Mercurial > repos > iuc > hyphy_fubar
diff test-data/busted-out2-2.json @ 32:90e57f65ddd9 draft
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/hyphy/ commit e74f0c1ed183da674db365c3a6ce320b0c08d9bc"
author | iuc |
---|---|
date | Sat, 27 Nov 2021 11:29:48 +0000 |
parents | cd41e7a4d35f |
children |
line wrap: on
line diff
--- a/test-data/busted-out2-2.json Tue Oct 05 05:08:01 2021 +0000 +++ b/test-data/busted-out2-2.json Sat Nov 27 11:29:48 2021 +0000 @@ -26,63 +26,1730 @@ END; BEGIN TREES; - TREE tree = ((((D_CD_83_ELI,D_CD_83_NDK),D_UG_94_94UG114),D_CD_84_84ZR085),B_US_83_RF,((B_FR_83_HXB2,B_US_86_JRFL),B_US_90_WEAU160)); + TREE tree = ((((D_CD_83_ELI,D_CD_83_NDK),D_UG_94_94UG114),D_CD_84_84ZR085),B_US_83_RF,((B_FR_83_HXB2,B_US_86_JRFL),B_US_90_WEAU160{B_US_90_WEAU160_BRANCH})); END; BEGIN HYPHY; -global busted.test.bsrel_mixture_aux_0=0.9641001770967245; +global busted.background.bsrel_mixture_aux_0=0.1693698006934513; +busted.background.bsrel_mixture_aux_0:<1; +global busted.background.bsrel_mixture_aux_1=0.988107636959172; +busted.background.bsrel_mixture_aux_1:<1; +global busted.background.omega1=0.2120937673953722; +busted.background.omega1:<1; +global busted.background.omega2=0.1679188282558003; +busted.background.omega2:<1; +global busted.background.omega3=13.84252711122189; +global busted.test.theta_AT=0.08592789487428711; +global busted.test.theta_CG=0.3252168536335274; +global busted.test.theta_CT=1.270142771514482; +global busted.test.theta_AC=0.2087011772321373; +global busted.test.theta_GT=0.01381611313186033; +global busted.test.bsrel_mixture_aux_0=0.9533274940567786; busted.test.bsrel_mixture_aux_0:<1; -global busted.test.bsrel_mixture_aux_1=0.7406649580775059; +global busted.test.omega1=0.08367159828032572; +busted.test.omega1:<1; +global busted.test.bsrel_mixture_aux_1=0.7963836507940498; busted.test.bsrel_mixture_aux_1:<1; -global busted.test.omega1=0.169565784922581; -busted.test.omega1:<1; -global busted.test.omega2=0.1490485393860332; -busted.test.omega2:<1; -global busted.test.omega3=15.09387961636913; +global busted.test.omega3=34.20463703717275; busted.test.omega3:>1; busted.test.omega3:<10000000000; -global busted.test.theta_GT=0.02357543200455627; -global busted.test.theta_CT=1.263698936859757; -global busted.test.theta_AC=0.2111611676313184; -global busted.test.theta_CG=0.3198378552689968; -global busted.test.theta_AT=0.08720815485914278; +global busted.test.omega2=0.2493792697064242; +busted.test.omega2:<1; global busted.test.theta_AG:=1; +global busted.background.theta_AC:=busted.test.theta_AC; +global busted.background.theta_AG:=1; +global busted.background.theta_AT:=busted.test.theta_AT; +global busted.background.theta_CG:=busted.test.theta_CG; +global busted.background.theta_CT:=busted.test.theta_CT; +global busted.background.theta_GT:=busted.test.theta_GT; +busted.background_Q_component_1={61,61}; +busted.background_Q_component_1[0][1]:=0.09717451507454297*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[0][2]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[0][3]:=0.1989860284705866*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[0][4]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[0][8]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[0][12]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[0][16]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[0][32]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[1][0]:=0.5074830879161225*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[1][2]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[1][3]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[1][5]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[1][9]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[1][13]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[1][17]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[1][33]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[1][48]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[2][0]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[2][1]:=0.09717451507454297*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[2][3]:=0.1989860284705866*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[2][6]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[2][10]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[2][14]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[2][18]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[2][34]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[3][0]:=0.5074830879161225*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[3][1]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[3][2]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[3][7]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[3][11]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[3][15]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[3][19]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[3][35]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[3][49]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[4][0]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[4][5]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[4][6]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[4][7]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[4][8]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[4][12]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[4][20]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[4][36]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[4][50]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[5][1]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[5][4]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[5][6]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[5][7]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[5][9]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[5][13]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[5][21]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[5][37]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[5][51]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[6][2]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[6][4]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[6][5]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[6][7]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[6][10]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[6][14]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[6][22]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[6][38]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[6][52]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[7][3]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[7][4]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[7][5]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[7][6]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[7][11]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[7][15]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[7][23]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[7][39]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[7][53]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[8][0]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[8][4]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[8][9]:=0.09717451507454297*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[8][10]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[8][11]:=0.1989860284705866*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[8][12]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[8][24]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[8][40]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[9][1]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[9][5]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[9][8]:=0.5074830879161225*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[9][10]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[9][11]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[9][13]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[9][25]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[9][41]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[9][54]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[10][2]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[10][6]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[10][8]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[10][9]:=0.09717451507454297*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[10][11]:=0.1989860284705866*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[10][14]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[10][26]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[10][42]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[10][55]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[11][3]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[11][7]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[11][8]:=0.5074830879161225*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[11][9]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[11][10]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[11][15]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[11][27]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[11][43]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[11][56]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[12][0]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[12][4]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[12][8]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[12][13]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[12][14]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[12][15]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[12][28]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[12][44]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[12][57]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[13][1]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[13][5]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[13][9]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[13][12]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[13][14]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[13][15]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[13][29]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[13][45]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[13][58]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[14][2]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[14][6]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[14][10]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[14][12]:=0.5074830879161225*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[14][13]:=0.09717451507454297*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[14][15]:=0.1989860284705866*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[14][30]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[14][46]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[14][59]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[15][3]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[15][7]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[15][11]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[15][12]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[15][13]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[15][14]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[15][31]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[15][47]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[15][60]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[16][0]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[16][17]:=0.09717451507454297*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[16][18]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[16][19]:=0.1989860284705866*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[16][20]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[16][24]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[16][28]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[16][32]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[17][1]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[17][16]:=0.5074830879161225*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[17][18]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[17][19]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[17][21]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[17][25]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[17][29]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[17][33]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[17][48]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[18][2]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[18][16]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[18][17]:=0.09717451507454297*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[18][19]:=0.1989860284705866*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[18][22]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[18][26]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[18][30]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[18][34]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[19][3]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[19][16]:=0.5074830879161225*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[19][17]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[19][18]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[19][23]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[19][27]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[19][31]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[19][35]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[19][49]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[20][4]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[20][16]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[20][21]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[20][22]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[20][23]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[20][24]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[20][28]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[20][36]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[20][50]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[21][5]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[21][17]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[21][20]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[21][22]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[21][23]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[21][25]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[21][29]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[21][37]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[21][51]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[22][6]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[22][18]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[22][20]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[22][21]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[22][23]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[22][26]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[22][30]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[22][38]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[22][52]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[23][7]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[23][19]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[23][20]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[23][21]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[23][22]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[23][27]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[23][31]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[23][39]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[23][53]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[24][8]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[24][16]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[24][20]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[24][25]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[24][26]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[24][27]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[24][28]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[24][40]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[25][9]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