Mercurial > repos > iuc > art
view test-data/art.solid.02_F3.map @ 4:531ff1d417b6 draft
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/art commit e0cd7ae10ce97bed51594e7cc0b969a803d698b7
| author | iuc |
|---|---|
| date | Fri, 07 Sep 2018 10:57:50 -0400 |
| parents | b98d6fffd00b |
| children |
line wrap: on
line source
##ART_SOLiD read_length 50 @CM art_SOLiD -s -r 42 test-data/input.fa test-data/art.solid.02 50 50 20 75 10 @SQ chr1 1626 ##Header End chr1 1_1_1_F3 1525 + 2 32 03 48 01 chr1 1_1_2_F3 186 + 1 35 13 chr1 1_1_3_F3 807 - 7 28 13 33 03 35 23 38 12 41 13 43 23 45 10 chr1 1_1_4_F3 1418 - 4 5 10 12 13 44 21 48 10 chr1 1_1_5_F3 652 + 7 4 23 18 32 28 10 37 32 43 02 44 02 48 10 chr1 1_1_6_F3 379 + 1 47 32 chr1 1_1_7_F3 1504 - 4 7 03 8 01 10 32 32 32 chr1 1_1_8_F3 1431 + 4 24 32 34 13 38 13 47 03 chr1 1_1_9_F3 1323 + 2 43 03 48 32 chr1 1_1_10_F3 473 + 4 26 03 28 13 31 23 43 23 chr1 1_1_11_F3 962 - 4 11 02 35 03 37 01 47 02 chr1 1_1_12_F3 1204 - 3 27 23 32 03 38 03 chr1 1_1_13_F3 1233 + 1 44 13 chr1 1_1_14_F3 905 + 0 chr1 1_1_15_F3 1216 + 2 6 03 8 23 chr1 1_1_16_F3 1099 - 1 44 32 chr1 1_1_17_F3 884 - 2 30 30 49 03 chr1 1_1_18_F3 149 + 2 8 32 38 32 chr1 1_1_19_F3 1063 - 2 7 03 49 32 chr1 1_1_20_F3 863 + 1 47 32 chr1 1_1_21_F3 1202 - 2 5 03 19 13 chr1 1_1_22_F3 498 - 3 15 32 42 03 43 03 chr1 1_1_23_F3 130 + 2 18 13 20 32 chr1 1_1_24_F3 1033 + 0 chr1 1_1_25_F3 565 + 2 8 01 43 13 chr1 1_1_26_F3 300 + 1 14 23 chr1 1_1_27_F3 305 + 3 20 03 43 01 49 03 chr1 1_1_28_F3 1210 - 4 19 03 27 03 39 32 47 13 chr1 1_1_29_F3 1376 - 2 35 03 37 13 chr1 1_1_30_F3 1265 + 4 13 20 33 23 44 13 47 32 chr1 1_1_31_F3 1206 - 1 44 30 chr1 1_1_32_F3 240 + 2 28 03 38 02 chr1 1_1_33_F3 550 + 0 chr1 1_1_34_F3 726 - 0 chr1 1_1_35_F3 1264 - 5 20 32 32 23 37 03 42 13 47 03 chr1 1_1_36_F3 989 + 2 7 03 43 30 chr1 1_1_37_F3 1379 + 0 chr1 1_1_38_F3 954 - 2 45 03 47 03 chr1 1_1_39_F3 348 - 5 35 03 42 03 46 13 47 32 48 13 chr1 1_1_40_F3 1032 - 0 chr1 1_1_41_F3 1057 - 1 34 01 chr1 1_1_42_F3 193 + 2 17 01 49 01 chr1 1_1_43_F3 1495 - 2 27 32 40 13 chr1 1_1_44_F3 865 - 0 chr1 1_1_45_F3 907 + 2 34 01 49 10 chr1 1_1_46_F3 1512 - 2 0 03 30 03 chr1 1_1_47_F3 1447 + 0 chr1 1_1_48_F3 1537 + 2 3 03 40 32 chr1 1_1_49_F3 1324 + 2 9 12 47 30 chr1 1_1_50_F3 1278 + 0 chr1 1_1_51_F3 459 - 1 13 13 chr1 1_1_52_F3 386 + 0 chr1 1_1_53_F3 1414 - 4 8 02 24 32 44 03 49 01 chr1 1_1_54_F3 1274 + 1 47 02 chr1 1_1_55_F3 662 + 4 7 03 32 03 