diff test-data/out.mle.gene_summary.txt @ 0:b8da4d41aa1d draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/mageck commit 71cef018eec5ee7ff7f3853599c027e80e2637fe

--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/out.mle.gene_summary.txt	Wed Feb 14 06:42:55 2018 -0500
@@ -0,0 +1,101 @@
+Gene	sgRNA	HL60|beta	HL60|z	HL60|p-value	HL60|fdr	HL60|wald-p-value	HL60|wald-fdr	KBM7|beta	KBM7|z	KBM7|p-value	KBM7|fdr	KBM7|wald-p-value	KBM7|wald-fdr
+A1CF	10	0.21726	2.3501	0.09	0.098901	0.018771	0.045548	0.22205	2.4019	0.11	0.13258	0.016311	0.044445
+AAAS	10	0.20562	2.038	0.108	0.11368	0.041547	0.048311	0.22245	2.2047	0.11	0.13258	0.027472	0.044445
+AAK1	10	0.25639	2.1126	0.054	0.07	0.034633	0.045548	0.31519	2.5972	0.026	0.092857	0.0093995	0.044445
+AATF	10	0.26019	2.137	0.048	0.07	0.032596	0.045548	0.17209	1.4898	0.202	0.20612	0.13627	0.14195
+AATK	10	0.37034	2.5201	0.012	0.07	0.011733	0.045548	0.32484	2.2105	0.024	0.088889	0.027074	0.044445
+ABCB8	10	0.25311	2.4583	0.054	0.07	0.013958	0.045548	0.2626	2.5505	0.058	0.10345	0.010756	0.044445
+ABCC1	10	0.20905	2.0722	0.106	0.11277	0.038249	0.045548	0.2381	2.3602	0.086	0.10886	0.018265	0.044445
+ABCF1	10	0.26857	2.0808	0.046	0.07	0.037453	0.045548	0.2407	1.8649	0.082	0.10886	0.062201	0.069889
+ABHD14B	10	0.25291	2.1394	0.054	0.07	0.032402	0.045548	0.24531	2.0751	0.076	0.10857	0.037979	0.049559
+ABI1	10	0.28136	2.2952	0.038	0.07	0.021724	0.045548	0.23619	1.9267	0.086	0.10886	0.054023	0.062096
+ABL1	10	0.35653	2.8826	0.014	0.07	0.0039444	0.045548	0.19033	1.5389	0.172	0.17938	0.12383	0.13174
+ABL2	10	0.31786	2.537	0.026	0.07	0.011181	0.045548	0.28849	2.3026	0.044	0.096154	0.0213	0.044445
+ABLIM2	10	0.33199	2.1246	0.024	0.07	0.033624	0.045548	0.35781	2.2898	0.016	0.088889	0.022035	0.044445
+ABT1	10	0.64492	1.2807	0	0	0.20031	0.20031	0.56048	1.113	0	0	0.26572	0.26572
+ABTB1	10	0.25881	2.2156	0.048	0.07	0.026717	0.045548	0.27981	2.3954	0.048	0.096154	0.016601	0.044445
+ACAD11	10	0.2457	2.1273	0.056	0.07	0.033397	0.045548	0.26753	2.3163	0.052	0.098113	0.020539	0.044445
+ACAD9	10	0.28033	2.3396	0.038	0.07	0.019306	0.045548	0.23942	1.9982	0.084	0.10886	0.045699	0.055059
+ACAT2	10	0.33017	1.9472	0.024	0.07	0.051509	0.056401	0.34801	2.0524	0.016	0.088889	0.040129	0.049805
+ACBD6	10	0.26005	2.4829	0.048	0.07	0.013031	0.045548	0.22982	2.1942	0.094	0.1175	0.028219	0.044707
+ACD	10	0.29956	2.263	0.028	0.07	0.023633	0.045548	0.30306	2.2895	0.036	0.096154	0.022052	0.044445
+ACHE	10	0.26039	1.9394	0.048	0.07	0.052453	0.056401	0.27459	2.0451	0.05	0.096154	0.04084	0.049805
+ACIN1	10	0.24992	1.6773	0.054	0.07	0.093484	0.097379	0.16332	1.1553	0.222	0.22424	0.24796	0.25047
