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--- a/EURL_VTEC_WGS_PT.py	Thu Oct 19 12:31:29 2023 +0000
+++ b/EURL_VTEC_WGS_PT.py	Thu Oct 19 19:07:24 2023 +0000
@@ -121,7 +121,7 @@
         log.write("parameters: minGeneCoverage=90, minGeneIdentity=90, minGeneDepth=15\n\n")
         log.write(os.popen("cat " +  TOOL_DIR + "/data/ViruloTyping_db.txt").read())
     # SEQUENCETYPER
-    subprocess.call("mlst --legacy --scheme ecoli " + args.contigs + " | cut -f3,4,5,6,7,8,9,10 > " + args.mlstsevenloci, shell=True)
+    subprocess.call("mlst --legacy --scheme ecoli_4 " + args.contigs + " | cut -f3,4,5,6,7,8,9,10 > " + args.mlstsevenloci, shell=True)
     sequence_typing = openFileAsTable(args.mlstsevenloci)
     log.write("\n\nSequence Typer\n==============\n")
     log.write(os.popen("mlst -v").read())
@@ -204,14 +204,14 @@
         report.write("</p>\n")
         if args.virulotyping:
             subprocess.call("sort " + args.virulotyper  + " | awk '/eae_|stx1._|stx2._|ehxa_/ && $2>50 && !seen[substr($1, 1, index($1, \"_\")-2)]++ { printf(\"%s%s\",sep,substr($1, 1, index($1, \"_\")-1));sep=\", \" }END{print \"\"}' > virulotyper_rep", shell=True)
-            for line in fileinput.input("virulotyper_rep", inplace=True):
-                print(line.replace("1a", "1"),)
-            for line in fileinput.input("virulotyper_rep", inplace=True):
-                print(line.replace("2a", "2"),)
-            for line in fileinput.input("virulotyper_rep", inplace=True):
-                print(line.replace("1b", "1"),)
-            for line in fileinput.input("virulotyper_rep", inplace=True):
-                print(line.replace("2b", "2"),)
+            # for line in fileinput.input("virulotyper_rep", inplace=True):
+                # print(line.replace("1a", "1"),)
+            # for line in fileinput.input("virulotyper_rep", inplace=True):
+                # print(line.replace("2a", "2"),)
+            # for line in fileinput.input("virulotyper_rep", inplace=True):
+                # print(line.replace("1b", "1"),)
+            # for line in fileinput.input("virulotyper_rep", inplace=True):
+                # print(line.replace("2b", "2"),)
             report.write("<p>Virulotypes: ")
             insertFile("virulotyper_rep", report)
             report.write("</p>\n")

--- a/data/SequenceTyping_db.txt	Thu Oct 19 12:31:29 2023 +0000
+++ b/data/SequenceTyping_db.txt	Thu Oct 19 19:07:24 2023 +0000
@@ -1,3 +1,3 @@
 Enterobase
-Allele database: v20181009
-Sequence database: v20181009
+Allele database: v20221028
+Sequence database: v20221028

--- a/data/ViruloTyping_db.txt	Thu Oct 19 12:31:29 2023 +0000
+++ b/data/ViruloTyping_db.txt	Thu Oct 19 19:07:24 2023 +0000
@@ -1,2 +1,2 @@
 Statens Serum Institut & Technical University of Denmark
-Virulotype database: v20200722 (with additions v20201121)
+Virulotype database: v20230714 (with additions v20231019)

--- a/eurl_vtec_wgs_pt.xml	Thu Oct 19 12:31:29 2023 +0000
+++ b/eurl_vtec_wgs_pt.xml	Thu Oct 19 19:07:24 2023 +0000
@@ -15,7 +15,7 @@
         <requirement type="package" version="0.11.9">fastqc</requirement>
         <requirement type="package" version="5.0.2">quast</requirement>
         <requirement type="package" version="3.8">muscle</requirement>
-        <requirement type="package" version="2.19">mlst</requirement>
+        <requirement type="package" version="2.23">mlst</requirement>
 		<requirement type="package" version="1.0.1">abricate</requirement>
         <requirement type="package" version="2020.2">tbb</requirement>
     </requirements>

--- a/scripts/modules/seq_conf/escherichia_coli/typing.fasta	Thu Oct 19 12:31:29 2023 +0000
+++ b/scripts/modules/seq_conf/escherichia_coli/typing.fasta	Thu Oct 19 19:07:24 2023 +0000
@@ -14,6 +14,50 @@
 CAGTAGAGTCTTCAAAAGAAAAAATCACACTAGAATCAAAAAAATGTAACATTGCAAAAAAAAGTAATAA
 AAGTGGTCCTGAAAGCATGAATAGTAGCAATTACTGCTGTGAATTGTGTTGTAATCCTGCTTGTACCGGG
 TGCTATTAA
+>AslA_1_CP022686
+ATGGAATTTTCGTTTTCACCCAAACTTCTTGTTGTTGCTGTCGCCGCAGCTCTTCCTCTCATAGCCAGCGCAGCAGATAC
+CCCGTCAACCGCCACCGCACGCAAAGGCTTTGCCGGATACGATCACCCAAACCAGTATCTGGTTAAACCGGCGACCACTA
+TTGCCGACAACATGATGCCGGTGATGCAGCATCCTGCACAAGACAAAGAAACCCAGCAGAAACTGGCGGAACTTGAGAAA
+AAAACCGGTAAGAAACCGAACGTGGTTGTTTTCTTGCTGGATGATGTGGGCTGGATGGACGTTGGCTTTAACGGCGGCGG
+CGTGGCGGTGGGTAACCCTACACCAGATATCGACGCCGTTGCCAGCCAGGGGCTGATTTTAACTTCGGCGTATTCTCAAC
+CGAGTTCTTCCCCAACCCGCGCCACGATTCTCACCGGACAATACTCCATCCACCACGGCATTCTGATGCCGCCAATGTAC
+GGGCAACCGGGCGGTCTGCAAGGGTTAACCACGCTGCCGCAGTTGCTGCACGATCAGGGCTACGTCACCCAGGCTATCGG
+GAAATGGCATATGGGGGAAAACAAAGAGTCGCAGCCGCAGAACGTTGGCTTTGATGATTTCCGCGGCTTTAACTCGGTGT
+CCGATATGTATACCGAATGGCGTGATGTTCATGTCAACCCGGAAGTCGCCCTGAGCCCGGCTCGTTCTGAATACATCCAA
+AAACTGCCGTTCAGCAAAGATGACGTTCATGCCGTGCGCGGCGGTGAACAGGAAGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATA
+TATGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATAAGCCTTTCT
+TCCTCTATTACGGCACTCGCGGCTGTCACTTCGATAACTACCCGAACGCCAAATATGCGGGTAGCTCTCCGGCGCGCACC
+TCTTACGGCGACTGCATGGTGGAGATGAACGATATCTTCGCCAATCTGTATAAAGCACTGGAGAAAAACGGTCAGCTTGA
+TAACACGCTGATTGTGTTCACCTCTGATAACGGTCCGGAAGCCGAAGTTCCGCCGCACGGTCGCACGCCGTTCCGCGGTG
+CGAAAGGTTCTACATGGGAAGGCGGCGTTCGTGTGCCAACCTTCGTTTACTGGAAAGGCATGATCCAACCGCGTAAATCT
+GACGGCATTGTCGATCTGGCGGATCTCTTCCCTACGGCGCTGGATCTGGCGGGGCATCCTGGGGCGAAAGTAGCGAATTT
+AGTACCGAAAACCACCTTTATCGATGGTGTGGACCAGACATCTTTCTTCCTGGGAACAAATGGTCAGTCTAACCGTAAGG
+CCGAGCACTACTTCCTCAACGGTAAACTTTCTGCTGTGCGTATGGATGAGTTCAAGTATCACGTCCTGATTCAGCAACCT
+TACGCTTATACCCAGAGCGGATATCAGGGTGGATTCACCGGCACAGTAATGCAAACGGCGGGATCGTCGGTGTTTAACCT
+GTACACCGATCCGCAGGAAAGCGACTCTATCGGCGTGCGCCATATCCCAATGGGTGTACCGCTACAGACCGAAATGCATG
+CGTATATGGAGATCCTGAAAAAATATCCACCACGCGCGCAGATTAAATCTGATTAA
+>AslA_2_CP054236
+ATGGAATTTTCGTTTTCACCCAAACTTCTTGTTGTTGCTGTCGCCGCAGCTCTTCCTCTCATAGCCAGCGCAGCAGATAC
+CCCGTCAACCGCCACCGCACGCAAAGGCTTTGCCGGATACGATCACCCAAACCAGTATCTGGTTAAACCGGCGACCACTA
+TTGCCGACAACATGATGCCGGTGATGCAGCATCCTGCACAAGACAAAGAAACCCAGCAGAAACTGGCGGAACTTGAGAAA
+AAAACCGGTAAGAAACCGAACGTGGTTGTTTTCTTGCTGGATGATGTGGGCTGGATGGACGTTGGCTTTAACGGCGGCGG
+CGTGGCGGTGGGTAACCCTACACCAGATATCGACGCCGTTGCCAGCCAGGGGCTGATTTTAACTTCGGCGTATTCTCAAC
+CGAGTTCTTCCCCAACCCGCGCCACGATTCTCACCGGACAATACTCCATCCACCACGGCATTCTGATGCCGCCAATGTAC
+GGGCAACCGGGCGGTCTGCAAGGGTTAACCACGCTGCCGCAGTTGCTGCACGATCAGGGCTACGTCACCCAGGCTATCGG
+GAAATGGCATATGGGGGAAAACAAAGAGTCGCAGCCGCAGAACGTTGGCTTTGATGATTTCCGCGGCTTTAACTCGGTGT
+CCGATATGTATACCGAATGGCGTGATGTTCATGTCAACCCGGAAGTCGCCCTGAGCCCGACTCGTTCTGAATACATCCAA
+AAACTGCCGTTCAGCAAAGATGACGTTCATGCCGTGCGCGGCGGTGAACAGGAAGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATA
+TATGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATAAGCCTTTCT
+TCCTCTATTACGGCACTCGCGGCTGTCACTTCGATAACTACCCGAACGCCAAATATGCGGGTAGCTCTCCGGCGCGCACC
+TCTTACGGCGACTGCATGGTGGAGATGAACGATATCTTCGCCAATCTGTATAAAGCACTGGAGAAAAACGGTCAGCTTGA