[25][17]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[25][21]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[25][24]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[25][26]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[25][27]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[25][29]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[25][41]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[25][54]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[26][10]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[26][18]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[26][22]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[26][24]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[26][25]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[26][27]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[26][30]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[26][42]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[26][55]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[27][11]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[27][19]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[27][23]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[27][24]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[27][25]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[27][26]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[27][31]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[27][43]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[27][56]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[28][12]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[28][16]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[28][20]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[28][24]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[28][29]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[28][30]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[28][31]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[28][44]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[28][57]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[29][13]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[29][17]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[29][21]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[29][25]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[29][28]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[29][30]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[29][31]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[29][45]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[29][58]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[30][14]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[30][18]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[30][22]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[30][26]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[30][28]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[30][29]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[30][31]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[30][46]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[30][59]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[31][15]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[31][19]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[31][23]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[31][27]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[31][28]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[31][29]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[31][30]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[31][47]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[31][60]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[32][0]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[32][16]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[32][33]:=0.09717451507454297*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[32][34]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[32][35]:=0.1989860284705866*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[32][36]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[32][40]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[32][44]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[33][1]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[33][17]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[33][32]:=0.5074830879161225*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[33][34]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[33][35]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[33][37]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[33][41]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[33][45]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[33][48]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[34][2]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[34][18]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[34][32]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[34][33]:=0.09717451507454297*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[34][35]:=0.1989860284705866*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[34][38]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[34][42]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[34][46]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[35][3]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[35][19]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[35][32]:=0.5074830879161225*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[35][33]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[35][34]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[35][39]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[35][43]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[35][47]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[35][49]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[36][4]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[36][20]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[36][32]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[36][37]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[36][38]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[36][39]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[36][40]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[36][44]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[36][50]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[37][5]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[37][21]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[37][33]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[37][36]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[37][38]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[37][39]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[37][41]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[37][45]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[37][51]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[38][6]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[38][22]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[38][34]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[38][36]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[38][37]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[38][39]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[38][42]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[38][46]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[38][52]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[39][7]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[39][23]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[39][35]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[39][36]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[39][37]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[39][38]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[39][43]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[39][47]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[39][53]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[40][8]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[40][24]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[40][32]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[40][36]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[40][41]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[40][42]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[40][43]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[40][44]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[41][9]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[41][25]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[41][33]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[41][37]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[41][40]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[41][42]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[41][43]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[41][45]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[41][54]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[42][10]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[42][26]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[42][34]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[42][38]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[42][40]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[42][41]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[42][43]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[42][46]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[42][55]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[43][11]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[43][27]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[43][35]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[43][39]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[43][40]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[43][41]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[43][42]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[43][47]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[43][56]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[44][12]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[44][28]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[44][32]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[44][36]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[44][40]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[44][45]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[44][46]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[44][47]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[44][57]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[45][13]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[45][29]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[45][33]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[45][37]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[45][41]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[45][44]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[45][46]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[45][47]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[45][58]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[46][14]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[46][30]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[46][34]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[46][38]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[46][42]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[46][44]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[46][45]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[46][47]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[46][59]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[47][15]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[47][31]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[47][35]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[47][39]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[47][43]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[47][44]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[47][45]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[47][46]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[47][60]:=0.257146542110382*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[48][1]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[48][17]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[48][33]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[48][49]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[48][51]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[48][54]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[48][58]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[49][3]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[49][19]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[49][35]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[49][48]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[49][53]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[49][56]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[49][60]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[50][4]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[50][20]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[50][36]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[50][51]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[50][52]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[50][53]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[50][57]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[51][5]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[51][21]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[51][37]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[51][48]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[51][50]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[51][52]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[51][53]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[51][54]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[51][58]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[52][6]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[52][22]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[52][38]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[52][50]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[52][51]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[52][53]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[52][55]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[52][59]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[53][7]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[53][23]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[53][39]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[53][49]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[53][50]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[53][51]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[53][52]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[53][56]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[53][60]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[54][9]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[54][25]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[54][41]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[54][48]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[54][51]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[54][55]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[54][56]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[54][58]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[55][10]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[55][26]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[55][42]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[55][52]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[55][54]:=0.09717451507454297*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[55][56]:=0.1989860284705866*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[55][59]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[56][11]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[56][27]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[56][43]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[56][49]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[56][53]