Mercurial > repos > iuc > ivar_filtervariants
directory /test-data/zika/ @ 8:b93845a04cc8 draft
| name | size | permissions |
|---|---|---|
| [up] | drwxr-xr-x | |
 db/
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drwxr-xr-x | |
 Z52.consensus.fa
|
10188 | -rw-r--r-- |
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Z52.consensus.fa.fai
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68 | -rw-r--r-- |
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Z52.consensus.qual.txt
|
10140 | -rw-r--r-- |
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Z52.masked.sorted.depth
|
176862 | -rw-r--r-- |
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Z52.merged.bam
|
7571164 | -rw-r--r-- |
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Z52.sorted.depth
|
183059 | -rw-r--r-- |
|
Z52.trimmed.sorted.depth
|
179048 | -rw-r--r-- |
|
Z52.tsv
|
1516 | -rw-r--r-- |
|
Z52_a.masked.bam
|
3366621 | -rw-r--r-- |
|
Z52_a.masked.sorted.bam
|
3366621 | -rw-r--r-- |
|
Z52_a.sorted.bam
|
4021097 | -rw-r--r-- |
|
Z52_a.sorted.bam.bai
|
96 | -rw-r--r-- |
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Z52_a.trimmed.bam
|
3524783 | -rw-r--r-- |
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Z52_a.trimmed.sorted.bam
|
3479627 | -rw-r--r-- |
|
Z52_a.trimmed.sorted.bam.bai
|
96 | -rw-r--r-- |
|
Z52_a.tsv
|
1304 | -rw-r--r-- |
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Z52_a.vcf
|
2621 | -rw-r--r-- |
|
Z52_a_pass.vcf
|
2002 | -rw-r--r-- |
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Z52_b.masked.bam
|
3968214 | -rw-r--r-- |
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Z52_b.masked.sorted.bam
|
3968214 | -rw-r--r-- |
|
Z52_b.sorted.bam
|
4762174 | -rw-r--r-- |
|
Z52_b.sorted.bam.bai
|
96 | -rw-r--r-- |
|
Z52_b.trimmed.bam
|
4194701 | -rw-r--r-- |
|
Z52_b.trimmed.sorted.bam
|
4132291 | -rw-r--r-- |
|
Z52_b.trimmed.sorted.bam.bai
|
96 | -rw-r--r-- |
|
Z52_b.tsv
|
1455 | -rw-r--r-- |
|
primer_mismatchers_indices.txt
|
40 | -rw-r--r-- |
|
primers_Z52_consensus.tsv
|
336 | -rw-r--r-- |