Mercurial > repos > iuc > bcftools_stats
directory /test-data/ @ 18:388983871932 draft
name | size | permissions |
---|---|---|
[up] | drwxr-xr-x | |
test-cache/ | drwxr-xr-x | |
23andme.fa | 287 | -rw-r--r-- |
annotate.hdr | 259 | -rw-r--r-- |
annotate.tab | 700 | -rw-r--r-- |
annotate.vcf | 2649 | -rw-r--r-- |
annotate2.tab | 82 | -rw-r--r-- |
annotate2.vcf | 1115 | -rw-r--r-- |
annotate3.vcf | 1181 | -rw-r--r-- |
annots.bcf | 1254 | -rw-r--r-- |
annots.vcf | 2646 | -rw-r--r-- |
annots2.vcf | 1154 | -rw-r--r-- |
check.vcf | 2692 | -rw-r--r-- |
cnv.vcf | 16703 | -rw-r--r-- |
cnv_baf_only.vcf | 9148 | -rw-r--r-- |
cnv_pairwise_summary.tab | 198 | -rw-r--r-- |
cnv_summary.tab | 182 | -rw-r--r-- |
color_chrs.dat | 210 | -rw-r--r-- |
color_chrs_unrelated.dat | 213 | -rw-r--r-- |
concat.1.a.vcf | 1774 | -rw-r--r-- |
concat.1.b.vcf | 1136 | -rw-r--r-- |
concat.2.a.vcf | 743 | -rw-r--r-- |
concat.2.b.vcf | 1194 | -rw-r--r-- |
consensus.fa | 1031 | -rw-r--r-- |
consensus.tab | 31 | -rw-r--r-- |
consensus.vcf | 660 | -rw-r--r-- |
convert.23andme | 440 | -rw-r--r-- |
convert.gs.gt.gen | 3236 | -rw-r--r-- |
convert.gs.gt.samples | 204 | -rw-r--r-- |
convert.gvcf.vcf | 9300 | -rw-r--r-- |
convert.hls.gt.hap | 1402 | -rw-r--r-- |
convert.hls.gt.legend | 986 | -rw-r--r-- |
convert.hls.gt.samples | 288 | -rw-r--r-- |
convert.hs.gt.hap | 2893 | -rw-r--r-- |
convert.hs.gt.samples | 204 | -rw-r--r-- |
convert.vcf | 7966 | -rw-r--r-- |
csq.fa | 1840 | -rw-r--r-- |
csq.gff3 | 2529 | -rw-r--r-- |
csq.vcf | 3316 | -rw-r--r-- |
fasta_indexes.loc | 324 | -rw-r--r-- |
filter.1.vcf | 2308 | -rw-r--r-- |
filter.2.vcf | 2472 | -rw-r--r-- |
filter.3.vcf | 3676 | -rw-r--r-- |
fixploidy.ploidy | 198 | -rw-r--r-- |
fixploidy.samples | 12 | -rw-r--r-- |
fixploidy.vcf | 1131 | -rw-r--r-- |
gvcf.fa | 472 | -rw-r--r-- |
isec.a.vcf | 1731 | -rw-r--r-- |
isec.b.vcf | 1797 | -rw-r--r-- |
merge.2.a.vcf | 1933 | -rw-r--r-- |
merge.2.b.vcf | 1934 | -rw-r--r-- |
merge.3.a.vcf | 1667 | -rw-r--r-- |
merge.3.b.vcf | 1672 | -rw-r--r-- |
merge.4.a.vcf | 2269 | -rw-r--r-- |
merge.4.b.vcf | 2228 | -rw-r--r-- |
merge.a.vcf | 2491 | -rw-r--r-- |
merge.b.vcf | 3272 | -rw-r--r-- |
merge.c.vcf | 3212 | -rw-r--r-- |
mpileup.1.bam | 67789 | -rw-r--r-- |
mpileup.1.bam.bai | 96 | -rw-r--r-- |
mpileup.2.bam | 27928 | -rw-r--r-- |
mpileup.2.bam.bai | 96 | -rw-r--r-- |
mpileup.3.bam | 27569 | -rw-r--r-- |
mpileup.3.bam.bai | 96 | -rw-r--r-- |
mpileup.3.cram | 19643 | -rw-r--r-- |
mpileup.AD.vcf | 1001357 | -rw-r--r-- |
mpileup.X.vcf | 643355 | -rw-r--r-- |
mpileup.ploidy | 49 | -rw-r--r-- |
mpileup.ref.fa | 4284 | -rw-r--r-- |
mpileup.samples | 30 | -rw-r--r-- |
mpileup.vcf | 647534 | -rw-r--r-- |
norm.fa | 1167 | -rw-r--r-- |
norm.merge.vcf | 5435 | -rw-r--r-- |
norm.setref.vcf | 2959 | -rw-r--r-- |
norm.split.vcf | 4803 | -rw-r--r-- |
norm.vcf | 5015 | -rw-r--r-- |
plugin1.vcf | 2269 | -rw-r--r-- |
plugin2.vcf | 5940 | -rw-r--r-- |
plugin_frameshifts.bed | 18 | -rw-r--r-- |
query.out | 536 | -rw-r--r-- |
query.vcf | 2312 | -rw-r--r-- |
reheader.hdr | 1008 | -rw-r--r-- |
reheader.samples | 8 | -rw-r--r-- |
reheader.samples2 | 24 | -rw-r--r-- |
reheader.vcf | 3917 | -rw-r--r-- |
roh.vcf | 298067 | -rw-r--r-- |
stats.a.vcf | 379 | -rw-r--r-- |
stats.b.vcf | 379 | -rw-r--r-- |
summary.pdf | 65152 | -rw-r--r-- |
view.GL.vcf | 1959 | -rw-r--r-- |
view.bcf | 2384 | -rw-r--r-- |
view.vcf | 5506 | -rw-r--r-- |