# HG changeset patch
# User iuc
# Date 1713024611 0
# Node ID 18d7d8582206bada534b8b49b42282cdae6e892a
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/chewbbaca commit 8722918e903ffa4229e0297555731f1172f736c6
diff -r 000000000000 -r 18d7d8582206 DownloadSchema.xml
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/DownloadSchema.xml Sat Apr 13 16:10:11 2024 +0000
@@ -0,0 +1,83 @@
+
+ Download a schema from Chewie-NS
+
+ macros.xml
+
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+
+chewBBACA is a software suite for the creation and evaluation of core genome and whole genome MultiLocus Sequence Typing (cg/wgMLST) schemas and results.
+
+The DownloadSchema module enables the download of schemas from the Chewie-NS server.
+
+
+.. class:: infomark
+
+**Note**
+
+The output schema files are in a zip file. This file can be used as input for other chewBBACA tools.
+
+-----
+
+Compressed versions of every schema in the Chewie-NS are also available for download:
+ - through the `Chewie-NS public website`_
+ - through the (/species/{species_id}/schemas/{schema_id}/zip) API endpoint in Swagger_
+ - with a simple curl command (e.g.: curl -X GET "https://chewbbaca.online/NS/api/species/9/schemas/1/zip?request_type=download" -H "accept: application/json")
+
+.. _Chewie-NS public website: https://chewbbaca.online/
+.. _Swagger: https://chewbbaca.online/api/NS/api/docs
+
+
+
\ No newline at end of file
diff -r 000000000000 -r 18d7d8582206 macros.xml
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/macros.xml Sat Apr 13 16:10:11 2024 +0000
@@ -0,0 +1,48 @@
+
+ 3.3.3
+ 0
+ 22.05
+
+
+ chewbbaca
+ blast
+ zip
+ fasttree
+
+
+
+
+
+ 10.1099/mgen.0.000166
+
+
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+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+ --bsr $blast_score_ratio
+ --l $minimum_length
+ --t $translation_table
+ --st $size_threshold
+
+
+
+
+
+
+
diff -r 000000000000 -r 18d7d8582206 test-data/CDS_Str_agalactiae.fasta
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/CDS_Str_agalactiae.fasta Sat Apr 13 16:10:11 2024 +0000
@@ -0,0 +1,28 @@
+>FJ801036.1 Streptococcus agalactiae strain ABC020023529 BibA gene, complete cds
+ATGAATAATAACGAAAAAAAAGTAAAATACTTTTTAAGAAAAACAGCTTATGGTTTGGCTTCAATGTCAG
+CGGCGTTTATAGTATGTAGTGGTATTGTAAATACTCCTACAGTGTCTGCTGATAGTCCTGATACATTAAA
+AGTCGAAAAATTAGGCAAATTGAAAGATGTGAAATCAGTTCATGAACTCACACCCATATCAATACCGAAC
+GAATTAAAAGGTGCTAAAGAGCAAGCACTTTCTTCAATAATTTCACATCCTAATATAACTAATTCGGAAG
+TAGACAAACTAGCTAGTGACTATAGTTTTAGAATTAATACATCTAATGATGTGAACGACGTTAAACGTCT
+ATTAAATGAATTTTATAACGCAGTTGCAAGGAAACAGTTAGATACAAATTCTGCTGACTACCGTAGTAAA
+ATTGATAATATCAGTACTACAGGTCTTGCGATAGCTCTTGAGGCTAAAGAAATTTATGAAGCAAATAAAT
