comparison test-data/concat.3.b.vcf @ 0:5add48c63b9a draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/bcftools commit ef90c4602bdb83ea7455946c9d175ea27284e643
author iuc
date Wed, 06 Jul 2016 07:04:14 -0400
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:5add48c63b9a
1 ##fileformat=VCFv4.0
2 ##INFO=<ID=T1,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
3 ##INFO=<ID=T2,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
4 ##INFO=<ID=T3,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
5 ##INFO=<ID=T4,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
6 ##INFO=<ID=T5,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
7 ##INFO=<ID=T6,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
8 ##INFO=<ID=T7,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
9 ##INFO=<ID=T8,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
10 ##INFO=<ID=T9,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
11 ##INFO=<ID=T10,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
12 ##INFO=<ID=T11,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
13 ##INFO=<ID=T12,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
14 ##INFO=<ID=T13,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
15 ##INFO=<ID=T14,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
16 ##INFO=<ID=T15,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
17 ##INFO=<ID=T16,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
18 ##INFO=<ID=T17,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
19 ##INFO=<ID=T18,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
20 ##INFO=<ID=T19,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
21 ##INFO=<ID=T20,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
22 ##INFO=<ID=T21,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
23 ##INFO=<ID=T22,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
24 ##INFO=<ID=T23,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
25 ##INFO=<ID=T24,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
26 ##INFO=<ID=T25,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
27 ##INFO=<ID=T26,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
28 ##INFO=<ID=T27,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
29 ##INFO=<ID=T28,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
30 ##INFO=<ID=T29,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
31 ##INFO=<ID=T30,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
32 ##INFO=<ID=T31,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
33 ##INFO=<ID=T32,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
34 ##INFO=<ID=T33,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
35 ##INFO=<ID=T34,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
36 ##INFO=<ID=T35,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
37 ##INFO=<ID=T36,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
38 ##INFO=<ID=T37,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
39 ##INFO=<ID=T38,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
40 ##INFO=<ID=T39,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
41 ##INFO=<ID=T40,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
42 ##INFO=<ID=T41,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
43 ##INFO=<ID=T42,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
44 ##INFO=<ID=T43,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
45 ##INFO=<ID=T44,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
46 ##INFO=<ID=T45,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
47 ##INFO=<ID=T46,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
48 ##INFO=<ID=T47,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
49 ##INFO=<ID=T48,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
50 ##INFO=<ID=T49,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
51 ##INFO=<ID=T50,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
52 ##INFO=<ID=T51,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
53 ##INFO=<ID=T52,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
54 ##INFO=<ID=T53,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
55 ##INFO=<ID=T54,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
56 ##INFO=<ID=T55,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
57 ##INFO=<ID=T56,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
58 ##INFO=<ID=T57,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
59 ##INFO=<ID=T58,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
60 ##INFO=<ID=T59,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
61 ##INFO=<ID=T60,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
62 ##INFO=<ID=T61,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
63 ##INFO=<ID=T62,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
64 ##INFO=<ID=T63,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
65 ##INFO=<ID=T64,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
66 ##INFO=<ID=T65,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
67 ##INFO=<ID=T66,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
68 ##INFO=<ID=T67,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
69 ##INFO=<ID=T68,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
70 ##INFO=<ID=T69,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
71 ##INFO=<ID=T70,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
72 ##INFO=<ID=T71,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
73 ##INFO=<ID=T72,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
74 ##INFO=<ID=T73,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
75 ##INFO=<ID=T74,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
76 ##INFO=<ID=T75,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
77 ##INFO=<ID=T76,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
78 ##INFO=<ID=T77,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
79 ##INFO=<ID=T78,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
80 ##INFO=<ID=T79,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
81 ##INFO=<ID=T80,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
82 ##INFO=<ID=T81,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
83 ##INFO=<ID=T82,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
84 ##INFO=<ID=T83,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
85 ##INFO=<ID=T84,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
86 ##INFO=<ID=T85,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
87 ##INFO=<ID=T86,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
88 ##INFO=<ID=T87,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
89 ##INFO=<ID=T88,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
90 ##INFO=<ID=T89,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
91 ##INFO=<ID=T90,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
92 ##INFO=<ID=T91,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
93 ##INFO=<ID=T92,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
94 ##INFO=<ID=T93,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
95 ##INFO=<ID=T94,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
96 ##INFO=<ID=T95,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
97 ##INFO=<ID=T96,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
98 ##INFO=<ID=T97,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
99 ##INFO=<ID=T98,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
100 ##INFO=<ID=T99,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
101 ##INFO=<ID=T100,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
102 ##INFO=<ID=T101,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
103 ##INFO=<ID=T102,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
104 ##INFO=<ID=T103,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
105 ##INFO=<ID=T104,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
106 ##INFO=<ID=T105,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
107 ##INFO=<ID=T106,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
108 ##INFO=<ID=T107,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
109 ##INFO=<ID=T108,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
