Mercurial > repos > iuc > mageck_pathway
view test-data/out.mle.gene_summary.txt @ 6:39a996d44e16 draft default tip
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/mageck commit e9c464070ad7c01b830345a550477e8dfdcac5ae"
| author | iuc |
|---|---|
| date | Wed, 01 Apr 2020 06:13:05 -0400 |
| parents | c871e57e2abb |
| children |
line wrap: on
line source
Gene sgRNA HL60|beta HL60|z HL60|p-value HL60|fdr HL60|wald-p-value HL60|wald-fdr KBM7|beta KBM7|z KBM7|p-value KBM7|fdr KBM7|wald-p-value KBM7|wald-fdr A1CF 10 0.21726 2.3501 0.09 0.098901 0.018771 0.045548 0.22205 2.4019 0.11 0.13258 0.016311 0.044445 AAAS 10 0.20562 2.038 0.108 0.11368 0.041547 0.048311 0.22245 2.2047 0.11 0.13258 0.027472 0.044445 AAK1 10 0.25639 2.1126 0.054 0.07 0.034633 0.045548 0.31519 2.5972 0.026 0.092857 0.0093995 0.044445 AATF 10 0.26019 2.137 0.048 0.07 0.032596 0.045548 0.17209 1.4898 0.202 0.20612 0.13627 0.14195 AATK 10 0.37034 2.5201 0.012 0.07 0.011733 0.045548 0.32484 2.2105 0.024 0.088889 0.027074 0.044445 ABCB8 10 0.25311 2.4583 0.054 0.07 0.013958 0.045548 0.2626 2.5505 0.058 0.10345 0.010756 0.044445 ABCC1 10 0.20905 2.0722 0.106 0.11277 0.038249 0.045548 0.2381 2.3602 0.086 0.10886 0.018265 0.044445 ABCF1 10 0.26857 2.0808 0.046 0.07 0.037453 0.045548 0.2407 1.8649 0.082 0.10886 0.062201 0.069889 ABHD14B 10 0.25291 2.1394 0.054 0.07 0.032402 0.045548 0.24531 2.0751 0.076 0.10857 0.037979 0.049559 ABI1 10 0.28136 2.2952 0.038 0.07 0.021724 0.045548 0.23619 1.9267 0.086 0.10886 0.054023 0.062096 ABL1 10 0.35653 2.8826 0.014 0.07 0.0039444 0.045548 0.19033 1.5389 0.172 0.17938 0.12383 0.13174 ABL2 10 0.31786 2.537 0.026 0.07 0.011181 0.045548 0.28849 2.3026 0.044 0.096154 0.0213 0.044445 ABLIM2 10 0.33199 2.1246 0.024 0.07 0.033624 0.045548 0.35781 2.2898 0.016 0.088889 0.022035 0.044445 ABT1 10 0.64492 1.2807 0 0 0.20031 0.20031 0.56048 1.113 0 0 0.26572 0.26572 ABTB1 10 0.25881 2.2156 0.048 0.07 0.026717 0.045548 0.27981 2.3954 0.048 0.096154 0.016601 0.044445 ACAD11 10 0.2457 2.1273 0.056 0.07 0.033397 0.045548 0.26753 2.3163 0.052 0.098113 0.020539 0.044445 ACAD9 10 0.28033 2.3396 0.038 0.07 0.019306 0.045548 0.23942 1.9982 0.084 0.10886 0.045699 0.055059 ACAT2 10 0.33017 1.9472 0.024 0.07 0.051509 0.056401 0.34801 2.0524 0.016 0.088889 0.040129 0.049805 ACBD6 10 0.26005 2.4829 0.048 0.07 0.013031 0.045548 0.22982 2.1942 0.094 0.1175 0.028219 0.044707 ACD 10 0.29956 2.263 0.028 0.07 0.023633 0.045548 0.30306 2.2895 0.036 0.096154 0.022052 0.044445 ACHE 10 0.26039 1.9394 0.048 0.07 0.052453 0.056401 0.27459 2.0451 0.05 0.096154 0.04084 0.049805 ACIN1 10 0.24992 1.6773 0.054 