+ACLY	10	0.64139	1.3277	0	0	0.18428	0.18614	0.56404	1.1676	0	0	0.24298	0.24794
+ACO2	10	0.26736	2.3551	0.048	0.07	0.018518	0.045548	0.24404	2.1496	0.078	0.10886	0.031586	0.045123
+ACP1	10	0.30066	2.0818	0.028	0.07	0.037363	0.045548	0.32268	2.2343	0.024	0.088889	0.025465	0.044445
+ACRC	10	0.316	2.1738	0.026	0.07	0.029722	0.045548	0.32721	2.2508	0.024	0.088889	0.024396	0.044445
+ACSL6	10	0.30715	2.5085	0.028	0.07	0.012125	0.045548	0.27154	2.2176	0.05	0.096154	0.026579	0.044445
+ACSS2	10	0.27125	2.396	0.044	0.07	0.016573	0.045548	0.31578	2.7894	0.024	0.088889	0.0052812	0.044445
+ACTL6A	10	0.23154	2.2408	0.072	0.085714	0.025038	0.045548	0.20097	1.945	0.138	0.14681	0.051771	0.060199
+ACTL6B	10	0.30195	2.3158	0.028	0.07	0.020569	0.045548	0.29791	2.2849	0.036	0.096154	0.02232	0.044445
+ACTL7A	10	0.22531	2.1897	0.078	0.089655	0.028544	0.045548	0.2423	2.3549	0.082	0.10886	0.018527	0.044445
+ACTN1	10	0.30451	2.4532	0.028	0.07	0.014161	0.045548	0.27462	2.2124	0.05	0.096154	0.026942	0.044445
+ACTN4	10	0.3039	2.2464	0.028	0.07	0.024679	0.045548	0.33156	2.4509	0.022	0.088889	0.01425	0.044445
+ACTR1A	10	0.28127	2.1093	0.038	0.07	0.034915	0.045548	0.30952	2.3212	0.028	0.093333	0.020274	0.044445
+ACTR3	10	0.28223	2.1469	0.038	0.07	0.031799	0.045548	0.25252	1.9209	0.068	0.10462	0.054741	0.062206
+ACTR5	10	0.2754	2.7989	0.04	0.07	0.0051271	0.045548	0.20514	2.0849	0.136	0.14624	0.037074	0.049433
+ACTR8	10	0.23674	1.6117	0.06	0.074074	0.10703	0.10922	0.21097	1.4362	0.122	0.13407	0.15095	0.15562
+ACTRT3	10	0.2132	1.984	0.096	0.10435	0.047252	0.053696	0.25182	2.3435	0.068	0.10462	0.019105	0.044445
+ACVR1B	10	0.28652	2.2884	0.034	0.07	0.022117	0.045548	0.27138	2.1674	0.05	0.096154	0.030201	0.045123
+ACVR1C	10	0.28949	2.3641	0.032	0.07	0.018076	0.045548	0.33664	2.7491	0.02	0.088889	0.0059762	0.044445
+ACVR1	10	0.34616	2.4128	0.018	0.07	0.015832	0.045548	0.32005	2.2308	0.024	0.088889	0.025696	0.044445
+ACVR2A	10	0.27696	2.1093	0.04	0.07	0.034917	0.045548	0.33802	2.5743	0.02	0.088889	0.010044	0.044445
+ACVR2B	10	0.36371	2.2098	0.012	0.07	0.027116	0.045548	0.37311	2.267	0.01	0.088889	0.023392	0.044445
+ACVRL1	10	0.39229	2.5262	0.006	0.07	0.011531	0.045548	0.36154	2.3281	0.012	0.088889	0.019905	0.044445
+ADAD1	10	0.30909	2.331	0.028	0.07	0.019753	0.045548	0.30601	2.3077	0.03	0.096154	0.021014	0.044445
+ADAM10	10	0.25292	2.1622	0.054	0.07	0.030601	0.045548	0.24874	2.1265	0.072	0.10746	0.033463	0.04584
+ADAM12	10	0.25552	2.205	0.054	0.07	0.027456	0.045548	0.27084	2.3371	0.05	0.096154	0.019433	0.044445
+ADAMTS5	10	0.24419	2.1566	0.056	0.07	0.031038	0.045548	0.27619	2.4392	0.048	0.096154	0.014719	0.044445
