Mercurial > repos > iuc > cnvkit_batch
directory /test-data/ @ 1:4653aeb60243 draft
| name | size | permissions |
|---|---|---|
| [up] | drwxr-xr-x | |
 access-excludes.bed
|
0 | -rw-r--r-- |
|
capture.antitarget.bed
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0 | -rw-r--r-- |
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capture.bed
|
579 | -rw-r--r-- |
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capture.split.bed
|
653 | -rw-r--r-- |
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capture.target.bed
|
208 | -rw-r--r-- |
|
excludes.bed
|
0 | -rw-r--r-- |
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excludes_1.bed
|
0 | -rw-r--r-- |
|
fasta_indexes.loc
|
1157 | -rw-r--r-- |
|
gene-breaks.txt
|
57 | -rw-r--r-- |
|
gene-sex.txt
|
59 | -rw-r--r-- |
|
gene_genemetrics.txt
|
31 | -rw-r--r-- |
|
gene_segmetrics.cns
|
106 | -rw-r--r-- |
|
genome.fasta
|
16909 | -rw-r--r-- |
|
genome.fasta.fai
|
19 | -rw-r--r-- |
|
multible_capture.antitarget.bed
|
0 | -rw-r--r-- |
|
normal.antitargetcoverage.cnn
|
31 | -rw-r--r-- |
|
normal.bam
|
245496 | -rw-r--r-- |
|
normal.bam.bai
|
128 | -rw-r--r-- |
|
normal.targetcoverage.cnn
|
2070 | -rw-r--r-- |
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ref-tas.cnn
|
2572 | -rw-r--r-- |
|
reference.antitarget-tmp.bed
|
0 | -rw-r--r-- |
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reference.cnn
|
3226 | -rw-r--r-- |
|
reference.cnn.1
|
3226 | -rw-r--r-- |
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reference.cnn.2
|
2556 | -rw-r--r-- |
|
reference.target-tmp.bed
|
1081 | -rw-r--r-- |
|
sample-diagram.pdf
|
6747 | -rw-r--r-- |
 sample-heatmap.png
|
11753 | -rw-r--r-- |
|
sample-scatter.pdf
|
10490 | -rw-r--r-- |
 sample-scatter.png
|
12015 | -rw-r--r-- |
|
sample.cnr
|
2399 | -rw-r--r-- |
|
sample.cns
|
94 | -rw-r--r-- |
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sample.targetcoverage.cnn
|
1205 | -rw-r--r-- |
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test.targetcoverage.cnn
|
2092 | -rw-r--r-- |
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tumor-diagram.pdf
|
6757 | -rw-r--r-- |
 tumor-heatmap.png
|
8239 | -rw-r--r-- |
|
tumor-scatter.pdf
|
10661 | -rw-r--r-- |
 tumor-scatter.png
|
13642 | -rw-r--r-- |
|
tumor.antitargetcoverage.cnn
|
31 | -rw-r--r-- |
|
tumor.bam
|
52884 | -rw-r--r-- |
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tumor.bam.bai
|
104 | -rw-r--r-- |
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tumor.bintest.cns
|
1890 | -rw-r--r-- |
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tumor.call.cns
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tumor.cnr
|
2265 | -rw-r--r-- |
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tumor.cns
|
123 | -rw-r--r-- |
|
tumor.targetcoverage.cnn
|
2092 | -rw-r--r-- |
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tumor_1.bam
|
52884 | -rw-r--r-- |