+CTATATTACCTCATCGTTACAAAGATTCTGTTGGAACTTATGTGAACAGTTTTGAGGAAAGACGAAGTCC
+AGGAAAATTTAATATTTGGAATGGTCAGGAAGGATTTAATGCAGCTCAAAAATTGTTAGAAGATGTTAAA
+AAATTATTACTTGAGCTACAAAATTTAACAAAAAATAACAAACCAAATATTCAAGTACCTAAACAAGCAC
+CTACAGAAGCTGCAAAACCAGCTTTGTCACCAGAAGCCTTGACAAGATTGACTACATGGTATAATCAAGC
+TAAAGATCTGCTTAAAGATGATCAAGTAAAGGACAAATACGTAGATATACTTTCAGTTCAAAAAGCTGTT
+GACCAAGCTTATGATCATGTGGAAGAGGGAAAATTTATTACCACTGATCAAGCAAATCAATTAGCTAACA
+AGCTACGTGATGCTTTACAAAGTTTAGAATTAAAAGATAAAAAAGTAGCCAAACCAGTAGCTAAAGGTAC
+ATACGATGTTAAGTATGTAGACACAGAAGGAAAAGAAGTAGCTAAGTCACGTCACTTCGAAGGAGAAGAA
+GGCGCAGCTTTTGTCACTTCAGCGAAAGAAGTAGCGGGTTACAAACTTGTTAGAACGGAAGGCGCTGTTT
+CAAATGTCTTCACAGCAGGAGCACAAGTACGTACATATGTTTACGAAAAAGTAGCCAAACCAGTAGCTAA
+AGGTACATACGATGTTAAGTATGTAGACACAGAAGGAAAAGAAGTAGCTAAGTCGCGTCACTTCGAAGGA
+GAAGAAGGCGCAGCTTTTGTCACTTCAGCGAAAGAAGTAGCGGGTTACAAACTTGTTAGAACGGAAGGTG
+CTGTTTCAAATGTCTTCACAGCAGGAGCACAAGTACGTACATATGTTTACGAAAAAGTTAAACCAGAAGT
+TAAACCAGACGTTAAGCCAGAGGCCAAACCAGAGGCTAAGCCAGAAGTTAAACCAGACGTTAAGCCAGAG
+GCCAAACCAGAGGCTAAGCCAGAAGTTAAATCAGACGTTAAGCCAGAGGCTAAGCCAGAAGCCAAACCAG
+AGGCTAAACCAGAAGTTAAACCAGACGTTAAGCCAGAGGCTAAACCAGAAGCCAAGCCAGCAACCAAAAA
+ATCGGTTAATACTAGCGGAAACTTGGTGGCTAAAAAAGCTATTGAAAACAAAAAGTATAGTAAAAAATTA
+CCATCAACGGGTGAAGCCGCAAGTCCACTCTTAGCAATTGTATCACTAATTGTTATGTTAAGTGCAGGTC
+TTATTACGATAGTTTTAAAGCATAAAAAAAATTAA
+
diff -r 000000000000 -r 18d7d8582206 test-data/GCA_000007265.1_ASM726v1_genomic.fna
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/GCA_000007265.1_ASM726v1_genomic.fna Sat Apr 13 16:10:11 2024 +0000
@@ -0,0 +1,1500 @@
+>AE009948.1 Streptococcus agalactiae 2603V/R, complete genome
+AATTAACATTGTTGATTTTATTCTTCAACATCTGTGGAAAACTTTATTTTTTTATGGTACAATATAACAATAATTATCCA
+CAAGACAATAAGGAAGAAGCTATGACGGAAAACGAACAACTATTTTGGAATAGAGTACTAGAGCTATCTCGTTCTCAAAT
+AGCACCAGCAGCTTATGAATTTTTTGTTCTAGAGGCTAGACTCCTCAAAATTGAACATCAAACTGCAGTTATTACTTTAG
+ATAACATTGAAATGAAAAAGCTATTCTGGGAACAAAATTTGGGGCCTGTTATCCTAACAGCTGGTTTTGAAATTTTCAAT
+GCTGAAATTACAGCTAACTATGTCTCAAACGATTTACATTTACAAGAAACTAGTTTTTCTAACTACCAGCAATCTAGCAA
+TGAAGTAAATACTTTACCAATTAGAAAAATCGACTCTAACCTTAAAGAGAAATATACTTTTGCTAATTTTGTTCAAGGAG
+ATGAAAATAGATGGGCTGTTTCAGCATCAATTGCTGTAGCTGATAGTCCTGGCACGACTTATAATCCTCTATTTATCTGG
+GGGGGACCTGGTCTAGGAAAGACGCATCTACTAAATGCTATTGGAAATCAAGTCTTAAGAGATAATCCAAACGCGAGGGT
+TTTATACATCACTGCTGAGAATTTTATTAATGAATTTGTCAGTCATATTCGTTTAGATTCGATGGAAGAATTAAAAGAAA
+AGTTTCGCAACTTAGACTTACTCCTGATTGATGATATTCAGTCGCTTGCTAAGAAAACCTTAGGGGGGACCCAAGAGGAG
+TTCTTCAATACTTTCAATGCTTTACATACAAACGATAAACAAATCGTATTGACCAGTGACCGAAATCCAAATCAATTAAA
+TGATCTAGAAGAACGTCTAGTCACGCGCTTTAGTTGGGGACTCCCAGTAAATATCACACCACCTGATTTTGAAACACGAG
+TTGCTATTTTAACCAATAAAATTCAAGAATATCCTTATGATTTTCCTCAAGATACCATTGAATACTTAGCAGGAGAATTT
