTTGTCATCTAACATGCAGTCTTAATGAGGACGTGAAAGCTAAAGCATACCTCACATGACAGTGTACTTGGTCTGATTGAACAAATTGACCAGTTGTGCGTCATTGGAGTT---CACCTACATGATAGACCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164440	203	+	647215	ATCCCCCTGCCAATTTTAGGACATATTGGATACTTGCAAGACCCCTACAGACCTAATGGTCCTCTGTGTACACTCTTGCTATCTAACCCGCAGGCTTAAACAGGACATGAAAGCTAAGGCATATCCCACATGATAGTGTACTTGGTTTGGCTGAACAGATT-----GTCGTACCCCATTGGTGTTCACCACCTACAAGATATACCCCT

a
s	mr.mrrefChr5	29776	17	+	294542	TCACCATATCTTTTGTT
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a
s	mr.mrrefChr5	29793	27	+	294542	TAACTATCAATTCTGAATACATCCGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	167120	27	+	636262	TAACTATCAATTCTGAATACAGCCGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164664	27	+	647215	TAACTATCAATTCCAAATACATCCAAG

a
s	mr.mrrefChr5	29820	41	+	294542	TGCATAACAAATATGATTCTACAACCTCGACATCCAAGAAC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	164706	41	+	647215	TGCATAACAAATATGATTCTATAACCTCGACATCCAAGAAC

a
s	mr.mrrefChr5	29861	98	+	294542	AACACCAACATCATAATTCCTGAAGTGAACTCACATTCTCCAGGTGAACTCAGTCCATTGCCATATAAATGAATGTCAGGTGAAGATAGGATGGCACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	167188	98	+	636262	AACACCAACATCTTAATTCTTGAAGTGAACTCACATTCTCCAAGTGAACTCAGTCCATTGCCATATAAATGAATGTCAGGTGGAGATAGGATGACTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164749	96	+	647215	AACACCAACAGCATAAATCCTGAAGTGAACTCACACTCTCCAGTTAAACTCAGTCCATTGCCATATAGATGAATGTTA--TGAAGGTAGTAAGGCACC

a
s	mr.mrrefChr5	29959	24	+	294542	AAAACTAATATTTACACAGGCTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	167286	24	+	636262	AAAACTAATATTTACACAGGTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	164980	24	+	647215	AAAACTAATATTTATACAGGCTGG

a
s	mr.mrrefChr5	29983	163	+	294542	TCCCTTCCCCTACACAACCATGGGGTAACAACATGAAACACTTACCAACGGAACTCACAGGAGTTGAACTCTATCAAAGTGCACCTAAAAACACCTAAGAACAGGTCTGGTCTAGCTGCATAAGTGGGTTACAGAAGCCAACGTGGCGGCTTGCTTCTGTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	167310	163	+	636262	TCCCTTCCCCTATACAACCATGGGGTAACACCATGAAACACTTACCCACGGAACTCACAGGCATTGAACTCTATCAAAGTGCACCTAAAAACACCTAAGAACGGGTCTGGTCTAGCTGCATAAGTGGGTTACCGAAGCCAACGTGGTAGCTTGCTTCTGTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	165009	163	+	647215	TCCCTTCCTCTACACAACCATGGGGTGACAACATGAAACACTTACCAATGGAACTCACACGAGTTGAACTCTATCAAAGTGCACCTCAAAACACCTAAGAACAGGTCTGTACTAGCTGCATAAGTGGGATACAGAGGCCAACGTGGCGGCATGCCTCTGTACG

a
s	mr.mrrefChr5	30146	67	+	294542	TTTCTGGACCAAGAGTGCAGCAGTCACATCGCCACATGTGTTTATTTAAATCTACATACGGTGTAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	167473	67	+	636262	TTTCTGGACCAAGAGTGCAGCAGTCACATCACCACATGTGTTTATTTAAATCTACATACGGTGTAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	165179	67	+	647215	TTTCTGGACTAAGAGTGTAGCAGTCACATCGCCACATGTGTTTATTTAAATCTACATATGGCGTAGC

a
s	mr.mrrefChr5	30213	154	+	294542	GGCAAGTATGCCCTAGACATGGTTTGGATCGCATGATGTACATTTTTATTCTTTATACACGGCGTTTATACACAGCGTACGGTCATCCGAGTCACACGCCAGATAAAGGACGTTCTCTCGGTGGCATTTAGATGTTTGACAACATATGGAACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	167544	154	+	636262	AGTAAGTATGCCCTAGACATGGTTTGGATCGCATGATGTACATTTTTATTCTTTATACACGGCGTTTATACACAGCGTACGGTCATCCGAGTCACACGCCAGATAAAGGACGTTCTCTCAGTGGCATTTATATGTTTGACAACATATGGAACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	165246	154	+	647215	GGCAAGTATGCCCTAGACATATTTTGGATCGCACGATGTACAGTTTTATTCTTTATACACGGCGTGTATACACGGCGTACGGTCATCCCAGTCACACGCCAGATAAAGGACGTTCTCTCGGTCGTATTTAGATGTTTGACAACATATGGAACAT

a
s	mr.mrrefChr5	30367	13	+	294542	AAGGCTGGCTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	167698	13	+	636262	AAGGCTGGCTGCT
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a
s	mr.mrrefChr5	30380	68	+	294542	ATGGCATTTTCTCTGTGGAAAGTACAACATAATGATGTGGGCAGGAGTGCGTCGCTTCATTCTTTTTC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	165417	68	+	647215	ATGGCATTTTCTCTGTGGAAATTACAACATAATGATGTGGGCAGGAGTGCATCGCTTCATTCTTTTTC

a
s	mr.mrrefChr5	30448	261	+	294542	CTTTCACACACTGCCTCACTAGCCCTGGTAAAATTGTGTAAAACTTAAATTATACTCACTCCAAAAATGTCAAAGTTGTCAAGCTAGGGGTTCTAACATTCCAAAGGCATCCTCCCATGGCAAGTTGTATGTAAACTAGATAAGGCAGCATTTTAAAAACTATTCCTACCTTAAATTTTCATTCAAAGACCTACTCGTCCTCCCCTTTCCTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTGAGCCTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	167785	261	+	636262	CTTTCACACACTGCTTCACTAGCCCTGGTAAAATTGTGTAACACTTAGATTATACTCACTCCGAAAGTGTAAAAGTTGTCAAGCTAGGGGTTCTAACATTCCAAAGGCATCCTCGCACGGCAAGTTATATGTAAACTAGATAAGGCAGCATTTTAAAAACTATTCCTACCTTAAATTTTCATTTAAAGACCTATTTGTCCTCCCCTTTCCTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTGAGCCTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	165485	256	+	647215	CTTTCACACACTGCCTCACTACCCCTTGTCAAATTGTGTAAACCTTAAATTATACTCACTCCAAAAATGTCAAAGTTGTTAAGCTAGGGGTTCTAACATGCCAA----ATCCTCCCATGGCAAGTTGTATGTAAACTAGATTGGGCAGTGTTTTAAAAACCATACCTACCTTAAATTTACATCCAAAGACCTACACGTCCTCCCCTTT-CTTTTGGGGGCAGTAATTGTACAGCCAGTTTCAGGAAAAGTTGTAAGCCTGT

a
s	mr.mrrefChr5	30709	64	+	294542	GTCCTAGGGCAAGATGTATTATGAGTACTAAGTACTGACAGGATATAGGGAATAAGGAACACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	168046	64	+	636262	GTCCTAGGGCAAGATGTATTATGAGTACTAAGTACTGACAGGATATAGGGAATAAGGAACACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	165742	64	+	647215	GTCCTAGGGCAATATGTATTATGGGTACTGAGCACTGATAGGATATTGTGTATAAAGAACATAC

a
s	mr.mrrefChr5	30773	13	+	294542	TTGTTAATTACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	168111	13	+	636262	TTGTTAATTACTA
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a
s	mr.mrrefChr5	30786	18	+	294542	CCTGCCAACTCATCATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	168124	18	+	636262	CCTGCCAACTCATCATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	165822	18	+	647215	CCTGTCAACTCACCATTA

a
s	mr.mrrefChr5	30804	75	+	294542	TGTTATTGTATGTAATGTACCAAACGATAGGCTATCTATTCAAAGCAACCTAGCATAAAGTTGAGGGTGGACCGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	168142	75	+	636262	TGTTATTGTATGTAATGTACCAAACGATAGGCTATCTATTCAAAGCAACCTAGCATAAAGTTGAGGGTGGACCGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	165909	75	+	647215	CGTAATTGTATGTATTGTACCAAATGATGGGCTATCTGTTCCAAGCAACCTAATATAAAGTTAAGGGCAAACCTA

a
s	mr.mrrefChr5	30879	82	+	294542	AAACTTCCAGTCTAGCTATGCTGCACTGGCACATAAGCCACCTCTGCTGTACTGGATTACATCCCCTTACATGTCCTGGAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	168217	82	+	636262	AAACTTCCAGTCTAGCTATGCTGCACTGGCACATAAGCCACCTCTGCTGTACTGGATTACATCCCCTTACATGTCCTGGAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	165985	82	+	647215	AAACTTCCAGTCTAGCTGCACTGCACTGGCATGTAAGCTAACTACGCTGTGCTGCTTAACATCCCCTTACATGTTTTGAAAA

a
s	mr.mrrefChr5	30961	38	+	294542	ACCTGATTTTCCTTTTAAACTCAAGAAGTTTGGTGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	168300	38	+	636262	ACCTGATTTTCCTTTTAAACTCAAGAAGTTTGGTGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	166067	38	+	647215	ACCTGGTTTTCCTTTTAAACTCAAGGAGTTTGGTGCCA

a
s	mr.mrrefChr5	30999	135	+	294542	AGCTTGCTACAGAGCGCACCACATGGAGACTTATGAGAATATTTACAGCTTGAGCAGATATTAAATAGTAGCCTCTGGTATCATTGCCAGTATTGGATAATGACTCTGTCACACAAAATGATGACTCCAGATTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	168339	135	+	636262	AGCTTGCTACAGAGCGCACCACATGGAGACTTATGAGAATATTTACAGCTTGCACTGATATTAAATAGTGGCCTCTGGTACCATTGCCAGTATTGGATAATGACTCTGTCACACAGAATGATGACTCCAGGTTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	166105	93	+	647215	------------------------------------------TTACAACTTGAGCAGACATTAAATAATAGCCTCTGGTATCATTGCCAGTATTGGATTATGACTCTGTTACACAAAATGATGACTCCAGAGTAG

a
s	mr.mrrefChr5	31134	146	+	294542	AAGTGTAGCCCAAGAGACAGATGTTGCCTTGGAACACTACAAAAGCCAGAGTCATTCCTTCTATTGGATTGGGGAAGATTGAGGAATCTTAGGAGTACCAAGGGCTGAGCATACATATTCATCTGGAAAAGAAAGTTAGGTGGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	168474	146	+	636262	AATTGTAGCCCAAGAGACAGATGTTGCCTTGAAACACTACAAAAGCCAGAGTCATTCCTTCTATTGGATTGGGGAAGATTGAGGAATCTTAGGAGTACCAAGGGCTAGGCATACAAATTCATCTGGAAAAGAGAGTTAGGTGGTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	166200	146	+	647215	AAGGGTTGCACAGGGGCCAGATGTTGTGTAGGCGGTCTATGAAGGGCAGAGTCACTCCTTCTATTGGATTGAGGAAGATCAAGGATTCTTAGGAGTACGAATGGCTGATCATACATATTCATCTGCAAAAGAAAGTTAGGTGGTAT

a
s	mr.mrrefChr5	31280	143	+	294542	GGTAAAGTCAGGTGAAATGCTGATAGATCCCTTCAGTGTGGTGCTCTTGTTCTACTAACTGACAATGTAGCTCCAAGGGTAACTGAGACGGGGTTAGCCAATAGGGGAAGCCCACAAGTGGCCCTCACAGACAAATATCCTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	168621	143	+	636262	GGTAAAGTCCGGTGAAATGCCAATAGATCCCTTCAGTGTGGTGCTCTTGCTCTACCAACTGGCCATGTAGCTCCAAGGGTAACTGAGACGGGGTTAGCCAATAGGGGAAGCCCACAAGTGGCCCTCACAGACAAATATCCTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	166346	114	+	647215	GGTGAAGCCAGGTGAAAAGCTGATAGATCCCTTCGGATT--TGCTCTTGTGCTAGTAACTGAGAATGTAGCTGC---------------------------TAGGGGAAGCCCTCAAATGGCTCTCACAGGAAAACATCCTCT

a
s	mr.mrrefChr5	31423	32	+	294542	GGGGAGGTCTAGAACTTCAGCAGGCACCGGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	168784	32	+	636262	GTGGAGGTCTAGAACTTCAGCAGGCACCGGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	166460	32	+	647215	GGGGAGGTCTAGAATTTTAGCAGGCACTGGCC

a
s	mr.mrrefChr5	31455	47	+	294542	CATTAAGTGTCAAGCTTATTAGCTAGTTTTGACCAACTTGATAATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	168819	47	+	636262	CATTAAGTGTCAAGCTTATTAGCTAGTTTTGACCAACTCGGCAATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	166492	47	+	647215	CATTAAGTACCAAGCCTATTAGTTAGTTTTGATCAACTTGATAATTA

a
s	mr.mrrefChr5	31502	227	+	294542	TATCTTGGTAATTATCTCAAGCTAATTAGATAACAGGATTTAAAATCAGTTCAATGTTATGGTGGTGAACTGGAGGCCACCATTCAAGGTTCTTAAATTCATACTTGTTTTATTACTTCTTGTGGCAGCTCACATATTGCCTCAAAGACATTCTTTCACATAAAAATTAGAACTTCATCATCCTGTCCCCCCCGAGTAGAGATATGTACAATAAGTGGCGATGCACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	168874	227	+	636262	TATCTTGGTAATTATCTCAAGCTAATTAGATAACAGGATTTAAAATCAGTTCAATGTTATAGTGGTGAACTGGAGGCCACCATTCAAGGTTCTTAAATTCATACTTGTTTTATTACTTCTTGTGGCAGCTCACATATTGCCTCAAAGATATTCTTTCACATAAAAATTAGAACTTCATCATTCTGACAGCCCCGAGTAGAAATATGAACAATGAGTGGCGATGCACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	166539	224	+	647215	TAACTTGGTAATTATCTCAAGCTAATTAAATACCAGCATTTAAATTCAGTTCAGCGTTATGGTGGTGAACTGGAGGCCACCTTTCTAGGTTCTTA---TCATATTTGTTTTATTACTTCTTATGGTATATCACATATTGTCTCAAAGACATTCTTTCATATAAAGATTAGAACTTCATCATCCTGTCCCCTCCGAGTGGAGGTCCGTACAATAAGTGGAGATGCACC

a
s	mr.mrrefChr5	31729	19	+	294542	AAAGATTTCCAGGTGGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	169101	19	+	636262	AGAGATTTCCAGGTGGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	166764	19	+	647215	AAAGATTTCCAGGTGGACT

a
s	mr.mrrefChr5	31748	306	+	294542	AGTTACAATATTCCTGTTGACCCATTACTAACCCCCAAGAGTGCTGCCAGTCATTGAAATTTCCATTCTTTTCATTGACATATGTGCAATTGTCACCACTTCCTTGATCCTTTTAAGTCTGCAGTTTAAGAGAGACTAGGTGCAAAGATGCTACTTATTATAGGTAATGCTGAGTTAGTGGTGAGTTCATTTGATAGTGGCTATCTTGACAAAGCAATATTAATCATTCTTTGTAACTAGGTGGCTATGCTAAATAATCCTCATTATATTATTATAGGTTGAGTTACCCTTTTGAGCAGTCTCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	169121	306	+	636262	AGTTACAATATTCCTGTTGACCCATTACTAACCCCCAAAAGTGCTTCCAGTCATTGCAATTTCCATTCTTTTCATTGACATATGTGCAATTGTCACCACTTCCCTGATCCTTTTAAGTCTGCAGTTTAAGAGAGACTAGGTGCAAAGATGCTACTTATCACAGGTAATGCTGAGTTAGTGGTGAGTTCATTTGATAGTGGCTATCTTGACAAAGCAATATTAATCCTTCTTTGTAACTAGGTTGCCATGCTAAATAATTCTCATTATATTATTATAGATTGAGTTACCCTTTTGAGCAGTCTCCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	166783	305	+	647215	AGTTACAATATTCCTGTTGGCCCATTGCTAACCCCCAAGAGTTTTGCCAGTCATTGAGATTTCCATTCTTTTCATTGACATATATGCAAATGTAGCCACTTCCTTGATCCTTTTAAGACTGCAGTTTAATGGAGACTAGGAGAAAAGCTGCTACTTATTATAGGTAATGCCAAGTTATTCGTGAGTTCATCTTATAGTGGATATCTCAACAAAGCAATACTTATCATT-TTTGCAACTAGGTGGATATGCTAAATAATCCTCATCATATTATTATAGGTTGAGTTACCCTTTTGAGCATTCTCACA

a
s	mr.mrrefChr5	32054	137	+	294542	AGCTTATATATATGGCCTATTAACCAATGTTAATAGTGTATCATAATACGTATATATTATGAGGTTATTTCTATAAATCTATAGGTACAACTAGAGAACTACCTACAAAGTCAGTACTCAAATATTGTGTCAAAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	169427	133	+	636262	AGCTTATATATATGGCCTATTAACAAATGTTAATAGTGTATCATA----GTATATATTATGAGGTTATTTCTATAAATCTATAGGTACAACTAGAAAACTACCTACAAAGTCAATACTTAAATGTTGTGCCAAAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	167095	136	+	647215	AGCTTATATATATGACCTAGTAACCAATGTTGGTAATGTATCATAATACGTACATATTATGAGTTTTTGTCTATAAATCAAT-GGTACAACTACAGAACTACCCACAAAGTCAGTACTCAAATATTGTGTCTAAGTA

a
s	mr.mrrefChr5	32191	140	+	294542	AAGTACATAGAGCTTTAAATATCAGAAGTACAACATCAGGCTAGAAGTACTACACTTAGTTGAAAACTGACAGATAAGTCATACTGTATGCTGGTATAGTGCATTTTCGGCCATGCTGGGAAATTAGAGGTCATGGCCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	169560	140	+	636262	AAGTACATAGAGCTTTAAATATCAGAAGTACAACATCAGGCTGGGAGTACTACACTTAGTTGAAAACTAACGGATAAGTCATACTGTATGCTGGTATAGTGCATTTTCGGCCATGCCAGGAATTTAGAGGTCATGGCCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	167235	140	+	647215	AAGTACATAGAGCTTTAAATATCAGAAGTACAACATCAGGCTAGAAGTACTACACTTAATTGAAAACTGACAGATAAGTCATACTGTATGCTTGTATAGTGCATCGTCTGCCATGCTGGAAAATTGGAGGTCATGGCCCG

a
s	mr.mrrefChr5	32331	15	+	294542	CTCTTTCTTTTGTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	169700	15	+	636262	CTTTTTCTTTTGTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	167379	15	+	647215	CTCTTTCTTTTGTAG

a
s	mr.mrrefChr5	32346	198	+	294542	CATCTTGGGAAAAACAACAACTGCCAAGGGGGGGTAAATTATGAATCCCTTGAGCACCATACATAACCATCCAACCATTCCAGTTATTAGGTATCAACTTTGCCTTTGCTCATCTTGTATTCCTCTTGAACACTTTTACACCATCCTGACAGCCTTTGAATTTAACAGACAGGCAATCTAGACAGCCTCTTAACCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	169715	198	+	636262	CATCTTGGGAAAAACAACAACTGCCAAGGGGGGGTAAATTATAAATCCCTTGAGCACCATACATAACCATCCCACCATTCCGGCTATTAGATATCAACTTTGCCTTTTCTCATCTTGTATTCCTCTTGAACACTTTTACACCATCCTGACAGCCTTTGAATTTAACAGACAGGCATTCTAGACAGCCTTTCGATCAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	167396	197	+	647215	CATCCTGGGAAGAACAACAACTGCCAAGGGGGGCTGGATTATGAATCCCTTGAGCATCATAAATGACCATCCAAGCATTCCAGTGATTAGGTATCAACATTGTGCTCGCTCTTCTTGTATTCATCCTGAACACTTTTACACCATCCTGATCACCTTTGAATTGAA-AGACAGCCAATCTGGACAGACTCTTAACCAGG

a
s	mr.mrrefChr5	32544	23	+	294542	ATGGAAACAATTTAAAGCAAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	169913	23	+	636262	ATGGAAACAATTTAAAGCAAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	167601	23	+	647215	ATGGAAACAACTTAAAGCAAATA

a
s	mr.mrrefChr5	32567	86	+	294542	GATAGTTTGCTGTTGAGAGCTTTGACACCACAGAGCAAGAGGAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAGCCATTAGGGCAAGCTTAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	169936	86	+	636262	GATGGTTTGCTGTTGAGAGCTTTGACACCACAGAGCAAGAGGAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAACCATTAGGGCAAGCTTAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	167628	67	+	647215	GATAGTTTTCTGTTGAAAGCTTTAACATCAGAAAGCAAGACAAAATTAAGCTGTTTAGAACTTTAGC-------------------

a
s	mr.mrrefChr5	32653	97	+	294542	GGCAAGCTTAAAGGAATAGAGGCCCAAGAATGCAGTTAGTAAGTTGAGTAAAGCAAGGAAGCAAGATATAGGTCCAAGTGAAAATTTATCTATCGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	170026	97	+	636262	GGCAAGCTTAAAGGAATAGAGGCTCAAGAATGCAGTTAGTAAGTTGAGTCAAGCACGGAAACAAGATATAGGTCCAAATGAAAATTTATCTATCGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	167695	97	+	647215	ACCAAGCTTAAAGCAATAGAGGTCCAAGAATGCAGTTAGTAAGTTGAGTAAAGGAAGGAAGCAAAATTTAGGTCCAAGTGAAAATTTATCTAGTGAG

a
s	mr.mrrefChr5	32750	50	+	294542	TGATTACTAACCAGGGGAGATGTGAGAATCACTTCATATTATTGGACAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	170123	50	+	636262	TGATTACTAACCAGGGGAGATGTGAGCATAGCTTCATATCATAGGACAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	167793	48	+	647215	TGA--ACCAACCAGGGGAGATGTGAGAATCACTTGGCATTATTGGACAGC

a
s	mr.mrrefChr5	32800	8	+	294542	TTGGGTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	170177	8	+	636262	CCGGGTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	167841	8	+	647215	TTGAGTTA

a
s	mr.mrrefChr5	32808	212	+	294542	CCACTTCATATTATGTGTCTGTATCTTTGATTTGCAAGAATAGTGTTTCCTAAGAGTGGCTGCCTTCTGAGAGCCCTCCTCAAATGGATGTTATACAGCAAGAGTGCATGAGTTGAAAACATTGTGCATCCTGAAGAGAAAAAGAATGGGATTATGGAAATTAAACTGTCAAATTGCAGTGTAGACATAGAAACTACTGCAAATCTTCAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	170185	209	+	636262	CCACTTCATATTATGTGTCTGTATCTTTGATTTGCAAGAATAGTGTTTCCTAAGAGTGGCTGCCTTCTAAGAGCCCTCCTCAAATGGATGTTATCCAGCAAGAGCGAACGAATTGAGAACATTGTGCATCCTGAAGAGAAACAGAA---GATTATGGAAATTAAACTGTCAAATAGCAGTGTAGACACAGAAACTACTGCTAATCTTCAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	167854	212	+	647215	CCACTACATATTATGTGTCTGTACCTTTGATTTGCAAGAATAGCGTTTTCTAAGAATGGTTGCCTTCTGAGAGCCCTCCTGAAATGGATGTTATACAGAAAGACTGCATGAGTCGAAAACATTGTGCATCCCGAGTAGAAAAGGAATGGGATTATGGAAATTAAACAATCAAATTGTAGTGTAGACATAGAAACTGCTGCAAACCTTCAGAT

a
s	mr.mrrefChr5	33020	125	+	294542	CTGATGTGGTCCACTAATCAATACACCTACAATCTACTTCTCTAACTAATCCGGCCCCTTGCAGTGCACAAATACAAATTACTGCAATCTTAGATGAACCACTGGCTGTAGTCCACTAATTAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	170394	125	+	636262	CTGATGTGGTCCACTAATCAATACACCTACAATCTACTTCTCTAACTAATCCGGCCCCTTGCAGTGCACAAATACAAATTACTGCAATCTTAGATGAACCACTGGCTACAGTCCACTGATTAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	168072	125	+	647215	CTGATGTTTTCCACTAATCGATACACCTACAACCAATTTCTCTAATTAATCTGGCCCCTTGCAGTACACAAATACAAACTACTGCAATTTCAGATGAACCACTGGCTGTAGTCCACTAATTAATG

a
s	mr.mrrefChr5	33145	8	+	294542	TGTCTACG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	170519	8	+	636262	TGTCTACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	168198	8	+	647215	TATCTACG

a
s	mr.mrrefChr5	33153	108	+	294542	AGTTCTCTAATTGATCCTGCCTTAAAGAAGAAAAAGCACAGCCAATAGTAACAACCCCTAGTGATAACCATCACAAAATTTGGAGATGGAGTGCCCCCTTCTTGCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	170531	108	+	636262	AATTCTCTAATTGATCCTGCTTTAAAGAAGAAAAAGCACGGCTAATAGTAACATCTCCTAGTGAGAACCACCACAAAGTTTGGGGATTGAGTGCCCCCTTCTTGCATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	168206	108	+	647215	TGTTTCCTAATTGATCCTGCCTTAAAGAAGAAAAAGAACAGCCAATAGTAACAACCCCTAGTGATAACCATCACAAAATTTGGAGATGGTGTGCCCCCTTCTTGGATG

a
s	mr.mrrefChr5	33261	130	+	294542	GAGCCCCCTTCTTGCATGTAAGCACTACATCTAGTCATGCGGGCCCCGTCAGTTTGGGATGTGTCATGTCCAGCCATAGGCGATAAGGCCAAGTCTATAGAGCTGAGTTTGATGACTTGGCTGCTTGGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	170640	130	+	636262	GAGCCCCCTTCTTGCATGTAAGCACTACATCTAGTTATGCGGGCCCCATCAGTTTGGGATGTGTCATGTCCAGCCATAGGCGATAAGGCCAAGTCTACAGAGCTGAGTTTGATGACTTGGCTGCTTGGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	168314	130	+	647215	GTACCCCCTCCTTGCATGTAAGCACTACATCTAGTCCTGCTGGCCCTGTCAGTTTGGGGTGTGTCATGTCCAGCCATAGGTGATAAGGCCAAGTCCATAGAACTGAGTTTGATGACTTGGCTGCTTGGTT

a
s	mr.mrrefChr5	33391	76	+	294542	ACTATCATGAGTGTACTGATGGGTCTAGACAATTTGCATGTCTCATAATGGATTGCTTACACCTAAATGTTGAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	170771	76	+	636262	ACTATTACAAGTGTACTGATGGGCTTAGACAATTTGCGTGTCTCATAATGGATTGCTTACACCTAAATGTTGAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	168444	69	+	647215	GCTATCATGGGTGTACCGATGGGTCTCGACAATTGGCATGTCTCATAATG-------TACACCTAAATGTTGAATT

a
s	mr.mrrefChr5	33467	564	+	294542	TGACAGAGATGCAATACGCTAGAGCAGCAGTAAAAAACATACAGTCTTCGACATCTATGTGACTTCAACCAGTGATATCCCTATCCCGAAATCCCATTGGAACTAGGAGGGCTGACTGATTGTTCTTGTTCTATTGAATGCTCTCACTCTACAACTGTAATGATAGCTAGGTACAGTACTGGGGTCAGTGCTGTGAGAGTGTGAGCGCAGTGCCTCACCTTCCTGTTTCTGACTGAACTACTTAACCTAAAATAATGCCACAACTAGCTTTGCAAAACAAGTCAGTATCTCAAATATCCTAATAGACACAAAAGAAACAGCCATTAGCATTCCATATGTCCAACCAGCAATGTGCTCCATGAGAGGGAGTTTTTAAACTAAGTCATCTCCTTTACATCCATCCTCTATTTATCTAGTGGAATCCACTAGTAACTATTCTTCCCTTCAGGAGTAACAGTATCTTATGGATTCAGAGTCATAAAGTTATTTTATATAAGTCACCCCCATTAGGCAGAAATATGTCCAGTTATTTGCAGGAAAGGTCTGAATAAGATACTAAATGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	170847	554	+	636262	TGACAGAGATGCAATACGCTAGAGCAGCAGTAAAAAACATATAGTCTTCGATATCTATGTGACTTCAATCAGTGATATCCCTATCCCAAAATCCCATTGGAACTAGGAGGGCTGACTGATTGTTCTTGTTCTA--GAATGCTCTCACTCCACAACTGTAATGAGAGAAAGGTACAGTACTGGGGTCAGTGCTGTGAGAGTGTGAGCG--------CACCTTCCTGTTTCTCACTGAATTACTTAACCTACAATAATGCCACAACTACCTTCGCAAAACAAGTCAGTATCTCAAATAACCTAATAGACACAAAAGAAACAGCTATTAGCATTCCATATGTCCAACCAGCAATGTGCTCCATGAGAGGGAGTTTTTAAACTAAGTCATCTCCTTTACATCCATCCTCTATTTATCTAGTGGAATCCACTAGTAACTATTCTTCCCTTCAGGAGTAACATTATCTTATGGATTCAGAGTCATAAAGTTATTTTATATAAGTCACCCCCATTAGTCAGAAATATGTCCGGTTGTTTGTAAGAAAGGTCTGAATAAGATAGTAAATCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	168514	544	+	647215	CGACAGAGATGCGATACGCTAGAGCAGCAGTAAAAAATGGACAGTCTTTGACATCTATGTGATTTCAACAAGCAATATCCCTATCCTGAAATCCCATTGGAACTGGGAGGACTGATTCATTGTTCTTGTTCTATTGA---CTATCCCTCTGCAATTGTAAGGATAACTAGGTACAGTACTGGGGTCAGTGCTGTGGGAGTGTATGTGCAGTGCCTCACATTCCTGTTTCTGACTGAACTACTTAACCTAAAATAATGGA------TGCTTTGCAAAACACCTCAGTATCTCAAAAATCCTAATAGACACAAAAGAAAAAGCCATTACCAGTCCATATGTCCAAGCAGCAGTGTGCT----------GAGTTTTTGAACGAAGTCATCTCCTTTACATTCATCCTCTATTTATCTAGTGGGATCCA-GAGTAACTATTCTTCCTTTCAGGAGTAACGGTATGGTATGAATTCAGAGTCATAAAGTTATTTTGTATAAGTCACCCCCATTAGGTAGAAATATGTCCAGTTATTCGCAGGAAAAGTCTGAATAAGATACTAAATGTG

a
s	mr.mrrefChr5	34031	229	+	294542	CCTACAGTGCCATGTTGCGTAGTTCAAATAAGTCAGGAAAAAGCAGAGTTGTGGTTCGATGCAGACATGGGTATTACGGTGCATTTAATCTTCCCTCATTTTGAGACTAATAAGGTTAAGAGTGAAAGGTAAACCAGACAAATAACTCAGAATGGAAGGCAAATTTACATCCTAGCTTAGCCATAATACTTACAAAGTGGAAAGTTTAACGTCAAATTATGCATTTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	171415	223	+	636262	CCTACAGTGCCATGTTGCGTAGTTCAAATAAGTCAGGAAAAAGCAGAGTTGTGGTTCCATGCAAACATGGTTATTACAGTGCATTTAATCTTCCG------TGAGACTAATAAGGTTAAGAGTGAAAGGTAAACCAGACTAATAACTCAGAATGGAAGGCAAGTTTACATCCTAGCTCAGCAGTAATACTTAAAAAGTGGAAAGTTTAACGTCAAATTATGCATTTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	169058	172	+	647215	-------------------------------------------------------TCGTTGCCGATATGGGTATTACGGTGCATTTAATCTTCCCTCATTTTGAGATTAACAAGATTAAGAGTAACAAGTAAATCAGACAAATA--TTAGAATGGAAGGCAAATTTACTTCCTAGCTTAGCCATAATACTTACAAAGTGAAAAGTTTAAATGCAAATTATGCATCTGAA

a
s	mr.mrrefChr5	34260	74	+	294542	TGTCGACTGAGGAGATCCGAGTGGCCAATGGATGTGGAGACAGTTTTTTAGTGCCCACCTGTTTTCATAAGTAA
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	182843	196	+	636262	ctcttcagcaagtctaactacaatgcatatttggtttatggtaccaattcactcagttgggatgctaatgataggttgctacagaatattggtaacactacttcatcttactgcaatggcccaaggacctgaggttctggtgcaagtagagacgagagtgttattttggttgagacaaaacttataacctggtgta
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a
s	mr.mrrefChr5	38228	31	+	294542	ccaccagcttgatttgtctgacttatgggct
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a
s	mr.mrrefChr5	38259	57	+	294542	ctctttggtggtcttacacaaacttgacaattgtttttttgcactctgtaaccagag
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	38411	34	+	294542	gaaaacattgagcctatagacccatgaacgacta
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a
s	mr.mrrefChr5	38445	54	+	294542	aacatatataaagtcatatatcttgatcgtatgcacttgatgccttgggtaaac
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	38521	85	+	294542	caatggtcagaggttactacactaggctctcgattgggctTGCCTGGGTGAAAGACTAAAGGAGACCTCAGAACTTGTGCTTTGA
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	38756	59	+	294542	CTTCCACTGCTCCAAAATCCATGCTATGATAACTATCTTCTTAGCTTGGAAAACTACAT
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	38861	138	+	294542	ATCATGTACTAACTTCAAAGTACTGAGTGGTCCCCAGAAGGGTCTATGTTCCTTCTACTAAGAGCTCTTGTAATAAGTAGTGTATCCATAGTGGTAAGGGAATGTATTACATTCCAGTCCTTCCGGCATTTTGAAAAC
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	39245	19	+	294542	CCCCTGAATCTCAGAAGCA
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	39275	76	+	294542	CTGTGTATCTCAATGACACAAGAGTGTTGGCTCACCAACAGGCTTCCTGCCTGCAGGACTCCCTGTAATGGTCCAC
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a
s	mr.mrrefChr5	39351	6	+	294542	AGCTTA
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a
s	mr.mrrefChr5	39357	21	+	294542	AATATATATTGGTGTATGACT
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a
s	mr.mrrefChr5	39378	52	+	294542	TAGGCCCAAGGCATGAGCAATACAGAAGAATTGTTTTATCACTTTGGACCTG
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	40501	68	+	294542	CCTCCGGATCTTGGTTGATTCATTTCCCTCTTGTGCAATGTAGGTCTCTCACAATCACCGCCAGTCCC
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	40787	12	+	294542	TGCTATTGGTGC
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	41265	344	+	294542	AGCCAGAGGATAATCTACAAGCTGAGCAAAAACAAAAACAGAATTCAAGATAGTACATTTTCCAGTAAAAGGCTTAGATGGACTGACAGGCTCAATTAGATATAATCTTCAAGAGTGTGCATCCTGAATCACTAAGATTTATAAGGAGAATATAGGTAACAACTCACAGGTACATGGTTAGCCTTACACGTGGTTAACAATTTAGTGATGTTGATACTGTTGATGTGACCAACAGGATAAGTTTACTTGTATAGGGAGGTGTAAAAGAGGCCTTTTATAGGAAACAACTATGCAAACCATGATCCCTAGTGACTATGTTAATAGTGACAACCAAAATGATAAAG
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	41996	78	+	294542	GTAGCTTTAACTGGTGCTAAAAATGGTTACAGTATAAGCTAGCTGTCCAACCTTGTATTCACCTACATTTCCAGATAC
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a
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	187006	202	+	636262	ACTCTCCAAATTTATCAAATTCTATGTGGGGAACGAGGTAACTTTGAATTGTAAATTTTTGGTAGCGAGTCTCTTGATTGGTACAACTTCCCTGTTCATGTGATGCGGCAGAAAATAAATGGGGCCAGCACAATCTTTCAGTGTTTATGTAACATACCATTTCCATGGTCTAATAGCTTATATTCAATGATTCAGACCCCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	177360	199	+	647215	GCTCTCCAAA-TTTTCAAATGCTATGTGTGGAACAAGGTAAATTTGAATTGTAAATATACAATGGAAAGTCTTTTGTTTGGTACAACTTCCCTGTTCATGTGATGCGTCAGAAAGTAAGTGGGGTCAGCACAATCTTTCA--GTTTATGTAACATACTGTTTTCAAGTTCTAATAGCTTATAATCAGTAATTCAGACCCCCA

a
s	mr.mrrefChr5	42290	16	+	294542	ATAATTACCAGCAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	187208	16	+	636262	ATGATTACCAGCAGTA
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a
s	mr.mrrefChr5	42306	61	+	294542	AGAAAGCCAGGCATCGTGGTTAGTCATCAAACCAACACAGGTCAGTGGGGAAGTTGGCAGC
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a
s	mr.mrrefChr5	42367	131	+	294542	GTTACATGTAATGGTACCATAACTTGCCATTTACCCTGTGATTTATTGTGAGAACTCGTGCTTCTAAAGAAAGCCAGGTACTATCAAATTGGTCACCTGATATAGAGCTGTACAACATTTTGAACGTCATG
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a
s	mr.mrrefChr5	42498	101	+	294542	ATAAGTATGTTAGTTTACTACATCTGGATAATGACGCTAAGGGTGAGACTTAATGATTGAAATGCAATTTTAGAGTCAACTAGATGGGAAATAACCCATGG
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a
s	mr.mrrefChr5	42599	90	+	294542	CCCTAATCATAAAAAGTTTGTGCTTTATAAATGATTTGCAACACACAATAGTTGTAAGGCTGTAAAGAATTACCCTGGTAGAATCAAGGC
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a
s	mr.mrrefChr5	42689	72	+	294542	TGGGACAAAGTGCAACTTAGCACAGACCTTCACTGCTGTTTATAGTGAGGAGAAGATAGTAATATACTAAAG
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a
s	mr.mrrefChr5	42761	82	+	294542	TTAATGTTGAGTTCAGTGTATAAATCTTTTAGTGTGTGAACTTATGACAACAGTTGTAACTAATGAATGTTAGTACTAATAT
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a
s	mr.mrrefChr5	42843	127	+	294542	TAGTAGCAGAGCTTCAGGGGACAGGGGAAAAGCCATTGCAGGTGGCACAGTCAATCTACCTACAGGTCTTTCTATATGTTTACCCTGATAATTCAACTCAATGATAATCTCTCTATATTCTTGTTTG
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a
s	mr.mrrefChr5	42970	239	+	294542	TGTTTGAAAATCATACTGGGCATTAAACCCCTTCATCTGATTTGGTTAACAATCACCAATCTCAAACAACTTTGCCTGTTGAACAGATAAATTCCAAGCAAAAATCTGAGGGTGATCATTAAATGATCTTACTTAGTATGCTAACTCTCATGGGACTGCACTCTTTCAGGATTAACTAGTCCCTATATTATGAAAAAATCTGGCTTATAACTGATTTTTATCCACTCAGAAGCAGAGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	187906	238	+	636262	TGTTTGAAAATCATACTGGGCATTAAACCTCTTCATCTGATTT-GTTAACAATCACCAATCTCAAACAGTTTTGCCTGTTGCACAGATAAATTCCAAGCAAAAATCTGGAGGTGATCATTAGATGATCTTACTTAGCATGCTAACTCTCATGGGACTGCACTCTTTCAGGATTAACTAGTCCCTATATTATGAAAAAATCTGGCTTATAACTGATTTTTATCCACTCAGAAGCAGAGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	178269	234	+	647215	-----GAAAATTAAACCGGGCATTAAACCCCTTAATCTGATTTGGTTAACCATCACCAATCTCAAACAACTTTGCCTGTTGAACAGGTATATTCCAAACAAAAATCTGAGGGTGATCATTAAATGATCTTACTTAGTATGCTCATTCTCATTGGACTGCATTCTCTTCGGATTAACTTGTCCCTATATTATGACAAAATCTGGCTTATAACTGATGTTTATCCAGTCAGAAGCCAAGTG

a
s	mr.mrrefChr5	43209	58	+	294542	TTGTAACCTAGTAAGATTGACATTGTCATTGTTGACATACCAGAAATTAGGGGCAACT
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a
s	mr.mrrefChr5	43267	281	+	294542	TGCAAAGTACATGGGTGCACATGGCTGCGTTTGCCTTTTTTTGGAGCTCTCCATGAGGCACTGTGCAAAATCTAAACAGTGCTAAGACCATGGGCCCTAAAAATTCTGGAGAAAATGAACTGTCATTTCTCCTCTTGCTGGGGGGTCCATTAGGTGCTGCTTGACGTATGTCAATAAATTTTTTGGTTACTCACAATGTCCATTTTTAAGTTGCACTTCATCATCTTCCATAACAACCAACACCAGTGTTACTGATCAGTTTGCCTGGGAGCTTAGTCCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	188202	279	+	636262	TGCAAAGTACATGGGTGCACATGGCTGCGTTTGCCTTTTTTTGGAGCTCTCCATGAGGCACTGTGCAAAATCTAAACAGTGCTAAGACCATGGGCCCTAAAAATTCTGGTGGAAATGTACTTTCATTTCTCCTCTTGCTGGGGGGTCCATTAGG-GCTGCTTGATGTCTGTCAATAACCTTTTTGGTTCCTCACAGAGTCCATTTTTAAATTGCACTTCATCATCTTCCATA-TAACCAACACCAGCGTTACTGGTCAGTTCGCCTGGGAGCTTAGTCCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	178565	281	+	647215	TGCAAAGTACATGGGTGAATGTGGCCGCATTTGCCTTTTATTGTAGCTTTGCATGAGGCACTGTGCAAAATCTAGTCAATGCTATGACCACGGTCCCTGAAAATTCTGGAGAAAATGAACTGTCATTTCTACTCTTGCTGAGGGGTCCATTAGGTGTTGCTTGACGTATGTCAAGGAATTTTTTGGTTACTCACAATGTCCATTTTTAAGTTGCACTTCATCATTTTCCATAACAACCAACAGCAGTTATACTGACCAGTTTACCCAGGAGCTTAGTCCAC

a
s	mr.mrrefChr5	43548	190	+	294542	AAGGAACTCCTTCTCCTCCACCTAAGTGATCCTTAAGTGCAACTACAAATTAACTGTTCTTAAAGTGCTGAGACTACACACTAGTGCAGTGCACTGCATGGTTTAGTTAGTGGCTACACTGATAACAATTAACTTCAATAAAAATTACCTTCTCACTCACAGTCTACTTTCCCTGATGCCTCCAAGATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	188527	189	+	636262	AAGGAACTCCTT-TCCTTCACACAAGTGACCCTTAAGTGCAACTACAAATTAACTGTTCTTAAAGTGGTGAGACTACACACTAGTGCAGTGCACTGCATGGTTTAGTTAGTGGCTACACTGATAACAATTAACTTCAATAAAAATTATGTTCTCACTCACAGTCTACTTTCCCTGATGCCTCCAAGATAC
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a
s	mr.mrrefChr5	43738	372	+	294542	TTCTTCACTCACATCCTTAACATCCTTATCTGGACCATGGTCCACGTCTTTCAATGGATTTTGAGCATCATATTTACTATCCTTCTTCTAGCTGCAATTTTCATGGATTGTTGGGATGAAGTCTAAGGCCAAAATAGTGCAAGTCTGGGTCTAGCAAGACTCTCATATAGCATGGGAGTTGTACATCTTTTACACACATATGGGCATCACCTTCTAAAGAAGCCCTCATTAACCCAGATTTCCAGTCCCTATGTGGGACAAATTAGTCTGTGTTTCCCAGGTTGACAGGTGACATCTATTCATGACGACTAAACTTTCTGGGTGGACCACATGGGTGTGGATGAGTCAACAGAACTATGAAGAATACTATGT
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a
s	mr.mrrefChr5	44110	138	+	294542	ACATCTTTACTATACTATGCATATCGCAAATGACCAATCACAGTGTTGAACCAAGATTTATTGTGTTAAACGAGTCAGTAACAGTTAGCTTTGCACATAAATCCTCTATGTACTTTTAGACATGTTACCAAGTCCCCT
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a
s	mr.mrrefChr5	44248	99	+	294542	TCATAACCTTGTATAGGTATACTATTGTCTTGTCTCTCGTTCCCTTGTTGAAATGCATTACTCATCACATGAAGAGGCTTAGGCACTGTGAACAGCCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	189232	99	+	636262	TCATAACCTTGTATAGGTATACTATTGTCTTGTCTCTCGTTCCGTTGTTGAAATGCATTACTCATCACATGAAGAAGCTTAGGCACTGTGAACAGCCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	179547	99	+	647215	TCATAACCTTGTATAGGTATACTATTGTCTTGTCTCTTGTTCCCCTGTTGAAATGCATTACTCATCACATGAAAAGACTTAGGCACTATGAACAGCCTA

a
s	mr.mrrefChr5	44347	82	+	294542	CATTGTTGCAAAATCATATGCCAGTCCTCTGCCTTTTCCATATGTTTTCTTTCATCTTAACAAGGGTTTTGCATCCACATGA
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a
s	mr.mrrefChr5	44429	130	+	294542	TGGACCATTATACCATTTTTGTGATTGTTAGACTCTTTCATCCTATTTGGGTGTACCTGACTTGTTAGAGGTCATTTCTTAAGTTCTCTCAGGTTTTAATAGGTATGCCTAGAGTGATGGCTAGGATGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	189413	130	+	636262	CGGACCATTATACCATTTTTGTGATTGTTAGACTCTTTCATCCTACTTGGGTGTACCTGACTTGTTAGAGGTCATTTCTTAAGTTGTCTCAGGTTTTAATAGGTATGCCTAGAGTGATGGCTAGGATCCC
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a
s	mr.mrrefChr5	44559	57	+	294542	CCAGCATTAGGATGCTTTAAATTGCTATCTGTAGGTTCCACTGTATAACCTGACAGG
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a
s	mr.mrrefChr5	44616	82	+	294542	CAAACTGACTTTTTAATTCTCTTAACTGTGGACTCACAGAAGAGGACAACAATATTCTGCAAGTCTACTTAGTTATCACTCA
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a
s	mr.mrrefChr5	44698	248	+	294542	TAACCTTGTAGAGGCAATTATTACTCTCTCTTCATTGCTCTTAAGAGTCTTATCAACTACCACTCATAAGGTCCGTGTCACTAACACTACTCTATCTTCATTACATCCTAACACCTGTACTAGTAGGTAGGCAAAAACATGGGACTGCCTGTGCTTGGCCACATACTAATTGACAATTTGAACATCCTATATAGACAAATTCCAGACAATGTACTGGGACTCCTCTGTTAGAGAGCAACAGCCTGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	189685	246	+	636262	TAACCTTGTAGAGGCAATTATTACTCTCTCTTCATTGCTCTTAAGAGTCTTATCAACTACCACTCATAAGGTTCGTTTCACTAACACTACTCTATCTTCATTACATCCTAACACCTGTACTAGTAGGTAGGCAAAAACATAGGACTGCCTGTGCTTGGCCACATACTAATTGACGATCTGAACATCC--TATAGACAAATTCCAGACAATGTACTGGGACTCCTCTGTCAGAGAGCAAAAGCCTGGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	180018	244	+	647215	TAACCTTGTATTGGCAATAATTACTCTCTGTCCATTGATCTTAACAGTCTTATCAACTACCACTCATAGGGGCGGTGTCACTAACATCACTCTGTCTTCATCACATCCTAACACCTGTACTA----ATAGGCAAAAAGTTGGGACTGCCTGTGCTGGGCCACATACTAGTTGACAATTTGAACATCCTATATAGACAAATTCCAGACGATGAACTGGTACTCCTCTGTTAGAGAGCTACAGCATAACA

a
s	mr.mrrefChr5	44946	73	+	294542	GGGTTGAGTATTCAAAATACATCAAGGCTTCCTGCTTCATTGGAATTCATTCCAGGCACTAATAGTTATGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	189932	73	+	636262	GGGTTGAGTATTCAAAATCCATCAAGGCTTCCTGCTTCATTGGAATTCATTCCAGGCACTAATAGTTAGGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	180262	73	+	647215	GGGTTGCGTATTGAAAATACATCAAGGCTTCCTACTACATTGGAATTCATTCCAGGCACTAATAGTTATGCCA

a
s	mr.mrrefChr5	45019	57	+	294542	TCAGATGATCAGTTGATTCCTCTGAGTGCCCTGATCTCAACTTTTGTTTGGAAGGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	190006	57	+	636262	CCAGATGATCAGTTGATTCCTCTGAGTGCCCTGAACTCAACTTTTGTTTGGAAGGCC
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a
s	mr.mrrefChr5	45076	42	+	294542	CAGACACAGCTCCATGCAGATGGGACATACCTCTACGGACGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	190063	42	+	636262	CAGACACAGCTCCATGTGGATGGGACATACCTCTACGGACGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	180393	42	+	647215	CAGATACAGCTCCATGCAGATGGGACATACCTCCACAGACAG

a
s	mr.mrrefChr5	45118	49	+	294542	GGTTTGAGCAATGTAACGAATATTGCGCGTGATGATCTTCCCCTACTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	190106	49	+	636262	TTTTTGAGCAATGTAACAAATATTACACGTGATGATTTTCCCCTATATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	180435	49	+	647215	GGTTTGAACAATGCAACGAAAATTGCGCCCGATGATCTTCCCCTACTTC

a
s	mr.mrrefChr5	45167	133	+	294542	TAACTGACAGTGCCATCATATAGAATATAATCTGTTACAACAGTTGAATCTTGTTGTTTCATTGCTCTGTATATTAGGTAGGTGCAAGGATTTCTTTTATGGTTTGGATGAGATGAGTAAGAGGTGCAAGAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	190156	133	+	636262	TAACTGACAGTGCCATCATATAGAATATAATCTGTTACAACAGTTGAATCTTGTTGTTTCATTGCTCTGCATGTTAGGTAGGTGCAGCAACTTCTTTTATGGTTAGGATACGATGACTAAGAGGTGCAAGAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	180484	133	+	647215	TAACTGACAGTGCCATCATATGGAATATAATCTGTTACAACAGTTGAATCTTGTTGTATCATTGCTCTGTATATTAGGTAGGTGCCAGGATTTCTTTTATGATTTGGACGAGATGAGTAAGAGGTGCAAGAAG

a
s	mr.mrrefChr5	45300	123	+	294542	AGGGGGTCCACAATTTCAAGGTCCATTGAATAAGCTACCTGAACTGCTTGCTGACCCACTAGAGGCAGTGTTGATTGCAAGATCATGAATGTTGCACCCATAAATCACAGGGGAATTGGGGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	190289	123	+	636262	AGGGTGTCCACAGTTTCAAGGTCCCTTGAATAAGCTACCAGAACTGCTTGATGAGCCACTAGAGGCAGTGTTCATTGCAAGATCATGAATGTTTCACCCATAAGTCACAGTAGAATTGGGGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	180620	123	+	647215	AGGGGCTCCACAATTTCAAGGTCCAATCAATGAGCCACCTGAACTGCTTGCTGACCTACTAGAGGCAGCGTTGATTGCAAGATCATAAATGTTGCACCCATAAATCACAGGGGAATTTGAGTA

a
s	mr.mrrefChr5	45423	192	+	294542	TGGAGTATGAATAGTCTAGACGATGGCTTGAGCCAGGCTGCATAGTCTCCCTAAAAATACTGTCCCTGACAAAAAAAGATAATTTATCTTTCTAGTTTGGCATCAAGAAAATAGCTCATCATGCCATCCCCCACACAATAGATTTGAGTTTGGTAAACCTTGAAACTGGAGTATTTGAGGTAATAAATCTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	190418	163	+	636262	TGGGGTAAGAATAGTCTAGATGATGGCTT-------GCTGTATAGTGTCCCTAAAAATAC--TCCCTGACAAAAAATGATAATTTATCTTTCTGGTTT------GAGAAGATAGCTCATCATGCCATCCCCCACACAATAGAATTGAGTTTGGT--------------GAGTATTTGAGGTAATAAATCCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	180743	192	+	647215	TGGAGTATGAATAGTCTAGACCATGGCTTGAGCCAGGCGGCATAGTCTCCCTAAAAATACTGTCCCTGACAGACAGAGATAATTTATATTTCCAGCTAGGCATCAAGAAAATAGCTCATCAGGCCATCCCCCACACAATAGATTTGAACTTGGTAAACCTTGAAACTGGAGTATTTGAGGTAATAAATCTAT

a
s	mr.mrrefChr5	45615	146	+	294542	TAGAACTAGACATAATATGAGCGTGGTGCTGGTAGTAGGCTGGTAAGACAGGAGAATAAGGAGACCAGTGTGGAGTATAAAGATCTCAGAGTATGAAGTCTCGTTCGTTACTCCAGTTTGCCAAGTTAAGGAGAGTTTCAGACTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	190582	145	+	636262	CAGGACTAGACATAATATGAGCGTGGTGCTGGTATTAAGC-AGCAAGACAGGAGAATGAGGAGACTCATGTGGAGTATAAAGATCTCAGAGTATGAAGTCTTGTTCATTACCCCAGTTTGCCAAGTTAAGGAGAGTTTCAGACTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	180935	140	+	647215	TAAAACTAGACACAAC------GTGGTGCTGGTAGTAGGCTGGTAAGACAGAAGAATAAGGAGACCAGTGTAGTGCATAAAGATCTTACAGTATGAAGTCTCGTTCGTTACTACAGTTTGCCAAGTTCAGTAGGGCTTCAGGCTAA

a
s	mr.mrrefChr5	45761	17	+	294542	GAGACTGTCCAATAGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	190728	17	+	636262	GAGGCTGTCCAATGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	181075	17	+	647215	GAGACTATCCAGTAGTC

a
s	mr.mrrefChr5	45778	9	+	294542	CTAACAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	190746	9	+	636262	CTAACAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	181092	9	+	647215	CTAACAAAT

a
s	mr.mrrefChr5	45787	72	+	294542	CAATCAAATATGCATGGCTCCCTAGCTTGAGCACTTGTGAAGGCTGAGGGTTTCCTTTCATGCTACTCCTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	190755	64	+	636262	CAAGCAAATATGCATGGCTCCCTAGCTTGACCTCATGTGA--------GGTTTCCTTTCAGCTAACAGCTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	181103	72	+	647215	AAATCAAATATGCATGGCTCCCTAGCTTGAGCACTTGTGAAGGCTGAGGGTTTCTTTTCATGCTATTCCTAA

a
s	mr.mrrefChr5	45859	58	+	294542	ACACTAACACTTCTTGTTGGACTCAGCCATAGCACAGTATATCTATCACAATATGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	190820	56	+	636262	ACCTAAACACTTCTTGTTGGACTCAGCCATAGCACAG--TATCTATCACAATATGGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	181175	58	+	647215	ACACTAACACTTCATGTCAGACTCAGTCATAGCACAGTATATCTATCACAATAAGGTA

a
s	mr.mrrefChr5	45917	289	+	294542	TATTTTGTGTGAGTAATCACAAGTACTAGATGATTGGAAGACCAAGTTTGTCTACTGGGAAAAGTTTGGGGTGTATCACAGTAGCCTCAAGAGGTGCCAAGCTCTGGTATGCACTCCCTCAATGAGCGAGATTACTGAATTAGGACACATGGGAGCCTTCAAATCCGGCTTCAATAATCTCCACTGTAACTAAATGATACAAGTACCGATTTGTGATGCTATAGATTTTAGAATATGAATTCGTGGGATTTCCATGGGTTAATTTATGGCTGCTTACCAATGACTTCGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	190880	255	+	636262	TATTTTGTGTGATTAATCACAAGTACTAGCTCATCGGGAGACCAAGTTTGTCTAGTAAGAAAAGTTTGGGGTGTATCACAGTAGCCTCAAGAGGTGCCAAGCTCTGATATGCACTCCCTCAATGCGCGAGACTACTGAATTAGGACACATGGGAGCCTTC--------------------------------AATGAAACAAGTACCGATTTGTGATGCTATAGATTTTAGAATATGAATCCGTGGGATTTTCATGGGTTAATTTATGGC--CTTACCAATGACTGCGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	181233	289	+	647215	TATTTTGTGTGAGTAATCACAAGTACTAAATGATTGGAAGAGTAAGTTTGTCTACTGGGCAAAGTCTGGGGCGTTTCACAGTAGACTCAAGAGGTACCAAGGTCTGGTATGCACTCCCTCAATGAGCGAGATTACTGGATTAGGACACATTGGAGCCTACAAATCCGGCTTCAATAATCTCCACTGTAACTAAATGATTCAAGTACAGATTTGTGAAGCTATAGATTATATAATCTGAATTTGTCAGACTTCCATGGGTTGATTTATGGCTGCTTACCAATGACATCTT

a
s	mr.mrrefChr5	46206	6	+	294542	TCCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	191136	6	+	636262	TCCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	181522	6	+	647215	TCAATT

a
s	mr.mrrefChr5	46212	200	+	294542	GCTTCAAATGCCACAAAGACATGAGACCTTGCTTTGTACTCATGTGCTTTCCTCAACCAGGAATAGAATCTCCTTCATGACATATGAGCCTACACCTGTAACCCACTAAATGATCAAACGATAGTTCTGTAACATTTTCTGTAACCTACTTGAAGCTGAGAAAGGGGCATGTTCCCCATACCTATGGAAGTTGGATCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	191145	184	+	636262	GTTTTAAATGCCACAAAGACATGAGAC----------ACTCATGTGCTTTCCTCAACCAGGAATAGAATCTCCTTCATGACATACGAGCCTACACCTGTAACCCACCAAATGATGAAAC------CCTGTAATATTTTCTGTAACTTACTTGAAGCAGAGAAAGGGGCATGTTCCCCATACCTATGGAAGTTGGAGCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	181528	200	+	647215	GCTTCAACTGGCACAAAGACATGAGACCTTGCTTTGTGCTCATGTACTTACCTCGACCATGAATAGCATCTCCTTCATGTCATATGAGCCTATACCTGTAACCTAATAAGTGATCAAATGATAGTTCCGTAACCTTCTCTATAACCTAATTGAAGCTGGGAAAGGGGCATGTTCCCCATACCTATGGACGTGAGCTCTTC

a
s	mr.mrrefChr5	46412	2	+	294542	AT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	191329	2	+	636262	AT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	181730	2	+	647215	AT

a
s	mr.mrrefChr5	46414	7	+	294542	AATAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	191332	7	+	636262	AATAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	181732	5	+	647215	AATAA--

a
s	mr.mrrefChr5	46421	86	+	294542	ATGAAAGTATTTTGCAGATCTTTAGTAAACAGCCTTAGTTAAGTATCTGCTTCGTTGCCAATCTGTTTACAGATTCGTATGACTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	191343	83	+	636262	ATGAAAGTATTTTGCAGATCT---GTAAACAGCCTTAGCTATATATCTGCTTCGTTGCCAATCTGTTTACAGTTTCGTATGACTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	181737	76	+	647215	----------TTTGCAGATCTTTAGTAAACAGCCTAAGTTAAGTCTCTGCTTCGTTGCCAATCTGTTTACAGAGTCGTATGATTCT

a
s	mr.mrrefChr5	46507	57	+	294542	CAAAAGTGCCTTTTCTGCATCTACAGAACTAATGTATTATGGCTAATTCCACACCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	191428	57	+	636262	CAAAAGTGCCTCCTCTGCACCCGCAGAACTAATGTATTATGGCTAATTCCACACCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	181813	57	+	647215	CAAAAGTACCTTTTCTGCATCTACAGAACTAATGTATTATGGCTAACTCCATCCCTG

a
s	mr.mrrefChr5	46564	48	+	294542	CTGCCTCTGTCTAGCCTGTCTAGGCTATGGAAAACTGCCCCCTCTGCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	191489	48	+	636262	CTGCCTCTGTCTAGCCTGTCTAGGCTATGGAAAACTGCCCCCTTTGCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	181870	48	+	647215	CCTCGTCTGTCTAGCTTGTTTAGGCTATGGAAAACTGCCCCCTCTGCA

a
s	mr.mrrefChr5	46612	205	+	294542	ACTCATTATAGTGCATTTCACCCTTGCCCCTTTGTCTAGTAGTATCACATTGCATCTTGACACTCATGAGATCTCCTGCATAAGTTGCCTTGGCAAGCATGCTCAGATCCTTTGACATTTAGATTAGATTGTCGAACAATGAAAAGTATGATTTGCTCTTCATTGCTCAACCCTACCAATGTACCAAGAGCTGAGTGATGTGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	191543	205	+	636262	CCTCATTATAGTGCATTTCACCCTTGCCCCTTTGTCTAGTAGTATCACATTGCATCTTGACACCCATGAGATCTCCTGCATAAGTTGCCTTGGCAAGCATGCTCGGATCCTTTGACATTCAGATTAGATTGTCGAACAATGAAAAGTACGATTTGCTCTCGATTGTTCAACCCTACCAATGTACCAAGAGCTGAGTGATGTGGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	181918	205	+	647215	ACTCGTTATAGTGCATTTTGCCCTTGCCCATTTGTATGGTAGTATCACCTTGCATCTTGACACTCATGAGATCTCCTGCACAAGTTGCCTTGGCAAGCTTGCTCAGATCCTTTGACATTTCGATTAGATTGTCTAATAATGAAAGGTATGATACGCTCTTCATTGCTCAACCCTACCAATGTACCAAGAGCTGAGTGATGTGGCG

a
s	mr.mrrefChr5	46817	21	+	294542	CATACAGCTCTGCGCTGGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	191748	21	+	636262	CATATAGCTCTGCGCTGGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	182132	20	+	647215	TATACAGCTC-ACGCTGGTTT

a
s	mr.mrrefChr5	46838	86	+	294542	TTGTCTCTTTCTACAAGACAAGCAGCATCTCTTGTATTTTTTATAGTAAAGATTGCTGTCATCTCAATGTGTTGAGACCATGGGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	191938	86	+	636262	TTGTCTCTTGCTACAAGACAAGCAGCATCTCTTGTATTTTTTATAGCAAAGATCACCGTCATCTCAATGTGTTGAAACCATGGGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	182152	86	+	647215	TTGTCTGTATCTACAAGACAATCAGCATCTCTTGTATTTTTTATAGTAAGGATTGCTGTCATCTCAATGTGTTGAGACTATGGGTC

a
s	mr.mrrefChr5	46924	157	+	294542	TGTGGAATATAACAAATGTATCCTGAAGTCAAAGCTAGCTAGTTTAACAGGATCTGCCATGTTAGACTCTGGGCTACTAGTGAATGATTATTTCTGGCTAAATAATGTGCATATTTGTAAGCCAAAAGAGGTGCTTCAGTCTGACACAGCATGCAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	192025	154	+	636262	T--GGAATATAACAAATGTA-CCTGAAGTCAAAGCTTGCTAGTTTAACAGGATCTGCCATGTTAGACTCTGGGCTACTAGTGGGTGATTATTTCTGGCTAAATAATGTGCACATTTGTAAGCCAAAAGAGGTGCTTCAGTCTGACACAGCATGCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	182238	151	+	647215	TGTGGGATATAACAAATGTATCTTGAAGTCAAAGCTAGCTGGTGTAACAGGATCTGCCATGTTAGACTCGGGGC------TGAATCCTTATTTCTGCTTAAATAATGTGCATATTTGTAAGCCAAAAGAGGTGCTTTGGTCTGACACAGCACGAGAC

a
s	mr.mrrefChr5	47081	52	+	294542	AAAAAAAATTGAATCCAACTGGTTTCAATATGATAGATGCTACCAACTTAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	192182	52	+	636262	AAAAAAAATTGAATCCAACTGGTTTCAATATGATAGATGCTACCAACTTAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	182389	52	+	647215	ACAAAAAATTGTATCCAACGAGTTTCAACATGATAGATGCTACCAACTTAGG

a
s	mr.mrrefChr5	47133	78	+	294542	ATAACACTATACACTTACCTTAGTTATTCACATCATTTAACCAGTCACAGTCACATGGGCCCTGTGGGGCCCTGTCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	192252	77	+	636262	ATAACACTATACACTTACCTTAGTTATTCACATCATTTAACCAGTTACAGTCACAT-GGCCCTGTGGCTCCCTGTCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	182441	74	+	647215	ATAACACAATAAACTTACCTTAGTTATTCACA--ACTCAAACAGTCACAGTCACATGGGCCCTCTGGGGCCCCGTC--

a
s	mr.mrrefChr5	47211	514	+	294542	TGAGATTGATCCTTTAAGACAGCATGCCCTGTTAACATGATGTTGGTCCTTTAAGACAGCACGTATAATGAACTCAGCACTTTATATCTCATGGACTGCTCACCGGATGTTATTGGCTAATCCAAATATACATGCAAAGCTTTGCCAGGCCCTTGAGCAGAAAAGAATGTGTTGCTGCATCCGTTGTGGGAGCAGATTTAAGCTGATGACCGCTCCTGTTATATACCAATTACAGTTACTCAGATTCAGGCACAGTCTGACTCTTTCAAGACTGCTTCTAGACAACATACCTCTCCTAAAGTCATAAGATGGGTAAATCGCTAAGATGGGTGTATGATGAAAGGACACAAAAGTATAGCCCTGCTGTAGCACATTAGGTGCAATCATGTGTAGGGAGATTGTTGGTAAGTGTCCTGGGGTACCACTGTAGCCCATAATGACTTGCCCAGTTGGCTGGCACACAGTGGATATTGTAGCTGTGAATTTAAGCGCGCGATGGACTGATCAATAATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	192331	492	+	636262	TGAGATTGATCCTTTAAGACAGCATGCCCTGTTAACCTGATGTTGGTCCATTAAGACAGCACATATAATGAACTCAGCACTTTATATCTCGTGGACCGCTTACCGGATGTTATTGGCTAATCCAAGCATACATGCAAAGCTTTGCCAGGCCCTTGAGCAGAAAAGAATGTGTTGCTGCATCCGTTGTGGGAGCAGATTTAAGCTGATGACCGCTCCTGTTATATACCAATTACGGTTACCCAGATTCAGGCACAGTCTGACCCTTTCAAGACTTCTTCTAGACAACATACCTCTCCTAAAGTC-----------------CTAAGATGGGTGTATGATGAAAGGACACAGAAGTATAGCCCTGCCATAGCACATTAGGTGCAATCAGGTGTAGGGAGATTGTTGGTAAGTGTCCTGGGGCACCACTGTAGCCCGTAATGACTTGCCCAGTTGGCTGGCACACAGTGGATATTG-----GTTAATTTAAGCGCGCGACGGACTAATGAAGGGTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	182515	504	+	647215	TGAGGTTGATCCTTTAAGATAGCAGGCCCTGTCAACATGATGTTGGTCCTTTAAGACAGCACGTATAACGAACTCAATACTTTATGTCTCATAGACTGTTCACCGGATGTTATTGGCTAGTCCAAATATACATGCAAAGCTTTGCTAGGCCCTGGAGCAGCAAAGAATGTGTTGCTGCATCTGTCCTGTGAGCAAATTTTAGCTGATGGCCACTCCTGTTATAAACCAATTAAAGTTACTCGGACTCAGGCACAGACTGACTCTTTCAAGACTGCTTCTAAAGAACATACATCTCCTAAAATCATAAGATGGGTAAATCGTTAAGATGGGTGTACGAAGAAAGGACACAAAAGTA--------CTGTACCACATTAGGTACAATCATGTGTAGGGAGATTATTGGTGAGTGTCCTGGGCTACCACTGTAGCCCATAATGACTTGCCCAGCTGGCTGACACACAGTGGATATTGTAGCTGTGAACATAAATGTTCTATG--CTGATCAATAATCA

a
s	mr.mrrefChr5	47725	10	+	294542	TGTGAACATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	192825	10	+	636262	TGTGAACATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	183019	10	+	647215	TCCAGACACC

a
s	mr.mrrefChr5	47735	230	+	294542	AATGCAATCCAACCTACCAATCTACATATCCCAAGAGGAGTGCTGCCCAGTAAGTCTCCAGAAAACAATAGGAAAAATCCATGTATTATTCTGTTTATTTGGTTTCTCACACATAGGTGGCCCAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCTGCTCAGGTGCTCTTCAGGGATAGAAATATTCCCAGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTGATATCTCAGAGGCTGTATCAATGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	192835	230	+	636262	AATGCAATCTAACCTACCAATCTACATATCCCAAGAGGAGTGCTGCCCAGAAAGTCTCCAAAAAACAATAGGAAAAATTCACGTATTGTTCTGTTTGTTTGGTCTGTCACACATAAGTGGCTCAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCGGCTCTGGTGCTCTTCAGGGATAGAAATATTCCCAGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTGATATCTCAGAGGCTGTATCAATGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	183030	226	+	647215	AGTGCAATCCAATCTACAAATCTACATAT----AGAGGAGTGCTTCCGAGTAAGTCTCCAGAAAACAATAGGAAAAATCCGTATATTATTGCAATTATTTGGTTTCCCATACATGGGTGGCCTAAAATACTAGTTTAAGGGGACACCTGCACAAGTGGCCTTCAGGAACAGAGATATTTCCGGTCCCAGCTTTTGAAAAACAGTTATATCTTAGAGGCTGTATCAATGCT

a
s	mr.mrrefChr5	47965	23	+	294542	TCACGGCTATGACTGTGGGTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	193070	23	+	636262	TCACGGCTATGACTGTGGGTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	183256	23	+	647215	TCATGTCTATGACTATAGGTTCG

a
s	mr.mrrefChr5	47988	135	+	294542	GGAAAGTCTTACCTCTCAAAAATTTGGGTAAGCATAAGGACTCTATGAGAATGATTGCTTTTCTGATGTAGGAGTGGGGCCACCTCCCTACTAAGTCTGGAATGCAGCACATACATCCTCATCTATTAGGCATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	193093	135	+	636262	GGAAAGTCTTACCTCTCAAAAATTTGGGTAAGCATAAGGACTCTATGAGAATGATTGCTTTTCTGATGTAGGAGTGGGGCCACCTCCCTACTAAGTCTGGAATGCAGCACATACATCCTCATCTATTAGGCATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	183290	135	+	647215	GGACAGTCTTACCTCTCAAAAATTTGGGTCAGCATGAAGAAACTATGAGAATGACTTCTTTTCAGATGTAGGAGTGGAGCCATCTCCCTTGTAAGTTTGGTACGCAGCACTTATGTCCTCCTCTATTAGGTATAA

a
s	mr.mrrefChr5	48123	63	+	294542	AAAGGGGGTGGTTCTGCATGACTAAGGGCAAATACTTCTAGCTCTTTATATTTGGTGAAGTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	193228	63	+	636262	AAAGGGGGTGGTTCTGCATGACTAAGGGCAAATACTTCTAGCTCTTTATATTTGGTGAAGTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	183426	63	+	647215	AAAGGGGGTCTCTCTGCATGACTCAGGGCAGATACTTCTACCTCTTTATATTTGGTGAAGCAG

a
s	mr.mrrefChr5	48186	83	+	294542	AGACCTCTGTTTTATTTTATCAATCTACATTTGGTCTAAGCCTCAGCAGCCCTAATAACCCTTTGGGCTGGGGACATGGAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	193291	83	+	636262	AGACCTCTGTTTTATTTTATCAATCTACATTTGGTCTAAGCCTCAGCAGCCCTAATAACCCTTTGGGCTGGGGACATGGAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	183492	83	+	647215	AGACCTCTTTTTTATTTTGTCAATCCACATTTGGTTAACGCCTCAGCAACCCCAATAACCCTTCAAGCTGGGGACATGGAACC

a
s	mr.mrrefChr5	48269	20	+	294542	TTATGTCATGGCTTCACGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	193375	20	+	636262	TTATGTCATGGCTTCACGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	183575	20	+	647215	TTATGTCATGGCCTCATGCA

a
s	mr.mrrefChr5	48289	205	+	294542	TACGAATGAACCTTTCAGGTTAATGAAGTGGGAGTACAACTGCTTTACCATTGTAGGCTTCTGTTATTACGGGGTGGAATCTCAAGGGTTTCAAAAACCCCAGGCATTACTCGATCAACTTATATTGTGGGCTTCATCTACTTCAGTCATGACTTTAGCAGGTGTACAAATGCTTTAGGCTCGAGAAGTGGGAGAATAAACTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	193413	205	+	636262	TACGAATGAACCTTTCAGGTTAATGAAGTGGGAGTACAACTGCTTTACCATTGTAGGCTTCTGTTATTACGGGGTGGAATCTCAAGGGTTTCAAAAACCCCAGGCATTACTCGATCAACTTATATTGTGGGCTTCATCTACTTCAGTCATGACTTTAGCAGGTGTACAAATGCTTTAGGCTCGAGAAGTGGGAGAATAAACTGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	183595	205	+	647215	CATGTATGAACCTTTCAGGCTTACGAGGTGGGACCACAACTGCTTTACCATTGTAGGCTTCTGCTATTATGGGGTGGAATCTCAAAGGTTTGAAAAGCCCCAAGAATTACTTGATCAACTCATATTGTGGGCTTCATTTACTTCAGTCATGACTCCAGCAGGTGTACGAACTCTTTAGGCTAGAGAAGTGGGAGAGAAAACTGCT

a
s	mr.mrrefChr5	48494	18	+	294542	AAACAAGAGGCTTTCAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	193624	18	+	636262	AAACAAGAGGCTTTCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	183800	18	+	647215	AAATAATAGGCTTTCAGT

a
s	mr.mrrefChr5	48512	12	+	294542	ATCATGGGATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	193643	12	+	636262	ATCATGGGATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	183818	12	+	647215	ATTATGGGATCA

a
s	mr.mrrefChr5	48524	21	+	294542	ATCTCAAAAGCTGCAGGAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	193655	21	+	636262	ATCTCAAAAGCTGCAGGAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	183835	21	+	647215	ATCTCAAAAGCTGCAGGTATT

a
s	mr.mrrefChr5	48545	13	+	294542	CTCGCTTGGCTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	193676	13	+	636262	CTCGCTTGGCTAC
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	49717	642	+	294542	TCACAGTGACCACTCCTGTTGTAAGTACCTGTTACTAGAATTTCAACATATGGTTCACACTCACCCATTAAACCTTCTATTTCAGTCACTGGAAAGTCCTAATGTTGCTGTGATATTATATTCCATTTCACAGCATACTGAGCCAGATATTGCTTGCAGTACTCACTAAGATCTAAATTACTATAGTAAACCTCACCCTTATCTGCATAGGGATATAATGGACTCACTTCAAATCAACCCAGAAGGGTCCATCTCATTTGTACAAATTCTCTACCTTAGCACAAGGAGCAAAATCCCTCTGCAAGGTCAGGAAAAATTGCAAGGTCAGTGGTTTTAGCTGAGCTGGGGGAAAGAACAATCAATTAATATTGAAAATACCAAATTCATTGAGAAGACTTATATACTCTTATTAAACTGATCTTAGGATACATGCAGCCTCTACAATACTGAAGTACAGGTTATATGTGTTTGAAGGCAGGGTAGAAATAAAAAGTTTTCTCATGCAATGATGTACCAGTTAAGTACCCTCATTGACCTGGATCAAAATATTGAGGGTGACAAATCAGTCATATTTACTGGTTTAAGTTGCCACGCTGCTTATATAGAGAACATATCAACAACATAGCACTATGGCATGTACCA
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	50384	49	+	294542	CATTCTGTCCACACAAGATGTCACAGCTAGTGCCCTTTGAGGGACATGA
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	50807	54	+	294542	GAACTATGAAACAGCCTCCAAAAGGCATACTGCCCCAAATTCAGATGATCTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	196005	54	+	636262	GAACTATGAAACAGCCTCCAAAAGGCATACTGCCCCAAATTCAGATGATCTAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	186211	54	+	647215	GAGCCATAAAACAGCCTTTAAAAGGCGAACTGCCCTAAATATGGATGGTCTAAA

a
s	mr.mrrefChr5	50861	33	+	294542	TAATGCTGTCTgaggtgtcTTTAaccttcatat
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a
s	mr.mrrefChr5	50894	14	+	294542	acaggataaaacca
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	50963	92	+	294542	atgaaacagccttcagaaagcaaactgccctaaatacggatggtctaagcaacctcaactggacagcttactttataaggccatagggccct
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	196166	92	+	636262	atgaaacagccttcaaaaggcaaactgccccaaatacggatgatctaagcaaccttcactggataacctactttataaggccataggccccc
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	52222	67	+	294542	ACTACAAGATGACTTAATACAAGTTTTTGAATTGTGCTGCAGGCTCTAAAGTTTGATGGCCTTTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	197442	67	+	636262	ACTACAAGATGACTTAATACAAGTTTTTGAATTGTGCTGCAGGCTCTAAAGTTTGATGGCCTTTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	187635	67	+	647215	GCTAAAAGATGACTTAATACAAGTTTTGGGATTGTGCTGCAGGCATTAAAGTTCGATGGGCTTTGTA

a
s	mr.mrrefChr5	52289	100	+	294542	GGTGGGCAATAGAGTGCTGATGGCTAGACTGCATAGCTGGGTGATACATGTGACAGACTTTAGTTTACCCTACCTGCCTTAGGAAAACCAGGCTCTTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	197509	100	+	636262	GGTGGGCAATAGAGTGCTGATGGCTAGACTGCATAGCTGGGTGATACATGTGACAGACTTTAGTTTACCCTACCTGCCTTAGGAAAACCAGGCTCTTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	187709	100	+	647215	ACTGGGCAATAGAGTGCATATGGCTGAGCCGCATAGCTGGGTGCTGCATGTAACAGACTTTAGTTTACCCAACCTGCCTTAGGAAAACTAGGCTCACGCA

a
s	mr.mrrefChr5	52389	14	+	294542	CAGTGCCAACACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	197631	14	+	636262	CAGTGCCAACACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	187809	14	+	647215	CAATGATAGCACAT

a
s	mr.mrrefChr5	52403	43	+	294542	tagtactcagttggtgtgcaaatcctaaaaatatttgaaaagt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	197652	43	+	636262	tagtactcagttggtgtgcaaatcctaaaaatatttgaaaagt
s	simRat_chr6.simRat.chr6	187823	43	+	647215	TAACACACAGTGCCAACACAACCtttgatgatacttggttggt

a
s	mr.mrrefChr5	52446	5	+	294542	gagca
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a
s	mr.mrrefChr5	52451	10	+	294542	tagcctataa
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a
s	mr.mrrefChr5	52461	8	+	294542	atattcta
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a
s	mr.mrrefChr5	52469	25	+	294542	aaagtcttgaggctgctggggaccc
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a
s	mr.mrrefChr5	52494	4	+	294542	CCCT
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	52501	340	+	294542	AGGTCTTGCAGAAGACATCCTGTGGGTTGGCCGTTGGCTTGCACGACCTTagtctacaccctcattgattaaagcaaaggagtgatatcgagtacatctaacaagaagagagaaatAGCTCTCCTAATCAGCCTATGATTATGATATGTTTCTCAAGCATAGGGCCACCGTATTGGGGAGTGTGGTTTGAAATGAACATCTTGGATCCACACGGCAATGAAAAAAAATAATTCATTGCATTATTTTACACAAATCAAGAAGAGCCTGTTTTACATTTTCCTTTGCTCATTAGGAGACATGCAGGGTGATTAGATGCAAACATAAGAATTCCAGTGGACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	197826	340	+	636262	AGGTCTTGCAGAAGACATCCTGTGGGTTGGCCGTTGGCTTGCACGACCTTAGTCTACACCCTCATTGATTAAAGCAAAGGAGTGATATCGAGTACATCTAACAAGAAGAGAGAAATAGCTCTCCTAATCAGCCTATGATTATGATATGTTTCTCAAGCATAGGGCCACAGTATTAGGGAGTCTGGTTTGAAATCAACATCTTGGATCCACACGGGAATGAAAAAAAATAATTCATTGCATTATTTTACACAAATCTAGAAGAGCCTGTTTTACATTTTCCTTTGCTCACTAGGAGACATGCAGGGTGATCAGATGCAACCATAAGGATTTCTGTGGACAA
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a
s	mr.mrrefChr5	52841	23	+	294542	GATTCTAGTACAAATGGCTGTAA
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a
s	mr.mrrefChr5	52864	100	+	294542	CTCATACATCATTGAGTTGTGAGAATTGTTGGCAAGGATAGCGAGCTAACAGCAGTATGATTCTTTTGATCGGATAGATTTAAAAGCAGACTACAATAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	52964	26	+	294542	GATGTATAGAAAAACATAACTGCCCT
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	52998	300	+	294542	GTATGTTTTTATGTAATAGAAGAATATCCATTGTCGCTATAGCAGGTCAGTTACAGATATTTGGCCAGTTTTCATCAGACTTCATTAATGTCTAGTAACCTGTCGTCAGGTACTACAGAAATTCCAGAGTATTTGAGTCTAAGAGATCACCTCAAATTTTAATTCCAGGGAGTTTGAGTTTAAGAGTCCACCTCAAATTTTGACTTGGCTTAGCCTCTCAACTATTTACCTGGCCAGACTAATTTTGCATGCAGGCTAATAGTGGGTATCTGCCTTGCTGATCAATGTCGAAGAGCTAGC
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a
s	mr.mrrefChr5	53298	146	+	294542	TCACTACCCATGTCCTATTCATATGAAAAGTATGTCTCCATAGTGCTATTGAATTGGTTGAGAGCACGTGAGGTGGGCAGGCTCTTCCCACAGGTGCCTGTGACTGCTTGATAGCGCATGAAGCGGGGCAGGTTCATCAGCTGAGT
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	53565	142	+	294542	AAGTTGTAAAGTCTATACTTAACTACATTTTCCTGCTTCTGATATTGCTCTTTATACTGTATCTTTTGTGCAGTTTTGGGTCTTGCTGCATGGCAACTTATCTTTTAGGCAGTGCAAAGTTAAAAAATATGGGTTAAATTAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	188977	142	+	647215	AAGTTGAGAAATCTATCCTTAACCACATTTTCCTGCTTCTGATGTTGCTCTTTATACTGTATCTTTTGTGCAGTTTTGGGTCTTGTTCACTGGCAACTTATCTTTAAGGCATTGCACAGATAAAGAATATTGGTTAAATTGA

a
s	mr.mrrefChr5	53707	100	+	294542	GTTCTAAGCCCACAGAAGCCGATTAGAATATAGTAACTTTTGACAAAAAAACATTCCTGCCCAGGTCCCACTTTCTGCACTCCAACAAAATGCCACTTTA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	189136	100	+	647215	GTTCTAATCACACAGAGGCCAATAAGAATATGGTAACTTTTGACAAAAAAACATTCCTGCCCGGGTCCCACTCTCTGCACCCCAACAAAATGCCACTTGA

a
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a
s	mr.mrrefChr5	54196	28	+	294542	TAGTGTGCTGCTGAACTCAGTCCACAAG
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a
s	mr.mrrefChr5	54224	80	+	294542	ACAATTCTCAATAGGGCCATGGCGGCAATTAGTTATGAGTGATGGGTAATCTGTAGCAAATGTCAGCATTACAACTGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	199582	75	+	636262	ACAATTCTCAAT-----CATGGCAGCAATTAGTTATGAGTCATGGGTAATCTGTAGCAAATGTCAGCATTACAACTGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	189659	80	+	647215	ACAATTCTCAACAGGGCCATGGTGGCAATTAGTTATGAGTGAAGGATAATCTGTCGCAATTGTCAGCCTTACAACTGGCA

a
s	mr.mrrefChr5	54304	8	+	294542	TGGACACT
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a
s	mr.mrrefChr5	54312	191	+	294542	GACAATGACGGGATTTTGATTTATGAAGTCTGACCATTTGTAGGCAAGTCTCATTTGGAGAGGTGTTTGCTTATTTCTGCTTATTTGTACAAGCTGACTTCTTTATGTCCCCCAATCAGAATGTAGTTTGGAATTTTCCCAGTTGTTGAACCTTTAAACATGAAACCCTGAGGTTAAGTGTTGGTGGAGAC
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a
s	mr.mrrefChr5	54503	120	+	294542	AGGACTTCACTCTATAAAGTACACACTTAGCCTCGTTTATACAGTATACTATGTCTGGGTACTACCTGGAGGATCTTTACTCACTACCTAAGTATTCCCTATTGACTCTGATTGATCCAA
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a
s	mr.mrrefChr5	54623	190	+	294542	CACCATCTCAGATTACACGCCTGAGAAAGAAGATAAGATGTAGTTACAGGGGCAGAGGAGTATCATGCAAACACTTTGTGGTCTAGACACAGTGACCGTAGTCTAGACACAGTGACCATGGTGTTTTCAAGTCAACACAGTGAAGATTATAGATTCTAATTGAGTATACAATAGTGAGTAGCAGAGAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	199975	171	+	636262	CACCATCTCAGATTACACGCCTGAGAAAGAAGATAAGATGTAGTTACAGGGGCAGAG------------------TTGTAGTCTAGACACAGTGACCGTAGTCTAGACACAGTGACCATGGTGCCTTGAAGTCAACTCAGTCAGGAT-ATAGATTCTAATGGAGTATACTATAGTGAGTAGCAGAGAATG
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	54858	36	+	294542	GAGGGTTTGACAACAAAAGCAAAGTAACCCTTACAC
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	54961	19	+	294542	GTCAGAGCATGTACAGTGT
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a
s	mr.mrrefChr5	54980	77	+	294542	AGCATTCATCCTTTTACTTTATGAAAGACAATTTAGAAGGACACCAGTTTTCACTACTTGTCAGATTTAGGAGATTT
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a
s	mr.mrrefChr5	55057	36	+	294542	TTACCAAGGTTTTTGGGTTTGCCATTACCCATGTGT
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a
s	mr.mrrefChr5	55093	19	+	294542	ATTAGTAACCAGATTGTCA
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a
s	mr.mrrefChr5	55112	87	+	294542	TCTTCATTTGTTCCAGGTTTGCTATTATGTGAGTGTACAATGCTTGAGTAAGCAAAGTGTCACCAATCTGCATTTGTATTTACTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	200428	87	+	636262	TCTTCATTTGTTCCAGGTTTCCCATTATGTGAGTGTACAATGCTTAATTCAGCAAAGTGTCACCAATCTGAATTTGTATTTACTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	190627	73	+	647215	TCCGCATCTGTTCCAGGGTTGCTATTATGTGGGTGTACGATGCTTGAGTAG--------------ATCTGCATTTGTATTTACTGTT

a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	61880	89	+	294542	TTTGGTGGTTGGTGGATGCCACCTTAGTCCTCCATATGATGAATAATGTGGGATCTGTTAACCACCAGCAGGCTTGCAGAAGAACACCT
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a
s	mr.mrrefChr5	61969	221	+	294542	AGGAATAAATTTGATATAGTGGTACGTGCAAGACTTGCTCTGGAACCTTGGTACTTGCAAGCATTGGCTTTATATATCAACAAAAATGATAACAAATTGGAGATGACAGTCAAAAATGATAAtaaagctggagctacattggctttagtaatatgacacgcCACTCATCTTTCTACAAGAGCACTCGTATACCAAGTCCACAATGAACTCATACTGTCCTC
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	62764	51	+	294542	TGGTGCTCAATCTGACACAAAAAATGTGGCTCCCCACTGTGACTTAATCAA
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	67012	129	+	294542	TTTGGTTGCATATAAGGACTTCTGGTCCAACTGAGCTTGACTTTTCATTTTCAGAAATAGAGTGATGCCCCCCTATTGAAAGGcatattactctctcttaattcagttaggaggcaggccaagtgatcc
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a
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a
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	212808	219	+	636262	TACATATTTGACTTACCAATCCAGAGTGTTTCAGAGATCAGGGTCAATCATTACAGTCCAAGTACCTACTGATGGCTGAGATGACTCTTTATACATAATGCAAAACTAAACCCTAGAGAGTTTCTATTCCCTTCCATCACTTCACACCATCACATCACCCACCTAGACATGCCCCAAGCCACCAGTATTAATGTACTACTGTTTTCTCTTGATTATCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	203816	218	+	647215	TACCTGTTTTACTTGCACATCCAAAGTGTTTCTGAGATCAGGGTCAATCATTACAGGCCAAGTGTCTACTGAAGGCAAAGATTATTCTTTATCCATAATCCAAAACTAAACCCTGGAGAGCATTTATTCTCTTCCATTACTTCACCCCAGCACATTGCCCGTCTTGACTTGCCCCAAGCTGCCGGTATTAATGTGCTGTCGTTTTCTCTTG-TTATGGT

a
s	mr.mrrefChr5	67608	134	+	294542	TGACTGTACAATCCCATCAAATGGATGCCCATGGTCAACAATTAAATGCATGCCTCAATGACACTGTTGCCCCATGGATGAGTATGTTGCACCCCCATCACCATTTCAAGGATGCAGAGCACACATGACCTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	213027	111	+	636262	TGACCATACAATCCCATCAAATGGATGCCCATGGTCAACAATCAAATGCGTCCCTCAATGACACCGTTGACCCATTGATTAGTATGTTACACCCCAATCACCATT-----------------------CCCGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	204035	134	+	647215	TGCCTGTACAATACCATCAAATGGATACCCGTGGTCAACAATTAGATGTATGCCTCAATGACCCTGTTGCCCCATGGATGAGTATGTTGCACCCCCAACACCCTTTCAAGGATGCAGAGCACACATGACCTGGT

a
s	mr.mrrefChr5	67742	111	+	294542	GAGTGCTGCCACCACTGCACTTCCCTTACCTACATGTTGTTTTCAAGATCTCACATAAAATTCCAGGTCTTACTGAATGATCATCATCTCTTTCATCTGGTGGAGGATTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	213138	111	+	636262	GAGTGCTGCCACCACTGCACTTCCCTTACCTACATGTTGTTTTCAAGATTTCACATAAAATTCCAGGTCTTACTGAATGATCATTATCTCTTTCATCTGGTGTAGGATTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	204170	110	+	647215	GAATGCTGCCACCACTGCACTTCCCTTACCTACCTGTTGATTTCAAGATCTCACATAGAACTCCAGGTCTGACTGAATCAT-ATCATTTCTTTCATGTGGTAGAGGATTGG

a
s	mr.mrrefChr5	67853	334	+	294542	TGTTTGAGGAGTTTGCTCTAAAGAGAGTGTGGGTCCATGCATCTTTATAGAACACCAAGATAATTAGCCCTTTTTTGAAGGGCCCTTTTTTGAAGGAATGTACGTCAATGTACCTCAGTTACGGAGAGGACCAATAAGTGTGTGATCATGATTCTAAACAGGGAAACGAAATGAATAGAGTGGTGAACACATTGGTTGAGCTGCATAAGAGGTTAAAAGAAGTGAGGGCCAGAGACCCCCTCAGAATGAGGATGGTTCATCCTGTCACAAATTTTTTGAGCAAACCAAACCAATGAGTCTGCCTGGCAAGGAAATTCAAGGAGGGAGAAGATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	213249	334	+	636262	TGTTTGAGGAGTTTGCTCTAAAGAGAGTGTGGGTCCATGCATCTTTATAGAACAACAAGATAATTAGCCCTTTTTTGAAGGGCCCTTTTTTGAAGGAATGTACGTCAATGTACCTCAGTTACGGAGAGGACCAATAAGTGTGTGATCATGATTCTAAACAAGGAAATGAAATGAATAGAGTGGTGAACACATTGGTTTAGCTGCATAGGAGGTTAAAAGAAGTGAGGGCCAGAGACCCCCTCAGAATGAGGATGGTTCATCCTGTCGCAAATTTTTTGAGCAAACCAAACCAATAAGTCTGCCTGACAAGGAAATTCAAAGAGGGAGAAGATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	204282	281	+	647215	TGCTGGTGGATTTT----TGAGAAG----------CGTACATCTTTATAGGATACCAAGATATTTAGCCCTATTTTGAAGGGCCCTT----------------------------------AGGAGAGGAACAATAAGTGTGTGATGATGATTCTAAACAGGGAAACAAAATGGATAGAGTGGTGAACACATTGGTTGAGCTGCATAAGA----AAAAGAAGTGGGAGCCATAGACCCTCTCAGAATGAGGATGGTTTATCCTGTCACAAATTTTTTGAGC-AACCAAACCAATGAGTCCACCTGGCAAGGAAATTCAAGGAAGGAGAAGATAT

a
s	mr.mrrefChr5	68187	66	+	294542	AGAAACCTAGTAGGAAGTGTTGCACATAAAGGAGGGCAAGAGTAAACTAGAGAGCACATTTCCAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	213588	66	+	636262	AGAAACCTTGTAGGAAGTGTTGCACATAAAGGAGGGCAAGAGTAAACTAAAGAGCACATTTCCAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	204563	66	+	647215	AGAAACCCAGCAGGAAGTCTTGCACATAACGGGGGGCAAGAGAAAACTAGAGAGCATAATTCCAAA

a
s	mr.mrrefChr5	68253	93	+	294542	CAAAGTCATAAGCTAAAGGGTATAGAATCTGAACCTAAAGTTGTAATATAGGAACCACAGTATGGCGTGAGTATTTGGTGCAAGAGCATTTAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	204629	93	+	647215	CAAAGTCATAAACTAAAGGGTATAGACTCCGAACCTAAAGTTGCAATATAGGAACCACAGTATGGGGTGAGTGTTTGCTGCGAGAGCATATAA

a
s	mr.mrrefChr5	68346	238	+	294542	GATGTTTCTTCATGATATTCTTAATGAAAAAATGTTGATTACAACCTAAAAACACGTTGATTAGGTAGATTACAAATTGAAGATATATGTTGGTCCCAACAGTCAACTGGAAGCACATTAACCAGATAAGTGTAGTATTGAAGTTTGGTGATCTGTACAATGATGTGAGGGAATGAACTCAACTATCCGGGCACATAGTGGAACCACTCAAGTTACTTCAGAATGCTTGACATTCAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	213749	237	+	636262	GATGTTTCTTCATGATACTCTTAATGAAAAAATGTTGATTACAACCTAAAAACACGTTGATTGGGTAGATTACAAATTGAAGATGTGTGT-GGTCCCAACAGTCAACTGGGAGCACACTAACTAGATAAGTGTAGTATTGAAGTTTGGTGATCTGTACAATTATGTGATGAAATGAACTCAACTATCCAGGCACATAGTGGAACCACTCAAGTTACTTCAGAGTGCTTAACATTCAAG
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a
s	mr.mrrefChr5	68584	40	+	294542	GTGCATATGATATTATATCTCAGGTCTTACATTTACATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	213986	40	+	636262	GTGCATATGATATTATATCTCAGGTCTTACGTTTACATCA
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	214027	157	+	636262	AATGCATCGATACTTTTTTAAGAGGGAGCCTACTGATGCTTGACCTTGATTACGCCACATGTATAAGAATAGGGGCCTGCAGAGTTGCATGATGTGTTGATCTTGAAACCTTGTTAAAAATAGCACGGAATAATTCTGGGTATTTAAATACACTCAT
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a
s	mr.mrrefChr5	68781	846	+	294542	AAGATTATTAGTCAGGCAAGATCTAATAAGATCTAATGGGTCTGAACGAAATTGTTTGCCAGTGTGGGTCTAGCTTTGTTTTTTGGTTTAGTGTGTGCCTAGGATTCCGCTATACACTCCAGAGAGTTACTAACTTGTGAATATTCCAATGTGGTGTGCTAGTTGTTCCCATATATTGCACTGATACTTTACAGAGATATACTATCAGGATTATCTATTGATGATGGTGCAAGTTATCTCTTGCTCTCCTGCATAGAGGGTTTCTTCAGAAAACAGTGGTTCTCAACATTCAGTCTCAGCAATATGAATGATGCACAACTATACCTGAGTCCCAGCAAAGTGACAGTCAGTGCAGCAGCAGGAGCAACGGAATACCCTACAATATGGAGCACAATATAGAGAGGTTGATAGGCAACAAAGTGCTACGGAAAGGTTGGCATGGGGCCTGCAATTGAAGGGTAAAATCGCAGGTCCAATAGCAAAAAGAGAAGCGCGCTAGCAAGAGAAAATAGGGCCAAGACCTACATAAAGAAAAGCATTAATTGAGTATGTCATTGGCATTAGATGAGTGCTCTAGTAAACCCCTCTCAGGGAGAGTCTTTACCCATATCCTGGGAGGGTTGGGAATGATGGTTTAAACAGTAAAATGGACATATAAGTATTATATGTGATGGTTGTGGAAACACCAGTAAGCATATCAGGTTGGGAGAAGAATTTATCAAATCTTGTATGCCCATTGGTTGAGAGATGGAATGCCCACAATGCTCTGCTAGAGACTTGCAACATACTCTCTATCATGTGTACCAATGGCCCTGAAATCTTAGGAATGAAAACTTTTGTTTGCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	214189	836	+	636262	AAGATTATTAGTCAGGCAAGATCTAATAAGATCTAATGGGTCTGGACGAAATTGTTTGCCAGTGTGGGTCTAGCTTTGTTTTTTGGTTTAGTGTGTGCCTAGGATTCTGCTATACACTCCAGAGAGTTACTAATTTGTGAAGATTCCAATGTGGTATGCTAGTT-TTTCCATATAATGCGCTGATACTTTACAGAGACATACTACCAGGATTGTCTATTGATGATGGTGCAAGTTATCTCTTGCTCTCCTGCATAGAGGGTTTCTTCAGAAAACAGTGGTTCTCAACATTCAGTCTC--------GAATGATGCACAACTATACCTGAGTCCCAGCAGAGTGACAGTCAGTGCAGCAGCAGGAGCAACGGAATACCCTACAATATGGAGCACAATATAGAGAGGTTGATAGGCAACAAAGTGCTACGGAAAGGTTGGCATAGGGCCTGCAATTGAAGGGTAAATTTGCAGATCCAATAGCAAAAAGAGAAGCACGCTAGTAAGAGAAGATAGGGCCAAGACCTAAATAAAGAAAAGCAATAGTTGAGTATGTCATTGGCATTAGATGAGTGCTCTAGT-AACCCCTCTCAAGGAGAGTCTCTACCCATATCATGGGAGGGTTGGTAATGTTGGTTTAAACAGTAAAATGGACATATAAGTATTATATGTGATGGTTGCAGAAACACGAGTAAGCAGATCAGGTTGGGAGAGAAGCTAATCAAATTTTGTATGCCCATTGGTTGAGAGATGGAATGCCCACAATGCTCTGCTAGGGACATACAACATACTCTCTATCACGTGTACCAATGGCCCTGAAATCTTAGGAATGAAAACTTTTGTTTGCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	205156	836	+	647215	AAGATTATTATTCAGGCAAGATCTAAGAAAATCTAATGAGTCTGAACAAAATTGTTTACCAGTGTTGGTCTAGCTCTTTTTTTTGGTTTAGTATGTGCCTAGAATGCCACTATACACTTCAGTGAGTTGCTAACTTGTGAATATTTCAATGTGTAGTGTTAGTTGTTCCCATGTATTGCACTGACATTTTACAGGGATACACTATCAGGATTATCTATTGATGATAGTGCAAGATATCTCTTGCTCTTCTGCATAGAGGGTTTCTTCAGAAAACAGTGGTTCTCACCATTCAGTCTCAGCAATATGAATGATGCAAAACTAC-TCTGAGTCCCGGCAAAGTGACGATCAGTGCAGCAGCAGGAGCAATGGAATACACTACAATATGGAGTACAATATGGAGCGGTTGACAGGCAACAAAGTGTTACATAAAGGTTGGCATGGGGCCTGCAATTGAGGGGTAAAATCGCAGGTCCAATAGCAAAAAGAGAAGTGAG-CGGCAAGAGTAAAGAGGGACAAGACCTACATAACGGAAAGCATTGATTGGGTATAACA-------TAGGTAAGTGCTCTAGTAAACCCCTCTCAGAGAGAGTCTTTACCCTTATTCTGCGAGGGTTGGGAATGATGGTTTAAATGGTAAAATGGACATATAGCTATTATATGTGAT-GCTGTGGAAACACCAATATGCATATCAGGTTGGGAGGAGAATTTATCAAATCTTGTGTGCCCTGTGGTTGAGAGGTGGACTGTTCACAATGCTCTGCTAGAGACTTGCAACATACTCACTATCATGTGTACCAATGGCCCAAAAATCTTAGGAATAGAAACTTTTGTTTGCCT

a
s	mr.mrrefChr5	69627	117	+	294542	GTATCACATGAGCTAATCAGCCCATAACCCATGCTGTCAAATAAGATAGAGAAACTAAACAGCAACAAAGTCGTTTTGCTTTCCAGAATTGGTACAAAAAAAATTGAAGTCCTTGTA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	206042	117	+	647215	TTAACACATGAGATAATCACCCCATAAACTCTGCTGTTAAATTAGATAGAGAAACTAAACAGCAACAAAGTGGTTTTGCTTACCAGAATTGGTACAAAGACAATTGAAGTCCTTATA

a
s	mr.mrrefChr5	69744	43	+	294542	TAAGCAGGCCTTTAAGGCGAGTGTAGCTGGCATGTTACAATTT
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a
s	mr.mrrefChr5	69787	17	+	294542	GTGTAATAAGTGAATCA
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a
s	mr.mrrefChr5	69804	93	+	294542	GTTTTGCTACAAGGCTGGCTAATTCTCATTTATCCCCATTTGGGACGCTTATTAGAGCCATTGTTTCTAGTCCTTACTTGCCTCTAGTGCCAC
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a
s	mr.mrrefChr5	69897	65	+	294542	TTTGATAAGGGTTGCAAGTATGAGTATCTTGAGTTGTTGTGAAGTCTGTTGTATGATGGTTATCC
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a
s	mr.mrrefChr5	69962	75	+	294542	TTAGATGTATCTTGGGCTGCTGTATAACCTGGTGTAGGATGGCCAGCCTCAAATGCAAAAACCCAATTCTCATCT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	206387	70	+	647215	TTATATGTATCTTGGGCGGCTGTATAACCTGCTGTAGGATGGTCAG-CTCTAATGC----ACCCGATTCTCATCT

a
s	mr.mrrefChr5	70037	126	+	294542	AATTAGTGGTGTTTGTGGAGGTTCACGGAACATACATATTCTAAATCTATGTTACCAGCAGTGAGTCATCAATATAGGGTCTAGAAGGGCATGTCTGATCTGTTCTGAGTAAACTGACTTTTATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	215440	126	+	636262	AATTAGTGGTGTTTGTGGACAATCATGGAACATACATGTTCTAAATCTATGTTACCAGCAGTGAGTCATCAATATAGGGTCTAGAACGGCATGTCTGATCTGTTCTGAGTAAACTGACTTTTATAA
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a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	206584	506	+	647215	TTTCTTTCATAGCTGTCAGATGGTCATAGAAGCCAACCTACTCTAAAAAACAAAGTCACATGCACGAGGTTGAACTCAATATACAGTCCTCCAG-------ATGCTGGCTCAACATGGGTTATCACGTGCACTAGATAAATATTGCCTGGTTACGATCTGTGGAGATTAGGCCGTCTCATATGAGCCTCTTCTGGATAAGTGTATACATTATTGTGAGTAGGAGCTAAAGATATCACTGTGAAGATGAAGGCTAGAGTACAAAATCTCAAAACCCTGACAGGGGAGTCCAGAATCAGGAGTCTTCATAATACAGTCCTTGCTGGGATAATCAGCCTGACACAGAGACTCACAGAGTAATTTTGACATGCAGAATAATCTGCACTCATTAATCCTTCAATTCTAACAAAATAAAACTTATTGTCTGGTATAAAAGAGAACTCATTTATTGTATGCAATCTACATAGACTACCCAATCTCCAACTACATTCAGTAATACTGCACCTAATGAGCCA

a
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a
s	mr.mrrefChr5	70721	13	+	294542	TCCAACCAACCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	216122	13	+	636262	TCCAACCTATCTG
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a
s	mr.mrrefChr5	70734	115	+	294542	TAAGCTAAACAAAACTTATTAGATATGTATAATGAGCAGGGACTCAATCCTTTCTCACAATTGTTAATCAGGACTTGCTCTCCCACCCTGTGGCTGCCAATTTAAGGTGAAAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	216139	115	+	636262	TAAACTAAACAAAACTTATTAGGTATGTATAACGAGCAGGGGCTCAGTCCTTTCTCACAGTTGTTAACCAGGACTTGCTCTCCCACCCTGTTGCTGCTAATTTAAGGTGAAAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	207202	115	+	647215	AAAGCTAAACAAAAACTACTAGATATGTATAATGAGCAAGGACTGAATACTATATCATAATTGTAAATCAGGACTTGCCCTCCTACCCTGTGGCTGCCAATCTAAGGTGAGCATT

a
s	mr.mrrefChr5	70849	266	+	294542	TCAGCATAGAAATGGAAGAAGCTCCCTATCTTTATGTCTTACTGGAAGAGACATAATAGATGAGGCTTTAGGGCCTGACTTGATCATCACCGACTGAGGCCCGTGCTGTTGTCATTCCTATGTCATGTCTTCTTATAAGACAAACTAGTCATTTCATCCTTCCTAGACTTCTTCTTGTCCATGTTAAGTGTTGTGCAGGGTGAGACCATGTAATTTATTTACTGTATCTAGTTTTATTTTTTATGATTATAATTTTACACATAAAG
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a
s	mr.mrrefChr5	71115	106	+	294542	ATAGCTCTGATTGTGTTCTCTGTGTACCAAGTTAATCAGGATCAATGGTTAGTTGTGGCACTGAAATTATTGTACAACAGCCACCAGTGGGTGGCAGGTCCCTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	216521	106	+	636262	ATAGCTCTGATTGTGTTCTCTGTGTACCAAGTAAATCAGGATCAATGGTTAGTTGTGGCACTTAAATTGTTGTACAACAGCCACCAGTGGGTGGCAGGTCCCTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	207584	106	+	647215	ATAGGTCTGATTGGGTTCTCTCTGTGCCGAGCTAATCAGGATCAATGGTTAGTGGTGGCACTGAAATTATTGTACAACAGTCACCGGTGGGCGGCAGGTCCCTGTC

a
s	mr.mrrefChr5	71221	459	+	294542	TTCCCTATCTAATAACTGTCACTTTTAGCATCAGGATTATAATTGATGCATGTGTTGAACAGCGTCCCTGGCAGAAAGCTGAGTTAGCACAGTCTTGGTTACTTCTAATTCAATGGGCACAACCAAGTGGCACATAGGATACACCTTTATGCGTGTTGTGGGCTTGTTCTATAGCATATGGTAGTAAATGACATGATTTGAACCAACAGATGCAGCTCAACCTACACAATTACCACACCTGTAAGTTTTAGTCAGTAGCAATCATGTTAGTTAATGAAAAAGTAAGTCCCTCCCACCTAAATTAACTATTAGATGCACCTGGATTACACCCAACTTGAGTATTGAAGTCTGCCTAGTGCACATATTGAATACCCTGATATTGCTTTAACTGAGGACATGACCCTCATGACCATACATATGAGTTGAGGTTACCATAATCCAGAATGCAGACCGATAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	216628	455	+	636262	TTCCCTATCTAAACACTGTTGCTTTTAGCATCAGGATTATAATTGATGCAGGTGTTAAACAGCGTCCCTGGCAGAAAGATGAGTTAGCACAGTCTTGGATACTTCTCATTCAATGGGCACAACCAAGTGGCACATAGGATACACCTTTA----TGTTGTGGGCTTGTTCTGTAGCATATGGTAGTAAACAATGTGATTTGAACCAACAGATGGAGCTCAACCTACACAATTACCACACCTGTAAGTTTTAATCAGTAGCAATCATGTTAGTTAATGAAAAAGTAAGTCCCTCCCACCTAAATTAACGATTAGATGCACCTGGATTACACCCTACTTGAGTATTGAAGTCCGCCTTGTGCACATATTGCATGCCCTGATATTGCTATAACTGAAGACATGACCCTCATGACCATACATGTGAGTTGAGGTTACCATAATCCAGAATGCAGACTGATATCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	207690	450	+	647215	TTCCCTATCTAATAACTGGCACTTTTGCCATCAGGACTATAATTAACACATGTGTTGGACATCATCCCTGGCAGAAAGCTGAGTTAGCACAGTCTTGGTTACTTCTAATTCAATGGGCGCCGCCAAGTGGCACATAGGATAACCCTTTATGCGTGTTATGGGCTTGTTCTATAGCAGATGGTAGCAAATGACATGATTTGAACCAACAAAGGCAGCTCAACCTCCATAATTACCATACCAGTAAGTTTTAGTCAGTAACAATCATGTTAGTTAATGAAAAAGTAAGTCCTTCCTGCCTTCATTAACTATT------ACCCGGATTGCACGCAACTTGAGTATGGAA---TGCCTAGTGCACATAATGAATACCCTGATATTGCTTTAACTAAGGACATGACCCTCATGACCATACACAAGAGTTGTGGTTACCATAATCCAGAATGCAGACCAATAACC

a
s	mr.mrrefChr5	71680	77	+	294542	TGGCAGCAATGCATATCTAATGATGTAGTCATGCTTGACAGTTAGAGGTTGGTTACATCTTGAAGTACTGAAGCCTG
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a
s	mr.mrrefChr5	71757	7	+	294542	ATCTATC
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a
s	mr.mrrefChr5	71764	29	+	294542	ATAATGTGATGGGTATAGTTAGTAAATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	217203	29	+	636262	ATAGTGTGGTGGGAATAGTTAGTAAATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	208291	20	+	647215	ATAACGTGAAAATTCTAGTT---------

a
s	mr.mrrefChr5	71793	15	+	294542	TTTTGATTAAATGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	217236	15	+	636262	TTTTGATTAAATGAA

a
s	mr.mrrefChr5	71808	157	+	294542	CATTTTCATAGCAAGGATGGACATTCAAACATGGGACTGGCTGCATACATGTCACTTTCTTGTTTCTTTCTCTATAACAGTTAACAAGCTACTAAACAGATTGAGACAGAGAGGGAGTCCCAGAGCACCCTATTTAGGTGCTCCTTCCAATGGAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	217253	157	+	636262	CATTTTCATAGCAAGGATGGACATTCAAACATGGGACTGGCTGCATACATGTCACTTTCTGGTTTCTGTCTCTATAACAGTTAACAAGCTACTAAACAGATTGAGACTGAGAGGAATTCCCAAAGCATCCTATTTAAGTGCTCCTTCCAATGGAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	208311	102	+	647215	-------------------------------------------------------TCTCTTGTTTCTTTCTCTGTAACAGTTAACAAGCTACTAAACAGATTGAGACAGAGACGGAGTCCCAGAGCACCCTATTTAGGTGCTCCTTCCAGTGGAAGC

a
s	mr.mrrefChr5	71965	86	+	294542	CTTGACTTATAGGTTTCATGAATAAGAATGGATTATCTAAAAACAGGCTTTCCTTAACTCTTGTTGGTGTGTTCTGTTTCAGTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	217419	86	+	636262	CTTGACTTATAGGTTTCATGAATAAGAATGGATTATCTAAAAACAGACTTTCCTTAACTCTTGTTGGTGTGTTCTGTTTCAGTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	208413	86	+	647215	GTTGACTTATAGGTTTCATGAATAAGAATGGATTGTCTAAAAGCAGGCTTTCATTAACTCTTGTTGGTCTGTTCTGCTTCAGTGAT

a
s	mr.mrrefChr5	72051	254	+	294542	CCCAATGGTCCAGAACTTGCTGGGTCTTGGGTGGTTGTACTAGTGTGTCTGCTTGCTTGTTTGGTAAGTTCCTTAGGAGAAGAAAAAGGAGACCATGACTATTTGGGAGAAAAATGAACACTGTGAGAAGTTTTTAGCAGTTGGGCATGACACCAAATTAACCATTCAATGGATTCAGTAATTGCAGACATTAGATTGAAGCAACATTCTGCTATCCTATCGATAGATTTTGGACACCAAAGATATGCCAATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	217508	233	+	636262	CCCAATGGTCCAGAACTTGCTGGGTCTTGGGTGGTTGTACTAGTGTGTC----TGCTTCTTTGGTAAGTTCCTCAGGAAAAGAAAAAGGAGACCGTGACTATTTGGGAGAAAAATAAACACTGTGAGAAGTTTTTAGCAGTTGGGCATGACACCAAAATAACCATCCAGTGGATTCAGTAATTGCAGACATTAGATTGAAGCAA-----------------GATAGATGTTGGACACCAAAGATATGCCATTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	208499	254	+	647215	CCCAATGGGCCAGAACTTGCTGGGTCATGAGTGGCTTTACTAGTGTGACTGCTTGCTTGTTTGGGACGTTCCTTAGGAGAAGAAAAAGGAGACCATGACTATTTGGTAAAAAAATGAACACTGTCTAAAGTTTTTAGTAGTTGGGCATGACACCAAATTGACCATTCAATGGATTTGGTAACTGCAGACATTAGATTGAAGAAACATTCTGCTATCCTATCCATAGAGTGTGTACTCCAAAGATATGCCAATTT

a
s	mr.mrrefChr5	72305	23	+	294542	ATAGTTGACCCACATTTGGTCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	217775	23	+	636262	ATAGTTAAGCCACATTTGGTCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	208753	20	+	647215	ATAGTTGACCCACATTTGGT---

a
s	mr.mrrefChr5	72328	118	+	294542	AACTACCCCCATGCAAGGCATCCCCAGATGATTCTGGTAGGCCAGTAGCCACCTTAGGTTTAAGAAAGCAAAATCTGAGGAGTATACAAGTAAGCTAATGTCTGTTGATGTACTCTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	217799	118	+	636262	AACTACCCCCATGCAAGGTATCCCTACATGATTCTGGTAGGCCAGTAGCCACCTTAGGTTAAAGAAAGCAAAATCTGAGGAGTATACAAGTAAGCTAATGTCTGTTGATGTACTCTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	208773	102	+	647215	----------------TGCATCCCCAGATGATTCTGGTAGACCAGTAGCTCACATAGACTTAAGAAAGCGAAATCTGAGGAGTATACAAGTAAGCTAATGTCTGTCGACATACTCTTG

a
s	mr.mrrefChr5	72446	47	+	294542	GTGCTGAGGAGGGGGGAGCACCTAGTGTGAGACTGTGAATATTTCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	217933	47	+	636262	GTGCCAAGGAGGGGCAAGCACCTAGTGTGAGACTGTGACTATTTCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	208875	47	+	647215	GTGCTGAGGGGAGGGGAGCACCTAGTGTGAGACTGTGAATATTTCTC

a
s	mr.mrrefChr5	72493	92	+	294542	CTGCTTGGATTTGCTCTTTCACCCCAATAACTATCAGAATGGCAGATGCTCTAAGCCAAATGAGGAGAAACTGATTACCAGCAGGACCGGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	217983	92	+	636262	CTGCTTGGATTTGCTTTTTCACCCCAATAACTGTCAGAATGGCAAATGCTCTAAGCCAAATGAGGAGAAACTGATTACCAGCAGGGCCGGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	208922	92	+	647215	CTGCTTGGATTTGCTCTATCACCCCAATAACTATCAGAATGGCAGATGCTACCTGCCAAAAGTGGAGAAACTGATTACCAGCAGGACCGGAC

a
s	mr.mrrefChr5	72585	304	+	294542	TGCTTGTGGTGGAGTGGTTAAGTACATGTATCAGGATGTCCCTTTTCACTTAGTTTCAACCTGATTTATCAAATCCTCTGTCGCTTCCCACATGAATGACATCAAAATGGGAATCCTTGAGTTGTATTACATCcaataaCTAAatcacaATAGTAATATTAAAAGTCTATGTTCCCATTGAGCAACTTGGAGTGATTACCATCACTAAGCAGTTTAACAGTCAAGGGATAATAACACCGCCCAAAGTGAATGCACAATTGAGGAAACACACTAAGTGGCAACCTGACAAGTGTGAGCATTCCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	218077	304	+	636262	TGCTTGTGGTGGAGTGGTTATGTACATGTATCTGGCTGTCCCTTTTCACTTAGTTTCATCCTGATTTAACAAATCCTCTGTCGCTTCCCACATGAATGACATTCAAATGGGAATCCTTGAGTTGCACTACATCCAATAACTAAATCACAATAGTAATATTAAAAGTCTATGTTCTCAGTCAGCAACTTGGAGTGATTATCATCACTAAGCAGTTTAACAGTCAAGGGAGAATAACACCGCCCAAAGCGAATGCACAATTGAGGAAACACACTAAGTCGCAACCCGACAAGTGTGAGCATTCCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	209014	283	+	647215	TGCTTGTGGTGGGGTGGTTAAGTACATGTATCAGGACCTCCCATTTCACTTGATTTCAACCTGATTTATCAAATCCTCTGTCACTTCCCACATGAATGGCATCAAATTGGGAATCTTTGAGTTGTATTACATC------CTAA-----------GATATTAAAAGTCTATATTCCCATTGAGCAACTTGGAGTGATAACCATCACTAAGCAGTTTAACAGTTGAGGGATAATCCCACCAACCAAAGTGATTGCACAATTGAGGAAACACACCAAGTGGCAACCTAACAAATGCGAGCATT----

a
s	mr.mrrefChr5	72889	32	+	294542	AGAATGTTTTAAATGTGGGTAGGCCACAACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	218386	32	+	636262	AGAATGTTTTAAATGTGAGTAGGCCACAACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	209297	32	+	647215	AGAATGTCCTAAACGTTGGTAGGGCCCAACCA

a
s	mr.mrrefChr5	72921	112	+	294542	TGTTGATTGTAATTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTCCATAGGCAATGTTTGGATTTTCAGAATGCTGATTGTAATTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTTCGTATGCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	218425	111	+	636262	TGTTGATTGTAATTTTCAACAAGAACTTTAATCTTTCTCTAT-GGCAATGTTTGGATTTTCAGAATGCTGATTGTAATTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTTCGTATGCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	209329	109	+	647215	TGTTGATTG---TTTTCAACAACAACTTTAATCTTTCTTCATAAACAATGTTTGGATTTTCAGAATGCTGATTGAAATTTTCAACAACAATTTTAATCTTTCTCCATAGGTG

a
s	mr.mrrefChr5	73033	11	+	294542	CTTGGATTTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	218536	11	+	636262	CTTGGATTTTC
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a
s	mr.mrrefChr5	73044	133	+	294542	GAATACTATCTCCTGGTATCCCTTTGCTGGTCGATACCTCATCCACTATTTAGACATATGTCAATCACACACCTATAAATCCCTTAACTACTACTTCTGGATACTCATGAGCTACTACTGGCTCCTCATGTTA
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a
s	mr.mrrefChr5	73177	186	+	294542	TACAGTCATTATCATGCTTTGGAGCTTTCTAGTGTACACAGTATATAGCATTAGATTCCCTTGGACCTTGGACCACCACGATCAAGGGCCCTCACTACCTATCTTTTACCTCATTTGCACTTGCAAGTATAGAGAAGCTAGGCTCTCTAAGGAGGTCAGTCTGAGACTCCAATGGTTTAGTTTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	218682	186	+	636262	TACAGTCGTTATCATGCTTTGGAGCTTTCTAGTGTACACAGTATATAGCATTAGATTCCCTTGGACCTTGGACCACCACGATCAAGGGCTGTCACTACCTATCTTTTACCTCATGTGCATTTGCAAGTATAGAGAAGCTAGGCTCTCTAAGGACGTCAGTCTGAGACTCCAATGGTTTAGTTTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	209620	146	+	647215	TACAGTCATTATCATGCTTTGGAGCTTTCTAGTGTACACAGTATATAGCATTAGATTC-------ACTGGGATGACCACGATTAAAGGCCCTCACTACCTATCTTTTACCTCTTTTGCACTTGCAAGTATTGAGAAGC-AGGCT------GGAGGTCAGT--------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	73363	21	+	294542	AGAACCCATGACATTATATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	218870	21	+	636262	AGAACCCATGACATTATATCT

a
s	mr.mrrefChr5	73384	59	+	294542	AGACTAACTGTGATGCTGGTAGAGGAACATACCCATGCATTTATCACCTTACAATTAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	218892	59	+	636262	AGACTAGCTTTGATGCTGGTAGAGGAACATACCCATGCATTTATCACCTTATCATAAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	209766	56	+	647215	---CTAACTGTGACGTTGGTAGAAGAACATACTGATGCATTTATCACCTTACAATTATG

a
s	mr.mrrefChr5	73443	45	+	294542	CAAGGTTAAATGACCAGGTATTAAGCTCTGGGTGGTGATTTGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	218954	45	+	636262	CAAGGTCAAATGACCAGATATTAAGCTCTGGGTGGTGATTTGTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	209822	44	+	647215	CAAGGTTAAATGGCCAGGTGACAAGCTCTGGG-AGTGATTTGTGT

a
s	mr.mrrefChr5	73488	38	+	294542	ACAACCGAACTGACGAATTGGGCTAAGTTGCAAACTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	219002	38	+	636262	ACAACCAAACTGACGAATTGGGCTAAGTTGCAAACTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	209866	38	+	647215	ACAACTGACCTAACAAATTGGGCTAAGTTGCACATTAA

a
s	mr.mrrefChr5	73526	494	+	294542	ATCACTTGAGAACGCCCATTAGTAAGCATTTTAGTCCATTCATTACGGGGTAAAATAGCTGGAGGATTCCTACGTTTTTTACATGAGATTGGAGATTTGCCGCCACCAGTAACATGCCACTTAATATAGTATGTTCATTTATCCATGGCTATATGCCTGTGAGACCACAACCTTATTTGAAGCCTCCCTTGTCCCATCAATGAGTGGAACTGGGTCTAAAACCACTTATACCCCTCCTCTATTTTCCACCCTATATCTAGATGGTGACACTAAAGCATGTGAACAATTTACCATCCCTTTTGTTGGCTGTTGTCAAGCCACAAGAATTTTGCTGTCTCAGGTGCCCAGCAATTAGATAATAATTTTGGCTCTTATTTATGTCCCCAACAGTCAGGATATCTATCTTCTCAGGTATCCTTAATAGAGGGCTCTGCAGATTTTCTTATGCCCTATTGAGTGGGTTTTAGGTTCACTCATCCAACCACCACAACCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	219049	425	+	636262	ATCACTTGAGAACGCCCGTTATTAAGCATTTTAGTCCATTCATTACGGGGTAAAATAGCTGG---------ACATTTTTTACATGAGATTGGAGATTT---GCCACACGTATCATGCCGCTTAATATAGTATGTTCATTTATCCATGGCTATATGCCTGTGAGACCACAACCTAATTTGAAGCCTCCCTTGTCGCATCAGCA---------------------------ACCCTTCCTCTACTTTCCACCCTATATCTAGATGGTGACACTAA-----GTGAACAATTTACCATCCCTTTTGTTGGCTGTTGTCAAGC------GATTTTGCTGTCTCAGGTGCCCAGTGATTAGATAATGATTTTGGCTCTTATTTATGTCCC--------------TTTGTCTTCTCGCGTATCCTTAGTAGAGGGCTCT---GATTTTCTTATGCCCTATTGAGTGGGTTATAAGTTCTCTCATAC--CCACCACAACCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	209904	486	+	647215	ATCACTTGAGAACCCCCATTAG-----ATTTGAGTCCAGTCATTATGGGGTAAAATAGCTGGAGGATTCCTAGGTTCTCTATATGAGATTGGAGATTTGCCGCCACCAGTTACATGCCACTTACTACAGTATGTTCATTTATCCATGGCTATATGCCTGTGAGACCACAACCTTATTTGAAGCCTCCCTTGTGCCATCAATGAGTGGAACTGGGTCTAAAACCACTTATACCCCTCCTCTATTTTCTACCCTATATCTAGATGGTGACACTAAAGCATGTGAACAATTTACCCTCCTTTCTGTTGGCTGTTGTCAAGCCACAAGAATTTTGCTGTCTCAGGTGCT--GCAAGGAGATAATAATTATGGTTCTTGTTTATGTCCTCAACAGTCAGGATATCTATCTTCTCAGGTATCTTTAATAGAGGGCTCTGCAGATTTTCTTGTGCTCCATTGAGTGGGTGTTAGGTTCACCGATCCAACCACCA-AACCAC

a
s	mr.mrrefChr5	74020	268	+	294542	TAGTTGTCTTTGCTGTATAAAATAGACCACCCTGCATTATTGCATCCCAAGGTTTTCAGGTCCTTACTCTCATTTTTCTTGCATCTTGTGTGTGGTTCGTATTAGTTTTAATAGATGTGAATTGGTGTTATACTACTTTTCTTTCCTGAATCTGTGAGTCTGCTGAGGGTATTCTGTATGTCCATTATGGTGTTAGACTAGGATCAGTAGCATCTGATCTGAGAGGTAGTTTATGGCAGTATTGTTTGCCTTGCATCTATCAAAAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	219474	263	+	636262	CAGTTGTCTTTGCTGTATAAAATATACGACCCTGCATTATTGCATCCCAAGGTTTCCAGGTCCTTACTCTCATTTTTCTTGCATCTTGTGTGTGGTTCGTATTAATTTTAATAGGTGTGAATTGGTGTTATACTACTTTTCTTTTCTAAATCTGTGAGTCTGCTGAGGGTATTCTGTATGTCCATTAT----TTAGACTAGGATCAGTAGCATCTGATCTGAGAGGTAGTTTATGGCAGTATTGTTTGCCTTGCAC-TATCAAAAAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	210400	268	+	647215	TAGTTGTCTTTGCTGTATAAAATAGACCACCCTGCATTATCTCATCCCAAGATTTTCAGGTGCTTATTCTCATTTTTCTTGCACCTTGTATGTGGTTTGTAATAGTTATTATAGATGTAAATTGGTGTTATACTACTTTTCTTTCCTGAATCTGTGAGGCTGCTGAGGGTATTCTGTATGTCCATTATGGTGTTAGACTAGGATCAGTAGCATCTGGTCTGAGAGGTATTTCATGGCAGTATTGTTTGCCATGCATCTATCAAAAAGA

a
s	mr.mrrefChr5	74288	48	+	294542	GCCTTGCTTAGTAAATCATGCCCAGTCTCTTAATGTAAAAGCTCTGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	219738	48	+	636262	CCCTTGCTTAGTAAATCATGCCCAGTCTCTTAATGTAAAAGCTCTGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	210668	48	+	647215	GCCTTGCTTAGTAAATCATTCCCAGACTCTTAAGGTATAAGCTCCAGA

a
s	mr.mrrefChr5	74336	117	+	294542	AGCAGAGGAGGACATGGTAGAAGTACAACATAGATCTCCCTTTAGCAATTAATATGACAGACTTGGCACATTGTTAAGTGTTACACATTCAGATGTATAAGACAGTAGGCTACCCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	219806	96	+	636262	AGTAGAGGAGGACATGGTAGAAGTACAACATAGATCTCCCTTTAGCAATTAATATGACAGACTTGGCACATTGTCAA---------------------AAGACATTAGGCTACCCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	210716	117	+	647215	AGCAGAGGAGGACATGGTACACGTACAACATAGGTCTCTCTTTATCAATTAATAGGACAGACTCGGCACATTGTTAAGTGTTACACATTCAGATGTATAAGGTCGTAGGCTACCCAA

a
s	mr.mrrefChr5	74453	73	+	294542	CCTTCAGCATGACTGATTGCACCAAACATTTAAATCCCTGGGTAAGGGTAGGAGGGTAAACAAAACGACATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	219902	73	+	636262	TCTTCAGCATGACTGACTGCACCAAACATGTAAATCCCTGGGTAAAAGTAGGAGGGTAAACAAAACTACATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	210834	73	+	647215	CCTTCAGCATGGCTGATTGCACTAAACATTTAAATACCTGGGTAAGGGTAGGAGGGTAAACAAAACGACGTGT

a
s	mr.mrrefChr5	74526	186	+	294542	CTGCCTTACACTGAAGCTAACAATATTTACTGCTACATGAGGTCAGCAACCAAAAGATTACAAGAAACGACTTGCATAAACAGATGGCAGTGAAATGCAGGACCATAATTGTTCCACTTCAATCACTATAAAAGCTATGATTGACCCTGTCCAGGGCATTGTGGCTCATGACTGTGGTCCTATCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	219976	177	+	636262	CTGCTTTACACTAAAGCTAACAATAT---------CACGAGATCAGCAACCAAAAGATTACAAGAAGCGACTTGCATAAACGGATGGCAGTGAAATGCAGGACCATAATTGTTCTGCTTCAATCGCTATACAAGCTATGCTTGACACAGTCCAGCGCATTGTGGCTCATGACTATGCTCCTATCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	210907	186	+	647215	CTGCCTTACACTGAAGGTAATGATATTTACTGCTATATGAAGTCAGCAACCAAAAGATGACAAGAAACAACTTGCATAAAAAGATGGCAGTGGGATGCAGGACCATAATTGTTCCACTTCAATCACTATAAAAGCTATGATAGACCCTGTCCAGGTCATTGTGGCTCAAGACTGTGGTCCTATCTA

a
s	mr.mrrefChr5	74712	149	+	294542	TCGAGACCTTTTTTCAAGCTTCTTATACCAACAACCAAATGCAATGCCCCCCTGTACAAGGCAGTGCTCACTGTTAGGACCCACCATTTTGCAGAAAGCTGCACAGCCCTTGGCTGGCTATCTTGGGAAAGCTCTAGTGGGCTCTTTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	220159	148	+	636262	TCGAGACCTTTTTTCAAGCTTCTGATACCAACAACCAAATGCAATGCCCCCCTGTACAGGACAGTGCCCACAGTTAGGACCCACCATTTTTCAGAAAGCTCCACAG-CCTTAGCTGGCTATCTTGGGAAAGCTCAAGTGGGCTCTTTAG
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a
s	mr.mrrefChr5	74861	42	+	294542	GTAGTTTGATGCTATGCCACCAGATGCCAATATCCAGTGATT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	211323	42	+	647215	GTAGTTTGATGCTATGCCACTAGATGACGATATCCAATGATT

a
s	mr.mrrefChr5	74903	117	+	294542	GTGTCAACAAGTTTAAGCCTCCCTGATTGTCTCACACAGTTGTGCCTTGTGTAACTGAGAGATATGATGGAACTTACTGTTAGTCATTAAGTTCATGTATGCTTTAGTTCAAAGGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	220349	117	+	636262	GTGTCAACAAGTTTAAGCCTCCCTGATTGTCTCACACAGTTGTGCCTTGCGTAACTGAGAGATATCATGGAACTTACTGTTAGTCATTAACTTCATGGACGCTTTAGTTCAAAGGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	211366	116	+	647215	GTCTCAACAAGTTTAAGCCT-GCTGATTGTCACACAAGGCTGTGGCTTGTGTAAATGAGGGATAAGATGGAACTTACTGTTAGTTGTTATGTTCATGTATGCTTTAGGTCAGAGGCC

a
s	mr.mrrefChr5	75020	18	+	294542	TGTTCCAGTCCCATGACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	220466	18	+	636262	TGTTCCAGTCCAGTAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	211508	18	+	647215	GGTTCCAGTCCCATGACC

a
s	mr.mrrefChr5	75038	7	+	294542	TGTCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	220484	7	+	636262	TGTACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	211527	7	+	647215	TGTCCTG

a
s	mr.mrrefChr5	75045	17	+	294542	TTTACCCTACACACGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	220643	17	+	636262	TTAACCCTACCCTCGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	211534	17	+	647215	TTTACCCGGCACACGGT

a
s	mr.mrrefChr5	75062	66	+	294542	TTATACATTACATAGATGTCACGGTTGTAGGTATTAGGAGCATCATTGGAACTGGTTGACCCAATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	220660	66	+	636262	TTATACATTACATAGATGTCACGGTTGTAGGTATTAGGAGCATCATTGGAACTGGTTGACCCAATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	211579	66	+	647215	TCATAGATTACACAGATGTTGTTCTTGTAGGTATTAGGGTAATCATTGGAACTGGTTGATCCAATC

a
s	mr.mrrefChr5	75128	37	+	294542	AACCCCAGCTGATTCAGCAGATGGGACCACCATTCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	220727	37	+	636262	AACCCCAGCTGATTCAGCAGATGGGACCACCATTCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	211645	37	+	647215	CACTCCAGGTGATTCAGCAGATGGGGCCACCATTATG

a
s	mr.mrrefChr5	75165	49	+	294542	AAGATGGTGATGCCTTATCAAAAACCCTGCCCTCCATGAGGAGGTTTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	220765	49	+	636262	AAGATGGTGATGCCTTATCAAAAACCCTGCCCTCCATGAGGAGGTTTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	211682	49	+	647215	AAGATGGTGATGCCTTATCAAAAACCCTGTCCTCCATCAGGAAGTTTGG

a
s	mr.mrrefChr5	75214	42	+	294542	AGACTATGGCATTCCACCTCCTAGAATTCCACCCCCCTATAC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	211731	42	+	647215	AAGCTATGGCATTCCACCCCCCACCATTCCACCCCCTTATAC

a
s	mr.mrrefChr5	75256	18	+	294542	GCAGGTCTAAGTCACAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	221045	18	+	636262	GCAGGTCTAAGTCACAGG
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a
s	mr.mrrefChr5	75274	24	+	294542	CATGCATTACAGCCATCTTCTCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	221063	24	+	636262	CATGCATTACAGCCATCTTCTCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	211792	24	+	647215	TATGCATTACAGCCATCTCATCTA

a
s	mr.mrrefChr5	75298	74	+	294542	ACAGACGGTTATTGTGAGTATGTGCATCAATATGCCCTCCTTTCAATTATACCAAGCCAATGCGACTGTAGAAT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	77492	206	+	294542	ACAACATGCCCCCAAATCAAACATAACCAGATGAGACGGGGAATAAAATAACTTGAGATTGTAGATGATAGCCTCATTTATCCATCATGAGGGTTCAATTGATGCTAGTACAGTGTACGGGACTAACGTAACCTCAGATGGCCAAGCATCCAAAAAGTATATTAATTGGCATGCAGTTCAATAGGGTAACAACATGTGCACATCTC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	214092	206	+	647215	ACAACATGCCCCCAAATCAAACATAACCAGATGAGATGGGGAACGAAATAACTTGAGATCCTGGATGATAGCCTCATTTATCCGCCATGAGTGTTCAATTGATGCCAGTACAGTTTGCAGGACTAATATAACCTCAGATGGCCAAGCATCCAAAAAGTATATTAATTGGCATAGAGTTCAATAGGGTAACAACATGTGCACATCTC

a
s	mr.mrrefChr5	77698	149	+	294542	TGCTCAGGGCATGACAAGGAAATAATTGTTGCACTATGTGGCATTCATTGGTGCAAGGCATATTATGTTAAGGTGGCTTCCAAAAACTTAACACTCAGATAGGACTTGATTTCTAATTAGATTCAGTCCAGCTTAGTGTGGGAGTTCGT
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a
s	mr.mrrefChr5	77847	79	+	294542	GATTGATAGAGGCACAGGGACATGAAATGCTGTTCATTCAATTTAATCTACTGATTCAAGCATGTTTAGTCCAAGAAAT
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a
s	mr.mrrefChr5	77926	202	+	294542	TTACAATAACCAATATAGATCTTTTTTTACTAACTATTCTAGTAAAAAGCATACTTACACATGTTGATGCTGCTTAACCATCTATATCCCCTGCACGCTTCAGCAGTCTAATACCCCTCCGAATTTCAATGTCCAAGGCACCTTGGGCTGACTGAATGAATTGTTAATCATCTAAATATTTATTGAACCTAATCCACTGTAC
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a
s	mr.mrrefChr5	78128	77	+	294542	TTTTGAGCTTTAGCCATGTAAAGTTGGGTGTAGTGTCATTATAACACAGGGATACCAAGATGCATTTTGTCGTTTCT
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a
s	mr.mrrefChr5	78205	131	+	294542	GCATGATATCGGATGATCAAAATAAGGAGTAGTGCATGACAGACTACTAATCCTTAAGAGATGTTGTCTTATTGTTGTTTAGATTTCATCAAGTGCCTTTGAAAGATAATAACGGAAGAACCATGAAAGCT
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	78478	48	+	294542	GGGAACCAGTTAGGATAAGCATAAGCTTTCTAGTTGATAATCTGCAGT
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a
s	mr.mrrefChr5	78526	28	+	294542	TTTGCAGGGCAACTGTGAGTATCCTCTA
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a
s	mr.mrrefChr5	78554	189	+	294542	CCAATCCTTGTTCTAAGTTTTATTCAAACATTGTCTTCTTGGAGAgcagggtgtgcaactgcgtgaggactcacactggcagggtaacagaatatgtactttggacaagtgctgcaactggacctacccccctcaaactattcagtactctgtgtgatgtttttgagaaattaatgtgctcaacaaaca
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	224379	189	+	636262	CCAATCCTTGTTCTAAGTTTTATCCAAGCATTGTCTTCTTGGAgagcagggtgtgcaactgcgtgaggactcacactggcagggtaacagaatatgtactttggacaagtgctgcaactggacctacccccctcaaactattcagtactctgtgtgatgtttttgagaaattaatgtgctcaacaaaca
s	simRat_chr6.simRat.chr6	215182	189	+	647215	CCAATCCTTGTTCTAAGTTTTGTTCAAACATTGCCTTCTTGGAACGCAGGGTGTGCAACTGAGTGAGGAGCCACGCTGGCAGCATAACAGGATGCGTACGTTGAACAAGGGCTGCAAGAGGGTCTATccccctcaagctattcagtaatctgtgtgatgtttctatgaaatcaatgtgcccaactcaca

a
s	mr.mrrefChr5	78743	147	+	294542	acagaagaataaccaacaaatgattcaaagaatgactggatccccttctatggttgacctggtgtgcagtaggctcttaggaacacagtttgcacaatacaggtacctacataataggatttgcagccctgccttgaaactaataag
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	224568	147	+	636262	acagaagaataaccaacaaatgattcaaagaatgactggatccccttctatggttgacctggtgtgcagtaggctcttaggaacacagtttgcacaatacaggtacctacataataggatttgcagccctgccttgaaactaataag
s	simRat_chr6.simRat.chr6	215380	147	+	647215	acaacagagtaaccaacaaatgattcaaagaatagatggatcaccttctatggttcacctagagggaagttagttcttaggaacacagcttgcacaatacagggaccaacatactaagatttgcaaccctctcttgagattaataag

a
s	mr.mrrefChr5	78890	38	+	294542	acacaagctaatatgcagatttagcaggaccaccaaca
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a
s	mr.mrrefChr5	78928	10	+	294542	acaccaatgg
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a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	215722	100	+	647215	tgcaaaaaagccactgtcaaatcagcctggaaacaaaaaagagaacccatggcaaaattaattctatgtaaaagaaattgagctggtgggaccatgttgc

a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	81799	112	+	294542	GAGTCCCTGTTCAATCCCTCACACTCATTCTACCATGAGTGAAAGTATATACTATTGTAGCAACATGTGTAAACATTGGGGCACTATTGAGAGTATGGCAATGTCCATACAG
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a
s	mr.mrrefChr5	81911	177	+	294542	GTCATTATTTAGGGTCGCTTCAGGTTCAAAAATACATGGGGCTGAACATTGAAATTATAGTTCCATTATGGAGGGTCCATATGTTAATAATCCCCATACAGAAAATTAGAAATAATATTAGAAATGTCAAACTATGCTTATATACATTGCATGTGCTGTGTGGATAGATATTCCAAC
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a
s	mr.mrrefChr5	82088	59	+	294542	CTTTATAATATTCTGTCTGTAGTGGAGTTATCAACATGTCAAGCATCTTCCTGGTGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	227953	59	+	636262	CTTTATAATATTCTTTCTGTAGTGGAGTTATCAACACGTCAAGCATCTTCCTGGTGTTC
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	83840	47	+	294542	ACACAGGGTGTCACATCATTAATTAAAGCACACTGATGTGATGCATA
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	84543	37	+	294542	AATAGGTTAGGCACAGCCTACGGAACATGTAAGTACA
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a
s	mr.mrrefChr5	84580	43	+	294542	CCATTCAAGTAGGCAATTGGCCTGAGGGAGATTGGATTGCACC
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a
s	mr.mrrefChr5	84623	11	+	294542	GTTTACCAAAC
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a
s	mr.mrrefChr5	84634	89	+	294542	ACCCGACCAGTTGAACTAGGGGACTAAAATGGATTCAACTGAGAATGGAGGTATGTCACACACGGGTGTTTGCCAGCCTGTGAAGTTTA
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a
s	mr.mrrefChr5	84723	11	+	294542	CAGGTTTGCCT
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a
s	mr.mrrefChr5	84734	28	+	294542	GTTAGGATTGGTAAGAACAACTAAGTGC
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a
s	mr.mrrefChr5	84762	42	+	294542	AACATGAGGGGGGATGTAGGGGTATAGGTAAATAAATCTAGG
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a
s	mr.mrrefChr5	84804	8	+	294542	TCACAATG
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a
s	mr.mrrefChr5	84812	20	+	294542	CAGCACTCATTGGGAGCTCT
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a
s	mr.mrrefChr5	84832	54	+	294542	ATCATGATTCTTCCATTCTTCTCTGCTTCTTCTTGCTGGCAAGTTTTGTGCCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	231200	54	+	636262	ATCATGATTCTTCCATTCTTCTCTGCCTCTTCTTGCTGGCAAGTTTTGTGCCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	222041	54	+	647215	ATCATGATTCTTCCATCCTGCTCGGCTTCATCTTGCTGGCAAGTTTTGTGCCTA

a
s	mr.mrrefChr5	84886	77	+	294542	TCACCAATGTGCTTCCAAGCAATTATCATGCTGCTGTGCTAAGTTAAGGGGTTGATAGTTCACAACTTTTACCTGTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	222105	77	+	647215	TCATCAATGTGCTTCCAAGCAATTATCATGTTGCTGCATTAAGTTAGGGGCTTGATAGTCCACAACTTTTACCTGTT

a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	86429	3	+	294542	ATA
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a
s	mr.mrrefChr5	86432	69	+	294542	AGGTATAATTTGCCTTATTATCTGTTGTGATAACATATACATAGGATTGAGCTAGAAGCTCCCCTAAAT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	223651	63	+	647215	AGGCTTAATTTGCCTTATTATCT----TGATAACGCATGCATAGGATTGAGATAGAAGCTCCCATAA--

a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	87017	98	+	294542	AAAAATGGTATTTTTAGTACTAATATTAATAAGTATGGTTATCTGTTTTGTTGTCTGTGATTGCATGCTATCAGAACCTGTTCTAAGGGCTGTTCATC
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	87349	206	+	294542	CTCAAAATGCAATAACTTTTGCTTGCTCTTGTCTTGGTGTGAACAAAATTGGTTGTGGATGTAAAGCCAAGTTTTGCAAACTAAACCTAGGGGCATAGGCATGCTAAGGTCAACAGGGTCTAAGAAAGGGCATTTGCCTTGAGTGAAGCAACCTTCTAGGTTCGTAGACCACATGATTCTGCCTGTTGTCTGCTCTGAATTAAACG
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	235538	7	+	636262	AAACTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	226188	7	+	647215	AAACTTA