0.07 0.093484 0.097379 0.16332 1.1553 0.222 0.22424 0.24796 0.25047 ACLY 10 0.64139 1.3277 0 0 0.18428 0.18614 0.56404 1.1676 0 0 0.24298 0.24794 ACO2 10 0.26736 2.3551 0.048 0.07 0.018518 0.045548 0.24404 2.1496 0.078 0.10886 0.031586 0.045123 ACP1 10 0.30066 2.0818 0.028 0.07 0.037363 0.045548 0.32268 2.2343 0.024 0.088889 0.025465 0.044445 ACRC 10 0.316 2.1738 0.026 0.07 0.029722 0.045548 0.32721 2.2508 0.024 0.088889 0.024396 0.044445 ACSL6 10 0.30715 2.5085 0.028 0.07 0.012125 0.045548 0.27154 2.2176 0.05 0.096154 0.026579 0.044445 ACSS2 10 0.27125 2.396 0.044 0.07 0.016573 0.045548 0.31578 2.7894 0.024 0.088889 0.0052812 0.044445 ACTL6A 10 0.23154 2.2408 0.072 0.085714 0.025038 0.045548 0.20097 1.945 0.138 0.14681 0.051771 0.060199 ACTL6B 10 0.30195 2.3158 0.028 0.07 0.020569 0.045548 0.29791 2.2849 0.036 0.096154 0.02232 0.044445 ACTL7A 10 0.22531 2.1897 0.078 0.089655 0.028544 0.045548 0.2423 2.3549 0.082 0.10886 0.018527 0.044445 ACTN1 10 0.30451 2.4532 0.028 0.07 0.014161 0.045548 0.27462 2.2124 0.05 0.096154 0.026942 0.044445 ACTN4 10 0.3039 2.2464 0.028 0.07 0.024679 0.045548 0.33156 2.4509 0.022 0.088889 0.01425 0.044445 ACTR1A 10 0.28127 2.1093 0.038 0.07 0.034915 0.045548 0.30952 2.3212 0.028 0.093333 0.020274 0.044445 ACTR3 10 0.28223 2.1469 0.038 0.07 0.031799 0.045548 0.25252 1.9209 0.068 0.10462 0.054741 0.062206 ACTR5 10 0.2754 2.7989 0.04 0.07 0.0051271 0.045548 0.20514 2.0849 0.136 0.14624 0.037074 0.049433 ACTR8 10 0.23674 1.6117 0.06 0.074074 0.10703 0.10922 0.21097 1.4362 0.122 0.13407 0.15095 0.15562 ACTRT3 10 0.2132 1.984 0.096 0.10435 0.047252 0.053696 0.25182 2.3435 0.068 0.10462 0.019105 0.044445 ACVR1B 10 0.28652 2.2884 0.034 0.07 0.022117 0.045548 0.27138 2.1674 0.05 0.096154 0.030201 0.045123 ACVR1C 10 0.28949 2.3641 0.032 0.07 0.018076 0.045548 0.33664 2.7491 0.02 0.088889 0.0059762 0.044445 ACVR1 10 0.34616 2.4128 0.018 0.07 0.015832 0.045548 0.32005 2.2308 0.024 0.088889 0.025696 0.044445 ACVR2A 10 0.27696 2.1093 0.04 0.07 0.034917 0.045548 0.33802 2.5743 0.02 0.088889 0.010044 0.044445 ACVR2B 10 0.36371 2.2098 0.012 0.07 0.027116 0.045548 0.37311 2.267 0.01 0.088889 0.023392 0.044445 ACVRL1 10 0.39229 2.5262 0.006 0.07 0.011531 0.045548 0.36154 2.3281 0.012 0.088889 0.019905 0.044445 ADAD1 10 0.30909 2.331 0.028 0.07 0.019753 0.045548 0.30601 2.3077 0.03 0.096154 0.021014 0.044445 ADAM10 10 0.25292 2.1622 0.054 0.07 0.030601 0.045548 0.24874 2.1265 0.072 0.10746 0.033463 0.04584 ADAM12 10 0.25552 2.205 0.054 0.07 0.027456 0.045548 0.27084 2.3371 0.05 0.096154 0.019433 0.044445 ADAMTS5 10 0.24419 2.1566 0.056 0.07 0.031038 0.045548 