110 ##INFO=<ID=T109,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
111 ##INFO=<ID=T110,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
112 ##INFO=<ID=T111,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
113 ##INFO=<ID=T112,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
114 ##INFO=<ID=T113,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
115 ##INFO=<ID=T114,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
116 ##INFO=<ID=T115,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
117 ##INFO=<ID=T116,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
118 ##INFO=<ID=T117,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
119 ##INFO=<ID=T118,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
120 ##INFO=<ID=T119,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
121 ##INFO=<ID=T120,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
122 ##INFO=<ID=T121,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
123 ##INFO=<ID=T122,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
124 ##INFO=<ID=T123,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
125 ##INFO=<ID=T124,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
126 ##INFO=<ID=T125,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
127 ##INFO=<ID=T126,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
128 ##INFO=<ID=T127,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
129 ##INFO=<ID=T128,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
130 ##INFO=<ID=T129,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
131 ##INFO=<ID=T130,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
132 ##INFO=<ID=T131,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
133 ##INFO=<ID=T132,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
134 ##INFO=<ID=T133,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
135 ##INFO=<ID=T134,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
136 ##INFO=<ID=T135,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
137 ##INFO=<ID=T136,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
138 ##INFO=<ID=T137,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
139 ##INFO=<ID=T138,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
140 ##INFO=<ID=T139,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
141 ##INFO=<ID=T140,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
142 ##INFO=<ID=T141,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
143 ##INFO=<ID=T142,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
144 ##INFO=<ID=T143,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
145 ##INFO=<ID=T144,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
146 ##INFO=<ID=T145,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
147 ##INFO=<ID=T146,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
148 ##INFO=<ID=T147,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
149 ##INFO=<ID=T148,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
150 ##INFO=<ID=T149,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
151 ##INFO=<ID=T150,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
152 ##INFO=<ID=T151,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
153 ##INFO=<ID=T152,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
154 ##INFO=<ID=T153,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
155 ##INFO=<ID=T154,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
156 ##INFO=<ID=T155,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
157 ##INFO=<ID=T156,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
158 ##INFO=<ID=T157,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
159 ##INFO=<ID=T158,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
160 ##INFO=<ID=T159,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
161 ##INFO=<ID=T160,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
162 ##INFO=<ID=T161,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
163 ##INFO=<ID=T162,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
164 ##INFO=<ID=T163,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
165 ##INFO=<ID=T164,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
166 ##INFO=<ID=T165,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
167 ##INFO=<ID=T166,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
168 ##INFO=<ID=T167,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
169 ##INFO=<ID=T168,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
170 ##INFO=<ID=T169,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
171 ##INFO=<ID=T170,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
172 ##INFO=<ID=T171,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
173 ##INFO=<ID=T172,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
174 ##INFO=<ID=T173,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
175 ##INFO=<ID=T174,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
176 ##INFO=<ID=T175,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
177 ##INFO=<ID=T176,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
178 ##INFO=<ID=T177,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
179 ##INFO=<ID=T178,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
180 ##INFO=<ID=T179,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
181 ##INFO=<ID=T180,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
182 ##INFO=<ID=T181,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
183 ##INFO=<ID=T182,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
184 ##INFO=<ID=T183,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
185 ##INFO=<ID=T184,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
186 ##INFO=<ID=T185,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
187 ##INFO=<ID=T186,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
188 ##INFO=<ID=T187,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
189 ##INFO=<ID=T188,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
190 ##INFO=<ID=T189,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
191 ##INFO=<ID=T190,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
192 ##INFO=<ID=T191,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
193 ##INFO=<ID=T192,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
194 ##INFO=<ID=T193,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
195 ##INFO=<ID=T194,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
196 ##INFO=<ID=T195,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
197 ##INFO=<ID=T196,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
198 ##INFO=<ID=T197,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
199 ##INFO=<ID=T198,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
200 ##INFO=<ID=T199,Number=1,Type=Integer,Description="Test Tag: Big header">
201 ##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total Depth">
202 ##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
203 ##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
204 ##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth">
205 ##FILTER=<ID=q10,Description="Quality below 10">
206 ##contig=<ID=2,length=62435964>
207 #CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT A B
208 2 170 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
209 2 180 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
210 2 190 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
211 2 200 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
212 2 210 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
213 2 220 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
214 2 230 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
215 2 240 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
216 2 250 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
217 2 260 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
218 2 270 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
219 2 280 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
220 2 290 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
221 2 300 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
222 2 310 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1
223 2 320 . T A 246 PASS DP=10 GT 1|0 0|1