a
s	mr.mrrefChr5	89045	660	+	294542	ACAGTATGCCGCACTCCCCCATTTTGCTCTATCATGATATATGCTTTATCTCACAATAAGTGTTGGACCCTTGGGCTATAAGAATATTCAGAATTAATTTGCATTTTGTCTTCACTTTGTGTGTTTAATATTAAGTGATTTCCATCAGTGTGTGTGGATTTTTTATTACTCTTCCTATTGTGTATAAACATGTGATACCCCAGAACAGATCACTTTCACCAGTGAATAATAGAAATTAGCAGCAGAAGCAACACTTTGTCCACTACCTTAGGACAATATGGGTTGTGTAAGTACCCTGCCTTAAGATGAGGGATCTCCAACTTATTTACCTAGCAGGTTCAATAATGGTGTTCTTAGCCATGCCCATACACAGATGAGTTGGGCTTGATTTGATGCACTGTTGAATTGTTTGGTGTGAAGAGTTAACACCTTGGTGAAAGGTGATCTGTAATTTTGGCTAACAATATCCATTAAATCTGCAACTGTCCATTCTGCAATCAAGTCTGTGTGACAGGTAAACCTGAACACAGACTCTGCCATAGTAACCTTGTTTACCTTAACTGCAACCTATCACAACCCTATCAACATGTCATAGAAACCCATTCAATATTCTTTCACATTCTACAAACCTGGTACAGAAGTAGCCCTTGGACATAATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	235545	660	+	636262	ACAGTATGCCGCACTCCCCCATTTTGCTCTATCATGATACATGCATTATCTCACAATGAGTGTTGGACCCTTGGGCTATAAGAATATTCAGCATTAACTTACATTTTGTCTTCACTTTGTGTGTTTAATATTAAGTGATTTCCATCAGTGTGTGTGGATTTTTTATCACTCTTCCTATTGTGTATAAATATGTGATACCCCAGAACAGATCACTTTCACCAGTGATGAATAGAAATTAGCGGCAGAAGCAACACTTTGTTTACTACCTTAGGACAATATGGGTTGTGTAAATGCCCTGCCTTAAGATGAGGGATCTCCAACTTATTTACCCAGCAGGTTCAATAATGGTGTTCTTAGCCATGCCCATGCACAGATGAGTTGGGTTTCATTTGATGCACTGTTGAATTGTTTGGTGTGAAGAGTTAGCACCTTGGTAAAAGGTGATTTGTAATTTTGGCTAAGAATATCCATTAAATTTGTAACTGTCCATTCTGCAATCAAGTCTGTATGACGGGTAAACCTGAACACAGACTCTGCCATAGTAACCTTGTTCACCTTAACTGTAACTGATCACAACCCTATCAATATGTCATAGAAAACCATTCAATATTCTTTCACATTCTACAAATCTGGTACAGGAGTAGCCCTTGGACATAATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	226268	641	+	647215	ATGGATTGCCGCACTCCCCCATCTTACTCTAGCCTGATAT-TGCTTTATCTCACAATAAGTGTTGGACCCT--GGCTATAAGAATCTTCAGAATTAATTTGCAT---------ACTTTGTGCATTTAATATTAAGCGATTTCCATCTGTGTGTGTGGATTTTTTATTAGTCTTCCTATTGTGTATAAACATGTGATACCCCAGAACAGACCACTTTCACGAGTGAATAATAGAAATTAGCAGGAGAAGCTACACTTTGTCCACTACCTTGTGAGAAGATG-----TGTAGGTACCCTGCCTTAAGATGACCGATTTCCAA-TTACTTGCCTAGCAGTATCAATAATGCTGTTTTTGGCCATGTCCATACACAAATGAGTTGGGCCTGATTTAATGCACTGTTAAATTGTCTGGTGTGAAGAGTTAACTCCTTGATGATAGGTGATCTGTAATTTTGGCTAACATTATCCATTAAATCTGCAACTCTCCATTAAGCAATCAAGTCTGTGTCACAGGTAAACCTGAACACAGACTTT-CCATAGTAACCTTGTTTATTTTACCTGCAACCTAACACAACCCTATCAACATGTCATAGCAACCCACTTAATATTCTTTCACATTCTACAAGCCTGGTACAGAAGTACCCCTTGGACATAATCC

a
s	mr.mrrefChr5	89705	84	+	294542	AGCTCACAGACTGGCTGTCAATCTGCAATGGAGACTCATTTATGGTAGTAACATAATGTTGATTGAGAATAAGCCCCATTGATG
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a
s	mr.mrrefChr5	89789	21	+	294542	TCCTGTTTCTCATCAGTAATT
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a
s	mr.mrrefChr5	89810	125	+	294542	CAATGCCAGTATGGTGCATTCCACCGGGTAAAGCAGATGGCCAGTATGGGTACACTGTGGGAAGGCCCTTTGTGCACTGTGGGAAGGCCCCTTCCTAATACCTAAGTTCACAAATATAGGTTTAT
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a
s	mr.mrrefChr5	89935	76	+	294542	ATGTACAATTGAGCAATACTATAATAGAGGGAGCTGACAAATCAGGCTGTATTTCCAGGGACCCAATAAACCATGC
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	90213	43	+	294542	CCCTCTATTGCCATCTCCTGCATCCTACATCTTTCATTATTCT
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a
s	mr.mrrefChr5	90256	206	+	294542	GATATAAGGTATAACTAGAATTTGTAGAAACCAAGTACCTCAGTGATTCCCCCATATAAATTATGCATAGATGCTGCTCTCATAGGGCTACCTACTTAAATGCAATGCTCCTTTCAACCTAAGCTGCCTGATTAAAGATCATTCCATGGTTACATAAATATGGGTAGCTGTTGGTCACAGGTTTTATCAAAGAGCATGGCCCAGAT
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a
s	mr.mrrefChr5	90462	18	+	294542	GCTGAAGAGTCTAGTGCA
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a
s	mr.mrrefChr5	90480	63	+	294542	ATTTTGTACCCTGGGTGGTTGCCATCCAGTGTGTTTCCTTCATTAAGCTTTGATTAATCACCC
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a
s	mr.mrrefChr5	90543	269	+	294542	GTTCATTGTGTCTGACACATATTATGATACTCCAACATGAAAGGCCAACTTCCATGTTTCTGATAGTGGTGGGTAGGAATAGTTTAAGCATAAAGTGTATGAATCAACAGCCCCCTTACCCTGAGCTGTAATTTATTGTGGATAGTTGCATTATGCAAGCATGAGAAACTAGTGTGCGATCTGGCATCGGCTTTACTGTCTGTTATCTGGGGCATTTTCCAGCAGTTACAGGCTCAGAATTGATAACTCACAAGTAAACCTTCTTACAG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	228054	269	+	647215	GCTCATTGCATCTGACACATATTATGAAACTCCAACATGAAAGGCCAACTTCCATATCTCTGATAGTGGTGGGTAGGAATAGTTTAAGCATAAAGTGTATGAATCTCCAGCCCCTTTACCCTGAGCTATGATTTATTGTGGACAGTCGCATTGTGCAAGCATGTGAAACTAGTGTTTGATCTGGCATCCGCCTTACTGTCTGTTATCTGGGGCATTTTCCAGCAGTTGCAGGCTCAGGATTGATTACTCACAAGTAAACCTTATTACAG

a
s	mr.mrrefChr5	90812	50	+	294542	TCCAGAACCATAAAAGGTTATCAAGTGGGTTGGGCCTGTTCAAGTAAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	237509	22	+	636262	CCCAGAACCATAAAAGGTTATT----------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	228354	50	+	647215	TCCAGAACCATAAAAGCTTATCAAGTGGGTTGGGCCTGTTCAAGTAAGTA

a
s	mr.mrrefChr5	90862	282	+	294542	TAAAGCAGTATTGCCATTTGGAAGAAATACTAATTTACACCCTCTTCTTTATTTCTAGCACACAACTATTCGAATCATATTCCAAGTGGTTGCCAGCTAACAAGTCATATTGCAAGTGTTTGAATGATATTGTGCCCATTCCCCTGAAACTCTTTGGCTACCCCCATACAAACTTAGGCAGCATACTTGACTGCTTCCCATGTGGCAAGTCCTAGTTCAGCTTTCATGAGAACCATCAAGTGTTTACCAGTGTTGCAAGCATTCACAAGGTCTTCTTAAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	237531	274	+	636262	--------TATTGCCATTTGGAAGAAATACTAATTTACACCCTCTTCTTTATTTCTAGCACACAACTATTCGAATCATATTCCAAGTGGTTGCCAGCTAACAAGTCATATTGCAAGTGTTTGAATGATATTGTGCCCATTCCCCTCAAAATCTTTAGCAACCCTCATACAAGCTTAGGCAGCGTACTTGACTGCTTCCCATGTGGCAAGTCCTAGTTCAGCTTTCATAAGAACCATCAAGTGTTTACCAGTGTTGCAAGCATTCACAAGGTCTTCTTAAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	228406	277	+	647215	TAAAGCAGTATTGCCACTTGGGAGAAATACTAATTTACACCCTCTTCTTGATCTCTAGTATACAACTATTTGAATCATATAGTAAGTGGTTGCCAGCTACCAAGTCATGTTACAAGTGTTTGAATGAACTTGTGGCCATTCCCCTGAAACTCTGTGACTACCCCCATACAAACCTAGGCAGCATAAC-----GCTTCCCATGTGGCAAGTCCTAGTTCAGCCCTCATGAGAACCATCAGCTGTTGACCAGTGTTGCAAGCATTCACAAGGTATTCTTAAACC

a
s	mr.mrrefChr5	91144	25	+	294542	TATTAGACTAACAGAAAGGTCAGGA
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a
s	mr.mrrefChr5	91169	331	+	294542	AGTTGTGAGAAGATAGGTGGCCCATGTAAAGCTAGGTCATAACATGGCACATCATATTCCACTTAGCTCTATGAGTAACCCTATCCCATGAAAATATTGCTGGTTGTTTCTATAAATAGGGTCCCACCTGTTCTGCATGATGAATACTTGGTTATCTTAATCTTGGTATGTATTTCCACATGTATGCACCTGTAACAGCCAGTGGCATAGTCCTTTGGGTTAGATACAATGACCGGAGTGAACATGTGATTAGCACAATTATCATGTTGTTGCGTTTATCCCAGGACAAATACACCAAAAATGGCCCTCTCATAAATATTATCCCTCAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	237845	313	+	636262	AGTTGTGAGAAGATAAGTGGCCCATGTAAAGCTAGGTCATAACATGGCACATCATATTCCACTTAGCTCCATGAGTATCTCTATCCCACATAAATCTTGCTGGTTGTTTCTATAAATAGGGTCCCACCTGTTCTGCATGATGAATACTTGGTTATCTTAATCGTGGTATGTACCTCCACATGTATGCACCTGTAAGAG------------------GAGTTAGATACAATGACCGGAGTGAACATGTGATTAGCACAATCATCATGTTGTTGTGTTTATCCCAGGACAGATACACCAAAAACAGCCCTCTCATAAATATTATCCCTGAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	228708	330	+	647215	AGTTGTGAGAAGATAGGTGGCCCATGTAAAGCTAGGTCATAATACGGCACATTGTATTCCACTTAGCTCTATGAGTAACCCTATCCCATGAGAATATTGTGGGTTGTTTCTATTAATAGAGTCCCACCTGTTTTGCATGATGAATACTTGGTTATTTCAATCTTGGTATGCATTGCCAGATGTATGCACCTGTAACAGCCAGTGGCATAGTCCTTTGGTTCGGATA-AATGACCAGAATGAACACCTGATTAGCACAGTTATCAGGTTGTTGCTATTATCCTGAGACAAATACACCAAAAATGGCCCTCTCGTAAATATTATCCCTCAGTT

a
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a
s	mr.mrrefChr5	91543	34	+	294542	AGTGGAGCTTCTTTCTGAGTTAGCTTTGGCAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	238200	34	+	636262	AGTGGAGCTTCTTTCTGAGTTAGCTTTGGCAAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	91577	208	+	294542	CCTAGTAGAATGACACTGAAATTTTATCAATATGCCAAATGACTGCGCATATATCCAATTTGAAGGGTGATTTGATGTTCAAGGGTATTTATTTTCCACAGATGGCATAGTCTCATCATGATGCTAACATGTTGCTACTATTGGATTAGGCTTCTCTAGTGGGATGTATGGTTGCATCTATAGTTGGATTCTGGATGCCGTTTATGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	238234	208	+	636262	CCTAGTAGAGTGTCCCTGAAATTCTATCAATTTGCCGAACGACTGCACATATATCCAATTTGAAGGGTGATTTGATGTTCAAGGGTATTTAATTTCCACAGATGGTGTAGTCGCATCATGATGCTAACATGTTGCTACTATTGGATTGGGCCTCTCTAGTGGGATGTTTGGTCACAGCTATAGTTGGATTCTGGATGCTGTTCATGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	229139	208	+	647215	CTTAGCAGAATGACACTGAAATTTTATCAATATGCCAAATGACTGCGCATATGTCCAATTTGAAGGTTGATTTGATGTTCAAGGGTCTTTATTTTCCATAGATTGCATAGTCTCACTATGATGCTAACATGTTGCTACTATTGGTTTAGGCTTCTCTAGCGGGATGTATGCTTGCATCTGTAGTTGGATTCTGGATGCCGTTTATGAA

a
s	mr.mrrefChr5	91785	446	+	294542	ACTTCTCACTTAAGGATAATACACTGTAATAATTCTTTAGGATAAATTTGGGAAAACTAGTATATTAAAAAGATGTCAGGTGAAACAATGCATGGGGTTGCAGTTCAAGTAAAAAGATTCCCACACCTAACCTACTCATACCTAGGAGTGAAGCAGAGACTGCCTATTGAGAGAAGGACTAGATACTTACTTCATACCCCAGCAGTACAGTATTATACACTATATTATGTACTATTACTCAATCTCATAGTCAGCCATAGGTAGGAATAGAAGTTAGTTGGGCAGAATAGTAAACTGATATGAGTACATACACTCTGTGTCAGTACCTGACCAGTTAAGCCACACGAGTGTCTGTTGATGCTACATGCTAATTGCTGGCTTTGATCTGAGGGTGAAAATAAAATGCTTTTCATCTTGACATATATGTGGATACAGAAATGATTAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	238443	445	+	636262	ACTTCTCACTTAAGGATAATACACTGTAATAAATCTTTAGGATAACTTTGAGAAAACTATTATATTAAAAAGGTGTCAGGTGAAACAATGCATGGGGTTGCAGTCCAAATAAAAAGATTCCCACACCTAACCTACTCATATCTAGGAGTGAAGCAGAGACTGCCTATTGAGAGAAGGATT-GATACTTACTTCACATCCCAGCAGTACAGTATTATGCATTATATTATGTTCTATTACTCAATCTCATAGTCAGCCAGAAGTAGGAATAGAAGTTAGTTGGGCAGAATAGTAAACTGATATGAGTACATACACTCTGTGTCCGTACCTGACCAGTTAAGCCACACGAGTGTCTGTTGATGCTACATGCTAGTTGCTGGCTTTGATCTGAGAGTGAAAATAAAATGCTTTTTATCTTGACATATATGTGGACACAGAAATGATTAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	229347	443	+	647215	ACTTTTCACTTAAGGATAATACACTGTAATAATTCTTTAGGATAAATTTAGGAAAACTAGTATATTAAAGAGATGTCTGGTGAAATAATGCATGGGGTTGCAGTTCAAGTTAAAAGATATTCACACCTAACCTACTCATACCTAGCAGTGAAGCAGAGACAGCCTCTTGAGAGAAGCACCAGATACTTACTTCATGCCCCAGCAGTACAGTATTATACACTATAA---GTACTATTACTCAATCTTATAATCAGGCATAGGTAGGAATAGCACTCATTTAGGAAGAATAGTAAACTGATATGAGTACATACACTCCGTGTGAGTACCTGACCCGTTAAGCCACACAATCATCTGTTGATGCTACATGCTAATTGCTGGTTTTGATCTAAAGGTGAAAATAAAATCCGTTTCATCTAGACATTTATGTGGATACAGAAATGATTAGT

a
s	mr.mrrefChr5	92231	100	+	294542	TTTTACCTGAACATGTTTGTGTAGAATATACAATGCAAAAACACATGTACATGCTGTTTCTATAACATACCTGTGAAGTATTACTTTCCATAAAAACACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	238892	100	+	636262	TCTCACCTGAACATGTTTGTTTAGAATGCACAATGCAAAAACACATGTACATGCTGTTTCTATGACATACCTGTGAAGTATTACTTTCCATAAAAACACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	229790	100	+	647215	TTTTACCTGAACATGTTTATGTGGAATATACAATGCAAAAACACATGTACATGACATTTCTAAAACATACCTGTGAAGCATTGCTTTCCACAAAAACACT

a
s	mr.mrrefChr5	92331	99	+	294542	GGCACAAGGAGACTATCGCCCCCTCATGCTTAAATATCACCATGTTTGCAACAGGTTTGCTCTGAACTTGGAAAAGAGAGCTATATGTTTGGTCATCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	239000	99	+	636262	GGCACAAGGAGACTATCGCCCCCCCATGCTTAAATATCACCATGTTTGCAGTAGGTTTGTTCTGAACTTGGAAAGGAGAGCTGTGTGTTAGGTCATCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	229890	84	+	647215	GGCACAAGGAGACTAATTCCTCCTCATGCGTAAATAT----ATGTTTGCAACAGGTTTGCTCTGAGCTTGGGAAAG-AAG--AGAAGGTTG--------

a
s	mr.mrrefChr5	92430	50	+	294542	TATCTTGGAAGATAGTGTGGAAGATCAGCATATGCCAAGTTTTGTCTATT
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a
s	mr.mrrefChr5	92480	143	+	294542	ACTTTCCCTACATGTGGGCAAAATAATTCCCCCAGTTATTGCCAAAGGAACTGCACTGTTAACTCAGATCCTCTGTCTTGGTGCCAAGAGGCAGGCTAGTATCTTTGCAGATTTGTTGCTCTAGGATTGGTATGCAGATAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	239364	143	+	636262	ACTTTCCCTACATGTGGGTAAAATAATTCCCCCAGTTATTGCCAAAAGAACTGCACTGTTGACTTAGATCCTCTGTCTCAGTGCCAAGAGGCAGGCTACAATTTTTGCAGATTTGTTGCTCTATGATCAGTATGCAGATAGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	229974	133	+	647215	----------CAAGTGGGCAAAGTAATTCCCCCAGTTATTGCCAAAGGGCCTGTACTGTTATCTCAAATCCTCTGTCTTGGTGCCTAGAGGCAGGCTAGTATCTTTGCAGATTTGTCACTCTAGGATTGGTATGCAGATAGAG

a
s	mr.mrrefChr5	92623	265	+	294542	GACTCTTAAGGATTCCAACATCTGCTATGTGCAATTCAACCCTCCTGAGATTCTGGGTTGCAAAATTAGAAATATCATTGAGATATTCCTTAATTTAAGTGGACATGAATTAGCAAATGATATGACATCAGTGACCCTAACTACATGTGTCCACCAGATTAACTTCATTTTCTGTGATGACAAAATTGTTTGTCATCAGGGCTGATTGTAGATGGTCTATGGCCTGAAAAGATAGCCAAAGCAGAAAATGAACAACTACTTTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	239509	263	+	636262	GGCTCTTAAGGATCCCAACATCTGCTATGTGCAATTCAATCCTCCTGAGATTCTGGGTTGCAAAATTCGAAATATCATTGAGATATTCCTCAATTTATGTGGACATGAATTAGCAAATGATATGACATCAGTGATCCTAACTA--TGTGTCCACCAGATTAACTTCATTTTCTGTGAGGACTCAATTGTCTCTCATCAGGGCTGACTGTAGGTGGTCTATGACCCGAAAAGATAGCCAAGGCAGACAATGAACAACTACTTTGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	230108	262	+	647215	AACTCCTAAGGATTCCAACATC--CAATGTGCAATTTGCCCCCCCTGACATTCTGGTTTGCAAAATCAGAAATATCATTGAGATATTCCTTAATCTAAGTGGACATGTATTAGCAAATGATATCACATCAGTGACCCCAACTACATGTGTCCGCCAGATTAACTTCATTTTCTGTGATGACAAAATTGTTTGTCTTCAGGGCTGATTGTAGATGGT-TATGGCCTGAAAAGATACCCAGAGCAGAAAATGAACAACTACTTTTGT

a
s	mr.mrrefChr5	92888	110	+	294542	TCAAAGGCCTCAACATTTCAAGCTGTACTGAGATGTTAGCCCAACTTCCAGTCCTAACCAGTAGTACTTCCAGGCCAGACAACAATAGTTTACTCCCATCAATTTGGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	239772	110	+	636262	TCAAAGGCCTCAACATTTGAAGCTGTACTGAGATGTTAGCCCAACTTGCAATACTAACCAGTAGTACTTCCTGGCCAGACAACAATAGTTTACTCCCATCAATTTGGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	230372	110	+	647215	TCAAAGACCTCAACATTTCAACTTGTACTGAGATGTTAGCCCAACTTCCAGTCCTACATAGTAGTACTTCCAGACCAGACAACACTAGTTTACTCCCATCACTTTGGGGG

a
s	mr.mrrefChr5	92998	27	+	294542	TTATACAAAGTATTACAACTGGTGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	239886	27	+	636262	TTATACAAAGTATTACAACTGGTGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	230482	27	+	647215	TTATACAAAGTATCACAACTGGTGTCA

a
s	mr.mrrefChr5	93025	24	+	294542	TTAGCTATCAGCCTGGAGGATGCT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	230509	24	+	647215	TTAGCTATCAGTCTGAAGGATGCT

a
s	mr.mrrefChr5	93049	166	+	294542	GGATTGCACCCTCATATACTCATGTTACCTGTCTCCTGTTACCTGTTTGCAGTAGATGCTTGGGTAAAGTAGCAGCTAAAGGCTATGATCCACCATTCACTGCTCATAAGAGTGAACATGGATCCCAATGAAGCAGGCTAGTGAGGTTAGACTCCAAATTACTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	239944	165	+	636262	GGATTGCACCCTCAGATACTCATGTTACCTGTCTCCTGTTACCTGTTTGCAGTAGATGCTTTGGTAAAATA-CAGCTAAAGGCTATGATCCGCCATTCACTGCTTATAAGAGTGAACATGGATCCCAGTGAAGCAGGCTAGTGAGGTTAGAATCTAAATTACTATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	230533	152	+	647215	GGATTGCACCCTCATATATT--------------TGTGTAACCTGTGTGCAGTAGATGGTTGGGTAAAGTAGCAGCCAGAGGCCACAATCCACCATTCACTGCTCATAAGAGTGAATATGCATCCCAATGAAGCAGGCTAGTGAGGTTAGACTCCAAATTAATTTA

a
s	mr.mrrefChr5	93215	370	+	294542	GGGGTGCCACAACAATGGTGAATCGACTGCCCTCTGGGGCTATAATCTTCTCACATACCTCACCGCAACCATCAGTGAAGGACCAGGTTTAACTATGTCCACGTAGGTCTTGAGTATTACCCCTTCCCCATTGAGGGGATCTTATACGGGGAGAAAATTTCCTTATGGATACTTTTAGAGTATACTCTGATAATACGGTCAGCCCATTTATATATGCTTTGCCTTGCAACAACCTAGCAGAGTTCAAGCGCACTCAGCTGGCAGGATTATTGACCCTATGAGTGAATTAAGGGTCGCATTGTGGGTAATAATGATGTGTCCAAAATAGCATTCAGATTTAAAGTGGTCTCCAAGTCTCTCCTGTCAGAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	240109	353	+	636262	GGGGTGCCA-ATAAATGGTGAGCCGACTGCCCTCTTGGGCTATAATCTTCTCACCTATCTCACCGCAATCATC---------------TTGACTATGTCCACGTTGGTCTTGAGTATTACCCCTTCCCCATTGAGGGGATCTTATAC-AGGAGAAAATTTCCTTATGGATACTTTTAGAGTAAACTCTGATAATACGGTCAGCCCATTTATATATGCTTTGCCTTGCAACAACCCAGCAGAGTTCAAGCGCACTCAGCTGGCAGGATTATTGACCCTATGAGTGAATTAAAGGTCGCATTGTGGGTACTAATGATGTGTCCAAAATTGCATTCAGGTTTAAAGTGGTCTCCAAGTCTCTCCTGTCAGAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	230687	356	+	647215	GGGCTGCCACAACAATGGTGAATCAACTGTCCTCTGGGGCTATAATCTTCTCACATACCTCACCGCAACCAACAGTGAAGGACCAGGTTTAACTATGTCCACGTAGGTGTTGAGTATTACCCCTTCCAGATTGAGGGGATCTTATACGGGGAGAAAATTTCCCTATAGACATTTTTAGAGTATACTCTGATAACACTGTCAGCCCATTTATATATGCTTTGCCCTGCAACAACCTAGCA-AATTCAAGGGCACTCAGCTGACAGGGTTATTGACCCTATGAGTGAATTAAGGGT-------------ATAATGATGCGTCCAGAATAGCATTCAGATTTAAAGTGGTCTCCAAGTCTCTCCTGTCAGAAT

a
s	mr.mrrefChr5	93585	79	+	294542	TGTATAAATGATAATCAATGTGACTTCGGCCTTTTTTACAGTCCCGAGCACTTATAGAACTCAATCCAAATTGTACTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	240491	78	+	636262	TGTATAAATAAAAATCAATGTGGCTTCAGCCTTTTTTA-AGTCCCAAGCACTTATAGAACTCGATCCAAATTGTACTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	231043	79	+	647215	TGTATAAATGGTAGTCAATATGACTTTGGCCTTTCTTACAGCCCCGAGCACTTATAGAGCTCAATCCAAATTGTACTTA

a
s	mr.mrrefChr5	93664	9	+	294542	GGGTCCTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	240574	9	+	636262	GGGTCCTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	231122	9	+	647215	GGGTCCTTC

a
s	mr.mrrefChr5	93673	65	+	294542	TAGCCACCCCTTGTTCCTCTCTGACAGGGAAGATTACATCAACACTTTTTAATACATGATTATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	240614	61	+	636262	TAGCCACCCCTTGTTCCTCTCTGACAGGGAAGATTACATCCACACTTT----TACATGATTATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	231131	65	+	647215	TAGCCACCCCTTGTTCCTCTCTGACAGGGAAGATTACATCAACACTTTTTAATCTATGATAATTC

a
s	mr.mrrefChr5	93738	49	+	294542	TAGTTCTTGGCGCATTTTTCTGTACTAGTCATATCATAACTAAGGTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	240675	49	+	636262	TAGTTCTTGGCGCATTTTTCTGTACTAGCCATATCATAACTAAGGTAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	231197	49	+	647215	TAGTCCCTGATCCATTTTTCTCTACTAGTCATATCATAACTAAGGTAAG

a
s	mr.mrrefChr5	93787	152	+	294542	CTAGAATGGAATCAGGACCTAGGAGACTGAACCATCTAAAACACACAAGGTATATCCCCATACTCTTACTGGTGATGTGATGAAGTATTCACATGCTTAAGTCTTGTGAGCATTTAGGTAATAATAAGCTACTGGAGTAATCAACTTGCAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	240725	151	+	636262	CTAGAATGGAATCAGGACCTAGGAGACTGGACCATCTAAAACACA-AAGGTATATACCCATACTCTGAGTGGTGATGCGATGAAGCATTCACATGCTTAAGTCTTGTGAGCATTTAGGTAATAATAAGCTACTGGAGTAATCAACTTGCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	231246	136	+	647215	CTAGAATGGAATCAGGATCTAGGAGACTGAACCATCTAAAGCACACAAGGTATAGCACCATACTATTACTGGTGATGTGAGGAAGTATACACATGTTTAAGTCTTGTGAGTATTTAGGTAATAATGAGCTACTGGA----------------

a
s	mr.mrrefChr5	93939	161	+	294542	TACTTGTTAATAAGTGACATAGAGCCTAGAAATTAGTAGCTTTCTTAGAAGGACACCAGCCACATCATTACATGTCTACAAGAATTCAGGGCATCAAAAACATGAGAGAGTGGGGACTCTTCAAGGTCAGTGAAACGAGGAGATTTAGGATGTTGATAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	240881	161	+	636262	TACTTGTTAATAAGTAACATAGAGCATAGAAATTAGTAGCTATCTTAGAAGGACACCAGCCACATCATTACATGTCTACAAGTATTGAGGGCATCAAAAGCATGAGTGAGTGGGGACTCTTCAAGGTCAGTGAAATGAGGAGATTTAGGATGTTGATAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	231382	160	+	647215	TCCTTCTTAATAAGTGACATAGAGCCTAGAAATTAGTAGCTTTCTTAGAA-GACACCAGCTACATCATTACATGTCTACAAGAATTCAGGGCATTAAAAACATGAGAGAGTGGGGGCTCTTCAGGGTCAGTGAAACAGGGAGATCTATGATGTTGATAGTT

a
s	mr.mrrefChr5	94100	63	+	294542	ATAATCACCTGTTATTCTTCCTACAGTATTTTGTCTCAGTGTGGCAAATGTTTGATACTTTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	241042	61	+	636262	ATAATCACCTGTTATTCTTCCTACAGTATTTTGTCTCAGTGTGGCAAATGTTTGATACTTT--
s	simRat_chr6.simRat.chr6	231543	63	+	647215	ACAGTCACCCGTTATTCTTCTTAAAGGGTTTTGTCTCACTATGGCAAGTGTTTAATACTTTTC

a
s	mr.mrrefChr5	94163	170	+	294542	TCTAATTCTATGAAGGAGTATTGTACTGTTGATCTACTCTAGGAAAAAACTTTTGTTAGGAAAGCAATCACTATCATCCTTAATGATGTGGCTAACGGCATCTGGTTCATTGGTATTTCACTAACTCAACCTTGGGTAGATACTCTAGCTACTACATCTTTCCTCCCCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	241103	166	+	636262	TCTAATCCTATGAAGGAGTATTGTACCGTTGATCTA----GGGAAAAAACTTTTGTTAGGAAAGAAATGACTAGCATCCTTAATGATGTGGTTAATGGAATTTGGTTCATTGGTATTTCACTAACTTAACCTTGGGTAGATACTCTAACTACTACATCTTTCCTCCCCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	231607	170	+	647215	TCTAATTCTCCGGAGGAGTATTGTACTGTTGATCTACTCTAGGAAAAAACTTTTGTTAGGAAAGCAATCACTATCGTCCTTAATGATATGGCTAACGGCTTCTAGTTCATTGGTATTTCACTAACTCAACCTTGGATAGATGCTCTAGCTACTACATCTTTCCTCCCCCC

a
s	mr.mrrefChr5	94333	28	+	294542	AGTAGAGGCCGTACACATTTGGGAACTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	241270	28	+	636262	AGTAGAGACCGTACACCTTTGGGAACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	231777	28	+	647215	AGTAGATGCGGTACACATTCGGGGAATG

a
s	mr.mrrefChr5	94361	83	+	294542	GGGACACTGGCAGATATGGCTCCAGAAAGATTGACTTTGGTTGACATAAGGGGTACATCAGAGCTGGGATCAGTGGTAATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	241298	83	+	636262	AGGATACTGGCAGATATGGCTCCAGAAAGATCGACTTTGGTTGACATAAGGGGTACATCAGAGCTGGGCTCAGTGGTAATCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	231812	83	+	647215	GGAACACTGGTAAATATGGCTCCAGATAACATGACTTTGGTTAACATTGGGGGTACATCAGACCTGGGATCAGTGGTAATCAA

a
s	mr.mrrefChr5	94444	125	+	294542	CCCTCACAACAAAAATTAAGGATGCAATGGCAATCGTGCCATCCATTGAGTGGGTAAGCTTTTGATGATACCATGACTGCCTTATTGAAAAGCTAAACACACTGATAGCAAAAACTGTAATCCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	241385	125	+	636262	TCTTCACAACAAAAATTAAGGATGCAATGGCAATCATGCCATCCATTGAGTGGGTAGGCTTTTGATGATACCATCACTGCCTTATTGGAAATCTAAACACATTGATAGTAAGAGCTGTAATCCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	231895	119	+	647215	CCCTCACAACAAGAATTAAGGAGGCAATTGCAATTGTGCCATCC------TGAGCAAGCTTCTGGTGATTCCAGGGTGGCCTTATTGAAAAGCTAAACACACTGATAGCAAAAACTGTAATGCAA

a
s	mr.mrrefChr5	94569	82	+	294542	CCATGAGTAGGAAGCAGCACCTGTTTATTTGCACACCTGGATGCATTTGACTGCATTCTTCACCCCTTAATATCCTCACAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	241512	82	+	636262	CCATGAGTAGGAAGCTGCACTTGTTTATTTGCACACCTGGATGCATTTGACTGCATTCTTCACCCCTTAATATCCTCACAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	232014	82	+	647215	CCATGAGTAGGAGGCAGCACCTCGTTATTTGCATGCCTGGATGGCTTTGACTGCATTCTTCACCCCTTAATATCTTCACAGA

a
s	mr.mrrefChr5	94651	50	+	294542	TCCAGGAGGTCACATCTTGATCCCCACTCAGAATGGAGAGCTTTGGTTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	241596	50	+	636262	TCCAGGAGGTCACATCTTGATCTCCACTCAGAATGGAGAGCTTTGGTTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	232096	50	+	647215	TGCAGGCGGTCACATCTTGATCCACACTCAGAATGGAAAGCTTTGGTTTC

a
s	mr.mrrefChr5	94701	96	+	294542	AGTTGAAGTCTTGGCTGGTCACTTACATATTGGGCAGCCAAGTTCTCAAGTGTGTCTCTCACATGTGGCTTATTGCAGGACAGTCTAATTGAGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	241646	88	+	636262	AGTTGAAGTCTTGGCTGGTCACTTACATATTGGGCAGCCAAGTTCTCAAGTTTGTCTCTCACATGTGGCATATTGGAGGACAGTCTAA--------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	232147	96	+	647215	AGTAGAAGTCACAGCTGGTCACTCACTTATTGGGCAGTTAAGTTCTCAATTGTGTCCCTCACATGTAGCTGATTGCAGGACAGTCTAATTGAGCAA

a
s	mr.mrrefChr5	94797	55	+	294542	CCGTTCCATAAAGTTTTAAAGGAACCTGTATCATGAAGTGGACCTCAATATGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	241734	55	+	636262	CCGTTCCAAAAAGTTTTAAAGGAACCTGTATCGTGAAGTGGACCTCAGCATGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	232246	55	+	647215	CCGTTCCATAGAGTTTTAAATGAACCTGTATCATGATGCGAACCTCAATATGGTG

a
s	mr.mrrefChr5	94852	103	+	294542	ACTTCTTTTCTCAATGTACTAGTGGGTAAATAAATGTGGGAATGTACAAAGCCAGTAGAAAAACATGCCTCTGTAATGACATCGACTGTTACACTGTAAGCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	241789	101	+	636262	ACTTCTTTTCTCAATGTACTAGTGGGTAAATAAATGTGGGAATGTACAAAGCCAGT--AAAAACATGCCTCTGTAATGACATCGACTGTTACACAGTACGCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	232302	98	+	647215	ACTTCTTTTCTCAATGTACTAGTGGGTAAATGAATGTGGGAATGTA-----CCAGTAGAAAAACATGTCTCTTTAATAACATCGACTGTTACACTGTTAGCAG

a
s	mr.mrrefChr5	94955	208	+	294542	TGAGCTACAGCAGGAGTAGACCTCAGAATGACCTAGGATAACATACGGTAATCGGCCCACGAAGTGAATCAGCTAACCATGTGAGTTGTGAGTTTAACTTAATACTTCTAGTACTCACACAATGCAAGGTATCATTTAGAGCCCCCAGCTGTAGTGAGGGTTCACTTCAGAAGACCCTGGGATTACACATGGAGACTCCTGGAGAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	241917	200	+	636262	TGAGCTACAGCAGGAGTAGATCTCAGAATTATCTAGGATAACATGCAGTAATCTGCCCACGGAGTGAATCAGCTAACCTTGTCAGTCGTGATTTTAACTTAATACTTCCAGTACTCACACAATGCTAGGTATCATTTAAAGCCCCCAGCTGTGGTGAGGGTT--------AAGACCCTGGGATTACACATGGAGAGTCCTGGAGAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	232400	208	+	647215	TGGACTACAGCAGCATTAGGCCTCAGAATGCCCAAGGATAACATATGGTAAGCGGCCCAAGAAGTGACTCGGCTTACCACATGAGTTGTGAGTTTTACTTAATACTTCTAGTACTCTCACAATGCAAGGAATCGTTTGGAGCCCCCAGCTGTAGTGAGGGGTCACTTCAGAAGAGCCTGGGATTACATATGGAAACTACTGGAAAGGT

a
s	mr.mrrefChr5	95163	94	+	294542	GTCACAGGTAGTCACAGGGCTTGTGGGCATGTTTTGAACTTTACAGTGATGGATGGCACATGCCATGAATATACCGCAAATACCTCTTGAATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	242117	66	+	636262	----------------------------ATGTTTTGAATTTTACAGTGATGGATGGCACATGCCATGAATATACCGCAAATACCTCTCGAATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	232616	94	+	647215	GTCACAGGTAGTCACAGGGCTTGTGGGCATGTTTTGAACTTTACAGTGATAGGTGACACATGCCATGAATAGACCACAAATACCTATTAAATAA

a
s	mr.mrrefChr5	95257	97	+	294542	CTGTAGTCTACTTAATCCATCTTGTGATACAGGACATGAGGGTGAGGCCCATTTTCTAAGGTTCCCAGCACCATAAAGAAATCCAGCAGGGCGCAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	242194	97	+	636262	CTGTAATTTACTTAATCCATCTTGTGATACAGGACATGAGGGCGAGGCCCATTTTCTAAGGTTCCCAGCACCATAAAGAAATCCAGCAGGGTGCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	232710	97	+	647215	GTGTAGTCTACTCAATCCATCTTGTGATACAGGACATGAGGGTGAGGCCCATTTCCTAAGGTCCCCAGCATCATAGAGAAATCCAGCAGGGCGCAAT

a
s	mr.mrrefChr5	95354	77	+	294542	GTGAACAAGCCTATCAATTTGTGAATGTATGCTATTTCCTAAAATTGAGGTCAGAACAGGCATGTTCTGAGATCTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	242295	57	+	636262	GTGAACAAGCCTATCAATTTGTAGATAT--------------------GGTCAGAACACGCATGTTCTGAGATCTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	232807	77	+	647215	GTCAATAAGCCTATCAATTTGTGAATGTATGCTATTTCCTAAAATTGAGGTCAGAAAAGGCATGTTCTGAGATCTGG

a
s	mr.mrrefChr5	95431	369	+	294542	GTTCTGAGATCTTGACCCAGAATACATTTAGTACGATTCTTTTGTGAGCTCTCAGTCAGATGAAACAAGAGACATGCAAGATTCTAAATGCCTTGTGAAGTAAGTCAGATTGTGAGGACCCAGATTAGGAGACATATATGGATTGACTGTCCCACTAAGCTTGCTGCACATCACTAAGCGAGCCTCCAGATGATTTACATCTTACCATAGTTTTTCCTTTGCCATTGTGAAAGGCTACAAAAAGTAATGCGTACTCTCTAACAATGATGTGAGTCAGTCTTGATAGGTTGTCAGGATTAAGTGATATATATCAGTAGATGATACACTAGATGATATGAAACGCTAGACCTCTTACAATCATGGGCTCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	242354	364	+	636262	GTTCTGAGATCTTGACCCAGAATACATTTAGTACGATTCTTCTGTGGGCTTTCAGCCAGATGAAACAAGAGACATGCAAGATTCTAAATGCCTTGAGGAGTAAGTCAGTTTGTGAGGACCCAGATTAGGAGACATGTATGGATTGACAGTCCCACCACGCTTGCTGCACATCACTAGGCGAGCCTCCAGATGATTTACATCTTACCATAGTTCTTCCTTTGACATTGCGAAAGGCTACAAAACATATTGCATACTTTCTAACAATGATGTGAGTCAGTCTCGACAGGTTGTCAGGATTAAGTGATGTATATCAGTAGATGATACACTAGATAATATGAAACACTAGACCTCTTATAATCATGGG-----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	232884	326	+	647215	------------------------------GTACACTTCTTTTGCGAGCTCCCAGTTAGATGAAACTGGATA-------------AAATGCCTTGTGAAGTGAGTCAGATTGTGAGGTCCCAGATTAGGAGACATATATGGATTGACTGTCTGATTAAGCTTGCTGCACATCGCTAAGCAAGCTGCCAAATGATTTATATATTACCATAGTTTTTCCTTCGCCATTGTGAAAGGCTACAAAAAGTAATGCGTACTCTCTAACAATGATGTGACTCAGTCTTGTTAGGTTGTCAGGATCAAGTGATACATCTCAGTTAATGATACATTAGATGATGTAAAACGCTAGACCTCTTCCAATCATGGGCTCAC

a
s	mr.mrrefChr5	95800	8	+	294542	AAtccAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	689	8	-	636262	AATCCAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	352577	8	+	647215	ccaccTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66880	3	-	647215	AA-----A

a
s	mr.mrrefChr5	95808	24	+	294542	GACTTCGAAGTCGCAAACAAAGCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	242718	24	+	636262	GACTTCAAATTCACAAACAAAGCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	697	24	-	636262	GACTTCGAAGTCGTGAACAAAGCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	352588	24	+	647215	GGCTTCTAAGTCGCAAACAATGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66883	19	-	647215	GG-----AAGTCGCAAACGAAGCA

a
s	mr.mrrefChr5	95832	4	+	294542	TACG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	242742	4	+	636262	TACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	721	4	-	636262	TACG
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a
s	mr.mrrefChr5	95836	61	+	294542	CAAGGCAGTCGCATACCAGAGTGCTCAGTTAGCAAATCGTCTCGAGCGAATCATGACCGTG
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	725	61	-	636262	CAAGGCGGTCGCATACCAGAGCGCTCAGTTAGCAAATCGTCTTGAGCGAATCATGACCGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	352612	61	+	647215	CAAGGCTATAGCAGACCAGAGGACTCAAATGGTGGATAATCCCGAGCCAATAATGGCTGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66906	61	-	647215	GGAGGCCATAGCATACCAGAGTGCTCAAGTGGCAGATAGTCCTGAGCTAATAATGACTGTG

a
s	mr.mrrefChr5	95897	19	+	294542	GGCCCAGACAGTACGATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	242807	19	+	636262	GGCCCAGACAGTATAATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	786	19	-	636262	GGCCCAGACAGTACGATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	66967	19	-	647215	GGGCCACACAATTCGATGT

a
s	mr.mrrefChr5	95916	31	+	294542	AGCACTCACTGGTTATTAAGACTTTCGTGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	242826	31	+	636262	AGCACTCACTGGTTATTAAGACTTTCGTGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	805	31	-	636262	AGCACTCACTGGTTATAACGACTTTCGTGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67036	12	-	647215	AGCACTCATTAG-------------------

a
s	mr.mrrefChr5	95947	25	+	294542	CATTATTACCAACGAATTTTGGATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	242877	25	+	636262	CATGGTTACCAACGAAGTTTGTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	836	25	-	636262	CACTATTTGCAAAGAATTTTAGATT

a
s	mr.mrrefChr5	95972	19	+	294542	TCTCCACACAAAACACAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	242902	19	+	636262	TCCCCACACAAAGCACCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	958	19	-	636262	TCTCCAATCAAGAAACAAG

a
s	mr.mrrefChr5	95991	4	+	294542	GCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	242921	4	+	636262	GCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	987	4	-	636262	GCCA

a
s	mr.mrrefChr5	95995	2	+	294542	CT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	994	2	-	636262	CT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	352673	2	+	647215	CT
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a
s	mr.mrrefChr5	95997	110	+	294542	CGTTTATCACGGCCACATGAGTCCCCCTATCCCAATTTGAAATGTGTcactcatgggctcgcttatgatggccagtggtcaaggcctcggattcacctcgcacatgaaag
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	242925	97	+	636262	CGTTAGTCACCGCCACATGAGTCCTCCTTTC-------------TGTcagtcatgggctcgcttatgatggccagtggtcaaggcctcggattcaccttgcacatgaaag
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	996	7	-	636262	TGCTTTT-------------------------------------------------------------------------------------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	352675	110	+	647215	CGTTTATCACGGTGACATGAGTCCCTTTATCCTGATTTGAAATGTGgcacttagggggtcgtctatgatggcctgtggccaaggcctcggattcacctcgcacatgaaag
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67050	110	-	647215	CGTTTATCACGGCCACGTGGGTCCCCCTATCCCAATTTGAAGTGTGAcactcatgggctcacttatgagggccagtggtcagggcttcggattcacctcacacacaaaag

a
s	mr.mrrefChr5	96107	103	+	294542	atggtacttcctgtacaacggttccaccgaacatgatgtcaggtcactgggtcagtacagatgccgagggcagagtcccccccacagaatcgcctaccccatt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	243022	103	+	636262	atggaacttcctgtacaatggttccagcgaatatgatgtcaggtcactgggtcagtactgatgccgagggcagagtcccccccacagaatcgcctaccccatt
s	simRat_chr6.simRat.chr6	353021	103	+	647215	atggtccttcgtgtacaacggtaccaccaaacatgatgtcaggtcactgcgtcagtacagatgccgagggtggcgtcccacccacaaagtcacccaccccact
s	simRat_chr6.simRat.chr6	67160	65	-	647215	atggtacttcctgtacaacagtgccactgtacatgatgtcaggtcgctgggtcagtacagatacc--------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	96210	10	+	294542	TAGGTATAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	243131	7	+	636262	CAAGTAT---
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	99347	95	+	294542	TGGATGACTACAGTGCCTTCTGTCTTCTCACAGTCTCCACTGTAAGAGCCATACTGAGACATGGAGCACACCTTTTGTTTGTTATCAAAATAAAC
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	100020	122	+	294542	TAGGGACACTGGGGATCCCAGTTGGGTGTTGAGCTACAAGTATGCTGGCCAGTATACAGTAAGAGTTGGTTCCAATAGGGTTATAGCATTCTTTCCACTTGTGGGGTAGGAGCTGACATATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	247232	121	+	636262	TAGGGACACTGGGGATCCCAGTTGGGTGTTGAGCTA-AAGTATGCTGGCCAGTATACAGTGAGAGTTGGTTCCAATAGGGTTATAGCATTCTTTCCACTTGTTGGGTAGGAGCTGTTGTATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	237342	122	+	647215	TAGGGACACTGGGGATCCCAGTTGGGTGTTGAGCTACAAGTACGCTGGCCAGTATACAGTAAGACTAGGTTCCAGGAGGGTTAGAGCATTCTTTCCACCTGTGGGGTAGGAGCTGACATATT

a
s	mr.mrrefChr5	100142	5	+	294542	TTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	247361	5	+	636262	TTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	237464	5	+	647215	TTCTG

a
s	mr.mrrefChr5	100147	15	+	294542	GGGTGACCTGATATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	247368	15	+	636262	GGGTGACCTGATATA
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a
s	mr.mrrefChr5	100162	96	+	294542	AGACTTCATTCTTTGACATGTCAGCTGGGTAGCATTCAACTTATATCATTTTTGCTCAGTGTACTGAACAACTCTTTCAGACACCCCTATAGTGGC
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a
s	mr.mrrefChr5	100258	189	+	294542	CATATTTGCTTAATTCTATTAAGAAACTCACTCCCGACTATCTAGGTGCCTTTGAGACCCACTGCTCGCAGAAAAGATGAGCCCCCACATACCAGCTAGCTACTGAATGCACACAATGGAATATACTCAGTCACAAACTGAAGTTCTGCATCCAGTTGTCACACTGGTATGACCAAAATGCAAAAGAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	247491	189	+	636262	CATATTTGCTTAATTCTATTAAGAAACTCACTCCCGACTATCTAGGTGCCTTTGAGACCCACTGCTCGCAGAAAAGATGAGCCCCCACATACCAGCTAGCTACTGAATGCACACAATGGAATATACTCAGTCACAAACTGAAGTTCTGCATCCAGTTGTCACACTGGTATGACCAAAATGCAAAAGAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	237580	189	+	647215	TCTATTTGTTTAATTCCATTAAGAATCCCACTCTTGACTATCTAGGTGCCTTCAAGACCCACCGCTGCCAGAAAAGATGAGCCCCCCTGTTCCAGCTAAATACTGAATGCACACAATAGAATATGCTTAGCCACGAGCTGTAGTTCTGCATCCAGTTGTGACACTGGTATGACCAAAAAGCAAAAGAAA

a
s	mr.mrrefChr5	100447	20	+	294542	TGCATATTTTCTATGATTCA
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a
s	mr.mrrefChr5	100467	60	+	294542	ATAAATAGCTACATACAACACTTGTTGACTATCATTCATTAAACATATGTATTGAAGAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	100527	5	+	294542	CTTCA
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a
s	mr.mrrefChr5	100532	117	+	294542	ACATAGCTGCTTTATTCTTGGCAAATCTTGGTAAGCAGGAATCATCAGAAACATGCAGTCCACATCTCAACTGTCCATTGGTGTATTTCTAGACCCTGCAAGAATGTATTATCACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	247773	117	+	636262	ACATAGCTGCTTTATTCTTGGCAAATCTTGGTAAGCAGGAATCATCAGAAACATGCAGTCCACATCTCAACTGTCCATTGGTGTATTTCTAGACCCTGCAAGAATGTATTATCACAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	237855	117	+	647215	GCATAGCCCTTTTAATCTTGGCAAATCTTGGTAGACAGAGGTCATCAGAGACTTGCAGTCAGCTTCTCACTTGTCCATTGGTATATTCCTATACCCTACAAGACTGTATTATCACAG

a
s	mr.mrrefChr5	100649	131	+	294542	GGAATGAAAGACAAAAAAAATGAAAGTCATTCTTAGTTTTGATTCCTTAGACTTCCACTGAAGCTACCAGAGGTGGGCGGTTAGATAGTCCATGTGTATTAACAAAGTAACTGATCAATGATACCCTATTG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	238006	131	+	647215	GGAGTGAAAGACAAAAAAAACTAAAGTTATTCTTAGGTTAGATTCCTTACACTTCCACTGAAGCTACCAGAGCTGGGCAACTAGATAGTCCATGTATAATAACACAGTAACTGATCAATAACACCCTACTG

a
s	mr.mrrefChr5	100780	43	+	294542	CCTACCAGCATTGTGATCTGCTGAAACAACAGGTGATGAAACT
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a
s	mr.mrrefChr5	100823	18	+	294542	ATATAACCAATGTGTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	248083	18	+	636262	ATATAACCAATGTGTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	238180	18	+	647215	ATATAATCAATGTGTTGT

a
s	mr.mrrefChr5	100841	124	+	294542	GGTCAAGAAGAATTGGTTTCAGATGTAACCTCATGACTGACTAACTGATTGGTTGAGGCAGGTGTTGCCTCATGACTCACTAACTGATTGTTTGGGGTTGGGCAGTCTTGGGGGGCACAAGCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	248104	124	+	636262	GGTCAAGAAGAATTGGTTTCAGATGTAACCTCATGACTGACTAACTGATTGGTTGAGGCAGGTGTTGCCTCATGACTCACTAACTGATTGTTTGGGGTTGGGCAGTCTTGGGGGGCACAAGCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	238198	124	+	647215	GGTCAAGAAGAATCCTTTTCAGATGTAAACTCATAACTCACTAACTGATTGGTTGGGGCAGATGTAACCCTAAGACTCACTATCTGATTGGTTGGGGTTGGGCAGTCCTGGGTGGCACTAACTG

a
s	mr.mrrefChr5	100965	87	+	294542	TTTGGTTGGGGTTGGTCAGTCTTGGGAGGTTTGCCCCTCAGAGTTTGCCCCCACTGTTTAATGGTGAGTGAATTATGAGTACAGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	248229	87	+	636262	TTTGGTTGGGGTTGGTCAGTCTTGGGAGGTTTGCCCCTCAGAGTTTGCCCCCACTGTTTAATGGTGAGTGAATTATGAGTACAGATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	238322	87	+	647215	TTTGGGAGGGGTCGGGCAGTCTTGGGAAGATTGCCCTTCAGAGTTTGCCCCCACCGCTCAACAGTGAGTACATTATAAGTACAGATG

a
s	mr.mrrefChr5	101052	53	+	294542	GACGGGTTGAGTGAGGCAAAAAAGAAGGTAGGTGCGTGATAGTCATAAAACCA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	238409	53	+	647215	GACAGGTTGAGTGAGGCAAAAAAGAAATTGGATGCATGGTAGTCATAAAACCA

a
s	mr.mrrefChr5	101105	116	+	294542	CCTCAAAATTTCATAGTAGTTTTAGAGAAGTAGCTACAAATTGGAAGGGTGAAAACACCGGTTCAAGGCTGTGAATACTAAGTCTATTTTTGCTAGCCACCATATTTTCAAGTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	248378	116	+	636262	CCTCAAAATTTCATAGTAGTTTTAGAGAAGTAGCTACAAATTGGAAGGGTGAAAACACCGGTTCAAGGCTGTGAATACTAAGTCTATTTTTGCTAGCCACCATATTTTCAAGTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	238462	116	+	647215	CCTCAAAATCTCATAGTAGCTTTAGAGAAGTAGCTATGAGTTGGAAGGATGAAAGCACCAGTTCAATCCTGTGTATACTAAGTCTATCTTTGCTAGCCAACCTATTTTCAAGTAAA

a
s	mr.mrrefChr5	101221	11	+	294542	GACATGTTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	248494	11	+	636262	GACATGTTTCT
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a
s	mr.mrrefChr5	101232	50	+	294542	TTATCTATTGTCCCCCAGGCCAATAGCCGATTCAAATGGCAGTAGCTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	248505	50	+	636262	TTATCTATTGTCCCCCAGGCCAATAGCCGATTCAAATGGCAGTAGCTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	238621	50	+	647215	TGATCTATTGTCCCCCAGACAAATAGCCAACTCACATGGCAGCAGCCATA

a
s	mr.mrrefChr5	101282	78	+	294542	ATGCTTTTTTAGGTCTGAATCCTCCAAGCTAGTAGTTAACTCACAAACAGTGCCAATGGAACAGTAAGGAACAATGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	248561	78	+	636262	ATGCTTTTTTAGGTCTGAATCCTCCAAGCTAGTAGTTAACTCACAAACAGTGCCAATGGAACAGTAAGGAACAATGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	238671	78	+	647215	ATACTTTTTTAGGTATGGGTCCCTCAAGCTAGTAGCCAACTCACAAACGATGCCAATGAAGCAGTAAGGAACGATGTA

a
s	mr.mrrefChr5	101360	64	+	294542	TGAATCACAGTGTCTGCTTAAACTCTTTGTGCGCACTAGTATTTAATATGTGACTTGCCCAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	248639	64	+	636262	TGAATCACAGTGTCTGCTTAAACTCTTTGTGCGCACTAGTATTTAATATGTGACTTGCCCAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	238762	64	+	647215	TGAATCACAGTGTTAGCTTAAGCTTTTTCCAAGCACTAATATTCAATGTTTGACTTGCCCAGTT

a
s	mr.mrrefChr5	101424	39	+	294542	AGGGGGAAGTACAGCAATCAGGAACCTACAGGGTggcac
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	248749	38	+	636262	AGGGGGAAGTACAGCAATCAGGAACCTACAGGGTg-cac
s	simRat_chr6.simRat.chr6	238826	39	+	647215	AGGGTTAAGTACAGCAATCAGGAACCTACAGGGTGGCAC

a
s	mr.mrrefChr5	101463	126	+	294542	tctcttgctaggggagaggtcttgtccctagcatacatatcttgtcctgaaacaactgaacggaactgagctcagtgtcatcctacagatgttgcagataagcactcacaaaggtgggctgtctct
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	248787	126	+	636262	tctcttgctaggggagatgtcttgtccctagcgaacatgtcttgtcctgaaaggactgaacggaactgagttcagtgtcatcctacagatgttgcagataagcactcacaaaggtgggctgtctct
s	simRat_chr6.simRat.chr6	238872	107	+	647215	TTCATTTCAAAGGGAGGGA--------ATAGCATAAGTAT-----------ACAACAAACTTACACAGATCCCACATACATTCAAACTatgttgcagatcagcacacacaaaggtgggctgactct

a
s	mr.mrrefChr5	101589	113	+	294542	cccctatagagtagcaccgcaccacatccctcctaagtagcaacagcctaaaagctagactcagccacatcttactaaccccaaaagcacatcttacccatcccagaggtatt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	248913	113	+	636262	cccctatagagtagcaccgcaccacatccctgctaagtagcaacagcctaaaagctagactcggccacatcttgctaaccccaaaagcacatcttacccatcccaaaggtatt
s	simRat_chr6.simRat.chr6	238981	113	+	647215	cccttatgaagtagcactgcaccacatccctcctaaatagcaaagacctaaaagctagacccagccacatcttactaatcccaaaagcacatcttacgcatcccagaggtatt

a
s	mr.mrrefChr5	101702	12	+	294542	gagaggaccata
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	249029	12	+	636262	gagaggaccata
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a
s	mr.mrrefChr5	101714	161	+	294542	gttaggatatacaatcaggcaacctatggcaacctaagcaggaggactactataggcgggaagacctcagtggaaagatatccactctgctactttagtggggacccactcctaacctgggggaggatttgcaaacatgaaatgggattgatatgccaatt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	249043	157	+	636262	gttaagatatacaatcaggcaacctatggcaacctaagcaggaggactactataggcgggaagacctcagtggaaagatacccactctgctacctt----gggaccccctgctaacctgggggaggatctgcaaacatgaaatggagttgatatgccactc
s	simRat_chr6.simRat.chr6	239106	161	+	647215	gctaggatatccaataagacaacctgtggcaacctgagcaggaagactaccattggtgagaagacctcagtggaaagatatccactctgcaactttagtggggaccaactcctaacctgggtgaggatttgcaagcatgaaatgggattgaTATGCTAATT

a
s	mr.mrrefChr5	101875	411	+	294542	ctagacaggaaacctggctcaatctgagggagaggctcatatgtaaacattcaaggggaaatgacatatgtaaacattcaaggggaaatgaagggatgcatgtttatgtaaacgcataagagaaagcaagagagagtcagtatgtaattatacccagtgcgtctgtgcaacacccattagaattagagtagtggctcatattgagtatgacaaaaaagtacagggccaaggcttgaactagaactttatcatcctcaaggctgacttagagcctttaaagcctcaaggtctaggaagaggtgtgaggtgaaacattcaccacctcaggacattcccccttagtcaattcaaggcctacattgggtggttaggatgaatttgaattacaggaaagttactttctggtcagtg
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	249205	399	+	636262	ctagacaggaaacctagctcagtcagagggagaggctcatatgtaaacattcaaggggaaatgacatatgtaaacattcaaggggaaatgaagggatgcatgtttatgtaaacgcataagaagaagcaagagagagtcagtatgtaatgatccccagtatgtctgtgcaacacccattagaattagagtagtggctcatattgagtatgacaaaaaggtacagggccaaggcttgaactagatttttatcatcctcaaggctgacttaaagcctttaaagcctcaaggtctaggaggaggtgtgaggtgaaacattcaccacctcaggacattcccccttagtgaattcgagacctacattgactggttaggataaattcaaattacaggaaagttacc------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	239267	373	+	647215	CTAGACAGGAcacctggctcaatttgagggagcggctcatatgtaaacatccaagggg---------------------------aaatgaagggatgcatgttcatgtaaatgcataacagaaagcaagagagaatcagtatgtcattgtacccagtgcgtctgtgcaagacccactagagttagagtagtggctcatattgagtatgaccaaaaagtacagggccaaggcttgcactagaactttatcatcctaaaaggtgacttag---------agcctcaaggtctaggcagag--gtgaggggaaacacttacctcctcaggacattccctcttagtcaattcaaggactaccatgggtggttatgatgaacttgaattacgggaaaattactttctggtcagtg

a
s	mr.mrrefChr5	102286	89	+	294542	atctatgtggtttcagagttaaaactcgatctacatgagaagctcatggtcttctgggaagtggagacagtatgacctgttgatggatt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	249604	84	+	636262	-----tgtggtttcagagttataactcgatctacatgagaagcccatggtctcccgggaagtggagacagtatgatctgttgatggatt
s	simRat_chr6.simRat.chr6	239641	89	+	647215	atctatgtggtttcagagttgaaacttgatctacatgaggagctcaaggtcttctggggagtggagacagtatgacctgttggtggatt

a
s	mr.mrrefChr5	102375	314	+	294542	cctagacctgatgcagacttttcttacctacaacaaagttaaagcaagggttacctcctcaGACAGCTATGGTCAAAAGATAATTGTCTGACTCAACTAAGTGCACTGGTTCTACATACAATGTTCAACTCTTCTATTTTACTGTGGAACACGTAACAATGGCTAAAATTGCCTCTGCAAGTTTAAAAATTTTTATTCCCCAGTTGGAAGATTTTTACAGCTCTGAAAAACTGCTGGGTATATTAAGCATAAGTAGTAAAAGAAGTGCTAGTTGGATGCAAAAGCACAACTTTACAAATCTCTACAAGCTGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	249689	312	+	636262	cctagacctgatatagacttttcttacctacaacaaagttaaagcaagggttacctcctcaGACAGCTATGGTCAAAAGATAATTGCCTGACTCAACTAAATGCACTGGTTCTACATACAATGTTCAACTCTTCTATTCTACTATGGAACACGTAACAATGGCTACAA-TGCCTCTGCAAGTTTAAAAATTTTTATTCCCCAGTT-GAAGATTTCTACAGCTCTGAAAAACTGCGTGGTATACTAAGCACCAGTAGTAAAAGAAGTGCTAGTTGGATGCAAAAGCACAACTTTACAAATCTCCACAAGCTGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	239730	312	+	647215	actagacctgatgcagactttttttacctacaacaacgttaggg--aggattacctcctcaGACAGCTATGGTCATAAGATAATTGTCTGACTCAACTAAGTGCAATGGTTCTACATACAATGTTCAACAATTTTATTTTACTGTGGGACATATAACAATGGCTAAGATTGCCTCCGCCAGTTCAAAAATTTTTATTCCCCAGTTGGAATATTTTTACAGCTCTGAAAAACTGCTGGGTATATTACGCATAAGTATTAAAAGAAGTGCTAGTGGGATGCAAACATACAGCTTTACACATGCCTACAAGCTGAGT

a
s	mr.mrrefChr5	102689	193	+	294542	TCCTGGCCATATTCGCCCCTTTACCCTGTGCACTGTAGTTCTGAAGACCCTAAGATTGAGTACTAGTTCATTCCAAAACAATTGTTTAACTACTTCCTTCTAAGTCTGATTTCCTCCTTAAGAGATCAGAGGGGTCTGAGATACTCAAGTAGCTCCAAACCTGTGAGGTTCTATTTCAATTGTGATATGGGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	250003	193	+	636262	ACCTGGCCATATTCGCCCCTTTACCCTGTGCATTGCAGTTCTGAAGACCCTAAGATTGAGTACTAGTTCATTCCAAAACAATCACTTAACTACTTCCTTCTAAGTCTGATTTCCTCCTGAAGAGATCAGAGGGGTCTGAGATACTCAAGTAGCTCCAAACCTGTGAGGTTCTATTTCAATTGTGATATGGGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	240042	191	+	647215	TCGTGGCCCTCAGCCCCCCTGTACCTGCTGCACTGTAGTTCTGAGGACCCTAAGATTGAGTACAGGTTCATTCCAAAACAGTTGTTTAACTACTTCCTTCTAAGTCTGATTTCCTCCTTAAGAGATCAGAGGGGTCTGAGATACTCAAGTAGTTCCAAACCTGTGAGGTTCTATTTCAATTGTGATA--GGAC

a
s	mr.mrrefChr5	102882	88	+	294542	TTGAAACGAGGTCTAGGTATGAGAAAGTGCACCCTAAAAATTGTGACAGGAGTGGGGGCCCACTGTGATAACAAGCAGTGGGTCGTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	250199	88	+	636262	TTGAAACGAGGTCTAGGTATGAGAAAGTGCACCCTAAAAATTGTGACAGGAGTGGGGGCCCACTGTTATAACAAGGAGTCGGTCGTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	240233	87	+	647215	TTGAAATGAGGTCTAGGT-TGAGAAAGTGCACCCTAAACATTGTGACAGGAGTGGGGGCCCCCTGTGACAACAAGCCCTGGGTCACGG

a
s	mr.mrrefChr5	102970	34	+	294542	AGACACTTAGATAGTTAAGAGTGGGTTTTTTAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	250287	34	+	636262	AGACACTTAGATAGTTAAGAGTGGGTTTCTTAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	240325	34	+	647215	AGGCACTTAGATAGTTAAGAGTGGGTTTTTTAAT

a
s	mr.mrrefChr5	103004	7	+	294542	GATTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	250321	7	+	636262	GGTTTCT
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a
s	mr.mrrefChr5	103011	352	+	294542	ATGGAATTCAACAAATATGCCGCCATTATACAGGTGTCTGAACGAGTTGTTTCAGGGCCATTAGCTAAAATGATACAAATATAAGGCTACCCAACTGACCTGTCAAACAACAAAGTCTATACCAGGTTGCAGGCCTATGACACATCTCCATTGAGCAACCCATAGACCCACCAGCGATTTGATTCTGCATTTTACAGGTTTGTGGCAAGTGTAGTTCTGCTCAATGGCCTCATAAGAAAGTGTTGTTGACTAACATCATAACTCTAACGTGAGTTGGAACTGAATATATATAAAGTGCCAGTCACTAATTTATTGGGGGGACTATATTACATAAGAGATTTGGTCTGCCCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	250330	319	+	636262	ATGGAATTCAACAAATATG---------TACAGGTGTCTGAACGAGTTGTTCC--------TAGCTAAAATGATACAAATATAAGGCTACCCAACTGACCTATCAAACAACGAAGTCTATATCAGGTTGCAGGCCTATGACATA--TCCATTGAGCAAGCCATAGACCCACCAGCGAATTGATTCCGCGTTTTACAGGTTTGTGGCAAGTGTAGTTCTGCTCAAAGGCCTCATAAGAAAGTGCTGTTGACTAACATCATA--------------TGGAACTGAATATATATAACGTGCCAGTAACTAATTTATTGGGGGGACTATATTACATAAAAGTTTTGGTCTGCCCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	240362	340	+	647215	-----ATTCAACTAATATGCCGCCATTATATGGGTGTCTGAATAAGCTGTTTCAGGGCCATTAGCTAAAATGATACAAGT-CAAGGCTACCCAGCAGACCTGCCAAAGAACAGGGTCTATACCAGGTCGCAGGCCTATGACACATCTCCATTGTGCAACCGATAGTCCCACCAGTGATTTGATTCTGTATTTTACAGGTTTGTGGCAAGTGTAGT--TGCTCAATGGCCTCATACGAAAGTATTGTTGACTAACATCCTAACTCTAACGTGAGTTCGAACTGA----ACATAAAGTGGCAGTCACCAATTTATTGGGGGAACTATATTAGATAAGAGATTTGGTCTGCCCTA

a
s	mr.mrrefChr5	103363	184	+	294542	GGCTTAGTTTATTGAACCCATGGCAATCTTGGATGGATATTATAGACTAGGACACAACTGTCTAGGTATCATTAACTGACAATAGACACCCCAGCCTAACTGGAAGCTTCAAGCACATAAGTTATCAATACTTATGTACATCCAGCTAGGCAAACAGCAATGGTGGATGCTAGGCAAACAGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	250649	184	+	636262	GGCTTAGTTTATTGAACCCATGGCAACCTTGGATGGATATTATAGACTAAGACACAACTGTCTAGGTATCATTAACTGACAATAGACACCCCAGTCTAACTGGAAGCTCCCAGCACATAAGTTATCAATACTTATGTACGTCCAGCTAGGCAAACAGCAATGGTGGATGCTAGGCAAACAGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	240703	184	+	647215	GGCTTAGTTTATTGAACCCATGGTTATCTTGGATGGATATTTAAGACTAGGACACAACTGTTTAGGTATCATTAACTGACAATAGACACCCCAGCCTAACTGGAAGCTTCAAGCACCTGAATTGTCAATACTTATGTATATCCATCTAGCCAAACGGCAATGGTGGATGCTAGGCAAACATCAT

a
s	mr.mrrefChr5	103547	46	+	294542	AGATGCTAGCTAAAGTCCATCCCAAACAACTACTGGTGTGGCCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	250833	46	+	636262	AGATGCTAGCTAAAGTCCATCCCAAACTACTACTGGTGTGGCCATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	240888	46	+	647215	GGATGCTAGGTAAAGTCCATCCCAAACAACTACTGGTGTGGCCATG

a
s	mr.mrrefChr5	103593	144	+	294542	CCCACTACACTCCCTAAGTACAAATGTTAACTATAAGAGACTCTGTCAACACTAAACTAAAATGTGGATGTAATTTGCCACAGTGGAACTTGTTTTGACCATGCCACCAGTTATAGAAACACTGAGAGCTATTAAGACCAATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	250883	144	+	636262	CCCACTACACTCCATAAGAACAAATGTTAACTATAAGAGACCCTGTCAACACTAAACTAGAATGTGGATTTAATTTGCCACAGTGGAACTTGTTTTGAGCATGCCACCAGTTATAGAAACACTGAGAGCTATTAAGACCAATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	240934	144	+	647215	CCCGCTATGCTCCCTAAGTACAGACGTTAACTATAAGAGACTCTGTCAACACTAAACTAAAATGTGGCTGTAATTTGCCACAGTGGAGCTTGTTTTGGCCATGCTACCAGCTGTAGAAACACTGAGAGTTGTTAAGACCAATCT

a
s	mr.mrrefChr5	103737	35	+	294542	AAGTATCTCCAAACACTACCCTTACTATTTGCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251027	35	+	636262	AAGTATCTCCAAACGCTACCCTTATTATTTGCACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241079	35	+	647215	AAGTATCTCCAAGCACTACCCTTACTATTTCCACA

a
s	mr.mrrefChr5	103772	252	+	294542	TCATAACATTGTTTTACATTAGGACATAAGATGGTTATAGTGACCATTGTTTGAGACTACCCAGTGAGTAATAGACATGATCTGGTGTTAGTTAACAGTATTAAAATAGACTGTGATCTGCTGCTAAGACATCTTATACCACTTCTGTCCTGGATGCAATGCTTCTTGTGACTCAAAGTTTGAACTACATATGCTACATGTTACTTAGTTGGAAAATGCACTAATTTTGCAGTATAACACCCCACACAAGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251062	247	+	636262	TCACAACATTGTTTTACATAAGGACATAAGATGGTTATAGTGACCATTGTTTGAGACTACCCAGTGAGTAATAGACATGATCTGGTGTTAGTTAACAGTATTAAAATAGACTGTGATCTGCTGCTAAGACATCTTATACCACTTCTGTCCTGGGTGCAATGCTTCTTGTGACTCAAAGTTTGAACTACATATGCTACATGTTACTTAGTTGGAAAATGCACTAATTT-----TATAACACCCCACACAAGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241119	249	+	647215	TTATAACACCATTGTAAATTAGGGCAGAAGA---TTATAGTGACCATTGTTTGAGACTACTCAATATGTTATAGACATGATCTGGTGTTAGTTAACAGTATTAAAATAGATTGCAATCTGCTGTTTAGACATCCTATACCACTTCTGTACTGGATGCAATGCTTCTTGTGACTCAAAGTTTGAACGACATATTCTACATGTTATTTCGTCAAAAACTGCACTAATTTTGCAGTATAACACCCCACACAAGTG

a
s	mr.mrrefChr5	104024	55	+	294542	CACAGGAGTTTCCAATGTTCCTGTACATGGGCAACTTAATTTTTTCACAAGTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251311	50	+	636262	CACAGGAGATTCCAATGTTCCTGTACAGGGGCAACTTAA-----TCACAAGTATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241368	55	+	647215	CACAAGAGTTTCCAATGTTCCTGTACATGGGCAATTTAATTTTTTCACAAGTATT

a
s	mr.mrrefChr5	104079	5	+	294542	ATTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251361	5	+	636262	ATTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241439	5	+	647215	ACTTA

a
s	mr.mrrefChr5	104084	47	+	294542	AACTTATGTTCTAGCAGTCTCAAATCATATCTTGCTCTCTGTTTTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251366	47	+	636262	AACTTGTGCTCTAGCAGTCTCAAATCATATCTTGCTCTCTGTTTTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241449	16	+	647215	AACTTAAGTTCAAGCA-------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	104131	114	+	294542	CAGATTTCTAGTTTAGATGACCCTAGTGTTTCAAGGATAAATGAAAAATGCTGTCAATAATCGGGACTTGAGTTGCTACATAGTCTCTGTGTGGTTTTGAGGCGAGGGTATACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251477	114	+	636262	CAGATTTCTAGTTTAGATGACCCTAGTGTTTCAAGGATAAATGAAAAATGCTGTCAATAATCGGGACTTGAGTTGCTACATAGTCTCTGTGTGGTTTTGAGGCGAGGGTATACA

a
s	mr.mrrefChr5	104245	16	+	294542	GTAGTGGTGCTAGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251592	16	+	636262	GTAGTGGTGCTAGTGT

a
s	mr.mrrefChr5	104261	9	+	294542	ACCAACAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251610	9	+	636262	ACCAACAAC

a
s	mr.mrrefChr5	104270	20	+	294542	CTACTGTGTACCCTCTCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251620	20	+	636262	CTACTGTGTACCCTCTCACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241465	9	+	647215	-----------TCTATCACA

a
s	mr.mrrefChr5	104290	77	+	294542	TCTTTCTATTACTCATCCCTGAGAACACTCGGGTCATCTAACCCAGAAACTGGATAGCAAAGCAGAGAGAGCAAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251640	77	+	636262	TCTTTCTATTACTCATCCCTGAGAACACTCGGGTCATCTAACCCAGAAACTGGATAGCAAAGCAGAGAGAGCAAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241475	77	+	647215	TGCATCTTTTACTCATCCTTGAGAACAGTTGGGTCATCTGAACTAGAAACTGGACAATAATGCAGAGAGAGCAAGAT

a
s	mr.mrrefChr5	104367	6	+	294542	TGATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251717	6	+	636262	TGATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241553	6	+	647215	TGATGT

a
s	mr.mrrefChr5	104373	46	+	294542	ATAGACTGCTGGAAAACTTTCGACGAGACTTCTGAAAAAATTAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251723	46	+	636262	ATAGACTGCTGGAAAACTTTCGACGAGACTTCTGAAAAAATTAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241560	46	+	647215	CTAGATTGCTGGAACACTGTGAACAAAACTTCTGGACAAATGAAAT

a
s	mr.mrrefChr5	104419	14	+	294542	GGACCAGGCACAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251769	14	+	636262	GGACCAGGCACAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241709	14	+	647215	GGAGCAGGCACAGG

a
s	mr.mrrefChr5	104433	59	+	294542	GCACTGGAAACCCATTTGTCCACCTGTGTTGGACGTTATGCTGCAAAATTAGTGAATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251784	59	+	636262	GCACTGGAAACCCATTTGTCCACCTGTGTTGGACGTTATGCTGCAAAATTAGTGAATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241723	59	+	647215	GCATTGGCAACTCATTTGTGCACCTGTGTTGGATGTTATACCGCAAAATTAGTTAATCT

a
s	mr.mrrefChr5	104492	65	+	294542	TCCTACTAGATAGCATGTGGAATCAGTAATTCAAACCCTTCAAAAGTAGCTACGAGCATCCAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251845	65	+	636262	TCCTACTAGATAGCATGTGGAATCAGTAATTCAAACCCTTCAAAAGTAGCTACGAGCATCCAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241782	65	+	647215	TCCGACTACGTAACATGGGAAATAAGTAATTCAAACCCTTCAGAAATAGCTTAGAGTATCCAGTA

a
s	mr.mrrefChr5	104557	53	+	294542	GGGAGTGGTACTGGACATCTTAGTGACAGATTGCAGAATTTTAGCTCTAAAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251910	53	+	636262	GGGAGTGGTACTGGACATCTTAGTGACAGATTGCAGAATTTTAGCTCTAAAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241848	53	+	647215	AGGAGTGGTACTGGACATCTTAGTGACAGATCGCAGAATTTTAGCTCTAAAGT

a
s	mr.mrrefChr5	104610	40	+	294542	AATCAATTGTCACAACTGTAGGACAAACAGTTATCCCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	251970	40	+	636262	AATCAATTGTCACAACTGTAGGACAAACAGTTATCCCTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241901	40	+	647215	AATCACTTGTCACAACTGTAGAGCAAACAGCTATTAATTA

a
s	mr.mrrefChr5	104650	376	+	294542	AGTACTTAGATATGTATTTTTAATTAATTTCATCATCCTTACACTTATAGAATGGTATGGATGGGCCTCTTGATATGTCACCCTAAGAAAACAATAGTAGAAACACTGTATGTTTACAAGCAATCTGATCACTATTCTTATGTGTGAATAGAAATAGAATTTCTATTGTACTAATGCCTGACAAGTTTTTGGGGTAAGATCCAGTACAAATGATGGGTCAAAGTAACGGAATGTTATCAGAATTATGAGAGACCGCCTGTAAGTATTGTCAAGTATTACATGAAATTCTTTCTGTTGGATCCTGATTTTTGAGGATGCAATTAAATTCTGAGCGAGTGCACATTGTCTCCATAGCACATACCTAGTAATGGATCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	252010	376	+	636262	AGTACTAAGATATGTATTTTTAATTAATTTCACCATCCTTTCACTTATAGGATGGTATGGATGGGCCTCTTGATATGTCACCCTAGGAAAACGATAGTAGAAACACTGTACGTTTACAAGCAATCTGATCACTATTCTTATGTGTGAATAGAAATAGAATGTCCATTGTACTAATGCCTGACAAGTTTTTGGGGCAAGATCCAGTACAAATGATGGGTCAAAGGAACGGAATGTTATCAGAATTATGAGAGACCGCCCGTAAGTATTGTTGAGTATTATATGAAATTCTTTCTGTTAGATCCTTATTTTTGAGGATGCAATTAAATTCTGAGTAAGTGCACATTGTCTCCATAGGACATACCTAGTAATGGACCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	241942	373	+	647215	AGTACTTAGTTATGTATCTTCAATTAATTTCATCATCCTTACACTGATCGAGTGGTATGGATGGGCCTCTTGAGATGCTACCCTAACAGAACAATGGTAGAAACATTGTATGGTTACAAGCAATCTAATCGCTACTCTTATGTGTGAATAGAAATAAAATTTGTATTGTATTTATGCATAACAAGTTTTTGGGGTAAGATCCAGTGCAATTGATGAGCCAAAGTAACAGAATGTTATGAGAATTATGAGAGACCGCCTGTAAGTGTTGTCAAGTATTACATGAA---CTTTCTGTTGGATCCTGCTTTTTGAGGATGTAACTAAATTCTGAGCGAGTCCATAATGTCTCAGTAGCACATACCTAGGAATGGATCCC

a
s	mr.mrrefChr5	105026	153	+	294542	TGTTGAGATGTGGTTATTGTTCAAAACTACCCTGTGTCAAATGGACAGTACCAAAGGGCTGTGACTCTTTTGTCTGGGGATAGCACTTGTATCATCCAAAACTAGGACTTAGAAAAGTACTCACGCAAAGGAGGGCAGTACAAGCTTAAATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	252389	52	+	636262	TGTTGAGATGT----------------------------------------------------------------------------------------------------GAAGGGTACTCACGCAAAGGA-GGCAGTACAAGTTTAAATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	242315	153	+	647215	TGTCGAGATGTGGTTATTGTTCAAAACTACCCTGTGTCAAATGGACAGTACCAAAGGGCTGTGACTCTTTTGTCTGGGGATAGCACTTGTATCATCCAAAACTAGGACTTAGAAAAGTACTCATGCAAAGGAGGGCAGTACAAGCTTAAATGG

a
s	mr.mrrefChr5	105179	149	+	294542	AAAGGGTTCCAATGTCTATAATGCATAAGGCTGAATATACCACAACCTTATCTATTGGTTATTTCAGGCCACGTATGACGTTTCTCTGCACAATCATACTTCAGGGTCTAAGTTGGCATTGAGAGAAGTTGGAGTGTATTTTAGCTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	252441	145	+	636262	AAAGGGTTCCAATGTCCATGATGCATAAGGCTGAATATACCACAACCTTATCTATTGGTTATTTCTGGCCACGTATGACATTTCTCTG----ATCATACTTCAGGGTCTAAGTTGGCATTGAGAGAAGTTGTAGTGTATTTTAGCTATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	242507	142	+	647215	AAAGGGTTCCAATGTCTATAACACATAAGATTGAATATATCACAACTTTAGCTATCGGTTATTTCAGGCCACCTATGACGTTTCTCTGCACAATCATACTTCAGGGTCTGAGTTGGCATTGAGTGAAGTTGGAGTGGATTTT-------

a
s	mr.mrrefChr5	105328	169	+	294542	CACCAGCTAAGCAGGCCTGACAGAGTGACTATACAAACCTTGTAACTGCATAAACAAGACTAACCACTACCTTAGGACTTAGAACAGTTACATTGGGAATCTGGACACGGTTCATCTGGAAAATGCTTGGGAGTCAATTTCCCTTACTGAATTATCAGGTCTCTGAGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	252587	169	+	636262	CACCAGCTAAGCAGGCCTGACAGAGTGACTATACAAACCTTGTAACTGCATAAACAAGACTAACCACTACCTTAGGACTTAGAACAGTTACATTGGGAATCTGGACATGGTTCACCTGGAAAATGCTTGGGAGTCAATTTCCCTTACTGAATTATCAGGTCTCTGGGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	242649	106	+	647215	------------------------------------------------CATAAACAAGACTGACCACTACCTTAGGACTT-------TTACATTGGGAATCTAGAGACGGTTCATCT-----ATGC---GGAGTCAGTTTCCCTTACCAAATTATCAGGTCTCTGAGCC

a
s	mr.mrrefChr5	105497	177	+	294542	TTTCAGACACAATAGGGATGAACAGGCAGCAAGGAGTTGCTCTTCATAGGAATCCAGGGACCCAATATTCAGTAGGACTGTGGGTATAATATAACTCGTGTCTGTAGCTAAACAGTCAGTGACTCTAATTTGCTAAATATCTCTTATGAATCTCCGGGGTCTTCTAATGTCCAGATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	252769	175	+	636262	TTTCAG-CACAATAGAGATGAACAGGCAGGAAGGAGTTGCTCTATATAGGAATCCAGGGACCCAATGTTCAGTAGGAC-GTGTGCATAACGTAACTCTTCTCTGTAGCTAAACAGTCAGTGAATCTAATTTGCTAAATATCTCTTATGAATCTCCGGGGTCTTCTAACGTTCAGATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	242755	177	+	647215	TTTCAGACACAATAGGGATGAACAGGTGGCAAGGAGTTGCTTTTCATAAGAATGCAGGGACCCAATATTCAGTAAGACTGTGGGTATAATATATCTCGTGTCTGTAGCTAAACAGTCAGTGACTGTAATTTGCTAAATATCTCTTATGAATCTCCTCGGTCTTCTAATGACCAGATA

a
s	mr.mrrefChr5	105674	8	+	294542	CAAGAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	252944	8	+	636262	CAAGAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	242934	8	+	647215	CAAAAGTG

a
s	mr.mrrefChr5	105682	10	+	294542	AGGAACTAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	252952	10	+	636262	AGGAACTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	242946	10	+	647215	AGGAACCCAA

a
s	mr.mrrefChr5	105692	59	+	294542	TGTTGAATGGGTGTGCACAGAGTGTTTTCAGGTCTATCACAAGTATTTCAAATAGATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	252965	59	+	636262	TGTTGAATGGGTGTGCACAGAGTGTTTTCAGGTCTATCACAAGTATTTCAAATAGATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	242956	8	+	647215	TGTTAATT---------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	105751	14	+	294542	AGTAAAGGAGGTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	253030	14	+	636262	AGTAAAGGAGGTTA

a
s	mr.mrrefChr5	105765	93	+	294542	AAGGTTGCCAGATTAGTGGTTTTATCTCCATGCCCTAAGAAGACTACTGAATTGTTAGGGTCTATTTTCACAGTCATGAGACTGCCATTGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	253057	93	+	636262	AAGGTTGCCAGATTAGTGGTTTTATCTCCATGCCCTAAGAAGACTACTGAATTGTTAGGGTCTATTTTCACAGTCATGAGACTGCAATTGGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	242964	17	+	647215	-----------------------------------------------------------------------AGTCTAGACAACGCCAT-----

a
s	mr.mrrefChr5	105858	71	+	294542	AAGTAGAACTTTCAGTGAGAATGATGAAGTCACTAACCAATCATACATCTGTATTGCAGTGGAAGATCTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	253151	71	+	636262	AAGTAGAACTTTCAGTGAGGACGATGAAGTCACTAACCAATCATACATCTGTATTGCAGTGGAAGATATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	242981	70	+	647215	-GGTAAAACTTACAGTGAGAATGATGAACTCACTAACCAACCATACATCTGTATTGCAGTGGAAGGCCTTC

a
s	mr.mrrefChr5	105929	26	+	294542	AAGTGTAGTCTAGTGTACAGTTATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	253223	26	+	636262	AAGTGGGGTCTAGTGTACAGTTATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	243051	25	+	647215	AAGTGTAGTA-AGTGTACAGTTATTA

a
s	mr.mrrefChr5	105955	106	+	294542	CCTGCACGTCACTTATTTTAGTAACAGCTCAATACTGTAATAGTGGCTACAGATATTAGTATTACCTCCACTATTTTTTGCCCTTGTACCACATTGTAAATCATCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	253249	90	+	636262	CCTGCACGTCAC----TTCAGTAACAGCTCAATACTGTAATAGTGGCTACAGATATTAGTATTACCT--ACTATTTTTTGAC------CCACATTGT-AATCA---
s	simRat_chr6.simRat.chr6	243080	106	+	647215	CCTGCACATCACTTATTTTACCAATTGCCAGCTACTGCAACAGTCGTGATAGTTACTGGTACTACCTCCACTATCTTTTGCCCTTGTACCACAATGTAAATCATCC

a
s	mr.mrrefChr5	106061	52	+	294542	GGTGAGAATGAAGAATTGGCAAAAGCTGACCCCCAAACTGGAGGAGTGTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	253339	52	+	636262	GGTGAGAATGAAGAATTGGCAAAAGCTGACCCCCAAACTGGAGGAGTGTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	243189	52	+	647215	GGTGAGAATGAAGAATTGGCAAAACCCGACACCAAAACTGGAGGAGTGTGAG

a
s	mr.mrrefChr5	106113	15	+	294542	CTATTGAGATTTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	253428	15	+	636262	CTATTGAGATTTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	243241	15	+	647215	CAAGTGAGATTTGAT

a
s	mr.mrrefChr5	106128	71	+	294542	CCCATCAAAAATTTGTGATCACACTCTGCATTATTTCAGGGGCCCTGGGTTTAAAGGCCGCTAAGGTGTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	253443	71	+	636262	CCCATCAAAAATTTGTGATCACACTCTGCATTATTTCAGGGGCCCTGGGTTTAAAGGCCGCTAAGGTGTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	243261	71	+	647215	ACCATCAAAATTTTGTGATCACAATCTGCATTATTTCAGGGGTACTGGGTTTAAAGGTCATTAAGTTGTGG

a
s	mr.mrrefChr5	106199	27	+	294542	TAATAGTAACCACCAATCCAGTAAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	253514	27	+	636262	TAATAGTAACCACCAATCCAGTAAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	243359	27	+	647215	TAACAGTAACCTCCAACCCAGTAAACC

a
s	mr.mrrefChr5	106226	88	+	294542	CAACAGACAGCATTTTTATTCTGATGTACCTGCCGTAGTAAGAAATAGCTCAACCAGCAAATCATGGTTTAACCGATTAATTTTGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	253542	72	+	636262	CAACAGACAGCATTTTTATTCTAATGTACCTGCCGTAGTAAGAAATGGCTCAAT----------------AGCCGATTAATTTTGTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	243386	88	+	647215	CAAAAGAGATTATTTTTATTCTGCTGTACCTGTCATAGTAAGAAATAGCTCAACCAGCAAATCATGGTTTAACCAATTAACTTTGTCA

a
s	mr.mrrefChr5	106314	229	+	294542	TTTCGACTTGGAAGGCTTTGGGAAATTCTTTTAGCATAAACCAGGGTTGTCATTGTTTAGCCAATTATGACAAAAGAAGGTCAAACCAAGAAGATCCATATATTCATACATTTTGCATAGAAGCCCATAACACTCCGTGCCAGAGACATTTAATTACAGAACTCCTTGGTACTACCTTTGTTGTTTTTTATGTGCTATCAGAGGCAGGTTAATTACCAGGCCCAAACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	253616	229	+	636262	TTTCGACTTGGAGGGCTTTGGCAAACTCTCTTAGCATAAACCAGGGTTGTCATTGTTTAGCCAATTATGACAAAAGAAGGTCAAACCAAGAAGATCCATATATTCATACACTTTGCATAGAAGCCCATAACACTCCGTGCCAGAGACATTTAATTACAGAACTCCTTGGTACTACCTTTATTCTTTTTTATGTGCTATCAGAGGCAGGTTAATTACCAGGCCCAACCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	243474	221	+	647215	--------TGGAAGGCTTTGGGAAATTCTTTTAGCATAAACCAGGGGTGTCATTGTTTAGCCAATGATGACAAAAGAAGGTGAAACCAAGAAGATTCATAAATTCATAAATTCTGCATAGAAGACGATAACACTCCATGCTAGAGACATTTGATTACAGAACTCCTCAGGACTGCCTTTGTTGTTTTTTCTGTGCTATCAGAGGCAGGTTCATTACCAGGCCCAGACAA

a
s	mr.mrrefChr5	106543	68	+	294542	ACCAATATAAGCGAGATAGTAATGTCACTTAGCTGTGGTCTACTAATAATCACCTGAGGAGAAATAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	253845	68	+	636262	ACCTACATAAGCGAGATTGTATTGTCAATTAGCTGTGGTCTACTAATAATCACCTGAGGAGAAATAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	243701	68	+	647215	ACCAATACAAGGGAGATAGTAACATCACTTTGCTGTGGTCTCCTAATAATCACCTGATGAACGATCAG

a
s	mr.mrrefChr5	106611	121	+	294542	GCTAAAGAGTACAGCCGTGAGATTAGTAGGGCAACTAAGAGCAAGATATGAGTGTTAGAGAAAATGCTGATGGCAATAAACGCCCCCCATTGAGATTAAGCAAAGGAAATTTGACTTAGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	253914	121	+	636262	ACTAAAGAGTACAGCCGTCAGATTAGTAGGGCAACTAAGAGCAACATATGAGTGTTAGAGAAGATGCAGATGGCAATAAACGTCCCCCATTGAGATTAAGCAAAGGAAATTTGACTTAGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	243769	121	+	647215	GCTAAAGAGTATAGCCGTGAGATTAGTAGGGTAACTAAGAGCAAGATACAAGTGTTAGAGAAAACGCTGATAGCAATCAAAGCCCCCTGTTGAGATTAAGCAAATGAAGTTTAACTTAGGA

a
s	mr.mrrefChr5	106732	193	+	294542	AATGACAATAGAAGTGGAATCTAAGTTTCTGCTATTAAAGTTTTCCACTATTGACTATGGTGCAAGCTGGCTACTTAAAAAGTGTTTATAAGGCTGTAGGAACATAATAGTCTGCAGTGGTCCTAAATGAATACTAAGCAATAGCGACCGTAAGAGATGTTTACTGGTCTAGTAAGTACAGGGTAGCCGATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	254068	193	+	636262	AATGACAATAGAAGTGGAATCTAAGTTTGTGCTATTAAAGTTTTCCGATATTGACTATTGCGCAAGCAAGCTACTTAAAAAGTGTTTATAGGGCCGTAGGAACATAATAGTCTGCAGTGGTCCTAGATCAATACTAAGCAATAATGACCGTAAGAGATGTTTACTGCTCTGGTAAGTACAGGGTAGTCCATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	243890	184	+	647215	AATGACAATAGAAGTGGAATCTAAGTTTCTGCTAT-----TTTTCTACTATTGACTATGGTGCAAGCTGGCTACTCAAAAAGTGTTTATAAGGCTCTAGGA----GATGGTCTGCATCGGTCTTAAATGAATACTAAGCAACAGCGACCATACGAGATGCTTACTGGTCTAGTAGCTACAAGGTGGCCGATCT

a
s	mr.mrrefChr5	106925	369	+	294542	GGATGCTGCAATTGTCTACCTATCTTACCCTTAAGTACCAACCATCATTCATGGCTTTTGCCAGGGACATACATGATCTAGCAACACACCCAAACAAACTCTGACATGCAGCTGAAGTCAACTGGCCAATAAAGCAGGTAGTTAGTTTGTGAGATATATGTTGTTGCATGTTTAATGGACAAGGTTCCACACTTACTACTCCGATCAGACATCATATATCCCCAGGTCACTTGGCTAAACTGAACAGTTGTCTACCCCAAAATTACCTTATTAGAATCTAGCTGACCATGGGAATATCACTTGATAGCTAAACAATGTACTTTGTATAGGTGTGGAATTAAAATATGACACACTACAACCCTGTGATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	254263	347	+	636262	AGATGCTGCAAGTGTCTACCTA-------------TACCAACCATCATTCATGGCTTTTGCCAGGGACATACATGATCCAGCAATACACCCAAACAAACTCTGGGATGCAGTTGGAGTCAACTGGCCAATAAAGCGGGTAGTTGGTTAGTGAGATATATGTTATTGCATGTTTAATGGACAAGGTTCCAAACTTGCTACTCTGATCAGACATCATATATCCCCAGGTCACTTGGCTAAACTAAACAGTTGCCTACCCCAAAATTACCTTATTAGAATCTAGCTGACCATGGGAATATCATTTGATATCTAAACAATGTACTTTGAGTAGGCGGACAACCAATACACAAC---------CCCTGTGATCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	244074	369	+	647215	GGATGCTGCAATTCTCTACCTATCTTACCCTTAAGTACCAACCATCCTTCATGGGTTTTGCCAGTGATATACATGATCTAGCAACACACCCAAACAAACTCCGACATGCAGCTTAACTCAAATGGCCAATAAAGCAGGTAATTAGATTGTGAGACTTATGTTGTTGCATGTTTAATGGACAAGGTTCCACACTTACTACTCCGATCAGACATCACATATCCCCAGGTCACTTGGTTAAACCGAACAGTTGTCTACCTCATAATTACCTTATTAGAATCTTATTGGCTATGGGAATATCACTTGCTAGCCAAACAACACACTTTGTATAGGTGTGGAATTAAAATATGACACACTACAACACTGTGATCT

a
s	mr.mrrefChr5	107294	16	+	294542	GCTGATCTACGTACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	254664	16	+	636262	GCTAAACAATGTACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	244443	16	+	647215	GCTGGTCTACGTACAC

a
s	mr.mrrefChr5	107310	170	+	294542	ACAACCAATACACAACCCCTGTGATCTCATTAAACTAAGTTTCATGACTTTGTCCTATAAGTTGTAACTATTGGGTTAGGTATCTGTCAACCTACTGGTGTTTAAGGTCCTTGATAGAGTATGAAGTCCTCGTGCCATGTTGTAGGTGGAGATGTGCTGGCTGCAACCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	254691	167	+	636262	ACAACCAATACACAACCCCTGTGATCTCAGTAAACTAAGTTTCCTGACTTGGTCCTATAACTTGTAACTATTGGGTTAGGTATCTGTCAACCTGCTGGTATTTAAGGTCCTTGATAGAGTATGAAGTCCTCATGCCATGTTGTAGGTGGAGATGTGC---CTGCAACCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	244459	156	+	647215	ACAACCAATACACAACCCCTGTGATCTCATTAAACTAAGTTTCATGACTTTGTCCTATAAGTTGTAACTATTGGCTT--------------CCACTGGAGTTCAAGATCCTTGATAGGGTATGAGGTGCTTGTGCCATGTTGTAGGTGGAGCTGTGCTGGCTGCAACGTC

a
s	mr.mrrefChr5	107480	17	+	294542	GTATGCCATTTTACCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	254858	17	+	636262	GTATGCCATTTTACCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	244616	17	+	647215	GTATGGCATTTTACCAG

a
s	mr.mrrefChr5	107497	127	+	294542	CACATAGATTCTAGCTTTGTCCAAACAGTTGTAGTGGAGTCATTCTGTAGGCTGGCAAGATGATGATACAAGAACTTCTACCCACCAAAGAAAGGTCATATCCATCTTATGCAGTATATGAATATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	254875	122	+	636262	CACATAGATTCTAGCTTTGCCCAAATAGTTGTAGTGAAATCATTCTGTTGGCTGGCAAGATGATGATACAAGAACTCTTACCCACCAAAGAAAGGTCATATCCTTCTT-----GTATATGAATATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	244634	127	+	647215	CACAGAGGTTCTAGCTTTCTCCTAACAACTGTAGTGGAGTCAAGCTGGAGGCTGGCAAGATGATGATAGAAGAGCTTCTACCCACCAAAGAAGGGTCGTCTCCATCTTATGCAGTATCAGAATATCA

a
s	mr.mrrefChr5	107624	15	+	294542	TTTGGAACAAGAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	255014	15	+	636262	TTTGGAACAAGAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	244761	15	+	647215	CTTGGAACAGGGAAG

a
s	mr.mrrefChr5	107639	18	+	294542	GTCATATCCATCTTATGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	255029	18	+	636262	GTCATTTCCATTTTATGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	244777	18	+	647215	GTCATATCTATCTTACGC

a
s	mr.mrrefChr5	107657	44	+	294542	AGTACATGAATATGACTTGGAACATCCTCCCATTTGGTAGCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	255048	44	+	636262	AGTACATGAATATGGCTTGGAACATCCTCCCATTTGGTAGCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	244795	44	+	647215	AGTCTATGAATATGACTTGGAACATTCCCCCATTTGGTAGCACT

a
s	mr.mrrefChr5	107701	135	+	294542	GTTAGGGCTAGACCTTTGGCTCTCAGCAACTGCTACTGAGTAAGATATTAATTTCCTTGATCAGAAGATATTCATGATATCACTTTCTTCATGCTTGATGGAGTCCGTTCAGGATATAGCTTCTTTGCTGCTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	255098	135	+	636262	GTTAGGGCTAGACCTTTGGCTCTCAGCAACTGCTACTCAGCAAGGTATTAATTTCCTTAATCAGAATATATCCCGGATATGACTTTCTTCATGCTTGATGGAGTCCGTTCAGGATATAGCTTTTTCGCTGCTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	244839	134	+	647215	GTTAGGACTAGACCTTTGGCTTTCAGC-ACTGCTGCTGGGTAAGATATTAACTTGCTTGATTAGAAGATATTCATGATATCACTTCCTTCATGCTTGATGGAATCCGTTCAGGATATAGCTTCTTTGCTGCTGAG

a
s	mr.mrrefChr5	107836	116	+	294542	AGTGTTGTTCAAGGTTCCTCTAGGTATTTTAGCCACGCAGTCAAGACTCCACTCCAATCTCCCCAATTTAATAGTTGTAGGCCCAAGCTTCCTGCTACTGTTTAAGAGACCCATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	255242	116	+	636262	AGTGTTGTTCAAGGTTCCTCTAGGTGTTTTAGCTACGCAGTCTAGACTCCACTCCAATCTCCCCAATTTAATAGTTGTAGGCCCAAGCTTCCTGCTACTGTTTAAGAGACCCATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	244973	116	+	647215	AGTGTTGTTCAAGGTTCCCCTAGGCATTTTGGCCACGCAGTCAAATCTCCACTCTGATCTCCCTAACCTAATAATTGTAGGCTCAAGCTTCCCAATACTGTTTGGGAGACCCATTT

a
s	mr.mrrefChr5	107952	122	+	294542	ATGTAGCTTCATTTATGGTTCTCGTAGGTGCTTTAGGTGCACAGTGAACACTCCTATCTCCACAGCTTGAAGAAAGCCCCAAGCTTGCTCCATGGTATGAAAAGTCCTATGCTTACTATTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	255358	122	+	636262	ATGTAGCTTCATTTATGGTTCTCGTAGGTGCTTTAGGTGCACAGTGAACACTCCTATCTCCACAGCTTGAAGAAAGCCCCAAGCTTGCTCCATGGTATGAAAAGTCCTATGCTTACTATTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	245091	122	+	647215	ACGTAGCTTCATTTATGTTTCCCATAGGTGCTTTAGCTGCACAGTGAAGACTCCCATCTCCACAACTTGAAGAAAGCCCCAAGCTTGCTCCATGGTATGAAAAGTCCTATGCTTACTATTAA

a
s	mr.mrrefChr5	108074	8	+	294542	ATCCACTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	255480	8	+	636262	ATCCATCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	245266	8	+	647215	GTTCACTA

a
s	mr.mrrefChr5	108082	123	+	294542	TCATCATGGACTCTAATTAATAAGACATTAGCTTCATCATATACTGTTCCTCTGACTCTACTTTGCACTCAAGTGTAGTACACAAGCTATCTTATTATCTATCACAGCCTCATGGGGCTAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	255488	114	+	636262	TCATCATGGAGTCTAATTA---------TAGCTTCATCATATACTGTTCCTGTGACTCTATTTTGCACTGAAGTGTAGTACACAAGCTATCTTATTATCTATCACAGCCTGATGGGGCCAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	245276	123	+	647215	TCATGATGGACTCTAACTAATAAGACATTGGCTCCATCACATACCGTTGCTCTGACCCTACTCTGCACTCAAGTGTAGTACACATGCTGTCCTATTATCTATCACAGTCTCATGGGGCTGTCA

a
s	mr.mrrefChr5	108205	71	+	294542	TGATGTCATGTATTTAATTATGGGTAAGAGTAAGGGTGTCCTTACTTGGTCTCAGTAGTATAGGAAGATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	255608	71	+	636262	CGATGTCATATATCTAGTTATGGGTAAGAGTAAGGGTGTCCTTACATGGTTTCGGTAGTTTAGGAAGATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	245399	67	+	647215	TGATGTCACGTATTTAATTAT----AAGGGTAAGGGTGTCCTTACTTGGTCTCAGTAGTATAGGATGATAA

a
s	mr.mrrefChr5	108276	156	+	294542	GTTTCAGCATTAGATGGCTTGACATCAGGCTCAGAACACAGGAGAGAAGTACCACGATACTGCGACAAAAGACACTACAACCCTCAGACTAGCAGCAGGGCGGACAAAACATAGAGACAGTAGGTGGTCCCTACTAACAGAGTTCAAACTAACTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	255680	99	+	636262	GTTTCAGCATTAGATGGCTTGACATCAGGCTTGGAAGAGAAGAGAGAAGCACCATG---------------------------------------------------------GAGACAGTAGGTGGTCCCTACTAATAGAGTTCAAACTAACTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	245466	156	+	647215	GTCTCAGCATCAGATGGCTTGACATCAGGCTCAGAACACAGGAGAGAAGTACCACGATACTGCGACAAAAGACACTACAACCCTCAGACTAGCAGCAGGGCGGACAAAACATAGAGACAGTAGTTGGTCCCTACTAACAGAGTTCCAACTAACTGG

a
s	mr.mrrefChr5	108432	263	+	294542	GTTCAACTATAGGTCACCAGTACAATATTGTCTCATTCTCTGTAACAAACAAAACATCCTAGGAACTTAACCATTTAATGCACAAGATACAGCAGCCTGTACCTAAGCTGCAGGGGGGTACTGTATACAATGTTCCAGGACTCACAAGTTTACAAATTTCATGATCTAATATATGACAAGGCACCTAATGGACAAAAGCCTGCTGCATCAAGTGACCTTAGCCATTTTACATATCAAACTGCCATGAACCCAATGCCCTGGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	255812	259	+	636262	GTTCAACCATAGGTCACAAGCACAATATCGTCTTATTCTCTGCAACAGACAAAACATCCTAGGAATTTAACCATTTAATGCACTAGATACAGCAGCCTCTACCTCAACCGCAGGGGGGTACTGTATACAATGTTCCAGAACTCACAAGTTTACAAA--TCGTGATCTAATATATGACAAGGCACCTAATGG--AAAAGCCTGTTGCATCAAGTGACCTTAGCTATCTTACATAACAAACTGCCATGAACCCAATGCCCTGGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	245622	256	+	647215	ATCTCACTATATGTCACCAGTAGAATATTGTCTCATTC-CTCTAACGAACAATACAT-GCAGGAACTTAGCCATTTAGTGCACAAGATACAGCAGCCGGTAGCTAAGCTGCA-GAGTGTACTGTATACAATGATCCAGGACTCACAAGTTTACAAATTTCATGATCTAGTATCTGACAAGGTGCTTAACGGACAAAAGCCTGCTGTGTCAAGTGACCTTTACCACTTTACATATCAAACTGCCATGAAC----TGCCCAGGAT

a
s	mr.mrrefChr5	108695	52	+	294542	TATACAGACTCCCATTGATTAGAATTAGGCTGAAGTGAAATACGCTCTAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	256072	52	+	636262	CATACAGACTCCCATTGATTAGAATTAGGCTGAAGTGAAATATGCTCTAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	245878	51	+	647215	TATACAGGC-CTCTGTGATTAGAACTGGGCTGCAGTGAAATACGCTCTAGCT

a
s	mr.mrrefChr5	108747	184	+	294542	TTTCACCTTCTAGTGTAGATTACATTGTGATTTATAGTACAACAGAGTAGCTCATGGTTCTAAATATCATCACACTGAGCAAAGAGAACCCCTACTTCAATACAATCAGCAGAATGGTAATTAAGACCTAATAGTTGTAACCTCGGTCCCTGGAAGAGGTTAGAGTGTTGCTTCAAAGTGTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	256127	180	+	636262	T-TCACCTTCTAGTGTAGATTACATTGTGATTTATAGTACAACAGAGTAGCTCATGGTACTAACTATCATCACACTGAGC---GGGAACCCCTACTTCAATACAATCAGCAGAATGGTAATTAAGACCTAATAGTTGTTACCTCAGTCCCTGGAAGAGATTAGAGCGTTGCTTCAAAGTGTTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	245929	184	+	647215	CTTCACCTTCTAGTGTAGATTATACTGTGATTTATCATACAGCAGAGTAGCTCATGGTTCTAAATATGATTACACTGAGCAAAGAGCACCCTTACTTCAACACAATCAGCAGAATGTTAATTAAGACCTAATAGTTGCAACCTCGGTCCTTGGGAGAGGTTAGAGTGTTTCTTCAAAGTGTTAA

a
s	mr.mrrefChr5	108931	101	+	294542	CCATGATAGGATGCCTGTGGTCAACAAACGATGTACTTGTTATTTAAATAACAGAGTAGTTGCTGAGGTGTGCCACACTAGAGCTCACTTATGCATGTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	256307	101	+	636262	CCATGATAGGATGCCTGTGGTCAACAAACGATGCACTTGTTATTTAAATAACAGAGTAGTTGCTGAGTTGTGCCACACTAGAGCTCACTTATGCATGTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	246151	101	+	647215	CCATGATAGGATGCCTGTGGTGAACAAACGAAGTACTTGTTATTTAAATATCAGAGTAGTTGCTGAGGTGTGCCCCACTAGAGCTTGCTCATGCCTGTGGT

a
s	mr.mrrefChr5	109032	263	+	294542	AGCAAATAAGCTACCCATTATATAAATAACAAACTTTATGCTTAAGGTGTGCTCCACTAAAGATCCTTTGATTCATAAACCCTTACTTTATGGCCCAGAATAACAAAGAACAACAAATGTGAATACATAAATGTCAGAGTCTCAGAGGAGTCCCCGACTAGCTTAAGCCCTGAGGATACATCTCCCAGTTAGGATCTAAGAATGACATATCATAGTTCTTGCTGAGTTTAGACTTTGTCACCTTTGCATTGCTCCGCCTGTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	256408	263	+	636262	AGCAAATAAGCTACCCATTATATAAATAACAAACTTTATGCTTAAGGTGTGCTCCAGTAAAGATCCTTTGATTTGTAAACCCTTACTTTATGGCCCAGAATAACAAAGAACAACAAATGTGAATAAATAAATGTTAGAGTCTCAGAGGAGTCCCTGACTAGCTTAAGCCCTGGGGATACATCACCCAGTTAGGATCTAAGAATGACATATCATAGTTCTTGCTGAGTTTAGACTTTGTCACCTTTGAATTGCTTCGCCTGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	246253	253	+	647215	AGCAAGCAATATACCCATAATTTAAATAACAAACTTGTTGTTTAAGGTGTGCTCTGCTAAAGATCCTCTGATTCATAAACCCTTACTTTATGGACCAGAGT----------AACAAACGTGAATGCATAAATGTCAGAGTCTCAAAGGAGGCCCCGACTAGCTTAGGCCCTGAGGATACATCTCCCACTTAGGATCTAGAAATGACATATCATAGTTCTTGCTGAGTTTAAACTTTGTCACCTTAGCATTGCTCCGCCTGTTA

a
s	mr.mrrefChr5	109295	104	+	294542	TTTGGATTTGGTACAATTCTATCTACAAAAAGAAGTTGTTTTTATAAAGGGTCCACCTGAAGGCCACCCAGTTATAGATGACTCATGAGTTCACTGATACAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	256673	101	+	636262	TTTAGATTTGGTGTAATTCTATCTACAAAAAGAACTTGTTTTTATTAGAGGTCCACCTGAAAGCCACCCA---ATAGATCACTCATGAGTTCACTGATACGAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	246506	104	+	647215	TTTGGATTTGGTACAATTCTATCTAGAAAAAGAAGTTGTTTTTAGAAAGGTTCCACATGAAGGCCACCCAGTTATAGATGACTCACGGGTTCACTGATATAGAC

a
s	mr.mrrefChr5	109399	8	+	294542	ATACACTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	256775	8	+	636262	ACACACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	400048	8	-	647215	TTTTTCTG

a
s	mr.mrrefChr5	109407	115	+	294542	CAACAGCTCTACTGTTTACAGCAGGTATACAACTAAAATGACTATATTTTCCAGGATATTTAACAAGTTACTAGACTAAAGCCAAGAAAATAGTAAGTTCAAATGAATATGGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	256783	115	+	636262	CAACAGCTCTACTGTCTGCAGCAGGTATACAACTAAAACGACTATATTTTCCAGGATATTTAACGAGTTACTAGATTGAAGCCAAGAAAATAGTAAGTTCAAATGAATATGGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	400057	115	-	647215	CGTCATCTCTACTGTTTACAGCAGGTATACAATTGCGGTGACAATATTTCTCAGGATATTTAGCAAGCTGCTAGACTAATGCCAAGAAAATAGTAAGTTCAAATGAATATGGTGT

a
s	mr.mrrefChr5	109522	78	+	294542	AGTCAAGTATGGGACCTATCAGTCAATGTGTTGACCAAAATACATGCCAAGGGGCCAGGAGACTTTGCAAGAGTGGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	256902	78	+	636262	AGTCAAGTATGGGACCTATCAGTCAATGTGTTGACCAAAATACATGCCAAGGGGCCAGGAGACTTTGCAAGAGTGGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	400172	78	-	647215	AGGTAAGTGTGGGAACTTTCAGTCAATGTGTTGACCAAAATCCATCCGAGGGGGCCTGGAGACTATGCAAGGGTGGAC

a
s	mr.mrrefChr5	109600	68	+	294542	TGCTGGCTTTTACTGATACAAATTGCTCTATGGCCTATGGACGACCAAGACATGAGACTAAAATTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	256980	68	+	636262	TGCTGGCTTTTACTGATACAAATTGCTCTATGGCCTATGGACGACCAAGACATGAGACTAAAATTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	400251	68	-	647215	CACGGGTGTTTACTGATACAGATTGCTCTTTGGCCAATGGACAACCAAGACATGAGACTGGAATTATG

a
s	mr.mrrefChr5	109668	82	+	294542	TGGAACTCTATGCGGTGCTGCATGTCCACAATTAGCTTCTACCTTTGAATATGGTTATGATTATGGTAGTGAGATTTGTAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	257048	82	+	636262	TGGAACTCTATGCGGTGCTGCATGTCCACAATTAGCTTCTACCTTTGAATATGGTTATGATTATGGTAGTGAGATTTGTAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	400322	82	-	647215	GGGAACTCTATGGTCTGCTGCAAGTCCATAATTAGCTTCCACCTTGGAGCATGGTTATGATTTTGGTAGTGAGATTTGATTT

a
s	mr.mrrefChr5	109750	15	+	294542	CTATTAGCTTTGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	257130	15	+	636262	CTATCAGCTTTGTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	400408	15	-	647215	CTATTACCTTTGTAC

a
s	mr.mrrefChr5	109765	80	+	294542	AAAGTGAACTTTATCTTGACTGAAGGAACTAATAACTGATCAGAGATGTGATGTGCAACTACAGTTGAGTTGCCCATGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	257156	79	+	636262	AAAGTGAACTTTATCTTGACTGAAGGAACTAATAACTGAT-AGAGATGTGATGTGCAGCTACAGTTGAGTTGCCCATGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	400423	80	-	647215	AACATAAACTTTGTCTTGACTGAAGGAACTAATAACTGATCATAGATGTGATGTATGACTACAGTTGAGTTGCCCATGCA

a
s	mr.mrrefChr5	109845	21	+	294542	CTGCATTCAAGATACCTATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	257235	21	+	636262	CTGCATTCAAGATACCTATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	400504	21	-	647215	TTGCATCCAAGATACCTATGG

a
s	mr.mrrefChr5	109866	80	+	294542	CTTGTTCAGGGGCATGAGTTATGTGATGAGGTGGTCCCAAGCCCAGCCAACAATGTGACATGCTGGATAGTCAGAACAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	257256	80	+	636262	CTTGTTCAGGGGCAAGAGTTATGTGATGAGGTGGTCCCAAGCCCAGCCAACAATGTTACAGGTTGGATAGTCAGAACAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	400526	79	-	647215	CTTGTTCAGGGGCATGAATAATGTGATGAGGTGGTTCCAAGCCCAGCCAACAATGTGAAATGCTGCATGG-CAGTGTGTT

a
s	mr.mrrefChr5	109946	37	+	294542	TGCAAGTTTCAACCAACAGAGTGACAACTATAATCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	257336	37	+	636262	TGCAAGTCTCAACCAACAGAGTGACAACTATAATCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	247168	37	+	647215	TGCAAGCTTCAACAAACCTAGTGACAACTATAATCAT

a
s	mr.mrrefChr5	109983	8	+	294542	GTCTAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	257373	8	+	636262	GTCTCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	247206	8	+	647215	GTCTAAGT

a
s	mr.mrrefChr5	109991	387	+	294542	GGTGATAGGTTCCTCCCAGGAAAGTAGCACAGGGGGCTGATAGAAGAGCTCCCTGTACCTATGATTGTCAGCATATGCCAGACCTCCTGTTTGGGATGTATGCACTGCCAAACTGGCTATAGATTACATTGGCAAATTAATTCCTTGAGCCCATTAATGCAGCAGCCTGGTATTGATTGGACTAGAGTTGGGCCTCTAAACACCAAGAGAAAGGAGAGAACATTTGTTAAGAAGGATTCTACATGCTACCGACCACACTAGTTAATCTTCTGTATCAAAATAACCCAGTCTACAACATTAAAATCTAACTTAGCCTGTTACTCGTGACACACCACTAAGTCATTGCTTTGAAGGCCATAACTTCTGTAGAAGCTACACTAGAAAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	257381	383	+	636262	GGTGATAGGTTCCTCCCAGGAAAGTAGTACAGGG-GCTGATAGCAGAGCTCTTTGTACCTATGATTGTCAGCTTATGCCAGACCTCCTGTTTGGGATGTACGTACTGCCCAACTGTCTATAGATTACATTG---AATTAATTCCTTGAGCCCATTAATGCAGCAGCCAGGTATTGATTGGACTAGAGTTGGTCTTCTAAACACCAAGATAAAGGAGAGTACATTTGTTAAGAAGGATTCTACATACTACCGACCACACTAGTTAATCTGCTGTATCAAAATGACCCAGTCTACAACATTAAAATCTAACTTAGCCTGTTACTCATGACACACCACTAAGTCATTGCTTTGAAGGCCATAACTTCTGTAGAAGCTACAGTAGAAAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	247215	379	+	647215	GGTGATAGGTTCCTTCAAGGAAAGTAGCACAGGGGGCTGACAGAGGAGCTCCCTGTACCTATGACTGTCTGCATATGCCAGACCTCCTGTTTGGGATGTATGCCCTGCCAAACTGGCTATAAATAACATTGGCAAAATAATTCCTTGAGCCCATCAATGCAGCAGCCTAGTATTGATTGGACTAGCATTGGGCCTCTAAACACCAGAAGAGAGGAGAGAACATTTGTTAAGGAGGATCATACATGCTATCAACCACACTAGTTAATCTTCTGTATCAAAATAACTCAGTCTACAATATTGAAGACTAGCTTACCCTGTTCCCTGTGAC--------AAGTCATCGCTTTGAAGACCATAACTTCTGTAGAAGCTATACTAGAAAGAT

a
s	mr.mrrefChr5	110378	17	+	294542	GATAAGGAGCTAGATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	257764	17	+	636262	GATAAGGAGCTAGATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	247616	17	+	647215	GATAAGGAGCTAGGTGG

a
s	mr.mrrefChr5	110395	145	+	294542	GAGAGATCAGGGTGATCTTCCTTAGCCAGGCTGGTTCTTTCACAAGTAGGGAGACGAAAAGGTTAACAGCTGTGGTAATGTGTGTTGTTGTTTAAAAGGGAAGGTTGAAGCTCAACTGTAAGCTCACACACTGTTTTGCTAGATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	257781	143	+	636262	GAGAGATCAGGGTGATCTTCCTTAGCCAGGCTGGTTCTTTCACAAGTGGGGAGACGAAAAGGTTAACAGCTGTGGTAATATGTG--GTTGTCTAAAAGGGAAGATTGAAGCTCAACTGTAAGCTCACACACTGTTTTGCTAGATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	247645	135	+	647215	AAGAAATCAGTGTGGTCCTCCTTAGCCAGGCTGGTCCTTTCAGAAGTAGGGAGACAAAAAGGTT--CAGCTGTGATAATGCGTGTTGTTGTTTCAAAGGGAAGGTTGAAGCT--------AGCTCACACATTGTTTTGCCAGATT

a
s	mr.mrrefChr5	110540	308	+	294542	CTCCTGCCTTGGAACCTTGTACTAACACTGGAGATATCAGGTTTCCAACCCTTATTAAACCCTTAGTAAGACCACGGCTCATGGTTTTTACTTCAATATCATGATCAATACCCTACATCAGATTCTTGTGCTGTAAGAAATGGGTGAATTAGTAAAAATGCTTGTAATGGATAAAGATCTAGGCTTTTTATAGAGGAAGCAGCAAGCAAGCACCTAAAATTTAATTTTGCGGGGCTATCTACACTCCAAAAACACTCCAGCAAGTTCAAGTGACAGAATGGTTTTTTTATTTTGCAACTATCATGTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	257924	303	+	636262	CTTCCGCCTTGATACCTTGTACT-----TGGAGATATCAGGTTTCCAACCCTTATTAAACCCTTAATAAGATCACAGCTCATGGTTTTTACTTCAATATCATGATCAATACCCTACATCAGGTTCTTGTGCTGTAAGAAATGGGTGAATTAGGAAAAATGCTTGTAATGGATAGAGATCTAGGCTTTTTAGAGAGGAAGCAGCAAGTGAGCACCTAAAATTTAATTTTGCGGGGCTATCTACACTCAAAAAACACTCCAGCAAGTTCAAGTGACAGAATGGTTTTTTCATCTTGCAACTATCATGTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	247795	306	+	647215	CTCCTGCCTTGGAACCTTCTACTAACACTGGAGATATCAGATTTCCAACCCTTATTAAGCCCTTAGTAAGACCACGGCTCTTGGTTTTTACTTCAATATCATGATCAATACTCTACATCAGATTCTTCTGCTGTAAGAAATTGGG-AATTAGTAAAAAGGCTTGTATTGGATAAAGATCTAGGCTTTTTATAG-GGAAGCCGCAAGCAAGCACTTAAAATTCAATTTTGTTGGGCTATCTACACTCCAAAAACACTCCAGAAAGTTCAAGTAACAGAATGGTTTTTTTAGTTTGCAACTATCGTGTGG

a
s	mr.mrrefChr5	110848	409	+	294542	TGCTATCAAAAGATTGAATTCTCAAATTCCTCCTTAGTGCAAGATTATCAGTATGTGGTGCAGTAGCCAGGTCTATTAATCTTTTAAGAGTCCGGTGCTAAAGCACCCACCAATGCGGTGACTTCCATGAGTTTGAAATGATTGCAGGCAACAGGCTCACAGGAGCAATAGACCGATCTAGGAGATTGAGATTATCAGTGGAAAGAGTTCATGTTCTGGAGATATTGTACTATAATTGTGTCAGGGATTAGCTGTTCTTCCTTTCTTCAGAGTATGACAGAATTTGGTTATAGAATAATTGCCCAAGGAAGTATGAGTATAGTAGGCCCTGTGCCTCTACCTGAATTTATATTGTCTATAGGGTAGTCTTCTGTGTAATTCTGCAAAGCTGCAACAAGCAAACACCAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	258228	409	+	636262	TGCTATCAAAAGATTGAATCCTCAAATTCCCCCTTAGTGCAAGAGTATCTGTATGTGGTGCAGTAGCCAAGTCTATTAATCTTTTAAGAGTCCGGTGCTAAAGCACCCAACAATGTGGTGACTTCCCTGAGTCTAAAATGATTGCAGGCAATAGACTTAAAAGAGCAATAGACCGATCTAGGAGATTGAGATTATCAGTGGAAAGAGTTCATGTTCTGGAGATACTCTACTATAATTGTGTCAGGAATTAGCTGTTCTTCCTTCCTTCAGAGTATGACAGAATTTGGTTATAGAGTAATCGCTCAAGGAAGTATGAGTACAGTAGGCCCTGTGCCTTTACTTGAATCTGTATTGTCTATAGGGTAGTCTTCTGTGTAATTCTGCAAAGCTGTGAGGAGCAAACACCCGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	248101	391	+	647215	TGCTATCAAAAGATTCAGTTCGCAAATTCCTCCTTAGTGCAAGATTATCAGTATATGGTGCAGCAGTCAGGTCCAGTAATCTTTTAAC------------AAGCATCCACCAATACGAAGAGTTCCATGAGTTTGAAATGATTGCAGGCAGCAGGCTCACAGGGGCAATAGACTGATCTAGGAGATTGAGATTATTAGTGGAAAGAGTTCATGC------AATCTTGTACTATAATTTTGTCAGGGATTAGCTGTTCTTCCTTTCTTCAGGATATGACAGAACTTGGTTATAGAATAATTGCCCATGGAAGTATGAATATGGTAGTCCCTGTGCTTCTACCTAAATTTATTTTGTTGATATGGTAGTCTTCTGTGTAATGCTGCTAAGCTGCAACAAATGAACACCAGC

a
s	mr.mrrefChr5	111257	148	+	294542	GCTTTTAACTAATCTGCCTGTTTAGAACAGCTATGTTTATACAGGATGGTCCATCTGGCCCCAGACTTCTATGACCAATTGGAGTCACAATTCTGTGGTGTGTTGGTCCCCTAGCACACAGGTGGACTAGCAGTCCAAGATAATTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	258637	145	+	636262	GCTTTTAACTAATCTGCCTGTTTAGAACAGCTATGTTTATATAGGCTGGTCCATCTGGCCCCAGACTTCTATGACCTATTGGGGTCAGAATTCTGTGGT-TGTTGGGCCTCTAGCACACAGGTGGACAAGCAGTCCAAGATAATTG--
s	simRat_chr6.simRat.chr6	248493	148	+	647215	ACTTTTAACTGATCTGTCTGTTTAGAACAGGTATGTTTATACAGGATGGTCCATCTGGCCCCAGACTTCCATGACTAATTGGAGTCACAATTCTGTGGTGTGCTGGTCCCCTAGTACACAGGTGGACTAGCAGTCCAAGATAATTGTA

a
s	mr.mrrefChr5	111405	27	+	294542	GCCAGGTTTTGATCGTCACTTGTAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	248644	27	+	647215	GCCAGGTTTTGATCGTCACTTGTAATG

a
s	mr.mrrefChr5	111432	269	+	294542	TTCTGCTGGCACAGAGAAGAGTTACTGAGCTACAGATCTAGATAGCCCCTTCAGTAGTGCTCATTCTAGGATGGAACTCCTCTTGCACAGCTAGCTGGGGGGTGATACACAGATACATCAGTTACCCAGTTAAAAGAATATTACTAGTAGTCTTCTGGTGTTCTGATTGACCTTGGGAGTGGGGGATTCAACAGCACTGCACAAATGATGGAGTACATAGTGCACCTTCTGCAGCATTTGTATAACAAGAGCATTTATAATTGGGCTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	258782	217	+	636262	----------------------------------------------------AGTAGTCCTCATTCTAGAATGGAACTCCTCTTGCACAGCTAGCTGGGGGGTCATACACAGATACATCAGTTACCCAGTTAAAAGAATACTACTAATAGTCTTCTAGTGTTCTGAGTGACCTTGGGAGTGGGGGATTCAACAGTACTGCACAAATGATGGAGTACATAGTGCACCTTCTGCAGCATTTTTACAGCAAGAGCATTTATAATCGGGTTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	248673	248	+	647215	TTCTGCTGGCACAGAGAAGAGTTACTGAGCTACAGATCTAGATAGCCCCTTCAGTAATGCTCATTCTAGGATGCAACTCCT-----------------GCGGTGATACACAGATACATCAGTTACCTGTTTAAAATAATATTACTAGTAGTCTTCTGGTGTTCTCATTGACCTTTGGAGTGGGGGATTCAACAGCACTGC----ATGATGGAGTACATAGTGCACCCTCTGCAGCATTTGTATAACAAGAGCATTTATATTTGGGCTCA

a
s	mr.mrrefChr5	111701	86	+	294542	TGTTACCCAAGCCAGATATTCACCAGGCTTGTGGTGTATAAGGGACGAGGATAGAGTTCAGAGGCAAAAGGTCAATAGCACCTTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	259001	86	+	636262	TCTTGCCCAAGCCAGATATTCACCAGGCTTGTGGTGTATAAGTGACGCGGATAGAGTTCAGAGGCAAAAGGTCAATAGCACCTTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	248921	83	+	647215	TGTTACCCAAGCCAAATATGCACAGG--TTGTGGTGTATAAGGGATGAAGATAGAGTTCAGAGGCAAAAGGTCAATAGCACCTTG-

a
s	mr.mrrefChr5	111787	91	+	294542	CAAAAGCAGAATCCTTCTGATCTACACATTTGGACTATTGACATTTTACTTCCTTACTCCTAAAGCTTCGCTTTTCACTTTTGGCTTGGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	259088	91	+	636262	CAAAAGCAGAATCTTTCTGATCTATGCATTTGGACTAATGACATTTTACTTCCTTACTCCCAGAGCTTCGCATTTCACTTTTGGCTTGGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	249004	80	+	647215	-----------TCCTTCTAATCTACACATCAGGACTATTGACATTTTACTTCACTACTCCTAAAGCTTTGCTTTTCAGTTTTGGCTTGGAT

a
s	mr.mrrefChr5	111878	221	+	294542	TTTCATCTGATCTGTGGCAAATGTTGAGGGCTCTCCAGACTTGTTTCTAATATGGCCACGATAGATTACAGTTGGTTGCCATTTATTCTCTTTGCTTTTATCTTCCCTTCCAAACTTATGTCCTTAATACAAACAATCGCTGTCCTGACATCCAATATTCCCAACATGCTCCCACTGACAGTAACCACATGACCAAACGGAAGTTAGAACCATCATGCAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	259180	210	+	636262	TTTCATCAGATCCATGGCAAATGTTGAGGGCTCTCCAGACTTGTTT---ATATGGCCACGATAGATTACAGTTGGTTGCCATTTATTTCTCTTGCTTT--------CTTCCAAACTTATGTCCTTAATACAAACAATCGCTGTCCAGACATCCAATATTCCCAACATGCTCCCACTGACAGTAACCACATGACCAAACAGGAGTTGGAACCATCATGCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	249084	215	+	647215	----ATCTGTTCTGTGGTAAATGTTGAGGGCCCTCTTG--TTGATTCTAATATGGCCACAATAGATTACAATTGGTTGCCATCTCTTCTCTTTGCATTTATCTTCCCTTCCAAACTAATGTCCTTAATACAAACAATCGCTGCCCTGACATCCAGTATTCCCAACATGCTCCCACTGACAGTAACCATGTGACCAAACGGAAGGTAGAACCATCACACAAC

a
s	mr.mrrefChr5	112099	16	+	294542	TTAAGCATTACAACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	259390	16	+	636262	TCAAGCATTACAACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	249300	16	+	647215	TTAAGCATTACAACTT

a
s	mr.mrrefChr5	112115	25	+	294542	AGCACTCTTGTGTTATTGCTAATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	259406	25	+	636262	AGCACTCTTGTGTTATTGCTAATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	249317	25	+	647215	AGCATTTTTGTGTCATCATTGATTT

a
s	mr.mrrefChr5	112140	50	+	294542	TTGGTCATTTTGGGTAGGCCAATCTTTGGGTTGGTCATTTCTAATCTTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	259452	50	+	636262	TTGGTCATTTTGGGTAGGCCAATCTTTAGGTTGGTCATTTCTAATCTTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	249342	50	+	647215	TTCACCGCTTTGGGCAGACCAATTTTTGGGTTGGTCATTTCTAATCTTGG

a
s	mr.mrrefChr5	112190	15	+	294542	CCAATCTTTGGGTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	259502	15	+	636262	CCAATCTTTGGGTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	249397	15	+	647215	CCAATCTTTGGGTTG

a
s	mr.mrrefChr5	112205	318	+	294542	ATTCCTTACTCTGGGGTCAATAGCTTCCCTATTGGAAATATAGACATATTTATGCATAGCAATCTCCTACACAAGCGTGCCCTCAAACAGCTTCTAGAAAAAATGTATACATGTCCCCTCTGGATCACAAAAACTGATCATATAACTCATATCAATTACCCTACACTTCTTATTCAGCTTTGGATTTTCTAAACTGATTGACCGATTCAAACATACCATCGACCATAGACATACTTAATGACCCCTTACTAAGTACCTATCTCAATGTGAGGCATTAGACTAGCGGATGCCTCATAAGATTGCATATGTTCTTAGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	259520	311	+	636262	ATTCCTTACTATGGGGTCAATAGC-------TTGGGAATATAGACATATTTATGCATAGCAATCTCCTACACAAGCGTGCCCACAAACAGCTTCTAGAAAAGATGTATACATGTCCCCTCTGGACCACAAAAACTGATCATATAACTCATATCAATTACCCTACACTTCTTATTCAGCTTCGTATTTTCTAAACTGATTGACCAATCCAAACATAACATTGACCATAGACATACTTAATGACCCCTTACTAAGCACCTATCTCAATGTGAGGCATTAGGCAAGCAGATGCCTCATGAGATTGCATATGTTCTTAGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	249412	312	+	647215	ATTCCTTACTCGGAGGTCAATAGCTTCCCTATTGGAAATATAAACATACTTATGCATAGCAATCTCCTACACAATTGTGCTTTCAAACAGCTTCTATAAAAAATGTATACGTGTCCCCTCTGGATGACAAAAACTGATCATATAACTCATATCAATTACCTTACACTTCTTATTTAGCTTTGGCTTTTCCAAATTGATTGACTGATTCAAACATACCCTCAACCATAGACATACCTGATGACCACTTACTAAATACCTATCTCAATGTTAGTCATTGGACTAGCGGGTGCATCATAAG------TATGTACTTAGCAT

a
s	mr.mrrefChr5	112523	4	+	294542	GATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	259831	4	+	636262	GTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	249726	4	+	647215	GATC

a
s	mr.mrrefChr5	112527	4	+	294542	TTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	259840	4	+	636262	TACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	249730	4	+	647215	TTCT

a
s	mr.mrrefChr5	112531	42	+	294542	TGGAGTTCATGGAAGTCACTTCTTACCCTAGCACCCACATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	259951	42	+	636262	TGGAGTTCATGGAAGTCCCTTCTTACCCTAGCACCCACATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	249734	42	+	647215	TGGAGTTCATGGAAGTCATTTCTTACCCTAGCACCCACATAG

a
s	mr.mrrefChr5	112573	162	+	294542	GATCTTCATGCTGCATGTCAATGGGAGTTAGGATCTTGCACTTATGCCTTTCTCATTGCCTGAGTGAAGACCACAGAGCACTAATGATAATCTGTAAATTAAGAAATACTAAAAGAGTGGAAACATCTGTAAGGTATGTATTTCTTTCTAATAGTGGAATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	259993	160	+	636262	GATCTTCATGCTGCATGTCAATGGGAGTCAGGAACTTGTACTTATGCCTGTCTCATTGCCTGAGTG-AGACCACATAGCAC-AATGATAATCTGTAAATTAAGAAATACTAGAAGAGTGGAAACATCTGTAAGGTATGTATTTCTTTCTAATAGTGGAATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	249797	162	+	647215	GGTCTTCATGCTGCATGTAAATAGGAATTAGGATTTTGCACTTATGCCTTTCTCATCCCCTGAGTGAAGAGCACAGATCACTGATGATAATCGGTAAATTAAGAAAAACTAAAAGAGTGGAAACACCCGTAAGGTATGTATCTCTTTGTAATACTGTAATAC

a
s	mr.mrrefChr5	112735	138	+	294542	CATCCATTTCACAGAGTCAAGTAACTATTGAAAACACAATCTTACACCACCTCCAAGCCCCATAATATTCTGTTCTTGCCTTTAGGTGAAGTGGACATAGTCACAACGATTTATCTCATACATGAATAAGGTTATGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	260154	138	+	636262	CGTCCATTGCACAGAGTCAAGTAACTAGTGAAAACACAATCTTACACTACCTCCAAGCCCCATAATATTCTGTTCTTGCCTTTAGGTGAGGTGGACCTAGTCACAAGGATTTATCTCATGCATGAATAAGGGTATGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	249959	133	+	647215	CATCCATTTCACAGAGTCAAGTGACTATCGGAAACACAATCATACACCATCTCCGAGCCCCATATGTTTCTTTTCTTACCT-----TGCAGCGGACATAGTCACAACCATTTATCTCCTACATGAGTGGGGTTATGCC

a
s	mr.mrrefChr5	112873	71	+	294542	ACAGGAGTAGTTGCGTCATGATTGTTCAGGTTCACAGTCACGTTTATTCCTATTTATGACAATACCTAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	260300	71	+	636262	ACAGGAGTAGCTGCGTCATGATTATCCAGGTTCACGGTCAAGTTTATTCCTATTTATGACAATACCTAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	250092	71	+	647215	ACAGGAGTAGTTGCATCATGATTGTTCAGGTTCACAGTCACGTTTATTCCAATTTATGACAATACTTGATA

a
s	mr.mrrefChr5	112944	95	+	294542	ATCATTGATGGCAGATACACTGAGCGTTGGGTTGTATGTGGCAGTAAATATTTCCACAACCTCAGGAGGAGTAAGACCTACTACATTTTGAATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	260378	92	+	636262	ATCATTTATGGCAAATACACTGAGCGCTTGGTTGTATGTGCCAGTGAATATTTCCATG---TCAGGAGGAATAAGACCTACTACATCTTGAATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	250163	92	+	647215	ATCATTGATGGCAGATACACTGAGTGTTGGCCTGT---TGGCAGTAAATATTTCCACAACCTCAGGAGGAGCAAGACCTACCACATTTTGAATTT

a
s	mr.mrrefChr5	113039	113	+	294542	GAAGGTTTTCATAAAACCAGTGCAACTAATGGTAAATATCTTCTCTAGTTCGTCTGAGAAAAGTGATCGCATAACCTTATGCATTTGTGTGATAATGAGTGGTGGAATTCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	260470	113	+	636262	GAAGGTCTTCATAAAACCTGTGCAACTAATGGTAAATATCTTCTCTAGTTCGCTTGAGAAAAGTGATCGCATGACCTTAGGCATATGTGTGATATTGAGTGGTGGAATTCATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	250256	113	+	647215	GAAGGTTTTTATAAAACCAGTGTAATTAATTGTAAATATCTTCTCTAGTAAGTCTGAGAAAAGTGATCTCATAACCTTATGCATTTGTGTGATAATGAGTGATGGAATTCATT

a
s	mr.mrrefChr5	113152	34	+	294542	GAATACTCATGGACCAATGGGCACTGTTGTCAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	374493	34	-	636262	GAATATTCCTTTGCCAATGGGCACTGTTGTCAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	250369	34	+	647215	GTTTACTCATGGACCAATGGGCACTGTTCTCCGG

a
s	mr.mrrefChr5	113186	57	+	294542	ACTGCTCTATGTCTAATGTTGTGTCAATGAGTAAAACCTGTACTGAGGAGCTTGGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	374527	57	-	636262	ACTGCTCTATGTCTAATGTTGTGTCAATGAGTAAAACCTGTACTGAGGAGCTTGGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	250404	57	+	647215	AATGCTCTATGTCTAACGTTGTTTCAATGAGTGAAACCTATACTGAGGAGCTTGGAA

a
s	mr.mrrefChr5	113243	180	+	294542	AAAGAGTGCAGATAGTACAGGGGTAAGTTTATCAGTGCTAGCCCTCAGAAAATGTGCAGTATACCCTAATTACACCTACGTCTTAGAGAGTTGTAGGTGGATTTAAAAATCCATTTACTGACATCTGGTTGCCCACATTCACACTCCAGAACCAAGCTCTTTATGGTGATAGTAAAGTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	374585	180	-	636262	AAAGAGTGCAGATAGTACAGGGGTAAGTTTATCAGTGCTAGCCCTCAGAAAATGTGCAGTATACCCTAATTACACCTACTTTTTAGAGAGTTGTAGGTGGATTTAAAAATCCATGTACTGACATCTAGTTGCCCACATTCACACTCCAGAACCAAGCTCTTTATGGTGATAGTAAAGTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	250461	180	+	647215	AAAGAGTGCAGATAGTACGGGGGTCAGTTTATCAGTGCTAGCCCTGAGAAAATGTGCCGTATACCCCAATTACACCTCCGTCTAAGAGAGTCTTAGTTGGATTTAAAAATCCATTTATTGACATCCGGCTGCCCACATTCACATTCCAGACCCAAGCTTTTTATGGTGATAGTAAAGTTG

a
s	mr.mrrefChr5	113423	28	+	294542	CAAATCGAATATAAGTGAGGTCTAATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	374765	28	-	636262	CAAATCGAATATAAGTGAGGTCTAATAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	250645	28	+	647215	CAAATTGAGTATAAGTGAGGTCTCATAG

a
s	mr.mrrefChr5	113451	17	+	294542	CTTGCATTATTCTCGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	374794	17	-	636262	CTTGCATTATTCTCGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	250673	17	+	647215	CTTGCATTTTTCTTGGG

a
s	mr.mrrefChr5	113468	145	+	294542	GAGGTCTGGGGTAGAAATACTGCATGGCAGGCAGTTGGATGAGTATTAGCACCAAATGAAATGTTGTCTGTATTTCCATCAGTCATGTGTCCCTAGTACAGATCTGTTATGGCAGCGTCCTGGACAAGATAGTTGAGATAGCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	374897	144	-	636262	GAGGTCTGGGGTAGAAATACCGCATGGCAGGCAGTTGGATGAGTATTAGCACCAAATAAAATGTTGTCTGTATTTCCATCAGCCATATGTCCCTAGCCCAG-ACTGTTATAGTAGCGTCCTGGACAAGATAGTTGAGATAGCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	250690	142	+	647215	GAGGTGTGGGGTTGGAATAGTGCATTGGCAGCAGTTGGATGAG---TAACACCTAATGAAATGTTGTCCATATTTCCACCAGTCATGTGTCCCTAGTACAGATCTGTTGTGGCAGCATCTTGGACAAGATGATTGAAATAGCACT

a
s	mr.mrrefChr5	113613	9	+	294542	AGGATTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	375043	9	-	636262	AGGATTGAT
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a
s	mr.mrrefChr5	113622	146	+	294542	CCTTGAGCACTTCTTCCTAGTTAATCTACATGTTTTCAACAGCAGAATGGAGATACAGTGAAGTCCGTGATGAAGCTAGGAAACTTAGCAGATTGAGCAGATATCCACTCTCAGGGCAGCACTTCCCAATGTCAACAATCTGTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	375055	146	-	636262	CCTTGAGCACTCCATCCTAGTGAATCTACATGTTTTCAACTACAGAATGGAGATACAGTGAAGTCCGTGATGAAGCTAGGTACCTTAGCAGATTGAGCAGATAACCACTCTCAGGGCAGCAATTCTCAATGTCAACAATCTGTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	250841	146	+	647215	CCTTGAGCAATTCTTCCTAGTTAATCTACGTGGCTTCAGCAGTGGAATGGAGATACAGTGAAGTCCATGATGAAGCTAGGAGACTTAGATGGTTGAGCAGATATCCACTTGCAGGGCAGCACTTCCCAATGTCAACAAGCTGTTGA

a
s	mr.mrrefChr5	113768	53	+	294542	TGCTCATCAAATTGCAGGAACAGTAGTCAATCTCATATTTGTTACCGAAAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	375203	53	-	636262	TGCTCATCAAATTGCAGGAACAGTAGTCAATCTCATATTTGTTACCGAAAGAG
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a
s	mr.mrrefChr5	113821	324	+	294542	CGGGGATTCGGATGAACACTTGGACCACTGGCCAGTACTTGTACATACCCTTGGTCACTTATTTAGTCTATTGGGCTTGCTGCTCAGGAATCCATTGGAATTGTTTGTATATGATAGAGTAGACAATTTCTTAATACCCAGTGATGTTCTAATATATGCACACAATCTGACTGGGAGTTAGAAAGATTCTCCTCTAGTTCACTAATGGAGAGGGTTGAAAGAGGGGGTTAGGGAGTCTTGATGGATATTGGCAACATCATTTTGTAAGCTGTAAATGGAACTTGATGCAACCTGTAGCTGTAGCACCACTTGCTTTGTATAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	375257	321	-	636262	CATGGGTTTGGATGAACACTTGGACCACTGGTCAGTACTTGTACATACCCTTCGTTACGTATTTAGTCTA-TGGGCTTGCTG--CAGGAATCTACTGGAATTGTTTGTATATGATATAGTAAACAATTTTTCAATACCCAGTGATGTTATAATATATGCACACAATCTGACTGGGAGTTAGAAAGAGTCTCCTCTAGTTCACTAATGGAGAGGGTCGAAAGAGGGGGTTAGGGAGTCTTGATGGATATTGGCAACATCATTTTGTAAGCTGTGGATGGAACTTGATGCAACCTGTAGCTGTGGCACCACTTGCTTTGTATAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	251039	324	+	647215	CGGGGATTCGGATGAATACTTGGACCACTGGCCAGTACTTGTATATACCCTTGGTCACTTATTTAGTCTATTGGGCTTGCTGCTCAGGAATCCATTGAAATTGTTTGTAAATGATCGAGTAGACAGTTTCTTAATACCCAGTGATTTCCTAATATAGGCTCACAATCTGACTGGGAGTTAGAAAGATTCTCCTCTAGTTCACTAATAGATAGAGTTGAAAGAGGGGGTTAGGGAGTCTTGATGGATTTTGGCAACATCAGTTTGTAAGCTGTAAACAGAACATGATGCAGTCTGTAACTGTAGCAACACTTGCTCTGTATAATT

a
s	mr.mrrefChr5	114145	54	+	294542	ATAAGTATTGGCGCCATAATAATAGCATAGGCAAAGCACGATGAAGGTTGTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	375580	54	-	636262	ATAAGTATTGGCGCCATAATAATAGCATAGGCAAAGCACCATGAAGGTTGTGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	251363	54	+	647215	ATAAGTATTAGCGCCATAATGATAAAATAGGCAAAGCACGATGAAGATTCTCCT

a
s	mr.mrrefChr5	114199	16	+	294542	CTGGCTAGCACAGCGC
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	117979	6	+	294542	AACCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266364	6	+	636262	AACCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255168	6	+	647215	GACCCT

a
s	mr.mrrefChr5	117985	54	+	294542	GATATTGTTTCATTTCCCGGCTGCCCTCTAGATAAATGGAACTTGATGACCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266381	54	+	636262	GATATTGTTTCATTTCCCGGCTGCCCTCTAGATAAATGGAACTTGATGACCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	391942	54	-	647215	AAGATTGTTTCATTTCCTGGTTGCCCTCTAGTCAAATGGAACTTGATGACCATT

