Mercurial > repos > iuc > medaka_variant
diff test-data/assembly.fasta @ 0:3cde72a6e37c draft
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/medaka commit 1b97fa7a21a2c85bf4891aed1b7df92685b346c3"
author | iuc |
---|---|
date | Sat, 23 May 2020 13:36:47 -0400 |
parents | |
children |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/assembly.fasta Sat May 23 13:36:47 2020 -0400 @@ -0,0 +1,56 @@ +>4 length=3792 depth=114.52x circular=true +TTGCGGTGTCTGCGTCAGAATCGCGTTCAGCGCGTTTCAGCGGTGCGTACAATTACAGCATTATGTTAAA +TTTTATAATTGTCTTTAGTCATTGCGCTATGATTTTGTAGGTGGAGTTGTTTCATATTTTTGATATAAAT +TCTTTTATCTCACTGAAGCAGTCATCGTCAGTATCAATGGTTTTGTTCTTCATTGATATGCCTATTCTAG +AATCTGATTCCTTATTACAACTAAGGTAAACTTGAACTTTTGCTTTCTTTTCATTATTTGGGTAAGCGTA +ATCAGGATCTAAGGATGTAATAATAGATTCTTGTTCTTTTATTTTATTGAATAGATCGTCTATATATCTA +AACACCTCTTTCTTACACGCGTGAGCAATGATTAGATCTTCTATTGCGCCATTCTTGTTTTTTCCTGGCA +TGATAAAGAAAGATATTTTTGTGCTTCCGTTAATGGCTATTTCATTATGCGAGCTTGGTGATGAAATGTT +AAGCTCATTTAATGTTGAAATTATCGATCTTTCCGTGTCAGAAAACGATTCGTCGGCATCGATGATTAAG +AATATACTTTCTTTTTCATTAAAAGACTCTATGCTTTTAAATGCTCTAAGGGTTTGTTTTAGTTTTGTCT +TTCCATTTATTTTTTCAACATAAACATCATTAATTCCTTCTATTTCAAGTAGATTGCAAAGGAAGTGAAA +ATCATCATCACCCTCAACGAAAATGACTTTTTTATAATCATTTATTTTTCTCGGTTTCATTTATCTCACC +TCCCAGCCATTTTCAACTGAAAAAGAAAAATCATCCATGTTAAATTGCATTGCTGTAGGTTTTTGAGATT +CCTTGTCTCTTCCCAGTCTTATGTAAGATATATCTTTTCTTTTTTCATCTAATTCGTTTATCGCACATAT +TACATCATGGCTGTGTGTTGTTGTAAATATTTGATTATTATTGGTTTTTGCTGCTTCTATCAAAGCGTTG +ATCATATCTTTGATTACTGAGTAATGAATTCCATTTTCTATCTCATCAATGAGAATAATTGAGTCTTTTT +GAACTAAGATTGAGCTAATGAAAGACAGCGCTCTGCTTACTCCTTCACCAAGCATTGATATTTCATTTAA +TTCACTTAGTCCTATATCTAAAAAAATCTCTTTGTTTTGATCTGTTGCTATTATTGCAATATCGTTAATT +CTATTATCTATTCTTTTTAGGTTGCCTATTATTTCATCTTTTCTTTTTTGTGTTAGTAGTTTTGATACGT +TTTTTATCGTTGCTTCTTTGTTTATGTTTCTTGATGTGGTTATTATCGCTGCGGTTTTGAATTCATATAG +CTTACCTTTTTTAGTTTGTTTTATTTCTCCGTTTATTTCTTGTGCTTTTTGTGTTATTTTTATAGTAATC +AATTCTTCTGGGGGGGTTCTTTTTCCGTTCTGTGTTTCACTAACCTTAATCATTAAAACATTCCCCTTTT +CCTGAGAGCCGAGGGTTTGTCGCAATGGAGGGGTGTTTGATAATATTGACTCAACATTGAGGGACACGCT +TGATTCACTTTGTGTGTTATCTATCGTTGAGTATTTTTGTGTTACTTCTGACCTTTCATCTCTTATTGTT +ATGGACATTTCTTTGGATGTGTCCATGTTATAAAAATAGCTATCCCAAAATGAGTTTTCTTTATTTAAAA +GAGATGCTTCATTTCTAAAGCTTTTTACTTTTAACAGAGCTGCTGGGTTTTTTACGTCATAAAATGAAAA +TATCGCGTCTAATATCGATGTTTTCCCAAAGTTGTTTTTTCCGGATATTACATTAAGTGTTTTTAGTTGT +TTGAGAGTTATGCTCTCGAAACACTTAAAATTTTTTAAGTGGATATCTTTTATCATGTTTAAACTTGCTC +TCCATTTCTGTTTACGTTTACATAGTAATAATGTGTTTATTTATGCATCACTATGCCACTGTTTCTTTTC +TAGAAGTATAATCAAAATAATATTACTTTATAGTCCTGTTTGGATTGATTTTAACCAGTTTGTCGGAGTT +TCTTCTTGTGATTATTGTGTTCTGGTCGTAATCTCCTAAACTGAAAACGAAAAAACCACCTGGGGAGGTG +GTTTGATCGAAGGTTAAGTCAGTTGGGGAACTGCTTAACCAGGTAACTGTCTTGTGCGAGACGAGTCACC +AAAACTGTCCTTTCAGTGTAGCTGTAGTCAGGCCATCACTTCAAGTACTCTCTTGAACCTCTCGCACATC +GACTTTTACCAATGGCTGCTGCCAGTGGCGCTTTGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTT +ACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACC +TACACCGAACCGAGATACCTACAGCGTGAGCTATGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGG +ACAGGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAAACACCTG +GTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGGCTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGG +GGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCTGCGGCGCTGGCTTCCTCCGGTGCTTTGCTTTTTGCTCACATGTTC +TTTCCGACTTTATCCCCCGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCTTTTGAGTGAGCTGACACCGCTCGCC +GCAGTCGAACGACCGAGCGTAGCGAGTCAGTGAGCGAGGAAGCGGAAGAGCGCCTTATGTGACATTTTCT +CCTTACGCTCTGTTGTGCCGTTCGGCATCCTGTCCTGAGCGTTATCTCTCTGTGCTATTTTCTACTTCAA +AGCGTGTCTGGATGCTGTTCTGGAGTTCTTCTGCGAGTTCGTGCAGCTTCTCACACATGGCAGCCTGTTC +GTCAGCATCGGGTGCGTCCAGTTTTTCGAGCAGCGTCAGGCTCTGACTTTTTATGAATCCCGCCATGTTG +AGTACGGCTTGCTGCTGCTTGTTCATCTTTTCGTTTTCTCCGTTCTGTCTGTCATCTGCGTTGTGTGATT +ATATCGCGTACCACTTTTCGACTGTTTTGCTGCCGTTATTCTGCCGCTTGGCTTTTTGACGGGCATTTCT +GTCAGACAACACTGTCACTGCCAAAAAACTGCCGTGCCTTTGTCGGTAATTCGAGCTTGCTGACAGGACA +GGATGTGCAATTGTTATACCGCGCATACATGCACGCTATTACAATTGCCCTGGTCAGGGCTTTGCCCCGA +CACCCATGTCAGATACGGAGCCATGTTTTATGACAAAACGAAGTGGAAGTAATACGCGCAGGCGGGCTAT +CAGTCGCCCTGTTCGTCTGACGGCAGAAGAAGACCAGGAAATCAGAAAAAGGGCTGCTGAATGCGGCAAG +ACCGTTTCCGGTTTTTTACGGGCGGCAGCTCTCGGTAAGAAAGTTAACTCACTGACTGATGATCGGGTAC +TGAAAGAAGTTATGAGACTGGGGGCGTTACAGAAAAAACTCTTTATCGACGGCAAGCGTGTCGGGGACAG +GGAGTATGCGGAGGTGCTGATCGCTATTACGGAGTATCACCGTGCCCTGTTATCCAGACTTATGGCAGAT +TAGCTTCCCGGAGAGAAAACTGTCGAAAACAGACGGTATGAACACCGTAAGCTCCCAAAGTGATCACCAT +TCGCTTTCATGCATAGCTATGCAGCGAGCTGAAAACGATCCTGACGCATCCTTCCTGTTTTCCCGGGGTA +AAACATCTCTTT \ No newline at end of file