Mercurial > repos > iuc > artic_guppyplex
diff test-data/nCoV-2019.scheme.V3.bed @ 0:7a82006f7c05 draft
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/artic commit dacdfa7ecfbdd1c1a12494cf7d0450185c122c84"
| author | iuc |
|---|---|
| date | Fri, 27 Aug 2021 20:34:52 +0000 |
| parents | |
| children |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/nCoV-2019.scheme.V3.bed Fri Aug 27 20:34:52 2021 +0000 @@ -0,0 +1,218 @@ +MN908947.3 30 54 nCoV-2019_1_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 385 410 nCoV-2019_1_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 320 342 nCoV-2019_2_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 704 726 nCoV-2019_2_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 642 664 nCoV-2019_3_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 1004 1028 nCoV-2019_3_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 943 965 nCoV-2019_4_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 1312 1337 nCoV-2019_4_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 1242 1264 nCoV-2019_5_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 1623 1651 nCoV-2019_5_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 1573 1595 nCoV-2019_6_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 1942 1964 nCoV-2019_6_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 1875 1897 nCoV-2019_7_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 1868 1890 nCoV-2019_7_LEFT_alt0 nCoV-2019_1 +MN908947.3 2247 2269 nCoV-2019_7_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 2242 2264 nCoV-2019_7_RIGHT_alt5 nCoV-2019_1 +MN908947.3 2181 2205 nCoV-2019_8_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 2568 2592 nCoV-2019_8_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 2505 2529 nCoV-2019_9_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 2504 2528 nCoV-2019_9_LEFT_alt4 nCoV-2019_1 +MN908947.3 2882 2904 nCoV-2019_9_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 2880 2902 nCoV-2019_9_RIGHT_alt2 nCoV-2019_1 +MN908947.3 2826 2850 nCoV-2019_10_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 3183 3210 nCoV-2019_10_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 3144 3166 nCoV-2019_11_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 3507 3531 nCoV-2019_11_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 3460 3482 nCoV-2019_12_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 3826 3853 nCoV-2019_12_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 3771 3795 nCoV-2019_13_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 4142 4164 nCoV-2019_13_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 4054 4077 nCoV-2019_14_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 4044 4068 nCoV-2019_14_LEFT_alt4 nCoV-2019_2 +MN908947.3 4428 4450 nCoV-2019_14_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 4402 4424 nCoV-2019_14_RIGHT_alt2 nCoV-2019_2 +MN908947.3 4294 4321 nCoV-2019_15_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 4296 4322 nCoV-2019_15_LEFT_alt1 nCoV-2019_1 +MN908947.3 4674 4696 nCoV-2019_15_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 4666 4689 nCoV-2019_15_RIGHT_alt3 nCoV-2019_1 +MN908947.3 4636 4658 nCoV-2019_16_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 4995 5017 nCoV-2019_16_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 4939 4966 nCoV-2019_17_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 5296 5321 nCoV-2019_17_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 5230 5259 nCoV-2019_18_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 5257 5287 nCoV-2019_18_LEFT_alt2 nCoV-2019_2 +MN908947.3 5620 5644 nCoV-2019_18_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 5620 5643 nCoV-2019_18_RIGHT_alt1 nCoV-2019_2 +MN908947.3 5563 5586 nCoV-2019_19_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 5932 5957 nCoV-2019_19_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 5867 5894 nCoV-2019_20_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 6247 6272 nCoV-2019_20_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 6167 6196 nCoV-2019_21_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 6168 6197 nCoV-2019_21_LEFT_alt2 nCoV-2019_1 +MN908947.3 6528 6550 nCoV-2019_21_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 6526 6548 nCoV-2019_21_RIGHT_alt0 nCoV-2019_1 +MN908947.3 6466 6495 nCoV-2019_22_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 6846 6873 nCoV-2019_22_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 6718 6745 nCoV-2019_23_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 7092 7117 nCoV-2019_23_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 7035 7058 nCoV-2019_24_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 7389 7415 nCoV-2019_24_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 7305 7332 nCoV-2019_25_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 7671 7694 nCoV-2019_25_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 7626 7651 nCoV-2019_26_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 7997 8019 nCoV-2019_26_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 7943 7968 nCoV-2019_27_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 8319 8341 nCoV-2019_27_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 8249 8275 nCoV-2019_28_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 8635 8661 nCoV-2019_28_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 8595 8619 nCoV-2019_29_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 8954 8983 nCoV-2019_29_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 8888 8913 nCoV-2019_30_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 