+GATTCCAACGTACGTGAATTAGAAGGAGCCTTGAAAAATATTAGTCTAGTTGCTGACTTTAAGCATGCTAAAACTATTAC
+AGTAGATATAGCTGCAGAAGCTATCAGAGCACGTAAAAATGATGGTCCTATTGTTACTGTCATTCCTATAGAAGAAATTC
+AAATACAAGTTGGTAAATTCTATGGCGTAACTGTAAAAGAGATAAAAGCAACTAAAAGAACACAAGATATTGTCCTTGCA
+AGACAGGTAGCCATGTACTTAGCTCGTGAGATGACAGATAACAGTCTCCCAAAAATAGGTAAAGAATTTGGGGGACGAGA
+TCACTCAACTGTTCTCCACGCTTATAATAAAATAAAAAATATGGTTGCTCAAGATGACAACTTACGAATTGAGATAGAAA
+CTATCAAAAATAAAATCAGATAGGCTTTGTGGATAAGTATCAGAAAAATACGAGACTTTTCCACAGGTTGTGAACAAGTT
+ATTTTCCTTATGAATATTAAAGTTATAATACTTATTCACAACTTTAACAGGACCTACTATTACTACTAAATTTATACTAA
+TATATAAAGGATATACTATGATTCATTTTTCAATAAATAAAAATTTCTTCTTGCATGCTCTAACGGTAACCAAACGAGCT
+ATTAGTCATAAAAATGCGATTCCAATCCTTTCAACTGTTAAAATAGAAGTGACTAGGGATGCTATCATTTTAACGGGGTC
+AAATGGACAAATTTCAATTGAAAATACTATTCCTGCTTCAAATGAAAATGCAGGTTTACTAGTAACGAATCCAGGCTCTA
+TTTTGTTAGAAGCTGGTTTCTTTATTAATATTATTTCAAGTTTACCAGATGTAACTTTAGAATTTACAGAGATTGAACAA
+CATCAAATTGTTCTTACTAGTGGAAAATCAGAGATTACTTTGAAAGGTAAGGATGTCGATCAATACCCTCGTCTGCAGGA
+AATGACAACAGATACTCCATTAACATTAGAAACTAAACTGTTAAAATCAATTATTAATGAAACTGCTTTTGCTGCTAGCC
+AACAAGAAAGCCGTCCAATCTTAACAGGTGTTCATTTGGTTATCAGTCAAAATAAATACTTTAAGGCTGTTGCGACAGAT
+TCACACCGTATGAGTCAACGCACTTTCCAATTAGAGAAATCGGCTAATAATTTTGATTTGGTTGTTCCAAGTAAATCCCT
+TCGAGAATTTTCGGCTGTTTTTACAGATGATATTGAAACTGTAGAGGTTTTCTTCTCAGATAGTCAAATGTTATTTAGAA
+GTGAAAATATCAGCTTCTATACACGTTTGCTTGAAGGAAACTACCCTGATACTGATCGCCTCCTAACTAATCAGTTTGAA
+ACCGAAATTATCTTTAATACAAATGCTTTACGCCATGCTATGGAACGTGCTTATTTAATTTCGAATGCAACTCAGAACGG
+TACTGTTCGTTTAGAAATTCAAAATGAGACAGTCTCAGCTCATGTAAACTCTCCAGAAGTTGGTAAAGTTAATGAGGAAT
+TGGATACTGTTAGTCTTAAAGGTGATAGTTTAAATATTAGCTTTAATCCAACTTACCTAATTGAATCTTTAAAAGCAGTA
+AAAAGCGAAACAGTTACGATTCGATTTATTTCTCCAGTACGTCCATTTACTTTGACACCTGGTGAAGATACTGAAGATTT
+CATCCAATTAATAACTCCTGTTCGTACTAACTAAATAAGAAAACTACCCAAGTTATTCTTGGGTAGTTTTCTTATTCTAA
+GATATGCTATAATGATGAGTAATATGACTCTATATATAATAGCTAACCCCCATGCTGGTAATAAAAATGCCTCCACTATT
+GTTGGTAAAATTCAGGAGCTTTATCATACTGAAGATATTTCTGTGTTCTATACAGAACAGAAAGATGATGAAAAAAAACA
+AGTCATTAATATACTAAGGTCTTTTAAAGAAAGTGATCATCTAATGATTATAGGAGGAGATGGTACCTTATCAAAAGTAA
+TGACTTATCTCCCCCAACATATTCCGTGCACTTATTATCCTGTTGGTTCGGGAAATGATTTTGCCAGAGCTTTGAAAATT
+CCTAACCTCAAAGAAACCCTTACCGCTATTCAGACAGAAAGATTAAAGGAAATTAATTGCTTTATTTATGATAAAGGGCT
+GATTTTGAATAGTTTAGATTTAGGTTTTGCAGCCTATGTCGTTTGGAAAGCATCTAACTCTAAAATAAAAAATATTTTGA
+ATAGATATCGTCTAGGAAAAATAACTTACATTGTTATAGCTATCAAATCATTATTACATTCTTCTAAAGTACAAGTATTA
+GTGGAAGGAGAGACAGGACAGCAGATAAAACTAAATGACCTTTATTTTTTCGCATTAGCAAATAACACTTATTTTGGAGG
+TGGCATTACTATTTGGCCTAAAGCAAGTGCTTTAACTGCAGAGTTAGATATGGTTTACGCTAAAGGGCATACTTTTCTAA
+AACGATTAAGTATTTTATTATCTTTGGTTTTTAAAAGGCATACTACCTCTAAAAGTATAAAACACCAGACTTTCAAAGCT
+ATGACCGTATATTTTCCTAAAAATAGTTTGATTGAAATAGATGGCGAAATAGTTGAGTTAGATCAGATTAGTTTAAAATG
