Mercurial > repos > iuc > medaka_variant

comparison test-data/assembly.fasta @ 0:3cde72a6e37c draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/medaka commit 1b97fa7a21a2c85bf4891aed1b7df92685b346c3"
author iuc
date Sat, 23 May 2020 13:36:47 -0400
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:3cde72a6e37c
1 >4 length=3792 depth=114.52x circular=true
2 TTGCGGTGTCTGCGTCAGAATCGCGTTCAGCGCGTTTCAGCGGTGCGTACAATTACAGCATTATGTTAAA
3 TTTTATAATTGTCTTTAGTCATTGCGCTATGATTTTGTAGGTGGAGTTGTTTCATATTTTTGATATAAAT
4 TCTTTTATCTCACTGAAGCAGTCATCGTCAGTATCAATGGTTTTGTTCTTCATTGATATGCCTATTCTAG
5 AATCTGATTCCTTATTACAACTAAGGTAAACTTGAACTTTTGCTTTCTTTTCATTATTTGGGTAAGCGTA
6 ATCAGGATCTAAGGATGTAATAATAGATTCTTGTTCTTTTATTTTATTGAATAGATCGTCTATATATCTA
7 AACACCTCTTTCTTACACGCGTGAGCAATGATTAGATCTTCTATTGCGCCATTCTTGTTTTTTCCTGGCA
8 TGATAAAGAAAGATATTTTTGTGCTTCCGTTAATGGCTATTTCATTATGCGAGCTTGGTGATGAAATGTT
9 AAGCTCATTTAATGTTGAAATTATCGATCTTTCCGTGTCAGAAAACGATTCGTCGGCATCGATGATTAAG
10 AATATACTTTCTTTTTCATTAAAAGACTCTATGCTTTTAAATGCTCTAAGGGTTTGTTTTAGTTTTGTCT
11 TTCCATTTATTTTTTCAACATAAACATCATTAATTCCTTCTATTTCAAGTAGATTGCAAAGGAAGTGAAA
12 ATCATCATCACCCTCAACGAAAATGACTTTTTTATAATCATTTATTTTTCTCGGTTTCATTTATCTCACC
13 TCCCAGCCATTTTCAACTGAAAAAGAAAAATCATCCATGTTAAATTGCATTGCTGTAGGTTTTTGAGATT
14 CCTTGTCTCTTCCCAGTCTTATGTAAGATATATCTTTTCTTTTTTCATCTAATTCGTTTATCGCACATAT
15 TACATCATGGCTGTGTGTTGTTGTAAATATTTGATTATTATTGGTTTTTGCTGCTTCTATCAAAGCGTTG
16 ATCATATCTTTGATTACTGAGTAATGAATTCCATTTTCTATCTCATCAATGAGAATAATTGAGTCTTTTT
17 GAACTAAGATTGAGCTAATGAAAGACAGCGCTCTGCTTACTCCTTCACCAAGCATTGATATTTCATTTAA
18 TTCACTTAGTCCTATATCTAAAAAAATCTCTTTGTTTTGATCTGTTGCTATTATTGCAATATCGTTAATT
19 CTATTATCTATTCTTTTTAGGTTGCCTATTATTTCATCTTTTCTTTTTTGTGTTAGTAGTTTTGATACGT
20 TTTTTATCGTTGCTTCTTTGTTTATGTTTCTTGATGTGGTTATTATCGCTGCGGTTTTGAATTCATATAG
21 CTTACCTTTTTTAGTTTGTTTTATTTCTCCGTTTATTTCTTGTGCTTTTTGTGTTATTTTTATAGTAATC
22 AATTCTTCTGGGGGGGTTCTTTTTCCGTTCTGTGTTTCACTAACCTTAATCATTAAAACATTCCCCTTTT
23 CCTGAGAGCCGAGGGTTTGTCGCAATGGAGGGGTGTTTGATAATATTGACTCAACATTGAGGGACACGCT
24 TGATTCACTTTGTGTGTTATCTATCGTTGAGTATTTTTGTGTTACTTCTGACCTTTCATCTCTTATTGTT
25 ATGGACATTTCTTTGGATGTGTCCATGTTATAAAAATAGCTATCCCAAAATGAGTTTTCTTTATTTAAAA
26 GAGATGCTTCATTTCTAAAGCTTTTTACTTTTAACAGAGCTGCTGGGTTTTTTACGTCATAAAATGAAAA
27 TATCGCGTCTAATATCGATGTTTTCCCAAAGTTGTTTTTTCCGGATATTACATTAAGTGTTTTTAGTTGT