9245 9271 nCoV-2019_30_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 9204 9226 nCoV-2019_31_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 9557 9585 nCoV-2019_31_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 9477 9502 nCoV-2019_32_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 9834 9858 nCoV-2019_32_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 9784 9806 nCoV-2019_33_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 10146 10171 nCoV-2019_33_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 10076 10099 nCoV-2019_34_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 10437 10459 nCoV-2019_34_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 10362 10384 nCoV-2019_35_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 10737 10763 nCoV-2019_35_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 10666 10688 nCoV-2019_36_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 11048 11074 nCoV-2019_36_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 10999 11022 nCoV-2019_37_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 11372 11394 nCoV-2019_37_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 11306 11331 nCoV-2019_38_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 11668 11693 nCoV-2019_38_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 11555 11584 nCoV-2019_39_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 11927 11949 nCoV-2019_39_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 11863 11889 nCoV-2019_40_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 12234 12256 nCoV-2019_40_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 12110 12133 nCoV-2019_41_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 12465 12490 nCoV-2019_41_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 12417 12439 nCoV-2019_42_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 12779 12802 nCoV-2019_42_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 12710 12732 nCoV-2019_43_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 13074 13096 nCoV-2019_43_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 13005 13027 nCoV-2019_44_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 13007 13029 nCoV-2019_44_LEFT_alt3 nCoV-2019_2 +MN908947.3 13378 13400 nCoV-2019_44_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 13363 13385 nCoV-2019_44_RIGHT_alt0 nCoV-2019_2 +MN908947.3 13319 13344 nCoV-2019_45_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 13307 13336 nCoV-2019_45_LEFT_alt2 nCoV-2019_1 +MN908947.3 13669 13699 nCoV-2019_45_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 13660 13689 nCoV-2019_45_RIGHT_alt7 nCoV-2019_1 +MN908947.3 13599 13621 nCoV-2019_46_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 13602 13625 nCoV-2019_46_LEFT_alt1 nCoV-2019_2 +MN908947.3 13962 13984 nCoV-2019_46_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 13961 13984 nCoV-2019_46_RIGHT_alt2 nCoV-2019_2 +MN908947.3 13918 13946 nCoV-2019_47_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 14271 14299 nCoV-2019_47_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 14207 14232 nCoV-2019_48_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 14579 14601 nCoV-2019_48_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 14545 14570 nCoV-2019_49_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 14898 14926 nCoV-2019_49_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 14865 14895 nCoV-2019_50_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 15224 15246 nCoV-2019_50_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 15171 15193 nCoV-2019_51_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 15538 15560 nCoV-2019_51_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 15481 15503 nCoV-2019_52_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 15861 15886 nCoV-2019_52_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 15827 15851 nCoV-2019_53_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 16186 16209 nCoV-2019_53_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 16118 16144 nCoV-2019_54_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 16485 16510 nCoV-2019_54_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 16416 16444 nCoV-2019_55_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 16804 16833 nCoV-2019_55_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 16748 16770 nCoV-2019_56_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 17130 17152 nCoV-2019_56_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 17065 17087 nCoV-2019_57_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 17430 17452 nCoV-2019_57_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 17381 17406 nCoV-2019_58_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 17738 17761 nCoV-2019_58_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 17674 17697 nCoV-2019_59_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 18036 18062 nCoV-2019_59_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 17966 17993 nCoV-2019_60_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 18324 18348 nCoV-2019_60_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 18253 18275 nCoV-2019_61_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 18650 18672 nCoV-2019_61_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 18596 18618 nCoV-2019_62_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 18957 18979 nCoV-2019_62_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 18896 18918 nCoV-2019_63_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 19275 19297 nCoV-2019_63_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 