Mercurial > repos > iuc > ivar_filtervariants
directory /test-data/covid19/ @ 13:9537184d421f draft
| name | size | permissions |
|---|---|---|
| [up] | drwxr-xr-x | |
 ARTIC-V1-bad.bed
|
9540 | -rw-r--r-- |
|
ARTIC-V1.bed
|
8952 | -rw-r--r-- |
|
NC_045512.fa
|
30429 | -rw-r--r-- |
|
NC_045512.fa.amb
|
10 | -rw-r--r-- |
|
NC_045512.fa.ann
|
119 | -rw-r--r-- |
|
NC_045512.fa.bwt
|
30000 | -rw-r--r-- |
|
NC_045512.fa.fai
|
27 | -rw-r--r-- |
|
NC_045512.fa.pac
|
7477 | -rw-r--r-- |
|
NC_045512.fa.sa
|
15000 | -rw-r--r-- |
|
PC00101P_sub.fa
|
29860 | -rw-r--r-- |
|
PC00101P_sub.qual.txt
|
29811 | -rw-r--r-- |
|
PC00101P_sub.sorted.bam
|
4593067 | -rw-r--r-- |
|
PC00101P_sub.sorted.bam.bai
|
168 | -rw-r--r-- |
|
PC00101P_sub.trimmed.bam
|
4390927 | -rw-r--r-- |
|
PC00101P_sub.trimmed.sorted.bam
|
4400289 | -rw-r--r-- |
|
PC00101P_sub.trimmed.sorted.bam.bai
|
168 | -rw-r--r-- |
|
PC00101P_variants.tsv
|
2196 | -rw-r--r-- |
|
nCoV-2019.scheme.bed
|
10324 | -rw-r--r-- |
|
primers_consensus.tsv
|
93 | -rw-r--r-- |
|
zika_primers.bam
|
6609 | -rw-r--r-- |
|
zika_primers.bed
|
5862 | -rw-r--r-- |
|
zika_primers.fa
|
2612 | -rw-r--r-- |
|
zika_primers_consensus.bam
|
232 | -rw-r--r-- |
|
zika_primers_consensus.bed
|
0 | -rw-r--r-- |