a
s	mr.mrrefChr5	118039	45	+	294542	TGTCATTCTGTATGATTTATTGTGTTTGAAGTGAGTCTATTGTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266436	45	+	636262	TGTCATTCTGTATGATTTATTGTGTTTGAAGTGAGTCTATTGTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	391996	45	-	647215	TGTCATTCTGTATGATTTATTGTATTTGAAGTGAGTCTATACTGC

a
s	mr.mrrefChr5	118084	26	+	294542	GCCCTTCAGAGATATGCTGTGAAGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266482	26	+	636262	GCCCTTCAGAGATATGCTGTGAAGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255285	26	+	647215	GCCTTTCAGAGATTTGCTGTGAAGGG

a
s	mr.mrrefChr5	118110	98	+	294542	TCACTGAGAGAAAAACTCCTAGATGCAAATGTATTGCAAGGTCGGGTATTGTGGGGTGGATACATTTTGCCCACTAATGAATAAGCCAAGGATGGATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266508	98	+	636262	TCACTGAGAGAAAAACTCCTAGATGCAAATGTATTGCAAGGTCGGGTATTGTGGGGTGGATACATTTTGCCCACTAATGAATAAGCCAAGGATGGATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255312	98	+	647215	TCACTGAGAAAAGAATTCCTATATGTAAATGTATTGCAATGCCATGTATTGTGGGGCGAATACGTGTTGTCCACTAATAAAGACACCAAGGATGGGTT

a
s	mr.mrrefChr5	118208	41	+	294542	CCCTCTAATCAATCCCTTTGTAACACATGGAGCTCTTCAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266606	41	+	636262	CCCTCTAATCAATCCCTTTGTAACACATGGAGCTCTTCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255413	41	+	647215	CCCTCTAATCAATCCCATTGTAACACATGGAGCCCTTGAAC

a
s	mr.mrrefChr5	118249	26	+	294542	GCTTCCAATTTGAATGCAATGTGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266654	26	+	636262	GCTTCCAATTTGAATGCAATGTGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255454	26	+	647215	GCTTCCAATTTGAGTGCAATGTGTTT

a
s	mr.mrrefChr5	118275	9	+	294542	CTTGCATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266681	9	+	636262	CTTGCATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255480	9	+	647215	CTTGCATGG

a
s	mr.mrrefChr5	118284	38	+	294542	ATTGACCTGAAGTGTTTCCCAGTGGTCATTGACTTACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266690	38	+	636262	ATTGACCTGAAGTGTTTCCCAGTGGTCATTGACTTACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255497	38	+	647215	GTTGACCTGAAGTGTTTCCCCGTGGCTATTGACTTACC

a
s	mr.mrrefChr5	118322	8	+	294542	TATGATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266729	8	+	636262	TATGATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255535	8	+	647215	TACGATTG

a
s	mr.mrrefChr5	118330	69	+	294542	CCCAACATAATTCCAGAATGCTATAGAGTATGAAACCTCCACAACAGTGCGTTGGGGTAGTGAACTTCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266738	69	+	636262	CCCAACATAATTCCAGAATGCTATAGAGTATGAAACCTCCACAACAGTGCGTTGGGGTAGTGAACTTCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255543	69	+	647215	CCCAACATAACTCCAGAATGCTTTAGAGTATGAAACCTCCCCAATAGTGGGTTAGGGTAGTGTACTTCA

a
s	mr.mrrefChr5	118399	26	+	294542	TATTAGCACCTCTGCCAGAAGATTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266807	26	+	636262	TATTAGCACCTCTGCCAGAAGATTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255613	26	+	647215	TATTAGCATCACTGCCAGAAGATGGG

a
s	mr.mrrefChr5	118425	53	+	294542	AGACACTGTAATACACGAACTGGCTTTATGAAATAACAATAGTGTTTAACAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266837	53	+	636262	AGACACTGTAATACACGAACTGGCTTTATGAAATAACAATAGTGTTTAACAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255639	53	+	647215	AGACCCTGTAATACATAAACTGATGTTATGAAACAACAATAGTGTTTAACAAC

a
s	mr.mrrefChr5	118478	18	+	294542	TGGCTTGATGGCCTCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266891	18	+	636262	TGGCTTGATGGCCTCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255692	18	+	647215	CAGCTTGACAGTCTCTTT

a
s	mr.mrrefChr5	118496	130	+	294542	GCTGGCAAGTTGCAAAGTGGGGAGATCCTCTTCTGTTGTCCATTATCTTTGAGCAATGTCTAGAACCCTCTATTCAGATACCTGCAACCCTTGCTCTTTTGCCTCATTTGTAACACAGTCAGGACATCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	266909	130	+	636262	GCTGGCAAGTTGCAAAGTGGGGAGATCCTCTTCTGTTGTCCATTATCTTTGAGCAATGTCTAGAACCCTCTATTCAGATACCTGCAACCCTTGCTCTTTTGCCTCATTTGTAACACAGTCAGGACATCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255711	130	+	647215	GCTGTCAAGTTACAAAGTGGGGGGACCCTGTTCTGTTGTCGGCAATCTTTGGGCAATGTCTAGAACCCTCTATTCAGATACCTACGACCCTTGCCCCTGTGTCTTATTTGTAATATGGCCTGGACATCCA

a
s	mr.mrrefChr5	118626	104	+	294542	CTTCCGCATTGACTGTTAGCTTTTAACTGTCTCTATAATCTGTTGGGACTGGGCTCATGCAGGAAGCGTAATGTGATTACTGTTCTGAATTAGCAAAGTCACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267039	104	+	636262	CTTCCGCATTGACTGTTAGCTTTTAACTGTCTCTATAATCTGTTGGGACTGGGCTCATGCAGGAAGCGTAATGTGATTACTGTTCTGAATTAGCAAAGTCACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	255878	104	+	647215	CTTCTGCATTGACTATAAGCTTTTAACAATCTTTATAATCTGTTGAGGCAGGGCTCATGCAGGAAGCATAATGTGGTTACTGTTTTGAATAAGCAGAGTTATAT

a
s	mr.mrrefChr5	118730	78	+	294542	GAGTCTCTCCCGAGCCTAAGTGCCATGTGGAATTTGCTTGGAAGATTATGGTTCAACAATTCATATAGTTCccctgat
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267143	78	+	636262	GAGTCTCTCCCGAGCCTAAGTGCCATGTGGAATTTGCTTGGAAGATTATGGTTCAACAATTCATATAGTTCccctgat
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256011	78	+	647215	GAGTCTCAGGCAAGCCTCAGTGCCATCGGGAATTTGGTTAGAAAATTATGGTGTAACAATTCATATAGTTCTCCTTAT

a
s	mr.mrrefChr5	118808	57	+	294542	gtttgacaacctttttacacaatcagttccatagcatcaccatgtttgtctcctgtt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267221	57	+	636262	gtttgacaacctttttacacaatcagttccatagcatcaccatgtttgtctcctgtt
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256095	57	+	647215	GTTTGACAACCTATTTGCACAATCAGTTCAATAGGGTCACCATGCTTGTCTCTTGTT

a
s	mr.mrrefChr5	118865	14	+	294542	tactcagcAgagaa
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267278	14	+	636262	tactcagcAgagaa
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256176	14	+	647215	TAATCACCAGagaa

a
s	mr.mrrefChr5	118879	162	+	294542	gtaggttcctatctcctccacagttaaagtaaattcctacccttgctgaggctagtagggcttcaggtggaagTCTATAGGTGCCTCTGATAGCTTGACAGCACAACAAGCGGGGCCTGCTCACAGCCAAGTTACTAACTGCATGCACATGGCTACATTTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267295	162	+	636262	gtaggttcctatctcctccacagttaaagtaaattcctacccttgctgaggctagtagggcttcaggtggaagTCTATAGGTGCCTCTGATAGCTTGACAGCACAACAAGCGGGGCCTGCTCACAGCCAAGTTACTAACTGCATGCACATGGCTACATTTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256190	162	+	647215	attagttcctatcccccccactgttggagtaaactcctacctttgctggggttagtaggacttcaggttgaagTCTATAGGTGCCTGTGATTACTTGACAGCACATCAAGCGGGGCAGGCTCAGAGCCAAATTACTAACTGCATGCACATGGTTTCATTTGC

a
s	mr.mrrefChr5	119041	55	+	294542	ATTAGAGCTTTGCACAGTGCGCTGTGCTAAATCTAAACAaggttaagcattgctc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267462	55	+	636262	ATTAGAGCTTTGCACAGTGCGCTGTGCTAAATCTAAACAaggttaagcattgctc
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256352	55	+	647215	ATTAGGGCTCTGCACAAAGTGCTGTACTAAGACCAAACAAGGTTAAGCATTGCTC

a
s	mr.mrrefChr5	119096	96	+	294542	ctgtccctcaactgcaaaacacagtagtgcatggacactttagaaacttctcaaccaagaagcAAGACAAGGTGTATAAGGGAACTCTGTGTAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267518	96	+	636262	ctgtccctcaactgcaaaacacagtagtgcatggacactttagaaacttctcaaccaagaagcAAGACAAGGTGTATAAGGGAACTCTGTGTAGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256407	96	+	647215	CTGCCCCTTAATCCCAAAACACAGTAGTGCATGGACACTTTAGAAACTTCTCAACCAGGAAGCAAGACAGGGTGTATGAGGGAACTCTATGTAGAA

a
s	mr.mrrefChr5	119192	15	+	294542	TTGAAGCGGGTAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267614	15	+	636262	TTGAAGCGGGTAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256505	15	+	647215	TCAAAATCGATAAAT

a
s	mr.mrrefChr5	119207	28	+	294542	GATGGCCATTGATGCTTCACTAAATTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267630	28	+	636262	GATGGCCATTGATGCTTCACTAAATTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256520	28	+	647215	GATGCCAATTGATAGTTCAACAAATTTA

a
s	mr.mrrefChr5	119235	17	+	294542	AAAGTTAGGTGCCAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267658	17	+	636262	AAAGTTAGGTGCCAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256552	17	+	647215	AAAGTCAGGTGCCAAAG

a
s	mr.mrrefChr5	119252	12	+	294542	TGATGCTATCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267675	12	+	636262	TGATGCTATCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256576	12	+	647215	TGATGCTATCAT

a
s	mr.mrrefChr5	119264	43	+	294542	CCTTTCTTTAGAAGAGTTATTTTAGAACACGCCCTGAAAAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267687	43	+	636262	CCTTTCTTTAGAAGAGTTATTTTAGAACACGCCCTGAAAAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256612	43	+	647215	TTTTGCTTGAGAAGAATTATTTTAGAACAGGCCCTGACAAGAT

a
s	mr.mrrefChr5	119307	100	+	294542	ATATAGATTTAGCTGGTATAATCTATGGTAGCTGCTGATTCCGTAGAGGCAAGACTCATATTCAATAGTCTGACCATGGAACATAATCAACAATGCTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267730	100	+	636262	ATATAGATTTAGCTGGTATAATCTATGGTAGCTGCTGATTCCGTAGAGGCAAGACTCATATTCAATAGTCTGACCATGGAACATAATCAACAATGCTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256658	100	+	647215	ATATATATTTAGCTGGTATGACCTATGGCAGCTGCTGATTCTGTAGAGGCAAGACTCATATTCAATAATCTGACAGTAGAACATAATCAACAATGCTTGT

a
s	mr.mrrefChr5	119407	11	+	294542	CGCTTGACATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267830	11	+	636262	CGCTTGACATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256759	11	+	647215	TGCTTGACATG

a
s	mr.mrrefChr5	119418	3	+	294542	TGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267846	3	+	636262	TGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256770	3	+	647215	TGC

a
s	mr.mrrefChr5	119421	6	+	294542	TCCGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267849	6	+	636262	TCCGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256775	6	+	647215	TCCACG

a
s	mr.mrrefChr5	119427	38	+	294542	CAATGGGCATAACATTTGACAGAGCTATCGTCTGCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267855	38	+	636262	CAATGGGCATAACATTTGACAGAGCTATCGTCTGCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256787	38	+	647215	CAGAGGGGATAACATTTGAAAGAGCTATCGTCTGCACT

a
s	mr.mrrefChr5	119465	92	+	294542	ATCATCTGCAGCTATTATAAGTGTTTATTGTAATGGGCCAAGCTCCACAGTAGAACTAGCCACAGGGGGGACATTTGGTATCAAGCCAATCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267898	92	+	636262	ATCATCTGCAGCTATTATAAGTGTTTATTGTAATGGGCCAAGCTCCACAGTAGAACTAGCCACAGGGGGGACATTTGGTATCAAGCCAATCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256825	92	+	647215	ATCATCTGCAGCTATTATAAGTTTCTATTGTAATGGGCCACGTTGCACAGGAGGGCCAGCCACAGAGAGGACATCTGGTGTCAATCCAATCC

a
s	mr.mrrefChr5	119557	41	+	294542	AGAGTCTTATCACCCTAGTGGTTTACTTTTGGTGGGTATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	267991	41	+	636262	AGAGTCTTATCACCCTAGTGGTTTACTTTTGGTGGGTATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256917	41	+	647215	AGAGTCCTACCCCCCTTGTGGTTTATTTTTGGTGGGTACTC

a
s	mr.mrrefChr5	119598	52	+	294542	AAATTAGAGAAGCTGCCTCACTTGGATGAGCAACTGAGGTGAGCAATTTTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268039	52	+	636262	AAATTAGAGAAGCTGCCTCACTTGGATGAGCAACTGAGGTGAGCAATTTTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	256958	52	+	647215	AAGTTAGAGATGCTGACTCATTTGGGTGAGCAACTGAGACAAGCAATTTTGC

a
s	mr.mrrefChr5	119650	132	+	294542	TGTCCTACCTCCATGGGGCGCATTCTTCATAGATGACTAGAGAACCACAAAAGGCAAATCATATAGCCTGCATCTCCACCTCCACTTATTACACAGACTGACCCCCTAGTCATGCCCCTGTTTTAGCTGCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268094	132	+	636262	TGTCCTACCTCCATGGGGCGCATTCTTCATAGATGACTAGAGAACCACAAAAGGCAAATCATATAGCCTGCATCTCCACCTCCACTTATTACACAGACTGACCCCCTAGTCATGCCCCTGTTTTAGCTGCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257010	132	+	647215	TGTCCTACCTCCGTGGGGTGCATTCATCACAGATGACTAATGAACCACAAAAGGCAAGTCATGTAGCCTGCATCACCATCTCCACTTATTACACAGAGTGATCCCCTAGTCATACCCCTGGTTTAGCTTGGG

a
s	mr.mrrefChr5	119782	16	+	294542	AATCTTGGCGTAGCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268226	16	+	636262	AATCTTGGCGTAGCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257144	16	+	647215	AATCCATGTGGAACTT

a
s	mr.mrrefChr5	119798	14	+	294542	CGACACAATGCGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268242	14	+	636262	CGACACAATGCGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257171	14	+	647215	CGCTACAACATTCG

a
s	mr.mrrefChr5	119812	14	+	294542	GAGGCATGGGATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268256	14	+	636262	GAGGCATGGGATGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257188	14	+	647215	GTGCCATCAAGTAA

a
s	mr.mrrefChr5	119826	19	+	294542	AATGTCTTTAGTCCAGGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268270	19	+	636262	AATGTCTTTAGTCCAGGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257204	19	+	647215	CAGGTCTATAGTCCAGGTA

a
s	mr.mrrefChr5	119845	135	+	294542	ATAGTTTCATGACAACCACATGTGACAAACATAGTAGCCCAGACAGGACTAGAAATGATAAGTATGCCAACCATTCTGCAGTGGACATTTAATTTCAATCGAGAGACTATTCGATGAGTATTTCATATGGCTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268292	135	+	636262	ATAGTTTCATGACAACCACATGTGACAAACATAGTAGCCCAGACAGGACTAGAAATGATAAGTATGCCAACCATTCTGCAGTGGACATTTAATTTCAATCGAGAGACTATTCGATGAGTATTTCATATGGCTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257223	135	+	647215	ATAGTTTCATGACAACTACATGTGACAAACATAATAGCCCAGATAGGGATAGAAATGATAAGTATGACAACCATAGAGCAGTGGACATTTGATTTCAGACAAGAGGCTATTCAATGAGTATTTCATATGGCTGTT

a
s	mr.mrrefChr5	119980	20	+	294542	CTGATACTTCCAGTGGGGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268427	20	+	636262	CTGATACTTCCAGTGGGGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257380	20	+	647215	TTGATATTTCCAGTGGTGAA

a
s	mr.mrrefChr5	120000	42	+	294542	TAAATTTCTAGACAGCAGCGAAAGCTAGTCAGCATTAAATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268447	42	+	636262	TAAATTTCTAGACAGCAGCGAAAGCTAGTCAGCATTAAATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257404	42	+	647215	TAAATTTCTTGACATCAAGATAAGTTAGTCAGCATTACGTTA

a
s	mr.mrrefChr5	120042	37	+	294542	TCATCACTTATTTTGTGCCTGACTGGAAATGTCCTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268494	37	+	636262	TCATCACTTATTTTGTGCCTGACTGGAAATGTCCTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257446	37	+	647215	TCATCACATATTTCGAGCCTGTCTGTACATGTCCTCT

a
s	mr.mrrefChr5	120079	12	+	294542	GACTTAGACAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268531	12	+	636262	GACTTAGACAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257484	12	+	647215	GATTTAAACTGG

a
s	mr.mrrefChr5	120091	25	+	294542	CATTTAGAAACTTTCTGGCTCCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268543	25	+	636262	CATTTAGAAACTTTCTGGCTCCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257500	25	+	647215	CATTCAGAGACTTTCTGGCACCACT

a
s	mr.mrrefChr5	120116	131	+	294542	GCATAGATTTGTAGCTTTAGTGCGCAGCACCCAAGCTCAAATGGTGAGCAACTTCAACATAGATATGTGATACATTAGTGGAAGATATTTGGCTCATCAGACACACGATTTTACTTTACCCTGAGTGATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268570	131	+	636262	GCATAGATTTGTAGCTTTAGTGCGCAGCACCCAAGCCCACATGGTGAGCAACTTCAACATAGATATGTGATACATTAGTGGAAGATATTTGGCTCATCAGACACATGATTTTACTTTACCCTGAGTGATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257525	129	+	647215	GCATAGATTGGTAGCTTTAGTGCGCAGCACCCAGGCTCAAATGGTGAGCGACTTCAACATAGATATGTGGTACGTTAGTGCAAGATATTTGGCTTATCAGACACACA--TTTACTTTACCCTTAGTGCTTA

a
s	mr.mrrefChr5	120247	23	+	294542	TTGTAACAATGCGTGGTTATCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268703	23	+	636262	TTGTGACAATGCGTGGTTATCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257654	23	+	647215	TTGTAACAATGTGTGATTATCAG

a
s	mr.mrrefChr5	120270	100	+	294542	CTTAGTCCAACATTGCTCTATGTCCAGAACTATATTGTGATGCTCATGTGATATTTTTATTATCCTATAGGTGCACCTGGCCCCCGTACTATAAAGTAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268726	100	+	636262	CTTAGTCCAACACTGCTCTATGTCCAGAACTATATCATAATGCTCATGTGATATTTTTATCATCCTATAGGTGCACCTGGCCCCCGTACTATAAAGTAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257679	100	+	647215	CTTAGTCCAACATTCCTCTACGTCCAGGACTATATTGTGATGCTCATGTGATATTTTTATTATCCTATAGGTGCACCTGACCCCCATACTATAATGTAGC

a
s	mr.mrrefChr5	120370	3	+	294542	CTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268828	3	+	636262	CTG
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	268832	184	+	636262	TGTACCTAGTTTTTGTTCTCTCCTAACCTGATGCTCCACAAAGGTTTACCTCCTTCGATACTATTTCT-AGAAAAAATGGTGGATATTGGGCACACTTCAACATCCTCAATGTAACAAAGGTAGTTATCTGGGCAATTGTCATCTAGTTTACCGTTGGTAAGATCAATCTATTATTCCCATTTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257782	180	+	647215	TGTGTCTAGTTTTTATTCTCTCCTAACCTGATGCTTTCCAAAGGTTTACCTTCTTTGATACTATTTTTAAGAAAAAATAGTGGATATTAAGCACACTTCA-----TTCAATGTAGCAAAGGTAGCTATCTGGGCAATTGTCATATATTTTACCATTGGTAAGATCGATCTATTGATGCCAGTTTC

a
s	mr.mrrefChr5	120558	84	+	294542	TTTCTACTACTAGAGAGTGCACTGAAGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTTCCAGTGTTGTTAATTTGGTACGAAGACATGAAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	269024	84	+	636262	TTTCTACTACTAGAGAGTGCACTGAAGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTTCCAGTGTTGTTAATTTGGTACGAAGACATGAAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	257962	84	+	647215	TTTCTGCTATTAGAGAGTGAACTGGGGTGCACCCAAGTGACCAGCCTTAAATGCATAGGTAATTTGGTACAGAAACATGAAATG

a
s	mr.mrrefChr5	120642	10	+	294542	AACATTGTGA
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a
s	mr.mrrefChr5	120652	45	+	294542	CAACTTGACAGCTCGGGGAGTCAGTTACCTGGACAACCAGGGCAG
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a
s	mr.mrrefChr5	120697	105	+	294542	GCAATCACTCTTAGATCAAGGATTCAACACAATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCGAAAAAGATATGTTACTTGTTGTTAGGTAGTGCAAGATCAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	269164	105	+	636262	GCAATCACTCTTAGATCAAGGATTCAACACAATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCGAAAAAGATATGTTACTTGTTGTTAGGTAGTGCAAGATCAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	258138	105	+	647215	GCAATGACACTTAGGTCAAGGATACAACACTATAGATCTTCAACAAGATAACCTATATCCTCAAAAAAGAAATGTTACTTGTAGTTAGGCAGTGTGATATCAGGT

a
s	mr.mrrefChr5	120802	15	+	294542	TTTGTTTTGTTCCAT
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a
s	mr.mrrefChr5	120817	41	+	294542	GTATAGCTTACTTACGTCGGGAGGCCTTCCCATTTACTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	269312	41	+	636262	GTATAGCTTACTTACGTCGGGAGGCCTTCCCATTTACTATT
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a
s	mr.mrrefChr5	120858	213	+	294542	TGTGGGATCCAAAAAGCAGGTTGAAGAGCTAGGTGAGGCAAGAAGCCCAGGCTGCTTCTAGAAAAAACAGTTCTGGATTGTGTAGCAAGGCTTCAACTTTAATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTAGGTTAGGAATTTACTGTGTACTCAGCAACACATGAAGTAGCAACACAAGAAGTATTTAATTGTCTGTCTTGGTACTATGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	269353	213	+	636262	TATGGGATCCAAAAAGCAGGTTGAAGAGTTAGGTGAGGCAAGAAGCCCAGGCGGATGCTAGAAGATACAGTTCAGGATTGTGTAGCAAGGCTCCGGCTTTAATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTAGGTTAGGAATTTACTGTGTACTCAGCAACACATGAAGTAGCAACACAAGAAGTATTTAATTGTCTGTCTTGGTACTATGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	258336	212	+	647215	TGTGGGTTCCCAAAAGCAGGTTGAAAAGCTAGGAGAGGCAGCAAGCCCAGGCTGCTTCAGGAAATAACAGTCCTGGCATGTGCAGTAAGGCTTCAACTTTTATCTGGAGAACAGTATGCTATTCCATACTGAGTTAGAAGTTTGTTGTGTACTCTGCAACACAAGAAGTAGCAACACAAGAAGTATATACTTGTCTGTCTTGGTACTATGTA-

a
s	mr.mrrefChr5	121071	45	+	294542	TCCTATCTCATTTAATATCAAGTAGCATTTATTGTCAAAGACATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	269581	45	+	636262	TCCTATCTCATTTAATATCAAGTAGCATTTATTGTCAAAGACATC
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a
s	mr.mrrefChr5	121116	150	+	294542	AAGGCAGAAACACACTCTTTAACTAGAGATGTACTTAAAGTTGGAAATTTGTTGTATACGTTGCAACAGAAAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATTAACTTTTTGAAAATTGGGAGCATTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	269631	149	+	636262	AAGGCAGAAACACACTCTTTAACTAGAGATGTACTTAAAGTTGAAAATTTGTTGTATACGTTGCAACAGAGAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATCAACTTTTTTAAAGTTGGGAGTACTT-
s	simRat_chr6.simRat.chr6	258593	150	+	647215	AAGGTAGAAATAAACTCTTTAACTGGAGATGTACCTAATATTGGAAATTTGTTGTGTACATTGCAGCAGAAAGGCTGTTTAACTCTCTGTCATAGTACTATGAAGCAACTTAGTATTCTACATTAACTTTTTGAAAATTGGGAGCATCTA

a
s	mr.mrrefChr5	121266	192	+	294542	TTGTCAAAGACATTAAGACAGAAACAAACTCCTCAACCAATTCCTGAACTAATTCAAGGAAAGCCTCTTTTTAAGACTAATATTCAGTATAAAGGCCAAGCAATTGACCCAGCTCTTCCAGATGCACAATCATCAGCTTGACATATGAGCTATTTGTCAATCCTGCCATGCACTTCCCCTTTTGCTTTTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	269780	184	+	636262	---TCTAAGACACTCAGACAGAAACAAACTCCTCAACCAATTCCTGAACTAATTCAAGGAAAGCCTCCTTTTAAGACTAATATTCAGTTTAAAGAGCAAGCAATTGACCCAGCTCTTCCACA-----AATTATCAGCTTGACACATGAGCTATTTTTCAATCCTGCCATGCGCTTCCCCTTTTGCTTTTTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	258744	191	+	647215	TTGTCAAAGACATTAAGACAGAAACAAACTCCTCAAGTAGTTCCTCAACTA-TTCAAGGAAAGCCTCTCTTTAAGACTAAAATTCAGTATAAAGGCCAAGCAGTTGACCCAGCTCTCCTAGGTGCACAATCATCAGTTTGACATATGAGCTATTTGTCAATCATGCCATGCACTTCCCCTTTCGCTTTTTTA

a
s	mr.mrrefChr5	121458	74	+	294542	ATGATAGTCTGAATCCCAATGTGTGACACCTAAAATTTTGATTGAGGCAATGAAATACAGTTCGATATGAAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	269965	44	+	636262	ATGATAGTCCGA------------------------------TGTGGCAATGAAATACAGTTTAATATGAAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	258935	74	+	647215	ATGACAGTCTGAATCCCAATGTGTGACACCTAAAATTTTGATTGAGGCAACGAATTACAGTTCGATATGAAAAA

a
s	mr.mrrefChr5	121532	701	+	294542	TGAAACCTCTTGTGAGCCAGGCCTAGTTTCTTATGCTGCTTTGGTTAAGAGGTCTACTATATTTGCTTTTTGACATGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTACTGGCTTGATTGCCTACACAGAAAAGAACCTCCATCATCATATAGGTAAATGTACAGGGATGCCTTCAAACACTCAGCCAATATATAATATGGAATAGTCTTGCTAGACTCAATTGAGGGCACAAGCCCAATTAGTTACTCATGGCACAAGGTCAATGAAATACTTGAGGCCCGCAAGATAAATGAGTTGAGCACTGCAATTACAACATTATCATTGTTACTCTTGGGTTAATAACATGCCACCAGGTACCAATCTATCATTCCATTCAGAGAGTGGCTGATTCATGTTGGAAAGTAAACAAAGTGTTCAGGATTCTAACTAATGATCATAAATTGGGACTGGTCTTATGCAAAGTACTGTGGTTCAATACTTCAATTAGTAGCAGCATTTGTAATTATCTGTGACACTACCCAGCCCCACCATAGCAGGGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTGGCTACAAAACCTTCTAGGAGCTGGCCATTCACTCATTGAGGCTTGGATGAGGTTGAGATGAAGTGTAGGCAGCAGAGATTTACTTACTGTTAAAAAGGCACATTTGTTAAATAAACCTATTAGGTCAGGTGATGCACCCACTTTACTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	270009	691	+	636262	TGAAACCTCTTGTGAGCCAGGCCT-GTTTCTTATACTGCTTTGGTTAAGAGGTCTACTATGTTTGCTTTTTGACATGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTATTGGTTTGATTACCTACACAGAAAAGAACCTCCATCATTGTATAGGTAAATGTACAGGGAAGCCTTCTAACACTCACCCAATATGTAGTATGGAATGGTCTTGCTAGACTCAATTGAGGACACAAGCCCAATTAGTTACTCATGGCACAAGGTCAATGAAATACTTGAGGCCCGCAAGATAAATGAGTTGAGCACTACAATTACAACCTGATCATTATTACTCTTGGGTTAGTAACATGCCACCAGGTACCGATCTATCATTCCATTCAGA---------ATTCATGTAGGAAAGTAAACAAAGTGTTCAAGATTCTAACTAATGATAATAAATTGGGACTGGTCTTATGCAAGGTATTGTGGTTCAATACTTCAATTAGCAGCAGCATTTGTAATTATCTGTGACACCACCCAGCTCCACCATAGCAGGGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTAGCTACAAAGCCTTCTAGGAGCTGGTCATTCACTCATTGAGGCTTAAATGCGGTTGAGATGTAGTGTAGGCAGCAGAGATTTACTTACTGTTAAAAAGGCACATTTGTTAAATAAACCCATTAGGTCAGGTGATGCACCCATTTTACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	259010	694	+	647215	TGATACTTCTTGTGAGCCAGGGCCAGTTTCTTATGCTGCTTTCGTTACCAGGTCTACTATATTCACTTTTTGACACGTCAACCCATGTTCAAGGGAGGTACTACCTTGATTGCCTACACAGAAAAGAACCTCCGACATCATACAGGTAGATGTACAGGGATGCCTTCAAACACTCAGCCAATATATGATATC-AACAGCCTTGCTAGACTCAATTGAGGGCACAAGGCCAATTAGTGATTGTTGGCACAAGGCCAATGCAATACTTGACCACTGCAATATAAATTAGTTGAGCACTGCAATTAGAACATTAACATTGTTACTCTTGGGTCAATAACAAGTCACAAGGTACCAATCTATCATTTTATGCTGAGAGTGGCTGATTCATGTTGGAAAGTAGACAAAGTATTCTGAACTCTAACTCACGATCATAGATTGAGACGGGTCTTATGCGAAGTACTGTGGCTCAATACTTCCATTAGTGGCAGCATCTGTAATTATCTGTGACACTACGCAGCCCCACCATGGCAGAGGTGCAAGTTTAAATATTAGGTGGTTACAAAAGCTTCTAGAAGCTGGCCATGCACTTATCAAGGCTTGGATGAGGTTGAGATGAAGTGCAAGCAGCAGAGAATCACTTAC------AAAGACACATTTGTTAAAAAGACATATTAGGTCAGGTGATGCACCCACTTTACTG

a
s	mr.mrrefChr5	122233	68	+	294542	CTACAGATCTCCAGACCAATTATTAGTTAATTAGTTGGTGTGGCATGTATCTGTGAGGAGGTGATGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	270702	66	+	636262	CTACAGATCCCCAGACCAATTAT--GTTAATTAGTTGGTATGGCATGTGTCTGTGCGGAGGTGATGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	259704	68	+	647215	CTATAAATCTGCAGAGCAATTATTAGTTAATTAGTTGACGCGGTATGAATCTGTGAGGAGGTGGTGAT

a
s	mr.mrrefChr5	122301	430	+	294542	GTTGCTACCTACTGCACTTTTCATTCTACATGCCTATATATTGGTTAAGAAATTTATGCACAAACAGGAGCCTCAGCAATATCTCCAGTTTGACAGCATAAATAACTGTATTGAGTGTGGGTATGTGTAGAACTTACTGATTTATGCACTGATGCTGGTGTGACTAGGGGAGATGTACCCAGCTCTGCCTTCCTGTCCATCTAATTGCAACTACATATTTTCGTCTGGTTACAGTAAAGTCCCCCCAAGCAAGCAGGAGTGATGACATCACTCACAGACTAGGTAAAAGTTCCAACATGAGGTAGGAGACCTGTGTTCCACTGCCTAGATGTTGGTACAGATCCATACAACTAAATGGTGACACCATTCCTGTCTAGACATCTATCTCATGCATGATGCATAAGAACGGTGCCATGTGAAAGGTCCCTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	270768	429	+	636262	GGTGCTACCCACTGCACTCTTCATTCTAAATGCCTATATATTGGTTAAGAAATTTATGCACAAACAGGGGCCTCAGCAGTATCTCCAGTTTGACAGCATAAATAACTGTATTGAGTGTGGGTATGTGTAGAACTTACTGATTTATGCACGGATGCTGGTGTGATTAGGGGAGATGTACCCAGATCTGCCTTCCTGTCCATCTAATCACAACTACATATTTTTGTCTGGTTTCAGTAAAGTCCCCCCAAGCAAGCAGGAGTGATGGCATCACCCACAGACTATGTAAAAGTACCAACGTAAGGTAGGAGACCTGTGTTCT-CTGCCTAGATGTTGGTACAGATCCATACAACTAAATGTTGCCACCATTCCTGTCTAGACATCTAGCTCATGCATGTTACATAAGAACTGTGCCATGTGAAAGGTCCCTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	259777	424	+	647215	GTTGCTACCTACTGCACTTTTCATTCTACATGCCTATATATTGGTTAAGAAATTTATGCACAAATGGGAGCCTCAGCAATACCTCCCGTTTGACAGCATAAATAACTATATTGAGTGTGGGTATGCGTAGAAGTTACTGATTTATGTGCTGATGCTGGTGTGACTAGGGGAGATGTACCCTGCTCTGTCTTCCTGTCCGCCTAATTGCAACTA------GTCGTCTGGTTACAGTAAATTCCCCCCAAGCAAGCAGGAGTGATGACATCACTCATAGACTAGGTAAAAGGTACAACATGAGGTAGGAGACCTGTGTTCCACTGACTAGATGTTCGTACAGATCCATACAACTAAATGGTGACACCCTTCCTGTCTAGATATCTATCTCATGCATGATGCATAACACCGGTGCCATGTGAAAAGTCCCTTG

a
s	mr.mrrefChr5	122731	109	+	294542	AGATCCCCTTCAAAACAGTGATCCTATATAGTCTTCCAGCCCTTACAATGTCCACAGAAGAATCATGACGGTTGAATTGTTGACTTTATCAAAGGTTGCAGCTGTCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	271204	108	+	636262	AGATCCCCTTCAAAACAGT-ATCCTATATAGTCTTCCAGCCCTTACAATGTCCACAGAAGAATCATGACGGTTGAATTGTTGACTTTACCAAAGGTTGCAACTGTCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	260201	108	+	647215	AGATCCCCTTCAAAACAGCGATCCTATATAGTCTTCCAACC-TTACAATGTCTACAGAGGAATCATGATGGTTGAATTGTTGACTTTTTCAAAGGTTGCAGCTGTCCTG

a
s	mr.mrrefChr5	122840	30	+	294542	GAGTGTATTATTTTACTCTAGACATACATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	271312	30	+	636262	GAGTGCATTATTTTACTCTAGACATACATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	260310	30	+	647215	GTGTGTATTATTTTACACTAGACATACATG

a
s	mr.mrrefChr5	122870	83	+	294542	TGTTAAACAGATTCTCTGCAAATGTGAGTAACTGTCACATTTTAGGACCAGTTGGATTAAAGATCCTAATGCCTACAATTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	271342	82	+	636262	TGTTAAACAGATTCTCTGCAAATGTGAGTGCCTTTCACATTTTAGGACCAGTTGGATTAAAGA-CCTAATGCCTACAATTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	260343	83	+	647215	TGTTAAACAGATCCTCTGCACATGTGAGTAACTGTCACATTTTAGGACCAGTTGGACTAAAGATCCTAATGCCTAAAATTGGT

a
s	mr.mrrefChr5	122953	11	+	294542	AGGATGGTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	271424	11	+	636262	AGGATAGTATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	260427	11	+	647215	AGGATGGTATA

a
s	mr.mrrefChr5	122964	142	+	294542	AACTCTCTGCTAGAGTTTATGAATCCCAAATACATGGTGACAGTGAATATTACCCACATCAATTAGATGTCCCTCAGAACAGGCTTGGAGAGAGTTGATATTCATAAGACCTGTATTAGTATTCAAGATTTATATATACTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	271435	135	+	636262	AACTCTTTGCTAGAGTTTATGAATCCCAAGTACATGGTGACAGTGAACATTACCCACATCAATTAGATGTCTGTCAGAAAAGGCCTGGAGAGAGTTGATATTCATAAGACCTGTATTAGTATTCAAGATT-------ACTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	260440	142	+	647215	AACTCTCTGCTAGAGTTTATAAATCCCAAATACATGGTGACATTGAATATTACCCACATCCATTAGATGTCCCTTAGAACAGGCTTGGAGAGAGGTGATATTTATAGGACCCATATTAGTATTCTAGATTTATATATACTTC

a
s	mr.mrrefChr5	123106	25	+	294542	GATTCTTCACTCCCCATTGAGCTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	271570	25	+	636262	GGTTCTTCACTCCCCATTGAGCTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	260583	25	+	647215	GATTCTTCACTCCCCATTGAGCTTG

a
s	mr.mrrefChr5	123131	112	+	294542	CCTCCAAGTATTGCAACTTAATACATTGCCTCTAGGAAATAGCGACTTTACTCTGCCAAGCATGTGGCGTTGTATCCACACAAGCAGGTTTAGTTAAGGCAAAACTAGCTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	271596	112	+	636262	CCTCCAAGTATTGCAACTTAAAACATTGCCCCTAGGAAATAGCGACTCTACTCTGTCAAGCATGTGGCGTTGTATCCACACAAGCAGGTTTAGTTAAGGCAAAACTAGCTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	260608	112	+	647215	CCGCCAAGTATTGCAACTTGATACATTGCCTCTAGGAAGTAGCAACTTTACTTTGCCAAGCATGTGGTGTCACATCCACACAAATAGGTTTTGTCAAAGCAAAACTAGCTGT

a
s	mr.mrrefChr5	123243	5	+	294542	TCAAG
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a
s	mr.mrrefChr5	123248	337	+	294542	ATGGTGCATCTTAATGTTGACTACTATCAAGAACCAAGGTGGTCACATTAGAGGCATGGACACTCCTATGGTAGGCACTTTGTAGGGATAGCTAAAGAAGAAAACCAAAGACAAAACAAGCACAAATAAATAACTTTTTACTTAGGTGAATTCCATAAAGAAGTCTCTTACATCCTATCAACTACTAACCTTCAACTCTTTATATACCAAATCAAATGGACTCTAGGAAGCATACTGGCTCCATTCAAGTTTCCCATCATTCTGACTCATACAGAATCTTCTGATGTTTCCTATATGTTTTTTAGTGCTAACATTCAACTAGGGCCAACTCAGCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	271713	331	+	636262	ATGATGCATCTTAATGTTGACTACTATCAAGAACAAAGGTGGTCACGTTAGAGGCATGGACATTCCTATGGTAGGCAATTTGTAGGGATAGCTAAAGTAGAAAACCAAAGACAAAACAAGCACAAATAAATAACTTTTTACTTAGGAGAATCCCATAAAGAAGTCTCTTACATCCTATCAGCTACTAACCTTTAACTCTTTATGTACCAAATCAAATGGACTCCAGGAAGCATACTGGCTCCATTCAAGTTTCCCATCATTCTGACTCATACAGAATCTACTGATGTTTCTTATATGTTTTCTAGTGCTAACATTCA-G-----CCTATTCAGCACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	260748	335	+	647215	ATGGTGCATCTTAATTTTGACTACTATTGAGAACCAAGGTGGTCTCATTAGAGGCATGCACACTCCTATCGTAGGCACATTGTAGGGATAGCTAAAGAGGAAAACCAGAGACAAGACTAGCACAAACCAATCA--TTTTATTCAGGTGAATTGCATAAAGAAGTCTATTACATCCCATTAACTACTATCCTTCAACTCTTTATATACCAAATCAAATAGACTTTAGGAAGCATACTGGATTCATTCAAATATCCCATCATTCTGACTCATACAGAATCTTCTTATGTTTCCCACTTATTTTTTAGTGCCAAGCTTCAACTAGGGCCAACTCAGCACA

a
s	mr.mrrefChr5	123585	72	+	294542	GCAAAGCCAACCATTGTTTACAACATTTACACTTCCCATCCCTGCAACATTAGTAGCAAATGCTTCTTGAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	272046	72	+	636262	GCAAAGCCGACCAGTGTTCACAACATTTCCACTTCTGATCCCTGCAACATTAGTAGCAAATGCTTCTTGAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	261083	72	+	647215	GCAAAGCCAACCCTTGTATGCAAAATTTACACTTCCCATCCCTGTAACATTGCAAGCAGATGCTACTTGAAC

a
s	mr.mrrefChr5	123657	52	+	294542	TAGTCTAATCTTAGGAAACTACTGTACCTCTGTTAGATTACACAGAATTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	272118	52	+	636262	TAGTCTAATCTTAGGAAACTACTGTACCTCTGTTAGATTACACAGAATTTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	261159	52	+	647215	TAGTCTAATTTTAGAAAACTACTGTATCTCTGTTAGCTTACACAGAATTCTA

a
s	mr.mrrefChr5	123709	43	+	294542	GTGTGGACCAGCAACTCTCACCAAATCAGCAAATCAATGTCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	272179	43	+	636262	GTGTGGACCAGCAACTCTCACCAAATCAGCAAATCAATGTCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	261211	43	+	647215	GTGTGGACCAACAACTTTGACCAAATCAGCAAATCAATGTCAA

a
s	mr.mrrefChr5	123752	195	+	294542	GAGTCCCGTCCCTTAGATATTGGTAGCAAATGCTACTCCCACAACCTAATCTCATTTCAAAAAACCATTACATCTAGAGTGTAGACAATATGAATCTGATGTCTACCAACCAATTTCTATTGAGATGTTGCTACAAATAGTCAGATGATCAATAGACATAGGTCTTTCTGGACCCCAATGACCCATTTGGCAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	272222	193	+	636262	GAGTCCCGTCCCTTAGATATTGGTAGCAAATGTTACTCCCACAACCTAATCTCATTTCAAAAAACCATTACATCTAGAGTGTAGTCGATATGAATCTGATGTCTACCAACCAATTTCTATTGAGATGT--CTACAAATAGTCAGATGATCAATAGACATAGGTCTTTCTGGACCCCAATGTCCCACTTGGCAGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	261274	183	+	647215	AAGTCCCATTACTTAGATATAGGTAGCAAAGGCTACTCCCACAACCTAATCCCAT--------AACATGACATCTAGAGTGTAGACAATAT----CTCATTTTTGCCAACCAATGTCTATTGAGATATTGCTATAAATAGTCAGTTTATCAATAGATATAGGCCTTTCTGGACCCCAATGACCCATATGGCAAAT

a
s	mr.mrrefChr5	123947	23	+	294542	GCAAGATGTGACGTTTCAATTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	272415	23	+	636262	GCAAGATGTGATGTTTCAGTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	261459	23	+	647215	GCAAGATGCAACATTTCAATTGG

a
s	mr.mrrefChr5	123970	98	+	294542	ACTAGCATAACTTAGACTTACGTAATAAATGCAATTAATGGAAGAAATTAAAAATACTTTAAATTAAGAGGATGTGGATACTACATAAGGTGGGGGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	272441	98	+	636262	ACTAGCATAACTTAGATTTACGTAATAAATGCAATTAATGGAAGAAATTAAAAGTACTTTAAATTAAGAGGATGTGGATACTACATAAGGTGGGGGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	261482	98	+	647215	ACCAGCATAACTCAGACTTACGTAATAAATACAATTGATGGGAGAAATTAAAAATACTTTAAATTAAGAAGATGTGCATACTACATTAGGTGGGGGCT

a
s	mr.mrrefChr5	124068	313	+	294542	GACTTGGGTTATGTATTCAATTCCAGTTCTTTTGATTCACTTACACTGGGGGCCTCATCCTAAGTATAGTTTTATCTTGTACTGTATGTTGCCAATTCGCTTCCACCATATGATAGTGGAAGCAGATCAGCTATTTCTATGTTGTATCCCTCTCTCCTAATCCCCTAGACTATCATATTAGTTATACTATATGGAAGATTTATAACTTTTCATCTCATTCCACCAGAGAATGACTAGGCCAGATAGCTCTGCAACTCTTCATGCAACCCCATAAGTGGTTGAGGCATTTGTATCATTGGCAACACAAAACCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	272539	271	+	636262	GACTTGGGTTATGAATTCAATTCCAGTTCCT------------------GGGCCTCATCCTAAGTATAGTTTTACTTTGTACTGCATGTTGCCAATTTGCTTCCACCATATGATAGCAGAAGCCAGGCAGCTATTTCTATGTTGTATCCCTCTCTCCTAATCCCCTAGACTGTCATATTAGTTATATTATATGGAAGGTTTATGACTCTTCATCTCATTCCACCAGAAAAT------------------------TCTTCATGCAACCCCATAAGTGGTTGAGGCATTTGTCTCATTGTCAACACAGAACCAA
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a
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	273036	58	+	636262	AAACTTCGAGAAGATGGTTGAAAGAACAGATATTCCTGTATGTAGAAGATATAGTATG
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	274855	474	+	636262	GTAGCCTTGACATAAGGGGCCCCACTTCTAGGGGGGGTGATACCTGCAGTATTTCAGGTAGAAAGCATTGCCTAGATGGCCCATATGTAATGTCACCACTGAATATCACGGCATTTTGGCTGGGAACTTGAACATTATGATGATGCTGGATGTAAAAAGTGGATCCAACATTGATTGAGTGAGTATAAGGAAACATACCAACCAGATGAGAATTGGTTCATTTGGCA--ACTAAAGCATGTCTTATATTCTCCTACATCACTGACAAGTAGACCCCCACAGCAAGGACTTGATCGAATTCACAAGATGGTCTTCTCATGAAGTATAGCAAGCTACAAACCGGATAATGGTGAAACATGAGATATTTTAAGAAAATATACTAAGTGCTTTAGTTACCGTCTGAACATATCCTAAAGGTCATATGCTAATC-CCAAGCCTCACAACCTTACCGTATTGCAGCTAGCTCCCCTCAAGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	263913	461	+	647215	GTATCCTTTACATAAGTGGCCCCATGTCTAGGGGG--TGACACCCACA----------TAGTAAGTCTTGCCCTGATGGCCTATAAGTAATGTCACCACTGAATACCATGGCATTTTGGCTGTGAACTTGAACGTGATGGTAATGCTGGATGTAAAGAGTGGATCCAACATTGATTGAGTGACTATAGGGGATATTACCAACCAGATGGGAGTTGGATCATGCGACAGGACTGGAGCATGCCTTATA----CTTCCATCTCTGAGATGTACACCCCCGCAGCAAGGAAGTGTTTTAATTTAAAAGATGGTTTTTTTATGAAGTATAGCAAATTATGAACCAGATAATGGTCAAACATGAGCCATCTTAAGAAAATATACTAAGGGCTTTAGTTGCTGCCtgaacatatgctaaaggtcatttgctaatctccaaggctttcagccttgcagaattgcagctcgctcccctcaagtaa

a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	276860	61	+	636262	TTCCCTTTTGATTTAGGAACACAGTTCATAATTCCACATTTTTAATTATATAAAAACAGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266128	61	+	647215	TTCAATTATGTTCTTGGCTCACAGTTCATAATTCAGCATCTCTAGTTATCTAAAAACAGTC

a
s	mr.mrrefChr5	128466	3	+	294542	TAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	276964	3	+	636262	TAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266189	3	+	647215	TAA

a
s	mr.mrrefChr5	128469	80	+	294542	CCTACTGACTTGTGGTGACATTGTATTGGTTTGTGTACAACACTTAAGTCGATGAATTCACGGCTACAGGCTTGCCTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	276967	80	+	636262	CCTACTGACTTGTGGTGACATTGTATTGGTTTGTGTACAACACTTAAGTCGATGAATTCACGGCTACAGGCTTGCCTGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266199	80	+	647215	CCCACCGAAGTGTAGGGACATTGTACTGGGTTGTATACAACACATAAATCAGTGAATTGACAGCTACAAGCTTGCCTGTG

a
s	mr.mrrefChr5	128549	96	+	294542	CAGATATTTATTGTTCTGTGCCTTATTGGATCTGTAGCCAGTGCTGGCCAGCTTTTGGAGCACAAAAGGCCTCAGCCCTGGCTGCGGCCATGAAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277052	96	+	636262	CAGATATTTATTGTTCTGTGCCTTATTGGATCTGTAGCCAGTGCTGGCCAGCTTTTGGAGCACAAAAGGCCTCAGCCCTGGCTGCGGCCATGAAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266279	96	+	647215	CAGATCTCTCTTGTACTATGCCTTGTTGGAACTGTGGGGAGTGCTAGCCAGCTTTTAGACCATAAAAGGCCTGACCCCTGGCTGCAGCCATAAAGC

a
s	mr.mrrefChr5	128645	54	+	294542	AATCACTGTCAATCCTGTCTCATGAGCAGCTTTTAAATTGTAAAAGACCTGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277151	54	+	636262	AATCACTGTCAATCCTGTCTCATGAGCAGCTTTTAAATTGTAAAAGACCTGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266375	54	+	647215	AATCACTGTCATTCCTGTATCTTGCCCAGCTTTTAAATCGTAAAAGACCTGACA

a
s	mr.mrrefChr5	128699	6	+	294542	CTGGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277206	6	+	636262	CTGGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266429	6	+	647215	TTGGCT

a
s	mr.mrrefChr5	128705	27	+	294542	TGCAATAAAGCAACTACCACTGTCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277212	27	+	636262	TGCAATAAAGCAACTACCACTGTCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266437	27	+	647215	GGCAACAAAGCAACTACCACTTCCGAT

a
s	mr.mrrefChr5	128732	64	+	294542	TCAGAATCATGCTGTATAAAGTTATGAAGATTAACGAAGTACAGCATATGAATTATTGATGTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277245	64	+	636262	TCAGAATCATGCTGTATAAAGTTATGAAGATTAACGAAGTACAGCATATGAATTATTGATGTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266464	64	+	647215	TCTGAATCATGCTGTATAAAGCTGTAAAGATTAGCGAAATACAGCAAATGAATTATTGATGTCT

a
s	mr.mrrefChr5	128796	43	+	294542	CCATAAGTAGGGGGGGGTGCCTGTTAATTGTGCAATCTAAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277316	43	+	636262	CCATAAGTAGGGGGGGGTGCCTGTTAATTGTGCAATCTAAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266528	43	+	647215	CCATCAGTAGGGGGGGGTGCCTGTTAAGTGTACAATCTAAATT

a
s	mr.mrrefChr5	128839	64	+	294542	ATACTGATGGATCACAGTTGTGCTCTTTAATATGTTCTGAGACACATGTCATGAGCATCAGGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277361	64	+	636262	ATACTGATGGATCACAGTTGTGCTCTTTAATATGTTCTGAGACACATGTCATGAGCATCAGGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266571	64	+	647215	ATACTGATGGATCATAGTAGTGTTCTTTAATATGTTCTGACACACATTTCATGAGCATTAAGTC

a
s	mr.mrrefChr5	128903	18	+	294542	ACAGTCAATTGTTCTAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277425	18	+	636262	ACAGTCAATTGTTCTAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266636	18	+	647215	ATAGTCAATTGTTGTAAC

a
s	mr.mrrefChr5	128921	81	+	294542	TTTGTCACCTTTTAAAATATATCTAAGGCTACTAAAGAGTTAAGCTGACCTCCTCATTATTATCTACTTTGCTCATTTCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277443	81	+	636262	TTTGTCACCTTTTAAAATATATCTAAGGCTACTAAAGAGTTAAGCTGACCTCCTCATTATTATCTACTTTGCTCATTTCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266666	81	+	647215	TTTGACACTATCTAAGATAGAGCTAAGGCTATTAAAGAATGAAGTTGATCTCCTCTTTACTGTCTCCTTTGCTCATTTCCT

a
s	mr.mrrefChr5	129002	102	+	294542	TTAGGCCTGCACAGCCTGGTTATGAGGGAAGCAAAATAGCTGTGTGTTTGTGCATGAATGTTTTGAATACTTAGAGTGCTAAAGAGAATGGTCTATGCCTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277524	102	+	636262	TTAGGCCTGCACAGCCTGGTTATGAGGGAAGCAAAATAGCTGTGTGTTTGTGCATGAATGTTTTGAATACTTAGAGTGCTAAAGAGAATGGTCTATGCCTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266748	102	+	647215	GTAGGCCTGCATAGCCTGGTTATCAGGCAAGCAAAATAACAGCATGATTGTGCATGAACTTTTTGAATAGTTAGAGTGTTAAAGAGAATGGTTTGTGTCTCT

a
s	mr.mrrefChr5	129104	37	+	294542	CTAGTGGTTTAGATAGTGGTTTAGAAGAGATCCTGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277628	37	+	636262	CTAGTGGTTTAGATAGTGGTTTAGAAGAGATCCTGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266850	37	+	647215	TTAGTGATTTAGATAGTGGTTCACGAGAGATCTTGTC

a
s	mr.mrrefChr5	129141	26	+	294542	ATGTATATTTAATGGAAACTGACCGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277667	26	+	636262	ATGTATATTTAATGGAAACTGACCGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266887	26	+	647215	ATCTAGTGTGAACAGATACCGACCAG

a
s	mr.mrrefChr5	129167	39	+	294542	TTAAGTCAGGTTGAGATACTGTGGGATCTACAACTTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277693	39	+	636262	TTAAGTCAGGTTGAGATACTGTGGGATCTACAACTTGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266915	39	+	647215	TTAAATCAGCTTGAGATACTGTGGGATCTACAACTTGTT

a
s	mr.mrrefChr5	129206	22	+	294542	ACTGGCATTAGTGGGCACTACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277732	22	+	636262	ACTGGCATTAGTGGGCACTACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266958	22	+	647215	GCTGGCCTTATTGGGCACTACT

a
s	mr.mrrefChr5	129228	101	+	294542	AGGTAGGTTGCTCCACCTTTTAGTCTAAGTTGTTTCTGACTTCTAGATAAAGTCTCCGCACTATTACGACTGGTACATCCAGTTAAAATGATGGGTCATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277755	101	+	636262	AGGTAGGTTGCTCCACCTTTTAGTCTAAGTTGTTTCTGACTTCTAGATAAAGTCTCCGCACTATTACGACTGGTACATCCAGTTAAAATGATGGGTCATAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	266980	101	+	647215	AAGTAGGTTGCTCCACCTTTTAGTCAAAGCTGTTTCTGACTTCTAGATAATATTTCTGCACCGTCACAACTGGTACATCCAGTTATAATGATGGATTATAG

a
s	mr.mrrefChr5	129329	7	+	294542	CCTCTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277856	7	+	636262	CCTCTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	267112	7	+	647215	CCATTCC

a
s	mr.mrrefChr5	129336	135	+	294542	TGGTGGTATTGTAAGGAGATTATCTAGTACCAACATTTAGCTATAGAGAGACCCCTTACATATATAGTTAATTGCGTCTCACTGTTTGTGGAATTAATGCTTGGCTCTGTCAATCTCAAGCTTCACATTCAATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277863	135	+	636262	TGGTGGTATTGTAAGGAGATTATCTAGTACCAACATTTAGCTATAGAGAGACCCCTTACATATATAGTTAATTGCGTCTCACTGTTTGTGGAATTAATGCTTGGCTCTGTCAATCTCAAGCTTCACATTCAATGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	267123	135	+	647215	TGGTGGTATCGTATGGGGATCATCTAGTACCATCATTTATCTATAGAGCTACCTCTCACATGTATAGTTAACTTCGTCACACCGTTTGTAGAATTAACGCTTTGCTCTGTCAATGTCAAGCTTCAAGATCAATGA

a
s	mr.mrrefChr5	129471	57	+	294542	CCCATTATTACATGGGTTTCATTAAGATTTTTAATAGTAGGCCCACAACTGCCTACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	277999	57	+	636262	CCCATTATTACATGGGTTTCATTAAGATTTTTAATAGTAGGCCCACAACTGCCTACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	267258	57	+	647215	ACCATTATTATATGGGATTCATTTAGATTTTTAATAGTAGACCCATAAGTGCCTCCT

a
s	mr.mrrefChr5	129528	58	+	294542	TCTTCTGTCTATGCTGGGAAGCAGAGCATTTGAGTTAAGTTTACCTGAAGAAATACGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	278064	58	+	636262	TCTTCTGTCTATGCTGGGAAGCAGAGCATTTGAGTTAAGTTTACCTGAAGAAATACGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	267315	58	+	647215	TCTTCTGTCTACGATGGGGAGCGGAGCATTTGAGTTTAGTTTACCTGAAGAAATACAC

a
s	mr.mrrefChr5	129586	32	+	294542	TGGCTTCACACCTTGTATCCGGGTTTACACCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	278123	32	+	636262	TGGCTTCACACCTTGTATCCGGGTTTACACCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	267373	32	+	647215	TGGCTTCATACCGTGTACCTGGGTTTACACCT

a
s	mr.mrrefChr5	129618	146	+	294542	ACTTGCTGCTTATTAGTTAGCACAAAAAGTGTAGATTTTAGGATTGGCATTTAAGCTGAGATGGGACAAGTATCTCGTTTCCATGCCCAATAACAGTCATGGCCATCCAAAAATGTACTGGACTGACAATCCTGCCATCCTAGTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	278174	146	+	636262	ACTTGCTGCTTATTAGTTAGCACAAAAAGTGTAGATTTTAGGATTGGCATTTAAGCTGAGATGGGACAAGTATCTCGTTTCCATGCCCAATAACAGTCATGGCCATCCAAAAATGTACTGGACTGACAATCCTGCCATCCTAGTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	267405	146	+	647215	ACTTGCTGCTTATTAGTTAGCACAAGAAGTGTAGCTTTTAGGATTGGCATTGAAGCTGGTATGGGCCAAATATCTTGTTTCCATGCCTAATAACAATCATGGCCATCCAAAAATGTACTGGACTGACAATCTTGCCATTCTAGTTC

a
s	mr.mrrefChr5	129764	6	+	294542	CAGGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	278320	6	+	636262	CAGGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	267552	6	+	647215	CAGGGT

a
s	mr.mrrefChr5	129770	261	+	294542	TTCCCTTAAGAGGCTTGCTGCATAGAGTCCTGTATTTTGCCCTTCTAGTTCTCTCTGCCCGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGCATTTTGAATATCACTTGACCTGGACATCTGGCTATTGCCATAAGAATGGACTAGCAGAGGAGGTCTATATTACTGTAAGTTGCTGCTCACATGAAGCAATACCTTATTATAACAAGCAGGTGGTCTATATGGTACCCTACAATTCAAGATAGTCTCCAAGCATTTCGTCGGCGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	278326	261	+	636262	TTCCCTTAAGAGGCTTGCTGCATAGAGTCCTGTATTTTGCCCTTCTAGTTCTCTCTGCCCGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGCATTTTGAATATCACTTGACCTGGACATCTGGCTATTGCCATAAGAATGGACTAGCAGAGGAGGTCTATATTACTGTAAGTTGCTGCTCACATGAAGCAATACCTTATTATAACAAGCAGGCGGTCTCTATGGTACCCTACAATTCAAGATAGTCTCCAAGCATTTCGTCGGCGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	267559	231	+	647215	TTCCCTTAAGAGATTTGCTGCCTCAAGTCTGTGATTTTACCCTTCTAGTTCTCTCTGTCGGAATGAACTATACAATACTGCAGGGGTGATTTGAATATCATTTGACCCGGGCTTCTAGCTCTCACTATAAGAATGGACTAGGAGAGGATGTCTAGAATACTGTAGGTTGTTATTCACATGAAACAATACTTTCTTATAACAAGCAGGTGGTCTATAAGGGACCCTACAATT------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	130031	161	+	294542	GCTGCAAGTTCTCTTTGCATCCTTCTTGCCTTTGAATGAACTATACCATACTGCAGGGAAGCTTTGAATACTACTAGACCCGGGCTTTTGGTTGTCACCCTAACACTGGTCTGTGAGAGGAACTCTACCATGAGAGGAAGTCTAGAACACTGTAAGTGCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	278590	161	+	636262	GCTGCAAGTTCTCTTTGCATCCTTCTTGCCTTTGAATGAACTATACCATACTGCAGGGAAGCTTTGAATACTACTAGACCCAGGCTTTTGGTTGTCACCCTAACACTGGTCTGTGAGAGGAACTCTAGTGTGAGAGGAAGTCTGGCACACTGTAAGTGCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	267790	86	+	647215	---------------------------------------------------------------------------AGACCCGGGCTTTTGGCTCTCACCCTAAGAATGGTCTGGGAGAGGAAGTCAACCATGAGAGGAAGTCTAGAACCCTGTAGGTGCTA

a
s	mr.mrrefChr5	130192	291	+	294542	AACACATGGAACTATAATTTCTTATAACAAGCAGGCAGTCCATAATGTGGCCTACAATCCTCCATACTCTCCAATCATTTGGTTGGCACTAAGCAGCAACTGGATTCATTGTACCACAGTAGGGGTTATTGGAAGTGATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTCCAGGTGGATGGTATATATACCAAGCTGGTGAAAATATTTTTCAAGTCATCTGGTGTGGTTGCTCTTATAGCTTCATTCTTAGTATGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGATCTGAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	278751	291	+	636262	AACACATGGAACTATAATTTCTTGTAACAAGCAAGTAGTCCATAATGTGGCCTACAATCCTCCATACCCTCCAATCATTTGGTTGGCATTAAGCGGCAACTGGATTCATTGTACCACAGGGGGGGTTATTGGAAGTAATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTGCAGGTGGATGGTGTATATACCAAGCTGGTGCAAATATTTTTCAAGTAATCTGGTGTGGTTGCTCCTATAGCTTCATTTTTAGTACGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGATCTGAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	267881	285	+	647215	AACACATGGAACTATAATTTCTCATACTACGCAGGCAGTC-----TGTGGTCTATGATCCACCATACTCTCCAATCATTTGGTTGGCACTAAGCAGCAATTGAATTCATTATACCAGAATAGGGGCTATTCGAAGTGATGTTTCACCACAGCCTCAAAAGATCATCCATGCCTCCAGGTGGATGATATATGTGCTAAGCCGGTGAAAATATTTCTCAAGCCAACTGGTGT-GTTCCTCTTATAGCTTCATTCTCAGTATGTTAACCCTGGGCCATCTTCTGGTTCTGAGGT

a
s	mr.mrrefChr5	130483	49	+	294542	GGTTAACATATGTAGGACCTAAAACACTGAAAAGTAGCAAGTCCAGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	279286	49	+	636262	GGTTAACATATGAAGGACCTAAAATAATGAAAGCTAGCATGTCCAGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	268166	49	+	647215	GGTCAACATATGTAGGACCTAAAACACTGAAAAGCAGCAAGATAAGCAG

a
s	mr.mrrefChr5	130532	66	+	294542	GGGCTTGGGGCTCCTGTAGTCCAGTGTCTCTCAAAGATGGAATAAACTATGTACCAAGTCAATAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	279335	66	+	636262	GGGCCTGGGGCTCCTGTAGTCCAGTGTCTCTCAAAGATGGAATAAACTATGTACCAAGTCAATAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	268216	6	+	647215	AAGATC------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	130598	98	+	294542	CTGAGTTGGTAGGGTTCAATATCTCAATTATGCTCTGTGACAAACAAAATTGTCTGCATTGGGTTGTTCACATGGAGCCCTACCAAGTTGGAGCCCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	279406	98	+	636262	CTGAGTTGGTAGGGTTCAATATCTCAATTAAGCTCTGTGACAAACAAAATTGTCTGCAGTGGGTTGTTCACATGGAGCCCTACCAAGTTGGAGCCCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	268222	97	+	647215	-TGAGTTGGTAAGGTTCAATGTCTCAATTATGCTCTGTGACAAACAAAATTGCCTGGATTCGGTTGTTCACATGGAGCCCTACCAAGTTGGAGCCTCA

a
s	mr.mrrefChr5	130696	38	+	294542	CAAGTGTATGACAAAAAACTTGAAGACAGGGTGACACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	279504	38	+	636262	CAAGTGTATGACAAAAAACTTGAAGACAGGGTGACACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	268320	38	+	647215	CAAGTGTATGACAAAAAACCTGTAGACAGGGTGACACA

a
s	mr.mrrefChr5	130734	126	+	294542	CTAGCTGTCCAGATCAAAACTAGTGGTATGGTCCAAATTACAGTCTAGCCCAGGGCAGCATGGTGCAGACCAAGAGGACAGTATAATGGAGGAAGCCTAAAAGGTAGTGTAACAATCTGGTGGAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	279637	124	+	636262	CTAGCTGTCCAGGTCAGAACTAGTGGTATGGTCCAAATTACA-TCTAGCCCAGGGCAGCATGGTGCAGACCAAGAGGACAGTATAAT-GAAGAAACCTAAAAGGTAGTGTAACAATCTGGTGGAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	268358	126	+	647215	CCAGCTGTCCAGATCAAAACTAGCGGTATGGTCCAAATTACAGTCTATCCCATGGGAGCATAGTACAGACCAAGAGGACAGTATTATGGAGGAAGCCTAAGAGGTAGTGTAACAATCTGGTGGAAC

a
s	mr.mrrefChr5	130860	171	+	294542	TACATGCCTAATGGAGTTTAACTTGGAGTACTCATGGTCAGTATCAAAGATACTATTGATCCCAGTCCCTCAGCTTCAGGAGGCAGGTTAGGATAACAATGCACTTTGTCAAAAATTTTCTTACAATTATGTCATCAAAAAATGTGTTCCATTCCGCCTTCATCTTGAGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	279761	171	+	636262	TAAATGCCTAATGGAGTTTAACTTGGAGTACTCACTATCAGTATCAAAGGTACTATGGATCCCAGTCCCTCAGCTTCAGGAGGCAGGTTAGCATAACAATGCACTTTGTCAAAAATTTTCTTACAATTGTGTCATCAAAAAATGTGTCCCATTCCGCCTTCATCTTGAGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	268485	171	+	647215	TACATGTCTAATGGAGTTTAACTTGAAATACTCATGGTCAGTATGAAAGATACTATTGATCCCAGTCCCTCAGCTCCAGGATGCAGGTTAGGATAACAATGCACTTTGTCAGAAATTTTCTTACAATTATGTCATCAAAAAATGTGTTCCATTCTGCCTTCATCTTAAACC

a
s	mr.mrrefChr5	131031	79	+	294542	AAAAAACTATATCATTCTACTGTCATATACTTGATGACTATTTGTTTGTGACCAAAACAGTCAATCAACACACATGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	279933	79	+	636262	AAAAAACTATATCATTCTACTGTCATATACATAATGACTATTTGTTTGTGACCAAAACAGTCAATTGACACACACGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	268656	79	+	647215	AAAAAATTTTATCATTCTGGTTTCATACACTTGATGACTATTTGTTGGTGAACAAAAGAGACAATCAACACGCATGACA

a
s	mr.mrrefChr5	131110	277	+	294542	TTCCACCCATTATTAGTTGACTTCAGTAGGTCTGTCTTGTAAACATAAAAGCATTTTCTTTTTCTCTCATGGTAATGGTGGAAGATAGAAGTTCCAAACCATCTATATTTCTATACCACCGTCACCACACATCATTAATTTGCGGGCCAGCTTTTAGTATTGAGTTCTCCAATTCTAATTGTCCAAACATTCTCCTGCTGTCACTGTTCGTCCAGCTTGGGAGCCAGACTGCTGTATTTTGGTCAGGGCATGGCAGAGACATGGCCCTCTGTGATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	280058	275	+	636262	TCCCACCCATTATTGGTTGACTTCAGTAGGTCTGTCTTGTAAACATAAAAGCATTTTGTTTTTCTCTCATGACAATGGTGGGAGATGGAAGTTCCAAACCATCTATATTTCTATACCACTGTCACCACAAATCATTAATTTACAGGCCAGCTTTTAGTATTGAGTTCTCCAATCCTAATTGTCCTAACATTCTCCTGCTGTCACTGTTCGGCCAGCTT--GAGCCAAACTGCTATAATTTGGTCAGGGCATGGCAAAGACATGGCCCTCTGTGATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	268735	263	+	647215	TTCCACGCCTTATTAG---------AAAGGTATGTCTTGTAAACATAGGAGCAGTTTCTTTTTCTCTCATGGTAATGGTGGAGGATAGAAATTCCAAACCATTTATATTTCTAAACCTCCGTCACCAAACAT-----ATTTGTGTACCAGTTTTTTGTATTGAGTTCTTCAATTCAAATTGTCCAAACTTTCTCCTGTTGTCACTGTTTGTCTGGGTTGGGAGCCAGACTGCTGTATTTTAGTCAGGGCATAGCAGAGACATGGCCTGCTTTGATTG

a
s	mr.mrrefChr5	131387	94	+	294542	TCCATCAATTCAATCTAGAGCACAGAACAAGAATTACAGTTTGCCAAGGCGGCAAAGTTGGTCATAGATTAACCCTTCCACTACCCATGCCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	280333	83	+	636262	TCCATCAATTCAATCTAGAC---ACAACAACAATTAC--TTTGCCAAGGCGGCAAAGTTG--TATAGATTAACCCTTCCACTACTCCTG----G
s	simRat_chr6.simRat.chr6	269003	92	+	647215	TCCATAAATTCGATCTAGAGCACAGAACAAGTATCACAGCTTGCCAAGGCAGCAAGGTTGGTCACAGATTAACCCCTCCACTACCCA--CCCTG

a
s	mr.mrrefChr5	131481	148	+	294542	CTGGGGATTTATATAGGTTAAAATTGCTCATTCAGAACTAGGAACATGAATTGTAAAATTTGACACTATTGGGTTCATGAGCACCCGTCAGATGTGGTCCAAGAGTGCTATAACAATCAATTCAGTGGGGCGAGAGTTAGATCCCAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	280416	147	+	636262	TAGGGGACTTATATAGGTTAAAATTGCTCATTCAGAA-TAGCAACCTAAATTGTAAAATTTGACACTATTGGGTTCATGAGAACCCGTCAGATGTGGTCCAAGAGTGCTATAACAATCAATTCAGTGGGGCGAGAGTTAGATCCCAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	269101	91	+	647215	CTGGGGATTTATATAGGTTAAAATTGCTCATTCAGAACTTGGAGCATGAATAGGAAAATTTGACACTATTGAGTTCATGAGCAC---------------------------------------------------------TCCCAGT

a
s	mr.mrrefChr5	131629	146	+	294542	AGACTGACCTTGAAGAATTGTGAGGTCTCATGAAGTCAGACTGAGCATCAATTACAGTGAGGGATACATACTGTTTACCACACCCCATGGAGGGAAGGAGCAAAGTATTATTAGTAGCAGGTCTATGTGTTCTGAAATGAGGAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	280564	138	+	636262	AGACTGACCTTGAAGA-------GGTCTCATGAAGTCAGACTGAGCATCGATT-CAGTGAGGGATACATACTGTTTACCACACCCCATGGAGGGAAGGAGCAAAGTATTATTAGTAGCAGGTCTATGTGTTCTGAAATGAGGAAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	269192	146	+	647215	AGACTGACTTTGAAGGATTGTGAGGTCTCATGAATTCAGACTGAGCATCAATTATAGTGAGGGATACATACTGTTTACCACATCCCATGAAGGGAAGGAGCAAAGTATTGTTAGGAGCAGGTCTATGTGTTCTGAAATGAGGAAGA

a
s	mr.mrrefChr5	131775	209	+	294542	GAAAGATGGTGCAAAGCGATTGGGAAACATTCACATGTATTAAGGCATTATGTCAACATACACATCAGTCACAATTGTACTAAGAGTCTGGAATAGGGACTCCAGTTTAATATCTGTAAGAATCTACCCGTGAAAACCACAACTAGAGCATGATAAAATGAGTGGCTGACCAATTAGGATGTTTGCCAGTAGAAACTCAAAAGAGCAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	280702	203	+	636262	GAAAGATGGTG------GGTTGGGAAACCTTCACATGTATTATTGCATTATGTCAACATACACATAAGTCACAGTTGTACCAAAAGTCAGGAGTAGGGACTCCAGTTTAATATCCGTATGAATCTACCCATGAAATGCACAACTAGGGCATAATAAGATGAGTGGCTGACCAATTAGGATGTTTGCCAGTAGAAATTCAAAAGAGCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	269342	200	+	647215	GAAAGGTAGTGCAAAGCAATTGGGAAACATTCACATGTATTAAGGCATTATGTCAACATACAAATCTGTTACAACTGTACTAAGAGTCTGGAACAGGGACTCTAGTTTCATATCTGTAAGAATCTACCCGTGAAAACTCCAACTAGAGCATGATAAAA---------GGCCAACTAGGATGTTTGCCAGTAGAATCTCAAAAGAACAAC

a
s	mr.mrrefChr5	131984	8	+	294542	CAGAGTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	280944	8	+	636262	CAGAATGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	269542	8	+	647215	CAGAGTGC

a
s	mr.mrrefChr5	131992	61	+	294542	TCTATGTAAGATGAAAGTGGCAGCAGCACAACGCCTCCATCTGATGCTAAATAATCTGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	280954	61	+	636262	TCTATGCAAGATGAAAGTGGTAGCAGCACAATGCCTCCACCTGATGCTAGATAATCTGAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	269550	60	+	647215	TTTATGTAAGATGAAAGGAGCAGCAGTAC-ACGCCTCCATCTGATGGTAAATAATCCGAGT

a
s	mr.mrrefChr5	132053	133	+	294542	GCTGTTTAACATTGAATTAATGCACTACATTTGTTCAGGGGTCCACTGGTGGTACAAGATTCTCTTATCATGATGTTTGTGCACACCTAGTGGTGTCCTACTTTATTTTTTATAAAGGTAATCTAACATCTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	281015	133	+	636262	GCTGTTGAACATTGAATTAGTGCACTACATTTGTTTAGGGGTCCACTGGTGGTACACGATTCTCTTATCATGATGTTTGTGCACACCTCGTGGTGTCCTACTTTATTTTTTATAAAGGTAATCTAACATCTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	269611	123	+	647215	ACTGTTTAACATTGAATTAATGCACTACATTTGTTCAGGGGTCCACTGGTGGTACAAGATTCTCTTATCATGATGTTTGTACACACCTAGTGGTGTCC----------TTTATAAAGGTAAGCTAACCTCTCA

a
s	mr.mrrefChr5	132186	9	+	294542	TGACTCCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	281148	9	+	636262	TGACTCCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	269736	9	+	647215	TGACTCCTG

a
s	mr.mrrefChr5	132195	178	+	294542	ACTTTATCTTAGTACTCTCCCCCACTTTCCTTCATTTAAAGGCTTGCTGATGGAATGGAATGCAGTACATCAAAGTAGGTGTTTTATTATCCAACCAGCTCTGTTTGCTTAAAGATAACTCACCTTGTTCATCCTCTCTCACTTTGGGGGTATAGAAGATGTTCATCAGATTCCTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	281160	178	+	636262	ACTTTATCTTAGTACTCTCCCCCACTTTCCTTCATTTAAAGGCTTGCTCATTGAATGGAATGCAGTACATCAAAGTAGGTGTTTTATTATCCAACCAGTTCTGTTTGCTTAAAGATAACTCACCTTGTTCATCCTCTCTCACTTTGGGGGTATAGAAGATGTTCATCATATTCCTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	269745	170	+	647215	ACTTTATCTTAGTACTCGCCCCCACTTTCCTTCGTTTAAAGGCTTGATGATGGAATGGAATGCAGTTCATCAAATCAGGTGTTTTCTTATCCAACCAGCT--------TTAAAGATAACTCTCATTGTTCTTCCTCTCTCATTTTGGGGGTATAGAAGCTGTTTGTCAGACTCCTGAA

a
s	mr.mrrefChr5	132373	21	+	294542	ACAAGAGGCGGGCAACTCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	281339	21	+	636262	ACAAGAGGTGGGCAACTCATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	269915	21	+	647215	ACAAGAGGCGAGCAACTCATC

a
s	mr.mrrefChr5	132394	103	+	294542	CACCTAGAGCTGTCAGTTGTTCACTTCTCCCCATCAGCAGAGGGTGTCATCCATCATCCTTGGTAACAGTGGCGGCAGCAACAATCATGTCACTAGAGGATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	281360	103	+	636262	CACCTAGAGCTGTCAGTTGTTCACTTCTCCCCATCAGCAGAGGGTGTCATCCATCATCCTTCTTAACAGTGGCGGCAGCAACAATCATGTCAGTAGAGGATCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	269942	103	+	647215	CACCTCAAGCTGTCAGTTTTCAGGCTCTCACCTTCGGCAGAGGGTGCCATCCATCATCCTTGGTAATAGTGATGGCAGCAACAATCATGTCACTAGAGCATCA

a
s	mr.mrrefChr5	132497	21	+	294542	TTTCCTTATTATCATATGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	281463	21	+	636262	TTTCCTTATTATCATATGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	270052	21	+	647215	TTTCCTTATTATCATATGCCT

a
s	mr.mrrefChr5	132518	95	+	294542	GAGTTGTGGTAAGCACTAACCCCAGACTTCAGACTGAAGATATCAGAATTTGTAGCTCAGGTTTTTCACAATCACAAACTGCCATCGAAAAGTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	281497	95	+	636262	GAGTTGTGGTAAGCAGTAAGCCCAGACTTCGGAATGAAGATATCAGAATTTGCAACTCAGGTTTTTCACAATCACAAACTGCCATTGAAAAGTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	270073	95	+	647215	GATTTGTGACAAGCACTAACCCCAGACTTCAGACTGAAGATATCAGAATTTGTAGCTCAGGCTGTTCACGATCACAAACTGCCATCGAAAAGTGG

a
s	mr.mrrefChr5	132613	20	+	294542	GACTGAATTCATGGTCCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	281596	20	+	636262	GACTAAATTCATGGTCCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	270168	20	+	647215	GGCTGAATTAATGGTCCCTT

a
s	mr.mrrefChr5	132633	108	+	294542	CAACAGACAATACATATTATAAGGTGAGTGGCCCAAATAATTTGGTAAATGAGCAGCAAGAACAGAAGCATAACCCATGGAGTATGTACTGTGTTGGTAATTAAGGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	281631	108	+	636262	CTACAGACAATACATATTATAAGGTCAGTGGCCCAAATACTTTGGTAAATGAGCAGCAAGAACAGAAGCATAACCCATGGAGTATGTACTGTGTTGGTAATAAAGGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	270188	106	+	647215	CAACAAACAATACATATTATAAGGTGAGTGGCCCAAATGATTTGGTAAATGAGCAGCTAGAACAGAAGCATAATCAATGGAGTACAAAT--TGTTGGTAACTAAGGAC

a
s	mr.mrrefChr5	132741	218	+	294542	AAGCAAATCATAATTTGCTGCTCCAGTATGATAGGGGATATAGAAGTGTTTAAGGGCCCTGGAGTCCTGTAATCAACATCTAACTTAAAAGTCCCTATAGCCCTATGTTATAGCTTTAGTACCCAACCCACTAAATACTCTTGGTATCTTGAAACATAAGTATTTCATAAGCTTATCATCTTTGGGTCATAGCCCAAGTAAAGGTAATACCCTGTACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	281742	218	+	636262	AAGCAAATCATAATTTGCTGCTCCAGTATGATAGGGGATATAGAAGCGTTTAGGGGCCCCGGAGTCCTGTAATCAACATCTTATTTAAAAGTCCCTATAGCCCGATGTTATTGCTTTAGTACCCAACCCACTAAATACTCTTGGCATCTTGAAACATAGGTACTTCATAAGCTTATCATCTCTGGGTCATAGCCCAAGTAAAGGTAATACCCTGTACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	270294	218	+	647215	AAGCAGCTCATAATTTGCTGGCCTAGTATGATAGGGGATATAGTAGTGCTTAAGGGCCCTGGAGGCCTCTAATCAACATCTAACCTAAAAGTCCCTATAGTCTTATGTTATAGCTTTAGTACCCAACCCATTAAATACTCTTGGTATCTTGAAACATTAGTATTTCATAAGCTTATCATCTTTGGGTCATAGCCCAAGTAAAGATAATACTCTGTACT

a
s	mr.mrrefChr5	132959	69	+	294542	TATGATACACTTGAAGGAAAATAGTTCTGTGATCATAAATTGCAGGAGACTGCCCAGGAATAATAGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	281962	69	+	636262	TATGATACACTTGAAGGAAAATAGTTCTTTAATCATAAATTGCAGGAGACTGCCCAGGAATATTAGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	270512	69	+	647215	TATGATAAACTTGAAGGAAAATAGTTCTGTGATCATAAATTGCAGTACACTGGCCAGGAAGAACAGGGG

a
s	mr.mrrefChr5	133028	347	+	294542	AAGGAAGATCTTTATGAATGGTAGGTATGCTTACATACCCAGATTGCCCCCATTCACCCTCAGCATCTTAGGGATATGCACAATAAGGCTTGTTGGAGCTCTTAACACGATAAGCTTTCCTGTTCTTGTCCACCAGTTATTGGGTAACTGTTACAATGATGTATTAGCAGGATGGGACCAGCCTCTGGTGAAAGTATTAGGGCATTAATATTCATTTTTAAGCCTGTACCTTCCATGACTCACCTAAGTAGCTCTCCCATCACCTTTATGACTAGATGGCCCTATGTCAGCTCATATCTGCCATTAGATCCAATTAATAAGACCATGAAACAGCTAATGGTCAAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	282042	347	+	636262	AAGGAAGATCTTTATGAATGGTAGGTATGCTTACATACCCAGATTGCCCCCTTTCACCCTCAGCATCTTGGGGATATGTACAATAAGGCTTGGAGGAGTTCTTAACACAATAAGCTTTTCTGTTCTTGTCCACCAGTTATAGGGTTACTAGTATAATCTTGTAATAGCAGGATGGGACCAGCCTCTGGTGAAAGTATTAGGGCATTAATATTCATTTTTAAGCCTGTACCTTCCATGACTCACCTAAGTAGCTCTCCCATCACCTTTATGGCTAGATGGCCCTACGTCAACTCATATCTGCTGTTAGAGCCAATTAATAAGACCATGAAACAGCTAATGGTCAAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	270581	254	+	647215	AAGTAAGATCTTTATGTATGGTAGGTATGCTTACATACCCGGATTGCCCCCATTCACCCTCAGCATCTTAGGGGTATGCACAATCAGGCTTGTTGGAGCTCTTAACACGATAAGCTTTCCTGTTCTTGTTCCCCAGTTATTGGGTAGATGTTACAATGATGTATTAGCAGGATGGGACCAGTTTC----------------------------------------------------------------------------------ATTACTAGACTGCCCTATGTCAGCTCATATCTGCCATTAGATCCAATTAATAAAACC-----ACAGCTACTGGT------

a
s	mr.mrrefChr5	133375	88	+	294542	GAGAGTGAGCCAATGATACAACATGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGCCCGTCAAATTTATTCCTGAGGCTGAAGTTTAACAGTGACATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	282408	88	+	636262	GAGAGTGAGCCAATGATACAACATGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGCCCATCAAATTTATTCCTCAGGCTGGAGTTTTACAGTAACACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	270835	70	+	647215	------------------CAACGTGGAAAGGCTTTGCAAATCTTGTGTGTCAAATGTATTCCTGAGGCTAAAGTTGAACAATGATATT

a
s	mr.mrrefChr5	133463	28	+	294542	CTAAATAGTGCATGGAAGTTCCAGCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	282497	16	+	636262	CTAAATAGTGCATGGA------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	270905	18	+	647215	----------CATGGAAGTTCCAGCACA

a
s	mr.mrrefChr5	133491	56	+	294542	CCACTAGATACCTAACCTTGGTTGGGTTCTAAACAAACACAAAGAATAACCAACGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	270927	56	+	647215	CCACTAGATACCTAACCTTGGTTGGGTTCTAAACAAACACAAAGAATAACCAACGA

a
s	mr.mrrefChr5	133547	20	+	294542	GATTTCCTGTGCTGACTTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	282513	20	+	636262	GATTTCCTGTGCTGACTTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	270986	20	+	647215	GACTTCCTGTGCTGCCTTAT

a
s	mr.mrrefChr5	133567	22	+	294542	ATGAATTGCTCTGCATTGTGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	282533	22	+	636262	ATGAGTTGCTCTGCATTGTGAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	271009	22	+	647215	ATGAATTGCTCTGCATAGTGAC

a
s	mr.mrrefChr5	133589	138	+	294542	TCTTACTTGTGCCATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAATCTTTGCAGCTAAACCCACCTCTCAATTTTTAGTGATCGTGCTTTGAGCTAGAAATACAGTAATATTTCTTGGACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	282555	133	+	636262	-----CTTACGCCATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAATCTTTGCAGCTATACCCACCTCTCAGTTTTTAGTGATCATGCTTTGAGCTATAAATACAGTAATATGTCTCGGACAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	271032	138	+	647215	TCTTACTTGTGCGATGCACTGAGAATAGTTGGAGTACCAGTAACCTGAGAATCTATTCAAACCTTTGCAACTAAACCCACCTCTCAATTTTCAGTGATCGCACTTTGAGCTGGAAATACAGTAATATTTCTTGGACAG

a
s	mr.mrrefChr5	133727	79	+	294542	CTGTGTTCTGGATAGGATAGTGCCACTAGCTCTAGTGTTATGAGAGGTTGTATCAATTAACATAGATAGAATCTTGATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	282692	79	+	636262	CTGTGTTCTGGATAGGATAGCACCACTAGCTCTAGTGTTATGAGAGGCTGTATCAATTAACATATATAGAATCTTGATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	271170	74	+	647215	CCGGGCTGT-----GGATAGTGCCACTAGCTCTAATGTTATGAGAGGTTGTAGAAATTAACATAGATAGAGTCCTGATA

a
s	mr.mrrefChr5	133806	32	+	294542	TGAATATCATTGTTCTGCTAGCATTGTGTAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	282771	32	+	636262	TGAATATCATTGTTCTGCTAGCATTGTGTAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	271248	32	+	647215	TGGATATCAATGTTTTGCTAACATTGTGCAAC

a
s	mr.mrrefChr5	133838	55	+	294542	CTCACTCTCTACCTCGCAATCATTATAATTATATCATTCCAATGACTCATCTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	282803	55	+	636262	CTCACTCTCTACCTCACAATCATTATAATTACATCATTCCAAAGACTCATCTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	271283	55	+	647215	CCCACTCACTACCTCGCAATCATTATAATTATATCATTCCAATGACTCATCTGAA

a
s	mr.mrrefChr5	133893	26	+	294542	ACTTGTACAGGTAAACCTAAAGTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	282864	26	+	636262	ACTTGTACAGGCAAACGTAAAGTAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	271338	26	+	647215	ACTTGTGCAGGTAAAACTAAGGTAGA

a
s	mr.mrrefChr5	133919	32	+	294542	GTCAGGGAAGATGGAAAGAAGGCAGAGAGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	282890	32	+	636262	GTCAGGGAAGATGGAAAGAAGGCAGAGAGAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	271392	32	+	647215	GTGAGGGAACATGGAGATGAGGCAGAAAGGAA

a
s	mr.mrrefChr5	133951	422	+	294542	TCCTGTCTACCGATGCCAAGGAGCGGTCATGATATCAGTGAAAGTTCACTCTGTGTCTGTTGAGTGGTGTTATAGAATGCCAGTGAAGGCCAAACTCTTGCTTAACTCAAGGCAAGAAGGAAATCTAGACATGGGCACAATAGAGCGGCTTCCAATGTACCTGTAGGAGAGTTTTGGATGAACTACCCTATATACCTCTATGCCAAGAAGGAGGCAATCAGTGCACACAGTACGGAGTGTTCCTGAGTTGGAATAACTTCATGGACAGATGGATAAATTAGGAAGGGGAGAGAGTAGAGACAACCAGTTCTTATTCTCCTGAAGACAGAATGTAGGCCAGAAATAGTACCAGGTTAGGCAGGCATTAGCTCAACATATTGCATCCAATGATCGGTGTGGTATTGCATAGGCTGCCCATTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	282925	420	+	636262	TCCTGTCCAAAGATGCCAGGGAGTGGTCATGATATCGGTGAAAGTTCACTCTGTGTCTGTTGAGTGGTGTTATAGAATGCCAATGAAGGTCAAACTCTTGCTTAACTCAAGGCAAGAAGGAAATCTAGACATAG--ACAATAGAGTGGCTTCCAATTTACCTGTAGGAGAGTTTTGGATGAACTGCCCTCTGTACCTCTATGCCAAGCAGGAAGCAATCAGTGCACACAGTACGGAGTGTTCCTGGGTTGGGATAGCTTCATGGACAAATGGATAAATTAAAAAGGGGAGAGAGTAGAGTCAACCAGTTCTCATTCTCCCGGAGACAGAATGTAGGCTAGACATAGTACCAGGTTAGGCAGGCAGTAGCTCAACATATTGGATCCAATGATTGATGTAGTATTCCATAGGCTGCCCATTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	271424	422	+	647215	TCCTCTCTACCGATGCCAAAGAGCGGTCATGATCTCAGTGAAAGTTGGCTCTGTGTCTGTTCAGTGGTGTTGTAGCATGCCAGTGGAGGCCAAACTATTGTTTAACTCAAGGCAAGAAGAGAATCTGGACATGGGCACGATAGAGCAGCTTCCAATGTACCTGGAAGAGAGTTTTGGATGAACTACCCTATATACCTCTATGCCATGAAGGAGGCAATCAGTGCACACAGTAAGAAGTGTTCCTGAGTTGGAATAACTTCATGGACAGATGGATAAATTAGGAAGGGGAGAGAGTAAAGACAACCAGTTCCTATTCTCCTGAAGACAGAATGTGAGCCAGGAGTAATACCAGGTTAGGCAGGGATGAGCTCAACACATTGCATCCAATGATCGGTGTGGTATTGCATGGGCATCCCATTTTT

a
s	mr.mrrefChr5	134373	71	+	294542	GTCATACTTTGGTACCCAGCAGTCTTTATGGTTGTCATAGGTTACCTTATATAGGAATGCCTGAAAGTGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	283345	71	+	636262	GTCTTACTTTTGTACCCAGCAGTCATTATGGTTGTCATGGGTTACCTTATATAGGAATGCCTGCAAGTGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	271847	71	+	647215	GTCATATCTTGGTACCTAGCAGTCTTTATGGTTGTCATAGGTTACCCTCTCTAGGAATGCCTGAAAGTGCC

a
s	mr.mrrefChr5	134444	148	+	294542	TGAGGATAGAAATAGACTGGAATGTCCACTCAAATATGATGGCTAATAATCATAAAAGTTTGTAGAATTTGTCCCACCCCTCTCAGAAGGCTGTGCAACTTCTGTGTAAATGGATGAGAAGTGGCCTCCATATCAACAACCACATGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	283418	64	+	636262	TGAGGATAGAAATTGACTGGAATGTCCACTCA------ATGGCTAATAATCATAAAAGTCTGTAGAATTT------------------------------------------------------------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	271918	148	+	647215	TGAGGATAGAAATAGACTGGATTGTCCACTCAAATATGATGGCTAATAATCATAAGCATTTGTAGAATTTGTCCCACCCCTCTCAGAAGGCTGTGCAACTTCTGTGTAAATGGATGAGAAGTGGCCTCCATATCAACAACCACATGAT

a
s	mr.mrrefChr5	134592	74	+	294542	TGTATGACCTTAACCCAAAACTAAGATCAATATTCTACTGTCTAGATGGTGTTAAGTTAAGAAGTGCGTAAATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	283482	32	+	636262	------------------------------------------TGGATGGTGTTAAGTTAAGAAGTGCGTAGATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	272068	74	+	647215	TGTATGACCTTAACCCAAAACTAAGATCAATATTCTACTGTCTAAATGGTGTTAAGTTAAGAAGTTCATAAATC

a
s	mr.mrrefChr5	134666	78	+	294542	ATACTAGTATATAGGCAGCATTTTGGTGTGAAGCTTCAGCATGCTTACATGGATAGATGGGTGATACTGATTACCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	283711	7	+	636262	ATACTAG-----------------------------------------------------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	272142	78	+	647215	ATACTAGTATATAGGCAGCATTTTGGTGTGAAGCTTCAGCATGCTTACATGGATAGATGGGTGATACTGATTACCATG

a
s	mr.mrrefChr5	134744	116	+	294542	GCTACTTTGTCATCAAGCCTTTGCTCTTAAAACTAAGGCTGGGCTTTTACTGTTAAGTAATCCTGAGTCGTTGATAAGCCATGGGAAATGGAACTAAGCCTATCTGGTAATTACGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	272221	116	+	647215	GCTACTTTGTCATCAAGCCTTTGCTCTTAAAACTAAGGCTGGGCTTTTACTGTTAAGTAATCCTGAGTCGTTGATAAGCCATGGGAAATGGAACTAAGCCTATCTGGTAATTACGA

a
s	mr.mrrefChr5	134860	19	+	294542	ACAAACCAGACCACTACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	283718	18	+	636262	-CAAACCAAACCACTACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	272342	19	+	647215	ACAAACCAGGCCACTCCAA

a
s	mr.mrrefChr5	134879	214	+	294542	ATGCCAGTCACTATGTTGGCTACAGATGACGTTATTAATTTGGCTAAAGATGACCTTAGTCATGATCTGAGCCCTGAACAGCTGGAAATGTGGGTATTCTTCATCTGTCCTCAAAGAATGGAATGTTTTTATGGGTTTACCTGATTGCTGCATATTTGGAGACTGACCTCTAAACTCTTGTCCATCTTTATGTCTTGATTCACAGCATCTAGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	283738	213	+	636262	ATGCCAGTCTCTAATTTGACAATAGATGACATCATTAGTTTGGCTAAACATGACCTTAGCCATGGTCTGAGGCCTGAGCAGCTGGAATTGTGGGTATTCTTCATCTGTCCTCAAAAAATGGAATATTTTGATGGGTTTACCTGATTGCTGCATA-TTGGAGACTGACCTCTAAACTCTTGTCCATCTTTATGTCTTGATTCACAGCATCTAGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	272361	214	+	647215	ATGCTGGTCACTATGTTGGCTACAGATGACGTTACTAATTTGGCTAGAGATGACCATAGTCATCATCTGAGCCCTGAACAACTGGAAAAGTGGATATTCTGCCTCCGTTCTCTAAGAATGGAATGTTTTTGTGGGTTTACCTGATTGCTGCATATTTGGAGACTGACCTCCAAACACTAGTCCATCTTTATGTCTTGATTCATAGCATCTAGGA

a
s	mr.mrrefChr5	135093	83	+	294542	GTCTTGTCCTAATACAACAGTGTGACATGCCAGACTCAAATAATGCCTGCATTTCATAGCTGATGCCTACACAGGGGAAAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	283952	83	+	636262	GTCTTGTCCTAATACAACAGTGTGACATGCCAGACTCAAATAATGCCTGCACTCCATACCTGATGCCTACACAGGGGAAAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	272575	77	+	647215	GTCTTGTCCTAATACAACAGTGTGACATGCAAGACTTAAATAATGCCTGCTTTTCACAGCTGATGCCTTCACAGGGG------

a
s	mr.mrrefChr5	135176	42	+	294542	AGGCACAGGAATAGATGAGGGCTGGGATCTTAGAAACAGGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	284048	42	+	636262	AGGCACAGGAATAGATGAGGGCTGGGATCTTAGAAACAGGAT

a
s	mr.mrrefChr5	135218	21	+	294542	GAGAATGAATTCGAAACAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	284156	21	+	636262	GAGAATGAATTCGAAACAATG

a
s	mr.mrrefChr5	135239	28	+	294542	AATGAGTTTAAGGAAGAATAGTCTCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	284178	28	+	636262	AATGAGTTTAAGGAAGAATAGTCTCTTA

a
s	mr.mrrefChr5	135267	16	+	294542	CAGTACCATTGTATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	284207	16	+	636262	CAGTACCATTGTATCT

a
s	mr.mrrefChr5	135283	346	+	294542	TGTGGCTGAAGTAACTTGCACAGTTAACATGGTAAAGGATGCCACCTACAGGCATTAAGCTAATCCTAACATCTGAGGCACTATCTGAGAACTGTGTAATGGAGGGAGAGTAATCATGTCAAGTTGGAGATTAGTTGGAATATACAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGTTAGTATATACAAGAATCTCTCTCTTTGATTTTCTGGTACATGTTGCTTACAAAACCTTTGCCCTGACAGGAGTCAAAAAAGGACCACTGGAATACTACATGGAAGTTTTCAGGATTGCAATATACTACTATCAGACAGATGGAAAGAATGGGGGTTTGATGCTTGGGTACTTTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	284235	342	+	636262	TGTGGCTGAAGTAACTTGCACAGTTAATATGGTAAAGGATGCCACCTACAGGCATTAAGCTAACCCTAACATCTGAGGCACTATCTGAGAATTGTGTAATGGAGGGAGAGTAATCATGTCAAATTGGAGATTGGTTGGAATATGCAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGTTAGTATATACAAGAATCTCTCTCT----TTTTCCGGTACATGTTGCTTGTGGAACCTTTGCCCCAACAGGAGTCAAAAAAGGACCACTGGAGTACTACATGGTACTTTTCAGGATTGCAATATACTACTATCAGACAGATGGGAAGAGTGGGGGTTTGATGCTTGGGTAATTTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	272652	320	+	647215	------------------------CAACATGGTAAAGAATGCCACCTACAGGCATTAAACTAATCATAATGTCTGAGGCACTATCTCAGAACTGTGTAATGGAGAGGGAGTAATCATGTCAAGTTGGAGGTTAGTTGGAATACACAAGAAGCTCTGTCTTCAGAGATTGGGTAATATATACAAGAATCCTTCTCTTTGATTTTCTGGTACATGTTGCTTACAAAACCTTTGCCTTGACAGCAGTCTATAAAGAACCACTGGAATATTACTTGGAAGTTTTTAGAATTGCAATATATTACTACCAGAAAGATGGAAAGGAG--GGGTATGATGCTAGGGTACTTTGT

a
s	mr.mrrefChr5	135629	73	+	294542	ATGTGCAGTGGTTCTACCACTTGTGCCGCTGTAGTAGTCTTGCAAACTCAGTCACTGCAAGGTGAATCTCTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	284577	62	+	636262	ATGTGC------TTTACC-----TGCCGCTGTAGTAGTCTTGCAAACTCAGTCACTGCAAGGTGAATCTCTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	272977	73	+	647215	CTTTGCAGTGGTTCTTCCACTTGTGCCACTGTATTAGTCTTGCAAACTCAGTCGCTGCAAGGTGAATCTCTGT

a
s	mr.mrrefChr5	135702	55	+	294542	ACCCTTTCCAGCCATGAGTACCATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAACTCTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	284639	55	+	636262	GCCCTTTCCAGCCATGAGTACCATTGCTATTATAGGGCTTGCTGCTAACTCTGTA
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a
s	mr.mrrefChr5	135757	68	+	294542	CCTACTTACTCGAACAGAGCTCATTTTGCAACTGTGCTTGATCAACCTAAGTAGCCAGAGTCAGTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	284694	63	+	636262	CTTACATACTTGAACAGAGCTCATTTTGCAGCTGTACTTGATCGACCTAGGTAGCCAGAGCTA-----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	273107	68	+	647215	CCTACTTTCTCGAGCAGAGCTCATTTTGCAACTTTGCTTGATCAACCTAAGTAGCCAGAGTCAGTATG

a
s	mr.mrrefChr5	135825	348	+	294542	CTTTATGCATGACTTGGGGTTGCTATAAAGGAAAATAGTGACAGATTTATTGATTCCATGTCTTGGATAATTGGAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGACGGAAGGCCATGAACATACCTCTCCAGCATTGTTTCTGAACATTTTGGGTGGCCCAGGGCAGTGTAGAATGTGTGATCATATCTTGAGGAAGTGCTTCCATGTTAGTAGAAGAAGATAGCCAATTATTGCCAAAAACATACGGTTCCAGTTCAGGTCCTCTTTTTAAGCAGATGGGGGGTGCCATAAACCATAAGTTATGTCAGAATGACATTAAGGGCCCTAGGTTGACTTTTATTCTCCTCTAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	284757	337	+	636262	----------GACTTGGGGTTGTTATAAAGGAAGATAGTGACAGATTTACTGATTCCAGGTCTTGGCTAATTGAAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGACGGAAGGCCATGAACATACCTCTTCAGCAGTGTTTCTGAACATTTTAGGTGGCCTAGGGCAGTA-AGAATGTGTGATCATATCTTGAGGAAGTGCTTCCATGTTAGTGGAAGAAGATAGCCAATTATTGCCAAAAACATACGGTTCCAGCTCAGGTCCTCTTTTTAAACAGATGGGGGGTGCCATAAACCATAAGTTATGTCAGAATGACAGTAAGGGCCCTAGGTTGACCTTTATTCTCCTCTAGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	273181	339	+	647215	CTTTATGCATGACTTGGGTTCACTATAAAGGAAAATAGTGACAGATTTATTGAGTCCATGTCTTGGAAAATTGGAACCTTATGATTGTGGATGTAAGTGAAAGAAGGCCATGAACATACCTCTCCAGCATTGTCTCTGAACACTTTGGGTGGCCCAGGGCAGTGTAGATCGTGTGATCATATCTTACAGAAGTGCTCCCATGCTAGTAAAAGAAGATAGCTGATTATTGCCACAAACATACAGTTCCTGTTCAGGCCCTTTTTTTAAGCAGATGGGAGTTGCTATAAACCATAAGTTATGTCAGACTGACATTAAGGGCCCTAGGTTGACTTTTGTTCT---------

a
s	mr.mrrefChr5	136173	27	+	294542	AACATTGACTTTTATTCTACTCTAAAG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	273520	24	+	647215	---ATTCACTTTTATTCTACTCTACGG

a
s	mr.mrrefChr5	136200	257	+	294542	AACTTCTTCCAAGTGCCACTGCTATCAGCTAGTGCCTTACCTTGTGATTGCCAGAACATCAGTCTACACTCACAGAATGTCTCCTGTAACCAAATTAACAAAATTAACCTTAACAAAACTAACCTTACTGAAGGTCCTTAGTCTCTTTTATGTGTTTAACATGCAGTTAACAACTTGTTAGCTTACAATTGTTGGACACAATAATATTGCCAGTGTAACCCATTCAAGTCATATAATTTGTTGTCTCATCAGCCAAC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	273549	252	+	647215	AACTTCTTCCTAGTGCCACTGCAATCAGCTAGTGCCTTACTTTGTGACTGCCAGAACATCTGTCT---CTCACACAATGTCTCCTGTAACTAAATTAACAAAATTAACCTTAACAAAATTAACCTTACTGAAGGTCCTTAGTCTGTTTTATGCGTTTAACATGCAATTAACAGCTTGTTA--TTACAATTGTTGGACACAACAATATTGCCAGTGTAACCCATTCAAGTCATATAGTTTGTTGTCTAATCAGCCAAC

a
s	mr.mrrefChr5	136457	4	+	294542	TACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	285364	4	+	636262	TACT
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a
s	mr.mrrefChr5	136461	13	+	294542	AACTGATGTAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	285373	13	+	636262	AACTGATGTAAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	136474	212	+	294542	AATTGACCATTCTAGCTAACTTGATGGTTTCAATCCGGGTAAGGTCATAGGTCAACAGTAGTGGCTACAATGTATCTACTCCTCGTGGTGGGAAATGCAACTGAGAATGTTAGACGCAACCTAGCCCTAGAAATAAATGGATGAATGAACGGGCAATCTAGAAGTTAACGGATGAACAAACGGACGAAATCATCTCACTATCACCAGGGGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	285386	212	+	636262	AATTGACCATTCTGGCTAACTTGATGGTTTCAATCCGGGTAAGGTAATAGGTCTACAGTAGTGGCTACAATGTATCTACTCCTCGTGATGGGAAATGCAGCTGAGAATGTTAGACGCAACCTAGCCCTAGAAATAAGTGGATGAATGAACGGGCAATCTAGAAGTTAACGGATGAACAAACGGACGAAATCATCTCACTATCACCAGGGGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	273832	212	+	647215	AGCTGACCATTCTAGCTAACTTGATGGATTCAATCAGCGTAAGGTCATAGGTCAACAGTACTAGCTACAATGTATCTACTCCTCGTGGTGGGAGATGCAACTGAGAATGTAAGATGCAACCTAGGCCTAAGAATAAATAGATGAGTAAACAGGCACTCTAGTAGTTAGTGGATGAACAAATGGACAAAATCTTCTGATGATGGACAGTGGGA

a
s	mr.mrrefChr5	136686	81	+	294542	CCAACATCCAAGTATCTGGAGTTTGGTAATTATGGAGACTTGCAGGGCCTTTTAGTAGTCTTACATCAAACTATTAGGAAT
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a
s	mr.mrrefChr5	136767	9	+	294542	GTACAGGTA
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a
s	mr.mrrefChr5	136776	43	+	294542	TCCAAAGGATGACAAGAGTAGACCAATACCTTTTAATTGTCCT
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a
s	mr.mrrefChr5	136819	147	+	294542	ATGTCAAACTGTTGGGAATAGTACAGGTACAGTGCGCAGACCCAAAGGATGTCAAGAGTAGACCAATGCAATAGATTGCGTAGTTAGCAACAGGCAGCTTGGGGCTAAGCTGCCCTGATGGATGGAAGGTTGTGTCATCCTGACCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	285734	147	+	636262	ATGTCAAACTGTTGGGAATAGTACAGGTACAGTGCGCAGACCCAAAGGATGTCAAGAGTAGACCAATGCAATAGATTGCGTAGTTAGCAACAGGCAGCTTGGGGCTAAGCTGCCCTGATGGATGGAAGGTTGTGTCATCCTGACCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	274190	147	+	647215	ATGTCAAACTGTTGGGAATAGTACAGGTACAATACACAGATCCAAAGGATAGTAAGAATAGACCAATGCAATAGACCACACAGATAGCAACTGGCAACTTGGGGCTAAGCTGCCCTGATGGATGGACTGTTACAGCAGCCTGACCTT

a
s	mr.mrrefChr5	136966	133	+	294542	GTCTTCTGAATCAGGCAATATATTAATTTTAATAGAAAGATTTTAAGGTCAGGGGCATCTTATCTTTGCCAAAATGAAGGTTAATGATACATTACAATTTTCAAGTTGCTCAGCTGAGAAGGTTAAGACCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	285881	133	+	636262	GTCTTCTGAATCAGGCAATATATTAATTTTAATAGAAAGATTTTAAGGTCAGGGGCATCTTATCTTTGCCAAAATGAAGGTTAATGATACATTACAATTTTCAAGTTGCTCAGCTGAGAAGGTTAAGACCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	274341	133	+	647215	GTCTTCTGAATCAGCCAATATATTAATATTCACAGAAAGATTATAAGGTCAGGAGTATCTTACTTTTGCCAAACTGAAGATTTACTGAACATTACAAGTTACAAGGTGCTCAGCTGAGAAGGCTAAGACGCTT

a
s	mr.mrrefChr5	137099	170	+	294542	CAAGTCCAGCACTTTATTTTGTTTAGGCACTGGACTCTTCATAGCCACTAGAGCCTAAGGGTAAACCAAGTGTACAAACTCCTCCGCTATCAGTATCTTCATCTACAGGTCCAGTCCTTCAATCGTCTTTCCATCAGGACCCTCATTGTGGACACAGGCGCAGATTCCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	286031	170	+	636262	CAAGTCCAGCACTTTATTTTGTTTAGGCACTGGACTCTTCATAGCCACTAGAGCCTAAGGGTAAACCAAGTGTACAAACTCCTCCGCTATCAGTATCTTCATCTACAGGTCCAGTCCTTCAATCGTCTTTCCATCAGGACCCTCATTGTGGACACAGGCGCAGCTGCCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	274474	170	+	647215	CAAGCCTAGCATTTTGTTTCATTTGGGCAGTGGGCTCTTCATAGCCACCTGTGCCTAAGGGTAAACCAAGTGTACAAATTCCTGCTCTATCAGTATCTTCACCTACTGGATCAGTCCTTGAATTTTTTCTCCATCAGGGCCCTCATTGTGGACTCAGGCCCAGAGTCCCC

a
s	mr.mrrefChr5	137269	32	+	294542	TAAATTCCAGATGCTTAAGGATCAGGTCTGTA
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a
s	mr.mrrefChr5	137301	97	+	294542	GATATCTGATGCACAATAATTTTCTATCAACCTAATTTCCTATCCACTGTCTCAATGATCTCTTTAGATCTGGATATGTGAAATCTTAGTTACAAGG
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a
s	mr.mrrefChr5	137398	15	+	294542	CAAAGGGATCACTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	286362	15	+	636262	CAAAGGGATCACTAA
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a
s	mr.mrrefChr5	137413	256	+	294542	TAGGTTACTATCCTCCAAGTGACTGTATGGACTTCAAATAACCAATTAGTTAACGGGTCAAGTGTTCAAAATTTTCAGACTCCAACTGCCATGGCAATTCTGCTGACATACCTCCATGCACATTCAAGGAACTCAAGGCGTCTGATGGCCATACAATTAAATCATGGCTTGGAAAATTCTACTTCCTGCAACTTCAAGAAAGGCCTTGAACCCGATTAATAAGTACCCCACAAACCCACCTTTACTTGCCACTATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	286396	254	+	636262	TAGGTTACTATCCTCCAAGTGACTGTATGGACTTCAAATAACCAATTAGCTAACAGGTCAAGTGTTCAGAATTTTCAGATTCCAACTGCCATGGCAATTCTGCTGGCAAACCTCCATGCACATTCAA--AACTCAAGGCATCTGATCGCCATACATTTGAATCATGGCTTGGAAAATTCTACTTCCTGCAACTTCAAGAAAGGCCTTGAACCCGATTAATAAGTATCCCACAAACCCACCTTTACTTGCCACTATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	274720	224	+	647215	TAGGT--------------------------------ATAACCAATTAGTTAACGGGTCAAATGTTCAAAGTTTACAGACTCCCACTGCCATGCAAATTCCGCTGACATACCTCAATGCACACTGAAGGAACTCAAGGCGTATGATGGCCATACAATTAAATCACGGCATGGAAAATTCTTCTTCCTGCAACAGCAAGAAAGGCCTTGAACCCATTTAGGAAATACCCCACAAACTCGCCTTTACTCACCACTATC

a
s	mr.mrrefChr5	137669	58	+	294542	TTCCCTTACTTGGTTCCCTTACAATCACCCCTATGTAATGCAATCAATCAAAGTGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	286650	58	+	636262	TTCCCTTGCTTGGTTCCCTTACAATCACTCCTATGTAATGCAACCAATCAAAGTGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	274948	56	+	647215	TTCCTTTACTTGGTTCCGTTACAATCACC--TATATAATGCAATCGATCAAGATGTGA

a
s	mr.mrrefChr5	137727	13	+	294542	AGGGACATCACTG
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a
s	mr.mrrefChr5	137740	357	+	294542	TGTCTGAGTTGAGCATTGCAACTTGATAACAATTTCTTACAGTACATACTCTCCTAGACATCAAACATAAGACAAGACTGCCACACACATTCACTATACAGTACCTGTTCTGCTCCCAAAACAAGGGTTATGGTTACCAGAGGTTTTTATAAAAAATTGTCTTCTGAATCTGGAATTTATGCCCTGCTCCACATACCTATTTACTAGATGGTACCAGGCTTCACCAGTAATCCCTGTTGTAGGCTCCCAGTGAAATATCTAGTCTTGGTATTTTATAACTGTCTAATAAGGGATAGTTCAACCCAGAGTCGCAGCTTATTACAGTCATTTCGAGAAGCCATCCACTGGTAAATTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	286724	328	+	636262	TGTTTGAGTTGAGCATTGCAACTTGATA--------------------------TAGACACCAAACACAAGACAAGACTGCCACACACATTCACTATACAGTACCTGTTCTGCTCACAGAACAAGGGTTATGGTTACCAGACATTTTTATAAAAAATTGTCTTCTGGATCTGATATTTATGCCCTGCTCCACATACCTATTTACTAGATGGCACCAGGCTTCACCAGTAATCCCTGTTGTAGG-TCCCAGTGAAATCCCTAGACTTGGTATTTTATAACCGTCTAATAAGGGATAATTTAACCCAGAGTCGCAGCTTATTACAGTCA--TCGAGAAGCAGTTCACAGGCAAATTCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	275017	357	+	647215	TGTCTGAGTTGAGCATTGCAACCTGATAACAATTTCTTACAGTACATACTCTCCTAGACATCAAGCATAAGACCAGACTGCAACACAAGTTCACTAAACAGTACCTGTTCGGCTCCCAAAACAAGGGTGATGGATACTAGAGGTGTCCATAAAAAATTGTCTGCTGAATCTGGAATTTATGCCCTGCTCCACATCCCTATTTACTAGATGGTACCAGGCTTTGCCAGTAATCTCTGTTGTAAGCTCCCACTGAAATATCTAGTCTTGGTATTTTATCACTGTCAAATGAGGGATAGTTCAAACCAGAGTTGCAGCTTAGTACAGTTCTTTTGAGAAGCCACCCACTGGTAAATTGCA

a
s	mr.mrrefChr5	138097	119	+	294542	TAGAATACTAAGCTCACAGACCTGAAGAAGTTCATAGTACTTGGTAGAGATAATAGGCTGCTTCTATAACTAACATATAGCTTACGGTTAGCATACCAAGGGTATTCCTGAGTCCTAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	287053	118	+	636262	TAGAATACTAAGCTCACAGACTTGAAGAAGTTCATAGTACTTGGTAGAGATAATAGGCTGC-TCTGTAACTAGCACATAGCTTACAGTTAGCATACTAAAGGTATTCCTGATTCCTAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	275374	119	+	647215	TAGAATACTAAGCTCACAGACCTGAAGAGGTTAATAGTACTTGGTAGAGATAATGGGCTACTTCTATAACTAACATATAGCTTACGGTTAGCATACCAAGGGTATTCCTGAGTCCCAGT

a
s	mr.mrrefChr5	138216	104	+	294542	AAAGAAGTGGAATATGACATCCAACTGATCTTATCTGTCAAGTGAGATGAGATCACTTGGATGTCATGTTCTACTTCTTTACTAAGACTGAGGGATACCCTTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	287174	104	+	636262	AAAGAAGTGGAATATGACATCCAAGTGATTTTATCTGTCAAGTGAGATGAGATCACTTGGATGTCATGTTCTACTTCTTTACTAAGACTGAGGGATACCCTTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	275493	104	+	647215	AAAGAACTTGAATATGACATTCAACTGATCTTATCTGTCAAGTCAGATGAGATCACTTGGATGTTCTACTCTGCTTCTTTACTGAGACTCAGGAATACCCTTAG

a
s	mr.mrrefChr5	138320	25	+	294542	ATGCTAAGGCTAAAAGCTTATGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	287278	25	+	636262	ATGCTAAGGCTAAAAGCTTATGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	275598	25	+	647215	ATGCTAACTCTAGAAGCTCAACCCA

a
s	mr.mrrefChr5	138345	118	+	294542	CACGCCAACCTCCCTAATGGAGGGGCTTGTGTTATTGTGGTGGCTCTGCACTGACTAAACATGAGCACAACTATGTGCCAGTTATAGAAGCCTATTATCTCTAACAAATGCTATTAAC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	275627	118	+	647215	CGTGCCAAACTCCCAAATGGGGGGGCTTGTGTTATTGTGATGGCTCAGCACTGGCTAAACTTGAGCCCAGCTATGTGCCAGTTACAGAAGCCTCTTTTCTCTACCAAACGCTGTTAAC

a
s	mr.mrrefChr5	138463	14	+	294542	AAGTTTCTACCAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	287441	14	+	636262	AAGTTTCTACCAGG
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a
s	mr.mrrefChr5	138477	60	+	294542	CGCGTCCCACAGCAACATGAGTATTATACCCAACATCTATCTGGGTGAGTTATGGTTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	287462	60	+	636262	CGCGTCCCACAGCAACATGAGTATTATACCCAACATCTATCTGGGTGAGTTATGGTTAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	275759	60	+	647215	CATGTTCCACAGCTATATGAGTATTACACACGACGCTTATTGGGGTGAGTTATGATAAAG

a
s	mr.mrrefChr5	138537	69	+	294542	AAGGATTTGGAGTGTAAGTTTTCAGCAACACAGACGACGTAGGCCTATTTCACTCATAATCAAGCAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	287522	69	+	636262	AAGGATTTGGAGTGTAAGTTTTCAGCAACACAGACGACGTAGGCCTATTTCACTCATAATCAAGCAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	275821	69	+	647215	AAGCATTTGGAGTCTAGGTCTTCAGCAACACAGGAGATGTAGGCTTATTTCACTTGTAATCAAGCAGTA

a
s	mr.mrrefChr5	138606	28	+	294542	ATAATGTAGGTCGAAATCATTAGGACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	287591	28	+	636262	ATAATGTAGGTCGAAATCATTAGGACAC
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a
s	mr.mrrefChr5	138634	66	+	294542	AAAATAGTCATATATATTTAGTACCATGAAAATATCCCCATGATGATGACCAAGCTTGTTTTTTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	287621	66	+	636262	AAAATAGTCATATATATTTAGTACCATGAAAATATCCCCATGATGATGACCAAGCTTGTTTTTTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	276015	66	+	647215	AAGATAGTTATACATATCTAGTACAATGAAAGTATCACCATGATGGTGACCGAGCCTGGTTTTTAT

a
s	mr.mrrefChr5	138700	124	+	294542	CTTGTGGGGAGAATAATTAGCACATACTTGTGGACAATTAAGGTATGCCCTACCCATTATCGCATATTTTCTGGCTGGGGGATGGAGACTCTACTCATCTTATTCATCCTCTCTGTGACTCCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	287692	124	+	636262	CTTGTGGGGAGAATAATTAGCACATACTTGTGGACAATTAAGGTATGCCCTACCCATTATCGCATATTTTCTGGCTTGGGGTTGAAGACACTACTCATCTTATTCAACCTCTCTGTGACTCCCT
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a
s	mr.mrrefChr5	138824	430	+	294542	CCTTCATGATAGTTCCCATTACCTAACAGCTTTGCAGCATAGTAAGTTTAAAACTTTCATGCTCTTTACCACCTCTACTAGCTCCATCCAGCATATTTTGAGGGCAGCAGATCATGGAGGGACAAGTACATTAGGTGATCAAGTGGTGACTTCAAACAAGATCAGTTGGGTTGGAAATTTTCTGAGGGCAAGGTGCTTCTGTCATCTGCATCCTAGTCCCTTGGCCCCACATGTGAGTAAGGTGCCCACAATCATCTGATCTAGGAGTCTGTCTTCTGGATCTGAAGAGGATAGCCTAAAGTATATCATAGAGAAAGGGTCACTGTGGAGGGGAAATGTAAGCACTTCTGGTTGCTGCAGATGGTGTGCATAGGAACAGCAAACTTCAATAATGCTCTTGCTTTTTCCTTGTCATCTATAAAGAAGATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	287816	430	+	636262	CCTTCATGATAGTTCCCATTACCTGACAGCTTTGCAGCATAGCAAGTTTAAAACATTCATGCTCTTTACCACCTCTACTAGCTCCATCCAGCATATTTTGAGAGCAGCAGATCATGGAGGGACAAGCTCATTAGGTGATCAAGCGGTGACTTCAAACAAGATCAGTTGGGTTGGAAATTCTCTGAAGGCAAGGTGCTTCTGTCATCTGCACCCTAGTCCCTTGGCCCCACATGTGAGTAGGGTGCCCACAATCATCTGATCTAGGAGTCTGTCTTTTGGATCTGAAGAGGTTAGCCTAAAGTATATCATAGAGAAAGGGTCACTGTGGAGGGGAAATGTAAGCACTTGTGGTTGCTGAAGATGATGTGGATAGGAACAGCAAACTTCAATAATGCCCCTACTTTTTCTTTGCCATCTATAAAGAAGATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	276206	428	+	647215	CCTTCATGATAGTTCCCACTACCCAACAGCTTTGCAGCATAGTAAGTCTAAAACTTTCATTCTCTTAACCACCTCTACTAGCTCCATCCAGCATATTTTGAGGGC--CAGATCATGGAGGGATAAGTACATTAGGTGATCAAGTGGTGACTTCAAACAAGATCTGCTGGGTTGGAAAGTTTCTGAGGGCATGGTGCTTCTGTCATCTGCATCATGCTCCCTTGGCCCCATGTATGAGTAAGGTGCCCACAATTATCTGATCTAGGAGTCTGTCTTCTGGATCTGAAAAAGATAGCCTACAGTATATCATAGAGAAACGGTCAATATGGAGGGGAAATATAAGCACTTCTGGTGGCTGCAGATGGTGTGCATAGGAACAGCAAACTTCAATAAAGCTCTTGCTTTTTCCTTGTCATCTAAAAAGAAGATAC

a
s	mr.mrrefChr5	139254	104	+	294542	AGAGACATTTTATGTAGTTAAGGTAAGGCATGTCAGAGCCCCTTTGAAGGAATATCCTCTGCGATTTATTTTCACTTGTAGACCACCCATGTTTAACTATCACT
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a
s	mr.mrrefChr5	139358	22	+	294542	AAAGTGGGCCTTGTTACCAAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	139380	98	+	294542	ATTCCAGCCTCGGAATTCTGGAGTTAAAACCTGGCTAGGGTTCATCAACCAATGAAGTACCCAATCTAGGTCCTTTGCTACAATAGTACTCTAGGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	288543	15	+	636262	ATTCCAGCATCATAA-----------------------------------------------------------------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	277062	97	+	647215	-TTACAGCCTGGGAATTCTGGAGTTAAAACCTGGCTAGGGTTCATCAACCAATGAAGTACCCAATCTAGGTCCTTTGCTACAATAGTACTCTAGGATG

a
s	mr.mrrefChr5	139478	186	+	294542	TGGTTTAAGTGGCTGTTGGCATTTCCTCCAATCAACTAATATATTGAGTACTATGTGTTGTCAAGCGTGTCATAGTGCCGGGCCTTTCTGATTAATGCGATTCTCTTGACAAGAATACAAAGAAGTCTGAATCCTGAATACCAGGTGCTTGGTGACTATCAGATTTTAGCTGCCACAATTACAGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	288558	163	+	636262	-------------------CGTTTCCCCCAATCAA--AATATGTTGTGTACTATGTGTTGTCAAGCGTGTCATAGTGCCGG-CCTTTCTGATTAATGCGATCCTCTTGACAAGAATACAAAGAAGTCTGAATCCTGA-TACCAGGTGCTTGGTGACTATCAGATTTTAGCTGTCATGATTACAGGG
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a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	277363	358	+	647215	GAGTGGAAACAGACAGGAGATCTATAATGGACATGGGGGGTCTCCTTGACATCATGTCAAGTCGGGGTGAGGAAAAGTGATGAACTAAGAGCCTATTGTAGTGAGTTTTTTCACAGACCCTGATACTTGTTCGGTATTCCGAGAGAGTAGCAAAGTGAATGGTTCAAACGCTGTAGAAGGTTCAAAACCATGGAGAGTGTCACTTTACAAACATGGCCCAAGTTATTCTGACATCTCAGTACACACCTACATTTGGTTCATTATGTTTTATTGGGGAACCCTTTCAAGGTAGTCTCAGGACCAGGGAAACAAATCAAGGAATGTGCTCTAATCACACCTCAACGCGCTGCCACATCTA

a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	277721	405	+	647215	ATATTCAATGAATCCCAGCTGGAAAGGTGATACCTGAAAAGACCCCTCATGCTTTAGATCACAGATGAACTCTCTATCAATCTAAGTCCATTTTCTAATCAAAGAAGATTTGTAGTCACAGAAGTGAGCATAGAATTGCTACTGTGCCCTCGTAAGTTGGTCTGGACCCTTAGATTCCTGTTTCAACACATAGCATCTATCAAGTGTCTCAACACAATTTGCCTCCATCAAATTCATCTACTAGGCAACAACACTCTGGAGGCCAAGACTAGTCTTTGAACTCACCAACCCCAGGGAGCATCCTACATTTTCGCTGTCTTATGGCACTTGAGTTGAGAGCTGGACAATAGCCACAGAATTTAGCTAGCATGCTCCATTAAGTTGAGAATGAGTTTAAAGTAGTCT

a
s	mr.mrrefChr5	140427	104	+	294542	TATCTGTATAATTTGGTTAGATAGAATGGAGTAGGAAGTGTGTCAGATAAGTAACATTGCCAGTTGTGTATATAAAATTCTGTCAAATAGGGTAGGCTCATTCA
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a
s	mr.mrrefChr5	140531	252	+	294542	ATAATTGAATTTCTGTTCCTGATTTGCAAGAGAGGAAGTTTAATATCATCCCATACACTGTTAGGAATCTCCCTAATAGGAGGATGCTGTACCTTTATTGATTGATGTCATCCATGCTTTCTTTGCTTTTAGCTTGTATCCTTGTTGAAAATTGCTGATTGTTTATAGAACTCTCCTTTATCAAGTCACCAGTGGCCACCAGAAGTTAACAGGTAAGCTATGAGTGTCTGATTTTAGTACCATACCCCTCCT
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a
s	mr.mrrefChr5	140783	163	+	294542	TTTATCTCTTCGTTGTGTGAGGAAGATCTGACCCCAATACTAATATAGCAAAAAGGATATTGGACAGCTATATAATGATCTGGTTCTGTTTAATGGAGCACACTTTTAGTATGCACACAAGTGGAATTAGGGTTTATCAGATGATGCTAGGCCAACACTGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	289933	162	+	636262	TTTTTCTCTTTGTTGTGCAAGGAAGATCGGACCCCAATACTAATATAGCAGAAAGGATATTGGAAAGCAATATAATGATCTGGTCCTGCGTAATGGAGCACACTCTTAGTATGCACACAAGTGGAATTAGGG-TTATTAGATGATGCCAGGCCAACACTGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	278482	156	+	647215	TTTATCTCTTCATTGTGTGAGGAAGATTT-------AGACTAATATAGCCAAAAAGATATTGGACGGCTACATATTGGTCTGGTTTTGTTTAATGGGGCACACTTTTAGTATACACACAAGTGGAATTAGGGTTTATCAGATGATGCTATGCCAGTACTCAGG

a
s	mr.mrrefChr5	140946	199	+	294542	TAAATTCTTCCCAATACCCAATTCATAAAGGTCACCCCCATATAATGCTCTTCCCTTGCCTCGGTGGGCTAATTGCACAAAGATATAGAATCATCTAGATTTCTCAGCTTTAAGTTTACTCAACCATCTGGACATTCACACTTAACAGCAAACTCATAGGTAATCCCCAGTCTCATTTAGATGCTTTAACTGATGAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	290095	190	+	636262	TAAATTCTTCCCAA---------CATAAAGGTCACCCCCATATGATGCTCTTCCCTTGCTTGGGTGGGCTAATTGCACAAAGATATAGAATCATCTAGATTTCTCAGCTTTAAGTTTACTCAACCATCTGGACATTCACACTTAACAGCAAACTCATAGGTAATCCCCAGTCTCATTTAGATGCTTTAACTGATGAGTA
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	141170	20	+	294542	TCGGGTATGCATATTATTCA
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a
s	mr.mrrefChr5	141190	96	+	294542	ACTTAAAGGTGGTATTGTTCTTGGGCTGAGGTGTTTATGCAGTTGCCCTTGCGTATGGATAAGTAAACCAATTTCTAAAGAGAGGAAGTTTGCCAT
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a
s	mr.mrrefChr5	141286	11	+	294542	CTCTTCTGTAC
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a
s	mr.mrrefChr5	141297	6	+	294542	AAGCAC
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a
s	mr.mrrefChr5	141303	34	+	294542	AATAGAGAAATCAGGTTAATCCCTTGTTAAACCC
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	141345	24	+	294542	TGCCCTAAATTTACTATCTTCACA
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a
s	mr.mrrefChr5	141369	14	+	294542	TGTCCCATTAGTTA
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	141399	35	+	294542	ACTGATGGATTGTCTATTAAATGATGCCCATCCTG
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	141486	4	+	294542	TCAA
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	141528	45	+	294542	TGGGCTAGATATTCTGGATTCAGTGGTTTTACCAAAGATTTAACC
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a
s	mr.mrrefChr5	141573	101	+	294542	AAATTAGTCTTTGCTTTTTCGATTTATAGTACTAGACCATTTGGCTAACCTGACATGAGGTAGACATCCTTATATAGGGTCAACCCAGGTGTGCATGGGGG
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a
s	mr.mrrefChr5	141674	7	+	294542	CAGAGTA
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a
s	mr.mrrefChr5	141681	57	+	294542	TTCTCCTCAGATTTTAGCATCTTCCACAAAGCTTGCATTTTATTAATTTCATGCTGT
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a
s	mr.mrrefChr5	141738	620	+	294542	TTAACTACAGCTATGTCTAGGAGAATGTGTAAATACCTATCCTCGTGGTTTGGGCAATCTCTGCAACATGACCCAATTGGCTTTGCTGTGGCTGTTTATGGGCATTAGTTGAATAGGTCTAACTAGACACACCCAAATGGACCTGAGTATGATCTGAGGGCTGGGGTTGATTTCGCATGTCCGCATATGCCGTGTCAAATTGCACCTTCATCTTTGGTTTTTTAATTTATTATGGACCCATTATTCCGCCTTGAGTCTTAAAATGCTAAAATGGAGTGTACTTAGCTTTGTGACTGATTTGTGATGGCTCCTGTGGTTTTTTAAAATTATAAAGGAAGGCATCATTGTAACAACATGCCATGGCCTTAGAATAAGGATCCCGCTGGTTAACAAAAATGAACCCAGACCCTCTTTTTCTGCTCAAATGAAAAAATTAGCATTAGAAGAGGATCACATAAGCAAGCATCTGATTGAGTCTAATTTTTTTCATTTGCTTTGCATATCCTCTCTTTTCTATGGTTTGCATCACCTTGGGGAATTTTTGTTAACTCAGGGCCTCATTAATATATGATACTCAGGACATCCTATGCTTCTGCCATATTATGCCCTAATCTGCTTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	290907	594	+	636262	-----------------TGGGAGAATGTGTAAGTACCTATCCTTGTGGTTTGGGCAATCCCTGCAACACGACCCAATTGGCTTTGCTGTGGCTGGTTATAGGCATGACTTGAATAGGTCTAACCAGACACGCCCAAATGGACCTGAGTATGATCTGAGGGCTTGGGTTGATTTCGCATGTCCGCACATGCCGTGTCAAATTGCCTCTTCATCTTTGGTTTTTTAATTCATTATGGACCCATTATTCCGCCTTGAGTCTTAAAATGCTAAAATGGAGTGTAATTAGCTTTGTGACAGATTTGTGATGGCTCCAGTGGTTTTTTAAAATTATAAAGCAAGGCATCATTGTAACAACATGCCATGGCCTTAGGATGAAGATCCCGCTGGTTATCAA--------TCAGATCCTCTTTTGCTGCTCAAATGAAAAAATTAGCAACAGCAGAGGATCACATAAGCAAGCATCTGATTGAGTCTAAT-TTTTTCATTTGCTTTGCATATCCTCTCTACTCTATGGTTTGCATCACCTTGGGGAATTTTTGTTAACTCAGGGCCTCATTAATATATGATACTCAGGACATCCTATGTTTCTGCCATATTATGCCCTAATCTGCTTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	279566	619	+	647215	TTAACTACAGCTATGTCTAGGAGAATGTGTAAATACCTATTCTCATGGTTTGGGCAATCTCTGCAACATGACCCAATCGGCTTTGCTGTGGCTGTTGATGGGCATTAGTTGAATAGGTCTAATTAGACACACCAAAATGGACCTGAATTTGT-CTGAGGGCTGGGGTTGATTTCGTATGTCCACATATGCTGTGCCAAATTGCACCTTCATCTTTGGTTTTTTAATTTATTATGGACCCATTATTCGACCTTGAGTCTTAAAATACTACAATGGAGTGTACTGAGCTTTGTGACTGATTTGTGATGGCTCCTGTGATTTTTTAAAATTATAAAGGCAGGCATCATTGCAACAACATGCGTGGGCCTTAGAATAAGGTTTGCCCTGGTTAACAAAAATGAACCCAGACCCTCTTTTTCTGCTCAAATGAAAAAATTAGCATTAGAGGAGGATCACATAAGCAAGCATTTGATTGAGTCTAATTTTTTTCATTTGCTTTGCGTATCCTCTCTTTTCTATGGTTTGCATTGACTTGGGAAATTTTTGTTAACTCAGGGCCTCATTAATATATAATACTAAGGACATCCAATGCTCTAACCATATTATGCCCTAATCTGATTAC

a
s	mr.mrrefChr5	142358	8	+	294542	CATTATTG
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a
s	mr.mrrefChr5	142366	236	+	294542	ACCGTCCTTTCTGTTGAAGAGTGTTTTCCATCTGAATATCATTCTTGTTCTGACTTGATGTCGTTACATCTTCTCAGACTCCACGAGGGCAATGCTAGAATTGAACATCTCAGGTCCACAAAAGAAGTTGCAACCATCCTTTGTCTCACCTTCAACCCATTTGTGAGGTAGTGTTCTTGCCTGCCTAATATTCTAGGTTAAATACTCTCCTGGTATGTCAGTGAGGGAGATGGCAG
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	148605	71	+	294542	AGTCACCCAAGTCACCTAGGTCTATGATGCACCCTTGCACACATACCACAAGACGGCCAAAGATAGAAATA
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a
s	mr.mrrefChr5	148676	18	+	294542	CTAAGCAAGAGGCATGAA
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a
s	mr.mrrefChr5	148694	97	+	294542	CAAAACTGCTACAAAGGCAAAGATGTCCATGCCTCAGAGCTAAAACAGCATACATTTCCCTTCTTTATTTCAATAAGTTGATATCTCCTCAACTAAC
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a
s	mr.mrrefChr5	148791	18	+	294542	CAGGAGGTCCTTATGGCT
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s	mr.mrrefChr5	148809	56	+	294542	ACACATAAAGAGCCAGCTCATACTTCAGAACTTGGAGTGAAATGCATACTCATTTA
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a
s	mr.mrrefChr5	148865	61	+	294542	AGCATTCTGGGGGGCTTGACCTCAAAAAATGAACACACTAAGTCCATTTTAAGCCTCATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298231	61	+	636262	AGCATTCTGGGGGGCTTGACCTCAAAAAATGAACACACTAAGTCCATTTTAAGCCTCATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289067	61	+	647215	GGCATTGCAGGGGGCTTAAGCTTAAAAAATGAACACATTAAGTCCATCCTAAGCCCCATAG

a
s	mr.mrrefChr5	148926	69	+	294542	GAATGCATTAAGTCCATTTCCAACCTCATACCATGAGTGTAAAAAAGACTAGTTAGTGGTTCTGTGCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298292	69	+	636262	GAATGCATTAAGTCCATTTCCAACCTCATACCATGAGTGTAAAAAAGACTAGTTAGTGGTTCTGTGCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289165	69	+	647215	GAATGCATTAATTCCATTGCAAACCTCATAGGATAAGAGTAAAAAAGGCCAGTTTGGGGTCCTGTGCTG

a
s	mr.mrrefChr5	148995	20	+	294542	CCTTTCATGTGTGGTAACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298361	20	+	636262	CCTTTCATGTGTGGTAACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289235	20	+	647215	CCCTTCATGTGTGGTATCTT

a
s	mr.mrrefChr5	149015	27	+	294542	TGTCCTCTCAGGTCAACTGGGGATTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298397	27	+	636262	TGTCCTCTCAGGTCAACTGGGGATTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289255	27	+	647215	TGTATGCTTAGGTCAACTGGGGATTAG

a
s	mr.mrrefChr5	149042	10	+	294542	AAAATAGTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298424	10	+	636262	AAAATAGTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289286	10	+	647215	AAAACAGTCT

a
s	mr.mrrefChr5	149052	53	+	294542	ATTTGCACACGAAAGACTTAGAGGAGAGGCTGACACTTAAAAACATTTTGAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298434	44	+	636262	ATTTGCACACGAAAGACTTAGAGGAGAGGCTGACACTTAAAAAC---------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289300	53	+	647215	ATTTGCACATGAAAGACTTAGAGGAGAGGCTGACACTTAAAAACATTTTGAGG

a
s	mr.mrrefChr5	149105	52	+	294542	AGCTACATTACTCTATTCATGGCCTAGGGCAATTTAAGGAAAGGGTGAACTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298478	39	+	636262	-----CATTACTCTGTTCATGG--------AATTAAAGGAGAGGGCGTACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289354	52	+	647215	AGCTACATTACTCTATTCATGGCCTAGGGCAAATTAAGGAAAGGGTGAACTG

a
s	mr.mrrefChr5	149157	197	+	294542	AGACATGAGACATGCATCGCCACCTAATTATCTCATAAGGCAACATAAAATAGTTAAGAGTATGATGTGTGGTGATGGCATAAGGCTGCACTTTGAGAAAATCTAAAAACAGAGAGTTACCTCTAGCCACAGCAATGTGCTCGCACAAGCAGTCTAACAGCACAGCGATGGGCTTGTTCAAAGCATGGAATAAGATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298517	193	+	636262	AGACATGAGACATGCATCGCCACCTGATTATCTCATAAGGCAACATAAAGTAGTTAAGAGTATT---TGTGGTGATGGCATAAGGATGCACTTTGAGAAAATCTAGAAACAGAGGGA-ACCTCTAGCCACGGCAATGTGCTCGCACAAGCAGTCTAACAGCACAGCAATGGGCTTGTTGAAAGCATGGAATAAGATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289409	197	+	647215	AAATATGAGACATGCATCACCACCCAATTATCTCATAAGGCAACATAAAAAAGTTAAGAGTATGATGTGTGGTGATGACATAAGGCTTCACTTTGAGATAATGTTAAAACAGAGAGTTACCATTAGCCACAGCAATGCGCTTACACAAGCAGTCTAACACCACAGCGATGGGCTTGTACAAAGCATGGAATACCATA

a
s	mr.mrrefChr5	149354	68	+	294542	GTGTGAACTTGCCATAAGTAGGGTTTTCACTGACGAACAACTCATCAGTAGCTGAATAATACCCCTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298722	64	+	636262	GTGTGAACTTGCAATAGGTAGGGTTTTCACTGAC----AACTCATCAGTAGCTGAATAATCCCCCTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289606	63	+	647215	-----CACTTGCCATAAGAAAGGTTTTTACTAACGAACAACTCATCAGTAGCTGAATAATACCCCTAA

a
s	mr.mrrefChr5	149422	78	+	294542	TAGGGGGTGCACACTAAAGGAACAACGCAACATATCCCTACCTTGTGAGCCTGAGCTCACCGTCCGCATTGTAAGTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298786	78	+	636262	TAGGGGGTGCACACTAAAGGAACAACGCAACATATCCCTACCTTGTAAGCCTGAAGTCACCGTCCGCATTGTGAGTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289676	78	+	647215	TAGGAGGTGCATGCTAAAGGAACAACACGACATATCCCTACCTTAAGAGCCTGAGCGCGCCTTCTGCATTGTAGGTCT

a
s	mr.mrrefChr5	149500	22	+	294542	TGTCACTTTGGGAAAGCAAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298865	18	+	636262	TCTCACTTTGGAAAAGCA----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289754	22	+	647215	TGTCACTTTAGGAAAGAAAAGA

a
s	mr.mrrefChr5	149522	36	+	294542	GAATGGTGGTGGATCATTAGAAATACCAGTTTGGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298883	36	+	636262	GAATGGTGGTGGATCATTAGAAATACCAGTTTGGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289777	36	+	647215	GGATGGTAGTGGATCATTAAAAATAACAGTTTGGGT

a
s	mr.mrrefChr5	149558	8	+	294542	GAGGTCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298942	8	+	636262	GAGGTCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289813	8	+	647215	GAAATCTA

a
s	mr.mrrefChr5	149566	138	+	294542	CTGCCCTACAGCTCAATCCAGGATTAAGTGGTGTAGCGAAAAATGGTAAAAAATACTATGGTCCCATAGCATAGTAGATGTCTGCTTGCTACACCAGCAAGTCCTAGGTCTTGGGATTAGGTACTCCAACTGCCGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	298950	138	+	636262	CTGCCCTACAGCTCAATCCAGGATCAAGTGGTGTAGCGAAAATCGGTAAAAAATACTATGGTCCCATAGCATTGAAGATGTCTGCTTGCTACAGCAGCAAGTCCTAGGTCTTGGGGTTAGGTACTCCAACTGCCAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289822	138	+	647215	CTGCTGTGTAGCTCAATCCAGGATTAAGTGGTGTATCGAAAAATGGTGAAAAAAACTATGGTCCCATAGCATAGTGGATGTCTGCTTGCTACACCAACAAGTCCTAGGTCTTGGGATCAGGTACTCCAACTGCCGACT

a
s	mr.mrrefChr5	149704	258	+	294542	GGCCTGGAGCCTGTGTGGCAGGTTAGATCTAAAGTGGTACATAACAGCCCCCTGATCAAATCTGTATCTTGTGATGGAGGTTTTCATGCCCAAAGATATAAGGACTAAGACACCATCTATATCAGTACTGACAATCACATTCCATGCATTTCATTTTCACTAGACCTACAGTCAACTGTATCACATGACACAGGACAGGCCACAGCCCATTCTGAGGCATTCAGAGCTTTAGTGAAGAAGTAGCTGAAGTCCACTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	299088	254	+	636262	GGCCTGGAGGCTGTGTGGCAGGTTAGATCTAAAGTGGTATGTAACAGCCCCTTGATCAAATCTGTATCTTGTGATGGAGGTCTTCATGCCCAAAGATATAAGGGCTGAGACACCATCTACATCAGTACTGACAATCACATTCCATGCATCTCATTTTCACCAGATCTACAGTCAACTGT----CATTACATGGGACAGGCCACAGCCCATTCTGAGGCATTCAGAGCTTTAGTGGAGAAGTAGCCGAAGTCCACTAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	289965	258	+	647215	GGCCTGGAGCCTGTGTGGCAGGTTAAATCTAAAATGGTACATAACAGCCTCCTGATCAAGTCTGTATCTTGTGATGGAGGTTCTCATGCCCAAAGATATAAGGACTAAGACACCATCTATATCAGTACTGACAAGCACATTCCATGCATTTCATTTTCACTAGACCTGCAGTTGACTGAATCACATGACACAGGACAGGCCATAGTGCATTCTGAGGCATTCAGAGCTTTAGTGAAGAAGTAGTTGAAGTTCACTAGA

a
s	mr.mrrefChr5	149962	114	+	294542	GCAGGTTGAAAACAGAGATCAATTCTATGAGTCCTGTCAAAGTGGTTGTAATTATGTTAGGCACATAGCAAGATGGCTGTACAGTTGGGATAATAATTCCTCCTTTGATACAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	299345	114	+	636262	GCAGGTTGAAAACAGAGATCAATTCTATGAGTCCTGTCAAAGTGGTAGAAATTATGTTAGGCACATAGCAAGATGGCTGTACAGTTGGGATAATAACTCCTCCTTTGATACACG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	290223	112	+	647215	GCGGGTTGAAAACAGAGATCAATTCTAAGAGTCCTGTCAACGTGGTTGTAGTTATGTTAGGCACATAGT--GATGGCTGTACAGTTGGGACAATAATTCCTCCTGTGATACAGG

a
s	mr.mrrefChr5	150076	100	+	294542	CCCATCCAGAAATAGCAAATAATTCACAATCGTATTCCCCTCATGAAGTACATTTACTACATCAAATGTTTGTAGTCCCCATACTTCATGGAGCGGTTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	299459	100	+	636262	CCCATCCAGAAATAGCAAATAATTCACAAACGTCTTCCCCTCATGAAGTACATTTACTACATCAAATGTTTGTAGTCCCCCTACTTCATGGAGTGGTTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	290397	100	+	647215	CTCATCCAGAAATATGAAATAACTCACCATTTTATTTGCTTCATGAAGTACATTTACTACATTAAATGTTTGCGATCCCCAAACTTCATGGAGCGGGCCA