+TAACACGCTGATTGTGTTCACCTCTGATAACGGTCCGGAAGCCGAAGTTCCGCCGCACGGTCGCACGCCGTTCCGCGGTG
+CGAAAGGTTCTACATGGGAAGGCGGCGTTCGTGTGCCAACCTTCGTTTACTGGAAAGGCATGATCCAACCGCGTAAATCT
+GACGGCATTGTCGATCTGGCGGATCTCTTCCCTACGGCGCTGGATCTGGCGGGGCATCCTGGGGCGAAAGTAGCGAATTT
+AGTACCGAAAACCACCTTTATCGATGGTGTGGACCAGACATCTTTCTTCCTGGGAACAAATGGTCAGTCTAACCGTAAGG
+CCGAGCACTACTTCCTCAACGGTAAACTTTCTGCTGTGCGTATGGATGAGTTCAAGTATCACGTCCTGATTCAGCAACCT
+TACGCTTATACCCAGAGCGGATATCAGGGTGGATTCACCGGCACAGTAATGCAAACGGCGGGATCGTCGGTGTTTAACCT
+GTACACCGATCCGCAGGAAAGCGACTCTATCGGCGTGCGCCATATCCCAATGGGTGTACCGCTACAGACCGAAATGCATG
+CGTATATGGAGATCCTGAAAAAATATCCACCACGCGCGCAGATTAAATCTGATTAA
 >astA_1_AF161000
 ATGCCATCAACACAGTATATCCGGAGACCCACATCCAGTTATGCATCGTGCATATGGTGCGCAACAGTCTGC
 GCTTCGTGTCATGGAAGGACTACAAAGCCGTCACTCGCGACCTGA
@@ -545,72 +589,33 @@
 CGGGCCCGATGGTATGGTGATAAAAAGCGTAAAATTTATGAATGGGATTCCCAGCACGGTGAGCTTGAAGGG
 TACCGCGCCAGTGATGGCGAACACCTCGGGGCATTCGATCCAAAAACGGGTAAGCAGGTTAAAGGGCCGGAT
 CCAAAACGAAACATTAAAAAATATCTTTAA
->cdtB_1_AJ508930
-ATGAAAAAATATATTATATCTCTGATAGTATTTTTATCGTTTTACGCTCAGGCGGATTTAACTGATTTTCGC
-GTTGCGACCTGGAACCTTCAGGGCGCATCCGCCACTACTGAAAGTAAATGGAATATAAATGTCCGACAATTA
-ATTTCTGGTGAAAATGCCGTAGATATTTTAGCTGTGCAGGAGGCAGGTTCTCCGCCATCAACGGCTGTAGAT
-ACAGGTAGAGTTATTCCTTCCCCAGGCATTCCTGTCCGGGAGCTTATCTGGAACTTGTCTACAAATAGCAGA
-CCACAGCAAGTATATATATATTTTTCTGCTGTTGATGCCTTTGGTGGAAGGGTCAATCTTGCTCTGGTTAGC
-AATCGGCAGGCCGATGAAGTGTTTGTTCTTCGCCCGGTAAGGCAAGGTGGGCGGCCACTGCTTGGCATACGG
-ATTGGCAATGATGCATTTTTCACTGCACATGCGATAGCTACACGAAACAATGACGCTCCCGCTCTTGTTGAA
-GAAGTCTATAGCTTCTTTCGTGACAGCCGAGACCCAGTCCACCAGGCCATTAACTGGATGATTCTTGGTGAT
-TTTAATCGCGAACCTGATGATTTAGAGGTGAACCTTACAGTTCCTGTAAGAAATGCATCAGAAATTATTTTC
-CCTGCTGCACCGACACAAACGAGTCAACGAACATTAGATTATGCAGTAGCAGGAAACGCTGTGGCCTTTAGA
-CCATTTCCGCTACAAGCAGGAATTGTATACGGAGCCAGAAGGACTCAGATGTCTTCAGACCATTACCCTGTT
-GGCGTTTCCAGACGATAA
->cdtB_2_AB472840
-ATGAAAAAATATATTATATCTCTGATAGTATTTTTATCGTTTTACGCTCAGGCGGATTTAACTGATTTTCGC
-GTTGCGACCTGGAACCTTCAGGGCGCATCCGCCACTACTGAAAGTAAATGGAATATAAATGTCCGACAATTA
-ATTTCTGGTGAAAATGCCGTAGATATTTTAGCTGTGCAGGAGGCAGGTTCTCCGCCATCAACGGCTGTAGAT
-ACAGGTAGAGTTATTCCTTCCCCAGGCATTCCTGTCCGGGAGCTTATCTGGAACTTGTCTACAAATAGCAGA
-CCACAGCAAGTATATATATATTTTTCTGCTGTTGATGCCTTTGGTGGAAGGGTCAATCTTGCTCTGGTTAGC
-AATCGGCAGGCTGATGAAGTGTTTGTTCTTCGCCCGGTAAGGCAAGGTGGGCGGCCATTGCTTGGCATACGG
-ATTGGCAATGATGCATTTTTCACTGCACATGCGATAGCTACGCGAAACAATGACGCTCCCGCTCTTGTTGAA
-GAAGTCTATAGCTTCTTTCGTGACAGCCGAGACCCAGTCCACCAGGCCATTAACTGGATGATTCTTGGTGAT
-TTTAATCGCGAACCTGATGATTTAGAGGTGAACCTTACAGTTCCTGTAAGAAATGCATCAGAAATTATTTTC
-CCTGCTGCACCGACACAAACGAGTCAACGAACATTAGATTATGCAGTAGCAGGAAACGCTGTGGCCTTTAGA
-CCATTTCCGCTACAAGCAGGAATTGTATACGGAGCCAGAAGGACTCAGATGTCTTCAGACCATTACCCTGTT
-GGCGTTTCCAGACGATAA
->cdtB_3_AY365042
-ATGAAAAAATATATTATATCTCTGATAGTATTTTTATCGTTTTACGCTCAGGCGGATTTAACTGATTTTCGC
-GTTGCGACCTGGAACCTTCAGGGCGCATCCGCCACTACTGAAAGTAAATGGAATATAAATGTCCGACAATTA
-ATTTCTGGTGAAAATGCCGTAGATATTTTAGCTGTGCAGGAGGCAGGTTCTCCGCCATCAACGGCTGTAGAT
-ACAGGTAGAGTTATTCCTTCCCCAGGCATTCCTGTCCGGGAGCTTATCTGGAACTTGTCTACAAATAGCAGA
-CCACAGCAAGTATATATATATTTTTCTGCTGTTGATGCCTTTGGTGGAAGGGTCAATCTTGCTCTGGTTAGC
-AATCGGCAGGCCGATGAAGTGTTTGTTCTTCGCCCGGTAAGACAAGGTGGGCGGCCATTGCTTGGCATACGG
-ATTGGCAATGATGCATTTTTCACTGCACATGCGATAGCTACGCGAAACAATGACGCTCCCGCTCTTGTTGAA
-GAAGTCTATAGCTTCTTTCGTGACAGCCGAGACCCAGTCCACCAGGCCATTAACTGGATGATTCTTGGTGAT
-TTTAATCGCGAACCTGATGATTTAGAGGTGAACCTTACAGTTCCTGTAAGAAATGCATCAGAAATTATTTTC
-CCTGCTGCACCGACACAAACGAGTCAACGAACATTAGATTATGCAGTAGCAGGAAACGCTGTGGCCTTTAGA
-CCATTTCCGCTACAAGCAGGAATTGTATACGGAGCCAGAAGGACTCAGATGTCTTCAGACCATTACCCTGTT
-GGCGTTTCCAGACGATAA
->cdtB_4_AY365045
-ATGAAAAAATATATTATATCTCTGATAGTATTTTTATCGTTTTACGCTCAGGCGGATTTAACTGATTTTCGC
-GTTGCGACCTGGAACCTTCAGGGCGCATCCGCCACTACTGAAAGTAAATGGAATATAAATGTCCGACAATTA
-ATTTCTGGTGAAAATGCCGTAGATATTTTAGCTGTGCAGGAGGCAGGTTCTCCGCCATCAACGGCTGTAGAT
-ACAGGTAGAGTTATTCCTTCCCCAGGCATTCCTGTCCGGGAGCTTATCTGGAACTTGTCTACAAATAGCAGA
-CCACAGCAAGTATATATATATTTTTCTGCTGTTGATGCCTTTGGTGGAAGGGTCAATCTTGCTCTGGTTAGC
-AATCGGCAGGCCGATGAAGTGTTTGTTCTTCGCCCGGTAAGGCAAGGTGGGCGGCCATTGCTTGGCATACGG
-ATTGGCAATGATGCATTTTTCACTGCACATGCGATAGCTACGCGAAACAATGACGCTCCCGCTCTTGTTGAA
-GAAGTCTATAGCTTCTTTCGTGACAGCCGAGACCCAGTCCACCAGGCCATTAACTGGATGATTCTTGGTGAT
-TTTAATCGCGAACCTGATGATTTAGAGGTGAACCTTACAGTTCCTGTAAGAAATGCATCAGAAATTATTTTC
-CCTACTGCACCGACACAAACGAGTCAACGAACATTAGATTATGCAGTAGCAGGAAACGCTGTGGCCTTTAGA
-CCATTTCCGCTACAAGCAGGAATTGTATACGGAGCCAGAAGGACTCAGATGTCTTCAGACCATTACCCTGTT
-GGCGTTTCCAGACGATAA
->cdtB_5_AB472839
-ATGAAAAAATATATTATATCTCTGATAGTATTTTTATCGTTTTACGCTCAGGCGGATTTAACTGATTTTCGC
-GTTGCGACCTGGAACCTTCAGGGCGCATCCGCCACTACTGAAAGTAAATGGAATATAAATGTCCGACAATTA
-ATTTCTGGTGAAAATGCCGTAGATATTTTAGCTGTGCAGGAGGCAGGTTCTCCGCCATCAACGGCTGTAGAT
-ACAGGTAGAGTTATTCCTTCCCCAGGCATTCCTGTCCGGGAGCTTATCTGGAACTTGTCTACAAATAGCAGA
-CCACAGCAAGTATATATATATTTTTCTGCTGTTGATGCCTTTGGTGGAAGGGTCAATCTTGCTCTGGTTAGC
-AATCGGCAGGCCGATGAAGTGTTTGTTCTTCGCCCGGTAAGGCAAGGTGGGCGGCCATTGCTTGGCATACGG
-ATTGGCAATGATGCATTTTTCACTGCACATGCGATAGCTACGCGAAACAATGACGCTCCCGCTCTTGTTGAA
-GAAGTCTATAGCTTCTTTCGTGACAGCCGCGACCCAGTCCACCAGGCCATTAACTGGATGATTCTTGGTGAT
-TTTAATCGCGAACCTGATGATTTAGAGGTGAACCTTACAGTTCCTGTAAGAAATGCATCAGAAATTATTTTC
-CCTGCTGCACCGACACAAACGAGTCAACGAACATTAGATTATGCAGTAGCAGGAAACGCTGTGGCCTTTAGA
-CCATTTCCGCTACAAGCAGGAATTGTATACGGAGCCAGAAGGACTCAGATGTCTTCAGACCATTACCCTGTT
-GGCGTTTCCAGACGATAA
->cdtB_6_KC618326
+>cdt_IB_8_U03293
+ATGATAAAATATATTATATCTCTGATAGTGTTTTTATCGTTTTACGCTCAGGCAGATTTAACTGATTTTCGT
+GTTGCTACTTGGAACCTTCAAGGAGCGGCCGCGACTACTGAAAGTAACTGGAATATACCTGTCCGGCAATTA
+ATTTCGGGTGAAAATGCCGTAGACATTTTAGCTATACAAGAGGCAGGTTCCCCACCATCAACTGCTGTAGAT
+ACAGGGAGAGTTATTCATTCCCCAGGAATTCCTATCCGAGAGCTTATCTGGAACTTATCTACAAATAGTAGA
+CCAGAGCAAGTATATATATATTTTTTTGCTGTTGATGCCCTTGGAGGAAGGGTTAATCTTGCTCTGATTAGC
+AATCGGCAGGCCGATGAAGTGTTTGTTCTGAGCCCAGTAAGGCAAGGAGGACGACCGTTGCTTGGTATACGA
+ATTGGTAATGATGCTTTTTTCACTGCACATGCAATAGCTACGCGAAACAATGATGCACCTGCTCTTTTTGAA
+GAGGTATATAACTTCTTCCGCGACAAGACGGATCCACTACACCAAGCTCTTAACTGGATGATTCTTGGTGAT
+TTCAACCGTGAACCGGATGGTTTAGAGGTGAACCTTACCGTTCCTGTAAGAAATGCATCTGAAATTATTTTC
+CCTGCAGCAGCAACACAAACGAGTCAACGAACATTAGATTATGCTGTAGCAGGAAACGCTGTAGCCTTTAGA
+CCATTACCACTACAAGCTGGAATTCTCTATGGAGCCAGAAGGACTCAGATATCTTCAGATCATTACCCTGTT
+GGCGTCTTCAGACGTTAA
+>cdt_IIB_13_U04208
+ATGAAAAAATATATTATATCTCTGATAGTGTTTTTATCATTTTACGCTCAAGCAGATTTAACTGATTTTCGC
+GTTGCGACCTGGAATCTTCAAGGTGCATCCGCTACGACTGAAAGTAAATGGAATATAAATGTCCGGCAATTA
+ATTTCTGGTGAAAATGCTGTAGACATTTTAGCTGTACAAGAGGCAGGCTCTCCGCCGTCAACGGCTGTAGAT
+ACAGGTACACTTATTCCTTCCCCAGGAATTCCCGTCCGAGAGCTTATCTGGAACTTGTCGACAAATAGCAGG
+CCACAGCAAGTATATATATATTTTTCCGCTGTTGATGCCCTCGGTGGAAGAGTCAATCTTGCTCTGGTTAGC
+AATCGGCGGGCCGATGAAGTGTTTGTTCTTAGTCCTGTAAGACAAGGTGGACGACCATTGCTTGGCATACGA
+ATTGGTAATGATGCATTTTTCACTGCACACGCCATAGCTATGCGAAACAATGATGCCCCGGCTCTTGTTGAG
+GAAGTGTATAACTTCTTCCGCGACAGCAGAGACCCAGTACACCAGGCGCTTAACTGGATGATTCTTGGTGAT
+TTCAACCGTGAACCTGCGGATTTAGAGATGAACCTTACTGTTCCCGTAAGAAGGGCATCAGAAATTATTTCA