+ADAP1	10	0.20948	2.1011	0.106	0.11277	0.035635	0.045548	0.25866	2.5944	0.06	0.10345	0.0094755	0.044445
+ADARB1	10	0.27489	2.3109	0.04	0.07	0.02084	0.045548	0.27467	2.309	0.05	0.096154	0.020942	0.044445
+ADARB2	10	0.30137	2.3429	0.028	0.07	0.019132	0.045548	0.30102	2.3402	0.036	0.096154	0.019273	0.044445
+ADAR	10	0.25245	2.4669	0.054	0.07	0.013631	0.045548	0.2202	2.1517	0.116	0.13258	0.031424	0.045123
+ADCK1	10	0.36605	2.2853	0.012	0.07	0.022294	0.045548	0.42581	2.6584	0.002	0.033333	0.0078507	0.044445
+ADCK2	10	0.28085	2.5525	0.038	0.07	0.010697	0.045548	0.24246	2.2035	0.08	0.10886	0.027556	0.044445
+ADCK3	10	0.37764	2.128	0.008	0.07	0.033335	0.045548	0.41407	2.3334	0.002	0.033333	0.019629	0.044445
+ADCK4	10	0.37984	2.2562	0.008	0.07	0.024061	0.045548	0.36256	2.1535	0.012	0.088889	0.031278	0.045123
+ADCK5	10	0.35764	2.5433	0.012	0.07	0.010981	0.045548	0.32232	2.2921	0.024	0.088889	0.021897	0.044445
+ADCY1	10	0.2228	2.0734	0.084	0.094382	0.038132	0.045548	0.2199	2.0464	0.116	0.13258	0.040715	0.049805
+ADD1	10	0.25091	2.5127	0.054	0.07	0.011981	0.045548	0.23536	2.357	0.086	0.10886	0.018424	0.044445
+ADD3	10	0.34943	2.4372	0.014	0.07	0.014802	0.045548	0.30967	2.1599	0.028	0.093333	0.030784	0.045123
+ADH5	10	0.31325	2.0785	0.028	0.07	0.037665	0.045548	0.3371	2.2368	0.02	0.088889	0.025302	0.044445
+ADH7	10	0.23185	2.1764	0.072	0.085714	0.029529	0.045548	0.25313	2.3761	0.068	0.10462	0.017497	0.044445
+ADI1	10	0.26344	2.2066	0.048	0.07	0.027345	0.045548	0.2966	2.4843	0.038	0.096154	0.012981	0.044445
+ADIRF	10	0.23157	2.1952	0.072	0.085714	0.028148	0.045548	0.21758	2.0626	0.118	0.13258	0.039152	0.049559
+ADK	10	0.25823	2.3541	0.05	0.07	0.018569	0.045548	0.25466	2.3215	0.066	0.10462	0.020258	0.044445
+ADNP2	10	0.19944	2.0931	0.12	0.12245	0.036336	0.045548	0.25778	2.7054	0.06	0.10345	0.0068216	0.044445
+ADNP	10	0.33596	1.9412	0.024	0.07	0.052236	0.056401	0.44376	2.5641	0	0	0.010346	0.044445
+ADPRHL2	10	0.26332	2.3044	0.048	0.07	0.021202	0.045548	0.27219	2.382	0.05	0.096154	0.017218	0.044445
+ADRA1A	10	0.26321	2.4075	0.048	0.07	0.016062	0.045548	0.24245	2.2176	0.08	0.10886	0.026583	0.044445
+ADRA1B	10	0.26869	2.4689	0.046	0.07	0.013554	0.045548	0.24756	2.2747	0.076	0.10857	0.022923	0.044445
+ADRB1	10	0.26113	2.1522	0.048	0.07	0.031385	0.045548	0.25076	2.0666	0.068	0.10462	0.038768	0.049559
+ADRB2	10	0.3434	2.0721	0.018	0.07	0.038261	0.045548	0.32418	1.9561	0.024	0.088889	0.050457	0.059361
+ADRB3	10	0.27356	2.3431	0.042	0.07	0.019123	0.045548	0.26345	2.1408	0.056	0.10345	0.032287	0.045408
+ADRBK1	10	0.39621	2.5298	0.006	0.07	0.011414	0.045548	0.38361	2.4493	0.004	0.057143	0.014314	0.044445