37 32 45 12 chr1 1_1_56_F3 240 - 2 38 03 48 31 chr1 1_1_57_F3 724 + 2 46 03 47 32 chr1 1_1_58_F3 328 - 1 28 32 chr1 1_1_59_F3 1319 - 1 49 03 chr1 1_1_60_F3 700 + 1 14 13 chr1 1_1_61_F3 440 - 1 47 03 chr1 1_1_62_F3 147 + 1 48 32 chr1 1_1_63_F3 81 - 4 13 13 43 03 47 21 48 23 chr1 1_1_64_F3 520 - 1 27 32 chr1 1_1_65_F3 1135 - 1 44 03 chr1 1_1_66_F3 772 + 2 15 30 31 01 chr1 1_1_67_F3 770 - 2 24 01 33 12 chr1 1_1_68_F3 956 + 2 7 13 28 32 chr1 1_1_69_F3 1094 - 1 17 32 chr1 1_1_70_F3 43 - 1 47 32 chr1 1_1_71_F3 1152 + 3 20 02 38 02 47 02 chr1 1_1_72_F3 65 - 3 19 23 21 03 49 03 chr1 1_1_73_F3 621 + 3 34 13 44 20 47 32 chr1 1_1_74_F3 850 + 1 48 23 chr1 1_1_75_F3 468 + 0 chr1 1_1_76_F3 1193 - 3 0 10 36 01 37 03 chr1 1_1_77_F3 640 + 1 43 03 chr1 1_1_78_F3 1205 + 0 chr1 1_1_79_F3 530 + 1 49 01 chr1 1_1_80_F3 446 - 2 31 32 48 23 chr1 1_1_81_F3 1446 + 1 44 03 chr1 1_1_82_F3 1469 + 1 48 23 chr1 1_1_83_F3 1404 - 2 37 01 38 03 chr1 1_1_84_F3 598 + 4 26 03 37 02 41 03 47 13 chr1 1_1_85_F3 1020 + 2 39 23 48 32 chr1 1_1_86_F3 489 + 1 16 32 chr1 1_1_87_F3 1330 - 4 12 13 24 32 30 02 35 03 chr1 1_1_88_F3 481 + 2 21 13 36 10 chr1 1_1_89_F3 1055 - 2 31 12 41 13 chr1 1_1_90_F3 284 - 1 37 32 chr1 1_1_91_F3 957 - 3 28 02 29 03 49 30 chr1 1_1_92_F3 44 + 2 12 02 29 13 chr1 1_1_93_F3 877 - 2 40 13 43 32 chr1 1_1_94_F3 1525 - 4 17 03 27 03 28 13 48 32 chr1 1_1_95_F3 1192 + 3 33 03 36 02 44 03 chr1 1_1_96_F3 1468 + 2 18 32 44 03 chr1 1_1_97_F3 231 + 0 chr1 1_1_98_F3 61 - 2 25 03 44 21 chr1 1_1_99_F3 227 - 1 47 32 chr1 1_1_100_F3 1368 + 4 6 03 34 20 37 30 48 01 chr1 1_1_101_F3 1222 - 4 8 01 34 03 37 30 48 12 chr1 1_1_102_F3 1126 - 3 39 03 40 03 47 02 chr1 1_1_103_F3 1223 + 3 38 03 42 03 47 30 chr1 1_1_104_F3 612 - 3 17 32 18 03 24 23 chr1 1_1_105_F3 190 + 2 17 32 48 32 chr1 1_1_106_F3 970 - 1 39 03 chr1 1_1_107_F3 152 - 3 22 03 28 13 48 32 chr1 1_1_108_F3 514 + 3 17 13 39 03 44 01 chr1 1_1_109_F3 967 - 2 9 23 27 03 chr1 1_1_110_F3 1353 + 4 9 03 25 03 37 01 43 13 chr1 1_1_111_F3 1064 - 3 19 03 26 32 38 03 chr1 1_1_112_F3 478 + 3 8 21 14 32 40 02 chr1 1_1_113_F3 1558 - 4 1 21 8 03 38 20 43 13 chr1 1_1_114_F3 755 - 1 37 01 chr1 1_1_115_F3 788 - 1 11 03 chr1 1_1_116_F3 933 + 2 0 20 35 13 chr1 1_1_117_F3 1560 + 3 8 12 34 03 38 32 chr1 1_1_118_F3 69 - 1 33 30 chr1 1_1_119_F3 1294 - 1 37 32 chr1 1_1_120_F3 537 + 3 17 13 34 12 44 01 chr1 1_1_121_F3 1250 + 2 19 32 43 03 chr1 1_1_122_F3 189 + 0 chr1 1_1_123_F3 1242 + 2 