a
s	mr.mrrefChr5	150176	90	+	294542	GGTGGCAATTCTTCAGTGTAACATGAAGGAGGGCTGCATTTTACTGCCATTCAAATATCTTCCCAAGATGTATGTCAATTCTTACCTTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	299562	76	+	636262	GGTTGCAATTCTTCAGTGTAACATGAAGGAGGGCTGCATTTTACTGCCATTTAAATATCTTCCCAAGATATATGTC--------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	290497	90	+	647215	GGTGGCAATTATGCTGTCGAATATGAAGGAGGGCTGCCTTTTACTGCCATTCAAATATCTTCCCAAGATGTATGTCAATTCTTACCTTAT

a
s	mr.mrrefChr5	150266	166	+	294542	CACTGACTCTTGTCTTAATATTTCTTACATGACTTTGTATAAAATCATTCATAGTCAGAATACAAAACCCCCGTCTGCAAGATGCACAGTCTGCAGATGATAGTCTCACTCGACTAGTAGTCTATGTCCCCTGACACATCTTTAGTTGTTAATTTAAATCACCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	299638	166	+	636262	CACTGACTCTTGTCTTAATCTTTCTTATACGACTTTCTATAGAATCATTCATAGTCAGAATACAAAACCCCTGTCTGCAAGATGCACAGTCTGCGGATGATAGTCTCACTTGACTACTGGCCTATGTCCCCTGACACATCTTTAGTTGTTAATTTAAATCCCCATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	290589	166	+	647215	CACTAACTCTTGTCTTAATATTTCTTACATGACTTTGTATAAAATCATTCATAGTCATAATCCAAAATCCCCATCTGCAAGATGCACACTCCACAGATAGTAGTCTCACTCAATTAGTAGTGTATGTCCCCTAACAAACCTTTAGTTGTTAAGATAAACCACCATC

a
s	mr.mrrefChr5	150432	59	+	294542	GACAATTGAGTTTAACCTGGTTATCACCATAATCAGATTGGGTTACACATCAGCCTGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	299804	38	+	636262	GACAATTG---------------------TAATCAGATTGGGTTACACATCAGCCTGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	290762	59	+	647215	CACACTTGAGTTTAACCTGGTTATCACCACAATCAGATTGGGTTACAGATCAGTCTTCC

a
s	mr.mrrefChr5	150491	15	+	294542	AGAACACTCCTTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	299850	15	+	636262	AGAACACTCCTTCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	290821	15	+	647215	AGTACGCTCCTTCTA

a
s	mr.mrrefChr5	150506	116	+	294542	GCAAGTTGCTTGTTTAGTCCCCACAGCTGTGGATGCCACAACAATTTGAAATACAAGCTGTCTGCTTGTGAACCAGCACACATGGCAAGGGACCAATTTCAGAGCTCACATAGGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	299866	116	+	636262	GCAAGTTGCTTGTTTAGTCCCCACAGCTGTGGATGCCACAACAATTTGAAATACAAGCTGTCTGCTTGTGAACCAGCACACATGGCAAGGGACCAATTTCAGAGCTCACATAGGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	290836	116	+	647215	GCGAGTTGCTTGTTTAGTCCCCACAGCCATGGATACTACAACAATTCAAAATCCTAGCTGTCTGCTCGAGAACCAGCACACATGACATGGAACCAATTTCAGAGTTCATATAGGCC

a
s	mr.mrrefChr5	150622	13	+	294542	GGTTACCAAGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	299982	13	+	636262	GGTTACCAAGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	290987	13	+	647215	TGTTACCAAGAGT

a
s	mr.mrrefChr5	150635	76	+	294542	TGGGATAAGGGGATTCGTCATTCTTCGTGATTACAACCAAGGTTCAATATATCTTCAGATGGATGATCTACATCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	299995	76	+	636262	TGGGATAAGGGGATTCGTCATTCTTCGTGATTACAACCAAGGTTCAATATATCTTCAGATGGATGATCTACATCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291036	76	+	647215	TGGCATAAGGGGGTTTGTCATTTGTCATGATTATTACCAAGGTTCATTATATCTTGAGATGGATGATCTACGGCTT

a
s	mr.mrrefChr5	150711	91	+	294542	TTTGAGTACCAGGGTTGTTGAGTACCAAGGGTCCAGTATTTACTTACTTGGCTAATAGGAGCCCAATACTCCTGAATGTGGGGGATGAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300071	91	+	636262	TTTGAGTACCAGGGTTGTTGAGTACCAAGGGTCCAGTATTTACTTACTTGGCTAATAGGAGCCCAATACTCCTGAATGTGGGGGATGAGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291116	91	+	647215	TTTGAGTACCAGGGTTTTTGAGTACTAGGGGCTCAGTATTTGTTTACTTGGCTCATAGGGACCCAGTACTGCTTAATGTGGGGGATGTGAC

a
s	mr.mrrefChr5	150802	82	+	294542	TATTTTTAGAACTTGTGGAAAGGACCCTTGGGTGTGGGTGTATACCATAATCTCTAGCAGGTACCTGGATCTTGGTTACCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300162	82	+	636262	TATTTTTAGAACTTGTGGAAAGGACCCTTGGGTGTGGGTGTATACCATAATCTCTAGCAGGTACCTGGATCTTGGTTACCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291210	82	+	647215	TATTTTTGAAACTTGTGGAAAGTACCCTTGGGTGTGGGTGTATTCTATAATCTTTAGTTCATACATGGATCTAGGTTACCCT

a
s	mr.mrrefChr5	150884	45	+	294542	TTGAATTGACTTTTGTAGATTTACGCCGGTATACTCCAAGTAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300244	45	+	636262	TTGAATTGACTTTTGTAGATTTACGCCGGTATACTCCAAGTAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291326	45	+	647215	TCGAATTGACTGTCATAGATTTGTGCCAGTACACTTTGAGAAAAG

a
s	mr.mrrefChr5	150929	52	+	294542	AGGTGATATAGGATAGGTGACTCTTCTGCCACTTCACAGTTCAATACCCTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300290	52	+	636262	AGGTGATATAGGATAGGTGACTCTTCTGCCACTTCACAGTTCAATACCCTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291371	52	+	647215	AGGTGATACAGGATAGTTGACTCTTCTGCCACTTCACAGTTCACTACCCCCC

a
s	mr.mrrefChr5	150981	62	+	294542	CACCATCCACATGTCCAATATTTCAAGGCCTTTGCGTAGGACTTTGAACATAGTCAATGTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300345	62	+	636262	CACCATCCACATGTCCAATATTTCAAGGCCTTTGCGTAGGACTTTGAACATAGTCAATGTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291423	62	+	647215	CACCATCCACATGTCCAATATTCCAAGCTTTTTGTGTAGGACTTTGCACATAGTCAATGCCA

a
s	mr.mrrefChr5	151043	10	+	294542	TAACCTGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300408	10	+	636262	TAACCTGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291485	10	+	647215	TAACCTGAGT

a
s	mr.mrrefChr5	151053	130	+	294542	TCCTTGACACTGAATAATTAATTTCATGCTGAGAGCAAATTACAACTACAATTAATGGTAAGTTTCCAAGAAATACTATTGTTCGAACAGCTATAAGTTTATTAAATGTTTTTCCTTTCAAACTAGATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300419	130	+	636262	TCCTTGACACTGAATAATTAATTTCATGCTGAGAGCAAATTACAACTACAATTAATGGTAAGTTTCCAAGAAATACTATTGTTCGAACAGCTATAAGTTTATTAAATGTTTTTCCTTTCAAACTAGATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291495	130	+	647215	TTCTTGACACTGAATCATTAATTTCATGCTGAGGGCAAAATATAACTACAATTAATGGTAAGTTTCCAAGAAATACTATTGTATGGATAGCTATAAATCTGCTAATTGTGCTTCCTTTAAAACTAGATAT

a
s	mr.mrrefChr5	151183	27	+	294542	GAATTCATGTGCCATAGGCTTCTCACG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300549	27	+	636262	GAATTCATGTGCCATAGGCTTCTCACG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291629	27	+	647215	GAATTTATGTGACATAGGTGTCTCACA

a
s	mr.mrrefChr5	151210	82	+	294542	AGTGCCCCTTTGACTCTTGGATACATGGAGTATGACTGACACTGTTTGAGCTAGCTTTTGGCTTCAGGGATGTACACAGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300657	82	+	636262	AGTGCCCCTTTGACTCTTGGATACATGGAGTATGACTGACACTGTTTGAGCTAGCTTTTGGCTTCAGGGATGTACACAGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291656	82	+	647215	AGTGCCCCTTTGACTTTTGGATACATGAAGTATGACTGACACTGTTTGAGATGGCTATGGGCGTCAGAGATGTACACATCGA

a
s	mr.mrrefChr5	151292	9	+	294542	TGCTACAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300739	9	+	636262	TGCTACAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291739	9	+	647215	TATTACAGC

a
s	mr.mrrefChr5	151301	9	+	294542	TGCTGCCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300748	9	+	636262	TGCTGCCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291749	9	+	647215	TGGTGCCAG

a
s	mr.mrrefChr5	151310	53	+	294542	TTGAATTGGCAATCAGTCTCTGGGAAAATATGGGTCCCCCTGCTACACTTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300778	53	+	636262	TTGAATTGGCAATCAGTCTCTGGGAAAATATGGGTCCCCCTGCTACACTTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291758	53	+	647215	TTGAGTTGGCAATGAGTCTGTGGGAAAGTCTGTGTCCACCTCCTACCCTTTTT

a
s	mr.mrrefChr5	151363	107	+	294542	AAGAAGTTCATTCAAGAAGTGGTATCTACATCCCTACTTTAACAGACAATCTTACATGTCTACCACCCTCCTCAACAGCCTGTGGGGACCAAAGTTCTTGATTCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300836	107	+	636262	AAGAAGTTCATTCAAGAAGTGGTATCTACATCCCTACTTTAACAGACAATCTTACATGTCTACCACCCTCCTCAACAGCCTGTGGGGACCAAAGTTCTTGATTCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	291941	107	+	647215	AAGCAGTTCATTTAAGAAGTGGTATCTGCATCCTTACTTTACAAAACAATCTAACTTGCCTGCTGCCCTCCTCTACACCTTGTGGAGACCAAAGTTCTTGATTCACT

a
s	mr.mrrefChr5	151470	116	+	294542	TTGGGATTATCATTGGCTGGAGTCTACCTAACTTTTGGCTTCAAGTGATTGTTTTTACAAGATAGACCCAAGGAATCTAAGATTGCTAACTTCTTCCTCACTGGTGACTTGGTAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	300943	116	+	636262	TTGGGATTATCATTGGCTGGAGTCTACCTAACTTTTGGCTTCAAGTGATTGTTTTTACAAGATAGACCCAAGGAATCTAAGATTGCTAACTTCTTCCTCACTGGTGACTTGGTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	292056	116	+	647215	TCAGGATTATCATTGGTTGAAGTCTGCCTGACTTCTGGCTCCAAGTAATTGTTCTTAGAAGGTAGACTCAAGGAATCTAAGATTGTTGACTTCTTCCTCACTGGTGACGTGATAAA

a
s	mr.mrrefChr5	151586	69	+	294542	GATGTATAGCCAATCTCCCCCCTCATGTGCTTTATTGTGGATCAGTCCTACCCTGTACTACCTATTAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	301059	69	+	636262	GATGTATAGCCAATCTCCCCCCTCATGTGCTTTATTGTGGATCAGTCCTACCCTGTACTACCTATTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	292301	69	+	647215	ATTAGATAGCCAACCTCCCCCCTCCTGTGCTTTATTGAGGATCACTCCTACCCTGTGTTACCTATTAGA

a
s	mr.mrrefChr5	151655	62	+	294542	GAAGTTGTGTTAGTCCAGTGTGTGTAGGTGTGCCCCCAATCCATAGATGAGGGTTTTCACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	301130	62	+	636262	GAAGTTGTGTTAGTCCAGTGTGTGTAGGTGTGCCCCCAATCCATAGATGAGGGTTTTCACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	292370	62	+	647215	GAAGGTGTGTTAAACCAGTATGTACAGGTGTGTCCCCAATCCATAGATGAGGGTTTTCATCA

a
s	mr.mrrefChr5	151717	158	+	294542	TGCCATGATATACTATTAACTCTATCTACTACAAAGAGGTATGATCAGCAGTAGAGTGGTGGTTCAGGTAGAGTCATGGTTTAGTTGGTACCACTGATTAGTGTAAAGAATTTGATCTAAGTGTATCCTGAGCTTACCCCAGTTCCTTGCTTCAGCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	301192	158	+	636262	TGCCATGATATACTATTAACTCTATCTACTACAAAGAGGTATGATCAGCAGTAGAGTGGTGGTTCAGGTAGAGTCATGGTTTAGTTGGTACCACTGATTAGTGTAAAGAATTTGATCTAAGTGTATCCTGAGCTTACCCCAGTTCCTTGCTTCAGCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	292446	158	+	647215	TGCCATGCTATACAGTTGACTCTTTCTACCACAAGGAGGTGTGATCAATAGTAGAGCAATGGTTTGGGTAGAGTCATGGTTTAGTTGGTTTCACCGATTAGCAAAAAGAATTCGATCTAAGTGCATCCTGAGTTTAATCCATTTCCTTGCTTTGGCTA

a
s	mr.mrrefChr5	151875	24	+	294542	TTTGCTCGAAGATTTGCTTTGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	301350	24	+	636262	TTTGCTCGAAGATTTGCTTTGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	292607	24	+	647215	CCTGCTGTTAGACTTGCTTTGCAA

a
s	mr.mrrefChr5	151899	97	+	294542	ATTAATGAGTGATGGCTTAATTACACCTAATCTTGTTGCTATTGTTACATTAGATGAACTACTCAGGTGTAATCCATTATTTCAATAGCTGTATCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	301374	97	+	636262	ATTAATGAGTGATGGCTTAATTACACCTAATCTTGTTGCTATTGTTACATTAGATGAACTACTCAGGTGTAATCCATTATTTCAATAGCTGTATCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	292648	97	+	647215	ATTAATGAGCGATGGCTTGATTACACCTAATCTTGTTACTGTCCTTACATTAACTGAGCTACTCGGGAGTAATCTATTATTTCAAGAGCTGTATCTA

a
s	mr.mrrefChr5	151996	25	+	294542	GGCACACAACAGATGGTTTTGACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	301471	25	+	636262	GGCACACAACAGATGGTTTTGACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	292746	25	+	647215	GGCACACAATAGATGGTTTCAACAC

a
s	mr.mrrefChr5	152021	53	+	294542	CTTATCTCAGAACCTTACCCCAGGACAAGCTATATCTCAGCACAATTTAAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	301507	53	+	636262	CTTATCTCAGAACCTTACCCCAGGACAAGCTATATCTCAGCACAATTTAAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	292771	53	+	647215	CTTATCTCAGTATCTTACCCCAGGACAAGCTATATCCCAGCACAAATTAAATT

a
s	mr.mrrefChr5	152074	62	+	294542	TATTTAATCATTTAATCTCATAAGCCCCGGTAACATATTCTTGCCAGAAACCACTTTCAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	301560	62	+	636262	TATTTAATCATTTAATCTCATAAGCCCCGGTAACATATTCTTGCCAGAAACCACTTTCAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	292831	62	+	647215	TATTTAATTATTTAATCTCATAAGCCCAGGTAAAATACTCTTGCCACAAACCAACAACAATA

a
s	mr.mrrefChr5	152136	104	+	294542	TTAGAGTTAGAGGCCTAAGCCACTGTCAGCCTAAACCATTGATTTCTAGACTCTTGACCATGTGCCCCCCTGTTTATCAATTTATATGAACTTGGCCCTCTCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	301628	104	+	636262	TTAGAGTTAGAGGCCTAAGCCACTGTCAGCCTAAACCATTGATTTCTAGACTCTTGACCATGTGCCCCCCTGTTTATCAATTTATATGAACTTGGCCCTCTCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	292893	104	+	647215	TCAGAGTTAAAGGCCTAAGCCACTGTTTGCTTAAACCATTGATTTCTGGACTCTCAACCATGTTCCCCCCTGTTTATCAGTATATATGAACTTGCCCTGCCCTG

a
s	mr.mrrefChr5	152240	84	+	294542	CTTTCTCATGACTTGCTTGAGGTTTATTCAGGGCTATGTTGCAGTTCCTCAATACCTCTTCCAGATATTCCAGATTTCTAGATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	301732	84	+	636262	CTTTCTCATGACTTGCTTGAGGTTTATTCAGGGCTATGTTGCAGTTCCTCAATACCTCTTCCAGATATTCCAGATTTCTAGATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	292998	84	+	647215	CTTTATCATGATTCGCTGGAGATTTATTCAGGGCTATGTTGCAATCCCTCAATGCCTCTTCCATGTGTACCAGTTTTCTAGATA

a
s	mr.mrrefChr5	152324	67	+	294542	CCACAAAGTTTATGATCCCTGGAGTGGATATAAGTTGTTTTGCAATTGCTGGCGCCTTGGTTGGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	301816	67	+	636262	CCACAAAGTTTATGATCCCTGGAGTGGATATAAGTTGTTTTGCAATTGCTGGCGCCTTGGTTGGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293083	67	+	647215	CCACAAAGCCTATGATCCCTGGAGTGGCTATGAGTTGTTTTGCAATTGCGGGTGCCTTAGTTGGGCA

a
s	mr.mrrefChr5	152391	26	+	294542	CATTATCGTGTGTTGCATAATAGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	301894	26	+	636262	CATTATCGTGTGTTGCATAATAGGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293150	26	+	647215	CTTTTTACTGTTTAGTGTCATGTGCA

a
s	mr.mrrefChr5	152417	120	+	294542	GCAAGTGACTTCTTACTGTTAGTGTCATATGCATACTGTGCAAACTAGCACATATAAGGCTTGCTATGTCAAAAGCTCCAGAAAGCTAGGCAGAATCGATTAAGATGCTCTGAGAGGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	301920	120	+	636262	GCAAGTGACTTCTTACTGTTAGTGTCATATGCATACTGTGCAAACTAGCACATATAAGGCTTGCTATGTCAAAAGCTCCAGAAAGCTAGGCAGAATCGATTAAGATGCTCTGAGAGGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293222	120	+	647215	GTTGGGCACTTTTTAATGTTAGTGTCATACGCTTACTGTGGAAACTAGCAGATATAAAGCTTGCCATGTCAAAAGCTCCAGTAAGCTAGACAAAATTGATTAAAACAATCTGAGAGGCAA

a
s	mr.mrrefChr5	152537	29	+	294542	CTGTTCCTTTAAGGTTTAAAGTAGAAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302040	29	+	636262	CTGTTCCTTTAAGGTTTAAAGTAGAAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293355	29	+	647215	CTGTTCCTTTCAGGTTTAAAGTAGAAATA

a
s	mr.mrrefChr5	152566	67	+	294542	GATATGAATAGGATTTATGATACTTCTGTATCCCTGTACTCATTAGGAGAGCCTCACTTGAGAGAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302080	67	+	636262	GATATGAATAGGATTTATGATACTTCTGTATCCCTGTACTCATTAGGAGAGCCTCACTTGAGAGAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293384	67	+	647215	GATATGAATAGGATTTGTGATATTTCTGGATCCCTGTACTCATCAGGAGAACATCATTCGAGACAAA

a
s	mr.mrrefChr5	152633	41	+	294542	TGGATGATGATAGTTGAATGGAATCTTCAACCATAGAGATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302149	41	+	636262	TGGATGATGATAGTTGAATGGAATCTTCAACCATAGAGATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293451	41	+	647215	TGGATGATGATAGTTAAAAGGAATTGTCAACCATGGAGATA

a
s	mr.mrrefChr5	152674	143	+	294542	TACGCAGGCTATATCTATTTGGGCGCACTAGAGCTTCCTGAAAATAATCTTGGAGTAAGTTTGAACACGCAGTACATGGGATATAAGGGGGTAAACCCATTCATAGCTGCATGTACAAGTCATCATGATTCAGGGCAGCGAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302192	143	+	636262	TACGCAGGCTATATCTATTTGGGCGCACTAGAGCTTCCTGAAAATAATCTTGGAGTAAGTTTGAACACGCAGTACATGGGATATAAGGGGGTAAACCCATTCATAGCTGCATGTACAAGTCATCATGATTCAGGGCAGCGAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293492	143	+	647215	TATTCAGGCTAGTTCTATTTGGGCCCACTAGAACTTCTTGAAAACAATCTTGGAGTATATTTGAATAGGAAATACATGGGCCATAAGGGGGTAAAGCCATACATAGCATCATATACCAGTCATTGTGATTCGGGGCAGGGAAC

a
s	mr.mrrefChr5	152817	24	+	294542	AATCCGATATATAGGAAGTTCATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302335	24	+	636262	AATCCGATATATAGGAAGTTCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293637	24	+	647215	AATCCAATATACAGGAAGTTCATA

a
s	mr.mrrefChr5	152841	56	+	294542	GATATGCTAGTGTTCACCTTTTGGGGTGGCTTGAATTTTCTGTGGGGAGGACGATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302360	56	+	636262	GATATGCTAGTGTTCACCTTTTGGGGTGGCTTGAATTTTCTGTGGGGAGGACGATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293661	56	+	647215	AATATGCTAGTGTTCACCTTGTGGGGCGGGTTGAATTTCTTGTAGAGAGACCAATT

a
s	mr.mrrefChr5	152897	27	+	294542	GGGCATGACCCTTGGGCATGACAACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302417	27	+	636262	GGGCATGACCCTTGGGCATGACAACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293717	27	+	647215	GGACATGACCATTGGGCATGACAACAG

a
s	mr.mrrefChr5	152924	80	+	294542	ATACTCCCATTACAGTGGTGACTTATTAAACTTATATCTGTCATGCCCACTGGCTTCAGGAGTGAAGCCCATCTCTACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302450	80	+	636262	ATACTCCCATTACAGTGGTGACTTATTAAACTTATATCTGTCATGCCCACTGGCTTCAGGAGTGAAGCCCATCTCTACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293744	80	+	647215	ATACTCCCATCACAGTGGTGATTTATTATACTCATATTTATTCATCCCCATGGCTTCGGGAGTGAGGCCCATCTCTACTA

a
s	mr.mrrefChr5	153004	6	+	294542	ACAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302530	6	+	636262	ACAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293825	6	+	647215	ACAGTT

a
s	mr.mrrefChr5	153010	42	+	294542	ACACATCACACCTCCCTCATCAGCATAAAAGGAGTTACTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302536	42	+	636262	ACACATCACACCTCCCTCATCAGCATAAAAGGAGTTACTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293833	42	+	647215	ACACACCACACCCTCTTTGTCAGCATTAATGGAGTTACTTTG

a
s	mr.mrrefChr5	153052	18	+	294542	CAGTTGTTCAGTTATGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302578	18	+	636262	CAGTTGTTCAGTTATGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293876	18	+	647215	CAGTTGCTCAGTTATGCT

a
s	mr.mrrefChr5	153070	19	+	294542	TGAATAATTCCCTTATTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302596	19	+	636262	TGAATAATTCCCTTATTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293898	19	+	647215	TGAATAGTTCCCTTATGGC

a
s	mr.mrrefChr5	153089	157	+	294542	CAGGTGCTTCTTCATGCACTCACATTCATGACAACTGGGTCGTGATGCCAGTCCTTATACACAGACTCATTAACTTTTGACTGGGTGTGAGTAGCCAATCTTCTGAAGGTTGGAGACAACTCCACATCCTGCTGACAGAGTTGATCACCTTCATCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302615	157	+	636262	CAGGTGCTTCTTCATGCACTCACATTCATGACAACTGGGTCGTGATGCCAGTCCTTATACACAGACTCATTAACTTTTGACTGGGTGTGAGTAGCCAATCTTCTGAAGGTTGGAGACAACTCCACATCCTGCTGACAGAGTTGATCACCTTCATCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	293920	157	+	647215	CAGGTGCTTCCTCATGTGCTCACTTTCATAACACCTGGGTATTGATGCCAGTCCATCTACTCAGACTAATTAATTTTTGAGTGTGTGTGAACTGGCAGTCTTCTGAGGCTTGGAGACGACTTAAAATCCACCTGACAGAGGTGAGCACGTTCATCCG

a
s	mr.mrrefChr5	153246	9	+	294542	TTATATGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302772	9	+	636262	TTATATGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	294078	9	+	647215	TTATATGTC

a
s	mr.mrrefChr5	153255	16	+	294542	TCTCTCTGAATAAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302781	16	+	636262	TCTCTCTGAATAAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	294354	16	+	647215	TCTCTGTCAATGAAGT

a
s	mr.mrrefChr5	153271	46	+	294542	AAGCTAGTAATGTCTCCAGTATATCTAACCTACAACCAGATACAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302797	46	+	636262	AAGCTAGTAATGTCTCCAGTATATCTAACCTACAACCAGATACAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	294372	46	+	647215	ACACAAGTAATGCTTCCAGTATATCTGACCTACAGCCAGATACAAC

a
s	mr.mrrefChr5	153317	242	+	294542	AACGGGTCACTCTTTGAAATACAGGTACAATTATCTTTATATACCTCATTCTTTAGATGGCTTTATTATACTAGGTGCCTCTGTGCCATACACTTGGGACTTATTTTCCCTACTGACCACTCTATTGAGTGGAATTTGTTAAATAGAAGGAGTAATGGGCGAAAACTCAAAACTTGGCCTACAACTTGAATACACAGAAGGCCTTAAATGGGAATGCCTTAGATGAATAAACTAATTCAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	302843	206	+	636262	AATGGGTCAC------------------------------------CATTCTTTAGGTGACTTTATTATACTCGGTGCCTCTGTGCCATACACCAGGTACTCATTTTCCCTACTTACCTCTCTATTGAGTGGAATTTGTTAAAGAGAAGGCGTAATGGGTGAAAACTCAAACTTTGGCCTACAACTCGAATAAACAGAAGGCCTTAGATGGGAATGCCTTAGACAAATAAACTACTTCAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	294422	242	+	647215	GACGGGTCATTCTTTGAAATACAGGTACAATTATCTTTATATACCTCATTCTTTAGATGGCCTTGTTATACTAGGTGCCTCTGTGGCATGCACTTGGGAATTGTTTTCCCAACTGACCACTCTATTGAGTGGAGATTGTAAAATAAAAGGAGTAATGGGCGAAAGCTCAAAACTTGGCGTACAACTTGAATGCACAAAAGGCCTTAAATGGGAAAGCCTTAGATGAATGAAATAATTCTATG

a
s	mr.mrrefChr5	153559	69	+	294542	ATGGTCCGGTTACTATAACAAGAGGTACAAGAATGTGAGCCACACTTCCCAAATATTATAGGTCAGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	303050	69	+	636262	ATGGTCTGGTTACTACAAAAAGAAGTACAAGGATGTGAGCCACACTTCCCAAATCTTATAGGTCAGTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	294664	68	+	647215	ATGGTCCAGTTATTATAACAAGAGGGACAAGAATGTGAGCCACACTTCCC-AATATTATAGGTCAGTAT

a
s	mr.mrrefChr5	153628	222	+	294542	GTACTATACAATATATAATCCATTCTGACAACAATTGAAGGGGAGAATAGTATTGGACTCTACCCCTGGATTTTGAAAGGGCTTGATTTAACACTTAGCACACAGACAGCACATATGGATCAGTGTAACAGCACTTCATGAAAATAAGTTGGCTGATGAGGGATAGGGATGTAGGATGAATGAAGAAGTTCATAGAATAAAGTACCGTCACCAGTTTGTCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	303124	222	+	636262	GTATCATACAAAATATAATCCATTATGACAACAGTTGAAGGGGAGAATAGTATTGGACTCTACCCACGGATTTTGAAAGGGCTTGATTTAACACTTAGCACACAGACAGCACATATGGATCAGTGTAACAGCACTTCATGAAAATAAGTTGGCTGATGAGGGATAGGGATGTAGGCTGAATGAAGAAGTTCATAGAACAAAGTACTGTCACCAGTTTTTCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	294732	221	+	647215	GTACTGCACAATATATAATCCATTCTGACAACAATTATAGGAGTGTATAGTATTGGACTCTACCCCTGGATCTTGAAAGGGCTTGAATTACCAGTTAGCCCACAAACAGAACATATGGATTAGTATAACAGCACTTCATGAGAATAAATTGGCCGATGAGGGATAGGGATGTAGGAT-GATGAAGAAGTTCATAAAATAAAGTACCGTCACCAGTTTGTCAG

a
s	mr.mrrefChr5	153850	40	+	294542	CCACCTCTGTCTTCAATAGTTGTCATCCATTTCTTTGCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	303350	40	+	636262	CCACCTCTGTCTTCAATAGTTGTCATCCATTTCTTCGCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	294953	40	+	647215	CCACCTCTCTCTTCAATAGTTGTCATCTATTTCCTTGCTA

a
s	mr.mrrefChr5	153890	39	+	294542	ATAGTATGTAGATCAATTCATCAGTTTGTCACTTTGTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	303390	39	+	636262	ATAGTATGTAGATCAATTCATCAGTTCGTCACTTTGACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	294994	39	+	647215	ATAGTGTGTAGATCAATTCTTTAGTTTGTCACTTTGTCC

a
s	mr.mrrefChr5	153929	68	+	294542	CCAAGCACATGCTCTGTGCCAATTGGTCAACCTTGGTGGTTAAAAGAGCTAAGGTTAACTCAGGAGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	303430	66	+	636262	CCAAGCACATGCC--ATGCCAATTGGTCGACCTTGGTGGTTAAAAGAGCTAAGGTTAACTCAGGAGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	295033	68	+	647215	CCAAGCACATGCTCTGGGCCAATTGGTCAACCTTGGTGGTTAAAAGAGCTAAGGCTAACTCAGGAGTG

a
s	mr.mrrefChr5	153997	5	+	294542	CTAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	303496	5	+	636262	CCAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	295104	5	+	647215	CTATT

a
s	mr.mrrefChr5	154002	12	+	294542	TGTGGTAGCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	303563	11	+	636262	TATGG-AGCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	295296	12	+	647215	TGGGGTAGCCTT

a
s	mr.mrrefChr5	154014	128	+	294542	GTCCCTGCTATCTGATCTAGCGTGTGAATCAATCCTAGGCCCACATATGTTGCTTGGATAGCATGAGTTATGGGTGTTGTCATCCTTCAGCAATATGGAATTGACTGCTTAAAACTCATGAGTTATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	303574	122	+	636262	---CCTGCTATCTGATCTAGCGTGTGAATCAATCCTAGGCCCACAAATGTTGCTTTGATAGCATGCGTTATGGGTGCTGTCAT---TCAGCAATATAGAATTGACTGTCTAAAACTCATGAGTTATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	295312	128	+	647215	GTCCCTGCTACCTGATCTAGTGGGTGAATCAATCCTATGCCTGCATATGTTGCTTGGCAAGCATGAGTTATGGGTGTTGTTACCCTTCAGCAATGTGGAATTGAATGCTTAATGCTCATGAGTTATGG

a
s	mr.mrrefChr5	154142	18	+	294542	GTGCCATCGGTTGGCAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	303696	18	+	636262	GTGCCATCGGTTGGCAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	295441	18	+	647215	GTGTCATTCTTTGGCAAT

a
s	mr.mrrefChr5	154160	149	+	294542	ACTGCTTAAAACTAGGCATTGCTAGAACCCCTGCTCACAGTGCATCAAGATGCAAGATACATGAGAAAGGTGCAGATTCTAGCTGTGCATGCCTCCCAGCTTTGGGTTCCAACTTTAACCCCACTGTTCACCAGAGACTCCAGGTATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	303723	149	+	636262	ACTGCTTACAGCTAGGCATTGCTAGAACCCCTACTCAAAGTGCATCAAGATGCAAGATACATGAGAAAGGTGCAGATTCTAGCTGTGTGTGCCTCCCAGCTTTGGGTTCCAACTTTCACCCCACTGTTCACCAGAGACTCCAGGTATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	295459	149	+	647215	ACTGCTTAAAACTAGGCACTGCTAAAACCCTTGCTCACAGTGGATCAAGATGCAAGATACAGGAAAAAGGTGCTGATTCTAACTGTGCATGCCTCCCAGCTATGGGTTCCAATCTTAAGCCCACTGTTCACCAGAGACTCCAGGTATGG

a
s	mr.mrrefChr5	154309	57	+	294542	CAAGATTAGGTTGGTTTATATCTATGGGGTACACATATGTGGCACATTGTCCCAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	303873	57	+	636262	CAAGATTAGGTTGATGTATATCTATGGGGTACACATATGTGGCACACTGTCCCAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	295608	53	+	647215	CAAGATTAAGTTGGTTTATATCTATGGGGTACACATATGTGGCACATTGTCCC----

a
s	mr.mrrefChr5	154366	316	+	294542	GAAACCCAAGCTTCACCAATGTAGTAATGACTATCTTGGATCTATAAGATCTTCCTCTAATAACTGGGGAAGGGCAGAATATTGATGAGTTGACTCTAGAGGTGCTAAAATGCTAATATAAATGAATTGTGATACTGAGCCACATGAGTAGTGAAACAAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCTGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCTAGAGCATTCTCTAAGGCTGACAGACATACTTGAGTTTTTACTCCGATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACATAGGGGGAGGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	303931	306	+	636262	GAAACTTAAGCTTCACCAATGTAGTATTGACTATCTTGGACCTACAAGATCTTCCCCTAATAACTAGGGAAGGGCAGAATATTGATGAGTTGACTCTTGAGGTGCTAAAGTGCTAATATAAAGGGATTGTGATACTGAGCCACATGAGTAGTCAAACAAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCTGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCT----------CTAAGGCTGACAGACATATTTGAGTTTTTACTCCGATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACATAGGGGGAGATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	295661	312	+	647215	----CCCAAGCTTCACCAATGTAGTGATGACTATCTAGGGTCTATAAGATCTTCCTCTAATAACTGGGGAAGGGTAGAATATTTATGAGTTGACTCTAGAGGTGTTAAAATGCTAATATGAATGAATTGCAATACTGAGTCACATGAGTAGTGAACCCAGGAGTGTGACCCAGTAGCCAACCTAATCCGTGTACTCAGGGCCCCAGAGCTAGCTAGAGCATTCTTTAAGACTGACAGACATACTTAAGCTCTTACTCCCATTATCATATGGCACTGCTTCATGTTTACTCACCAGATGTAACACAGGGGGAGGTGT

a
s	mr.mrrefChr5	154682	14	+	294542	TAGTGAACAACCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	304237	14	+	636262	TAGTGGACAACCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	296021	14	+	647215	TAGTGAACAACCAC

a
s	mr.mrrefChr5	154696	364	+	294542	TACGGGATGACTCTGTGTGGTTAGTTAATTAAGCACCCTTGCCCTAACTTGGGTTCAGTCACGCTTCTCATCTTACTGTTTAACATCAGATCTTTGAAGCCATATCAAAGCTCCCCTATTGTATAACCCTCACAACAGCTCAAGGAACATTTTGCATTCAATCATGGAGGTGAGATTGCTGATGATTCATTTCTACCAGCCTAGGATACCACAAGACCCATGGTGATGAGTGGTTGTGTTAAGGACACACATCTAAGTGTGATCAAGGCACCCAGGGGCCTATGGTTCCTTGAATATCCTAAGAAGTAATTGTAGACTGTCATGATAAGACTGTGATTTGCTTGCAATTTAGTCAGTGTCAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	304251	357	+	636262	TATGGGATGACTCTGTGTGGTTAGTTAATTAAGCACCCTTGTCCTAACTTGGATTCAGTCACGCTTCACATCTTACTGTTCAACATCAGATCTTTGAAGCCATATCAAAGCTCCCCTATTGTATAACCCTCACAATAGCTCAAGGAACATTTTGCATTCAATCATGGAGGTGAGATTGCTGATGATTCATTTCTACCAACCTAGGATAACACAAGACCCATAGTGCTGAGTGGTTGTGTTAAGAACACACATTTAGGTATGATCAAGGCAACCAGGGGGCTATGTTTCCTGGAATATCCTAAGAAGTGATTGTAGACTG-----ATAAGACTGTGATTTGCTTGCAATTTCGTCAGTGTCAG--
s	simRat_chr6.simRat.chr6	296038	342	+	647215	TACTGGATGACTCTCTGTGGTTAGGTAATTAAGCACCCTTGCCCTGACTTGGGTTCAGTCAAGCTTCTCATTTTACTGTTTAGCATCAGATCTTTGAAGCCACATCAAAGC-------------------CACAACAGCTCAAGGAACATTTTACATTCAATCACAGATGAGAGATGGCTGCTGATTCATTTCTACTGGCCAAGGATACCACAATACCCATGGGGATGAGTGGTTGTGTCAAGGACACACATCTAAGTGTGAACAAGGCACCCAGAGGCCTATAGTTCCTTGATTATCCTAAGAAGCAATTGCAGACTGTCATGGTAAGACTGTGA---GCTTGCAATCTAGCCAGTGTCAGGT

a
s	mr.mrrefChr5	155060	54	+	294542	TAGACAGGGTGTCTAACACTGTGAGTATACTAGGTTTGTGGGAGTTATTATTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	304608	41	+	636262	-------------TGACATCGTGAGTATACTAGGTTTGTGGTAGTTATTATTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	296381	54	+	647215	TAGACAGGGTGTCTAACACTGTGAGTATACTAGGCTGGTGAGAGTTACTATTTG

a
s	mr.mrrefChr5	155114	38	+	294542	TCCTATCAACCCAATGGGGTTATGAAATGCCAACTCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	304650	38	+	636262	TCCTATCAACCCAATGGGGTTATGAAATGCCAACTCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	296435	37	+	647215	TCCTATCAACCCAATGGGATTATGAAGTGTCAACTCA-

a
s	mr.mrrefChr5	155152	390	+	294542	TTTTCAGCGGCATTTTTTCAGTGAGTATAGCATGAATTAGATGTACAGGGAGGACAAATTTATTGGCATACACTGATAAAACTTAGGGCAATTTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATGTTACAAGGCAACTGTTCATGCCCTGTTAGATTGCTTTAACACACCATGATCATTCCTACTATTGCTACTGTATACTTGCCTCGGGCATGTGGGCACATGTGTTTGGTATTAATATGCCATGAACCTGCTGTTAATCCTCTAACAATGCTGATTACAATCTTCTTACCTAGGAAAACCAGATAGGCTAACCACATTATTAGGACCTGTATTGGAGGTGTTCGTTTACCCACGTCATGCTCCCAAGTGTGATCCCCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	304690	390	+	636262	TTTTCAGCAGCATTTTTTCAATGCGTATAGCATGAATTAGGTGTGCAGGGAGGACAAATTTAATGGCATACACTGATAAAACTTAGGGCAATTTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATATTACAAGGCAACTGTTCATGCTCTGTTAGATTGTTTTAACACACCATGATCATTCCTACTATTGCTACTGTATACTTGCCTCGGGCATGTGGGCACGTGTGTTTGGTATTAATATGCCATGAACTTGTTATTAATCCTCTAACAATGTGGTTTGCAATCTTCTTACGTAGGAAAACCAGATAGGCTAACCACGTTATTAGGACCTGCATTGGAGGTGTTTGTTTACCCACGTCATGCTCCCAAGAGTGATTCCTGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	296472	373	+	647215	---TCAGCGGCATTTTTTCAGTGAGTATAGCATGAATTAGATGTACAAGGAGGACAAATTTATTGGCAAACACTGATAAAACTTAGGGAAATCTGGGGCATGGGAACACTGCACTGTCAAGTCAAGCCTGATGTCACAAGGCAACTGCACATGTCCTGTGAGATTACTTTAACACACAATGCTCATT--TACTATTGCTATTGTATACGTGCCTCGGGCATGTGGGCTCATATGTTTGGTATTAATATGCCAGGAGCCTACTGTTAATC----------GCTGATTACAATATTCTTCCCTAGGGAAACCAGATAGGCCAACTACATTATTAGGACCTGTATTGGAGATGTTCTTTTACCCACGTCA--CTCCCAATTGTGATCCCCAGA

a
s	mr.mrrefChr5	155542	247	+	294542	ACCCTTTGCATTAGTCTCAAGGTTATACATATTAGGCTGGATCTCATGTTATCTGAATACATCTGTAGTTGCATCATCACTAAGCTTAATTTGTAATAGTCCATTTTAAAGTCCAATTGATTTTAAGTTCCTCACATCTCATTTGGCTGGTGAGGCCTAAACTATGTGGCATCATCTACCTAACGTTTGGGTAACAATGAGAGTGAAAAAATTTTTCTTTGATGGAGATGTGTAGACAGGGCTTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	305082	197	+	636262	ACCCTTTGCATTAGTCTCAAGGTTGTACATATTAGGCTGGATCTCACGTTATCTGATTATATGTGTTGTTGCATCATCACTAAGCTTAATTTGTAATAGTCCATATTAAAGTCCAATTGATTTTAAGTTCCTCACATCTCATTTGGCTGGTGACGCCTAAACT--------------------------------------------------TTTCTTTGATTGAGACGTGTAGACAGGGCTTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	296845	240	+	647215	ACCCTTTGCATTAGCCTCAAGCTTATACATATTAGGCTGGATCTCATGTTATCTGGATACATCTGTAGTTGCATCATCGCTAAGCTTAATTGGTAATAGTCCATTTTCAAGTCCAATTGATGTTGAGGTCCTCACATCTCATTTGGCTGGTGAGGCCTAAGCTATGTGGCATCATCTACCTAACGTTTGGGTAACAATGAGAGTGAAAAAATTTTTCTTTGATGGAGATGTGTAGACAGG-------

a
s	mr.mrrefChr5	155789	91	+	294542	AACTTATATATCAGCTAAATGACTATGTAAAAAAAATAATATTCCTCTGAGAGATGACGTACACCATATATTACCCTAGGGGATGTAACCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	305281	91	+	636262	AACTTATATATCAGCTAAATGACTAAATAAAAAAAATAATATTCCTCTGAGAGATGACGTACACCATATATTACCCTAGGGGATGTAACCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	297085	60	+	647215	AACTTATAGATCACCTACATGACTATGTTAAAAAAATAAAAT-CCTCTGAGAGATGACGTA------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	155880	128	+	294542	TTGCATAACAGCCATGCCCCCATAACCCAGGTCTTTGTTCCTAATCTGTGTGACATCATTGGAGAGAACAACTGGCATCCAGGTCATCTACTCCTCCAAAGTTATGGCATGAACTCTTAAGCTGTAGC
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a
s	mr.mrrefChr5	156008	12	+	294542	GGAAGTGTTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	305503	12	+	636262	GGAAGTGTTTCT
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a
s	mr.mrrefChr5	156020	252	+	294542	TGAAGCTATTATAGCTATAATAGCCTGGGAAGTTCATACAGCCTCTGCTCTATTACATTTATCTATGGAGACTAACGTTCCCTTAAAGTTCTGGTGCTTATCCCCTAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGAACAGCTGGGTCATATAAGGCCAATCTGTCTACTGCCATAACCTTGAAGCATACCTTTTGCTCATCTCCATGATATAACTGAGCTGAGGTTTTTGAAAATAGAGGACTAAGGTTTAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	305515	252	+	636262	TGAAGCTATTATAGCTATAATAGCCTGGGAAGTTCATACAGCCTGTGCTCTATTACATTTATCTATAGAGACTAACGTTCCCCAAAAGTTCTGGTGCTTATCTCCTAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGGACAGCTGGGTCATATAAGGACAATCTGTCTACTGGCATAACCTTGAAGCATACCTTTTGCTCATCTCCACGATATAACTGAGCAGAGGTTTTTGAAAATAGAGGATTAAGGTTTAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	297277	252	+	647215	TGAAGCTGTAATTGCTATAATACCCTGGGAAGTTCATGCCTCTTCTGTTCTATTACATTTGTCTATGGAGACTAATGTACTCTTAATGTTCTGGTCCTTATCCCCGAGGTATAAGGTCCAAATCTTTAATCTGAACAGCTGGGTCACATAAGGCCAATCTGTCTGCTGCCATAACTTTGAAGCATACCTTTTGCCCATCTCCATGATATAACTGAGCTAAGGTTTTTTAAAATAGAGGACTAAGGTTTAACA

a
s	mr.mrrefChr5	156272	72	+	294542	CCTGAAGCAATAGGTTTGCATAGAAGGTGAGTAAGACTGGTTCACATTGAGCTCTATCTAGACAGGGTGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	305769	68	+	636262	CCTGAAGCAATAGGTTTGCATAG----TGGGTAAGACTGGTTCACATTGAGCTCTATCTAGACTGGGTGTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	297529	72	+	647215	CCTGAAGCAATGGGTTTGTGTAGAAGGTGAGTGAGCCCGATTCACATTGAGCTCTATCTGGACAGGATGTAC

a
s	mr.mrrefChr5	156344	64	+	294542	ATTTAGGAGGTTAGCCTGCACATCAGCACTTACTAATCCACTGTACTTAGAATGGCTAACCAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	305910	64	+	636262	ATCTAGGAGGTTAGCCTGCACATCAGCACTTACTAATCCACTGTACCTAGAATAGCTGGCCAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	297601	64	+	647215	ATTGAGGGGGTTAGCCTGCTCATCAGCACTTACTAATCCGCCGTACTTAGAATGACTAACCAAT

a
s	mr.mrrefChr5	156408	477	+	294542	CAGTCTGGTGGTTGATGATTGAATATTATAAGGTGAGTGATCTAGTGGATTGGTATTACTAGGTACGCATTGCATGTGTTATGCCTTTATGTTTCTTTTATCTTAGGCATACTTCCGTCATAAACAGAGTTTGATGTGATGGTTTTGGGTGACCTCAACCTTATGCTTACACAAGTAAGAACTTAGGTATAGTGTGATAGTCACATCCAATTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGACAGTCTTGTTAGCACCATTCCTTGTACAGGAACCTCTGATTCGCATTCACAATTCTGCACTACCTGATGAAAGAAGGTACTCACAAAACTAACACATAATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATCTATCATACACAAGCTTTTCTCACAGCATGGGTGAGGTGTGGTATAGTGGCTTAATATTTTGGGCACTTTTTCTCTCTGGAAAATCAGTTCAAAGAAGAGCTACATCCAGCACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	306031	473	+	636262	CAGTCTGGTGGTTGATGATTGAAAATTATAAGGTGTGTGTTCTAGTGGATTGGTGTTACAAGGTACGCAT-GCAAGTGTTATGCCTTTATGTCTCTTTTATCCTAGGCATGCTTCCGTCATAGACAGAGTTTGATGTGATG---TTGGGTGACCTCAACCTTATGCTTACACAAGTAAGAACTTAGGTATAGTGTGATAGTCCCATCCAGTTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGACAGTCTTGTTAGCGCCATTTCTTGTACTGGAATCTCTGATTCGCCTTCACAATTCTGCACTACCTGATGAAAGTAGGTACTCACAAAACTAACACATGATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATATATCATACACAAGCTTTTCTCACAGCATGAGTGAGGTGTGGCATAGTGGCTTAATATTTTGGGCACTTTTTCTCTCTGAAAAGTTAGTTCAAAGAAGAACTACATCCAGCACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	297665	457	+	647215	CAGTCTGGTGGTTGGTGATTGAATATTATAAGGTGAGTGATCTAGTGG-----TAGTACTAGGTACGCATTGCATGTGTTATCC------GTTCCTTTTATCTTAGTCATACTTCTGTCATAAAAAGATTTTGATGTGATGGTTTTGGGTGACCTTAACCTTATGCTTAGACAAGTGAGAACTTAAGTATAGTGTGATAGTCACATCCAATTTCAACTGCTCATGTAGGAAAGATAGTCTTGTTAGCACCACTCCTTATACAGGAACCTCTGCTTCACATTCACAATTCTGCACTGCCTGATGAAAGAAGGTACTCACAAAACGAACACATAATTGCTTATGGTACAGACTTATTCCAACCATCTATCACGCAAAAGCT--------TGCATGGGTGAGGTGTAGTATAGTGGCTTAGTATTTTGGGCACTTTTTCTCTGTGGAAAATCAG-TCAAAGAGGAGGTACATCCAGCACC

a
s	mr.mrrefChr5	156885	208	+	294542	ATGTAGGATGTCACCCTTGAGTGGCATGGGCAGTGAAACAGCTGGTTTATTAATGTACAACTTCAAGCAGTGTCCCAATGGGTGTAGTCAACATATAATATCAGACCTTCACTACAGAAGGCTCCATACAGAGGTTACACTCACATGCTCTGTCAATCAGAAAGACCCTACATCTATAGGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTATGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	306505	208	+	636262	AGGTAAGATGTCACCCTTGAGTGGCACGGGCAGTAAAACAGCTGATTTATAAATGTACGACTTCAAGCAGCGTCCCAATGGGTGTAGTCAACATATAATATCAGACCTTCACTACAGAAGGCTCCATACAGAGGTTACACTCACATGCTCTGTCAATCAGAAAGACCCTACATCTATAGGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTATGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	298122	208	+	647215	ATGTAGGATGTAACCCTTGGGTGGCATGGGCAGTGAAACAGCTGGTTTATTAATGTACAACTTCGAGCAGTGTCCTAATGCGTGTAGCCAATATATAATGTCAGACTTTCACTAGAGAAGGCTCCATACGGAGATTACACTCGCATGCTGTGTCAATCAGAAAGACGCTACATCTATAAGCTCAGTCATCCATCACCAAGATTGAGCA

a
s	mr.mrrefChr5	157093	196	+	294542	CTTGCTGATAATTTTCCTGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTTACAATCATGTAACAGTGGCTACTTCAATTCCATATGTGAAAGCCAATGCTAGTTGATGATAAAGGTATAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTTAAGTGGCAGACTTGCTGATGCACCAATAAGTTACACACATACTCTAGTCTACAGTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	306720	196	+	636262	CTTGCTGATAATTTTCCCGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTTACAATCATGTAACAGTAGCTACTTCAACTCCGTATGTGAAAGCCAATGCTAGTTGATGATAAAGGTATAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTCAAGTGGCAGACTTGTCGATGCACCAATAAATTACACACATACTCTAGTCTACAGTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	298330	196	+	647215	CTTGCTGATAATTTTTCTGGAAAGTAAGGATCTGGGCTTGCTCAAAATCACGTAACAGTGGCTACTTCAATTCCATATATGAAAGCCAATGCTACTTGATAACAAAAGTGTAATCCTATAGCATCTTAGGTGCACTTTAAGTGGCAGACTTGCTGATGCACCAATAAGTTACACACATACTCTAGACTACAATTGT

a
s	mr.mrrefChr5	157289	182	+	294542	TGCTGCTCTCATGACAGGTAAAAGTGTCTAGGGTTATTCATGTAAATTTCTAGGAACCAACAATTAACCATGACTACAAGGAGCTTGATTTTCACATGTTTCAACATTAAATATCTTTAATCCACATAAGCTGCACCTCAAGACTAACCCTTCTACTATACGACCCTACGCATAGTCCATGC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	298526	182	+	647215	TGCTGCTTTCATGACAGGTAAAAGTGTCGAGGGTTATTCATGTAAATTTCTAGGAACCCACAATTAACCATGACTACAAGGAGCTTGATTTTCACTTGTTTCAACACTTAATGTCTTTAATCCACACAAGCTGTACCTCTAGACTAGCTCTCCTACTATATGACCCTATCCATAGTCAATGT

a
s	mr.mrrefChr5	157471	86	+	294542	CATGGTCATCTCTATTTGTAACTTAGCCAGTGAATGGCTTCTTGTGGTGCCCTTGAAACACTAGTACCAGATGATGTGGATTCTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	307099	86	+	636262	CATGGTCATCTCTATTTGTAACTTAGCCAGTGAATGGCTTCTTGTGGTGCCCTTGAAACACTAGTACCAGATGATGTGGATTCTCT
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a
s	mr.mrrefChr5	157557	27	+	294542	ACACTGGTTAACAAGATGCTAATGCTT
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a
s	mr.mrrefChr5	157584	28	+	294542	TCTCTTCCTGCTCTGAAACTAAGGTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	307212	26	+	636262	TCTCTTCCTGCTC--AAACTAAGGTGAG
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a
s	mr.mrrefChr5	157612	11	+	294542	TTTTGAGTTGC
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a
s	mr.mrrefChr5	157623	366	+	294542	TATTTGCTTGCTCATCTACTCTTCCGCTGTGCTGTTAATCTTATTTTGGGTTGAGTCTATGATTGATATAATGATAAGATTAGTAGGATGAATTGGGGGAAACAAACGCTGGCATGTAAAGACACTCCACCTTACAGTTGATTCCTTATTCTAGTTTGAATGGAATGTTCTTGTATAGTAGTGCCATTAAGTGGTGTCTATTGTCAAAGACAGGCCTCCATGACTTGCTACTTCAGTTGAGACTTACAGAAAGTTACCAGTCACTCTCAAGGTTTTTTCTGTTGCTGCTGCCCATAGGTTCCCAGTAAACCAAATTGATCTGAAGATTGATTGGTCTGACACTCCAGGCATGCAACTAGAAGATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	307252	366	+	636262	TATTTGCTTGCTCATCTACTCTTCCGCTGTGCTGTTAATCTTATTTTGGGTTAAGTCTATGATTGGTATGATGATAAGATTAGTAGGATGAATTGGGGGAAACAGATGCTGGCATGTAAAGACACTCCACTTTACAGTTTATGCCTTAGTCTAGTTTGAATGGAATGTTCTTGCATAGTGGTGCCATCAAGTGGTGTCTTTTGTCAGAGACAGGCCTCCATGACTTGCTACTTCAGTTGAGACTTACAGAAAGTTACCAGTCACTCTCAAGGCTTTTTTTGTTGCTGCTGCCCATAGGTTCCCAGCAAACCTAATTGATCTGAACATTGATTGGTCTGACACTCCAGGCATGCAACTAGAAGATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	298866	362	+	647215	TATTTGCTTGCTCATCTGCTCTTCTG-TGTGCCATTAATCTTATTTTGGGTTGAATCTATGATTGATATAATGATAAGATCAGTACGATTAATTGGGGGAAACAAACACTGGTGTCTAGAGACACTCCACCTTACAGTTGATTCCTTATTCTAGTTTGAATGGAATGTTCTTGTATAGTAGTGCCATTAAGTGGTGTCTATTGTCAAAGGCAGGCCTCCATGACTTGCTACTTCAGTTGAGACTGACAGAAAGTTACCAGTCACTCTCAAGGTTTTTTCTGTTGCCACTGCCCGTACGTTCCCAGTAAACCAAATTGACCTGAAGATTAATTGCTCTGTCACTCCAGGCATGC---TAGAAGATGT

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	307625	156	+	636262	AGATCTGTCGGAAATTGTACATTGCTGGAGCAGCAGCACCACACAACTGTATGAGCAGTAAAAAATTGAGGATATCTGCTGGAGA-GAAGTACACTTGGTTGGTGAGAACTATCTGATTGTACCTTACATGTAATTAAGCCAGTTAAAAAAACATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	299228	157	+	647215	AGATCTGTCAAAAATTGTACATTGCTGGAGCAGCAGCACCACACAGCCATATGAGCAGTAAAAAATTGAGGATACCTGTTGAAGAAGAAGTACACTTAGGTGGTGAGAAATATCTGATTCTACCTGATATGTAATTAAGCCAGTTAGAAAAACATAC

a
s	mr.mrrefChr5	158146	167	+	294542	TGAATTTTGGTAAGAGGAAACTATCAAGTGTCAGGGAAGCCCACAATCCGAATGTAGTCAGAGAGTGTGTATTGGGAAGTGCCTATATGATCCCTCGCATGCCACTATGGGTTTGAGGGCCAGAGTCTATATCTAAAGAAATCGACCAAAATAGCATAAAGTTCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	307781	167	+	636262	TGAATTTTGGTAAGAGGAAGACATCCAGTGTCAGGGAATCCCACAATCCGAATGTGGTCAGAGAGTGTGTATTGGGAAGTGCCTATATAATCCCTTGCATGCCACTATGGGTTTGAGGGCCAGAGTCTATATCTAAAGAAATCGACCAAAATAGCATAAGTTTCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	299386	167	+	647215	TAAATTTTGGTAAGAGGAAACTATCAAGTGTCAGGGAAGCCCACAATGCCAATGTAATCAGAGAGTTTGTATTGGGAAGAAGCTATATGATCCCTCACATGCTACTATGGGTTTAAGGGCAAGAGTCTATATCTAAAGAAAAGGACCAAAATAGCACAAAGTTGCTT

a
s	mr.mrrefChr5	158313	86	+	294542	TACTACTACAGCTATACTAAGTATTTGAGATGGCCAATTGGAATTGCCTTTCATCTTCGCAGTTTAAAAAACTGTGACCTTACATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	307950	81	+	636262	TACTACTACAGCTATACTAAGTATTTGAGATGGCCAATTGGAATTGCCTTTCATCTTCGCAGTTTAAAAAACTGTGACCTT-----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	299553	86	+	647215	TACTACTGCAGCTATACTGAGTATTTGAGATGGCCAATTGGAATTCCCTTTCATCTTCACAGTTCAAAAATCTGTGACCTTACATC

a
s	mr.mrrefChr5	158399	6	+	294542	AGGCAA
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a
s	mr.mrrefChr5	158405	17	+	294542	AAGTCAAAACCAACAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	158422	27	+	294542	GAAGGTTTGGTATTTTGGGAACAAGCT
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a
s	mr.mrrefChr5	158449	52	+	294542	GTATCTTATAACTGAAGCCAGTCTATCAAGACAGGCAGTGTATTATAAGGTG
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a
s	mr.mrrefChr5	158501	15	+	294542	TATGTTTAAACTGTG
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a
s	mr.mrrefChr5	158516	208	+	294542	GGTTAAGAAAAGGAGAGGTATTACAGAACGTGAAACACAGATTATTTTACACATGCCAAATAATGCATAATCACAAATGAATGGGTAAAACTATTAATAGTAACAATGCAACTTGGCACATGATCATCCTGCACTCTAAGTGTACCCAGTATTGTTCAACTAGCAAACCTTCCCCAGAGAGGCAATAACATACAAGCCCATTCTCTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	308031	98	+	636262	--------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACTTGGCACATAGTCATCCTGCACTCTAATTGTACCCAGTATTGTTCAACCAGCAAACCTCCCCCAGAGAGGCAATGACATACAAGCCCAGTCTCTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	299794	208	+	647215	GGTTAAGAAAAGGAGAGGTATTACAGAACGTGAAACACAGATTATTTTACACATGCCAAATAATGCATAATCACAAATGAATGGGTAAAACTATTAATAGTAACAATGCAACTTGGCTCATGATCATCCTGCATTCTAAGTGTACACAGTATTCTTCAACTTCCAAACCTTCCCCAGAGAGGCAATAACATACAAGCCCATGGTCTAT

a
s	mr.mrrefChr5	158724	54	+	294542	AACATACTAGCATACTACTAGAATTTCTAGTCTGTTATCAAAAATGTATCCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	308129	54	+	636262	AACATACTAGCATAATACTAGAATTCCTAGCATGTGATCAAAGATGTATCCCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	608840	54	-	647215	AGCATACAAGCATACTACTAGAATTTCAAGTCTGTTATCTAAAATGTATGTCTG
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a
s	mr.mrrefChr5	158778	6	+	294542	TATACA
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a
s	mr.mrrefChr5	158784	93	+	294542	GAAGGAAATGTCAGCAAGGAGATGTCATACTTCAGCGCTTCTATGTGTATGCCATTTCAAAACAGCACTAAGGGCATATGATATGAACCTATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	308189	81	+	636262	GAAGG------------GGAAATATCAGACTTCAGCGTTTCTTTGTGTATGCGATTTCAAAACAGCACTAAGGGCATATGATATGAACCTATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	608894	93	-	647215	GAAGGAAATGCCAGGAAGGCGATGTGATACTTCAGTGCTTCTATGTGTGTGCCATTTCAACCCAACACCACGGGCATATGTTATGAATCTATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	300065	93	+	647215	GAAGGAAATGTCAGCAAGATGATGTCGTACCTCAGCGCTTCTATGTGTATGCCATTTCAAAACAGCACTAAGGACACAAGATATGAGCCTACC

a
s	mr.mrrefChr5	158877	21	+	294542	AGAGAGTGGTTCATTGTTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	308270	21	+	636262	AGGGAGTGGTTCATTATTCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	608990	21	-	647215	CAATAGTGGTTAACTGGCAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	158898	168	+	294542	GGGTTTTGTCCTTATCAGACCGATGTAAGCATTGGTTGTTCTAGTGGTATTACGGCAGTCTTTTCATAACCCCAATCATAAGTAGATTTGTATCCGCCTGATCTGTCTATGTTGAATGGTATTGCATCATTTCAAAGGACGATGCATTTAAATGACAATGTATTGGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	308291	165	+	636262	GGGTTTTGTCTTTATCCGAC--ATGTAAGCATTGGTTGTTCTAGTGGTATTACGGCAGTCTTTTCATAACCC-AATCATAAGTATATTTGTATCCGCCTGATCTGTCTATGTTGAATGGCCTTGCATAATTTCAAAGGACGATGCATTCATATGACAATGCATATGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	300179	168	+	647215	GTATTTTATCCTTATCAGACCGATGTAAGCATTGGATGTTCTGGTGATATTACGGCAGTCTTTTCATAACCCCAATCATAAGTAGATTTGTGTCTGCCTGATCTATCTATACTGAATGGTATTGCATCATTTCAAAGGACAATGCATTTAAATGACAGTGTACTGCAT

a
s	mr.mrrefChr5	159066	218	+	294542	AAAGGACAATGCATTCAGATGACAATGCATGTGAAAAGACCTGAACTTGATCAATATCTTGATGAAATTAGCCACACTGTCCCTATACCTCTGAGACTGGCTCTGGCACACTGGTAAGTACCATGGCACTTATGGTTGTAGTATTAGCAAGAGGACTAGAACAGGATCCGCTAGGCAGAGCTGTAAAGCCTATAAAGCTTAGGGTCAAAATTCAATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	308461	216	+	636262	AAAGGACAATGCATTCAGATGAGAATGCATGTGAAAAGACCTGAACTTAATTAATGTCTTGATAAAATTAGCCACACTGTCCCTATACATGGGAGACTGACTCTGGCACACTGGTAAGTACCACTGCACTTATGGTTGTGATGTTAGCAAGAG--TTAGAATAGGATCCGCTAGGCAGAGCTGTAAATCCTATAAAGCTTAGGGTCAAAATTCAATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	300347	211	+	647215	ATAGGACAATGAATTCAGATGACAATGCATGTGAAAAGACCTCAACATGATCAATATCTTGACGAAATAGGGCACACTGTCCCTATACCTCTGAGAATGGCTCTGGAACACAGTTGAGTACCATGGCA-------TTGCAGTACTAGCGAGAGGACTAGAACAGGATGCCCTAGGCAGAGCTGTAAAGTCTATATAGCTTGGGGTCAAAAATCAATCA

a
s	mr.mrrefChr5	159284	112	+	294542	ATGTAGATTTGTACATGAAAATGCTGGTCAAAACAAATATTATGCCCTATAAGAAGTGAATGATAGCTTTTCACATTGGTACAAGGTGGCCAGCAATTTGACATGTTGTTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	308694	112	+	636262	ATGTAGATTTGTACATGAAAATACTGGTCAAGACAAATATTATACCCTGTAAGAAGTGAATGTTAGCTTTTCACTTTGGCACAAGGTGGCCAACAATTTGACATGTTGTTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	300558	111	+	647215	ATGTACATATGTACATGAAAATGCTGGGCACAACAAATATTATGACCTATAAGAAGTGAATCATAGCTTTCCACATTGATACAAGGTGGCCAGCA-TTTGACGTGTTGTTTA

a
s	mr.mrrefChr5	159396	26	+	294542	TCCTCTGATAAGATTTCTCTTGCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	308808	26	+	636262	TCCTCTGACAAGATTTCTCTTGCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	300669	26	+	647215	TTCCCTAATAAGATTTTTCTTGCACT

a
s	mr.mrrefChr5	159422	78	+	294542	CCTGATGTTCTTCTACCTCTAGCCTGTGAACTCAGAATAAAATGAGGGTGGCCCATTGGCCCTTTGTAATCATGACGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	308835	75	+	636262	CCTGATGTTCATCTAACTCTAGCCTGCGAACTTAGAATAACATGAGGGTGGCCCCTTG---CTTCGTAACCATGACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	300695	76	+	647215	CCTGATGTTCTTCTACATCTAGCATATGAACTCAGAATAAAATGAGGGTGGCCCATTGGCCCTTTGTAATCA--GCGT

a
s	mr.mrrefChr5	159500	274	+	294542	TGTCCTTATTTACCTGTAGGACAAAGGTCTGACCTTGGTTTCCACTGAAATCAACTAGTTtcaatattgctcttgtagtttggtcctaacagtgcaacacagcttgagtggtcccactttcaaggcctccaggttgagaattaagatgtgctgcagcaactagagggttcccagttttaggacttacagTTTGGATGATCAAATAAAGCTGGGTGATGTAGACATATGATGTACCATTTAGGATTCTCTAACTTGCAAACACACAGTTGAGGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	308911	274	+	636262	TGACCTTATTTACCTGTAGAACAAAGGTTTGACCTTGGTTTCCACTGAATTCAGCCAGTTTTAATATTGCTCTTGTAGTTTGTTCCTAACAGtgcaacacagcttgagtggtcccactttcaaggcctccaggttgagaATTAAGATGTGATGCACCAACTAGAGGGTTCCCTGTTTTAGGACTTACAGTCTGGATGATCAAATAGAGCTGTGTGATGCAGACATATGATGTACCAAGTAGGATTCTCTAACTTGCAAACACACAGTTGAGGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	300771	273	+	647215	TGTCCTTATTTACCTGTAGGACAAAAGTCTGACCTTGGTTGCTGCCGAAATCAActagtttcaatat-gttcttgtagtctggtcctaacaatgcaacacagcttaagaggtcccactttcaaggcctccagtttgtgaatcaggatgtcctgcagtagttggagggttcccagttttaggacttccagTTTGGATCATCAAATAAAACTGGGTGATGTAGACATATGACATACAATTCAGGATTCACTAACTAGGAAGCACACAGTGGAGCGG

a
s	mr.mrrefChr5	159774	34	+	294542	ATCAGTACCTGCAGTTCTGTGACTGTCTTATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309185	34	+	636262	ATCAGTACCTGCAGTTCTGTGACTGTCTTATCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	301079	34	+	647215	ATCAGTACCTGCAGTTCCGTGGCCGTTTAATCAA

a
s	mr.mrrefChr5	159808	24	+	294542	ATTTTTTCATAAACACTTGTCAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309221	24	+	636262	ATTTTTTCATAAACACTTGTCAAG
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a
s	mr.mrrefChr5	159832	81	+	294542	CTTACTAGCGGCTCTCCTTGGCATTTAATATATTGACTTTGCCATTTCACTGGCAGCTACACATGTTCTCACTGGCAGCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309245	81	+	636262	CTTACTAGCGGCTCTCCTTGGCATTTAATATATTGACTTTGCCATTTCACTGGCAGCTACACATGTTCTCACTGGCAGCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	301141	81	+	647215	CTTACCCGCTGCTCTCCTTGGCACTTAATGCATTGACTTCGTCATTTCACTGGCAGCTACACATGTCCCCACTGACAGCTA

a
s	mr.mrrefChr5	159913	3	+	294542	AGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309337	3	+	636262	AGC
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a
s	mr.mrrefChr5	159916	40	+	294542	AAATGTATCGGACACCTGCATGAAGTCTGGAGCTACAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309340	40	+	636262	AAATGTATCGGACACCTGCATGAAGTCTGGAGCTACAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	301227	40	+	647215	AAATGGATTGAACACATGTATAAAGTCTTCAGCTAAAGTA

a
s	mr.mrrefChr5	159956	31	+	294542	CATGGTTAATGTATTGTACTAATGGAGTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309380	31	+	636262	CATGGTTAATGTATTGTACTAATGGAGTAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	345812	31	-	647215	CCTCATTTTAGGATTGTACTAATGGAGTAAG

a
s	mr.mrrefChr5	159987	93	+	294542	GTTGGACCATTAGGCAGTGCACCCACCAGGTTTATAATTGGATTCATATGGCTCTGGCCACTTCATGTATATGTCTGATGCACTTTTTCCCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309415	93	+	636262	GTTGGACCATTAGGCAGTGCACCCACCAGGTTTATAATTGGATTCATATGGCTCTGGCCACTTCATGTATATGTCTGATGCACTTTTTCCCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	345843	93	-	647215	ATTGGACCATTAAGCAGTGCACCCACCAGGTTTATAATGGGGTTCATATGGCTTTGGCTACTTCATGTATATGTCTGATGCACTTCTGCCCAC

a
s	mr.mrrefChr5	160080	12	+	294542	ATCATACTAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309692	12	+	636262	ATCATACTAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	345936	12	-	647215	AACATTACCATG

a
s	mr.mrrefChr5	160092	10	+	294542	GGCTTAATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309704	10	+	636262	GGCTTAATGG
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a
s	mr.mrrefChr5	160102	64	+	294542	ACTCGGCTGATGCAGGGTAGCCAGGGCTCATTATGTAAATCCTGATTAGTACTGGATTGGATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309714	64	+	636262	ACTCGGCTGATGCAGGGTAGCCAGGGCTCATTATGTAAATCCTGATTAGTACTGGATTGGATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	301414	64	+	647215	ACTCAGTTGATGCTGGGTAGCCAGGGCTCATCATGCTAATCCTGATTAGTGATGAATTGGATTG

a
s	mr.mrrefChr5	160166	18	+	294542	GAGGGTGTCTCAGGGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309784	18	+	636262	GAGGGTGTCTCAGGGGCA
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a
s	mr.mrrefChr5	160184	136	+	294542	AAGGAGGGTGTCGTACTTTAGAATCAGAGATTACCTCCTGGAGTTGGTTATCAAGATTTGTATCCAGGCAAACTTGATCGTGGGGACCACCTACCTATCACCACTGTGGTTAATATTGATTGGTCTTGCACATATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309804	136	+	636262	AAGGAGGGTGTCGTACTTTAGAATCAGAGATTACCTCCTGGAGTTGGTTATCAAGATTTGTATCCAGGCAAACTTGATCGTGGGGACCACCTACCTATCACCACTGTGGTTAATATTGATTGGTCTTGCACATATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	301496	136	+	647215	AAGGAGCATGTCGTACTGTAGAATCAGAGATGACCCCCTGAAATTGGTTCACAAGAATTCTATCCAGGCAGACTTGTTCATAGAGACTGCCTACATGCCACCGCTGTGATTAAAATTGATTGGTTATGCATATATT

a
s	mr.mrrefChr5	160320	29	+	294542	GTGGGCTTAGGTGTAGTTGATGCACAGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309940	29	+	636262	GTGGGCTTAGGTGTAGTTGATGCACAGGG
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a
s	mr.mrrefChr5	160349	41	+	294542	CTCAGATTCGATCTAGCAAGAGATGTTATTAATGACACTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	309969	41	+	636262	CTCAGATTCGATCTAGCAAGAGATGTTATTAATGACACTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	301673	41	+	647215	CTCAGATTCTTTCTAACAAAAGATGTTATTAATTATGCCAT

a
s	mr.mrrefChr5	160390	207	+	294542	AAGCAAAGTCTATAGGTGCAATGTGTGGGTAACTAAACTCAGCTTGGACAGGTGACAAAAACGTGTAGTCATTTGCATGGGGATACAGGTGTAGCTCAATTGTTGCGATGCCTTGGGATACATGCTGCTGCTGCCACTCCAGACAGAAGAGGACACTCGCAATCACTTCAGTCTTGTGTGGCCATAGACAGGTGTTCACAGCCTATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	310013	207	+	636262	AAGCAAAGTCTATAGGTGCAATGTGTGGGTAACTAAACTCAGCTTGGACAGGTGACAAAAACGTGTAGTCATTTGCATGGGGATACAGGTGTAGCTCAATTGTTGCGATGCCTTGGGATACATGCTGCTGCTGCCACTCCAGACAGAAGAGGACACTCGCAATCACTTCAGTCTTGTGTGGCCATAGACAGGTGTTCACAGCCTATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	301714	207	+	647215	AAGAAGGGTTTATAGGTGCTATGTGCGGCTAACTAAACTCAGCTTGGACAGGTGACATATACACATAGTTACATGCATGCAGATGCAGGTGCAGCTCAATTTTTGTGATGCCTCGGGATACATGCTGTTGCTGTCACTCCAGACAGAAGAGGGCACTTGCAATCACTTTGATTCTGTGCAGCCACAGACAGGTTTTCACAGCATTTC

a
s	mr.mrrefChr5	160597	18	+	294542	ACAGCCTCCCTGGGTCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	310221	18	+	636262	ACAGCCTCCCTGGGTCAC
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a
s	mr.mrrefChr5	160615	79	+	294542	CCAGTGGGCATTAAATATGTTGGACCATGCTTGACCAAGTCTTCTCACTGCTAATTGTGTGTATGAGTAGACTTGCTTG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	301939	79	+	647215	CCGTGGGGGACCAAATATGTTGGACCATGCATGACCAAGTCTTCTCAATGCTCATTGTGTGCATGAGCAGACTTGCTTG

a
s	mr.mrrefChr5	160694	32	+	294542	CGGGTCACTGAGATGCTCCAAACCCTGCTAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	310328	32	+	636262	CGGGTCACTGAGATGCTCCAAACCCTGCTAGC
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a
s	mr.mrrefChr5	160726	87	+	294542	TGCACCTGGATTGTGTCTGGCTGAATTTCTTACCACCCTATCCCCCTTTGCAGTAGCCATACTTTGGGTTGGGCCTCTCATGGGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	310360	87	+	636262	TGCACCTGGATTGTGTCTGGCTGAATTTCTTACCACCCTATCCCCCTTTGCAGTAGCCATACTTTGGGTTGGGCCTCTCATGGGTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	302051	87	+	647215	TGCACCTAGATCATGCCTGGCTGAATTTCTTACTATTCTATCCCCCTGTGCAGTAACCATACTTTGAGTTAGGCCTTTTATGGATAT

a
s	mr.mrrefChr5	160813	188	+	294542	AATGCCGAGATCTGTGAGATTGAGTCAAGGCAAAAAACATTACCACATGAAACTGCACAATCTACTAGATGATTCATCATTCTTTTTCCCCTGTTAGTGTAGGACTGTTCTTTTTCTCTGCCGTCTGCAGTTGAGGTGAAGTTTACCTAAAAAATAGGCCTATTTCTGCCCATCCATACTGAGAAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	310461	188	+	636262	AATGCCGAGATCTGTGAGATTGAGTCAAGGCAAAAAACATTACCACATGAAACTGCACAATCTACTAGATGATTCATCATTCTTTTTCCCCTGTTAGTGTAGGACTGTTCTTTTTCTCTGCCGTCTGCAGTTGAGGTGAAGTTTACCTAAAAAATAGGCCTATTTCTGCCCATCCATACTGAGAAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	302138	188	+	647215	AATGGTGAGAACTGTGAGATTGAGTCAAAGTAAACAACACTGGCACATGAAACTGCACAACCTAAGGGATTATTCATCATTCTTCTTCCCCTGTTAGTGTAGAACTGTTCTTTTTCTCTACAGTCTGCAGTTGAGATGAAGTTTACCTATGAAATAGGCCCATTTTTGCTAAACCATGCGGAGAAATA

a
s	mr.mrrefChr5	161001	29	+	294542	TTGTGTTGTTGACAGGTTCTCAAGGAGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	310694	29	+	636262	TTGTGTTGTTGACAGGTTCTCAAGGAGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	302326	29	+	647215	TTATGTTGCTGACAGGTTCTCAGGGAATC

a
s	mr.mrrefChr5	161030	102	+	294542	GAGGTAAAGGATTGAATGTGTAACAAGTAGAAATCTATGGTTGTCCTCATCGCACTGGTCATATATATTTTGATCCTCAGGCAGCAAGTATCCTGAACTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	310757	102	+	636262	GAGGTAAAGGATTGAATGTGTAACAAGTAGAAATCTATGGTTGTCCTCATCGCACTGGTCATATATATTTTGATCCTCAGGCAGCAAGTATCCTGAACTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	302355	102	+	647215	TGGGTAGAGGATTGAAGGTGCAATGAATAGGAAGTTAAGGTTGTCCTTGTTGCACGGGTCACATAAATTCTGATCCTCAGGAAGCACATACCCTGGACTGGC

a
s	mr.mrrefChr5	161132	57	+	294542	GCAAATTAGAAATTTAATGAATAGGGAAAGCAGTTTTTCCGAAAAAAAAGAAGAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	310859	57	+	636262	GCAAATTAGAAATTTAATGAATAGGGAAAGCAGTTTTTCCGAAAAAAAAGAAGAAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	161189	53	+	294542	TAGTCCATAGTTTGTTTTCTTTATAACTATAGGTATATGAAGTATTTCATATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	310916	53	+	636262	TAGTCCATAGTTTGTTTTCTTTATAACTATAGGTATATGAAGTATTTCATATG
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a
s	mr.mrrefChr5	161242	79	+	294542	ACTTGTGTGGATTGCTTTCATGTTGTAAGTATTCAGACTATGTAACCTTGTATCAGGCGTAGGCATATCAGGCAAGGGT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	302612	79	+	647215	ACTCGTGTGAATTTCTTCCTTGTTGTAAGTATTCAGGCTATGTAACCCCACATCAGACGTAGGCATATCAGGCAAGTGT

a
s	mr.mrrefChr5	161321	22	+	294542	CTTAGACAGGGTTGCAACCAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	161343	12	+	294542	TTGTTCCTATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	311074	12	+	636262	TTGTTCCTATTA
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a
s	mr.mrrefChr5	161355	29	+	294542	ATGCACTGTTATCCTAAAGTTTAAGTTAG
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a
s	mr.mrrefChr5	161384	76	+	294542	TAATTAAGCCAAAAAGAGTATGGGTGTGATAGCATGCATTTGCATGAAATTGGATTTTGCCTTTCTATTGGGCAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	161460	13	+	294542	AAATGTGCATAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	311192	13	+	636262	AAATGTGCATAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	302833	13	+	647215	GAATAAGCTGAGG

a
s	mr.mrrefChr5	161473	52	+	294542	GTAACATAGGATAGCCTATATACCACTGAACTCAAATGTCTGCAGTTTTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	311205	52	+	636262	GTAACATAGGATAGCCTATATACCACTGAACTCAAATGTCTGCAGTTTTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	302852	52	+	647215	AAAACATAGAATAGTCAATATACCACTGAACTCAAATGTCTGCAGTTTTATG

a
s	mr.mrrefChr5	161525	8	+	294542	AAAAATGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	311257	8	+	636262	AAAAATGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	302908	8	+	647215	AAAAATGC

a
s	mr.mrrefChr5	161533	88	+	294542	GATTACTTTTAAGGTGAGAAGCAATGCGTAATCATACATAGTGTTGATGATTTGTATATACATTGTGGTTAAACCCATTTATACTAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	311266	88	+	636262	GATTACTTTTAAGGTGAGAAGCAATGCGTAATCATACATAGTGTTGATGATTTGTATATACATTGTGGTTAAACCCATTTATACTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	302916	88	+	647215	GATTACTTTCAAAGTGAGAAGCAATGCATAATCATACATAGTGATGATGGTATGTATATACATTGTGGGTAAACCCATTTACACTAAA

a
s	mr.mrrefChr5	161621	13	+	294542	GTCCTGTGCCCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	311370	13	+	636262	GTCCTGTGCCCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	303004	13	+	647215	GTCCTGTGCCCCA

a
s	mr.mrrefChr5	161634	51	+	294542	ATTTGAATGGGCAATTTCCTTTAACTAATGAACTAGTCCTTTCCCAGAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	311383	51	+	636262	ATTTGAATGGGCAATTTCCTTTAACTAATGAACTAGTCCTTTCCCAGAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	303029	51	+	647215	ATTTGAATGGGCAGTGTCCTTTAACTAATGAACTACTTCTTCCCCAGAATA

a
s	mr.mrrefChr5	161685	46	+	294542	GGAACAATATGTAGTCCCCTTCTCCATAATGCATCAATGAGATCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	311439	46	+	636262	GGAACAATATGTAGTCCCCTTCTCCATAATGCATCAATGAGATCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	303080	46	+	647215	GGACTAATATGTAGTCCCCTTCTCCATAATGCATCATTGAAATTCC

a
s	mr.mrrefChr5	161731	27	+	294542	GTTTGGTGTACTCCATCTCAGGACAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	311487	27	+	636262	GTTTGGTGTACTCCATCTCAGGACAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	303126	27	+	647215	ATTTGGTGTACTTCAGCACAAGGTGGT

a
s	mr.mrrefChr5	161758	51	+	294542	TGACATAGACCTATAAGATAGTTGGTTATTATTTCTGTCTTCTGTCCTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	311528	51	+	636262	TGACATAGACCTATAAGATAGTTGGTTATTATTTCTGTCTTCTGTCCTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	303153	51	+	647215	TGGCATAGACCTATAAGGTAGTTGGTTATTATTTCTGTCTTCTGTCCCTTG

a
s	mr.mrrefChr5	161809	40	+	294542	TATATAAACAGCCATTGCTCTGGTTACCTGGTTATACCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	311583	40	+	636262	TATATAAACAGCCATTGCTCTGGTTACCTGGTTATACCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	303204	40	+	647215	TATATAGACAGGCATTGCTCCGGTTAATTGGTTATTCCAA

a
s	mr.mrrefChr5	161849	196	+	294542	AGCTGGTTCATACCAGCAACTTATCCTCTCTTCCTCCTGAACATAAGTAGATTTGATAGCCCCTTGCACCTTTTCATCAGGTCACATGACCTTATACCCCTGAAAGTAGGTCTGACACTGGTAAGTACAATGGCACATATGATCATGATAAAACAGATTGGGACCTAGGACAAGACCAGCTAAGTTGATTGATAAG
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	162245	21	+	294542	AGCATTTGCCTGGCTGTTTCT
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	162352	114	+	294542	TAATGCAGAGGGCGGTAATGTGGACTGCACTAGGTACTCCATGTTTCTACTTGAAGGAAAAAGGTCTGACCCCTACTCCCATTTATGTCAACTCAGATTCAGTACCACTTTCCT
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a
s	mr.mrrefChr5	162466	65	+	294542	GTCTGTCATCTTAGTTCCTTATTCACAAGAGACAGTCATGACAGTGTGAGACACCTTATTTAAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	162531	90	+	294542	TGGGcagtcatgacagtgcaagatagttgcaggagtcccatgttgacaggattctggttctgagtatgatgtgatacagcttaagagatc
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	303977	90	+	647215	CGGGcagtcatgacagtgcaagatagctgcaagggtcccattttgacaggattctggttctgattataatgtgagacagcttaatggatt

a
s	mr.mrrefChr5	162621	27	+	294542	gtactaagatttccagaggtggcaagt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	312411	27	+	636262	GTACTAAGATTTCCAGAGGTGGCAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	304067	27	+	647215	gtacttaggctgccaggggtggcaagc

a
s	mr.mrrefChr5	162648	25	+	294542	ctggaggattatcaaacaTACCACA
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a
s	mr.mrrefChr5	162673	84	+	294542	AGTTGGGAGGGACTGATCGCAGTATGTAGCCCTAAGGCAGGAATGAAACTTCTAATTGTACAAGGAAGTGTGCCATCACTCCAA
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a
s	mr.mrrefChr5	162757	217	+	294542	CTGGAATATATGCCATTTTTGACAGGTGAGTAAGCAGAGGTGGCTAGGGGTATTGTACCAGTGAGTAAGGTTATCAACAAAGCACATTAAAGAGAGGCTAACATGGAATGTCACTTGTCTCATACCATGTCTGTACCTGCTAAGACAAATCAACTTCAGTGCCTGTAGCTCCTTGAGAATGATACAGCAAATTTTTTACTGACATCAGTGGAGGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	312548	217	+	636262	CTGGAATGTATGCCATTTTTGACAGGTGAGTAAGCAGAGGTGGCTAGGGGTATTGTGCCTGTGAGTAAGGTTATCAACAAAGCACATTAAAGAGAGGCTAACATGGAATGTCACTTGTCTCACACCATGTCTGTACCTGCTAACACAAATCAACTTCAGTGCCTGTAGCTCCTTGAGAATGATACAGCAAATTTTTTGCTGACATCAGAGGAGGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	304311	217	+	647215	CTGGAATATGTGCCATTTTTGACAGGTGAGTAAGCAGAGGTGGCTAAGGGTATTGTACCAACGAGTAAGGTTAACAACAAAGCGCATCACAGATAGGCTAACATGGAATGTCACCAGTCTGATACGATGTCTCTACTTGCTAAGACAAGTCAATCTCAGTGCCTGTAGGTCCTTGCGAATGATACAGCAAGTTTTTTACTGACATCAGTGGTGACAA

a
s	mr.mrrefChr5	162974	181	+	294542	AATACTTGCAGCTGGCCTTCCCTGACACTAATGCATCAAGCACACCTCATCACTGGCAACTAGAGAGATGTTGGTGTGGTGCGCCAGAATGAATCAGACACATGTATGAAATCCTCGCTCCATCATAGGCCAGGTGGACCCACCATTAAGAGGTCAAATATACCTTTCTCATGCTTAACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	312768	180	+	636262	AATACTTGCAGCTGGCCTTCCCTGACACTAATGCATCAAGCACACCTCATCACTGGCAACTAGAGAGACATTGGTGTG-TGCACCAGAATGAATCGGGCACATGTATGAAATCCTCGCTCCATCATAGGCCAGGTGGACCCACCATTAAAAGATCAAATATAACTTTCTCATGCTTAACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	304528	169	+	647215	AAGCCTTGTAGTTGGCCTTCCCTGACACTAATGCATCAAGCACACCTCATCACTGGCAGCTAGAGAGATGTTGGTGTGGTGCGCCAGAATGAATCAGACACATGTATGAAATCCTTGCTCCATCATAGG------------AACATTTAGAGGTCAAATATACCTTTCTCATATATAACGT

a
s	mr.mrrefChr5	163155	16	+	294542	GCTTAGATTTTGCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	312949	16	+	636262	GCTTAGATTTTGCACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	304697	16	+	647215	GCTTAGATTTCACACA

a
s	mr.mrrefChr5	163171	102	+	294542	GTGCCTCGTGCAAAGCTTCATTAAATGGCAAACATGGACACGTACAAGCGGTTAGTGCTTCACCCTGCCCTGCTTGATGTGATGTAAAACAGTCACAGGCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	312975	102	+	636262	GTGCCTCGTGCAAAGCTTCATTAAATGGCAAACATGGACACGTACAAGCGGTTAGTGCTTCACCCTGCCCTGCTTGATGTGATGTAAAACAGTCACAGGCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	304713	102	+	647215	GTGCCTCGTGCAAAGCTCCATTAAATGGCAAATGTGGCCATGTATATGCAGCTAGTGCTTCACCCTGCCTTGCTTGATGCAATGTTAAACAGCCACAGGCAC

a
s	mr.mrrefChr5	163273	46	+	294542	TGTAGAGGGAGCCTGTTCACCTCACACAAGAGGTTTGACATGTTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	313078	46	+	636262	TGTAGAGGGAGCCTGTTCACCTCACACAAGAGGTTTGACATGTTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	304815	46	+	647215	TGCAAAGGGAGCCTGTTCACCTCACGCATGATGTTTGTCATGTTTC

a
s	mr.mrrefChr5	163319	182	+	294542	TATTAGCTAGTTGAAGACCTTTTATCTCTTTTAAAAGCCAATCCTAGATAGAGATGGGTTAAAACCTTTTAAGTTCACTGGCTTAGTCAGGTTTTGATTATTGCATTGGTTTGTAGCTGCACTTTGAAGGAAGCTATTCACTTAGCCCACTTAATCATTGGAGCATAAACTGACAAGTTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	313138	182	+	636262	TATTAGCTAGTTGAAGACCTTTTATCTCTTTTAATAGCCAATCCTTGAATAGAATGGGTTAAAACCTTTTAAGTTCATTGGCTTAGTCAGGTTTTGATTATTTCATTGGTTTGTAGCTGCACTTCGAAGGAAGCTATCCACTTAGCCCACTTAATCATTGGAGCATAAACTGACAAGTTTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	304861	159	+	647215	----------------------TATCTCTTTTAAAAGCCAATCCTAGATAGAGATGGGTTAAAACCTTATG-GTTGACTGGCCTACTCAGGTTTTGATCATTGCGTTGGTTCGTAGCTGTACTTTAGAGGAAGCTATTTACTTAGCCTGCTTCATCATTGAAGAATGAACTGACAGGTTTTA

a
s	mr.mrrefChr5	163501	36	+	294542	AACAACCTCCTCAATAATAAACTGCTGCATAAGTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	313342	36	+	636262	AACAACCTCCTCAATGATAAACTGCTGCAAAAGTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	305020	36	+	647215	AACAGCTTCCTCAACAAGAAATTGTTGCATAAGTGA

a
s	mr.mrrefChr5	163537	93	+	294542	ATGAGGCATCCATGCTAAACAGCCAGGGAGATCAGATTGAGACTGGACAGCCAGAACTTAGCTCTTCTGTATTGATTAATGATCAAATCGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	313378	93	+	636262	ATGATGCATCCATACTAAACAACCAGGGAGATCAAATTAAGACTGGAGTGCCAGAATTTAGCTCTTCTGTATTGATTAATGATCAAATCGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	305059	93	+	647215	ATGAGGCATCCATGATAAACAGCCAGGGAGATCAGATTGAGACAGGACAGCCAGAACTTAACTCACCTGTTTTGATTAATAATCAAATCGGCT

a
s	mr.mrrefChr5	163630	57	+	294542	GAAGTTTGTTGGGACATCAAGAAGAGTGTCTTGCTGTAGGATCATTTAATCTGGTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	313471	57	+	636262	GAAGTTTGTTGGGACATCAAGAAGAGTGTCTTGCTGTAGGATCATTTAATCTGGTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	305157	57	+	647215	GAAGACTGTTGGGATATCAAGAATAGTGTCTTGCTGTAGGATCACTTAATCTGGTGG

a
s	mr.mrrefChr5	163687	55	+	294542	TTAATTGTTATATCTAGGCAGATTGGTTAATATAAACCTATTAGAGGTTGCACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	313528	55	+	636262	TTAATTGTTATATCTAGGAACGTTTGTTCATATGAACCTATTAGAGGTTGCACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	305215	39	+	647215	TTAATTGTTATATTTAGGCAGATTGGTTAATGTAAATCT----------------

a
s	mr.mrrefChr5	163742	142	+	294542	CGTTGAACCCTCCTTGGGTAGCTGGCTTGATATGTGTATACTAGACATGATGTGAAGCTGATGCAGTTACAGTCTCATTGTGACAAGCTATTATTAGTGTACTTATTTCAGGTATGTTTAGGTGCTATATGTAGGTAGCCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	313591	142	+	636262	CGTCTAACCCTCCTTGGGTAGCTGGCTTGATATGTGTATACTGGACACAATGTGAAGCTGATGCAGTTACAGTCACATTGTGACAAGCCATTATTAGCGTACTTGATTCAGGTATGTTTAGGTGCTATGTGTAGGTAGCTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	305254	140	+	647215	CATTGAACCCTCCTTGGGCAGCTGGCTGGAT--TTGTAGACTAGACATGATGTGAAGCTGATGCAGTCACAGTCTCATTGTGACAGACTGTTATTAGTGTACTTATTTCTGGTATCTGTAGGTGCTATATGAAGATAGCCAA

a
s	mr.mrrefChr5	163884	256	+	294542	AGCCACAGAAATGAATATGTGTTCATGTTAACAGGTGTAGCTCATATTGATGTGATGCCTTGGGATGCATGCTGCCATGACTTCAAACGCATAGCAGCTTTCTTTGTTTTGAAGATGGTGTATATATAAATATGTATTCACCAGCTCTCTAGGTTCTGGCCAGAGCCTTAAATATAATGAACCTTGCATGACCAATTAATCTTACTACTCAATGAGTGTTGATGTGGCATTGGGATGATGAATGATTTTACTTTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	313733	248	+	636262	AGGCACAGAAATGAATACATGTACATGTTAACAGGTGTGGCTCATCTTGATGTGATGCCTTGGAATGCACACTGCCATGACTCCAAATGCATGGCAGCTTTCTTTGTTTTGAAGATGGTGTATATATAAGTATGTATTCACCAGCTCTCTAGGTTCTGGCCAGAGCCTTAAATATA-----CCTTGCATGACCAATCAATTTTACTATTCAATGAGTATTGGTGTGGCATTGGGATGA---ATGATTTTACTTTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	305413	243	+	647215	ATCCACAGAAATGAATATGTGTTC----------TTGTAGCTCATATTGATGTG---CCCTGGGATGCATGCTGCCATAACTTCAAACACATAGTAGCTTTCTTTGTTTTGAAGGTGGTGTATATATAGATGTGCATTCACTAGCTTTCTAAGTTCTGGCCAGAGCCTTAAATATAATGAACCTTGCATGACCAATTGATCTCACTACTCAGTGAGTGTTGATGTAGCATTGGGATGATGAATAATTTTACTTTAT

a
s	mr.mrrefChr5	164140	49	+	294542	ACCTAGACCGTGCCTGACTCAATTTCATGGAGATAATGAGACTGAATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	313981	46	+	636262	ACCTAGACCATGCCTAACTCAATTT---GGAGATAATGAGACTGAATCA
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a
s	mr.mrrefChr5	164189	367	+	294542	AAACTAAAGTGCAGAAGTTCAGATTTGGATAAatgataagacCTTGGTGATAACATTCAGTACCCCAGAATGAAGCTTCATGACTAAAGTGCTTGTTACAGTGGTAGATAAAACTAAGGTTGAAACAAATGAATACCATTTTATAATATATCGAAGACTGTAGATATGACGACAGACCAAGTACCACGAGTGTTGGTGTATGAGATCATATAAACGAGCATGAATGAGCTCAAGAACAAGTTAATTGCCCCTGCAGCATAGTCATCAAATAGGGCTCTTGTATCTAGGGTTTCAAATGAGTCAATACAAACCCTTGAGGAAAAGATTAGTAACCCATGAAATGGTAGGCCAAGGATAGCCAGTAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	314028	357	+	636262	AAACTGAAGTGCAGAAGCTCAGACTTGGATAA----------CTTGGTGGTAACATTCAGTGCCCCAGAATGAAGCTTCATGACTAAAGTGCTTGTTACAGTGATAGATAAATCTAAGGTTGGAACACATGCATACCATTTTATAATATATCGAAGACTGTAGATATGACGACAGACCAAGTACTGCGAGTGTTGTTGTATGAGATCATATAAACGAGCATGAGTGAGCTCAAGAACAAGTTGATAGCCCCTGCAGCATAGTCATCAAATAGGGCCCATGTATCTATGGATTCAAGTGAGTCAATACAAACCCTTGCAGAAAAGATTAGTAACCCATGAAATGGTAGGCCAAGGATAGCCAGTAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	305712	367	+	647215	AAACTAGAGTGCAGAAGTTCGGGTTTGGATAAATGATAAGACATTGATGACAACATCCAGTACCCCAGAATGAAGCTTCACGACTAAAGCACTTTTTACAGTGGCAGATAAAACTAAGTTTGAATCAAATGAATACCAAGTTACAATATATCGAAGACTGTAGATATGACAACAGACCAAGTACCACAAGTGTTGGTGTATGAAGCCATATAAGAGAGCATTCATGAGCTCAAGAAGAAGTTAATTGCCCCTGCAACATGGTCATCAAATAGGGCTCTTGTATCTAGGCTTTCAAATGAGTCAATACAAACCCTTGAGGAAAAGATTAGTAACTCATTAAGTGGTAGGCCAAGGATAGCCAGTAAAT

a
s	mr.mrrefChr5	164556	13	+	294542	ATATCTTGATGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	314499	8	+	636262	ATATCTTG-----
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a
s	mr.mrrefChr5	164569	68	+	294542	GATCACAAGATATGTTCAAAAGTGACAAAGTTTTATAGGAAGCACCTGTAAAAATGAATGGTTAGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	314507	6	+	636262	--------------------------------------------------------------TAGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	306147	68	+	647215	GATCACAAGATATGTTCAAAAGTGACAAAGTTTTATAGGAAGCACCTGTAAAAATGAATGGTTAGACT

a
s	mr.mrrefChr5	164637	10	+	294542	ATGAAGATAT
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a
s	mr.mrrefChr5	164647	178	+	294542	CACACTTGGTATCCCTATCTGTGGCAAGAGAGTGGATTAAATGATTTATTTTAGCTATATGACCTTAGATTCACTGCCTTTCCTATAGTTCAGAGGTTGTGGACACACCACCACATATATAGAACTGCCTTGTCATGTTACAAGCACACATAGGTGACTTACAGGAATCTGATAACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	314530	176	+	636262	CACACTTGTTATCCCTATCTATGGCCAGAGAGTGGATTAAATGATTTATTTTAGCTATGTGACCTTAGATTCACTGACTTTCTTAT-GTTCAGAGGTTGTGGACACACCACCACATATATAGAACTGCCTTGTCATGTTACAAGCACACATAGGT-ACTTACAGGAATCTGATAACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	306225	166	+	647215	CACACTTGGGATCCCTATCTGTGGCAAGAGAGTGG------------ATTTTTGGTGCATGACCTTAGATTCATTGCCTTTCCTTTAGTTCGGAGGTTGTAGACACACCACCAAATATAGAGAACTGCCTTGTCATGTTACAAGCCCACATAGGTGACTTTCTGGAATCTGATAACCA

a
s	mr.mrrefChr5	164825	163	+	294542	TTGCATAACTGACTGGGTTTCACACCTTCTTTCCCATCAGGACACTCTGTGCATGGAATCTGACAACATGGCTTCCCATATATGAAGAGCATCTCACTTGCTGTGAGAATTGGAGCCAGCAGATGTGGAAAATACCCTACTTGATAGTCTTATGTCTGGCAAG
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a
s	mr.mrrefChr5	164988	38	+	294542	TGGATTAAATGATTTATTTCGACTGCCTTACCTTAGAC
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a
s	mr.mrrefChr5	165026	405	+	294542	TCACTGGTCTACCTAATATTCAGAGATTATGCTGTGCATCAAAACTGGAAGATTGTCCCCCCATTATATGAACAGCATATCACTGGCCAAAAGGGTTTGATCACCCTCATATTCACAAGAGATCACTCCAGTTCAGAGAGCATCAGATTCTATTTACACATTTCAACCCATTGAATAATCACCTGCTACCTGTTCAGGTGATAAAAATAGGGAATATGGCATACCAGTAACCATTAGCATTATATTTTTCCAACCTCATGTGCATCACTCAGCATTATTTTTTTCTGACCTTGTGTGCCTCAGCCCTAACTCAGACCAGAAGTTAGACCCCCATTATGTTAGGGTGGCTTCCATATTATTCTTCCAATTTGATGGCACACAATATAGCTCCCAGAGTTATCTTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	314907	405	+	636262	TCACTGGTCTACCTAATATTCAGAGATTATGCTGTGCATCAAAACTGGAAGATTGTCCCCCCATTATATGAACAGCATATCACTGGCCAAAAGTGTTAAATCACCCTCATAATCACAAGAGAACACTTCAGTTCAGAGAACATCAGATTCTATTGACAAATTTCAACCCATTGAATAATCACCTGCTACCTGTTCAGGTGATAAAAATAGGGAATATGGCATAGCAGTAACCATTAGCATTACATTTTTCCAACCTCATGTGCATCACTCAGCATTATTTTTTTCTGGCCTTGTGTGCCTCAGCGCTAACTCAGACCAGAAGTTAGACCCCCATTATGTTAGGGTGGCTTCCATATTATTCTTCCAATTTGATGGCACACAATATAGCTCCCAGAGTTATCTTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	306606	403	+	647215	TCTCTGACTTACCTAATAATCAGAGATTACGCTGTGCATTAAAACTGAAAGATTTACCCCCCAT-ATATGAACAGCACATGACTGGC-ATAGGGGTTTGATGACCCTCATATTCACAAGAGATCACTCCAGTTAAGAGAGCATCAGATTCTGCTTACACATTTCAACTCCTTGAATAATCACCTGTTACCTGTTCAGGTGATAAAAATAGGAAATATGGCATACCAGGAACCATAAGCATCATATGCTTCCAACCTTTTGTGCATCATTAAGCATTGTTTTTTTCTGACCTTGTGTGCATCAGCCCTAACTCTGTCCAGAAGCTAGATCCAGATTATGTTGGGGTTGCTTCCATATTATTCTTCCAATTCAATAGCACTGAATATAGCTCCAAGAGTTATTTTAC

a
s	mr.mrrefChr5	165431	52	+	294542	AATTTAAAGGTCCTGAGCTTGGGGGGTATTTAAACATTTCCAGGACACTAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	315324	52	+	636262	AATTTAAAGGTCCTGAGCTTGGGGGGTATTTAAACATTTCCAGGACACTAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	165483	9	+	294542	TGTGTTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	315380	9	+	636262	TGTGTTTTA
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a
s	mr.mrrefChr5	165492	37	+	294542	GAGACCCTAGAGGTCATATTGTGCAAGATGGTTCGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	315412	37	+	636262	GAGACCCTAGAGGTCATATTGTGCAAGATGGTTCGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	307070	37	+	647215	GAGACCCAGATGGTCATACTATGCGAGATGGTTCAGG

a
s	mr.mrrefChr5	165529	5	+	294542	GTTTG
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a
s	mr.mrrefChr5	165534	77	+	294542	ATAGTGTTCAAAAACTAGAACTATCTCTTTCAGAGTCCCACTACCTAGGTGTCATTCATGAACCATTGTTCCTTTAT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	307113	77	+	647215	ATAGGGTTCAAAAACTGGACCTATCTCTTCCAGAGTCCCACTACCTAGGCGTCATTCATAGACCCTTGTTCCTTTAT

a
s	mr.mrrefChr5	165611	21	+	294542	CAAAATGCAGGGGAGATGCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	315545	21	+	636262	CAAAATGCAGGGAAGATGCAG
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a
s	mr.mrrefChr5	165632	63	+	294542	TTATGCAGGTCTATGACTATTATCTGGTAGAGGAATGGGGGATTGGGATTACACATGATTATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	315566	63	+	636262	TCATGTAGGTCTATGACTATTATCTGGTAGAGGAATGGGGGATTGGGATTACACATGATTATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	307213	25	+	647215	TTATGCAGGTCTATGTGTATTATTT--------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	165695	249	+	294542	CATCCAGCACCAACCACCCTAATGTTAGCTCCAAAATGATGTGCCAGAACTCCAGATATGTGGAAAATTAGGTAAGCTTCACCTGACCGAGCTTTGGAATTTGTGGAGGTAAGCCCTAGTATTAATCCTGACTGGATAGCAACTGAAATAAGCTACATTTCACCCAGATGAGTTTAGTGTTTATCAATCATGCAACCAGGAAGGGTTAAACTGGGGCAATCTGGACTTGTACAGCTATATGAGTATCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	315635	242	+	636262	CATCCAGCACCAACCACCCTAATGTTAGCTCCAAAATGATGTGCCAGAACTCTAGATATGCGGAAAATTAGGTAAGCTTCATCTGACTGAGCTTTCAAATTT-------CAAGCCCTAGTATTAATCCTGACTGGACAGCAACTGAAATAAGGTACATTTCACCCAGATGAGTTTAGTGCTTATCAATCATGCAACCAGGAGGGGTTAATCTGGGGCAACCTGGACTTGTACAGCGATATGAGTATCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	307238	206	+	647215	-------------------------------------------CTAGAAATTCAGATATGTGGAAAATAAGGTAGGCTTCACCTGACCAAGCTTTGGAAATTGTGGAGGTAAACCCTAGCATTAATCATGCCTGTATAGGGACTAGAAATTGCTACAATTCACCCAAATGAGTTTAGTGTCTATCAATCATGCAACTAGGAAGGGTTAAACTGGGGCAATCTGGACTAGTACAGCTATATGAGTATCCC

a
s	mr.mrrefChr5	165944	170	+	294542	ATCCTCCTCACCCCATGTACTGACAGACATTAGCAATTACATGTATAGAAGAGCTTGGAATCTAAGCAAACACAGAATCATAATCATTTTCAATTTACTAGCATTGTACTGTCTCCCCTTGCCCAAAGATATGCATCGCCAAATAACGGAAGACTGCCTAAAGTGATGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	315877	170	+	636262	ATCCTCCTCACCCCATGTACTGACAGGTATTAGCAAATTCATGTATAGAGGCGCTTGGAATCTAAGCAAACACAGAATCATAATCATTTTCAATCTACTAGCATTGTACTGTCTCCCCTTACCCAAAGATATGCATCGCCAAATAACGGAAGACTGCCTAAAGTGATGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	307445	170	+	647215	ATCCTCTTCATGCCATGTACTAACAGACATTAGCAATTACATGTATAGAAGAGCTTGAAATTTAAGCAAACACAGATTCAAAATCATTTATAATTTACTAGAATTGTACTGTCTCCCCTTGCCCAAAGACATGCATCACCAAATAAGGGATAACTGCCTAAAGGGATCGC

a
s	mr.mrrefChr5	166114	101	+	294542	ACTCTAGAAAAAAAGTCCTTAAAGTGCCATTACTTTTAAATTACGTCCCAAAGACATTGTTGGGTGGTACCTGCTTGGTACTTGGTACCAGTGGCTTAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	316047	101	+	636262	ACTCTAGAAGAAAAGTCCTTAAAGTTCCATTACTTTTAAATTACGTCCCATAGACATTGTTGGGTGGTACCTGCTTGGTACTTGGTACCAGTGGCTTAATG
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a
s	mr.mrrefChr5	166215	30	+	294542	TTGTGCAAAGTTCCAATAAAAGGCAAATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	316171	30	+	636262	TTGTGCAAAGTTCCAATAAAAGGCAAATGT
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a
s	mr.mrrefChr5	166245	35	+	294542	GCTGTGTGCATGTGGTTAGTAGTTGGCTGCTGAGC
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a
s	mr.mrrefChr5	166280	109	+	294542	AGCTGTCAAGCAGCTGCAGACACCAGGAGAAGAAGTCTGCCTGCCTCATGCACTGCCAAGTGATCACAGGGACATGTAGAAGGACCCAACACCCTCCACCCCATAAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	316252	109	+	636262	AGCTGTCAAGCAGCTGCAGACACCAGGAGAAGAAGTCTGCCTGCCTCATGCACTGCCAAGTGATCACAGGGACATGTAGAAGGACCCAACACCCTCCACCCCATAAACT
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a
s	mr.mrrefChr5	166389	42	+	294542	CATGAGATGCTATTTATTGCACAATACTCATAACCAAGATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	316362	42	+	636262	CATGAGATGCTATTTATTGCACAATACTCATAACCAAGATTC
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a
s	mr.mrrefChr5	166431	326	+	294542	TTCCAGCTTCATGATGTTCACAACTCTTGGCTCTTGGGGGCAGGGGTCTGCAAATACTGCCTCTGACTATCTCTTGTAGCATTGAAGAAGTTTATGTATTCCATGCCTAACATCCAAAACTTTAGTGGCTCTTAAAGCACAAGCACACTGCCTTAACACTGAGGATTGCCCCTGTTCTGTCACACTAAAGTATGTGCAGTACATTATGCTGCAGACACAGAGGGATCAATAAAATGAGTCGACAATAATACAACATTAAGAATAGCTTTCTAGTCCCCTCTGGGGTTTGTTCGTTGGACAGGGCATCTATAATGTACTCGGGGAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	316405	326	+	636262	TTCCAGCTTCATGATGTTCACAACTCTTGGCTCTTGGGGGCAGGGGTCTGTAAATACTGCCTCTGACTATCTCTTGTAGCATTGAAGAAGTTTACGTATTTCATGCCTAACATCCAAAACTTTAGTGACTCTTAAAGCAGAAGCACGCTGGCTTAACACTGAGGATTGCCTCTGTTCTGTCACACTAAAGTATGTACAGTACATTATGCTGCAGACACAGAGGGATCAATAAAATGAGTCGACGATAACACAACGTTAAAAATAGCTTTCTAGTCCCCTCTGGGGTTTGTTCGTTGGACAGGGCATCTATAATGTACTCGGGGAAC
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a
s	mr.mrrefChr5	166757	80	+	294542	CACATGACAAGCCTCTTGTTAGAGGCACCACACTCACAAATTATGAGTTTATTTCTAGTGAGTGATTTGCCTATGCAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	316733	80	+	636262	CACATGACAAGCCTCTTGTTAGAGGCACCACACTCACAAATTATGAGTTTATTTCTAGTGAGTGATTTGCCTATGCAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	308236	80	+	647215	CACATGACAAACCTCTTGCACGATGCGTTGCACTCATAAATTATGAATTTGTATCCAGTGAATGATTTGCCTATGCGTCT

a
s	mr.mrrefChr5	166837	10	+	294542	CTTCTGGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	316813	10	+	636262	CTTCTGGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	308373	10	+	647215	CTTTTGGATT

a
s	mr.mrrefChr5	166847	70	+	294542	TGGAGTATTTACAAGTTGTGGGCCATCTCGTGTGCCATGCACAGACTATAAGTTCTCAACTGACTGAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	316823	70	+	636262	TGGAGTATTTACAAGTTGTGGGCCATCTCGTGTGCCATGCACAGACTATAAGTTCTCAACTGACTGAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	308388	70	+	647215	TGGAGAATTTACAAGTTGTGGGCCAGCTCATGTGGCATGCACAGACTTCAAGTTCTGAACTGACTGGACC

a
s	mr.mrrefChr5	166917	71	+	294542	AGATTAATGAAGAGGGGATGCGATCAAAAGGATGGGAAGCAGTGACCTAAAAAATGATTACTCTCTAGGCT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	308459	71	+	647215	AGATTAGTGAAGAGCAAATACGATCAGAAGTATGGAAAGTAGTGACTCAAGATATGATTACTCTCTTAACC

a
s	mr.mrrefChr5	166988	11	+	294542	CAATGAATTCT
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a
s	mr.mrrefChr5	166999	88	+	294542	GGATCATCCCTACAAATATCATCAGATGTGGAAACTCAAGTGGACCTAACTAAAGTTCAGTTTTACACAATTTGCCAAGCTAATTTTA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	308541	88	+	647215	GGATCATCCCTACAAATACCATCAGATGCGGAAACTCCAGTGGATCCGGCTAAAATTCAGTTTTACACAATTTGCCAAGCTAATTTAA

a
s	mr.mrrefChr5	167087	3	+	294542	GAA
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a
s	mr.mrrefChr5	167090	61	+	294542	ATTCTTTCTACACAGTTTATGAAGTTTGCCTCTTACTGGAGCTTTGCATGAGGCATTGTGT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	308646	61	+	647215	ATTCTGTCTACTCAGTTCATGAAGTTTGCCTCTTATTGAAGCTTTACATGATGCATTATGT

a
s	mr.mrrefChr5	167151	39	+	294542	AAATATAATCCATGTTAAGGTGCAACTCAGATGTAGGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	317136	39	+	636262	AAATATAATCCATGTTAAGGTGCAACTCAGATGTAGGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	308708	39	+	647215	AAATACAACCAATGTTAAGGTGCAACTCAGGTCGAGATT

a
s	mr.mrrefChr5	167190	19	+	294542	GCCAATGCAGGTTCCCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	317175	19	+	636262	GCCAATGCAGGTTCCCACA
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a
s	mr.mrrefChr5	167209	23	+	294542	TTGGTCTGGCTTACTTCACAAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	317197	23	+	636262	TTGGTCTGGCTTACTTCACAAGG
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a
s	mr.mrrefChr5	167232	131	+	294542	CATTCCCAGCAAGAGGTTTCCTGTTCTAGCTGCTTTCCCAGCAAGAGGTATCCCAGGCTACATGTCAACTTCATGAGACTTCTCACAGAACCTAATCAGGCACTGCGGTACTGCACAATGTATGCATTTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	317222	131	+	636262	CATTCCCAGCAAGAGGTTTCCTGTTCTAGCTGCTTTCCCAGCAAGAGGTATCCCAGGCTACATGTCAACTTCATGAGACTTCTCACAGAACCTAATCAGGCACTGCGGTACTGCACAATGTATGCATTTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	308792	131	+	647215	CATTCCCAGCAAGAGGTTTCCTGTTCTAGCCAGATTCCCAGCAACAGGAATCATGTTCTACATATCAACTTCAAGAGACACCTCACAGAACCTATTCAGGTTGTGGGGTGTTGTACAATGTATGCACTTCC

a
s	mr.mrrefChr5	167363	101	+	294542	AAAATATCGTGCATTATATGCATTTCCAAACTTTTCTGGTATAACTCACCCTTCTACCTAAGAGCTTGTTGGATCGCTTGAGTCCTTCTAGGATAAGACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	317353	101	+	636262	AAAATATCGTGCATTATATGCATTTCCAAACTTTTCTGGTATAACTCACCCTTCTACCTAAGAGCTTGTTGGATCGCTTGAGTCCTTCTAGGATAAGACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	308924	101	+	647215	AAAAGATCGTGCATTATATGCATTTTCAAACTTTGCTTGTACAACTCGTCCTTCCACCTAAGAGCTTGTTGGATTGCTTGAATCCTTTTAGGATAAAACAA

a
s	mr.mrrefChr5	167464	21	+	294542	ACTATGCACACTGAATTACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	317455	21	+	636262	ACTATGCACACTGAATTACTT
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a
s	mr.mrrefChr5	167485	16	+	294542	AAGACTTGCATAACAG
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a
s	mr.mrrefChr5	167501	15	+	294542	TCCAGACAATGATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	317492	15	+	636262	TCCAGACAATGATAT
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a
s	mr.mrrefChr5	167516	25	+	294542	ACTGGAATCGTACTGTATCATCCAA
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a
s	mr.mrrefChr5	167541	25	+	294542	CCCGACTCACAATGCTTCTCTCAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	317581	25	+	636262	CCCGACTCACAATGCTTCTCTCAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	167566	177	+	294542	TTACAAACTAATGGACAATTCCATCCCTATACCATTCATAAATTCCCAACTAACCTTGTTCAGCCTTTGAAGAGACCATTGCATTCAATACATAGGCCATTGGCCCTAGTACTATTCCAATTCCATAGACTGGTGAGATTGGTGCAAAATTCAAATTATTCCTACATTGCTTTTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	317610	144	+	636262	TTACAAACTAATGGACAGTTCCATCCCTTTATCACTCATAAATTCCCAACTAACCTTGTTCAGCCCTTGAACAGACCATTGCATTCAATACATAGGCCATTTACCCTAGAACTATTCCAATTCC---------------------------------ATTCCTACATTGCTTTTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	309130	177	+	647215	TTGCAAACTTACGTACAAGTCCATCCCTATACCATGCATAGATTCCTGACTAACCTTGTTCAGCCTTTGAAGAGACCATTGCATTCAATACATAGGCCATTGGCCCTAGTACTATTTAAATTCCATAGACTGGTGAGATTGGTGCAAAATTCAAATTATGCCTACATTGCTATTTTG

a
s	mr.mrrefChr5	167743	237	+	294542	CTTTTGGCATATAATAGGTTGTTTATCCATGAGATGTATAGGAAACTTATCTCACCCAATAAGTAAACAAAACTTATTATCTGGGTTCAGGCACATTAGAGTGCTGTGGCACAGTACAAGTGTGAGTTTGCTGCCCTCATTCTCAGGAACCTGTCAGGCACTCAAACTGTACAAAATAGAACAGTCTACACACTCATGTGTGGGATCCTGTCAGATTTCATATTCTGACTGAAGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	317754	232	+	636262	CCTTTGGCATATAATAGGTTGTTTATCCATGAGATGTATAGGAAACTTATCTCACCCAATGAGTAAACAAAACTTATTATCTGGGT-----CACATTAGAGTGTTGTGGCCCAGTACAAGTGTGAGTTTGCTGTCCTCATGCTCAGGAACCTGTCAGGCACTCAAACTGTACAAAATAGGACAGTCTACACACTCATGTGTGGGATCCCGTCAGATTTCATATTCTGACTCAAGTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	309308	230	+	647215	CTTTTGGCATATATTAGGTTATTTATCCATGAGGTATATAGGAAACTTATCTCACCGAATAGGTAAACAAAACTTATTATCTGGGTTCAGGCATAT-------CTGTGGCACAGTACAAGTGTGAGTTTGCTGCCCTCATTCTCAGGGACCTGTCTGGCACTCAAAATGTACAAAATAGAACAGTCTACACACTAATGTGTGGGGTCCTGCAAGATTTCATATTCAGACTGAAGTGT

a
s	mr.mrrefChr5	167980	9	+	294542	CTCAGGTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	317986	9	+	636262	CTCAGGTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	309606	9	+	647215	CTCAGGTGA

a
s	mr.mrrefChr5	167989	98	+	294542	TTGCCTGGATAGCTCTACCTCTGTTCCAATTTGTCCTTCTTGCTCCTGGGAATAGTTTCTTGAGAATAGTCTCTTTTTGTAGCCCGAAACCCACAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	317996	98	+	636262	TTGCTTGGATAGCTCTACCTCTGTTCCAATTTATCCTTCTTGCTCCTGGGAATAGTTTCTTGAGAATAGTCTCTTTTTGTAGCCCGAAACCCACAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	309615	98	+	647215	TTGCCTGGATAGCTCTACCTCTGTCCCAATTTGTCCTTCTGTCCCCTGGGAATAGTTTCTTGAGAATGGTCTCTTTTTGTGGACCACAACCCAGAACA

a
s	mr.mrrefChr5	168087	31	+	294542	CTTGTTCCACTTAGTTCCATCCATTGCCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318094	31	+	636262	CTTGTTCCACTTAGTTCCATCCATTGCCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	309718	31	+	647215	CTTGTCCCACTGAGTTTCATCCATTGCCAAT

a
s	mr.mrrefChr5	168118	90	+	294542	GTATCCTATTTTCTATATACTTGGTAAGCCTCTGATATGTGTTTCTTGCTCTTGAGAACAGTTTCTTTAGAATAGTCTTTTTTTGTGGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318125	90	+	636262	GTATCCTATTTTCTATATACTTGGTAAGCCTCTGATATGTGTTTCTTGCTCTTGAGAACAGTTTCTTTAGAATAGTCTTTTTTTGTGGGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	309750	90	+	647215	GTATTCTATTTTCTATATACTTGGTAAGCCTCTGATTTTTCTCTCTCGCTCCTGGGAACATTTTCTTGAAAATAGTCTCTTTTTGTGGGC

a
s	mr.mrrefChr5	168208	26	+	294542	CCATTTGGTTTAGTCCATTGCCAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318215	26	+	636262	CCATTTGGTTTAGTCCATTGCCAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	309860	26	+	647215	CCACTTAGTTTAGTCCATTGCCAATT

a
s	mr.mrrefChr5	168234	119	+	294542	GAATTCTATTTTCTATGTACTTGAAAAGCCTGCCTAGGTGTACTCCTTTCCTGAGTTAACAGCTCCAACTACAGACTTCATGAGCTGGGGCAGCCTAAACACCTAGTATTCATCATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318241	119	+	636262	GAATTCTATTTTCTATGTACTTGAAAAGCCTGCCTAGGTGTACTCCTTTCCTGAGTTAACAGCTCCAACTACAGACTTCATGAGCTGGGGCAGCCTAAACACCTAGTATTCATCATCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	309887	119	+	647215	AAACTCGATTTTCTATGTATTTGGTAAGCCTGCCTGGGTTTACACCTTTCCTGAGTTGACAGCTACAACTATAAACTTTATGAGCTGGGGCAACCTAAACATCTAGGATTCATCAGCAA

a
s	mr.mrrefChr5	168353	72	+	294542	GTTGGAAACTGGCCTCTCTCCCTTCATTGGTCAAAGCTCACGTCAGCCTTCTATAGTGACTATAAACAATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318363	72	+	636262	GTTGGAAACTGGCCTCTCTCCCTTCATTGGTCAAAGCTCACGTCAGCCTTCTATAGTGACTATAAACAATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	310006	72	+	647215	ATTAAAAACTGGCCTCTCTCCCTTCTTTGGCTAGAACACACATCAGCTTCCTATAGTGACTGCAAACGATGG

a
s	mr.mrrefChr5	168425	43	+	294542	CTGCTCCACAGCACTGAGATACATGCTAATGATATCCAGGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318437	43	+	636262	CTGCTCCACAGCACTGAGATACATGCTAATGATATCCAGGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	310078	43	+	647215	CTGCTCCAAAGCAATGAGATACATGTTAATGATATCCAGGGTG

a
s	mr.mrrefChr5	168468	103	+	294542	AATTCATTTTCTCTCATAGGACAACCTCTTCTTGTCTTAGAGGACAGACTTCTTGACTAGAAGCTTTCCTGCATTGGTTTATGGATGCGTTTACAGGACAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318480	103	+	636262	AATTCATTTTCTCTCATAGGACAACCTCTTCTTGTCTTAGAGGACAGACTTCTTGACTAGAAGCTTTCCTGCATTGGTTTATGGATGCGTTTACAGGACAGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	310137	103	+	647215	AATTCATTTTCTCTCATAGGTCAACCTCTTCTAGTCTTAGGGAGCAGACTCCTAGACCTGAAGCCCTCCTGTATTGGTTTATGGATTTGTTGACAGGACAGAA

a
s	mr.mrrefChr5	168571	20	+	294542	CTGACTACTTATATGTGTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318583	20	+	636262	CTGACTACTTATATGTGTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	310253	20	+	647215	CTAAACATTTATACGTGTAG

a
s	mr.mrrefChr5	168591	11	+	294542	CATGTAAGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318603	11	+	636262	CATGTAAGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	310274	11	+	647215	CATATAAGTTT

a
s	mr.mrrefChr5	168602	61	+	294542	ATATTTCAAAGCTTATATAAAGTGAAACAGCAAATTAACTTACTGGACTGTTATGTGAGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318628	61	+	636262	ATATTTCAAAGCTTATATAAAGTGAAACAGCAAATTAACTTACTGGACTGTTATGTGAGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	310285	61	+	647215	ATATTTGGAAGTTTATACAAAGTGATAAAGTAAATTAACTGACTAGAGTGTTATGTGAGCC

a
s	mr.mrrefChr5	168663	46	+	294542	ACAAGCGCAATCATGAACAATCTGCTGTTGGCAGCGAGTCTGCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318691	46	+	636262	AAAAGCGCAATCATGAACAATCTGCTGTTGGCGGCGAGTCTGCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	310346	46	+	647215	ACAAGCGTAATCATGAACAATCTGCCTTTGGCAACTAATCTGCATT

a
s	mr.mrrefChr5	168709	139	+	294542	CATATCTGCCTGTGTAACTGACCTAGATTTTATGGATTGAAATTATTGTGCAATAAACTGATTCTTGCCCATTGACCATATGGTCTAATGATGTTTCTACACCACAGCTGGAAGAAAACTAGTGGTAATGCCAGCTGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318746	139	+	636262	CATATCTGCCTGTGTACCTGACCTGGATTGAATGGATTGAAATTACTGTGCAATAAACTGATTCTTGCCCATTGACCATATGGTCTAATGATGTTTCTACACCACAGCTGGAAGAAAACTAGTGGTAATGCCAGCTGGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	310392	134	+	647215	CATATCTGCCTGTGTAATTGACGTAGATTTTATGGATTGAAATCATTGTGCAATAAACTGCTTC-TGCCCATTGACCATA-GGTCTAACAATGTTTCTACGCCACAACTGGAAG---ACTAGTGGTTATGCCAGTTGGC

a
s	mr.mrrefChr5	168848	111	+	294542	TATTCTCAGCCAGTACCAGAAGCATTTGGCAAGATAATTAACCTCGCTATGAGCTTTGATGTGAGGATAAAAAGTTATAAAGACATGGTCTACACTGTGGATTGCCACATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318885	109	+	636262	TATTCTCAGCCAGTACCAGAAGCATTTGGCCAGATAATTAACCCTGCTATGAGCTTTGATATGAGGAT--AAAGTTATCAAGACATGGTCTACACTGTGGATTGCCACATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	310539	111	+	647215	TATTCTCAGCCAGTACCAGAAGCATTTGGCAAGATAATTAACCTCGCTATGAGCTCTGACGTGAGGATAAAAAGTTATAAAGACAAGGTTTATGCTGTGGATTGCCATGTT

a
s	mr.mrrefChr5	168959	14	+	294542	TGGGTGTGGTGAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	318997	14	+	636262	GGGGTGTGGTGAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	310650	14	+	647215	TGGGTGTGGTGAGA

a
s	mr.mrrefChr5	168973	432	+	294542	ATATGGAATATGTGTGATTCTCTGTTACAGCAAGATGGGTCAAGACTACAAGCTCAGTATGTGTAATTCCCATTAGGTAATACCTTGATTTTTAAGCCTACAAATGTCCAAGTATCTGCACCACTCTTGGTATGCTTTACAGGGCTGAAATCGTGGCCCAGTTCATGAACATACAGGCTGGGAGACTGGCCTCAAACCATGTCTATCATTTTATTAAACTTTCTAACTCCAGCATTCTTAAAACCTAAGTCCTCTGACCCTAAAGTGTGACTTTAAGTATCATTCGGGCTCCACTTTAGAATCACACAGTTATTAATAACTTTGGTATCTTGATGGAATGTATGCAGGAAAAAACCATGAATCAAGTTCTCCTTGGGGCATATATTGCCCCACACAATTAATTTTGAGGATAAAATAGAAAGGACATAGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	319011	431	+	636262	ATATGGAATATGTGTGATGCTCTGTTACTGCAAGATGGGTCAAGACTACAAGCTCAGTATGTGTAGTTCCCATTAGGTAATACCTTGATTTTTAAGCCTACAAATGTCCAAGTATCTGCACCACTCTTGGTATGCTTTAGAGGGCTGAAAGTGT-GCACAATTCATGAACATACAGGCTGGGAGACTGGCCTCAAACCATGTCCATCATTTTATTAAACTTTCTAACTCCAGCATTCTTAAAACCTAAGTCCTCTGACCCTAAAGTGTGACTTTAAGTATCATTCGGGCTCCACTTTAGAATCACACAGTTATTAATAACTTTGGTATCTTGACGGAATGTATGCAGGAAAAAACCATGAATTGAGTTCTCCTTGAGGCATATATTGCCCCACACAATTGATTTTGAGGATAAAATGGAAAGGACATAGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	310717	429	+	647215	ATATGGAATGTATGTGATTCTCCATTACAACAAGATGGATCAAGACTGCTAGCTCAGTATGTGTCATTCCCATTAGGTAATACCCTGATTTTTGAGACTACAAATATCCAAGTATCTCCATCGCTCTTGGCATTCATTACAGGGGTGAAATCGTGGCCCAGTTCATGAACATACAGGTAGGGAGACCGGCCTCAAACCATTAGTATCATTTTATTAAACTCTGTAACCCCAGCATTCTTAAATCCTAAGTCCTCTGACCTTACAGTGTGACTTTAAGTATCATTCGGGCTCCACTTTAGACCCACGCAG---TTAACAATTTTGGTATCTTGATGAAATGTATGCCGGAAAAAACCATGAATCAAGTTCTCCTTGGGGCATATATCGCCCCACACAATTAATTTTGAGGATAAAATAGAAAGGACATAGACA

a
s	mr.mrrefChr5	169405	21	+	294542	ATATGGATAGATCACATTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	319442	21	+	636262	ATGTAGATAGATCACCTTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	311183	21	+	647215	ATATGGATAGATCTCATTCGA

a
s	mr.mrrefChr5	169426	64	+	294542	ATAACACAGTACGCTGGTTGCAAGTTGTTTCCTTCTACTATAGTACAGGGATTTTGTGAGGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	319465	64	+	636262	ATAACACAGTACGCTGGTTGCAAGTTGTTTCCTTCTACTATAGTACAGGGATTTTGTGAGGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	311204	64	+	647215	ATAGCATAGTACACTGGTTGCAAGTTGTTTCCTACTACTATAGCACATGAATTTTATGAGGCAT

a
s	mr.mrrefChr5	169490	248	+	294542	ATAGAGGAGCACAGCATTGTATCTTTAGGGTGAATTGTATTGCAGTATTGGTTTGCTCATAATTGGCCCACCAAAGGATTGTTGAGGTGACTGTACCCCACACCTCCAGGCCTCCCATCCAGTACAGCTATTTCAATTGTATGATGGGCGACTAGGCAACAATGGCTGCAGTCTAGGCAGTTGAAACATTTTTTACTTTGGTACCTGCATATATTCTCTGGCTATTAATTCGGTTGCATGGTGTACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	319535	239	+	636262	ATAGAGGAGCACAGCATTGTATCTTTAGGGTGAAT--TACTGCAGTATTGGGTTGCTCATAATTGGCCTACCAGAGGCTTGTTGAGG-------ACCCCACACCCACAGGCCTCCCATCCAGCATAGCTATTTCAATTGTATGAAGGGCGACTAGGCAACAATGGCTGCAGTCTAGGCAGTTGAAACATTTTTTACTTTGGTACCTGCATATATTCTCTGGTTATTGATTCAGTTGCATGGTGAACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	311268	246	+	647215	ATAGAGGAGCACAGCATTGCACCTTTAGCATGACTTGTGTTGCAGTATTGGTTTGCTCATAATTGTCCCACCAACGTATTGTTGAGGTGACTGTACCCCACATTTCCAGAGCTCCCATCCAGTGCAGCCATCTCAATTGTATGATGGGAGACTCGGCAGTGATGGCTGCAGTCTAGGCAG--GAAATATTTTGTACTTGGGTACCTGCATATATTCCCTGGCTATTAATTCGGTTGCATGGTGTACTT

a
s	mr.mrrefChr5	169738	129	+	294542	AGCTACTCTCCTTATTCGTCAGGAGGGTGCGAAGGTGTTTATGGATAGATCATGTGGTCTACACACATCTTGTATTCACAGAATTCTGAAATTAAAACATTTAGTCTTCCCAAATCTACTTATGATATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	319809	129	+	636262	AGCTACTCTCCTTATTCGTCAGGAGGGTGCGAAGGTGTTTCTGGATAGATCTTGTGGTCTACAAACATCTTGTATTCACAGAATTCTGAAATTAAAACATTTGGTCTTCCCAAATCAACTTATGATATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	311514	127	+	647215	GGCTACT-TCCTCATATATCAGAAGGGTGAGAAGGTGTTTATGGATAGGTCATGTGGTCTACACG-ATCTTGTAATCACAGAATTTTGAAATTAGAACATTTAGTCTTGCTAAATCTACTTCTGACATG

a
s	mr.mrrefChr5	169867	95	+	294542	TACCGTTCAAGATTGAGTGGTGCTTGTCCCCAACCAAGATAGAAAAAATACTTTACCTTCTCCAGGGAAGTAATATTCAGCTGAGTAGTAAGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	319938	95	+	636262	TGCTGTTCAAGATTGAGTGGTGCTTGTCCCCAACCAAGATAGAAAAAATGCTTTACTTTCTCTGGGGAAGTAATATTCAGCTGAGTAGCAAGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	311695	93	+	647215	TACCGGTCAAGATTGAGTGGTGGTTGTCCCCAACCAAGATAGAAGAAATACTTTACCTTCTACAGGGAAGTAATATTCAGCCAAGTTGTAAGG--

a
s	mr.mrrefChr5	169962	171	+	294542	ACACACCAGCAGCCTCATGTTAAATAGATCCCCCATGGTGCTCAGGTTCAAAAAGGAGAGGGAAGAGTTTACAAAACTAGATCAGAAGTTTGATATTCAAAAGGTTGGGTCGGACAAGGTTGCTATTAGGATTCTATAGCATACCCCTAGTCAGTCTCCTGACAGGAACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	320035	171	+	636262	ACACACCAGCAGCCTCGTGTTAAATAGATCCCCCATGGTGCTCAGGTTCAAAAAGGAGAAGGAAGAGTTTACAAAACTAGATCAGAAGTTTGATATTCAAACGGTTGGGTTGGACAAGGTTGTTATTAGAATTCTATAGCATACCCCTAGTCAGTCTCCTGACAGGAACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	311788	145	+	647215	--ACCCCAGCAGACTCATGTTAAATAGATCCCCCATGGTGCTCAGGTTCAAAAAAGAGAGGGAAGAGTTTACAAAACTAGATCAGATGTTTGATATTTGAAAAGTTGGGTCAGACAAGGTTGCTATAAGGATTCTATAGCACACCCC------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	170133	35	+	294542	AGAAAATAGGTAGCAACCACCAGTCAATGCAGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	320213	35	+	636262	AGAAAATAGGTAGCAACCACCAGTCAATGCAGGAG

a
s	mr.mrrefChr5	170168	4	+	294542	ACCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	320342	4	+	636262	ACCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	311933	4	+	647215	ACCC

a
s	mr.mrrefChr5	170172	30	+	294542	AGACCAGACCTTATCAAGGAGTGTGGGTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	320346	30	+	636262	AGACCAGACCTTATCAAGGAGTGTGGGTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	311939	30	+	647215	GGACCAGACCTTATCAAGGACTGTGGTCCC

a
s	mr.mrrefChr5	170202	20	+	294542	ACCCATTACGATGTAGCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	320383	20	+	636262	ACCCATTACGATGTAGCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	311969	20	+	647215	ACCCATTACGATGTAGCACT

a
s	mr.mrrefChr5	170222	102	+	294542	TGACGCGTGTCATACCTGGACCAGATTTATTAATGACTATGGGTCCACCTACCTCAATGTAGGTCTCACTGGGGGAAATGAATTTCACTTCTACAGCAGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	320403	101	+	636262	TGACGCGTGTCATACCTGGACCAGATTTATTAATGACTATGGGTCCACCTACCTCAATGTAGGTCTCACT-GGGGAAATGAATTTCACTTCTACAGCAGGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	311999	102	+	647215	TAATGACTGGCATACTTGGACCAGACTTATTAATGACTGTGGGTCCACCCATCTCAGTGTAGCACTCATTGGGGGAAATGAATTTCACATCTACAGCAGGCA

a
s	mr.mrrefChr5	170324	21	+	294542	AGGTCAGATTGCTTATCATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	320504	21	+	636262	AGGTCAGATTGCTTATCATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	312106	21	+	647215	AGGTCAGATTGCTTATTATCA

a
s	mr.mrrefChr5	170345	120	+	294542	ATTGCACTTGTCACACTATCTCCGCTATATATGGGGTTTGATCAATGAAGATTCAACTTTCCATGAGTCCTTTTTGTTTATATTGTTAAATCACCCGTGATATCCTAGCAAATTTCCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	320525	119	+	636262	ATTGCCCTTGTCACACAATCTCCGCTATATATGGGGTTTGATCAATGAAGATTCAACTTTCCATGAGTCCTTTTTGTTCATATTGGTAAATCA-CCGTGATATCCTAACAAATTTCCTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	312135	114	+	647215	ATTGCACTTG-----CTATCT-TGCTATATATGGGGTTTAATCAATGAACATGCAACTTTCCATGAGGCCTTTTTGTGTATCTTGTTAAATCACCCGTGATATCCTAGCAAGTTTCCTTA

a
s	mr.mrrefChr5	170465	148	+	294542	ATGAGGCAGAACAGCAACCACTATCTGAAGAGTTGGGAATGGTACTATGCATAAGTAAATCCGCTTGATGAAAACCAACTCAAAAACTGCTTCTGGAGGCTCCAGAGTCTAGATGCTCTAAACACCCAAGTATTTGGAGGCTTCTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	320694	122	+	636262	ATGAGGCAGAACAGCAACCACTATCTGGGGAGTTGGGAATGGTACTATGCATAAGTGAATTCGC---ATGTAAACCAACTCAAAAACTGC-----------------------TGCTCTAAACACCCAAGTATTTAGAGGCTTCTAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	312249	148	+	647215	ATGAGGCAGAACAGAAACCACTATCTGAAGATTTGGTAATTGTACTGTGCATATGTAAATCAGCTTGATGAAAACCAACTCCAAAACAGCTTCTGGAGGCTCCAGAGTCTAGATGCTCTAAACACTCAAGTATATGGAGGCTTCTGGA

a
s	mr.mrrefChr5	170613	122	+	294542	TGATGTATGGATCCTCAGTCAATGGCTTTCCTCTCCTACAGCTCTTTGAAATACCCCATATCATTAGAAACAAACTTACTTTATGTTTACTTTGCTAACCTTCCAGGCCTTATGACCTTAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	320816	122	+	636262	TGATGTATTGATCCTCAGTCAATGGCTTTTCTCTCCTACTGCTCTTTGACATGTCCCATATCATTAGACACAAACTTACTTTATGTTTACTTTGCTAACCTTCTTGGCTTTAAAATCCTAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	312420	122	+	647215	TGCTGTATGGATCCTCAGTCAATGGCTTTCCTATCCTACAGCCCTTTGAAATACCCCATATCATTAGAAACAAACTCACTATATGTTGATTATAGTGGCCTTCCAGTGCTTGTGGCTTCAAT

a
s	mr.mrrefChr5	170735	196	+	294542	TCTTAACATTATTTCGGAAGATGTAATACCTCAACTCAATATGTATGATATTAAATGACATCAGAGATGGCTATGCCTACTGCACTAACCTAGTAGGTCTTATGATTATAGTCAATTAGAGCATAACATATGTCTGCCTGAAGAGTGCGTCCTTTCTGTGTACATAACAGGTCCAATGGTCACATTATGCAAGGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	320940	196	+	636262	TCTTAACATTATTTCGGAAGATGTAATACCTCAACTCAATATGTATGATGTCAAATGACACCAGAGATAGCTATGCCTACTGCACTAACCTAGCAAGTCTTATAATTATAGTCAATTAGAGCATAACATATGTCTGCCTGAAGAGTGCGTCCTTTCTGTGTATATAACAGGTTCAATGGTCACATTATGCAAGGGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	312542	196	+	647215	CCTTAACATTATTTCGCAAGATATAATACCTCAACCCAATATGTATGATATTAAATGACATCAGATGCGGCTATGCCTGTTGCACTAACCTAGTAGGTCTTGTGATTATGGTCAATTAGGGCATAGCTTATGTCTGCCTGAAGAGTGCATCCTTTCTGTGTACATAAGAGGTCTGATGGTCACATTATGCAAGGTC

a
s	mr.mrrefChr5	170931	167	+	294542	AATGTATTACAATCATCACAATGTCAATTAATGCCCACCCCAGGCTGCTCCTAACTTAACACTTTTAACCATGATAAGTACAATAATAGCCCAGATATTTAGGGGACCTGGTAGTGGGGAACACCTGAAAATGCAAGCCCATACTAATATGATCCCACACTATCAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	321136	167	+	636262	AATGTATTGCAATCATCACAATGTCAATTAATGCCCACCCCAGGCTGCTCCTAACTTTACACTTTCAACCATGTTAAGTACAATAATAGCCCAGATGTTTAGGGGACCTGGTAGCGGGGAACACCTGAAAATGTCAGCCCATGCTAATATGATCCCATGATATCAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	312740	167	+	647215	ATTGTATGACAATCATCAAAATGTCAATTGAAGCCCACCCCAGGCTGATCCTAACTTAACACTTTTAACCATGAGAAGAACAATCATATTACAGACATGTAGGGAACCTGAGAGTGGGGAACACCTGAAAGTGCAAGTCCATACTAATATGATTCCACACCATCAGC

a
s	mr.mrrefChr5	171098	166	+	294542	AGGCAAAGAGATGTGGCACATTTGACAACAAGATGCATCAAAATGCCTCATGTCTCGGGAAGTCCCACTTCATGATTAAGGTCCAGGAGGCAAGGTCTCAAGAAAACAGGCTGCTGTGCTTGAGCACCCCTCCATGTGGGGATTATAACCCTTGTCTATGTCCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	321303	166	+	636262	AGGCAAAGGGATGTGGCACATGTGACAACAAGATGCATCAAAATGCCTCATGTCTCTGGAAGTTCCACTTTATGATTAAGGTCCAGGGGGCAAGGTCACAAGAAAACAGGCTGCTGTGCTTGGGCACCCCTCCATGTCGGGATTATAACCCCTGTCTATGTCTAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	312946	165	+	647215	AGGAAAAGAGATGTGGCACCTTTGACAACAAGATGCATCAACATGCCTCATGTCTTGAAGAGTCCCCCTTCATGATTAAGGTCCAGAAGGCAAGGTCTTAAGAAAAAAGGCTGATGGGCTTGAGCACCCCTCCATGTGGGGATTATAACACTTGTCTATG-CCAGA

a
s	mr.mrrefChr5	171264	157	+	294542	ATGTCGAGACAAAACCTGGCCAATGTCAATGTCCTGAAAGACCATACAGCCTCATGCTGAGGTATCACTGGCAAGATGAGGTTGGGCAATCTTCACTTTGCACTGTGGTTGGGTATCTTTTTATGACTTAGCCCTCAATCTTGACAACCCTAGTTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	321470	155	+	636262	AAGTCTAGACAAAACCTGGCCAATGTCAATGTCCTGAAAGACCATACAGCCTCATG-TGAGGTATCACTGGCATGATGAGGTT-GGCAATCTTCACTTTGGACTGTGATTGGGTACCTTTTTATGACTTAGCCCTCAATCTTGACAACCCTAGTCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	313111	157	+	647215	ATGTAGAAACAAAACCTGGCCAATGTCAATGTCCTGAAAAACCCTACTGCCTCATGCTGAGATATCACTAGCAAGATGAGGTCGGGCAATCTTCACTGTGCACTGTGGTTACGTATGTCTTTATGACCTAACCCTCAATCTTTACAACCCTAGTTAC

a
s	mr.mrrefChr5	171421	63	+	294542	TGCACCACCTTAACTATAATCCTTTATCCCGCTATGATTGCATTAAAGCTGAACCCTTCAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	321625	61	+	636262	TGCACTGCCTTAACTATAACCCTTTACCCCGCTAGGATTGCATTAAAGCTGAACCCTTCAG--
s	simRat_chr6.simRat.chr6	313279	59	+	647215	TGCCCCACCCTAACTAGAATGCTTTATCC--CTATGATTGCA-TAAAACTGAA-CCTTCAGGT

a
s	mr.mrrefChr5	171484	113	+	294542	ACCCAATATGTAGTAGCCCTCACCTTGATTTGGCAAGGAGAATGCATATAAGCCCTTAGTACCATGATTCTCCAATGAATAGGAGAGTAATAAGTCAAGAACCTGAACATTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	321686	113	+	636262	ACCCAATATGTAACAGCCCTCACCTTGATTTGGCAAGGAGAGTGCATATAAGCCCTTAGTACCATGATTCTCCAATGAATGGGAGAGTAATAAGTCAAGAACCTGAAGATTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	313339	112	+	647215	ACCCAACATGTAGTAAAACTCACCTTGACTTGGC-AGTAGAATGCATATAATCCCTTAGTGCCATGATTCTCCAATGAATAGGACAGTAATAAGTCAGGAACCTGAACATTCA

a
s	mr.mrrefChr5	171597	80	+	294542	TATATGGCTTTTGGGAACCCCAGGGTCTAAGTTCATTGAGCTACAGGGTCACAATAGAGACTATTGAGTCCTCAGAAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	321799	80	+	636262	TATATGGCTTTTGGGAACTCCAGGGTCTAAGCTCATCGAGTTACAGGATCACAATAGAGGATATTGAGTCCTCACAAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	313463	80	+	647215	TATATGGCTTTCGTGAACCCCAGGGTCTAAGTTCATTAAGCTACAGGGTCACAATAGAGACTATTGAGTCCTCAGAAGTT

a
s	mr.mrrefChr5	171677	34	+	294542	AGTGCCCTGCTGGAAATATTCCTATTTGCAATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	321896	34	+	636262	AGTGCCCTGTTGGAAATATTCCTATTTGCAGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	313543	34	+	647215	AGTGCCCTGCTGGAAATGTTCCTATTAGCAATAA

