comparison karyotype/karyotype.rat.rn4.txt @ 6:740057a5126d draft

"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/circos commit 1584882716a1d2c598e8485da9d73bcf80d9b29a"
author iuc
date Fri, 01 May 2020 07:28:50 -0400
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
5:a64dc31ab7f2 6:740057a5126d
1 chr - rn1 1 0 267910886 chr1
2 chr - rn2 2 0 258207540 chr2
3 chr - rn3 3 0 171063335 chr3
4 chr - rn4 4 0 187126005 chr4
5 chr - rn5 5 0 173096209 chr5
6 chr - rn6 6 0 147636619 chr6
7 chr - rn7 7 0 143002779 chr7
8 chr - rn8 8 0 129041809 chr8
9 chr - rn9 9 0 113440463 chr9
10 chr - rn10 10 0 110718848 chr10
11 chr - rn11 11 0 87759784 chr11
12 chr - rn12 12 0 46782294 chr12
13 chr - rn13 13 0 111154910 chr13
14 chr - rn14 14 0 112194335 chr14
15 chr - rn15 15 0 109758846 chr15
16 chr - rn16 16 0 90238779 chr16
17 chr - rn17 17 0 97296363 chr17
18 chr - rn18 18 0 87265094 chr18
19 chr - rn19 19 0 59218465 chr19
20 chr - rn20 20 0 55268282 chr20
21 chr - rnX x 0 160699376 chrx
22 band rn1 p13 p13 0 10142096 gneg
23 band rn1 p12 p12 10142096 24272657 gvar
24 band rn1 p11 p11 24272657 38517175 gneg
25 band rn1 q11 q11 38517175 48659271 gpos
26 band rn1 q12 q12 48659271 69741157 gneg
27 band rn1 q21 q21 69741157 90025350 gpos
28 band rn1 q22 q22 90025350 123756368 gneg
29 band rn1 q31 q31 123756368 141191657 gpos
30 band rn1 q32 q32 141191657 162273543 gneg
31 band rn1 q33 q33 162273543 170478385 gpos
32 band rn1 q34 q34 170478385 174466850 gneg
33 band rn1 q35 q35 174466850 179822789 gpos
34 band rn1 q36 q36 179822789 187913675 gneg
35 band rn1 q37 q37 187913675 190762578 gpos
36 band rn1 q41 q41 190762578 204893140 gneg
37 band rn1 q42 q42 204893140 207400175 gpos
38 band rn1 q43 q43 207400175 223240078 gneg
39 band rn1 q51 q51 223240078 231330964 gpos
40 band rn1 q52 q52 231330964 239421850 gneg
41 band rn1 q53 q53 239421850 245575482 gpos
42 band rn1 q54 q54 245575482 253666368 gneg
43 band rn1 q55 q55 253666368 267910886 gvar
44 band rn10 q11 q11 0 6254774 gpos
45 band rn10 q12 q12 6254774 26232711 gneg
46 band rn10 q21 q21 26232711 34821357 gpos
47 band rn10 q22 q22 34821357 47517616 gneg
48 band rn10 q23 q23 47517616 49851488 gpos
49 band rn10 q24 q24 49851488 63761360 gneg
50 band rn10 q25 q25 63761360 66468650 gpos
51 band rn10 q26 q26 66468650 83085813 gneg
52 band rn10 q31 q31 83085813 88033620 gpos
53 band rn10 q32.1 q32.1 88033620 103717234 gneg
54 band rn10 q32.2 q32.2 103717234 105397621 gpos
55 band rn10 q32.3 q32.3 105397621 110718848 gneg
56 band rn11 p12 p12 0 6656992 gvar
57 band rn11 p11 p11 6656992 15001672 gneg
58 band rn11 q11 q11 15001672 36660337 gpos
59 band rn11 q12 q12 36660337 48380393 gneg
60 band rn11 q21 q21 48380393 64975993 gpos
61 band rn11 q22 q22 64975993 76696050 gneg
62 band rn11 q23 q23 76696050 87759784 gpos
63 band rn12 p12 p12 0 5483638 gvar
64 band rn12 p11 p11 5483638 12566672 gneg
65 band rn12 q11 q11 12566672 18678644 gpos
66 band rn12 q12 q12 18678644 26846981 gneg
