annotate test-data/eggnog.tsv @ 6:12494257f0f0 draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxy-genome-annotation/galaxy-tools/tree/master/tools/genenotebook commit 5ad4d3b59c746740b22834fbef55e3e6170b52a8

# emapper version: emapper-2.0.1 emapper DB: 2.0
# command: ./emapper.py  --data_dir /shared/ifbstor1/galaxy/mutable-data/tool-data/eggnog_data/2.0 -m diamond --matrix BLOSUM62 --gapopen 11 --gapextend 1 --query-cover 0 --subject-cover 0 --target_orthologs=all --go_evidence=non-electronic --seed_ortholog_evalue=0.001 --seed_ortholog_score=60 --output=results -i /shared/ifbstor1/galaxy/datasets/002/201/dataset_2201165.dat --cpu 8
# time: Tue Nov 23 17:29:53 2021
#query_name	seed_eggNOG_ortholog	seed_ortholog_evalue	seed_ortholog_score	best_tax_level	Preferred_name	GOs	EC	KEGG_ko	KEGG_Pathway	KEGG_Module	KEGG_Reaction	KEGG_rclass	BRITE	KEGG_TC	CAZy	BiGG_Reaction	taxonomic scope	eggNOG OGs	best eggNOG OG	COG Functional cat.	eggNOG free text desc.
MMUCEDO_000002-T1	36080.S2J5L3	1.23e-186	523.0	Fungi incertae sedis	ABP140	GO:0001510,GO:0003674,GO:0003779,GO:0003824,GO:0005488,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005856,GO:0005884,GO:0005937,GO:0005938,GO:0006139,GO:0006396,GO:0006399,GO:0006400,GO:0006725,GO:0006807,GO:0006996,GO:0007010,GO:0007015,GO:0008033,GO:0008092,GO:0008150,GO:0008152,GO:0008168,GO:0008173,GO:0008175,GO:0008757,GO:0009451,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015629,GO:0016043,GO:0016070,GO:0016427,GO:0016740,GO:0016741,GO:0022607,GO:0030029,GO:0030036,GO:0030427,GO:0030479,GO:0030488,GO:0030674,GO:0030863,GO:0030864,GO:0032259,GO:0032432,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034660,GO:0042995,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043332,GO:0043412,GO:0043414,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044260,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044430,GO:0044444,GO:0044446,GO:0044448,GO:0044463,GO:0044464,GO:0044877,GO:0046483,GO:0051015,GO:0051017,GO:0051286,GO:0052735,GO:0060090,GO:0061572,GO:0061645,GO:0071704,GO:0071840,GO:0071944,GO:0090304,GO:0097435,GO:0099080,GO:0099081,GO:0099512,GO:0099513,GO:0099568,GO:0120025,GO:0120038,GO:0140098,GO:0140101,GO:1901360	2.1.1.268	ko:K17053					ko00000,ko01000,ko03016				Fungi	1GSMQ@112252,38G2U@33154,3NUGD@4751,KOG2361@1,KOG2361@2759	NA|NA|NA	S	Methyltransferase domain
MMUCEDO_000003-T1	36080.S2J001	0.0	948.0	Fungi													Fungi	39PS9@33154,3Q616@4751,KOG3577@1,KOG3577@2759	NA|NA|NA	T	7 transmembrane receptor (Secretin family)
MMUCEDO_000004-T1	36080.S2J485	7.4e-114	328.0	Fungi incertae sedis	RPS9B	GO:0000462,GO:0002181,GO:0003674,GO:0003676,GO:0003723,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005488,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006139,GO:0006364,GO:0006396,GO:0006412,GO:0006417,GO:0006450,GO:0006518,GO:0006725,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009889,GO:0009891,GO:0009893,GO:0009987,GO:0010467,GO:0010468,GO:0010556,GO:0010557,GO:0010604,GO:0010608,GO:0010628,GO:0015935,GO:0016070,GO:0016072,GO:0019222,GO:0019538,GO:0019843,GO:0022613,GO:0022626,GO:0022627,GO:0030490,GO:0030684,GO:0030686,GO:0031323,GO:0031325,GO:0031326,GO:0031328,GO:0032040,GO:0032268,GO:0032270,GO:0032991,GO:0034248,GO:0034250,GO:0034470,GO:0034641,GO:0034645,GO:0034660,GO:0042254,GO:0042274,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044085,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0045727,GO:0045903,GO:0046483,GO:0048518,GO:0048522,GO:0050789,GO:0050794,GO:0051171,GO:0051173,GO:0051246,GO:0051247,GO:0060255,GO:0065007,GO:0065008,GO:0071704,GO:0071840,GO:0080090,GO:0090304,GO:0097159,GO:1901360,GO:1901363,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904,GO:2000112		ko:K02997	ko03010,map03010	M00177			br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011				Fungi	1GT32@112252,38B77@33154,3NU1W@4751,COG0522@1,KOG3301@2759	NA|NA|NA	J	Ribosomal protein S4/S9 N-terminal domain
MMUCEDO_000005-T1	36080.S2JYJ1	6.56e-107	308.0	Fungi incertae sedis	RPL21A	GO:0002181,GO:0003674,GO:0003735,GO:0005198,GO:0005575,GO:0005622,GO:0005623,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005840,GO:0006412,GO:0006518,GO:0006807,GO:0008150,GO:0008152,GO:0009058,GO:0009059,GO:0009987,GO:0010467,GO:0015934,GO:0019538,GO:0022625,GO:0022626,GO:0032991,GO:0034641,GO:0034645,GO:0043043,GO:0043170,GO:0043226,GO:0043228,GO:0043229,GO:0043232,GO:0043603,GO:0043604,GO:0044237,GO:0044238,GO:0044249,GO:0044260,GO:0044267,GO:0044271,GO:0044391,GO:0044422,GO:0044424,GO:0044444,GO:0044445,GO:0044446,GO:0044464,GO:0071704,GO:1901564,GO:1901566,GO:1901576,GO:1990904		ko:K02889	ko03010,map03010	M00177,M00179			br01610,ko00000,ko00001,ko00002,ko03011				Fungi	1GTD9@112252,39YIF@33154,3P285@4751,COG2139@1,KOG1732@2759	NA|NA|NA	J	Ribosomal protein L21e