+CCAGCGGCGGCAACACAAACCAGCCAGCGAACATTAGATTATGCAGTAGCAGGAAACTCTGTGGCATTTAGA
+CCATCTCCGCTACAAGCGGGAATTGTATATGGAGCCAGGAGAACTCAAATATCTTCAGATCATTTCCCTGTT
+GGCGTATCCAGACGATAA
+>cdt_IIIB_6_KC618326
 ATGAAAAAATATATTATATCTCTGATAGTATTTTTATCGTTTTACGCTCAGGCGGATTTAACTGATTTTCGC
 GTTGCGACCTGGAACCTTCAGGGCGCATCCGCCACTACTGAAAGTAAATGGAATATAAATGTCCGACAATTA
 ATTTCTGGTGAAAATGCCGTAGATATTTTAGCTGTACAGGAGGCAGGTTCTCCGCCATCAACGGCTGTAGAT
@@ -623,7 +628,7 @@
 CCTGCTGCACCGACACAAACGAGTCAACGAACATTAGATTATGCAGTAGCAGGAAACGCTGTGGCCTTTAGA
 CCATTTCCGCTACAAGCAGGAATTGTATACGGAGCCAGAAGGACTCAGATGTCTTCAGACCATTACCCTGTT
 GGCGTTTCCAGACGATAA
->cdtB_7_AY365044
+>cdt_IIIB_7_AY365044
 ATGAAAAAATATATTATATCTCTGATAGTATTTTTATCGTTTTACGCTCAGGCGGATTTAACTGATTTTCGC
 GTTGCGACCTGGAACCTTCAGGGCGCATCCGCCACTACTGAAAGTAAATGGAATATAAATGTCCGACAATTA
 ATTTCTGGTGAAAATGCCGTAGATATTTTAGCTGTGCAGGAGGCAGGTTCTCCGCCATCAACGGCTGTAGAT
@@ -636,85 +641,72 @@
 CCTGCTGCACCGACACAAACGAGTCAACGAACATTAGATTATGCAGTAGCAGGAAACGCTGTGGCCTTTAGA
 CCATTTCCGCTACAAGCAGGAATTGTATACGGAGCCAGAAGGACTCAGATGTCTTCAGACCATTACCCTGTT
 GGCGTTTCCAGACGATAA
->cdtB_8_JF297618
-ATGATAAAATATATTATATCTCTGATAGTGTTTTTATCGTTTTACGCTCAGGCAGATTTAACTGATTTTCGT
-GTTGCTACTTGGAACCTTCAAGGAGCGGCCGCGACTACTGAAAGTAACTGGAATATACCTGTCCGGCAATTA
-ATTTCGGGTGAAAATGCCGTAGACATTTTAGCTATACAAGAGGCAGGTTCCCCACCATCAACTGCTGTAGAT
-ACAGGGAGAGTTATTCATTCCCCAGGAATTCCTATCCGAGAGCTTATCTGGAACTTATCTACAAATAGTAGA
-CCAGAGCAAGTATATATATATTTTTTTGCTGTTGATGCCCTTGGAGGAAGGGTTAATCTTGCTCTGATTAGC
-AATCGGCAGGCCGATGAAGTGTTTGTTCTGAGCCCAGTAAGGCAAGGAGGACGACCGTTGCTTGGTATACGA
-ATTGGTAATGATGCTTTTTTCACTGCACATGCAATAGCTACGCGAAACAATGATGCACCTGCTCTTTTTGAA
-GAGGTATATAACTTCTTCCGCGACAAGACGGATCCACTACACCAAGCTCTTAACTGGATGATTCTTGGTGAT
-TTCAACCGTGAACCGGATGGTTTAGAGGTGAACCTTACCGTTCCTGTAAGAAATGCATCTGAAATTATTTTC
-CCTGCAGCAGCAACACAAACGAGTCAACGAACATTAGATTATGCTGTAGCAGGAAACGCTGTAGCCTTTAGA
-CCATTACCACTACAAGCTGGAATTCTCTATGGAGCCAGAAGGACTCAGATATCTTCAGATCATTACCCTGTT
-GGCGTCTTCAGACGTTAA
->cdtB_9_AB583184
-ATGAGAAAATATATTATATCTCTGATAGTGTTTTTATCGTTTTACGCTCAAGCAGATTTAACTGATTTTCGT
-GTTGCTACTTGGAATCTTCAAGGAGCATCAGCGACTACTGAAAGTAAATGGAATATAAATATCCGGCAATTA
-ATTTCGGGTGAAAATGCCGTAGACATTTTAGCTATACAAGAGGCAGGCTCCCCGCCATCAACAGCTGTAGAT
-ACTGGAAGAGTTATTCATTCCCCAGGAATTCCTATCCGAGAGCTTATCTGGAACTTATCTACAAATAGTAGA
-CCACAGCAAGTATATATATATTTTTCTGCTGTTGATGCCCTTGGAGGAAGGGTCAATCTTGCTCTGGTTAGC
-AATCGGCGAGCCGATGAAGTGTTTGTTCTGAGCCCAGTAAGGCAAGGAGGACGACCGTTGCTTGGCATACGA
-ATTGGTAATGATGCTTTTTTCACTGCACATGCAATAGCTACGCGAAACAATGATGCACCAGCTCTTGTTGAA
-GAGGTATACAGCTTCTTCCGCGACAGCAGAGATCCACAACACCAAGCTCTTAACTGGATGATTCTTGGTGAT
-TTCAACCGTGAACCGGATGATTTAGAGATGAACCTTACCGTTCCAGTAAGAAATGCATCTGAAATTATTTTC
-CCTGCAGCAGCAACACAAACCAGTCAACGAACATTAGATTATGCTGTAGCAGGAAACGCTGTAGCCTTTAGA
-CCATTACCGCTACAAGCTGGAATTGTGTATGGAGCTAGAAGGACTCAGATATCTTCAGATCATTACCCTGTT
-GGCGTATTCAGAAGGTAA
->cdtB_10_AB583185
-ATGATAAAATATATTATATCTCTGATAGTGTTTTTATCGTTTTACGCTCAAGCAGATTTAACTGATTTTCGT
-GTTGCTACTTGGAATCTTCAAGGAGCATCAGCGACTACTGAAAGTAAATGGAATATAAATGTCCGGCAATTA
-ATTTCGGGTGAAAATGCCGTAGACATTTTAGCTATACAAGAGGCAGGTTCCCCACCATCAACTGCTGTAGAT
-ACAGGGAGAGTTATTCATTCCCCAGGAATTCCTATCCGAGAGCTTATCTGGAACTTATCTACAAATAGTAGA
-CCAGAGCAAGTATATATATATTTTTCTGCTGTTGATGCCCTTGGAGGAAGGGTTAATCTTGCTCTGATTAGC
-AATCGGCGAGCCGATGAAGTGTTTGTTCTGAGCCCAGTAAGGCAAGGAGGACGACCGTTGCTTGGTATACGA
-ATTGGTAATGATGCTTTTTTCACTGCACATGCAATAGCTACGCGAAACAATGATGCACCTGCTCTTGTTGAA
-GAGGTATATAACTTCTTCCGCGACAGCAGAGATCCACTACACCAAGCTCTTAACTGGATGATTCTTGGTGAT
-TTCAACCGTGAACCGGATGATTTAGAGATGAACCTTACCGTTCCTGTAAGAAATGCATCTGAAATTATTTTC
-CCTGCAGCAGCAACACAAACCAGTCAACGAACATTAGATTATGCTGTAGCAGGAAACGCTGTAGCCTTTAGA
-CCATTACCGCTACAAGCTGGAATTGTGTATGGAGCCAGAAGGACTCAGATATCTTCAGATCATTACCCTGTT
-GGCGTATTCAGAAGGTAA
->cdtB_11_AY696755
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@@ -727,188 +719,1366 @@
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->eae_2_AB647609
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 ACAAATGCTCGTTCAGATATGCACTCGTTGCAATATCGAACTATTCAGGCAATAAGTTTTGGTAAATAA
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 TAA
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 TTCCGTTATTCTTTCTGA
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 TTTTCTCCGGCTGTGTCGCATATCAATGCAAGAACGAATTTTAATGTGAGTGGAGTTACAACGTCATTAACT
@@ -6177,6 +6916,1501 @@
 GCTTCGGCCGAAAAATACCTGTCGTTTAATCAGGAGCAGGTGCAGTCGCGTGGTAAAGAAACAATGGCGCTG
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->f17G_4_AF022140
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 >hlyE_1_AF052225
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+>hlyE_3_ECU57430
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 >iha_1_CP000970
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 >ireA_1_CU928162
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->K88ab_1_CP002968
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 >mchB_1_AE014075
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->stb_2_AJ555214
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+>tibA_3_CP024243
+ATGAATAAGGTCTATAACACTGTCTGGAATGAATCCACAGGAACGTGGGTCGTAACTTCAGAACTGACCCGTAAAGGGGGTCTACGCCCACGACAAATCAAACGTACCGTGCTGGCAGGGTTGATTGCTGGTTTGCTGATGCCGTCGATGCCCGCTCTGGCGGCAGCCTATGACAATCAGACAATTGGTAGGGGTGAAACAAGCAAGTCCATGCACCTGTCTGCAGGCGACACGGCAAAAAACACGACCATTAACAGCGGTGGGAAGCAGTATGTCTCCAGTGGTGGCAGTGCCACGAGTACCACCATTAACATCGGCGGGGTTCAGCATGTTTCTAGCGGCGGTAGTGCCACTAGTTCCACCATCAACAGCGGAGGGCACCAGCATGTCTCCAGTGGTGGTAGTGCCACGAATACAACTGTTAACAATGGTGGGAGACAGACGGTATTCAGCGGCGGCAGTGCCATGGGCACCATAATTAACAGCGGAGGAGATCAGTATGTAATCAGTGGTGGCAGTGCCACAAGCGCATCTGTTACCAGCGGAGCGCGACAGTTTGTCTCCAGTGGCGGCATCGTCAAGGCGACTTCTGTTAATAGCGGTGGTCGCCAGTATGTCCGTGACGGCGGCAGTGCCACGGACACCGTGCTTAACAATACTGGGCGCCAGTTTGTCTCCAGCGGCGGTAGTGCCGCTAAAACTACAATTAATTCCGGCGGGGGGATGTATCTCTACGGCGGAAGTGCCACGGGCACCTCTATTTACAACGGCGGACGCCAGTACGTCTCCAGTGGTGGCAGCGCCACTAACACAACCGTTTACAGCGGTGGACGTCAGCATGTTTACATCGATGGAAATGTCACAGAAACGACCATTACAAGCGGCGGCATGCTGCAGGTAGAGGCCGGTGGTTCAGCCTCTAAGGTTATCCAGAACAGTGGCGGTGCTGTCATCACCAATACCAGTGCAGCCGTGAGTGGTACCAACGATAACGGCAGCTTCAGTATCGCTGGCGGCAGTGCAGTCAATATGCTGCTGGAAAACGGCGGATACCTGACGGTGTTTGACGGTCATCAGGCCAGCGATACGATGGTTGGCAGTGACGGTACGCTGGATGTTCGCAGCGGCGGTGTGCTCTACGGCACCACAACCCTGACTGATAAAGGGGCGCTCGTCGGTGACGTAGTCACAAACGAAGGCAACCTGTATTACCTCAACAACAGTACTGCGACTTTCACCGGTACCCTGACGGGGATCGGTACCCTGACACAGGAAGGCGGGAACACCCGCTTCAGCGGCCTGTTGTCTCAGGACGGTGGGATTTTCCTTCAGAGTGGCGGGGCCATGACGATGGATGCACTTCAGGCTAAGGCTAATGTGACGACGCAGTCAGGCACCACCCTGACGCTGGATAACGGGACCATCCTGACGGGGAACGTGGCGGGAGACAGCACCGGTGCCGGTGATATGGCGGTTAAAGGTGCCTCTGTCTGGCATCTCGATGGTGACTCTACTGTAGGCGCATTGACGCTGGATAACGGGACCGTTGATTTCCGTCCGTCAACAACCACACGCATGACGCCAGCCTTCCAGGCGGTGTCGCTGGCGCTCGGGAGCCTGTCGGGTAGCGGGACGTTCCAGATGAACACGGATATAGCATCACATACCGGAGATATGCTTAATGTCGCGGGCAATGCCAGCGGTAACTTTGTGCTGGATATCAAAAACACCGGTCTGGAGCCAGTATCTGCTGGAGCACCGCTTCAGGTGGTGCAGACTGGCGGCGGTGATGCCGCGTTTACCCTGAAAGGCGGGAAAGTCGATGCCGGTACCTGGGAATACGGCCTGAGCAAGGAAAATACCAACTGGTATCTGAAGGCTGATACTCCGCCTCCAGTTACTCCACCGACCAACCCGGATGCAGATAACCCGGATGCAGGTAACCCGGATGCAGGTAACCCGGATGCTGGTAAACCGGGAACAGGTAAGCCAGATGCAGGTACATCGTCGTCTCCAGTGCGTCGCACAACAAAATCGGTCGACGCAGTACTGGGCATGGCGACAGCACCGGCATACGTCTTCAACAGCGAGCTGGATAATCTGCGTTTCCGTCATGGTGATGTGATGCAAAATACCCGTGCACCAGGGGGCGTATGGGGCCGTTATACCGGGTCAGACAACCGCATTAGCGGCGGGGCCAGCTCGGGCTATACCCTGACCCAGAACGGTTTCGAAACCGGCGCCGATATGGTCTTTGACCTGAGTGACAGCAGTTTAGCGGTAGGTACTTTCTTCTCTTACAGCGACAACAGCATTAAACATGCACGTGGAGGAAAGAGTAACGTTGACAGCTCTGGTGGTGGTCTGTACGCGACCTGGTTTGATAATGACGGCTACTACGTGGACGGTGTGCTGAAATACAACCGCTTTAATAATGAGCTGCGTACCTGGATGAGTGACGGCACGGCGGTGAAGGGCGATTACAGCCAGAACGGTTTCGGCGGTAGCCTCGAAGCGGGCAGAACCTTCAGTCTAAATGAGAATGCATGGGCGCAGCCATACGTGCGGACGACGGCATTTCGGGCGGATAAGAAGGAAATCCGCCTGAATAACGGCATGAAAGCCAGTATCGGTGCGACCAAATCCCTGCAGGCTGAGGCTGGCCTGAAGCTGGGGATGACCCTGGACGTTGCAGGAAAAGAGGTCAAACCGTACCTGTCGGCAGCGGTGAGTCATGAATTTTCGGATAACAACAAAGTCCGTATCAATGACACCTATGACTTCAGGAACGATATCTCCGGGACGACCGGGAAATACGGGCTGGGTGTCAATGCTCAACTGACCCCAAATGCTGGTGTCTGGGCTGAAGCTCGTTATGAAAACGGTAAGCAGACCGAGTCACCAATAACTGGTGGCGTTGGTTTCCGAATCAACTTCTGA