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[56][54]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[56][55]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[56][60]:=0.2361684149931496*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[57][12]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[57][28]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[57][44]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[57][50]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[57][58]:=0.09717451507454297*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[57][59]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[57][60]:=0.1989860284705866*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[58][13]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[58][29]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[58][45]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[58][48]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[58][51]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[58][54]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[58][57]:=0.5074830879161225*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_1[58][59]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[58][60]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[59][14]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[59][30]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[59][46]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[59][52]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[59][55]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[59][57]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_1[59][58]:=0.09717451507454297*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_1[59][60]:=0.1989860284705866*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[60][15]:=0.3148753970510747*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[60][31]:=0.1712746635706107*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[60][47]:=0.2567033972679326*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[60][49]:=0.4256503784977386*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[60][53]:=0.1818409092376876*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[60][56]:=0.1563402972714242*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_1[60][57]:=0.5074830879161225*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_1[60][58]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_1[60][59]:=0.1963563685387479*t*busted.background.omega1*busted.background.theta_GT; + + +busted.background_Q_component_2={61,61}; +busted.background_Q_component_2[0][1]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[0][2]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[0][3]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[0][4]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[0][8]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[0][12]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[0][16]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[0][32]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[1][0]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[1][2]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[1][3]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[1][5]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[1][9]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[1][13]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[1][17]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[1][33]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[1][48]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[2][0]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[2][1]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[2][3]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[2][6]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[2][10]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[2][14]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[2][18]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[2][34]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[3][0]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[3][1]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[3][2]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[3][7]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[3][11]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[3][15]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[3][19]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[3][35]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[3][49]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[4][0]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[4][5]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[4][6]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[4][7]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[4][8]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[4][12]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[4][20]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[4][36]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[4][50]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[5][1]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[5][4]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[5][6]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[5][7]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[5][9]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[5][13]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[5][21]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[5][37]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[5][51]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[6][2]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[6][4]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[6][5]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[6][7]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[6][10]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[6][14]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[6][22]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[6][38]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[6][52]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[7][3]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[7][4]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[7][5]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[7][6]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[7][11]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[7][15]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[7][23]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[7][39]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[7][53]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[8][0]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[8][4]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[8][9]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[8][10]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[8][11]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[8][12]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[8][24]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[8][40]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[9][1]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[9][5]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[9][8]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[9][10]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[9][11]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[9][13]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[9][25]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[9][41]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[9][54]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[10][2]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[10][6]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[10][8]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[10][9]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[10][11]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[10][14]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[10][26]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[10][42]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[10][55]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[11][3]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[11][7]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[11][8]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[11][9]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[11][10]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[11][15]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[11][27]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[11][43]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[11][56]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[12][0]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[12][4]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[12][8]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[12][13]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[12][14]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[12][15]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[12][28]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[12][44]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[12][57]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[13][1]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[13][5]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[13][9]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[13][12]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[13][14]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[13][15]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[13][29]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[13][45]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[13][58]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[14][2]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[14][6]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[14][10]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[14][12]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[14][13]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[14][15]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[14][30]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[14][46]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[14][59]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[15][3]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[15][7]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[15][11]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[15][12]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[15][13]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[15][14]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[15][31]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[15][47]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[15][60]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[16][0]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[16][17]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[16][18]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[16][19]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[16][20]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[16][24]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[16][28]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[16][32]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[17][1]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[17][16]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[17][18]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[17][19]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[17][21]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[17][25]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[17][29]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[17][33]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[17][48]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[18][2]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[18][16]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[18][17]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[18][19]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[18][22]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[18][26]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[18][30]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[18][34]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[19][3]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[19][16]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[19][17]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[19][18]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[19][23]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[19][27]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[19][31]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[19][35]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[19][49]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[20][4]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[20][16]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[20][21]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[20][22]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[20][23]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[20][24]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[20][28]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[20][36]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[20][50]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[21][5]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[21][17]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[21][20]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[21][22]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[21][23]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[21][25]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[21][29]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[21][37]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[21][51]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[22][6]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[22][18]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[22][20]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[22][21]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[22][23]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[22][26]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[22][30]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[22][38]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[22][52]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[23][7]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[23][19]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[23][20]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[23][21]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[23][22]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[23][27]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[23][31]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[23][39]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[23][53]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[24][8]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[24][16]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[24][20]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[24][25]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[24][26]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[24][27]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[24][28]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[24][40]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[25][9]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[25][17]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[25][21]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[25][24]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[25][26]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[25][27]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[25][29]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[25][41]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[25][54]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[26][10]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[26][18]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[26][22]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[26][24]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[26][25]