a
s	mr.mrrefChr5	171711	122	+	294542	cctcgacaaacaactcatagaggattgttagcatgtgatcctgctctgcctgctcgatcggcccgtcatctcttaggtgattctcttgatcagcccagttaataggttgtattatgctaata
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	323656	122	+	636262	cctcgacaaacaactcatagaggattgttagcatgtgatcctgctctgcctgctcgatcggcccgtcatctcttaggtgattctcttgatcagcccagttaataggttgtattatgctaata
s	simRat_chr6.simRat.chr6	315210	122	+	647215	cctctatacacaactcattgaggatcattagcatgtgattgtgctctgttggttcaatcagcccatcatctcttatgtgattctcctgattggccttgttaatgggttgtatagtgttaata

a
s	mr.mrrefChr5	171833	227	+	294542	aggtcttcatatcttgcacactcctgggatccctggggtgagttgcaagtgattgtaatgtattggctttccgaccatttgctggtagtttcggttggcaagtatctggttcaagttcctgtcttgcaagatcaaaaccacaggtctaactctctgtcctctcactatggctttacttggtttggataccagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	323797	227	+	636262	aggtcttcatatcttgcacactcctgggatccctggggtgagttgcaagtgattgtaatgtattggctttccgaccatttgctggtagtttcggttggcaagtatctggttcaagttcctgtcttgcaagatcaaaaccacaggtctaactctctgtcctctcactatggctttacttggtttggataccagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta
s	simRat_chr6.simRat.chr6	315332	227	+	647215	atgtcttcatttcttgcaccatcctggcattcctggggcgaattctgagtggttgtaatgaattaactgtctggccatttgctggtagtttcgcttggcaagtgtctgggtcaggttcccatctttcaagatcaaaaacaaaggtctaactctctgttctctcactgtggctttactcgatttggatatcagtatgatgcatgacttgtgcaaatagtttggtagta

a
s	mr.mrrefChr5	172060	95	+	294542	tccccttaatttcaatggactgtggatcaagaaCTTTAGCAGCTGTGTGGAATGACCTGGAACCATAGCATAGGTAGTCAAAACCAAAAATGTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	324025	95	+	636262	tccccttaatttcaatggactgtggatcaagaaCTTTAGCAGCTGTGTGGAATGCCCTGGAACCATAGCATAGGTAGTCAAAACCAAAAATGTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	315559	95	+	647215	tccccttgctttcaatgaattgtggctcgggAACTTTACCAGCTGTGTGGAATGACCTGTAACCATAGTGTGGGTAGACAAAATCAAAAATGTTC

a
s	mr.mrrefChr5	172155	104	+	294542	AAGCTTGTCTTCAAATTGCATGAAGTCACACCTTGATGGCATGATCCTTGCCTCTTTGTAGAAAACAATCATGTTCCCTGCTTCTTAGAAGTAAACAGTGGCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	324120	102	+	636262	AATCACACCTTCAAAT--CATGCACATAGATCTGGGTAGGATGATCCTTGCCTCTTTGCAGAAAATAATCATGTTCCCTGCTTCTTAGAAGTAAACAGTGGCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	315655	104	+	647215	AAGATTGTCTTCCATTTGCATGAAGTCACACCTTCAAGGCATGATCCCTGCTTCCCTGTAGAAAACAGTTGTGTGCCCTGCTTCCTAGAAGAAAACAGTTGCAC

a
s	mr.mrrefChr5	172259	153	+	294542	TATGATTCTGTGGAATTCTCAGAGATAAGATCACTTACACTCTTACATCCCATATATATGTTTATAGTATCCTCAAGTGGTTATTATGGTCATGGCATCAAACCAGTCCGCAAGTAGATCGGTAGATCTAGGATAGTGTGAACTGGCTGCACG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	324222	153	+	636262	TATGATTTTGGAGAATCCTCAGGGATAAGATCACTTACACTTTTACATCCCATATGTACGTTTATAATATCCTCAAGTGGTTATTATGGTCATGGTATCAGACCAGTCCGCAGGTAGATTGGTAGATCTAGGATAGTGTGAATTGGCTGCACG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	315761	144	+	647215	TATGATTCTGTGGAATTGTCAGAAATAAGATGACTTACATTCTTGCATGTCATCTATATGTTTATAGTATCCTCAAGTGGTTGTTATGTTCACGGCACCAAATCAGTTGGCAAGTAGATCGGTAGATCTAGGATAGTGAGAACT---------

a
s	mr.mrrefChr5	172412	111	+	294542	TACTTGAATGATAATAATAAGTTAAGAGGTCAATAATTTGCCAGAGATCTTGAATCAGAACATAGCCAAATTACAACAGCCAGGTAATCCCAGTTTGTGTCTGCACGTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	324376	109	+	636262	TACTTGAATGATAATAGTAGGTTAAGAGCTCAATAATTTGCCAGAGATCTTGA--CAGAACATGACCAAATTATAACAGCCAGCAAATCCCAGCTTGCGTCTGCATGCTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	315905	107	+	647215	--CTGGAATGCTAATAATAAGCCAAGAGGTCAATAAT--GCCAGAGACCTTGAATCAGAACATAGCCAAATTACAACAGCCAGGTAATCCCAGTTTGTGTCTGCCCGTTGA

a
s	mr.mrrefChr5	172523	15	+	294542	CCCCACCTAGAGAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	324486	15	+	636262	CCCCGCTTAGAGAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	316012	15	+	647215	CCCCACCTAGAAAAC

a
s	mr.mrrefChr5	172538	114	+	294542	GCCTGGTAGTTGTTGTTTTTTAGGGCATACTTTGTTACTGTTTGCGTGACTTTCACTCTCCCAGAGATTAGGTTGTTGGACTCCAGAAGGGACAGAGCTAAAGAGCGGCTTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	324505	114	+	636262	GCCTGGTAGTCTTCGTTTTTTAGGGCATACTTTGTTACTGTTTGGGTGACTTTCTCGCTTCCAGAGATTAGGTTGTTGGACCCCAGAAGGGACAGAGCTAAAGAGCGGCTTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	316027	87	+	647215	GCCTGGTAGTTGTTGTTTTTTAGGGTGTACTTTGTTACTGTTTCCGCGACTTTCACTCACCCAGAGTTTAGGTTGTTGGACTCCAGA---------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	172652	176	+	294542	TGATGGTCTGTCATGGTATTCATTAGTGTACATGAGCTTAGCAAAACAATCTCGTATGCCCAAATGCTGCCTGTATTTGCTTTGCTTGTGTAGAGTGATGTAAACGAAAAATCTGGATATTACACTCAAAAAGTTCATTAAGGCAGTCCTCCCAATTCTGATCCGTAAGTAACCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	324620	175	+	636262	TGATGGTCTGTCATGGTATTCATTAGTGTACATGAGCTTAGCAAAACAATCTCGTATGCTTAAATGCTGCCTGTATTTGCTTTGCTTGTGTAGGGTGATGCAAACGAAAAATCTGGATATTACACTCAAAAA-TTCATTAAGGCAGTCCTCCCATTTCTGATCTGTAAGTAACCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	316114	113	+	647215	----------------------------------------------------CATATGCCCAAACGCTGCCT----TTGCTTTGTTTGTGTAGAGTGATGTAAACGAAAAATCTGGATATTACACTCAAAAAGTACATTAAGGCAGTCCTCCTAATTCTGACACGTAAG-------

a
s	mr.mrrefChr5	172828	289	+	294542	TACTAACTTACTCATTATTTAAACAGCGGTCAAGATTGTGGTCTTATTAGTTTGAGCTTCATGTATAGGCATGTGAAGCTGTGCGCCCTGTATTTAACACCCTCTCCTTTGTATTCCCCCCAGGTCTGCTTCCCTCAGAGGCTTTTCTGCACGGATCTTCTGCAGGTGAGGCTGTTCTATTTTGAATTGCTGGTCAAATCAAGACTCAATTACAGTGGATAAGTAATCAACTGAAAACAATCTGCTCCTTCTGGTCCTCTGCTCCTGAATCTTGAGTGATGACTAATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	324797	289	+	636262	TACTAACTCACTTACTATTTAAAAAGCGGTCAAGCTTGCAGTCTTATTGGTTTGAGCTTCATGTATAGGCATGTGAAGCTGTGCGCCCTGTATTTAACACACTCTCCTTTGTATTCCCCCCAGGTCTGCTTCCCTCAGCGGCATTTCCGCACGGATCTTCTGCAGGTGAGGCTGTTCTATTTTGAATTGCTGGTCAAATCAAGACTCAATTACAGTGGATAAGTAATCAACTGAAAACAATCTGCTCCTTCTGGTCCTCTGCTCCTGAATCTTGAGTGATGACTAATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	316227	285	+	647215	---TAACTTACTCATTATCTAAGCACCGGTCG-GATTGTGGTCTTATTAGGTTGAGCTTCATGTCCAGGTACGTGAAGTTGTCTGCCCTGTATGTAACACCCTTTCCTTTGTTTTCCCCCCAAGTCAGTTGCGCTCAGAAGCTTTTCTGCACGGATGTTCTGAAGCTGAGGCTGTTCTACATGGAATTGCTGGTCAAACAAAGACTCAATCACAGTGGATAAGTAATAGACTTAAAACAATCGGCTCCTTCTGGTGCTCCGCTTTTGAATCTTGAGTGATGACTGATGT

a
s	mr.mrrefChr5	173117	10	+	294542	ACCACACCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	325089	10	+	636262	ACCACACCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	316512	10	+	647215	ACCACACCTC

a
s	mr.mrrefChr5	173127	80	+	294542	TGAACTCCTGCAATCCATACAAGTCCAATGTATAGTTTTTGACCCTTCATATCGAATTGTTGTGACAGGTCCTAAACTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	325112	80	+	636262	TGAACTCCTGCAATCCATACAAGTCCAATGTATAGTTTTTGACCCTTCATATCGAATTGTTGTGACAGGTCCTAAACTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	316522	80	+	647215	TGAAGTCCTGCAATCTGTACAAGTTCAATGGATAGTTTTCTACCCTCCATATCGAATTGTTATGACAGGCCATAGACTTA

a
s	mr.mrrefChr5	173207	117	+	294542	TTTTAAGACAACCTCAAACAACATGAGGTAAGGCCCTGTAATGATAATATTTGCTGTCATGGCAACTTGTGGGAAAAGACATACAGCTTGTGTATGAGCTTGAATGCTAATTATGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	325193	117	+	636262	TTTTAGGACAACCTCAAACAACACGAGGTACAGCCCTGTAATGATAACATTTGCTGTCATGGCAACTTGCGGGAAAAGACATACAGTTTGTATATGAGCTTGAATGCTAATTATGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	316602	106	+	647215	CTTTAAGACAACCTCAGACAGCATGAGTTAAGGCCATGTATTGACAATATTTGTGGTTATGGCAACTTGTGAGAAAAGAGATACAGCTTGTGTAT-----------TTAATTATGAA

a
s	mr.mrrefChr5	173324	84	+	294542	TCAATTGGCATCTAATACTATAATCAATCTGTATTCAATGCTACTTATTGCACTAAGTTCTGCGGGCACACTTCCAAAAAATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	325310	84	+	636262	TAAATTGGCATCTAATACTATAATCAATCTGTATTTAATGCTACTTATTGCACTAAGTTCTGCGGGCACACTTTCAAAAAATGG
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a
s	mr.mrrefChr5	173408	166	+	294542	GTCATTGTCCTTCTTCCCTATCCAATAATGAACTCACAACAACTCTCTTGATGCATATTGGGGTTAAGGTTCAAACACTTGGGTGTTTCTTAGTGCTTGGGGATCTAGGCCTTGACCCCAGAGGCCTCACTGATTACACATTGTGGTAAGTCACCCAGGTTTTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	325396	158	+	636262	GTAATTGTCCCTCTTCCCTATCCAATAATGAACTCACAACAACTCTCTAGACG-----TGGGGTTGAGGTTCAAACACTTGGGTGTTTCTTAGTGCTTGGGGATCTAGGCTTTG---CCAGAGGCCTCATTGATTACACGTTGTAGTAAGTCACCCAGGTTTTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	316793	160	+	647215	ATC----TCTTTCTTCCTTATT--ATAATGAACTCACAACAACTCCCATCGTGCATATTGGGGTTAAGGCTCACACACCTGGGTGCTTCTTGGTGCTTGAGGCTCTAGTCCTTGACCCCAGAAGTCTCACTGATTACACATTGTGGTAAGTCACGCAGGTTTTGTA

a
s	mr.mrrefChr5	173574	183	+	294542	CATAATAGTGATTCTTTAGTTTAATCTCTGCTTTATGGCTGTCATAACTGTGAGTGTAGACAATATGGACGCTAAAGGATCATGGCCCTACTTGCACTTACATTTTATCTGAAGCGTGTGATCTATTGCAGTACTTGGTGATAAACTCAACTAAAAACAATGCTTCTAGTAATAGTCTGTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	325571	183	+	636262	CATAATAGTGATTCTTTAGTTTAATGTCTGCTTTATGGCTGTCATAACTGTGAGTGTAGACAATATGGACGCTAAAGGATCATGGCCCTGCTTGCACATACATTTTATCTAAAGCGTGTGATCTATTGCAGTACTTGGTGATAAACTCAACTAAAAACAGTGCTTTTATTAATAGGCTGTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	316953	181	+	647215	CATAATGGTGATTCTTGAGTTTAACCTCTGCTTTATGGCTGCCATAACTGAGAGTGTAGACAATGTGGATACTAAAGGCCCATGGCCCTACTTGCACTTACATTTTATCTGAAGCGTG--ATCTCTTGCAGTACTTGGTGATAAATTGACCTGAAAACAATACTTCTAGTAATACTCTGTTTT

a
s	mr.mrrefChr5	173757	44	+	294542	ACAGGTCCAAGGAGAGTCAATTGAGATGGCTACCAACTTTTTTA
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a
s	mr.mrrefChr5	173801	63	+	294542	CAAAAGCTTCAAATTTGTTGACAATGTCTAACTCCTAGTATTGATTGCATTAATCTGCTCTGT
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a
s	mr.mrrefChr5	173864	121	+	294542	AACCTAGCCTGGTGTTTATACACCTTGAGTGATGGTCTGAACCTAAATAGGCGTGATATGACTAGAATGCATGATATCACTGCAATCATTTACATCTCAAAGACACCTAATTGATGGGCTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	317242	120	+	647215	AACCTAGCCTG-TGTTTATACACCTTGAGTGATGGTCTGAACCTGAGTTGACACGACATGTCTAGAATGCATGATATCACTGCAATAAATTACATCTCAAAGACACCTAATTGAGGGGCTT

a
s	mr.mrrefChr5	173985	162	+	294542	TATGATTTCCCTCAGTTTGAGACAGTGTATGCCCATGTAGGGACAATACCCACTTTTTATATCAAAAAATACGGACTATCAGTCAATAAAGGTCTGTACTGAGAATACTGCATCTAATTACCAACACTATGAAGTTTAGTTGACTCCTGCTATCCTTTGTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	325977	162	+	636262	TATTATTTCCCTCAGTTGGAGACAGTGTATGCCCATGTAGGGACAATACCCATTTCTAATATCAAAAAATACGGACTATCAGTCAATAAAGGTCTGTACTGAGAATACCGCATCTAATTACCAACACTATGAAGTTTAGTTGACTCCTGCTATCCTTTGTCA
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a
s	mr.mrrefChr5	174147	60	+	294542	TATGGCCATGGCCAGGGTGATATGGAGTATCCATATCACACCTTATGTCAAACACTTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	326139	60	+	636262	TATGGCCATGGCCAGGGTGATATGGAGTATCCATATCACACCTTATGTCAAACACTTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	317509	60	+	647215	TATGGCCACGGCCAGGGTGATACGGAGTATCCATGTCACACCTTATGTCAAACACTTGGA

a
s	mr.mrrefChr5	174207	210	+	294542	ATCTGGTTAGGTTCAGCATCAACAATGAGTAGATATTCTATCCCATGTGTCTGACTACCATAGTTGCATGATATTTTGTTGTCCATGCCACACCCAACCTCCTTTTGTCAATTGGTATCCTGACTGTTCATTATAACAATATTTAGTCTTTAAAGCTACACAATAGTGGTTTCATTGTGTAAATGTGGCACCTTCAACAATTCAACCTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	326199	206	+	636262	ACCTGGTTAGGTTTAGCATCAACAATGAGTAGATATCCTCTCCCATGTGTC--ACTCGCATAGTTGCATGTTATCATGTTGTCCATGCCACACCCAACCTCCTTTTGTCAATTG-TATTCTGACTGTTCATGATAACAATATTTAGTCTTTAAAGCT-CACAATAATGGTTTCATTGTGTAAACATGGCGCCTTCAACCATTCAACCTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	317572	210	+	647215	ATCTGGTTAGGTTCAGCATTGACAATGAGTAGAAATTCTATCCCATGTGTCTGACTACTATAGTTGCATGACATTTCGTTGTCCATGCCCCACCCAACCTCCTTTTGTCAATTGGTATCCTGACTCTCCATTATAACAATATTTAGTCTTTAAAGCTACACAATAGTGGTTTCAGTGTGTAAGTGTGGCACCTTCAACAATTCAACCCCA

a
s	mr.mrrefChr5	174417	108	+	294542	GGAATTCTCTTGTAATACAATCAGGGATCTGCTGAGACTCAGTTGCAATATGTCTAGGGCTTCAAAACCTTAGTACAATGTAGGATGAAAAGTGATTACAGCGGGTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	326405	108	+	636262	GAAATGCTAGTGTAATACAATCAGGGATCTGCTGAGACTCAGTTGCAATATGTCTAGGGCTTCAAAACCTTAGTACAATGTAGGATGAAAAGTGATTACAGCGGCTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	317784	88	+	647215	AGAATTCTCTTGTGGTATGATCAGGGATCTGCTGAGACTCAGTTGCAATGTGCTT--------------------CAATGTAGGATGAAAAGCAATTACAGCAGGTCC

a
s	mr.mrrefChr5	174525	59	+	294542	AACCAGAACAGACTACTATCACCCAACAAATTAGCATGTTTAGCATGTTGGAATTGGGC
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a
s	mr.mrrefChr5	174584	34	+	294542	GACAGTTTCCCCACTATTCTTACATTAAGCACAG
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a
s	mr.mrrefChr5	174618	85	+	294542	CTTCTCTCTTTGCTTCAGGAGTGGGCATGCAGTCATATTGTTCTGGAGCCTCAGAGTATTACTGATGGTATGCATATGCAGCCCA
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a
s	mr.mrrefChr5	174703	59	+	294542	GGAAATTGGCCATTGCCCATACTAGCTCCCCAAAATACATAGGTAGACTCATTGGTCCG
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a
s	mr.mrrefChr5	174762	142	+	294542	GTTCCAGATTGCACCCACTTAACCAGCTTTTCCTCCAGTAGTATCTTCTTTATACATTTTTCAAACTTAGTTTATTCTTCATAAATTTTTCAATGTAAGTTTATGGGCAGGTCTTTAGAGTGTTTGGGGTACCTGAATGCTT
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a
s	mr.mrrefChr5	174904	7	+	294542	CTGCATA
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a
s	mr.mrrefChr5	174911	451	+	294542	AGTGAAATGCCTTGCTTGAACAGCAATTTAATTTTGCATAAGTGAAATGCTTTGCTTGAATAGCAGTTTAATTGATTTACCAGGAGATAGCAAGTGTTCAATATGACTGGCAATAAACACCCAAGTTGAACTCCCAGAATTTCAGCGTGTGACTCGTAAATCATGAGTACGTTAGCACCTATTAACAATTGGATGTTCCATCCTTTTTAATTTAACCTTTTCCCTTTTTGTTATGCTGGATATCTCACATTGTGCTTTCTTAATCTCCAATTTCCAAGTGAGTGGCAACAACCTTCCTGTTCTCTCCAGGCTCCCTCGTAGCCCAATTGACTGGGAGCCCCTATCCTTGAGGTCTATCCTACTTAGGGGTGGTAGCTGGCTTGTAAGATTGACTGCAACCAATTATTATAGACTGGCCAAACCAGACATCTTTGCATGTTGGTTCAACACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	326924	451	+	636262	AGTGAAACGCCTTGCTTGAACAGCAATTTAATTTTGCATAAGTGAAATGCTTTGCTTGAATAGCAGTTTAATTGATTTACCAGGATATCACAAGTGTTCAATATGACTGGCAATAAACACCCAAGTTGAACTCTCAGAATTTCAGCATGTGACTCGTAAATCATGAGTACGTTAGCACCTATTAACAATTGGATGTTCCATCCTTTTTAGTTTAATCTTTTCCCTTTTTGTTATGCTGTGTATCTCACATTGTGCTTTCTTAATCTCCCATTTCCAAGTGAGTGGCAACAACCTTCCTGTTCTCTACAGGCTGCCTCGTAGCCCAATTGACTGGGAGCCCCTATCCTTGAGGTTTATCCTACTTAGGGGTGGTAGCTGGCTTGTAAGATTGACTGCAACCAATTATTATAGACTAGCCAAACCAGACATCTTTGCATGTTGGTTCAACACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	318287	443	+	647215	AGTGAAATGCCTTGCTCGAATAGCGACTTAATTTTGCATAAGTTAAATGCCTTGCTTGACTAGCAGTTTAATTAATTTACCAGGAGATAGTGAGTGGTCAATATGACGGG-AATAAACACCCATGTTGAACTCCCAGAATTTCAGTGTGTAACTTGTAAACAATGAGTATGTTAGGACGTATTAACAACTGGATGTTACATCCTT---AATTTAACCTTTTCCCTTTTTGTTATA---GATCTCTCACATTGTGCTGTCTTAATCTCCAATTTCCAAGTGTGTGGCAACAACCTTCCTGTTCTCTCCAGGCTCCCTCGTAGCCCAATTGACTGGGGGCCCCTACCCTTGAGGTCTATCC-ACTTAGGGGCAGTAGCTGGCTTGTAAGATGGACCGCAACCAATTATTATAGAATGGCCAAATGAGAAGTCTTTGCATGTTGGTTCAACACA

a
s	mr.mrrefChr5	175362	33	+	294542	CAGCACATCATATCAATTGGTAAGCAATCAAAG
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a
s	mr.mrrefChr5	175395	66	+	294542	TGTATTCTGCCACAAATGCCCTAGATTCTGAAGTGCTGATGTTCGTGTTGATACATGCCTTTTAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	327409	66	+	636262	TGTATCCTGCCACAAATGCCCTAGATTCTGAAGTGCTGATGTTCGTGTTATTACATGCCTTTTAGT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	178941	55	+	294542	CAGATAACAAAACAAAAAGTCTTGGAAATTGAATGCGGCTGTTTCCAAACTTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	331387	55	+	636262	CAAGTAACAAAGCAAAAAGTCTTGGAAATTGGATGAGGCTGTTTCCAAGCTTTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	322411	55	+	647215	CAGAGAACAAAACAAAAAGTTTTGGAAATTGAACGCGGCTGTTTCCAAACTTTTA

a
s	mr.mrrefChr5	178996	71	+	294542	CCATCCTCATTAATTCCAGTTACTAGTTGAATTGTCAGTTCTGTGATTTCCAGTATGATAATCCAACCTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	331443	61	+	636262	CCATCCTCATTAATTCCAGTTACCAGTTGAATTGTCAGT----------CCAGTATGATAATCCAACCTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	322466	71	+	647215	CCATCCTCATTAATTCCAGTTACTAGTCAAATTGTCAGTTCTGTGATTTCCAATATAATAATCTGACCTAT

a
s	mr.mrrefChr5	179067	168	+	294542	CTATGGAGTATCCAAACAACTTTTAAGTCTTTTTGCTAAGTTAAGAAATGACACTACGTCTCAAGAGAAACCACTCTCTCTTTGACATAAGGGTTAGACTCCCTCGACTAGTTCCACAATGCACAGCTCTCAGAAGAGCCCACCACAGCCAGTTCTCAGACCAGGATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	331505	167	+	636262	CTATGGAGTATCCAAACAACTTTTAAGTCATTCTGCTAAGTTAAGAAATGACACTACGTCTCAAGAGAAACCACTGTTTCTTTGACATAAGGGTTAGACTCCCTCGACTAGTTCCACAATGCACAGCTCACAGAA-AGACAACCACAGTGAGTTCTCAGACCAGGATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	322537	144	+	647215	CTATGGTGTATCCAAACAACTTTTAAATCTTTTTGCTAAGTTATGAAATGACCCTACATCTCAAGAGGATACACTCTCTCTTTGACATAAG-------------------GGTCCACAATGCACAGCTCT-----GAGCCCACCACAGCCAGTTCTCAGTCCAGGATA

a
s	mr.mrrefChr5	179235	137	+	294542	CCTTATAAGGAGCATGCTCCAGTGATGTCAGGCACATGTTTGGGGTAGTCTGTCTCAATGTTCAGACAAGAACTAGCCCAACACTGGGATGGCGGAAGGGAGCCCTACTCAACCCTCCAGGACAGCAAAATGAAGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	331675	137	+	636262	CCTAATAAGGAGCATGCTCCAGTGATGTCAGGCACATGTTTGGGGTAGTCTGTCTCAATGTTCAGACAAGAACTAGCCCAACACTGGGATGGCGGAGGGGAGCCCTGTTCAACCTTCCAGGACAGCAAAATGAAGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	322681	124	+	647215	CCTTATATGGAGCATGCTCCAGTGATGTCAGGCACATGTTTGGGGTAGCCTGTCTCAATGCTCAGACAAGAACTAGCCCA-------------GGTAGGGAGCCCTACTCAACCCTCCAGGCCAGCAAACTGAATCC

a
s	mr.mrrefChr5	179372	40	+	294542	CTGCTCAACCTTTCAGATAAGAAACTATCACCAACTAAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	331816	36	+	636262	CTGCTCAACCTTTCAGATAAGAA----TCACCAACTAAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	322805	40	+	647215	CTACCCAACCTTTCAGATAAGAAACTATCACCAACTAAGG

a
s	mr.mrrefChr5	179412	57	+	294542	TTTGTTCTACCTGTACGAGTATAAAGCATCAAAAACAACTCCTGAACACCCACTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	331852	57	+	636262	TTTATTTTACTTGTACAAGTGTAAAGCATCGAAAACAACTCCTGAACACCCACTTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	322851	57	+	647215	CTGGTTCTACCTGTACGAGTATAAAGCAACAAGAACAACTCCTGAGCACCCACTACC

a
s	mr.mrrefChr5	179469	214	+	294542	ATCCAATTGATCTATGCTCCCCTCCTGAGCACCGACTCCAATCCAATTGAGCTATGTGCCCACAATTCGCTCATAGACACCAACAATCTCTTTTTAGATAAACAGCTGGGTGCTTCAAATTACTCTAGGTGATATCAGATTTTGGTAATAAACCACCAGACTGTTTTGAATCTGAAACAATGGTTTCCTTCCACAGTATATGTAATCCATTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	331909	211	+	636262	ATCCAATTGCACTATGCTCCCCTCCTGACCACCCACTCCAATCCACTTGAGTTATGCGCCCGCAACTCGCTCATAGACACCAACAATCCCTTTTTAGATAAAAAGCCGGGTGTTTCAAATTAGTCTTGGTGATATCAGATTTTGGTAATA---CACCAGACTGTTTTGAATCTGATACAAATGTTTCCTTCCACGGTATATGTAATCTGTTCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	322915	214	+	647215	ATCCAATTAATCTATGTGCCCCTCCTGAGCACGGACTCCAATCCAATTGAGCTATGTGCCCACAATTCGCTCATAGACACCAACAATCTCTTTTTAGATGAACAGCTGGGTGCTTCAAATTACTCTAGGTGATATCAGATTTTGGCAATAAACCACCAGACTGTTTTGAATCTGAAACAATGGTTTCCTTTCACAATATATGTAATCCATTTTT

a
s	mr.mrrefChr5	179683	5	+	294542	AATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332120	5	+	636262	AATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	323135	5	+	647215	CATGT

a
s	mr.mrrefChr5	179688	20	+	294542	TCCATTCACAGTAGGGCAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332171	20	+	636262	TCCATTCACAGTAGGGCAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	323140	20	+	647215	TCCATTCACAACAGGACAAT

a
s	mr.mrrefChr5	179708	119	+	294542	TATGCCAGATTATTGGCTGATAGTTCATGAGGATTAAAGGATTTAGTGACACTAGGCTAAATAAAACTTCTTGCAAACCACTCAGTCTCAATCCCCAAGATGCTAGCTTCCATTTCCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332191	119	+	636262	TATGCCAGATTATTGGCTGATAGTTCATGAGGATTAAAGGATTTAGTGACACTAGGCTAAATAAAACTTCTTGCAAACCACTCAGTCTCAATCCCCAAGATGCTAGCTTCCATTTCCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	323161	119	+	647215	TATACCAGATTATTGGCAGATAGCTCACAGGGCTTAAAGGACTGAATAACATTAGACTAAGTGAAACTTCTTGCAGACCACTCAGTCTCAATCCAGAAACTACTAGCTTCCATTTCCTA

a
s	mr.mrrefChr5	179827	60	+	294542	TTATGATGTGTGTAGGTGGTAAGCCTAAAGATCTAAAGGGGTGTACTCATGTCAAACACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332312	60	+	636262	TTATGATGTGTGTAGGTGGTAAGCCTAAAGATCTAAAGGGGTGTACTCATGTCAAACACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	323280	60	+	647215	TTGTGATGTGTGTAGGTGGTAAGCCTAAAGATTTAAAGGGGTGTACCCCACTCAAATACC

a
s	mr.mrrefChr5	179887	31	+	294542	ACAAAGGGATCAATTTACAGGCCCTAAATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332373	31	+	636262	ACAAAGGGATCAATTTACAGGCCCTAAATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	323340	31	+	647215	ACAAAGGGATCAATTTACAGGCCCTAGATTT

a
s	mr.mrrefChr5	179918	9	+	294542	CCGGACAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332404	9	+	636262	CCGGACAGT
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a
s	mr.mrrefChr5	179927	129	+	294542	GAGTAGCTTGCTGAGTGAGGAGATAGCTGTAGGCCCGGAGTCCTCTTAGAAGAGAGCCAGGAATGCTAGCCAAGAATCTATGTCAGATTGCTCACTTAGGTCATGCAAGGATGGTTGACCAGATACCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332413	129	+	636262	GAGTAGCTTGCTGAGTGAGGAGATAGCTGTAGGCCCGGAGTCCTCTTAGAAGAGAGCCAGGAATGCTAGCCAAGAATCTATGTCAGATTGCTCACTTAGGTCATGCAAGGATGGTTGACCAGATACCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	323399	129	+	647215	GGGAAGTCATCTGAGTGGGGAGTTAGTTGTAGGTCCTGAGTCCTCTTAGAAGAAAGCCTGGAATGCTAGCCAAGAATTCAAGTCAGATTCCTCACTTAAGTCACACAAGAAGGGTGGACCAGCTACCTT

a
s	mr.mrrefChr5	180056	50	+	294542	CAAAATATACCAGGTACATGTGATGGCTTCTCTTCTGCCACACTATTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332543	50	+	636262	CAAAATATACCAGGTACATGTGATGGCTTCTCTTCTGCCACACTATTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	323528	50	+	647215	CTAAATATACCAGCTACATGTGATGGCTTCCCTTCTACCATACTATTATT

a
s	mr.mrrefChr5	180106	95	+	294542	TTTTTTTGTTATCTGCTACAGGCAAACCGAACCATTGGTTCACAACGCAGTATTTATGATGTGATACTAAATGACATGGAGATTGTTGCACAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332600	95	+	636262	TTTTTTTGTTATCTGCTACAGGCAAACCGAACCATTGGTTCACAACGCAGTATTTATGATGTGATACTAAATGACATGGAGATTGTTGCACAGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	323578	95	+	647215	TTTTTTTGCTTTCTGCTACAGGCTCAAAAAACAATTGGTCCACAAAGCAGTATTTATAATCTGCTACTAAATTACATGGAAATTGTTGCAAAGAG

a
s	mr.mrrefChr5	180201	20	+	294542	TGTCCATATGAGGGGGCACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332698	20	+	636262	TGTCCATATGAGGGGGCACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	323673	20	+	647215	TGTCCATATGAGGGTGCTCC

a
s	mr.mrrefChr5	180221	18	+	294542	CAACCATTTTTTGACATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332721	18	+	636262	CAACCATTTTTTGACATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	323693	18	+	647215	CAACCATACTTTGACATG

a
s	mr.mrrefChr5	180239	58	+	294542	CATAGCGTTAACCTACATTGAAAAACAATGAATATTGAGTATGATTCCAGAAAACACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332740	58	+	636262	CATAGCGTTAACCTACATTGAAAAACAATGAATATTGAGTATGATTCCAGAAAACACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	323711	58	+	647215	CATATCATTGACCTACTTTAAACAACAATGGATATTGAGTGTGATTTCAGAAAACACA

a
s	mr.mrrefChr5	180297	94	+	294542	TGTCTCTGTGTCATTTTAAAAATGTAGATACAGCTCCCAGCATCACTTTGACTAACTGCATTGCTATGGCCACAGTGTGTTAGACCCCAAACCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332804	94	+	636262	TGTCTCTGTGTCATTTTAAAAATGTAGATACAGCTCCCAGCATCACTTTGACTAACTGCATTGTTATGGCCCCAGTGTGTTGGACTCCAAACCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	323769	94	+	647215	TGTCTCTGTTTCATTTTAAAAAAGTAGATCCAGCTCCCAACATCACTTTGACTAACTGCACTGCTGTGGCTACAGTGGGTTAGACCCTGAACCA

a
s	mr.mrrefChr5	180391	5	+	294542	TGTAC
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a
s	mr.mrrefChr5	180396	21	+	294542	GCTCCCACACGTGACTATTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332903	21	+	636262	GCTCCCACACGTGACTATTTG
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a
s	mr.mrrefChr5	180417	187	+	294542	ATAGCACAGACTCCATTGTAACTACAGATAGCAGCTGAAGTAGCAGTTAGTGAGTGGGACATATGTTGCTGAGCAGTATAACTTTTATAAAATCTGTTTCATCTATACTGGTAAGTATAGATGATGTCGTGTACACAAATGTGGACTGGTATAACAACCAAGGGATGAAGACAAGGCTAGAGATGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	332929	178	+	636262	ACAGCACAGAACCCATCATAACTACGGATAGCAGCTGTAGTAGCAGTCAGTGAGTGGG---------GCTGAGTAGTAGAACTTTTATAAGATCTGTTTCATCTATACTGCTAAGTATAGATGATGTCGTGTACATAAATGTGGACTGGTATAACGACCAAGGGATGAAGACAAGGCTAGAGATGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	323910	186	+	647215	ATGGCACTGACTCCATTGTAACTATAAATAGCAGCTGAAGTAGCAGTT-GTGAGTGGGACATATGTTGCTTAGCAGTATAACTTTTATAAAATCTGGTTCATCTCTACTGGTAAGTATTGATGATGTTGTGTACACAAATGTGGACTGGTATAACAACCAAGGGATGAAGAGAAGGTTAGAGATGTT

a
s	mr.mrrefChr5	180604	611	+	294542	AAAATTGGACTGGTGCCAGTGGTCTGGGCCTTTGCCCCACAGGGGGCAGTCATGGTCCATGACACAACAGAATGTGTAAGCAGACTCGGAAGTATATGTCTTTTCCTTTTTGAGCCCACTTTCTATTAGGAATCTCATCTATATTCTTTTAAAACACATGAACAATCGTCAAATTAGGATTTGATACTATAGAAACCACCAGGTGTTGTGATATGCAATaaagtcttgtagctgtgattcttcaagtctattttgcgtacataaagtcttgCGTCTGCCACATTTGAAATAATGAATGGATATTGCATATAATGGGCGACTATCATACCATAAGATGCTTTCTTAGCGGAGCCAGGACAGGATGCAGCATAGGTATGAATTGCGGTTTGCAAGTTATTGAAATATTGCAGCAATTCTGAGCTGTCAGTAGGGATGAATAAAATTGAAACTTAGAATACATGAGGACAACCTAATTGTCATAAACAAACCATAGTAGACATGTTAAATCACAATGccccacAGCTTATGTGGTAATATAGCATGATTGGTATGGATAGGCCATAAACAGGCCATAAAAAAAACTCTGACTGTATTACTCATACTGAGTTACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	333108	604	+	636262	AAAATTGTACTGGTTCCAGTGGTCTGGGCCTTTGCCCCACAGGGGGCAGTCATGGTCCATGGCACAACAGAATGTGTAAGCAGACTCGGATGTATATGTCTTTTCCTTTTTGGGCCCACTTTCTATTAGGAATCTCATCTATATTCTTTTAAAACACATAAACAATCGTCAAATCAGGATTTGATATTATAGAAACCACCAGGTGTTGTAATATGCAATaaagtcttgtagctgtgattcttcaagtctattttgtgtacataaagccttgCGTCTGCCACATCTTAAATACTGAATGGATATTACATTTAATGGGCGGCTATCATACCATAAGAGGCTTCCTTAGAGGAGCAAGGACAGGATGCAGCATAGGTATGAATTGTGATTTGCAAGCTATTGAAATATTGCAGCAATTTTGAGCTGTCAGTAGGGAAGAATAAAATTGAAA-TTAGAATACATGAGGACGACCTAATTGTCATAGACAACCTATAGTAGACATGTTAAATCACAATG------GGCTTATGTGGTAATATAGCATGATTGGTATGGGTAGGCCATAAACAGGCCATAAAAGAGACCCCAACTATACTACTCATACTGAGTTACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	324096	611	+	647215	AAAATTGGACTGGTGCCAGTGGTCTAGGCCTTTGCCCCACAGGGGGCAGTCATGGACCATGACACAACAGAATGTGTGAGCAGGCTCGGAAGTATATGTCTTTTCCTTTTCCAGTCCACTTTCTATTTGGAATCTCATCGATATTCTTTTAAAACACATGAGGAATCATCAAATTGAGATTTGATACTATAGAAACCGCCAGGTGTTATGATATGCAATaaagtcttgtagttgtgattcttcaagtctattttgcgcatataaagtcttgtatctgCCACATTTGACATAATGAATGGATCTTGCATATAATGGGTGACTATCATACTATAAGATGCTTTCTTAGCGGAGCCAGGACAGGCTGCAGCATAGGTATGAATTGCTGTTTGCAAGTTATTGAAATATTGATGCAACTCTGAGCTGTTAGTAGGGATGAATAAAATTGAAACTTAGCATACATGAGGACAACCTAATTGGGATAAACAAACCATAGCAGACATGTTAGGTCATAATGCCCCACAGCTTCTGTGTTAATCTATCAAGATTGGAAAGGATAGGCCATAAACAGGCCATAAAAAAAACTCTGACTGTATCACTCATACTGAATTACA

a
s	mr.mrrefChr5	181215	492	+	294542	CAGTACCAGAGGCTGTCTCACAAGAGAGTAGACTTTTGACTAATATTTGTTCTTCTTTTCAGTGTGGGTAAGAACACTTGTATGGGCTGAGCATCACACCAATAAATCGACACTCCATGTCAGAATACATGCTAGTTAAGCATGAAGGAATGAGTGCCTCAATATACATCCCTTATCTCAGTTTGTATCGTTCTGACTTTTAGGGTATGCTAGTTTTCAGATAGAGTCTTGTACACTTTTAAGGCATTGGTTTGAATTCTGACTTTGGATGGCTACTGAGTAGCACTAGAGCACCACAAACCCTAAGCATAAGTGTGAAATTGTAACAAGTTAATTCCCAAGTGCTTGTGCCCAAGAAGACAGCATTGCTACGTAAAACAGCCTACACCACTTAATCTCTTCACGTATTTAGTGTAGCAAATTTGCTAAGTTTTTGGATGGTGCTTCAGTGCATAGTTGTCAGCATCTAACCTTGTCACTATAGGGGACATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	333712	474	+	636262	CAGTACCAGAGGCTGTCTCACAAGAGAGTAGACTTTTAACTAATATTTATTGTTCTTTTCAGTGTGGGTAGGAG-ACTTGTGTGGGCTGAGCATCACACCAATAAA-------TCCATGTCA-AATACATGCTAGTCAAACATGTAGGAGTGAGTGCCTCAATATACATCCCTTATCTCAGTTTGTATCGTTCTGACTTTTAGGGTATGCTAGTTTTCAGATAGAGTCTTATACACGTTTAGGGCGTTGG------CTCTGACTTTGGATGGCTACTGA-TATCACTAGGGCACCACAAACCATAAGCATAAGTGTGAAATTGTAACAAGTTAATTCTGAA--GCTTCTGCCCAAGAAGACAGCATTTCTACGTTAAACAGCCTACACCACTTAATCCCTACACGTATTTAGTGTAGCAAATTTGCTAAGTTGTTGGATGGAGCTTCAGTGCAGAGTTGTCAGCATCTAACCTTGTCACTATAGGGGACATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	324775	492	+	647215	CAGTACAAGAGGTTTTCTCACAAGAGTGTAGACTTTTGACTAGTATTTGTTCTTTTTTTCGGTGTGGGTAAAAACACTTGTATGGGCTGAGCATCACACCAATAAATCGACACTCCATGTCAGAATTTACACTAGTTAAGCATGAAGGAATGAGTGCCTCAGCACACATCCCTTAGCTCAGGTTTTATAGTTCTGACTTTTGGAGTATGCTTGTTTTCAGATAGAATATTGTACATTTTTAAGGCATTGGTTTGAATTCTGACTTTGGATGGCTACTGAGTTGCACTAGAGTACCACAAACTCCAAGCATAAGTGTGAAATTGTAACAAGTTAATTCCCAAGTGCCTGTGCCTAAGAAGACAGCATTGCTACGTAAAACAGCCTACACCATTTGATCTCTTCAAGGATTTAGTGTAGCAAATTTGCTAAATTTTTGGATGGTGCTTCAATACATGGTCGTCAGCACTTAACCTTCTCACTATAGGGGACATG

a
s	mr.mrrefChr5	181707	26	+	294542	CTCACTACTTCTCACATGAACCTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	334186	25	+	636262	-TTACTACTTCTCACATGGACCTGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	325270	26	+	647215	CTCACTACTTTTTACATGAACCTAGG

a
s	mr.mrrefChr5	181733	98	+	294542	ATGCTAATAAACCATTGCATGGAAAGCTTTTGGGCTCCGAGACAACCAGCTGATTTGGAGATCTTAACTTTGGAATGTCATTAACAAGCCCAGCTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	334240	98	+	636262	ATGCTAATAAACCATTGTATGGAAAGCTTTTGGGCTCCGAGACTACCAGCTGATTTGGAGATCTTAACTTTGGAATGTCATTAACAAGCCCAGCTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	325296	98	+	647215	ATGTTATTAAATGGTGACATAGAAAGCTTTAGGGCTCTGAGACAGCCAGCTGATTTGGAGGTCTTGCCTTTGGAATGTCATTAACAAGCCCAGCTACA

a
s	mr.mrrefChr5	181831	60	+	294542	GGCTTGCCCTAGCAAGGTCACTTTGGATCCTGCCAGTGTATGCCTGAATTGCACCCGCCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	334339	60	+	636262	GGCTTGCCCTAGCAAGGTCACTTTGGGTTCTGCCGGTGTATGCCTGAATTGCACCAGCCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	325394	60	+	647215	GGCTTGCTCTAGCAAGGTCACTTTGGATCCTGCCAGTGTATGCCTGAATTGCCCCCACCA

a
s	mr.mrrefChr5	181891	52	+	294542	TTTGGGAGGACTCAAGCTTGGAACCCAGCTGGCGTTGCTGCCTGCAGGCCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	334402	21	+	636262	TTTGGGAGGAATTGAGCTTGG-------------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	325454	52	+	647215	TCTAGGAGGGCTCAAGCTTTGAACCCAGCTGGCGTTGCTGCCTGCAGGCCAC

a
s	mr.mrrefChr5	181943	36	+	294542	CACACCATCAACCTCAACAGATATGTCATCAATGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	325545	36	+	647215	CACACCATCAACCTCAACAGATATGTCATCAATGAT

a
s	mr.mrrefChr5	181979	9	+	294542	CAATATTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	325583	9	+	647215	CAATATTTT

a
s	mr.mrrefChr5	181988	23	+	294542	GAATCCAGCACTCTGAGGCCGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	334423	9	+	636262	--------------GGGGCCGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	325593	23	+	647215	GAATCCAGCACTCTGAGGCGGCA

a
s	mr.mrrefChr5	182011	40	+	294542	TAGAATTAGTCTGGGGATAATTCCATAAAAATCTGCTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	334447	35	+	636262	TAGAATTATCCTCGGACTAATTCTATG-----CTGCCTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	325616	40	+	647215	TAGAATTAGTCTGAGGATAATTCCATAAAAATCTACTTCA

a
s	mr.mrrefChr5	182051	25	+	294542	GAAAGAACCCTTAACATAGAATCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	334605	25	+	636262	GAAAGAACCCTTAACAAAGACTCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	325656	25	+	647215	GAAAGAACCCTTAACGTAGAATCAC

a
s	mr.mrrefChr5	182076	101	+	294542	ACCTCTTGTTTTTTTTATACCTACCCATTGATTTCTAAGTGTGGATAGCCATAAGTCATCTTTGTTGTTGGATTTGCAGTTTTAGTAGTTGCTTAGTAGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	334640	100	+	636262	ACCTCTTGTTTTTTTTATACCCACCCATTGATATCTCAGTGTGGATAGCCATAAGTCATCTTTGTTGTTGGATTTGCAGTTTTAGTAGTAGCTT-GTAGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	325681	101	+	647215	ACTTCTTGATTTTTTTATATTTACCCATTCCTTTCTAAGGGTGGATAGCTATAAGTCATCTTTGTCGGTGGATTTGCAGTTTTAGTAGTTGCTTAGTAGTC

a
s	mr.mrrefChr5	182177	203	+	294542	TTCTGCTAAACAGAGCTATTATCTCTCACTAAGGTATGTATCACTTCCCCCATTCTGATCATAATAGTGGTTGTGCTGAGATGTGGTCACTTCTCACTGTTCTATACATAGAAGATTGTAGGCATTCTAGGGGCTTGGCCCCATCACTAGTCTTGCAAGGCTAGAACGACACTTATGTGATCCAGTAAAGAGTCATGCATGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	334741	183	+	636262	ATCTGCTAAACAGGGCTATCCTCTCTCA--------------------CCCATTTTGATCATAATAGTGGTTGTGCTGAGATGTGGTCATTTCTCACTGTTCTATACATAGAAGATTGTAGGCATTCTAGGGGCTTGGCCCCATCACTAGTCCTGCAAGTCTAGAACGACACTTATGTCATCCAGTAAAGAGTTATGCATGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	325782	162	+	647215	TTCTGCTAAATAGAGACATTATCTCTCACTAAGGTATGTATCACTTCCCCCATTCTGCTCATAATAGTGGTTGTGCTAAGATGAGGTCACTTCTCACTGTTTTATACATTG-----------------------------------------TTGCAAGGCTAGAAAGAGACTTATATGATCCAGTAAAGAGTCATGCATGCT

a
s	mr.mrrefChr5	182380	66	+	294542	CCCAAAGTGCATAGGTTCATGTGCACTCAGGACACTGCTTTGAACTTTTCATTCTCTCACATATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	334924	66	+	636262	CCCAAAATGCATAGGTTCATGTGCATTCTGGACACTGCTTTGAACTTTTCATTCTCTCACATATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	325945	66	+	647215	CCCAAAGTGCTCAGGTTCATGTACACTCAGGACACTGCTTTGAACTTCTCATTCTCACACATACTC

a
s	mr.mrrefChr5	182446	81	+	294542	GCAATGTTAGGTAGCTCCTACCTGCAAAACTGTGCAACAGCACTAGCACTTCACCATGTCACCACTTATGAGTCTGAACCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	334990	81	+	636262	GCAATGCTAGGTAGCTCCTACCTGCAAAACTGTGCAACAGCACTAGCACTTCACCATGTCACCACTTATGAGTCTGAACCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	326014	81	+	647215	GCAATGTTAATTTGCTCTTACCTGCAAGTCTGTGTAACAGCACTAGCATTTGATCATGTTATCATTTAGAAGTCTCAACTC

a
s	mr.mrrefChr5	182527	139	+	294542	CGCTACTCACTTGTGTGTGTGCTATTGTTCTGGTCAATACTGATTCATGGTGGTAAGAGAGGCAAAGTCAATTAAAAAATAATCTTCAGTGGCAACACAAAAACAAACTTCAGTGACAATCCATTGTATGACAGTGTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	335071	139	+	636262	CCCTACTCATTTGTGTGTGTGCGTTTGTGTTGGTCAATACAGATTCATGGTGATAAGAGAGGCAAACTCAATTAAAAAATAAACTTTAGTGGCAACACAAAAACAAACTTCAGTGACAGTGCATTGTATGACAGTGTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	219561	139	+	647215	CGCTACTCACTTGTGTGTGTGCTATTGTTCTGGTCAATACTGATTCATGCTGGTAAGAGAGGCAAGGTCAATTAAAAGATAATCTTCAGTAGCAACACAAAAACAAACCTCAATGACAATCCATTGTATGAAAGTGTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	326095	137	+	647215	CGCTACTCACTTGTGTGTGTGCTATTGTTCTGGTCAATACTGATTCATGGTGGTACGAGAGGCAAAGTCAATTAAAAAATAATCTTCAGTGCCAACACAAAAACAAACTTCAGTGACAATCCAT--TATGACAGTGTTA

a
s	mr.mrrefChr5	182666	72	+	294542	CACCTGTGCATGAAATGGTCCCCCCCTGTTCTGCACCAAAGCTAGCAAGGGGTATAGGAAAGTTATTACATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	335211	72	+	636262	TGCATGTGCATGAAATTATCTCCCCCTATTCTGCACCAAAGCTAGCAAGGGGTATATGAAAGTTATTCCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	219700	72	+	647215	CACCTGTGCATGAAATGGTCCCCCCCTGTTCTGCACCAAAGCTAGCAAGGGGTATAGGAAGGTTATTACATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	326232	72	+	647215	CACCTGTGCATGAGATGGTCCCCCCCTGTTCTGCACCAAAGCTAGCAAGGGGTATAGGAAAGTTATTACATT

a
s	mr.mrrefChr5	182738	1	+	294542	G
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	335283	1	+	636262	G
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a
s	mr.mrrefChr5	182739	50	+	294542	AAGTAATATCCCACGACCCAAGCACAACTAGTAAGAGTGGCACCTATCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	335284	50	+	636262	AAGTAATATCCCATGATCCAAGCACAACAAGCAAGAGTGGCACCTATCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	193706	50	+	647215	AACAGATATCCCACAACCCAAGCACAACTAGTGAGAGTGGCACCTATCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	326305	50	+	647215	AAGTAATATCCCACGACCCAAGCACAACTAGTTAGGGTGGAACCTATCAT

a
s	mr.mrrefChr5	182789	9	+	294542	CTTAAACAG
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a
s	mr.mrrefChr5	182798	1	+	294542	A
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a
s	mr.mrrefChr5	182799	22	+	294542	ATTTTTTATTAGGAAGGTGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	335355	22	+	636262	ATTTTGTATTAGGAAGGTAAGT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	326365	22	+	647215	ATTTTTTATTAGGAAGGTGAGT

a
s	mr.mrrefChr5	182821	259	+	294542	TCATGGACTAACCAATCCCTCTACACCAAGGGACTGCCTTAAGAAGATAGCCCTTGTACCCAGATCATCTAAGAGCCACTAGAAGTAGGGCACAGTATTAACCTTTCCAGGCACGTGGAGGGAATGTGTCATATTGAGATACCTGCTATATTAATTAATGAAGAGGCCGTGTCAGTAGCACATTTGCCTTAATAATATGGGCTTCCAGCCCTGCCCTCAATTCTCTTATGTTCTAGACATATCCATGAGGCTATGTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	335377	259	+	636262	TCATGGACTAACCAATCGCTCTACACCAAGGGACTGCCTTAAGAAGATAGCCCTTGTATCCAGATCATCTAAGAGCCACTTGAAGTAGGGCACAGTATTAACCTTTCCAGGTACGTGTAGGTAATGTGCCATATTGAGAAACCTACTATATTAATTGATGAAAAAGCTGTGTCAATAGCACATTTGCCCTAATAAGATGGGCTTCCAGCCCTGGCCTCAATTCTCTTAGGTACTATACATGTCCATGAGGCTATGTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	326387	254	+	647215	CCATG----CACCAATCCCTCTACACCAAGGGATTGCCTTAAGAAGACAGCCCTTGTACCTAGATCATCTAAGAGCCACTAGAAGTAGGGTCTAGTATTAACCTTTCCAGGCACACGGAGGGAACGTGTCAT-TTGAGATACCTGCTATATTAATTAATGAAGAGGTCGAGTCAGTAGAACATTTGCCTTAAGAATATGGGCTTCCAGCCCTGCCCTCGATTCTCTTATGTTCTAGATATATCCATGAGGCTATAGTTT

a
s	mr.mrrefChr5	183080	130	+	294542	AGCTAGGCTATGCCTACGTATCTGATCCCTTTAGAGTCATATCCACCCCCAGCTTCGACACGACTAAGACAGTGGATACCTAAGCTGGGCCTGCTATACAGTGGTCGGTAGCACCTATTTGACATTTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	335636	105	+	636262	------------------------ATCCCTTTGGCGTCATATCCACCCCCAGCCTCGGCACGACTAAGACAGTGGATACCTAAGATGGGCCTGC-ATACAGTGGTCGGTAGCACCTATTTTACATTTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	326725	130	+	647215	AGCTAGGCTATGCCTACGTATCTGATCCCTTTAGAGTCATATACGCCCCCGGCTTGGACGCTGCTAAGACACTGGATACCTAAGCTGGGCCTGCTGTACTGTGGTCAGTAGCACCAATTTGACATTTATA

a
s	mr.mrrefChr5	183210	94	+	294542	TTGAAAGGGATAGCATACATATGGCCATTGCAGGAGAGTGTCTTAGTGCCCATATAGTCTTACACTCACTTGGTGACAGACAGGATGCAGTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	335741	92	+	636262	TTGAAAGGGATAGGATACATGTGGCCATTGCAGAAGA--GTCTTAGTGCCCATATAGTCTTACACTCACTTGATGACAGACAGGAGGCAGTAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	326900	94	+	647215	TTGAAAGGGATAGCATACATATGGCCAGTGCAGGAGAGTGTCTCAGTGCCCATACAGTCTTAACCCCACTTGGTGACAGATAGGATGCAGCAGA

a
s	mr.mrrefChr5	183304	80	+	294542	ATAAATCATAACCAATAACTAAAAAATTGATGGAGACATCAATCCTGTGGTGTGCAGACTGTGATGACCACATGACACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	335833	80	+	636262	ATAAATCATAACCAATAACTAAAAAATTGATGGAGACATCAACCCTGTGGTATGCAGACTGTAATGACCACAGGACACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	326998	80	+	647215	ATAAATCATAACCAATAACTAAAAACTTGATGGAGGCATCAATCCTGTGGTGTGCAGAGTGGGATGACCACATGAGCCAT

a
s	mr.mrrefChr5	183384	35	+	294542	ATTGTTCGGGGTACACAAAGCATCACAAGGCATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	335937	35	+	636262	ATTGTTCGGGGTACACAATGCATCACAAGGCTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	327078	35	+	647215	ATTGTTTGGGGCACACTAAGCATCACAGGGCATGT

a
s	mr.mrrefChr5	183419	62	+	294542	AGGAATTTTGCTGAAGTTATTTCATGTTGCGGGCCTATGGCAATTAGCTTGCTGAAAGCTTT
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a
s	mr.mrrefChr5	183481	272	+	294542	CAGCAGTTTGGAATTTAGGAGACAATGCAACAAAGACTTGGAGAATAACAGTATCTAAGTGTGCACACCAATCGGGGACATTACACACAGTCAAGAGGCCAGTAAATTCTCTGGTACTTCCACCATCAAAAACATGCTTCACATCAGCTCTCTCTCTGGGTGTAGTGAAGATTCATTGGATAGGTAATAGTCACCATTTAGATCACAGCCTTGTTCCATTGGCATCGGTCATATATTAAGACACAAGATAATAAGATAATCTTTATTCAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	336034	248	+	636262	CAGGAGTTTGGAATTTAGGAGTCAATGCACCAGAGACTTGGAGAATAACAGTATCTAAGTGTCCACACCAATCAGAGACATTACACACAGTCAAGAGGCCAGTGAATTCTCTGGTACTTCCACCATCAAAAACATGCTTCACATCAGCTCTCTCT------------------------ATAGTTAATAGTTATCATTTAGATCACAGCCTTGTTCCATTAGCATCGGTCATATATTAAGACACAAGATGATAAGATAATCGTTATTCAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	327190	271	+	647215	CAGCAGTTTGGAATTTAGGAGACGGTGCAACAAAGTCTTGGAG-ATAAAAATATATAAGTGTGCACATCAATTGGGGACATTTCACATAATCAAGAGGCAGGTAAATTCTCTGGTCCATCCACCAGCAAAATCATGCTTAAAATTAGCTTTCTCTCTGGGTGTAGTGAAGATTCATTGGCTAGGTAATAGTCACCATTTAGGTCTCAGCCTTGTTCCATTGGCATCGGTCATATATTAAGACACAAAAGAATAAAATAATCTTTGTTCAATG

a
s	mr.mrrefChr5	183753	10	+	294542	CAGGCGAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	336282	10	+	636262	CAGGCGAAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	327466	10	+	647215	CAGTTCAAGA

a
s	mr.mrrefChr5	183763	122	+	294542	GCTAGACTAATGTGATGAATTTTCCCAACAGTGGGCTAACTTTGTAAATTCTGACTGATCCCACCTATTTAACATTCTACGGATATACGGGTAAGACCTACCCTGAGTTTCAGCTGATGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	336292	121	+	636262	GCTAGACTAATGTGATGCA-TTTCCCAACAGTGGGCTAACTTTGTAAACTCTGACTGATTCCACTTCTTTACCATTCTACGGATATACGGCTAAGACCTACCCTGAGTTTCAGCTGATGATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	327478	122	+	647215	GTTAGACTAATGCGATGAATTTTCCCAGCACTGGGTTAACTTTGTAAATTCTGATTGACCCCACCCATTTAACATTCTATGGATATATGGGTAAGACCTACTCTGAGTTCCAGCTGATGATG

a
s	mr.mrrefChr5	183885	379	+	294542	GGTCCTTGGTGTCAGCTTGATTACAAATGTAGCATGTACCCCGTTTTTGACAGTGCCTAGCTAACCAAAACCTACAATCTGTAAGGTTAGTGAACTAATGGGATCAACCCTCTATCGTGACCAGTCCCGGAGGACATTGGCACTCTTGCTATTGAATATCCTAAGTCAGGCAATAAATTAGATCATTGCTCTGTACCTCGAGTCTCAACTAGGTAGCTAGGTACCACACAGCAATCAATCATAATAGATTGACTTCCCTACTAACTAAATCTAGGAATTCATTTTTAGATCCAATAATATCTATGCTGTTAACTAAAGCATTAAGGGTCTTGGGGGGGTGAGTTTCTAGGGGATGGGTTTTGGAAGTAGCCAATGAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	336413	378	+	636262	GGTCCTTGGTGTCAGCTTGATTACAAATGTAGCATGTACCCCATTCTTGACAGTGCCTAGCTAGCCAAAACCTACAATCTGTAAGGTTAGTGATCTAATGGGATCAACCCTCTATCGTGACCAGTCTTGGAGGACATTGGCACTCTTGCTATTGAATGTCCTAAGACAGGCAATAAATTAGATCATTGCTCCATACCTCGAGTCTCAACTAGGTACCCAGGTACCACACGGCAAACAATCTTAATAGATTGACTTCCCTACTAACTAGATCTAGGAATTCATATTTAGATCCAATAATCTCTATGCCGTTAACTAAAGCATTAAGGGTC-TGGGGGGGTGAGTTTCTAGGGGATGGGTTTTGGACGTAGCCAATGAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	327601	354	+	647215	CATCCTTGGTGTCTTCTTGATTACAAATGTAGCATGTACCCCGTTTTTTACAATGCTTAGCTAAGCAAAGCCTACAATCAGTAAAGTTAGTGAACTAATGGGATGAACCCTCTATAGTGACCAGGCCCGGAA---------------------GCATATCTTAAGTCAGGCAATAAAATG----ACTGCTCTGTATCTCAAGTCTCAACTAGTTAGCTAGGTACCACACAGCAATCAATCATAGTAGATTGACTTCCCTACTAACTAAATCTATGAGGTCATTTTCTGATCCAATAATATCCGCCCTCTGTACTAAAGCATTAAGGGTCTTGGGGGGGTGAGTCTCGTGGGGATGGGTTTTGGAAGTAGACAATGAGAT

a
s	mr.mrrefChr5	184264	115	+	294542	AGGCAATGAGAAATGACAGTGACCAACATATGGCAAGCCCTGTGGAGACCTATTGTGATAGAGGAACCCTCACATATTGTTTCCATTGCTTGTAGAGGGCAATGGGTAATGGGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	336829	115	+	636262	AGGCAATGAGGAATGACAGTGACCAACATATGGCAAGCCCTGCACAGACCTATTGTGATAGATGAACCCTCACATATTGCTTCCATTGATTGTAGAGGGCAATGGGTAGTGGGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	327955	114	+	647215	AGGCAATGAGATATGACAGTGACCAACATATGGTAGGCCCTGTGGAGACTTTTTGTGATGGAGGAGCCCTC-CATATTGTTTCCATTGCTTGTAGAGGGCAATGGGTAATAGGGA

a
s	mr.mrrefChr5	184379	232	+	294542	AAGTACTTATATAACCACACTCCCCAGACTTACATTTAGGACATAGTTATTAAGCTTATAGCTTTACCAATAACTCCCTCCTAATGAGATGTATGACCTCAATGGCTTGTATTTACCCCTACACCACAGATGTAGTGTCTAATCATACAGGCAAGTTGGGCAAGTGATTGCTAAGATGAGATTTTTAACTAAGAAGGGGAATAGTGGCAGACATAGTGCCCAAATAGCAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	336944	232	+	636262	AAGTACTTATATAACCGCACTCCCCAGACTTACATTTAGGACATAGTTATTAAGCTTATAGCTTTACCAATAACTCCCTCCTAATGAGATGTATGACCTCACTGGCTTGTATTTACCCCTACACCACAGATGTAGTGTCTAATCATACAGGCAAGTTGGGCAAGTGATTGCTAAGATGAGATTTTTAACTAAAAAGGGGAGTAGTGGAAGGCATAGCGCCCAAATAGCAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	489949	116	+	636262	AAGTACTTATATAACCACACTCCCCAGACTTACATTTAGGACATAGTTATTAAGCTTATAGCTTTTCCAATAACTCCCTCCTTATGAGATGTATGACCTCAATGGCTTGTATTTAT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	328069	223	+	647215	AAGTCCTTATCTAACCATACTCCAAAGACTTACATTTAGGACATAG---TTAGGCTCATATACTTACCCATGAGTCCCACCTAATGAGATGTATGAACTCAATCGCTTATATTTACCCCTACACCACAGATTTAGCATCTAATAATACAGGCAAGTTGTGCAAGTGATCGCTAGGCTGAGATTGTTAACTATGAAGGGGAATAGTGGCAGACATAGTGCCCAAATA------

a
s	mr.mrrefChr5	184611	208	+	294542	CACACATACCAGCCAGTGATCTCTCAAGGGTGATAGCATTATTCAAGGCATGGACAGTGCCTTGGTCTCAAATCATACTGCCCCAGTTGTAACCATTATTCTTCTGAGAGGGTCATACCATTGATGGTTTGTCTCTGTTTGCCTATTTATGTCCAGTTATATATATCCATCTATATTCATGTGGTATACTTGAGATTAGACGTTGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	337178	208	+	636262	CACACATACCAGCCAGTGATCTCTCAAGGGTGATAGCATTATTCAAGGCATGGACTGTGACTTGGTATTAAATCATACTGCCCCAGTTGTAACCATTATTCTTCTGAGAGGGTCATACCATTGATGGTTTGTCTCTGTTTGCCTATTTATGTCCAGTTATATATAGCCATCTATATTCATGTGGTACATATGCGCTTAGCCGTTGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	328292	191	+	647215	----CATA-------------TCTAAAGGGTGATAGTGATATTCAAGGCATGGGTACTGCCTTGGTCTCAAATCATACTGCCCCAGTTGTAACCATTATTCTTCTGAGAGGGCCATACCATTGATGGTTTGTCTCTGTTTGCCTATTTATGTCCAGTTATATATATCCATCTATATTCATGTGGTATACTGGAGATCAGATGTTGCCT

a
s	mr.mrrefChr5	184819	77	+	294542	GTTGTACCGTGTGACTATTAAGAGTGAGGTGACTCATAGAGAACATAAAGAATTCATAAGGTCACTTTATAATGATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	337386	77	+	636262	GTTGTACCGTGTGACTATTAAATGTGAGGTGATTCCTAGAGAACCTAAAGAATTCATAAGGTCACTTTGCAATGATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	328492	77	+	647215	GTTATATCATGGGACTATTAAGAGTGAGGTGACTCATAGAGAACATCTAGCTTTCATAAGGTCACTTTATAATGATA

a
s	mr.mrrefChr5	184896	13	+	294542	CTCACATTATTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	337463	13	+	636262	CTCACATTATTAA
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a
s	mr.mrrefChr5	184909	73	+	294542	TTTGCCAAGCTAGTACCTGCTCATTTGCAAACCAAGAAATCCCAGCATAAATATTTAATGATGTTTAGATTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	337476	73	+	636262	TGTGCCAATCTAGTACCAGCTCATTTGCAAACCAAAAAATCTCAGCATAAATATTTAATGATGTTTAGATTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	328586	73	+	647215	TTTGCCCAGATAGTGCCTGCTCATTTCCAAACCAAGAAATCCCAGCATAAATACTTAATATTGTTTGGATTTC

a
s	mr.mrrefChr5	184982	135	+	294542	GCACAGTGCCTCATGCAAAGCTCCAATAAAACACAAACGTGGCCAAGTATATGCAGTAAATGATTGGCTGTGAGCCTGCCCCACATGGCCAAGTACATACAGTTAGTACATGGCTATGAGTAATATCAAGCCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	337550	135	+	636262	GCACAGTGCCTCATGCAAAGCTCCAATAAAACACAAACGTGGCCAAGTATATGCAGTAAATGATTGGCTGTGAGCCTGCCCCACATGGCCAAGTACATACAGTTAGTACATGGCTATGAGTAATATCAAGCCCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	328659	135	+	647215	ACTCAGTGCCTCATGCAAAGCTCCAATAAAATGCAAACGTGGCCATGTACGAACAGTTAATGATTGTCTTTGAGCCTGCCCTGCGCAGCTGCATACATACAGTTAATGCTTGACTATATGTAATAACAAGCCCAT

a
s	mr.mrrefChr5	185117	8	+	294542	TACTGCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	337685	8	+	636262	TACTGCAG
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a
s	mr.mrrefChr5	185125	35	+	294542	ACACTAGACATTGCATGGAATGTACACCTGTAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	337693	35	+	636262	ACACTAGACATTGCATGGAATGTACACCTGCAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	328804	35	+	647215	ACACTAGATATTGCATGGAATGTACATCTGTAGGT

a
s	mr.mrrefChr5	185160	28	+	294542	GCAGACTTCAGATTCATCATCAATATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	337728	28	+	636262	GCAGACTTCCGATTCATCATCAATATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	328863	28	+	647215	ACGGACTTCAACTTCATCATTAATATAT

a
s	mr.mrrefChr5	185188	213	+	294542	AGATTTAAGGCTAGCGTGGGGGTGGGGAGAGGATGAGAGGGAGGACAATATTAGAAAATAAGTGTTCATCCTGGTATGCTTGCAGATATACGACATCCAGACAATGAGGTGAGCTTACTGTTCAGAGGATCACTCAATTGACTTTCCTAGACCAAAAGGCTTGTACAAAATCATTGAATCAACAACTTGTTTTTCCATCTCAATAAATTGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	337756	213	+	636262	AGATTTAAGGCTAGCGTGGAGGTGGGGAGAGTATGAGAGGGAGGACAACATTAGAAAACAAGCGTTCATGCTGGTATGCTTGCAGACATACGACATCCAGACAATGAGGTGAGCTTACAGTTCAGAGGATCACTCAATTGACTTTCCTAGACCAAAAGGCTTGTACAAAATCATTGAATCAACAACTTGTTTTTCCATCTCAATAAATTGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	328892	189	+	647215	GGATTCAAGGCTAGCATGGGGGTGGGGAGAGGATTAGAAGGAGAAAAATATTAGAAAATAAGTATTCATCCTGGTATGCTTGCAGATATATCACATCCAGACAATGATGAGAGTTTACTGTTCAG------------------------GACCAAAAGGCTTGCACAAAATCATTGAATCAATAACTTGTTCTTCCATCTCAATTAATTGACA

a
s	mr.mrrefChr5	185401	70	+	294542	TTCAACCAAAGGGGGCCAGATTTAGGTTTCAAAGAGAAAAGAAAAACTGTCTAGAACAAGATAACATCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	337969	70	+	636262	TTCAACCAAAGGGGACCAGATTTAGGCTTCAAAGAGAAAAGAAAAACTGTCTAGAACAAGATAACATTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	329082	70	+	647215	TTCAATCTAAGGGGGGCAGATTTAGGTTTCAAAGAGAAAAGAAAAACTGTCTAGAACAATATAACATCCG

a
s	mr.mrrefChr5	185471	59	+	294542	GCCACAAATTGATTTGGTGCATGGAGAAGCATGGGGGGACCAAATAGTAggtccaataa
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	338039	59	+	636262	GCCACTAATTGATTTGGTGCATGGAGAAGCATGGGGGGACCAAATAGTAGGTCCAATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	329198	59	+	647215	GCCACAAATTGATTTGGTGCATGGAGAAGCATGGGGGGACCAGATAGTAggttcaatga

a
s	mr.mrrefChr5	185530	75	+	294542	tggaagaaactgtgtcccagcatggcagggtttatgatccaccctaagaaggaaaccttgatagaggtggtggac
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	338098	75	+	636262	tggaagaaactgtgtcccagcatggcagggtttatgatccaccctaagaaggaaaccttgatagaggtggtggac
s	simRat_chr6.simRat.chr6	329265	75	+	647215	tggaagaaactgtgtcccagcatggcagggtttatgatccagcctaagaaggaaaccttaatagagctggtggac

a
s	mr.mrrefChr5	185605	58	+	294542	tctaagaaatcagaggagagggctttcatggattggattcaggccaggttcaaggaat
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	338173	58	+	636262	tctaagaaatcagaggagagggctttcatggattggattcaggccaggttcaaggaat
s	simRat_chr6.simRat.chr6	329344	58	+	647215	tcaaactaatcataggagagggctctcagggattgaattcaggccaggttcaagcaat

a
s	mr.mrrefChr5	185663	97	+	294542	aattgacacaacacttaacactttaatgcaagtatttatgagtattggcttagaccgtgcaatcatcttcctcctgacgatgatggataatggatca
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	338231	97	+	636262	aattgacacaacacttaacactttaatgcaagtatttatgagtattggcttagaccgtgcaatcatcttcctcctgacgatgatggataatggatca
s	simRat_chr6.simRat.chr6	329403	97	+	647215	aatggatacaacacttaacattttagtgcaggtattggtgagtattggcttagatcgtacatctatcttccttccgatgatgatggatgatggattg

a
s	mr.mrrefChr5	185760	100	+	294542	ccttcagtaccgagcaagtggttgcaatgaatgtgactgggtatttgtaggggcattatgatgtttgatgtacttaacttgcccaggcctgcccacttcc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	338328	100	+	636262	ccttcagtaccgagcaagtggttgcaatgaatgtgactgggtatttgtaggggcattatgatgtttgatgtacttaacttgcccaggcctgcccacttcc
s	simRat_chr6.simRat.chr6	329501	100	+	647215	ccttcagtactgagcaagtggttgtgatgaatatgatggtgcatttgtaggggtgtaacgatgttcaatgtacttaattcgtccaggcctgcccattttc

a
s	mr.mrrefChr5	185860	141	+	294542	acttttcagaagtttacctgccttttgtgagatggatcataccatgattagtttagtctgattgacccctattgatgaagtgctctatggaaatatcttaagagaaatgaatacataagaaaaatcaccaagtattgtctg
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	338429	141	+	636262	acttttcagaagtttacctgccttttgtgagatggatcataccatgattagtttagtctgattgacccctattgatgaagtgctctatggaaatatcttaagagaaatgaatacataagaaaaatcaccaagtattgtctg
s	simRat_chr6.simRat.chr6	329601	141	+	647215	actattcaggattttccctgctttttgtcagatggatcaaaccatggttagtgtagtctgattgaaactaattgatgaagtgccctatgaaactatcttgagagaaatgaaaactttaggaagatcaccaagtgttgtttg

a
s	mr.mrrefChr5	186001	35	+	294542	aggcccgcatcagcccaactagctgtgcagggact
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	338570	35	+	636262	aggcccgcatcagcccaactagctgtgcagggact
s	simRat_chr6.simRat.chr6	329743	35	+	647215	aggcccctgtcagcccagctacctctgcggggatt

a
s	mr.mrrefChr5	186036	54	+	294542	tcactggttgctgccagtacacctggtgcaagctccattcctactcctctccta
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a
s	mr.mrrefChr5	186090	151	+	294542	tgctaagttgtcaagatgagtcatggcatactcccctcttatgtactctgctaaacgccctgatggtggagtgccatgatgatccactagtgcctgactaccagtaagtactaatcttatccctctgatgtaTTTCTGGTGATCCAGTTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	338659	151	+	636262	tgctaagttgtcaagatgagtcatggcatactcccctcttatgtactctgctaaacgccctgatggtggagtgccatgatgatccactagtgcctgactaccagtaagtactaatcttatccctctgatgtaTTTCTGGTGATCCAGTTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	329848	151	+	647215	tactaagttgtcaagatgagatatgacttgctcccctcttatgtagtctgctgaatcccctgatggaggactgctaggatgattcactaccacctgattaccagtaagtacTAATCTTATCCCTATGATTGATGTCTGCGGAACCAGTTGC

a
s	mr.mrrefChr5	186241	52	+	294542	TGATTAACAGTTGGTATCCATCTGCGTCGTCTTGTGTCTTTGTCTCAGGAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	186293	29	+	294542	CACTAAAGCACACCCAACCATACTAACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	338862	29	+	636262	CACTAAAGCACACCCAACCATACTAACAT
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a
s	mr.mrrefChr5	186322	8	+	294542	ATGCTAGT
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a
s	mr.mrrefChr5	186330	14	+	294542	AGTTGGAAATTAAC
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a
s	mr.mrrefChr5	186344	34	+	294542	ACCATTTTCTTATCTCAGTAGCATATTTTACTAC
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a
s	mr.mrrefChr5	186378	5	+	294542	AGTAT
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a
s	mr.mrrefChr5	186383	209	+	294542	GCATCTGCGAGGTTCTGAAAGTGTCATCttcttatgttgaacctagaagcatacaaagttgtttcccagtcccacacctgcacaatatctacacacctgatcgctctttctcagtatttaatgactgtgttggagggtgcTTGGTACACCAGTAAGTACATCGCTGTCTTATCTGCACTTGATTTACGGTATGCTCAGGTGGAATGTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	338957	209	+	636262	GCATCTGCGAGGTTCTGAAAGTGTCATCTTCTTATGTTgaacctagaagcatacaaagttgtttcccagtcccacacctgcacaatatctacacacctgatcgctctttctcagtatttaatgactgtgttggagggtgcTTGGTACACCAGTAAGTACATCGCTGTCTTATCTGCACTTGATTTACGGTATGCTCAGGTGGAATGTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	330195	209	+	647215	GAATCTGTTTTGTGTTGAAAGTGCCATCttcttgtcttgagccttgaagcatacaatgttgtttaccagtcccacatctgcacagtatctacacacatgattggtctttctcagtttttaatgactgtgttagagggTTCTTTGTGCACCAGTAAGTGCATCACTGTCTTATCTGCACTTGATTTAGGGTATGCTCAGGTAGAATGTTA

a
s	mr.mrrefChr5	186592	37	+	294542	GAATTAAGTTAGACTTGCTCTGAGACTTGCTATGAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	186629	447	+	294542	CCTGTCAGGCCTGATCTTGTTTCTTTTAACAACATCTGGTATGCAGGCCTGTCTGTAAACTTAAATTAAAAATGGTTAGACTTACTTTTTTTTATCACTGTCATACTTGATTGACCTAGTGGTGATGGAGGTGCCACTAAGGAGCAGTGAAACAATTGCTACAAATTAAACTATAGCTCTGTTATCCTAGGTATGACTGGGAGACTAAATCATGTGCTGCAAATTAATAGTCTACAAAATAAAAAAGCTTTGCAAGCACCGTCAACAAACTTTTTGGCTAAGGAGATGAGTATTAACAAAAAATTGTGAACTTGGAAGATGGGCCTACATATTTGCTGTGGTACCATCTGCTTCTTGAACCGAGGTGACCAGCCTGCAAAAGTCCACCCTGGTCTACTTGCCCATTTCATTGCATTTGCCTGTGAAGTTTACTTGGCCACGAGCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	339208	430	+	636262	CCTGTCAGGCCTGATCTAGTTTCTTTTAACAATATCTGGTATGCA----------TAAACTTAAATTAAAAATGGTTAGACTTACTTTTTTTTATCACTGTCATACTTGATTGACCTAGTGGTGATGGAGGTGCCACTAAGGAGCAGTGAAACAATTGCTACAAATTAAACTATAGCTCTGTTATACTAGGTATGACTGGGACACTAAATCATGTGCTGCAAATTAATAATCTAGAAAATAAAAAAGCTCTGCAAGCACCGTCAACAGACTTTTTGGTTAAGGAGATGATTATTAACAAAAAATTGTGACCTCGGAAGATGGGCCTACATATTTGCAG-------ATCTGCTTCTTGAGCCCAGGTGACCAGCCTGCAGAGGTCCACCCCGGTCTACTTGCCCATTTCATTGCATTTGCCTGTGAATTTTACTTAGCTACGAGCCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	330472	443	+	647215	TTTGTCAGGCCTGATATTGTTTCTTTTAACAACATTGGATATGCAGGCCTGTCTGTAAACTTAAATTAAAAATGGTTAGACTTACTTTTTTGTAGCACTGTCATGTTTGACTGACCTAGTGGCGATGGAGGTGCCACTAAGGAGTAGTG-AACAACTGCTACAAGTTAAACTATAGCTTTGTTATCCTGGGTATAACTGGGTGACTAAATCATGTGCCGCAGGGTACTAGTTTACAAAATAAAAAAGCTTTGCAAGCACCATCAACAAACTATTTGACTAATGAGATGAGTAC---CGAAAAGGGGTGAACTTAGAAGATGGGCCTACATATTTGCTGTGGTACCATCTGCTTCTTGAACCGAGGTGACTAGGCTGCAAAAGACTACCCTGGTCTACTTGCCCATTTCATTGTATTTGCCTGCCGAGTCTACTTGACCATGAGCCTG

a
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a
s	mr.mrrefChr5	187125	52	+	294542	TGTCCGATTTATGCACTATCAAGCGATGACAGGCCCTCTTGTACATTGAAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	187177	45	+	294542	CCCCTGTCTGATTCACGGACTGTCAAGCGATGTTGTATTCAACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	339740	45	+	636262	CCCCTGTCTGATTCACGGACTGTCAAGCGATGTTGTATTCAACAC
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a
s	mr.mrrefChr5	187222	81	+	294542	GCCCTTGGTCTACTTGCGCCTTCTGTTGTATTTAACATCTACTCTTTAACAAGTTAGGGTGAGCACACAGTTGTAACTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	339839	81	+	636262	GCCCTTGGTCTACTTGCGCCTTCTGTTGTATTTAACATCTACTCTTTAATAAGTTAGGGTGAGCACACAGTTGTTACTGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	331063	81	+	647215	GCCCTTGGTCTACTTGCACCTTCTGTTCTATTTAACATCTACTCTGTAGCAAGTTAGGGTGAGCACACATTTGTACCTGCT

a
s	mr.mrrefChr5	187303	22	+	294542	AGCAGCTCATCTAGATCCTCTG
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a
s	mr.mrrefChr5	187325	14	+	294542	AAGAAATTTATAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	339945	14	+	636262	AAGAAATTTATAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	187339	64	+	294542	TAGAATGTTATGGTGTGCATCAATTTGAAAGCATAATTTCTAATTTCATACAAGGAAGATATGA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	331180	64	+	647215	TAGAATATTAAGGTGTGCATCAATTTGAAAGCATGATTTCTAATCTCATACAAAGAAGATATGA

a
s	mr.mrrefChr5	187403	56	+	294542	TTTTATTTAAAGACCAGTGTCCTAATTGGAAGTTAATGGAGTTTGAGACAAATTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	331252	56	+	647215	TTTTATTTAAAGACCAGTGTCCTAATTGGAAGTTAATGGAGTTTGAGACAAATTAC

a
s	mr.mrrefChr5	187459	94	+	294542	AAGCAGGGTGTTGTGCCATAGGCTGTGTATTCAAATCAATTCTACTGTTGTTGGCCAATAGAATGATCCACACCAGGGCTAAGTATGTGTGTGT
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a
s	mr.mrrefChr5	187553	16	+	294542	GTCCAATCAGCAATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	331629	16	+	647215	GTCCAATCAGCAATTC

a
s	mr.mrrefChr5	187569	55	+	294542	AATCGAAGGCGTAAGACCACTAGCTTATTTAAGAATAGATACAATAGGGAATGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	331646	55	+	647215	AATCGAAGGCGTAAGACCACTAGCTTATTTAAGAATAGATACAATAGGGAATGAG

a
s	mr.mrrefChr5	187624	116	+	294542	TAAAGTATTTTAGACTCTGTTGGATTGGATGATTACTTAATTCAGGCTGTTGACCACACTAACTAAAGCTCTCATTGGTGTTCAACCAGGTAAGTATATTAATGCTGGATTGATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	340025	73	+	636262	-------------------------------------------AGGTAGTTGACCACACTAACTAAAAGTCTCATTGGTGTTCAACCAGGTAAGTATATTAGTGCTGGATTGGTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	331703	116	+	647215	TAAAGTATTTTAGACTCTGTTGGATTGGATGATTACTTAATTCAGACTGTTGACCACACTGACCAAAGCTCTCATTGGTGTTCAACTAGGTAAGGATATTCATGCAGGATTGAATG

a
s	mr.mrrefChr5	187740	175	+	294542	CACAGTTCTATTTTCTGTGTTAAGACAGACAAGAGTGATTGCCTTGGAGCTGTGTGGTACATGGTACAAGTCAGCCCTTCCAAAAAGCAGGCAGCCTGTTCAACAACAGGAGTTCTTATGTCACAAGAGAAGTACAGATGGGTAGCTGTTATTGGGATTTGGATATGTTGCATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	340099	175	+	636262	CACAGTTATATTTTCTGTGTTAAGACAGACAGGAGTGATTGCCTTGGAGCTGTGTGGTACATGGGACAAGTCAGCCCTTCCACAAAGCAGGCAGTCTGTTCAACAACAGGAGTTCTTATGTCACAAGAGAAGTACAGATGGGTAGCTGTTATTGGGATTTGGATATGTTGCATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	331819	127	+	647215	CACAGTTCT--TTTTGGCGTTAAGACAGGCAAGAGTGATTGCTTTGAAGCTGTGTGGTACATGGTACAAGTCAGCCCTTAGAAAAAACAGGCAGCCTGGTCAACAACAGGAGTTCTTATGTCACGAGGG----------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	187915	144	+	294542	AACTGTTCATGAAAGTTATGGTCCAGGGTAGTGAAATAGTCTGTGGACCATTTTACTATATAATCCTCTCTGAACACTTTATACTTCCAGGGTATTGGAAGCTAGTGATGGCACCTCATCAGGACACAGACTTGTCACGTTAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	340275	127	+	636262	AACTGTTCATGAAAGTTATGGTCAAGGGTAATGAAATAGTCTGTGGACCATTTTACTATATAAT-----------------TACTTCCAGGGTATTGGAAGCTAGTGATGGCACCTCATCAGGACAAAGACTTGTCACGTTAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	331946	131	+	647215	----GTTCATGCAAGT------CCAGGATAGTGAAATAGTCGGTGGACCATTCCACTATATAATCCTCTCTGAACACTTTATACTTCCAGGGTATTGGAAACTAGTGATGGCACCTCATCAGAACACA---TTGTCATGTTAAC

a
s	mr.mrrefChr5	188059	81	+	294542	TACAGTCTGTCCCATGCCCACTATCAGTCCATATAAAACATCTTGAAATCAGAAAAAATGAGCTCTAGTAACTCAAGACTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	340408	81	+	636262	TACAGTCTGTCCCATGCCCACTATAAGTCCATATAAAACATTTTGAAATCAGAAAAAATGAGCTCTAGTAACTCAAGACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	332077	78	+	647215	CAAAGTCTGTCTTATGTCCTCTATCATTCCATAACAAATATCTTGGAATCGGAAAAAACAAGCTCTGGTAAC---AAGCTG

a
s	mr.mrrefChr5	188140	107	+	294542	TAGAATAATTGGAGAAAATAAGTGCACTGTGCAAACAAATATCAATGTGTATGGTCTCAAAGGTGGGCCCTAGAAAAGTCCATGGATCATCATAGAGCTAATGGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	340549	107	+	636262	TAGAGTAATTGATGAAAATAAGTGCACTGTGCAGACAAATATCAATGTGTATGATCTCAAAGGTGGGCCCTAGAACAGTCCATGGATCATCATAGAGCTAATGGATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	332155	103	+	647215	TAGAATAATTGGAGAGAGTAAGTGCACTGTGCAAACC----TCGATGTGTATGGTCTAAAAGGTGGGCCCTAGAAAAGTCCATGGACCATCTTAGATCTAATGGATG

a
s	mr.mrrefChr5	188247	74	+	294542	TAACTATCCTACATAGGAACTTGATTGTGGATCATGTGCCTATAGCCCATTACCAATTCAAATGTATGTAGGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	340656	73	+	636262	TAACTATCCTA-ATAGGAACTTGATTGTGGATCATGTGCCTATAGCCCATTACCAATTCAAATGTATGTAGGTC
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a
s	mr.mrrefChr5	188321	169	+	294542	TTGTCTAGGAGCAGCTCTTATTATATGAGTGCAGGGGATCAATGGCTACAGTTGGGAGTCAACAATCATTTACATGTTCTATATAATCATGGCATCTCTGTTCAGTAAATTTCTAGGTAGGTACTGTTTTTGTCTTTTGGATCCAAAGATGGAATAACAAGCAAGGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	340745	164	+	636262	TTGTCTAGGAACAGCTCTTATTATATGAGTGCAGGGGATCAATGGCTACAGTTGGGAGTCAACAAT-----ACACGTTCTAGATAATCAAGGCATCTCTGTTCAGTAAATTTCTAGGTAGGCAGTGTTTTTGTCTCTTGGATGCAAAGATGAAATAACAAGCAAGGGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	332336	168	+	647215	TTGTTTAGAAGCAGCTCTTATAATATGAAAGCAGGGGATCAATG-CTATAGCTGGGAACCAACAATCATTTACATGTTTTATATAATCATGGCATCTCTGTTCAGTAATTTTCTAGGTAGGTACTGTCTTTGTCTTTTGGATCCAAAGATGGAATAATAAGCAAGAGCA

a
s	mr.mrrefChr5	188490	145	+	294542	GGTTATTGGAACTAACTTCACTAGATATATAAAAGGAAAACAATAATTGGTTGGAAGGTGAAAGACTGAAAAGGCGGTCTACCACCTCTACTAATAGTCGTGGTGGGAAAAGACTGAGAAGGCTGCACACTGCTCTACTAGCTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	340909	145	+	636262	GGTTATTGGAACTAACTTCACTAGATATATACAAGGAAATCAATAATTGGTTGGAAGGTGAAAGATTGAAAAGGTGGTCTACCACCTCTACTTATAGTCGTGGTGGGAAAAGACTGAGAAGGCTGCACACTGCTCTACTAGCTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	332505	145	+	647215	GGTTATTGGAACTACCTTCACTGGATATAGGAAAGGAAAACAATAATAGTCTTGAAGGTGAAAAACTGGGAAGGCAGTCTACCACCTCTACTAATAGTCTTGGTGGTCAAAGATTGAGAAGGCTGCACAATGCTCTACGAGCTTA

a
s	mr.mrrefChr5	188635	106	+	294542	CCTCTGTAATTCTGCTAAATTTCCACAAAAAGACAAGACAAGAGAAGGCAAGACCTTTATAGCAATAAGAGAAGACAATGATGGAAAGTAGCTTGAATCCGTCAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	341054	105	+	636262	CCTCTGTAATTCTGCTAACTTTCCACAAAAAGACAAGACAAGAGAAGGCAAGACCTTTATAGCAATAAGAGAAGACAATGATGGTAAGTAGCTTGAATCTGTCAG-
s	simRat_chr6.simRat.chr6	332652	106	+	647215	CCTCTGTAATTTCGCTAAATGTCCACAAAAAGACAAGTCAAGAGACGGCAAAACCTTTATAGCAATAAGAGAAGACAATGATGGAAAGTAAATCGAATCCATCAGG

a
s	mr.mrrefChr5	188741	91	+	294542	TACAGGGATAAAAGGACCCACTCGTGCTCTCTTAAAAATGTGGGACAACTTTGGTTAACCAATCTGATAATGTAGCCTTGGGCGTATGTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	341159	91	+	636262	TACAGGGATAAAAGGACCCACTCGTGCTCTCTTAAAAATGTGGGACAACTTTGGTTAACCAATCTGATAATGTAGCCTTGGGCGTATGTAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	332763	91	+	647215	CGCAGGGATAAAGGGACCCACTCCTGATATGTTATAAATGTGTGATAACTGTGGTTAATCAGTGTGATATTGTAGCCTTGGGTGTATGTAA

a
s	mr.mrrefChr5	188832	192	+	294542	AATTGGAACAAAGCATTCATGTTGTTTAGGTGTTGATTTCAACAGAAGATTGTGCACTCTGGGCATTAAAAAAGGCAGTAAGTTAAGCTGGCACATCGGTAAGTTCAAAGTTTGCCACCTTTCCCAATGCAAGATGCAGAGCATCTGAGCCTACCCCCTTCTCTATGTATAATTGTCATGTGGGAGTTAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	341251	192	+	636262	AATTGGAACAAAGCATTCATGTTGTTTAGGTGTTGATTTCAACAGAAGATTGTGCACTCTGGGCATTAAAAAAGGCAGTAAGTTAAGCTGGCACATCGGTAAGTTCAAAGTTTGCCACCTTTCCCAATGCAAGATGCAGAGCATCTGAGCCTACCCCCTTCTCTATGTATAATTGTCATGTGGGAGTTAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	332854	192	+	647215	AATTGCAACTAAGCATTTATTTTGTTTAGGTGTTGATATCCACACAAGCCTGTCCACTCCAGTCATTAAAAAAGGCAGTAATTTGAGCTGGCACATCGATAAGTTCAAAATTAGCCATCTTGCACTATGCAAGATGCATAACATCTCAACCTATCCCCTTACCTATGTACAATTGTGGTGTGGGGGTCAAAT

a
s	mr.mrrefChr5	189024	30	+	294542	CAAAGTTGTTACTCATATTTTCAGACACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	341444	30	+	636262	CAAAGTTGTTACTCATATTTTCAGACACAA
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a
s	mr.mrrefChr5	189054	266	+	294542	GCCTGGAGTCCTCAATAACCATGGCATAAACAGCAGCTGGAAGGAGGCCTTAGCCCCATTGTGCAGTGAACTGGAGGGGCAAATTGGACTTCAGTGAACAAGCTGGGGGGGGCTTGGCCACCTCTAAGGACCCATCACAAATAGCCACTTGGGGACCGCCTGAATTCCACCCATCACTACTCAATGTCTGCACCGAACAAATTTCTCCAGTTCAGTATGTTTATTTCTCCTTCTATGATTCAACTGTGCGTGTAGTTTGATTGTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	341479	266	+	636262	GCCTGGAGTCCTCAATAACCATGGCATAAACAGCAGCTGGAAGGAGGCCTTAGCCCCATTGTGCAGTGAACTGGAGGGGCAAATTGGACTTCAGTGAACAAGCTGGGGGGGGCTTGGCCACCTCTAAGGACCCATCACAAATAGCCACTTGGGGACCGCCTGAATTCCACCCATCACTACTCAATGTCTGCACCGAACAAATTTCTCCAGTTCAGTATGTTTATTTCTCCTTCTATGATTCAACTGTGCGTGTAGTTTGATTGTGG
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	189907	144	+	294542	TAATGAAGCCCCCCCATGGCATATTAACAACCAGGAAGTGTCATGTACAATATAATCCCTGCAATCTACTGAGGTGTGAGTCTAATGTTGAAGGATCTCTTCATAAAGATAACTTTTACACTGTAAATTGTCTCTATTAAAGGA
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a
s	mr.mrrefChr5	190051	4	+	294542	TCTA
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	190059	86	+	294542	CCTTGTGACCATAGACATTGGACTAATGAAGCTGAAAAAAGGCCAAATGAATCAAGCAAGTAAAAGAGGTTCCTAGTAATAGTCCA
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a
s	mr.mrrefChr5	190145	67	+	294542	CTATAAATAGAAAAATCATAGTTGACAGGATACAGTAGATGTCAATTGATATTATATGCTGTATCTG
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a
s	mr.mrrefChr5	190212	27	+	294542	ATAATTAGACTTTCGTTGATCACAAGG
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a
s	mr.mrrefChr5	190239	267	+	294542	TGGGGCCATGGTCTGAAAGCTGGCCTATCAGTGTCTTAGCCCCCCAGATATTGTATACAACTAATCAGAGTGATCACTACAGGACATTAGCTTTGAGTCAAAGCAGTCCTCTGATGTTAGGCCATTGTGACTTGAGCTGCATTACATTCATCTCATTAAATCATGGGGTTCTGACACTTGTTATTGTTGACACATTATTTaaactctatgcacatgcaatacacctcaaagggtgaaagtctcaggaatttaaggtgttcagagcaa
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	342706	253	+	636262	TGGGGCCATGGCCTGAAAGCTGGCCT--------------CCCCCAGATATTGTATACAACTAGTCAGAGTGATCACTACAGGACATTATCTTTGAGCCAAAGCAGTCCTCTGATGTTAGGCCATTGTGACTTGAGCTGCATTACATTCATCTCATTAAATCATGGGGTTCTGACACTTGTTATTGTTGACACATTATTTaaactctatgcacatgcaatacacctcaaagggtgaaagtctcaggaatttaaggtgttcagagcaa
s	simRat_chr6.simRat.chr6	334254	245	+	647215	-----CCATGGTCTGCGAGCTGGCCTATCAGTGTCTTAGCCCCCAAGATATTGTATACAATTAACCAGAGTGATCACTACAGGATATTAGTTTTGAGTCAAAGCAATGCCCTT-TGCTAGCAGAT---------------ATTTCATTCATCTCATT-AATCATGGGGTGCTGACACTTGTTATTGTTGACACATTATTTaaactccatgctcatgcaatacacctaagggggtgtaaatttcaggaattttaggtgatctgagcag

a
s	mr.mrrefChr5	190506	36	+	294542	ggtagcgaaataaatttgggatatgtacaccaacca
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	342963	36	+	636262	ggtagcgaaataaatttgggatatgtacaccaacca
s	simRat_chr6.simRat.chr6	334499	36	+	647215	cgtaggaaaatgattttgggatatgtacaccaacca

a
s	mr.mrrefChr5	190542	111	+	294542	cctatcgagctctttatgaaggATCGAACCAACATGTGACCCAAACTTAGTAATTCACCTTCCACCTTACTAGATATAATTGACATGTAACAAGGGCCTACACTAAAATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	343000	79	+	636262	cctatcgagctctttaTGAAGGATCGAACCAACATGTGACCCAAATTTAGTAATTCACCTT-------ACTAGATAT-------------------------CTAAAATGA
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a
s	mr.mrrefChr5	190653	54	+	294542	GTTATCCCTACCAAGCCTGCACGTGAGCCGGCCACTGATGACATTGGCAAGGTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	334646	54	+	647215	GTTATCCCTACCAAGCCTGCACATGAGCCGGCCACTGATGACATTGGCAAGGTT

a
s	mr.mrrefChr5	190707	221	+	294542	CAGGTGTTTAAGCAAGGACGATCACTCTCAATTATGAGACCAAAAGTTGAGTCTTAATTTTTGTGGAGGGAGATTCAGCCATCTCTGAAATGAAAAGAGGTCTCACACTACTGATTACAACCTTAGAGTAGTGTAATGCCCAGGTGAATGCTTAGTTTAAACACTCTGGTTTATATCAAAAAGCGGTGCAAGTGGCACTGTAAGTCAATAAACATACACTA
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	190936	119	+	294542	AATCAACCTCATATTCATTGTCATTTCTTACTTGCCAATTAAGGTTGACACTTGGTGGCACACTGCAAGTAAGGATACCAACCTTAGAAGCCAAAACCAACCTACAAGTACCAGAGTAT
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a
s	mr.mrrefChr5	191055	408	+	294542	GTAAAAGAACTGTTACAGTGGCTTAATACTTTTTTAGATGGTTATTTTACATATGGCATTATCTACCGTGGTGGACTAGTTTCTCCAAGAAACATTTTAGTTATAATCTAGTCAAGCTACAATTAAACTCAATGGTGTAAAAAAGCCTTTACTAATGAACTAAACCCTAGACAGGTTTCATTACATGAGGTGGTGGACATACCGGCCACTCAGATTATGGAGATTAAAATGGGTAACAACAAATCGCTAGATTGACTTTCTCCTGGACACAAAGTACTTATGTTAATTTCCCAGGCTCAAATGCTAAGGTCCCTCTTTGTAGATCTGACATGGATTTTTAAGGCAGGGTGCTGGGTATTCAGGGTTTAATATTGTTAATACTGGTGGGGCCTGTATGTGCATTAAAGC
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a
s	mr.mrrefChr5	191463	97	+	294542	TAATGTGGCGGGGTCCTTGTACTAAGGCTGTTAGGTCTCATACTGTAACAGCTAAAATTGGCCAGATTTTCTATTATAAAGCTAATGCTGTAACTTC
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a
s	mr.mrrefChr5	191560	128	+	294542	ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACTGTGGCCCTTGATAATTATGTGGTAAATGGGATAATACAGGTTAAGATGCATTCCATGGTAGTGATCAGAGCTACAAATACTAAACCAGAATTTTTTGATC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	335535	128	+	647215	ATGGTGTGTCCCTGCAATGAAACATACCGTGGCGCTTGATAACTATGTGGTAAATGTGATAATACAGGTTAAGATGCATTCCATGGTAGTGATCAGAGCTACAAATACTAAACCAGAATTTTTTGATT

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	344159	135	+	636262	ATTTGTTTCCTGCTACCTACCATTAGTGCATATCAGCAGCCCTCAAACTACCGTGACCTTTGTGTATCGCACAGTCAACCCTTTGGCTTCTTTCTATAGCAATTTCAGAAAGTGTTATTCAATGTACTGATCCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	335663	129	+	647215	ATTTGTTTCCTGGTACCTACTATTAGTGCATATCGG------TCAAACTACCCTGACCTTTATGTACCACACAGTCAACCCTTCGGACTCTTTCTAGAACAATTTCAGAAATAGTTATTCAATGTACTAATCCTC

a
s	mr.mrrefChr5	191823	20	+	294542	ATCTCAGGCAGCATGAATTC
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a
s	mr.mrrefChr5	191843	47	+	294542	GTCACTCTTGGTTACAATGTTTTATACTGATTTTAGTGTGTAACATG
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a
s	mr.mrrefChr5	191890	203	+	294542	TTAGATCATACTCTTAACAAGCTTTCCCATGACTTGTGTGTTGTGTGATATGCCCCATCTATGGTCAAGTTCAAGCAAGCTGCCTGTGGGATCTATACCAAGCATTGCCACCGTGGGTCTCTATATGCATCTTGCATGTGCAACATAACATGGGACTACATACAAGTACATAAAATTGGTATCTCTGAGGTATTCCATGCAGG
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a
s	mr.mrrefChr5	192093	42	+	294542	ACTCACTGGAGTTAAAGACCAAAGGAGCCAGGAATGGCACAC
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a
s	mr.mrrefChr5	192135	279	+	294542	TAGCTTTCCATACACTACTGGATTATTGTTCAGAAAGCAGGGTATCTCAAGGAAAACCTAGTAGCACACCTTTTCTATGTGTTCACCAAATGTGAATAGATCATGGCAATCAGAAGTCAAAATGTATGGACCAGTTCTTGACACATGACCAGGGATACAATCATTCTGCATGCAGAACATCTGGTGAGCTAAGGGCCTCCTGTATGAACAGTCCTTTGCTGGTTAGGATAGCATGGTTCACTCCCATATGAGGACATGCCAGGATTCATCAAAGATCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	344675	279	+	636262	TAGCTTTCTATACAGTACTGGATTATTGTTCAGGAAGCAGGGTATCTCAAGGGAAACCTAGTAGCACACCTTTTCTACGCATTGACCAAATATGAACAAATCATGGCATTCAGAAGTCAAAGTGTATGGGCCAGTTCTTGACACATGACCAGGGATACACTCATTCTGCGTGCAGAAGATCTGGTGAGCTAAAGGCCTCATGTATGAACGGTCCTTTGCTGGTTAGGATAGCATGGTTCACTCCTATATTAGGACATGCCAGGATTCATCAAGGATCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	336109	279	+	647215	TAGCCTTCCATACACTACTAGGCTATTGTTCAGAAAACAGGGTATCTCGAGGAAAACCTCGTAGTACAACTTTTCTATGTGCTCACCAAATGTGGATAGATCATGGCAATCAGAAGTCGAAATGTATGGATCAGTTCTTGACACATGGCCAGGGATACAATCATTCTGCATGCAGAACATCTGGTGAGCTAAGGGCCTCCTGTATGAACAATCCTTTGCTGGTTAGGACAGCATGGTTCACTCCCATATGAGGACATACCAGGATTCATCACAGATCCT

a
s	mr.mrrefChr5	192414	128	+	294542	AAGGAACTTTTATAATGCCAATTTAATTCAACCAGTTCCAGATGCAATCATGCCCCATGGGTGTTTTGGGTCAGTCTGAGGCCAGAATATATCAAACCTGTCTGGGTTCTATAACACTTCCATCATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	344954	128	+	636262	AAGGAACTTTTATAATGCCAATTTAATTCAACCAGTTCCAGATGTAATTGTGCCCCATGGGTGTTTTGGGCCAGTCTGGGGCCAGAATATATCAAACCTGTCTGAGTTCTATAACACTTCTATCATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	336395	128	+	647215	AAGGAACTCTCATATTGCCAATATAGTCCAACCAGTTCTAAATGCAATCATGCCCCATGGGCATTTTGGGTCAGTGTGAGGCCAGAATATATCAATCCCATGTGGATCCTAGAACACTTCCCTCGCAT

a
s	mr.mrrefChr5	192542	272	+	294542	GCTGGAGTATGGGAATAATAATGGGATCTAGTTGGATAGAGTATGCTTATATTACTATTTGGGTCCTGCATTAGTTTAGCCACCACCATGAATGATAAGTAGTGGTGGACCCAGGGACTTCTGTGGCTGGCAGGCCCAGTGTAAAGTGCCTATGCCTAGGATCCGCTCCCAAAGGCTCGCAAGTACCTCAAATGTACTAGTTCTTTCTCTGTTCAACATGGACAACATGGACATATCCCCTTACACTTATACAATTTTTCGGTGCATCAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	345087	270	+	636262	GCTGGAGTATGGGGATAATAATTGGACCTAGTTGGATAGAGTATGCTTATGTTGCT-TTTGGGTCCTGCACTAGTTTA-CCACCACCATGAATGATAAGTGGTGGTGGACCCAGGGACTTCTGTGGCTGACAGGCCCAGTGTAAAGTGCCTATGCCTAGGATCCACTACCAAAGGCTCGTAAGTACCTCAAATGTACTAGTTCTTTCTCTGTTCAACATGGACAACATGGAGATATCCCCTTATACTTATACAATTTTTCGGTGCATCAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	336523	268	+	647215	GTTGGAGAATGGGAATAATAATGGGATCTAGTTGGATAGTGTGTGCTTATATTACTATTTGGGTCCTGCATTAGTTTAGCCGCCACAATTATTGATAAACATTGATGGACCCGGGGACTTCTGTGGCTGGTAGGCCCAGTGCAAAGTGCCTATGTCTGAGATCTGCTCCCTGAGGCTCGCAAGTACCTTAAATGTACTGGTTCTTTCTCTGTTCAACATGGACAACATGGACACATCCCTTTACACTTACAAAATTTTTTGGTGTATC----

a
s	mr.mrrefChr5	192814	185	+	294542	TCCTAAAATCCATTGATTCTCAGACATGGTGGATATGGAGCTCAGTAGATTAGAGGCCTGACTGGAGGTGACAGCTTCATAATGTGAAGAAGTCTGAGGCATAATGGCAGATCCCTGTATTTTTATTAGAAAAAATGGAAACAAGGCTCACGAAAGAACAGGGCTAACTTCGCTCTAGGCATACG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	345358	181	+	636262	TCCTAAAATCCATTGATTCTCAGACATTGTGGAGATCGAATTCAGT----TAGAGGCCTGACTGGAGGTGACAGGTTCATAATGTAAAGAAGTCTGAGGCATAATGGCAGATCCCTGTATTTTTATTAGAAAAAATGGAAATGACGCTAACGAAAGAACAGGGCTAACTTCGCTCTAGGCATACG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	336791	183	+	647215	TCCTAGAATCCATTGATTCTCAGACATGGTGTATATGGAGCTCAGTAGATTAGAGGCCTGACTGGAGGCAACAGCTGCATAATGTGAAGGAGTCTGAGACAT--TGGCAGATCCCTGTATTTTTGTTAAAAAAAATGGAATCAAGGCTCACAAAAGAACAGGGCTAACTTGGCTGTAGGCATACT

a
s	mr.mrrefChr5	192999	150	+	294542	AGGCTAACTTGGCTGTAGTCATACTTTCATAGATCAGACATAGACATCAAGTGGAAACTGATGCTTGAGGGCCCTTACTGCAGGAGCTGGATGGTAGAGAGGATAAGGCCACCTTTGTTATGATTTTTCACTGGGGTCATTTGTAACATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	345539	150	+	636262	AGGCTAACTTGGCTGTAGGCGTACTTTCATAGATCAGACATAGAGATCAAGTGGAAACTGATGCTTGAGGGCCCTTACTCCAGGAGCTGGATGGTAGAGAGGATAAGGCCACCTTTGTTATGATTTTTCACTGGGGTCATTTGTAACATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	336979	150	+	647215	AGGCTAACTTGGATGTAGTCATACTTTCATAGATCAGACAGTGACATCAACTTGAAACTTATGCTTGGGAGCCCTTACTGCAGGAGCTGGATGGTAGAGAGGATAATGCCATCCTTGTTATGATTTTTCACTGGGGTCACTTGTAACATT

a
s	mr.mrrefChr5	193149	9	+	294542	GAACAGCCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	345689	9	+	636262	GAACAGCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	337138	9	+	647215	GAAAAGACA

a
s	mr.mrrefChr5	193158	147	+	294542	ATGAATCCTGGAAAGGCTAATGATGCTGGATAGTGTATGCTTGGATTTGGTTGTGAATGTCTGCCATGCTTCAACATGAGTCTTTCCACTTTTGCATTGGTAAAGATAATAAGTTTTAATACAAAACTCATTGAAGATGTAATCTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	345698	146	+	636262	ATGAATCCTGGAAAGGCTAATGATGCTGGATAGTATATGCTTGGATTTGGTTGTGAATGTCTGCCATGCTTCAACATAAGTCTTTCCACTTTTG-ATTGGTAAAGATAATAAGTTTTAATACAAAACTCATTGAAGATGTAATCTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	337149	147	+	647215	ATGAATCCTGGAAAGGTTAATGATGCTGGATAGTGTATGCTTTGATTTGGTTGTGCATTTCTGCCTTGCTTCAACATGAGTCTTTTCGGTTTTGCATTAGTGAAGGTAATAAGTTTTAATATAGAACTCATTGAGGGTATAATCGGT

a
s	mr.mrrefChr5	193305	29	+	294542	GTCACAAGGTTAGGTGAAGCTTAGTAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	345844	29	+	636262	GTCACAAGGTTAGGTGAAGCTTAGTAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	337297	29	+	647215	GTCACAAGATTAGGCAAAGCCTAGTAACA

a
s	mr.mrrefChr5	193334	17	+	294542	CTTCCCCCTAAAACTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	345873	17	+	636262	CTTCCCCCTAAAACTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	337333	17	+	647215	CTTCCCTGCAAGACTGT

a
s	mr.mrrefChr5	193351	203	+	294542	GATGTGCTAACCCATTGGTGGCTAGATTCCACAACATAGAGACGCTACAATTGTGTTATGGACAAACATCAGGCAGGTCGGCTGTGCACTTGAGAGTTTTCATGTTTAATTGCTTCAATTTTGGAATTTTGTTTTCCTGATAACTTTCAAGGCACAAATACCAACCCAGCCAAAGATAATAGCGTTTGGTGGTTCAACTTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	345890	203	+	636262	GATGTGCTAACCCATTGGTGGCTAGACTCCACAACATAGAGACGCTGCAATCATGTTATGGACAAACATCAGGCAGGTCGGCTGTGCACTTGAGAGTTTTCATGTTTAATTGCTTCAATTTTGGAATTTTGTTTTCCTGATAACTTTCAAGGCACAAATACCAACCCAGCCAAAGAAAATAGCGTTTGGTGGTTCAAGTTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	337356	152	+	647215	AATACACTGACCCATTGGTGGCTAGATTTCACAACAGAGAGACACTACAGTTGTCTTATGGACACACATCAGGCA---------------------------------------------------TTTTGTTTTCCTGATAACTTTCAAGGAACAAATACCAACCCAGACAAAGATGATAGCGTTTGGTGGTTCAACTTGTT

a
s	mr.mrrefChr5	193554	45	+	294542	TGATTGTTACCTGTTCACCTGCATACTTGATATTACAGTTTTACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	346095	40	+	636262	TGATT-----CTGTTCACCTGCATACTTGATATTACAGTTTTACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	337611	40	+	647215	-----GTTACCTGTTCACCTGCATACTTGATATTACAGTTTTACA

a
s	mr.mrrefChr5	193599	101	+	294542	TGCCATCTGAAGAGGGATGGAATTATACACACCATCTTAGCTGGGGAGTGTCATAAGGTTCTGAAAGGCAGATGTTCCTACACTCAAAAGAAGTGCAGAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	346137	101	+	636262	TGCCATCTGAAGAGGGATGGAATTTTGCACACCATCTTAGCTGGGGAGTGTCATAAGGTTCTGAAACGCAGATGTTCCTGCACTCAAAGGAAGTGCAGAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	337651	95	+	647215	TGCTGTCTGGAGAGGGGTGGAATTATACACACCATCTTAGCT------TGTCATAAGGTTCTGAAGGGCAGAAGCCCCTACGCTCAAAAGAAGTGCAGAAG

a
s	mr.mrrefChr5	193700	180	+	294542	CTATTATCAAGGGCCAAAAATTTGCCTACATTCTAGTAGTGAAGCCCATATGGTAATCTAATGTAGGGCTATATTACCTGGATCTATCCCAACTTTTATCATGCTTCAAAATTTCAGAGCTACATTTATGGACACCCTATGGGATGCATCAATCAATTAAAGACACAAAAGTAAGATGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	346238	180	+	636262	CCATTATCAAGGGCCATAAATTTGCCTACATTCTAATAGTGAAGCCCATATGGTAATCTAATGTAGGGCTATATTACCTGGATCTATCCCAACTTTTATCATGCTTCAAAATTTCAGAGCTACATTTATGGACACCCTATGGGATGCGTCAATCAATTAAAGACACAAAAGTAAGATGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	337749	179	+	647215	ATACTATCAAGGGACAAAAATTTGTCTACATTCTCGTAGT-AAGCCCATGTGGTAATCTAATATAGAGGTAGACTACCGGGCTCTATCCCAACTTGTATCACGCTTCAAAATTCCAGAGCTACATTGATTGACACCCTATGGGATGTATCGATCAATTAAAGACGCGAAAGTAAGATGCG

a
s	mr.mrrefChr5	193880	94	+	294542	GATCTAGTGAGTTATGTTGCCAATTAAGCATATTGAAGTAGCATCAGTAATAACAGGTGTCAATCTGCATCTATTAACAGGGGTTGTAACTAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	346418	94	+	636262	GATCTAGTGAGTTATGTTGCCAATCAAGCATATTGAAATAGCATCAGTAATAACAGATATCAATCTGCATCTATTAACAGGGGTTGTAACTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	337930	82	+	647215	GATTTAGTGAGTTATGTTGCCAGTTGAGCATATTAAAGTAGCATC----ATGACAGGTG------TGGATCTATCAACAGGGGT--TCACTAGA

a
s	mr.mrrefChr5	193974	289	+	294542	AATTGAACTGAAGTGGAAGATTTCGGAAATGTAATGAACATATTACTGACCATCAAAACCCAGCTTTCTGAAGACATTGATAAACTTCTAGTTAAAGCTTGTAAGAACAAGGCAAAGACACATGATTGTTAAAATATTACATGTAACATCAGAAATTAGACTAGATCCAAAATACTTGAGAAAAGGATGTAGTATACCTCACCAAGTCTCATGTTTTATATGATGACATTACATCAAGGTGATAACAGAAGCAGCAAGCCCAAGTCATTTGCTTAGCTGGTTTAGGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	346512	281	+	636262	AATTGAACGGAAGTGGAAGATTTCGGAAATGTAATGAACATATTACTGACCATCAAAAACCAGCTTTCTGAAGACATTGATAAACTTCTAGTTAAACCTTGTAAG---AAGGCAAAGACATGTGATTGTTAAAATATTACATGTGATATCAGAAATTAGGTTAGATCCAAAATACTTGAGAAAAGGATGTAGTATACCTCATCAAGTCTCATGTTTTATATGATG-----AGATCAAGGTGATAACAGAAGCAGCAAGCCCAAGTCATTTGCTTAGCTGGTTTAGGTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338023	286	+	647215	AATTGAACTGAACTGGAAGA-TTCAGAAATGTAATGAACATATCACTGACCATCAAAACCTAGCTTTC--AAGACATTGATATACTTCTAGTTACAGCTTATAAAAACAAAGCAAAGACACATGATTGTCAAAATATCACATGTAACATCAGAAATTAGACTAGATCCAATATACTCGAGAAAAGGATGTAGTATACCTCACCAATCCTCATGTTTTACATAATGACATTACATCAAGGCGATAACAGCGACAGCGAGTCCAAGTTATTTGCTTAACTGACTTGAGTCA

a
s	mr.mrrefChr5	194263	46	+	294542	GGGCTCTTGAATAATACTTAACTCACTGACCAAAAACAAAAAACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	346798	46	+	636262	GGGCTCTTGAATAATACTTAACTCACTGACCAAAAACAAAAAACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338309	46	+	647215	TGACTCTTGATTAATACTTAACTCACTGACCCATTAAAAATATCCA

a
s	mr.mrrefChr5	194309	24	+	294542	TCCAGGCAGCACACATACACTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	346844	24	+	636262	TCCAGGCAGCACACATACACTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338371	24	+	647215	TGCAGAGAGTATACACATAATCTT

a
s	mr.mrrefChr5	194333	7	+	294542	GAGTCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	346872	7	+	636262	GAGTCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338395	7	+	647215	GAGTTTC

a
s	mr.mrrefChr5	194340	8	+	294542	GTACCCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	346880	8	+	636262	GTACCCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338402	8	+	647215	GTATCGAG

a
s	mr.mrrefChr5	194348	11	+	294542	GGACTCACATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	346888	11	+	636262	GGACTCACATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338411	11	+	647215	AGACCCTGATA

a
s	mr.mrrefChr5	194359	28	+	294542	ATTCATATGCGCAACATAATGAATATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	346903	28	+	636262	ATTCATATGCGCAACATAATGAATATAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338422	28	+	647215	ACTCAAATAGTCCAGGTAACACACATAA

a
s	mr.mrrefChr5	194387	39	+	294542	CCATGGTGGCCCTATAAAAATGGTCTAAAGTGAAGTTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	346933	39	+	636262	CCATGGTGGCCCTATAAAAATGGTCTAAAGTGAAGTTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338450	39	+	647215	CCATGGTGGCCCTATAAAAGGGGGTCCAAGTGAAGTTCA

a
s	mr.mrrefChr5	194426	9	+	294542	ACCCCTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	346972	9	+	636262	ACCCCTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338491	9	+	647215	AACCCATTG

a
s	mr.mrrefChr5	194435	38	+	294542	TGCTGGGTTATTTATGGGGGACAAGACCCTGGTGTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	347143	38	+	636262	TGCTGGGTTATTTATGGGGGACAAGACCCTGGTGTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338500	38	+	647215	TGCTGCGTTATTTATGGGGAACAAGACGCTTGTAGGCA

a
s	mr.mrrefChr5	194473	175	+	294542	GAAAACATTGAAATAACCGCATTGATCACTGCCAAACTCCATTTCAAAGGGCTATTGGAAAACCGTTCAATCGGAAAAGGTGGTTTTAAGTAATGGTGATGCAGGATTACTGGGATGAATCCAGGTGCTGGGCAGTAGAAAAGTCACTATCTTTAAAAAATAGTAAAAACAGGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	347181	175	+	636262	GAAAACATTGAAATAACCGCATTGATCACTGCCAAACTCCATTTCAAAGGGCTATTGGAAAACCGTTCAATCGGAAAAGGTGGTTTTAAGTAATGGTGATGCAGGATTACTGGGATGAATCCAGGTGCTGGGCAGTAGAAAAGTCACTATCTTTAAAAAATAGTAAAAACAGGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338543	175	+	647215	GAAAACATTGAAATAACCACATTGACCAATACCAAACTCCATTTCGAGGGGCTATTGGAAAACTGTTAGATCAGAAAAGGATATTTTTAGTAATGGAGATGTAGGATCACTGAGATGAATCCAGCTGCAAGGCAGTAAAAAAGCCACTATCTTTGAAAAATAGTAAAAATGGGTG

a
s	mr.mrrefChr5	194648	87	+	294542	CTTCCAGAAAGTCACTGGCTGATAACTTGGGAAACATCTTTGCCATGTACTGGGCCATTAGGTCGGGCTCATTCACAAGCACATTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	347360	87	+	636262	CTTCCAGAAAGTCACTGGCTGATAACTTGGGAAACATCTTTGCCATGTACTGGGCCATTAGGTCGGGCTCATTCACAAGCACATTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338718	87	+	647215	CTTCCAGAAAGTCATTGGTTGATGACTGGGGAAACATCTTTGCCAAGTACTGGGCCATTAGATTGCGCTCATCCACAAGCACATTAA

a
s	mr.mrrefChr5	194735	32	+	294542	AAAAATTCCTAGTCAGAGTACTAAATTAAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	347447	32	+	636262	AAAAATTCCTAGTCAGAGTACTAAATTAAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338830	32	+	647215	AAAAATTCCTAGTCATACTACTAAATTAAGAT

a
s	mr.mrrefChr5	194767	63	+	294542	GAGAATTATAATGCGGTGTCCTGCTTGTAGGTCGTCTAAGAGTATAGCTAACAATGTTCTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	347479	63	+	636262	GAGAATTATAATGCGGTGTCCTGCTTGTAGGTCGTCTAAGAGTATAGCTAACAATGTTCTATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338883	63	+	647215	AAGAACTATAACGTGGTGGCCTGTTAGTAGGTTGTTTAAGAGCACAGCTAAAGATGTTCTACT

a
s	mr.mrrefChr5	194830	82	+	294542	GTGGTTGGGTTTTCCCTCAAGCATACCACTAGCATGAACTCAATTTTGGATACCAAAATTATTCCAAGGTCCTTTCTAGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	347542	81	+	636262	GTGGTTGGGTTTTCC-TGAAGCATACTACTAGCACGAACCCAATTGCGGATACCAAAATTATTCCAAGGTCCTTTCTAGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	338954	82	+	647215	GTGGTTGAGTTTTCCCTCAAACATACCACTAGCATTAACTCATTTTTGGGTACCAAAATCATTCCAAGGTCCTTTCTAGCAA

a
s	mr.mrrefChr5	194912	205	+	294542	GCTTCAACCATTGTCTCACTACCTTTGTACTTAGGGACAAACTTGGTGTAACTTCTGGTGCAACTTCATTGGTGAAGTTTCTCATATTCCTGTGTGTGTAACCACATATTTAAAATCAAACTATAAAGAAACAGCTCTACATTCACGCTCTTCCGTGGTAGATTAGTTAACTAGCTGTCACCAGTAATTAATTTTAAACTAGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	347623	205	+	636262	GCTTAAACTATTGTCTCACTACCTTTGTACTTAGGGACAAACTTGATGTGACTTCTGGTGCAACTTCATCAGTGAAGTTCCTCATATTCCTGTGTGTGTAACCACATATTTAAAATCAAACTATAAAGAAACAGCTCTACATTCACCCTCTTCCAGGGTAGTTTAGTTAACTAGCTGTCACCAGTAATTAATTTTAAACTAGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	339037	205	+	647215	GCTTCAACCATTGTCTCACCACCTTTGTACTTAGGGACAAATTTGGTGCAACTTCTGATGCAACTTCACTGGTGAGGTTTCTTATATTCCGTTATGTGTAACCACACATCTAAAATCAAACTATGAAAAAACAGCACTACATGCATGCTCATCTGTGTTAGATTAATTAACTAGCTGTCACTAGTAATTAATTTTAAACTAGAAT

a
s	mr.mrrefChr5	195117	236	+	294542	CTAATAATTCAAGAGAGCTAGGAAGTCATAATGTTTAGTTGCATATAGATCGTAACGTTCTGGTTTACTCTTTAGATGGCTGGAACTGTTTTTTGCTGGTATATTTCAGGTACATATGGTATACCAGCCATTTGTGTATTGGGTATAACAGACATCAAGGGCATGGTGTTAGGATCAACTGGACATTATAAATTCTATCAGGGCACAGCAGCGTTTACAACTGGTCTGGGCCTGCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	347828	235	+	636262	CTAATAATTCAAGAGAGCTAGGAAGTC-TAATGTTTAGTTGCATATAGATCGTAACGTTCTGGTTTACTCTTTAGATGGCTGGAACTGTTTTTTGTTGGTATATTTCAGGTACATATGGTATACCAGCCATTTGTGTATTGGGTATAACAGACATCAAGGGCATGGTGTTAGGATCAACTGGACATTATAAATTCTATCAGGGCACAGCAGCGTTTACAACTGGTCTGGGCCTGCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	339250	233	+	647215	TTAATAATTCAAGAG--CCAGGAAGTCATAATGTTTAGTGGGATATAGATCATAACATTTTGGTTTACTCTTTAGATGACTGGAACTGTTTTTTGCTGGTTAAGTTCAGGTACATATGCTATACCAACCATTTGTGTATTGGTTATAACAGACATCAAGGGCATAGTGTTAGGA-CAACTGGACATTATAGATTCTATACGGGCATTACAATGTGTACAACAGGTCTGGGCCTGCT

a
s	mr.mrrefChr5	195353	258	+	294542	CAGCATTACCAATGTTATGATAATAACTCAGGATTGAGCCTGGTGCCTTTGCTACTGATGGACAAACAGGTGCGACTTCTGGTGCACCTACTATGGTAATCATTTTGTGTTGCTTTCAGTATAACGATGATGACACAACTCTCAGTTCAGGTTCCTTGGTGGTAGTTTAGTCAACTAACCCTGTTATTCACCAATTGATGTATAATGATGCAAGAAAGTGGTTGTAATGCTCAGGCATTGCTAGGATACAAGAGAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	348063	258	+	636262	CAGCATTACCAATGTTATGATAATAACTCAGGATTGAGCCTGGTGCCTTTGCTACTGATGGACAAACAGGTGCGACTTCTGGTGCACTTACTGTGGTAATCATTTTGTGTTGCTTTCAGTATAACGATGATAACATAACTCTCAGTTCCAGTTCCTTCGTGGTAGTCTAGTCTACTAACCCGGTTATTCACCAATTGATGTATAATGATGCAAGAAAGTGGTTGTAATGCTCAGGCATTGCTGGGATACAAGAGAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	339490	243	+	647215	CAGCATTACCAGTGTTATGATAAGAACCCAGGATTAAGTCTGGTGCCTTTTCTACTGATGGACAAACACGTGCAACTTCTGGGGCACCTACTATGGTAATCCT------TTGTTATCAGTATAAATATGATGACACAACTCTGAGTTCAGGTCCCTTGGTGGTAGCTTAGTCAACTAACCCTGTTATT---------ATGTATATCGATGGAAAAAAGAAGTTGTAGTGCTCAGGCGTTGCTAGGATACAAGAGAGCT

a
s	mr.mrrefChr5	195611	59	+	294542	GAGAGGTTATAATGCTAATGCCCAGTGGTGTTTCCCTAAGACACTGGCACAGCCTGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	348321	59	+	636262	GAGAGGTTATAATGCTAATGCCCAGTGGTGTTTCCCTAAGACACTGGCACAGCCTGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	339737	59	+	647215	GAGAGGTTATAACACTAATGCTCACTGGTGTTTCCCTAAGGCATTGCTAATGCCTACAA

a
s	mr.mrrefChr5	195670	33	+	294542	TCCAGATTGTTTTTTGCTGTTCTATTCCTGGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	348382	33	+	636262	TCCAGATTGTTTTTTGCTGTTCTATTCCCGTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	339796	33	+	647215	ATCAGATTGTTTTTTGCTGTTCTATTCCTGGTA

a
s	mr.mrrefChr5	195703	145	+	294542	TCGGACACCTATTGGCCTTTGGTCCATTGGAAGTACCACAAGTCAAGATATAGGATAAAGAGTTAGGATCAACTGGGCATTAAAGATAACATTGGGGCTGCAACAGTGTGAACAGTTGGTCTGGACCTGTACCATTTACTGCACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	348415	145	+	636262	TCGGACACCTATTGGCCTTTGGTCCATTGCAAGTACCACAAGTCAAGACATACAATAAAGGGTTAGGATCAACTGGGCATTAAAGATAACATTGGGGCTGCAACAGTGTGAACAGATGCTCTGGCCCTGTACCATTTACTGCACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	339833	145	+	647215	TTGGACATTCATTGGTGTTTGATCCATTGGAATTACCACAAGTCGAGGTATGGGACAGAGAGTTGGGATCAACTGGGTATTACAGATTACATTGGGGCTGCAACAGTGTGAACACTGTGTCTGGACCTGTACCATTCACTGCACC

a
s	mr.mrrefChr5	195848	30	+	294542	AGGTGTGTTAGGTGTCTCAGAGGTATCAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	348635	30	+	636262	AGGTGTGTTAGGTGGCTCAGAGGTATCAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	339978	16	+	647215	AGGTGTGTTAGGTATC--------------

a
s	mr.mrrefChr5	195878	32	+	294542	AGAGAGGAGCTCATGAAATTGGGATTAGTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	348668	32	+	636262	AGAGAGGAGCTCATGAAATTGGGATTAGTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	339994	5	+	647215	-------------------T--------TGTA

a
s	mr.mrrefChr5	195910	84	+	294542	AAAGTGAAACAGTTAACTGGGGAATAATGGCTACACATGTGAACCATCTTCTTGTCCCATCCCAACATTATCCTCAATATCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	348700	84	+	636262	AAAGTGAAACAGTTAACTTTGAAATAATGGCTACACACATGAACCATCTTCTTGTCCCATCCCAACATTATCCTCAATATCATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	340005	84	+	647215	AAAGCAAAACAGTTAACTGGGGAATAATAACTACACATGTGAACCATCTTCTTGCCATATCCCATCATTGCCCTAAATATCATC

a
s	mr.mrrefChr5	195994	183	+	294542	AGAGAATTACAAAAGTAAGGCTTCACTAGACTACACCTGAACAAATGTGGAATCATCGGTCAGGCACATTGAAAAACTGATGTTGTGTTCAAGGCAGACCTACTATTATTCTTGTTTCTCTTAAAATATCACCTTTAACCAACCTCTCAAGAAAACCATCAAATGTCAAAAAATTCTGACTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	348784	182	+	636262	AGAGAATTACCAAAGTAAGGCTTCACTAGACTACACCTG-ATAAATGTGGAATCATTGTTCATGCACATTGAAAAGCTGATGTTGTGTTCAAGGTTGACCTACTCTTATTCTTGTTCCTCTTAAAATATCACCTTTAACCAACCTCTCAGGAAAACCATCAAATGTCAAAAAATTCTGACTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	340090	182	+	647215	AGAGAATTACAAAAGCAAGGCTTCACTAGACTACACCTGAACAAGTCTGGAATCATCGGTCAGGCACATTGAAAAA-TGATATTGTGCTCAAGGCAGACTTACTATTATTCTTGTTTCTCTTAAAATATCACCTTCAACCATCCTCTCAAGAAAAACATAAACTGTCAAAAAGCCCTGACTTT

a
s	mr.mrrefChr5	196177	279	+	294542	CCCCGTGTGCCAGTAATCACCCTACTCTGTCTCACTGCCACCAAGAATGTATACAACCATGCGGATGTCACACAATAAAACTGCTTCTTATTCTCTTGGGCAATTCTCAATTTTAGTACTTATATTGCCATTCTGTACCGTCTGAATATGATCCATTTGACTAGTAGATGTGTCAACTACATTATTACTCTGGATGCTTCAAAGTGAGTATCTTACAGACTCACATCTATTGAGCTTGTTAAAGGTGCAAAGGTTCCCATGGGAGAGGTGGTAGAATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	348971	277	+	636262	CCCTGTGTGCCAGTAATCACCCTACTCTGTCTCACTGCCACCAAGAATGTATACAACC--GCGGAAGTCACACAATAAAACTGCTTCTTATTCTCTTGGGCAATTCTCAACTTTAGTACTTATATTGCCATACTGAACCGTCTGAATATGATCCATTTGACTAGTCGATGTGTCAACTACATTATTACTCTGGATGCTTCTAAGTGAGTGTCTTACAGACAGACATCTATTGAGCTCGTTAAAGGTGCAAACGTTCCCATGGGAGAGGTGGTAGAATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	340272	276	+	647215	CTCCTCATACCAGTAATCACCTTACTCTGTCTCACTGCCACCAAGAATGTCTACAACCATGCAGATGGCACACAATAAAACTGCTTCTTGTGCTCTTGGGCAATTCTCAATTTTAGTGCTTATATTTCCATTCTGTA---TCTGAATACGATCCATTTGACTAGTAGATGTATCAACTATATTATTACTCTGGTTGCTTCAAAGTGAGTATCTTACAAACTCATGTCTATTGAGCTTGTTATAGCTGTGAAGGTTCCCATGGGAGAGGTGGTAGAATGT

a
s	mr.mrrefChr5	196456	188	+	294542	AGATCTCACTCCTAGCAGTACCGTCAATAGTCTAGGGTGCTGTCCCATATATACATTTTTGACCCATCGGGACTCTGTCTGTTATAACCTGGTGACATCTGGGATGACTCTCAGTCACCAATCCTGGATCCATACATGTTCATCGATCATTAAGGACCACTAGATTGCTAAGCAGATGTAACTCACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	349248	188	+	636262	AGATCCCACTCCTAGCAGTATCGTCAATAGTCTAGGGTGCTGTCCCATATATACATTTTTAACCCATCAGGACTCTGTCTGTTCTAACCTGGTGACATCTGGGATGACTCTCAGTCACCAATCCTGGATCCATACATGTTCATCAATCATTAAGGACCACCAGATTGCTAAACAAATGCAACTCACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	340549	174	+	647215	AGATCTCACTCCTAGCATCACTGTCAATAGTCTAGGGTGCTGTCGCATACATACATTTTTGACCCATCGGGACTCTCCCTGCTATAACCTGGTGACAACTAGGA--------------CCATCCTGGATCCACATAGGTTCATGGATCATTAAAAACCACTAGATTGCTAAGCAGATGTAACTCACAC

a
s	mr.mrrefChr5	196644	82	+	294542	CTTCTTCTTGTTGGGGATGAGGAGTCCGTGCCCTATGTTGCTGGATTCCAAATTCTTTTTTCCCTTCTTGTCAACCCTCTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	349439	82	+	636262	TTTCTTCTTGTTGGGGATGAGGAGTCTGTGCCCTATGTTGCTGGATTCCAAATTCTTTTTTCCCTTCTTGTCAACCCTCTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	340723	82	+	647215	CTCATTATTGTTGGGGATGAAGATTCCATGCCCTATGTTGCTGGATTTAAAATTCTTTTTTCCCTTCTTGTCAACCCTCTTG

a
s	mr.mrrefChr5	196726	43	+	294542	GCCCAGCTAATGTAGACATATACTGGTCCCAGTGTCTGGAGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	349521	43	+	636262	GTCCAGCTAATGTAGACGTATACTGGTCCCAGTGTCTGGAGAC
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a
s	mr.mrrefChr5	196769	25	+	294542	AGGCAACCCTAGCCATTAGGTGCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	349564	25	+	636262	AGGCAACCCTAGCCATTAGGTGCAG
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a
s	mr.mrrefChr5	196794	65	+	294542	ACCTTCATTGGAACCTTTTCCTTAAACTTGACTCATATCTTTGTAAAGATTACCTGACACACAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	349589	65	+	636262	ACCTTCATTGGAACCTTTTCCTTAAACTTGACTCACATCTTTGTAAAGATTACCTGACACACAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	340899	65	+	647215	ACCTTCGTTGAAACCTTTTTCTTACATTTGACTCATATCTTAGAAAAGCTTACCTGACACATGGG

a
s	mr.mrrefChr5	196859	147	+	294542	CCTGCAGACTCAGATAAAATACCGACGTAATGTACAATACTACTAGTTCTGAAGCATCCCTGTGGGAGGCATGGGAAGTAGAGTAGGATTATGTAACTTGGTTCCTACCCAGACTGACACCCACACATAGTCCAGGCCCTGAGTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	349663	147	+	636262	CCTGCAGACTCAGATGAAATACCGACGTAATGTACAATACTACTAGCTCTGAAGCATCCCTGTGGGAGGCATGGGAAGTGGAGTGGGATTATGTAGCTTGGTTCCTACTCAGACTGACACCCACACAAAGTCCAGGCCCTGAGTGAA
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a
s	mr.mrrefChr5	197006	46	+	294542	AGATAGTCCATTGCCTAGCCTAGTTCACTTCCATCAAGGATCACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	349810	46	+	636262	AGATAGTCAATTGCTTAGCTTAGTTCACTTCCATCAAGGATCACTT
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a
s	mr.mrrefChr5	197052	177	+	294542	TCAAGGTATAGTTCTTGACTCATCTGTCGATTTCTTAGTGAACACTCTTCTCTTTGGAAGTTTAAAGGAAACCTTGTCATGGGTCCTTTGCTCGGTGGTAACCAGATAGAGGGATCCTAGCCGTATGTACACTATGCTTGGGGTGTACTTGAAGATAAGCTCACTACCATCATAAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	349856	176	+	636262	TCAAGGTATAGTTCTTGACTTGTCCATCGATTTCTTAGTGGA-ACTCTCCTCTTTGGAAGTTTAAAGGAAACCTTGTCCTGGGTCCTTTGCTCGGTGGCAACCAGATATAAGGATCCTAGCCGTATGTGCACTATGCTTGAGGTGTACTTGAAGATACGCTCACTACTATCATAAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	341162	174	+	647215	TCAAGGCAGAGCTCTTGACTCATCTGTCAATTTCTTAGTGAACCCTCTTCTCTTTGGAGATTTAAAGGAAACCTTGTCATGGGTCCTTTGCTCAGTGGTAACC--ATAGAGGCATCCTAGCCACATGTACACGAG-CTCAGGGTATACTTGAAGATAAGCTCACTACCATCATAAAC

a
s	mr.mrrefChr5	197229	79	+	294542	ATCTCTTGTCTGAGATGCACTCAAAAGGGGAGCCTATGGAACCATAACAAAGGTATTTTTGGTATGGCAGGTTTGAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	350032	79	+	636262	ATCTCTTGTCTGATATGCACTCAAAAGGGGAGCCTACAGAACAATAACAAAGGTATTTTTGGTATGGCAGGGCTGAGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	341337	79	+	647215	ATCTATTGTCTGAGATGCACTCAAAAGGGGAGCCTATGGAACCATAACAGAGGTAGTTTTGGTATGCCAGGTTTGAGCT

a
s	mr.mrrefChr5	197308	131	+	294542	CCATACCTACTTCACACCAAAAGAAGTCAGGCATCCCACAATGAAAAATTGTAACAACTCTGGTCTGCCCATAAGAATCTCAGATTACTGCACAGAAGCTGCCACTGGCTTGATCTCTGGTCCAAGGTAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	350116	131	+	636262	CCATACCTACTTCACACCAAAAGAATTCAGGCATCCCACAATGAAAAATTGTAACAACTCTGGTCTGCCCATAAGAATCTCAGTGTACTGCACAGAAGCTGCCACTGGTTTGATCTCTGGTCCAAGGTAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	341416	131	+	647215	CCCTACCTACTTCACAGCAAAAGAAGTTAGGCTGCCCACAATGAAAAATTGTAACAACTCTGGTCAGCCCATAAGAATCTCAGATTATTGCACAGAAGCTGCTACTGGCTTAATTTCTGGTCCAAGATAGT

a
s	mr.mrrefChr5	197439	23	+	294542	TGGATTTCATAAGATCACTGGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	350247	23	+	636262	TGGATTTCATAAGATCACTGGTC
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a
s	mr.mrrefChr5	197462	22	+	294542	TGTGTATTCAAACGAGATTAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	350270	22	+	636262	TGTGTATTCAAACGAGATTAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	341576	22	+	647215	TATGTCTGCAAACAAGATCGGT

a
s	mr.mrrefChr5	197484	118	+	294542	TTCTTGCAAACATAACAACCCACCATGGCATGTAGATGGTGTACTATTTGTTTCCAATGTCTTGAGAATGGGGGATGCACTTATCTTAAGTGTAGGTTAGCCTGTTGTGTATTACCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	350302	118	+	636262	TTCTTGCAAACATAACAACCCACCATGGCATGTAGATGGTGTACTATTTGTTTCCAATGTCTTGAGAATGGGGGATGCACTTATCTTAAGTGTAGGTTAGCCTGTTGTGTATTACCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	341598	118	+	647215	TTCTAGCACACAAAATAACTCACCATGGTATGTAGATGGTGTTCTATTTGTCTCCAATGTCTTGACCACTGGGGATGCACTTATCTTAAGTGTAGGTCAACCTGCTGTGTATTATCTT

a
s	mr.mrrefChr5	197602	286	+	294542	AAACACTCTGCACTATAACAAGATCTACACGTCAGATCACTTACCTGAATTACCGCACTTACTTTGGCATGACAGTGTAGGAACAAACTGTAGGATTGAGACGGATAGACTGAGTGCAGATATTTGGCACTCTAAAGTATCTTTTGGTAGCCTAATCAACAGACAATGGGCTCTCAGAGGAGTGCTTGTTTGTGCCAGTTAGGCTGTACTCCTTTCCTTTGGTAAGCCTATAGATAAGTTTGGCTTAGGAGCGTCATAAACCTATCCAATATATCGATATATTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	350421	286	+	636262	AAACACTCTGCACTATAACAAGATCTACACGTCAGATCACTTACCTGAATTACCGCACTTACTTTGGCATGACAGTGTAGGAACAAACTGTAGGATTGAGACGGATAGACTGAGTGCAGATATTTGGCACTCTAAAGTATCTTTTGGTAGCCTAATCAACAGACAATGGGCTCTCAGAGGAGTGCTTGTTTGTGCCAGTTAGGCTGTACTCCTTTCCTTTGGTAAGCCTATAGATAAGTTTGGCTTAGGAGCGTCATAAACCTATCCAATATATCGATATATTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	341716	286	+	647215	AATCACTCCACACTATTATAAAATGCACACCTCAGATCGCTTGCTTGAATTACCCCACCTATTTTGGCATGACAGTGGAGGAACAAACTGTAGGATTGAGAGGGACAGACTGTGCACAGATATTTCATACTCTAAAGCATCCTTTGGTACCCTAATCAACAGATAATGGGCTTTCAGGTGAGTGCTTGTTTGTGCCAGTTAGACTGTACTCTTTCCCTTTGGTAAGCCTATAGATAGGTTTGGCTTAGTAGCATCATAAACCTATCCAATATATCAATATATGTGT

a
s	mr.mrrefChr5	197888	95	+	294542	CTCAAATCACAATCAGTTTCTGTATTTCTCCATATCCTGATTCACAAGTTAGGCTAGTCCCTTACTGTGATTGTAATTTCATGACTCCTATACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	350712	95	+	636262	CTCAAATCACAATCAGTTTCTGTATTTCTCCATATCCTGATTCACAAGTTAGGCTAGTCCCTTACTGTGATTGTAATTTCATGACTCCTATACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	342002	95	+	647215	CTCAAACCACAATCAGTTTCTATATCTCTCCATATCTTGATCCATTGGTCAGGCTAATCCTTTACTGAGATTGTAATTGCATGACTGCTATAGTA

a
s	mr.mrrefChr5	197983	11	+	294542	TGCCTCTTGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	350807	11	+	636262	TGCCTCTTGCA
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a
s	mr.mrrefChr5	197994	10	+	294542	CCTGAGGCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	350818	10	+	636262	CCTGAGGCAC
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a
s	mr.mrrefChr5	198004	131	+	294542	TTTTGTTAACAGAGTTCACATATGGATATGTTGTGACAGTGCATTCTCACTTATCTGTTAAAGCAGTTTTGGCTGGATTGGTTTAAACATGGCGCAAACTGCAAATGCAGTGACTCCACCAGTGTCCCCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	350837	131	+	636262	TTTTGTTAACAGAGTTCACATATGGATATGTTGTGACAGTGCATTCTCACTTATCTGTTAAAGCAGTTTTGGCTGGATTGGTTTAAACATGGCGCAAACTGCAAATGCAGTGACTCCACCAGTGTCCCCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	342164	131	+	647215	TTTTGTTAACAGACATTGCATATGGTTATGTTGTAATAGTGCACTCTCACTTACCTGTTAAAACAGTTTTAGCTAGATTGGTCGAAATGTGGCGCACAGTCCAAGCACAATGACTCACCAAGCATTCCCTC

a
s	mr.mrrefChr5	198135	107	+	294542	ACTCGCAGTCTTAATCTGTCACAACATCCACACTGATAAGCCTAAATTTGATGAATCAGAGAACAATGGCCCTCAGGCAAAAGTTTGATCCCAGAATGGATCACAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	350969	107	+	636262	ACTCGCAGTCTTAATCTGTCACAACATCCACACTGATAAGCCTAAATTTGATGAATCAGAGAACAATGGCCCTCAGGCAAAAGTTTGATCCCAGAATGGATCACAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	198242	36	+	294542	CAGGGGTTTTCATCACATCTAGGTTGTACTTTACCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351076	36	+	636262	CAGGGGTTTTCATCACATCTAGGTTGTACTTTACCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	342403	36	+	647215	CAGGGATGTTCATCAAACCTAGGTTGTACTCAACCT

a
s	mr.mrrefChr5	198278	13	+	294542	TTAAATGAGTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351112	13	+	636262	TTAAATGAGTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	342462	13	+	647215	TTCAATGGGTTGG

a
s	mr.mrrefChr5	198291	119	+	294542	AAGGTTTGTCCCTGTGGTGGAATCATAGACTTTATGGAATCAAGGTGTGGTGAAAACAGTCACTATCATCATTTTGGTTGACTGCACATGGATATGATTTGCCTTTGATAAGCGGCAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351130	119	+	636262	AAGGTTTGTCCCTGTGGTGGAATCATAGACTTTATGGAATCAAGGTGTGGTGAAAACAGTCACTATCATCATTTTGGTTGACTGCACATGGATATGATTTGCCTTTGATAAGCGGCAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	342475	119	+	647215	AAGGTTTGTCCCTGTGGTGGAATCATAGACTTTATGGAACCAGGAAGTGGAGGAAACAGTTATTGTCATCATTTTGGTTAACTGCACTTGGGTATGGTTGATTTTTGATAATTGGCAAG

a
s	mr.mrrefChr5	198410	33	+	294542	TAAAGGGCCATTAAGTATCCTTATTGTAGAGAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351251	33	+	636262	TAAAGGGCCATTAAGTATCCTTATTGTAGAGAC
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a
s	mr.mrrefChr5	198443	8	+	294542	TTCTCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351287	8	+	636262	TTCTCAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	198451	7	+	294542	TCTGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351295	7	+	636262	TCTGTGT
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a
s	mr.mrrefChr5	198458	25	+	294542	AGCCTCTGTGTAGAGACTGTTTCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351303	25	+	636262	AGCCTCTGTGTAGAGACTGTTTCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	342645	25	+	647215	ATCCTTATTGTAGAGACTTCTTCTC

a
s	mr.mrrefChr5	198483	53	+	294542	AGATCTGTGTGAGCCTCTGCGTTAATGTCTGAGGGGGATGCTCAGAGGGTTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351328	53	+	636262	AGATCTGTGTGAGCCTCTGCGTTAATGTTTGAGGGGGATGCTTAGAGGGTTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	342672	47	+	647215	AGATCTGTGTGAGCCCCTGGGTTAGTGTCTCAGGGGGATGCTCAGAG------

a
s	mr.mrrefChr5	198536	32	+	294542	TGCTTAGAGGGTTGGGGGTGTTGTATGTGACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351384	32	+	636262	TGCTTAGAGGGTTGGGGGTGTTGTATGTGACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	342719	23	+	647215	---------GGATGGGGGTCTTGTATGTGACA

a
s	mr.mrrefChr5	198568	3	+	294542	TAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351416	3	+	636262	TAT
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a
s	mr.mrrefChr5	198571	222	+	294542	CACCTAACTCAATTGCTACAAGAGGATAGAATGCTTAAGTGACCCTATTATGAATAGCTATGGCAACTGTATCTTACTCACATGAGCTCAAATTCCCATTCTCAATTTTATGCCTAACCAACAATGGGTATACTGCAGAATACCATGGAATTTCAGATTGTTGCCCTAAAGGTTGCTTGCAAGGCTAGTCAATCAGATTCAAAGTATAAGAACATACAGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351419	219	+	636262	CACCTAACTCAGTTGCTACAAGAGGATAGAATGCTCAA-TGACCCTATTATGACTAGCTATGGAAACTGTATCTTGCTCACATGTGCTCAAACTCCCATTCTCACTTTTATGCGTAACCAACAATGGGTATAGTGCAGAATACCATGGAATTTCAGAATGTTACCCTAAAACTTG--TGCATGGCTAGTCAATCAGATTCAAAGTATAATAACATACAGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	342753	222	+	647215	CACTTAACTCAATCGCTACAAGAGAATAGAATGCTTAAGTGACCCTACTATGGATAGCTATGGCAACTGTATCTTACTCACATGAGCTCAAATTCCCATTGTCAATTTTATGCCTAACCAAAGATGGGTATACTGCGGAATACCATAGAAGCTCAGATTGTTGTCCCAAAGGTTGCTTGGAAAACTAGTCAATCAGAGTCAATGTATAAGAACATACAGTGT

a
s	mr.mrrefChr5	198793	56	+	294542	AATGTTGCAGATGGTCCCTTTAGAGTCATCCAGGGTAACTTGAGTCAGCGTTGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351639	56	+	636262	CATGTTGCAGATGGTCCCTTTAGACTCATCCAGGGTAACTTGAGTCAGCGTTGTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	342975	33	+	647215	AATGTTGTAGATGGTCCCTTGAGAGTCATCCAA-----------------------

a
s	mr.mrrefChr5	198849	14	+	294542	ATCTCAAACCTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351696	14	+	636262	ATCTCAAACCTTGA

a
s	mr.mrrefChr5	198863	408	+	294542	CAAGTGCTCTTTCACAGGTATCAGGTATAGGTGGGATTCAACACCCCAAAGTTATAAACAAAAAAGTTACATTTTACAAAGGTGTGTGCTACAACCATAATTGAGCTTATAGTAAGCCAAGCTTCTCAAAGGTTAACTCATTTGGGAATACAACCCTTATATATCCATGGGGATGACAGAACAGTCCTAAATGTGGACACTCCTAACTAGCCCATTCCTAGTTATTGAGGCCACACTTGTGCTTGTCTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGACTATGAGTGGGGTGCGGCCATTGGCAAGGTTCTGTAGGAGTTGCTGTGAGGTTTGAATGGCCACCCTATTTTATGAAGCTTGAAACTAAGGGGTCAATGTTTTTTTCTGTGTTGATGCTATCCAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	351713	407	+	636262	CAAGTGCTCTTTCACAGGTATCAGGTATAGGTGGGATTCAAAACCCCAAAGTTATAAACAAACAAATTACATTTTGCAAGGCTGTGTGCTACAACCATAATTGCACTTATAGAGAGCCAAGCTTCTCAAAGATTAACTCATATGGGAATACAACCCTTATATATCTATGGAGCTGACAGAATGGTCCTAAATGTGGACACT-CTAACTAGCTCATTCCTAGTTATTGGGGCCACACTTGTGCTTGCGTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGAGTATGAGTGGGGTGCGGCCACTGGCAGTGTTCTGTAGGAGTTGCTGTGGGGTTTGAATGGCCACCCTATTCTATGAAGCTTGAAACTATGGGGTCAATGTTTTTTTCTGTGTTGATGCTATCCAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	343008	389	+	647215	-------------ACAGGTATCA-GTATAGCTGGGATTCAACACCCAAAAGTTATAAGCAAAAAAGTTCCATTTTACAAAGGTGTGGGCTACAGCCATAATTGAGCTTATGGTATG-CAAGGTTCTCAAAGGTAAACTCATTTGGGAATACAACCTTTCAATGCCCATGGGGATGACAGAACAGTCCTGAATGTGGACACTCCTAGCTACCCCATTCCTAGTTATTAAGGCCACATTTGCGCTTGTCTCCTTGAAAACCTCTAACAGAGCACCACACTGTGACTATGAGTGGGGTGAGGGCATTGGCAAGGTTCTATAGGAGTTGCTGTGAG----GAATGGACACCCAATTTTATGAAACTTGAAACTAAGGGGCCAATGTTTTTTTCCTTCTTGATGCTATCCAAG

a
s	mr.mrrefChr5	199271	46	+	294542	CCTATAGACAGAGAACCAAATGAATTGTGCTACAGTGGCTGGTGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	352120	46	+	636262	CCTATAGACAGAGAACCAAATGAATAGTGCTACAGTGCCTGGTGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	343429	46	+	647215	CCTATAGACAGATAACCAAATGAATTGTGCTACAGTGGCGGGTGAA

a
s	mr.mrrefChr5	199317	83	+	294542	GAAGCTTCTTGTTGCATATTTCTGGCACTCATTATAAAGTGGTCAGTGTCTCCAGCCAACCATGCTCAACAGGCTTTAATGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	352167	83	+	636262	GAAGCTTCTTGTTGCATATTTCTGGCACTCATTACAAAGTGGTTAGTGTCTCCAGCCAACCATGCTCAACGGGCTTTAATATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	343475	76	+	647215	GAAGGTTCTTGTTGCATAATTCTGGCACTCATTATAAAGCGGCCAGTGTC-------AACCATTCTCAACAGGCTTTAATGTT