67 band rn12 q13 q13 26846981 28446376 gpos
68 band rn12 q14 q14 28446376 32501984 gneg
69 band rn12 q15 q15 32501984 33930015 gpos
70 band rn12 q16 q16 33930015 46782294 gneg
71 band rn13 p13 p13 0 17399939 gneg
72 band rn13 p12 p12 17399939 22926979 gvar
73 band rn13 p11 p11 22926979 30194013 gneg
74 band rn13 q11 q11 30194013 40019861 gpos
75 band rn13 q12 q12 40019861 42988086 gneg
76 band rn13 q13 q13 42988086 55679807 gpos
77 band rn13 q21 q21 55679807 71749163 gpos
78 band rn13 q22 q22 71749163 80142075 gneg
79 band rn13 q23 q23 80142075 83007948 gpos
80 band rn13 q24 q24 83007948 91093802 gneg
81 band rn13 q25 q25 91093802 93959675 gpos
82 band rn13 q26 q26 93959675 105627870 gneg
83 band rn13 q27 q27 105627870 111154910 gpos
84 band rn14 p22 p22 0 21145501 gneg
85 band rn14 p21 p21 21145501 31410307 gpos
86 band rn14 p11 p11 31410307 49271071 gneg
87 band rn14 q11 q11 49271071 68671555 gpos
88 band rn14 q21 q21 68671555 94949460 gpos
89 band rn14 q22 q22 94949460 112194335 gneg
90 band rn15 p16 p16 0 14498477 gneg
91 band rn15 p15 p15 14498477 17183380 gpos
92 band rn15 p14 p14 17183380 31681858 gneg
93 band rn15 p13 p13 31681858 34366761 gneg
94 band rn15 p12 p12 34366761 47791278 gvar
95 band rn15 p11 p11 47791278 54235046 gneg
96 band rn15 q11 q11 54235046 60356625 gpos
97 band rn15 q12 q12 60356625 71848011 gneg
98 band rn15 q21 q21 71848011 86776073 gpos
99 band rn15 q22 q22 86776073 91716295 gneg
100 band rn15 q23 q23 91716295 99341421 gpos
101 band rn15 q24 q24 99341421 106214773 gneg
102 band rn15 q25 q25 106214773 109758846 gpos
103 band rn16 p16 p16 0 10244998 gneg
104 band rn16 p15 p15 10244998 12107726 gpos
105 band rn16 p14 p14 12107726 25043330 gneg
106 band rn16 p13 p13 25043330 29389694 gneg
107 band rn16 p12 p12 29389694 34977875 gvar
108 band rn16 p11 p11 34977875 42325298 gneg
109 band rn16 q11 q11 42325298 51535449 gpos
110 band rn16 q12.1 q12.1 51535449 58882872 gneg
111 band rn16 q12.2 q12.2 58882872 61780448 gpos
112 band rn16 q12.3 q12.3 61780448 69231356 gneg
113 band rn16 q12.4 q12.4 69231356 71818477 gpos
114 band rn16 q12.5 q12.5 71818477 90238779 gneg
115 band rn17 p14 p14 0 22957568 gneg
116 band rn17 p13 p13 22957568 25253325 gneg
117 band rn17 p12 p12 25253325 42744806 gvar
118 band rn17 p11 p11 42744806 48648181 gneg
119 band rn17 q11 q11 48648181 54442234 gpos
120 band rn17 q12.1 q12.1 54442234 73136254 gneg
121 band rn17 q12.2 q12.2 73136254 75869298 gpos
122 band rn17 q12.3 q12.3 75869298 97296363 gneg
123 band rn18 p13 p13 0 10604365 gneg
124 band rn18 p12 p12 10604365 27505073 gvar
125 band rn18 p11 p11 27505073 37336204 gneg
126 band rn18 q11 q11 37336204 51033510 gpos
127 band rn18 q12.1 q12.1 51033510 67602832 gneg
128 band rn18 q12.2 q12.2 67602832 71469007 gpos
129 band rn18 q12.3 q12.3 71469007 82846608 gneg
130 band rn18 q13 q13 82846608 87265094 gpos
131 band rn19 p14 p14 0 4060256 gneg
132 band rn19 p13 p13 4060256 10571989 gneg
133 band rn19 p12 p12 10571989 12257379 gvar