+ADRBK2	10	0.311	2.4196	0.028	0.07	0.015537	0.045548	0.30224	2.3515	0.036	0.096154	0.018698	0.044445
+ADRM1	10	0.19795	2.0633	0.12	0.12245	0.039089	0.045987	0.21217	2.2114	0.122	0.13407	0.027005	0.044445
+AEBP1	10	0.30109	2.094	0.028	0.07	0.036256	0.045548	0.31995	2.2252	0.024	0.088889	0.026067	0.044445
+AEBP2	10	0.25078	2.3902	0.054	0.07	0.016839	0.045548	0.25977	2.4758	0.06	0.10345	0.013293	0.044445
+AEN	10	0.31767	2.5501	0.026	0.07	0.010771	0.045548	0.21703	1.7422	0.118	0.13258	0.081467	0.089524
+AES	10	0.27613	2.5026	0.04	0.07	0.01233	0.045548	0.28435	2.5771	0.048	0.096154	0.0099638	0.044445
+AFAP1L2	10	0.27787	2.5825	0.038	0.07	0.0098091	0.045548	0.25248	2.3465	0.068	0.10462	0.018949	0.044445
+AFF1	10	0.24186	2.0236	0.056	0.07	0.043007	0.049434	0.28577	2.391	0.044	0.096154	0.0168	0.044445
+AFF2	10	0.22079	1.9621	0.086	0.095556	0.049749	0.055889	0.28962	2.5737	0.044	0.096154	0.010061	0.044445
+AFF3	10	0.22476	2.1578	0.078	0.089655	0.030942	0.045548	0.21756	2.0887	0.118	0.13258	0.03673	0.049433
+AFF4	10	0.31149	2.1142	0.028	0.07	0.034496	0.045548	0.3627	2.4618	0.012	0.088889	0.013825	0.044445
+AFMID	10	0.22778	2.1955	0.078	0.089655	0.02813	0.045548	0.22159	2.1358	0.112	0.13258	0.032694	0.045408
+AFTPH	10	0.25053	2.1997	0.054	0.07	0.027828	0.045548	0.24929	2.1888	0.072	0.10746	0.028613	0.044707
+AGAP2	10	0.3135	2.4258	0.028	0.07	0.015274	0.045548	0.27805	2.1516	0.048	0.096154	0.031432	0.045123
+AGAP3	10	0.27682	2.4409	0.04	0.07	0.01465	0.045548	0.31626	2.7887	0.024	0.088889	0.0052921	0.044445
+AGBL5	10	0.18851	1.7706	0.146	0.14747	0.076634	0.080668	0.25487	2.3938	0.066	0.10462	0.016673	0.044445
+AGFG1	10	0.26133	2.2912	0.048	0.07	0.021954	0.045548	0.24813	2.0639	0.074	0.10857	0.039025	0.049559
+AGL	10	0.65242	1.6625	0	0	0.096417	0.099399	0.60099	1.5314	0	0	0.12566	0.13228
+AGPAT3	10	0.20246	2.1377	0.112	0.11667	0.03254	0.045548	0.18609	1.9649	0.174	0.17938	0.049424	0.058838
+AGPAT5	10	0.32784	1.8786	0.024	0.07	0.060303	0.064152	0.31917	1.8289	0.024	0.088889	0.067418	0.074909
+AGTPBP1	10	0.25153	2.1735	0.054	0.07	0.029741	0.045548	0.29805	2.5755	0.036	0.096154	0.01001	0.044445
+AHCTF1	10	0.24987	2.2694	0.054	0.07	0.023245	0.045548	0.18875	1.7143	0.174	0.17938	0.086471	0.09399
+AHCY	10	0.25511	1.9574	0.054	0.07	0.0503	0.055889	0.20591	1.5799	0.136	0.14624	0.11413	0.12272
+AHNAK2	10	0.27116	2.5067	0.044	0.07	0.012185	0.045548	0.27693	2.5601	0.048	0.096154	0.010466	0.044445
+AHNAK	10	0.22102	2.4775	0.084	0.094382	0.01323	0.045548	0.21459	2.4055	0.118	0.13258	0.016151	0.044445
+AHRR	9	0.19687	2.5399	0.15	0.15	0.011087	0.045548	0.18565	2.2584	0.226	0.226	0.023923	0.044445