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[26][27]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[26][30]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[26][42]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[26][55]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[27][11]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[27][19]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[27][23]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[27][24]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[27][25]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[27][26]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[27][31]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[27][43]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[27][56]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[28][12]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[28][16]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[28][20]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[28][24]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[28][29]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[28][30]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[28][31]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[28][44]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[28][57]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[29][13]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[29][17]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[29][21]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[29][25]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[29][28]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[29][30]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[29][31]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[29][45]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[29][58]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[30][14]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[30][18]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[30][22]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[30][26]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[30][28]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[30][29]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[30][31]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[30][46]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[30][59]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[31][15]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[31][19]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[31][23]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[31][27]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[31][28]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[31][29]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[31][30]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[31][47]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[31][60]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[32][0]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[32][16]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[32][33]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[32][34]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[32][35]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[32][36]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[32][40]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[32][44]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[33][1]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[33][17]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[33][32]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[33][34]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[33][35]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[33][37]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[33][41]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[33][45]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[33][48]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[34][2]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[34][18]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[34][32]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[34][33]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[34][35]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[34][38]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[34][42]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[34][46]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[35][3]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[35][19]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[35][32]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[35][33]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[35][34]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[35][39]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[35][43]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[35][47]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[35][49]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[36][4]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[36][20]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[36][32]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[36][37]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[36][38]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[36][39]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[36][40]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[36][44]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[36][50]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[37][5]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[37][21]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[37][33]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[37][36]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[37][38]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[37][39]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[37][41]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[37][45]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[37][51]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[38][6]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[38][22]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[38][34]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[38][36]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[38][37]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[38][39]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[38][42]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[38][46]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[38][52]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[39][7]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[39][23]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[39][35]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[39][36]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[39][37]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[39][38]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[39][43]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[39][47]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[39][53]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[40][8]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[40][24]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[40][32]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[40][36]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[40][41]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[40][42]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[40][43]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[40][44]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[41][9]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[41][25]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[41][33]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[41][37]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[41][40]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[41][42]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[41][43]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[41][45]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[41][54]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[42][10]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[42][26]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[42][34]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[42][38]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[42][40]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[42][41]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[42][43]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[42][46]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[42][55]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[43][11]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[43][27]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[43][35]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[43][39]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[43][40]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[43][41]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[43][42]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[43][47]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[43][56]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[44][12]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[44][28]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[44][32]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[44][36]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[44][40]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[44][45]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[44][46]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[44][47]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[44][57]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[45][13]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[45][29]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[45][33]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[45][37]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[45][41]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[45][44]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[45][46]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[45][47]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[45][58]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[46][14]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[46][30]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[46][34]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[46][38]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[46][42]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[46][44]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[46][45]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[46][47]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[46][59]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[47][15]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[47][31]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[47][35]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[47][39]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[47][43]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[47][44]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[47][45]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[47][46]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[47][60]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[48][1]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[48][17]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[48][33]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[48][49]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[48][51]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[48][54]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[48][58]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[49][3]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[49][19]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[49][35]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[49][48]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[49][53]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[49][56]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[49][60]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[50][4]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[50][20]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[50][36]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[50][51]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[50][52]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[50][53]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[50][57]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[51][5]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[51][21]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[51][37]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[51][48]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[51][50]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_2[51][52]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[51][53]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[51][54]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[51][58]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[52][6]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[52][22]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[52][38]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[52][50]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[52][51]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_2[52][53]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[52][55]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[52][59]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[53][7]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[53][23]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[53][39]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[53][49]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[53][50]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_2[53][51]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[53][52]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_2[53][56]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[53][60]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[54][9]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[54][25]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[54][41]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[54][48]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[54][51]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[54][55]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[54][56]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[54][58]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[55][10]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[55][26]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[55][42]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[55][52]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[55][54]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[55][56]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[55][59]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[56][11]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[56][27]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[56][43]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[56][49]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[56][53]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[56][54]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[56][55]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[56][60]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[57][12]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[57][28]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[57][44]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[57][50]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[57][58]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[57][59]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[57][60]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[58][13]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[58][29]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[58][45]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[58][48]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[58][51]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