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	352251	342	+	636262	CAGGACCCAGATCTAACACAT-ATGAACCCAATTTTTTGTAGGTAGG----TTCAGGAACAACAAGTTACTGTGTATAAACTTTTTTTACCAGTAGTCATGCCTTAGGTCCCCGCCAAACAAGCTACTGTTCTATCCGTATTATGTTAGTAGCAGAGAGCATAATAATTCAGTGGGCAACATTTGGCTGATCTATCTTTTATTGCTATCTGATTATCTGAAGGGTACCTAGAAGTTCTTTGTGGTATTACCATTAATCTAAGTGCACTCCCTGGCTTTCACGGCCCTGTACTGGCATCCAAATATTGAACAAGGCCTGCTGGACACTCTGTAAATAGGGGCTAACCT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	347061	235	+	647215	TCTTGGACCGTAATGAAAAGGAAATACATCCTCAGTCCTGGGAATAATTACTCAAATGTTGTTATGTTGCTTATATATAACTATCCAATGACAGATTCATATTACTACTCGTATATTATAGATACCGTAAGCATAAAGGCAGTGTGTGCTTGCAGTTCCCCTGAATTAGTAATCGAATTGTAACAACCTGCAGCTGGTCTAATCCACATTGTGAGGACATGAGT--AGTCCAGTATG

a
s	mr.mrrefChr5	202930	120	+	294542	AGTAGAGATGGAGTACACTGGATAAGAGTACTAGTCCACGCTAAGCAACAACACCTGTCTTGAGACTCAAATATTAGCAGAGTCAAGGATGGTGTTACAGTGTATGATAGTCCATCATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	355474	119	+	636262	AGTAGAGATGGAGTACACTGGATGAGAGTACTGGACCACGCTAGGCAACAACGACTGTCTTGAGACTCAAATATGAGCAGAGTCAAGGATAGTGCTAC-GTATATGATAGTCCATCATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	347296	120	+	647215	AGTAGAGATAGAGCACACTGGATAAGAGTGCTAGTCCACGCTTAGCAACATCACCTGTCTTGAGACTGAAATATTAGCAGAGTCAAGGATGGTGTTACAGAGTATGATAGTCCATCATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	347416	97	+	647215	CAT----------------------GTGTACTAGTCCACGCTAAGCAACAACACCTGTCTTG-GACTCAAATATTAGCAGAGTCAAAGATGGTGTCACAGGGTATGATAGTCCATCATGG

a
s	mr.mrrefChr5	203050	554	+	294542	CATGTCATCTTGACCACAATTTGACCAATGCAGATAACACGATTGTAATGTTGGGTCCCTGTTGCAAGCAGCTCAAGGTTAGGATGATGTTTATATCTGATCACAGTGCAAAGTTGTGCAAATTCTGTGGCCTTTAACTTTTACATGAGTGCTGGTAGTGTATCAAGACACCGGAATTTCTAAAGTGCAGGGAACTCAGTATTGTGGAACATGGGAGTTATGCATGGTGACTTTTGAATAGGATATTAAAAGTTGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAATAATTTCAGATCCTCCTATAAGTTCCTGTGAGGCTGCTTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGACACTCCTTGTTGATCATTTTACTGTCTAGTTCCTATGTATTATTATGCCTTCTGTGAGTTTCCCTTCTGCTCCACTATAACAGTTTGGATGCTGCAGAGGGACTGGATAAACATGAATGAACGTGAATTCTATTATTGCATCAAATCACTGGATAAACACATCATTAGACCCTCTAATGATTATCACACTGTTTATAGCTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	355593	544	+	636262	CATGTCATCTTGACCACAATTCGACCAATGCAGATAATAGGATTGTAATGTTGGGTCCATGTTGCAAGCAGCTCAAGGTTAGGATGATGTTTATATCTGATCACAGTGCAAAGTTGTGCAA----TGTGGCCTTTAACTTCTACATGAGTGCTGGTAGTGTACCAAAACACCGGAGTTTCTAAAGTGTAGGGAACTCAGTATTGTGGAAGATAGAAGTTATGCATGGTGACTTTTGAATATAATATTAAAAGTGGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAATAATTTCAGATCCTCTTAT-CGTCCCTCTGAGGCTGCTTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGATGCTCCTAGTTGATCATTTTACTGTCTAGTTCCTATGTATTACCATGCCTTCTGTGAGTTTCCCC-----TCCACTATAACAGTTTGGATGCTGCAGAGGGACTGGACAAACATGAATGAACGTGAATTCTATTATTGCATCAGATCACTGGATAAACACATCATTAGAGCCTCTAATGATTACCACACTGTTTATAGCTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	347513	536	+	647215	CATGTCATCTTGACCATAATTTGACCAATCCAGATAACACCAGCAT-ATGTTGGGTGTCGGTTGCAACCAGTTTAATGCTAGGATGGTGTTTATATCTGATGACGATGCAAAGTTGTGCAAATTCTGTGGCCTTTTACTTTTACATGATTGCTGGTAGTGTATCAAGACACGTGAATTTCTAAAGTGCAGGGAACTCAGCATTGTGGAACATGGGAGTGATCTGTGGTGAGTCTTGAATAGGATATTAAAAGTTGGTAAGGTTGATTACATATAGTCAAGTAATTTCAAATCCTCCTAGAAGTTCCTGTGAGGCTGCCTTGGAATCCATGTGACACATACCAACCAAGTGGACACTTGTTGATGATCATTTTAC----------------ATTATTATGCCTTCTGTGAGTTTCCCTTCTGCTCCACTATAACAGTTTGGATGTTGCAGAGGGACTGGATAGACATGAATGAACATGAATTCTATTATTGCATCAAATCATTTGATAAACAC-TCATTGGACCCTCTAATGATTATCTCACTGTTTCTAGCTCA

a
s	mr.mrrefChr5	203604	27	+	294542	AGTCATTATGAAAAAATCTAGGATGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	356137	27	+	636262	AGTCATTATGATAAAATCTAGGATGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	348052	22	+	647215	AGTCATTATGAAAAAATCTATG-----

a
s	mr.mrrefChr5	203631	389	+	294542	AAGGGCAGACTAAGGTGAGTCTTGCCATTGGGTGGTTCCCACTAAGTACTGATTGCAAGGCATCCTCAGAGCTGGTCAAACACACATACTTGCCGCACAGATTGTAGTGACATATTACTAACTTGATTCACTCAGTTGTACAATTGTTAAATTCTACAAAGGAGGTGAATAAAGTCTGTTGTGCCAGATTTACTGGTCATGACGCATACTGAATGAGAATCATGATTCAATTGTGTTAATAAGGTCATGCCCTGTGCTTTTGGGTAAGAAGACAGTAGCAAGCTAAGTTGCTGTACCACCAGATGTGGCAGTCAATTTTTGTCCTCACCATAGGGGATCTTGTGTGATACATAGCACATATAAATTCACAGCTGCACTTTATTTACAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	356170	372	+	636262	AAGGACAGACT--GGTAAGTCTTGCCATTG------TCCCACTAAATACTGATTGCAAGGCATCCTCAGAGCTGGTCAAACATACAT--------CACAGACTGTAGCGACATATTATTAACTTGATTCATTCAGTTGTACAATTGTTAAATTCTACAAAGGAGGTGAATAAAGTTTGTTGTGCCAGATTTACTGGTCATGATGCATACTGAACAAGAATCATGATTCAATTATGTTAATAAGGTCATGCCCTGTGCTTTTGG-TAGGAAGACAGTAGCAAGCTAAGTTGCTGTACCACCAGATGCGGCAGTCAATTTTTGTCCTCACCACAGGGGATCCTGTGTGATACACAGCACATATAAATTCACAGCTGCACTCTATTTACAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	348074	381	+	647215	-AGGGCAGACTAAGGTGTGTCTTGCCACTGGGTGGTTCACAGTAAGTACTAGTTGTAAGGCATCCACAGAGCTGGTCAAACCCACATACTTGCCGTACAGATTGAAGTGACATATTACTAACTTGATTCACTCAGTTGTACAATTGTTACATTCTACAAA--AGGTGAATAAAGTCCGTTGTCCCACATCCACTGATCACGACGCATACTGAATGAGAATGACGATTCAATTGTGTTAATAAGGTCGTGACCTGCGCTTTTGGGCCAGAAGACTATAGCAAGTTATGTTACTGTACCGCCAGATGTGGCAGTCAATTCTTGTCCTCCCCATAGGGGATCTTGTTTGATGCTTAGCACATATACATTCA-----GCATTTTATTTTAAAT

a
s	mr.mrrefChr5	204020	341	+	294542	ATACGGTTCCCCAAGGCAGCCTATATCAAACTACAGAAAGTATGTCAGCTTAGACTGGTTAATTGAAACTAAACCAACATATTAAGTCGATCTGGCAGCCCTTCGAAAGGAATCCCTTAGCACGGACTTCAGTCCACCAGCGCTTTTATGGCCCGCTGGTCCGCGACAATAACGGAGATGAAGGTGAAAAAAAAGACGTACGAAGTTCGTGGTTGGATCATGTCCGACCTTGCCCGAAGAACCTAACTGGCCTACTGCACTCATCAATCACAGAACTTTCTTTCAGTATCATGCTGGTCTATCCATAGATATGCCACATCATAGAGACCCTATGGTTATCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	356543	337	+	636262	ATACGGTTCCCCAAGGCAGCCTATATCAAACTACAGAAAGTATGTCAGCTTAGATTGGTTAATTGAAACTAAACCAACATATTAAGTCGATCTGGCAGCCCATCAGAAAGAATTCCCTAGCACGGACTGCAGTCCACCAGCGGTTTCATGGCCCGCTGGTCCGCGATAATAACGGAGATCAAGGTGAAAAAAAAGACGTACGAAGTTCATTGTTGGATCATGTCCGAC----CCTGAAGAACCTAACTGGCCTACTGCACTCATCAATCACAGAACTTTCTTTCAGTATCATGCTGGTCTATCCATAGATATGCCACATCATAGAGACCCTATGGTTATCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	348455	328	+	647215	ATACAGTTCCCCAAAGCTGCCTATATCTAACTACAGAAAGAATGCCAACTTAGACTGGTTAATTGAGACTAAGCCAACATACTAAGACGATCTGGCAGCCCTTCGAAAGAAATCTCTTAGCACGGACTTCAGTCTACCAGCGCTATTATGGCCTCCAGGTCCGCGACAATAACGGAAATGAAGGTG-------------ACGGAGTTCGTGGTTGGATCATGTTCGACCTTGCCCGAAGAACCTAACTGGCATATTGCACTCATCAACCACAGAACTTTCTTTCAATATCATGCTGGTCTATCCATAGATGTGCCACATCATAGAGAGCCTATGATTATCC

a
s	mr.mrrefChr5	204361	254	+	294542	CCACCATTTATTGCTGAGACAAGATTTAGCTATCTTAATATATGGCTCTATTTAGACATACCTATGTCCTACCATATTGCCCGTTTACTGGCACTTAAAGGTGTACTGTCCTTGACCTCAGAGAACTCCTGGATAAAGTATCAACACTAAAGAGTGAACTGTCATTGCCTATGAGCATGTGCCCTTTTCATTGATCCAGCCCTTTGGCTGCTCTTTACAAGCTAGGTTAGTTGCAATGTGTTGGATCAAATATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	356881	252	+	636262	CCACCATTTATTGCTAAGACAAGATTTAGCTATCTTAATATATGGCTCTATTTAGACATACCTGTGTCCTACCATATTGCCCGTTTACTGGCACTTAAAGGTGTACTGTCCTTGACCTCAGAGAACTCCTGGATAAAGTATCAACACTAAAGAGTGAACTGTCATTGCCTAT--GCATGTGACCTTTTCATTGATCCAGCCCTTAGGCTGCTCTTTGCAAGCTAAGTTAGTTGCAATGTGTTGAATCAAATACG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	348783	228	+	647215	CCACCATATATTGCTGAGACAA-------------------------CCCTTTAGACATACCTA-GTGCTACCATATTGCCCATTTACTGGCACTTAAAGGTGTACTATTGTTGACCTCAGAGAACACCTGGGTAAAGTATCAACTCAAAAGAGTGAACTGTCATCGCCTATGAGTGTGTGCGCATTTCATTGATCCAGCCCATTGGCTGCTCTTCACGAGCTAGGTTATTTGTAATGTGTTAGATTGAATATT

a
s	mr.mrrefChr5	204615	15	+	294542	CGTCAATTGGTAGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	357133	15	+	636262	CGTCAATTGGTAGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	349096	15	+	647215	CATCAATTGGTAGTG

a
s	mr.mrrefChr5	204630	54	+	294542	CTGAGGCATCTACAGCTAGGTTACTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	357148	54	+	636262	CAGAGGCATCTACAGCTAGGTTACTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCATCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	349117	54	+	647215	CTGATACATCTGCAGCTAGGTCATTTGCAATGTGTTGGATCAAATATGCGTCAA

a
s	mr.mrrefChr5	204684	180	+	294542	TTGGTAGTACAGAGCCCGAGGCATCTACAGCCCTATCTTGCCCCAGCTAGTACTTGATCAGCAGAGGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTATATTTCCTCTATTGGACACTAGTGAATTGTGCACTCAAATTCAATATGACCAAACGTACAAGAGGTACATTCTACGCCTCCTCTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	357206	180	+	636262	TTGGTAGTACAGAGCCCGAGGCATCTACAGCCCTATCTTGCCCCAGCTAGTACTTGGTCAGCAGACGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTAGATTTCCTCTATTGGACACTAGTGAATTGTGCACTCAAATTCAATATGACCAAACGTACAAGATGTCCATTCTATGCCTCCTCTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	349171	169	+	647215	TTGGTAGTGTAGAGTCAGAGACATCTACAGCCTTATCTGG-CCCAGCTAGTACTCAATCAGCAGAGGGAGTCCCTGTACAAAGTCCCTTTACTATATTTCCTCTTTTGGACACTAGTGGATTGTGCACTGAAATTCAATATGACCAAACGGACAAGAGGTACATTCTACG----------

a
s	mr.mrrefChr5	204864	222	+	294542	GAGTCTAGACTTGACATGGTTTAATAAAATTATACAGGAAAAGATGAAGTGATGTGACTGAGCCAATTGATAAATCAGTTTCCCTAACTATATGTCTAGCATTTGGTGCTACAAAAGGGTACCGGCCCTCTACAATCCACTTTCAAAAGATTGCATCTCCTGTATGTTATTTACAAAGCTATGTGCAGTGGTAAGTCTGCACAGCTTTATAGGCATGCAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	357392	209	+	636262	GAGTCTAGACTTGACATGGTTTAATAAAATTATACAGGAAAAGATGAAGTGATGTGACTGAGCCAATTGATAAAGCAGTTTCCCTAACTACATGTCTAGCATTTGGTGCTACAAAAGGGTACCGGC-------------CTTTCAAAAAACTGCATCTCCTGTATGATATTTACAAAGCTATGTGCAGTGGTAAGTCTGCACAGCTTTATAGACATGTGGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	349340	199	+	647215	-----------TGACATGGTCTAATAAGATTATACAGG-AAAGATGAAGTGATGTGACT-----------TAAATCAGTTTCCATAACTATATGTCTAGCACTTGGTGCTACAAAATGGTACTGGCCCTCTACAATCCACTTTCAAATGATTGCATCTCCTATATGTTATTTACAAAGCTATGTGCAGTGGTCAGTCTGCACAGCTTTATAGGCATGCAGTT

a
s	mr.mrrefChr5	205086	254	+	294542	TATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTACAGCTAGTTAACCTTGTTTTGATACTCTTGTCTAGAGTTATTGTTTGATACCTAGTTAAACAAAAAACGGAGTAATGTATATACTCTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGTGGAACAGTTCTCATAGACAAAAATTGTCATTTATTGTTGAAGATAGTAGTACAAGAATCCATTCTCAATTTATCCCCTATGCATCATTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	357611	251	+	636262	TATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTACAGCTAGTTAAGCTTGTTTTGATACTCTTGTCTAGAGTTAGTCTTTGATACCTAGTTAAACAAAAAACGGAGTAGTGTAT-TACTCTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGTGGAGCAGATCTCATAGACAGAA--TGTCATTTCTTGTTGAAGATAGTAGTACAAGAATCCATTCTCAATTTATCCCCTATGCATCATTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	349539	253	+	647215	GATAGAGGAAACCTATGATATAACCTGCAAAGCTTCATTGTAAAGCTCCAGCTAGTTAGCCTTGTATTGATACTCTTGTCTAGAGTTATTGTTTCATACCTAATTAAATGAAAAACAGAGTCATGTATATACTTTGCAGATGTTTACTTGAGGTCTTTGTTTGCAGAACAGTTCTCATAGACAAAAATGGTCACTTATTA-TGAAAATAGTAATACAAGAATTCATTCTCCATCTATCCCCTATGCATTATTTA

a
s	mr.mrrefChr5	205340	55	+	294542	TCTTTCTTTGTTCTCATGCCAAAGTGCCCTGGGTGTGGTCCGTTTATAGTTTAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	357862	55	+	636262	TCTTTCTTTGTTCTCATGCCAAAGTGCCCTGGGTGTGGTCCGTTTATAGTTTAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	349815	55	+	647215	TCTTCCTCCGTTCTCGTGCCAAAGTGCCCTGGGCTTGGACCATCTATAATCTAAC

a
s	mr.mrrefChr5	205395	28	+	294542	TTCACAATTCCAACCAATGAGTACCACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	357917	28	+	636262	TTCACAATTCCAACCAATGAGTACCACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	349880	28	+	647215	TTCACAATTCTTACCAATCAGTACCACA

a
s	mr.mrrefChr5	205423	147	+	294542	ACATGAAACTCTCTAATCTTTAAAGGCTAACATTCTATTGCAACCTAGTACGGCTCCAACAGGATTATTTCCATTATTGTAACAGTCCAAGGAAAGGATGGTGAGAAGAATAAGATGACCAGGGGGTCACGGGCTCTGTTTCAAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	357948	147	+	636262	ACATGAAACTCTCTAATCTTTAAAGGCTAACATTCTATTGCAACCTAGTACGGCTCCAACAGGATTATTTCCATTATTGTAACAGTCCAAGGAAAGGATGGTGAGAAGAATAAGATGACCAGGGGGTCACGGGCTCTGTTTCAAAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	349908	147	+	647215	GCATGAAACCCTTTAGTCTTTAAAGGCCAACATTATATTGAAACTTATTAAGGCTCGAAAAGGATTCTTTCCATCATTGTTACATTCCAAGGAGAGAGAGATGAGAAGGTTAAGGTGACCAGCGGGTCACAGGCTCAGTTTCAAAGT

a
s	mr.mrrefChr5	205570	162	+	294542	TAGCCCTCCTAGCAGACTGGTTTATCTCTGAACTCAATGCATCCCAGTGGAGTCCTAGTTGGTAGTGACAGGATTTGCAGAGAGAGTCAGAGGCATCAGTAGGGAATTTTTATTGAAATAGGCAATGTCTTGTTTTATGCACTGATGTAATTATTTAGATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358095	161	+	636262	TAGCCCTCCTAGCAGACTGGTTTATCTCTGAACTCAATGCATCCCAGTGGAGTCCTAGTTGGTAGCGACAAGATTTGCAGAGAGGGTCAGAGGAATCAGTAGGGAATCTTTATTGAAATAGGC-ACGTCTTGTTTTATGCACTGATGTAATTATTTAGATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350072	162	+	647215	TAGCCCCCTTGGCAGGCTGGTAGATCTCTGAGCTCAATGCATCCCAGTGGAGTCCTAGTTGGTAGTAACAGGATTTGCAGAGAGAGTCAGAGGCATCAGTAGGGAATTTTTATTGAAATAGGCAATGTCTTGTTTTATGCCCTGGTGTATTCATTTAGATCA

a
s	mr.mrrefChr5	205732	73	+	294542	AATTTGAGCTTAAGATCAGAACAGGGTGACCGTATGATGGTGCTTCATGACAACTATCTCTTTATTATCATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358274	73	+	636262	AATTTGAGCTTAAGATCAGAACAGGGTGACCGTATGATGGTGCTTCATGACAACTATCTCTTTATTATCATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350234	73	+	647215	AATTTGAGATTAAGATCAGAACAGAGTGACTATATGGTAATGCATCATGACAACTATCTCTTTATTATCACTG

a
s	mr.mrrefChr5	205805	9	+	294542	gcagctcTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358347	9	+	636262	GCAGCTCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350497	9	+	647215	gcagcccTT

a
s	mr.mrrefChr5	205814	11	+	294542	GAGTGACTTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358357	11	+	636262	GAGTGACTTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350506	11	+	647215	GAGTGGCTTCA

a
s	mr.mrrefChr5	205825	108	+	294542	TTTGGCTCCTGAGGGGATGAGCATGCAATCAGGgatcacttctttgtttcaccattaattccctttcatttcttggattgcaattagttaatgccattttttcacctc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358369	108	+	636262	TTTGGCTCCTGAGGGGATGAGCATGCAATCAGGGATCACTTCTTTGTTTCACCATTAATTCCCTTTCATTTCTTGGATTGCAATTAGTTAATGCCATTTTTTCACCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350517	108	+	647215	TTTGGCTCCTGGGGGGATAAGTATGCAATCAGGgcttccatctttgtttcactgttaattccctttcatttcttggattgcaattagttaatgacctcatctcacctc

a
s	mr.mrrefChr5	205933	57	+	294542	ctccttgtgacacaagtctcactatacagacccctaacttcagttcaatctcaagtg
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358477	57	+	636262	CTCCTTGTGACACAAGTCTCACTATACAGACCCCTAACTTCAGTTCAATCTCAAGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350626	57	+	647215	ctccttgtaacactatactcactacatagacccctgacttcatatcaatctcaagtt

a
s	mr.mrrefChr5	205990	8	+	294542	cttcagtc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358545	8	+	636262	CTTCAGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350683	8	+	647215	ctttggtc

a
s	mr.mrrefChr5	205998	95	+	294542	cattcttcaaggcacttatgttcttaacttcttctgtgcttgtgccttatctgcctgtcagtttagtttcatgtgatggaggaacaagttccggt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358553	95	+	636262	CATTCTTCAAGGCACTTATGTTCTTAACTTCTTCTGTGCTTGTGCCTTATCTGCCTGTCAGTTTAGTTTCATGTGATGGAGGAACAAGTTCCGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350693	95	+	647215	caatcttcaaggcacttatgtatttaactacttctgtccttgtgcgttatctgactgttagcttagttccaggtgatgggggaaaaaattacagt

a
s	mr.mrrefChr5	206093	14	+	294542	ccttgtcactaggt
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358663	14	+	636262	CCTTGTCACTAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350788	14	+	647215	tctggtcaatcagc

a
s	mr.mrrefChr5	206107	67	+	294542	gaggcaggatcctagctacacgtgaaccccaagggtgcatgtttaattggtaccccattgactcaac
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358682	67	+	636262	GAGGCAGGATCCTAGCTACACGTGAACCCCAAGGGTGCATGTTTAATTGGTACCCCATTGACTCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350802	67	+	647215	aaggtagcatcctacccacacgtgaaccccatgggtgtgtttttaattggcatcccactgttacaac

a
s	mr.mrrefChr5	206174	6	+	294542	ctgtta
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358749	6	+	636262	CTGTTA
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a
s	mr.mrrefChr5	206180	49	+	294542	ttggtaccatgtcaaggccagcctaccacacacatatttcgttgtctct
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358755	49	+	636262	TTGGTACCATGTCAAGGCCAGCCTACCACACACATATTTCGTTGTCTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350877	49	+	647215	ccagtactatgttaaggtcagcctaccacccacatatttcgttgtctct

a
s	mr.mrrefChr5	206229	11	+	294542	ccagctgcctg
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358805	11	+	636262	CCAGCTGCCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350926	11	+	647215	ccagctgtctg

a
s	mr.mrrefChr5	206240	51	+	294542	cactctatgagaaggcccttaaagctcatgtattcgTTTAGATACATGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358816	51	+	636262	CACTCTATGAGAAGGCCCTTAAAGCTCATGTATTCGTTTAGATACATGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350939	51	+	647215	ccctctgtataaaggcccttaaagcccatgtattcaTTTAGATATGTACAT

a
s	mr.mrrefChr5	206291	130	+	294542	CTGCTCATTCAGCCTGAATCCTCATTCTAGTGCCGTTGTCACCATTACTACCGATGTATAtattgtggtcccttgtagtggcttgataacctttatgatgggaggtgctgtgaagtgtgcatgtacagca
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358868	130	+	636262	CTGCTCATTCAGCCTGAATCCTCATTCTAGTGCCGTTGTCACCATTACTACCGATGTATATATTGTGGTcccttgtagtggcttgataacctttatgatgggaggtgctgtgaagtgtgcatgtacagca
s	simRat_chr6.simRat.chr6	350990	130	+	647215	CTGCTGATTCTGCTTGAATCCTCATCCTAGCTCCATTGTCACCATTGCTACTGCTGTATAcattgtaagcccttgcaatgccttgataacctttatagtaggaggtgctgtggagtgtgcatgtatagca

a
s	mr.mrrefChr5	206421	36	+	294542	aaccatctgtacctcgcactgtctatctcatgtgag
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	358998	36	+	636262	aaccatctgtacctcgcactgtctatctcatgtgag
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a
s	mr.mrrefChr5	206457	99	+	294542	cctactgttacattgcaggagcagtgatgccacactcacactgtgtaacttgtgattatcaaattctttccattcccattaattcattatgactatagc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	359052	99	+	636262	cctactgttacattgcaggagcagtgatgccacactcacactgtgtaacttgtgattatcaaattctttccattcccattaattcattatgactatagc
s	simRat_chr6.simRat.chr6	351157	99	+	647215	cctattgttacattgcaggcagagtgatgccatactcacactgtatgacttgtgattatcaaattcgttccatttgcattaattcatcatgaatatagc

a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	208295	118	+	294542	ttcagAGCATGATGTGGTAGTTGGTAGAAACTTACTCATAGAGTGACTCAGTTCAAAAGTCACTCAGTTTAAACAACGATGGGTTGGTTTTAAGCACAACAGGCCCCATCATACTTCT
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a
s	mr.mrrefChr5	208413	119	+	294542	AGAAGCCGTCATTTCCAGCAAGACAGCAATGGGGTAAAACTTGAGGACCACCCCCTATTGTTCTTATAGTTTGGTCACAAGAATACAGCTTGAGGGGGGCCCGAGATTTAAGATCATGG
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a
s	mr.mrrefChr5	208532	50	+	294542	CCATGATTCTAATGCATGTCAACACTAGCCCCTTGGCACTTAATTCAATG
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a
s	mr.mrrefChr5	208582	116	+	294542	ATACCTAATCTAAGGGTTCATGATGACTCAAGACAGGTTCTAATCATGAGAGTTGATTGGACCCATGCTAAGCCCATATAGCAGCTCTTAATAATAGCCACAATGGAAATGGAATG
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a
s	mr.mrrefChr5	208698	49	+	294542	ATCCTGGGAATTAGTGAAAAGCattgatcttctaacccggtggttaaaa
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a
s	mr.mrrefChr5	208747	18	+	294542	CTTGTGAGAGACCCACTA
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a
s	mr.mrrefChr5	208765	72	+	294542	GGAATCCTTGCAGCTCCTTGTTTAGAGGCTCCATGGGAAGCTGTGGCAAGCAATCCCAAGTGACTCCCTGTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	354068	72	+	647215	GAGATCCTCACAGCTACTTGTTTAGGGGTTCCACGGGAAGCTGGATCCAGGAATGCCAAGTGACTCCCTGTT

a
s	mr.mrrefChr5	208837	193	+	294542	TGGTAGATTCAATCCTACTCCACTAGTTCCCCCACAAGTTCTACTAACGATGCCCATATGCCCCCCAGAGTGGTAACCAACCCAAAAGCCAGCTGTATGACTCTATGTGTGCCATATAGATTGAAGGGCCGCAGCTTCCAGATGGTATGCCGACAATCTCCAGAGGTGTTAAAACTTTCTGGATGTGAGGGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	361821	193	+	636262	TGGTAGATTCAATCCTACTCCACTAGTTCCCCCACAAGTTCTACTAACGATGCCCATATGCCCCCCAGAGTGGTAACCAACCCAAAAGCCAGCTGTATGACTCTATGTGTGCCATATAGATTGAAGGGCCGCAGCTTCCAGATGGTATGCCGACAATCTCCAGAGGTGTTAAAACTTTCTGGATGTGAGGGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	354140	193	+	647215	TGGTAGATTCGGTCCTACTCCACTAGCTCCTCCACTAGTTCAATTAATAATGCCACTATGCCCCCCAGAGTGGTAGCCAACTCAAAAGCCAGCTGCGTCACCTTATGTATGCAATATAGGTTGAAGGGCTGCAGCTTCTAGATGGTATGCCAACAGTCTGCAGGGGTGTTATAACTTTCTGGTTGTGTGGGAT

a
s	mr.mrrefChr5	209030	10	+	294542	AATAATCATG
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	362025	398	+	636262	CAGAATTTGCACACCAACCAGGTACTCAAATAGGATTTGCCCATTGACTAAGTGCTATCAGGCCAGTATGGTTAACATTATAATATTTGAGCCAATGGTGATCACTCTGTTTCTAATTATAAATGCACCAGGTAACCCAGATTACTCGCTTTCTTCTTAGTACATTCCTTGGGGTTTCCTTTTAGAAGGCAACTGTTCATGCAGCACCTGACAGGTAGAGGCATTCTCAATTCACCCCTGTGTACCTCTTATGTGACCGGGAATTCAACATGCAAGCTATACAAATAATTTGACCAGAGGAACACTAGTTCATTACACTAGGTTGATTGCTTGTTCAGTATCTTCATTTTCCCAGCGTGGCTCTCCAGGCTCCAGCAGGTACGTATAACAAAGGCCTG
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	209445	42	+	294542	GAGCGAAGCCCTCACCACTTGGAGGAACTCCTGTGCCCATAC
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a
s	mr.mrrefChr5	209487	283	+	294542	CAGTATTATAACTTCCTAACTATGGTAGTGTATAGTAGTGATTTCTAGCCCTATTAGCATGTGACAGACTGTCCTTATCCTCTAGCCTCTGTTATCCATGTCACAGGCCTGTGGGTCTGTACCAAAACTAGTAACAAGTGTGGAACTCTGTTCCTATATTGTTTGTACTGAAGTCTGTCTGATTGTTGCTTCAACTGGAAGTCATCATCAGCAACCTACTGCTTTATCACCTGCGTCACTTTTTAGAGGTCTTAACCTATTAACTTGACACAATCTGGAGATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	362471	283	+	636262	CAGTATTATAACCTCCTAACTATGGTAGTGTATGGTAGCGATTTCTTGCCCTATTAGCGTGTGACAGACTGTCCTTATCCTCTAGCCTCTGGTACCCATATCACAGGCCTGTGGGTCTGTACCAAAACTAGTAACAAGTGTGGAACTCTGTTCCTATATTGTTTGTACTGAAGTCTGTCTGATTGTTGCTTCAACTGGAAGTCATCATCAGCAACCTACTGCTTTATCACCTGCGTGACTTTTTAGAGGTCTTAACCTATTAACTTGACACAATCTGGAGATC
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a
s	mr.mrrefChr5	209770	83	+	294542	AACCTATCCATCAGGAGGCCATGGGTTGGGGATGGCCCTGTTATACAACTTGTAATCACTTGCATCAATGACCTACTGAATGG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	355089	83	+	647215	AACCTATCCATCAGGAGGTCATGCGTTGGGGACAGCCCCATTACACAACTTGTAACCACTTGCATCAATGACCTACTGAATGG

a
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a
s	mr.mrrefChr5	209864	11	+	294542	TTGATGAAAAC
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a
s	mr.mrrefChr5	209875	112	+	294542	TAGTCAGTCTTATAATCGCATGTGTCAGAGAATGCAGCAGTACCTCTCATATCCTGGACAACCTCTCTAAAACATGAGGTATCACTACCATTTAAAGTTGAATTACATGGAT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	210513	88	+	294542	CTATGGTCAATTCTTTGAGAGGTGGTGGGGAACAATGTCATTGTCAGCATCTGTCAGATCCAGGTTGGAGAGCTGATTCACAATGAGA
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	363550	213	+	636262	GCTCAACGGCTGCCTGGTTGATTGATACATAAATTAGAATCCGCGTGGGCATGATTTCTGGGTGACACCAGGACACAGCCAAAACTGATTGAGAGGTGCTACAATCTTTGAATTATACATGTAGAATCAGATTCTGGTTGATTCTAGAGATAGACTCTATGTTTGGCACCCCGTTGAGACAGAGTAAGTACTGGGTCATCCTACTGTTCTGGG
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a
s	mr.mrrefChr5	210814	123	+	294542	ATGCCCCTGTACCCTAGGATATATTCTCTCTGCCCATGGTAAAGTGTTGAAACAGTTTCCCGTACAGAGTAGTACACTGTAACTAAGATCACTTACATTTCACCTAAGTAGGTACTCGTATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	363763	123	+	636262	ATGCCCCTGTACACTAGGATACATTCTCTCTGCCCTTGGTAAAGTGTTGAAGCAGTTTTCCGTACAGAGTAATACACTGTAACCAAGATCACCTACGTTTCACCTAAGTAGGTACTCGTAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	356187	123	+	647215	ATGCCCCTGTACCCTAAAATATATCCTGTCTGCCCATGGTAAAGTGTTGCAACATTTTCTAGTACAGAGTAGTACACTGTAACTAAGATCACTTACATTCCACCTAAGTATGTATTGGTATCT

a
s	mr.mrrefChr5	210937	123	+	294542	AAGATCACTTACATTTCACCTAAGTACTCAGAAGGGCAGTCCATACTTAAGTTCAATGGACCTTTTAACCTGGCCATGAGTCATCCAAAATTATGTGTATCCATACACCCACACATTTTTTAA
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a
s	mr.mrrefChr5	211060	104	+	294542	GTAGTTTTGAGGCTGCATTGCTGTCATTCATAATGTTTGAGTCCAGCAATAAACTTGTACATCACAATTATGGCATTAAGCCCACCGCCAGCTGTACCCATATC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	356431	104	+	647215	GTAGTTTTGTGGCTGCATTGCTGTCAGTCACAATGTTTGAGTCCAGCAATAAACTTGTACATCACAATTATGGCATTAAGCCCACCTCCAGCTGTACCCTTGTC

a
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a
s	mr.mrrefChr5	211165	131	+	294542	ACCCTAAACTAGGCATGCATTACACCTTTTGATGATGAACCCAATAAAACCATTGAAACAACTGAAAAAATAAAATTGGATGCATTGGCATTCCATGCCCAATGACACACACAACCACTGTGTAGGTCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	364111	131	+	636262	ACCCTAAACTAGGCATGCATTACGCCTTTTCATGATAAACCCAATAAAATCATTGAAACAAAAGGAAAAATAAAACTGGATGCATTAGCATTCCATGTCCAATGACACACACCACCACTGTGTAGGTCCTT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	211749	81	+	294542	ATTCATCACTTTTGGAAGAAGTTAAACAGAAAACAAGTATCATTCCCCAGTGTTGAGCTATTTGTGTCCAATAAACTTTAT
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a
s	mr.mrrefChr5	211830	302	+	294542	TCCTAACACTTTTGAAACTAAATGTACTAAATGTAGCAAGGCTGGAATAATTGTGATATTTCCTAAGGTATGTCTGTTCCACCCAGCGTCATGTGGTCTAGATTATGCTATGGAGAGTGCTACATCACACTTTATATGAGAGAATAAGCATAGTCATCCATGGCAGGCCTTGCCTCTTTAGCCATACTGGTACCTACTATGTATGGAAAATTTTTGTGCTAGACCAGTATTTAGCCTTTCCCATCCCAACTTGAAATTGTCCTTCTGTTTGAACAACCTCCATTCTCCCAATGCTCTTCGTA
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	212780	13	+	294542	GAGTGCTTAACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	365748	13	+	636262	GAGTGCTTAACAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	358201	13	+	647215	GAGTGCTTAACAG

a
s	mr.mrrefChr5	212793	43	+	294542	TGAGATGTCCTCATACAGGGGATTCACATTGGAGGCATCAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	365761	43	+	636262	CAAGATGTCCTCATACAGGGGATTCACATTGGAGGCATCAGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	358215	43	+	647215	TGTGATGTCCTCATACAGGGGATTCACATTGGAGGCATCAGCG

a
s	mr.mrrefChr5	212836	224	+	294542	AGGAATTGACCTGCCACTCCCGTTTGGCTGGGTGATTTTGTTGGCACCTAAGAAGACCATGCTGCAGGAGACCCAAAGACTGAGGCAGAATACTCTTCATCCGATTGCAGCATATTACCTGGTCATATGGTCCTCCTTTCTGCCTGATGAATGGCTCCTGGACAAGTGTGAGCATATCTCTTAATATCTTATTTACATACACATATAAGGTTTGATCACTTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	365804	221	+	636262	---AATCGACCTGCCACTCCCGTTTGGCTGGGTGATTTTGTTGGCACCTAAGAAAACCATGCTGCATGAGACCCAAAGACTGGGGCAGCATACTCTTCATCCGATTGTAGCATATTACCTGGTCATATGGTCCTCCTTTCTGCCTGATGAATGGCTCCTGGACAAGTGTGAGCATATCTCTTAAGATCTTATTTACATACACATATAAGGTTTGATCACTTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	358260	223	+	647215	AGGAATTGACCGTGCACTCCCATCTGGCTAGGTGATTTTGTTG-CACCTAAGCAGATCATGCTGCAGGAGACCCAAAAACTGAGGCGGAATACTCATCATCCAATTGCAGCATATTACCTGGTACTATGGTCCTACTTTCTGCCTGATGAATGGTTCCTGGACAAGTGTGAGCATATCTCTTAATATCATATTTGTATACACATATGAGTTTTGATCACTAGGT

a
s	mr.mrrefChr5	213060	383	+	294542	AGATAGATATGTTAGTTAATGAAACAGTTATACAAAGAGTGGTTAAGGTAGCAGAAACCTCCAACCATGAAAGCAGTGCTTTCAGATGTGTCATGGCTGAGAGGACCACCCAACCTAACTCCCTCTAGAACATACAAATAAGCTCTCCAAAGCAACCGATGACAGGTGTGCTTATGCAACAGCTAATGGGACTGCAACTTCATGGTCACTCAAGCTCTACACCTAATGTAGTGTTCAAATGGTATACACTCCAGCGATTGCTAAGCCACCATTAAGTAGGAGCAATTTAAGATTAATCATTGTTCGTTGATAGCAGCACTAAGAAGAACTTCATGCATGACTTATATCTATAGGAGGTCTCAAAGCACCAAAGCCAAAGGCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	366027	383	+	636262	AGATAGATATGTTAGTTAATGAAACAGTTATACAAAGAGTGGTTAAGGTAACAGAAACCTCCAACCATGAAAGCAGTGCTTTCAGATGTGTCAGGGCTGAGAGGACCACCCAACCTAACTCCCTCTAGAACATACAAATAAGCTCTCCAAAGCAACCGATGACAGGTGTGCTTATGCAACAGCTAATGGGACTGCAACTTCATGGTCACTCAAGCTCTACACCTAATGTAGTGTTCAAATGGTATACACTCCAGCGATTGCTAAGCCACCATTAAGTAGGAACAATTTAAGGTTAATCATTGTTCATTGATAGCAGCACTAATAAGAACTTCATGCATGACTTATATCTATAGGAGGTCTCAAAGCATCAAGGCCAGATGCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	358483	380	+	647215	AGATAGATACCTCAGTTAGTGAAA--GGTATACAAAGAGTGAGTAAGATGGCAGAAACCTCCAATCATGAAAGCAGCGCTTTCCAGTCTGTCATGGCCAGGAGGACCACCCAACCCTATTCACACTAGAACATACAAATAAGCTCCCTGAAGCAACCAATCACGGGTGTGCTTATGCAACAGCCGATGGGTCTTCGACTTCATGGTCGCTCAAGCCCTACACCTGATGTAGTGTTCAAATCGCCTGCATTCCAGCCATTGCAAAGCCATCATTAAGTATGAGCAATTTAAGATTAATTATTGTTCGTTGATAGCAGCACTAAGAAGAACTTCATGCATGACTGATATCTATAGGAGGTCTCAAAGCACCAAAACCAAAG-CCT

a
s	mr.mrrefChr5	213443	32	+	294542	GACATTGTGCCAACCTTAGTAAGTTTTGAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	366412	32	+	636262	GCTATTGTGCCAACCTTAGTAAGTTTTGAGTG
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a
s	mr.mrrefChr5	213475	468	+	294542	AGTCCTCATGGCCTATTTATTGAACCTGGAGATCAGATGATTAGAATTTATTATATAGGGATTCTCAAAAGCCTGACTCAATGAATTAGAAATATGAGGGGGAAGCAAGTTTGCATACTTTATGCAGATACTGGGAGATAGAAGTAACACTATCAGTTAGGAGATTACCCAAAACCCGCACTGGAAAAATACTGCTCGTCATGAGTATTAGAATGGTGTCACTGATAAATGTTATTGAAGGGCCATGTCCTACAATTCATCCTACACTTAAAAATCTTGTCCACTTACATACCAATCCACTTACAGGTGTTGTTGAGTGGTAAAAGTGACCATGTAAGGCTGGCAACAGATCTCATGGGAAGCGCTTCCTTGTTTGGTGGAGTCCATCTCAGTCCTCCAGTTCAATTAATAGAGGACTTGAATGAATAAGGGTGTGATCCAATTGCATACCATTAGTCACCAATGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	366444	468	+	636262	AGTCCTCATGGCCTGTTTATTGAACCTGGAGATCAGATGATTAGAATTTATTATATAGTGATTCCCAAAAGCCTGACTGAATGAATTAGAAATATGAGAGGGAAGCAAGTTTGCATACTTTATGCAGACACTGGGAGATAGAAGTAACACTATGAGTTAGGAGATTACCCAAAACCCGCACTGGAAAAGTGCTGCTCGTCAAGAGTATTAGAATAGTGTCACTGATCAATGTTATTGAAGGGCCATGTCCTACAATTCATCCTACACTTCAAAATCTTGTCCACTTACATACCAATCCACTTACAGGTGTTGTTGAGTGGTGAAAGTGACCACATAAGGCTGGCAACAGATCTCATGGGAAGCGCTTCCTTGTTTGGTGGAGTCCATCTCAGTCCTCCAGTTCAATTAACAGAGGACTTGAATGGATAAGGGTGTGATCCAATTGCATACCATTAGTCACCAATGTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	358896	440	+	647215	AGTCCTCATGGCCTAATTGTTGAATCCGCAGATCA---------AATTTATTATATAGGGATTCTCAAGAGCCTGACTCAATGAATTAGAAATATGAGGGGGAAGCAAGTTTGCATACTTTATGCAGATACTGGGAGATAGAAGTAATGCTGTCAGGTAGGAGATAACCCAAAACCACTACAAGAAAAACACTGCTCGTCATGAG---TAGAATG--GTCACTGATAAGTGTTATTGAAGGGCCAGGTCCTACAATCCATCCTACACGTAAACATCTTGTC-------------ATCCACTTAGAGGTGTCGTAGAGTGGTACAAGTGACCATGAAAGGCTGGCAACAGATCTCATGGGATGCGCTTCCTTGTTTGGTGG-GTCGATCTCAGTCCTCCAGTTCAATTAATAGAGGGGTTCAATGAATAAGAGTGTGATGAGGTTGCATAACATTAGTCACCAATGGGT

a
s	mr.mrrefChr5	213943	80	+	294542	GATGGAAAAAGGAACACCTTCAACATTAAGCTTACACCTGCACATAAACGTGGCACTGACACATAAACATGCTAAAGTTG
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	214275	159	+	294542	AGGCCACAAGGAAGACTAATATGACTGTTCTTTGATATGAATCTCTCCAATCTGGAGGAAGGCGCATGCTCTAGAACTGCATTGGCAAACTGGGTATAAAAAAGAGAGGATTTCAAGTGTTACAGGCAGTAGGTAACACCCCTTTATTTACCTTCTCTA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	359752	153	+	647215	AGGCCACAAGGAAGGCTAATATGGCTGTTCTTTGATATGAAACTCTCCAATCTGGAGGAAGGCATATGCCCTAGAACTGCATTGGCAAACTGG--ACAAAAAAGGGACGATTTCAAGTGTTACAGGCAGTAGGTAACACCCCTTTATTTACCTTC----

a
s	mr.mrrefChr5	214434	267	+	294542	GATTTTTTCAGCTAATCTGACTATCTGGTGGTAGCCATCTTTTGCAGAGGTTGGCTCATGCCAGGACTCATTAAATAGAGATTGAAGCAGGGTACAGGAAATGACTATTCCACCAATTATAACAGGACTTCCACATCTGGGCAGATTAGGAAAGTGTGATTTGCCTGACTAATGGTCTGTATGAGACAGTCTGAGTTGTGGCTACAGTGTTTCTGGACCCAGCATCGCAGAGCACCCCCAGACCTAGGATTCCTGATATGAGCATGT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	359905	155	+	647215	AATTTTTTCAGCTAATCTGACTACCTGGTGGCAGCAATTTTT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTGATTTGCCTGATTAATGGTCAGTATGCGACAGTCTGCGTTGTGGCTACAGTGTTTCTGGACCCAGCATCGCAGAGCACCCCCACACCTATGATTCCTGACATGAGCATGT

a
s	mr.mrrefChr5	214701	387	+	294542	ATGAGAAGAAATGCTATTACATAGAAACACAAAGATGGGACTAATGAGAGACAAAAACAAACTTCAAAGACTATAACTGGGAACCAGGAGGACAAGTTATAGAATAAACACTGAAAATTATGAACTCATTGGCTAGGAGGGACAGGAACAGTAACTTGAGCCTTCATGGAAAACACGCTTTAAGTACAACAGGAGTATAGTAGGAATGGGGACACTTAACTGCTAGCCCAGTTGACCCCTTGATACTAACTATGCTATGGCTAAACCTCAGGTAACCATTATTATCTAGGTCATCAAGGTCATACTCACAAAGAGTCATGCTTATACCAACTACTCTGTAAGGCACCCTGGATATTATGTGCCTAGTCATCCAACCAGACAGTTGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	367682	358	+	636262	ATGAGTAGAAATCCTATTACATAGGAACACAAAGATGGGACTAATGAGAGACAAAAACAAACTCC----------ACTAGGAACCAGGAGGAGAAGTCATGGAATAAACACTGAAA---ATGAACTCATTAGCTGGGAGGGACAGGAACAGTAACTTGAGCCTTCATGGAAAACACGCTTCAAGTACAACAGGAGTATAGACAGAATGGGGACGCATAACTGGTGGCCCAG-TGACCCCTTGATACTAACTATGCTATGGCTAAACCTCAGGTGATCATTATTATCTAGGGCATC---------------AAGAGTCATGCTTATACCAACTACTCTGTAAGGCACCCTGGATATTATGTGCCTAGTCATCCAGCCAGACAGTTGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	360060	383	+	647215	ATGAGAAGGAATGCTATTACATAGAATCACAAAGATGGGACTAATGAGA---CAAAACAAACTTCAAAGACTATAACTGGGAACCAGGAGGCCAAGTTATACAATAAACACTGAAGATTATGAACTCAATGGCTAGGCGGGACAGGAACGTTAACTTGCGCCTTCATGAAAAACACACTTTAAGTACAACAAGAATATAGTAGGAATGGGGACACTTAACTGCTATCTCAGTTGACCCCTCAATACCAATTATGTTATGGATAAACCT-GGGTAACCATTATTATCTAGGTCATCAAGGTCATACTCACAAAGAGTCATGCTTATATCAACCACTCAGTAAGGCTCCCCCAATATTATTTGACTAGTGATCCAACCAGACAGTGGGA

a
s	mr.mrrefChr5	215088	23	+	294542	GAATACTTTGGTTGTATAAACTC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	360443	23	+	647215	GAATACTCTGGTTGTATAAATTC

a
s	mr.mrrefChr5	215111	18	+	294542	TTCCTGAATTAGACAAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	368068	18	+	636262	TTCCTGAACTAGACAAAT
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a
s	mr.mrrefChr5	215129	161	+	294542	GAAGGCTTTGAGCTGAGGGTCATTTAACATCTTATTAGTACTAGGTGCAGTGCCTGAGACCCACTAGTCTTTCTATGTCTGACATCCCATATAATAGAAGAAGTTCTCACTAACTATTGTCAAAAGTTCTTGCTGATTATTGTCAAGGCACCCATCTTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	368086	161	+	636262	GAAGGCTTTGAGCTGAGGGTCATTTAACACCTTATTAGTACCAGGTACAGTGCCTGAGACCCACTAGTCTTTCTATGTCCGACATCTCATATAATAGAAGAAGTTCTCACTAATTATTGTCAAAAGTTCTAGCTGATTATTGTCAAGGCACCCATCTTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	360500	161	+	647215	GAGGGTTTTGAGCTGAGGGTCATTTAAGATCCTATTAGTACTGGGTGCAGTGCCTGATACCAACTGGTCCTTCCATGTATGATGTTCCATATAATAGAAGAAGTTCTCGCTAACTATTGTCAAGAGTTCTTGCCAATTAGTGTTAATGCGCCCATCTTGAG

a
s	mr.mrrefChr5	215290	34	+	294542	GACATATCGCCCTTCATGACAGGCCCTGGAATCC
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a
s	mr.mrrefChr5	215324	28	+	294542	TAGACCCATATCTTTGAAGGCAACAGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	368282	28	+	636262	TAGTCCCATATCTCTGAAGGCAACAGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	360699	20	+	647215	AAGACCCATATCTTTCAAGG--------

a
s	mr.mrrefChr5	215352	102	+	294542	TTTTTGTAGTATCAGCACAGACATGTTGAAGTACCATGACCCAGGTCTGGTAGGCATGGTTCAGGTCAAGGTGAGAGAAGAAAGATTACAATGCCTGAACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	368311	102	+	636262	TTTTCGTAGCATAAGCACAGACATGCTGAAGTACCATGACCCAGGTCTGGTAGGCATGGTTCAGGTCCCGGTGAGAGAAGAAAGATTACAATGTCTGAACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	360719	101	+	647215	-TTTTGTAGTATCAGCAAAGATATGTTAGAGTAACATGACCCAGTTCTGGTCAGCATGATTCAGGTTAAGGTGAGAGAAGAGAGATTACAATCCCTGAACAC

a
s	mr.mrrefChr5	215454	97	+	294542	CCACTTTAGTGACTTCTATAGGGTATTCTTAATGTGAATCTGACAAGCCTGCACATCAGTGTATTCTGTATTCCTGGTACCATAGTTCTAAAATCGC
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a
s	mr.mrrefChr5	215551	121	+	294542	TTTGGATGCACTGCAATTATTCTCAGGCATATCCGTAAATAAAGTATTAAATCAGTGTCTGTACTTTTCTGTATTAAAAGGTGTCTAATTGCTTTTGCCTAGCCTACATGGATGGTATGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	368525	92	+	636262	TATGGATGCACTGCAATTATTCTCAGGCATATCTGTAAATAAAGTATT-AATCAGTGTATGTACCTTCCTGTATTAAAAGGTATCTATTTGCT----------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	360921	121	+	647215	TTTGGATGCACTGCCATTATTCACAGGCATATCCGTAAATAAAGTATTAAATCAGTGTCTGTTCTTTTCTGGATTAAAAGGTGTCTAATTGCCTTTGCCTAGCCTACATGGATGGTATGTT

a
s	mr.mrrefChr5	215672	99	+	294542	CAGTATCCGCTCAATGCCCACTTATCCCCCTTTTGGAAAGGAAATATTCAATCAACTCTTAGGAGTAATTGTCAGGCTGTATGGTACAGGACCCCAAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	368617	92	+	636262	--GTATCCGCTCAATGCCCACTTATCCCCCTTTTGGAAAGTAAATATTCAATCAACTCTTAGGAGTAATTGTCA-----GATGGTACTGGACCCCAAGC
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a
s	mr.mrrefChr5	215771	29	+	294542	CTCTGATTTCATACACTGAGTCTCTTAAG
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a
s	mr.mrrefChr5	215800	59	+	294542	TGCCATCACACACAGTCTTAAAGAATCTGTTGGGATAAACCAGAAAGAAAGAAATCATC
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a
s	mr.mrrefChr5	215859	206	+	294542	GGTTTGCCTCAACATCAGGTAAGCGTGGTCCCAACTGTTATTACAGGGCATTGGCCTGCGTGAATGGGTGATACATTGATGACACGAAACTGTGATCACCCAAATTATGTCACCCTTGGCAGCCTATACAGTAGCTATGGATTTATGGACACCTATATTGCAGCTGTTCATTTATGGAGGAGCCTATCCGGCAGCTATTGTGTTAC
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a
s	mr.mrrefChr5	216065	199	+	294542	CAATGTAACACCAGTATACATCAGATATTAAGGAGCTGTATCATACTATTGAGGGATCACCATCCTGCTATTAACTACCATTAAAGAGAGGTCCAGTCTTCCTGCAGTGGCTGACAAAATTAAACCTTTCAAAAATTAACTCAGCCTGTAGCCTACAAATTGGTGTGTGTTGGATACTTGTTATGATATCACTAGCCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	368997	186	+	636262	CAATGTAACACCAGTATACATCAGATATTAAGGAGCTGTATCATGCTATTGAGGTATCACCAT-CTGCTATTGACTACCATTAATGAGAGGTCTGGTCTTCCTGCAGTGGCTGACAATATTTAACCTTTCAAAA--TAACTCAGCCTGTAGCCTACAAATTGGTGTGTGTTGGATACTTGTTAT----------GCCAC
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a
s	mr.mrrefChr5	216264	129	+	294542	CCTGTGATTAAGTGAGAGGCAATTGCATGTGTCCAGTGCCTGTTCTAATCCTATTTGGCTCGGACAAATTAGTATAAATCATTAACTAATGGCTTTGAGCGATTTCGACATTCGTATGAGTAACAGCAC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	361628	129	+	647215	CCTGCAAATAAGTGAGAGGCAATTGCATGTGTCCGGTGCCTGTTCTAACCCTACTTGGCTCGGACAAATTAGTATAAATCATTAACTAATGGCTTTGAGTGATTTCTACATTCATATGAGTAACAGCAC

a
s	mr.mrrefChr5	216393	36	+	294542	CGGCCTGATCTCTTCCTTCTCCTTGGGCGGCAATCT
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a
s	mr.mrrefChr5	216429	98	+	294542	ACATGCATCTGTCATGAATAACTTGTCAAAAGACCCACTGGGGCACACATTTGTAGTGCCACTCCGAGTAACTTTGAGATGAGTGAATGACTTCTTCT
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a
s	mr.mrrefChr5	216527	56	+	294542	ATAGGTAGGCCTTGCGGCCAGGTACTTTTCCAAAGCGATCAAACCTGGGTTCAGGA
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a
s	mr.mrrefChr5	216583	151	+	294542	CACCTGGTCTGGCGCATTGACCTTCAATCTCATTGGCGATCATGCATCCTCGAGGTGTCTGGGAACGTTAATGGTCTGCAATGAGCGCCACGTATCTTGGGCCTATAGTGGTCCGAAAATGGTGAAAGGTGAGAAGACAAGCATTTATGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	369497	151	+	636262	CACCAGGTCTGGCGCATTGACCTTCAATCTCATTGGCGATCATGCATCCTAGAGGTGTCTGGGGACGTTAAGGGTCTACAATGAGCGCCACGTACCTAGGGCATATAGTGGTTCGAAAATGGTGAAAGGTGAAAAGAAAAGCACCTATGAC
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a
s	mr.mrrefChr5	216734	38	+	294542	TGACCACCTTCCTGGTGTTAGGCAGTAGGTTTACAGCG
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a
s	mr.mrrefChr5	216772	48	+	294542	GTAGTCTAATCTCAAATAGTCATGGTAAACCCGCCTTATATAGTGACG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	369711	48	+	636262	GTAGTCTAATCCCACATAGTCATGGTAAGCTCGCCTTATATAGTGACG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	362149	35	+	647215	---GTGGAGTATCAAATAATCATGGTAAACCCGCCTTA----------

a
s	mr.mrrefChr5	216820	20	+	294542	CTCCCCCAATCACCCTCTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	369760	20	+	636262	CTCCCCCAATCACCCTCTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	362184	20	+	647215	CTCCCCCAATCATCTTCCTT

a
s	mr.mrrefChr5	216840	48	+	294542	ATACACACTTCCTTATGTAGCCCTGCTACATTAGCATCTCATGTATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	369780	48	+	636262	ATACACACTTCCTTATGTAGCCCTGCTACATTAGCATCTCATGTCTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	362205	48	+	647215	ATACACACTTTCCTTTGTAGCCCTACTACATTAGCATCGCATGTATGT

a
s	mr.mrrefChr5	216888	40	+	294542	GAGTCAGACAGGCCCATGGTTACTATATGCTAGAAGAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	369870	40	+	636262	GAGTCAGACAGGCCCATGGTTACTATATGCTAGAAGAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	362253	40	+	647215	GAGACAGACAGGCCCATGGTTACTATATTCTAGAAGCATA

a
s	mr.mrrefChr5	216928	309	+	294542	ATCTATCTGGTATCACCTGTGTATTCTCATGGCTACATAGACAAGAGGTTGCAAACAATGCATATCAATTTCCAAAATTTCCAAAATAGAGACAAATTTGAGGACTTCATAGGATGTAGGAACAATGAAATCTTTCAAAGTGTTTGGCTGTCTGTAGTACTCCCAGTGTTTGTGGCTCTATGTCATTTTAATTTGGGAAGTTGCAGGAGATGAGACCACTAGGACCCAATCCTAATTTGTGTCAAGGTCCATGATTCAGCTAATTCTATAATGCCATTGCCTTAAAGACATCTGTCACTTAATACAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	369910	306	+	636262	ATCTATCTGGTATCACCTGTGTATTCTCATGGTT---TAGACAAGAGGTTGCAAACAATGCATATCAATCTTCATAATTTCCAAAATAGAGACAAATTTGAGGACCTCATAGGATGTAGGAATAATGCAATCTTTCAAAGTGTTTGGCTGTCTGTAGTTCTCCCAGTGTTTGTGGTTCTATGTCATTTTAATTTGGGAAGTTGTAGGAGATGAGACCACTAGGACCTAATCCTAATTGGTGTCAAGATCCATGATTCAACTAATTCTATAATCCCATTGCCTTAAAGACATCTGTTACTTGACACAAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	362317	309	+	647215	ATCTATCTGGTATCACCTGTGTATTCTCATGGCGACATAGATGAGGGGTTGCAAACAATGCATATCAGTTTCCAAAATTTCCAAAATAGACACAAATTTGAGGAGTTCATAGGATGTTGTAACAATGAAATCTTTCAAAGTGTTTGACTGTCTGTAGTACTCCCAGTGTTTGTGGCACTACGTTATTTTAATTTGGGAAATTGCAGGAGATGAGACTACTAGGACCCAATCCTAATTTGTGTCGAGGGCCACGGTTCAGCTAATTCAATAATGCCATTGCCTTAAACACATCTGTCACTTAATACAAGA

a
s	mr.mrrefChr5	217237	62	+	294542	GCTTCTTATCTTAATCAGGGGGTCATTATCTAGTCAAAGCAATCCTGCCCTTGGGGGTGTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	370216	62	+	636262	GCTTCTTATCTTAATCAGGGGACCATCATCTAGTCAAAGCAATCCTGCCCTTGGGGGGGTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	362630	62	+	647215	CCTTCTTATCTTAATCAGGGGGTCATTATCTAGTTAATGTGATCCCGCCCTTGGGGGTGTTA

a
s	mr.mrrefChr5	217299	10	+	294542	TGTGTGCCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	370278	10	+	636262	TGTGTGCCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	362702	10	+	647215	TGTGTGCCAA

a
s	mr.mrrefChr5	217309	131	+	294542	CCCAACTGTCCCCAGATGATGTAGTGGCAATTGAGGGTGGGTTAGGCTGATGGGGGTGAGTTCAAACAAGACTTCAGTAAATGCCCTGGCAAAAGCATATAGCCATTCTTTTTCCATAAAAGTGATGGAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	370288	131	+	636262	CCCAGCTGTCCCCGGATGATGCAGTGGCACTTGAGAGTGGGTTAGGCTGATGGGGGTGAGTTCAAACAAGACTTCAGTAAATGCCTTTGAAAAGGCACATAGCCATTCTTTTCCCATAAAAGTGATAGAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	362714	118	+	647215	CCCAACGGCCCCAAAATAATGTGGTGGCAATTGATGGTGGGTTAGAACAATGGGGGCTAGTTCAAACAAGACTT----------CCTGGCAAAAGTATGTACCCATTCTTTTTCCATAAAAGTGCTGG---

a
s	mr.mrrefChr5	217440	133	+	294542	TAGACAACAAGACTTATATACCAATCAAGCCAGCACAGCACAGCTCACTTGAAATTGTCAATCTGACAGACAGTTCAACAGTATACTAAACTCATGTCAAAACTATTCAGCATTGACCAACCCTGCCGGCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	370422	133	+	636262	TAGACAACAAGACTTATATACCAATCAAGCCAGCACAGCACAGCTCACTTGAAATTGTCAATCTGACAGACAGTTCAACAGTATACTAAACTCATGTCAAAACTATTCAGCATTGACCAACCCTGCCGGCATT

a
s	mr.mrrefChr5	217573	20	+	294542	GGATCTAGATGAGCTCAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	370558	20	+	636262	GGATCTAGATGAGCTCAGTT

a
s	mr.mrrefChr5	217593	22	+	294542	CATGTCACGGTCTCTCAGGTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	370579	22	+	636262	CATGTCACGGTCTCTCAGGTTC

a
s	mr.mrrefChr5	217615	25	+	294542	GAGCGCTCTAGTATGTGGATACAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	370618	25	+	636262	GAGCGCTCTAGTATGTGGATACAAA

a
s	mr.mrrefChr5	217640	17	+	294542	ATCCTGGGTTTTGCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	370645	17	+	636262	ATCCTGGGTTTTGCATC

a
s	mr.mrrefChr5	217657	20	+	294542	GTGTACTTTCAGGTAGCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	370668	20	+	636262	GTGTACTTTCAGGTAGCATT

a
s	mr.mrrefChr5	217677	12	+	294542	AACGTATAGCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	370693	12	+	636262	AACGTATAGCCC

a
s	mr.mrrefChr5	217689	56	+	294542	GGTTATCTTTGATGCTGCATCAGGTGTGGTATATCTAGAGGGGCTGTATTACCTAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	362832	35	+	647215	---------------------AGGTGTGGTAGACCTAGAGGTGCAGTATTACGTGA

a
s	mr.mrrefChr5	217745	70	+	294542	AAAGGCATTTGTGGCTATTATCTGTAATGGCGATTATCACCATCTTACGTTGACTCCATCTAGGCTTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	370763	70	+	636262	AAAGGCATTTGTGGCTATTATCTGTAATGGCGATTATCACCATCTTACGTTGACTCCATCTAGGCTTAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	217815	26	+	294542	GTCTAGTTAGCTAATGAGTGTCACAA
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a
s	mr.mrrefChr5	217841	28	+	294542	TTTGTTTGATAAATTTCACTGTACCATC
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a
s	mr.mrrefChr5	217869	45	+	294542	CTCAGTGACAAGTAAATCTGGAGATTGGCTGCAGCACTTGATAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	370977	45	+	636262	CTCAGTGACAAGTAAATCTGGAGATTGGCTGCAGCACTTGATAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	217914	57	+	294542	TGGTAGGAGCTAGTTTAAGAAAAGTAACAACTAGTTTGAGGACCATTTATGCCTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	371022	57	+	636262	TGGTAGGAGCTAGTTTAAGAAAAGCAACAACTAGTTTGAGGACCATTTATGCCTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	363286	57	+	647215	TGTTAGGAGTTAGGCTAATAAAAATAGCAACTAGTTTGAGGACCATGTATGCCTATG

a
s	mr.mrrefChr5	217971	68	+	294542	TGCCCCTGGAACTCATTTGTTTTTGCTTGCTTGTGGTATACAGAGTGCGGTGGTATACAGAATGCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	371079	68	+	636262	TGCCCCTGGAACTCATTTGTTTTTGCTTGCTTGTGATATACAGAGTGCGGTGGTATACAGAATGCCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	363432	68	+	647215	TGCCCCTGGAACTCATTTGTTTTTGCTTGCTGGTGGTTTACAGAGTGCTGTGGTGTACAGAATCCCAT

a
s	mr.mrrefChr5	218039	153	+	294542	GCATGGCAGCAGGAAGCATCAGCCCTGGGATAGAATGCTGTGTTGGTGTTCACTGCCATCAGGAGGGGAGAAAGAGGCTGCCTGTTGTCAACTTATACTCCACCATCTAATGGCATTTATGAGTGCTAGGAAATGAGGGAACTGCTTGAACTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	371165	152	+	636262	GCATGGCAGCAGGAAGCATCAGTCCTGGGATAGAATGCTGTGTTGGTGTTCACTGCCATCACAAGGGGAG-AAGAGGCTGCCTGTTGTCAACTTATACTCCACCATCTAATGGCATTTATGAGTGCTAGGAAATGAGGGAACTGCTAGAACTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	363500	152	+	647215	GCATGACAGCAGGAAGCATCAGCCCTGGGATAGAATGCTGTGTTGGTGTG-GTTGCGATCAGGAGAGAAGAAAGAGGCTGCCTGTTGTCAACTTATACTTTGCCATCTAATGGCATTTGTGAGTGCTGGGAAACAAGGGAACTGCTTGAACTG

a
s	mr.mrrefChr5	218192	323	+	294542	CCTATGAATGGATCCATCCCTGCAATCTGAGACAGGATTTGAATTATTGAACTTATGGTTCTGCATGGTGAATGGAACACATGACTGCACTGGGATTCCAGCAATATATGAGTACACTTCTCCCATAAGATATCTAACTGAGACAGTCATGTAAATAATGTGATAAGTATTAGGATGAATTTTATGTTGGATACAGTTGTTGGTGCTCAAACCCATATTACTGTCATGACAATTCAAATCAATCATAAACACTTACCACTGAGCATCAATTGGGCCTAGACATGGAATGGAGACCATATGATTAAAAAGGTTACTGCAGGGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	371317	316	+	636262	CCTATGAATGGATCCATCCCTGCAATATGAGACAGGATTGGAATTATTGAACTTATGGTTCTGCATGGTGGATGGAACACATGACT-CACTGGGATTCCAGCAATATATGAGTACACTTCTCCCATAAGATATCTAACTAAGACAATCATGTAAATAATGTGGTAAGTATCAGGATGACTTTTATGTTGGATGCAGTTGTTGATGCTCAAACCCATATTACTGACATAACAATTCACATCAATCATAAACACTTACCA------ATCAATTGGGCCTAGATATGGAATGGAGACGATATGATTAAGAAAATTACTGCAGTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	363731	323	+	647215	CCTATGAATGGATCCATCCCTGCAATCTGAGACAGGATTTGAATTATTGAACTTATGGTTCTGCACAGTGAATGGAACACATGGCTGCACTGGGATTCCAGCAATATGTGAGTACTCTTATGTTATAAGTTATTTAACTGAGACGGTCATGTAAACAATCTGATAAGTATTGGGATGGATTTTATGTTAGATACAGTTGTTGGTGGTCAAACCCATACCACTGTCAGGTCGATCCAAATCAATCCTAAATACTTACCACTGAGCATCAATTGGGTCTAGACATGGAACGGAGACCATATGGTTAAAAAGGTTACTGCAGGGTA

a
s	mr.mrrefChr5	218515	30	+	294542	GTGAGAGAACCTGGATGCAGCAAACAAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	371653	30	+	636262	GTGAAAGAACCTGGATGCAGCAAACAAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	364054	30	+	647215	GTAAGAGAACTTGAACGCAGCAAACAGAGT

a
s	mr.mrrefChr5	218545	75	+	294542	AATGGTGCAGCAATGCTACTCATGCCAATGTGAAGGAACCTGTGATGCTGAGGACAAAGTGAGTTTGTGATTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	371683	75	+	636262	AATGGTGCAGCAATGCTACTCATGCAAATGTGAAAGAAGCTGTGATGCTGAGGACAAAGTGAGTTTGTGGTTGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	364086	75	+	647215	AATGGAGCAGCAATGGTACTCATGCCAATGTGAAGGAACCTGGGATGCTGAAAACAAAGTGAATTTGTGATTGCT

a
s	mr.mrrefChr5	218620	9	+	294542	GGTTGACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	371759	9	+	636262	GGTTGACAC
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a
s	mr.mrrefChr5	218629	22	+	294542	ACAACCTGGTGGAGGTTTTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	371769	22	+	636262	ACAACCTGGTGGAGGTTTTGAA
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a
s	mr.mrrefChr5	218651	635	+	294542	GAGGTTTACATCCTGGTAGGTGCCTCTAGAGGCCTATTCGAATAATGAATACTTTTGGAATGGCAAACCAACTTTGCTACATTGCCCCTCACCCAATTTGAAGAAAAGTGCCTGGATCCTGGATGTAAGACAAGAAGGGCCCCAGAGGATGGCATATATGAGAGGAAGCAGAAACCACTCAATATAATACTATCCCAGTGTATAGATCAACTAATCTGCCAATGCCTTACTGGATGCTTATGGAGCAATTTTCAGGAGTGGAGTGACTTGGTCAAATAGCATGGGGTGTGGGAAGAACCTGATTCAGTGGCATACAGTGGATGCAGATAAGATCATAGACTACAAGGACAAAAACTGCGATAAGATTGCCCACTACACAATGCAAGGGACAGTGTTATCTGGCCTATCTAATAGGCCGGTGATGCGCAGGTGCTGGGGGACACTGTGATGGAGATCCAGGCTAGGAGAGTATTCCCACAAGAGACATTTAAACTACAGTTAGTACATCAATGTCATGTTAGTGGGCCCCAAGCTTTGTAGGGGGTTCCTAAACCAAGTAGCCATGATTATACAGTATTTATGGTATACAGTAATGGTCCAATGGCATGTTTCTGCAGCTCTTACTACTCCTTAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	371794	628	+	636262	GAGGTTTACGTCCTGGTAGGTGCCTCTAGAGGCCTATTCGAATAATGAATACTTTTGGAATGGTAAACCAACTTTACTACATTGCCCTTCACCCAATATGAAGAAAAGTGCCTGGATCCTGGATGTAAGACAAGAAGGGCCCCAGAGGATGGCCTATATGAGAGAAAGCAGAAACCACTCAATATAATACTATCCCAGTGTATAGGTCAACTAATCTGCCAATGCCTTACTGGATGCTTATAGAGCATTTTTCAGGGGTGGAGTGACTTGGTTAAATAGCATGGGATGTGGGAAGAACCTGATTCAGTGGTATACAGTGGATGCAGATAAGATCATAGACTATAAGGAC-AAAACTGCAATAAGATTGCTCACTACACAAGGCAAGGGACAGTGTTATC------ATCTAATAAGCCGGTGATGCGCAGATGCTGGGGGACACTGTGGTGGAACTCCAGGCTAGGAGAGTATTCCCATATGAGACATTCAAACTACAGTTGGTACATCAATGTGATGTTAGTGGGCCCCAAGCTTTGTAAGGGGTTCCTAAACCAAATAGCCATGATTACGCAGTAATTATGGTATACCGTAATGGTCCAATGGCATGTTTCTGCAGCTCTTACTACTCCTTAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	364192	622	+	647215	CAGGTTTATATCCTGGTAGGTGCCCCTAGAGGCCTATTTGATTAATGAATACTTGTGGAATGCCAAACCAGTTTTGCTACATTGCCCCTCACCCAATTTGAAGAAAAGTGCCTGGATCCTGGATGTAAGACAGGAAGGGCCCCAGAGGATGACATATATTGGAGGAAGCTGAAACCACTCAATATAATACTATCCTAGTCTATAGATCAACTCATCTGCCAATGCCTTACTGGATGCTTATGGAGTGATTTTCAGGAGTGGCGTGACT----CAAATAGCATGGGGTGTGGGAAGAGCCTAATTCAGTGGCATACATTGGATGCGGATAGGATCATAGACTTCAAGGACAAAAACTGCGATAAAATTGCCCACTACACAATCCAAGGGACAGTGTTGTCTGGCCTATCTAATAGGCCAGTGATGGGCAGGTGCTGGGGGACACTGTGATGGAGATCCAGGCCAGTCAAGTATCCCCACAAGAGACATTTAAACCACAGTTAG---------GTCATGTCAGTGGGCCCCAAGCTTTGTCGGGAGTTCCTAAACCAAGTAGCCATGATTATACAGTATTCGTGGTACACAGCAATAGTCCAATGGCATGTTTCTGCAGTTCTTACCACTTTTGAGT

a
s	mr.mrrefChr5	219286	49	+	294542	TTGCTACTACAATTGAGCTCAGACTCACAGCTGGCTGGCCCCAGATCTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	372436	49	+	636262	TTGCTACTACAATTGAGCTCAGACTCACAGCTGACTGGCCCCAAATCTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	364814	49	+	647215	TAGCTGCTATGATTGAGCTCACACTCACAGCTGGCTGGCCCCAGATCTA

a
s	mr.mrrefChr5	219335	160	+	294542	AGGTATTTGCAAAACTGTTAAGCCCAGTTTACCAGCATACTACACATTGGTGTGGGTAGTTTATGGGACAAAGATGTTGTGTAAGCATATTGTCATGACGACACTGCTCTTCTCTTAGCATTACAGGACCAGGTCAGGCACTGCCAACCCTTGAGTATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	372486	156	+	636262	AGGTATTTGCAAAACTGTTAAGCCCAGTTTACCAGCATACTACACAATGGTGTGGGTAATTTATGGGACAAAGATGTTGTGTAAGCATATTGTCATGACGACATTGCTCTTTTCTTAGCACTACAGGACCAGGTCAGCCACTG-TAACCC---AGTATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	364863	151	+	647215	AGGTATTTGCAAAACTGTTCAACCCAGTTTACCAGCATGTTCCACATTGGTGTGGGTAGTTTATGGGACAA---------GTTAGCAAGTTGTCATAACAACACTGTTCCTCTCTTAGCCTTGCCAGTCCAGATCAGGCCCCGCCAACCCTTGAGGATTG

a
s	mr.mrrefChr5	219495	79	+	294542	CGGTTGCAGAGCAATGCAGACCAGCCCTTAAAAAATCAGGTTTGGCATAAAAAACCGGGTTTAGCATAATGATGTGCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	372642	60	+	636262	CGGTTGCAGAGCAATGTAGACCAGCT-------------------GATAAAAAACCGGGTTTAGCATAATGATGTGCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	365015	79	+	647215	AGGTTGCAGAGTAATGCAGACCAGCCCTTAAAAAATCAGGTTTGGCATGAAAAACCAGGTTTGGCATGACCATCTTCTC

a
s	mr.mrrefChr5	219574	190	+	294542	TAAATGCCAGGCTTGGACCCACCAGATCTAGCCAAGGTGAACAGCATCACACTGAAAGACATTGCTTGACTTTTTTTTTCGACTGCATTGTTCTAATTAGATGGAGTTCTCTGTCAAACAACTTAGCTAGTTTGTGCAAGGAAAATTCACACAATCAAACAATTGGCTGAAACCTCCTTCTTTAAAACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	372702	190	+	636262	TAAATGCCAGGCTTGGACCCACCAGATCTAGCCAAGGTGAGCAGCATCACACTGAAAGGCATTGCTCGGCTTGTTTTATCACCTACATTGTTCTAATTAGATGGAGTTCTCTGTCAAACAACTCAGCTAGCTTGTGCAAGGAAAATTCATACAATCAAACAATTGGCTCAAACCTCCTTCTTTAAAAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	365095	190	+	647215	GGAATGCCAGGCTTGCGCCCACCAGATCCAGCCAAGGTGAACAACATCACAGTGAAAGACATTGCTTGACTTTTTTTTTCGACTGCATTGTTTTAATTAGATGGAGTCCTCTGTCAAACAACTTGGCTAGTTTGTACAGGGAAAATTCACACAATCAACGAGTTGGATGAGACATCCTTCGCGAACACTT

a
s	mr.mrrefChr5	219764	51	+	294542	TGACACTCAGGTATTGTAGACTGGCCCTATTGAAAACCTCCCTTGGTAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	372897	51	+	636262	TGACACTCAGGTATTATAGACTCCCTCTATTGAAAATCTCCCTTGGTAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	365285	51	+	647215	TGAGACTCAGGAGTTGGAGACTGGCCCTATCAGATTCCTCCCTTGGTAACG

a
s	mr.mrrefChr5	219815	116	+	294542	CCAATGATAGCCCAGCTCTTTCTACTGTCCAGTTCTGTAACTTAGTAAATTCATCTCTTTCCACGTTCTGCATGCTATTGAGTCAGCCTTGTGAAAAGGAAGGTGTACTGACTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	373074	116	+	636262	CCGGGGATAGCCCAGCTCTTTCTACTGTCCAGTTCTGTAACGTGGTAAATTCAGCTCTTTCCACGTTCTGTATGCTATTGAGTCAGCCTTGTGAAAAGGAAGGTGTACTGACTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	365336	116	+	647215	CGAATGGTAGCCCAGCTCTTTCCACTGTCCAGTTCTGTAACTTAGTAAATTCATCCCTTTCCATGTTCCGCGTGCTGTTGACTGGGCCTTGTGAAAAGGAAGGTGTACTTACTGTT

a
s	mr.mrrefChr5	219931	6	+	294542	GGATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	373190	6	+	636262	GGGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	373349	6	+	636262	GTATGA
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a
s	mr.mrrefChr5	219937	1	+	294542	A
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	373196	1	+	636262	G
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	365458	1	+	647215	A

a
s	mr.mrrefChr5	219938	6	+	294542	GGCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	373267	6	+	636262	GGCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	373360	6	+	636262	GGCCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	365459	6	+	647215	GGCCTG

a
s	mr.mrrefChr5	219944	1	+	294542	T
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	373366	1	+	636262	T
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a
s	mr.mrrefChr5	219945	45	+	294542	AACATTCTGACTCATTATTAGATGTTTGATTTTGATGTCCACTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	373273	45	+	636262	AACATTCTGTCTCATTATTTGATGTTTGAGTTTGATGTCCACTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	373367	45	+	636262	AAGATTCTGACTCATTATTAGAGGTTTGATGCTCATTGTTACTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	365466	45	+	647215	AAAATTCTGACTCATTATTAGATGTTTGATTTTTGTGTCCCTTTA

a
s	mr.mrrefChr5	219990	1	+	294542	C
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	373412	1	+	636262	C
s	simRat_chr6.simRat.chr6	365511	1	+	647215	C

a
s	mr.mrrefChr5	219991	31	+	294542	CAAATTGTACTCCTGTGGGTCATGTTCTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	373318	31	+	636262	CAAATTGTACTCCTGTGGGTCATGTTCTCCA
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	222647	71	+	294542	CCATTTGACATTGCGGGATCAGTCACAGAGGGTAAACTTCAGTATTTGCCATTTGTGGGGTACATTGTTTG
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	178346	143	+	636262	CACT-AAGTTGCTATAGTTATGGAGATCTTGTCGCTGGATGGAATATTCCAGTAATCTTGAGGATATCGCA-------CAGGGAGGAAATTATATCAATTATGTCATATAG---ACACTAAATTGCACCAATGAGCAGCAAAGGAGTCTGATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	373135	154	+	647215	CAGTCAAGTTGCTATAGGTAAGGAGCTCATGTCACTGGATGGAATATTCCAGCAACATTGAGGATATGGCAGCAACAGAAGGGAGGGAATTATATCAATCATGTTCTATAGTTTACACTAAATCGCACCAATAAGCAGCAAAGGGGCCTTATGG

a
s	mr.mrrefChr5	227619	51	+	294542	AAAGCCTTTAGTTTAAAAACCACTAGTTTACTATGACAAGCAGAGTAAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	178495	51	+	636262	AAAGCCTTTAGTTTAAAAACGATTAGTCTATTATGACAAGCAGAGTAAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	373289	51	+	647215	AAAACCTTTAGTTTAAGAACCACTAGTTTACTATAACAAGCAGATTAAAGG

a
s	mr.mrrefChr5	227670	34	+	294542	CTCAACAAAGTGGTCAGTTACTGTGTGTTTGGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	178546	34	+	636262	CTCGACAAAGTGGTCAGTTACTGTGTGGTTGGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	373345	34	+	647215	CTCAACAAAGTGGTGAGTTATTGTGTGTACGGGA

a
s	mr.mrrefChr5	227704	78	+	294542	CACCTTGCCCTGGCTAGGTTAATGTGGTCTTGTCCCTTCGAGGGAAACTAATAATTTCGTATTGGCCTGGTGACTTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	178580	68	+	636262	CACCTTGCCCTGGCTAGGTTCATGTGGTCTCGTCCCTTCGAGGGAGACTAATAATT----------CTGGTGACTTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	178753	68	+	636262	AACCTTGCCCTAGCTAGGTTAACATGGTCTTTTCCCTTCGAGGAAAACTAATAATT----------CTGGTGACTTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	373379	74	+	647215	CACCCTGCCCTGGCTATTTT----CCATCTTGTCCCAGCTAGGGAAACTAATAATTTCGTATTGGCCTGGTGACTTGC

a
s	mr.mrrefChr5	227782	105	+	294542	TGTGGTAGGTCTAGGTCCTGGGTAGATACATAATTTAGTTCCATACATTAATGTGAGGCAGCCAAAGGTGTGGCCACACCTCTAAGGCTAGCCTGGCGAGACAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	178648	105	+	636262	TGTGGTAGGTCTAGGTCCTGGGTAGATACATGATTTAATTCCATACATTAATGTGAGGCAGCCAAAGGTGTGGCCACACCTCTAAGTCTAGCCTGGCTAGACAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	178823	99	+	636262	TGTGGTAGGTCTAGGTCCTGGGTAGTTACATAATTTAGTTCCATACATTAATGTGAG------AAAGGTGTGTCCACACCTCTAAGGCTAGCCTGGCGAGACAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	373453	69	+	647215	TGCGGTAGGCCTGGGTTTTGGGTAGATACATAATTTAGTTCCATACATTCGTGTGAGGCAGCCAAAGGT------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	227887	60	+	294542	CCGCCAGGCTCTGACTAGAATAGATATGTATGTAGCTTTGACCACTTGATGAGACCATCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	179004	55	+	636262	CCGCCAGGCTCTGAGTAGAATAGATATGTATGTAGTTTTGA-CAATTGACGAGA----AA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	373522	60	+	647215	CTGCCAGGCTCTGACTAGAATAGATGTGTATGTAGCTTTGACCACTTGATGAGACCATCC

a
s	mr.mrrefChr5	227947	112	+	294542	CTACCCTAAAGGTATGCTGTCATAGTAGGTTCCCAGACTATGGAGATTAAACACTGTCTCATTGTATGTCACTATTACATTACCCCTTCCTCAATGTATCTTAACAAGTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	374277	112	+	636262	CTACCCTAAAGGTGTGCAGTCATAGTAGGTCTGCAGACTATAGAGATTAAATACTGTCTCATTTTGGGTCACTATTACATTCCCTCCTCCTCAATGCATCTTAACAAGTTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	373582	112	+	647215	CTACCCTGAAGGCATACTATCATAGTAAGTTCCCAGAATTTGGAGATTAAACACTGTCTCATTGTATGTTGCTATTACATTAACCCTCCCTCAATGTATCTCAACAAGTTGA

a
s	mr.mrrefChr5	228059	73	+	294542	TTGATTTATATGAGCCTCTACAAAGTCTTATGAATATGCAAGCTACAAGATGCCTTTTTTAGGCTCACAGTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	374390	73	+	636262	TTGATTTAGATGAGGCTCTACAAAGTCTTATGAATATGCAGGTTACAAGACACCTTTTTTAGGCTCACAGTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	373694	73	+	647215	TTGATTGATATGAGCCTCCACGAAGTTTTATGAGTTTGCAAGCTACAAGATGCCTTTTTTAGTTTCACAGAGT

a
s	mr.mrrefChr5	228132	321	+	294542	GAAAAGTGAGGATCTAAGTAAAGGTAAACCGTAAGGAACAAAAAGAACAAAGTCTAGGATAGAGGACACAAGAGTTAACTTTGCTCTTACCAAAGACAATTTTTAGATACTTTCACTCACTCAAGACGCCACTAAGTATACTGAGCTTTAAGTTACTTAGAAATGCATGGATAGTTTTGTATTCCCCTCAATTCCAGGTCTCTCAGGACCTCACTTTGGGCAAAAGACCAGAATCACACAGGTATAATCAGCTGTGTTGTGCATGTCAGCGATGGTGCAACTCTTATTATGCAATCCTGAATGGCTATTACATACCATTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	374463	321	+	636262	GAAAAGTGAGGATCTAAGTAGAGGTAAACCATAAGGAACAAAAAGAATAAAATCTAGGATAGAGGACACAAGAGTCAACTTTGTTCTTACCAAGGACAATTTTTAGATACTTTCACTCACTCAAGACGCCCCTAAGAATACTGAGCTTTAAGCTACATAGAAATGCATGGATCGTCTTGTATTCCCATCAATTCCAGCTCTCTTAGGACCCCACTATGGGCAAAAGACCAGAATCACACAGGTATAATCAGCTGTGTTATGCATGTCAGGGATGGTGCAACTGTTAATATGCAATCCTGAATGGCTATTACATACCATTTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	373768	321	+	647215	GAAAAGTGAGGATCTAAGTAAAGGGAAACCGTAAAGAACAAAAAGAACAACGACTAGGAGAGAGCACACAAGAGTTGACTTTGCACTTACCAAAGACAATTTTTAGAGCCTTTCGCTCGCTCAAGACACCACTAAGTATACTGGGCTTAAAGTTACTTAGAAATGCATGGATAGCTTTGTATTCCCCTCAATTCCAGGTCTCACATGACCTAACTTTGGGCAAAAGACCAGAATCACACAGGTATAATCAGCTGTGTTGTGCATGTCAGCTATGGTGAACCTCTTATTACACAATCCTGTATAACACTCATGTAACAGTTA

a
s	mr.mrrefChr5	228453	133	+	294542	ATTTTTTGGCATGCTTCATTGTCTTTCAACAGCTGTGGAATTCGTGTCTATAACATCCCCTGGACCCAGTCTTCTTTTACCTTTACTCCCATGTTTGACTGGCATGTTCAAAGGGAGTGAGAAAATTCCTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	374800	133	+	636262	ATTTTTTGGCATGCTTCATTGTCTTTCAACAGCTGTGGAATTCGTGTCTATAACATCCCCTGGACCCAGTCTTCTTTTACCTTTACTCCTACGTTTGACTGGCATGTTCAAAGGGAGTGAGAAAATTCCCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	374089	133	+	647215	ATCTTTTGGCATGCTTCAGTGTCTTTCAACAGCTGCAGAATTGGTGTCTATAAAATTCTGTGAACCCAGTCATCTTCTATCTTTACTCCCATGTTTAAGTGGCATGTTCAAAGCGAGTGAGTCAACTCCTATA

a
s	mr.mrrefChr5	228586	41	+	294542	TCTCAAGTGTGGGACCAACCTGTGACATGTTCACTGAAAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	374935	41	+	636262	TCTCAAGTGTGGGACCAACCTGTGACATATTCACTGAAAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	374222	41	+	647215	TCTCAAGTATGGGACCAACCTGTGACATGTTCACTGAAAGG

a
s	mr.mrrefChr5	228627	258	+	294542	GTTAAGCAACTATGTCTATTCTTTCATCTTGAGACATCTAGTTTCTGCTATGGTGTGAATCAAGTGTTCATTTGGAGACTGGCTTTATTAGCTGTGAAGTTTATACTATTGAATGTGCCTTCAGCCCAGCAGTGTGGGAACTCCAAGATTTTCAACTGGATATCCCTACTAACATCCTCTACCTGCATAGTTCTCTCAGGATTTAGACAAGAGTTACATTATTCAAGTGGAGGTATTGGTCTAGCGTATTCAATTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	374978	250	+	636262	GTTAAGCAACTATGTCTATTCTTCCATCTTGAGACATCCAGTTTCTGCTATGGTGTGAATCAAGTGTTC--------ACTGGCTTTATTAGCTGTCAAGTTTTTATAATTGAATGTGCCTTCAGCCCAGCAAACTGGGAACTCCAAGATTTTCAACTGGGTATACCTACTAACATCCTCTACCTGCATAGTTCTCTCAGGATTTAGACAAGAGTTACATTATTCAAGGGGAGGTATTAGTCAAGCGTATTCAATTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	374263	256	+	647215	GTTAAGCAAGTATGTCTTTTCTTTCATCTTGAGACATCTAGTTTCTGCTATGATGTGAATCAA-TGTTTATTTGGAGACTGGCTTTCATAGCTGTGAAGTTTACACTATCAGATGTGCCTTCAGCTCAGCAGTGTGGGAACTCCAAGATCTTCAACTGGATGTCCCTACTAACATCCTCTACCTGCACAGTTTTCTCAGGGTTTAGACAATAGTTACATTATTCAAGTGG-GGTATTGTTCTAGTGTATTCAATTGAA

a
s	mr.mrrefChr5	228885	35	+	294542	CTAGTGTATTCAATCGAAGATAAGTGTCTATCAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	375228	21	+	636262	-------GATCAATC-------AGTGTCTATCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	374520	35	+	647215	CTAGTGTATTCAATTGAAGATAAGGGTCTATCAAC

a
s	mr.mrrefChr5	228920	28	+	294542	ACCATGCTCACTATACATTTCAGTGAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	375249	28	+	636262	ACCATGCTCACTATACATTTCAGTGAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	374556	25	+	647215	ACCATGGTCACAATACATTTTAGTG---

a
s	mr.mrrefChr5	228948	210	+	294542	AAGTAATGTATAATCTAGTTGGGAACAAACCCGTTTATTGATAGTTTGTGATTCCTTGACCTCAGTGGCACATAAATTAAGAATATGTCTGGCTTCAACGGAGGATGCTGTTACTACTATATATTATTACTGTACATATTACTAATGTAGTCAGAGGGGTAAGCTAACTCCATGATCATTTTTTCAAGTGAGAAAAGACCAATCCTGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	375279	208	+	636262	AAGTAATGTATAATCTAGTTAGGAACAAACCTGTTTATTGATAGTTTGTGACTCATAGACCTCAGTGGCAC--AAATTAAGAATATGTCTGGCTTCAACGGAGGATGCTGTTACTACTATATATTATTATTGTACATATTACTACTGTAGTCAAAGGGGTAAGCTAACTCCATGATCATTTTTTCAAGTGAGAAAAGACCAATCCTGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	374581	210	+	647215	AAGTAATGTATAATCTAGTTGGGAAGAAACCCGTTTATTGATAGTTTGTGTTTCCTTGACCTCAGTGGCACATAAATTAAGAATATGTCTGTCTTCAATGCAGGATGCTGTCACTGCTATATATTGTTACTCTACATTTTACCAATGTAATCAGAGGGGTGAGCTAACTCCATTATCATCTTGTCGAGTGAGCAAAAACCAATCCTGCCA

a
s	mr.mrrefChr5	229158	218	+	294542	TGTCCTATTGTTGGAGGTGTCAATCTGGTTTGTTTGATGGTACAAGGGTCCTATGATCTCTTTAAATGCATCTTGACTTTTCTAGTTTCAGACTTGAGCTTATAGGGGCCATCCAGTCTACATAATGGCTGCCATATTCCTAAGTTGGCCAAGCAAAGTGAGTAAGAGTAGGTAGTACTAAATTGGTTTAAGACTCCTGCTTGTGTACTCGCACCTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	375580	218	+	636262	TGTCCTATTGTTGGAGGTGTCAATCTGGTTTGTTTAATGGTACAAGGGTGCTATGATCTCTTTAAATGCATCTTGACTTTTCTAGTCTCAGACTTGAGCTTATAGGGGCCATCCAGACTACATAATGGTTGCCCTATTTCTAAGTTGGCCAAGCAAAGTGAGTAAGAGTAGGTAGTACTAAACTTGTTTAAGACTCCTGCTTATATACTCGTACTTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	374791	216	+	647215	TGTCCTATTTTTGGAGGTGTCAGTCTGGGTTGTTTGATGGTAC-CGGGTCCTGTGATCTCTTTAAATGCATCTTGCCTTTTCTAGTTTCGGACTGGATC-TATAGGGACCATGAAGTCTGCATAATGGCTTCCATATGCCTAAGTTTGCCAAGCAAAGTGAGTAAGAGTAGGTAGTCCTAAATTGGCTTAAGACTCCTACTTGTGTACTCGCACCTAA

a
s	mr.mrrefChr5	229376	51	+	294542	TGTTATTTAGATTTCAGAACAGTGCCTGGTGCAAAGCTGTAATAAAGGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	375798	51	+	636262	TGTTATTTAGATTTCAGAACAGTGCCTGGTGCAAAGCTGTAATAAAGGGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	375008	51	+	647215	TGTTGTTTAGATTTCAGCACAGTGCCTGATGCAATGCTATAATAAAAGGCA

a
s	mr.mrrefChr5	229427	222	+	294542	AACACAGCCATGTACTTTTGGTTATTGCTTGGCCATGAGCCTGCCCACTTTAGGAGATGTTAAGCGATCACAGAAGGAGTCTGCCCACATCATGCAAGAGGTTAGTCATGCACAGCTCCCTACGTACATTCTATATCCCCTGTCCACCTCATGCTAATGCATCTTCATTGTGGTGGCAGAAACAAGGAAAGAGAGAAGGAAAGCCTTCAATGGTAATTTTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	375862	218	+	636262	AACACAGCCATGTACTTTTGGTTATTGCTTGGCCATGAGCCTGCCCACTTTAGGAGATGTTAAGCGATCACAGAAGGAGTCTGCCCACATCATGCAAGAGGTTAGTCATGCACAGCTCCCTACGTACATTCTATATCCCCTGTCCACCTCATGCTAATGCATCTTCATTGTGGTGGCAGAAGCAGG----GAGAGAAGGAAAGCCTTCAATGGTAATTTTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	375059	220	+	647215	AACACAGCCATGTACTCATGGTTATTGCATGGCTATCAGTCTGCCCTCTTGAGAAGATGTTTAGCGATCACAGAAGAAGTCTGCCTGCCTCATGCAAGAGGTTTGTCATGCAGAGCTGCCCACGTACATTTGAGATCCCCTGCCCACCTCATGCTTATGCACCTTTATTGTGGTGGCAGAAACAAGGAAAGAAAGAAGGAAAGCCTTCAATGG--GTTTTAT

a
s	mr.mrrefChr5	229649	156	+	294542	GAAACTCTTCAGTTCCTTAAAGGAGACTAGAAATAGTTGCATCCCACAGCATACACAGAAAGGTAACTGGTGTAGTTTATACTCAGCCCTCACTTTGCAGCGCTGACTGATTCTCTCACAAACTGATTAAACATCAAACTATATTGAGTCCATCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	376080	154	+	636262	GAAACTTTTCAGTTCCTTC-AGGAGACTGGAACTAGTTGCATCCCACAGCATACACAGAAAGGTAACTGGTGTAGTTTGTACTCAGCCCTCACTTTGCAGCCCTGACTTACTCTCTCACAAACTGA-TAAACATTAAACTATATTGTGTCCATCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	375336	156	+	647215	GAAATTCTTCACTTACTTAAAGAAAACTATAAATAGTTGCACTGCACAGCATGCACAGTGAGGTGACTGGGGTAGTTTATGCTCAGCCCTCACATTGCAGCGCCAACTGGTTCTCTCACAAACTGATTAAATATCAAACTATATTGAGTCCATCAC

a
s	mr.mrrefChr5	229805	110	+	294542	AGACAGCAGTAACATAAGAAAAGCTAAAGTTTTCAGTGTAATTTCCATGCAAAAGAATTTGATTGACAAACATTCAGTGGTCCCATGCTGACTGAAAGTGTATACAAAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	376236	110	+	636262	GGACAGCAGTAACATAAGAAAAGCTAAAGTTTTCAGTGTAATGTACAAGCAAAAAAAATCACTTGACAAACATTCAGTGGTCCCATGCTGACTGAAAGTGTATACAAAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	375492	110	+	647215	AGACGGCAGTACCATAAGAAAAGGTAAAGTTTTCAGTGTAATTTCCATGCAAAAGACTTTGATTGACAAGCATTCAGTAGTCCAATGCTGCCTGAAATTGTATACAAAGC

a
s	mr.mrrefChr5	229915	59	+	294542	GACAAAGCTTGCATAATAGGAGGAGGCCTTCCCACCCCTTGTGTAGTAGACTTGTTTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	376346	51	+	636262	--------TTACATAATAGAAGGAGGCCTTCCCACCCCTTCTGTAGTAGACTTGTTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	375604	59	+	647215	GACAAAGCATGCATAATAGGACGAGGCCTTCCCACCTCTTGTGTAGTAGAATTGTTTGA

a
s	mr.mrrefChr5	229974	232	+	294542	GATCACATGCACAGGTGACTCATGGGAACTACTGTCTGTATCCTTTTGATTGTACAATCCAAAATATACTGAAAATACAAACACTATAAAGGTGCCATGGAGATGGGAAGTCATAACAAAAACTCTTAACAATACCCTACCATTCCTATATTTTGGTTCATAAAAAAATCCATTTTATCCCCTTTATCCACACACCTTGCCAGCATAACTATAGAATCTTGCTCTCTAAGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	376398	230	+	636262	GATCACATGCACAGGTGACCCATGGGAACTACTGTCTGTGTCCTCTTGATTGTACAATCCAAAACATACTGAAAATACAAACACTATAAAGGTGCCATGGAGATGGGAAGTCGTAACAAAAATTCTTAACAGTGCCCTACCATTCCTATATTTTGGGTCATAAAAAAACCCATCTTAT--CCTTTATCCGCACACCTTGCCAGCATAAATATAGAATCTTTCTCTCTAAGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	375663	230	+	647215	GATCACATGAGTGGGTGACTCATGAGGACTACTGTCTG-ATCCTTTTGATTGTACAATACAAAGTATACTGAAAATACAAATGCCATAAAGCTGCCATGG-TATGGTCAGTCATAACAATAACTCTAAACAATACCCTACCATTCCTATATTTTGGTTCAAAAAACAATCCATTTTATCCCCTTTATCCACACACCTTGCCAGCATGACTATAGAACCTTGCTCTCTAAGAG

a
s	mr.mrrefChr5	230206	261	+	294542	AAATGCACGCATTGTACAACACTGACCCTATGCATGTGAAACTTGCACCTTATTATCCTTTGACCAGCAATATTTTTGGTAATTGTGTGTACCTAGTGTTAGACAGTGATTTCTCCATAGATACATGGTGACCACCAGGCTTTTCATAATTGGGAGTATGGAACCCTAGTAGCTACGAGCAAACCCATCAGTCATTTGCATGGGAGAGTATATTCTTCTCAGCATGATGATACCTTCCTTTTTCCAGAATAGACCAGCTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	376628	261	+	636262	AAATGCATGCATTGTACAACACTGACCCTATGCATGTGAAACTAGCAGCTTATTATCCTTTGTCCAGCAATATTTTTGGTAATTGTGTGTACCTAGCATCAGACAGTGATATCTCCATAGACACATGGTGACCACCAGGCTTTTGATAATTGGGAGTATGGAACCCTAGTAGCTACGAGCAAACCCATCTGTCATTTGCATGGGAGAGTATATTCTTCTCAGCATGATGATACCTTCCTTTTTCCAGAATACACCAGCTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	375894	259	+	647215	AAATGGACGCAATGCAAAACGCTGACCCTATGCATGTGAAATGTGCACCTTAGTATTCTTTGACCAGCAATATTTTTAGTAATTGTGTGTACCTAATGCTGAACAGTCATTTCTCCATATGTACATGGTGACCACCAGGCTTCTCATAATTGGGAGTATAAGACCCTAGTAGC--CGAGCAAACCCTTCAGTCATTTGAGTGGGTGGGTGTATTCTTCTCAGCATGATGATAGCCTTCTTTTTCCAGAATAGACCAGCTGA

a
s	mr.mrrefChr5	230467	15	+	294542	GCAGACCCACACAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	376889	15	+	636262	GCAGACCCACACGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	376166	15	+	647215	GCAGACCCACACAAT

a
s	mr.mrrefChr5	230482	158	+	294542	CAATGTTTATACCCAGCACTGGATTTGGTATTTATAGGGGATAGGGGCTCAGGGCAACAATAGGAGACCATTGACATAAAAAAATTGTTGTGGGGGTATGCATGTGGACAGACTAAAAGAGAGGTGAGTATTTTTGAACATTCCAATTGCAGTCTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	376904	158	+	636262	CAATGTTTATACCTAGTACTGGATTTGGTATTTATGGGGGATAGGGGCTCACAGCAACAATAGGAGACTATTGACATAAAAAAATCGTTGTAGGGGTATGCACGTGGACAGACTAAAAGAGAGGTGAGTATTTTTGAACATTCCAATTGCAGTCTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	376182	158	+	647215	CAATGTTGATGCCCAACACTTCATTTGGTATTTATAGGGGATAGGGGCTCAGGGCAACAACAGGAGACCATTGACATCGAAAAATTGCGGTGGGGGCATGCATGTGGGCAGACTGAAAGAAAGGTGAGTATTTCTGAACACTCCGATTGCAGTCTGTT

a
s	mr.mrrefChr5	230640	11	+	294542	AGGAAGGTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	377062	11	+	636262	AGGAAGGTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	376341	11	+	647215	AGGGAGGTTTG

a
s	mr.mrrefChr5	230651	20	+	294542	TTACAGTATCAAGAGATGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	377074	20	+	636262	TTACAGTATCAAGAGATGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	376352	20	+	647215	TTACAGTATTAAGAGATGAA

a
s	mr.mrrefChr5	230671	225	+	294542	ATGAATAAGGTTCCGCTATGGATGATATACAGCATTTAATAACAACTACCTGAGCGTTATGGTGATCAACTTTTGAAATTAAAAATGACAGTAAGGGAAATCTGGCATGCAGCAACATCATAAGCCTTAATTCTATAGTTAATGGGCAGCAAAGTGGGTGTGGACATCCCAGAAGGAGGGGACTCCAAGAGACTATGCCTGCAGATAGTACTAGCAAGTTAGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	377094	225	+	636262	ATGAATCAGGTTCCACTATGGATGATATACAGCATTTAATAACAACTATCTGAGCGACATGGTGATCAACTTTTGAAATCAAAAATGACAGTAAGGGAAATCTGGCATGCAGCAACATCATAAGCCTTAATTCTATAGTTAATCGGCAGCAAAGTGGGTGTGGACATCTCAGAAGGAGGGGACTCCAAGAGACTATGCCTGCAGATAGTACTAGCAAGTTAGGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	376373	225	+	647215	ATGAGTAAGGTTCCGCTATGGATGATCTACAGTGTTCAATAACGACTACCTGAGGGTTACAGCGAACAACTTTTGAAATTAAAAATGCCAGTATGGCAAATCTGGCATGCAGCAACATCTTAGGCCTTAGATCTATAGTGAATGGGCAGCAAAGTGGGTGTGGACATCCCACAAGGAGGGGTCTGCAAGAGACCATGCCTGCAGATAGAACTAGCAAGTTAGGAG

a
s	mr.mrrefChr5	230896	270	+	294542	GGGGAGGAACCCAAGAGGCTATGCCTGCAGATTGTTTGAGGGTTAAATTCTGAAAAGTGGATTTCCAGATGGTTTGTAGAAGTCAGCATGGATGCCCTGATTCTGATATACCACAAGGGCATACTTAACACCAAGGCAGAGTGCTCCCAAGATACTATCGGACCATTCTAAGGGAGTGACCGATAAGCAATGTTGTGACAAAGATAGAAATGTGTGTTACTTGTGCAAGAGTCAACATTATAAGAAGTATATAGGTAGGGTTGAGTTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	377336	270	+	636262	GGGGGAGAACCCAAGAGGCTATGCCTACAGATTGTTTGAGAGTTAAATTCTGAAAAGTGGATTTCCAGATGGTTTGCAGAAGTTAGCATGGATGCCATGATCCTGATGTACCACAAGGGCATACTTAACACCAAGGCAGAGTGCTCCTGAGATACTGTTGGCCCAATCTAAGGAACTGACCGATAAGCAATGTTGTGACAAAGATAGAAATGTGTGTTACTTGTACAAGAGTCAACATTATAAGAAGTATGTAGGTAGGGTTGAGTTATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	376598	266	+	647215	GGGGAGGATTCCAAGGTGTTATGCCTGCAGATTATTTAAGGGTTAAATACTGAAAAGTGGATTTCCAGATTGTTTATAGGAGTCAGCATGGATGCACTGATTTTGATATACC----GGGCATACTTAATGTCAAGGCAGAGTGCTCCCAAGGTATTATCAGACCATTCCAAGGGAGTGACCAATAACCAATGTTGTGACGAAGATAGAAACTTGTGTTGCTTTTGCAAGAGTCAACATTATAAGAAGTATATAGGTAGGGTTGAGTCATT

a
s	mr.mrrefChr5	231166	178	+	294542	TACTTATAGTGACTGTAAATGATATCAATATTGAATGCTACTATAACATGAGGGGGTTTCTTTTTCCTCAAGGCTGTATGGATATATGTATGCCCTTCTTCCATACTTAATTATTTATTGAGGTTGGCTAAGGTTTTTGTGATCCTGGCTTAACCAGTGGACCATTGTTTGAGGAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	377606	178	+	636262	TACTTATAGTGACTGTAAATGATATCAATATTGAATGCTACTATAACATGACGGGGTTTCTTTTTCCTCAGGGCTGTATGGATATATGTATGCCCTTCTTCCATACTTAACTATTTATTGAGGTTGGCTAAGGTTTTTGTGATCCTGGCTTAACCAGTGGACGATTGTTTGAGGAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	376902	178	+	647215	TACTTATAGTGACTGTAAATGATATCATGATTGAATGCTACTATAACATGAGGAGGTTTCTTTTTCCCCAAGCCTATATGGATATATGTATGCCCTTCTTCCATCCTTAATTATTTATTGAGGTTGGCTAAGGTTTCTGTGATCCAGGGTTAACTAGTGGACCATTGTTTAAGGAAAG

a
s	mr.mrrefChr5	231344	103	+	294542	CCTGGTATGCCTAGATGTGATTCCATCCAATCCTTTAATGGCATTAGCTTGCCCTCAATTGAAATGAGCATCGGAGTTCTACAGTCAACCTTTCCTACCTAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	377784	103	+	636262	TCTGTTATGCCTAGATGTGATTCCATCCAATCCTTTAATGGCATTAGCTTGCCCTCAATTGAGATGAGCATCGGAGTTCTACGGTCAACCTTTCCTACCTAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	377090	103	+	647215	CCTGGTGTGCTTAGATGTGATTCCATCCAATCCACTAATGGCACTAGCTTGCCCTCAACTGAAAGATGCATAGTAGCTCTACAGTCAACCTCACCTATCTAAC

a
s	mr.mrrefChr5	231447	273	+	294542	TATTCAGGGAGTATCTTCTGTGTTTTTTTGAAGAGACTATTTTCCGCTGGGATCGACTGTTGTAATGGACACTCAAGTAACTGGTAAACCTGAGCAGTAGTCAGGCATGCATGAAACGGTCTTACTAAGTTGTTGCAGGGCATTCTAGCCATGAAAATGCACCAATTAGTGGGGAGACCATTTTTTTAGGCAGAAACTTGTGTCTGGTTTTTTAGGCTGAAACTCATGTTGGTTTGCTGTACAAGAGTAAATATCTAATATCAGCATAGAGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	377887	261	+	636262	TATTCAGGGAGTATCTTCTGTGTTTTTTTGAAGAGACTATTTTCCGCTG------------GTAATGGACACTCAAGTAACTGGTGAACCTGAGCAGTAGTCAGGCATGCATGAAACGGTCTTACTAAGTTGTTGCAGGGCATTCTAGCCATGGAAATGCACCAATTAGTGGGGAGACCATTATTTTAGGCAGAAACTTGTGTATGGTTTTTTAGGCTGAAACTCATGTTGGTTTGCTGTACAAAAGTAAATATCTAATATCAGCACAGAGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	377199	262	+	647215	TATCTAGAGAGTATCTTCTGTGTTGTTTTGAAGAGACTATCTACCAATGGGATCGACTGTTGTAATGGACACTCAAGTCGCTGGTAGACCTGAGCAGTAATCAGGCATGCATGAAACAGGCTTACTAAGTTG----------TTCTTGCCATGAAAATGTACCAATTAGTGAGAAGACCATTTTTCTAGGCCGAAA-TTGTGTCTGGTCTTCTAGGTAGAAACTTGTGTTGAGTTGCTGTACAAGGATAAATATCTAATATCAGAATACAGTG

a
s	mr.mrrefChr5	231720	18	+	294542	CTATAATATGAGATTAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	378148	18	+	636262	CTATAATATGAGATTAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	377467	18	+	647215	CTATTATATGAGACTAAA

a
s	mr.mrrefChr5	231738	253	+	294542	ATGTCTTTGTACAGGCTGTGTTCTTAATTGATTTATCATAGTGCAGTGTGACTGCACAGAGGAATACCAGGTTACTCCAAGTCAAGGATTTTCCCCAGCAAGTGTTTAGTGTACAAAGGGTACATGCGTAATGTTGTTATCATATTAAGTAGTGCAAGCAGTTGGGGTAATACAAGTAGTATGTCCTACACACATTTAACAGTTGGGCAGGTGAGTATTTAACAGTTGGGCAATCGAGTGGGTGCAACCATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	378166	253	+	636262	ACGTCTTTGTACAGGTTGTGTTCTTAATTGATTTATCATAGTGCAGTGTGACTGCACAGAGGAATACCAGGTCGCTCCAAGTCAAGGATTTTCCCCAGTAAGTGTTTAATGTATAAAGGGTACATGCGAAATGTTGATATCATATTAAGTAGTGCAAGCAGTGGGAGTAATACAAGTAGTATGTCCTACACACATTTAACAGTTGGGCAGGTGAGTATTTAACAGTTGGGCAATCGAGTGAGTGCAACCATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	377487	253	+	647215	ATGTCTTTGTACCGGCTGTGTTCTAAGTGGATCTATCATAGTGCAGTGTGGCTGCACAGAGGAACACAAAGCTACTCCAAGTCAAGGATCTTCCCCAGCAAGTGTTTAGTGTACAAAGGGTACATGCGTAATGTTGTTATCATATTAAGTGGTGCAAGCAGTTAGGGTAATACAAGTAAGATGTTCTACACACATTAAACAGTTGGGCACATGAGTATTTAACAGTTGGGCAGGTGGGTGGGGGCAACCATTC

a
s	mr.mrrefChr5	231991	16	+	294542	AACGCCCAAATAAAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	378419	16	+	636262	AACGCCTAAATAAAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	377746	16	+	647215	AACACCCAAATAAGGC

a
s	mr.mrrefChr5	232007	207	+	294542	AGATAATGTGTTCCAGAATAATGGGTTAAAATTAAGGGATGAGGACAGTCCCTGAATAGGCTGCAAGGATTTTGGGGAAGTAGTACCAAAGCTGATGTGTGGTTCATAACATAGAAGCTATGAAACTTGGAATAATGAGCAAGTGATTGTTCTTGTAAGATCCGAAGGCTGGGGAAGAGGAACATCTATGAGGGATTGAACATCAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	378435	206	+	636262	AGATAATGTGTTCCAGATTAATGGGGTAAAATCAAGGTATGGGAACAGTCCCTGAATAGGCTGCAAGGATTCCGGGGAAGTAGTACCAAAGCGGATGTGTGGTTC-TGAAATAGAAGCTATGAAACTTGGAATAATGAGCAAGTCATTGTTCTTGTAAGATCCGAGGGCTGGGGAAGAGGAACATCTGTGAGGGATTGAACATCAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	377764	206	+	647215	AGATAATGTATTCAAGAATAATGGGTTAAAATTAGGGGATCAGGCTAGTCACTGAATAGGCTGCAAGGATTTTGGGGAGGTAGTTCCAAAGCTG-TGTGTGGTTCATAACATAGAAGCTACAGAGCTGGGAATAATGAGCAAATGATTGTTCTTGTAAGATCCGAAGGCTGGGGAATAGGAACATCTATGAAGGACTGAACATCTGG

a
s	mr.mrrefChr5	232214	142	+	294542	GGGTAACGAAAAGTCCTCATACTTTGGCGAGATTAGTCTTTGGGACCACTACAGGACAATACAACAAGTGGAAGTGTATCCAGTAATGTTGGGGGGTTGGCACACCACCTGACAGTGTTAGGAGACAAGTATGTTTAGTTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	378641	139	+	636262	GGGTTACGATAAG-CCCCATACTTTGG-GAGATTGGCCTTTGGGACCACTACAGGACAATACAACAA-TGGAAGAGGATCCAGTGATGTTGGGGGGTTGGTACACCACCTGACAGTGTTAGGAGACAAGTATGGTTAGTATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	377972	142	+	647215	GGGTATCGAAATGTCCTCATACTTTTGCGAGATTAGTCTTTGGTACCACTACAGGACAATACAACAAGTGGAAGTGTATCCAGTAATGATGGGGGGTTGCCACACCACCTGACAGTGTAAGGAGAGAAATATGTTTAGTTTA

a
s	mr.mrrefChr5	232356	85	+	294542	CAATGATATTGATTAATGACCCTAGCTAAAATTCTCAGATGTCTTTATCCAGCAGGTAGATAATATTAGGTGGGTCAATCAGTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	378780	85	+	636262	CAATGATGTTGATTAATGACCCTAGCTAAAATTCTCAGACGTCTTTATCCACTGTGTAGATAATATTAGGTGGGTCAATTGGTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378218	81	+	647215	CAATGATATTGATCACTGACCCTAGCTAAAGTTCTTATATGTCTTTAACCAGCAGGTAGATAATATTAGGTGGG----TCAATTA

a
s	mr.mrrefChr5	232441	43	+	294542	GAAAGAATGGCGTGTTTTCTCAACTACTAATATAGCAATTTGC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	378303	35	+	647215	GAAGGAATGG---AGT-----GACTACTAATATATCAATTTGC

a
s	mr.mrrefChr5	232484	40	+	294542	TCCTTGTTGCCTAGCTCGCTATCTTTAGCTCTCTTATACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	378908	40	+	636262	TCCTTGTTGCCTAGCTCGCTATCTTTAGCTCTCTTATACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378338	40	+	647215	TCCTTGTTTCCTAGCTAGCTACCTTTAACTCTCCCGTACT

a
s	mr.mrrefChr5	232524	111	+	294542	GTCATACGGCCGATCTCATCCACTGCACGGCTCGTTGCTGGTGCACCGAGCGTGAACCCGACTCAAGAAATTGCAGCGAGCGGCCCTCGTCCGAAGCCCTGGCGAGCACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	378948	111	+	636262	GTCATGCGGCCGATCTCAACCACCGCACGGCTCGTGGCCGGTGCAACGAGCATGAACCCGACTCAAGAAATTGCACTGAGTAGCACTCGTCCGAAGCCCTGGCGAGCACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378388	109	+	647215	GTCATACGGCCGATGTCATCCACTGCACGGCTCGTTGCTAGTGCACC--GCGTGAACACGACTCAAGGTATTGCAGCGAGCGGCCCTCGTCCGAAGGCGTGTCGAGCACAA

a
s	mr.mrrefChr5	232635	104	+	294542	AATCCCAAATTAGCCCCCATGAGCCGCATTGTCCTAGTGGCATAGGATCTCTAGGTCCCCAAACCCCCTCTCGATCACCAACTGGTGCCGAAGACTGCACCCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379063	104	+	636262	AATCCCAAATTCGCCCCCATTAGCCGCATTGTCCTAGTGGCATAAGATCTCTAGGTCCCCAAACCCCCTCTCGAGCACCAACTGGTGCCTAAGGCTGCAGCCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378497	104	+	647215	AATCCCAAATTAGCCTCCATGAGCCGCATTGTCCAATTGGCACAGGATCACTAGGTCTCCAAGTCCCCTCTTGATCACCAACTGATGCCGAAAACTGGACCCTC

a
s	mr.mrrefChr5	232739	65	+	294542	GGTACTCTTCACAGGTCGCCCTACTCAAGCGCCCAAGGTCAATCGTTGGCCGCACATACTGGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379222	65	+	636262	GGTACTCTTCACAGGTCGCCCTACTCAAGCGCCCAAGGTCAATCCTGGGCCGCACATACTGGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378601	65	+	647215	GGTACTCTTCACAGGTCGCCCTACTCACGCGCCCAACGGCAATCGTTGGCCGCACAGACTGGGTG

a
s	mr.mrrefChr5	232804	35	+	294542	TGTTACCAGAGTAACTGATCGCACAAGTTATTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	321930	35	+	636262	TGTTACCAGAGTAACTGATCACACAAGTTATTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379414	35	+	636262	CGTTGCCGAAGTAACTGATTGCACAAGCTATATAG

a
s	mr.mrrefChr5	232839	13	+	294542	AATGTTATTGCGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379472	13	+	636262	AATGTTATTGCGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378666	13	+	647215	AACATTACTGCGA

a
s	mr.mrrefChr5	232852	15	+	294542	AAAAAAATAATATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379485	15	+	636262	AAAAAAATAATATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378679	15	+	647215	AAAAGAATAATATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	193946	15	-	647215	ACGATCATAAGATTT

a
s	mr.mrrefChr5	232867	9	+	294542	CCAAAAGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379500	9	+	636262	CCAAAAGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378694	9	+	647215	CCAACAGGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	193964	9	-	647215	CTTAAAGGG

a
s	mr.mrrefChr5	232876	40	+	294542	TGTTGTACAACATACTGTTTTGTTTTGATCCCACGGGCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379509	40	+	636262	TGTTGTACAACATACCATTTTGTTTTGATTCCATGGGCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378703	40	+	647215	TGCTTTACAACAAACTGCTTTGTCTCAATCCCACGGACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	193976	30	-	647215	TGTTGTTGGAGACACTG----------ATCACACAAGCAT

a
s	mr.mrrefChr5	232916	4	+	294542	TTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	321965	4	+	636262	TACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379549	4	+	636262	TTCA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	194006	4	-	647215	TTCA

a
s	mr.mrrefChr5	232920	75	+	294542	TAGGCACCTGCCCCTATAATACAATCTGTTTCGTATGCTCCTTCACACTGTATGAGGTTTACCTGACTAATTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	321969	75	+	636262	TAGGCTCCTCCCACTATAATACAATTTCTTTTGTGTGCTCCTTCACACTGTATGAGGTTTACTTGACTGATTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379553	72	+	636262	TAGGCACCTGCCCCTATAATACAACCTGTTTCGTATGCTCCTTCAAACTGTGTGAGGTTCACCTG---AATTTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378747	75	+	647215	TATGCACCTGCCCCTATAATACAATCTGTTCCGTATGCTCCTTCCCACTGTATGAGGTTTACCTGACTAACTTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194017	71	-	647215	TAGGACTCTGACTCTA--ATACAATCAATTTCTTACGCTCCTTCATACCGA--GAGGTTTACCTGGCCGGTTTTT

a
s	mr.mrrefChr5	232995	27	+	294542	TCCTTTTACTTGAATGTTCCTGTCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	322044	27	+	636262	TCCTTTTACGTGAATGTTCTTGTCCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379625	27	+	636262	TCCTCTTACTTGAATGTTCCTGTCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378822	27	+	647215	TCCTTTTATTTGAATGTTCCAGTCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194095	27	-	647215	TCCTTTTACTCAAATGTCCCTGTGCTT

a
s	mr.mrrefChr5	233022	6	+	294542	CATACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	322075	6	+	636262	CATACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379652	6	+	636262	CATGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378849	6	+	647215	CAACCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194122	6	-	647215	CAAACA

a
s	mr.mrrefChr5	233028	1	+	294542	A
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	322081	1	+	636262	A
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379658	1	+	636262	A
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194128	1	-	647215	A

a
s	mr.mrrefChr5	233029	35	+	294542	TACAAGGTTTACTTGACTGTTTTTGTTCCCTCACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	322082	35	+	636262	TATGAGATTTACTGGACTGTTTTTATTCCCTCACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379659	35	+	636262	TACAAGGTTTACTTGACTGTTTTTGTTCCCTCACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378855	35	+	647215	TACAAGGTTTACTTGACTGTTTTTGTTCCCTCACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194129	35	-	647215	TATAAGGTTTACTTGACTGTTTTTGTTCCATCACC

a
s	mr.mrrefChr5	233064	8	+	294542	ATATTAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	322117	8	+	636262	ATCTTAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379694	8	+	636262	ATATTAGG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	194237	8	-	647215	ATATTAGG

a
s	mr.mrrefChr5	233072	7	+	294542	TGTATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	322125	7	+	636262	TGTATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194245	7	-	647215	TGTACTT

a
s	mr.mrrefChr5	233079	27	+	294542	GAAGGTGGCACTTCTGAGTATGGCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	322132	27	+	636262	GACTGTCGCACTTCTGATTATTTCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379702	27	+	636262	GAAGGTGGCACTTCTGAGTATGGCCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378898	27	+	647215	GAGGGTGGCACTTCTGAGTATGGCCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194252	27	-	647215	GAAGGTGGCACTTTTGAGTATGGCCGT

a
s	mr.mrrefChr5	233106	6	+	294542	TTTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379729	6	+	636262	TTATGC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	194279	6	-	647215	TTTTGT

a
s	mr.mrrefChr5	233112	28	+	294542	ATGCTTCTCCACAATATTAGATTTTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	322159	28	+	636262	ATTCTTCTCCACAATATTAGATTTCTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379735	28	+	636262	ATGCTTCTCCACGACATTAGATTTTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378931	28	+	647215	ATGCTTCTCCACAATATTAGATTTGCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194285	15	-	647215	GTGCTTCCCCACTAT-------------

a
s	mr.mrrefChr5	233140	44	+	294542	ATTGTCTGTCTTATGGCTCTTCAGAGTATCACTGCTGGCCCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	322203	44	+	636262	ATTGTGTGTCTTATGTCTCCTCAGAGTATCACCGCCGGCTCTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379763	34	+	636262	ACTT----------GGCTCACCAGAGTATCACTACTGGACCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	378959	44	+	647215	ATTTTCCATCTTATGGCTCTTCAGAATATCAGTGCTGGCTCTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194300	29	-	647215	-TCGTCTGTGTTATGGCTTTTCAGA--------------CCTTT

a
s	mr.mrrefChr5	233184	14	+	294542	ACTGCTGGCCTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379797	14	+	636262	ACTGCTGGCCTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	379003	14	+	647215	ACTGCAGGCTTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194329	14	-	647215	ACCACTGTTCCTTT

a
s	mr.mrrefChr5	233198	22	+	294542	TCGTATGCTTCTCCACTATATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	322247	20	+	636262	CCGTATGCTTCTCCACTGTA--
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379811	18	+	636262	TCGTACACTTATCCAGTA----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	379017	22	+	647215	ACATACGTTTCTCCGGTTTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194343	22	-	647215	TCGTGTGCTTTTCCCCTATATC

a
s	mr.mrrefChr5	233220	35	+	294542	AGGTTTTTTAATCGTCCTTCTTATGGCTCTTCAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379829	35	+	636262	AGGTTTTTTAATCGTCCTTCTTATGGCTCTTCAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	379039	35	+	647215	AAGTTTTTTAATTGCTCTTCTTATGGCTCTTCAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194365	26	-	647215	GGGTCTC---------CTTCTTATGGCTCTTCAGA

a
s	mr.mrrefChr5	233255	37	+	294542	GTATCACCCCCACTCACAGTTCAGATATCAACCGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379864	37	+	636262	GTATCACCTCTCCTCACAGTTCAGATATCAACCGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	379074	37	+	647215	GTATCACCCCCACTTTCAGTCCAGAAATCAACCACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194392	14	-	647215	GTATCGGCCCCACT-----------------------

a
s	mr.mrrefChr5	233292	11	+	294542	ATCCCTTACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	322267	11	+	636262	ACCACTTAAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379901	11	+	636262	CTCCATTGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	379111	11	+	647215	CTCCATTACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194406	11	-	647215	ATCCCTTGCAC

a
s	mr.mrrefChr5	233303	5	+	294542	GCATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379912	5	+	636262	GCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	379122	5	+	647215	GCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194417	5	-	647215	GTGTG

a
s	mr.mrrefChr5	233308	18	+	294542	ACCCATCCCCCCCTACaa
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	322278	18	+	636262	ACCCATCCCCCCCTAAaa
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379917	18	+	636262	ACCCATCCCCCCCTAcaa
s	simRat_chr6.simRat.chr6	379127	18	+	647215	GCCCATCCCCCCCTACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194422	10	-	647215	--------TCCCTTACAA

a
s	mr.mrrefChr5	233326	19	+	294542	tcttattgggacgagctga
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	322296	19	+	636262	tcttattggaatgagctac
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	379935	19	+	636262	tcttattgggacaagctga
s	simRat_chr6.simRat.chr6	379145	19	+	647215	Tcttattgggacgagctga
s	simRat_chr6.simRat.chr6	194433	19	-	647215	TCTCAAGAGGACAGGTAGa

a
s	mr.mrrefChr5	233345	1	+	294542	a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	242687	129	+	294542	TCCATGCTAGCAAAAGGGTGACATTCATGGACTCAGATCAGGGATTTTGATGCCATATCCCCTGTTTGGGTCTCTCCCATCTTGGGTCAAGCCCACATCCACTTGGCCCTTTTAGAGCTCAGTTTATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	388864	129	+	636262	TCCATGCTACTAAAAGGGTGACATTCATGGAGTCAGATCAGGGATTTTGACGCCATATCGCCTGTTTGTGTCTCTCCCATCTTGGGTCAAGCCCACATCCACTTGGCCCTTTTAGAGCTTAGTGTATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	388832	129	+	647215	TCCATGCTAGCAAAATGGTGACATACATGGACTCAGATCAGGGATTTTGATGCCATATCCCATGCTTGGGTCTCTCCCATCTTGGGTCGAACCCGCATCCATTTGGCCCTTTTAGAGCTCAGTTTATCA

a
s	mr.mrrefChr5	242816	9	+	294542	AGGTTCACC
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a
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a
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a
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	389224	40	+	636262	TGAGTATGTCCGGGAGGACTATTTAGCAGTTCAATCATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	389177	40	+	647215	TGCGTACGTCCCGGAGGACTATTCAACAGTTCAAACAGTG

a
s	mr.mrrefChr5	243076	29	+	294542	CTCAGTATTGCACACCTGTAAGTTCAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	389264	29	+	636262	CTCAGTATTGCACACCTGTAAGTTCAAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	243105	27	+	294542	ATCCATTTTTTTTCTGCCACTCAGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	389293	27	+	636262	ATCCATTTTTTTTCTGCCACTCGGTAT
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a
s	mr.mrrefChr5	243132	271	+	294542	TCTTCTGCCATTTAGATAAGACCAACCTGGCATGCAAAGAGTGACTGGTATGTGATTTGAGATCTAGGACTGTGCTACCTTGTCTGTCTGCTTCCACCTTGCTTGTAGTTGTCATGACGACGTCACCCCTTGATATACTTCAATAATAGATTTAATATTCACTTCAGTCTTTCCCTTCAGCCTAAAAGCTTCTCAGAGTTCAACACTGTTTTCTCTACTGTAAATACCCTGCCACCTATTTGTTTGGCTCTGGCTACCATGTGTTCAAACT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	389381	250	+	647215	TCTTTTGCTGTTTAAATAAGATCAGCCTGGCATGCAAAGAGTCACAGATATGTGAATTGGGATCTAGGACTGTACCACCTCTTCTGTCTGGTTTCACCTTGCTCGTAGTTGTCATTATGATGTCACCCCTTGATATACTTCAATAATAGATTTAATATTGACTTCAGTCTTTCCCTTCTGCCTAAAAGCTTCTCAGAGTTCAACTCTGTTTTCTCTACTTTAGATACCCTGCCACCTATTTGTTTAGCTT---------------------

a
s	mr.mrrefChr5	243403	181	+	294542	AGTTGAGTCTGAGAAGTCATTCTAAGATACTATTTATTGAACATGGGTGAATTCTCCAAAAGTCAGTTTAATTCTCTGTCACTCATGTGCTCCTGCTGTGAAATGATGGTGCTGATGGTGATCCATGCTGTGGAACAATGGGGCTCATGGTGTGCTACATCCAGAACTGCCCAATGCTCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	389594	181	+	636262	AGTTGAGTCTGAGAAGTCATTCTAAGATACTATTTATACAACATGGGCGAATTCTCCAAAAGTAAGTTTAATTCTCTGTCACTCATGTGCTCCTGCTGTGAAATGATGGTGCTGATGGTGATCCATGCTGTGGAACAATGGGGCTCATGGTGTGCTACATCCAGAACCGCCCAATGCTCTC
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a
s	mr.mrrefChr5	243584	325	+	294542	AGTTCTTGGTCGTAGGTGCACTCAATTCTTGTTTGTGACTTCCCTTTTTTGGTGGAGTTACTGCACTTTGTAATTCTAACATATGTTAAGAGCTGGCAGGCTATGACAATATGTACTGGCCATTTGGAAAAGGTCTGTCAACGATCCTCTAGCTACAATGATTTCTGATCCTAATTAACCCAACAATGACATTACTTTTATTAAGATGACATAACAAGAGAGGAGACTGCAATTCCTTGGATGGTTTGATAGAGATCACGAATTGTTCAGCGGTCCAGCTCACCAGCTTCAACCACCATCTGAGTGATGTACACATGAGAGATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	389775	325	+	636262	AGTTCTTGGTCGTAGGTGCACTCAATTCTTGTTTGTGACTTCCCTTTTTTGGTGGAGTTACTGCACTTTGTAATTCTAACATATGGTAAGAGCAGGCAGACTATGACAATATGTACTGGCCATTTGGAAAAGGTCTGTGAACGATCCTCTAGCTACAATGATTTCTGATCCTAATGAACCCAACAATGACATTACTTTTATTAAGATGACATAACAAGAGAGGAGACTGCAGTTCCTTGGATGGTTAGATAAGGATCACGAATTGTTCAGCGGTCCAGCTCACCAGCTTCAACCACCATCTGAGTGATGTACACATGAGAGATAG
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a
s	mr.mrrefChr5	243909	265	+	294542	AGTAAGTCCTTTGGACTATAACTTCATTCTACATGTATGCTGTAGGTGGCATATAATCCTTGGTGCTCTGAGGCATTGTATTTCCTGCCTATGGCTAGATTATTGGTACTTCCAGTATATTTCCATTCTATGGCTAGATTCTTGGTACTTCCAGTACTAGGAGGCTAATATTATTGGTCCATATGGGTAGCTAGATGAGGCACAAGTGGGCAGGCTGATGAGCCACAATGTGTGAAGCTCAAGATTATGCACTGATGCCCTCAGT
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a
s	mr.mrrefChr5	244174	249	+	294542	ATTAGGTGTAGAAGTTAAATCACATAATTCAATTACCATACTGCTAGGGCACTGAAGTATGCCCAGAAAACCCATTACATGTGCTTTTTCTAGGGATGGCTCTACATACACAAGAGTATGTTTGGCTTGTTTCAACCCTAGAAATGTAATAATTAATGAATGCCCACATGTACCCAAGACTGAAATCAGTACCAATTCTTTCCTGTAAAGCTGTAATAATCTTTTTGGATAGGAAGGTCTGAAAAGTCT
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a
s	mr.mrrefChr5	244423	25	+	294542	GTGTACCCCAACTCATAAACCTTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	390707	25	+	636262	GTGTACCCCAACTCATAAACCTTGC
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a
s	mr.mrrefChr5	244448	356	+	294542	ATTCCACTGGACTCATAGGGAACATGTAAAATGCAGGCAAAATATGGGTAAGTTACATGCTAGGTTTCCAACTACTAGCATCTGTGCATCAATACTATGTGTTCCTACTATCTCCCCAGATATGATGGAAAACTCTAAAGCAGAGAACTTGCTGGAGACCAAATACCAATACAACCCTTCTGCAGACCATAGGTGTTCACTTCTATGCAAGGGCAAGCTGGTCCAGAATGATTTTTAGGACTATGGGACATCTGTAATATGTTTATGCGTGAGGGGGACTTAGGCTTCTTTGTAGTAGTCATTAGGATGGAGATGATTCTAGTGTACAATGTATATTGCGCCAACACAGGCTCCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	390733	356	+	636262	ATGCTGCTGGACTCATAGGAAACATGTAAAATACAGGCAAAATATGGGTAAGTTACATGCTAGGTTTCCAACTACTAGCATCTGTGCGTCAATACTATGTGCTCCTACCATTTCCCCACATATGATGGAACACTCTAAAGCAGAAAACTTGCTGGAGACCAAATACCAATACAACCCTTCTGCAGACCATAGGTGTTCACTCCCATGCAAGGGCAAGCTGGTCCAGAATGATTTTTAGGACTATGGGACATCTGTAATATGTTTATGCGTGTGGGGGACTTAGAGTTCTTTGTAGTAGTCATTAGGATGGAGATGATTCTAATGTACAATGTATATTGCGCCAACACAGGCTCCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	390652	354	+	647215	ATTCCACTGGACTCATAGGGAACATGTAAAATGCAGGCAACATGTGGGTAAGTTACAAGCTAGGCTTCCAATTAGTAGCATCTGTGCATCAATACTATGTGTTCCTACTATCTCTCCAGATATGATGGAAAAATCTAAAGCAGAGAACTTGGTGGAGACCAAACACCAATCCAACTCTTCTGCAGACCATAGGTGTTCATTTGTATGCAAGGGTGAGGTGGTCCAGAATAATTTTTATGACTATAGGACATCTATAGTATTTTTATGTATGAGAGGGACTTAGGCTTCTCTGTAGCAGTCATTAGGATGAAGATGATTCTAGTGTCCAATGTATGTTGCATCAACACAGGC--TCC

a
s	mr.mrrefChr5	244804	179	+	294542	AACCAGTGCTCTGCAACTTCTGTGCTTGACATTGACTAGACTTGAACAGTTCACTTGTTGCTGCCCAAGAGCAACTTACTACTACACACTATAACTTGTTAATGAGAGCCAGTCAATCTCTACTTCCAAGCTCAGTATATAAATAAATGTTTCTCATAGGGCCTGCATGAAAAATCACA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	391007	178	+	647215	AACCAATGCTCTGCAACTTTCGTGTTTACCATTGACTAGGCTTGAACAGTTCACTTGTTACTGCCCAAGAGCAACTTACAACTACACACTATGACTTGTTAACGAGAGCCAGTCAATCTCTCCTACCAAGCCCAGTATATAAA-AAATGTTTCTCATAAGGCCTGCATGAAACACCACA

a
s	mr.mrrefChr5	244983	134	+	294542	CGCAATGCCAGCTTTCCTATGTGTTTCCCCTATTAATTGCCTCTTTTCCTCATTCTTTATTAAATGTATGATTAAGCAACACATATGCATGAGAATAAGACTTTGTTTCCTAATAGCACGTCATTGGCTGTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	391266	117	+	636262	CGCGATGATGCCTTTCCTATGTGTTTCCCCTATTAATCGCCTTTTTCCCTCATGCTTTACTAAATATATGATTCAGCAACACATATGCATGAGAGTAAGATTTTGTTTCTTAATAGA-----------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	391186	134	+	647215	TGCAATGCCAGCTTTCCTATGTGTTCCCCCTATTAATTGCCTCTTTTGCTCATTCTATATTGAATGTATGATCAAACAACGCATATGCATGAGAATAAGACTTTGTTTCCTAATAGCACGTCATTGGCTGTTGT

a
s	mr.mrrefChr5	245117	34	+	294542	TGGTGGTATCTAGGCAAAATTAACCTTGGCTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	391322	34	+	647215	TGGTGGTATCTAGGCAAAATTAACCTTGGCTGAA

a
s	mr.mrrefChr5	245151	10	+	294542	TCTGGGAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	391383	9	+	636262	-CTGGGGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	391357	10	+	647215	TCTGGGAACT