+TCAAAAAAGGTATTTATATATGTAAGGAGAAAAGATGTATCAAGTTGGATCACTTGTTGAAATGAAAAAACCTCATGCTT
+GTGTAATTAAAGAAACTGGTAAAAAGGCTAATCAATGGAAGGTACTGAGAGTAGGAGCTGATATTAAAATTCAGTGTACT
+AACTGTCAGCATGTGATTATGATGAGTCGTTATGATTTTGAGCGAAAATTAAAAAAAGTACTGCAACCATGAAAGTCCTT
+TTAAACAAATAATTATAGCTATATTTGCAACCAATACTTTCCTAAATAATGCTAGTATGCCGTTGGAAAATTAGCTATTC
+TAATGTTATCGAAAGAAGAAAGGTGGTCATTGACAATGACGAAAGTTGCAGAACAGTTATTTATTTTTCGGTAAGTCATA
+TCAAAATGGGAAAATGGGGATACCACACCAGATTTGGATAATTTAATCAGGTTAGCTGAGATTTTTGACGTGAGCTTAGA
+TGAACATGTTTTAGCTAAAACAAATGAAGTTAAAGTTGAACGTATTTATGAAAATAAACCCCTTGATCTACGAAAATACA
+ATAAAATTTATTGGTTTATTTTTCGAAATATTATTCGATCTCTACTAATTATTTTAGCTATATTAACTTTCTTATAAGCT
+CTAGGTATTCCCTTTGTTTCGGAGTGGATAATTTAAATGAAGGTGAAAGAGTGGCATAATGATAAGCAAATCTGAAATTT
+TCTTCTTATCATACCGCTTTTTCTTCTATTTTTTGATATAATAGTCTTGATTGAAATTTGAATGGAGACTCACTAAATGG
+CTTTAACAGCAGGTATTGTAGGCTTACCAAATGTTGGTAAATCAACTTTATTTAACGCAATTACAAAAGCAGGAGCAGAA
+GCTGCTAATTATCCTTTTGCGACTATTGATCCCAATGTTGGTATGGTAGAAGTACCAGATGAGCGTCTACAAAAATTGAC
+AGAATTGATTACGCCTAAAAAAACAGTTCCGACAACCTTTGAATTTACTGATATTGCAGGTATTGTTAAAGGTGCTTCGA
+AGGGGGAAGGTCTAGGTAATAAATTTTTAGCTAATATTCGTGAAGTGGATGCTATTGTTCATGTGGTACGTGCGTTTGAT
+GATGAAAATGTTATGCGTGAACAAGGTCGTGAGGATGCTTTCGTTGATCCTATAGCAGATATTGATACTATTAATCTTGA
+ATTAATCTTAGCTGATTTAGAGTCAATCAATAAACGTTATGCGCGTGTTGAAAAAATGGCACGAACTCAAAAAGATAAAG
+AATCAGTAGCAGAGTTCAATGTTTTACAAAAGATTAAACCTGTTTTGGAAGATGGGAAATCAGCTCGTACCATTGAGTTT
+ACAGAAGAGGAAGCAAAAGTTGTTAAAGGTCTTTTTTTATTAACAACTAAACCTGTTTTATATGTTGCTAATGTTGATGA
+GGACAAAGTAGCTGATCCTGATGATATCGACTATGTTAATCAAATTCGTGCATTTGCAGAAACAGAGAATGCAGAAGTAG
+TCGTGATTTCTGCTCGAGCTGAAGAAGAAATATCTGAACTTGATGATGAAGATAAGTTAGAATTTTTAGAAGCTATTGGA
+TTAACAGAATCTGGTGTTGATAAATTAACACGAGCTGCTTATCATCTTTTAGGCCTTGGAACTTACTTTACTGCTGGTGA
+AAAAGAGGTTCGCGCTTGGACGTTTAAGCGTGGTATAAAAGCTCCACAAGCTGCTAGTATTATCCATTCAGATTTTGAAA
+GAGGTTTTATTCGTGCAGTAACGATGTCATATGATGACCTTATTCAATATGGATCTGAAAAAGCAGTAAAAGAAGCTGGC
+CGGTTACGTGAAGAAGGAAAAGAGTATATTGTTCAAGATGGCGATATCATGGAATTCCGTTTCAATGTCTAGTAATAAAT
+AATCGATTTGTTAACTTTTAGGTTAAGGATATTGTTAATATCCTTAACCATTTTTGCGTTTTAATGGAGAAGATAATGGT
+AAAAATGATTGTTGGATTAGGAAATCCAGGAAGTAAATATAATGATACAAAACATAATATTGGATTTATGGCTGTTGACA
+GAATTGTAAAAGACCTTGACGTCAACTTTACAGAAGATAAAAATTTTAAAGCAGAGATAGGTAGTGATTTTATCAACGGT
+GAAAAAATTTATTTTATCAAACCGACTACTTTTATGAATAACAGTGGTATTGCTGTAAAAGCCCTGCTTACTTACTACAA
+CATTTCTATTAAGGATATGATTATCATATATGATGATTTAGACATGGAAGTCGGTAAAATACGTTTTCGTCAAAAAGGAT
+CTGCTGGGGGACATAATGGTATCAAGTCTATTATTGCTCATTTAGGTACTCAAGAATTTGATCGTATTAAAGTAGGTATA
+GGACGTCCGAATGGACGTATGACAGTTATTAATCATGTTCTAGGGAAATTTGATAAAAATGATGAAATTATGATATTAAA
+TACCCTTGATAAGGTTGACAATGCTGTCAATTATTATTTACAGACGAATGATTTTCAAAAAACAATGCAGAAATACAACG
+GTTTAAAATGAATATTATAGAATTATTTAGCCAAAATAAAGTGGTGCGGACATGGCACTCTGGATTAGTAACTAATAGTC