134 band rn19 p11 p11 12257379 22369717 gneg
135 band rn19 q11 q11 22369717 35469792 gpos
136 band rn19 q12 q12 35469792 59218465 gneg
137 band rn2 q11 q11 0 15886252 gpos
138 band rn2 q12 q12 15886252 34569380 gneg
139 band rn2 q13 q13 34569380 37030630 gpos
140 band rn2 q14 q14 37030630 47770632 gneg
141 band rn2 q15 q15 47770632 50903132 gpos
142 band rn2 q16 q16 50903132 63656884 gneg
143 band rn2 q21 q21 63656884 72830636 gpos
144 band rn2 q22 q22 72830636 84801263 gneg
145 band rn2 q23 q23 84801263 97555015 gpos
146 band rn2 q24 q24 97555015 117468768 gneg
147 band rn2 q25 q25 117468768 126642519 gpos
148 band rn2 q26 q26 126642519 145437522 gneg
149 band rn2 q31 q31 145437522 159310024 gpos
150 band rn2 q32 q32 159310024 171280651 gneg
151 band rn2 q33 q33 171280651 174525027 gpos
152 band rn2 q34 q34 174525027 205178781 gneg
153 band rn2 q41 q41 205178781 219051283 gneg
154 band rn2 q42 q42 219051283 227106285 gpos
155 band rn2 q43 q43 227106285 235049411 gneg
156 band rn2 q44 q44 235049411 246236913 gneg
157 band rn2 q45 q45 246236913 258207540 gvar
158 band rn20 p12 p12 0 15959251 gvar
159 band rn20 p11 p11 15959251 26670159 gneg
160 band rn20 q11 q11 26670159 38023721 gpos
161 band rn20 q12 q12 38023721 45735574 gneg
162 band rn20 q13 q13 45735574 55268282 gpos
163 band rn3 p13 p13 0 5305065 gneg
164 band rn3 p12 p12 5305065 11010513 gvar
165 band rn3 p11 p11 11010513 16315578 gneg
166 band rn3 q11 q11 16315578 21320357 gpos
167 band rn3 q12 q12 21320357 39137369 gneg
168 band rn3 q21 q21 39137369 54151705 gpos
169 band rn3 q22 q22 54151705 55853329 gneg
170 band rn3 q23 q23 55853329 60557821 gpos
171 band rn3 q24 q24 60557821 78374833 gneg
172 band rn3 q31 q31 78374833 88284295 gpos
173 band rn3 q32 q32 88284295 91187067 gneg
174 band rn3 q33 q33 91187067 96191846 gpos
175 band rn3 q34 q34 96191846 99695191 gneg
176 band rn3 q35 q35 99695191 112207137 gpos
177 band rn3 q36 q36 112207137 128222429 gneg
178 band rn3 q41 q41 128222429 145338772 gneg
179 band rn3 q42 q42 145338772 165658174 gpos
180 band rn3 q43 q43 165658174 171063335 gneg
181 band rn4 q11 q11 0 15612157 gpos
182 band rn4 q12 q12 15612157 25397242 gneg
183 band rn4 q13 q13 25397242 31993929 gpos
184 band rn4 q21 q21 31993929 46176804 gpos
185 band rn4 q22 q22 46176804 69595041 gneg
186 band rn4 q23 q23 69595041 72343661 gpos
187 band rn4 q24 q24 72343661 92683444 gneg
188 band rn4 q31 q31 92683444 102908308 gpos
189 band rn4 q32 q32 102908308 104447535 gneg
190 band rn4 q33 q33 104447535 112253614 gpos
191 band rn4 q34 q34 112253614 136991188 gneg
192 band rn4 q41 q41 136991188 146776273 gneg
193 band rn4 q42 q42 146776273 170194509 gpos
194 band rn4 q43 q43 170194509 174152521 gneg
195 band rn4 q44 q44 174152521 187126005 gneg
196 band rn5 q11 q11 0 12292177 gpos
197 band rn5 q12 q12 12292177 20226219 gneg
198 band rn5 q13 q13 20226219 34529844 gpos
199 band rn5 q21 q21 34529844 51627145 gpos
200 band rn5 q22 q22 51627145 66824746 gneg
