diff test-data/rawAbundances.csv @ 0:c9040bdb918c draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/DIMet commit abca848510cb4ac8d09d95634147626ea578cdf0
author iuc
date Tue, 10 Oct 2023 11:55:25 +0000
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/rawAbundances.csv	Tue Oct 10 11:55:25 2023 +0000
@@ -0,0 +1,26 @@
+ID	MCF001089_TD01	MCF001089_TD02	MCF001089_TD07	MCF001089_TD08	MCF001089_TD19	MCF001089_TD20	MCF001089_TD25	MCF001089_TD26	MCF001089_TD37	MCF001089_TD38	MCF001089_TD43	MCF001089_TD44	MCF001089_TD55	MCF001089_TD56	MCF001089_TD61	MCF001089_TD62
+Fructose_1,6-bisphosphate		81.46798666666666	31.66305777777778	488.62223666666665	30.88032133333333			108.58193666666666								
+Fumaric_acid	1765.8621555555562	2350.101706666667	565.6100944444463	1636.1451616666689	1112.7411533333332	1571.7939723809532		2082.227511666667								
+Glycine	31339.848144444444	19953.502358333335	15011.070372222222	26867.879408333334	20173.435886666666	14121.041376190477	15741.494772222224	25731.819858333336	21082398.016666666	20528546.116666667	19650482.416666664	19152242.516666666	35768152.41666667	21132662.81666667	21540901.71666667	22233782.916666664
+Hexose	15263.525582222223	10653.204421666667	7620.2662477777785	12194.176071666667	9284.639177333334	7131.811518095239	6702.562494444444	11674.364736666666	23812934.643333334	24242428.643333334	22336054.643333334	22906432.643333334	23957348.643333334	23850557.643333334	26889340.643333334	25837975.643333334
+Hexose-phosphate	556790.6730444445	410704.96478333336	215369.08985555556	457681.9897833334	337548.2038266667	233788.3998761905	229354.86985555556	416586.1147833334	1792538.5666666667	1790949.5666666667	1218328.5666666667	1457111.5666666667	2069691.5666666667	1915534.5666666667	1684708.5666666667	1734938.5666666667
+Ile_Leu	723695.6614222223	871117.5290666667	433211.3440444445	674932.9420666667	545783.4088533333	441641.19203809527	354037.3863777778	633452.6395666667	2111708660.1333334	2203285239.133333	2037012929.1333334	2023660803.1333334	2311992779.133333	2210982973.133333	2389754947.133333	2339735205.133333
+L-Alanine	14581.8738	7816.563399999999	7056.1678999999995	14626.51065	9781.123839999998	6324.36291142857	8061.856666666667	13276.4346	1548485.77	1701510.73	1309197.7400000002	1820745.4700000002	1935085.62	1763954.77	1931224.9000000004	2282473.1300000004
+L-Arginine	5680.366466666666	7466.331200000001	4182.386200000001	4069.3133000000003	5139.229840000001	3719.8487428571434	2943.6414666666674	4496.78815	76704557.1	76562817.1	74284491.1	72162535.1	76269336.1	76291863.1	74652772.1	74944609.1
+L-Asparagine									3617749.87	3435790.2	2756887.13	2910381.68	3513705.7	3293797.9	3311566.8	3892175.2
+L-Aspartic_acid	71486.78267333333	55376.312	8361.739503333332	20235.678005	34321.611392	23119.754611428572	7664.626003333333	15616.709855000001								
+L-Glutamic_acid	139191.37992666668	104355.48684499999	46972.50566333334	106954.896995	82261.28531600001	55875.258682857144	47872.660330000006	95053.066995								
+L-Glutamine	18606.32958888889	9863.261441666667	4512.041427777778	8956.960391666667	8701.497033333335	5374.547080952381	4094.7460777777783	6858.299791666668								
+L-Histidine	16420.387355555555	15111.119316666667	8215.772844444444	11717.067916666667	12255.282253333333	8082.469038095238	7269.836411111111	11350.365116666668	66137818.63333333	67607708.63333334	63420421.63333333	61687625.63333333	64943662.63333333	66958084.63333333	67970373.63333334	69607422.63333334
