Mercurial > repos > iuc > gemini_gene_wise
comparison test-data/gemini_dump_result.tabular @ 0:99d6e7b1b7f1 draft
planemo upload for repository https://github.com/bgruening/galaxytools/tree/master/tools/gemini commit 4bbfca6f0e9cae9a8f263aad4eab7304c96358c4
author | iuc |
---|---|
date | Thu, 18 Feb 2016 08:55:26 -0500 |
parents | |
children |
comparison
equal
deleted
inserted
replaced
-1:000000000000 | 0:99d6e7b1b7f1 |
---|---|
1 chrom start end ref alt type sub_type aaf in_dbsnp gene sample genotype | |
2 chr1 16976 16977 G A snp ts 0.375 0 DDX11L1 child_1 G/A | |
3 chr1 16976 16977 G A snp ts 0.375 0 DDX11L1 child_2 G/G | |
4 chr1 16976 16977 G A snp ts 0.375 0 DDX11L1 dad_2 G/A | |
5 chr1 16976 16977 G A snp ts 0.375 0 DDX11L1 mom_2 G/G | |
6 chr1 16976 16977 G A snp ts 0.375 0 DDX11L1 dad_1 G/G | |
7 chr1 16976 16977 G A snp ts 0.375 0 DDX11L1 mom_1 G/A | |
8 chr1 16976 16977 G A snp ts 0.375 0 DDX11L1 child_3 G/A | |
9 chr1 16976 16977 G A snp ts 0.375 0 DDX11L1 dad_3 G/A | |
10 chr1 16976 16977 G A snp ts 0.375 0 DDX11L1 mom_3 G/A | |
11 chr1 16976 16977 G A snp ts 0.375 0 DDX11L1 child_4 G/A | |
12 chr1 16976 16977 G A snp ts 0.375 0 DDX11L1 dad_4 G/A | |
13 chr1 16976 16977 G A snp ts 0.375 0 DDX11L1 mom_4 G/A | |
14 chr1 17221 17222 A G snp ts 0.166666666667 1 DDX11L1 child_1 A/A | |
15 chr1 17221 17222 A G snp ts 0.166666666667 1 DDX11L1 child_2 A/G | |
16 chr1 17221 17222 A G snp ts 0.166666666667 1 DDX11L1 dad_2 A/A | |
17 chr1 17221 17222 A G snp ts 0.166666666667 1 DDX11L1 mom_2 A/G | |
18 chr1 17221 17222 A G snp ts 0.166666666667 1 DDX11L1 dad_1 A/A | |
19 chr1 17221 17222 A G snp ts 0.166666666667 1 DDX11L1 mom_1 A/A | |
20 chr1 17221 17222 A G snp ts 0.166666666667 1 DDX11L1 child_3 A/A | |
21 chr1 17221 17222 A G snp ts 0.166666666667 1 DDX11L1 dad_3 A/A | |
22 chr1 17221 17222 A G snp ts 0.166666666667 1 DDX11L1 mom_3 A/G | |
23 chr1 17221 17222 A G snp ts 0.166666666667 1 DDX11L1 child_4 A/G | |
24 chr1 17221 17222 A G snp ts 0.166666666667 1 DDX11L1 dad_4 A/A | |
25 chr1 17221 17222 A G snp ts 0.166666666667 1 DDX11L1 mom_4 A/A | |
26 chr1 17362 17366 TTCT T indel del 0.0833333333333 0 WASH7P child_1 TTCT/TTCT | |
27 chr1 17362 17366 TTCT T indel del 0.0833333333333 0 WASH7P child_2 TTCT/TTCT | |
28 chr1 17362 17366 TTCT T indel del 0.0833333333333 0 WASH7P dad_2 TTCT/TTCT | |
29 chr1 17362 17366 TTCT T indel del 0.0833333333333 0 WASH7P mom_2 TTCT/TTCT | |