201 band rn5 q23 q23 66824746 69618423 gpos
202 band rn5 q24 q24 69618423 85486507 gneg
203 band rn5 q31 q31 85486507 104595256 gpos
204 band rn5 q32 q32 104595256 112194056 gneg
205 band rn5 q33 q33 112194056 123257016 gpos
206 band rn5 q34 q34 123257016 128509128 gneg
207 band rn5 q35 q35 128509128 135213952 gpos
208 band rn5 q36 q36 135213952 173096209 gneg
209 band rn6 q11 q11 0 3920547 gpos
210 band rn6 q12 q12 3920547 21058941 gneg
211 band rn6 q13 q13 21058941 25091504 gpos
212 band rn6 q14 q14 25091504 36629115 gneg
213 band rn6 q15 q15 36629115 40661678 gpos
214 band rn6 q16 q16 40661678 55783790 gneg
215 band rn6 q21 q21 55783790 67769464 gpos
216 band rn6 q22 q22 67769464 72138074 gneg
217 band rn6 q23 q23 72138074 83787701 gpos
218 band rn6 q24 q24 83787701 107647034 gneg
219 band rn6 q31 q31 107647034 119632707 gpos
220 band rn6 q32 q32 119632707 139571492 gneg
221 band rn6 q33 q33 139571492 147636619 gpos
222 band rn7 q11 q11 0 15273239 gpos
223 band rn7 q12 q12 15273239 18101617 gneg
224 band rn7 q13 q13 18101617 41068044 gpos
225 band rn7 q21 q21 41068044 52268420 gpos
226 band rn7 q22 q22 52268420 76479334 gneg
227 band rn7 q31 q31 76479334 91752574 gpos
228 band rn7 q32 q32 91752574 94580951 gneg
229 band rn7 q33 q33 94580951 104649976 gpos
230 band rn7 q34 q34 104649976 128860890 gneg
231 band rn7 q35 q35 128860890 136101537 gpos
232 band rn7 q36 q36 136101537 143002779 gneg
233 band rn8 q11 q11 0 11874368 gpos
234 band rn8 q12 q12 11874368 16813265 gneg
235 band rn8 q13 q13 16813265 31735037 gpos
236 band rn8 q21 q21 31735037 40351836 gpos
237 band rn8 q22 q22 40351836 48968634 gneg
238 band rn8 q23 q23 48968634 54222779 gpos
239 band rn8 q24 q24 54222779 82279915 gneg
240 band rn8 q31 q31 82279915 106554067 gpos
241 band rn8 q32 q32 106554067 129041809 gneg
242 band rn9 q11 q11 0 7255483 gpos
243 band rn9 q12 q12 7255483 17060190 gneg
244 band rn9 q13 q13 17060190 28237556 gpos
245 band rn9 q21 q21 28237556 41866100 gpos
246 band rn9 q22 q22 41866100 52357136 gneg
247 band rn9 q31 q31 52357136 62063796 gpos
248 band rn9 q32 q32 62063796 70103656 gneg
249 band rn9 q33 q33 70103656 78535705 gpos
250 band rn9 q34 q34 78535705 83732200 gneg
251 band rn9 q35 q35 83732200 90007212 gpos
252 band rn9 q36 q36 90007212 101184578 gneg
253 band rn9 q37 q37 101184578 107459591 gpos
254 band rn9 q38 q38 107459591 113440463 gneg
255 band rnX q11 q11 0 7738332 gpos
256 band rnX q12 q12 7738332 21538359 gneg
257 band rnX q13 q13 21538359 29792580 gpos
258 band rnX q14 q14 29792580 39465496 gneg
259 band rnX q21 q21 39465496 59585161 gpos
260 band rnX q22 q22 59585161 81252493 gneg
261 band rnX q31 q31 81252493 100985241 gpos
262 band rnX q32 q32 100985241 112463768 gneg
263 band rnX q33 q33 112463768 115688074 gpos
264 band rnX q34 q34 115688074 122523601 gneg
265 band rnX q35 q35 122523601 135420822 gpos
266 band rnX q36 q36 135420822 149220849 gneg
267 band rnX q37 q37 149220849 160699376 gpos