a
s	mr.mrrefChr5	245161	108	+	294542	AAGTTGACCCTGGGAATGATCTTGAGCATCATGATCTAGTACGTGTGGCCACACTGTAGGTACTAATTAGCTATTACTGCACTTAATTTATTAAGCCTGGCAAGGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	391394	108	+	636262	TAGTTGACCCTGGGAATGATCTTGAGCATCATGATCTAGTACGTGTGGCCACACTGTAGGTACTAATTAGCTATTACTGCACTTAATTTATTAAGCCCGGCAAGGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	391367	108	+	647215	AGGTTGACCCTAGGACTGAACTTGAGTATCATGATCTAGTACGTGTGACCAGACTGTAGGTACTAATTAGCTATCACTGCACTTAATTTATTAAGCTTGGCAGGGTCA

a
s	mr.mrrefChr5	245269	195	+	294542	TGTCATACACTTTTATGGCATACTAGTTACAGACTAGAACCACTCCTCGTGGCTTACTTGGGGTTAGTTGGGGGTGATTCACTTGACATTATCCTGTACAATATTTGAGCCTGAAACATATTTGCTCCACACGCGACTTGCCTGAAAATGTAAGGAATACAATTAAAACAATATAGCTACCAATGGGCACTTTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	391511	191	+	636262	TGTCATACAC----ATGGCATACTGGTTACAGACTGGAACCACTCCTCATGGCTTACTTGGGATTAGGTGGGGGTAATTCACTTGACATTACCCTGTACAATATTTGAGCCTGAAACGTATTTGCTCCACACACGACTTGCCTGAAAATGTAAGGAATACAATTAAAACGATATGGCTACCAATGGGCACTTTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	391475	195	+	647215	TGTCTTACGCTTTTATGGCTTACTAGTTACAGACTAGAACCACTCCTGGTGGGATACTAGGGGTTAGTTGGGGGTGACTCACTTGTCATTATCCTGTACAATATTTGAGCCTGAAACACACTTGTTCCACACGCTACTTGCCAGAATGTGTAAGGAATACAATTAAAACACTATAGCTACCAATGGGCACCTtgc

a
s	mr.mrrefChr5	245464	54	+	294542	TGAGGGTGTCTAGGCCATTTGCATTGGGATCTATTGCTTATATCCTGCTTAAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	391702	54	+	636262	TGAGGATGTGTAGGCCGTTTGCATTGGGATCTATGGCTTATATCCTGCTTACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	391875	54	+	647215	TGGGGGTGTCTAGGCCATTTGAGTTGGGATCTATTGCTTATATCATGCTTCAAA

a
s	mr.mrrefChr5	245518	284	+	294542	TAATAAGAAAGCATCATGCATGCAGTAAGGGATCATACTACATTACACATAGCAAGATGGAGTATTGACTCCCTTTATTTGATTAGGCCATCTGAAGTCAACACACCAGACAGGCAGTACTTGAACTAGAAGCTTTACAAATTCTGCTTCTTAGTGCACGGTGACGGGTCTGGCAAGCGAGACACTCCTGATCTTGGTTGCTACATGATAGCGCTTACCCACGACTCCGTCTCATACAACGACGAAAAGTAATGGGCGTTCGGTCTAGGAATTTTTCCAGGAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	391756	284	+	636262	TAATAAGAAAGCATCATGCATGCAGTAAGGGATCATACTACATTACACATAGCAAGATGGAGTATTGACTCCCTTTATTTGATTAGGCCATCTGAATTCAACACGCCAGACAGGCAGCACTTGAACTAAAAGCTTTACAGATTCTGCTTTTTAGTGCCCGGTGACGGGTCTGGCAAGCGAGACACTCCTGATCTTGGTTGATACAGGATAGCGCTTACCTACGACTCCGTCTCATACAACGACGAAAAGTAATGGGCGTTCGGTCTAGGAATTTTTCTAGCGGT
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a
s	mr.mrrefChr5	245802	51	+	294542	GAATACTTCAACCAAAAAGAGCTGAAGGCGCGGAGGTTATAGACAGCAGAG
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a
s	mr.mrrefChr5	245853	129	+	294542	CACAGACATGACCACTGGGTCACAGCTGCTAGGGTTCAACCATTTCAACACATAGTCCCCATCACAGATTATCTGCATCTCAAATCGTCGACACCTAATTTCCGGGTGGCACTCCTTCTTGGAGCACTC
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a
s	mr.mrrefChr5	245982	100	+	294542	GAACCCTCCGAGTCAGCCATGCCGATTTTCTGATGACGCAATACACCCGGTGTCCAAGGCTTCGTGTGCGTGAATTGGCTCACCGTGGGGATTGCCCCGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	392221	100	+	636262	GAACCCTCCGAGTCAGCCATGCCGATTTTCTGATGACGCAATACACCCGGTGTCCAAGGCTTCGTGTGCGTGAATTGGCTCACCGTGGGGATTGCCCCGT
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a
s	mr.mrrefChr5	246082	8	+	294542	CCCTTAGT
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a
s	mr.mrrefChr5	246090	184	+	294542	AAAAGCAAGCTCTGGTAAGGTCTGTAAATTACCCTTGAGTGAACTAGAACAGGTAGAATGAACAGGTAGTATAGAACTGTGCAATGAAAAAAGAATTTTTGAGTGCCAATTGTTGTCCTTCAGTCTTGAAAGACATGCATTAGTAAGGATACTCCTCTTCCTCTGTGTTCTACATCCAGAGGCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	392348	184	+	636262	AAAAGCAAGCTCTGGTAAGGTCTGTAAATTACCCTTGAGTGAACTAGAACAGGTAGAATGAACAGGTAGTATAGAACTGTGCAATGAAAAAAGAATTTTTGAGTGCCAATTGTTGTCCTTCAGTCTTGAAAGACATGCATTAGTAAGGATACTCCTCTTCCTCTGTGTTCTACATCCAGAGGCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	392524	184	+	647215	AAAAGGATTCTGTGGTAAACACTGTATATTATCCTTGGGTAGAATAGAACAGGTAGAATGAACAGGTAGTATAGGACTGTACAATGAAAACAGAATTTCTCAGTGCCAAATGTGGTCCATCAATTTAGGAAGACATGCATTAGATAAGATACTATTGCGCCTCTGTGTCCTATATCCAGATGGG

a
s	mr.mrrefChr5	246274	129	+	294542	ATGAAGTGAGGAGCAAAGCCAAACACATAGTACTTTGATTCTGTGGACCTTGTTGATTCCAAATTAGCATGGCTAATCACATTGTCCCCAATCCCATTGTTCCCATTGAGTGTTTGTATCATACATCCC
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a
s	mr.mrrefChr5	246403	274	+	294542	ACATTTAGCAGCCTGATTGAAAAGATGACTAACACAACTCCGAGCTTACTAAAACTTAGTAGGAGCTCCAATATTGTTAGTAGACAAGTAGGAGATTGATGTGATTGAGACTGTCAACTAATAAATAGTCATAAAATTGATGGGATGACATCCGCAGGGATTCTAGAAGAAGGATTATTGCATTCTCTCCACATTTATTGAAGTGCAAGAGGCACCATCACTAGGTGATACACTCTTTATACCCTACAATGGCTTCCTAAAATGGTTGTGGTGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	392726	274	+	636262	ACATTTAGCAGCCTGATTGAAAAGATGACTAACACAACTCCGAGCTTACTAAAACTTAGTAGGAGCTCCAATATTGTTAGTAGACAAGTAGGAGATTGATGTGATTGAGACTGTCAACTAATAAATAGTCATAAAATTGATGGGATGACATCCGCAGGGATTCTAGAAGAAGGATTATTGCATTCTCTCCACATTTATTGAAGTGCAAGAGGCACCATCACTAGGTGATACACTCTTTATACCCTACAATGGCTTCCTAAAATGGTTGTGGTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	392838	274	+	647215	ACATTTAGCAGCCTGATTGAAAGGATGACTAACACAACTCTAAGCTTACTAAAACTTAGTAGGAGCTCCAATATTGTGAGTAGATATGTAGGAGATTGATGTGATTGAGACTGTTACCTAATAAATAGCCATAAAGTTGATGGGTTGACATCTGCTGGGATTCTAGAAATAGCATGCATGCATCCTCTCCACATGTATTCAACTGCAACTGGCACCATCACTAGGTGGTACACACTTTATACCCTTCAATGGCTTTCTGAAATGGTTGTGGTGA

a
s	mr.mrrefChr5	246677	9	+	294542	TCATAGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	393000	9	+	636262	TCATAGGTG
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a
s	mr.mrrefChr5	246686	67	+	294542	CACTATGTTAACCCTGAGCATAGCAGTAAATCCTGTTTTAGATACTATTTCACTAAGGCAAGCTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	393009	67	+	636262	CACTATGTTAACCCTGAGCATAGCAGTAAATCCTGTTTTAGATACTATTTCACTAAGGCAAGCTGAA
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a
s	mr.mrrefChr5	246753	59	+	294542	GACAGACAGAATAGAAAATCATGTGGCGCCATTGCATGCAGTCATACAATGTGCGCAAC
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a
s	mr.mrrefChr5	246812	284	+	294542	CAATGTGATGTTGCCAGTGATAGAATCACTCATAATCTCACTCACTAGCTTAGTAGTGCAATGTTTGCCTGCATAATGGGAAAAAATTATTAGAAATAGCAAAGTATAAGTTAAGTTTTATGTAGTGAAAAGGCACTGGAGTGCTACTCTCTCTTTTTGTGGATTCTCCAGTTTTTTGGGTTATTTGTTGGTTTTGTCACTGTTAGGTGGGCAGAATGCCCAGTTTACAATGTTGTGTGTATCTTAACCTAGTGATTAAGAATGGGTATGCTGGTAGGGCATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	393151	272	+	636262	CAATGTGATGTTGCCAGTGATAGAATCACTCATAATCTCACTCACTAGCTTAGTAGTGCAATGTTTGCCTGCATAATGGGAAAAAATTATTAGAAATAGCAAAGTATAAGTTAAGTTTTATGTAGTGAAAAGGCACTGGAGTGCTACTCTCTCTTTTTGTGGATTCTCCAGTTTCTTGGGTTATTTGTTGGTTTTGTCACTGCTGGGTGGACAGAATGCCCAGTTTACAATGTTGTGTGTGTCTTAACCTAGTGATGAAGAATGGGTATGCT------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	393249	284	+	647215	CAATATGGTGTTGCCAGTGATAGGATCACTCATTATCTCACTCATTAGCTAAGTAGTGCAATGTTAGCCTGCATAATGGGTGTAAATTAGTAGACATGGCAAAATATAAGTTAAGTTTTATGTAATGAAAAGGTACTAAAGTCCTACTGGCTCTTTTTGTGGACTCTCCTGTTTTTTGGGTTATTTATTGGTTTTGTCACTGTCAAGTGGGCAGAATGCCCAGTTTACAATGTTGTGCATATCTCAAACTCGTGACTAAGAATGGGGATGCTGGTAGGGCATAT

a
s	mr.mrrefChr5	247096	305	+	294542	CAACTAATCTTATCCATGGACCACATTCTGCTAAGCTCATGTCACCTCGTGTGCATGCAGCTCCTTTCTTTACCTATGGGGAATTCTAGCCCAACCAATTTCTACTTACCCCATTCTGTTGTGAATTTGGTCACATGGGATGGGTACATGTGCTTACTTCATACCTTAATTAATAATGCCACCGGTAACACTTAAGAATGCCTCTGGCAAAATTTAGCATCCAGCACAATTCATCTTAAGGCCCAATCATAGGGAGAGAAAGAAACTAGCATGGTCTATCTTAACATTGTGATCTATTCAGCACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	393423	277	+	636262	--------CTTATCCATGGACCACATACTGCTAAGCTCATGTCACCTCGTGTGCATGCAGCTCCCTTCTTTACCTATGGGGAATTCTAGCCCAATCAATTTCTACTTACCCCATTCTGTGGTGAATTTGGTCACATGGGATGGGTACATGTGCTTACTTCA------------------TACC--TAACACTTAAGAATGCCTCTGGCAAAATTTAGCATCTAGCACAATTCATCTTAAGGCCCAATCATAGGAAGAGAAAGAAACTAGCATGGTCTATGTTAACGTTGTGATCTATTCATCACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	393534	302	+	647215	CAACTAATCTTATCCATGGAGCACATTCAACTAATCTCATGTCAGCTCATGGGCATGCAGGTAGTTTCTTGACCTATGGGGAATTCTAGCTCAACCAATTCCTACTTACCTCATTCTGTTGTGAATTTGTTCACATGGGATGGGTTCATGTGCTTACTTCATACCTTAATTAATAATGCCACTGGTGACACTTAAGAACGCCTCTGGCAATGCTTAGCATCCAGCACAATTC---TTAAGGCCCAATCATAGGGAGAGAAAGAATCTAGCATGGTCTGTCTTAAGATTGTGATTTATGCAGCACT

a
s	mr.mrrefChr5	247401	228	+	294542	ATCTCTTAGGGGAAATACAACTGGACAGAGACAATATGCATATTGTTATTTTCTTATGACTATTTTTACATATCAGGCTCAACAGGAAAGAATGCCTGGGAGATGGCTGGTGCCCAATAATTGAAGATATTGTGATTAGAGAGTTAAGATTCAGATTAAGCTAGAATCTCGATCACACATAAAAATTAGAGTTACAACATCTGTACACTTCCTGCTGTTTATGTATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	393736	228	+	636262	ATCTCTTAGGGGAAGTACAACTGGACAGAGACAATATGCCTATTATTATTTTCTTATGACTATTTTTTAATATTAGGCTCAACAGGAAATAATGCCTGGGAGATGGTAGGTGCCCAATAGTTGAAGATATTGTGATTAGAGAGTTAAGATTCAGATTAAGCTAGAATCTCGATCACACATAGAAATTAGAGTTACAACATCTGTACACTTTCTGCTGTTTAGGTATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	393836	228	+	647215	GTCTCTTAGGGGAAATGCAACTGGATATAGACAATATGCATATCGTTATTTTCTTATGACTATTTTTACATATCAGGCTCAATGGGAAAGAATTCCTGGGAGATGGCTGGTGCTGAATAATCGAAGATATTGTTATTTGTGGGTTAAGATGCAGATTAAGCTAGAATCTTGATCACACATAAAACTTAGAGTTACTACATCTGTACCCTTCCTGCTGTTAATGTGTTC

a
s	mr.mrrefChr5	247629	51	+	294542	CCTGCTCTGGAGTTAACTTATTAGATGTGATTGGGAACACAATTTATTAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	393968	51	+	636262	CCTACTCGGGAGTTAACTTATTAGTTGTGATTGGGAACACAATTTATTAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	394064	49	+	647215	CCTGCTCTGGAGCTAACTTATTAGATGTGATTGGGCACACAATTTATCA--

a
s	mr.mrrefChr5	247680	77	+	294542	TTCATACTGTCTAGTATGGATGCCTCTGGATGATTAAACCCAGTATTTAGAATTAACAGCTGGTTGTGCCAAAGCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	394022	77	+	636262	TTCATACTGTCTAGTATGGATGCCTCTCGATGATTAAACCCAGTATTTAGAATTAACAGCTGGTTGTGCCAAAGCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	394113	77	+	647215	TTCATACGGTCTAGCATGGATACATCTGGATGATTAAACGCAGTATTGAGGATTAACAACTGATTGTGATAAAACCT

a
s	mr.mrrefChr5	247757	98	+	294542	GAGTGCTAAACAATGTTGTTGTCAATAAACCTGGGACAGCATACTCAGAATGGTTGTCTGTAAACTTAAAGAGTTCTTGGAATTTTCTCTGAAAGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	394099	98	+	636262	GAGTGCTAAACAATGTTGGTGTCAATAAACCTGGGACAGCATACTCAGAATGGTTGTCTGTAAACTTAAAGAGTTCTTGGGGTTTTCTCTGAAAGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	394214	98	+	647215	GAGTGCTACACAATGTTATTGTTAATAAACCTGGGATAACACACTCAGAATGGTTGTCTGTAAACTCTAAGAGTTCTTGGAATTTCCTCTGAAAGTCA

a
s	mr.mrrefChr5	247855	70	+	294542	CTCAAATGAGCAATATCATTCGGCAGAAGGAGCCCTCTTGTATTCATGGTAAAGCTTCCTTGAGAGCTCA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	394312	70	+	647215	CTCAATTGAGCAATATCATTTGGCAGAAGGAGCCCTCTTGTATTCATGGCAATGTTTCCTTGTGAGTCCA

a
s	mr.mrrefChr5	247925	11	+	294542	CCACTATTTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	394383	11	+	647215	CCACTATTTAC

a
s	mr.mrrefChr5	247936	27	+	294542	GTCCACACTATCTGTTGCTATCAATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83810	27	+	636262	GTCCACACTATCTGTTGCTATCAATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	394395	27	+	647215	GTCCACACCGTCTGGTACTATTGATAA

a
s	mr.mrrefChr5	247963	15	+	294542	GTAACCAGGGTATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83837	15	+	636262	GTAACCAGGGTATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	394448	15	+	647215	ATAACCAGGGTAGAT

a
s	mr.mrrefChr5	247978	14	+	294542	CACTGGTTCATCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	83852	14	+	636262	CACTGGTTCATCCA
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a
s	mr.mrrefChr5	247992	25	+	294542	CTAGGGCATTTACTTGTTGTAAACA
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a
s	mr.mrrefChr5	248017	5	+	294542	CCCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	394277	5	+	636262	CCCAC
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a
s	mr.mrrefChr5	248022	20	+	294542	AGGATTATGTACAATTGAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	394282	20	+	636262	AGGATTACGTACAATTGAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	394553	13	+	647215	AGGATTATGTACA-------

a
s	mr.mrrefChr5	248042	152	+	294542	CTGCAATCATAAAATTAGTTCTCCTGTTTTCAACTTCCCAACCTTGACAGTCAGGGTAGGGCTTAGAAATTTTATGTCCCAACTGCCCCCAGGGTAAGTGTGCCATCGCTGGCATATGGTTGTGACTCTGTCCAACACTTGCAGTGTCATCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	394305	128	+	636262	CTGCAATCATAAAATTAGTTTCCCTGTTTTGAACTTCCCAATCTTG-----CAGGGTAGGGCTTAGAAATTTTATGTCCCAACTGCCCCCAGGTAAAGTGTGCCATCACTAGCATATGGTTGTGACTATGTCC-------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	394566	130	+	647215	-------CATAAAATTATTTCTCCTGTTTTCAAGTTCCCAACTTTGACAGTCAGGGTAGGGCTTAGAAATTT---------------CCCAGGGTAAGTGTGCCATCGCTGGCATATGGTTGTGACTCTGTCCAACACTTGCAGTGTCATCA

a
s	mr.mrrefChr5	248194	119	+	294542	GTAATTGGCTTGCTGAAAGAAGGTGTTTAATTACTTGTAAGAGATAAACTTGATTACATGTTCTTGGTTGGCACATAACTGAAACTCTGGCATAATCCAGTGTGATCCAAGGTTCCTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	394433	94	+	636262	-------------------------TTTATTTACTTGTAAGAGATAGACTTGATACCATGTTCTTGGTTGGCACATAACTGAAACTCTGGCATAATTCAGTGTGATCCAAGGTTCCTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	394699	105	+	647215	GTAATTGGCTTGCTGAAAGAAGGTGTTTAATAACTTGTAAGAGATAAACTTGATTACATGTACTTGGTTGGCATATCACTGAAACTCAGGCATAATCCAGTGTGA--------------

a
s	mr.mrrefChr5	248313	32	+	294542	GGATAAGACACGCAACTGCCCTTAGCCAGGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	394533	32	+	636262	GGATAAGACACACAACTGCCCTAAGCCAGGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	394804	32	+	647215	GAATAAGACATGCAACTGCCCTTAGCCATGTC

a
s	mr.mrrefChr5	248345	138	+	294542	CAAGTTATCAGGCAGTGGGCCCCACAAGGGTCCGTTGATCCACATTTCGATTGGAGCATCTCCTGGGTGTCTGGGAGTGGGCAGGAAGCAGGCTTGAAGGACCCTGTTATACTGGAGGTCTTACTGCTGGGTGTCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	394571	138	+	636262	CAAGTGATCAGGCAGTGGGCCCCAGAAGGGTCAGTTGATCCACATTTCGATTGGAGCATCTCTTGGGTGTCTGGGAGTGGACAGGGAGCAGGCTTGAAGGACTCTGTTATACTGGAGGTCTTACCGCTGGGTGTCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	394836	138	+	647215	CAAGCTATCAGGCAGTGGGCCCCACGAGGGTCCGTTGATCCACATTCCTATTGGAGCATCTCCCGGGTGTCTGGGAGTGGGCAGGAAGCAGGCTTGAAGGACCCTGTTATACTGTAGGTCGTACTATTGGGTGTAATT

a
s	mr.mrrefChr5	248483	3	+	294542	ACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	394709	3	+	636262	ACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	394980	3	+	647215	GCT

a
s	mr.mrrefChr5	248486	242	+	294542	GGTGTCCTCTAACCACCATGATTTGTACTTTGTTTTTCATGTAAAGACTGGTTGCTTAACATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTTGACCCCTAAAGGATGACTGGCTAGAGCCCAACCTGAGATTTTCCTGCAGAACTCCTTTAATCAATACCACTCTACACCAGGAGGACTCTCCAGTGAAGCTACAGCCTAACATGCAGAGTACTCTCATGATGAACTTTCTCCATGAGAGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	394712	240	+	636262	GGTGTCCTCTAACCACCATGATTTGTACTTTGTTT--CATGTAAAGAGCGGTTGCTTAACATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTTGACCCCTAAAGGATGACTGACTAGAGCCCAATCTGAGATTTTCCTGCGGAACTCCTTTAATCAATACCACTCTACACCAGGAGTACTCCCCAGTGAAGCTACAGCCTAACATGCAGAGTACTCTCATGATGGACTTTCTCCATGAAAGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	394985	232	+	647215	GGTGTCCTTTATACACCATGATTTGAGCTTTTTGGTTCATGTAATGACTG----------ATATGGATTGGCAATTGAATTGTTTTTACTTCCGTTGCTAAAGGATGACATGCTAGAGCCCTACCTGAGGTTTTCCTGCAGAACTCCTTTAATCAAGACCACTCTACACCAGATGGACTCTCCAGTGAAGCCACAGCCTAAGATGCAGAGTACTTTCATGATGAACCTTCTCCATGAGAAGG

a
s	mr.mrrefChr5	248728	68	+	294542	ACCGTCCAGAGGGGTACAGACTCATATTCCCCACCCTCTTTTGAGTCCCTATTCTATCTTTCTCTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	394954	68	+	636262	ATCCTCCAGAGGGGTACAGACTCATATTCCCCACCCTCTTTTGAGTCCCTACCCTATCTTTCTCCTTT
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a
s	mr.mrrefChr5	248796	192	+	294542	GTCTCCCTTGTTTATCTTTTAGTCATCTTGGGCCAGAGGTAATTTATCATCTCCAACAACATTCAGCATTCATCTCTACCTTTTAATAGCACTGATGATTGGCACAGAGCCAATAAAAGGCTCACGCATCATGTAGGCACTCGAGAAATTAAATACAGACATAAAGACCGAATCACACAATACTAGCTCATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	395023	191	+	636262	GTCTCCCTTGTTTATCTTTTACTCATCTTGGGCCAGAGGTAATTTATAATCTACAACAACATTCAGCAGCCA-CTCTACCTTTTAATAGCACTGATGATTGGCACAGAGCCAATAGAAGGCTCACGCATCATGTAGGCACTTGAGAAATTAAATACAGACATGAAGACTGAATCACCCAATACTAGCTCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	395283	192	+	647215	GTCTCCCTTGCTTATCTTTTAGTCATCTTGGGCCAGAGGTAATTTATCATCCCCAACCACATTCAGCATTCATCTCTACTTCTAAATAGCACTGATGATTGGCACAGAGAAAATAAAAAGCTCACATATCATGCAGGCACTCGAGAAATCAAATACAGCCATAAAGACCGAATCACACAATACTAGCTCATA

a
s	mr.mrrefChr5	248988	46	+	294542	TGGAGTGACTCTGCAACATCTTCCTGCATCGGCCATGTCCAAATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	395293	46	+	636262	TGGATTGACTCTGCAACACCTTCCTGCATCAGCCATGTCCAAATTT
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a
s	mr.mrrefChr5	249034	7	+	294542	ACCTACC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	395526	7	+	647215	ACTCACT

a
s	mr.mrrefChr5	249041	20	+	294542	CACACATATACACATAGTTT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	395534	20	+	647215	CACACATACACACATTGTTT

a
s	mr.mrrefChr5	249061	449	+	294542	AAACCCAATTACTTGTTGATGAACAGTAGTTACTGTAGTACCTTGGAAAGGGCCTACTTTAATTATAACTATGAGCTTGTCTGTGAGTCAAGACAAGCTATTAGTTAATCCATTCCATGAAAGATGTAGAAGTGAAGAGAAAACATCTTTTTCAGAGCCGCAGATGAGATTATTATTTAAAAGCAAGACTATGCAAGACACTCATGTGATTGACATGGTACTGAATAAGGACAATGCTGTATTTTTGTTCTCTAGCATGTACAATACAGCCCAAGGTACTCCTTATAAAAAACCCCCATCGGTTGTTGAACCACAATTCTTTGTTCCAGTTCTACTTCCACTACTGAGAGTTAGGTTCACCACAACATAGGAGCATTGCAGAGTTCTCAGTTCTTGGCGCAATAGACAATTTGCAATAGATTTAGACTCTTGAATAAAAGAATCCATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	395366	449	+	636262	AAACCCAATTACTTGTTGATGGAGAGTAGTCAATGTAGTGCCTTGGAAAGGGCCTACTTTAACTATAACTATGAGCTTGGCTGTGAGTCAAGACAAGCTATTAGTTAATCCATTTCATGAAAGATGTAGAAGTGAAGAGAAAACATCTTTTTCAGACCCACAGATGAGATTATTACTTAAAAACAAGTCTACACTAGACAGTCATGTGATTGACATCGTACTGAATAAGGACAATGCTGTATTTTTGCTCTCTAGCATGTACAATACAGCCCAAGGTACTCCTTATAAAAAACCCCCATCGGTTGTTGAACCACAATTCTTTGTTCCAGTTCTACTTCCACTACTGAGAGTTAGGTTCACCACAACATAGGAGCATTGCAGAGTTCTCAGTACTTGGCGCAATAGCCAATTTGCAATAGATTTAGACTCCTGAATAAAAGAATCCATTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	395622	445	+	647215	AAACCCAATTACTTGTTGATGAACAGTAGTTACTGTAGTACCTTGGAAAGGGCCTACTTTAATTATAACTATGACCTTCTCTGTGAGTCAAGACAAGCTATTAGTTAATCCACTCCA----AGAGGTAGAAGTGAAGGGAAAACATCCCTTTCAGAGCAGCAGATGAGATTATTTTTCAAAGGCAAGACTATGCAAGACACTCATGTGCTTAACAAGGTACTGAATAAGTATAACGCTGTATTTTAATTCTCTAATGTGTACAATACAGTCCAAGCTACTCCTTATAAAAGGGCCCCATCAGTTCTTCAACCACAATTCTTTACTCGAACTCTAATACAACTACTGAGAGTTAGGTTCATCACAAGCGAGGAGAATTGCAGAGTTCTTGGTTCTTGGTGCAATAAATAATTTACAATAGATTTGGACTCTTGAATAAAAGAATCCTTTT

a
s	mr.mrrefChr5	249510	48	+	294542	GTGATCACCCCCAACATGTGCCCCCGTCTGATATTTCATTAAATGTCA
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a
s	mr.mrrefChr5	249558	276	+	294542	GTCCTGACTCTATCAGCAGGGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACCACAGATTAGATGAGGAAAAATGGTTTGAGCTGGTGCTTGCAATCCAACAAAAAGGACCTGCTAAATGCATGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAACATGGACCAACCAGTATCTGATACAGGTGTGGCAGAAGTAGGTCCCTACATTATGAGCAGCTATCAGCAACAGAGAAAGTCATGCATTGGATTTCACTATAGTATCCGGCCTCAAGTAATCCTCAAGTTGTTGCTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	395871	274	+	636262	GTACTGACCCTATCAACAAGGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACAATAGATTGGATGAGGAAAAATGGTTGGAGCTGGTGGTTGCAATTCGAGAAAAAGGACCTGCTAAATGCGTGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAGCATAGACAACCCAATATCTGATACGAGTGTGGCAAAATCAGGTTGCTATATTATGAGCAACTATCAGCAACAGGTGAAGTCATGTACTGGATTTCACTATAGTATCAAGCCTCATATAATCTTCAAGTTGTTGCTG--
s	simRat_chr6.simRat.chr6	396115	272	+	647215	GTCCTGACTCTATCAGCAGAGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACCACAGATTAGATGAGGAAAAATGGTTTGAGCTGGTGCTTGCAATCCAACAAAAAGGACCTGCTAAATGCCTGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAACATGGACCAACCAGTCTCT----CAGGTGTGGCCGAAGTAGGTCCCTACATTATGAGCAGCTATCAGCAACAGAGAAAGTCATGCATTGGATTTCACTATAGTATCCGGCCTCAAGTAATCCTCAATTTGTTGGTTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	396397	263	+	647215	GTCCTGACTCTATCAGCAGGGACAGTAGTTGTGAGTGGTAGACCACAGATTAGATGAGGAAAAATGGTTTGAGCTGGTGCTTGCAATCCAACAAAAAGCACCTGCTAAATGCATGCCTGTTGGGTTTGGCTGGCAAAACATGGACCAACCAGTATCT----CAGGTGTGGCAGAAGTAGGTCCCTACATTATGAGCAGCTATC---------GAAAGTCATGCATTGGATTTCACTATAGTATCCGGCCTCAAGTAATCCTCAACTTGTTGCTGAA

a
s	mr.mrrefChr5	249834	8	+	294542	TCCTACCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	396145	8	+	636262	TCCTACCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	396660	8	+	647215	TCCTATCT

a
s	mr.mrrefChr5	249842	10	+	294542	TCAAGTATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	396153	10	+	636262	TCACATATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	396387	10	+	647215	TCAACTGTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	396668	10	+	647215	TCGAGTATTT

a
s	mr.mrrefChr5	249852	77	+	294542	CTGAGTCCTATTAGGTTTTGTTTTAGTGAAAAGGAGTGAGGTGTAGTCATTTAGGTTCACTTTATGAGCTTAATGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	396163	77	+	636262	CTGAGTCCTATTAGGTTTTGTTTTAGTGAAAAGGAGTGAGGTGCAGTCATTTAGGTTCACTTCGTGAGCTTAACAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	396678	77	+	647215	CTGAATCCTATTACGTTTTGTCTGAGTGAAAAGGGGTGAGGTGTAGTCATATATCTTAACTTTATGAGCTTAATGGG

a
s	mr.mrrefChr5	249929	54	+	294542	CTTGGGCCATTTCCTTTATGTTGGTACTATAGGCAACCATTAGTTTGTCAATGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	396240	54	+	636262	CTTCAGCCATTTCCTTTATGTTGGTATTGTAGGCAACCATTAGTTTGTCAATGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	396757	54	+	647215	AGTGGGCCGTTTACTTTATGTTGGTACTATAGACAACCACTAGTTTGTTAATGT

a
s	mr.mrrefChr5	249983	64	+	294542	TTACATCATCTACTCCAGTCTGATCCTTAGTAATTATGTAATTCTTCAACACCTAAGCTTTAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	396294	64	+	636262	TTACATCATCTACTCCAGTCTGATCCTTAGTAATTATGTAATTCTTCAACACCTAAGCTTTAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	396815	64	+	647215	TTACATCCTCTACCCCGGTCTGATCCTTCATAATAACTTAATTGTTTAGCACCTCAGCTTTAGA

a
s	mr.mrrefChr5	250047	146	+	294542	TGGGTGAGTGAGATAGTATGAGTAATATGAGCATTTATTTGTTGCTCCCTGCTTATACTGTATGGTTTACCCTTGGGACAGGATCTATCAAAGAGGCACGTGTCAGGGCGCATATGCTGTTTCACTCAAACTCCACTGTAAGCCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	396369	146	+	636262	TGGGTGAGTGAGATAGTATGAGTAATATGAGCATTTATTTGTTGCTCCCTGCTTATACTGTATGGTTTACCCTTGGGACAGGATCTATCAAAGAGGCACGTGTCAGGGCGCATATGCTGTTTCACTCAAACTCCACTGTAAGCCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	396879	146	+	647215	TGAGTGAGTGAAATCGTATGAGTAGTATGAACATTTCTTTGTTGCTCCAGGCTTATACTGTATGGGTCACCCTTATGACATGATAAATCAAGGGGGTGCTCATCAGAGCGCATGTGCTCTTTCACTCAAACTTTACTGTAAACCAA

a
s	mr.mrrefChr5	250193	19	+	294542	TGACTATATCTTTTCTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	396516	19	+	636262	TGACTATATCTTTTCTATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	397025	19	+	647215	TATCAGTATCTTTTCTGTT

a
s	mr.mrrefChr5	250212	22	+	294542	AGTCAGGACCCATTTACCTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	396536	22	+	636262	AGTCAGGACCCATTTACCTGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	397044	22	+	647215	AGTCAGGACCCATTTACCTGCT

a
s	mr.mrrefChr5	250234	126	+	294542	CACTACCCACTGCCAGCAGGACAATGGATAGTAGTCAATTTCCTTCCAGGTTGAGAGCATAAGAATTGCACCTGAATCTTGTCTCAAAATCCATGACATGTTAAATAATCAGGTAATGCACCTTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	396558	125	+	636262	CACTACCCACTGCCAGCAGGACAATGGATAGTAGTCAATTTCCTCCCAGGTTGAGAGTATAAGAGTTGCACCCGAATCTTGTCTCAAAATCCATGACATGTTAT-TAATCAGGTAATGCACCCTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	397072	126	+	647215	TACTACCCACTCCTAGCGGGACAATGGATAGTGCTCAATTACCTTCCAGGTTGAGAGCCCAAGAAGTGCACCTGAATCATGTCTCAAAATTCATGACGTGTTAAATAATCAGGTAATGCACCTTTC

a
s	mr.mrrefChr5	250360	479	+	294542	CAGCATCAAGTACTTAACTCAAGACTAGGCGCTAATAAGGACTCTAAGGGTGTCTAACAACTGTTCCCATTCAATTGAGGCTTGAGCCAGTGTCAATGCATTAAGCTGTTTCGTATACTCAGCACTTGGACCAACTCAATGTCATGTTAAGTAGTACAGGTGCACTTGAGCTTAGGCATTTATTAATGCTATAAAGACTCATATGACGCTACTCCATGGAGGTTGACAGATCACAGCATATACCACTAGTTCTGGGGGGATAGTAGATGTAAATTCTTGACTCTGACTGATTGACTCGACAATTGTGTCCAGCTTGGATTTCTTGTTATGTAAATGTCTGGATAGTGATTAAGGCCTTCAATGGGGTAGTACCATCCTTTTCAGGTAAACAAGGCAGTGGACATGGGGTCCAATAAATATGGTGTGGGTTGGTGGACTTACCTCAGGATGTTGCCAAAATATAATTTTTGTTTGCTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	396792	468	+	636262	CACCATCAAGTACTTAACTCAAG--TAGGCACTAATAGGGACTCTAAGGGTGTCTAACAACTGTTCCCATTCAACCGAGGTTTGTGCCAGTGTCAATGCATTAAGCTGTCTCGTATACTCAGCACGCAGACCAACTCAATGTCATGTTAAGTAGTACAGATGC---------TAGGCATTTATTAATGCTAAAAAGACTCATATGACGCTACTCCATGGAGGCTGACAGATCACAGCATATACCACTAGTTTTGGGGGGATATTAGATGTAAATTCCTGACTCTGATTGATTGGCTCGACAATTGTGTCCTGCTTGGATTTCTTGTTATCTAAATGTCTGGATGGTGATTAAGGCTTTCAATGGGGTAGTAACATCCTTTTCAGGTAAACAAGGCAGTGGACATGGGGTCCAATGAATATGGTGTGGGTTGATGGACTTACCTCAGGATGTTGCCAAAATATGATTTTTGTTTGCTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	397198	472	+	647215	CAGCATCAAGCAATTAACTCAAGACTAGGCGCTAATCAGGGTTCAAAGAGGGTCTAACTACTGTTCCCAATCAATTGAGGCTTGAGCCAGTGTTAATGCATTAAGCTGCTT-----ATCCAGCACTTGGATTAACTCAATGTCATGTTGAGTAGGACAGGTGCACTTGAGCTTAGGCATTCAATAAT--TATAAAGACTCATATGATGCTACTCCATAGAGGTTGACGGATCATGGCATATACCATTGGCTCTGGGGCGATGGTAGATGTAAATCCTTGACTCTGCCTGATTGACTCAACAATTGACTCCAGCTTGGATTTCTCATTATGTAAATATCTGGACAGTTATTAAGGCCTTCACGGGGGTAGTACCATCCTTATCAGGTAAATAAGGCAGAGAAGATGGGGTCTGATAAATATGGTGGGGGTTGGACGAATTACCTCAGGATGCTGACAAAATATAATTTTGGCTTGCTGAT

a
s	mr.mrrefChr5	250839	21	+	294542	GTCACAGGTCACCCCACTGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	397262	21	+	636262	GTCACAGGTCACCCCACTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	397670	21	+	647215	GTCACAGGTCACTTCTCTGGT

a
s	mr.mrrefChr5	250860	204	+	294542	TTTGTGGCAGCAATTGACTTGGTACAGTGGTGCAATGATGATAGAACCTTTGTTGTGGGCTCAACATCACCCCCGCTTACTGTTCAGTTCAACAGGAAATGTTTATTAATTCATTTCCTTACAAAGTCATAATGCCAGTTAAGTCAGGCTCACAGGGTAGGTAGGTTGCATTTTGCTGTTCtaGTTCAGCTATTAGGGTGCAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	397287	202	+	636262	TTTGTGGCAGCAATTGACTTGGTACAGTGGTGCAATGATGATAGAACCTTTGTTGTGGGCTCAACATCATCCACGCTTACTGTTCGGTTCAACAGGAAATGTTTATTGATTCATTTCCTTACAAGGTCATAAGGCCAGTTAAGTCAGGCTCACAGGGTAGGTAGGTTGCATTTTGCTGTTC--GTTCAGCTATTGGGGTGCAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	397691	204	+	647215	TTGGTGGCAACAATTGACTTGATGCAGGTGGGCAATGATGATAGAACCTTTGTTGTGGGCACAACATCACCGCCGCTTACTGTTCAGTTCAACAGGAAACATTTATTAATTCATTTCTTTACAAAGTCCTAATGCAAGTAAAGTCAGGCTCACAGAGTAGGTAGGTTGCATTTTGCTGTTCTAGTAGAGCTATTAGAGTGCAAG

a
s	mr.mrrefChr5	251064	137	+	294542	GCGGCTTGGAGGTCATAGCTTTCAGACTTTTAGCTCATGAGCTCTGGAGGGTTGGCAGGGATAATGGGGGTATAAACATGGGGAGCAGAGGAAATGATGTCAGCAACACAACCAAACAACTGAAGTATAAGGTCTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	397489	137	+	636262	GCAGCTTGAAGGTCATAGCTTTCAGACTCTTAGCTCATGAGCTCTGTAGGGTTGGCAGGGATAACGGGGGTATAAACATGGAGAGCAGAGGAAATGATGTCTGCAACACAACCGAACAACTGAAGTGTAAGGTCTGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	397907	137	+	647215	GCGGCTTTGAGGTCATAGCTTTCTGACTTTTACCTTATGAGTTCTGGAGGGTTGGCAGGGATAATGGTGGTATTAACATGGGGAGTAGAGGAAATGATGTCAGTAACACAACCAAACAACTGAAGTATAAGGTCTAA

a
s	mr.mrrefChr5	251201	225	+	294542	ATGAATTCTCATATTACAGTTGAGCCCCAACCTGCATCACCGAGTATAAGAGTTTGGTGTCAAATACTATGCAGCTGATCTGCTCCAAACATACTTCCAATCAGTTCACTAGGTTAAGAATAATGGATAAGCTCTACTTGAGTTGTCTGGGAGCTTAAGTTGAACCTGAGCTAACAGTGAACCTGCATAAAATTAGGACTAAAGAGCTGTAGAGAAGGGATACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	397738	218	+	636262	CCAAATTCTCATATTACAGTTGAGCCCCAACCAGCATCACCGAGTATAAGAGTTTGGTGTCAAATACTATGCAGCTGATCTGCTCCAAACATACTTCCAGTTAGTTCACTATGTTAAGAATAATGGATAAGCTCTACTTAAGTTGTCTGGGAGCTTAAGTTGAACCTGAGCTGACAGTGAACCTGCATAAAATTAGGACTAAAGAGCTGTAGAGAAGG-------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	398044	225	+	647215	ATGAATTCTCATCTTACAGTTGAGCCCCAACATGCATCATTGAGTATAAGAGTTTGGTGGTAAATACTATGCAGCTGATCTGCTCCAAACACACTTCCAATCAGTTCCCTAGGGTAAGAATGATGGATAAGCTCTACTTGAGTTCTCTTGGAGCTCAAGTTGAACCTGAGCTAACTGTGAACCTGCATAAAATTGGGACTAAAGAGCTGTATAGAAAGGATACAG

a
s	mr.mrrefChr5	251426	101	+	294542	AGGGGATACTCAATTTGCAATTATCTCAGAAATCTTAGAAGGGAGTTACAGCAATATATCCATCTTCAATCCTTGAGACACTAGGGGTTGGGACTAGATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	397956	97	+	636262	----GATACTCAATCTGCAATTATCTCAGAAATCTTAGAAGGGAGTTACAGCAATACAACGATCTTCAATTCTTGAGACACCAGGGGTTGGGACTAGATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	398277	101	+	647215	AGGGGATACTCAATTTGCAATTATCTCAGACATCTCAGACGGGAGTTACAGCACCATATCCATCTTGAATCCTTGAGACACTAGGGGTTGGGACTACATAT

a
s	mr.mrrefChr5	251527	155	+	294542	ATATTGGAGGCAAAAAGGGGTGCATTCAAGAACAAAAAAATTCTTGCATTAAAATATACTGAATTGCACAGTACTTACCTCTTTTGATATCATTGCTATCAGCCAATATAGCAAATGAATAAAGAGCTAAGATAAGGTTGCAAAAGTGCCGATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	398053	155	+	636262	ACATTGGAGGCTAAAAGGGGTGCATTCAAGAACAGAAAAATTCTTGCACTAAAATATACTGAATTGCACAGTACTTACCTCTTTTGATATCATTGCTATCAGCCGAGATGGCAAATGAATGAAGAGCTAAGATAAGGTTGCAAAAGTACCAATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	398379	155	+	647215	ATATTGGAAGCAAAAAGGGATGCCCTCAAGAACAAAAAAATTCTTGCATTAAAATATATTGAATTGCAGAGCACTTACCTATCCTGACATCATTGCTATCAACCAATACAGCAAATAAATAAAGAGCTTAGATAAGGTTGCAAACATGCCGATAC

a
s	mr.mrrefChr5	251682	46	+	294542	AAGCCCGCAGTGGGAGGCTGCTGCATTTACAACCATTTCAGGAGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	398208	45	+	636262	AAGCCCGCCGTGGGAGGCTGCTGCATTTACAACCATTTCAGG-GCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	398538	46	+	647215	AAGTCAACAGTGGGAGGCTGCTGTGTTTACAACCATTTCAGGAGCT

a
s	mr.mrrefChr5	251728	4	+	294542	TGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	398253	4	+	636262	TGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	398585	4	+	647215	TGGC

a
s	mr.mrrefChr5	251732	189	+	294542	TGGTGGCTAGTAGTGATATATACAATTTTGGTAGGCAGCAGAGTATTCAAGACCCTTGGAAGTAGATTACATTGGCAATGACTACCATATGAGAAATGCAGGCAGTGTATTTCCCTTCAATATTCATGAGACAATAGTGCAAGTAATAATTTGTAGCCAGCAGGGCATTCAAGGAACATAGGAAGCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	398257	189	+	636262	TGGTGGCTAGTAGTGATATAGACAATTTTGGTAGGGAGCAGAGTATCCAAGACCCTTGGAAGTAGATTACATTGGCAATGACTACCATATGAGAAATGCAGGGAGTGTATTTCCCTTCAATATTCATGGAACAATAGTGCAAGTAATAATTTGTAGCCACCAGGGTATTCAAGGAACATAGGAAGTCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	398505	183	+	636262	TGGTGGCTAGTAGTGATATATATGATTTTGGTGGGTAGGAGAGTATGCAAGACCCTTGGAAGTAGATTACATTG-CAATGACTACCATATGAGAATTGCAGGCTGTGTATTTC-----AATATTCATGAGACAATAGTGCAAGTCATAATTTGTAGCCAGCAGGACATTCAGGGAACATAGGAAGCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	398589	181	+	647215	TAATGGCTAGTACTGATCTATACAATTTTGGTAGGCAGCAGAGCATTCAAGACCCTCGAAAGTAGATTACATTGGCAACCACTACCAT--GAGAAACGCAGGCAGTG-ACGCA-----AATGTCCATGAGACAATAGTACAAGTAGTAATTCGTAGCCAGCAGGGCATTCAAGAAACACAGGAAGCCTG

a
s	mr.mrrefChr5	251921	7	+	294542	CATTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	398446	7	+	636262	CATTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	398688	7	+	636262	CATTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	398771	7	+	647215	CATTTTC

a
s	mr.mrrefChr5	251928	52	+	294542	GTATATGTAAACAGCTGATTAAAGGTGGACCACACTAGACAGGATGCCATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	398453	52	+	636262	GTATATGTAAACAGCTGATTAAAGGTGGACCACACCAGACAGGATGCCATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	398695	52	+	636262	GTATATGTAAACAGCTGATTAAAGATGGACCACACTAGACAGAATGCCATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	398779	51	+	647215	GTATAT-TAAACAGCTGATTAAAGGTGGATCACACTAAACAGGATGACATAA

a
s	mr.mrrefChr5	251980	16	+	294542	TGACTTTTCAATATCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	398747	16	+	636262	TGACTTTTCAATATCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	398830	16	+	647215	TGAATATGCAGTACCC

a
s	mr.mrrefChr5	251996	72	+	294542	GGGGCATGTTTACTCATTGGTATTAGCTTAGTAATCTGGATCAGAGTAATGACATGAATGAGCCACTCACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	398767	72	+	636262	GGGGCATGTTTACTCATTGGTATTAGCTGAGTAATCTGAAACGGAGTAATGACATGAATGAGCCACTCACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	398846	52	+	647215	--------------------TATTAGCTTAGTAATCTGGATCAGAGTAATGACATGAATGAGCTACTCACAT

a
s	mr.mrrefChr5	252068	37	+	294542	TTGACCACAGCTACAGGTTAGGCATATAGCTGCTACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	398885	37	+	636262	TTGACCACAGCTACAGGTTAGGCATGTAACTGCTACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	398898	37	+	647215	TTGAGCAGAGCTACAGGTTGGGCATATAGCCGCTACT

a
s	mr.mrrefChr5	252105	108	+	294542	GAAGTGATAGACCATTCTGTTTTTACTGCAGAGCCAAGAATAAAACTGAAGGGAGTAGGGTCTTCTTCAGCGTCAACTGGTAATCAAGAGGGCAAAGTGGTGTAGACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	398922	107	+	636262	GAAGTCATTGACCATTCTGTTTTTACT-CAGAGCCAAGAATAAAACTGAAGGGAGTAGGGTCTTCTTCAGCGTCAACTGGTAATCAAGAGGGTAAAGTGGTGTAGACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	398936	108	+	647215	GAAGTGATAGACCATTCTGTTCTTACTGCAGAGCCAACACAAAAACTGAAGGGAGTAAGGTCTTCTTCAGCATCAACGGGTAATCCAGAGCGCAAAGCGGTGTCGACT

a
s	mr.mrrefChr5	252213	140	+	294542	GCTCATTGGAGTGAAGATGTGGTTAATGGACTACACCACCCCCTGACCCACCACTCCCAGATGAGGATTGTTATAGTCTTGTGTGCTAAGAGAATCCCCAGAATTTTACCCATATTGCATAATCCCCAGGTAAATTCAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	399029	140	+	636262	GCTCATTGGAGTGAAGATGTGGTTAATGGGCTACACCACCCTCTGACCCACCACTCCCAGATGAGAATTGCTATAGTCTTGTGTGCTAAGAGAATCCCCAGAATTTTACCCATATTGCATAATTCCCAGGTAAATTCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	399045	138	+	647215	GCCTATTGGAATAAAGATGTGCTTAATGTACTACACCACCCCCTGACCCACCACTCCCAGATGAGGGTTGTTAAAGTCATG-GTGCTAAGAGA-TTCCCAGAATTTTACCCATATTGCATAATCTCCAGGTAATTTCAAC

a
s	mr.mrrefChr5	252353	82	+	294542	ACCCTTCAGGATTTCATCACCAAAATTAGCACTCCTTACTTCACAATTGTATAGTGTCATAAGGTGAAGTAGAAAAGGAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	399169	82	+	636262	ACCCTTCAGGATTTCATCACCAAATTTAGCACTCCTTACTTCTCAATTGTATAGTGTCATAAGGTGAAGTAGAAAAGGAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	399184	82	+	647215	ACCCTGCAGGATTTCATCACCAAAATTAGCTCTACTTACTTCACAATTGTACAGTGTCATAAGGAGAAGTAGAAAAGTAAGT

a
s	mr.mrrefChr5	252435	38	+	294542	TAGACCTTGGTCAGCATTCTTGTCTCATAAATGTTTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	399255	38	+	636262	TAGACCTTGGTCAGCATTCTTGTCTCATAAATGTTTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	399266	38	+	647215	TAAACCTAGGTCAGCATTCTTCTCTTATAAATGTTTTT

a
s	mr.mrrefChr5	252473	271	+	294542	TTTTTCACTAAGGGGCAATCTTCCATGGTGCTCTCAGGGATTAGTATGTGAGTCACATTGCCTTCTCATACCTCTTTATACTCTTTGCTAACTTTTCATGCAAAAACCATGTTGATATCTGGACTCTAATTATTCACATTCACAGACTAGAGATCTAATTAGTGAATACCCATGGCTCAATGTAATAGAGGAGAAGACAAACTCCAACCAGACTGTCAAAGAATACTGGTAGGAAAGACAGCTACACCAATTTGATGGCAGGTGTGGCTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	399333	271	+	636262	TTTTTCATTGAGAAGCAATTTTCCATGGTGCTCTCAGGGATTAGTATTTGAGTCACATTGCCTTCTCATACCTCTTTATACTCTTTGCTAACTTTTCATGCAAAACCCATGTGGTTATCTGGACTCTAATTATTCACATTGACAGACTAGAGATCTAATTAGTGAATTCCCATGGCTCAATGTAATAGAGGAGAAGACAAACTCCATCCAGACTGTCAAAGAAAACTGGTAGGAAAGACAGCTACACCAATTTGATGGCAGATGTGGCTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	399304	268	+	647215	TTTTTCACTAAGGGGCAATCTTCCATGGTGCCCTCAGGGACTAGTATGTTGGTCAAATTGCCTTCTCATACCTCTTTATACTCTTTACTAACTTTTTGTGCAAAAACCATGTTGATATT--GTCTCTAATTATTCACATTCCCAGACTAGAGATCTAATTAGTGAATACCTATGGCCCA-TGTAATAGAGGAGAAGACAAACTCCAACCGGACTGTCAAAGAATACTGGTAGGAAAGACAGCTACACCAATTTAATAGCAGGTGTGGCGAA

a
s	mr.mrrefChr5	252744	268	+	294542	ATGAATTCTGCTAGATTATCTGAGAACTTATCAGGTGAGAGTGAGAGATGACAGATTGGGTTATTCGAGAGGCTCATGTGAGAGACAGCTGCTTGCTAACACATGATACTGGCAGTTCACAGTCACTGTAGCCTGAGGTTAGAAATCTAATAGGATCAATCTCCTCATGCAAGTTATTGATACAAACAACAAGAAGGCCTTCCATTGGATAGAAATGATGATGTCAACATACAGATAAATTTAGATTGGTTCCACTTCTAAGCCCAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	399608	268	+	636262	ATGAATTCTGCTAGATTATCTGAGAACTTATCAGGTGAGAGTGAGAGATGGCAGATTGGGTTATCTGAGAGGCCCATGTGAGAGACAGCGGCTTGCTAACACATGTTACTGGCAGTTCACAGTCACTGTAGCCTGAGGTTAGAAATCTAATAGGATCGTTCTCTTCATGCAAGTTATTGATACCAACAACAAGAAGGCCTTCCATTGGATACAAATGATGATGTCAACATACAGATAAATTTAGACTGGTTCCACTTCTAAGCCCAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	399572	268	+	647215	ATGAATTGTGCTAGATTATCTGAGAACTTATCAGGTGAGAGTGAGAGATGACAGATTAGGTTACTCGAAAGGCTCATGTGAGAGACAGCTGTTTGCTGACACAAGATACTGGCAGGTCACAGTCACTGTAGCCTGGGGTTACAGATCTAATAGGATCAATCTCCTCTTGCAATTTGTTGATACAACCAACAAGAAGGCCTTCCATTAGATAGAAATGATGAGATCAAAATACAGATAAATTTAGATTCATTCCACTTCTACGCCCAAA

a
s	mr.mrrefChr5	253012	154	+	294542	TCAGTTGCAAGACTTCACCAGTGGCCCTTGTCTATGTCTCAGTACTGGGGTCCACGGCTATCACACTATGGAGGTTATAGGATCTCAACAAGATACAGAACCTTTCTCAATTTAAAATAGGAGAGCACAAACAACAAACAAAGAGATAACAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	399879	154	+	636262	TCAGTTGCAAGACTTCACCAGTGGCCCTTGCCTATGTCTCACTACCGGGGCCCACGGCTGTCACACTATGGAGGTTATAGGATCGCGACAAGATAGAGAGCCTTTCTCAATTTAAAGTAGGAGAGCACAAACAACAAACAAAGAGATAACAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	399840	145	+	647215	TCAGTTGCAAGACTTGACTGCTAGCACTTGTCTATGTCTCAGTACTGGGGTCCATGGCCATC-CATGACGGAGGTTGTAGGATCTCAACAAGATACGGAACCTTTCTCAATTTAAAATCGGAGAGCGCAAATAATAAACAAAGAG--------A

a
s	mr.mrrefChr5	253166	19	+	294542	CCTCTCAGATTGGGTGATA
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a
s	mr.mrrefChr5	253185	51	+	294542	CTGAAGGGTATCAAAACTTTTATCTTGTGAATGCTTATAAATTTGTTTTTA
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a
s	mr.mrrefChr5	253236	15	+	294542	TAAGATAGAACACAA
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a
s	mr.mrrefChr5	253251	30	+	294542	ATTCCATTTCCATCTTGAGTCATAAATCCC
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a
s	mr.mrrefChr5	253281	265	+	294542	GGGCTCTGTTACCTAGACAGAAACTGGGGTCTAGTTCTGGCTTAGGGGGGGTGCACCCAGGCAAAATCTATAGTGGTGCATTATCAGTCAGCGAGAAAATGAACACAGACCAGGGAGTAATTGTGCTGCATAACAGGGACAGGGGATACATCTCTGAATGCATACTTCCGACCTAAAAGGAGGTGGGGGATGCTAGTCCACAGAAGCTGCCAACCCCCAACCCCCTAGGGGAAAAGCCCTGATAATATGATACAGGACACTAGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	400212	265	+	636262	GGGCTCTGTTACCTAGACAGAAACTGGGGTCTAGTTCTGGCTTAGGGGGGGTGCACCCAGGCAAAATCTATAGTGGTGCATTATCAGTCAGCGAGAAAATGAACACAGATCATGGAGTAATTGTGCTGCATAACAGGGACAGGGGATACATCTCTGAATGCATACTTCCGACCTAAAAGAAGGTGGGGGATGCTAGTTCACAGAAGCTGCCAACCCCCAACCCCCTAGGGGAAAAGCCCTGATAATATGATACAGGACACTATCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	400115	265	+	647215	GGGCTCCACTACCTTGTCAGAAACTGGGATCAAGTTCTGGCTTAGGGTGGATGCACCCAGGCGAAATCTATAGTGGTGCATTACCAGTCAGAGAGAAAATGAACACAGACCAGGGAGCAATTGTGCTACATAACAGGGATAGGGGATACATCTCAGAATGCATACTTCCAAACTAAAAGGAGGTGGGGGATGCTAGTCCACTGAAGCTGCCAACCCCCCATCCCTTAGGGTAACAGCCTTGATCATATGATACAGGACACTAGTA

a
s	mr.mrrefChr5	253546	89	+	294542	GATGGAGAGATGATTCTTTACAGGCCTACACAAAGTGTCTTTTCTGGGGACAGATCACAGTTCATTCAACAGCCTAAGGATATGTGTAT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	400387	89	+	647215	GATGGAGAGATGATTCCTTACAGGCCTACACAAAGTGTCATTTCGGGGAACGCATCACAGTTCATTCAACAGCCTAAGGATATGTGGAT

a
s	mr.mrrefChr5	253635	74	+	294542	TGACAGTGTATTTCAGCTGTATAATGATTGTTATTAGATTAATGAGAATCAAGGTATTAAATTTGATGCAAAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	400567	74	+	636262	TGACAGTGTAATTCAGCTGTACAATGATTGTTATTAGATTAATGAGGATCAAGGTATTAAATTTGATGCAAAGT
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a
s	mr.mrrefChr5	253709	97	+	294542	ATACATTGACTCATGGTAGTCAttgcttggtgtacatatcctaaagttaatgactgactgccgtcatgacctgaatgttttgaggatggggcccttc
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	400642	97	+	636262	AGACATTGACTCATGGTAGTCAttgcttggtgtacatattctaaagttaatgactgactgccgtcttgacttgaaggttttcaggatggggcccttc
s	simRat_chr6.simRat.chr6	400550	96	+	647215	ATAGTTTGACTCAGGGTAGTCAttgtttggtgtacatatcctaaagtta-tgactgactgtcatcaagacctgaatgttttgaggatggggcccttc

a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	400754	347	+	636262	gaaacttcttcctcatacctatgctcacactttttgttagcccctcaagtggttgaagttgcacctttgtaaccaaactagggtaattatatgcaatccaCTGAAAGAGAACAATGACGTGTGTTTGCCAGCCTGCTAAGTGGAATGGGCCAAGGTTGTGAATAGGATTAAGAGAAATATGTGCAAAGAACACTAAAAAAGGTACAAAGAACAAAGAAACATATGCTGTGCTTCCTAATAAGCACCTTTGCTCCAGTACAGATGTTTGTGATAGCTGTGAGGTGGAAATATCATGATATGTCTGAGACTTTAGTAAGTAGTGAGCTCGTTCTGGTAAGGGGAAAAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	400646	346	+	647215	aaagcttctttcatgtacatatgctcacattttttgttaacccctcaagtagttgaagttgcacctttgtaaccatactagggtagttatatgcagtccactgaatgagaacaataacatggGTT-GCCTGCCTCTTAAGTGGAGTGGGCCAATGTTATGAATAGGATTCAAAGAATTATGGGCAAAGAATACTAAAAAAGATACAAAGAACGATGAAACATATGCTGTGCCTTCTAATAAGCACTTTGGCTCCAGTACAGGTATTTGTGATAGCTGTGAGGTGGGAATATCATCATATGTCTGAGACTTAAGTAAGTGGTGAGCTTGTTCTGGTAAGGGGAAAAAA

a
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a
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a
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	401308	211	+	636262	AACCATGATTGCCATTAAGGCTCCTATTGCTCTGTCTTAAATAATAAAGGGATACCCCTCCTCACCTGGGGTGTTATGTAATTGCATTTCATCCTTTCTACTGTGCTCTAACATATGTTACACTAAAGTGCTATT--AGTGACCTGGAGTTACCTTACATTATAATTATAAAAAGTTACCTGGAAGCAGAATGTCCTTAAGGAAACTCTGTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	401187	213	+	647215	AACTATGATTGCCATTAAGGCTCCTATTGCGCTGTCTTATGTCATAAGTGGTTAACCCACCTCAACTGGGGTGTTATGTAATTGCACTTCATCCTTTCTACTGTGCTCTAACATATGTTACACTAAAGTACTATTTGAGTGACCTGGAGTCACCTGATATTATTACTTTAAGAAATTACCTGGAAGTAAGATGACCTTAGGGAAACGCTGTAT

a
s	mr.mrrefChr5	254560	209	+	294542	CATGACAGGACAGCTGCAATCTCAACAAAGGGAGTTGTACAATGCTTAAGTCTTGAACCTTGGGGAAGAGCTAGTTGTGTGTGCACTTCACCAGTAACCAAGCACCTGCTGAGTGGAGTTCTGGATTTCTGTAAGGAAACTGGAATAAATGTGTGCATATTAGTACAATGATTCGTAATTTAGAAGGCATTAGACATGAGAGGATACCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	401519	209	+	636262	CATGACAGGACAGCTGCAATCTCAAGAAAGGGAGTTATACAATGCTTAAGTATTGAACCTTGGGGAAGAGCTACTTGTGTGTGCACTTCACCAGTAACCAAGCACCTGCTGAGTGGAGTTCTGGATTTCTGTAAGGCAACTGGAATAAATGTGTGCATATTAGTACAATGATTCGTAATTTAGAAGGCAGTAGACATAAGAGGATACCC
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a
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a
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a
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	255300	104	+	294542	AGTTGCACAACCTGAAAAAATCATAGCTCTCATCTTGGGATCTTGTGTCACTATTGAATATCAAACACTTTCTTCTGACTATCCTGCTATGGCAAAATTTGAGT
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a
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	255499	403	+	294542	AAGCTATGACACTAAGTTGGGAATTGTGTATAACACCTGGCATTCCTCAGTTGATTTGGGAGCAAATCTGAATGGTGTAAGCTGGCTCTAGTATCGGATCCTCTTACCTATAGTGTAATCTTTGGAAAATCAGATGAACTTTGAGATCTGGAATACATAAATCCTGCCAAATAAGCAGCTGCTAACATAGCTAGTTATGTTGTTATACACCATAAATTAACCCAGTATGTGAAAGATAAGCCAATGAGGGTGGAATGAGGGTGGAATCAACTAATGAGCAGTTATGACTGTCTTGTAAGTAGAGGACATAGAATTTGGCCCAGGTGGTGTGTCCCTAGCTATCTCCCCTGCCAACCATCTCTTGATTTGTTGACCTACCTCCTAAAGTTACAGAACTCTAAGT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	402334	402	+	647215	AAGCTGTGATGTTAAGTTGAGAATTGTGTATAACACCTGGCCTTCCTCAGTTGATCTGGGAGCAAATCTGATTAGTGAAAGCTGGCTCTAGTATTCAATCCTGGTACCTGTAGTGTAATCTTTGGAAAATCGGATGAAATTTGAGATCCAGAATACATAAATCCTGCCTAATAACCAACTACTAACAAAGCAAGTTATGTTGTTATACACCATAAATTAAGCCAGTATGTGAAAGATAAGCCAATGAGGGCAGAATGAGGGTGTGATCATC-AATGAGCAGTTATGACTGTCTTGCAAGTGGAGGATATAGAATTTGGCCCAGGTGGTGTGCCCCTAGCTATCTCCCCTGCCAGCCATCTCTTGATTTGTTGACCTACTTGCTAAAGTTACAGAACTCTCAGT

a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	402736	157	+	647215	ATGGAACTCTTCCATGATATTGTTGCTCAAGACTCAGTATATCTTTCTCACCAAAAAGATAGAGTGTAGTTTGTCTATGAGGTCCTGGACTTGATAGCTATCAAATGTAGCTCTGAGGAGCGATCAAGAGCTGGGAGATATATTAGCATTT----AGCATT

a
s	mr.mrrefChr5	256063	25	+	294542	GGACACTCTTTCCCCATTTCCAAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	256088	11	+	294542	AAGACAAGGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	403052	11	+	636262	AAGACAATGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	402919	7	+	647215	----CAAGGTA

a
s	mr.mrrefChr5	256099	199	+	294542	TGAGGCTGGTCATGATACATGATAAACGTTTGTGAGTGAGTCATTGCTAGACAAGGCAGCATTAATTATCCATGATTCAAGGGTTATAGGAGTTGTCAGTTGAGTGTGTATTTATAGGCCTTTCTAGTAAATTGAAATACTAACTCCCCTGTACAGGCACACCCAGACTAGCCCTATCGAGTGGATGAAATTTAACTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	403340	199	+	636262	TGGGGCTGGTCATGATACATGATAAACGTTTGTGAGTGAGTCATTGCTAAACAAGGCAGCATTACTTATCCAAGATTCAAGGGTTATAAGAGTTGTCAGTTGTGTGTGTATTTATAGGCCTTTCTAGTAAATTGAAATGCTAACTCCCCTGTACAGGCACATCCAGACTAGCCCTATCGAGTGGATGAAATTTAACTGC
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a
s	mr.mrrefChr5	256298	77	+	294542	AAAGATAGCATAATATTCAGGGAATGTGGGCATGGACTATATATATTCTACCCTACTTTCATCTCGCCGAGCATCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	403540	76	+	636262	AAAGATAGCA-AATATTCAGGGGATGTGGGCATGGACCATCTATATTCTACCCTACTTTCATCTCGCCGAGCATCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	403124	66	+	647215	AGAGATAGCATAATACTCGGGGAAAGTGGGGACGGACTATATATATGCTACCCTACTTTCAGC-------GCA----

a
s	mr.mrrefChr5	256375	425	+	294542	GCTGAGCAGAGATAATTATGTATAAACATAGTAAGACTATTGCCCAACTATTGAGTATCACATGTGGTCTCTCAAGGATGCAGGATCCTGATCAGTCCAACTGAGAGCTGGGAGGAACTTTAGCTTTTATGAGTATGAGAAACTAGTTAGGGTTGTTAATATGGTTTGAAAACCAGACTATTAGTGAGGTTTTTGGTCAGTGGTGACACCTGTAATGCACAGCAGCACAGTGGGATTCAGTTGTGGCTAATATTCTATCATTGTACAGGTGTAATCTTCTTAAGCAAAGTAGGGTTCTTTCAGTAGCCCCAGTGGTGACTCCTAACCTTAAAGCCAGCTTACAAGCATAGTTAGCAGATTAGCTTTGAGCAAGGTAACACCATACATCTTATAACACCCTCATTCAGGATGCTGATAGGATGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	403617	403	+	636262	GCTGAGCAGAGATAATTATGTATAAACATGGTAAGACTATTGCCCAACTATTGAGCATCACATGTGGTCTCTCAAGGATGCAGGATCCTGG--------ACTGAGGGCTGGGAAGAACTTTAGCTTTTATGAGTATGAGAAACTAGTTTGGGTT----------TTTGAAAACCAGACTATTAGTGAGCTTTTTGGTCAGTGGTGACACCTGTAATGCACAGCAGCACAGTGGGATTCAGTTCTGGCTAATATTCTACCATTGTACAGGTGTAATCTTCTTAAGCAAAGTAGGGTTCTTTCAGTAGCCCCAGTGGTGACTCCTAACCTTAAAGCCAACTTGCAAGCATAATCAGCAGATTAGCTTTGAGCAAGGTAACACCGTACATCTT----CACCCTCATTCAGGATACTTATAGGATGTTG
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a
s	mr.mrrefChr5	256800	98	+	294542	ACTATTTATAGCCATCCAGATAGTTCTAACAGTTTTTATGTTCGTCCTTTGGCCTCAATGGTGAATGCAGAGAAAATGGCGATTCCACAGATAACACG
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	257030	106	+	294542	GTACGCAGTATGTGGATATTCAAGTAGTTGGAGTCTAGAAGCAGCATCCTTCACAGTTCTTGGCTTTGGCTGCAATAACAGTCAGTACGATCAAGAACGTTTGTAT
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a
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s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	404358	254	+	636262	GCTCTAATTGTGCCTCATGCTGATTTGTCTCCAGATTACTCACTCTGCCATACCCATTTGTAGTTGTGGGGCTGACCACATCCATAGGTACACCCTACAATAATCCGAGGCTGAAAGTGCCATCACTAGCTCTATGTGTCAGTCATGCTAGTGCTCACTAAACTAGCACTGGCAAAACTTATGGAAAGATAGCTCGGTGGGGACACCAAAGCATATCAGTGACACAACACCCAGCAAATCAAATAGCCCAGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	403915	254	+	647215	GCTCTAATTGTACCTCATGCTGATTTATCTCCAGTCTACTCACTCTGCCGTACTCGCCTGTAGTTGTGGAGCTGAGTGCACCCATAGGTATAGCCTACAATAGTCCGAGGGTGAAAGCACCATCCCTGGCTCGATGTGTCAGTCATGCTAGTGCTCGCTTAAATCACACTGGCAAAACATATCCAAAGATAGCTTGGTGGGGACACCTATGCATATCAGTGACACAACACCCAGCAGATCAAATAGCCCAGTTT

a
s	mr.mrrefChr5	257390	121	+	294542	TAAAAAAAATGGCAATATATGCTGTAAGGGTGTTAGTGAGCCGAAGAATAACCTGAGAACATCAGTAAGTGTCAACAGCTAGTGATAATAAAATCACAACCCAGCCAGTTCCAGAAGAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	404619	108	+	636262	TAAAAAAAATGGCCACATATGCTGTAACGGTGCTAGTGAGCCGAAGAATAACCTGAGAACTTCACTAAGTGTCACC------------TAAGTTCACAACCCAGCCAGTTC-AGAAGAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	404169	121	+	647215	CAAAAGAAATGGCAGTATATGTTGTAAGGGGGTTAGTGACTCAAAGAATAACCTGAGAACATCAGTAAATGTCAACAGCTAGTGATAATAAAAGTACAACCCAGCCAGTTCCAGAAGAACC

a
s	mr.mrrefChr5	257511	82	+	294542	CCCAAGATACATTGATACACTGGAAGGGAGCATCGTGTTTGGGACTATGCTGATTTAGTTGAGAGCCAGCTGTTAAAGTTGG
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	257612	363	+	294542	TGAATTTGGCCTAGACAATTAATACATTGTTTGATTGGCAATTAACCCAGTGATTATTTGATAATGTGACAATAATCCAGCCCACAGGAGATTACATGCCTTCCCCATGAGAGTGGGTGACTGACAGTCCAGCCTACTAGTGCACTATTGATTGTGTAGGGTACCCTTACCTGGTTGCTATCTGTTCTAATTAAAACCTTCTAATTGATGCTAAGATGGCATGGAACGCAGTGAAAGAATCTGGTTCAAATATGTGTGATACTATTAAGAGTTGAACTCTCTAGCCAGCCACCCTAATTTGTACCTTCTGCTTTTTGATAGTTTTCCATTTATATTCCCCTGCTTTTTCTGTTAATACTGCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	404837	361	+	636262	CGAATTTGGCCTAGACAATTAATACATTGTTTGATTGGCAACTAACCCAGTGAGTATTTGATAACGTTATAATAATCCAGCCCACAGGAGATTACATGCCTTCCCCATGAGAGTGGGTGACTGACAGTCCAGCCTACTAGTGCACTATTGAT-GTGTAGGGTACCCTTACCTGGTTGCTATCTGTTCTAATTAAAACCTTCTAATTAATGCTGAGATGGCATG-AACGCACTCAAAGAATCTGGTTCAAATATGTGTGATAATATTAAGGGTTGGACTCTCTAGCCAGCCAACCTAGTTTGTACCTTCTGCTTTTTGATAGTTTTCCATTTATATTCCCCTGCTTTTTCTGTTAATACTGCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	404393	312	+	647215	TGAATTTGGCCTAGACAATTAATACATT------TTGGTAATTAACCCAGTGATTCCGTGATAATGTGACAATAATCCAGCCAACGAGAGACTACATCCCTTCTCCATGGGAGTGTGTGACTGACAATACAGCCTACTAGTGCACTATTGATTGTGTGGGGTACCCATACCTGGTTGCCCTCTGTTCTAATTAAAACCTTCTAATTGATGCTAAGATGGCATGGAATGCAGTGAAAGAATCCAGTTCAAACATGTGTGATACCATAAAGAGTTGAACTCTCTAGCCAAGCACCCTAATTGCTACCTTATACTATCTGA---------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	257975	8	+	294542	AGTTGGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	405203	8	+	636262	AGTTGGAA

a
s	mr.mrrefChr5	257983	6	+	294542	ACCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	405213	6	+	636262	ACCCAT

a
s	mr.mrrefChr5	257989	34	+	294542	GTAGGGCCTTCAAAGGTCAGGACCACCTATCTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	405222	34	+	636262	GTAGGGCCTTCAAAGGTCAGGACCACCTATCTCT

a
s	mr.mrrefChr5	258023	3	+	294542	GCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	405258	3	+	636262	GCT

a
s	mr.mrrefChr5	258026	152	+	294542	TCTGCTCCTTGTGTCCCTATATGTCACTTCATCATCAACACTTTCATGAGATCATGTAAAACCCCTTAAATTGGTGGGAATAAGGGCACAATCCTAAAAGTATCAATATTGCCACATTTTTGTCTTTCATATTCAAAGGTCCATTTATCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	405262	152	+	636262	TCTGCTCCTTGTGTCCCTATATGTCACTTCATCATCAACACTTTCATGAGATCATGTAAAACCCCTTAAATTGGTGGGAATAAGGGCACAATCCTAAAAGTATCAATATTGCCACATTTTTGTCTTTCATATTCAAAGGTCCATTTATCATT

a
s	mr.mrrefChr5	258178	11	+	294542	AACATATTGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	405415	11	+	636262	AACATATTGCC

a
s	mr.mrrefChr5	258189	191	+	294542	CAATGATTCATTCAATTTAACACCCCTATTAAGTAAGGATGAATCCCCTTATTATGGATTATGATCACCCTAATCATGCTGTGTTTATGCCCTGTCTTTCTCATTACTAGGTGCAAACAGGAGTGCTGGGAGTTCTTGATCCCTTTGATAGACAGGTCCCATACATCTTTTCTTAGTGAGATTTACAACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	405443	191	+	636262	CAATGATTCATTCAATTTAACACCCCTATTAAGTAAGGATGAATCCCCTTATTATGGATTAAGATCACCCTAAACATACTGTGTTTATGCCCTGTCTTTCTCATTACCAGGTGCAAACGGGAGTGCTGGGGGTTCTTGATCCCTTTAAGAGACAGCTCCCATACATCTTTTCTTAGTGAGATTTACAACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	404705	138	+	647215	-----------------------------------------------------ATGGATTATGATCACTCTAATCAAGCTGTGTTTATGCCCTGTGTTTCTCACTACTAGTGGCAAACAATAGTGCTGGGAGCTCTTGATCTCTTTGATAGACAGGTCCCATACATCATTCCTTAGTGAAATTTACAACAT

a
s	mr.mrrefChr5	258380	8	+	294542	CCTGTATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	405634	8	+	636262	CCTGTATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	404861	8	+	647215	CCTGTATA

a
s	mr.mrrefChr5	258388	101	+	294542	ACCCCTTAAGTATTGGTTTGTATGCAGCTTAAATGATGTAGAGTCAGCTTAAATGAAATAGAGGTAATTCCTCGCCTAGTGACTAATACGGTGAGGCTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	405642	101	+	636262	ACCCCTTAAGTATTGGTTTGCATACAGCTTAAATGATGTAGAGTCAGCTTCAATGAAATAGAGGTAATTCCTCGCCTAGTGACTAATACGCTGGGGCTCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	404871	76	+	647215	ACCCCTTAAGTAT-GGTCTGTATGCAGCTTAAATGATGTAGAGTCAGCTTAAATA------------------------AGACTAATACGGTCAGGCTCCA

a
s	mr.mrrefChr5	258489	127	+	294542	TGTAATCCATGCCACTACGCATCTCCTTAGTGATCATCTCTACAATGTAGATTTCATGTAGTTGCAAAATTCTACCAATTATGTGGTGTCTTTATCTTACATTAATTAATTCGAGCAAATATAAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	405747	120	+	636262	TGTAAACCATGCCACC-------TCTTAGGTGATTGTCTCTACAATGTAGATTTCATGTAGTTGCAAAATTCTACCAATTATGTGGTGTATTTATCTTACATTAATTTATTCGAGCAAATATAAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	404947	127	+	647215	TGTAATCCATGCCACTACGCATCTCCTTAGTGATCATCTCTACAACGGAGATTTCATGTAGTTACAAAATTCTACCAATTATGTGGCGTCCGTATCTTACATTAATTAATTCATGCAAATATAAACA

a
s	mr.mrrefChr5	258616	396	+	294542	CATTTCTCTGGTCTACTAATTAGTATTTGAGATTAATAGTCTGTCAGCAATCCTGGCTGGCTGATATCTATGTCTATGCTGGCATAATTATGGTATACAGCTTCATCACTTCAGCAAACCAATAACAACTTTATTTAGGTGAGCAGGGAGGTAGAAGTGACAATCTTTTGGTGTGACTCTAACACGACTGACATGATCTTTTAGAATATGCCCATCAGATTCCATTCCACCTTGCATATGTACTGATGACCAATGCATTACCTGAGAGGAGTCAAGCTCTACTACATTAACTCTTAATAAGGCTCAATAAGTCCAGGGATTTGGACCATATATATAACCACTTCATAGTATCAAGGCTAGTACATCTCCATCACCACTAACTACTGGTATAGAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	405868	383	+	636262	CATTTCTCTTGTCTACTAATTAGTATTCG-------------GTCAGCAATCCTGGCTGGCTGATATCTATGTCTATGCTGGCATAATTATGGTATGCAGCTTCCTCACGTCAGAAAACCAATAACAACTTTATTTAGGTGAGCAGAGAGGTTGAAGTGACAATCTTTTGGTGTGACTCTAACATGACTGACATGATCTACTAGAATATGCCCATCAGATTCCATTTCATCTTGCATATGTACTGATGACCAATGCATTACCTGAGAAGAGTCAAGCTCTACCACATTAACTCTTAATAAGGCTCAATAGGTCCAGGGACTTGGATCATATATATAACCACTTCATAGTATCAAGGCTAGTACATCTCCATCACCACTAACTATTGGTATAGAAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	405074	388	+	647215	CATTTCTCTGGTGTGCTAATTGGTATTTGAGATTAATAGTCTGCTAGCAATCCTGGCTGGCTGATATCTATGTCTATGCTGGCATAATTATGGTATACAGCTTTATTACTTCAGCAAACCAAAGACAACTTTATTTAAGTCAGCAGGGAGGTAGAAGTGACGATCTTATAGTGTGACTCTAACACGACTGACATAATCTTTTAGAATGTCCCGATCAGATTCCATCCCACCTTGCATATGTGCTCATAGCCAATGCATTACCTGTGAGGAGTCAAGTTCTACTGCATTAGCTCTCAATAAGGCTCTATAAGTCCAGGGATTTGGACTATATATATAATCGCTTCATGATATC--------TATATCTCCATCACCACTTATTACAGGTATAGAGGA

a
s	mr.mrrefChr5	259012	83	+	294542	TCAGAATGAATCTAAGTACTGACATCGCTGATAGTCAGACACTACTCACTCTTTCACTAATTAAGGCCATTCTTTGTAATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	406252	81	+	636262	TCAGTATGAATCTAAGTACTGACATCGCTGATAGTCAGACACTACTCACTCTTTCACTAATTAAGACCG--CTTCGTAATCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	405462	83	+	647215	TCAGAATGAATCTAAGTGCTGACACCGCTGATAGTCAGACACTACTCAGTCTTTCACTAATTAAGGCCATTCTTTGTAATCAA

a
s	mr.mrrefChr5	259095	24	+	294542	GCATAGACCTCATACCAGCCATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	406333	24	+	636262	GCATACACCTCATACCAGCCATAC
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a
s	mr.mrrefChr5	259119	220	+	294542	CTTTAGTGACTATTATCTATACTTCCTAGAGTCAACATCTGTGATGTCTAAATCATACTGTGCATGCACATTGACTTCACCTCAGTATATACAATCCATTGTGCTGGTGTGCACAGTAGATTAAGTGCTTGTCTTATTTCAGGTAATTGTTAGCATGTTGTTGAAATATAGCATCCTAAACCTGGATCCCCTTTCTCTATAGCATAAACAGTTGGTTTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	406361	220	+	636262	CTTTAGTGACTATTATCTATACTTCCTAGTGTCAACATCTGTGATGACTAAATCATACTGTGTATCCACATTGACTTCACCTCAGTATATACAACCCATTGTGCTGGTGTGCACAGTAGATTAGGTGTTTGTCTTATTTCAGGTAATTGTTAGCATGTTGTTGGAATATAGCATCCTGAACCTGGATCCCCTTTCTCTATAGCATAAACAGTTGGTTTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	405571	212	+	647215	CTTTAGTGAATATTATCTACACTTCTTAGAGTCAAGATCTGTGATCTCTAAATCATACTGTGCATGCACATTGCCTTCACCTCAGTATAAACAATCCATTGTGCTGGTGTTC------GATTCAGTGCTAGTCTTATTTCACTTAATTGTTAACACGTCG--GAAATATACCATCCTAAACCTGGATGCGCTTACTCTATAGGATAAACAGTTAGTTTCG

a
s	mr.mrrefChr5	259339	22	+	294542	ACCAGTTTGCTGCACCTGATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	406581	22	+	636262	ACCAGTTTGCTGCACCTGATAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	405785	22	+	647215	GCCGGTCTGCTGCACCTAATAG

a
s	mr.mrrefChr5	259361	137	+	294542	ATATCCTGACTTACTTAAACTTTTATTTTAGGGCTTAGCAGCAGCTCAACCACTATGTGATGTAATCTGCTGAGGGCAATGCAAAGAGCCTATTAGACTAGATATGTGTAATGTTGAGGTATACAGGTGGGAAACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	406604	137	+	636262	ATATCCTGACTTACTTAAACTTTTATTTTAGGGCTTAGCAGCAGCTCAACCACTATGTGATATAACCTGCTGAGGGCGATGCAAAGAGCCTATTAAACTAGATATGTGTAATGCTGAGGTATACTGGTGGGAAACAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	405807	136	+	647215	GTATCCTGACCTATTTAAACCTTAACTGTAGGGTTTAGCAGCAGCTCAGCTAGTAAGTGATGTAATCTGCTAAGGGCAATGCAATGAGTCTTTTAGACTACATATGTGTGCTGTTGAGGTATGCAGGT-GGAAACAC

a
s	mr.mrrefChr5	259498	193	+	294542	ATACATGATAGTATACCGATATCATCCTGGTGAAAACTTCCTGGCATAACCCCTAAGAGTGTTGGTAACACTTGTTTCTGCAACATAGTTTGGTGGCCTAACACACTTGAATGATCTACATATGTTTAGAAGTTCTAAATTGTTATCTCAAAAATGGAACATGTACATCCTGTGGCTGTGCAGTATGCGAGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	406741	192	+	636262	ATATATGATAGTATACCGATATCATCCTGGTGAAAACTTCCTGGCATAACCCATAGATGTGTTGGTAACTCTTGTTCCTGCAACATAGTTTAGTGGCCAATCACACTTGAATGAGCTACATATGTTCAGAAGTTCTAAATTGTTATCTCGAAAATGGAACATGTACAT-CTGTGGCTGTGCAGTATGCAAGGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	405944	178	+	647215	ATACATGATAG-ATACCGAAATC--------------TTCCTGGCATAAAGCCTAAGAATCTTGGTAACACTTGCTTCTGCAACATAGTTTGGTGGCCTAACACACTTGAATGATCTACATATGTTTAGATGTTCTAAATTGTTATCTCAAAAATGGAACATGTACATCCTGTCACTGTGCAGTATCTGAGGC

a
s	mr.mrrefChr5	259691	191	+	294542	ACAGTGATTCAGATTGCCATGTATCTCATGTATGAGTACCCTACCCACTAAAACATCTAGTGTCTTATCTGGAGTATAACTCCAGTTGGGCAGGAACTAGTTGAGTCTGGGCTCCAGATACTGCAGCTGATCCATATAACCATTGCACAAGCATCATAGCCAAAGATTACCATGAAATGACAAGATGAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	406933	191	+	636262	ACAGTGATTCAGATTGCCATGTATCTCATGTATGAGTACCCTACCCACTAAAACATCTAGTGTCTTATCTGGGATATAACTCCAGTTGAGCAGGAACTAGTTGAGTCTGGGCTCCAGATACTGCAGCTGATCCATATTACCATTGCACAATCATCATTGCCAAACATTACCATGAAATGACAAGATGAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	413216	190	+	647215	ACAGCGATGCCAATTGGCATGTATCCCATGTATGAGTATCCTACCCACTAAAACATGTAGTGCCTCATCTGGAGTATAACTCCATTTAGGCAGGAACTAGTTGAGTCTGGGCTTCA-CTACTGCAGCTGGTGCATGTAACCATTGTACAAGCATCATAGCCAAAGATTGCCATTACATAACAAGATTGACA

a
s	mr.mrrefChr5	259882	202	+	294542	AGACAAGAACACTGGGGTTGCATGCCATATGGGACAGGGGAAGAGGCATGTAATTTCTACAAATTTCAGGTTATACCATGTCTGATAGTATGATCGGACTAAGGACTAAGATTAGAGATAAAGCCAGAATGGCCATTCAAGGATCCCTGACTATTTGAAAATACCACATTTTCACAGTCACAAAACTATTATGGAGAAAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	407124	200	+	636262	AGACAAGAACACTGGGGTTGGATGCCATACAGGACAGGGGAAGAGGCATGTAATTTCTACAAAGTTCAGGTTATACCATGTCTGACAGCATGATCGGACTAAGGACTAAGATTAGAGATAAAGCCAGAACGGCCATTCAAGGATTCCTGACTATTTGAAG-CACCACATTTTCACCGTCACAAA-CTATTATGGAGAAAATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	413589	196	+	647215	GGACAAGGACGCTGGGGTTGCATGCCATATGCAACCGGGGAAGAGGCATGTAATTTCTACAAATTTCAGGTTATACCATGTCTGCTAGTATGATCAGAGTAAGTACTAAGATTTGGAGTGAAGACAGCATGGCCATTCAAGGATCCCCAACTATTTGAAAATACCAC----TCACAGCCACAAAACTATTATGGAGAAAG--

a
s	mr.mrrefChr5	260084	23	+	294542	GATGGGTTTGTGTTGTCTTGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	407325	23	+	636262	GATGGGTTTGTGTTGTCTTGATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	413785	23	+	647215	AAGGAGATTGTGTTGTCTTGGTG

a
s	mr.mrrefChr5	260107	60	+	294542	GGATCCTATGGATGATTGGTTATCAAGATTTAAGCAAAAATAAAATACTAATTATTTAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	407348	59	+	636262	GGATCCTATGGATGATTGATTATCAA-ATTTAAGCAGTAATAAAATACTCATTATTTAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	413809	60	+	647215	GGTTCCTATGGATGACTGGTTATCAAGATTTAACCAAAAATAAACTAGTAATTATTTAAA

a
s	mr.mrrefChr5	260167	70	+	294542	GGGGTAATTCACTTTATGGAAGTATATAGTTACATTACTAGAGTTCTAGTAGAATAACCAGCAGAATCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	407407	61	+	636262	GGGGTAATTCACTTTATGGAAG-ATATGGTTACATTACTAGAGTTCTAGTAGAATAACCAAC--------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	413870	69	+	647215	GAGGTAATTCACTTTATGGAAGTATATAGTCAC-TTACTAGCGTTCTAGTGGAATATCCAGCAGAATCAT

a
s	mr.mrrefChr5	260237	196	+	294542	CACCTATTCCCTTTATAACAAAATCAATTTTATCTCCCAAATATGACATGTCTAAATTGTAAACTTCTAAATTATTTCTATTTTTCAAGCAGCCAGCCTGGATAAGAGGATTGCAAACCTCAATTGTTAGTATTCCACAGTCTGTTACCCAAGATGATTGTTGCCTCAAGGGCAATGGGAAGCTCCTACACTCAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	407468	150	+	636262	-----------------------TCAATTTTATCTCCCAAATGTGACACGCCTAAATTGTAAACTTCTAAATTATTTCTATTTTTCAAGCAGCCAGCCTGGATAAGAGGATTGCTGACCTCAATTGTTAGTATTCCACAGTCTGTTACCCAAGATGATTGTTGTCTCAAGGGC-----------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	413940	196	+	647215	CACCTATTCCCTTTATAACAAAACAAATTTTAGTTCCCAAATATGACATGTCTAAATAGTAAACATCGAAATTATTTTTATGTTTCAAGCAGCCAGCCTAGATAAAAGGATTGCAAATCTCAATTGTTAGTATTACCCAGTCTGTTACCCAAGATGATTGTTGCCTCATGGGCAATGGGAAGCTCCTACACTCAGC

a
s	mr.mrrefChr5	260433	11	+	294542	TACTATGTGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	414137	11	+	647215	TACTATGTGGT

a
s	mr.mrrefChr5	260444	110	+	294542	AGTGATATTTAGCAATACGTTACATGAATTAGATCTACCAATACAGAGATTTCTTGTCTTCATGAGTAGTCATTTCACTTCTTTTTCTAAGCCCCCCACAGTCGCTGTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	407618	86	+	636262	----------------------TGTGAATTAGATCTA--AATACAGAGATTTCTTGTCTTCATGAGTAGTCATTTCACTTATTTTTCTAAGCACCCCACAGTCGCTGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	414149	110	+	647215	AGTGATATTTAGCAATACGTTACATGAATTAGATCTACCAATACAGAAATTGTTTGTTTTCGTGAGTAGTCATTTCAGTTCTCTTTCTAAGCCATGCACAATCTCTGTCC

a
s	mr.mrrefChr5	260554	160	+	294542	TATCTTAGGTGCCTCCAAAATATAAAGCAGAACAGAAGCAATAGGTGAGCAGATATGAGGAATGGTTCTAGCCTTCTTTCACATCCCCAGGATTGACAATCCAGGTGGTGGATGCAGGAGAAGGGGTTCAGAGGTTTCCCAACCCCATAGACATGGTCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	407717	160	+	636262	TACCCTAGGTGCCTCCAAAATTTAAAGCGGAATAGAAGCAATAGGTGAGCAGATATGAGGAATGGCTCTAGCCTTCTTTTACATCCCCAGGGTTGATAATCCAGGTGGTGGATGCAAGACAAGGGGTTCAGAGGTCTCCCAACCCCATAGACACGGTCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	414259	160	+	647215	TGTCTTAGGTGCCGCTGAAATATTAAATAGAACAGAAGCAATAGGTGAGTGGATATGAAGAAAGGTTCTAGTCTTCTTTCACATCCCCAGGATTGACAATCCAAGTGGTAGATGCAGTAGAAGGGTTTCAGAGGTTTCCCAACCCCATAGACATGGTCAA

a
s	mr.mrrefChr5	260714	29	+	294542	GACCACCTCATTTACGCAGCAGGGGTCAG
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	414420	25	+	647215	GACACCCTCAATTGCACAGCAGGGA----

a
s	mr.mrrefChr5	260743	46	+	294542	ACGTTTATGAGCAAGCAAGTCGAATTTGCCTAGCTATGCTGTGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	407909	46	+	636262	ACGTTTATGAGCAAGCAAGTCGAGTTTGCCTAGCTATGCTGTGTCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	414445	34	+	647215	-----------CAGGCAAGTGGAATTTGCCTAGCT-TGCTGTGTCA

a
s	mr.mrrefChr5	260789	39	+	294542	GACATTCTCTGTTTTTGTGTCTTTAAGGCTAGATTTCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	407955	39	+	636262	GACATTCTCTGTTTTTGTGTCTTTAAGGCTAGATTTCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	414480	32	+	647215	GA-------TGTTTTTGTGTCTTTAAGGCTAGACTTCAA

a
s	mr.mrrefChr5	260828	160	+	294542	TGGAGAAGGTGTATTTGATTATGATCACCCTGCACCCCTGGTGTTTCCTCAAGAGCAAAGTAAGAGTGTTCCTGTACCAACAGACAGAACCTGTTGCAACAAATAGATCCTCACGGTTTTTGAGAGGTAAGGAAGCCTGTGGAGAGAGCCAATATACATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	408001	157	+	636262	TGGAGAAGGTGTATTTGATTACGATCACCTTGCACCCCTGGTGTTTCCTTAAGAGCAGAGTAAGAGTGTTCCTGTACCAACAGACAGAACCTGTTGCACCAAATAGATC---ACGGTTCTTGAGAGGTAAGGAAGCCTGTGGAGAGAGCCAATATACATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	414512	156	+	647215	TGGAGAAGATGTATTTGATTATGCTCACTCTGCACCCCTCGTGCTTCCTCAAGAGCAAAGTGAGAGTATTCCAGTGCCAACAGA----ACCTGTTGCAACAAATAGAACCTCACTGTTTTTGAGAGGTATGTCAGCCTGTGGAGAGAGCTAATATACATT

a
s	mr.mrrefChr5	260988	606	+	294542	TAAGGTGAAAGGATGATTGAAGTGATTCTATGGCAAGTGATGCTATGGGCAGGGGGCAGTCTTGTCTTGTTCTGAGCTTAGTTAGTATTTCCCACACTACTAATGAATCATTGTCAGACATCCAATATAGCAGTTTATGGCATAATAGGTTGTACACACTATTGAGATCTGCTTGGTAAAGGGGCTAATGTGTGAAGTTAGCATAGAACAAGAATATTTATGATGGTATCTGAATTATTAACCTACTTTTGTGGTATTGGTCAATTATTTCACACTACAACTAAGCCTATACAAATATATTTATTATCGGATTACAGGGCAAGAACATTATTCAGAGAGTGGATTGTAGACTGAATTTCATTATAATAAGTCATAGAATAGTACTGGGGGTGAACAATTACAGCCCAAGATCTGAAATTGAGATCGTAATTGTGACTAGAGGTTTAAATTTACATTTTATTGTACACACATCACCTGCCCACTCTCATACCTTGGGCATTTTCAATAGACTACAATAAGTTTGTAAGTGGTTATTAATATGGTAGTCACTGCTAGAACTTGTGTTTCTATCCAAGCAGTTATGCAACTATGCAACTTCTGGTGGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	408158	600	+	636262	TAAGGTGAAAGGATGATTGAAGTGATTCTATGGCAAGTGATACTATAGCCAGGGGGCAGTCTTGTCTTGTTCTGAGCTTAGTTAGTATTCCCCACACTACTAATGAGTTCACGTCAGACATCCAATATA-TAGTTTATGGCATAATAGGTGGTAC----TGTTGAGATCTGCTTGGTAAAGGTGC-AATGTGTGGAGTTAGCATAGAACAAGAATTATTATGATGGTATCTGAATTATTAAGCTACTCTTATGGTATTGGGCAATTATTTCACACTACAACTAAGCCTATACAAATATATTTATTATGGGATTACAGGCCAGGAACATTATCCAGAGAGTGGATTGTAGACTGAATTTCATTATATTAAGTCATAGAATAGTACTGGGCGCGAACAGTTACAGCCCAAGATCTGAAATTGGGATCGTAATTGTGACTAGAGGTTTAAATTTGCATTTTATTGTACATACATCACCTGCCCACCCTCATATCTTGGGCATTTTCAACAGACTATAATAAGTTTGTGAGTGGTTATCAATATGGTAGTCACTGCTAGAACTCGTGTTTCTATCCAAGCAGTTATGCAACTATGCAACTTTTGGTGGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	414673	605	+	647215	TAAGGTAAAAGGATGATTGAGGTGATGCTATGGCAAGTGATGCTATGGGCGGGGGGCAGTCTTGTCTTGTTCTGAGCTTAGTTAGTATTTCCCACACCACTAATGGATCATTGTCAGACATCCAATATAGCAGTTTATGGCATAATAGGTTGTACACACTACTGAGATCTGCTTGGTGAAGGGGCTAATGTGTGAAGTTAGCATAGAACAAGAATATTTATGATGCAATCTGAAGTATTAACCTACTTTGGTGGTATTGCTCAAGTATCTCACACCGCAACTAAGCCTATACAA-TATATTTTTTGTCGGATTACAGGGAAAGAACATTAGTCAGAGACTGGATTGTAAACTGCATTTCATTACAATAAGTCATAGCATAGTACTGGGGGTGAACAATTACAGCCCAAGATCTAAAATTGAGATCCTACTGTTGGCTAAAGGTTTAAATTTACATTTTATTCTAGACACATCACCTGCCCATTCTCATACCTTGGGGATTTACAATAAACTGCAATAAGGTTGTAAGTGGTTATTAATATGGCAGTCACTGCTAGAACTTGTATTTCTATCCAAGCAATTATGCAACTATGCAACCTCTGGTGACC

a
s	mr.mrrefChr5	261594	61	+	294542	TTAAGGCAACATAACGCTGGGGTCACGTACTTATGACACCAGTCCCAGTATCTGAAAGTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	408758	61	+	636262	TTAAGGCAATATAATGCTAGGGTCACATACTTATGACACTAGTCCCAGTATCTGAAAGTCT
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a
s	mr.mrrefChr5	261655	313	+	294542	AGAGGCGATATTTTTTGCATGGTTGTCACAATATCAGCTTCTACATTGATACCAGATCAACCCTTGAAATGATCCAATTCTTACCACAGTTCTGGCATACTGCACAGAACTTGTGAGCTTAGTGAGTATTCCAACAATGTTGTAGGTCATAACTTGACATGCTAATGTGAGCTATAGTCATAGAATTGTCCGAAGAGTAAGCCCATTTTTCCATAATTTAATCTCCAGTACTGCGTCCCCTATCTATGGGTCTGGTGCAGTTTGCCCATTGGGATGAGATTAGTCTCTTAAACTGTTTAAGGCCTAGAATGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	408819	275	+	636262	AGAGGCTATATTTTTTGCATTGTTGTCACAATGTCAGCTTCTACATTGATACCAGATCAGCTCTTGAAATGATCCAATTCTTACCACAGTTCTGGCATACTGCACAGAACTTGTGAGCTTAGTGAGTATTCCAACAATGTTGTAGGTCATAATT--------------------------------------AAGAGTAAGCCCATTTTTCTATAATTTAATCTCCAGTACTGTGTCCCCCATCTATGGATCTGGTGCAGTTCGCCCATTGGAATGAGATTAGTCTCTTAAACTGTTTAAGGCTTATAATATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	415343	307	+	647215	AGAGGCGATATTTTTTGCGTG-----CACAAAATCAGCTTAGACCTTGGTACCAGATCAACCCATGAAATGCTCCATTTCTTACCACAGTTCTGGCATACTGCACAAAACTTGTGAGGTTAGTGAGTATTCCAA-AATGTTGTAGGTCATAACTTGACATGCTAATGTGAGCTATAGTCATAGAATTGTCCGAAGAGTGAGCCCATTTTACCATAATTTAATCTCCAGTACTGCGTCCCCTATCCTTTGGTCTGGTGCAGTTTGCCCATTGGGATGAGATTAGTCTCATAAGATGTTTAAGGCCTAGAAGGAT

a
s	mr.mrrefChr5	261968	63	+	294542	GTCATTGTGAGGACTCCTCAACAAGACTTAGAGGTGCCTATTCACATGGGTAATGTTGATGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	409095	63	+	636262	GTCATTGTGAGGACTCCTCAACAAGACTTAGAGGTGCCTATTCACATGGGTAATGTTGATGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	415650	59	+	647215	GTCGTTGAGAGGACT----ATCTAGACTTAGAGGTGCCTATTCACATGGGTAATATTGATGGG

a
s	mr.mrrefChr5	262031	117	+	294542	TGGCTATATGTCATGGGCTTTCCATTGGTCCCCAGTCATCAGATTAAATCTTGATATTTAAAGCTGATCTCAGAAATCATTACGTCTGATTATTTCCTTGAATAAAATACTGATTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	409158	117	+	636262	TGGCTATATGTCATGGACTTTCAATTGGTCCCCATTCATCAGATCAAATCTTGATATTTAAAGCTGATCTCAGAAATCATTACGTCTGGTTATTTCCTGGAATAAAATACTGATTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	415731	115	+	647215	TATCTGCATCTCATGGGCTTTCCATTGGTCTCCAGTCAT--GGTTGAACCTTGATATTTAAAGCTGATCTCAGAAATCACTATGTCTGATTATTTTCTTGAATAAAATACTGATTAT

a
s	mr.mrrefChr5	262148	19	+	294542	ATAGTGTGAAGCTTCCATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	415849	19	+	647215	ATAGTGTGAAGCTTCCATT

a
s	mr.mrrefChr5	262167	90	+	294542	ATTTATATATGATTTGTTTTCAGATCTGCAGTTGAGCTACCTAAAGTCTTCAGGTTACACCATATAAAAACTCAGCTATGTGTCTCTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	409275	86	+	636262	----ATATACGATTTGTTTTCAGATCTGCAGTTGAGCTACCTAAAGTCTTCAGGTTACACCATATAAAAACTCAGCTATGTGTCTCTGTT
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a
s	mr.mrrefChr5	262257	27	+	294542	GACTGCATAATGTGACACTGGAATTCA
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a
s	mr.mrrefChr5	262284	93	+	294542	TATCCAGTCCTGAGCTCTAGACCATAAATAACAGTTCTCATATAATGGTTACAAAGATGAGAGTCACCAGGATACACCTTGATATTGTGTGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	409389	93	+	636262	TATCCAGTCCTGAGCTCTTGACCAGAAATAACAGTTCTGATATAATGGTTACAAAGATGAGAGTTACCAGGATACACCGTGATATTGTGTGGC
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a
s	mr.mrrefChr5	262377	188	+	294542	AGATAGATGGTGTCCCAAGGCTGTGACTGAGTGTTGTACGTGACAATCACCTTCTGGTTTTTCCAGGAGTGTATCCTATTGATGATTGGTCCATGGGTCAGTCCTTAGTCATTTGTGTCAGTTGCTAGTCATTAGGACGTTTAGTAGATGATCAAGGGTTTAACTAAGACAAACTAAGACAACCTAAG
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a
s	mr.mrrefChr5	262565	7	+	294542	CCAATTA
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a
s	mr.mrrefChr5	262572	5	+	294542	TGAAC
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a
s	mr.mrrefChr5	262577	21	+	294542	CTCCTCATTTACCATTACAAC
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a
s	mr.mrrefChr5	262598	357	+	294542	CTGGTATAGGAGATGTTTCACTTACTCTATTAGGGTGATGATGAATCAAGACTTAGGTCAGCCTAAACACATGTACAATGTTTTTGCTTCTATTTAGTTCAGTCCAGTCGTTGTGCATGTGTGTGCACTGTACAGTTTCCCTTCCTTCAAATTCATATGATTACAATGCCACTAACAATCTTAAATCTTTCCTATTATAACAAACTGAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTGGATGAGGTCTCACCACCTCACTCCATTGTCCATAACAGATTTGTCAGCATTGTCCAAGAAGCTCCAAAGAGAAATACCACATGACAGATGGCTCTACTGACCCATGGTATTCCAGAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	409740	341	+	636262	CTGGTACAGGAGGTGTTTCACTTACTCTATTAGGGTGATGTTGTATC--------TGTCAGCCTAAACACATGTAGAATGTTTTTGCTTCTATTTAGTTAGGTCCAGTCATCATGCAAGTGTGTGTACTGTACAGTTACTCTCCCTTCTGATTCATATGATGACAATGCCACTAACAATCTTAAATCTTTTCTATTATAACAAACTGAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTGAATGAGGACACACCACCTCTCTCCATTGTCCATAACAGATTTGTCAGCATTGTCCAAGAAGCTTCAAAGAGATATATCTCATGACAGATGGCT--------CCATGGTATTCCAGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	230292	357	-	647215	CTGGTATAGGAGATGTTTTGCTTACTCTATTAGGTTCATCATTAACCAAGACTTAGGTGAGCCCTAACACATGCACACTGTTTTTGCTTCTATTTAGTTCAGTCCATTTGTTGAGCATGTGTGTGCACTGTACAGTTTTCCATCCTTCAAATTCATATGAGTACAATGCCACTAACAGCCTTCAATCTTTCCTATTATAACAAACTAAGCATCCCATCTCAGCCTCTCTGTGTTATCTAGATGAGGTCTCACCACCTCACTCCAATGCCCATAACAGATTAGTCAGTATTGTCCAGGAAACTCCAAAGAGAAATACTACATGACATATGGCTCTACTGACCCATGGTATTCAAGAAG

a
s	mr.mrrefChr5	262955	4	+	294542	CTTG
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a
s	mr.mrrefChr5	262959	14	+	294542	GCAAATGTTTGGTA
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a
s	mr.mrrefChr5	262973	7	+	294542	TACAAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	262980	7	+	294542	ATTCAGG
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a
s	mr.mrrefChr5	262987	7	+	294542	AAAGGCA
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a
s	mr.mrrefChr5	262994	125	+	294542	TTCTCTAGTGCACCATGATGTTCACAACTCTTGAGAAATATGTTTATGGCATTGTACATTGAAGTGGGATGCTATTTGCATCTTACTAGACTCTTACCACCCCAATTTGCCTGCTCATTGTCATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	410282	119	+	636262	TTCTTTTGTGCACCATGATGTTCACAACTCTTGAGGAATATGTTTATGGCATTGCATATTAAAGTAGGGTGCT------ATCCTACTAGACTATTACCACCCCAACTTGCCTGCTCATCGTCATG
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a
s	mr.mrrefChr5	263119	148	+	294542	TGGTTCTAGTGTTTCTTAGTGTCTAGGATTATGCCTGTCACTTACTTGTCTCTCTTCACAATAAGTTAGTTACTGACTGTGTGGCTATGTTATCACAAATCTACTCATCTAAAAATCTGGGTTTAACACAAAAACCTTGCAAGTAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	410408	148	+	636262	TGGTTCTAGTGTTTCTTAGTGTCTGGGATTATGCCTGTCACTTACCTGTCTCTCTTCACAATAAGTTAGTTACTGACAGTGTGGCTATGTGATCACAAATCTACTCATCTAAAAATCTGGGTTTAACACAAAAACCTTGCAAGTAGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	230812	133	-	647215	---------------TTAGTGTCAAGGATTATGCCTGTCACCTACTTATCTCTCTTCACAATAAGTCTGTTACTGGCTGTGTGGCTATGTTATAACAAATCTACTCATCTAAAAATCTGGGTTTCGCACAAAAATTTTGTAAGTGATT

a
s	mr.mrrefChr5	263267	64	+	294542	ATCATGTGCTCCTGGTCACCAGTCATATTGATCTAGCTTAGGGGCCCCCTACAATTTTATTTAA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	416976	51	+	647215	-------------GGTCACCAGTTATATTGATCTAGCTTAGGGGCCCCCTGCAAATTTATTTAA

a
s	mr.mrrefChr5	263331	14	+	294542	ACTAGTATAAAAAC
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a
s	mr.mrrefChr5	263345	647	+	294542	TCTTCCTTGTTCACTATTACCCAAGCATGATATTTTCAAATGTTCTGTCACCATTTGCACCCCAACCTCTCCAGGTATTTAAACTTTCTTGAGAATCTTCACCATATCTGAGACACCATATGGACGGGGGGTGGTGCAATATGACCAGTACCAAATATATGTCTGGTGCTTGGGGGTGAAAAGGGTGCTTGGGGGTCAAAAGGACTATGACATAGGACCTTGATAACAATGATTAGTTGACCAATAATTGAAGGAGGTCAAAGTGTGGTGTTAAGGATTGGCCTTTTGTCTTAAGGACATGGGAAAAAGCAACCTCTTAAGAACAGAAACACAAACAGAATAAACTTCTGAATAAAAAGTCATCTGGTAAGGATACTGGAGTAAGGGGTCAAAAAGGAGTACTGGATGCTATCCCCCATATGTAAGCTCCCTCTTAAGACTTTGCTGAGTAAAGGACCACCACATTGTTAGCCTCACTCTGCCTTTAGTAAAGACTGTGCCATAATAAGGCCCTTACCATGGGATGGTTTCTTGGGACCTGAGTGAGGAGTGCAATGATCCATAGATGGAACACAATGATCTAAGGGTAAGAGATCCTTGTTGTAATGGTATCACCTAATAGGCAGTTTTACCTTCTATGAGCATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	410639	644	+	636262	TCTTCCCTGTTCACTATCACCCAAGCATGATATTTTCAAATGTTCTGTCACCATGTGCACCCCAACCTCTCCAGGTATTTAAACTTTCTTGAGAATCCTCACCATATCTGAGACACCATATAGACGGGGGG-AGTGCAATATTACCAGTACCACATATATGTCTGGTGCTTGGGGGTGAAAAGGGTGCTTGGGGGTCAAGAGGACTATGACATAGGACCTTGATAACAATGATTAGTTGACCAATAATTGAAG-AGGTCAAAGTGTGGAGTTGAGGATTGGCCTTTTGTGCCAAGGACATGGGAAAAAGCAACCTCTTAAGAACAGAAACACAAACAGAATAAACTTCTGCATGAAAAGTCATTTGGTAAGGATACTGGAGTAAGGGGTCACAGAGGAGTGCTGGGTGCTATCCCGCATATGTAAGCTCCCTCTTATGACTTTGCTGAGAAAAAAACCAC-ACATTGTTAGCCTCACTCTGCCTTTAGTAAAGACTGTGCCATAATAAGGCCCTAACCGTGGGATGGTTTCTTGAGACCTGAGTGAGGAGTGCAATGATCCATAGATGGAACACAATGATCTAAGGGTAATAGATCCTTGTTGTAATGGTATCACCTAATAGGCAGTTTTACCTTCTATGAGCATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	417041	623	+	647215	TCTTCATTGTTCACTAATACTCAACCATAATATTTTCAAATGTTCTGGCACCATTTGCACCCCAACCTCTCCAGGTAT--AGACTTTCTTGAGAATCTTCACTGTATCTGAGCCACCATATGGACGGGGAGTGGTGCAATATGACCAGTACCAAATATGTGTGTAGTGCTTGGGGGT-------------------CAAAAAGACCATGACATATGACCTTGATAACAATGGTTAGTTGACCAATAATTGAGGGAGGTCAAAGTGTGGTCTTAAGGATTCGCCTTTTGTCTTAAAGACTTGGGAAAAAGCAACCTCTTAAGAACAGAAACACAAACAGAATAAACTTCTGAATAAAAAGTCATCTGGTAAGGATACTGGAATAAGGGGGCAAAAAGCAGTACTGGATGCTACCCCCCATATGTA---TCCCTCTTAAGACTTAGCTGAGTAAAGGACCACCACATTGTTAGCCTCGCTCTGCCTTTAGTAAAGACTGTGCCATAATAAGGCCCTTACCATAGGATGGTTTTTTGGGACCTGAGTGAGGAGTGCAGTGATCCATAGATGGAGCATAAAGATCTAATGGTAAGAGATCCTTGATGTATTGGTATCAGCTAATAGGCAGTGTCACCTTCTATGGGTCTCT

a
s	mr.mrrefChr5	263992	80	+	294542	ACCAAAAAAGCATAGAACTGTGTATTAACTGTAAGTTGACCATTCAGAATCTATTGCTCTAAACATATGGCAAATTGCCC
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	417664	64	+	647215	----AAGAAGCATAGAACTGTGTATTA-CTGTAAGTTTCCCATTCAGAATCTATTGCCCTAAACATATG-----------

a
s	mr.mrrefChr5	264072	12	+	294542	ATTGTGGACAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	264084	18	+	294542	GCATGCAAGCTCACTTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	411392	18	+	636262	GCATGCAAGCTCACTTCT

a
s	mr.mrrefChr5	264102	58	+	294542	AATATGAACTACGTCAGATGAGATGCCACCTTAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTG
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a
s	mr.mrrefChr5	264160	253	+	294542	TTGCACCACACGGCCAAAGTGTAAGCTCACTTCTGATACCCACAGAATTCGAATTACAATAAATGAGATGCCACCTCAACATGAGTTTTAGGAATGGAACTTGGTAGTCTGTTGCACCACACAGCTAAACAAAGTGAAGTCATTCCACACTGGCTATCTGTAGATCCTATACTAAGCAATGCACCCAACTATACAAAGCCTAATTGCTAGGCAAGTTACTATAACACAGGATCATAGTGAGGTTCTTCGGAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	411487	244	+	636262	TTGCACCACACGGCCAAAGTGTAAGCTCACTTCTGATACCCACAGAATTCAAATTACAACAAATGAGATGCCACCGCAACATGGG----AGGAATGGAACTTGGTA-----TTACGCCACACAGCTAAACAAACTGAAGTCATTCCACACTGGCTATCTGTAGATCCTATACTAAGAAATGCACCCAACTATACAAAGCCTAATTGCTAGGCAAGTTACTATAACACAGGATCATAGTGAGGTTCTTCTGAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	417779	252	+	647215	TTGCACCACACAGCCATAATGCAAGCTCACTTCTGATTTCCAGAGAATTTGAATTACAATAAACGAGATGCTACCTCAGCAAGAGTTTTAGGAATTGAAGTTGGTAGTCTGTTGCACCACACAGTGAAACAAAGTGAAGATATTCCAC-CTGGCTATCTGTAGATCCTATACTAAGCAATGCACCCAACTATACAAAGCTTAATGGCTAGGCAAGTTACTACAACCCAGGAGAATAATGGGGTTCTTTGGAAG

a
s	mr.mrrefChr5	264413	44	+	294542	CTAGCTGGCAAAGGTAAATACATGACATGGAAGAAATAAGACAG
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a
s	mr.mrrefChr5	264457	287	+	294542	TACAGTTGAAGTCAGCACTGCCTTTTCACTTCAGTCCCTGTGTCTAAATCATGATTCACACCCGGTGTGTAATGTGTGGAAAGAGGTCAGACAATGACTACCATTTTAAGACAACCAACTATGTTGTTTTACATAGCTGTTGCAAGCGGTTAGCTGCACTTTCTAGGCTTCAGGGTCATAGAAAAGAAACAATGGGAATGTGGGCCACCTTACACTTACATTAATACATGCAATAATAGTGAGAGTTGAATACATTGCTGGCCAACTGATGGGTGGGGAAAACGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	411784	279	+	636262	TACAGCTGAAGTCAGCACTGCCTTTTCACTTCAGGCCCTGTGCCTAAATCATGATTCACACCCGGTGTGGAATTTGTGGAAAGAGGTAGGACAATGCCTACCATTTTAAGACAACCAACTATGTTGTTTTACACAGCTGTTGCAAGCGATTAGCTGCACTTTCTAGGCTCCAGGGTCATAGAAAAGAAACA--------GTGGACCTACTTACACTTACATTAATACATGCAACAATAGTGAGAGTTGAATACATTGCTGGACAACTGATGGGTGGGGAAAGCGCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	418077	285	+	647215	TACAGTTCAAGTCAGCAATGCCTTTTTACTTTGGTTCCTATGTCTAAATTATGATTCAAATCCCGTATGTAATGTATGGAAGGAGGTCAGACAATGACTACCATTTTAAGACAACCAGCTATGTTGTTCTGCATAGCTGTTGCAAGCAGTTAGCTGCACTTTCTAGGCTTCAGGGTCATAGAAATGAAATAATGGGAATGTGGGCCACCTTATACTTACATTAA--CATGCAATAATAGTGAGAGTAGAATACATTGTTGGCCACCTCACGGGTGGGGAAAACACCA

a
s	mr.mrrefChr5	264744	58	+	294542	GGGGAACAGAATAATAGTCTTGGTTATAAGCACTTATAGATCTGTGCACAGCCTGAGG
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a
s	mr.mrrefChr5	264802	48	+	294542	TCAAAAAGCATAACTGGAAACCTGTCAATAAATAATCATATAAATCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	412122	48	+	636262	TCAAAAAGCAGAACTGCAAACCTGTCAATAAATAATCATATAAATCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	418425	48	+	647215	TCAAAAAACATAACTGGAAACCTGTCAGTAAATAATCATATAAATCTG

a
s	mr.mrrefChr5	264850	35	+	294542	TCTAATTGCAATAAACTTACATGGAAGAATCACCA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	418474	19	+	647215	TCTAATTGCAAGATACTTA----------------

a
s	mr.mrrefChr5	264885	147	+	294542	ATATGGGGTCTTATTATATTTTATTTTTTTCAGAGTTTATCCATAAAGTTGTATCATTTGATAATGCCTAGAAAAAAGCACTAAACCACAAAATATAGGAAAGAAACCTGATTTGCCTCAACAACAGAGCTAGCCAAGAAGAAGAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	412201	147	+	636262	ATATGGGGTCTTATTATATTTTATTTTTTTCAGAGTTTATCTATAAAGTTGTATCATTTGATAATGCCTAGAAAAAAGCACTAAACCACAAAATATAGGAAAGAAACCTGATTTGCCTCAACAACAGAGCTAGCCAAGAAGAAAAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	418493	105	+	647215	---------------------------------------TCCATAAAGTCATATCATTGGATAATGCCTAGGACAAAGCACTAAACCACAAAATATAGGAAAGAAACCTGACTTACCTGAACAACAGAGCTAACCAAGTAGATG---

a
s	mr.mrrefChr5	265032	18	+	294542	TGGGTGCACTGAGCAATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	412351	16	+	636262	TGGGTGCACTGAG--ATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	418598	18	+	647215	TGGGTGCACTGAGCAATG

a
s	mr.mrrefChr5	265050	119	+	294542	CATGTAAATATTGCTATGGCACAATAACTCAACTATTAGGCCTTAAAGTCTAATAACTCTAATCTTTGTGAGTATAAAATCATGGGGCTGAGGCTCTGAAAGTGCTGAGCAATGTCCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	412368	119	+	636262	CATGTAAATCTTGCTATGGCACAATAACTCAACTATTAGGCCTTAAAGTCTAATAACTCCAATCTTTGTGAGTATAAAATCATGGGGCTGGGGCTCTGAAAGTGCTGAGCAATGTCCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	418616	119	+	647215	CCAGTAAGTATTGCTATGGCACAATACTTTAACTATTAGGCCTTAAAGTCTAATAACTCTAATGTTTGTGAGTCTAAAATCATGGGGCTAAGGCTCTGAAAGTGCTGAGCAATGTCCTC

a
s	mr.mrrefChr5	265169	50	+	294542	CAATAGATGTAAGATTTGTATCATTCTTATTGGAAGGTTTATATGTAATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	412487	48	+	636262	CAATAAATGTAAGATTT-TATCACTCTCATTGGAAGGTT-ATATGTAATC
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a
s	mr.mrrefChr5	265219	41	+	294542	CCACGCACAGGCCTAAAATTTTTGTGACTTCTGCAACAATT
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a
s	mr.mrrefChr5	265260	37	+	294542	AGTCTCTTTTCACGTGACACTCTACTCTGTTTTTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	412585	37	+	636262	AGTCTCTTTTCACGTGACACTCTACTCTGTTTTTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	418832	37	+	647215	GGTCTCTTTCCACATGACACTCTACTTTGTTTTTAGG

a
s	mr.mrrefChr5	265297	42	+	294542	TTATAGTGAGATGCTGGGCCCTTTATTAGCACCCCTAGAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	412622	42	+	636262	TTATAGTGAGATGCTGGGCCCTTTATTAGCACCCCTAGAGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	418896	42	+	647215	TTATAGTGAGATGCTGGGCTGTTTATAAGCACCCTTAGAGAG

a
s	mr.mrrefChr5	265339	33	+	294542	CCCGGCAGTAGCTATCAATGAGGCAGTAGCTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	412664	33	+	636262	CCCGGCAGTAGCTATCAATGAGGCAGTAGCTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	418939	33	+	647215	TTTGGCAGCAGCTGCTAATGGGGCAGCAGCTAT

a
s	mr.mrrefChr5	265372	102	+	294542	CAAGGCCACCCCCATAATGTATCTCCTTGCTCTTTTTTGTTTACATTAAGTATAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGACCATTAGTGTGGAGGATGACCATTGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	412698	102	+	636262	CAAGGCCACCCCCATAATGTATCTCCTTGCTCTTTTTTGTTTACATTAAGTATAGCTGGTGCCCTTTGAGTTGACCATTAGTGTGGAGGATGACCATTGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	418972	102	+	647215	CAACACACCCCCAATAATGCGTCTCTTCGAGCTTCTTTGTCTACATTAAGCATAGCTGGCGCCCTTTGAGTCAACCATTGGTGTGGGGGATGACTATAGGTG

a
s	mr.mrrefChr5	265474	94	+	294542	AGGGGATATGTACATGAAGTATTGCAGCTAGTGACAGTGGGGACTGAGTTCTGACAATATTTAGCGGTGTCTCACGCCAAGTGATTAGATATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	412800	94	+	636262	AGGGGATATGTACATGAAGTATTGCAGCTAGTGACAGTGGGGACTGAGTTCTGACAATATTTAGCGGTGTCTCACGCCAAGTGATTAGATATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	419075	94	+	647215	GGGGGACGTGTACATGAAGTATTGCAACTGGCACCAGTGGGCACTGGGTCCTGAAAATATTTAGCGGTGCCGCACACCAAATGATTAGATGTTC

a
s	mr.mrrefChr5	265568	18	+	294542	TGGATTGACTATCAGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	412902	18	+	636262	TGGATTGACTATCAGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	419169	18	+	647215	TAGATTGACTATGCGTTT

a
s	mr.mrrefChr5	265586	84	+	294542	CTAGGCCACACCCTAGTTTGTTGAACCGCCCTGTTAATTTAACTGGGGGATGAGGTTTATGGAACTATGGGCCTAATTCCCCGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	412921	84	+	636262	CTAGGCCACACCCTAGTTTGTTGAACCGCCCTGTTAATTTAACTGGGGGATGAGGTTTATGGAACTATGGGCCTAATTCCCCGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	419187	84	+	647215	CTAGACCACACCCTAGCTTGTTGAACCCCCCTGTTAATTAAACTGGGGGATAAAGTTTATGGAACTATGGGTCTAATTCCTCAA

a
s	mr.mrrefChr5	265670	22	+	294542	GTTGCTGACACTCATTTGAGGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	413005	22	+	636262	GTTGCTGACACTCATTTGAGGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	419272	22	+	647215	GTTGTTGACATTCTTTTGAGGG

a
s	mr.mrrefChr5	265692	61	+	294542	CCATGATTGGTTGATCTGCCATAAGCATAGGCTAAGATGAATTCCACTGACTGCAGAGGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	413027	61	+	636262	CCATGATTGGTTGATCTGCCATAAGCATAGGCTAAGATGAATTCCACTGACTGCAGAGGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	419295	61	+	647215	CCGTGATTGACTGATCTGCCATGAGCACAGGCCAAGATGAATTCCACTCAATGAAGAGATA

a
s	mr.mrrefChr5	265753	12	+	294542	CAATTTAACCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	413093	12	+	636262	CAATTTAACCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	419356	12	+	647215	CAATTTAACCCA

a
s	mr.mrrefChr5	265765	187	+	294542	TACCTAATATATGTGTGGTGCTTGGGGCTCATAATTAAGGAATGTGACATGCAGACCCCGACATCACTGATTCATTGACCAATAATTCAAGTAAGGTGAAAGTGTGGAGTTAAGATTGGACACTTGTTTTAAGGACTTGTTACAAAGTAACCTCTTGAAACTAGATAGGGAATACACTCCCACATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	413105	179	+	636262	TACCTAACATGTGTGTGGTGCTTGGGGCTCATGATTAAGGAATGTGACATGCAGACCCCGACATCACTGATTCATTGACCAATAA-----GGAGGGTGGAAATGTGGAGTTAG---TGGACACTTGTTTTAAGGACTTGTTACAAAGTAACCTCTTGAAACTAGATAGGGAATACACTCCCACATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	419370	187	+	647215	TACCTAATATATGTGTGGTGCGCGGGGCTCATAACTTAGGTATATGACATGCAGACCCCAACAGCCCTAATCCATGGACCAATAATTCAAGTAAGGTGAATGTGTGGAGTTAAGATTGGACACTTGTTTTAAGGACTTGTTACAAAGTAACGTCTTGAGACTATATAGGGAACACACTCCCACATAA

a
s	mr.mrrefChr5	265952	132	+	294542	AGAGATACAGGTGCACTTGATGCTACTCCCCATCTATCACCTCCCTCTTTTTACTTTGCTCAGTGAAGGGCCACATCACACATTGTTAGTCTTACTCAACCTATAGCACAGTCTGTGCTACAATGAGGGCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	413284	132	+	636262	AGAGATCCGGTTGCACCTGAAACTACTCCCCATCTATCACCTCCCGATTTTTACTTTGCTCAGTAAAGGACCACATCACACATTGCTAGTCTTACTCGACCTATAGCACAGCCTATGCCACAATGAGGGCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	419614	123	+	647215	AGACAGACAGGGGAACTCAATGCTACTCCC------TCACCTCTTTCTTTTCATTTTGCTCAGTGAAGGGC---ATCACACATTGTTAGGGTTACTCAACCTATAGCACAGTCTGTGCTACAATGAGGACCT

a
s	mr.mrrefChr5	266084	178	+	294542	GATGGGATGCTTTCTTGAGACCTGAGTAAGGAGTGCAACAATCTACAGATGAACCGCAGTGACCTAATGATAAATAATCCATAGACAGAACACCAGGATGTAACAGTATTAGCTAACAGTTAGGTTCACATTCTATGGGACGGGTACATGATAAATTAAGGGGGCATCATGTGTCAAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	413416	178	+	636262	GATGGGATGCTTTCTTAAGACCTGGACAAGGAGTACAACAATCTACAGATGAACCGCAGTGACCTAATGATAAATAATCCATAGACAGAACACCAGGATGTAACAGTATCAGCTAACATTTAGGTTCACATTCTATGGGATGGGTATATGATAAATTAAGGGGGCATCATGTATCAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	419740	177	+	647215	GATGGGATGCTTTCTTGAGACCTGAGTGAGGAGTGCAGCAATCTACAGATGAACCACGATGACCTAATGGCAAATGATCCATAGACAGAGCACCAGGATGTAACAGTATTAGCTAATAGTCAAGTTCACATTCTATGGGACGGGT-CATGACAAACTAAGGAGGCATCATGTGTCAAC

a
s	mr.mrrefChr5	266262	121	+	294542	TGTAAGGTGAACACTCAGAATCTATTGCTCTACACAAATGGTATAGATCCCATCATGGACAAATTTAGGAGGCCATATGCGAGCTTACTACTAATACCCTTATAATTAGAATTATAACAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	413594	121	+	636262	TGTAAGGTGAATACTCAAAATCTGCTGCTCTACACAAATGGTGGAGACCATATCATTGACAAACTTAAGAGGCCAAATGTGAGCTTACTACTGATACCCTTATAATTAGAATTATAACAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	419920	121	+	647215	TGTAAGGTGAACACTCAGAATCTATTGCTCTACACAAATGGGATAGATCCCATCATGGACAAATTTAGGAGGCCATATGCCAGCTTGCTACCAATACCCTTACAATTAAAATTGTAACAGA

a
s	mr.mrrefChr5	266383	14	+	294542	TGAGATCACACCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	413720	14	+	636262	TGCTATGACACCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	420041	14	+	647215	TGAGATCACACCTT

a
s	mr.mrrefChr5	266397	71	+	294542	TTATGAAAGGAACTCAGTAGTCTACTGAGTGAAACAGCTAAACAGGGTGAACTCATCCTGCACTAGCTATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	413743	69	+	636262	TTATGAAAGGAACTCAGTAGTCTACTGAGTGAAACAGCTAAACAGGGT-AGCTCATCCTGCAC-AGCTGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	420055	71	+	647215	TTATGAAAGGGTCTAAGTAGTCTATTGAGTGAAATAGCTAAACAAGTTGAACTCATTCTGCACTAGCTATC

a
s	mr.mrrefChr5	266468	255	+	294542	AAATTCCATACTAAGCTGCACACCCAACCGCACAAAGCCTGATTGCTAAGCAAGTTGCTATAACTCAAGCACGTGTGATGAGGTGCTTTGGAAGCCAGGTAGATACATACCATGGAAGAAATGACACATCACATAATCGTTACAGTTCAAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGCCCCTGAGTCTAAACTGTGATTCACACCAGCTGTGTAATTAAAGCAACAAGAGTGAGAGTTGAATGTTGGTCTGGGGGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	413812	201	+	636262	---------------------------------------------------AAGTTGCTATAACTCAAGCACATGTGACGAGGTGCGTTGGAAGCCAGGTAGATACATACCAGGGAAGAAGCGACACATCACATAATCGCTACAGTTCAAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGC---TGAGTCAAAGCTGTGATTCACACCAGCTATGTAATACATGCAACAAGAGTGAGAGTTGAATGTTGGTCTGGGGGATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	420129	253	+	647215	AAATTCCATACTAAGCTGCACACCCAACCGCACAAAGCCTGATTGCTAAGCAAGTTGCTATAACTCAGG-GTGTTTGATGAGGTGCTTTGGAAGCCAGGTAGATACATAACATGGAAGAAATGACACATCACATAAGCATTACAGTCAGAGTGAGCAATGCCTCCTCACTTAGGCCCCTGAGTCTAAACTGTGCTTCACACCAG-GGTGTAATTAAAGCAACAAGAGTGAGAGTTGAGTTCTTGGATGGCTATTG

a
s	mr.mrrefChr5	266723	6	+	294542	AGCTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	414030	6	+	636262	AGCTGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	420382	6	+	647215	GGCCGG

a
s	mr.mrrefChr5	266729	116	+	294542	GGCTCTCAGTCTGAGAGTTATCACACTCTTATTTGCGACCTTTCCCATTAGCTGATCCATAAGACTAACATGAAATTCTGCTAAATGATATGGTGTGCCACATGAGATCCCCCTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	414049	116	+	636262	GGCTCTCAGTCTGAGAGTTATCACACTCTTATTTGCGACCTTTCCCATTAGCTGATCCATAAGACTAACATGAAATTCTGCTAAATGATATGGTGTGCCACATGAGATCCCCCTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	420388	116	+	647215	GGGGCTCAGTCTGAGGGTCATCACACTCTCATTTGTAAACTCTCCCATTAGCTAATCTGTAAGACTGAGATGGAATTCTTCTTAACAATAAGGTGCACAACGTGAGGTCCCTCTCC

a
s	mr.mrrefChr5	266845	104	+	294542	ACCCTTGTAATCACCAGGTTCTGTGTACTTGTCAGGTAATCATGTATGGCTCATAAATTGCTAGGGAAGTTGGACCAGCTGGTAGGAAATATGGTGGTAGCTCG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	414176	104	+	636262	ACCCTTGTAATCACCAGGTTCTGTGTACTTGTCAGGTAATCACGTATGTATCATAAATTGCTAGGGAAGTTGGACCAGCTGGTAAGAAATATGGTGGTAATCCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	420504	101	+	647215	ACCCTTGTAATCACCAGGTTCTGTGTACTTGTCAGGTAATCATGTATGGCTTGTAAATTGCT---GAAGCTGTACCAGATGGTAGGAAATATGGTGGTAGCTCG

a
s	mr.mrrefChr5	266949	378	+	294542	TTAGGAAGGCCACAATCATGAGGATGCTTGCCCCCTAGATACTTTTTGACTTGAGCTTGAATAGCAAAAACAGCATGACATGTGGTGAGTTTGTGATCTAAGCTAGTCACCTGTGCACAAACTGGTGAATTTCAGCCCATGATTTTGTTATCCCTAATATTGATTAAACATATACATTATATAACCCCATAATTTCCACTGGCCAACTGCTAGGAGTGTTTGTGGTGATTTCTATCACTGTCCAATTGATTAAGGGAATACAAAGAGCTTATGAGCTTCTCCCTTTAAATCACTATTATGTCACAATGGCTCAACTCCTAATGTGAAACTGTAGGAATATCTTGTTAAACAAAACTTTTCAAAATCCAGACCCATGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	414281	362	+	636262	TTAGGGAGGTCACAATCATGAGGATGCTGGCCCCCTAAATACTTTTTGATTTGGGCTAGAA---CAAAAACACCATGACATGTGGTGAG------GTCTAAGCTAGTCACGTGTGCAAAAACTGCTGAATTTCAGTCTATGATTTTGTTATCCCTAATATTGATTAAACATATACACTATATAACCCCATA-------CTGGCCAACTGCTAGGAGTGTTTGTTGCGATTTCCATCACTGTCCAATTGATTAAGGGAATACAAAGAGCTTATGAGCTTCTCCCTTTAAATCACAATTATGTCACAATTGCTCAACTCCTACTCTGAAACTGTAGGAATATCTTACTAAACAAAACTTTTCAAAATCCAGACCCATGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	420605	339	+	647215	TTAGGAAGACCATAATCATGTGGATGCTTGCCCCCTGGGTATTTTTTGACTTAAGCTTGGATAGCAAATTCAGCATGACATGTTGTGAGTTTGTGATCTAAGCTAGTCACCTGTGCACAAACTGGTGAAGTTCAGCCCATGATTAT------------ATTGATTAAATATACACATTATATAACCCCATAATTTCCACTGACCAACTCCTAAGAGTGTTCATGGTGTTTTCTATAACTGTCCAATCGATTGAGAGAATGCAAAAAGCTTATGAGCTTCTCCATTATATTCACTATTATGACAGAATGGCTCAACTCCTAATGTAAAACC-CAGGATTATCTTGTCACATAA--------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	267327	164	+	294542	GCAGCACAGTTTTAGGTGGTCTCCCAATGCTTAAGGGCAATGCATCCATGGAGGGTGCAGATGATTGCAAGCCAATGTGCCACACTCCAGTGCATTTTGTGATTTGAATCCATATCGTCAACTTGCAGGACATAGTTGCAATGTCCAACCTGCAGTCAACTACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	414644	128	+	636262	GCAGCACAGTTTTTGGTGGTCTGCCACTGCTTAAGGGCAATGCAACCATGG---------------------CAATGTG------TCGAGTGCATTTTGTGATTTGAATCCATATCCTGGACTTGCGGGACATAG----AATGTCCAACCTGCAGTCAA-----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	420944	164	+	647215	GCAGCACAGTTTTAGGTGGTCCCCAAATGCTTAAGGGCAATGCATCCATGGAGGGTGCAGATGATTGCAAGCCAATGTGCCACACTCCAGTGCATTTTGTGATTTGAATCCATATCGTCAACTTGTAGGACATAGTTGCAATGTCCAACCTGCAGTCAACTACC

a
s	mr.mrrefChr5	267491	95	+	294542	ATTTTGTTATTCTCTTCTCTCTAATAGTGGAATGATAAAGAGCAGCGTAGGATTGCAAAAACTAGGATGGAAAAAATGTACTAATGTAGGAAATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	414772	94	+	636262	-TTTTGTTATTCTCTCCTCTCTAATAGTGGAGTGATAAAGAGCAGCGTAGGATTGCAAAAATTAGGATGGAAAAAATGTACTAATGTAGGAAATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	421110	95	+	647215	ATTGTGTTATCTTCTTCTCTCTAATAGTTGAATGATAAAGAGCAGAGTAGGATTGCAAGGTCTAGGATTCAAAAAATGTACTAATGTAGGAAACT

a
s	mr.mrrefChr5	267586	117	+	294542	AATCCTGGTGTCCGTATTATTCCACATGTCCTCTACATGCAGTTGGGTGGCTACATATTGAGCTTTGAGTTGAATACATTTGCAAGAGAGTAGCTATGAATTATCATGGGGCAATTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	414872	114	+	636262	AACCCTGGTGTCCGTAATATTCCACATGTCCTCC---TGCAGTTGGGTGGCTACATATTGAGCTTTGAGTTGAATACATTTGCTAGAGAGTAGTTATGAATTATCATGGGGCAATTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	421205	117	+	647215	AATCCTGGTGTCCGTATTATTCCACATGTCCTCTACATGCAGTTGGGTGGCTACATATTGAGCTTTGAGTTGAAAATGTTTGCAAGAGAGTGGCTATGACTTATCACAGGGCAATTG

a
s	mr.mrrefChr5	267703	14	+	294542	CATGCTGAGTTTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	414996	14	+	636262	CATGCTGAGTTTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	421322	14	+	647215	CATGCTGAGTTTTG

a
s	mr.mrrefChr5	267717	12	+	294542	ATTGAATATGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	415011	12	+	636262	GTTGAATATGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	421336	12	+	647215	ATTGAATATGTT

a
s	mr.mrrefChr5	267729	81	+	294542	GAGGGTAGCTATGCATTCTCTTACACATCCAGGGCATTGGGTCAGTATCACAAAATGGTTGTTACTATGGCAGAGGAAGGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	415023	81	+	636262	GAGGGTAGCTATGCATTCTCTCACACAGCCAGGGCATTGAGTCAGTACCACAAAGTGGTTGTTACTATGGCAGAGGAAGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	421353	81	+	647215	GAGGGTAGCTATAAATTCTCTTACACATCCAAGTCATTGGGTCAATATCCGAAAATGGTTGTTATTATAGCATAGGAAGGG

a
s	mr.mrrefChr5	267810	71	+	294542	TGGAATCCACAAGAGTAGTTGTATAAATGAGAGATGCACAGAATCATTTATCATTTATGTTCAACGTGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	415109	71	+	636262	TCGAATCCACAGGAGTAGTTGTTTAAATGAGAGATGCACAGAATCATTTATCATTTATGTTCAATGTGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	421434	71	+	647215	TGGAATCCACAAGAGTAGTTGTATAAAAGAGGGATGCACAGAATCATTTATCATTTATGTTCAACATGGTG

a
s	mr.mrrefChr5	267881	19	+	294542	CCTGTAAAAGCTATATGCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	415180	19	+	636262	CCTGGAAAAGCTATATGCA
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a
s	mr.mrrefChr5	267900	369	+	294542	GATTGAGAAGACCAAGTGTGTACTATCTAGGAGATTGATGTTACCATTATGGTAGTAGCCTAGGGCCACTGAAAGGGGACTTAACTTGGTAACTTTAAGTGATAAATTGAGCAGCTAGTTATTTGTACTTCTTTGTAGTGGTACAGAACTATTATGTCAGCAGGGCATGATCATGCCAAAGCGGAAATATGCCTTGAACTGGTGTCATTCAGGAGTTCTGTGCAGCAGATCCATGAGACTGTTATTGTTATCTATATTTGGCCAATTGAATGAAGTCTTCTGCGGCTGGGACCTACGCATGGGCACTGGCCAAAGAGCATTGAAACTTTTACATGGAGTGTTAGATGCTTTATCAGGCACATTATTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	415199	369	+	636262	GATTGAGAAGACCAAGTGTGTACTATCTGGGAGATTAATGTTACCATTATGGTAGTAGCCTAGGGCCACCGAAAGGGAACTTAACTTGGTAACTTTAAGTGATAAATTGTGCAGCTAGTTCTTTGTACTTCTTTGCAGTGGTACAGAATTATTATGTCAGCAGGGTGTGATCATGCCAAAGCGGAAATATGCCTTGAACTGGTTTCATGTAGGAGTTCTGTGCAGCAGACTCATGAGACTGTTATTGTTATCTATATTTGGCCAATTGAATGAAGTCTTCTGCGGCTAGGACCTATGCATGGGCATTGGCCAAAGAGCGTTGAAACTTTTACATGGAGCGTTAGATGCTTTATCAGGCACATTGCTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	421527	368	+	647215	GACTGAGAAGACCAAGTGTGTACTGTCTAGGAAATTGATGTTACCATTATGATAGTAGCCTAGGGCCACTGAAAGGGGATTTAACTTGGTAACTTTAAGTGATAAATAGAGCAGCTAGTTATTTG-ACTTCTTTGTAGTGGTACAGAACTATTATGTCAGCAGGGCATGATCATGCCAAAGCGGAAATATGCCACAAACTGGGGTCATTCAGGAGTTCAGTGCAGTAGATCCATGAGACTGTTATTGTTATCTATATTTGGCCAATTGAAGGAAGTCTTCTGCGGCTGGGACCTGCGCATGGGCACTGGCCAGAGATCACTGAAACTTTTACATGGAGTGTTAGATGTGTTATCAGGCATATTATTTGT

a
s	mr.mrrefChr5	268269	382	+	294542	GATGTCTGGGCAATCAAAAGTGGGCAGATTCCTGCTCAAATACAGTTTATCATCACGCACTGGGCAGGGTATAAGCCAGTTATTTGATTGCTCGTAGGGGACCCAGAGCACAACTTCTGCTTAAACAAGATCCATACTTCCACTTAAGAAAGCCCAATTTGATTTTCCCTTGAATTTTGGCAGATCTTTTGATAGACACCCACATTCGTACGTCATGACAAGTTTGTCTAATCACTGTGACTTAACCATCATGAATGAAAGGCTTGCTGGTCACCAACCCAAGACAGATGTTCAAAGCTGTCATTACACAGTGTGCTTTGGCCACTGTACACTATGGACAAATATGCAAACCAGAGAACACCTCATTAATGGTATGACTTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	415570	382	+	636262	GATGTCTGGCCAATCAAGAGTGGGCAGATTCCTGCTCAAACACAGTTTATCATCATGCACTGGGCAGGGTATAAGCCAATTATCCGATTGCTCGTAGGGAACCCAGAGCACAACTTCTGCTTAAACAAGATCCATACTTCCACTTAAGAAAGCCCAATTTGATTTTCCCCTGGAGTTTGGCAGATCTTTTGATAGACAACCACATTCGTACATCATGACCAGTTTGTCTAATCACTGTGACTTAACCATCATGAATGAAAGGCTTGCTGATCACCAACCCAAGACAGATGTTCAAAGCTGTCATTACACAGTGTGCTTTGGCCAGTGTGCACTATGGACAAATATGCAAACCAGAGAACACCTCATTAATGGTATGACTTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	421895	382	+	647215	GATGTCTGGGCAATCAAAAGTGGGTGGATTCCTGCTCAACTACAGTTTTTCATCACGCACTGGGCAGGGTATAAACCAGTTATTTGGGTGCTTGTAGGAGACCCAGAACACAACTTCTGCTTAAAAAAGATCCATACTCCCACCTAAAAAACCTCCATTTGATTTTACCTTGAATTTTGGCAGAGCTTTTGATAGCCACCCGCACTTGTCTGTCATGGCAAATTTTTCTAATCACTGTGACTTAACCATCATGAAAGAAAGGCTTGCTGGTCACCGACCCAAGACAGATGTTCAAGGCTGTCATTACACAGTGTACTTTGACCACTGTACACTACAGACAGAAATGCAAACCAGAGAATACCTAATTAATGATGTGACTTAT

a
s	mr.mrrefChr5	268651	268	+	294542	ATCTGGCTGGAGCATGTCTATTCCCCAGTAGCAATAAAGGGCCCTGCTTAAGGCTGCAAGCTTAATCAGCCTCCAAACAAGGGGTTAATTTTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTAGGACCTGTGGTCTCCCTGGCCTTTAATGAATCACAAAGAGCTTCCAACTCCTGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACATCAGTAAACAGACTGTTATGCAGAGTTTCCCTTCCCCAAGTTCATCCCCACCATTAGGCTTACAACTGAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	415952	268	+	636262	ATCTGGCTGGAGCACGTCTATTCTCCAGTAGCAATGAAGGGCCCTGCTTAAGGCCGCAAGCTTAATCAGCCCCCAAACAAGGGGTTAATTGTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTAGGACCTGTGGTCTCCCTGGCCTTTAATGAATTGCAAAGAGCTTCCAACCCTCGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACATCAGTAAACAGACTGTTATGCAGAGTTTCCTTTCCCCAAGTTCATCCCCACTGTTAGGCTTACAACTGAAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	422278	266	+	647215	ATCTGGCTAGAGCATGTCTATTTCCCAGTAGCAATAAATGGCCCTTTTTGAGGCTGCAAGCTTGATCAGACTCCACACATGGGGTTAATTTTAGCCTAAATGACAAGCAGTATTATAGCCTGTAGTCTCCTTGGCCTTTAAAGATGCACAAAGAGCTGCCAACTCCTGGATTCATAGGTAGTTTCATTTACACAACACCAG--TACAGACTATTATGCTGAGTTTCCCTACTCCAAGTTCATCCCCACCACTAGGCGTGCGACTGAGT