+>tibA_4_CP025856
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 >tir_1_AF301618
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 CAAACAGACGGCGCGACAAGGGGGAATGGTAGTAGTCTTATTAGCTCTACAGGATCATTGGGATCTCGTTTA
@@ -16545,7 +22479,7 @@
 AGCGTTATTCAGCATTTTTCAGGGAATAATCCTGTGACTGGGCGGTTAGTAGGATCTCCTGGGCAGGGTATC
 CAAAGCACTTATGCGCTTCTCGCAAGCAGCGGTGGATTGCGATTAGGTATGGGAGGATTGACTGGGGGAGGT
 GAGAGCGCAGGGAGCGCTGCGAATGCCGCTACAACACCGGGAGTTGAACGTTTCGTCTAA
->tir_3_AF311901
+>tir_cr_3_AF311901
 ATGCCTATTGGTAATCTTGGTAATAATAATATAAGTAACAATTTAATTCCGCCTGCGCCGCCACTACCGTCA
 CAAACAGACGGCGCGACAAGGGGGAATGGTAGTAGTCTTATTAGCTCTACAGGATCATTGGGATCTCGTTTA
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@@ -17375,6 +23309,68 @@
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 ATCCAGAGTGTTTATGCACTTCTGTCACAGAGTGGCGGATTACAACATGGGCTGGGAGGATTAACGGGTAGT
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+>tleA_1_KF494347
+ATGAACAGAATTTATTCTCTTCGCTACAGCGCTGTGGCCCGGGGCTTTATTGCCGTATCTGAGTTTGCCA
+GGAAATGTGTTCATAAGTCTGTCAGACGTCTGTGTTTCCCGGTTTTATTACTGATCCCGGTACTATTCTC
+TGCAGGAAGTCTTGCGGGAACGGTCAATAATGAACTCGGGTATCAGTTATTTCGTGATTTTGCTGAAAAT
+AAGGGGATGTTCCGCCCGGGGGCAACGAATATCGCTATTTATGATAAGCAGGGAGAACTTGTCGGTACGC
+TGGATAAGGCAGCTATGCCTGATTTCAGTGCTGTGGATTCGGAAATCGGTGTGGCGACACTGATAAACCC
+GCAGTATATCGCCAGCGTGAAACATAACGGGGGATATACAAACGTTAGCTTTGGTGATGGTGAAAACCGT
+TACAATATCGTGGACCGGAATAATGCGCCGTCACTGGATTTTCATGCCCCCCGGCTGGATAAACTGGTGA
+CAGAGGTTGCCCCTACTGCGGTGACGGCGCAGGGGGCAGTGGCTGGCGCATATCTGGATAAGGAGCGCTA
+TCCTGTTTTTTATCGTCTGGGGTCTGGTACTCAATATATTAAGGACAGTAACGGACAGCTGACACAAATG
+GGAGATGCATATTCCTGGCTGACCGGCGGGACTGTCGGTAGCCTGTCATCCTATCAGAATGGAGAAATGA
+TTAGCACCAGTTCAGGTCTGGTTTTTGATTACAAACTTAATGGTGCAATGCCCATTTATGGCGAGGCCGG
+TGACAGCGGTTCGCCTTTATTTGCTTTTGATACTGTTCAGAATAAATGGGTGCTGGTCGGTGTTCTTACT
+GCGGGGAATGGAGCGGGGGGCAGGGGAAATAACTGGGCTGTTATTCCACTGGATTTTATCGGGCAGAAAT
+TTAATGAAGACAATGATGCCCCGGTCACGTTCAGAACATCGGAAGGTGGTGCACTGGAGTGGAGCTTTAA
+CAGCAGTACCGGAGCTGGTGCGCTGACACAGGGAACCACCACATATGCCATGCACGGGCAGCAGGGAAAT
+GACCTGAATGCTGGTAAGAACCTGATATTTCAGGGGCAGAATGGTCAGATTAACCTTAAGGATTCGGTTT
+CTCAGGGGGCGGGTTCCCTGACGTTCCGTGATAATTACACAGTAACAACCTCTAACGGAAGTACCTGGAC
+CGGTGCCGGTATTGTTGTGGACAACGGGGTGTCCGTAAACTGGCAGGTTAATGGCGAGAAAGGCGATAAT
+CTGCATAAAATCGGTGAGGGCACACTGATTGTACAGGGAACTGGTGTTAATGAAGGGGGGCTGAAAGTCG
+GGGACGGAACCGTTGTGCTGAATCAGCAGGCGGACAGTTCAGGGAAGGTTCAGGCTTTCAGTAGCCTCAA
+TATCGCCAGTGGTCGCCCGACCGTCGTTCTGGCTGATAACCGGCAGGTTGATCCGGACAATATCTCCTGG
+GGGTACCGTGGGGGCGTTCTGGACGTTAACGGAAACGATCTTTCCTTCCACAATATCAGTGCAGCAGATT
+ACGGCGCGGAGTTACACAACAGCAGTAACAAAGAGGCCCGGATTTCTCTGGTTATGCCTGATGCCATTGA
+ATGGGAAGGAAAGGATACGCCAAGAATTTTAGGCCAGGCCTATAAGTACTTTAACAGTGAAACGCAAAAG
+ACAGAATTCTTTATATTGAATACTGGAAGTCTCGGATGGAGGCCTTCTCCGGAAGAAAAACTCCTGCCGG
+AATTTCTGAGAGGGGCTGACTATTTTAGTTCTCTGGCTGATGCAAACAAAGAAGCAGGGAAAAATAAGCA
+GTCTGTTTTTCATGGAAAGTTAACCGGCAATATCAGTTTCAATGCTGATCATATCGGTAAGTTTATAATG
+GACGGCTCTGCAGACATCAGTGGGTCTTTCAGCAAGGAGAATGGTCGCCTGACTTTGCAGGGGCATCCGG
+TTATCCATACCTATAACAGTCAGACTGTGGCCGATAATGTGGCTGCCACCGGCGATGATTCCGTACTGAC
+GCAGCCCACATCATTTACCCAGGACGACTGGGAAAACAGAACGTTCAGTTTTGGTTCCCTGGTATTAAAG
+AATGCGGACTTTGGTCTGGGGCGCAATGCCACACTGAACACAACCATCCAGGCAGATAACTCCAGCGTCA
+CGCTGGGCGACAGCCGGGTATTTATCGACAAAAACGATGGCCAGGGAACAGCCTTTACCCTTGAAGAAGG
+CTCATCTGTTGCAACTAAAGATGCAGATAAAAGTGTCTTCAACGGCACCGTCAACCTGGATAATCAGTCA
+GTGCTGAATATCAATGATATATTCAATGGCGGAATACAGGCGAACAACAGTACCGTGAATATCTCCTCAG
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+GGCCAGTCAGAGTTTTGTTTCTGACGGTCCAGTGAATATTTCTGATGCCACCCTGAGTCTGAACAGCCGT
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+CACCCTCGGAGGGGAAGGGGAACTGAGTCCTGACCTGACTCTTCAGAATCAGATGTTGTACAGCCTGTTT
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+AGTGGTCGATGAACGGAAACTCCACGGCAGGAAATATGAAACTTAACCGGACAATAGTCGGTTTTAACGG
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+ACAGACCTTAACAAGGCAGACAAACTGGTGATAAACAAGTCGGCAACAGGTCATGACAACAGCATCTGGG
+TTAACTTCCTGAAAAAACCTTCTAACAAGGACACGCTTGATATTCCACTGGTCAGCGCACCTGAAGCGAC
+AGCTGATAATCTGTTCAGGGCATCAACACGGGTTGTGGGATTCAGTGATGTCACCCCCATCCTTAGTGTC
+AGAAAAGAGGACGGGAAAAAAGAGTGGGTCCTCGATGGTTACCAGGTTGCACGTAACGACGGCCAGGGTA
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+CATGGGCGATTTGAGGGATATTAATGGCGAAGCCGGTACGTGGGTGCGTCTGCTGAACGGTTCCGGCTCT
+GCTGATGGCGGTTTCACTGACCACTATACCCTGCTGCAGATGGGGGCTGACCGTAAGCACGAACTGGGAA
+GTATGGACCTGTTTACCGGCGTGATGGCCACCTACACTGACACAGATGCGTCAGCAGACCTGTACAGCGG
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+>tleA_2_CP050203
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 >toxB_1_AB011549
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 AAACATGGCCAAATTCAAGAGAGAAAAAGGAACTTTATCTATAAAAAAAATGATGATATCTCATCCAGATTT
@@ -18598,7 +24594,7 @@
 TCAAATTCTACAGGGGTAGTGGATGACAAGGGGATGGTGTATCTGAGTGGATTGTCAGAAGCTGGCAAACTG
 AAGGCACAGTGGGGAATGAATAGCCATTGCTATGCAAACTACCGCCTTCCTGTAAAAAAAGGACCAGCAGGG
 CTCTATCTTACTAGTGCAGTATGCATATAG
->agg3C_2_TD000189-6
+>agg3C_2_TD000189_6
 ATGCTTCATATAAATAGCATGGTAAAAGTGTGTTTTTTCGTAATAATCGCATTTTCACTTTTCCATACGAGA
 AATTCAGATGGAAAGACATATTCATTCGATGCATCTTTGCTAAAGAGAAGAGGGGAGGGAGTAGACCTAACT
 CTTTTTGAAAATGGAGGGCAGCTTCCCGGCATTTATCCAGTCGATATTTTTCTAAATGGAACTATTGTGGGT
@@ -18635,7 +24631,7 @@
 TCAAATTCTACAGGGATAGTGGATGACAAAGGGATGGTGTATCTGAGTGGATTGTCAGAAGCTGGCAAACTG
 AAGGCACAGTGGGGAATGAATAGCCATTGCTATGCAAACTACCGCCTTCCTGTAAAAAAAGGACCAGCAGGG
 CTCTATCTTACTAGTGCAGTATGCATATAG
->agg3C_3_ESBL-2014-0082
+>agg3C_3_ESBL_2014_0082
 ATGCTTCATATAAATAGCATGGTAAAAGTGTGTTTTTTCGTAATAATCGCATTTTCACTTTTCCATACGAGA
 AATTCAGATGGAAAGACATATTCATTCGATGCATCTTTGCTAAAGAGAAGAGGGGAGGGAGTAGACCTAACT
 CTTTTTGAAAATGGAGGGCAGCTTCCCGGCATTTATCCGGTCGATATTTTTCTAAATGGAACTATTGTGGGT
@@ -18709,7 +24705,7 @@
 TCAAATTCTACAGGGGTAGTGGATGACAAGGGGATGGTGTATCTGAGTGGATTGTCAGAAGCTGGCAAACTG
 AAGGCACAGTGGGGAATGAATAGCCATTGCTATGCAAACTACCGCCTTCCTGTAAAAAAAGGACCAGCAGGG
 CTCTATCTTACTAGTGCAGTATGCATATAG
->agg3C_5_TD48-19
