Mercurial > repos > iuc > bcftools_annotate
directory /test-data/ @ 23:2c372041ed8c draft default tip
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|---|---|---|
| [up] | drwxr-xr-x | |
 test-cache/
|
drwxr-xr-x | |
 23andme.fa
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287 | -rw-r--r-- |
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annotate.hdr
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259 | -rw-r--r-- |
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annotate.tab
|
700 | -rw-r--r-- |
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annotate.vcf
|
2649 | -rw-r--r-- |
|
annotate2.tab
|
82 | -rw-r--r-- |
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annotate2.vcf
|
1115 | -rw-r--r-- |
|
annotate3.vcf
|
1181 | -rw-r--r-- |
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annots.bcf
|
1254 | -rw-r--r-- |
|
annots.vcf
|
2646 | -rw-r--r-- |
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annots2.vcf
|
1154 | -rw-r--r-- |
|
check.vcf
|
2692 | -rw-r--r-- |
|
cnv.vcf
|
16703 | -rw-r--r-- |
|
cnv_baf_only.vcf
|
9148 | -rw-r--r-- |
|
cnv_pairwise_summary.tab
|
198 | -rw-r--r-- |
|
cnv_summary.tab
|
182 | -rw-r--r-- |
|
color_chrs.dat
|
210 | -rw-r--r-- |
|
color_chrs_unrelated.dat
|
213 | -rw-r--r-- |
|
concat.1.a.vcf
|
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concat.1.b.vcf
|
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concat.2.a.vcf
|
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concat.2.b.vcf
|
1194 | -rw-r--r-- |
|
consensus.fa
|
1031 | -rw-r--r-- |
|
consensus.tab
|
31 | -rw-r--r-- |
|
consensus.vcf
|
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|
convert.23andme
|
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|
convert.gs.gt.gen
|
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|
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|
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|
9300 | -rw-r--r-- |
|
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|
1402 | -rw-r--r-- |
|
convert.hls.gt.legend
|
986 | -rw-r--r-- |
|
convert.hls.gt.samples
|
288 | -rw-r--r-- |
|
convert.hs.gt.hap
|
2893 | -rw-r--r-- |
|
convert.hs.gt.samples
|
204 | -rw-r--r-- |
|
convert.vcf
|
7966 | -rw-r--r-- |
|
csq.fa
|
1840 | -rw-r--r-- |
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csq.gff3
|
2529 | -rw-r--r-- |
|
csq.vcf
|
3316 | -rw-r--r-- |
|
fasta_indexes.loc
|
324 | -rw-r--r-- |
|
filter.1.vcf
|
2308 | -rw-r--r-- |
|
filter.2.vcf
|
2472 | -rw-r--r-- |
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filter.3.vcf
|
3676 | -rw-r--r-- |
|
fixploidy.ploidy
|
198 | -rw-r--r-- |
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fixploidy.samples
|
12 | -rw-r--r-- |
|
fixploidy.vcf
|
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gvcf.fa
|
472 | -rw-r--r-- |
|
isec.a.vcf
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isec.b.vcf
|
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merge.2.a.vcf
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merge.2.b.vcf
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1934 | -rw-r--r-- |
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merge.3.a.vcf
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merge.3.b.vcf
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merge.4.a.vcf
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merge.4.b.vcf
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2228 | -rw-r--r-- |
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merge.a.vcf
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merge.b.vcf
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merge.c.vcf
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3212 | -rw-r--r-- |
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mpileup.1.bam
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mpileup.2.bam
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mpileup.2.bam.bai
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96 | -rw-r--r-- |
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mpileup.3.bam
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mpileup.3.bam.bai
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96 | -rw-r--r-- |
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mpileup.3.cram
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mpileup.ploidy
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mpileup.ref.fa
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4284 | -rw-r--r-- |
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mpileup.samples
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mpileup.vcf
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norm.fa
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1167 | -rw-r--r-- |
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norm.merge.vcf
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norm.vcf
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plugin2.vcf
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plugin_frameshifts.bed
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18 | -rw-r--r-- |
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query.out
|
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query.vcf
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reheader.hdr
|
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reheader.samples
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reheader.samples2
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reheader.vcf
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roh.vcf
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stats.a.vcf
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stats.b.vcf
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379 | -rw-r--r-- |
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summary.pdf
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65152 | -rw-r--r-- |
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targets_file.tab
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9 | -rw-r--r-- |
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view.GL.vcf
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view.bcf
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2384 | -rw-r--r-- |
|
view.vcf
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5506 | -rw-r--r-- |