0.27619 2.4392 0.048 0.096154 0.014719 0.044445 ADAP1 10 0.20948 2.1011 0.106 0.11277 0.035635 0.045548 0.25866 2.5944 0.06 0.10345 0.0094755 0.044445 ADARB1 10 0.27489 2.3109 0.04 0.07 0.02084 0.045548 0.27467 2.309 0.05 0.096154 0.020942 0.044445 ADARB2 10 0.30137 2.3429 0.028 0.07 0.019132 0.045548 0.30102 2.3402 0.036 0.096154 0.019273 0.044445 ADAR 10 0.25245 2.4669 0.054 0.07 0.013631 0.045548 0.2202 2.1517 0.116 0.13258 0.031424 0.045123 ADCK1 10 0.36605 2.2853 0.012 0.07 0.022294 0.045548 0.42581 2.6584 0.002 0.033333 0.0078507 0.044445 ADCK2 10 0.28085 2.5525 0.038 0.07 0.010697 0.045548 0.24246 2.2035 0.08 0.10886 0.027556 0.044445 ADCK3 10 0.37764 2.128 0.008 0.07 0.033335 0.045548 0.41407 2.3334 0.002 0.033333 0.019629 0.044445 ADCK4 10 0.37984 2.2562 0.008 0.07 0.024061 0.045548 0.36256 2.1535 0.012 0.088889 0.031278 0.045123 ADCK5 10 0.35764 2.5433 0.012 0.07 0.010981 0.045548 0.32232 2.2921 0.024 0.088889 0.021897 0.044445 ADCY1 10 0.2228 2.0734 0.084 0.094382 0.038132 0.045548 0.2199 2.0464 0.116 0.13258 0.040715 0.049805 ADD1 10 0.25091 2.5127 0.054 0.07 0.011981 0.045548 0.23536 2.357 0.086 0.10886 0.018424 0.044445 ADD3 10 0.34943 2.4372 0.014 0.07 0.014802 0.045548 0.30967 2.1599 0.028 0.093333 0.030784 0.045123 ADH5 10 0.31325 2.0785 0.028 0.07 0.037665 0.045548 0.3371 2.2368 0.02 0.088889 0.025302 0.044445 ADH7 10 0.23185 2.1764 0.072 0.085714 0.029529 0.045548 0.25313 2.3761 0.068 0.10462 0.017497 0.044445 ADI1 10 0.26344 2.2066 0.048 0.07 0.027345 0.045548 0.2966 2.4843 0.038 0.096154 0.012981 0.044445 ADIRF 10 0.23157 2.1952 0.072 0.085714 0.028148 0.045548 0.21758 2.0626 0.118 0.13258 0.039152 0.049559 ADK 10 0.25823 2.3541 0.05 0.07 0.018569 0.045548 0.25466 2.3215 0.066 0.10462 0.020258 0.044445 ADNP2 10 0.19944 2.0931 0.12 0.12245 0.036336 0.045548 0.25778 2.7054 0.06 0.10345 0.0068216 0.044445 ADNP 10 0.33596 1.9412 0.024 0.07 0.052236 0.056401 0.44376 2.5641 0 0 0.010346 0.044445 ADPRHL2 10 0.26332 2.3044 0.048 0.07 0.021202 0.045548 0.27219 2.382 0.05 0.096154 0.017218 0.044445 ADRA1A 10 0.26321 2.4075 0.048 0.07 0.016062 0.045548 0.24245 2.2176 0.08 0.10886 0.026583 0.044445 ADRA1B 10 0.26869 2.4689 0.046 0.07 0.013554 0.045548 0.24756 2.2747 0.076 0.10857 0.022923 0.044445 ADRB1 10 0.26113 2.1522 0.048 0.07 0.031385 0.045548 0.25076 2.0666 0.068 0.10462 0.038768 0.049559 ADRB2 10 0.3434 2.0721 0.018 0.07 0.038261 0.045548 0.32418 1.9561 0.024 0.088889 0.050457 0.059361 ADRB3 10 0.27356 2.3431 0.042 0.07 0.019123 0.045548 0.26345 2.1408 0.056 0.10345 0.032287 0.045408 ADRBK1 10 0.39621 2.5298 0.006 0.07 0.011414 0.045548 0.38361 2.4493 0.004 