+>agg3C_5_TD48_19
 ATGCTTCATATAAATAGCATGGTAAAAGTGTGTTTTTTCGTAATAATCGCATTTTCACTTTTCCATACGAGA
 AATTCAGATGGAAAGACATATTCATTCGATGCATCTTTGCTAAAGAGAAGAGGGGAGGGAGTAGACCTAACT
 CTTTTTGAAAATGGAGGGCAGCTTCCCGGCATTTATCCAGTCGATATTTTTCTAAATGGAACTATTGTGGGT
@@ -18994,7 +24990,7 @@
 GATGATAAAGGGGATGTGTATCTAAGCGGGTTGTCTGAAACCGGAAAGTTAAAAGCGCAGTGGGGAATGAAC
 AGTAAGTGTTATGCTGACTACCGCCTGCCAGAGGAAAAAGGGGATGCAGGAATCTTTCTTACTAGGGCGATT
 TGTATGTGA
->agg4C_2_TD000069-14
+>agg4C_2_TD000069_14
 ATGTTTTATATGTTTAATCGGTTCGTTATCATAACAGTCTGCTCTTTATTTTTTACAAAAAATGCAACTGCA
 GGAAAGTATTCTTTTGATGCTTCCATGTTGAAAAGAGGGGGGGAGGGAATAGATATGGCATTATTTGAAGAA
 GGAGGTCAACAGCCTGGGATATATCCCGTTAATATTATTCTAAATGGCGATTATGTTGGATCAGAAAACATA
@@ -19303,7 +25299,7 @@
 TCATATTTCCAGACTCCAGGAACTAATGCAGCAATTTATAAAAATGTGACAACCAGAGACAGAGTTCTGAAG
 GCAAGTGTCAAGGTTGACCCTAAAATTCAAGTATTAATACCAGGCGAATATAGAATGATACTCCATGCCGGA
 ATTAATTTTTAA
->aggA_6_TD000209-18
+>aggA_6_TD000209_18
 ATGAAAACATTAAAAAATATGAGAAGAAAGAATTTATGTATTACTTTGGGTTTAGTTAGTCTTCTATCTGGG
 GGGGCTAACGCTGCGTTACAAAAACCTACATCAAAAACAACTGAGACAATCCGCCTCATCGTTACAAATGAT
 TGTCCTGTTAATATAACTGCATTTAGTCCATCAACTACTGTTGGTGTATCGTCAACAAAACCAATAACATTG
@@ -19843,7 +25839,7 @@
 AAATCAGCAGGATTCACTCTGGCCTCTCCTAGGTTTTCTTACATTCCGAATAATCCAGCAAACATTATGAAT
 GGATTTGTTCTTACGAATCCTGGTGTTTATCAATTAGGAATGCAGGGCTCAATTACACCGGCTATCCCGCTA
 CGACCAGGCCTATATGAAGTAGTATTAAATGCTGAGCTTGTGACAAATTAA
->aafA_5_TD000088-19
+>aafA_5_TD000088_19
 ATGAAAAAAATCAGAATGTTTGTTATTGCTACTTTATTATCAAGTGGAGCCGCTATTAATGCAACTGCGGTA
 GCAAAAACTGCGACCAGTACTATCACTGTAGTGAATAATTGTGATATAACGATAACACCGGCTACAAATCGT
 GATGTCAACGTTGACAGGAGCGCAAATATCGACCTGAGTTTTACTATTAGACAACCGCAACGCTGCGCTGAT
@@ -20513,7 +26509,7 @@
 CTGAAGGAAAGCGGTAAGCTGAAGGCGCAGTGGGGAGAGAACAGTCTGTGCCATGCGGAT
 TACCGTCTTCCGGAAGAGAAGGGTCCTGCGGGGATATTTCTGACCCGTACGGTGTGTATG
 TGA
->afaC_7_AF072900 AF076152
+>afaC_7_AF072900_AF076152
 ATGCACAGGAATAAGTCATCTTCAGGTTTATCTTTATATTGCGTAAAAACAAAAATTACA
 GCGGTTGCTCTCTCTGTGATGGCGGCCTGTACCCTTCTTTACACCGGGAATACTGAGGCC
 CGCACATACTCCTTTGATGCTTCCATGCTTAAAGGTGGCGGAAAGGGGGTGGACCTGACG
@@ -20972,36 +26968,6 @@
 AAGGGAGAAGGCGGGAAGGGGGTGTCGAGGCCCGGTCAGGAGGAGCAGTTTTTTTTTGAT
 GTGATGGCGGACGGAAATCAGGACATTGCTCCTGGTGAATACCGGTTTTCGGTTGGCGGA
 GCCTGTGTGGGGCCACAGGAATAA
->afaE8_1_GQ916596
-ATGAATTTAAAGAAAATAGCTATCGCAAGCAGTGTCTTTGCAGGTATAACAATGGCGCTA
-ACTTGCCATGCTGTGACAGTAACAGCCACTCATACAGTTGAATCAGATGCTGAATTCACA
-ATAGATTGGGTCGACGCTGGGCCAACGACTACAGATGCAAAAAATGGTGAGGTTTGGGGG
-CACCTTGATATGACTCAAACCAGGGGAGCACCAACATTCGGAAAACTCCGCAATCCTCAA
-GGAGAGACTTCGCCAGGACCGTTGAAGGCGCCATTCAGTTTTACCGGGCCAGATGGTCAT
-ACTGCAAGAGCGTACCTTGATTCATACGGCGCACCGATTCACAACTACGCAGGGGATAAC
-CTTGCTAATGGGGTGAAGGTAGGTAGTGGAAGCGGAAACACTCCATTTGTTGTTGGGACA
-GCAAGTCGACTAACTGCAAGAATCTTCGGAGACCAGACATTGGTTCCAGGAGTCTACCGG
-ACAACCTTTGAATTAACTACTTGGACCGACTGA
->afaE8_2_AP017620
-ATGAATTTAAAGAAAATAGCTATCGCAAGCAGTGTCTTTGCAGGTATAACAATGGCGCTA
-ACTTGCCATGCTGTGACAGTAACAGCCACTCATACAGTTGAATCAGATGCTGAATTCACA
-ATAGATTGGGTCGACGCTGGGCCAACGACTACAGATGCAAAAGATGGTGAGGTTTGGGGG
-CACCTTGATATGACTCAAACCAGGGGAACACCAACATTCGGAAAACTCCGCAATCCTCAA
-GGAGAGACTTCGCCAGGACCGTTGAAGGCGCCATTCAGTTTTACCGGGCCAGATGGTCAT
-ACTGCAAGAGCGTACCTTAGTTCATACGACGCACCGATTCACAACTACGCAGGGGATAAC
-CTTGCTAATGGGGTGAAGGTAGGTAGTGGAAGCGGAAACGATCCATTTGTTGTTGGGACA
-ACAAGTCGACTAACTGCAAAAATCTTCGGAGACCAGACATTGGTTCCAGGAGTCTACCGG
-ACAACCTTTGAATTAACTACTTGGACCGACTGA
->afaE8_3_GQ497943
-ATGAATTTAAAGAAAATAGCTATCGCAAGCAGTGTCTTTGCAGGTATAACAATGGCGCTA
-ACTTGCCATGCTGTGACAGTAACAGCCACTCATACAGTTGAATCAGATGCTGAATTCACA
-ATAGATTGGGTCGACGCTGGGCCAACGACTACAGATGCAAAAGATGGTGAGGTTTGGGGG
-CACCTTGATATGACTCAAACCAGGGGAACACCAACATTCGGAAAACTCCGCAATCCTCAA
-GGAGAGACTTCGCCAGGACCGTTGAAGGCGCCATTCAGTTTTACCGGGCCAGATGGTCAT
-ACTGCAAGAGCGTACCTTAGTTCATACGGCGCACCGATTCACAACTACGCAGGGGATAAC
-CTTGCTAATGGGGTGAAGGTAGGTAGTGGAAGCGGAAACGATCCATTTGTTGTTGGGACA
-ACAAGTCGACTAACTGCAAAAATCTTCGGAGACCAGACATTGGTTCCAGGAGTCTACCGG
-ACAACCTTTGAATTAACTACTTGGACCGACTGA
 >afaE_10_DQ386062
 ATGAAAAAATTAGCGATCATGGCCGCGGCCAGCATGGTGTTCGCCGTGAGCTCCGCGCAT
 GCTGGGTTCACCCCGAGTGGCACCACCGGCACCACCAAACTCACAGTTACCGAAGAGTGC
@@ -34338,7 +40304,7 @@
 CATGTCAACGACGTGATGCAAAAATACCCGCATCTGGTGGTGACAAACGGTTATGGGCCG
 ACGGAAAACACTATTTTTACCACCGCATATCGTTTCAACGGGTTGCAACCCGCCCGAGTC
 CCGATAGGATACGCGGTACCGGGCACCTCGCTCTACATTACCGATCTCCATGGGCATTTG
-TTGCCTATCGGTGCCACCGGTGAACTAGTGGCGGGTGGAGTGGGGGmCGCCATCGGCTAT
+TTGCCTATCGGTGCCACCGGTGAACTAGTGGCGGGTGGAGTGGGGGMCGCCATCGGCTAT
 CAGAACAACCCGGCGCTAAGTGCGACGGTTTTTGTCCCTGATCCTTTTATTCCCGGCGGT
 ATGATGTACAAAACTGGCGATTATGCCCGGTTGCTGGATGATGGCTGTGTTGACTGTTTT
 GGGCGTAAAGACGGTCAAATTAAGATCAATGGACAACGAATTGAAACCGGAGAGATCGAG
@@ -42787,62 +48753,62 @@
 TGGGGCGATAAATATAAATCAGAAGTTGATGTTAAAAGTCATGACATCATGCTTGGTGTG
 ACTTATAACTTCTGA
 >hra_6_LM995856
-atgaaaaaggtttttgctgtttcagtggtgggcgcagcctgtgtatttgcagcaaatgcaggtgctgaggacggtaaaag
-cggtttttatctgaccggtaaagccggtgcctctgtggtgtcactttcagaccagcgtttcctgtcaggagatgaagaag
-aaacgtcaaagtataaaggtggggatgaccatgacacggtattcagtggcggtatcgcagccggttatgatttttatccg
-cagttcagtattccggttcgtacagaactggagttttacgcacgtggaaaagctgattcgaagtataacatagataaagg
-taaaggcagctggtcagatggttactggcgtgatgaccttaagaatgaggtatcactcaacactctgatgctgaatgcat
-actatgacttccggaatgacagtgcattcacaccatgggtatcagcagggattggttacgccaggattcatcagaaaaca
-accggtatcagcacctgggattacgggtacggatacagtggtcgtgaatcgttgtcacgttcaggctctgctgacaactt
-cgcatggagccttggcgcgggtatccgctatgacgtcaccccggatatcgctctggacctcagctatcgctatcttgatg
-cgggtgacagcagtgtgagttacaaggacgagtggggcgataaatataaatcagaggttgatgttaaaagtcatgacatc
-ctgcttggtgtgacttataacttctga
+ATGAAAAAGGTTTTTGCTGTTTCAGTGGTGGGCGCAGCCTGTGTATTTGCAGCAAATGCAGGTGCTGAGGACGGTAAAAG
+CGGTTTTTATCTGACCGGTAAAGCCGGTGCCTCTGTGGTGTCACTTTCAGACCAGCGTTTCCTGTCAGGAGATGAAGAAG
+AAACGTCAAAGTATAAAGGTGGGGATGACCATGACACGGTATTCAGTGGCGGTATCGCAGCCGGTTATGATTTTTATCCG
+CAGTTCAGTATTCCGGTTCGTACAGAACTGGAGTTTTACGCACGTGGAAAAGCTGATTCGAAGTATAACATAGATAAAGG
+TAAAGGCAGCTGGTCAGATGGTTACTGGCGTGATGACCTTAAGAATGAGGTATCACTCAACACTCTGATGCTGAATGCAT
+ACTATGACTTCCGGAATGACAGTGCATTCACACCATGGGTATCAGCAGGGATTGGTTACGCCAGGATTCATCAGAAAACA
+ACCGGTATCAGCACCTGGGATTACGGGTACGGATACAGTGGTCGTGAATCGTTGTCACGTTCAGGCTCTGCTGACAACTT
+CGCATGGAGCCTTGGCGCGGGTATCCGCTATGACGTCACCCCGGATATCGCTCTGGACCTCAGCTATCGCTATCTTGATG
+CGGGTGACAGCAGTGTGAGTTACAAGGACGAGTGGGGCGATAAATATAAATCAGAGGTTGATGTTAAAAGTCATGACATC
+CTGCTTGGTGTGACTTATAACTTCTGA
 >hra_7_CP012693
-atgaaaaaggtttttgctgtttcagtggtgggcgcagcctgtgtatttgcagcaaatgcaggtgctgaggacggtaaaag
-cggtttttatctgaccggtaaagccggtgcctctgtggtgtcactttcagaccagcgtttcctgtcaggagatgaagaag
-aaacgtcaaagtataaaggtggggatgaccatgacacggtattcagtggcggtatcgcagccggttatgatttttatccg
-cagttcagtattccggttcgtacagaactggagttttacgcacgtggaaaagctgattcgaagtataacatagataaagg
-taaaggcagctggtcagatggttactggcgtgatgaccttaagaatgaggtatcactcaacactctgatgctgaatgcat
-actatgacttccggaatgacagtgcattcacaccatgggtatcagcagggattggttacgccaggattcatcagaaaaca
-accggtatcagcacctgggattgcggggacggatacagtggtcgtgaatcgttgtcacgttcaggctctgctgacaactt