28 TTGAGAGTTATGCTCTCGAAACACTTAAAATTTTTTAAGTGGATATCTTTTATCATGTTTAAACTTGCTC
29 TCCATTTCTGTTTACGTTTACATAGTAATAATGTGTTTATTTATGCATCACTATGCCACTGTTTCTTTTC
30 TAGAAGTATAATCAAAATAATATTACTTTATAGTCCTGTTTGGATTGATTTTAACCAGTTTGTCGGAGTT
31 TCTTCTTGTGATTATTGTGTTCTGGTCGTAATCTCCTAAACTGAAAACGAAAAAACCACCTGGGGAGGTG
32 GTTTGATCGAAGGTTAAGTCAGTTGGGGAACTGCTTAACCAGGTAACTGTCTTGTGCGAGACGAGTCACC
33 AAAACTGTCCTTTCAGTGTAGCTGTAGTCAGGCCATCACTTCAAGTACTCTCTTGAACCTCTCGCACATC
34 GACTTTTACCAATGGCTGCTGCCAGTGGCGCTTTGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTT
35 ACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACC
36 TACACCGAACCGAGATACCTACAGCGTGAGCTATGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGG
37 ACAGGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAAACACCTG
38 GTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGGCTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGG
39 GGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCTGCGGCGCTGGCTTCCTCCGGTGCTTTGCTTTTTGCTCACATGTTC
40 TTTCCGACTTTATCCCCCGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCTTTTGAGTGAGCTGACACCGCTCGCC
41 GCAGTCGAACGACCGAGCGTAGCGAGTCAGTGAGCGAGGAAGCGGAAGAGCGCCTTATGTGACATTTTCT
42 CCTTACGCTCTGTTGTGCCGTTCGGCATCCTGTCCTGAGCGTTATCTCTCTGTGCTATTTTCTACTTCAA
43 AGCGTGTCTGGATGCTGTTCTGGAGTTCTTCTGCGAGTTCGTGCAGCTTCTCACACATGGCAGCCTGTTC
44 GTCAGCATCGGGTGCGTCCAGTTTTTCGAGCAGCGTCAGGCTCTGACTTTTTATGAATCCCGCCATGTTG
45 AGTACGGCTTGCTGCTGCTTGTTCATCTTTTCGTTTTCTCCGTTCTGTCTGTCATCTGCGTTGTGTGATT
46 ATATCGCGTACCACTTTTCGACTGTTTTGCTGCCGTTATTCTGCCGCTTGGCTTTTTGACGGGCATTTCT
47 GTCAGACAACACTGTCACTGCCAAAAAACTGCCGTGCCTTTGTCGGTAATTCGAGCTTGCTGACAGGACA
48 GGATGTGCAATTGTTATACCGCGCATACATGCACGCTATTACAATTGCCCTGGTCAGGGCTTTGCCCCGA
49 CACCCATGTCAGATACGGAGCCATGTTTTATGACAAAACGAAGTGGAAGTAATACGCGCAGGCGGGCTAT
50 CAGTCGCCCTGTTCGTCTGACGGCAGAAGAAGACCAGGAAATCAGAAAAAGGGCTGCTGAATGCGGCAAG
51 ACCGTTTCCGGTTTTTTACGGGCGGCAGCTCTCGGTAAGAAAGTTAACTCACTGACTGATGATCGGGTAC
52 TGAAAGAAGTTATGAGACTGGGGGCGTTACAGAAAAAACTCTTTATCGACGGCAAGCGTGTCGGGGACAG
53 GGAGTATGCGGAGGTGCTGATCGCTATTACGGAGTATCACCGTGCCCTGTTATCCAGACTTATGGCAGAT
54 TAGCTTCCCGGAGAGAAAACTGTCGAAAACAGACGGTATGAACACCGTAAGCTCCCAAAGTGATCACCAT
55 TCGCTTTCATGCATAGCTATGCAGCGAGCTGAAAACGATCCTGACGCATCCTTCCTGTTTTCCCGGGGTA
56 AAACATCTCTTT