+GCCAATTAGTTATGGGGTTTTCAGGAGCAAGTAAAGCTATTGCCATAGCATCAGCCTACGAGAAGTTATCTAAAAAAATT
+ATGGTAGTCACTGCCACTCAAACCGATTCTGATAAATTATCAAGTGATATATCAAGTTTAATTGGAGAAGATAACGTTTA
+TCAATTTTTTGCTGATGACGTTCCTGCAGCAGAGTTTATTTTCTCTTCATTAGATAAATCAATTTCACGACTCAGTGCCC
+TGAGGTTTCTAAAAGATCCAGAAAAAAACGGTGTTTTGATTACTAGTATCAGTGGTTTAAGGTTACTATTACCAAATCCG
+GAAGTTTTCTCGAAAAGTCAATATAAGTTTGAAATCGGTCAAGAATGTTATTTAGATAAATTGTGTAAGAACCTAGTCAA
+TTTAGGTTATCAGAAAGTTTCTCAAGTATTTAGTCCTGGTGAATTTAGCCAAAGAGGAGATATTTTAGATATTTTTGAGA
+TGACACAAGAATATCCTTATCGCTTGGAATTCTTCGGAGATGAAATAGATGGCATCAGGCAGTTTGATATTGACACTCAA
+AAGTCTCTTAAACAATTAGAGTCAGTACAGATTTCGCCAGCAGATGATATTATTTTACAAGATGCAGATTTCGAGCGTGC
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+CCTGAGGGAACTCCACTTTTTGTTGATGATTTTCAAAAAATTGTAGATCGAAATGCTAAGTTAGATTTAGAAATAGCTAG
+CCTTCTGACGGAAGATTTACAACAAGGCAAGTCTCATTCTAGTTTGAACTATTTTTCAGATCCTTATAAGCAATTAAGAC
+AATACCAACCAGCAACCTTCTTTTCAAATTTCCACAAAGGATTAGGAAATCTGAAATTTGATAAACTTCATCATTTTACT
+CAATATGGAATGCAAGAATTTTTTAATCAATTTCCATTGTTGGTCGATGAAATCAATCGTTATAAGAAATCTGGAGCGAC
+AGTACTGTTGCAAGTAGATTCTCAAAAAGGTTTAAATCTCCTTCAAGAAAATTTAAAAGAATATGGGTTAGATTTAATCA
+TTTCAGATAAAAACGATATCGTTCAAAAGGAGTCACAACTTATTGTTGGGCATCTTTCAAATGGTTTTTATTTTGCAGAT
+GAGAAAATTGTTCTGATTACTGAACGTGAGATTTATCATAGGCGTGTTAAAAGGAAAATTAGACGCAGTAATATTAGTAA
+TGCAGAACGTCTAAAAGATTATAATGAACTTTCAGTTGGCGATTATGTTGTTCATAATGTTCATGGCGTAGGAAAATTTT
+TAGGTATTGAAACAATTGAGATACAAGGTATTCATCGTGATTATCTGACTATTCAATATCAAAATGCTGATCGTATCTCT
+ATCCCCGTAGAACAAATTGAACTTCTAACAAAATATGTCTCTGCAGATGGCAAAGAGCCTAAAATTAATACGTTAAATGA
+TGGTCGCTTCAAAAAAGCAAAACAGAGAGTTGCAAAGCAAGTAGAAGATATTGCTGATGATTTGTTGAAACTTTATGCAG
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+GAGACAGAGGATCAATTGCGGTCTATAAAAGAAATTAAACAGGATATGGAAGGTAATCGTCCGATGGATCGATTATTGGT
+TGGAGACGTTGGTTTTGGTAAGACAGAGGTTGCTATGCGTGCGGCTTTCAAAGCTGTCAATGACCATAAACAAGTTGTTG
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+GATGTACTTAGTCGTTTTCGTAGCAAAAAAGAACAAACAGATACACTAAAAAGATTATCTAAGGGCCAAGTTGATATTAT
+TATTGGAACACATCGACTTCTCTCTCAAGATGTTGTATTTTCGGATTTAGGGTTAATAGTTATTGATGAGGAACAGCGAT
+TTGGTGTAAAGCATAAAGAAAAGTTAAAAGAATTAAAAACAAAAGTTGATGTATTAACTTTGACAGCGACCCCAATACCT
+AGAACATTACATATGTCAATGCTTGGCATTAGAGACTTATCAGTCATTGAAACACCTCCAACTAATCGTTATCCTGTGCA
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+GTTCATGGTCAAATGTCTGAAATTCAATTAGAAAATACATTAATAGACTTTATCAATGGAGATTACGATGTTTTAGTTGC
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+CAACCCTTTATCAATTAAGAGGCCGTGTGGGTAGAAGTAATCGCATTGCTTATGCTTACCTTATGTACAGACCTGATAAA
+GTTTTAACAGAAATTTCTGAGAAAAGACTAGATGCAATCAAAGGGTTTACAGAATTGGGATCTGGTTTTAAAATAGCGAT
+GCGTGATTTATCTATACGTGGTGCAGGAAATATTTTAGGAGCTTCACAAAGTGGTTTTATTGATTCGGTTGGATTCGAGA
+TGTATTCACAGCTTCTAGAGCAAGCGATTGCCACCAAACAAGGGAAATCATTAATTCGTCAAAAAGGTAATGCTGAATTA