-cgcatggagccttggcgcgggtgtccgctatgacgtcaccccggatatcgctctggacctcagctatcgctatcttgatg
-cgggtgacagcagtgtgagttacaaggacgagtggggcgataaatataaatcagaggttgatgttaaaagtcatgacatc
-ctgcttggtgtgacttataacttctga
+ATGAAAAAGGTTTTTGCTGTTTCAGTGGTGGGCGCAGCCTGTGTATTTGCAGCAAATGCAGGTGCTGAGGACGGTAAAAG
+CGGTTTTTATCTGACCGGTAAAGCCGGTGCCTCTGTGGTGTCACTTTCAGACCAGCGTTTCCTGTCAGGAGATGAAGAAG
+AAACGTCAAAGTATAAAGGTGGGGATGACCATGACACGGTATTCAGTGGCGGTATCGCAGCCGGTTATGATTTTTATCCG
+CAGTTCAGTATTCCGGTTCGTACAGAACTGGAGTTTTACGCACGTGGAAAAGCTGATTCGAAGTATAACATAGATAAAGG
+TAAAGGCAGCTGGTCAGATGGTTACTGGCGTGATGACCTTAAGAATGAGGTATCACTCAACACTCTGATGCTGAATGCAT
+ACTATGACTTCCGGAATGACAGTGCATTCACACCATGGGTATCAGCAGGGATTGGTTACGCCAGGATTCATCAGAAAACA
+ACCGGTATCAGCACCTGGGATTGCGGGGACGGATACAGTGGTCGTGAATCGTTGTCACGTTCAGGCTCTGCTGACAACTT
+CGCATGGAGCCTTGGCGCGGGTGTCCGCTATGACGTCACCCCGGATATCGCTCTGGACCTCAGCTATCGCTATCTTGATG
+CGGGTGACAGCAGTGTGAGTTACAAGGACGAGTGGGGCGATAAATATAAATCAGAGGTTGATGTTAAAAGTCATGACATC
+CTGCTTGGTGTGACTTATAACTTCTGA
 >hra_8_CP007149
-atgaataaggtttttgttgtttcagtggtggccgcagcctgtgtatttgcagtaaatgcaggagcaaaggaaggtaaaag
-cggtttttatctgaccggtaaagccggtgcctctgtgatgtcactttcagaccagcgtttcctgtcaggagatgaggaag
-aaacatcaaagtataaaggcggcgatgaccatgatacggtattcagtggcggtattgcggtcggttatgatttttatccg
-cagttcagtattccggttcgtacagaactggagttttacgctcgtggaaaagctgattcgaagtataacgtagataaaga
-cagctggtcaggtggttactggcgtgatgacctgaagaatgaggtgtcagtcaacacactaatgctgaatgcgtactatg
-acttccggaatgacagcgcattcacaccatgggtatccgcagggattggctacgccagaattcaccagaaaacaaccggt
-atcagtacctgggattatgagtacggaagcagtggtcgcgaatcgttgtcacgttcaggctctgctgacaacttcgcatg
-gagccttggcgcgggtgtccgctatgacgtaaccccggatatcgctctggacctcagctatcgctatcttgatgcaggtg
-acagcagtgtgagttacaaggacgagtggggcgataaatataagtcagaagttgatgttaaaagtcatgacatcatgctt
-ggtatgacttataacttctga
+ATGAATAAGGTTTTTGTTGTTTCAGTGGTGGCCGCAGCCTGTGTATTTGCAGTAAATGCAGGAGCAAAGGAAGGTAAAAG
+CGGTTTTTATCTGACCGGTAAAGCCGGTGCCTCTGTGATGTCACTTTCAGACCAGCGTTTCCTGTCAGGAGATGAGGAAG
+AAACATCAAAGTATAAAGGCGGCGATGACCATGATACGGTATTCAGTGGCGGTATTGCGGTCGGTTATGATTTTTATCCG
+CAGTTCAGTATTCCGGTTCGTACAGAACTGGAGTTTTACGCTCGTGGAAAAGCTGATTCGAAGTATAACGTAGATAAAGA
+CAGCTGGTCAGGTGGTTACTGGCGTGATGACCTGAAGAATGAGGTGTCAGTCAACACACTAATGCTGAATGCGTACTATG
+ACTTCCGGAATGACAGCGCATTCACACCATGGGTATCCGCAGGGATTGGCTACGCCAGAATTCACCAGAAAACAACCGGT
+ATCAGTACCTGGGATTATGAGTACGGAAGCAGTGGTCGCGAATCGTTGTCACGTTCAGGCTCTGCTGACAACTTCGCATG
+GAGCCTTGGCGCGGGTGTCCGCTATGACGTAACCCCGGATATCGCTCTGGACCTCAGCTATCGCTATCTTGATGCAGGTG
+ACAGCAGTGTGAGTTACAAGGACGAGTGGGGCGATAAATATAAGTCAGAAGTTGATGTTAAAAGTCATGACATCATGCTT
+GGTATGACTTATAACTTCTGA
 >hra_9_CP040456
-atgaataaggtttttgttgtttcagtggtggccgcagcctgtgtatttgcagcaaatgcaggagcaaaggaaggtaaaag
-tggtttttatctgaccggtaaagccggtgcctctgtggtgtcactttcagaccagcgtttcctgtcaggagatgaggaag
-aaacatcaaagtataaaggcggcgatgaccatgatacggtattcagtggcggtattgcggccggttatgatttttatccg
-cagttcagtattccggttcgtacagaactggagttttacgctcgtggaaaagctgattcgaagtataacgtagataaaga
-cagctggtcaggtggttactggcgtgatgacctgaagaatgaggtgtcagtcaacacactaatgctgaatgcgtactatg
-acttccggaatgacagcgcattcacaccatgggtatccgcagggattggctacgccagaattcaccagaaaacaaccggt
-atcagtacctgggattatgagtacggaagcagtggtcgcgaatcgttgtcacgttcaggctctgctgacaacttcgcatg
-gagccttggcgcgggtgtccgctatgacgtaaccccggatatcgctctggacctcagctatcgctatcttgatgcaggtg
-acagcagtgtgagttacaaggacgagtggggcgataaatataagtcagaagttgatgttaaaagtcatgacatcatgctt
-ggtatgacttataacttctga
+ATGAATAAGGTTTTTGTTGTTTCAGTGGTGGCCGCAGCCTGTGTATTTGCAGCAAATGCAGGAGCAAAGGAAGGTAAAAG
+TGGTTTTTATCTGACCGGTAAAGCCGGTGCCTCTGTGGTGTCACTTTCAGACCAGCGTTTCCTGTCAGGAGATGAGGAAG
+AAACATCAAAGTATAAAGGCGGCGATGACCATGATACGGTATTCAGTGGCGGTATTGCGGCCGGTTATGATTTTTATCCG
+CAGTTCAGTATTCCGGTTCGTACAGAACTGGAGTTTTACGCTCGTGGAAAAGCTGATTCGAAGTATAACGTAGATAAAGA
+CAGCTGGTCAGGTGGTTACTGGCGTGATGACCTGAAGAATGAGGTGTCAGTCAACACACTAATGCTGAATGCGTACTATG
+ACTTCCGGAATGACAGCGCATTCACACCATGGGTATCCGCAGGGATTGGCTACGCCAGAATTCACCAGAAAACAACCGGT
+ATCAGTACCTGGGATTATGAGTACGGAAGCAGTGGTCGCGAATCGTTGTCACGTTCAGGCTCTGCTGACAACTTCGCATG
+GAGCCTTGGCGCGGGTGTCCGCTATGACGTAACCCCGGATATCGCTCTGGACCTCAGCTATCGCTATCTTGATGCAGGTG
+ACAGCAGTGTGAGTTACAAGGACGAGTGGGGCGATAAATATAAGTCAGAAGTTGATGTTAAAAGTCATGACATCATGCTT
+GGTATGACTTATAACTTCTGA
 >hra_10_JF808724
-atgattgaaatgaaaaaggttattgctgtttcaacactcgcaatggcaggcatgttttcggcccagactctggctgatgagaacaaaactggcttttatgtgaccggtaaagccggtgtttctgttatgtcactttcagagcaacgtttcgttgatggtgaaggggcatgggcggataaatacaaaggcagtgacaaaagtgatacggtttttggcgcaggccttgcggtgggatacgatttttatcagcactacaatgtgccggtgcgtactgaagtggagttttatggccgcggtaacgctgaatcaaaatatcgtctgagttattgggaaagtgccggtggtgccgagttcgatgatgcacagaacaagctcagtgtaaacacgctgatgctgaatgcgtattatgatttcagaaacagcagtgcattcacgccatggatatctgctggtctgggttatgcacgggttcatcataaaacttcgtacatatataccgataacagcccggcaggcagtgaagtttattcagcttcagcgtcaaaatacgaaaacaacctggcatggagcctgggtgccggtgttaaatacgatgtgacgcaggatttcagccttgacctcagctaccggtatctggatgcaggggattccactctgacttataaagatgaggatggtgctaaatataaatcctctgttgatgtcagaagtaacgagtttatgttaggcgcaacgtataacttctga
+ATGATTGAAATGAAAAAGGTTATTGCTGTTTCAACACTCGCAATGGCAGGCATGTTTTCGGCCCAGACTCTGGCTGATGAGAACAAAACTGGCTTTTATGTGACCGGTAAAGCCGGTGTTTCTGTTATGTCACTTTCAGAGCAACGTTTCGTTGATGGTGAAGGGGCATGGGCGGATAAATACAAAGGCAGTGACAAAAGTGATACGGTTTTTGGCGCAGGCCTTGCGGTGGGATACGATTTTTATCAGCACTACAATGTGCCGGTGCGTACTGAAGTGGAGTTTTATGGCCGCGGTAACGCTGAATCAAAATATCGTCTGAGTTATTGGGAAAGTGCCGGTGGTGCCGAGTTCGATGATGCACAGAACAAGCTCAGTGTAAACACGCTGATGCTGAATGCGTATTATGATTTCAGAAACAGCAGTGCATTCACGCCATGGATATCTGCTGGTCTGGGTTATGCACGGGTTCATCATAAAACTTCGTACATATATACCGATAACAGCCCGGCAGGCAGTGAAGTTTATTCAGCTTCAGCGTCAAAATACGAAAACAACCTGGCATGGAGCCTGGGTGCCGGTGTTAAATACGATGTGACGCAGGATTTCAGCCTTGACCTCAGCTACCGGTATCTGGATGCAGGGGATTCCACTCTGACTTATAAAGATGAGGATGGTGCTAAATATAAATCCTCTGTTGATGTCAGAAGTAACGAGTTTATGTTAGGCGCAACGTATAACTTCTGA
 >hra_11_CP006632
-atgaaaaaggttattgctgtttcaacacttgcaatggcaggcatgttttcggcccagactctggctgatgagaacaaaac
-tggcttttatgtgaccggtaaagccggtgtttctgttatgtcactttcagagcaacgtttcgttgatggtgaaggggcat
-gggcggataaatacaaaggcagtgacaaaagtgatacggtttttggcgcaggccttgcggtgggatacgatttttatcag
-cactacaatgtgccggtgcgtactgaagtggagttttatggccgcggtaacgctgaatcaaaatatcgtctgagttattg
-ggaaagtgccggtggtgccgagttcgatgatgcacagaacaagctcagtgtaaacacgctgatgctgaatgcgtattatg
-atttcagaaacagcagtgcattcacgccatggatatctgctggtctgggttatgcacgggttcatcataaaacttcgtac
-atatataccgataacagcccggcaggcagtgaagtttattcagcttcagcgtcaaaatacgaaaacaacctggcatggag
-cctgggtgccggtgttaaatacgatgtgacgcaggatttcagccttgacctcagctaccggtatctggatgcaggtgaca
-gcagtgtgagttacaaggacgagtggggcgataaatataaatcagaggctgatgttaaaagtcatgacatcatgtttggt
-gtgacttataacttctga
+ATGAAAAAGGTTATTGCTGTTTCAACACTTGCAATGGCAGGCATGTTTTCGGCCCAGACTCTGGCTGATGAGAACAAAAC
+TGGCTTTTATGTGACCGGTAAAGCCGGTGTTTCTGTTATGTCACTTTCAGAGCAACGTTTCGTTGATGGTGAAGGGGCAT
+GGGCGGATAAATACAAAGGCAGTGACAAAAGTGATACGGTTTTTGGCGCAGGCCTTGCGGTGGGATACGATTTTTATCAG
+CACTACAATGTGCCGGTGCGTACTGAAGTGGAGTTTTATGGCCGCGGTAACGCTGAATCAAAATATCGTCTGAGTTATTG
+GGAAAGTGCCGGTGGTGCCGAGTTCGATGATGCACAGAACAAGCTCAGTGTAAACACGCTGATGCTGAATGCGTATTATG
+ATTTCAGAAACAGCAGTGCATTCACGCCATGGATATCTGCTGGTCTGGGTTATGCACGGGTTCATCATAAAACTTCGTAC