[58][54]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[58][57]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[58][59]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[58][60]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[59][14]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[59][30]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[59][46]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[59][52]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[59][55]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[59][57]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_2[59][58]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[59][60]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[60][15]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[60][31]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[60][47]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[60][49]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[60][53]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[60][56]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[60][57]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega2; +busted.background_Q_component_2[60][58]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_2[60][59]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega2; + + +busted.background_Q_component_3={61,61}; +busted.background_Q_component_3[0][1]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[0][2]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[0][3]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[0][4]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[0][8]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[0][12]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[0][16]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[0][32]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[1][0]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[1][2]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[1][3]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[1][5]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[1][9]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[1][13]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[1][17]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[1][33]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[1][48]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[2][0]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[2][1]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[2][3]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[2][6]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[2][10]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[2][14]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[2][18]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[2][34]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[3][0]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[3][1]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[3][2]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[3][7]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[3][11]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[3][15]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[3][19]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[3][35]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[3][49]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[4][0]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[4][5]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[4][6]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[4][7]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[4][8]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[4][12]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[4][20]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[4][36]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[4][50]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[5][1]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[5][4]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[5][6]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[5][7]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[5][9]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[5][13]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[5][21]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[5][37]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[5][51]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[6][2]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[6][4]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[6][5]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[6][7]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[6][10]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[6][14]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[6][22]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[6][38]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[6][52]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[7][3]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[7][4]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[7][5]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[7][6]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[7][11]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[7][15]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[7][23]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[7][39]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[7][53]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[8][0]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[8][4]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[8][9]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[8][10]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[8][11]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[8][12]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[8][24]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[8][40]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[9][1]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[9][5]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[9][8]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[9][10]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[9][11]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[9][13]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[9][25]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[9][41]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[9][54]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[10][2]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[10][6]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[10][8]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[10][9]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[10][11]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[10][14]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[10][26]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[10][42]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[10][55]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[11][3]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[11][7]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[11][8]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[11][9]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[11][10]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[11][15]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[11][27]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[11][43]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[11][56]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[12][0]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[12][4]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[12][8]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[12][13]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[12][14]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[12][15]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[12][28]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[12][44]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[12][57]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[13][1]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[13][5]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[13][9]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[13][12]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[13][14]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[13][15]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[13][29]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[13][45]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[13][58]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[14][2]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[14][6]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[14][10]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[14][12]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[14][13]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[14][15]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[14][30]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[14][46]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[14][59]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[15][3]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[15][7]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[15][11]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[15][12]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[15][13]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[15][14]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[15][31]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[15][47]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[15][60]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[16][0]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[16][17]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[16][18]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[16][19]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[16][20]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[16][24]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[16][28]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[16][32]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[17][1]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[17][16]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[17][18]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[17][19]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[17][21]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[17][25]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[17][29]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[17][33]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[17][48]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[18][2]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[18][16]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[18][17]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[18][19]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[18][22]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[18][26]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[18][30]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[18][34]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[19][3]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[19][16]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[19][17]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[19][18]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[19][23]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[19][27]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[19][31]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[19][35]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[19][49]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[20][4]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[20][16]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[20][21]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[20][22]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[20][23]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[20][24]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[20][28]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[20][36]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[20][50]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[21][5]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[21][17]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[21][20]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[21][22]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[21][23]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[21][25]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[21][29]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[21][37]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[21][51]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[22][6]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[22][18]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[22][20]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[22][21]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[22][23]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[22][26]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[22][30]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[22][38]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[22][52]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[23][7]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[23][19]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[23][20]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[23][21]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[23][22]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[23][27]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[23][31]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[23][39]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[23][53]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[24][8]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[24][16]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[24][20]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[24][25]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[24][26]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[24][27]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[24][28]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[24][40]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[25][9]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[25][17]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[25][21]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[25][24]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[25][26]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[25][27]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[25][29]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[25][41]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[25][54]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[26][10]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[26][18]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[26][22]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[26][24]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[26][25]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[26][27]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[26][30]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[26][42]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[26][55]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[27][11]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[27][19]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[27][23]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[27][24]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[27][25]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[27][26]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[27][31]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[27][43]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[27][56]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[28][12]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[28][16]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[28][20]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[28][24]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[28][29]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[28][30]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