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+TGAATTAGAAACTAGGGCTGATTATGAAGCCTTACAAGATGAGTTAATAGATCGTTTTGGAGAATATCCTGATCAAGTTG
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+TAAGGCTAGAATTAGCGAAACAAATGGTAAGATGGAAGTTGTTTTTAATATCAAACATAAGAAAAATTATGAAATTATTG
+AAGAACTTCTAAAATTTGCCGAATGTTTTATCGAGATTAAGTCACGTAAACCAGTAGAAGAATAACTAAGTGAAAAGTTG
+CAAGGAAATTTGGATACTCTTTTAGAAAATGTTTGGTTCAAGAAGAATAGTACGAGCAACATTATGTTTCACGTCAAACA
+TCTCAACTTTTGAAAGACATAAATATTTTTAGAGGTTATTAAAATAGAAGTTTTTTACTTGATATTTGAGAGAATTAAGA
+GAGCTATTAGCTCTCTTTTTGTTACATTATATTGACAAATATTATCAGTTCAGATATTTTTCAAAAAAAATGCTAAAATA
+GTAGAGTTAATTTAGATAGAAGGATGTGATCATCAGTGAGATTAGACAAGTATCTAAAAGTGTCGCGTATCATTAAGCGT
+CGTCCCGTTGCTAAAGAAGTTGCAGACAAAGGACGTGTCAAGGTGAATGGCGTATTAGCAAAGTCATCAACTGACCTAAA
+GCTTAATGACCAAGTTGAAATTCGTTTTGGTAATAAATTGTTGACCGTTAAAGTATTAGAAATGAAAGATAGCACTAAGA
+AAGAAGATGCTATCAAAATGTATGAAATTATTAATGAAACAAGGATAGAAACAGATGAGCAAGCCTAATGTTGTTCAGTT
+AAATAATCAATATATTAACGATGAGAATCTAAAAAAACGTTACGAAGCTGAGGAGTTACGCCGAAAAAATCGTTTAATGG
+GTTGGGTTCTTATTTTTGTCATGCTTTTATTTATTTTACCCACTTATAATTTAGTTAAGAGTTACAGAACTTTACAAGAA
+CGTCGTCAAGAAGTTGTAAAATTAACGAAAGACTATCAGACATTAACTAATAGAACTGAGAACCAGAAGTTGCTAGCAAA
+ACAACTAAAAAATCCAGATTACGTTCAAAAATATGCTCGAGCTAAGTATTATTTCTCTAAGACCGGCGAAATGATTTACC
+CATTACCAGACCTTTTACCAAAATAATTATGAATAATTTAATTGAAACAATAGAACATTTTCTAGCCTACTCGGATGACA
+AACTAGAAGAATTAGCTGATAAGAACTATCAACTTAGGCAAACAATTGTAGAAAAAGAAAAGATTGAGAGCAGAGAAAAG
+TAATGAAGAAAGTTTTAACCTTCTTATTATGTAGCTTATATTTTGTATCAATCCCAGCTATAAGTACCGAGGAGCCATTA
+ACGCTTTCTCAAAATAGACGATACGCCTTAACTCAGACAGTTGTGGATAAGGAAATGTATTTTGATGCTATTCCAGAGAG
+ACCAACTACAAAAATTGAAATAAGCAGTTTTCAAGATGAAGCTTTAACCATAACAGGAGAGACTTTAGTTCCAAATACTT
+TATTGTCGATTGTTTCTCTTACAATTAATTCAAATGGAATTCCAGTATTTACTTTGTCCAATGGACAGTTCATAAAGGCT
+AGTCGTGAAGCTATTTTTAATGATTTAGTTTCTAAGCAGCAATCTGTCTCATTGGATTATTGGTTAAAACCTTCTTTTGT
+GACTTATGAAGCACCTTACACAAATGGTGTTAGTGAAGTTAAAAATAATTTAAAACCTTATTCCAGAGTGCATTTAGTAG
+AACAAGCAGAAACAGAACATGGTATTTATTATAAAACGGACAGTGGTTTTTGGATATCAGTAGAAGATCTATCGGTTGCT
+GATAATCGTATGGCTAAGGTTCAAGAAGTATTATTGGAAAAATATAATAAAGATAAATATGGTATATACATCAAACAATT
+AAATACACAGACAGTAGCTGGTATTAATATTGATAGGTCAATGTACTCTGCAAGTATTGCAAAATTAGCAACACTTTATG
+CTAGCCAAGAGCAAGTAAAATTAGGAAAACTGTCATTGGACAGCAAATTTGAATACAAAGATAATGTTAATCAATTTCCT
+AATAGCTATGATCCAAGTGGTAGTGGGAAATTAGAGAAAAAAGCTGATCATAAATTATATACCGTTAAGGAGTTACTTGA
+AGCAACTGCCAAGGAATCAGATAATGTTGCAACAAATATGCTAGGTTATTATGTCAATAATCAATATGATTCAATGTTTC
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+ATGGAAGCAATTTATTATCAAAATGGAGATATTGTTAATTACCTATCAAAGACTGATTTTGATAATACAAGAATCCCTAA
+AAATATACCAGTTAAAGTAGCACATAAAATTGGAGATGCTTATGACTACAAACATGATGCGGCTATTGTTTATGCAGAAC
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+TTAAAATAATATGTATAACACTATTTTGAAAGATACCTTATCCAAAGGGTTATTTACCGCTCATCAGAAAGTTCTAATTG