19204 19232 nCoV-2019_64_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 19591 19616 nCoV-2019_64_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 19548 19570 nCoV-2019_65_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 19911 19939 nCoV-2019_65_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 19844 19866 nCoV-2019_66_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 20231 20255 nCoV-2019_66_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 20172 20200 nCoV-2019_67_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 20542 20572 nCoV-2019_67_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 20472 20496 nCoV-2019_68_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 20867 20890 nCoV-2019_68_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 20786 20813 nCoV-2019_69_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 21146 21169 nCoV-2019_69_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 21075 21104 nCoV-2019_70_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 21427 21455 nCoV-2019_70_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 21357 21386 nCoV-2019_71_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 21716 21743 nCoV-2019_71_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 21658 21682 nCoV-2019_72_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 22013 22038 nCoV-2019_72_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 21961 21990 nCoV-2019_73_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 22324 22346 nCoV-2019_73_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 22262 22290 nCoV-2019_74_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 22626 22650 nCoV-2019_74_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 22516 22542 nCoV-2019_75_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 22877 22903 nCoV-2019_75_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 22797 22819 nCoV-2019_76_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 22798 22821 nCoV-2019_76_LEFT_alt3 nCoV-2019_2 +MN908947.3 23192 23214 nCoV-2019_76_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 23189 23212 nCoV-2019_76_RIGHT_alt0 nCoV-2019_2 +MN908947.3 23122 23144 nCoV-2019_77_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 23500 23522 nCoV-2019_77_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 23443 23466 nCoV-2019_78_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 23822 23847 nCoV-2019_78_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 23789 23812 nCoV-2019_79_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 24145 24169 nCoV-2019_79_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 24078 24100 nCoV-2019_80_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 24443 24467 nCoV-2019_80_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 24391 24416 nCoV-2019_81_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 24765 24789 nCoV-2019_81_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 24696 24721 nCoV-2019_82_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 25052 25076 nCoV-2019_82_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 24978 25003 nCoV-2019_83_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 25347 25369 nCoV-2019_83_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 25279 25301 nCoV-2019_84_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 25646 25673 nCoV-2019_84_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 25601 25623 nCoV-2019_85_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 25969 25994 nCoV-2019_85_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 25902 25924 nCoV-2019_86_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 26290 26315 nCoV-2019_86_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 26197 26219 nCoV-2019_87_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 26566 26590 nCoV-2019_87_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 26520 26542 nCoV-2019_88_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 26890 26913 nCoV-2019_88_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 26835 26857 nCoV-2019_89_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 26838 26860 nCoV-2019_89_LEFT_alt2 nCoV-2019_1 +MN908947.3 27202 27227 nCoV-2019_89_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 27190 27215 nCoV-2019_89_RIGHT_alt4 nCoV-2019_1 +MN908947.3 27141 27164 nCoV-2019_90_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 27511 27533 nCoV-2019_90_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 27446 27471 nCoV-2019_91_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 27825 27854 nCoV-2019_91_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 27784 27808 nCoV-2019_92_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 28145 28172 nCoV-2019_92_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 28081 28104 nCoV-2019_93_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 28442 28464 nCoV-2019_93_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 28394 28416 nCoV-2019_94_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 28756 28779 nCoV-2019_94_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 28677 28699 nCoV-2019_95_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 29041 29063 nCoV-2019_95_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 28985 29007 nCoV-2019_96_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 29356 29378 nCoV-2019_96_RIGHT nCoV-2019_2 +MN908947.3 29288 29316 nCoV-2019_97_LEFT nCoV-2019_1 +MN908947.3 29665 29693 nCoV-2019_97_RIGHT nCoV-2019_1 +MN908947.3 29486 29510 nCoV-2019_98_LEFT nCoV-2019_2 +MN908947.3 29836 29866 nCoV-2019_98_RIGHT nCoV-2019_2