a
s	mr.mrrefChr5	268919	137	+	294542	TCCCAAGAATACAGAGTGTTTTTAGTCTCTTATTCCAAGTACCATAATTTGCTGAGGGCCTGTACACCTAGTTAGACAAAATTACAGCCAAAACAGTAGTTTTTTTAATCCATTCCCACCCTCCATAGCACAATCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	416518	137	+	636262	TCCCAAGAACACAGAGTGTTTTTAGTCTCTTATTCCCAGTACCATCGTTTGCTGAGGGCCTGTGAACATAGTTAGACAAAATAACACCCAAAGCAGTAGTTTTTTTAATCCATTCCCACCCTCCATAGCACCATCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	422544	136	+	647215	TCCCAAGAGTATAGAGTGTCTTTAGTCTCTTATTGCAAGTACCATAATTAGCTGAGGGC-TGTACACCTAGTTAGACAAAACTACAGCAAACACTTTAGTTTTTTTAATGCATACCCACCCTCCATAGCACAACCAA

a
s	mr.mrrefChr5	269056	450	+	294542	TGTTGAATTGAACTTTCCCATTTAATGAGTCATAGGTAACTTATTCCTGTTTTCCTCTTACTTATAAACAAACCCTGCCACCACATATTGACAACTTGACATGCATTCAGGATATGCATTATGATTTGTCATTTTTGGCATGTACTAGTTGCTAGGGGGGCTGATGGCGGAAACCTTTTTTGTCACAGCTTGATAGTCAGTGGTTCACTAAAGTATGTATTTAGATGCCCTCACGTCTATTCCAGATGCAAGTATCAATCCCAGCTACCAGCTCACTTCCAAACAAAAGAGCATATTTGCAATCATGCTGAGGCATTGGACTACAAAAGTCAAGTCACTGATAAACTCTGCGCAATCTTAAGGTATTTAATAAAGAGAGTTGGTCTCCTAAGGTATCACTAGTCTGAATGCTATCATGTTGCTATTGGATTTCTCATCAGCAGGATTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	416655	446	+	636262	TGTTG--TTGAACTTTCTCATTTAATGAACCATAGGTAACTTATTCCTGTTTTCCTCTTACTTATAAACAAACCCTGCCACCACATATTGACAACTTGACATGCATTCAGGATGTGCATTATGATTTGTCATTTTTGGCATGTACTAGATGCTAGGGGGGCTGATGGCGGGAACCTTTTTTGCCACAGCTTGATAGTCAGTGGTTCATTAGAGTATGTATTTAGATGCACTCACGTCTATTCCCGATGCAAGTACCAATCCCAGCTGCCAGCTCACCACCAAACAAAAGAGCATATTTGCAATCATGCTGAGGCATTGGACTACGAAAGTCAAGTCACAGATAAACTCTGCGCATTCTTAAGGTATTCAATAAGGAGAGTTGATCT--TAAGGTATCACTAGTCTGAATGCTATCATGTTGCTATTGGATTTCTCATAAGCAGGATTGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	422683	438	+	647215	TGTTGAATTGAACTTTCCCATAAAATGAGTCATTGCTAACTCATTCCCGTTTTCCCCTCACTTATAAACAAACCCTGCCACTATGTATTGACAACTTGACATGCATTCAGGATATGCATTACGATTTGTTCTTTTTGGCATGCACTAGTTGCTAGGGGGGCTGTTGGCGGAAACCCTTTTTGTCATAGCTTCATAGTCAGTAGTTCACCCAAGTATGTATCTAGATGCCCTCATGTCTATTCCAGATGCAAGTATCAATCTGAGCTACTGGCTCCCTTCCAAACCAAACAGGATATTTGCAATCATGCTGAGGCGTTAGACTACAAAAGTAAAGTCACTGATAACCTCTACATAATCTTAAGGTACTTAACAAAGAGAGTTGGCCTCCTAAGGTATCACTAATCTGG------------TGCTATTGGATTTCTCCTCAGCGGGATTGCT

a
s	mr.mrrefChr5	269506	126	+	294542	CCAGTTGAGCTGGACTGGGGTATCACAAAGTCATTATTTCTCTGTTACCTCCGTATATGTCCAAAGTGACTATCTTGACTGCTTTCCAGATGCAACATACACACTTTGACCATACTCACCATATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	417101	126	+	636262	CCAGTTGAGCTGGACTGGGGTATCACAAAGTCATTATTTCTCTGTTACCTCCCTATATGTCCAAAGTCACCATCTTGACTGCTTTCCAGATGCAACATACACACTTTGACCATACCCAGCATATAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	423136	126	+	647215	CCGGTTGAGCTGGACCAGGTTATCACAAAGTCTTTATTTATCTCTTACCTCCGTATATGTCCAAGGTGACTATCCTGACTGCTTTCCAGATGCAACATACACACTTTGACCATACTCACCATATTG

a
s	mr.mrrefChr5	269632	47	+	294542	CCTACTCAATAATTGTCTAGTCATTGGTCAGGTTGCTATTTTGAATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	417228	47	+	636262	TCAACTCCATAATTGTCTAGTCATTGGTCAGGTTGCTATTTTGAATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	423262	47	+	647215	CCTGCTCAATAATTGTCTAGTCATTGGTCATGTTGCTATATAGAAAC

a
s	mr.mrrefChr5	269679	88	+	294542	ACACCCAGTAATGGGCCCTCTAATCATGGAAGCAAGGCAGGGCAACTACTAAAAAGAGCGATCCATGTCAACTATGTTGGGGTGCCTG
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a
s	mr.mrrefChr5	269767	38	+	294542	CATACTAAAGTTAATATGGGTTCCATTAATATGGGCCC
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a
s	mr.mrrefChr5	269805	33	+	294542	AAAGCATCTGGTGATGGTTGGGATAAAACGACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	417404	32	+	636262	-AAGGATCTGGTGATGATTGGGATAAAACGACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	423436	33	+	647215	AAAGCATCTGGTGATGGTTGGAATAAAACAACC

a
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a
s	mr.mrrefChr5	269928	108	+	294542	CTGCCCACTCTCGTGTCTAATGGACCTTCCCATGAATGTTTGCATCAATCCTTGGCCAACAGATATGACCAGTTCTGGTGGGGCATACACGAAAGGGATGGAACTGAA
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a
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a
s	mr.mrrefChr5	270126	193	+	294542	ATGTAGATCCTGCTGTGACACTACTAATGATAGCTGACATGATTTTAAGTGGAAACGTGAAGTGTCTCTAGGAATGTAAACCAAAAAATCCTCATGGGTGATCAAGGTCAGCAAACCATCATGAGTGGTTGGATGACTGGAAGGCATAAATGTATCATGTTAATTTCTTACCCCACTGATTTCATGTCTTTAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	417727	193	+	636262	ATGTAGATCCTGTTGTGACACTACTAATAATAGCTGACATAATTTTAAGTGGAAACGTGAAGTGTCTCTAGGAATGTAAACCAAACATTCCTCATGGGTGATCAAGGTCAGCAAACCATTATGAGTGGTTGGATCACCAGAAGTCATAAATGTATCATGTTGATTTCTTATCCCACTGATTTCACATCATTAG
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a
s	mr.mrrefChr5	270319	31	+	294542	CTGAAGTTCGTCTCCATGTGGTTGCCAGAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	270350	61	+	294542	TACCAGAAATCTGATGTACACTGATAGGCCTACTAAGCTCCACTGCCTCGTCTTAGTAGAC
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a
s	mr.mrrefChr5	270411	54	+	294542	ACCACACTTTGTAAGTTAAGTTGTGGTAGGACATAGAACCCTACTAACATGGGA
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a
s	mr.mrrefChr5	270465	265	+	294542	ACATCAATGTCACTACCTTAAATAGCTCATCTTGAATATATGGCCCCTGGATATGAGATCTTCGTTTCATATAAAATAGTCAGAACTTCCTAGTTTGGTTACAGACACAGGCATCCCTATTAACCTAGTAGTTCCTGCTCTGCCACCGGCAGTTTGAGGACCCTTGACTGTTCGTTCTTTCTACACTTGGTGCCATCTTTCCCCAGTGTGGTGTGGCAGATCAAGTCTACCTATGCTATTCATCTTTTTCTCTATCAATTGCACT
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	424116	259	+	647215	ACATCAACGCCACTACCTTAAATAGCTCATCTTGAATATATGGCCTCTGGATATGAGATCTTCGTTTCATATAAAATAGTCAGAACTTCCTAGTTTGGTCACAGACACAGGCATCCCTATGAGCCTAGTAGTGCCTGCTTTTACACCGG------GAGGACCCTTGACTGTTCGTGTTTTCTACAATTGGTGCCATCTTTCCCCAGTGTGGTGTGGCAGATCAAGTCTACCTATGCTATACATCTTTATCTCTATCAATTGCACT

a
s	mr.mrrefChr5	270730	282	+	294542	CCAATACTTGTATAGACCTCTACAGCATTGAGATAATGAGCAGACCATGTATCCTTTCTTGATGCCCATGCTATTGCAGTATTTGCTTGGAACTTTTACAGGGCTAGAATGCACAAAAGTGCCCAAACAATTTATTTATATCCTGAGCCATAACTTAGTTTAGGGAGATCTACAGGATTTCATGTTCACATGTTTCACTAGAGTTCTCATGTTGTGCCCTAACCATTCCTCCCAACTGCATGGATAACTCTACGTTTTAGAAATATCTGGTGTAGGATGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	418318	273	+	636262	CAAATACT---------CTCTACAGCATTGAGATAATGAGCAGACCATGTATCCTTTCTTGATGACCATGCTATTGTAGTATTTGCTGGGAAGTTTTACAGGGCTAGAATGCACAAAGGTGCCCAAACAATTTATTTATATCCTGAGCCATAAATTAGTTTAGTGAGATCTACAGGATTTCATGTTCACATGTTTCACTAGAGTTCTCATGTTGTGCCCTAACCATTCCTCCCAACTGCATGGATAACTCTACGTTTTAGAAATATCTGGTGTAGGATGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	424382	282	+	647215	CCAATACCTGTATAGACCTCTACAGCATTGAGATAATGAGCAGACCATGTATCCTTTCCTGATGCTCATGCTATTGCAGTATGTGTTTGGAACTTTCACTAGGCTAGGATGCACAAAAGTGCCCAAACAATTTATTTATATCCTGAATCATAACTTAATTAAGGGAGATCTACAGGGTTTCATGTTCACATGTCCCACTAGAGTTCCCATCTTTTGCTATAATCATTCCTCCCAAATGCATTGATGACTCAACATTGTAGAAATATCTGGTGTATGTTGGTG

a
s	mr.mrrefChr5	271012	180	+	294542	GTGTGGTACTTTCCCTTTCTCTTGGCACTATGAAGGCTTTTCTAATCTGTTGAGAACATCTGAAGGTTAACTGACTATTGGCATGACTGGATCCTCTGAGGTGACAGCAAAACATAAACACTTAAATCACCTCTGGCTGTTCCTTGGATGTGAAAGAAATGATTGCTGAGAGCAATTCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	418591	175	+	636262	GTGTGGTACTTTCCCTTTCTCTTGGCACTATGAAGGCTTTTCTAATCTGGTGAGAACATCTGAAGGTTAACTGACTATTGGCATGACTGGATCCTCTGAGGTGACAGCAAAACATAAACACTTAAACCACCTCAGGCTGTTCCTTGGAGGTGAAAGAAGTTATTGCTGTGAGCAA-----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	424666	178	+	647215	GTGTGGTCCTTTCCCTTTCTCTCGGCA--ACTAGGGCTTTCCTGGTCGGTTGAGAACATCTGAAGGTTAACTGACTATTGGCAGGTTTGGATCCCTTGAGGTGACAGCAAAACATTCACACTTAAATCACCTCTGGCTGTTCCTTGGATGTGAGAGAAATGATTGCAGAGAGCAATTCAG

a
s	mr.mrrefChr5	271192	5	+	294542	GAGCA
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a
s	mr.mrrefChr5	271197	243	+	294542	CAGAGACAACTACCTAAAATTTCACATTGGCAGCTATGATGTGGAAGAGTCTCCAGTTACAAAGGAGGATCCCATCCAGGACATCAGGACCCATAAAGGAGAGACAACTGACAAAGCAATTCTATACTCAACCAGAGGGCAAGATACAGTGCAACATGCATCACAGGAAGCATAATCAGAGTCATGATGGTACGCAACCACTAATGATAGCATCACAGGACCACATGCTCTAGTTTAGAGAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	418766	205	+	636262	------------------------CATTGGCAGCTATGATGTGGAAGAATCTCCAATTCCAAAGGAGGATCCCATCCAGGACATCAGGACCCATAAAGGAGAGACAACTGACCAAGCAATTCTATACTTAACCAGAGGGCAAGATACAGTGCAACATGCATCACAGGAAGCATATTCAGAGTCATGATGGTGCGCA--------------CATCACAGGACCACATGCTCTAGTTTAGAGAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	424857	243	+	647215	CAGAGACAACTACCTAAAATTTCACATTGGCGGCTATAATGTGGAAGAGTCTCCAGTTACAAAGCAAGATACCATCCAGCACATCAGGACCCATAAAGGAGAGACAACTGACAAAGTGATTCTATACTCAACCAGAGGGCAAGATATAGTGCACTATACATCACAGACAACGAGATCAGAGTCATGAGGGTATCCAACCACTAATGATAGCATCACAGGGCCACGGGCTCTAGTTTAGAGAGA

a
s	mr.mrrefChr5	271440	56	+	294542	TTTGCCCTGCTGTGTGAGAGAATCACCATAAGTGTCGTCCGCCCTAATCGACAACG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	418973	56	+	636262	TTTGCCCTGCTGCGTGAGACAATCACCATAAGTGTCGTCCGCCCTAATCGACAACG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	425100	33	+	647215	TTTGCCCTGCTGTGTGAGAGAATCACCATAAGC-----------------------

a
s	mr.mrrefChr5	271496	114	+	294542	GGCCACGTGGTACAGACAGTGTGTAAGTAAGAATGATATCGATTTTGCATTAAGTCACTATACATACACCAGCCTAGATAGGAGGAGAAAAATTAAATGAAAATTGACGGTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	419034	114	+	636262	GGCCACGTGGTACAGACAGAGTGTAAGTAAGAATGATATCGATTCTGCATTAAGTCACTATACATACACCAGCCTAGATAGGAGGAGAAAAATCAAATGAAAATTGACGGTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	425133	98	+	647215	---------------ACAGTGTGTAAGTAAGAATGATATCAATTTTGCATTAAGTCACTATACATGCACCAGC-TAGATAGGAGGACAAAAATTGAATGAAAATTGACAGTGCT

a
s	mr.mrrefChr5	271610	11	+	294542	CGTACAAGGCT
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a
s	mr.mrrefChr5	271621	48	+	294542	TTTTTCTACTTGATAGAAAAGTTGAAAAGTTCTAATTGACTAGTGCAC
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a
s	mr.mrrefChr5	271669	216	+	294542	TATAAGTATCCAAACTCAGGTGGCTGCTGAGGCCAAAAATGTGTTCATTATATACGTGTAACTTCTATGCAAAATTACATTTAATATTCCTGATGACAGGTTGTCTGTCCAGATTGTGTTTCCAGATGCTGTACACAGGGATATAGACTTTAATTAATGAAGGCTCGTGCCTACATCTGACACTGAGCTGATGCAACTTAAATCAATCGAGCAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	419327	216	+	636262	TATAAGTATCCAAACTCAGGTGGCTGCTGAGGCCAAGAATGTGATCATTATATACGTGTAACTTCTATGCAAAACTACATTTAATATTCCTGATGACAGGTTGTCTGTCCAGATTGTGTTTCCAGACACTGTACACAGGGATATAGACTTTAATTAATGAAAGCTCGTGCCTACATCTGACACTGAGCTGATATAACTTAAATCAATCGAGCAAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	425378	216	+	647215	TATAAGTATCAAAACTCAGGTGGCTTTTGAGGCAAAAAATGTATTCATTATATACGTGTAACTTCTATGCAAAATTACATTTAATATTCCTTATGACAAGTTGTCTTTCCAGATTGTGTCTCCAGATGCTGTATACAGGGACTTAAACTTTAATTAATGAAGGCTTGTGCTTACATCTAACACTGAGCTGATGCAACTTAAATCAATTGAGCAAGA

a
s	mr.mrrefChr5	271885	118	+	294542	CTAACTTGCTAGTAGTGAACTGTAGAGATAGAAAATTTATGTCTCCAAGTCAGTACACTTGATACAGTATGTGGAAGAGGCACAACTAGGCACTAGGCATATGGATTGTGGGTCACAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	419543	118	+	636262	CTAACCTGCTAGTAGTGAACGGTAGAGATAGAAAATTTATGTCTCCAAGTCAGTACACTTGATACAGTATCTGGAAGAGGCACAACCAGGCACTAGGCATATGGATTGTGGGTCACAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	425598	118	+	647215	TTAGCTTGCTAGTAGTGAACTGTAGATATAGAAAATTTATGTCTCCAAGTCAGTACACGTGATACAGCATGTGGAAGCGACACAACTAGGCACTAGGCACATGGATTGTTGTTCACAT

a
s	mr.mrrefChr5	272003	184	+	294542	ACCTTTTGATGCTCTTAGACAGGGGTGCTTAGTGGCTACCTCAAATTTTCAAACCAACCAGGATGTCTTAACCTATCTAGTAAGTTACAGTAGCCTGAACACCAGGCTAACCATCTCTCTGATTTTAGACTAGCCACCTAGATTCCAGCTCATTCACAACTGGAAGAATTGTGATCCATACTTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	419661	181	+	636262	ACCTTTTGATGCTCTTAGGCAGGGGTGCTTAGTGGCTACCTCGAATTCTCGAATCAACCAGGATGTCTTAACCTATCTGGTAAGTTACAGTAGCCTGAACACCAGGCTGACCATCTCTCTGATT---GACTAGCAACCCAGATTCCAGCTCATTCACAACTGGAAGAATTGTGATCCATACTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	425732	184	+	647215	ACCTATAGAAGCTCTTAGACAGGGGTGCTTAGTGGGTACCTCATATCTTCAAACCAACCAGGATGTCTTGACCTATATAGTGAGTTACAGTACCCTGAACACTAACCCAAACAGCTCTCTGATTTTAGACTAGCCACATAGATTCAAGCTTACACACATCTGGAAGAATTGTGAGTGATACATA

a
s	mr.mrrefChr5	272187	7	+	294542	AGGATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	419845	7	+	636262	AGGATTA
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a
s	mr.mrrefChr5	272194	94	+	294542	GAAGACCAAAGCTATATTTTGTTTCAGAGTAGCACCTTAGTCGCAAACTCAGTACACTAGATTAGTGATCTGTTCCCAACTAAGGTACTTTACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	419853	94	+	636262	GAAGACCAAAGTTATACTCTGTTTCAGAATAGCACCTTAGTTGCAAACTCAGTACACTAGATTAGTGATCTGTTCCTAACTAAGGTACTTTACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	425923	94	+	647215	GAAGACCAAAGCTCTATTTGGCTTTAGAGTAGCACCCTAGTCACAAACTCAGTACGCTAGATTAGTAATATGTTCCCAACTAAAGTACATTATG

a
s	mr.mrrefChr5	272288	57	+	294542	CTGAGAACTTAGACACATCCAGCAGCACAGCCCCCCAGTCTCTGTCAAAGGAGCAAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	419947	57	+	636262	CTGGAAACTTAGACACATCCAGCAGCACAGCCCCCCAGTCTCTGTCAAAGGAGCAAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	426167	57	+	647215	CTGAGAACTTAGATGCGTCCAGCCGCCCAGCCCACCAGCCTCTGGCAAAGGAGCAAA

a
s	mr.mrrefChr5	272345	70	+	294542	GGAGCTAAGAAATATATTATAGTTTACTCTTGTAATCACCAGATTCTTAGGGACCTCTCAGAATGGGGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	420007	70	+	636262	GGAGCTAAGAAATATATTATAGTTTACTCTTGTAATCACCAGATTCTTAGGGACCTCTCAGAATGGGGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	426224	70	+	647215	GGAGCTCATAAATGTAATATAGTTTACTCTTTTAACCACCAGATTCTTGGGGATCTCTCTAAATGAGGTA

a
s	mr.mrrefChr5	272415	203	+	294542	TATTGTCAGTATAGACATCTGCTCTCAGTACTCTGCTTGAGTTATCTTATCACTTGAGCATGAAGACATATGTTCTGGGCTTCTTGAGCGATAATGTAAGGTTAGGAGATGCCCATTCTATATGCATGCATGGGCTATACACCTTTATCCCCTGGTATGCCAAGGTCCCTGTGATAAACTGCGCTTGACCAAACTGGCTCTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	420077	196	+	636262	TATTGTCAGTATAGACATCTGCTCTCAGTACTCTGCTTAAGTTATCTTATCACTT-AGCATGAAGAGATATG------GCTTCTTGAGCGATAATGTAAGGTTAGGAGGTGCCCATTCTATATGCATGCATGGGCTATACACCTTTATCCCCTGGTATGCTAAGGTCCCCGTGACAAACTGCGCTTGACCAACCTAGCTCAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	426295	203	+	647215	TGTTGGCATTATAGGCGTCTACTCTCAGTACTCTGCTGGAGTTATGTCATCACTTGAGCATGAAGACATATGTTCTGGGCATCTTTAGCAATAATGTAAGGTTAGGAGATGCCCATTCTATATGTATGCATGGGCTATACACCTTAATCCCCTGGTATGCCAAGGTCCCTGTGATAAACTGGGCCTGACCAAACTGACTCTCT

a
s	mr.mrrefChr5	272618	29	+	294542	TGGAACAGAGGCAACAATCAGAGTAAAAT
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a
s	mr.mrrefChr5	272647	14	+	294542	ATCAGTAAGATACA
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a
s	mr.mrrefChr5	272661	203	+	294542	AATTTTCTACACTTTAGGAGAGTTTTGTCATATGAGGAATCAGGCATGCCGGGTGTATATCCATATCACCAATAATCATAAAAGGTTCACCAGCCTTAGGTAGGTAAGTATCAGGTCAATTGTTCTGCCATTCTAATGTCAAAGTTGGCAGCATAAACACTTGCCATGTGCCTTGAGGGACATTGTGTAGCGACCCTGGACAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	420326	192	+	636262	AATTTTCTACACT------GAGTTTTGTCATATGAGGAACCAGGCATGCCGGGTGAATA-----ATCACCAATAATCATAAAAGGTTCACCAGCCTTAGGTTGATAAGTATCTGGTCAATTGTTCAGCCATTCTAATGTCAAAGTTGGCAGCATACACACTTGCCATGTGCCTTGAGGGTCATTGTGTAGCGACCCTGGACAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	426541	197	+	647215	AATTTTCTACACTTTAGGAGAGTTTTGTCATACGAGAAATCAGGCAAGCCAGGTGTATATCCATATCACCAGTAATCATAAAAGGGTCACCAGCCTTAGGTAGGTAAGTATCAGGTCAACTCTTCTGCCATTCT---GTTAAAGTGTGCAGCATAAACACTTGCCATGTGCCTTG--GGACATTGTGAGGAGATCCTGGACG-

a
s	mr.mrrefChr5	272864	41	+	294542	GGATAACACAGAGAATTCCTTGGAAACAATACACTTTCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	420519	41	+	636262	GTACAACACAGAGAATTCCTTGGAAACAATACACTTTCCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	426738	41	+	647215	GGATAACACAGAGAATTCCTTGAAAACTATACATTTTCATC

a
s	mr.mrrefChr5	272905	123	+	294542	TGTGTTCCTTGCAAGTAACATGTTACAAGAACTTAGGTCTTGATAATGTACATTTAATTTTAGATGTCAACTTGACCACACTTAAGAAAGTCCTGATGATCATCTGTTATTTTCAATTTTTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	420560	123	+	636262	TGTGTCCCTTGCAAGTTACATGTTACAAGAACTTAGGTCTTGATAATGTACATTTAATTTTAGATGTCAACTTGACCACACTTAAGAAAGTCCCGATGATCATCTGTTATTTTCAATTTTTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	426783	123	+	647215	TGTGTTCCCTTCAAGCAGCATTTTGCAAGAACTTAGGTCTTGGTAATGTACATTTAATTTTAGTTGTCAGCTAGACCACACTTAAGAGAGTCCTGATGATCATCTGTTATCTTCAATTTTTCC

a
s	mr.mrrefChr5	273028	45	+	294542	TCTCATATATCCACATTGTATGATTCTGCTTAAACAAGGTCTCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	420683	45	+	636262	TCTCATATATCCACATTGTATGATTCTGCTTAAACAAGGTCTCCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	426913	45	+	647215	TCTCATATACACACATTGTATGATTCTGCTCAAACAAGATCTCCT

a
s	mr.mrrefChr5	273073	18	+	294542	GACCCATAATTGTCTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	420729	18	+	636262	GACCCATAATTGTCTAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	426958	18	+	647215	AACTAGTAACTGTTGAAA

a
s	mr.mrrefChr5	273091	16	+	294542	TGCAGCCTTAATTGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	420747	16	+	636262	TGCAGCCTTAATTGAG
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a
s	mr.mrrefChr5	273107	37	+	294542	CTAGCATTGGCAACTTGAGCTATTTGGTCTGTAGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	420766	37	+	636262	CTAGCATTGGCAACTTGAGCTATTTGGTCTGTAGTAC
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a
s	mr.mrrefChr5	273144	276	+	294542	GTTCAGAACTAAGACATATGAGACACTTCACACAATCTGAATAACTAGTATGTCTAATAGACAACTGGGATGTAGGGAATTGGCTACTAGATTAGTTGGCGTCACCTAATATAATAAGTATATATTATTGGTTATGTGAGCTATATAGTTTATATCTGTAAGTATATGTATTTAGGCTAGAGCCCTTGTCATGACCATACATAGAATCCAGAACAATTGCAGCTTTACAAACTGGTATTATCTGTATATGCCTATAGTATGTAGCTTGACCCTAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	420803	254	+	636262	GTTCAGAACTAAGACATATGAGACACTTCACACAATCTGAATAACTAGTATGTCTAATAGACAACTGGGATGCAGGGAAT----------------------CATCTAACATAATAAGTATATATTATTGGTTATGTGAGCTATATAGTTTATATCTGTAAGTATATGTATTTGGGCTAGAGCCCTTGTCATGACCATACATAGGATCCAGAACAATCACAGCTTTTCAAACCGGTATTATCTGTATATGCCTATAGTATGTAGCTTGACCCTAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	427031	276	+	647215	GTCCCATACTAAGACAGATGAGGCACTTCGTGCAATTTGAATAACTAGTCTGTATAATAGACAACTGGGATGTAGGGAATTGGCTACTAGATTAGTTGGCGTCACTTAATATATTAAGTAAATATTATCGGTTATGTGAGCTACCTAATTAATACCTGTAAGCATATGTTTTTAGGCTACAGTCCCTGTCATAACCATAGATAGAATCCAGAACAATTGCAGCTTTACAAACTGGTATTACCTGAATATGCCTATAGTATGTAGCTTGACCCTAGT

a
s	mr.mrrefChr5	273420	66	+	294542	ATTCCTCCACACATATCTGTCTGACCTTTTCCTGGCCTCATGATGCTTTGTTGTTCTGATTGTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	421063	66	+	636262	ATTCCTCCACACATATCTGTCTGACCTTTTCCTGGCCTCATGATGCTTTGTTGTTATGATTGTGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	427307	66	+	647215	ATTCCTTTACACATGACTGTCTGACCTTCTCCTAGACTCATGATGCTTTGTTGTTCTGATTGTGTG

a
s	mr.mrrefChr5	273486	343	+	294542	GCTACCCTTTGATCTGAAGTAGAACTTCAGTGTGTGAGGTGTGGCCAAGCCAATCACAAGATATGACAGGCTCATGGGCATTTCCTAAGCACCACTGGGTTTTGGTGCTAAGATTACCATATCATGTTGGAATAGTTTATGTGATACTAGTAAGGACTGAAATTGATACAGTTATGGAGGCTGACTGTTCCCCCTGGCTAGGACCTATGAGACATGCCCCAGAAGGCTTTTAGAGAGCACTGCTTTAGCCTGGATAATCATAACTATTGCCCTGTCTTTTTCCAAAGTTAGCATCATGTTTGCCAGGCAGTCCATTGGACAAACAGAATGTTTACCTCCTCCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	421130	343	+	636262	GCTACCCTTTGAACTGAAGTAGAACTTCAGTGTGTGAGGTGTGGCCAAGCCAATCACAAGATATGACAGGCTCATGGGCATTTCCTAAGCACCACTGGGTTTTGGTGCTAAGATTACCATATCATGTTTGAATAATTTATGTGATACTAGTAAGGACTGAAATTGATACAGTTATGGAGGCTGACTGTTCCCCCCAGCTAGGACCTCTGAGACATACCCCAGAAGGCTTTTAGAGAGCACTGCTTTAGCATGGATAATCATAACTATTGCCCTATCGTTTTCCAAAGTTAGCATCATGTTTGCCAGGCAGCCCATGGGACAAACAGAATGTCTACCTCCTCCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	427373	342	+	647215	ACCACCCTTTGATCTGAAGTGGAACTTCAGTGTGTAAAGTGTGGCCAAGCCAATCACAAGATATGACAGCCTCATGGGCATTTCCCAAGAACCACTGGGTTTTGGTGCTAAGATTGCCATATCATGGAGGAATAGTTTATG-GCTATTAGTAGGGACTGAAATTGATACACTTATGGAGGCTGACTGTTCCCCCTGGCTAGGACCTATGAGATATGACCCAGAAGGCTTTTAGAGAGCACTGGTTTAGCCTGGATAATCATAACTATTGCAATGTATTTTTCCAAAGTTAACATCAGGTTTGTCGGGCAGTCCATTGGACAAACAGAATGTTAACCTCTTCGC

a
s	mr.mrrefChr5	273829	148	+	294542	CAACCATCTGCATGCTGATAGATAAGCTGTATGAGTCAATCCTATCTTCAGTTTTTGAGCACCAGAAAACTAGGAGGAGTACCAGGCCATTCACATCAACATGCTTGTTACCTAGTGTTGTTTAGATTTTGCATAGCAAATCGTGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	421473	148	+	636262	CAACCATCTGCATGATAATAGATGAGCCATATGAGTCAGTCCTATCTTCAGTTTTTGAGTACCAGAATGCTAGGAGGAGTACCAGGCCATTCACATCTACATGCTCGTTACCTAGTGTTGTTTAGATTTTGCATAGCAAATCGTGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	427718	148	+	647215	CAACCATCTGTATGCTGATACATAAGCTGCATGAGTCAATCCTATCGTCAGTGTTTGAGCACCAGAAAACTAGCAGGAGTACCAGACCATTCACATCAACATGCTTGTTACCTAATGTTGTTTAGATTTTGCATAGCAAATCGTGCAA

a
s	mr.mrrefChr5	273977	95	+	294542	AGCACACATATCAGGGGATTTTTTGCATCAAGAGGTATACTAATTAACTTCCTAGTTATCCGAGCACCGAAACCTGGAAATGAGGTTCCTCAATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	421634	95	+	636262	AGCACACATATCGGGGGATTTCATGCCTCAAGAGGTATACTAATTAACTTCCTAATTATCCAAGCACCGAGACCTGGAAATGAGGTTCCTCAATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	427866	95	+	647215	AGCACACATATCAGGGAATTTTTTGCATTGAGAAGTGTACTAATTAAATTCCTAGTTATCAGAGTACCGAAACCTGGAAATGAAGTTCCTCAATA

a
s	mr.mrrefChr5	274072	143	+	294542	TGCCTGTTAACGTCAAATGGATGAATACTTCCATTTGTGATTTCCACAGGCAAGTCGCTAACTTCCAAAATACCAATTATGTTTTGCCTTCATGATCCTCTAAACTGGTTGGATCATCGCTTAAACTGGTTGGGCTGTTAAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	421731	143	+	636262	TGCCTGTTAATGTCAAATGGATGAATACTTCCATTTGTAATTTCCACAGGTAAGTCGCTAACTTCCAGAATACCAATTAAGTTTCGCCCTCATGATCTTCTAAATTGGTTGGATCATCGCTTAAACTGGTTGGGCTGTTGAAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	427961	127	+	647215	-----TTGAGCTTCACA-------ATAC----ATTTGTGATTTCTGCAGGCAAGTCGCTAACTTCCAAAATACCAATTATGTTTTGCCTTCATGATCCTCTAAACTGGTTAGATCATCCTCTAAACTGGTTGGGCTGTTAAAG

a
s	mr.mrrefChr5	274215	54	+	294542	ATAGCCCAGTGTACTGCACCACTTCTGGAGTGTGGGGCTTTCAGACTTGATATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	421874	40	+	636262	ATAGCTCAGTGTGCTG--------------TGTGGGGCCTTCAGACTTGATATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	428089	54	+	647215	ATAGCCCAGTGTATTGCACCACTTCTGGAGTGTGGGGCTTTTAGACTTGATGTA

a
s	mr.mrrefChr5	274269	78	+	294542	TGGTCCTAACCTCGGCAACATCATAAAGTATATAATCTAACAACTCAATATTAACTCTACACACTATTGAGTGACCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	421915	78	+	636262	GGGTCCTAACCTTGGCAATATCATGGAGTATATAATCTAACAACTCAATATGAAAGCTACACACCATTGAGTGACCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	428143	78	+	647215	TGGTCCTATCCTCGGCAACATCATAAAGTACATAATCTAACAACTCATTATTAACTCTGCACACTATTGAGTGACCAT

a
s	mr.mrrefChr5	274347	77	+	294542	GCCTGCAGCATTGGTAACCAGCTGAGGTATGTGATCAAAATGCTTGAACTTAGTGCCTTGTGGTTTCTAAGAGTAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	421993	77	+	636262	GCCTGCAGCATTGGTAACCAGCTGAGGTCTGTGATCAAACTGCTTGAACTTAGTGCCTTGTGGTTTCTAAGAGTAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	428224	77	+	647215	GCCTGCAGCATTGGTAACCACCTGAGTTACATGATCAAAATGCTTGAAGTTAGTGCCTTGTGGTTTCTAAGAGCAGC

a
s	mr.mrrefChr5	274424	118	+	294542	ATATGAAATAGTCATTTATCAATCAGTTAAAGGCCATTGTGGCCACAATTGAGGTGGCCATGCAGATGAGCTAAGGGGTATACTTTTACTCCTAAATAATATTGAATGTCTGCCTGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	422070	118	+	636262	ATATGAAATAGACATTTATCAATCAGTTAAAGGCCATTGTGGCCATAATTGAGGTGGCCATGCAGATGAGCTAAGGGGAATGCTTTTACTCCTAAATAATAATGAATGTCTGCCTGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	428314	118	+	647215	ATATGAAATAGTCATTTATCAATGAGTTAAAGGCTATTGTGGCCACAATTGAGGTGGCCATGCAGATGAGCCGAGGGGTACACTTGTACTCTGGAATAACATAGAATGTCTGCCTGCT

a
s	mr.mrrefChr5	274542	50	+	294542	AAGTCTGTCAATTAGATGTCGATGTTACACAAACACACGCATACCTACCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	422188	50	+	636262	AGGTCTGTCAATTAGATGTCTATGTTACACAAACACACGCATACCTACCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	428433	50	+	647215	AAGTCTACCAATAAGATGTCGATGTCACACAAACACACACATACCTACCC

a
s	mr.mrrefChr5	274592	125	+	294542	CTACATCATACCTACCCTAATCTGCATAGGGACATGAGAAATAGTATGCAATATATGTCCTGTAGCATGCTTATGACCATGCTGTCAATCTTTAATTACACTGCAGAGTAAACCTGCCCCCGCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	422242	125	+	636262	CTACATCATACCTACCCTAATCTGCATAGGGACATGAGAAATAGTATGCAATATATGTCCTGTAGCATGCTTATGACCACGCTGTCAAACTTTAATTACACTGCAGAGTAAACCTGCCCCTGCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	428483	125	+	647215	CCGAATCATACCTACCTTAATCTGCATAGGGACATGAGAAATAGTATGCAATATATGTCCTGTAGTATGCTTATGATCATGCTGTCAATCTTTAATTACACTGCAAAGTAAACCTGCCCCCCCCC

a
s	mr.mrrefChr5	274717	175	+	294542	AGAATTAATATCATACTGGTTACAAGTGGGATGAGAGGTAGGCACCCTTCATTGCAGGATGCACACACCCAGCCAACAAAATGTGCGATTTTTTCATTTTGCCTATCTTGGCTGTGCATCATTGTGAAAGGTGATCTTTCAATCGGGTTGTGGATTTAGGCATGTGCCATGTGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	422367	175	+	636262	AGAATTAATATCATACTGGTTACAAGTGGGGTGAGAGGTAGGCACCCTTCTTTGCAGGATGCACACACCCAGCCAACAAAATGTGCGATTTTTTCATTTTGCCTATCTTGGCTGTGCATCATCGTGAAAGGTGATCTTTCAATCGGGTTGTGGATTTAGGCATGTGCTAGGTGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	428613	141	+	647215	AGAGCTAATATCATACTGGTTACAAGTGGGATCAGAGATAGGCACCCTTCATTACAGGATGCACACACCCAGCCAGCAAAATGTGC---------------------------------CATTGTGAAAGATGATCTTT-AATTGACTTGTGCATTTAGGCATGTGCCATGTGTC

a
s	mr.mrrefChr5	274892	12	+	294542	TTAGATTAGAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	422542	12	+	636262	TTAGATTAGAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	428782	12	+	647215	TTAGATTAAAGG

a
s	mr.mrrefChr5	274904	114	+	294542	GAGATGTGACTAACACACAAGTCAAATCAGGCTCAAGATTCCAATGAGAGTGGCTTGTATATAAACACAAAGGCAAAACAGAGCACACCTGTCAGTGGGGTACATGTATCAAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	422554	114	+	636262	GAGATGTGACTAACACACAAGTCAAATCAGGCTTAAGATTCCAATGAGAGTGGCTTGTATGTAAACACAAAGGCAAAACAGAGCACACCTGTCAGTGGAGTACATGTATCAAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	428798	114	+	647215	GAGATAGGACTAACACACAAGTCAAATCAAGATCAAGCTGCTAATGAGATTGGCCTGTATATAAACACAAAAGCAAAACAGAGCACACCTGTTAGCAGGGTACATGTATCAAGC

a
s	mr.mrrefChr5	275018	89	+	294542	TTAGCTCGGCTACTTGGTACTTGGGCCCATAAGATGTCTTTACAATTGTCCCACCTAGCAAATTTTTAGGAAACAACTTGTGGCCATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	422674	89	+	636262	TTAGCTCGGCTACTTGGTACTTGGGCCCATAAGATGTCTCTACAACTGTTCCACCTAGCAAATTTTTAGGAAACAACTTGTGGCCATAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	428912	87	+	647215	TTAGCCTCGCTACTTGGTACTTGGGCCCATAAGATCTCTTTACAATTGTCCCACCTATCAAATTTTTAGAAAACAA--TATGCCCATAA

a
s	mr.mrrefChr5	275107	22	+	294542	TTATTGTAACAGAGTACCGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	422765	22	+	636262	CCATTGTAACAGAGTACCGCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	428999	21	+	647215	TTGTTGTAACAGAG-ACTGCTT

a
s	mr.mrrefChr5	275129	87	+	294542	ATAGCTAGGAGCTAGCTAGTATTGGGACACTGGGCCATTTATTATTTACTAGGAACAGGTGAGTAGCTGAGCTTTTCTATATTTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	422787	87	+	636262	ATAACTAGGAGCTAGCTAGTATTGGGACACTGGGCCATTTATTATTTAATAGGAACAGTTGAGTAGCTGAGCTTTTCTATATTTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	429024	86	+	647215	ATAGCTTGGAGCCAGCTCGTATTGGGACAC-GGGCCATTTATTTTTTACTTGGAATAGGTGAGTAGCTGAGTTTTACTATATTTGTT

a
s	mr.mrrefChr5	275216	148	+	294542	TGCATTTAGTATTACAACATCTGGTTTGATCTCTACCACAGTTCACCCGGTAAATTTGCAGTGCTGCATAAAATACTAAAGTCTTCAACATTAGCCTGCCAAACTTAATATCCCACACAGTCTCCAGTGGGATCTAGAGACATTGTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	422874	148	+	636262	TGCATTTAGTATCATAACCTCTGGTTTGATCTCTCCCACAGTTCACCCGGGAAAATTGCAGTGCTGCATAAAACACTAAAGTCTGCAACATCAGCCTGCCAAACTTATTATCCCACACAGTCTCCAGTGTGATCTAGAGACACTGTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	429114	139	+	647215	TGCAATTAGTATTACAACATCTAGTTTGATCTCTACCACAGTTTACCCAGTAAGTTTGCAGTGCTGCATAAAATACTAAAGTCTTCGACATTAGC---------TTAATATCCCATACAGTCTCTAGTGGGATCTAGAGACATTGTTG

a
s	mr.mrrefChr5	275364	6	+	294542	TCTTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	423028	6	+	636262	TCTTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	429253	6	+	647215	TCTTGT

a
s	mr.mrrefChr5	275370	30	+	294542	CATCAGTACAGATAAACAATAAAATGCTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	423038	30	+	636262	CATCAGTACAGATAAACAATAAAATGCTAC
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a
s	mr.mrrefChr5	275400	11	+	294542	TTAAGCAAGTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	423070	11	+	636262	TTAAGCAAGTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	429289	11	+	647215	TTAAGCAAGTC

a
s	mr.mrrefChr5	275411	15	+	294542	TCTGTGACTGGTGGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	423082	15	+	636262	TCTGTGACTGGTGGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	429300	15	+	647215	TCTGTGACTGGTGGA

a
s	mr.mrrefChr5	275426	9	+	294542	TCGCCATTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	423097	6	+	636262	---CCATTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	429316	9	+	647215	TCGCCGTTA

a
s	mr.mrrefChr5	275435	278	+	294542	TCTATTGACTCATGCCAGTGCAACACACATAGTCCCTGTGATTTGCACTAAGTGAGCTGATTGTACATGAAATCTCTCATAATCTCTCTGGTACCAAAATAACTCCTACTACCAAGTGTGATCTGTGCATACACCAGTACCTTATAGATTCCAACAATTGGGATCACCTACAGAGAGACAAAAAACGTACAGACCTGTTTTGTCCCCTCTTCTATGTCGTAGGTTCATAAAGACTAGACACATGAGGACATAGAAGATGAGTACTGTACATTTCCCAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	423104	273	+	636262	TCTATTGACTCATCCCAGTGCAACACACATAGTCCCTGTAATTTGCACTAAGTGAGTTGATTGTACATGAAACCTCTCATAATCTCTCTGGTAACAAAATAATTCCTACTACTAAGTGTGATCTGTGCATACACTAGTACCTTATAGATGCCAACAATTGTGATCACCCATAGAAAGACAAAAGACTTAC----CTGTTATGTCCCCTCTTCTATATCGTGGGTTCATAAAGACTAG-CACATGAGGACATAGAAGATGAGTACTGTACATTTCCCAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	429325	271	+	647215	TTTATTGACTCATGCCAGTGAAGCACATTTAGTCTCTGTGATTTGCACTAGGTGAGCTAATTGTGCATGAACTCTCTTATAATCACTCTGGTACCAAAATAACTCACACTACCAAGTGTGATCTGTGCATACACCAGTACCTTATAGATTCCAACAATCGGGATCACCTACAGAGAGACAAAAAACGTACAGACCTGTTTTGTCCACTCTTCTAGGTCATAGG-------GGACTAGACGGGTGAAGACATAGAAGATGAGTATTGTACATTTCCCAT

a
s	mr.mrrefChr5	275713	118	+	294542	ACATACCCAGCGAAGGAAGTCTGGTATAGGATTACAATTCCATTCATCCACCACGGGCCATCAGTCAACTCAACTCATCTGGTCTCAAATTAAACATAACTTCGCACCCTCTAAGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	423382	118	+	636262	ACATACCCAGCGAAGGAAGTCTGGTATAGGATTACAATCCCATTCATCCACCATGGGCCATCAGTCAACTCAACTGATCTGGTCTCAAATTAAACATAACTTGGCAGCCTCTAAGTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	429596	111	+	647215	ACAAACTCAGTGAAGGAAGTTTGGTATAGGATTACAAGTCCGTTCATCCACCACAGGCCA-------ACTCAAATCAACTGATCTCAAATTAAATATATCTTCGCACCCTCTAAGTAT

a
s	mr.mrrefChr5	275831	9	+	294542	CCTTTGTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	423500	9	+	636262	CCTTTGTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	429762	9	+	647215	CCTTCTTAC

a
s	mr.mrrefChr5	275840	149	+	294542	CAACCATTTGAAAGCTATAAAGCATGAACATTGCCAAAACTTTAAGAGAGACCTTAGACTTAGGATGAGAGGCATCTGAACTGTGCTGTGACTCCACTTGGGGCTGTTTAAGCATTACAATCAAGGATGGTAGATGGTGAAGTAAGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	423509	149	+	636262	CAACCATTTGAAAGCTATAAAGCATGAACATTGCCAAAACTTTAAGAGAGACCTTAGACTTAGGATGAGAGGCATCTGAACTGTGCTGTGACTCCACTTGGGGCTGTTTAAGCATTACAATCAAGGATGGTAGATGGTGAAGTAAGGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	429779	12	+	647215	CTACCATCTGAG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

a
s	mr.mrrefChr5	275989	17	+	294542	GATGTTATTAATCTAAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	423668	17	+	636262	GATGTTATTAATCTAAG

a
s	mr.mrrefChr5	276006	87	+	294542	GGGGCAATGGTTGTGTAGATATAGGATGAACATCCTCTACCCAGTATTGTATTGTGGTTATCATGTGGACTCACCATGATGCACAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	423686	87	+	636262	GGGGCAATGGTTGTGTAGATATAGGATGAACATCCTCTACCCAGTATTGTGTCGTGGTCATCATGTGGACTCACCATGATGCATAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	429791	60	+	647215	---------------------------GAACATCCTCTACACAGTATTGTATTATGGTTATCATGTGGACTCACTATGATGCACAGT

a
s	mr.mrrefChr5	276093	215	+	294542	ACATCAAAGCCAGTCATGTGCAACAGTAAAATTGTCTAATCTTACTCCTTGTCTGCAAGAACACTCCTCTAACATCCTGATAGATTTAAATTCCTTACGAGACATCATGTTGTGTTGTATTCTCCTTTAGGAACAATGTATGACTGAACCTGCACACCCTGCAAGTGGCAATGCTACAAGTTGATTGATCACCTTACACCATTAGTGAAATGCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	423773	215	+	636262	ACATCAAAGCCAGTCATCTCCAACAGTCAAATTGCCTAATCTTACTCCTTGTCTGCAAGAACATTCCTCTAACATCCTGATAGATTTAAATTCCTTACGAGACATCACGTTGTGTTGTATTCTCCTTTTGGAACAATGTATGACTGAACCTGCACACCCTGCATGTGGCAATGCTACAAGCTGATTGAGTACCTTACATCTTTAGTGAAGTGCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	429861	215	+	647215	AAATCAAAGCCAGTCATGTGCTACAGTAATATTGTCTAATCTTACTCCTTGTCTGCCAGACCACTCCTCTAACATCCTGATAGGTTTAACTTCCTTCCGAGACAGCATATTGTGGTGTATTCCCCTTTAGGAACAATGTATGGCTGAACCTACAAGCTCTGCAAGTGTTAATGCTGCAAGTTGATTGATCATCTTACACCATGAGTGAAATGTGG

a
s	mr.mrrefChr5	276308	13	+	294542	CTTTTTTTAGTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	423989	13	+	636262	CTTTTTTTAGTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	430076	13	+	647215	CTTTTTTTAGTCC

a
s	mr.mrrefChr5	276321	126	+	294542	CATGCTGAAAACCCTCACTATAAAGTCTTTACTAGACACAGTACATATATAAGATGAACCACATAAACAAAGCACCAACTAATGGACGGTCTCGTATCATGGCCTGCATGCCATCCCCAAAAATAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	424003	120	+	636262	CATGCTGAAAACCATCACTATAAAGTTTTTACTAGACACAGTACATATATAAGATGAACAACATAAACAAAGCACCAACTAA-----GGTCTCGCATCATGACCTGCATAC-ATTCCCAAAAATAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	430089	126	+	647215	CATACTGACAACCCTCACTATAAAGTCTTTAATAGACACAGTAAATATACAAGCTGGACCACATAAACAAAGGACCGAGTACTGGACGGTCTGGTGTCATGGCCTGCATGCCATCCCCACAAATAG

a
s	mr.mrrefChr5	276447	336	+	294542	TGATGTTGGCTATTGCTTTTTTGTGTCTTCTCTGCCCTCTTCTTATTCTTGTTCCACACTCAAGTTAAACAAGTGTAGCTTGTCAACCAATTCTTTCACAGGTATTGTCAACTTCCAACGGTTAGTCAATGGAACACTGGTCAAAATAGCACTCTAATAGCAGTTCAAAGCATAATACTACATTTTTTAACAAAGTCAAGTACTATGTCTTTGAACATCTAGGGCTTTGAACATTGAACTGGCCTAAGCCCTGACATCTGTGATAGCCCTAGCCATGCAAAATAATCCAAGCTTGTGGTACATGGCAGTGGGATCCTCATCTGTGACACTCTGATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	424124	324	+	636262	TGATGTTGGCTATTGCCTTCTTGTGTCTATTCTGCCCTCATCTTATTCTTGGTCCACACTCAA------------TAGCTTGCCAACCAATTCTTTCACAGGTATTGTCAACTTCCAACGGTTAGTCAATGGAACACTGGTCAAAATAGCACTTTAATAGCAGTTCAAAGCACAATACTATATTTTTTAACAAAGTCAAATACTATGTCTTTGAACATCTAGGGCTTTGAACATTGAACTGGCCTAAGCCCTGACATCTGTGATAGCCCTAGCCATGCAAAATAATCCAAGCTTGTGGTGCATGGCAATAGGATCCTCATCTGTGATACTCTGATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	430215	325	+	647215	TGATGTTGGCTATTGCTTTTTGGCGTCTTCTCTGCCCTCTTCTTATTCTTGTTCCACACTCAAGTTAAACAAGTGTAGTGTGTCAACCAATTCTTTCACAGGTGTTGTCAACATCCAACAGTAAGTCCATGGAACACTGAGCAAAAAAGCAGTCCAACAG-----------ATAATACTACATTTTTTAACAAAGTCGGGTCCTATGCCTTTGAACATCTATGGCTTTGAACATTGAACTGGCCAGAGCCCTGGCATCTGTGATAGCCTTTGCCACACAAAATAATCCAAGTTTGGGGTACATGGCAGTGGGATCCTTATCTGTGACACTCTAATC

a
s	mr.mrrefChr5	276783	189	+	294542	AGTGACCCCTTTGGACCTGGGATGAAGGGTGTCGTGTCCTTCTAAAGGTGCTTGCAATCAGATGACAGCATGTGAAGTGGGCACATGAGCCAGGCAGGGTCCTCCTACAGGTGCCTGTAATCACTTGAGAGCGCATAAGTGGGGCCGGCTCAGAGCCACGCACTAACCATGTGCACATGGCCACATTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	424448	189	+	636262	AGTGACCCCTTTGGACCTGGGATGAAGGGTGTCGTGTCCTTCTAAAGGTGCTTGCAATCAGATGACAGCATGTGAAGTGGGCACATGAGCCAGGCAGGGTCCTCCTACAGGTGCCTGTAATCACTTGAGAGCGCATAAGTGGGGCCGGCTCAGAGCCACGCACTAACCATGTGCACATGGCCACATTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	430542	189	+	647215	AGTGAACCCTTTCGACTTGGGATGAATGACGTTGTGTCCCTCTAAAGGTGCTTGCAATCACTTGACAGCATGTGACATGGGCACGTGAGGCAGGCAGGGTCCTCCTACAAGAGCTTGTAATCATTCGAGAGTGCATAAGTGGGGCAGGCTCAGAGCTACATGCTAACCACGTGTATGTGGCCACATTTG

a
s	mr.mrrefChr5	276972	16	+	294542	CCTTTCATTGGAGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	424637	16	+	636262	CCTTTCATTGGAGCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	430740	16	+	647215	TCATACAGTTCAACTA

a
s	mr.mrrefChr5	276988	9	+	294542	TACATGAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	424653	9	+	636262	TACATGAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	430759	9	+	647215	CACTTGTAG

a
s	mr.mrrefChr5	276997	9	+	294542	GCTGTGCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	424663	9	+	636262	GCTGTGCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	430768	9	+	647215	GCGGTGTAA

a
s	mr.mrrefChr5	277006	97	+	294542	TTAAGATTGTTTCTTCTATAGGCTTCTAAGGTGCCTGTTGGAATGATGACTCAACAACACCTCCTAAAAGTTTAGTTGACCTGTAGGGTAAATGTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	424685	97	+	636262	TTAAGATTGTTTCTTCTATAGGCTTCTAAGGTGCCTGTTGGAATGAAGACTCGACAACACCTCCTAAAAGTTTAGTTGACCTGTATGATAAATGTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	430777	93	+	647215	TTGAGTCTTTCACTGCAACAGGCACCTAAGAAGCCTATAGGAAACATGATTTAACA----TTGTTGAGAATTTGCACAGCACCTTGTGTAAAGCTCC

a
s	mr.mrrefChr5	277103	14	+	294542	CTGGGCCACACAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	424782	14	+	636262	CTGGGCCACACAAT
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a
s	mr.mrrefChr5	277117	27	+	294542	ATGTAGTCTGAAGTATCAGTTAGAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	424796	27	+	636262	ATGTAGTCTGAAGTATCAGTTAGAGTA
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a
s	mr.mrrefChr5	277144	30	+	294542	CAGTTACCTAGGGATGAGTGGCTGTGGGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	424823	30	+	636262	CAGTTACCTAGGGATGAGTGGCTGTGGGGT
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a
s	mr.mrrefChr5	277174	92	+	294542	AGGTCCCTGTCTAAACTCAGTGGATCAGTGGTTTGAGCGCTGATGAATGGGTGCAGATAAACCTGATGCATGAAGGGTGCAGCCCTATGTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	424853	88	+	636262	ATATCCCTGTCTAAATGCAGTGGATCAGTGGTCTGAGCGCTGATGAATGGGCACAGATAAACCTGATGCATAAAAGGTGCAGCCTTAT----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	430989	91	+	647215	AGGTCCCTGTCGAAACTCAGTGTCTCAGTGGCTTGA-GGCTGATGAATAGGTGCAGATAAATCAGATGCATGGAGAGTGGAGCCCTATGTCA

a
s	mr.mrrefChr5	277266	23	+	294542	CAATCCAGCCCTCCATTATGTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	424941	22	+	636262	-AATCCAGCCCTCCATTATGTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	431084	23	+	647215	CAACCCAGCCCTCCATTATTTCT

a
s	mr.mrrefChr5	277289	452	+	294542	CTTGCCAGTTATATAAGTCATCTTTGTTAGTGCTTATGGGTGCCTTCTGTCTTTTGGGCTGACAGTCAAAGCAAGAACCAGGCTAAGTAGTAGGCAGGGAGAGTAGGTGAGTGGAATCTTAACTATGTCTAATCCCTGATAGCCAACAACAGGCTAGTTTAATCAGCAACATATTTTTATTGCTGGGTCCCCTTGGATCTACTACTTAGAGTGGCTCTTGTATCTTAATCTGTAAGTAAACATCTGGCTGCAGACATTCAAGGCATGTTATCAAATCCATGCCATATAATGAACATATCCGATATCTCATGGCCATGTGACAGGTACAGTGTACGACACAGCATTCCCCATGAGGCAAGTTCCCTTCAGTGGTCTTACTAATTCCAGCTATACATGCCCTTTACTGTGACCTTATGCCCCTACTTACCAGCAGTATTGTCAATCCTAGAACT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	424963	414	+	636262	CTTGCGAGCTATATAAGTCGTCTTTGTTACTGCTTCTGGGTGCCTTCTGTCTTTTGGGCTGACAGTCAAAGCAACAACAAGGCTAAGTAGTAGGCAGA---AGTAGGTGAGTGGAATCTTAACTATGTCTAACCCCTGATAGCCAACAACAGGTTAGTTTAATCAGCAACATATTTTTATTGCTGGGTCCCCTTGGATCTACTATTTAGAGTGGCTCTTGTATCTTAATCTGTAGGTAAACATCTGGCTGCAGACATTCAAGGCGTGTTA-----------------------------------CTCATGGCCATGTGACGGGTACAGTGTACGACACAGCATTCCCCATGAGGCAAATTCCCCTCAGTGGTCTTATTAATTCCAGCTATGCATACCCTTTACTGTGACCTTATGCCCCTACTTAACAGCAGTATTGTCAATCCTAGAACT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	431108	429	+	647215	CTTGGCAGTTATTTGAGTCATCTTTGTTAGTGCCTA-------CCTCTGTCTTTTG-A------GTCAAAGCAAGAACCAGGCTAAGTTGTAAGCAGGGAGAGTAGGTTAGTGGAATTTTAACTATGTCTAATCTCTGATAGCCAACAACAGGCCAGTTTAATCAGCAACCTATTTTTATTGCTATGCCCCCTTGGGTCTACTGCCTAGACCGGCTCTTGTATCTTACTCTGTAAGTC---------CTGCATACATTCAAGGCACGTTATCAAATCCATGCCATATAATGAACATATCCGATATCTCACGGCCATGTGACAGGTACAGTGTACGACACTGCATTCCCCATGAGGTAAGTTCCCTTCAGTGGTCTTACTGATTCCAGCTATACATGCCCTTTACTGTAACCTTATGCACCTACTTACCAGCAGTATTGGCAATCATAGAACT

a
s	mr.mrrefChr5	277741	11	+	294542	CTATTAACGCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	425377	11	+	636262	CTATTAACGCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	431541	11	+	647215	CTATTAACGCT

a
s	mr.mrrefChr5	277752	36	+	294542	GGTGCAGTGCTTGAAATTGTACCTTATTATAATCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	425388	33	+	636262	GGT---GTGCTTGAAATTGTTCCTTATCATAATCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	431554	36	+	647215	GGTGCAGTGCTTAAAATTGTACCTTATTATAATCTT

a
s	mr.mrrefChr5	277788	47	+	294542	ATCTGCCTAGTCTAAAGGCTTGTCAGATAAATTAGCTTAGTTCCTGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	425421	47	+	636262	ATCTTCCTAGTCTAAAGGGTTGTCAGATAAATGAGCCTAGTTCCTGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	431591	40	+	647215	CTCTGCCTAGTCAAGGGGCTTGTCAGTTAAATTAGCTTAG-------

a
s	mr.mrrefChr5	277835	7	+	294542	GTCTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	425528	7	+	636262	GTCTGTG

a
s	mr.mrrefChr5	277842	19	+	294542	TAACTATTGCATCCCCCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	425536	19	+	636262	TAACTATTGCATCCCCCTT

a
s	mr.mrrefChr5	277861	16	+	294542	AGTTTAACATGGATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	425556	16	+	636262	AGTTTAACATGGATAC

a
s	mr.mrrefChr5	277877	333	+	294542	TGATTGCCCAAGTGTCACTCTTATAGTTCTGACTTTTATATTATCCAGAGGACATGCATGTCAGGAGACATGACATACTCAAAATGGAGTGGCATGTGCTGTTTGACTAGTCTGTCTTTCCTGGCCCATGTAGATTATGGGAGGGAGCATCTAGCAGAAGGGTTTTCAGCCACAAATTAGTTGCTTGCCAGAAACTTGTAGCAGGTGTAGGGAGCGTCCCTGTAATTGATCCAGGTATTATTCTCAGGTGTCACCATCTCAAATGTAGGGCTGGTGATGTATTCCAGGATTCTGCAAGATAAGATTGAAAGTGGCTAGTCATAGCTGTTGAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	425574	327	+	636262	TGATCACCCAAGTCTCACTCTTATAGTACTGACTTCTATATTATCCAGTGGACATGCATGTCAGGAGACATGACATACTCAAAATGGAGTGACATCTGCTGTT------GTCTGTCTTTCCTGGCCCATGTAGATTATGGGAGGGAGCATCTAGCAGAAAGGTTTTCAGTCACAAATTAGTTGCTTACCAGAAACTTGTAGCAGGTGCAGGGAGCGTCCCTGTAATTGATCCAGGTATTATTCTCAGGTGTCACCATCTCAGATGTAGGGCTGGTGATGTATTCCAGGATTCTGCAAGATAAGATTGAAAGTGGCTAGTCATACCTGTTGAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	431631	324	+	647215	--ATTGCCCAAGTGTCACGCCTATAGTTCTGTCTTTTATATTATCCAGAGAACATGCATTTCAGGAGACATGACATGCCCAAAATGGAGTGGCATGT-CTATTTGACTAGTCTGTCT------ACCCATGTAGATTATGGAAGGGAGCATCTAGAAGAAGGGTTTTTGGCCACAAATTAGTTGCTTGTCAAAAACTTGTAAAAGGTGTAGAGAGCATCCCTGTAACTGATCCAGGTATTATTCTCAGGTGTTACCATCTCAAATGTAGGGCTGATGGTGTATTCTAGGATTCTGCAAGATGAGATTGAAAGTGGCTAGCCAGAGCTGTTGAGC

a
s	mr.mrrefChr5	278210	69	+	294542	AGCCGCTGTACTTTCCCTATTGTTTCTACCCTTATGCCCCTATTTTACTATATCTGTGTAGTAGTTGAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	425905	69	+	636262	AGATGCTGAACTTTTCCTATTGTTTCTACCCTTATGCCCCTATTTTACTATATATGTGTAGTAGTTGAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	431955	69	+	647215	AGCCGCTGTTCTTTCCCTATTGTTTCTACCCTTATGCCGCTATTTTACTGTATCTGTGTAGTAGTTGAT

a
s	mr.mrrefChr5	278279	15	+	294542	CCTGTTAGCCAGCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	425999	15	+	636262	CCTGTTAGCCAGCCG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	432024	15	+	647215	TCTGTTAGCCAGCCA

a
s	mr.mrrefChr5	278294	120	+	294542	TGCTGCTATGCGGGACAGAAGACCAAGCCAAACAAGGAAAAGAACTTATGGAGATTTGGGTATACCATAAGAGCAGTGGTCTGGGTTTGCTGTGCACCTGTGACTGGACTGAGGGTCTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	426014	120	+	636262	TGCTGCTATGCAGGACAGAAGACCTAGCCAAACAAGGAAAAGAACTTATGGAGATTTGGGTATACCATAAGAGCAGTGGTCTGGGTTTGCTGTGCACCAGTGACTGGACTGAGGGTCTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	432040	118	+	647215	TACTGCTATGCGGGACAG--GACCAAGTCGAACAAGGAAAAGAACTTATGGAGATTTGCATATACCATAAGAGCAGTGGTCTGGTTTTGCTGTGCACCTGTGACTGGACTGAGGGTCTTC

a
s	mr.mrrefChr5	278414	532	+	294542	ACCACTGGCTCCTTATAATGACACAGACCCAGAAAGCAGAGAAGGGAGGAGTTGCTGGAGTACCTGGAAATTGCTGATACATATTTTGCATATGAAACAGTAGAATCATTCTTCAGTTGCATAGGTGCTAGATCAGCTTTTAACATTGAGCTTACTTAGGGATGATTCCTCAAGATGGTGTGAACAGATGTGTGTTATACTTGGGGTCCACAGTGACAATCCTGGTTGCTCTCTGAGGGTACAGTGATTATAACTTCTCAAGAGAAATTCTGATTAAGCCATGATATGGTATAGCAATCATACCTGTTCCTTGGTATCTTGGGTGGAAGGGAATCAAACACAGTTTCAATACTAGTACCTGCTGATCGACATCTCCTGTTGTGATAATAAGCAAGCTCAGGAAATGGCCTAAAAAGTTGGTTTTCAATTGGATACTGTTATGTGCAAATAGTAATAGAATCACGTCATGACAAGAAGAAGCTATTCAAAGCAGCTTAATGGATGATTTGTGCAAATAGTTTGTGTCTTAATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	426134	486	+	636262	ACCACTGGCTCCTTATAATGAC-------CAGGAAGCAGAGAAGGGAGGAGTTTCTGGAGTACCTGGAAATTGCTGACACATGCTTTGCATATGAA-CAAAAGATTCATTCTTCAGCTTCATAGGTGCTAGATCAGCTTTTAACATTGAACTTAATTAAGGAGGATTCCTCAAGATGGTGTGAACAGATGTGTGTTATACTTGGGGCCCCC---------------TGCT---TGAGGGTACAGTGATTATAACTTCTCAAGAGAAATTCTGATTAAGCCATGATATGGTATAGCAATCATACCTGTCCCTTGGTATCTTGGGTGAAAGGGAATCAAACACAGTTTCAATACTAGTACCACCTGATAAACATCTCCTGTTGTGATAATAAGCAAGCTCGGGAAATGGCATAATCAGCTGGTTTTCAATTGGATACTGTTATGTGCAGATA--------------------CAAGAAGAAGCTATCCAAAGCAGCTTAATTGATGATTTGTGCAAATAGTTTGTGTCTTAATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	432161	522	+	647215	GCCACTGGCTCCTTATGATGACACAGACCCAGACAGCAGAAAAGAGAGGACTTGCTTGAGTACCTGGAAATTGCCAATATACATTTTGCATATGAAACAGTAGAATCATCCTTCAGTTGCATAGGCGCTAGATCATCTTTTAACATTGAGCTTACTTAGGGATAATTCCTCAAGATGGTGTGAACAGATGTGTGTTATACTTGGGGTCCACAGTGACAATCCTGGTTGCTCTCTTAGTGTACAGTGATTATAACTTCTCAAGAGTAATTCTGACTAAGCCATGATATGGTATAGCAATCATACCAATTCCTTGGTATCTTGGGTGGA-TGGAATCAAACACAGTTTCAATACTAGTACCTGAAGTTCGGCATCTCATGTTGTGATGATCAGC----TCAGGAAATAGCCTAGAAAGTTG-TTTTTAATTGAATACTGTTATGTGCAAATAGTAATAGAATCACGTCATGACAAAAAGAAGCTATTCAAAGC----TTGTGCAAATTTTGTGCAACTAGTTTGTGTCTTAATC

a
s	mr.mrrefChr5	278946	21	+	294542	TCATGTCACCAACAGTTAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	426620	21	+	636262	TCGTGCCACCAACAGTTAGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	432684	21	+	647215	TCATGTCATCAGCAGTTAGAG

a
s	mr.mrrefChr5	278967	88	+	294542	CCCCAGGATTCAACTATTCAGCCTTTTTCCGAAAAACCACAAAATAGAACCAACAGCTTGTATTAATAAGCAAATAAACTGACTCAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	426641	88	+	636262	CCCCAGGATTCAACTATTCAGCCTTTTTCTGAAAAACCACAAAATAGAACCAACAGCTTATATTAATAAGCAAATAAACTGACTCAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	432711	88	+	647215	CCCCAGAATTCAACTATTCAGCCTATTTCCGAAAAACCACCAAATAGAACCAACAGCTTGTATTAATAAGCCAATAAACTGACTCAGG

a
s	mr.mrrefChr5	279055	203	+	294542	TCCTGCAACTCTTCATGGTACTCAAAAATAGCTGCCCATTTGCAAGCTTGGATTACCTGACTTGTCTCAGCTTAAATTGCAAAGAAGATTTTGTATGTAGGGTAGATGCTTTCCAAAAGATGGTTTAAGTCGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGACAACACTCATAAGATTCACATCCGCCAATGTTTTATAAGGTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	426737	203	+	636262	TCCTGCAACTCTTCATGGTACTCAAAAATAGCTGTCCATATGCAAGCTTGGATTAACTGACTTGTCTCAGCTTAAATTGCTAAGAAGATTTTGTACATAGGGTAGATGCTTTCCAAAAGATGGTTTAAGTCGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGACAACACTCATAAGATTCACATCCGCCAATGTTTTATATGGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	432799	198	+	647215	TCCTGCAACTCT-----GTACTCAAAAATAGCTGCCCATTTGCAAGCTTGGATAACCTGACTTATCTGAGCTTGAATTGCAAAGAAGATCTTGTATGCAGGGTACATGCTTTCCAATCGATGGTTTAAATTGACTTTTTTGACATGGGTTATTCTTCTGAAAACACTCATGGGATTCATATCCGCCAATGATTTATAAGGTTC

a
s	mr.mrrefChr5	279258	28	+	294542	AGTAGCCTGGTTGCCTTTTTTCATGCTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	426941	28	+	636262	AGTAGCCTGCTTGCCTTTATTCATGCTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	432997	28	+	647215	AGTAGCCTGGTTGCCTTTTTTCATGCTT

a
s	mr.mrrefChr5	279286	237	+	294542	CAGTGTGTCGTCACACTCCAGACTCAGGTGTAATATTGCTGCAACAAGAAACTCACTCATGTAGGATTTAGACTTTCATTACCCATAAAGCTGGAGCAAGCAGCCAAGTGAATGTAGTAGGCTATGAGCCACAAATGAGTCTTCATCAATAGCCCAGAAATTCATAGCCCTCAGTTATCCTGAACCATGATTCCATTGGGGAAGGAGTTTATAGTCATCAAAGTGGGTACACTCCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	426969	235	+	636262	CAATGT-TCGTCACACTCCAGACTCAGGTGTGATATTGCTGCTACAAGAAACTCACTCATGTAGGATTTAGACTTTCATGACCCATAAAGCTGGAGCAAGCAGC-AAGTCAATGTAGTAGGCTATGAGCCACAAATGAGTCTTCGTCAATAGCCTAGAAATTCATAGCTCTCAGTTATCCTGAAGCATGATTCCATTGGGGAAGGCGTTTATAGTAATCAAAGTGGGTACACTCCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	433026	237	+	647215	CAGTGTGTTGGCACACTCCAGACTCAGGTGCAATGTTGTTGCAACAAGAAACCCACTCATGTAGGATTTAGACTATCATTACTCTCAAAGTTGGAGCAGGCTGCCAAGTGAATGTATAAGGCCATGAGCCACAAATGAGTCTTCATCAATAGCCCAGACATTCATAGCCCTCAGTTAGCCTGAACCATGATCCCATTGGGGAACGAGTTTATAGCCATCAAAGTGGGTGCATTACTG

a
s	mr.mrrefChr5	279523	35	+	294542	TCCCCTGTGATGTCACATGGCCCAAACAAGTGATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	427217	35	+	636262	TCCCCTGTGATGTCACATGGCCCAAACAAGTGATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	433263	35	+	647215	TCCCCTGTGGTGTCACATGGCACAAACTAGTGATT

a
s	mr.mrrefChr5	279558	197	+	294542	AAGATGTCTATGCAAACTGTGTCTATTTTGATCCAATACCTTAGCCCTGACTGAACCCTAAACAAGACACATAGTAGTAGGATGATTTCTGCAGGTGCACAATCCATCCTCATAGGGGTAATCTCAGGAATGCTTACTCCATATCAACCTCTTTGCTGCCCTTCTGTGCATTCGCTGTTGGTATTAATATCAGTCAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	427252	188	+	636262	AAGATGTCTATGCGAATCGTGTCTATTTTGATCCAATACCTTAGCCCTAA--GCACCCTAAACAGGACACATAGTAGTAGGGTGATTTCTGCAGGTGCACAATCCATCCCCATAGGGATAATCTCAGGAATGCTTACTCCATATCAACCTTTTTGCTGCCTTTCTGTGCATTCGCTGTTGGTATTAATAC-------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	433299	197	+	647215	AAAACGTCCTTGCAAACTGTGGCTATTCTTATTGCATATCTTAGCCCTGACTGAGCCCTGAACAAGAGACATAGTAGTAGGATGTTTTCTGCGGGTGCACAATCCATCCTCATAAGAGTAATCTCAGGAATACTCACTCCATATCAACCTCTTTGCTGCCCCTCTATGCATTCACTGTTGGTAATAATATCAGTCAG

a
s	mr.mrrefChr5	279755	20	+	294542	AGGTGTAGCATAAATTGATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	427440	20	+	636262	AGGTGTTTCATAAATTGATG
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a
s	mr.mrrefChr5	279775	603	+	294542	CAGTAGACTATGGGATTAGTATGCTATCTTCTACACCTATAGCAGTCCATTCACATCATCCTGAGGTAAGAATACGACTGGAGCGTATTGCAATTTTCACTGGCCATACTAAGTCTATTAGAGTTGTTTAAGTAGTCATGTTTGCTACCATTTGGATAACTTATTATTAATGTTGTTTAACTGGACTTGGACGCATCCTCTCAATGAGAGAGGTACCCTGTTCCCAATTTGAATGAGTGTTTTGGCACTCACATATAGTGCATCTGATCATAATATAAGCCCCATGATGAGCATTTGCAGGGCAAGATCTGTAAAAGAATGATTCTTCTGACGGAAAATATAGGTTGGGCTAGCTGGTAATGAAAAATCTCATGTCAGTGGATGTGAAGGTATAATAGACTTCATTGTATTATCAACTTTGTTTAGGCTTGGAACTTGGGCAACATACTATACTGTATTTGCTTGCATAAGATTGTTGGTTAACATGGCATTAGTATGACCTTGCTGGCCATGTTTCCAGATATGTATCCTGTTTTCTATTAAGTCTGATCTTCCAATAATAGTGAACCTGACCCAACTGTTCCAGTGATCTGCTGGGCATTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	427460	524	+	636262	CAGTAGACTATGGGATTAGTTTGCTGTCTTCTAAACCTAAAGCATTCCATTCACATCATCCTGAGGTATGAACACGACCGGAGCGTATTGCAATTTTCACTGGCCATACTAAGTCTATTAGAGTTGTCTAAGTAGTCATGTTTGCTACCATTTGGATAACCTATTATTAATGTTGTTTGACAGGACTTGGACGCATCCTCTCAATGAGAGAGGTACCCTGTTCCCAATCTGAATGAG--------CACTACTATATAGT--------------------------------------CTTGGCAAGATCTGTAAAAGAATGATTCTTCTGATGGAAAATATAGGTTGGGCTAACTGCTAATGATAAATTTCATGTCAGTGGATGTGAAGATATAATAGACTTCATTGTATTATCAACTTTGTTTAGGCTTGGAACTTGGGCAACATACTATACTGTATCTGCTTGCATAAGATTGTTGGTTAATGTGGCATTAGTATGACCTTGCTGGCCATGTTTCCAGATATGTATCCTGTTTTCTATTAAGTCTGATCTTATAATAATAGTGAACCT---------------------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	433523	588	+	647215	CAGTAGATCATGG-ATTAGTATGCCATCTTCTACACCTATAGCAGTCCATTCACATCATCCTGATGCTAGACTACAACTGGAGCCTGTTTCAGTATTCACTGGCCGTACTAAGTCTATTAGAGTTGTTTATGTAGTGATGTTTGCTACCATTTAGATAACTTATTGTTAAAGTTATCTAATTAGACTTAGACGCATCCTCTCAATGAGAGAGGTACCCTATTTCCAATTTGAATGAGTGTTTTGGCACTCACATATAGTGCATCTGATCATAATATAAGCCCCATGATGAGCATTTGCAGGGCAAGATCTGTAAAAGAAC-ATTCTTTTGACGGAGGATATAGGTTTGGCTGGCTGGTAATGAAAAATCTCATGTCAGTGGAGGTGAGGGTATAACAGACTACATTGTATCATCAGCTTTGTACAGG-TTGGACCTTGGGCAGCACTATATCCTCCATTTGCTTGCATAAGGTTGTTGGTTAACATGGCATGAGTATGACCT------CAATGTTTCGAAATATGTATCCTGTTTTCGATTAAGT------TTCCAACAATAGTGGACCTGACCCAACTGTTCCAGTGATCTGCTGGGCATTT

a
s	mr.mrrefChr5	280378	10	+	294542	TGCTATTCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	434118	10	+	647215	TGCTATTCAA

a
s	mr.mrrefChr5	280388	30	+	294542	TTGCTTTATTCACTACATACTTGGCTGGCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	427984	18	+	636262	------------CTACATACTTGGCTGGCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	434154	30	+	647215	TTGCTTTATTCACTATATACCTGGCTGTAC

a
s	mr.mrrefChr5	280418	161	+	294542	TCTAGAAGTATTCCACTCCTGAGACGACTGACCTTGGCCCATCTTCAAGTACACACCAAGGGGCAGTCCAGGCAGGTACCCTGGGAAGCTGACCAGGATTCTCCAATTTTTCATCCTAATGCCAAGGACATTGCATATGAGCTTTGTAGGCTCACTATGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	428002	161	+	636262	TCCAGGAGTATTCCACTCCTGAGACGACTGACGTTGGCTCATCTTCAAGTACACACCAAGGGGCAGTCCAGGCAGGTACCCTGGGAAGCTGACCAGGATTCTCCAATTTTTCATCTTAATGCCAAGGACATTGCATATGAGCTTTGCAGGCTTACTATGTG
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a
s	mr.mrrefChr5	280579	29	+	294542	CAGTGTCCAGAGGTTAACTTGTTATACAA
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a
s	mr.mrrefChr5	280608	65	+	294542	GTCCTATCTTTGACAATGGCTAATCTAGTCCATTGTTCTATTTCTGAACAGAAGAAAGCAGATTC
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a
s	mr.mrrefChr5	280673	47	+	294542	TAGTTTACATTGGTTAAAACATTAAGTGCTCTAAGATGACATGTTTT
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a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	434468	170	+	647215	CACCCATGGAGTAATTCCAGGGTGACAGAGAGCTGGGTATTGTATTATTTGTAGTCTTTCATGCTACATGGTGACTTGTGGTGTAGCCTCACATTGCATCTTAGCTCATGATTTTCAATACCTCACATGTATGGCAAACTTAAGAATCCACTAAAAGAGGAGAGTAGTAT

a
s	mr.mrrefChr5	280890	192	+	294542	ATCTCTAGCCTGGTGGATGTACATATGTGCAGTCCACCCACTTTCTGAAACACAGAGCTTTAGGTCCAGACTCCACCACTGGGTCTTGAAATGTGGTTCTTGTCAAAAACAGGCAGTAGACTCTAACAAAGTCCGAGTTAGCTGAAGGTTCAAACCGTAAGTGACTAAGCTTGCAATGCTTTTAGCCTTTAC
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a
s	mr.mrrefChr5	281082	167	+	294542	AAGAACGCTCTATGTCAAGGCTGAAAATCTCCAGGTGTTAGCTTTTAGTGCTTACAAGGACACTTCCATGTCAAGGCTGAAAATCTCCAGGTGTTAGCCATATCAAAAGTAAATATGAAGGGTTAGGTATACCTTGACTGGAGATCTTGTCAATTGCCGAATTGGCA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	434829	167	+	647215	AAGGACACTCCATGTCAAGGCTGAAAATCTCCAGGTGTTATCCTTTAGTGCTGACAAGGACACTTCCATGTCAAGACTGAAAATCTCCAGGTGTTAGCCATATCAAAAGTGAATATGAAGGGATAGGTATACCTTGAGGGGAGATCTAGTCAATCACTGAATTCGCA

a
s	mr.mrrefChr5	281249	178	+	294542	ACATTCCCATCGGCACCGCCCAGGAGGAACAATGGCCAGCATTAGGGAATAGTCATAATTCCATGGTTATGGTATGTAGGGAGTACTGCATGAACACACCACTCAAAAACACAATAGTGGATAGACTAAAACTAGTAAGGATGTGCAACAATGTACAACACTGTTATTTCATTATGTG
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a
s	mr.mrrefChr5	281427	303	+	294542	TGATACAAAGGATCACTGGAACTCACTAAGCCACATGTTTGACAATCTTTCCAAAGAGGTAGGTCACCTAATATGGCACTGGCAGGCAAAGACTTGCCTTTACAGTGAAGTCAAAATATTTGTTGTACACTTGATGGTCACTCAAGGAAATTTGTTGGTTGTTTTAACTCTTTTATCTGAAATCTGCATGAAGTGTGAAATTTGAAAGAGAAAAGACAGGACCTTGAACAGCTAGTTATGGTCTTCAACCAAAGAGGCCTGACTCACTGGATATGTGTATGTGTCTACCCATAACGTTATATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	429004	286	+	636262	TGATACAGAGGATCACTGGAACTCAATATGCCACATGTTTGACAATCTTTCCAAAGAGGTAGGTCACCCAATATGGCACTGGCAGGCAAAGACTTGCCTTTACAGTGAGGTCAAAATATTTGTTGTACACTTCTTGGTCACCCAAGGAAATTTGTTGGTTGTTCTAACTCTTTTATCTGAAATTTGCATGAAGAATGAAATTTGAAAGAGAAAAGAC---A--------------TTATAGTCTTCAACCAAAGAGGCCTGACCCACTGGATATGTGTATGTGTCTACCCATGACATTATATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	435179	270	+	647215	TGATACAAAGCATCACTGGAACTAACTAAGCCACATGTTTAACAATCTTTCTAAAGAGGTAGGTCACCTAATATGCCACTGGCA---------------------GGAAGTCAAAATATCTGTTGCACACTTGATGGTCACTCAAGT-------TCAGCTGTTTTGACTCTTTTATCTGAAATCTGCATGAAGTGTGAAATTTGAAAGAGAAAATACAGGTCCTTGAACAGCTAGTTATGGGCTTCAACCAAAGAG-CCTGACTCACTG----TGGATATGTGTCTACCTATAACGTTATATT

a
s	mr.mrrefChr5	281730	210	+	294542	GTGTAACCCTTCACAGCACCCATGACAGCTCTTCTATCTAAATTTGGCATGTACACAAATACGCAGTGACCAGGCAATGCAGAATCAATGCAGAAAAATTGTTTCAGTATGTTGCCGGGGTCATTATCTGGTGTCTGGTGGACTGGTTAAGAAGCCTTGCAGGGGCCCATGTATATACACTGAGGATGCACATGGTGTAAGTTATTAAGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	429290	191	+	636262	GTGTAAGCCTTCA------------------TTCAATCTAAATTTGGCATGTACACAAATACGCAGT-ACCAGGCAATGCAGAATCAATACAGAGAAATTGTTTCAGTATGTTGCCAGGGTCATTATCTGGTGTCTGGTGGACTGGTTAAGAAGCCTTGCAGGGGCCCATGTATATACACTGAGAATGCACATGGTGTAAGTTATTAAGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	435450	208	+	647215	GTGTAGCCCTTCACAGCACCCATGACAGCTCTTCTATCTAAATTTGGCGTGTACACAAATACACAGTGACCAGGCAATGCAGGAGCAATGCAGAATAATTGTTTCAGTATGTTACCGGGGTCATTATGTGGTGCCTGGTCGACTGGTTAAG--GCCTTACAGGGGCCCATGTATATACACTGAGGATGCACATGGTGTAAGTTATTAAGC

a
s	mr.mrrefChr5	281940	173	+	294542	ATTTCCCCAGAATCAGACAAACAAACTGCATCTCACAACACTGTAGGAACTTCAAAGAATGACTTGGACTGTGCGACACCTTGTGAACTTTTTGATGGCACTTGAGACTTCCCCACCAGAGCCAAGTATCAAACTGTTTCCACCAGTACCCAGTACCAAACTTATTTTTGATA
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	435658	162	+	647215	AGTTTCCCAGTATCAGACAAACAAACTGCATCTAACAACACTCTAG-AACTTCAAAGAATGACTCAGACTGTG----------TGAACTTTTCGACGGCCCTTGAGACTTCCCCAACAGAGCCAAGTATCAAACTGTTTCCACCAGTACCCAGTACCAAACTTATTTTTGACC

a
s	mr.mrrefChr5	282113	56	+	294542	AAGAAACGACATACAGCAGCAAACAATGTACAGCAGCCAAAAGAAGACATACAAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	429658	56	+	636262	AAGAAACGACATACAGCAGCAAACAATGTACAGCAGCCAGAAGAAGACATACAAGA
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a
s	mr.mrrefChr5	282169	74	+	294542	CCATGGCCAAGGTATAAAAAGTTCAGATTCACCTACAGCAAAATTTGGTTTCGGCAATTACTATATGTTTCTTA
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a
s	mr.mrrefChr5	282243	28	+	294542	TACAGATGGACAACCATTGTTGTTTTGA
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a
s	mr.mrrefChr5	282271	437	+	294542	AATCTCTAGCATTGCGAGGCAATGCCAAAAATTTGAACACCAATGATGATAATCTATAGGTAAGAAACATATGCATACATGGAATAAGAAAAGTATATATAATGTTTGGATTTAAGCAGACACATGAGCCTAAGCACATGTGGCTGCTATTCATCAGTTTAAATACTGATAGGCCACAGGAAGTACTAACTAAATAGCAAAAAATTGCTGTCTAAATGTCTTATCATATTTACTTTACAGACTACCAATTACTAGCATAATTTTCTGCTGGAGCAGCTTATTATAATTTTGTGGGTAATAGGAATTTAGGATACATGCAACTTATCTTCACCACGAGCAATTTAAAGAAGCTTACTGTAATAGAAGTGTAATTAAACACTGAAGTGAATGGAAACACATTTAATTTGAATTCAAGATTAGTTTTGTAGCATGCCATA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	429820	419	+	636262	AAT---TAGCATTGCCTCACAATACTAAAAATTTGAA-ACCAATGATGGTTGTCTA--------AAACATATGCATACATGGAATAAGAGAAGTATATATAATGTTTGGTTTTAAGCAGACACATGAGCCTAAGCGCATGTGGCTGCTATTCATTAGTTTAAATACTGATAGGCCACAGGAAGTACTAACTAAAGAGCAAAAAATTGCTGTCTGAATGTCTTATCATATTTACTTTACAGAGTACCAATTACTAGCATAATTTTCTGCTGGAGCAG-TTATTATAATTTTGTGGGTAATAGGAATTTAGGATACACGCAACTTATCTTCACCACGAGCAAGTTAAAGAAGCTTACTGTAATAGAAGTGTAATTAAACACTGAAGTGAATGGAAACACATTTAATTTGAAT-----ATTAGTTTTGTAGCATGCCATA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	435980	429	+	647215	AATCTCTAGAAATGCGAGGCAATGTCAATTGTATGAGCATCAAGGTTGATAATTTGTAGGTAAGGAAGATATGCAGACATGGAATAAGAAAAGTGTATATAATGTTTGGATTTAACCAGACACACGAGCCTAAGGACATGTGGCTGCTATTCATCAGTTTAAATAC----AGGCCTCAAGAA----TCACTAAATAGCAAAAATTTGCTGTCTAAATATCTCATCGTATTTACTTTAGAGACTACCAATTAATAGCGTAATTTTCTGCTGGAGCAGCTTATTATAATTTTGTGGGTAATAGGAATTTAGGATACATGCAACTTATCTTCACCAGGAGCAATTTAAAGAAGCTTACTGTAATAGAAGTGTATTTAAACGCTGAAGTGAATTGAAATGCATTTGACTTGACTTCAAGAGTAGTTTTATAGTGTGCCATA

a
s	mr.mrrefChr5	282708	56	+	294542	TTATTCACATACAGTAATCATTGTTTTAGAGTGCACTTTTGTTATTAATGAACAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	282764	171	+	294542	CTGTGGAATCCTGTCTCACACTCTTATTTGTGTGAGCTAAGCTTGCAAAGGACTTGATCCAAGGCAGGATGTGCTGCACAGATCTTAGACTTTGTCTAATCTGGCTCTAAAGACAGGAATAGATTAGATGGGATTGCTTAAATATCTGTACAAAAGAAATAATCTACTACA
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a
s	mr.mrrefChr5	282935	392	+	294542	CAACCCAGGGTTTTGGATACAACTGTGGCTTTACAAATAGGTTGAAGCCCTTCTCTTCCTATTTTGCCACTGGACTCCCAAGGCAGCATGCCATGATAGTCACCCTAAATGACCACACACCATGAGAGTTGTAAATCCTTTCTTTACTCTATTTGCTATATATAATATATGCCTATCATGACAGCACCTGACAGCAATAATAAGAGGTAGAGACAATGGATAACCTGTGGGCTAGAAAGATCAATCTTGGTGGGCCTCCTGCACAAGCAGGATCCCAAGCACATTCTTAAGTGCCCATAATTTGCCCCTTTTGGAGCCAACTATACTAAAGTGAAAACAGCTTGAGAAAAACCATAGGATGGAGGAGCGTAATGACAGTGTTGCAGGGAAAG
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a
s	mr.mrrefChr5	283327	29	+	294542	CAAATGCAGGATGCATAGGTGAGTGGAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	283356	26	+	294542	GGTCCCATCTGCCAAACGGCCATGTT
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a
s	mr.mrrefChr5	283382	496	+	294542	AATGTACAGGTGTATACCTCTATGGTGTTAGCTCAGCCACCGCATGGGAGAGCCCTAGATGGCAGAAGCAATAATTGTGACAGAGTTGAGTTTCATTGGAAGGATTCTGGCATTTTTAGCACAGGTTAATTCAAACCACCTCCTTACTTGCCCCAATGCCCGGAGCCTGTTGGCACATCCTATATGTAGCCATACCAGGATCGGGTTTGTTTCTATCTATGGGCATAGACATCACTATAAAAGATTGCCTAACATGAGTAAAATGCCAATGGGCCTGGTAAGAGAACAAGACTAGTGCACTCTGAGTATGAAAGAAGTGAATTGTGTGTGGCCCCTGAATGTCTCAGTGTGCACATTTATGCTCTTTCACTAGGTGAAGTTCTCCAGAACACCTGCCCCAAGGTGGTCTCTTGTTTTAAGTTGAGCTAGTTGCAGAAGGTGGCACACAAAGTTCAGATCCTTACTAATGGATATTCTTTGTTCATAGATGTATGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	177800	483	-	636262	AATGTACAGGTGTATACCTCTATGGTGTTAGTTCAGCGACCGCATAGGAGAG-------------AAGCAATAATTGTGATAGAGTTGAGTTTCATTGGAAGGATTCTGGCATTTTTAGCATAGGTTAATTCAAACCATCTCCTTACTTGCCTCAATGCCCGGAGCCTGTTGGCACATCCTATATGTAGCCATACCAGGATCGGGTTTGCTTCTATCTATGGGCATAGACATCACTATAAAAGATTGTCTAACATGAGTTAAATGTCAATGGGCACAGTAACAGGACAAGACTAGTGCACTTAGAGTCTGAAAGAAGTGAAGTGTGTGTGGCCCCTGAATGTCTCAGTGTGCACATCTATGCTCTTCCACTAGGTGAAGTTCTCCAGAACGCCTGCCCCAAGGTGGTCTCTTGTTTTAAGTTGAGCTAGTTGGAGAGGGTGGCACACAAAATTCAGACCCTTACTAAAGGATATTCTTCGTTCATTGATGTATGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	437088	491	+	647215	AGTGTACAGGTGTATACTTCTATGGTCTTAGCTCAGCCACCGCATGGGAGATCCCTAGATGGCAGCAGCAATAATCGCGACAGAATTGAGTTTAACAGGAGGGATGCTGGCATTTTTAGCACAGGTTAATTCAAACCACCTCCTTACATGCCCCAATGCCAGGAGCCTGTTAGCACATCCCATATGTAGCCCTACCAGGATTGGGTTTGTTTCTATCTATGGTCATAGACGTCACTGTAAAAGATTGCTTAGCATGAGTAAAATGCTAACGGGCCTGGTAGGAGAATAAGACTAGTGCACTCTGAGTATGAAAGAAATGAATTTTGTGTGCCCCCTGAAGGTCT-----TGCACACTTATGCCCTCTCACTAGGTGAAGTTTTCCAGAACACTTGACCCAGGGTGGTCTCTAGTTTTAAGTTGAGCTAGTTGCAGAAGGTGGCACACAAAGTTCAGATTCATACTAATGGAAATTCTTTGCTCATAGAGGTATGGT

a
s	mr.mrrefChr5	283878	214	+	294542	TACATAGATTGACAGACAGCTAGTGACAGATGTAACTAAATATGAATTAGTAGGTATTAATAGTAATCTTTTTCCTAATAAGTGTATAAGGATGTGTCAGTTCCTGATACTTTAGGTAGTGGAATGACTAACAGATCTTATTTATTGATAGGCTATTGAATTTTATTGAGTACACCAGGGCCAAGCCCCATTTGTGTGAGAATTTGTGTGAGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	178284	212	-	636262	TACATAGATTGACAGACAGCTAGTGACAGAGGTAACTAGATATGAATTAGTAGGTATCAACAGTCATCTTTTCCCTAATAAGTGTATAAGGATGTGTCAGTTCCTGATACTTTAGGTAATGTAATGACTAACGGATCTTACTTTTTGATAGGCTATTGAATTTTATTCAGTACACAAGGG--AAGTCCCATTTATGTGAGAATTTGTGTGAGAA
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a
s	mr.mrrefChr5	284092	35	+	294542	ACATGGTAGACTCAGGGTTTGAACCATTCTCTAAA
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a
s	mr.mrrefChr5	284127	58	+	294542	CCATTCACAGAGATTCTGTTGAAAATGGAACTAGTTCATGCTCTGTTGTATTAAAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	178544	58	-	636262	CCATTCACAGAGATTCTGTTGAAAATGGAACTAGTTCATGCTTTGTGGTATTAAAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	437880	20	+	647215	-------------------------------------ATGCTCTGTTGTATTAAAAC-

a
s	mr.mrrefChr5	284185	15	+	294542	ATGAGGTTTGTTTAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	178603	15	-	636262	ATGAGGTTTGTTTAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	437900	14	+	647215	-TGAAGTTTGTTTCC

a
s	mr.mrrefChr5	284200	184	+	294542	TTAGGTGGTGATTTATATTTTACATTTCTCTATTGACAGGACTGCCTTGTTCTTTGTTATGTTGTCAGTAAGCTTTCCATGTAATTACAGCACAGTTTAAATAGTTCATAGGCAAGAAGAATTAACAAAGTTTAAAGTTTGCAGACAGCCATATGGTCCATGATCTATCTGTGTCATCCCGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	178618	184	-	636262	TTAGATGGTGATTTATATTTTACATTTCTCTATTGTCAGGACTGTCTTGTTCTTTGGTATGTTGTCAGTAAGCTTTCCATGTAATTACAGCACAGTTTCAATAGTTCATAGGCAAGAAGAATTAACAAAGTATAAAGTTTGCAGACAGCCATCTGGTCCATGACCTATCTGTGTCATCCTGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	437915	184	+	647215	TTAGGTGGTGATTTATATTTTACATTCCTCAAATGACAGGACTGCCTTGTTCTTTGTTATGATGCCAGTAGGCTTTCCATGTAATTATAGTACAGTTTAAATAGTTCATAGGCAAGAAGAATTAACAAAGTTTAAAGTTTGCAGGCAGCCATATGGTCCATGATCTATCTGTGTCACCCCATAA

a
s	mr.mrrefChr5	284384	132	+	294542	AGACTATAAAGTTCTTACACTTATATAAGGGTTAGAAATAATTATGCTGTGGTGTTAGATCATGGGTAGTCCCCAGTTGAAGTAGCTACATGTTGAGTGGATTGTAAGAAGAGCGTAGTATGGGTGTCAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	178802	127	-	636262	AGACTATAAAGTTCTTACACTTATATAAGAGTTAGAAATAATTATGCTGTGGTGTTAGATCATGGGTAGTCCCCAGTTGAAGTAGCTACATGTTGAGTGGATTGTAAGAAGAGCGTAATATGGGTCT-----
s	simRat_chr6.simRat.chr6	438101	132	+	647215	TGACTATAAGGATGGTACACTTATACAAGGGTTAGAAATAACTATGCCCTGGTGTTAGATCATGGGTAGGCCCCAATTGGAGTAGTCACGTGTTGATTGGATTGTAAGAAGAGCTTAGTATGGGTGTCAGTT

a
s	mr.mrrefChr5	284516	36	+	294542	GAGCAATGACTACAATGCTGTTCAATTAAATACCAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	179160	36	-	636262	GAGCAATGACTACAATGCTGTTCAATTAAATACCAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	438233	36	+	647215	GAGCAATGACTAAAATGTTGTTCCATTAAGTAACCA

a
s	mr.mrrefChr5	284552	218	+	294542	TGCACAATGGAACATCTGGCCCCTGTCACGCATGCAGCAGCTGAAATTCACCGTGTGCACCGAGGAGGCAAATTATTGTTTAAAACTTCTGTAGACTTCTTGTTTAACCTCTCTGACAAGATTCTTAGGAGGGGTTGTGTACTCACCAGTCGTAATAGCTTCAAAAGGCCAAGCAGGCAAAGTTCCTGATCATTTGTCACCTACCACACTCAGTAGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	179196	218	-	636262	TGCACAATGGAACATCTGGCCCCTGTCACGCATGCAGCAGCTGAACTTCACCATGTGCACCAAGGAGGCAAATTAGTGTCTACAACTTCTGTAGACTGCTTGTTGAACCTCTCTGACAAGATTCTTTGGAGGGGTTGTGTTTTCACCAGTTGTGATAGCTTCAAAAGGCCAAGCAGGCAAAGTTCCTGATCATTAGGTTCCTACCACACTCAGTAGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	438280	188	+	647215	TGAATAATGGAACATCTGGCCTCTGTGACAAATGCAGCAGCCGAAATTCACTGCATGCACCGAGGAGGCAAACTATTGCTGAAAATTTCTGTAGACTTCTTGTCTAACCTCTCTGACATGATTCTCAGGAGGGGTTGTGTACTCACCAGTCACAATAGCTTCAAAAGGACAAGCTGGCA-----------AGGTTGTCA-------------------

a
s	mr.mrrefChr5	284770	53	+	294542	TGAATGCACTAGTTCGTTGTGTCTGGTTTGGAAATGATCTGGGGTCTTGACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	179418	53	-	636262	TGAATGCACTAGTTCGTTGTGTCTGGTTTGGAAATGATCTGGGGTCTTCACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	438468	50	+	647215	---ACATACTAATTCATTGTTTCTGGTTTAGAAATGACCTGGGGTCTTGACTA

a
s	mr.mrrefChr5	284823	216	+	294542	ATGTCTTGCATGTGTCCAGTTTTGATTGAGTGGCTTTAGTGAGTGGTTTTATTGTTGACTGAGATTCGAATAGACTTTGACCAAGATTCCAAGAGGATTTGAATCTTTGAACAGGGCACCAGCTGATTCATCAATGTGTACTAACATATTGCCAAATATGGATAAGGTCCTTGATAAGGAGCATTTCATATGATAGGGCAGTGAATAGAGAACAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	179481	216	-	636262	ATGTCTAGCATGTGTCCAGTTTTGACTGAGTAGCTTTAGTGAGTGGCTTTATTGTTGACTGAGTTTTGAGCAGACTTTGACCAAGATTCCAAGAGGATTTGAACCTTAGAACAGGGCACCAGCTGTTTTATCAATGTGTACTAACATATTGCCAAATGTGGATAAGGTCCTTGATAAGGAGCATTTCATATGATAGGGCAGTGAATAGAGAACAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	438518	216	+	647215	ATGTCTTGCATGTGTCCATTTTTGGTTGAGTGGCTTTCGTGAGTAGTCTTATTGTTGATTGAGATTCGAATAGACCTAGAACAAGATTACAAGAGGATTCAAATCTTTGAACAGGTTACCAGCTGACTCATCAATGTGTACTAACATATTGCCAAATATGGCTAAGGCCCTTGATAAGGAGCATTTCGTATGATAGGACAGAGAATGGAAAACAGG

a
s	mr.mrrefChr5	285039	87	+	294542	CGTAGGCAAAGGGTGAACAAGAACAGGCATAAAGTAGCCATCAGAAGATAAACTCAAGACAAATACTCACCCTTAGATAAGATATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	179697	87	-	636262	CGTAGGCAAAGGGTGAACAAGAACAGGCATAAAGTAGCCATCAGAAGATAAACTCAAGACAAATACTCACCTTTAAATGAGATATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	438735	86	+	647215	AACAGTCAAAGGGTGAGCAAGAACAGGCATAAAGTAGCCATCAGAAGAGGGCCACAAGACAAATACTGAGTCTTTGGTAGAATACT-

a
s	mr.mrrefChr5	285126	94	+	294542	AAATGGCATAGCAGCATGAATTTGATTAATAATAAATGATGCACTATTAACACTGTTGTACAAATTATCGTTACCCAAGTTATGGAGCACTGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	179784	94	-	636262	AAATGGCATAGCAGCATGAATTCGATTTATAATAAATGATGCACTATTAACACTGTTGTACAAGTTGTCGTTACCCAGGTTATGGAGCACTGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	439032	94	+	647215	AAGTGGCATAGCAGCATGGACTTGATTAATATTATATGATGCACTATTAACACTGTGACACAAATTATTGTTACACAAGTTATGGAACACTGTC

a
s	mr.mrrefChr5	285220	129	+	294542	CACAAGTTAAATCTTTGTGGGCCCTAGGGTGAGCAAAGTTTTTACAGAGATTTTTGAGACAAGGTACAGCTGTTTGAAATCTTCTGTCATCCTGGGATGATAGGCATTCTGGGATGACACATTAGGTGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	179878	129	-	636262	CACAAGTTAAATCTTTGTGGGCCCTAGGGTGAGCAAAGTTTTTACAGAGATTTTTGGGACAAGGTACAGCTGTTTGAAAACTTCTGTCATCCTGGGATGATAGGCATTCTGGAATGACACATTAGGCGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	439127	128	+	647215	CAAAAGTTAAGTTTACACGAGCCCTAGGGTTGGCAAAGTTTTTACAGAGATTTTTGAGACAAGGTACAGCTGCTTGAAATCTTCTGTCATCCTGCAATCATATGCAGTCTGGGATGACACATTAGGTG-

a
s	mr.mrrefChr5	285349	112	+	294542	CGGAGAAACTAAACCCATGTTAGGTACTATGCTCTTGTTTGCTGGCCATTTCACAAATACTCCACCATATTGTGTCTTTTTATTAGGTTGAGAAAAGACGCTATATGAATAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	180008	112	-	636262	CGGAGAAACTAAACCCATGTTAGGTACTATGCTCTTGTTTGCTGGCCATCTCACAAATATTCCACCATGTTGTGTCTTTTTATTAGATTGAGAAAAGACGGTATAGGAATAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	439255	111	+	647215	-GGAGAAATTAGACCCATGTTAGGTTCTATGCTCTTGTTTGCTGGCCATTTCACGAATACTCCACCGTATTGTGTCTTTTTATTAGGTTCAGAAAAGTCACTATGTGAATCC

a
s	mr.mrrefChr5	285461	88	+	294542	AAAAACATAATGTATTCAGCTGACCCCAAACAGTAACTAAGTGTGGTATATGACTCAATACAATCCTTACTTTCTCTGGTGGATGAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	180120	88	-	636262	AAAAACATAATGTATTCAGCTGACCCCAAACAGTCACCAAGTGTGGTATATGACACAATACAATCCTTGCTTTCTCTGGTGGATGAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	439377	87	+	647215	AGAAACATTATG-ATTCAGCTCACCCCAAACAGTAACTAAGTGTGGCATAGGACTCAACACAATCCTTACTTTCTTTGGAGGTTAACG

a
s	mr.mrrefChr5	285549	30	+	294542	TTTCTGGGCTTCTTGTTATGAGTAATGGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	180222	29	-	636262	TTTCTGGGCTTCTT-TTATGAGTAATGGTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	439464	30	+	647215	TTTCTGGGCTTCTTGTTATGAGTAATGGTT

a
s	mr.mrrefChr5	285579	45	+	294542	TATCTTGCACTATTTCAGCTGGTATATCATGATTGTATCGCAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	180257	25	-	636262	TATCTGGTACTATTTCAGCTGGTAT--------------------
s	simRat_chr6.simRat.chr6	439494	45	+	647215	TATCTTGCACGATTTCAGTTAGTATATCATGATTGTATCGCAGTT

a
s	mr.mrrefChr5	285624	390	+	294542	GATAGCTTAGGTATAGCATCCATGATATTAGCACAGACGAGCATGCCCCTCAATATATGGTCAATATGGGGATAGCAATATTGCTGCTGTAATACTGAAATGATGAATCATATTGTTGTTTCAAGATAGCACCTCAAAATGTTTTAAAAGATTCAATGGGCTAGAACTGTGTTTGCATTGGTGTTTACATCTAATAATGCCAGTTGTTGCGTTGTTGCTGGAATGCTTTATGATGTAGATTTTTCAACGGTGGCAGTGGTTTGAATAGTTCAGCCAAATAGGTTGGCCCAAGATTAGTAAGATAGTCTAGCATGTGAGCTTCATTTAGGTCTCATAACACATATAGGAGGGACAGGTGGTAGCTGTAGAGAATGTAGGAAACCACATTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	430999	379	+	636262	GATAGGTTAGGTATAGCATCCATGATGTTAGCACAGACAGGCATA-CTCGCTATATATGGTAAATATGGGGATAGCAATATTGCTGCTGTAATACTGAAATGATGAAGCATATTGTTGTTTCAGGACAGCAC-------TGTTTTAAAAGATTCAATGGGCTAGAACTGTGTTTGCATTGGTGTTCACATCTAATGATGCCAATTGTTGCGTTGTTGTTGG---GCTTTATGATGTAGATTTTTCAACGGTGGCGGTGGTTTGAATAGTTCAGTCAAATAGATTGGCCCAAGATTAGTAAGATAATCTAGCATGAAAGCTTCATTTAGGTCTCATAACACATATAGGAGGGATAGGTGGTAGCTGTAGAGAATGTAGGAAACCACATTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	439539	390	+	647215	GATAGCTAAGGTATAGCAGCCATGATATTAGCACAGACGAGCATGCCCCTCAATATATGGGCGATATGGGCATAGCAATCTTGTTGTTGTAATACTGAAATAATGAATCATATTGTAGTTTCGAGATAACACCTCAAAATGTTTTAAAAGATTCAATGGGCTACGTGGGTGTTTGGATTTTCGTTTACATGTAATACTGCCAGTTGTTGTGTTGTTGCTGGAATGCTTTATGATGTAGATGTCTCAAGGGTGGCAGTGGTTTGAAAAATTCAGCTAAATGGGTGGGCCCAAGGTTAGTAAGGTAGTCTAGCATGTGAGATTTGTTTAACTCTCATAACACACATTGGAGGGACCGGTGGTAGCTGTAGAGAGTGTAGGAAACCACATTAA

a
s	mr.mrrefChr5	286014	144	+	294542	GGTTATTGGTAGTTTGTTAGCAGGATGACCCATTTTGTTTCGTCTTAAAGCCTTACCTCAAAGTCACAGTTCATTATAGTTTTCAAAAATCTGCTTTGCAACACCTGTGACTGCCCTTTGAGCTAGGCCAAACATTGTCTTCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	431378	144	+	636262	GGTTATTGGTAGTCTGTTAGCAGGATGACCCATTTTGTTTCGTTTTAAAGCCTTACCTCAAAGTCACAGTTCATTATAGTTTTCAAAAATCTGCTTTGCCACACCTGTGACCGCCCTTTGAGCTAGGCCAAACACTGTCTTCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	439931	144	+	647215	GGTTATTGGTAGTTTGTTAGCAGGATGACCCATCTTGTGTCATCTAAAAGCCTTACCTCAAAGTCACAGTTCATTATAGTGTTCAGAAATCTGGTTTGCAACACCTGTGACTGCCTGTTGAGCTGGGCCAAACATTGTCTTCTT

a
s	mr.mrrefChr5	286158	158	+	294542	GGTAAAAAGATTCGAGCTAGGCCAAACATTGTCATCTGGAGTAAAAAGAGTTTCCCTCACCACCATCTGAGCTATAAGACTATTGCTGGGAAGCTCTACTGGGCTCACATAAGCTTATCCGATCAATGGAATGCCAGGGTATTTTGTAGTAACCCTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	431523	156	+	636262	GGTAAAAAGATTCGAGCTAGGCCAAACATTGTCATCTGGAGTAAAAAG-GTTTCCCTCACCACCATCTGAGCTATAAGACTATTGCTGGGGATCTCTAATGGGCTCACATAAGGTCATCTG-TCAATGGAATGCCAAGGTCTTTTGTAGTAACCCTTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	440075	158	+	647215	GGTAAATAGATTTGAGCTAGGCCAAACATTGTCTTCTGCAGTAAAAAGAGTTTCCCTCACAACCATCTGGGCCATAAGACAGTATTTGGGAAGCTCTACTGGGCTCACATAAGCCTATCCGATCAATGGAATGCCCGGGTATTTTGTAGTAACCCTTG

a
s	mr.mrrefChr5	286316	37	+	294542	TATGGACCTGTCAGGCCGCCTTACAATACTTAGCCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	431681	37	+	636262	TATGGACCTGTCAGGCCGCCTTACAATACTTAGCCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	440233	37	+	647215	TATGGACCTATCAGGCCGCCTTACAGTACTTAGCTCA

a
s	mr.mrrefChr5	286353	51	+	294542	TTTACAGAAGCCTCATAGTCACTTCAAAGAGCATCCTTAAATAAAAGATAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	431718	51	+	636262	TTTACAGAAGCCTCATAGTCACTTCAAAGAGCATCCTTACATAAAAGATAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	440282	51	+	647215	CTTACTGAAGCCTGATAGTTACGTCAAGGAGCATCCTTAAATAAAAGATAT

a
s	mr.mrrefChr5	286404	82	+	294542	TGGTTGTCCCACAGGAAATCTACTCAGTGCCTCGTTTTCGATGGAAATAACTAAGATAAGAGTTACATGAAAGGTTGCTACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	431769	82	+	636262	TGGTTGTCCCACAGGAAATCTACTCAGTGCCTCTTTTTCGATGGACATAACTAAGATAAGAGTTACATGAAAGGTTGCTGCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	440343	82	+	647215	TGGTTGTCCCACAGGAAGTTTACTCAGTGCCTCGTTTTCGATGGGAATAGCTAAGATAAGAGTGACATGAAAGGTTGCTACA

a
s	mr.mrrefChr5	286486	50	+	294542	TTTGAAATAGTCCATCCAAGTAGTTGTGTGTCCCTTATGACCACATGGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	431851	50	+	636262	TTTGAAATAGTCCATCCAAGTAGTTGTGTGTCCCTTATGACCACGTGGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	440426	50	+	647215	TTTGAAAAAGTCCACCTGATTAGTTGTGTGTCCCCTATGACCACATGTTG

a
s	mr.mrrefChr5	286536	258	+	294542	AATAATATCTCTATCTCTCCTCACTATCATGGCACACATTCTTGATAGGAACCTCTTCATAAGATTTCAGGTGCAATCTAAAGCACCTGTAGCATGGGAAATGTACATTATTTTCATGAATCGGGAATAGGGCACTAATAACCAGTCCCTGGTACTTTCATGTCATCTCATCTCAGTGTACAATGAAGTTAGATGCAAATAAATGTTCCAGGCAATATTAGATTTGATAACAAACGCATTCAGGACACGATTACACTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	431901	255	+	636262	AATAATAGCTCTATCTCTCCTCATCATTATGGCACACATTCTTGATAGGAACCTCTTCCTAGGATTTCA-GTTCAATCTAAAGCACCTGTAGCGTGGGAAATGTACATTATTATCGTGAATCAGGAATAGGGCACTGATAACCAGTCCCTGGTATTTTCATCTCATCTCATCTCATTGCACGATGAAGTTAGACGCAAATAAATGTTCCAGGCAATATTAGATTTGAT-ACGGACGCATTCAGGACGC-ATTACACTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	440477	257	+	647215	AATAATATCTCTATCTCTCCTCACTATCATGACACACACTCTT-ATAGGAACCTCTTCATAAGATTGCAGGTGCAATCTAAAGCACCTGTAGCATGGGAAATGTACATTATTTTCAAGAATCGGGAATAGGGCACTAATAACCAGTCCCTGGTACTCTCAAGTCATCCCGTCTCGGTGTGCAATGAAGTTAGATGCAAATAAATTTTCCAGGCAGTTTTAGATTTGATAACAAACGCATCCAGGACACGATTACATTT

a
s	mr.mrrefChr5	286794	28	+	294542	CTGCTGCTGCTACAGGTTTTCTCTACTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	432157	28	+	636262	TTGCTGCTGGTACAGGTTTTCTCTACTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	440734	28	+	647215	CTGCTGCTGCTACAGGTGTTCTCTACTA

a
s	mr.mrrefChr5	286822	19	+	294542	TTGGGGTGTTCATTCCCGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	432268	19	+	636262	TTTGGGTGTTCATTCCCGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	440762	19	+	647215	CTGTGGTGGTCATTCCCAT

a
s	mr.mrrefChr5	286841	138	+	294542	AGCGGCAGAACCAGCTAATATGCACTCAGAATCTTCCATTAGTGTTCATGTTGAACCTTCCAATTATTGTCTAAGGTGAGTTATGAGTTGCATTAAAACTAAGTCCTAACACTGCAAGGAATAGATCTCTCAGGAGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	432295	131	+	636262	AGTGGCAGGACCAGCCAACATGTACTCAGA-------ACTAGTGTCCTTATTGAACCTTCCAATTATTGTGTGAGCTGGGTTATGAGTTGCATTAAAACTAAGTCCTAACACTGCAAGGAATAGATCTCTCAGGAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	440781	138	+	647215	AGCGGCAGAACTAGCTAATGTGCACTCAGAATCTTCCATTAGTGTTCATGATGAACCTTCCGACTATTGTCCAAGGTGAGGTATGAGTTGCATTAAAACTAAGTCCTAACACTACGACGAATAGATGTCTCAAGAGGA

a
s	mr.mrrefChr5	286979	11	+	294542	ATAGTGGCTGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	432426	11	+	636262	ATAGTGGCTGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	440920	11	+	647215	ATAGGAGCTGC

a
s	mr.mrrefChr5	286990	23	+	294542	TTGAGACTATGCTCTGCCACTCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	432442	23	+	636262	TTGAGACTATGCTCTGCCACTCA
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a
s	mr.mrrefChr5	287013	25	+	294542	CAGCAACAATACTCATCCATCAGTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	432466	25	+	636262	CAGCAACAATACTCATCCATCAGTT
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a
s	mr.mrrefChr5	287038	175	+	294542	GACATAGGGCTCATATCTCATGATATAGACTGTTTAGTCTCCACAAGGCTTAGAGCTACAAACCTGCTGATGTAAATTCTGTCGCTAGTACATACATTTAGCCTAGTCACAACCCACAGGGGCATGTAAGAATCAAGAGTGTTTTTTATAAGAGGTTGATAATGAGTTTATCAAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	432492	175	+	636262	GACATAGGGCTCATATCTCATGATATAGACTGTTTAGTCTCCACAAGGCTTAGAGCTACAAACCTGCTGATGTAAATTCTGTCGCTAGTACATACATTTAGCCTAGTCACAACCCACAGGGGCATGTAAGAATCAAGAGTGTTTTTTATAAGAGGTTGATAATGAGTTTATCAAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	440979	175	+	647215	GACATAGGGCTCATATCCCAGGAAATAGACTGTCTAGTCTGCACAAGGCTTGGAGCTGCAAACCTATGGATGTAAATTCTGTAGCCAACACATACATCTAGCCTAGTAGCAAACCAGAGGGGTGTGTAAGAATCAAGAGTGTTTTTTATAAGAGGCTGATAATGAGTTGATCAAC

a
s	mr.mrrefChr5	287213	106	+	294542	CACTGTGATAGATAAACAACCCCCATAACTAGAGCAATGAAACACTTTTATAAGAGATTGACAATGGGTTAGTCAATATGCTATGATTGACATGCCAACGATATGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	432668	106	+	636262	CACTGTGATAGATAAACAACCCCCATAACTAGAGCAATGAAACACTTTTATAAGAGATTGACAATGGGTTAGTCAATATGCTATGATTGACATGCCAACGATATGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	441154	106	+	647215	CACTGTGATAGATAAGCAACCCCCATAACTAGAGCAAGGAAGTGCCTTTATAAGACCTGGACAATGGATTAGTCAGTACGCTATGATTGATATGCCAGTGATATGC

a
s	mr.mrrefChr5	287319	169	+	294542	GGGGCCTCATAACTAGAGTAAGGACACGCCTTAATAAAAGTCTTATAATGGATTGATCAAAATGCTATGGTAGACTTGCAGGCCCACCTACTAGAGTAATGACACACTGGTTTGACTAGTTGATACCAGACTGTTAGACAACATCAATGAATAGTTTCTAGGCCATGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	432774	169	+	636262	GGGGCCTCATAACTAGAGTAAGGACACGCCTTAATAAAAGTCTTATAATGGATTGATCCAAATGCTAAGGTAGACTTGCAGGCCCACCTACTAGAGTAATGACACACTGGTTTGACTAGTTGATACCAGACTGTTAGACAACATCAATGAATAGTTTCTAGGCCATGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	441261	152	+	647215	AGGGCCCCATAGGTAGAGTAATGATACACCTTAATAAAA-----------------TCAAAATGCTGTGGTAGTCTTATAGGCTCACTTACTAGAGTAACGAAACACTGGTTTGACTAGTTGATACCAGACTGTTAGACAACAGCAATGAACAGTTTCTAGGCCATGAG

a
s	mr.mrrefChr5	287488	75	+	294542	TATTCATAATTATTGTGAACTACAGCAAAGAAAAATGCAATGGGGACGTCTGAGAAGAATCGATGCCAAAGACAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	432952	75	+	636262	TATTCATAATTATTGTGAACTACAGCAAAGAAAAATGCAATGGGGACATCTGAGAAGAATCGATGCCAAAGACAG
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a
s	mr.mrrefChr5	287563	82	+	294542	AAACAACTCCAACCTGGCATAAATGAAATAAATATTAGCTAGAATCTTTCTCTTGGTAGAAAGGGAGCAAGATGCTCCACAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	433028	82	+	636262	AAACAACTCCAACCTGGCATAAATGAAATAAATATTAGCTAGAATCTTTCTCTTGGTAGAAAGGGAGCAAGATGCTCCACAC
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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s	simRat_chr6.simRat.chr6	203630	74	-	647215	ccaggggcttgcatttcttctttgctagttggagttctcaagggggtcttctgcctccaggacaatgagattct

a
s	mr.mrrefChr5	290582	4	+	294542	attg
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	436136	4	+	636262	attg
s	simRat_chr6.simRat.chr6	443187	4	+	647215	ATTG

a
s	mr.mrrefChr5	290586	28	+	294542	GAGTGAGCTCTACACATATACTGGTGTA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	436845	28	+	636262	GAGTGAGCTCTACACATATACTGGTGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	443191	28	+	647215	GACTGAGCTCTACACAAATACTGGTGTC

a
s	mr.mrrefChr5	290614	50	+	294542	GGCAGAGCATCACCTTAATGACTGACTTAGCTCTACACAAGTATGTTATG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	436873	50	+	636262	GGCAGAGCATCACCTTAATGACTGACTTAGCTCTACACAAGTATGTTATG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	443222	50	+	647215	GACATAGTGTCACTTTAATAACTTCCTGAGCTCCATGCAAATATGTTATG

a
s	mr.mrrefChr5	290664	2	+	294542	GT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	436925	2	+	636262	GT
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a
s	mr.mrrefChr5	290666	30	+	294542	GTGAGAAGCATACCACATACTGTGGGCATC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	436927	30	+	636262	GTGAGAAGCATACCACATACTGTGGGCATC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	443275	30	+	647215	ATGACAAATATACCACATACCGTGAACATA

a
s	mr.mrrefChr5	290696	8	+	294542	CATGATAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	436957	8	+	636262	CATGATAA
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a
s	mr.mrrefChr5	290704	11	+	294542	GTTAAGGGTAT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	436965	11	+	636262	GTTAAGGGTAT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	443316	11	+	647215	GTTAAGGGTAT

a
s	mr.mrrefChr5	290715	9	+	294542	GGCAACTTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	436979	9	+	636262	GGCAACTTG
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a
s	mr.mrrefChr5	290724	157	+	294542	GGGCAGATAGCAACACCACCGTTCCATTTCATACTATATAAATGAGGGAAACAGGGGGTAACATGACGTCAAAATCTAGAAGTAGTTCTTTGTCTCTTCATCCCTATATTGGTAAGAGGTGCCTTCCATTGGGTTTTAAGCTGAATCTCTGTTATTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	436988	157	+	636262	GGGCAGATAGCAACACCACCGTTCCATTTCATACTATATAAATGAGGGAAACAGGGGGTAACATGACGTCAAAATCTAGAAGTAGTTCTTTGTCTCTTCATCCCTATATTGGTAAGAGGTGCCTTCCATTGGGTTTTAAGCTGAATCTCTGTTATTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	443337	157	+	647215	GGGCATATAGCAACACCACTGTTCCATTGCTCACTATGTGAATGAACACAACAGGGGGTAACACAACATCAAAATTTAGAAGTAGCTCTTTGTCACTTCATCCCTATAATGGTCAGAGGTGCCTTCTGTTGGGTTTTAAGCTGAATGTCTGTCATTA

a
s	mr.mrrefChr5	290881	17	+	294542	AACCTAAGGCTggagta
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437152	17	+	636262	AACCTAAGGCTGGAGTA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	443494	17	+	647215	GATCCAAGGCTaccgga

a
s	mr.mrrefChr5	290898	60	+	294542	GACCCAGTTATATGGTATTTAGACGCTGGTAGTGCATTGCAGGGGATGAGTTCCTCATCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437169	60	+	636262	GACCCAGTTATATGGTATTTAGACGCTGGTAGTGCATTGCAGGGGATGAGTTCCTCATCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	445709	60	+	647215	GACTCAGTTATAAGGTTTTTGGATGCTGGTAGTGCATTGCAAGGGATGGATTCCTCACCC

a
s	mr.mrrefChr5	290958	28	+	294542	CACACATATGTCCTGAGGGCCTGGTAGC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437229	28	+	636262	CACACATATGTCCTGAGGGCCTGGTAGC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	445773	28	+	647215	CCCACATATGTCCTGGGGGCCTGATAGT

a
s	mr.mrrefChr5	290986	6	+	294542	AGAGGT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437260	6	+	636262	AGAGGT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	445801	6	+	647215	AGAGGT

a
s	mr.mrrefChr5	290992	12	+	294542	AGTTTATTCAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437267	12	+	636262	AGTTTATTCAGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	445807	12	+	647215	AATTTATTCAGG

a
s	mr.mrrefChr5	291004	146	+	294542	GAGGCTGCTATAATATGGCTCACGCTCTCAGAATCCAGGCGTTTAGTACTAGTAATGCACAAGAAACCATTAGTTCAACTTTCTTCAGTGTTCTTCTACACGAACTGTTTTCAGCAAGTGCTGCATCCATGGTTGGGTATTGGTTT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437287	146	+	636262	GAGGCTGCTATAATATGGCTCACGCTCTCAGAATCCAGGCGTTTAGTACTAGTAATGCACAAGAAACCATTAGTTCAACTTTCTTCAGTGTTCTTCTACACGAACTGTTTTCAGCAAGTGCTGCATCCATGGTTGGGTATTGGTTT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	445819	146	+	647215	GAGGCTGCCATAATATGACTCAAGCTCTCAGAAACCAGGAGTTTAGTACTAGTGATGCGCAAGAAACTGTTAGTTCAACTTTCTTCAGTGTTCTTCAACACGAATTGTTTTCAGCAACTGCTGCATCCATGGTTAGGTATTGAATT

a
s	mr.mrrefChr5	291150	21	+	294542	CATTTTGCCTTCCCCCAGTTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437440	21	+	636262	CATTTTGCCTTCCCCCAGTTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	445965	21	+	647215	CATTTTGCCTTCCTCCTGATC

a
s	mr.mrrefChr5	291171	42	+	294542	GGGGTTCGATTTTAGAGTATTGTCTATGAGAAATTCAGAACC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437461	42	+	636262	GGGGTTCGATTTTAGAGTATTGTCTATGAGAAATTCAGAACC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	446000	42	+	647215	AGCGTTTGATTCTTAAGAATTGTCTATGGGAAATTCAGGGCC

a
s	mr.mrrefChr5	291213	234	+	294542	TCTAAGTAAAGTCCAGTGATGGCCACCATGCCACCTATAGTGTTTTGATCAGCCAACATGGGCAACAGGCATTTACTCACAGCCAGTCAATATGGAGAACTTGAGTGTGATCTCAGGAAGGTCTCGAACATCGAGGGATGACCAGTCCATGCCCTACCTTAGATCCTGTGTATACACAAGCTACCCTTCTTGCTAACAACACATTTCTTTGCTCGAAGAGTAGAAAGAAGTCCA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437503	234	+	636262	TCTAAGTAAAGTCCAGTGATGGCCACCATGCCACCTATAGTGTTTTGATCAGCCAACATGGGCAACAGGCATTTACTCACAGCCAGTCAATATGGAGAACTTGAGTGTGATCTCAGGAAGGTCTCGAACATCGAGGGATGACCAGTCCATGCCCTACCTTAGATCCTGTGTATACACAAGCTACCCTTCTTGCTAACAACACATTTCTTTGCTCGAAGAGTAGAAAGAAGTCCA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	446044	234	+	647215	TCTCAGTAAAGTCCAGTGACAGCCACCACAGCACCTCTAGTGTTTTGACCAGCCCGCATAGGCAATAGGCGTTTGTCCACAGACAGTTAATATGGGGAACTTGAGCATGATCTCAGCAAGGCCTAGGACATTGAGGGATGAACAGTCCATGCCCTGCCTTAGATCCCATGTATAAGCAAGCTACCCTTCTTGCTAACAACACATTTCTTTACTTGAAGAGTAGAAAGAAGTCCA

a
s	mr.mrrefChr5	291447	17	+	294542	TAGATGTCTCTAAGCCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437737	17	+	636262	TAGATGTCTCTAAGCCT
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a
s	mr.mrrefChr5	291464	22	+	294542	GCTACTGCATATAATAGGGTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437754	22	+	636262	GCTACTGCATATAATAGGGTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	446311	22	+	647215	GATACTGCTTATACTAGAGTAA

a
s	mr.mrrefChr5	291486	6	+	294542	TATCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437777	6	+	636262	TATCTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	446333	6	+	647215	TATCTG

a
s	mr.mrrefChr5	291492	17	+	294542	TCTTTTGTACTATGGAG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437783	17	+	636262	TCTTTTGTACTATGGAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	446340	17	+	647215	TCTTTTGTGCTATGGAG

a
s	mr.mrrefChr5	291509	28	+	294542	TGCCCTCCTGCCATCAAGCAATGTATGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437800	28	+	636262	TGCCCTCCTGCCATCAAGCAATGTATGG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	446358	28	+	647215	TGTCATTTTTCCTTCAAGCTATATGTAG

a
s	mr.mrrefChr5	291537	177	+	294542	TGGTCTAAGTAGTCACTTGATAATTGGTTCTGTCAAAGTGATCATGCCATGGTTATATGAATCCCCATGGATATCCCTACAATTCACTCTGTTAGGAACCCTGATAACAATCCCTAGAATTCAGCTTCTATCCACAGACTGGTGACTATTCCCAGAGCTCATCTTTTATCCAGGCAC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	437836	177	+	636262	TGGTCTAAGTAGTCACTTGATAATTGGTTCTGTCAAAGTGATCATGCCATGGTTATATGAATCCCCATGGATATCCCTACAATTCACTCTGTTAGGAACCCTGATAACAATCCCTAGAATTCAGCTTCTATCCACAGACTGGTGACTATTCCCAGAGCTCATCTTTTATCCAGGCAC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	446386	177	+	647215	CGGTCTAAGCATTCACTTGATAATGGGTTATGTCAGAGAGATTATGCCATGGTTATATGAATCCCCATGGATATCCCTACAATTCACTCTGTGAGGAACCCTGATAGTTGCCCCTAGATTTCATTTTCTATCCACAGACTGGTGACTATCTCCAGAGCTCATCTTTTATCCAGGCAC

a
s	mr.mrrefChr5	291714	96	+	294542	ACCCTTGCTATGGTGAGTGAGAACTTTTTACCATGCCCATGGAGTCAAATTCTGAGGTGGAGCCTCTAACAGATCATGTGCCTATTGCCTCAAACA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	438013	96	+	636262	ACCCTTGCTATGGTGAGTGAGAACTTTTTACCATGCCCATGGAGTCAAATTCTGAGGTGGAGCCTCTAACAGATCATGTGCCTATTGCCTCAAACA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	446570	96	+	647215	GCCGTTGCTGTTGTGGGTGAGAACTTTTTACCATGCCTATGGAGTCGAATTCTGAGGTAGAGCCACTAATAGATTATGTGGCTATTGTCTCAAACA

a
s	mr.mrrefChr5	291810	119	+	294542	CTAAATTTTGGGGTCGAGCAGAGAGGCTTTTTTCAGGAAGTAGAGAAGTAAGGCCCTCACCAGTTATGCTGTTGATTGTTCCAATCACTGACCTACCTCTTGTTATGCTTCTTCTGAGA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	438109	107	+	636262	CTAAATTTTGGGGTCGAGCAGAGAGGCTTTTTTCAGGAAGTAAAGAAG------------CAGTTATGCTGTTGATTGTTCCAATCACTGACTTACCTCTTGTAATACCTCTTCTGAGA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	446667	119	+	647215	CTAAATCTTGTGGTAGTGAAGTGAGGCTCCTTTCAGGATGTAGAGAAATAAGGCCCTCACCAGTTATGCCATGGATTGTTCCAATCAATGACCTACCCCTTGTTATGCTCCTTCTGAGA

a
s	mr.mrrefChr5	291929	7	+	294542	TTTTATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	438219	7	+	636262	TTTTATT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	446786	7	+	647215	TTCCATT

a
s	mr.mrrefChr5	291936	224	+	294542	ATTTTTCTTCTCCTGAGATACTGGAAAATCCCCTCCTCAACCCTCCAATGGCATCTCTGTGGTAACTGTTTGTCTTGAACATTCTTTCATACCTCTGTTATAAGAAGCATGTTGATTGCAGATATCGGTATTTGAAGGTAAATAGGCACTCACAATGCAGTCTGCAGGGCCTTTGGGTCAGCCCCTATGTAAGTTGGTATGTAGGATTTATTTCTCTTGGGCTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	438227	224	+	636262	ATTTTTCTTTTTCTGAGATGCTGAAAAATCCCCTCCTCAACCCTCCAATGGCATCTCTATGCTAACTGTTTGTCTTGAACATTCCTTCATACCTCTGTTATAAGGAGTATGTTGACTGCAGATATCGGTATTTGAAGGTAAATAGGCACCCACATTGTAGTCTGCAGGGCCTTTTGGTCAGCTCCTATGTAAGTTGGTTTGTAGGATTTATTTCTCTTGGCCAG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	446793	215	+	647215	-TTTTTTTTCTCCTGAGATAACGGAAAATCC------CAACTCTCCAATGGCATCTGTGTGGTAAGTGTTTGTCTTGAACATTCTTTCATACCTCTGTGATAAGAAGCAGATTGATTGCAGATCTCAGTATTTGAAGGC-AATAGGCACTCACAATGCAAACTGCAGGGCTTTTGGGTTAGTCCCTATTTAAG-TGGTATGTACAATTTATTTCTCTTGGGCTG

a
s	mr.mrrefChr5	292160	23	+	294542	ACTACCCTATACTAATATTTTCC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	438460	23	+	636262	ACTACCCTATACTGATATTTTCC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	447008	23	+	647215	ACTACCCTATACTAATATTGTCC

a
s	mr.mrrefChr5	292183	75	+	294542	ATACTTCTAAAATCATACTCCATCAATTTCAGTGGTTCTGTTGCCTATGTGTACTCAGGTACATAACTGGGTGTG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	438486	75	+	636262	ATACTTCTAAAATCATACTCCATCAATTTCAGTGGTTCTGTTGCCTATGTGTACTCAGGTTTGTAACCAGGTGTG
s	simRat_chr6.simRat.chr6	447031	65	+	647215	GTACTTGTAAAA-------CCATCAATTTGAGTGGTTCTGTTGCCC---TACACCTGGATACAAACCTGAGTATA

a
s	mr.mrrefChr5	292258	151	+	294542	GGTTGTCTAGCAGTATCCTTTATGATAGGGGAAGGGAAAATTATGTATTTTGCGGTTTCAGAAATGTTACTACAGGCCTTTGCAGTGAATGAAGCCAGCCCAAAGATTGAAATGAGGTTACAACATTAAAGCAGTCATTATAGCAGTTGAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	438561	151	+	636262	GGTTGTTTAGCAGTATCCATTATGATAGGGGAGGGGCAAATTATGTATTTTGCGGTTTCGCAATTGTTACTACAGGCCTTTGCAGTGAATGAAGCCAGCCCAAAGATTGAAATGGGGTTACAACATTAAAGCAGTCATTATAGCAGTTGAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	447099	151	+	647215	AGTTGTCTAGCAGTATCCTTCATGATACAGGAAGGGAAAATTATGTATTTTGCTGTTTTAGAAATGTTACTACAGGCCCTTGCAGTGAATGAAACCATCCCAAAGAGTGAAATGAGGTTACAACATCAAAGCAGTCATTATTGCAGTTAAA

a
s	mr.mrrefChr5	292409	46	+	294542	TTACAGGACAGGAGACATCAACAAACATTAATATCCAAAAAGTAGG
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	438739	46	+	636262	TTACAGGACAGGAGACATCAACAAACATTAATATCCAAAAAGTAGG
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a
s	mr.mrrefChr5	292455	274	+	294542	TTGATATTGTTTGTTTAAGCTAGCAACTTACTAAACTTACTAAATTGGATTGCATAAAATAGGGACACCAGTCAGGTTTTTGGTGTGTTTCTCTCTACAACCATTCTGGGAGATTTTAACTCCAAGGAATCTGGAGGTGGAAAGCAGTCCACACATGTCTGGAAAAGCAAATCTATAAATATTGTGAGGTATGGGCATATCTCGCAACTTTCTAGTTGATGCCAAAACGCTTAAACACACAGGCTATCAGCAGTCTATGGCATCTTGGCTCTAA
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	438789	274	+	636262	TTGATATTCTTTGTTTAAGCTAGCAACTTACTAAACTCACTAAATTGGATTGCATAAAATAGGGACACCAGTCAGGTTTTTGGTGTGTTTCTCTCTACAACCATTTTGGGAGATTTTAACTCCAAGGAATCTGGGGGTGGAAAGCAGTCCACACCTGTCTGGAAAAGCAAATCTATAAATATTGTGAGGTACGGGCATATCTCGCAACTTTTAAGTTGATGCCTAAACGCTTAAACACACAGGCTATCAGCAGTCTATGGCGTCTTGGCTCTAA
s	simRat_chr6.simRat.chr6	447296	273	+	647215	TTGTGATTGTGTGTTTAAGCTAGCAACTTGCTAAACTTACTAAATTGGATTGCATAAAATAAGGACACCAGTTAGGTTTTTAGTGTGTTTCTCCCC-CAACCATTCTGGGAGATTTTAACTCCAAGGGGTCTGGAGGTGGAAAGCAGTCCACACATACCTGGAAAAGCAAAGCTATACATGTTGTGAGGTATGGGCATATCTGGCAACTTTCTAGTTGACGCTAAAAGGCATAGACATACAGGCTATCCGCTGTCTATGGCATCTTGGCTCTAA

a
s	mr.mrrefChr5	292729	359	+	294542	TAAATCAGTTGAAGTACAATGGCCGTTACATAATGGCAATTACATAGACAGATTCTATGAGACATAATGACTGGAGACTAAGTCTGCATAGAATAACTAGTGCATATAGCCCTTTAATGAAATGATCCACTTGTGGCTAGCCTAGATAACTTGACCACTCTTTCAGTGCCATGCCAATATTGACCAGTTGGAAGGGTACCATTCAGTCCGGATTACCATTCAGTTCAGACGAGTAGCTTACCATCACAACATAGATCATCTTTCTATTAACCCCACTAGTGCAATGGAGAGACACATATTCGCCTTAAGATCCTACGTTGTAGTACTTACTCAGAAACAAACTGAGACAGTATAGTCTC
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	439063	359	+	636262	TAAATCAGTTGAGCTATGATGGCCGTTACATAATGGCAATTACATAGACAGATCCCATGACACATAATGACTGGAGACTAAGTCTGCATAGAATAACTAGTGCATATAGCCATTTGATGAAATGATCCACTTGTGGCTAGCCTAGATAACTTTACTACTCTTTCAGTGCCATGCCAATATTGACCAGTTGGAAGGGTACCATTCAGTCCAGATTACCATTCAGTTCAGACGAGTAGCTTACCATCACAACATAGATCATCTTTCTATTAACCCCACTAGTGCAATGGAGAGACACATATTCGCCTTAAGATCCTACGTTGTAGTACTTACTAAGAAACAAACTGAGACAGTGTAGTCTC
s	simRat_chr6.simRat.chr6	447577	352	+	647215	TAAATCAGTTGAAGTACAATGGCCATCACATAATGGCAATTACATAGACACAATCTATGAGACATAATGACTGGAGACTAAGTTTGAATATAATAACTAGTGCATACAGTCCTTTAATGAGATGATCCACTTGTGGCTAGCCTGCATAACTTGACCACTCTTTTGGTGCCATGCCAATATTGACCAGTTGGAAGTGTACCATTCAGCCTGGATTACCATTCAGTTCAAAAGAGTAGCTTACCATCACAACATAGATCATCTTTCTATTAA-------AGTGCAGTGGAGGGACGTGTATTCGTCTTAAGATCCTATGTTGTACTACTTACTCAGAAACAATCTGAGACAGTATAGTCTC

a
s	mr.mrrefChr5	293088	838	+	294542	TAGGACATACCGAGCAGCCCATAAGAACCAACATGAATGTACAAACTACACAAGATTCCCACATAACCAGCAGCACAGACAATACAGGTTCCACCTGTTATAGTATCCTGGTTATTAGGAACTAGATGAAATGCCCAGGGGATATATGGTATCTTAGCAAACAACAATACTACAAAGGCTACAAGAAGTGGATTGCCCAATGCTAAAACATCCAGGTTTGTTTCATCTGTTCTCCCTATTTGAATCAAGTCCACAAAAGGAAAAATGGAAAGAGAAGACACTAACTTTAACGAAAAGACTATTACACTACTGTGCCAGTTTATGTGAAGGACACTTTGTATAAGCTATTGGAGATACTACTCTGTTCCACATTTTCATGACAGCACAGGGTCCCAACTCACCTCTTCATTCTCCTCTTTATTTATGAATGCATATATGTGTTTCGCGAAGCTGTTGATTTGTTGTACTTGCAGTACTCATATTGTTACTTTGCCTCATGTTTTAATTGTATGTGTTAGTTTGATACTTAAACTGTTGAATGTTATGATCATAAACTTAACTGTTACCTCTCTCAAGAAGGGATCATATGGTGAAGTTTTCAATTTCAGGCTACATCTAGGTTGGTTCAGCAGCTCCAATTGAGGTGTTTCCCAAGTATCAGGTGGTGCTTTTGACAAAGCTAGTACTTTTGATATGATACAGATGTCCTGCCAGTGGACTAAGCACAATTTAAGTGTAAACAACTCAGTCATAGATAATTTAGACCAGTACAAAAATAAGTCATGTAAGCCATTTTTAATATTCCAACGCACACAAACTTTACAATTGTAATGTCTCT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	439618	819	+	636262	TAGGATATACAGATCAGCCCATAAGAACCAACATGAATATACAGACTACACATGATTCCCACATGACCAGCGGCATAGACAACACAGGTTCCACCTGTTATAGTATCCTGGATATTAGGAACTAGATGAAATGCCCAGGGGATATATGGTATCTTAGCAAACAACAATACTACAAAGGCTACAAGAAGTGGGTTGCCCAATACTAAAATATCCAGATTTGTTTTATCTGTTCTCCCTATTTGAGTCAAGTCCATGAAAGGAAAAATGGAAAGGGGAGACACTAACTTTAACATAGAGACTATTAC---ACTGTGCTAGTTTATGTGAAGGACGCTTTGTATAAGCTATTGGAGATACTACTCTGTTCCACATTTTCATGACAGCACAGGGTCCCAACTCACCTCTTCATTCTCCTCTTTATTTACTAGCGCATATACATGTTTCGCGAAGCTGTTAATTTGTTGTACTTGTAGTACTCATATTGTTACTTTGCCTCATGTTTTAATTGTATGTGTTAGTTTGATATTTAAACTGTTGAATGTTATGATCATAAACTTAACTGTTACCTCTCACTAGATGGGATCATATGGTCTAGTTTTCAATTTCAGGCTACATTTAGGTTGGTTCAGCAGCTCCAATTGAGGTGTTTCCCGAGTGTCAGGTGGTGCTTTTGACAAAG-----------GATATGATACAGATGTCCTGCCAGTGGGCTAAGCACAATTTAAGTGTAAAC----CAGTCATA-ATATTTTAGACCAGTACAAAAATAAGTCATGTAAGCCATTTTTAATATTCCAACACACACAAACTTTACAACTGTAATGTCTCT
s	simRat_chr6.simRat.chr6	447929	832	+	647215	TAGTCCATATCCAGCAGCCCATAACAACCAAAATGAATGTACAAAGTACACAAGATTCCT-TAAAACCAGCAGCACAGACAGTACAGGTTCCACCTGCTGCAGTGTGCTGGTTATTTGGAACTAGATGAAATGCCCAGGGGATGAATGGTTTCTTAGCGAACAACAATACTACAAAGGTTACCAGAAGTGGATTGCCTAATGCTAAAACATTCATGTTTGTTTCATCTGTTCTCTCTATTTGAATCAAGCCCACAAAAGGAAAAATGGAAAGAGAAGACACTAACTTTAAGGAAAGGACTATTGCACTACTGTGCCAGTTTATGTGAAGGACACTTTGTATCAGTTATTGGAGATACTATTCTGTTCCTCATTGTCATGACACCAAAGGCCCCCAACTCACTTCTTCATTCTCCTCTTCATTTGTGAATGCATATATGTGTTTCAAGAAGCTGTTGCTTTGCTGTACTTGCAGCACTCATATTGTTA-TTTGCCACATGAATTAATTGTATGTTTAAGTTTAATACTTAACCTGTTGAAGGTTCTGATGCTTAACTGATCTGTTACCTCTCTCAAGAAGGGATCATATGGTGACGTCTTCAATTTCAGGCTCCATCTAGG-TGGTTCCGCAGCTCCAATTGA---GTTTCCCAAGTATCTGGCGGTGCTTTTGACACAGCTAGTACTTTTGGTAGGATAGAGTTGTCCTGCCAGTGAACTAACCACATTTTAAGTATCAACAACTCAGTCATAGGTAATTTAGACCAGTGTAAAAATGAGTCATGTAAGCCGTTTTTAATATTCCAACGCACACAGACTATACAATTGTAATATCTCT

a
s	mr.mrrefChr5	293926	271	+	294542	CAAAAAACCAAGTTTTAAGGTTTCGTCAAGTGAACAGGGACACTTATCATACATGCAATCAGATTGTCTGTATTTTAAGAATACCAGTGTTTTTGGTGGATTCATCCAAACCTCAGGTTGACTAGGTATTTGCTGTGGAGTAAGTACATGCATATGACATTAATATCATATTAAGGACTTCTGTAGTATAATGTGTAACCATTGACTTGACTAATATGTAGTGCAAGCTTGTTTACTATCCACATTACCTTCCATCAACTGGGAATTCATT
s	simMouse_chr6.simMouse.chr6	440437	271	+	636262	CAAAAAACCAAGTTTTAAGGTTTCGTCAAGTTAACAGGGACACTTATCATACATGCAATCAGATTGTCTGTATTTTAAGAATACCAGTGTTTTTGGTGGATTCATCCAAACCTCAGGTTGACTAGGTATTTGCTGTGGAGTAAGTACATGCATATGACATTAATATCATATTAAGGACTTCTGTAGTATAATGTGTAACCATTGACTTGACTAATATGTAGTGCAAGCTTGTTTACTATCCACATTACCTTCCATCAACTGGGAATTCATT
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a
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a
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a
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a
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a
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a
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