+CTGTTTCTGGTGGCATTGATTCAATAAATTTGTTGCAATTTTTATACCAGTATCAAAAAGAGTTATCGATTAGTATTGGT
+ATTGCACACATAAATCATGGACAGCGAAAAGAATCAGAAAAAGAAGAAGAATATATCAGACAGTGGGGACAGATACATGA
+TGTCCCTGTCTTTATCTCTTATTTTCAAGGAATATTTTCAGAAGATAGAGCACGTAACCATCGCTACAATTTTTTTTCAA
+AAGTTATGCGTGAAGAAGGTTACACGGCTTTAGTAACAGCTCACCATGCTGATGATCAAGCTGAAACTGTATTTATGAGA
+ATTTTAAGAGGAAGCAGGCTACGCTATTTATCAGGGATTAAGCAAGTGAGTGCTTTTGCAAACGGTCAATTGATTAGACC
+ATTTCTTCCATATAAAAAGGAGTTATTACCAAATATTTTTCATTTTGAAGATGCTAGCAACGCTTCGTCTGATTATTTAA
+GAAATCGAATAAGAAACGTCTACTTTCCTGCTTTGGAAAGAGAAAATAATCAATTGAAAGATTCTCTCATAACTCTCTCT
+GAGGAAACAGAGTGTTTATTCACGGCTTTAACAGACCTAACAAGGAGCATCGAAGTAACAAACTGCTATGATTTTTTAAG
+GCAAACTCATTCTGTCCAAGAATTTTTATTGCAAGATTACATTAGCAAATTTCCAGATTTACAAGTGAGTAAAGAACAGT
+TCAGAGTAATATTAAAATTGATTAGAACTAAAGCCAATATTGACTATACTATTAAATCGGGCTATTTTCTTCATAAGGAT
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+ACAAATATTCTCACAATATTTATTTTCCTATGGAAAATTCATTTCTCAAGCAGACATTACTATTCCTATTTATGATACTT
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+GCA-000007265-protein81 GCA_000007265 AE009948.1 87338 87976 81 1 Adenylate kinase http://purl.uniprot.org/uniprot/P65203
+GCA-000007265-protein33 GCA_000007265 AE009948.1 46475 47374 33 1 Peptidase M23 domain-containing protein http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E7W5
+GCA-000007265-protein38 GCA_000007265 AE009948.1 52118 52948 38 1 ABC transmembrane type-1 domain-containing protein http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E7W0
+GCA-000007265-protein11 GCA_000007265 AE009948.1 10803 12089 11 1 beta-lactamase http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E7Y3
+GCA-000007265-protein40 GCA_000007265 AE009948.1 53424 54086 40 1 Beta-carotene 15,15'-monooxygenase http://purl.uniprot.org/uniprot/A0A1F0CI38
+GCA-000007265-protein56 GCA_000007265 AE009948.1 72071 73087 56 1 Alcohol dehydrogenase http://purl.uniprot.org/uniprot/X5K0V4
+GCA-000007265-protein3 GCA_000007265 AE009948.1 2812 3705 3 1 diacylglycerol kinase family protein http://purl.uniprot.org/uniparc/UPI0002BB2C63
+GCA-000007265-protein7 GCA_000007265 AE009948.1 5676 6251 7 1 Peptidyl-tRNA hydrolase http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E2I1
+GCA-000007265-protein53 GCA_000007265 AE009948.1 66825 67205 53 1 MORN motif family protein http://purl.uniprot.org/uniprot/A0A1F0CHD6
+GCA-000007265-protein16 GCA_000007265 AE009948.1 20579 20866 16 1 RNAase http://purl.uniprot.org/uniprot/U5P1X6
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+GCA-000007265-protein26 GCA_000007265 AE009948.1 35756 36460 26 1 Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E2G4