30 chr1 17362 17366 TTCT T indel del 0.0833333333333 0 WASH7P dad_1 TTCT/TTCT | |
31 chr1 17362 17366 TTCT T indel del 0.0833333333333 0 WASH7P mom_1 TTCT/TTCT | |
32 chr1 17362 17366 TTCT T indel del 0.0833333333333 0 WASH7P child_3 TTCT/TTCT | |
33 chr1 17362 17366 TTCT T indel del 0.0833333333333 0 WASH7P dad_3 TTCT/TTCT | |
34 chr1 17362 17366 TTCT T indel del 0.0833333333333 0 WASH7P mom_3 TTCT/TTCT | |
35 chr1 17362 17366 TTCT T indel del 0.0833333333333 0 WASH7P child_4 TTCT/T | |
36 chr1 17362 17366 TTCT T indel del 0.0833333333333 0 WASH7P dad_4 TTCT/T | |
37 chr1 17362 17366 TTCT T indel del 0.0833333333333 0 WASH7P mom_4 TTCT/TTCT | |
38 chr1 17562 17563 G A snp ts 0.0416666666667 0 DDX11L1 child_1 G/G | |
39 chr1 17562 17563 G A snp ts 0.0416666666667 0 DDX11L1 child_2 G/G | |
40 chr1 17562 17563 G A snp ts 0.0416666666667 0 DDX11L1 dad_2 G/G | |
41 chr1 17562 17563 G A snp ts 0.0416666666667 0 DDX11L1 mom_2 G/G | |
42 chr1 17562 17563 G A snp ts 0.0416666666667 0 DDX11L1 dad_1 G/G | |
43 chr1 17562 17563 G A snp ts 0.0416666666667 0 DDX11L1 mom_1 G/G | |
44 chr1 17562 17563 G A snp ts 0.0416666666667 0 DDX11L1 child_3 G/A | |
45 chr1 17562 17563 G A snp ts 0.0416666666667 0 DDX11L1 dad_3 G/G | |
46 chr1 17562 17563 G A snp ts 0.0416666666667 0 DDX11L1 mom_3 G/G | |
47 chr1 17562 17563 G A snp ts 0.0416666666667 0 DDX11L1 child_4 G/G | |
48 chr1 17562 17563 G A snp ts 0.0416666666667 0 DDX11L1 dad_4 G/G | |
49 chr1 17562 17563 G A snp ts 0.0416666666667 0 DDX11L1 mom_4 G/G | |
50 chr1 17696 17697 G C snp tv 0.166666666667 1 DDX11L1 child_1 G/C | |
51 chr1 17696 17697 G C snp tv 0.166666666667 1 DDX11L1 child_2 G/G | |
52 chr1 17696 17697 G C snp tv 0.166666666667 1 DDX11L1 dad_2 G/G | |
53 chr1 17696 17697 G C snp tv 0.166666666667 1 DDX11L1 mom_2 G/C | |
54 chr1 17696 17697 G C snp tv 0.166666666667 1 DDX11L1 dad_1 G/G | |
55 chr1 17696 17697 G C snp tv 0.166666666667 1 DDX11L1 mom_1 G/G | |
56 chr1 17696 17697 G C snp tv 0.166666666667 1 DDX11L1 child_3 G/G | |
57 chr1 17696 17697 G C snp tv 0.166666666667 1 DDX11L1 dad_3 G/C | |
58 chr1 17696 17697 G C snp tv 0.166666666667 1 DDX11L1 mom_3 G/G | |
59 chr1 17696 17697 G C snp tv 0.166666666667 1 DDX11L1 child_4 G/C | |
60 chr1 17696 17697 G C snp tv 0.166666666667 1 DDX11L1 dad_4 G/G | |
61 chr1 17696 17697 G C snp tv 0.166666666667 1 DDX11L1 mom_4 G/G | |