[28][31]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[28][44]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[28][57]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[29][13]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[29][17]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[29][21]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[29][25]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[29][28]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[29][30]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[29][31]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[29][45]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[29][58]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[30][14]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[30][18]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[30][22]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[30][26]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[30][28]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[30][29]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[30][31]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[30][46]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[30][59]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[31][15]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[31][19]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[31][23]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[31][27]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[31][28]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[31][29]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[31][30]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[31][47]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[31][60]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[32][0]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[32][16]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[32][33]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[32][34]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[32][35]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[32][36]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[32][40]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[32][44]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[33][1]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[33][17]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[33][32]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[33][34]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[33][35]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[33][37]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[33][41]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[33][45]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[33][48]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[34][2]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[34][18]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[34][32]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[34][33]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[34][35]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[34][38]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[34][42]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[34][46]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[35][3]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[35][19]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[35][32]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[35][33]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[35][34]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[35][39]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[35][43]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[35][47]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[35][49]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[36][4]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[36][20]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[36][32]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[36][37]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[36][38]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[36][39]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[36][40]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[36][44]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[36][50]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[37][5]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[37][21]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[37][33]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[37][36]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[37][38]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[37][39]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[37][41]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[37][45]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[37][51]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[38][6]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[38][22]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[38][34]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[38][36]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[38][37]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[38][39]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[38][42]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[38][46]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[38][52]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[39][7]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[39][23]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[39][35]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[39][36]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[39][37]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[39][38]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[39][43]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[39][47]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[39][53]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[40][8]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[40][24]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[40][32]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[40][36]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[40][41]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[40][42]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[40][43]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[40][44]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[41][9]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[41][25]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[41][33]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[41][37]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[41][40]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[41][42]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[41][43]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[41][45]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[41][54]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[42][10]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[42][26]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[42][34]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[42][38]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[42][40]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[42][41]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[42][43]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[42][46]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[42][55]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[43][11]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[43][27]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[43][35]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[43][39]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[43][40]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[43][41]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[43][42]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[43][47]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[43][56]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[44][12]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[44][28]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[44][32]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[44][36]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[44][40]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[44][45]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[44][46]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[44][47]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[44][57]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[45][13]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[45][29]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[45][33]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[45][37]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[45][41]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[45][44]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[45][46]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[45][47]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[45][58]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[46][14]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[46][30]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[46][34]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[46][38]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[46][42]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[46][44]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[46][45]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[46][47]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[46][59]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[47][15]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[47][31]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[47][35]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[47][39]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[47][43]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[47][44]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[47][45]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[47][46]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[47][60]:=0.257146542110382*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[48][1]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[48][17]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[48][33]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[48][49]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[48][51]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[48][54]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[48][58]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[49][3]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[49][19]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[49][35]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[49][48]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[49][53]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[49][56]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[49][60]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[50][4]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[50][20]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[50][36]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[50][51]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[50][52]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[50][53]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[50][57]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[51][5]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[51][21]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[51][37]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[51][48]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[51][50]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC; +busted.background_Q_component_3[51][52]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[51][53]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[51][54]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[51][58]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[52][6]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[52][22]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[52][38]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[52][50]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[52][51]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG; +busted.background_Q_component_3[52][53]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[52][55]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[52][59]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[53][7]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[53][23]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[53][39]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[53][49]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[53][50]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT; +busted.background_Q_component_3[53][51]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[53][52]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT; +busted.background_Q_component_3[53][56]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[53][60]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[54][9]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[54][25]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[54][41]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[54][48]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[54][51]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[54][55]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[54][56]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[54][58]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[55][10]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[55][26]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[55][42]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[55][52]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[55][54]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[55][56]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[55][59]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[56][11]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[56][27]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[56][43]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[56][49]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[56][53]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[56][54]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[56][55]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[56][60]:=0.2361684149931496*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[57][12]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[57][28]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[57][44]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[57][50]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[57][58]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[57][59]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[57][60]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[58][13]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[58][29]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[58][45]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[58][48]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[58][51]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[58][54]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[58][57]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AC*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[58][59]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[58][60]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[59][14]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[59][30]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[59][46]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[59][52]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[59][55]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[59][57]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AG; +busted.background_Q_component_3[59][58]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CG*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[59][60]:=0.1989860284705866*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[60][15]:=0.3148753970510747*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[60][31]:=0.1712746635706107*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[60][47]:=0.2567033972679326*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[60][49]:=0.4256503784977386*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[60][53]:=0.1818409092376876*t*busted.background.theta_CT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[60][56]:=0.1563402972714242*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[60][57]:=0.5074830879161225*t*busted.background.theta_AT*busted.background.omega3; +busted.background_Q_component_3[60][58]:=0.09717451507454297*t*busted.background.theta_CT; +busted.background_Q_component_3[60][59]:=0.1963563685387479*t*busted.background.theta_GT*busted.background.omega3; + + +busted.background_pi={ +{0.07535940345366139} +{0.01443006409728228} +{0.02915821068672351} +{0.02954870567752823} +{0.03219408024958758} +{0.006164627375802654} +{0.01245659774045292} +{0.01262342001471309} +{0.0276793164843978} +{0.005300125700761717} +{0.01070973633984303} +{0.01085316415297191} +{0.0418125103783387} +{0.008006395714089126} +{0.01617817990958604} +{0.0163948426631036} +{0.0409913146415633} +{0.007849150478922548} +{0.01586044121725868} +{0.01607284872448998} +{0.01751178502783737} +{0.003353213651232053} +{0.006775694789785172} +{0.006866436807635995} +{0.01505600521072376} +{0.002882972930821469} +{0.005825499564956559} +{0.005903516300053625} +{0.02274367484777162} +{0.004355032959661065} +{0.008800028033786655} +{0.008917880494044083} +{0.06143704799998004} +{0.01176416611541591} +{0.0237713451467977} +{0.0240896977132239} +{0.0262463496652457} +{0.005025736545566795} +{0.01015528996016046} +{0.01029129247081581} +{0.02256567087217255} +{0.004320948178469224} +{0.008731154380523415} +{0.00884808446536876} +{0.034087812394816} +{0.006527245376826684} +{0.01318932435908579} +{0.01336595951511979} +{0.01178447449308153} +{0.02413128354890585} +{0.0262916585104385} +{0.005034412430862358} +{0.01017282094890981} +{0.01030905823951665} +{0.004328407393735399} +{0.008746226896405704} +{0.008863358836639712} +{0.03414665788893068} +{0.006538513303760755} +{0.0132120929750345} +{0.01338903305480236} +}; +Model busted.background=('Exp(busted.background_Q_component_1)*1*busted.background.bsrel_mixture_aux_0+Exp(busted.background_Q_component_2)*1*(1-busted.background.bsrel_mixture_aux_0)*busted.background.bsrel_mixture_aux_1+Exp(busted.background_Q_component_3)*1*(1-busted.background.bsrel_mixture_aux_0)*(1-busted.background.bsrel_mixture_aux_1)',busted.background_pi,EXPLICIT_FORM_MATRIX_EXPONENTIAL); + busted.test_Q_component_1={61,61}; busted.test_Q_component_1[0][1]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[0][2]:=0.1963563685387479*t*busted.test.theta_AG; busted.test_Q_component_1[0][3]:=0.1989860284705866*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[0][4]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[0][8]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[0][8]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[0][12]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[0][16]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[0][32]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[0][32]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[1][0]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[1][2]:=0.1963563685387479*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[1][3]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[1][5]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[1][9]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[1][9]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[1][13]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[1][17]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[1][33]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[1][33]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[1][48]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[2][0]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AG; busted.test_Q_component_1[2][1]:=0.09717451507454297*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[2][3]:=0.1989860284705866*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[2][6]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[2][10]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[2][10]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[2][14]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[2][18]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[2][34]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[2][34]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[3][0]:=0.5074830879161225*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[3][1]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[3][2]:=0.1963563685387479*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[3][7]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[3][11]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[3][11]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[3][15]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[3][19]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[3][35]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[3][35]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[3][49]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[4][0]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[4][5]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_AC; @@ -91,7 +1758,7 @@ busted.test_Q_component_1[4][8]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[4][12]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[4][20]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[4][36]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[4][36]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[4][50]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[5][1]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[5][4]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AC; @@ -100,7 +1767,7 @@ busted.test_Q_component_1[5][9]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[5][13]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[5][21]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[5][37]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[5][37]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[5][51]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[6][2]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[6][4]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AG; @@ -109,7 +1776,7 @@ busted.test_Q_component_1[6][10]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[6][14]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[6][22]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[6][38]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[6][38]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[6][52]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[7][3]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[7][4]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AT; @@ -118,51 +1785,51 @@ busted.test_Q_component_1[7][11]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[7][15]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[7][23]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[7][39]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[7][39]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[7][53]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; -busted.test_Q_component_1[8][0]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[8][0]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[8][4]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[8][9]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[8][10]:=0.1963563685387479*t*busted.test.theta_AG; busted.test_Q_component_1[8][11]:=0.1989860284705866*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[8][12]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[8][24]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC; -busted.test_Q_component_1[8][40]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; -busted.test_Q_component_1[9][1]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[8][40]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; +busted.test_Q_component_1[9][1]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[9][5]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[9][8]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[9][10]:=0.1963563685387479*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[9][11]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[9][13]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[9][25]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[9][41]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[9][41]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[9][54]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; -busted.test_Q_component_1[10][2]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[10][2]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[10][6]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[10][8]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AG; busted.test_Q_component_1[10][9]:=0.09717451507454297*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[10][11]:=0.1989860284705866*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[10][14]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[10][26]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC; -busted.test_Q_component_1[10][42]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[10][42]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[10][55]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; -busted.test_Q_component_1[11][3]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[11][3]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[11][7]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[11][8]:=0.5074830879161225*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[11][9]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[11][10]:=0.1963563685387479*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[11][15]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[11][27]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[11][43]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[11][43]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[11][56]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[12][0]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[12][4]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[12][8]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[12][13]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_AC; -busted.test_Q_component_1[12][14]:=0.1963563685387479*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[12][14]:=0.1963563685387479*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[12][15]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[12][28]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[12][44]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[12][44]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[12][57]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[13][1]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[13][5]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; @@ -171,16 +1838,16 @@ busted.test_Q_component_1[13][14]:=0.1963563685387479*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[13][15]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[13][29]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[13][45]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[13][45]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[13][58]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[14][2]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[14][6]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[14][10]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[14][12]:=0.5074830879161225*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[14][12]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[14][13]:=0.09717451507454297*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[14][15]:=0.1989860284705866*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[14][30]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[14][46]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[14][46]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[14][59]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[15][3]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[15][7]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; @@ -189,14 +1856,14 @@ busted.test_Q_component_1[15][13]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[15][14]:=0.1963563685387479*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[15][31]:=0.1712746635706107*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[15][47]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[15][47]:=0.2567033972679326*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[15][60]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[16][0]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[16][17]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[16][18]:=0.1963563685387479*t*busted.test.theta_AG; busted.test_Q_component_1[16][19]:=0.1989860284705866*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[16][20]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[16][24]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[16][24]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[16][28]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[16][32]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[17][1]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; @@ -204,7 +1871,7 @@ busted.test_Q_component_1[17][18]:=0.1963563685387479*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[17][19]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[17][21]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[17][25]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[17][25]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[17][29]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[17][33]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[17][48]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; @@ -213,7 +1880,7 @@ busted.test_Q_component_1[18][17]:=0.09717451507454297*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[18][19]:=0.1989860284705866*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[18][22]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[18][26]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[18][26]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[18][30]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[18][34]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[19][3]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; @@ -221,7 +1888,7 @@ busted.test_Q_component_1[19][17]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[19][18]:=0.1963563685387479*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[19][23]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[19][27]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[19][27]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[19][31]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[19][35]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[19][49]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; @@ -262,7 +1929,7 @@ busted.test_Q_component_1[23][39]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[23][53]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[24][8]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AC; -busted.test_Q_component_1[24][16]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[24][16]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[24][20]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[24][25]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_AC; busted.test_Q_component_1[24][26]:=0.1963563685387479*t*busted.test.theta_AG; @@ -270,7 +1937,7 @@ busted.test_Q_component_1[24][28]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[24][40]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[25][9]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[25][17]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[25][17]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[25][21]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[25][24]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AC; busted.test_Q_component_1[25][26]:=0.1963563685387479*t*busted.test.theta_CG; @@ -279,7 +1946,7 @@ busted.test_Q_component_1[25][41]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[25][54]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[26][10]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AC; -busted.test_Q_component_1[26][18]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[26][18]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[26][22]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[26][24]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AG; busted.test_Q_component_1[26][25]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_CG; @@ -288,7 +1955,7 @@ busted.test_Q_component_1[26][42]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[26][55]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[27][11]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[27][19]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[27][19]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[27][23]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[27][24]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[27][25]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_CT; @@ -332,41 +1999,41 @@ busted.test_Q_component_1[31][30]:=0.1963563685387479*t*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[31][47]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[31][60]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; -busted.test_Q_component_1[32][0]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[32][0]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[32][16]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[32][33]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[32][34]:=0.1963563685387479*t*busted.test.theta_AG; busted.test_Q_component_1[32][35]:=0.1989860284705866*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[32][36]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[32][40]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[32][40]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[32][44]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; -busted.test_Q_component_1[33][1]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[33][1]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[33][17]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[33][32]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[33][34]:=0.1963563685387479*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[33][35]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[33][37]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[33][41]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[33][41]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[33][45]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[33][48]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[34][2]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[34][2]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[34][18]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[34][32]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AG; busted.test_Q_component_1[34][33]:=0.09717451507454297*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[34][35]:=0.1989860284705866*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[34][38]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[34][42]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[34][42]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[34][46]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; -busted.test_Q_component_1[35][3]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[35][3]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[35][19]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[35][32]:=0.5074830879161225*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[35][33]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[35][34]:=0.1963563685387479*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[35][39]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[35][43]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[35][43]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[35][47]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[35][49]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[36][4]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[36][4]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[36][20]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[36][32]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[36][37]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_AC; @@ -375,7 +2042,7 @@ busted.test_Q_component_1[36][40]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[36][44]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[36][50]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[37][5]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[37][5]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[37][21]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[37][33]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[37][36]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AC; @@ -384,7 +2051,7 @@ busted.test_Q_component_1[37][41]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[37][45]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[37][51]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[38][6]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[38][6]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[38][22]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[38][34]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[38][36]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AG; @@ -393,7 +2060,7 @@ busted.test_Q_component_1[38][42]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[38][46]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[38][52]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[39][7]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[39][7]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[39][23]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[39][35]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[39][36]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AT; @@ -402,42 +2069,42 @@ busted.test_Q_component_1[39][43]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[39][47]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[39][53]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[40][8]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[40][8]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[40][24]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; -busted.test_Q_component_1[40][32]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[40][32]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[40][36]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[40][41]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_AC; busted.test_Q_component_1[40][42]:=0.1963563685387479*t*busted.test.theta_AG; busted.test_Q_component_1[40][43]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[40][44]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[41][9]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[41][9]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[41][25]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; -busted.test_Q_component_1[41][33]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[41][33]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[41][37]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[41][40]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AC; busted.test_Q_component_1[41][42]:=0.1963563685387479*t*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[41][43]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[41][45]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[41][54]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[42][10]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[42][10]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[42][26]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; -busted.test_Q_component_1[42][34]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[42][34]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[42][38]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[42][40]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AG; busted.test_Q_component_1[42][41]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[42][43]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[42][46]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[42][55]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[43][11]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[43][11]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[43][27]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; -busted.test_Q_component_1[43][35]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[43][35]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[43][39]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[43][40]:=0.5074830879161225*t*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[43][41]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[43][42]:=0.1963563685387479*t*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[43][47]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[43][56]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[44][12]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[44][12]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[44][28]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[44][32]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[44][36]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; @@ -446,7 +2113,7 @@ busted.test_Q_component_1[44][46]:=0.1963563685387479*t*busted.test.theta_AG; busted.test_Q_component_1[44][47]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[44][57]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[45][13]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[45][13]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[45][29]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[45][33]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[45][37]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; @@ -455,7 +2122,7 @@ busted.test_Q_component_1[45][46]:=0.1963563685387479*t*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[45][47]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[45][58]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[46][14]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[46][14]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[46][30]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[46][34]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[46][38]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; @@ -464,7 +2131,7 @@ busted.test_Q_component_1[46][45]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[46][47]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[46][59]:=0.257146542110382*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[47][15]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[47][15]:=0.3148753970510747*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[47][31]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[47][35]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[47][39]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; @@ -478,14 +2145,14 @@ busted.test_Q_component_1[48][33]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[48][49]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[48][51]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[48][54]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[48][54]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[48][58]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[49][3]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[49][19]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[49][35]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; busted.test_Q_component_1[49][48]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[49][53]:=0.1818409092376876*t*busted.test.theta_AC*busted.test.omega1; -busted.test_Q_component_1[49][56]:=0.1563402972714242*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[49][56]:=0.1563402972714242*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[49][60]:=0.2361684149931496*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[50][4]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[50][20]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; @@ -523,7 +2190,7 @@ busted.test_Q_component_1[54][9]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[54][25]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[54][41]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[54][48]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[54][48]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[54][51]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[54][55]:=0.1963563685387479*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[54][56]:=0.1989860284705866*t*busted.test.theta_CT; @@ -538,7 +2205,7 @@ busted.test_Q_component_1[56][11]:=0.3148753970510747*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AT; busted.test_Q_component_1[56][27]:=0.1712746635706107*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[56][43]:=0.2567033972679326*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; -busted.test_Q_component_1[56][49]:=0.4256503784977386*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_AG; +busted.test_Q_component_1[56][49]:=0.4256503784977386*t*busted.test.theta_AG*busted.test.omega1; busted.test_Q_component_1[56][53]:=0.1818409092376876*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_CG; busted.test_Q_component_1[56][54]:=0.09717451507454297*t*busted.test.theta_CT; busted.test_Q_component_1[56][55]:=0.1963563685387479*t*busted.test.omega1*busted.test.theta_GT; @@ -1702,29 +3369,27 @@ Model busted.test=('Exp(busted.test_Q_component_1)*1*busted.test.bsrel_mixture_aux_0+Exp(busted.test_Q_component_2)*1*(1-busted.test.bsrel_mixture_aux_0)*busted.test.bsrel_mixture_aux_1+Exp(busted.test_Q_component_3)*1*(1-busted.test.bsrel_mixture_aux_0)*(1-busted.test.bsrel_mixture_aux_1)',busted.test_pi,EXPLICIT_FORM_MATRIX_EXPONENTIAL); TRY_NUMERIC_SEQUENCE_MATCH=0; ACCEPT_ROOTED_TREES=0; - -UseModel (busted.test); -Tree cuWdXMfP.tree_id_0=((((D_CD_83_ELI,D_CD_83_NDK)Node3,D_UG_94_94UG114)Node2,D_CD_84_84ZR085)Node1,B_US_83_RF,((B_FR_83_HXB2,B_US_86_JRFL)Node10,B_US_90_WEAU160)Node9); +Tree QCdustmY.tree_id_0=((((D_CD_83_ELI{busted.background},D_CD_83_NDK{busted.background})Node3{busted.background},D_UG_94_94UG114{busted.background})Node2{busted.background},D_CD_84_84ZR085{busted.background})Node1{busted.background},B_US_83_RF{busted.background},((B_FR_83_HXB2{busted.background},B_US_86_JRFL{busted.background})Node10{busted.background},B_US_90_WEAU160{busted.test})Node9{busted.background}); -cuWdXMfP.tree_id_0.D_CD_83_ELI.t=0.1377903766097694; -cuWdXMfP.tree_id_0.D_CD_83_NDK.t=0.06607109645594529; -cuWdXMfP.tree_id_0.Node3.t=0.0890081009446355; -cuWdXMfP.tree_id_0.D_UG_94_94UG114.t=0.4322474154485661; -cuWdXMfP.tree_id_0.Node2.t=0.01436667144151429; -cuWdXMfP.tree_id_0.D_CD_84_84ZR085.t=0.2152052309993384; -cuWdXMfP.tree_id_0.Node1.t=0.1867555551194544; -cuWdXMfP.tree_id_0.B_US_83_RF.t=0.2093873697545922; -cuWdXMfP.tree_id_0.B_FR_83_HXB2.t=0.08552069057797769; -cuWdXMfP.tree_id_0.B_US_86_JRFL.t=0.1313117411090917; -cuWdXMfP.tree_id_0.Node10.t=0.01181372524396516; -cuWdXMfP.tree_id_0.B_US_90_WEAU160.t=0.1600546391700751; -cuWdXMfP.tree_id_0.Node9.t=0.03506352054252541;SetParameter (DEFER_CONSTRAINT_APPLICATION, 1, 0); +QCdustmY.tree_id_0.D_CD_83_ELI.t=0.1370833707498818; +QCdustmY.tree_id_0.D_CD_83_NDK.t=0.06548157292895862; +QCdustmY.tree_id_0.Node3.t=0.08713663976914707; +QCdustmY.tree_id_0.D_UG_94_94UG114.t=0.4280587759297035; +QCdustmY.tree_id_0.Node2.t=0.01513176299488742; +QCdustmY.tree_id_0.D_CD_84_84ZR085.t=0.2130038858362291; +QCdustmY.tree_id_0.Node1.t=0.1846586758901705; +QCdustmY.tree_id_0.B_US_83_RF.t=0.2063734346567031; +QCdustmY.tree_id_0.B_FR_83_HXB2.t=0.08448292129897501; +QCdustmY.tree_id_0.B_US_86_JRFL.t=0.1299787017728399; +QCdustmY.tree_id_0.Node10.t=0.01154139173279806; +QCdustmY.tree_id_0.B_US_90_WEAU160.t=0.1759147205880889; +QCdustmY.tree_id_0.Node9.t=0.03592645553508322;SetParameter (DEFER_CONSTRAINT_APPLICATION, 1, 0); SetParameter (DEFER_CONSTRAINT_APPLICATION, 0, 0); DataSet busted.codon_data = ReadDataFile(USE_NEXUS_FILE_DATA); DataSetFilter busted.filter.default = CreateFilter(busted.codon_data,3,"0-1319","4,5,7,6,1,0,2,3","TAA,TAG,TGA"); ASSUME_REVERSIBLE_MODELS=1; USE_LAST_RESULTS=0; -LikelihoodFunction cuWdXMfP.likelihoodFunction = (busted.filter.default,cuWdXMfP.tree_id_0); +LikelihoodFunction QCdustmY.likelihoodFunction = (busted.filter.default,QCdustmY.tree_id_0); END; \ No newline at end of file