+GCA-000007265-protein106 GCA_000007265 AE009948.1 110766 111524 106 1 pyridoxal kinase http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E7Q4
+GCA-000007265-protein37 GCA_000007265 AE009948.1 51221 52108 37 1 ABC transmembrane type-1 domain-containing protein http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E7W1
+GCA-000007265-protein5 GCA_000007265 AE009948.1 4114 4317 5 1 Gbs0005 protein http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E7Z0
+GCA-000007265-protein71 GCA_000007265 AE009948.1 81916 82221 71 1 Large ribosomal subunit protein uL24 http://purl.uniprot.org/uniprot/Q3K3V8
+GCA-000007265-protein68 GCA_000007265 AE009948.1 80951 81157 68 1 Large ribosomal subunit protein uL29 http://purl.uniprot.org/uniprot/A2RC22
+GCA-000007265-protein47 GCA_000007265 AE009948.1 60012 61103 47 1 N5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthase http://purl.uniprot.org/uniprot/A0A0E1EJA7
+GCA-000007265-protein99 GCA_000007265 AE009948.1 102830 103405 99 1 Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase-like domain-containing protein http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E7R0
+GCA-000007265-protein102 GCA_000007265 AE009948.1 105338 107167 102 1 Chaperone protein DnaK http://purl.uniprot.org/uniprot/P0A3J2
+GCA-000007265-protein96 GCA_000007265 AE009948.1 100791 101270 96 1 Competence-specific sigma factor ComX http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E7R3
+GCA-000007265-protein66 GCA_000007265 AE009948.1 79871 80524 66 1 Small ribosomal subunit protein uS3 http://purl.uniprot.org/uniprot/A2RC20
+GCA-000007265-protein20 GCA_000007265 AE009948.1 30369 31337 20 1 Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1 http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E2H0
+GCA-000007265-protein57 GCA_000007265 AE009948.1 73207 74697 57 1 Threonine synthase http://purl.uniprot.org/uniprot/A0A0E1EJC0
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+GCA-000007265-protein14 GCA_000007265 AE009948.1 13935 15911 14 1 ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E7Y0
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+GCA-000007265-protein98 GCA_000007265 AE009948.1 102081 102833 98 1 Peptidase M15B domain-containing protein http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E7R1
+GCA-000007265-protein64 GCA_000007265 AE009948.1 79220 79498 64 1 Small ribosomal subunit protein uS19 http://purl.uniprot.org/uniprot/Q1JE54
+GCA-000007265-protein52 GCA_000007265 AE009948.1 66381 66818 52 1 protein-tyrosine-phosphatase http://purl.uniprot.org/uniprot/A0A0E1EJB3
+GCA-000007265-protein10 GCA_000007265 AE009948.1 10295 10666 10 1 Cell division protein DivIC http://purl.uniprot.org/uniprot/Q8E7Y5