0.057143 0.014314 0.044445 ADRBK2 10 0.311 2.4196 0.028 0.07 0.015537 0.045548 0.30224 2.3515 0.036 0.096154 0.018698 0.044445 ADRM1 10 0.19795 2.0633 0.12 0.12245 0.039089 0.045987 0.21217 2.2114 0.122 0.13407 0.027005 0.044445 AEBP1 10 0.30109 2.094 0.028 0.07 0.036256 0.045548 0.31995 2.2252 0.024 0.088889 0.026067 0.044445 AEBP2 10 0.25078 2.3902 0.054 0.07 0.016839 0.045548 0.25977 2.4758 0.06 0.10345 0.013293 0.044445 AEN 10 0.31767 2.5501 0.026 0.07 0.010771 0.045548 0.21703 1.7422 0.118 0.13258 0.081467 0.089524 AES 10 0.27613 2.5026 0.04 0.07 0.01233 0.045548 0.28435 2.5771 0.048 0.096154 0.0099638 0.044445 AFAP1L2 10 0.27787 2.5825 0.038 0.07 0.0098091 0.045548 0.25248 2.3465 0.068 0.10462 0.018949 0.044445 AFF1 10 0.24186 2.0236 0.056 0.07 0.043007 0.049434 0.28577 2.391 0.044 0.096154 0.0168 0.044445 AFF2 10 0.22079 1.9621 0.086 0.095556 0.049749 0.055889 0.28962 2.5737 0.044 0.096154 0.010061 0.044445 AFF3 10 0.22476 2.1578 0.078 0.089655 0.030942 0.045548 0.21756 2.0887 0.118 0.13258 0.03673 0.049433 AFF4 10 0.31149 2.1142 0.028 0.07 0.034496 0.045548 0.3627 2.4618 0.012 0.088889 0.013825 0.044445 AFMID 10 0.22778 2.1955 0.078 0.089655 0.02813 0.045548 0.22159 2.1358 0.112 0.13258 0.032694 0.045408 AFTPH 10 0.25053 2.1997 0.054 0.07 0.027828 0.045548 0.24929 2.1888 0.072 0.10746 0.028613 0.044707 AGAP2 10 0.3135 2.4258 0.028 0.07 0.015274 0.045548 0.27805 2.1516 0.048 0.096154 0.031432 0.045123 AGAP3 10 0.27682 2.4409 0.04 0.07 0.01465 0.045548 0.31626 2.7887 0.024 0.088889 0.0052921 0.044445 AGBL5 10 0.18851 1.7706 0.146 0.14747 0.076634 0.080668 0.25487 2.3938 0.066 0.10462 0.016673 0.044445 AGFG1 10 0.26133 2.2912 0.048 0.07 0.021954 0.045548 0.24813 2.0639 0.074 0.10857 0.039025 0.049559 AGL 10 0.65242 1.6625 0 0 0.096417 0.099399 0.60099 1.5314 0 0 0.12566 0.13228 AGPAT3 10 0.20246 2.1377 0.112 0.11667 0.03254 0.045548 0.18609 1.9649 0.174 0.17938 0.049424 0.058838 AGPAT5 10 0.32784 1.8786 0.024 0.07 0.060303 0.064152 0.31917 1.8289 0.024 0.088889 0.067418 0.074909 AGTPBP1 10 0.25153 2.1735 0.054 0.07 0.029741 0.045548 0.29805 2.5755 0.036 0.096154 0.01001 0.044445 AHCTF1 10 0.24987 2.2694 0.054 0.07 0.023245 0.045548 0.18875 1.7143 0.174 0.17938 0.086471 0.09399 AHCY 10 0.25511 1.9574 0.054 0.07 0.0503 0.055889 0.20591 1.5799 0.136 0.14624 0.11413 0.12272 AHNAK2 10 0.27116 2.5067 0.044 0.07 0.012185 0.045548 0.27693 2.5601 0.048 0.096154 0.010466 0.044445 AHNAK 10 0.22102 2.4775 0.084 0.094382 0.01323 0.045548 0.21459 2.4055 0.118 0.13258 0.016151 0.044445 AHRR 9 0.19687 2.5399 0.15 0.15 0.011087 0.045548 0.18565 2.2584 0.226 0.226 0.023923 0.044445