Mercurial > repos > iuc > falco
diff test-data/fastqc_data_hisat.txt @ 0:e462044ece67 draft
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/falco commit 8593dacde03b50726e9ca12fa15e4a104531708c
| author | iuc |
|---|---|
| date | Tue, 04 Jun 2024 14:14:49 +0000 |
| parents | |
| children | 959a14c1f2dd |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/fastqc_data_hisat.txt Tue Jun 04 14:14:49 2024 +0000 @@ -0,0 +1,448 @@ +##FastQC 0.12.1 +>>Basic Statistics pass +#Measure Value +Filename hisat_output_1_bam +File type Conventional base calls +Encoding Sanger / Illumina 1.9 +Total Sequences 20 +Total Bases 1.4 kbp +Sequences flagged as poor quality 0 +Sequence length 70 +%GC 43 +>>END_MODULE +>>Per base sequence quality pass +#Base Mean Median Lower Quartile Upper Quartile 10th Percentile 90th Percentile +1 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +2 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +3 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +4 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +5 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +6 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +7 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +8 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +9 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +10 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +11 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +12 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +13 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +14 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +15 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +16 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +17 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +18 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +19 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +20 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +21 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +22 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +23 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +24 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +25 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +26 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +27 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +28 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +29 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +30 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +31 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +32 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +33 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +34 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +35 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +36 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +37 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +38 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +39 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +40 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +41 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +42 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +43 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +44 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +45 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +46 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +47 