30 03 49 10 chr1 1_1_124_F3 1322 - 5 7 03 17 01 45 03 46 03 48 23 chr1 1_1_125_F3 1574 - 1 38 03 chr1 1_1_126_F3 810 + 4 29 32 33 02 39 03 44 23 chr1 1_1_127_F3 815 + 0 chr1 1_1_128_F3 971 + 3 7 03 43 23 48 03 chr1 1_1_129_F3 1090 - 1 37 03 chr1 1_1_130_F3 1161 - 4 17 03 35 03 39 32 43 13 chr1 1_1_131_F3 198 - 3 22 03 44 23 47 20 chr1 1_1_132_F3 637 - 2 23 32 28 03 chr1 1_1_133_F3 1028 - 4 6 30 27 12 29 20 40 03 chr1 1_1_134_F3 330 + 1 17 32 chr1 1_1_135_F3 207 + 1 44 01 chr1 1_1_136_F3 574 - 3 33 01 46 23 47 03 chr1 1_1_137_F3 1204 + 1 10 10 chr1 1_1_138_F3 33 + 0 chr1 1_1_139_F3 1413 - 1 48 13 chr1 1_1_140_F3 876 + 1 24 32 chr1 1_1_141_F3 188 - 4 5 03 8 03 10 13 40 32 chr1 1_1_142_F3 50 + 2 24 01 39 13 chr1 1_1_143_F3 487 + 3 27 32 33 03 49 32 chr1 1_1_144_F3 1273 - 1 44 03 chr1 1_1_145_F3 358 - 2 9 23 47 20 chr1 1_1_146_F3 167 + 2 38 01 48 03 chr1 1_1_147_F3 176 - 3 17 03 33 13 43 30 chr1 1_1_148_F3 883 + 3 8 02 45 32 49 30 chr1 1_1_149_F3 324 - 3 10 13 44 30 47 03 chr1 1_1_150_F3 120 + 2 47 12 49 12 chr1 1_1_151_F3 51 + 1 46 13 chr1 1_1_152_F3 835 - 4 10 13 17 13 28 02 37 03 chr1 1_1_153_F3 761 - 0 chr1 1_1_154_F3 1350 - 1 17 02 chr1 1_1_155_F3 1182 - 4 20 23 28 03 40 02 42 03 chr1 1_1_156_F3 532 - 2 18 03 28 32 chr1 1_1_157_F3 928 + 1 43 03 chr1 1_1_158_F3 1318 - 5 9 13 22 23 28 13 33 03 47 01 chr1 1_1_159_F3 382 + 3 34 02 37 03 47 03 chr1 1_1_160_F3 829 + 1 20 01 chr1 1_1_161_F3 254 - 1 27 13 chr1 1_1_162_F3 1140 - 4 5 10 28 03 34 03 48 21 chr1 1_1_163_F3 500 - 2 26 32 48 10 chr1 1_1_164_F3 709 + 5 4 31 5 13 17 03 37 32 44 01 chr1 1_1_165_F3 128 + 2 44 03 48 03 chr1 1_1_166_F3 1554 - 3 37 23 43 13 44 01 chr1 1_1_167_F3 265 - 3 38 21 40 01 41 02 chr1 1_1_168_F3 883 - 4 14 32 17 03 48 03 49 03 chr1 1_1_169_F3 1223 + 3 34 01 38 03 49 03 chr1 1_1_170_F3 1219 - 4 7 13 34 30 43 20 49 03 chr1 1_1_171_F3 1483 + 1 49 12 chr1 1_1_172_F3 821 + 2 10 10 47 13 chr1 1_1_173_F3 1448 - 1 38 10 chr1 1_1_174_F3 982 - 1 27 03 chr1 1_1_175_F3 1213 - 2 21 01 43 03 chr1 1_1_176_F3 1316 - 2 47 12 48 12 chr1 1_1_177_F3 854 + 3 28 30 40 03 43 13 chr1 1_1_178_F3 313 - 1 43 32 chr1 1_1_179_F3 31 + 3 9 30 28 32 43 03 chr1 1_1_180_F3 1064 - 1 48 32 chr1 1_1_181_F3 364 + 2 38 03 49 03 chr1 1_1_182_F3 267 + 1 33 02 chr1 1_1_183_F3 700 - 1 13 03 chr1 1_1_184_F3 303 + 4 9 13 30 32 37 32 38 13 chr1 1_1_185_F3 707 - 1 40 32 chr1 1_1_186_F3 27 - 1 43 03 chr1 1_1_187_F3 281 + 4 7 32 37 01 42 01 47 32 chr1 1_1_188_F3 