+L-Lactic_acid	1073607.0293955556	1722584.2720466666	973301.2546977778	991816.0770466666	879872.2496373333	726504.4068838095	614361.0746977777	951194.5220466666	9322737799.093334	9302697744.093334	9196079213.093334	8719390692.093334	8901197393.093334	8704911808.093334	9400722189.093334	9863466762.093334
+L-Lysine	11537.73680888889	13806.366056666666	8333.777904444445	8813.939856666668	9173.407525333334	6579.528718095239	6643.038094444445	9442.279106666667	117443154.71333334	121027940.71333334	115723826.71333334	115850611.09333333	119744345.59333333	119004184.71333334	118584270.71333334	117133694.71333334
+L-Malic_acid	83435.18658666659	84111.08978999997	28512.006359999974	76546.89803999996	79766.01795199995	59945.28643999999	37016.17602666664	84042.47953999996								
+L-Methionine	50953.09172444445	49086.99679333334	28047.987862222224	45217.35266333333	38660.34303466667	29593.68731047619	25367.68152888889	44736.38582833333	111550662.21666667	114041484.58666667	102236906.58666667	107705253.05666667	118873593.96666667	116214414.89666668	118851523.58666667	123449681.58666667
+L-Phenylalanine	246751.26231111115	294311.09893333336	140657.68205555558	222115.47443333335	189439.93394666666	150023.76081904763	115791.1377888889	208570.64043333335	636990553.8666667	649933157.8666667	607515203.8666667	606053781.8666667	685784788.8666667	665904616.8666667	714741480.8666667	705881485.8666667
+L-Proline	6399.387268888889	4826.820016666667	3510.949071111111	6967.536411666666	4196.610013333333	3581.472580952381	4106.875117777778	6867.035166666667	6433495.033333333	6609824.833333334	5540393.533333333	4245151.533333333	7152407.533333333	6966378.033333333	9268074.033333333	9909521.833333334
+L-Serine	34591.22677111111	27843.714578333333	20292.688385555557	30783.493578333335	24105.163262666665	18470.518616190475	18382.152052222224	30617.729578333332	85713015.15666667	86442185.15666667	80830195.15666667	77735867.15666667	87723164.15666667	84905739.15666667	90456917.15666667	93913089.15666667
+L-Threonine	162184.6072	122218.556075	79915.61493	130398.02227	113231.489568	82710.40769142858	75580.73975333333	125274.2576	285717399.29	278341478.49	261018102.39	262753775.69	287841134.94	283733608.09	296904540.79	288355169.29
+L-Tryptophan	4101.068422222223	4813.902566666667	2571.5729777777774	2610.923316666667	2975.5369333333333	2079.1386666666667	2157.056777777778	2678.538611666667	23656601.733333334	24177093.733333334	23401859.733333334	19146747.733333334	22572464.733333334	20887438.733333334	20532655.733333334	21681238.733333334
+L-Tyrosine	216327.26993777775	233028.43495333332	117722.98240222223	189134.5396533333	158752.20572266664	127191.96683047619	98779.61883555555	178181.92245333333	526242843.90666664	541860987.9066666	489041215.90666664	498219681.90666664	554116402.9066666	532238404.90666664	568375310.9066666	574309133.9066666
+L-Valine	204800.46126444443	179839.41518833334	124299.92819888888	183414.65549833333	153570.35555866666	121953.23554190475	102920.69711555555	178884.87684833334	577225423.9966667	578990937.1966666	545903388.7966666	557138987.7966666	606569154.8966666	603361959.6966666	611454433.5966667	621103613.1966666
+Pyruvic_acid	629.5377555555556	1468.3793166666667	1214.9325444444444	2671.4148166666664	750.1246533333333	639.8964666666667	960.6392111111111	2012.0523166666667	1917193228.8333335	1800847679.2333333	1898133517.2333333	1831205498.1333334	1954504808.4333334	1917436849.8333335	1873057071.1333334	2047218329.5333335