Mercurial > repos > goeckslab > bayestme_deconvolve
diff test-data/refFree_test_data/marker_genes.csv @ 0:4f6d716e5da2 draft
planemo upload for repository https://github.com/goeckslab/tools-st/tree/main/tools/bayesTME commit 26edd05a863adac97cb54a9fb2ae5613ce95df50
| author | goeckslab |
|---|---|
| date | Wed, 03 Dec 2025 19:49:22 +0000 |
| parents | |
| children |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/refFree_test_data/marker_genes.csv Wed Dec 03 19:49:22 2025 +0000 @@ -0,0 +1,121 @@ +gene_name,rank_in_cell_type,cell_type +S100A13,0,1 +GFRA1,1,1 +AGR2,2,1 +MORF4L2,3,1 +FN1,4,1 +HSBP1,5,1 +ENO1,6,1 +TTLL12,7,1 +LAPTM4B,8,1 +BST2,9,1 +KRT8,10,1 +NACA,11,1 +APOD,12,1 +HLA-DRA,13,1 +ARF1,14,1 +ACADSB,15,1 +SPP1,16,1 +CXCL14,17,1 +SNRPE,18,1 +IFITM3,19,1 +KRT19,20,1 +ATP5F1B,21,1 +S100P,22,1 +CTTN,23,1 +HSP90AB1,24,1 +BTF3,25,1 +TPI1,26,1 +SLC9A3R1,27,1 +PBX1,28,1 +APOE,29,1 +IDH2,30,1 +IER3,31,1 +TUBA1B,32,1 +MAGED2,33,1 +MT2A,34,1 +COX17,35,1 +TOMM6,36,1 +KRT10,37,1 +AGR3,38,1 +SELENOM,39,1 +SELENOM,0,2 +BTF3,1,2 +MAGED2,2,2 +S100P,3,2 +IFITM3,4,2 +COX17,5,2 +KRT10,6,2 +SLC9A3R1,7,2 +TPI1,8,2 +IER3,9,2 +ARF1,10,2 +TOMM6,11,2 +IDH2,12,2 +TUBA1B,13,2 +KRT8,14,2 +HLA-DRA,15,2 +BST2,16,2 +CXCL14,17,2 +KRT19,18,2 +APOE,19,2 +ENO1,20,2 +SPP1,21,2 +MORF4L2,22,2 +PBX1,23,2 +AGR2,24,2 +APOD,25,2 +ATP5F1B,26,2 +ACADSB,27,2 +NACA,28,2 +SNRPE,29,2 +HSBP1,30,2 +FN1,31,2 +AGR3,32,2 +LAPTM4B,33,2 +S100A13,34,2 +HSP90AB1,35,2 +GFRA1,36,2 +CTTN,37,2 +MT2A,38,2 +TTLL12,39,2 +AGR3,0,3 +MT2A,1,3 +TTLL12,2,3 +HSP90AB1,3,3 +CTTN,4,3 +PBX1,5,3 +APOE,6,3 +ATP5F1B,7,3 +LAPTM4B,8,3 +TOMM6,9,3 +KRT10,10,3 +SNRPE,11,3 +ACADSB,12,3 +TUBA1B,13,3 +NACA,14,3 +APOD,15,3 +IDH2,16,3 +HSBP1,17,3 +FN1,18,3 +IER3,19,3 +GFRA1,20,3 +SELENOM,21,3 +SPP1,22,3 +KRT19,23,3 +COX17,24,3 +S100A13,25,3 +CXCL14,26,3 +HLA-DRA,27,3 +ENO1,28,3 +MAGED2,29,3 +AGR2,30,3 +MORF4L2,31,3 +BST2,32,3 +SLC9A3R1,33,3 +KRT8,34,3 +TPI1,35,3 +S100P,36,3 +ARF1,37,3 +BTF3,38,3 +IFITM3,39,3