+ATATATACCGATAACAGCCCGGCAGGCAGTGAAGTTTATTCAGCTTCAGCGTCAAAATACGAAAACAACCTGGCATGGAG
+CCTGGGTGCCGGTGTTAAATACGATGTGACGCAGGATTTCAGCCTTGACCTCAGCTACCGGTATCTGGATGCAGGTGACA
+GCAGTGTGAGTTACAAGGACGAGTGGGGCGATAAATATAAATCAGAGGCTGATGTTAAAAGTCATGACATCATGTTTGGT
+GTGACTTATAACTTCTGA
 >ibeA_10_UGAO01000001
 ATGGAATTTTATCTGGAACCCGCTCGTAATATACCTGTGCTGGCAACCACGGAAGTGTTA
 GTTGTTGGTGGTGGTCCATCGGGTATTGCCGCAGCAATGAGTGCCGCTCGTGAAGGCGCA
@@ -44332,6 +50298,8 @@
 GCAGATAATTTCGCCTACGCGACAATCCGTAATATGGGGTGTTGTATTGTCACTGGAGAA
 GGTGCAGGGACTGCCGCTGCTATTGCCATTAAAAATAACACTACCGTTTCACAGGTAGAT
 ATTCAGACGGTACAGGAACGCTTACAGCAAAATGGCGTAAAAGTCTTTTAA
+>ibeA_67_L42624
+ATGGAATTTTATCTGGAACCCGCTCGTAATATACCTGTACTGGCAACCACGGAAGTGTTAGTTGTTGGTGGTGGTCCATCGGGTATTGCCGCAGCAATGAGTGCCGCTCGTGAAGGCGCAGCTACTATGCTGATTGAACGTTTCGGTTGTTTTGGCGGAATGATGACAACGGCTGGCGTCGAGTCAATTGCCTGGTGGCGTCATGAAAATACGGTAGAGTCAGGTGGACTGGCACGCGAAATAGAAGAAACGGCAAAATCAATGGGGGCGTCCAGCCCTGAGCCGCAATCGAATAGTCAGGCTATTAACGAAGAGCGTTTCAAACTGGTTGCGGATGCAATGCTTGAACAGGCAGGTGTGCGCCGCGTACTACACATTACCGCCGTTGATGTTATCAAGCAGGGCAATAATTTACTCGGCGTAATAACAGAGAGTAAATCTGGTCGTCAGGCTATTTTGGCAAATGTCATTATTGACTGTACTGGTGATGCTGATATTGCATGGTTTGCCGGAGCACCATTTATTAAGCGTGAACGCGAAGAGCTAATGTGTATGACAACCGTTTTTAGTTGCGCAAATATAAATAAAAACGCGTTCATGCAAAATATTAATAGCACGGAACCTAAATATGGAGACTGGGGGGCGGATGAAGAAAATAAAAACTGGTCTTATGATGTTCATGAATCTTGTCGCGATATGTTTAGCCCTTATCTGGGTAAAGTCTTGCGAAAGGAAAGGTCGGCAGGAATTATTCCAAAAGATGTGACGTTAGGCGGTTCCTGGAGTACGGTCACCGAGTATGGTGATGCGAATTACTTGAACGTTGTCAGCATCCCTGCCGTCGATTGTACGGATGTTTTTGACCTGACGCGTGCAGAAATAGAAGGCCGCAAGCAAGCCATGCAGGCGATTGAAGCGTTGCGTCAATTCCAGCCAGGATTTGAACAGGCACAATTAAAAAATTTCGGTATGACGGTGGGAACAAGAGAATCAAGACATATTATTGGGCGAGTCCAGCTTACGGAAAATGATATTTGTAATGAGGGACGTCATGCGGATTCAATAGGGGTATTCCCTGAGTTTATAGATGGAAATGGTCATCTTAAATTACCTCTTGAAGCGAACTATTTTCAAATCCCTTATGGCGTAATGATTCCGCAGCAAGTTGAAAACCTGTTGGTTTGCGGACGGGCAATCGATGCAGATAATTTCGCCTATGCGACAATCCGTAATATGGGGTGTTGTATGGTCACTGGAGAAGGTGCAGGGACTGCCGCTGCTATTGCCATTAAAAATAACACTACCGTTTCACAGGTAGATATTCAGACGGTACAGGAACGCTTACAGCAAAATGGCGTAAAAGTCTTTTAA
 >ibeA_6_AJ829704
 ATGGAATTTTATCTGGAACCCGCTCGTAATATACCTGTGCTGGCAACCACGGAAGTGTTA
 GTTGTTGGTGGTGGTCCATCGGGTATTGCCGCAGCAATGAGTGCCGCTCGTGAAGGCGCA
@@ -44591,7 +50559,7 @@
 GGACATGATTTAACGTTATCGCAAATTCTTCGCGGTGCCCGTAACGAACTGTCATTACTG
 AACGACGCGCAGTGGTCGCCGGAAAGCCTGGCCTTTAACCATCCGGCCAGCGCCCCGTAT
 ATTCAGGAACTGGCGACAATTTGCCAACAGCTTGCACAGCGCTTACAGCGCCCGGTACGC
-vCTGCTTGATGTGGGAACCCGCACTGGCCGCGCCGCAGAATCGCTGTTAGCACAGCTCAAC
+VCTGCTTGATGTGGGAACCCGCACTGGCCGCGCCGCAGAATCGCTGTTAGCACAGCTCAAC
 GCCGGACAGATTGAGTATGTCGGGCTTGAGCAGAGCCAGGAGATGCTGCTGAGCGCCCGG
 CAGAGGCTCGCCCCCTGGCCTGGCGCCCGTCTGTCCCTCTGGAATGCAGACACGCTGGCG
 GCGCACGCTCACTCGGCGGACATTATCTGGCTTAATAACGCCCTGCATCGTCTGCTGCCG
@@ -63180,7 +69148,7 @@
 TACTGGCTGGCGAAAGCATCGACGCTTCCCCCCGCGCCCGTCTTGCCGCTGGCCTGCGAA
 CCCGCCACGCTACGTGAAGTCCGTAATACCCGACGCCGCATGATTGTCCCGGCAACACGC
 TGGCACGCCTTTAGCAACCGGGCCGGCGAGTATGGCGTGACGCCGACAATGGCACTGGCG
-ACCTGTTTTTCTGCCGTGCTGGCTCGCTGGGGCGrCCTGACGCGTCTGCTGCTTAACATC
+ACCTGTTTTTCTGCCGTGCTGGCTCGCTGGGGCGRCCTGACGCGTCTGCTGCTTAACATC
 ACCTTATTCGACCGCCAGCCGCTGCACCCGGCGGTTGGCGCGATGCTTGCCGACTTCACC
 AATATTCTTCTGCTGGATACCGCCTGCGATGGCGATACCGTCAGCAACCTGGCGCGTAAA
 AACCAGCTCACGTTTACGGAGGACTGGGAGCATCGCCACTGGTCCGGCGTCGAATTACTC
@@ -67183,7 +73151,7 @@
 TACCAACAATTACGCGAGCGGCTCATACAGGAACTGAATTTAACGCCGCAGCAGTTACAT
 GAAGAGAGCAACCTGATCCAGGCCGGCCTGGATTCCATAAGATTGATGAGATGGTTACAC
 TGGTTTCGTAAAAATGGCTACCGCCTTACCCTTCGCGAGCTGTATGCCGCCCCCACGCTG
-GCGGCATGGAACnnnnnnnnnnCCTACCTGACGGGCCGCATGCCGGGGCAGACGCTTGGC
+GCGGCATGGAACNNNNNNNNNNCCTACCTGACGGGCCGCATGCCGGGGCAGACGCTTGGC
 GGCGTGGGTTGCCACCTGTATCAGGAGTTTGAAGGCCATTGTCTGACGGCGTCGCAGCTG
 GAGCAGGCCATCACGACCTTGCTGCAACGCCACCCAATGCTGCATATCGCCTTTCGCCCC
 GACGGGCAGCAGGTCTGGCTACCGCAACCTTACTGGAACGGCGTCACCGTTCATGATTTA
@@ -72741,6 +78709,109 @@
 GTGCAACTGCACGTTTTGTTACAACGTCACGAATTTTCCACCCTGACGTTGCTTGACCTC
 TTCACCCACCCTTCTCCTGCTGCCCTGGCCGATTATCTGGCCGGCGTCGCCACGGTGGAG
 AAAACAAAACGACCTCGCCCTGTTCGCCGTCGTCAGCGGCGGATATAG
+>irp2_36_NZ_NOSM01000001
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+TACCAACAATTACGCGAGCGGCTCATACAGGAACTGAATTTAACGCCGCAGCAGTTACAT
+GAAGAGAGCAACCTGATCCAGGCCGGCCTGGATTCCATAAGATTGATGAGATGGTTACAC
+TGGTTTCGTAAAAATGGCTACCGCCTTACCCTTCGCGAGCTGTATGCCGCCCCCACGCTG
+GCGGCATGGAACCAGTTAATGCTCAGCCGGTCGCCGGAGAACGCGGAAGAAGAAACGCCG
+CCCGACGAATCATCCTGGCCGAACATGACCGAAAGTACCCCCTTCCCATTGACGCCAGTA
+CAGCACGCCTACCTGACGGGCCGCATGCCGGGGCAGACGCTTGGCGGCGTGGGTTGCCAC
+CTGTATCAGGAGTTTGAAGGCCATTGTCTGACGGCGTCGCAGTTGGAGCAGGCCATCACG
+ACCTTGCTGCAACGCCACCCAATGCTGCATATCGCCTTTCGCCCCGACGGGCAGCAGGTC
+TGGCTACCGCAACCTTACTGGAACGGCGTCACCGTTCATGATTTACGCCATAACGACGCT
+GAAAGCCGCCAGGCCTATCTGGACGCACTGCGCCAGCGCCTGAGCCACCGTCTTTTACGC
+GTGGAAATCGGCGAAACGTTTGATTTTCAGCTGACGCTCTTGCCGGACAATCGCCACCGC
+CTCCATGTCAATATTGACCTGCTGATTATGGATGCCTCCAGCTTTACGCTTTTCTTCGAT
+GAGCTTAACGCCCTGCTGGCCGGAGAATCGCTGCCGGCTATCGACACCCGCTATGATTTC
+CGCTCGTATTTGCTGCACCAACAGAAGATCAATCAACCACTGAGAGACGACGCGCGCGCT
+TACTGGCTGGCGAAAGCATCGACGCTTCCCCCCGCGCCCGTCTTGCCGCTGGCCTGCGAA
+CCCGCCACGCTACGTGAAGTCCGTAATACCCGACGCCGCATGATTGTTCCGGCAACACGC
+TGGCACGCCTTTAGCAACCGGGCCGGCGAGTATGGCGTGACGCCGACAATGGCACTGGCG
+ACCTGTTTTTCTGCCGTGCTGGCTCGCTGGGGCGGCCTGACGCGTCTGCTGCTTAACATC
+ACCTTATTCGACCGCCAGCCGCTGCACCCGGCGGTTGGCGCGATGCTTGCCGACTTCACC
+AATATTCTTCTGCTGGATACCGCCTGCGATGGCGATACCGTCAGCAACCTGGCGCGTAAA
+AACCAGCTCACGTTTACGGAGGACTGGGAGCATCGCCACTGGTCCGGCGTCGAATTACTC
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+TGGCTACAATGGGACAGCAACGACGCGCTGTTCCCTCCGGCGTTAGTCGAAACATTGTTC
+GACGCCTACTGCCAGTTGATTAACCAACTCTGCGATGACGAAAGCGCCTGGCAAAAGCCG
+TTCGCAGATATGATGCCCGCCAGCCAGCGCGCGATACGCGAACGGGTCAACGCCACCGGC
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+CAGGCGCTGGCGGTAACGGACATGCGTTATCAGTGGAATTATCATGAGCTGACAGACTAT
+GCCCGCCGTTGCGCGGGCAGGTTAATCGAGTGCGGGGTTCAGCCCGGCGATAATGTGGCT
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+GCGGTTTACGTTCCGGTTTCGCTGGATCAGCCTGCCGCACGGCGCGAGAAAATCTACGCT
+GACGCCAGCGTCCGGCTGGTGCTCATTTGTCAGCACGACGCCAGCGCCGGGTCAGACGAT
+ATTCCCGTCCTTGCCTGGCAGCAGGCCATTGAGGCGGAGCCGATCGCCAACCCGGTAGTA
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+GGGGTAGTCATTTCTCACCGGGGAGCGCTTAACACCTGTTGCGATATCAATACCCGCTAT
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+TACGACATTTTTGGCGTACTGCGCGCGGGCGGCGCGCTGGTGATGGTGATGGAAAATCAA
+CGGCGCGATCCTCACGCATGGTGTGAGCTGATCCAGCGCCATCAGGTCACGCTCTGGAAC
+AGCGTCCCGGCGCTGTTCGATATGCTGCTGACCTGGTGTGAAGGTTTCGCCGACGCCACG
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+CGTTATCGGGCCTTCCGGCCACAAGGACAATTTATCGCGATGGGCGGTGCCACCGAGGCG
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+TACGGTTTTCCGCTAACCAACCAACGCTACCGGGTGGTGGATGAACAGGGCCGGGACTGC
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+AACGATCCCCTGCGTAGCGAGCAGCAATTTTTGACGCTCCCGGACGAGCGCTGGTATCGC
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+AAGCAGGTCAAAGTCGGAGGATATCGCATCGAGCTGGGCGAAATCGAAAGCGCGCTCAGC