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +48 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +49 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +50 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +51 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +52 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +53 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +54 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +55 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +56 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +57 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +58 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +59 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +60 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +61 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +62 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +63 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +64 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +65 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +66 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +67 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +68 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +69 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +70 17.0 NaN NaN NaN NaN NaN +>>END_MODULE +>>Per sequence quality scores fail +#Quality Count +17 20.0 +>>END_MODULE +>>Per base sequence content fail +#Base G A T C +1 20.0 5.0 35.0 40.0 +2 10.0 10.0 45.0 35.0 +3 35.0 20.0 20.0 25.0 +4 35.0 30.0 25.0 10.0 +5 20.0 20.0 30.0 30.0 +6 20.0 35.0 20.0 25.0 +7 15.0 40.0 35.0 10.0 +8 20.0 15.0 45.0 20.0 +9 20.0 25.0 35.0 20.0 +10 20.0 20.0 30.0 30.0 +11 15.0 20.0 45.0 20.0 +12 10.0 40.0 35.0 15.0 +13 25.0 35.0 20.0 20.0 +14 35.0 20.0 20.0 25.0 +15 30.0 35.0 15.0 20.0 +16 10.0 45.0 25.0 20.0 +17 25.0 25.0 40.0 10.0 +18 25.0 35.0 10.0 30.0 +19 5.0 30.0 25.0 40.0 +20 20.0 15.0 40.0 25.0 +21 25.0 25.0 25.0 25.0 +22 15.0 30.0 20.0 35.0 +23 20.0 5.0 45.0 30.0 +24 10.0 30.0 35.0 25.0 +25 30.0 40.0 15.0 15.0 +26 15.0 35.0 20.0 30.0 +27 15.0 35.0 30.0 20.0 +28 25.0 25.0 30.0 20.0 +29 15.0 30.0 20.0 35.0 +30 20.0 35.0 30.0 15.0 +31 20.0 35.0 25.0 20.0 +32 35.0 15.0 35.0 15.0 +33 30.0 35.0 15.0 20.0 +34 25.0 25.0 25.0 25.0 +35 25.0 20.0 35.0 20.0 +36 30.0 25.0 20.0 25.0 +37 15.0 45.0 25.0 15.0 +38 30.0 25.0 35.0 10.0 +39 20.0 45.0 15.0 20.0 +40 15.0 35.0 20.0 30.0 +41 35.0 25.0 20.0 20.0 +42 30.0 30.0 35.0 5.0 +43 25.0 15.0 40.0 20.0 +44 40.0 20.0 30.0 10.0 +45 15.0 35.0 25.0 25.0 +46 15.0 30.0 40.0 15.0 +47 35.0 15.0 30.0 20.0 +48 30.0 35.0 20.0 15.0 +49 10.0 55.00000000000001 30.0 5.0 +50 40.0 25.0 20.0 15.0 +51 25.0 35.0 10.0 30.0 +52 30.0 25.0 20.0 25.0 +53 30.0 10.0 30.0 30.0 +54 20.0 40.0 20.0 20.0 +55 10.0 35.0 10.0 45.0 +56 50.0 10.0 30.0 10.0 +57 15.0 45.0 30.0 10.0 +58 20.0 35.0 20.0 25.0 +59 30.0 35.0 30.0 5.0 +60 20.0 35.0 25.0 20.0 +61 25.0 15.0 35.0 25.0 +62 10.0 20.0 55.00000000000001 15.0 +63 25.0 20.0 35.0 20.0 +64 20.0 35.0 25.0 20.0 +65 30.0 35.0 25.0 10.0 +66 15.0 40.0 35.0 10.0 +67 20.0 35.0 20.0 25.0 +68 20.0 25.0 30.0 25.0 +69 15.0 35.0 25.0 25.0 +70 5.0 40.0 40.0 15.0 +>>END_MODULE +>>Per sequence GC content fail +#GC Content Count +0 0.0 +1 0.0 +2 0.0 +3 0.0 +4 0.0 +5 0.0 +6 0.0 +7 0.0 +8 0.0 +9 0.0 +10 0.0 +11 0.0 +12 0.0 +13 0.0 +14 0.0 +15 0.0 +16 0.0 +17 0.0 +18 0.0 +19 0.0 +20 0.0 +21 0.0 +22 0.0 +23 0.0 +24 0.0 +25 0.0 +26 0.0 +27 0.0 +28 0.0 +29 0.5 +30 1.0 +31 0.5 +32 0.5 +33 1.0 +34 0.5 +35 0.0 +36 0.0 +37 0.0 +38 1.0 +39 2.5 +40 3.0 +41 2.0 +42 1.5 +43 2.0 +44 2.5 +45 2.5 +46 1.0 +47 0.0 +48 0.5 +49 0.5 +50 0.0 +51 1.5 +52 1.5 +53 0.0 +54 0.5 +55 0.5 +56 0.0 +57 0.0 +58 0.0 +59 0.0 +60 0.0 +61 0.0 +62 0.0 +63 0.0 +64 0.0 +65 0.0 +66 0.0 +67 0.0 +68 0.0 +69 0.0 +70 0.0 +71 0.0 +72 0.0 +73 0.0 +74 0.0 +75 0.0 +76 0.0 +77 0.0 +78 0.0 +79 0.0 +80 0.0 +81 0.0 +82 0.0 +83 0.0 +84 0.0 +85 0.0 +86 0.0 +87 0.0 +88 0.0 +89 0.0 +90 0.0 +91 0.0 +92 0.0 +93 0.0 +94 0.0 +95 0.0 +96 0.0 +97 0.0 +98 0.0 +99 0.0 +100 0.0 +>>END_MODULE +>>Per base N content pass +#Base N-Count +1 0.0 +2 0.0 +3 0.0 +4 0.0 +5 0.0 +6 0.0 +7 0.0 +8 0.0 +9 0.0 +10 0.0 +11 0.0 +12 0.0 +13 0.0 +14 0.0 +15 0.0 +16 0.0 +17 0.0 +18 0.0 +19 0.0 +20 0.0 +21 0.0 +22 0.0 +23 0.0 +24 0.0 +25 0.0 +26 0.0 +27 0.0 +28 0.0 +29 0.0 +30 0.0 +31 0.0 +32 0.0 +33 0.0 +34 0.0 +35 0.0 +36 0.0 +37 0.0 +38 0.0 +39 0.0 +40 0.0 +41 0.0 +42 0.0 +43 0.0 +44 0.0 +45 0.0 +46 0.0 +47 0.0 +48 0.0 +49 0.0 +50 0.0 +51 0.0 +52 0.0 +53 0.0 +54 0.0 +55 0.0 +56 0.0 +57 0.0 +58 0.0 +59 0.0 +60 0.0 +61 0.0 +62 0.0 +63 0.0 +64 0.0 +65 0.0 +66 0.0 +67 0.0 +68 0.0 +69 0.0 +70 0.0 +>>END_MODULE +>>Sequence Length Distribution pass +#Length Count +70 20.0 +>>END_MODULE +>>Sequence Duplication Levels pass +#Total Deduplicated Percentage 100.0 +#Duplication Level Percentage of total +1 100.0 +2 0.0 +3 0.0 +4 0.0 +5 0.0 +6 0.0 +7 0.0 +8 0.0 +9 0.0 +>10 0.0 +>50 0.0 +>100 0.0 +>500 0.0 +>1k 0.0 +>5k 0.0 +>10k+ 0.0 +>>END_MODULE +>>Overrepresented sequences fail +#Sequence Count Percentage Possible Source +CCTTTCGCCATCAACTAACGATTCTGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAG 1 5.0 No Hit +TGGCGCTCTCCGTCTTTCTCCATTTCGTCGTGGCCTTGCTATTGACTCTA 1 5.0 No Hit +ACCATAAACGCAAGCCTCAACGCAGCGACGAGCACGAGAGCGGTCAGTAG 1 5.0 No Hit +TGTTTTCCGTAAATTCAGCGCCTTCCATGATGCGACAGGCCGTTTGAATG 1 5.0 No Hit +CTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGT 1 5.0 No Hit +TCTGCGTTTGCTGATGAACTAAGTCAACCTCAGCACTAACCTTGCGAGTC 1 5.0 No Hit +CCATACAAAACAGGGTCGCCAGCAATATCGGTATAAGTCAAAGCACCTTT 1 5.0 No Hit +TAAGCATTTGTTTCAGGGTTATTTGAATATCTATAACAACTATTTTCAAG 1 5.0 No Hit +CAAATTAGCATAAGCAGCTTGCAGACCCATAATGTCAATAGATGTGGTAG 1 5.0 No Hit +GCGTTAAGGTACTGAATCTCTTTAGTCGCAGTAGGCGGAAAACGAACAAG 1 5.0 No Hit +CTGAATGGAATTAAGAAAACCACCAATACCAGCATTAACCTTCAAACTAT 1 5.0 No Hit +GCGACCATTCAAAGGATAAACATCATAGGCAGTCGGGAGGGTAGTCGGAA 1 5.0 No Hit +GTGAAATTTCTAGGAAGGATGTTTTCCGTTCTGGTGATTCGTCTAAGAAG 1 5.0 No Hit +CTCAAATCCGGCGTCAACCATACCAGCATAGGAAGCATCAGCACCAGCAC 1 5.0 No Hit +TTCTGGTGATTTGCAAGAACGCGTACTTATTCGCCACCATGATTATGACC 1 5.0 No Hit +CTCGCGATTCAATCATGACTTCGTGATAAAAGATTGAGTGTGAGGTTATA 1 5.0 No Hit +TTAGGTGTGTGTAAAACAGGTGCCGAAGAAGCTGGATTAACAGAATTGAG 1 5.0 No Hit +GCGGTATTGCTTCTGCTCTTGCTGGTGGCGCCATGTCTAAATTGTTTGGA 1 5.0 No Hit +TTTCGGATATTTCTGATGAGTCGAAAAATTATCTTGATAAAGCAGTAATT 1 5.0 No Hit +CTCGCCAAATGACGACTTCTACCACATCTATTGACATTATGGGTCTGCAA 1 5.0 No Hit +>>END_MODULE +>>Adapter Content pass +#Position Illumina Universal Adapter Illumina Small RNA 3' Adapter Illumina Small RNA 5' Adapter Nextera Transposase Sequence PolyA PolyG +1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +10 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +20 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +30 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +40 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +50 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 +>>END_MODULE