858 + 1 47 01 chr1 1_1_189_F3 1260 + 1 33 02 chr1 1_1_190_F3 508 - 2 43 02 47 23 chr1 1_1_191_F3 1186 - 2 47 10 48 03 chr1 1_1_192_F3 1120 - 3 46 03 47 01 48 01 chr1 1_1_193_F3 1295 - 4 0 10 17 20 42 03 44 01 chr1 1_1_194_F3 1364 + 3 2 03 8 03 43 32 chr1 1_1_195_F3 714 + 2 19 01 44 30 chr1 1_1_196_F3 162 - 3 34 03 39 13 44 01 chr1 1_1_197_F3 706 - 4 7 03 8 10 28 10 47 13 chr1 1_1_198_F3 214 + 1 19 01 chr1 1_1_199_F3 250 - 1 43 13 chr1 1_1_200_F3 310 + 1 48 01 chr1 1_1_201_F3 777 + 1 7 23 chr1 1_1_202_F3 529 - 0 chr1 1_1_203_F3 584 + 1 38 13 chr1 1_1_204_F3 1250 + 3 8 32 34 13 38 01 chr1 1_1_205_F3 244 + 2 38 03 48 03 chr1 1_1_206_F3 766 + 4 27 03 37 02 47 13 48 02 chr1 1_1_207_F3 668 + 3 20 13 27 03 43 21 chr1 1_1_208_F3 976 - 5 31 30 33 03 46 12 47 13 48 13 chr1 1_1_209_F3 944 - 1 11 10 chr1 1_1_210_F3 231 + 2 2 03 34 21 chr1 1_1_211_F3 317 - 1 37 03 chr1 1_1_212_F3 455 + 2 19 10 39 32 chr1 1_1_213_F3 115 - 1 34 32 chr1 1_1_214_F3 776 + 4 17 03 18 32 35 03 38 02 chr1 1_1_215_F3 350 + 1 43 13 chr1 1_1_216_F3 918 + 1 18 13 chr1 1_1_217_F3 180 + 3 8 30 17 10 38 30 chr1 1_1_218_F3 808 - 0 chr1 1_1_219_F3 99 + 1 43 03 chr1 1_1_220_F3 1467 + 2 27 03 48 10 chr1 1_1_221_F3 1305 + 2 33 30 46 13 chr1 1_1_222_F3 956 + 0 chr1 1_1_223_F3 693 + 3 7 13 17 30 42 03 chr1 1_1_224_F3 309 - 2 43 13 47 30 chr1 1_1_225_F3 220 - 4 37 03 38 03 42 03 47 10 chr1 1_1_226_F3 279 - 4 37 03 46 32 47 30 48 10 chr1 1_1_227_F3 1381 + 1 32 10 chr1 1_1_228_F3 1099 + 2 19 03 23 32 chr1 1_1_229_F3 354 + 1 30 01 chr1 1_1_230_F3 1502 + 1 24 03 chr1 1_1_231_F3 1541 - 1 17 03 chr1 1_1_232_F3 1301 - 1 43 02 chr1 1_1_233_F3 1153 + 1 36 03 chr1 1_1_234_F3 855 + 0 chr1 1_1_235_F3 961 + 5 1 13 18 02 37 02 44 02 47 32 chr1 1_1_236_F3 853 + 2 43 10 47 30 chr1 1_1_237_F3 314 + 1 38 30 chr1 1_1_238_F3 56 + 2 13 23 44 02 chr1 1_1_239_F3 1231 - 6 5 03 17 03 29 02 37 03 38 13 48 32 chr1 1_1_240_F3 636 - 1 27 13 chr1 1_1_241_F3 103 + 4 19 30 27 03 30 20 44 03 chr1 1_1_242_F3 1069 - 2 27 10 48 03 chr1 1_1_243_F3 511 + 0 chr1 1_1_244_F3 453 - 2 15 32 43 12 chr1 1_1_245_F3 960 + 2 6 32 43 03 chr1 1_1_246_F3 1332 - 2 18 32 40 01 chr1 1_1_247_F3 444 - 0 chr1 1_1_248_F3 1396 + 2 17 13 40 32 chr1 1_1_249_F3 607 + 2 3 32 38 13 chr1 1_1_250_F3 911 + 3 9 20 27 13 44 30 chr1 1_1_251_F3 548 - 2 29 13 48 31 chr1 1_1_252_F3 1318 + 2 1 32 34 30 chr1 1_1_253_F3 475 + 2 18 10 47 21 chr1 1_1_254_F3 212 + 3 8 03 24 30 47 01 chr1 1_1_255_F3 333 - 2 6 03 48 21 chr1 1_1_256_F3 1275 - 3 28 03 32 13 39 13 chr1 1_1_257_F3 347 - 3 16 23 37 31 43 03 chr1 1_1_258_F3 1508 - 3 34 03 40 32 44 02 chr1 1_1_259_F3 1154 + 4 0 10 28 32 40 03 43 01 chr1 1_1_260_F3 473 - 2 8 13 39 32 chr1 1_1_261_F3 66 - 2 34 01 45 13 chr1 1_1_262_F3 40 + 3 34 03 41 31 48 23 chr1 1_1_263_F3 1271 + 5 5 30 27 23 37 13 47 02 48 32 chr1 1_1_264_F3 506 - 1 8 12 chr1 1_1_265_F3 1037 - 0 chr1 1_1_266_F3 1356 - 1 7 13 chr1 1_1_267_F3 122 + 0 chr1 1_1_268_F3 1230 + 2 38 13 43 32 chr1 1_1_269_F3 628 + 2 7 03 38 03 chr1 1_1_270_F3 509 - 1 47 31 chr1 1_1_271_F3 102 + 3 22 03 36 20 43 23 chr1 1_1_272_F3 350 - 2 44 13 49 32 chr1 1_1_273_F3 1297 + 4 11 10 31 13 43 13 48 10 chr1 1_1_274_F3 769 + 2 1 03 37 32 chr1 1_1_275_F3 538 - 0 chr1 1_1_276_F3 1043 - 3 2 03 7 10 43 12 chr1 1_1_277_F3 611 - 0 chr1 1_1_278_F3 690 + 1 26 03 chr1 1_1_279_F3 1406 - 1 19 30 chr1 1_1_280_F3 555 - 5 8 23 19 02 24 21 28 21 38 21 chr1 1_1_281_F3 167 - 4 0 30 18 13 20 03 35 03 chr1 1_1_282_F3 364 - 2 7 03 48 12 chr1 1_1_283_F3 980 + 1 43 23 chr1 1_1_284_F3 204 - 0 chr1 1_1_285_F3 1144 + 2 13 03 39 03 chr1 1_1_286_F3 64 + 1 43 23 chr1 1_1_287_F3 1071 - 3 11 03 38 13 48 13 chr1 1_1_288_F3 304 - 3 39 03 47 02 48 13 chr1 1_1_289_F3 1050 - 6 3 03 10 30 25 03 35 23 47 23 48 02 chr1 1_1_290_F3 1142 + 3 1 03 24 03 43 03 chr1 1_1_291_F3 251 - 3 2 03 30 13 33 32 chr1 1_1_292_F3 828 - 3 16 31 23 03 28 03 chr1 1_1_293_F3 1327 - 2 38 03 49 23 chr1 1_1_294_F3 906 + 4 2 23 10 02 37 10 47 01 chr1 1_1_295_F3 1515 - 3 40 03 44 23 47 20 chr1 1_1_296_F3 1241 + 3 8 30 10 32 20 03 chr1 1_1_297_F3 1520 - 1 28 32 chr1 1_1_298_F3 1028 + 2 27 03 42 32 chr1 1_1_299_F3 1403 - 2 31 23 46 13 chr1 1_1_300_F3 1225 - 0 chr1 1_1_301_F3 584 - 2 43 13 48 20 chr1 1_1_302_F3 942 - 1 44 03 chr1 1_1_303_F3 876 - 0 chr1 1_1_304_F3 331 + 3 25 10 33 23 37 32 chr1 1_1_305_F3 912 - 1 24 10 chr1 1_1_306_F3 517 - 5 25 32 29 23 33 03 39 30 44 32 chr1 1_1_307_F3 1349 - 1 44 03 chr1 1_1_308_F3 759 - 2 8 03 29 13 chr1 1_1_309_F3 1437 + 2 41 03 47 32 chr1 1_1_310_F3 347 + 0 chr1 1_1_311_F3 684 - 2 33 32 47 03 chr1 1_1_312_F3 371 + 1 43 31 chr1 1_1_313_F3 507 + 2 19 21 43 01 chr1 1_1_314_F3 573 + 4 12 32 17 23 22 03 41 13 chr1 1_1_315_F3 255 - 3 17 03 45 01 48 20 chr1 1_1_316_F3 1259 + 3 9 12 31 03 32 12 chr1 1_1_317_F3 391 - 1 47 03 chr1 1_1_318_F3 532 + 3 7 31 18 02 47 01 chr1 1_1_319_F3 1160 + 3 0 10 27 32 30 01 chr1 1_1_320_F3 1552 + 1 7 03