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+GCGGCATACGTTGTTCCTCAGGGCGAGGCTTTTTGCGTTACCGATCATCGGAACCCGGCA
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+ATCTCCGCAGAACAGGTAGCCGATTTCCTTCAGCATCGCCTGCTAAAACTGAAGCCGGGT
+CACACCGCTGGCGCCGATCCTCTCCCCCTGATGAACTCACTCGCTATCCAGCCGCGCTGG
+CAGGCCGTGGTGGAACGCTGGTTAGCATTTCTGGTGACACAACGGCGACTGAAGCCCGCT
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+AACGACGCGCAGTGGTCGCCGGAAAGCCTGGCCTTTAACCATCCGGCCAGCGCCCCGTAT
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+GCCGGACAGATTGAGTATGTCGGGCTTGAGCAGAGCCAGGAGATGCTGCTGAGCGCCCGG
+CAGAGGCTCGCCCCCTGGCCTGGCGCCCGTCTGTCCCTCTGGAATGCAGACACGCTGGCG
+GCGCACGCTCACTCGGCGGACATTATCTGGCTTAATAACGCCCTGCATCGTCTGCTGCCG
+GAAGATCCCGGGCTCCTTGCGACATTACAACAGCTTGCCGTTCCCGGCGCGCTGCTCTAC
+GTGATGGAGTTTCGCCAGTTAACGCCGTCCGCCCTACTCAGCACGCTCCTGTTAACCAAT
+GGGCAGCCGGAGGCCTTGCTGCATAACAGCGCCGACTGGGCGGCATTATTTAGCGCGGCC
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+TTCACCCACCCTTCTCCTGCTGCCCTGGCCGATTATCTGGCCGGCGTCGCCACGGTGGAG
+AAAACAAAACGACCTCGCCCTGTTCGCCGTCGTCAGCGGCGGATATAG
 >irp2_37_NZ_PGIY01000009
 ATGATTTCTGGCGCACCATCTCAGGATTCGCTGTTACCGGACAACCGCCACGCGGCTGAT
 TACCAACAATTACGCGAGCGGCTCATACAGGAACTGAATTTAACGCCGCAGCAGTTACAT
@@ -90556,7 +96627,7 @@
 TATCGCAGTAAAGTCAAAGACCAAAATTACTATTCTGTTGCAGTCAATGCAGGTTATTAC
 GTAACGCCTAATGCAAAAGTTTATATTGAAGGCGCATGGAATCGGGTTACGAATAAAAAA
 GGTGATACTTCACTTTATGATCACAATGATAACACTTCTGACTACAGCAAAAATGGTGCA
-GGCyTAGAAAACTATAACTTCATCACTACTGCTGGwCTTAAGTACACCTTTTAA
+GGCYTAGAAAACTATAACTTCATCACTACTGCTGGWCTTAAGTACACCTTTTAA
 >ompT_63_AVSA01000040
 ATGCGGGCGAAACTTCTGGGAATAGTCCTGACAACCCCTATTGCGATCAGCTCTTTTGCT
 TCTACCGAGACTTTATCGTTTACTCCTGACAACATAAATGCGGACATTAGTCTTGGAACT
@@ -94500,6 +100571,66 @@
 GCGACCGATCACATCTGGCATCATGGTTACAGCATCGCGGCAACAACCAGCCTGTATGTT
 GTACTGGGTGTACTGGCGCTGGGCATTCTCGCAAGCGTCATGTTCCCGGGCAAACCTGAA
 TCTGAGGAAAAGGGGAGTTAA
+>traJ_1_AP001918
+ATGTATCCGATGGATCGTATTCAACAAAAACATGCTCGTCAAATAGATCTGCTGGAAAATCTGACGGCAGTTATTCAGGA
+TTATCCAAATCCAGCCTGTATCAGGGACGAAACTGGAAAATTTATTTTTTGCAATACGCTGTTTCATGAGTCATTTCTTA
+CACAAGATCAAAGTGCTGAAAAATGGCTTCTGTCGCAGAGAGATTTTTGTGAATTGATCTCTGTCACAGAGATGGAAGCA
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+AAAAAACGATTGTCAGTGATGATATCAGAAATATAATCAGAAGAATGAGTGATGATTCTTCTGTATCATCATATGTAAAT
+GATGTCTTTTACTTATATAGCACCGGAATCAGTCATAATGCTATAGCAAGAATATTAAATATATCCATCTCCACATCAAA
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+>traJ_2_AY230886_AF237698
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+>traJ_3_AP019676
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+>traJ_4_CP007150
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+TAAACCAGTTAAACGGAAAATAAAAGAATTTTTTGAACACTTTGATTTATTCAGAGTGTCATGTATCTATAAAGGAGAAA
+TAGATTCGCTATTAAGTATAATTCGTGAATTTTATGGTGTTAAGTAA
+>traJ_5_AF550679
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+AAAAAACGATTGTCAGTGATGATATCAGAAATATAATCAGAAGAATGAGTGATGATTCTTCTGTATCATCATATGTAAAT
+GATGTCTTTTACTTATATAGCACCGGAATCAGTCATAATGCTATAGCAAGAATATTAAATATATCCATCTCCACATCAAA
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+TTATTTATTATTTATACGAGAAGGCTATGTGTATCATAAATACGCGTTAA
+>traJ_6_CU928146
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+ATTTCTTAATGGACACAGAAATATTATTCTGTGGCAATTTTATGATGCTGCTCATGTTCGTCATAAAGACAGTTATAATC
+AAAAAACGATTGTCAGTGATGATATCAGAAATATAATCAGAAGAATGAGTGATGATTCTTCTGTATCATCATATGTAAAT
+GATGTCTTTTACTTATATAGCACCGGAATCAGTCATAATGCTATAGCAAGAATATTAAATATATCCATCTCCACATCAAA
+GAAACACGCATCTCTGATATGCGACTACTTCTCTGTTTCTAATAAAGATGAGTTAATTATCTTACTCTACAATAAAAAGT
+TTATTTATTATTTATACGAGAAAGCTATGTGTATCATAAATACGCGTTAA
 >traT_100_UGBW01000005
 ATGAGATGTTTAACCCATATTGCTTTGGTAACGGTGATACAGTTTATCGCCTGTTATCTG
 GCTGGTTGGGGGAATGCCGAAACAATTTTTATGCTGTTCTTCATAGTACTATGGCAGGGA
@@ -98054,7 +104185,7 @@
 TCATATCTACTCTGGAACCCATTAGTGCATGTTGTGGAGTTAAGCCGCGAGGCAGTTATG
 CCTGGCTATATCAGTGAAGGCGTGAGTCTGAACTACCTTGCAATGTTTACTCTGGTCACC
 CTGTTCATCGGCCTGGCATTATACCGAACGCGTGAAGAGGCAATGCTGACATCATGA
->kpsMII_K1_4_UWVJ01000006 UWVJ01000000
+>kpsMII_K1_4_UWVJ01000006_UWVJ01000000
 ATGGCAAGAAGTGGATTTGAAGTTCAGAAAGTCACCGTAGAGGCATTATTTCTACGAGAA
 ATACGAACACGCTTTGGTAAGTTTCGTCTGGGGTATTTGTGGGCGATTCTTGAACCCTCC
 GCGCATTTGCTGATACTGTTGGGAATTTTGGGTTACGTTATGCACCGCACTATGCCAGAC
@@ -98692,7 +104823,7 @@
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 >papA_F536_4_AF237477
 ATGATTAAGTCGGTTATTGCCGGTGCGGTAGCTATGGCAGTGGTGTCTTTTGGTGCAAATGCAGCTGCAACTGTTCCTCAGGGGCAGGGTAAGGTAACTTTTAGCGGAACTGTGGTTGATGCACCATGTGGTATTGATGCGCAGTCAGCTGATCAGTCTGTCGATTTTGGCCAGATATCAAAAGTCTTTCTGGACAATGATGGGCAAACCACACCTAAGGCTTTTGATATTAAGCTCGTGAATTGCGATATTACTAACTATAAGAAACCAGCCACTGGTGCCGCTCCAGGCGGCGCACCTAAAGCAGGAACAGTATCCATGACATTCTCCGGTGTTACAGCAGGTGCAGGTAACGCCAATGACATGTTACAGACGAATGGCGAGACCAATACAGCCATCGTTGTTATCGACCCGCATGGCAAACGTGTGAAGTTTGATGGTCGGACCTCTACCGGGGTTTCAAATCTGATTAATGGTGATAACACGATTCATTTCACTGCCGCAGTTATGAAAGATGGTAGTGGCAACCATGTAAAAGAAGGTGCCTTCTCAGCAGTTGCGAATTTCAACCTGACTTATCAGTAA
->papA_F8_5_AF247348
+>papA_feiA_F8_5_AF247348
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 >papA_F12_6_AF247354
 ATGGCAGTGGTGTCTTTTGGTGCAAATGCAGCTCCACAGGGGCAGGGAAAAGTAACTTTTAACGGAACTGTAGTAGATGCACCATGTGGTATTGATGCTCAGTCTGCTGATCAATCTATTGAGTTTGGTCAGGTTTCTAAAGTTTTACTGAATAATGGTGGATCCTCAACGCCCAAGAATTTTGATATAAAACTTACCGATTGTGATGTTACTAACTATAAGAAGGCTGGTAAAGCGGGGACTGTATCTCTGACATTCTCAGGGGTTCAAGCTGGTACCGATATGTTGCAAACAGTTGGTACGACTAATACAGCAATTCTTGTTACAGATCCTCATGGCAAAGCAGTAAAATTTGATGGAACAACAGCGACAGGTGTGTCAAGTCTTGTCGATGGGGATAATACAATCCATTTTACTGCCCTAGTTAAGAAAGACACAAGTGGCAATGATGTAGCTGAAGGTGCCTTCTCAGCAGTTGCGAATTTCAACCTGATTTATCAGTAA
@@ -98706,7 +104837,7 @@
 ATGATTAAGTCGGTTATTGCCGGTGCGGTAGCTATGGCAGTGGTGTCTTTTGGTGCAAATGCTGCTGCAACTGTTCCTCAGGGGCAGGGTAAGGTAACTTTTAGCGGAACTGTGGTTGATGCACCATGTGGTATTGATGCGCAGTCAGCTGATCAGTCTGTCGATTTTGGCCAGATATCAAAAGTCTTTCTGGACAATGATGGGCAAACCACACCTAAGGCTTTTGATATTAAGCTCGTGAATTGCGATATTACTAACTATAAGAAACCAGCCACTGGTGCCGCTCCAGGCGGCGCACCTAAAGCAGGAACAGTATCCATGACATTCTCCGGTGTTACAGCAGGTGCAGGTAACGCCAATGACATGTTACAGACGAATGGCGAGACCAATACAGCCATCGTTGTTATCGACCCGCATGGCAAACGTGTGAAGTTTGATGGTCGGACCTCTACCGGGGTTTCAAATCTGATTAATGGTGATAACACGAATCATTTTATTGCCGAATTTAGTAAAGATGGTAGTGGCAACCATGTAAAAGAAGGTGCCTTCTCAGCAGTTGCGAATTTCAACCTGACTTATCAGTAA
 >papA_F48_11_AF287159
 ATGATTAAGTCGGTTATTGCCGGTGCGGTAGCTATGGCAGTGGTGTCTTTTGGTGCAAATGCTGCTCCAACTACTCCACAGGGGCAGGGTAGAGTAACCTTTAACGGAACTGTTGTTGATGCTCCATGCAGCATTTCTCAGAAATCAGCTGATCAGTCTATTGATTTTGGACAACTTTCAAAAAGTTTTCTTGAAAATGATGGTCGATCCAAGCCAATGAACTTGGATATTGAATTAGTTAATTGTGACATTACTGCCTTTAAAAATAATGCTAAAACTGGGAGCGTTAAGTTAGCTTTTACAGGCCCAACAAGTGGTAATAATGAGGAGTTAGATACCAGTGGGGGGACAGGTACGGCTATTGTAGTTCAGGCTGCAGGTAAAAACGTTTCTTTCAATGGGACTGCAGGTGACGCTTATCCCCTGAAAGATGGTGATAATGTGCTGCATTATACTGCGATTGTTAAGAAGTCGTCAGCCAATAATGCCCAAGTCACTGAGGGTGCTTTTTCTGCAGTCGCAACCTTTAATTTAACGTACCAGTAA
->papA_F7-1_12_AF447814
+>papA_F7_1_12_AF447814
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 >papA_F11_13_AP017617
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