62 chr1 17721 17722 A G snp ts 0.125 1 DDX11L1 child_1 A/A | |
63 chr1 17721 17722 A G snp ts 0.125 1 DDX11L1 child_2 A/A | |
64 chr1 17721 17722 A G snp ts 0.125 1 DDX11L1 dad_2 A/A | |
65 chr1 17721 17722 A G snp ts 0.125 1 DDX11L1 mom_2 A/A | |
66 chr1 17721 17722 A G snp ts 0.125 1 DDX11L1 dad_1 A/A | |
67 chr1 17721 17722 A G snp ts 0.125 1 DDX11L1 mom_1 A/A | |
68 chr1 17721 17722 A G snp ts 0.125 1 DDX11L1 child_3 A/A | |
69 chr1 17721 17722 A G snp ts 0.125 1 DDX11L1 dad_3 A/A | |
70 chr1 17721 17722 A G snp ts 0.125 1 DDX11L1 mom_3 A/A | |
71 chr1 17721 17722 A G snp ts 0.125 1 DDX11L1 child_4 A/G | |
72 chr1 17721 17722 A G snp ts 0.125 1 DDX11L1 dad_4 A/G | |
73 chr1 17721 17722 A G snp ts 0.125 1 DDX11L1 mom_4 A/G | |
74 chr1 17729 17730 C A snp tv 0.208333333333 0 WASH7P child_1 C/C | |
75 chr1 17729 17730 C A snp tv 0.208333333333 0 WASH7P child_2 C/C | |
76 chr1 17729 17730 C A snp tv 0.208333333333 0 WASH7P dad_2 C/C | |
77 chr1 17729 17730 C A snp tv 0.208333333333 0 WASH7P mom_2 C/C | |
78 chr1 17729 17730 C A snp tv 0.208333333333 0 WASH7P dad_1 C/A | |
79 chr1 17729 17730 C A snp tv 0.208333333333 0 WASH7P mom_1 C/C | |
80 chr1 17729 17730 C A snp tv 0.208333333333 0 WASH7P child_3 C/A | |
81 chr1 17729 17730 C A snp tv 0.208333333333 0 WASH7P dad_3 C/C | |
82 chr1 17729 17730 C A snp tv 0.208333333333 0 WASH7P mom_3 C/C | |
83 chr1 17729 17730 C A snp tv 0.208333333333 0 WASH7P child_4 C/A | |
84 chr1 17729 17730 C A snp tv 0.208333333333 0 WASH7P dad_4 C/A | |
85 chr1 17729 17730 C A snp tv 0.208333333333 0 WASH7P mom_4 C/A | |
86 chr1 17745 17746 A G snp ts 0.333333333333 1 DDX11L1 child_1 A/A | |
87 chr1 17745 17746 A G snp ts 0.333333333333 1 DDX11L1 child_2 A/A | |
88 chr1 17745 17746 A G snp ts 0.333333333333 1 DDX11L1 dad_2 A/A | |
89 chr1 17745 17746 A G snp ts 0.333333333333 1 DDX11L1 mom_2 A/A | |
90 chr1 17745 17746 A G snp ts 0.333333333333 1 DDX11L1 dad_1 A/G | |
91 chr1 17745 17746 A G snp ts 0.333333333333 1 DDX11L1 mom_1 A/G | |
92 chr1 17745 17746 A G snp ts 0.333333333333 1 DDX11L1 child_3 A/G | |
93 chr1 17745 17746 A G snp ts 0.333333333333 1 DDX11L1 dad_3 A/G | |
94 chr1 17745 17746 A G snp ts 0.333333333333 1 DDX11L1 mom_3 A/G | |
95 chr1 17745 17746 A G snp ts 0.333333333333 1 DDX11L1 child_4 A/G | |
96 chr1 17745 17746 A G snp ts 0.333333333333 1 DDX11L1 dad_4 A/G | |
97 chr1 17745 17746 A G snp ts 0.333333333333 1 DDX11L1 mom_4 A/G |